A novel fragmented mitochondrial genome in the protist pathogen Toxoplasma gondii and related tissue coccidia Sivaranjani Namasivayam a,b, Rodrigo P. Baptista b,c, Wenyuan Xiao a,b, Erica M. Hall a, Joseph S. Doggett d, Karin Troell e and Jessica C. Kissinger a,b,c,1 a Department of Genetics, University of Georgia, Athens, GA, 30602, USA b Center for Tropical and Emerging Global Diseases, University of Georgia, 30602, USA c Institute of Bioinformatics, University of Georgia, Athens, GA 30602, USA d Division of Infectious Diseases, Oregon Health Sciences University, OR, 97239, USA e Department of Microbiology, National Veterinary Institute, SE-751 89 Uppsala, Sweden Corresponding Author: Jessica C Kissinger, University of Georgia, 500 D.W. Brooks Drive, Coverdell Center, Athens, GA, 30602, USA jkissing@uga.edu, +1-706-542-6562 ORCID: 0000-0002-6413-1101 Dataset_S1 Sequences of the Toxoplasma gondii RH PCR products >M1/T2 GTTAGTATAAGCATAGAACCAATCCGGTAGTAAGGTATAAGATAGTAGCTAATCTACCATATAAGATGTATGTTGCTTGTGGAATAGCACTACCTATAATAATCAAGAAGATCATACTATATACCCAAATAATCACCCATCCACTGACTACATTTCGAGTCATGAACTGTTGACGAATTAACATTCGGGTATTTAAAGCTCGAATCTCAGAAAGTAAACCTAAATTAATCAGAGATGACATAAATACTAACAAACCACCGGTTTTGGATGGAATTACTTTTAACACCGCATAATATGCTAGAAAATACCATTCAGGTACGATATGAAGTGGTGTTACGAACCGGTTGACTGGTATTGAGTTATCTGGATGTGATAGTTCCATCAAACCAAAAGCCGCTTGTAAGAAGATTAATCCAATTAAATAGGATAGACATTTAGCATCTGTCATTAACATATGAGGATAAAAGGCAACTTTAAGCGCGGTATCAATACCTGCAGGATTGCTAGAACCATTTAAATGTAAATAGAAGATATGTAAAACTATTATAATACAACCAATAAAAGGCAAGATAAAATGTAATACAAAGAATCGTTTTAATGTTACATCAGATACGTAGTAACCTCCAAGTAGCCAAGGTACAAATATGGGTNATTGGGANAAAAAGGAGGTTGGTAATGACTGTAGCACCCCAGAAACTCATTTGTCCCCATGGTAGTACATATCCGANGAANGCAGTGGGCTATAGTAAGTNAANTATAAAACTAANCCAGACATCCNAGGCGGGTAGTTAAATAACTATAACTCCAGTTNTACAATCCTCGAGTCNTGTGAATTAAATACCCAGAATNCNNNNGAGCNNNTGTAGCATGCAACATCCNAATTCCCTCC >E4/C6 or H1 