unique_id	wt_id	SNP	rna_3_wt_med	rna_4_wt_med	rna_5_wt_med	rna_6_wt_med	rna_7_wt_med	rna_8_wt_med	rna_9_wt_med	rna_10_wt_med	rna_11_wt_med	rna_12_wt_med	rna_13_wt_med	rna_14_wt_med	combined_wt_med	rna_3_snp_med	rna_4_snp_med	rna_5_snp_med	rna_6_snp_med	rna_7_snp_med	rna_8_snp_med	rna_9_snp_med	rna_10_snp_med	rna_11_snp_med	rna_12_snp_med	rna_13_snp_med	rna_14_snp_med	combined_snp_med	rna_3_l2fc	rna_4_l2fc	rna_5_l2fc	rna_6_l2fc	rna_7_l2fc	rna_8_l2fc	rna_9_l2fc	rna_10_l2fc	rna_11_l2fc	rna_12_l2fc	rna_13_l2fc	rna_14_l2fc	combined_l2fc	rna_3_pval	rna_4_pval	rna_5_pval	rna_6_pval	rna_7_pval	rna_8_pval	rna_9_pval	rna_10_pval	rna_11_pval	rna_12_pval	rna_13_pval	rna_14_pval	combined_pval	rna_3_padj	rna_4_padj	rna_5_padj	rna_6_padj	rna_7_padj	rna_8_padj	rna_9_padj	rna_10_padj	rna_11_padj	rna_12_padj	rna_13_padj	rna_14_padj	combined_padj	rna_3_sig	rna_4_sig	rna_5_sig	rna_6_sig	rna_7_sig	rna_8_sig	rna_9_sig	rna_10_sig	rna_11_sig	rna_12_sig	rna_13_sig	rna_14_sig	combined_sig	downsamp_sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr1:109642741..109642855,+__3.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:109642741..109642855,+__3.1.0.0	rs4970820	2.286466480239819	2.5331746444427448	2.2114891637206093	2.2378109113560662	2.5242647744382745	2.4221478387410467	2.4382389397780497	2.4698507931884515	2.363380278638416	2.6635774266804777	2.5571978418920955	2.4766672907171	2.432022198652762	2.2988578692173323	2.5869921347860148	2.2025242533642375	2.0281172003127192	2.2760957906509476	2.301570901905495	2.2224277415659546	2.523826070817396	2.505070230014234	2.4698720479403926	2.464988127638798	2.4839883744368043	2.3636942285541935	0.012391388977513351	0.05381749034326999	-0.008964910356371814	-0.209693711043347	-0.24816898378732688	-0.1205769368355516	-0.21581119821209516	0.05397527762894461	0.14168995137581764	-0.1937053787400851	-0.09220971425329738	0.007321083719704191	-0.06832797009856877	0.957167318493	0.572794651112	0.242741268695	0.0986283746992	0.129198935732	0.237368605078	0.206893929435	0.87199428352	0.657696241675	0.0959193233604	0.285759223278	0.48504462162	0.184393883963	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr1:113499003..113499117,+__5.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr1:113499003..113499117,+__5.1.0.0	rs60844753	-0.6796074136496677	-0.05269732175896209	-0.3615488156669868	-1.0734973288358105	0.1707354246661114	-1.0006543321410155	-0.3024475988919211	-1.0478709950737441	-0.4515657418082615	-0.9692723955733809	0.10676725976545327	-0.4979247672149662	-0.513298668848596	-0.44775059075932494	-0.01210239911512878	-0.24387500068548237	-0.030057600305465296	-0.1494501390511612	0.04599227824289015	-0.8254621493022785	0.1979916898183407	-0.5995711953156834	-0.6888681762388386	-0.30874218769514705	-0.6628191084346463	-0.3103928815701605	0.23185682289034276	0.04059492264383331	0.11767381498150445	1.0434397285303452	-0.3201855637172726	1.0466466103839056	-0.5230145504103574	1.2458626848920848	-0.1480054535074219	0.2804042193345423	-0.4155094474606003	-0.1648943412196801	0.20290578727843553	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:113499041..113499155,+__6.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:113499041..113499155,+__6.1.0.0	rs60844753	-1.017331900837374	-0.7047332848864013	-1.0001903293695795	-1.0372875983437002	-0.9547530544001618	-0.818437753405195	-1.3843159629676614	-1.0738082583237323	-0.8746710832668274	-0.9296010877577511	-0.830441328978644	-0.9216407040501204	-0.962267695548929	-1.0448619257930019	-1.029009348834101	-1.1343740442865329	-0.6389687213164724	-0.7826135097229759	-1.054824052601478	-1.093866455404246	-1.0727095514924994	-1.126738427327168	-1.0081688286350927	-0.7759690997493282	-0.9776971741659028	-0.9783167616107332	-0.02753002495562784	-0.3242760639476997	-0.13418371491695336	0.3983188770272278	0.17213954467718584	-0.23638629919628307	0.29044950756341525	0.0010987068312329207	-0.2520673440603405	-0.07856774087734164	0.05447222922931583	-0.05605647011578241	-0.01604906606180424	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0440018610392	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.21176555971	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0381769103775	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:116961180..116961294,-__8.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:116961180..116961294,-__8.1.0.0	rs115274951	2.6601579207893584	3.402033802401689	2.6242429232441298	2.543345473474006	2.855234494623555	2.842445760916737	2.8611283455698113	3.0270875288633166	3.093857704414253	3.0139528636859816	3.1451033745786052	2.90909819278214	2.9148073654452986	2.9224415059482447	3.2075771901956918	2.753416748752001	2.582298626155908	2.7899658329954566	2.998519588164971	2.91211639455025	3.3539539126422158	3.0998974940549795	3.0568826025863216	3.1065987478850228	3.1149096692625933	2.9915481927661376	0.2622835851588863	-0.1944566122059972	0.12917382550787115	0.038953152681902026	-0.06526866162809819	0.15607382724823404	0.05098804898043863	0.3268663837788992	0.0060397896407264895	0.04292973890034002	-0.038504626693582455	0.20581147648045306	0.07674082732083942	0.8931878581	0.390154148302	0.957167318493	0.85089220831	0.428242856315	0.628827692687	0.581967350665	0.510582765025	0.687084607526	0.696989544957	0.382791178922	0.452098798395	0.912110809494	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:117602051..117602165,-__9.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:117602051..117602165,-__9.1.0.0	rs1555794	-0.481364882829578	-0.6272721338360152	-0.793396301544102	-0.5276936679244776	-0.820783643651727	-0.3776906489224358	-0.4187289603032154	-0.5644425623474352	-0.31221686712046776	-0.5373908115306736	-0.617445632500373	-0.5512179722645607	-0.5524703403979219	-0.744241401067961	-0.3138209387633505	-0.9411746366030843	-0.827445519289631	-0.6831313507100573	0.029902286996341232	-0.27234750590511536	-0.4372773639344525	-0.3988958436957002	-0.7273295462807389	-0.5125580535436994	-0.6611197704566312	-0.5407866369378401	-0.262876518238383	0.3134511950726647	-0.1477783350589823	-0.29975185136515337	0.1376522929416697	0.40759293591877704	0.14638145439810002	0.12716519841298268	-0.08667897657523244	-0.18993873475006529	0.10488757895667356	-0.10990179819207047	0.011683703460081745	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.276771967065	0.326996172605	0.170821264488	0.727009731456	NA__no_active_tile	0.88258056334	0.737113058664	0.687081215138	0.914457985151	0.791023984807	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:117602051..117602165,-__9.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:117602051..117602165,-__9.1.0.0	rs1555795	-0.481364882829578	-0.6272721338360152	-0.793396301544102	-0.5276936679244776	-0.820783643651727	-0.3776906489224358	-0.4187289603032154	-0.5644425623474352	-0.31221686712046776	-0.5373908115306736	-0.617445632500373	-0.5512179722645607	-0.5524703403979219	-0.08955344887718003	-0.06879096925275689	0.14343291652683215	-0.3431292845452755	-0.23785928956458768	-0.4673894343183811	0.026251058359322454	0.09498634981531892	0.18552361446062626	0.035066229303340926	-0.09512351155304119	0.14036888066848843	-0.05635140741477445	0.391811433952398	0.5584811645832584	0.9368292180709341	0.18456438337920206	0.5829243540871393	-0.08969878539594528	0.44498001866253784	0.6594289121627541	0.497740481581094	0.5724570408340145	0.5223221209473318	0.6915868529330491	0.4961189329831474	0.188220673538	0.0440018610392	0.00522462344006	0.619326784864	0.0531733827136	0.87199428352	0.301187193336	0.0249397487324	0.122558611289	0.0276615481105	0.0412580447575	0.00460947122508	5.52158500611e-06	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.00462708823512	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:117602051..117602165,-__9.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:117602051..117602165,-__9.1.0.0	rs73004198	-0.481364882829578	-0.6272721338360152	-0.793396301544102	-0.5276936679244776	-0.820783643651727	-0.3776906489224358	-0.4187289603032154	-0.5644425623474352	-0.31221686712046776	-0.5373908115306736	-0.617445632500373	-0.5512179722645607	-0.5524703403979219	-0.4410769708272615	-1.1324971815430096	-1.267292347985863	-1.0734973288358105	-0.7511791682032948	-1.1480153225682428	-1.00947515000037	-0.7364658129064194	-1.0948579207431113	-0.8784988551134919	-0.730203021402756	-0.7567900221822051	-0.9183207585259864	0.04028791200231652	-0.5052250477069944	-0.4738960464417611	-0.5458036609113329	0.06960447544843218	-0.7703246736458069	-0.5907461896971546	-0.17202325055898426	-0.7826410536226436	-0.3411080435828183	-0.11275738890238296	-0.20557204991764444	-0.36585041812806457	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.468411351413	NA__no_active_tile	0.405136064622	0.179364149792	NA__no_active_tile	0.0959193233604	0.298053645387	NA__no_active_tile	0.66743649171	0.14061707543	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr1:117602051..117602165,-__9.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:117602051..117602165,-__9.1.0.0	rs1555794,rs1555795,rs73004198	-0.481364882829578	-0.6272721338360152	-0.793396301544102	-0.5276936679244776	-0.820783643651727	-0.3776906489224358	-0.4187289603032154	-0.5644425623474352	-0.31221686712046776	-0.5373908115306736	-0.617445632500373	-0.5512179722645607	-0.5524703403979219	-0.8203617362587765	-0.8203842243643275	-0.29144521748039753	-0.5382440499549133	-0.5694878535860508	-0.6852961296191453	-0.49552453460446677	-0.5269542575758112	-0.4527662260204157	-0.7397390881896857	-0.5338080088119525	-0.2826232032745196	-0.5630528774783718	-0.3389968534291985	-0.19311209052831224	0.5019510840637045	-0.010550382030435679	0.25129579006567615	-0.3076054806967095	-0.07679557430125139	0.037488304771624015	-0.14054935889994796	-0.20234827665901212	0.08363762368842054	0.2685947689900411	-0.010582537080450094	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0932701621097	0.946473618223	0.476688253492	0.60051573606	0.265084565602	NA__no_active_tile	0.368322877114	0.127508858211	0.586575008857	0.677233097055	0.377436791777	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr1:119682960..119683074,+__10.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr1:119682960..119683074,+__10.1.0.0	rs3934789	0.7002862242984369	0.9416730212868544	0.12190034822666848	0.6197599533856913	0.5150639807075291	0.3134461968964282	0.397751649204794	0.1941681010174422	0.778140253184094	0.6812000171336202	0.6462430088157654	0.673283703514948	0.5485763714726893	1.0254772132097882	0.7735802289525925	0.5564863576170977	0.3263443941772293	0.9140369986781156	0.6660757988451934	0.4465264321768794	0.6964852096863141	0.5436919655353553	0.6184942647978634	0.6101638225037948	0.9235171351038616	0.6750733184403405	0.32519098891135134	-0.1680927923342619	0.43458600939042924	-0.293415559208462	0.3989730179705865	0.3526296019487652	0.04877478297208537	0.5023171086688719	-0.2344482876487387	-0.06270575233575681	-0.0360791863119706	0.25023343158891354	0.12649694696765112	0.861430881609	0.79863356553	0.265084565602	0.609889042629	0.301187193336	0.288805731951	0.861430881609	0.183747876053	0.788281320858	0.946473618223	0.595849425807	0.572794651112	0.845265899384	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:119683314..119683428,+__11.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:119683314..119683428,+__11.1.0.0	rs12096448	0.8433329120390533	1.0961435228114635	1.1356613510011209	0.8601602802798944	1.0666322129310994	1.1434196805457228	1.0337991179345414	1.2483590762107428	1.3345526600718614	1.1049263604662418	1.2672955963326191	1.0856983145314123	1.1016650904296477	0.6178357270614068	0.6322558606831888	0.5328011628942932	0.7130962739852662	0.8354994523761999	0.8841131960986123	1.1286912124783282	1.131656189977845	0.8914852136328262	0.7283970260551793	1.1951709381642115	1.2679019060619203	0.8799086799557733	-0.22549718497764648	-0.4638876621282747	-0.6028601881068276	-0.14706400629462824	-0.2311327605548995	-0.2593064844471106	0.09489209454378678	-0.11670288623289782	-0.4430674464390352	-0.3765293344110625	-0.07212465816840763	0.18220359153050802	-0.22175641047387462	0.250954198416	0.0368026762697	0.175053819161	0.361218104761	0.0856555181328	0.216719559135	0.914457985151	0.777966336216	0.0698833862508	0.122554330111	0.732052639825	0.648013768535	0.0592653159503	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr1:145382340..145382454,-__15.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr1:145382340..145382454,-__15.1.0.0	rs542065471	1.633654271085567	1.8279741726431569	1.5310182102253862	1.2043533962556339	1.7931699836710737	1.7822646729424958	1.5759621546734082	1.8276501747379308	1.9451392868115096	1.5549828884758374	1.5654855842745186	1.7543159837500772	1.6663308982955496	1.5532741280122637	1.7237955566386116	1.4404342274904351	1.6308164554899938	1.6897443137647707	1.473451576132996	1.4288740447484316	1.4945748713627194	1.5191540143878322	1.6136914604613353	1.5817007487578527	1.6132495751199873	1.5635634143639356	-0.08038014307330332	-0.10417861600454525	-0.09058398273495105	0.4264630592343599	-0.10342566990630297	-0.30881309680949975	-0.14708810992497656	-0.3330753033752114	-0.42598527242367745	0.05870857198549784	0.016215164483334155	-0.1410664086300899	-0.10276748393161382	0.757452311924	0.978575937473	0.866708095346	0.85089220831	0.519249062249	0.63839046467	0.253736305913	0.234708652176	0.113101776132	0.914457985151	0.382791178922	0.527990680582	0.865015449031	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr1:146989664..146989778,-__17.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr1:146989664..146989778,-__17.1.0.0	rs681814	2.593252849527328	2.8399666692116083	2.3768189952080756	2.0447959286836155	2.5683147794753864	2.4642671644475316	2.1477440684485325	2.880436545269929	2.3224189049176296	2.341506302477415	2.6271398689577374	2.4600959576814656	2.472229836192188	2.9447307053592544	3.1399477270338	2.622402736645567	2.4127640604528846	2.5909769165143963	2.5732523837335552	2.394179203293085	3.21959771903928	2.72928113789221	2.5573700149953122	2.6826773153647188	2.614322979017195	2.706791908278438	0.35147785583192626	0.29998105782219175	0.2455837414374913	0.3679681317692691	0.022662137039009878	0.10898521928602367	0.24643513484455237	0.33916117376935073	0.40686223297458035	0.21586371251789727	0.05553744640698133	0.1542270213357293	0.23456207208625027	0.0426112802219	0.0906800339379	0.527990680582	0.0548474154937	0.397602565759	0.0412580447575	0.21176555971	0.0258200569765	0.0306357720046	0.183752894264	0.192768091005	0.166665831608	2.86916052126e-05	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0240435651681	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr1:151584446..151584560,+__20.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr1:151584446..151584560,+__20.1.0.0	rs73000031	0.5620566714745284	0.4236776286556493	0.2950612940196203	0.6967269032565764	0.4805038218160705	0.6124175514504556	0.8398507702177286	0.9255590215418781	0.845266678510106	0.5847827025385677	0.6392887755964376	0.6768099935738788	0.6318334843876247	1.0869110532958612	1.0658738716982281	1.1157264361611636	0.8011469463252895	1.0324369342235253	1.1903912726814228	1.3104937534143168	1.2187042067551779	1.213900615236779	1.1611606549185522	1.181310038454127	1.214136072036767	1.132682654600101	0.5248543818213328	0.6421962430425788	0.8206651421415434	0.10442004306871311	0.5519331124074549	0.5779737212309671	0.47064298319658826	0.2931451852132998	0.3686339367266731	0.5763779523799846	0.5420212628576895	0.5373260784628883	0.5008491702124761	0.000617238254542	0.00406065558642	0.0145358169752	0.226876581559	0.000222088887318	0.0125089884503	0.00441948685714	0.0426112802219	0.0350255264852	0.000246746816615	0.000288590960955	0.000827700533168	3.1328723407e-19	0.437004684216	1	1	1	0.17145262101	1	1	1	1	0.193696251042	0.221926448974	0.644778715338	2.6253470215e-16	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:151763230..151763344,+__21.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:151763230..151763344,+__21.1.0.0	rs3811414	-1.1762089581763238	-1.2963344326890207	-1.2817056701177618	-1.16416896203321	-1.508407815223751	-1.1696657572507903	-1.4369540642841494	-1.0129511024594016	-1.168439400856622	-1.434771957866041	-1.100886742262414	-1.095454242716439	-1.2371624254946603	-1.4248543489908068	-1.063099219882735	-1.0428241946869319	-1.4138222401697327	-1.2233140931646065	-1.174077216601242	-1.0511918329341696	-1.1256266657376153	-1.1313635546054925	-1.2970722563024921	-1.2348201068333815	-0.989644121026965	-1.1809758209113477	-0.248645390814483	0.23323521280628579	0.23888147543082994	-0.2496532781365226	0.2850937220591445	-0.004411459350451841	0.3857622313499798	-0.11267556327821371	0.03707584625112936	0.13769970156354883	-0.1339333645709675	0.10581012168947412	0.05618660458331281	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:152161701..152161815,+__22.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:152161701..152161815,+__22.1.0.0	rs10788826	2.137979855383147	2.3432420996350207	1.8978661088646773	1.735546794964944	2.1381414204646148	2.0019607313513355	1.9756448079843891	2.085829544043018	2.201839977955248	2.2287476500256433	2.2292436361027597	2.2241931246414883	2.100019645951357	2.2836292550033503	2.549302178019496	2.1120634037021073	2.0372811253410106	2.167959733622009	2.1640692688594383	2.091282131278473	2.3307876172357527	2.3313578805555695	2.3169172855045215	2.2849303155884604	2.284053808939424	2.246136166970801	0.1456493996202033	0.20606007838447526	0.21419729483743	0.3017343303760667	0.02981831315739436	0.16210853750810283	0.11563732329408394	0.24495807319273455	0.12951790260032148	0.08816963547887813	0.05568667948570072	0.059860684297935673	0.14611652101944392	0.132622250874	0.270885072145	0.0785847853765	0.216719559135	0.628827692687	0.436112310787	0.30750859871	0.0619890035232	0.192768091005	0.129198935732	0.242741268695	0.136115392203	0.00281948110478	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr1:152161701..152161815,+__22.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:152161701..152161815,+__22.1.0.0	rs10788825,rs10788826	2.137979855383147	2.3432420996350207	1.8978661088646773	1.735546794964944	2.1381414204646148	2.0019607313513355	1.9756448079843891	2.085829544043018	2.201839977955248	2.2287476500256433	2.2292436361027597	2.2241931246414883	2.100019645951357	2.193705428345399	2.5050666522032925	2.05333463007336	1.944076622161632	2.1126737405178067	2.12387531027226	2.094936833953763	2.336496790475921	2.2371185337779305	2.278701817939652	2.224908259744813	2.297579611743135	2.2002061859340802	0.05572557296225211	0.16182455256827177	0.15546852120868282	0.208529827196688	-0.025467679946808097	0.12191457892092439	0.11929202596937394	0.25066724643290295	0.03527855582268247	0.04995416791400853	-0.004335376357946785	0.07338648710164675	0.10018653998272324	0.476688253492	0.221756412245	0.206893929435	0.242741268695	0.777966336216	0.270885072145	0.510582765025	0.13967914143	0.326996172605	0.368322877114	0.510582765025	0.460214637573	0.118440096989	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:155531741..155531855,+__23.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:155531741..155531855,+__23.1.0.0	rs377014224	-1.0601064832840765	-0.770859201746944	-0.9629639664636571	-0.7156781343824733	-0.927590760579628	-0.9172157080178622	-0.8677728226570758	-0.5922642306036155	-0.8749213243902102	-0.38290742250574816	-0.4736479607603979	-0.6765925654576704	-0.7685433817374466	-1.021763644740554	-0.6245881073627579	-1.1114050257828199	-0.8487846627549778	-0.5854093370486995	-0.8578749912012862	-0.43391669884662093	-0.5538508244057175	-0.4419203708287158	-0.7328620261001926	-0.5722314768278928	-0.6146579227638432	-0.6999387573886732	0.038342838543522495	0.14627109438418606	-0.14844105931916274	-0.13310652837250447	0.3421814235309285	0.059340716816576045	0.43385612381045485	0.038413406197898015	0.4330009535614944	-0.3499546035944444	-0.09858351606749488	0.0619346426938272	0.06860462434877342	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0658387268341	0.333666485083	0.0249397487324	0.476688253492	NA__no_active_tile	0.609884951243	0.628827692687	0.175053819161	0.0527263108053	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr1:159930967..159931081,+__25.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr1:159930967..159931081,+__25.1.0.0	rs138939070	-1.1702783019839302	-0.7840190749212224	-0.7639357650765844	-1.166442420772918	-1.0223975678237642	-0.9601589896723902	-1.30191948305553	-0.7517720317658257	-1.0884582463181485	-0.923610075510938	-0.8325697743918488	-1.0989929332826565	-0.9887128887146464	-1.096994131312463	-1.1710828309206	-1.2092982511528507	-1.3726879321659604	-1.5130450379629423	-1.2133768722508351	-1.0315909909166383	-1.1317616075460932	-1.3258210973067608	-1.206506038561436	-1.008200805518159	-1.036875844456366	-1.1931034533392588	0.07328417067146731	-0.3870637559993777	-0.4453624860762663	-0.20624551139304237	-0.4906474701391781	-0.2532178825784449	0.27032849213889176	-0.3799895757802675	-0.23736285098861232	-0.2828959630504979	-0.1756310311263103	0.06211708882629052	-0.20439056462461236	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:17216082..17216196,-__30.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:17216082..17216196,-__30.1.0.0	rs113018699	0.4818481687690022	0.7770530936193638	0.26562071786662195	0.4137898356067361	0.5527171030687028	0.4958813790893116	0.531436794614109	0.6867811787738911	0.6237429656389712	0.5816101372684482	0.6479307286522797	0.5165511068116356	0.5479136008149229	0.5546937555640666	0.5335323964518285	0.35188532419402113	0.4258786346987832	0.7139497922625964	0.5694352202962017	0.5517554755344308	0.39983728852452416	0.5663564633261844	0.6513885396596116	0.5914523333877577	0.6519704322361579	0.546844638011347	0.07284558679506442	-0.24352069716753533	0.08626460632739918	0.012088799092047076	0.16123268919389355	0.07355384120689012	0.020318680920321852	-0.28694389024936695	-0.05738650231278686	0.0697784023911634	-0.05647839526452203	0.13541932542452229	-0.0010689628035757727	1.0	0.347268461228	0.989287003123	0.493479697885	0.270879586965	0.510582765025	0.493479697885	0.0658387268341	0.183752894264	0.840380101088	0.978575937473	0.536806685117	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:17216082..17216196,-__30.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:17216082..17216196,-__30.1.0.0	rs6684252	0.4818481687690022	0.7770530936193638	0.26562071786662195	0.4137898356067361	0.5527171030687028	0.4958813790893116	0.531436794614109	0.6867811787738911	0.6237429656389712	0.5816101372684482	0.6479307286522797	0.5165511068116356	0.5479136008149229	0.5624219498509444	0.2835841078899467	0.2529301685084438	0.39400139136113854	0.4553401790646728	0.2537538737312722	0.21361279148462364	0.4916271910715602	0.35549299435930803	0.54886670889974	0.3639167090703338	0.3889368810654687	0.38037374552978775	0.08057378108194219	-0.4934689857294171	-0.01269054935817815	-0.01978844424559756	-0.09737692400403003	-0.24212750535803945	-0.31782400312948533	-0.1951539877023309	-0.2682499712796632	-0.03274342836870825	-0.28401401958194594	-0.12761422574616693	-0.16753985528513507	0.727009731456	0.00993701022923	0.232080506959	0.809021331888	0.0719809426143	0.132622250874	0.436112310787	0.361218104761	0.0327677521954	0.265084565602	0.00816548763477	0.951818833033	0.0114430830281	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:17216082..17216196,-__30.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:17216082..17216196,-__30.1.0.0	rs116155333	0.4818481687690022	0.7770530936193638	0.26562071786662195	0.4137898356067361	0.5527171030687028	0.4958813790893116	0.531436794614109	0.6867811787738911	0.6237429656389712	0.5816101372684482	0.6479307286522797	0.5165511068116356	0.5479136008149229	0.5250897773785741	0.993420156098322	0.4260834806135549	0.4927249215887912	0.645447313022303	0.3978974037789944	0.631764950115759	0.7572886833501364	0.5650585690197878	0.5793029182120347	0.4952382529244157	0.6317288312135878	0.5950871047763551	0.04324160860957188	0.2163670624789582	0.16046276274693294	0.07893508598205512	0.09273020995360015	-0.09798397531031722	0.10032815550164997	0.07050750457624533	-0.058684396619183454	-0.002307219056413512	-0.15269247572786404	0.11517772440195218	0.0471735039614323	0.493479697885	0.412748894176	0.716953652062	0.63839046467	0.572794651112	0.925117039075	0.48504462162	0.914457985151	0.88258056334	0.90381429355	0.452098798395	0.326996172605	0.946049507124	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr1:17216082..17216196,-__30.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:17216082..17216196,-__30.1.0.0	rs113018699,rs6684252,rs116155333	0.4818481687690022	0.7770530936193638	0.26562071786662195	0.4137898356067361	0.5527171030687028	0.4958813790893116	0.531436794614109	0.6867811787738911	0.6237429656389712	0.5816101372684482	0.6479307286522797	0.5165511068116356	0.5479136008149229	0.4104560735911743	0.7056179206122494	0.9074170606102436	0.22488139798024925	0.4593976856839952	0.4773394415697021	0.5464121374722013	0.6301692313115573	0.6201414365223679	0.6715297540537876	0.7966086092736839	0.6692649827408469	0.5932696442851716	-0.07139209517782791	-0.07143517300711444	0.6417963427436217	-0.18890843762648685	-0.09331941738470761	-0.01854193751960953	0.014975342858092322	-0.05661194746233378	-0.003601529116603386	0.08991961678533933	0.1486778806214042	0.15271387592921126	0.045356043470248776	0.87199428352	0.87199428352	0.045430560235	0.687084607526	0.809021331888	0.941129588792	0.545696106059	0.63839046467	0.619326784864	0.716953652062	0.29495293544	0.253741740693	0.854103301957	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:17216132..17216246,-__31.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:17216132..17216246,-__31.1.0.0	rs116155333	0.3813469563406647	0.7017838617597705	-0.7602426803516477	0.1572537669941235	-0.5635382996957891	-0.49396819768956834	-0.16645809972726336	0.5652542289052684	-0.05345391134928937	0.005755496974054679	0.011115954800429595	0.020119684437406544	-0.01625260321681999	0.07170174649521179	-0.05473938458579819	0.04419436813463076	-0.42304240271921467	0.16731771602537684	-0.6122309821262107	-0.3349592951126604	0.30062847440487594	0.4542452202572793	0.2598696316580849	-0.008579987459732541	-0.3722005835219725	-0.04231628987917746	-0.3096452098454529	-0.7565232463455687	0.8044370484862784	-0.5802961697133382	0.7308560157211659	-0.1182627844366424	-0.16850119538539707	-0.2646257545003925	0.5076991316065687	0.2541141346840302	-0.019695942260162136	-0.392320267959379	-0.026063686662357487	NA__not_enough_barcodes	0.436112310787	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.638386621154	0.696989544957	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.658871898493	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr1:17216132..17216246,-__31.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:17216132..17216246,-__31.1.0.0	rs6684252,rs116155333,rs71644016	0.3813469563406647	0.7017838617597705	-0.7602426803516477	0.1572537669941235	-0.5635382996957891	-0.49396819768956834	-0.16645809972726336	0.5652542289052684	-0.05345391134928937	0.005755496974054679	0.011115954800429595	0.020119684437406544	-0.01625260321681999	0.2378748149850201	0.07933124686385798	-0.2888422805925742	-0.49310092462533006	-0.15147637776336348	-0.33259864708279974	-0.04892035719077403	0.28755949969060196	-0.06093138174675125	0.025766485327295863	0.0069058142047283	-0.10738983304455882	-0.07048516174788728	-0.14347214135564457	-0.6224526148959125	0.47140039975907344	-0.6503546916194536	0.4120619219324256	0.1613695506067686	0.11753774253648933	-0.2776947292146665	-0.007477470397461883	0.020010988353241183	-0.004210140595701295	-0.12750951748196537	-0.05423255853106729	NA__not_enough_barcodes	0.00300328973882	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.0267253699531	0.0216734048733	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	5.49355393998e-05	NA__not_enough_barcodes	0.606664527241	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.0124703674438	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:173834005..173834119,-__33.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:173834005..173834119,-__33.1.0.0	rs113351229	-1.3344041744942479	-1.0101131649216206	-1.4137013849899147	-1.78590472477996	-1.8744002104350708	-1.2421940785425978	-1.3894207215636545	-1.3047565822415224	-1.473761686480084	-1.4220603294062184	-1.6610812951213374	-1.339860645574268	-1.4376382498792084	-1.0150051377516112	-1.030553594272966	-1.3016079408522536	-1.2579354287257052	-1.5096731653304707	-1.498423319118996	-1.1140109656596693	-1.339860645574268	-1.250536693519294	-1.502699623421536	-1.5658660169022334	-1.3743220665755036	-1.313374549808709	0.3193990367426367	-0.02044042935134538	0.11209344413766109	0.5279692960542548	0.3647270451046001	-0.2562292405763982	0.2754097559039852	-0.03510406333274574	0.2232249929607899	-0.08063929401531755	0.09521527821910403	-0.034461421001235504	0.12426370007049913	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:173835815..173835929,-__34.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:173835815..173835929,-__34.1.0.0	rs13476	-2.0775751417869737	-2.4653520797741	-2.1000849678499964	-1.5203976814218991	-2.1784729621628065	-2.2514061116275785	-1.664254476951939	-1.836757616758977	-1.5038253277584552	-2.063200567126953	-2.4663643279705654	-1.9665269981681976	-2.007851521613204	-1.876194718716936	-1.9734072063386172	-2.0872259473851678	-2.0335421699631473	-2.510566462595822	-1.8845911207950705	-2.1520866292629512	-1.663531742424775	-1.784422382229634	-2.083844367375786	-2.0564734120595856	-2.293755817478102	-2.033303498052133	0.20138042307003756	0.49194487343548277	0.012859020464828674	-0.5131444885412482	-0.33209350043301544	0.366814990832508	-0.4878321523110123	0.1732258743342019	-0.28059705447117866	-0.020643800248832722	0.4098909159109798	-0.32722881930990444	-0.02545197643892942	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:19536933..19537047,+__38.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:19536933..19537047,+__38.1.0.0	rs75750439	-0.7240876163738167	-0.9977336979555748	-0.7269703971883225	-0.9381095470277666	-1.1458488668372748	-0.9976619793628791	-0.7007162129363133	-0.5836082526816603	-0.6079393307938271	-0.7576993272642136	-0.6324921622882498	-0.5587583475318318	-0.7809688115201442	0.31274149965991466	0.62683586576551	0.4994148260564824	0.4857758199289334	0.3776748678639	0.5591768032358714	0.5357944012775077	0.6139445352661548	0.6101638225037948	0.4766546570811327	0.34564579459184025	0.5673800513363868	0.5009335787139524	1.0368291160337313	1.6245695637210846	1.226385223244805	1.4238853669567	1.5235237347011747	1.5568387825987506	1.236510614213821	1.197552787947815	1.2181031532976219	1.2343539843453464	0.9781379568800901	1.1261383988682185	1.2819023902340965	6.12218195512e-05	6.26237314719e-08	0.000320085853942	0.00300328973882	7.2450725415e-07	2.96882111052e-05	0.000161276729747	6.76305944647e-07	8.27992768152e-06	4.77393269186e-07	1.63168639115e-05	2.07737663516e-05	1.51787571473e-47	0.0433450482422	4.65920562151e-05	0.238463961186	1	0.000559319600204	0.0226817932844	0.119183503283	0.000491674421759	0.00640038409781	0.000374753716311	0.012547668348	0.0161827639879	1.27197984895e-44	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr1:201476261..201476375,+__40.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr1:201476261..201476375,+__40.1.0.0	rs117708536	1.2205410442704843	1.4580852150232815	1.2246912102210477	0.8407277740402874	1.2362757990682312	1.279951717631374	1.1920246341524732	1.3923804516152316	1.0637458128778148	1.2513073620415591	1.2416145100537483	1.2869079011565487	1.2240211193460067	1.128826612846897	1.1771166287624042	1.0877090874535595	0.9044321996051896	1.1450350278354062	1.1593723095578394	1.198235553563726	1.5169106904995475	1.3409322484920922	1.3331268537380954	1.4208478015754626	1.3761765978440819	1.2323934676478583	-0.09171443142358737	-0.2809685862608773	-0.1369821227674881	0.06370442556490219	-0.09124077123282492	-0.12057940807353451	0.0062109194112527355	0.12453023888431591	0.27718643561427747	0.08181949169653624	0.1792332915217143	0.08926869668753312	0.008372348301851648	0.397602565759	0.397602565759	0.581967350665	0.572794651112	0.87199428352	0.76769033028	0.757455001208	0.221756412245	0.412754243182	0.405136064622	0.967868733231	0.87199428352	0.887105293261	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:201798621..201798735,-__41.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:201798621..201798735,-__41.1.0.0	rs11585549	0.3672009695214749	0.7358672376892729	0.3561737052006207	-0.06615704217631674	0.3327471107931947	0.46072286611845314	0.2162199582486899	0.04234465371667871	-0.0245490632328248	0.07473861473271158	0.18138855338060345	0.4878071574955388	0.26370872679067475	0.1865065329689951	0.5693437979254933	0.27666634098027065	0.2052347947329458	0.34090540502312916	-0.05906056279904835	0.3534343726578042	0.20743683651815903	-0.1768984640652715	0.31981238904034054	-0.026438605571407942	0.29915323973116	0.20800800642854747	-0.1806944365524798	-0.1665234397637796	-0.07950736422035004	0.27139183690926255	0.00815829422993447	-0.5197834289175015	0.1372144144091143	0.1650921828014803	-0.1523494008324467	0.24507377430762894	-0.2078271589520114	-0.18865391776437884	-0.055700720362127275	0.545696106059	0.242741268695	0.301187193336	0.85089220831	0.914457985151	0.181543682451	0.967868733231	0.819442862795	0.420451345493	0.468411351413	0.197395731844	0.390154148302	0.69323465325	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr1:209602085..209602199,+__48.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr1:209602085..209602199,+__48.1.0.0	rs17014467	-1.143911902006841	-1.27695192980682	-1.5362959407914358	-1.9374813283399468	-1.7734818673308193	-1.969837320738737	-1.0601300404121183	-1.311736455214986	-2.1266924708751405	-1.903358297772804	-1.5602881145835856	-1.2667930235583424	-1.5722465576192979	-1.354728937506797	-1.2579516791187146	-1.5418251063574964	-2.0786697998920296	-2.0314158533778133	-1.806822278072514	-1.6078926542508902	-1.2559538454374	-1.4491751364979442	-1.892126048700514	-1.692841306163296	-1.4395138894422133	-1.6174097112348018	-0.21081703549995612	0.01900025068810529	-0.005529165566060534	-0.1411884715520828	-0.257933986046994	0.1630150426662229	-0.5477626138387719	0.05578260977758598	0.6775173343771963	0.011232249072290035	-0.13255319157971046	-0.1727208658838708	-0.04516315361550385	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:209848537..209848651,-__49.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:209848537..209848651,-__49.1.0.0	rs1815548	-0.4039609273638469	-0.5176230087861545	-0.5596919738584629	-0.4554478350848578	-0.05042453394852055	-0.12716841724755856	-0.10388120715249696	-0.6829031804071422	-0.5330258964170783	-0.00512152200835625	-0.4856025609137352	-0.7012782879523132	-0.38551077926171023	-0.43355062622990637	-0.9228112966129142	-0.6464603992482235	-0.03193650210118511	-0.01715191576366218	-1.1363252851397017	-0.09125821339367612	-0.8227799723406108	-1.671078968680056	-0.7121430575295248	-0.6022888461740241	-0.714899159748748	-0.6502236869135194	-0.029589698866059444	-0.40518828782675964	-0.0867684253897606	0.4235113329836727	0.03327261818485837	-1.009156867892143	0.012622993758820839	-0.1398767919334687	-1.1380530722629776	-0.7070215355211685	-0.1166862852602889	-0.013620871796434786	-0.2647129076518091	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.226876581559	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	0.226876581559	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr1:211556065..211556179,+__50.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:211556065..211556179,+__50.1.0.0	rs41303051	2.2530593317928576	2.5788150963383147	2.242171304945692	1.9741774712709155	2.2379951253230708	2.3312221286995856	2.0754808353285275	2.4657155417177776	2.4022436607798863	2.2485486723075985	2.2162664553567084	2.341441214152473	2.280594736501118	1.4146495676385318	1.5949222684731081	1.4169200530323711	1.2872274183261831	1.594186603689438	1.4188569203827748	1.507709697481417	1.6030510956521984	1.5097400553913465	1.5958058010455343	1.6979013486643935	1.5748296368604617	1.5179833722198133	-0.8384097641543258	-0.9838928278652066	-0.825251251913321	-0.6869500529447323	-0.6438085216336327	-0.9123652083168108	-0.5677711378471104	-0.8626644460655792	-0.8925036053885398	-0.6527428712620642	-0.518365106692315	-0.7666115772920115	-0.762611364281304	9.53931849178e-07	3.38768884882e-06	0.000751093855117	0.000320085853942	4.67965309508e-06	1.45948915094e-08	0.000144763512967	2.34105229667e-05	1.25214566711e-06	6.04095401414e-06	1.06220766775e-05	2.44178879239e-06	3.66167320679e-50	0.000675383749218	0.00252044050352	0.559564922063	0.235903274355	0.0036126921894	1.11504971131e-05	0.106980236083	0.0170194501968	0.000967908600679	0.0047421489011	0.00816837696496	0.00190215346927	3.06848214729e-47	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr1:213031405..213031519,-__51.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:213031405..213031519,-__51.1.0.0	rs2201601	-0.7966950948500575	-0.24660103166545516	-0.881270430052239	-0.5580872056353893	-1.1039284317401779	-1.040087323517421	-0.8475057301190522	-1.1492700108431544	-1.1249881227258043	-0.650741216636548	-0.8698037404875651	-0.5666664763180609	-0.8196370678825772	-0.7401512012978424	-0.9663406905716644	-1.0703728581103815	-1.4930781931676191	-0.6327347423774817	-0.44564195537701146	-0.7811359360632893	-1.347730448515029	-1.0216814929379283	-1.0381908920487757	-1.753104879594301	-1.0465018959557135	-1.0280554321680866	0.05654389355221512	-0.7197396589062093	-0.18910242805814248	-0.9349909875322299	0.4711936893626961	0.5944453681404096	0.06636979405576282	-0.1984604376718746	0.10330662978787597	-0.38744967541222763	-0.8833011391067358	-0.47983541963765264	-0.2084183642855094	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.340418419004	NA__no_active_tile	0.747262025795	0.571428892477	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr1:213031405..213031519,-__51.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:213031405..213031519,-__51.1.0.0	rs12404942	-0.7966950948500575	-0.24660103166545516	-0.881270430052239	-0.5580872056353893	-1.1039284317401779	-1.040087323517421	-0.8475057301190522	-1.1492700108431544	-1.1249881227258043	-0.650741216636548	-0.8698037404875651	-0.5666664763180609	-0.8196370678825772	-1.1070261878231065	-0.940709970674537	-1.0720228781417243	-0.4735798078380054	-1.0916311060463924	-1.3671919004251554	-1.5694833031209765	-1.2721152290045703	-1.346267481474965	-1.1843355335606818	-1.263247899590218	-1.2078459862447155	-1.1579547736620872	-0.31033109297304895	-0.6941089390090818	-0.19075244808948522	0.08450739779738387	0.012297325693785499	-0.3271045769077343	-0.7219775730019243	-0.12284521816141591	-0.22127935874916083	-0.5335943169241337	-0.39344415910265296	-0.6411795099266546	-0.3383177057795103	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.150801701171	NA__no_active_tile	0.0484054419273	0.0284158154317	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr1:213031405..213031519,-__51.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:213031405..213031519,-__51.1.0.0	rs2201602	-0.7966950948500575	-0.24660103166545516	-0.881270430052239	-0.5580872056353893	-1.1039284317401779	-1.040087323517421	-0.8475057301190522	-1.1492700108431544	-1.1249881227258043	-0.650741216636548	-0.8698037404875651	-0.5666664763180609	-0.8196370678825772	-0.8115862128855719	-1.0287953833598522	-0.7856560051391581	-1.2449213985272378	-0.8665449626570512	-1.2551225817422484	-0.6985760330180997	-1.0891525997019913	-1.0852421769508018	-0.8061955412789678	-0.43299247539680485	-0.6281289320664983	-0.8944095252270237	-0.01489111803551435	-0.782194351694397	0.09561442491308092	-0.6868341928918485	0.23738346908312669	-0.21503525822482739	0.1489296971009525	0.06011741114116309	0.039745945775002456	-0.1554543246424197	0.4368112650907603	-0.06146245574843745	-0.07477245734444651	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.914457985151	0.501992688725	0.657696241675	0.847938093316	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr1:213031405..213031519,-__51.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:213031405..213031519,-__51.1.0.0	rs3768554,rs2201601,rs12404942,rs2201602	-0.7966950948500575	-0.24660103166545516	-0.881270430052239	-0.5580872056353893	-1.1039284317401779	-1.040087323517421	-0.8475057301190522	-1.1492700108431544	-1.1249881227258043	-0.650741216636548	-0.8698037404875651	-0.5666664763180609	-0.8196370678825772	-1.0719939489984862	-0.9663406905716644	-1.2336918563050219	-1.042171897912794	-0.8295341388602054	-1.134235957769788	-0.4717834230551907	-0.850957405463805	-1.1688829603495312	-0.7148078656511052	-0.9904874011921952	-1.119671220999202	-0.9662132305940824	-0.2752988541484287	-0.7197396589062093	-0.35242142625278283	-0.4840846922774048	0.2743942928799724	-0.09414863425236697	0.37572230706386145	0.29831260537934934	-0.04389483762372692	-0.06406664901455716	-0.1206836607046301	-0.553004744681141	-0.1465761627115054	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.85089220831	NA__no_active_tile	0.554657938956	0.797511094466	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr1:222763224..222763338,+__52.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr1:222763224..222763338,+__52.1.0.0	rs3008651	2.4243758092693577	2.8565303236964024	2.451097044155114	2.331811161148262	2.6521278973671203	2.5129086287605347	2.432664269763692	2.6345558010887373	2.503804082338595	2.608739857637968	2.5868588558598953	2.6524583592581483	2.5539943408619856	2.6362330090347306	3.0592077924952394	2.5976886202230762	2.458796111846193	2.738886209451865	2.6165777092570757	2.6580961410478174	2.8000824866978133	2.7033151715417665	2.754076381634336	2.7465835179376663	2.7291229196576774	2.708222172568771	0.21185719976537287	0.20267746879883708	0.14659157606796214	0.12698495069793125	0.08675831208474483	0.103669080496541	0.22543187128412523	0.16552668560907602	0.1995110892031713	0.14533652399636798	0.15972466207777103	0.07666456039952907	0.1542278317067858	0.0316863885398	0.113101776132	0.468411351413	0.60051573606	0.270885072145	0.428242856315	0.162586850726	0.276771967065	0.143314270352	0.206893929435	0.248198866138	0.375513989452	0.00939923849811	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr1:222763224..222763338,+__52.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr1:222763224..222763338,+__52.1.0.0	rs3008652	2.4243758092693577	2.8565303236964024	2.451097044155114	2.331811161148262	2.6521278973671203	2.5129086287605347	2.432664269763692	2.6345558010887373	2.503804082338595	2.608739857637968	2.5868588558598953	2.6524583592581483	2.5539943408619856	2.641114420201223	2.9737333113531284	2.4464831071401374	2.219425743667176	2.606882084300701	2.5713087301637687	2.243302259114465	2.642335137990825	2.5804419320408627	2.6238919709470307	2.6781874105815415	2.5959469223203695	2.568587752485102	0.21673861093186542	0.11720298765672599	-0.004613937014976699	-0.11238541748108588	-0.045245813066419505	0.05840010140323404	-0.1893620106492273	0.007779336902087763	0.0766378497022675	0.015152113309062631	0.09132855472164625	-0.056511436937778825	0.014593411623116781	0.333666485083	0.326996172605	0.591208103411	0.368322877114	0.581967350665	0.88258056334	0.282745459933	0.527990680582	0.809021331888	0.63839046467	0.501992688725	0.609889042629	0.658985828147	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr1:222763224..222763338,+__52.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr1:222763224..222763338,+__52.1.0.0	rs3008651,rs3008652	2.4243758092693577	2.8565303236964024	2.451097044155114	2.331811161148262	2.6521278973671203	2.5129086287605347	2.432664269763692	2.6345558010887373	2.503804082338595	2.608739857637968	2.5868588558598953	2.6524583592581483	2.5539943408619856	2.238260808674685	2.7962832679089136	2.3058395160341263	2.1238764644342716	2.461306901371123	2.607876119407348	2.2383682633294644	2.4330121258302224	2.6689876409336786	2.5427998847169455	2.507667681162222	2.5588771466340416	2.456929651703087	-0.18611500059467279	-0.06024705578748879	-0.1452575281209878	-0.20793469671399034	-0.19082099599599722	0.09496749064681342	-0.19429600643422784	-0.2015436752585149	0.16518355859508338	-0.0659399729210226	-0.07919117469767345	-0.09358121262410668	-0.0970646891588988	0.527990680582	0.545696106059	0.154655491485	0.226876581559	0.170821264488	0.716953652062	0.202104162379	0.747262025795	0.967868733231	0.609889042629	0.687084607526	0.476688253492	0.54966290222	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr1:22351918..22352032,+__53.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:22351918..22352032,+__53.1.0.0	rs61778042	3.16257089821792	3.605974680503029	2.987910081496339	2.8115935945317894	3.098034552133723	3.09893159436809	3.1512782255436944	3.3090928648827003	3.252318432076941	3.303381647524806	3.069682158078209	3.340261584966627	3.182585859526989	2.740173579968933	3.118232830881353	2.51532659122329	2.5244464425682778	2.8431184897455477	2.8642867723122443	2.719119821218694	2.8754258210262504	2.8637179728287343	2.9414011339585677	2.854342585839275	2.814647919927911	2.806186663458257	-0.4223973182489873	-0.4877418496216759	-0.472583490273049	-0.2871471519635116	-0.2549160623881752	-0.23464482205584591	-0.4321584043250004	-0.43366704385644983	-0.38860045924820685	-0.3619805135662384	-0.21533957223893418	-0.525613665038716	-0.3763991960687325	0.000827700533168	0.00849533044186	0.00480682187369	0.00591301274865	0.0232568344756	0.0249397487324	0.00251850159852	0.0129907246043	0.0162407194134	0.0730456174475	0.0258200569765	0.00753998341959	8.27363754462e-16	0.586011977483	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	6.93330826239e-13	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr1:231664267..231664381,-__56.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:231664267..231664381,-__56.1.0.0	rs554008873	0.2874041964110865	-0.5609305622423628	-0.053449381743412946	-0.27793426688204265	0.299077289069956	-0.1851440980681125	0.7173046419413481	-0.5125932581362842	-0.0245490632328248	-0.28632127034004906	0.29566238118509774	0.2548410325401033	-0.0038860299581247684	0.7618440107335994	0.5395108957639114	0.08712149312568572	0.05212238146015948	0.452712431280536	0.08939594949900874	0.3510996935995607	-0.20639533176265132	-0.034746888118680375	0.6567021898565367	0.4558864915060235	0.6202039673020293	0.3187881070204766	0.4744398143225129	1.1004414580062742	0.14057087486909867	0.3300566483422021	0.15363514221058	0.27454004756712125	-0.3662049483417874	0.30619792637363286	-0.010197824885855574	0.9430234601965858	0.16022411032092576	0.365362934761926	0.32267413697860137	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr1:234764949..234765063,+__58.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr1:234764949..234765063,+__58.1.0.0	rs643342	-1.4257586585648412	-1.0542067859669146	-1.7593898475703216	-1.5333524442660316	-1.7821424937464438	-1.893056687736372	-1.8068087460779907	-1.8995589259522072	-1.2731564658564272	-1.506200549108728	-1.454747876501032	-1.8709320508475418	-1.6049426276829044	-2.2744229566143903	-1.7132225556573533	-1.670215855771069	-1.8198352575632468	-1.849226940825179	-1.444003092759968	-1.4033436877677838	-1.7904388336632466	-1.5716169877077006	-1.6327469363669485	-1.8940870561058132	-2.0837082933327697	-1.7622390378446224	-0.8486642980495491	-0.6590157696904386	0.08917399179925267	-0.28648281329721526	-0.06708444707873507	0.44905359497640385	0.40346505831020685	0.10912009228896058	-0.2984605218512735	-0.12654638725822043	-0.4393391796047812	-0.21277624248522797	-0.1572964101617181	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr1:234764949..234765063,+__58.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr1:234764949..234765063,+__58.1.0.0	rs16843708	-1.4257586585648412	-1.0542067859669146	-1.7593898475703216	-1.5333524442660316	-1.7821424937464438	-1.893056687736372	-1.8068087460779907	-1.8995589259522072	-1.2731564658564272	-1.506200549108728	-1.454747876501032	-1.8709320508475418	-1.6049426276829044	-1.0867435496383555	-1.1814710794918173	-1.3113791755979833	-1.5280258865415874	-1.6444439138222053	-1.4583326283138778	-1.2709400963956223	-1.2590044029469856	-1.3360718339571385	-1.5169660334416497	-1.6054020443582782	-1.297390582354736	-1.3746809355716865	0.3390151089264857	-0.12726429352490265	0.44801067197233824	0.005326557724444125	0.1376985799242385	0.43472405942249415	0.5358686496823684	0.6405545230052216	-0.0629153681007113	-0.010765484332921682	-0.15065416785724617	0.5735414684928057	0.23026169211121786	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr1:234764949..234765063,+__58.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr1:234764949..234765063,+__58.1.0.0	rs643342,rs16843708	-1.4257586585648412	-1.0542067859669146	-1.7593898475703216	-1.5333524442660316	-1.7821424937464438	-1.893056687736372	-1.8068087460779907	-1.8995589259522072	-1.2731564658564272	-1.506200549108728	-1.454747876501032	-1.8709320508475418	-1.6049426276829044	-1.3723760671380092	-1.6382547375707666	-2.0872259473851678	-1.6018363638575552	-1.390815265758203	-1.5397934592053535	-1.6078926542508902	-1.7517874712269985	-1.9788327093056837	-1.9511970513831975	-2.027756526705418	-1.7558469147050215	-1.725301264041022	0.05338259142683199	-0.5840479516038519	-0.3278360998148462	-0.06848391959152367	0.39132722798824093	0.35326322853101844	0.19891609182710046	0.1477714547252087	-0.7056762434492565	-0.4449965022744695	-0.5730086502043861	0.11508513614252025	-0.12035863635811776	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:239882369..239882483,-__61.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:239882369..239882483,-__61.1.0.0	rs12022014	0.3385389836716771	0.6691819244039385	0.3203511653001249	0.3418095682857145	0.45443040672973145	0.4354021499715326	0.5454998443995869	0.4532259037965507	0.558311136892437	0.5765288257532746	0.4472707526515569	0.48264208830867306	0.46859939584706645	-1.9387577007659813	-1.4621473950167	-1.733156328348827	-1.4265755896751033	-1.8739277920554176	-1.5511415976583152	-1.4255369399941014	-1.3984041416085036	-1.8836428249953459	-1.846557019512585	-1.689952991845395	-1.3307566398929491	-1.6300464134474355	-2.2772966844376583	-2.1313293194206384	-2.0535074936489517	-1.7683851579608179	-2.328358198785149	-1.9865437476298478	-1.9710367843936882	-1.8516300454050543	-2.441953961887783	-2.4230858452658595	-2.1372237444969517	-1.8133987282016222	-2.098645809294502	2.29972389144e-09	2.1168207267e-09	7.13508168948e-10	6.55420316999e-10	2.9325851825e-08	1.99366201481e-08	4.07565079322e-09	7.75604315257e-09	2.33346554357e-10	1.79481890187e-09	1.94893905913e-09	1.45948915094e-08	1.75195410162e-90	1.62820451514e-06	1.57491462067e-06	5.31563585867e-07	4.83044773628e-07	2.26395576089e-05	1.52315777932e-05	3.01190593619e-06	5.63864337192e-06	1.80376886518e-07	1.40893283797e-06	1.49873413647e-06	1.13694204858e-05	1.46813753716e-87	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr1:28975032..28975146,+__64.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr1:28975032..28975146,+__64.1.0.0	rs76909508	-1.5360057704435486	-1.1285407865400496	-1.8664338991713163	-1.7721750460332597	-1.687425732746424	-1.7482689092250805	-1.8158401169414269	-1.707122012517338	-1.5758232146977216	-1.708075959142715	-1.7742134747903238	-1.7510939647377377	-1.6725849072489114	-1.1209660758445992	-1.2120260106548442	-1.1716517096393109	-1.3374275748150677	-1.3087615751889312	-1.3749057621332177	-1.9621496985892373	-1.2281498925880316	-1.5420999807909972	-1.7124952295621867	-1.4268627205721724	-1.3674549614368419	-1.3970792659846198	0.4150396945989494	-0.08348522411479453	0.6947821895320054	0.434747471218192	0.3786641575574927	0.3733631470918628	-0.14630958164781038	0.47897211992930644	0.03372323390672438	-0.004419270419471655	0.3473507542181513	0.38363900330089584	0.275505641264292	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:31191505..31191619,+__65.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:31191505..31191619,+__65.1.0.0	rs10914186	0.853379894448661	1.1464678680840719	0.6043856120885255	0.28196151941255804	0.415916535133311	0.7765697462818987	0.6179072643892123	0.32402236028695897	1.218517070992969	0.6553873326409074	1.1841403796046863	0.673432504238491	0.7293406739668543	-0.08138366834163019	1.0887465487955799	-0.07047479245137929	0.6622376398895004	0.13616132287342833	0.7447594664554401	0.4940278063788996	0.5185676572309614	0.33491628716879823	0.8431299662932231	0.8465822975741584	0.0009935937117635891	0.4598553437982287	-0.9347635627902913	-0.057721319288492	-0.6748604045399048	0.3802761204769423	-0.27975521225988265	-0.031810279826458565	-0.12387945801031269	0.19454529694400247	-0.8836007838241706	0.1877426336523157	-0.33755808203052795	-0.6724389105267274	-0.2694853301686256	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr1:37939973..37940087,-__71.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr1:37939973..37940087,-__71.1.0.0	rs75785507	0.9284027396331356	-1.1125079924171535	0.5208548344816036	0.20879433955232699	-0.2574294144818752	0.30272163148812725	1.9906188028311105	1.0981398465181365	-0.8657397642944474	0.16701260269907978	-0.018232009120243458	0.20807451851890163	0.2642258446173918	0.8360807617583486	-0.9781548314841693	0.4376888676172211	0.25421408346631796	0.3542486110254552	-0.34747878832897555	0.44943163876438796	-0.5215605212560821	-0.4456322753885736	-0.32810228493235605	0.4350682417987833	0.9435334800194028	0.0907780819216467	-0.09232197787478702	0.13435316093298422	-0.08316596686438255	0.04541974391399098	0.6116780255073304	-0.6502004198171027	-1.5411871640667225	-1.6197003677742186	0.42010748890587385	-0.49511488763143585	0.45330025091902676	0.7354589615005012	-0.17344776269574513	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr1:3816890..3817004,+__72.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:3816890..3817004,+__72.1.0.0	rs12095854	0.7299258670525404	0.7913278599439422	0.6679701834570259	0.8581902307580336	0.9965863208328375	0.9105736402025556	0.8574218120712598	0.9209657403862409	1.0460067822423642	0.5670293791643687	0.9289202998142486	0.18173059198149746	0.7880540589922428	0.9129632017398964	0.8217424502233416	0.7578535121665599	0.7672021374875628	1.285576102861958	0.658734786700756	0.2503426712277149	0.8626399465759638	0.611250805276935	1.0345443521997075	1.08168024651335	0.8914451535798092	0.8279979472127964	0.18303733468735606	0.03041459027939941	0.08988332870953408	-0.09098809327047075	0.2889897820291204	-0.2518388535017996	-0.6070791408435449	-0.05832579381027714	-0.4347559769654292	0.46751497303533884	0.1527599466991013	0.7097145615983118	0.039943888220553364	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr1:3816890..3817004,+__72.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:3816890..3817004,+__72.1.0.0	rs12095856	0.7299258670525404	0.7913278599439422	0.6679701834570259	0.8581902307580336	0.9965863208328375	0.9105736402025556	0.8574218120712598	0.9209657403862409	1.0460067822423642	0.5670293791643687	0.9289202998142486	0.18173059198149746	0.7880540589922428	0.6157101471707336	0.8358290172182481	0.4832087513776969	0.1028056386133246	1.1448875664735256	1.0584603420687588	1.0839087905683336	0.1953929518725405	0.4548050718667696	0.5986013767768078	1.116058922649373	0.4173920754613926	0.6755883876764587	-0.11421571988180679	0.044501157274305925	-0.18476143207932894	-0.755384592144709	0.14830124564068814	0.14788670186620323	0.22648697849707378	-0.7255727885137004	-0.5912017103755947	0.03157199761243912	0.18713862283512428	0.23566148347989516	-0.11246567131578418	0.460214637573	0.946473618223	0.866708095346	NA__not_enough_barcodes	0.737113058664	0.788281320858	0.85089220831	0.63839046467	0.253741740693	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.48504462162	0.943394271691	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	1	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr1:3816890..3817004,+__72.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:3816890..3817004,+__72.1.0.0	rs75689004	0.7299258670525404	0.7913278599439422	0.6679701834570259	0.8581902307580336	0.9965863208328375	0.9105736402025556	0.8574218120712598	0.9209657403862409	1.0460067822423642	0.5670293791643687	0.9289202998142486	0.18173059198149746	0.7880540589922428	0.4070647644060065	0.9755047311858815	0.48500063031104407	1.0142178919718516	0.8906570229367131	0.0975619547193369	-0.197600524480388	1.4333454461306216	0.2711028446810977	1.3053550189732548	0.9051079768137992	1.5301232955488806	0.7597867544331748	-0.3228611026465339	0.18417687124193938	-0.1829695531459818	0.15602766121381806	-0.10592929789612437	-0.8130116854832187	-1.0550223365516478	0.5123797057443807	-0.7749039375612665	0.7383256398088861	-0.023812323000449442	1.348392703567383	-0.028267304559067934	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr1:3816890..3817004,+__72.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:3816890..3817004,+__72.1.0.0	rs12095854,rs12095856,rs75689004	0.7299258670525404	0.7913278599439422	0.6679701834570259	0.8581902307580336	0.9965863208328375	0.9105736402025556	0.8574218120712598	0.9209657403862409	1.0460067822423642	0.5670293791643687	0.9289202998142486	0.18173059198149746	0.7880540589922428	0.45042955583181066	0.7408968008965522	0.42978582359693207	0.5841403147104207	0.365021087859063	0.8195661522509076	0.6629069328305228	0.5866313018093077	0.9009001237151987	0.7744921590036312	1.078438939689578	0.3966777430952126	0.6491572446074282	-0.2794963112207297	-0.05043105904738998	-0.2381843598600938	-0.27404991604761286	-0.6315652329737744	-0.09100748795164804	-0.19451487924073696	-0.33433443857693323	-0.14510665852716553	0.20746277983926253	0.14951863987532932	0.21494715111371512	-0.13889681438481477	0.8931878581	0.527990680582	0.777966336216	0.840380101088	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.914457985151	0.840380101088	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.986820078878	1	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:43312058..43312172,-__75.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:43312058..43312172,-__75.1.0.0	rs9988434	1.1083672077148263	1.175204102806111	0.9108256470533552	0.8777294742497471	1.0777890254382994	1.2656949108198516	1.0633608442432596	1.2596393270205883	1.0789534192328285	1.1077365094542566	1.2735456473564215	1.1397369055596458	1.1115485850790991	0.5952600744968104	1.1691502740567359	0.9397195928314783	0.5508318351566841	1.0830638229147498	0.862404365994693	1.1146031327535812	1.1303653567009517	1.0547442681067354	1.1834987586489099	1.3294268547158965	0.9563656661430917	0.9974528335433597	-0.5131071332180159	-0.006053828749375212	0.028893945778123098	-0.326897639093063	0.005274797476450432	-0.4032905448251587	0.05124228851032164	-0.1292739703196366	-0.02420915112609312	0.07576224919465324	0.055881207359474994	-0.1833712394165541	-0.11409575153573943	0.861429311442	0.861430881609	0.510577925344	0.624065454014	0.248198866138	0.468411351413	0.946473618223	0.946473618223	0.727009731456	0.925117039075	0.914457985151	0.88258056334	0.997160371319	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr1:713977..714091,-__88.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:713977..714091,-__88.1.0.0	rs114983708	1.4648352324428175	1.5451295340955657	1.1466357979557227	1.119267299300991	1.228834794486128	1.2804931972707938	0.9557260289260148	0.926990188257572	1.2542354806803382	1.4391743462953883	1.617069602627169	1.5827726123756645	1.2967636762261805	1.523248993585298	1.674686552558284	1.1603692368058869	1.2578841789329895	1.4628958815867874	1.4261541897393493	1.275714292344586	1.209111212390552	1.4969687276668084	1.3958131600417203	1.3360492750134116	1.5592695219098447	1.3981804352146268	0.058413761142480425	0.12955701846271817	0.013733438850164204	0.13861687963199865	0.23406108710065943	0.14566099246855546	0.31998826341857134	0.2821210241329801	0.24273324698647025	-0.04336118625366803	-0.2810203276137573	-0.023503090465819776	0.10141675898844608	0.87199428352	0.819442862795	0.677233097055	0.628827692687	0.501992688725	0.379136386009	0.737113058664	0.716950551484	0.941129588792	0.48504462162	0.0932701621097	0.545696106059	0.879643258092	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr1:762867..762981,-__90.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:762867..762981,-__90.1.0.0	rs534930819	3.2554351537269928	3.4295028293437166	3.0638353175025044	2.899315357109814	3.1419575574544547	3.2882671039067977	3.245132327323361	3.2553181168743723	3.277179462283838	3.3454923652743673	3.2858471644282563	3.4395195360023534	3.243900190935902	2.980248933607058	3.474363580413213	2.9077358652448058	2.738545503179183	3.2068255436175725	3.203432625559419	3.0425905906725257	3.418847830536774	3.2141700868328025	3.31736941026794	3.317192422042882	3.3150030491113465	3.17802712009046	-0.2751862201199349	0.044860751069496274	-0.1560994522576986	-0.1607698539306308	0.06486798616311784	-0.08483447834737845	-0.20254173665083552	0.16352971366240165	-0.06300937545103569	-0.028122955006427475	0.03134525761462559	-0.12451648689100692	-0.06587307084544225	0.657696241675	0.657696241675	0.591208103411	0.288805731951	0.840380101088	0.493479697885	0.354199901149	0.935789553219	0.967868733231	0.935789553219	0.727009731456	0.609889042629	0.976258128777	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr1:91317140..91317254,-__95.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr1:91317140..91317254,-__95.1.0.0	rs7538464	0.0755045845638288	0.6059626733861632	0.4668772176208138	0.35482171320393874	-0.35159213798884303	-0.4978484406920069	-0.665607089085597	-0.01148762615636939	0.5862223126385189	1.1223785291527195	1.2551061382044857	-0.10234751391970784	0.23649919674399542	1.244616531819834	1.1390317722463048	1.490145719069727	0.8103253685798868	0.7936573304540073	0.1691095685396601	0.3612895886350105	-0.22573451802273775	0.42541607880513743	0.9946438744156293	0.0898615881974096	0.5891673175278767	0.6567941850223121	1.1691119472560052	0.5330690988601416	1.0232685014489131	0.45550365537594806	1.1452494684428505	0.666958009231667	1.0268966777206074	-0.21424689186636836	-0.16080623383338144	-0.12773465473709023	-1.165244550007076	0.6915148314475845	0.42029498827831685	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr1:93811262..93811376,-__97.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr1:93811262..93811376,-__97.1.0.0	rs6679630	-0.26926588695682674	-0.664426995213052	-0.6893019747575224	-0.921212461768824	-0.6702528050092461	-0.6502966054469654	-1.1314704399459554	-1.1223087485837753	-0.5546582597163283	-0.94278000230985	-0.6286679560641965	-1.0066652148101574	-0.770942279215225	-1.1418527716161966	-0.7491974452970456	-1.3012257235229254	-0.9650440288961942	-1.3551989746285162	-0.8503137352172295	-0.8451886603822896	-0.4825044634139386	-0.9465598030898257	-0.963374409978914	-1.1571638388912442	-1.2173517713421869	-0.9979146355230423	-0.8725868846593698	-0.08477045008399353	-0.611923748765403	-0.04383156712737024	-0.6849461696192701	-0.2000171297702641	0.28628177956366585	0.6398042851698367	-0.39190154337349736	-0.020594407669063952	-0.5284958828270477	-0.2106865565320295	-0.22697235630781729	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr1:93811312..93811426,-__98.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr1:93811312..93811426,-__98.1.0.0	rs6679630	2.1206094735283614	2.659114297281829	2.2765952260370903	2.1009543281211616	2.4434316395634683	2.485171453803056	1.8451790353149664	2.2171066709477145	2.199028376029851	2.4820981001249294	2.2738180662161978	2.378293053421306	2.2901166433658275	2.3037495966072434	2.4270691390324224	2.0713314226226753	1.5722201948430898	1.8524562011994732	2.099147564871093	2.046762554410927	1.799567777375176	2.089270126583747	2.153737638452517	1.953424306482089	1.9224826758836637	2.024268266530343	0.18314012307888206	-0.23204515824940675	-0.20526380341441497	-0.5287341332780717	-0.5909754383639951	-0.38602388893196293	0.20158351909596073	-0.4175388935725386	-0.10975824944610402	-0.3283604616724123	-0.32039375973410866	-0.4558103775376421	-0.2658483768354845	NA__not_enough_barcodes	0.624065454014	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.909133064849	NA__not_enough_barcodes	0.605190125793	0.523605760741	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.838622077286	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	1	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr1:93811312..93811426,-__98.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr1:93811312..93811426,-__98.1.0.0	rs6693904	2.1206094735283614	2.659114297281829	2.2765952260370903	2.1009543281211616	2.4434316395634683	2.485171453803056	1.8451790353149664	2.2171066709477145	2.199028376029851	2.4820981001249294	2.2738180662161978	2.378293053421306	2.2901166433658275	0.4124136335586256	0.9628546221901458	0.30208718344639246	1.1616931545932354	0.8859610753389567	1.1624411271350108	0.7205663523111925	0.1977659954966858	1.1462661138990071	0.27501988136420424	1.3341993472492546	0.2927381471154747	0.7378338861415156	-1.708195839969736	-1.6962596750916834	-1.9745080425906978	-0.9392611735279262	-1.5574705642245115	-1.322730326668045	-1.124612683003774	-2.0193406754510286	-1.052762262130844	-2.207078218760725	-0.9396187189669432	-2.085554906305831	-1.5522827572243123	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr1:93811312..93811426,-__98.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr1:93811312..93811426,-__98.1.0.0	rs6679630,rs6693904	2.1206094735283614	2.659114297281829	2.2765952260370903	2.1009543281211616	2.4434316395634683	2.485171453803056	1.8451790353149664	2.2171066709477145	2.199028376029851	2.4820981001249294	2.2738180662161978	2.378293053421306	2.2901166433658275	0.999949526385076	1.1583811559732176	1.5392068224669735	0.943931903238432	0.7376630393594372	0.4312579372854044	1.3503139366707881	1.0377910851161007	-0.33132564891229066	1.193715073923334	1.058594392086496	0.3707952111530947	0.8741895362288385	-1.1206599471432854	-1.5007331413086116	-0.7373884035701168	-1.1570224248827294	-1.705768600204031	-2.0539135165176514	-0.49486509864417827	-1.1793155858316138	-2.5303540249421417	-1.2883830262015954	-1.2152236741297018	-2.007497842268211	-1.415927107136989	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr1:98511745..98511859,-__102.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr1:98511745..98511859,-__102.1.0.0	rs552418648	0.01899792217667621	0.10910843514497254	-0.025815082245435862	0.1353521561209296	0.14265858093656725	0.29353376358714933	-0.23543910923310307	0.173524413396224	0.19857351398592954	0.13522510852848213	0.19533599711125	0.146107253260906	0.10726357939754565	-0.3400704019457715	-0.125166712961023	-0.5883319235120811	-0.5206524342763564	-0.16971288867457363	-0.38231791824500205	-0.5010890648017854	-0.2903016059626271	-0.4454501781545432	-0.1768493636845033	-0.08970219096549858	-0.5922839157314098	-0.3518273832429312	-0.3590683241224477	-0.23427514810599553	-0.5625168412666453	-0.656004590397286	-0.3123714696111409	-0.6758516818321514	-0.2656499555686823	-0.4638260193588511	-0.6440236921404727	-0.31207447221298545	-0.2850381880767486	-0.7383911689923158	-0.4590909626404769	0.232080506959	0.788281320858	0.444064484515	0.0741297894045	0.0583274625199	0.0129907246043	0.253741740693	0.211760329767	0.301181659941	0.633597542154	0.248198866138	0.00616002497902	0.00171178347123	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr10:102133304..102133418,+__103.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr10:102133304..102133418,+__103.1.0.0	rs568148902	-1.0834442117742495	-1.3624837637567346	-1.1088453977061865	-1.3004589114096023	-1.3076451362864787	-1.2713905293665129	-1.3268588510895944	-0.7941143767474013	-1.5767223136923598	-1.3367791898856514	-1.0303179658173915	-1.222212181346415	-1.2267727357398817	-0.9160262950716549	-1.1334245837161865	-1.2045826297886029	-1.3659860220069484	-0.9224534226406323	-1.434149770971282	-1.4523799767031567	-0.5889046362931494	-0.5152259450998675	-0.9899583065847772	-1.1207825893201058	-0.8969428211484151	-1.0450680832787316	0.16741791670259465	0.22905918004054815	-0.09573723208241636	-0.06552711059734606	0.38519171364584637	-0.16275924160476918	-0.1255211256135622	0.2052097404542519	1.0614963685924923	0.3468208833008741	-0.09046462350271423	0.325269360198	0.18170465246114997	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr10:10836906..10837020,-__106.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr10:10836906..10837020,-__106.1.0.0	rs4749989	-1.7026435884702469	-1.503367059221959	-1.7168449047038192	-1.460949009200088	-1.5294603077681774	-1.8424755100348946	-1.7190576502140795	-1.4773861964254875	-1.3540811181775787	-1.90805204853239	-1.733019719115131	-1.4919661513651419	-1.619941938602416	-1.7072204464140253	-1.6307327272345358	-1.770867787573852	-2.120589366631393	-1.8453396580511976	-2.1498607689980096	-1.4008068479392222	-1.520323138442672	-2.1375067175209375	-2.1182922000476707	-1.6205967159718353	-1.8994938216124724	-1.8268025163698187	-0.0045768579437783785	-0.12736566801257676	-0.05402288287003287	-0.659640357431305	-0.31587935028302017	-0.30738525896311497	0.31825080227485736	-0.042936942017184565	-0.7834255993433588	-0.21024015151528075	0.11242300314329579	-0.4075276702473305	-0.2068605777674025	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr10:11936664..11936778,-__110.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr10:11936664..11936778,-__110.1.0.0	rs75405465	2.6867689621092277	2.9409899928752568	2.6889994892399676	2.442671569844734	2.5443110755551395	2.750888773845208	2.4314093010499853	2.6002051655136214	2.7891596543995423	2.852035276140601	2.8369265945995483	2.702952834751544	2.6889432241603646	2.3461144447026876	2.644055080427579	2.4272187014878774	2.1705799478739145	2.3455113163047727	2.2340842673021815	2.258661265577215	2.3053919975130297	2.385374890389012	2.5039256128057854	2.4244742318266628	2.5968008717688456	2.3868493856649637	-0.34065451740654007	-0.29693491244767767	-0.2617807877520901	-0.2720916219708194	-0.19879975925036675	-0.5168045065430267	-0.1727480354727704	-0.29481316800059165	-0.4037847640105303	-0.3481096633348155	-0.41245236277288555	-0.10615196298269858	-0.30209383849540106	0.0286240283844	0.0111573361887	0.0808926541269	0.0181189115857	0.00883703695038	0.00357181666747	0.0249397487324	0.00544559218276	0.0111573361887	0.0145358169752	0.00423662678721	0.088148079887	5.88108228448e-14	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	4.92834695439e-11	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr10:17428870..17428984,+__116.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr10:17428870..17428984,+__116.1.0.0	rs436299	3.754066533872989	4.154373997907797	3.5412351785560445	3.225833521456924	3.7266900932121385	3.745631779848909	3.4861576345791327	3.853173318930946	3.784205619380536	3.8020625161691854	3.875948398235837	3.881891585768473	3.7359391814932423	3.772093646002912	4.136528422573964	3.401644007984859	3.112953372202119	3.772923749831279	3.7784105636834795	3.456775467019047	4.0374885985200235	3.87694344678854	3.8461801802489486	3.782056555011124	3.8808852537810288	3.737906938637277	0.01802711212992314	-0.017845575333833352	-0.13959117057118542	-0.11288014925480505	0.04623365661914036	0.03277878383457056	-0.029382167560085826	0.18431527958907745	0.0927378274080044	0.04411766407976314	-0.09389184322471289	-0.0010063319874440424	0.001967757144034373	1.0	0.563691144959	0.452098798395	0.436112310787	0.30750859871	0.978575937473	0.829896383209	0.957167318493	0.914457985151	0.914457985151	0.563691144959	0.967868733231	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr10:17428870..17428984,+__116.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr10:17428870..17428984,+__116.1.0.0	rs366032	3.754066533872989	4.154373997907797	3.5412351785560445	3.225833521456924	3.7266900932121385	3.745631779848909	3.4861576345791327	3.853173318930946	3.784205619380536	3.8020625161691854	3.875948398235837	3.881891585768473	3.7359391814932423	3.6544923747045215	4.1514990413851045	3.433145168427356	3.0704880663166607	3.579218973101452	3.6356509429699004	3.4648703976885304	3.5585115729331065	3.7238925783473715	3.708140276968607	3.762775994497296	3.75468077339972	3.624780513394969	-0.09957415916846735	-0.002874956522692429	-0.10809001012868835	-0.15534545514026332	-0.14747112011068664	-0.1099808368790085	-0.0212872368906023	-0.29466174599783956	-0.06031304103316426	-0.09392223920057852	-0.11317240373854087	-0.12721081236875298	-0.11115866809827375	0.354199901149	0.545696106059	0.237368605078	0.242741268695	0.60051573606	0.519249062249	0.476688253492	0.162586850726	0.320413072024	0.444064484515	0.226876581559	0.162586850726	0.0851020001526	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr10:17428870..17428984,+__116.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr10:17428870..17428984,+__116.1.0.0	rs436299,rs366032	3.754066533872989	4.154373997907797	3.5412351785560445	3.225833521456924	3.7266900932121385	3.745631779848909	3.4861576345791327	3.853173318930946	3.784205619380536	3.8020625161691854	3.875948398235837	3.881891585768473	3.7359391814932423	3.7544903210848877	4.2065772912789345	3.512076950369817	3.2052443922595026	3.671164083189693	3.6880280861399775	3.4177636862570395	3.78434464602491	3.7694216206877003	3.7837695906455444	3.8384835924475595	3.7986073808596554	3.702497636770435	0.0004237872118988406	0.052203293371137605	-0.029158228186227486	-0.020589129197421396	-0.055526010022445504	-0.05760369370893148	-0.06839394832209322	-0.06882867290603611	-0.014783998692835532	-0.018292925523641035	-0.03746480578827738	-0.08328420490881738	-0.033441544722807505	0.727009731456	0.8931878581	0.436112310787	0.572794651112	0.752350373358	0.545696106059	0.428242856315	0.204483664188	0.60051573606	0.527990680582	0.757455001208	0.375513989452	0.752699242244	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr10:20017419..20017533,-__117.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr10:20017419..20017533,-__117.1.0.0	rs74536920	-1.4641234936446965	-1.0357881747076565	-1.3897545974657546	-1.6060520874857778	-1.2082129825794439	-1.557714487889001	-1.354728937506797	-1.5792657761489803	-0.8316042916462916	-1.4789596475366185	-1.8800009433178153	-1.6512669425244688	-1.419789363537775	-1.178617250802516	-1.5158455407762035	-1.3724834979489808	-1.3412671709098036	-1.2042405761884405	-1.2776463255277768	-1.2129367241932836	-1.5980645323671754	-1.1638811630415136	-1.3377988290016465	-1.3200621352763615	-1.5095624477642415	-1.3360338494831618	0.2855062428421806	-0.480057366068547	0.017271099516773747	0.26478491657597414	0.00397240639100338	0.2800681623612242	0.14179221331351344	-0.018798756218195045	-0.332276871395222	0.14116081853497198	0.5599388080414538	0.14170449476022728	0.08375551405461322	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr10:28821597..28821711,-__118.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr10:28821597..28821711,-__118.1.0.0	rs149864425	-0.028283454383874657	-0.6673278228689759	0.175379167176288	-0.7811359360632893	-2.161382190521585	-0.6283413224508445	-0.5653909103178114	-0.7554423520118089	-0.7813355569180788	-0.2472099895628073	-0.8318286013913052	-1.1497876626655645	-0.7018405526649715	0.2021197261274424	-0.7136428665808086	0.4376888676172211	0.3052252595552477	-0.5689384233389102	-0.33760210887633957	-0.7452648237222518	0.028598496040862436	0.6908737530854985	-0.1971974886668424	0.12963389555325694	-0.37614163926270094	-0.09538727937236036	0.23040318051131706	-0.046315043711832704	0.2623097004409331	1.086361195618537	1.5924437671826746	0.29073921357450494	-0.17987391340444037	0.7840408480526713	1.4722093100035774	0.0500125008959649	0.9614624969445622	0.7736460234028636	0.6064532732926112	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr10:29698406..29698520,+__119.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr10:29698406..29698520,+__119.1.0.0	rs7921051	1.5019471727111635	1.7641600018341184	1.5111221365318526	1.4776499228326896	1.6309693519684123	1.6980380011711949	1.5865894402722158	1.93488286982781	1.8776005528419308	1.782344069348694	1.7550988738960969	1.9276873281993452	1.7040074767862936	2.1882888510526373	2.4149178095250297	1.9960379934265144	2.0103895736334696	2.1031818663559703	2.2108364668918803	2.3232009362336887	2.452984479307492	2.366814944491815	2.253732735980416	2.401626249229544	2.3755142896393195	2.2581271829806484	0.6863416783414737	0.6507578076909113	0.4849158568946619	0.53273965080078	0.47221251438755796	0.5127984657206854	0.7366114959614729	0.5181016094796822	0.48921439164988434	0.47138866663172196	0.6465273753334471	0.44782696143997436	0.5541197061943545	0.00183860515565	0.00372847011721	0.00544559218276	0.0249397487324	0.0468981580933	0.00078853414695	0.0134887989876	0.0162407194134	0.0216734048733	0.000320085853942	0.00406065558642	0.0181189115857	9.37867296706e-18	1	1	1	1	1	0.60244008827	1	1	1	0.251267395344	1	1	7.8593279464e-15	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr10:29698426..29698540,+__120.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr10:29698426..29698540,+__120.1.0.0	rs7921051	1.8211951315056245	2.2906453916606067	1.8172787799118468	1.6058542941553042	1.96429980922098	2.0129099782678392	2.1410499814075927	2.0258829595658683	2.0887497863751885	2.061301515037356	1.9212788413770487	2.204938807866009	1.9962821063626055	2.107216230023955	2.3956328694912212	2.055212248089954	1.9939698113196704	2.137329891633345	2.192026674465984	2.2292008404810586	2.5558375754875104	2.398556566112628	2.3786867854728806	2.394947891635965	2.57675081422731	2.28461401653679	0.2860210985183307	0.10498747783061457	0.23793346817810712	0.3881155171643662	0.17303008241236517	0.17911669619814496	0.08815085907346587	0.5299546159216422	0.30980677973743953	0.31738527043552445	0.4736690502589165	0.3718120063613011	0.28833191017418486	0.279742372288	0.313917214294	0.591208103411	0.696989544957	0.253741740693	0.468411351413	0.619326784864	0.0107365258413	0.0719809426143	0.0638899216795	0.088148079887	0.13967914143	0.00719501000321	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr10:29698438..29698552,+__121.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr10:29698438..29698552,+__121.1.0.0	rs7921051	-0.11086515922034346	0.1987396358489916	0.044974474780792056	-0.09632376029813022	-0.011714992435617497	0.1318610821487096	0.2817914456386041	0.11067179066981837	0.39359702530018653	0.12807182206332862	0.3254187088537977	0.9645508525730648	0.19673107716026683	0.4809629007020195	0.6675051132671852	0.2517083071152271	0.48110132589631105	0.8385990354162673	0.6741814887711001	0.8238720852612024	0.8564632222131887	0.518655044167678	0.7680567570182499	0.5191020743820804	0.6297076030239616	0.6258262464362059	0.591828059922363	0.46876547741819363	0.20673383233443507	0.5774250861944412	0.8503140278518848	0.5423204066223904	0.5420806396225983	0.7457914315433704	0.12505801886749152	0.6399849349549214	0.19368336552828275	-0.3348432495491033	0.4290951692759391	0.420446026331	0.638386621154	0.572794651112	0.428242856315	0.354199901149	0.957167318493	0.237368605078	0.925117039075	0.221751122162	0.696989544957	0.809021331888	0.361218104761	0.764302196113	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr10:29698438..29698552,+__121.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr10:29698438..29698552,+__121.1.0.0	rs34503423	-0.11086515922034346	0.1987396358489916	0.044974474780792056	-0.09632376029813022	-0.011714992435617497	0.1318610821487096	0.2817914456386041	0.11067179066981837	0.39359702530018653	0.12807182206332862	0.3254187088537977	0.9645508525730648	0.19673107716026683	-0.23121359279222786	0.2766080157620331	0.19238491719918185	0.05994074545759478	0.19350676220116364	0.19583561819972428	0.4149054953788307	0.32621518859417054	-0.15642230416839192	0.5633175179967733	0.471503365888729	0.543477234963804	0.23750491372344876	-0.1203484335718844	0.07786837991304149	0.1474104424183898	0.156264505755725	0.20522175463678113	0.06397453605101469	0.13311404974022661	0.21554339792435218	-0.5500193294685785	0.4352456959334447	0.1460846570349313	-0.4210736176092609	0.04077383656318192	0.313906135344	0.716947450805	0.677233097055	0.925117039075	0.840380101088	0.444054053353	0.8931878581	0.914457985151	0.150801701171	0.448066215252	0.747262025795	0.978575937473	0.978114246008	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr10:29698438..29698552,+__121.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr10:29698438..29698552,+__121.1.0.0	rs7921051,rs34503423	-0.11086515922034346	0.1987396358489916	0.044974474780792056	-0.09632376029813022	-0.011714992435617497	0.1318610821487096	0.2817914456386041	0.11067179066981837	0.39359702530018653	0.12807182206332862	0.3254187088537977	0.9645508525730648	0.19673107716026683	0.1519856949670737	0.3520320236718427	0.2127559843456329	0.07459844673825643	0.09174007204468683	0.3037302021810669	0.5246837520849115	0.08564258574134148	0.3620999221817765	0.2547844625088865	0.4734254686220979	0.2890542807134503	0.2647110746500853	0.26285085418741716	0.15329238782285112	0.16778150956484084	0.17092220703638666	0.10345506448030432	0.1718691200323573	0.24289230644630738	-0.025029204928476892	-0.03149710311841003	0.12671264044555786	0.1480067597683002	-0.6754965718596145	0.06797999748981845	0.667429334947	0.95716535904	0.405136064622	0.436112310787	0.361218104761	0.320407532564	0.79863356553	0.104229562843	0.197395731844	0.536806685117	0.85089220831	0.0484054419273	0.400735457256	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr10:4285846..4285960,-__124.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr10:4285846..4285960,-__124.1.0.0	rs10795144	-1.498637590131822	-1.3480911221655865	-1.4265715725978834	-1.4159745978269105	-1.6657719422685362	-1.7288056205691902	-1.7555761346737586	-1.7264504506308762	-1.5758561104238615	-1.8154467629621744	-1.5872007096018312	-1.6371673679772352	-1.5984624984858053	-1.6852282025224938	-1.4033436877677838	-1.6504843199979338	-1.397594491862027	-1.4435585026285618	-1.5996200749662988	-1.4489027164496784	-1.6046610662532144	-1.9647669630046547	-1.5953268405660734	-1.559430443572862	-1.9290220925997843	-1.606828283515947	-0.18659061239067176	-0.05525256560219738	-0.2239127474000504	0.018380105964883375	0.22221343963997442	0.12918554560289142	0.30667341822408023	0.12178938437766185	-0.38891085258079316	0.220119922396101	0.02777026602896915	-0.29185472462254913	-0.0083657850301417	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr10:43915994..43916108,+__127.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr10:43915994..43916108,+__127.1.0.0	rs2248933	-1.5514757548637672	-0.9199533583141049	0.3786486638721178	-0.3900211186432009	-0.07830184414043083	-1.029337639614062	-0.22478372027574794	-0.6346957325731291	0.5759261241289811	-0.7903181324320708	0.5232598480274472	-1.4957690919523987	-0.4697351463983639	0.8354358223087379	1.3295245022012634		-0.5753080839962781		-0.44564195537701146	1.6663004862324267	-0.9524035473364032	0.7333951571788008	0.5973018207506536		2.9235683839651188	0.6791302873252564	2.386911577172505	2.249477860515368		-0.1852869653530772		0.5836956842370506	1.8910842065081745	-0.31770781476327414	0.15746903304981963	1.3876199531827245		4.4193374759175175	1.3969556678296453	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr10:43915994..43916108,+__127.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr10:43915994..43916108,+__127.1.0.0	rs2248931	-1.5514757548637672	-0.9199533583141049	0.3786486638721178	-0.3900211186432009	-0.07830184414043083	-1.029337639614062	-0.22478372027574794	-0.6346957325731291	0.5759261241289811	-0.7903181324320708	0.5232598480274472	-1.4957690919523987	-0.4697351463983639	-0.8032333745906994	-0.4681045273903188	-0.931372135651352	1.056724082523355	-1.6414481152952327	0.1042178335751876	0.11388718057148199	-1.36959805407946	-0.5612153764381552	-0.5130417475588583	1.7141321549970283	-0.2154980300830628	-0.2928791757850073	0.7482423802730678	0.451848830923786	-1.3100207995234698	1.4467452011665558	-1.5631462711548019	1.1335554731892497	0.33867090084722995	-0.7349023215063308	-1.1371415005671364	0.2772763848732125	1.190872306969581	1.2802710618693358	0.17685597061335664	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr10:43915994..43916108,+__127.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr10:43915994..43916108,+__127.1.0.0	rs2248933,rs2248931	-1.5514757548637672	-0.9199533583141049	0.3786486638721178	-0.3900211186432009	-0.07830184414043083	-1.029337639614062	-0.22478372027574794	-0.6346957325731291	0.5759261241289811	-0.7903181324320708	0.5232598480274472	-1.4957690919523987	-0.4697351463983639																											NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr10:54515153..54515267,-__130.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr10:54515153..54515267,-__130.1.0.0	rs2120130	-1.480271063141252	-1.5288674625091754	-1.31155567360119	-1.4184853232863892	-1.9737112346158967	-1.50313449673022	-1.8376387210050145	-1.2315806680930326	-1.4331620370934761	-1.2340116011624447	-1.3476967897634058	-0.9743651068263418	-1.4395400148189867	-1.4427567047969303	-1.2259125741287187	-1.542975485443292	-1.2526394660398672	-1.295759267412989	-1.0679986126102958	-1.6969538924654184	-1.15620208349244	-1.5933737602894869	-1.2496154101416321	-1.6067198540098158	-1.4003254980033701	-1.3776027174028547	0.0375143583443216	0.3029548883804567	-0.23141981184210203	0.165845857246522	0.6779519672029077	0.4351358841199242	0.14068482853959607	0.07537858460059255	-0.16021172319601074	-0.01560380897918745	-0.25902306424641	-0.42596039117702833	0.06193729741613186	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr10:5987842..5987956,-__131.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr10:5987842..5987956,-__131.1.0.0	rs3750661	0.7012449666664377	1.1201360741194604	0.7376694985033242	0.46821537965648996	0.8704824025410254	0.4792727684921962	0.22179891564227489	0.7178406414892344	0.6869627829684792	0.7391421748672089	0.6215436549139914	0.6418982762672634	0.6671839613439489	-0.31162439747653553	-0.021526466926977555	-0.1285673520108267	-0.08675482029598597	0.008742258841869271	0.06980245788653597	-0.4222762001142315	-0.4487006014191506	-0.14404993701333155	0.058470665573529125	-0.3100624068966979	0.31058660041981945	-0.11883001661933194	-1.0128693641429731	-1.1416625410464378	-0.8662368505141509	-0.5549701999524759	-0.8617401436991561	-0.4094703106056602	-0.6440751157565063	-1.166541242908385	-0.8310127199818108	-0.6806715092936798	-0.9316060618106894	-0.3313116758474439	-0.7860139779632808	0.00849533044186	2.4119143758e-05	0.0426112802219	0.326996172605	4.21654944787e-05	0.0808891792923	0.0523498070189	0.00313710581496	0.0103298859694	0.00695778717972	0.0115927323179	0.0601351299193	4.03079989545e-15	1	0.017944642956	1	1	0.0325517617375	1	1	1	1	1	1	1	3.37781031238e-12	not sig	sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr10:5987842..5987956,-__131.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr10:5987842..5987956,-__131.1.0.0	rs3750660,rs3750661	0.7012449666664377	1.1201360741194604	0.7376694985033242	0.46821537965648996	0.8704824025410254	0.4792727684921962	0.22179891564227489	0.7178406414892344	0.6869627829684792	0.7391421748672089	0.6215436549139914	0.6418982762672634	0.6671839613439489	-0.41282029276800736	0.13915939497594085	-0.4781063014978401	-0.33940885191852876	0.01776809221094583	-0.023213138845741072	-0.0783249771402415	-0.31793252011296097	0.13332978142630492	-0.31917296274584844	0.09276934708129017	-0.18871865809542188	-0.14788925728584237	-1.1140652594344451	-0.9809766791435195	-1.2157758000011643	-0.8076242315750187	-0.8527143103300796	-0.5024859073379373	-0.3001238927825164	-1.0357731616021955	-0.5536330015421743	-1.0583151376130573	-0.5287743078327013	-0.8306169343626852	-0.8150732186297914	3.14895644184e-05	8.8142435835e-06	0.00641629102443	0.00567496309713	0.00192430688789	0.00313710581496	0.0785847853765	0.000129852144011	0.0187859264625	0.000129852144011	0.0224529881577	0.00251850159852	1.00127067859e-23	0.00610897549718	0.00178047720387	1	1	0.394482912018	0.630558268807	1	0.0253211680821	1	0.0270092459543	1	0.518811329295	2.27288444039e-21	sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr10:60759312..60759426,+__132.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr10:60759312..60759426,+__132.1.0.0	rs115644100	-0.7360500423530834	-1.298858168071221	-1.2172801548170906	-1.4487033883646003	-1.3266745148333088	-1.2847164810770422	-1.1334683288177414	-1.0889630563472175	-1.3049896617902552	-1.7703907850156217	-1.2612295175516204	-1.4558664815984708	-1.2772658817197726	-0.9933860412875125	-1.0046559599376375	-1.0194451856268687	-1.386038835421537	-1.1108453552441135	-1.2698859979208512	-0.9883696819842772	-1.1931207477540189	-1.2641030907065844	-0.8623819076053272	-1.3433232972806437	-1.0920128027035254	-1.1272974086227416	-0.25733599893442916	0.29420220813358355	0.19783496919022192	0.06266455294306339	0.21582915958919524	0.014830483156190954	0.14509864683346418	-0.10415769140680142	0.040886571083670775	0.9080088774102946	-0.08209377972902332	0.36385367889494535	0.14996847309703135	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr10:60759312..60759426,+__132.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr10:60759312..60759426,+__132.1.0.0	rs1212019	-0.7360500423530834	-1.298858168071221	-1.2172801548170906	-1.4487033883646003	-1.3266745148333088	-1.2847164810770422	-1.1334683288177414	-1.0889630563472175	-1.3049896617902552	-1.7703907850156217	-1.2612295175516204	-1.4558664815984708	-1.2772658817197726	-1.7908300822940006	-1.4149682257515892	-1.3147131807927694	-1.5396964952690704	-1.478538192623247	-1.2357500955731002	-1.4714184557912555	-0.8151591667466679	-1.1593012998991201	-1.5173749155889222	-1.6383468459127568	-1.340792374330656	-1.3930741108810965	-1.0547800399409173	-0.1161100576803682	-0.09743302597567882	-0.09099310690447004	-0.15186367778993826	0.048966385503941945	-0.3379501269735141	0.2738038896005496	0.1456883618911351	0.2530158694266995	-0.37711732836113643	0.11507410726781475	-0.11580822916132354	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr10:60759312..60759426,+__132.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr10:60759312..60759426,+__132.1.0.0	rs115644100,rs1212019,rs12260856	-0.7360500423530834	-1.298858168071221	-1.2172801548170906	-1.4487033883646003	-1.3266745148333088	-1.2847164810770422	-1.1334683288177414	-1.0889630563472175	-1.3049896617902552	-1.7703907850156217	-1.2612295175516204	-1.4558664815984708	-1.2772658817197726	-1.4043630654596777	-1.3579611095748787	-1.284284200729622	-1.6353756624241298	-1.6116246631053504	-1.2932687216279677	-1.2350640775082156	-1.3822417724103877	-1.4546804415456245	-1.4940133271339524	-1.3243732338047098	-1.336627983707813	-1.4011565215860273	-0.6683130231065944	-0.05910294150365769	-0.0670040459125314	-0.18667227405952946	-0.28495014827204157	-0.008552240550925516	-0.10159574869047416	-0.29327871606317024	-0.14969077975536926	0.27637745788166934	-0.06314371625308945	0.11923849789065777	-0.12389063986625466	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr10:80008510..80008624,+__139.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr10:80008510..80008624,+__139.1.0.0	rs74140983	-1.3806064392274284	-1.5102499671419367	-1.5018116688900989	-1.801596031971029	-1.9066555551776183	-2.078039104130068	-1.7129250721322975	-1.6390808019818135	-1.6066555979044004	-1.9268904398467344	-1.8186702196088347	-1.6456013812859975	-1.710731856608188	-1.7053259931856015	-1.8679232311698404	-1.6423193374639882	-1.814150662112644	-1.7663726992829147	-1.5779411909395353	-1.6664718088768495	-1.981794411043988	-1.6963609933743526	-1.8370739980482933	-2.002635676998641	-1.9417573026841888	-1.7916772754317363	-0.3247195539581731	-0.35767326402790367	-0.1405076685738893	-0.012554630141615064	0.14028285589470357	0.5000979131905328	0.04645326325544796	-0.3427136090621745	-0.08970539546995226	0.08981644179844106	-0.1839654573898062	-0.29615592139819125	-0.08094541882354833	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr10:89102065..89102179,-__141.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr10:89102065..89102179,-__141.1.0.0	rs61858506	0.6244118928450116	0.8200780751897704	-0.10981743276856962	-0.004206348604386474	0.03221531246317472	0.2817358624278849	0.4986606427421292	0.09017060254567744	-0.07075868829558668	-0.04904017512492458	0.7237934775495777	0.10311787291038291	0.24503009115667843	0.5108584892492308	0.9777593676859317	0.19207144435156337	0.8623556712834677	0.0951169715068809	0.3120282739785218	0.8993607764844085	0.07677396717451401	0.5252288152112609	-0.1244439218373888	0.36943762842033023	-0.1074212654608382	0.3824271848373235	-0.11355340359578081	0.15768129249616136	0.301888877120133	0.8665620198878542	0.06290165904370619	0.03029241155063689	0.4007001337422793	-0.013396635371163423	0.5959875035068476	-0.07540374671246422	-0.35435584912924745	-0.21053913837122112	0.13739709368064515	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr10:97667530..97667644,-__146.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr10:97667530..97667644,-__146.1.0.0	rs41291578	-1.0363876487293049	-1.3409964558865821	-1.1034039082432694	-1.546904472947909	-1.3484677871325197	-1.4151259663591818	-1.1809371979892995	-1.1823429717145366	-1.4604684116274842	-1.5992364227496985	-1.2973783600340416	-1.2411593735224795	-1.3127340814113588	-2.0042829762684593	-1.4198136988969798	-1.821474366590638	-1.6162263092992155	-1.3897246853946388	-1.476874620436723	-1.3850084030694354	-1.452369832990159	-1.32484638463665	-1.5780926258783574	-1.7082930024995433	-1.436509872673338	-1.5511263982195114	-0.9678953275391544	-0.07881724301039772	-0.7180704583473687	-0.06932183635130662	-0.04125689826211909	-0.061748654077541154	-0.20407120508013588	-0.2700268612756225	0.13562202699083414	0.021143796871341047	-0.4109146424655017	-0.19535049915085856	-0.23839231680815262	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr10:97667625..97667739,-__147.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr10:97667625..97667739,-__147.1.0.0	rs7906654	0.6590420158303705	0.633677275545328	-0.2023751367244671	0.1337003500174071	-0.5664807026315752	-0.028283454383874657	-0.2274735364663036	-0.08941827513572548	-0.33142048282709	-0.11185513788721724	0.10396087484628516	-0.2379729325080642	-0.022074928527077226	0.6872520522928872	0.2503645215929178	1.4902296365992702	-0.3841583139172713	-0.4235730325840819	0.08512567035745237	0.4750442988997801	-0.4404709425235882	-0.11967383575750301	0.873248614741018	0.5766094113385164	0.24365680851397833	0.27613790746278133	0.02821003646251674	-0.38331275395241027	1.6926047733237373	-0.5178586639346784	0.14290767004749333	0.11340912474132703	0.7025178353660837	-0.3510526673878627	0.211746647069587	0.9851037526282352	0.47264853649223126	0.48162974102204253	0.2982128359898586	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr10:97889399..97889513,+__149.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr10:97889399..97889513,+__149.1.0.0	rs4917721	0.3094508277415962	0.603503513134805	0.17768283551975095	0.5069592628374836	0.3866296672426624	0.654050165960486	0.6140256722193405	0.6894161821581946	0.5583216262290753	0.5527154081344667	0.5667545776862137	0.7912891579904895	0.534233241404547	0.5572828046161732	0.7592286469213462	0.7316151961718163	0.7044703700708848	0.6081943174116252	0.5676712560569617	0.6727648137732573	1.0842571786441138	0.7647191138894319	0.7212497158491566	0.8790601758754293	0.8515114689930261	0.7418354215227684	0.24783197687457698	0.15572513378654118	0.5539323606520653	0.19751110723340115	0.22156465016896282	-0.08637890990352437	0.058739141553916796	0.3948409964859192	0.2063974876603566	0.1685343077146899	0.31230559818921555	0.06022231100253661	0.20760218011822149	0.30750859871	0.158583637061	0.192768091005	0.468390984235	0.107123399254	0.420456664513	0.460214637573	0.0142664447502	0.0719809426143	0.113101776132	0.129198935732	0.420451345493	0.00164013518675	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr10:97889733..97889847,+__150.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr10:97889733..97889847,+__150.1.0.0	rs115366378	2.569127071045738	2.8080652717341437	2.3996771974821742	2.278532895675899	2.5881678726616224	2.5391050622604383	2.411127156455163	2.625183295682932	2.5652994560051763	2.695564776725696	2.607234182425863	2.66533517183926	2.5627016174995094	2.1807114145855753	2.5204652575982784	2.2966014066818277	2.2984312432133294	2.4151892735048097	2.3707628907712404	2.261793886675666	2.4753992918577046	2.57070938147618	2.5986373793533826	2.5413257714333577	2.48130686522177	2.417611171864427	-0.38841565646016285	-0.2876000141358652	-0.10307579080034657	0.01989834753743036	-0.17297859915681268	-0.16834217148919794	-0.1493332697794969	-0.1497840038252276	0.005409925471003607	-0.09692739737231326	-0.06590841099250522	-0.18402830661749014	-0.14509044563508203	0.188220673538	0.132622250874	0.493479697885	0.609889042629	0.265084565602	0.162586850726	0.777966336216	0.147021540231	0.85089220831	0.572794651112	0.609889042629	0.226876581559	0.203055236082	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr11:118868677..118868791,-__157.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr11:118868677..118868791,-__157.1.0.0	rs76726894	1.6349004068928183	1.6906065744412049	1.618279637911224	1.5994467790716789	1.6976214408739692	1.764913442819939	1.554400410527012	1.8143911916171074	1.8119520721829971	1.7873264496373082	1.7275258716004986	1.587136708909857	1.690708415540468	1.799649784280411	1.2999695689511637	1.5479876387953986	1.264252443459596	1.5694503867448377	1.3205734911682252	1.3591091252600738	1.5578999773602706	1.6672748371980486	1.6619509962698935	1.561229994446637	1.721795102725595	1.5275952788883458	0.16474937738759254	-0.3906370054900412	-0.07029199911582551	-0.3351943356120828	-0.12817105412913143	-0.4443399516517137	-0.19529128526693817	-0.25649121425683674	-0.14467723498494856	-0.12537545336741474	-0.16629587715386163	0.1346583938157382	-0.163113136652122	0.619326784864	0.253741740693	0.677233097055	0.545696106059	0.468411351413	0.0258200569765	0.957167318493	0.840380101088	0.788281320858	0.706946403854	0.628827692687	0.340423946445	0.734243281801	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr11:118868677..118868791,-__157.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr11:118868677..118868791,-__157.1.0.0	rs114037241	1.6349004068928183	1.6906065744412049	1.618279637911224	1.5994467790716789	1.6976214408739692	1.764913442819939	1.554400410527012	1.8143911916171074	1.8119520721829971	1.7873264496373082	1.7275258716004986	1.587136708909857	1.690708415540468	1.8232339584758848	2.433149192270442	2.197061031047532	1.9614894439196888	2.2498766340253584	2.1463737317327163	2.033185503043798	2.1435772470061765	2.0882084423665885	1.95349463166648	1.9897181749093924	1.9621076802279445	2.0817896392243336	0.18833355158306642	0.7425426178292371	0.5787813931363077	0.36204266484800995	0.5522551931513893	0.3814602889127774	0.47878509251678625	0.3291860553890691	0.2762563701835914	0.16616818202917183	0.26219230330889376	0.37497097131808754	0.39108122368386566	0.147021540231	0.197395731844	0.0601351299193	0.119339994516	0.317148697424	0.29495293544	0.248198866138	0.347268461228	0.175053819161	0.301187193336	0.158583637061	0.0209174885683	0.000605651364696	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.507535843616	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr11:118868677..118868791,-__157.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr11:118868677..118868791,-__157.1.0.0	rs4445645	1.6349004068928183	1.6906065744412049	1.618279637911224	1.5994467790716789	1.6976214408739692	1.764913442819939	1.554400410527012	1.8143911916171074	1.8119520721829971	1.7873264496373082	1.7275258716004986	1.587136708909857	1.690708415540468	1.572217637714004	1.6194868795473365	1.3485307061544645	0.8468047776003224	1.6338096361692818	1.4149753213826346	1.2628123780027007	1.2551061382044857	1.4820398091008078	1.5304799672439848	1.1185329550862577	1.4898801403055562	1.3812230288759864	-0.06268276917881432	-0.07111969489386838	-0.2697489317567596	-0.7526420014713565	-0.06381180470468739	-0.3499381214373043	-0.2915880325243112	-0.5592850534126217	-0.32991226308218935	-0.2568464823933234	-0.6089929165142409	-0.09725656860430076	-0.30948538666448144	0.536806685117	0.301187193336	0.914457985151	0.101398170673	0.192768091005	0.0426112802219	0.21176555971	0.0741297894045	0.428242856315	0.29495293544	0.183752894264	0.935789553219	0.064125335963	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr11:118868677..118868791,-__157.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr11:118868677..118868791,-__157.1.0.0	rs76726894,rs114037241,rs4445645	1.6349004068928183	1.6906065744412049	1.618279637911224	1.5994467790716789	1.6976214408739692	1.764913442819939	1.554400410527012	1.8143911916171074	1.8119520721829971	1.7873264496373082	1.7275258716004986	1.587136708909857	1.690708415540468	1.9304279260375667	1.9495245829606391	1.6119472928089271	1.3388064536367708	2.098569886948656	1.7370427494698242	1.641749274230385	1.9360839031619568	1.6109997203388078	1.772108400974001	1.7190536192864696	1.9464190226979745	1.774394402712665	0.2955275191447484	0.25891800851943425	-0.006332345102296966	-0.2606403254349081	0.40094844607468705	-0.027870693350114717	0.08734886370337303	0.1216927115448494	-0.20095235184418936	-0.015218048663307338	-0.008472252314029038	0.3592823137881176	0.08368598717219701	0.00300328973882	0.0959193233604	0.00955750115232	0.989286880498	0.00342117348194	0.197395731844	0.132622250874	NA__not_enough_barcodes	0.202104162379	0.0258200569765	0.0224529881577	0.00919097005605	8.06868482549e-07	0.582638209331	1	1	1	0.701340563799	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	1	0.000183159145539	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr11:122073676..122073790,-__160.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr11:122073676..122073790,-__160.1.0.0	rs115833873	-0.3265335569508231	-0.852426379851178	-0.948817663508309	-0.7682295480121983	-0.8039826491054245	-1.6390898025055147	-0.07620898268494286	-1.2450213062363784	-1.5268194316366033	-1.1622910031922309	-0.7926128665879313	-0.7414546745964169	-0.9069573220723292	-1.322532968883098	-1.8732207773191687	-1.272261564220098	-1.4744831014700717	-1.8417248987231236	-1.2263172393271422	-1.5594117261177785	-1.247263182828484	-1.7818053134378755	-1.534115647003432	-1.6136489121993016	-1.5967880811453228	-1.528631117722908	-0.9959994119322749	-1.0207943974679907	-0.3234439007117891	-0.7062535534578733	-1.0377422496176991	0.4127725631783725	-1.4832027434328356	-0.0022418765921055073	-0.25498588180127224	-0.37182464381120117	-0.8210360456113703	-0.8553334065489059	-0.6216737956505788	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.000413457613232	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.000413457613232	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.305545176179	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.346477479889	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr11:122238640..122238754,-__163.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr11:122238640..122238754,-__163.1.0.0	rs115767300	-1.3980913094167964	-1.7191565134186686	-1.4942674770605182	-1.0487353808935753	-1.429377833693553	-1.5242490104850406	-1.852020819919384	-1.5131358777006283	-1.2091746036973146	-1.7453366395857781	-1.5110557036315035	-1.3552661762738996	-1.4833222788147218	-1.0418999145635486	-1.8787885569104419	-1.437174369916397	-0.9825115760290348	-1.7700954684022856	-1.7779453324050885	-1.6278319862771176	-1.4340264741895894	-1.7545346135122903	-1.5359655294975236	-1.6706611326063998	-1.9698005854223384	-1.5734362949776715	0.3561913948532478	-0.1596320434917733	0.05709310714412119	0.06622380486454049	-0.3407176347087326	-0.2536963219200479	0.22418883364226638	0.0791094035110389	-0.5453600098149758	0.2093711100882545	-0.15960542897489627	-0.6145344091484388	-0.09011401616294962	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr11:122293488..122293602,-__164.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr11:122293488..122293602,-__164.1.0.0	rs11218616	-0.6694940198119367	-1.363221893001758	-0.6206899098093109	-1.097714078419282	-0.27671751699689284	-1.2161848032739366	-0.699058490246651	-0.3255338139908817	-0.7813355569180788	-0.8071093243621643	-0.9519438243982388	-0.771559385465839	-0.7983802180579143	-0.6824087784569072	-1.5865536711381099	-0.570316572913683	-1.3894714792197853	-0.7952192183525257	-0.8757852892189713	-0.3742703573398949	-1.7590457589778925	-1.1914852094144115	-1.2347936909705706	-0.5269182742171834	-0.054346754316857426	-0.9200512545447328	-0.012914758644970492	-0.22333177813635197	0.05037333689562795	-0.2917574008005033	-0.5185017013556329	0.3403995140549654	0.3247881329067561	-1.4335119449870108	-0.41014965249633273	-0.42768436660840625	0.42502555018105537	0.7172126311489816	-0.1216710364868185	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr11:13011056..13011170,-__166.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr11:13011056..13011170,-__166.1.0.0	rs564268774	3.6471624306206314	4.113155210084247	3.4397822664071556	3.2541302748931917	3.735282020257521	3.744712582730018	3.76040397346005	4.101748812594077	3.9641257571745943	3.96366128675315	4.0893857404358	4.09580376267826	3.8257795098407246	3.571207031114872	4.124166483138805	3.3558711482045327	3.1024646321108307	3.5919174764327138	3.56068309783982	3.5968224286466883	4.053819469104845	3.804026901304154	3.7936654449746734	3.7761242737066127	3.8378758441584893	3.6807203525614196	-0.07595539950575958	0.011011273054558401	-0.08391111820262287	-0.15166564278236105	-0.14336454382480746	-0.184029484890198	-0.16358154481336173	-0.0479293434892325	-0.16009885587044037	-0.16999584177847682	-0.3132614667291871	-0.2579279185197709	-0.145059157279305	0.320413072024	0.989287003123	0.420456664513	0.202104162379	0.0906800339379	0.259370210024	0.0959193233604	0.320413072024	0.0306357720046	0.0386605553759	0.0115927323179	0.0362033618716	0.00104504207719	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.875745260689	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr11:2017351..2017465,-__170.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr11:2017351..2017465,-__170.1.0.0	rs3024270	-0.6077636336916065	-0.9872699296929116	-0.4922045490178898	-0.9676840252332077	-1.04446676595969	-0.9303616020115308	-0.6679137391559767	-0.9355265207798148	-0.9811299270032123	-0.7603284151379415	-1.064465765999795	-0.6897835256704514	-0.8440748666128357	-1.0947530879008958	-1.016666600614746	-1.4185371207250004	-1.2291086446516086	-1.1186228277795776	-1.1928390775202955	-1.045186577238257	-0.9793596893688108	-1.3624930989110218	-1.2680699278393956	-1.060658547665505	-1.085715118150525	-1.1560008598638032	-0.4869894542092893	-0.0293966709218344	-0.9263325717071106	-0.2614246194184009	-0.07415606181988754	-0.26247747550876466	-0.3772728380822802	-0.043833168588996	-0.38136317190780944	-0.5077415127014542	0.0038072183342898747	-0.3959315924800735	-0.31192599325096754	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr11:2017351..2017465,-__170.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr11:2017351..2017465,-__170.1.0.0	rs3024270,rs3825028	-0.6077636336916065	-0.9872699296929116	-0.4922045490178898	-0.9676840252332077	-1.04446676595969	-0.9303616020115308	-0.6679137391559767	-0.9355265207798148	-0.9811299270032123	-0.7603284151379415	-1.064465765999795	-0.6897835256704514	-0.8440748666128357	-1.2157876303723243	-1.0639741164748688	-1.1718691635445386	-1.0384307168068707	-0.9058571890910552	-0.9879665344047861	-1.1606612864914088	-1.0387938883454988	-1.2224334818777585	-0.9052246325303572	-0.7824861426461185	-1.1814302213909271	-1.0562429169980427	-0.6080239966807178	-0.07670418678195723	-0.6796646145266488	-0.07074669157366298	0.13860957686863484	-0.05760493239325526	-0.492747547335432	-0.103267367565684	-0.24130355487454613	-0.14489621739241576	0.28197962335367643	-0.4916466957204757	-0.21216805038520706	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr11:2018415..2018529,-__171.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr11:2018415..2018529,-__171.1.0.0	rs2075744	-1.001646251351636	-1.4304186372578036	-1.9173583071943432	-0.9908834646629322	-1.3132800077812417	-1.61884718964339	-1.3797659348663571	-0.8941261887214069	-1.2902435352088544	-1.2806757673923697	-1.018637824141761	-1.4681916638576578	-1.3003395643399795	-1.1808529252783695	-1.1860832232868013	-1.0716787245100663	-1.1078205890007429	-1.2769327781344733	-1.3325231146515102	-1.337583038874599	-1.5324473112113273	-1.2131204679441343	-1.3012257235229254	-1.0905013436387072	-1.4564447100934634	-1.2572678291789268	-0.1792066739267335	0.24433541397100234	0.8456795826842769	-0.11693712433781067	0.0363472296467684	0.28632407499187984	0.04218289599175806	-0.6383211224899203	0.07712306726472007	-0.02054995613055577	-0.07186351949694614	0.011746953764194323	0.04307173516105279	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr11:2399192..2399306,-__174.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr11:2399192..2399306,-__174.1.0.0	rs186652218	1.2830189021390241	1.2776703912602225	0.9302088983910766	1.3302031009561066	1.3780229495734992	1.1425103690700509	1.0330582765946152	0.4933308548245421	0.915488172098688	0.6798683600586233	1.4061856343907881	0.9067187281096266	1.0646903864555721	1.6049853209321658	1.7607466018643199	1.6561189352378407	1.9026734342860243	0.8114153803972637	1.4817659052168644	1.42650464958006	1.2421061430225866	0.9956762347781449	1.431197245174983	1.5893709148225168	1.2276398395651413	1.4275167170731595	0.3219664187931417	0.48307621060409733	0.7259100368467641	0.5724703333299177	-0.5666075691762356	0.3392555361468135	0.3934463729854447	0.7487752881980445	0.08018806267945688	0.7513288851163598	0.18318528043172866	0.3209211114555147	0.36282633061758723	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr11:27528316..27528430,+__175.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr11:27528316..27528430,+__175.1.0.0	rs2242341	3.8190271501834845	4.087235490900731	3.676214356524862	3.3288438444016832	3.787933033844239	3.703717706194703	3.446089684643726	3.950840009753979	3.811120969993296	3.784650632549769	3.782710677287607	3.937167330237134	3.759629240542934	3.806319658812245	4.170332328991344	3.7329563479483183	3.320220477853008	3.854044712467625	3.7848429626374425	3.5087279752639584	3.8825815460771462	3.888441395152909	3.905101935923888	3.8008744209794303	3.8868617470588607	3.795108792430515	-0.012707491371239499	0.0830968380906123	0.05674199142345637	-0.00862336654867546	0.06611167862338574	0.0811252564427396	0.06263829062023252	-0.06825846367683264	0.07732042515961268	0.1204513033741188	0.018163743691823164	-0.050305583178273494	0.03547955188758001	0.696989544957	0.428242856315	0.79863356553	0.76769033028	0.397602565759	0.188220673538	0.609889042629	0.354199901149	0.226876581559	0.150801701171	0.591208103411	0.572794651112	0.41946650834	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr11:47417123..47417237,-__178.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr11:47417123..47417237,-__178.1.0.0	rs10769263	-1.6678039990515323	-1.5054994997925863	-1.1218011765151525	-1.0442679635814305	-1.2028808334069117	-1.4643282259298531	-1.7291262559734166	-0.9761851316985903	-1.4862211910539331	-1.7049055953152197	-1.6427120230744567	-1.321021200943227	-1.4055627580280259	-1.8480284324642104	-1.9189031476447052	-1.5666670632663124	-1.7867753866207885	-1.8124682029482744	-1.760404313157781	-1.3695192733410058	-1.6883432461730425	-1.705704727669493	-1.6920106990417807	-1.7594060785708727	-1.749135227966423	-1.7214471499053907	-0.18022443341267813	-0.4134036478521188	-0.4448658867511599	-0.742507423039358	-0.6095873695413627	-0.2960760872279278	0.35960698263241087	-0.7121581144744522	-0.21948353661555986	0.012894896273438983	-0.11669405549641598	-0.428114027023196	-0.315884391877365	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr11:62599683..62599797,+__181.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr11:62599683..62599797,+__181.1.0.0	rs2282538	-1.1296588771630682	-0.5266974706521572	-1.0207508021328346	-1.1498150222175485	-1.2655951856970042	-0.8609572050469271	-1.2270929236662695	-0.9820642872254182	-1.249775594642615	-0.9280188155268725	-1.158077331118376	-0.7605041731000971	-1.0215839740157657	-1.0467272868905533	-0.6780894359422271	-1.0383916787526535	-1.0757938307113846	-1.0150730827827263	-0.8415794810509546	-1.2697003712557153	-1.1011319803664352	-1.3725960694574189	-0.9652581026778364	-0.9113636402435707	-0.9612408926545551	-1.0230788210655026	0.08293159027251495	-0.15139196529006993	-0.017640876619818835	0.07402119150616393	0.2505221029142779	0.019377723995972485	-0.04260744758944579	-0.11906769314101706	-0.12282047481480385	-0.03723928715096392	0.24671369087480532	-0.20073671955445804	-0.0014948470497369026	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr11:62622910..62623024,-__186.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr11:62622910..62623024,-__186.1.0.0	rs11558674	-1.1528400241159886	-0.8278301726325791	-1.0591546568316987	-1.2967220104363575	-1.1866438230504397	-1.2855634040677446	-1.418427000689503	-1.3980441383536584	-0.8966865307213983	-0.8179784937413057	-1.2595965403816454	-1.1261430863013044	-1.1438024901103019	-1.480488179997414	-1.427382482951725	-1.5417496021905248	-1.479342636742694	-1.47827068953401	-1.4727930716533337	-1.2918114325924008	-1.523440618749056	-1.7152727973418065	-1.7580615036336709	-0.9183575504600404	-1.8201882218133605	-1.492263232305003	-0.3276481558814255	-0.5995523103191459	-0.4825949453588261	-0.18262062630633658	-0.2916268664835704	-0.18722966758558912	0.12661556809710217	-0.12539648039539752	-0.8185862666204082	-0.9400830098923652	0.34123898992160495	-0.694045135512056	-0.3484607421947012	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr11:62622910..62623024,-__186.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr11:62622910..62623024,-__186.1.0.0	rs11558674,rs2071035,rs2071034	-1.1528400241159886	-0.8278301726325791	-1.0591546568316987	-1.2967220104363575	-1.1866438230504397	-1.2855634040677446	-1.418427000689503	-1.3980441383536584	-0.8966865307213983	-0.8179784937413057	-1.2595965403816454	-1.1261430863013044	-1.1438024901103019	-1.489446025605867	-1.4899435555759195	-1.1675013680491793	-1.0388574026307735	-1.43764318383491	-1.036909082764089	-1.6928532562438183	-1.2602279000239862	-1.3119688390670055	-1.0540214151102054	-1.1752858211291108	-1.4036084818959065	-1.2965221943275642	-0.3366060014898784	-0.6621133829433404	-0.10834671121748052	0.25786460780558396	-0.25099936078447027	0.2486543213036556	-0.2744262555543153	0.13781623832967216	-0.4152823083456072	-0.2360429213688997	0.08431071925253453	-0.27746539559460204	-0.1527197042172623	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr11:64013348..64013462,+__188.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr11:64013348..64013462,+__188.1.0.0	rs11605738	0.8714910663740874	0.965862845655377	0.8228401900476345	0.7817765416033116	0.9750925821488419	1.0622562910549271	0.25267497489739477	0.3237106400017308	0.5704959025873663	0.664714556658094	0.7965889900416185	0.7731600134899362	0.7383887162133601	1.0601795318206306	1.1454132518432585	1.0835763475184756	0.9245931541183428	1.1103423223984277	1.1807826014472242	0.5507257660649375	0.32405955252961094	0.9270816964738924	0.9625951281143292	0.8838523369145427	0.8662463302918196	0.918287334961291	0.18868846544654327	0.17955040618788154	0.2607361574708411	0.1428166125150312	0.1352497402495858	0.11852631039229711	0.29805079116754274	0.000348912527880163	0.3565857938865261	0.29788057145623525	0.08726334687292414	0.0930863168018834	0.179898618747931	0.101398170673	0.0468981580933	0.122558611289	0.122558611289	0.147021540231	0.170821264488	0.0107365258413	0.727009731456	0.0174727290303	0.0440018610392	0.476683207768	0.0906800339379	2.1254265559e-05	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0178110745385	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr11:70244500..70244614,-__195.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr11:70244500..70244614,-__195.1.0.0	rs115719351	-0.2734306923979737	-0.012735295411812156	-0.35770877543077234	-0.007451748623939898	-0.751376489978648	-0.10787504936836496	-0.4638723353017526	0.30119786611306937	-0.0063460096176154515	-0.6548519482941728	-0.6286679560641965	-1.2757445800890517	-0.35323858453876916	0.9566606709137371	0.4336521107940895	-0.026524242926990127	-0.5641156866205772	-0.4328890892558295	-0.2825491746196498	-0.3675155448247039	-1.1990713748863087	-0.6540478246914186	0.8339854802734297	0.8633146021786908	0.4427343496259637	0.00030285633003610907	1.2300913633117108	0.44638740620590167	0.3311845325037822	-0.5566639379966373	0.31848740072281856	-0.17467412525128484	0.0963567904770487	-1.500269240999378	-0.6477018150738032	1.4888374285676025	1.4919825582428872	1.7184789297150154	0.35354144086880535	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr11:71159594..71159708,+__196.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr11:71159594..71159708,+__196.1.0.0	rs10450662	0.44303562917265055	0.17021018666793128	-0.13343807374671596	0.214896966271088	1.1271584192854527	0.008720702250566596	0.07065748129497573	0.1154412425363485	-0.05814404331147657	0.6503098306684266	0.5861555434050081	-0.17231817431236016	0.2518904758484913	0.3814492777757027	0.2291760948353815	0.6198336532850908	-1.048719337506294	0.7778427175887559	-0.6278316376043923	0.550992963148193	0.7753146201490555	0.9711130451098628	0.2511833162915699	-0.05445483015785569	0.3094421398512541	0.2612785018971937	-0.06158635139694785	0.05896590816745023	0.7532717270318068	-1.263616303777382	-0.3493157016966968	-0.636552339854959	0.4803354818532173	0.659873377612707	1.0292570884213394	-0.3991265143768567	-0.6406103735628638	0.4817603141636143	0.00938802604870242	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr11:77850722..77850836,+__199.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr11:77850722..77850836,+__199.1.0.0	rs615116	-0.0006896141257336877	0.06539621885624619	0.09224731037358172	-0.016208055205284115	-0.12014244341927051	0.2517083071152271	0.3176998031825224	0.11574634435547365	-0.07530275412632968	-0.003209418140901236	-0.05380796397570403	-0.09688594460611996	0.039712649190308986	-0.0027102383196654506	-0.346138655332946	-0.5898336673411658	-0.4876658427997638	-0.09456332815130336	-0.535150767768833	0.12217626795909403	0.23889850191791864	-0.31090712375918894	0.1413366418731091	-0.4447574166839324	-0.08004941866110793	-0.19911375392231545	-0.002020624193931763	-0.4115348741891922	-0.6820809777147475	-0.4714577875944797	0.025579115267967148	-0.78685907488406	-0.19552353522342836	0.12315215756244499	-0.23560436963285925	0.14454606001401032	-0.3909494527082284	0.016836525945012032	-0.2388264031126244	0.390154148302	0.326996172605	0.00522462344006	0.0115917793602	0.814225899608	0.00955750115232	0.0629305158311	0.793450583062	0.154655491485	0.420456664513	0.237368605078	0.375513989452	0.00200139160052	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr11:77850722..77850836,+__199.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr11:77850722..77850836,+__199.1.0.0	rs582266	-0.0006896141257336877	0.06539621885624619	0.09224731037358172	-0.016208055205284115	-0.12014244341927051	0.2517083071152271	0.3176998031825224	0.11574634435547365	-0.07530275412632968	-0.003209418140901236	-0.05380796397570403	-0.09688594460611996	0.039712649190308986	-0.4386842722443545	0.09021812741537316	0.17951766225348653	-0.06151837442131234	-0.05302853277267266	0.10228088006044812	-0.012477214162996334	0.12480313593848733	0.08441245268167336	-0.06158469926564152	-0.05095630328130394	0.20734692545897285	0.009194148971680001	-0.4379946581186208	0.02482190855912697	0.08727035187990481	-0.045310319216028225	0.06711391064659786	-0.14942742705477902	-0.33017701734551874	0.009056791583013674	0.15971520680800305	-0.05837528112474029	0.002851660694400092	0.3042328700650928	-0.030518500218628997	0.3303093589	0.563691144959	0.777966336216	0.444064484515	0.282745459933	0.935789553219	0.727009731456	0.978575937473	0.777966336216	0.405136064622	0.829894465792	0.967868733231	0.981820100533	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr11:77850722..77850836,+__199.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr11:77850722..77850836,+__199.1.0.0	rs2156785	-0.0006896141257336877	0.06539621885624619	0.09224731037358172	-0.016208055205284115	-0.12014244341927051	0.2517083071152271	0.3176998031825224	0.11574634435547365	-0.07530275412632968	-0.003209418140901236	-0.05380796397570403	-0.09688594460611996	0.039712649190308986	-0.4666675108070139	-0.2551515092333044	-0.6392131589822855	-0.4685899636741471	-0.25373429291862654	0.058151082390325376	-0.46686129325870984	-0.4461218142301835	-0.2634285721198849	0.12653038573240927	-0.11034406141585335	-0.1780171586944559	-0.2802873222676442	-0.4659778966812802	-0.32054772808955057	-0.7314604693558672	-0.452381908468863	-0.13359184949935604	-0.19355722472490175	-0.7845610964412322	-0.5618681585856571	-0.1881258179935552	0.1297398038733105	-0.05653609744014931	-0.08113121408833593	-0.31999997145795317	0.925117039075	0.957167318493	0.657696241675	NA__not_enough_barcodes	0.088148079887	0.397602565759	0.202104162379	0.572794651112	0.935789553219	0.320413072024	0.313917214294	0.253741740693	0.64227890857	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr11:77850722..77850836,+__199.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr11:77850722..77850836,+__199.1.0.0	rs615116,rs582266,rs2156785	-0.0006896141257336877	0.06539621885624619	0.09224731037358172	-0.016208055205284115	-0.12014244341927051	0.2517083071152271	0.3176998031825224	0.11574634435547365	-0.07530275412632968	-0.003209418140901236	-0.05380796397570403	-0.09688594460611996	0.039712649190308986	0.021352182312009	-0.02844404163066183	-0.330420903849903	-0.7759301228067317	-0.3815802000391316	-0.25847183836693394	0.045136228822457033	0.04574184240941679	-0.1544652339160311	0.19335666085311404	-0.1790304515712524	0.33080460383578625	-0.12266260616232187	0.022041796437742688	-0.09384026048690802	-0.4226682142234848	-0.7597220676014476	-0.26143775661986113	-0.5101801454821611	-0.27256357436006534	-0.07000450194605687	-0.07916247978970141	0.19656607899401526	-0.12522248759554838	0.42769054844190624	-0.16237525535263087	0.480851528886	0.476688253492	0.510582765025	0.619322774121	0.925117039075	0.405136064622	0.179364149792	0.282745459933	0.536806685117	0.957167318493	0.428242856315	0.577368064655	0.693989922717	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr11:77850775..77850889,+__200.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr11:77850775..77850889,+__200.1.0.0	rs615116	-0.7746460134055547	-0.6563337380995934	-0.9950096013797024	-0.7155130733141548	-0.8195042985208666	-0.5954811297512012	-0.4547601711764536	-0.7486381433447798	-0.6513504560665737	-0.31128211862448457	-0.7926972958282352	-0.6407792858703704	-0.6796662771151643	-0.6082569303094075	-0.9328168983969602	-0.5565880877675472	-0.5457392395406117	-0.625009191575723	-0.4832737100779279	-0.48613073448079025	-0.04574033608641676	-0.16724790873365455	-0.4687707946918527	-0.5509476405532481	-0.647644483872011	-0.5098471630071791	0.1663890830961472	-0.27648316029736686	0.4384215136121552	0.16977383377354316	0.1944951069451436	0.11220741967327325	-0.03137056330433663	0.702897807258363	0.48410254733291913	-0.1574886760673681	0.24174965527498715	-0.006865198001640649	0.16981911410798492	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0468956383984	0.368322877114	0.397602565759	0.687084607526	0.737113058664	0.102802176292	0.0531733827136	0.405136064622	0.154655491485	0.677233097055	0.0634568085973	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr11:77850775..77850889,+__200.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr11:77850775..77850889,+__200.1.0.0	rs582266	-0.7746460134055547	-0.6563337380995934	-0.9950096013797024	-0.7155130733141548	-0.8195042985208666	-0.5954811297512012	-0.4547601711764536	-0.7486381433447798	-0.6513504560665737	-0.31128211862448457	-0.7926972958282352	-0.6407792858703704	-0.6796662771151643	-0.7748637967749469	-0.3041267980249832	-0.5948548032950757	-0.5720423947403811	-0.44198370276829024	-0.46998657057425064	-0.7212908447006803	-0.6769828082331864	-0.32670543532028845	-0.23014491483784394	-0.3280371667677092	-0.4261485805612656	-0.4889306513832418	-0.00021778336939215492	0.3522069400746102	0.40015479808462673	0.1434706785737737	0.37752059575257635	0.12549455917695052	-0.26653067352422666	0.0716553351115935	0.32464502074628526	0.08113720378664063	0.464660129060526	0.21463070530910477	0.19073562573192238	NA__no_active_tile	0.242741268695	0.119335765104	0.591208103411	0.0741297894045	0.757455001208	0.66743649171	NA__no_active_tile	0.288805731951	0.914457985151	0.265084565602	0.221756412245	0.210735675122	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr11:77850775..77850889,+__200.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr11:77850775..77850889,+__200.1.0.0	rs2156785	-0.7746460134055547	-0.6563337380995934	-0.9950096013797024	-0.7155130733141548	-0.8195042985208666	-0.5954811297512012	-0.4547601711764536	-0.7486381433447798	-0.6513504560665737	-0.31128211862448457	-0.7926972958282352	-0.6407792858703704	-0.6796662771151643	-1.354728937506797	-0.8843620035147202	-0.9170932470321378	-1.0122956634181335	-1.4619159069868175	-0.7474366185526882	-1.2236910072021927	-1.411412111878809	-1.1346106819812185	-1.0264315674815263	-1.4028292054952667	-0.9029511844400637	-1.123313177957531	-0.5800829241012423	-0.22802826541512677	0.07791635434756461	-0.29678259010397867	-0.6424116084659509	-0.15195548880148702	-0.7689308360257391	-0.6627739685340291	-0.4832602259146448	-0.7151494488570418	-0.6101319096670315	-0.26217189856969336	-0.44364690084236674	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0499532058383	0.00883703695038	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00641629102443	0.0159437028439	0.202104162379	1.10632929885e-05	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	0.00927103952436	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr11:77850775..77850889,+__200.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr11:77850775..77850889,+__200.1.0.0	rs615116,rs582266,rs2156785	-0.7746460134055547	-0.6563337380995934	-0.9950096013797024	-0.7155130733141548	-0.8195042985208666	-0.5954811297512012	-0.4547601711764536	-0.7486381433447798	-0.6513504560665737	-0.31128211862448457	-0.7926972958282352	-0.6407792858703704	-0.6796662771151643	-1.354728937506797	-1.605319429872546	-1.2025230398989344	-1.0693187758932199	-1.2249639970225918	-1.4754082963122648	-1.0940315084518768	-1.0938413050135427	-1.0053510840648583	-1.3405607745916412	-1.081636171011107	-1.5667548505607112	-1.259536514183341	-0.5800829241012423	-0.9489856917729526	-0.20751343851923199	-0.3538057025790651	-0.40545969850172525	-0.8799271665610636	-0.6392713372754232	-0.34520316166876286	-0.3540006279982846	-1.0292786559671567	-0.28893887518287187	-0.9259755646903408	-0.5798702370681768	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00480682187369	0.0583274625199	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00240905380364	0.0638899216795	0.000617238254542	7.75979644109e-08	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.966171196611	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.501083191157	1	0.127151080436	1.76147379213e-05	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr11:9797133..9797247,+__205.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr11:9797133..9797247,+__205.1.0.0	rs4910501	-1.8813594606088926	-1.6182254185719276	-2.172601512992093	-2.0013949140503207	-1.997589774199961	-2.0204475493035523	-1.6900415077930806	-1.7987520318919037	-1.6932341470467498	-1.8353013168077903	-1.94032945875186	-1.896055698536604	-1.8787777325462278	-1.8293239239269972	-1.3661608463290076	-1.6950903447094139	-1.7436394325959743	-2.0050562175826956	-1.9758843726864384	-1.866470273320188	-1.2644780571723837	-1.9880296196991945	-1.4096078840253583	-1.7988920423182413	-1.8112501329438464	-1.7294902622758117	0.05203553668189542	0.25206457224292	0.47751116828267914	0.25775548145434635	-0.0074664433827345	0.04456317661711395	-0.1764287655271073	0.53427397471952	-0.29479547265244466	0.425693432782432	0.14143741643361873	0.08480556559275754	0.1492874702704164	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr11:9797133..9797247,+__205.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr11:9797133..9797247,+__205.1.0.0	rs4910502	-1.8813594606088926	-1.6182254185719276	-2.172601512992093	-2.0013949140503207	-1.997589774199961	-2.0204475493035523	-1.6900415077930806	-1.7987520318919037	-1.6932341470467498	-1.8353013168077903	-1.94032945875186	-1.896055698536604	-1.8787777325462278	-1.7675123444980394	-1.6674980485126816	-1.5130743701581721	-1.4818546174253615	-1.9052396216444816	-1.8867738239640133	-1.7476186422449913	-1.3050919734811282	-1.6180281195455022	-1.5119909441666748	-1.597006504989365	-1.574778816161924	-1.6313723188993616	0.11384711611085319	-0.04927262994075399	0.6595271428339209	0.5195402966249592	0.09235015255547951	0.13367372533953903	-0.057577134451910705	0.49366005841077554	0.07520602750124761	0.3233103726411155	0.3433229537624951	0.3212768823746799	0.24740541364686677	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr11:9797133..9797247,+__205.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr11:9797133..9797247,+__205.1.0.0	rs4910503	-1.8813594606088926	-1.6182254185719276	-2.172601512992093	-2.0013949140503207	-1.997589774199961	-2.0204475493035523	-1.6900415077930806	-1.7987520318919037	-1.6932341470467498	-1.8353013168077903	-1.94032945875186	-1.896055698536604	-1.8787777325462278	-1.901191447434503	-1.6412501531387507	-1.6515142221076622	-1.8217125904769085	-1.7888203740512254	-1.740845700021434	-1.5212373227877127	-1.4520775685525127	-1.6315053218699207	-1.7055581810055567	-1.9399808157877665	-1.635134086224416	-1.7025689819548642	-0.019831986825610493	-0.02302473456682308	0.5210872908844308	0.17968232357341218	0.20876940014873568	0.2796018492821184	0.16880418500536787	0.346674463339391	0.061728825176829094	0.12974313580223362	0.00034864296409353734	0.260921612312188	0.17620875059136387	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr11:9797133..9797247,+__205.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr11:9797133..9797247,+__205.1.0.0	rs4910501,rs4910502,rs4910503	-1.8813594606088926	-1.6182254185719276	-2.172601512992093	-2.0013949140503207	-1.997589774199961	-2.0204475493035523	-1.6900415077930806	-1.7987520318919037	-1.6932341470467498	-1.8353013168077903	-1.94032945875186	-1.896055698536604	-1.8787777325462278	-1.3893628648292458	-1.0671350843389185	-1.7710688820646423	-1.7431713790665293	-1.4925357909680423	-1.5152046040245863	-1.8643180559932968	-1.6326699981563235	-1.5681279807555666	-1.9557738955997792	-1.5316646269105194	-1.457508310548945	-1.5823784561046998	0.49199659577964683	0.5510903342330091	0.40153263092745073	0.25822353498379136	0.5050539832319187	0.505242945278966	-0.1742765482002162	0.16608203373558017	0.1251061662911832	-0.12047257879198892	0.4086648318413406	0.4385473879876589	0.29639927644152836	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr12:110211254..110211368,-__208.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr12:110211254..110211368,-__208.1.0.0	rs12310773	-0.003502755922497288	0.2725252273865905	-0.0030515570596844808	0.16935302551439407	0.5539855425817807	0.2970072838321386	0.3870355965251431	0.34501192245566764	0.4248794062596624	0.3474374896562599	0.6009902494447069	0.3294711010290168	0.3100952109752649	0.3813469563406647	0.47171113407192766	0.3761508057078354	0.040399043167358005	0.3796424160061446	0.37340017596433145	0.2441598572390602	0.500888120768707	0.10291588094901832	0.37834725765183136	0.5993556446942765	0.24379190449311855	0.34100909975452276	0.38484971226316195	0.19918590668533714	0.37920236276751984	-0.12895398234703606	-0.17434312657563605	0.07639289213219286	-0.14287573928608288	0.1558761983130394	-0.3219635253106441	0.030909767995571436	-0.001634604750430424	-0.08567919653589823	0.030913888779257912	0.226876581559	0.762564839604	0.347268461228	0.259370210024	0.76769033028	0.361218104761	0.777966336216	0.333666485083	0.397602565759	0.946473618223	0.60051573606	0.840380101088	0.741226486308	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr12:13080588..13080702,+__219.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr12:13080588..13080702,+__219.1.0.0	rs4763903	2.1373610797298674	2.465387361036119	2.1567179182120038	1.9381018948929016	2.1016188177535873	2.301584486621686	2.445544659842718	2.419490486938628	2.3726447622412503	2.1408137348669083	2.2843010083603383	2.2550067394615425	2.251547745829796	2.395487641925771	2.6463017465931684	2.2923504803182633	2.266944484292943	2.416572967819251	2.3526541009345534	2.3964759674509177	2.567520746224126	2.382958742145405	2.4749564101299057	2.45074414813555	2.523384293840641	2.430529310817541	0.25812656219590346	0.18091438555704942	0.1356325621062595	0.3288425894000415	0.31495415006566363	0.05106961431286727	-0.04906869239180045	0.1480302592854983	0.010313979904154724	0.33414267526299746	0.16644313977521152	0.26837755437909827	0.1789815649877454	0.175053819161	0.232080506959	0.375513989452	0.188220673538	0.122558611289	0.405136064622	0.967868733231	0.777966336216	0.8931878581	0.116187990183	0.188220673538	0.129198935732	0.148005484374	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr12:24715358..24715472,-__222.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr12:24715358..24715472,-__222.1.0.0	rs73293674	-1.441622475602173	-1.4379334005916438	-0.9231180582787615	-1.05096953099074	-0.9973312419805851	-0.9930574586206523	-1.5077535910113316	-1.0698698445548915	-1.1242215114023426	-0.7253558169962988	-0.9905929649125911	-0.7687617999875795	-1.085882307910799	-0.8587669247910631	-0.7177311833365695	-1.1768810986370664	-0.9120131287537432	-1.2025833986524577	-1.1948541163881288	-0.8843529481480067	-0.7986172033284251	-1.1142555211288143	-0.8386152196011665	-0.808134694138564	-0.6788771489328786	-0.932140215486407	0.5828555508111098	0.7202022172550743	-0.2537630403583049	0.1389564022369969	-0.20525215667187258	-0.20179665776747646	0.6234006428633249	0.2712526412264664	0.009965990273528291	-0.11325940260486766	0.1824582707740271	0.08988465105470089	0.15374209242439227	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.66743649171	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.66743649171	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr12:27863622..27863736,-__225.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr12:27863622..27863736,-__225.1.0.0	rs17552080	1.0471608154094294	1.2314757341239235	1.1769962524579392	1.180490749673425	1.252644431910272	1.3318395451346081	1.1550458009266005	1.231579394074727	1.1990655741288143	1.3097452810430799	1.4713118539289978	1.4715700289951887	1.2549104551505839	0.96572872681675	1.5320661442058745	1.1441954262225127	1.1070088788073276	1.4097703070440692	1.2577643627899957	1.2987562319809751	1.40730639490605	1.3943759664764266	1.4372408048597394	1.664808562114155	1.4598625666244915	1.3399070310706973	-0.08143208859267936	0.300590410081951	-0.03280082623542646	-0.07348187086609737	0.15712587513379717	-0.07407518234461241	0.14371043105437464	0.17572700083132298	0.19531039234761227	0.12749552381665952	0.1934967081851573	-0.011707462370697197	0.0849965759201135	0.563691144959	0.162586850726	0.677233097055	0.638386621154	0.468411351413	0.265084565602	0.375513989452	0.248198866138	0.143314270352	0.861430881609	0.162586850726	0.925117039075	0.360599752734	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr12:30948822..30948936,+__228.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr12:30948822..30948936,+__228.1.0.0	rs256653	-1.4934761829331091	-1.3140495958680485	-1.181197203529624	-0.9105233602519953	-1.2645534530094287	-1.452228622407393	-1.0236745348514544	-0.9032387906654176	-1.1302157030178657	-1.4402456668302595	-0.9508090234546578	-1.147264602397179	-1.184289728268036	-0.37598832467913773	-0.3016189791157735	-0.6301934011157388	-0.7901904982929194	-0.734136760648111	-0.5100534869743485	-0.7470657576272102	-0.30865610843112545	-0.6237813801792825	-0.6074306527892359	-0.5132856401205941	-0.5125529981611042	-0.5545794990112152	1.1174878582539713	1.012430616752275	0.5510038024138852	0.12033286195907589	0.5304166923613177	0.9421751354330445	0.27660877722424426	0.5945826822342921	0.5064343228385831	0.8328150140410235	0.4375233833340637	0.6347116042360749	0.629710229256821	NA__no_active_tile	0.00460947122508	0.0362033618716	0.154655491485	0.000505862288815	0.000827700533168	NA__no_active_tile	0.0201846528804	0.0267271087754	0.000531799681309	0.0412580447575	0.00460947122508	6.13386597995e-14	NA__no_active_tile	1	1	1	0.390525686965	0.632363207341	NA__no_active_tile	1	1	0.417462749828	1	1	5.1401796912e-11	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr12:30948822..30948936,+__228.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr12:30948822..30948936,+__228.1.0.0	rs73082102,rs256653	-1.4934761829331091	-1.3140495958680485	-1.181197203529624	-0.9105233602519953	-1.2645534530094287	-1.452228622407393	-1.0236745348514544	-0.9032387906654176	-1.1302157030178657	-1.4402456668302595	-0.9508090234546578	-1.147264602397179	-1.184289728268036	-0.4842592852694648	-0.5296374249953084	-0.4190893298365429	-0.5909263396089379	-0.5609327194424346	-0.6256501391601346	-0.4745454633723012	-0.5543634171494185	-0.4712129156816023	-0.4389777850550387	-0.32175659709449184	-0.34872048678469425	-0.4850059919541974	1.0092168976636442	0.7844121708727401	0.7621078736930812	0.3195970206430574	0.7036207335669941	0.8265784832472585	0.5491290714791532	0.34887537351599907	0.6590027873362634	1.0012678817752207	0.629052426360166	0.7985441156124848	0.6992837363138386	0.000681115576796	0.0125089884503	0.000648445766563	0.0741297894045	9.38141513904e-06	0.00210630874131	0.276771967065	0.0808926541269	0.00342117348194	1.2780782346e-05	0.0107365258413	6.04095401414e-06	1.31183752476e-21	0.132136421899	1	0.129040707546	1	0.0019231901035	0.423368057003	1	1	0.704761737281	0.00265840272796	1	0.00124443652691	2.97787118119e-19	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr12:53694109..53694223,-__237.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr12:53694109..53694223,-__237.1.0.0	rs57820124	-0.8645601623159449	-0.6081252019017037	-0.6834297630261271	-0.7750673667712545	-1.0640541848186755	-0.7937618250787493	-0.9383292015430578	-1.1166765701482504	-0.9713456974199635	-0.7637373825266268	-1.4700411696907616	-0.4960599206083168	-0.878765703820786	-0.25512882397644726	-0.7508571325868918	-0.4994139183485278	-0.7234153878930519	-0.5064498426886501	-0.7221510921189673	-1.0143927959548904	-0.6415188581211025	-1.0471995969724943	-0.7533408435631908	-0.7576050121413548	-0.7280343866470727	-0.6999589742510534	0.6094313383394976	-0.14273193068518808	0.18401584467759935	0.05165197887820261	0.5576043421300254	0.07161073295978193	-0.07606359441183264	0.47515771202714785	-0.07585389955253086	0.010396538963436064	0.7124361575494068	-0.23197446603875588	0.17880672956973254	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.122550048902	0.460214637573	0.0484054419273	0.107123399254	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.1527099507	0.0296152123457	NA__no_active_tile	0.00193360852996	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr12:54393747..54393861,-__238.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr12:54393747..54393861,-__238.1.0.0	rs56368105	0.10323059849898723	-0.02980019748854712	-0.015223220790413475	-0.03291835656548521	-0.018623413489601427	0.13325333013839313	-0.061513334531252885	0.15369722949235604	0.5774841492206624	0.35397741825622875	-0.016199302025603157	0.1581171270228702	0.10879016897821621	-0.3194299050351709	-0.09229246246533067	-0.23994048204373314	-0.3822286072309405	-0.13436888334769756	-0.1634122307408031	-0.3975998278449356	0.0576209591451218	-0.3296617343424575	0.09971992345966474	-0.02499729590172541	0.03707129992600903	-0.15745993720183324	-0.4226605035341581	-0.06249226497678355	-0.22471726125331967	-0.3493102506654553	-0.11574546985809614	-0.29666556087919627	-0.3360864933136827	-0.09607627034723423	-0.9071458835631199	-0.254257494796564	-0.008797993876122252	-0.12104582709686118	-0.26625010618004946	0.90381429355	0.687084607526	0.361218104761	0.136115392203	0.279742372288	0.288805731951	0.657696241675	0.63839046467	0.044708952363	0.340423946445	0.677233097055	0.88258056334	0.442171755089	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr12:54393747..54393861,-__238.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr12:54393747..54393861,-__238.1.0.0	rs12817092	0.10323059849898723	-0.02980019748854712	-0.015223220790413475	-0.03291835656548521	-0.018623413489601427	0.13325333013839313	-0.061513334531252885	0.15369722949235604	0.5774841492206624	0.35397741825622875	-0.016199302025603157	0.1581171270228702	0.10879016897821621	0.3672009695214749	0.36451651250660866	-0.031697422275447716	-0.7143727314106467	-0.061375706989571226	-0.3066947256419953	-0.3563132288447175	-0.2375681866987309	-0.04339542852160961	0.2511833162915699	-0.14284926475466736	-0.010063402013574084	-0.07678577490260889	0.26397037102248766	0.3943167099951558	-0.016474201485034243	-0.6814543748451615	-0.0427522934999698	-0.4399480557803884	-0.2947998943134646	-0.3912654161910869	-0.620879577742272	-0.10279410196465882	-0.1266499627290642	-0.1681805290364443	-0.18557594388082513	0.66743649171	0.476688253492	0.85089220831	0.291862935071	0.532384751695	0.242741268695	0.706946403854	0.0220586796764	0.368322877114	0.85089220831	0.989287003123	0.79863356553	0.775539774933	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr12:54393747..54393861,-__238.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr12:54393747..54393861,-__238.1.0.0	rs56154542	0.10323059849898723	-0.02980019748854712	-0.015223220790413475	-0.03291835656548521	-0.018623413489601427	0.13325333013839313	-0.061513334531252885	0.15369722949235604	0.5774841492206624	0.35397741825622875	-0.016199302025603157	0.1581171270228702	0.10879016897821621	-0.27820235890643913	0.12427424920906532	-0.03970035071865994	-0.1382185255602639	0.14628302300070292	0.29677721305944	0.3937326846735513	-0.07499914392399164	-0.002669415288239431	0.42818608386733115	0.19372947329205428	0.020119684437406544	0.08910938476182978	-0.3814329574054264	0.15407444669761244	-0.024477129928246466	-0.10530016899477869	0.16490643649030434	0.16352388292104686	0.45524601920480423	-0.2286963734163477	-0.5801535645089018	0.0742086656111024	0.20992877531765744	-0.13799744258546365	-0.01968078421638641	0.340423946445	0.829896383209	0.8931878581	0.253741740693	0.887880425794	0.245454024731	0.510582765025	0.0619890035232	0.0181189115857	0.605190125793	0.726997730702	0.696989544957	0.434666315828	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr12:54393747..54393861,-__238.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr12:54393747..54393861,-__238.1.0.0	rs56368105,rs12817092,rs56154542	0.10323059849898723	-0.02980019748854712	-0.015223220790413475	-0.03291835656548521	-0.018623413489601427	0.13325333013839313	-0.061513334531252885	0.15369722949235604	0.5774841492206624	0.35397741825622875	-0.016199302025603157	0.1581171270228702	0.10879016897821621	-0.24991154117729983	-0.19482056635276185	-0.6775272171248098	-0.44283588146291486	0.055917598484199034	0.029104162504462086	0.017909077011621838	-0.023014591141906036	0.034803362037785	-0.10605783193016344	0.11903398089621255	-0.20238388939633206	-0.13664861147099228	-0.35314213967628705	-0.16502036886421473	-0.6623039963343963	-0.40991752489742966	0.07454101197380046	-0.10414916763393105	0.07942241154287472	-0.17671182063426208	-0.5426807871828774	-0.4600352501863922	0.1352332829218157	-0.3605010164192023	-0.24543878044920844	0.24003896129	0.119339994516	0.00327633608155	0.0959193233604	0.468411351413	0.00695778717972	0.8931878581	0.0362012288315	0.00668210963275	0.0232568344756	0.737113058664	0.179364149792	3.61344760981e-05	1	1	0.651990880229	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.00820252607428	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr12:58329796..58329910,-__242.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr12:58329796..58329910,-__242.1.0.0	rs2372309	-0.45328614937582357	-0.9899263143835313	-1.0943755994142133	-1.811804363926362	-1.3628939637500646	-1.3988544146911384	-0.6016077849676114	-1.030911992872735	-1.3441803381834037	-1.3011810228552874	-1.2518367601300566	-1.9682961088670305	-1.2174295677847713	-1.0327634875616425	-1.0821191836078958	-0.9958206588185964	-1.224729789148232	-1.4182870673863979	-1.2382100961956048	-1.4128258112596688	-1.253467349946063	-2.103294539528808	-1.2128893747865084	-0.8314499931646098	-1.3383041754325056	-1.2620134605697109	-0.5794773381858189	-0.09219286922436454	0.09855494059561687	0.5870745747781299	-0.05539310363633332	0.1606443184955335	-0.8112180262920574	-0.22255535707332785	-0.7591142013454042	0.08829164806877898	0.42038676696544686	0.629991933434525	-0.04458389278493959	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr12:58329844..58329958,-__243.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr12:58329844..58329958,-__243.1.0.0	rs2888288	-1.0630341961166978	-1.6728782007674319	-1.9096484045101143	-1.0734973288358105	-1.090103872554042	-1.1676876431677916	-1.516316429120284	-1.63930868533451	-1.3864963015384577	-1.5490243979274687	-1.9709049402725074	-1.9895688197246766	-1.5023724349891492	-1.6583448857893563	-0.6249122637782611	-1.6886491565628972	-1.4693252621231725	-1.7103361878565533	-1.3284820048308918	-1.8247057536718423	-1.3125863490380412	-0.6788204639742886	-1.3693260346438347	-1.4544139050430995	-1.4570283446345278	-1.3814108843288972	-0.5953106896726585	1.0479659369891707	0.22099924794721715	-0.395827933287362	-0.6202323153025113	-0.16079436166310024	-0.3083893245515583	0.32672233629646885	0.7076758375641691	0.17969836328363398	0.5164910352294079	0.5325404750901488	0.12096155066025216	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr12:58329844..58329958,-__243.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr12:58329844..58329958,-__243.1.0.0	rs2888288,rs370317534	-1.0630341961166978	-1.6728782007674319	-1.9096484045101143	-1.0734973288358105	-1.090103872554042	-1.1676876431677916	-1.516316429120284	-1.63930868533451	-1.3864963015384577	-1.5490243979274687	-1.9709049402725074	-1.9895688197246766	-1.5023724349891492	-0.9586921910344877	-1.1381834342871269	-1.6050722746996948	-1.8476677577421607	-1.4590595192604363	-1.6024659360273468	-1.2833089476152684	-1.0253240501245249	-1.3009651234210113	-1.6079608774684386	-1.4934880488766822	-1.3097339880018901	-1.3859935123799225	0.10434200508221014	0.534694766480305	0.3045761298104195	-0.7741704289063502	-0.36895564670639436	-0.43477829285955516	0.2330074815050156	0.6139846352099851	0.08553117811744637	-0.05893647954096992	0.4774168913958252	0.6798348317227865	0.11637892260922698	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr12:58329889..58330003,-__244.