Table 2.
Distribution of Transcripts for Cytoskeletal Filaments and Collagens across Libraries
| Blood | Connective/muscle | Epithelial | Neural | Cluster ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene name | GenBank | B01 | B02 | B03 | B04 | B05 | B06 | C01 | C02 | C03 | C04 | C05 | C06 | C07 | C08 | C09 | C10 | C11 | C12 | E01 | E02 | E03 | E04 | E05 | E06 | E07 | E08 | N01 | N02 | N03 | N04 | N05 | N06 | N07 | N08 | N09 | N10 | N11 | N12 | N13 | BodyMap | UniGene |
| Cytokeratin 4 | X07695 | 4 | GS08105 | Hs. 3235 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytokeratin 5 | M19723 | 2 | 7 | 2 | GS05829 | Hs. 195850 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytokeratin 6 | L42601 | 3 | GS05780 | Hs. 111758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytokeratin 8 | X12882 | 1 | 2 | 2 | 2 | 1 | 12 | 26 | 29 | 86 | GS00223 | Hs. 78271 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytokeratin 12 | D78367 | 55 | GS08025 | Hs. 66739 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytokeratin 13 | X52426 | 2 | 23 | GS06283 | Hs. 74070 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytokeratin 14 | J00124 | 15 | 2 | GS05738 | Hs. 117729 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytokeratin 17 | Z19574 | 3 | GS05804 | Hs. 2785 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytokeratin 18 | X12883 | 1 | 1 | 4 | 5 | 5 | 8 | GS00243 | Hs. 65114 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytokeratin 19 | Y00503 | 1 | 4 | 14 | 13 | 5 | 25 | GS05013 | Hs. 182265 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| α-Actin, cardiac | J00073 | 13 | 88 | 1 | GS13600 | Hs. 7768 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| α-Actin, skeletal | M20543 | 18 | 2 | 301 | 1 | 1 | 1 | GS14552 | Hs. 1288 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| α-Actin, vascular | X13839 | 3 | 3 | 2 | 8 | 5 | 4 | 5 | 1 | 23 | GS03142 | Hs. 195851 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| β-Actin | X00351 | 14 | 1 | 4 | 2 | 1 | 2 | 11 | 2 | 2 | 1 | 5 | 3 | 22 | 4 | 2 | 2 | 10 | 7 | 12 | 17 | 1 | 6 | 4 | 3 | 1 | 3 | 1 | 8 | GS00244 | Hs. 180952 | |||||||||||
| γ-Actin, cytoskeletal | M19283 | 1 | 5 | 1 | 4 | 1 | 3 | 9 | 9 | 3 | 5 | 2 | 1 | 11 | 2 | 2 | 4 | 9 | 3 | 17 | 3 | 6 | 1 | 2 | 4 | 9 | 8 | 4 | 2 | 9 | GS00114 | Hs. 215747 | ||||||||||
| γ-Actin, enteric | D00654 | 1 | 1 | 6 | GS03304 | Hs. 77443 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Neurofilament-l | X05608 | 1 | 6 | 1 | 5 | 1 | GS04860 | Hs. 222661 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Neurofilament-M | Y00067 | 3 | 4 | 1 | 2 | 1 | GS05625 | Hs. 71346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GFAP | S40719 | 8 | 22 | 3 | 8 | 12 | 12 | 7 | 4 | GS06290 | Hs. 1447 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| COL1A1 | M32798 | 1 | 11 | 4 | 2 | 9 | 1 | 1 | 57 | 1 | 1 | GS02049 | Hs. 172928 | |||||||||||||||||||||||||||||
| COL1A2 | J03464 | 26 | 13 | 15 | 34 | 22 | 3 | 8 | 1 | 54 | GS02285 | Hs. 179573 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| COL2A1 | X16468 | 2 | GS12481 | Hs. 81343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| COL3A1 | X14420 | 4 | 1 | 28 | 5 | 16 | 14 | 12 | 5 | 2 | 11 | 2 | GS03074 | Hs. 119571 | ||||||||||||||||||||||||||||
| COL4A1 | M26576 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | GS06075 | Hs. 119129 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| COL4A2 | J02760 | 1 | GS16997 | Hs. 75617 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| COL5A1 | M76729 | 1 | 3 | 1 | 2 | 1 | GS03963 | Hs. 146428 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| COL5A2 | M11718 | 1 | 3 | 1 | 2 | 1 | GS03623 | Hs. 82985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| COL6A1 | X15880 | 2 | 1 | 1 | GS03931 | Hs. 10885 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| COL6A2 | M34572 | 3 | 1 | 1 | 2 | GS02756 | Hs. 219020 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| COL6A3 | X52022 | 1 | 5 | 2 | 1 | 6 | 2 | 1 | GS03837 | Hs. 80988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| COL9A2 | M95610 | 2 | 1 | GS09520 | Hs. 37165 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| COL9A3 | L41162 | 1 | GS05017 | Hs. 53563 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| COL11A1 | J04177 | 1 | GS12953 | Hs. 82772 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| COL15A1 | L25286 | 1 | 1 | 2 | 1 | 3 | GS3082 | Hs. 83164 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| COL18A1 | L22548 | 1 | 2 | 3 | 1 | 1 | GS02482 | Hs. 78409 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
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The numbers are the observed recurrence of each GS in library grouped by tissue system. For the source materials and number of total isolates, see Table 1.
