A novel fragmented mitochondrial genome in the protist pathogen Toxoplasma gondii and related tissue coccidia

Sivaranjani Namasivayam a,b, Rodrigo P. Baptista b,c, Wenyuan Xiao a,b,  Erica M. Hall a, Joseph S.
Doggett d, Karin Troell e and Jessica C. Kissinger a,b,c,1

a Department of Genetics, University of Georgia, Athens, GA, 30602, USA
b Center for Tropical and Emerging Global Diseases, University of Georgia, 30602, USA
c Institute of Bioinformatics, University of Georgia, Athens, GA 30602, USA
d Division of Infectious Diseases, Oregon Health Sciences University, OR, 97239, USA
e Department of Microbiology, National Veterinary Institute, SE-751 89 Uppsala, Sweden

Corresponding Author: Jessica C Kissinger, University of Georgia, 500 D.W. Brooks Drive,
Coverdell Center, Athens, GA, 30602, USA jkissing@uga.edu, +1-706-542-6562
ORCID: 0000-0002-6413-1101


Dataset S7 (The 21 mtDNA sequence blocks of Neospora caninum)

>Nc_mtDNA__A
CTATCATACTTAATTGGATTAATCTTCTTACAAGCGGCTTTCGGTTTGATGGAACTTTCA
CACCCAGATAACTCCATACCAGTCAACCGGTTCGTAACACCACTTCATATCGTACCAGAA
TGGTATTTTCTAGCATATTATGCGGTGTTAAAAGTAATACCATCCAAAACCGGTGGTTTG
TTAGTATTTATGTCAT
>Nc_mtDNA__B
CTTTTCATGACCATCATGTTAAGTGCATTAAGTATAGTGG
>Nc_mtDNA__C
GTTCTGTATTAGTTACTCAAAGTATCTGTTCAGAATTCGGTAGTGGTTTAGGTTGGACAA
TGTACCCTCCATTAAGTACTAGTCTGATGGTGTTAAATCCAGAGGCTACTGATTGGATAA
TTGGAGGTCTTGCTGTCTTAGGTATCAGTAGTATCCTTAGTTCTATTAACTTCCTTGGTA
CATGTGTCTTTATGGGATCTTGTGCAGGAGCTAAAAACTATATCTTATATATTTGGTCTA
TTATCTTTACTGCTCTTATGTTAGTATTTACTCTACCTATTCTTACTGGTGGATTAGTTA
TGATTCTATTAGATTTACATGTTAATACAGAATTCTATGATTCTATGTACTCAGGAGATA
GTGTATTATATCAACATCTATTCTGGTTTTTCGGACATCCAGAAGTATATATTCTAATCT
TACCTGGTTTCGGTGTAATCTCCCAAACTCTATCTATGTATTCATGCAGAGCGGTCTTCG
GTGGCCAATCTATGATTTTAGCAATGGGTTGCATCTCTATTCTAGGTTCCCTAGTGTGGG
CACATCACATGATGACTGTCGGTCTAGAAGTTGATACACGTGCTTACTTCTCAGCTATGA
CAATTATGATTGCTATTCCTACAGGTACTAAAATCTTTAACTGGTTAGGTACCTATATGG
