Table 3.
Summary of Significant Marker Pair from Genome-Wide Interaction Analysis
| Trait | Marker1 | Marker2 | F-all | F-int | F-add1 | F-add2 |
| Period | D4Mit178 | D5Mit188 | 6.57 | 1.78 | 13.50 | 7.81 |
| D4Mit178 | D12Mit236 | 5.54 | 1.36 | 12.03 | 5.12 | |
| D5Mit98 | D12Mit236 | 5.73 | 3.06 | 9.03 | 7.00 | |
| Phase | D7Mit30 | D12Mit81 | 5.77 | 2.65 | 7.50 | 9.91 |
| D8Mit13 | D12Mit263 | 5.23 | 5.89 | 0.59 | 7.11 | |
| D12Mit81 | D18Mit17 | 6.21 | 2.43 | 11.89 | 9.49 | |
| D12Mit195 | D18Mit17 | 5.47 | 2.22 | 9.65 | 6.16 | |
| Amplitude | D1Mit33 | D4Mit27 | 6.46 | 6.88 | 1.81 | 8.81 |
| Activity | D16Mit106 | DXMit27 | 5.04 | 7.23 | 0.00 | 5.00 |
| Dissociation | D12Mit251 | D15Mit28 | 5.90 | 8.80 | 1.17 | 4.56 |
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Significance of F-all is assessed by permutation analysis. See text for threshold values.
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The alpha = 0.01 critical value for F-int is 3.42.
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The alpha = 0.01 critical value for F-add1 and F-add2 is 4.72.
