Table 3.
miRNAs found in the BBSRC chicken EST/cDNA collections
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Libraries in which miRNA is found |
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| miRNA
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Pri-miRNA Genbank I.D. (coordinates of stem-loop precursor in brackets)
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St. 10 whole embryo
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St. 20–21 whole embryo
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16 day embryo brain
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St. 22 limbs
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St. 36 limbs
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St. 36 trunk
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St. 36 head
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Chondrocytes
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Muscle
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Ovary
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Adult kidney + adrenal
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Adult adipose
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Adult small intestine
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Adult brain cerebellum
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Adult brain other parts
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Adult pancreas
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| let-7b | CR524335 (693–778) | • | • | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||
| let-7d | BU121246 (70–172) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-9 | CR405877 (385–471) | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-9* | CR405877 (385–471) | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-18b | BU384584 (46–129) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-19b-1 | CR390304 (219–305) | • | • | • | |||||||||||||||||||||||||||||
| mir-19b-2 | BU384584 (359–443) | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-20a | CR390304 (85–182) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-20b | BU384584 (224–319) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-22 | CR353219 (86–178) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-24 | BU434799 (515–582) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-27b | BU346082 (102–196) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-30b | BU436353 (418–495) | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-92-1 | CR390304 (341–418) | • | • | • | |||||||||||||||||||||||||||||
| mir-92-2 | BU384584 (511–586) | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-101-1 | CR406426 (617–728) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-181a | BU391109 (74–179) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-181b-1 | BU391109 (269–357) | • | • | • | • | • | • | ||||||||||||||||||||||||||
| mir-199a-1 | BU253899 (134–241) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-213 | BU391109 (74–179) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-221 | BU382625 (395–493) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-301 | BU260747 (455–547) | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-363
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BU384584 (644–721)
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