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr12:58329889..58330003,-__244.1.0.0	rs2888288	1.0690395562614334	1.3374590185984392	1.125773646550401	1.1623346449004388	1.4274596026961965	1.1470272847347907	0.7540780923863012	1.1061645058472145	1.1308542012893446	0.9730282673372825	1.118236032981238	1.2657935263554645	1.1347706983282122	0.8316842062129881	1.3436452808996735	1.2306611558560618	0.8455572051369931	1.123463801615928	1.0117394186598332	0.7489696710647106	0.7543876166146454	1.093843295171813	0.7207508479372003	0.9136813245234584	0.8196108635138216	0.9531662239339274	-0.23735535004844532	0.006186262301234313	0.10488750930566093	-0.31677743976344575	-0.3039958010802686	-0.13528786607495746	-0.005108421321590617	-0.3517768892325691	-0.03701090611753166	-0.2522774194000822	-0.20455470845777957	-0.4461826628416429	-0.18160447439428481	0.0583274625199	0.687084607526	0.747262025795	0.202104162379	0.554657938956	0.452098798395	0.444064484515	0.253741740693	0.405136064622	0.591208103411	0.313917214294	0.125844655769	0.144279716424	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr12:58329889..58330003,-__244.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr12:58329889..58330003,-__244.1.0.0	rs370317534	1.0690395562614334	1.3374590185984392	1.125773646550401	1.1623346449004388	1.4274596026961965	1.1470272847347907	0.7540780923863012	1.1061645058472145	1.1308542012893446	0.9730282673372825	1.118236032981238	1.2657935263554645	1.1347706983282122	1.4865892440344377	1.7141321549970283	1.2303268760562474	1.2498487373562066	1.3611856213969322	1.3977080347918929	1.0716576875888908	1.2818564885909731	1.364065668331165	1.4008425620155307	1.4315582800155051	1.3375011505528822	1.3606060421439743	0.4175496877730043	0.3766731363985891	0.10455322950584645	0.0875140924557678	-0.06627398129926432	0.2506807500571022	0.3175795952025896	0.17569198274375863	0.23321146704182039	0.42781429467824816	0.31332224703426714	0.07170762419741772	0.22583534381576229	0.468411351413	0.444064484515	0.63839046467	0.79863356553	0.591208103411	0.170821264488	0.313917214294	0.154655491485	0.747262025795	0.0548474154937	0.170821264488	0.232080506959	0.13212394772	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr12:58329889..58330003,-__244.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr12:58329889..58330003,-__244.1.0.0	rs2888288,rs370317534	1.0690395562614334	1.3374590185984392	1.125773646550401	1.1623346449004388	1.4274596026961965	1.1470272847347907	0.7540780923863012	1.1061645058472145	1.1308542012893446	0.9730282673372825	1.118236032981238	1.2657935263554645	1.1347706983282122	1.3432969844026268	1.2348213326662894	1.0798714701073	1.0663694909460686	1.1504694504805704	0.9303751205537366	0.943931903238432	1.1701916750948351	0.9510420822217824	1.2098497276057874	1.0182220875753383	0.8180990375600486	1.0763783635377346	0.27425742814119336	-0.10263768593214984	-0.045902176443100906	-0.09596515395437022	-0.2769901522156262	-0.21665216418105404	0.18985381085213082	0.06402716924762064	-0.17981211906756212	0.2368214602685048	-0.1000139454058997	-0.44769448879541585	-0.05839233479047743	0.657696241675	0.716953652062	0.554657938956	0.397602565759	0.63839046467	0.390154148302	0.614595886613	0.340423946445	0.150801701171	0.147021540231	0.946473618223	0.0808926541269	0.380170042107	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr12:68383179..68383293,+__247.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr12:68383179..68383293,+__247.1.0.0	rs59781510	-1.258973547379971	-1.3544117766658106	-1.8296017847191015	-1.3646280918986151	-1.6907044204382733	-1.6615162422913066	-1.3899553787529912	-1.6764464878438348	-1.4921822575942834	-1.6806867856198977	-1.521363189153572	-1.2558952213976813	-1.514697098646278	-1.448267027793379	-1.5066305626324186	-1.6633345214058453	-1.2362322130703154	-1.6523641732476044	-1.8400925547666995	-1.416196956889347	-1.1929985026068368	-1.7092512099007902	-1.8734194803683004	-1.916957390000477	-1.3168983150289293	-1.564386908975912	-0.18929348041340788	-0.15221878596660798	0.16626726331325625	0.12839587882829973	0.038340247190668864	-0.17857631247539296	-0.02624157813635586	0.48344798523699795	-0.2170689523065068	-0.1927326947484027	-0.3955942008469051	-0.06100309363124801	-0.04968981032963371	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr12:68845441..68845555,-__248.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr12:68845441..68845555,-__248.1.0.0	rs10083027	-1.9432052560194726	-1.9755803804216523	-1.587130431211215	-1.3233610362416293	-1.3978156824183972	-1.9486796731343767	-1.678649135856995	-1.5362550421670211	-1.6782908021461065	-1.886535981852033	-1.438937399776946	-1.4969113701656194	-1.657612682617622	-1.365740809930034	-1.1035447306663175	-1.4698227157519983	-1.6747505918172443	-1.6098337947598476	-1.5669146898545223	-1.7703038582352153	-1.7304461701383074	-1.982379066126848	-1.4614741101638211	-1.3582627116892048	-1.5789008358285157	-1.556031173746823	0.5774644460894385	0.8720356497553348	0.11730771545921681	-0.351389555575615	-0.2120181123414504	0.3817649832798544	-0.09165472237822025	-0.19419112797128624	-0.3040882639807416	0.42506187168821197	0.08067468808774114	-0.08198946566289633	0.10158150887079898	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr12:69080561..69080675,-__249.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr12:69080561..69080675,-__249.1.0.0	rs12831591	-0.5295386700999326	-0.41992553312755526	-0.4977014518504481	-0.6460269873621929	-0.5743117477206298	-0.5244539820145891	-0.3323137858202488	-0.33454050640003263	-0.7203185279366449	-0.3774279420392983	-0.40224763932787055	-0.2546914319979393	-0.46779151714144845	-0.980614415493785	-0.3778169584618215	-0.635389213760618	-0.2846118353371341	-0.7413055611390815	-0.40448648703575385	-0.5472397983572855	-0.7605065082820598	-0.6433848327739036	-0.6700585170612886	-0.6016554600047843	-0.3535156854432838	-0.5833821060959	-0.4510757453938524	0.042108574665733756	-0.13768776191016985	0.3614151520250588	-0.16699381341845176	0.1199674949788353	-0.21492601253703675	-0.42596600188202716	0.07693369516274129	-0.2926305750219903	-0.19940782067691376	-0.09882425344534451	-0.11559058895445146	0.428232282614	NA__no_active_tile	0.354199901149	0.147021540231	0.687084607526	0.397602565759	0.326996172605	0.242741268695	0.436112310787	0.147021540231	0.468411351413	0.989287003123	0.324359555774	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr13:30951056..30951170,-__263.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr13:30951056..30951170,-__263.1.0.0	rs17590091	-1.266692435316322	-1.2442020798594415	-1.513259786395651	-1.2387784493792457	-1.4584877341380875	-1.6163515799229875	-1.606136315236693	-1.266416221672015	-1.224885473701641	-1.4910176273957236	-1.5301564182434284	-1.501926770280547	-1.4131925742951488	-1.4382953524198245	-1.2501826027590748	-1.5340816781740136	-1.2730921517585272	-1.4011861816291447	-1.0891701419130229	-1.2150276991920417	-1.0948818171390102	-1.2331631587492162	-1.6038367104883946	-1.122746286102867	-0.9965862570984412	-1.2710208364519648	-0.1716029171035025	-0.005980522899633245	-0.02082189177836269	-0.03431370237928144	0.057301552508942866	0.5271814380099646	0.3911086160446513	0.17153440453300473	-0.0082776850475752	-0.11281908309267097	0.40741013214056143	0.5053405131821058	0.14217173784318374	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr13:34250896..34251010,-__265.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr13:34250896..34251010,-__265.1.0.0	rs57673460	-0.8268700473592416	-0.3369555654226549	-1.1855732373321353	-1.548867951987158	-1.0661374079124746	-0.8636517050334915	-0.8595612655971836	-1.191382031279991	-0.9721733803659769	-0.7385368646449892	-1.2392585730097083	-1.2154421161144888	-1.0037008455049576	-0.8992423445520447	-0.43446684024974935	-0.462597344084219	-0.7169108900452412	-0.9251724194261501	-0.4936003325892633	-0.4974244158553439	-0.6242865850451457	-0.9179840670561163	-0.9881642942816007	-0.8245739407994916	-1.093599170962025	-0.7398352204121993	-0.07237229719280303	-0.09751127482709443	0.7229758932479162	0.8319570619419168	0.14096498848632444	0.37005137244422825	0.3621368497418397	0.5670954462348453	0.05418931330986054	-0.24962742963661144	0.4146846322102167	0.12184294515246386	0.2638656250927585	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr13:34250896..34251010,-__265.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr13:34250896..34251010,-__265.1.0.0	rs9538300	-0.8268700473592416	-0.3369555654226549	-1.1855732373321353	-1.548867951987158	-1.0661374079124746	-0.8636517050334915	-0.8595612655971836	-1.191382031279991	-0.9721733803659769	-0.7385368646449892	-1.2392585730097083	-1.2154421161144888	-1.0037008455049576	-1.1287679573104483	-0.6205582965702102	-1.3145766492404374	-0.5908770037086326	-1.0203471588173931	-0.8067652918881535	-1.4179868944182856	-1.044686144303217	-1.2193587649655762	-1.2102268341579792	-1.3257583795753392	-0.7262364466766931	-1.035512151802697	-0.3018979099512067	-0.2836027311475553	-0.1290034119083021	0.9579909482785254	0.04579024909508145	0.056886413145338044	-0.558425628821102	0.14669588697677405	-0.24718538459959927	-0.4716899695129899	-0.08649980656563083	0.48920566943779575	-0.03181130629773929	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr13:34250896..34251010,-__265.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr13:34250896..34251010,-__265.1.0.0	rs57673460,rs9538300	-0.8268700473592416	-0.3369555654226549	-1.1855732373321353	-1.548867951987158	-1.0661374079124746	-0.8636517050334915	-0.8595612655971836	-1.191382031279991	-0.9721733803659769	-0.7385368646449892	-1.2392585730097083	-1.2154421161144888	-1.0037008455049576	-1.1528244750244099	-0.29270540435969034	-0.720425802353884	-0.5397709400343513	-0.6161197129042999	-0.6648656151588621	-0.7013687003696054	-0.8603284260671665	-0.7522567612950829	-0.5445758565230854	-0.8500672109440289	-0.3203756672151747	-0.6679737143541368	-0.32595442766516824	0.04425016106296459	0.4651474349782513	1.0090970119528067	0.4500176950081747	0.19878608987462942	0.15819256522757819	0.33105360521282445	0.219916619070894	0.19396100812190387	0.3891913620656794	0.8950664488993141	0.33572713115082103	NA__not_enough_barcodes	0.444059269006	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0316863885398	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0789351364764	NA__not_enough_barcodes	1	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr13:45915489..45915603,+__266.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr13:45915489..45915603,+__266.1.0.0	rs12872567	1.0201598610870972	1.3631199670534968	1.2379232228534076	0.8346608548534751	1.1038357622096546	1.179367001929354	1.185632051513611	1.3215677889033126	1.0866196070021572	1.2047139019802375	1.186977121077826	1.213481044472876	1.1615048487447088	0.8417739054291663	1.1386628823236535	0.9019067631966085	0.9188448169746308	0.9817962457411119	1.0077689907201242	0.7933928436075538	0.9637063109976638	0.9908891218322571	0.8672283700451132	1.2944595703315604	0.9433730647897138	0.970316907165763	-0.17838595565793092	-0.22445708472984327	-0.33601645965679916	0.08418396212115575	-0.12203951646854272	-0.1715980112092299	-0.39223920790605715	-0.3578614779056488	-0.09573048516990013	-0.3374855319351243	0.10748244925373451	-0.27010797968316225	-0.1911879415789457	0.242741268695	0.696989544957	0.206893929435	0.628827692687	0.957166828655	0.412754243182	0.282745459933	0.232075162485	0.930450144558	0.229462716724	0.270885072145	0.476688253492	0.453029367969	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr13:45915489..45915603,+__266.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr13:45915489..45915603,+__266.1.0.0	rs112020474	1.0201598610870972	1.3631199670534968	1.2379232228534076	0.8346608548534751	1.1038357622096546	1.179367001929354	1.185632051513611	1.3215677889033126	1.0866196070021572	1.2047139019802375	1.186977121077826	1.213481044472876	1.1615048487447088	0.7888518802611881	0.9935030664452892	0.7821005629399626	0.5499577605219524	1.090586390055788	1.1585065699074777	0.8723677537442346	0.9081479512527522	1.1977776745679931	1.286172493099595	0.9574979494864996	1.018862002252921	0.9670276712113045	-0.2313079808259091	-0.3696169006082076	-0.45582265991344506	-0.28470309433152263	-0.013249372153866679	-0.020860432021876374	-0.31326429776937637	-0.41341983765056045	0.1111580675658359	0.08145859111935749	-0.22947917159132636	-0.19461904221995519	-0.19447717753340435	0.0601351299193	0.326996172605	0.0306357720046	0.0986283746992	0.946473006422	0.48504462162	0.30750859871	0.0338805621681	0.687081215138	0.444064484515	0.30750859871	0.397602565759	0.0337440410342	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr13:45915489..45915603,+__266.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr13:45915489..45915603,+__266.1.0.0	rs113210477	1.0201598610870972	1.3631199670534968	1.2379232228534076	0.8346608548534751	1.1038357622096546	1.179367001929354	1.185632051513611	1.3215677889033126	1.0866196070021572	1.2047139019802375	1.186977121077826	1.213481044472876	1.1615048487447088	1.1007005661107043	1.5642998331486586	1.3042802392440762	1.0545058481755274	1.3322728376818072	1.3998816654271848	1.2971687935416465	1.1860506818670278	1.5600518803972774	1.3125402245263564	1.4731015004425956	1.322197067920611	1.3255875948736229	0.0805407050236071	0.2011798660951618	0.0663570163906686	0.21984499332205232	0.22843707547215253	0.22051466349783078	0.11153674202803554	-0.13551710703628483	0.4734322733951202	0.1078263225461189	0.28612437936476964	0.1087160234477349	0.16408274612891396	0.501992688725	0.259370210024	0.460214637573	0.63839046467	0.183747876053	0.468411351413	0.909133064849	0.48504462162	0.0286222059958	0.777966336216	0.197395731844	0.840380101088	0.379852206311	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr13:45915489..45915603,+__266.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr13:45915489..45915603,+__266.1.0.0	rs12872567,rs112020474,rs113210477	1.0201598610870972	1.3631199670534968	1.2379232228534076	0.8346608548534751	1.1038357622096546	1.179367001929354	1.185632051513611	1.3215677889033126	1.0866196070021572	1.2047139019802375	1.186977121077826	1.213481044472876	1.1615048487447088	1.4033376660782269	1.6154225573451504	1.2742006216024282	0.9992197297776494	1.4388768221381287	1.4580299528385883	1.3928394004982982	1.6072711792917858	1.4555167058852148	1.540311849197212	1.4757842822770035	1.6826542327936318	1.4452887499769431	0.38317780499112963	0.2523025902916536	0.036277398749020584	0.16455887492417431	0.3350410599284741	0.2786629509092342	0.2072073489846873	0.28570339038847314	0.36889709888305755	0.33559794721697456	0.2888071611991776	0.4691731883207557	0.28378390123223435	0.87199428352	0.37190218233	0.609889042629	0.978575937473	0.0267236311687	0.536806685117	0.510582765025	0.536806685117	0.147016912141	0.29495293544	0.143314270352	0.259370210024	0.291102864321	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr13:79980346..79980460,+__274.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr13:79980346..79980460,+__274.1.0.0	rs2765081	3.598886191819169	4.0465168347334135	3.310428992770618	3.030510801040407	3.575364997756163	3.5875506838080944	3.2587237422593045	3.659350238820442	3.6290656981151934	3.599288078445837	3.5677842382100184	3.6830981840420383	3.5455473901517247	3.4051272631279756	4.010520269925037	3.167556870812601	2.9372172481325185	3.368194794322191	3.4257295643731647	3.33552354145018	3.603669209754738	3.5170643234317653	3.520199628380352	3.5282317031710746	3.498644209987375	3.443139885572414	-0.19375892869119316	-0.035996564808376874	-0.14287212195801713	-0.09329355290788843	-0.20717020343397197	-0.16182111943492972	0.07679979919087554	-0.055681029065703935	-0.11200137468342808	-0.07908845006548493	-0.03955253503894385	-0.18445397405466313	-0.10240750457931047	0.368322877114	0.340423946445	0.237368605078	0.216719559135	0.116187990183	0.0440018610392	0.405136064622	0.368322877114	0.158583637061	0.150801701171	0.340423946445	0.188220673538	0.00448849939428	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr13:79980346..79980460,+__274.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr13:79980346..79980460,+__274.1.0.0	rs2765081,rs74100220	3.598886191819169	4.0465168347334135	3.310428992770618	3.030510801040407	3.575364997756163	3.5875506838080944	3.2587237422593045	3.659350238820442	3.6290656981151934	3.599288078445837	3.5677842382100184	3.6830981840420383	3.5455473901517247	4.060644492995677	4.306872376422552	3.7502765309294506	3.5124002681435744	3.909985285219698	4.001200496467948	3.7394511927705456	4.2219445764290215	4.15224521232928	4.144084350316645	4.0844315210163495	4.235016422413919	4.009879393787888	0.4617583011765083	0.26035554168913855	0.4398475381588325	0.4818894671031675	0.3346202874635349	0.413649812659854	0.4807274505112411	0.5625943376085796	0.5231795142140867	0.5447962718708084	0.5166472828063311	0.5519182383718806	0.46433200363616356	2.78491922777e-06	0.00146142948273	0.000144763512967	0.000129852144011	3.85703616239e-06	9.98335414644e-06	5.30937746215e-05	5.66885732617e-06	8.9082802627e-07	1.84173011953e-05	1.2780782346e-05	2.28582318034e-06	1.29734401115e-46	0.000540274330186	0.295208755512	0.0288079390805	0.0245420552181	0.000790692413291	0.00200665418343	0.0106187549243	0.0011054271786	0.000183510573412	0.00383079864862	0.00262006038092	0.00047087957515	2.9449709053e-44	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr13:99852893..99853007,-__276.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr13:99852893..99853007,-__276.1.0.0	rs7331894	1.5054430261271778	1.6405032583390615	1.485661537092592	1.5835800752266982	1.5587466307620252	1.6290184265002838	1.599325826231376	1.5845635856883367	1.7197562226005076	1.7153649374974633	1.7712970157015393	1.7655303351933491	1.629899239746701	1.6312899562726573	1.8670198645266	1.6569278061696389	1.7007446277918081	1.5681493264175321	1.6585171677009298	1.6886801540384142	1.7146550209738134	1.9029563590709886	1.6490957830391912	1.7357752678051193	1.6830145234729832	1.7047354881066397	0.12584693014547943	0.22651660618753855	0.17126626907704678	0.11716455256510994	0.009402695655506887	0.029498741200645995	0.08935432780703811	0.13009143528547673	0.18320013647048095	-0.06626915445827208	-0.03552174789642004	-0.08251581172036593	0.07483624835993878	0.840380101088	0.510582765025	0.706946403854	0.572794651112	0.914457985151	0.79863356553	0.476688253492	0.757455001208	0.696989544957	0.405136064622	0.619326784864	0.935789553219	0.973370029342	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr13:99852893..99853007,-__276.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr13:99852893..99853007,-__276.1.0.0	rs115307678	1.5054430261271778	1.6405032583390615	1.485661537092592	1.5835800752266982	1.5587466307620252	1.6290184265002838	1.599325826231376	1.5845635856883367	1.7197562226005076	1.7153649374974633	1.7712970157015393	1.7655303351933491	1.629899239746701	2.0482057313638906	2.1155733388342437	1.9280188104890272	1.8403720909864412	1.9294807418239877	2.0063106305975844	2.1245318939644906	2.0356302204402352	2.225858013482706	2.075886579240609	2.109067322821953	2.109174247708748	2.0456758018128265	0.5427627052367128	0.4750700804951822	0.44235727339643516	0.256792015759743	0.3707341110619624	0.3772922040973006	0.5252060677331145	0.45106663475189857	0.5061017908821985	0.3605216417431456	0.3377703071204139	0.34364391251539894	0.4157765620661255	0.00357181666747	0.00695778717972	0.0129907246043	0.0601351299193	0.00167824394514	0.00441948685714	0.00160288548718	0.0741297894045	0.0115927323179	0.0174727290303	0.00668210963275	0.0468981580933	1.28150049102e-15	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1.07389741148e-12	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr13:99852893..99853007,-__276.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr13:99852893..99853007,-__276.1.0.0	rs7331894,rs115307678	1.5054430261271778	1.6405032583390615	1.485661537092592	1.5835800752266982	1.5587466307620252	1.6290184265002838	1.599325826231376	1.5845635856883367	1.7197562226005076	1.7153649374974633	1.7712970157015393	1.7655303351933491	1.629899239746701	1.7497596642617235	1.9736820530625028	1.7069778299762646	1.6059447263377171	1.9728593380289765	2.027190158445239	1.7992533621062718	2.008224883122077	1.956947723285627	1.9503164463408882	2.017409900896262	2.1349115600182067	1.9086231371568132	0.24431663813454563	0.33317879472344125	0.2213162928836725	0.02236465111101893	0.41411270726695126	0.39817173194495536	0.19992753587489576	0.42366129743374037	0.2371915006851193	0.23495150884342486	0.24611288519472252	0.3693812248248576	0.2787238974101121	0.154655491485	0.0658387268341	0.113101776132	0.237368605078	0.00423662678721	0.0134887989876	0.0362033618716	0.0906800339379	0.0808926541269	0.0209174885683	0.0856734395523	0.0531733827136	2.66827582032e-08	1	1	1	1	0.868508491378	1	1	1	1	1	1	1	6.05698611212e-06	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr14:105147390..105147504,+__278.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr14:105147390..105147504,+__278.1.0.0	rs79485812	0.8594508407142079	1.1354575947911263	1.204637142047221	0.9383493790986008	1.0710955564610078	1.038781874093627	0.8421188444606198	0.6704465542355736	0.859111152759003	0.8956411335677972	1.0887975718996654	1.0478112582754229	0.970974908533656	0.724419300775629	0.7981474541316473	1.0047973407833999	0.7403505746713817	0.6933475964659774	0.90588475417411	0.4432300049585039	0.4782668820813345	0.8174896890583171	0.8386144385227297	0.8065758427417942	0.7923417535769721	0.7536221359951498	-0.13503153993857886	-0.33731014065947895	-0.19983980126382117	-0.19799880442721918	-0.3777479599950304	-0.13289711991951703	-0.3988888395021159	-0.19217967215423915	-0.04162146370068587	-0.05702669504506752	-0.28222172915787125	-0.25546950469845076	-0.2173527725385063	0.136115392203	0.116187990183	0.270885072145	0.747262025795	0.0111573361887	0.460214637573	0.0719809426143	0.0638899216795	0.428242856315	0.333666485083	0.162586850726	0.0741264784486	0.00105907933887	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.887508485976	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr14:106355851..106355965,+__279.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr14:106355851..106355965,+__279.1.0.0	rs3814949	-1.0002809081475978	-1.5046827012141577	-1.2764104620789534	-1.5969332939889398	-1.4118928106953044	-1.2294816919791258	-1.4844007188870638	-1.508736517922098	-1.5602090895806642	-1.4602505793321718	-1.2094575408793842	-1.6615759869252384	-1.4086926918025584	-1.3696910600645809	-1.2101281457439546	-1.5922519426371515	-1.401034874623203	-0.7940620223393942	-1.0998642959594862	-1.6180644900464105	-1.342016586599882	-1.3415153207369799	-1.429456174867885	-1.4263536540007384	-1.1055107126522692	-1.3108291066893278	-0.369410151916983	0.29455455547020315	-0.31584148055819816	0.1958984193657367	0.6178307883559102	0.12961739601963962	-0.1336637711593467	0.16671993132221585	0.2186937688436843	0.03079440446428694	-0.21689611312135426	0.5560652742729693	0.09786358511323033	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr14:20811533..20811647,-__282.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr14:20811533..20811647,-__282.1.0.0	rs3093877	-1.354728937506797	-1.324691294478242	-1.3599361109938934	-1.2131204679441343	-1.2960316302195491	-1.4906249418061441	-1.9669189726914755	-1.3400923532650528	-1.540583366619463	-1.5243528920901193	-1.5148437033644528	-1.6731374005577875	-1.466588505961426	-1.4192929125884461	-1.0704281048860504	-1.1817686037825634	-0.9598327018155092	-1.1308518046519058	-1.0108138756969012	-1.0379097531991512	-1.1432853637761862	-0.983366333299403	-1.5569286783065175	-1.1746327836329482	-1.310007542289689	-1.1649265381604392	-0.06456397508164913	0.25426318959219163	0.17816750721133	0.25328776612862514	0.16517982556764332	0.47981106610924296	0.9290092194923243	0.19680698948886666	0.55721703332006	-0.03257578621639823	0.34021091973150464	0.3631298582680984	0.30166196780098664	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr14:20811533..20811647,-__282.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr14:20811533..20811647,-__282.1.0.0	rs75149378	-1.354728937506797	-1.324691294478242	-1.3599361109938934	-1.2131204679441343	-1.2960316302195491	-1.4906249418061441	-1.9669189726914755	-1.3400923532650528	-1.540583366619463	-1.5243528920901193	-1.5148437033644528	-1.6731374005577875	-1.466588505961426	-1.067799555889988	-1.0849415790219668	-1.0215335791219362	-1.4298064203180731	-1.1909955138089363	-1.2162921971693752	-1.1145830195819963	-1.483079631115919	-1.0563535878357073	-1.407559577679303	-1.3156932511717276	-1.395455903945685	-1.232007818055051	0.28692938161680903	0.23974971545627533	0.33840253187195724	-0.21668595237393884	0.10503611641061283	0.27433274463676893	0.8523359531094792	-0.14298727785086607	0.4842297787837557	0.1167933144108162	0.1991504521927252	0.2776814966121024	0.2345806879063748	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr14:20811533..20811647,-__282.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr14:20811533..20811647,-__282.1.0.0	rs2297617	-1.354728937506797	-1.324691294478242	-1.3599361109938934	-1.2131204679441343	-1.2960316302195491	-1.4906249418061441	-1.9669189726914755	-1.3400923532650528	-1.540583366619463	-1.5243528920901193	-1.5148437033644528	-1.6731374005577875	-1.466588505961426	-0.758485704338264	-0.618399107567679	-1.142633348142399	-1.3814052214453956	-1.3645313644425898	-1.0162135182009713	-1.0818008010941964	-1.1285467464304024	-1.165621909494603	-1.2304172205329158	-1.5578740677942342	-0.9445715468737992	-1.1158750463631208	0.596243233168533	0.7062921869105631	0.21730276285149452	-0.16828475350126126	-0.06849973422304068	0.47441142360517286	0.8851181715972791	0.2115456068346504	0.37496145712486006	0.29393567155720346	-0.043030364429781365	0.7285658536839883	0.3507134595983051	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr14:20811533..20811647,-__282.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr14:20811533..20811647,-__282.1.0.0	rs3093878	-1.354728937506797	-1.324691294478242	-1.3599361109938934	-1.2131204679441343	-1.2960316302195491	-1.4906249418061441	-1.9669189726914755	-1.3400923532650528	-1.540583366619463	-1.5243528920901193	-1.5148437033644528	-1.6731374005577875	-1.466588505961426	-0.6311977847187406	-0.7258820779327249	-1.295218448804685	-0.8768485588643409	-0.7496109445785003	-0.9965862570984412	-0.9262697518577565	-0.7668868703813818	-1.5299698726059363	-1.0833767199027786	-1.300914375818094	-1.2180684101143338	-1.008402506056476	0.7235311527880565	0.5988092165455172	0.06471766218920849	0.33627190907979343	0.5464206856410488	0.49403868470770296	1.040649220833719	0.573205482883671	0.010613494013526736	0.44097617218734064	0.21392932754635874	0.4550689904434537	0.4581859999049498	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr14:20811533..20811647,-__282.1.4.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr14:20811533..20811647,-__282.1.0.0	rs3093877,rs75149378,rs2297617,rs3093878	-1.354728937506797	-1.324691294478242	-1.3599361109938934	-1.2131204679441343	-1.2960316302195491	-1.4906249418061441	-1.9669189726914755	-1.3400923532650528	-1.540583366619463	-1.5243528920901193	-1.5148437033644528	-1.6731374005577875	-1.466588505961426	-0.5446623587897931	-0.8497405706576879	-0.8355893643751551	-1.3101635712861368	-0.8428926079535015	-0.9819968592333392	-1.3391146877861262	-0.8858393671645993	-0.8488908823623665	-1.1444197075748246	-1.1113207740274635	-0.970956976386446	-0.97213231063312	0.8100665787170039	0.47495072382055414	0.5243467466187384	-0.0970431033420025	0.45313902226604763	0.5086280825728049	0.6278042849053493	0.4542529861004535	0.6916924842570965	0.3799331845152947	0.4035229293369893	0.7021804241713415	0.494456195328306	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr14:24423345..24423459,-__284.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr14:24423345..24423459,-__284.1.0.0	rs8009022	2.7472559944903954	3.011336711741595	2.765177772609265	2.5054397899473746	2.735378611686455	2.746610850947067	2.6181918809503553	2.9481393137188068	2.870604417405694	2.821015649568122	2.8619099867788327	2.888461549550419	2.793293544116198	2.6769031111754327	3.158029613532751	2.652445936674437	2.4829861861986924	2.6645631596656205	2.7113115507897922	2.687576320416847	2.984632696137357	2.7883874281050187	2.9209587917079745	2.8880601673432134	2.901893660831419	2.7931457185482125	-0.0703528833149627	0.1466929017911558	-0.11273183593482816	-0.022453603748682216	-0.07081545202083461	-0.03529930015727478	0.06938443946649153	0.03649338241855027	-0.08221698930067545	0.09994314213985245	0.026150180564380676	0.013432111281000303	-0.0001478255679855748	0.510582765025	0.677233097055	0.136115392203	0.8931878581	0.354199901149	0.460214637573	0.946473618223	0.935789553219	0.628827692687	0.989287003123	0.946473618223	0.493479697885	0.984969760742	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr14:35451688..35451802,-__286.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr14:35451688..35451802,-__286.1.0.0	rs116594918	0.8951596229663178	1.0388721164413934	1.2065644910450035	0.6756994044304261	0.9116094774819123	1.017084197575615	1.0712003924761262	1.1505637398230149	1.0933487964027515	0.9785844139960211	1.1950471809889376	1.0137234952551646	1.020621444073557	0.860380916979753	1.264537901157047	0.7383358429994082	0.7712081315417008	1.0470998945000656	0.9961418103395809	0.9441953455477001	1.0333217140263284	1.09156218485911	1.0490583487689444	1.1631407107641794	0.9914290205910561	0.9958676518395727	-0.03477870598656474	0.22566578471565357	-0.4682286480455953	0.09550872711127467	0.13549041701815323	-0.020942387236034143	-0.12700504692842607	-0.11724202579668641	-0.0017866115436415697	0.0704739347729233	-0.03190647022475823	-0.0222944746641085	-0.02475379223398418	0.64800625442	0.390154148302	0.412754243182	0.536806685117	0.946473618223	0.706946403854	0.514901630041	0.460214637573	0.87199428352	0.390154148302	0.788281320858	0.696989544957	0.889502884819	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr14:35451727..35451841,-__287.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr14:35451727..35451841,-__287.1.0.0	rs116594918	0.8491117277453794	0.9771345263238338	0.4924314749359162	0.8687133220307068	0.8622082802829506	0.762239378424581	0.4202376653427926	0.9081319657851866	0.7364403477801429	0.5801573288671419	0.7336439794952412	0.7267142520371764	0.743097020754254	0.904645309336281	1.0409603964805465	0.8165163057222067	0.5466839139921694	0.6918787516542744	1.113653908576069	1.0395425448954219	0.8326590139919063	1.0009247447215395	0.9138015873169416	1.4643394255669917	0.7135867359148076	0.9232660531807629	0.055533581590901604	0.0638258701567127	0.32408483078629047	-0.3220294080385374	-0.17032952862867623	0.35141453015148805	0.6193048795526293	-0.07547295179328029	0.2644843969413966	0.3336442584497997	0.7306954460717505	-0.013127516122368843	0.18016903242650886	0.444064484515	0.978575937473	0.727009731456	0.554657938956	0.809021331888	0.132622250874	0.188220673538	0.925117039075	0.428242856315	0.136115392203	0.0583274625199	0.978575937473	0.72965921802	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr14:56046793..56046907,-__291.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr14:56046793..56046907,-__291.1.0.0	rs187641359	-0.12480781227882193	0.5404745260580489	-0.23782557172602672	-0.4606088601659277	-1.1167849207599492	-0.01757911618955697	-0.2962006142124292	-0.6051123542464928	-0.5438219727050453	-0.07315591192306338	-1.3486192147119451	-0.933914432183353	-0.4348296879203802	-1.0919659419780023	-0.04888228740363082	-0.6183632337272211	-0.5021816195071959	-1.413382834181924	-1.0973703389054286	-1.4986404958538522	-1.1828687831958902	-1.3194178648313137	-1.9128509446402036	0.09640606562167246	-1.178146339085404	-0.9806387181406994	-0.9671581296991805	-0.5893568134616798	-0.38053766200119443	-0.04157275934126814	-0.2965979134219747	-1.0797912227158717	-1.202439881641423	-0.5777564289493974	-0.7755958921262684	-1.8396950327171402	1.4450252803336177	-0.24423190690205088	-0.5458090302203192	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr14:73712660..73712774,-__298.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr14:73712660..73712774,-__298.1.0.0	rs1003647	0.6829669780291512	0.8398279700174174	0.5589846391308607	0.3100308036991877	0.73302775861758	0.8756585077044821	0.4327426214683684	0.5269124279247421	0.7427057660596676	0.8610008592848808	0.706966957456942	0.7415415449943853	0.667697236198972	0.6574905446961936	0.3976410029911837	0.8825312269911115	0.4074452293972932	0.6638681848129583	0.3528871352975861	0.5898514138711325	0.712944540214497	0.7471762339756196	0.8797494897957292	0.536447746764487	0.6018332720810308	0.6191555017407353	-0.02547643333295757	-0.44218696702623367	0.3235465878602508	0.09741442569810554	-0.06915957380462168	-0.522771372406896	0.1571087924027641	0.18603211228975491	0.004470467915951959	0.018748630510848407	-0.17051921069245501	-0.13970827291335453	-0.048541734458236896	1.0	0.0698833862508	0.301187193336	0.444064484515	0.581967350665	0.0548474154937	0.468411351413	0.48504462162	0.79863356553	0.85089220831	0.382791178922	0.166665831608	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr14:73929044..73929158,+__299.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr14:73929044..73929158,+__299.1.0.0	rs17127736	-1.3005336539440617	-1.2040692514109455	-1.3490346886300173	-0.8882980587175912	-2.112689878627854	-1.6986681906433025	-1.5970567192383067	-1.4191681536885905	-1.495046291928143	-1.3966699866916734	-1.072765991057814	-2.0513200316074305	-1.4654434080154777	-1.3062026628367285	-1.694802658970528	-0.9935173057832056	-1.2441372673211006	-1.4495115587807912	-1.389624925155527	-1.26862312322794	-1.4424535533408864	-1.4096608320310071	-1.267820304934216	-1.7563932131100946	-1.6692533801598304	-1.4076667321376546	-0.005669008892666749	-0.4907334075595826	0.35551738284681167	-0.3558392086035095	0.6631783198470629	0.3090432654877755	0.3284335960103668	-0.023285399652295924	0.08538545989713597	0.12884968175745737	-0.6836272220522805	0.3820666514476001	0.05777667587782292	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr14:75083315..75083429,-__300.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr14:75083315..75083429,-__300.1.0.0	rs28522589	2.39055972519667	2.45771767653324	2.351123210858624	2.066352538386068	2.3419188887931126	2.4628711880839047	1.6709176153574812	1.9983107867920504	2.360382705655977	2.476554705839788	2.5110461218281275	2.4232463239323447	2.292583457271449	2.293665449346013	2.6169121855470343	2.428199876422325	2.125754132557125	2.3020761359908244	2.393307337086087	1.8833699607728493	1.9304002907288442	2.4570756761513053	2.355640066788305	2.4296406588041126	2.562780429757777	2.31490184999605	-0.0968942758506568	0.1591945090137945	0.07707666556370096	0.05940159417105706	-0.03984275280228822	-0.06956385099781759	0.21245234541536817	-0.0679104960632062	0.0966929704953281	-0.12091463905148325	-0.08140546302401486	0.13953410582543224	0.022318392724601177	0.276771967065	0.591208103411	0.545696106059	0.967868733231	0.572794651112	0.253741740693	0.88258056334	0.136115392203	0.967868733231	0.147021540231	0.657696241675	0.946473618223	0.877831060168	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr14:77425899..77426013,+__304.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr14:77425899..77426013,+__304.1.0.0	rs73311950	-2.0993103597687472	-1.8421113437476966	-1.7963856010836718	-1.364751429597297	-1.4667021960842699	-2.0608416411528587	-1.505747672088224	-1.0726776511296297	-2.178495576868218	-1.8210471685273184	-1.530914028656916	-2.2065486289105896	-1.7454611081346199	-1.7215770147672893	-1.5039116283752043	-1.5516461959211463	-1.1124418232001605	-1.6424667554004724	-1.6681504274258745	-1.6713602800144391	-1.8972542772800405	-1.8334590120655028	-1.5563713393460605	-1.7364256934340545	-1.6311413665171364	-1.6271838178122817	0.37773334500145794	0.33819971537249227	0.24473940516252557	0.2523096063971364	-0.1757645593162025	0.39269121372698423	-0.16561260792621524	-0.8245766261504108	0.34503656480271516	0.26467582918125787	-0.20551166477713845	0.5754072623934532	0.11827729032233797	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr14:86400970..86401084,+__306.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr14:86400970..86401084,+__306.1.0.0	rs58294977	0.8928174383165028	1.2125494077186578	0.852954664777398	0.8996315730087416	1.186288946539693	1.1161482858669454	1.263190971467314	1.3259286110103283	1.186902114663485	1.1359115154318502	1.1438041842236906	1.1976366037337052	1.1178136930631928	0.9434683209774885	1.1773175971815084	0.9079413901162625	0.7825865397950827	0.9268688150989218	0.9189389388141977	0.8028181165944402	0.9672134856013661	0.84072254734292	0.9527031388827822	1.0035990416022418	1.0758455532725368	0.9416686237733124	0.05065088266098561	-0.03523181053714941	0.054986725338864506	-0.11704503321365889	-0.25942013144077125	-0.19720934705274762	-0.4603728548728737	-0.3587151254089622	-0.3461795673205651	-0.18320837654906796	-0.1402051426214488	-0.12179105046116834	-0.17614506928988027	0.586575008857	0.935789553219	0.716953652062	0.460214637573	0.66743649171	0.840380101088	0.0267271087754	0.158583637061	0.397602565759	0.361218104761	0.242741268695	0.192768091005	0.335690907644	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr14:96001053..96001167,-__309.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr14:96001053..96001167,-__309.1.0.0	rs45582537	-1.11666230999489	-1.0608078077465095	-1.2619647342101554	-1.1107278809352397	-1.0272213608610354	-1.1752765753293428	-0.9689693619127748	-0.8941898205149379	-1.2643042755386753	-1.048008843478472	-1.1690021698313622	-1.0721318029781657	-1.0974389119442967	-1.4643282259298531	-1.7303660235405953	-1.224260616280513	-1.2414497257155035	-1.3805689251865525	-1.266455703800383	-1.380544977754976	-1.0624790225283025	-1.4179043406522285	-1.368892651236186	-1.5071777082253217	-1.4920049810018463	-1.3780360751543552	-0.3476659159349631	-0.6695582157940858	0.037704117929642456	-0.13072184478026383	-0.35334756432551706	-0.09117912847104015	-0.41157561584220126	-0.1682892020133646	-0.15360006511355317	-0.3208838077577141	-0.33817553839395953	-0.4198731780236806	-0.2805971632100584	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr15:41576083..41576197,+__316.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr15:41576083..41576197,+__316.1.0.0	rs79436692	0.2096936963466876	0.10193861557045317	0.23684731511846532	-0.09100691048750079	0.1781910839324129	0.2278605676673076	0.11668393630634974	0.40658942471935056	0.22761226915994962	0.3455689380481166	0.655397250522529	0.3167755560349838	0.24434597857825877	-0.05645292491961556	0.3573316270606927	0.12199833960547025	-0.026741398340387405	0.1449933612900376	0.3411030601968453	0.29501887523714143	0.6221040744284708	0.3948518255023614	0.3256224791093095	0.38661551640302827	0.48828677019445904	0.2828943004806511	-0.2661466212663032	0.2553930114902395	-0.11484897551299507	0.06426551214711337	-0.033197722642375305	0.11324249252953766	0.1783349389307917	0.21551464970912027	0.1672395563424118	-0.019946458938807088	-0.2687817341195007	0.17151121415947523	0.03854832190239235	0.501987794151	0.282745459933	0.88258056334	0.460214637573	0.727006731416	0.476688253492	0.0986283746992	0.63839046467	0.125844655769	0.572794651112	0.989287003123	0.197395731844	0.570468713357	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr15:41576126..41576240,+__317.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr15:41576126..41576240,+__317.1.0.0	rs79436692	1.0957467692229201	1.5290741196282625	1.118211847876677	1.0196712889671997	1.2052547505065994	1.197588285527441	1.187118869099812	1.1629851982778978	1.1022158320149573	1.3938046105115771	1.1052312715545631	1.3398898461818258	1.2047327241141446	0.938329079505807	1.2970596012387299	1.1916912944558748	1.208099925101916	1.0813991603393314	1.184481607498654	1.0379656268596598	1.1533828501394157	1.0825658495475468	1.1879543306219187	1.138099766426639	1.2753696325352533	1.1480332270225622	-0.15741768971711312	-0.23201451838953258	0.07347944657919792	0.18842863613471628	-0.12385559016726799	-0.013106678028786956	-0.14915324224015225	-0.009602348138482153	-0.019649982467410565	-0.20585027988965843	0.03286849487207588	-0.06452021364657257	-0.05669949709158221	0.428242856315	0.0386605553759	0.819442862795	0.436112310787	0.536806685117	0.967868733231	0.519249062249	0.476688253492	0.436112310787	0.136115392203	0.706946403854	0.519249062249	0.508250368996	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr15:45571390..45571504,-__320.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr15:45571390..45571504,-__320.1.0.0	rs78212061	2.553400219140066	2.7659295086525444	2.611173071565368	2.37062101813604	2.5884579759143658	2.548422074394032	2.7238074270701977	2.7325053760851223	2.7003139917178114	2.738522631940412	2.764835023847304	2.8646526523781954	2.6635534142367887	2.38727108143222	2.5382216479825224	2.2765952260370903	2.1779293306900467	2.652126560381621	2.6365624442588502	2.3204668111638767	2.736933110919992	2.6594071890518878	2.579357065702729	2.751706547063915	2.829520746680464	2.545508146780435	-0.16612913770784576	-0.22770786067002202	-0.3345778455282775	-0.1926916874459934	0.06366858446725532	0.08814036986481844	-0.4033406159063211	0.004427734834869579	-0.040906802665923614	-0.1591655662376832	-0.013128476783388798	-0.03513190569773128	-0.11804526745635362	0.340423946445	0.436112310787	0.527990680582	0.354199901149	0.809021331888	1.0	0.248193451531	0.444064484515	0.397602565759	0.716953652062	0.989287003123	0.397602565759	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr15:45571390..45571504,-__320.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr15:45571390..45571504,-__320.1.0.0	rs1719231,rs78212061	2.553400219140066	2.7659295086525444	2.611173071565368	2.37062101813604	2.5884579759143658	2.548422074394032	2.7238074270701977	2.7325053760851223	2.7003139917178114	2.738522631940412	2.764835023847304	2.8646526523781954	2.6635534142367887	2.511401962856249	2.7072933630383575	2.4759189663894814	2.255737765838039	2.456374890841796	2.5578296096049673	2.6609973712278427	2.7891185000697734	2.5733166089560924	2.7622220119865983	2.881901690310663	2.814530987069258	2.6205536440157595	-0.041998256283816815	-0.05863614561418684	-0.13525410517588643	-0.114883252298001	-0.1320830850725696	0.009407535210935514	-0.062810055842355	0.056613123984651015	-0.126997382761719	0.023699380046186214	0.11706666646335906	-0.05012166530893758	-0.042999770221028376	0.83513271997	0.788281320858	0.628827692687	0.727009731456	0.90381429355	0.8931878581	0.527990680582	0.946473618223	0.460214637573	0.90381429355	0.29495293544	0.397602565759	0.982972643463	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr15:48624018..48624132,-__322.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr15:48624018..48624132,-__322.1.0.0	rs28381100	-1.2726885233773388	-1.808153512776651	-1.5706978790284385	-0.8857204269758543	-1.0724073478292961	-1.6280689858420274	-0.95082875209819	-1.4343615503746314	-0.5221496248287837	-1.5340816781740136	-1.39412923835838	-1.053598638331614	-1.2605738464996015	-1.1656637725237993	-1.238558802330678	-0.9524350107097621	-0.5325260373505799	-0.8522384567018184	-1.639843264786208	-0.714583711575158	-1.1710159010628671	-0.8697364768305433	-0.8488165986175885	-1.1137476181070225	-1.46456531671058	-1.0469775806088837	0.10702475085353957	0.5695947104459731	0.6182628683186764	0.3531943896252744	0.22016889112747773	-0.011774278944180594	0.23624504052303197	0.2633456493117643	-0.34758685200175965	0.6852650795564251	0.2803816202513576	-0.41096667837896605	0.21359626589071787	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr15:48624018..48624132,-__322.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr15:48624018..48624132,-__322.1.0.0	rs28381101	-1.2726885233773388	-1.808153512776651	-1.5706978790284385	-0.8857204269758543	-1.0724073478292961	-1.6280689858420274	-0.95082875209819	-1.4343615503746314	-0.5221496248287837	-1.5340816781740136	-1.39412923835838	-1.053598638331614	-1.2605738464996015	-0.6240271174716124	-0.968395872511866	-0.2574294144818752	-1.154852002828203	-1.9342690284317785	-1.5370827493746368	-1.3514471988849592	-1.1106496689303649	-0.6337384248381375	-0.7720875939050533	-1.3974274245836469	-1.3951635657755093	-1.0947141718348037	0.6486614059057264	0.839757640264785	1.3132684645465633	-0.2691315758523487	-0.8618616806024824	0.09098623646739057	-0.4006184467867693	0.32371188144426655	-0.11158880000935378	0.7619940842689603	-0.003298186225266786	-0.3415649274438952	0.16585967466479798	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr15:48624018..48624132,-__322.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr15:48624018..48624132,-__322.1.0.0	rs191889282	-1.2726885233773388	-1.808153512776651	-1.5706978790284385	-0.8857204269758543	-1.0724073478292961	-1.6280689858420274	-0.95082875209819	-1.4343615503746314	-0.5221496248287837	-1.5340816781740136	-1.39412923835838	-1.053598638331614	-1.2605738464996015	-1.039896169296224	-1.5866123370759637	-1.4231572682739826	-1.2976605099748222	-1.1564525501940957	-0.9633224123078198	-0.8582378278164398	-0.9866643760746762	-1.1616881674916228	-1.4597363700221369	-1.4433595266651325	-1.155888515068429	-1.211056335855112	0.23279235408111476	0.22154117570068732	0.1475406107544559	-0.4119400829989679	-0.08404520236479951	0.6647465735342076	0.0925909242817502	0.44769717429995526	-0.6395385426628392	0.07434530815187679	-0.04923028830675236	-0.102289876736815	0.0495175106444895	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr15:48624018..48624132,-__322.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr15:48624018..48624132,-__322.1.0.0	rs553728626	-1.2726885233773388	-1.808153512776651	-1.5706978790284385	-0.8857204269758543	-1.0724073478292961	-1.6280689858420274	-0.95082875209819	-1.4343615503746314	-0.5221496248287837	-1.5340816781740136	-1.39412923835838	-1.053598638331614	-1.2605738464996015	-0.366644547673124	-0.3611164308961132	-1.3235707963904844	-0.3779363701754537	-0.9116494658915673	-0.4940144724301722	-0.8889207283191026	-0.6456007648172465	-0.7901051811174595	-1.2911710317258018	-0.8937357913551698	-1.146954695740637	-0.7909516897110277	0.9060439757042149	1.4470370818805378	0.24712708263795413	0.5077840568004006	0.16075788193772889	1.1340545134118551	0.06190802377908733	0.7887607855573849	-0.26795555628867584	0.2429106464482118	0.5003934470032103	-0.09335605740902286	0.4696221567885739	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr15:48624018..48624132,-__322.1.5.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr15:48624018..48624132,-__322.1.0.0	rs536339606	-1.2726885233773388	-1.808153512776651	-1.5706978790284385	-0.8857204269758543	-1.0724073478292961	-1.6280689858420274	-0.95082875209819	-1.4343615503746314	-0.5221496248287837	-1.5340816781740136	-1.39412923835838	-1.053598638331614	-1.2605738464996015	-1.2854739116113243	-1.0287953833598522	-1.0248295732091206	-1.2929144478679555	-0.6315023298995944	-0.7080333716126934	-0.5974135059681589	-0.7183021218530785	-2.052908141213425	-1.2224640166998304	-1.16683852324568	-1.4498898550380703	-1.098280431798232	-0.01278538823398545	0.7793581294167988	0.5458683058193179	-0.4071940208921012	0.4409050179297017	0.920035614229334	0.35341524613003106	0.7160594285215529	-1.5307585163846413	0.31161766147418324	0.22729071511270016	-0.3962912167064563	0.16229341470136957	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr15:48624018..48624132,-__322.1.5.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr15:48624018..48624132,-__322.1.0.0	rs28381100,rs28381101,rs191889282,rs553728626,rs536339606	-1.2726885233773388	-1.808153512776651	-1.5706978790284385	-0.8857204269758543	-1.0724073478292961	-1.6280689858420274	-0.95082875209819	-1.4343615503746314	-0.5221496248287837	-1.5340816781740136	-1.39412923835838	-1.053598638331614	-1.2605738464996015	0.8979757263560924	-0.02980019748854712	0.2517083071152271	0.24188703665764374	-0.22150222251723617	-0.6403668079993009	0.7324382829238448	0.3947428217647313	-0.05409306822306677	0.04769270938418483	-0.8150081908657739	-0.06275159875404972	0.06191023319614581	2.170664249733431	1.778353315288104	1.8224061861436656	1.127607463633498	0.85090512531206	0.9877021778427265	1.683267035022035	1.8291043721393627	0.46805655660571693	1.5817743875581984	0.5791210474926062	0.9908470395775644	1.3224840796957473	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr15:50647384..50647498,+__323.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr15:50647384..50647498,+__323.1.0.0	rs114496920	0.228835868508681	0.5674284094329993	0.22878107399324366	0.1395861879664757	0.2859743641856589	0.40347617791000073	0.050268437201768296	0.029799977741263698	0.3335155366547786	0.4838822384311346	0.3328209682664801	0.6061423707801921	0.3075426342560564	0.13183303275371341	0.16906002526510167	0.07911758228575816	0.0004318243820755352	0.0697501995625128	0.2458317416035548	-0.19807660556752532	-0.07120311024472237	0.05174050559058192	0.0018628887793043416	0.2308138249384012	-0.08146508145451772	0.05247473565785321	-0.0970028357549676	-0.39836838416789766	-0.1496634917074855	-0.13915436358440017	-0.21622416462314611	-0.15764443630644592	-0.24834504276929362	-0.10100308798598606	-0.2817750310641967	-0.48201934965183024	-0.10200714332807892	-0.6876074522347098	-0.25506789859820317	0.101398170673	0.0986283746992	0.202104162379	0.30750859871	0.00522462344006	0.162586850726	0.0610532783728	0.605190125793	0.0619890035232	0.000481108176159	0.256539812928	0.088148079887	3.48535399101e-06	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.377669918285	1	1	0.00292072664447	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr15:50647384..50647498,+__323.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr15:50647384..50647498,+__323.1.0.0	rs79469565	0.228835868508681	0.5674284094329993	0.22878107399324366	0.1395861879664757	0.2859743641856589	0.40347617791000073	0.050268437201768296	0.029799977741263698	0.3335155366547786	0.4838822384311346	0.3328209682664801	0.6061423707801921	0.3075426342560564	0.23194629215172527	0.29479491076804915	0.2309657628298841	0.21733156617199828	0.34352122739624535	0.0218235804434547	0.04422474200385198	-0.17865997043873708	0.4195070522555707	0.4581392637714722	0.37662608453225377	0.440904787635478	0.24176044162677057	0.0031104236430442578	-0.2726334986649502	0.0021846888366404416	0.07774537820552258	0.05754686321058644	-0.381652597466546	-0.006043695197916317	-0.20845994818000077	0.0859915156007921	-0.02574297465966241	0.04380511626577366	-0.16523758314471404	-0.06578219262928585	0.628827692687	0.347268461228	0.861430881609	0.757455001208	0.994643319531	0.0932701621097	0.628827692687	0.320413072024	0.978575937473	0.436112310787	0.925117039075	0.989287003123	0.992459768445	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr15:50647384..50647498,+__323.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr15:50647384..50647498,+__323.1.0.0	rs114496920,rs79469565	0.228835868508681	0.5674284094329993	0.22878107399324366	0.1395861879664757	0.2859743641856589	0.40347617791000073	0.050268437201768296	0.029799977741263698	0.3335155366547786	0.4838822384311346	0.3328209682664801	0.6061423707801921	0.3075426342560564	-0.10203346830426707	0.07012896111903721	0.03508121010084581	0.010230893681955795	0.1403183270600452	0.14662178019784367	-0.08852977308459856	-0.2214477377861025	0.18233826825595106	0.10804152313361692	0.039122403590192006	0.03954889334037824	0.02995177344207482	-0.33086933681294806	-0.4972994483139621	-0.19369986389239785	-0.12935529428451992	-0.1456560371256137	-0.25685439771215707	-0.13879821028636685	-0.2512477155273662	-0.15117726839882756	-0.37584071529751767	-0.2936985646762881	-0.5665934774398138	-0.2775908608139816	0.0785847853765	0.0350255264852	0.282745459933	0.687084607526	0.0374147936077	0.510582765025	0.206893929435	0.245454024731	0.428242856315	0.0374147936077	0.0763307839553	0.166665831608	0.000798402771051	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.181237429029	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr15:69707322..69707436,-__330.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr15:69707322..69707436,-__330.1.0.0	rs76176579	-0.16949148272040507	-0.26275167809589045	-0.4145507988470267	0.0293094266253149	-0.05031729202107022	-0.29672853552246814	-0.3497339075148693	-0.1124884987804358	-0.3710300872854986	-0.06275539982245516	0.1328879862080366	-0.3480778641835299	-0.18964401099669148	-0.5447932377800878	-0.4213919909254753	-0.4804472620108758	-0.5636198926939509	-0.4284879303257052	-0.34785358342730344	-0.6064778206574453	-0.6162101647569366	-0.7381244671717516	-0.40669537451217974	-0.561060526824058	-0.46651500974066884	-0.5151397717355365	-0.3753017550596828	-0.15864031282958485	-0.06589646316384906	-0.5929293193192657	-0.378170638304635	-0.0511250479048353	-0.25674391314257594	-0.5037216659765008	-0.36709437988625304	-0.3439399746897246	-0.6939485130320946	-0.11843714555713897	-0.32549576073884506	0.0986283746992	0.132622250874	0.226876581559	0.00201342137527	0.0368026762697	0.226876581559	0.313917214294	0.150801701171	0.119339994516	0.0548474154937	0.00327633608155	0.147021540231	7.89964273701e-07	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.000661990061361	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr15:76030923..76031037,-__332.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr15:76030923..76031037,-__332.1.0.0	rs12904654	0.9340761916519176	1.281381965834803	0.9224749365905814	0.8531388789347492	0.9433730647897138	0.9253159475722232	0.9456170056083923	1.022198333168782	1.1130145905281676	1.0905649283091188	0.888440368102943	1.1011321175601467	1.0017273607209616	0.6667915551428016	1.2466508943220067	1.0447508887675225	0.7948229270803913	1.0798390445903299	1.0443287588061896	0.7911407876381885	1.3294012350335676	1.0854477218245797	0.8646406145231149	0.8405454698062271	1.1494928625040766	0.9948210633365827	-0.26728463650911594	-0.0347310715127962	0.1222759521769411	-0.058315951854357895	0.13646597980061603	0.11901281123396634	-0.15447621797020383	0.3072029018647855	-0.027566868703587932	-0.22592431378600386	-0.04789489829671589	0.048360744943929834	-0.0069062973843785624	0.76769033028	0.554657938956	0.0856734395523	0.468411351413	0.0426112802219	0.107123399254	0.893186642743	0.0412580447575	0.282745459933	0.914457985151	0.136115392203	0.232080506959	0.071649071846	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr15:76030923..76031037,-__332.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr15:76030923..76031037,-__332.1.0.0	rs7181595	0.9340761916519176	1.281381965834803	0.9224749365905814	0.8531388789347492	0.9433730647897138	0.9253159475722232	0.9456170056083923	1.022198333168782	1.1130145905281676	1.0905649283091188	0.888440368102943	1.1011321175601467	1.0017273607209616	0.9192049295074728	1.1161155951794546	1.115000045539425	0.9728049116615016	1.2556966030853214	1.0370921580607395	1.1575447509232402	1.2620499611879945	0.9559231022936888	1.1891203935284174	1.3007296182184802	1.237717615115299	1.1265833070250861	-0.014871262144444786	-0.16526637065534833	0.19252510894884367	0.11966603272675247	0.31232353829560755	0.11177621048851627	0.21192774531484782	0.23985162801921245	-0.15709148823447883	0.09855546521929859	0.4122892501155372	0.13658549755515237	0.12485594630412471	0.706946403854	0.609889042629	0.581967350665	0.946473618223	0.107123399254	0.104225598099	0.276766468575	0.279742372288	0.143314270352	0.288805731951	0.0601351299193	0.591208103411	0.125336360162	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr15:76030923..76031037,-__332.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr15:76030923..76031037,-__332.1.0.0	rs12904654,rs7181595	0.9340761916519176	1.281381965834803	0.9224749365905814	0.8531388789347492	0.9433730647897138	0.9253159475722232	0.9456170056083923	1.022198333168782	1.1130145905281676	1.0905649283091188	0.888440368102943	1.1011321175601467	1.0017273607209616	0.752003361544199	1.0090366376135143	0.7153668824992698	0.8111164344962908	0.7634134185156297	1.0339438087632526	0.8578317108334852	0.9576915628999112	0.9221195693565748	0.910413210645814	0.9472164927629565	1.0491206316891113	0.8941061434683341	-0.18207283010771858	-0.27234532822128865	-0.2071080540913116	-0.04202244443845837	-0.17995964627408412	0.1086278611910294	-0.08778529477490715	-0.06450677026887086	-0.19089502117159285	-0.18015171766330473	0.05877612466001347	-0.052011485871035434	-0.10762121725262747	0.232080506959	0.0565651674203	0.428242856315	0.420456664513	0.727009731456	0.523605760741	0.485039624018	0.8931878581	0.259370210024	0.265084565602	0.581967350665	0.76769033028	0.368476659865	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr15:83419244..83419358,+__335.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr15:83419244..83419358,+__335.1.0.0	rs116006788	3.0335854878820703	3.374508631729902	2.8877003281622535	2.8680007465043724	3.1216214823619106	2.908908481824551	2.7796772278834796	3.073253873632546	3.010156779354419	3.288866443988483	3.0522129271078584	2.963665941924984	3.0301798626964023	3.1123562783701786	3.7518194605105384	2.981672815472638	2.706818457781555	3.167673533319863	3.2156065627310397	2.8968614628413407	3.2624247666437407	3.299892271729391	3.4268488635586616	3.4022316902453813	3.3915227481926715	3.2179774092830833	0.07877079048810831	0.3773108287806366	0.09397248731038443	-0.16118228872281737	0.046052050957952506	0.30669808090648853	0.11718423495786112	0.1891708930111946	0.28973549237497176	0.13798241957017865	0.3500187631375229	0.4278568062676875	0.1877975465866808	0.572794651112	0.125844655769	0.8931878581	0.914457985151	0.60051573606	0.192768091005	0.554657938956	0.30750859871	0.088148079887	0.0741264784486	0.116187990183	0.0362033618716	0.0697902693984	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr15:88120080..88120194,+__336.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr15:88120080..88120194,+__336.1.0.0	rs6496426	-1.291951847590387	-1.5236087856196647	-1.3111270214964965	-1.6044557545999054	-1.5593195976444694	-1.7909939025359662	-1.942912041650267	-1.8192164091836478	-1.6510383223531475	-1.7978168025055572	-1.671852230999693	-1.9608831554379051	-1.6604313226347591	-1.5623250472784402	-1.1392658234349022	-1.6736150786754849	-1.5358412402561723	-1.6175886019466696	-1.7984953854905732	-1.7180611402190746	-1.4781142238735678	-1.9116639307092416	-1.6758231368085172	-1.4170491679079351	-1.5896790445325404	-1.59312681842776	-0.2703731996880532	0.3843429621847625	-0.36248805717898835	0.06861451434373311	-0.05826900430220028	-0.007501482954606953	0.22485090143119235	0.34110218531007996	-0.26062560835609405	0.12199366569703995	0.25480306309175793	0.37120411090536476	0.06730450420699897	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr15:88120080..88120194,+__336.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr15:88120080..88120194,+__336.1.0.0	rs8026805	-1.291951847590387	-1.5236087856196647	-1.3111270214964965	-1.6044557545999054	-1.5593195976444694	-1.7909939025359662	-1.942912041650267	-1.8192164091836478	-1.6510383223531475	-1.7978168025055572	-1.671852230999693	-1.9608831554379051	-1.6604313226347591	-1.7544282753772644	-1.4487410772378981	-1.6696394625020017	-1.5277191516523752	-1.654131869128272	-1.527406634700269	-1.515311693470218	-1.6143885040081518	-1.9093028557012923	-2.1328221505030567	-2.0746212527973116	-1.8486817726802038	-1.7230995583131927	-0.46247642778687736	0.0748677083817666	-0.35851244100550517	0.07673660294753026	-0.09481227148380267	0.2635872678356972	0.427600348180049	0.20482790517549598	-0.2582645333481448	-0.3350053479974995	-0.40276902179761853	0.1122013827577013	-0.06266823567843398	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr15:88120080..88120194,+__336.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr15:88120080..88120194,+__336.1.0.0	rs6496426,rs8026805	-1.291951847590387	-1.5236087856196647	-1.3111270214964965	-1.6044557545999054	-1.5593195976444694	-1.7909939025359662	-1.942912041650267	-1.8192164091836478	-1.6510383223531475	-1.7978168025055572	-1.671852230999693	-1.9608831554379051	-1.6604313226347591	-1.646172466349401	-1.5015579020687224	-1.4008813505262196	-1.9879048728544633	-1.626878946100127	-2.1354165756143115	-1.5720488088401992	-1.3386130419323192	-2.017583824625433	-1.6086548544522912	-1.81299496389202	-2.115938289220682	-1.7303871580396823	-0.354220618759014	0.022050883550942313	-0.08975432902972313	-0.38344911825455785	-0.06755934845565759	-0.3444226730783453	0.37086323281006783	0.4806033672513286	-0.36654550227228544	0.18916194805326603	-0.14114273289232693	-0.1550551337827768	-0.06995583540492352	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr15:91260318..91260432,-__338.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr15:91260318..91260432,-__338.1.0.0	rs7164444	-0.8538728705056061	-0.6968217293323173	-0.7015289802532026	-0.8351089826347325	-0.7086371486018956	-0.6624405494637748	-0.5310529871356883	-0.4059457132649427	-0.3848929241219333	-0.7297425629327828	-0.6613894960462989	-0.561988105126563	-0.6444518374516449	-0.7249877483829862	-0.4381049088858095	-0.2693008325069901	-0.5385195214792999	-0.5328921020490673	-0.43481286382559015	-0.3809630706404754	-0.6493697820320462	-0.6150095011129972	-0.48589134165543424	-0.47219915370212523	-0.5240573201117275	-0.5055090121987124	0.12888512212261993	0.25871682044650784	0.43222814774621254	0.2965894611554326	0.1757450465528283	0.2276276856381847	0.15008991649521286	-0.24342406876710349	-0.23011657699106391	0.2438512212773486	0.1891903423441737	0.0379307850148356	0.13894282525293242	NA__no_active_tile	0.696989544957	0.29495293544	0.572794651112	0.788278954998	0.687084607526	0.581967350665	0.428242856315	0.501992688725	0.687084607526	0.721972635732	0.866708095346	0.865539927389	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr16:2014868..2014982,+__341.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr16:2014868..2014982,+__341.1.0.0	rs149683491	2.0465504658041445	2.2858315536935288	2.0390582230496292	1.9455075407918077	2.1632146202658786	2.175118742080379	2.2408005737990684	2.560951427640126	2.308584260267189	2.219910876724553	2.2080437080466098	2.332170436135839	2.210478535691563	2.258210917709149	2.5367158143164112	2.3264909087958885	2.1361450446096217	2.3429622796571623	2.461042163085179	2.3685126001430326	2.6564889498963797	2.5105721343266225	2.5072058409974374	2.5771657965176153	2.486000784211787	2.430626102855524	0.2116604519050047	0.2508842606228825	0.28743268574625924	0.19063750381781408	0.17974765939128368	0.2859234210048003	0.12771202634396417	0.09553752225625356	0.20198787405943364	0.28729496427288437	0.3691220884710056	0.15383034807594775	0.22014756716396114	0.183752894264	0.202104162379	0.265084565602	0.0986283746992	0.119339994516	0.0906800339379	0.510582765025	0.276771967065	0.0698833862508	0.0181189115857	0.0548474154937	0.202104162379	0.000117951054159	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0988429833855	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr16:2014868..2014982,+__341.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr16:2014868..2014982,+__341.1.0.0	rs17135720	2.0465504658041445	2.2858315536935288	2.0390582230496292	1.9455075407918077	2.1632146202658786	2.175118742080379	2.2408005737990684	2.560951427640126	2.308584260267189	2.219910876724553	2.2080437080466098	2.332170436135839	2.210478535691563	1.2868646022785182	1.556149028136053	1.5221675404514623	1.2265272819727115	1.5353180422437749	1.5239151989745423	1.6406819629732423	1.7852364293714678	1.688644687553181	1.6742006542947439	1.7373345280287351	1.6506537595437631	1.568974476318516	-0.7596858635256263	-0.7296825255574757	-0.516890682598167	-0.7189802588190961	-0.6278965780221037	-0.6512035431058365	-0.6001186108258261	-0.7757149982686584	-0.6199395727140078	-0.5457102224298092	-0.47070918001787465	-0.6815166765920759	-0.6415040593730464	4.11448729888e-06	0.000104264461287	0.000320085853942	0.000751093855117	5.66885732617e-06	2.96882111052e-05	1.12997083356e-05	0.00043495277549	2.34155615835e-05	9.98335414644e-06	1.2780782346e-05	1.95617684722e-05	6.74394683526e-43	0.00291305700761	0.0775727591976	0.238463961186	0.553556171222	0.0043763578558	0.0226817932844	0.00835048446005	0.316210667781	0.0181002291041	0.00783693300495	0.00982842162404	0.0152386176399	5.65142744795e-40	sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr16:2014868..2014982,+__341.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr16:2014868..2014982,+__341.1.0.0	rs2302176	2.0465504658041445	2.2858315536935288	2.0390582230496292	1.9455075407918077	2.1632146202658786	2.175118742080379	2.2408005737990684	2.560951427640126	2.308584260267189	2.219910876724553	2.2080437080466098	2.332170436135839	2.210478535691563	2.193623589695539	2.4840663892567583	2.285153440650854	2.059715818029555	2.2719686988480907	2.3266749892399523	2.405139947479599	2.507567640714276	2.487683544882966	2.494212314574719	2.422253552684177	2.493811524641372	2.369322620891488	0.1470731238913947	0.19823483556322952	0.24609521760122455	0.11420827723774729	0.10875407858221209	0.1515562471595735	0.16433937368053053	-0.053383786925849996	0.17909928461577707	0.2743014378501658	0.21420984463756731	0.16164108850553305	0.15884408519992546	0.104229562843	0.242741268695	0.170821264488	0.397602565759	0.29495293544	0.382791178922	0.747262025795	0.914457985151	0.147021540231	0.0484054419273	0.188220673538	0.158583637061	0.029076515985	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr16:2014868..2014982,+__341.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr16:2014868..2014982,+__341.1.0.0	rs149683491,rs17135720,rs2302176,rs2302177	2.0465504658041445	2.2858315536935288	2.0390582230496292	1.9455075407918077	2.1632146202658786	2.175118742080379	2.2408005737990684	2.560951427640126	2.308584260267189	2.219910876724553	2.2080437080466098	2.332170436135839	2.210478535691563	1.4616917081216618	1.7213054766948421	1.6012021971344468	1.6238678653880088	1.7819134167904742	1.5642371027533075	1.6376559057794533	1.8649242910633952	1.797257510999871	1.878943572456532	1.7114627583087128	1.8338744139546452	1.7065280182871125	-0.5848587576824826	-0.5645260769986866	-0.43785602591518247	-0.3216396754037989	-0.3813012034754044	-0.6108816393270713	-0.6031446680196151	-0.696027136576731	-0.5113267492673179	-0.340967304268021	-0.496580949737897	-0.49829602218119384	-0.5039505174044502	0.0010031111026	0.00406065558642	0.0258200569765	0.0484054419273	0.00389134425826	1.53542809806e-05	1.95617684722e-05	0.00127069654712	0.000413457613232	0.000137117000352	0.000273955335251	0.000373410950373	4.38731133615e-27	0.194603553905	0.820252428457	1	1	0.797725572943	0.00308621047709	0.00391235369445	0.247785826688	0.0851722683259	0.0285203360732	0.0561608437265	0.0769226557769	9.95919673306e-25	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr16:21312125..21312239,+__342.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr16:21312125..21312239,+__342.1.0.0	rs155931	0.05984752623173617	0.38069661610657946	0.06799513820910039	0.05744556586642626	0.4561133965990416	0.4466060492170647	0.5100861457490088	0.6164903896589405	0.38692566861397576	0.47741402920246395	0.3967761858497607	0.3948381180699444	0.3542695691145035	0.39478665308939465	0.4961606111290783	0.6186450146176095	0.2549750117504452	0.6209473644856238	0.6611828870320418	0.6359260086245745	0.6839420443974601	0.49880072457532365	0.40438998868833337	0.6104728584894676	0.6448558268405948	0.5437570828099956	0.3349391268576585	0.11546399502249882	0.550649876408509	0.1975294458840189	0.16483396788658222	0.21457683781497705	0.1258398628755657	0.06745165473851955	0.11187505596134789	-0.07302404051413058	0.21369667263970693	0.25001770877065044	0.18948751369549208	0.0426112802219	0.460214637573	0.00784715402968	0.390154148302	0.0258200569765	0.0698833862508	0.237368605078	0.88258056334	0.333666485083	0.757452311924	0.242735875888	0.276771967065	0.00714211910486	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr16:21312125..21312239,+__342.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr16:21312125..21312239,+__342.1.0.0	rs74012159	0.05984752623173617	0.38069661610657946	0.06799513820910039	0.05744556586642626	0.4561133965990416	0.4466060492170647	0.5100861457490088	0.6164903896589405	0.38692566861397576	0.47741402920246395	0.3967761858497607	0.3948381180699444	0.3542695691145035	0.19160607638737703	0.615467116225294	0.3529155048553176	0.16906054941234683	0.35823799398910594	0.40206544306411585	0.45023104505063793	0.7610628796595538	0.4116453141115765	0.44526500116304524	0.6132717669209904	0.5524716354858445	0.4436083605271004	0.13175855015564086	0.2347705001187146	0.2849203666462172	0.11161498354592056	-0.09787540260993566	-0.04454060615294886	-0.059855100698370856	0.14457249000061323	0.02471964549760075	-0.032149028039418714	0.21649558107122968	0.15763351741590015	0.08933879141259693	0.288805731951	0.326996172605	0.158583637061	0.436112310787	0.619326784864	0.777966336216	0.809021331888	0.819442862795	0.420456664513	0.803820918046	0.301187193336	0.154655491485	0.477822837066	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr16:21312125..21312239,+__342.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr16:21312125..21312239,+__342.1.0.0	rs155931,rs74012159	0.05984752623173617	0.38069661610657946	0.06799513820910039	0.05744556586642626	0.4561133965990416	0.4466060492170647	0.5100861457490088	0.6164903896589405	0.38692566861397576	0.47741402920246395	0.3967761858497607	0.3948381180699444	0.3542695691145035	0.3370557735196356	0.6176518126677739	0.3829899785861013	0.5136786657950447	0.3699347895437653	0.3712242096264389	0.3888017490930895	0.4701096715000626	0.4542987600501656	0.5914091123341335	0.6094516678992302	0.7493215863255379	0.4879939814117482	0.27720824728789945	0.23695519656119446	0.3149948403770009	0.4562330999286185	-0.0861786070552763	-0.07538183959062583	-0.12128439665591928	-0.14638071815887793	0.06737309143618986	0.11399508313166956	0.2126754820494695	0.3544834682555935	0.13372441229724466	0.107123399254	0.202104162379	0.0565651674203	0.0638899216795	0.361218104761	0.706946403854	0.951818833033	0.563691144959	0.76769033028	0.619326784864	0.147021540231	0.0763307839553	0.0913704605533	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr16:54963049..54963163,-__346.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr16:54963049..54963163,-__346.1.0.0	rs12599623	-0.32175741929559437	-0.49789094120391064	-0.645459655760397	-0.6050485505184883	-0.7791351312605109	-0.5956053131653756	-0.6632109431237001	-0.3670929309217016	-0.5666227100022171	-0.5702746064026375	-0.6764020122074013	-0.6178602679692335	-0.5755300401525975	-0.9694715935373348	-0.8193653228376014	-0.6908045569797423	-1.0257599078559798	-0.8161007828104826	-0.7541014181203408	-0.8217132705717508	-0.4045038098736237	-0.6583880500837415	-0.9780673189181034	-0.6904535450095266	-0.8115150706989955	-0.7866870539414353	-0.6477141742417405	-0.3214743816336908	-0.04534490121934531	-0.42071135733749154	-0.03696565154997167	-0.15849610495496524	-0.1585023274480507	-0.03741087895192213	-0.09176534008152437	-0.4077927125154659	-0.014051532802125344	-0.193654802729762	-0.21115701378883797	0.0162407194134	0.0531733827136	0.237368605078	0.00654737116888	NA__no_active_tile	0.0426112802219	0.175053819161	0.757455001208	0.501992688725	NA__no_active_tile	0.88258056334	0.444064484515	0.00650021242562	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr16:54963049..54963163,-__346.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr16:54963049..54963163,-__346.1.0.0	rs147144457	-0.32175741929559437	-0.49789094120391064	-0.645459655760397	-0.6050485505184883	-0.7791351312605109	-0.5956053131653756	-0.6632109431237001	-0.3670929309217016	-0.5666227100022171	-0.5702746064026375	-0.6764020122074013	-0.6178602679692335	-0.5755300401525975	-0.2565477948369099	-0.37351353952327343	-0.3914884171821577	-0.7605604951100874	-0.4468047228615745	-0.5584824266611442	-0.31352867683672664	-0.0905522218914882	-0.13212740044661442	-1.0641483933822486	-0.4540738616360778	-0.4109332758763498	-0.4377301021870545	0.06520962445868445	0.12437740168063721	0.2539712385782393	-0.15551194459159912	0.3323304083989364	0.037122886504231345	0.34968226628697346	0.2765407090302134	0.43449530955560267	-0.49387378697961115	0.22232815057132344	0.20692699209288373	0.13779993796554293	0.9571663388	0.554657938956	0.501992688725	0.147021540231	0.150801701171	0.248198866138	0.829896383209	0.809021331888	0.195066735841	NA__no_active_tile	0.226876581559	0.777966336216	0.510045935208	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr16:54963049..54963163,-__346.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr16:54963049..54963163,-__346.1.0.0	rs12599623,rs147144457	-0.32175741929559437	-0.49789094120391064	-0.645459655760397	-0.6050485505184883	-0.7791351312605109	-0.5956053131653756	-0.6632109431237001	-0.3670929309217016	-0.5666227100022171	-0.5702746064026375	-0.6764020122074013	-0.6178602679692335	-0.5755300401525975	-0.5640274453569941	-0.31873920881944423	-0.5476110484978939	-0.7151776514075835	-0.23710479445691907	-0.5732315045822046	-0.7023538750084137	-0.12847081784886075	-0.6563330155800468	-0.7528245851882079	-0.6669339058695305	-0.5336876728306897	-0.5330412937872323	-0.24227002606139975	0.1791517323844664	0.0978486072625031	-0.11012910088909522	0.5420303368035919	0.02237380858317095	-0.03914293188471363	0.23862211307284084	-0.08971030557782966	-0.18254997878557044	0.009468106337870763	0.0841725951385438	0.04248874636536493	0.221756412245	0.672324307433	0.204483664188	0.0906763403324	0.0785847853765	0.170821264488	0.134355585812	0.819442862795	0.633597542154	NA__no_active_tile	0.619326784864	0.935789553219	0.193000909369	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr16:66442347..66442461,+__347.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr16:66442347..66442461,+__347.1.0.0	rs2289149	1.533407009912301	1.8533607731804214	1.3182445834309093	1.4761089514136794	1.5728765082201326	1.5673523639554037	1.664978820770457	1.5676867865197046	1.6066853016589204	1.70608740662286	1.7774255063250255	1.670584091734237	1.6095665086453377	2.3636774007717225	2.644807293378586	2.170519154503142	2.151219649743659	2.418151284140999	2.525918917047841	2.592819105963365	2.7300020446123034	2.5543359846220235	2.4971972438387247	2.510267675554435	2.4428308210555083	2.4668122146026925	0.8302703908594216	0.7914465201981646	0.8522745710722326	0.6751106983299797	0.8452747759208665	0.9585665530924374	0.9278402851929082	1.1623152580925988	0.9476506829631031	0.7911098372158647	0.7328421692294094	0.7722467293212714	0.8572457059573547	5.66885732617e-06	2.79850783474e-05	5.31875791367e-06	0.000320085853942	2.00209749007e-06	3.16622650145e-08	4.77393269186e-07	5.12013208431e-07	8.9082802627e-07	1.53272450794e-06	7.2450725415e-07	1.53272450794e-06	5.17611204346e-57	0.00401355098693	0.0208208982905	0.00396247464568	0.235903274355	0.00154561926234	2.41899704711e-05	0.000352793625928	0.000372233602529	0.000688610064307	0.00120318873873	0.000557146078442	0.00119399239169	4.33758189242e-54	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr16:699214..699328,-__348.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr16:699214..699328,-__348.1.0.0	rs2272864	2.4787460382226114	2.6578395290605794	2.1820060112981423	1.9435570527381616	2.5026019702391746	2.466675844733347	2.070694405193116	2.405031564031451	2.509770272204107	2.4310223461418934	2.2874431740572883	2.6117216500435916	2.378925821496955	2.2582570349987616	2.3759436936663354	2.09082419205124	2.087169520191705	2.266168955220748	2.3407818165396157	2.05373289155454	2.2929374913890808	2.228231084555495	2.1991807029394432	2.293545829887609	2.1734329065463984	2.221683843295081	-0.2204890032238498	-0.281895835394244	-0.0911818192469025	0.1436124674535435	-0.23643301501842684	-0.12589402819373108	-0.016961513638575898	-0.11209407264237026	-0.28153918764861174	-0.23184164320245015	0.006102655830320547	-0.43828874349719316	-0.15724197820187427	0.0249397487324	0.0719809426143	1.0	0.803820918046	0.0638899216795	0.179364149792	0.66743649171	0.777966336216	0.00470673488948	0.248198866138	0.132622250874	0.0515422504639	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr17:13972761..13972875,-__350.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr17:13972761..13972875,-__350.1.0.0	rs6502330	2.577100213937293	3.036962291120865	2.699358853076797	2.6185839675425275	2.8153586818626506	2.8785525700826384	2.7197602003866246	2.6432111018321	2.7822682618853034	2.7097119200650592	2.8552226466398705	2.888161976036966	2.7686877237057246	2.542478268416568	2.8871233683314803	2.5595460152312888	2.379749612533518	2.7812323622669184	2.5279233876979506	2.1931274066456568	2.347082375044913	2.5668153219345053	2.6859385749257183	2.5332663097605983	2.4516131808282275	2.5379913486347787	-0.03462194552072484	-0.14983892278938482	-0.13981283784550813	-0.2388343550090095	-0.0341263195957322	-0.3506291823846879	-0.5266327937409678	-0.29612872678718727	-0.21545293995079806	-0.02377334513934093	-0.32195633687927216	-0.43654879520873857	-0.230696375070946	0.357692665759	0.259370210024	0.572794651112	0.136115392203	0.767687747466	0.0499532058383	0.361218104761	0.320413072024	0.282745459933	0.581967350665	0.313917214294	0.0249397487324	0.0308251952926	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr17:13972761..13972875,-__350.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr17:13972761..13972875,-__350.1.0.0	rs28680987	2.577100213937293	3.036962291120865	2.699358853076797	2.6185839675425275	2.8153586818626506	2.8785525700826384	2.7197602003866246	2.6432111018321	2.7822682618853034	2.7097119200650592	2.8552226466398705	2.888161976036966	2.7686877237057246	2.926844672813803	3.3180349626260077	2.848894839922547	2.462557362642654	3.0861023297005907	3.0301608789599053	2.6905171859391555	2.7869595350683607	3.0190846281444355	3.021187223802782	3.058241137201727	2.9823346433683504	2.93590995001586	0.34974445887650996	0.2810726715051426	0.1495359868457502	-0.15602660489987352	0.27074364783794014	0.15160830887726684	-0.02924301444746913	0.14374843323626063	0.23681636625913205	0.3114753037377227	0.2030184905618566	0.0941726673313843	0.16722222631013528	0.125844655769	0.232080506959	0.375513989452	1.0	0.0574378409847	0.0698833862508	0.276771967065	0.354199901149	0.192768091005	0.0258200569765	0.0548474154937	0.320413072024	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr17:13972761..13972875,-__350.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr17:13972761..13972875,-__350.1.0.0	rs77877576	2.577100213937293	3.036962291120865	2.699358853076797	2.6185839675425275	2.8153586818626506	2.8785525700826384	2.7197602003866246	2.6432111018321	2.7822682618853034	2.7097119200650592	2.8552226466398705	2.888161976036966	2.7686877237057246	2.6617462205728253	2.915636711737964	2.599821830319761	2.3050988584984258	2.7055660383647795	2.6221910356936924	2.41408135122633	2.748934541663745	2.833721713756145	2.7551660585868256	2.744751930919021	2.6085617208033387	2.6596065010119045	0.08464600663553234	-0.12132557938290134	-0.09953702275703602	-0.31348510904410176	-0.1097926434978711	-0.25636153438894604	-0.3056788491602944	0.10572343983164512	0.051453451870841604	0.045454138521766385	-0.11047071572084954	-0.2796002552336274	-0.10908122269382019	0.677233097055	0.752350373358	0.368322877114	0.183752894264	0.85089220831	0.192768091005	0.925117039075	0.8931878581	0.819442862795	0.989287003123	0.63839046467	0.166665831608	0.939151141463	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr17:13972761..13972875,-__350.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr17:13972761..13972875,-__350.1.0.0	rs6502330,rs28680987,rs77877576	2.577100213937293	3.036962291120865	2.699358853076797	2.6185839675425275	2.8153586818626506	2.8785525700826384	2.7197602003866246	2.6432111018321	2.7822682618853034	2.7097119200650592	2.8552226466398705	2.888161976036966	2.7686877237057246	2.954327121711573	3.1264674666733545	2.663211939697156	2.38448591888244	2.7919958268577103	2.8334326898106585	2.549723924723561	2.6254448145708458	2.709329443693324	2.762904683853117	2.7057026840070684	2.8310912882618324	2.744843150228554	0.37722690777428003	0.08950517555248938	-0.03614691337964082	-0.23409804866008743	-0.023362855004940286	-0.045119880271979884	-0.17003627566306356	-0.017766287261254288	-0.07293881819197923	0.05319276378805782	-0.1495199626328021	-0.05707068777513369	-0.02384457347717117	0.696989544957	0.677233097055	0.301187193336	0.101398170673	0.777966336216	0.696989544957	0.696989544957	0.609889042629	0.581967350665	0.60051573606	0.397602565759	0.687084607526	0.712927356593	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr17:16342543..16342657,+__354.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr17:16342543..16342657,+__354.1.0.0	rs35517418	-1.5138912710480281	-1.0318464090103767	-1.3451369175413803	-1.1849960680306686	-1.457350133560095	-1.0623341049766457	-1.068300308914982	-1.5113619085973253	-1.0588291543526789	-1.2075043369623613	-1.2120897038420462	-1.6743631966745731	-1.2773336261259303	-0.5458470565271059	-0.8880403505739795	-0.7680032788548656	-0.40704241255603374	-0.7155816147114129	-0.961693161362184	-0.7403273894054859	-1.015689456244226	-1.0601994668283878	-1.2414252586741137	-0.8516913466693514	-0.8714135007489607	-0.8389128577630091	0.9680442145209223	0.14380605843639727	0.5771336386865147	0.7779536554746349	0.741768518848682	0.10064094361446174	0.32797291950949614	0.4956724523530993	-0.0013703124757089569	-0.03392092171175243	0.36039835717269475	0.8029496959256124	0.43842076836292115	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	0.0362033618716	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0362033618716	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr17:19015911..19016025,-__356.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr17:19015911..19016025,-__356.1.0.0	rs377483205	1.7858351008686357	1.8553407190965716	1.7065633177557609	1.6183070097260182	1.6840925784930965	1.9540939305210623	1.1095198820711318	1.1220248633492327	1.8665264820850225	1.8991771989109347	1.6251696361551733	1.7391063304522767	1.6638130874570765	1.515357427431156	1.5824631743897237	1.5722922212306525	1.7520150135962496	1.5181960835860557	1.7853562520640516	0.888631301465516	0.8835859918463707	1.441338496683053	1.4612696067031865	1.558055240290504	1.6273969492411537	1.465496479877306	-0.27047767343747964	-0.2728775447068479	-0.13427109652510838	0.1337080038702314	-0.16589649490704073	-0.1687376784570107	-0.22088858060561578	-0.23843887150286203	-0.42518798540196956	-0.4379075922077482	-0.06711439586466939	-0.11170938121112295	-0.19831660757977032	0.460214637573	0.333666485083	0.677233097055	0.591208103411	0.382791178922	0.340423946445	0.340423946445	0.436112310787	0.0350255264852	0.0306357720046	0.510582765025	0.368322877114	0.069950831177	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr17:19015911..19016025,-__356.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr17:19015911..19016025,-__356.1.0.0	rs556668068	1.7858351008686357	1.8553407190965716	1.7065633177557609	1.6183070097260182	1.6840925784930965	1.9540939305210623	1.1095198820711318	1.1220248633492327	1.8665264820850225	1.8991771989109347	1.6251696361551733	1.7391063304522767	1.6638130874570765	1.4410661606693616	1.8029889049868004	1.4475007469076457	1.4441681063651064	1.5424609911406972	1.6456001968461087	0.851349253543739	1.0118183788820236	1.4718033193348163	1.5299553042853917	1.4119011778700177	1.6992425511448581	1.4416545909980474	-0.3447689401992742	-0.05235181410977119	-0.2590625708481151	-0.17413890336091176	-0.14163158735239922	-0.3084937336749536	-0.2581706285273928	-0.11020648446720904	-0.39472316275020614	-0.369221894625543	-0.21326845828515562	-0.03986377930741858	-0.2221584964590292	0.232080506959	0.347268461228	0.66743649171	0.188220673538	0.333666485083	0.101398170673	0.206893929435	0.687084607526	0.0548474154937	0.0125089884503	0.162586850726	0.510582765025	0.00761157215805	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr17:19015911..19016025,-__356.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr17:19015911..19016025,-__356.1.0.0	rs370710089	1.7858351008686357	1.8553407190965716	1.7065633177557609	1.6183070097260182	1.6840925784930965	1.9540939305210623	1.1095198820711318	1.1220248633492327	1.8665264820850225	1.8991771989109347	1.6251696361551733	1.7391063304522767	1.6638130874570765	1.7490454798313775	2.0428707884444206	1.8324502642081972	1.6706401628965013	1.798378149503468	2.0925510721324967	1.1930292862732412	1.4051981449450404	1.822909302504199	1.765179123337136	1.7236590951708388	1.6996907794290914	1.7329668040563337	-0.03678962103725825	0.187530069347849	0.12588694645243637	0.05233315317048315	0.11428557101037162	0.1384571416114344	0.0835094042021094	0.2831732815958077	-0.04361717958082356	-0.13399807557379884	0.09848945901566553	-0.03941555102318528	0.0691537165992576	0.737113058664	0.554657938956	0.460214637573	0.737113058664	0.444064484515	0.444064484515	0.989287003123	0.340423946445	0.967868733231	0.581967350665	0.536806685117	0.957167318493	0.974883509432	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr17:19015911..19016025,-__356.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr17:19015911..19016025,-__356.1.0.0	rs377483205,rs556668068,rs370710089	1.7858351008686357	1.8553407190965716	1.7065633177557609	1.6183070097260182	1.6840925784930965	1.9540939305210623	1.1095198820711318	1.1220248633492327	1.8665264820850225	1.8991771989109347	1.6251696361551733	1.7391063304522767	1.6638130874570765	1.6536960255566693	1.687793385629803	1.8832858632147615	1.5399619748825852	1.8615705041640493	1.7251604627904367	1.1677436786269868	1.2938597338523303	1.9712798398791191	1.7436796760981808	1.6675277371769464	1.8075965782730004	1.6669296216787393	-0.13213907531196645	-0.16754733346676853	0.17672254545900068	-0.07834503484343291	0.17747792567095289	-0.22893346773062562	0.05822379655585497	0.17183487050309765	0.10475335779409667	-0.15549752281275397	0.042358101021773065	0.06849024782072366	0.0031165342216626737	0.493479697885	0.957167318493	0.493479697885	0.563691144959	0.957167318493	0.0906800339379	0.757455001208	0.361218104761	0.747262025795	0.66743649171	0.87199428352	0.706946403854	0.938774565265	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr17:20771760..20771874,+__357.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr17:20771760..20771874,+__357.1.0.0	rs75931850	-1.0611678836033185	-0.857288255588781	-0.9939323607037764	-1.0502114298459257	-0.8722609637416917	-0.7695958091690587	-0.7307253741365501	-1.1217817091193831	-1.0081546504467265	-0.662118542910014	-0.7275920162804189	-0.8185032261174553	-0.8894443518052583	-1.378143941211189	-1.2507760650887312	-1.8262731066022009	-1.4815055998859719	-1.5424405131840158	-1.5378996323732677	-1.9139569278443516	-1.3806369215507255	-1.456291346533515	-1.556497246348719	-1.888914322601519	-1.306679214259156	-1.5433345697902803	-0.3169760576078706	-0.3934878094999502	-0.8323407458984244	-0.4312941700400461	-0.670179549442324	-0.768303823204209	-1.1832315537078015	-0.25885521243134235	-0.4481366960867885	-0.894378703438705	-1.1613223063211002	-0.4881759881417006	-0.653890217985022	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00146142948273	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00300328973882	5.30832986734e-05	NA__no_active_tile	1.49428800975e-08	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	0.0408210566798	NA__no_active_tile	1.25221335217e-05	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	sig	NA__too_many_rep_NAs	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr17:20771760..20771874,+__357.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr17:20771760..20771874,+__357.1.0.0	rs562129808	-1.0611678836033185	-0.857288255588781	-0.9939323607037764	-1.0502114298459257	-0.8722609637416917	-0.7695958091690587	-0.7307253741365501	-1.1217817091193831	-1.0081546504467265	-0.662118542910014	-0.7275920162804189	-0.8185032261174553	-0.8894443518052583	-0.9677338102805216	-0.5088724005955297	-1.1202761201701366	-0.65010561136731	-0.6773394644292471	-0.5345635971169453	-0.5854093370486995	-0.8006559067991039	-1.127724413063244	-1.2199760427929518	-0.8523680994849856	-0.9089984597447596	-0.829501938574453	0.09343407332279685	0.34841585499325123	-0.12634375946636012	0.4001058184786157	0.19492149931244462	0.23503221205211333	0.14531603708785068	0.3211258023202792	-0.11956976261651753	-0.5578574998829378	-0.12477608320456668	-0.09049523362730427	0.05994241323080544	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.893186642743	0.706946403854	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0258200569765	0.333666485083	NA__no_active_tile	0.384418579884	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr17:20771760..20771874,+__357.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr17:20771760..20771874,+__357.1.0.0	rs75931850,rs562129808	-1.0611678836033185	-0.857288255588781	-0.9939323607037764	-1.0502114298459257	-0.8722609637416917	-0.7695958091690587	-0.7307253741365501	-1.1217817091193831	-1.0081546504467265	-0.662118542910014	-0.7275920162804189	-0.8185032261174553	-0.8894443518052583	-1.1098343338727072	-1.1552508803540555	-1.3810585633578654	-1.4509343057443476	-1.4314574954902994	-1.394698899620026	-1.424524869165788	-1.034559140669692	-1.3965333656777688	-1.0917001983809531	-1.479353132613885	-1.5890867225109642	-1.3282493256215295	-0.04866645026938876	-0.2979626247652746	-0.3871262026540889	-0.4007228758984218	-0.5591965317486077	-0.6251030904509673	-0.6937994950292378	0.08722256844969123	-0.3883787152310423	-0.42958165547093907	-0.751761116333466	-0.7705834963935089	-0.438804973816271	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00153065306427	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0115927323179	0.00955750115232	NA__no_active_tile	6.11294569099e-06	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.313783878175	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	0.00138763867185	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr17:21117577..21117691,+__359.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr17:21117577..21117691,+__359.1.0.0	rs3744223	1.6251458474494598	2.343824519346962	1.4838547938524271	1.6567320530894174	1.9997297475353375	1.6548593917024899	1.566258491924656	2.221119380599234	1.1161992030721728	1.5736661421165028	1.1928739028453803	1.5034080787363338	1.6614726293558648	2.0554756758285344	2.3066058844630355	2.171037750910839	1.8291335756547609	2.2836962155996785	2.127723550132575	2.032662302015357	2.301366615472217	1.9980426501010893	2.266658636945442	2.048751499406909	2.371754161801351	2.149409043194316	0.43032982837907463	-0.037218634883926516	0.6871829570584118	0.17240152256534347	0.283966468064341	0.4728641584300852	0.46640381009070087	0.0802472348729828	0.8818434470289165	0.692992494828939	0.8558775965615286	0.8683460830650174	0.48793641383845116	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.183752894264	0.648013768535	0.989287003123	0.706946403854	0.877350444839	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr17:21117577..21117691,+__359.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr17:21117577..21117691,+__359.1.0.0	rs61121321	1.6251458474494598	2.343824519346962	1.4838547938524271	1.6567320530894174	1.9997297475353375	1.6548593917024899	1.566258491924656	2.221119380599234	1.1161992030721728	1.5736661421165028	1.1928739028453803	1.5034080787363338	1.6614726293558648	0.24720560331917213	0.22736656756272766	1.0054268786664988	0.6088996149764327	0.7320762955944251	0.5680190015662406	0.4237188997255285	1.1105053693130138	0.7304838389169802	0.35264643383174094	1.0714125772538652	0.1633170172715908	0.6034231748331848	-1.3779402441302877	-2.116457951784234	-0.4784279151859283	-1.0478324381129847	-1.2676534519409124	-1.0868403901362491	-1.1425395921991275	-1.1106140112862204	-0.3857153641551926	-1.2210197082847618	-0.12146132559151512	-1.340091061464743	-1.0580494545226797	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr17:21117577..21117691,+__359.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr17:21117577..21117691,+__359.1.0.0	rs3744223,rs61121321	1.6251458474494598	2.343824519346962	1.4838547938524271	1.6567320530894174	1.9997297475353375	1.6548593917024899	1.566258491924656	2.221119380599234	1.1161992030721728	1.5736661421165028	1.1928739028453803	1.5034080787363338	1.6614726293558648	1.8232446326705727	1.9588393546696308	1.8442064102430114	1.6545431721904498	2.2004443496353017	1.8917136337049305	1.8582978191890511	2.3986927038360237	2.0868600917634836	1.9609545248325608	1.7651555474182123	1.9256623676505984	1.9473845506503193	0.1980987852211129	-0.38498516467733124	0.3603516163905842	-0.0021888808989676267	0.20071460209996417	0.23685424200244065	0.2920393272643951	0.17757332323678954	0.9706608886913108	0.38728838271605803	0.572281644572832	0.42225428891426464	0.28591192129445436	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.340423946445	0.87199428352	0.382791178922	0.845630974801	0.764895457718	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr17:46667702..46667816,+__365.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr17:46667702..46667816,+__365.1.0.0	rs114686333	-1.6135759081573768	-1.4318926995556969	-1.533597561144719	-1.7172139660254984	-1.8812601972819873	-1.7463432563664365	-1.661920402911004	-1.7982070206305447	-1.457797637942308	-2.0070058418389505	-1.7484974937943754	-1.6099565343358357	-1.6839390433320611	-1.8532787088180764	-1.4524384895974718	-1.748627268551588	-1.4472502926912294	-1.8129671723168608	-1.759238133319763	-1.9565953932945284	-2.2510201048055847	-2.052908141213425	-2.1534974865811014	-1.778819515558565	-1.7804970225324899	-1.8372614774400569	-0.2397028006606996	-0.020545790041774925	-0.215029707406869	0.26996367333426896	0.06829302496512657	-0.012894876953326584	-0.2946749903835244	-0.45281308417503996	-0.5951105032711168	-0.14649164474215093	-0.030322021764189744	-0.17054048819665413	-0.15332243410799587	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr17:5015167..5015281,+__367.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr17:5015167..5015281,+__367.1.0.0	rs113640298	3.435457866673814	3.954701632270462	3.442599201967321	3.0426061901189394	3.525791159562949	3.565667763831523	3.3403043294970063	3.7929423118886723	3.695425048190182	3.641377408877742	3.6509945594200666	3.602740273169626	3.557550645455692	3.665056223448025	4.042215594127608	3.4953305982947493	3.1512550075515264	3.581524668437265	3.75966490639266	3.511797481991129	3.8622374199671454	3.797529777795109	3.786920171844432	3.8010628327600138	3.8551691717832575	3.6924803211994095	0.2295983567742108	0.08751396185714633	0.05273139632742829	0.10864881743258703	0.05573350887431605	0.1939971425611371	0.17149315249412256	0.06929510807847317	0.10210472960492734	0.14554276296668966	0.1500682733399472	0.2524288986136316	0.13492967574371809	0.183752894264	0.202104162379	0.347268461228	0.368322877114	0.313917214294	0.088148079887	0.253741740693	0.259370210024	0.259370210024	0.259370210024	0.253741740693	0.0698833862508	0.00453454688383	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr17:72209446..72209560,-__370.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr17:72209446..72209560,-__370.1.0.0	rs116380597	-0.3409383780185518	-0.1356729297793586	-0.05033395625152987	-0.4899545154360177	0.36024458295028383	-0.056051694518297855	0.1492322707429963	-0.1804629615903523	-0.2697793072269322	-0.5405404682232448	-0.3507452074835227	0.2907773483477065	-0.13451876804056842	-0.32649072456830797	-0.6129046710304392	-0.6183632337272211	-0.6401461276955919	-0.7473652056918717	-0.4501470844799484	-0.6689223130815172	-0.2946561668087038	-0.6175840894594214	-0.5882835678502083	-0.2013726339037097	-0.14107536291569406	-0.4922759317677196	0.014447653450243847	-0.4772317412510806	-0.5680292774756912	-0.15019161225957417	-1.1076097886421556	-0.39409538996165056	-0.8181545838245134	-0.11419320521835152	-0.34780478223248923	-0.04774309962696355	0.149372573579813	-0.4318527112634006	-0.3577571637271511	0.732052639825	0.946473618223	0.361218104761	0.8931878581	0.0072436377838	0.226876581559	0.104229562843	0.428242856315	0.226876581559	0.468411351413	0.829896383209	0.116187990183	0.227970261255	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr18:3594030..3594144,+__374.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr18:3594030..3594144,+__374.1.0.0	rs12967944	-0.9084835824881488	-0.7381999108421017	-1.3792512583428254	-1.3833494699924067	-1.2391735928123762	-0.9160528292445639	-1.02537373308075	-0.8215979451433939	-0.8057868189877392	-0.8464611796595065	-1.0182842911340046	-0.9156939551600294	-0.9998090472406537	-0.92146623514245	-0.6648783226895113	-0.3957611061494624	-0.9154069593764508	-0.5499534364899152	-0.49089554631195204	-0.5877716142348539	-0.5480643566896102	-0.6401043580341725	-0.5357945651817188	-0.4877145161763345	-0.2926571142851521	-0.5858723442301319	-0.012982652654301208	0.07332158815259038	0.983490152193363	0.46794251061595593	0.6892201563224609	0.42515728293261185	0.43760211884589606	0.2735335884537837	0.16568246095356665	0.31066661447778776	0.5305697749576701	0.6230368408748772	0.4139367030105219	NA__no_active_tile	0.270885072145	0.248198866138	NA__no_active_tile	0.00046908881243	0.0468981580933	0.428242856315	0.501992688725	0.405136064622	0.313917214294	0.00616002497902	0.0741297894045	0.000217714377773	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	0.362136563196	1	1	1	1	1	1	1	0.182444648574	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr19:11750538..11750652,+__375.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr19:11750538..11750652,+__375.1.0.0	rs12973387	-0.8515582924192657	-1.2594614688656245	-1.1045713924003455	-1.4040915069004605	-0.9944409568021934	-1.155337565010372	-1.89971016855548	-1.2298529384991574	-1.3910044107547879	-1.2753761803566541	-1.4051741417588282	-1.5422918593037043	-1.2927392401355726	-0.7774557752771785	-1.5228485541198695	-1.6296159008517712	-1.862337875867377	-1.2134915649640656	-2.44299899136895	-1.7735611836774527	-1.0993779079402548	-0.9657062593263668	-1.2492972546427732	-1.4659000507342936	-1.1487076515478012	-1.4292749141931795	0.07410251714208727	-0.26338708525424503	-0.5250445084514257	-0.4582463689669165	-0.21905060816187227	-1.2876614263585777	0.12614898487802728	0.13047503055890264	0.4252981514284211	0.02607892571388093	-0.06072590897546548	0.3935842077559031	-0.13653567405760672	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr19:12098391..12098505,+__376.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr19:12098391..12098505,+__376.1.0.0	rs73923338	0.6897721450205309	0.39106005575905683	0.16941715107027233	0.3054729381257577	0.11840595401777777	0.1129925100975049	0.18402848946329675	0.30089191464551185	0.37827287958382655	0.4346524875771856	0.4286833927793356	0.29109606337349964	0.3170621651261297	0.36227958622823575	0.4207493007298804	0.5974297492832028	0.422670252019248	0.8659414600031122	0.5565255274135865	0.3618728374289828	0.4483218157954143	0.39953844984292375	0.592052985211218	0.714937707274427	0.7951055808325109	0.5447854376718951	-0.3274925587922951	0.02968924497082359	0.4280125982129305	0.1171973138934903	0.7475355059853345	0.44353301731608163	0.17784434796568604	0.14742990114990245	0.0212655702590972	0.15740049763403235	0.28625431449509137	0.5040095174590113	0.2277232725457655	0.154655491485	0.0565651674203	0.0140036728837	NA__not_enough_barcodes	0.00460760078019	0.00287470049861	0.0240855495486	0.0499532058383	0.0719809426143	0.00784715402968	0.0316863885398	0.0120431385799	2.59733091072e-11	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	1	1	1	1	1	2.17656330318e-08	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr19:12098391..12098505,+__376.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr19:12098391..12098505,+__376.1.0.0	rs10409509	0.6897721450205309	0.39106005575905683	0.16941715107027233	0.3054729381257577	0.11840595401777777	0.1129925100975049	0.18402848946329675	0.30089191464551185	0.37827287958382655	0.4346524875771856	0.4286833927793356	0.29109606337349964	0.3170621651261297	0.030963849382556353	-0.0046207101309437915	-0.01768003601940099	-0.19194911260657566	0.25955129971743146	-0.058486568717124786	0.29039104680104705	-0.22818304150405339	0.4645971238698822	-0.15948166824718546	0.15977975328567165	-0.0708482526290326	0.03950280693352267	-0.6588082956379745	-0.3956807658900006	-0.18709718708967332	-0.49742205073233337	0.1411453456996537	-0.17147907881462968	0.1063625573377503	-0.5290749561495652	0.08632424428605567	-0.5941341558243711	-0.2689036394936639	-0.36194431600253224	-0.2775593581926071	0.76769033028	0.347268461228	0.8931878581	0.716953652062	0.30750859871	0.657696241675	0.581967350665	0.657696241675	0.270885072145	0.925117039075	0.510582765025	0.696989544957	0.878529427734	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr19:12098391..12098505,+__376.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr19:12098391..12098505,+__376.1.0.0	rs79207481	0.6897721450205309	0.39106005575905683	0.16941715107027233	0.3054729381257577	0.11840595401777777	0.1129925100975049	0.18402848946329675	0.30089191464551185	0.37827287958382655	0.4346524875771856	0.4286833927793356	0.29109606337349964	0.3170621651261297	0.4224841750409056	0.41616183571307086	0.5957097599108739	0.25770309435820105	0.25286823389567054	0.3749763149721508	0.9312215262718149	0.7367056363169211	0.9870246607357736	0.7264086309088068	0.35391859863152964	0.8085220960973718	0.5719753802377575	-0.2672879699796253	0.025101779954014025	0.4262926088406016	-0.04776984376755666	0.13446227987789278	0.2619838048746459	0.7471930368085181	0.43581372167140925	0.608751781151947	0.2917561433316212	-0.07476479414780596	0.5174260327238722	0.25491321511162784	0.354199901149	0.61459183517	0.0741297894045	0.401353314521	0.978575937473	0.0763307839553	0.00955750115232	0.0763307839553	0.00275115621019	0.0832552515755	0.444048837556	0.136115392203	0.00139848303112	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr19:12098391..12098505,+__376.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr19:12098391..12098505,+__376.1.0.0	rs73923338,rs10409509,rs79207481	0.6897721450205309	0.39106005575905683	0.16941715107027233	0.3054729381257577	0.11840595401777777	0.1129925100975049	0.18402848946329675	0.30089191464551185	0.37827287958382655	0.4346524875771856	0.4286833927793356	0.29109606337349964	0.3170621651261297	-0.2715934164911484	0.10136228241033955	-0.10344289418169564	0.15683266366940138	-0.11865534822328516	0.2230403460887989	-0.08357727203058668	0.25076459713060306	0.08991680243404573	0.289197080383631	0.02801323617557866	0.015350033777858516	0.04810067592862841	-0.9613655615116792	-0.28969777334871727	-0.27286004525196794	-0.14864027445635633	-0.23706130224106292	0.11004783599129402	-0.26760576149388343	-0.05012731751490879	-0.28835607714978084	-0.1454554071935546	-0.40067015660375693	-0.2757460295956411	-0.26896148919750124	0.0362033618716	0.563691144959	0.248198866138	0.819442862795	0.536806685117	0.687084607526	0.382791178922	0.468411351413	0.489247397307	0.79863356553	0.226876581559	0.206893929435	0.286039209246	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr19:12098432..12098546,+__377.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr19:12098432..12098546,+__377.1.0.0	rs79207481	-0.466443065528364	0.11497260044594979	-0.2139984382961395	-0.4404007664944995	-0.14318333551244075	-0.13044712275971815	-0.16208010075120446	-0.06581206017397612	0.06685771195774662	-0.16991962120523432	-0.012396588595933549	0.12482200323090516	-0.12483573197357574	-0.6284843724422814	-0.21011832546171347	-0.5963046234539093	-0.5867872009858641	-0.348921071364936	-0.2934263879941092	-0.6586909528477176	-0.47340652389657023	-0.0724879895259851	-0.1983484156972784	-0.4053696860533825	-0.2985300215267837	-0.39757296427087757	-0.16204130691391738	-0.32509092590766325	-0.3823061851577698	-0.14638643449136463	-0.20573773585249525	-0.16297926523439105	-0.4966108520965131	-0.4075944637225941	-0.1393457014837317	-0.02842879449204408	-0.39297309745744896	-0.42335202475768885	-0.2727372322973018	0.0774477122405	0.90381429355	0.0658387268341	0.0906800339379	0.368322877114	0.428242856315	0.0741297894045	0.188220673538	0.412754243182	0.706946403854	0.0276615481105	0.0531733827136	0.00461916845669	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr19:12098432..12098546,+__377.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr19:12098432..12098546,+__377.1.0.0	rs10409509,rs79207481	-0.466443065528364	0.11497260044594979	-0.2139984382961395	-0.4404007664944995	-0.14318333551244075	-0.13044712275971815	-0.16208010075120446	-0.06581206017397612	0.06685771195774662	-0.16991962120523432	-0.012396588595933549	0.12482200323090516	-0.12483573197357574	-0.9539796747617914	-0.6704723327251806	-0.9860475417572818	-0.9770672258615896	-1.1495857548030397	-0.7195654407196339	-1.212657623539248	-0.9421189918699746	-0.6208301946308948	-0.9015255922260552	-0.7561224749092463	-0.8076973400953151	-0.8914725156582707	-0.48753660923342734	-0.7854449331711304	-0.7720491034611423	-0.53666645936709	-1.006402419290599	-0.5891183179599158	-1.0505775227880436	-0.8763069316959985	-0.6876879065886414	-0.7316059710208209	-0.7437258863133128	-0.9325193433262203	-0.7666367836846951	0.00210630874131	0.0286240283844	0.00263248034207	0.00883703695038	1.2780782346e-05	0.0338805621681	5.62183900058e-05	0.00955750115232	0.00567496309713	0.0156526560932	0.000911503005752	1.12997083356e-05	2.6737707534e-23	0.408623895814	1	0.523863588071	1	0.00262006038092	1	0.0112436780012	1	1	1	0.186858116179	0.00232773991714	6.06945961023e-21	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr19:12305750..12305864,+__378.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr19:12305750..12305864,+__378.1.0.0	rs2459038	1.3456441021695218	1.4902296365992702	1.2779913218873964	1.2096189954753345	1.3423019103595248	1.3427251083183	1.3418789777979256	1.6196664356457857	1.6020831964203182	1.4652909989354064	1.6288679890956168	1.5260554424040818	1.4326961762590402	1.371080720176686	1.6533312610592716	1.257333409800925	1.258335027904575	1.4331085311263978	1.3790070155374208	1.4298820034974902	1.9750512727920395	1.6850098703733547	1.3623051839173277	1.613133256969702	1.4315582800155051	1.4874279860975579	0.025436618007164125	0.16310162446000143	-0.020657912086471386	0.04871603242924061	0.09080662076687296	0.036281907219120724	0.08800302569956453	0.3553848371462538	0.08292667395303654	-0.10298581501807869	-0.01573473212591492	-0.09449716238857664	0.054731809838517755	0.648013768535	0.88258056334	0.563691144959	0.829896383209	0.48504462162	0.29495293544	0.619326784864	0.136115392203	0.468411351413	0.628827692687	0.545696106059	0.536806685117	0.695108294097	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr19:36036367..36036481,-__379.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr19:36036367..36036481,-__379.1.0.0	rs116850940	2.2972879830813477	2.8871233683314803	2.4026985864719856	2.2345009580643187	2.483715049508578	2.603148800948999	2.1202861081570967	2.11517422735659	2.486470841036768	2.5449032329905297	2.190079253025337	2.627263944560671	2.4160543627944753	2.234928797159337	2.9577783463325216	2.145303709582337	2.096028267254187	2.1254624851042934	2.255605980866068	1.9030169001423771	2.5895927920788546	2.6298924018661203	1.830975502981025	2.3153625214925393	2.354109353117706	2.286504754831447	-0.06235918592201095	0.07065497800104126	-0.25739487688964857	-0.13847269081013192	-0.35825256440428443	-0.34754282008293114	-0.2172692080147196	0.4744185647222645	0.1434215608293523	-0.7139277300095046	0.12528326846720228	-0.27315459144296517	-0.129549607963028	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr19:37064191..37064305,+__381.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr19:37064191..37064305,+__381.1.0.0	rs2967442	2.3725750730115753	2.6732189026466697	2.320695082602634	2.1466851157319904	2.265169454026101	2.4284802559934455	2.2871658586922976	2.431891263077592	2.355971139925527	2.42058956247884	2.36156363072562	2.481473691255906	2.378789919180683	2.461984319204448	2.715584035599112	2.4202903925710677	2.2332341106633455	2.4800497761149964	2.501422251531128	2.5283027701554666	2.6617486697993327	2.4792486295498013	2.5551607492909074	2.58620491516975	2.532326310180977	2.512963077485861	0.0894092461928726	0.04236513295244215	0.09959530996843391	0.08654899493135515	0.21488032208889551	0.07294199553768266	0.24113691146316896	0.2298574067217407	0.12327748962427432	0.13457118681206737	0.22464128444413012	0.05085261892507109	0.13417315830517787	0.581967350665	0.619326784864	0.536806685117	0.737113058664	0.313917214294	0.313917214294	0.226876581559	0.0741297894045	0.313917214294	0.29495293544	0.170821264488	0.326996172605	0.104614802654	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr19:37064191..37064305,+__381.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr19:37064191..37064305,+__381.1.0.0	rs3096618	2.3725750730115753	2.6732189026466697	2.320695082602634	2.1466851157319904	2.265169454026101	2.4284802559934455	2.2871658586922976	2.431891263077592	2.355971139925527	2.42058956247884	2.36156363072562	2.481473691255906	2.378789919180683	2.2384554426008427	2.4558524029364746	2.1919323056031805	2.1028791344408733	2.2670867937038803	2.2616362886129235	2.170521546227396	2.422605680145832	2.303020569243291	2.3103027047676896	2.412969196981171	2.3797639918537126	2.293085504759772	-0.1341196304107326	-0.21736649971019517	-0.12876277699945327	-0.043805981291117124	0.001917339677779406	-0.16684396738052198	-0.11664431246490148	-0.009285582931759961	-0.05295057068223619	-0.11028685771115043	0.051405566255550816	-0.10170969940219354	-0.08570441442091097	0.333666485083	0.536806685117	0.563691144959	0.66743649171	0.572794651112	0.129198935732	0.253741740693	0.737113058664	0.390154148302	0.248198866138	0.428242856315	0.468411351413	0.287884956116	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr19:37064191..37064305,+__381.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr19:37064191..37064305,+__381.1.0.0	rs75577228	2.3725750730115753	2.6732189026466697	2.320695082602634	2.1466851157319904	2.265169454026101	2.4284802559934455	2.2871658586922976	2.431891263077592	2.355971139925527	2.42058956247884	2.36156363072562	2.481473691255906	2.378789919180683	2.2185100067888657	2.506971175003356	2.3822820988216216	2.2463846675695343	2.346970759877504	2.3895113201606346	2.2052968252617204	2.461406420549253	2.3707548167985486	2.4531956002753974	2.4823350131413275	2.3938514057942166	2.371455842503498	-0.15406506622270966	-0.16624772764331386	0.06158701621898777	0.09969955183754386	0.08180130585140288	-0.038968935832810914	-0.08186903343057716	0.029515157471661002	0.014783676873021623	0.03260603779655735	0.1207713824157075	-0.08762228546168949	-0.007334076677184924	0.957167318493	0.978575937473	0.354199901149	0.591208103411	0.706946403854	0.716953652062	0.85089220831	0.13967914143	0.581967350665	0.628827692687	0.428242856315	0.347268461228	0.909764174611	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr19:37064191..37064305,+__381.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr19:37064191..37064305,+__381.1.0.0	rs2967442,rs3096618,rs75577228	2.3725750730115753	2.6732189026466697	2.320695082602634	2.1466851157319904	2.265169454026101	2.4284802559934455	2.2871658586922976	2.431891263077592	2.355971139925527	2.42058956247884	2.36156363072562	2.481473691255906	2.378789919180683	2.0788415946741194	2.4962587330791175	2.165534900511071	1.8634140253386033	2.2460771612518977	2.1820604896807714	2.152221220097414	2.3185276829888055	2.371180474448961	2.3465969113794602	2.3581403109346573	2.2352421428175386	2.2345079706002013	-0.2937334783374559	-0.17696016956755223	-0.15516018209156268	-0.28327109039338705	-0.019092292774203212	-0.24641976631267415	-0.1349446385948836	-0.11336358008878644	0.01520933452343387	-0.0739926510993798	-0.0034233197909627755	-0.24623154843836748	-0.1442819485804818	0.253741740693	0.301187193336	0.460214637573	0.476688253492	0.609889042629	0.29495293544	0.727009731456	0.747262025795	0.428242856315	0.757455001208	0.677233097055	0.226876581559	0.487993864031	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr19:37178274..37178388,-__382.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr19:37178274..37178388,-__382.1.0.0	rs7259256	-0.5147357523412105	-0.7800215771300615	-1.5496277733793593	-1.0258307269459785	-0.7315620221417259	-0.7453996783891892	-0.8079209402129638	-0.8430853536973657	-0.8312988664340243	-0.9174933991038712	-0.8205608446370639	-0.9552657087775224	-0.8769002202658615	-0.9967627161300114	-0.3921752914620557	-0.6055389648456208	-0.3626112480276999	-0.5500942820381	-0.9352713940164377	-0.31857824194506235	-0.64405301095024	-0.5426904174326435	-0.5842010859082547	-0.6828034444768207	-0.15182657831989144	-0.5638838896294032	-0.48202696378880094	0.3878462856680058	0.9440888085337386	0.6632194789182786	0.18146774010362599	-0.18987171562724847	0.48934269826790144	0.19903234274712567	0.28860844900138083	0.3332923131956165	0.13775740016024318	0.8034391304576309	0.3130163306364581	NA__no_active_tile	0.294947407958	NA__no_active_tile	0.591208103411	0.747262025795	NA__no_active_tile	0.563691144959	0.657696241675	0.925117039075	0.581967350665	0.716950551484	0.88258056334	0.925684985574	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr19:37742733..37742847,+__383.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr19:37742733..37742847,+__383.1.0.0	rs116455385	3.358583991711731	3.8833230056140007	3.3363304303584878	3.0343211454952517	3.513184877197868	3.205697032426748	3.161148857328362	3.567422626170031	3.6789983346160744	3.5399230457867397	3.587087782648603	3.361504730786038	3.435627155011661	3.2547455959146387	3.828513946455657	3.323882658991532	3.088991378251457	3.3031452429742485	3.4465387310609925	3.286528225439219	3.471914702297173	3.5421843446336	3.5802686682596976	3.6566337935846676	3.5718333203181922	3.446265050681756	-0.10383839579709209	-0.054809059158343665	-0.012447771366955962	0.054670232756205195	-0.2100396342236195	0.24084169863424432	0.12537936811085704	-0.09550792387285822	-0.1368139899824743	0.04034562247295792	0.06954601093606438	0.21032858953215428	0.010637895670094951	0.536806685117	0.545696106059	0.333666485083	0.536806685117	0.397597163509	0.85089220831	0.788281320858	0.935789553219	0.63839046467	0.648013768535	0.978575937473	0.777966336216	0.96961867598	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr19:37742733..37742847,+__383.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr19:37742733..37742847,+__383.1.0.0	rs190851415	3.358583991711731	3.8833230056140007	3.3363304303584878	3.0343211454952517	3.513184877197868	3.205697032426748	3.161148857328362	3.567422626170031	3.6789983346160744	3.5399230457867397	3.587087782648603	3.361504730786038	3.435627155011661	3.3101896155554464	3.806259357073799	3.2038920358386154	3.0330607250844714	3.365662914960355	3.418421168996154	3.1216303893843844	3.402272249022664	3.3522719251622437	3.445878488512041	3.494985182718246	3.463125769308001	3.3681374851347017	-0.04839437615628439	-0.07706364854020187	-0.13243839451987238	-0.0012604204107802275	-0.14752196223751302	0.2127241365694057	-0.03951846794397751	-0.16515037714736724	-0.3267264094538307	-0.09404455727469863	-0.09210259993035708	0.10162103852196314	-0.06748966987695952	0.946473006422	0.757455001208	0.122558611289	0.444064484515	0.390154148302	0.76769033028	0.420456664513	0.591208103411	0.476688253492	0.221756412245	0.493479697885	0.809021331888	0.669825505062	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr19:37742733..37742847,+__383.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr19:37742733..37742847,+__383.1.0.0	rs73627766	3.358583991711731	3.8833230056140007	3.3363304303584878	3.0343211454952517	3.513184877197868	3.205697032426748	3.161148857328362	3.567422626170031	3.6789983346160744	3.5399230457867397	3.587087782648603	3.361504730786038	3.435627155011661	3.4005137644384096	4.047428881374643	3.3386769642823144	3.101050081419436	3.3044360241579813	3.425530093048464	3.324536998202994	3.596281991546645	3.4811877078010376	3.3421218822353507	3.66826185882204	3.614537624857829	3.4703803226822623	0.04192977272667875	0.16410587576064195	0.002346533923826666	0.06672893592418427	-0.20874885303988666	0.2198330606217156	0.16338814087463227	0.028859365376614043	-0.1978106268150368	-0.197801163551389	0.08117407617343675	0.25303289407179097	0.034753167670600736	0.747262025795	0.545696106059	0.412754243182	0.493479697885	0.248198866138	0.925117039075	0.63839046467	0.444064484515	0.428242856315	0.214226986986	0.66743649171	0.87199428352	0.729115353106	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr19:37742733..37742847,+__383.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr19:37742733..37742847,+__383.1.0.0	rs147400348	3.358583991711731	3.8833230056140007	3.3363304303584878	3.0343211454952517	3.513184877197868	3.205697032426748	3.161148857328362	3.567422626170031	3.6789983346160744	3.5399230457867397	3.587087782648603	3.361504730786038	3.435627155011661	3.3775442545015846	3.9534579857974315	3.214877063474319	2.900909590302093	3.38057207734355	3.454660307391653	3.283719034067124	3.501992405206403	3.642598004640105	3.711846473820985	3.517965882514111	3.6197849753018283	3.4633273378634324	0.018960262789853743	0.07013498018343078	-0.12145336688416863	-0.13341155519315873	-0.13261279985431784	0.2489632749649049	0.12257017673876192	-0.06543022096362794	-0.0364003299759692	0.17192342803424543	-0.06912190013449226	0.25828024451579035	0.027700182851771043	0.412754243182	0.696989544957	0.0698833862508	0.0986283746992	0.30750859871	0.957167318493	0.390154148302	0.925117039075	0.519249062249	0.757455001208	0.333666485083	0.87199428352	0.652577985389	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr19:37742733..37742847,+__383.1.4.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr19:37742733..37742847,+__383.1.0.0	rs116455385,rs190851415,rs73627766,rs147400348	3.358583991711731	3.8833230056140007	3.3363304303584878	3.0343211454952517	3.513184877197868	3.205697032426748	3.161148857328362	3.567422626170031	3.6789983346160744	3.5399230457867397	3.587087782648603	3.361504730786038	3.435627155011661	3.2715581020658515	3.6130264137391297	3.1140931088686434	2.75421381255282	3.100705099546788	3.146713988968169	2.9708138501138635	3.4224554440852	3.4064538301563356	3.13200661658722	3.23279179063766	3.3299767187582834	3.207900731339997	-0.08702588964587932	-0.270296591874871	-0.22223732148984432	-0.2801073329424315	-0.4124797776510798	-0.05898304345857941	-0.19033500721449848	-0.14496718208483106	-0.27254450445973877	-0.40791642919951965	-0.3542959920109432	-0.03152801202775457	-0.22772642367166426	0.0959193233604	0.170821264488	0.0072436377838	0.0316863885398	0.0120431385799	0.116187990183	0.0165401036288	0.192768091005	0.0785847853765	0.0296152123457	0.0959193233604	0.175053819161	4.29924851545e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	9.75929413007e-06	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr19:54960184..54960298,-__386.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr19:54960184..54960298,-__386.1.0.0	rs1010645	2.15498903575127	2.5261089102009406	2.09607307410331	1.9999338429155875	2.138162305685123	2.3595558904588287	2.174973299544971	2.344583160257649	2.3028094420616334	2.1812024030533097	2.379994359332232	2.304402165248106	2.246898990717747	2.0599273478134865	2.49919775268559	1.9795567661782782	1.8774008605350319	2.140827138622462	2.1284057734495074	1.9617501557306674	2.047995635228091	2.278196792491034	2.231247360571306	2.165492453035484	2.1708973593941616	2.1284079496445916	-0.09506168793778347	-0.02691115751535067	-0.11651630792503154	-0.12253298238055566	0.002664832937339323	-0.2311501170093213	-0.21322314381430374	-0.2965875250295582	-0.024612649570599388	0.0500449575179962	-0.2145019062967477	-0.1335048058539443	-0.11849104107315504	0.476688253492	0.672324307433	0.452098798395	0.527990680582	0.527990680582	0.206893929435	0.301187193336	0.30750859871	0.85089220831	0.788281320858	0.420456664513	0.13967914143	0.400297261883	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr19:54960184..54960298,-__386.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr19:54960184..54960298,-__386.1.0.0	rs369824777	2.15498903575127	2.5261089102009406	2.09607307410331	1.9999338429155875	2.138162305685123	2.3595558904588287	2.174973299544971	2.344583160257649	2.3028094420616334	2.1812024030533097	2.379994359332232	2.304402165248106	2.246898990717747	2.1433055864839705	2.6814284696014754	2.2474486194338903	2.202700581768098	2.472613891235868	2.516704475584107	2.4091718395746637	2.423128306356375	2.6059914192489533	2.309757476635027	2.5273629397323094	2.5032405972098837	2.4202378502387187	-0.011683449267299473	0.15531955940053477	0.1513755453305805	0.2027667388525103	0.3344515855507453	0.1571485851252783	0.23419854002969265	0.07854514609872609	0.3031819771873199	0.12855507358171714	0.1473685804000775	0.19883843196177775	0.17333885952097172	0.183752894264	0.110080523892	0.192768091005	0.313917214294	0.0515422504639	0.0232568344756	0.21176555971	0.202104162379	0.0276615481105	0.0374147936077	0.0386605553759	0.326996172605	1.17695614059e-05	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.00986289245817	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr19:54960184..54960298,-__386.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr19:54960184..54960298,-__386.1.0.0	rs1010645,rs369824777	2.15498903575127	2.5261089102009406	2.09607307410331	1.9999338429155875	2.138162305685123	2.3595558904588287	2.174973299544971	2.344583160257649	2.3028094420616334	2.1812024030533097	2.379994359332232	2.304402165248106	2.246898990717747	2.5090688845346456	2.948893163071129	2.5401844493137133	2.3469220661270715	2.6888612457565544	2.8178885798382245	2.5131774939206473	2.866206078367516	2.780865147651422	2.8232208077492347	2.850859653101474	2.7897825756373282	2.70632751208908	0.3540798487833756	0.4227842528701884	0.44411137521040356	0.34698822321148404	0.5506989400714315	0.45833268937939575	0.33820419437567617	0.521622918109867	0.4780557055897887	0.642018404695925	0.47086529376924213	0.4853804103892223	0.45942852137133333	0.000288590960955	0.000617238254542	0.00146142948273	0.00423662678721	1.2780782346e-05	1.44459868922e-05	0.00275115621019	0.000373410950373	2.96882111052e-05	1.89109819415e-07	1.2780782346e-05	0.000170183141363	8.46356408662e-37	0.0559866464253	0.124682127418	0.290824467064	0.800722462783	0.00262006038092	0.00290364336533	0.550231242038	0.0728151353228	0.00611577148768	3.93348424383e-05	0.00262006038092	0.0350577271207	1.92122904766e-34	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr2:135676193..135676307,-__398.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr2:135676193..135676307,-__398.1.0.0	rs41362150	2.552024802846373	2.8468172730084214	2.1476476111732112	2.306283901236422	2.4770006433154386	2.807989105177592	2.448590167562597	2.714014885375297	2.9995589346314473	2.7110990501667227	2.529540387364584	2.340347356693515	2.5734095098793017	2.75241752079285	3.1675581878255805	2.9271653006832103	2.465046622377479	2.838357899985141	2.936151896357094	3.0016102893093386	3.060611153982409	2.8815652600918824	2.9522642603503364	3.0114603823027304	2.801801872894433	2.899667553912707	0.20039271794647728	0.32074091481715916	0.7795176895099991	0.15876272114105694	0.3613572566697023	0.12816279117950202	0.5530201217467416	0.346596268607112	-0.11799367453956489	0.2411652101836137	0.4819199949381465	0.4614545162009178	0.3262580440334053	0.64800625442	0.819442862795	0.347268461228	0.840380101088	0.840380101088	0.788281320858	0.840380101088	NA__not_enough_barcodes	0.8931878581	0.591208103411	0.591208103411	NA__not_enough_barcodes	0.978409550858	1	1	1	1	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr2:139259230..139259344,-__400.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr2:139259230..139259344,-__400.1.0.0	rs142954856	1.6481974816298353	0.633677275545328	0.7395413083022103	0.647804511084232	0.303395551053246	0.8998016442315385	0.13808028480157086	-0.14562655471113353	0.4885601350291653	1.3919079346086058	0.7144212911628393	0.9514552998029818	0.7009346802117017	-0.6565853943128936	0.20772474277226338	-0.08652450157071986	-0.8696939324594237	-0.17648162144340376	-0.07798698195932446	0.10628342830565407	-1.6196824274336583	-0.4225606504336268	-0.220418115428489	-0.6177915318394255	-0.01768003601940099	-0.3709497518185374	-2.304782875942729	-0.42595253277306466	-0.8260658098729302	-1.5174984435436558	-0.47987717249664974	-0.977788626190863	-0.03179685649591679	-1.4740558727225248	-0.9111207854627921	-1.6123260500370948	-1.3322128230022647	-0.9691353358223829	-1.071884432030239	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr2:160471774..160471888,+__402.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr2:160471774..160471888,+__402.1.0.0	rs1425043	-0.2766547961405465	-0.6759669920242407	-0.5892429022782244	-0.6738395839973033	-0.6888530232503745	-0.9838690944825066	-0.2513660438468656	-0.6153087341309241	-0.5839133114033412	-0.2615657075689054	-0.5683883362329347	-0.4141633543586629	-0.5485943233095691	0.022852344537983613	0.13468754878493083	-0.7099606706457295	-0.749355906538022	-0.3919570302205486	-0.7446848769309974	-0.1854259186851835	-0.4890488324719056	-0.6626938432163779	-0.4455922085766595	-0.4117483740352271	-0.5414667854115243	-0.43119954611743844	0.2995071406785301	0.8106545408091715	-0.12071776836750514	-0.07551632254071872	0.29689599302982583	0.2391842175515092	0.06594012516168213	0.12625990165901851	-0.07878053181303668	-0.18402650100775408	0.1566399621977076	-0.12730343105286135	0.11739477719213072	0.259359303335	0.0267253699531	0.809021331888	0.361218104761	0.591203856829	NA__no_active_tile	0.216719559135	0.829896383209	NA__no_active_tile	0.63839046467	0.420451345493	0.706946403854	0.380904316539	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr2:160568910..160569024,-__403.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr2:160568910..160569024,-__403.1.0.0	rs1972709	2.366006786774969	2.488039211066637	2.325116291682651	2.0976762431083875	2.382440884371833	2.2675117315004183	2.193901279450064	2.3886537579405465	2.3449861065526427	2.359998420138985	2.477195246434691	2.417676345682896	2.3424335253920603	2.127261937719097	2.2374184111064155	2.079831695447358	1.937770300737569	2.2094999405207894	2.0062265559749903	2.0707203646196572	2.1958078419280684	2.2565416236697273	2.1435691400233194	2.2948364661771636	2.1645900091803325	2.1436728572587076	-0.2387448490558719	-0.2506207999602217	-0.24528459623529297	-0.15990594237081845	-0.17294094385104364	-0.26128517552542796	-0.12318091483040661	-0.19284591601247802	-0.0884444828829154	-0.21642928011566553	-0.18235878025752728	-0.2530863365025633	-0.19876066813335272	0.101398170673	0.0548474154937	0.368322877114	0.21176555971	0.221756412245	0.493479697885	0.354199901149	0.113101776132	0.375513989452	0.313917214294	0.320413072024	0.107123399254	0.0051511603033	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr2:160568910..160569024,-__403.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr2:160568910..160569024,-__403.1.0.0	rs1972709,rs28365982	2.366006786774969	2.488039211066637	2.325116291682651	2.0976762431083875	2.382440884371833	2.2675117315004183	2.193901279450064	2.3886537579405465	2.3449861065526427	2.359998420138985	2.477195246434691	2.417676345682896	2.3424335253920603	2.107314740596885	2.323819117365566	2.0742128101056063	2.0724928078763902	2.2444234805904966	2.103646870703546	2.1437102046848064	2.223289429094355	2.15987182682821	2.1839841891244363	2.2652937767828805	2.227168131941978	2.177435615474596	-0.25869204617808395	-0.16422009370107116	-0.25090348157704456	-0.025183435231997287	-0.13801740378133642	-0.16386486079687224	-0.050191074765257415	-0.16536432884619146	-0.1851142797244325	-0.17601423101454872	-0.21190146965181045	-0.19050821374091775	-0.16499790991746366	0.696989544957	0.390154148302	0.276771967065	0.63839046467	0.460214637573	0.554657938956	0.687084607526	0.536806685117	0.452098798395	0.476688253492	0.460214637573	0.288805731951	0.474737043305	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr2:174146730..174146844,-__407.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr2:174146730..174146844,-__407.1.0.0	rs10210586	2.570585404244711	2.869484311902887	2.326568639454459	2.1932856612293614	2.533099998632074	2.428592393343301	2.4202929346178474	3.0773838285123554	2.3997445913326034	2.4319024339935824	2.362108265782151	2.617157470709712	2.5191838278129204	2.5883332435855557	2.650201336588914	2.33984046163937	2.1119848212698797	2.4114458822019897	2.2204944050287656	2.2509105973143173	3.024925678234486	2.3345319858215627	2.3470703554292083	2.2295078557366246	2.3501951292972247	2.4049534793456577	0.017747839340844784	-0.2192829753139729	0.013271822184910853	-0.08130083995948167	-0.12165411643008417	-0.20809798831453552	-0.16938233730353014	-0.052458150277869375	-0.06521260551104069	-0.08483207856437414	-0.13260041004552647	-0.2669623414124871	-0.11423034846726221	0.412754243182	0.390154148302	0.941129588792	0.572794651112	0.100001742422	0.21176555971	0.248198866138	0.914457985151	0.809021331888	0.706946403854	0.154655491485	0.0856734395523	0.374252474766	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr2:174146730..174146844,-__407.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr2:174146730..174146844,-__407.1.0.0	rs114442478,rs10210586	2.570585404244711	2.869484311902887	2.326568639454459	2.1932856612293614	2.533099998632074	2.428592393343301	2.4202929346178474	3.0773838285123554	2.3997445913326034	2.4319024339935824	2.362108265782151	2.617157470709712	2.5191838278129204	2.2529024245036324	2.4996040409353664	2.074613338740224	2.0134611918043115	2.156653054590909	2.033235798027317	2.1966630136332626	2.9116844432903584	2.031841330199952	2.0541566851253683	2.033918689265075	2.0842512892012053	2.1952487749430816	-0.3176829797410785	-0.36988027096752063	-0.251955300714235	-0.17982446942504993	-0.37644694404116485	-0.3953565953159841	-0.2236299209845849	-0.165699385221997	-0.3679032611326516	-0.3777457488682141	-0.3281895765170759	-0.5329061815085065	-0.3239350528698386	0.00816548763477	0.0399413890972	0.158583637061	0.122558611289	0.00153065306427	0.00389134425826	0.0583274625199	0.436112310787	0.00616002497902	0.0932701621097	0.00955750115232	0.0440018610392	2.51162208271e-10	1	1	1	1	0.313783878175	0.78216019591	1	1	1	1	1	1	5.70138212776e-08	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr2:177053205..177053319,-__409.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr2:177053205..177053319,-__409.1.0.0	rs71421551	0.5645018128653058	1.2302517470758478	-0.2241834132186116	0.06657630116836782	0.6345388664699101	-1.5068997706393952	0.9035364360455456	-0.08205785614003476	0.3238420796676352	-0.28607744366785837	0.9116383469318701	0.3294711010290168	0.23876151729896655	-0.1412456430797721	1.1271482706025444	-0.4268024309595617	1.2561686605905469	-0.1739931245591844	-0.7174635672161556	-0.382579214863317	-0.4608889514009569	-0.11967383575750301	-0.25825530711438066	0.025472976124555364	-1.1111583784540047	-0.11527254550726579	-0.7057474559450778	-0.10310347647330342	-0.20261901774095012	1.1895923594221791	-0.8085319910290945	0.7894362034232396	-1.2861156509088625	-0.3788310952609222	-0.4435159154251382	0.027822136553477705	-0.8861653708073147	-1.4406294794830214	-0.3540340628062324	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr2:177053244..177053358,-__410.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr2:177053244..177053358,-__410.1.0.0	rs71421551	1.2361084737805486	2.081942558032416	1.367192983425498	2.19753247005963	1.4276912726885733	1.3379863504902634	0.4812318552074002	1.8925529460391597	0.5999005421901571	1.7696985894937336	-0.13880797292949476	3.652550797215951	1.4921317388078197	1.663394852953882	-0.9371353569117848	-0.4662801496231459	-1.0734973288358105	0.4597972826247042	0.3360624892895347	0.024521552289765935	-0.8140459540881831	-0.4589276612127522	0.15058050111145266	-0.014982122175810325	-0.3961360281215707	-0.1272206602249765	0.42728637917333345	-3.0190779149442006	-1.833473133048644	-3.271029798895441	-0.9678939900638691	-1.0019238612007286	-0.45671030291763426	-2.706598900127343	-1.0588282034029093	-1.6191180883822809	0.12382585075368444	-4.048686825337522	-1.6193523990327963	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr2:177502682..177502796,-__413.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr2:177502682..177502796,-__413.1.0.0	rs2969356	0.4766028983970345	0.8616250453146116	-0.16304190486423037	-0.4667759707825034	-0.3155286693875448	-0.6247785330331885	-0.8505324259759174	-0.7392744774708484	-0.608820726550801	-0.8036695751865491	-0.8471649723635575	-0.7041540951158085	-0.3987927839182752	-0.530953493703276	-0.42741972895597385	-0.7389101756651121	-1.0292269411900625	-1.2150276991920417	-1.5558911040091565	-1.4313917037278303	-0.9379389982032535	-0.6713972791197262	-1.0468981056844722	-1.3238115109311592	-1.4004367717956865	-1.0257752926814792	-1.0075563921003106	-1.2890447742705855	-0.5758682708008818	-0.5624509704075591	-0.8994990298044969	-0.931112570975968	-0.5808592777519129	-0.19866452073240515	-0.06257655256892525	-0.24322853049792303	-0.47664653856760175	-0.696282676679878	-0.626982508763204	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr2:179278623..179278737,+__414.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr2:179278623..179278737,+__414.1.0.0	rs57384290	0.024065087624699204	0.24180307629156614	0.12981199846797076	0.12147314279354393	0.03914922960186438	-0.007216606701729494	-0.22220626799549698	-0.04194320563597839	-0.17322376912659165	0.1972971154960983	0.21476156735625784	0.24427202770607626	0.06400361632319003	0.1019674976493818	0.42720255953102815	-0.012446543235045146	-0.07036647806494103	-0.05587618685103651	-0.3881053567433703	-0.24036143815195943	-0.1616443986838796	-0.19907737050392488	-0.2048340685342788	0.052619581037018484	-0.025396271673713562	-0.0646932061853934	0.0779024100246826	0.185399483239462	-0.1422585417030159	-0.19183962085848497	-0.09502541645290088	-0.3808887500416408	-0.018155170156462452	-0.1197011930479012	-0.025853601377333224	-0.40213118403037706	-0.16214198631923937	-0.2696682993797898	-0.12869682250858341	0.757455001208	0.30750859871	0.840380101088	0.405136064622	0.211760329767	0.0216734048733	0.90381429355	0.320413072024	0.333666485083	0.107123399254	0.119335765104	0.0808926541269	0.0636690619234	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr2:187867922..187868036,+__416.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr2:187867922..187868036,+__416.1.0.0	rs142137128	2.5988873817520544	2.9727088218323834	2.6015762092630643	2.471282213797413	2.759407450732504	2.8777461666454136	2.7418188768710654	2.940684928979218	2.7349252821719636	2.8287543240589392	2.813998973275061	2.6603237761385756	2.750176200459805	2.406115725459912	2.7308363522925547	2.439905157941669	2.337588551538827	2.569508066674543	2.6005052439198533	2.6420582700578983	2.7918862074960593	2.635093569941235	2.7151848019643743	2.7590761167867575	2.7761327639156033	2.61699090233244	-0.19277165629214243	-0.24187246953982866	-0.16167105132139525	-0.13369366225858625	-0.18989938405796103	-0.27724092272556033	-0.09976060681316712	-0.14879872148315876	-0.09983171223072862	-0.11356952209456495	-0.05492285648830375	0.11580898777702764	-0.13318529812736413	0.382791178922	0.166665831608	0.320413072024	0.554657938956	0.30750859871	0.493479697885	0.375513989452	0.390154148302	0.600511566052	0.0832552515755	0.452098798395	0.428242856315	0.116009670509	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr2:192711181..192711295,+__417.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr2:192711181..192711295,+__417.1.0.0	rs35012125	-1.1682449361017768	-1.4479895485792815	-1.7433145658523734	-1.2675224341728755	-1.2621641487836754	-0.9317485343011271	-0.9520254890528316	-1.2423874548015397	-1.433206617917428	-1.502697090431899	-1.5287977127425991	-1.400181140566815	-1.3233566394420186	-1.7343500890180203	-1.23013025920888	-1.7241692981895027	-1.8262710033313767	-1.915368328202348	-1.477913015267502	-1.5789330281939558	-1.4557659559608809	-1.2304943835251732	-1.2729541527391035	-1.2943182421782522	-1.1390235682019056	-1.4899742770014086	-0.5661051529162435	0.21785928937040144	0.019145267662870724	-0.5587485691585012	-0.6532041794186725	-0.5461644809663748	-0.6269075391411242	-0.2133785011593412	0.20271223439225494	0.22974293769279552	0.23447947056434693	0.26115757236490933	-0.16661763755938988	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr2:209119873..209119987,+__421.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr2:209119873..209119987,+__421.1.0.0	rs73070962	1.2773109143999655	1.4642047952620725	1.438392568940502	1.1727001197488511	1.4240511522070405	1.3879584764073685	1.3013170038148325	1.313590873632194	1.379911073574644	1.3147340715879994	1.3831213421566861	1.1964505989042786	1.3378119158863697	1.3385274281484216	1.6439652627911654	1.351000701752263	1.2424313423632911	1.3827689161354209	1.3789435796010863	1.3371328480637217	1.3797573346440557	1.2656611702204101	1.3965030829876586	1.3242444397169169	1.242703502192139	1.3569699673847124	0.06121651374845616	0.17976046752909292	-0.08739186718823899	0.06973122261443998	-0.04128223607161963	-0.009014896806282202	0.03581584424888917	0.06616646101186174	-0.1142499033542339	0.0817690113996592	-0.058876902439769285	0.04625290328786047	0.01915805149834297	0.79863356553	0.829896383209	0.405136064622	0.468411351413	0.989287003123	0.85089220831	0.628827692687	0.809021331888	0.591208103411	0.737113058664	0.90381429355	0.925117039075	0.997266914904	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr2:209119873..209119987,+__421.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr2:209119873..209119987,+__421.1.0.0	rs116374598	1.2773109143999655	1.4642047952620725	1.438392568940502	1.1727001197488511	1.4240511522070405	1.3879584764073685	1.3013170038148325	1.313590873632194	1.379911073574644	1.3147340715879994	1.3831213421566861	1.1964505989042786	1.3378119158863697	1.3692732706382746	1.6656182392063892	1.4292968021332104	1.2091541938598156	1.5083289643849795	1.4728818078598542	1.170563015323876	1.3019814405725287	1.399299923050024	1.391701393876552	1.374695984084474	1.297282691625129	1.3825064772179256	0.09196235623830917	0.2014134439443167	-0.009095766807291517	0.03645407411096446	0.08427781217793906	0.08492333145248576	-0.13075398849095654	-0.01160943305966522	0.01938884947538	0.07696732228855252	-0.00842535807221223	0.10083209272085036	0.04469456133155605	0.527990680582	0.563691144959	0.87199428352	0.696989544957	0.192768091005	0.581967350665	0.90381429355	0.737113058664	0.572794651112	0.527990680582	0.361218104761	0.696989544957	0.848879856299	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr2:209119873..209119987,+__421.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr2:209119873..209119987,+__421.1.0.0	rs73070962,rs116374598	1.2773109143999655	1.4642047952620725	1.438392568940502	1.1727001197488511	1.4240511522070405	1.3879584764073685	1.3013170038148325	1.313590873632194	1.379911073574644	1.3147340715879994	1.3831213421566861	1.1964505989042786	1.3378119158863697	0.9171368704787906	1.4109840360995058	1.3833837604468002	1.1529419302724517	1.4431005451308017	1.2976609519610893	1.1433060046802894	1.2444859014011598	1.2565708604207602	1.3562945250124823	1.2766682210656524	1.112964173044928	1.249624815001226	-0.3601740439211749	-0.05322075916256663	-0.05500880849370171	-0.0197581894763994	0.019049392923761177	-0.09029752444627914	-0.15801099913454308	-0.06910497223103418	-0.12334021315388388	0.04156045342448289	-0.10645312109103378	-0.08348642585935062	-0.0881871008851436	0.397602565759	0.412754243182	0.270885072145	0.989287003123	0.87199428352	0.572794651112	0.452098798395	0.326996172605	0.978575937473	0.79863356553	0.687084607526	0.436112310787	0.931439164502	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr2:217363440..217363554,-__422.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr2:217363440..217363554,-__422.1.0.0	rs116221471	3.2517988890321674	3.682341066529218	2.8893803610018938	2.8531754931044797	3.3057516499263215	3.160643555649529	2.6801443117371275	3.162132991972186	3.0788335389518484	3.3758883076336006	3.3064432496705765	3.2209361236484373	3.163955794904782	3.2168734389180247	3.778120150793562	3.153490408489027	2.862777117905092	3.1424307918924725	3.2505921445501507	2.9700410602523344	3.285917268681502	3.257756473439225	3.404229025756724	3.2920868615965357	3.3642377961997996	3.2482127115395376	-0.03492545011414272	0.09577908426434378	0.2641100474871334	0.009601624800612107	-0.163320858033849	0.08994858890062174	0.28989674851520686	0.12378427670931602	0.1789229344873764	0.02834071812312322	-0.014356388074040716	0.14330167255136228	0.08425691663475528	0.711940675829	0.519249062249	0.501992688725	0.925117039075	0.737113058664	0.90381429355	0.628827692687	0.967868733231	0.747262025795	0.87199428352	0.946473618223	0.747262025795	0.998455109826	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr2:217363440..217363554,-__422.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr2:217363440..217363554,-__422.1.0.0	rs80236843	3.2517988890321674	3.682341066529218	2.8893803610018938	2.8531754931044797	3.3057516499263215	3.160643555649529	2.6801443117371275	3.162132991972186	3.0788335389518484	3.3758883076336006	3.3064432496705765	3.2209361236484373	3.163955794904782	3.346926184598737	3.9268744252049204	3.0465260412585056	2.963065745994287	3.276461832805741	3.3908482840365526	3.1382137295452672	3.3496843642470697	3.224305826102372	3.4780934754607387	3.3988352252612266	3.4430241480447807	3.331904940213349	0.09512729556656963	0.24453335867570214	0.1571456802566118	0.10989025288980736	-0.02928981712058043	0.23020472838702366	0.4580694178081397	0.18755137227488383	0.14547228715052363	0.10220516782713807	0.09239197559065015	0.22208802439634345	0.16794914530856775	0.696989544957	0.340423946445	0.66743649171	0.677233097055	0.978575937473	0.829896383209	0.221756412245	0.757455001208	0.829896383209	0.687084607526	0.677233097055	0.989287003123	0.990386515124	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr2:217363440..217363554,-__422.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr2:217363440..217363554,-__422.1.0.0	rs75845318,rs116221471,rs80236843	3.2517988890321674	3.682341066529218	2.8893803610018938	2.8531754931044797	3.3057516499263215	3.160643555649529	2.6801443117371275	3.162132991972186	3.0788335389518484	3.3758883076336006	3.3064432496705765	3.2209361236484373	3.163955794904782	3.3693584348102528	4.0449086501408535	3.1851594354361144	2.77375914027273	3.1798358312536785	3.2095459961008075	3.1487228053730423	3.51922739096037	3.3154110530756067	3.4708322338174438	3.4010603356074953	3.5015345176706347	3.3432796520432526	0.11755954577808536	0.3625675836116353	0.2957790744342206	-0.07941635283174975	-0.125915818672643	0.04890244045127856	0.46857849363591475	0.3570943989881843	0.23657751412375827	0.09494392618384317	0.09461708593691887	0.28059839402219744	0.17932385713847032	0.66743649171	0.0719809426143	0.591208103411	0.696989544957	0.727009731456	0.90381429355	0.129198935732	0.554657938956	0.687084607526	0.90381429355	0.628827692687	0.460214637573	0.778098530314	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr2:235363204..235363318,-__424.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr2:235363204..235363318,-__424.1.0.0	rs10187606	-1.476261239040058	-1.2294382021597934	-1.5716857390921843	-1.7690481225563202	-1.006491266015123	-1.6954983117302531	-1.561965645346165	-0.808134694138564	-1.6347353458573393	-1.7147689028944886	-1.4287395733047819	-1.91409815819422	-1.4842387666941077	-1.95386916701165	-2.2223525952720853	-1.3577415539945128	-2.0545848719575	-2.0006839958616265	-1.7664266301447975	-1.8588593734842984	-2.0726448617222357	-2.2640047863594006	-2.0460148275876957	-1.73237870889656	-1.3884774544818577	-1.8931699022311854	-0.4776079279715919	-0.9929143931122919	0.21394418509767155	-0.28553674940118	-0.9941927298465034	-0.07092831841454439	-0.2968937281381334	-1.2645101675836719	-0.6292694405020614	-0.3312459246932071	-0.30363913559177824	0.5256207037123624	-0.4089311355370775	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr2:235363204..235363318,-__424.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr2:235363204..235363318,-__424.1.0.0	rs143765840	-1.476261239040058	-1.2294382021597934	-1.5716857390921843	-1.7690481225563202	-1.006491266015123	-1.6954983117302531	-1.561965645346165	-0.808134694138564	-1.6347353458573393	-1.7147689028944886	-1.4287395733047819	-1.91409815819422	-1.4842387666941077	-1.5733500417795383	-1.8428940837297436	-1.6973536812866674	-1.3364438181809812	-1.473899543811191	-2.0955387328024084	-1.896055698536604	-1.713479653252259	-1.8102009020555871	-1.7693965392243451	-1.7677304941916343	-1.6855848185506603	-1.721827333950135	-0.09708880273948028	-0.6134558815699502	-0.12566794219448307	0.4326043043753389	-0.467408277796068	-0.4000404210721553	-0.33409005319043894	-0.905344959113695	-0.17546555619824789	-0.054627636329856566	-0.33899092088685245	0.2285133396435597	-0.23758856725602748	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr2:235363204..235363318,-__424.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr2:235363204..235363318,-__424.1.0.0	rs10187606,rs143765840	-1.476261239040058	-1.2294382021597934	-1.5716857390921843	-1.7690481225563202	-1.006491266015123	-1.6954983117302531	-1.561965645346165	-0.808134694138564	-1.6347353458573393	-1.7147689028944886	-1.4287395733047819	-1.91409815819422	-1.4842387666941077	-1.9653235337850823	-1.7104161257072528	-2.011508254451953	-1.9672954529359272	-2.1297624975506886	-2.049770718542937	-1.6874490739659274	-2.01638201072882	-2.218063174000442	-2.2030730381185823	-1.9112719363594104	-2.354211529546128	-2.0187106121410956	-0.4890622947450243	-0.4809779235474594	-0.4398225153597686	-0.19824733037960707	-1.1232712315355655	-0.3542724068126837	-0.12548342861976236	-1.2082473165902563	-0.5833278281431027	-0.48830413522409377	-0.48253236305462854	-0.4401133713519081	-0.5344718454469883	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr2:237076010..237076124,+__425.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr2:237076010..237076124,+__425.1.0.0	rs112186240	2.1989291259125068	0.12143377908840593	0.7429661191936123	1.057970159210086	0.7945806976325471	0.1442784200744211	1.4553300009913495	-1.3163589980473411	0.6512456172079166	2.060339791810061	2.065870441321312	0.7607674968019343	0.8947793875997343	-0.6282040777938563	-0.5883193808911704	-1.6093806729693	-0.1551646916886249	-0.6161197129042999	-1.6163515799229875	-0.8070390196421122	-0.01148762615636939	0.12773515667483384	-0.2838726902247767	-1.7893787774156544	-0.9612408926545551	-0.7449019971324061	-2.8271332037063632	-0.7097531599795763	-2.3523467921629124	-1.213134850898711	-1.410700410536847	-1.7606299999974087	-2.2623690206334617	1.3048713718909717	-0.5235104605330828	-2.3442124820348376	-3.855249218736966	-1.7220083894564895	-1.6396813847321405	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr2:238343430..238343544,-__427.