Markup | Genome Research

Table 1.

Average DNA Curvature Genomic Values

Genome		Size (bp)		% AT		Average curvature (n.u.)[i] Noncoding vs. coding vs. shuffled noncoding
Genome		Size (bp)		% AT		window = 50 bp		window = 100 bp		window = 150 bp
Escherichia coli	4639221	49	0.141	0.119	0.129	0.104	0.084	0.092	0.087	0.068	0.075
Mycobacterium tuberculosis	4411529	34	0.099	0.089	0.096	0.071	0.063	0.068	0.059	0.052	0.056
Bacillussp.	4214814	56	0.153	0.132	0.135	0.111	0.093	0.094	0.092	0.076	0.077
SynechocystisPCC6803	3573470	52	0.154	0.137	0.129	0.112	0.098	0.091	0.093	0.080	0.074
Haemophilus influenzae	1830138	62	0.170	0.145	0.143	0.124	0.102	0.101	0.104	0.083	0.082
Helicobacter pylori	1667867	61	0.178	0.160	0.147	0.133	0.115	0.104	0.113	0.094	0.084
Chlamydia pneumonia	1230230	59	0.151	0.135	0.140	0.109	0.096	0.099	0.089	0.079	0.081
Chlamydia trachomatis	1042519	59	0.153	0.135	0.134	0.109	0.096	0.096	0.090	0.079	0.077
Mycoplasma pneumoniae	816394	60	0.156	0.140	0.137	0.109	0.097	0.095	0.089	0.079	0.076
Mycoplasma genitalium	580074	68	0.161	0.151	0.143	0.113	0.107	0.100	0.088	0.088	0.081
Borrelia burgdorferi	910724	71	0.166	0.160	0.149	0.123	0.114	0.103	0.104	0.094	0.083
Rickettsia prowazekii	1111523	71	0.158	0.154	0.151	0.114	0.109	0.107	0.095	0.089	0.089
Treponema pallidum	1138011	47	0.118	0.117	0.107	0.080	0.083	0.080	0.065	0.068	0.065
Hyperthermophiles
Aquifex aeolicus	1551335	57	0.140	0.136	0.133	0.100	0.097	0.093	0.081	0.080	0.076
Thermotoga maritima	1860725	54	0.136	0.126	0.131	0.095	0.090	0.093	0.076	0.073	0.076
Archaea
Aeropyrum pernix	1669695	44	0.109	0.100	0.109	0.077	0.071	0.077	0.062	0.058	0.064
Pyrococcus horikoshii	1738505	58	0.137	0.130	0.133	0.097	0.092	0.095	0.080	0.076	0.077
Pyrococcus abyssi	1765118	55	0.138	0.123	0.131	0.098	0.087	0.092	0.082	0.071	0.074
Archaeoglobus fulgidus	2178400	51	0.143	0.128	0.131	0.101	0.092	0.091	0.083	0.075	0.073
Methanobacterium thermoautotrophicum	1751377	50	0.130	0.111	0.135	0.091	0.079	0.096	0.074	0.065	0.078
Methanococcus jannaschii	1664970	69	0.159	0.152	0.145	0.113	0.108	0.102	0.092	0.088	0.082

[i] The largest values are shown in boldface type.