CTAGTCATATAAGTACACGAACAGTGGACCTATGGGCTGCCCTTAGTTTCGTTCTTCTAT
TCACCCTTGGTGGTACAACAGGAGTAGTTATGGGTAATGCAGGTATGGATATTGCACTAC
ATGATACATACTATATTGTTGCACATTTCCATTTTGTATTATCTCTTGGAGCTGTCTTAG
CAACTATATGTGGATTTATCTTCTATAGTAAAGATATGTTCGGAGATACTGTCAATCTAT
TCCATGTAAATTCAGGTTCTTCACCTTACTTAGGTATCTGGTTTGTTGTATTCTTGGCTA
GTATTATGTTAATCTTTCTACCTATGCATCTACTTGGATTTAATGTTATGCCAAGAAGGA
TCCCAGATTACCCTGATTATCTTTGTTATA
>Nc_mtDNA__D
TAATGTGAACACATAAGATCATCGAATATAACGGTATGCTCCTGAATGTAACGGTACAAG
CTGTAAACAAAGGACTCCTTAA
>Nc_mtDNA__E
TTAGCATGGTTTCGAGAACACTCAGTATATCCATGAGTCTATTCCGGGCACACCTTGTCT
TTTATCGGTGTGCTCTAAATCTAAATTCATCTTATAACTTTGGTTTTTTAGTTGCAATGA
CCTTTGTACTCCAAATAATTACAGGTATCACTCTAGCATTTAGATATACTTCAGAAGCAT
CTTGTGCATTTGCTAGCGTTCAACATCTAGTTAGAGAAGTAGCAGCAGGATGGGAATTTA
GGATGTTGCATGCTACAACTGCCTCTTTCGTATTCTTGTGTATTTTAATTCACATGACTC
GAGGACTGTATAACTGGAGTTATAGTTATTTAACTACCGCTTGGATGTCTGGTTTAGTTT
TATATCTACTTACTATAGCCACTGCCTTCCTTGGATATGTACTACCATGGGGACAAATGA
GTTTCTGGGGTGCTACAGTGATTACAAACCTCCTTTCTCCAATACCATATTTGGTACCTT
GGCTACTTGGAGGATACTACGTATCTGATGTAACATTAAAACGATTCTTTGTATTACATT
TTATATTGCCTTTTATAGGTTGTATTATAATAGTTTTACATATCTTCTACTTACATTTAA
ATGGTTCTAGTAACCCTGCAGGTATAGATACCGCGCTTAAAGTTGCCTTTTATCCTCATA
TGTTAATGACGGATGCTAAATGT
>Nc_mtDNA__F
TGGTGACTTATATTATGATTCTTATTAATGGGAGCACAGTTCCCTGGGTATCCAATCCAG
TGCTCTGCCTTGGGCATTGAAACTAACCCACAGTTCAACCCTGTATTATTTAACTCAGTT
AATTAGTATTAGGTTTGATATTCTGTACCAACCGATCTAAAATCGTGATGTCTTTTTGT
>Nc_mtDNA__H
GCTATCTATAGTGCCTGTCGAGTCGCTCAAGGAAGATTTGATCCTGTTTATGATTTAAGG
GATGTAAAGGTGCTCAGGGTCTAACCGTCGGGCCATCTCGATCCTCATATTCAAAGATAA
TTCTATTTAAAAAAGTTTTAGATAAACGACATGTGAAGAGTCGGACCAACTTTCACGCAC
GACGATAATTACCCGACAAGGATTTTCCTACCTTTGGACCGTCATAATACAGCCGCCGTT
TACATGTTACTGCACCGGGCAGGGATTATATACTATACCTCTACAGTGGTATTAGCAGTA
TCTAGTGTTGATGTACAACAGACGCTCTCCTTGTTCCACTACCTAATCATAATCTACTGT
TCCAGATATTAAGGAATGTACGCAACATTTAACTACACAACGTTATGCCAAGAAGGATCC
CAGATTACCCTGATTATCTTTGTTATA
>Nc_mtDNA__I
TGATTGTATTTATGAAACGTGATTAGTTCACCTAGCCAACACGATCCGGTTGTTTGGGAA
