Summary
| A. Hexamers | |||||||||||||||||
| Phase | Hexamer | Aligns with MCB at positions | Contains pentamer | Clustered | |||||||||||||
| 4/6 | 5/6 | ||||||||||||||||
| Early | |||||||||||||||||
| G1 | *C | C | C | C | G | C | / | G | C | G | G | G | G | ||||
| C | C | C | C | G | C | ||||||||||||
| A | C | G | C | G | G | / | C | C | G | C | G | T | Y | Y | Y | ||
| Late | |||||||||||||||||
| G1 | *A | C | G | C | G | T | / | A | C | G | C | G | T | Y | Y | Y | Y |
| *A | C | G | C | G | T | Y | Y | Y | Y | ||||||||
| *A | A | C | G | C | G | / | C | G | C | G | T | T | Y | Y | Y | Y | |
| *A | A | C | G | C | G | Y | Y | Y | Y | ||||||||
| *C | G | C | G | T | T | Y | Y | Y | Y | ||||||||
| *C | G | C | G | T | C | / | G | A | C | G | C | G | Y | Y | Y | Y | |
| *G | A | C | G | C | G | Y | Y | Y | Y | ||||||||
| *C | G | C | G | T | C | Y | Y | Y | |||||||||
| *A | C | G | C | G | A | / | T | C | G | C | G | T | Y | Y | Y | Y | |
| *A | C | G | C | G | A | Y | Y | Y | Y | ||||||||
| T | C | G | C | G | T | Y | Y | Y | |||||||||
| *C | G | C | G | T | A | / | T | A | C | G | C | G | Y | Y | Y | Y | |
| *C | G | C | G | A | A | / | T | T | C | G | C | G | Y | Y | Y | ||
| C | G | C | G | A | A | Y | Y | ||||||||||
| *C | G | A | C | G | C | / | G | C | G | T | C | G | Y | Y | |||
| S | C | C | G | T | G | C | / | G | C | A | C | G | G | ||||
| A | G | T | C | A | G | / | C | T | G | A | C | T | |||||
| G2 | *G | A | G | T | C | A | / | T | G | A | C | T | C | ||||
| Early | |||||||||||||||||
| G1, M | C | C | C | T | T | T | Y | ||||||||||
| B. Pentamers | |||||||||||||||||
| Phase | Pentamer | Aligns with MCB at 4/5 positions | Contained within hexamer | Clustered | |||||||||||||
| Early | |||||||||||||||||
| G1 | A | T | A | T | A | / | T | A | T | A | T | Y | |||||
| A | T | A | T | A | Y | ||||||||||||
| G | G | C | C | A | / | T | G | G | C | C | Y | ||||||
| C | C | G | C | G | / | C | G | C | G | G | Y | Y | |||||
| *C | C | C | T | T | Y | ||||||||||||
| T | A | T | A | A | Y | ||||||||||||
| Late | |||||||||||||||||
| G1 | *A | C | G | C | G | / | C | G | C | G | T | Y | Y | Y | |||
| *A | C | G | C | G | Y | Y | Y | ||||||||||
| *C | G | C | G | T | Y | Y | Y | ||||||||||
| *C | G | C | G | A | / | T | C | G | C | G | Y | Y | Y | ||||
| *C | G | C | G | A | Y | Y | Y | ||||||||||
| *T | C | G | C | G | Y | Y | |||||||||||
| *G | A | C | G | C | / | G | C | G | T | C | Y | Y | |||||
| *G | A | C | G | C | Y | Y | |||||||||||
| *G | C | G | T | C | Y | Y | |||||||||||
| *A | A | C | G | C | / | G | C | G | T | T | Y | Y | Y | ||||
| *G | C | G | T | T | Y | Y | Y | ||||||||||
| *A | A | C | G | C | Y | Y | Y | ||||||||||
| *G | C | G | A | A | / | T | T | C | G | C | Y | Y | |||||
| G | C | G | T | A | / | T | A | C | G | C | Y | Y | |||||
| C | G | A | A | A | / | T | T | T | C | G | |||||||
| *A | T | A | A | A | Y | ||||||||||||
| *A | A | T | A | A | Y | ||||||||||||
| T | A | A | C | A | |||||||||||||
| T | A | A | T | A | Y | ||||||||||||
| S | G | C | C | A | C | / | G | T | G | G | C | ||||||
| *A | A | C | A | A | Y | ||||||||||||
| G | T | T | G | G | |||||||||||||
| A | A | A | C | A | Y | ||||||||||||
| M | *A | A | C | C | C | / | G | G | G | T | T | ||||||
| G2, | |||||||||||||||||
| Late G1 | *C | A | G | C | C | / | G | G | C | T | G | Y | |||||
| Many | G | C | C | G | C | / | G | C | G | G | C | ||||||
| *A | C | A | A | A | |||||||||||||
[i] Summary of the data presented in Tables 1 T2 T3 T4. (*) Hexamers and pentamers with P ≤ 0.05 from Table 1 or 2.