A novel fragmented mitochondrial genome in the protist pathogen Toxoplasma gondii and related tissue coccidia

Sivaranjani Namasivayam a,b, Rodrigo P. Baptista b,c, Wenyuan Xiao a,b,  Erica M. Hall a, Joseph S.
Doggett d, Karin Troell e and Jessica C. Kissinger a,b,c,1

a Department of Genetics, University of Georgia, Athens, GA, 30602, USA
b Center for Tropical and Emerging Global Diseases, University of Georgia, 30602, USA
c Institute of Bioinformatics, University of Georgia, Athens, GA 30602, USA
d Division of Infectious Diseases, Oregon Health Sciences University, OR, 97239, USA
e Department of Microbiology, National Veterinary Institute, SE-751 89 Uppsala, Sweden

Corresponding Author: Jessica C Kissinger, University of Georgia, 500 D.W. Brooks Drive,
Coverdell Center, Athens, GA, 30602, USA jkissing@uga.edu, +1-706-542-6562
ORCID: 0000-0002-6413-1101


Dataset_S2 (The 21 mtDNA sequence blocks of Toxoplasma gondii)

>Tg_mtDNA_A
CTATCCTATTTAATTGGATTAATCTTCTTACAAGCGGCTTTTGGTTTGATGGAACTATCA
CATCCAGATAACTCAATACCAGTCAACCGGTTCGTAACACCACTTCATATCGTACCTGAA
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>Tg_mtDNA_I
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>Tg_mtDNA_L
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ACTGGGAGTAATCATCTCTGAGACAGGATTATTTATAAG
>Tg_mtDNA_M
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TCACTTTGGTAGTCTCCTTCCTAATGTTAGTCTGTACGGAATACTTAGGTCTATCTATTT
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ATGTTATTGTCGGTGCTATCTTGGGTTTCTTTAATCAGGGTATGTATAGCTCTCTAGTTA
CATATTTACCAGTAAACTGCATAACTTTGAGTAAATGCAAAGGTACATTATGTAAAATCT
TCTCAGAACCATTTACAATCTTATATCTACATTTCGTCGAAGCAGTGTGGATAATGATCC
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AATATATACAGCAGAACTACAATGTTCACGCTCATGGATTCAGTGTCCAGGACTACCTGG
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GTAAACTAGTCTTAAACACACCGCTCGTCACGTA
>Tg_mtDNA_N
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GGCTCGTGAGTGTCTCTCAATAACTAGCTGAGTGCTTGTACGATAATTATATCAATGCAT
TACCAATTAAGGTGTGTAGCATTTCCTATGCTCCTTAACATCACAG
>Tg_mtDNA_O
GTAGTTTATATAAACCTAGGAATCCCATTTTATAATGTGTAACAGGGAGTCTAGCTTCAG
TTGTTATCTGATTGGTATTGCATGCC
>Tg_mtDNA_P
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AGATTAAGCTGCATTACGTTTAAACTTTACACTGGATACGTTTTAATGTTAACTTACTAC
AGACCATGGGAGCGAAGATAATCTAATATGTAACTCCGTTCATGGAAATCAAAAGAGCTT
TCAC
>Tg_mtDNA_Q
TTAATACATGGTGTTCAATTGGTTCTATTTCTACAATAATTATCATCTTAACTATGCTCT
GCTAA
>Tg_mtDNA_R
CGTTTATATAAATCTAGTAATGCTTGTCAAGTTCCTTGTATCTATTTAGCTCACTGCGTA
CTTAGGATCAGACCAAATGAGTTCA
>Tg_mtDNA_S
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AACTTCTTTGTACCAATCTATATTGGTGGTTCGGAAGTCGTTTTCCCAAGAACTAACGCG
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>Tg_mtDNA_T
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TGATCTTCTTGATTATTATAGGTAGTGCTATTCCACAAGCAACATACATCTTATATGGTA
GATTAGCTACTATCTTATACCTTACTACCGGATTGGTTCTATGCTTATACTAAAACAACA
TTGTTAATGACTACAGCTTCCAAGCAAACATGAATACCG
>Tg_mtDNA_U
ATCCCTTTTCTTTGAAACACACTTCCCTTCTCGCCGTTAGTATGATCTCAAAGTACCAGA
AGCCATGTGATCTATATAGTATAACGGGACATTAGACCGAACCTGCGATAGATAAATATA
TCTTGGATGATTGTATATTAGCGGCTAAATGTCAATCAAACATGCGAATTTTAGGTTTTC
CATGAAATCTATTTGGAAGAAGAGGCTTGATAGTACTACCGTAAGTACATAATATACAGT
CCCAGCAGTAGCGGTTAAACTATAGAAGAGTCGAGTATTATCCATACATACCAGGCGTAA
AAAGCGTTCATCCAGTTACTAAACAGGTGCCAGGCCAACAAGAATCCGATCCGT
>Tg_mtDNA_V
GTAGGATATTGAAATCCAACACTTTTAGCTGTCTTAAGCAGTCCAGTGGGGTGGTGGTGT
ACAGCAATCATAAAGAACTTGGTTGTCTGTATCTCATAACTGGAGTCATATTCAGTATCC
TAGGTACTATAATGTCTCTGTTTATTCGATTTGAGTTATAC
>Tg_mtDNA_Fp
CACAGTTCAACCCTGTATTATTTAACTCAGTTAATTAGTATTAGGTTTGATATTCTGTAC
CAACCGATCTAAAATCGTGATGTCTTTTTGT
>Tg_mtDNA_Kp
CTTAAACTGAGGAGTCAAGTAGGTACAAACCGTACAAGGATTAATTATGTCCATCTGTGC
ATCTAAGTTGATACTCGGTTATATATGTTAGACGCTAACTTCCCGGCTAAAC
>Tg_mtDNA_Mp
TATCCAGCGTATATTTGAAAAACCAACATTTATATACAAGCTGTACAAATATCATGATAT
TCACTTTGGTAGTCTCCTTCCTAATGTTAGTCTGTACGGAATAC