Markup | Genome Research

Table 3.

Summary of RH Results

Locus	Pos.	Prev. locus	Pos.	lod	cR	Next locus	Pos.	lod	cR
D1Mit211	15	D1Mit316	8	1.5	108.2	D1Mit171	20.2	3.3	75.7
D1Mit234	26	D1Mit232	21	6.3	51.4	D1Mit236	26	11.7	25.1
D1Mit303	35	D1Mit236	26	2.7	86.0	D1Mit19	37	3.6	73.8
D1Mit332	43	D1Mit46	43	5.8	53.8	D1Mit216	50	5.8	56.0
D1Mit216	50	D1Mit332	43	5.9	56.0	D1Mit10	57	2.7	78.3
D1Mit136	60	D1Mit10	57	3.9	64.6	D1Mit87	62	5.2	57.1
D1Mit446	70	D1Mit286	67	10.0	30.6	D1Mit102	73	7.5	38.9
D1Mit424	82	D1Mit102	73	5.6	50.3	D1Mit33	82	10.6	28.1
D1Mit206	96	D1Mit36	92	6.4	50.3	D1Mit291	102	6.5	48.3
D2Mit117	5	D2Mit312	2	3.5	71.7	D2Mit149	7	5.0	60.1
D2Mit417	22	D2Mit149	7	2.3	90.9	D2Mit365	22	15.0	19.9
D2Mit365	22	D2Mit417	21	15.0	19.9	D2Mit372	27	1.7	103.8
D2Mit372	27	D2Mit365	22	1.8	103.8	D2Mit297	29	4.1	66.8
D2Mit380	40	D2Mit182	37	4.0	68.9	D2Mit44	53	3.1	78.1
D2Mit206	60	D2Mit300	53	7.4	42.9	D2Mit274	62	6.0	49.9
D2Mit525	61	D2Mit106	76	17.2	10.0	D2Mit194	81	7.6	39.6
D2Mit493	72	D2Mit285	86	12.3	22.4	D2Mit263	92	10.9	23.9
D2Mit148	105	D2Mit263	92	7.8	36.8	D2Mit346	92	13.7	19.6
D3Mit130	4	D3Mit264	4	10.6	28.6	D3Mit203	11	1.3	117.8
D3Mit307	22	D3Mit224	22	3.8	65.4	D3Mit22	34	0.0	230.3
D3Mit278	25	D3Mit22	34	6.9	48.5	D3Mit212	40	4.3	67.1
D3Mit77	37	D3Mit29	45	1.8	103.0	D3Mit215	55	1.5	105.6
D3Mit258	70	D3Mit42	59	3.6	73.6	D3Mit84	72	12.4	23.4
D3Mit44	79	D3Mit200	77	19.4	8.0	D3Mit59	84	7.2	48.5
D3Mit87	84	D3Mit59	84	14.0	20.2	D3Mit163	88	11.0	30.0
D4Mit211	6	D4Mit149	12	4.6	2.3	D4Mit94	11	2.8	74.4
D4Mit178	36	D4Mit111	22	1.5	84.2	D4Mit245	43	6.5	50.6
D4Mit166	45	D4Mit245	42	5.9	55.3	D4Mit9	45	13.6	22.6
D4Mit203	60	D4Mit12	57	4.6	51.8	D4Mit54	66	7.6	43.2
D4Mit310	71	D4Mit54	66	8.7	38.9	D4Mit225	80	2.4	79.2
D5Mit346	1	—	—	—	—	D5Mit66	17	0.0	237.5
D5Mit388	18	D5Mit66	17	5.4	58.5	D5Mit78	26	4.0	69.7
D5Mit10	54	D5Mit200	36	2.6	86.3	D5Mit157	57	6.6	50.8
D5Mit25	61	D5Mit240	59	7.2	45.4	D5Mit136	65	8.4	37.4
D5Mit138	69	D5Mit95	68	4.2	65.8	D5Mit221	80	1.1	110.9
D5Mit31	80	D5Mit221	80	14.5	15.2	D5Mit292	83	13.2	22.8
D6Mit139	3	D6Mit138	1	11.8	26.3	D6Mit223	19	1.6	102.7
D6Mit188	33	D6Mit123	29	4.8	61.3	D6Mit8	36	2.7	79.4
D6Mit102	41	D6Mit31	39	16.2	14.2	D6Mit105	46	4.2	67.5
D6Mit105	47	D6Mit102	41	4.3	67.5	D6Mit256	60	4.4	59.6
D6Mit52	61	D6Mit24	57	7.0	46.0	D6Mit289	62	17.7	14.6
D6Mit289	62	D6Mit52	61	17.7	14.6	Kap	64	6.5	46.0
D6Mit14	74	D6Mit259	67	10.7	25.5	D6Mit15	74	9.4	32.2
D7Mit227	16	D7Mit246	15	5.1	58.2	D7Mit69	25	3.7	66.9