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr2:238343430..238343544,-__427.1.0.0	rs77695508	-0.8405741060958021	-1.0032068405041366	-1.1113122663330524	-1.0349666610793746	-0.9943782363169744	-0.9920777361651196	-0.9065869467510588	-1.3556458523552093	-1.0468439419957387	-0.9573215543247031	-1.4442631833666242	-0.7549717120663781	-1.0368457531128479	-0.9389635565674479	-1.5271625605247463	-1.0363876487293049	-1.1482569757437884	-1.2652036406344231	-1.828729678338064	-1.0261474517795184	-1.1245416683371616	-1.2179223145122318	-1.350768339101539	-1.7518137151358226	-1.3197021738641328	-1.2946333102723484	-0.09838945047164582	-0.5239557200206097	0.07492461760374747	-0.11329031466441375	-0.2708254043174487	-0.8366519421729444	-0.11956050502845961	0.23110418401804766	-0.17107837251649305	-0.3934467847768359	-0.30755053176919844	-0.5647304617977547	-0.25778755715950075	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr2:238343430..238343544,-__427.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr2:238343430..238343544,-__427.1.0.0	rs77695508,rs58112709	-0.8405741060958021	-1.0032068405041366	-1.1113122663330524	-1.0349666610793746	-0.9943782363169744	-0.9920777361651196	-0.9065869467510588	-1.3556458523552093	-1.0468439419957387	-0.9573215543247031	-1.4442631833666242	-0.7549717120663781	-1.0368457531128479	-1.3094580850932729	-0.9882291127352012	-1.4680708670219103	-0.36165749161793836	-0.9167847975279722	-0.9169939684732784	-1.6310512044582002	-1.3752585934615547	-1.2892026560304815	-1.053931481454339	-1.3891535302566576	-0.7976842009256635	-1.1247896657547058	-0.4688839789974708	0.014977727768935356	-0.3567586006888579	0.6733091694614363	0.07759343878900227	0.07508376769184122	-0.7244642577071414	-0.019612741106345366	-0.24235871403474274	-0.0966099271296359	0.05510965310996663	-0.04271248885928536	-0.08794391264185814	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr2:27579075..27579189,+__431.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr2:27579075..27579189,+__431.1.0.0	rs73921514	-1.6637858453013044	-1.4550381719453496	-1.7284049691324548	-1.4852915930688522	-1.383052722845099	-1.237802047741361	-1.305055950090553	-1.0793983506391454	-1.3725960694574189	-1.5039633880430232	-1.349452650536838	-1.9182204978800605	-1.4568385213901216	-1.3807107555147329	-1.544406540015356	-1.8346406544345597	-1.1046402578889467	-1.376443943964739	-1.374910643217268	-1.7170962132076373	-0.8480326973515764	-1.3236979026971898	-1.2100538334329478	-1.3989487747567164	-1.7536258290463018	-1.4056006704606643	0.2830750897865715	-0.08936836807000637	-0.10623568530210492	0.38065133517990546	0.0066087788803601555	-0.13710859547590704	-0.4120402631170843	0.23136565328756897	0.04889816676022907	0.2939095546100754	-0.04949612421987837	0.16459466883375873	0.05123785092945735	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr2:38466697..38466811,-__436.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr2:38466697..38466811,-__436.1.0.0	rs74410625	-1.5295555035108757	-1.6640933647397689	-1.35877408329909	-1.5001383250500036	-1.1122966939122523	-1.3895687625228097	-1.5175291373746433	-1.2147202467624156	-1.7085358606855106	-1.6266948850085365	-1.5407318847362381	-1.4481951784083733	-1.4675694938342094	-1.5830296250335012	-1.5484106761257632	-1.3225273437305625	-1.6939886329588447	-1.4971160904183345	-1.8068676249335696	-1.8782740938436484	-1.2991611280416597	-1.9463874437325597	-1.8589820778221773	-1.599897245154375	-1.3031459616125085	-1.611482328617292	-0.05347412152262554	0.11568268861400566	0.03624673956852753	-0.19385030790884117	-0.3848193965060822	-0.41729886241075986	-0.36074495646900506	-0.0844408812792441	-0.23785158304704912	-0.23228719281364074	-0.0591653604181368	0.1450492167958648	-0.14391283478308223	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr2:47572092..47572206,-__437.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr2:47572092..47572206,-__437.1.0.0	rs4380295	-1.0062816486873534	-1.6474410464931988	-1.7781198601371275	-1.157945320223186	-1.1582867639332057	-1.54062596188817	-1.5584681119922337	-1.3888275694135697	-1.3355921084488684	-1.1416239830867185	-1.4310766072332712	-1.2355030732946304	-1.3649826712359612	-1.3652178610942116	-1.07337430733652	-1.3600418781840904	-1.4446885769654743	-1.4955963384014102	-1.0353395489261574	-1.2297117786866503	-1.5242509860939015	-1.2678327737989075	-1.4669520921513919	-1.400273429623941	-1.2612104965996742	-1.3270408389885273	-0.35893621240685825	0.5740667391566787	0.41807798195303714	-0.2867432567422883	-0.3373095744682044	0.5052864129620125	0.3287563333055834	-0.13542341668033187	0.06775933464996098	-0.32532810906467335	0.030803177609330268	-0.02570742330504383	0.03794183224743358	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr2:74375092..74375206,+__445.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr2:74375092..74375206,+__445.1.0.0	rs72917141	-0.4182429699743464	-0.03238801002259364	0.0763405828632754	0.024594565169837504	0.009642858182238381	0.2168310889019706	-2.032070929083953	-2.2181725113557698	-0.5900816452915817	-0.3665971781064685	-0.07544294162997509	-0.8811582662227272	-0.5238954463808412	0.5990329087190359	-0.9231955000122987	-0.895115550707799	0.7968929317046097	-1.3100577804932816	-1.1225920832332075	-0.3027761155059208	-0.9900706259981624	-0.6218146788124587	0.19697469811759166	-0.2683927810415194	-0.911138570888666	-0.479354429012673	1.0172758786933822	-0.890807489989705	-0.9714561335710744	0.7722983665347722	-1.31970063867552	-1.3394231721351781	1.7292948135780322	1.2281018853576073	-0.031733033520876974	0.5635718762240602	-0.19294983941154434	-0.029980304665938817	0.04454101736816805	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr2:87754921..87755035,+__450.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr2:87754921..87755035,+__450.1.0.0	rs185316827	0.8302298483789841	0.8903342131707507	0.24319702717689115	0.12452936938834405	0.3847280432767647	0.5645436149091205	0.11664689730412987	0.3197793340357011	0.4004730334001055	0.7674681919247568	0.5371123100168372	0.5663349728979534	0.47878140465669494	0.8927794083939163	1.3588485062815043	0.75437667958306	0.3661359494499369	0.7504905223303773	0.6875220184458283	-0.20289142619609102	0.6581843330409773	0.7947221783551172	1.0808679234986778	0.6270266029731917	1.334959390870418	0.7585851739189096	0.06254956001493228	0.46851429311075365	0.5111796524061688	0.24160658006159283	0.3657624790536126	0.12297840353670775	-0.3195383235002209	0.33840499900527626	0.3942491449550117	0.313399731573921	0.08991429295635445	0.7686244179724646	0.2798037692622146	0.914457985151	0.48504462162	0.935789553219	0.648013768535	0.747262025795	0.657696241675	0.382791178922	0.154655491485	0.298053645387	0.76769033028	0.737113058664	0.206888731619	0.807336876668	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr2:89165673..89165787,-__453.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr2:89165673..89165787,-__453.1.0.0	rs1825473	-2.174294672785616	-2.1126990974054793	-2.2128944907656454	-2.0855850655731927	-1.6327358493232094	-1.8888033879502957	-1.965717065826711	-1.807851874640913	-1.9547637421278468	-1.868931641765154	-2.155791038913757	-1.9201605646071327	-1.9816857076404129	-1.4058750695752984	-1.927601251730631	-1.4900239972000384	-1.5602090895806642	-1.88655881835151	-1.629618181927356	-1.4104309359584355	-1.6597342823657182	-1.679072118608652	-1.7190576502140795	-1.4611049250888932	-1.4816418742809792	-1.609244016240188	0.7684196032103174	0.18509784567484844	0.722870493565607	0.5253759759925285	-0.2538229690283007	0.2591852060229396	0.5552861298682754	0.14811759227519472	0.27569162351919485	0.1498739915510745	0.6946861138248637	0.43851869032615354	0.3724416914002247	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr20:18547998..18548112,+__457.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr20:18547998..18548112,+__457.1.0.0	rs12624935	2.9809382115209044	3.385880622687888	3.0330607250844714	2.8407747521675506	2.9122141947691853	2.9598390662782577	2.7943526965498573	3.167649119290167	2.854392933522952	3.128303156970275	3.127223243515429	3.290317328503336	3.0395788375716895	2.6966869974638783	3.2366975977617214	2.7544348048521226	2.4855983374494532	2.7762836947113443	2.8354486216922252	2.6267037154795894	2.9225573569402097	2.856384910818129	2.9694914681252587	2.940793706665938	2.8715274237231214	2.8310507196402495	-0.28425121405702614	-0.14918302492616675	-0.2786259202323489	-0.35517641471809736	-0.13593050005784102	-0.12439044458603243	-0.16764898107026793	-0.24509176234995733	0.001991977295177083	-0.15881168884501617	-0.18642953684949104	-0.4187899047802146	-0.20852811793144022	0.170821264488	0.150801701171	0.0507398712534	0.0140036728837	0.0426112802219	0.382791178922	0.158583637061	0.132622250874	0.677233097055	0.226876581559	0.0763274184496	0.107123399254	9.65317190464e-05	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0808935805608	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr20:19738227..19738341,+__459.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr20:19738227..19738341,+__459.1.0.0	rs113214904	-0.7012229863789469	-0.7308125723959058	-0.5821885060330618	-0.5148869116635896	-0.6763169343246815	-0.48880448101947904	-0.7302646699277465	-0.6321534900616098	-0.5041030346746197	-0.7478495328363239	-0.8834532361070286	-0.6567778984320154	-0.654069521154584	-1.211859570677226	-1.2315159449581017	-1.0503524743164787	-1.1643501014796631	-1.0581660482248654	-0.8829274813142529	-1.1024145070050813	-0.9848501031845917	-1.0288593587275188	-0.9020244570137402	-0.9606202241575891	-0.9936834851317298	-1.0476353130159033	-0.5106365842982791	-0.5007033725621959	-0.4681639682834169	-0.6494631898160735	-0.38184911390018383	-0.3941230002947739	-0.37214983707733473	-0.35269661312298184	-0.5247563240528991	-0.1541749241774163	-0.07716698805056044	-0.3369055866997144	-0.3935657918613192	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0583245817739	NA__no_active_tile	0.0399413890972	0.0350255264852	NA__no_active_tile	0.0426112802219	0.0399413890972	NA__no_active_tile	0.572790257636	0.21176555971	0.000245773736408	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	0.20595839111	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr20:25604604..25604718,+__464.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr20:25604604..25604718,+__464.1.0.0	rs8120065	2.2214449413381443	2.645678658465541	2.145461995181898	2.0777596100574316	2.4369625860467803	2.334613088467474	2.2242809883251704	2.407302666453038	2.3672858559267933	2.3655741911437524	2.3554747361267925	2.4188388818904123	2.333389849951936	2.1859861594739067	2.5491439533553706	2.2952053559947445	2.1957368870434224	2.304823636872002	2.295186698871262	2.1194061396706187	2.3307229872321154	2.242234398718833	2.4140291449369538	2.1803436077345113	2.2425563377813287	2.2796146089737555	-0.035458781864237565	-0.09653470511017037	0.14974336081284667	0.11797727698599081	-0.1321389491747782	-0.03942638959621192	-0.10487484865455166	-0.07657967922092279	-0.1250514572079604	0.048454953793201305	-0.17513112839228118	-0.17628254410908362	-0.05377524097817991	0.87199428352	0.63839046467	0.989287003123	0.935789553219	0.536806685117	0.737113058664	0.727009731456	0.88258056334	0.510582765025	0.957167318493	0.113101776132	0.340423946445	0.989158696119	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr20:25604643..25604757,+__465.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr20:25604643..25604757,+__465.1.0.0	rs8120065	-0.13804402453421785	-0.3822785803758492	0.003804239469319423	-0.47576082861221414	-0.21233984978471054	-0.25633469202990816	-0.4671375576730262	-0.32941200268211773	-0.35319813597534244	-0.09923693056293015	-0.2594173868875279	-0.17293204222943145	-0.2618573159898297	-0.4500546624441447	-0.298725894394667	-0.19305751598791718	-0.6365204225180293	-0.4489281881998523	-0.3934704723996867	-0.5195463047450048	-0.47380413818432926	-0.1189689523995747	-0.2035609143085769	-0.18448840379553855	-0.6073072384821341	-0.3773694256549546	-0.3120106379099269	0.0835526859811822	-0.1968617554572366	-0.16075959390581518	-0.23658833841514176	-0.13713578036977853	-0.05240874707197862	-0.14439213550221153	0.23422918357576775	-0.10432398374564675	0.07492898309198937	-0.4343751962527026	-0.11551210966512492	0.563691144959	0.737113058664	0.154655491485	0.154655491485	0.170821264488	0.87199428352	0.340423946445	0.175053819161	0.829896383209	0.687084607526	0.687084607526	0.37190218233	0.409002216163	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr20:42839552..42839666,+__475.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr20:42839552..42839666,+__475.1.0.0	rs148846545	2.653913924645616	3.040489778297583	2.692732582052326	2.52676596383197	2.595037890843245	2.5810827015250712	2.4889530138644465	2.734927973228347	2.6638088898670915	2.651765193777556	2.647364447434958	2.73079773040382	2.667303340814336	2.453472687336511	2.7729661536071197	2.3782662421553695	2.2653715735719793	2.5409443196580956	2.51605125660845	2.168515043165776	2.5653144471670726	2.5414467103380396	2.669548675665057	2.447126390930552	2.7152820775140367	2.5028587981431714	-0.2004412373091049	-0.2675236246904631	-0.31446633989695627	-0.26139439025999067	-0.05409357118514935	-0.06503144491662116	-0.3204379706986704	-0.16961352606127456	-0.12236217952905193	0.017783481887501118	-0.20023805650440618	-0.015515652889783293	-0.16444454267116423	0.282745459933	0.136115392203	0.143314270352	0.136115392203	0.390154148302	0.48504462162	0.122558611289	0.104229562843	0.572794651112	0.935789553219	0.301187193336	0.696989544957	0.0797122347414	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr20:42839552..42839666,+__475.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr20:42839552..42839666,+__475.1.0.0	rs4142441	2.653913924645616	3.040489778297583	2.692732582052326	2.52676596383197	2.595037890843245	2.5810827015250712	2.4889530138644465	2.734927973228347	2.6638088898670915	2.651765193777556	2.647364447434958	2.73079773040382	2.667303340814336	2.118339002702872	2.4531397028192217	2.3267006999704285	2.265304609111789	2.12253018740757	2.211566146301524	2.135594399255469	2.298977577767626	2.310072734183898	2.2830735433004934	2.3069316145919747	2.400828854861053	2.2694215893561602	-0.5355749219427439	-0.5873500754783612	-0.3660318820818973	-0.26146135472018095	-0.47250770343567483	-0.3695165552235471	-0.35335861460897755	-0.4359503954607211	-0.3537361556831935	-0.36869165047706254	-0.3404328328429833	-0.3299688755427672	-0.39788175145817584	0.00883703695038	0.0115927323179	0.0286240283844	0.179364149792	0.00251850159852	0.0103298859694	0.0276615481105	0.0107365258413	0.188220673538	0.0350255264852	0.0276615481105	0.136115392203	4.09142933112e-11	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	3.42861777948e-08	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr20:42839552..42839666,+__475.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr20:42839552..42839666,+__475.1.0.0	rs148846545,rs4142441	2.653913924645616	3.040489778297583	2.692732582052326	2.52676596383197	2.595037890843245	2.5810827015250712	2.4889530138644465	2.734927973228347	2.6638088898670915	2.651765193777556	2.647364447434958	2.73079773040382	2.667303340814336	2.2190484810001108	2.2877531711431893	2.017212565945864	1.904170399678022	2.204140280540161	2.2052034855880533	2.0280019630053263	2.1124657911079034	2.271662020117896	2.3088162584143044	2.3247591921125315	2.1618576007516555	2.1704242674504184	-0.43486544364550506	-0.7527366071543935	-0.6755200161064616	-0.622595564153948	-0.3908976103030839	-0.3758792159370179	-0.46095105085912014	-0.6224621821204437	-0.39214686974919566	-0.34294893536325155	-0.32260525532242657	-0.5689401296521646	-0.49687907336391773	0.00115660425805	0.00210630874131	0.00849533044186	0.0168468410067	0.00167824394514	0.0115927323179	0.00501178746069	0.00133155906714	0.0267271087754	0.0232568344756	0.00849533044186	0.00480682187369	1.82607769027e-18	0.224381226062	0.425474365744	1	1	0.344040008754	1	1	0.259654018093	1	1	1	0.990205305979	4.14519635691e-16	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr20:47895099..47895213,+__478.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr20:47895099..47895213,+__478.1.0.0	rs479474	4.260145960668998	4.750095222157292	4.084689542589453	3.7529504477622453	4.199236063074	4.308340050743631	4.119122436144384	4.424638546400692	4.518599634179812	4.492630599783302	4.48420549755153	4.450019436062176	4.320389453093127	4.2687148727367745	4.681185928063267	4.001221590334943	3.7559067615899417	4.203667095785938	4.298476556984714	4.091569037019136	4.3468621722811385	4.4543204640452565	4.5149055964550655	4.463453385182487	4.435776735319866	4.293005016316543	0.008568912067776324	-0.06890929409402435	-0.08346795225451054	0.002956313827696455	0.004431032711937455	-0.009863493758916597	-0.02755339912524768	-0.07777637411955318	-0.06427917013455531	0.022274996671763247	-0.02075211236904284	-0.014242700742309822	-0.027384436776582238	0.591208103411	0.677233097055	0.66743649171	0.63839046467	0.66743649171	0.412754243182	0.313917214294	0.154655491485	0.248198866138	0.967868733231	0.452098798395	0.375513989452	0.604842404975	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr20:47895099..47895213,+__478.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr20:47895099..47895213,+__478.1.0.0	rs479473	4.260145960668998	4.750095222157292	4.084689542589453	3.7529504477622453	4.199236063074	4.308340050743631	4.119122436144384	4.424638546400692	4.518599634179812	4.492630599783302	4.48420549755153	4.450019436062176	4.320389453093127	4.270250398514049	4.7223307218203985	4.146053295031967	3.7966690964947265	4.241364348990659	4.282411932473401	4.166722791641611	4.438466730971163	4.554231765262796	4.502958026031367	4.567030768542093	4.426945797293664	4.342952972755659	0.010104437845050995	-0.02776450033689315	0.061363752442513686	0.04371864873248121	0.04212828591665918	-0.02592811827022956	0.0476003554972273	0.01382818457047108	0.03563213108298413	0.010327426248064597	0.08282527099056303	-0.023073638768511984	0.02256351966253171	0.248198866138	0.925117039075	0.147021540231	0.444064484515	0.347268461228	0.87199428352	0.382791178922	0.914457985151	0.628827692687	0.8931878581	0.237368605078	0.545696106059	0.751819313734	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr20:47895099..47895213,+__478.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr20:47895099..47895213,+__478.1.0.0	rs28362648	4.260145960668998	4.750095222157292	4.084689542589453	3.7529504477622453	4.199236063074	4.308340050743631	4.119122436144384	4.424638546400692	4.518599634179812	4.492630599783302	4.48420549755153	4.450019436062176	4.320389453093127	4.25236115992687	4.609785975597309	4.032678879175488	3.7326162997907657	4.1575543123911665	4.2803706866528	4.095875966936418	4.420090396693006	4.506540119073797	4.4737783946922525	4.422058975105775	4.449999366318481	4.286142544362844	-0.007784800742128617	-0.14030924655998245	-0.05201066341396565	-0.020334147971479588	-0.04168175068283375	-0.02796936409083095	-0.023246469207965248	-0.004548149707686022	-0.012059515106014551	-0.01885220509104979	-0.06214652244575536	-2.0069743694506315e-05	-0.03424690873028221	0.809021331888	0.63839046467	0.777966336216	0.468411351413	0.468411351413	0.79863356553	0.554657938956	0.809021331888	0.687084607526	0.591208103411	0.66743649171	0.326996172605	0.897299373153	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr20:47895099..47895213,+__478.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr20:47895099..47895213,+__478.1.0.0	rs479474,rs479473,rs28362648	4.260145960668998	4.750095222157292	4.084689542589453	3.7529504477622453	4.199236063074	4.308340050743631	4.119122436144384	4.424638546400692	4.518599634179812	4.492630599783302	4.48420549755153	4.450019436062176	4.320389453093127	4.267789726150232	4.774251847227195	4.118899640792662	3.8149223277551174	4.231774709198659	4.263174924220977	4.116369251204573	4.328902963602853	4.494987447606693	4.563080383141232	4.503093482355208	4.353172190582168	4.319201574486464	0.0076437654812338	0.024156625069903015	0.03421009820320897	0.061971879992872125	0.0325386461246584	-0.04516512652265359	-0.0027531849398103603	-0.09573558279783878	-0.0236121865731187	0.07044978335792962	0.018887984803678037	-0.09684724548000823	-0.0011878786066621405	0.957167318493	0.809021331888	0.581967350665	0.788281320858	0.648013768535	0.340423946445	0.591208103411	0.0484054419273	0.30750859871	0.510582765025	0.989287003123	0.0150857114019	0.697868862581	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr20:48909177..48909291,+__482.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr20:48909177..48909291,+__482.1.0.0	rs113226127	0.8246441439866858	1.210171010085742	0.867417579005251	0.8650379056677331	0.9806683031222734	1.0617545319500676	0.9472769015404423	1.077299643182272	1.2314993620254726	1.2477404169484736	1.2513241633809138	1.1210659028218055	1.0571583219764278	0.6987800039642249	0.9116938055399366	0.652936487947005	0.4684472493276917	0.5231208427453262	0.5999049617635416	0.7973085371353092	0.702882243943336	0.931770966599109	0.8148883631262585	0.7749737339005176	0.7759761579887192	0.7210569461650813	-0.12586414002246094	-0.2984772045458053	-0.21448109105824598	-0.39659065634004137	-0.45754746037694716	-0.46184957018652606	-0.14996836440513306	-0.3744173992389359	-0.29972839542636365	-0.43285205382221514	-0.4763504294803962	-0.3450897448330863	-0.3361013758113464	0.188220673538	0.0531733827136	0.0832552515755	0.147021540231	0.00342117348194	0.00567496309713	0.192768091005	0.0181189115857	0.0374147936077	0.00695778717972	0.00175684955224	0.101398170673	2.40957217511e-10	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	2.01922148274e-07	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr20:48909177..48909291,+__482.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr20:48909177..48909291,+__482.1.0.0	rs17196808	0.8246441439866858	1.210171010085742	0.867417579005251	0.8650379056677331	0.9806683031222734	1.0617545319500676	0.9472769015404423	1.077299643182272	1.2314993620254726	1.2477404169484736	1.2513241633809138	1.1210659028218055	1.0571583219764278	0.30840792083284607	0.583797391220607	0.1238219564155678	0.03887073951685434	0.3697785916942663	0.29326133737972687	0.4431156097889944	0.3868367502173009	0.4118931142255591	0.44942564371168503	0.46589532502888464	0.39895902009494355	0.35617195001060303	-0.5162362231538398	-0.6263736188651349	-0.7435956225896831	-0.8261671661508787	-0.6108897114280071	-0.7684931945703408	-0.504161291751448	-0.690462892964971	-0.8196062477999135	-0.7983147732367886	-0.7854288383520291	-0.722106882726862	-0.7009863719658247	0.00105204507021	0.00146142948273	0.00115660425805	0.00641629102443	4.38836124619e-06	0.000137117000352	0.0216734048733	0.000273955335251	0.000170183141363	6.66706650175e-05	2.20570481755e-05	0.000152810281165	1.67853794008e-31	0.744847909709	1	0.861670172248	1	0.00338781488206	0.104757388269	1	0.199165528728	0.131551568273	0.0523364720387	0.0169618700469	0.119039209027	1.40661479379e-28	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr20:48909177..48909291,+__482.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr20:48909177..48909291,+__482.1.0.0	rs113226127,rs17196808	0.8246441439866858	1.210171010085742	0.867417579005251	0.8650379056677331	0.9806683031222734	1.0617545319500676	0.9472769015404423	1.077299643182272	1.2314993620254726	1.2477404169484736	1.2513241633809138	1.1210659028218055	1.0571583219764278	0.3847477046814947	0.5289035115620453	0.18973972458333088	-0.013497531728908423	0.2191749355100741	0.2732004334491549	0.329540234557427	0.4153596632013356	0.38794096478166945	0.2603799744025722	0.485853825139076	0.33786105000057465	0.3166003741783205	-0.4398964393051911	-0.6812674985236966	-0.6776778544219201	-0.8785354373966415	-0.7614933676121993	-0.7885540985009127	-0.6177366669830153	-0.6619399799809362	-0.8435583972438032	-0.9873604425459014	-0.7654703382418377	-0.7832048528212309	-0.740557947798107	0.000481108176159	0.000110173251151	0.00023411339895	0.000392957862114	2.03284743013e-07	9.98335414644e-06	0.000104264461287	1.20184897547e-05	3.61506667287e-06	3.86551195752e-07	8.8142435835e-06	1.84173011953e-05	1.16378613259e-45	0.0933349861748	0.0222549967326	0.046588566391	0.0742690359395	4.16733723177e-05	0.00200665418343	0.0208528922574	0.00234360550216	0.000744703734612	8.04026487163e-05	0.00180691993462	0.00379396404623	2.64179452098e-43	not sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr20:50827123..50827237,+__483.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr20:50827123..50827237,+__483.1.0.0	rs13043316	1.9337356978280715	2.4895284838411387	2.2050747222149605	1.8300980770317525	2.015082158678689	2.1584334707593817	2.024923745794505	2.2895029762595316	2.362799062479963	2.16394248669819	2.2464145245883778	2.266789762585132	2.165527097396641	2.669439934338527	3.246097640775853	2.628591884034403	2.6284305172515454	2.895530720756314	2.7166531136009757	2.5114811530714483	2.97627730418237	2.8578433042322136	2.748934541663745	2.9656029395418764	3.0424980912315283	2.8239484287233996	0.7357042365104556	0.7565691569347144	0.42351716181944266	0.7983324402197929	0.8804485620776252	0.558219642841594	0.4865574072769432	0.6867743279228384	0.4950442417522507	0.5849920549655554	0.7191884149534986	0.7757083286463962	0.6584213313267588	0.0468981580933	0.166665831608	0.0832552515755	0.0374147936077	0.00406065558642	0.0181189115857	0.0187859264625	0.0583274625199	0.113101776132	0.0150857114019	0.0072436377838	0.0306357720046	1.30971366332e-10	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1.09754004986e-07	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr20:57425898..57426012,-__485.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr20:57425898..57426012,-__485.1.0.0	rs116335020	1.7721925316643388	2.0801291510410405	1.6998765504817082	1.6125186129467513	1.6023568747131192	1.7015883450348994	1.715966011438392	1.9504884421247064	1.9814149373117051	1.9244881611503566	2.097284267905941	1.9948562082431962	1.844430007838013	1.7760699386992969	2.2246020918261897	1.847945938254897	1.8827369554264803	2.015082158678689	1.9076394094717453	2.0678024898593033	2.017048813553373	2.2871128179013267	2.049333871521775	2.135195035956752	2.221119380599234	2.0359740751457553	0.0038774070349580914	0.14447294078514927	0.1480693877731889	0.2702183424797291	0.41272528396556973	0.20605106443684584	0.35183647842091137	0.06656037142866666	0.30569788058962155	0.12484571037141845	0.03791076805081106	0.226263172356038	0.19154406730774234	0.90381429355	0.87199428352	0.326996172605	0.687084607526	0.104229562843	0.248198866138	0.326996172605	0.265084565602	0.226876581559	0.554657938956	0.840380101088	0.307503061329	0.425154359052	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr21:16126131..16126245,-__492.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr21:16126131..16126245,-__492.1.0.0	rs2822904	-1.6371364996326774	-1.6834627068991082	-1.6465710625994896	-1.7786201054679522	-2.1526909130513325	-1.6995951963992986	-1.680810158586953	-1.3179685647313342	-1.8368155912316484	-2.1371814314077566	-1.7623668077597041	-1.7314400302839625	-1.7553882556709348	-1.1175829580197725	-1.5443577987529453	-1.486389025618679	-1.589927623875702	-1.3897246853946388	-2.0271069354044364	-1.666382289252842	-1.7448383419430027	-1.4462497918586927	-1.8705925840860391	-1.3532130456860179	-1.8508991724805677	-1.5906053543644445	0.5195535416129049	0.13910490814616283	0.16018203698081068	0.18869248159225016	0.7629662276566938	-0.32751173900513786	0.01442786933411111	-0.4268697772116685	0.39056579937295566	0.2665888473217175	0.40915376207368626	-0.11945914219660514	0.16478290130649012	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr21:16126131..16126245,-__492.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr21:16126131..16126245,-__492.1.0.0	rs9985156	-1.6371364996326774	-1.6834627068991082	-1.6465710625994896	-1.7786201054679522	-2.1526909130513325	-1.6995951963992986	-1.680810158586953	-1.3179685647313342	-1.8368155912316484	-2.1371814314077566	-1.7623668077597041	-1.7314400302839625	-1.7553882556709348	-1.4613801492190763	-1.4275457368718527	-1.7956852451510241	-1.6329301251244757	-1.7512409943413634	-1.614448243732238	-1.9305300928869675	-1.5387521628728098	-1.7357120042272831	-1.3404294888014177	-1.592446175351369	-1.5766028192460988	-1.6164752698188314	0.17575635041360105	0.25591697002725544	-0.14911418255153452	0.14568998034347658	0.40144991870996916	0.08514695266706052	-0.2497199343000145	-0.22078359814147563	0.10110358700436528	0.796751942606339	0.1699206324083351	0.15483721103786374	0.13891298585210343	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr21:16126131..16126245,-__492.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr21:16126131..16126245,-__492.1.0.0	rs116064928	-1.6371364996326774	-1.6834627068991082	-1.6465710625994896	-1.7786201054679522	-2.1526909130513325	-1.6995951963992986	-1.680810158586953	-1.3179685647313342	-1.8368155912316484	-2.1371814314077566	-1.7623668077597041	-1.7314400302839625	-1.7553882556709348	-1.4839816122367482	-1.5586413180873544	-1.6905247513397557	-1.7261752651312616	-1.8285032708559934	-1.4727510235282597	-1.6824156617889017	-2.211086030628425	-1.9051759545602995	-1.6363486120595347	-1.9423222545027807	-1.3703029538721705	-1.7090190590492904	0.1531548873959292	0.12482138881175375	-0.04395368874026606	0.05244484033669061	0.32418764219533913	0.22684417287103886	-0.0016055032019486326	-0.8931174658970908	-0.06836036332865114	0.5008328193482219	-0.17995544674307662	0.36113707641179205	0.04636919662164435	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr21:16126131..16126245,-__492.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr21:16126131..16126245,-__492.1.0.0	rs2822904,rs9985156,rs116064928	-1.6371364996326774	-1.6834627068991082	-1.6465710625994896	-1.7786201054679522	-2.1526909130513325	-1.6995951963992986	-1.680810158586953	-1.3179685647313342	-1.8368155912316484	-2.1371814314077566	-1.7623668077597041	-1.7314400302839625	-1.7553882556709348	-1.5132004278435467	-1.5683047871760885	-1.716019430670959	-1.925590063586617	-2.267538305055755	-1.295458205420289	-1.6320970133469492	-1.9080510291246018	-1.7924323054004592	-1.737048568604861	-1.7733054277495317	-1.5767547632096965	-1.7254833605991127	0.12393607178913069	0.1151579197230197	-0.06944836807146948	-0.14696995811866476	-0.1148473920044224	0.40413699097900957	0.04871314524000381	-0.5900824643932676	0.04438328583118922	0.40013286280289573	-0.010938619989827592	0.154685267074266	0.029904895071821907	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr21:16254290..16254404,-__493.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr21:16254290..16254404,-__493.1.0.0	rs7282113	-0.3187128813582679	-0.40578047923861665	-0.6575820056361148	-0.4939188799561912	-0.3879101032632719	-0.6931950732388708	-0.5118507765725911	-0.5237143030764464	-0.3806901890481584	-0.49774596991570585	-0.3106747475388935	-0.5493025965750493	-0.47758983378484815	-0.6694940198119367	-0.334819409066614	-0.6343598422172805	-0.7737546135264801	-0.3667184463203422	-0.287725169060498	-0.7477645107514876	-0.025509759051224573	-0.8928070755824911	-0.5559485749165524	-0.7548340615778795	-0.9710966471969524	-0.5845693440899783	-0.35078113845366876	0.07096107017200265	0.02322216341883432	-0.2798357335702889	0.021191656942929737	0.40546990417837275	-0.2359137341788965	0.49820454402522185	-0.5121168865343326	-0.05820260500084651	-0.44415931403898595	-0.4217940506219031	-0.10697951030513009	0.809021331888	0.37190218233	NA__no_active_tile	0.333666485083	0.154655491485	0.206893929435	NA__no_active_tile	0.188215617012	0.914457985151	0.777966336216	0.85089220831	0.628827692687	0.612311094187	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr21:17566701..17566815,+__495.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr21:17566701..17566815,+__495.1.0.0	rs16994440	-1.3822124851465798	-0.9042971913672714	-1.2306059418411184	-1.573498196159963	-1.6578381383503542	-1.402616799097854	-1.7247007633858469	-1.6930969047788027	-1.6301463786290011	-1.625656260306979	-1.5519537768151743	-1.6999592635187732	-1.5063818416164765	-1.5307033567167825	-1.5290210671810625	-1.2925828857202926	-1.4174434719246338	-1.6143156854084169	-1.5263623400115096	-1.4878821257935018	-1.57298616647036	-1.0901588167068947	-1.545191631085668	-1.743075334073658	-1.7578567873579956	-1.508964972370898	-0.1484908715702027	-0.6247238758137911	-0.061976943879174184	0.15605472423532918	0.04352245294193735	-0.12374554091365564	0.23681863759234512	0.12011073830844277	0.5399875619221064	0.08046462922131115	-0.19112155725848368	-0.05789752383922231	-0.002583130754421468	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr21:17566701..17566815,+__495.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr21:17566701..17566815,+__495.1.0.0	rs16994440,rs62219500	-1.3822124851465798	-0.9042971913672714	-1.2306059418411184	-1.573498196159963	-1.6578381383503542	-1.402616799097854	-1.7247007633858469	-1.6930969047788027	-1.6301463786290011	-1.625656260306979	-1.5519537768151743	-1.6999592635187732	-1.5063818416164765	-1.1631445156517497	-1.6213933879395843	-1.5102979911585008	-1.6232932241839806	-1.3541449535096304	-1.516486789801407	-1.5865880935907044	-1.443667117208577	-1.6780473985502269	-1.2069333750099513	-1.1675049760501608	-1.8369315987950583	-1.4757027851207944	0.2190679694948301	-0.7170961965723129	-0.27969204931738245	-0.049795028024017585	0.30369318484072383	-0.11386999070355297	0.13811266979514247	0.2494297875702256	-0.04790101992122575	0.4187228852970277	0.38444880076501353	-0.13697233527628505	0.03067905649568221	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr21:37802543..37802657,+__504.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr21:37802543..37802657,+__504.1.0.0	rs218642	-0.7194085164594329	-0.49571663305933955	-0.8355395586928774	-0.9704251849272952	-0.5175046207658747	-0.5786416006458097	-0.8279306918907245	-0.9285396028761932	-0.4717834230551907	-0.725857102058854	-0.7009796872126243	-0.7241557583631707	-0.7080401983339489	-0.6089759518503565	-0.6134929614663897	-0.9405214565719154	-0.8785249987223736	-0.4944449825549225	-0.5907097173198619	-0.8414632173684148	-0.9716612725219183	-0.7075188963519189	-0.7022947065797069	-0.7753631533197205	-0.3901006572135057	-0.7095893309867504	0.11043256460907647	-0.1177763284070501	-0.104981897879038	0.09190018620492169	0.023059638210952194	-0.012068116674052165	-0.013532525477690238	-0.04312166964572506	-0.23573547329672817	0.02356239547914707	-0.07438346610709623	0.334055101149665	-0.0015491326528014604	0.687084607526	0.0959193233604	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.925117039075	0.476688253492	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0698833862508	0.265084565602	0.935789553219	0.468406259835	0.486040518315	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr21:45595258..45595372,+__507.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr21:45595258..45595372,+__507.1.0.0	rs547608834	-0.062288774822701586	0.8427313830784828	0.303958322545139	0.2066695278186245	0.7021233123411067	0.7930229760063112	0.3993472231373709	0.5825750846116076	0.3443963817961338	0.46212406766885705	0.27608807663374596	0.39247222395851006	0.436934983731099	0.5555743743457979	0.5941097030478389	0.3730767958296924	0.16274642442692594	0.14863053375826832	0.5316215077541444	0.2392230910446983	-0.21655329420667602	0.2003369745561618	0.14244974100225452	0.4118342659683609	0.035466561266639766	0.26487638989950896	0.6178631491684995	-0.2486216800306439	0.0691184732845534	-0.043923103391698554	-0.5534927785828384	-0.2614014682521668	-0.16012413209267262	-0.7991283788182836	-0.144059407239972	-0.31967432666660256	0.13574618933461496	-0.3570056626918703	-0.17205859383159008	NA__not_enough_barcodes	0.301187193336	0.88258056334	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.428242856315	0.777966336216	0.687081215138	NA__not_enough_barcodes	0.510582765025	0.76448652017	NA__not_enough_barcodes	1	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr22:27053403..27053517,+__515.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr22:27053403..27053517,+__515.1.0.0	rs147062430	-1.2383716875746906	-1.2738475767062696	-1.6004363029309445	-1.7137241273111734	-1.4286441483676535	-1.7203303771505198	-0.7731892550584106	-1.2808577186172152	-1.2903562586821056	-1.35011734291807	-1.183392510794326	-1.5417064332314678	-1.3662478116119037	-1.1026859907329043	-1.1284825891722168	-1.2645552229762826	-0.9495444769685938	-1.2769900880296334	-1.2132803662679954	-1.2022782179780374	-1.3803797851094974	-1.2612620562804333	-1.286340846614238	-1.1703164927331584	-0.8771969701780252	-1.1761094252534179	0.13568569684178633	0.1453649875340528	0.3358810799546619	0.7641796503425796	0.1516540603380201	0.5070500108825244	-0.4290889629196267	-0.09952206649228224	0.029094202401672264	0.06377649630383186	0.013076018061167538	0.6645094630534426	0.19013838635848587	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr22:27068673..27068787,+__518.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr22:27068673..27068787,+__518.1.0.0	rs9625066	2.6137063860613834	2.8933464411503786	2.3920701191358544	2.354967553522374	2.510718051713103	2.5398177348808306	2.2492290762472877	2.4050279092875857	2.4672843731029284	2.647476977750417	2.6945682936230675	2.72415892961323	2.5410309871740364	2.6722703328285573	2.9411146436549864	2.445503899690483	2.2956033748140117	2.568037184891934	2.5258215712344483	2.2983128546999736	2.5088171089994726	2.4537474977363125	2.5317775103387405	2.5641159590875007	2.5175357647325844	2.5268881418924174	0.05856394676717391	0.04776820250460778	0.05343378055462855	-0.0593641787083623	0.057319133178831194	-0.013996163646382342	0.049083778452685856	0.10378919971188694	-0.013536875366615853	-0.11569946741167625	-0.13045233453556682	-0.20662316488064558	-0.014142845281619576	0.957167318493	0.809021331888	0.88258056334	0.609889042629	0.914457985151	0.572794651112	0.925117039075	0.428242856315	0.8931878581	0.436112310787	0.444064484515	0.737113058664	0.992632753968	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr22:28315407..28315521,+__522.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr22:28315407..28315521,+__522.1.0.0	rs16985722	-0.34450088353804675	-0.3820948830754588	-0.2623255573853822	-0.564889392429905	-0.20445584207657447	-0.23273309594667	-0.19733957514279254	-0.2890550335623273	-0.2201866022143276	-0.36683206460043133	-0.04053732013755548	-0.09989601335540989	-0.26707052195540676	-0.12001324893692594	0.13583496715463994	0.07719813978654776	0.04134030972232835	0.049553045405304384	-0.046001857210531676	0.1529487176484362	0.21075685261747826	0.05427598384799494	0.1440935306949929	0.12099264426813433	0.11566842400566686	0.07805395908367219	0.2244876346011208	0.5179298502300987	0.33952369717193	0.6062297021522334	0.25400888748187883	0.1867312387361383	0.35028829279122875	0.49981188617980554	0.27446258606232254	0.5109255952954243	0.1615299644056898	0.21556443736107675	0.34512448103907895	0.248198866138	0.0103298859694	0.0719809426143	0.132617817397	0.313917214294	0.340423946445	0.183752894264	0.0129907246043	0.0276615481105	0.00115660425805	0.436112310787	0.221756412245	3.91624144623e-06	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.90793434257	1	1	0.00328181033194	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr22:42765220..42765334,-__529.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr22:42765220..42765334,-__529.1.0.0	rs190491124														0.08785717098728585	-0.6133793268794953	1.1938180814338422	2.441003904301066	0.3553191692310902	-0.08752873828545155	1.0217282218402526	-0.5512939115326464	0.4395570662079695	2.2573819988777326	-0.13501460449397368	0.412002745994269	0.5684543148068285														NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr22:43011170..43011284,+__530.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr22:43011170..43011284,+__530.1.0.0	rs137114	-2.2637569412119176	-1.5162358355890122	-1.9359807460458276	-1.8485820567504234	-1.7443145164340994	-1.630355029813138	-1.8796856771174677	-1.8521515836134799	-1.8900659340390549	-1.7440136700691022	-1.9137603902257856	-1.9552454481658452	-1.8478456524229294	-1.8996199111313241	-1.1764587697300521	-1.7507900305197044	-1.8324861028802786	-1.9915670575677065	-2.2969062254440304	-1.5802097685399108	-2.1149164857113227	-1.767578103670293	-2.085979414065804	-1.849208073321424	-2.053092331166296	-1.8665676894790124	0.3641370300805935	0.33977706585896006	0.1851907155261232	0.01609595387014484	-0.24725254113360706	-0.6665511956308925	0.2994759085775569	-0.26276490209784287	0.12248783036876176	-0.34196574399670165	0.06455231690436158	-0.09784688300045086	-0.018722037056082757	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr22:45559539..45559653,-__531.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr22:45559539..45559653,-__531.1.0.0	rs3788632	-0.9322043345453334	-1.1418917063342604	-1.3950249680079378	-1.2374481984457633	-0.7692101530744834	-1.204811002600903	-1.060012313152598	-1.0777695364409825	-1.2749925658449894	-1.0253401884394815	-1.4921947487432825	-1.2201881840341655	-1.1525906583053485	-1.3670475032645022	-1.6316120689834412	-1.8573748858452197	-1.863036672765652	-1.2678498097733621	-1.548043464892202	-1.0509629289014495	-1.277395993834959	-1.2961903778071724	-1.9685763346406244	-1.295458205420289	-1.35039004106854	-1.4811615239331177	-0.43484316871916884	-0.48972036264918084	-0.46234991783728185	-0.6255884743198887	-0.4986396566988788	-0.343232462291299	0.00904938425114854	-0.19962645739397655	-0.021197811962182955	-0.9432361462011429	0.1967365433229935	-0.1302018570343746	-0.32857086562776944	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr22:45559539..45559653,-__531.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr22:45559539..45559653,-__531.1.0.0	rs132847	-0.9322043345453334	-1.1418917063342604	-1.3950249680079378	-1.2374481984457633	-0.7692101530744834	-1.204811002600903	-1.060012313152598	-1.0777695364409825	-1.2749925658449894	-1.0253401884394815	-1.4921947487432825	-1.2201881840341655	-1.1525906583053485	-1.1917414131755542	-1.5786278990041847	-0.6089754587740938	-0.9538792699946795	-1.2108928990702426	-0.4538284336692322	-0.7601127825395974	-0.648179770392756	-1.7158335882549869	-1.6182213255250413	-1.4913639877879816	-1.7831582056387951	-1.1679012528189288	-0.2595370786302208	-0.43673619266992425	0.7860495092338441	0.2835689284510837	-0.4416827459957592	0.7509825689316707	0.2998995306130007	0.4295897660482265	-0.44084102240999745	-0.5928811370855598	0.0008307609553008799	-0.5629700216046296	-0.015310594513580356	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr22:45559539..45559653,-__531.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr22:45559539..45559653,-__531.1.0.0	rs3788632,rs132847	-0.9322043345453334	-1.1418917063342604	-1.3950249680079378	-1.2374481984457633	-0.7692101530744834	-1.204811002600903	-1.060012313152598	-1.0777695364409825	-1.2749925658449894	-1.0253401884394815	-1.4921947487432825	-1.2201881840341655	-1.1525906583053485	-0.8456150542206601	-1.4617287585552357	-1.4855032975749989	-1.4276686098402411	-1.3582921532991672	-1.644681269357064	-1.2206397652971337	-1.713479653252259	-1.7655685196951454	-0.9086885452363537	-1.5258712925203168	-1.3855030644078639	-1.3952699986047035	0.08658928032467328	-0.31983705222097525	-0.09047832956706103	-0.19022041139447787	-0.5890820002246838	-0.43987026675616114	-0.16062745214453567	-0.6357101168112764	-0.49057595385015595	0.11665164320312782	-0.03367654377703433	-0.16531488037369835	-0.2426793402993549	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr22:45559619..45559733,-__532.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr22:45559619..45559733,-__532.1.0.0	rs132847	0.3314238913674196	1.0852570998738906	1.4821066349485528	1.5622604677140417	1.2474489248069829	0.7244563939348526	1.2822218465245554	0.8731552906752953	0.6751585863988022	0.2027036986427332	0.11776542536856444	0.00301081408105075	0.7989140895280618	2.189124001104038	1.7923952000693557	0.3730781616660805	1.0002282248868126	0.11149631756207576	0.2248733289017571	-0.2731448604795029	0.3905067929151467	0.8555023950176408	-0.5658483072553291	1.7058932561338782	1.0179937301275856	0.7351748533874615	1.8577001097366181	0.7071381001954651	-1.1090284732824722	-0.5620322428272291	-1.135952607244907	-0.4995830650330955	-1.5553667070040582	-0.48264849776014856	0.18034380861883859	-0.7685520058980623	1.5881278307653137	1.014982916046535	-0.06373923614060016	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr22:48027372..48027486,+__534.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr22:48027372..48027486,+__534.1.0.0	rs12170227	2.6736305420935587	3.464203105188032	2.909418542640899	2.76353816602946	3.0799630629776686	2.899489528790971	2.7603165972623724	3.2267282903971717	3.154872534979223	3.0085905506306316	3.1372764102284627	3.174029453728531	3.021004732078915	2.805710038495965	3.0613991799810374	2.6313826959549247	2.4331886926476765	2.6723641881628213	3.2439639431653577	3.09694251189527	2.944212545605981	3.4333365093445685	3.0893960887925096	3.2159277718072583	3.1675481223210316	2.9829476906812	0.13207949640240635	-0.4028039252069946	-0.27803584668597425	-0.33034947338178355	-0.40759887481484736	0.34447441437438675	0.3366259146328976	-0.28251574479119057	0.27846397436534565	0.08080553816187797	0.0786513615787956	-0.006481331407499624	-0.03805704139771501	NA__not_enough_barcodes	0.357692665759	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.382791178922	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.319654819832	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr22:48027372..48027486,+__534.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr22:48027372..48027486,+__534.1.0.0	rs9626750	2.6736305420935587	3.464203105188032	2.909418542640899	2.76353816602946	3.0799630629776686	2.899489528790971	2.7603165972623724	3.2267282903971717	3.154872534979223	3.0085905506306316	3.1372764102284627	3.174029453728531	3.021004732078915	2.991646096533492	3.6243527896637584	2.951375073053767	2.495799930728408	3.137842856978891	2.875250701356709	3.0146388430134525	3.7036001463721195	3.1697038266139743	3.3384917679021364	3.230465263916832	3.321331571512393	3.154541572303828	0.31801555443993346	0.16014968447572642	0.041956530412868176	-0.267738235301052	0.05787979400122234	-0.024238827434261978	0.2543222457510801	0.47687185597494786	0.014831291634751498	0.3299012172715048	0.09318885368836938	0.14730211778386204	0.13353684022491266	0.63839046467	0.762562203295	0.90381429355	0.428242856315	0.788281320858	0.989287003123	0.788281320858	0.48504462162	0.727009731456	0.648013768535	0.88258056334	0.809021331888	0.995697168269	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr22:48027372..48027486,+__534.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr22:48027372..48027486,+__534.1.0.0	rs12170227,rs9626750	2.6736305420935587	3.464203105188032	2.909418542640899	2.76353816602946	3.0799630629776686	2.899489528790971	2.7603165972623724	3.2267282903971717	3.154872534979223	3.0085905506306316	3.1372764102284627	3.174029453728531	3.021004732078915	2.9609894221513366	3.3251769939162004	2.7000341838596427	2.7704847499340146	3.114745449577394	3.282583732606445	2.707293319327521	3.1666585174721877	3.25450106819054	3.3408719752497147	3.0475258179297184	3.17657260027486	3.0706198192074647	0.287358880057778	-0.13902611127183162	-0.20938435878125627	0.006946583904554604	0.034782386599725434	0.3830942038154741	-0.05302327793485162	-0.060069772924983944	0.09962853321131737	0.33228142461908305	-0.08975059229874427	0.0025431465463290337	0.049615087128549486	0.90381429355	0.282745459933	0.317148697424	0.375513989452	0.563691144959	0.677233097055	0.591208103411	0.536806685117	0.476688253492	0.914457985151	0.519249062249	0.375513989452	0.710349806673	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr3:101659611..101659725,+__536.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr3:101659611..101659725,+__536.1.0.0	rs771572	-0.8731856366659759	-0.686100036087157	-1.0192539242287029	-1.249612417580448	-1.1720208255416331	-1.0925330843122363	-1.4035542858824412	-1.0639897125980542	-0.7533888567415536	-1.01426262261747	-0.9907709497104291	-1.150013956951142	-1.0390571924097702	-1.0069569535560297	-0.7496663882767199	-1.2136343375470051	-1.0116102149850124	-0.9291373430778876	-1.266455703800383	-0.19395264113813748	-1.1918041875219034	-0.8676111359614513	-1.0783982811803299	-0.9734681454418588	-0.8193827518986128	-0.9418398403654443	-0.13377131689005373	-0.06356635218956297	-0.19438041331830225	0.23800220259543559	0.24288348246374547	-0.1739226194881467	1.2096016447443039	-0.12781447492384923	-0.1142222792198977	-0.06413565856285985	0.017302804268570338	0.3306312050525293	0.09721735204432602	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.354194392099	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.354194392099	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:113933158..113933272,+__541.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:113933158..113933272,+__541.1.0.0	rs9853061	-0.7060760562812519	-1.0432917271177335	-1.291522287744418	-0.7204325624594803	-0.6356874683037527	-1.0765057353695169	-1.33401489084446	-0.5121098904903743	-0.8827031085748416	-0.7693863313442699	-0.5527368568468606	-1.2922918657164728	-0.9013965650911194	-0.7926216240679561	-1.0392434521411742	-1.1169240547804808	-0.5720423947403811	-0.7323318322409692	-0.5611521350630543	-0.6451067693296033	-0.9753408521208687	-0.890999301481723	-0.5842010859082547	-0.9662984253792705	-0.5704808425209131	-0.7872285641478874	-0.08654556778670419	0.004048274976559352	0.17459823296393706	0.1483901677190992	-0.09664436393721654	0.5153536003064626	0.6889081215148567	-0.4632309616304945	-0.008296192906881439	0.18518524543601522	-0.4135615685324099	0.7218110231955597	0.11416800094323194	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.581967350665	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0820635557109	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.201157493007	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:13521485..13521599,-__547.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:13521485..13521599,-__547.1.0.0	rs2271673	1.0438466217932467	0.9341861985046508	0.551935526133729	0.7140675135810524	1.0536304083294001	1.1124011537644478	0.9726903061940128	0.9488599362889241	1.2896824792298114	1.1010508398371885	1.1410823322883583	0.4615217270339052	0.9437462535815606	0.1619168875841153	0.7896332215955052	0.5555840848910385	0.503651439131193	0.8685554051121123	0.9536899937168264	0.3804569244197251	0.8586133641710504	0.9029907756164064	0.4560305341093199	0.4155450402540963	0.9617525942007972	0.6507016887335154	-0.8819297342091315	-0.1445529769091456	0.003648558757309517	-0.21041607444985932	-0.18507500321728787	-0.15871116004762142	-0.5922333817742876	-0.09024657211787368	-0.386691703613405	-0.6450203057278687	-0.725537292034262	0.500230867166892	-0.29304456484804503	0.158583637061	0.609889042629	0.66743649171	0.270885072145	0.983930924304	0.326996172605	0.0484054419273	0.737113058664	0.175053819161	0.179364149792	0.192768091005	0.989287003123	0.425618540787	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:156392133..156392247,-__559.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:156392133..156392247,-__559.1.0.0	rs6441095	0.4429793481580366	0.4592343060527375	0.13251943463144045	0.217320585114386	0.5677410509509145	0.519798065687745	0.44180630385806596	0.8293490779513805	0.48206132633669074	0.5532682157238688	0.4886589840549982	0.379260977368742	0.4594998063240839	0.2122132540224009	0.5518176464386695	0.5797425613455545	0.5047124336385682	0.4079251944748848	0.5023860821972819	0.42175934592982933	0.9973424170341736	0.7154571784810269	0.5019721775515363	0.5751235396663266	0.6631823704898205	0.5528028501058394	-0.23076609413563567	0.09258334038593197	0.447223126714114	0.2873918485241822	-0.15981585647602975	-0.017411983490463134	-0.02004695792823663	0.16799333908279312	0.2333958521443361	-0.051296038172332414	0.08646455561132838	0.28392139312107856	0.09330304378175557	0.757455001208	0.716953652062	0.158583637061	0.276771967065	0.687084607526	0.819442862795	0.706946403854	0.361218104761	0.125844655769	0.420456664513	0.452098798395	0.420456664513	0.454180679175	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:156392133..156392247,-__559.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:156392133..156392247,-__559.1.0.0	rs113621060	0.4429793481580366	0.4592343060527375	0.13251943463144045	0.217320585114386	0.5677410509509145	0.519798065687745	0.44180630385806596	0.8293490779513805	0.48206132633669074	0.5532682157238688	0.4886589840549982	0.379260977368742	0.4594998063240839	0.25812044792539324	0.5238884727190303	0.511677954206777	0.35772226144646424	0.5522038689549948	0.5994762324763081	0.6426104416733687	0.8486742242006116	0.6074947767394869	0.6167661307117562	0.49825904736271526	0.686970526157713	0.5586553653812184	-0.18485890023264334	0.06465416666629276	0.37915851957533653	0.14040167633207823	-0.015537181995919691	0.0796781667885631	0.2008041378153027	0.019325146249231095	0.1254334504027962	0.06349791498788748	0.009600063307717066	0.30770954878897105	0.09915555905713443	0.946473618223	0.64319083408	0.30750859871	0.401353314521	0.397602565759	0.747262025795	0.104229562843	0.79863356553	0.226876581559	0.154655491485	0.87199428352	0.232080506959	0.482627827049	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr3:156392133..156392247,-__559.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:156392133..156392247,-__559.1.0.0	rs66538320,rs6441095,rs113621060	0.4429793481580366	0.4592343060527375	0.13251943463144045	0.217320585114386	0.5677410509509145	0.519798065687745	0.44180630385806596	0.8293490779513805	0.48206132633669074	0.5532682157238688	0.4886589840549982	0.379260977368742	0.4594998063240839	0.07373591482660022	0.521768574096982	0.4920228225185205	0.1495162584618897	0.3919359342048115	0.4525126524985128	0.5175260187796601	0.8180928458606537	0.6720789961871668	0.635089504172355	0.5197963653844587	0.49959957465957916	0.4786396218042659	-0.3692434333314364	0.06253426804424445	0.35950338788708003	-0.0678043266524963	-0.17580511674610305	-0.0672854131892322	0.07571971492159413	-0.011256232090726792	0.19001766985047608	0.08182128844848624	0.031137381329460534	0.12033859729083718	0.019139815480181992	0.861430881609	0.88258056334	0.648010011537	0.706946403854	0.737113058664	0.545696106059	0.85089220831	0.354199901149	0.819442862795	0.397602565759	0.967868733231	0.361218104761	0.97455885261	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr3:177159673..177159787,+__566.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr3:177159673..177159787,+__566.1.0.0	rs73173158	-1.07910003183805	-1.2752242529967859	-1.1625382398119946	-1.5499219016634926	-1.1977073776209852	-1.5249380470135785	-1.332146684754024	-1.257423905393837	-1.3020512840380774	-1.294217865408305	-1.6812213949143833	-1.3413390424379463	-1.3331525023242883	-1.5636674047235386	-1.5697659371433055	-1.4545038579893002	-1.5870151097509495	-1.465791842358227	-1.7267150168082184	-1.4721628831617553	-1.5941741932022697	-1.6648690126064545	-1.3900102336149187	-1.740421056257354	-1.829619732496779	-1.588226356676089	-0.4845673728854887	-0.2945416841465196	-0.2919656181773056	-0.037093208087456864	-0.2680844647372418	-0.20177696979463988	-0.14001619840773127	-0.33675028780843275	-0.36281772856837713	-0.09579236820661374	-0.05919966134297083	-0.48828069005883257	-0.25507385435180097	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:194304663..194304777,+__570.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:194304663..194304777,+__570.1.0.0	rs144889211	3.7763304147766976	4.132566185415538	3.714297467541677	3.423579984595433	3.8274255875905228	3.800516905760609	3.624173015145968	4.130263909338947	3.9479356141342983	3.979154459968546	3.9425879113295634	3.9892187506783134	3.8573375171896753	3.802669430983242	4.044015578337498	3.6571791042791983	3.4567458724271827	3.760112709516095	3.7786303253072013	3.6537046906417063	3.976699916439462	3.9819600937297466	3.908226760917459	3.905414760255089	4.059729613431636	3.832090738022126	0.02633901620654422	-0.08855060707803997	-0.057118363262478766	0.033165887831749785	-0.06731287807442765	-0.021886580453407856	0.02953167549573843	-0.15356399289948452	0.0340244795954483	-0.07092769905108742	-0.037173151074474386	0.07051086275332263	-0.025246779167549766	0.777966336216	0.8931878581	0.914457985151	0.460214637573	0.946473618223	0.48504462162	0.382791178922	0.989287003123	0.737113058664	0.861430881609	0.946473618223	0.527990680582	0.998466789462	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:194304663..194304777,+__570.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:194304663..194304777,+__570.1.0.0	rs12489829	3.7763304147766976	4.132566185415538	3.714297467541677	3.423579984595433	3.8274255875905228	3.800516905760609	3.624173015145968	4.130263909338947	3.9479356141342983	3.979154459968546	3.9425879113295634	3.9892187506783134	3.8573375171896753	3.7849395639721193	4.182498388163301	3.6147082644740127	3.3195658677161712	3.83773582492757	3.756159555132422	3.5496174273811576	4.1195278001841755	3.8905070842766363	3.9239706323195493	3.924854088789414	4.055784908311301	3.8299891171373197	0.008609149195421661	0.049932202747763554	-0.09958920306766439	-0.10401411687926165	0.01031023733704739	-0.04435735062818713	-0.0745555877648103	-0.010736109154771079	-0.057428529857662	-0.055183827648996875	-0.017733822540149546	0.06656615763298745	-0.02734840005235691	0.591208103411	0.397602565759	0.809021331888	0.978575937473	0.819442862795	0.687084607526	0.79863356553	0.619326784864	0.967868733231	0.788281320858	0.619326784864	0.493479697885	0.992033830535	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:194304663..194304777,+__570.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:194304663..194304777,+__570.1.0.0	rs12487318	3.7763304147766976	4.132566185415538	3.714297467541677	3.423579984595433	3.8274255875905228	3.800516905760609	3.624173015145968	4.130263909338947	3.9479356141342983	3.979154459968546	3.9425879113295634	3.9892187506783134	3.8573375171896753	3.5573571028806215	4.0195219032918725	3.3798049396436034	3.1373266023148254	3.5753114236838632	3.635206828368416	3.4631206471469635	3.824630407651621	3.5615270292585492	3.751968810857867	3.7150884183181487	3.7696106719487275	3.6158728987804234	-0.21897331189607616	-0.11304428212366524	-0.3344925278980737	-0.2862533822806075	-0.2521141639066595	-0.1653100773921934	-0.16105236799900435	-0.3056335016873257	-0.38640858487574903	-0.2271856491106794	-0.2274994930114147	-0.219608078729586	-0.2414646184092529	0.0832552515755	0.619326784864	0.179364149792	0.183752894264	0.0906800339379	0.276771967065	0.405136064622	0.116187990183	0.0187859264625	0.0719809426143	0.206893929435	0.270885072145	0.000593730522997	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.497546178272	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr3:194304663..194304777,+__570.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:194304663..194304777,+__570.1.0.0	rs144889211,rs12489829,rs12487318	3.7763304147766976	4.132566185415538	3.714297467541677	3.423579984595433	3.8274255875905228	3.800516905760609	3.624173015145968	4.130263909338947	3.9479356141342983	3.979154459968546	3.9425879113295634	3.9892187506783134	3.8573375171896753	3.601183825937274	4.117436693669788	3.519671077230303	3.129145864719875	3.5509365659762135	3.5810894016031978	3.3116863310799287	3.5862900264537485	3.735336360100319	3.744022680790721	3.5431989943339683	3.669980637751589	3.590831538303911	-0.1751465888394237	-0.015129491745749846	-0.1946263903113743	-0.2944341198755578	-0.2764890216143092	-0.2194275041574114	-0.3124866840660392	-0.5439738828851981	-0.21259925403397917	-0.23513177917782535	-0.3993889169955951	-0.3192381129267243	-0.2665059788857656	0.313917214294	0.777966336216	0.66743649171	0.527990680582	0.154655491485	0.375513989452	0.382791178922	0.197395731844	0.288805731951	0.259370210024	0.175053819161	0.270885072145	0.0996610058271	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:194868496..194868610,+__572.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:194868496..194868610,+__572.1.0.0	rs1494326	-1.220030987717855	-1.6277930545214647	-1.4067227822385855	-1.4836474832938873	-1.424836784327441	-1.0643213294856373	-0.8910558402101859	-1.1300818030331026	-1.5470157365879271	-1.579031305177507	-1.6123524608953923	-1.3234555324955721	-1.3591954249987133	-1.1942843704072925	-0.8599620963407477	-1.3588892540786004	-1.1403431190089302	-0.7200519484211899	-0.9284607667115852	-1.5198588127078319	-0.8234749309060946	-0.8685002348374864	-1.369667872296941	-1.3385734000351435	-1.113888561293308	-1.1029962805870956	0.025746617310562492	0.767830958180717	0.047833528159985095	0.34330436428495714	0.7047848359062511	0.13586056277405212	-0.6288029724976459	0.306606872127008	0.6785155017504407	0.2093634328805658	0.27377906086024884	0.20956697120226409	0.2561991444116172	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:40494633..40494747,-__577.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:40494633..40494747,-__577.1.0.0	rs7639233	2.7467878931996217	3.163577669453918	2.7242594332332137	2.3853370676072427	2.847111994927295	2.816791217474292	2.449272788157839	2.7460855052707114	2.81419166002674	2.872723920966858	2.7814860401458166	2.965047838906794	2.7760560857808616	2.6755690758228727	2.99664745955993	2.651806344723027	2.496735348731028	2.739929236060119	2.709076031244873	2.5076542518665774	2.781105131769576	2.7628883247488973	2.6896150055745762	2.702562085611077	2.797006043495296	2.7092161949339872	-0.07121881737674896	-0.1669302098939882	-0.07245308851018661	0.11139828112378547	-0.1071827588671761	-0.10771518622941922	0.05838146370873831	0.035019626498864476	-0.0513033352778427	-0.1831089153922818	-0.07892395453473977	-0.1680417954114981	-0.06683989084687443	0.527990680582	0.326996172605	0.428242856315	0.527990680582	0.347268461228	0.989287003123	0.706946403854	0.737113058664	0.405136064622	0.687081215138	0.397602565759	0.428242856315	0.756252649053	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:40494633..40494747,-__577.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:40494633..40494747,-__577.1.0.0	rs7641495	2.7467878931996217	3.163577669453918	2.7242594332332137	2.3853370676072427	2.847111994927295	2.816791217474292	2.449272788157839	2.7460855052707114	2.81419166002674	2.872723920966858	2.7814860401458166	2.965047838906794	2.7760560857808616	2.646814993900071	3.0817608602978703	2.690296735710576	2.550234127206535	2.7212335742213254	2.7708128275170174	2.508727873559029	2.8696730701277775	2.8162409632207885	2.8501576709555536	2.8179912541449026	2.7251140461883074	2.754088166420813	-0.09997289929955055	-0.08181680915604783	-0.0339626975226377	0.16489705959929246	-0.12587842070596977	-0.04597838995727477	0.05945508540118993	0.12358756485706612	0.002049303194048502	-0.022566250011304412	0.03650521399908602	-0.23993379271848658	-0.02196791936004905	0.706946403854	0.788281320858	0.747262025795	0.957167318493	0.545696106059	0.737113058664	0.519249062249	0.757455001208	0.840380101088	0.861429311442	0.677233097055	0.468411351413	0.986775331282	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:40494633..40494747,-__577.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:40494633..40494747,-__577.1.0.0	rs7639247	2.7467878931996217	3.163577669453918	2.7242594332332137	2.3853370676072427	2.847111994927295	2.816791217474292	2.449272788157839	2.7460855052707114	2.81419166002674	2.872723920966858	2.7814860401458166	2.965047838906794	2.7760560857808616	2.590863846348622	3.073228817494234	2.6096453666280723	2.4054566550634595	2.755088952535461	2.71666480202719	2.509583277571802	2.74685786250565	2.8328040131538406	2.7106059793185864	2.7001572576245128	2.817893979118076	2.7057375674491255	-0.1559240468509997	-0.09034885195968423	-0.1146140666051414	0.02011958745621678	-0.09202304239183423	-0.10012641544710199	0.060310489413963	0.0007723572349385144	0.018612353127100523	-0.16211794164827165	-0.08132878252130382	-0.14715385978871787	-0.07031851833173634	0.628827692687	0.829896383209	0.657696241675	0.819442862795	0.476688253492	0.677233097055	0.536806685117	0.737113058664	0.677233097055	0.882579228976	1.0	0.581967350665	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr3:40494633..40494747,-__577.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:40494633..40494747,-__577.1.0.0	rs7639233,rs7641495,rs7639247	2.7467878931996217	3.163577669453918	2.7242594332332137	2.3853370676072427	2.847111994927295	2.816791217474292	2.449272788157839	2.7460855052707114	2.81419166002674	2.872723920966858	2.7814860401458166	2.965047838906794	2.7760560857808616	2.5425245542803294	2.7999548387604962	2.506184406301313	2.36327443270784	2.541330079074358	2.537663724463726	2.275028861963748	2.624843331457059	2.542267123037915	2.5313542997503293	2.5146187907441484	2.567438278063303	2.5288735600503807	-0.20426333891929227	-0.36362283069342194	-0.21807502693190095	-0.022062634899402855	-0.3057819158529371	-0.27912749301056605	-0.1742439261940909	-0.12124217381365243	-0.27192453698882524	-0.3413696212165287	-0.26686724940166817	-0.39760956084349086	-0.24718252573048147	0.0619890035232	0.0515422504639	0.107123399254	0.265084565602	0.0216719022787	0.0601351299193	0.175053819161	0.101398170673	0.00883703695038	0.04542809053	0.0515422504639	0.0986283746992	1.37919723355e-07	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	3.13077772016e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:40494765..40494879,-__578.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:40494765..40494879,-__578.1.0.0	rs73827419	2.590672353965834	2.7859790232168398	2.4211547228902326	2.4332456415897488	2.6558933264239393	2.5758958792142703	2.5435064657676225	2.748318351332288	2.779309383140137	2.5988895305042163	2.6935892233138823	2.606633090530777	2.6194239159908155	2.6602073793038503	3.1008884173548603	2.7610169023990565	2.3126195000185783	2.7449548580392764	2.788682503845731	2.629915072237888	3.02220870894477	2.8736306441069956	2.8914784925917005	2.739764047318131	2.7935452152640066	2.7765759784520703	0.06953502533801625	0.31490939413802055	0.3398621795088239	-0.12062614157117046	0.08906153161533714	0.2127866246314607	0.0864086064702656	0.27389035761248204	0.09432126096685867	0.2925889620874842	0.04617482400424855	0.1869121247332295	0.1571520624612547	0.29495293544	0.242741268695	0.253741740693	0.819442862795	0.563691144959	0.276771967065	0.333666485083	0.113101776132	0.452098798395	0.226876581559	0.501992688725	0.192768091005	0.0833519346619	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:40494765..40494879,-__578.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:40494765..40494879,-__578.1.0.0	rs116910682	2.590672353965834	2.7859790232168398	2.4211547228902326	2.4332456415897488	2.6558933264239393	2.5758958792142703	2.5435064657676225	2.748318351332288	2.779309383140137	2.5988895305042163	2.6935892233138823	2.606633090530777	2.6194239159908155	2.6713498945254885	3.014012727830699	2.659631540066396	2.402831718056241	2.828193810961011	2.7939014762660968	2.6070956979520226	2.9194633488550528	2.8579438914019875	2.8427966091952888	2.9381695531760563	2.955156920462711	2.7908789323957546	0.08067754055965448	0.2280337046138592	0.23847681717616354	-0.030413923533507692	0.1723004845370717	0.21800559705182643	0.06358923218440005	0.1711449975227648	0.07863450826185048	0.24390707869107242	0.24458032986217404	0.348523829931934	0.17145501640493863	0.179364149792	0.183752894264	0.276771967065	0.436112310787	0.226876581559	0.154655491485	0.572794651112	0.29495293544	0.0548474154937	0.0932701621097	0.0932701621097	0.0678362651725	0.00130618109456	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr3:40494765..40494879,-__578.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:40494765..40494879,-__578.1.0.0	rs73827419,rs116910682	2.590672353965834	2.7859790232168398	2.4211547228902326	2.4332456415897488	2.6558933264239393	2.5758958792142703	2.5435064657676225	2.748318351332288	2.779309383140137	2.5988895305042163	2.6935892233138823	2.606633090530777	2.6194239159908155	2.9099562277906514	3.468616905032242	2.9604993940290836	2.642136091019643	2.9258026757151336	2.974933341815772	2.8644059577691623	3.061972583380607	3.1141071575749883	3.0516895426157165	3.0807043691453586	3.128197607235027	3.015251821093615	0.3192838738248174	0.6826378818154022	0.539344671138851	0.20889044942989443	0.26990934929119437	0.39903746260150186	0.3208994920015398	0.3136542320483189	0.33479777443485137	0.4528000121115001	0.3871151458314763	0.5215645167042497	0.39582790510279975	0.00441948685714	0.00287470049861	0.00522462344006	0.0174727290303	0.0232568344756	0.00342117348194	0.0181189115857	0.00567496309713	0.00695778717972	0.00275115621019	0.00275115621019	0.00441948685714	2.35106864733e-18	0.857380450285	0.580689500719	1	1	1	0.687655869871	1	1	1	0.57224049172	0.563987023089	0.910414292571	5.33692582945e-16	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr3:4534827..4534941,-__580.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr3:4534827..4534941,-__580.1.0.0	rs116337368	2.0783196396296955	2.4206299585283535	2.1606406748109266	1.8867485509074609	2.104175164873598	2.1701209525254663	2.2282929488822445	2.1706011899366837	2.2145143537020626	2.1526648735367155	2.1964601777474213	2.133899351592178	2.159755653056067	2.0986365147874793	2.34463321846169	2.024468760978795	1.9523600935037584	2.2026348120524437	2.2978939453022136	2.3460032075671435	2.087888685059013	2.1917263249807704	2.2502953238705365	2.2446324741827848	2.3771826330331214	2.2015296661483124	0.020316875157783798	-0.07599674006666346	-0.13617191383213179	0.06561154259629753	0.0984596471788457	0.12777299277674725	0.11771025868489904	-0.08271250487767068	-0.022788028721292264	0.097630450333821	0.04817229643536347	0.24328328144094336	0.041774013092245245	0.706946403854	0.706946403854	0.8931878581	0.696989544957	0.76769033028	0.412754243182	0.288805731951	0.510577925344	0.967868733231	0.840380101088	0.493479697885	0.501992688725	0.948977018318	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr3:4534827..4534941,-__580.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr3:4534827..4534941,-__580.1.0.0	rs116050495,rs116337368	2.0783196396296955	2.4206299585283535	2.1606406748109266	1.8867485509074609	2.104175164873598	2.1701209525254663	2.2282929488822445	2.1706011899366837	2.2145143537020626	2.1526648735367155	2.1964601777474213	2.133899351592178	2.159755653056067	2.1613741987674753	2.442266527734227	2.3199806657848385	2.3241842812812017	2.3886311001660747	2.324815228562888	2.2944629187309924	2.431679633644911	2.2992103937879924	2.371270409184912	2.4422554109460224	2.4390268937851878	2.353263138531393	0.08305455913777982	0.021636569205873535	0.15933999097391194	0.43743573037374084	0.2844559352924767	0.15469427603742147	0.0661699698487479	0.2610784437082274	0.08469604008592979	0.21860553564819662	0.24579523319860108	0.30512754219300975	0.1935074854753264	0.0531733827136	0.444064484515	0.253741740693	0.119339994516	0.143314270352	0.0986283746992	0.424334016828	0.527990680582	0.150801701171	0.0808926541269	0.116187990183	0.221756412245	0.00126008024067	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.286038214633	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:47205883..47205997,+__582.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:47205883..47205997,+__582.1.0.0	rs2291721	-0.6310272487753741	-0.6237280766939048	-1.3136928086144615	-0.5337420957266811	-0.6069326935947431	-0.8278732000186468	-0.7959229928416359	-0.9434893417011028	-0.9086537951343574	-0.6388440109166629	-0.8569764959647161	-0.7555080844086213	-0.7863659036992424	-0.8734432082129727	-0.8888826203228651	-1.112465954322515	-0.7748747757619165	-1.3818942724729917	-1.083928445084502	-0.6686566283016803	-0.9134911780038976	-1.3014135981792927	-1.0824569754784004	-1.076252747280353	-1.004542290101543	-1.0135252244602444	-0.24241595943759864	-0.2651545436289603	0.20122685429194642	-0.24113268003523547	-0.7749615788782486	-0.2560552450658551	0.12726636453995566	0.029998163697205205	-0.3927598030449353	-0.4436129645617375	-0.21927625131563677	-0.24903420569292178	-0.22715932076100184	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.609889042629	0.129194552482	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.125844655769	0.706946403854	0.233774285709	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr3:67705091..67705205,+__589.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr3:67705091..67705205,+__589.1.0.0	rs74551152	-0.7634217646832128	-0.2356543541329424	-0.5185778415052793	-0.5103602249678859	-0.7148707074785255	-0.5154981073739546	-0.888853368320605	-0.8084888138236483	-0.1365337516787173	-0.9546974108096379	-0.8543501447180609	-0.8873463175112132	-0.6490544005836403	-0.6652335693964111	-0.7016459191982195	-1.1021915820582378	-0.7301898905630555	-0.9367492549968724	-0.9000567611019542	-0.7349258858384471	-0.5870840389338542	-0.8678539404903377	-0.4682401326280046	-1.0241109896667702	-0.758836184721454	-0.7897598457994682	0.09818819528680167	-0.4659915650652771	-0.5836137405529584	-0.2198296655951696	-0.2218785475183469	-0.3845586537279996	0.15392748248215793	0.22140477488979415	-0.7313201888116204	0.48645727818163326	-0.16976084494870924	0.1285101327897592	-0.14070544521582792	NA__no_active_tile	0.0906800339379	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0856734395523	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0125089884503	0.460214637573	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00582217379469	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr3:67705091..67705205,+__589.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr3:67705091..67705205,+__589.1.0.0	rs13076100	-0.7634217646832128	-0.2356543541329424	-0.5185778415052793	-0.5103602249678859	-0.7148707074785255	-0.5154981073739546	-0.888853368320605	-0.8084888138236483	-0.1365337516787173	-0.9546974108096379	-0.8543501447180609	-0.8873463175112132	-0.6490544005836403	-0.5610328345633486	-0.979928586313279	-0.6085906311309396	-0.9177429726041296	-1.3916575781163028	-0.7895945054651321	-1.3612745926993293	-1.0820835952560932	-0.6704723327251806	-0.2760595079658882	-0.6731366399938271	-0.3887092981097546	-0.8083569229119337	0.20238893011986414	-0.7442742321803366	-0.09001278962566028	-0.4073827476362437	-0.6767868706377772	-0.2740963980911775	-0.47242122437872425	-0.27359478143244487	-0.5339385810464633	0.6786379028437497	0.1812135047242338	0.4986370194014586	-0.15930252232829342	NA__no_active_tile	0.104229562843	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.170821264488	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0162407194134	0.326996172605	0.397602565759	NA__no_active_tile	0.0118906485163	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr3:67705091..67705205,+__589.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr3:67705091..67705205,+__589.1.0.0	rs74551152,rs13076100	-0.7634217646832128	-0.2356543541329424	-0.5185778415052793	-0.5103602249678859	-0.7148707074785255	-0.5154981073739546	-0.888853368320605	-0.8084888138236483	-0.1365337516787173	-0.9546974108096379	-0.8543501447180609	-0.8873463175112132	-0.6490544005836403	-1.3330049710413954	-0.06734926118054722	-1.0295124709928456	-0.6581674875584901	-1.385083137936327	-0.7565110903267144	-0.7915303778040901	-0.4690841439033394	-0.6894367821718144	-1.2831235873586941	-0.8724935766011821	-0.8832511044484271	-0.8515456659436555	-0.5695832063581826	0.16830509295239515	-0.5109346294875663	-0.14780726259060417	-0.6702124304578015	-0.24101298295275975	0.09732299051651494	0.33940466992030893	-0.5529030304930971	-0.32842617654905626	-0.018143431883121175	0.004095213062786041	-0.2024912653600153	NA__no_active_tile	0.716953652062	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.119339994516	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.265084565602	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.238410324739	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr3:94657011..94657125,+__595.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr3:94657011..94657125,+__595.1.0.0	rs114686953	1.169383249814114	1.2137892137545936	0.7381164044475397	0.5645503478153675	0.7505219483451349	0.11166613572454874	0.6886942309959757	0.7543876166146454	0.3387938813404979	0.7039034631530731	0.6439464851424996	0.3404635701090646	0.6681847122714212	0.5612424775793331	0.5535197562145048	0.22354380705444368	0.22235609700520917	0.24427202770607626	0.28674913777486155	0.5243819928615301	-0.3243372007857518	-0.02195803805724013	0.3595042677933936	0.4404460356331148	0.21392305470534173	0.2736369512904014	-0.6081407722347808	-0.6602694575400888	-0.514572597393096	-0.3421942508101583	-0.5062499206390586	0.1750830020503128	-0.16431223813444562	-1.0787248174003972	-0.36075191939773804	-0.34439919535967944	-0.20350044950938484	-0.12654051540372285	-0.3945477609810198	0.0638899216795	0.00423662678721	0.0698833862508	0.147021540231	0.0808926541269	0.536806685117	0.609884951243	0.00342117348194	0.282745459933	0.0678362651725	0.221756412245	0.0932701621097	1.30375437219e-05	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.010925461639	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr3:94657045..94657159,+__596.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr3:94657045..94657159,+__596.1.0.0	rs114686953	1.1648175788902746	1.4457714769656698	1.1221946851452729	0.9168359167482643	1.125619005777465	1.1911386929327379	1.236227033153459	1.2104520095346818	1.1335478273184876	1.3495183322985294	1.3969255499925604	1.2560331238809228	1.2124234360531938	1.0405183592999943	1.3147405788723912	0.7671869209892441	0.73173062764848	0.918117954069231	1.08811425383766	0.8225710497937035	1.361827582983657	1.2356887694908392	1.1019982813385487	1.0690169311916633	1.1604971336136534	1.0510007035940887	-0.12429921959028034	-0.1310308980932786	-0.35500776415602875	-0.1851052890997843	-0.20750105170823407	-0.10302443909507786	-0.4136559833597555	0.15137557344897523	0.10214094217235159	-0.24752005095998064	-0.32790861880089706	-0.09553599026726944	-0.16142273245910496	0.0698833862508	0.158583637061	0.132622250874	0.545696106059	0.0986283746992	0.436112310787	0.0548474154937	0.368322877114	0.90381429355	0.221756412245	0.0338805621681	0.206893929435	0.00481152435515	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr4:100009953..100010067,+__599.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr4:100009953..100010067,+__599.1.0.0	rs1154400	0.8861603756390822	0.9691637254565114	0.9153705236999989	0.5496118898989643	0.8905892714267397	0.9177632260522872	0.9380620539683733	0.7984877306455541	1.1760931382274378	0.6822040255027731	1.1181723935409809	0.8081340441804842	0.8874843665199323	0.4488929236411714	0.930472602746768	0.5403111922585344	0.36522847043271267	0.5530709465310262	0.5264042208180951	0.48682041032759027	0.759165805376028	0.7610749088153591	0.7513465003258162	0.748616561810596	0.7235697870695821	0.6329145275127733	-0.43726745199791084	-0.0386911227097434	-0.3750593314414645	-0.18438341946625159	-0.33751832489571354	-0.3913590052341921	-0.451241643640783	-0.03932192526952616	-0.41501822941207867	0.06914247482304303	-0.36955583173038486	-0.0845642571109021	-0.254569839007159	0.237368605078	0.197395731844	0.122554330111	0.382791178922	0.248198866138	0.368322877114	0.30750859871	0.667432913386	0.0386605553759	0.76769033028	0.116187990183	0.428242856315	0.0298468510398	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr4:110354885..110354999,-__601.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr4:110354885..110354999,-__601.1.0.0	rs72896632	1.4971205353272423	1.759850223233104	1.5693171643770671	1.3307235852514077	1.6628180382552264	1.7308223676552634	1.7058932561338782	1.8721760563365424	1.6245188575179583	1.865562061755755	1.8687852468909236	1.7963241080732046	1.6903259584006312	1.5148475645980837	1.9178776773992687	1.621643297590719	1.4473333043534649	1.772911874701136	1.7463068470376857	1.7001451346727219	1.5590143486373071	1.7930809404319181	1.5609592228037985	1.6788356102816469	1.7762213241994873	1.6740980955589366	0.017727029270841355	0.15802745416616482	0.05232613321365176	0.1166097191020572	0.11009383644590964	0.015484479382422256	-0.00574812146115633	-0.31316170769923524	0.1685620829139598	-0.3046028389519564	-0.18994963660927677	-0.020102783873717334	-0.016227862841694602	0.76769033028	0.390154148302	0.476688253492	0.809021331888	0.468411351413	0.727009731456	0.657696241675	0.288805731951	0.354199901149	0.788281320858	0.468411351413	0.866708095346	0.814591405344	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr4:120988033..120988147,+__603.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr4:120988033..120988147,+__603.1.0.0	rs17009778	1.0142155833470263	1.5119465044160751	1.2452609693976724	1.162761256481024	1.3932027527290682	1.5048827713260522	1.458664806898896	1.073017055571458	1.3830804170560569	1.4632372705051564	1.5547592460063804	1.447391085608838	1.3510349766119754	1.3727952378467032	1.4995226623587194	1.3316412187263942	1.2004844039353313	1.2622431575153457	1.4014585819621237	1.3064203853916456	1.4026550883486826	1.3533882025958337	1.4161156854114785	1.3049219533116023	1.4525883113580442	1.3586862407301588	0.3585796544996769	-0.012423842057355694	0.08638024932872179	0.03772314745430738	-0.13095959521372258	-0.1034241893639285	-0.15224442150725048	0.3296380327772246	-0.029692214460223187	-0.04712158509367792	-0.24983729269477806	0.005197225749206336	0.00765126411818338	0.809021331888	0.90381429355	0.493479697885	0.716953652062	0.76769033028	0.8931878581	0.226876581559	0.382791178922	0.677233097055	0.591208103411	0.221756412245	0.88258056334	0.915976879799	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr4:120988033..120988147,+__603.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr4:120988033..120988147,+__603.1.0.0	rs73845514	1.0142155833470263	1.5119465044160751	1.2452609693976724	1.162761256481024	1.3932027527290682	1.5048827713260522	1.458664806898896	1.073017055571458	1.3830804170560569	1.4632372705051564	1.5547592460063804	1.447391085608838	1.3510349766119754	1.1249847434166176	1.4026720084284126	1.2409685681095424	0.8743378158538957	1.2704947627780974	1.3957602638206037	1.0934047617536347	1.5019195534442007	1.2467711788376525	1.383747466816508	1.3450543478645631	1.199542625256779	1.2566381746983757	0.11076916006959125	-0.10927449598766259	-0.004292401288130021	-0.2884234406271282	-0.12270798995097087	-0.1091225075054485	-0.36526004514526145	0.4289024978727427	-0.13630923821840435	-0.07948980368864844	-0.20970489814181725	-0.24784846035205899	-0.09439680191359973	0.536806685117	0.501992688725	0.460214637573	0.416589617895	0.361218104761	0.677233097055	0.0619890035232	0.572794651112	0.30750859871	0.226876581559	0.382791178922	0.390154148302	0.170951066278	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr4:120988033..120988147,+__603.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr4:120988033..120988147,+__603.1.0.0	rs903147	1.0142155833470263	1.5119465044160751	1.2452609693976724	1.162761256481024	1.3932027527290682	1.5048827713260522	1.458664806898896	1.073017055571458	1.3830804170560569	1.4632372705051564	1.5547592460063804	1.447391085608838	1.3510349766119754	1.4056739832819038	1.511311747216242	1.4664104124023267	1.1457072966837625	1.3753739074040678	1.4481574122937104	1.4244895410503375	1.5120939104421238	1.4905519759144836	1.5475251889691617	1.524437121846325	1.4260865446416426	1.439818253512174	0.3914583999348775	-0.0006347571998330803	0.22114944300465433	-0.01705395979726143	-0.017828845325000398	-0.05672535903234177	-0.03417526584855857	0.43907685487066583	0.10747155885842674	0.0842879184640053	-0.030322124160055308	-0.02130454096719525	0.08878327690019866	0.79863356553	0.523605760741	0.79863356553	0.925117039075	0.819442862795	0.819442862795	0.468411351413	0.619326784864	0.925117039075	0.788281320858	0.840380101088	0.87199428352	0.997200069709	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr4:120988033..120988147,+__603.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr4:120988033..120988147,+__603.1.0.0	rs17009778,rs73845514,rs903147,rs17009783	1.0142155833470263	1.5119465044160751	1.2452609693976724	1.162761256481024	1.3932027527290682	1.5048827713260522	1.458664806898896	1.073017055571458	1.3830804170560569	1.4632372705051564	1.5547592460063804	1.447391085608838	1.3510349766119754	0.7110637924271401	0.9943811652034149	0.9745941277946246	0.7275143061287497	0.8617467372595959	0.7259041170772385	0.9770867264804137	1.123134062328388	0.8108121740595101	0.742257260011559	1.0645929638206377	1.0047828223366295	0.8931558545773252	-0.3031517909198862	-0.5175653392126602	-0.27066684160304777	-0.43524695035227423	-0.5314560154694723	-0.7789786542488137	-0.4815780804184824	0.050117006756930094	-0.5722682429965468	-0.7209800104935974	-0.49016628218574265	-0.44260826327220837	-0.45787912203465014	0.00263248034207	0.0125089884503	0.0216734048733	0.0201846528804	0.00086866520518	0.000648445766563	0.000354775949455	0.572794651112	3.54084840538e-05	8.34895163788e-05	0.00919097005605	0.0150857114019	2.23391198448e-19	0.510701186361	1	1	1	0.178076367062	0.130337599079	0.0709551898911	1	0.00729414771508	0.0173658194068	1	1	5.07098020478e-17	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:124310..124424,+__605.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:124310..124424,+__605.1.0.0	rs3747693	-1.3990837961105609	-1.1638349562438974	-1.1342485641203055	-1.1483809502063278	-1.2660870794084782	-1.3255740993017044	-1.3994033348700323	-0.9647295264661504	-1.2631062914687496	-1.3093380337506844	-1.3098725199870094	-1.2014365916119183	-1.240424645295485	-0.9890401872628792	-0.7170132283649502	-1.404968651167321	-1.3522106809546717	-0.7780332155978777	-0.9593465678108718	-1.1238918515569427	-0.9466290286361942	-0.7488445485169724	-1.2700946102799149	-1.1130104944899544	-1.1588460348194847	-1.0468274249548362	0.41004360884768165	0.44682172787894725	-0.27072008704701545	-0.20382973074834387	0.48805386381060045	0.36622753149083265	0.2755114833130896	0.018100497829956153	0.5142617429517773	0.03924342347076948	0.196862025497055	0.04259055679243362	0.19359722034064866	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:135248590..135248704,-__607.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:135248590..135248704,-__607.1.0.0	rs61734066	1.5364252159160035	1.6992311997193537	1.4651544345678205	1.317289515210031	1.3463276033317808	1.489830649160947	1.342560491437971	1.5231141953331004	1.4363047718425392	1.3719974939181836	1.444225362559469	1.5163571157248525	1.4574015040601707	1.325887905580249	1.488302820560606	1.0920038556331124	1.0105700383598892	1.1808581926452957	1.3932067645942625	1.1265339381904245	1.1770494655536956	1.4371197965957014	1.1812596154984267	1.4364689532983126	1.2027831916984524	1.2543370448507025	-0.2105373103357544	-0.21092837915874774	-0.37315057893470804	-0.3067194768501418	-0.16546941068648513	-0.09662388456668447	-0.2160265532475465	-0.34606472977940483	0.0008150247531621968	-0.19073787841975687	-0.007756409261156394	-0.31357392402640016	-0.20306445920946867	0.405136064622	0.122558611289	0.101398170673	0.122558611289	0.175053819161	0.107123399254	0.166665831608	0.270885072145	0.727009731456	0.79863356553	0.270885072145	0.412754243182	0.0219206880263	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:152330009..152330123,-__613.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:152330009..152330123,-__613.1.0.0	rs73861286	0.30343285479581017	0.11388718057148199	0.5494676142481884	0.14941943833673285	0.4261849960413397	0.2746203956568414	0.30333059950549257	0.17397763853167514	0.21706133208019734	0.554388960840246	0.25066656921472	0.4456796797816275	0.31350977163369614	0.44007854520904016	0.5175260187796601	0.47541788229406823	0.2360603736777298	0.7397569374027185	0.14595258600137778	0.34065943828370715	0.5158318333454377	0.3203016477845861	0.5289957665515415	0.4175563512421656	0.17142386951969785	0.40413010417431083	0.13664569041323	0.4036388382081781	-0.07404973195412012	0.08664093534099696	0.31357194136137884	-0.1286678096554636	0.03732883877821458	0.34185419481376256	0.10324031570438874	-0.025393194288704568	0.1668897820274456	-0.27425581026192963	0.0906203325406148	0.819442862795	0.609889042629	0.88258056334	0.436112310787	0.234708652176	0.946473618223	0.397602565759	0.143314270352	0.696989544957	0.83513271997	0.732052639825	0.313917214294	0.837333458764	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:165798062..165798176,+__615.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:165798062..165798176,+__615.1.0.0	rs17045714	-1.1745996425146892	-1.0760170296065685	-1.1591980655258574	-0.9983550857999027	-1.0634312565766553	-1.0519851809664504	-1.4196850571158863	-1.15074008960334	-1.390875294794013	-0.8166618519923581	-1.3176021088553167	-1.166937830606107	-1.148840707829762	-1.320308269828174	-1.1054585872602782	-1.470822967358112	-1.1865292639299885	-1.3481592834955065	-1.8267729808372648	-1.7043266938926314	-1.1793068392117017	-1.3061201780544929	-1.3450208546406068	-1.3451657419949306	-1.5687193119005545	-1.3922259143670201	-0.14570862731348488	-0.029441557653709705	-0.31162490183225455	-0.18817417813008575	-0.28472802691885124	-0.7747877998708144	-0.28464163677674503	-0.028566749608361697	0.08475511673952019	-0.5283590026482488	-0.027563633139613852	-0.4017814812944476	-0.24338520653725812	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:165798062..165798176,+__615.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:165798062..165798176,+__615.1.0.0	rs2068792	-1.1745996425146892	-1.0760170296065685	-1.1591980655258574	-0.9983550857999027	-1.0634312565766553	-1.0519851809664504	-1.4196850571158863	-1.15074008960334	-1.390875294794013	-0.8166618519923581	-1.3176021088553167	-1.166937830606107	-1.148840707829762	-0.5416364573091155	-0.4831549884810391	-1.4320056434278712	-1.2575657415664894	-1.135519267894805	-0.8447412691172841	-0.7831752427892634	-0.9417189726344756	-1.088912199809914	-0.8738208320452412	-0.6290266781539131	-1.087728004922726	-0.9249171081793448	0.6329631852055737	0.5928620411255294	-0.2728075779020138	-0.25921065576658664	-0.07208801131814968	0.20724391184916635	0.6365098143266229	0.20902111696886438	0.301963094984099	-0.05715898005288311	0.6885754307014036	0.07920982568338086	0.22392359965041728	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr4:165798062..165798176,+__615.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:165798062..165798176,+__615.1.0.0	rs17045714,rs2068792	-1.1745996425146892	-1.0760170296065685	-1.1591980655258574	-0.9983550857999027	-1.0634312565766553	-1.0519851809664504	-1.4196850571158863	-1.15074008960334	-1.390875294794013	-0.8166618519923581	-1.3176021088553167	-1.166937830606107	-1.148840707829762	-1.283453222774353	-1.1968872024289856	-1.0399020899392202	-1.4236154572184923	-0.8637808738941586	-1.1936742674309069	-0.9892468131675124	-0.8992883611731528	-1.1676081932255362	-1.264814795351825	-1.2724620340860193	-0.9664772427148315	-1.1301008794504162	-0.10885358025966374	-0.12087017282241708	0.11929597558663718	-0.4252603714185895	0.19965038268249669	-0.14168908646445644	0.43043824394837393	0.25145172843018715	0.22326710156847684	-0.44815294335946687	0.04514007476929738	0.2004605878912754	0.018739828379345912	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr4:174451533..174451647,+__618.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr4:174451533..174451647,+__618.1.0.0	rs146646015	-1.2450244036503573	-1.1646604048623186	-1.2180309368351463	-1.110908716567157	-1.313836083500648	-1.1479169048571691	-1.548750205767459	-0.903748117266749	-0.9919870718870789	-1.1374773922603283	-1.435845626421018	-1.487748285397154	-1.2254945124393821	-0.2561100326671794	-1.0967103349428475	-1.4903632131960916	-1.0166628668408104	-1.0953326703757555	-1.7074833211861185	-0.8847137464340968	-1.9325711759392297	-0.9457834152447779	-0.8679608196516672	-0.9113636402435707	-0.8843537352920162	-1.0907840810011802	0.9889143709831778	0.06795006991947106	-0.27233227636094526	0.09424584972634653	0.2185034131248924	-0.5595664163289493	0.6640364593333621	-1.0288230586724807	0.04620365664230097	0.26951657260866113	0.5244819861774472	0.6033945501051378	0.1347104314382018	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr4:174451533..174451647,+__618.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr4:174451533..174451647,+__618.1.0.0	rs3822127	-1.2450244036503573	-1.1646604048623186	-1.2180309368351463	-1.110908716567157	-1.313836083500648	-1.1479169048571691	-1.548750205767459	-0.903748117266749	-0.9919870718870789	-1.1374773922603283	-1.435845626421018	-1.487748285397154	-1.2254945124393821	-1.6557877518670001	-1.5003404922575831	-1.1276386706669481	-1.1078205890007429	-1.0681834183897372	-1.2925890998494327	-1.6018308017147291	-1.4191681536885905	-1.061308701195951	-1.3133371820584536	-1.457244351624577	-1.8367382115398292	-1.3701656186544646	-0.41076334821664284	-0.33568008739526456	0.09039226616819818	0.0030881275664140784	0.24565266511091077	-0.14467219499226358	-0.053080595947270215	-0.5154200364218415	-0.06932162930887209	-0.17585978979812533	-0.02139872520355901	-0.3489899261426752	-0.1446711062150826	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr4:174451533..174451647,+__618.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr4:174451533..174451647,+__618.1.0.0	rs146646015,rs3822127	-1.2450244036503573	-1.1646604048623186	-1.2180309368351463	-1.110908716567157	-1.313836083500648	-1.1479169048571691	-1.548750205767459	-0.903748117266749	-0.9919870718870789	-1.1374773922603283	-1.435845626421018	-1.487748285397154	-1.2254945124393821	-1.266455703800383	-0.612010864302272	-1.3483440642431974	-1.0097063000475592	-1.3521276828874813	-1.1235188550567705	-1.1560046213182402	-1.1359746726888535	-1.5797159034709216	-1.1065440114786065	-1.0124028146113204	-0.97005353402417	-1.139404918994148	-0.0214313001500257	0.5526495405600466	-0.13031312740805112	0.10120241651959772	-0.03829159938683335	0.024398049800398613	0.3927455844492187	-0.23222655542210457	-0.5877288315838427	0.03093338078172181	0.42344281180969756	0.5176947513729839	0.08608959344523397	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:175041637..175041751,-__619.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:175041637..175041751,-__619.1.0.0	rs59451701	-0.5058046719415854	-0.8298937976968394	-1.1501907985464788	-0.9551587180933125	-0.890434855011888	-0.8294546602039707	-0.7857534303741571	-0.6214407681582792	-0.7411824672960149	-0.6461052736698669	-0.7578526853865554	-0.8768485588643409	-0.799176723770274	0.7080338403257596	0.18683909460299064	0.3684703383896704	-0.14652346650312367	0.36161930693396577	0.2716232679736997	0.5783515264554867	0.5742469569839221	0.33787392436106267	0.5503748962673671	0.6413437723280946	0.3789217597280485	0.40093126815391195	1.213838512267345	1.01673289229983	1.5186611369361491	0.8086352515901889	1.2520541619458538	1.1010779281776704	1.3641049568296437	1.1956877251422013	1.0790563916570775	1.196480169937234	1.39919645771465	1.2557703185923894	1.2001079919241862	0.0932701621097	0.0484054419273	0.0399413890972	0.476688253492	0.0906800339379	0.00919017024645	0.00993701022923	0.0271891048922	0.0374147936077	0.00544505876384	0.0316863885398	0.122558611289	3.35600906571e-09	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	2.81233559706e-06	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:175041637..175041751,-__619.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:175041637..175041751,-__619.1.0.0	rs76039604	-0.5058046719415854	-0.8298937976968394	-1.1501907985464788	-0.9551587180933125	-0.890434855011888	-0.8294546602039707	-0.7857534303741571	-0.6214407681582792	-0.7411824672960149	-0.6461052736698669	-0.7578526853865554	-0.8768485588643409	-0.799176723770274	-1.0160528118206151	-0.9853025392880759	-0.7634217646832128	-1.1498150222175485	-1.177195215121663	-1.1260635767431122	-1.1436568216122118	-0.6661225607438701	-0.7713676852096084	-0.6850083879450213	-0.8908092702286172	-0.911353092475424	-0.9405140623407484	-0.5102481398790297	-0.15540874159123652	0.386769033863266	-0.19465630412423596	-0.2867603601097749	-0.29660891653914145	-0.3579033912380547	-0.04468179258559091	-0.03018521791359352	-0.03890311427515436	-0.13295658484206185	-0.03450453361108308	-0.14133733857047426	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0774477122405	0.667432913386	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.242037479833	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr4:175041637..175041751,-__619.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:175041637..175041751,-__619.1.0.0	rs59451701,rs76039604	-0.5058046719415854	-0.8298937976968394	-1.1501907985464788	-0.9551587180933125	-0.890434855011888	-0.8294546602039707	-0.7857534303741571	-0.6214407681582792	-0.7411824672960149	-0.6461052736698669	-0.7578526853865554	-0.8768485588643409	-0.799176723770274	-0.6537901749754402	-0.4932314567999178	-0.21887896376657112	-0.5523124151319571	-0.5151284586725632	-0.5295848828919543	-0.346319896612593	-0.3099578729469527	-0.31221686712046776	-0.18707698856889374	-0.20229290055239296	-0.46485830058899924	-0.3988040982190586	-0.14798550303385483	0.33666234089692154	0.9313118347799076	0.4028463029613555	0.37530639633932483	0.29986977731201647	0.43943353376156413	0.3114828952113265	0.42896560017554713	0.45902828510097315	0.5555597848341625	0.41199025827534164	0.4003726255512156	0.202098998008	0.967868733231	0.798631310048	0.747262025795	0.541228390094	0.405136064622	0.628827692687	0.79863356553	0.882579228976	0.88258056334	0.476688253492	0.563691144959	0.959022262241	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr4:183064944..183065058,-__621.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr4:183064944..183065058,-__621.1.0.0	rs921331	-1.3735608220966284	-1.3882611017299793	-1.6932902703267816	-1.2556072078222942	-1.6186571166240382	-2.0539325552955905	-1.6138612428847088	-1.5402203937963108	-1.4955859520450372	-1.5392098688515488	-1.507089152537464	-1.6481469527359192	-1.5606185530621914	-1.7082930024995433	-1.5080349933249286	-1.5453618224107826	-1.4853857413961118	-1.8251708171038352	-1.9920958992153717	-2.0721706762884615	-1.9764104834943201	-1.9182995541020422	-1.5077535910113316	-1.6296786699433088	-2.0730910029743086	-1.770145521147029	-0.33473218040291486	-0.11977389159494933	0.14792844791599902	-0.2297785335738176	-0.206513700479797	0.06183665608021882	-0.45830943340375274	-0.4361900896980093	-0.42271360205700503	0.031456277840217206	-0.1225895174058449	-0.42494405023838944	-0.2095269680848371	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:185776772..185776886,-__623.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:185776772..185776886,-__623.1.0.0	rs61746900	-1.5116624961080805	-1.6529118231116928	-1.5069070529404844	-2.1583183271590727	-2.323807379117582	-1.6636982171109382	-1.5768218601325348	-1.7006858157108515	-1.6261682767075234	-1.8079201206987956	-1.8819229656274012	-1.9395852742850956	-1.779200800725838	-1.8775109237324574	-2.0420359546790445	-1.7792662775294954	-2.1489895556812297	-1.5071777082253217	-1.7761217224329149	-1.6818294076675089	-1.8394105986774816	-1.8723305250310558	-1.973854782484225	-1.6038733696981062	-1.5539496187874209	-1.8046958703855218	-0.36584842762437697	-0.3891241315673517	-0.27235922458901096	0.009328771477842945	0.8166296708922605	-0.11242350532197665	-0.1050075475349741	-0.13872478296663004	-0.2461622483235324	-0.16593466178542937	0.278049595929295	0.38563565549767476	-0.025495069659684084	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:185776772..185776886,-__623.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:185776772..185776886,-__623.1.0.0	rs12650715	-1.5116624961080805	-1.6529118231116928	-1.5069070529404844	-2.1583183271590727	-2.323807379117582	-1.6636982171109382	-1.5768218601325348	-1.7006858157108515	-1.6261682767075234	-1.8079201206987956	-1.8819229656274012	-1.9395852742850956	-1.779200800725838	-1.3349230772468803	-1.7207393261228328	-1.7980392148525224	-1.7310046712342435	-1.5264427965810932	-1.6635968740247742	-1.4152637273866873	-1.6909220226045327	-1.7136195830415017	-1.943947334029589	-1.5763150270568804	-1.871068045177044	-1.6654901416132153	0.17673941886120015	-0.06782750301113993	-0.29113216191203795	0.42731365592482917	0.797364582536489	0.00010134308616405185	0.16155813274584752	0.009763793106318808	-0.08745130633397835	-0.13602721333079337	0.3056079385705208	0.06851722910805158	0.11371065911262263	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr4:185776772..185776886,-__623.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:185776772..185776886,-__623.1.0.0	rs61746900,rs12650715	-1.5116624961080805	-1.6529118231116928	-1.5069070529404844	-2.1583183271590727	-2.323807379117582	-1.6636982171109382	-1.5768218601325348	-1.7006858157108515	-1.6261682767075234	-1.8079201206987956	-1.8819229656274012	-1.9395852742850956	-1.779200800725838	-1.7738765370252678	-2.1022757504024376	-2.288065684380604	-1.9347873569918763	-2.4051327210889424	-1.757145111711866	-2.450156518858648	-1.705169911689685	-2.0880875579471736	-1.9239580909633	-1.8540550584267677	-1.5973525753959468	-1.9900052395735426	-0.26221404091718736	-0.4493639272907448	-0.7811586314401198	0.22353097016719636	-0.08132534197136021	-0.0934468946009277	-0.873334658726113	-0.00448409597883348	-0.4619192812396502	-0.11603797026450446	0.02786790720063359	0.34223269888914887	-0.21080443884770525	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:189321810..189321924,+__624.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:189321810..189321924,+__624.1.0.0	rs76278055	-1.4092314014412015	-1.4068431643717594	-1.0744815085522723	-1.0085526666597378	-2.0815609128475363	-1.3943346299847104	-1.5903084948855148	-1.4764879305399246	-1.1074695361223486	-1.6294595011835327	-0.8725597737107513	-1.18913341681198	-1.3533685780926057	-1.0379002756669662	-0.7451092656267448	-0.8331758812072296	-0.5461598232511752	-0.8117681970692685	-0.7819659849422832	-0.8895781877925572	-1.0082100063396775	-0.7470778961677744	-0.8243822489304107	-0.8455778847826573	-0.9775517024814556	-0.8373714461881834	0.3713311257742353	0.6617338987450145	0.24130562734504268	0.46239284340856257	1.2697927157782678	0.6123686450424272	0.7007303070929577	0.46827792420024705	0.36039163995457413	0.805077252253122	0.026981888928094055	0.21158171433052442	0.5159971319044224	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.224300750114	0.00263248034207	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00605554196563	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr4:189321810..189321924,+__624.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:189321810..189321924,+__624.1.0.0	rs59315041,rs76278055	-1.4092314014412015	-1.4068431643717594	-1.0744815085522723	-1.0085526666597378	-2.0815609128475363	-1.3943346299847104	-1.5903084948855148	-1.4764879305399246	-1.1074695361223486	-1.6294595011835327	-0.8725597737107513	-1.18913341681198	-1.3533685780926057	-1.6672092559821436	-1.6280192469564603	-1.1494919157541303	-1.3461589246563346	-1.666751747698457	-1.8030991774863523	-0.9691757079174057	-1.2637738666966214	-1.314497224017302	-1.4022204181111384	-1.2479010650303	-1.6382053684753648	-1.4247086598985008	-0.25797785454094213	-0.2211760825847009	-0.07501040720185803	-0.3376062579965968	0.4148091651490793	-0.40876454750164193	0.6211327869681091	0.21271406384330316	-0.20702768789495352	0.22723908307239427	-0.37534129131954863	-0.44907195166338476	-0.07134008180589507	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:189376652..189376766,+__625.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:189376652..189376766,+__625.1.0.0	rs28641985	1.720241914109649	1.9754748551493209	1.7502438188057472	1.7444858846264037	1.8461314466352097	1.7161979711866888	1.9661823553318043	2.131130041396035	1.839378651086972	1.834523265982952	2.0099490661831756	2.1314161485798646	1.8887796182561516	1.4750122125819802	1.8307113527978367	1.4595634662143524	1.1120979483484952	1.4425923676036634	1.5611511886031522	1.6983178062093058	1.857643484757636	1.7603913907124558	1.6806325450383597	1.7444381228654346	1.7335817094964547	1.613011132935761	-0.24522970152766876	-0.14476350235148416	-0.2906803525913948	-0.6323879362779086	-0.4035390790315463	-0.15504678258353666	-0.26786454912249846	-0.2734865566383988	-0.07898726037451631	-0.15389072094459233	-0.26551094331774094	-0.3978344390834099	-0.2757684853203914	0.162586850726	0.501992688725	0.110080523892	0.0440018610392	0.232080506959	0.147021540231	0.221756412245	0.0601351299193	0.202104162379	0.288805731951	0.0150857114019	0.0216734048733	4.36348577462e-05	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0365660107914	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr4:2936563..2936677,+__626.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr4:2936563..2936677,+__626.1.0.0	rs2857866	3.9058035336580352	4.224049367313446	3.744939959868284	3.4517637551894307	3.9652294551367846	3.870573407164149	3.585073274322067	3.97048329637469	4.041027766447491	4.015996105061961	4.086630164917107	4.141451817447495	3.916918491908412	3.86763768602399	4.159151311368355	3.7530890521522084	3.4345443773343742	3.8916195625568344	3.8809543713543664	3.6303962173980184	4.1265933139558815	4.116029712951506	4.013588865863147	3.950955731662371	4.045475189859741	3.905836282706733	-0.0381658476340454	-0.06489805594509157	0.008149092283924464	-0.01721937785505645	-0.07360989257995021	0.010380964190217501	0.04532294307595164	0.15611001758119158	0.07500194650401504	-0.0024072391988143593	-0.13567443325473594	-0.0959766275877536	-0.011082209201678942	0.581967350665	0.245454024731	0.90381429355	0.935789553219	0.60051573606	0.390154148302	0.737113058664	0.66743649171	0.777966336216	0.527990680582	0.166665831608	0.333666485083	0.792478956175	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr4:2936563..2936677,+__626.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr4:2936563..2936677,+__626.1.0.0	rs376583166	3.9058035336580352	4.224049367313446	3.744939959868284	3.4517637551894307	3.9652294551367846	3.870573407164149	3.585073274322067	3.97048329637469	4.041027766447491	4.015996105061961	4.086630164917107	4.141451817447495	3.916918491908412	4.108459955055418	4.369614700379543	3.962659032053483	3.6351931596122737	4.134371949828795	4.189214187007163	3.8565241049969354	4.286479447830983	4.245799725951473	4.289885975201029	4.208067736125516	4.261134753439997	4.128950393956884	0.2026564213973825	0.14556533306609687	0.21771907218519893	0.18342940442284306	0.16914249469201037	0.3186407798430144	0.27145083067486864	0.315996151456293	0.20477195950398208	0.27388987013906796	0.12143757120840881	0.11968293599250224	0.21203190204847241	0.0601351299193	0.166665831608	0.00522462344006	0.0386605553759	0.00210630874131	0.00501178746069	0.00372847011721	0.104229562843	0.00668210963275	0.00423662678721	0.0499532058383	0.0856734395523	1.06406072122e-12	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	8.91682884384e-10	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr4:2936563..2936677,+__626.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr4:2936563..2936677,+__626.1.0.0	rs2857866,rs376583166	3.9058035336580352	4.224049367313446	3.744939959868284	3.4517637551894307	3.9652294551367846	3.870573407164149	3.585073274322067	3.97048329637469	4.041027766447491	4.015996105061961	4.086630164917107	4.141451817447495	3.916918491908412	4.108673274025303	4.293203004734225	3.8854192936453438	3.582291626369387	4.090524363257229	4.1609568798181	3.7437427919915893	4.2513966771523055	4.221849593434844	4.246153333714494	4.220173587397271	4.23714983535535	4.086794521741287	0.20286974036726813	0.0691536374207784	0.1404793337770598	0.13052787117995646	0.12529490812044441	0.2903834726539509	0.15866951766952253	0.28091338077761563	0.18082182698735316	0.23015722865253263	0.13354342248016415	0.09569801790785526	0.16987602983287511	0.0531733827136	0.259370210024	0.0187859264625	0.0638899216795	0.0162407194134	0.0162407194134	0.0856734395523	0.288805731951	0.0306357720046	0.0107365258413	0.0658387268341	0.154655491485	3.05781778844e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	6.94124637976e-06	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:31998921..31999035,+__627.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:31998921..31999035,+__627.1.0.0	rs55893519	1.6485098218838417	1.860657869631406	1.4247838601010079	1.5093936491672906	1.4904754267983558	1.504017048258561	1.4063501443708768	1.8078277584693505	1.5611873713347242	1.569505238710394	1.7051510006789905	1.5637490462952492	1.587634019641671	1.7641600018341184	2.0107535704910067	1.6870483281728437	1.709669896613956	1.74725778219598	1.7176175458990386	1.5930951206212052	2.1332285260812043	1.7070260437670852	1.7666534256858846	1.8706431732561544	1.8162574895198764	1.7936175753448629	0.11565017995027671	0.15009570085960067	0.2622644680718358	0.2002762474466655	0.2567823553976243	0.2136004976404775	0.18674497625032838	0.32540076761185377	0.14583867243236104	0.19714818697549052	0.16549217257716387	0.2525084432246272	0.20598355570319207	0.0986283746992	0.113101776132	0.0583274625199	0.129198935732	0.0698833862508	0.175053819161	0.0932701621097	0.0515422504639	0.170821264488	0.0296152123457	0.0531733827136	0.0181189115857	3.9375499971e-07	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.000329966689757	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:31998921..31999035,+__627.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:31998921..31999035,+__627.1.0.0	rs116129283	1.6485098218838417	1.860657869631406	1.4247838601010079	1.5093936491672906	1.4904754267983558	1.504017048258561	1.4063501443708768	1.8078277584693505	1.5611873713347242	1.569505238710394	1.7051510006789905	1.5637490462952492	1.587634019641671	1.648739464510039	1.8284093311783214	1.584700873567562	1.3234197256716647	1.5799701898493468	1.520088905862019	1.4209791341167048	1.888223988772137	1.690076476412874	1.536399945070372	1.6800557210998703	1.7215946489000884	1.6185548670842496	0.0002296426261974016	-0.03224853845308462	0.15991701346655418	-0.18597392349562591	0.08949476305099102	0.016071857603457973	0.014628989745828047	0.08039623030278653	0.12888910507814977	-0.033105293640022015	-0.025095279579120167	0.15784560260483915	0.03092084744257928	0.563691144959	0.87199428352	0.405136064622	0.957167318493	0.468411351413	0.757455001208	0.819442862795	0.609889042629	0.412754243182	0.88258056334	0.85089220831	0.166665831608	0.947832414592	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr4:31998921..31999035,+__627.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:31998921..31999035,+__627.1.0.0	rs55893519,rs116129283,rs112065591	1.6485098218838417	1.860657869631406	1.4247838601010079	1.5093936491672906	1.4904754267983558	1.504017048258561	1.4063501443708768	1.8078277584693505	1.5611873713347242	1.569505238710394	1.7051510006789905	1.5637490462952492	1.587634019641671	1.7933342508895198	2.083827998003296	1.6275773239504208	1.6869875318727166	1.830872253231956	1.8065678515603132	1.7382578343521933	2.1593567744744298	1.7993158205345707	1.7875757192606931	1.8671637101111964	1.9264633804059283	1.8422750373872694	0.14482442900567816	0.22317012837188988	0.20279346384941288	0.17759388270542598	0.34039682643360014	0.3025508033017521	0.3319076899813165	0.35152901600507924	0.23812844919984655	0.2180704805502991	0.16201270943220591	0.3627143341106791	0.25464101774559883	0.0168468410067	0.0162407194134	0.0499532058383	0.0678362651725	0.00210630874131	0.0267271087754	0.00357181666747	0.00668210963275	0.0338805621681	0.0072436377838	0.0187859264625	0.00342117348194	1.22495793376e-14	1	1	1	1	0.431793291968	1	0.714363333494	1	1	1	1	0.704761737281	2.78065450963e-12	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:34041504..34041618,-__628.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:34041504..34041618,-__628.1.0.0	rs67951022	4.2194392305517905	4.655500638866931	4.060739169615575	3.764238051325414	4.189887688123868	4.254698675823629	4.116578308755823	4.429097494848369	4.402887245979139	4.478894209975424	4.448430326825073	4.376867954477503	4.283104916264045	4.157674208278749	4.378352757199294	3.9624358907607053	3.657738830398329	4.112672442375633	4.196553982651496	4.027596078290373	4.286953163186299	4.338413174991673	4.347214754459578	4.317904199302323	4.2849394771181695	4.172370746584385	-0.06176502227304148	-0.27714788166763693	-0.09830327885486945	-0.10649922092708497	-0.0772152457482349	-0.058144693172133444	-0.08898223046544995	-0.1421443316620703	-0.06447407098746627	-0.13167945551584648	-0.13052612752275028	-0.09192847735933363	-0.11073416967965984	0.452098798395	0.0484054419273	0.175053819161	0.270885072145	0.0619890035232	0.232080506959	0.119339994516	0.0125089884503	0.170821264488	0.0601351299193	0.0785847853765	0.326996172605	5.59530612233e-05	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0468886653052	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr4:4543833..4543947,+__632.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr4:4543833..4543947,+__632.1.0.0	rs62636563	-0.09494938136168068	0.1831247591395055	0.1796428852256303	0.16918180091108845	0.20516877905209852	0.06043357242999822	-0.12140061381558503	-0.024330639117847982	0.04977354275086504	0.03772502487181375	0.30246415231567225	0.3438608614109373	0.10755789531770794	0.12390254908225724	0.04397527407966195	-0.2551671310485292	-0.09621624616163664	0.016312240388755544	0.0398005018753199	-0.17113015767416706	-0.40028505188598135	-0.014234030566304809	-0.11734435622013205	-0.15797127189550844	-0.025464902344182028	-0.08448521519753723	0.21885193044393791	-0.13914948505984354	-0.4348100162741595	-0.2653980470727251	-0.18885653866334298	-0.02063307055467832	-0.049729543858582026	-0.37595441276813335	-0.06400757331716984	-0.1550693810919458	-0.46043542421118067	-0.36932576375511933	-0.19204311051524522	0.197395731844	0.628827692687	0.536802023505	0.757455001208	0.946473618223	0.946473618223	0.375513989452	0.0140036728837	0.581967350665	0.382791178922	0.0856734395523	0.0986283746992	0.304537944391	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr4:53578591..53578705,+__634.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr4:53578591..53578705,+__634.1.0.0	rs76772101	-0.96660221282254	-0.4018588810151508	-0.6095070356154761	-0.9372285629560918	-0.8099230891739136	-0.8631238500094526	-0.8372076782175495	-0.5627635318014829	-0.3762348587331849	-0.7334192984076058	-0.6808820529926407	-0.7559754660216886	-0.7112272098138982	-0.9034862323591314	-0.25914006764621234	-0.7263131722142759	-0.9465325674061393	-0.6353434503568756	-0.8228694827602387	-0.9871352411660778	-0.4142750691191119	-1.111483193237022	-0.9492583543583171	-0.5314092743658196	-0.5899682721750933	-0.7397678647636928	0.0631159804634086	0.1427188133689385	-0.11680613659879979	-0.009304004450047532	0.17457963881703809	0.04025436724921383	-0.14992756294852827	0.14848846268237098	-0.735248334503837	-0.2158390559507113	0.14947277862682107	0.16600719384659535	-0.028540654949794787	NA__no_active_tile	0.989287003123	NA__no_active_tile	0.861429311442	0.63839046467	0.747262025795	NA__no_active_tile	0.609889042629	NA__no_active_tile	0.989287003123	0.519249062249	NA__no_active_tile	0.99608070527	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr4:53578591..53578705,+__634.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr4:53578591..53578705,+__634.1.0.0	rs113985786,rs76772101	-0.96660221282254	-0.4018588810151508	-0.6095070356154761	-0.9372285629560918	-0.8099230891739136	-0.8631238500094526	-0.8372076782175495	-0.5627635318014829	-0.3762348587331849	-0.7334192984076058	-0.6808820529926407	-0.7559754660216886	-0.7112272098138982	-0.6148671863328855	-0.2043323625976503	-0.9496300373827068	-0.6826143031976142	-0.8808934503078293	-0.5930390250661639	-1.0193140359815758	-0.7454869641140548	-0.8339360204562256	-0.9208908416284336	-0.8009294216733732	-0.7012744515810958	-0.7456006750266341	0.3517350264896545	0.19752651841750052	-0.34012300176723065	0.2546142597584776	-0.07097036113391564	0.27008482494328867	-0.18210635776402628	-0.18272343231257193	-0.4577011617230407	-0.18747154322082782	-0.12004736868073251	0.05470101444059283	-0.03437346521273595	0.147021540231	0.428242856315	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.840380101088	0.436112310787	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.716953652062	NA__no_active_tile	0.531876919694	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr4:66536255..66536369,+__636.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr4:66536255..66536369,+__636.1.0.0	rs77509384	-0.9091388812049852	-0.7029604606038746	-1.2102244956931267	-1.2120635202144714	-0.910959126641552	-1.0435850944073952	-0.8774521990536389	-1.1296117181839715	-0.9644186983673554	-1.0502394598734217	-1.1108841236745632	-0.9270999042080171	-1.0040531401771977	-1.3499249383547856	-1.4460087907763648	-1.2000103223547067	-1.4437441801242161	-1.560268553649684	-1.6406800258061225	-1.2507897684566338	-1.1997536630461851	-1.726488166847421	-1.3552306202449935	-1.396854278615119	-1.5534906324921964	-1.4269369950640358	-0.44078605714980035	-0.7430483301724902	0.010214173338420007	-0.23168065990974474	-0.6493094270081321	-0.5970949313987273	-0.3733375694029949	-0.07014194486221359	-0.7620694684800656	-0.3049911603715718	-0.2859701549405558	-0.6263907282841793	-0.42288385488683794	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr4:6675094..6675208,+__637.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr4:6675094..6675208,+__637.1.0.0	rs66895304	1.0078230610442973	1.0646955556838034	0.7533633601412181	0.7052207161568268	0.9208173127647984	0.9379902715186876	0.9576660169609886	1.3794796794570356	0.9040400819398512	0.7862656252532584	0.9002106087272083	0.9474344511854738	0.9387505617361208	0.8275022337255531	1.0659625667121841	0.7712594613455531	0.7594508338578562	1.096049427310564	0.959065739989813	0.922679027333861	1.5665516565382849	0.9846705987993013	0.9611087938761984	0.9832627696160496	1.0978144426357006	0.9996147959784097	-0.18032082731874421	0.0012670110283807823	0.017896101204335046	0.05423011770102937	0.1752321145457657	0.021075468471125403	-0.03498698962712765	0.18707197708124923	0.08063051685945011	0.17484316862294003	0.08305216088884138	0.15037999145022685	0.06086423424228934	0.412754243182	0.706946403854	0.819440831591	0.554657938956	0.563691144959	0.545696106059	0.452098798395	0.87199428352	0.609889042629	0.819442862795	0.581967350665	0.819442862795	0.924635471995	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr4:6675094..6675208,+__637.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr4:6675094..6675208,+__637.1.0.0	rs116570743	1.0078230610442973	1.0646955556838034	0.7533633601412181	0.7052207161568268	0.9208173127647984	0.9379902715186876	0.9576660169609886	1.3794796794570356	0.9040400819398512	0.7862656252532584	0.9002106087272083	0.9474344511854738	0.9387505617361208	0.9391903728626442	1.2179457160298868	0.9471692472076874	0.8272670939115623	1.0799910186109989	0.9002864810504212	1.026332633349765	1.4983491048835953	1.1320775590433063	0.9934109949450376	0.8750069217932259	0.8304725162281068	1.022291638326353	-0.06863268818165313	0.1532501603460834	0.19380588706646928	0.12204637775473548	0.1591737058462005	-0.03770379046826644	0.06866661638877647	0.11886942542655965	0.22803747710345512	0.2071453696917792	-0.02520368693398234	-0.11696193495736695	0.08354107659023251	0.829896383209	0.510582765025	0.628827692687	0.840380101088	0.476688253492	0.563691144959	0.687084607526	0.677233097055	0.861430881609	0.591208103411	0.648013768535	0.66743649171	0.943324261538	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr4:6675094..6675208,+__637.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr4:6675094..6675208,+__637.1.0.0	rs66895304,rs116570743	1.0078230610442973	1.0646955556838034	0.7533633601412181	0.7052207161568268	0.9208173127647984	0.9379902715186876	0.9576660169609886	1.3794796794570356	0.9040400819398512	0.7862656252532584	0.9002106087272083	0.9474344511854738	0.9387505617361208	1.3153908502271197	1.5090355798393942	1.2885793151480505	1.336994727841605	1.4217202968601004	1.1740936912438944	1.1256536220777154	1.5322233166130599	1.2287139576779835	1.2056929455696324	1.2185938708929624	1.3109579058784417	1.3056375066558301	0.30756778918282235	0.4443400241555908	0.5352159550068324	0.6317740116847782	0.500902984095302	0.23610341972520676	0.16798760511672672	0.15274363715602424	0.32467387573813233	0.419427320316374	0.3183832621657542	0.363523454692968	0.36688694491970936	0.0832552515755	0.0187859264625	0.0174727290303	0.00641629102443	0.00342117348194	0.13967914143	0.333666485083	0.226876581559	0.21176555971	0.0763307839553	0.132622250874	0.0249397487324	6.0579699032e-08	1	1	1	1	0.701340563799	1	1	1	1	1	1	1	1.37515916803e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr4:68566922..68567036,+__639.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr4:68566922..68567036,+__639.1.0.0	rs28653581	2.686149056665257	2.844089838626638	2.652310096257408	2.4605829920814566	2.6622288613597087	2.7151576953969383	2.763048785082431	2.834760887933441	2.796479016224042	2.7437609657571036	2.7278813233649806	2.8861146569821625	2.731047014644297	2.840931330403689	3.240115907364509	2.8287193422910386	2.717414095489468	2.941621893801768	2.949470342221926	2.9253263358756554	3.1192857336387236	3.048565310502063	3.0757874629638753	3.158727208134205	3.157686868241521	3.000304319244037	0.15478227373843234	0.3960260687378714	0.1764092460336304	0.2568311034080115	0.2793930324420595	0.23431264682498787	0.16227755079322437	0.28452484570528247	0.2520862942780213	0.3320264972067717	0.43084588476922425	0.2715722112593584	0.2692573045997396	0.375513989452	0.0932701621097	0.687084607526	0.276766468575	0.420456664513	0.476688253492	0.110080523892	0.206893929435	0.361218104761	0.197395731844	0.101398170673	0.326996172605	0.0220519519428	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr4:68566999..68567113,+__640.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr4:68566999..68567113,+__640.1.0.0	rs28653581	0.3870736192543352	0.5977137637632957	0.6691999687766451	0.22914761459871866	0.5003992510148537	0.5708769435780139	0.5171522356666042	0.5896116063450135	0.4746162821153394	0.4876503713471466	0.4432489479831843	0.5881812693154521	0.5045726561465501	-0.6639591263579424	-0.5089851479474878	-0.04478469175196135	-0.6438508404590927	-0.01096795416137188	-0.5144679429321046	-0.05307329306259236	-0.5011886116809471	-0.07581189901575491	-0.10061670779649112	-0.04721278850557089	-0.31019578078669	-0.28959289870483396	-1.0510327456122777	-1.1066989117107835	-0.7139846605286064	-0.8729984550578114	-0.5113672051762256	-1.0853448865101185	-0.5702255287291965	-1.0908002180259606	-0.5504281811310943	-0.5882670791436377	-0.4904617364887552	-0.8983770501021422	-0.7941655548513843	0.000222088887318	5.01342010717e-05	0.0115927323179	0.00251850159852	0.00313710581496	1.2780782346e-05	0.0107365258413	0.000288590960955	0.00591301274865	0.00654737116888	0.000715310039185	9.98335414644e-06	9.11266861421e-28	0.157238932221	0.0372998455974	1	1	1	0.00976451771231	1	0.209805628614	1	1	0.550073420134	0.00777703288007	7.63641629871e-25	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr4:79567260..79567374,+__646.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr4:79567260..79567374,+__646.1.0.0	rs72859453	-1.3489037829364454	-1.403801540953004	-1.6272619045108832	-1.4490466475601704	-1.5308288026516068	-1.4810240724370904	-1.3631739905780424	-1.6427642562454106	-1.4474114269117746	-1.6468806238425653	-1.4004886031284045	-1.3955053524167382	-1.4780909170143444	-1.091867316159574	-1.129841224728053	-1.3892435457805457	-0.9836966139076396	-1.388671546396139	-1.955780364319665	-1.270171078035536	-0.820582256118236	-1.674834815356522	-1.5945942122979229	-1.5708946358427534	-1.419667834225076	-1.357487120263972	0.2570364667768714	0.2739603162249511	0.2380183587303375	0.4653500336525308	0.14215725625546782	-0.4747562918825745	0.09300291254250648	0.8221820001271746	-0.2274233884447474	0.05228641154464242	-0.17040603271434884	-0.024162481808337688	0.1206037967503728	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr4:90602576..90602690,+__650.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr4:90602576..90602690,+__650.1.0.0	rs111836791	-1.0331945730974321	-0.9415391520742771	-0.9221391347728014	-0.6615789865202816	-0.8269362306134023	-0.9504651484859632	-0.9022137083571312	-0.8698870377688896	-0.8308906214888334	-0.6352483514853746	-0.8593920614394843	-0.8839236102027854	-0.8597840513588881	-1.092904636498296	-1.0088819057360252	-1.0359538771048789	-1.1259558857904788	-1.5201955191645269	-0.9631536354472188	-0.9442132006798976	-1.2224334818777585	-1.5602090895806642	-1.1134585249866895	-1.1487454250326485	-1.0673272398700036	-1.1502860351474238	-0.05971006340086382	-0.06734275366174813	-0.11381474233207745	-0.4643768992701972	-0.6932592885511246	-0.012688486961255574	-0.04199949232276634	-0.3525464441088688	-0.7293184680918308	-0.4782101735013149	-0.2893533635931642	-0.18340362966721813	-0.2905019837885358	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0156538458129	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00522410712556	0.088148079887	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.000230701369952	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.19332774802	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr4:90602576..90602690,+__650.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr4:90602576..90602690,+__650.1.0.0	rs371046360,rs111836791	-1.0331945730974321	-0.9415391520742771	-0.9221391347728014	-0.6615789865202816	-0.8269362306134023	-0.9504651484859632	-0.9022137083571312	-0.8698870377688896	-0.8308906214888334	-0.6352483514853746	-0.8593920614394843	-0.8839236102027854	-0.8597840513588881	-0.5801850890810981	-0.8344998908297663	-1.1637926830907575	-0.9544387848537323	-1.2815468102691736	-1.254459408345976	-0.9527688973058943	-1.4444233341458634	-1.070114059119604	-0.977420047437501	-0.9206160855962069	-0.9853949101617487	-1.0349716666864435	0.453009484016334	0.1070392612445108	-0.24165354831795605	-0.29285979833345077	-0.45461057965577134	-0.3039942598600127	-0.0505551889487631	-0.5745362963769738	-0.2392234376307707	-0.3421716959521264	-0.06122402415672257	-0.10147129995896331	-0.17518761532755547	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0232568344756	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.727009731456	0.265084565602	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.122381893801	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr5:104728636..104728750,-__651.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr5:104728636..104728750,-__651.1.0.0	rs13167840	1.1546853692906403	1.4543028099564284	1.115756635838625	0.8390046538237665	1.2763682650843926	1.1824123486077258	1.1750948286308849	1.5993992969221928	1.1701445599456344	1.3360556054627786	1.156765145017506	1.4626855629759679	1.2435562567963785	1.4988745823841738	1.7416276823961028	1.4044224688979972	1.147654678864663	1.4136319334480378	1.4270986030240165	1.5238565812745013	1.8085375558510326	1.662609089445202	1.5881226189485007	1.5119616646385876	1.5522553197181748	1.523387731574249	0.34418921309353356	0.2873248724396744	0.2886658330593721	0.30865002504089656	0.13726366836364523	0.24468625441629066	0.3487617526436164	0.20913825892883975	0.49246452949956754	0.25206701348572214	0.35519651962108156	0.08956975674220691	0.27983147477787057	0.0658387268341	0.101398170673	0.0583274625199	0.0906800339379	0.0267271087754	0.0316863885398	0.0129907246043	0.0267271087754	0.00641629102443	0.0374147936077	0.00883703695038	0.113101776132	2.78586551344e-10	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	2.33455530027e-07	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr5:111496519..111496633,+__652.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr5:111496519..111496633,+__652.1.0.0	rs17134162	0.19899670103154996	0.37123846657592896	0.32698221774894237	0.08426052222960362	0.13897348353979921	0.275161966621911	0.29509354937280974	0.4525391996410941	0.3517662653065786	0.5638450324026836	0.36834280169247313	0.35579903433313453	0.31524993670804236	0.37970980704677415	0.44469310043117116	0.3091317940092546	0.05309591043967004	0.08156255070130489	0.14445444029744925	0.4695456448013894	0.30872276485254446	0.2875833128752195	0.5947872494686908	0.4126407568569167	0.5797736170818828	0.33880841240518905	0.1807131060152242	0.0734546338552422	-0.01785042373968776	-0.03116461178993358	-0.05741093283849433	-0.13070752632446175	0.17445209542857965	-0.14381643478854966	-0.06418295243135913	0.030942217066007194	0.04429795516444357	0.22397458274874826	0.02355847569714657	0.798631310048	0.468411351413	0.777966336216	0.777966336216	0.978575937473	0.989287003123	0.554657938956	0.914457009705	0.536806685117	0.706946403854	0.777966336216	0.48504462162	0.996909078737	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr5:12574875..12574989,+__654.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:12574875..12574989,+__654.1.0.0	rs6554725	0.8668811525343966	-0.7735425423635656	-0.5457909942320369	0.5332664827462563	1.241238962473847	0.01201451421053599	-0.7891078085541311	1.4227731561262273	0.3431329996852457	0.4483894186341133	-0.22286037497253236	0.07590224742464263	0.21769143447608327	0.6451276063467664	1.0887465487955799	0.5205819534278543	0.8470417982266862	-0.019892782390154014	-0.34798715818463233	-1.2967551944508324	0.9353846168082602	0.4939043967474328	0.37863609796254794	-0.07621775576499445	1.1547718998421157	0.3602785022805525	-0.2217535461876302	1.8622890911591454	1.0663729476598913	0.3137753154804299	-1.261131744864001	-0.36000167239516834	-0.5076473858967013	-0.4873885393179671	0.15077139706218712	-0.06975332067156537	0.1466426192075379	1.078869652417473	0.14258706780446928	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr5:12574875..12574989,+__654.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:12574875..12574989,+__654.1.0.0	rs112472721	0.8668811525343966	-0.7735425423635656	-0.5457909942320369	0.5332664827462563	1.241238962473847	0.01201451421053599	-0.7891078085541311	1.4227731561262273	0.3431329996852457	0.4483894186341133	-0.22286037497253236	0.07590224742464263	0.21769143447608327	1.8188529063297427	2.2110753566999484	1.8981072549085307	1.5439004341275648	1.720387085063023	2.047356919469926	2.0593872163803173	1.7619347429659338	1.8088256313799214	1.738166542717912	2.0543299815874168	1.66604852537308	1.860697716416943	0.9519717537953462	2.984617899063514	2.4438982491405676	1.0106339513813085	0.47914812258917605	2.03534240525939	2.8484950249344485	0.33916158683970643	1.4656926316946757	1.2897771240837987	2.277190356559949	1.5901462779484372	1.6430062819408597	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr5:12574875..12574989,+__654.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:12574875..12574989,+__654.1.0.0	rs6554725,rs112472721	0.8668811525343966	-0.7735425423635656	-0.5457909942320369	0.5332664827462563	1.241238962473847	0.01201451421053599	-0.7891078085541311	1.4227731561262273	0.3431329996852457	0.4483894186341133	-0.22286037497253236	0.07590224742464263	0.21769143447608327	0.8080126133697445	1.0662459573212473	0.4747402504830164	-0.017076551730613104	0.2766754597554416	1.1144054252073643	0.9483860843378507	0.8926849237616135	1.2101019579363737	1.010309596510774	0.9631114024106596	0.463905787585825	0.7676252422457748	-0.05886853916465207	1.8397884996848128	1.0205312447150532	-0.5503430344768694	-0.9645635027184053	1.1023909109968284	1.7374938928919819	-0.5300882323646139	0.866968958251128	0.5619201778766607	1.185971777383192	0.3880035401611824	0.5499338077696916	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr5:131705263..131705377,-__657.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr5:131705263..131705377,-__657.1.0.0	rs2631368	0.7084733145940969	-0.2356543541329424	-0.8676662448204407	-0.015243545880622156	-0.059833764665783065	-0.06966210176567884	-0.5897268412820911	-0.47602987388588847	0.3630739838061923	-0.09950669050425859	-0.51026094531226	-1.0888431443577875	-0.2450733506839553	0.9071114994050874	0.8276534586845322	0.7557443067946329	1.600693590838579	-0.6069326935947431	1.0162445130921993	0.4520629795837818	1.482765725166417	0.9937106122349719	2.062732433860798	2.082354726382361	0.48685280304949835	1.005082829624843	0.1986381848109905	1.0633078128174747	1.6234105516150736	1.6159371367192013	-0.5470989289289601	1.0859066148578782	1.041789820865873	1.9587955990523054	0.6306366284287797	2.1622391243650565	2.592615671694621	1.5756959474072858	1.2501561803087984	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr5:131705263..131705377,-__657.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr5:131705263..131705377,-__657.1.0.0	rs2631369,rs2631368	0.7084733145940969	-0.2356543541329424	-0.8676662448204407	-0.015243545880622156	-0.059833764665783065	-0.06966210176567884	-0.5897268412820911	-0.47602987388588847	0.3630739838061923	-0.09950669050425859	-0.51026094531226	-1.0888431443577875	-0.2450733506839553	0.4987227738770017	0.2953306099465135	-0.24951381232283382	-0.936251601575113	-0.165002651881352	-0.050644947954626235	0.5041640580117533	-0.32965196687877196	-0.24794607751727976	-0.04597974568015898	-0.9468438442210472	-0.3679185813831849	-0.1701279822982583	-0.2097505407170952	0.530984964079456	0.6181524324976069	-0.9210080556944908	-0.10516888721556893	0.01901715381105261	1.0938908992938443	0.1463779070071165	-0.6110200613234721	0.05352694482409961	-0.4365828989087872	0.7209245629746026	0.07494536838569701	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr5:131705526..131705640,-__658.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr5:131705526..131705640,-__658.1.0.0	rs13180186	-1.509331716816417	0.30959720561599285	-1.284446518295569	-1.2304528784132387	-0.5480643566896102	-0.4952720611964122	-0.5608757520464559	-0.2961893580831889	-2.5598466962558577	-0.3106747475388935	-1.993629876467875	-0.20199174387327454	-0.8900982083383999	-0.6980534212268273	-0.3320140821674881	-0.2627370326615439	0.44337830057519834	-3.958871939376433	-0.8141882610427182	0.6346351007265885	-1.0597033237159383	-0.2544446216413109		-0.7756339866989066	-0.9028887941608272	-0.7255020055809279	0.8112782955895897	-0.641611287783481	1.0217094856340252	1.673831178988437	-3.4108075826868225	-0.31891619984630604	1.1955108527730443	-0.7635139656327494	2.305402074614547		1.2179958897689684	-0.7008970502875527	0.21727106283015454	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr5:131705526..131705640,-__658.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr5:131705526..131705640,-__658.1.0.0	rs13180043	-1.509331716816417	0.30959720561599285	-1.284446518295569	-1.2304528784132387	-0.5480643566896102	-0.4952720611964122	-0.5608757520464559	-0.2961893580831889	-2.5598466962558577	-0.3106747475388935	-1.993629876467875	-0.20199174387327454	-0.8900982083383999	1.1037959293928459	-0.504503724658891	-0.35259726871565966	1.494540822486728	0.3064360066662722	-0.20102253227222136	-0.8863815349221721	0.20400525146501525	-0.09721830156920967	-0.1971974886668424	0.17410888332752675	0.3000814785417174	0.11200396008959246	2.613127646209263	-0.8141009302748838	0.9318492495799094	2.724993700899967	0.8545003633558823	0.2942495289241909	-0.3255057828757162	0.5001946095482042	2.462628394686648	0.11347725887205112	2.1677387597954016	0.502073222414992	1.0021021684279925	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr5:131705526..131705640,-__658.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr5:131705526..131705640,-__658.1.0.0	rs13180295	-1.509331716816417	0.30959720561599285	-1.284446518295569	-1.2304528784132387	-0.5480643566896102	-0.4952720611964122	-0.5608757520464559	-0.2961893580831889	-2.5598466962558577	-0.3106747475388935	-1.993629876467875	-0.20199174387327454	-0.8900982083383999	2.620984182192554	3.0626159140364173	1.6251458474494598	0.7239753422086744	1.6457536787467082	1.8991777301190775	0.659696471808819	-1.828729678338064	1.2235591909998202	0.8339854802734297	-0.08416298231241744	-0.16932154452152326	1.017723302721913	4.130315899008971	2.7530187084204245	2.909592365745029	1.9544282206219132	2.193818035436318	2.39444979131549	1.220572223855275	-1.532540320254875	3.783405887255678	1.1446602278123232	1.9094668941554576	0.03267019935175128	1.9078215110603132	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr5:131705526..131705640,-__658.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr5:131705526..131705640,-__658.1.0.0	rs13180186,rs13180043,rs13180295	-1.509331716816417	0.30959720561599285	-1.284446518295569	-1.2304528784132387	-0.5480643566896102	-0.4952720611964122	-0.5608757520464559	-0.2961893580831889	-2.5598466962558577	-0.3106747475388935	-1.993629876467875	-0.20199174387327454	-0.8900982083383999	0.0378155201778414	-0.9818639014875034	-0.39263552312835803	-1.014061167566475	-0.6493697820320462	0.10933914026743352	-0.1582392031521018	0.25538403800062903	-0.4772097730518575	-1.1477016203366204	-0.5269182742171834	-0.7280343866470727	-0.47279124443110954	1.5471472369942585	-1.2914611071034963	0.8918109951672111	0.21639171084676367	-0.10130542534243603	0.6046112014638457	0.4026365488943541	0.551573396083818	2.0826369232040003	-0.8370268727977268	1.4667116022506916	-0.5260426427737981	0.41730696390729044	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr5:158527441..158527555,+__668.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:158527441..158527555,+__668.1.0.0	rs113122010	-0.4424397275177214	-0.23533668324489815	-0.2800954477842667	-0.7328061218608	-0.4042605140580572	-0.4575442165777696	-0.4681073203547383	-0.38097984296124265	-0.6926886310261591	-0.2752647647977013	-0.32680132368577697	-0.46686866125580406	-0.43026610459374465	-0.29312900625786925	-0.17555793628509198	-0.45000430836582916	-0.92146623514245	-0.560019522325714	-0.4881732248296473	-0.3648049510071596	-0.6226470671153808	-0.4516553023458676	-0.4702453038647715	-0.7190097920653359	-0.5757369459864897	-0.5077041329659674	0.14931072125985217	0.05977874695980617	-0.16990886058156246	-0.18866011328165	-0.15575900826765676	-0.0306290082518777	0.10330236934757869	-0.2416672241541381	0.24103332868029148	-0.1949805390670702	-0.3922084683795589	-0.10886828473068566	-0.0774380283722226	0.757452311924	0.850888834575	0.935789553219	NA__no_active_tile	0.444064484515	0.978575937473	0.554657938956	0.405136064622	0.390154148302	0.742179092338	0.0959193233604	0.350717810416	0.869196078055	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr5:158527441..158527555,+__668.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:158527441..158527555,+__668.1.0.0	rs76992476	-0.4424397275177214	-0.23533668324489815	-0.2800954477842667	-0.7328061218608	-0.4042605140580572	-0.4575442165777696	-0.4681073203547383	-0.38097984296124265	-0.6926886310261591	-0.2752647647977013	-0.32680132368577697	-0.46686866125580406	-0.43026610459374465	-0.25360513153825853	0.31241800864452873	-0.26070332283746983	-0.5629424298357577	-0.4955584461154519	-0.39141693165413016	-0.534252721548325	-0.5688830172094539	-0.135147878341282	-0.320036959535031	-0.2746843076727713	-0.7642274423380159	-0.3540867149984515	0.1888345959794629	0.5477546918894269	0.019392124946796874	0.16986369202504226	-0.09129793205739473	0.06612728492363945	-0.06614540119358675	-0.18790317424821124	0.557540752684877	-0.044772194737329685	0.05211701601300567	-0.2973587810822118	0.07617938959529306	0.652840269106	0.0412533998463	0.591208103411	0.591203856829	0.326996172605	0.829896383209	NA__no_active_tile	0.519249062249	0.63839046467	0.472534754287	0.412754243182	0.282745459933	0.400247309959	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr5:158527441..158527555,+__668.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:158527441..158527555,+__668.1.0.0	rs113122010,rs76992476	-0.4424397275177214	-0.23533668324489815	-0.2800954477842667	-0.7328061218608	-0.4042605140580572	-0.4575442165777696	-0.4681073203547383	-0.38097984296124265	-0.6926886310261591	-0.2752647647977013	-0.32680132368577697	-0.46686866125580406	-0.43026610459374465	-0.5514190006143918	-0.3604129818022484	-0.6211146023896033	-0.4823098290251201	-1.0286034323984046	-0.64738758993337	-0.6503269159239805	-0.6245109823583315	-0.4574153584813097	-0.29901682445540395	-0.6644812998375299	-0.6017378411058713	-0.5823947215271305	-0.10897927309667033	-0.12507629855735025	-0.34101915460533655	0.25049629283567987	-0.6243429183403474	-0.18984337335560036	-0.18221959556924222	-0.2435311393970888	0.23527327254484937	-0.023752059657702662	-0.33767997615175294	-0.1348691798500672	-0.15212861693338578	0.313906135344	0.737107262675	0.476688253492	0.382785732326	0.0832552515755	0.397602565759	0.66743649171	0.788281320858	0.66743649171	0.935789553219	0.143314270352	0.79863356553	0.625423486735	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr5:175612155..175612269,-__676.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:175612155..175612269,-__676.1.0.0	rs3815694	-1.1463871383869864	-1.0220754275366148	-1.181422844328369	-1.135557100035581	-1.167523568731049	-1.11991012055257	-1.5552503540942366	-1.3028788915092469	-1.24591292978862	-1.2090395928383177	-1.2444326327477675	-1.1405539514350587	-1.2059120459987016	-1.4708581412631152	-1.1354245841248527	-0.9356109716079163	-1.112019631649877	-1.0369580383635082	-1.1838141502265445	-1.0371565877941558	-1.3535225893154976	-1.1501284860981278	-1.2462902135034861	-1.135395577068238	-1.1910796632877232	-1.1656882195252534	-0.32447100287612884	-0.11334915658823785	0.24581187272045268	0.02353746838570414	0.13056553036754082	-0.06390402967397435	0.5180937663000809	-0.050643697806250776	0.09578444369049222	-0.03725062066516838	0.10903705567952948	-0.05052571185266452	0.04022382647344796	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr5:180257947..180258061,+__678.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:180257947..180258061,+__678.1.0.0	rs57226091	-0.7528576024321019	-1.5950029220046316	-0.8443663684288465	-1.413752520433067	-1.0676133038047184	-1.2992044084305567	-0.6583443121700238	-1.1290077126756661	-0.7100688678703757	-1.2444647872701944	-1.0248071908081169	-1.306063018900301	-1.0871294179357167	-0.5499534364899152	-0.7643703341924555	-0.7263131722142759	-1.363853052747812	-1.2340667716029452	-0.8336493681352376	-0.983625434093109	-1.280126834835295	-0.986921817812074	-0.8308937183225127	-0.745603068741072	-0.7678516058904967	-0.9222690512564334	0.20290416594218663	0.8306325878121761	0.11805319621457055	0.049899467685254884	-0.16645346779822678	0.46555504029531913	-0.3252811219230852	-0.15111912215962886	-0.2768529499416983	0.4135710689476817	0.2792041220670449	0.5382114130098044	0.16486036667928325	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr5:180618810..180618924,+__679.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr5:180618810..180618924,+__679.1.0.0	rs1149252	3.7527295143254253	4.145414162662215	3.643464537779188	3.371373775343856	3.8078010674695815	3.8907544345198106	3.7407532694141663	4.22283598092672	4.080065272182695	4.060078234391897	4.094964043519322	4.063406757171702	3.906136754142215	3.7813130115303966	4.205817119904442	3.6243527896637584	3.280351171479125	3.5956528721779226	3.6619699497652856	3.6345493396181023	4.047697501386215	3.851428948154021	3.9361799915305067	3.858755702995844	3.97048329637469	3.7873793078816926	0.02858349720497122	0.06040295724222666	-0.019111748115429705	-0.09102260386473082	-0.21214819529165885	-0.22878448475452506	-0.10620392979606397	-0.17513847954050554	-0.2286363240286744	-0.12389824286139017	-0.23620834052347828	-0.09292346079701197	-0.11875744626052258	0.60051573606	0.554657938956	0.460214637573	0.30750859871	0.0224529881577	0.0856734395523	0.48504462162	0.183752894264	0.259370210024	0.313917214294	0.276771967065	0.382791178922	0.0294504569836	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr5:180618810..180618924,+__679.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr5:180618810..180618924,+__679.1.0.0	rs114137036	3.7527295143254253	4.145414162662215	3.643464537779188	3.371373775343856	3.8078010674695815	3.8907544345198106	3.7407532694141663	4.22283598092672	4.080065272182695	4.060078234391897	4.094964043519322	4.063406757171702	3.906136754142215	3.781609148559121	4.167362915274351	3.627869752932357	3.2648446735650847	3.837853114758208	3.820501763349127	3.6892644097211686	4.184760440822108	4.1127349096984265	4.0327482489486375	4.0847326212814785	4.084193277499997	3.8907062730341724	0.02887963423369566	0.021948752612136246	-0.015594784846831189	-0.10652910177877128	0.030052047288626316	-0.07025267117068346	-0.05148885969299766	-0.03807554010461178	0.032669637515731154	-0.027329985443259375	-0.010231422237843901	0.02078652032829531	-0.01543048110804283	0.757455001208	0.90381429355	0.737113058664	0.412754243182	0.66743649171	0.66743649171	0.87199428352	0.737113058664	0.87199428352	0.677233097055	0.536806685117	0.861430881609	0.988070617142	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr5:180618810..180618924,+__679.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr5:180618810..180618924,+__679.1.0.0	rs1149252,rs114137036	3.7527295143254253	4.145414162662215	3.643464537779188	3.371373775343856	3.8078010674695815	3.8907544345198106	3.7407532694141663	4.22283598092672	4.080065272182695	4.060078234391897	4.094964043519322	4.063406757171702	3.906136754142215	3.7865739566456655	4.187541039722365	3.6652424077003105	3.2885149061339134	3.766861254100731	3.762457609950727	3.61683862417767	4.065587413105793	3.8791232806449054	3.9469234169039034	4.081114540994643	4.109186257703959	3.8463303923153824	0.0338444423202402	0.04212687706015039	0.021777869921122406	-0.08285886920994256	-0.04093981336885033	-0.12829682456908342	-0.12391464523649631	-0.15724856782092722	-0.2009419915377899	-0.1131548174879935	-0.013849502524679203	0.04577950053225699	-0.05980636182683271	0.727009731456	0.989287003123	0.591208103411	0.301187193336	0.232080506959	0.147021540231	0.361218104761	0.104229562843	0.150801701171	0.619326784864	0.375513989452	0.819442862795	0.395970223542	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr5:180708287..180708401,+__682.