Markup | Genome Research

Table 1.

Polychotomous Linkage Analysis and Association of Distal Chromosome 6 Markers with Type 1 Diabetes Phenotype in BC1 (NOD/PWK × NOD) Progenies

Locus

Normal (1 + 2)

Insulitis (3 + 4)

Severe insulitis (5)

Diabetes (6)

χ²

P value

N/N : N/P

N/N : N/P

N/N : N/P

N/N : N/P

Sex combined

D6Mit21

54 : 50

23 : 22

11 : 15

5 : 11

3.98

0.05

D6Mit53

57 : 48

21 : 24

10 : 16

5 : 11

7.96

0.01

D6Mit11

59 : 46

21 : 24

9 : 17

5 : 11

12.15

0.00049

Ly4

58 : 47

21 : 24

8 : 18

5 : 11

12.29

0.00045

D6Mit25

60 : 45

20 : 25

9 : 17

5 : 11

12.11

0.0005

D6Mit14

60 : 45

19 : 26

9 : 17

6 : 10

10.31

0.0013

Males

D6Mit21

35 : 25

9 : 8

4 : 10

3 : 4

6.60

0.01

D6Mit53

37 : 24

7 : 10

3 : 11

3 : 4

14.18

0.00016

D6Mit11

35 : 26

8 : 9

3 : 11

3 : 4

11.32

0.00076

Ly4

35 : 26

8 : 9

2 : 12

3 : 4

13.29

0.00026

D6Mit25

37 : 24

8 : 9

2 : 12

3 : 4

13.08

0.00029

D6Mit14

37 : 28

7 : 10

2 : 12

3 : 4

14.50

0.00014

Females

D6Mit21

19 : 25

14 : 14

7 : 5

2 : 7

0.01

0.95 (N.S.)

D6Mit53

20 : 24

14 : 14

7 : 5

2 : 7

0.03

0.95 (N.S.)

D6Mit11

24 : 20

13 : 15

6 : 6

2 : 7

2.49

0.20 (N.S.)

Ly4

23 : 21

13 : 15

6 : 6

2 : 7

1.76

0.20 (N.S.)

D6Mit25

23 : 21

12 : 16

7 : 5

2 : 7

1.48

0.30 (N.S.)

D6Mit14

23 : 21

12 : 16

7 : 5

3 : 6

0.50

0.50 (N.S.)