TAACTCCCTTTTGTAAGGGTAATTTATGTGCTACAATAACACAGTCGGTACGAAGTCGAA
ACAAGGTAGTTGATGGTGAACCAGTGGCTGAACAAACCTTTTAATTGATTATGCTGACTT
TAGTCCCGATAAACTACAGTTCTG
>Nc_mtDNA__J
CTTTTTCTGGGGAGTATATACTACGAGTTGGACTACTGGTTTAGATCTTGAATGTCTTTG
TTTACCGGATCCAAGTTCTATTGTG
>Nc_mtDNA__K
CTTAAACTGAGGAGTCAAGTAGGTACAAACCGTACAAGGATTAATTATGTCCATCTGTGC
ATCTAAGTTGATACTCGGTTATATATTTTAGACGCTAACTTCCCGGCTAAACTTTGACTT
ATTAAACCAGCCTGGGATCATAAAAGTACTATGTATGGTAAGATTGAGCGTGGACTATCG
AATGAAACAATGTGCTCCAACGCTAGTCTAAGTCTCTAACATACCTTTTACCTACAACTG
TACGGAACGTAACAAACCTCCAGGCAAAGAACTTGATATTCTGTTCTAATTCCCCGTGGT
AAACACAGTCAACGAATGGCGGAAGGAGCATTTATATGTTATGCAGTGTCATCGGAGATA
AACTCTATATTTAGCATTCATCTACAGCTACGGTAACTGTTGTGTTTAAATAGCGGTTAA
CCTTTCCTTTTCCTTACGTACTCAG
>Nc_mtDNA__L
TACATTAAGGTTATTCCACATCGGTTATGTTCTAGGCGTAATATATGGATTACTGTTATC
ACTCGTATTAACAGCGAGAGAAAACTACTACTCAGATGCTAGTATGATCAGTACCATCGT
ACTGGGAGTGATACTCTCTGAGACAGGATTATTTATAAG
>Nc_mtDNA__M
TGTCCAGCGTATATTTGAAAAACCAACATTTGTATACAAGCTGTACGAATATCATGATAT
TCACTTTGGTAGTCTCCTTCCTGATGTTAGTCTGTACGGAATACTTAGGTCTATCTATTT
ATATTAACGATAATGGATTTGGTAATGGTCTATTTATACTTACTGGTATACATTTCAGTC
ATGTCATTGTTGGTGCTATCTTGGGATTCTTTAATCAGAGTATTTATAGCTCGCTGGTTA
CATACTTACCAACAAACTGTATAAGTTTGAGTAAATGCAAAGGTACATTATGTAAGATAT
TCTCAGAACCATTTACAATTTTATATCTACATTTTGTCGAAGCAGTGTGGATAATGATCC
ACGTTACCTTCTATCTCTAAATTATATAACGGTCGTAAGGTACGCCGGGGATAACAGGTC
AGATAATATTGGGAGTTCTAATCCTCGGATTGTATCAGCACCTCCATGTCGGCTCATTAC
TCCCTTGTTATTGAACAAGATTCAGTTAGGAACGATAGTTCACCGTCAGATGTAATACGT
GAGCTGGGTTAAGAACGTCTGGAGACAGTTTGTTCCCTATCTACCATTTAAAATCGTGGA
AATATATTCAACAGAACTACAATGTTCACGCTCATGGATTCAGTGTCCAGGACTACCTGG
CGCTTAATAACGATTCCGTCTTCCAGCTTCCAATTAAACTACATATTAAAATGAGCGCAT
GTAAACTAGTCTTAAACACACCGCTCGTCACGTA
>Nc_mtDNA__N
TAAATATCATTGTGTTATGGTTCTATCGCAAACCATTGAGATTACGAAGTTATGGTTTTG
GGCTCGTGAGTGTCTCTCAATAACTAGCTGAGTGCTTGTACGATAATTATATCAATGCAT
TACCAATTAAGGTGTTTAGCATTTCCTATGCTCCTTAACATCACAG
>Nc_mtDNA__O
GTAGTTTGTATAAACCTAGGAATCCCATTTTATAATGTGTAACAGGGAGTCTAGCTTCAG
