Oligonucleotides Used. The Nonhomologous Tail in the S1 Mapping Primer S1-04nht Is Underlined
Tn5062 linker oligonucleotides | ||
|---|---|---|
| VC1 | 5′-GATCTGAATTCGGATCCTAATTAATTAATCTAGAAAGGAGGTGATCA | |
| VC2 | 5′-TATGATCACCTCCTTTCTAGATTAATTAATTAGGATCCGAATTCA | |
| VC3 | 5′-TATGGACGGAGCTCGGCCGCTTAAGGTACCGAATTCC | |
| VC4 | 5′-TCGAGGAATTCGGTACCTTAAGCGGCCGAGCTCCGTCCA | |
| Tn5062 sequencing primers | ||
|---|---|---|
| EZR1 | 5′-ATGCGCTCCATCAAGAAGAG | |
| EZL2 | 5′-TCCAGCTCGACCAGGATG | |
| IPCR primers | ||
|---|---|---|
| Tsr1 | 5′-GCAAGGGGAAGTCGTCGCTCTCTGG | |
| Tsr2 | 5′-CGGCGTGGGGACGTCGTCGTTCTCG | |
| Tsr3 | 5′-GGATTTGCGATGGTGTCCAACTCAG | |
| Tsr4 | 5′-GGACGTCGAGCCCCTCATGCACAGC | |
| Tsr5 | 5′-GGAGAGAACGACGGGAAGGGAGAAG | |
| Tsr6 | 5′-GACCTCGATTCGTCAGTGATGATCC | |
| Tsr7 | 5′-CGGATTGTCCCCGAGTTCCTTCACG | |
| Tsr8 | 5′-GCGTCTTCCGCCTCGGTTTCCATCC | |
| S1 mapping primers | ||
|---|---|---|
| S1-04nht | 5′-GCGCAAGCTTCCCGAAGCCGTGTAGAAGTA | |
| S1-04r | 5′-AGTGCTTTGAGCGCTTCCT | |