miRNAs found in the BBSRC chicken EST/cDNA collections
Libraries in which miRNA is found | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| miRNA | Pri-miRNA Genbank I.D. (coordinates of stem-loop precursor in brackets) | St. 10 whole embryo | St. 20–21 whole embryo | 16 day embryo brain | St. 22 limbs | St. 36 limbs | St. 36 trunk | St. 36 head | Chondrocytes | Muscle | Ovary | Adult kidney + adrenal | Adult adipose | Adult small intestine | Adult brain cerebellum | Adult brain other parts | Adult pancreas | ||||||||||||||||
| let-7b | CR524335 (693–778) | • | • | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||
| let-7d | BU121246 (70–172) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-9 | CR405877 (385–471) | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-9* | CR405877 (385–471) | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-18b | BU384584 (46–129) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-19b-1 | CR390304 (219–305) | • | • | • | |||||||||||||||||||||||||||||
| mir-19b-2 | BU384584 (359–443) | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-20a | CR390304 (85–182) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-20b | BU384584 (224–319) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-22 | CR353219 (86–178) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-24 | BU434799 (515–582) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-27b | BU346082 (102–196) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-30b | BU436353 (418–495) | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-92-1 | CR390304 (341–418) | • | • | • | |||||||||||||||||||||||||||||
| mir-92-2 | BU384584 (511–586) | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-101-1 | CR406426 (617–728) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-181a | BU391109 (74–179) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-181b-1 | BU391109 (269–357) | • | • | • | • | • | • | ||||||||||||||||||||||||||
| mir-199a-1 | BU253899 (134–241) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-213 | BU391109 (74–179) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-221 | BU382625 (395–493) | • | |||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-301 | BU260747 (455–547) | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||||
| mir-363 | BU384584 (644–721) | • | • | ||||||||||||||||||||||||||||||