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:180708287..180708401,+__682.1.0.0	rs11739788	-0.5625015975335612	-0.266835108967076	-0.3230336457680403	-0.4163317828320378	-0.39789776747403355	-0.3013062245541717	-0.33249938079242597	-0.004428756381400492	-0.10446689977140568	-0.3715638048408195	-0.10655698544363419	-0.2636921098403511	-0.2875928386832465	-0.29923024473749815	-0.5336301661977577	-0.37039784823156374	-0.5787417596600233	-0.20639602984930963	-0.35704445352364167	-0.3264942814738896	0.08992689066641937	-0.41551610285031054	-0.23028962501025912	-0.1535925526558881	-0.10225063556923797	-0.29030473409108	0.26327135279606306	-0.2667950572306817	-0.047364202463523464	-0.16240997682798547	0.19150173762472392	-0.05573822896946995	0.006005099318536378	0.09435564704781986	-0.3110492030789049	0.1412741798305604	-0.047035567212253895	0.1614414742711131	-0.0027118954078335505	0.183752894264	0.76769033028	0.572794651112	0.242741268695	0.253741740693	0.591208103411	0.757455001208	0.48504462162	0.206893929435	0.136115392203	0.85089220831	0.276771967065	0.289429963162	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr5:180708287..180708401,+__682.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:180708287..180708401,+__682.1.0.0	rs2770970	-0.5625015975335612	-0.266835108967076	-0.3230336457680403	-0.4163317828320378	-0.39789776747403355	-0.3013062245541717	-0.33249938079242597	-0.004428756381400492	-0.10446689977140568	-0.3715638048408195	-0.10655698544363419	-0.2636921098403511	-0.2875928386832465	-0.955394280533225	-0.7968413707394255	-0.6116590444037544	-0.5248230309344373	-0.6509968131961759	-0.9623076587378268	-0.6592370878484992	-0.4430077197430169	-0.5966062098397966	-0.9651130036540156	-0.4238142066954022	-0.42165000329098157	-0.6676208691347131	-0.39289268299966373	-0.5300062617723496	-0.2886253986357141	-0.10849124810239946	-0.2530990457221423	-0.661001434183655	-0.32673770705607325	-0.4385789633616164	-0.49213931006839096	-0.5935491988131961	-0.31725722125176803	-0.1579578934506305	-0.38002803045146655	0.0808926541269	0.00320568245066	0.183752894264	0.110080523892	0.0276615481105	0.00121241130235	0.0499532058383	0.0808926541269	0.0107365258413	9.33325531828e-05	0.0386605553759	0.113101776132	9.4633575294e-12	1	1	1	1	1	0.926282234996	1	1	1	0.0732660542485	1	1	7.93029360964e-09	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr5:180708287..180708401,+__682.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:180708287..180708401,+__682.1.0.0	rs11739788,rs2770970	-0.5625015975335612	-0.266835108967076	-0.3230336457680403	-0.4163317828320378	-0.39789776747403355	-0.3013062245541717	-0.33249938079242597	-0.004428756381400492	-0.10446689977140568	-0.3715638048408195	-0.10655698544363419	-0.2636921098403511	-0.2875928386832465	-0.6531444582604405	-0.6199292926474747	-0.6279065284251799	-0.4574153584813097	-0.6334467137234884	-0.8380478311901208	-0.8943543990899673	-0.3402512687301781	-0.6251358334085528	-0.7848457939314737	-0.3982405734279351	-0.7035209397183864	-0.6313532492528756	-0.09064286072687933	-0.35309418368039863	-0.30487288265713963	-0.0410835756492719	-0.23554894624945483	-0.5367416066359492	-0.5618550182975413	-0.3358225123487776	-0.5206689336371472	-0.41328198909065417	-0.29168358798430094	-0.4398288298780353	-0.3437604105696292	0.63839046467	0.0515422504639	0.572794651112	0.354199901149	0.166665831608	0.00110317967744	0.0156538458129	0.192768091005	0.00372847011721	0.00883703695038	0.248198866138	0.132622250874	4.63616195997e-06	1	1	1	1	1	0.221739115165	1	1	0.768064844145	1	1	1	0.00105240876491	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr5:20616428..20616542,+__685.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:20616428..20616542,+__685.1.0.0	rs72749114	2.730493432263816	3.3001278573810313	2.673086004302644	2.647823328908882	2.863337796851518	2.828932796845749	2.6465814642010455	2.9704677288603802	3.025391129705026	3.000894882940071	2.9673426693329343	2.9968831278315524	2.8876135182853875	3.0208236156481365	3.4843049853092776	2.83854429180359	2.70717179662701	3.0958486589930256	3.0821642719057953	2.901438962208241	3.3211483807864823	3.2037721266485475	3.355253525235887	3.246997013210162	3.3369734622152887	3.132870090882621	0.2903301833843206	0.18417712792824625	0.16545828750094582	0.05934846771812774	0.2325108621415075	0.2532314750600464	0.25485749800719537	0.3506806519261021	0.17838099694352127	0.35435864229581604	0.2796543438772279	0.34009033438373626	0.24525657259723277	0.206893929435	0.197395731844	0.536806685117	0.493479697885	0.0785847853765	0.0719809426143	0.175053819161	0.0698833862508	0.125844655769	0.129198935732	0.183752894264	0.0399413890972	0.000326390062675	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.273514872521	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr5:38468371..38468485,-__690.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr5:38468371..38468485,-__690.1.0.0	rs10067809	-1.2667314984373308	-0.8987388409014805	-1.351931294037536	-1.2874786609695392	-1.3123311820794799	-1.5288483490499345	-1.4581096237875075	-1.397097404047447	-1.1075198226663208	-1.1599617826145585	-1.2256377582089275	-1.14729562982756	-1.2618068205523019	-1.1114096931979593	-1.0132381017318792	-1.1045713924003455	-1.4064839409480598	-1.1496504305041169	-1.2923650668841764	-1.119142201831207	-0.9513297147476988	-1.3678711781497006	-1.0705097977216775	-1.150668044328971	-1.5367284362350118	-1.1894973332234002	0.15532180523937145	-0.11449926083039874	0.24735990163719057	-0.11900527997852062	0.162680751575363	0.2364832821657581	0.3389674219563006	0.4457676892997483	-0.26035135548337984	0.08945198489288098	0.07496971387995655	-0.3894328064074517	0.07230948732890156	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr5:38845829..38845943,-__693.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr5:38845829..38845943,-__693.1.0.0	rs2292016	0.5115094880613573	0.7482547836209719	0.7237386239649528	0.5158639621721384	0.6549685103388587	0.9362675669872464	0.5329550469180225	0.8839697473861532	0.7925369857885792	0.5934792420765553	0.7620544673110556	0.9340795723983275	0.7158064997520182	0.6124407764524535	0.7696967460306046	0.7225074647257912	0.6444559971180783	0.8244560268663996	0.7629078976297953	0.7969126177608628	0.7374367315747776	0.7314158992096111	0.781774714076128	0.7479977731354936	0.8875063132133527	0.7516257464827789	0.10093128839109622	0.021441962409632698	-0.0012311592391616166	0.12859203494593996	0.1694875165275409	-0.17335966935745117	0.2639575708428402	-0.14653301581137557	-0.06112108657896809	0.18829547199957264	-0.01405669417556199	-0.04657325918497479	0.035819246730760784	0.468411351413	0.76769033028	0.925117039075	0.501992688725	0.304331462321	0.405136064622	0.265084565602	0.554657938956	0.747262025795	0.183752894264	0.648013768535	0.809021331888	0.705737024424	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr5:44808796..44808910,-__698.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr5:44808796..44808910,-__698.1.0.0	rs78665523	-1.7651943513251689	-1.5965931769925965	-1.268056619657444	-1.6583448857893563	-1.1829536601173016	-1.5530502376559236	-1.4403234694971343	-1.4261148615795192	-1.4430614884496091	-1.272505140319741	-1.7702096790515827	-1.3745821458642835	-1.479249143024972	-1.5772042431365545	-1.5439891904969634	-1.6956702059331819	-1.6354439737460325	-1.3774212331228186	-1.5850226013356559	-1.922041539272171	-1.8207384432952456	-1.7074833211861185	-1.6371822544027705	-2.3694189143413675	-1.500137774058247	-1.6976461411939268	0.1879901081886144	0.05260398649563314	-0.42761358627573776	0.022900912043323896	-0.19446757300551698	-0.03197236367973222	-0.48171806977503673	-0.3946235817157264	-0.2644218327365093	-0.3646771140830296	-0.5992092352897849	-0.1255556281939636	-0.21839699816895553	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr5:52405635..52405749,+__699.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr5:52405635..52405749,+__699.1.0.0	rs62621806	2.1111226543513926	2.5874725551458124	2.1648055836693447	1.7809362709104928	2.259424927793957	2.4082341442655117	2.165012763939663	2.101089551106766	2.222658200660399	2.4758319568966765	2.2448990474728845	2.3163117089043173	2.2364832804264343	1.4034677701466265	1.287524315957211	1.1926626952420132	1.1118743540785578	1.277451205961189	1.3420542823302721	1.1332883757952015	1.0272888928845638	1.0618348334142163	1.4515899119517095	1.2968508109858832	1.3243533276733719	1.2425200647017347	-0.7076548842047661	-1.2999482391886015	-0.9721428884273315	-0.6690619168319349	-0.9819737218327678	-1.0661798619352396	-1.0317243881444615	-1.0738006582222022	-1.1608233672461827	-1.024242044944967	-0.9480482364870013	-0.9919583812309454	-0.9939632157247001	0.000518603153423	3.86551195752e-07	1.89109819415e-07	0.00406065558642	1.05403470168e-07	2.70962217641e-07	4.38836124619e-06	6.31017334604e-07	5.8094165088e-08	5.29902344673e-07	1.75189286168e-06	1.06220766775e-05	4.3058698291e-56	0.367171032623	0.000287594089639	0.000140886815464	1	8.13714789701e-05	0.000207015134278	0.00324299896093	0.000458749602257	4.4906789613e-05	0.000415973340568	0.00134720561063	0.00827459773174	3.60831891678e-53	not sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr5:80597282..80597396,-__706.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr5:80597282..80597396,-__706.1.0.0	rs2291942	2.1074433228085603	2.3201048527680346	2.1675060226198983	2.0727266316482247	2.2151908096751534	2.13615425808467	2.1408772682752852	2.100543632222566	2.323166657458795	2.312466892973342	2.260448430184919	2.241716020234756	2.199862066579517	2.084565296412798	2.315077551122634	2.0194360233718505	1.9537433528687704	2.1249893128009663	2.0700818107291408	1.9632493311818104	2.0546396720879097	2.1766434189431454	1.9605556796184593	2.2408036758279355	2.276440675464201	2.1033521500358017	-0.02287802639576242	-0.005027301645400772	-0.14806999924804787	-0.11898327877945425	-0.0902014968741871	-0.0660724473555292	-0.1776279370934748	-0.04590396013465625	-0.14652323851564963	-0.35191121335488273	-0.01964475435698354	0.03472465522944512	-0.09650991654371528	0.468411351413	0.48504462162	0.232080506959	0.162586850726	0.132622250874	0.476688253492	0.110080523892	0.925117039075	0.476688253492	0.0286240283844	0.510582765025	0.412754243182	0.0767281690549	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr5:80597282..80597396,-__706.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr5:80597282..80597396,-__706.1.0.0	rs11955364	2.1074433228085603	2.3201048527680346	2.1675060226198983	2.0727266316482247	2.2151908096751534	2.13615425808467	2.1408772682752852	2.100543632222566	2.323166657458795	2.312466892973342	2.260448430184919	2.241716020234756	2.199862066579517	2.187397574369241	2.5675797545146013	2.295003118540542	2.153685834129723	2.3038538672569957	2.3730481283754195	2.2452354238034538	2.3309651464007732	2.503654517987838	2.5790701834265732	2.470742231896068	2.49684409846241	2.3755899899303032	0.07995425156068059	0.24747490174656672	0.12749709592064384	0.08095920248149824	0.08866305758184234	0.2368938702907495	0.10435815552816852	0.23042151417820733	0.18048786052904298	0.26660329045323117	0.2102938017111491	0.25512807822765415	0.1757279233507862	0.85089220831	0.66743649171	0.60051573606	0.706946403854	0.554657938956	0.158583637061	0.545696106059	0.158583637061	0.320413072024	0.158583637061	0.288805731951	0.276771967065	0.272928046151	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr5:80597282..80597396,-__706.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr5:80597282..80597396,-__706.1.0.0	rs62365038	2.1074433228085603	2.3201048527680346	2.1675060226198983	2.0727266316482247	2.2151908096751534	2.13615425808467	2.1408772682752852	2.100543632222566	2.323166657458795	2.312466892973342	2.260448430184919	2.241716020234756	2.199862066579517	0.730670630434936	0.7917427083992858	0.6853093046484569	0.5574207529093931	0.8755782939453642	0.7435292679882897	0.7559548321881937	0.9458151819830805	0.7951578895821927	0.836982417227886	0.8545858554582482	0.9028433270674361	0.7896325384860635	-1.3767726923736243	-1.5283621443687487	-1.4821967179714415	-1.5153058787388316	-1.3396125157297891	-1.3926249900963803	-1.3849224360870915	-1.1547284502394854	-1.5280087678766023	-1.4754844757454562	-1.4058625747266709	-1.3388726931673198	-1.4102295280934536	2.54565200622e-10	1.79534902262e-10	1.2865021608e-09	2.54565200622e-10	8.85463967688e-11	6.7731302312e-11	5.66002570384e-11	1.18322371712e-09	2.13858816101e-10	6.7731302312e-11	3.30166096949e-10	1.79534902262e-10	3.18558004408e-104	1.8023216204e-07	1.33573967283e-07	9.58444109798e-07	1.87614552858e-07	6.83578183055e-08	5.17467149664e-08	4.18275899513e-08	8.60203642343e-07	1.65312864846e-07	5.31690723149e-08	2.53897728554e-07	1.39857688862e-07	2.66951607694e-101	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr5:80597282..80597396,-__706.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr5:80597282..80597396,-__706.1.0.0	rs2291942,rs11955364,rs62365038	2.1074433228085603	2.3201048527680346	2.1675060226198983	2.0727266316482247	2.2151908096751534	2.13615425808467	2.1408772682752852	2.100543632222566	2.323166657458795	2.312466892973342	2.260448430184919	2.241716020234756	2.199862066579517	1.6673861809755675	1.9316814762445143	1.6935853891749257	1.5226678399161637	1.660772823769387	1.7291603501639354	1.7601149522818866	1.6700129090657305	1.8762108477745927	1.8498910679330924	1.8596748252746553	1.6805482175828867	1.741808906679778	-0.4400571418329928	-0.3884233765235203	-0.4739206334449726	-0.550058791732061	-0.5544179859057663	-0.40699390792073453	-0.3807623159933986	-0.4305307231568354	-0.44695580968420234	-0.46257582504024963	-0.4007736049102637	-0.5611678026518692	-0.458053159899739	0.000587432962331	0.00086866520518	0.000531799681309	3.14895644184e-05	3.38768884882e-06	7.77665488063e-06	0.00043495277549	0.00849533044186	0.000179550689913	0.000179550689913	9.86556518966e-05	7.46332826159e-05	1.97087225837e-35	0.113961994692	0.175470371446	0.105828136581	0.00595152767509	0.000694476214007	0.00156310763101	0.0869905550981	1	0.036987442122	0.0373465435018	0.0202244086388	0.0153744562189	4.47388002649e-33	not sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr5:80597302..80597416,-__707.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr5:80597302..80597416,-__707.1.0.0	rs2291942	2.1801124013736826	2.3121468918720227	2.1552323748022957	2.0022703936242334	2.065197539411291	2.1144711156293585	1.9403703851544414	2.1800953962566827	2.1021747311732906	2.1180588480251883	2.1403071542292866	2.063611167815724	2.1145040332806246	1.9910062580914465	2.1868597580695144	1.8640335683521785	1.7765245359937598	1.938522167414921	2.0916420347032068	1.7767775770649712	1.919893927187732	2.0159750207144773	2.097363787140812	2.1193030554788415	2.0422927328803757	1.985016201924353	-0.18910614328223607	-0.12528713380250833	-0.2911988064501172	-0.2257458576304736	-0.12667537199637025	-0.022829080926151768	-0.1635928080894702	-0.2602014690689507	-0.08619971045881325	-0.020695060884376115	-0.021004098750445177	-0.02131843493534813	-0.12948783135627173	0.30750859871	0.301187193336	0.104229562843	0.129198935732	0.226876581559	0.368322877114	0.183752894264	0.0531733827136	0.412754243182	0.320413072024	0.375513989452	0.405136064622	0.00856734298173	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr5:80597302..80597416,-__707.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr5:80597302..80597416,-__707.1.0.0	rs11955364	2.1801124013736826	2.3121468918720227	2.1552323748022957	2.0022703936242334	2.065197539411291	2.1144711156293585	1.9403703851544414	2.1800953962566827	2.1021747311732906	2.1180588480251883	2.1403071542292866	2.063611167815724	2.1145040332806246	2.003924252982668	2.298611025434588	1.8391037856916435	1.781279528297829	2.0681629046218912	2.054539138153761	2.0060108467711815	2.0484210196296115	2.2735621074826424	2.126379438930134	2.1475868189037577	2.1757484463399055	2.068610776103301	-0.17618814839101438	-0.013535866437434763	-0.3161285891106522	-0.22099086532640433	0.0029653652106000905	-0.05993197747559753	0.06564046161674009	-0.13167437662707115	0.17138737630935186	0.008320590904945746	0.007279664674471054	0.11213727852418165	-0.045893257177323656	0.452098798395	0.581967350665	0.21176555971	0.253736305913	0.554657938956	0.412754243182	0.648013768535	0.48504462162	0.978575937473	0.428242856315	0.609889042629	0.85089220831	0.722669340991	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr5:80597302..80597416,-__707.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr5:80597302..80597416,-__707.1.0.0	rs62365038	2.1801124013736826	2.3121468918720227	2.1552323748022957	2.0022703936242334	2.065197539411291	2.1144711156293585	1.9403703851544414	2.1800953962566827	2.1021747311732906	2.1180588480251883	2.1403071542292866	2.063611167815724	2.1145040332806246	1.1220994310517085	1.3646827119266984	1.0305129745444415	0.9282606772777731	1.2143266113157785	1.0216845831953882	1.1130993296135334	1.1549326062341605	1.2798198221739536	1.2424059206734583	1.3575541630973855	1.2213138865088695	1.1708910598010958	-1.058012970321974	-0.9474641799453243	-1.1247194002578542	-1.0740097163464604	-0.8508709280955127	-1.0927865324339703	-0.827271055540908	-1.0251627900225222	-0.8223549089993369	-0.87565292735173	-0.7827529911319011	-0.8422972813068543	-0.943612973479529	4.77393269186e-07	1.75892558936e-07	1.2780782346e-05	2.28582318034e-06	3.68889472684e-08	2.51442970215e-08	3.85703616239e-06	3.60162929514e-07	1.22116804654e-07	4.79198826066e-09	7.27316832781e-08	1.45948915094e-08	3.68799516292e-69	0.000337994434584	0.000130864063848	0.00952168284773	0.00168465168391	2.84782672912e-05	1.92102429244e-05	0.00285034972401	0.000261838449757	9.43962899972e-05	3.76171078462e-06	5.59306644408e-05	1.13694204858e-05	3.09053994653e-66	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr5:80597302..80597416,-__707.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr5:80597302..80597416,-__707.1.0.0	rs2291942,rs11955364,rs62365038	2.1801124013736826	2.3121468918720227	2.1552323748022957	2.0022703936242334	2.065197539411291	2.1144711156293585	1.9403703851544414	2.1800953962566827	2.1021747311732906	2.1180588480251883	2.1403071542292866	2.063611167815724	2.1145040332806246	1.783100730443486	2.0725923142789173	1.7212132635924935	1.5605446570151376	1.7595884016585601	1.8400748338084212	1.665272843532032	1.8729884747419727	1.827066492836478	1.8199064577856032	1.909338842968512	1.8677571717673764	1.8082870403690825	-0.3970116709301965	-0.2395545775931054	-0.4340191112098022	-0.44172573660909586	-0.305609137752731	-0.27439628182093734	-0.2750975416224093	-0.30710692151471	-0.27510823833681264	-0.29815239023958506	-0.23096831126077455	-0.1958539960483474	-0.3062169929115423	0.0134887989876	0.0258200569765	0.0276615481105	0.00220311126631	0.000481108176159	0.000715310039185	0.0296152123457	0.0240855495486	0.00567496309713	0.00357181666747	0.0145358169752	0.0201846528804	5.51641691352e-17	1	1	1	0.416388029333	0.0986271761126	0.143777317876	1	1	1	0.742937866833	1	1	1.25222663937e-14	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr5:80597330..80597444,-__708.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr5:80597330..80597444,-__708.1.0.0	rs2291942	3.1760098691083143	3.581301556779931	2.92363842377595	2.6863998172291796	3.0565485416693416	3.098206653307833	2.748441094602293	2.9996617744436955	3.1673029780356865	3.1776899219303125	3.1608051924756912	3.067943493482441	3.070329109736722	2.9886895027933083	3.3980639731493802	2.769354505665719	2.7043044724402514	2.9241784302771574	2.895194050580221	2.7111086211169657	2.9351668346533675	2.918944326667755	2.985572983181931	2.8531311754093447	2.9537221538803395	2.919785919151312	-0.18732036631500604	-0.18323758363055065	-0.1542839181102309	0.017904655211071763	-0.13237011139218424	-0.203012602727612	-0.03733247348532709	-0.06449493979032805	-0.24835865136793167	-0.19211693874838165	-0.30767401706634656	-0.11422133960210168	-0.15054319058541074	0.536806685117	0.840380101088	0.361218104761	0.76769033028	0.428242856315	0.320413072024	0.420456664513	0.978575937473	0.85089220831	0.88258056334	0.788281320858	0.554657938956	0.953183714134	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr5:80597330..80597444,-__708.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr5:80597330..80597444,-__708.1.0.0	rs11955364	3.1760098691083143	3.581301556779931	2.92363842377595	2.6863998172291796	3.0565485416693416	3.098206653307833	2.748441094602293	2.9996617744436955	3.1673029780356865	3.1776899219303125	3.1608051924756912	3.067943493482441	3.070329109736722	3.0614010027709933	3.549106117368721	2.8227360894493705	2.634723680029289	3.1201076868219086	3.089762870047421	2.5182955697379734	2.728485793892864	3.027316011975814	3.176969562481168	3.182376655062222	3.020017825509091	2.994274905428903	-0.11460886633732104	-0.032195439411209836	-0.10090233432657936	-0.051676137199890615	0.063559145152567	-0.008443783260411841	-0.23014552486431938	-0.2711759805508316	-0.1399869660598725	-0.0007203594491445031	0.021571462586530643	-0.04792566797335018	-0.07605420430781944	0.282745459933	0.967868733231	0.925117039075	0.925116184404	0.66743649171	0.88258056334	0.706946403854	0.563691144959	0.581967350665	0.925117039075	0.696989544957	0.460214637573	0.99318325333	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr5:80597330..80597444,-__708.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr5:80597330..80597444,-__708.1.0.0	rs62365038	3.1760098691083143	3.581301556779931	2.92363842377595	2.6863998172291796	3.0565485416693416	3.098206653307833	2.748441094602293	2.9996617744436955	3.1673029780356865	3.1776899219303125	3.1608051924756912	3.067943493482441	3.070329109736722	1.515957708979552	1.5609683511590275	1.4495317712316425	1.5460711771249893	1.7231426170907458	1.5830191686808568	1.4263842294367501	1.5018500397931402	1.597738194849026	1.6569193322400029	1.4854438795560019	1.6054565265799123	1.554373583060137	-1.6600521601287623	-2.0203332056209033	-1.4741066525443074	-1.1403286401041903	-1.3334059245785959	-1.5151874846269762	-1.3220568651655427	-1.4978117346505553	-1.5695647831866606	-1.5207705896903096	-1.6753613129196894	-1.4624869669025289	-1.515955526676585	6.61054563843e-09	1.06544395451e-08	1.43307835393e-06	1.84173011953e-05	2.71570845885e-08	9.09364429293e-09	2.60794292158e-06	2.71570845885e-08	3.46395922999e-09	2.51442970215e-08	1.39854909491e-09	2.15438690979e-08	4.45989209159e-76	4.68026631201e-06	7.92690302156e-06	0.00106764337368	0.0135735509809	2.09652693023e-05	6.9475442398e-06	0.00192726981905	1.97432004958e-05	2.67764048478e-06	1.97382731619e-05	1.07548425398e-06	1.67826740273e-05	3.73738957275e-73	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr5:80597330..80597444,-__708.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr5:80597330..80597444,-__708.1.0.0	rs2291942,rs11955364,rs62365038	3.1760098691083143	3.581301556779931	2.92363842377595	2.6863998172291796	3.0565485416693416	3.098206653307833	2.748441094602293	2.9996617744436955	3.1673029780356865	3.1776899219303125	3.1608051924756912	3.067943493482441	3.070329109736722	2.5022012714769284	2.964833887686629	2.3806457576599658	2.065148131239315	2.6093861928943642	2.5063036866226795	2.167880816673925	2.5172062028189135	2.382751052328474	2.5140072645507097	2.3182971033453863	2.595948446233133	2.4603841511275353	-0.6738085976313859	-0.6164676690933018	-0.5429926661159841	-0.6212516859898645	-0.4471623487749774	-0.5919029666851534	-0.5805602779283676	-0.48245557162478203	-0.7845519257072127	-0.6636826573796029	-0.842508089130305	-0.4719950472493082	-0.6099449586091872	0.000373410950373	0.00816548763477	0.00668210963275	0.00641629102443	0.000750988700281	0.00043495277549	0.00522462344006	0.00591301274865	0.000337013519112	0.00086866520518	0.000137117000352	0.00220311126631	9.87954858907e-25	0.0724417243724	1	1	1	0.153952683558	0.0874255078736	1	1	0.069424784937	0.180682362677	0.0281089850722	0.45384092086	2.24265752972e-22	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr5:90610184..90610298,-__717.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:90610184..90610298,-__717.1.0.0	rs116161964	1.4967087665771075	1.4807925395075026	1.48027407993653	1.4135290594407082	1.5475251889691617	1.4544652288584339	1.0113019253019864	0.9536224277000463	1.0619554153171868	1.2640808144246731	1.3006887970834604	1.3820575628262122	1.3205834838285841	1.4676987975807847	1.643067048263934	1.6998955714359223	1.4240714499334823	1.4882350171934453	1.5293111748989852	1.0056053573179016	1.0255218043677623	1.1137384934903358	1.3572856141739598	1.3660279518259744	1.234317865119397	1.3628980121334902	-0.0290099689963228	0.16227450875643146	0.21962149149939236	0.010542390492774167	-0.05929017177571638	0.07484594604055128	-0.005696567984084799	0.07189937666771595	0.05178307817314898	0.09320479974928664	0.06533915474251395	-0.14773969770681528	0.04231452830490629	0.501992688725	0.925117039075	0.405136064622	0.628827692687	0.967868733231	0.648013768535	0.819442862795	0.882579228976	0.428242856315	0.957167318493	0.914457985151	0.76769033028	0.996959710347	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr5:9546244..9546358,+__720.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr5:9546244..9546358,+__720.1.0.0	rs112536265	-0.9599869708428264	-0.2544192313058288	-0.21430648644228856	-0.8048556262994856	-0.5057349775077489	-2.091218282695486	-2.195279309808314	0.7338771622000948	-0.6744542959688161	-0.3890861136777388	-0.09934605097851032	-2.1979987708559823	-0.804400746181911	-0.6109431892420167	-0.259480392009677	0.39082928459714283	-0.2022266015841511	-0.4694464668356243	-0.32011052357719466	-0.6793976302658279	-1.320308269828174	-0.5482652422393062	-0.27793426688204265	-0.07813053738913965	-0.2634010195556311	-0.38656790456763684	0.3490437816008096	-0.005061160703848211	0.6051357710394314	0.6026290247153345	0.036288510672124574	1.7711077591182915	1.515881679542486	-2.0541854320282686	0.12618905372950995	0.11115184679569617	0.02121551358937067	1.9345977513003512	0.41783284161427403	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr5:9546244..9546358,+__720.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr5:9546244..9546358,+__720.1.0.0	rs181074606,rs112536265	-0.9599869708428264	-0.2544192313058288	-0.21430648644228856	-0.8048556262994856	-0.5057349775077489	-2.091218282695486	-2.195279309808314	0.7338771622000948	-0.6744542959688161	-0.3890861136777388	-0.09934605097851032	-2.1979987708559823	-0.804400746181911	-0.4157088531847573	-0.24650225819981544	-0.02146570009419757	1.0311877381112793	0.1609959830046431	0.3403644689899155	-0.4221515921165333	0.7111925318374649	-0.5759336979403213	-0.15237918123043226	-0.2631894389132336	-0.7818224483962868	-0.052951037344356244	0.5442781176580691	0.00791697310601333	0.192840786348091	1.8360433644107648	0.666730960512392	2.4315827516854016	1.7731277176917806	-0.02268463036262991	0.09852059802849478	0.23670693244730656	-0.16384338793472328	1.4161763224596955	0.7514497088375546	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr5:9546328..9546442,+__721.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:9546328..9546442,+__721.1.0.0	rs530742203	0.3314238913674196	-0.055415302873556616	-0.6042564968504407	0.06657630116836782	0.15628822370125484	-0.016199302025603157	0.3612363022878008	0.1220671640400958	0.3832512983752487	-0.4904499138245574	-0.2531355192716007	-0.10675273454788996	-0.00878050737112176	-0.17270491627432122	-0.6632737688056238	-0.13551722601449417	-0.1454839426548832	-0.0012117053155514257	-0.5288804909528425	0.20284267786592794	-0.23123158247203726	-0.2231621443669364	-0.7079224292174051	0.10724313366266515	-0.280467879475104	-0.23164752283505052	-0.5041288076417408	-0.6078584659320672	0.4687392708359465	-0.21206024382325103	-0.15749992901680626	-0.5126811889272394	-0.15839362442187285	-0.35329874651213306	-0.6064134427421851	-0.21747251539284773	0.36037865293426585	-0.17371514492721402	-0.22286701546392873	0.737113058664	0.428242856315	0.468411351413	0.76769033028	0.829894465792	0.397602565759	0.501992688725	0.667432913386	0.554657938956	0.983930924304	0.226876581559	0.253736305913	0.815026281294	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr5:9546328..9546442,+__721.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:9546328..9546442,+__721.1.0.0	rs59758866	0.3314238913674196	-0.055415302873556616	-0.6042564968504407	0.06657630116836782	0.15628822370125484	-0.016199302025603157	0.3612363022878008	0.1220671640400958	0.3832512983752487	-0.4904499138245574	-0.2531355192716007	-0.10675273454788996	-0.00878050737112176	-0.7265796827712845	-0.3331117979187732	-0.607678562014131	-0.4912988023957332	-0.22906697785585833	-0.15382281578138435	-0.8863815349221721	-0.9134911780038976	-0.6252729862031362	-0.5826181463165344	-0.2202123276411306	-0.7319895866511908	-0.5417936998729355	-1.0580035741387042	-0.2776964950452166	-0.0034220651636902577	-0.557875103564101	-0.38535520155711317	-0.1376235137557812	-1.2476178372099729	-1.0355583420439933	-1.0085242845783848	-0.09216823249197703	0.03292319163047011	-0.6252368521033009	-0.5330131925018139	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr5:9546328..9546442,+__721.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:9546328..9546442,+__721.1.0.0	rs530742203,rs59758866	0.3314238913674196	-0.055415302873556616	-0.6042564968504407	0.06657630116836782	0.15628822370125484	-0.016199302025603157	0.3612363022878008	0.1220671640400958	0.3832512983752487	-0.4904499138245574	-0.2531355192716007	-0.10675273454788996	-0.00878050737112176	0.4257324346638191	0.6059626733861632	0.4322717690441957	0.2794461441696278	0.6803904285272426	1.0096048013950558	0.37300288173579327	0.05060405849717127	-0.5584120802145474	0.4031308979744909	0.35008770411881424	0.020119684437406544	0.3393284498112694	0.09430854329639948	0.6613779762597198	1.0365282658946364	0.21286984300126	0.5241022048259878	1.025804103420659	0.011766579447992476	-0.07146310554292452	-0.9416633785897961	0.8935808117990482	0.6032232233904149	0.1268724189852965	0.34810895718239127	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr5:98109106..98109220,-__722.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr5:98109106..98109220,-__722.1.0.0	rs1508792	-1.1476483935506363	-1.0897280876008648	-1.390958027292072	-1.0619392060322774	-0.9910162952636272	-1.4073770459417803	-1.620557734133559	-1.5113032500025962	-1.6102339352389468	-1.4504109492922093	-1.0729170486165136	-1.2130917969854251	-1.2972651474958756	-1.7843482766190892	-0.9280100541541082	-1.6526950285889714	-1.2960316302195491	-1.5768632477131568	-1.6249013011886355	-1.2287937544370728	-1.5051420703104574	-1.6661911558160956	-1.2827483640346788	-1.4517298063849013	-1.4803159943033155	-1.4564808903141693	-0.6366998830684529	0.16171803344675661	-0.26173700129689936	-0.23409242418727172	-0.5858469524495296	-0.21752425524685526	0.39176397969648624	0.006161179692138807	-0.0559572205771488	0.16766258525753042	-0.37881275776838774	-0.2672241973178904	-0.15921574281829365	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr6:10435005..10435119,-__725.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr6:10435005..10435119,-__725.1.0.0	rs35115063	-1.48431047310239	-1.041417577486486	-1.0190527540186387	-1.5799689570689004	-1.286292503572857	-1.1861756120175746	-1.1804095276638984	-0.9900939973587092	-1.4949905272630222	-1.1732565045040622	-1.158995980793157	-1.198258168345543	-1.2327685485996032	-1.4635955023072114	-1.5591809184354164	-1.4776282063402333	-1.4401618038530608	-1.5141461817176596	-1.2645735240185223	-1.4988243889670523	-1.737893585498743	-1.2875882382826185	-1.4029656755358944	-1.508736517922098	-1.3758489727290029	-1.4609286263006258	0.02071497079517859	-0.5177633409489304	-0.4585754523215946	0.13980715321583959	-0.22785367814480262	-0.0783979120009477	-0.3184148613031539	-0.7477995881400338	0.2074022889804037	-0.2297091710318322	-0.34974053712894104	-0.17759080438345975	-0.22816007770102287	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr6:114317039..114317153,+__730.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr6:114317039..114317153,+__730.1.0.0	rs4551200	-1.6528136875700796	-1.4400991749891876	-1.2040942430632184	-1.2813288136195853	-1.6460735103745914	-1.4110064686221802	-1.2211632194935367	-1.5472884768460697	-1.4833918367789496	-1.2286310209644056	-1.3048467334485887	-1.487432658966845	-1.4090141537281031	-1.257637143733604	-1.2545759058099175	-1.2033630181081092	-0.8860204628234561	-1.545409371140542	-1.4871250765764206	-1.6675355170596353	-1.2098176194730617	-1.192014107490428	-1.640105681666386	-1.5798786081654739	-1.6063438476329146	-1.377485529973329	0.3951765438364756	0.1855232691792701	0.0007312249551092442	0.39530835079612914	0.10066413923404927	-0.07611860795424041	-0.44637229756609864	0.3374708573730081	0.29137772928852157	-0.41147466070198035	-0.27503187471688517	-0.11891118866606964	0.031528623754774075	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr6:135818912..135819026,+__733.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr6:135818912..135819026,+__733.1.0.0	rs13197301	-1.3380618735273269	-0.4370375842448506	-0.6287303633565863	-0.4399378107252603	-1.8425211977168392	0.02763391739480041	-1.2502263235906346	-0.5535950471398826	-0.6748054201169292	-0.5297134687409748	-1.418733705027722	-0.9309835540266376	-0.8347260359015704	0.2802419184778099	0.25956443317304445	0.2029025239640563	-0.28763800059420874	-0.18096692182754437	-0.3167976710845408	-1.3572160037658882	0.06837007656964134	-1.050832091745959	-0.03296069584795528	-1.0280797841074516	-1.0517026037391737	-0.3745929017106808	1.6183037920051366	0.6966020174178951	0.8316328873206426	0.15229981013105154	1.6615542758892947	-0.34443158847934124	-0.10698968017525368	0.621965123709524	-0.3760266716290298	0.4967527728930195	0.3906539209202704	-0.12071904971253611	0.4601331341908894	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr6:147453054..147453168,-__734.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr6:147453054..147453168,-__734.1.0.0	rs78794591	-0.7313388038895121	-0.7206647272268228	-0.9557564925515782	-0.9417189726344756	-1.3872665680729392	-1.0645423718739448	-0.7836462097151049	-0.46386695232174535	-0.5405251315070128	-0.70052989849516	-0.8218214158040293	-1.1575531353906152	-0.8557692232902451	-0.8233009581964499	-1.0095915209464597	-1.0843635698545842	-0.7067758282131962	-1.033220887917992	-1.16504229979365	-1.1586820232612525	-0.582243461338588	-0.6630864212646	-1.0270854415962711	-0.7371096355190256	-1.0578786427047862	-0.9206983908839046	-0.09196215430693777	-0.2889267937196368	-0.1286070773030059	0.2349431444212794	0.3540456801549472	-0.10049992791970519	-0.37503581354614757	-0.1183765090168426	-0.12256128975758729	-0.3265555431011111	0.0847117802850037	0.09967449268582906	-0.06492916759365958	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.221756412245	0.677233097055	0.0932701621097	0.460214637573	NA__no_active_tile	0.193920945353	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr6:149353715..149353829,-__735.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr6:149353715..149353829,-__735.1.0.0	rs6904550	-0.9132014228914216	-0.8039164807208969	-0.7256817535248369	-0.6478302874969311	-0.6809577233198912	-0.8101738750315342	-0.8077383157060849	-0.7059240851682079	-0.7779139495156269	-0.7174857608632812	-0.7117422264311994	-0.7591851812895443	-0.7551459218299548	-1.2332741307159407	-1.0253240501245249	-0.859978673902027	-1.3633600810994788	-1.065124003402195	-0.9969274834089243	-1.178875990639541	-0.6855464969709829	-1.2577418384647812	-0.9233856998526209	-0.7681536531865936	-1.0367666589473756	-1.0328715633929155	-0.32007270782451913	-0.22140756940362794	-0.1342969203771901	-0.7155297936025478	-0.3841662800823037	-0.1867536083773902	-0.37113767493345606	0.020377588197225016	-0.4798278889491543	-0.20589993898933967	-0.05641142675539412	-0.27758147765783137	-0.27772564156296076	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0741297894045	0.48504462162	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.21176555971	0.845630974801	NA__no_active_tile	0.263425707633	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr6:153304788..153304902,+__737.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr6:153304788..153304902,+__737.1.0.0	rs116821303	0.7791355294677424	1.0470020108512352	0.4825248160817193	0.6615337501967795	0.9201459961927689	0.3815383315359262	0.5246413024418538	0.40126614336077643	0.03685549802873905	0.6108679357912618	0.9560808757784226	0.4141475426635851	0.6013116443659009	0.8004680896682639	0.9639134525537612	0.38129617605246374	0.2463795911025164	0.3861329640008495	1.0009370104497248	0.5725701061428858	0.7926012156144809	0.6033663018648745	0.6569640066498202	1.2403396090320902	0.815310900047427	0.70502328526493	0.021332560200521433	-0.08308855829747408	-0.10122864002925558	-0.4151541590942631	-0.5340130321919194	0.6193986789137986	0.04792880370103203	0.3913350722537045	0.5665108038361355	0.04609607085855849	0.2842587332536676	0.4011633573838419	0.103711640899029	0.711937525478	0.87199428352	0.8931878581	0.317148697424	0.282739949934	0.0763307839553	0.88258056334	0.856156710108	0.0592197583223	0.276771967065	0.935789553219	0.60051573606	0.749440429072	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr6:19804948..19805062,-__741.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr6:19804948..19805062,-__741.1.0.0	rs6456272	-0.5231089324251417	-0.9741326248149599	-0.18295460961028742	-0.053063097211432764	-0.10353446761639448	-0.8321464005136708	-0.07808912229568732	-0.6651044478336956	-1.1017092291749242	-0.6094980669580081	-0.9865931449857742	-0.70251782654274	-0.5677043308318931	-1.0448757703203957	-1.0033307337540984	-0.9694113682608216	-0.7640428888940596	-0.9803847487772751	-1.0847512237912913	-0.9221521448671672	-1.0948818171390102	-0.8984674426692882	-0.7754575537953734	-1.03483731796749	-1.0680125996486125	-0.9700504674904069	-0.521766837895254	-0.029198108939138545	-0.7864567586505342	-0.7109797916826268	-0.8768502811608806	-0.25260482327762046	-0.8440630225714799	-0.4297773693053146	0.20324178650563596	-0.16595948683736528	-0.04824417298171568	-0.36549477310587253	-0.4023461366585139	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr6:29716780..29716894,-__744.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr6:29716780..29716894,-__744.1.0.0	rs114419664	0.4527600504548441	0.6500304398359824	0.5888216884014496	0.44809147277374106	0.5023200230538153	0.5522003815685869	0.7796342855298626	0.6688193190876389	0.6570145953351676	0.5633450414572941	0.4922390860720803	0.7544702712111432	0.5924788878984673	0.3730490596978071	0.7150686910164878	0.4992618442610513	0.5079962408034949	0.6053263058319698	0.6452652736056255	0.8425035792013951	0.9700194654527128	0.7718479561552092	0.6918857511195418	0.7591394351041478	0.671042833978135	0.6710338696856315	-0.07971099075703697	0.06503825118050544	-0.08955984414039825	0.05990476802975386	0.10300628277815449	0.0930648920370386	0.06286929367153249	0.30120014636507386	0.11483336082004159	0.12854070966224762	0.26690034903206755	-0.08342743723300816	0.07855498178716434	0.248198866138	0.696989544957	0.79863356553	0.581967350665	0.527990680582	0.861430881609	0.978575937473	0.510582765025	0.510582765025	0.935789553219	0.66743649171	0.609889042629	0.966535263227	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr6:29716780..29716894,-__744.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr6:29716780..29716894,-__744.1.0.0	rs1633082	0.4527600504548441	0.6500304398359824	0.5888216884014496	0.44809147277374106	0.5023200230538153	0.5522003815685869	0.7796342855298626	0.6688193190876389	0.6570145953351676	0.5633450414572941	0.4922390860720803	0.7544702712111432	0.5924788878984673	0.4001292454207616	0.7852201094647487	0.7747496056838458	0.4804817720965147	0.6961196198970279	0.683629709699722	0.7137891153510236	0.8896866868198283	0.7973868302123791	0.6891992008969203	0.6721585956506453	0.7391012564320159	0.693470978968786	-0.05263080503408246	0.13518966962876633	0.18592791728239622	0.03239029932277365	0.19379959684321257	0.13142932813113517	-0.06584517017883895	0.2208673677321894	0.1403722348772115	0.1258541594396262	0.179919509578565	-0.015369014779127332	0.10099209107031897	0.757455001208	0.30750859871	0.170821264488	0.29495293544	0.154655491485	0.397602565759	0.619326784864	0.197395731844	0.259370210024	0.63839046467	0.340423946445	0.397602565759	0.119430732708	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr6:29716780..29716894,-__744.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr6:29716780..29716894,-__744.1.0.0	rs117543560	0.4527600504548441	0.6500304398359824	0.5888216884014496	0.44809147277374106	0.5023200230538153	0.5522003815685869	0.7796342855298626	0.6688193190876389	0.6570145953351676	0.5633450414572941	0.4922390860720803	0.7544702712111432	0.5924788878984673	0.2676013305042356	0.7854535448717073	0.6296684442036525	0.3870970941870985	0.6031600635232206	0.5309204057244825	0.6797780848679102	0.8053174748584144	0.8708033194127295	0.8493894719565322	0.7774090329207797	0.8154983510069532	0.6668413848364764	-0.18515871995060845	0.13542310503572486	0.04084675580220298	-0.060994378586642584	0.10084004046940531	-0.02127997584410435	-0.09985620066195233	0.1364981557707755	0.2137887240775619	0.2860444304992381	0.2851699468486994	0.06102807979581004	0.07436249693800921	0.536806685117	0.90381429355	0.757455001208	0.925117039075	0.871992830865	0.967868733231	0.382791178922	0.706946403854	0.361218104761	0.476688253492	0.706946403854	0.706946403854	0.984159616013	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr6:29716780..29716894,-__744.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr6:29716780..29716894,-__744.1.0.0	rs114419664,rs1633082,rs117543560	0.4527600504548441	0.6500304398359824	0.5888216884014496	0.44809147277374106	0.5023200230538153	0.5522003815685869	0.7796342855298626	0.6688193190876389	0.6570145953351676	0.5633450414572941	0.4922390860720803	0.7544702712111432	0.5924788878984673	0.4846783722939008	0.638921211423302	0.660871642698322	0.5158146504278125	0.6874623347443911	0.7121750746636746	0.6675526460801189	0.9524108327034847	0.7586355591951295	0.7670241443055518	0.7865629660988211	0.7624247370771313	0.6995445143093034	0.03191832183905674	-0.011109228412680361	0.07204995429687244	0.06772317765407143	0.18514231169057582	0.15997469309508772	-0.1120816394497437	0.2835915136158458	0.10162096385996189	0.20367910284825763	0.29432388002674087	0.007954465865988136	0.10706562641083621	0.989287003123	0.967868733231	0.747262025795	0.468411351413	0.237368605078	0.609889042629	0.333666485083	0.493479697885	0.554657938956	0.946473618223	0.444064484515	0.737113058664	0.960831895056	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr6:30028899..30029013,-__745.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr6:30028899..30029013,-__745.1.0.0	rs7770505	2.0227426609322023	2.3268576868942676	2.040173084841661	1.9176749285142036	2.120515966134986	2.2110412241229724	1.790413646474607	2.088737509875867	2.074244351278592	2.2212946498765707	2.25179673564737	2.129773401988821	2.0996054872151766	2.0116373076672827	2.3656898100744264	1.930366600688949	1.8348719723476745	2.0979514638320715	1.907864996839109	1.62466885670703	1.859975439188156	2.1159482964565663	2.0681880815347133	2.158858813366435	2.2202617057809837	2.0163569453736168	-0.011105353264919682	0.03883212318015872	-0.10980648415271199	-0.08280295616652911	-0.022564502302914402	-0.3031762272838634	-0.165744789767577	-0.22876207068771093	0.041703945177974155	-0.15310656834185732	-0.09293792228093478	0.09048830379216266	-0.08324854184156026	1.0	0.861430881609	0.819442862795	0.747262025795	0.757455001208	0.716953652062	0.628827692687	0.122558611289	0.90381429355	0.88258056334	0.727009731456	0.935789553219	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr6:30294128..30294242,-__747.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr6:30294128..30294242,-__747.1.0.0	rs114052920	1.6881466934020453	2.1009684350104103	1.5745496590858434	1.429522953154698	1.8157515182469464	1.8603382708108016	1.726957119097829	1.8157937398823107	1.863068558536715	1.8393618874729172	1.8128861855548513	2.0083479408091227	1.7946410800887078	1.6075483744950234	2.042022181844178	1.4469739031764337	1.4463578454495871	1.8730724666762057	1.9044796172997493	1.6917291874401306	1.9394156617072928	1.8449161867736001	2.0244629013036244	1.8853017531526308	1.9475887546109893	1.8044890694941207	-0.08059831890702185	-0.05894625316623214	-0.12757575590940973	0.016834892294889103	0.05732094842925939	0.04414134648894774	-0.03522793165769844	0.1236219218249821	-0.018152371763114905	0.1851010138307072	0.07241556759777956	-0.060759186198133364	0.00984798940541289	0.706946403854	0.619326784864	0.60051573606	0.79863356553	0.476688253492	0.60051573606	0.819442862795	0.527990680582	0.727009731456	0.493479697885	0.527990680582	0.563691144959	0.87214821364	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr6:4021366..4021480,-__751.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr6:4021366..4021480,-__751.1.0.0	rs58275491	-0.01438231818742327	0.5410576802911952	0.05716653036649937	0.19423464236541274	0.11055159667943182	0.2597910086344993	0.1584171872022732	0.17908376552682626	0.5255535698550413	0.03772502487181375	0.3842584583768472	0.08123045451506568	0.2095573000414569	0.7375949172315872	0.657837618737078	0.11859184903722607	0.3694752329704756	0.41081613027845504	0.2567939391669889	0.2690827837518334	0.5104615602717478	0.5226905028736399	0.5790572807978337	0.4604704180405952	0.5332938102872151	0.45218050362038964	0.7519772354190105	0.11677993844588286	0.061425318670726696	0.17524059060506283	0.3002645335990232	-0.0029970694675103826	0.11066559654956021	0.33137779474492157	-0.0028630669814013743	0.54133225592602	0.076211959663748	0.45206335577214946	0.24262320357893277	0.216719559135	0.125844655769	0.809021331888	0.262162010841	0.166665831608	0.60051573606	0.420456664513	0.554653407081	0.527990680582	0.0194743211566	0.716953652062	0.170821264488	0.0811944491199	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr6:41513910..41514024,-__752.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr6:41513910..41514024,-__752.1.0.0	rs4714477	-1.1717778340108411	-0.7296429224173433	-0.6627338469286007	-0.6890261016303751	-0.7611276074709449	-0.8525072511271463	-0.7939491355458941	-0.714583711575158	-1.007572959544739	-0.7842088920488408	-0.848756863823916	-0.8092855547056861	-0.8187643900691238	-0.7456844409634924	-0.21923177300592445	-0.4076523298516014	-0.6707811160678232	-0.5654898208685858	-0.6614450364586494	-0.4044649549478033	-0.2598706705506196	-0.8572012445345054	-0.8714058365910818	-0.4637410646220238	-0.5002263817932548	-0.5522662225212804	0.4260933930473487	0.5104111494114189	0.25508151707699933	0.01824498556255194	0.1956377866023591	0.19106221466849693	0.38948418059809076	0.4547130410245384	0.1503717150102335	-0.08719694454224103	0.3850157992018922	0.30905917291243123	0.26649816754784333	NA__no_active_tile	0.361218104761	0.265084565602	0.536806685117	0.340423946445	0.436112310787	0.405136064622	0.545696106059	NA__no_active_tile	0.545691508224	0.682148641351	0.572794651112	0.398188744658	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr6:73972891..73973005,+__757.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr6:73972891..73973005,+__757.1.0.0	rs510551	0.734963374661705	-0.5883193808911704	-1.4524646855432846	-1.9176664397343473	-0.2697362515420027	-0.7594904625637711	-0.18214930602266383	0.05895930264112659	-0.3349853232768575	-1.3657882976708018	-1.0357881747076565	-0.8073914491529874	-0.6599880911502259	-1.6583448857893563	0.2425017599887918	0.30077468892391573	-0.7681958088445073	0.17353648305824074	0.5588224992239597	0.8316842062129881	0.1815142625171545	0.2997089985843599	-1.4453598587716112	0.028598496040862436	0.16040827548922118	-0.09119590694716508	-2.3933082604510614	0.8308211408799622	1.7532393744672004	1.14947063088984	0.4432727346002434	1.3183129617877307	1.0138335122356519	0.12255495987602791	0.6346943218612173	-0.07957156110080943	1.064386670748519	0.9677997246422086	0.5687921842030609	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr6:73972891..73973005,+__757.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr6:73972891..73973005,+__757.1.0.0	rs35806061	0.734963374661705	-0.5883193808911704	-1.4524646855432846	-1.9176664397343473	-0.2697362515420027	-0.7594904625637711	-0.18214930602266383	0.05895930264112659	-0.3349853232768575	-1.3657882976708018	-1.0357881747076565	-0.8073914491529874	-0.6599880911502259	0.3392229230564129	-0.4109664997476862	0.2926806735275801	-0.8864616917706764	-0.4302549587461276	0.30209073861692126	0.4750442988997801	0.3580290249018501	0.2680865370674911	0.3248578583155239	-0.25051385579208385	-0.5600950033123859	-0.01485666291528337	-0.39574045160529214	0.17735288114348424	1.7451453590708645	1.0312047479636708	-0.16051870720412492	1.0615812011806924	0.6571936049224439	0.29906972226072354	0.6030718603443486	1.6906461559863257	0.7852743189155726	0.2472964458406015	0.6451314282349425	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr6:73972891..73973005,+__757.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr6:73972891..73973005,+__757.1.0.0	rs510551,rs35806061,rs115202371	0.734963374661705	-0.5883193808911704	-1.4524646855432846	-1.9176664397343473	-0.2697362515420027	-0.7594904625637711	-0.18214930602266383	0.05895930264112659	-0.3349853232768575	-1.3657882976708018	-1.0357881747076565	-0.8073914491529874	-0.6599880911502259	0.25854047209732184	-0.08955465856019595	0.3646128560290819	-0.2253519119849247	0.6649640879789056	0.09087466769534708	1.515895187571692	2.073580945131142	0.7333951571788008	0.4380705125253229	2.1456708811324474	-0.01257035869481593	0.6631773198416769	-0.4764229025643832	0.49876472233097446	1.8170775415723663	1.6923145277494225	0.9347003395209084	0.8503651302591182	1.6980444935943557	2.0146216424900154	1.0683804804556583	1.8038588101961248	3.181459055840104	0.7948210904581715	1.323165410991903	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr6:96969541..96969655,-__761.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr6:96969541..96969655,-__761.1.0.0	rs4839844	2.4609656115134313	2.5574697030990667	2.162160271257701	2.0831271345619413	2.431794195444944	2.383172418485555	2.438877232137814	2.7643919999833413	2.3789172801001555	2.7066193555742792	2.4759660239423837	2.4727611764556556	2.4430185335463555	2.5126562073617333	2.492403809211522	2.2055505035980665	2.1305215095919188	2.339258735419399	2.597702774207747	2.273483344684813	2.1489902582234084	2.47517224030737	2.68874404495228	2.6749445650632486	2.4906847780092174	2.419176064219227	0.051690595848302046	-0.06506589388754458	0.04339023234036565	0.047394375029977454	-0.09253546002554458	0.21453035572219203	-0.1653938874530012	-0.6154017417599329	0.09625496020721469	-0.01787531062199932	0.19897854112086488	0.017923601553561763	-0.023842469327128673	0.614595886613	0.677233097055	0.390154148302	0.527990680582	0.536806685117	0.628827692687	0.737113058664	0.85089220831	0.568229750021	0.527990680582	0.313917214294	0.648013768535	0.788518222258	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr6:96969541..96969655,-__761.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr6:96969541..96969655,-__761.1.0.0	rs112373805	2.4609656115134313	2.5574697030990667	2.162160271257701	2.0831271345619413	2.431794195444944	2.383172418485555	2.438877232137814	2.7643919999833413	2.3789172801001555	2.7066193555742792	2.4759660239423837	2.4727611764556556	2.4430185335463555	2.2710787178013323	2.7103932952413263	2.293014688072218	2.23064063256224	2.262931791712311	2.4950026072878946	2.1204641259092045	2.8212256156173043	2.4923951900654284	2.588678728775406	2.6596551530178347	2.6534146669544736	2.466574601084748	-0.189886893712099	0.1529235921422596	0.13085441681451737	0.14751349800029878	-0.16886240373263295	0.11183018880233941	-0.3184131062286095	0.05683361563396305	0.11347790996527296	-0.11794062679887318	0.18368912907545099	0.18065349049881796	0.023556067538392123	0.172918025013	0.536806685117	0.935789553219	0.66743649171	0.100001742422	0.320413072024	0.0919640516447	0.63839046467	0.476688253492	0.788281320858	0.468411351413	0.957167318493	0.58701663984	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr6:96969541..96969655,-__761.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr6:96969541..96969655,-__761.1.0.0	rs76029328	2.4609656115134313	2.5574697030990667	2.162160271257701	2.0831271345619413	2.431794195444944	2.383172418485555	2.438877232137814	2.7643919999833413	2.3789172801001555	2.7066193555742792	2.4759660239423837	2.4727611764556556	2.4430185335463555	2.4041317087685745	2.694027191844385	2.531668709450631	2.1339446338304118	2.278862296485513	2.5110461218281275	2.4583575856052478	2.384508539694121	2.5184305782210767	2.4992456384580364	2.497100712724941	2.5511664903615148	2.455207517272715	-0.05683390274485678	0.13655748874531826	0.3695084381929301	0.050817499268470456	-0.1529318989594306	0.1278737033425723	0.01948035346743371	-0.3798834602892205	0.13951329812092128	-0.20737371711624286	0.0211346887825572	0.07840531390585914	0.012188983726359312	0.397580955911	0.840380101088	0.757455001208	0.687084607526	0.382791178922	0.809021331888	0.48504462162	0.21176555971	0.609889042629	0.276771967065	0.711940675829	0.90381429355	0.822923546934	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr6:96969541..96969655,-__761.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr6:96969541..96969655,-__761.1.0.0	rs4839844,rs112373805,rs76029328	2.4609656115134313	2.5574697030990667	2.162160271257701	2.0831271345619413	2.431794195444944	2.383172418485555	2.438877232137814	2.7643919999833413	2.3789172801001555	2.7066193555742792	2.4759660239423837	2.4727611764556556	2.4430185335463555	2.188627434135245	2.76901974189432	2.314648515791963	2.245910130424289	2.361747809026789	2.391085998581251	2.344192176972311	2.501901082664673	2.4704215726837635	2.6428601228258337	2.6294846877892817	2.5031824202502904	2.4469234744200006	-0.27233817737818633	0.21155003879525314	0.15248824453426213	0.16278299586234768	-0.07004638641815486	0.00791358009569576	-0.09468505516550296	-0.26249091731866825	0.09150429258360804	-0.06375923274844553	0.15351866384689794	0.030421243794634734	0.003904940873645124	0.130897505822	0.687084607526	0.809021331888	0.809021331888	0.536806685117	0.545696106059	0.197395731844	0.0698833862508	0.648010011537	0.66743649171	0.687084607526	0.581967350665	0.557489449084	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr7:100942814..100942928,+__765.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:100942814..100942928,+__765.1.0.0	rs117428073	-0.1255605094950415	-0.3255970639812452	-0.18085332588865646	-0.21644861922663797	-0.4664114902331481	-0.4330736525658589	-0.3647068969051474	-0.4409609144587278	-0.2938981799861946	-0.2872921534489597	-0.27116480150321826	-0.3962997861733211	-0.31685561615551305	0.0490145130986813	0.31434124491664217	-0.06627560501230652	-0.042292903797588544	-0.15631459174201115	0.18793668262718446	-0.07588133811738898	-0.02250228329337744	0.20524496876464615	0.1258973858441324	0.07525873558018818	0.05663359821330102	0.05425503392350859	0.1745750225937228	0.6399383088978874	0.11457772087634994	0.17415571542904942	0.310096898491137	0.6210103351930434	0.2888255587877584	0.41845863116535037	0.49914314875084076	0.4131895392930921	0.34642353708340645	0.4529333843866221	0.3711106500790216	0.460214637573	0.0638899216795	0.170821264488	0.154655491485	0.154655491485	0.00275115621019	0.188220673538	0.0374147936077	0.00406065558642	0.0426112802219	0.0174727290303	0.00300328973882	1.31962041363e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1.10584190662e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr7:112635647..112635761,-__768.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:112635647..112635761,-__768.1.0.0	rs6952403	-1.9618487944466692	-1.6471581491836271	-1.3987003259803872	-1.8424656634895675	-1.5637044433269316	-1.7075982600955697	-1.8149814859285305	-1.626987897505927	-1.7081001764623276	-1.6246349803516695	-1.911607696581151	-1.7873709125281865	-1.716263232156712	-1.5596111103015005	-1.8255015109488277	-2.242523584494856	-1.8607231879058093	-1.6392695070726953	-1.5106738527658805	-1.6754119955739877	-1.87263149576678	-1.8914260609641111	-1.4745311166222983	-2.1936749087080534	-1.6971811011161049	-1.786929952686742	0.4022376841451687	-0.1783433617652006	-0.8438232585144687	-0.018257524416241733	-0.07556506374576366	0.1969244073296892	0.1395694903545428	-0.2456435982608529	-0.18332588450178355	0.15010386372937123	-0.28206721212690233	0.0901898114120816	-0.07066672053003	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr7:116594305..116594419,-__769.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr7:116594305..116594419,-__769.1.0.0	rs73473262	-0.7125719687326094	-0.9804607460545971	-0.6812819837848555	-0.4667759707825034	-0.8013014581962569	-0.8504309804296092	-0.7795495036625425	-0.5330094118369333	-0.8496184019784976	-0.8001664830555565	-0.8214947256636628	-0.762798658820607	-0.7532883577498525	-0.7647778748229799	-0.7485559003038689	-0.8214746220338516	-0.850957405463805	-0.822342261035256	-0.9820318485688968	-0.5441813045661218	-0.9468578523596096	-0.8438614968017001	-0.3939860498964085	-0.6077322800884232	-0.703926892125365	-0.7525571490055238	-0.05220590609037046	0.23190484575072823	-0.14019263824899608	-0.38418143468130167	-0.021040802838999118	-0.13160086813928762	0.2353681990964207	-0.41384844052267633	0.0057569051767975	0.406180433159148	0.2137624455752396	0.05887176669524208	0.0007312087443287393	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.925117039075	NA__no_active_tile	0.448066215252	0.397602565759	0.88258056334	0.0484054419273	0.0986283746992	0.436112310787	0.370783045707	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr7:119547394..119547508,-__770.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr7:119547394..119547508,-__770.1.0.0	rs111505816	3.7015170275627547	4.184921348868837	3.6005438848565663	3.280645824491087	3.718638727634497	3.7232204408683014	3.674996336691469	4.218000767694576	4.0276325654782745	4.016215572506554	4.0163127191082815	4.123370339943248	3.857167962975371	3.8480974983710547	4.246463325879823	3.761312541541111	3.3664291081026563	3.8672940529983517	3.864917484902406	3.761978889206856	4.3123523418293495	4.149467025715127	4.195591981099221	4.15853556112512	4.215716296971301	3.9790130089785314	0.14658047080830006	0.06154197701098596	0.16076865668454454	0.08578328361156906	0.14865532536385473	0.14169704403410455	0.08698255251538711	0.09435157413477313	0.12183446023685285	0.1793764085926668	0.14222284201683877	0.09234595702805315	0.12184504600316089	0.0548474154937	0.119339994516	0.101398170673	0.197395731844	0.0134887989876	0.0601351299193	0.179364149792	0.045430560235	0.0678362651725	0.0362033618716	0.0658387268341	0.0531733827136	1.64551452094e-07	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.000137894116855	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr7:1199934..1200048,+__771.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr7:1199934..1200048,+__771.1.0.0	rs147225237	0.6049298825785053	0.8979189913087005	0.7031685161804186	0.481548045349204	0.9683704572942328	0.9442450929788055	0.9979267973854213	0.8282603548480652	0.6702660133231654	0.7833950058773484	1.1213657531631154	0.8355352022778068	0.8197441760470657	0.978444743488508	1.4300091889864983	0.712944540214497	0.8750958950750598	1.0140421163905102	1.2546565255227708	0.8428630430140921	1.6388234432189832	1.1405330520275343	1.4051483984853064	1.0775833709483995	1.462619755316374	1.1527303393907111	0.37351486091000263	0.5320901976777979	0.009776024034078401	0.3935478497258558	0.04567165909627746	0.3104114325439653	-0.15506375437132924	0.8105630883709181	0.4702670387043689	0.6217533926079579	-0.043782382214715865	0.6270845530385672	0.3329861633436454	0.192768091005	0.0507398712534	0.648013768535	0.519249062249	0.591208103411	0.21176555971	0.63839046467	0.0140036728837	0.0548474154937	0.0374147936077	0.375513989452	0.136115392203	0.00367344695131	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr7:1199934..1200048,+__771.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr7:1199934..1200048,+__771.1.0.0	rs73263335	0.6049298825785053	0.8979189913087005	0.7031685161804186	0.481548045349204	0.9683704572942328	0.9442450929788055	0.9979267973854213	0.8282603548480652	0.6702660133231654	0.7833950058773484	1.1213657531631154	0.8355352022778068	0.8197441760470657	0.3476309161753002	0.5966321694428602	0.7554304238848366	0.35950924659196504	0.4334765408383903	0.5593756417523728	0.5541942982252005	0.3930111868754044	0.6001442435551836	0.7415257647662241	0.5998924039479165	0.6005295960123849	0.5451127026723366	-0.25729896640320515	-0.3012868218658402	0.052261907704417965	-0.12203879875723894	-0.5348939164558424	-0.3848694512264328	-0.44373249916022084	-0.4352491679726608	-0.07012176976798179	-0.04186924111112433	-0.5214733492151988	-0.23500560626542188	-0.27463147337472915	0.276771967065	0.175053819161	0.88258056334	0.162586850726	0.0856734395523	0.122558611289	0.166665831608	0.0145358169752	0.0959193233604	0.242741268695	0.0399413890972	0.113101776132	0.000275554511528	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.230914680661	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr7:1199934..1200048,+__771.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr7:1199934..1200048,+__771.1.0.0	rs147225237,rs73263335	0.6049298825785053	0.8979189913087005	0.7031685161804186	0.481548045349204	0.9683704572942328	0.9442450929788055	0.9979267973854213	0.8282603548480652	0.6702660133231654	0.7833950058773484	1.1213657531631154	0.8355352022778068	0.8197441760470657	0.908229219870283	1.2342455841867523	0.9731854073744743	0.903636271398067	1.0008422511388133	1.0503479848279464	1.2343566555718155	1.2598662461276684	1.166451517094801	1.1385277096451003	1.4037793952113429	1.2115384431368246	1.1237505571319906	0.3032993372917777	0.3363265928780519	0.2700168911940557	0.42208822604886304	0.03247179384458054	0.1061028918491409	0.23642985818639417	0.43160589127960325	0.4961855037716357	0.35513270376775186	0.2824136420482275	0.3760032408590178	0.304006381084925	0.270885072145	0.150801701171	0.0763307839553	0.861430881609	0.581967350665	0.361218104761	0.397602565759	0.237368605078	0.216719559135	0.288805731951	0.199734666592	0.248198866138	0.0423536116705	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr7:121944881..121944995,+__773.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr7:121944881..121944995,+__773.1.0.0	rs13238374	0.006820382085608996	0.29019988539639163	0.4416916127749392	0.1119406269376065	0.26454273733947536	0.3100492149285188	0.12179408700616826	0.5077057289097284	0.26367924549326627	0.36713963575952385	0.346269840445588	0.24000549418306355	0.2726532076049899	0.04424371182003777	0.020598111196234836	-0.033195890867187605	0.09889070486259123	0.07702729156983722	0.21549742190449123	0.12818385709524685	0.2245716056533799	0.1815676530841604	0.1746496496752059	0.29740284186268573	0.04083940606458346	0.12252303032677224	0.03742332973442877	-0.2696017742001568	-0.4748875036421268	-0.013049922075015263	-0.18751544576963813	-0.09455179302402755	0.006389770089078595	-0.2831341232563485	-0.08211159240910587	-0.19248998608431794	-0.04886699858290228	-0.19916608811848008	-0.15013017727821762	0.581967350665	0.104229562843	0.0565651674203	0.8931878581	0.0763307839553	0.829896383209	0.527990680582	0.183752894264	0.288805731951	0.0267271087754	0.536806685117	0.183752894264	0.0417416283446	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr7:130792770..130792884,-__780.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr7:130792770..130792884,-__780.1.0.0	rs61729643	-1.0281119839934154	-1.1351689374771206	-0.981551427366402	-1.250536693519294	-1.341910968550858	-1.1587120416839722	-1.4924490226852871	-1.011438993897383	-1.4546804415456245	-0.7754758480211303	-1.379851118353164	-1.2130917969854251	-1.1852482728399232	-1.0889349322540975	-1.4460225942882634	-1.227042335816674	-1.2380667939757912	-1.4417622549333629	-1.128210264686861	-1.0244274060778449	-1.3571501287869927	-1.6849286164835835	-1.2183102265029262	-1.2018646749250943	-0.7309123592688086	-1.2323027156666917	-0.06082294826068213	-0.31085365681114285	-0.245490908450272	0.01246989954350286	-0.09985128638250496	0.030501776997111207	0.46802161660744224	-0.3457111348896098	-0.23024817493795902	-0.44283437848179585	0.1779864434280698	0.48217943771661653	-0.047054442826768655	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr7:135777593..135777707,+__784.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:135777593..135777707,+__784.1.0.0	rs7782399	0.3393723228433605	0.40064252791057975	0.5055252639001151	0.3199507958313237	0.48671485043493845	0.4321194679120659	0.6029689053435096	0.6409804711416464	0.713195597620002	0.7012019054585814	0.6012821408002523	0.6914869754232047	0.5362867687182983	-1.582219890348095	-1.3763703549041157	-1.4897191660736528	-1.425997967427876	-2.0668911273288657	-1.266455703800383	-1.8445304742616506	-1.4902127558968723	-1.5013785772186636	-1.3368903106040664	-1.8605672370445427	-1.9011261973785656	-1.5951966468572791	-1.9215922131914556	-1.7770128828146956	-1.995244429973768	-1.7459487632591997	-2.5536059777638043	-1.6985751717124489	-2.4474993796051603	-2.1311932270385188	-2.2145741748386656	-2.0380922160626476	-2.461849377844795	-2.5926131728017703	-2.1314834155755773	3.38768884882e-06	7.24718602024e-07	6.74946443676e-08	5.01342010717e-05	6.61054563843e-09	1.02132784807e-06	2.52244414867e-07	5.1947018217e-09	3.12503971844e-07	9.09364429293e-09	3.59934781305e-10	1.08804472643e-09	6.92496813031e-73	0.00239848370496	0.000539190639906	5.02835100538e-05	0.0369489061899	5.10334123287e-06	0.000780294475925	0.000186408622586	3.77654822438e-06	0.000241565570236	7.13851076995e-06	2.76789846824e-07	8.47586841889e-07	5.8031232932e-70	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr7:142198030..142198144,-__785.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:142198030..142198144,-__785.1.0.0	rs17278	-0.6592769771639564	-0.4643050163340149	-0.4271758176470869	-0.30958380958466836	-0.35745810540926803	-0.306230720747578	-0.34561995518960176	-0.4498994291439779	-0.47522915015495026	-0.486473048172694	-0.3968585853194425	-0.5239350115660302	-0.43350380220277246	-0.6448036431243022	-0.547564824736369	-0.3033401993970853	-0.3838891802870615	-0.39967927921879	-0.39103172086611243	-0.31493294976245656	-0.14410344293105617	-0.5479327594160366	-0.5229745466541414	-0.4782446243069858	-0.4332384524967353	-0.42597796859976106	0.014473334039654229	-0.08325980840235414	0.12383561825000161	-0.07430537070239313	-0.04222117380952195	-0.08480100011853442	0.030687005427145198	0.3057959862129217	-0.07270360926108632	-0.03650149848144746	-0.08138603898754326	0.09069655906929486	0.00752583360301141	0.79863356553	0.727009731456	0.925117039075	0.819442862795	0.202104162379	0.628827692687	0.687084607526	0.259370210024	0.687084607526	0.935789553219	0.340423946445	0.628827692687	0.927811346835	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr7:142198030..142198144,-__785.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:142198030..142198144,-__785.1.0.0	rs17277	-0.6592769771639564	-0.4643050163340149	-0.4271758176470869	-0.30958380958466836	-0.35745810540926803	-0.306230720747578	-0.34561995518960176	-0.4498994291439779	-0.47522915015495026	-0.486473048172694	-0.3968585853194425	-0.5239350115660302	-0.43350380220277246	-0.6070848544229498	-0.2253123483315528	-0.721844842925722	-0.5855395127491664	-0.4286062752854056	-0.32796106877406517	-0.37342906469965753	-0.24857949637394533	-0.3352888134039925	-0.5100217368182139	-0.27758558643966724	-0.4242025404426195	-0.42212134505557986	0.0521921227410066	0.23899266800246208	-0.29466902527863514	-0.275955703164498	-0.07114816987613759	-0.021730348026487156	-0.027809109510055774	0.20131993277003257	0.13994033675095774	-0.023548688645519955	0.11927299887977527	0.09973247112341066	0.01138245714719261	0.898497645189	0.216719559135	0.320413072024	0.716953652062	0.265084565602	0.361218104761	0.777966336216	0.202104162379	0.375513989452	0.677233097055	0.301187193336	0.382791178922	0.372003763429	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr7:142198030..142198144,-__785.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:142198030..142198144,-__785.1.0.0	rs17276	-0.6592769771639564	-0.4643050163340149	-0.4271758176470869	-0.30958380958466836	-0.35745810540926803	-0.306230720747578	-0.34561995518960176	-0.4498994291439779	-0.47522915015495026	-0.486473048172694	-0.3968585853194425	-0.5239350115660302	-0.43350380220277246	-0.376001935861436	-0.30870271955694495	-0.5510542125644728	-0.5809688414318157	-0.5293933755568491	-0.4568416329108629	-0.4644633643897098	-0.49367132473324005	-0.6478905751700587	-0.46514882147980774	-0.4004677585652733	-0.663804077585033	-0.4948673866504587	0.2832750413025204	0.15560229677706994	-0.12387839491738595	-0.27138503184714735	-0.17193527014758103	-0.15061091216328487	-0.11884340920010805	-0.043771895589262144	-0.1726614250151084	0.02132422669288625	-0.0036091732458307657	-0.13986906601900284	-0.06136358444768623	0.270885072145	0.935789553219	0.63839046467	0.270885072145	0.170821264488	0.946473618223	0.519249062249	0.925117039075	0.935789553219	0.978575937473	0.554657938956	0.563691144959	0.972493859134	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr7:142198030..142198144,-__785.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:142198030..142198144,-__785.1.0.0	rs17278,rs17277,rs17276	-0.6592769771639564	-0.4643050163340149	-0.4271758176470869	-0.30958380958466836	-0.35745810540926803	-0.306230720747578	-0.34561995518960176	-0.4498994291439779	-0.47522915015495026	-0.486473048172694	-0.3968585853194425	-0.5239350115660302	-0.43350380220277246	-0.29143111420320106	-0.10902351656199842	-0.202269924369538	-0.40022330932935984	-0.10862822422647714	-0.36354044698122917	-0.04599127897941939	0.06704894238532581	-0.4448212264026127	-0.4488099025229758	-0.0019057645798829133	-0.1527210665602895	-0.2085264026943048	0.36784586296075533	0.35528149977201645	0.2249058932775489	-0.09063949974469149	0.2488298811827909	-0.05730972623365116	0.29962867621018235	0.5169483715293037	0.030407923752337584	0.03766314564971818	0.3949528207395596	0.3712139450057407	0.2249773995084676	0.110080523892	0.237368605078	0.527990680582	0.706946403854	0.397602565759	0.288805731951	0.0658387268341	0.00183882744533	0.545696106059	0.333666485083	0.0932701621097	0.0856734395523	0.00289627256086	1	1	1	1	1	1	1	0.35857135184	1	1	1	1	0.657453871314	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr7:149678..149792,+__786.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:149678..149792,+__786.1.0.0	rs3814455	-1.3855539545782904	-1.7438979502224499	-1.5222230064590516	-1.203067062810725	-1.4184354998146438	-1.308403691452574	-1.778852972643687	-1.6422338698340402	-1.5185781527274154	-1.456962959977863	-1.4082286338094765	-1.5296720059561677	-1.4930091466905322	-1.5952143737201394	-1.050437331519427	-1.0931123557680023	-1.5397968273870466	-1.2355762742802119	-1.3480454156389337	-1.4381258737158826	-1.2872043030502334	-1.5871739245356158	-1.4100348802583293	-1.3958496763824022	-1.0083482591402797	-1.3324099579497088	-0.20966041914184896	0.6934606187030228	0.42911065069104937	-0.33672976457632164	0.1828592255344319	-0.039641724186359584	0.3407270989278044	0.3550295667838068	-0.06859577180820042	0.04692807971953372	0.012378957427074289	0.521323746815888	0.16059918874082338	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr7:1609638..1609752,+__789.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr7:1609638..1609752,+__789.1.0.0	rs12702939	1.2597990446099505	1.8368014771842835	0.974353458500886	1.632859393398771	1.0481569234961798	0.6387662681457119	0.2931714878709826	0.12967282828773283	0.8555023950176408	1.140704812768573	0.9194703408655807	-0.4306977007288131	0.8582133941181235	0.8436145044061529	-0.3578223943111852	0.6749196258370939	0.17812005035427725	1.0006371674707013	0.4894270653060568	0.23882633313265383	-1.713479653252259	1.1746020585947385	1.234491208422748	1.030131822781862	1.7526217776457145	0.5455074638657129	-0.4161845402037976	-2.1946238714954687	-0.2994338326637921	-1.4547393430444937	-0.04751975602547853	-0.14933920283965513	-0.054345154738328794	-1.8431524815399918	0.31909966357709774	0.0937863956541749	0.11066148191628145	2.1833194783745276	-0.3127059302524104	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr7:22602876..22602990,+__794.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr7:22602876..22602990,+__794.1.0.0	rs1122913	0.28699687524152384	-0.63435211566037	-0.6350830465267967	-0.5562022457191228	-0.3742703573398949	-0.4952720611964122	-0.6641582405585331	-1.203066760398887	-0.22606530275045797	-0.7457285870857724	-0.4317490573843749	-0.9660544060874154	-0.5537504421222095	-0.7634217646832128	-0.757113234494906	-0.7871894044319467	-0.7980842764447036	-0.8817782351349052	-0.5947433732023941	-0.9599156272563913	-0.8695367292740409	-0.8585172451864328	-0.8967537566609913	-0.9879579969644589	-0.6213648998683631	-0.8146980453002288	-1.0504186399247366	-0.122761118834536	-0.15210635790515004	-0.2418820307255808	-0.5075078777950103	-0.09947131200598192	-0.2957573866978582	0.333530031124846	-0.6324519424359748	-0.15102516957521894	-0.556208939580084	0.34468950621905237	-0.2609476031780194	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	0.00257462145681	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	8.34895163788e-05	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	0.0140036728837	2.12884410074e-07	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.0645373961608	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	1	0.000178397135642	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr7:23145264..23145378,-__795.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr7:23145264..23145378,-__795.1.0.0	rs9648300	3.0289650913589306	3.530961793700964	2.9741395946533613	2.8176772243720083	3.2429934282052226	3.2865660244290265	2.979281556943647	3.2719762736453033	3.2933656398802595	3.3087954469989582	3.2752455142795274	3.417164398467526	3.2022609989112283	3.0508686698861567	3.639176941553994	2.99505648775742	2.803956736665186	3.2360694189920713	3.299265812127978	3.0258730667320997	3.4141764389799	3.3990704881399036	3.304971046381882	3.3136703486783774	3.278187071379306	3.230028543939523	0.02190357852722613	0.10821514785302977	0.020916893104058865	-0.013720487706822215	-0.006924009213151283	0.012699787698951415	0.04659150978845261	0.14220016533459656	0.1057048482596441	-0.003824400617076229	0.03842483439885003	-0.1389773270882202	0.027767545028294965	0.989287003123	0.747262025795	0.967868733231	0.935789553219	0.242741268695	0.412754243182	0.368322877114	0.202104162379	0.179364149792	0.397602565759	0.536806685117	0.66743649171	0.850415373649	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr7:23145264..23145378,-__795.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr7:23145264..23145378,-__795.1.0.0	rs10256996	3.0289650913589306	3.530961793700964	2.9741395946533613	2.8176772243720083	3.2429934282052226	3.2865660244290265	2.979281556943647	3.2719762736453033	3.2933656398802595	3.3087954469989582	3.2752455142795274	3.417164398467526	3.2022609989112283	3.2920868615965357	3.808058872745203	3.1665083054276706	3.0354893076537723	3.4502518800882185	3.410061841438057	3.2257132172838143	3.6155592137137744	3.5327148133922104	3.5852371503165137	3.473268420171458	3.6702244792753738	3.4387645302585503	0.2631217702376052	0.2770970790442391	0.19236871077430928	0.21781208328176405	0.20725845188299585	0.12349581700903034	0.24643166034016728	0.3435829400684711	0.23934917351195084	0.27644170331755546	0.19802290589193072	0.2530600808078476	0.23650353134732224	0.0741297894045	0.202104162379	0.175053819161	0.129198935732	0.0162407194134	0.0440018610392	0.0267271087754	0.00883703695038	0.0515422504639	0.0350255264852	0.0678362651725	0.116187990183	3.82332867542e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	3.20394943e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr7:23145264..23145378,-__795.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr7:23145264..23145378,-__795.1.0.0	rs9648300,rs10256996	3.0289650913589306	3.530961793700964	2.9741395946533613	2.8176772243720083	3.2429934282052226	3.2865660244290265	2.979281556943647	3.2719762736453033	3.2933656398802595	3.3087954469989582	3.2752455142795274	3.417164398467526	3.2022609989112283	3.4115248439200148	3.9107975452107513	3.262007776856639	3.04513441054138	3.5403928536567664	3.653000442338592	3.4262433306011726	3.6774525818511616	3.638906134404011	3.603056587791774	3.6706001677136633	3.6452532949226946	3.5403641641507186	0.3825597525610842	0.3798357515097872	0.2878681822032778	0.22745718616937172	0.29739942545154374	0.36643441790956555	0.44696177365752554	0.40547630820585834	0.34554049452375146	0.29426114079281573	0.3953546534341359	0.2280888964551684	0.3381031652394905	0.0316863885398	0.122558611289	0.088148079887	0.0316863885398	0.00043495277549	0.000273955335251	0.000827700533168	0.00175684955224	0.000392957862114	0.000681115576796	0.00183882744533	0.0150857114019	3.81003364205e-19	1	1	1	1	0.0891653189755	0.0550650223855	0.165540106634	0.342585662687	0.0809493195955	0.141672039974	0.376959626293	1	8.64877636746e-17	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr7:23720421..23720535,-__796.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr7:23720421..23720535,-__796.1.0.0	rs12700456	-1.4401029876310953	-1.2163675374478449	-1.3904252800565076	-1.2395347756713375	-1.2706761193665645	-1.2040771887832524	-1.0676476994152737	-1.2628217358544513	-1.3385467389410597	-1.4115205144683691	-1.2916587412286686	-1.1342595953549177	-1.272303242851612	-0.30822486019202944	-0.17845586211446923	-0.23582173511792315	-0.5275276870926087	-0.1782407677477132	-0.1620696329054495	0.012773678271993653	0.12004091515436113	-0.1522256018318644	-0.21760882329026232	0.043555327580476644	-0.035240244173810505	-0.15158710778827492	1.131878127439066	1.0379116753333757	1.1546035449385843	0.7120070885787289	1.0924353516188514	1.0420075558778028	1.0804213776872673	1.3828626510088124	1.1863211371091953	1.1939116911781067	1.3352140688091452	1.0990193511811073	1.120716135063337	8.8142435835e-06	4.73314572056e-05	1.43307835393e-06	0.000681115576796	3.12503971844e-07	3.35517507832e-07	4.11448729888e-06	3.98069788177e-08	1.33967727792e-06	1.84460412812e-08	1.33967727792e-06	3.98069788177e-08	2.49476070309e-59	0.00624048445712	0.035214604161	0.00106764337368	0.501982180099	0.000241253066264	0.000256335375984	0.00304060611387	2.89396736005e-05	0.00103557053583	1.44801424057e-05	0.00103021182672	3.1009636499e-05	2.09060946919e-56	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr7:26415852..26415966,-__797.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr7:26415852..26415966,-__797.1.0.0	rs138341616	0.8341020664177283	1.0607754161540992	2.2227919320404546	0.8369232022755372	0.3947662399539957	1.2556966030853214	-0.01909748800981805	-0.4170566582354847	-0.4549954193245547	0.4742358960171077	-0.06672290094753272	-0.9660544060874154	0.4296137069449532	-0.42261195063695683	-0.49234826750197463	-1.0834385681631316	-1.6215709976254606	-0.5204289987584458	-1.4727510235282597	-0.8606060813386325	-0.1920295215722257	-0.9264478735525492	-0.9222634365988587	-0.7915700515576807	-1.1747001663022818	-0.8733972447613715	-1.256714017054685	-1.5531236836560738	-3.3062305002035863	-2.458494199900998	-0.9151952387124416	-2.728447626613581	-0.8415085933288144	0.22502713666325902	-0.47145245422799453	-1.3964993326159663	-0.7248471506101479	-0.20864576021486636	-1.3030109517063246	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr7:26415852..26415966,-__797.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr7:26415852..26415966,-__797.1.0.0	rs2249325	0.8341020664177283	1.0607754161540992	2.2227919320404546	0.8369232022755372	0.3947662399539957	1.2556966030853214	-0.01909748800981805	-0.4170566582354847	-0.4549954193245547	0.4742358960171077	-0.06672290094753272	-0.9660544060874154	0.4296137069449532	0.041558467516052265	0.11859184903722607	-0.9710582262543583	-1.435478738500396	-1.1422470956630904	-1.4667736890804828	-1.7817679970042954	-1.1900704882033744	-0.8109694891985898	-1.1477221888406697	-0.25784164973771584	-2.164590635716055	-1.0173641568038123	-0.792543598901676	-0.9421835671168731	-3.193850158294813	-2.272401940775933	-1.537013335617086	-2.722470292165804	-1.7626705089944774	-0.7730138299678897	-0.3559740698740351	-1.6219580848577775	-0.19111874879018312	-1.1985362296286395	-1.4469778637487656	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr7:26415852..26415966,-__797.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr7:26415852..26415966,-__797.1.0.0	rs138341616,rs2249325	0.8341020664177283	1.0607754161540992	2.2227919320404546	0.8369232022755372	0.3947662399539957	1.2556966030853214	-0.01909748800981805	-0.4170566582354847	-0.4549954193245547	0.4742358960171077	-0.06672290094753272	-0.9660544060874154	0.4296137069449532	-0.5609990501482927	-0.6013321993108277	-1.0270115060367664	0.1477058054526844	-0.4747508480513112	-0.2971407059651891	-1.6534464318905933	-0.8635694375745604	0.3859394252881569	-0.33838121380859226	-0.7833654504649314	-0.7353070653934114	-0.5668048898253029	-1.395101116566021	-1.6621076154649268	-3.2498034380772207	-0.6892173968228528	-0.8695170880053069	-1.5528373090505105	-1.6343489438807752	-0.4465127793390757	0.8409348446127116	-0.8126171098257	-0.7166425495173987	0.23074734069400404	-0.9964185967702562	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr7:26438141..26438255,+__798.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:26438141..26438255,+__798.1.0.0	rs2269895	-0.2092338467940392	-1.0779753595577468	-0.6735931336836395	-0.7001147366697831	-0.42366110356431774	-0.39220854264790567	-0.13439776143997625	-0.06774560804922451	-0.9655817028639664	-1.8890520650226432	-0.7670298074240179	-1.5383382442108329	-0.7365776593273411	-0.17569612089044914	-0.6134929614663897	-0.8278978462057598	-0.4152882066717056	-0.837428059156619	-0.5153663090058209	-0.1867018427430976	-0.8646339478710587	-1.0105751572097108	-0.7462225357630285	-0.7849336629201065	-0.33864040843384435	-0.6097397548614659	0.033537725903590054	0.46448239809135716	-0.1543047125221203	0.2848265299980775	-0.41376695559230126	-0.12315776635791525	-0.052304081303121336	-0.7968883398218343	-0.04499345434574442	1.1428295292596147	-0.017903855496088528	1.1996978357769885	0.1268379044658752	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr7:27224936..27225050,+__801.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr7:27224936..27225050,+__801.1.0.0	rs17437495	-0.40764968600687856	-0.27130574965824955	-0.19807075415025066	-0.6662260735605718	-0.25882887244715025	-0.2899619606258529	-0.6172890897044911	0.14705804179389353	-0.42575346133284864	-0.10335991113828563	-0.13611072109917702	-0.5931174848706138	-0.31838464356670637	-0.6504136828444714	-0.4073617804232545	-0.34625672716405825	-0.3969807418328141	-0.09871193618366148	-0.6854509080835396	-0.3087849273034446	-0.5289489724075653	-0.30021707842685996	-0.2436033768905551	-0.42896453672452173	-0.5186838064561351	-0.40953153956174004	-0.24276399683759287	-0.13605603076500494	-0.1481859730138076	0.2692453317277577	0.16011693626348877	-0.3954889474576867	0.30850416240104656	-0.6760070142014589	0.12553638290598867	-0.14024346575226948	-0.29285381562534474	0.07443367841447868	-0.09114689599503374	0.619326784864	0.788281320858	0.76769033028	0.259370210024	0.967868733231	0.333660951583	0.856156710108	0.248198866138	0.747262025795	0.501992688725	0.545696106059	0.989286880498	0.96037790386	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr7:29603237..29603351,-__803.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr7:29603237..29603351,-__803.1.0.0	rs7805168	-1.1539428421804396	-1.3798296564346098	-1.3491990799379778	-1.271159697473837	-1.397594491862027	-1.2493508549529544	-1.420979788441068	-1.417063498477464	-1.054724929309216	-1.2594437554088005	-1.0454566021507588	-0.952492929232488	-1.24593651048847	-0.8741089613817058	-0.9228112966129142	-1.1103124029421536	-0.8120216808472525	-1.032823189968184	-1.0630918140224397	-1.044353723961047	-1.1744519439950547	-1.0503394771777683	-0.738809177364511	-1.1989276811899934	-0.9463629283402923	-0.9973678564836096	0.27983388079873384	0.4570183598216956	0.23888667699582422	0.4591380166265846	0.3647713018938432	0.1862590409305147	0.376626064480021	0.24261155448240923	0.004385452131447698	0.5206345780442895	-0.15347107903923463	0.0061300008921956195	0.2485686540048604	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.150801701171	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.150801701171	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr7:53879598..53879712,-__808.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:53879598..53879712,-__808.1.0.0	rs115983039	0.9035851783869979	1.129973264225659	0.8173644465992884	0.6967491064194767	0.9735476575140487	0.9383345634158649	0.5919262504336297	1.0378270835757397	1.056140099142334	0.909465986999137	0.9518254184273263	0.9647265635945118	0.914288801561168	0.787210596313629	1.1228739427714465	0.7380598010878434	0.5940345400034257	0.8689952806651435	1.0221653405084319	0.6986989377521915	0.9228706776995408	0.8954274798650961	1.0119693801087934	0.9605111344922532	0.9988218291793429	0.885136578370595	-0.11637458207336893	-0.007099321454212548	-0.079304645511445	-0.10271456641605103	-0.10455237684890517	0.08383077709256703	0.10677268731856182	-0.11495640587619893	-0.1607126192772379	0.1025033931096564	0.008685716064926963	0.034095265584831114	-0.029152223190573017	0.412754243182	0.85089220831	0.452098798395	0.85089220831	0.150801701171	0.829896383209	0.476688253492	0.63839046467	0.143314270352	0.21176555971	0.76769033028	0.840380101088	0.700100952247	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr7:53879598..53879712,-__808.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:53879598..53879712,-__808.1.0.0	rs76730113	0.9035851783869979	1.129973264225659	0.8173644465992884	0.6967491064194767	0.9735476575140487	0.9383345634158649	0.5919262504336297	1.0378270835757397	1.056140099142334	0.909465986999137	0.9518254184273263	0.9647265635945118	0.914288801561168	0.5386483208727447	0.8153486129474374	0.6297378157310725	0.6335295959501192	0.7865346108435558	0.7612671202627309	0.7828754622700328	0.7558830452153041	0.7707816563200041	0.6566047761267092	0.8872024834058859	0.6757313522361225	0.7245120710151433	-0.3649368575142532	-0.3146246512782216	-0.18762663086821596	-0.06321951046935759	-0.1870130466704929	-0.17706744315313394	0.19094921183640312	-0.2819440383604356	-0.2853584428223299	-0.25286121087242786	-0.06462293502144034	-0.28899521135838935	-0.1897767305460246	0.0601351299193	0.221756412245	0.63839046467	0.819442862795	0.0531733827136	0.276771967065	0.221756412245	0.179364149792	0.0808926541269	0.232080506959	0.572794651112	0.420456664513	0.0203122005914	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr7:53879598..53879712,-__808.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:53879598..53879712,-__808.1.0.0	rs115983039,rs76730113	0.9035851783869979	1.129973264225659	0.8173644465992884	0.6967491064194767	0.9735476575140487	0.9383345634158649	0.5919262504336297	1.0378270835757397	1.056140099142334	0.909465986999137	0.9518254184273263	0.9647265635945118	0.914288801561168	0.4648835847422423	0.7491312747216756	0.6434768948022288	0.5590454850367019	0.6646581713449572	0.7634567838824975	0.7149959203135872	0.7466161699705407	0.8819735360083818	0.7920746312417969	0.6370390078922008	0.7538224810331052	0.6975978284158263	-0.43870159364475564	-0.3808419895039834	-0.17388755179705961	-0.1377036213827748	-0.3088894861690915	-0.17487777953336736	0.12306966987995749	-0.291210913605199	-0.17416656313395218	-0.11739135575734017	-0.31478641053512546	-0.21090408256140658	-0.21669097314534155	0.00955750115232	0.183752894264	0.460214637573	0.288805731951	0.0115927323179	0.21176555971	0.382791178922	0.326996172605	0.202104162379	0.361218104761	0.143314270352	0.202104162379	0.000904898522408	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.205411964587	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr7:54826976..54827090,+__809.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr7:54826976..54827090,+__809.1.0.0	rs113189971	1.9206066894299285	2.259501810222615	1.894660420754998	1.8284057358219767	2.0521015052312777	2.021274805330949	1.9289858377530242	2.0840460824188307	2.1566765926886955	2.0967044451260137	2.082666030027471	2.078134383262211	2.0336470281723327	1.8042208139053213	2.090780232506061	1.8740857874209933	1.7879533426402587	1.9233244095849082	1.8957682054486238	1.7636960444578684	2.0481603904689534	2.074246906198374	2.0044460939667075	2.111030679178738	1.968944173894584	1.9455547566392826	-0.11638587552460722	-0.16872157771655383	-0.020574633334004666	-0.040452393181718005	-0.1287770956463694	-0.12550659988232526	-0.1652897932951558	-0.03588569194987734	-0.08242968649032134	-0.09225835115930625	0.02836464915126724	-0.10919020936762669	-0.08809227153304988	0.957167318493	0.397602565759	0.706946403854	0.727009731456	0.276771967065	0.270885072145	0.563691144959	0.88258056334	0.420456664513	0.527990680582	0.757455001208	0.202104162379	0.763572106217	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr7:54826976..54827090,+__809.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr7:54826976..54827090,+__809.1.0.0	rs113189971,rs75821627	1.9206066894299285	2.259501810222615	1.894660420754998	1.8284057358219767	2.0521015052312777	2.021274805330949	1.9289858377530242	2.0840460824188307	2.1566765926886955	2.0967044451260137	2.082666030027471	2.078134383262211	2.0336470281723327	1.3459260980725711	1.5997044238165772	1.4690388498473703	1.3027484250399382	1.5918604094435516	1.5865894402722158	1.430268228849891	1.3585345257634576	1.6217860525925518	1.6843160090357798	1.7160298107068537	1.5418433158757532	1.5207204657763758	-0.5746805913573574	-0.6597973864060378	-0.42562157090762764	-0.5256573107820386	-0.4602410957877261	-0.43468536505873323	-0.4987176089031333	-0.7255115566553731	-0.5348905400961437	-0.4123884360902339	-0.3666362193206172	-0.5362910673864576	-0.5129265623959567	0.00460947122508	0.00313710581496	0.00441948685714	0.00287470049861	0.00105204507021	0.000617238254542	0.00263248034207	0.00501178746069	5.62183900058e-05	0.000170183141363	0.00753998341959	0.00023411339895	2.76031280161e-25	0.894237417666	0.633695374622	0.879477884571	0.543318394237	0.215669239393	0.124064889163	0.526496068413	0.977298554835	0.0115809883412	0.0353980934035	1	0.0482273601837	6.26591005965e-23	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr7:65958508..65958622,-__810.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:65958508..65958622,-__810.1.0.0	rs114282028	1.9102501903384648	2.294362583042987	1.8788294810630966	1.7077308929806578	1.8872994265338185	1.9604533842680667	1.7325835284526385	1.999177000383091	2.037677921962955	2.034783209959978	1.9173462744531635	2.029747780229888	1.949186806139067	2.3694339769692148	2.7068549954178933	2.0912987766999658	1.9246938944181595	2.3003317715130907	2.3090095421399286	2.089354737129758	2.2170398901573845	2.404693741443047	2.33104507563928	2.3374756936049694	2.3121274393544637	2.282779961207263	0.45918378663075	0.4124924123749065	0.21246929563686923	0.2169630014375017	0.4130323449792721	0.3485561578718619	0.3567712086771193	0.21786288977429336	0.3670158194800921	0.29626186567930235	0.4201294191518059	0.2823796591245755	0.3335931550681958	0.0267271087754	0.0808926541269	0.045430560235	0.166665831608	0.0785847853765	0.0399413890972	0.107123399254	0.30750859871	0.0216734048733	0.0232568344756	0.0174727290303	0.0658387268341	4.43884406369e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	3.71975132537e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr7:65958634..65958748,+__811.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr7:65958634..65958748,+__811.1.0.0	rs75577046	1.1663128596521835	1.4868009597425416	1.5197424982443848	1.328243255041274	1.2665643900808756	1.2499462086215085	1.5946403536815357	1.5095537650565032	1.4162169522649806	1.4198548760041294	1.4839326435635694	1.4661412840210786	1.4089958371645468	1.0281781484805808	1.4001014172355677	1.223312211415953	0.9877256116572319	1.113158185484963	1.2297043574019075	1.2384572043085795	1.3911595779779637	1.240618960961564	1.3072559667731372	1.3067209760789238	1.1104154031451943	1.2147340017434638	-0.1381347111716027	-0.08669954250697387	-0.29643028682843187	-0.340517643384042	-0.1534062045959126	-0.02024185121960098	-0.35618314937295614	-0.11839418707853944	-0.17559799130341647	-0.11259890923099225	-0.17721166748464556	-0.3557258808758843	-0.1942618354210832	0.13967914143	0.162586850726	0.232080506959	0.13967914143	0.175053819161	0.510582765025	0.0638899216795	0.320413072024	0.119339994516	0.202104162379	0.397602565759	0.0316863885398	0.000821729464813	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.688609291513	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr7:86781612..86781726,-__817.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr7:86781612..86781726,-__817.1.0.0	rs17515896	1.8239221231661096	1.4295122194255367	1.544514187012	1.2450228724361052	1.2982455054136655	0.6303071496100722	1.8112275243719904	1.4332591734579765	1.0332228841872055	2.103210881112239	1.582149024273091	1.6196559673001927	1.4628541259805152	0.6451610648447719	0.44802715529600623	0.03962553515219287	0.14776111102775802	0.7862117076106515	0.3894651380637623	0.5057457802330554	1.0821683248084863	1.261567510513717	0.6930282406012855	0.028598496040862436	0.4695786267806603	0.5414115575811008	-1.1787610583213377	-0.9814850641295305	-1.5048886518598072	-1.097261761408347	-0.512033797803014	-0.24084201154630985	-1.305481744138935	-0.35109084864949014	0.22834462632651142	-1.4101826405109534	-1.5535505282322284	-1.1500773405195324	-0.9214425683994145	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr7:86974738..86974852,-__818.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:86974738..86974852,-__818.1.0.0	rs114729506	0.19519579810463394	0.29562874203117895	0.30494617911896754	-0.08031679065405159	0.10386711461917734	0.18508878377941118	0.04837834934585931	0.23741870169048993	0.3374793341751493	0.27117740004763297	0.2024139019094032	0.3314934435899273	0.20273091314648162	-0.017208990833815593	0.054372482612677804	-0.08229475923681978	-0.10015173939541158	-0.17167795510984588	0.08814344193770576	0.10822530503045569	0.08870798803157386	0.2242965842806773	0.12785291216006867	0.03423453821291474	0.19251144174546744	0.04558427078630404	-0.21240478893844955	-0.24125625941850115	-0.3872409383557873	-0.019834948741359992	-0.2755450697290232	-0.09694534184170542	0.05984695568459638	-0.14871071365891608	-0.113182749894472	-0.1433244878875643	-0.16817936369648845	-0.13898200184445983	-0.15714664236017756	0.397602565759	0.444064484515	0.340423946445	0.957167318493	0.116187990183	0.206893929435	0.591208103411	0.248198866138	0.493479697885	0.333666485083	0.0832552515755	0.747262025795	0.216372477845	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr7:86974785..86974899,-__819.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:86974785..86974899,-__819.1.0.0	rs114729506	0.21848172155852846	0.45987003667586246	0.2896430526404521	0.412972559160193	0.4614260262636764	0.2532037299729386	0.35192788130865565	0.49173278135867454	0.656841510673384	0.3723290481562729	0.4494210109137164	0.4090081394355633	0.40223812484315985	0.18359140294147247	0.28951479084666015	0.23390264044316916	0.2488058957480993	0.3374125663680938	0.27710109890592094	0.07540410756684342	0.11763972360106509	0.3151900066762813	0.26009305065505556	0.3457646451346684	0.5817838195432037	0.27218364570254444	-0.03489031861705599	-0.1703552458292023	-0.05574041219728293	-0.16416666341209368	-0.1240134598955826	0.023897368932982332	-0.27652377374181225	-0.3740930577576095	-0.34165150399710276	-0.11223599750121732	-0.10365636577904797	0.17277568010764038	-0.13005447914061538	0.527990680582	0.677233097055	0.66743649171	0.946473618223	0.935788819786	0.696989544957	0.436112310787	0.501992688725	0.0986283746992	0.333666485083	0.591208103411	0.696989544957	0.84259847783	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr8:126963396..126963510,-__833.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:126963396..126963510,-__833.1.0.0	rs28361528	-1.4464658396427414	-1.5720081178670031	-1.2722277646858584	-1.9119357039708853	-1.8773374794976936	-1.7159288420536831	-1.8531671948402035	-1.47897059477098	-1.7120719752771616	-1.8234034305513505	-1.665054512335617	-1.448955273755506	-1.6481272274373902	-1.5397424759460732	-1.5873467702408044	-1.5128154010967156	-1.2635548772161396	-1.9924971004272343	-1.989721298976602	-1.9167233465241718	-1.6542541501911274	-2.161304363496596	-1.7345724363278534	-1.8783691846242128	-1.5692406201775748	-1.7333451687704253	-0.09327663630333172	-0.015338652373801276	-0.24058763641085723	0.6483808267547457	-0.11515962092954068	-0.27379245692291887	-0.06355615168396822	-0.1752835554201475	-0.44923238821943423	0.08883099422349705	-0.21331467228859569	-0.12028534642206878	-0.08521794133303512	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr8:132320782..132320896,+__839.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:132320782..132320896,+__839.1.0.0	rs79712647	-1.4353220056425355	-1.6080770677063323	-1.902101944288428	-1.7475435394608558	-1.9975250285620545	-1.6412391026823392	-1.2652987602632395	-1.6409180286943312	-1.7237256712328315	-1.446763791088084	-1.5757327125700895	-1.9395852742850956	-1.660319410539685	-0.8044327474466092	-1.083136981196918	-1.7948115763866657	-1.4312297228074766	-1.5356825815727044	-1.672718830916826	-1.154844162561609	-1.806585858414931	-1.9762027275283287	-1.6986976238585285	-1.610648352907072	-1.6032170373016639	-1.5143506835749445	0.6308892581959263	0.5249400865094143	0.10729036790176227	0.3163138166533792	0.46184244698935006	-0.03147972823448675	0.11045459770163046	-0.1656678297205998	-0.2524770562954972	-0.25193383277044457	-0.03491564033698258	0.33636823698343177	0.14596872696474028	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr8:143808383..143808497,-__841.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr8:143808383..143808497,-__841.1.0.0	rs138227826	-0.011724120553415651	-0.23325716320009537	0.2170024432413284	0.3025427851240198	-0.90150419216479	-1.9999168203430573	-0.5364796674524911	0.3922487047007206	0.21001719564575544	-0.3050563151711718	-0.9565867813409812	-1.646990800646566	-0.45580872768006203	0.95609618395575	1.7210233545534848	0.4668772176208138	0.8186629178081731	1.0230687501438223	0.9790390476369637	1.3838583936954185	1.6088431317711556	1.3973851788201206	0.87706344053825	0.8790568373182391	1.4414604112377896	1.1293695720916652	0.9678203045091657	1.9542805177535802	0.2498747743794854	0.5161201326841534	1.9245729423086124	2.978955867980021	1.9203380611479095	1.216594427070435	1.187367983174365	1.1821197557094218	1.8356436186592204	3.0884512118843555	1.5851782997717274	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr8:143808383..143808497,-__841.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr8:143808383..143808497,-__841.1.0.0	rs187474668	-0.011724120553415651	-0.23325716320009537	0.2170024432413284	0.3025427851240198	-0.90150419216479	-1.9999168203430573	-0.5364796674524911	0.3922487047007206	0.21001719564575544	-0.3050563151711718	-0.9565867813409812	-1.646990800646566	-0.45580872768006203																											NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr8:143808383..143808497,-__841.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr8:143808383..143808497,-__841.1.0.0	rs138227826,rs187474668	-0.011724120553415651	-0.23325716320009537	0.2170024432413284	0.3025427851240198	-0.90150419216479	-1.9999168203430573	-0.5364796674524911	0.3922487047007206	0.21001719564575544	-0.3050563151711718	-0.9565867813409812	-1.646990800646566	-0.45580872768006203	0.44303562917265055	-0.7408751558844175	0.5739359748645881	0.15607937018514215	-0.32320136074306244	-0.3843842581974077	-0.4638723353017526	-1.1604210682684812	-0.595995802689033	-1.7046668079153022	-0.547732517516241	0.2149456509377831	-0.3777627234462945	0.4547597497260662	-0.5076179926843222	0.35693353162325975	-0.14646341493887763	0.5783028314217276	1.6155325621456496	0.0726073321507385	-1.5526697729692018	-0.8060129983347883	-1.3996104927441304	0.4088542638247402	1.8619364515843493	0.07804600423376754	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr8:144363753..144363867,-__843.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:144363753..144363867,-__843.1.0.0	rs56184499	0.2841944795969811	0.4199857059210894	-0.35393543256544224	0.0020113752751918235	0.12589732681691598	0.2771336643374275	0.29677721305944	-0.0059561398196613475	0.35459162515709053	0.4501399002380381	0.5530519145774365	0.3893625281040879	0.2327711800582163	0.2436123212109206	0.4087326631668836	0.2773134690327165	0.19609926976417524	0.047460374567067566	0.475976327718125	0.32456767901458483	0.3992928382882923	0.4254594356586693	0.5289957665515415	0.03208947505272123	0.6296223595257777	0.33243516496262293	-0.04058215838606047	-0.0112530427542058	0.6312489015981587	0.19408789448898342	-0.07843695224984842	0.1988426633806975	0.02779046595514484	0.4052489781079537	0.07086781050157875	0.07885586631350333	-0.5209624395247153	0.24025983142168983	0.09966398490440669	0.493479697885	0.967868733231	0.368322877114	0.288794692487	0.967868733231	0.156605481197	0.63839046467	0.757455001208	0.79863356553	0.282745459933	0.276771967065	0.861430881609	0.850066964946	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr8:144363811..144363925,-__844.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr8:144363811..144363925,-__844.1.0.0	rs56184499	1.6992779050711988	1.9368738610922758	1.7265618424801408	1.4024999800008833	1.663641051835892	1.6606505292394675	1.4321903237065552	1.4328188690814678	1.600342644126055	1.8618985359201212	1.5106125264031391	1.7351681662038434	1.63854468626342	2.328401171453719	2.5512621020490833	2.0868903802573837	1.9377442174058759	2.1573682799057674	2.1526191541078323	2.204348233292317	2.0467049102534256	2.060052653441483	2.353578288724672	2.4565084416303544	2.1815151226240492	2.20974941292883	0.6291232663825204	0.6143882409568076	0.36032853777724294	0.5352442374049926	0.49372722806987546	0.4919686248683648	0.7721579095857618	0.6138860411719578	0.4597100093154278	0.4916797528045507	0.9458959152272153	0.44634695642020583	0.5712047266654102	0.000354775949455	0.0168468410067	0.0440018610392	0.00127069654712	0.00313710581496	0.00139510136839	3.33944592614e-05	0.045430560235	0.0140036728837	0.0115927323179	0.000303956631358	0.00127069654712	2.82906429912e-21	0.251181372214	1	1	0.936503355225	1	1	0.0246785053942	1	1	1	0.233742649515	0.989872610204	2.37075588266e-18	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr8:144363811..144363925,-__844.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr8:144363811..144363925,-__844.1.0.0	rs61736733	1.6992779050711988	1.9368738610922758	1.7265618424801408	1.4024999800008833	1.663641051835892	1.6606505292394675	1.4321903237065552	1.4328188690814678	1.600342644126055	1.8618985359201212	1.5106125264031391	1.7351681662038434	1.63854468626342	0.909337971567874	1.1126988687130712	1.0526192185955552	0.8720417894212337	1.066881117939268	0.8159378671923924	1.04138815239006	0.8540276548325579	0.9462595506313752	0.998874989375928	0.8917970963129924	0.9771525349675579	0.961584734328322	-0.7899399335033248	-0.8241749923792046	-0.6739426238845856	-0.5304581905796496	-0.5967599338966239	-0.8447126620470752	-0.3908021713164951	-0.5787912142489099	-0.6540830934946799	-0.8630235465441932	-0.6188154300901467	-0.7580156312362855	-0.6769599519350978	0.154655491485	0.00470673488948	0.0906800339379	0.197395731844	0.110080523892	0.0932701621097	0.412754243182	0.232080506959	0.104229562843	0.00183882744533	0.0808926541269	0.00800418438635	3.08895233396e-07	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.000258854205586	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr8:144363811..144363925,-__844.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr8:144363811..144363925,-__844.1.0.0	rs56184499,rs61736733	1.6992779050711988	1.9368738610922758	1.7265618424801408	1.4024999800008833	1.663641051835892	1.6606505292394675	1.4321903237065552	1.4328188690814678	1.600342644126055	1.8618985359201212	1.5106125264031391	1.7351681662038434	1.63854468626342	1.4073524094186927	1.7637011589641618	1.6332682219066454	1.4522544108797206	1.4060842951422883	1.5309088364397825	1.3253630033420376	1.3401090793587649	1.4257640682204853	1.465187576022721	1.5396777317385686	1.4984358333780807	1.4823422187343291	-0.29192549565250614	-0.17317270212811398	-0.09329362057349533	0.04975443087883735	-0.2575567566936037	-0.12974169279968506	-0.10682732036451759	-0.09270978972270294	-0.1745785759055698	-0.39671095989740013	0.029065205335429445	-0.23673233282576267	-0.15620246752909087	0.845630974801	0.221756412245	0.88258056334	0.397597163509	0.175053819161	0.412754243182	0.527990680582	0.619326784864	0.628827692687	0.13967914143	0.914457985151	0.428242856315	0.595123905959	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr8:144450700..144450814,-__845.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:144450700..144450814,-__845.1.0.0	rs80267243	1.8132484448586044	1.9558197887030566	1.7311353948794337	1.3892041497243115	1.6824625946732912	1.6863391893081463	1.710357772957385	1.9102512569212784	1.7176999480422572	1.8210302367733222	1.7769729065513995	1.9435361487646772	1.7615048193464304	1.6588084328116917	1.7082097975270158	1.3988859128036186	1.3987987297733986	1.613133256969702	1.7149621897642164	1.5421055894045568	1.6298831615393692	1.6528932096403073	1.6718457859589997	1.6554951070606048	1.7500633256890057	1.6162570415785407	-0.1544400120469127	-0.24760999117604077	-0.33224948207581506	0.009594580049087087	-0.06932933770358929	0.028623000456070136	-0.16825218355282812	-0.2803680953819092	-0.06480673840194995	-0.14918445081432252	-0.12147779949079474	-0.19347282307567149	-0.14524777776788972	0.609889042629	0.420456664513	0.333666485083	0.967868733231	0.536806685117	0.88258056334	0.8931878581	0.122558611289	0.657696241675	0.110080523892	0.76769033028	0.788281320858	0.848792142935	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr8:17658773..17658887,+__848.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:17658773..17658887,+__848.1.0.0	rs114402935	-0.053022773207982175	0.2242059680758164	-0.15355594690397495	0.07438922817112109	-0.08297063553205182	0.26880307475168674	0.17634356442548127	0.2673105088662737	0.10700273436792726	0.015540569778886756	0.12211132549861257	0.15607937018514215	0.09351974903974491	0.1002004306121629	0.060445849293367576	0.07426489759291512	-0.12246818485445682	-0.031286488577848146	0.0896349475526907	-0.2592418560300956	-0.16528298276741	0.03646796500358987	0.1298202429989008	0.20079666802968615	0.1639171995034382	0.02310572402974506	0.15322320382014507	-0.1637601187824488	0.22782084449689005	-0.1968574130255779	0.051684146954203675	-0.17916812719899605	-0.43558542045557685	-0.4325934916336837	-0.07053476936433739	0.11427967322001405	0.07868534253107358	0.007837829318296047	-0.07041402500999984	0.893185427345	0.762564839604	0.444064484515	0.747262025795	0.946473618223	0.777966336216	0.166665831608	0.614595886613	0.946473006422	0.282745459933	0.648013768535	0.545696106059	0.950532467681	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr8:30601601..30601715,+__852.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr8:30601601..30601715,+__852.1.0.0	rs73672521	2.225607802816824	2.467852696649354	2.1852677900405126	1.9000498042385527	2.5195094819627943	2.416149195743171	2.2481549407112436	2.548642237068946	2.4504284027172325	2.473885442867771	2.4268360726437983	2.3964726299624006	2.35490470811855	2.5965585419903388	2.888172979447391	2.4007376201881114	2.4350257944177285	2.5674304793452096	2.4565084416303544	2.426153067240889	2.5668153219345053	2.4771005977602045	2.701471426983039	2.5710515516988406	2.6060931498887308	2.557759914377112	0.37095073917351495	0.42032028279803724	0.2154698301475988	0.5349759901791757	0.04792099738241529	0.04035924588718354	0.17799812652964553	0.018173084865559463	0.026672195042972024	0.22758598411526787	0.14421547905504228	0.20962051992633013	0.2028552062585619	0.0276615481105	0.170821264488	0.0296152123457	0.00784715402968	0.226876581559	0.66743649171	0.125844655769	0.706946403854	0.519249062249	0.0327677521954	0.107123399254	0.119339994516	0.000191814179249	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.160740282211	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr8:30601660..30601774,+__853.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:30601660..30601774,+__853.1.0.0	rs3174043	2.8079317388637004	3.300553991885336	2.670302316218291	2.528771024814624	2.769529354998179	2.7902849266513723	2.7368294670472384	2.927821638283662	2.878966601672631	2.9235777418100284	2.8425950221787186	2.987227568197504	2.8470326160517736	2.7995357891595747	3.1619451275516086	2.7641824119768454	2.5774551560989254	2.764806376067747	2.776862156133008	2.7979058880346104	2.911641779932914	2.8077461152945116	2.8663600503461657	2.9509662665049587	2.9343076670415345	2.8428095653452004	-0.008395949704125716	-0.13860886433372732	0.09388009575855438	0.04868413128430138	-0.004722978930432387	-0.01342277051836449	0.06107642098737198	-0.016179858350747978	-0.0712204863781194	-0.057217691463862685	0.10837124432624012	-0.05291990115596956	-0.004223050706573472	0.989287003123	0.648013768535	0.412754243182	0.989287003123	0.978575937473	0.706946403854	0.757455001208	0.545696106059	0.747262025795	0.829896383209	0.925117039075	0.829896383209	0.99977537744	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr8:52811806..52811920,+__858.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr8:52811806..52811920,+__858.1.0.0	rs73681409	0.6565883818974819	0.48889842695541696	0.23396155107360134	0.2814315813914604	0.4794836581217338	0.525752119409651	0.4264025134204852	0.3008645209464967	0.2802273967710282	0.5515068848193225	0.5092238272042467	0.5164516258233074	0.4375660406528527	0.6783922547510285	0.9991168243994067	0.7355974964385537	0.4907790636939101	0.6071524473447434	0.6541348380084133	0.550444578846547	0.6382993131105263	0.6411778618060759	0.7182297998708935	0.6693414515307263	0.8276439357955361	0.6841924887996967	0.02180387285354657	0.5102183974439898	0.5016359453649524	0.2093474823024497	0.12766878922300956	0.12838271859876227	0.12404206542606178	0.33743479216402966	0.36095046503504774	0.166722915051571	0.16011762432647958	0.3111923099722287	0.246626448146844	0.333666485083	0.0698833862508	0.0658387268341	0.221756412245	0.397602565759	0.119339994516	0.226876581559	0.270885072145	0.0240855495486	0.179364149792	0.158583637061	0.0181189115857	9.09717950403e-05	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0762343642437	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr8:52811806..52811920,+__858.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr8:52811806..52811920,+__858.1.0.0	rs73681409,rs13264242	0.6565883818974819	0.48889842695541696	0.23396155107360134	0.2814315813914604	0.4794836581217338	0.525752119409651	0.4264025134204852	0.3008645209464967	0.2802273967710282	0.5515068848193225	0.5092238272042467	0.5164516258233074	0.4375660406528527	0.590582941508842	0.8358046377395605	0.4212056746268314	0.39679682853377995	0.3738109190349391	0.48757309433627893	0.5265666585104207	0.4829617483335822	0.6801710358812731	0.9308369637052922	0.7494082411509633	0.5648055710887099	0.5867103595375395	-0.06600544038863987	0.3469062107841435	0.18724412355323006	0.11536524714231955	-0.1056727390867947	-0.03817902507337212	0.10016414508993554	0.1820972273870855	0.39994363911024494	0.3793300788859697	0.24018441394671652	0.04835394526540249	0.14914431888468674	0.420456664513	0.226876581559	0.48504462162	0.957167318493	0.88258056334	0.677233097055	0.978575937473	0.716953652062	0.0741297894045	0.0162407194134	0.166665831608	0.301187193336	0.489145294644	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr8:61429297..61429411,-__863.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:61429297..61429411,-__863.1.0.0	rs80278351	0.17127851488009824	0.18199227175117894	-0.3715506918584053	-1.1627125341634732	0.2316502384032721	-0.02923064035583948	-1.2591828800534068	0.5107043117009991	-0.12410697770626158	0.9178420751818157	0.3785723227701832	-1.157790021713914	-0.14271116759697944	0.3916779395274968	-0.6121846409747732	0.1697889553465463	0.9606163797655016	0.41351505850820985	1.1244567486624484	0.6633142824317733	0.9599435865631653	-0.44775059075932494	-1.8143734937575438	-0.30324400482031905	-0.2670505635909975	0.10322580474184857	0.22039942464739856	-0.7941769127259521	0.5413396472049516	2.123328913928975	0.18186482010493776	1.153687389018288	1.92249716248518	0.4492392748621662	-0.32364361305306333	-2.7322155689393597	-0.6818163275905023	0.8907394581229167	0.24593697233882814	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr8:6264034..6264148,-__864.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr8:6264034..6264148,-__864.1.0.0	rs2916655	0.8502941499499437	1.415483432888219	0.5623460082979066	-1.6377227817771463	0.19322103303173216	-0.30159677843036503	1.419922390879451	0.6737104179831632	0.8064471914175405	-0.15896552925130344	1.118761674042526	0.4627284474903598	0.4503858047101688	0.5552708649330872	0.0214324947603729	0.015933570224470058	-0.6738409906976016	0.6048768540419902	-0.8411760143973366	0.14395031261381463	-0.137829587216203	0.8591992065275957	0.37834725765183136	-0.7414698256613962	-0.3679185813831849	-0.015268703216880017	-0.2950232850168565	-1.394050938127846	-0.5464124380734365	0.9638817910795446	0.41165582101025805	-0.5395792359669715	-1.2759720782656363	-0.8115400051993662	0.05275201511005523	0.5373127869031348	-1.860231499703922	-0.8306470288735447	-0.4656545079270489	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr8:6264034..6264148,-__864.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr8:6264034..6264148,-__864.1.0.0	rs2305023	0.8502941499499437	1.415483432888219	0.5623460082979066	-1.6377227817771463	0.19322103303173216	-0.30159677843036503	1.419922390879451	0.6737104179831632	0.8064471914175405	-0.15896552925130344	1.118761674042526	0.4627284474903598	0.4503858047101688	0.9038027662146022	0.49547226875875167	0.12922769126668288	1.014366063279413	0.299077289069956	0.4664056368497702	0.01255580150907585	1.0269913230872176	-0.33934980917554847	0.8756367363593747	0.6734215614427385	0.5574225970083602	0.5095858271391995	0.053508616264658526	-0.9200111641294675	-0.4331183170312237	2.652088845056559	0.10585625603822385	0.7680024152801352	-1.407366589370375	0.3532809051040544	-1.145797000593089	1.0346022656106781	-0.44534011259978745	0.09469414951800037	0.05920002242903055	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr8:6264034..6264148,-__864.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr8:6264034..6264148,-__864.1.0.0	rs2916655,rs2305023	0.8502941499499437	1.415483432888219	0.5623460082979066	-1.6377227817771463	0.19322103303173216	-0.30159677843036503	1.419922390879451	0.6737104179831632	0.8064471914175405	-0.15896552925130344	1.118761674042526	0.4627284474903598	0.4503858047101688	1.6746455193116059	1.201040946161285	0.9852619810518956	1.3793253780032781	1.0159853019637572	1.740768586752554	0.27994265476400093	1.2851407716664531	1.040644128447197	1.5281852889318222	0.9686139955297114	0.5933302086651138	1.141073730104056	0.8243513693616622	-0.2144424867269341	0.42291597275398896	3.0170481597804244	0.8227642689320251	2.042365365182919	-1.13997973611545	0.6114303536832899	0.2341969370296565	1.6871508181831256	-0.15014767851281452	0.13060176117475397	0.6906879253938872	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr8:6565702..6565816,-__866.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr8:6565702..6565816,-__866.1.0.0	rs28362552	-0.21419895153431256	-0.03039478512598734	-0.00762258495889398	-0.13697502410407036	-0.08357969887172116	-0.1284025784341736	0.10583821241908498	0.37804888897942146	-0.06683539803836316	-0.07126417564869002	0.03506177774354416	-0.006513116857836252	-0.01890311953599982	-0.2963975212824164	0.00344034175515869	-0.4013432230818089	-0.1006171272808001	-0.2928376457739263	-0.17113015767416706	0.03330465863012455	0.05741698458438164	0.0028665079418357673	-0.20863712155093317	-0.2613946155343169	0.011057447045989884	-0.13535595601840653	-0.08219856974810386	0.03383512688114603	-0.3937206381229149	0.03635789682327026	-0.20925794690220512	-0.04272757923999346	-0.07253355378896043	-0.3206319043950398	0.06970190598019893	-0.13737294590224314	-0.2964563932778611	0.017570563903826136	-0.11645283648240669	1.0	0.87199428352	0.619326784864	0.716953652062	0.354199901149	0.364754193662	0.76769033028	0.119339994516	0.326996172605	0.420456664513	0.737113058664	0.914457985151	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr8:6565702..6565816,-__866.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr8:6565702..6565816,-__866.1.0.0	rs118051369	-0.21419895153431256	-0.03039478512598734	-0.00762258495889398	-0.13697502410407036	-0.08357969887172116	-0.1284025784341736	0.10583821241908498	0.37804888897942146	-0.06683539803836316	-0.07126417564869002	0.03506177774354416	-0.006513116857836252	-0.01890311953599982	-0.11641200387451855	-0.24021276400193073	-0.39388918694593217	-0.3710387658038621	-0.19486473312242192	-0.09542699877320583	-0.26969266967427946	-0.005945995855446376	-0.2570638860978812	-0.032718559646270816	0.013718482119296094	-0.23249017949744022	-0.18300310509782444	0.09778694765979401	-0.2098179788759434	-0.3862666019870382	-0.23406374169979172	-0.11128503425070076	0.03297557966096777	-0.37553088209336444	-0.3839948848348678	-0.19022848805951806	0.0385456160024192	-0.021343295624248065	-0.22597706263960396	-0.16409998556182462	0.375513989452	0.354199901149	0.762564839604	0.119339994516	0.581967350665	0.946473618223	0.444064484515	0.0125089884503	0.628827692687	0.581967350665	0.66743649171	0.326996172605	0.364735343964	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr8:6565702..6565816,-__866.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr8:6565702..6565816,-__866.1.0.0	rs28362552,rs118051369	-0.21419895153431256	-0.03039478512598734	-0.00762258495889398	-0.13697502410407036	-0.08357969887172116	-0.1284025784341736	0.10583821241908498	0.37804888897942146	-0.06683539803836316	-0.07126417564869002	0.03506177774354416	-0.006513116857836252	-0.01890311953599982	-0.5265095475586031	-0.21830578539171644	-0.3872262963787487	-0.4979891226304094	-0.13815253938663677	-0.25970721511349626	-0.1573139996418378	-0.008282456654106327	-0.20901451739080867	-0.09800117740094656	0.04190107564115578	-0.35666849157259584	-0.23460583945656252	-0.31231059602429057	-0.1879110002657291	-0.3796037114198547	-0.36101409852633903	-0.05457284051491561	-0.13130463667932266	-0.26315221206092276	-0.3863313456335278	-0.1421791193524455	-0.026737001752256545	0.006839297897611618	-0.3501553747147596	-0.21570271992056264	0.265084565602	0.706946403854	0.914457985151	0.158583637061	0.609889042629	0.90381429355	0.125844655769	0.0232568344756	0.609889042629	0.468411351413	0.382791178922	0.0515422504639	0.193425448916	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr8:82066455..82066569,+__870.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:82066455..82066569,+__870.1.0.0	rs80057743	1.4003717470809391	1.4460911766261213	1.5309903253424118	1.3722443004183107	1.4072588573121716	1.370753717709407	0.8450739618082523	1.0661469728726067	1.3967281979856527	1.4942689169917225	1.5638102672665362	1.5674058447229666	1.3717620238447579	1.5394425378614445	1.8830668107760935	1.8585910320840067	1.693487264378867	1.6796404947480565	1.8431068317088153	1.3198730270289414	1.2985849915780316	1.6433217259772654	1.7069433342916103	1.7172849686396081	1.619565398745227	1.6502423681514973	0.13907079078050533	0.4369756341499722	0.3276007067415949	0.3212429639605563	0.27238163743588495	0.4723531139994084	0.47479906522068904	0.2324380187054249	0.24659352799161272	0.21267441729988779	0.15347470137307195	0.05215955402226036	0.2784803443067391	0.0856734395523	0.0306357720046	0.0338805621681	0.0187859264625	0.0181189115857	0.00105204507021	0.101398170673	0.101398170673	0.0678362651725	0.0678362651725	0.119339994516	0.259370210024	6.80528138974e-09	1	1	1	1	1	0.80376243364	1	1	1	1	1	1	5.7028258046e-06	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr8:96280983..96281097,+__884.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr8:96280983..96281097,+__884.1.0.0	rs62524394	-0.6897835256704514	-0.7462025224853006	0.12504825285493315	0.0160620593945271	-0.10935755006623678	-0.9707943168280726	-1.5758232146977216	-0.9569768128335618	-0.7756919257314722	0.09224731037358172	-0.5235350331752444	0.6690512531695162	-0.453813002141292	-0.34779198935111244	0.8237576262854888	0.03316705510231347	-0.5111018893271572	0.4705496580479537	0.021115802024077285	-0.822889122458879	1.0153924209940814	0.2184583113123341	-0.07557786973312094	0.25129026742402427	-0.49104589357098327	0.04877703139575167	0.341991536319339	1.5699601487707895	-0.09188119775261969	-0.5271639487216843	0.5799072081141905	0.9919101188521499	0.7529340922388426	1.9723692338276433	0.9941502370438062	-0.16782518010670266	0.7748253005992687	-1.1600971467404995	0.5025900335370437	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr9:102582142..102582256,-__886.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:102582142..102582256,-__886.1.0.0	rs7467433	0.8623373400768702	0.03535992001619713	0.5181048730199384	0.27224236513835565	0.2182394042443613	-0.1689221653624565	0.7624185965717004	0.7991009820422678	0.3452108251136058	0.8519037311531586	0.218300875484999	0.30932086160145794	0.41863480075837134	0.15649204956887955	-0.0036323623720326452	0.15724688884159782	0.6203186707339946	1.0184825452583248	0.6948303999629686	0.24741628914792121	0.9281166235656874	-0.07862566476460545	0.46235639214346835	0.714937707274427	1.299291222467431	0.5181025634856719	-0.7058452905079907	-0.03899228238822978	-0.36085798417834053	0.34807630559563896	0.8002431410139635	0.8637525653254251	-0.5150023074237792	0.1290156415234196	-0.4238364898782112	-0.3895473390096903	0.49663683178942797	0.9899703608659729	0.09946776272730051	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr9:119051004..119051118,-__888.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:119051004..119051118,-__888.1.0.0	rs12001266	-1.7168069400799502	-1.52191155348542	-2.091876167810744	-1.6313762709508326	-2.0703639480604084	-1.5375058534879131	-1.689952991845395	-1.4320771454547618	-1.9421355441465007	-2.042887855191792	-2.09900075024247	-1.6617081193542966	-1.7864669283425405	-1.2921912476744497	-1.3175166946792474	-1.3676570049529535	-1.6087586657146202	-1.73237870889656	-1.4821034907948192	-1.6012136370021155	-1.146126237245065	-1.3802722303051786	-1.6182802589362908	-1.6434890345849489	-1.6136965543675388	-1.4836403137628158	0.42461569240550046	0.20439485880617259	0.7242191628577905	0.022617605236212368	0.33798523916384826	0.055402362693093954	0.08873935484327955	0.28595090820969693	0.561863313841322	0.42460759625550115	0.45551171565752124	0.04801156498675785	0.3028266145797247	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr9:119051004..119051118,-__888.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:119051004..119051118,-__888.1.0.0	rs115837817	-1.7168069400799502	-1.52191155348542	-2.091876167810744	-1.6313762709508326	-2.0703639480604084	-1.5375058534879131	-1.689952991845395	-1.4320771454547618	-1.9421355441465007	-2.042887855191792	-2.09900075024247	-1.6617081193542966	-1.7864669283425405	-1.5305831558217118	-1.4399632873451786	-1.9046573487461231	-1.7026435884702469	-1.7155927119915375	-1.4787825549185418	-1.640183100237844	-1.6078926542508902	-1.6314404442271795	-1.7501661652909455	-1.6697349270553723	-1.2276866921322993	-1.6082772192073227	0.18622378425823838	0.08194826614024131	0.1872188190646209	-0.07126731751941429	0.35477123606887084	0.05872329856937131	0.049769891607551076	-0.1758155087961284	0.3106950999193212	0.29272168990084646	0.42926582318709783	0.4340214272219973	0.1781897091352178	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr9:119051004..119051118,-__888.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:119051004..119051118,-__888.1.0.0	rs12001266,rs115837817	-1.7168069400799502	-1.52191155348542	-2.091876167810744	-1.6313762709508326	-2.0703639480604084	-1.5375058534879131	-1.689952991845395	-1.4320771454547618	-1.9421355441465007	-2.042887855191792	-2.09900075024247	-1.6617081193542966	-1.7864669283425405	-1.8909664002093727	-1.7139351320722556	-1.8598127678013645	-1.742165901471877	-1.8379497196995391	-1.547387181718801	-1.5831415461536646	-1.7287908781945656	-1.492621071955731	-1.9667378981575279	-1.8389565859447203	-1.6191544550960333	-1.7351349615396214	-0.17415946012942252	-0.1920235785868356	0.23206340000937953	-0.11078963052104451	0.23241422836086922	-0.009881328230887831	0.1068114456917304	-0.2967137327398037	0.4495144721907698	0.07614995703426408	0.2600441642977498	0.042553664258263346	0.05133196680291933	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr9:12814341..12814455,-__891.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:12814341..12814455,-__891.1.0.0	rs80103914	-0.7517860100073884	-0.4666170411717081	-0.6368449217088472	-0.6040519569769505	-0.675576879160504	-0.4069572904702823	-0.35026157705047556	-0.4555712230918652	-0.3408363197845564	-0.30384015521108443	-0.25981923353241093	-0.42128393633592837	-0.47278721204183344	-0.8894459487119084	-0.7058523188788666	-1.1730091030906922	-0.8478946162596978	-0.9677192790609117	-0.6021135015179493	-0.8942580136944448	-0.708482845170763	-0.6540478246914186	-0.4891378268907721	-0.7906322663950897	-0.851858254089217	-0.7978709832043109	-0.13765993870451998	-0.23923527770715847	-0.536164181381845	-0.2438426592827473	-0.2921423999004077	-0.195156211047667	-0.5439964366439692	-0.2529116220788978	-0.3132115049068622	-0.1852976716796877	-0.5308130328626788	-0.43057431775328864	-0.32508377116247744	NA__no_active_tile	0.301187193336	0.0808926541269	0.188220673538	0.259370210024	0.234708652176	0.0362033618716	0.107123399254	0.166665831608	0.0548446397145	0.0201846528804	0.0209174885683	1.45672152994e-05	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0122073264209	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr9:12814341..12814455,-__891.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:12814341..12814455,-__891.1.0.0	rs75648584	-0.7517860100073884	-0.4666170411717081	-0.6368449217088472	-0.6040519569769505	-0.675576879160504	-0.4069572904702823	-0.35026157705047556	-0.4555712230918652	-0.3408363197845564	-0.30384015521108443	-0.25981923353241093	-0.42128393633592837	-0.47278721204183344	-0.40922037066498695	-0.19362765625346176	-0.3863815372319457	-0.14006065054306086	-0.2907806103834141	-0.2111477620884802	-0.44961351114932707	-0.40307262278003375	-0.19219797794184856	-0.3794679095299736	-0.39173068542594314	-0.3073523952471223	-0.31288780743663314	0.3425656393424015	0.2729893849182463	0.25046338447690153	0.46399130643388964	0.38479626877708994	0.19580952838180207	-0.09935193409885151	0.052498600311831456	0.14863834184270786	-0.07562775431888918	-0.1319114518935322	0.11393154108880604	0.15989940460520027	0.122558611289	0.136115392203	0.253741740693	0.0168468410067	0.00993701022923	0.313917214294	0.677233097055	0.677233097055	0.79863356553	0.405136064622	0.197395731844	0.401353314521	0.0158168469152	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr9:12814341..12814455,-__891.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:12814341..12814455,-__891.1.0.0	rs80103914,rs75648584	-0.7517860100073884	-0.4666170411717081	-0.6368449217088472	-0.6040519569769505	-0.675576879160504	-0.4069572904702823	-0.35026157705047556	-0.4555712230918652	-0.3408363197845564	-0.30384015521108443	-0.25981923353241093	-0.42128393633592837	-0.47278721204183344	-0.548793449978254	-0.5159040204789485	-0.5788216278638003	-0.7751896818557038	-0.9506661587871928	-0.7543816377984949	-0.5578384518609273	-0.568507413779527	-0.610198999055868	-0.6172670905497937	-0.6224606961027761	-0.6466268756191621	-0.6455546753108706	0.20299256002913446	-0.04928697930724035	0.0580232938450469	-0.17113772487875334	-0.27508927962668883	-0.3474243473282126	-0.20757687481045173	-0.11293619068766175	-0.26936267927131163	-0.31342693533870924	-0.36264146257036517	-0.22534293928323373	-0.17276746326903725	NA__no_active_tile	0.85089220831	0.79863356553	0.0638899216795	0.340423946445	0.0426112802219	0.0986283746992	0.175053819161	0.0678362651725	0.0224529881577	0.0426112802219	0.0785847853765	0.000671213060806	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.152365364803	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr9:131486644..131486758,+__893.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:131486644..131486758,+__893.1.0.0	rs2275625	-0.42954142783442373	-0.6936394779885552	-1.5245766122877291	0.4844307313453218	-0.4337902145320728	-0.8805374482964308	-1.6157317700414544	-0.6445977050366793	-1.4091253312717518	-1.1438238113222319	-0.8070822288166558	-0.7712460216417263	-0.8224384431436991	1.2361084737805486	1.6560121985150549	0.7871244518121037	0.2559770497742824	1.765997598654408	1.313868237794897	1.2354513683402184	1.0130753426510004	0.8709633736328093	1.1726871650778259	1.1867257735551289	1.2655458516646267	1.1466280737710752	1.6656499016149722	2.34965167650361	2.311701064099833	-0.2284536815710394	2.199787813186481	2.1944056860913275	2.851183138381673	1.6576730476876798	2.280088704904561	2.3165109764000578	1.9938080023717846	2.036791873306353	1.9690665169147745	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr9:131486644..131486758,+__893.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:131486644..131486758,+__893.1.0.0	rs2275625,rs2275624	-0.42954142783442373	-0.6936394779885552	-1.5245766122877291	0.4844307313453218	-0.4337902145320728	-0.8805374482964308	-1.6157317700414544	-0.6445977050366793	-1.4091253312717518	-1.1438238113222319	-0.8070822288166558	-0.7712460216417263	-0.8224384431436991	1.9504377710093916	0.8775936329664622	0.20946189835495266	0.14097434926200925	1.2818460549131878	0.4970344507503307	-0.4271690867031945	0.07376113101702803	0.3757637763172988	0.5694588472073369	1.9333841256681208	1.2046077060285236	0.7239295547326207	2.3799791988438153	1.5712331109550175	1.7340385106426819	-0.34345638208331253	1.7156362694452607	1.3775718990467616	1.1885626833382599	0.7183588360537074	1.7848891075890505	1.7132826585295686	2.7404663544847767	1.97585372767025	1.5463679978763194	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr9:132251325..132251439,+__898.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:132251325..132251439,+__898.1.0.0	rs80012795	-1.227823925756978	-1.3632092954750628	-1.1872864577173963	-1.339680284982601	-1.2563031719153683	-1.3121661318600792	-1.4331193279570598	-1.3152327216864368	-1.4427585088364967	-1.3576296132081236	-1.1815420520962645	-1.2954132305257295	-1.3093470601681332	-1.5215956614867656	-1.7134061611013092	-1.4701558323841983	-1.4965560683996384	-1.322566148998975	-1.4970654287089373	-1.3017846956867152	-1.4521830863806127	-1.327406523271131	-1.3773816525999432	-1.2619609252643165	-1.2300286460509315	-1.4143409025277895	-0.29377173572978754	-0.3501968656262464	-0.28286937466680206	-0.15687578341703734	-0.06626297708360673	-0.18489929684885809	0.1313346322703446	-0.13695036469417587	0.11535198556536574	-0.019752039391819576	-0.08041887316805196	0.065384584474798	-0.10499384235965643	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr9:136890491..136890605,+__901.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:136890491..136890605,+__901.1.0.0	rs433994	0.3966284481561477	-0.3039809151669229	-1.898662558852371	0.8763151148924968	-1.390040738997599	0.01695064588913686	0.09204994692072807	1.1277754335251244	-0.025541939131012287	-0.7968888283525557	-0.5521527948211402	-0.48096036395626196	-0.24487571249118578	-0.5318458220955419	-0.9368094752957418	-0.917802541248985	-0.15529008424062418	-0.3028079658008029	-1.0217454426012278	-1.7597445008722588	-0.8169207934648024	-0.994325039753156	-0.17197412177314614	-0.9450335330454309	-0.26308177984398207	-0.7347817583363083	-0.9284742702516895	-0.6328285601288188	0.9808600176033859	-1.031605199133121	1.0872327731967961	-1.0386960884903647	-1.8517944477929869	-1.9446962269899268	-0.9687831006221437	0.6249147065794096	-0.3928807382242907	0.2178785841122799	-0.4899060458451225	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr9:136890491..136890605,+__901.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:136890491..136890605,+__901.1.0.0	rs401826	0.3966284481561477	-0.3039809151669229	-1.898662558852371	0.8763151148924968	-1.390040738997599	0.01695064588913686	0.09204994692072807	1.1277754335251244	-0.025541939131012287	-0.7968888283525557	-0.5521527948211402	-0.48096036395626196	-0.24487571249118578	0.5730084789400443	-0.3089722388648592	-0.6132787205126388	-0.25404164802301854	-1.5280326742385872	0.374818780221147	-2.108866751018448	-0.7134781773393529	-0.8607456107628412	-0.6845885236850603	-0.1663384307633499	-0.0012763000450201172	-0.524315984674332	0.17638003078389658	-0.004991323697936312	1.2853838383397322	-1.1303567629155153	-0.13799193524098818	0.35786813433201015	-2.2009166979391757	-1.8412536108644773	-0.8352036716318288	0.11230030466749541	0.38581436405779035	0.47968406391124185	-0.2794402721831463	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr9:136890491..136890605,+__901.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:136890491..136890605,+__901.1.0.0	rs433994,rs401826,rs115771424	0.3966284481561477	-0.3039809151669229	-1.898662558852371	0.8763151148924968	-1.390040738997599	0.01695064588913686	0.09204994692072807	1.1277754335251244	-0.025541939131012287	-0.7968888283525557	-0.5521527948211402	-0.48096036395626196	-0.24487571249118578	-0.1649457552936882	-0.4531675625762186	-0.5324751257246408	-1.3679088383531337	-0.3675893125240415	-0.53296469093782	-0.5731130544686561	-1.6842295779514052	-0.9327685364064454	-0.8047826432541009	-0.7922450983358085	-0.6542309349299534	-0.7383684275629928	-0.5615742034498359	-0.14918664740929571	1.3661874331277302	-2.2442239532456307	1.0224514264735576	-0.5499153368269568	-0.6651630013893842	-2.8120050114765296	-0.9072265972754331	-0.00789381490154517	-0.24009230351466826	-0.17327057097369147	-0.4934927150718071	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr9:136890532..136890646,+__902.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr9:136890532..136890646,+__902.1.0.0	rs433994	-0.7745635322095329	-0.3600102487376632	0.11279423475828815	0.29874545671950786	-1.584290357682117	-1.7991786592837988	0.045808953197196786	-1.526003704631917	-0.7974982051238616	-0.47582404469837924	-0.3600404470631173	-0.5115296362715672	-0.6442991825855802	-0.1662326791273593	-0.464164855042053	2.3969594689939253	-0.035738273152891915	0.6398132026268222	0.4263694832397038	-1.7476186422449913		2.118038574156834	-0.26527084314425625	1.3451917507994273	0.41016053857206164	0.42340979324338385	0.6083308530821736	-0.10415460630438983	2.2841652342356373	-0.33448372987239977	2.224103560308939	2.2255481425235026	-1.793427595442188		2.9155367792806954	0.210553201554123	1.7052321978625447	0.9216901748436288	0.9875540192792971	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr9:136890532..136890646,+__902.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr9:136890532..136890646,+__902.1.0.0	rs401826	-0.7745635322095329	-0.3600102487376632	0.11279423475828815	0.29874545671950786	-1.584290357682117	-1.7991786592837988	0.045808953197196786	-1.526003704631917	-0.7974982051238616	-0.47582404469837924	-0.3600404470631173	-0.5115296362715672	-0.6442991825855802	2.366558519778851	1.153270982669039	1.496918361356704	0.504044070469532	-1.8549488264218241	-2.98920503121397	2.1955915268809965	-1.2351210707723326		-1.0703752102559283	-0.8931290598886689	-0.5554607272836705	-0.08016876951647929	3.141122051988384	1.5132812314067023	1.3841241265984159	0.20529861375002417	-0.2706584687397071	-1.1900263719301714	2.1497825736837997	0.29088263385958446		-0.594551165557549	-0.5330886128255516	-0.04393109101210324	0.5502032292019844	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr9:136890532..136890646,+__902.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr9:136890532..136890646,+__902.1.0.0	rs115771424	-0.7745635322095329	-0.3600102487376632	0.11279423475828815	0.29874545671950786	-1.584290357682117	-1.7991786592837988	0.045808953197196786	-1.526003704631917	-0.7974982051238616	-0.47582404469837924	-0.3600404470631173	-0.5115296362715672	-0.6442991825855802																											NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr9:136890532..136890646,+__902.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr9:136890532..136890646,+__902.1.0.0	rs433994,rs401826,rs115771424	-0.7745635322095329	-0.3600102487376632	0.11279423475828815	0.29874545671950786	-1.584290357682117	-1.7991786592837988	0.045808953197196786	-1.526003704631917	-0.7974982051238616	-0.47582404469837924	-0.3600404470631173	-0.5115296362715672	-0.6442991825855802	-1.3031767356329576	-1.1148085202893367	-1.8116356068720345	-0.20117590397088822	-0.617761158997423	-1.2927210872476795	-0.37974871912305774	-0.7729340532231417	-0.15498796841426615	-0.9814003017579916	0.0040602578916876615	-1.5705683260700969	-0.849738176975599	-0.5286132034234247	-0.7547982715516736	-1.9244298416303227	-0.49992136069039605	0.966529198684694	0.5064575720361193	-0.42555767232025454	0.7530696514087754	0.6425102367095954	-0.5055762570596124	0.36410070495480495	-1.0590386897985296	-0.20543899439001875	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr9:138799602..138799716,+__903.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:138799602..138799716,+__903.1.0.0	rs62585193	1.6577891764811443	2.153638971972612	2.012414115641123	1.5464105830235084	1.941346550706469	1.9195808641450436	1.8344701000261208	2.016380462870252	2.0290780858575017	1.883034577110992	1.832219501574493	2.042713148494419	1.9057563448253063	1.9173051025856316	2.1806313175393566	1.4235016600610304	1.6420288785749015	1.5081346949521104	1.7731026277975068	2.093451200712533	1.7645894219498064	1.849812596368605	1.841432769166408	1.9861701115327242	2.028818166348906	1.8340815456324597	0.25951592610448726	0.026992345566744458	-0.5889124555800926	0.09561829555139312	-0.4332118557543587	-0.14647823634753676	0.25898110068641245	-0.2517910409204458	-0.17926548948889676	-0.0416018079445839	0.15395060995823107	-0.01389498214551299	-0.0716747991928466	0.721972635732	0.444064484515	0.216719559135	0.554657938956	0.87199137816	0.79863356553	0.13967914143	0.301181659941	0.696989544957	0.545696106059	0.452098798395	0.379136386009	0.543038748499	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.flip.sense__chr9:139622601..139622715,-__904.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr9:139622601..139622715,-__904.1.0.0	rs9411221	4.115712722351347	4.31889183261356	3.855068886441069	3.6271506640936026	4.076248042087181	4.106614876825152	3.824022458484694	4.303957121155609	4.311931762068508	4.273255354126547	4.2929346341676435	4.295665223383772	4.116787798149891	3.8440229147356755	4.236590506037458	3.711915415057465	3.3032906048671595	3.807184265038421	3.805822258754114	3.584663199414795	4.246727567153062	4.09468976303026	4.101909952549377	4.190044978491278	4.13395111322893	3.9217343781965	-0.2716898076156715	-0.08230132657610234	-0.14315347138360401	-0.3238600592264431	-0.2690637770487605	-0.3007926180710374	-0.2393592590698992	-0.05722955400254648	-0.21724199903824815	-0.17134540157716938	-0.10288965567636588	-0.1617141101548425	-0.19505341995339087	0.00192430688789	0.0601351299193	0.0741297894045	0.0249397487324	0.00078853414695	5.62183900058e-05	0.0107365258413	0.179364149792	0.000122951138804	0.00441948685714	0.00937182550479	0.136115392203	4.79759897134e-16	1	1	1	1	0.608748361446	0.0429508499644	1	1	0.0950412302957	1	1	1	4.02038793798e-13	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.flip.sense__chr9:139622601..139622715,-__904.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.flip.sense__chr9:139622601..139622715,-__904.1.0.0	rs538831931,rs9411221	4.115712722351347	4.31889183261356	3.855068886441069	3.6271506640936026	4.076248042087181	4.106614876825152	3.824022458484694	4.303957121155609	4.311931762068508	4.273255354126547	4.2929346341676435	4.295665223383772	4.116787798149891	3.6921710966651053	3.99937846567751	3.422387958609021	3.0987528227098906	3.6059866540078085	3.601320089487115	3.384522619525086	3.8066805303191833	3.8495528776226746	3.9152756846531425	3.8146412771827336	3.9738584968053408	3.680377381105384	-0.42354162568624165	-0.31951336693605015	-0.43268092783204803	-0.528397841383712	-0.4702613880793729	-0.5052947873380367	-0.4394998389596081	-0.4972765908364254	-0.46237888444583364	-0.3579796694734041	-0.47829335698490993	-0.3218067265784317	-0.4364104170445062	3.14895644184e-05	5.30937746215e-05	0.00175684955224	0.000246746816615	1.53272450794e-06	3.38768884882e-06	0.000354775949455	6.43635880739e-06	6.04095401414e-06	2.34155615835e-05	1.75236973871e-06	0.000457487620218	2.92332113142e-43	0.00610897549718	0.0107249424735	0.349613060896	0.0466351483402	0.000314208524128	0.000680925458612	0.0709551898911	0.00125508996744	0.00124443652691	0.00487043680938	0.000359235796435	0.0942424497649	6.63593896833e-41	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr9:35657979..35658093,-__907.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr9:35657979..35658093,-__907.1.0.0	rs7024732	0.12286157696035968	0.08831686109936365	-0.03826250763509928	-0.24030313201468825	-0.2444325164495435	-0.27263753749572567	-0.16070151029118052	0.20091035416026545	-0.45982431807207186	-0.40184751987501066	-0.08328494978326928	-0.28410827413877565	-0.14777612279461466	-0.1737783568100082	-0.1648346249241464	-0.3324022345048616	-0.46072215559065777	-0.422550144904218	-0.4939641410440738	-0.3289383301858746	0.17204482680727803	-0.5401993133525811	-0.5802046940233273	-0.37755238085173093	-0.3029163334317464	-0.3338348235679957	-0.2966399337703679	-0.25315148602351006	-0.2941397268697623	-0.2204190235759695	-0.1781176284546745	-0.22132660354834816	-0.16823681989469408	-0.02886552735298742	-0.08037499528050923	-0.17835717414831664	-0.29426743106846165	-0.018808059292970747	-0.18605870077338105	0.088148079887	0.282745459933	0.202104162379	0.554657938956	0.248198866138	0.788281320858	0.545696106059	0.326996172605	0.460214637573	0.143314270352	0.122558611289	0.591208103411	0.0771829723474	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr9:35657979..35658093,-__907.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr9:35657979..35658093,-__907.1.0.0	rs3829076	0.12286157696035968	0.08831686109936365	-0.03826250763509928	-0.24030313201468825	-0.2444325164495435	-0.27263753749572567	-0.16070151029118052	0.20091035416026545	-0.45982431807207186	-0.40184751987501066	-0.08328494978326928	-0.28410827413877565	-0.14777612279461466	0.3583472084198807	0.5365124298495283	-0.31501207293524325	-0.3616603759627687	-0.09912926982040268	-0.13206920340364825	0.06909413175815043	0.44139124325323664	-0.3490828981053969	-0.2801299312017247	-0.028947620537566596	-0.07231823395690959	-0.01941704938690538	0.23548563145952103	0.44819556875016464	-0.27674956530014394	-0.12135724394808042	0.14530324662914082	0.14056833409207742	0.22979564204933095	0.2404808890929712	0.11074141996667497	0.12171758867328597	0.054337329245702684	0.21179004018186606	0.12835907340770927	0.519249062249	0.0619890035232	0.501992688725	0.88258056334	0.390154148302	0.170821264488	0.162586850726	0.143314270352	0.166665831608	0.460214637573	0.326996172605	0.48504462162	0.0693412926345	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr9:35657979..35658093,-__907.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr9:35657979..35658093,-__907.1.0.0	rs12551232	0.12286157696035968	0.08831686109936365	-0.03826250763509928	-0.24030313201468825	-0.2444325164495435	-0.27263753749572567	-0.16070151029118052	0.20091035416026545	-0.45982431807207186	-0.40184751987501066	-0.08328494978326928	-0.28410827413877565	-0.14777612279461466	1.3221765795332292	1.2342596329526172	0.8511689241399476	0.5982482988260632	0.775579243190724	0.6476986198851857	1.0127694077421205	1.5256298998389082	0.6294973930581738	0.6088700489764052	0.8224906612681425	0.6460134404828782	0.8895335124911997	1.1993150025728696	1.1459427718532536	0.8894314317750469	0.8385514308407515	1.0200117596402676	0.9203361573809115	1.173470918033301	1.3247195456786427	1.0893217111302456	1.0107175688514158	0.9057756110514118	0.9301217146216538	1.0373096352858144	1.99292169026e-08	3.19261187764e-09	2.00209749007e-06	6.43635880739e-06	2.51442970215e-08	7.27316832781e-08	1.57825746834e-08	2.71058914141e-09	9.1955369021e-10	1.53272450794e-06	3.41788294666e-08	3.86551195752e-07	4.89705023322e-75	1.4109885567e-05	2.37530323696e-06	0.0014915626301	0.00474359644104	1.94113973006e-05	5.55670060244e-05	1.1663322691e-05	1.97059830581e-06	7.10815002532e-07	0.00120318873873	2.62835198598e-05	0.00030112338149	4.10372809544e-72	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.flip.sense__chr9:35657979..35658093,-__907.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr9:35657979..35658093,-__907.1.0.0	rs3829077	0.12286157696035968	0.08831686109936365	-0.03826250763509928	-0.24030313201468825	-0.2444325164495435	-0.27263753749572567	-0.16070151029118052	0.20091035416026545	-0.45982431807207186	-0.40184751987501066	-0.08328494978326928	-0.28410827413877565	-0.14777612279461466	1.5520948786355202	1.603270242414126	1.021512589486108	0.9609074557095165	1.0605999021317412	0.9185736603032617	1.2267855496299565	1.9951166037698478	0.8708796454699121	0.7861358149051477	1.1677397991617253	0.9343959783301039	1.174834343328914	1.4292333016751606	1.5149533813147624	1.0597750971212072	1.2012105877242047	1.3050324185812847	1.1912111977989874	1.387487059921137	1.7942062496095823	1.330703963541984	1.1879833347801583	1.2510247489449946	1.2185042524688796	1.3226104661235285	8.39899322416e-09	9.67857429079e-11	4.29483083715e-08	1.25214566711e-06	1.08804472643e-09	2.49693878412e-09	3.75770817515e-09	1.15574606291e-10	2.94200293519e-09	2.71570845885e-08	7.13508168948e-10	5.49047958631e-07	1.3585434133e-86	5.9464872027e-06	7.20085927235e-08	3.19964897367e-05	0.000922831356663	8.39970528804e-07	1.90766123107e-06	2.77694634144e-06	8.40227387735e-08	2.2741682689e-06	2.1318311402e-05	5.48687781921e-07	0.000427708359774	1.13845938034e-83	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.flip.sense__chr9:35657979..35658093,-__907.1.4.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.flip.sense__chr9:35657979..35658093,-__907.1.0.0	rs7024732,rs3829076,rs12551232,rs3829077	0.12286157696035968	0.08831686109936365	-0.03826250763509928	-0.24030313201468825	-0.2444325164495435	-0.27263753749572567	-0.16070151029118052	0.20091035416026545	-0.45982431807207186	-0.40184751987501066	-0.08328494978326928	-0.28410827413877565	-0.14777612279461466	2.8806152220718846	3.205329265914933	1.9632055542481863	1.7853003756848491	2.245874029416072	2.156461401126414	2.7017179726884617	3.46274845895086	2.067124323908851	2.130134124531744	2.3494642900803946	2.0427524625062534	2.415893956760742	2.7577536451115248	3.1170124048155694	2.0014680618832856	2.0256035076995373	2.4903065458656153	2.4290989386221398	2.862419482979642	3.2618381047905944	2.526948641980923	2.5319816444067547	2.432749239863664	2.326860736645029	2.5636700795553566	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.82483302974e-12	9.04126082625e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	8.23367049956e-12	6.21192327504e-12	7.49689041119e-12	1.04105897493e-121	1.20511311536e-09	1.25480850156e-09	1.35814177292e-09	1.70879829616e-09	1.27344427138e-09	1.24859657828e-09	1.24238465501e-09	1.21132503863e-09	1.27965619466e-09	1.71260346391e-09	1.27344427138e-09	1.5443594247e-09	2.36320387309e-119	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr9:37079834..37079948,+__908.