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Table 1.

Allele Sizes of Markers Used in the Genotyping of the C32 and SJD Strains

Marker name	Linkage group	Size of C32 allele	Size of SJD allele	Marker name	Linkage group	Size of C32 allele	Size of SJD allele	Marker name	Linkage group	Size of C32 allele	Size of SJD allele
Z1351	1	200	180	Z1273	9	130		Z1276	16	300	270, 302
Z1368	1	110	112	Z1322	9	320	240, 300	Z15453	16	215, 225	200, 210
Z450	1	150	158	Z1777	9	200	218, 222	Z6854	16	165	180
Z5508	1	200	200	Z1830	9	160	160, 168	Z1408	17	100	250
Z728	1	210	208	Z3124	9	140	150	Z14083	17	210	210
Z10838	2	205, 225		Z4544	9	160		Z1411[i]	17	150
Z1484	2	210, 209	196	Z5394	9	100	140	Z1490	17	130	120
Z21363	2	2100		Z5564	9	250	260	Z1990	17	190	180
Z3551	2	240		Z562	9	200	200	Z21435	17	300	310
Z3743	2	220	216	Z1145	10	210	199, 204	Z22083	17	210
Z3754	2	130, 134	150	Z1296	10	280	310	Z3123	17	140	160
Z4289	2	250	250	Z13219	10	190		Z4314	17	250
Z4300	2	175		Z13632	10	275		Z4332	17	190, 210
Z4469	2	140	165	Z1450	10	260	240	Z4640	17	170	156
Z644	2	160	154	Z355	10	255	250	Z4862	17	200	206
Z6617	2	115		Z3835	10	150	200	Z7170	17	150, 200	220
Z1183	3		130, 140	Z531	10	110		Z852	17	250	244
Z1185	3	140	136	Z13411	11	240		Z1417	18	160	140
Z1209	3	152, 160	150	Z3362	11	160	180	Z15417	18	110
Z1401	3	190	150	Z3527	11	170	200	Z3558	18	250	230
Z20058	3	110		Z3952	11	145	157, 165	Z4263	18	320	318
Z3439	3	100		Z4221	11	200		Z4717	18	218, 200	218
Z3725	3	280	300	Z685	11	200		Z5231	18	180	170
Z5033	3	260	240	Z868	11	120	120	Z5442	18	150	150
Z872[i]	3	220		Z1312	12	100	115	Z737	18	160, 168	150
Z9463	3	170	180	Z1400	12	110	106, 118	Z928	18	120	130
Z963	3	200	202	Z1473	12	150	120	Z1234	19	130
Z1366	4	130	150	Z1778	12	170, 200	180	Z15451	19	120	170
Z1389	4	180	150	Z22369	12	205	200	Z1803	19	190	200
Z1416	4	150	142	Z3801	12	195	180	Z3782	19	120	170
Z3275	4	290	300	Z4499	12	250	252	Z4009	19	300	260
Z3602	4	90	110	Z4568	12	170	180	Z5183	19	150	154
Z4951	4	240	250	Z4830	12	190, 198	190, 198	Z533	19	200	194
Z9920	4	100		Z4847	12	130	130	Z5352	19	150	1154
Z1167	5	186, 190	184	Z9172	12	120		Z7	19	144	140
Z1390	5	150	165	Z10362	13	180	174	Z10056	20	195	180
Z1492	5	200	192	Z10582	13	210, 230		Z20046	20	170	180
Z1842	5	200	150	Z11696	13	194, 200		Z3211	20	120, 135
Z23075	5	188	190	Z1531	13	200	140	Z3824	20	230	270
Z3902	5	230	215	Z1627	13	270	240	Z3954	20	255	175
Z2499	5	290, 310	290, 310	Z17223	13	180	200	Z4329	20	150	160
Z5208	5	350	360	Z17223	13	150	190	Z9708	20	230	220
Z5260	5	230	230	Z1826[i]	13	150		GOF16	21	200	200
Z5538	5	250	320	Z4252[i]	13	140		Z1162	21	130	130
Z5552	5	180		Z4285	13	130	140	Z15491	21	190
Z647	5	190, 200		Z5188	13	120, 130, 210	120	Z4425	21	150	130
GOF2	6	185	165	Z5395	13	200	170	Z4910	21	180	186
GOF20	6	250	270	Z6104	13	150	150	Z5503	21	220
GOF26	6	190		Z6657	13	180	184	Z722	21	100
Z1050	6	130	150	ZZ3424	13	190, 210	250	Z1148	22	210	230
Z1265	6	110	100	Z1257	14	150	140	Z178	22	110
Z1461	6	122		Z1396	14	150	135, 150	Z3093	22	150	180
Z1701	6	1701		Z1536	14	220	200	Z3286	22	104	100
Z5294	6	350	348	Z21080[i]	14	250		Z4682	22	270	268
Z6601	6	140		Z4592	14	135		Z5238	22	220	222
Z880	6	150	152	Z4701	14	250	250	Z9516	22	200
Z10451	7	210	218, 232	Z5435	14	130		Z130	23	100	110
Z1059	7	180	180, 184	Z5436	14	100	85	Z13781	23	270, 290
Z1206	7	140	160	Z618	14	118, 120	150	Z1498	23	180
Z1217	7	208	200	Z6756	14	200		Z3157	23	130	110
Z1239	7	200, 260	240	Z974	14	190	200	Z3724	23	130
Z1313	7	160	130, 166	Z21982	15	200		Z4003	23	242, 250, 270	242
Z13253	7	180	176	Z24	15	150	120, 144	Z4120	23	160	150
Z1535	7	110		Z3309	15	100	150	Z5141	23	100, 112
Z20715	7		130	Z3358	15	200		Z1243	24	210	202, 26
Z4999	7	180	200	Z37	15	110	104, 106	Z1584	24	190
Z5025	7	214, 220	214	Z3760	15	100	160	Z249	24	160	150
Z5467	7	290	220, 300	Z470	15	130	130	Z3310	24	150	170
Z8574	7	210	200, 210	Z5223	15	180	220, 260	Z3399	24	290
Z8604	7		140	Z5393	15	225	211, 215	Z5075	24	220	200
Z1068	8	120	120	Z732	15	140	110, 134	Z9852	24	280
Z1637	8	160	140	Z858	15	290	310, 330	Z1213	25	130
Z3083	8	110		ZGOF18	15	180, 190	170	Z1431	25	150	200
Z4077	8	270	270	Z1543	16	150		Z1477	25	190
Z4318	8	150		Z1642	16	220	240	Z3028	25	250	240
Z4956	8	260	262	Z3104	16	230	250	Z3490	25	120	150
Z5081	8	230	210	Z4670	16	140, 150	140, 150	Z3745	25	130, 150, 154	130, 154
Z789	8		205	Z4678	16	200		Z5669	25	260	250
Z9279[i]	8	150		Z9891	16	150		Z787	25	120	120
Z106	9	200	202

[i] Markers that did not amplify an SJD allele but amplified in the C32 strain.