TTGTTATCTGATTGGTATTGCATGCC
>Nc_mtDNA__P
CAACATGTCAATGAAATATCAATAACGATGAAACTTATTTGATTAACATAACAACATAGA
AGATTAAGCTGCATTACGTTAAAACTTTACACTGGATACGTTTTAATGTTAACTTACTAC
AGACCATGGGAGCGAAGATAATCTAATATGTAACTCCGTTCATGGAAATCAAAAGAGCTT
TCAC
>Nc_mtDNA__Q
TTAATACATGGTGTTCAATTGGTTCTATTTCCACAATAGTTATCATCTTAACTATGCTCT
GCTAA
>Nc_mtDNA__R
CGTTTATATAAATCTAGTAATGCTTGTCAAGTTCCTTGTATCTAGTTAGCTCACTGCGTA
CTTAGGATCAGACCAAAAGAGTTCA
>Nc_mtDNA__S
AGTTCTGGATCGCGTATCATTTGTACAGAGACAATATCTACTTATAATGTGATAATAACA
ATACATGGTCTAGCTATGATCTTTATGTTCTTAATGCCGGCTTTGTACGGAGGATATGGT
AACTTCTTTGTACCAATCTATATTGGGGGTTCGGAAGTCGTTTTCCCAAGAACTAACGCG
ATCTCCTATTTCCTAGTACCATTAG
>Nc_mtDNA__T
CCCTTATTAATCTAGGTTTATTAGCAGAGATTCGAGCTTTAAATACCCGAATGTTGATTC
GTCAACAATTTATGACTCGAAATGTAGTCAGTGGATGGGTTATTATTTGGGTATATAGTA
TGATCTTCTTGATTATTATAGGTAGTGCTATTCCACAAGCGACTTACATCTTATATGGTA
GACTAGCTACTATCTTATATCTTACTACCGGATTGGTACTATGCTTATACTAAACAACAG
TGTTAATGACTACAGCTTCCAAGCAAACATGAAGATCG
>Nc_mtDNA__U
ATCCCTTTTCTTTGAAACACACTTCCCTTCTCGCCGTTAGTATGATCTCAAAGTACCAGA
AGCCATGTGATCTATATAGTATAACGGGACATTAGACCGAACCTGCGATAGATAAATATA
TCTTGGATGATTGTATATTAGCGGCTAAATGTCAATCAAACATGCGAATTTTAGGTTTTC
CATGAAATCTATTTGGAAGAAGAGGCTTGATAGTACTACCGTAAGTACATAATATACAGT
CCCAGCAGTAGCGGTTAAACTATAGAAGAGTCGAGTATTATCCATACATACCAGGCGTAA
AAAGCGTTCATCCAGTTACTAAACAGGTGCCAGGCCAACAAGAATCCGATCCGT
>Nc_mtDNA__V
GTAGGATATTGAAATCCAACACTTTTAGCTGTCTTAAGCAGTCCAGTGGGGTGGTGGTGT
ACAGCAATCATAAAGAACTTGGTTGTCTGTATCTCATAACTGGAGTCATATTCAGTATCC
TAGGTACTATAATGTCTCTGTTTATTCGATTTGAGTTATAC
>Nc_mtDNA__Fp
CACAGTTCAACCCTGTATTATTTAACTCAGTTAATTAGTGTTAGGTTTGATATTCTGTAC
CAACCGATATAAAATCGTGATGTCTTTTTGT
>Nc_mtDNA__Kp
CTTAAACTGAGGAGTCAAGTAGGTACAAACCGTACAAGGATTAATTATGTCCATCTGTGC
ATCTAAGTTGATACTCGGTTATATATTTTAGACGCTAACTTCCCGGCTAAAC
>Nc_mtDNA__Mp
TGTCCAGCGTATATTTGAAAAACCAACATTTGTATACAAGCTGTACGAATATCATGATAT
TCACTTTGGTAGTCTCCTTCCTGATGTTAGTCTGTACGGAATAC
>Nc_mtDNA__Sp
AGTTCTGGATCGCGTATCATTTGTACAGAGACAATATCTACTTATAATGTGA