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:37079834..37079948,+__908.1.0.0	rs2291588	3.1108805081098003	3.7441720934347433	2.8898333251249664	2.6426982694230436	3.1417238089788313	3.2090687329784333	3.016396342514743	3.2855896640044757	3.2493252620660864	3.1241985673408657	3.1104605339389373	3.1711532565524143	3.141291697038945	3.1476479398575954	3.512314597094972	2.9509197469024473	2.9428211813582372	3.2520257784772513	3.2781874962739455	3.0964900944432348	3.342643737339949	3.216294049245911	3.310688814751053	3.27395428581633	3.2606634067912186	3.215387594029345	0.036767431747795065	-0.23185749633977126	0.061086421777480915	0.3001229119351936	0.11030196949841997	0.06911876329551214	0.08009375192849166	0.05705407333547319	-0.033031212820175515	0.1864902474101875	0.16349375187739268	0.08951015023880426	0.07409589699040035	0.677233097055	0.8931878581	0.657696241675	0.340423946445	0.527990680582	0.510582765025	0.648013768535	0.946473618223	0.48504462162	0.29495293544	0.30750859871	0.476688253492	0.777770715227	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr9:74920389..74920503,+__911.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:74920389..74920503,+__911.1.0.0	rs34965542	-1.7774479044212614	-1.5288810415650227	-1.5348723631131465	-1.7162600374389303	-1.870709964686668	-1.3972656242665293	-1.4990733683815385	-1.3197977216495111	-1.3690357749617454	-1.609104835583545	-1.4572783013062411	-1.5512176734790353	-1.5525787175710979	-1.3680954921879893	-1.284951719556397	-1.2385093558298197	-1.366604552478293	-1.4994611985127375	-1.5944019118649573	-1.1781984764493725	-0.7486381433447798	-1.2555023942556474	-1.4222330631000208	-1.4221842940252696	-1.3498052432475829	-1.3107154870710722	0.4093524122332721	0.2439293220086256	0.29636300728332676	0.34965548496063725	0.37124876617393054	-0.19713628759842794	0.320874891932166	0.5711595783047313	0.11353338070609809	0.18687177248352405	0.03509400728097156	0.2014124302314524	0.24186323050002567	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr9:8858030..8858144,+__913.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:8858030..8858144,+__913.1.0.0	rs118166957	0.10331213226077805	-0.14798386551925613	-0.4593838700118592	-0.4503922934891059	-0.09305771960613865	-0.14789244210187485	-0.5276077720311999	-0.3612537568560483	-0.3514202297765041	0.026708121333083683	0.07652261240768382	-0.1439223627651875	-0.20636428717963573	-0.11535703049712302	-0.22188321433051372	-0.22088329659475683	-0.39556825386385575	-0.33625760539406463	-0.4076840097989862	-0.6971266243749589	-0.5480643566896102	-0.05259395031869415	-0.8018752228278494	-0.6786250688559526	-0.5835893228225943	-0.42162566303074667	-0.21866916275790108	-0.07389934881125759	0.23850057341710237	0.054824039625250176	-0.24319988578792598	-0.25979156769711137	-0.16951885234375896	-0.18681059983356185	0.29882627945781	-0.828583344160933	-0.7551476812636364	-0.43966696005740685	-0.2152613758511109	0.742176245913	0.436112310787	0.914457985151	0.989287003123	0.788278954998	0.510582765025	0.242735875888	0.957167318493	0.747262025795	0.195066735841	0.0432970632264	0.519249062249	0.884412013322	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr9:93195787..93195901,-__916.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:93195787..93195901,-__916.1.0.0	rs115851118	-0.8669261033596801	-0.8649633841617845	-0.9486711798624278	-1.1618550870245077	-0.8380478311901208	-0.7546194166918868	-0.9310375945664864	-1.089970843692694	-0.9291373430778876	-1.130270025410104	-1.1451369217063605	-0.7446848769309974	-0.9504433839729113	-1.0409763867567703	-0.7068759042541588	-0.8631480378184841	-0.888650919329157	-0.8796419852620208	-0.6237060319198092	-0.8507145928266949	-0.8377959655192145	-0.819015096317399	-0.8632750503579276	-0.756051095780559	-0.8675678477800626	-0.8331182428268549	-0.17405028339709017	0.15808747990762573	0.08552314204394362	0.2732041676953507	-0.041594154071899925	0.1309133847720776	0.08032300173979146	0.2521748781734795	0.11012224676048865	0.2669949750521763	0.38908582592580154	-0.12288297084906519	0.11732514114605663	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.90381429355	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.270885072145	NA__no_active_tile	0.688056338912	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr9:93195787..93195901,-__916.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:93195787..93195901,-__916.1.0.0	rs2114345	-0.8669261033596801	-0.8649633841617845	-0.9486711798624278	-1.1618550870245077	-0.8380478311901208	-0.7546194166918868	-0.9310375945664864	-1.089970843692694	-0.9291373430778876	-1.130270025410104	-1.1451369217063605	-0.7446848769309974	-0.9504433839729113	-0.8738042158759238	-0.17024561938503335	-0.3337496640913335	-0.8032439897571136	-0.4853014925030855	-0.848003266407551	-0.608471904482282	-0.5633031016181669	-0.3621294000377108	-0.5584279036649963	-0.7228246129306451	-0.46047925468010886	-0.5658320354528293	-0.006878112516243706	0.6947177647767512	0.6149215157710943	0.35861109726739404	0.3527463386870353	-0.09338384971566416	0.3225656900842043	0.5266677420745272	0.5670079430401769	0.5718421217451076	0.42231230877571535	0.2842056222508885	0.38461134852008216	NA__no_active_tile	0.122558611289	0.340423946445	NA__no_active_tile	0.00993701022923	0.87199428352	0.375513989452	0.0698833862508	0.101398170673	0.0412580447575	0.0601351299193	0.162586850726	0.000695843957852	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	0.58311723668	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr9:93195787..93195901,-__916.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:93195787..93195901,-__916.1.0.0	rs2114346,rs115851118,rs2114345	-0.8669261033596801	-0.8649633841617845	-0.9486711798624278	-1.1618550870245077	-0.8380478311901208	-0.7546194166918868	-0.9310375945664864	-1.089970843692694	-0.9291373430778876	-1.130270025410104	-1.1451369217063605	-0.7446848769309974	-0.9504433839729113	-0.9937645476018386	-0.4108445155391449	-0.5440192951404401	-0.807296255294065	-0.5604892848883365	-0.7401552043275981	-0.7314076811367922	-0.7592352687621369	-0.6303752599200108	-0.7396869183951834	-0.7963447055313839	-0.920062828382374	-0.719473480409942	-0.1268384442421585	0.4541188686226396	0.40465188472198765	0.35455883173044267	0.27755854630178434	0.014464212364288742	0.19962991342969416	0.33073557493055716	0.2987620831578769	0.3905831070149205	0.3487922161749766	-0.17537795145137658	0.23096990356296943	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.397602565759	NA__no_active_tile	0.0187859264625	0.696989544957	0.197395731844	NA__no_active_tile	0.313917214294	0.0327677521954	0.452098798395	NA__no_active_tile	0.0264615920958	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr9:94903461..94903575,+__917.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:94903461..94903575,+__917.1.0.0	rs10992251	-0.8521155593158777	-0.7038334945664344	-1.033237626738555	-1.1671876992095154	-0.7094947776766107	-0.9392501973557544	-0.6306189523383988	-0.8849643658354365	-0.9358272435616077	-1.1266812605944687	-1.0536924634982863	-0.8950295635373184	-0.9109944336856888	-1.0632485858719323	-0.8745254652122314	-0.9815655852773426	-1.0430853864952594	-0.8630508108343773	-0.8313436865471129	-0.8378191642824746	-0.7985555064647014	-0.9130125696273713	-0.9955896233405139	-0.7317125610114998	-0.7486563105415979	-0.8901804379588679	-0.2111330265560546	-0.170691970645797	0.051672041461212403	0.12410231271425598	-0.15355603315776656	0.10790651080864155	-0.20720021194407579	0.08640885937073506	0.022814673934236418	0.13109163725395478	0.32197990248678643	0.14637325299572057	0.020813995726820772	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.347268461228	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.563691144959	0.434743041086	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr9:94903461..94903575,+__917.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:94903461..94903575,+__917.1.0.0	rs10992251,rs3927571	-0.8521155593158777	-0.7038334945664344	-1.033237626738555	-1.1671876992095154	-0.7094947776766107	-0.9392501973557544	-0.6306189523383988	-0.8849643658354365	-0.9358272435616077	-1.1266812605944687	-1.0536924634982863	-0.8950295635373184	-0.9109944336856888	-1.0318155031226892	-1.0064891008563719	-0.7361768652095839	-0.9597775306032428	-0.6710691577215493	-0.7755388409031684	-1.2162352095542377	-1.2439914790099684	-0.7831705402247326	-1.2871928927350664	-0.7570540688135141	-1.0721318029781657	-0.9617202493110243	-0.17969994380681154	-0.3026556062899375	0.2970607615289711	0.2074101686062726	0.03842561995506144	0.16371135645258605	-0.5856162572158389	-0.35902711317453195	0.1526567033368751	-0.16051163214059772	0.29663839468477216	-0.17710223944084724	-0.050725815625335534	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.777966336216	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.777966336216	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr9:98189077..98189191,-__919.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:98189077..98189191,-__919.1.0.0	rs357525	1.1086060976931715	0.5629986467503357	-0.08526598218944166	-2.09667792241523	0.3305800039208833	-0.6282040777938563	0.22218648607659294	-0.9603157204584468	-0.7120283861623803	-0.47201174009932534	-0.24822571312228375	-0.7816648851228627	-0.3133352660769036	-0.6032086080683603	-0.9228112966129142	-0.6858338937884574	-1.0138521367458493	-0.2299147953316408	-0.20900947584860677	-0.30301220738673545	-0.5112825241189652	-0.5351873453707912	-0.7489540651084873	-0.46357027377189913	-0.024444620067288633	-0.5209234368516663	-1.7118147057615318	-1.48580994336325	-0.6005679115990157	1.0828257856693808	-0.5604947992525241	0.4191946019452496	-0.5251986934633284	0.4490331963394816	0.17684104079158913	-0.27694232500916194	-0.21534456064961538	0.757220265055574	-0.20758817077476266	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr9:98189077..98189191,-__919.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:98189077..98189191,-__919.1.0.0	rs535305821	1.1086060976931715	0.5629986467503357	-0.08526598218944166	-2.09667792241523	0.3305800039208833	-0.6282040777938563	0.22218648607659294	-0.9603157204584468	-0.7120283861623803	-0.47201174009932534	-0.24822571312228375	-0.7816648851228627	-0.3133352660769036	-0.5705854064827572	-1.1649185056256006	-1.0841912190643286	-0.9089804333066712	-0.7228297773370257	-0.5685907208822801	-1.2452300468456166	-1.1993164093064586	-0.4126071679276544	-1.0173725029744032	-0.07430381033484139	-0.5017727172987412	-0.7892248931155313	-1.6791915041759289	-1.7279171523759365	-0.9989252368748869	1.187697489108559	-1.053409781257909	0.05961335691157621	-1.4674165329222095	-0.23900068884801173	0.2994212182347259	-0.5453607628750778	0.17392190278744235	0.2798921678241215	-0.47588962703862797	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr9:98189077..98189191,-__919.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:98189077..98189191,-__919.1.0.0	rs357524	1.1086060976931715	0.5629986467503357	-0.08526598218944166	-2.09667792241523	0.3305800039208833	-0.6282040777938563	0.22218648607659294	-0.9603157204584468	-0.7120283861623803	-0.47201174009932534	-0.24822571312228375	-0.7816648851228627	-0.3133352660769036	-0.5079985960526276	0.13981985367568772	-0.4434695865588136	0.12228421647161293	-0.4802077246253333	-0.8411760143973366	-0.3742703573398949	0.09346960791603219	-0.44775059075932494	-0.6331705087714605	0.3056503001936962	0.9997505366126911	-0.1722557386362559	-1.6166046937457992	-0.423178793074648	-0.35820360436937193	2.2189621388868432	-0.8107877285462166	-0.21297193660348024	-0.5964568434164879	1.053785328374479	0.26427779540305535	-0.1611587686721352	0.5538760133159799	1.7814154217355538	0.1410795274406477	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr9:98189077..98189191,-__919.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:98189077..98189191,-__919.1.0.0	rs357525,rs535305821,rs357524	1.1086060976931715	0.5629986467503357	-0.08526598218944166	-2.09667792241523	0.3305800039208833	-0.6282040777938563	0.22218648607659294	-0.9603157204584468	-0.7120283861623803	-0.47201174009932534	-0.24822571312228375	-0.7816648851228627	-0.3133352660769036	-0.002272328650864665	-0.11598164243957647	-0.724984422361408	-1.0310417057863903	-0.7946729609611476	-1.094057674003662	-0.7150137435354346	-0.8441168108891666	-0.7764777944440255	0.09453112646746832	0.10355897884377292	-0.04852305680620378	-0.4957543362138865	-1.110878426344036	-0.6789802891899122	-0.6397184401719663	1.0656362166288398	-1.1252529648820309	-0.4658535962098057	-0.9372002296120275	0.11619890956928025	-0.06444940828164525	0.5665428665667936	0.35178469196605666	0.7331418283166589	-0.18241907013698286	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr9:98638226..98638340,-__922.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:98638226..98638340,-__922.1.0.0	rs75475951	2.18076953500448	2.5564136373652606	2.067653409960565	1.9949476434868432	2.356471348125474	2.2950637820848923	2.2470804882109565	2.6008249307217497	2.4603537810715106	2.2805942568883943	2.372376711882372	2.7052281948744468	2.3431481433064123	2.505508367137206	2.913606452180316	2.418163943577497	2.406111882850757	2.455414244049892	2.5455976109343306	2.2481169383702606	2.507554335004622	2.5346571356791117	2.6036483130174384	2.6761302011894603	2.621438170803735	2.5363289662328854	0.3247388321327258	0.3571928148150554	0.35051053361693185	0.4111642393639139	0.09894289592441785	0.2505338288494383	0.001036450159304092	-0.09327059571712759	0.07430335460760107	0.32305405612904403	0.3037534893070881	-0.08379002407071168	0.19318082292647343	0.129198935732	0.0932701621097	0.166665831608	0.276771967065	0.777963861227	0.554657938956	0.66743649171	0.202098998008	0.333666485083	0.347268461228	0.510582765025	0.343829805771	0.0870830694038	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr9:98638226..98638340,-__922.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:98638226..98638340,-__922.1.0.0	rs690528	2.18076953500448	2.5564136373652606	2.067653409960565	1.9949476434868432	2.356471348125474	2.2950637820848923	2.2470804882109565	2.6008249307217497	2.4603537810715106	2.2805942568883943	2.372376711882372	2.7052281948744468	2.3431481433064123	2.064294530496758	2.741372804594154	2.2910585387297675	2.191357612871062	2.2440742839522136	2.4147970232190805	2.30621629676618	2.465506511814996	2.3473536936844352	2.3278685871346725	2.544505749398631	2.652920671742081	2.3826105253670025	-0.11647500450772208	0.1849591672288935	0.2234051287692025	0.19640996938421873	-0.11239706417326056	0.11973324113418826	0.0591358085552236	-0.13531841890675356	-0.11300008738707534	0.04727433024627814	0.17212903751625896	-0.05230752313236575	0.03946238206059053	0.79863356553	0.288805731951	0.276771967065	0.21176555971	0.935788819786	0.428242856315	0.76769033028	0.361218104761	0.946473618223	0.706946403854	0.476688253492	0.313917214294	0.738769601594	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr9:98638226..98638340,-__922.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:98638226..98638340,-__922.1.0.0	rs56108623	2.18076953500448	2.5564136373652606	2.067653409960565	1.9949476434868432	2.356471348125474	2.2950637820848923	2.2470804882109565	2.6008249307217497	2.4603537810715106	2.2805942568883943	2.372376711882372	2.7052281948744468	2.3431481433064123	2.3216946886258167	2.539890728157041	2.053973113658439	2.0085203166608983	2.0982496584967953	2.179105030088486	1.6072787313005814	2.124173647106388	2.159192113327564	2.3189687186332093	2.2944942688363037	2.3533650550191694	2.1715755058258908	0.14092515362133673	-0.016522909208219527	-0.01368029630212586	0.013572673174055083	-0.25822168962867886	-0.11595875199640604	-0.6398017569103751	-0.4766512836153618	-0.30116166774394637	0.03837446174481496	-0.0778824430460685	-0.3518631398552774	-0.17157263748052107	0.591208103411	0.861430881609	0.609889042629	0.696989544957	0.199729519346	0.368322877114	0.0440018610392	0.0134887989876	0.301187193336	0.60051573606	0.510582765025	0.162586850726	0.112221003285	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Antisense.noflip.NA__chr9:98638226..98638340,-__922.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr9:98638226..98638340,-__922.1.0.0	rs75475951,rs690528,rs56108623	2.18076953500448	2.5564136373652606	2.067653409960565	1.9949476434868432	2.356471348125474	2.2950637820848923	2.2470804882109565	2.6008249307217497	2.4603537810715106	2.2805942568883943	2.372376711882372	2.7052281948744468	2.3431481433064123	1.9639035851019333	2.140244502292316	1.8342985379099677	1.6501701470118677	1.9577972526011285	2.282600986956879	2.0411109762133046	1.7642461350977932	2.170519154503142	2.072604007111493	1.995085036818817	2.101964612000019	1.9978787444682216	-0.2168659499025467	-0.4161691350729444	-0.23335487205059735	-0.34477749647497546	-0.39867409552434574	-0.012462795128013404	-0.2059695119976519	-0.8365787956239565	-0.28983462656836867	-0.2079902497769015	-0.3772916750635551	-0.6032635828744279	-0.34526939883819036	0.420456664513	0.313917214294	0.572794651112	0.232080506959	0.0619770559193	0.554657938956	0.170821264488	0.00167824394514	0.361218104761	0.0531733827136	0.04542809053	0.00501178746069	0.000115695924775	1	1	1	1	1	1	1	0.327257569303	1	1	1	1	0.026262974924	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr9:99449259..99449373,+__923.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr9:99449259..99449373,+__923.1.0.0	rs10978594	0.389000394505934	0.4841832985671922	-0.04562042185282907	-0.1061901372764799	0.7499776684721005	0.08127107113318638	0.20357566139598932	0.11153295866344637	0.06925962934019089	0.34376840600518077	0.3873598625306414	0.18299950050699956	0.2375931576659627	-0.36578611728909993	0.050605784337672655	-0.2092338467940392	-0.25485181051196604	-0.11943081980446925	-0.4546317479402123	-0.1373358048306204	-0.1794471763122553	-0.012647831892218206	-0.2752313587751061	-0.25830207958761425	-0.08906705576154443	-0.1921133220967894	-0.7547865117950339	-0.43357751422951957	-0.16361342494121012	-0.14866167323548612	-0.8694084882765697	-0.5359028190733988	-0.3409114662266097	-0.29098013497570163	-0.08190746123240909	-0.618999764780287	-0.6456619421182557	-0.272066556268544	-0.42970647976275206	0.0150857114019	0.0426112802219	0.0808926541269	0.162586850726	0.000751093855117	0.000715310039185	0.0350255264852	0.0350255264852	0.412754243182	0.00039289737638	0.0111573361887	0.0785847853765	5.44766054941e-12	1	1	1	1	0.579844456151	0.546496869938	1	1	1	0.308424440459	1	1	4.56513954041e-09	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chrX:102024009..102024123,+__924.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chrX:102024009..102024123,+__924.1.0.0	rs2499827	3.521221658896952	4.083667054012883	3.4336200872586566	3.2032756502957973	3.5714039174489782	3.6437313892522663	3.464502149937341	3.784254021549839	3.6661721971992955	3.703397704866789	3.743373551949423	3.748118492568394	3.6305614896030516	3.6132734193953855	4.10219620383596	3.5026270668053465	3.2440977192809917	3.6659717332419826	3.7378763097654297	3.4683713238131904	3.8423209471207844	3.7594613801472456	3.7256466304985194	3.732549104257327	3.7742933695386256	3.680723767308399	0.09205176049843367	0.01852914982307663	0.06900697954668988	0.04082206898519436	0.09456781579300433	0.09414492051316348	0.0038691738758491745	0.058066925570945394	0.09328918294795008	0.0222489256317302	-0.010824447692096228	0.026174876970231686	0.05016227770534772	0.777966336216	0.967868733231	0.706946403854	0.88258056334	0.79863356553	0.88258056334	0.989287003123	0.519249062249	0.747262025795	0.946473618223	0.79863356553	0.706946403854	0.999824135139	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chrX:102024009..102024123,+__924.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chrX:102024009..102024123,+__924.1.0.0	rs2499827,rs149119626	3.521221658896952	4.083667054012883	3.4336200872586566	3.2032756502957973	3.5714039174489782	3.6437313892522663	3.464502149937341	3.784254021549839	3.6661721971992955	3.703397704866789	3.743373551949423	3.748118492568394	3.6305614896030516	3.503697247705027	3.994393363327305	3.3758453238863946	3.1009888544868907	3.4976329887127875	3.554859838572805	3.381332954903895	3.7452194776913315	3.657022952115949	3.6538597633844887	3.6100621396042225	3.692720970844352	3.56396965626962	-0.017524411191924827	-0.089273690685578	-0.05777476337226206	-0.10228679580890665	-0.07377092873619073	-0.08887155067946129	-0.08316919503344611	-0.039034543858507575	-0.009149245083346358	-0.04953794148230051	-0.1333114123452006	-0.05539752172404189	-0.06659183333343055	0.519249062249	0.657696241675	0.361218104761	0.206893929435	0.237368605078	0.221756412245	0.175053819161	0.60051573606	0.412754243182	0.206893929435	0.63839046467	0.563691144959	0.163033338137	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chrX:114957217..114957331,+__927.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chrX:114957217..114957331,+__927.1.0.0	rs2301952	-0.723081373740291	-0.6296401677709438	-0.691180340859218	-0.5974151023872317	-0.6988458809591396	-0.48053866489153474	-0.5764475373237454	-0.579120988420887	-0.4505507760392231	-0.7340393448782022	-0.45150595637518115	-0.5896631323121966	-0.6001691054964828	-1.1712031378281513	-0.970946689440102	-0.9273864645866419	-0.9607313301332971	-1.0569289530974713	-1.1749403084599865	-1.0939433538029841	-0.8426469438720794	-0.8475530792873659	-1.072036159128741	-1.0278533326864518	-0.9677079554958112	-1.0094898089849236	-0.4481217640878603	-0.3413065216691582	-0.2362061237274239	-0.3633162277460654	-0.3580830721383317	-0.6944016435684518	-0.5174958164792387	-0.2635259554511924	-0.3970023032481428	-0.33799681425053885	-0.5763473763112708	-0.37804482318361465	-0.4093207034884408	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.122558611289	0.0426112802219	0.0125089884503	0.00153065306427	0.0619890035232	0.0209174885683	0.48504462162	0.00993701022923	0.00883703695038	0.0515422504639	5.95468177562e-09	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	4.99002332797e-06	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chrX:115085410..115085524,-__928.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chrX:115085410..115085524,-__928.1.0.0	rs5991048	-0.4835813638035613	-0.5080569712616823	-0.49540128184819454	-0.38159048750204383	-0.4245268722420813	-0.43458461109766205	-0.5248561768753304	-0.49785685078454534	-0.5134052882941217	-0.46023962491368875	-0.47007544033458015	-0.30968827149507316	-0.4586552700377137	-0.6462623574891305	-0.4802105947362265	-0.4338911466961393	-0.43309396436871156	-0.45836257525092583	-0.24219727844066363	-0.5052175466886741	-0.4741717452189287	-0.3809255811696799	-0.30652245999680283	-0.20257962390581363	-0.3069760623299044	-0.4058675780243	-0.1626809936855692	0.02784637652545574	0.06151013515205522	-0.05150347686666773	-0.03383570300884453	0.19238733265699842	0.019638630186656236	0.02368510556561665	0.1324797071244418	0.15371716491688592	0.2674958164287665	0.0027122091651687885	0.052787692013413656	0.619326784864	0.978575937473	0.757455001208	1.0	0.978575937473	0.206893929435	0.609889042629	0.788281320858	0.188220673538	0.0741297894045	0.354199901149	0.946473618223	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chrX:134555829..134555943,+__931.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chrX:134555829..134555943,+__931.1.0.0	rs57673335	0.14481922919811874	-0.5354400544018353	-0.6087806501972306	-0.8846842374859724	-0.40559830674005326	-0.7633219884503677	-0.7726789938787679	-0.2344642185241016	0.2594034636705753	-0.526460496772012	0.36943762842033023	-0.550937249363272	-0.3757254895437157	-0.6103142386971829	-0.2799993675394168	-0.7708953608045409	-0.7468498974583847	-0.23559332374854536	-0.3325900875782387	-0.8854136503758743	-0.422898870411361	-0.13942410175927814	-0.6081288640083218	-0.3254774997759311	-0.022531289880730047	-0.4483430460031505	-0.7551334678953017	0.2554406868624185	-0.1621147106073103	0.13783434002758765	0.1700049829915079	0.430731900872129	-0.11273465649710634	-0.18843465188725939	-0.3988275654298534	-0.08166836723630977	-0.6949151281962613	0.528405959482542	-0.07261755645943477	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chrX:46187043..46187157,-__937.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chrX:46187043..46187157,-__937.1.0.0	rs67963969	-1.250414445591577	-1.3065515831030163	-1.7420680579676886	-1.167213154708414	-1.5016806915202632	-1.5126167027001283	-1.1044723447893472	-1.2774933222456846	-1.5094672130976954	-1.1665880586809108	-1.5824691203262176	-1.0238822725686374	-1.3454097472749649	-1.3345029989039132	-1.5246177576543516	-1.4273699563759694	-1.5923232972729522	-1.4227440605951784	-1.301569809975661	-1.7151608669072314	-1.3785000529444835	-1.4835550032472342	-1.6224193674690208	-1.9451778547437892	-1.4242177686408	-1.5143465662275488	-0.08408855331233611	-0.21806617455133526	0.3146981015917192	-0.4251101425645383	0.07893663092508474	0.2110468927244673	-0.6106885221178842	-0.10100673069879895	0.025912209850461165	-0.45583130878811007	-0.3627087344175717	-0.40033549607216257	-0.16893681895258372	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chrX:73511864..73511978,-__946.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chrX:73511864..73511978,-__946.1.0.0	rs174140	-0.06968420102678982	0.008590438162580032	-0.0281563478828476	-0.11264190371825028	-0.19808722344564886	-0.23207683699277618	-0.3529022212888497	-0.47680985985459645	-0.37759789804948385	-0.2696574916425186	-0.3349592951126604	-0.37120884488865735	-0.23459930714504162	-0.5693331383015565	-0.32576293720247984	-0.14145263636192734	-0.44591048962913604	-0.09736174407228795	-0.31586142667030925	-0.3830506635730781	-0.3946798783229225	-0.16509523044233326	-0.2393837128971468	-0.29711710795218527	-0.6006703359697405	-0.331306608449592	-0.49964893727476667	-0.3343533753650599	-0.11329628847907974	-0.33326858591088576	0.1007254793733609	-0.08378458967753308	-0.030148442284228416	0.08212998153167395	0.21250266760715059	0.03027377874537182	0.03784218716047516	-0.22946149108108316	-0.09670730130455037	0.119339994516	0.737113058664	0.648013768535	0.368322877114	0.829896383209	0.501992688725	0.90381429355	0.757455001208	0.444064484515	0.809021331888	0.76769033028	0.107123399254	0.7807075918	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:145076059..145076173,-__951.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:145076059..145076173,-__951.1.0.0	rs1663850	-1.8370739980482933	-1.9255002904191807	-1.2042807654890184	-1.6687736273293694	-1.3790360947394624	-1.5445908675956772	-1.4664539556129768	-1.610278699196554	-1.846320454144087	-1.9727690686051917	-1.8121266784336625	-2.1935090396981467	-1.7050594616093016	-1.3596822498916683	-1.494245059937496	-1.6271009003588626	-1.5671752691414076	-1.5974623811257151	-1.5448905538492148	-1.5036842927442144	-0.9884122889216587	-1.350000772924424	-1.2369159163277776	-2.217471081605954	-1.6316445642534434	-1.5098904442568195	0.477391748156625	0.4312552304816848	-0.42282013486984416	0.10159835818796181	-0.21842628638625272	-0.00029968625353760103	-0.03723033713123769	0.6218664102748954	0.49631968121966286	0.7358531522774141	-0.4053444031722917	0.5618644754447033	0.19516901735248196	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:145076059..145076173,-__951.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:145076059..145076173,-__951.1.0.0	rs1663849	-1.8370739980482933	-1.9255002904191807	-1.2042807654890184	-1.6687736273293694	-1.3790360947394624	-1.5445908675956772	-1.4664539556129768	-1.610278699196554	-1.846320454144087	-1.9727690686051917	-1.8121266784336625	-2.1935090396981467	-1.7050594616093016	-1.420289842497938	-1.1127467525278127	-1.3655942224658786	-1.1456418511812219	-1.4336225124152693	-1.1722945909250604	-1.344277488507032	-1.0948818171390102	-1.7102821388755338	-1.3591348612503373	-1.4917999303713907	-0.9984290318500888	-1.3040829200005477	0.4167841555503553	0.812753537891368	-0.16131345697686017	0.5231317761481475	-0.05458641767580685	0.3722962766706168	0.12217646710594465	0.5153968820575439	0.13603831526855314	0.6136342073548544	0.3203267480622718	1.195080007848058	0.40097654160875384	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr1:145076059..145076173,-__951.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:145076059..145076173,-__951.1.0.0	rs1663850,rs1663849	-1.8370739980482933	-1.9255002904191807	-1.2042807654890184	-1.6687736273293694	-1.3790360947394624	-1.5445908675956772	-1.4664539556129768	-1.610278699196554	-1.846320454144087	-1.9727690686051917	-1.8121266784336625	-2.1935090396981467	-1.7050594616093016	-1.4848800975038905	-0.9132074219893164	-1.1170017691710443	-0.9897245546980228	-1.2872595808631209	-1.2240884051198386	-1.3862470869471852	-0.8470556278104481	-1.4752487512087746	-1.4165008941415054	-1.4275457368718527	-1.399904804180687	-1.2473887275421405	0.3521939005444028	1.0122928684298644	0.08727899631797409	0.6790490726313466	0.09177651387634156	0.3205024624758386	0.08020686866579152	0.763223071386106	0.37107170293531233	0.5562681744636864	0.3845809415618098	0.7936042355174597	0.45767073406716113	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:150946895..150947009,-__953.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:150946895..150947009,-__953.1.0.0	rs587645085	-0.01683690548910033	0.9812007661587252	1.1310255528123778	0.9913816158790514	0.8615097358148381	0.09596248584178696	1.6930265661185302	0.3932959138034413	2.7385251528581844	0.8649708247482005	0.6541386300970166	0.5117471172943966	0.9083289546614539	0.5533782224217906	0.3372982811558135	-0.7704752003106491	0.9305173390522364	1.1304156355293604	0.5939603931690755	0.9706302371355433	0.5006885017184203	1.6709155968502658	0.2313921202266726	-0.7744271050283751	-0.15948166824718546	0.4345676961394142	0.5702151279108909	-0.6439024850029117	-1.901500753123027	-0.060864276826814945	0.2689058997145223	0.4979979073272885	-0.7223963289829869	0.10739258791497897	-1.0676095560079186	-0.633578704521528	-1.4285657351253915	-0.671228785541582	-0.47376125852204004	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:150946895..150947009,-__953.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:150946895..150947009,-__953.1.0.0	rs587703995	-0.01683690548910033	0.9812007661587252	1.1310255528123778	0.9913816158790514	0.8615097358148381	0.09596248584178696	1.6930265661185302	0.3932959138034413	2.7385251528581844	0.8649708247482005	0.6541386300970166	0.5117471172943966	0.9083289546614539	-0.32578351618893125	1.998032423737528	0.05564973384655392	-0.5172433757475017	0.2606911166437868	0.4784914004452161	-2.1529823233163667	-0.9094169176133002	-0.01609624161821851	-0.9271175355637551	-0.3979883278423944	-0.3694927222964991	-0.23527135712615688	-0.3089466106998309	1.0168316575788028	-1.0753758189658238	-1.508624991626553	-0.6008186191710514	0.38252891460342914	-3.8460088894348967	-1.3027128314167415	-2.754621394476403	-1.7920883603119555	-1.052126957939411	-0.8812398395908957	-1.1436003117876108	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr1:150946895..150947009,-__953.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:150946895..150947009,-__953.1.0.0	rs587645085,rs587703995	-0.01683690548910033	0.9812007661587252	1.1310255528123778	0.9913816158790514	0.8615097358148381	0.09596248584178696	1.6930265661185302	0.3932959138034413	2.7385251528581844	0.8649708247482005	0.6541386300970166	0.5117471172943966	0.9083289546614539	0.38038084488397944	0.17021018666793128	-0.14340434793186763	-1.047122902266436	0.6990724341016089	1.259361045629486	1.207594379876794	0.432189509337906	0.3773347882320384	-0.7569192621029274	0.5282199722833072	0.11831949797240986	0.2687696788903525	0.39721775037307977	-0.8109905794907939	-1.2744299007442454	-2.038504518145487	-0.16243730171322923	1.163398559787699	-0.4854321862417361	0.0388935955344647	-2.361190364626146	-1.621890086851128	-0.12591865781370937	-0.3934276193219867	-0.6395592757711015	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr1:153939883..153939997,+__954.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr1:153939883..153939997,+__954.1.0.0	rs12027029	-0.8776816719236236	-0.790057579592168	-0.7730455625054902	-0.9056429874299743	-0.6137618984161501	-0.6930877741264121	-0.710277735367099	-0.9571602630897373	-0.5650285205420907	-0.5267364185018234	-0.45342538733019255	-0.4969202774949262	-0.6969021730266406	-0.26014864519347447	0.05418358349784508	-0.0936773764741934	-0.13676021325087134	-0.08899211140230581	-0.09046926509337597	-0.11640254292050076	0.2227421780514689	-0.0052932150208402735	0.03685108831094263	0.024627113817809788	-0.07659980399963545	-0.04416160080642758	0.6175330267301491	0.8442411630900131	0.6793681860312968	0.7688827741791029	0.5247697870138444	0.6026185090330362	0.5938751924465983	1.1799024411412062	0.5597353055212505	0.563587506812766	0.47805250114800235	0.4203204734952907	0.652740572220213	0.00023411339895	0.00115660425805	0.000246746816615	0.000303956631358	0.000303956631358	0.000110173251151	0.00110317967744	9.98335414644e-06	0.000116396943443	6.29975961399e-05	0.000956291509096	0.000587432962331	8.8303495232e-34	0.165752286456	0.86051356799	0.183826378378	0.224016037311	0.234654519409	0.0841723638797	0.815249781627	0.00725789846446	0.0899748372815	0.0494531129698	0.735388170495	0.457610277656	7.39983290044e-31	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:160147114..160147228,+__957.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:160147114..160147228,+__957.1.0.0	rs1408664	-1.1712558205995292	-0.8714015937219386	-0.9780161603371189	-1.1812324535406817	-1.0075046318579022	-1.0726586896026564	-0.8683367097508738	-0.8002757820768661	-1.1308152656562709	-0.9670630160930964	-0.9333756857437274	-0.8463329718019779	-0.98568906506522	-1.3206685933314688	-1.1403456974850323	-1.449501124427366	-1.30286152529515	-1.2262252925579709	-1.5284617854351508	-1.3980514780634907	-1.55782270415262	-1.2026507473143075	-1.102966391848259	-1.4457474392840504	-1.045543520873904	-1.310070525005731	-0.14941277273193965	-0.26894410376309374	-0.471484964090247	-0.12162907175446835	-0.21872066070006868	-0.45580309583249434	-0.5297147683126169	-0.7575469220757539	-0.07183548165803666	-0.13590337575516265	-0.5123717535403229	-0.19921054907192604	-0.3243814599405109	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.154655491485	0.154655491485	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:175162049..175162163,-__960.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:175162049..175162163,-__960.1.0.0	rs115368522	0.12151812479478373	0.27155500227858254	0.21081441692404557	0.2291992494988664	0.12876055735028746	0.199631400308261	0.06486597296281563	0.1738607516675929	0.11789900358293158	0.32058938863802466	0.22942239275757073	0.002867490691774703	0.1725819792879614	0.21784705300697704	0.42784172706900325	0.17582520975985325	0.36845884864302136	0.17140173956087526	0.29045320981894973	0.19847235271778224	0.0888120699875318	0.20613263664116066	0.2920361145161837	0.22815687934372364	0.2560868966536482	0.24346039480989248	0.09632892821219331	0.15628672479042072	-0.03498920716419232	0.13925959914415498	0.0426411822105878	0.09082180951068874	0.13360637975496661	-0.0850486816800611	0.08823363305822908	-0.028553274121840944	-0.0012655134138470914	0.2532194059618735	0.0708784155219311	0.519249062249	0.809021331888	0.696989544957	0.179364149792	0.248198866138	0.354199901149	0.125844655769	0.946473618223	0.270885072145	0.788281320858	0.657696241675	0.170821264488	0.451438134741	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:179851151..179851265,+__961.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:179851151..179851265,+__961.1.0.0	rs112714304	-1.6861991532283351	-1.504222129152864	-1.6127196992742254	-1.933024289515722	-1.8284386461534348	-1.5264012427634304	-1.8607515617238781	-1.5031372875561964	-1.3522011725683556	-1.6647631449541342	-1.6973253253481868	-1.879599452547513	-1.6707319253988564	-1.4844007188870638	-1.0688682066086188	-1.2545209118571543	-1.4781530139658279	-1.1436377745013937	-1.6559714563968508	-1.3875236081563238	-1.451372510864055	-1.483079631115919	-1.4039797255554602	-1.1508676737833277	-1.7521221837303362	-1.3928747846185277	0.20179843434127132	0.4353539225442451	0.3581987874170711	0.45487127554989404	0.6848008716520411	-0.12957021363342047	0.4732279535675543	0.05176477669214141	-0.1308784585475633	0.260783419398674	0.5464576515648591	0.1274772688171768	0.2778571407803287	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr1:179851151..179851265,+__961.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:179851151..179851265,+__961.1.0.0	rs113821980,rs112714304	-1.6861991532283351	-1.504222129152864	-1.6127196992742254	-1.933024289515722	-1.8284386461534348	-1.5264012427634304	-1.8607515617238781	-1.5031372875561964	-1.3522011725683556	-1.6647631449541342	-1.6973253253481868	-1.879599452547513	-1.6707319253988564	-1.1887509351274823	-1.1523618125064812	-1.387485283194783	-1.1922679004296313	-1.3695099470426155	-1.3396131366546904	-1.3764208466056074	-1.3211174462834008	-1.2377249791729723	-1.740421056257354	-1.300543361173948	-1.3729578850953397	-1.3315978824620256	0.4974482181008528	0.35186031664638273	0.2252344160794424	0.7407563890860906	0.45892869911081924	0.18678810610873997	0.48433071511827075	0.18201984127279558	0.11447619339538329	-0.07565791130321986	0.3967819641742387	0.5066415674521734	0.3391340429368308	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr1:46769244..46769358,+__968.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr1:46769244..46769358,+__968.1.0.0	rs149948577	1.95436078080676	2.138775821216425	1.8289016463761456	1.5958577375210474	1.8534650553234668	1.9780746379369891	1.4682813638669134	1.6487155499025252	1.8489725373282564	1.9618865317337253	1.980449720881764	1.89747598567204	1.8462681140471713	2.1505166800973905	2.1980330178084455	1.8127293488475584	1.7440280181115664	1.7906611078639114	1.8932997038262456	1.6403447668206457	1.7599855466599408	1.9463802876359224	1.9674348586700132	2.1256159865287763	1.83906450795336	1.9056744859019812	0.1961558992906305	0.059257196592020556	-0.016172297528587176	0.14817028059051895	-0.06280394745955542	-0.08477493411074355	0.17206340295373224	0.11126999675741556	0.09740775030766602	0.005548326936287928	0.1451662656470123	-0.05841147771867994	0.05940637185480983	0.619326784864	0.777966336216	0.8931878581	0.648013768535	0.8931878581	0.202104162379	0.586575008857	0.368322877114	0.206893929435	0.79863356553	0.706946403854	0.563691144959	0.85784581414	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:91102409..91102523,-__978.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:91102409..91102523,-__978.1.0.0	rs1332332	-1.0884052250486407	-1.0844336072956071	-1.1345959942209165	-1.584371019902655	-1.0745401728072543	-1.1945652332140524	-1.1217936971489868	-1.145956140759996	-1.1428611175754124	-1.3614443893977055	-1.1746327836329482	-1.0501670008036361	-1.1798138651506511	-1.07700094720419	-1.4720567310893202	-1.3285027308099953	-1.5162634444767162	-1.3964665134970178	-1.0949580831373629	-1.2348739720284256	-1.3489736339489182	-0.9449399585693056	-1.2294334664533155	-1.085283743929538	-0.9585829476611065	-1.2239446810671009	0.01140427784445075	-0.3876231237937131	-0.19390673658907875	0.06810757542593882	-0.32192634068976345	0.09960715007668952	-0.11308027487943884	-0.20301749318892215	0.19792115900610685	0.13201092294438999	0.08934903970341024	0.0915840531425296	-0.044130815916450045	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:91102409..91102523,-__978.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:91102409..91102523,-__978.1.0.0	rs1332333	-1.0884052250486407	-1.0844336072956071	-1.1345959942209165	-1.584371019902655	-1.0745401728072543	-1.1945652332140524	-1.1217936971489868	-1.145956140759996	-1.1428611175754124	-1.3614443893977055	-1.1746327836329482	-1.0501670008036361	-1.1798138651506511	-1.2188880900555015	-1.1823585700270747	-1.3193787052931678	-1.1901633729606151	-1.0558245245424462	-0.9093555687441214	-0.6045522371547276	-0.9323614088385441	-1.2068984605732767	-1.0114837318005776	-1.1305024175760414	-0.9548389804430202	-1.0597171723340928	-0.1304828650068608	-0.09792496273146756	-0.1847827110722513	0.3942076469420399	0.018715648264808094	0.285209664469931	0.5172414599942592	0.21359473192145195	-0.06403734299786423	0.3499606575971279	0.04413036605690679	0.09532802036061594	0.12009669281655809	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.206893929435	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.206893929435	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr10:91102409..91102523,-__978.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:91102409..91102523,-__978.1.0.0	rs1332332,rs1332333	-1.0884052250486407	-1.0844336072956071	-1.1345959942209165	-1.584371019902655	-1.0745401728072543	-1.1945652332140524	-1.1217936971489868	-1.145956140759996	-1.1428611175754124	-1.3614443893977055	-1.1746327836329482	-1.0501670008036361	-1.1798138651506511	-1.018807272427794	-1.072893477211623	-1.2554907494824226	-1.1298307620400942	-0.7803237413621892	-0.8780210273883974	-0.9551634299532931	-1.0004906946346634	-0.5479336951174055	-0.7904727701225173	-0.9229821210471147	-0.6845512579547393	-0.919746749895188	0.06959795262084678	0.011540130083984135	-0.12089475526150606	0.4545402578625608	0.29421643144506515	0.316544205825655	0.16663026719569374	0.14546544612533263	0.5949274224580069	0.5709716192751882	0.25165066258583346	0.36561574284889686	0.26006711525546317	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0468981580933	0.0468981580933	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:118095758..118095872,-__980.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:118095758..118095872,-__980.1.0.0	rs3802866	-2.931602141505928	-2.485603708152422	-2.7015184832424635	-2.3160863180238502	-3.096911714165245	-2.6120132912896232	-2.3959904762032758	-1.9253462578098115	-2.6193408485571337	-2.6825897496941775	-2.4094391552825747	-2.196166522956776	-2.5310507222402734	-2.212909890519691	-2.316135312074449	-2.6723601278051854	-2.4361097492105936	-2.3042369750221603	-2.239439666257298	-2.3881130596691618	-2.4062751949294903	-1.6549572629516331	-2.6995905751518894	-2.235811386465086	-2.2421797015540963	-2.3173432418008946	0.718692250986237	0.16946839607797282	0.029158355437278072	-0.12002343118674341	0.7926747391430848	0.37257362503232505	0.007877416534114001	-0.48092893711967877	0.9643835856055005	-0.017000825457711866	0.17362776881748854	-0.04601317859732035	0.21370748043937884	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:118927851..118927965,-__981.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:118927851..118927965,-__981.1.0.0	rs17552226	1.1586570845373056	0.6146026288109376	0.9354982493114402	-0.8374783457033902	-1.9407975787313008	-1.054824052601478	1.3931285698111704	-0.8877312872750766	-0.944576542655997	-0.7281330775299626	-1.0706900779098285	-0.8417553022286072	-0.35034164434706555		-1.587779693659627	0.03359779465474694	-1.3558148952804765	-0.6328392724472747	-1.2747171402131408	-0.7720672833029325	-0.9518679476227224		-0.2202181927633588	-1.0770667971574424	-1.0794541921601637	-0.8918227619952391		-2.2023823224705645	-0.9019004546566933	-0.5183365495770863	1.307958306284026	-0.2198930876116627	-2.1651958531141027	-0.06413666034764587		0.5079148847666037	-0.006376719247613849	-0.23769888993155652	-0.4500047345906297	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:17756264..17756378,+__983.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:17756264..17756378,+__983.1.0.0	rs150102860	0.3390418751972834	-0.32399117334934896	0.5650446871501833	-0.5729666160612141	0.8130744889560071	0.11403804538367306	-1.2630911947105399	-0.7185656159810954	-0.29069322199048275	0.8491714160939252	-0.5729869196602878	-0.2670505635909975	-0.1107478993802412	0.7012449666664377	1.559469974358155	0.48764209122000934	0.10137052498017296	-0.08331971590840921	0.03466112409305577	0.3051369111980195	0.8782275375993339	0.7902862124148422	0.9138015873169416	0.2591036797799047	1.078792528140336	0.5855347851549	0.36220309146915425	1.883461147707504	-0.07740259593017396	0.6743371410413871	-0.8963942048644163	-0.07937692129061728	1.5682281059085594	1.5967931535804292	1.080979434405325	0.0646301712230164	0.8320905994401926	1.3458430917313335	0.6962826845351412	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:17756264..17756378,+__983.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:17756264..17756378,+__983.1.0.0	rs28526619	0.3390418751972834	-0.32399117334934896	0.5650446871501833	-0.5729666160612141	0.8130744889560071	0.11403804538367306	-1.2630911947105399	-0.7185656159810954	-0.29069322199048275	0.8491714160939252	-0.5729869196602878	-0.2670505635909975	-0.1107478993802412	-0.5095188490406528	-0.6856974066371729	0.5354733996547634	-0.15077893331860098	1.0830638229147498	-0.8234366908719366	-1.1861390065161779	-1.3787673878133533	-0.2930715381042299	-0.07996987606314976	-1.7284461798204132	-0.9660544060874154	-0.5152785876419658	-0.8485607242379363	-0.361706233287824	-0.02957128749541993	0.42218768274261315	0.2699893339587427	-0.9374747362556096	0.076952188194362	-0.6602017718322579	-0.0023783161137471698	-0.929141292157075	-1.1554592601601255	-0.699003842496418	-0.40453068826172456	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr11:17756264..17756378,+__983.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:17756264..17756378,+__983.1.0.0	rs150102860,rs28526619	0.3390418751972834	-0.32399117334934896	0.5650446871501833	-0.5729666160612141	0.8130744889560071	0.11403804538367306	-1.2630911947105399	-0.7185656159810954	-0.29069322199048275	0.8491714160939252	-0.5729869196602878	-0.2670505635909975	-0.1107478993802412	0.9827280613584576	0.6659872937926314	0.10296566543709162	0.023812228972563868	0.4867588030407348	0.2711110909941607	0.7979805754069179	-0.3535744781963639	-0.1993452247472347	0.18391209929338473	0.26736215743827657	1.054766258284071	0.35703871092289097	0.6436861861611742	0.9899784671419805	-0.4620790217130917	0.596778845033778	-0.32631568591527227	0.15707304561048763	2.061071770117458	0.36499113778473147	0.09134799724324805	-0.6652593168005405	0.8403490770985644	1.3218168218750683	0.46778661030313223	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr11:72145537..72145651,-__989.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr11:72145537..72145651,-__989.1.0.0	rs117104239	1.7833808048493869	2.165290017140227	1.864943885475181	1.7984912923291778	2.1749228622739083	2.1271284409516404	2.394492049628704	2.4874300241366853	2.241712847567506	2.2298030918533627	2.195830436403015	2.3195881105864276	2.1485844885996017	0.4989233100687478	0.7061567281987129	0.552791110837804	0.3476940419572472	0.552132745984846	0.4738681525669475	0.5657946391466858	0.6914649191550625	0.549831579349191	0.6187853247918008	0.7025007057869099	0.38255851060547763	0.5535418140374527	-1.284457494780639	-1.4591332889415143	-1.3121527746373771	-1.4507972503719306	-1.6227901162890623	-1.653260288384693	-1.8286974104820182	-1.7959651049816228	-1.691881268218315	-1.6110177670615617	-1.493329730616105	-1.93702959998095	-1.5950426745621489	5.07255502274e-10	7.40729972622e-11	4.31804023528e-11	1.79534902262e-10	1.8991040068e-11	1.31220928624e-11	2.74073014017e-11	4.72651046031e-11	1.19520227015e-11	1.08960636655e-11	1.19584464128e-11	8.23367049956e-12	1.25163193492e-113	3.5913689561e-07	5.51103099631e-08	3.21693997529e-08	1.32317222967e-07	1.46610829325e-08	1.00252789469e-08	2.02539957359e-08	3.43617310464e-08	9.23891354827e-09	8.55340997743e-09	9.19604529148e-09	6.41402931916e-09	1.04886756146e-110	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:124086630..124086744,+__996.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:124086630..124086744,+__996.1.0.0	rs113620982	-1.289665656192219	-1.1383130542130306	-1.2161356048337963	-1.1856719779179454	-1.3368191460483847	-1.1643128453185176	-0.9450346503816864	-1.346774332149129	-0.8761250228028746	-1.2275550343831558	-1.0308444834463673	-1.0030319036006925	-1.1466903092739835	-1.2543715827757969	-1.5186304202587377	-1.5990541079338807	-1.4205432032170615	-1.4716161914009747	-1.2381268510985308	-1.4534487033903423	-1.4722120153997278	-1.1453596925165392	-1.3856320435863265	-1.3958496763824022	-1.0856422528771303	-1.3700405617364542	0.03529407341642221	-0.3803173660457071	-0.38291850310008435	-0.23487122529911608	-0.13479704535258996	-0.07381400578001318	-0.5084140530086558	-0.12543768325059879	-0.2692346697136646	-0.1580770092031707	-0.36500519293603495	-0.08261034927643784	-0.22335025246247095	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:124873335..124873449,-__997.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:124873335..124873449,-__997.1.0.0	rs191752208	-0.5117235657380148	-0.20761199761747334	-0.7033702662525405	-0.7806717349879259	-0.3346472498428755	-0.28436752978392865	-0.6264964022886421	-0.8279244779898693	-0.5161995327233609	-0.5736715989482312	-0.4986119395220357	-0.3206312463828907	-0.5154939618398157	-0.4318584617476876	-0.6500657166757343	-0.36720199467726977	-0.7940620223393942	-0.7044825318253599	-0.4974782199598688	-1.0361688987188384	-0.5820454091646134	-0.7342861817865785	-0.8087651013368609	-0.4372773639344525	-0.7081466670577702	-0.6459865474353691	0.0798651039903272	-0.442453719058261	0.33616827157527074	-0.0133902873514683	-0.3698352819824844	-0.21311069017594014	-0.4096724964301963	0.2458790688252559	-0.2180866490632175	-0.2350935023886297	0.06133457558758321	-0.3875154206748795	-0.1304925855955533	0.819442862795	0.0959193233604	0.175048880887	0.727009731456	0.116179635744	0.119339994516	0.110080523892	0.326996172605	0.276771967065	0.788281320858	0.88258056334	0.197395731844	0.111331184665	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:32655017..32655131,+__999.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:32655017..32655131,+__999.1.0.0	rs11052033	-1.5359584121702965	-1.658818311882868	-1.5941312630218525	-1.6390898025055147	-1.7867753866207885	-2.043994315661944	-1.7251068174858941	-0.8260911011158591	-1.579382624038151	-1.5021873542354507	-1.5504975110921233	-1.5285536248611915	-1.5808822103909945	-1.6076977245544586	-1.6001358473628553	-1.520860742447165	-1.833962811794897	-1.6061791493561115	-1.6486839308392058	-1.4823793380207053	-1.5792993517423737	-1.7361378104665837	-1.7108201613582652	-1.6613794060476992	-1.6331876625171131	-1.6350603280422862	-0.07173931238416209	0.0586824645200128	0.07327052057468753	-0.19487300928938223	0.180596237264677	0.39531038482273795	0.2427274794651888	-0.7532082506265145	-0.15675518642843267	-0.2086328071228145	-0.11088189495557588	-0.10463403765592161	-0.05417811765129162	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr13:102104846..102104960,+__1007.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr13:102104846..102104960,+__1007.1.0.0	rs16958936	-1.789720358095352	-1.1892304089494332	-1.4691074855017434	-1.9137603902257856	-1.676156359595191	-1.6957301984635138	-1.8199477273093585	-1.4508646721661878	-1.6165429735756751	-1.54638335637848	-1.4618855077609083	-1.2817096943568809	-1.575919927698209	-2.016812421737353	-1.418998611435489	-1.2244711600188596	-1.5232643529959995	-1.4320056434278712	-1.4556659856769922	-1.5529999245006514	-1.2097882086076943	-1.6034528089406446	-1.5753847598690758	-1.3908074765351053	-1.4190528150937145	-1.4852253474032875	-0.22709206364200085	-0.2297682024860559	0.24463632548288383	0.3904960372297861	0.24415071616731976	0.24006421278652157	0.2669478028087071	0.24107646355849344	0.013090164635030543	-0.02900140349059588	0.07107803122580303	-0.13734312073683363	0.0906945802949216	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr13:51796427..51796541,+__1014.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr13:51796427..51796541,+__1014.1.0.0	rs7323665	-1.2000616067015122	-0.5705799659125947	-0.5125580535436994	1.4942837281971777	0.2700697177161097	-1.1170017691710443	0.4588209431615844	0.19369615386051192	0.05955306549660133	-0.11185513788721724	-0.8809106503836002	0.540670947177431	-0.114656052332521	0.14481922919811874	0.8828516908374758	-0.0039052179616772173	-0.44357355513392543	-0.10074697776543456	-0.6560405360500091	-1.1437156302229452	-1.4248499025977974	0.6033966845370565	-0.3852316655898836	0.36943762842033023	-0.12941143123412835	-0.1905808069635683	1.344880835899631	1.4534316567500705	0.5086528355820222	-1.9378572833311032	-0.3708166954815443	0.4609612331210352	-1.6025365733845296	-1.6185460564583094	0.5438436190404552	-0.27337652770266635	1.2503482788039304	-0.6700823784115594	-0.07592475463104732	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr14:24521139..24521253,+__1018.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:24521139..24521253,+__1018.1.0.0	rs117562093	0.14481922919811874	0.08854175646747992	-0.08272227179845754	-0.8580968381710407	0.24260786112691674	0.10156599788248906	1.9114772935700275	1.3231036040438424	0.4116434762675632	0.5036877725514647	1.0606976100310446	0.463905787585825	0.44260260656293954	0.9242491655375716	0.8368818250666221	0.46761389780356344	0.26747042575174884	0.6684796523377251	0.28001459071477935	0.962970951329628	0.20167396616866032	0.2831789208366645	0.353229065630785	-0.08416298231241744	0.28977436651306354	0.45428115378153294	0.7794299363394529	0.7483400685991421	0.550336169602021	1.1255672639227896	0.42587179121080837	0.1784485928322903	-0.9485063422403995	-1.121429637875182	-0.12846455543089869	-0.1504587069206797	-1.144860592343462	-0.17413142107276147	0.011678547218593396	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr14:92413341..92413455,-__1022.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:92413341..92413455,-__1022.1.0.0	rs75301896	-1.5006577525899003	-1.39380720987084	-1.524429306236579	-1.4423856179681984	-1.253172457419538	-1.5419176672875219	-1.330884857501027	-1.7167211164941103	-1.4506061842878781	-1.3226223491783693	-1.8376231433025016	-1.777590331521802	-1.507701499471522	-1.8350225771662094	-1.846459377685506	-1.7291689581587188	-1.8425179498177193	-1.840885646370002	-1.8224132435627785	-1.6014036722697371	-1.5424622266314225	-1.5703850037287594	-1.5289013570683625	-1.5855762519734768	-1.5995602373815705	-1.695396375151189	-0.3343648245763091	-0.452652167814666	-0.20473965192213983	-0.4001323318495209	-0.5877131889504641	-0.28049557627525656	-0.2705188147687101	0.17425888986268778	-0.11977881944088131	-0.2062790078899932	0.2520468913290248	0.17803009414023152	-0.18769487567966645	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr15:100273601..100273715,-__1023.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr15:100273601..100273715,-__1023.1.0.0	rs11631604	1.6329955956896465	1.7923324782477208	1.5003175063532939	1.3959604963801104	1.5254148445010411	1.5797020990773103	1.654712828432114	1.8874055869593815	1.8550201250828597	1.6546676048064477	1.753046363425391	1.7221992916241748	1.6628145683816244	1.587283739893592	1.7110322592222786	1.4283007577314635	1.4769749049384067	1.4928017741078627	1.537958861632612	1.5253389062191216	1.8865404881076528	1.650852236829364	1.6255665648314146	1.6938191930846647	1.7905918529307319	1.617255128294097	-0.045711855796054524	-0.08130021902544216	-0.07201674862183038	0.08101440855829622	-0.0326130703931784	-0.04174323744469821	-0.12937392221299238	-0.0008650988517286962	-0.20416788825349563	-0.029101039975033105	-0.05922717034072633	0.06839256130655702	-0.045559440087527214	0.8931878581	0.747259231451	0.29495293544	0.66743649171	0.788281320858	0.527990680582	0.706946403854	0.747262025795	0.333666485083	0.412754243182	0.957167318493	0.696989544957	0.942795169158	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr15:100273601..100273715,-__1023.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr15:100273601..100273715,-__1023.1.0.0	rs183900604,rs35747287,rs11631604	1.6329955956896465	1.7923324782477208	1.5003175063532939	1.3959604963801104	1.5254148445010411	1.5797020990773103	1.654712828432114	1.8874055869593815	1.8550201250828597	1.6546676048064477	1.753046363425391	1.7221992916241748	1.6628145683816244	1.163260301741852	1.54589791204591	1.303808246422278	1.055500279946373	1.3481285993558516	1.1868908319981133	1.2540382703251691	1.6317197407609476	1.3060959901621316	1.2869253668881817	1.4012734348751297	1.3890861158578085	1.3227187575316455	-0.46973529394779456	-0.2464345662018108	-0.19650925993101587	-0.34046021643373736	-0.17728624514518954	-0.392811267079197	-0.40067455810694486	-0.25568584619843393	-0.5489241349207281	-0.367742237918266	-0.3517729285502613	-0.33311317576636634	-0.3400958108499788	0.00849533044186	0.0224529881577	0.0103298859694	0.237368605078	0.0224529881577	0.00105204507021	0.00567496309713	0.0201846528804	0.00183882744533	0.0010031111026	0.00955750115232	0.00167824394514	1.36064486086e-16	1	1	1	1	1	0.211461059112	1	1	0.378798453738	0.208647109341	1	0.345718252699	3.08866383414e-14	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr15:101142755..101142869,+__1024.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:101142755..101142869,+__1024.1.0.0	rs78402474	0.0006038251746362418	0.25962118803977624	0.14746757023642473	-0.01787629507721966	0.33767245842681703	0.13964633592625908	0.3304455301657838	0.6189289276299555	0.4587036377989282	0.48473627303239	0.4570343061885458	0.5120317531195633	0.310751292555155	-0.031784480190013314	-0.07223331951437752	0.13375472571912447	-0.026813704817175363	0.0932555726317383	0.15723960040398827	0.2830739950955876	0.3769493509208802	0.3295528485738626	0.38479331071335193	0.4602293020772513	0.2677366435459161	0.19631282043001122	-0.03238830536464955	-0.33185450755415374	-0.01371284451730026	-0.008937409739955701	-0.24441688579507875	0.017593264477729187	-0.0473715350701962	-0.24197957670907533	-0.12915078922506562	-0.09994296231903804	0.003194995888705532	-0.2442951095736472	-0.1144384721251438	0.727009731456	0.476688253492	0.989287003123	0.989287003123	0.104229562843	0.90381429355	0.361218104761	0.154655491485	0.175053819161	0.510582765025	0.861430881609	0.0832552515755	0.774878996788	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:19079149..19079263,+__1031.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:19079149..19079263,+__1031.1.0.0	rs35787586	3.2482777134989216	3.820110660734804	3.11879973915865	3.0346309121357504	3.3531318223120365	3.4862819234248086	3.2140099927972177	3.678844961295445	3.3008001578865223	3.440876791758208	3.5237129829130964	3.6227858894466825	3.4035219622801782	3.093406312153138	3.4462088302952	3.059997387494108	2.7245955048566426	3.169405131076987	3.170897234608474	2.922762234825788	3.171273396083895	3.2031562385224346	3.098108255377846	3.2898762445007557	3.202873482173076	3.129380020997362	-0.1548714013457837	-0.3739018304396038	-0.05880235166454195	-0.31003540727910783	-0.1837266912350497	-0.3153846888163345	-0.2912477579714299	-0.50757156521155	-0.09764391936408767	-0.3427685363803623	-0.23383673841234076	-0.41991240727360646	-0.27414194128281655	0.0785847853765	0.00993701022923	0.101398170673	0.00567496309713	0.00641629102443	0.0267271087754	0.00784715402968	0.00251850159852	0.248198866138	0.00753998341959	0.0327677521954	0.00544559218276	5.14318322678e-13	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	4.30998754404e-10	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:34900775..34900889,+__1038.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:34900775..34900889,+__1038.1.0.0	rs115694700	-0.8125057138525964	-0.5354049129740941	-0.794709722628933	-0.7614153692474114	-1.0662122662742688	-0.7558526304931779	-0.9776571009308688	-0.8163927733449132	-0.9942784699633259	-0.8466928090382622	-0.9064322910288396	-0.5206524342763564	-0.8156838745044207	-0.42336478708882347	-0.19710109217035673	-0.6530237655486663	-0.8039826491054245	-0.7880022971467608	-0.8833085480590349	-0.6007768489464755	-0.5599534648207276	-0.4003907943131259	-0.8052581104350643	-0.7104596912197518	-0.9291588723595533	-0.6462317434344804	0.38914092676377293	0.33830382080373733	0.14168595708026677	-0.04256727985801312	0.27820996912750795	-0.12745591756585706	0.37688025198439323	0.2564393085241856	0.5938876756502001	0.04143469860319782	0.19597259980908777	-0.40850643808319687	0.1694521310699402	0.0515422504639	0.088148079887	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.48504462162	0.0201846528804	NA__no_active_tile	0.0216734048733	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.914457985151	0.00975211096235	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:34900775..34900889,+__1038.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:34900775..34900889,+__1038.1.0.0	rs3736166	-0.8125057138525964	-0.5354049129740941	-0.794709722628933	-0.7614153692474114	-1.0662122662742688	-0.7558526304931779	-0.9776571009308688	-0.8163927733449132	-0.9942784699633259	-0.8466928090382622	-0.9064322910288396	-0.5206524342763564	-0.8156838745044207	-0.18176258352723085	-0.26949032774674075	-0.4951235630630251	-0.3694513820475671	-0.14713079804454945	-0.28297592376231084	-0.19038768242208012	-0.362878024020828	-0.43203170184686107	-0.23843973251891126	-0.34960900767093483	-0.16967467899934188	-0.29074628380586504	0.6307431303253656	0.26591458522735334	0.29958615956590795	0.39196398719984427	0.9190814682297194	0.472876706730867	0.7872694185087886	0.4535147493240852	0.5622467681164649	0.6082530765193509	0.5568232833579048	0.3509777552770146	0.5249375906985555	0.0932701621097	0.0658387268341	0.0115927323179	0.0209174885683	0.00110317967744	0.0601321962246	0.000129852144011	0.162586850726	0.000956291509096	0.00533354973393	0.00849533044186	0.0145358169752	7.8309596348e-15	1	1	1	1	0.851654710983	1	0.095960734424	1	0.739213336532	1	1	1	6.56234417396e-12	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:34900775..34900889,+__1038.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:34900775..34900889,+__1038.1.0.0	rs3736167	-0.8125057138525964	-0.5354049129740941	-0.794709722628933	-0.7614153692474114	-1.0662122662742688	-0.7558526304931779	-0.9776571009308688	-0.8163927733449132	-0.9942784699633259	-0.8466928090382622	-0.9064322910288396	-0.5206524342763564	-0.8156838745044207	-0.6806286202746691	-0.7538286306698011	-1.0910425425140942	-1.0340861914557686	-0.9224534226406323	-0.8255845281887407	-0.831970591826099	-0.9970092519735084	-1.2752162742789919	-1.2148320731140425	-1.035301789639545	-0.9300215445963328	-0.9659979550976855	0.13187709357792732	-0.218423717695707	-0.29633281988516114	-0.27267082220835726	0.14375884363363645	-0.06973189769556287	0.14568650910476977	-0.1806164786285952	-0.28093780431566595	-0.36813926407578035	-0.1288694986107053	-0.40936911031997636	-0.15031408059326481	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.60051573606	0.60051573606	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr17:34900775..34900889,+__1038.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:34900775..34900889,+__1038.1.0.0	rs115694700,rs3736166,rs3736167	-0.8125057138525964	-0.5354049129740941	-0.794709722628933	-0.7614153692474114	-1.0662122662742688	-0.7558526304931779	-0.9776571009308688	-0.8163927733449132	-0.9942784699633259	-0.8466928090382622	-0.9064322910288396	-0.5206524342763564	-0.8156838745044207	-0.7661339849627469	-0.39908545016901853	-0.7569436538890977	-0.720425802353884	-0.6425049106278737	-0.6025832123501563	-0.3732996498126696	-0.6290266781539131	-0.7582605989504577	-0.8840338263114671	-0.9705325701962015	-0.9459642289013872	-0.7040662138899062	0.04637172888984953	0.13631946280507556	0.037766068739835346	0.040989566893527396	0.42370735564639506	0.15326941814302153	0.6043574511181992	0.18736609519100011	0.2360178710128682	-0.037341017273204935	-0.06410027916736194	-0.42531179462503077	0.1116176606145145	NA__no_active_tile	0.282745459933	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.107123399254	0.00183882744533	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.957167318493	0.0666441195816	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	0.367765489066	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr17:5372218..5372332,-__1039.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr17:5372218..5372332,-__1039.1.0.0	rs28372907	-0.6575655317153122	-0.32000884168684296	-0.5071328806962152	-0.4301125728680447	-0.45542361853188607	-0.5829563619047247	-0.9693009830040289	-0.5830349346442738	-0.43653778505546886	-0.4054952313955348	-0.586918237112596	-0.3302781795469528	-0.5220637631801568	-0.5929543486867247	-0.7162083662912462	-0.767494139788089	-1.0032068405041366	-0.4941335812545154	-0.34141426034503697	-0.7217285526097631	-0.536797879517825	-0.876675256798292	-0.3623075406028779	-0.3659434731855398	-0.4400528897661041	-0.6015764274458458	0.06461118302858748	-0.3961995246044032	-0.2603612590918738	-0.5730942676360918	-0.03870996272262933	0.2415421015596877	0.2475724303942658	0.04623705512644882	-0.4401374717428231	0.043187690792656885	0.22097476392705623	-0.1097747102191513	-0.07951266426568913	0.242741268695	0.204483664188	0.90381429355	0.354194392099	0.914457985151	0.563691144959	0.158583637061	0.563691144959	0.405136064622	0.519249062249	0.501992688725	0.83513271997	0.6006322257	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:9862777..9862891,-__1043.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:9862777..9862891,-__1043.1.0.0	rs7217708	0.19572044901551164	0.17162762365723538	-0.14995726035710435	-0.13877758025209397	0.08561703958591058	0.07621996003615443	0.06704410771114161	0.09016856779274461	0.32245432002267566	0.014958528148287511	0.33953100839253925	0.2315657483447466	0.10884770934147908	0.22368860199173093	0.49869841383003044	0.32724952306724925	0.4242733587326959	0.21748537949915892	0.3712994059546207	0.22785917700775143	0.30915380109117696	0.31026075014046733	0.49717699037338176	0.49719802100950466	0.5638161677334017	0.3723466325359308	0.027968152976219296	0.32707079017279506	0.47720678342435363	0.5630509389847899	0.13186833991324834	0.29507944591846624	0.16081506929660982	0.21898523329843234	-0.012193569882208322	0.48221846222509424	0.15766701261696542	0.33225041938865507	0.26349892319445173	0.76769033028	0.197395731844	0.0583274625199	0.0296152123457	0.510582765025	0.259370210024	0.259370210024	0.460214637573	0.375513989452	0.0224529881577	0.179364149792	0.125844655769	0.00354943257579	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:128180784..128180898,+__1052.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:128180784..128180898,+__1052.1.0.0	rs5936	-0.9432856818556532	-1.1529518420282745	-1.131182223012404	-0.4115571132412279	-1.127021829983256	-0.9310802062343371	-1.4321258058120607	-1.355410333394488	-1.6322846778913218	-0.648979834779875	-0.9882700047778288	-0.962873324606208	-1.059751906468078	-1.2179608753201832	-1.3714782562160337	-1.4397078704549937	-1.1477221888406697	-1.0057098636506028	-1.0308444834463673	-1.3047881243851358	-1.107232480590943	-0.8568761027493672	-1.6374524710961704	-1.1943108834445764	-1.2781547494572285	-1.2160198624710226	-0.27467519346452995	-0.2185264141877592	-0.3085256474425897	-0.7361650755994418	0.12131196633265318	-0.09976427721203018	0.12733768142692492	0.24817785280354498	0.7754085751419546	-0.9884726363162954	-0.20604087866674758	-0.3152814248510205	-0.1562679560029447	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:128283978..128284092,-__1053.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:128283978..128284092,-__1053.1.0.0	rs149288544	1.2302081069708373	1.386702114976956	1.1063643080786283	1.0736130512613862	1.0410721216825138	1.1683703205037816	1.1624070089373726	1.1398681508505812	1.139850117123953	1.1655827637215626	1.153184339871331	1.1819650176179928	1.1624322851330746	1.292776201798472	1.3278808060401572	1.0764340293369559	1.0990312599281888	1.147026422109898	1.1313720891676988	1.0344731631596749	1.2373818099567244	1.1449720038045343	1.186721090296397	1.2509584068281754	1.1745295270016611	1.1752964007857114	0.06256809482763481	-0.05882130893679882	-0.029930278741672423	0.025418208666802666	0.10595430042738418	-0.03699823133608282	-0.12793384577769773	0.09751365910614318	0.0051218866805813335	0.021138326574834387	0.09777406695684432	-0.007435490616331641	0.012864115652636787	0.420456664513	0.66743649171	0.978575937473	0.8931878581	0.265084565602	0.436112310787	0.624065454014	0.788281320858	0.88258056334	0.727009731456	0.840380101088	0.648013768535	0.978298050576	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:128283978..128284092,-__1053.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:128283978..128284092,-__1053.1.0.0	rs17522960	1.2302081069708373	1.386702114976956	1.1063643080786283	1.0736130512613862	1.0410721216825138	1.1683703205037816	1.1624070089373726	1.1398681508505812	1.139850117123953	1.1655827637215626	1.153184339871331	1.1819650176179928	1.1624322851330746	1.5270650827802923	1.8557546604499042	1.625307118026032	1.4534576774087316	1.4468540879931568	1.4193762078193148	1.4633792750605357	1.402375709484779	1.5089540311679623	1.6120676823902138	1.492846002802764	1.5709235987018322	1.5315300945071264	0.296856975809455	0.46905254547294817	0.5189428099474036	0.3798446261473454	0.405781966310643	0.2510058873155332	0.3009722661231631	0.26250755863419784	0.36910391404400933	0.44648491866865125	0.33966166293143285	0.3889585810838394	0.36909780937405184	0.0174727290303	0.00078853414695	0.00695778717972	0.0638899216795	1.95617684722e-05	0.0072436377838	0.00287470049861	0.00695778717972	0.000170183141363	0.000260017581797	0.000715310039185	0.000751093855117	1.3451046828e-23	1	0.586669405331	1	1	0.0151016852606	1	1	1	0.131551568273	0.204113801711	0.550073420134	0.585102113137	1.12719772418e-20	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr2:128283978..128284092,-__1053.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:128283978..128284092,-__1053.1.0.0	rs149288544,rs17522960	1.2302081069708373	1.386702114976956	1.1063643080786283	1.0736130512613862	1.0410721216825138	1.1683703205037816	1.1624070089373726	1.1398681508505812	1.139850117123953	1.1655827637215626	1.153184339871331	1.1819650176179928	1.1624322851330746	1.5658654582207352	1.8390510143019274	1.5247994993453036	1.4690583064669434	1.4987902475900614	1.547099459927715	1.4572191865916806	1.5811077788860264	1.6049290884593552	1.64336300447121	1.583724166505458	1.6226403113586259	1.5781372935104203	0.33565735124989793	0.45234889932497135	0.4184351912666753	0.3954452552055572	0.45771812590754757	0.3787291394239334	0.294812177654308	0.44123962803544514	0.4650789713354022	0.4777802407496474	0.43053982663412693	0.4406752937406331	0.4157050083773455	0.00263248034207	5.95166561664e-05	0.00043495277549	0.00567496309713	5.12013208431e-07	1.63168639115e-05	0.00023411339895	0.000152810281165	2.07737663516e-05	5.62183900058e-05	2.34155615835e-05	7.77665488063e-06	6.88135339095e-39	0.510701186361	0.0120223645456	0.0865556023226	1	0.000104962707728	0.00327968964622	0.04682267979	0.0297980048271	0.00427939586842	0.0116934251212	0.00480019012463	0.00160199090541	1.56206721975e-36	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:99771457..99771571,+__1064.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:99771457..99771571,+__1064.1.0.0	rs2516834	0.9347252461080086	1.2944506692850792	0.9863998242209602	0.9487145136551494	1.0628886807233595	1.028824659433625	1.0614293188715513	1.1253944067045714	1.1917223315194838	1.1283123732758553	1.1589568590082044	1.2267950221258628	1.095717825410976	0.7950567344825388	0.8781246337080173	0.722246566414406	0.8018558890030683	0.9640636938824356	0.7971212978863262	0.9030916295038698	0.9641586773443548	1.081267223085355	1.2055588348586355	0.9936369388030597	0.891717880733853	0.9164916666421602	-0.13966851162546978	-0.41632603557706194	-0.2641532578065542	-0.1468586246520811	-0.09882498684092389	-0.23170336154729876	-0.15833768936768156	-0.16123572936021657	-0.11045510843412876	0.07724646158278015	-0.16531992020514474	-0.3350771413920097	-0.1792261587688159	0.119339994516	0.0181189115857	0.0638899216795	0.202104162379	0.29495293544	0.221756412245	0.119339994516	0.405136064622	0.166665831608	0.861430881609	0.259370210024	0.0484054419273	0.00117296384918	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.982943705609	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:149375223..149375337,-__1071.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:149375223..149375337,-__1071.1.0.0	rs6783790	-1.2407506104887802	-0.9567996054255405	-1.1828867600951145	-1.1474109683422309	-1.3121644898122435	-1.3316546992882614	-1.12415643503707	-1.0579245630814256	-1.1167236257282442	-1.2656889550577644	-1.1671858455105155	-1.0031052038566748	-1.1588709801436554	-1.112922945847887	-1.2156624808512988	-1.2788065284785972	-1.1302444514386658	-1.1519933780155212	-1.2570517394937069	-1.0035029401973066	-0.909397594391427	-1.0297455313383486	-1.1955255506206113	-1.337228638906409	-1.152326365243892	-1.1478673454019728	0.12782766464089312	-0.25886287542575825	-0.0959197683834827	0.017166516903565077	0.1601711117967224	0.07460295979455456	0.12065349483976351	0.1485269686899986	0.08697809438989568	0.07016340443715308	-0.17004279339589345	-0.1492211613872172	0.011003634741682866	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:159557769..159557883,+__1072.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:159557769..159557883,+__1072.1.0.0	rs79601953	-0.5609093240484443	-0.39201344020361895	-0.5303794704558842	-0.6309791280365348	-0.4924013525761012	-0.26575459786881783	-0.44687288680967097	-0.5372165605449292	-0.3395491422526375	-0.42463848717614	-0.2433394250038418	-0.29485887242569525	-0.4299093906168596	-0.7166059619523283	-0.5057924854262058	-0.5763522807621541	-0.4624554102576328	-0.503612932732231	-0.2327016596263507	-0.2587950372895194	-0.5372630365192639	-0.14021642307433613	-0.24057022397695085	-0.4020542564260785	-0.4249401522116313	-0.4167799883545569	-0.155696637903884	-0.11377904522258686	-0.04597281030626987	0.16852371777890196	-0.011211580156129775	0.033052938242467134	0.18807784952015155	-4.647597433471429e-05	0.19933271917830137	0.18406826319918915	-0.1587148314222367	-0.13008127978593603	0.013129402262302766	0.687084607526	0.76769033028	1.0	0.382791178922	0.468411351413	0.76769033028	0.967868733231	0.788281320858	0.591208103411	0.946473618223	0.326996172605	0.340423946445	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr3:184529904..184530018,+__1073.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr3:184529904..184530018,+__1073.1.0.0	rs116661841	2.2445435678885897	2.7183022485026145	2.34565564081472	2.208047074206194	2.389925872193152	2.5154886250517006	2.310072734183898	2.403829185759317	2.48094200653296	2.5941554244192444	2.4384365784312765	2.519069979183389	2.4307057447639213	2.6170512507166466	2.8541252508322987	2.5195507984694654	2.3312789185960003	2.5893067951444375	2.5198781700214106	2.5022775759008278	2.918031124769522	2.641303240926261	2.683776711805492	2.620102413463795	2.9445556832338227	2.645103161156665	0.3725076828280569	0.13582300232968425	0.17389515765474517	0.12323184438980617	0.19938092295128573	0.004389544969710002	0.19220484171692975	0.5142019390102051	0.16036123439330074	0.08962128738624742	0.18166583503251843	0.4254857040504336	0.2143974163927436	0.276771967065	0.687084607526	0.527990680582	0.978575937473	0.554653407081	0.545696106059	0.957167318493	0.265084565602	0.727006731416	0.87199428352	0.788281320858	0.291862935071	0.937909811186	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr3:184529904..184530018,+__1073.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr3:184529904..184530018,+__1073.1.0.0	rs7640976	2.2445435678885897	2.7183022485026145	2.34565564081472	2.208047074206194	2.389925872193152	2.5154886250517006	2.310072734183898	2.403829185759317	2.48094200653296	2.5941554244192444	2.4384365784312765	2.519069979183389	2.4307057447639213	2.8975510142696335	3.2886706673260915	2.791067535482888	2.6347837323203485	2.826991822949511	2.8746639576130577	2.8734431116998453	3.023695291671535	3.0522299507560504	3.031423676069246	2.8962419868013396	2.973403579866363	2.9303471939021595	0.6530074463810438	0.570368418823477	0.445411894668168	0.4267366581141543	0.437065950756359	0.35917533256135714	0.5633703775159473	0.6198661059122181	0.5712879442230903	0.4372682516500017	0.4578054083700631	0.4543336006829741	0.4996414491382379	0.0134887989876	0.00423662678721	0.00753998341959	0.00240905380364	0.0174727290303	0.113101776132	0.0267271087754	0.0267271087754	0.0115927323179	0.0906800339379	0.0601351299193	0.0601351299193	2.1762192091e-12	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1.82367169722e-09	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr3:184529904..184530018,+__1073.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr3:184529904..184530018,+__1073.1.0.0	rs116661841,rs7640976	2.2445435678885897	2.7183022485026145	2.34565564081472	2.208047074206194	2.389925872193152	2.5154886250517006	2.310072734183898	2.403829185759317	2.48094200653296	2.5941554244192444	2.4384365784312765	2.519069979183389	2.4307057447639213	2.743934119995868	3.0536309371281414	2.6333102039779632	2.35975527382648	2.6487044092315357	2.805287018192924	2.6886558047076328	2.969813388666095	2.8324325055595687	2.765198662212534	2.7976944387972837	2.9699082123125913	2.772360414550718	0.4993905521072781	0.3353286886255269	0.287654563163243	0.1517081996202858	0.25877853703838394	0.28979839314122335	0.37858307052373474	0.5659842029067783	0.35149049902660856	0.17104323779328956	0.35925786036600726	0.45083823312920224	0.3416546697867968	0.0619860165974	0.0134887989876	0.0249397487324	0.216719559135	0.0719809426143	0.0499532058383	0.0548474154937	0.0296152123457	0.0932701621097	0.320413072024	0.0499532058383	0.0484054419273	7.67997527207e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1.74335438676e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:186435038..186435152,+__1074.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:186435038..186435152,+__1074.1.0.0	rs3806689	-0.8182733280739072	-0.5847684550667995	-0.5087966582329196	-0.8811395089015543	-0.9049544139970537	-0.7731774153550288	-1.0324111873397728	-0.5280980548030483	-0.7408603826292006	-0.8202263653563834	-0.8262578833498683	-0.5513587649819129	-0.7475268681739542	-1.4713311609252289	-1.390958027292072	-1.0954938883263583	-1.2959637003514144	-1.2854739116113243	-1.1113422645892823	-1.4567836492595847	-1.6559374894921586	-0.9319077158875593	-0.8621274063686392	-1.1821899958032578	-1.3633993654177716	-1.2585757146103878	-0.6530578328513217	-0.8061895722252725	-0.5866972300934387	-0.41482419144986005	-0.3805194976142706	-0.3381648492342535	-0.4243724619198119	-1.1278394346891103	-0.19104733325835865	-0.04190104101225578	-0.3559321124533895	-0.8120406004358587	-0.5110488464364336	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.716953652062	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.716953652062	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr4:40058390..40058504,+__1085.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr4:40058390..40058504,+__1085.1.0.0	rs368093271	0.6961275968164258	0.3424447404097197	0.04866010148793562	-0.14667919214565983		-0.44564195537701146	1.8271946419433676	-1.2198926365137404	-1.7707465131803592	-1.0381908920487757	-0.6619029504461784	-0.13479965191559162	-0.2275842464518062	0.8302877130412886	-0.7144137583729021	-1.623486481381102			-0.912489191584856	-1.46721658802007	-1.0967752685919343	-2.5037797398780866	-1.5484106761257632	-1.0760690975063802	-0.6242865850451457	-1.0736639673464952	0.1341601162248628	-1.0568584987826217	-1.6721465828690376			-0.4668472362078445	-3.294411229963438	0.12311736792180605	-0.7330332266977273	-0.5102197840769875	-0.41416614706020183	-0.48948693312955405	-0.8379892154640742	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:89300004..89300118,+__1086.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:89300004..89300118,+__1086.1.0.0	rs111670008	-0.8204884579263999	-0.9902732804641148	-0.9318220765421332	-0.6475121302475111	-1.031197323828131	-0.8651321155420063	-0.8280791710384249	-0.9931102686188468	-1.045758821204552	-0.9728745390082516	-0.8389448457914178	-0.9053892426555126	-0.9058818560722752	-1.0968284847923098	-0.841379484260288	-1.0136755277264218	-1.17497347668549	-1.195685646647578	-0.9892519074266274	-0.9109523764157716	-1.1494156436429888	-1.18301382132284	-0.9376254289352863	-1.1989276811899934	-0.9447957712539301	-1.0530437708582936	-0.27634002686590986	0.1488937962038268	-0.08185345118428855	-0.5274613464379789	-0.16448832281944714	-0.12411979188462108	-0.08287320537734677	-0.156305375024142	-0.13725500011828795	0.03524911007296527	-0.35998283539857556	-0.039406528598417534	-0.1471619147860186	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr5:137514778..137514892,+__1088.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr5:137514778..137514892,+__1088.1.0.0	rs17171770	-0.7885398590932121	-0.6900115124010009	-0.5850783848821176	-0.6331601618981871	-0.6115330706885442	-0.7102787906492919	-0.5083846138007412	-0.6373558356747241	-0.7536412234897211	-0.718937842400594	-0.6169295318633184	-0.5177978609298218	-0.6476373906476062	-0.935953650707024	-0.8117082846156689	-0.8333202517193756	-0.635955054523693	-0.9329708601466518	-1.0886959619552732	-0.7727071652969055	-0.7447646178998213	-0.9612336897527426	-0.7533009152144049	-0.7410130913853294	-0.8995599153862893	-0.8425986215502651	-0.14741379161381185	-0.12169677221466801	-0.24824186683725802	-0.002794892625505918	-0.3214377894581075	-0.3784171713059813	-0.26432255149616435	-0.1074087822250972	-0.20759246626302152	-0.0343630728138109	-0.124083559522011	-0.3817620544564675	-0.19496123090265874	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.104229562843	NA__no_active_tile	0.0808926541269	0.0120421581005	0.0763307839553	0.107123399254	0.101398170673	1.0	0.101398170673	0.00230397578633	1.0	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr5:137514778..137514892,+__1088.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr5:137514778..137514892,+__1088.1.0.0	rs17171772	-0.7885398590932121	-0.6900115124010009	-0.5850783848821176	-0.6331601618981871	-0.6115330706885442	-0.7102787906492919	-0.5083846138007412	-0.6373558356747241	-0.7536412234897211	-0.718937842400594	-0.6169295318633184	-0.5177978609298218	-0.6476373906476062	-0.6082166809271599	-0.6663637342250968	-0.7081443446602591	-0.6169074133871345	-0.6786250688559526	-0.7034758170171644	-0.7549717120663781	-0.6842950401114247	-0.8540944232194199	-0.7542731188536929	-0.6822393847868014	-0.6398755127101764	-0.6959568542350549	0.18032317816605226	0.023647778175904133	-0.1230659597781415	0.016252748511052628	-0.0670919981674084	0.006802973632127451	-0.24658709826563696	-0.04693920443670063	-0.1004531997296988	-0.03533527645309886	-0.0653098529234829	-0.12207765178035457	-0.048319463587448847	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.88258056334	NA__no_active_tile	0.76769033028	0.829896383209	0.162586850726	0.216719559135	0.619326784864	0.788281320858	0.282745459933	0.581967350665	0.730415594194	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr5:137514778..137514892,+__1088.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr5:137514778..137514892,+__1088.1.0.0	rs17171770,rs17171772	-0.7885398590932121	-0.6900115124010009	-0.5850783848821176	-0.6331601618981871	-0.6115330706885442	-0.7102787906492919	-0.5083846138007412	-0.6373558356747241	-0.7536412234897211	-0.718937842400594	-0.6169295318633184	-0.5177978609298218	-0.6476373906476062	-1.1753842851447351	-1.1260928911918364	-0.9154924640424985	-0.8171098893791313	-0.8762775976442758	-0.993345409385192	-0.7632382920866183	-0.8259693971309077	-0.7071146667115933	-0.8613011072503286	-0.9507490396218261	-0.7388097450008628	-0.8959070653824838	-0.386844426051523	-0.4360813787908355	-0.3304140791603809	-0.18394972748094418	-0.2647445269557316	-0.2830666187359001	-0.2548536782858771	-0.18861356145618358	0.04652655677812778	-0.1423632648497346	-0.33381950775850766	-0.221011884071041	-0.24826967473487763	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0327677521954	NA__no_active_tile	0.088148079887	0.107123399254	0.0565651674203	0.0601351299193	0.527990680582	0.301187193336	0.0181189115857	0.0276615481105	3.01426391691e-05	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	0.00684237909139	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr5:145562057..145562171,-__1089.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr5:145562057..145562171,-__1089.1.0.0	rs11540215	-0.8697367030525256	-1.1458143392392914	-1.1680680647937094	-0.7592763353545862	-1.1172422604729277	-0.8867219259067411	-1.3569478705501918	-0.7668705049856053	-1.303469013180734	-1.18608395175976	-1.139557149293951	-0.8036149195638133	-1.0419502531794864	-1.0575752967345622	-1.075453132932026	-1.12779840319449	-1.3004902374729697	-1.4171165171295759	-1.0001082721436183	-1.408961158780199	-1.1668309515742683	-1.155468507591436	-1.3653291341967224	-1.1938113220130382	-1.0510173675393029	-1.1933300251085175	-0.1878385936820366	0.07036120630726539	0.0402696615992193	-0.5412139021183835	-0.29987425665664813	-0.11338634623687716	-0.05201328823000706	-0.39996044658866303	0.14800050558929811	-0.17924518243696252	-0.05425417271908728	-0.2474024479754896	-0.151379771929031	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:147525608..147525722,+__1095.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:147525608..147525722,+__1095.1.0.0	rs11963039	-1.354728937506797	-1.3515373844844611	-1.3250042125574748	-1.6624409750966005	-1.2195437409826522	-1.3445647922508832	-1.5594117261177785	-0.8008074721634136	-1.4193388950002856	-1.2373283595876254	-1.4056736492547741	-1.2794089092604144	-1.3299824211885969	-1.3171416305937296	-1.2092251217668073	-1.3590920380904816	-1.5766903796114087	-1.6098337947598476	-1.568555146284497	-1.3316241997761604	-1.3191987203182087	-1.2926380952642262	-1.4453598587716112	-1.2679950917341047	-1.4342843502662297	-1.394303202269776	0.03758730691306744	0.14231226271765385	-0.03408782553300682	0.08575059548519182	-0.3902900537771954	-0.2239903540336139	0.22778752634161803	-0.5183912481547951	0.1267007997360594	-0.20803149918398578	0.13767855752066938	-0.1548754410058153	-0.06432078108117936	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:149969767..149969881,-__1096.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:149969767..149969881,-__1096.1.0.0	rs190331938	1.4423418095584952	1.6837294464425883	1.348028292423786	1.2633168162370123	1.393411413772006	1.3810040246594522	1.4279929109087695	1.3790620170404633	1.6111567808204743	1.5627978444121382	1.521448786673148	1.581463166395413	1.4663127757786454	1.549420211130405	1.7087805705829058	1.4739430384718903	1.3007731164389433	1.516336391064423	1.5549810386444816	1.451348901574645	1.4615874660785508	1.5350460401733088	1.725690682303842	1.7945442134947416	1.6166353108194056	1.5574239150647953	0.10707840157190973	0.025051124140317516	0.12591474604810426	0.037456300201931025	0.12292497729241703	0.1739770139850294	0.02335599066587557	0.08252544903808756	-0.0761107406471655	0.16289283789170383	0.2730954268215935	0.035172144423992524	0.09111113928614971	0.60051573606	0.777966336216	0.737113058664	0.706946403854	0.368322877114	0.192768091005	0.978575937473	0.527990680582	0.978575937473	0.48504462162	0.0932701621097	0.8931878581	0.925575915229	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:163148952..163149066,+__1097.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:163148952..163149066,+__1097.1.0.0	rs183571508	-0.7967759621245767	-0.6465199932990621	-0.7264992460717641	-0.9189786772090948	-0.7946046892002682	-0.6944021863119062	-0.7228796750953719	-0.29158245172809216	-0.7696459242391825	-0.7426044053611074	-0.7719618016404398	-0.6495761344124538	-0.7105025955577765	-1.0113834917021745	-0.7238983740351315	-0.5700502850666546	-0.8671193597435402	-0.6875939706942757	-0.8001699991400079	-0.9288812010491238	-0.5012986544259493	-0.8008735751021474	-0.9108333769192442	-0.9150060037291676	-0.6487980031550572	-0.7804921912302062	-0.21460752957759777	-0.0773783807360694	0.15644896100510952	0.05185931746555461	0.10701071850599242	-0.10576781282810166	-0.20600152595375187	-0.20971620269785718	-0.031227650862964862	-0.16822897155813676	-0.1430442020887278	0.0007781312573965637	-0.06998959567242952	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.747262025795	NA__no_active_tile	1.0	0.66743649171	NA__no_active_tile	0.340423946445	0.90381429355	0.436112310787	0.840380101088	0.90381429355	1.0	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:163148952..163149066,+__1097.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:163148952..163149066,+__1097.1.0.0	rs68144677	-0.7967759621245767	-0.6465199932990621	-0.7264992460717641	-0.9189786772090948	-0.7946046892002682	-0.6944021863119062	-0.7228796750953719	-0.29158245172809216	-0.7696459242391825	-0.7426044053611074	-0.7719618016404398	-0.6495761344124538	-0.7105025955577765	-0.1293130084829675	-0.13544826343952013	-0.2441019439738153	-0.2781045827283388	-0.08291212411723842	-0.2577603039098363	-0.34083091449379355	0.08787394892616947	-0.1578349815064696	-0.20497870265587836	-0.09746156893263659	-0.11254921759624532	-0.16278513857588087	0.6674629536416092	0.511071729859542	0.4823973020979488	0.6408740944807559	0.7116925650830297	0.4366418824020699	0.38204876060157833	0.3794564006542616	0.611810942732713	0.537625702705229	0.6745002327078032	0.5370269168162084	0.5477174569818958	0.000531799681309	0.00133155906714	0.00175684955224	6.66706650175e-05	1.53272450794e-06	2.34155615835e-05	0.00127069654712	0.00522462344006	0.00372847011721	0.000751093855117	0.000303956631358	0.000110173251151	1.36676160566e-31	0.376514174367	0.990679945954	1	0.0491362801179	0.00118326332013	0.0178894890498	0.939044748319	1	1	0.589608676267	0.233742649515	0.085824962647	1.14534622555e-28	not sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:163148952..163149066,+__1097.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:163148952..163149066,+__1097.1.0.0	rs9347683	-0.7967759621245767	-0.6465199932990621	-0.7264992460717641	-0.9189786772090948	-0.7946046892002682	-0.6944021863119062	-0.7228796750953719	-0.29158245172809216	-0.7696459242391825	-0.7426044053611074	-0.7719618016404398	-0.6495761344124538	-0.7105025955577765	-0.5541563559774005	-0.6418168008206522	-0.5744368973268956	-0.5613849727763058	-0.4351077041710737	-0.4789799028142822	-0.38414109027504506	-0.23461769156153112	-0.4286899847085082	-0.40448860939039755	-0.4681831980527157	-0.6493769516707595	-0.48461501329546386	0.24261960614717615	0.00470319247840989	0.15206234874486846	0.35759370443278893	0.35949698502919447	0.215422283497624	0.3387385848203268	0.056964760166561046	0.3409559395306743	0.33811579597070984	0.3037786035877241	0.00019918274169428152	0.22588758226231268	0.460214637573	0.819442862795	0.737113058664	0.179364149792	0.158583637061	0.0267271087754	0.0145358169752	0.444064484515	0.375513989452	0.0209174885683	0.101398170673	0.914457985151	0.0219242344251	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr6:163148952..163149066,+__1097.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:163148952..163149066,+__1097.1.0.0	rs183571508,rs68144677,rs9347683	-0.7967759621245767	-0.6465199932990621	-0.7264992460717641	-0.9189786772090948	-0.7946046892002682	-0.6944021863119062	-0.7228796750953719	-0.29158245172809216	-0.7696459242391825	-0.7426044053611074	-0.7719618016404398	-0.6495761344124538	-0.7105025955577765	-0.4954898560279262	-0.19727114155150868	-0.17616194551552253	-0.4198066437468184	-0.3070357997012386	-0.3603268453274527	-0.33892971625883994	-0.20153276210208138	-0.23094288154939274	-0.47545023190891866	-0.2629707346618407	-0.32213476167813093	-0.31567111000247267	0.30128610609665046	0.44924885174755336	0.5503373005562415	0.49917203346227634	0.48756888949902955	0.3340753409844535	0.38394995883653193	0.09004968962601079	0.5387030426897899	0.2671541734521887	0.5089910669785991	0.32744137273432283	0.39483148555530395	0.0763307839553	0.0832552515755	0.0276615481105	0.0249397487324	0.0181189115857	0.00919097005605	0.0499532058383	0.301187193336	0.0111573361887	0.00816548763477	0.00192430688789	0.216719559135	1.98214986258e-10	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.394482912018	1	4.49948018806e-08	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:2988811..2988925,+__1098.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:2988811..2988925,+__1098.1.0.0	rs150455546	-0.7355052704645034	-0.6328813474528134	-0.5594218770500545	-0.6405128319028663	-0.4856904701816933	-0.5284860606628665	-0.7454039715918165	-0.8847354019614293	-0.539820848721864	-0.5029943949690983	-0.543319836315489	-0.5254641469766282	-0.6103530381875937	-0.5205649444943238	-0.5500603376727593	-0.4123374455761376	-0.9111644394227785	-0.7774875685618846	-0.7932595654655207	-0.6352401980839566	-1.0077103094066613	-0.6092451362697204	-0.7351164756159292	-0.6375217965253799	-0.6899522293207943	-0.6899717038679872	0.21494032597017965	0.08282100978005413	0.14708443147391692	-0.27065160751991213	-0.2917970983801913	-0.26477350480265416	0.11016377350785989	-0.12297490744523198	-0.06942428754785646	-0.23212208064683093	-0.09420196020989091	-0.164488082344166	-0.07961866568039361	NA__no_active_tile	0.519249062249	0.840380101088	0.197390602198	0.13967914143	0.237368605078	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.519249062249	0.79863356553	0.957167318493	0.581967350665	0.656332811393	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:31465842..31465956,+__1099.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:31465842..31465956,+__1099.1.0.0	rs2516498	-1.3198360615911349	-1.1168589461566187	-1.2454634069627968	-1.6156811720732562	-1.4669769508807793	-1.4461534546967698	-1.334307132697894	-1.2022662492081022	-1.672256819425983	-1.3452922073170868	-1.4128775964214502	-1.6422286712308365	-1.4016832223885591	-1.1856167866175826	-1.0180439221459026	-1.0283782607827752	-1.1204666372228311	-1.5707864739308135	-1.0294396492171858	-1.4417467438087812	-1.357469073368644	-1.3527188147910951	-1.1510877026298572	-1.1216195348194729	-1.0457830000622916	-1.201929716616436	0.13421927497355224	0.09881502401071618	0.21708514618002162	0.4952145348504251	-0.10380952305003421	0.41671380547958403	-0.10743961111088729	-0.15520282416054187	0.3195380046348879	0.1942045046872296	0.2912580616019773	0.5964456711685449	0.19975350577212295	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:31465842..31465956,+__1099.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:31465842..31465956,+__1099.1.0.0	rs2516497	-1.3198360615911349	-1.1168589461566187	-1.2454634069627968	-1.6156811720732562	-1.4669769508807793	-1.4461534546967698	-1.334307132697894	-1.2022662492081022	-1.672256819425983	-1.3452922073170868	-1.4128775964214502	-1.6422286712308365	-1.4016832223885591	-1.7473165638976715	-1.1356405401999532	-1.6050923342432388	-1.658818311882868	-1.6443807660935654	-1.580634097747242	-1.3779419851239416	-1.3258655206767738	-1.3929302687365757	-1.574435848401328	-1.7768406697428956	-1.8257494421210536	-1.5538038624055925	-0.42748050230653667	-0.01878159404333446	-0.35962892728044205	-0.04313713980961187	-0.17740381521278614	-0.13448064305047214	-0.0436348524260477	-0.12359927146867156	0.27932655068940737	-0.22914364108424135	-0.3639630733214454	-0.18352077089021712	-0.15212064001703327	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:31465842..31465956,+__1099.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:31465842..31465956,+__1099.1.0.0	rs3828916	-1.3198360615911349	-1.1168589461566187	-1.2454634069627968	-1.6156811720732562	-1.4669769508807793	-1.4461534546967698	-1.334307132697894	-1.2022662492081022	-1.672256819425983	-1.3452922073170868	-1.4128775964214502	-1.6422286712308365	-1.4016832223885591	-1.2450244036503573	-1.4238635800019088	-1.1250858561768955	-1.5899421949610553	-1.3855030644078639	-1.3063061487165921	-1.4472719543784183	-1.1949120222671246	-1.2325475609338368	-1.2531419073814998	-1.0367666589473756	-1.3136166244160794	-1.296165164686584	0.0748116579407776	-0.3070046338452901	0.12037755078590129	0.025738977112200967	0.08147388647291542	0.1398473059801777	-0.11296482168052435	0.007354226940977648	0.43970925849214626	0.09215029993558699	0.37611093747407454	0.3286120468147571	0.10551805770197509	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:31465842..31465956,+__1099.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:31465842..31465956,+__1099.1.0.0	rs3828917	-1.3198360615911349	-1.1168589461566187	-1.2454634069627968	-1.6156811720732562	-1.4669769508807793	-1.4461534546967698	-1.334307132697894	-1.2022662492081022	-1.672256819425983	-1.3452922073170868	-1.4128775964214502	-1.6422286712308365	-1.4016832223885591	-1.307504482315954	-1.2904921400473084	-1.4295717209740872	-1.0734973288358105	-1.3167152240544886	-1.08208435495107	-1.4160527121670774	-1.2710716550185106	-1.0423091766224584	-1.560875998869978	-1.1317616075460932	-1.4471999994458034	-1.2807613667373865	0.012331579275180804	-0.17363319389068965	-0.18410831401129046	0.5421838432374457	0.1502617268262907	0.3640690997456999	-0.08174557946918348	-0.0688054058104084	0.6299476428035247	-0.2155837915528913	0.28111598887535694	0.19502867178503314	0.12092185565117237	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr6:31465842..31465956,+__1099.1.4.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:31465842..31465956,+__1099.1.0.0	rs114861390,rs2516498,rs2516497,rs3828916,rs3828917	-1.3198360615911349	-1.1168589461566187	-1.2454634069627968	-1.6156811720732562	-1.4669769508807793	-1.4461534546967698	-1.334307132697894	-1.2022662492081022	-1.672256819425983	-1.3452922073170868	-1.4128775964214502	-1.6422286712308365	-1.4016832223885591	-1.3519168435895685	-1.0645423718739448	-1.1948267251121731	-1.3630171564352054	-1.2836301265401877	-1.371274268551115	-1.0914354641520454	-1.047903213087415	-1.0374035384054752	-0.9390025605553907	-1.2178017055727146	-1.2787078886844667	-1.1867884885466418	-0.03208078199843367	0.05231657428267389	0.050636681850623644	0.25266401563805085	0.18334682434059157	0.07487918614565481	0.24287166854584852	0.15436303612068714	0.6348532810205079	0.4062896467616961	0.19507589084873556	0.36352078254636977	0.21489473384191718	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:41888791..41888905,-__1101.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:41888791..41888905,-__1101.1.0.0	rs2274578	3.0402863099071773	3.4269019758849417	2.95943571542926	2.8199955147480815	2.8773916202027046	2.9845047570279672	2.9222284500936127	3.288228182353463	3.0741942662816726	3.14257548823951	3.183530875450479	3.1734042872081347	3.0743897869022505	2.837340480678558	3.423338903891075	2.8444852530683615	2.727388128246293	2.9439050592262292	3.0669396465437715	2.9678687606069065	3.1749879789734443	3.0600741871535586	3.1092335185563735	3.1513003791855727	3.1444317341259342	3.0376078358546734	-0.20294582922861926	-0.003563071993866629	-0.11495046236089834	-0.09260738650178846	0.06651343902352469	0.08243488951580424	0.04564031051329387	-0.11324020338001883	-0.014120079128113971	-0.03334196968313652	-0.03223049626490626	-0.02897255308220048	-0.036781951047577165	0.282745459933	0.747262025795	0.390154148302	0.270885072145	0.925116184404	0.581967350665	0.829896383209	0.563691144959	0.8931878581	0.628827692687	0.989287003123	0.967868733231	0.986754931918	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:80714245..80714359,+__1103.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:80714245..80714359,+__1103.1.0.0	rs45452496	1.634998025653097	1.8683738958724716	1.630826061027415	1.519830761312178	1.7885414358996519	1.6917026440451857	1.608426635933911	1.8097180495723715	1.7994057021313616	1.7753029707232064	1.8089879798794002	1.7389684547306135	1.7229235513984051	2.0706358324158005	2.3493743901894213	1.921485618559227	1.8192596558829053	1.9015806931040906	1.913762902302709	1.9142034900156064	2.1493045248939637	2.0226040626687034	1.9805907615567202	2.0057146243475334	1.990303094327212	2.0032349708553245	0.4356378067627036	0.4810004943169497	0.29065955753181205	0.2994288945707273	0.11303925720443875	0.2220602582575233	0.3057768540816954	0.33958647532159225	0.22319836053734177	0.20528779083351378	0.19672664446813326	0.2513346395965985	0.2803114194569192	0.0187859264625	0.0150857114019	0.110080523892	0.179364149792	0.132622250874	0.00919097005605	0.0719809426143	0.0548474154937	0.0785847853765	0.0856734395523	0.0565651674203	0.045430560235	2.13248971713e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1.78702638296e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr7:1199731..1199845,-__1106.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr7:1199731..1199845,-__1106.1.0.0	rs71518378	-0.5306743328803342	-0.6725464419368515	-0.785104049678597	-0.6571692643432279	-0.769313293094748	-0.6965567938478374	-0.7112380067036429	-0.5379596444605342	-0.8696811123278173	-0.7047322509015003	-0.6935075081095561	-0.7139668319747865	-0.6952041275216194	-0.5426658485673188	-0.6102644247684315	-0.7788164740841266	-1.0112584633040134	-0.9563495657261012	-0.8069385543516494	-0.7481949605325293	-0.7141291517328282	-0.7460515353881025	-0.7649860999369664	-0.6973557015214367	-0.7368404687965702	-0.7594876040591729	-0.011991515686984644	0.06228201716842008	0.0062875755944704625	-0.3540891989607855	-0.18703627263135314	-0.11038176050381199	-0.03695695382888642	-0.17616950727229397	0.12362957693971477	-0.060253849035466156	-0.003848193411880585	-0.02287363682178367	-0.0642834765375534	0.79863356553	0.510582765025	0.829896383209	0.147021540231	0.242741268695	0.122558611289	0.519249062249	0.347268461228	0.840380101088	0.326996172605	0.819442862795	0.79863356553	0.598178348936	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr7:1199731..1199845,-__1106.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr7:1199731..1199845,-__1106.1.0.0	rs6946684	-0.5306743328803342	-0.6725464419368515	-0.785104049678597	-0.6571692643432279	-0.769313293094748	-0.6965567938478374	-0.7112380067036429	-0.5379596444605342	-0.8696811123278173	-0.7047322509015003	-0.6935075081095561	-0.7139668319747865	-0.6952041275216194	-0.9772886038756217	-0.6733604041750834	-0.9103522677921092	-0.7027615649448002	-0.5597958748825665	-0.8662678777996906	-0.8132256215387148	-0.7799942108376934	-0.9244787004650588	-0.8552288861487132	-0.6772968349044721	-0.6849805298370616	-0.7854192814334655	-0.4466142709952875	-0.0008139622382318246	-0.12524821811351217	-0.04559230060157238	0.2095174182121815	-0.1697110839518532	-0.1019876148350719	-0.24203456637715914	-0.05479758813724145	-0.1504966352472129	0.01621067320508396	0.028986302137724906	-0.09021515391184602	0.116187990183	0.493479697885	0.412754243182	0.727009731456	0.563691144959	0.0832552515755	0.809021331888	0.0763307839553	0.30750859871	0.501992688725	0.777966336216	0.76769033028	0.321290163084	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr7:1199731..1199845,-__1106.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr7:1199731..1199845,-__1106.1.0.0	rs79849558	-0.5306743328803342	-0.6725464419368515	-0.785104049678597	-0.6571692643432279	-0.769313293094748	-0.6965567938478374	-0.7112380067036429	-0.5379596444605342	-0.8696811123278173	-0.7047322509015003	-0.6935075081095561	-0.7139668319747865	-0.6952041275216194	-0.7203636010042481	-0.47311459930295974	-0.5646890609861925	-0.6968236062005511	-0.8847948682890319	-0.6977270019421675	-0.860783250375559	-0.8828096245961881	-0.7882217401685503	-0.7256199689255938	-0.6921362592491662	-0.7907686451895293	-0.7314876855191447	-0.18968926812391396	0.1994318426338918	0.2204149886924045	-0.039654341857323194	-0.11548157519428381	-0.0011702080943301052	-0.14954524367191613	-0.3448499801356538	0.08145937215926702	-0.020887718024093505	0.001371248860389862	-0.07680181321474278	-0.03628355799752534	0.510582765025	0.76769033028	0.66743649171	0.757455001208	0.460214637573	0.242741268695	0.716953652062	0.0531733827136	0.581967350665	0.925117039075	0.757455001208	0.777966336216	0.819257196013	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr7:1199731..1199845,-__1106.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr7:1199731..1199845,-__1106.1.0.0	rs11767061	-0.5306743328803342	-0.6725464419368515	-0.785104049678597	-0.6571692643432279	-0.769313293094748	-0.6965567938478374	-0.7112380067036429	-0.5379596444605342	-0.8696811123278173	-0.7047322509015003	-0.6935075081095561	-0.7139668319747865	-0.6952041275216194	-0.6178670122977257	-0.5423902936200119	-0.5757369459864897	-0.7099525986233374	-0.7121812772859453	-0.6995198909053704	-0.7171197175042616	-0.5677726391196084	-0.6537687795820123	-0.5710536647577986	-0.6441369468661481	-0.7280343866470727	-0.6449611794329818	-0.0871926794173915	0.13015614831683964	0.20936710369210731	-0.052783334280109506	0.05713201580880278	-0.0029630970575329485	-0.005881710800618722	-0.029812994659074166	0.215912332745805	0.13367858614370165	0.049370561243407995	-0.014067554672286153	0.050242948088637614	0.256539812928	0.861430881609	0.242741268695	0.76769033028	0.757455001208	0.88258056334	0.420456664513	0.716953652062	0.29495293544	0.206893929435	0.276771967065	0.777966336216	0.671926422666	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr7:1199731..1199845,-__1106.1.4.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr7:1199731..1199845,-__1106.1.0.0	rs71518378,rs6946684,rs79849558,rs11767061	-0.5306743328803342	-0.6725464419368515	-0.785104049678597	-0.6571692643432279	-0.769313293094748	-0.6965567938478374	-0.7112380067036429	-0.5379596444605342	-0.8696811123278173	-0.7047322509015003	-0.6935075081095561	-0.7139668319747865	-0.6952041275216194	-0.9045684243896309	-1.0263936646493519	-1.0460544297272245	-0.9126534757138267	-0.8902364795370703	-1.114344607672496	-0.9651007320704102	-1.0729548864573106	-1.0768396599817558	-0.9022608830350691	-1.0358735634126084	-0.8355395586928774	-0.981901697111636	-0.37389409150929676	-0.35384722271250035	-0.2609503800486275	-0.25548421137059885	-0.12092318644232225	-0.4177878138246587	-0.25386272536676735	-0.5349952419967764	-0.20715854765393849	-0.19752863213356886	-0.3423660553030523	-0.12157272671809094	-0.2866975695900166	0.0296152123457	0.0338805621681	0.192768091005	0.141483179219	0.510577925344	0.00423662678721	0.554657938956	0.00883703695038	0.197395731844	0.0906800339379	0.00460947122508	0.591208103411	6.92079537054e-06	1	1	1	1	1	0.851561984229	1	1	1	1	0.944941601142	1	0.00157102054911	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:44621849..44621963,-__1108.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:44621849..44621963,-__1108.1.0.0	rs11983759	0.6343908580182765	1.041329207804842	0.8104231485138484	0.6604801105924554	0.8260823813204106	0.9500185200450548	0.9474546981828251	0.9689147873474312	1.032134099288427	0.9697887856655076	0.9544349530299896	0.9593731190512826	0.896235389071696	0.4416010721793363	0.8406077053527425	0.5985884891133515	0.5661920458319557	0.6507729512592895	0.5057987711135126	0.753217486735251	0.81807416502576	0.6413377886362182	0.7010542398991224	0.601635041722242	0.801693712505783	0.660047789114547	-0.19278978583894024	-0.2007215024520994	-0.21183465940049695	-0.09428806476049967	-0.1753094300611211	-0.44421974893154226	-0.1942372114475741	-0.15084062232167117	-0.39079631065220877	-0.2687345457663852	-0.35279991130774757	-0.1576794065454996	-0.23618759995714886	0.192768091005	0.226876581559	0.170821264488	0.519249062249	0.0583274625199	0.00240905380364	0.0698833862508	0.132622250874	0.0150857114019	0.0216734048733	0.000505862288815	0.0678362651725	4.89426360009e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.389008100099	1	4.10139289688e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr8:142011228..142011342,-__1113.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr8:142011228..142011342,-__1113.1.0.0	rs148639490	0.6776623078602074	-0.35944076446716633	-0.7263131722142759	-0.2074545493250116	-0.02168048140186088	-0.961693161362184	0.08808781177113689	-0.4966195140381632	-1.010707249257116	-1.3657960653720544	-1.792644734404338	-1.894909781210151	-0.6726257794517481	-0.14045934405605653	-0.24976369889467298	0.3496253276443558	-0.8800435003600722	-0.7009331988413292	-1.6810216893968115	-1.53085557623611	0.14435337303797804	-1.2275487175440514	-1.1418068370441752	-0.3413660479378714	-1.8304432991928186	-0.7691886007351362	-0.818121651916264	0.10967706557249335	1.0759384998586317	-0.6725889510350606	-0.6792527174394684	-0.7193285280346275	-1.618943388007247	0.6409728870761412	-0.2168414682869353	0.22398922832787926	1.4512786864664666	0.0644664820173324	-0.09656282128338821	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr8:1711901..1712015,+__1114.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr8:1711901..1712015,+__1114.1.0.0	rs71499040	1.7236121398428923	1.143986862120098	0.35998299151921115	1.1223435910273614	1.0480962896407022	1.2404914492972892	0.6900477115903001	1.1908885990911364	0.6255704658269252	-0.1370346607746987	0.2331773040226296	0.35534276495031064	0.7997087923461796	0.6093297191293946	0.3424447404097197	1.7996857972749898	1.0247972682500477	0.6803904285272426	-0.3182085630987308	-0.027247415985245174	1.2799854978830414	0.031890720960131874	0.050387297503703875	0.6762791393371964	0.5903081062407705	0.5616702280360218	-1.1142824207134976	-0.8015421217103782	1.4397028057557786	-0.09754632277731368	-0.3677058611134596	-1.55870001239602	-0.7172951275755453	0.08909689879190497	-0.5936797448667933	0.18742195827840258	0.4431018353145668	0.23496534129045982	-0.23803856431015794	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:42065048..42065162,-__1116.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:42065048..42065162,-__1116.1.0.0	rs8178675	-0.4044149033522828	-0.317508571474696	-0.3494588494558093	-0.4479226105841826	-0.24036499968485403	-0.34099450889165084	-0.33960685858204065	-0.2200253298529094	-0.37805105103311976	-0.40091507554163547	-0.2511308976491799	-0.4532318638849647	-0.34530212666561044	-0.08922603694872269	-0.08902231080979689	-0.16751184336245264	-0.2647587655656866	-0.1414585446676849	-0.08451919528807095	-0.22703618999881736	-0.192168620042717	-0.015839208941671973	-0.08142680804684839	-0.08350176748076377	-0.19665400307323794	-0.13609360785220595	0.31518886640356014	0.22848626066489913	0.18194700609335665	0.18316384501849597	0.09890645501716913	0.2564753136035799	0.11257066858322329	0.027856709810192393	0.3622118420914478	0.3194882674947871	0.16762913016841613	0.2565778608117268	0.20920851881340455	0.397602565759	0.110080523892	0.313917214294	0.221756412245	0.276771967065	0.452098798395	0.221756412245	0.727009731456	0.0216734048733	0.0785847853765	0.390154148302	0.0856734395523	0.00604185152851	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr9:72435677..72435791,+__1123.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr9:72435677..72435791,+__1123.1.0.0	rs17439752	-1.4803465470614203	-1.5567205990609558	-1.4498914530458265	-1.404928797070975	-1.5330041290698608	-1.3788540772141853	-1.4853127658976595	-1.042343927584454	-1.5981666040137603	-1.4400778376411152	-1.576662125516228	-1.5278337934484574	-1.4561785547187414	-1.353927030738601	-1.2979961922544176	-1.4436923695499202	-1.5627785022630687	-1.3716962958191363	-1.2993875343762362	-1.286934607145429	-1.0596268898431132	-1.4167726671002778	-1.4757921954303264	-1.3064527221094715	-1.5852774123627573	-1.371694534916063	0.12641951632281923	0.2587244068065382	0.006199083495906255	-0.15784970519209374	0.1613078332507245	0.07946654283794907	0.19837815875223042	-0.017282962258659218	0.1813939369134825	-0.03571435778921117	0.2702094034067566	-0.05744361891429994	0.08448401980267856	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr1:176176611..176176725,-__1134.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr1:176176611..176176725,-__1134.1.0.0	rs539723	1.724525492827174	2.170102402490825	1.7541911334841465	1.6897072470422838	1.9169265265812427	1.6885671527781834	1.7187801736005393	1.907502466542649	1.7518296777972044	1.8499338229110007	1.8487787847479726	1.8403922976984552	1.8217697648751399	1.8891605779141307	2.2443247285418693	1.9569234164905196	1.8449499100616207	2.0143798784773335	2.030793523037807	2.0316617947011792	2.1904794060040196	2.2525185773495506	2.2721300086833986	2.1766930653045633	2.2676822461965447	2.0976414277302116	0.16463508508695668	0.07422232605104417	0.20273228300637314	0.15524266301933687	0.09745335189609072	0.34222637025962355	0.31288162110064	0.2829769394613706	0.5006888995523462	0.4221961857723979	0.32791428055659066	0.42728994849808943	0.27587166285507164	0.179364149792	0.0986283746992	0.122558611289	0.0856734395523	0.0619890035232	0.00955750115232	0.136115392203	0.0132366390577	0.00251850159852	0.00240905380364	0.0120431385799	0.0216734048733	1.45545103526e-10	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1.21966796755e-07	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr1:201476216..201476330,-__1135.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr1:201476216..201476330,-__1135.1.0.0	rs117708536	-0.18102287295018613	-0.3320140821674881	-0.5287846298886311	-0.8731707235195456	-0.6025144690130347	-0.3100227290579857	-0.09363840751872893	-0.49408139664897255	-0.07708276169766877	0.04383862202927023	-0.29226352260634214	-0.3465315527106948	-0.340607377145834	0.0746521205041057	-0.7713163071980903	-0.7418296266933646	-1.3314174965373249	0.019529584523253568	-1.130702181519835	-0.8525605231610781	-0.07395457959985031	-0.6667196034342355	-0.2980016841794433	-0.4718951504866498	-0.5513587649819129	-0.5662978510637021	0.25567499345429184	-0.4393022250306022	-0.21304499680473354	-0.4582467730177793	0.6220440535362883	-0.8206794524618493	-0.7589221156423491	0.42012681704912225	-0.5896368417365667	-0.34184030620871353	-0.17963162788030768	-0.20482721227121814	-0.22569047391786812	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr1:24104828..24104942,+__1138.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr1:24104828..24104942,+__1138.1.0.0	rs56743324	3.328148158776646	2.242555930238935	0.3635098137190546	2.248001805510909	0.2705406415255662	1.4207500994631934	1.1903831483082903	1.3597825528811562	1.8003513206022452	0.7858608281082614	1.6251853009140933	-0.23717229282136784	1.3664914422689154	0.84072254734292	-0.03212227899329628	-0.5488891577358769	-0.7990058743144154	-0.8061999979994605	-0.8344588149694442	0.15883206401643254	0.11755139826335492	0.3938136547340866	0.2979837104153412	-0.45821708748609	-0.38914657040420997	-0.17159470059422155	-2.4874256114337263	-2.2746782092322313	-0.9123989714549314	-3.0470076798253243	-1.0767406395250267	-2.2552089144326377	-1.0315510842918578	-1.2422311546178013	-1.4065376658681585	-0.4878771176929202	-2.0834023884001835	-0.15197427758284213	-1.538086142863137	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr1:3816787..3816901,-__1139.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr1:3816787..3816901,-__1139.1.0.0	rs61770363	1.185676175920053	1.2058516989913852	0.7139183719411567	0.6310660446190872	0.9808416336033826	0.9563099316369144	1.297960651378831	1.0907431543838662	1.1737884083804029	1.110185220889942	1.0793976240088168	1.0177111118483064	1.0369541689668453	0.7278941619652911	0.8187878008829825	0.7357883550745997	0.6407275032590974	0.7885836187138149	0.6570653447501988	1.0522672171062004	0.9460450447896976	0.9353677821200044	1.0173315660953763	0.9386791864744152	1.239810866847852	0.8748623706732942	-0.4577820139547618	-0.3870638981084027	0.021869983133443016	0.009661458640010223	-0.19225801488956773	-0.2992445868867155	-0.24569343427263068	-0.1446981095941685	-0.2384206262603985	-0.09285365479456575	-0.1407184375344016	0.2220997549995456	-0.16209179829355116	0.0191260417446	0.0327657556683	0.79863356553	0.572794651112	0.038651648644	0.519249062249	0.0316863885398	0.0719809426143	0.13967914143	0.234708652176	0.197395731844	0.85089220831	0.00292984279403	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr1:95285851..95285965,+__1143.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr1:95285851..95285965,+__1143.1.0.0	rs187254725	0.5874772923354636	0.16942840702933273	-1.6526950285889714	-0.4862567201464506	-2.7678958536885565	0.17751659655942317	-0.22451496011605998	-0.2102578906096068	-0.14614325047742135	-1.114699492718808	-0.5568431869886593	-0.04742871648841688	-0.5226927336582277	1.7415063792788068	0.9903388591301823	0.9306601759193248	1.6818887816643633	2.712648680883407	0.6515997118476916	0.8425301024259026	1.0862494717721782	-0.7845649251645824	1.3019553909434145	0.3740049755952567	0.014382583449021803	0.9619333489787474	1.1540290869433432	0.8209104521008496	2.583355204508296	2.168145501810814	5.480544534571964	0.4740831152882684	1.0670450625419625	1.296507362381785	-0.638421674687161	2.416654883662223	0.930848162583916	0.06181129993743868	1.484626082636975	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr10:28821628..28821742,+__1144.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr10:28821628..28821742,+__1144.1.0.0	rs149864425	1.062181677410291	1.2030370929353138	1.0240897961488757	0.8097834461272103	1.0704157965663925	1.3710563431601344	0.9514175734290828	1.545267737156374	1.1462661138990071	1.039726198234887	1.2828227331235973	1.3752767489306417	1.1567784380934838	0.39024091685608064	0.6965555745810168	0.4281051440017597	0.294390097725075	0.6197868487929666	0.7200065575408696	0.516154308176576	0.8541443724893403	0.7911611253187993	0.5636811884532721	0.6591072887528675	0.6968835470585503	0.6025180808122645	-0.6719407605542104	-0.506481518354297	-0.595984652147116	-0.5153933484021354	-0.4506289477734259	-0.6510497856192647	-0.4352632652525068	-0.6911233646670338	-0.3551049885802078	-0.476045009781615	-0.6237154443707298	-0.6783932018720914	-0.5542603572812196	0.00313710581496	0.0156538458129	0.00544559218276	0.00327633608155	0.00591301274865	7.89440729856e-05	0.0515422504639	0.000481108176159	0.0125089884503	0.0338805621681	0.00313710581496	0.000210645996816	2.7799930039e-20	1	1	1	1	1	0.060313271761	1	0.349765644068	1	1	1	0.16409323152	2.32963413727e-17	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr10:38146503..38146617,-__1146.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr10:38146503..38146617,-__1146.1.0.0	rs1148296	0.39549089720559205	0.8305489071278587	0.4364771364534769	0.5779860957957583	0.6214852508531796	0.4674145226054003	0.7376875074784481	0.9639808846842061	0.7894040169783532	0.7283594153745299	0.8339652193108451	0.6919010586273888	0.6728917427079196	0.8303355440633349	1.0797444506532607	0.8663064528894054	0.8087836543777382	0.9661215295390209	0.9824439081879943	1.12419795490744	1.237378522939878	1.3608913330973733	1.0632774631902357	1.3042953668238186	1.15314497769769	1.0647434298639327	0.4348446468577428	0.24919554352540207	0.42982931643592853	0.23079755858197992	0.34463627868584124	0.515029385582594	0.38651044742899177	0.27339763825567187	0.5714873161190202	0.3349180478157059	0.47033014751297353	0.46124391907030127	0.3918516871560127	0.00955750115232	0.340423946445	0.00441948685714	0.154655491485	0.00522462344006	0.00139510136839	0.00816548763477	0.0959193233604	0.0258200569765	0.0267271087754	0.00784715402968	0.00522462344006	7.59790314802e-13	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	6.36704283804e-10	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr10:38146503..38146617,-__1146.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr10:38146503..38146617,-__1146.1.0.0	rs114378760	0.39549089720559205	0.8305489071278587	0.4364771364534769	0.5779860957957583	0.6214852508531796	0.4674145226054003	0.7376875074784481	0.9639808846842061	0.7894040169783532	0.7283594153745299	0.8339652193108451	0.6919010586273888	0.6728917427079196	0.6586033192840212	0.9589892666484432	0.8328907191833554	0.8581902307580336	1.0526540166429543	0.9387196251751876	1.0473713408977734	1.2126959099308896	1.0554646131174759	1.0949890943907954	1.167297223326782	0.9736445800038208	0.9876258282799611	0.2631124220784291	0.12844035952058452	0.39641358272987853	0.28020413496227525	0.4311687657897747	0.4713051025697873	0.30968383341932526	0.24871502524668354	0.2660605961391227	0.36662967901626553	0.3333320040159369	0.281743521376432	0.31473408557204124	0.0678362651725	0.313917214294	0.00849533044186	0.0399413890972	0.000413457613232	0.000505862288815	0.0111573361887	0.361218104761	0.0103298859694	0.0129907246043	0.0181189115857	0.0216734048733	1.95822080725e-12	1	1	1	1	0.319189277415	0.386478788655	1	1	1	1	1	1	1.64098903648e-09	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr10:38146503..38146617,-__1146.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr10:38146503..38146617,-__1146.1.0.0	rs1148296,rs114378760	0.39549089720559205	0.8305489071278587	0.4364771364534769	0.5779860957957583	0.6214852508531796	0.4674145226054003	0.7376875074784481	0.9639808846842061	0.7894040169783532	0.7283594153745299	0.8339652193108451	0.6919010586273888	0.6728917427079196	0.727271860175198	0.9331234296558972	0.812984604870227	0.5636859844719124	1.021652575063985	1.0547332779834886	1.0369433000520483	1.118375749551796	0.9788112198611698	1.0283576396224057	1.1309132894923253	0.8616238483460953	0.9390397315955458	0.3317809629696059	0.10257452252803856	0.37650746841675004	-0.014300111323845899	0.4001673242108055	0.5873187553780883	0.29925579257360013	0.15439486486759002	0.18940720288281665	0.2999982242478758	0.2969480701814802	0.16972278971870647	0.266147988887626	0.21176555971	0.8931878581	0.0484054419273	0.143314270352	0.0194743211566	0.00480682187369	0.0216734048733	0.90381429355	0.29495293544	0.0224529881577	0.0296152123457	0.29495293544	0.000134157475401	1	1	1	1	1	0.966171196611	1	1	1	1	1	1	0.0304537469161	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr11:27528279..27528393,-__1150.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr11:27528279..27528393,-__1150.1.0.0	rs2242341	4.117777349914098	4.399735416024836	3.968584560087219	3.6517901278495346	4.1046588404370725	4.170116675076834	3.876632921144382	4.325337131713941	4.250157275952914	4.253405153333894	4.258576966081705	4.334859609929753	4.142636002295515	4.117289669529386	4.323832976609268	3.9960254122761745	3.684862927223605	4.074903429736581	4.158875079172738	3.9140463232943974	4.330130208872173	4.275223477356249	4.268542582212195	4.23677301318761	4.337533357144784	4.143169871384597	-0.0004876803847118083	-0.07590243941556807	0.02744085218895531	0.03307279937407026	-0.029755410700491147	-0.011241595904095902	0.03741340215001543	0.004793077158232073	0.025066201403335597	0.015137428878301051	-0.021803952894095424	0.002673747215030886	0.0005338690890815215	0.957167318493	0.63839046467	0.757455001208	0.840380101088	0.829896383209	0.967868733231	0.591208103411	0.788281320858	0.368322877114	0.527990680582	0.967868733231	0.935789553219	0.999001972936	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr11:70244567..70244681,+__1152.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr11:70244567..70244681,+__1152.1.0.0	rs11825736	0.9557807704700452	0.73402942539229	-0.1279168767231406	1.0080998848879876	0.9527905432636181	0.7495652535138368	0.4750442988997801	-0.6286596882569991	0.7304838389169802	-0.7489540651084873	0.4908877021953618	-0.18216004138579822	0.3674159205054563	1.7133863893560524	0.7472235180190456	1.026414875767819	1.3910640748614684	1.2506689321191042	1.1051287369531084	1.1436859139164344	1.7928660846107616	0.9171860366215112	1.5497688530596734	0.9136813245234584	1.0138951466073132	1.2137474905346457	0.7576056188860072	0.013194092626755638	1.1543317524909598	0.3829641899734808	0.2978783888554861	0.3555634834392716	0.6686416150166543	2.421525772867761	0.186702197704531	2.2987229181681608	0.4227936223280966	1.1960551879931114	0.8463315700291898	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr12:112279772..112279886,+__1154.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr12:112279772..112279886,+__1154.1.0.0	rs11066043	3.6009100929786912	4.117004694519467	3.343590704076626	3.172817876248218	3.517561696961022	3.548605373178522	3.4571486317741775	3.971224056260101	3.747017698721585	3.7570666478984567	3.7712463123035027	3.762986213490806	3.647264999867598	3.3750804151148692	3.9557480399433214	3.144684851297912	2.8424019990769356	3.432444353489165	3.4727264794553445	3.1956567707751207	3.5613894317922945	3.5303580903097678	3.5637138813722986	3.5506183506874436	3.5061207446345266	3.427578617329084	-0.22582967786382202	-0.16125665457614602	-0.1989058527787142	-0.3304158771712826	-0.08511734347185707	-0.07587889372317758	-0.26149186099905686	-0.4098346244678064	-0.2166596084118173	-0.19335276652615807	-0.22062796161605913	-0.2568654688562795	-0.21968638253851472	0.150801701171	0.0959193233604	0.405136064622	0.197395731844	0.216719559135	0.519249062249	0.226876581559	0.045430560235	0.288805731951	0.444064484515	0.242741268695	0.110080523892	0.00387054296839	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr12:50222161..50222275,-__1156.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr12:50222161..50222275,-__1156.1.0.0	rs56967049	0.8348237106360923	0.8735892903307773	0.6780987516569349	0.5457523348366705	0.5737066823299967	0.7085113605646047	0.47816756426807094	0.9142055159492333	0.7089514895914073	0.5881615968379338	0.6687061709135842	0.9140774093054715	0.7072293231017315	0.832405325351607	1.067690888941558	0.8890589232457496	0.5736444619672686	0.8029214431387741	0.8012394836124295	0.5025157735832655	0.9863838614473612	0.7405927871951705	0.6061892740338759	0.6923037220217307	0.6106905451704048	0.7588030408090997	-0.002418385284485236	0.1941015986107807	0.21096017158881475	0.027892127130598077	0.22921476080877745	0.09272812304782474	0.024348209315194547	0.07217834549812796	0.03164129760376322	0.018027677195942116	0.02359755110814654	-0.30338686413506677	0.051573717707368176	0.468411351413	0.361218104761	0.48504462162	0.727009731456	0.237368605078	0.840380101088	0.727009731456	0.48504462162	0.206893929435	0.405136064622	0.563691144959	0.301187193336	0.449621082099	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr12:96390087..96390201,-__1159.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr12:96390087..96390201,-__1159.1.0.0	rs7970524	-1.4534428460073192	-1.0743035779475247	-1.1166216150764574	-1.1886387600908053	-1.0891320319845956	-1.4801324910870557	-1.2315867165509025	-1.090122900460873	-1.0979407645529369	-1.078521024342821	-1.0808160374631708	-1.1910584865903422	-1.1810264376795672	-1.2279298813046653	-1.050714323835089	-0.9593172132718182	-0.8187698431041142	-1.3080724807453956	-1.08292082935623	-1.0548626165448327	-1.0780085655812786	-1.3136040940848348	-0.9297468345934574	-1.2424067589509535	-1.0346378665332496	-1.0917492756588265	0.22551296470265392	0.023589254112435842	0.15730440180463923	0.3698689169866911	-0.2189404487608	0.39721166173082567	0.17672410000606975	0.012114334879594457	-0.21566332953189793	0.14877418974936352	-0.16159072148778275	0.15642062005709256	0.08927716202074044	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0439994408777	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0439994408777	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr12:96390087..96390201,-__1159.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr12:96390087..96390201,-__1159.1.0.0	rs77869005,rs7970524	-1.4534428460073192	-1.0743035779475247	-1.1166216150764574	-1.1886387600908053	-1.0891320319845956	-1.4801324910870557	-1.2315867165509025	-1.090122900460873	-1.0979407645529369	-1.078521024342821	-1.0808160374631708	-1.1910584865903422	-1.1810264376795672	-1.2071831405393396	-1.103964189036043	-0.9624423892260674	-1.1185869794949967	-1.1890900877878425	-1.1346601263530947	-1.2771264934993518	-1.104875122060193	-1.2278079507556803	-1.0309416910345766	-1.04741375896866	-0.9546658678327028	-1.113229816382379	0.2462597054679796	-0.02966061108851825	0.15417922585039	0.07005178059580852	-0.0999580558032469	0.34547236473396103	-0.04553977694844935	-0.014752221599319881	-0.1298671862027434	0.047579333308244376	0.03340227849451072	0.2363926187576394	0.06779662129718798	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr16:2014792..2014906,-__1167.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr16:2014792..2014906,-__1167.1.0.0	rs17135718	3.5214553158985336	3.9958594633981193	3.2292019814852484	3.0303058437518158	3.305333416354797	3.44651708916174	3.4690607886695752	3.966854529198316	3.7045105927672	3.712024307174957	3.649986958930457	3.8044076136096834	3.5696264917000367	3.4297960998684185	4.082123208902635	3.359433588338276	3.0939753667439582	3.5179708757595933	3.536970804645301	3.429400617641256	4.102062411697879	3.7419720322280527	3.7888969365554326	3.755613017739476	3.7723132193983675	3.6342106816265543	-0.09165921603011506	0.08626374550451565	0.1302316068530276	0.06366952299214246	0.2126374594047964	0.09045371548356096	-0.03966017102831909	0.1352078824995635	0.037461439460852564	0.07687262938047557	0.10562605880901899	-0.03209439421131588	0.06458418992651697	0.809021331888	0.687084607526	0.452098798395	0.354199901149	0.101398170673	0.687084607526	0.648013768535	0.737113058664	0.85089220831	0.202104162379	0.519249062249	0.619326784864	0.683492522492	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr16:2014792..2014906,-__1167.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr16:2014792..2014906,-__1167.1.0.0	rs116433481	3.5214553158985336	3.9958594633981193	3.2292019814852484	3.0303058437518158	3.305333416354797	3.44651708916174	3.4690607886695752	3.966854529198316	3.7045105927672	3.712024307174957	3.649986958930457	3.8044076136096834	3.5696264917000367	3.471696182282604	4.08680635338267	3.4687074551528596	3.2410859211978327	3.5549467160142436	3.5279466269701336	3.4585309253937684	4.077631818806063	3.6818843991402534	3.7683270297433142	3.9262240759183493	3.8109529386687724	3.6728950368892384	-0.04975913361592976	0.0909468899845507	0.2395054736676112	0.2107800774460169	0.24961329965944667	0.08142953780839379	-0.01052986327580685	0.11077728960774724	-0.022626193626946733	0.05630272256835722	0.27623711698789233	0.006545325059089002	0.10326854518920181	0.412754243182	0.809021331888	0.282745459933	0.192768091005	0.188220673538	0.85089220831	0.727009731456	0.989287003123	0.85089220831	0.361218104761	0.150801701171	0.727009731456	0.767166173099	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr16:2014792..2014906,-__1167.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr16:2014792..2014906,-__1167.1.0.0	rs114006682,rs570978665,rs559695881,rs17135718,rs116433481,rs149683491	3.5214553158985336	3.9958594633981193	3.2292019814852484	3.0303058437518158	3.305333416354797	3.44651708916174	3.4690607886695752	3.966854529198316	3.7045105927672	3.712024307174957	3.649986958930457	3.8044076136096834	3.5696264917000367	3.6494269768163354	3.949237846602949	3.3331014297879658	3.172662304452471	3.583981071418311	3.61884204980376	3.5842401571073523	4.146623633277235	3.7573395535531837	3.8332184637255606	3.788957406511598	3.932696676026692	3.6958606307569517	0.12797166091780188	-0.04662161679517007	0.10389944830271736	0.14235646070065533	0.27864765506351397	0.1723249606420203	0.1151793684377771	0.1797691040789191	0.052828960785983536	0.12119415655060362	0.13897044758114108	0.12828906241700855	0.1262341390569143	0.361218104761	0.657696241675	0.76769033028	0.460214637573	0.0785847853765	0.30750859871	0.30750859871	0.914457985151	0.444064484515	0.301187193336	0.519249062249	0.493479697885	0.386507234858	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr17:5015136..5015250,-__1169.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr17:5015136..5015250,-__1169.1.0.0	rs112282117	2.682976722216879	2.9374511408244217	2.567167235370727	2.422092561386221	2.6176744582204785	2.5157675269365747	2.589354135879174	2.6573674282683832	2.561504996545306	2.6107119148412448	2.663694017100008	2.724898103400755	2.629221686749181	2.718076169742204	2.996634346044394	2.6376914932450837	2.4779482947322187	2.6426014945676672	2.78775616299252	2.698935320815317	2.7853610550677237	2.7464621089038848	2.7844206413639285	2.7226361726425607	2.7785729257042338	2.731424682151811	0.03509944752532457	0.05918320521997211	0.07052425787435679	0.05585573334599747	0.024927036347188736	0.27198863605594514	0.10958118493614322	0.12799362679934045	0.1849571123585787	0.17370872652268377	0.058942155542552666	0.05367482230347864	0.10220299540263018	0.468411351413	0.88258056334	0.125844655769	0.326996172605	0.320413072024	0.0258200569765	0.179364149792	0.320413072024	0.276771967065	0.0386605553759	0.29495293544	0.527990680582	0.0200557140435	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr17:5015136..5015250,-__1169.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr17:5015136..5015250,-__1169.1.0.0	rs77618631	2.682976722216879	2.9374511408244217	2.567167235370727	2.422092561386221	2.6176744582204785	2.5157675269365747	2.589354135879174	2.6573674282683832	2.561504996545306	2.6107119148412448	2.663694017100008	2.724898103400755	2.629221686749181	2.2997152865841928	2.6651607313716026	2.1794767358563814	2.131173430876899	2.3392224012031404	2.259218215645171	2.254645797602217	2.392775186265597	2.2571165716574066	2.315820028718992	2.324675483731369	2.2978807516182784	2.3097400517609374	-0.38326143563268644	-0.2722904094528191	-0.38769049951434553	-0.29091913050932217	-0.2784520570173381	-0.2565493112914039	-0.3347083382769567	-0.2645922420027862	-0.3043884248878994	-0.2948918861222527	-0.3390185333686393	-0.4270173517824767	-0.31948163498824383	0.0134887989876	0.0103298859694	0.0162407194134	0.0808926541269	0.00695778717972	0.00287470049861	0.00115660425805	0.0249397487324	0.00110317967744	0.00993701022923	0.00240905380364	0.00146142948273	8.75536582319e-18	1	1	1	1	1	1	0.854730546699	1	0.85275789066	1	1	1	7.33699655983e-15	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr17:5015136..5015250,-__1169.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr17:5015136..5015250,-__1169.1.0.0	rs112282117,rs77618631	2.682976722216879	2.9374511408244217	2.567167235370727	2.422092561386221	2.6176744582204785	2.5157675269365747	2.589354135879174	2.6573674282683832	2.561504996545306	2.6107119148412448	2.663694017100008	2.724898103400755	2.629221686749181	2.5180875951984385	2.995686003378032	2.490269065976241	2.292727052733298	2.495952432788245	2.519696774029102	2.457741692076444	2.738695291102448	2.6761167178708662	2.5506884148208755	2.5762043167420083	2.584979299211476	2.5747370546606225	-0.16488912701844072	0.058234862553610434	-0.0768981693944859	-0.1293655086529233	-0.12172202543223332	0.003929247092527177	-0.13161244380272974	0.08132786283406457	0.11461172132556019	-0.06002350002036927	-0.08748970035799974	-0.13991880418927893	-0.054484632088558214	0.468411351413	0.563691144959	0.619326784864	0.436112310787	0.468411351413	0.978575937473	0.30750859871	0.90381429355	0.76769033028	0.914457985151	0.563691144959	0.216719559135	0.900410994781	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr19:37064159..37064273,-__1171.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr19:37064159..37064273,-__1171.1.0.0	rs2967442	3.629473180713382	4.012656376168954	3.372213449140442	3.1775113947658538	3.726944834875318	3.7291375281503107	3.5575561056136147	3.953466149399662	3.783849527311607	3.8402154379256173	3.7929302288744013	3.816758950809408	3.6993927636457147	3.443590453151273	4.060220734367384	3.4632595663724457	3.2075781440479925	3.606108282295488	3.56709782738417	3.486828941430342	3.768259326553122	3.7613402659294586	3.7813088804055495	3.7641606482477927	3.798204913818523	3.642329832000295	-0.1858827275621091	0.047564358198429524	0.09104611723200362	0.030066749282138705	-0.12083655257982961	-0.16203970076614072	-0.07072716418327252	-0.18520682284654022	-0.02250926138214826	-0.05890655752006779	-0.028769580626608615	-0.01855403699088498	-0.05706293164541917	0.276771967065	0.925117039075	0.829896383209	0.79863356553	0.221756412245	0.0350255264852	0.48504462162	0.265084565602	0.436112310787	0.397602565759	0.609889042629	0.30750859871	0.359218339281	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr19:37064159..37064273,-__1171.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr19:37064159..37064273,-__1171.1.0.0	rs2967442,rs3096618	3.629473180713382	4.012656376168954	3.372213449140442	3.1775113947658538	3.726944834875318	3.7291375281503107	3.5575561056136147	3.953466149399662	3.783849527311607	3.8402154379256173	3.7929302288744013	3.816758950809408	3.6993927636457147	3.627791207616169	4.095212347814114	3.49116471015308	3.1908971822486967	3.6095038018308703	3.746369281851274	3.5201633860667343	3.9314405739041343	3.8159015167886787	3.7914794605206747	3.814702173425397	3.8262075403592917	3.705069431881593	-0.0016819730972130742	0.08255597164515915	0.11895126101263775	0.013385787482842915	-0.11744103304444753	0.017231753700963193	-0.03739271954688039	-0.02202557549552786	0.032051989477071885	-0.04873597740494251	0.021771944550995848	0.00944858954988348	0.005676668235878572	0.79863356553	0.935789553219	0.648013768535	0.88258056334	0.30750859871	0.619326784864	0.88258056334	0.563691144959	0.85089220831	0.48504462162	0.687084607526	0.978575937473	0.993424270434	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr19:54960298..54960412,+__1172.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr19:54960298..54960412,+__1172.1.0.0	rs11878643	1.8588298890564885	2.1358068375084778	2.1786017562610684	1.9728746940237032	2.0950827741845135	1.9810560340797236	2.1319532300109163	2.3093773527951997	2.1850393688628325	2.1498927271444432	2.1247556475878486	2.156997522152416	2.1066889861389693	1.792070383119917	2.1780708399087874	1.8132830143595489	1.726637411005937	1.945514565139752	1.9935567567643204	1.9794143160733815	2.1935373058778946	2.073822838745569	2.073758677518581	2.109571947365472	2.107348020475193	1.9988821730295292	-0.06675950593657154	0.042264002400309586	-0.3653187419015196	-0.24623728301776615	-0.14956820904476142	0.012500722684596788	-0.15253891393753483	-0.1158400469173051	-0.11121653011726362	-0.07613404962586223	-0.015183700222376473	-0.04964950167722293	-0.10780681310943979	0.527990680582	0.648013768535	0.301187193336	0.340423946445	0.313917214294	0.412754243182	0.382791178922	0.648013768535	0.66743649171	0.545696106059	0.989287003123	0.619326784864	0.722634589009	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr2:139259260..139259374,+__1174.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:139259260..139259374,+__1174.1.0.0	rs142954856	0.14393909979540478	0.8489463238255799	-1.2430470044341801	0.6408712773094815	-1.0538979151864776	0.25104509827870797	-0.49301927641530585	0.7550712482326191	-0.24427595035310984	0.5516671425258662	0.2558962893873195	-1.137586180546268	-0.06036582063169687	-0.9382920061886538	-0.4652113293980796	-1.0473170056054046	-0.965664583334897	-0.08748313012806408	-0.5750488783743476	-0.3823824957184283	-0.2314285795513611	0.18793668262718446	0.37834725765183136	-1.0336523875333485	-1.2534425730469658	-0.5344699190500445	-1.0822311059840586	-1.3141576532236594	0.1957299988287755	-1.6065358606443785	0.9664147850584135	-0.8260939766530555	0.11063678069687755	-0.9864998277839802	0.43221263298029433	-0.17331988487403488	-1.289548676920668	-0.1158563925006979	-0.47410409841834755	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr2:160568937..160569051,+__1176.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:160568937..160569051,+__1176.1.0.0	rs1972709	3.3246719799493736	3.9179720143803087	3.201537635289335	3.0056577076828477	3.3817746526659143	3.367647994453143	3.3461296085376837	3.731435724404733	3.589558193560891	3.5955142361017867	3.5528573720066268	3.606348324230617	3.468425453605272	3.38869380613937	3.809657534897722	3.0678716940142445	2.93416877654833	3.347801484173795	3.292820237176503	3.201227920660088	3.6462542199830077	3.5820129925484725	3.563021511245709	3.4975959586812984	3.606041153411783	3.4114306074566927	0.0640218261899963	-0.10831447948258655	-0.13366594127509046	-0.07148893113451749	-0.0339731684921194	-0.0748277572766396	-0.14490168787759572	-0.08518150442172523	-0.007545201012418623	-0.03249272485607779	-0.05526141332532841	-0.00030717081883402386	-0.05699484614857808	0.788281320858	0.777966336216	0.501992688725	0.696989544957	0.619326784864	0.405136064622	0.501992688725	0.60051573606	0.527990680582	0.687084607526	0.657696241675	0.757455001208	0.880101599798	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr2:160568937..160569051,+__1176.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:160568937..160569051,+__1176.1.0.0	rs28365982	3.3246719799493736	3.9179720143803087	3.201537635289335	3.0056577076828477	3.3817746526659143	3.367647994453143	3.3461296085376837	3.731435724404733	3.589558193560891	3.5955142361017867	3.5528573720066268	3.606348324230617	3.468425453605272	3.3696868174838546	3.946523636420661	3.201565537513879	2.9170004093703925	3.401209440779114	3.32041644988716	3.1748050792008593	3.709055876042651	3.4986210371887463	3.582986848915202	3.554134040992987	3.601639080678282	3.439803687872816	0.04501483753448099	0.02855162204035233	2.7902224544185117e-05	-0.08865729831245517	0.01943478811319954	-0.047231544565983	-0.1713245293368244	-0.022379848362081844	-0.09093715637214483	-0.012527387186584527	0.001276668986360363	-0.004709243552335263	-0.028621765732455968	0.747262025795	0.925117039075	0.737113058664	0.76769033028	0.8931878581	0.572794651112	0.591208103411	0.809021331888	0.119339994516	0.452098798395	0.829896383209	0.8931878581	0.976851932899	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr2:160568937..160569051,+__1176.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:160568937..160569051,+__1176.1.0.0	rs1972709,rs28365982	3.3246719799493736	3.9179720143803087	3.201537635289335	3.0056577076828477	3.3817746526659143	3.367647994453143	3.3461296085376837	3.731435724404733	3.589558193560891	3.5955142361017867	3.5528573720066268	3.606348324230617	3.468425453605272	3.228800447311432	3.7545396633763244	3.164598980535187	2.9885248849819477	3.3420818862722603	3.427652566128383	3.285256766355253	3.6324136402018388	3.5318852012704545	3.5878228549388735	3.494757955978301	3.5750145908216906	3.417779119847662	-0.09587153263794157	-0.16343235100398434	-0.036938654754147926	-0.017132822700899997	-0.03969276639365393	0.060004571675240204	-0.06087284218243072	-0.09902208420289416	-0.05767299229043665	-0.007691381162913125	-0.05809941602832591	-0.031333733408926534	-0.05064633375760955	0.382791178922	0.216719559135	0.88258056334	0.967868733231	0.554657938956	0.76769033028	0.716953652062	0.554657938956	0.428242856315	0.493479697885	0.716953652062	0.66743649171	0.895199579213	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr2:237994477..237994591,+__1179.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:237994477..237994591,+__1179.1.0.0	rs62621255	2.636681579106658	3.160272072265781	2.7060299178604286	2.5102547026666397	2.717535352109521	2.798617840335898	2.6103270762589235	2.7134599053981416	2.8115960798877766	2.826312162805349	2.8012666727166504	2.853260304832541	2.7621344721870256	2.9515481977748346	3.336939138800711	2.969802085883333	2.7127767191135925	2.9507984640167697	3.0117580333834515	2.816454511492992	2.8905794336554598	3.093596554751861	3.099367815902318	3.0038295493295113	3.009367763217651	2.9872348556102075	0.31486661866817656	0.17666706653493014	0.2637721680229044	0.20252201644695278	0.2332631119072488	0.2131401930475536	0.20612743523406873	0.17711952825731814	0.2820004748640845	0.2730556530969692	0.20256287661286088	0.15610745838510987	0.22510038342318148	0.0350255264852	0.045430560235	0.0267271087754	0.045430560235	0.0120431385799	0.0162407194134	0.0306357720046	0.110080523892	0.0103298859694	0.0499532058383	0.0499532058383	0.0338805621681	9.78801143843e-11	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	8.20235358541e-08	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr2:3605885..3605999,-__1181.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:3605885..3605999,-__1181.1.0.0	rs114898086	3.966718165955373	4.2223829403364315	3.8318262468078506	3.4873611082026565	4.043201935913173	4.10763232058772	3.7970048505933667	4.231864008486649	4.199718859531233	4.221705321803432	4.173067177496547	4.239871764156696	4.043529558322594	4.0396263974460025	4.258466991750806	3.815929727910943	3.5384025533282872	4.071050380876349	4.080918174903331	3.780625849805199	4.242135669552402	4.170674853351817	4.177597979619448	4.205246873507004	4.252395186233043	4.05275588652372	0.0729082314906293	0.03608405141437476	-0.015896518896907352	0.05104144512563069	0.027848444963176178	-0.026714145684388235	-0.016379000788167897	0.010271661065753612	-0.029044006179415938	-0.04410734218398371	0.03217969601045745	0.012523422076347046	0.009226328201125492	0.788281320858	0.840380101088	0.788281320858	0.935789553219	0.696989544957	0.397602565759	0.716953652062	0.87199428352	0.619326784864	0.368322877114	0.727009731456	0.76769033028	0.983499164865	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr2:3605885..3605999,-__1181.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:3605885..3605999,-__1181.1.0.0	rs115672056	3.966718165955373	4.2223829403364315	3.8318262468078506	3.4873611082026565	4.043201935913173	4.10763232058772	3.7970048505933667	4.231864008486649	4.199718859531233	4.221705321803432	4.173067177496547	4.239871764156696	4.043529558322594	4.07181249153572	4.232264224304734	3.759781918331611	3.5573901327945756	3.974050805419136	4.090546826398086	3.7810159553257536	4.295212422765214	4.18871951451694	4.166608100923275	4.162492625986351	4.27600018549722	4.046324600316551	0.10509432558034693	0.009881283968302235	-0.07204432847623954	0.07002902459191906	-0.06915113049403665	-0.0170854941896339	-0.015988895267613046	0.06334841427856563	-0.010999345014292672	-0.05509722088015678	-0.010574551510195818	0.036128421340523964	0.0027950419939574513	0.935789553219	0.179364149792	0.132622250874	0.581967350665	0.226876581559	0.706946403854	0.545696106059	0.76769033028	0.90381429355	0.13967914143	0.375513989452	0.935789553219	0.694468650913	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr2:3605885..3605999,-__1181.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:3605885..3605999,-__1181.1.0.0	rs28384453	3.966718165955373	4.2223829403364315	3.8318262468078506	3.4873611082026565	4.043201935913173	4.10763232058772	3.7970048505933667	4.231864008486649	4.199718859531233	4.221705321803432	4.173067177496547	4.239871764156696	4.043529558322594	3.9905998520305768	4.178865668051534	3.7864487080898095	3.4706789787382917	3.9515199728825943	4.067391396530732	3.786730978207833	4.197410050900016	4.16946298356757	4.188529605615047	4.161883730484926	4.250510089701184	4.016669334566676	0.02388168607520358	-0.043517272284897324	-0.045377538718041066	-0.01668212946436487	-0.0916819630305783	-0.04024092405698809	-0.010273872385533789	-0.03445395758663228	-0.03025587596366286	-0.033175716188384996	-0.011183447011620551	0.010638325544487515	-0.02686022375591775	0.501992688725	0.468411351413	0.468411351413	0.609889042629	0.320413072024	0.175053819161	0.493479697885	0.242741268695	0.29495293544	0.276771967065	0.390154148302	0.609889042629	0.183836643755	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr2:3605885..3605999,-__1181.