TGGTTTCTTAGTTGCAATGACCTTTGTACTCCAAATAATTACAGGTATCACTCTAGCGTTTAGATATACTTCTGAAGCATCTTGTGCATTTGCTAGCGTTCAACATCTAGTTAGAGAAGTAGCAGCAGGATGGGAATTTAGGATGTTGCATGCTACAACAGCCTCTTTTGTATTCTTGTGTATTTTAATTCACATGACTCGAGGATTGTATAACTGGAGTTATAGTTATTTAACTACCGCTTGGATGTCTGGTTTAGTTTTATATTTACTTACTATAGCCACTGCCTTCCTCGGATATGTACTACCATGGGGACAAATGAGTTTCTGGGGTGCTACAGTCATTACAAACCTCCTTTCTCCAATACCATATTTGGTACCTTGGCTACTTGGAGGTTACTACGTATCTGATGTAACATTAAAACGATTCTTTGTATTACATTTTATCTTGCCTTTTATTGGTTGTATTATAATAGTTTTACATATCTTCTATTTACATTTAAATGGTTCTAGCAATCCTGCAGGTATTGATACCGCGCTTAAAGTTGCCTTTTATCCTCATATGTTAATGACAGATGCTAAATGTCTATCCTATTTAATTGGATTAATCTTCTTACAAGCGGCTTTTGGTTTGATGGAACTATCACATCCAGATAACTCAATACCAGTCAACCGGTTCGTAACACCACTTCATATCGTACCTGAATGGTATTTTCTAGCATATTATGCGGTGTTAAAAGTAATTCCATCCAAAACCGGTGGTTTTGTTAGTATTTATGTCATCAACATGTCAATGAAATATCAATAACGATGAAACTTATTTGATTAACATAACAACATAGAAGATTAAGCTGCATTACGTTTAACTTTACACTGGATACGTTTTATGNTAACTTACTACAGACCATGGGAGCGAAGATAATCTAATATGTAACTCCGTTCATGGAAATCAAAAGAGCTTTCACGCTATCTTTAGTGCCTGTCGAGTCGCTCAAGGAAGATTTGATCCTGTTTATGATTTAAGGGATGTAAAGGTGCTCAGGGTCTAACCGTCGGGCCATCTCGATCCTCATATTCAAAGATAATTCTATTTCAAAAAGTTTTAGATAAACGACATGTGAAGAGTCGGACCAACTTTCACGCACGACGATAATTACCCGACAAGGATTTTCCTACCTTTGGACCGTCATAATACAGCCGCCGTTTACATGTTACTGCACCGGGCAGGGATTATATACTATACCTCTACAGTGGTATTAGCGGTATCTAGTGTTGATGTACAACAGACGCTCTCCTTGTTCCACTACCTAATCATAATCTATCGTTCCAGATATTAAGGAATGTACGCAACATCTAACTACACAACGTTATGCCAAGAAGGATCCCAGATTACCCTGATTATC >A1 CTCANNCNAGTCACCGGTTCGTAACACCACTTCATATCGTACCTGAATGGTATTTTCTAGCATATTATGCGGTGTTAAAAGTAATTCCATCCAAAACCGGTGGTTTGTTAGTATTTATGTCATCAACATGTCAATGAAATATCAATAACGATGAAACTTATTTGATTAACATAACAACATAGAAGATTAAGCTGCATTACGTTTAAACTTTACACTGGATACGTTTTAATGTTAACTTACTACAGACCATGGGAGCGAAGATAATCTAATATGTAACTCCGTTCATGGAAATCAAAAGAGCTTTCACGCTATCTTTAGTGCCTGTCGAGTCGCTCAAGGAAGATTTGATCCTGTTTATGATTTAAGGGATGTAAAGGTGCTCAGGGTCTAACCGTCGGGCCATCTCGATCCTCATATTCAAAGATAATTCTATTTCAAAAAGTTTTAGATAAACGACATGTGAAGAGTCGGACCAACTTTCACGCACGACGATAATTACCCGACAAGGATTTTCCTACCTTTGGACCGTCATAATACAGCCGCCGTTTACATGTTACTGCACCGGGCAGGGATTATATACTATACCTCTACAGTGGTATTAGCAGTATCTAGTGTTGATGTACAACAGACGCTCTCCTTGTTCCACTACCTAATCATAATCTATCGTTCCAGATATTAAGGAATGTACGCAACATCTAACTACACAACGTTATGCCAAGAAGGATCCCAGATTACCCTGATTATCTTTGTTANATTAATACATGGTGTTCAATTGGTTCTATTTCTACATAATTATCATCTTAACTATGCTCTGCTAACACAATAGAACTTGGATCNGNTAACAAAGACCTTCAAGANNNAACCAGTAGTCNACTCGTANTATTACTCCCCNNAAAANGNAGNTTTNNAAACTAGGAGCCCATNTNNAGGGGNAAC >R2 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>C5/R1* 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