D7Mit145	27	D7Mit69	25	8.0	39.2	D7Mit232	27	10.3	30.9
D7Mit31	44	D7Mit176	27	3.6	71.3	D7Mit220	52	2.4	90.1
D7Mit238	53	D7Mit220	52	5.0	60.0	D7Mit165	64	3.7	70.5
D7Mit71	65	D7Mit165	64	1.3	108.2	D7Mit166	66	2.4	89.4
D7Mit46	69	D7Mit12	66	6.5	48.1	—	—	—	—
D8Mit4	14	D8Mit223	11	4.9	61.8	D8Mit191	21	9.9	30.5
D8Mit46	28	D8Mit227	24	0.7	125.5	D8Mit261	33	0.5	146.1
D8Mit242	47	D8Mit184	47	23.0	5.2	D8Mit112	53	0.4	163.0
D8Mit184	47	D8Mit183	47	11.0	23.4	D8Mit242	47	23.0	5.2
D8Mit112	53	D8Mit242	47	0.5	163.0	D8Mit12	53	−0.1	274.9
D8Mit121	67	D8Mit13	67	20.4	5.8	D8Mit93	72	5.6	50.3
D9Mit89	8	D9Mit64	7	14.3	11.7	D9Mit90	9	15.9	14.4
D9Mit269	43	D9Mit207	33	0.6	122.8	D9Mit196	48	6.4	48.9
D9Mit12	55	D9Mit136	54	21.3	5.5	D9Mit182	55	12.0	23.4
D9Mit311	65	D9Mit24	56	5.7	57.3	D9Mit52	72	8.8	35.0
D10Mit183	17	D10Mit86	17	9.0	37.8	D10Mit184	26	1.8	113.6
D10Mit86	17	D10Mit16	16	5.3	57.8	D10Mit183	17	9.0	37.8
D10Mit36	29	D10Mit38	27	7.5	47.5	D10Mit20	32	3.6	74.9
D10Mit38	27	D10Mit184	26	10.6	29.8	D10Mit36	29	7.4	47.5
D10Mit31	36	D10Mit20	32	15.2	13.9	D10Mit42	44	1.9	101.6
D10Mit42	44	D10Mit31	36	2.0	101.6	D10Mit132	47	10.0	34.7
D10Mit132	47	D10Mit42	44	10.1	34.7	D10Mit117	48	13.6	20.7
D10Mit134	59	D10Mit95	51	4.3	64.3	D10Mit136	62	8.0	42.5
D10Mit266	62	D10Mit136	62	13.8	19.9	D10Mit14	65	10.3	26.7
D10Mit271	70	D10Mit14	65	8.4	35.5	—	—	—	—
D11Mit2	2	D11Mit1	1	0.5	154.2	D11Mit227	2	2.5	87.7
D11Mit271	21	D11Mit236	20	14.2	18.4	D11Mit242	31	4.6	64.1
D11Mit242	31	D11Mit271	21	4.6	64.1	D11Mit4	37	9.5	33.3
D11Mit36	48	D11Mit117	45	2.1	101.1	D11Mit213	55	1.3	105.6
D11Mit263	55	D11Mit213	55	13.1	21.3	D11Mit99	60	10.3	31.6
D11Mit224	66	D11Mit166	64	6.9	43.1	D11Mit214	74	1.1	128.0
D11Mit214	74	D11Mit224	66	1.2	128.0	D11Mit69	71	1.5	114.3
D12Mit12	6	D12Mit182	2	3.0	76.8	D12Mit11	6.0	8.8	35.8
D12Mit221	16	D12Mit153	15	9.9	25.9	D12Mit54	24	3.4	75.1
D12Mit201	29	D12Mit54	24	7.4	45.3	D12Mit156	34	6.1	54.3
D12Mit4	34	D12Mit156	34	17.1	12.7	D12Mit158	38	10.2	30.9
D12Mit259	45	D12Mit204	41	5.7	47.8	D12Mit97	47	6.8	43.9
D12Mit167	52	D12Mit97	47	4.3	62.5	D12Mit19	58	4.7	61.1
D12Mit263	58	D12Mit19	58	18.0	10.4	D12Nds2	60	22.1	27.6
D13Mit14	10	D13Mit207	9	7.0	45.3	D13Mit64	30	3.0	81.9
D13Mit64	30	D13Mit14	10	3.0	81.9	D13Mit139	32	6.3	47.6
D13Mit67	37	D13Mit66	37	3.8	69.7	D13Mit125	44	4.2	68.7
D13Mit202	47	D13Mit125	44	10.3	31.3	D13Mit53	62	5.2	59.6
D13Mit53	62	D13Mit202	47	5.2	59.6	D13Mit171	71	10.3	29.8