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:3605885..3605999,-__1181.1.0.0	rs113011558	3.966718165955373	4.2223829403364315	3.8318262468078506	3.4873611082026565	4.043201935913173	4.10763232058772	3.7970048505933667	4.231864008486649	4.199718859531233	4.221705321803432	4.173067177496547	4.239871764156696	4.043529558322594	4.138451323994631	4.255449368826877	3.927993333487094	3.57088375339403	4.10274812901595	4.140964063281578	3.851523499191924	4.261297238508519	4.232638824661165	4.2314416490229885	4.26514212179731	4.264743895735227	4.103606433409774	0.17173315803925782	0.03306642849044561	0.09616708667924323	0.08352264519137353	0.05954619310277742	0.03333174269385797	0.05451864859855737	0.029433230021870038	0.032919965129932116	0.009736327219556529	0.09207494430076313	0.02487213157853052	0.06007687508718044	0.253741740693	0.591208103411	0.436112310787	0.436112310787	0.253741740693	0.85089220831	0.368322877114	0.90381429355	0.444064484515	0.677233097055	0.270885072145	0.405136064622	0.506923292714	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr2:3605885..3605999,-__1181.1.4.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:3605885..3605999,-__1181.1.0.0	rs114898086,rs115672056,rs28384453,rs113011558	3.966718165955373	4.2223829403364315	3.8318262468078506	3.4873611082026565	4.043201935913173	4.10763232058772	3.7970048505933667	4.231864008486649	4.199718859531233	4.221705321803432	4.173067177496547	4.239871764156696	4.043529558322594	4.106806282305127	4.22984482921261	3.8164389464907096	3.5653701395306876	4.092918534835468	4.118988050386696	3.8454646994278057	4.256265061635869	4.223737051953773	4.258524524579366	4.202553825815577	4.2571566089032915	4.081172379589748	0.14008811634975338	0.007461888876178158	-0.015387300317140973	0.07800903132803105	0.04971659892229585	0.011355729798975922	0.04845984883443899	0.024401053149220253	0.024018192422539997	0.0368192027759342	0.029486648319029918	0.017284844746595418	0.03764282126715435	0.104229562843	0.737113058664	0.819442862795	0.609889042629	0.420456664513	0.76769033028	0.428242856315	0.861430881609	0.563691144959	0.361218104761	0.436112310787	0.609889042629	0.711158295254	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr22:29196522..29196636,-__1188.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr22:29196522..29196636,-__1188.1.0.0	rs138290856	0.14481922919811874	-0.6251725064812783	0.04031474252322164	-1.4888448698172376	1.0516310213207245	-0.4004996144409607	-0.0014247738637114225	0.3930467516724243	-1.7376256671332655	0.30841416770105967	0.001513946445741432	-0.8010435191828963	-0.2595725910048383	1.2361084737805486	2.741423282118161	2.0555289017440415	0.0913863631827376	3.0498076169238204	1.7373768252500177	1.9791623533667515	0.13934572493801375	1.0910534243347156	0.3723290481562729	-0.13880797292949476	0.3881829632518743	1.2285747503431217	1.0912892445824298	3.3665957885994393	2.01521415922082	1.5802312329999753	1.998176595603096	2.137876439690978	1.980587127230463	-0.25370102673441053	2.828679091467981	0.06391488045521321	-0.1403219193752362	1.1892264824347705	1.4881473413479596	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr22:29196522..29196636,-__1188.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr22:29196522..29196636,-__1188.1.0.0	rs187995237	0.14481922919811874	-0.6251725064812783	0.04031474252322164	-1.4888448698172376	1.0516310213207245	-0.4004996144409607	-0.0014247738637114225	0.3930467516724243	-1.7376256671332655	0.30841416770105967	0.001513946445741432	-0.8010435191828963	-0.2595725910048383	1.5820935755814687	1.1255194653110814	1.2908579042455943	-0.6983745792964315	-0.3906347936735197			-1.9383891147114167	-1.5616614698986346	-1.7210728685259422	-1.5878412996683782	1.4575969974566156	-0.2441906183179563	1.43727434638335	1.7506919717923597	1.2505431617223728	0.7904702905208061	-1.4422658149942442			-2.331435866383841	0.17596419723463086	-2.029487036227002	-1.5893552461141196	2.258640516639512	0.027104052057382422	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr22:29196522..29196636,-__1188.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr22:29196522..29196636,-__1188.1.0.0	rs2269575,rs138290856,rs187995237	0.14481922919811874	-0.6251725064812783	0.04031474252322164	-1.4888448698172376	1.0516310213207245	-0.4004996144409607	-0.0014247738637114225	0.3930467516724243	-1.7376256671332655	0.30841416770105967	0.001513946445741432	-0.8010435191828963	-0.2595725910048383	0.6121889474464374	-0.2936074485808011	1.4136104274565688	0.015089042172886109	0.3502257462760438	1.1487877347535178	0.8371496724661494	0.3181629655057076	0.6938350964559417	0.7368760662561605	0.811144010036974	1.9234924513233298	0.7139128926307431	0.46736971824831863	0.3315650579004772	1.3732956849333473	1.5039339119901238	-0.7014052750446806	1.5492873491944785	0.8385744463298608	-0.0748837861667167	2.4314607635892074	0.42846189855510086	0.8096300635912326	2.724535970506226	0.9734854836355812	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr3:153839139..153839253,+__1192.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr3:153839139..153839253,+__1192.1.0.0	rs6796569	0.020752288038775882	0.7945806976325471	-0.006188671325199097	0.7401736784964132	0.9566408370583863	0.5985087563978206	0.693234635495699	-0.08641249780055711	-0.43762196956408117	0.023470541803865742	0.7339824730987249	0.44636962032909583	0.37312419913845757	-0.9606223715499808	-0.3020557957095506	-1.313204855944157	-0.9727444505820619	-0.2289488349742248	-0.21001180432197986	-1.3129111774825335	-0.6878322196833612	-0.7299146687706548	-0.6694100244532383	-0.913982884003312	-0.9660544060874154	-0.7723077911302059	-0.9813746595887567	-1.0966364933420978	-1.3070161846189579	-1.7129181290784752	-1.1855896720326111	-0.8085205607198005	-2.0061458129782324	-0.601419721882804	-0.29229269920657364	-0.692880566257104	-1.647965357102037	-1.4124240264165113	-1.1454319902686634	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr3:153839139..153839253,+__1192.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr3:153839139..153839253,+__1192.1.0.0	rs148353166	0.020752288038775882	0.7945806976325471	-0.006188671325199097	0.7401736784964132	0.9566408370583863	0.5985087563978206	0.693234635495699	-0.08641249780055711	-0.43762196956408117	0.023470541803865742	0.7339824730987249	0.44636962032909583	0.37312419913845757	0.4846227942895101	-0.0036323623720326452	1.7076109623852709	1.9706330591528136	0.36161930693396577	0.1923575210249292	0.5931761337805229	0.6741984602350568	0.2089876921339585	0.3873522890562918	-0.4917711532595344	0.6297012767352089	0.5595713316746634	0.4638705062507342	-0.7982130600045798	1.71379963371047	1.2304593806564004	-0.5950215301244206	-0.40615123537289144	-0.10005850171517605	0.760610958035614	0.6466096616980397	0.36388174725242606	-1.2257536263582594	0.1833316564061131	0.1864471325362058	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr3:153839139..153839253,+__1192.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr3:153839139..153839253,+__1192.1.0.0	rs6796569,rs148353166,rs35525643	0.020752288038775882	0.7945806976325471	-0.006188671325199097	0.7401736784964132	0.9566408370583863	0.5985087563978206	0.693234635495699	-0.08641249780055711	-0.43762196956408117	0.023470541803865742	0.7339824730987249	0.44636962032909583	0.37312419913845757	-0.14284926475466736	-0.6217641699470791	-0.5378167530537811	-0.009011843420958787	-0.2519621008540841	-1.0057098636506028	-0.20470159733824794	-0.8119130136246204	-0.13723950431569365	-0.15237918123043226	-0.165449317793506	-0.030502686595867006	-0.33927494138162834	-0.16360155279344324	-1.4163448675796262	-0.531628081728582	-0.749185521917372	-1.2086029379124703	-1.6042186200484234	-0.8979362328339469	-0.7255005158240633	0.3003824652483875	-0.175849723034298	-0.8994317908922309	-0.47687230692496285	-0.7123991405200859	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr4:4543705..4543819,-__1200.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr4:4543705..4543819,-__1200.1.0.0	rs112936039	0.5491699742196362	0.2481571438878586	-0.08869942884587778	0.047564652983584935	-0.08450144606794054	0.5522042527439204	-0.32337331183286594	0.2679095691041803	0.4760237517154956	0.2653372017529561	0.2547593252748283	0.5611500483974882	0.22714181111110535	0.08466805312970166	0.17690484230770695	-0.2558240698755639	-0.4258116275697924	-0.19916283571476728	-0.22820836013459736	-0.11055520823931057	-0.6550389875943236	-0.27381884408179596	-0.30048859419178225	-0.021642557586673765	0.08615998449356332	-0.17690151708813626	-0.46450192108993454	-0.07125230158015164	-0.1671246410296861	-0.4733762805533773	-0.11466138964682675	-0.7804126128785177	0.21281810359355535	-0.9229485566985038	-0.7498425957972916	-0.5658257959447384	-0.2764018828615021	-0.47499006390392484	-0.40404332819924155	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr5:33440795..33440909,+__1204.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr5:33440795..33440909,+__1204.1.0.0	rs3756661	0.037389233072419634	0.2002138600561234	0.10898285553813496	0.16971258055275268	0.06047060382730012	0.04131236793876477	-0.1677410929060145	0.09870119833135868	0.18830331634576872	0.07014371414897791	-0.061195103688305524	0.386522227574186	0.09440131339928891	-0.3218494316229621	0.1258258259789634	-0.1167538836036811	-0.2704657427571661	-0.08361774198085893	-0.021526466926977555	-0.1647283107065503	-0.037177001938043804	-0.2032692893988903	-0.07409395085828929	-0.04403380149366225	-0.08628361915884843	-0.10816445120558056	-0.35923866469538174	-0.07438803407715999	-0.22573673914181605	-0.4401783233099188	-0.14408834580815905	-0.06283883486574232	0.003012782199464187	-0.13587820026940248	-0.391572605744659	-0.1442376650072672	0.017161302194643277	-0.4728058467330344	-0.20256576460486944	0.436112310787	0.226876581559	0.276771967065	0.0719809426143	0.0583274625199	0.183752894264	0.914457985151	0.8931878581	0.00993701022923	0.460214637573	0.476688253492	0.045430560235	0.0216638649997	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr5:33440795..33440909,+__1204.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr5:33440795..33440909,+__1204.1.0.0	rs73074360	0.037389233072419634	0.2002138600561234	0.10898285553813496	0.16971258055275268	0.06047060382730012	0.04131236793876477	-0.1677410929060145	0.09870119833135868	0.18830331634576872	0.07014371414897791	-0.061195103688305524	0.386522227574186	0.09440131339928891	0.08755115541423612	-0.16254439584412222	0.007903543614062371	-0.2235365562464848	-0.05846659230139276	0.06621257723668572	0.06743247004235864	0.11090343112680492	-0.11819600838496942	0.11489333614008312	0.3034724173638316	-0.06520904453104164	0.010868027802504307	0.05016192234181649	-0.36275825590024563	-0.10107931192407259	-0.39324913679923745	-0.11893719612869288	0.02490020929792095	0.23517356294837313	0.012202232795446244	-0.30649932473073815	0.044749621991105215	0.3646675210521372	-0.4517312721052276	-0.08353328559678459	0.428242856315	0.216719559135	0.412754243182	0.313917214294	0.609889042629	0.967868733231	0.192768091005	0.79863356553	0.136115392203	0.809021331888	0.259370210024	0.63839046467	0.49012083381	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr5:33440795..33440909,+__1204.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr5:33440795..33440909,+__1204.1.0.0	rs3756661,rs73074360	0.037389233072419634	0.2002138600561234	0.10898285553813496	0.16971258055275268	0.06047060382730012	0.04131236793876477	-0.1677410929060145	0.09870119833135868	0.18830331634576872	0.07014371414897791	-0.061195103688305524	0.386522227574186	0.09440131339928891	-0.11848823499376478	0.1318974540262307	0.06747218382265807	-0.15932091426557082	0.01296972133392423	0.09940073175017472	0.0453926897422734	-0.04412693674386798	0.010891974694762477	0.2216188963733531	0.2512607927159723	0.24911915857753525	0.06400729308614006	-0.1558774680661844	-0.0683164060298927	-0.041510671715476885	-0.3290334948183235	-0.04750088249337589	0.05808836381140995	0.2131337826482879	-0.14282813507522665	-0.17741134165100625	0.1514751822243752	0.31245589640427784	-0.13740306899665072	-0.030394020313148848	0.554657938956	0.788281320858	0.87199428352	0.262211172943	0.79863356553	0.978575937473	0.0638899216795	0.76769033028	0.8931878581	0.0678362651725	0.158583637061	0.777966336216	0.808665795465	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr5:9546152..9546266,-__1209.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr5:9546152..9546266,-__1209.1.0.0	rs189132790	0.9002184059032907	0.18622752567023484	1.419589032086906	-0.24866449122075668	0.8123168709860549	0.9371797648083284	-0.06807795345811576	-1.129262760757163	-0.0785604351929523	0.6109329518528495	0.513886279774896	0.3882343919314729	0.35366829853208714	0.6466619578893043	-0.7016459191982195	1.9063685710288865	0.17422453919749997	0.5388199421334307	0.5758697196076259	0.9913010028565375	0.39475507559297296	1.1752290818711493	0.448571883432904	1.8862156093634888	0.90481980564153	0.7450992724514259	-0.25355644801398647	-0.8878734448684543	0.48677953894198045	0.42288903041825665	-0.2734969288526242	-0.36131004520070253	1.0593789563146534	1.524017836350136	1.2537895170641016	-0.16236106841994546	1.3723293295885928	0.5165854137100571	0.39143097391933873	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr5:9546152..9546266,-__1209.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr5:9546152..9546266,-__1209.1.0.0	rs181074606	0.9002184059032907	0.18622752567023484	1.419589032086906	-0.24866449122075668	0.8123168709860549	0.9371797648083284	-0.06807795345811576	-1.129262760757163	-0.0785604351929523	0.6109329518528495	0.513886279774896	0.3882343919314729	0.35366829853208714	2.9084162010381305	3.2718352959953654	1.9263779253840247	2.043853407376031	0.865271324922884	1.6966027925671086	2.151219649743659	2.582152471224991	1.0006877037019697	0.48971090984757076	1.4153400956915605	1.6040390592052995	1.8296255697248827	2.0081977951348398	3.0856077703251303	0.5067888932971187	2.292517898596788	0.05295445393682918	0.7594230277587801	2.219297603201775	3.711415231982154	1.079248138894922	-0.1212220420052787	0.9014538159166645	1.2158046672738267	1.4759572711927957	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr5:9546152..9546266,-__1209.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr5:9546152..9546266,-__1209.1.0.0	rs189132790,rs181074606	0.9002184059032907	0.18622752567023484	1.419589032086906	-0.24866449122075668	0.8123168709860549	0.9371797648083284	-0.06807795345811576	-1.129262760757163	-0.0785604351929523	0.6109329518528495	0.513886279774896	0.3882343919314729	0.35366829853208714	0.011587594041613173	-1.748188242389158	-2.268887656643393	-0.010453812779869398	-0.14859310844787596	-0.6402800777505251	-0.5243490745018379	-1.92187812905712	-0.6061771922685587	-0.1675275742587924	-1.3722683745651587	0.05022859507793506	-0.7788989211285618	-0.8886308118616776	-1.9344157680593927	-3.688476688730299	0.23821067844088728	-0.9609099794339309	-1.5774598425588535	-0.45627112104372214	-0.792615368299957	-0.5276167570756064	-0.7784605261116418	-1.8861546543400547	-0.3380057968535378	-1.1325672196606489	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:111804879..111804993,-__1210.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:111804879..111804993,-__1210.1.0.0	rs17539093	-0.052698471061769864	-0.3612879801864596	-0.6817669067383951	-0.14080945304171608	0.9217087584346519	-0.15007051620698086	-0.7315249144616167	-0.1663384307633499	-1.0482619650705478	-1.1696931306350955	-0.031497154008275026	0.9179566548968507	-0.2245236257368919	-1.4884848331973224	-0.6185172099512132	-0.6850727362913183	-1.110274889813434	-0.3709659153108636	-1.0222104150287246	-0.7333657335453392	-1.3756224138906037	0.16310742337039308	-0.4122066594779432	0.22084214668536328	-0.4902959822971678	-0.6602556015623477	-1.4357863621355524	-0.2572292297647536	-0.003305829552923134	-0.9694654367717179	-1.2926746737455155	-0.8721398988217437	-0.001840819083722467	-1.2092839831272537	1.2113693884409409	0.7574864711571523	0.2523393006936383	-1.4082526371940185	-0.4357319758254557	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:135818822..135818936,-__1211.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:135818822..135818936,-__1211.1.0.0	rs13197384	1.431788547605221	1.580233811551654	1.310528391880565	1.1278370921782523	1.5245915446090856	1.935880743922728	1.7000434723308768	1.241170798840948	1.2705742482281814	1.4881202229952208	1.5360369178378888	1.774509886805076	1.4934429732321417	1.2944595703315604	1.6781172954156247	0.9653370624696394	1.09714314914907	1.2676848184164469	1.3384087479062003	1.1833073762957549	1.2092298377144963	1.5547592460063804	1.1770494655536956	1.2891886436010687	1.4216810020634085	1.2896971845769454	-0.13732897727366056	0.09788348386397061	-0.3451913294109257	-0.03069394302918238	-0.25690672619263877	-0.5974719960165276	-0.5167360960351219	-0.03194096112645162	0.28418499777819894	-0.31107075744152524	-0.2468482742368201	-0.3528288847416674	-0.20374578865519596	0.179364149792	0.493479697885	0.0281374406516	0.420456664513	0.0276615481105	0.175053819161	0.237368605078	0.10711938092	0.652843982252	0.21176555971	0.154655491485	NA__not_enough_barcodes	0.00258227927379	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:135818822..135818936,-__1211.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:135818822..135818936,-__1211.1.0.0	rs557508766	1.431788547605221	1.580233811551654	1.310528391880565	1.1278370921782523	1.5245915446090856	1.935880743922728	1.7000434723308768	1.241170798840948	1.2705742482281814	1.4881202229952208	1.5360369178378888	1.774509886805076	1.4934429732321417	0.2502031167515582	0.5169617150711875	0.3582467080927774	-0.06411130181682465	0.5914927711664012	0.21696797095822082	0.4614994661847027	-0.9807472095370948	1.3566041558136657	0.026412182588077593	0.7325735032656373	0.6806262543123989	0.34556077773755906	-1.1815854308536629	-1.0632720964804667	-0.9522816837877877	-1.191948393995077	-0.9330987734426844	-1.718912772964507	-1.238544006146174	-2.2219180083780428	0.08602990758548423	-1.4617080404071432	-0.8034634145722515	-1.093883632492677	-1.1478821954945826	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:135818822..135818936,-__1211.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:135818822..135818936,-__1211.1.0.0	rs13197301	1.431788547605221	1.580233811551654	1.310528391880565	1.1278370921782523	1.5245915446090856	1.935880743922728	1.7000434723308768	1.241170798840948	1.2705742482281814	1.4881202229952208	1.5360369178378888	1.774509886805076	1.4934429732321417	1.316403020668276	1.0887465487955799	1.5537617467242353	1.3584854837709948	1.4038690652397063	1.3709124055290183	0.866446815892563	1.2911709156632476	1.5309438256539174	1.619323863631425	1.8956292152441818	1.7850512249241557	1.4233953443114418	-0.11538552693694504	-0.49148726275607424	0.24323335484367026	0.23064839159274242	-0.1207224793693793	-0.5649683383937096	-0.8335966564383138	0.050000116822299656	0.26036957742573597	0.13120364063620427	0.35959229740629306	0.010541338119079757	-0.07004762892069973	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr6:135818822..135818936,-__1211.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:135818822..135818936,-__1211.1.0.0	rs13197384,rs557508766,rs13197301	1.431788547605221	1.580233811551654	1.310528391880565	1.1278370921782523	1.5245915446090856	1.935880743922728	1.7000434723308768	1.241170798840948	1.2705742482281814	1.4881202229952208	1.5360369178378888	1.774509886805076	1.4934429732321417	0.3062552858915293	-0.3422854422622205	-0.22491997911426342	-0.9918090243451743	0.1491771334515454	-0.9507313510169958	0.1160934208277206	-0.02446735044277805	0.04199886862291305	-0.4748054839071722	0.10240952282464102	-0.184908710765584	-0.20649942585298653	-1.1255332617136917	-1.9225192538138747	-1.5354483709948283	-2.119646116523427	-1.3754144111575402	-2.8866120949397236	-1.5839500515031562	-1.265638149283726	-1.2285753796052683	-1.962925706902393	-1.4336273950132477	-1.95941859757066	-1.699942399085128	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:153304679..153304793,-__1212.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:153304679..153304793,-__1212.1.0.0	rs2207610	0.4817223257546307	1.1632393481850116	0.86262654165036	0.38951799948887944	0.4589127397871876	0.7137485026949132	0.8058996292274059	0.9750611392021441	0.9875066013961751	0.8340069504584021	1.1014727654392302	0.6975299105044894	0.7892703711490691	0.24732535696976943	0.3065540322342793	0.2396180647285853	0.055696218523931716	0.16649981322235097	0.10650997999821712	0.3727133368553798	0.8509636177753588	0.16161581775486314	0.17489962498461867	0.4370522192579983	0.45874990631878027	0.2981831657186777	-0.23439696878486127	-0.8566853159507324	-0.6230084769217747	-0.33382178096494775	-0.29241292656483664	-0.6072385226966961	-0.4331862923720261	-0.12409752142678532	-0.825890783641312	-0.6591073254737835	-0.6644205461812319	-0.23878000418570916	-0.49108720543039136	0.276771967065	0.0232568344756	0.162586850726	0.122558611289	0.154655491485	0.0168468410067	0.326996172605	0.925117039075	0.170821264488	0.00406023278348	0.0986283746992	0.925117039075	0.00143913300004	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:30294166..30294280,+__1215.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:30294166..30294280,+__1215.1.0.0	rs114052920	2.6466073945933473	2.8522609415169193	2.2621043356645947	2.2239295224409856	2.432178643661583	2.486692586008942	2.5671475222845066	2.6971379235546635	2.737156888070838	2.5987276489970412	2.6667544242924794	2.786117870019381	2.579734641758774	2.544815459237304	2.9189896799142265	2.2485864624327903	2.299985568324794	2.420617377634332	2.665793949578837	2.4650237633165517	2.656215727472368	2.745253645488913	2.591904675640234	2.7190078250017367	2.591279767981473	2.572289491835296	-0.10179193535604325	0.0667287383973072	-0.013517873231804423	0.07605604588380821	-0.011561266027251271	0.17910136356989526	-0.10212375896795489	-0.040922196082295414	0.008096757418075029	-0.00682297335680726	0.052253400709257214	-0.19483810203790775	-0.007445149923476779	0.501992688725	0.777966336216	0.90381429355	0.501992688725	0.60051573606	0.436112310787	0.978575937473	0.60051573606	0.66743649171	0.819442862795	0.935789553219	0.545696106059	0.984062680358	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:96969635..96969749,+__1217.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:96969635..96969749,+__1217.1.0.0	rs9486460	2.1102223108287848	2.7097352377980606	2.141112600335256	1.87422512959425	2.2583091840023037	2.242350437618179	2.207965742608182	2.2710903918525176	2.1660687302941515	2.3850426883076485	2.198321260098856	2.218331729181503	2.231897953543308	2.361916670701322	2.791940037478731	2.3009660547068687	2.123190007141429	2.4318429308411025	2.4412888764173006	2.3589026694210173	2.6366278665521845	2.5577372653858514	2.3184004072934954	2.490881799619387	2.4159558237343433	2.43580420077442	0.2516943598725372	0.08220479968067052	0.1598534543716128	0.2489648775471789	0.17353374683879874	0.19893843879912154	0.15093692681283555	0.3655374746996669	0.39166853509169997	-0.06664228101415315	0.29256053952053085	0.19762409455284047	0.2039062472311117	0.202104162379	0.420456664513	0.536806685117	0.154655491485	0.0565651674203	0.476688253492	0.170821264488	0.113101776132	0.0187859264625	0.452098798395	0.0168468410067	0.188220673538	0.00076992201023	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.645194644573	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:96969635..96969749,+__1217.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:96969635..96969749,+__1217.1.0.0	rs13210597	2.1102223108287848	2.7097352377980606	2.141112600335256	1.87422512959425	2.2583091840023037	2.242350437618179	2.207965742608182	2.2710903918525176	2.1660687302941515	2.3850426883076485	2.198321260098856	2.218331729181503	2.231897953543308	2.2723049952449728	2.743019749278843	2.271739882565355	2.106832327284951	2.4311709300251576	2.267957447086979	2.0889574785288647	2.4056823561923237	2.3931351408679857	2.5184427664168982	2.56592782286169	2.2763530742154217	2.36179366421412	0.162082684416188	0.033284511480782264	0.13062728223009934	0.23260719769070093	0.17286174602285387	0.0256070094687999	-0.11900826407931708	0.13459196433980614	0.22706641057383425	0.1334000781092497	0.367606562762834	0.05802134503391887	0.12989571067081251	0.788281320858	0.76769033028	0.554657938956	0.237368605078	0.150801701171	0.85089220831	0.967868733231	0.375513989452	0.119339994516	0.242741268695	0.0232568344756	0.476688253492	0.339847367967	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr6:96969635..96969749,+__1217.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:96969635..96969749,+__1217.1.0.0	rs9486460,rs13210597	2.1102223108287848	2.7097352377980606	2.141112600335256	1.87422512959425	2.2583091840023037	2.242350437618179	2.207965742608182	2.2710903918525176	2.1660687302941515	2.3850426883076485	2.198321260098856	2.218331729181503	2.231897953543308	2.3931369315239186	2.6041502987335434	2.3232217211010533	2.1576521607961423	2.3998591448080995	2.4306640761455496	2.3350568834297416	2.6372421039367446	2.5935880252222496	2.5127429783011244	2.4066199756358264	2.5129933592173894	2.442243971570949	0.28291462069513384	-0.10558493906451716	0.18210912076579744	0.2834270312018923	0.14154996080579574	0.18831363852737049	0.1270911408215598	0.36615171208422703	0.42751929492809815	0.12770028999347582	0.2082987155369702	0.29466163003588663	0.21034601802764086	0.183752894264	0.777966336216	0.179364149792	0.197395731844	0.0531733827136	0.132622250874	0.301187193336	0.0906800339379	0.00160288548718	0.0741297894045	0.0412580447575	0.00849533044186	7.38098307239e-06	1	1	1	1	1	1	1	1	0.330194410359	1	1	1	0.00167548315743	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr7:54826869..54826983,-__1223.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr7:54826869..54826983,-__1223.1.0.0	rs2709289	3.5538233388872134	4.077357593812344	3.405341181731475	3.1597633760835055	3.5523387440356196	3.562982456872742	3.7456616267844822	3.921835288461679	3.9075767210476764	3.757515831776005	3.7685202144534857	4.0312057022344865	3.70366017301506	2.962883771731415	3.4936662325788768	3.1280407859252777	2.874322858328178	3.202911594323313	3.307409698465529	3.3522719251622437	3.7045105927672	3.4457009279553223	3.3831551296916724	3.49731202050179	3.3698825041506506	3.3101723367984555	-0.5909395671557984	-0.5836913612334675	-0.2773003958061975	-0.2854405177553274	-0.3494271497123065	-0.2555727584072134	-0.3933897016222385	-0.217324695694479	-0.46187579309235405	-0.3743607020843327	-0.2712081939516957	-0.6613231980838359	-0.3934878362166039	0.179364149792	0.282745459933	0.147021540231	0.116187990183	0.0515422504639	0.122558611289	0.0327677521954	0.29495293544	0.104229562843	0.0440018610392	0.104229562843	0.0201846528804	5.8728147825e-06	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.00492141878774	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr7:86781689..86781803,+__1224.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr7:86781689..86781803,+__1224.1.0.0	rs17515896	0.4846227942895101	-0.5148080504327451	0.9224201667642491	1.006992526221189	1.055865544830998	1.4485622677594316	0.876529596175911	1.191131637139184	1.1447309961697947	1.029617291577332	-0.3753580353369309	0.9810502410066682	0.7709464146803827	2.111907501970923	2.1890507148359766	2.3576745384486837	1.9091925213521583	2.3838696029979562	1.8789027024077414	1.8928063152176928	1.8702834765780785	1.8352735194732737	2.2591429381902386	2.148235511534184	2.3804388699105665	2.1013981844097893	1.627284707681413	2.7038587652687216	1.4352543716844346	0.9021999951309694	1.3280040581669583	0.43034043464830973	1.0162767190417819	0.6791518394388945	0.690542523303479	1.2295256466129065	2.523593546871115	1.3993886289038984	1.3304517697294067	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr8:6264068..6264182,+__1227.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr8:6264068..6264182,+__1227.1.0.0	rs2305023	-0.2561100326671794	-1.4883183262746895	-2.0304463798647947	-1.73017767613012	-0.34756988779253517	-0.6950902749113218	0.44522102236180455	-1.1617978968404674	-1.2315867165509025	-0.6248931982864293	-0.3929096230490729	-2.1829200779699764	-0.9747165889979738	0.37339565951040776	-0.8555634351774221	0.19613809991502174	-1.2380873056146844	-0.5629261088249833	0.4909833013458419	-1.1802653525719893	-0.7622668750723082	-2.3462103954315596	-1.0139584404886075	-0.27918675177304597	-1.0030038178670142	-0.6817459518375286	0.6295056921775872	0.6327548910972675	2.2265844797798167	0.4920903705154356	-0.21535622103244811	1.1860735762571637	-1.6254863749337938	0.39953102176815924	-1.1146236788806572	-0.3890652422021782	0.11372287127602693	1.1799162601029622	0.29297063716044514	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr8:6264068..6264182,+__1227.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr8:6264068..6264182,+__1227.1.0.0	rs2916655,rs2305023	-0.2561100326671794	-1.4883183262746895	-2.0304463798647947	-1.73017767613012	-0.34756988779253517	-0.6950902749113218	0.44522102236180455	-1.1617978968404674	-1.2315867165509025	-0.6248931982864293	-0.3929096230490729	-2.1829200779699764	-0.9747165889979738	0.378667836749549	-0.04103740009833615	0.15111325895558406	0.20272737562801052	0.26948622216954576	-0.5069830249913219	0.1744242347299926	0.23115902382114922	0.1409196612502682	-0.274115958295196	0.29140391229988544	-1.9250272797063768	-0.07560517812393715	0.6347778694167284	1.4472809261763533	2.181559638820379	1.9329050517581305	0.6170561099620809	0.18810724991999994	-0.2707967876318119	1.3929569206616166	1.3725063778011706	0.3507772399912333	0.6843135353489583	0.2578927982635997	0.8991114108740365	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr9:98637893..98638007,+__1230.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr9:98637893..98638007,+__1230.1.0.0	rs112083815	2.1120955808556703	2.432045581691712	2.0210365667819943	1.8829859538669933	2.26226040055725	2.133665150279292	2.2105863268322925	2.427841130157277	2.351320801002712	2.3401455298316085	2.380417616601746	2.401133658585068	2.2462945247536346	2.035530048856256	2.38995102493779	2.1638255201579324	2.113351530747171	2.199583048995727	2.2900386493272458	2.2650540695485875	2.424230701854893	2.4467380153324996	2.456218813746416	2.5448356390104587	2.51204751665279	2.32011704826398	-0.0765655319994143	-0.04209455675392215	0.1427889533759381	0.23036557688017756	-0.06267735156152288	0.15637349904795395	0.05446774271629495	-0.0036104283023838946	0.09541721432978756	0.11607328391480731	0.16441802240871262	0.1109138580677218	0.07382252351034589	0.757455001208	0.30750859871	0.527990680582	0.248198866138	0.412754243182	0.444064484515	0.66743649171	0.76769033028	0.619326784864	0.527990680582	0.436112310787	0.935789553219	0.729889945248	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:12838101..12838215,+__1238.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:12838101..12838215,+__1238.1.0.0	rs114757581	2.692355335116023	2.2135234975834024	1.4680891471397812	2.2587164439478036	-0.15174294212675155	0.23957857683642314	0.1632520813132427	0.6654997525817727	1.0789534192328285	1.444331180529803	-0.547732517516241	0.9297183109264446	1.0378785237970443	0.3520925238999793	0.6280526328762319	0.11233314167361434	0.3630595314245892	0.6024048752872571	0.865182958300029	-0.24249587325326674	0.4275471925572176	0.04234465371667871	-0.23319858637965266	0.3785723227701832	0.3485617958468054	0.30370476405997215	-2.3402628112160437	-1.5854708647071705	-1.3557560054661668	-1.8956569125232143	0.7541478174140086	0.6256043814636059	-0.40574795456650947	-0.23795256002455512	-1.0366087655161498	-1.6775297669094555	0.9263048402864242	-0.5811565150796392	-0.7341737597370722	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:12838101..12838215,+__1238.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:12838101..12838215,+__1238.1.0.0	rs78302043	2.692355335116023	2.2135234975834024	1.4680891471397812	2.2587164439478036	-0.15174294212675155	0.23957857683642314	0.1632520813132427	0.6654997525817727	1.0789534192328285	1.444331180529803	-0.547732517516241	0.9297183109264446	1.0378785237970443	2.753230321414559	0.2449625667666212	0.29371550984423794	-0.06770289369351579	1.3809115923726727	0.3700001202147235	1.6135623364761056	2.7330750044607885	-1.7751868880611903	0.9556088030081016	0.9389160996089349	2.439557957171036	0.9900542107985896	0.06087498629853583	-1.968560930816781	-1.1743736372955433	-2.3264193376413194	1.5326545344994242	0.13042154337830036	1.4503102551628628	2.067575251879016	-2.854140307294019	-0.48872237752170133	1.4866486171251758	1.5098396462445913	-0.04782431299845482	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr3:12838101..12838215,+__1238.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:12838101..12838215,+__1238.1.0.0	rs114757581,rs78302043	2.692355335116023	2.2135234975834024	1.4680891471397812	2.2587164439478036	-0.15174294212675155	0.23957857683642314	0.1632520813132427	0.6654997525817727	1.0789534192328285	1.444331180529803	-0.547732517516241	0.9297183109264446	1.0378785237970443	0.6274029628707838	1.5683699686994959	1.6861751632213635	0.9770608894212928	0.5622131157959108	0.9878546263897636	0.6606628709425136	0.39062620928807823	0.4587834700501401	0.3384866491260753	0.747604134156377	0.6118871769537741	0.8014272697429642	-2.064952372245239	-0.6451535288839065	0.2180860160815823	-1.2816555545265107	0.7139560579226624	0.7482760495533405	0.49741078962927093	-0.2748735432936945	-0.6201699491826884	-1.1058445314037275	1.295336651672618	-0.3178311339726705	-0.23645125405408027	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:94124143..94124257,-__1239.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:94124143..94124257,-__1239.1.0.0	rs549281862	0.8526263185558847	0.4917931644377758	0.7707663477788721	0.5432331280695353	-0.6753070950458413	1.3069817966507478	0.7369653569123933	1.2799854978830414	-0.7853560906903478	0.47843349553081915	0.6565075153316057	0.04915329954154122	0.4754818945796689	0.4736589185995684	0.4410009195886319	0.8511755712455006	-0.06615704217631674	1.1003321645523227	1.1137403339821204	0.40454485063280565	0.4051341490000353	1.8348859177167232	0.5799596286772596	0.48633485635726603	0.7298310229582992	0.6962034409278512	-0.3789673999563163	-0.05079224484914391	0.08040922346662849	-0.609390170245852	1.775639259598164	-0.1932414626686274	-0.33242050627958764	-0.8748513488830061	2.6202420084070708	0.10152613314644043	-0.17017265897433964	0.6806777234167579	0.2207215463481824	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:94124143..94124257,-__1239.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:94124143..94124257,-__1239.1.0.0	rs184467783	0.8526263185558847	0.4917931644377758	0.7707663477788721	0.5432331280695353	-0.6753070950458413	1.3069817966507478	0.7369653569123933	1.2799854978830414	-0.7853560906903478	0.47843349553081915	0.6565075153316057	0.04915329954154122	0.4754818945796689	1.1608059099368224	1.4756375508146662	-0.4611798481398395	0.6326966214971471	0.7362297534873358	-0.4851170900775947	0.8214998454104817	0.5972127237396253	0.1436419059383319	0.5189167126598268	-0.9646927796106705	0.9130170327914016	0.42405569487062783	0.30817959138093776	0.9838443863768904	-1.2319461959187117	0.08946349342761184	1.411536848533177	-1.7920988867283425	0.08453448849808842	-0.6827727741434161	0.9289979966286798	0.0404832171290076	-1.6212002949422761	0.8638637332498603	-0.0514261997090411	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr9:94124143..94124257,-__1239.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:94124143..94124257,-__1239.1.0.0	rs549281862,rs184467783	0.8526263185558847	0.4917931644377758	0.7707663477788721	0.5432331280695353	-0.6753070950458413	1.3069817966507478	0.7369653569123933	1.2799854978830414	-0.7853560906903478	0.47843349553081915	0.6565075153316057	0.04915329954154122	0.4754818945796689	1.7080627045951269	-1.3917873156303389	0.0706900889364791	0.12717188938670046	-0.28007285604361015	-1.1941334975511797	0.5327293780393751	0.6529479284630145	-0.8657397642944474	-0.7660748151723068	-0.8515318335402329	-0.009823316977902124	-0.1889634508157768	0.8554363860392422	-1.8835804800681146	-0.700076258842393	-0.41606123868283484	0.39523423900223115	-2.5011152942019272	-0.20423597887301814	-0.6270375694200269	-0.08038367360409959	-1.244508310703126	-1.5080393488718387	-0.058976616519443345	-0.6644453453954458	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:116102499..116102613,-__1240.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:116102499..116102613,-__1240.1.0.0	rs111634786	-0.822132116767195	-0.5736715989482312	-1.197552517840473	0.19641233484251477	-0.7582605989504577	-0.11994201962361672	0.1763297222299681	-1.1657087375970918	-0.7073137122562299	-0.2321339051779464	-0.7145840800579821	-2.6968344574440137	-0.7179493072992296	0.8526263185558847	0.5703796461864888	-0.09156470878256939	0.448784574931119	0.4597972826247042	-0.3476557608784464	0.4370522192579983	-0.04786735168566039	-0.5479292854673599	0.1686875628328105	-1.4195213707323024	-0.08388957968367172	0.03324162892991625	1.6747584353230796	1.14405124513472	1.1059878090579036	0.25237224008860426	1.218057881575162	-0.22771374125482968	0.2607224970280302	1.1178413859114313	0.15938442678887	0.4008214680107569	-0.7049372906743203	2.612944877760342	0.7511909362291457	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:116102499..116102613,-__1240.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:116102499..116102613,-__1240.1.0.0	rs10481675	-0.822132116767195	-0.5736715989482312	-1.197552517840473	0.19641233484251477	-0.7582605989504577	-0.11994201962361672	0.1763297222299681	-1.1657087375970918	-0.7073137122562299	-0.2321339051779464	-0.7145840800579821	-2.6968344574440137	-0.7179493072992296	0.6446809900246474	0.4801550279566422	-0.14524736939751126	-0.06857862710244639	0.09922179168099793	0.20336930739551312	0.06589510380224428	0.36460861176928144	0.2643996164636848	-0.0006298119337564481	0.5094054361861174	-0.6305208478314254	0.14889660241783242	1.4668131067918424	1.0538266269048733	1.0523051484429615	-0.2649909619449612	0.8574823906314557	0.32331132701912985	-0.11043461842772381	1.5303173493663733	0.9717133287199147	0.23150409324418997	1.2239895162440995	2.0663136096125885	0.8668459097170621	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr9:116102499..116102613,-__1240.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:116102499..116102613,-__1240.1.0.0	rs111634786,rs10481675	-0.822132116767195	-0.5736715989482312	-1.197552517840473	0.19641233484251477	-0.7582605989504577	-0.11994201962361672	0.1763297222299681	-1.1657087375970918	-0.7073137122562299	-0.2321339051779464	-0.7145840800579821	-2.6968344574440137	-0.7179493072992296	1.2381713844663116	0.2140254863903662	1.1965188717250188			1.0594308822734344		0.05265509138113861	0.5119488941619439	0.9942666941247994	0.30356345867802326	2.280790342826034	0.8723745673363411	2.0603035012335065	0.7876970853385974	2.3940713895654917			1.1793729018970511		1.2183638289782304	1.2192626064181737	1.2264005993027458	1.0181475387360055	4.977624800270048	1.7868049168599833	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:7222095..7222209,+__1242.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:7222095..7222209,+__1242.1.0.0	rs740531	2.0712745149195797	2.3309563315369526	2.0191619018055427	1.4082922450014217	2.176502289099711	1.983399995850399	1.75939816159322	1.6329435947828923	2.146568157167766	1.8385531170475802	2.1200665717286498	2.1281337870275445	1.9679375556301049	2.042224464946038	2.674740805759628	2.0097744587988715	1.808333165252047	2.1778474918570043	2.239019487236632	2.174409471826535	2.242479893926129	2.3220749084045593	2.2641227826704635	2.2762044319503394	2.344276623019225	2.214625665470623	-0.029050049973541547	0.3437844742226752	-0.009387443006671159	0.4000409202506252	0.001345202757293329	0.25561949138623286	0.41501131023331506	0.6095362991432367	0.17550675123679316	0.42556966562288334	0.15613786022168963	0.21614283599168038	0.2466881098405177	0.480851528886	0.428242856315	0.861430881609	0.536806685117	0.581967350665	0.420456664513	0.301187193336	0.110080523892	0.448066215252	0.326996172605	0.158583637061	0.276771967065	0.196250998433	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:7222095..7222209,+__1242.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:7222095..7222209,+__1242.1.0.0	rs740530	2.0712745149195797	2.3309563315369526	2.0191619018055427	1.4082922450014217	2.176502289099711	1.983399995850399	1.75939816159322	1.6329435947828923	2.146568157167766	1.8385531170475802	2.1200665717286498	2.1281337870275445	1.9679375556301049	1.9972649361390904	2.099512987341213	2.22724321488582	1.5543053030331682	1.9459351860409215	1.897915704816105	1.8790791094991668	1.9738976916713344	2.1208070957317324	2.0343417056676527	1.8844852626766202	1.970143791676017	1.9654109990982367	-0.0740095787804893	-0.23144334419573953	0.20808131308027722	0.14601305803174647	-0.23056710305878947	-0.08548429103429389	0.11968094790594686	0.34095409688844214	-0.02576106143603374	0.19578858862007253	-0.23558130905202956	-0.15798999535152758	-0.002526556531868155	0.76769033028	0.397602565759	0.757455001208	0.397602565759	0.347268461228	0.706946403854	0.397602565759	0.727009731456	0.8931878581	0.957167318493	0.428242856315	0.489247397307	0.885151978145	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr7:7222095..7222209,+__1242.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:7222095..7222209,+__1242.1.0.0	rs740531,rs740530	2.0712745149195797	2.3309563315369526	2.0191619018055427	1.4082922450014217	2.176502289099711	1.983399995850399	1.75939816159322	1.6329435947828923	2.146568157167766	1.8385531170475802	2.1200665717286498	2.1281337870275445	1.9679375556301049	1.968580828288844	2.1037946873893327	1.7890451811817245	1.5733127736534895	1.918899268832624	1.9134323796278312	1.7099071349859931	1.7789195663425852	2.0892065102056003	2.102407383027944	2.102097696704819	1.9635506496679345	1.9177628383257266	-0.10269368663073575	-0.22716164414761986	-0.23011672062381816	0.16502052865206784	-0.2576030202670869	-0.06996761622256775	-0.04949102660722682	0.14597597155969289	-0.057361646962165835	0.26385426598036377	-0.017968875023830932	-0.16458313735961005	-0.050174717304378134	0.63839046467	0.237368605078	0.0187859264625	0.0856734395523	0.0209116273429	0.333666485083	0.0763307839553	0.609889042629	0.672324307433	1.0	0.568229750021	0.320413072024	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:3539539..3539653,-__1245.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:3539539..3539653,-__1245.1.0.0	rs77838064	1.2542868800734372	1.5227577265026888	1.210759548194129	0.9551339740846212	1.2544301191396205	1.1548430221984751	0.9196540423238078	1.1526684246769698	1.055734260892247	1.1269590471750228	1.3485801044983186	1.3121795937762257	1.1889988952946302	0.9412465747366522	1.2460244907048803	1.2180417625239204	1.0574789378919374	1.089878384872937	1.1872363556146637	0.8374116100284071	1.232572678276731	0.9324898984008106	1.2479580783997393	1.1449140770781026	1.2177983363593174	1.1127542654073415	-0.31304030533678506	-0.2767332357978085	0.007282214329791481	0.10234496380731617	-0.16455173426668357	0.03239333341618855	-0.08224243229540062	0.07990425359976117	-0.12324436249143644	0.12099903122471645	-0.203666027420216	-0.09438125741690828	-0.07624462988728872	0.361218104761	0.259370210024	0.919784795402	0.619326784864	0.320413072024	0.946473618223	0.390154148302	0.79863356553	0.326996172605	0.354199901149	0.276771967065	0.48504462162	0.608885836257	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:3539539..3539653,-__1245.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:3539539..3539653,-__1245.1.0.0	rs111541274	1.2542868800734372	1.5227577265026888	1.210759548194129	0.9551339740846212	1.2544301191396205	1.1548430221984751	0.9196540423238078	1.1526684246769698	1.055734260892247	1.1269590471750228	1.3485801044983186	1.3121795937762257	1.1889988952946302	1.1736546916736286	1.4196258498965646	1.2709798592895893	0.9565945209563516	1.2521540851466748	1.291608997315564	0.980497914801317	1.272230775291726	1.3003156480355527	1.2848511822847017	1.3545867719939562	1.3589799997908145	1.2430066913730369	-0.08063218839980868	-0.10313187660612422	0.060220311095460444	0.0014605468717303616	-0.0022760339929457363	0.13676597511708888	0.06084387247750922	0.11956235061475606	0.24458138714330557	0.15789213510967892	0.006006667495637608	0.04680040601458879	0.05400779607840644	0.706946403854	0.861430881609	0.757455001208	0.747262025795	0.935789553219	0.609889042629	0.79863356553	0.757455001208	0.563691144959	0.476688253492	0.829896383209	0.935789553219	0.994926981106	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr17:3539539..3539653,-__1245.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:3539539..3539653,-__1245.1.0.0	rs77838064,rs111541274	1.2542868800734372	1.5227577265026888	1.210759548194129	0.9551339740846212	1.2544301191396205	1.1548430221984751	0.9196540423238078	1.1526684246769698	1.055734260892247	1.1269590471750228	1.3485801044983186	1.3121795937762257	1.1889988952946302	0.9542405855274212	1.3469581552597534	1.3124056479917252	1.0484386447279257	1.2268474580478936	1.1694977665898685	0.9398912455299446	1.284169443055052	1.2474489248069829	1.253698054920685	1.2117866833210067	1.3069603843680504	1.191861916178859	-0.30004629454601606	-0.17579957124293544	0.10164609979759631	0.0933046706433045	-0.027582661091726912	0.01465474439139336	0.020237203206136867	0.13150101837808226	0.1917146639147358	0.12673900774566227	-0.13679342117731186	-0.005219209408175329	0.002863020884228814	0.727009731456	0.819442862795	0.527990680582	0.628827692687	0.747262025795	0.66743649171	0.788281320858	0.925117039075	0.716953652062	0.259370210024	0.79863356553	0.716953652062	0.971526601941	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chrX:31285000..31285114,-__1247.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chrX:31285000..31285114,-__1247.1.0.0	rs145666976	1.2269605083339257	0.3028442199399021	0.3352495952202352	1.606088709737162	0.6702743268595439	-0.6246795592445401	1.1699148736582674	0.432189509337906	0.9333728497027283	0.20645384969075964	0.88621577979447	-0.0396588928478494	0.5921021475152092	0.6801696673168088	0.6059626733861632	-0.203282307651948	-1.8529101850516312	-0.5897757523445314	0.48649111005752677		-0.49817553200108833	0.7956717171847592	-0.48902628274272675	0.5913671117231217	0.014382583449021803	-0.04173865424313856	-0.5467908410171168	0.30311845344626104	-0.5385319028721831	-3.458998894788793	-1.2600500792040754	1.1111706693020669		-0.9303650413389943	-0.13770113251796912	-0.6954801324334864	-0.29484866807134824	0.054041476296871206	-0.5813123721089789	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:146277773..146277887,+__1250.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:146277773..146277887,+__1250.1.0.0	rs138689758	3.008157037471287	3.225379436008847	2.7401463463734093	2.699010815303689	3.0379295346831903	3.0117669087817323	2.745618269462269	3.1351009646971515	3.03922671055014	3.216809758968992	3.0337720298129165	3.0897476008286704	2.998555451078525	3.1518097279579127	3.7807915047576217	3.1338649237317955	2.8683665244866297	3.1771696742761506	3.0122375762064286	2.9951226064866	3.275034549210705	3.2531308958267187	3.2104844340524883	3.364857864838434	3.285917268681502	3.2090656292094155	0.14365269048662554	0.5554120687487747	0.3937185773583862	0.16935570918294074	0.13924013959296033	0.00047066742469636935	0.24950433702433106	0.13993358451355364	0.21390418527657884	-0.006325324916503838	0.33108583502551747	0.19616966785283152	0.21051017813089104	0.248198866138	0.0499532058383	0.132622250874	0.192768091005	0.354199901149	0.777966336216	0.0808926541269	0.619326784864	0.166665831608	0.29495293544	0.154655491485	0.276771967065	0.00948745205851	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr13:22033372..22033486,-__1255.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr13:22033372..22033486,-__1255.1.0.0	rs149977193	-0.9542526430402092	-1.3098847869322006	-1.119545281828829	-1.014061167566475	-0.8260636433654431	-0.9248367422873804	-1.5758232146977216	-1.0408639978154774	-1.180901209784384	-1.2821886794055033	-1.7030809343283917	-0.7998277325533785	-1.1442775028004495	-1.2293201786963892	-0.9823376517746947	-1.131910943346632	-1.0372875983437002	-1.127778690242259	-0.9880829741924143	-1.6760282302610583	-1.1577311787346551	-1.1930983845085628	-1.2483389424086142	-1.2770665066979736	-0.9528624910586734	-1.1668203141888023	-0.27506753565618003	0.3275471351575059	-0.01236566151780294	-0.023226430777225193	-0.30171504687681594	-0.06324623190503387	-0.10020501556333672	-0.1168671809191777	-0.012197174724178694	0.03384973699688909	0.4260144276304181	-0.1530347585052949	-0.022542811388352745	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:53073460..53073574,+__1256.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:53073460..53073574,+__1256.1.0.0	rs75660813	3.3450396310981056	3.784656265802276	3.2124144521092033	2.9706549438275713	3.3793634511978112	3.40638979717172	3.258219648566375	3.554322281015347	3.495867589461267	3.4523113384282986	3.3981806744928034	3.43052960878964	3.3906624734967017	3.2462244897639416	3.6619699497652856	3.2455058980801006	2.943683143439643	3.2782352823192054	3.3693584348102528	3.1600179698305464	3.5408150009562136	3.370863069475052	3.453007121791561	3.276626327755852	3.496119548118568	3.336868853008852	-0.09881514133416403	-0.12268631603699065	0.033091445970897304	-0.026971800387928457	-0.10112816887860587	-0.03703136236146731	-0.09820167873582841	-0.013507280059133375	-0.1250045199862151	0.000695783363262592	-0.12155434673695131	0.06558993932892809	-0.05379362048784971	0.777966336216	0.85089220831	0.747262025795	1.0	0.536806685117	0.468411351413	0.706946403854	0.60051573606	0.29495293544	0.696989544957	0.501992688725	0.88258056334	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:50431928..50432042,+__1257.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:50431928..50432042,+__1257.1.0.0	rs4802640	-0.26173988815707283	-0.5201887915124098	-1.344172797503044	-0.7255296802252641	-1.0492214143055072	-0.7845628839484223	-0.6995198909053704	-0.8423168949683407	-0.8026420512852209	-0.3122412045192637	-0.9988283523494397	-0.5836082526816603	-0.7437143418634179	-0.3144946879855511	0.16062833046301314	-0.1287728236045557	-0.17031280739671134	-0.1399667237823641	0.00833867678584847	-0.40262050923838777	-0.3288077340299346	-0.3046764647502358	-0.023042622262573576	0.13387476265185494	-0.14242945677638466	-0.1376901716604985	-0.05275479982847825	0.680817121975423	1.2153999738984882	0.5552168728285527	0.9092546905231431	0.7929015607342708	0.2968993816669826	0.5135091609384062	0.4979655865349851	0.2891985822566901	1.1327031150012945	0.44117879590527564	0.6060241702029195	0.60051573606	0.0986283746992	0.166665831608	0.408929232264	0.0316863885398	0.192768091005	0.501987794151	0.48504462162	0.313917214294	0.978575937473	0.00641629102443	0.382791178922	0.0359299017244	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:76139852..76139966,+__1259.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:76139852..76139966,+__1259.1.0.0	rs77544843	-1.2487644506507205	-0.7954919209757728	-1.0744815085522723	-0.925197206774408	-1.3707818366752824	-1.1525280199373789	-0.7005911408668997	-0.8817602102313914	-1.149668878058594	-1.4730572757842018	-1.2078987482193622	-1.3601908839281445	-1.1117010067212023	-1.0720612903381943	-1.0283431238779461	-1.2966102136359932	-1.4438975752400762	-1.310744328346705	-1.0916029365239048	-1.4631480911890509	-0.8780077112093396	-1.3972322818297973	-1.7709021477410702	-1.2494867752996726	-1.2959637003514144	-1.2748333479652636	0.1767031603125262	-0.23285120290217332	-0.22212870508372085	-0.5187003684656682	0.06003750832857735	0.060925083413474024	-0.7625569503221512	0.0037524990220517696	-0.24756340377120334	-0.2978448719568685	-0.0415880270803104	0.06422718357673007	-0.1631323412440614	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:122042743..122042857,-__1271.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:122042743..122042857,-__1271.1.0.0	rs140736460	2.292037066684608	2.441155323669716	2.2195586627624304	2.8236255630745988	2.92656676406445	3.6710055740204415	3.5208951179844323	3.5036371270395916	3.1382137295452672	3.694451367804776	3.0833557224373185	3.2334987286600394	3.045666728978972	1.7061686765693438	-1.090563204760753	-1.3613299065157394	-1.442300281495963	-1.5508889138290811	-0.022794207499370722	1.6135623364761056	-1.277473207244202	-0.13308463092109413	-1.7580287725521764	-1.039896169296224	-0.7356316326540759	-0.5910216594769359	-0.5858683901152644	-3.531718528430469	-3.58088856927817	-4.265925844570562	-4.4774556778935315	-3.6937997815198123	-1.9073327815083267	-4.7811103342837935	-3.2712983604663615	-5.452480140356952	-4.123251891733543	-3.9691303613141153	-3.6366883884559087	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr2:122042743..122042857,-__1271.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:122042743..122042857,-__1271.1.0.0	rs13415738,rs140736460	2.292037066684608	2.441155323669716	2.2195586627624304	2.8236255630745988	2.92656676406445	3.6710055740204415	3.5208951179844323	3.5036371270395916	3.1382137295452672	3.694451367804776	3.0833557224373185	3.2334987286600394	3.045666728978972	1.4971205353272423	0.5553073767390886	-0.24207285364660325	2.1601175119376768	-0.3216522962704453	0.9788078197620196	0.7743134793629772	-0.9150385602067814	-1.2094267791602231	1.0587528265808277	-0.7600043043667177	0.3276536543929427	0.32532320087100025	-0.7949165313573658	-1.8858479469306275	-2.4616315164090334	-0.663508051136922	-3.2482190603348955	-2.692197754258422	-2.746581638621455	-4.418675687246373	-4.34764050870549	-2.635698541223948	-3.843360026804036	-2.9058450742670967	-2.7203435281079718	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:32526143..32526257,-__1273.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:32526143..32526257,-__1273.1.0.0	rs3739674	0.026708121333083683	0.024434789727057392	0.18651255039978332	-0.10924193087346157	0.10272590160748349	0.1321868665967141	0.10949364556830778	-0.252507943882347	0.15239087016275113	0.07485177653170233	-0.09047974189707392	0.4074546254419753	0.06371079422633134	-0.5355255145658221	0.11178540591701985	0.06303920190481999	-0.6203701419137619	-0.1867705363105809	0.026462304804123774	-0.05254566380526563	-0.12917476789129806	-0.0775152480748864	-0.2512113295954504	-0.0976179459720194	0.2424233348045939	-0.12558507505821062	-0.5622336358989057	0.08735061618996245	-0.12347334849496333	-0.5111282110403004	-0.2894964379180644	-0.10572456179259034	-0.16203930937357341	0.12333317599104893	-0.2299061182376375	-0.3260631061271527	-0.007138204074945476	-0.1650312906373814	-0.18929586928454192	0.628819836345	0.29495293544	0.476688253492	0.595849425807	0.973221425691	0.66743649171	0.747262025795	0.648013768535	0.657696241675	0.819442862795	0.687084607526	0.288800212278	0.909466434716	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr9:32526143..32526257,-__1273.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:32526143..32526257,-__1273.1.0.0	rs10813831,rs3739674	0.026708121333083683	0.024434789727057392	0.18651255039978332	-0.10924193087346157	0.10272590160748349	0.1321868665967141	0.10949364556830778	-0.252507943882347	0.15239087016275113	0.07485177653170233	-0.09047974189707392	0.4074546254419753	0.06371079422633134	-0.6485082075618653	-0.32081726480311124	-0.5111556537534172	-0.5088310876668053	-0.3840851539520367	-0.3616736809250066	-0.3833580140991529	-0.3149774458261198	-0.3255101083415615	-0.044315663671348496	-0.1767060870206092	-0.2031999691440255	-0.34859486139708834	-0.675216328894949	-0.3452520545301686	-0.6976682041532005	-0.3995891567933437	-0.4868110555595202	-0.4938605475217207	-0.49285165966746064	-0.06246950194377282	-0.4779009785043127	-0.11916744020305083	-0.08622634512353528	-0.6106545945860008	-0.41230565562341964	0.00127053293566	0.0386605553759	0.0678362651725	0.122558611289	0.00160288548718	0.00313710581496	0.00300328973882	0.0932701621097	0.0426112802219	0.226876581559	0.179364149792	0.00544559218276	1.23775664648e-11	0.246483389518	1	1	1	0.328591524871	0.630558268807	0.600657947764	1	1	1	1	1	2.80970758751e-09	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:45956777..45956891,-__1277.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:45956777..45956891,-__1277.1.0.0	rs41311209	0.62395341708742	0.6964418270818336	0.6764897492525433	0.5585550754502757	0.6410925805252805	0.7718608728324085	0.508147711541003	0.6334741750867241	0.857988134906	0.676055463937292	0.6213587422916544	0.7812661537174843	0.6705569919758266	0.6652436806429538	0.9494870562075279	0.8680590627594931	0.769907486305557	0.7574187756740949	0.7609280266453722	0.8088855141335134	0.7855401652592412	0.8898220840851304	0.7187934963165165	0.6590479828585343	0.9475421686612342	0.7983896249624308	0.04129026355553378	0.2530452291256944	0.19156931350694972	0.21135241085528134	0.11632619514881437	-0.010932846187036271	0.3007378025925104	0.1520659901725171	0.031833949179130405	0.042738032379224467	0.037689240566879834	0.16627601494374988	0.1278326329866041	0.628827692687	0.405136064622	0.609889042629	0.162586850726	0.188220673538	0.545696106059	0.162586850726	0.320413072024	0.375513989452	0.66743649171	0.609889042629	0.397602565759	0.217759423081	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:45956777..45956891,-__1277.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:45956777..45956891,-__1277.1.0.0	rs3790583	0.62395341708742	0.6964418270818336	0.6764897492525433	0.5585550754502757	0.6410925805252805	0.7718608728324085	0.508147711541003	0.6334741750867241	0.857988134906	0.676055463937292	0.6213587422916544	0.7812661537174843	0.6705569919758266	0.7496957553417665	0.8294866329154799	0.829047923448313	0.637749959882405	0.752848284001279	0.72376177256109	0.6659902164415261	0.7500724504475704	0.7825070038960047	0.878669994607204	0.8050831110788859	0.7414575612351724	0.7621975554880581	0.12574233825434644	0.1330448058336463	0.15255817419576967	0.0791948844321293	0.1117557034759985	-0.04809910027131847	0.1578425049005231	0.11659827536084633	-0.07548113100999532	0.20261453066991197	0.18372436878723142	-0.039808592482311944	0.09164056351223145	0.657696241675	0.628827692687	0.819442862795	0.444064484515	0.354199901149	0.90381429355	0.390154148302	0.747262025795	0.967868733231	0.340423946445	0.563691144959	0.90381429355	0.950860844044	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr1:45956777..45956891,-__1277.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:45956777..45956891,-__1277.1.0.0	rs41311209,rs3790583	0.62395341708742	0.6964418270818336	0.6764897492525433	0.5585550754502757	0.6410925805252805	0.7718608728324085	0.508147711541003	0.6334741750867241	0.857988134906	0.676055463937292	0.6213587422916544	0.7812661537174843	0.6705569919758266	0.7665976589250328	1.1045238067201997	1.0090137455523989	0.8995761548828246	0.9962605461611341	1.0706706452761932	0.6813659411764608	0.8722512119012633	1.0793878865806101	0.9312096611272325	0.9838189878846966	1.0384655479965412	0.9527618161820489	0.14264424183761282	0.4080819796383661	0.3325239962998555	0.3410210794325489	0.3551679656358536	0.2988097724437847	0.17321822963545774	0.2387770368145392	0.22139975167461012	0.2551541971899405	0.36246024559304213	0.2571993942790569	0.2822048242062224	0.60051573606	0.0638899216795	0.136115392203	0.0174727290303	0.0125089884503	0.00883703695038	0.265084565602	0.259370210024	0.0350255264852	0.0374147936077	0.0198252990072	0.150801701171	4.3158649734e-07	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	9.79701348962e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:44117148..44117262,+__1278.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:44117148..44117262,+__1278.1.0.0	rs78395259	2.572801920860213	2.738051962645533	2.504439413147007	2.3620339630444525	2.63258668913978	2.8118149691262335	2.5841312145138398	2.6949041986653257	2.5519419526312266	2.6964909974539704	2.6803189477358993	2.5109566591533383	2.6117060740097346	2.5571063050709544	2.8150300200955023	2.2668668735008266	2.251428537543163	2.673319910321618	2.7176909366901825	2.6477505995039294	2.6033163990212618	2.6808625549422307	2.7815025270824627	2.7098291312171017	2.6309821289932973	2.6113071603318776	-0.01569561578925871	0.07697805744996922	-0.2375725396461803	-0.11060542550128938	0.040733221181838086	-0.09412403243605105	0.06361938499008968	-0.09158779964406394	0.1289206023110041	0.08501152962849234	0.02951018348120238	0.12002546983995899	-0.0003989136778573821	0.527981234064	0.737113058664	0.452098798395	0.107123399254	0.397602565759	0.262211172943	0.175053819161	0.13967914143	0.150801701171	0.66743649171	0.591208103411	0.519249062249	0.130660136242	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:66563807..66563921,-__1280.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:66563807..66563921,-__1280.1.0.0	rs12297278	-0.16241050053290298	0.05287623308882888	-0.20586833024826728	-0.33224572338582387	-0.02795810266885516	-0.20423502102033814	-0.11643510974638685	-0.04279723435296354	0.12064048679665275	-0.10493715110340478	-0.055849193422073215	-0.2673302788481424	-0.11221249378697307	-0.3003156587669472	0.18634123424500432	-0.2880664728784474	0.07287371399778886	-0.23140487433540874	0.01766444617436921	-0.017695874674447526	0.013713353212747338	-0.28150167770392	0.13908670053701466	-0.11433973658952323	-0.11038944692706514	-0.07616952447573623	-0.13790515823404423	0.13346500115617543	-0.0821981426301801	0.4051194373836127	-0.2034467716665536	0.22189946719470735	0.09873923507193932	0.056510587565710875	-0.4021421645005727	0.24402385164041945	-0.05849054316745002	0.15694083192107727	0.036042969311236815	0.914457985151	0.452098798395	0.460214637573	0.0515422504639	0.375513989452	0.110080523892	0.48504462162	0.340423946445	0.270885072145	0.527990680582	0.989287003123	0.493479697885	0.416585874613	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:137113580..137113694,-__1281.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:137113580..137113694,-__1281.1.0.0	rs140110518	3.0330662916467954	0.594218471292978	1.996888194177179	1.0223483345563307	1.686945099156316	2.3715108816645496	0.7359492393575154	0.8349049179334275	0.15849337317747886	3.263316175906291	2.939564616801745	3.0102384487739013	1.8039536703703758	1.1775315194490943	-0.6958042370150022	-1.1161318326920764	0.10525578738165724	1.7632930267368	0.1210074068706966	2.7347181056151197	-0.8040567381312358	0.4623487263450561	0.046913155018817126	-0.7838272614052757	-0.7672970608442169	0.1869958831107862	-1.8555347721977011	-1.2900227083079803	-3.1130200268692554	-0.9170925471746735	0.07634792758048414	-2.250503474793853	1.9987688662576044	-1.6389616560646632	0.3038553531675772	-3.2164030208874737	-3.7233918782070208	-3.7775355096181182	-1.6169577872595895	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:137113580..137113694,-__1281.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:137113580..137113694,-__1281.1.0.0	rs183320694	3.0330662916467954	0.594218471292978	1.996888194177179	1.0223483345563307	1.686945099156316	2.3715108816645496	0.7359492393575154	0.8349049179334275	0.15849337317747886	3.263316175906291	2.939564616801745	3.0102384487739013	1.8039536703703758	-1.3900472501991112	-0.959254968838059	0.07802003786080075	0.2987358074531111	0.014253686840633883	-0.13949837477407756	-1.0332424475450364	-0.5310006116866437	0.2160238508848525	-1.3316298284142025	-0.17600512889551773	-1.093599170962025	-0.5039370331896063	-4.423113541845907	-1.553473440131037	-1.9188681563163783	-0.7236125271032195	-1.672691412315682	-2.5110092564386273	-1.769191686902552	-1.365905529620071	0.05753047770737363	-4.5949460043204935	-3.115569745697263	-4.103837619735926	-2.307890703559982	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr6:137113580..137113694,-__1281.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:137113580..137113694,-__1281.1.0.0	rs140110518,rs183320694	3.0330662916467954	0.594218471292978	1.996888194177179	1.0223483345563307	1.686945099156316	2.3715108816645496	0.7359492393575154	0.8349049179334275	0.15849337317747886	3.263316175906291	2.939564616801745	3.0102384487739013	1.8039536703703758	-1.7782513665289017	0.18802140612215268	-1.5233641283358663	-0.4862567201464506	-0.3011951320146296	-1.0094020442245284		0.6247464029310169	-0.6001076340714088	0.24059446605015106	-0.6091822372951875	-0.808263689972495	-0.551150970680559	-4.811317658175697	-0.4061970651708253	-3.5202523225130453	-1.5086050547027812	-1.9881402311709455	-3.3809129258890778		-0.21015851500241056	-0.7586010072488876	-3.02272170985614	-3.5487468540969327	-3.818502138746396	-2.4521959529611945	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:126220956..126221070,+__1283.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:126220956..126221070,+__1283.1.0.0	rs11154336	0.8140080797992136	0.8453966666554685	0.9712709853202128	0.4735772157091437	0.9418795083040985	0.9096723209108688	0.9944907660275673	0.8264321122029621	0.7278941619652911	0.8825312269911115	0.8376440924306687	1.0046664329543624	0.8524552974392474	0.8779932088844321	0.6132252593625727	0.5078474308331812	0.5560327306784049	0.8130744889560071	0.8302877130412886	0.5029718867774136	1.3239387733036945	0.5416599969566143	0.8141661358415373	0.5522282447444995	0.7505219483451349	0.7236623181437317	0.06398512908521847	-0.23217140729289587	-0.46342355448703165	0.08245551496926118	-0.1288050193480914	-0.07938460786958024	-0.4915188792501537	0.4975066611007324	-0.18623416500867684	-0.06836509114957423	-0.28541584768616923	-0.25414448460922756	-0.12879297929551572	0.30750859871	0.914457985151	0.436112310787	0.840380101088	0.340423946445	0.737113058664	0.162586850726	0.0258200569765	0.706946403854	0.757455001208	0.337028796626	0.788281320858	0.570644648054	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr4:110354902..110355016,+__1284.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr4:110354902..110355016,+__1284.1.0.0	rs72896632	1.8874467858270512	2.2889854162399197	1.9659834757821228	1.7740963657518454	2.08488618304383	2.0589960622912247	2.225317678857169	1.9935624925222029	2.1035578934418533	2.1206885554821646	2.178831860483598	2.1263337326920784	2.0673905418679217	2.0531869295509253	2.2943453750737453	2.131533698139314	1.8208076142854386	2.2413300564358694	2.2728925374891062	2.1511602596276544	2.2340169098577753	2.2958773373065924	2.2511167242451986	2.2094584054967887	2.2826644382407637	2.1865325238124314	0.16574014372387413	0.005359958833825562	0.1655502223571912	0.04671124853359321	0.15644387339203947	0.21389647519788157	-0.07415741922951469	0.2404544173355725	0.1923194438647391	0.13042816876303398	0.030626545013190842	0.15633070554868533	0.11914198194450935	0.368322877114	0.648013768535	0.221756412245	0.476688253492	0.591208103411	0.21176555971	0.444064484515	0.216719559135	0.276771967065	0.554657938956	0.405136064622	0.493479697885	0.194335092941	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:8428960..8429074,+__1285.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:8428960..8429074,+__1285.1.0.0	rs4076317	-0.0059561398196613475	0.1672162489399217	0.2042086009079584	-0.12029485085270347	0.20775776746321248	-0.2675781237346864	-0.3818807352333216	-0.26690601218713383	0.09506739707837496	0.18010235936361324	-0.01965375350526256	0.20582191010370837	-0.00017461095633167223	0.03883671143655251	-0.015815462658836564	0.06494586304940897	-0.3507452074835227	-0.06840333902766015	-0.3320629796938193	-0.05809902203800375	-0.34682244007106766	-0.07374884820477806	0.16855605902657406	0.010629124005300594	-0.06209083477413935	-0.08540169803616597	0.04479285125621386	-0.18303171159875828	-0.13926273785854942	-0.23045035663081925	-0.2761611064908726	-0.06448485595913289	0.32378171319531784	-0.07991642788393383	-0.16881624528315303	-0.011546300337039184	0.030282877510563154	-0.2679127448778477	-0.08522708707983428	0.777966336216	0.197395731844	0.0741297894045	0.30750859871	0.158583637061	0.452098798395	0.90381429355	0.147021540231	0.226876581559	0.989287003123	0.493479697885	0.202104162379	0.262699933387	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr19:8428960..8429074,+__1285.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:8428960..8429074,+__1285.1.0.0	rs4076317,rs35137994	-0.0059561398196613475	0.1672162489399217	0.2042086009079584	-0.12029485085270347	0.20775776746321248	-0.2675781237346864	-0.3818807352333216	-0.26690601218713383	0.09506739707837496	0.18010235936361324	-0.01965375350526256	0.20582191010370837	-0.00017461095633167223	0.02449158374722489	0.045032286421418384	0.08932051950341814	0.0056511598512475345	-0.20978698101372767	0.03627084997277162	0.04003175036989731	0.15624342685587367	0.1436419059383319	-0.008389864429379851	-0.08746217720157859	-0.12800515131852186	0.008919942391414625	0.03044772356688624	-0.12218396251850333	-0.11488808140454025	0.125946010703951	-0.4175447484769401	0.30384897370745806	0.4219124856032189	0.4231494390430075	0.04857450885995694	-0.1884922237929931	-0.06780842369631603	-0.33382706142223023	0.009094553347746295	0.861430881609	0.85089220831	0.554653407081	0.819442862795	0.304331462321	0.8931878581	0.156605481197	0.788281320858	0.510582765025	0.29495293544	0.209314265508	0.192768091005	0.668792908703	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:32526158..32526272,-__1288.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:32526158..32526272,-__1288.1.0.0	rs3739674	0.6093297191293946	0.924005532489812	0.8886973923401009	0.587833825657363	0.7081299336017007	0.8585135990378072	0.5115119771662344	0.4536496647898728	0.6619108252962096	0.6323883339605708	0.7473512572423507	0.787847799208699	0.6975974883266765	0.312882580252713	0.7120368529887696	0.6540393874260995	0.5684275977685904	0.46207351266479746	0.4935848083950979	0.5193193702930318	0.3198416509052714	0.5370515738485351	0.36689462529377226	0.514452719357284	0.3248752211992576	0.48212332503276834	-0.2964471388766816	-0.21196867950104237	-0.23465800491400146	-0.019406227888772554	-0.24605642093690328	-0.36492879064270933	0.007807393126797346	-0.1338080138846014	-0.12485925144767451	-0.26549370866679856	-0.23289853788506676	-0.46297257800944136	-0.215474163293908	0.00955750115232	0.347268461228	0.158583637061	0.609889042629	0.113101776132	0.0267271087754	0.935789553219	0.170821264488	0.179364149792	0.147021540231	0.0399413890972	0.175053819161	0.00102238711403	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.856760401553	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chrX:2609217..2609331,+__1292.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chrX:2609217..2609331,+__1292.1.0.0	.	1.244616531819834	-0.7382269426096623	0.4758870736020471	0.09661613222361168	-0.35573978367811865	1.0225884584069949	1.2015623948153324	0.022334286858799512	0.07964558170821874	0.23405227378637228	-0.41989617467579216	-1.2917278864725525	0.13097599548209038	0.3966284481561477	-0.6593535665884525	-1.8237967268271895	-0.6612189267307177	0.05767086068422195	-3.305957775581879	-0.08147748310140789	-1.4111278159936511	0.6841329265596422	-0.7197972583710729	0.15009764056184416	0.014382583449021803	-0.6133180911486243	-0.8479880836636862	0.0788733760212098	-2.2996838004292366	-0.7578350589543293	0.4134106443623406	-4.328546233988874	-1.2830398779167402	-1.4334621028524506	0.6044873448514234	-0.9538495321574452	0.5699938152376363	1.3061104699215744	-0.744294086630715	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chrX:2609217..2609331,+__1292.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chrX:2609217..2609331,+__1292.1.0.0	.	1.244616531819834	-0.7382269426096623	0.4758870736020471	0.09661613222361168	-0.35573978367811865	1.0225884584069949	1.2015623948153324	0.022334286858799512	0.07964558170821874	0.23405227378637228	-0.41989617467579216	-1.2917278864725525	0.13097599548209038	1.17655673288009	0.4458360656141379	0.08965872813025072	0.2987358074531111	0.6138789483630626	0.7222738700335104	1.2617887653935638	1.134880581027507	1.437608320097142	0.4742143936206121	0.6484705368460347	1.0219315799757578	0.7771528607862317	-0.06805979893974379	1.1840630082238002	-0.38622834547179635	0.20211967522949945	0.9696187320411812	-0.30031458837348446	0.060226370578231325	1.1125462941687077	1.3579627383889232	0.2401621198342398	1.068366711521827	2.3136594664483106	0.6461768653041413	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr15:66790065..66790179,-__1296.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:66790065..66790179,-__1296.1.0.0	rs73471762	3.2796763380968716	3.8777101096054034	3.2052369975192345	2.9622052070585227	3.248931230089578	3.5142010051438817	3.2302879690308814	3.600739500697783	3.4370153418317098	3.5007533924547247	3.54886398922566	3.6300785046124897	3.4196416321138954	3.630592422508032	4.105118601786182	3.4271933735139464	3.21959771903928	3.614722144853236	3.6496429517010665	3.4018577055785824	3.760668851315976	3.718228915967583	3.672365594481864	3.699371861981513	3.7644494003430133	3.6386507952558564	0.3509160844111605	0.2274084921807784	0.22195637599471185	0.2573925119807572	0.3657909147636582	0.13544194655718478	0.1715697365477009	0.1599293506181927	0.2812135741358732	0.17161220202713912	0.1505078727558531	0.13437089573052363	0.21900916314196114	0.0856734395523	0.0763307839553	0.202104162379	0.179364149792	0.397602565759	0.757455001208	0.248198866138	0.313917214294	0.444064484515	0.501992688725	0.468411351413	0.270885072145	0.0390908152367	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:62104849..62104963,+__1297.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:62104849..62104963,+__1297.1.0.0	rs2246920	1.6381203279039451	1.927114905863042	1.6068590616340208	1.663778942547912	1.8457335706130316	1.873512872789125	1.9129662064481965	1.9114772935700275	1.8975683508779904	1.893654668729101	1.8950687842159115	2.006129595763435	1.8393320484129785	1.197900861041307	1.1499795839786398	1.1277062968493496	0.8094176661385101	1.089620298071911	1.1809908744737099	1.16991677365739	1.0915481837667194	1.136908879496821	1.4782171964332491	1.183992756825537	1.1867150925009018	1.1502428719361706	-0.440219466862638	-0.7771353218844022	-0.47915276478467117	-0.8543612764094018	-0.7561132725411206	-0.6925219983154152	-0.7430494327908064	-0.8199291098033081	-0.7606594713811694	-0.4154374722958518	-0.7110760273903745	-0.8194145032625333	-0.6890891764768078	0.0296152123457	0.0174727290303	0.0125089884503	0.0249397487324	0.00287470049861	0.000363925330015	0.000273955335251	0.0209174885683	0.00230397578633	0.0440018610392	0.000457487620218	4.46687275285e-05	3.66248940024e-20	1	1	1	1	1	0.278038952131	0.202452992751	1	1	1	0.351807979948	0.0347969387447	3.0691661174e-17	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:121302190..121302304,-__1298.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:121302190..121302304,-__1298.1.0.0	rs77190301	0.7061311103119459	0.8128543453390188	0.6684740806285991	0.8506149564180072	1.0465478523929497	0.8941777632378924	0.8195661522509076	0.8131035542825572	1.1061599906661868	1.2547202367168668	0.9314183597562562	0.9566033400833605	0.9050309785070456	0.8580449435736628	0.9596813901508416	0.7307782121321681	0.8488727529453818	1.149949310037355	0.8513497241375418	0.8918087151619775	0.9088352621567942	0.9360157411635766	0.9388301615118193	1.0282463850838017	1.1286093909340333	0.9359184990824128	0.15191383326171692	0.14682704481182285	0.06230413150356895	-0.0017422034726254365	0.10340145764440534	-0.0428280391003506	0.0722425629110699	0.09573170787423702	-0.1701442495026102	-0.3158900752050475	0.09682802532754553	0.1720060508506729	0.030887520575367134	0.861430881609	0.788281320858	0.113101776132	0.60051573606	1.0	0.554657938956	0.90381429355	0.727009731456	0.232080506959	0.382791178922	0.226871263542	0.757455001208	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr13:115047023..115047137,+__1306.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr13:115047023..115047137,+__1306.1.0.0	rs143755276	0.08168842880838588	-0.1666558517574912	-0.7980611610688894	-0.07493950419298184	-0.12967379524855227	0.3881249761433522	-0.6810010113293086	-0.3889527110682685	-0.8657397642944474	-0.1766063160048941	-0.8978573264886344	-0.24943374422703857	-0.329925648394064	-0.7399445372402506	-0.15529312735126752	0.20530004871560115	0.456375997602333	-0.39003380990317776	-1.29486453643603	-0.9927638871111992	-0.22528915961818569	-0.687949038618612	-0.9472317896922936	-0.2419113537229375	-0.6382177258178044	-0.47098524326615193	-0.8216329660486364	0.011362724406223684	1.0033612097844906	0.5313155017953148	-0.2603600146546255	-1.6829895125793821	-0.31176287578189066	0.16366355145008282	0.17779072567583543	-0.7706254736873995	0.6559459727656969	-0.3887839815907659	-0.141059594872088	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:9291316..9291430,-__1307.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:9291316..9291430,-__1307.1.0.0	rs66596003	1.3180858810965823	1.4360794658860911	1.4350594694595902	1.3495640049001305	1.2662598826783291	1.3367378826742133	1.1825190429194707	1.4623677904688082	1.4756968827239934	1.3290190952249394	1.315620170523934	1.4943406116542912	1.3667791816841977	1.067105790222258	1.4084918567526823	1.3407777582831055	1.1964356104298	1.2545764151579148	1.2419247636763613	1.1652605904352964	1.3616370922196348	1.3234473233029433	1.3453064563328434	1.3913539759893034	1.3681652458737217	1.2887069065563221	-0.25098009087432427	-0.027587609133408852	-0.09428171117648465	-0.15312839447033055	-0.01168346752041427	-0.09481311899785205	-0.017258452484174347	-0.10073069824917336	-0.15224955942105	0.016287361107903964	0.07573380546536934	-0.12617536578056954	-0.07807227512787572	0.320413072024	0.957167318493	0.270885072145	0.452098798395	0.591208103411	0.10711938092	0.737113058664	0.60051573606	0.687084607526	0.60051573606	0.76769033028	0.361218104761	0.66936498769	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr3:45017656..45017770,+__1308.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr3:45017656..45017770,+__1308.1.0.0	rs13085466	2.2515165924977936	2.435131116252393	0.9852619810518956	1.8899379690940505	1.7682968856364985	1.0512665767299696	1.8797545884161997	1.3876373881716362	0.9199082888598396	1.4721946537312736	1.363543076401242	2.4363367597855454	1.6533988230523615	3.1225922600333567	2.5113004976040685	2.344790336171572	1.9500143681278228	2.526673549247034	2.8535737851815703	2.854161776445933	2.927589961036885	2.7530746183299413	2.352350630949292	2.4791882069601057	2.7051814770978497	2.615040955598786	0.8710756675355631	0.07616938135167528	1.3595283551196764	0.060076399033772265	0.7583766636105354	1.8023072084516008	0.9744071880297331	1.5399525728652488	1.8331663294701017	0.8801559772180183	1.1156451305588637	0.2688447173123043	0.9616421325464245	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:25291462..25291576,-__1311.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:25291462..25291576,-__1311.1.0.0	rs80256975	-1.161894905635846	-1.056499314654339	-1.437174369916397	-1.0955526461154832	-0.8722609637416917	-1.1261428708880015	-0.8283659599294569	-1.1842368588884395	-1.2729326379914754	-1.1504284956798458	-1.1484180107987871	-1.1519366955021444	-1.1238203108118257	-1.0821516294761615	-0.9804057720889297	-1.0077718749319236	-1.2524896077130268	-1.1745886430043626	-1.4119980988933882	-1.4131396255162458	-0.7559754660216886	-1.025783620750749	-1.4191291654917748	-1.141945460742856	-1.1319048538160288	-1.1497736515372612	0.07974327615968457	0.07609354256540946	0.42940249498447347	-0.15693696159754356	-0.3023276792626709	-0.28585522800538676	-0.5847736655867889	0.4282613928667509	0.24714901724072647	-0.26870066981192897	0.006472550055931059	0.020031841686115603	-0.02595334072543563	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:33744186..33744300,-__1318.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:33744186..33744300,-__1318.1.0.0	rs73482997	-1.2353178371452147	-1.457541258448626	-1.0724583018505618	-1.2622309461867949	-1.3563348187209248	-1.2938338967684628	-1.1775980523300134	-1.1648094755275116	-1.167206550279495	-1.2678977333088381	-1.0212763234098738	-1.3552661762738996	-1.2359809475208514	-1.54062596188817	-1.7977857992553719	-1.6157403493733702	-1.8189636241593936	-2.067039167552461	-1.8071597465477016	-2.117556973457655	-1.7685021918791284	-1.6568683183141084	-1.7490947483253194	-1.9068126875688771	-1.8665229864313122	-1.809389379562739	-0.3053081247429552	-0.3402445408067458	-0.5432820475228084	-0.5567326779725987	-0.7107043488315363	-0.5133258497792388	-0.9399589211276416	-0.6036927163516168	-0.48966176803461336	-0.48119701501648127	-0.8855363641590033	-0.5112568101574126	-0.5734084320418876	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chrX:46618518..46618632,-__1321.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chrX:46618518..46618632,-__1321.1.0.0	rs191507051	-0.550757374096706	-0.5536425886064104	-0.04199006059408874	-0.2684625968285917	-0.14153260271292104	0.7651962725341955	-1.7355309174443108	0.0768938258632545	-1.1066632303104607	0.09141299980404753	-0.10406119501957922	0.2025306981531186	-0.280550564104871	1.0701883852515537	-0.1997723943324826	1.7881591468985025	0.013359067423124926	-1.1258966256502683	1.2363968017562814	0.1946624282030797	-0.4983204088759831	1.2970317450129143	0.12866001026130872	-1.1179034063651567	0.7474140689564251	0.294498234878275	1.6209457593482597	0.35387019427392774	1.8301492074925914	0.2818216642517166	-0.9843640229373473	0.4712005292220859	1.9301933456473905	-0.5752142347392376	2.4036949753233747	0.037247010457261184	-1.0138422113455774	0.5448833708033065	0.5750487989831461	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr15:51973620..51973734,+__1324.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:51973620..51973734,+__1324.1.0.0	rs2606134	-0.617962057350302	-0.30350997357932097	-0.32792052495400664	-0.6468008996386119	-0.6633702995783936	-0.5571616287008756	-0.5946980661663411	-0.7271677546624148	-0.2934091855103549	-0.3957424288196854	-0.40167934676257055	-0.46806341507077587	-0.49979046506613783	-0.008782967409770156	0.09146018977360908	-0.1019417541912692	-0.16901685267053304	-0.11785615848917302	0.022064393575032686	-0.1290746269184805	-0.1992820324099821	0.10841861707691276	0.2134677983833326	-0.19261638297595465	0.15996041933381935	-0.026933279743538003	0.6091790899405318	0.39497016335293006	0.22597877076273742	0.47778404696807886	0.5455141410892206	0.5792260222759082	0.46562343924786065	0.5278857222524327	0.40182780258726764	0.609210227203018	0.2090629637866159	0.6280238344045952	0.4728571853225998	0.0168468410067	0.116187990183	0.162586850726	0.270885072145	0.0145358169752	0.00133155906714	0.0134887989876	0.00784715402968	0.0832552515755	0.0145358169752	0.202104162379	0.00501178746069	1.86747466303e-10	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1.56494376762e-07	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:57753082..57753196,-__1326.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:57753082..57753196,-__1326.1.0.0	rs17710502	-1.5183801708789704	-1.6529118231116928	-1.8265591516579371	-1.1500945082062346	-2.1756725562406496	-0.8735026679812373	-1.2591828800534068	-1.9399488533922349	-1.5637755031017873	-1.4421085147529986	-1.6914261133317279	-1.5520472341719511	-1.5538008314067355	-1.5151044649045893	-1.8261889745868531	-1.3724219846625572	-1.6610319542976315	-1.1060700314422305	-1.4133084895951429	-1.5292935060157213	-1.4944959694599422	-1.614468507131737	-2.034274759877749	-2.0812636618465	-1.9224414150676328	-1.6308636432406907	0.0032757059743810935	-0.17327715147516032	0.45413716699538	-0.5109374460913969	1.069602524798419	-0.5398058216139056	-0.2701106259623145	0.44545288393229265	-0.050693004029949806	-0.5921662451247505	-0.38983754851477226	-0.37039418089568166	-0.07706281183395489	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:57753082..57753196,-__1326.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:57753082..57753196,-__1326.1.0.0	rs17767072	-1.5183801708789704	-1.6529118231116928	-1.8265591516579371	-1.1500945082062346	-2.1756725562406496	-0.8735026679812373	-1.2591828800534068	-1.9399488533922349	-1.5637755031017873	-1.4421085147529986	-1.6914261133317279	-1.5520472341719511	-1.5538008314067355	-1.1690342584526867	-1.0713605411870384	-1.7021328891097771	-1.7842199934850222	-1.275314321914318	-1.3800904942846621	-1.291625553068157	-1.3523216234836823	-1.5961137596445352	-2.007172829072825	-1.6970914742027368	-1.5401549450787737	-1.4888860569153515	0.34934591242628366	0.5815512819246544	0.12442626254816003	-0.6341254852787876	0.9003582343263317	-0.5065878263034248	-0.032442673014750234	0.5876272299085525	-0.03233825654274791	-0.5650643143198262	-0.005665360871008884	0.01189228909317741	0.0649147744913845	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr5:57753082..57753196,-__1326.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:57753082..57753196,-__1326.1.0.0	rs17710502,rs17767072	-1.5183801708789704	-1.6529118231116928	-1.8265591516579371	-1.1500945082062346	-2.1756725562406496	-0.8735026679812373	-1.2591828800534068	-1.9399488533922349	-1.5637755031017873	-1.4421085147529986	-1.6914261133317279	-1.5520472341719511	-1.5538008314067355	-1.316674361131803	-1.524429306236579	-2.0582691657521845	-1.5384866446897671	-2.187862990664145	-1.757145111711866	-1.408961158780199	-1.3062439747056958	-1.712978038945655	-1.790913213917881	-1.6635708339839668	-1.378848979817195	-1.6370319816947447	0.20170580974716734	0.1284825168751138	-0.2317100140942474	-0.38839213648353255	-0.012190434423495322	-0.8836424437306286	-0.14977827872679206	0.6337048786865391	-0.14920253584386778	-0.3488046991648823	0.027855279347761108	0.1731982543547561	-0.08323115028800905	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:73256811..73256925,-__1330.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:73256811..73256925,-__1330.1.0.0	rs10276377	-0.2173832195692642	-0.13736870384501645	-0.44646833636555894	-0.050507453224937736	-0.10449863481764346	-0.1866765418047521	0.001055727686398759	0.09209749950197826	0.12982936198474926	0.17709443802627683	-0.2804789408424454	-0.05740745805529889	-0.0900593551104595	-0.2659664105820616	-0.02178158712642177	0.06001588372935736	-0.2435394961623966	-0.12208051889591315	-0.08219170629704732	-0.0896739901162201	0.20433368589813045	-0.033660688698441556	-0.11213681103672933	-0.019892788304183187	-0.21517047453552413	-0.07847874184395424	-0.0485831910127974	0.11558711671859469	0.5064842200949163	-0.19303204293745885	-0.01758188407826969	0.10448483550770478	-0.09072971780261886	0.11223618639615218	-0.1634900506831908	-0.2892312490630062	0.26058615253826223	-0.15776301648022523	0.011580613266505271	0.914457985151	0.361218104761	0.0763307839553	0.747262025795	0.716950551484	0.158583637061	0.978575937473	0.288805731951	0.809021331888	0.501992688725	0.354199901149	0.989287003123	0.881520748982	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:73256811..73256925,-__1330.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:73256811..73256925,-__1330.1.0.0	rs11772456	-0.2173832195692642	-0.13736870384501645	-0.44646833636555894	-0.050507453224937736	-0.10449863481764346	-0.1866765418047521	0.001055727686398759	0.09209749950197826	0.12982936198474926	0.17709443802627683	-0.2804789408424454	-0.05740745805529889	-0.0900593551104595	-0.17503182925423558	-0.048401870411492416	-0.18255928741375504	-0.18437778119061238	-0.15644941586099473	-0.26941068877743246	-0.19596445618615632	-0.1536502862667636	0.04382909349826351	-0.10593710850075336	-0.15339227253140605	-0.09817122653798482	-0.13995976078611028	0.04235139031502863	0.08896683343352405	0.2639090489518039	-0.13387032796567463	-0.05195078104335127	-0.08273414697268036	-0.19702018387255507	-0.24574778576874187	-0.08600026848648575	-0.2830315465270302	0.12708666831103935	-0.04076376848268593	-0.04990040567565076	0.909133064849	0.66743649171	0.397602565759	0.747262025795	0.798631310048	0.935789553219	0.452098798395	0.158583637061	0.628827692687	0.301187193336	0.727009731456	0.648013768535	0.887469842658	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr7:73256811..73256925,-__1330.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:73256811..73256925,-__1330.1.0.0	rs10276377,rs11772456,rs10233067	-0.2173832195692642	-0.13736870384501645	-0.44646833636555894	-0.050507453224937736	-0.10449863481764346	-0.1866765418047521	0.001055727686398759	0.09209749950197826	0.12982936198474926	0.17709443802627683	-0.2804789408424454	-0.05740745805529889	-0.0900593551104595	-0.06705606347861204	0.04984491604740686	-0.10480722193825426	-0.1377528758624047	0.04444398810656236	0.12329578855092915	-0.1922684390285042	0.29620088421109425	0.001254267669572786	0.06286214495663094	0.09998990947681696	0.22284873646407338	0.033238002931275955	0.15032715609065217	0.1872136198924233	0.3416611144273047	-0.08724542263746696	0.14894262292420582	0.3099723303556813	-0.19332416671490296	0.204103384709116	-0.12857509431517647	-0.1142322930696459	0.38046885031926236	0.2802561945193723	0.12329735804173547	0.716953652062	0.248198866138	0.158583637061	0.657696241675	0.677229610811	0.116187990183	0.819442862795	0.85089220831	0.935789553219	0.657696241675	0.216719559135	0.088148079887	0.535622037625	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:26503918..26504032,+__1336.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:26503918..26504032,+__1336.1.0.0	rs61177191	1.9445772411040056	2.25410265524925	2.0223656539254056	1.9311615191070133	1.9619488659754531	2.1194401021020783	1.9799477554585039	2.024570767565854	2.1778474918570043	2.0891303699654857	2.233283069649728	2.3077374961787713	2.0871760823448793	2.178853271651003	2.300905179977142	2.269474243686786	1.9792676309129749	2.169133333449622	2.100013998521754	1.8929273178428967	2.117207108721143	2.1984682195759415	2.146223989478954	2.24066024294897	2.139987524278655	2.144426838420487	0.23427603054699753	0.046802524727891814	0.2471085897613805	0.04810611180596158	0.20718446747416897	-0.019426103580324483	-0.08702043761560718	0.09263634115528863	0.020620727718937193	0.05709361951346814	0.007377173299242035	-0.16774997190011653	0.05725075607560735	0.946473618223	0.76769033028	0.925117039075	0.747262025795	0.727009731456	1.0	0.696989544957	0.476688253492	0.66743649171	0.519249062249	0.840380101088	0.88258056334	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:1102659..1102773,+__1337.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:1102659..1102773,+__1337.1.0.0	rs11250244	3.2015857880906973	3.755689661674962	2.988889038291539	2.9179551407234996	2.9967268305318933	3.003859411454312	2.778849041687329	2.9768887680416345	3.19330391259516	3.0984636741404814	2.9522642603503364	3.2753695727589527	3.094987091695067	2.6603089505861948	3.0090630838914922	2.363088508983312	2.315706330102907	2.6535268687911175	2.547463261932441	2.5199906156561314	2.4642812382392316	2.6125239361458994	2.6220366911561817	2.499126059899985	2.4782240897292365	2.562111636259511	-0.5412768375045025	-0.74662657778347	-0.6258005293082274	-0.6022488106205928	-0.3431999617407757	-0.4563961495218707	-0.25885842603119746	-0.5126075298024029	-0.5807799764492607	-0.47642698298429975	-0.45313820045035147	-0.7971454830297162	-0.5328754554355556	0.0115927323179	0.00133155906714	0.0216734048733	0.0111573361887	0.00544559218276	0.00342117348194	0.00175684955224	0.0719809426143	0.0209174885683	0.00287470049861	0.0028119942632	0.0010031111026	3.30547232993e-18	1	0.990679945954	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.781423548927	2.76998581248e-15	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:1102659..1102773,+__1337.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:1102659..1102773,+__1337.1.0.0	rs547661907	3.2015857880906973	3.755689661674962	2.988889038291539	2.9179551407234996	2.9967268305318933	3.003859411454312	2.778849041687329	2.9768887680416345	3.19330391259516	3.0984636741404814	2.9522642603503364	3.2753695727589527	3.094987091695067	1.806829058560393	1.200360497346996	2.156790050062015	2.3135191781399898	2.1399877066220814	2.0198921500946634	1.8775696019614914	0.8893294657103122	2.604588678578503	1.6173961797851246	1.4284332356599234	1.9199950428472845	1.8312242371140648	-1.3947567295303043	-2.5553291643279663	-0.8320989882295242	-0.6044359625835098	-0.8567391239098119	-0.9839672613596484	-0.9012794397258375	-2.0875593023313224	-0.5887152340166573	-1.4810674943553568	-1.523831024690413	-1.3553745299116682	-1.2637628545810016	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr10:1102659..1102773,+__1337.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:1102659..1102773,+__1337.1.0.0	rs11250244,rs547661907	3.2015857880906973	3.755689661674962	2.988889038291539	2.9179551407234996	2.9967268305318933	3.003859411454312	2.778849041687329	2.9768887680416345	3.19330391259516	3.0984636741404814	2.9522642603503364	3.2753695727589527	3.094987091695067	2.7418692393353283	3.0289236616228976	2.2169875175714573	2.3323625941586066	2.5286929854773725	2.7520240137542804	2.467789167735212	2.6320396311509517	2.5072819264422024	2.6286898669978407	2.490368821871572	2.5738498865084996	2.5750732760521853	-0.45971654875536894	-0.7267660000520646	-0.7719015207200819	-0.585592546564893	-0.4680338450545207	-0.2518353977000314	-0.31105987395211665	-0.34484913689068275	-0.6860219861529577	-0.4697738071426407	-0.4618954384787646	-0.7015196862504531	-0.5199138156428814	0.0209174885683	0.0205467749343	0.0111573361887	0.0240855495486	0.0362033618716	0.0316863885398	0.0156538458129	0.0362033618716	0.00287438022332	0.00210630874131	0.00263248034207	0.00501178746069	3.79890521913e-15	1	1	1	1	1	1	1	1	0.592122326004	0.438112218192	0.539658470123	1	8.62351484742e-13	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:108746008..108746122,+__1338.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:108746008..108746122,+__1338.1.0.0	rs77628266	2.3263116856270307	0.8276534586845322	1.395175968142841	0.10348539117764771	0.6684796523377251	0.9693283224924141	-0.01909748800981805	2.2303941153874196	2.0062812203529687	1.5082097140693196	0.8687849347296317	1.5196292955167285	1.2003863558757033	1.919137001929232	2.0654516248187234	1.7073674833545232	0.38054021480192024	1.5750462426725864	2.6719624410189784	-0.26813114461943166	1.9303389037933263	1.5640740874581889	1.0057983357589169	0.1757421808409159	0.23198818262643536	1.2466096295378597	-0.40717468369779874	1.237798166134191	0.3121915152116821	0.27705482362427253	0.9065665903348613	1.7026341185265643	-0.2490336566096136	-0.3000552115940933	-0.44220713289477986	-0.5024113783104027	-0.6930427538887158	-1.2876411128902931	0.04622327366215614	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:118532891..118533005,+__1343.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:118532891..118533005,+__1343.1.0.0	rs6469696	1.06047508677921	1.0778847658146071	0.8136518402479771	0.80099804678343	1.1037959293928459	1.0034119383840696	0.8775955202536924	1.2103396383658025	0.9250393115913652	1.2029430721495098	1.0747499389036304	1.0193599757106424	1.0141870886980653	0.9179997055300746	1.0894907286021052	0.8630152573865815	0.6692821776323987	0.8846552842206681	0.8087223072798542	0.7436037267517029	0.8427821968203437	1.1252731291939635	0.7682864773802365	1.0199075800354922	0.9761120173248929	0.8924275490131928	-0.1424753812491355	0.011605962787498036	0.04936341713860437	-0.13171586915103128	-0.2191406451721778	-0.19468963110421544	-0.13399179350198942	-0.3675574415454588	0.20023381760259829	-0.4346565947692733	-0.05484235886813815	-0.04324795838574946	-0.12175953968487237	0.320413072024	0.747262025795	0.88258056334	0.914457985151	0.125844655769	0.301187193336	0.536806685117	0.113101776132	0.253741740693	0.0362033618716	0.609889042629	0.648013768535	0.298724201794	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:26223078..26223192,+__1345.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:26223078..26223192,+__1345.1.0.0	rs7073084	-0.8639949287967896	-0.8484531360487462	-0.695195090097716	-1.0305851828754864	-0.5539459871064808	-0.7629859806749154	-0.8017689906666021	-0.7572973460510315	-1.1951837969575547	-0.6383064856365547	-0.9623733833518189	-0.6785361215741861	-0.815718869153157	-1.2030775945500944	-0.9583242890226848	-1.3315069452982273	-0.9511501828667518	-1.1054132521771578	-0.8244909762783164	-0.7207234756372496	-0.8662241654002247	-0.8899566150392187	-0.7199456162467822	-0.7234940724126456	-1.0213134307841059	-0.9429683846427883	-0.3390826657533048	-0.10987115297393868	-0.6363118552005114	0.0794350000087346	-0.551467265070677	-0.06150499560340095	0.08104551502935253	-0.10892681934919324	0.305227181918336	-0.08163913061022754	0.23887931093917325	-0.3427773092099198	-0.1272495154896314	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.188220673538	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.79863356553	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.486540481811	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:26223078..26223192,+__1345.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:26223078..26223192,+__1345.1.0.0	rs188597967	-0.8639949287967896	-0.8484531360487462	-0.695195090097716	-1.0305851828754864	-0.5539459871064808	-0.7629859806749154	-0.8017689906666021	-0.7572973460510315	-1.1951837969575547	-0.6383064856365547	-0.9623733833518189	-0.6785361215741861	-0.815718869153157	-0.5962526750409424	-0.6413934665805014	-0.8355395586928774	-1.174201095184444	-0.8590253457190417	-0.6280776977617586	-0.8966284646868413	-0.6474474875804985	-0.6865412894909872	-0.7826946284319486	-0.7407922132840918	-0.8373885192260835	-0.7771652034733347	0.26774225375584726	0.20705966946824472	-0.14034446859516148	-0.14361591230895754	-0.30507935861256086	0.13490828291315682	-0.0948594740202392	0.10984985847053297	0.5086425074665675	-0.14438814279539391	0.22158117006772704	-0.1588523976518974	0.03855366567982216	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.368322877114	0.757455001208	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.591208103411	0.226876581559	0.935789553219	NA__no_active_tile	0.729021559976	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr10:26223078..26223192,+__1345.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:26223078..26223192,+__1345.1.0.0	rs7073084,rs188597967	-0.8639949287967896	-0.8484531360487462	-0.695195090097716	-1.0305851828754864	-0.5539459871064808	-0.7629859806749154	-0.8017689906666021	-0.7572973460510315	-1.1951837969575547	-0.6383064856365547	-0.9623733833518189	-0.6785361215741861	-0.815718869153157	-0.8501593767204711	-0.959814059329263	-0.9894404458649236	-1.0358126193274542	-0.7032345895116782	-0.9518141179617794	-0.9293134509828176	-0.8273802131517649	-1.1815089209200087	-0.9519762663394632	-0.9181080218846431	-1.005584600749334	-0.9420122235619667	0.01383555207631848	-0.11136092328051683	-0.2942453557672077	-0.005227436451967771	-0.14928860240519737	-0.18882813728686398	-0.12754446031621547	-0.07008286710073341	0.013674876037546024	-0.3136697807029085	0.044265361467175746	-0.327048479175148	-0.1262933544088099	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.390154148302	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0856734395523	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.122117248314	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:108956300..108956414,+__1353.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:108956300..108956414,+__1353.1.0.0	rs2287554	2.234128424403978	2.591031375528317	1.660045874214208	2.1199039019998596	2.2580257264755117	2.4123702376858445	2.084257998090755	1.7473594437501048	2.8650123067609865	2.488616579204633	2.432568743803852	3.4358576024132947	2.3607648511942787	2.1765493722479885	2.4887435970636664	2.078091733150713	1.5800108950790583	2.121751217125505	2.547859685696068	1.5220777459094423	1.7962481890450883	1.9675036830296049	2.2810838838303598	2.483286643829639	1.7670378130384419	2.0675203715871313	-0.05757905215598935	-0.10228777846465054	0.41804585893650525	-0.5398930069208012	-0.13627450935000684	0.13548944801022333	-0.5621802521813126	0.04888874529498355	-0.8975086237313816	-0.20753269537427332	0.05071790002578691	-1.6688197893748529	-0.29324447960714745	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:149969815..149969929,-__1354.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:149969815..149969929,-__1354.1.0.0	rs190331938	0.6815077058541542	0.1039602550223187	0.42822819721964417	1.4626673381444724	0.6316452786051863	-0.058387429289840795	0.6574620427663727	-0.6286213813710289	0.6948303999629686	-1.0175160921913984	1.8572689577992825	0.5580880296378312	0.4475944418466636	0.44303562917265055	0.9843344776162132	1.0379579294842396	1.4090533247842334	0.8302178512020228	0.9036283878166254	1.4303906092986611	1.7893177235175908	1.423432885275842	0.2643498740911522	1.5685547710166166	0.4322717690441957	1.0430454360266703	-0.23847207668150366	0.8803742225938944	0.6097297322645954	-0.053614013360238966	0.19857257259683658	0.9620158171064661	0.7729285665322885	2.4179391048886196	0.7286024853128734	1.2818659662825507	-0.2887141867826659	-0.12581626059363554	0.5954509941800067	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:220325375..220325489,+__1360.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:220325375..220325489,+__1360.1.0.0	rs3755061	1.1277346460521325	0.9946648925708813	0.7037123813555597	1.2426556239447146	1.3035105995783594	0.29570129124403793	1.250678133138963	0.7030739007087123	0.773383305264413	0.6798404274656009	1.1000695615625833	0.6896782822833174	0.9053919204307729	0.5694352202962017	0.7580892820568522	0.7902646092808994	0.6442713730553599	0.8004538978729248	0.8266209325358103	0.4237188997255285	0.7437266986186297	0.7723737002476159	0.8906394522140676	1.2118084347295661	0.9800092214189096	0.7842843101710303	-0.5582994257559307	-0.2365756105140291	0.08655222792533968	-0.5983842508893548	-0.5030567017054346	0.5309196412917723	-0.8269592334134344	0.04065279790991738	-0.0010096050167971438	0.21079902474846668	0.11173887316698283	0.29033093913559216	-0.12110761025974252	0.229462716724	0.696989544957	0.925117039075	0.510582765025	0.0240855495486	0.476688253492	0.0426112802219	0.76769033028	0.682141761946	0.79863356553	0.829896383209	0.493479697885	0.553468111148	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:19431574..19431688,+__1361.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:19431574..19431688,+__1361.1.0.0	rs150821427	3.184139987598739	3.84816464007449	3.1302783123937807	2.845055971866482	3.3329636781773124	3.4394509675219713	3.157608616009264	3.666953696836868	3.415803810870119	3.355936450512397	3.4951546211147013	3.4733967081776544	3.3620756217628145	2.829429600905115	3.2905758536841443	2.9822049373521717	2.674155693627644	2.9034289006576914	3.001781579546007	2.9015463590285897	3.1740211342546	3.189786387831482	3.2026810808896187	3.206435630575018	2.849077839559378	3.0170937498259547	-0.35471038669362365	-0.5575887863903457	-0.148073375041609	-0.1709002782388378	-0.429534777519621	-0.43766938797596433	-0.2560622569806741	-0.49293256258226803	-0.22601742303863714	-0.1532553696227783	-0.2887189905396834	-0.6243188686182766	-0.34498187193686	0.0439994408777	0.0856734395523	0.716953652062	0.657696241675	0.00406065558642	0.0140036728837	0.270885072145	0.0111573361887	0.347268461228	0.122558611289	0.132622250874	0.0232568344756	1.43359143204e-05	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0120134962005	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:6745090..6745204,-__1367.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:6745090..6745204,-__1367.1.0.0	rs7298989	-0.2820319728407069	-0.4248351507551409	-0.5571851752233936	-0.6256153963720066	-0.49741386072591276	-0.5411254479258459	-1.1122613169176923	-0.8979907761384142	-0.6596754012892645	-0.5446891403482407	-0.965733644795018	-0.6552343580545837	-0.646982636782185	-0.4059511894751535	-0.6593127655621851	-0.7178028846684468	-0.9219785215249248	-0.6369656248253659	-0.7626722342300589	-1.0196252239717187	-1.1264659010000688	-0.9581702637936876	-0.45190759610606746	-0.5224496791647448	-0.7932547349305725	-0.7480463849377496	-0.1239192166344466	-0.2344776148070442	-0.16061770944505316	-0.2963631251529182	-0.13955176409945313	-0.22154678630421298	0.09263609294597352	-0.22847512486165467	-0.29849486250442314	0.09278154424217322	0.44328396563027317	-0.13802037687598878	-0.10106374815556458	0.79863356553	0.175053819161	0.375508523987	NA__no_active_tile	0.38645652471	0.554657938956	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.242741268695	0.727009731456	0.809021331888	NA__no_active_tile	0.530228658017	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	1	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chrX:114827744..114827858,+__1368.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chrX:114827744..114827858,+__1368.1.0.0	rs12847396	-1.7823771608776593	-1.5039384773872155	-1.1327423060572543	-1.4594217188667833	-1.793606339736277	-1.8395837882715824	-1.297061060295458	-1.4645254407813855	-1.8176904838465964	-1.3477920618633916	-1.6033182876115821	-1.7002916426227817	-1.5618623973514971	-1.81706565296143	-1.1720244305331966	-1.2348792033942402	-1.8972719261689108	-1.86652247066506	-1.4055117754194797	-2.1399151408150567	-1.713479653252259	-1.5860698379733558	-1.766119383668697	-1.9548607773587552	-1.8518440403074492	-1.7004636910431572	-0.03468849208377067	0.33191404685401893	-0.10213689733698583	-0.43785020730212754	-0.07291613092878313	0.43407201285210273	-0.8428540805195988	-0.24895421247087346	0.2316206458732406	-0.4183273218053054	-0.35154248974717306	-0.15155239768466755	-0.13860129369166027	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr14:100772772..100772886,-__1371.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:100772772..100772886,-__1371.1.0.0	rs75432828	-0.6193770176250291	0.07884392188979941	-0.2617129186460876	-0.232764529217387	-0.8956355368600297	-0.09082680877769933	0.9463398086821204	1.0153924209940814	-1.7260463580065881	-0.03598190608990737	2.4093260344149594	0.6033662732974504	0.09924361533797359	1.1246302348381174	0.14546053196075365	2.3424865345703174	0.8932057063040296	2.0393734381084507	1.1475106166234648	1.01334897628724	-0.8314960018137971	1.3711274428076046	2.8829092255937074	2.500771296122049	0.8394881451772761	1.2890680122149345	1.7440072524631465	0.06661661007095424	2.6041994532164052	1.1259702355214167	2.9350089749684805	1.238337425401164	0.06700916760511966	-1.8468884228078786	3.0971738008141925	2.9188911316836146	0.09144526170708955	0.2361218718798257	1.189824396876961	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr14:100772772..100772886,-__1371.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:100772772..100772886,-__1371.1.0.0	rs539171055	-0.6193770176250291	0.07884392188979941	-0.2617129186460876	-0.232764529217387	-0.8956355368600297	-0.09082680877769933	0.9463398086821204	1.0153924209940814	-1.7260463580065881	-0.03598190608990737	2.4093260344149594	0.6033662732974504	0.09924361533797359	1.7256054179491152	0.970232958927493	0.9132640690601598	0.11817366973352343	-0.05587618685103651	-0.7174287220463105	0.9219261761059828	-0.5550102168161314	0.13958965645245128	-0.3334551253475371	0.9026137258996452	0.4211260189126351	0.37089678683166594	2.344982435574144	0.8913890370376936	1.1749769877062475	0.35093819895091044	0.8397593500089933	-0.6266019132686111	-0.0244136325761376	-1.5704026378102127	1.8656360144590394	-0.2974732192576297	-1.5067123085153142	-0.18224025438481528	0.27165317149369234	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr14:100772772..100772886,-__1371.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:100772772..100772886,-__1371.1.0.0	rs75432828,rs539171055	-0.6193770176250291	0.07884392188979941	-0.2617129186460876	-0.232764529217387	-0.8956355368600297	-0.09082680877769933	0.9463398086821204	1.0153924209940814	-1.7260463580065881	-0.03598190608990737	2.4093260344149594	0.6033662732974504	0.09924361533797359	0.40297332470356345	0.08645517494371446	0.5114347263831184	-0.7199749030418277	-0.006754034019809581	-0.7867211916867343	-0.14007812892970478	-0.406628171556389	-0.17044720421670972	0.25162117853710386	-2.0959755557493165	1.2210278031140278	-0.15442224845991362	1.0223503423285925	0.007611253053915051	0.773147645029206	-0.48721037382444066	0.8888815028402202	-0.6958943829090349	-1.0864179376118253	-1.4220205925504703	1.5555991537898783	0.28760308462701123	-4.505301590164276	0.6176615298165774	-0.2536658637978872	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr15:90744482..90744596,+__1374.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:90744482..90744596,+__1374.1.0.0	rs7173647	1.5873852469130032	1.6975157656036728	1.4407848850585663	1.6652884244535917	1.4983927015666227	2.108119752581985	1.9932014782446408	1.3485604867977636	1.7432488538824873	1.779398312443956	2.0094657228035904	1.7472904906592794	1.7182210100840967	1.5352675740262947	1.8953049108059872	1.85811261492416	1.6271123385001325	2.057806699125023	1.4161478239314762	1.500852741290331	1.6029821754020783	1.1382075939374308	1.72336489505701	1.7564060991321377	1.6948469667421833	1.650534369406187	-0.052117672886708544	0.1977891452023144	0.41732772986559374	-0.03817608595345923	0.5594139975584003	-0.6919719286505088	-0.4923487369543098	0.2544216886043147	-0.6050412599450565	-0.056033417386946116	-0.2530596236714526	-0.05244352391709617	-0.06768664067790957	0.989287003123	0.967868733231	0.276771967065	NA__not_enough_barcodes	0.30750859871	NA__not_enough_barcodes	0.914457985151	0.706946403854	0.361218104761	0.706946403854	0.60051573606	0.662555609067	0.967425705441	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr15:90744482..90744596,+__1374.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:90744482..90744596,+__1374.1.0.0	rs7173647,rs7175006	1.5873852469130032	1.6975157656036728	1.4407848850585663	1.6652884244535917	1.4983927015666227	2.108119752581985	1.9932014782446408	1.3485604867977636	1.7432488538824873	1.779398312443956	2.0094657228035904	1.7472904906592794	1.7182210100840967	1.6793099581284068	2.04093101801749	1.6619003647718276	1.5174117585755025	1.8660250229480635	1.912773559161307	1.7634937853294064	1.9389756474800723	1.9738290290591207	1.9924806725972264	1.9791799782452744	1.9713645546701386	1.8581396124153196	0.09192471121540358	0.34341525241381743	0.2211154797132613	-0.14787666587808923	0.36763232138144075	-0.19534619342067794	-0.2297076929152344	0.5904151606823087	0.23058017517663343	0.2130823601532703	-0.030285744558316008	0.22407406401085916	0.13991860233122308	0.317148697424	0.66743649171	0.706946403854	NA__not_enough_barcodes	0.88258056334	NA__not_enough_barcodes	0.276771967065	0.777966336216	0.476688253492	0.809021331888	0.248198866138	0.405136064622	0.710880941709	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:64173609..64173723,+__1375.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:64173609..64173723,+__1375.1.0.0	rs75517044	-0.13882936007842192	-0.020640916440215516	-0.16075047060816974	-0.29550520720951323	-0.21453005284544704	-0.061594437074057234	-0.3714156937517468	0.11247072250614512	-0.23882079227223846	-0.31330802907716726	-0.05836486866891589	-0.16587886260257229	-0.16059733067686002	-0.07025467801501088	0.2645303197238613	0.2829448415924551	-0.11564760977577306	0.10255351961208577	0.21303501837206146	-0.002532635431994057	-0.02816159549733433	0.10519171781753946	0.07714354708422137	0.19526916143431428	0.24867664670896314	0.10606235446878244	0.06857468206341104	0.28517123616407686	0.44369531220062486	0.1798575974337402	0.3170835724575328	0.2746294554461187	0.36888305831975277	-0.14063231800347945	0.3440125100897779	0.39045157616138865	0.25363403010323016	0.4145555093115354	0.2666596851456425	0.175053819161	0.0499505848864	0.132622250874	0.37190218233	0.055697973287	0.452098798395	0.946473618223	0.829894465792	0.0856734395523	0.0719809426143	0.0869000376912	0.0209174885683	0.00335184152724	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:19577983..19578097,-__1377.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:19577983..19578097,-__1377.1.0.0	rs2294943	2.66005953608194	2.0101245016028693	1.7838753706374617	1.5051736236247697	2.517938037589828	1.7590431457825242	1.6811399410504317	2.1329014787198304	1.4725644782511464	2.3990000916573524	1.5165027753817553	0.6865203503331112	1.8437369442260854	3.5671959219850278	3.9318065481660343	3.5314827283377315	3.3717085857778404	3.562892595104679	3.574152942916299	3.224019048426021	3.646822753890652	3.643397926382865	3.533175003022282	3.751929682300288	3.811151142503168	3.595811239901074	0.9071363859030876	1.921682046563165	1.7476073577002698	1.8665349621530707	1.044954557514851	1.8151097971337748	1.5428791073755894	1.5139212751708215	2.1708334481317184	1.1341749113649295	2.2354269069185326	3.124630792170057	1.7520742956749888	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:19577983..19578097,-__1377.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:19577983..19578097,-__1377.1.0.0	rs6680255	2.66005953608194	2.0101245016028693	1.7838753706374617	1.5051736236247697	2.517938037589828	1.7590431457825242	1.6811399410504317	2.1329014787198304	1.4725644782511464	2.3990000916573524	1.5165027753817553	0.6865203503331112	1.8437369442260854	3.387921924984603	3.7198533408407575	3.3500936508420063	3.3398997003779636	3.5937058927297927	3.777412286966255	3.475290826168677	3.8636652200732815	3.4213832008721017	3.806712486986452	3.629695864078101	3.791483707245385	3.5964265085137814	0.727862388902663	1.7097288392378882	1.5662182802045446	1.8347260767531939	1.0757678551399645	2.0183691411837312	1.794150885118245	1.7307637413534511	1.9488187226209552	1.4077123953290998	2.1131930886963457	3.1049633569122737	1.7526895642876965	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:19577983..19578097,-__1377.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:19577983..19578097,-__1377.1.0.0	rs17523685	2.66005953608194	2.0101245016028693	1.7838753706374617	1.5051736236247697	2.517938037589828	1.7590431457825242	1.6811399410504317	2.1329014787198304	1.4725644782511464	2.3990000916573524	1.5165027753817553	0.6865203503331112	1.8437369442260854	2.731768932737027	3.1948675812820726	2.751325920234814	2.6658646525014484	3.004631802141751	2.6711210525394424	3.1610774952908542	3.1597759871674387	3.0172462413695738	2.9260304995988307	3.054363411887309	3.108313280288133	2.953865571419891	0.0717093966550868	1.1847430796792033	0.9674505495973524	1.1606910288766787	0.4866937645519229	0.9120779067569182	1.4799375542404225	1.0268745084476083	1.5446817631184273	0.5270304079414783	1.5378606365055538	2.421792929955022	1.1101286271938062	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr1:19577983..19578097,-__1377.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:19577983..19578097,-__1377.1.0.0	rs2294943,rs6680255,rs17523685	2.66005953608194	2.0101245016028693	1.7838753706374617	1.5051736236247697	2.517938037589828	1.7590431457825242	1.6811399410504317	2.1329014787198304	1.4725644782511464	2.3990000916573524	1.5165027753817553	0.6865203503331112	1.8437369442260854	3.1663787790605507	3.7117214197410777	2.829757391264657	2.702343766860806	3.0228515960251006	3.0043283628905684	2.9666621924453818	3.2122477727698664	3.213783295478941	3.3009448484185446	3.02367090425551	3.214068573213679	3.114063241868724	0.5063192429786105	1.7015969181382085	1.0458820206271953	1.1971701432360362	0.5049135584352724	1.2452852171080442	1.28552225139495	1.079346294050036	1.7412188172277947	0.9019447567611922	1.5071681288737548	2.5275482228805677	1.2703262976426384	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr20:44441554..44441668,+__1379.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:44441554..44441668,+__1379.1.0.0	rs45486998	-0.911138570888666	-0.7658351297409701	-0.8657778282813358	-1.1446555446666895	-1.1564525501940957	-1.1283046935396492	-1.212333118214116	-0.8773062226653526	-1.3512909832815625	-1.010608137017738	-0.8516365071724601	-1.0960581780724277	-1.0309497886445884	-1.1430117506528084	-0.726608518242454	-1.2735469837275228	-1.0027306040219337	-1.0476660331831198	-0.9252921856706171	-0.8091683588636869	-0.9950416180309478	-1.0144344778220993	-1.0429335410100289	-1.224066298466735	-0.7192881098380195	-0.9936490399608312	-0.23187317976414235	0.03922661149851614	-0.4077691554461871	0.1419249406447558	0.10878651701097586	0.20301250786903213	0.40316475935042906	-0.11773539536559519	0.3368565054594632	-0.03232540399229089	-0.3724297912942749	0.3767700682344082	0.0373007486837575	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr2:264820..264934,+__1382.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:264820..264934,+__1382.1.0.0	rs111341344	1.5770089841047727	1.8096312222441384	1.1287335682812139	1.0247972682500477	1.7134692358227597	2.1793138460306003	1.6641191629705183	1.6126263367034348	2.1786686172442256	1.95349463166648	1.538445501828953	1.7561073312059599	1.678034642196092	-0.4474214108607386	0.8474139258194017	-0.2574294144818752	-0.025357417268973073	-0.05587618685103651	-0.4538284336692322	-0.08443379293830416	0.961009181697386	0.44717468682814937	0.1751251266758974	0.0040602578916876615	1.0808737420322965	0.1826091887395549	-2.0244303949655116	-0.9622172964247367	-1.386162982763089	-1.0501546855190207	-1.7693454226737961	-2.6331422796998325	-1.7485529559088224	-0.6516171550060488	-1.7314939304160761	-1.7783695049905828	-1.5343852439372652	-0.6752335891736634	-1.4954254534565372	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr2:264820..264934,+__1382.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:264820..264934,+__1382.1.0.0	rs4854300	1.5770089841047727	1.8096312222441384	1.1287335682812139	1.0247972682500477	1.7134692358227597	2.1793138460306003	1.6641191629705183	1.6126263367034348	2.1786686172442256	1.95349463166648	1.538445501828953	1.7561073312059599	1.678034642196092	2.3185615899437635	1.1043853264636911	0.6770183275249076	0.04692269719081005	2.813818596345578	2.6063364647438347	1.5895460159090673	1.2660535793261818	1.9386108703193887	1.0101268503519198	1.1404922424569286	2.1139854554366204	1.552154834667724	0.7415526058389907	-0.7052458957804473	-0.4517152407563062	-0.9778745710592376	1.1003493605228185	0.42702261871323444	-0.07457314706145102	-0.346572757377253	-0.24005774692483683	-0.9433677813145602	-0.3979532593720243	0.35787812423066057	-0.12587980752836767	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr2:264820..264934,+__1382.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:264820..264934,+__1382.1.0.0	rs111341344,rs4854300	1.5770089841047727	1.8096312222441384	1.1287335682812139	1.0247972682500477	1.7134692358227597	2.1793138460306003	1.6641191629705183	1.6126263367034348	2.1786686172442256	1.95349463166648	1.538445501828953	1.7561073312059599	1.678034642196092	1.287302322439787	1.1412823151147111	1.099496277198663	0.5026699411954361	0.5603322431362565	-0.10059820641608877	0.6574620427663727	0.17127851488009824	0.5565926444365946	1.3691223168824385	1.3039680659854074	0.5777333189198346	0.7605534830449593	-0.2897066616649857	-0.6683489071294273	-0.02923729108255091	-0.5221273270546116	-1.1531369926865032	-2.279912052446689	-1.0066571202041457	-1.4413478218233367	-1.622075972807631	-0.5843723147840416	-0.23447743584354552	-1.1783740122861253	-0.917481159151133	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:186732868..186732982,-__1385.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:186732868..186732982,-__1385.1.0.0	rs35656124	-1.4931669996408294	-1.1593809181536392	-1.4807674556054196	-0.9632310556350274	-1.560169126994725	-1.4444235296505643	-1.687657963543746	-1.6840121393546723	-1.087478481482525	-1.2183017778797085	-1.377097647837015	-1.4625510710889402	-1.3848531805722344	-0.9793831819315828	-1.015981798631617	-1.5189724201046926	-1.3531669416117145	-1.483766369810875	-1.1033870536327886	-1.255899015094502	-1.1981574699591262	-1.054392583605091	-1.0357814699865981	-1.653028465197036	-1.3991977807496352	-1.2542595458596049	0.5137838177092466	0.1433991195220221	-0.03820496449927302	-0.38993588597668705	0.07640275718385015	0.34103647601777576	0.4317589484492441	0.4858546693955461	0.03308589787743399	0.18252030789311036	-0.275930817360021	0.06335329033930504	0.13059363471262944	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:119606468..119606582,+__1392.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:119606468..119606582,+__1392.1.0.0	rs17323034	3.327654530233478	3.8116340098283543	3.1987448213233862	2.8811329537597508	3.269775524316522	3.2468169251261174	2.9951226064866	3.376488874766177	3.3111110410022424	3.4762572922102906	3.2531308958267187	3.3270614115260537	3.2895775738671413	3.215115879117912	3.7582655565989054	3.012621098934976	2.8871233683314803	3.200938380237189	3.1665083054276706	2.9954360372232705	3.2098365569341785	3.3642684155159817	3.1879257458878785	3.259122308284776	3.3628869378965858	3.218337382532567	-0.11253865111556571	-0.05336845322944894	-0.18612372238841024	0.005990414571729552	-0.06883714407933272	-0.08030861969844683	0.0003134307366705613	-0.16665231783199852	0.05315737451373925	-0.2883315463224121	0.005991412458057344	0.035825526370532046	-0.07124019133457386	0.777966336216	0.727009731456	0.288805731951	0.60051573606	0.460214637573	0.405136064622	0.354199901149	0.63839046467	0.809021331888	0.188220673538	0.468411351413	0.737113058664	0.64112476356	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr4:119606468..119606582,+__1392.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:119606468..119606582,+__1392.1.0.0	rs17323034,rs17050450	3.327654530233478	3.8116340098283543	3.1987448213233862	2.8811329537597508	3.269775524316522	3.2468169251261174	2.9951226064866	3.376488874766177	3.3111110410022424	3.4762572922102906	3.2531308958267187	3.3270614115260537	3.2895775738671413	3.32758583525845	3.7160967718519453	3.213940203550995	2.7739619178305803	3.367689492172083	3.2386632907866946	3.0878076373953833	3.406421444730429	3.441260963784816	3.3609558810903413	3.3600269897194055	3.5656530314386004	3.321671954967478	-6.869497502792754e-05	-0.095537237976409	0.015195382227608967	-0.10717103592917043	0.09791396785556117	-0.008153634339422844	0.09268503090878344	0.029932569964251865	0.13014992278257376	-0.11530141111994929	0.10689609389268684	0.23859161991254663	0.0320943811003361	0.967868733231	0.747262025795	0.706946403854	0.390154148302	0.88258056334	0.757455001208	0.476688253492	0.88258056334	0.747262025795	0.829896383209	0.914457985151	0.925117039075	0.998421650706	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:4458644..4458758,-__1394.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:4458644..4458758,-__1394.1.0.0	rs7219079	1.0812420683573787	1.2288084251390545	1.4396182912907862	1.2575687518471907	1.4171204170242895	1.5354674256287542	1.5045206857458886	1.4364072928816305	1.5669554372298433	1.488302820560606	1.1635388374896982	1.7322563847486734	1.4043172364953158	1.4237062556574795	1.5618770963888402	1.215733976588331	1.326116613104582	1.2746273594727393	1.236180047811122	1.1747154672659756	1.439904874660922	1.290643800190792	1.3995677602182912	1.569715718872545	1.5864741407726135	1.3749385925836861	0.34246418730010086	0.3330686712497857	-0.22388431470245518	0.06854786125739132	-0.14249305755155017	-0.29928737781763215	-0.32980521847991295	0.003497581779291492	-0.27631163703905126	-0.08873506034231471	0.4061768813828468	-0.14578224397605988	-0.029378643911630014	0.572794651112	0.259370210024	0.48504462162	0.326996172605	0.721972635732	0.519249062249	0.468411351413	0.861430881609	0.727009731456	0.871992830865	0.150801701171	0.687084607526	0.707450396246	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:8834116..8834230,+__1396.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:8834116..8834230,+__1396.1.0.0	ss1388081888	-0.8268326542147898	-0.63760458746333	-0.6550916853322143	-0.6340536153402689	-0.5322395912367518	-0.5822923321699518	-0.9528624910586734	-0.8203534416884912	-0.6073462026323292	-0.7964338755228008	-0.5986967576530688	-0.5395570552902533	-0.6819470241335769	-1.035220062262081	-0.9320023078706058	-0.8845863054885101	-0.8583141182174329	-0.8356073120406681	-1.0796431630498418	-1.0653633171298145	-0.6871366322025262	-0.8288665443419445	-0.909002297457816	-1.0318631383806731	-0.777589657523778	-0.9104329046638077	-0.20838740804729128	-0.29439772040727574	-0.22949462015629585	-0.22426050287716393	-0.3033677208039163	-0.49735083087988996	-0.11250082607114109	0.13321680948596504	-0.22152034170961532	-0.11256842193501526	-0.43316638072760427	-0.23803260223352463	-0.2284858805302307	NA__no_active_tile	0.0399413890972	0.166665831608	0.221756412245	0.0316863885398	0.0232568344756	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.119339994516	0.248198866138	0.00313710581496	0.375513989452	2.24799017398e-05	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	0.018838157658	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:8834116..8834230,+__1396.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:8834116..8834230,+__1396.1.0.0	ss1388081889	-0.8268326542147898	-0.63760458746333	-0.6550916853322143	-0.6340536153402689	-0.5322395912367518	-0.5822923321699518	-0.9528624910586734	-0.8203534416884912	-0.6073462026323292	-0.7964338755228008	-0.5986967576530688	-0.5395570552902533	-0.6819470241335769	-0.6202693854247643	-0.7367081460804247	-0.757244970641457	-0.850675367030015	-0.5197551976270456	-0.5938306330428461	-0.823886030952802	-0.5692908317378451	-0.7936742664706276	-0.6566892994776596	-0.4926930332606441	-0.6933779518518531	-0.6756745927998319	0.2065632687900255	-0.09910355861709463	-0.10215328530924273	-0.21662175168974607	0.012484393609706212	-0.011538300872894314	0.12897646010587138	0.2510626099506461	-0.18632806383829836	0.13974457604514112	0.10600372439242473	-0.1538208965615998	0.0062724313337449294	NA__no_active_tile	0.677233097055	0.79863356553	0.79863356553	0.63839046467	1.0	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.48504462162	0.563691144959	0.819442862795	0.8931878581	1.0	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr12:8834116..8834230,+__1396.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:8834116..8834230,+__1396.1.0.0	ss1388081888,ss1388081889	-0.8268326542147898	-0.63760458746333	-0.6550916853322143	-0.6340536153402689	-0.5322395912367518	-0.5822923321699518	-0.9528624910586734	-0.8203534416884912	-0.6073462026323292	-0.7964338755228008	-0.5986967576530688	-0.5395570552902533	-0.6819470241335769	-0.9243830839182388	-0.4853493979794957	-0.3613292731737561	-0.6594530246237476	-0.563142749047409	-0.5866126380810548	-0.7410765823966898	-0.45448117716950076	-0.4569787775081059	-0.6054573318616272	-0.6983299068891107	-0.5189238123090396	-0.587959812913148	-0.09755042970344896	0.15225518948383432	0.29376241215845816	-0.025399409283478613	-0.030903157810657222	-0.004320305911102995	0.21178590866198355	0.36587226451899046	0.1503674251242233	0.19097654366117356	-0.09963314923604183	0.020633242981213717	0.09398721122042897	NA__no_active_tile	0.657696241675	0.333666485083	0.737113058664	0.829896383209	0.935789553219	0.460214637573	0.107123399254	0.90381429355	0.197395731844	0.619326784864	0.545696106059	0.784716492519	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chrX:100662878..100662992,-__1398.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chrX:100662878..100662992,-__1398.1.0.0	rs2071225	-0.2537950047708465	0.018384847911940838	-0.1613532287772819	-0.15434013182132164	-0.05008540223372265	-0.12498109282178343	-0.1582392031521018	-0.3889527110682685	-0.26948400913826165	-0.28692073452347544	-0.32555429067595576	-0.12312657049437715	-0.18987062763045462	-0.8735530277343975	-0.8530489173801439	-0.9150474364266401	-0.966834772736112	-0.8442685619745063	-0.6960559599296776	-0.8888953573090816	-0.5300267520600126	-1.0020653695792274	-0.8953767827859813	-0.9136411559850541	-0.9727218943827947	-0.8626279990236357	-0.619758022963551	-0.8714337652920847	-0.7536942076493582	-0.8124946409147903	-0.7941831597407836	-0.5710748671078942	-0.7306561541569798	-0.1410740409917441	-0.7325813604409658	-0.6084560482625059	-0.5880868653090984	-0.8495953238884175	-0.6727573713931813	0.00183882744533	0.000210645996816	0.00460947122508	0.00287470049861	1.4133498883e-07	0.00567496309713	0.000161276729747	0.088148079887	0.000320085853942	0.000531799681309	7.89440729856e-05	3.85703616239e-06	3.33077725032e-30	1	0.156720621631	1	1	0.000109110611377	1	0.119183503283	1	0.247426365097	0.417462749828	0.0607079921259	0.0030046311705	2.79119133577e-27	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chrX:100662878..100662992,-__1398.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chrX:100662878..100662992,-__1398.1.0.0	rs3027585	-0.2537950047708465	0.018384847911940838	-0.1613532287772819	-0.15434013182132164	-0.05008540223372265	-0.12498109282178343	-0.1582392031521018	-0.3889527110682685	-0.26948400913826165	-0.28692073452347544	-0.32555429067595576	-0.12312657049437715	-0.18987062763045462	-0.3877328667403852	-0.49184184896989125	-0.6309178288830317	-0.4700113894627816	-0.5072843010314986	-0.5744905697428958	-0.7080308613359183	-0.5984522578622873	-0.6383258041238914	-0.3681190951251325	-0.37588844464865434	-0.45410314743843344	-0.5170998679470669	-0.13393786196953872	-0.5102266968818321	-0.46956460010574985	-0.31567125764146	-0.4571988987977759	-0.44950947692111237	-0.5497916581838165	-0.20949954679401878	-0.36884179498562975	-0.08119836060165708	-0.05033415397269858	-0.3309765769440563	-0.3272292403166122	0.527990680582	0.175053819161	0.219217048308	0.444064484515	0.0145358169752	0.0619890035232	0.0267271087754	0.519249062249	0.107123399254	0.493479697885	0.382791178922	0.242741268695	0.00270054038551	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chrX:100662878..100662992,-__1398.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chrX:100662878..100662992,-__1398.1.0.0	rs2071225,rs3027585	-0.2537950047708465	0.018384847911940838	-0.1613532287772819	-0.15434013182132164	-0.05008540223372265	-0.12498109282178343	-0.1582392031521018	-0.3889527110682685	-0.26948400913826165	-0.28692073452347544	-0.32555429067595576	-0.12312657049437715	-0.18987062763045462	-0.9525276098736889	-1.0726285709849928	-1.099074119097912	-1.1691060907723168	-1.131933587635065	-0.9046325753329492	-1.1357217377090867	-0.7495189557505718	-0.9691677139461075	-0.67616569150386	-0.6656189196264686	-0.9904053819259955	-0.9597084128465845	-0.6987326051028424	-1.0910134188969336	-0.9377208903206302	-1.0147659589509952	-1.0818481854013422	-0.7796514825111658	-0.9774825345569849	-0.3605662446823033	-0.6996837048078458	-0.3892449569803845	-0.3400646289505128	-0.8672788114316183	-0.7698377852161299	0.00544559218276	0.000956291509096	0.00230397578633	0.00441948685714	1.35890743059e-05	0.00501178746069	0.00220311126631	0.0638899216795	0.00275115621019	0.136115392203	0.162586850726	0.00275115621019	3.21669196314e-18	1	0.193170884837	0.458491181479	0.835283016	0.0027857602327	1	0.440622253262	1	0.566738179299	1	1	0.566738179299	7.30189075633e-16	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:4987114..4987228,-__1401.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:4987114..4987228,-__1401.1.0.0	rs112664243	-1.1114211866801331	-0.9733877713187259	0.15583442368412803	0.29131010200699153	0.05767086068422195	-1.2915406920541888	-0.4729527943250409	0.5696877402704703	-1.1733086802533963		-0.1663384307633499	-1.439940016653072	-0.5049442223092814	0.7107781265035202	0.8276534586845322	0.9160681311361778	0.7742476151539532	1.7271003248189107	1.0624427080786296	-0.4070331422383752	0.7241532667023439	0.3382266931608102	-0.40218987204711243	0.09698399543865352	2.001257022725523	0.6974740273431305	1.8221993131836534	1.801041230003258	0.7602337074520498	0.4829375131469617	1.6694294641346887	2.3539834001328184	0.06591965208666567	0.1544655264318736	1.5115353734142065		0.2633224262020034	3.4411970393785953	1.302387695051525	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:2587909..2588023,+__1404.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:2587909..2588023,+__1404.1.0.0	rs191389305														0.7969093020244431	1.6683662160777024	1.610205811726269	1.1494552478149562	1.4468316548486433	1.371347254666048	1.1349437505951256	1.3469581552597534	0.4041559362216304	1.3092068738924216	0.9307354778951904	0.7961103383825193	1.1637688349503919														NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:50017127..50017241,+__1405.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:50017127..50017241,+__1405.1.0.0	rs138529836	3.453218819979491	2.7638392554285036	1.3164642697641704	1.9139305650701115	1.4539232144782943	1.11571452238047	1.687488991587522	2.9581431723734894	1.2754800244379756	-0.05781231709855485	1.917102734591157	0.020119684437406544	1.6514677447858366	-0.11195768414397753	-0.48117036362953286	-1.7723748982150234	-0.172595390163558	-1.1960363286054105	-1.1380134258275054	-0.17299639833833658	-0.7957705045564353	-1.3103363790138018	0.5191639389870558	-0.1864164287703126	-1.6304920695405227	-0.7040829943181134	-3.5651765041234684	-3.2450096190580364	-3.088839167979194	-2.0865259552336695	-2.649959543083705	-2.2537279482079757	-1.8604853899258584	-3.753913676929925	-2.585816403451777	0.5769762560856107	-2.1035191633614696	-1.6506117539779293	-2.3555507391039496	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:5932135..5932249,+__1408.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:5932135..5932249,+__1408.1.0.0	rs2253422	1.0586360192869404	1.6862340785339416	1.7533160021631218	0.1383727353344874	1.6689364163779283	2.1614704395544764	0.19362833974032576	1.9052172937390395	0.7115811904891314	0.23116239183779175	0.6227127983059976	0.8705012393280477	1.0834807453909356	0.8412295908846534	1.2963006144426568	1.0005183393509824	1.3458614377803897	0.44128397579504186	1.011768788449065	1.0980390206091253	0.5880950563680517	0.6216465489843508	0.7245563494127006	0.5923734691379171	1.8954532852700958	0.9547605397070859	-0.21740642840228697	-0.3899334640912848	-0.7527976628121393	1.2074887024459022	-1.2276524405828866	-1.1497016511054114	0.9044106808687995	-1.3171222373709877	-0.08993464150478059	0.4933939575749089	-0.030339329168080464	1.0249520459420483	-0.1287202056838499	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:5932135..5932249,+__1408.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:5932135..5932249,+__1408.1.0.0	rs188143833	1.0586360192869404	1.6862340785339416	1.7533160021631218	0.1383727353344874	1.6689364163779283	2.1614704395544764	0.19362833974032576	1.9052172937390395	0.7115811904891314	0.23116239183779175	0.6227127983059976	0.8705012393280477	1.0834807453909356	1.0423648782135235	0.9133090592585308	0.22247610088364256	0.8631564649517115	1.2021278862867506	1.7855792652564388	0.8201484765099959	1.7902668314258434	0.25206538623247743	0.12919253132890166	0.08234879021570148	-0.5798219129789292	0.7102678131320492	-0.016271141073416873	-0.7729250192754108	-1.5308399012794793	0.7247837296172241	-0.46680853009117773	-0.37589117429803753	0.6265201367696701	-0.11495046231319606	-0.45951580425665395	-0.10196986050889009	-0.540364008090296	-1.4503231523069768	-0.3732129322588867	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr10:5932135..5932249,+__1408.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:5932135..5932249,+__1408.1.0.0	rs2253422,rs188143833	1.0586360192869404	1.6862340785339416	1.7533160021631218	0.1383727353344874	1.6689364163779283	2.1614704395544764	0.19362833974032576	1.9052172937390395	0.7115811904891314	0.23116239183779175	0.6227127983059976	0.8705012393280477	1.0834807453909356	0.7375949172315872	1.7210233545534848	0.3302040546782105	1.7308426864058206	0.9196873970295214	0.5180695650512342	1.4464437335979718	2.085099886855593	0.9414264042776739	0.7621076360556626	1.0106197730987136	-0.08418933306146391	1.0099108396478342	-0.3210411020553532	0.03478927601954318	-1.4231119474849112	1.5924699510713332	-0.7492490193484069	-1.643400874503242	1.252815393857646	0.17988259311655352	0.2298452137885425	0.5309452442178708	0.3879069747927161	-0.9546905723895116	-0.07356990574310165	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:116286634..116286748,-__1409.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:116286634..116286748,-__1409.1.0.0	rs141394498	-1.1823536836107862	-1.1127467525278127	-1.3012257235229254	-1.3248933216743355	-1.360624080677126	-1.6097352849379216	-1.1436846577123383	-1.5483269248928275	-1.3068928386744532	-1.7936716309363077	-1.3440243477681832	-1.8543134832500852	-1.4068743941820918	-1.1753842851447351	-1.1450955813531556	-1.0884478020809718	-0.6873487398653737	-1.194128118310396	-0.8932105375589275	-1.1936794046172745	-0.9582618685909348	-1.349263233367061	-1.19187631280744	-0.9252261660667458	-1.5609758601724826	-1.1135748258279585	0.006969398466051047	-0.032348828825342846	0.21277792144195362	0.6375445818089618	0.16649596236672992	0.7165247473789941	-0.049994746904936216	0.5900650563018928	-0.04237039469260795	0.6017953181288676	0.41879818170143746	0.2933376230776026	0.2932995683541337	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr10:116286634..116286748,-__1409.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:116286634..116286748,-__1409.1.0.0	rs56729718,rs141394498	-1.1823536836107862	-1.1127467525278127	-1.3012257235229254	-1.3248933216743355	-1.360624080677126	-1.6097352849379216	-1.1436846577123383	-1.5483269248928275	-1.3068928386744532	-1.7936716309363077	-1.3440243477681832	-1.8543134832500852	-1.4068743941820918	-0.6051123542464928	-0.9256104075064392	-1.5332578129157624	-1.4229532555721705	-0.7611874888648649	-1.6230204781039612	-0.7546194166918868	-0.8068588322154746	-1.3600983065798706	-0.9180633246112697	-0.6678491059438488	-1.4099336052786888	-1.0657136990442275	0.5772413293642934	0.18713634502137355	-0.23203208939283693	-0.09805993389783496	0.599436591812261	-0.0132851931660396	0.3890652410204515	0.7414680926773529	-0.05320546790541747	0.8756083063250379	0.6761752418243344	0.44437987797139633	0.34116069513786434	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:30584985..30585099,-__1411.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:30584985..30585099,-__1411.1.0.0	rs367729754	1.7211047444434058	1.9869872070338936	1.7851835804187584	1.5983128716962007	1.7758255200487876	1.8063571301135468	1.891699223850468	1.843203117977776	1.9217147669141112	1.9589694043125407	1.8981887350434659	1.9879884903030145	1.847961232679664	1.3019553909434145	1.7076928626678285	1.6513630333753566	1.3573516654638589	1.504237347269825	1.5931503149557167	1.4629821773512655	1.5859565837945508	1.5524466059139281	1.5321815410605861	1.788424987332613	1.570346646683641	1.5506740964010488	-0.4191493534999913	-0.27929434436606515	-0.13382054704340174	-0.24096120623234185	-0.27158817277896263	-0.21320681515783013	-0.4287170464992025	-0.2572465341832251	-0.3692681610001831	-0.4267878632519546	-0.10976374771085284	-0.4176418436193734	-0.29728713627861536	0.0120431385799	0.0168468410067	0.21176555971	0.188220673538	0.0107365258413	0.0296152123457	0.0232568344756	0.0678362651725	0.00695778717972	0.0168468410067	0.232080506959	0.00544559218276	2.27662257044e-10	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1.90780971403e-07	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:110009111..110009225,+__1412.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:110009111..110009225,+__1412.1.0.0	rs4970765	-0.09394821652085847	0.05615616625381765	-0.18774209507528417	0.09799543769848511	-0.3097062033263257	-0.28601606444698435	-0.6679292289441785	-0.08363192426294837	-0.34085056209777387	-0.18771711499304217	-0.13645080583860592	0.015023505123206354	-0.17706809220254108	-0.4178946893979179	-0.34659018391918034	-0.1079287416789533	-0.4518292683149598	-0.4339364738847016	-0.1977965732759135	-0.8325392877908113	-0.1348935000475616	-0.2621582068081	-0.00537887420151754	-0.5267428973012807	-0.5458172843867916	-0.35529216508397415	-0.32394647287705947	-0.402746350172998	0.07981335339633086	-0.5498247060134449	-0.12423027055837588	0.08821949117107086	-0.16461005884663282	-0.051261575784613225	0.07869235528967389	0.18233824079152464	-0.39029209146267474	-0.5608407895099979	-0.17822407288143308	0.143314270352	0.333666485083	0.8931878581	0.0499532058383	0.747262025795	0.772818296065	0.527990680582	0.304331462321	0.85089220831	0.893186642743	0.175053819161	0.444064484515	0.532688663971	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:110009143..110009257,+__1413.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:110009143..110009257,+__1413.1.0.0	rs4970765	-0.8947277192431629	-0.8908092702286172	-0.9034862323591314	-0.8129709885805416	-1.2312574965408365	-0.6397203940178114	-0.7753208420129405	-0.8794861783210294	-0.6522772028070718	-0.5904398571566357	-0.9373183866411182	-0.5305691903183639	-0.8115319798522718	-0.7954196126878441	-0.6334614964637508	-0.6258556872311138	-0.8199199230125065	-0.8952756206159735	-0.4529880566251469	-0.726026483657992	-0.7291991136530109	-0.3814543869879442	-0.5393062017479839	-0.827078990855332	-0.6587982960028763	-0.6737319891284562	0.09930810655531874	0.2573477737648664	0.27763054512801755	-0.0069489344319648705	0.33598187592486295	0.18673233739266454	0.04929435835494844	0.15028706466801844	0.2708228158191276	0.05113365540865178	0.11023939578578623	-0.1282291056845124	0.13779999072381546	NA__no_active_tile	0.221756412245	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.476683207768	0.79863356553	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.757455001208	0.648013768535	0.390154148302	0.143314270352	0.461704271214	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:11159873..11159987,-__1414.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:11159873..11159987,-__1414.1.0.0	rs17552394	2.061875807142201	2.197203545751674	1.986254235062796	1.9438237046002125	1.9383969435281736	2.0033045840036565	1.964340747170696	1.7736875287371179	1.9773018497737052	1.988439151511224	2.007884171359163	2.120390334527575	1.996908550264016	2.47227520736074	2.7038380436453204	2.3996090693843013	2.1504046805597565	2.257863642086193	2.166561324681009	2.3552231701778497	2.4159598899872163	2.4759575065357455	2.2075635345375315	2.428530025971826	2.4073573125368606	2.370095283955362	0.4103994002185387	0.5066344978936463	0.4133548343215052	0.20658097595954406	0.31946669855801946	0.1632567406773524	0.3908824230071537	0.6422723612500985	0.4986556567620404	0.21912438302630743	0.4206458546126628	0.2869669780092856	0.3731867336913462	0.0698833862508	0.042608909143	0.0327677521954	0.301187193336	0.0344469162732	0.0678362651725	0.0296152123457	0.0785847853765	0.0678362651725	0.054002235758	0.136115392203	0.045430560235	9.25373821723e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	7.75463262603e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:145727624..145727738,+__1416.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:145727624..145727738,+__1416.1.0.0	rs1797052	-1.7041115224876502	-1.5543069489610457	-1.6457126910922	-1.5428281411416966	-2.2240904820096916	-1.6857070195034352	-1.85732355480335	-1.5152778889932623	-1.5215804205292442	-1.892411781265413	-1.5888185073292966	-1.5489713859583614	-1.6900950286728869	-2.080456570636106	-2.0471864313323844	-2.1281306010717898	-1.8607226221878117	-1.6327358493232094	-2.1419950783385127	-1.6725527370980395	-1.4344890228906844	-1.8635286485716278	-1.7718704923958564	-1.8603065642461267	-1.6577702905229175	-1.845978742384589	-0.3763450481484556	-0.4928794823713387	-0.4824179099795898	-0.31789448104611506	0.5913546326864823	-0.4562880588350775	0.18477081770531045	0.08078886610257796	-0.34194822804238356	0.12054128886955673	-0.2714880569168301	-0.1087989045645561	-0.1558837137117016	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:150940574..150940688,-__1417.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:150940574..150940688,-__1417.1.0.0	rs267738	-0.6871674853703533	-0.65587117296016	-1.2657643167309882	-1.6058276035544126	-1.0777344998761904	-1.270428944497396	-1.262829678861964	-1.1273209416666712	-0.9399340611983454	-0.8357374070189502	-1.068837257809242	-1.189353459694357	-1.0822339024365857	-0.8667353583444521	-0.5160151930537019	-0.9314890842838647	-0.862630818782597	-0.5251018990826772	-0.6106286993651524	-0.8612534659485934	-0.7207964051346974	-0.9537581247329966	-0.8587202234996816	-0.7350344179890673	-0.6662482521922429	-0.7590343285341438	-0.17956787297409882	0.13985597990645804	0.33427523244712354	0.7431967847718156	0.5526326007935132	0.6598002451322436	0.40157621291337053	0.40652453653197373	-0.013824063534651154	-0.022982816480731416	0.33380283982017467	0.523105207502114	0.3231995739024422	NA__no_active_tile	0.361218104761	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0296152123457	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.76769033028	NA__no_active_tile	0.0194743211566	0.0369222512495	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:155658069..155658183,-__1418.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:155658069..155658183,-__1418.1.0.0	rs2666826	2.4326536929475964	2.7124628782144122	2.381318203456674	2.229363360255573	2.3841250534383285	2.47343337273061	2.395035335977783	2.6168508602860885	2.465863947373798	2.570789732137124	2.575958513002189	2.565867167714696	2.483643509794572	2.6072746701723286	3.0112566558295586	2.4756376170934375	2.359520145750584	2.485111827586193	2.4574212388853756	2.5915658022823065	2.7590040640094577	2.6325262344531812	2.559477615622283	2.6044892105917605	2.5435849106106745	2.5905724994072616	0.17462097722473224	0.29879377761514636	0.09431941363676355	0.13015678549501075	0.10098677414786472	-0.016012133845234366	0.19653046630452353	0.14215320372336926	0.16666228707938302	-0.011312116514840653	0.028530697589571385	-0.02228225710402132	0.10692898961268904	0.0986283746992	0.158583637061	0.536806685117	0.405136064622	0.527990680582	0.861430881609	0.248198866138	0.188220673538	0.197395731844	0.914457985151	0.493479697885	0.989287003123	0.495022760064	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr1:156698202..156698316,-__1419.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr1:156698202..156698316,-__1419.1.0.0	rs3806415	1.822048758438216	2.0030154667605684	1.8356386871959	1.778332302735829	2.0343764294897424	1.9714143855910096	1.9473427445101636	1.9125431836987856	2.1287320899751894	2.045417950219571	2.011590410183825	2.04447172864654	1.9612436781204448	2.1907915224250845	2.4043576617932074	2.1662260488515788	1.8990726066186703	2.3056571314667407	2.22187564577042	2.0209844895278213	2.025368416868788	2.2596860924678825	2.2717734249054096	2.404770937295002	2.340518147504657	2.209256843791272	0.36874276398686856	0.401342195032639	0.3305873616556787	0.12074030388284118	0.2712807019769983	0.2504612601794105	0.07364174501765763	0.11282523317000259	0.13095400249269318	0.2263554746858385	0.393180527111177	0.29604641885811667	0.24801316567082685	0.248198866138	0.0986283746992	0.232080506959	0.382791178922	0.13967914143	0.0658387268341	0.397602565759	0.375513989452	0.428242856315	0.301187193336	0.0959193233604	0.0959193233604	0.00310888472182	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr1:156698181..156698295,+__1420.