Table 2.

Estimated REV Rate Matrix, Q, Its Symmetric Part, R, and Its Equilibrium Distribution π, for Four Types of Regions

Region		Q					R
AR	-0.87	0.18	0.52	0.18	-2.97	0.84	2.52	0.60	0.29
	0.25	-1.17	0.19	0.74	0.84	-5.64	0.90	2.52	0.21
	0.74	0.19	-1.18	0.26	2.52	0.90	-5.74	0.87	0.21
	0.18	0.52	0.18	-0.88	0.60	2.52	0.87	-3.00	0.29
Rodent	-0.88	0.17	0.53	0.19	-3.03	0.83	2.53	0.63	0.29
	0.24	-1.16	0.18	0.74	0.83	-5.55	0.84	2.54	0.21
	0.74	0.18	-1.16	0.25	2.53	0.84	-5.56	0.84	0.21
	0.19	0.53	0.18	-0.89	0.63	2.54	0.84	-3.06	0.29
Exon	-1.05	0.19	0.71	0.15	-4.53	0.72	2.60	0.64	0.23
	0.17	-0.96	0.18	0.61	0.72	-3.55	0.64	2.68	0.27
	0.60	0.17	-0.95	0.17	2.60	0.64	-3.48	0.75	0.27
	0.15	0.72	0.20	-1.07	0.64	2.68	0.75	-4.69	0.23
Conserved	-0.89	0.18	0.54	0.18	-3.09	0.83	2.51	0.61	0.29
	0.24	-1.14	0.19	0.72	0.83	-5.35	0.88	2.51	0.21
	0.72	0.19	-1.15	0.24	2.51	0.88	-5.40	0.85	0.21
	0.18	0.54	0.18	-0.89	0.61	2.51	0.85	-3.12	0.29

Identification of Evolutionary Hotspots in the Rodent Genomes