D14Mit109	3	D14Mit132	1	10.0	26.1	D14Mit11	3	18.6	6.4
D14Mit257	17	D14Mit64	22	9.0	34.0	D14Mit82	20	11.1	26.7
D14Mit158	29	D14Mit82	20	2.2	89.7	D14Mit203	29	14.9	15.9
D14Mit160	40	D14Mit217	33	7.9	38.1	D14Mit67	38	18.7	8.9
D14Mit92	45	D14Mit67	38	6.2	55.7	D14Mit196	47	5.4	49.4
D14Mit97	58	D14Mit75	54	10.3	27.8	D14Mit170	63	8.2	35.5
D15Mit252	10	D15Mit179	11	1.8	93.1	D15Mit136	14	3.4	75.7
D15Mit85	15	D15Mit136	14	2.1	96.8	D15Mit183	23	4.6	63.3
D15Mit270	S	D15Mit183	23	7.5	43.9	D15Mit29	43	5.7	56.2
D15Mit105	42	D15Mit188	44	6.6	46.8	D15Mit107	50	5.4	53.3
D15Mit171	54	D15Mit190	52	22.9	3.6	D15Mit39	57	8.7	36.1
D15Mit14	57	D15Mit193	58	5.1	56.9	D15Mit16	62	5.5	59.2
D16Mit146	17	D16Mit145	14	10.3	25.6	D16Mit57	22	5.0	57.6
D16Mit189	55	D16Mit49	53	4.9	60.7	D16Mit158	55	8.1	40.6
D17Mit133	10	D17Mit196	7	1.9	97.3	D17Mit55	13	14.3	14.5
D17Mit50	23	D17Mit176	23	14.3	12.3	D17Mit52	23	12.6	9.1
D17Mit180	29	D17Mit139	30	10.3	29.3	D17Mit6	31	14.9	16.0
D17Mit185	41	D17Mit119	39	6.5	51.9	D17Mit3	42	9.2	38.3
D17Mit72	47	D17Mit39	45	8.7	41.1	D17Mit73	49	11.0	30.6
D17Mit123	57	D17Mit1	57	3.5	77.0	—	—	—	—
D18Mit60	16	D18Mit147	16	2.7	81.4	D18Mit150	25	4.1	74.9
D18Mit55	25	D18Mit150	25	15.2	16.0	D18Mit123	31	7.4	42.3
D18Mit40	37	D18Mit152	37	7.2	41.1	D18Mit142	47	4.5	58.0
D19Mit56	5	D19Mit59	0	5.4	50.4	D19Mit68	18	4.5	62.0
D19Mit111	15	D19Mit79	6	5.1	61.6	D19Mit40	25	6.8	44.3
D19Mit63	24	D19Mit86	20	1.8	95.5	D19Mit88	34	4.9	63.9
D19Mit88	34	D19Mit63	24	5.0	63.9	D19Mit82	29	3.4	73.2
D19Mit10	47	D19Mit53	43	6.7	41.0	D19Mit91	47	0.2	155.1
D19Mit6	55	D19Mit71	54	15.1	16.6	—	—	—	—
DXMit54	2	DXMit124	3	9.1	35.2	DXMit137	7	11.0	25.4
DXMit81	12	DXMit125	6	7.0	38.9	DXMit49	14	9.4	31.1
DXMit192	19	DXMit50	11	6.8	44.9	DXMit140	19	3.5	62.2
DXMit74	22	DXMit140	19	4.2	54.8	DXMit119	28	6.6	36.7
DXMit170	29	DXMit119	28	3.3	57.6	DXMit95	43	23.0	1.9
DXMit172	40	DXMit149	51	2.9	74.9	DXMit67	60	4.9	57.5
DXMit80	50	DXMit67	60	8.6	35.1	DXMit179	62	6.3	48.9

[i] Data were analyzed using RHMAPPER (Stein et al., 1995), along with all publicly available data (http://www.jax.org). For each marker the lod scores for linkage to the next most centromeric (previous) or telomeric (next) markers are reported as well as the RH distance estimates. Also shown are the genetic map positions of the markers taken from the 1998 Chromosome Committee reports (http://www.jax.org), except for D15Mit52 and D15Mit270, whose positions are from http://www-genome.wi.mit.edu.