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr1:156698181..156698295,+__1420.1.0.0	rs3806415	1.4064740270951448	1.691976059708399	1.4387096156041324	1.278865371742797	1.339445904368949	1.3446133487273175	1.3269826981793067	1.4071053273530503	1.3865204344629691	1.502826428461983	1.4498695877919658	1.4532880747659602	1.4188897398551648	1.5215359833294615	1.7179566861366147	1.6103773569198512	1.5603590459555068	1.6040388967309456	1.731923328762893	1.3317601171466507	1.6900585351712385	1.63283553920831	1.7367015943173927	1.8043605315041489	1.695864643318859	1.6364810215418226	0.1150619562343167	0.025980626428215636	0.17166774131571882	0.2814936742127099	0.2645929923619965	0.3873099800355755	0.00477741896734396	0.2829532078181882	0.2463151047453409	0.23387516585540968	0.35449094371218304	0.24257656855289889	0.21759128168665817	0.188220673538	0.747262025795	0.354199901149	0.183752894264	0.0426112802219	0.0187859264625	0.788281320858	0.110080523892	0.0258200569765	0.0224529881577	0.0531733827136	0.0638899216795	0.000108754890363	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0911365981238	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:157670668..157670782,-__1421.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:157670668..157670782,-__1421.1.0.0	rs11264799	-0.9169485878296724	-1.239737514234486	-1.4761574071958294	-1.3256390174983443	-2.1222935795261386	-1.5127231480705885	-2.3250297637531636	-1.1437181207384741	-1.8586991883242672	-1.7552131935385689	-1.3855848181411445	-2.300830109515497	-1.6135478706971815	-0.738809177364511	-1.08110857330259	-1.3523841633406941	-1.338125427911256	-0.4625089230235598	-1.9176736215296384	-1.2965670604223045	-1.055036919789891	-0.8122845134703198	-2.0724088286866333	-0.9794959989034983	-1.8039882074185336	-1.242532617930286	0.17813941046516135	0.15862894093189595	0.12377324385513533	-0.012486410412911653	1.659784656502579	-0.4049504734590499	1.028462703330859	0.08868120094858312	1.0464146748539473	-0.3171956351480645	0.4060888192376463	0.49684190209696344	0.37101525276689534	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:159174613..159174727,+__1422.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:159174613..159174727,+__1422.1.0.0	rs2814778	-2.080344443351304	-1.6901957395083522	-1.8359707212881835	-1.868960459967934	-1.7217999748910682	-2.1218158478649163	-1.1591227323082873	-1.9860140913433963	-1.5853607622002583	-1.8013220696757175	-1.585768837561096	-1.922041539272171	-1.779893101602724	-1.494404857573962	-1.7734669208774863	-1.947912657756529	-1.5082061146542998	-2.0235130446591043	-1.7592760318864964	-1.5637961039370876	-1.840199305195303	-1.6463981307727718	-2.196068873450097	-2.282139622785835	-1.9257941442975068	-1.8300979839872065	0.585939585777342	-0.08327118136913403	-0.1119419364683456	0.36075434531363415	-0.30171306976803614	0.3625398159784199	-0.40467337162880024	0.1458147861480934	-0.061037368572513406	-0.39474680377437954	-0.6963707852247387	-0.003752605025335809	-0.05020488238448284	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:159272046..159272160,+__1423.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:159272046..159272160,+__1423.1.0.0	rs2251746	-1.1675049760501608	-1.8290926853460148	-1.6402499552570486	-1.3797659348663571	-1.5452080534022115	-1.3167557312391895	-1.182699357120828	-1.238729387093966	-1.6543409083434866	-1.1616778735311843	-1.7164025437968962	-1.4638272556089929	-1.4413545551380282	-1.1560904825463987	-1.3020876431285429	-0.9947729668622161	-1.3843817886925145	-1.465615815244159	-1.5813097801783793	-1.3051578299070272	-1.5913700861288587	-1.8950085505103358	-1.346223750063075	-1.5829970833863949	-1.6512974419402742	-1.4380261015490146	0.011414493503762113	0.5270050422174719	0.6454769883948326	-0.004615853826157368	0.0795922381580525	-0.26455404893918977	-0.12245847278619926	-0.3526406990348927	-0.24066764216684922	-0.18454587653189058	0.13340546041050128	-0.18747018633128132	0.003328453589013347	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:166944741..166944855,-__1424.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:166944741..166944855,-__1424.1.0.0	rs186023662															-3.0458603450325317	-3.0214669719042253	0.8034674311418666	-0.7080636904645482	-1.5197412479493606	-0.4545293486976767	-3.6210477382926975	-0.4154366044758603	-1.0692027434038138	-1.3422088496099558	-1.1966246127332625	-1.4173377019474604														NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr1:166944741..166944855,-__1424.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:166944741..166944855,-__1424.1.0.0	rs112416021,rs186023662														2.13112372148492	3.34045142831873	1.565899589235442	-0.08927292091030804	3.2135346686230646	2.9852293286689773	3.930182837707325	2.706964900141037	3.2498665165093064	3.368857519718243	3.0368227269118644	-0.22197207692932952	2.4348073532899392														NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:183605164..183605278,+__1425.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:183605164..183605278,+__1425.1.0.0	rs114491252	-0.29073848112460066	-0.30781845967511745	-1.0434357465779285	-0.8379406740433744	-0.5781600629063561	-0.9895790888220991	-0.7823676300875629	-0.5009068937745675	-0.5922561593907253	-0.6238006858857279	-0.8681264954767653	-0.7685822295330309	-0.6819760506081547	-0.4060231323413712	-0.1827892197448337	-0.899279886193162	-0.5391317987475898	-0.8544575629675657	-0.6499749532447621	-1.0351124770231392	-0.8348309264228411	-0.3774761982498132	-0.763946110422502	-0.6244712068722669	-0.6087069992974972	-0.648016705960612	-0.11528465121677056	0.12502923993028375	0.14415586038476647	0.2988088752957846	-0.27629750006120957	0.33960413557733704	-0.2527448469355763	-0.3339240326482735	0.21477996114091208	-0.14014542453677414	0.24365528860449848	0.15987523023553374	0.03395934464754267	0.628827692687	0.737113058664	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.978575937473	NA__no_active_tile	0.809021331888	0.840380101088	0.412754243182	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.619326784864	0.969111290117	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:203155796..203155910,-__1426.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:203155796..203155910,-__1426.1.0.0	rs4950928	-0.8559930283890432	-0.6155006211068431	-1.012050856253018	-1.1058248776823831	-1.2135024393359712	-1.1811417789818142	-0.8484595321497513	-0.7963708104239201	-1.3525806236201945	-0.74525632097479	-0.5063105154587333	-1.0680125996486125	-0.9417503336687562	-0.021313054481316422	-0.7075947980158167	-0.4331534085752705	-0.4739095243401897	-0.4139475302687649	-0.5284294851180357	-0.7318537325347468	-0.561060526824058	-0.31221686712046776	-0.3173090561878767	-0.6632545046505497	-0.7358071422751051	-0.4916541358660165	0.8346799739077269	-0.09209417690897359	0.5788974476777474	0.6319153533421935	0.7995549090672063	0.6527122938637785	0.1166057996150045	0.23531028359986206	1.0403637564997268	0.4279472647869133	-0.1569439891918164	0.3322054573735074	0.45009619780273963	0.882579228976	NA__no_active_tile	0.301187193336	0.532384751695	0.390154148302	0.696989544957	0.657696241675	0.347262941929	0.420456664513	0.563691144959	0.444064484515	NA__no_active_tile	0.601995806534	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:214161796..214161910,+__1428.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:214161796..214161910,+__1428.1.0.0	rs340839	-1.0763711964982103	-1.4699266994524223	-1.699532350768812	-1.8187606895321902	-1.5677850920200924	-1.4786098286982665	-1.414469024819749	-1.9263696517076376	-1.7784302789851747	-0.916523274204909	-1.4783583004035137	-1.399372272670453	-1.5020423883134526	-1.1853048548396654	-1.4103945374328364	-1.3288916163997202	-1.5255737412558164	-1.65927846285804	-1.6633345214058453	-0.8409770131887113	-1.2034018691536539	-1.7547185292059049	-1.2643858118669409	-1.5879604291919969	-0.807794486555247	-1.3526679894461981	-0.10893365834145508	0.05953216201958589	0.37064073436909184	0.2931869482763738	-0.09149337083794751	-0.18472469270757874	0.5734920116310376	0.7229677825539838	0.02371174977926982	-0.3478625376620319	-0.10960212878848319	0.591577786115206	0.14937439886725434	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:21766575..21766689,+__1429.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:21766575..21766689,+__1429.1.0.0	rs1566523	0.1876385547921586	0.2453983380866782	0.24115427721157062	0.4228301502133194	0.718764937409351	0.4319762221949743	0.7128747529596525	0.29993814515557143	0.28440729053582653	0.0989754694985896	0.36943762842033023	0.3364070984401265	0.36248357207651244	0.17902908912404047	0.49877132298828475	-0.03385818860738639	0.09261573788614214	-0.12198353243556581	0.359815238627409	0.04687138739032428	0.6304917697574022	0.2476899074891568	0.11959176760849025	-0.0655262721119503	0.3294711010290168	0.190248277395447	-0.008609465668118127	0.25337298490160653	-0.275012465818957	-0.33021441232717724	-0.8407484698449168	-0.07216098356756528	-0.6660033655693283	0.33055362460183074	-0.036717383046669716	0.02061629810990065	-0.4349639005322805	-0.006935997411109729	-0.17223529468106538	0.76769033028	0.361218104761	0.79863356553	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.893186642743	0.21176555971	NA__not_enough_barcodes	0.170821264488	0.747262025795	0.226876581559	0.587022966503	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:2487730..2487844,+__1430.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:2487730..2487844,+__1430.1.0.0	rs2227313	0.14481922919811874	0.051965655040541264	-0.2154800439212948	-0.9753111100753211	-0.3293464683003167	-0.22035181730347556	-0.4729170931673274	-0.4302729153306912	-0.500101028666051	-0.486232005611	-0.38155365153177867	-0.461012949689649	-0.3563161832798538	-0.4789565075746096	-0.2515797174165372	-0.5646157401966069	-0.5004712987751014	-0.3644852595159171	-0.10164842438064717	-0.20259529107404972	-0.5338955275427423	-0.530654756490651	0.0009560481782531033	-0.547732517516241	-0.4020528763370724	-0.37314432238682693	-0.6237757367727284	-0.30354537245707847	-0.34913569627531205	0.4748398113002197	-0.03513879121560037	0.11870339292282839	0.27032180209327766	-0.1036226122120511	-0.030553727824599974	0.4871880537892531	-0.1661788659844623	0.058960073352576636	-0.016828139106973092	0.0115927323179	0.523605760741	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.861430881609	0.90381429355	0.29495293544	NA__no_active_tile	0.150801701171	0.66743649171	0.619326784864	0.845630974801	0.547978354265	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:38156154..38156268,-__1432.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:38156154..38156268,-__1432.1.0.0	rs115208084	-0.33846978126700267	-0.301568951215092	-0.4923553602302727	-0.29907285485780205	-0.11232438596849	-0.2563854496944156	-0.1360212752797287	-0.15226041869939924	-0.20594673486213233	0.18382164294648576	0.12652991115370224	-0.15276793584852186	-0.1780684661518891	-0.3492841506917356	-0.2896389867041732	-0.015618446807243946	-0.3275028276132559	0.05767086068422195	-0.1784558981608373	-0.3287364168831573	-0.16748236783933348	-0.12703374213806784	-0.17190044768113696	0.2359978999143365	-0.39045141700001246	-0.17103632841003294	-0.010814369424732906	0.011929964510918767	0.47673691342302876	-0.028429972755453836	0.16999524665271193	0.07792955153357833	-0.1927151416034286	-0.015221949139934243	0.07891299272406449	-0.3557220906276227	0.10946798876063427	-0.2376834811514906	0.007032137741856137	0.11007645226	0.259370210024	0.716953652062	0.253741740693	0.978575937473	0.648013768535	0.412754243182	0.420456664513	0.444064484515	0.192768091005	0.393862283952	0.677233097055	0.409342405055	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:38156154..38156268,-__1432.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:38156154..38156268,-__1432.1.0.0	rs679742	-0.33846978126700267	-0.301568951215092	-0.4923553602302727	-0.29907285485780205	-0.11232438596849	-0.2563854496944156	-0.1360212752797287	-0.15226041869939924	-0.20594673486213233	0.18382164294648576	0.12652991115370224	-0.15276793584852186	-0.1780684661518891	0.12809377488441984	-0.09087075064610926	-0.1296404010460871	-0.26025977701352143	0.12883664552954266	-0.1541362709837992	-0.3454785269626509	-0.030404260572887	0.025971442629070335	-0.010896695966338181	0.21920542244660618	-0.1248761540612614	-0.05370462931358461	0.46656355615142253	0.2106982005689827	0.3627149591841856	0.03881307784428062	0.24116103149803264	0.10224917871061642	-0.2094572516829222	0.12185615812651224	0.23191817749120267	-0.19471833891282395	0.09267551129290394	0.027891781787260456	0.12436383683830447	0.501987794151	0.64800625442	0.757452311924	0.170821264488	0.757455001208	0.840380101088	0.609889042629	0.197395731844	0.333666485083	0.282745459933	0.304331462321	0.8931878581	0.611542551258	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:38156154..38156268,-__1432.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:38156154..38156268,-__1432.1.0.0	rs58877851	-0.33846978126700267	-0.301568951215092	-0.4923553602302727	-0.29907285485780205	-0.11232438596849	-0.2563854496944156	-0.1360212752797287	-0.15226041869939924	-0.20594673486213233	0.18382164294648576	0.12652991115370224	-0.15276793584852186	-0.1780684661518891	0.09400455101489984	-0.06381044332128993	0.0189203123728944	-0.20065589549607724	-0.5756745496480803	-0.26585089572541504	-0.06862608678772265	0.29004963117871263	-0.19304693101606996	-0.026300100769442537	-0.08586005341637166	-0.27706928505105805	-0.11282664555541838	0.4324743322819025	0.23775850789380204	0.5112756726031671	0.09841695936172482	-0.4633501636795903	-0.009465446030999414	0.06739518849200606	0.44231004987811184	0.012899803846062374	-0.2101217437159283	-0.21238996457007392	-0.12430134920253619	0.0652418205964707	0.957166828655	0.672324307433	0.412754243182	0.747262025795	0.532384751695	0.85089220831	0.716953652062	0.320413072024	0.914457985151	0.262211172943	0.134355585812	0.935789553219	0.924963958923	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr1:38156154..38156268,-__1432.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:38156154..38156268,-__1432.1.0.0	rs115208084,rs679742,rs58877851	-0.33846978126700267	-0.301568951215092	-0.4923553602302727	-0.29907285485780205	-0.11232438596849	-0.2563854496944156	-0.1360212752797287	-0.15226041869939924	-0.20594673486213233	0.18382164294648576	0.12652991115370224	-0.15276793584852186	-0.1780684661518891	-0.1613911436403289	-0.2590170992471781	0.14418491933938865	-0.2785671506425595	-0.09456332815130336	0.0749567233778792	-0.43173639264371205	-0.20403108702003067	0.09832957314028543	-0.4412817792230997	-0.3342104334154717	-0.24228723122390342	-0.1774678691125028	0.17707863762667378	0.04255185196791389	0.6365402795696613	0.02050570421524256	0.017761057817186635	0.33134217307229485	-0.29571511736398337	-0.05177066832063143	0.3042763080024178	-0.6251034221695855	-0.4607403445691739	-0.08951929537538156	0.0006005970393862479	0.420451345493	0.519249062249	0.48504462162	0.687084607526	0.501987794151	0.166665831608	0.333666485083	0.840380101088	0.361218104761	0.248198866138	0.136115392203	0.829896383209	0.35607474745	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:45965599..45965713,-__1433.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:45965599..45965713,-__1433.1.0.0	rs3748643	-1.128598942838864	-1.0770068689037888	-0.8509454972444069	-1.0412286113692881	-1.4561160961172954	-0.958335778286102	-0.9369723727115649	-1.0286564063149923	-0.6723676712959428	-0.7604504810273706	-0.8094384337944049	-0.9164057649878038	-0.9697102437409856	-0.5484259840002776	-0.6794094796479058	-0.5158649998535502	-0.8147435973431165	-0.5268174275878084	-0.7858397532013547	-0.5888676008782233	-0.4760670195462089	-0.6548790991194307	-0.7456317729404125	-0.4057823385080852	-0.8154626586014073	-0.629815977602315	0.5801729588385864	0.39759738925588306	0.33508049739085677	0.2264850140261716	0.9292986685294871	0.17249602508474726	0.34810477183334154	0.5525893867687834	0.017488572176512118	0.014818708086958066	0.40365609528631974	0.10094310638639648	0.3398942661386703	NA__no_active_tile	0.347268461228	0.978575937473	NA__no_active_tile	0.0168468410067	NA__no_active_tile	0.777966336216	0.493479697885	0.90381429355	NA__no_active_tile	0.206893929435	NA__no_active_tile	0.610739771586	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:59762425..59762539,+__1435.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:59762425..59762539,+__1435.1.0.0	rs835367	0.18295153855712173	-0.16859699255583008	-0.1597878064708662	-0.8934737442219013	0.20178430236537628	0.09978095504221356	-0.6057661674684521	-0.22855899516765096	-0.8485193153642359	0.8834493046276156	0.21801151504891855	-0.9612408926545551	-0.1899971915218538																											NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:8021691..8021805,+__1436.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:8021691..8021805,+__1436.1.0.0	rs17523802	2.205772571646584	2.2015181408281035	2.0843699635339723	1.9636090636490424	1.9724400622830096	2.2198502609838595	2.0953861595391707	2.129358354696067	2.4476003041397982	2.333757735154826	2.027473808978205	2.4138678473201325	2.1745836893960644	2.0173905181979013	2.4759034276020877	2.0309396789742546	1.9892032756559646	2.1072769948573566	2.144171091098821	2.121036743515897	2.2500944227082194	2.224709472376897	2.3962893918410844	2.194803612380295	2.2856205757981654	2.186453267083912	-0.18838205344868264	0.2743852867739842	-0.053430284559717656	0.025594212006922135	0.13483693257434703	-0.07567916988503853	0.02565058397672626	0.12073606801215231	-0.22289083176290125	0.06253165668625815	0.16732980340209025	-0.12824727152196713	0.011869577687847762	0.0619890035232	0.87199428352	0.408929232264	0.382791178922	0.347268461228	0.809021331888	0.313917214294	0.978575937473	0.361218104761	0.79863356553	0.935789553219	0.48504462162	0.811126574193	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:8021691..8021805,+__1436.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:8021691..8021805,+__1436.1.0.0	rs226249	2.205772571646584	2.2015181408281035	2.0843699635339723	1.9636090636490424	1.9724400622830096	2.2198502609838595	2.0953861595391707	2.129358354696067	2.4476003041397982	2.333757735154826	2.027473808978205	2.4138678473201325	2.1745836893960644	1.9305038825051573	1.9936493442496177	1.6007649054287199	1.2498487373562066	1.749707841815815	1.9891437993204915	1.6654464517380771	1.9310646742390398	1.908398911483026	1.8659281392721403	1.9493806257705297	1.6662382988794202	1.7916729676715202	-0.27526868914142666	-0.20786879657848578	-0.48360505810525245	-0.7137603262928358	-0.22273222046719465	-0.23070646166336806	-0.4299397078010936	-0.19829368045702722	-0.5392013926567722	-0.4678295958826859	-0.07809318320767522	-0.7476295484407123	-0.38291072172454416	0.119339994516	0.179364149792	0.0763307839553	0.183752894264	0.0698833862508	0.253741740693	0.536806685117	0.8931878581	0.265084565602	0.166665831608	0.56368668121	0.0565651674203	0.00861999289493	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr1:8021691..8021805,+__1436.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:8021691..8021805,+__1436.1.0.0	rs17523802,rs226249	2.205772571646584	2.2015181408281035	2.0843699635339723	1.9636090636490424	1.9724400622830096	2.2198502609838595	2.0953861595391707	2.129358354696067	2.4476003041397982	2.333757735154826	2.027473808978205	2.4138678473201325	2.1745836893960644	1.8387412583162237	2.2801137184297984	2.0418984388881025	1.6892054829661258	1.7450891381892788	1.9917213983997568	2.2533616356370194	2.189051883335999	2.200777410774523	2.157739181724274	2.1248111255281645	2.2644603570250745	2.064747585767862	-0.3670313133303602	0.07859557760169489	-0.042471524645869785	-0.2744035806829166	-0.2273509240937308	-0.2281288625841027	0.15797547609784868	0.05969352863993205	-0.2468228933652754	-0.17601855343055206	0.09733731654995958	-0.14940749029505795	-0.10983610362820252	0.104229562843	0.545696106059	0.510582765025	0.253741740693	0.0785847853765	0.397602565759	0.79863356553	0.788281320858	0.90381429355	0.559161188502	0.716953652062	0.476688253492	0.517447254241	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:90098628..90098742,+__1438.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:90098628..90098742,+__1438.1.0.0	rs10047070	0.4770919489653891	-0.2675781237346864	-0.9571586759006547	0.6139927951566624	-0.04786476292231165	-0.6175553852555945	0.36436251079449694	-0.06968848114309541	0.08542952323222038	-0.47735686317121523	-0.7786175873462552	-0.5468650647901389	-0.1851506805095986	-0.03748505530841165	-0.6330097265397321	-0.3129560227724152	-0.3247916283501332	-1.0587275100246605	-0.6134032940705396	-0.569376283126685	-0.7640404293355929	-0.1348902044494386	-0.2938179023067896	-0.05630936379910086	-0.21619747107975795	-0.4179170742636047	-0.5145770042738007	-0.36543160280504566	0.6442026531282395	-0.9387844235067956	-1.0108627471023488	0.004152091185054885	-0.9337387939211819	-0.6943519481924975	-0.22031972768165897	0.18353896086442562	0.7223082235471543	0.3306675937103809	-0.23276639375400612	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr1:90098668..90098782,+__1439.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:90098668..90098782,+__1439.1.0.0	rs10047070	-0.8006278835914585	-0.3320140821674881	-1.0175013920654317	-1.0609113702120463	-0.8631583217492507	-1.3284399842065358	-0.6688758415434816	-1.078487269018238	-0.921579245043906	-0.7355026282417905	-1.2633991314171733	-0.9037842811224132	-0.9145234525316012	-1.266455703800383	-1.1581235966068908	-0.8510697544121336	-0.8568619720117879	-0.8639949287967896	-0.9449733435843362	-1.4037633090548638	-1.334141331328292	-0.9449923643843818	-0.913851259365428	-0.9031103674146794	-0.748482241040915	-1.0158183476500733	-0.46582782020892444	-0.8261095144394026	0.16643163765329805	0.20404939820025836	-0.000836607047538962	0.3834666406221996	-0.7348874675113822	-0.25565406231005383	-0.023413119340475852	-0.17834863112363752	0.3602887640024939	0.15530204008149817	-0.10129489511847228	NA__no_active_tile	0.04542809053	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.04542809053	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr1:90098668..90098782,+__1439.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr1:90098668..90098782,+__1439.1.0.0	rs10047070,rs183209113	-0.8006278835914585	-0.3320140821674881	-1.0175013920654317	-1.0609113702120463	-0.8631583217492507	-1.3284399842065358	-0.6688758415434816	-1.078487269018238	-0.921579245043906	-0.7355026282417905	-1.2633991314171733	-0.9037842811224132	-0.9145234525316012	-1.0069596706877817	-0.7501781844532031	-0.7480744712815339	-1.0542726829546907	-0.4747508480513112	-0.8411760143973366	-0.9826240680518068	-0.6156928054776966	-1.1407514607233675	-1.1082044958854562	-0.9653766764760625	-0.6926351157935323	-0.8650580411861483	-0.20633178709632316	-0.41816410228571493	0.26942692078389774	0.006638687257355613	0.3884074736979395	0.48726396980919917	-0.31374822650832523	0.46279446354054155	-0.21917221567946155	-0.37270186764366575	0.2980224549411108	0.21114916532888084	0.04946541134545288	NA__no_active_tile	0.31069646386	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.31069646386	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr10:1034322..1034436,+__1440.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr10:1034322..1034436,+__1440.1.0.0	rs12772979	1.621218066768218	1.6576300786507119	1.4152921507592902	1.4500290577967467	1.6215971178124624	1.7252936684971043	1.7650758866580643	2.0075753373657186	1.764913442819939	1.7029308626718238	1.8598056101654687	1.7209728166356146	1.6926945080500968	1.1938876712557651	1.3195976608882458	1.1427041505649087	1.0925544066942092	1.2950644433529126	1.1577824942555126	1.2777920141579593	1.233326634416679	1.2609600314557308	1.1476989094706216	1.3844562806517207	1.3162277668146916	1.235171038664913	-0.4273303955124528	-0.33803241776246606	-0.27258800019438145	-0.3574746511025375	-0.3265326744595498	-0.5675111742415917	-0.48728387250010496	-0.7742487029490397	-0.5039534113642081	-0.5552319532012022	-0.4753493295137481	-0.4047450498209231	-0.4575234693851839	0.0224529881577	0.101398170673	0.368322877114	0.0959193233604	0.0105296868835	0.0362033618716	0.0267271087754	0.0181189115857	0.0181189115857	0.000481108176159	0.00423662678721	0.00423662678721	3.83458380356e-12	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.377669918285	1	1	3.21338122739e-09	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:104597135..104597249,-__1441.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:104597135..104597249,-__1441.1.0.0	rs743572	-0.8579971253799636	-1.4069968611917285	-1.5496277733793593	-1.5457814736132327	-1.5508889138290811	-0.8903348231643774	-1.0340861914557686	-1.576219448369078	-1.3217044161041094	-0.8966919035878893	-1.2469542456802576	-1.2547227258664464	-1.2610004918017743	-0.8769213964007104	-1.4335449569478296	-1.8363228919597616	-1.5097197020752466	-2.2058519799610243	-1.7436644835075672	-1.4869806883963195	-1.3476520292870944	-1.840767234673824	-1.2831574584150585	-1.9041894666997303	-1.6559714563968508	-1.593728645393418	-0.018924271020746786	-0.026548095756101064	-0.2866951185804023	0.036061771537986065	-0.6549630661319432	-0.8533296603431898	-0.45289449694055084	0.22856741908198352	-0.5190628185697146	-0.38646555482716916	-0.6572352210194727	-0.40124873053040444	-0.3327281535916438	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:135192695..135192809,+__1442.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:135192695..135192809,+__1442.1.0.0	rs12250188	0.3966284481561477	0.2658471198653784	0.3493599159674302	0.630833384365719	0.44102028340901195	0.7754336683757459	0.4136764606298732	0.6016567169624196	0.18447264469569136	0.727402720919269	0.6762791393371964	0.7559061124858499	0.518209717930811	1.0022313986396196	1.114664753408654	-0.0185182481939503	1.0289816612200668	0.7282358686077016	0.8512052341863631	1.4255064361121168	0.4762500621385042	0.2530459957805279	1.631284670229494	0.6130328000845716	0.5018285786333195	0.8006457675705824	0.6056029504834719	0.8488176335432756	-0.3678781641613805	0.39814827685434784	0.28721558519868967	0.07577156581061717	1.0118299754822435	-0.12540665482391544	0.06857335108483653	0.903881949310225	-0.0632463392526248	-0.2540775338525304	0.28243604963977137	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:135192712..135192826,+__1443.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:135192712..135192826,+__1443.1.0.0	rs12250188	1.107317852999424	1.6998407260777644	1.3825189568039156	1.0334018923562014	1.5355477062245533	1.567050615298901	1.2791747309957087	1.0768625214894287	1.3137187710610987	1.3937269292468195	1.363543076401242	1.4534933795723468	1.3505164298772838	1.1768762190590198	1.3094956527702215	1.0724307522157788	0.8367378477147875	1.1115543450502512	1.41579031575966	1.35236365283812	1.188225332382421	1.4023074801647248	1.0606976100310446	1.4153400956915605	1.2299011099811112	1.2143100344715583	0.06955836605959576	-0.39034507330754287	-0.3100882045881368	-0.19666404464141385	-0.4239933611743021	-0.15126029953924092	0.07318892184241133	0.11136281089299227	0.08858870910362615	-0.33302931921577494	0.05179701929031855	-0.22359226959123557	-0.13620639540572524	0.265084565602	0.265084565602	0.0515422504639	0.242741268695	0.011815065659	0.0350255264852	0.179364149792	0.840380101088	0.237368605078	0.0698833862508	0.0741297894045	0.288805731951	0.000338491053263	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.283655502634	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:51549473..51549587,+__1444.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:51549473..51549587,+__1444.1.0.0	rs10993994	-2.3551765972787466	-1.4489732572273486	-2.150615574761468	-2.110831494542845	-2.174294672785616	-1.957850889119129	-2.5782814218190886	-1.6606420183415966	-1.8748007765162396	-1.9518184115238155	-1.6106946301857819	-2.1397203615297773	-2.0011416754692877	-1.4101714621796742	-1.5265494735264846	-1.439746099276518	-2.0028252832315894	-1.9666003355378767	-1.9763773063588768	-1.7692397581765429	-1.1206489548716605	-1.757312362029202	-1.6661408864191742	-1.717969686611512	-2.0269950769097282	-1.698381390427403	0.9450051350990725	-0.07757621629913602	0.7108694754849498	0.10800621131125565	0.2076943372477391	-0.018526417239747683	0.8090416636425457	0.5399930634699361	0.11748841448703762	0.2856775251046413	-0.1072750564257301	0.11272528462004905	0.3027602850418844	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:51549473..51549587,+__1444.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:51549473..51549587,+__1444.1.0.0	rs4935176	-2.3551765972787466	-1.4489732572273486	-2.150615574761468	-2.110831494542845	-2.174294672785616	-1.957850889119129	-2.5782814218190886	-1.6606420183415966	-1.8748007765162396	-1.9518184115238155	-1.6106946301857819	-2.1397203615297773	-2.0011416754692877	-1.5790697395842281	-1.7764936891548007	-1.578623192020447	-1.5609899025914995	-1.518394822360599	-1.4768431501928196	-1.8758221878071204	-1.3291691294042411	-1.7711957334445618	-1.9282043118890275	-1.975217533708114	-1.7984720728328976	-1.680707955415863	0.7761068576945185	-0.32752043192745206	0.5719923827410209	0.5498415919513455	0.6558998504250169	0.48100773892630944	0.7024592340119682	0.3314728889373555	0.10360504307167773	0.023614099634788	-0.3645229035223321	0.34124828869687973	0.32043372005342463	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr10:51549473..51549587,+__1444.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:51549473..51549587,+__1444.1.0.0	rs10993994,rs4935176	-2.3551765972787466	-1.4489732572273486	-2.150615574761468	-2.110831494542845	-2.174294672785616	-1.957850889119129	-2.5782814218190886	-1.6606420183415966	-1.8748007765162396	-1.9518184115238155	-1.6106946301857819	-2.1397203615297773	-2.0011416754692877	-1.4168872560867527	-1.3307856127692477	-1.1224347617229387	-1.4250663701196675	-1.3723945176473697	-1.8137006988954618	-1.411928226454681	-1.2985086260694794	-1.4572741325552587	-1.4677534711897695	-1.48264022962213	-1.740981440269955	-1.4450296119502257	0.9382893411919939	0.11818764445810093	1.0281808130385293	0.6857651244231775	0.8019001551382461	0.14415019022366726	1.1663531953644075	0.36213339227211727	0.4175266439609808	0.484064940334046	0.12805440056365192	0.39873892125982224	0.5561120635190618	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:52645352..52645466,-__1445.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:52645352..52645466,-__1445.1.0.0	rs10994860	-1.5311112841587726	-1.120238738328795	-1.5170238346484357	-1.7441862485675868	-1.4555695365591632	-1.2436761968103764	-1.2804038914071558	-1.2962672812714429	-1.524316428149941	-1.9069059961546702	-1.0960891466226923	-1.453750832978413	-1.4307949513047873	-1.7589039955065793	-1.8868272294174195	-2.0196910290791967	-1.3595105951721589	-1.6569100232278824	-1.423089237465068	-1.8618381037443141	-1.5881313972139048	-1.4821383126904695	-1.234540812322109	-1.8891890846939332	-1.4249117995860947	-1.6321401350099274	-0.22779271134780665	-0.7665884910886245	-0.502667194430761	0.38467565339542786	-0.20134048666871918	-0.17941304065469166	-0.5814342123371583	-0.291864115942462	0.04217811545947159	0.672365183832561	-0.7930999380712409	0.028839033392318303	-0.20134518370514043	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:52645397..52645511,-__1446.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:52645397..52645511,-__1446.1.0.0	rs10994860	0.7220810039547695	1.0292565386066448	0.7301043800587617	0.7443193154199375	0.8952912030088489	0.9809309392665658	1.0170002950764256	1.2102313640115292	1.142013487106094	1.2287213272547404	1.120655726398427	1.174474630628663	0.9995900175659506	0.523816788468539	0.5000016006838766	0.4910164299264769	0.6237606183910294	0.556712374382833	0.6104065649600899	0.7836037525967637	0.825621200145002	0.5139364706978603	0.8014612435519053	0.7669349375180831	0.6465320512742395	0.6369836693830583	-0.19826421548623052	-0.5292549379227682	-0.23908795013228473	-0.12055869702890809	-0.33857882862601585	-0.3705243743064759	-0.2333965424796619	-0.38461016386652724	-0.6280770164082338	-0.4272600837028351	-0.35372078888034386	-0.5279425793544236	-0.36260634818289245	0.282745459933	0.166665831608	0.143314270352	0.85089220831	0.143314270352	0.0583274625199	0.158583637061	0.0619890035232	0.000751093855117	0.0168468410067	0.0296152123457	0.0072436377838	1.14725123077e-06	1	1	1	1	1	1	1	1	0.580595550006	1	1	1	0.000961396531387	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:60028845..60028959,+__1447.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:60028845..60028959,+__1447.1.0.0	rs2251039	0.3738960139482509	0.3947510335724569	0.5119705633398566	0.09395657253858547	0.4648464185416894	0.34505686863073715	0.3037344199584522	0.4665903306448707	0.3351657332137238	0.31969961201009733	0.35587050992430147	0.4842858140690042	0.37081865753266885	0.31126561534077046	0.4716047441970011	0.3861748382261596	0.2435397161668585	0.4062494822224106	0.5316007128377328	0.3319459055837558	0.6318077336199578	0.5600195354614054	0.37781895356876194	0.3860192401286251	0.5600081076991554	0.4331712154210496	-0.06263039860748043	0.07685371062454421	-0.12579572511369697	0.14958314362827302	-0.058596936319278814	0.18654384420699566	0.028211485625303623	0.16521740297508708	0.2248538022476816	0.058119341558664606	0.030148730204323626	0.07572229363015126	0.062352557888380705	0.340418419004	0.326996172605	0.788281320858	0.657696241675	0.840380101088	0.747262025795	0.301187193336	0.175053819161	0.288805731951	0.628827692687	0.861430881609	0.978575937473	0.839478954916	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:60028845..60028959,+__1447.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:60028845..60028959,+__1447.1.0.0	rs2790171	0.3738960139482509	0.3947510335724569	0.5119705633398566	0.09395657253858547	0.4648464185416894	0.34505686863073715	0.3037344199584522	0.4665903306448707	0.3351657332137238	0.31969961201009733	0.35587050992430147	0.4842858140690042	0.37081865753266885	0.24874946194600467	0.21066109479886141	0.3079842615089424	0.13674664125624	0.2626465517481452	0.29058935514167944	0.02920610008182733	0.44769334215132683	0.2447036806046365	0.08693464739678998	0.2658008417155846	0.16964127421541111	0.22511310438045415	-0.12514655200224623	-0.18408993877359547	-0.20398630183091415	0.042790068717654534	-0.20219986679354418	-0.054467513489057706	-0.27452831987662485	-0.018896988493543876	-0.0904620526090873	-0.23276496461330737	-0.09006966820871687	-0.3146445398535931	-0.14570555315221473	0.136115392203	0.301187193336	0.29495293544	0.706946403854	0.21176555971	0.326996172605	0.0531733827136	0.925117039075	0.253741740693	0.033878520686	0.737113058664	0.0678362651725	0.0326835709704	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr10:60028845..60028959,+__1447.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:60028845..60028959,+__1447.1.0.0	rs35093457,rs2251039,rs2790171	0.3738960139482509	0.3947510335724569	0.5119705633398566	0.09395657253858547	0.4648464185416894	0.34505686863073715	0.3037344199584522	0.4665903306448707	0.3351657332137238	0.31969961201009733	0.35587050992430147	0.4842858140690042	0.37081865753266885	0.09449263061998368	0.18938254041882197	0.3079785205760643	0.5822603415064608	0.24113580928707984	0.3748200828660756	0.4345222860322856	0.45759112230312915	0.6110952601377457	0.37864641442971664	0.5522003815685869	0.7462390631327178	0.414197037739889	-0.2794033833282672	-0.20536849315363492	-0.2039920427637923	0.4883037689678753	-0.22371060925460956	0.029763214235338453	0.13078786607383341	-0.00899920834174156	0.27592952692402195	0.058946802419619304	0.1963298716442854	0.26195324906371364	0.04337838020722016	0.162586850726	0.925117039075	0.242741268695	0.190479315237	0.0499532058383	0.88258056334	0.572794651112	0.957167318493	0.13967914143	0.536806685117	0.107123399254	0.104229562843	0.180719589239	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:64564400..64564514,+__1448.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:64564400..64564514,+__1448.1.0.0	rs7090365	1.7126595792920374	2.145213267715068	1.6361403808211226	1.5798305822863616	1.5437820667788258	1.8033283093630337	1.7299357785560032	1.9863769336352108	1.8792010476746297	2.0444132452474393	1.8809659364462106	1.7601772204428305	1.8085020290215645	2.2352021644851368	2.201051926834837	2.0222322498273124	1.6803582714809857	1.835669119683104	2.0149246360261164	1.8648187185924288	1.9782316194518152	1.879882075087371	2.106743989534281	1.9926640036898933	1.9757742152449718	1.9822960824948543	0.5225425851930994	0.05583865911976904	0.38609186900618986	0.10052768919462407	0.2918870529042783	0.2115963266630827	0.13488294003642554	-0.008145314183395591	0.0006810274127413418	0.06233074428684171	0.1116980672436827	0.21559699480214123	0.17379405347329002	0.0224529881577	0.727009731456	0.129198935732	0.493479697885	0.0362033618716	0.0785847853765	0.265084565602	0.914457985151	0.716953652062	0.76769033028	0.390154148302	0.397602565759	0.109833072915	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr10:90967036..90967150,-__1449.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr10:90967036..90967150,-__1449.1.0.0	rs4417181	0.7551769684646569	0.7859074462861743	0.7450782410983532	0.3453698699684435	0.6311804003213171	0.6969849123778769	0.6189683165005061	0.5754417737240668	0.5707029706652565	0.7241876322119897	0.7263438055945937	0.7027793587806163	0.6565101413328209	0.5826270947320493	0.9395510640491325	0.8865225867024615	0.629127833507189	0.7608134093122199	0.6770935680109005	0.511712174994604	0.7123901167136648	0.5808205727431335	0.8244679187368751	0.7218424656223302	0.7463177807380552	0.7144405488218847	-0.17254987373260755	0.1536436177629582	0.14144434560410835	0.28375796353874555	0.1296330089909028	-0.01989134436697637	-0.10725614150590213	0.13694834298959802	0.01011760207787693	0.10028028652488541	-0.0045013399722634295	0.043538421957438955	0.05793040748906373	0.677233097055	0.428242856315	0.591208103411	0.347268461228	0.8931878581	0.545696106059	0.737113058664	0.628827692687	0.79863356553	0.967868733231	0.935789553219	0.687084607526	0.980269906323	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:101454532..101454646,-__1450.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:101454532..101454646,-__1450.1.0.0	rs41302375	-1.049870669124242	-1.1322197031014394	-0.725584309106893	-0.9279260512582967	-1.4692756622471017	-1.1712447916294628	-1.16020111420024	-1.5428028266166616	-1.0567602333453523	-1.37613209039421	-1.0161892099814165	-0.9932239807470374	-1.1351192201460294	-1.185683194679268	-1.0331673272386257	-0.6735931336836395	-0.9261303876335724	-1.1422470956630904	-1.1121391573734882	-1.1702281034190332	-0.8845477940905077	-1.0293077607133296	-1.3047358128281192	-1.300543361173948	-1.3906948364170346	-1.0960848304094715	-0.135812525555026	0.09905237586281368	0.05199117542325349	0.0017956636247243862	0.32702856658401136	0.05910563425597459	-0.010026989218793192	0.6582550325261539	0.027452472632022662	0.0713962775660908	-0.2843541511925316	-0.3974708556699972	0.03903438973655807	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:111169954..111170068,+__1451.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:111169954..111170068,+__1451.1.0.0	rs11213823	-1.1877120298744288	-1.5484737569269056	-1.9653484019107934	-1.6260236907987815	-1.634052363344028	-1.6729544458571959	-1.347624842106805	-1.5795393956976296	-1.5738672795073119	-1.502952879532526	-1.4153658970392824	-1.9443175271685909	-1.5831860424803563	-1.3482445088857014	-1.201065377696654	-1.2647032421910043	-1.6471350016561286	-1.708128726356792	-2.071988087410705	-2.1565429085469003	-1.5751140269334216	-1.7303037534422945	-1.4516595167561044	-2.0826314232265646	-1.9029091662697404	-1.6783688116143345	-0.16053247901127254	0.3474083792302516	0.7006451597197891	-0.021111310857347076	-0.07407636301276388	-0.3990336415535092	-0.8089180664400952	0.00442536876420796	-0.1564364739349826	0.0512933627764216	-0.6672655261872822	0.04140836089885047	-0.09518276913397766	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:116662560..116662674,-__1452.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:116662560..116662674,-__1452.1.0.0	rs651821	-1.0301334517209384	-1.5632311475526928	-1.5906623384749816	-1.2923175912205225	-1.9545684248165718	-1.4303501347812484	-1.6556855945390954	-1.2123259059740958	-1.5682818527435272	-1.2531317537315418	-1.7235649087192952	-1.5715086979304036	-1.4871468168504096	-1.119121630587007	-0.92429405268969	-1.5535294634321517	-1.0866285574101129	-1.4270252547549749	-0.9705258417313768	-1.1283626705857468	-0.7574990737368925	-1.0743059842129208	-1.1095666005536513	-1.033943880177183	-0.8150081908657739	-1.0833176000614568	-0.08898817886606869	0.6389370948630028	0.037132875042829916	0.2056890338104096	0.5275431700615969	0.4598242930498716	0.5273229239533486	0.4548268322372033	0.4939758685306064	0.14356515317789054	0.6896210285421123	0.7565005070646297	0.4038292167889527	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:118901547..118901661,-__1453.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:118901547..118901661,-__1453.1.0.0	rs1784559	1.318880249412833	1.5200038930448398	0.9039782008714204	1.1183837886251164	1.2481388409213694	1.0737190985525564	1.3369588973553792	1.249192784037244	1.3000972363749561	1.205951659703916	1.278205974037824	1.0873700545919431	1.2200733897941165	1.1861141702955535	1.4274077895492805	0.9659983073207666	0.9814527746023425	1.3848398219212756	1.3038011770774616	1.0054591985983568	1.3439263814020983	0.940791633444461	1.0571261760553472	1.0895984780219146	1.1593927187910404	1.1538257189233248	-0.13276607911727956	-0.09259610349555936	0.06202010644934619	-0.13693101402277397	0.13670098099990624	0.23008207852490514	-0.33149969875702245	0.0947335973648542	-0.35930560293049507	-0.14882548364856873	-0.18860749601590943	0.07202266419909731	-0.06624767087079163	0.253741740693	0.692027146526	0.301187193336	0.440072858924	0.206893929435	0.0619890035232	0.375513989452	0.31069646386	0.581967350665	0.935789553219	0.946473618223	0.493479697885	0.422515573283	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:118901547..118901661,-__1453.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:118901547..118901661,-__1453.1.0.0	rs114116089	1.318880249412833	1.5200038930448398	0.9039782008714204	1.1183837886251164	1.2481388409213694	1.0737190985525564	1.3369588973553792	1.249192784037244	1.3000972363749561	1.205951659703916	1.278205974037824	1.0873700545919431	1.2200733897941165	0.8616949569486647	1.0876949745951137	0.9884805943090984	0.8752721080751124	1.1874206309838147	1.100965898099924	1.1942274841869762	1.4397308651789658	1.1950471809889376	1.0880980310939643	0.9801277883922962	1.2437162093073937	1.1035397268466887	-0.4571852924641684	-0.4323089184497262	0.08450239343767796	-0.2431116805500041	-0.060718209937554724	0.02724679954736753	-0.142731413168403	0.19053808114172166	-0.10505005538601853	-0.11785362860995163	-0.2980781856455278	0.15634615471545055	-0.11653366294742805	0.288805731951	0.536806685117	0.390154148302	0.967868733231	0.696989544957	0.232080506959	0.412754243182	0.288805731951	0.677233097055	0.989287003123	0.605185994712	0.323688179414	0.780696342805	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr11:118901547..118901661,-__1453.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:118901547..118901661,-__1453.1.0.0	rs1784559,rs114116089	1.318880249412833	1.5200038930448398	0.9039782008714204	1.1183837886251164	1.2481388409213694	1.0737190985525564	1.3369588973553792	1.249192784037244	1.3000972363749561	1.205951659703916	1.278205974037824	1.0873700545919431	1.2200733897941165	1.2718937920297189	1.3391874836061357	1.3113413232222877	1.0484973120984054	1.1945667149097199	1.509740200334094	1.2915036592292486	1.5265777700102348	1.4026372200102613	1.2604936124037358	1.069013768801413	1.4669096754348645	1.3076968776741766	-0.046986457383114244	-0.18081640943870414	0.40736312235086725	-0.0698864765267111	-0.05357212601164951	0.43602110178153763	-0.045455238126130615	0.27738498597299066	0.10253998363530514	0.05454195269981987	-0.20919220523641102	0.37953962084292137	0.0876234878800601	0.85089220831	0.989287003123	0.347268461228	0.757455001208	0.967868733231	0.0986283746992	0.946473618223	0.501992688725	0.79863356553	0.63839046467	0.333666485083	0.192768091005	0.95056422987	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:125439321..125439435,+__1454.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:125439321..125439435,+__1454.1.0.0	rs3017281	1.2346441311424623	1.9527638213443224	1.4391311185269726	1.6045830764314415	1.8967787199517563	1.0812183247060756	0.8979306616459065	1.442231887512396	1.9100567679566005	2.7060926381787698	1.1957638443357184	0.29416247503689424	1.4712797888974432	1.5755190185040102	1.4217694404075223	1.5438224454512561	0.39507140370695737	0.8268167593217663	0.41829821965193437	0.7216935493368741	0.8453586983092475	1.573556780432885	0.5973018207506536	0.831432722591976	0.13065574499132904	0.906774716954701	0.3408748873615479	-0.5309943809368001	0.10469132692428351	-1.2095116727244841	-1.06996196062999	-0.6629201050541412	-0.17623711230903238	-0.5968731892031486	-0.33649998752371557	-2.1087908174281162	-0.3643311217437424	-0.1635067300455652	-0.5645050719427419	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:129685665..129685779,+__1455.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:129685665..129685779,+__1455.1.0.0	rs11606613	-0.4062835877428571	-0.08719049983177374	0.019501542441964066	-0.5720423947403811	0.4782671290465215	-0.7949077021600447	-1.0566891603644526	0.5355288733445871	-1.596315971320997	-0.6118524437449107	0.24994178285711444	0.09297841726556155	-0.31242200124580566	0.3672009695214749	-0.6263401569412509	-0.2474212825746236	-0.009113957169792427	1.0009458272911624	0.3205310636379254	0.71719459696611	0.2573136981714537	0.408720092244598	-0.5023207873969725	-0.35504774261815725	0.14625191851177594	0.12315951997030866	0.7734845572643321	-0.5391496571094772	-0.26692282501658765	0.5629284375705886	0.522678698244641	1.11543876579797	1.7738837573305626	-0.2782151751731334	2.005036063565595	0.10953165634793816	-0.6049895254752717	0.05327350124621438	0.43558152121611426	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:18287731..18287845,+__1456.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:18287731..18287845,+__1456.1.0.0	rs1829575	-0.8118813860985223	-1.2255412046177159	-1.4367785437104916	-1.2032852079820282	-1.1444271982090184	-0.9275294766530401	-1.18069293142445	-1.2623658451901998	-0.8965495002440363	-1.4211824566081834	-0.9632042448403868	-0.7200241515204363	-1.0994551789248759	-1.114234162013225	-1.1499742109467388	-1.1620119488143306	-1.4824658099317831	-1.3075161409578426	-1.346881292786951	-1.0741078719523212	-1.0993779079402548	-0.9193723915010159	-1.4958370005166934	-1.2614950935704945	-1.4437881684155318	-1.2380884999455986	-0.30235277591470267	0.07556699367097708	0.27476659489616106	-0.2791806019497549	-0.16308894274882424	-0.4193518161339108	0.10658505947212893	0.16298793724994498	-0.02282289125697956	-0.07465454390851001	-0.2982908487301077	-0.7237640168950955	-0.1386333210207228	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:18287731..18287845,+__1456.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:18287731..18287845,+__1456.1.0.0	rs11024595	-0.8118813860985223	-1.2255412046177159	-1.4367785437104916	-1.2032852079820282	-1.1444271982090184	-0.9275294766530401	-1.18069293142445	-1.2623658451901998	-0.8965495002440363	-1.4211824566081834	-0.9632042448403868	-0.7200241515204363	-1.0994551789248759	-0.9240931061811484	-1.1537572646815335	-1.0760690975063802	-1.3172377189245195	-1.5356002818581391	-1.1153700670882651	-1.1379293731290705	-1.5316646269105194	-1.4635010255273275	-1.5461202413070882	-1.0740023963285836	-1.1741746854668897	-1.2541266570757885	-0.11221172008262603	0.07178393993618237	0.3607094462041114	-0.11395251094249126	-0.39117308364912073	-0.18784059043522505	0.04276355829537959	-0.2692987817203196	-0.5669515252832912	-0.12493778469890482	-0.11079815148819683	-0.45415053394645344	-0.15467147815091298	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:18287731..18287845,+__1456.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:18287731..18287845,+__1456.1.0.0	rs2445166	-0.8118813860985223	-1.2255412046177159	-1.4367785437104916	-1.2032852079820282	-1.1444271982090184	-0.9275294766530401	-1.18069293142445	-1.2623658451901998	-0.8965495002440363	-1.4211824566081834	-0.9632042448403868	-0.7200241515204363	-1.0994551789248759	-0.8105477410945434	-1.5952065026986988	-1.626987897505927	-1.2126529536670212	-1.2395646405725924	-1.2223444767656488	-1.2652987602632395	-1.4605375137192416	-1.28514025195971	-1.364316389812933	-1.229936130218121	-1.4530137720201517	-1.3137955858581523	0.0013336450039789227	-0.3696652980809829	-0.19020935379543547	-0.00936774568499299	-0.09513744236357402	-0.29481500011260875	-0.08460582883878942	-0.19817166852904178	-0.3885907517156736	0.056866066795250525	-0.2667318853777343	-0.7329896204997154	-0.2143404069332766	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr11:18287731..18287845,+__1456.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:18287731..18287845,+__1456.1.0.0	rs1829575,rs11024595,rs2445166	-0.8118813860985223	-1.2255412046177159	-1.4367785437104916	-1.2032852079820282	-1.1444271982090184	-0.9275294766530401	-1.18069293142445	-1.2623658451901998	-0.8965495002440363	-1.4211824566081834	-0.9632042448403868	-0.7200241515204363	-1.0994551789248759	-0.8926921386071993	-1.0581808448530936	-0.8699982060472231	-0.9734681454418588	-1.660847617607578	-1.9530503002813804	-1.6394648925389594	-1.411872404025309	-1.7329542522183723	-1.568485114952297	-1.379851118353164	-1.199962393103206	-1.36173561900247	-0.08081075250867698	0.16736035976462227	0.5667803376632685	0.22981706254016943	-0.5164204193985595	-1.0255208236283404	-0.45877196111450935	-0.14950655883510922	-0.836404751974336	-0.1473026583441135	-0.4166468735127773	-0.47993824158276965	-0.26228044007759427	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:18344014..18344128,+__1457.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:18344014..18344128,+__1457.1.0.0	rs3802967	2.3747560157468808	2.5766547228112273	2.4589451900005708	2.168785091098376	2.3193888877290036	2.3901510833718316	2.065233234989281	2.370307312946168	2.248988106393881	2.090058227081362	2.162685760740036	2.3920002506375986	2.3014961569621843	2.491710474555342	2.876133599513697	2.3937171319351016	2.373087670133954	2.4467708629899065	2.306679948677685	2.1969250014177577	2.3615058359886394	2.3259692582111384	2.3434598628544983	2.3248139074274805	2.354108806817113	2.399573530043526	0.11695445880846123	0.29947887670246987	-0.06522805806546916	0.2043025790355779	0.1273819752609029	-0.08347113469414635	0.1316917664284767	-0.008801476957528642	0.0769811518172574	0.2534016357731361	0.16212814668744446	-0.03789144382048537	0.09807737308134142	0.468411351413	0.747262025795	0.476688253492	0.657696241675	0.737113058664	0.66743649171	0.957167318493	0.60051573606	0.87199428352	0.104229562843	0.301187193336	0.716953652062	0.870245191324	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:18344034..18344148,+__1458.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:18344034..18344148,+__1458.1.0.0	rs3802967	1.8223001262994083	1.8543794204143902	1.814912029236914	1.7007300332795716	1.872239148014896	1.9279868812402667	1.4094858357987476	1.6764322039918045	1.5349349571343465	1.6022646643392848	1.6695318647315176	1.5996127806097231	1.7070674954242395	2.108526414699464	2.323420566660471	1.984050237309004	1.8794243220528568	1.8327142731019825	1.9082499835742666	1.7281981473996724	1.9424405679987244	1.7860779736915577	1.6852132816984617	1.7658823638000987	1.843818301269271	1.8990013694379861	0.2862262884000557	0.46904114624608084	0.16913820807209	0.1786942887732852	-0.039524874912913566	-0.019736897666000175	0.3187123116009247	0.26600836400691996	0.2511430165572113	0.08294861735917691	0.09635049906858106	0.24420552065954793	0.19193387401374665	0.0658387268341	0.0194743211566	0.0698833862508	0.147021540231	0.8931878581	0.696989544957	0.0619890035232	0.0350255264852	0.253741740693	0.265084565602	0.63839046467	0.276771967065	0.00389717900538	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:1892488..1892602,+__1459.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:1892488..1892602,+__1459.1.0.0	rs78405116	-0.41837609346348004	-0.4531675625762186	-0.6591836496203806	-0.868672680406441	-0.9878757029273644	-0.7088521273843202	-0.6298119035741069	-1.223863635969482	-0.7329778837886484	-0.6650096900471049	-0.5602204508715285	-0.821881120967069	-0.7274910417996788	-0.9425709522815872	-1.1304608604401243	-0.7026953119355178	-1.0647141438086165	-0.9236800729454637	-0.644424884143362	-0.9409906858477048	-1.3992451240704726	-1.1250022358215417	-0.9878757029273644	-0.8091138947092626	-0.7800143285718244	-0.9542323497919037	-0.5241948588181071	-0.6772932978639057	-0.043511662315137256	-0.19604146340217554	0.06419562998190065	0.06442724324095828	-0.31117878227359796	-0.17538148810099052	-0.3920243520328933	-0.3228660128802595	-0.24889344383773415	0.0418667923952446	-0.22674130799222472	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.819442862795	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.809021331888	0.896881622629	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:1892488..1892602,+__1459.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:1892488..1892602,+__1459.1.0.0	rs4980389	-0.41837609346348004	-0.4531675625762186	-0.6591836496203806	-0.868672680406441	-0.9878757029273644	-0.7088521273843202	-0.6298119035741069	-1.223863635969482	-0.7329778837886484	-0.6650096900471049	-0.5602204508715285	-0.821881120967069	-0.7274910417996788	-0.8376147070943609	-0.385888677575274	-1.1652436835018798	-1.056779518498231	-0.6917477546512026	-0.36664614310112065	-0.5533975835273676	-0.6830314363514215	-0.6428964644439851	-0.647338676791072	-0.7974335154916674	-0.8158101508360264	-0.7203190259886342	-0.4192386136308809	0.06727888500094459	-0.5060600338814992	-0.18810683809178996	0.29612794827616173	0.3422059842831996	0.07641432004673931	0.5408321996180606	0.0900814193446633	0.01767101325603282	-0.2372130646201389	0.00607097013104263	0.007172015811044642	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.737113058664	0.757455001208	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.826979812542	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr11:1892488..1892602,+__1459.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:1892488..1892602,+__1459.1.0.0	rs78405116,rs4980389	-0.41837609346348004	-0.4531675625762186	-0.6591836496203806	-0.868672680406441	-0.9878757029273644	-0.7088521273843202	-0.6298119035741069	-1.223863635969482	-0.7329778837886484	-0.6650096900471049	-0.5602204508715285	-0.821881120967069	-0.7274910417996788	-0.9170227658119772	-0.6428589060955732	-0.6560312435312823	-0.8230198803308365	-0.8848139403606624	-0.7734926286101458	-0.732428181999701	-0.7325154710845561	-0.6227080203915327	-0.43061399913475085	-1.2830118886964335	-0.4227678811116044	-0.743440400596588	-0.49864667234849713	-0.18969134351935457	0.003152406089098281	0.04565280007560446	0.10306176256670196	-0.06464050122582554	-0.10261627842559407	0.49134816488492605	0.11026986339711564	0.23439569091235402	-0.722791437824905	0.3991132398554646	-0.01594935879690927	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.8931878581	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.313917214294	0.704232190375	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr11:207356..207470,-__1460.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr11:207356..207470,-__1460.1.0.0	rs71487219	2.286466480239819	2.4589431809595803	1.8575107064194665	1.9901773432388548	2.5621824423158297	2.4078695126507155	2.1900489591432484	2.568463567088095	2.3858503311014374	2.424973897318174	2.1290726614915325	2.536353839654972	2.3164927434684777	2.2529862219484045	2.3271530109074963	2.3037122752943846	2.10803018631065	2.4429303866366934	2.1430150437377056	2.11620093397286	2.1427625525230596	2.3755184205474906	1.740432493437588	2.114321639231946	1.8039128486863791	2.155914667769555	-0.03348025829141443	-0.13179017005208404	0.44620156887491813	0.11785284307179511	-0.11925205567913633	-0.2648544689130099	-0.07384802517038835	-0.4257010145650355	-0.010331910553946777	-0.6845414038805859	-0.014751022259586577	-0.7324409909685927	-0.16057807569892227	0.737110160717	0.444064484515	0.0808926541269	0.0440018610392	0.242741268695	0.436112310787	0.232080506959	0.747262025795	0.66743649171	0.60051573606	0.0638899216795	0.809021331888	0.15637665075	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr11:207356..207470,-__1460.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr11:207356..207470,-__1460.1.0.0	rs58692051	2.286466480239819	2.4589431809595803	1.8575107064194665	1.9901773432388548	2.5621824423158297	2.4078695126507155	2.1900489591432484	2.568463567088095	2.3858503311014374	2.424973897318174	2.1290726614915325	2.536353839654972	2.3164927434684777	2.678904185896749	3.159706692288927	2.577603855277456	2.3149131931737763	2.734536781359357	2.829006637814963	2.6277863910825205	2.96183089711988	2.764550345609814	2.825379242892631	2.9226259880285985	2.9756018920732314	2.781037175218158	0.3924377056569299	0.7007635113293467	0.7200931488579894	0.32473584993492155	0.17235433904352737	0.4211371251642477	0.43773743193927217	0.39336733003178503	0.37870001450837654	0.40040534557445717	0.793553326537066	0.4392480524182596	0.4645444317496816	0.648010011537	0.0678362651725	0.0306357720046	0.0832552515755	0.354199901149	0.136115392203	0.108589952947	0.581967350665	0.79863356553	0.192768091005	0.00480682187369	0.143314270352	0.00115890521063	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.971162566508	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr11:207356..207470,-__1460.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr11:207356..207470,-__1460.1.0.0	rs71487219,rs58692051,rs11245998	2.286466480239819	2.4589431809595803	1.8575107064194665	1.9901773432388548	2.5621824423158297	2.4078695126507155	2.1900489591432484	2.568463567088095	2.3858503311014374	2.424973897318174	2.1290726614915325	2.536353839654972	2.3164927434684777	1.8360906839746947	2.5191712173666527	1.796416000008232	1.6025177589969097	2.2123646789165696	1.9034408267564977	1.9324155019051203	2.089369548395018	1.5503799859932728	2.244554787027612	1.8627698874359742	2.171960317818656	1.9767875995496007	-0.45037579626512425	0.060228036407072416	-0.06109470641123438	-0.387659584241945	-0.3498177633992601	-0.5044286858942177	-0.257633457238128	-0.4790940186930772	-0.8354703451081646	-0.18041911029056212	-0.26630277405555836	-0.3643935218363157	-0.3397051439188763	0.31389505589	0.747262025795	0.687084607526	0.648013768535	0.29495293544	0.390154148302	0.76769033028	0.354199901149	0.0638899216795	0.819442862795	0.79863356553	0.30750859871	0.535899600047	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:44087929..44088043,+__1461.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:44087929..44088043,+__1461.1.0.0	rs2074038	0.27083748800934176	0.6059626733861632	0.4269424188661533	0.17158918630408987	0.4484275127334105	0.3351369834496138	0.10884692687080644	0.5265670125217301	0.607764437893024	0.716223457382629	0.5266853099690627	0.5798013724635797	0.44373206498746703	1.341278947628247	1.6153916035660818	1.2330569564308846	1.3077259021930303	1.5082062747714866	1.559561881189654	1.3648214995073937	1.6197882919926723	1.6487769129686642	1.5160063128735346	1.5097348632375038	1.7208872164199822	1.4954363885649278	1.0704414596189051	1.0094289301799186	0.8061145375647314	1.1361367158889404	1.059778762038076	1.2244248977400403	1.2559745726365872	1.0932212794709422	1.0410124750756402	0.7997828554909056	0.9830495532684411	1.1410858439564024	1.051704323577461	2.34155615835e-05	1.2780782346e-05	0.00115660425805	5.30937746215e-05	5.8094165088e-08	5.38827834679e-08	8.8142435835e-06	4.73314572056e-05	8.8142435835e-06	1.093294991e-06	0.000129852144011	5.88658815831e-07	2.1539346948e-50	0.0165782176011	0.00950890206539	0.861670172248	0.039130111896	4.48486954479e-05	4.11664465694e-05	0.00651372600821	0.0344099693885	0.00681341029005	0.000858236567933	0.0998562987444	0.000458565217532	1.80499727424e-47	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:44087955..44088069,+__1462.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:44087955..44088069,+__1462.1.0.0	rs2074038	0.9256738075195633	1.0614485558286217	0.9977450758556096	0.8539890080739196	1.1411687269359745	1.0942597501483373	1.1276232000312625	1.0782184524863674	1.1504118814401292	1.3060272758726512	1.1434566810507731	1.3795837443462515	1.1049671799657885	1.6174123751525262	1.8519752726935184	1.7362130469830155	1.463216764748712	1.7095415640850469	1.7789609739288994	1.6627097261798345	1.862212647544227	1.744633452804266	1.9394033884190103	1.7679197179639328	1.856003396398485	1.7491835272417895	0.6917385676329629	0.7905267168648966	0.7384679711274059	0.6092277566747923	0.5683728371490724	0.6847012237805621	0.535086526148572	0.7839941950578597	0.5942215713641368	0.6333761125463591	0.6244630369131596	0.47641965205223347	0.6442163472760011	1.2780782346e-05	0.00105204507021	0.00480682187369	0.000911503005752	1.12997083356e-05	4.67965309508e-06	0.00110317967744	2.79850783474e-05	0.000505862288815	9.98335414644e-06	6.66706650175e-05	0.00146142948273	7.75104589871e-36	0.00904879390093	0.782721532236	1	0.671777715239	0.00872337483512	0.00357525496464	0.815249781627	0.0203451519586	0.391031549254	0.00783693300495	0.0512697413985	1	6.49537646312e-33	sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:46722124..46722238,-__1463.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:46722124..46722238,-__1463.1.0.0	rs7932354	2.0136341169008287	2.68874404495228	2.209457187851109	2.1291352660467764	2.0034920425295164	2.2384089753079954	2.03204448334605	2.4185803088880498	2.221712686467649	2.1777303543615227	2.242016245739229	2.2341142574669686	2.217422497488165	2.310155300408144	2.3493167216709065	1.919107748845294	1.999126646995572	2.1457581024968473	2.3128030834672026	1.9574248264198255	1.978601641522067	2.153056776879305	2.1766816554201203	2.296289368166542	1.9916092131830845	2.1324942571229086	0.2965211835073154	-0.33942732328137337	-0.290349439005815	-0.13000861905120442	0.14226605996733088	0.07439410815920722	-0.0746196569262243	-0.4399786673659827	-0.06865590958834389	-0.0010486989414024706	0.05427312242731297	-0.24250504428388409	-0.08492824036525531	0.772820825216	0.0286222059958	0.116187990183	0.809021331888	0.416589617895	0.90381429355	0.66743649171	0.0719809426143	0.925117039075	0.460214637573	0.364748703842	0.265084565602	0.38181756641	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:46958249..46958363,+__1464.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:46958249..46958363,+__1464.1.0.0	rs17787930	-0.5617875052038571	-0.9221656012256083	-0.9977868106015384	-1.2242157251230477	-0.8197776167932613	-1.0593822660931669	-0.8897887331296289	-1.5442283850021368	-1.3484863240045706	-0.9058035444624188	-0.5286719465344171	-0.9803710805065544	-0.9818721282233503	-1.4409481414068677	-1.2488961929621025	-1.3567270528475577	-1.7862982438419688	-1.1967118977783162	-1.6951979526804548	-1.1436312743051502	-1.0433964168070058	-1.4396011988392747	-1.2322217792228816	-1.3287377732193113	-1.270265069044744	-1.3485527494129697	-0.8791606362030105	-0.3267305917364942	-0.3589402422460193	-0.5620825187189211	-0.3769342809850549	-0.6358156865872879	-0.2538425411755213	0.500831968195131	-0.09111487483470415	-0.3264182347604627	-0.8000658266848942	-0.2898939885381895	-0.366680621189619	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr11:46958249..46958363,+__1464.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:46958249..46958363,+__1464.1.0.0	rs77436432,rs17787930	-0.5617875052038571	-0.9221656012256083	-0.9977868106015384	-1.2242157251230477	-0.8197776167932613	-1.0593822660931669	-0.8897887331296289	-1.5442283850021368	-1.3484863240045706	-0.9058035444624188	-0.5286719465344171	-0.9803710805065544	-0.9818721282233503	-1.130569807898115	-1.315869994580572	-1.1089325744844492	-1.3583358911185501	-1.1489408920449922	-1.8975906132354747	-1.5885698829603188	-0.8642905898578821	-1.2770420028832759	-1.0106683494345494	-0.8515318335402329	-1.0556341653870656	-1.2173313831187897	-0.5687823026942579	-0.39370439335496377	-0.11114576388291075	-0.13412016599550247	-0.32916327525173084	-0.8382083471423079	-0.6987811498306898	0.6799377951442547	0.07144432112129473	-0.10486480497213058	-0.3228598870058158	-0.07526308488051114	-0.23545925489543928	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:506733..506847,-__1465.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:506733..506847,-__1465.1.0.0	rs116101630	1.4442022683510398	1.6614757184366775	0.9186412720854098	0.7504704457140196	1.0830638229147498	1.0610868183961655	1.3822098623971637	0.9840526473663468	1.0418575962197771	1.2122842413005344	1.1355829622344613	1.229359696297166	1.1586906126427925	2.2710838283192865	2.316891017661953	2.290577717313576	1.9625082249383048	2.110483563466751	2.1485233998236204	2.136188614995592	2.1219718145954487	2.2895131122308188	2.2509972979818857	2.2992103937879924	2.2848656605343005	2.2069012204707943	0.8268815599682466	0.6554152992252753	1.3719364452281662	1.2120377792242851	1.0274197405520011	1.087436581427455	0.7539787525984283	1.1379191672291018	1.2476555160110416	1.0387130566813514	1.163627431553531	1.0555059642371345	1.0482106078280016	0.00668210963275	0.00372847011721	0.00133155906714	0.00210606019307	0.00480633843519	0.00205914066534	0.0648552183257	0.00251850159852	0.000199758557674	0.00389134425826	0.00342117348194	0.00490735403579	5.86503620405e-21	1	1	0.992011505021	1	1	1	1	1	0.154413365082	1	1	1	4.91490033899e-18	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:537447..537561,+__1466.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:537447..537561,+__1466.1.0.0	rs112360405	0.8655540037435382	1.4120381939508317	0.8688429649339187	0.7385762958950346	1.1980170737958389	1.108896071861456	0.8371633479171909	1.0269300577046214	1.1435930853397167	1.0498641574327832	1.027792487884404	1.069625458632755	1.0289077665910076	0.9985772769845551	1.1271117804504918	0.9786702954125791	0.7905801177771168	0.9998060492649434	0.9849767548877129	0.695093366548765	0.8455907193855858	0.7616818860089458	1.0024278349133156	1.0527328037108774	0.9727178759811599	0.9341638967771709	0.13302327324101693	-0.28492641350034	0.10982733047866045	0.05200382188208219	-0.19821102453089545	-0.12391931697374314	-0.14206998136842597	-0.1813393383190356	-0.3819111993307709	-0.04743632251946761	0.02494031582647338	-0.09690758265159505	-0.09474386981383671	0.935789553219	0.188220673538	0.788281320858	0.63839046467	0.347268461228	0.347268461228	0.242741268695	0.288805731951	0.0638899216795	0.727009731456	0.925117039075	0.382791178922	0.496982391943	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:537447..537561,+__1466.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:537447..537561,+__1466.1.0.0	rs112687793	0.8655540037435382	1.4120381939508317	0.8688429649339187	0.7385762958950346	1.1980170737958389	1.108896071861456	0.8371633479171909	1.0269300577046214	1.1435930853397167	1.0498641574327832	1.027792487884404	1.069625458632755	1.0289077665910076	0.885916616822944	1.2440738686573496	0.9882880996339414	0.9117040015385556	1.0600454350809598	1.0696667958898132	0.8581796773744232	1.036201573510539	0.9423490558246032	1.0693034848815046	0.8920406013037095	0.9624574521535786	0.9933522218893268	0.02036261307940579	-0.16796432529348215	0.11944513470002271	0.17312770564352098	-0.13797163871487905	-0.03922927597164283	0.021016329457232308	0.009271515805917563	-0.20124402951511355	0.019439327448721455	-0.13575188658069448	-0.10716800647917635	-0.03555554470168063	0.706946403854	0.788281320858	0.234708652176	0.448066215252	0.87199428352	0.716953652062	0.628827692687	0.628827692687	0.90381429355	0.619326784864	0.967868733231	0.747262025795	0.978071305818	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:537447..537561,+__1466.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:537447..537561,+__1466.1.0.0	rs61877795	0.8655540037435382	1.4120381939508317	0.8688429649339187	0.7385762958950346	1.1980170737958389	1.108896071861456	0.8371633479171909	1.0269300577046214	1.1435930853397167	1.0498641574327832	1.027792487884404	1.069625458632755	1.0289077665910076	0.9974572589020889	1.1233278027838056	1.0623879658791608	0.8315490238884213	0.9826758579699325	0.8326884728376918	0.6311942013077679	0.7268537790165424	0.7419476660612383	0.7640007834704506	0.775728026473159	0.8046935208138586	0.8562086966170098	0.13190325515855073	-0.2887103911670261	0.19354500094524218	0.09297272799338674	-0.21534121582590637	-0.27620759902376424	-0.205969146609423	-0.30007627868807907	-0.4016454192784784	-0.2858633739623325	-0.25206446141124506	-0.26493193781889635	-0.17269906997399764	0.946473618223	0.192768091005	0.747262025795	0.935789553219	0.125844655769	0.493479697885	0.116187990183	0.0548474154937	0.0120431385799	0.0959193233604	0.527990680582	0.175053819161	0.057780346334	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr11:537447..537561,+__1466.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:537447..537561,+__1466.1.0.0	rs112360405,rs112687793,rs61877795	0.8655540037435382	1.4120381939508317	0.8688429649339187	0.7385762958950346	1.1980170737958389	1.108896071861456	0.8371633479171909	1.0269300577046214	1.1435930853397167	1.0498641574327832	1.027792487884404	1.069625458632755	1.0289077665910076	0.666281363957625	1.0537825922999997	0.9038774912165697	0.5672166230979796	0.8343976478929529	1.0241251024168618	0.7384381953668235	1.0750347140896939	0.9651698457039728	0.9891199373925064	0.7643047612568021	1.0057367730439781	0.8822904206446472	-0.19927263978591314	-0.35825560165083203	0.035034526282651024	-0.171359672797055	-0.363619425902886	-0.08477096944459417	-0.0987251525503674	0.04810465638507244	-0.1784232396357439	-0.0607442200402768	-0.2634877266276019	-0.0638886855887768	-0.1466173459463603	0.0619890035232	0.162586850726	0.85089220831	0.0678362651725	0.108589952947	0.288805731951	0.170821264488	0.60051573606	0.628827692687	0.572794651112	0.648013768535	0.716953652062	0.124392768772	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:57435223..57435337,+__1467.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:57435223..57435337,+__1467.1.0.0	rs113945170	1.4986979668028053	1.7552055647806375	1.450798846033328	1.1939310723491938	1.633688718593876	1.6850098703733547	1.8677858568295025	1.8966847111438023	1.782344069348694	1.7403799155281978	1.9190610770397079	1.8146080520384391	1.686516310071795	1.3846699539676304	1.4369124389058674	1.3228219506305146	1.4090533247842334	1.2179843575020577	1.1983526181284618	1.4791579100334533	1.7816279714803773	1.6751172930755418	1.5418433158757532	1.6633597985074533	1.4867267755861822	1.4664689757064604	-0.11402801283517494	-0.3182931258747701	-0.12797689540281354	0.21512225243503957	-0.4157043610918183	-0.48665725224489287	-0.3886279467960492	-0.115056739663425	-0.10722677627315225	-0.19853659965244463	-0.25570127853225455	-0.32788127645225695	-0.2200473343653344	0.232080506959	0.0906763403324	0.206893929435	0.390154148302	0.0986283746992	0.00993701022923	0.113101776132	0.197395731844	0.113101776132	0.282745459933	0.116183812976	0.045430560235	4.78607279912e-05	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0401072900566	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:57435223..57435337,+__1467.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:57435223..57435337,+__1467.1.0.0	rs11602109	1.4986979668028053	1.7552055647806375	1.450798846033328	1.1939310723491938	1.633688718593876	1.6850098703733547	1.8677858568295025	1.8966847111438023	1.782344069348694	1.7403799155281978	1.9190610770397079	1.8146080520384391	1.686516310071795	1.3869106938858184	1.9312917540137615	1.7907922468971844	1.5154381952267262	1.7828897757378723	1.879686281071028	1.358226111417884	1.7428578653909401	1.949157453707131	1.595084870225081	1.628126858306254	1.9992751679422616	1.7133114394851614	-0.11178727291698687	0.17608618923312402	0.3399934008638563	0.32150712287753236	0.14920105714399634	0.19467641069767327	-0.5095597454116185	-0.1538268457528622	0.16681338435843696	-0.14529504530311677	-0.2909342187334538	0.18466711590382245	0.026795129413366963	0.29495293544	0.87199428352	0.747262025795	0.206893929435	0.777963861227	0.563691144959	0.175048880887	0.460214637573	0.747262025795	0.340423946445	0.390143297103	0.38645652471	0.502764546007	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr11:57435223..57435337,+__1467.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:57435223..57435337,+__1467.1.0.0	rs113945170,rs11602109	1.4986979668028053	1.7552055647806375	1.450798846033328	1.1939310723491938	1.633688718593876	1.6850098703733547	1.8677858568295025	1.8966847111438023	1.782344069348694	1.7403799155281978	1.9190610770397079	1.8146080520384391	1.686516310071795	1.717752594175492	1.5269562767104519	1.4954647454640517	1.2132989419591196	1.5236139068635213	1.2888953285546854	1.6963262026853247	1.679630782121051	1.6240072503574008	1.7347504491920684	1.5144049377329245	1.6400132497899547	1.5545928888005038	0.21905462737268677	-0.22824928807018563	0.04466589943072363	0.01936786960992576	-0.11007481173035472	-0.39611454181866934	-0.17145965414417774	-0.21705392902275134	-0.15833681899129326	-0.005629466336129374	-0.40465613930678335	-0.17459480224848445	-0.13192342127129109	0.619326784864	0.122558611289	0.861430881609	0.85089220831	0.313917214294	0.02911414697	0.436112310787	0.476688253492	0.347268461228	0.871992830865	0.166660977403	0.0658387268341	0.188415522553	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:61560036..61560150,-__1468.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:61560036..61560150,-__1468.1.0.0	rs174538	2.9515796049383862	3.200135131843781	2.725094902228374	2.6377251974185305	2.7913230024526587	2.8773408338593	2.8171760632545526	3.1932360404702935	3.035580160480535	2.938658196713842	2.9979066921294644	2.932622611863433	2.9248648698044293	2.6906530047628685	3.0969565199523634	2.5162132609403605	2.618307880690015	2.620943197043986	2.673138091776522	2.8037284382867913	3.0012402050097826	2.843970398625067	3.0042648425151315	2.763428589914186	2.603046268231331	2.769657558145701	-0.2609266001755177	-0.10317861189141775	-0.20888164128801368	-0.019417316728515654	-0.1703798054086727	-0.2042027420827779	-0.013447624967761307	-0.1919958354605109	-0.19160976185546819	0.06560664580128961	-0.2344781022152782	-0.3295763436321022	-0.1552073116587289	0.132622250874	0.347268461228	0.375513989452	0.420456664513	0.428242856315	0.129198935732	0.777966336216	0.320413072024	0.468411351413	0.476688253492	0.154655491485	0.436112310787	0.10448713391	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr11:62432704..62432818,+__1469.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr11:62432704..62432818,+__1469.1.0.0	rs73502133	3.273135736753925	3.3350984729367914	3.0708550371542893	2.8203651350191503	2.795289410824143	3.2382844678301486	3.2606127597011816	3.486315242711602	3.317149517202709	3.311216243592792	3.573658482233305	3.3263728506074557	3.234029446380624	1.4320310266347993	1.648035754266606	1.5570054641855506	0.90722683817182	1.5982573202665509	1.2408936951932303	1.5230308911135961	1.702785632822348	1.1944821545624469	1.3929301319796985	1.3203318645214346	1.3087854662978096	1.4021496866679908	-1.8411047101191256	-1.6870627186701854	-1.5138495729687387	-1.9131382968473303	-1.1970320905575922	-1.9973907726369182	-1.7375818685875855	-1.7835296098892541	-2.1226673626402617	-1.9182861116130936	-2.2533266177118705	-2.017587384309646	-1.8318797597126333	0.000260017581797	1.7063912625e-08	6.04095401414e-06	7.05457685779e-05	9.98335414644e-06	0.000110173251151	7.89440729856e-05	4.21654944787e-05	1.06220766775e-05	4.46777109943e-05	1.53272450794e-06	2.63694940302e-05	5.10802741249e-47	0.184092447912	1.2695550993e-05	0.00450051074053	0.0519922314419	0.00770714940105	0.0841723638797	0.0583396699364	0.030654314486	0.00821086527167	0.0350720031305	0.00117866514661	0.0205418358495	4.28052697167e-44	not sig	sig	sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr11:62432704..62432818,+__1469.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr11:62432704..62432818,+__1469.1.0.0	rs73502133,rs4489748	3.273135736753925	3.3350984729367914	3.0708550371542893	2.8203651350191503	2.795289410824143	3.2382844678301486	3.2606127597011816	3.486315242711602	3.317149517202709	3.311216243592792	3.573658482233305	3.3263728506074557	3.234029446380624	1.6875222786549136	1.867649127106061	1.3420060372024958	1.2126929015265673	1.4885013352492886	1.4708874501510723	1.3615809824833147	2.2139450789125807	1.5834282280445695	1.5686045803010142	1.4972093328251095	1.4875830499672424	1.5651341985353524	-1.5856134580990113	-1.4674493458307305	-1.7288489999517935	-1.607672233492583	-1.3067880755748544	-1.7673970176790763	-1.8990317772178669	-1.2723701637990215	-1.7337212891581393	-1.7426116632917779	-2.0764491494081954	-1.8387898006402132	-1.668895247845272	1.69568451719e-07	2.70962217641e-07	4.38836124619e-06	9.53931849178e-07	2.60794292158e-06	3.75375068986e-05	2.28582318034e-06	5.62183900058e-05	1.53542809806e-05	1.43307835393e-06	4.77393269186e-07	1.75236973871e-06	2.08940972745e-56	3.28962796335e-05	5.47343679634e-05	0.000873283887991	0.000180293119495	0.000534628298924	0.00754503888661	0.000457164636068	0.0109625860511	0.003162981882	0.000298080297617	9.78656201831e-05	0.000360988166173	4.74296008131e-54	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:62649091..62649205,+__1470.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:62649091..62649205,+__1470.1.0.0	rs73487879	3.658894722084044	3.963613676152475	3.1678553301902532	3.1693752748624746	3.455842904636288	3.4849563539041672	3.005552776347617	3.3385575389913713	3.449576637473475	3.5877136282240656	3.5408183829663553	3.6991406297756235	3.460158154634017	3.6380773396224653	3.9709899445727315	3.283583215899257	3.083280682113525	3.476860648450116	3.473147122531263	3.2322969417508682	3.5406109426944923	3.687558325185958	3.7353577558964726	3.575181289614177	3.7741503386327757	3.539257878913675	-0.020817382461578937	0.007376268420256515	0.11572788570900361	-0.0860945927489496	0.021017743813827927	-0.01180923137290435	0.22674416540325115	0.20205340370312097	0.23798168771248296	0.14764412767240698	0.03436290664782149	0.07500970885715219	0.07909972427965757	0.501992688725	0.840380101088	0.536806685117	0.8931878581	0.147021540231	0.536806685117	0.259370210024	0.687084607526	0.30750859871	0.501992688725	0.757455001208	0.687084607526	0.709339095753	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:64546206..64546320,-__1471.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:64546206..64546320,-__1471.1.0.0	rs1633462	-0.6336675706248552	-0.055820606925171865	-0.2409489304508059	-0.4601743068259472	-0.09857592955431732	-0.10596723494966614	-0.37027300365723975	-0.5887290543739012	-0.1739931245591844	-0.09798917808236225	0.011115954800429595	0.03322077936254675	-0.23181685048670628	0.033519945497299995	0.11374712688022368	0.14027538218577376	-0.1979936560869534	0.016330415969085337	0.1572058180714058	0.05103264122167252	0.23384609137242413	0.05850740331185469	-0.20826607867607225	-0.006150933334002972	0.031495688503171575	0.035295820409656904	0.6671875161221552	0.16956773380539553	0.38122431263657963	0.26218065073899377	0.11490634552340266	0.26317305302107197	0.42130564487891226	0.8225751457463253	0.2325005278710391	-0.11027690059371	-0.017266888134432567	-0.0017250908593751738	0.2671126708963632	0.989287003123	0.840380101088	0.375513989452	0.819442862795	0.628827692687	0.856156710108	0.591208103411	0.706946403854	0.957167318493	0.468411351413	0.572794651112	0.188220673538	0.978315278801	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:64546234..64546348,-__1472.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:64546234..64546348,-__1472.1.0.0	rs1633462	1.2878789596796167	1.1799771339842011	1.3113109981435551	1.1368394788631333	1.3581087237631784	1.163113722219808	1.4586417498280344	1.4669357250748911	1.3236858877973545	1.412322229721997	1.3406397589934134	1.3431782435725355	1.3152193843034767	1.0880491633631943	1.4352555492287782	1.1567298075167503	1.03485667646658	1.3620413092667345	1.397200654965648	1.3507545582709168	1.5054144912779264	1.4201270343087788	1.498810732456089	1.5293865756714657	1.53013785173323	1.3590637003771742	-0.1998297963164224	0.25527841524457706	-0.15458119062680487	-0.10198280239655322	0.00393258550355613	0.23408693274583992	-0.10788719155711757	0.03847876620303525	0.09644114651142432	0.08648850273409203	0.18874681667805238	0.18695960816069457	0.0438443160736978	0.436112310787	0.354199901149	0.581967350665	0.179364149792	0.619326784864	0.197395731844	0.957167318493	0.591208103411	0.609889042629	0.405136064622	0.420456664513	0.226876581559	0.41378837101	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:65308062..65308176,-__1473.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:65308062..65308176,-__1473.1.0.0	rs71462347	-0.7379473098769185	-0.7237050000352129	-1.335731076649425	-0.5767336694805629	-0.482112569902467	-0.29158245172809216	-1.2652987602632395	-1.007506321976463	-0.4356720155274931	-1.1940954965600572	-0.7484528523119677	-0.4835470812583254	-0.7735320504641855	0.1519883854859263	-0.8248675919737054	-1.443403883308362	-0.6494120294355585	-1.0604421510500797	-0.7549012753099096	-1.3013506505787995	-0.9741984220274172	-0.6493787595368934	-1.0219419511207308	-0.76952238171343	-1.8276091008466202	-0.9270866509512984	0.8899356953628448	-0.10116259193849253	-0.10767280665893697	-0.07267835995499561	-0.5783295811476127	-0.4633188235818174	-0.03605189031556	0.033307899949045816	-0.21370674400940032	0.17215354543932637	-0.02106952940146234	-1.3440620195882949	-0.15355460048711297	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:65405527..65405641,+__1474.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:65405527..65405641,+__1474.1.0.0	rs56343805	1.1719044426758776	0.3424447404097197	1.4404033250168542	0.5240480118391486	1.128914454875381	0.23637966326208498	1.663853331945349	0.33009393294717543	0.959039190092877	0.03235036129278372	0.7172641632234291	-0.010758673896153231	0.7113280786403772	0.2340473116044957	1.2709075871449702	2.976155011290583	1.849504024400883	0.5716146717730057	0.062120009665146025	0.04687138739032428	1.8665837413843605	2.170519154503142	1.1827540567578134	1.116925958053386	1.121864923936829	1.2058223198254117	-0.9378571310713819	0.9284628467352505	1.5357516862737288	1.3254560125617343	-0.5572997831023752	-0.17425965359693896	-1.6169819445550246	1.536489808437185	1.211479964410265	1.1504036954650296	0.3996617948299568	1.1326235978329822	0.4944942411850342	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr11:65405527..65405641,+__1474.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:65405527..65405641,+__1474.1.0.0	rs2306363	1.1719044426758776	0.3424447404097197	1.4404033250168542	0.5240480118391486	1.128914454875381	0.23637966326208498	1.663853331945349	0.33009393294717543	0.959039190092877	0.03235036129278372	0.7172641632234291	-0.010758673896153231	0.7113280786403772	0.18237284181174385	-0.4381049088858095	0.6102899636851413	0.007794974330730305	-0.5164414213267814	0.6246054173625026	0.7184695897388403	0.3304306612387349	-0.5738564622824994	-0.5094423546632462	0.3568494128147321	-0.14209240475640506	0.05423960908897368	-0.9895316008641337	-0.7805496492955292	-0.8301133613317129	-0.5162530375084183	-1.6453558762021623	0.38822575410041765	-0.9453837422065087	0.0003367282915594516	-1.5328956523753763	-0.5417927159560298	-0.360414750408697	-0.13133373086025182	-0.6570884695514035	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr11:65405527..65405641,+__1474.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr11:65405527..65405641,+__1474.1.0.0	rs56343805,rs2306363	1.1719044426758776	0.3424447404097197	1.4404033250168542	0.5240480118391486	1.128914454875381	0.23637966326208498	1.663853331945349	0.33009393294717543	0.959039190092877	0.03235036129278372	0.7172641632234291	-0.010758673896153231	0.7113280786403772	0.9995642504088564	-0.6783323338825773	0.7645290571998439	1.3036511693662909	0.0784777958643654	0.779442823236991	-0.3175040801036278	1.2082320582633268	-0.3750479215487226	0.1231842979698759	0.7679296558596925	0.2079597653067505	0.4051738781617554	-0.17234019226702113	-1.020777074292297	-0.6758742678170103	0.7796031575271423	-1.0504366590110155	0.5430631599749061	-1.9813574120489768	0.8781381253161513	-1.3340871116415995	0.09083393667709218	0.05066549263626341	0.21871843920290374	-0.30615420047862174	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr11:65647228..65647342,+__1475.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr11:65647228..65647342,+__1475.1.0.0	rs658524	-0.874428095114969	-0.7012852411143516	-0.7288076613966272	-0.9972110121283224	-0.776629274421119	-0.7354656588162902	-0.6692587797215734	-0.9951766411960088	-0.7763552417854874	-0.924235386755651	-0.3838688205081677	-0.8685002348374864	-0.7859351706496712	0.21862961465580305	0.2626023334951021	-0.305314057320938	0.24454452181056935	-0.28824600061306177	0.09741842217856612	-0.23648662909518978	-0.25207519309251464	-0.43391669884662093	0.16624773831091127	0.0030170114602920033	0.16901663494200725	-0.0295468585095895	1.093057709770772	0.9638875746094537	0.4234936040756892	1.2417555339388917	0.4883832738080572	0.8328840809948563	0.43277215062638363	0.7431014481034941	0.3424385429388665	1.0904831250665623	0.38688583196845966	1.0375168697794936	0.7563883121400816	NA__not_enough_barcodes	0.00160288548718	0.170821264488	0.00955750115232	0.011815065659	0.0216734048733	0.313917214294	0.192768091005	0.024938091084	0.0103298859694	0.393862283952	0.104225598099	4.89343859678e-08	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	4.1007015441e-05	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr11:65647228..65647342,+__1475.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr11:65647228..65647342,+__1475.1.0.0	rs41302417	-0.874428095114969	-0.7012852411143516	-0.7288076613966272	-0.9972110121283224	-0.776629274421119	-0.7354656588162902	-0.6692587797215734	-0.9951766411960088	-0.7763552417854874	-0.924235386755651	-0.3838688205081677	-0.8685002348374864	-0.7859351706496712	-0.6550372974321332	-0.5634120740039638	-0.8954511091692801	-0.6941700360616511	-0.6390624687958416	-0.7770694365933299	-1.1620234272806398	-0.7071887649899159	-1.4644488479095372	-0.5188792923550959	-0.876891418372949	-1.0261474517795184	-0.8316484687286548	0.21939079768283576	0.13787316711038788	-0.16664344777265283	0.30304097606667135	0.13756680562527734	-0.04160377777703972	-0.49276464755906635	0.2879878762060929	-0.6880936061240498	0.4053560944005551	-0.49302259786478136	-0.157647216942032	-0.04571329807898348	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.375513989452	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.747256437014	0.00501128780378	NA__no_active_tile	0.0993187631928	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr11:65647228..65647342,+__1475.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr11:65647228..65647342,+__1475.1.0.0	rs658524,rs41302417	-0.874428095114969	-0.7012852411143516	-0.7288076613966272	-0.9972110121283224	-0.776629274421119	-0.7354656588162902	-0.6692587797215734	-0.9951766411960088	-0.7763552417854874	-0.924235386755651	-0.3838688205081677	-0.8685002348374864	-0.7859351706496712	0.4407341559204996	0.5438444067169325	0.5767319473054112	0.4493839147637346	0.2635670585637569	-0.06938368700817062	0.3598230862206151	0.232759450535777	0.4879573062998353	0.12866001026130872	0.10424796558805136	0.7449525119638213	0.35527317726096447	1.3151622510354686	1.245129647831284	1.3055396087020386	1.446594926892057	1.0401963329848758	0.6660819718081196	1.0290818659421885	1.2279360917317859	1.2643125480853228	1.0528953970169597	0.488116786096219	1.6134527468013076	1.1412083479106356	0.0271891048922	0.000110173251151	0.00210630874131	0.0461569531412	0.00201342137527	0.166665831608	0.150801701171	0.0350255264852	0.00201342137527	0.0181189115857	0.581967350665	0.0440018610392	8.35898879571e-12	1	0.0222549967326	0.41915543952	1	0.41275138193	1	1	1	0.414764803306	1	1	1	1.89749045663e-09	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:110318198..110318312,-__1476.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:110318198..110318312,-__1476.1.0.0	rs71458309	1.2059146931005347	2.190227735023029	0.8082630040833797	1.3047047995039882	2.7826113064094318	1.7331037163193748	2.541109569258276	1.019109750976411	3.16825354735138	1.3347708372996236	2.144907019200623	1.811665987873464	1.8370534971999595	0.3426841392068925	0.4994691701173539			1.4380378942117948	-0.6175553852555945		0.7669349375180831	0.5833188801419368	-0.7197972583710729	-0.03886420995057425		0.28177852095235245	-0.8632305538936422	-1.6907585649056749			-1.344573412197637	-2.350659101574969		-0.25217481345832804	-2.5849346672094433	-2.0545680956706964	-2.1837712291511973		-1.6655838047576985	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:114404095..114404209,-__1477.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:114404095..114404209,-__1477.1.0.0	rs2290798	4.055873134723546	4.290609529132636	3.8076945196645995	3.488404280935902	3.971150758428405	4.048096766607237	3.817008809522201	4.238867496724518	4.08263827157406	4.0951448414929335	4.170142559631449	4.127264092829032	4.016074588438877	3.9806382521597374	4.227338011764791	3.8219272408547766	3.5028312886149475	4.065375940739263	4.079155385969818	3.780890978018565	4.262873881869823	4.127211471497753	4.21962383739014	4.153858145075667	4.2214263876162175	4.036929235130958	-0.07523488256380872	-0.06327151736784487	0.014232721190177156	0.014427007679045367	0.09422518231085775	0.031058619362580586	-0.03611783150363568	0.024006385145304954	0.044573199923692464	0.12447899589720635	-0.016284414555782334	0.09416229478718563	0.020854646692081553	0.444064484515	0.63839046467	0.946473618223	0.88258056334	0.657696241675	0.412754243182	0.727009731456	0.737113058664	0.460214637573	0.0565651674203	0.706946403854	0.192768091005	0.758463542523	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:114404095..114404209,-__1477.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:114404095..114404209,-__1477.1.0.0	rs114857206	4.055873134723546	4.290609529132636	3.8076945196645995	3.488404280935902	3.971150758428405	4.048096766607237	3.817008809522201	4.238867496724518	4.08263827157406	4.0951448414929335	4.170142559631449	4.127264092829032	4.016074588438877	3.949981311874756	4.274065296901855	3.7850512862383754	3.429072335825542	3.958221089308302	4.059092925390959	3.7521271718787044	4.221276539490768	4.094695815172578	4.078269705285171	4.093482601040941	4.111314057246723	3.9838875113045567	-0.10589182284879017	-0.016544232230780942	-0.022643233426224096	-0.059331945110359996	-0.012929669120103071	0.010996158783721732	-0.06488163764349641	-0.01759095723375026	0.01205754359851774	-0.016875136207762154	-0.07665995859050767	-0.015950035582308786	-0.03218707713432034	0.29495293544	0.48504462162	0.76769033028	0.90381429355	0.687084607526	0.716953652062	0.501992688725	0.727009731456	0.737113058664	0.747262025795	0.340423946445	0.8931878581	0.935595134631	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr12:114404095..114404209,-__1477.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:114404095..114404209,-__1477.1.0.0	rs2290798,rs114857206,rs2290799	4.055873134723546	4.290609529132636	3.8076945196645995	3.488404280935902	3.971150758428405	4.048096766607237	3.817008809522201	4.238867496724518	4.08263827157406	4.0951448414929335	4.170142559631449	4.127264092829032	4.016074588438877	3.8667937662994123	4.142196901730331	3.779552994976125	3.4308353442344286	4.041953294682077	4.04655281587684	3.8348200480366668	4.2279887131405225	4.120681747529845	4.156355051039434	4.199208702271594	4.185551108691675	4.002707540709079	-0.18907936842413386	-0.14841262740230565	-0.02814152468847464	-0.05756893670147356	0.07080253625367217	-0.0015439507303973699	0.017811238514465977	-0.010878783583995855	0.038043475955785055	0.06121020954650014	0.029066142640145287	0.05828701586264273	-0.013367047729797465	0.405136064622	0.0678362651725	0.777966336216	0.957167318493	0.8931878581	0.677233097055	0.8931878581	0.716953652062	0.757455001208	0.320413072024	0.861430881609	0.29495293544	0.927648657729	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:121454255..121454369,-__1478.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:121454255..121454369,-__1478.1.0.0	rs558753262	3.9463764549921203	4.247988767670821	3.80047977886687	3.4515337827018397	3.941389100479676	3.875175472822429	3.7491641480654447	4.148977595245365	3.9981121319963275	4.064904956946686	4.053354562631942	4.151696581988703	3.952429444534019	3.84948187361335	4.191741727633373	3.7215592870752747	3.3616088422595523	3.817945195513006	3.7951141623431646	3.650577841280594	4.0864500206791075	4.025209033045548	3.9909179429925117	4.012692132797357	4.022066071472892	3.8771136775588104	-0.09689458137877027	-0.05624704003744796	-0.0789204917915951	-0.0899249404422875	-0.12344390496667001	-0.08006131047926424	-0.09858630678485092	-0.0625275745662579	0.027096901049220357	-0.07398701395417406	-0.04066242983458501	-0.12963051051581065	-0.07531576697520777	0.87199428352	0.861430881609	0.63839046467	0.777966336216	0.619326784864	0.572794651112	0.967868733231	0.777966336216	0.8931878581	0.619326784864	0.90381429355	1.0	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:121454255..121454369,-__1478.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:121454255..121454369,-__1478.1.0.0	rs2258287	3.9463764549921203	4.247988767670821	3.80047977886687	3.4515337827018397	3.941389100479676	3.875175472822429	3.7491641480654447	4.148977595245365	3.9981121319963275	4.064904956946686	4.053354562631942	4.151696581988703	3.952429444534019	3.930124862557559	4.257269190694661	3.643004515444086	3.3371494876474035	3.807862153164285	3.90192071385499	3.6487925813748108	4.190634838075482	4.098529316311215	4.0323171572518755	3.8902769095853884	4.09390676351867	3.902649040790035	-0.016251592434561424	0.009280423023840356	-0.15747526342278384	-0.11438429505443626	-0.13352694731539128	0.02674524103256104	-0.10037156669063396	0.041657242830116736	0.10041718431488711	-0.03258779969481029	-0.1630776530465532	-0.05778981847003273	-0.04978040374398315	0.819442862795	0.572794651112	0.452098798395	0.301187193336	0.444064484515	0.648013768535	0.706946403854	0.861430881609	0.527990680582	0.436112310787	0.527990680582	0.696989544957	0.792303610096	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:121454255..121454369,-__1478.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:121454255..121454369,-__1478.1.0.0	rs73214155	3.9463764549921203	4.247988767670821	3.80047977886687	3.4515337827018397	3.941389100479676	3.875175472822429	3.7491641480654447	4.148977595245365	3.9981121319963275	4.064904956946686	4.053354562631942	4.151696581988703	3.952429444534019	4.046882494757359	4.209511172859028	3.7782193753346767	3.525087852362756	4.020798209069668	4.0004800858553216	3.740659123295544	4.241072577776824	4.171862159912648	4.158018711807065	4.138365301667109	4.235062765045663	4.0221683191453055	0.10050603976523842	-0.03847759481179214	-0.022260403532193163	0.07355406966091627	0.07940910858999217	0.12530461303289275	-0.008505024769900782	0.09209498253145831	0.17375002791632088	0.09311375486037932	0.08501073903516776	0.08336618305696053	0.0697388746112867	0.122558611289	0.657696241675	0.657696241675	0.444064484515	0.154655491485	0.088148079887	0.436112310787	0.354199901149	0.0232568344756	0.122558611289	0.204483664188	0.132622250874	0.007142303468	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr12:121454255..121454369,-__1478.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:121454255..121454369,-__1478.1.0.0	rs2258227,rs558753262,rs2258287,rs73214155	3.9463764549921203	4.247988767670821	3.80047977886687	3.4515337827018397	3.941389100479676	3.875175472822429	3.7491641480654447	4.148977595245365	3.9981121319963275	4.064904956946686	4.053354562631942	4.151696581988703	3.952429444534019	3.908427563792006	4.265403895696178	3.7277713189200328	3.3903168825942744	3.891298710724714	3.967967079213195	3.6925261211331533	4.165394746567097	4.057646362114095	4.039965825820096	4.04137079851051	4.108708961496911	3.938066522215188	-0.03794889120011424	0.017415128025357163	-0.07270845994683706	-0.06121690010756531	-0.05009038975496205	0.09279160639076611	-0.056638026932291474	0.016417151321731716	0.059534230117767706	-0.02493913112658941	-0.011983764121431761	-0.04298762049179228	-0.014362922318830074	0.60051573606	0.397602565759	0.989287003123	0.957167318493	0.63839046467	0.48504462162	0.88258056334	0.79863356553	0.30750859871	0.687084607526	0.85089220831	0.8931878581	0.993605743918	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:124196820..124196934,+__1479.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:124196820..124196934,+__1479.1.0.0	rs561163813	0.6776623078602074	-0.9327692949152542	-0.22197207692932952	-0.4076714729880397	1.9692421041061463	0.4140576208416425	1.4378864166862866	-0.5685127094364311	0.3466227627836425	-0.5693212052903106	-0.13878917723362122	0.23351200802146524	0.18666227362553375	-0.12231261854588982	-0.4381049088858095	-0.6735931336836395	-0.2545505501303752	1.200161671763117	0.9899870529657306	0.9257680252507642	-1.1305436022294344	0.33800863874633713	-0.8605063342014301	-0.5298376077661276	0.08501357552971225	-0.039209149265587113	-0.7999749264060972	0.4946643860294447	-0.45162105675430997	0.1531209228576645	-0.7690804323430294	0.5759294321240882	-0.5121183914355224	-0.5620308927930033	-0.008614124037305382	-0.2911851289111195	-0.39104843053250643	-0.14849843249175299	-0.2258714228911208	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:124196820..124196934,+__1479.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:124196820..124196934,+__1479.1.0.0	rs71458814	0.6776623078602074	-0.9327692949152542	-0.22197207692932952	-0.4076714729880397	1.9692421041061463	0.4140576208416425	1.4378864166862866	-0.5685127094364311	0.3466227627836425	-0.5693212052903106	-0.13878917723362122	0.23351200802146524	0.18666227362553375	0.7187380394767381	0.3386622024893524	0.04590437995518104	0.3094456430767129	0.6684796523377251	-0.03424706530460392	0.2253392029793811	-1.7624485731874115	-0.7813355569180788	-0.7569192621029274	-1.3527910425001937	-0.1865128425207463	-0.21397376851823924	0.041075731616530664	1.2714314974046066	0.26787645688451056	0.7171171160647526	-1.300762451768421	-0.4483046861462464	-1.2125472137069055	-1.1939358637509805	-1.1279583197017213	-0.18759805681261676	-1.2140018652665725	-0.4200248505422115	-0.4006360421437729	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr12:124196820..124196934,+__1479.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:124196820..124196934,+__1479.1.0.0	rs561163813,rs71458814	0.6776623078602074	-0.9327692949152542	-0.22197207692932952	-0.4076714729880397	1.9692421041061463	0.4140576208416425	1.4378864166862866	-0.5685127094364311	0.3466227627836425	-0.5693212052903106	-0.13878917723362122	0.23351200802146524	0.18666227362553375	1.5717556849024747	2.3955532172316616	1.7763879762273391	1.9049591431197053	2.4417108200275357	1.542429607491254	2.7018129172689043	1.5900048340461344	2.2687751587300133	2.1959123591975995	1.8603140043914284	2.005024074477852	2.0212199830926583	0.8940933770422673	3.328322512146916	1.9983600531566688	2.312630616107745	0.4724687159213894	1.1283719866496116	1.2639265005826177	2.1585175434825654	1.9221523959463709	2.76523356448791	1.9991031816250495	1.7715120664563868	1.834557709467125	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:29936810..29936924,-__1480.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:29936810..29936924,-__1480.1.0.0	rs186216	0.7497598056720045	0.6625278776349138	0.11298603828053022	0.24077133620417993	-1.0029700056938684	-0.11883039843714774	-0.39446564631643005	-0.38123987560446265	0.3635098137190546	-0.3989712875116924	-0.1274086313076347	-0.4672862112168229	-0.0634680987147813	0.3468779151169446	-0.1496554787352172	-1.565663461344266	-1.0734973288358105	0.12207329725258646	-0.9059612596706332	0.388583787186801	0.461647826523312	0.2585169967964113	-0.2708707430515485	-0.3275449803944457	0.23351200802146524	-0.20683178509453337	-0.4028818905550599	-0.8121833563701311	-1.6786494996247963	-1.3142686650399904	1.1250433029464548	-0.7871308612334855	0.783049433503231	0.8428877021277746	-0.10499281692264328	0.1281005444601439	-0.200136349086811	0.7007982192382881	-0.14336368637975208	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:32552716..32552830,+__1481.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:32552716..32552830,+__1481.1.0.0	rs2651369	0.7742756060898051	1.0159730066244672	0.9969984880097562	0.9856047671291052	1.247022340607625	1.203040422012279	1.04214875882304	1.1249325164864992	0.9331631471490189	0.9556088030081016	1.0782453201135787	1.1607011478065141	1.0431428603216493	0.23320215238719683	0.4196738459666892	0.2552985036915403	0.4332828896690127	0.5146636314108317	0.2543232054458641	0.4201260894879193	0.4685381937302667	0.22116758130823505	0.3297933519492222	0.20422591682652397	0.5839750321305417	0.3615225328336537	-0.5410734537026083	-0.596299160657778	-0.7416999843182159	-0.5523218774600924	-0.7323587091967934	-0.9487172165664148	-0.6220226693351207	-0.6563943227562324	-0.7119955658407839	-0.6258154510588794	-0.8740194032870547	-0.5767261156759724	-0.6816203274879955	0.00139510136839	0.0162407194134	0.000152810281165	0.00591301274865	0.00078853414695	0.000179550689913	0.00240905380364	0.0129907246043	0.000827700533168	5.95166561664e-05	0.00153065306427	8.82815218607e-05	1.41516875267e-26	0.987731768821	1	0.113843659468	1	0.608748361446	0.137176727093	1	1	0.639812512139	0.0467205750906	1	0.0687713055295	1.18591141474e-23	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:38710496..38710610,+__1482.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:38710496..38710610,+__1482.1.0.0	rs7315028	2.499608262449239	2.9192922369264034	2.5158804203395295	2.298437800878264	2.4361699103720538	2.5930163170676597	2.644632607228206	2.6142869592577607	2.6162010131460356	2.5964890433869714	2.6573591479236756	2.5453442972373472	2.5780598346844283	2.291198066934898	2.429934695262017	2.290856053128868	1.9992495970783675	2.2657013704938307	2.361159885990128	2.3659636328883	2.431117031655955	2.333193561165099	2.465454348017583	2.3435583806442652	2.3995907579534625	2.331414781767731	-0.20841019551434092	-0.4893575416643863	-0.22502436721066132	-0.2991882037998965	-0.17046853987822308	-0.2318564310775315	-0.27866897433990623	-0.1831699276018055	-0.2830074519809367	-0.1310346953693884	-0.3138007672794103	-0.14575353928388468	-0.2466450529166976	0.110080523892	0.088148079887	0.581967350665	0.179364149792	0.170821264488	0.179364149792	0.563691144959	0.179364149792	0.113101776132	0.192768091005	0.104229562843	0.282745459933	0.00228072707126	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:38710496..38710610,+__1482.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:38710496..38710610,+__1482.1.0.0	rs12304754	2.499608262449239	2.9192922369264034	2.5158804203395295	2.298437800878264	2.4361699103720538	2.5930163170676597	2.644632607228206	2.6142869592577607	2.6162010131460356	2.5964890433869714	2.6573591479236756	2.5453442972373472	2.5780598346844283	2.0342379456691075	2.279806292210867	2.1668649165574	1.8528459064624478	1.9791492345694905	2.1434869108080967	2.247734797476152	2.343165562958519	2.046137776836849	2.2854633069353234	2.2329979157402704	2.2009026969317538	2.151066105263023	-0.4653703167801315	-0.6394859447155365	-0.3490155037821294	-0.44559189441581615	-0.4570206758025632	-0.44952940625956295	-0.3968978097520539	-0.2711213962992418	-0.5700632363091866	-0.311025736451648	-0.42436123218340516	-0.34444160030559345	-0.42699372942140573	0.00220311126631	0.00287470049861	0.0209174885683	0.0205467749343	4.73314572056e-05	0.000104264461287	0.00641568456823	0.00480682187369	0.000110173251151	0.000122951138804	0.000122951138804	0.00210630874131	5.98187538194e-26	1	1	1	1	0.0365398849627	0.0796580484233	1	1	0.0851639231401	0.0965166439613	0.0945494257404	1	5.01281157007e-23	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:38710496..38710610,+__1482.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:38710496..38710610,+__1482.1.0.0	rs7296576	2.499608262449239	2.9192922369264034	2.5158804203395295	2.298437800878264	2.4361699103720538	2.5930163170676597	2.644632607228206	2.6142869592577607	2.6162010131460356	2.5964890433869714	2.6573591479236756	2.5453442972373472	2.5780598346844283	2.2270032795187094	2.4548461247323745	2.1507870364561734	2.1468872290848915	2.115711395471897	2.386518172789278	2.1314963675759637	2.4580101184787653	2.3426324657838764	2.3764834162215136	2.341030745128979	2.314629523710982	2.287169656246117	-0.2726049829305297	-0.46444611219402887	-0.3650933838833561	-0.1515505717933725	-0.32045851490015664	-0.20649814427838153	-0.5131362396522423	-0.1562768407789954	-0.2735685473621592	-0.2200056271654578	-0.31632840279469665	-0.23071477352636505	-0.29089017843831183	0.0386605553759	0.0162407194134	0.0327677521954	0.0808926541269	0.0338805621681	0.0276615481105	0.0168468410067	0.0515422504639	0.0286240283844	0.0327677521954	0.0276615481105	0.0224529881577	5.99266399167e-11	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	5.02185242502e-08	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr12:38710496..38710610,+__1482.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:38710496..38710610,+__1482.1.0.0	rs7315028,rs12304754,rs7296576	2.499608262449239	2.9192922369264034	2.5158804203395295	2.298437800878264	2.4361699103720538	2.5930163170676597	2.644632607228206	2.6142869592577607	2.6162010131460356	2.5964890433869714	2.6573591479236756	2.5453442972373472	2.5780598346844283	1.558569786456396	1.83163091873232	1.7414258233564182	1.5800528981681814	1.6357970221301708	1.7402615593854138	1.666174358392397	1.8432394370143745	1.7015168773423155	1.7272340605585312	2.0304589146535017	1.7035360872047334	1.7299914786162294	-0.941038475992843	-1.0876613181940833	-0.7744545969831114	-0.7183849027100826	-0.800372888241883	-0.8527547576822458	-0.9784582488358091	-0.7710475222433861	-0.9146841358037201	-0.8692549828284402	-0.6269002332701739	-0.8418082100326139	-0.8480683560681994	1.63570483193e-07	4.1480046148e-07	1.75892558936e-07	1.20184897547e-05	1.84460412812e-08	6.26237314719e-08	4.98941474284e-06	3.12503971844e-07	1.99366201481e-08	3.16622650145e-08	2.34778603013e-07	4.77393269186e-07	2.38765155224e-68	3.17326737394e-05	8.37896932189e-05	3.50026192282e-05	0.00227149456363	3.78143846265e-06	1.25873700259e-05	0.000997882948567	6.09382745096e-05	4.10694375051e-06	6.58575112302e-06	4.81296136176e-05	9.83430134523e-05	5.41996902358e-66	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:48516393..48516507,+__1483.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:48516393..48516507,+__1483.1.0.0	rs2269935	-1.72794338057456	-1.290375193533312	-1.54062596188817	-1.8164546471361227	-1.7525219482872323	-1.5119909441666748	-1.6871747136418849	-1.5025706016282263	-1.8243512098570291	-1.6742595579930948	-1.7282873579471243	-1.307823417579169	-1.6136982445193835	-1.5428195369171005	-1.4919273836328222	-1.3422088496099558	-1.5866586383936583	-1.72018308452711	-1.5456734238135437	-1.3071844875419336	-1.146926237724421	-1.3929922522736167	-2.04954627862295	-1.6981469909998153	-1.7386188745669156	-1.5469071698853203	0.1851238436574596	-0.2015521900995101	0.19841711227821412	0.22979600874246442	0.032338863760122294	-0.03368247964686888	0.37999022609995126	0.3556443639038054	0.4313589575834125	-0.37528672062985513	0.03014036694730904	-0.4307954569877466	0.06679107463406316	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr12:53574395..53574509,-__1484.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr12:53574395..53574509,-__1484.1.0.0	rs3108403	3.4895371345174917	3.975463348295562	3.489971642402123	3.160999168255642	3.519775621409204	3.5810689962794475	3.314525810835079	3.7193553076625596	3.6121533741619887	3.7434362549053866	3.645155717242321	3.7327448763823434	3.5820156043624287	3.3591566653082126	3.7901782589528223	3.185476766334512	2.985819773036182	3.298343044307054	3.2095283029669623	3.1441949560757045	3.4172403568783922	3.4280801532798924	3.460139818856172	3.414147096754548	3.4822734617719613	3.3478815545435343	-0.13038046920927915	-0.1852850893427398	-0.3044948760676114	-0.17517939521946024	-0.22143257710215014	-0.3715406933124852	-0.17033085475937426	-0.3021149507841674	-0.18407322088209632	-0.2832964360492145	-0.23100862048777282	-0.25047141461038214	-0.23413404981889444	0.368322877114	0.412754243182	0.110080523892	0.206893929435	0.175053819161	0.0785847853765	0.248198866138	0.101398170673	0.368322877114	0.166665831608	0.125844655769	0.313917214294	0.00225639625199	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr12:53574426..53574540,+__1485.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr12:53574426..53574540,+__1485.1.0.0	rs3108403	1.527130519999489	1.7923952000693557	1.3180858810965823	1.358731671735681	1.5230454768733817	1.3698415577534382	1.3322219248834226	1.5091111747577957	1.6729754957688627	1.4946746453340731	1.6539708768033787	1.6269148387671597	1.5149249386535517	1.5604359889331745	1.7536964225278235	1.3524342043250317	1.374697242352341	1.7630266145182836	1.6639058586941813	1.743183815178019	1.4566159432857027	1.511499999565458	1.5514746459769937	1.7579773144070476	1.7655718284658433	1.604543323185825	0.03330546893368558	-0.03869877754153217	0.034348323228449384	0.01596557061665993	0.23998113764490192	0.2940643009407431	0.4109618902945964	-0.05249523147209301	-0.16147549620340462	0.05680000064292057	0.1040064376036689	0.13865698969868356	0.08961838453227329	0.829896383209	0.777963861227	0.554657938956	0.536806685117	0.0959193233604	0.288805731951	0.183752894264	0.978575937473	0.545696106059	0.216719559135	0.63839046467	0.242741268695	0.522909746202	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:58166317..58166431,+__1486.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:58166317..58166431,+__1486.1.0.0	rs148073180	-0.3436276229494515	-0.8287368805395041	-0.682594130287023	-0.8776423107727925	-0.7444923810068383	-0.549416226635454	-0.4717857990405075	-1.0963803403545553	-0.3204600456871392	-0.6096932687606205	-0.8929706956273882	-0.5114753440643469	-0.6607729204771352	-0.613442084563008	-0.3544766446978223	-0.3555214449655404	-0.7442314092958453	-0.34460016074357064	-0.7257580389867601	-0.36504869475272816	-0.6834021695245288	-0.33972155489222616	-0.4095174479919531	-0.848767438152791	-0.8602656944255762	-0.5537293985826959	-0.2698144616135565	0.4742602358416818	0.3270726853214826	0.13341090147694723	0.3998922202632677	-0.17634181235130608	0.10673710428777933	0.4129781708300265	-0.019261509205086957	0.20017582076866736	0.04420325747459719	-0.3487903503612293	0.10704352189443923	0.716953652062	NA__no_active_tile	0.978575937473	0.757455001208	0.116187990183	0.101398170673	0.60051573606	NA__no_active_tile	0.87199428352	0.382791178922	0.762564839604	0.716953652062	0.844971973261	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:58166317..58166431,+__1486.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:58166317..58166431,+__1486.1.0.0	rs2291617	-0.3436276229494515	-0.8287368805395041	-0.682594130287023	-0.8776423107727925	-0.7444923810068383	-0.549416226635454	-0.4717857990405075	-1.0963803403545553	-0.3204600456871392	-0.6096932687606205	-0.8929706956273882	-0.5114753440643469	-0.6607729204771352	-1.0313463277161714	-0.9363994216664471	-0.9302530907001683	-0.7383210161546009	-0.6355602632011039	-0.9800884877363124	-0.8544400064846066	-0.6205126935792896	-0.6239835317584579	-0.750629790403114	-0.492163994153333	-0.5102004722315027	-0.7586582579820923	-0.6877187047667199	-0.10766254112694296	-0.24765896041314528	0.13932129461819165	0.10893211780573442	-0.43067226110085843	-0.3826542074440991	0.4758676467752657	-0.3035234860713187	-0.14093652164249348	0.40080670147405517	0.0012748718328442488	-0.09788533750495725	0.803820918046	NA__no_active_tile	0.38645652471	0.219222323973	0.545696106059	0.428242856315	0.88258056334	NA__no_active_tile	0.935789553219	0.687084607526	NA__no_active_tile	0.452093621924	0.824803300208	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr12:58166317..58166431,+__1486.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:58166317..58166431,+__1486.1.0.0	rs148073180,rs2291617	-0.3436276229494515	-0.8287368805395041	-0.682594130287023	-0.8776423107727925	-0.7444923810068383	-0.549416226635454	-0.4717857990405075	-1.0963803403545553	-0.3204600456871392	-0.6096932687606205	-0.8929706956273882	-0.5114753440643469	-0.6607729204771352	-0.6663543019242735	-1.068847536656144	-0.8701105466566614	-0.8436719113663562	-0.7981485876424474	-0.8452352951247913	-1.091990592137702	-0.9762428041288473	-0.9424830948492482	-0.889930790678211	-0.4209214272391282	-0.7194950108776896	-0.8444526582734584	-0.322726678974822	-0.24011065611663995	-0.18751641636963845	0.033970399406436314	-0.053656206635609105	-0.29581906848933737	-0.6202047930971946	0.120137536225708	-0.622023049162109	-0.28023752191759055	0.47204926838826	-0.20801966681334272	-0.1836797377963233	0.696989544957	NA__no_active_tile	0.657696241675	NA__no_active_tile	0.962515895475	0.242741268695	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00955750115232	0.38645652471	0.452098798395	0.727009731456	0.479793576522	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:58166359..58166473,+__1487.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:58166359..58166473,+__1487.1.0.0	rs148073180	-0.6867561013774948	-0.4094530920367788	-0.5529796069336395	-0.5219869752529266	-0.5950466916039084	-0.37213040411715825	-0.7160227021082328	-0.4932184922848143	-0.5149357733826428	-0.6716129984978694	-0.4831608364135361	-0.540993079003183	-0.5465247294176819	-0.8314499931646098	-0.4583614682770517	-0.8988431767763663	-0.8078795068260741	-1.003963823745724	-0.7419334291819445	-0.8623338316527973	-0.7899636747855941	-1.0674239879751777	-0.73335881886619	-0.7950168246645593	-1.0366988145512481	-0.8356022792056116	-0.144693891787115	-0.04890837624027289	-0.3458635698427268	-0.28589253157314753	-0.4089171321418156	-0.36980302506478624	-0.1463111295445645	-0.29674518250077986	-0.5524882145925348	-0.06174582036832066	-0.3118559882510232	-0.4957057355480651	-0.2890775497879293	0.840380101088	0.706946403854	0.609889042629	0.197395731844	0.0785847853765	0.276771967065	NA__no_active_tile	0.13967914143	0.00919097005605	0.375513989452	0.192768091005	0.0156538458129	0.00921901343173	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr12:58166359..58166473,+__1487.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:58166359..58166473,+__1487.1.0.0	rs2291617	-0.6867561013774948	-0.4094530920367788	-0.5529796069336395	-0.5219869752529266	-0.5950466916039084	-0.37213040411715825	-0.7160227021082328	-0.4932184922848143	-0.5149357733826428	-0.6716129984978694	-0.4831608364135361	-0.540993079003183	-0.5465247294176819	-0.6042745796264873	-0.1862097991335932	-0.8361580624052782	-0.7308626157602129	-0.6143322794873642	-0.7229404514948619	-0.4999199932044148	-0.7643703341924555	-0.6175553852555945	-0.7498927556019764	-0.821309642201753	-0.5008247641727477	-0.637387555211395	0.08248152175100743	0.22324329290318562	-0.2831784554716388	-0.20887564050728635	-0.0192855878834558	-0.3508100473777036	0.216102708903818	-0.2711518419076412	-0.10261961187295165	-0.07827975710410706	-0.3381488057882169	0.04016831483043537	-0.0908628257937129	0.925117039075	0.412754243182	0.29495293544	0.044708952363	0.468411351413	0.313917214294	0.967868733231	0.206893929435	0.30750859871	0.405136064622	0.253741740693	0.619326784864	0.316870204796	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr12:58166359..58166473,+__1487.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr12:58166359..58166473,+__1487.1.0.0	rs148073180,rs2291617	-0.6867561013774948	-0.4094530920367788	-0.5529796069336395	-0.5219869752529266	-0.5950466916039084	-0.37213040411715825	-0.7160227021082328	-0.4932184922848143	-0.5149357733826428	-0.6716129984978694	-0.4831608364135361	-0.540993079003183	-0.5465247294176819	-1.1947660016779846	-1.2270168305495506	-1.1097956810496392	-1.0085882508678101	-1.1057317601505454	-1.4673139318982242	-1.1224136051964102	-0.987775206669294	-0.9633541373152428	-1.2161966574657193	-1.0946673483220875	-1.1733944051996945	-1.1392511513635168	-0.5080099003004899	-0.8175637385127718	-0.5568160741159998	-0.48660127561488353	-0.510685068546637	-1.095183527781066	-0.4063909030881774	-0.4945567143844797	-0.44841836393259993	-0.5445836589678499	-0.6115065119085514	-0.6324013261965115	-0.5927264219458347	0.175053819161	0.0216734048733	0.0156538458129	0.0374147936077	0.00668210963275	0.000116396943443	NA__no_active_tile	0.0763307839553	0.0181189115857	0.0678362651725	0.00784715402968	0.00816548763477	2.63910085963e-12	1	1	1	1	1	0.0233957856321	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	5.99075895136e-10	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr13:23755067..23755181,+__1488.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr13:23755067..23755181,+__1488.1.0.0	rs4770403	-1.7244700373657251	-1.890391054856715	-1.7872039298735842	-1.862244997684428	-1.8485681733337755	-1.4542597739287166	-1.4283220196280881	-1.4832205250346864	-1.6012136370021155	-1.653298945542725	-1.8496895696225533	-1.838787508417937	-1.701805847690921	-2.0102695226907272	-1.3792114718541553	-2.10992027536596	-1.8371641041715097	-1.6533583979666964	-1.7854617808083035	-1.626868929295067	-1.9450147598686214	-1.4508580237215127	-1.962572329546895	-1.6674515815630198	-1.7897636600032085	-1.768159569737973	-0.2857994853250021	0.5111795830025598	-0.3227163454923758	0.025080893512918312	0.19520977536707917	-0.3312020068795869	-0.19854690966697897	-0.461794234833935	0.15035561328060276	-0.30927338400417015	0.1822379880595335	0.04902384841472851	-0.06635372204705224	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr13:30880958..30881072,-__1489.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr13:30880958..30881072,-__1489.1.0.0	rs202082	-0.7338811702714477	-1.3820813218956192	-0.8593630052669503	-0.9979613542082753	-0.7083105610336714	-0.7870555397003705	-1.0272480086989169	-1.2959951244168781	-0.7833861970953926	-0.6620659729908445	-0.9627956420899146	-1.2403825774456727	-0.9533772062594963	-1.1694922733359867	-1.0336367758304683	-1.292406175448317	-1.6732923687328518	-0.9648308022956388	-1.5861573379825042	-0.966605711623804	-1.0841750150394913	-1.0350882100210237	-1.3068001844438772	-1.2690698237263165	-0.8298643778465817	-1.184284921360572	-0.435611103064539	0.34844454606515085	-0.4330431701813666	-0.6753310145245766	-0.2565202412619674	-0.7991017982821338	0.060642297075112817	0.21182010937738682	-0.2517020129256311	-0.6447342114530328	-0.30627418163640185	0.41051819959909097	-0.23090771510107566	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr13:30880958..30881072,-__1489.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr13:30880958..30881072,-__1489.1.0.0	rs116650258,rs202082	-0.7338811702714477	-1.3820813218956192	-0.8593630052669503	-0.9979613542082753	-0.7083105610336714	-0.7870555397003705	-1.0272480086989169	-1.2959951244168781	-0.7833861970953926	-0.6620659729908445	-0.9627956420899146	-1.2403825774456727	-0.9533772062594963	-1.8725642907587456	-1.6418447550123718	-1.6417830192134217	-1.5147328884125582	-1.4760690534217789	-1.749047417182329	-1.826495284090078	-1.27426548254643	-1.6438457795667365	-1.5842021141188656	-2.0648050744806814	-1.7736352131025919	-1.671940864325549	-1.1386831204872978	-0.25976343311675265	-0.7824200139464714	-0.5167715342042829	-0.7677584923881074	-0.9619918774819585	-0.7992472753911612	0.021729641870448235	-0.8604595824713439	-0.9221361411280211	-1.1020094323907668	-0.5332526356569192	-0.7185636580660528	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr13:33160607..33160721,+__1490.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr13:33160607..33160721,+__1490.1.0.0	rs7994229	-0.041342838429626966	-0.07655056522921794	-0.33749512827250355	-0.3268271070092255	0.05700875522509858	-0.3418334892068833	-0.12321362760902956	0.04832555515325971	-0.34252341738185443	0.12433687743418796	-0.08852198603755664	-0.2928795020129629	-0.14512637278135954	0.22332796687401485	0.1753968604543205	0.04502237529439592	-0.10426925829138116	0.08242337188880106	0.21517307389251966	-0.11314069848462362	-0.09757838426807786	0.017420610685661087	0.1231335531204441	0.04739786745380751	0.2800917958968676	0.07453326120972914	0.26467080530364184	0.25194742568353845	0.38251750356689945	0.22255784871784434	0.025414616663702476	0.557006563099403	0.010072929124405938	-0.14590393942133756	0.3599440280675155	-0.001203324313743856	0.13591985349136415	0.5729712979098305	0.21965963399108868	0.288805731951	0.188220673538	0.87199428352	0.320413072024	0.930450938691	0.175053819161	0.66743649171	0.586575008857	0.107123399254	0.767687747466	0.0832552515755	0.136115392203	0.229266100187	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr13:76334724..76334838,+__1491.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr13:76334724..76334838,+__1491.1.0.0	rs7997101	0.9691977443100874	1.233248149861801	1.235724850226707	1.1497807687690624	1.1825823801582556	1.262321329971936	1.3991873287434418	1.5295624063702116	1.3693279118220503	1.3314159829046042	1.2346271864344138	1.322350369798316	1.2682772007809073	1.4039374838296395	1.8790926802284385	1.8282983441713818	1.4493929830462402	1.7627733129259426	1.764080434672104	2.103064313225729	1.8950350290570082	1.8480610981943952	1.877297530977991	2.050697106305332	2.046158562374324	1.8256574065840436	0.434739739519552	0.6458445303666374	0.5925734939446747	0.29961221427717777	0.5801909327676871	0.5017591047001679	0.7038769844822874	0.3654726226867966	0.47873318637234497	0.5458815480733867	0.8160699198709183	0.723808192576008	0.5573802058031366	0.00210630874131	9.33325531828e-05	0.000273955335251	0.0216734048733	5.62183900058e-05	0.000505862288815	0.000531799681309	0.00372847011721	0.000587432962331	0.000354775949455	7.05457685779e-05	9.86556518966e-05	3.53149452587e-30	1	0.069439419568	0.204096724762	1	0.0434005970845	0.386478788655	0.392999964488	1	0.454085679882	0.278499120323	0.0542496960364	0.0768527528274	2.95939241268e-27	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr14:102706915..102707029,-__1492.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:102706915..102707029,-__1492.1.0.0	rs12891405	-0.8782641685377649	-1.4729422175663878	-1.3845667064603848	-1.1051663955803928	-1.6207708147006206	-1.0634051004659857	-1.5742137761645263	-1.2787354739134331	-1.6634089578906133	-1.3061593067501873	-1.3819878751582904	-0.9579037715786193	-1.3072937137306007	-1.400674295614015	-1.6266112387677405	-1.6397158921024368	-1.4372423882435859	-1.6152495135542608	-1.806645047260924	-1.3297772810170478	-1.4192459758449865	-1.3667621537315278	-1.2676470980361634	-1.410282120400065	-1.2632452522889048	-1.465258188071805	-0.5224101270762501	-0.15366902120135273	-0.255149185642052	-0.3320759926631931	0.005521301146359736	-0.7432399467949382	0.24443649514747845	-0.14051050193155334	0.2966468041590855	0.03851220871402394	-0.028294245241774707	-0.30534148071028555	-0.15796447434120434	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr14:102706915..102707029,-__1492.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:102706915..102707029,-__1492.1.0.0	rs12887161,rs12891405	-0.8782641685377649	-1.4729422175663878	-1.3845667064603848	-1.1051663955803928	-1.6207708147006206	-1.0634051004659857	-1.5742137761645263	-1.2787354739134331	-1.6634089578906133	-1.3061593067501873	-1.3819878751582904	-0.9579037715786193	-1.3072937137306007	-1.377607416319195	-1.3092011816373268	-1.3358376288340963	-1.3651927367442696	-2.0236564026460258	-1.383621860360119	-1.2686946697915655	-1.467719365613553	-1.386519301777292	-1.7926862795888856	-1.9451084169555457	-1.4417114400846105	-1.5081297250293737	-0.49934324778143	0.16374103592906097	0.04872907762628853	-0.2600263411638768	-0.4028855879454052	-0.32021675989413323	0.30551910637296076	-0.18898389170011987	0.27688965611332117	-0.4865269728386983	-0.5631205417972553	-0.4838076685059912	-0.20083601129877318	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr14:24610684..24610798,-__1493.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:24610684..24610798,-__1493.1.0.0	rs2236352	1.744442274673559	1.0334324820349852	1.4598706590679957	0.42778892713140376	2.3588114606006285	-0.016199302025603157	1.017463315747248	1.294194778316445	2.9340400415270653	2.0643271509711205	1.4021098931968838	0.8239656418114487	1.3786872769210985	1.0634105320178189	1.8417731209193555	-1.0110770478810858	1.0653237098584665	1.1929445461563968	0.8314576266841393	1.5766972645768687	2.543593006884678	2.149068451977413	1.0296664471151151	1.805235576209356	0.29677721305944	1.1987392039648304	-0.6810317426557402	0.8083406388843704	-2.4709477069490813	0.6375347827270628	-1.1658669144442317	0.8476569287097424	0.5592339488296207	1.2493982285682332	-0.7849715895496523	-1.0346607038560054	0.4031256830124721	-0.5271884287520088	-0.17994807295626816	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr14:24610684..24610798,-__1493.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:24610684..24610798,-__1493.1.0.0	rs2236352,rs10151187	1.744442274673559	1.0334324820349852	1.4598706590679957	0.42778892713140376	2.3588114606006285	-0.016199302025603157	1.017463315747248	1.294194778316445	2.9340400415270653	2.0643271509711205	1.4021098931968838	0.8239656418114487	1.3786872769210985	0.39362823926954316	0.7357883550745997	0.30378737873371153	-0.7640428888940596	0.5614930705558329	-0.15263901025399124	-0.8737506498787386	0.389774686940986	0.6785348003815082	-0.04597974568015898	1.0080079425108486	0.18974639149393066	0.20202904752116768	-1.350814035404016	-0.29764412696038545	-1.1560832803342842	-1.1918318160254633	-1.7973183900447958	-0.13643970822838808	-1.8912139656259865	-0.904420091375459	-2.255505241145557	-2.1103068966512795	-0.39410195068603526	-0.634219250317518	-1.1766582293999306	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr14:24610717..24610831,-__1494.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:24610717..24610831,-__1494.1.0.0	rs2236352	0.5096216509235538	0.6089893088640612	1.2374610649187978	-0.05445944404139056	0.4724630855920335	0.3818048409233762	0.6475557497659971	0.3237998251929869	0.4832087513776969	0.5036877725514647	0.6685829371575043	0.3974691420173007	0.5150153904369487	1.169383249814114	1.0888766274614532	1.1641175981297405	0.6570145953351676	1.0456265588141676	0.5328662371228018	0.8356497277334057	0.786821712470064	0.8499084769568362	0.7087381126573606	0.8701587057335655	0.7490897710860144	0.8715209477762244	0.6597615988905601	0.479887318597392	-0.07334346678905734	0.7114740393765582	0.573163473222134	0.1510613961994256	0.18809397796740868	0.46302188727707716	0.3666997255791393	0.20505034010589596	0.2015757685760612	0.35162062906871366	0.3565055573392757	NA__not_enough_barcodes	0.00849533044186	0.390154148302	NA__not_enough_barcodes	0.107123399254	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.288805731951	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.301187193336	0.0128850997796	NA__not_enough_barcodes	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr14:24610717..24610831,-__1494.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:24610717..24610831,-__1494.1.0.0	rs10151187	0.5096216509235538	0.6089893088640612	1.2374610649187978	-0.05445944404139056	0.4724630855920335	0.3818048409233762	0.6475557497659971	0.3237998251929869	0.4832087513776969	0.5036877725514647	0.6685829371575043	0.3974691420173007	0.5150153904369487	0.5003221106611091	0.4623279756829132	0.5202487537413683	-0.2764827697411447	0.7665776550011172	0.09372902142367714	0.38211801205850104	0.16062833046301314	0.043533071814448585	0.15956673245757974	0.4174098617531773	0.23769845523856117	0.28897310087952677	-0.009299540262444728	-0.14666133318114805	-0.7172123111774296	-0.22202332569975416	0.2941145694090837	-0.28807581949969907	-0.265437737707496	-0.16317149472997375	-0.4396756795632483	-0.34412104009388494	-0.251173075404327	-0.15977068677873954	-0.22604228955742178	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr14:24610717..24610831,-__1494.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:24610717..24610831,-__1494.1.0.0	rs2236352,rs10151187	0.5096216509235538	0.6089893088640612	1.2374610649187978	-0.05445944404139056	0.4724630855920335	0.3818048409233762	0.6475557497659971	0.3237998251929869	0.4832087513776969	0.5036877725514647	0.6685829371575043	0.3974691420173007	0.5150153904369487	0.561051104280363	0.8576734402720141	0.2733991608592672	0.2677576093630855	0.6111593187618156	0.06940507548403682	-0.04705825733893437	0.635946154669023	0.2831789208366645	0.6877832612964868	-0.005527030694787105	1.071576458023209	0.438862101317687	0.05142945335680915	0.24868413140795287	-0.9640619040595306	0.3222170534044761	0.13869623316978213	-0.31239976543933934	-0.6946140071049314	0.31214632947603616	-0.2000298305410324	0.18409548874502213	-0.6741099678522914	0.6741073160059083	-0.07615328911926152	NA__not_enough_barcodes	0.0658387268341	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.107123399254	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.0412580447575	0.00480080400224	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr14:25103361..25103475,-__1495.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:25103361..25103475,-__1495.1.0.0	rs2273843	-0.7634217646832128	-1.1961022149919718	-0.699126704685131	-0.5881970409854367	-0.9224534226406323	-1.2655340163465962	-0.7745791910960762	-0.8857789413564938	-0.8006181615907288	-1.2980614921912008	-1.62319726677004	-0.8937260624344872	-0.9758996899810005	-0.9716789551828429	-0.845869515672899	-1.0565577060351656	-0.8919112832836209	-1.0072860934726755	-1.1374296045976904	-1.1184433065117665	-1.2248856964583579	-0.8649086411708966	-1.104762123260715	-1.0725251197550307	-0.9925052250699944	-1.0240636058726378	-0.2082571904996301	0.35023269931907275	-0.3574310013500346	-0.3037142422981842	-0.08483267083204316	0.12810441174890586	-0.3438641154156903	-0.33910675510186405	-0.06429047958016776	0.19329936893048583	0.5506721470150093	-0.09877916263550723	-0.0481639158916373	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr14:25103361..25103475,-__1495.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:25103361..25103475,-__1495.1.0.0	rs2273844	-0.7634217646832128	-1.1961022149919718	-0.699126704685131	-0.5881970409854367	-0.9224534226406323	-1.2655340163465962	-0.7745791910960762	-0.8857789413564938	-0.8006181615907288	-1.2980614921912008	-1.62319726677004	-0.8937260624344872	-0.9758996899810005	-1.138458422700751	-1.094606378104636	-0.9614255044150641	-1.262418575940003	-1.4079113137215191	-1.2765260232859033	-1.28790035676824	-1.5545420369670393	-1.2779773326317712	-1.5451578211357337	-1.1493516998613618	-1.2308824089840618	-1.2655964895430067	-0.37503665801753827	0.10149583688733577	-0.2622987997299331	-0.6742215349545664	-0.48545789108088677	-0.01099200693930702	-0.5133211656721639	-0.6687630956105455	-0.4773591710410423	-0.24709632894453293	0.4738455669086783	-0.3371563465495746	-0.28969679956200645	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr14:25103361..25103475,-__1495.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:25103361..25103475,-__1495.1.0.0	rs2273843,rs2273844	-0.7634217646832128	-1.1961022149919718	-0.699126704685131	-0.5881970409854367	-0.9224534226406323	-1.2655340163465962	-0.7745791910960762	-0.8857789413564938	-0.8006181615907288	-1.2980614921912008	-1.62319726677004	-0.8937260624344872	-0.9758996899810005	-1.368892651236186	-0.8985154293894602	-1.0170463240171477	-1.1818000613266564	-1.2183180346380837	-1.345479453123044	-1.1346634374205418	-1.4052560112172172	-1.1751074010345124	-0.9573826533099002	-1.3097871675060373	-1.0572214823133186	-1.172455842211009	-0.6054708865529733	0.2975867856025116	-0.3179196193320166	-0.5936030203412197	-0.2958646119974514	-0.07994543677644783	-0.36008424632446556	-0.5194770698607234	-0.37448923944378354	0.34067883888130057	0.31341009926400276	-0.16349541987883143	-0.1965561522300082	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr14:64680803..64680917,+__1496.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:64680803..64680917,+__1496.1.0.0	rs1152591	-1.388559657289645	-1.4193471939829596	-0.9119160143411529	-1.5885050264599114	-1.2538085789232225	-1.348154251405274	-1.3470159073200247	-1.6540723609988475	-1.7395498258663389	-0.8343675338028215	-1.6610812951213374	-1.692642553426458	-1.403251683244833	-1.1957479393667088	-0.5169948749843631	-0.8078498330983962	-0.7244543662894544	-0.5733775663705586	0.14533297455909547	0.3082445695324329	0.06621257723668572	-1.1166931407090177	-1.108523370070414	-0.5820819528821688	-0.7872471288870012	-0.5744316709441558	0.19281171792293628	0.9023523189985965	0.10406618124275668	0.8640506601704571	0.6804310125526639	1.4934872259643694	1.6552604768524577	1.7202849382355332	0.6228566851573212	-0.27415583626759255	1.0789993422391686	0.9053954245394568	0.8288200123006769	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr14:91282804..91282918,-__1497.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:91282804..91282918,-__1497.1.0.0	rs185035663	0.07649489951696964	-0.801066954062676	-0.5430573924845971	0.12559602992213534	0.08771681023103084	1.018862002252921	0.8588301151348888	0.7426150321410766	-0.16075959770547193	-0.6248931982864293	0.36943762842033023	0.014382583449021803	0.09701316321076665	2.591687043099215	0.8023904863676097	2.6247091944852015	1.3244255942807996	2.1295250543585573	0.6188970604597186	1.2760725539851645	1.747856205534076	4.146721939573749	-0.526460496772012	0.7385662172119649	1.2315501546437733	1.5588284172689848	2.5151921435822455	1.6034574404302857	3.1677665869697984	1.1988295643586644	2.0418082441275267	-0.3999649417932023	0.4172424388502757	1.0052411733929993	4.307481537279221	0.0984327015144173	0.3691285887916347	1.2171675711947514	1.4618152540582179	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr14:92414299..92414413,-__1498.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:92414299..92414413,-__1498.1.0.0	rs3814835	-1.0291306714152197	-1.0214163857632141	-1.4257586585648412	-1.2650911750250735	-0.9473831502528838	-1.178438852754147	-1.0548463270037358	-0.9392516566542612	-1.0908007276533769	-1.414048786455418	-1.326117180223715	-1.3418559815626725	-1.1695116294440464	-1.0168161020495272	-1.13654895772058	-1.794558937460683	-1.10840509194563	-0.9224534226406323	-1.0444651632560578	-1.0509629289014495	-0.9691439582967504	-0.9459241828286294	-1.3855849038111354	-0.9085651761346203	-0.9578995610579657	-1.1034440321753052	0.01231456936569253	-0.11513257195736593	-0.36880027889584177	0.15668608307944343	0.02492972761225143	0.1339736894980892	0.0038833981022863284	-0.029892301642489127	0.14487654482474743	0.02846388264428268	0.41755200408909476	0.3839564205047068	0.06606759726874148	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr14:92414299..92414413,-__1498.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr14:92414299..92414413,-__1498.1.0.0	rs111821909,rs3814835	-1.0291306714152197	-1.0214163857632141	-1.4257586585648412	-1.2650911750250735	-0.9473831502528838	-1.178438852754147	-1.0548463270037358	-0.9392516566542612	-1.0908007276533769	-1.414048786455418	-1.326117180223715	-1.3418559815626725	-1.1695116294440464	-1.252810677787911	-1.1180065502011423	-1.565663461344266	-0.8335249634901924	-0.8204427547347559	-1.3367908314930115	-1.1043258965378389	-1.2513447485172617	-1.3771280388947356	-1.2918942679967236	-1.4992038515986366	-1.4555877488589577	-1.2422269826212864	-0.22368000637269136	-0.09659016443792812	-0.13990480277942474	0.43156621153488106	0.12694039551812786	-0.15835197873886453	-0.04947956953410304	-0.3120930918630005	-0.2863273112413587	0.12215451845869452	-0.1730866713749215	-0.1137317672962852	-0.07271535317723953	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr15:40675065..40675179,+__1499.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:40675065..40675179,+__1499.1.0.0	rs7164132	1.903373407400745	2.6079444396609115	2.2181571620313267	1.9011224428133804	2.1845696832000603	2.028864038256503	2.0340188186092067	2.0436582835207884	2.0149246360261164	2.164584816350743	2.103854960612624	2.333584601450798	2.1282214408277667	2.617473104035441	2.9292455644439763	2.336214691688849	2.2770021051675005	2.684515673953768	2.564547613462133	2.3121274393544637	2.6729341319943067	2.5777277948990047	2.3957007975607016	2.5631326484084065	2.542478268416568	2.539424986115426	0.7140996966346962	0.32130112478306483	0.11805752965752214	0.37587966235412007	0.4999459907537078	0.5356835752056299	0.278108620745257	0.6292758484735184	0.5628031588728883	0.23111598120995858	0.4592776877957827	0.20889366696576994	0.4112035452876596	0.00423662678721	0.0350255264852	0.0986283746992	0.107123399254	0.000199758557674	0.00389134425826	0.226871263542	0.00175684955224	0.00372847011721	0.0156526560932	0.00501178746069	0.119339994516	1.06563798796e-13	1	1	1	1	0.154213606524	1	1	1	1	1	1	1	8.93004633907e-11	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr15:49913033..49913147,-__1500.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:49913033..49913147,-__1500.1.0.0	rs113483771	0.3179725018903559	0.602677873841238	0.4702135755006819	0.4768339454947939	0.4155052436794976	0.6094997016819234	0.42516641969982855	0.2796213969025125	0.4741932775599076	0.4009557072382273	0.5046635421893664	0.4746737983611343	0.4543314153366223	0.4586518891242205	1.0343156947390026	0.8690171730853545	0.5852606407182558	0.7708840364633955	0.9223977351525758	0.531094848118437	0.31807890156527824	0.6640943271032986	0.5774797765269353	0.6130835048856937	0.7087286626613967	0.6710905991786538	0.14067938723386458	0.4316378208977646	0.39880359758467265	0.10842669522346188	0.35537879278389795	0.3128980334706525	0.10592842841860844	0.03845750466276576	0.18990104954339104	0.17652406928870795	0.10841996269632737	0.23405486430026234	0.2167591838420314	0.638386621154	0.0808926541269	0.628827692687	0.405136064622	0.85089220831	0.493474750668	0.66743649171	0.978575692288	0.819442862795	0.967868365621	0.88258056334	0.175053819161	0.94521053586	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr15:49913033..49913147,-__1500.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:49913033..49913147,-__1500.1.0.0	rs114332954	0.3179725018903559	0.602677873841238	0.4702135755006819	0.4768339454947939	0.4155052436794976	0.6094997016819234	0.42516641969982855	0.2796213969025125	0.4741932775599076	0.4009557072382273	0.5046635421893664	0.4746737983611343	0.4543314153366223	0.5749329764151482	0.9230524706562842	0.7562603632533644	0.5236669014088945	0.7474896630869671	0.956179363168822	0.6990555251003494	0.6753008499168653	0.6958325741583188	0.73248126948181	0.5583276335438145	1.071472114261762	0.7428376420377001	0.25696047452479226	0.3203745968150461	0.28604678775268255	0.04683295591410058	0.3319844194074695	0.34667966148689866	0.27388910540052086	0.39567945301435287	0.2216392965984112	0.3315255622435827	0.05366409135444816	0.5967983159006277	0.2885062267010778	0.375508523987	0.354199901149	0.536806685117	0.946473618223	0.493479697885	0.162586850726	0.0763307839553	0.211760329767	0.113097651531	0.0531733827136	0.340423946445	0.0267271087754	0.0165010025279	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr15:49913033..49913147,-__1500.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:49913033..49913147,-__1500.1.0.0	rs113956008	0.3179725018903559	0.602677873841238	0.4702135755006819	0.4768339454947939	0.4155052436794976	0.6094997016819234	0.42516641969982855	0.2796213969025125	0.4741932775599076	0.4009557072382273	0.5046635421893664	0.4746737983611343	0.4543314153366223	0.3097996903522437	0.422670252019248	0.028496152014519396	0.11276585918855375	0.2839952700361557	0.2958222176860968	0.175930428416469	0.28254619773894885	0.32109762907835826	0.09276934708129017	0.5557614025854112	0.4044481205463111	0.2738418805619672	-0.008172811538112223	-0.18000762182199004	-0.4417174234861625	-0.36406808630624016	-0.13150997364334188	-0.31367748399582657	-0.24923599128335955	0.00292480083643637	-0.15309564848154933	-0.3081863601569371	0.0510978603960448	-0.07022567781482325	-0.1804895347746551	0.677229610811	0.412754243182	0.226876581559	0.405136064622	0.572794651112	0.192768091005	0.48504462162	0.468406259835	0.347268461228	0.354199901149	0.8931878581	0.967868733231	0.588686146418	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr15:49913033..49913147,-__1500.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:49913033..49913147,-__1500.1.0.0	rs113483771,rs114332954,rs113956008	0.3179725018903559	0.602677873841238	0.4702135755006819	0.4768339454947939	0.4155052436794976	0.6094997016819234	0.42516641969982855	0.2796213969025125	0.4741932775599076	0.4009557072382273	0.5046635421893664	0.4746737983611343	0.4543314153366223	0.39830584033338146	0.6481558437959669	0.5584855757829505	0.25415997089841474	0.3787763669216846	0.5735999468453422	0.5469606346732299	0.5909770480607575	0.6972785035615536	0.5329251229016839	0.627195250703882	0.6822573453349419	0.5407564541511491	0.08033333844302554	0.04547796995472886	0.08827200028226867	-0.22267397459637917	-0.036728876757813	-0.035899754836581144	0.12179421497340132	0.311355651158245	0.22308522600164604	0.1319694156634566	0.12253170851451567	0.20758354697380754	0.08642503881452683	0.819440831591	0.60051573606	0.63839046467	0.716953652062	0.368322877114	0.925117039075	0.809021331888	0.554653407081	0.777966336216	0.66743649171	0.989287003123	0.21176555971	0.976963833213	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr15:49913077..49913191,+__1501.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr15:49913077..49913191,+__1501.1.0.0	rs113483771	-0.6295165155781929	-0.6070245614771683	-0.3151772070789845	-0.15809564551688968	-0.3846469183005231	-0.7720672833029325	-0.6552225428292058	-0.4763271520048545	-0.5150583565848041	-0.4988378942582115	-0.2625273811895039	-0.5923141236322979	-0.4889012984794641	-0.4985642472300413	-0.13700203440485892	0.10777692719935053	-0.13702139018837622	-0.18786713128377816	-0.3733294219238523	-0.3875817168131554	-0.4319407710784877	-0.38914731210142717	-0.03418998921504262	0.03864883768452515	-0.19449297613298627	-0.21872593545734423	0.1309522683481516	0.4700225270723094	0.42295413427833506	0.021074255328513453	0.19677978701674495	0.3987378613790802	0.2676408260160504	0.044386380926366764	0.12591104448337698	0.4646479050431689	0.30117621887402907	0.3978211474993116	0.2701753630221198	0.783116642561	0.452098798395	0.747262025795	0.63839046467	0.527990680582	0.221756412245	0.90381429355	0.262211172943	0.79863356553	0.412754243182	0.545696106059	0.609889042629	0.779025333549	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr15:49913077..49913191,+__1501.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr15:49913077..49913191,+__1501.1.0.0	rs114332954	-0.6295165155781929	-0.6070245614771683	-0.3151772070789845	-0.15809564551688968	-0.3846469183005231	-0.7720672833029325	-0.6552225428292058	-0.4763271520048545	-0.5150583565848041	-0.4988378942582115	-0.2625273811895039	-0.5923141236322979	-0.4889012984794641	-0.5198346181543223	-0.31839595522810865	-0.5553265117295055	-0.265249959453682	-0.4411942785683576	-0.10388120715249696	-0.23982992562776606	-0.6909438763275924	-0.5049480304609997	-0.2882409115269023	-0.08854003922665156	-0.19791395433200795	-0.35119160564903273	0.10968189742387058	0.28862860624905967	-0.24014930465052103	-0.10715431393679234	-0.05654736026783447	0.6681860761504356	0.4153926172014397	-0.21461672432273787	0.01011032612380447	0.21059698273130922	0.17398734196285237	0.39440016930028987	0.1377096928304313	0.510577925344	0.973221425691	0.0906800339379	0.788281320858	0.572794651112	0.0201846528804	0.8931878581	0.248198866138	0.125844655769	0.412754243182	0.809021331888	0.737113058664	0.529902424344	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr15:49913077..49913191,+__1501.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr15:49913077..49913191,+__1501.1.0.0	rs113956008	-0.6295165155781929	-0.6070245614771683	-0.3151772070789845	-0.15809564551688968	-0.3846469183005231	-0.7720672833029325	-0.6552225428292058	-0.4763271520048545	-0.5150583565848041	-0.4988378942582115	-0.2625273811895039	-0.5923141236322979	-0.4889012984794641	-0.19008341255573902	-0.6191318999786949	-0.8267360601065211	-0.5290888730572413	-0.3090890160465817	-0.521707280846651	-0.7018308987542399	-0.47189380892682986	-0.30970986126971217	-0.10335414796708947	-0.5011886116809471	-0.3985335881322966	-0.45686228827687864	0.43943310302245386	-0.012107338501526566	-0.5115588530275366	-0.3709932275403516	0.07555790225394143	0.25036000245628154	-0.046608355925034095	0.004433343078024621	0.20534849531509197	0.39548374629112204	-0.23866123049144317	0.19378053550000124	0.03203901020258539	0.967868733231	0.382791178922	0.0583274625199	0.102802176292	0.60051573606	0.265084565602	NA__no_active_tile	0.662555609067	0.361218104761	0.983930924304	0.192768091005	0.777966336216	0.553837581725	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr15:49913077..49913191,+__1501.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr15:49913077..49913191,+__1501.1.0.0	rs113483771,rs114332954,rs113956008	-0.6295165155781929	-0.6070245614771683	-0.3151772070789845	-0.15809564551688968	-0.3846469183005231	-0.7720672833029325	-0.6552225428292058	-0.4763271520048545	-0.5150583565848041	-0.4988378942582115	-0.2625273811895039	-0.5923141236322979	-0.4889012984794641	-0.4004996144409607	-0.1876706040048478	-0.2923150454257199	-0.5700525199144308	-0.2862677337874613	-0.2423552570761454	0.09896463977625362	-0.22264753167222	-0.4318927398371246	-0.2928376457739263	-0.5543695496069544	-0.104797058841485	-0.2905617217170852	0.22901690113723217	0.4193539574723205	0.0228621616532646	-0.41195687439754114	0.09837918451306182	0.5297120262267871	0.7541871826054594	0.25367962033263447	0.08316561674767953	0.20600024848428522	-0.2918421684174505	0.48751706479081286	0.19833957676237882	NA__no_active_tile	0.88258056334	0.368322877114	0.282745459933	0.819442862795	0.045430560235	0.677233097055	0.619326784864	0.270885072145	0.541237650508	0.468411351413	0.989287003123	0.724500670144	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr15:63449639..63449753,-__1502.