Assessment of Polymorphism in Zebrafish Mapping Strains

Table 1.

Allele Sizes of Markers Used in the Genotyping of the C32 and SJD Strains

Marker name Linkage group Size of C32 allele Size of SJD allele Marker name Linkage group Size of C32 allele Size of SJD allele Marker name Linkage group Size of C32 allele Size of SJD allele
Z1351 1 200 180 Z1273 9 130 Z1276 16 300 270, 302
Z1368 1 110 112 Z1322 9 320 240, 300 Z15453 16 215, 225 200, 210
Z450 1 150 158 Z1777 9 200 218, 222 Z6854 16 165 180
Z5508 1 200 200 Z1830 9 160 160, 168 Z1408 17 100 250
Z728 1 210 208 Z3124 9 140 150 Z14083 17 210 210
Z10838 2 205, 225 Z4544 9 160 Z1411 17 150
Z1484 2 210, 209 196 Z5394 9 100 140 Z1490 17 130 120
Z21363 2 2100 Z5564 9 250 260 Z1990 17 190 180
Z3551 2 240 Z562 9 200 200 Z21435 17 300 310
Z3743 2 220 216 Z1145 10 210 199, 204 Z22083 17 210
Z3754 2 130, 134 150 Z1296 10 280 310 Z3123 17 140 160
Z4289 2 250 250 Z13219 10 190 Z4314 17 250
Z4300 2 175 Z13632 10 275 Z4332 17 190, 210
Z4469 2 140 165 Z1450 10 260 240 Z4640 17 170 156
Z644 2 160 154 Z355 10 255 250 Z4862 17 200 206
Z6617 2 115 Z3835 10 150 200 Z7170 17 150, 200 220
Z1183 3 130, 140 Z531 10 110 Z852 17 250 244
Z1185 3 140 136 Z13411 11 240 Z1417 18 160 140
Z1209 3 152, 160 150 Z3362 11 160 180 Z15417 18 110
Z1401 3 190 150 Z3527 11 170 200 Z3558 18 250 230
Z20058 3 110 Z3952 11 145 157, 165 Z4263 18 320 318
Z3439 3 100 Z4221 11 200 Z4717 18 218, 200 218
Z3725 3 280 300 Z685 11 200 Z5231 18 180 170
Z5033 3 260 240 Z868 11 120 120 Z5442 18 150 150
Z872 3 220 Z1312 12 100 115 Z737 18 160, 168 150
Z9463 3 170 180 Z1400 12 110 106, 118 Z928 18 120 130
Z963 3 200 202 Z1473 12 150 120 Z1234 19 130
Z1366 4 130 150 Z1778 12 170, 200 180 Z15451 19 120 170
Z1389 4 180 150 Z22369 12 205 200 Z1803 19 190 200
Z1416 4 150 142 Z3801 12 195 180 Z3782 19 120 170
Z3275 4 290 300 Z4499 12 250 252 Z4009 19 300 260
Z3602 4 90 110 Z4568 12 170 180 Z5183 19 150 154
Z4951 4 240 250 Z4830 12 190, 198 190, 198 Z533 19 200 194
Z9920 4 100 Z4847 12 130 130 Z5352 19 150 1154
Z1167 5 186, 190 184 Z9172 12 120 Z7 19 144 140
Z1390 5 150 165 Z10362 13 180 174 Z10056 20 195 180
Z1492 5 200 192 Z10582 13 210, 230 Z20046 20 170 180
Z1842 5 200 150 Z11696 13 194, 200 Z3211 20 120, 135
Z23075 5 188 190 Z1531 13 200 140 Z3824 20 230 270
Z3902 5 230 215 Z1627 13 270 240 Z3954 20 255 175
Z2499 5 290, 310 290, 310 Z17223 13 180 200 Z4329 20 150 160
Z5208 5 350 360 Z17223 13 150 190 Z9708 20 230 220
Z5260 5 230 230 Z1826 13 150 GOF16 21 200 200
Z5538 5 250 320 Z4252 13 140 Z1162 21 130 130
Z5552 5 180 Z4285 13 130 140 Z15491 21 190
Z647 5 190, 200 Z5188 13 120, 130, 210 120 Z4425 21 150 130
GOF2 6 185 165 Z5395 13 200 170 Z4910 21 180 186
GOF20 6 250 270 Z6104 13 150 150 Z5503 21 220
GOF26 6 190 Z6657 13 180 184 Z722 21 100
Z1050 6 130 150 ZZ3424 13 190, 210 250 Z1148 22 210 230
Z1265 6 110 100 Z1257 14 150 140 Z178 22 110
Z1461 6 122 Z1396 14 150 135, 150 Z3093 22 150 180
Z1701 6 1701 Z1536 14 220 200 Z3286 22 104 100
Z5294 6 350 348 Z21080 14 250 Z4682 22 270 268
Z6601 6 140 Z4592 14 135 Z5238 22 220 222
Z880 6 150 152 Z4701 14 250 250 Z9516 22 200
Z10451 7 210 218, 232 Z5435 14 130 Z130 23 100 110
Z1059 7 180 180, 184 Z5436 14 100 85 Z13781 23 270, 290
Z1206 7 140 160 Z618 14 118, 120 150 Z1498 23 180
Z1217 7 208 200 Z6756 14 200 Z3157 23 130 110
Z1239 7 200, 260 240 Z974 14 190 200 Z3724 23 130
Z1313 7 160 130, 166 Z21982 15 200 Z4003 23 242, 250, 270 242
Z13253 7 180 176 Z24 15 150 120, 144 Z4120 23 160 150
Z1535 7 110 Z3309 15 100 150 Z5141 23 100, 112
Z20715 7 130 Z3358 15 200 Z1243 24 210 202, 26
Z4999 7 180 200 Z37 15 110 104, 106 Z1584 24 190
Z5025 7 214, 220 214 Z3760 15 100 160 Z249 24 160 150
Z5467 7 290 220, 300 Z470 15 130 130 Z3310 24 150 170
Z8574 7 210 200, 210 Z5223 15 180 220, 260 Z3399 24 290
Z8604 7 140 Z5393 15 225 211, 215 Z5075 24 220 200
Z1068 8 120 120 Z732 15 140 110, 134 Z9852 24 280
Z1637 8 160 140 Z858 15 290 310, 330 Z1213 25 130
Z3083 8 110 ZGOF18 15 180, 190 170 Z1431 25 150 200
Z4077 8 270 270 Z1543 16 150 Z1477 25 190
Z4318 8 150 Z1642 16 220 240 Z3028 25 250 240
Z4956 8 260 262 Z3104 16 230 250 Z3490 25 120 150
Z5081 8 230 210 Z4670 16 140, 150 140, 150 Z3745 25 130, 150, 154 130, 154
Z789 8 205 Z4678 16 200 Z5669 25 260 250
Z9279 8 150 Z9891 16 150 Z787 25 120 120
Z106 9 200 202

  • ↵Markers that did not amplify an SJD allele but amplified in the C32 strain.

This Article

  1. Genome Res. 9: 1231-1238

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