Markup | Genome Research

Table 4.

Accuracy of Gene-finding Programs on Human Chromosome 22

Program		Nucleotide		Exon		Gene
Program		Sn	Sp	CC	Sn	Sp	(Sn+Sp)/2	ME	WE	Sn	Sp	(Sn+Sp)/2	MG	WG	JG	SG
GENSCAN	0.86	0.50	0.64	0.70	0.40	0.55	0.13	0.50	0.06	0.04	0.05	0.11	0.45	1.24	1.07
GENOMESCAN	0.87	0.44	0.59	0.72	0.36	0.54	0.10	0.55	0.11	0.06	0.08	0.12	0.52	1.07	1.14
GENEID	0.80	0.63	0.69	0.66	0.53	0.59	0.19	0.35	0.09	0.07	0.08	0.14	0.39	1.20	1.08
TBLASTX	0.84	0.39	0.54	—	—	—	0.12	0.74	—	—	—	0.11	—	—	—
SGP2	0.83	0.67	0.73	0.68	0.56	0.62	0.16	0.31	0.13	0.10	0.11	0.14	0.36	1.14	1.13