Table 8.

Escherichia coli TUs Predicted to Belong to the FNR Regulon

Operon Site sequence Position Score
Category I
b1674-b1673-b1672- TTAATTGATAACGATCAATGTT −21820.04
 b1671-ydhU-b1669
b2503 TTGTTTGATATATATCAATTGG −14520.26
b2504 CCAATTGATATATATCAAACAA −22920.26
cydAB GGAATTGATATTTATCAATGTA −35021.30
TAAATTGTTCTCGATCAAATTG −29819.10
narXL CAATTTGATGTAAATCAAACGA −28320.38
ATCATTGATATTTATCATTACC −24516.41
ung ATCTTTGATTTAAATCAATAAA −20220.93
TTTATTGTTTTACATCAACTTA −14914.99
yciCB TAATGTGATTTAAATCAATTTT −21220.88
yciD AAAATTGATTTAAATCACATTA −16720.88
yehDCBA TAATTTGTTTTAAATCAATAAA −12420.17
yfiD TTTATTGATTTAAATCAAAGAT −12520.93
TAAGTTGATGTAAAACAATAAA −17814.99

[i] Listed are predictions from category I.