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:63449639..63449753,-__1502.1.0.0	rs2292038	2.720245274929764	3.1461752835652312	2.6668033814929855	2.6395136403844943	2.8279671774351653	2.872129659095354	2.793393870081248	3.0260415523027513	2.9284769569885016	2.927452391519692	2.933782975025175	3.069750106761699	2.879311022465172	2.7392065129281145	3.228498193291916	2.831115225459431	2.412928053010435	2.8741402515106453	2.8811988237533956	2.829372669924319	2.8792835182588083	2.8513539986408962	2.982994581321794	2.9475196793854694	2.8708001790663853	2.860700973879301	0.018961237998350366	0.08232290972668466	0.16431184396644571	-0.2265855873740592	0.04617307407547999	0.00906916465804164	0.03597879984307095	-0.14675803404394294	-0.07712295834760541	0.055542189802102016	0.013736704360294283	-0.19894992769531372	-0.01861004858587097	0.978575937473	0.8931878581	0.757455001208	0.628827692687	0.609889042629	0.757455001208	0.687084607526	0.170821264488	0.375513989452	0.628827692687	0.946473618223	0.591208103411	0.972792966423	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr15:63449639..63449753,-__1502.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:63449639..63449753,-__1502.1.0.0	rs28366055	2.720245274929764	3.1461752835652312	2.6668033814929855	2.6395136403844943	2.8279671774351653	2.872129659095354	2.793393870081248	3.0260415523027513	2.9284769569885016	2.927452391519692	2.933782975025175	3.069750106761699	2.879311022465172	2.7061571004708176	3.2513791581503453	2.8744355459312123	2.633667875642323	2.8836205978391876	2.8772112094092734	2.865718423990354	2.9825402384584683	2.951460034251077	3.0132000951161464	2.9941021253080216	3.0983749726718006	2.9276556147699186	-0.0140881744589465	0.10520387458511404	0.20763216443822685	-0.005845764742171244	0.055653420404022214	0.005081550313919436	0.07232455390910619	-0.04350131384428302	0.022983077262575424	0.08574770359645445	0.0603191502828464	0.028624865910101605	0.04834459230474716	0.957167318493	0.935789553219	0.657696241675	0.978575937473	0.657696241675	0.563691144959	0.935789553219	0.527990680582	0.609889042629	0.840380101088	0.809021331888	0.840380101088	0.999231505726	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr15:63449639..63449753,-__1502.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:63449639..63449753,-__1502.1.0.0	rs2292038,rs28366055	2.720245274929764	3.1461752835652312	2.6668033814929855	2.6395136403844943	2.8279671774351653	2.872129659095354	2.793393870081248	3.0260415523027513	2.9284769569885016	2.927452391519692	2.933782975025175	3.069750106761699	2.879311022465172	2.5324439124247258	2.768254669243669	2.532655790939402	2.249758171931753	2.5723130333397894	2.78748911750254	2.3864266545049104	2.6493873426979384	2.6914114282597272	2.676539656757762	2.7214914145570477	2.6155708328007488	2.5986451687466676	-0.18780136250503832	-0.3779206143215621	-0.13414759055358338	-0.3897554684527411	-0.2556541440953759	-0.08464054159281398	-0.4069672155763375	-0.3766542096048129	-0.2370655287287744	-0.25091273476193	-0.21229156046812747	-0.45417927396095026	-0.28066585371850394	0.253741740693	0.170821264488	0.282745459933	0.301187193336	0.116187990183	0.104229562843	0.0548474154937	0.0386605553759	0.0232568344756	0.0327677521954	0.179364149792	0.0531733827136	8.5762054414e-06	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0019467986352	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr15:81391669..81391783,+__1503.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:81391669..81391783,+__1503.1.0.0	rs1509560	-0.7987393884901968	-0.8275739217154572	-0.9079896440829485	-0.6253771073025945	-0.9476899740656436	-1.1886387600908053	-0.716843879475168	-0.7380129458765161	-0.6788292682052582	-0.8350269756610929	-0.8157868065240168	-0.432156803757848	-0.7927221229372955	-0.7693103666807407	-1.1176330823988745	-1.0875350711652878	-1.0684999204916832	-1.0852014943555055	-0.9303703026178528	-0.997971661465862	-1.0330983358440438	-0.819078171278939	-0.9262521328539371	-0.7648916166503119	-0.8862043691695968	-0.9571705437477197	0.029429021809456057	-0.2900591606834173	-0.17954542708233934	-0.44312281318908864	-0.1375115202898619	0.25826845747295246	-0.281127781990694	-0.29508538996752764	-0.14024890307368076	-0.0912251571928443	0.050895189873704894	-0.4540475654117488	-0.16444842081042413	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.242741268695	0.66743649171	0.270885072145	0.132622250874	0.160003673978	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr15:81391669..81391783,+__1503.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr15:81391669..81391783,+__1503.1.0.0	rs61001834,rs1509560	-0.7987393884901968	-0.8275739217154572	-0.9079896440829485	-0.6253771073025945	-0.9476899740656436	-1.1886387600908053	-0.716843879475168	-0.7380129458765161	-0.6788292682052582	-0.8350269756610929	-0.8157868065240168	-0.432156803757848	-0.7927221229372955	-1.0997440258101292	-1.1826206228136569	-1.1177272447126858	-1.2262268004485688	-1.041785838036744	-1.4129658376502137	-1.0719518755895048	-0.7664021661350744	-1.009766652253289	-0.917337654041334	-0.8448456167531474	-1.0164195879503957	-1.0589828268495618	-0.30100463731993243	-0.3550467010981997	-0.20973760062973734	-0.6008496931459743	-0.09409586397110037	-0.2243270775594084	-0.35510799611433674	-0.02838922025855828	-0.33093738404803086	-0.0823106783802412	-0.029058810229130594	-0.5842627841925476	-0.2662607039122664	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0072436377838	0.545696106059	0.288805731951	0.0440018610392	0.010822879123	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:1922127..1922241,-__1504.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:1922127..1922241,-__1504.1.0.0	rs542541097	-0.5714877491126302	-0.0036323623720326452	-0.7594949630726185	-0.04071453390288464	-0.0883259437675956	0.024671876802414894	-0.05116905611663943	-0.474908150989208	-0.5882072559166704	-0.09508606765451903	0.1827385248471617	-0.16932154452152326	-0.21957810214806214	1.2361084737805486	0.3045796615739504	-0.011465915104984181	-0.1479911677596628	0.06721362633195686	-1.5183252722755476	0.16924630971816051	-0.9203568195763183	0.3134857427505879	0.3432500679635677	-0.0020686144751939084	0.5321083565822968	0.030482037459113532	1.8075962228931788	0.308212023945983	0.7480290479676344	-0.10727663385677817	0.15553957009955247	-1.5429971490779626	0.22041536583479995	-0.4454486685871103	0.9016929986672584	0.43833613561808676	-0.1848071393223556	0.7014299011038201	0.2500601396071756	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:1922127..1922241,-__1504.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:1922127..1922241,-__1504.1.0.0	rs575841559	-0.5714877491126302	-0.0036323623720326452	-0.7594949630726185	-0.04071453390288464	-0.0883259437675956	0.024671876802414894	-0.05116905611663943	-0.474908150989208	-0.5882072559166704	-0.09508606765451903	0.1827385248471617	-0.16932154452152326	-0.21957810214806214	0.7478108137358579	0.853944878445539	1.1214601565753797	-0.012033132703629323	1.1915752852621209	0.4168330742633296	1.1159392323733486	0.3166414238595832	0.2641020696246953	1.3347708372996236	-0.6650151162766855	-0.03976631839321079	0.553855267005496	1.3192985628484881	0.8575772408175717	1.8809551196479983	0.028681401199255316	1.2799012290297165	0.3921611974609147	1.167108288489988	0.7915495748487913	0.8523093255413657	1.4298569049541427	-0.8477536411238472	0.12955522612831247	0.7734333691535582	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:1922127..1922241,-__1504.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:1922127..1922241,-__1504.1.0.0	rs71384658	-0.5714877491126302	-0.0036323623720326452	-0.7594949630726185	-0.04071453390288464	-0.0883259437675956	0.024671876802414894	-0.05116905611663943	-0.474908150989208	-0.5882072559166704	-0.09508606765451903	0.1827385248471617	-0.16932154452152326	-0.21957810214806214	1.1153383844107312	0.032733513735186404	-0.6350830465267967	0.26549105940283274	0.4181599684790133	0.22204401190177805	0.2530914898407133	-0.6234474513948974	0.6217490702674927	-0.6709687162451449	0.63688562619218	0.2000069286526028	0.15300006989297427	1.6868261335233614	0.03636587610721905	0.12441191654582184	0.3062055933057174	0.5064859122466089	0.19737213509936316	0.3042605459573527	-0.1485393004056894	1.2099563261841633	-0.5758826485906259	0.45414710134501834	0.3693284731741261	0.3725781720410364	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:1922127..1922241,-__1504.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:1922127..1922241,-__1504.1.0.0	rs115834807	-0.5714877491126302	-0.0036323623720326452	-0.7594949630726185	-0.04071453390288464	-0.0883259437675956	0.024671876802414894	-0.05116905611663943	-0.474908150989208	-0.5882072559166704	-0.09508606765451903	0.1827385248471617	-0.16932154452152326	-0.21957810214806214	1.2464095540249225	0.6706222058521879	-0.448640079183205	0.2987358074531111	-1.47827068953401	0.22221239916947738	0.4910682791222725	-0.14948875724174376	-0.3750479215487226	0.21497940429266507	-0.6255424766509328	-0.8562173347393399	-0.06576496741527647	1.8178973031375527	0.6742545682242206	0.31085488388941357	0.3394503413559958	-1.3899447457664145	0.1975405223670625	0.5422373352389119	0.32541939374746426	0.21315933436794787	0.3100654719471841	-0.8082810014980945	-0.6868957902178167	0.15381313473278566	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr16:1922127..1922241,-__1504.1.4.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:1922127..1922241,-__1504.1.0.0	rs542541097,rs575841559,rs71384658,rs115834807	-0.5714877491126302	-0.0036323623720326452	-0.7594949630726185	-0.04071453390288464	-0.0883259437675956	0.024671876802414894	-0.05116905611663943	-0.474908150989208	-0.5882072559166704	-0.09508606765451903	0.1827385248471617	-0.16932154452152326	-0.21957810214806214	-0.17569612089044914	0.49219874210522585	-0.33375782385333164	-0.326690264701203	-0.16212294891845686	0.3583259954923455	0.295172754881899	-0.01148762615636939	0.31552696586192314	-0.6727167359726157	-0.21615492516541712	0.258381130769728	-0.014918404712226782	0.39579162822218106	0.4958311044772585	0.4257371392192869	-0.28597573079831834	-0.07379700515086125	0.3336541186899306	0.3463418109985384	0.46342052483283863	0.9037342217785935	-0.5776306683180967	-0.3988934500125788	0.4277026752912513	0.20465969743583534	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr16:28875089..28875203,+__1505.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr16:28875089..28875203,+__1505.1.0.0	rs7198606	0.42451562951773786	0.6665998559066786	0.42138856592942564	0.7702313919745517	0.4462382846302309	0.6401181094554297	0.7450152832436335	0.7478108137358579	0.5931930210368319	0.6211311462328579	0.5796819456214812	0.7830456322755166	0.6199141399633529	0.8709999906425376	0.7477456667646674	0.7661611477418765	0.5841732065444684	0.39666757718128565	0.7218193410777584	0.8404365511992985	0.8596889290703846	0.8571060484120134	1.0695051595339238	0.672350658295326	0.9619047148380329	0.7790465826084644	0.4464843611247998	0.08114581085798878	0.34477258181245085	-0.18605818543008334	-0.04957070744894526	0.08170123162232867	0.09542126795566497	0.11187811533452674	0.2639130273751815	0.44837401330106585	0.0926687126738448	0.17885908256251626	0.15913244264511164	0.125844655769	0.747262025795	0.468411351413	0.706946403854	0.747262025795	0.554657938956	0.727009731456	0.405136064622	0.829896383209	0.405136064622	0.333660951583	0.125844655769	0.533303657669	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:30968541..30968655,+__1506.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:30968541..30968655,+__1506.1.0.0	rs4889599	1.5489979707356811	1.8034571446439311	1.4781245026745289	1.4875169521585594	1.5961936741707157	1.5105852728696378	1.621461454362109	1.5995691202358997	1.6637157024548903	1.8080097406959603	1.7130960692340222	1.7142892036118347	1.6287514006539812	1.2034573909283484	1.668413702444496	1.2756309310040954	1.3196204464887193	1.561268836895326	1.476721551950947	1.2682688751811237	1.5066551861956985	1.4516646074164399	1.6404829522599487	1.4898182992602105	1.5590667911429135	1.4517557975973556	-0.34554057980733277	-0.1350434421994351	-0.20249357167043347	-0.16789650566984005	-0.03492483727538964	-0.03386372091869094	-0.35319257918098534	-0.09291393404020121	-0.21205109503845043	-0.16752678843601165	-0.22327776997381177	-0.1552224124689212	-0.17699560305662532	0.0338805621681	0.361218104761	0.510582765025	0.90381429355	0.5192442797	0.63839046467	0.946473618223	0.405136064622	0.175053819161	0.125844655769	0.175053819161	0.340423946445	0.234882157745	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:30968541..30968655,+__1506.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:30968541..30968655,+__1506.1.0.0	rs115516928	1.5489979707356811	1.8034571446439311	1.4781245026745289	1.4875169521585594	1.5961936741707157	1.5105852728696378	1.621461454362109	1.5995691202358997	1.6637157024548903	1.8080097406959603	1.7130960692340222	1.7142892036118347	1.6287514006539812	1.4337783050087096	1.5330740416801052	1.4968387516209722	1.2913535778381706	1.3612016245180092	1.5319254623669356	1.2859936538309422	1.6066288852678277	1.5315324902697527	1.3934053974265068	1.4021326440684465	1.5174678099524548	1.4487777203207362	-0.11521966572697151	-0.27038310296382595	0.018714248946443357	-0.19616337432038877	-0.23499204965270648	0.021340189497297768	-0.33546780053116687	0.007059765031927956	-0.13218321218513762	-0.4146043432694535	-0.31096342516557574	-0.1968213936593799	-0.1799736803332448	0.202104162379	0.0986283746992	0.757455001208	0.545696106059	0.0986245178752	0.519249062249	0.609889042629	0.79863356553	0.125844655769	0.0168468410067	0.216719559135	0.397602565759	0.048502994233	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr16:30968541..30968655,+__1506.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:30968541..30968655,+__1506.1.0.0	rs4889599,rs115516928	1.5489979707356811	1.8034571446439311	1.4781245026745289	1.4875169521585594	1.5961936741707157	1.5105852728696378	1.621461454362109	1.5995691202358997	1.6637157024548903	1.8080097406959603	1.7130960692340222	1.7142892036118347	1.6287514006539812	0.471503365888729	0.8266476167549617	0.6418748462341557	0.7381351437950054	0.8900239169813253	0.8541625879684867	0.8172266869858179	0.8485194816846298	0.6753097353755693	0.6967883473885037	0.8881914696013582	0.8597156010697032	0.7673415666440205	-1.0774946048469523	-0.9768095278889695	-0.8362496564403732	-0.749381808363554	-0.7061697571893903	-0.6564226849011512	-0.8042347673762912	-0.7510496385512699	-0.988405967079321	-1.1112213933074566	-0.824904599632664	-0.8545736025421314	-0.8614098340099604	4.33956096742e-05	0.000273955335251	9.86556518966e-05	0.00139510136839	2.0015585356e-06	3.14895644184e-05	0.00210630874131	2.48534577241e-05	2.00209749007e-06	3.60162929514e-07	1.25214566711e-06	1.12997083356e-05	3.35079002782e-44	0.0084187482768	0.0553389777208	0.0196324747274	0.263674158626	0.000410319499797	0.00632940244811	0.421261748261	0.00484642425621	0.000412432082955	7.49138893389e-05	0.000256689861758	0.00232773991714	7.60629336316e-42	sig	not sig	sig	not sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:31044799..31044913,+__1507.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:31044799..31044913,+__1507.1.0.0	rs12445650	1.3489137884644737	1.5908350176983184	1.3633237705168404	1.427451732998724	1.3651633397530978	1.4376270185927869	1.6310864625104988	1.76035791935272	1.5973057250350506	1.6035907126853655	1.5869873329554396	1.6634842181000642	1.5313439198886147	1.2728976240848084	1.6030666652962715	1.5743777269650723	1.39167562686058	1.4697389329255213	1.4409374178084262	1.743563888737066	1.7311968895634005	1.4221580640854135	1.4359795822161958	1.4089924994652971	1.6176618647173968	1.5093538985604542	-0.0760161643796653	0.012231647597953144	0.21105395644823188	-0.03577610613814386	0.10457559317242349	0.003310399215639359	0.11247742622656709	-0.029161029789319448	-0.17514766094963719	-0.16761113046916964	-0.17799483349014245	-0.04582235338266738	-0.021990021328160858	0.90381429355	0.563691144959	0.368322877114	0.536806685117	0.581967350665	0.460214637573	0.301187193336	0.476688253492	0.935789553219	0.819442862795	0.767687747466	0.452098798395	0.863172572248	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:4475789..4475903,+__1508.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:4475789..4475903,+__1508.1.0.0	rs2304631	1.42130341686526	1.9531488104764336	1.6638907179504396	1.8251235648308128	1.0334145496544438	0.3988510069424993	0.2427788872313681	1.6243431977976326	1.5417092413008089	0.37839554758123506	1.8800112686316983	1.2359525981160149	1.2665769006148873	1.2935929132245796	1.55859004968674	1.216589669828708	1.6507857817269125	2.074612799234415	0.19867342170249452	1.8332095565256536	0.5663747697954025	2.3694625675466305	1.3713722902387122	0.9784569181235976	0.8018905041671008	1.3261342701500791	-0.12771050364068048	-0.39455876078969365	-0.44730104812173166	-0.17433778310390036	1.0411982495799714	-0.20017758524000479	1.5904306692942856	-1.0579684280022301	0.8277533262458217	0.9929767426574772	-0.9015543505081007	-0.43406209394891404	0.05955736953519167	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:4524495..4524609,-__1509.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:4524495..4524609,-__1509.1.0.0	rs17887050	0.3303752452123354	-0.1522244208675605	0.4185473329215609	0.2605923034125722	-0.21453005284544704	0.5833624065219126	0.1809490456503812	0.19451986637337115	-0.006945094006738678	0.5674503755863032	0.23180235042941633	0.30720653433959216	0.22509215772730826	-0.583934313357535	0.3081583812293974	-0.7343018093994962	-0.9930613007389575	-1.3118356518884269	-0.9846917288982056	-1.3666146967469128	-0.7040081215005727	-1.2091746036973146	-1.3938632204305934	-0.6005423147357446	-0.8194567606222621	-0.8661105117322186	-0.9143095585698704	0.4603828020969579	-1.152849142321057	-1.2536536041515296	-1.0973055990429799	-1.5680541354201183	-1.547563742397294	-0.8985279878739438	-1.202229509690576	-1.9613135960168966	-0.8323446651651609	-1.1266632949618542	-1.0912026694595272	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:67927077..67927191,+__1510.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:67927077..67927191,+__1510.1.0.0	rs7196789	3.119678773073851	3.4649965258332447	3.069605226696644	2.901304964523563	3.2784221499494413	3.3953526356526718	3.176806535677023	3.351342812926746	3.4666486991909635	3.3531318223120365	3.3255557262549695	3.5798100194235802	3.290221324292895	3.315326905854351	3.750858459378572	2.9506228895853464	2.9040684603465645	3.328780218139935	3.284216096576167	3.216322288655411	3.4069642837437595	3.2939851190902885	3.4094889166076787	3.3699915398090705	3.38096344466458	3.3009657185376438	0.19564813278049975	0.2858619335453274	-0.11898233711129746	0.002763495823001616	0.05035806819049382	-0.11113653907650489	0.03951575297838783	0.0556214708170133	-0.17266358010067506	0.056357094295642174	0.04443581355410098	-0.19884657475900003	0.01074439424474912	0.819442862795	0.677233097055	0.777966336216	0.737113058664	0.609889042629	0.320413072024	0.727009731456	0.819442862795	0.253741740693	0.510582765025	0.628827692687	0.527990680582	0.867749271697	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:74700722..74700836,-__1511.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:74700722..74700836,-__1511.1.0.0	rs4887783	-0.051665940763411425	0.03402066691873946	-0.047410543180945036	0.2462921909486717	0.0229897219311407	-0.06087930455592148	-0.009779933705151584	0.1651096373284231	0.04782995456492098	-0.030926541255820374	0.051073742174669236	-0.0932166271551819	0.022786418604177777	-0.029583340085371387	0.24862134727698204	0.18023220562413836	0.2776922677055921	-0.04012426460247533	0.10750325695983652	0.3386413173177367	0.5443412930660624	-0.00975040309072713	0.3668477190767454	0.15184735364714003	0.2753299243469149	0.2009665564368812	0.022082600678040038	0.2146006803582426	0.2276427488050834	0.031400076756920386	-0.06311398653361604	0.168382561515758	0.3484212510228883	0.3792316557376393	-0.05758035765564811	0.3977742603325658	0.1007736114724708	0.3685465515020968	0.17818013783270345	0.572794651112	0.581967350665	0.809021331888	0.967868733231	0.8931878581	0.361218104761	0.428242856315	0.0678362651725	0.809021331888	0.586575008857	0.687084607526	0.468411351413	0.865677946799	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:85045083..85045197,-__1512.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:85045083..85045197,-__1512.1.0.0	rs2270845	3.268545295050463	3.7501911166557846	3.1238292136462014	3.1190141888893015	3.158729121846847	3.1424859237943235	2.9428525553792557	3.172298711028943	3.2622377481626312	3.202803043845324	3.2459614265380607	3.0827747266340237	3.2059769226225963	3.2483733086939166	3.812629205406164	2.857247148284409	2.6890167505401465	3.1146277573060983	3.0684153524257196	2.6929486072639626	3.258953096829094	3.4791284216256138	3.5359435093993805	3.39699031601015	3.3152893469681137	3.2057969017293977	-0.0201719863565466	0.06243808875037926	-0.2665820653617925	-0.42999743834915494	-0.044101364540748644	-0.07407057136860384	-0.24990394811529315	0.08665438580015117	0.21689067346298252	0.3331404655540564	0.15102888947208903	0.23251462033408998	-0.00018002089319927675	0.452098798395	0.259370210024	0.0468981580933	0.0601351299193	0.13967914143	0.619326784864	0.591208103411	0.188210560412	0.87199428352	0.456141411048	0.460214637573	0.162586850726	0.0566683208584	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:85045083..85045197,-__1512.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:85045083..85045197,-__1512.1.0.0	rs113086877	3.268545295050463	3.7501911166557846	3.1238292136462014	3.1190141888893015	3.158729121846847	3.1424859237943235	2.9428525553792557	3.172298711028943	3.2622377481626312	3.202803043845324	3.2459614265380607	3.0827747266340237	3.2059769226225963	3.620573287577975	4.004873433790197	3.1470241826514287	2.9174105242397066	3.51514135632332	3.3193085944638323	3.087791223644614	3.625263659328506	3.6800275297058187	3.335262799519093	3.4089883220645443	3.672329318464663	3.4444995193144745	0.3520279925275118	0.2546823171344119	0.02319496900522733	-0.2016036646495949	0.3564122344764731	0.17682267066950885	0.1449386682653584	0.452964948299563	0.41778978154318747	0.13245975567376878	0.16302689552648353	0.5895545918306393	0.23852259669187822	0.129194552482	0.197395731844	0.333666485083	0.619326784864	0.242741268695	0.088148079887	0.0583274625199	0.216719559135	0.0362033618716	0.143314270352	0.452098798395	0.0785847853765	0.000820792270017	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.687823922274	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr16:85045083..85045197,-__1512.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:85045083..85045197,-__1512.1.0.0	rs8062510,rs2270845,rs113086877	3.268545295050463	3.7501911166557846	3.1238292136462014	3.1190141888893015	3.158729121846847	3.1424859237943235	2.9428525553792557	3.172298711028943	3.2622377481626312	3.202803043845324	3.2459614265380607	3.0827747266340237	3.2059769226225963	3.33750383193268	3.86443800758716	3.192611509261213	3.0793680717057033	3.3017874453045652	3.2385388228994785	3.059209012711187	3.441874612685702	3.2321343415535884	3.258885981817814	3.418588003263177	3.706475079357804	3.344284560006672	0.06895853688221676	0.11424689093137541	0.0687822956150117	-0.03964611718359823	0.1430583234577183	0.09605289910515502	0.11635645733193112	0.26957590165675915	-0.03010340660904287	0.056082937972489866	0.17262657672511628	0.6237003527237803	0.13830763738407606	0.716953652062	0.628827692687	0.572794651112	0.737113058664	0.614595886613	0.809021331888	0.436112310787	0.935789553219	1.0	0.747262025795	0.87199428352	0.840380101088	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr16:89724164..89724278,+__1513.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr16:89724164..89724278,+__1513.1.0.0	rs35415928	0.6360417399085665	-0.44260757166855014	-1.2992371276125576	-0.5767336694805629		0.12576146291241688		0.4255063871638887	-1.5420999807909972	-0.30286093584627183	-1.5451249733250008	-0.9787936885078442	-0.5500148357246912	0.0378155201778414	-0.5529464426213513	0.18252623278483907	0.0375841278347826	-0.8696954692068456	0.032096898830895976	0.22218648607659294	0.26839420576524603	-0.6740365077904626	0.14380527434417198	-0.47579979902346825	-1.1487076515478012	-0.23306476036462995	-0.5982262197307251	-0.11033887095280115	1.4817633603973968	0.6143177973153455		-0.0936645640815209		-0.1571121813986427	0.8680634730005345	0.44666621019044384	1.0693251743015324	-0.16991396303995698	0.33508802160016066	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:89753019..89753133,+__1514.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:89753019..89753133,+__1514.1.0.0	rs397891	1.5620273670953468	4.2108275034071285	-0.13474096405034763	0.6891683811159642	-0.6069326935947431	-0.4672855711958668	-1.5556767070990631	-0.045099096779332985	-0.3612879801864596	0.3723290481562729	-2.1023394324303384	-1.1336530961039522	0.035611396527884	1.3642623208609153	1.0116870103599302	0.3302040546782105	0.24216099991289936	0.2267603171784629	0.1674144471462839	1.0175854472112305	-0.1378348008744036	2.7279779199614342	0.22500175323677696	1.7073625802407462	0.4904028182745992	0.7810820723489238	-0.19776504623443159	-3.1991404930471985	0.46494501872855815	-0.4470073812030649	0.833693010773206	0.6347000183421507	2.5732621543102936	-0.09273570409507062	3.0892659001478937	-0.14732729491949592	3.8097020126710843	1.6240559143785513	0.7454706758210397	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr16:89753019..89753133,+__1514.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:89753019..89753133,+__1514.1.0.0	rs543938798	1.5620273670953468	4.2108275034071285	-0.13474096405034763	0.6891683811159642	-0.6069326935947431	-0.4672855711958668	-1.5556767070990631	-0.045099096779332985	-0.3612879801864596	0.3723290481562729	-2.1023394324303384	-1.1336530961039522	0.035611396527884																											NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr16:89753019..89753133,+__1514.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr16:89753019..89753133,+__1514.1.0.0	rs397891,rs543938798	1.5620273670953468	4.2108275034071285	-0.13474096405034763	0.6891683811159642	-0.6069326935947431	-0.4672855711958668	-1.5556767070990631	-0.045099096779332985	-0.3612879801864596	0.3723290481562729	-2.1023394324303384	-1.1336530961039522	0.035611396527884	2.789604992199337	3.0044922182707934	1.5930716180727267	0.9908578174322459	0.8591992065275957	0.1828961920428774	3.39336339000889	-2.301621132594399	0.3287410423771202	1.3953138938791225	2.745229846312372	-0.20982077531482482	1.2309440257678212	1.2275776251039903	-1.2063352851363351	1.7278125821230743	0.30168943631628165	1.4661319001223387	0.6501817632387442	4.949040097107953	-2.256522035815066	0.6900290225635798	1.0229848457228496	4.847569278742711	0.9238323207891274	1.1953326292399373	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:17726909..17727023,-__1515.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:17726909..17727023,-__1515.1.0.0	rs202244145	0.020752288038775882	-0.020807124525811127	0.004769968306377548	0.8815654573251571	1.9138067770260243	1.899791933439992	0.7803855398109578	-0.4055924799778931	0.7457195489045747	-0.30062339812566113	-1.0640136305903973	-0.3513504282747206	0.3420337042797814	0.12199267208318154	1.7457420065460352	1.115102971198895	0.878502744481744	0.166695260338473	4.108535384238542	1.6130727158703062	0.5418398372922052	-0.23168996747053827	2.218827440897678	1.742211102447948	0.29513016732678843	1.1929968612709383	0.10124038404440566	1.7665491310718462	1.1103330028925174	-0.0030627128434130846	-1.7471115166875513	2.20874345079855	0.8326871760593484	0.9474323172700982	-0.977409516375113	2.519450839023339	2.8062247330383454	0.6464805956015091	0.8509631569911568	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:17726909..17727023,-__1515.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:17726909..17727023,-__1515.1.0.0	rs12936927	0.020752288038775882	-0.020807124525811127	0.004769968306377548	0.8815654573251571	1.9138067770260243	1.899791933439992	0.7803855398109578	-0.4055924799778931	0.7457195489045747	-0.30062339812566113	-1.0640136305903973	-0.3513504282747206	0.3420337042797814	-0.2766412965954834	-1.4290670527091849	-0.7319874753112044	-0.3759287941422895	-1.0155606582032526	-1.0137043254029094	-2.1174782948712183	0.33415498687422807	-1.0884582463181485	-2.1304039138755537	-1.5836920658434002	-1.157790021713914	-1.0488797631760276	-0.2973935846342593	-1.4082599281833739	-0.736757443617582	-1.2574942514674468	-2.9293674352292767	-2.913496258842901	-2.897863834682176	0.7397474668521211	-1.8341777952227232	-1.8297805157498925	-0.5196784352530028	-0.8064395934391935	-1.3909134674558088	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr17:17726909..17727023,-__1515.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:17726909..17727023,-__1515.1.0.0	rs202244145,rs12936927	0.020752288038775882	-0.020807124525811127	0.004769968306377548	0.8815654573251571	1.9138067770260243	1.899791933439992	0.7803855398109578	-0.4055924799778931	0.7457195489045747	-0.30062339812566113	-1.0640136305903973	-0.3513504282747206	0.3420337042797814	0.5642468703185531	0.8266476167549617	-1.2517168583811211	0.15319802029650634	0.27479245122619744	-0.473513605570445	-0.890916971407956	-0.7832159300898973	0.7882048682484496	-2.222557246116362	-0.9667255223929696	1.7966776970938731	-0.18207321750168415	0.5434945822797772	0.8474547412807728	-1.2564868266874987	-0.7283674370286508	-1.6390143257998269	-2.373305539010437	-1.6713025112189137	-0.3776234501120042	0.042485319343874894	-1.9219338479907009	0.09728810819742773	2.1480281253685938	-0.5241069217814655	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:20059257..20059371,+__1516.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:20059257..20059371,+__1516.1.0.0	rs62066869	-0.0024987782003537315	0.11981147762209536	0.07373060913896827	-0.7531908353788674	-0.22086289045055527	-0.2973493714154273	-0.27154537309221427	-1.0289189480634322	0.3202807360139601	-0.3133557055221696	0.1316754680073704	-0.36057348582792226	-0.21689975809737896	0.30434559827874524	0.01883951477290527	-0.8631974786029274	-1.1125047979738425	-0.3537766388899475	-0.06271400847570226	-0.761266029086481	1.621218066768218	-1.1733086802533963	-0.3256245188320764	0.1498342760715092	-0.3814886147011501	-0.24497027591034548	0.30684437647909896	-0.10097196284919009	-0.9369280877418956	-0.35931396259497506	-0.13291374843939222	0.23463536293972503	-0.48972065599426673	2.65013701483165	-1.4935894162673564	-0.012268813309906756	0.018158808064138804	-0.02091512887322783	-0.028070517812966475	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:20059305..20059419,+__1517.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:20059305..20059419,+__1517.1.0.0	rs62066869	-0.22615649968727158	-0.3913664653784319	-1.3154566617162082	-0.20843689955433026	0.0516581830762689	-0.9337576600728844	-0.977490871603539	0.3287691322752304	-0.595995802689033	-1.021705176352494	0.31111598909210025	-1.0134351889314215	-0.4993548267951679	0.29882587027478996	0.3339401935361507	-0.5491529418777389	-0.4930518630368413	-0.42458826230460567	-0.8550437279411497	0.16936217224375716	-0.7660212680894752	-0.15991360588460884	-0.8479076080967649	0.6565075153316057	-0.4347142932710074	-0.2559798182596574	0.5249823699620615	0.7253066589145826	0.7663037198384693	-0.28461496348251103	-0.4762464453808746	0.07871393213173472	1.1468530438472961	-1.0947904003647055	0.4360821968044241	0.17379756825572912	0.3453915262395054	0.5787208956604141	0.2433750085355105	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:20946342..20946456,-__1518.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:20946342..20946456,-__1518.1.0.0	rs140762989	0.31608590606672693	0.9080776990017728	-0.9459241828286294	-0.04824912213310628	0.09235543311224578	-0.0062717560951632105	0.166690363056499	0.3287691322752304	0.9856749541286448	0.9976245530040392	1.4400632127176696	-0.3570758835867371	0.323151692393266	0.7805893278645922	0.8742199605337387	0.38414766506654413	-0.8322698319235338	0.5093088922543766	-0.09542699877320583	0.6189683165005061	1.1533971439238273	0.1416984814341861	1.4408328534364998	-0.8159417953743704	-0.0738535075927028	0.3404725422792049	0.4645034217978653	-0.03385773846803408	1.3300718478951736	-0.7840207097904275	0.4169534591421308	-0.08915524267804262	0.4522779534440071	0.8246280116485969	-0.8439764726944587	0.4432083004324606	-2.25600500809204	0.28322237599403427	0.017320849885938797	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:2207170..2207284,+__1519.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:2207170..2207284,+__1519.1.0.0	rs408067	2.0524144472044346	1.0537024023612829	2.3336205345990306	0.8180616533903045	1.0184650519141556	0.1294411647402881	2.186541031749892	1.5385399012726355	1.4348056662323627	1.1992228786064847	0.4319084163897533	1.5539300119628454	1.3125544300352892	0.8200169660912174	0.08254198774347654	-0.895115550707799	0.3115088016843012	0.5108471898837886	0.5717987905850082	1.224169857268719	0.6829007091613063	0.7572293464996375	0.1434065903951563	0.3076356313811923	0.8742127007177918	0.44926275172531627	-1.232397481113217	-0.9711604146178063	-3.2287360853068297	-0.5065528517060033	-0.507617862030367	0.44235762584472005	-0.9623711744811732	-0.8556391921113292	-0.6775763197327253	-1.0558162882113284	-0.12427278500856098	-0.6797173112450536	-0.8632916783099728	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:42200971..42201085,-__1522.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:42200971..42201085,-__1522.1.0.0	rs112114764	1.9415492502269776	1.9057445788415752	1.4615919448033967	1.5833239288729495	1.7628246777619478	1.6727631942233356	1.1433049901823567	1.3355703935708834	1.776640308420112	1.7577820204328383	1.6343188082016529	1.7802736085423192	1.646307308673362	1.6880510801858175	1.6137826048079456	1.7767775770649712	1.3430680018147205	1.64888477200139	1.4017267867917216	1.0060988450313222	1.123847501631929	1.5237201407785024	1.5809165652742994	1.5962827777091084	1.5723301975277524	1.4896239042182902	-0.25349817004116004	-0.29196197403362967	0.3151856322615745	-0.24025592705822896	-0.1139399057605579	-0.27103640743161406	-0.13720614515103446	-0.21172289193895444	-0.2529201676416095	-0.1768654551585389	-0.03803603049254445	-0.20794341101456681	-0.15668340445507206	0.143309689892	0.122554330111	0.914457985151	0.158583637061	0.337028796626	0.30750859871	0.226871263542	0.340423946445	0.273812215243	0.221756412245	0.224300750114	0.444064484515	0.0365248239615	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:43971846..43971960,+__1523.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:43971846..43971960,+__1523.1.0.0	rs62056779	0.4846227942895101	0.6073777146305648	0.14494345730055835	1.8177538763756325	0.6339678087381811	-0.1384673256613279	0.25648743057355683	-1.1091703472816654	-0.34263469840174665	0.17528855746771593	0.6044570134131542	0.7400676488598656	0.32289116085866665	0.4530694146505896	1.2614900378287972	-0.853997308854024	-0.9615063112052262	0.42837867825921827	-0.3390060519579958	0.2127559843456329	-0.7729340532231417	1.630633038236442	-0.4466125457963956	0.23925360661077183	-0.2463288941192297	0.05043296623128657	-0.03155337963892052	0.6541123231982324	-0.9989407661545824	-2.7792601875808587	-0.20558913047896288	-0.2005387262966679	-0.04373144622792394	0.33623629405852373	1.9732677366381886	-0.6219011032641115	-0.36520340680238234	-0.9863965429790953	-0.27245819462738	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:46184858..46184972,+__1524.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:46184858..46184972,+__1524.1.0.0	rs16952265	0.23765048238244293	0.36488378927699017	-0.11950705183732438	0.346921600731453	0.5671002421459905	0.4322717690441957	0.4779139543638482	0.7327742590942182	0.5223150215537467	0.41453261996704505	0.4338656932694981	0.2843080217534436	0.3912525334787957	-0.8969943708557482	-0.4574493098865723	-0.3446272633510614	-0.8855957761396265	-0.38720002734416104	-0.43294334189440425	-0.48555264003657994	-0.41863692361957516	-0.3825432804849109	-0.45235375905460373	-0.3885926282968477	-0.31469589328185155	-0.48726543452049526	-1.1346448532381912	-0.8223330991635625	-0.22512021151373704	-1.2325173768710795	-0.9543002694901516	-0.8652151109385999	-0.9634665944004281	-1.1514111827137934	-0.9048583020386576	-0.8668863790216488	-0.8224583215663458	-0.5990039150352952	-0.8785179679992909	0.00153065306427	9.86556518966e-05	0.0187859264625	7.24718602024e-07	5.63026935075e-09	2.34778603013e-07	6.8564559793e-06	1.093294991e-06	6.43635880739e-06	2.03284743013e-07	1.12997083356e-05	0.00210630874131	2.02538204406e-47	1	0.0733998050111	1	0.000534117609692	4.34656793878e-06	0.000179370852702	0.0050669209687	0.000794825458455	0.00497530535811	0.000159578523265	0.00868947571011	1	1.69727015292e-44	not sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:46184858..46184972,+__1524.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:46184858..46184972,+__1524.1.0.0	rs4794453	0.23765048238244293	0.36488378927699017	-0.11950705183732438	0.346921600731453	0.5671002421459905	0.4322717690441957	0.4779139543638482	0.7327742590942182	0.5223150215537467	0.41453261996704505	0.4338656932694981	0.2843080217534436	0.3912525334787957	0.33516606924811293	0.3302460086629696	0.23755801453653855	0.42845683268049056	0.4514193924714042	0.459708322714805	0.5903221659393492	0.7086101513306994	0.6716647219396374	0.4759283378483615	0.6860467285768941	0.40260085183692	0.4814772998155152	0.09751558686567	-0.034637780614020564	0.3570650663738629	0.08153523194903756	-0.1156808496745863	0.02743655367060932	0.11240821157550096	-0.02416410776351885	0.1493497003858908	0.06139571788131648	0.252181035307396	0.11829283008347641	0.09022476633671955	0.79863356553	0.930450938691	0.242741268695	0.788281320858	0.354199901149	0.48504462162	0.757455001208	0.809021331888	0.333666485083	0.510582765025	0.536806685117	0.265084565602	0.777100803141	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr17:46184858..46184972,+__1524.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:46184858..46184972,+__1524.1.0.0	rs16952265,rs4794453	0.23765048238244293	0.36488378927699017	-0.11950705183732438	0.346921600731453	0.5671002421459905	0.4322717690441957	0.4779139543638482	0.7327742590942182	0.5223150215537467	0.41453261996704505	0.4338656932694981	0.2843080217534436	0.3912525334787957	-0.5533604194992163	-0.13131809324688615	-0.2697367783112816	-0.17137147303307027	-0.16004618615845734	-0.17352152974740975	-0.2866498492618753	-0.044106022347138785	0.011211641865102512	-0.11862621151639441	-0.14003119505786615	-0.055660956527505405	-0.1744347560701666	-0.7910109018816592	-0.4962018825238763	-0.15022972647395724	-0.5182930737645233	-0.7271464283044479	-0.6057932987916055	-0.7645638036257235	-0.776880281441357	-0.5111033796886442	-0.5331588314834395	-0.5738968883273643	-0.339968978280949	-0.5656872895489623	0.00919097005605	0.0565651674203	0.0785847853765	0.00183882744533	6.8564559793e-06	0.000413457613232	0.000288590960955	0.000222088887318	0.00115660425805	0.000260017581797	7.46332826159e-05	0.00616002497902	3.12733355074e-25	1	1	1	0.347538387168	0.00140557347576	0.0831049802597	0.057718192191	0.0433073330271	0.238260477158	0.0540836570138	0.0152998229363	1	7.09904716018e-23	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:5390106..5390220,+__1525.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:5390106..5390220,+__1525.1.0.0	rs1805462	3.210683493428674	3.846540046132408	3.0977663102475645	2.963694031892795	3.2845303119361127	3.2775391168598134	3.1317178735556737	3.6532410877288606	3.4156441682972716	3.3859946018033757	3.4878365610705386	3.395820023378206	3.3459173021942745	2.8892539148933953	3.176263331560713	2.8698400274993587	2.4623057653655054	2.8555534669890084	2.9044372595210617	2.7947260378531844	3.045130712433107	3.0764763677828815	2.982726041537917	3.0335548178286147	3.1410943566085656	2.935946841656109	-0.32142957853527854	-0.670276714571695	-0.2279262827482058	-0.5013882665272895	-0.4289768449471043	-0.3731018573387517	-0.33699183570248925	-0.6081103752957535	-0.3391678005143901	-0.40326856026545865	-0.45428174324192394	-0.2547256667696405	-0.40997046053816505	0.0412580447575	0.0399413890972	0.00919097005605	0.016239497389	0.0232568344756	0.0719809426143	0.0932701621097	0.00441948685714	0.00849533044186	0.00460947122508	0.0072436377838	0.0515422504639	8.60383936754e-13	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	7.21001739e-10	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:5390106..5390220,+__1525.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:5390106..5390220,+__1525.1.0.0	rs2240050	3.210683493428674	3.846540046132408	3.0977663102475645	2.963694031892795	3.2845303119361127	3.2775391168598134	3.1317178735556737	3.6532410877288606	3.4156441682972716	3.3859946018033757	3.4878365610705386	3.395820023378206	3.3459173021942745	3.0769875108704188	3.6555770620580392	2.888039613184965	2.9935274945661683	3.288041867101447	3.1994457448796463	3.11879973915865	3.256540690695456	3.276784605671617	3.196560541076084	3.366081104025864	3.365662914960355	3.2235040740207257	-0.1336959825582551	-0.19096298407436896	-0.2097266970625995	0.02983346267337339	0.0035115551653341903	-0.07809337198016708	-0.012918134397023717	-0.39670039703340443	-0.13885956262565458	-0.18943406072729196	-0.12175545704467483	-0.03015710841785113	-0.12241322817354865	0.221756412245	0.572794651112	0.30750859871	0.788278954998	0.914457985151	0.572794651112	0.88258056334	0.333666485083	0.60051573606	0.60051573606	0.716953652062	0.420456664513	0.799364860692	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:5390106..5390220,+__1525.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:5390106..5390220,+__1525.1.0.0	rs1805463	3.210683493428674	3.846540046132408	3.0977663102475645	2.963694031892795	3.2845303119361127	3.2775391168598134	3.1317178735556737	3.6532410877288606	3.4156441682972716	3.3859946018033757	3.4878365610705386	3.395820023378206	3.3459173021942745	2.7945579928053133	3.146047986074082	2.645189606511652	2.6280959589653294	3.064431893129362	3.0830503635844178	2.579593307997729	2.825021002830434	2.9709788918637856	2.930411262420926	3.0440567457874588	2.897877650354751	2.884109388527103	-0.4161255006233606	-0.700492060058326	-0.45257670373591274	-0.33559807292746546	-0.22009841880675074	-0.1944887532753956	-0.5521245655579445	-0.8282200848984265	-0.44466527643348597	-0.45558333938244955	-0.44377981528307986	-0.4979423730234549	-0.46180791366717105	0.0959193233604	0.119339994516	0.0601351299193	0.0932664139634	0.545696106059	0.320413072024	0.139674609309	0.0565651674203	0.183752894264	0.0412557222864	0.0468981580933	0.192768091005	4.54871017243e-05	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.038118191245	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr17:5390106..5390220,+__1525.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:5390106..5390220,+__1525.1.0.0	rs1805462,rs2240050,rs1805463	3.210683493428674	3.846540046132408	3.0977663102475645	2.963694031892795	3.2845303119361127	3.2775391168598134	3.1317178735556737	3.6532410877288606	3.4156441682972716	3.3859946018033757	3.4878365610705386	3.395820023378206	3.3459173021942745	2.9795441566497463	3.4202444595927477	2.660493324540995	2.574003093468852	2.948273108923506	3.2006750729780884	2.8276015552896063	3.185696739234643	3.193459865926716	3.1229790023363475	3.1983310682807016	3.1447876426025467	3.0380074241520414	-0.23113933677892762	-0.4262955865396605	-0.43727298570656936	-0.38969093842394287	-0.33625720301260653	-0.07686404388172496	-0.30411631826606733	-0.46754434849421767	-0.22218430237055564	-0.26301559946702824	-0.28950549278983706	-0.25103238077565937	-0.3079098780422331	0.0678362651725	0.162586850726	0.00313710581496	0.029613347289	0.107123399254	0.361218104761	0.122558611289	0.116187990183	0.147021540231	0.221756412245	0.197395731844	0.0316863885398	3.47249402904e-06	1	1	0.624284057178	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.000788256144592	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:58042063..58042177,-__1526.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:58042063..58042177,-__1526.1.0.0	rs75421338	-0.4452518654422864	0.4655378069687468	0.2042086009079584	-1.0041070455864884	0.37452645391800055	0.3862283217983684	1.1408845854498857	0.7197162360553322	0.7942050316835023	0.6987893376199303	-0.46005065298791964	2.149625637641684	0.4186927040022262	1.3490580941828731	-0.799799352610671	1.4104720739900882	1.1381509971542707	-0.200066824412668	-1.2161848032739366	0.40400888386389844	-0.8188573247249007	-0.22156866120889496	1.849648485264684	1.424937623590486	0.2557094862000904	0.38129238983460995	1.7943099596251595	-1.2653371595794178	1.2062634730821298	2.1422580427407594	-0.5745932783306685	-1.602413125072305	-0.7368757015859873	-1.5385735607802329	-1.0157736928923973	1.1508591476447536	1.8849882765784056	-1.8939161514415934	-0.03740031416761622	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:58042063..58042177,-__1526.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:58042063..58042177,-__1526.1.0.0	rs76419616	-0.4452518654422864	0.4655378069687468	0.2042086009079584	-1.0041070455864884	0.37452645391800055	0.3862283217983684	1.1408845854498857	0.7197162360553322	0.7942050316835023	0.6987893376199303	-0.46005065298791964	2.149625637641684	0.4186927040022262	2.1930117837375764	1.5633865316102877	0.40264768648495314	1.2077175071647586	-0.16212294891845686	1.0773760490779467	0.6474647072116845	2.43875434686171	1.542002234598705	0.4706461226533995	1.1003321645523227	2.994290578928992	1.2896255636636564	2.638263649179863	1.097848724641541	0.19843908557699474	2.211824552751247	-0.5366494028364575	0.6911477272795783	-0.4934198782382012	1.7190381108063777	0.7477972029152027	-0.22814321496653084	1.5603828175402423	0.8446649412873084	0.8709328596614304	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr17:58042063..58042177,-__1526.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:58042063..58042177,-__1526.1.0.0	rs75421338,rs76419616	-0.4452518654422864	0.4655378069687468	0.2042086009079584	-1.0041070455864884	0.37452645391800055	0.3862283217983684	1.1408845854498857	0.7197162360553322	0.7942050316835023	0.6987893376199303	-0.46005065298791964	2.149625637641684	0.4186927040022262	-0.5620874578987155	0.8072645329201132	-0.7045878571284963	1.3445795448181164	-0.3989337485286118	0.6124175514504556	0.8723677537442346	-0.20672672760180782	-1.0170764568140986	-0.7695889205269939	-1.0995529518253933	-0.5063080448283805	-0.13568606518496482	-0.1168355924564291	0.34172672595136644	-0.9087964580364547	2.348686590404605	-0.7734602024466124	0.2261892296520872	-0.2685168317056511	-0.9264429636571401	-1.811281488497601	-1.4683782581469242	-0.6395022988374737	-2.6559336824700646	-0.554378769187191	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.0.0	rs9282699	-1.3990837961105609	-0.9056714918747998	-1.6809661601100432	-0.9919959209761067	-1.4034296287430064	-1.3056004512829757	-1.102047770191477	-0.8258772728430626	-1.2907588164720711	-1.1507013637040466	-1.6517392812650482	-1.0705378733657311	-1.2315341522449108	-1.2754573453069031	-1.163859595524215	-1.0263936646493519	-1.546456148346553	-1.119794470285532	-1.3537811674819953	-1.0015211363625869	-1.009766652253289	-1.0709314029877344	-1.3118356518884269	-1.3252078955169728	-1.3152698572383572	-1.2100229156534932	0.12362645080365775	-0.25818810364941525	0.6545724954606913	-0.5544602273704464	0.28363515845747433	-0.048180716199019535	0.10052663382889016	-0.18388937941022654	0.21982741348433676	-0.16113428818438025	0.3265313857480754	-0.24473198387262607	0.021511236591417637	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.0.0	rs370080186	-1.3990837961105609	-0.9056714918747998	-1.6809661601100432	-0.9919959209761067	-1.4034296287430064	-1.3056004512829757	-1.102047770191477	-0.8258772728430626	-1.2907588164720711	-1.1507013637040466	-1.6517392812650482	-1.0705378733657311	-1.2315341522449108	-1.1029944394453075	-1.2399799858199159	-1.3271934036647037	-1.222212181346415	-1.4029560735329027	-1.3043314912895188	-1.2357713487205204	-1.4622926823798699	-1.7844811918567225	-1.2825195155977007	-1.2256377582089275	-1.288146530800781	-1.323209716888607	0.2960893566652534	-0.3343084939451161	0.35377275644533945	-0.2302162603703084	0.00047355521010361556	0.0012689599934569973	-0.13372357852904337	-0.6364154095368073	-0.49372237538465136	-0.1318181518936541	0.4261015230561207	-0.21760865743504976	-0.09167556464369635	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.0.0	rs6175	-1.3990837961105609	-0.9056714918747998	-1.6809661601100432	-0.9919959209761067	-1.4034296287430064	-1.3056004512829757	-1.102047770191477	-0.8258772728430626	-1.2907588164720711	-1.1507013637040466	-1.6517392812650482	-1.0705378733657311	-1.2315341522449108	-1.13195867821304	-1.8331735813837091	-1.6757551106938973	-1.379115007345712	-1.4282323591983417	-1.3720982728982114	-1.3296810391562572	-1.8509134502639442	-1.2553489614168596	-1.4211186103120261	-1.2249914721321433	-1.6133874468466864	-1.4596478324884028	0.2671251178975209	-0.9275020895089093	0.005211049416145919	-0.38711908636960524	-0.02480273045533532	-0.06649782161523565	-0.2276332689647802	-1.0250361774208816	0.03540985505521155	-0.2704172466079795	0.4267478091329049	-0.5428495734809553	-0.22811368024349155	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.0.0	rs6171	-1.3990837961105609	-0.9056714918747998	-1.6809661601100432	-0.9919959209761067	-1.4034296287430064	-1.3056004512829757	-1.102047770191477	-0.8258772728430626	-1.2907588164720711	-1.1507013637040466	-1.6517392812650482	-1.0705378733657311	-1.2315341522449108	-1.802735326481172	-0.7695819518805322	-1.6402499552570486	-1.663753376461269	-1.7284049691324548	-1.3096813324171999	-1.2679450970443291	-0.9262057036549076	-1.2575657415664894	-1.2620916525054944	-0.91313643751163	-1.254221914450881	-1.3162977881969506	-0.4036515303706112	0.13608953999426754	0.04071620485299454	-0.6717574554851624	-0.3249753403894484	-0.0040808811342241125	-0.16589732685285208	-0.10032843081184506	0.033193074905581765	-0.11139028880144775	0.7386028437534182	-0.1836840410851499	-0.08476363595203991	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.5.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.0.0	rs71651679	-1.3990837961105609	-0.9056714918747998	-1.6809661601100432	-0.9919959209761067	-1.4034296287430064	-1.3056004512829757	-1.102047770191477	-0.8258772728430626	-1.2907588164720711	-1.1507013637040466	-1.6517392812650482	-1.0705378733657311	-1.2315341522449108	-1.024709380547701	-1.7617586048390574	-1.4912205649985812	-1.289559860369005	-1.4181465325956593	-1.5631406159054104	-1.3966785109596913	-1.4656119798310323	-1.2835625410369935	-1.7200287690650002	-1.4959682560020244	-1.5714101550252697	-1.4568163142646189	0.3743744155628599	-0.8560871129642577	0.18974559511146194	-0.2975639393928984	-0.014716903852652896	-0.2575401646224347	-0.29463074076821427	-0.6397347069879697	0.007196275435077615	-0.5693274053609536	0.15577102526302378	-0.5008722816595386	-0.22528216201970805	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.6.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.0.0	rs71651678	-1.3990837961105609	-0.9056714918747998	-1.6809661601100432	-0.9919959209761067	-1.4034296287430064	-1.3056004512829757	-1.102047770191477	-0.8258772728430626	-1.2907588164720711	-1.1507013637040466	-1.6517392812650482	-1.0705378733657311	-1.2315341522449108	-1.469475748497383	-1.434447327378444	-1.1416230097619078	-1.0948466428596961	-1.2321916808253928	-0.952142646944394	-0.9756331321787816	-0.99650227577138	-0.9902183574061564	-0.9459871861115496	-1.0037645807264557	-1.133992278769829	-1.1142354056026142	-0.07039195238682217	-0.5287758355036442	0.5393431503481354	-0.10285072188358946	0.1712379479176136	0.35345780433858176	0.12641463801269548	-0.1706250029283174	0.30054045906591476	0.204714177592497	0.6479747005385925	-0.06345440540409797	0.11729874664229661	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.7.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.0.0	rs61762493	-1.3990837961105609	-0.9056714918747998	-1.6809661601100432	-0.9919959209761067	-1.4034296287430064	-1.3056004512829757	-1.102047770191477	-0.8258772728430626	-1.2907588164720711	-1.1507013637040466	-1.6517392812650482	-1.0705378733657311	-1.2315341522449108	-1.1489110699853269	-1.427074958153442	-1.1250047478295206	-1.4628801357814876	-1.7184900542164443	-1.5119909441666748	-1.4420113310126264	-1.1391590539948184	-1.373535343482017	-1.4091231425890793	-1.5118309098498393	-1.2757445800890517	-1.3788130225958606	0.250172726125234	-0.5214034662786423	0.5559614122805225	-0.4708842148053809	-0.31506042547343793	-0.20639049288369904	-0.3399635608211493	-0.31328178115175587	-0.08277652700994587	-0.2584217788850327	0.13990837141520895	-0.20520670672332053	-0.14727887035094991	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.8.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.0.0	rs2005172	-1.3990837961105609	-0.9056714918747998	-1.6809661601100432	-0.9919959209761067	-1.4034296287430064	-1.3056004512829757	-1.102047770191477	-0.8258772728430626	-1.2907588164720711	-1.1507013637040466	-1.6517392812650482	-1.0705378733657311	-1.2315341522449108	-1.6051837534657525	-1.1906873280479362	-1.1311497637149195	-1.0257168713038107	-1.2310906176793643	-0.9387570040759208	-1.9910420051879516	-1.2343110877869956	-1.1339250342920226	-1.465298046213298	-1.4667289798784395	-1.6098015258426057	-1.335307668124085	-0.2060999573551916	-0.2850158361731364	0.5498163963951237	-0.03372095032770406	0.17233901106364202	0.366843447207055	-0.8889942349964746	-0.40843381494393305	0.1568337821800485	-0.31459668250925144	0.18501030138660868	-0.5392636524768746	-0.10377351587917398	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.8.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:61996164..61996278,-__1527.1.0.0	rs6172,rs9282699,rs370080186,rs6175,rs6171,rs71651679,rs71651678,rs61762493,rs2005172,rs11568828	-1.3990837961105609	-0.9056714918747998	-1.6809661601100432	-0.9919959209761067	-1.4034296287430064	-1.3056004512829757	-1.102047770191477	-0.8258772728430626	-1.2907588164720711	-1.1507013637040466	-1.6517392812650482	-1.0705378733657311	-1.2315341522449108	-0.4687001040849552	-0.32648041380640225	-0.6033900717518705	-0.571784489682357	-0.5676564653603333	-0.9274078722110906	-0.5464347956754203	-0.5852248653847745	-0.6260273833451502	-0.3507701420145884	-0.45883715286524746	-0.8090277048073321	-0.5701451217491268	0.9303836920256057	0.5791910780683975	1.0775760883581726	0.4202114312937497	0.835773163382673	0.3781925790718852	0.5556129745160567	0.2406524074582881	0.664731433126921	0.7999312216894583	1.1929021283998007	0.26151016855839904	0.6613890304957839	0.0216734048733	0.0763307839553	0.0224529881577	NA__no_active_tile	0.0174714405594	NA__no_active_tile	0.0785847853765	0.183747876053	0.0103298859694	0.0484054419273	0.00357181666747	0.468411351413	7.31074273108e-08	1	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	0.732222416831	1	1.65953859996e-05	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:64188159..64188273,-__1528.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:64188159..64188273,-__1528.1.0.0	rs189912907	1.2211949514741405	0.39410931437618496	0.9448298130774988	1.28615234694549	-0.11025262067930018	1.0812183247060756	1.0029934978847512	1.8525347318805925	0.8368818250666221	1.108965749614067	-0.06464883177651487	0.014382583449021803	0.7973634738348857	-0.07655056522921794	0.3424447404097197	0.20628257955156096	0.5467238487257995	-0.4744459719886269	-0.8669281835435554	-0.1405033610778445	0.14435337303797804	-1.06665274594419	-0.22349612291454712	-0.3600919849786121	0.25210373389636753	-0.14306338833793067	-1.2977455167033585	-0.05166457396646529	-0.7385472335259379	-0.7394284982196906	-0.36419335130932673	-1.948146508249631	-1.1434968589625958	-1.7081813588426145	-1.903534571010812	-1.3324618725286141	-0.29544315320209724	0.23772115044734574	-0.9404268621728166	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr17:73663226..73663340,-__1529.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr17:73663226..73663340,-__1529.1.0.0	rs2165635	4.041282583560735	4.2830783787567945	3.8520639321622427	3.566749605960392	4.06940378949772	4.133835362554164	3.8278609079894714	4.274930783195916	4.26640225525386	4.236784086578057	4.173681679934891	4.26688976218277	4.08274692730225	3.8012107276627525	4.251792456429699	3.589594281701305	3.3309099065370145	3.8357716969040583	3.954021235651214	3.671155308454566	4.205438742930365	4.137083544539342	4.049414191221722	4.007242363311418	4.055702658345922	3.907444759474115	-0.2400718558979822	-0.03128592232709515	-0.26246965046093784	-0.23583969942337735	-0.2336320925936617	-0.17981412690294984	-0.15670559953490537	-0.06949204026555034	-0.12931871071451795	-0.1873698953563352	-0.16643931662347278	-0.21118710383684824	-0.17530216782813615	0.0350255264852	0.21176555971	0.0658387268341	0.0959193233604	0.0296152123457	0.0267271087754	0.122558611289	0.116187990183	0.0785847853765	0.0412580447575	0.0306357720046	0.0258200569765	4.16224663654e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	3.48796268142e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr17:73663226..73663340,-__1529.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr17:73663226..73663340,-__1529.1.0.0	rs2165634	4.041282583560735	4.2830783787567945	3.8520639321622427	3.566749605960392	4.06940378949772	4.133835362554164	3.8278609079894714	4.274930783195916	4.26640225525386	4.236784086578057	4.173681679934891	4.26688976218277	4.08274692730225	3.963381729503043	4.2014841075173965	3.847088425078274	3.5125461112389207	4.06897384663692	4.108532953007588	3.8221897953205097	4.2543969580210454	4.208737105179371	4.208249704426457	4.187536298061676	4.255889132687143	4.053250513889862	-0.07790085405769176	-0.081594271239398	-0.0049755070839685445	-0.054203494721471124	-0.00042994286079967026	-0.025302409546576143	-0.0056711126689616975	-0.020533825174870124	-0.05766515007448891	-0.028534382151599758	0.013854618126785567	-0.011000629495627301	-0.029496413412388955	0.747262025795	0.237368605078	0.935789553219	0.63839046467	0.536806685117	0.340423946445	0.88258056334	0.8931878581	0.221756412245	0.320413072024	0.989287003123	0.757455001208	0.950182249443	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr17:73663226..73663340,-__1529.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr17:73663226..73663340,-__1529.1.0.0	rs864234	4.041282583560735	4.2830783787567945	3.8520639321622427	3.566749605960392	4.06940378949772	4.133835362554164	3.8278609079894714	4.274930783195916	4.26640225525386	4.236784086578057	4.173681679934891	4.26688976218277	4.08274692730225	3.860440692164391	4.300821827598838	3.780742107185744	3.3895961131623027	3.9940725202550293	4.009766042956191	3.7718648731846436	4.198833538239056	4.049542105580246	4.125178803826542	4.092968756328766	4.1235441118967735	3.97478095769821	-0.18084189139634388	0.01774344884204382	-0.07132182497649886	-0.17715349279808912	-0.07533126924269062	-0.12406931959797252	-0.05599603480482784	-0.07609724495685999	-0.21686014967361444	-0.1116052827515146	-0.08071292360612503	-0.14334565028599666	-0.10796596960404081	0.361218104761	0.978575937473	0.436112310787	0.301187193336	0.132622250874	0.192768091005	0.591208103411	0.313917214294	0.0125089884503	0.116187990183	0.276771967065	0.476688253492	0.0618020121033	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr17:73663226..73663340,-__1529.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr17:73663226..73663340,-__1529.1.0.0	rs2165635,rs2165634,rs864234	4.041282583560735	4.2830783787567945	3.8520639321622427	3.566749605960392	4.06940378949772	4.133835362554164	3.8278609079894714	4.274930783195916	4.26640225525386	4.236784086578057	4.173681679934891	4.26688976218277	4.08274692730225	3.829464683781267	4.207226588313558	3.701136369471181	3.45355787521228	3.972386346982627	3.9767726118191704	3.7540497234393255	4.215834788333711	4.189120319603939	4.070666254455686	4.1503631785175354	4.169832143412306	3.974200906945216	-0.21181789977946774	-0.07585179044323631	-0.15092756269106156	-0.11319173074811184	-0.09701744251509314	-0.15706275073499354	-0.0738111845501459	-0.05909599486220429	-0.07728193564992125	-0.16611783212237086	-0.023318501417355364	-0.0970576187704646	-0.10854602035703553	0.226876581559	0.288805731951	0.192768091005	0.536806685117	0.0601351299193	0.0658387268341	0.420456664513	0.581967350665	0.0658387268341	0.116187990183	0.563691144959	0.0763307839553	0.00427865168217	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.971253931853	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:74733378..74733492,-__1530.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:74733378..74733492,-__1530.1.0.0	rs3744061	3.7981891829827266	4.143646979520291	3.614598111097726	3.2528448325155113	3.8034303163307603	3.8944164360290277	3.6991530731128073	4.201343509176489	4.11402247755732	4.089112816344699	4.02165245898669	4.196029616577773	3.902369984185986	3.855322201554046	4.258917014871544	3.722535614720399	3.500616628801602	3.844356770421249	3.8655029753251218	3.7771282672208972	4.2439991337232605	4.106716540000575	4.133028075407466	4.14822640587891	4.193631144599314	3.970831731043699	0.05713301857131947	0.11527003535125324	0.10793750362267307	0.24777179628609058	0.04092645409048856	-0.02891346070390588	0.07797519410808995	0.04265562454677152	-0.0073059375567448015	0.04391525906276783	0.12657394689222023	-0.0023984719784593267	0.06846174685771371	0.320413072024	0.226876581559	0.13967914143	0.0286240283844	0.313917214294	0.85089220831	0.147021540231	0.628827692687	0.935789553219	0.361218104761	0.282745459933	0.727009731456	0.180092200479	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr17:8055678..8055792,-__1531.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr17:8055678..8055792,-__1531.1.0.0	rs3027172	0.14481922919811874	0.23995522755280707	0.17233338315374203	-0.30214117566243026	-0.0012117053155514257	-0.16415103473958886	-0.19905845926428944	-0.23634477766739026	-0.01640533398695765	-0.35601104686245644	-0.30471290188157	-0.13121194416655	-0.09617837830350971	0.5891405759616081	-0.5883193808911704	0.38308870336059897	-0.262913560143693	-0.09959943057445644	-0.44772211102807996	-0.39864382086648414	-0.27161099911712827	0.841382404982814	-0.48117935457855393	-1.5065317170028218	0.2464932021424745	-0.16636795731290768	0.44432134676348933	-0.8282746084439775	0.21075532020685694	0.03922761551873727	-0.09838772525890502	-0.2835710762884911	-0.1995853616021947	-0.03526622144973801	0.8577877389697717	-0.1251683077160975	-1.2018188151212519	0.3777051463090245	-0.070189579009398	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr18:44676829..44676943,-__1532.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr18:44676829..44676943,-__1532.1.0.0	rs116124011	2.943683143439643	3.2102667125796818	2.511230206391662	2.6981104167059664	2.917383752951299	3.0230831533771454	2.6387342515410563	2.9242588378553034	3.0095595145769205	2.733901076740402	3.1141494391845668	3.0226999390678566	2.895588370367625	2.6373401589410626	3.1631749343784086	2.7340940367490933	2.6133386101644467	2.9101265664022176	2.7976372527211604	2.624555213871466	3.0001677446837665	2.8428729722612265	2.9270784685637303	2.934922709994144	2.809593419545178	2.832908507356325	-0.30634298449858033	-0.04709177820127319	0.2228638303574315	-0.08477180654151972	-0.0072571865490815846	-0.22544590065598502	-0.0141790376695905	0.07590890682846307	-0.16668654231569402	0.19317739182332838	-0.1792267291904226	-0.21310651952267845	-0.0626798630113002	0.0198238883694	0.0374147936077	0.320413072024	0.122558611289	0.152714648871	0.0181189115857	0.0583274625199	0.0515422504639	0.045430560235	0.175053819161	0.0134887989876	0.0412580447575	5.79445501172e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	4.85575329982e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr18:44676829..44676943,-__1532.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr18:44676829..44676943,-__1532.1.0.0	rs3809965	2.943683143439643	3.2102667125796818	2.511230206391662	2.6981104167059664	2.917383752951299	3.0230831533771454	2.6387342515410563	2.9242588378553034	3.0095595145769205	2.733901076740402	3.1141494391845668	3.0226999390678566	2.895588370367625	3.40741688645889	4.036244573425998	3.2159555800856596	3.0339119776506482	3.3066082338744023	3.3923165433239704	3.1666786049714615	3.3646073276404165	3.5182919142875626	3.498337042876768	3.474943710065154	3.5077791638834013	3.410257629878694	0.46373374301924697	0.8259778608463164	0.7047253736939978	0.33580156094468183	0.38922448092310313	0.369233389946825	0.5279443534304051	0.4403484897851131	0.5087323997106421	0.7644359661363662	0.36079427088058713	0.48507922481554466	0.5146692595110691	0.727009731456	0.444064484515	0.288805731951	0.819442862795	0.66743649171	0.79863356553	0.861430881609	0.788281320858	0.777966336216	0.925117039075	0.320413072024	0.60051573606	0.9575954044	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr18:44676829..44676943,-__1532.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr18:44676829..44676943,-__1532.1.0.0	rs116124011,rs3809965	2.943683143439643	3.2102667125796818	2.511230206391662	2.6981104167059664	2.917383752951299	3.0230831533771454	2.6387342515410563	2.9242588378553034	3.0095595145769205	2.733901076740402	3.1141494391845668	3.0226999390678566	2.895588370367625	3.4642259855484996	3.8364121671315985	3.1662094561421834	2.9658541823975706	3.3909583281353672	3.2785968556294542	3.1277237321224725	3.372172993012247	3.3155345694544485	3.4128001809224227	3.4411144390570474	3.5037758510587507	3.356281561717672	0.5205428421088567	0.6261454545519167	0.6549792497505216	0.2677437656916042	0.4735745751840681	0.25551370225230885	0.4889894805814161	0.44791415515694366	0.30597505487752796	0.6788991041820207	0.3269649998724806	0.48107591199089406	0.46069319135004666	0.591208103411	0.63839046467	0.333666485083	0.967868733231	0.354199901149	0.687084607526	0.967868733231	0.946473618223	0.696989544957	0.536806685117	0.444064484515	0.436112310787	0.955395590697	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr18:44702698..44702812,-__1533.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr18:44702698..44702812,-__1533.1.0.0	rs2277717	2.900026250441213	3.4208970671581027	2.9483355175843937	2.6914041142233667	3.1252901109756945	3.124735215617187	2.9895340419544763	3.579340438300445	3.225833521456924	3.1824842568346887	3.2579014510356816	3.264253787794264	3.142502981114703	3.1734819262300507	3.619599720719598	3.0652710769792293	2.667707583506264	3.0427962831036295	2.9359080980493113	2.921783129482462	3.466898492200761	3.0341056853504513	3.222015347898395	3.175166291602345	3.247359711664792	3.1310077788989408	0.27345567578883756	0.19870265356149508	0.11693555939483558	-0.02369653071710287	-0.08249382787206505	-0.18882711756787574	-0.06775091247201415	-0.11244194609968394	-0.1917278361064727	0.039531091063706114	-0.08273515943333676	-0.016894076129472246	-0.011495202215762427	0.925117039075	0.563691144959	0.554657938956	0.66743649171	0.79863356553	0.253741740693	0.301187193336	0.340423946445	0.29495293544	0.824663761487	0.978575937473	0.777966336216	0.907776773679	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:11688472..11688586,-__1534.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:11688472..11688586,-__1534.1.0.0	rs8107187	0.06183723444981486	0.27859122758574745	0.3213974683434603	0.13171717570052313	0.11266766847943027	0.24516296129270754	0.19101192870495332	-0.06357847645968387	0.2718355065521553	0.15794674208523296	0.3277069578775015	0.4475763990303011	0.20698939947017866	-0.8835596488250748	-0.5223876929016222	-0.5810633066800379	-0.733915084679609	-0.6715838563129375	-0.5366854370509611	-0.40975841561846726	-0.5408761497616447	-0.5508465707752179	-0.6584725129510407	-0.5727414031401409	-0.6287531700396054	-0.6075536040613633	-0.9453968832748896	-0.8009789204873696	-0.9024607750234982	-0.8656322603801321	-0.7842515247923678	-0.7818483983436686	-0.6007703443234206	-0.4772976733019608	-0.8226820773273733	-0.8164192550362737	-0.9004483610176424	-1.0763295690699066	-0.8145430035315419	5.31875791367e-06	1.63168639115e-05	4.73219996965e-05	1.73367966396e-05	7.77665488063e-06	7.76461476868e-07	3.33944592614e-05	0.00133155906714	8.34895163788e-05	1.63168639115e-05	3.60162929514e-07	2.28582318034e-06	7.5544131788e-48	0.00376568060288	0.0121397467502	0.0352548897739	0.0127772191234	0.00600357756785	0.000593216568327	0.0246785053942	0.968043441813	0.0645373961608	0.0128087381706	0.000276965292796	0.00178065625748	6.33059824383e-45	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:11688472..11688586,-__1534.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:11688472..11688586,-__1534.1.0.0	rs2071483	0.06183723444981486	0.27859122758574745	0.3213974683434603	0.13171717570052313	0.11266766847943027	0.24516296129270754	0.19101192870495332	-0.06357847645968387	0.2718355065521553	0.15794674208523296	0.3277069578775015	0.4475763990303011	0.20698939947017866	0.1283003281615392	0.31837642901746444	0.1489955490187886	-0.09425751094284604	-0.025859588839800884	0.013814413224369392	0.17355840302682923	0.02284135660595741	0.13933850898956873	0.1630540623115438	0.2070602475115937	0.24684103873094765	0.1201719364013296	0.06646309371172433	0.03978520143171699	-0.1724019193246717	-0.22597468664336917	-0.13852725731923116	-0.23134854806833816	-0.017453525678124082	0.08641983306564127	-0.1324969975625866	0.00510732022631083	-0.1206467103659078	-0.20073536029935346	-0.08681746306884906	0.706946403854	0.79863356553	0.572794651112	0.63839046467	0.265084565602	0.428242856315	0.727009731456	0.989286880498	0.143314270352	0.747262025795	0.788281320858	0.129198935732	0.828519332374	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr19:11688472..11688586,-__1534.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:11688472..11688586,-__1534.1.0.0	rs8107187,rs2071483	0.06183723444981486	0.27859122758574745	0.3213974683434603	0.13171717570052313	0.11266766847943027	0.24516296129270754	0.19101192870495332	-0.06357847645968387	0.2718355065521553	0.15794674208523296	0.3277069578775015	0.4475763990303011	0.20698939947017866	-0.7719618016404398	-0.44696103218499295	-0.5299998939109223	-0.7655625617192593	-0.7505097883679934	-0.6641300313579176	-0.35543707985727463	-0.6330500244166697	-0.5389459039330483	-0.5930740743881489	-0.42825606089604895	-0.25692118326303837	-0.5612341196613129	-0.8337990360902546	-0.7255522597707404	-0.8513973622543826	-0.8972797374197824	-0.8631774568474238	-0.9092929926506251	-0.546449008562228	-0.5694715479569858	-0.8107814104852036	-0.7510208164733818	-0.7559630187735504	-0.7044975822933395	-0.7682235191314915	0.000715310039185	0.00313710581496	7.05457685779e-05	0.00883703695038	3.75375068986e-05	3.54084840538e-05	0.000664499252857	0.0362033618716	0.000152810281165	0.000210645996816	9.98335414644e-06	0.00167824394514	3.07098356053e-30	0.138770147602	0.633695374622	0.014038607947	1	0.00769518891421	0.00711710529481	0.132899850571	1	0.0314789179199	0.0438143673378	0.00204658760002	0.345718252699	6.9711326824e-28	not sig	not sig	sig	not sig	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:11849715..11849829,-__1535.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:11849715..11849829,-__1535.1.0.0	rs72986630	-0.11452509315258536	-0.1334483496072659	-0.44984912117237474	-0.3723991128877999	-0.07683547779071559	-0.462082473560529	-0.44198370276829024	-0.3370570537778972	-0.6459943252867081	-0.4946926386968554	-0.22748256737746314	-0.30165759497393585	-0.33816729258770173	-0.30601399173261773	-0.24976369889467298	-0.0764842229489099	-0.2606020281110509	-0.21915683474662445	0.2361663200939099	-0.5330910060436252	-0.18680179156176727	-0.5732663284339666	-0.6336733798251822	-0.11432985175597367	-0.4837073539128896	-0.28339368065611426	-0.19148889858003237	-0.11631534928740708	0.37336489822346486	0.11179708477674904	-0.14232135695590886	0.6982487936544389	-0.091107303275335	0.15025526221612992	0.07272799685274145	-0.1389807411283268	0.11315271562148947	-0.18204975893895375	0.054773611931587494	0.485039624018	0.288805731951	0.536806685117	0.188220673538	0.682148641351	0.00993701022923	0.183752894264	0.330314894784	0.154655491485	0.514896818504	0.493479697885	0.313917214294	0.0400608794575	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:16582746..16582860,-__1536.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:16582746..16582860,-__1536.1.0.0	rs7252649	1.246434543445441	-1.1375279435730563	-1.0749598716235929	-0.5497075961740788	-0.5480643566896102	0.12807182206332862	-0.0748016851011392	-0.6808829285697868	-0.3270303724347965	-0.29616608272055567	-0.2635448684370369	0.8026920168033285	-0.23129061025096295	0.13838583572693394	-0.00047427713203529454	1.5019601914521092	0.2460125797565905	0.5914927711664012	0.8967288449750669	0.5307094734332868	0.508282185904804	0.4609202356429823	0.4311296168651981	0.5801573288671419	0.4211260189126351	0.5255359004642596	-1.108048707718507	1.137053666441021	2.5769200630757023	0.7957201759306693	1.1395571278560115	0.7686570229117382	0.6055111585344259	1.1891651144745907	0.7879506080777787	0.7272956995857538	0.8437021973041787	-0.38156599789069334	0.7568265107152227	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:2900875..2900989,+__1537.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:2900875..2900989,+__1537.1.0.0	rs7255359	-0.635955054523693	-0.3074862310060036	-0.9215806767557451	-0.9647969766782964	-0.7618393801701316	-0.9547052826948066	-1.169370843960758	-0.987998851474712	-0.8595968262293572	-0.8589444284748394	-0.9362440167712092	-1.0138969772827908	-0.8643679621685285	-1.268820051761338	-0.8916383492882476	-0.8444855781763771	-0.889540393001711	-1.0752903247055765	-0.7232449293176062	-1.1749346208021605	-0.9018928516799042	-0.6382865271360096	-0.8448456167531474	-1.4706632806170779	-1.2074481856870003	-0.9942575590771797	-0.6328649972376449	-0.584152118282244	0.07709509857936792	0.0752565836765855	-0.31345094453544486	0.2314603533772004	-0.0055637768414025235	0.08610599979480782	0.22131029909334754	0.014098811721692028	-0.5344192638458687	-0.19355120840420947	-0.12988959690865112	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.301187193336	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.188220673538	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.160157392718	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:2900875..2900989,+__1537.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:2900875..2900989,+__1537.1.0.0	rs7256762	-0.635955054523693	-0.3074862310060036	-0.9215806767557451	-0.9647969766782964	-0.7618393801701316	-0.9547052826948066	-1.169370843960758	-0.987998851474712	-0.8595968262293572	-0.8589444284748394	-0.9362440167712092	-1.0138969772827908	-0.8643679621685285	-1.354728937506797	-1.2579971778375763	-1.148548400003606	-1.178645187203657	-0.9925528330805359	-0.8416628581323659	-1.4788338634689475	-0.958903868018566	-0.7201676139710751	-1.2821795906172189	-1.1334683288177414	-1.0264300319875428	-1.1145098908871358	-0.718773882983104	-0.9505109468315727	-0.22696772324786085	-0.21384821052536052	-0.23071345291040424	0.11304242456244074	-0.30946301950818955	0.02909498345614603	0.1394292122582821	-0.42323516214237944	-0.19722431204653224	-0.012533054704751967	-0.25014192871860724	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:2900875..2900989,+__1537.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:2900875..2900989,+__1537.1.0.0	rs12981209	-0.635955054523693	-0.3074862310060036	-0.9215806767557451	-0.9647969766782964	-0.7618393801701316	-0.9547052826948066	-1.169370843960758	-0.987998851474712	-0.8595968262293572	-0.8589444284748394	-0.9362440167712092	-1.0138969772827908	-0.8643679621685285	-0.6443396214934544	-0.9080369416588759	-1.188606528162566	-1.1871837174226154	-1.4666702220185472	-1.2358543588060313	-1.1645558993151892	-0.97578610625953	-1.0218474707924274	-1.3184942459156292	-1.1070209363390626	-1.0225354093206385	-1.1034109547920474	-0.008384566969761309	-0.6005507106528724	-0.2670258514068209	-0.22238674074431897	-0.7048308418484156	-0.28114907611122475	0.004814944645568753	0.012212745215182008	-0.16225064456307026	-0.4595498174407898	-0.17077691956785346	-0.008638432037847643	-0.2390429926235187	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr19:2900875..2900989,+__1537.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:2900875..2900989,+__1537.1.0.0	rs7255359,rs7256762,rs12981209	-0.635955054523693	-0.3074862310060036	-0.9215806767557451	-0.9647969766782964	-0.7618393801701316	-0.9547052826948066	-1.169370843960758	-0.987998851474712	-0.8595968262293572	-0.8589444284748394	-0.9362440167712092	-1.0138969772827908	-0.8643679621685285	-0.9838992951735489	-1.009766652253289	-1.1433521735303172	-1.3408628830575005	-1.31698997401408	-1.063310454314082	-1.2114488643678158	-1.1563117067347517	-1.178067198078946	-1.1228722821245696	-1.3649948577515014	-1.2081782067010982	-1.175004545675125	-0.34794424064985585	-0.7022804212472855	-0.22177149677457209	-0.376065906379204	-0.5551505938439484	-0.10860517161927552	-0.04207802040705788	-0.1683128552600397	-0.31847037184958893	-0.26392785364973015	-0.42875084098029226	-0.1942812294183074	-0.3106365835065965	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:41196520..41196634,-__1538.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:41196520..41196634,-__1538.1.0.0	rs551127475	0.2352686687941542	-0.5536425886064104	-0.24992191461062327	0.04011648078705826	-1.190094069577867	-1.266455703800383	-0.7127122650628971	0.7167809150914779	-1.7950459449191893	-0.6209580646063612	-0.039091636497627535	-0.38056260044946494	-0.48469322695484446	-0.8769213964007104	-1.8998324763652257	-1.3312687239096186	-1.2275193930360864	-0.014930753785846592	-0.40687528074282253	-0.3268481504779478	-0.6682694469610109	-1.257717573967092	-1.2615645788761065	-0.8931290598886689	-1.1405945116880287	-0.9421226121749303	-1.1121900651948646	-1.3461898877588152	-1.0813468092989953	-1.2676358738231446	1.1751633157920205	0.8595804230575604	0.3858641145849493	-1.3850503620524888	0.5373283709520973	-0.6406065142697454	-0.8540374233910413	-0.7600319112385638	-0.4574293852200859	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:41196520..41196634,-__1538.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:41196520..41196634,-__1538.1.0.0	rs112542690	0.2352686687941542	-0.5536425886064104	-0.24992191461062327	0.04011648078705826	-1.190094069577867	-1.266455703800383	-0.7127122650628971	0.7167809150914779	-1.7950459449191893	-0.6209580646063612	-0.039091636497627535	-0.38056260044946494	-0.48469322695484446	1.4599656414074034	0.8861675077199149	0.964614768235016	-0.22588713725388754	0.2632215109676732	-0.17509134049992175	-0.25730945525347393	0.5410656408043237	-1.029288528897576	0.13337985659850043	0.20875132270731298	-0.29475983147380735	0.20623582958845654	1.2246969726132493	1.4398100963263252	1.2145366828456392	-0.2660036180409458	1.4533155805455402	1.0913643633004613	0.45540280980942316	-0.17571527428715417	0.7657574160216134	0.7543379212048615	0.2478429592049405	0.08580276897565758	0.690929056543301	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr19:41196520..41196634,-__1538.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:41196520..41196634,-__1538.1.0.0	rs551127475,rs112542690	0.2352686687941542	-0.5536425886064104	-0.24992191461062327	0.04011648078705826	-1.190094069577867	-1.266455703800383	-0.7127122650628971	0.7167809150914779	-1.7950459449191893	-0.6209580646063612	-0.039091636497627535	-0.38056260044946494	-0.48469322695484446	1.6846896328766294	-0.6856974066371729	0.9602661667355092	-0.4673110818966248	-0.20685422736582235	1.2816389996309978	-0.6040040079922412	0.7919524024229263	0.7004235486948411	-1.3486237713886982	-0.5464656558317746	-0.3799649045148375	0.09833747456114435	1.4494209640824751	-0.13205481803076258	1.2101880813461325	-0.507427562683683	0.9832398422120446	2.5480947034313806	0.1087082570706559	0.0751714873314484	2.4954694936140305	-0.727665706782337	-0.5073740193341472	0.0005976959346274402	0.5830307015159888	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:45449206..45449320,+__1539.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:45449206..45449320,+__1539.1.0.0	rs2288911	1.5007653043761566	1.5781889045649904	1.5709687061968014	1.382676074715276	1.510034277300699	1.6422205852159717	1.5941500925488277	1.5122473014338706	1.6651401165434505	1.8214859267733274	1.767061827924979	1.6808138407047215	1.6021460798582563	1.3252421759923445	1.6955070935096892	1.3014893854113871	1.1992016164014203	1.5140290472643556	1.6134345222908728	1.5371206379131437	1.6859791420902317	1.7054891765492393	1.7484401577866349	1.7386074386723145	1.6844357242068442	1.562414676507373	-0.17552312838381212	0.11731818894469881	-0.26947932078541426	-0.18347445831385567	0.003994769963656664	-0.028786062925098888	-0.057029454635683985	0.17373184065636105	0.04034906000578875	-0.07304576898669257	-0.028454389252664525	0.003621883502122669	-0.03973140335088284	0.696989544957	0.29495293544	0.21176555971	0.276771967065	0.554657938956	0.8931878581	0.935789553219	0.501992688725	0.444064484515	0.493479697885	0.85089220831	0.829896383209	0.831613529576	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:50084511..50084625,+__1540.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:50084511..50084625,+__1540.1.0.0	rs3760708	-1.1570936299902774	-1.151981600265699	-1.3691696289909223	-1.289877648011656	-1.2736762182445172	-0.9456470149672975	-1.0615056585111642	-1.1155976283254256	-1.2617714971497271	-1.1052906001238867	-1.2114505906215065	-1.3944379037106307	-1.1947916349093923	-1.4675238541818203	-1.2538085789232225	-1.2448281560561645	-1.2047743859922948	-1.1564525501940957	-1.2061796991223517	-1.1716729205816483	-0.754586574256438	-1.209998378811361	-1.0595176110249656	-1.1832067936476847	-1.335212491254964	-1.1873134995039176	-0.31043022419154287	-0.10182697865752344	0.12434147293475784	0.08510326201936125	0.1172236680504215	-0.26053268415505415	-0.1101672620704841	0.3610110540689876	0.051773118338366064	0.045772989098921135	0.028243796973821844	0.05922541245566659	0.007478135405474938	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:5839678..5839792,-__1541.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:5839678..5839792,-__1541.1.0.0	rs3760776	-1.5909257526194416	-1.9999273820163816	-1.6830799200008997	-1.5619582379218233	-1.5956480482031263	-1.7138388114179743	-1.690327057698216	-1.1179462005826437	-1.824303056075876	-1.822267336300821	-1.6727924773293048	-1.6098898382706766	-1.656908676536432	-1.3984958019991853	-1.7543961808024018	-1.6091955784671947	-1.4283602772393662	-1.7435827259788748	-1.9640352824347092	-1.4969880147117531	-1.5313448621108134	-1.311928290909163	-1.5158718651564298	-1.4574756802011817	-1.1465413097435722	-1.5298513224795538	0.19242995062025625	0.24553120121397987	0.07388434153370493	0.1335979606824571	-0.14793467777574842	-0.2501964710167348	0.19333904298646276	-0.41339866152816973	0.512374765166713	0.30639547114439125	0.21531679712812313	0.4633485285271044	0.12705735405687832	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:5839698..5839812,-__1542.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:5839698..5839812,-__1542.1.0.0	rs3760776	-1.534713472731424	-1.4460746332791914	-1.4904034907825836	-1.4883647522378087	-1.4477304319673236	-1.666530397255726	-1.3626750037883182	-1.0948818171390102	-1.167206550279495	-1.5329720470494	-1.317453933025425	-1.3123037713401562	-1.405109191739655	-1.2772304283567764	-1.2234337792938137	-1.3557635834868016	-1.4046919608492106	-1.5974620086757394	-2.017211025791103	-1.4555091588599078	-1.0907239565859492	-1.381146962395066	-1.3288548826368345	-1.6706237644325093	-1.6105490676814018	-1.4511000482537595	0.25748304437464764	0.2226408539853777	0.134639907295782	0.08367279138859818	-0.14973157670841575	-0.3506806285353772	-0.09283415507158965	0.004157860553060999	-0.21394041211557102	0.20411716441256544	-0.35316983140708436	-0.29824529634124564	-0.045990856514104304	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:8274174..8274288,+__1543.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:8274174..8274288,+__1543.1.0.0	rs3745375	1.0438095452630933	1.2392018233783597	0.4111864828865712	-0.34095061806451454	0.1440823991188115	0.8178017491235269	0.99930720372199	0.7105261177838942	-0.3368268996312517	-0.4052155927939569	0.2928986212858642	-0.3877237244037115	0.34900809230572305	0.321348555608242	0.5437448979637589	-0.05956372286448744	0.23448427247273687	0.4316953993188395	1.1047957785946536	0.2993704334562903	0.5174832295158246	0.3836821278860058	0.42954583981314487	0.4243718395975241	0.8566283187772041	0.4572989141783114	-0.7224609896548513	-0.6954569254146008	-0.47075020575105864	0.5754348905372514	0.287613000200028	0.28699402947112673	-0.6999367702656998	-0.1930428882680696	0.7205090275172574	0.8347614326071018	0.13147321831165992	1.2443520431809156	0.10829082187258839	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:8274174..8274288,+__1543.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:8274174..8274288,+__1543.1.0.0	rs922442	1.0438095452630933	1.2392018233783597	0.4111864828865712	-0.34095061806451454	0.1440823991188115	0.8178017491235269	0.99930720372199	0.7105261177838942	-0.3368268996312517	-0.4052155927939569	0.2928986212858642	-0.3877237244037115	0.34900809230572305	0.23024888062776447	0.8768644978216587	-0.32106674948663205	-0.16001403031671746	-0.09472118476852853	1.3171060717447542	0.5439842127959511	0.8642455035472987	1.965430035586774	-0.6064737784450748	0.14343806157727856	0.7403379482623446	0.45828162241223924	-0.8135606646353288	-0.36233732555670106	-0.7322532323732033	0.18093658774779708	-0.23880358388734002	0.49930432262122737	-0.4553229909260389	0.1537193857634045	2.3022569352180255	-0.20125818565111786	-0.14946055970858563	1.128061672666056	0.10927353010651626	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr19:8274174..8274288,+__1543.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:8274174..8274288,+__1543.1.0.0	rs3745375,rs922442	1.0438095452630933	1.2392018233783597	0.4111864828865712	-0.34095061806451454	0.1440823991188115	0.8178017491235269	0.99930720372199	0.7105261177838942	-0.3368268996312517	-0.4052155927939569	0.2928986212858642	-0.3877237244037115	0.34900809230572305	0.6240072354006063	2.2465202728275684	0.6240181734054172	2.7530746183299413	2.5952946695162047	0.1831210372396505	-0.39999361329859834	1.2295059844306513	-1.7347423036819232	0.16795058115595624	1.1150621057242014	0.22256222446361246	0.8021984154594407	-0.419802309862487	1.0073184494492087	0.21283169051884598	3.094025236394456	2.4512122703973933	-0.6346807118838764	-1.3993008170205883	0.5189798666467571	-1.3979154040506714	0.5731661739499132	0.8221634844383372	0.610285948867324	0.45319032315371777	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:8274209..8274323,+__1544.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:8274209..8274323,+__1544.1.0.0	rs3745375	-0.841962106045631	-1.2692934976827552	0.3188627844685729	-0.28744591733647235	-0.06513764314176583	-0.6009125707644544	1.215051828463855	-0.8461407892093165	0.06685771195774662	-0.3240612806792037	-0.555099694025959	-1.1833714518480547	-0.3643877188202865	0.20486462422895432	-0.76802094776641	0.29462910562946776	-1.6468806238425653	-0.8669628747000535	-0.4490932855725818	-1.0392950487076744	-0.7546024390971618	-0.2316855204793763	-1.082985016558703	-0.9194888909340067	-1.0748994286776523	-0.694535028873147	1.0468267302745853	0.5012725499163453	-0.024233678839105155	-1.359434706506093	-0.8018252315582877	0.15181928519187254	-2.254346877171529	0.09153835011215461	-0.2985432324371229	-0.7589237358794992	-0.3643891969080476	0.10847202317040239	-0.3301473100528604	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr19:8274209..8274323,+__1544.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:8274209..8274323,+__1544.1.0.0	rs922442	-0.841962106045631	-1.2692934976827552	0.3188627844685729	-0.28744591733647235	-0.06513764314176583	-0.6009125707644544	1.215051828463855	-0.8461407892093165	0.06685771195774662	-0.3240612806792037	-0.555099694025959	-1.1833714518480547	-0.3643877188202865	0.051914798691524836	-0.40312499952353	-1.197552517840473	-0.6219286503088848	-0.8827659563698942	0.41103687512054377	-1.0005671672422465	-0.08641249780055711	-2.3784754535231207	0.03170391551613427	0.010562396533659812	1.5322649622726718	-0.37777869120618107	0.8938769047371559	0.8661684981592253	-1.5164153023090459	-0.33448273297241243	-0.8176283132281283	1.0119494458849982	-2.2156189957061017	0.7597282914087593	-2.4453331654808674	0.355765196195338	0.5656620905596188	2.7156364141207265	-0.013390972385894448	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr19:8274209..8274323,+__1544.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr19:8274209..8274323,+__1544.1.0.0	rs3745375,rs922442	-0.841962106045631	-1.2692934976827552	0.3188627844685729	-0.28744591733647235	-0.06513764314176583	-0.6009125707644544	1.215051828463855	-0.8461407892093165	0.06685771195774662	-0.3240612806792037	-0.555099694025959	-1.1833714518480547	-0.3643877188202865	-1.075516777111596	-1.315869994580572	-1.6147439881532393	-0.9453673659024737	-1.2557159966226736	-0.4792967149329218	-0.08741958237682795	-1.178130567266896	-0.4824491759779528	-0.8546545507779726	-0.9734681454418588	-0.9391227619658982	-0.9334796350925734	-0.23355467106596506	-0.046576496897816844	-1.9336067726218122	-0.6579214485660014	-1.1905783534809078	0.12161585583153256	-1.302471410840683	-0.33198977805757957	-0.5493068879356994	-0.5305932700987689	-0.41836845141589973	0.24424868988215653	-0.5690919162722871	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:103039540..103039654,+__1545.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:103039540..103039654,+__1545.1.0.0	rs3817465	-0.5000557776850579	-0.37940676958505437	-0.587837369370834	-1.065998794405348	-0.48314841657125995	-0.4443303804463802	-1.005211040992536	-0.6744542959688161	-0.5306919865605493	-0.8011408216512191	-0.5191723175653774	-0.5166602838516933	-0.6256756878878438	-0.44004090697153475	-0.4707990805164733	-0.5390202150491308	-0.6635411069885182	-0.5253408937381842	-0.2855720885324323	-0.6795613358134158	-0.9871088526594738	-0.298473501578933	-0.6442906507866151	-0.496177046666632	-0.3990657868874469	-0.5357492888490659	0.06001487071352318	-0.09139231093141892	0.04881715432170319	0.40245768741682975	-0.0421924771669242	0.15875829191394786	0.3256497051791203	-0.31265455669065767	0.2322184849816163	0.15685017086460407	0.022995270898745424	0.11759449696424634	0.08992639903877797	NA__no_active_tile	0.412754243182	0.978575937473	0.452098798395	0.572794651112	0.333666485083	0.554657938956	NA__no_active_tile	0.554653407081	0.829896383209	0.788281320858	0.978575937473	0.958791017755	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:111880188..111880302,+__1546.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:111880188..111880302,+__1546.1.0.0	rs570626746	0.5884506137135058	-0.8869122183880935	0.10535891393569814	-1.047122902266436	-0.633772416351589	-1.9061529122530458	0.13961022909934587	0.5201768236162346	-0.9581702637936876	3.1738726737891163	-0.3028079658008029	0.4065902047410599	-0.06673993499655782	1.6384270726624048	0.5563227556432456	-0.21511741801218073	0.6436572696068539	1.3932027527290682	0.4680680233257595	0.7903581444601161	1.9342888165560432	-0.19624927553226224	0.3488734441472833	-0.3730009165988408	0.18381829896971244	0.5977207473297671	1.049976458948899	1.443234974031339	-0.3204763319478789	1.6907801718732898	2.0269751690806572	2.3742209355788053	0.6507479153607703	1.4141119929398087	0.7619209882614254	-2.824999229641833	-0.07019295079803795	-0.22277190577134745	0.6644606823263247	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:111880188..111880302,+__1546.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:111880188..111880302,+__1546.1.0.0	rs4302219	0.5884506137135058	-0.8869122183880935	0.10535891393569814	-1.047122902266436	-0.633772416351589	-1.9061529122530458	0.13961022909934587	0.5201768236162346	-0.9581702637936876	3.1738726737891163	-0.3028079658008029	0.4065902047410599	-0.06673993499655782	1.5568581842818583	0.389000394505934	1.3655419365956996	1.7219734029509903	1.3500823781324023	1.6843929209439703	0.1744618843602777	2.039132005028162	0.6347425153605265	0.552630308602998	-0.5820819528821688	-0.7955406692979486	0.8409327757152251	0.9684075705683525	1.2759126128940275	1.2601830226600015	2.7690963052174262	1.9838547944839913	3.590545833197016	0.03485165526093184	1.5189551814119273	1.5929127791542141	-2.6212423651861183	-0.2792739870813659	-1.2021308740390086	0.907672710711783	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr2:111880188..111880302,+__1546.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:111880188..111880302,+__1546.1.0.0	rs570626746,rs4302219	0.5884506137135058	-0.8869122183880935	0.10535891393569814	-1.047122902266436	-0.633772416351589	-1.9061529122530458	0.13961022909934587	0.5201768236162346	-0.9581702637936876	3.1738726737891163	-0.3028079658008029	0.4065902047410599	-0.06673993499655782	0.8000756358322616	1.07226466303872	0.2517083071152271	-0.04110583890656788	0.047460374567067566	-0.31048873650213005	1.2515010839193357	0.37788082032332665	0.45215408141864827	-0.3644247760705652	0.28142159035210673	-0.8046421814942182	0.2511504186327677	0.21162502211875578	1.9591768814268136	0.146349393179529	1.006017063359868	0.6812327909186565	1.5956641757509158	1.1118908548199897	-0.14229600329290798	1.410324345212336	-3.5382974498596815	0.5842295561529096	-1.211232386235278	0.31789035362932555	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:128284030..128284144,-__1547.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:128284030..128284144,-__1547.1.0.0	rs17522960	2.7856553500149466	3.421760542893896	2.5823311946941634	2.5487592149230656	2.856147961546543	2.9920444717230144	2.6155302991262666	2.9819194629477286	3.0840513921846906	2.883044176865626	3.047804541887351	3.1264431862961404	2.9104576495919527	3.1756217989968643	3.601115597270717	3.2280630340930374	2.9015639678552425	3.088361652574308	3.1067247741099315	3.008006953145582	3.0997617273267717	3.125915525420412	3.4262961928301983	3.1504748343070283	3.4088709443071132	3.193398083519767	0.3899664489819177	0.17935505437682098	0.645731839398874	0.35280475293217695	0.232213691027765	0.11468030238691718	0.3924766540193154	0.1178422643790431	0.04186413323572147	0.5432520159645722	0.10267029241967718	0.28242775801097286	0.2829404339278145	0.301187193336	0.935789553219	0.110080523892	0.253741740693	0.301187193336	0.444064484515	0.21176555971	0.840380101088	0.747262025795	0.242741268695	0.967868733231	0.747262025795	0.627776943266	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:160143111..160143225,-__1548.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:160143111..160143225,-__1548.1.0.0	rs968380	0.8053580571205315	1.2063446841788026	0.5069592628374836	1.012303013379763	0.8252219371255682	-0.19208152807563306	0.9694484916935948	0.3133318401443857	-0.3074212034588077	1.3533459793965772	0.4312778464253947	0.29915323973116	0.601936801708235	1.0833025119590958	1.1679342905882126	0.4519094878208552	0.7584363116768871	0.17561326622664142	0.7152507353966909	1.0125225951426118	0.7337686969501402	0.259941485668003	0.7856546365151283	1.1656032292976748	0.3961310114940216	0.7255056882279969	0.2779444548385642	-0.03841039359058995	-0.05504977501662839	-0.25386670170287595	-0.6496086708989268	0.907332263472324	0.043074103449016965	0.42043685680575454	0.5673626891268106	-0.5676913428814488	0.7343253828722801	0.0969777717628616	0.12356888651976183	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:160143177..160143291,-__1549.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:160143177..160143291,-__1549.1.0.0	rs968380	1.8120122361328583	2.129288030398344	0.9455566045196968	0.4783458304777231	1.5968613020510831	0.17936610183998528	1.093605086862462	1.6748982509362849	1.6496026812797515	0.15298191210764356	0.8210913871435709	1.0226927323502562	1.1296918463416386	-0.9986898469296224	-0.9079300232519052	-1.0110770478810858	-1.2203385596085978	-0.6885642668448624	-0.25654328175647484	0.3255748119508098	0.11247072250614512	-1.0735654857328962	-0.9015255922260552	-0.4264370150596556	-0.8652696162666104	-0.6593246000917342	-2.8107020830624805	-3.0372180536502493	-1.9566336524007826	-1.6986843900863209	-2.2854255688959455	-0.43590938359646014	-0.7680302749116523	-1.5624275284301397	-2.7231681670126475	-1.0545075043336989	-1.2475284022032265	-1.8879623486168664	-1.7890164464333724	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:160143177..160143291,-__1549.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:160143177..160143291,-__1549.1.0.0	rs140550417	1.8120122361328583	2.129288030398344	0.9455566045196968	0.4783458304777231	1.5968613020510831	0.17936610183998528	1.093605086862462	1.6748982509362849	1.6496026812797515	0.15298191210764356	0.8210913871435709	1.0226927323502562	1.1296918463416386	0.2171068445049813	0.5423714784768289	0.8627592607478414	-0.08249449209715672	0.7074153359524282	-0.15637564602814594	0.020591599136303783	0.6795866248088099	0.2498682233014195	-0.5168735476335908	0.416091070251536	0.014382583449021803	0.24620244457252308	-1.594905391627877	-1.5869165519215152	-0.08279734377185544	-0.5608403225748798	-0.8894459660986549	-0.3357417478681312	-1.0730134877261583	-0.9953116261274749	-1.399734457978332	-0.6698554597412344	-0.40500031689203486	-1.0083101489012343	-0.8834894017691152	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr2:160143177..160143291,-__1549.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:160143177..160143291,-__1549.1.0.0	rs968380,rs140550417	1.8120122361328583	2.129288030398344	0.9455566045196968	0.4783458304777231	1.5968613020510831	0.17936610183998528	1.093605086862462	1.6748982509362849	1.6496026812797515	0.15298191210764356	0.8210913871435709	1.0226927323502562	1.1296918463416386	-0.016466074134711833	0.15979578957925364	0.10312221653414134	0.4023922437771059	0.173524413396224	0.24462304655298794	1.0376035198271325	-0.2962006142124292	0.1436419059383319	0.7544292781593729	0.8343794961591369	-0.4662983225513961	0.25621224158542916	-1.8284783102675701	-1.9694922408190905	-0.8424343879855555	-0.07595358670061719	-1.4233368886548592	0.06525694471300267	-0.05600156703532955	-1.971098865148714	-1.5059607753414197	0.6014473660517293	0.013288109015565985	-1.4889910549016523	-0.8734796047562091	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:172543863..172543977,+__1550.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:172543863..172543977,+__1550.1.0.0	rs6721680	2.530157593483671	2.981367211846804	2.574828609621929	2.4271193976137115	2.7855597993314003	2.933405562379424	2.70825277112061	2.9417325828022842	2.9266372378677294	2.855961382352314	2.9031069035684194	2.8835413006019275	2.7876391960491858	2.679621720784584	3.0882528519350734	2.7425848640133648	2.532610096566085	2.7763697894240513	2.8328582452002773	2.850017551615542	3.2160069213048503	3.0190368708539337	3.0338602032199136	2.99091134925422	2.985676282040519	2.895650562184368	0.14946412730091296	0.10688564008826917	0.1677562543914357	0.1054906989523734	-0.009190009907348973	-0.10054731717914667	0.14176478049493202	0.2742743385025661	0.09239963298620424	0.17789882086759956	0.08780444568580048	0.10213498143859168	0.10801136613518247	0.301181659941	0.957167318493	0.313917214294	0.420456664513	0.788278954998	0.747262025795	0.129198935732	0.288805731951	0.412754243182	0.122558611289	0.628827692687	0.468411351413	0.404004710149	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:172543899..172544013,+__1551.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:172543899..172544013,+__1551.1.0.0	rs6721680	0.22127858126367528	0.6781631984112599	0.4607585304602782	0.5789345157843869	0.6323750790409071	0.5790046219456317	0.8359857245203379	0.8845680608354616	0.6302517342565759	0.9636402869559776	0.9809800988292348	0.9040301836737674	0.6958308846647911	-0.022745263674060018	0.2468922391332945	-0.06437512256839872	0.020086308702863848	0.17115327066649944	0.21480114590013266	0.24619666294798792	0.651370706267961	0.1819138192283401	0.054666403628188975	0.32271066891028277	0.1349048823257965	0.17979797678907408	-0.2440238449377353	-0.43127095927796544	-0.525133653028677	-0.558848207081523	-0.4612218083744076	-0.3642034760454991	-0.58978906157235	-0.23319735456750057	-0.4483379150282358	-0.9089738833277886	-0.658269429918952	-0.7691253013479709	-0.516032907875717	0.412754243182	0.0499532058383	0.0306357720046	0.0719809426143	0.0267271087754	0.0601351299193	0.0174727290303	0.333666485083	0.0785847853765	0.000681115576796	0.00591301274865	0.00470673488948	7.30084873533e-10	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.534675727785	1	1	6.1181112402e-07	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:177001228..177001342,+__1552.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:177001228..177001342,+__1552.1.0.0	rs711829	-0.43387647858375056	-0.8111113332683576	-0.8390957979930791	-0.3228695414189325	-0.6621117628008442	-0.7488739941939928	-0.644060106000971	-0.5134371221912396	-0.4451998983279461	-0.2768064717821218	-0.3046786382646236	-0.20539345173020324	-0.5172928830463385	-0.9525084722121356	-0.3814726650166864	-0.5248235793360957	-0.6221358742134989	-0.38687052429143	-0.819196227954851	-0.08455266697863649	-0.3730009165988408	-0.8169123368852036	-0.45077198325562273	-0.4944917839642575	-0.6151788027997825	-0.5434929861255867	-0.5186319936283851	0.4296386682516712	0.3142722186569834	-0.29926633279456644	0.2752412385094142	-0.07032223376085822	0.5595074390223345	0.14043620559239878	-0.3717124385572575	-0.17396551147350092	-0.18981314569963392	-0.4097853510695793	-0.026200103079248287	NA__no_active_tile	0.76769033028	0.85089220831	0.0440018610392	0.946473618223	0.197395731844	0.788281320858	0.368322877114	0.468411351413	0.914457985151	0.333666485083	0.248193451531	0.671172226837	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:192110125..192110239,+__1553.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:192110125..192110239,+__1553.1.0.0	rs13019004	0.37457747306816946	-0.07239301174556502	0.21629998728151112	-0.6544718072255353	1.0481569234961798	-0.5892002843705298	0.373449565688465	0.05535868462620538	0.3578995359931107	0.23116239183779175	0.3113420713579955	0.13635992959862442	0.14904512163386857	0.2982123123900331	0.5703796461864888	-0.017493876849875578	-0.015946012334527332	0.3947662399539957	1.3612870318414514	-0.28699602012588254	1.119267299300991	1.593404805329751	0.2048079469581721	0.6824149662416256	0.2561255073477268	0.5133524871866625	-0.07636516067813637	0.6427726579320538	-0.2337938641313867	0.638525794891008	-0.6533906835421841	1.9504873162119813	-0.6604455858143475	1.0639086146747856	1.2355052693366402	-0.02635444487961966	0.37107289488363004	0.1197655777491024	0.3643073655527939	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:200820436..200820550,+__1554.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:200820436..200820550,+__1554.1.0.0	rs281766	0.6986073246328086	0.5351721061308616	0.6113183762517865	0.5240806334161293	0.6106654612521812	0.6764574854532492	0.7603116804430935	0.7505902241500113	1.0368939115125513	0.78235259397608	1.1604441329491997	0.9374878771662782	0.7570318172778526	1.392546004510896	1.4593374548772051	0.966440949589413	0.8484352855336872	1.5785418767561044	1.68467019611924	1.3419070323363946	1.5098596036298713	1.4703110045131567	1.4585605207255097	1.5668017372178524	1.7711160704299007	1.4207106446866025	0.6939386798780873	0.9241653487463435	0.3551225733376264	0.3243546521175579	0.9678764155039231	1.0082127106659908	0.5815953518933011	0.75926937947986	0.4334170930006054	0.6762079267494296	0.40635760426865275	0.8336281932636225	0.66367882740875	0.0181189115857	0.00153065306427	0.0959193233604	0.253741740693	0.00263248034207	9.86556518966e-05	0.158583637061	0.0484028718114	0.0286240283844	0.00372847011721	0.0327677521954	0.00175684955224	8.45027546344e-14	1	1	1	1	1	0.075372918049	1	1	1	1	1	1	7.08133083836e-11	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:203736184..203736298,-__1556.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:203736184..203736298,-__1556.1.0.0	rs149846585	2.1674347287450098	1.1190526729457528	1.6931619108697566	0.22313861096376061	0.36161930693396577	-0.9525467475352422	1.3007350367890618	1.0760320898820646	0.6878657067371616	0.5946975681695457	-0.32940286281885056	0.47268740025509126	0.7012062851614232	2.5631326484084065	-0.05797450183906262	-0.48752100290461076	-0.1715693535690993	0.9441689654744241	-0.4940144724301722	0.5670758688141132	0.25830240590704673	0.1436419059383319	1.3231036040438424	0.4790215425623842	0.948255712189932	0.501301943549628	0.39569791966339674	-1.1770271747848156	-2.1806829137743673	-0.39470796453285995	0.5825496585404584	0.45853227510506994	-0.7336591679749486	-0.8177296839750179	-0.5442238007988297	0.7284060358742968	0.8084244053812348	0.4755683119348407	-0.19990434161179507	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:207630250..207630364,+__1557.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:207630250..207630364,+__1557.1.0.0	rs3762567	3.0097723254028783	3.5207513666757113	3.122251660808388	2.8516227929636515	3.2623159915744644	3.458279522005646	3.173433850968893	3.557777795181048	3.378560840342247	3.404156873013383	3.4780945857696746	3.3305899086804116	3.295633959448866	3.1966317206835826	3.744661941791801	3.1637073706457186	2.9548174390767867	3.2529879172414766	3.298123777439433	3.2381547598430713	3.620116746143517	3.424303959710639	3.523376086926512	3.572729155730899	3.3226093019210703	3.3593516814295423	0.18685939528070428	0.22391057511608947	0.04145570983733071	0.10319464611313522	-0.009328074332987768	-0.16015574456621273	0.06472090887417847	0.06233895096246922	0.04574311936839193	0.11921921391312917	0.09463456996122455	-0.007980606759341313	0.06371772198067593	0.727009731456	0.747259231451	0.66743649171	0.8931878581	0.8931878581	0.361218104761	0.609889042629	0.687084607526	0.8931878581	0.436112310787	0.925117039075	0.777966336216	0.988624549058	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr2:207630250..207630364,+__1557.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:207630250..207630364,+__1557.1.0.0	rs3762567,rs16838842	3.0097723254028783	3.5207513666757113	3.122251660808388	2.8516227929636515	3.2623159915744644	3.458279522005646	3.173433850968893	3.557777795181048	3.378560840342247	3.404156873013383	3.4780945857696746	3.3305899086804116	3.295633959448866	2.8951515327354462	3.419796075783155	2.8419912756278265	2.758008745091734	3.0519809208942834	3.1713560897188966	2.9553886248318726	3.1767800224407754	2.8666449845110873	3.060256097448729	3.1764767259186084	3.185849699010408	3.046640066167735	-0.11462079266743208	-0.10095529089255617	-0.2802603851805614	-0.09361404787191763	-0.21033507068018098	-0.2869234322867493	-0.21804522613702026	-0.38099777274027247	-0.5119158558311598	-0.3439007755646539	-0.30161785985106615	-0.14474020967000367	-0.24899389328113117	0.104229562843	0.30750859871	0.104229562843	0.237368605078	0.101398170673	0.0374147936077	0.113101776132	0.0638899216795	0.00591301274865	0.0350255264852	0.0140036728837	0.13967914143	3.81043214922e-07	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	8.64968097872e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:207630286..207630400,+__1558.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:207630286..207630400,+__1558.1.0.0	rs3762567	2.2815243093559894	2.546516298403206	2.1707069320012304	2.256383195713572	2.4143860860045545	2.3865188297114983	2.321279461483975	2.4922375439168674	2.51548080694065	2.632328375213483	2.514698366093086	2.4734467445348365	2.4171255791144124	1.6364689091196831	2.0113935027877523	1.7805149519985193	1.7437127328378037	1.9533205716815445	1.891699223850468	1.7319832910390085	1.956937404345916	1.891323809583824	2.123539806245391	1.795574831892016	2.014131864725424	1.8775500750089458	-0.6450554002363063	-0.5351227956154538	-0.39019198000271116	-0.5126704628757683	-0.46106551432301	-0.49481960586103035	-0.5892961704449666	-0.5353001395709513	-0.624156997356826	-0.5087885689680922	-0.7191235342010702	-0.45931487980941244	-0.5395755041054665	0.0468981580933	0.0156538458129	0.0515422504639	0.0316863885398	0.00153065306427	0.00883703695038	0.0209174885683	0.0107365258413	0.00372847011721	0.0316863885398	0.00501178746069	0.0906800339379	1.06457930993e-13	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	8.92117461723e-11	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:207630286..207630400,+__1558.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:207630286..207630400,+__1558.1.0.0	rs16838842	2.2815243093559894	2.546516298403206	2.1707069320012304	2.256383195713572	2.4143860860045545	2.3865188297114983	2.321279461483975	2.4922375439168674	2.51548080694065	2.632328375213483	2.514698366093086	2.4734467445348365	2.4171255791144124	2.1693075623275484	2.3497107859165807	2.220877027537634	2.197061031047532	2.0336768078243623	2.3926993173812976	2.2164519034317727	2.2135896286199968	2.2895131122308188	2.3283141315328155	2.1499430165981757	2.155742136700195	2.2264072050957275	-0.11221674702844098	-0.19680551248662548	0.050170095536403725	-0.059322164666040234	-0.3807092781801922	0.006180487669799284	-0.10482755805220245	-0.2786479152968706	-0.22596769470983125	-0.30401424368066765	-0.3647553494949105	-0.3177046078346413	-0.19071837401868497	0.657696241675	0.375513989452	0.88258056334	0.978575937473	0.253741740693	0.568229750021	0.648013768535	0.301187193336	0.206893929435	0.563691144959	0.343829805771	0.747262025795	0.744520382768	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr2:207630286..207630400,+__1558.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:207630286..207630400,+__1558.1.0.0	rs3762567,rs16838842	2.2815243093559894	2.546516298403206	2.1707069320012304	2.256383195713572	2.4143860860045545	2.3865188297114983	2.321279461483975	2.4922375439168674	2.51548080694065	2.632328375213483	2.514698366093086	2.4734467445348365	2.4171255791144124	1.6117884918169187	2.06720172506529	1.6508734664927103	1.5180904653956728	1.6943280315293667	1.538445501828953	1.5063514092893486	1.7815200974229854	1.8378508470164447	1.9159558875305984	1.7087743840734215	1.878943572456532	1.7258436566598536	-0.6697358175390706	-0.47931457333791627	-0.5198334655085202	-0.7382927303178992	-0.7200580544751878	-0.8480733278825454	-0.8149280521946265	-0.7107174464938819	-0.6776299599242053	-0.7163724876828848	-0.8059239820196646	-0.5945031720783045	-0.691281922454559	0.143314270352	0.0484054419273	0.13967914143	0.00800418438635	0.00423662678721	0.0111573361887	0.00849533044186	0.0327677521954	0.00175684955224	0.0194743211566	0.00160288548718	0.143314270352	1.01917090268e-12	1	1	1	1	0.868508491378	1	1	1	0.361911007762	1	0.328591524871	1	2.31351794908e-10	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:219134825..219134939,-__1559.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:219134825..219134939,-__1559.1.0.0	rs1877714	2.3079096442149805	2.2032536980613178	2.144820137421857	1.9853130247653576	2.1041907277098866	2.148608412498357	2.078971488924147	2.0176816580204524	2.0531243945556263	2.2807900259346274	2.4037738574001324	2.2068015822307263	2.161269887644789	1.8216148471672997	2.1789429457667557	1.8711680000603665	1.4775880467506368	2.063049736702726	2.0216397829276764	1.6303178697349558	2.0054340634870558	1.8550336479205989	2.026681874717568	2.1478312589752058	1.9122420855222746	1.91762867997776	-0.48629479704768075	-0.024310752294562032	-0.27365213736149063	-0.5077249780147208	-0.04114099100716073	-0.12696862957068067	-0.4486536191891912	-0.012247594533396633	-0.19809074663502746	-0.2541081512170593	-0.2559425984249266	-0.2945594967084517	-0.24364120766702904	0.125844655769	0.747262025795	0.591203856829	0.591208103411	0.79863356553	0.967868733231	0.259370210024	0.8931878581	0.301187193336	0.903813197854	0.48504462162	0.476688253492	0.87309588957	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:219146811..219146925,-__1560.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:219146811..219146925,-__1560.1.0.0	rs2292554	-0.5013231523447289	-0.3840822340382664	-0.8525966768175961	-0.7972443523127088	-0.7123195850706688	-0.23938356508459724	-0.8612829059411277	-1.0170764568140986	-0.8270611789967459	-0.7075989054276561	-0.5941500100557037	-0.5787830164712485	-0.6727418366145956	-0.6280658017762255	-0.34898438258003034	-0.36825091418890343	-0.6504136828444714	-0.5396904117425254	-0.490342088322447	-0.8736008575176988	-0.6567430705607096	-0.5419889523873045	-0.3666239156816362	-0.4257585516606833	-0.545930723051245	-0.5363661126928234	-0.1267426494314966	0.03509785145823607	0.48434576262869267	0.14683066946823742	0.17262917332814343	-0.2509585232378498	-0.012317951576571118	0.36033338625338907	0.2850722266094414	0.3409749897460199	0.16839145839502034	0.03285229342000351	0.1363757239217722	0.85089220831	0.87199428352	0.113101776132	0.333666485083	0.313917214294	0.824663761487	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.139674609309	0.237368605078	0.354199901149	0.452098798395	0.339770476308	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:219432929..219433043,-__1561.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:219432929..219433043,-__1561.1.0.0	rs500317	-0.6369092342353637	-0.5437141317264443	-0.542609492686118	-1.055036919789891	-0.5313461184122604	-0.4598477692721854	-0.8308917831493915	-0.8556031931131786	-0.5314155893488548	-0.8396431948155323	-0.731288492491434	-0.8112635492010093	-0.6974641223534719	-0.8496871433275519	-0.40536464313590154	-0.43514910094642156	-0.7945296527035894	-0.8098171796967066	-0.7233643351654574	-0.47898684601726105	-0.6871674853703533	-0.62202609087128	-0.880533319490705	-0.7265776316307938	-0.6797750670663915	-0.6744148746185344	-0.2127779090921882	0.1383494885905428	0.10746039173969646	0.26050726708630156	-0.2784710612844462	-0.263516565893272	0.35190493713213045	0.16843570774282524	-0.09061050152242522	-0.04089012467517272	0.004710860860640209	0.13148848213461783	0.02304924773493752	NA__no_active_tile	0.638386621154	0.609889042629	NA__no_active_tile	0.162586850726	0.0515422504639	0.619326784864	NA__no_active_tile	0.0698833862508	0.452098798395	0.8931878581	0.727009731456	0.317199315789	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:219432929..219433043,-__1561.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:219432929..219433043,-__1561.1.0.0	rs500422	-0.6369092342353637	-0.5437141317264443	-0.542609492686118	-1.055036919789891	-0.5313461184122604	-0.4598477692721854	-0.8308917831493915	-0.8556031931131786	-0.5314155893488548	-0.8396431948155323	-0.731288492491434	-0.8112635492010093	-0.6974641223534719	-0.8079346371379016	-1.3969248975613338	-1.1045713924003455	-1.507188382956787	-0.9923786401193855	-0.7184677620998188	-0.9155300429094226	-1.2108767423207083	-0.9626773453916304	-1.2128893747865084	-0.8931290598886689	-1.1405914503622963	-1.0719299773279005	-0.17102540290253787	-0.8532107658348894	-0.5619618997142275	-0.4521514631668959	-0.46103252170712505	-0.25861999282763337	-0.08463825976003114	-0.35527354920752974	-0.4312617560427756	-0.3732461799709761	-0.16184056739723485	-0.32932790116128696	-0.37446585497442864	NA__no_active_tile	0.000531721286872	0.125844655769	NA__no_active_tile	0.0583274625199	0.0412557222864	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00784715402968	0.137883884654	0.119339994516	NA__no_active_tile	1.36540395353e-06	NA__no_active_tile	0.395600637433	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	0.00114420851306	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr2:219432929..219433043,-__1561.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:219432929..219433043,-__1561.1.0.0	rs500317,rs500422	-0.6369092342353637	-0.5437141317264443	-0.542609492686118	-1.055036919789891	-0.5313461184122604	-0.4598477692721854	-0.8308917831493915	-0.8556031931131786	-0.5314155893488548	-0.8396431948155323	-0.731288492491434	-0.8112635492010093	-0.6974641223534719	-0.576769936199299	-0.6417760797696079	-0.7690506305175124	-0.7878528689246478	-1.0317237256581964	-0.8776310867831822	-1.3186169565112724	-0.5770705858591001	-1.2134178234229775	-0.8321572352331348	-0.7587902908459895	-0.7253245214120441	-0.8425151450947471	0.06013929803606477	-0.0980619480431636	-0.2264411378313944	0.2671840508652432	-0.5003776072459359	-0.41778331751099684	-0.4877251733618809	0.27853260725407847	-0.6820022340741227	0.007485959582397506	-0.027501798354555462	0.08593902778896523	-0.1450510227412751	NA__no_active_tile	0.10711938092	0.0719809426143	NA__no_active_tile	0.0491716185004	0.0120431385799	NA__no_active_tile	0.648013768535	0.000956291509096	0.147021540231	0.175053819161	NA__no_active_tile	3.14184966121e-05	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	0.196996050874	1	1	NA__no_active_tile	0.00713199873095	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:219433283..219433397,+__1562.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:219433283..219433397,+__1562.1.0.0	rs139197173	-0.6072711149112568	-0.9268460501169696	-0.5790402363676623	-0.7881939286650641	-1.017803239965463	-0.4771588413201531	-0.378944596036199	-0.2729377317436368	-1.0158709736076945	-0.367767998539827	-1.29357933587756	-0.3880314137232391	-0.6761204550728936	-0.8962604089332737	-0.5406691575438807	-0.8249257041905033	-0.3202541895013903	-0.933133716750441	-1.065706532841571	-0.7469241005630932	-0.31859829376026183	-0.3421949028199216	-0.4985785441286083	-0.21112439328738786	-0.26104927760042096	-0.5799516018267293	-0.2889892940220169	0.38617689257308896	-0.24588546782284093	0.4679397391636738	0.08466952321502208	-0.5885476915214178	-0.3679795045268942	-0.04566056201662505	0.6736760707877729	-0.1308105455887813	1.0824549425901722	0.12698213612281817	0.09616885324616431	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.898497645189	0.333666485083	NA__no_active_tile	0.809021331888	NA__no_active_tile	0.935789553219	0.947269934627	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:219433283..219433397,+__1562.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:219433283..219433397,+__1562.1.0.0	rs524902	-0.6072711149112568	-0.9268460501169696	-0.5790402363676623	-0.7881939286650641	-1.017803239965463	-0.4771588413201531	-0.378944596036199	-0.2729377317436368	-1.0158709736076945	-0.367767998539827	-1.29357933587756	-0.3880314137232391	-0.6761204550728936	-0.7360500423530834	-0.9564372789840102	-1.1249076536194664	-1.8403485240398891	-1.3342842873572276	-0.5755241590659962	-0.9419976185543952	-0.593713089082557	-0.5362397904736248	-0.7450831820445338	-1.0760690975063802	-0.5610509492125554	-0.9184754726911432	-0.1287789274418265	-0.029591228867040575	-0.5458674172518041	-1.052154595374825	-0.3164810473917645	-0.09836531774584306	-0.5630530225181962	-0.32077535733892026	0.4796311831340697	-0.37731518350470683	0.21751023837117978	-0.17301953548931626	-0.24235501761824949	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.412754243182	0.501992688725	0.747262025795	0.747262025795	NA__no_active_tile	0.248198866138	0.577325325143	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr2:219433283..219433397,+__1562.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:219433283..219433397,+__1562.1.0.0	rs139197173,rs524902,rs6734184	-0.6072711149112568	-0.9268460501169696	-0.5790402363676623	-0.7881939286650641	-1.017803239965463	-0.4771588413201531	-0.378944596036199	-0.2729377317436368	-1.0158709736076945	-0.367767998539827	-1.29357933587756	-0.3880314137232391	-0.6761204550728936	-1.0488038282050387	-0.8111113332683576	-0.6735931336836395	-1.2074481856870003	-1.0853299641024332	-1.06728156541055	-1.120383556255502	-0.7058678793702723	-0.6353371068074597	-1.031895502894908	-1.0662361256198498	-1.2316811189625136	-0.9737474416889604	-0.44153271329378185	0.11573471684861203	-0.09455289731597716	-0.4192542570219362	-0.06752672413697014	-0.590122724090397	-0.741438960219303	-0.4329301476266355	0.3805338668002348	-0.6641275043550809	0.2273432102577102	-0.8436497052392745	-0.2976269866160666	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.819442862795	1.0	NA__no_active_tile	0.13967914143	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1.0	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:219433517..219433631,+__1563.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:219433517..219433631,+__1563.1.0.0	rs526897	1.4078207199408563	1.7301934646966697	1.5661360311226276	1.4892733811932621	1.4740046465788428	1.3214211008159038	1.1886757337965121	1.6928029500757054	1.5016494173764792	1.524305416010378	1.5590852014074583	1.6510243034131213	1.5088660305356514	1.4344756322074292	1.7473313845970304	1.2856028810237121	1.2419543138642064	1.4884747175196682	1.3219031346007548	1.556198542980444	1.7500887871943334	1.5116999061585799	1.336841649075827	1.5915167319042312	1.4424595053521847	1.475712265539867	0.026654912266572905	0.017137919900360732	-0.28053315009891544	-0.24731906732905573	0.014470070940825419	0.00048203378485101034	0.36752280918393176	0.057285837118628	0.010050488782100686	-0.1874637669345509	0.03243153049677283	-0.20856479806093664	-0.03315376499578462	0.925117039075	0.536806685117	0.116187990183	0.248198866138	0.819440831591	0.216719559135	0.510582765025	0.742179092338	0.168724198081	0.113101776132	0.861430881609	0.527990680582	0.437199812333	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:219433556..219433670,+__1564.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:219433556..219433670,+__1564.1.0.0	rs526897	-0.5251662825787179	-0.6180877052734806	-1.0357746005033142	-1.198363150319482	-0.5615102815443705	-0.7907457537928977	-0.4658054655107662	-1.1784356799620999	-0.6625696615298425	-0.5810130175039985	-0.5754456833755879	-0.6820334040228601	-0.7395792238264516	-0.9817545438674018	-0.7789225844286571	-0.960680658676947	-0.7220639353294367	-1.2602578314146178	-0.8345553007843365	-0.8630215013683951	-0.8293718357153381	-1.1763363092945047	-0.9202647127680968	-0.949268878907122	-1.1236941207768283	-0.9500160177776401	-0.4565882612886839	-0.16083487915517658	0.0750939418263672	0.47629921499004535	-0.6987475498702472	-0.0438095469914388	-0.3972160358576289	0.34906384424676173	-0.5137666477646622	-0.3392516952640984	-0.3738231955315341	-0.44166071675396823	-0.21043679395118867	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00616002497902	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.572794651112	NA__no_active_tile	0.0504997759762	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:234160269..234160383,+__1565.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:234160269..234160383,+__1565.1.0.0	rs2289477	3.7208141745944516	4.15877896477148	3.4496535190827835	3.1139156035833406	3.7206131296013174	3.6588454910331527	3.394193047548439	3.845442732037313	3.733336698073943	3.765188613054483	3.705154988835748	3.841378256049417	3.675609601522156	3.6365866638267867	3.97910533690006	3.2856133355591033	3.1881192122457995	3.576260296557736	3.6031077280962984	3.379064806478135	3.5174980325405225	3.5624628769076168	3.757885749895745	3.631901438512988	3.7741214660295173	3.5743105786291927	-0.08422751076766488	-0.17967362787142038	-0.16404018352368022	0.0742036086624589	-0.14435283304358126	-0.055737762936854285	-0.015128241070303972	-0.3279446994967903	-0.17087382116632632	-0.00730286315873796	-0.0732535503227596	-0.0672567900198997	-0.10129902289296333	0.412754243182	0.337028796626	0.687084607526	0.677233097055	0.591208103411	0.737113058664	0.60051573606	0.110080523892	0.468411351413	0.563691144959	0.809021331888	0.788281320858	0.713850641004	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:234160301..234160415,+__1566.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:234160301..234160415,+__1566.1.0.0	rs2289477	-0.46092674699261693	0.09800228581453986	-0.17066099589890305	-0.26518901176751775	-0.2757524692248964	0.04936707052749031	-0.12151139785057699	0.15187421935023565	0.1644806772424036	0.06573097279259435	0.04768690555274899	-0.09304796090081204	-0.06749553761294254	0.19203444373170037	0.1286443901621141	0.15609038876773557	-0.1887978029101426	0.2107161177481398	0.13964467758009946	0.2509001396996322	0.15130843254811568	0.2507859973604792	0.23012820163007866	0.14845890536785328	0.1950762797978621	0.155415847623639	0.6529611907243174	0.030642104347574237	0.3267513846666386	0.07639120885737516	0.4864685869730362	0.09027760705260915	0.37241153755020917	-0.0005657868021199663	0.0863053201180756	0.1643972288374843	0.10077199981510429	0.28812424069867415	0.22291138523658152	0.00738980158608	0.572794651112	0.0201846528804	0.545696106059	0.00955750115232	0.0774477122405	0.00641629102443	0.88258056334	0.282745459933	0.732052639825	0.326996172605	0.192768091005	0.00118710306989	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.99479237257	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:238499342..238499456,-__1567.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:238499342..238499456,-__1567.1.0.0	rs2292873	0.03744266544958083	0.24746235294473756	0.030806847777075822	0.04661283144757435	0.4703426701985636	0.3161367958472776	0.5810731573407504	0.6050193162722757	0.28377174207228406	0.22321448872188626	0.12431771866897394	0.41855072030998686	0.2820626089209139	-0.16344087187188666	0.2606042062813342	0.433213441663816	-0.039430215645035	0.21911980644750081	0.41981919681543267	0.49561969837443975	0.4429731399161567	0.39729523235182695	0.2810643994285957	0.41970005013770467	0.423281035557467	0.29915159328811275	-0.2008835373214675	0.01314185333659662	0.40240659388674016	-0.08604304709260935	-0.25122286375106273	0.10368240096815506	-0.08545345896631062	-0.16204617635611895	0.1135234902795429	0.05784991070670942	0.2953823314687307	0.0047303152474801324	0.017088984367198818	0.354199901149	0.527990680582	0.460214637573	0.840380101088	0.21176555971	0.619326784864	0.519249062249	0.935788086327	0.170821264488	0.737113058664	0.143314270352	0.819442862795	0.635005822457	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:238499697..238499811,-__1568.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:238499697..238499811,-__1568.1.0.0	rs6755617	-0.2556273531357567	-0.1417878089628232	0.045699980233987816	-0.12277228587426554	0.1293757000037361	0.0619765923184774	-0.04799656943998869	0.11476207295174978	-0.06065570119874821	0.046431298969164994	-0.10343454272557617	-0.06302831531734732	-0.03308807768144914	-0.027988272730694486	-0.31175133261024024	-0.08252497593782554	-0.06700685766551923	0.14957731963881454	-0.059810639451218964	-0.13073470871729614	0.3476649476013138	-0.03138771044871931	0.004804465114107155	0.09942997465268791	-0.08679778268662716	-0.016377131103434805	0.2276390804050622	-0.16996352364741704	-0.12822495617181334	0.05576542820874632	0.02020161963507844	-0.12178723176969636	-0.08273813927730746	0.232902874649564	0.0292679907500289	-0.04162683385505784	0.20286451737826408	-0.023769467369279845	0.01671094657801434	0.136115392203	0.687084607526	0.925117039075	0.428242856315	0.8931878581	0.914457985151	0.444064484515	0.0316863885398	0.591208103411	0.727009731456	0.340423946445	0.946473618223	0.829541045695	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:238499697..238499811,-__1568.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:238499697..238499811,-__1568.1.0.0	rs79820740	-0.2556273531357567	-0.1417878089628232	0.045699980233987816	-0.12277228587426554	0.1293757000037361	0.0619765923184774	-0.04799656943998869	0.11476207295174978	-0.06065570119874821	0.046431298969164994	-0.10343454272557617	-0.06302831531734732	-0.03308807768144914	-0.6035131939430971	-0.6372078094825558	-0.3814295524541356	-0.3931222866114828	-0.3839652441222674	-0.45454198832101533	-0.6700182511932058	-0.26203002795599606	-0.46309206803058767	-0.5320739747389325	-0.5320104711783371	-0.3944505338531703	-0.4756212834903986	-0.3478858408073404	-0.4954200005197327	-0.4271295326881234	-0.27035000073721727	-0.5133409441260035	-0.5165185806394927	-0.6220216817532171	-0.37679210090774584	-0.4024363668318395	-0.5785052737080975	-0.42857592845276093	-0.331422218535823	-0.44253320580894956	0.0619890035232	0.101398170673	0.0932701621097	0.288805731951	0.00544559218276	0.00480682187369	0.00544559218276	0.0399413890972	0.00591301274865	0.000751093855117	0.00389134425826	0.00849533044186	3.55710847949e-13	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.589608676267	1	1	2.98085690582e-10	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr2:238499697..238499811,-__1568.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:238499697..238499811,-__1568.1.0.0	rs6755617,rs79820740	-0.2556273531357567	-0.1417878089628232	0.045699980233987816	-0.12277228587426554	0.1293757000037361	0.0619765923184774	-0.04799656943998869	0.11476207295174978	-0.06065570119874821	0.046431298969164994	-0.10343454272557617	-0.06302831531734732	-0.03308807768144914	-0.455471351118955	-0.45705351215610124	-0.3491101310062152	-0.3547101835745631	-0.2688643842488382	-0.5435142963323829	-0.6918535626443036	-0.38698224178045726	-0.3127045131709726	-0.5311324570356871	-0.3930098485537147	-0.3000374185744571	-0.4203703250163873	-0.1998439979831983	-0.31526570319327807	-0.394810111240203	-0.23193789770029755	-0.3982400842525743	-0.6054908886508603	-0.643856993204315	-0.501744314732207	-0.2520488119722244	-0.5775637560048521	-0.2895753058281385	-0.23700910325710978	-0.3872822473349382	0.270885072145	0.0741297894045	0.0103298859694	0.202104162379	0.00275115621019	0.00220311126631	5.30937746215e-05	0.00372847011721	0.00522462344006	0.000587432962331	0.0129907246043	0.0499532058383	2.84583083834e-15	1	1	1	1	0.563987023089	0.442825364529	0.0106187549243	0.727051672856	1	0.122186056165	1	1	6.46003600304e-13	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr2:27851832..27851946,-__1569.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:27851832..27851946,-__1569.1.0.0	rs3749147	3.0854464243158675	3.4958411554122977	2.860810961184068	2.6729749034989396	2.9456857327347787	3.0021404801211125	2.701442809754015	3.1893721958124353	2.9491091282161426	3.0315520575457127	3.1677621415749018	3.065163026686909	3.0139417514047655	3.183023476390222	3.526347419603457	2.815036902079221	2.7887712523292336	3.0188076042845067	3.003051589633997	2.8983878964384546	3.0179051148638587	3.133663735960776	3.127734410594317	3.1218454633178045	3.165909213679476	3.066707006597944	0.09757705207435441	0.030506264191159538	-0.045774059104847	0.115796348830294	0.07312187154972793	0.0009111095128844227	0.19694508668443955	-0.17146708094857654	0.18455460774463361	0.09618235304860434	-0.04591667825709722	0.10074618699256677	0.05276525519317865	0.79863356553	0.925117039075	0.829896383209	0.809021331888	0.436112310787	0.8931878581	0.60051573606	0.737113058664	0.657696241675	0.989287003123	0.809021331888	0.737113058664	0.998516730059	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr2:27851837..27851951,+__1570.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr2:27851837..27851951,+__1570.1.0.0	rs3749147	3.3866437423287126	3.899606678709392	3.217732976357592	2.865247224841225	3.2701479291109554	3.347883416904626	3.1018102192810715	3.499602433245137	3.3571659909166485	3.3956817002951976	3.4429362744393988	3.3729380031134273	3.346449715795282	3.551334021677766	3.989953761725877	3.3154110530756067	3.1309089576513904	3.466520920181973	3.6186500341160808	3.26831523373394	3.750570733480773	3.664794930836473	3.63313453740138	3.6549620726733463	3.7492720844078327	3.56615236174687	0.16469027934905345	0.09034708301648475	0.09767807671801476	0.2656617328101656	0.19637299107101747	0.2707666172114549	0.16650501445286858	0.2509683002356362	0.30762893991982443	0.23745283710618237	0.21202579823394752	0.3763340812944054	0.21970264595158795	0.101398170673	0.347268461228	0.390154148302	0.0785847853765	0.045430560235	0.0959193233604	0.158583637061	0.0619890035232	0.150801701171	0.166665831608	0.226876581559	0.0162407194134	3.46493843385e-05	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0290361840756	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:28974390..28974504,+__1571.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:28974390..28974504,+__1571.1.0.0	rs7598876	-0.1307681143065145	-0.5575993179287959	0.12138653905641511	-0.1162218568589475	-0.1203678452774892	-0.159301725863866	-0.02091590632392896	0.2547844625088865	-0.046543032547612606	-0.020358563951860743	0.14343806157727856	-0.11147758364084538	-0.06366207362977339	0.2314702227088029	0.7813966237170411	-0.40617062558642	-0.28833019723574704	0.43417807200232456	0.37279840660549773	0.2253392029793811	-0.07428869873131508	0.07357235611244843	-0.20842964268975794	0.7028096643997436	0.1644589839815255	0.16740036402196037	0.3622383370153174	1.338995941645837	-0.5275571646428351	-0.17210834037679956	0.5545459172798137	0.5321001324693637	0.24625510930331004	-0.3290731612402016	0.12011538866006104	-0.1880710787378972	0.559371602822465	0.2759365676223709	0.23106243765173384	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.188220673538	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.0216734048733	0.0199868079192	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:40006352..40006466,-__1572.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:40006352..40006466,-__1572.1.0.0	rs371296499	1.2855681163622248	1.2706330013234486	1.193892578765336	0.6799975205017352	1.8137256245768327	1.073627301762464	0.7409851777388121	0.9291510610805035	0.9939093061628241	0.5610501234483096	1.971393740677228	0.6592295766226149	1.0977635940851942	3.0459711482223013	1.3452467381909874	2.0611515246519034	1.4093095789633963	1.3641804955156602	1.4492630961169433	1.7168542674211276	1.2311091886846086	2.280714153376657	0.5955227333995743	2.418421534235685	1.6951840048699272	1.7177440386373972	1.7604030318600765	0.0746137368675388	0.8672589458865674	0.729312058461661	-0.4495451290611725	0.37563579435447925	0.9758690896823154	0.3019581276041051	1.2868048472138327	0.034472609951264666	0.447027793558457	1.035954428247312	0.619980444552203	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:40006352..40006466,-__1572.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:40006352..40006466,-__1572.1.0.0	rs12620957	1.2855681163622248	1.2706330013234486	1.193892578765336	0.6799975205017352	1.8137256245768327	1.073627301762464	0.7409851777388121	0.9291510610805035	0.9939093061628241	0.5610501234483096	1.971393740677228	0.6592295766226149	1.0977635940851942	1.5084665722437964	0.7051790579561321	1.490669944165616	0.631926080268558	1.6838588732056738	-0.04005519630448626	0.20860518353420088	-0.7486381433447798	0.7304838389169802	0.8966768078161206	0.7590314236804602	-0.5053634712995342	0.6100700809032281	0.22289845588157164	-0.5654539433673165	0.2967773654002799	-0.04807144023317722	-0.12986675137115888	-1.1136824980669502	-0.5323799942046112	-1.6777892044252833	-0.2634254672458439	0.33562668436781096	-1.2123623169967677	-1.1645930479221491	-0.48769351318196624	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:40006352..40006466,-__1572.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:40006352..40006466,-__1572.1.0.0	rs35761077	1.2855681163622248	1.2706330013234486	1.193892578765336	0.6799975205017352	1.8137256245768327	1.073627301762464	0.7409851777388121	0.9291510610805035	0.9939093061628241	0.5610501234483096	1.971393740677228	0.6592295766226149	1.0977635940851942	-0.850857956987149	0.38621992260713445	0.5823725940293581	0.2987358074531111	-0.5545481943677577	-0.6878029883848216	-0.5896764824545617	-1.2423874548015397	-0.12284420528811604	-0.33838121380859226	0.11511447182596984	0.6774810296330618	-0.19388122254532517	-2.136426073349374	-0.8844130787163141	-0.6115199847359779	-0.3812617130486241	-2.3682738189445907	-1.7614302901472856	-1.3306616601933738	-2.1715385158820433	-1.1167535114509402	-0.8994313372569018	-1.8562792688512582	0.01825145301044684	-1.2916448166305197	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr2:40006352..40006466,-__1572.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:40006352..40006466,-__1572.1.0.0	rs371296499,rs12620957,rs35761077	1.2855681163622248	1.2706330013234486	1.193892578765336	0.6799975205017352	1.8137256245768327	1.073627301762464	0.7409851777388121	0.9291510610805035	0.9939093061628241	0.5610501234483096	1.971393740677228	0.6592295766226149	1.0977635940851942	-0.0721624934798732	0.4693430577124962	0.12155508510388068	0.2922719872632965	0.5364728905248053	0.6277869826273029	-0.9008098427822797	0.41886194590707726	-0.2740222890873682	0.40143101266348413	0.9232153650501228	0.2060694663900695	0.22916776399108452	-1.357730609842098	-0.8012899436109524	-1.0723374936614554	-0.3877255332384387	-1.2772527340520274	-0.4458403191351611	-1.6417950205210918	-0.5102891151734262	-1.2679315952501924	-0.1596191107848255	-1.048178375627105	-0.45316011023254543	-0.86859583009411	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:43019645..43019759,-__1573.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:43019645..43019759,-__1573.1.0.0	rs2304656	-0.9187187203281918	-0.1538947910821663	-0.007059553532078478	-0.6295189129073168	-0.7742003528276937	-0.5486796799550725	-0.3006776666215	-0.48994393258880264	-0.7419983453979722	-0.11512873282684187	-0.9689980259919974	-1.0789299291105223	-0.5606457202641797	0.1072480820902968	-0.3607603036425986	-0.6735931336836395	-0.17920424052336706	-0.3989337485286118	0.31552696586192314	-0.496413162908133	-0.8125624780482316	-0.14205809032271738	-0.2283003925448368	0.0638153614906001	-0.6859577686163949	-0.2909327424479759	1.0259668024184887	-0.20686551256043229	-0.6665335801515611	0.45031467238394973	0.37526660429908193	0.8642066458169957	-0.195735496286633	-0.3226185454594289	0.5999402550752548	-0.11317165971799494	1.0328133874825975	0.3929721604941274	0.2697129778162038	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:43019688..43019802,-__1574.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:43019688..43019802,-__1574.1.0.0	rs2304656	-0.2384195025789205	0.07205083716774369	-0.26467843035425564	-0.3937896988994827	-0.13413218925349246	-0.10808994469755406	-0.3633185908323925	0.12700997766268457	-0.2856949201051888	-0.16428901459029466	-0.16998089484581533	-0.5455582959209047	-0.20574088893732276	-0.12480781227882193	-0.1671111090382564	-0.4896663533638217	-0.2018359820591732	-0.19103455199127026	-0.42654524068763955	-0.4563011986932639	-0.4323233564229189	-0.2855504061391877	-0.1513341314198887	-0.6781455104070239	-0.2867642275451661	-0.32428499000386934	0.11361169030009857	-0.2391619462060001	-0.22498792300956605	0.19195371684030949	-0.056902362737777795	-0.3184552959900855	-0.09298260786087142	-0.5593333340856035	0.0001445139660011252	0.012954883170405967	-0.5081646155612085	0.25879406837573854	-0.1185441010665466	0.581967350665	0.267968556658	0.87199428352	0.64319083408	0.188220673538	0.0301198912436	0.13967914143	0.129198935732	0.63839046467	0.90381429355	0.120936669873	0.696989544957	0.202762184301	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:61108734..61108848,+__1575.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:61108734..61108848,+__1575.1.0.0	rs67574266	-1.4969880147117531	-1.085755330651495	-1.4195722601911258	-1.4429050118361433	-1.58635772726338	-1.5951297859004938	-1.7670963943272466	-1.3085042953949209	-1.5453134510306228	-1.28963879914831	-1.885936433851197	-1.6056717907442406	-1.5024057745875774	-1.6705470316843172	-1.3932519847572147	-1.7394664326074905	-1.1498150222175485	-1.2751820833611465	-1.2991133061798217	-1.030230588503117	-1.6314152472282235	-1.0564977185049536	-1.5960339356460942	-1.3642351665325547	-1.1014507312729043	-1.3589366040412825	-0.17355901697256404	-0.3074966541057196	-0.31989417241636464	0.2930899896185948	0.3111756439022335	0.29601647972067213	0.7368658058241295	-0.32291095183330265	0.48881573252566923	-0.30639513649778416	0.5217012673186423	0.5042210594713363	0.14346917054629524	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr2:61108734..61108848,+__1575.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:61108734..61108848,+__1575.1.0.0	rs6727504,rs67574266	-1.4969880147117531	-1.085755330651495	-1.4195722601911258	-1.4429050118361433	-1.58635772726338	-1.5951297859004938	-1.7670963943272466	-1.3085042953949209	-1.5453134510306228	-1.28963879914831	-1.885936433851197	-1.6056717907442406	-1.5024057745875774	-1.5521827832769848	-1.5066058836579805	-1.0608149431505796	-1.1434553242744534	-1.3588480582748783	-1.7506408092076349	-1.661991257315926	-1.1317616075460932	-1.7460614377740251	-1.5158718651564298	-1.7613632105697163	-1.4050684869265184	-1.4662221389276013	-0.055194768565231644	-0.42085055300648544	0.35875731704054625	0.2994496875616899	0.22750966898850167	-0.15551102330714106	0.10510513701132074	0.17674268784882763	-0.20074798674340233	-0.22623306600811977	0.12457322328148068	0.20060330381772218	0.03618363565997573	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:96874530..96874644,-__1576.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:96874530..96874644,-__1576.1.0.0	rs6725867	-0.09124906814270195	-0.1890294695746751	-0.9662178235463325	-0.8790076680571179	-0.7149960355641292	-0.40687528074282253	-0.6411635960746292	-0.2512702970781813	-0.5541783598960692	-0.6142237681229699	-0.6976918418728691	-0.976869492068879	-0.5818977250617813	-1.035154096125144	-0.4813195875507834	-0.5133552361735657	-0.5994239406095245	-0.5976640512402591	-0.1495776733378699	-0.0889758763635388	0.03546461542365942	-0.5134712468474917	-0.4967641724529633	-1.1561130243673912	-0.1791762870981541	-0.4812942147285855	-0.943905027982442	-0.2922901179761083	0.45286258737276675	0.2795837274475934	0.11733198432387004	0.25729760740495267	0.5521877197110905	0.28673491250184074	0.04070711304857755	0.11745959567000658	-0.458421182494522	0.7976932049707248	0.10060351033319588	0.452098798395	0.925117039075	0.0601351299193	NA__no_active_tile	0.420456664513	0.0658387268341	0.259370210024	0.0658387268341	0.682148641351	0.428242856315	NA__no_active_tile	0.0619890035232	0.0456390832461	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:96874530..96874644,-__1576.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:96874530..96874644,-__1576.1.0.0	rs6725872	-0.09124906814270195	-0.1890294695746751	-0.9662178235463325	-0.8790076680571179	-0.7149960355641292	-0.40687528074282253	-0.6411635960746292	-0.2512702970781813	-0.5541783598960692	-0.6142237681229699	-0.6976918418728691	-0.976869492068879	-0.5818977250617813	-0.29817492350366115	-0.02980019748854712	0.21888233623940084	-0.34947444264687466	-0.4747508480513112	-0.02967556626972749	-0.31436887335097924	-0.3510771808155516	-0.9359062213329477	-0.9927638871111992	-0.4074011134728374	-0.5547923223642713	-0.3766086033473756	-0.2069258553609592	0.15922927208612797	1.1851001597857334	0.5295332254102433	0.24024518751281798	0.377199714473095	0.32679472272365	-0.09980688373737029	-0.3817278614368784	-0.37854011898822937	0.29029072840003173	0.4220771697046076	0.2052891217144058	0.563691144959	0.452098798395	0.0129907246043	0.0440018610392	0.197395731844	0.0174727290303	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.382791178922	0.80381871813	0.270885072145	0.0412580447575	0.00314039835709	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:96874530..96874644,-__1576.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:96874530..96874644,-__1576.1.0.0	rs80229301	-0.09124906814270195	-0.1890294695746751	-0.9662178235463325	-0.8790076680571179	-0.7149960355641292	-0.40687528074282253	-0.6411635960746292	-0.2512702970781813	-0.5541783598960692	-0.6142237681229699	-0.6976918418728691	-0.976869492068879	-0.5818977250617813	-0.9720413977388009	-0.9511768610328488	-0.7473766179723045	-0.6434178423855407	-0.6514067453879443	-0.8886413204445701	-0.6823762962886855	-0.4586667730505247	-0.8712892780793429	-0.8003662450280533	-0.5801520272337625	-0.9445589871735778	-0.765955865984663	-0.880792329596099	-0.7621473914581738	0.21884120557402797	0.23558982567157727	0.06358929017618487	-0.4817660397017476	-0.04121270021405621	-0.2073964759723434	-0.31711091818327364	-0.18614247690508345	0.11753981463910668	0.032310504895301184	-0.18405814092288164	0.119339994516	0.0484054419273	NA__no_active_tile	0.259370210024	0.989287003123	0.510582765025	NA__no_active_tile	0.76769033028	0.989287003123	0.572794651112	0.63839046467	NA__no_active_tile	0.789314459674	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr2:96874530..96874644,-__1576.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:96874530..96874644,-__1576.1.0.0	rs6725867,rs6725872,rs80229301	-0.09124906814270195	-0.1890294695746751	-0.9662178235463325	-0.8790076680571179	-0.7149960355641292	-0.40687528074282253	-0.6411635960746292	-0.2512702970781813	-0.5541783598960692	-0.6142237681229699	-0.6976918418728691	-0.976869492068879	-0.5818977250617813	-0.4293462629894229	-0.19282338156348366	-1.4690961052735334	-0.964162569650986	-0.6133226090265828	-0.7272033293828666	-0.42550208612448315	-0.6572684766923743	-0.6999243495809716	-0.7789107032366728	-0.37934975424450845	-0.2742725866059501	-0.6342651845309862	-0.33809719484672096	-0.0037939119888085737	-0.502878281727201	-0.08515490159386807	0.10167342653754641	-0.32032804864004405	0.2156615099501461	-0.405998179614193	-0.14574598968490238	-0.16468693511370291	0.3183420876283607	0.7025969054629289	-0.0523674594692049	0.559161188502	0.536806685117	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.361218104761	0.382791178922	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.85089220831	0.158583637061	0.501992688725	0.468411351413	0.437293300708	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr2:97304076..97304190,-__1577.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr2:97304076..97304190,-__1577.1.0.0	rs7580048	0.6391227436260535	0.8776743667745854	0.9182258149136988	0.5862014102723194	1.0082301371327982	1.235935577985718	0.585228703459785	0.905867596134484	1.2254712045299636	0.8930776239840043	0.6823933268613043	1.0544737740131405	0.8843251899739878	0.8677352483247277	1.0742006724842594	0.8665604568798426	0.6492767448424464	0.7846745617853752	0.8541025195458405	0.6450291864033558	0.7961103383825193	0.5920337419951395	0.7000648441383523	0.9147874405882144	0.8018201363576408	0.7955329909773096	0.22861250469867422	0.196526305709674	-0.05166535803385619	0.06307533457012693	-0.22355557534742299	-0.38183305843987747	0.059800482943570876	-0.10975725775196465	-0.6334374625348241	-0.1930127798456519	0.2323941137269101	-0.25265363765549964	-0.08879219899667841	0.727009731456	0.957167318493	0.628827692687	0.66743649171	0.202104162379	0.412754243182	0.412748894176	0.747262025795	0.0531706589121	0.519249062249	0.777966336216	0.476688253492	0.679490290496	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr20:22566058..22566172,-__1578.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:22566058..22566172,-__1578.1.0.0	rs2277764	-0.9731490621382692	-1.0144322626005342	-0.9278528806718396	-1.259763467184532	-1.1356782503046396	-1.056191841522728	-1.1772470452095836	-0.8970729182479062	-1.25286629484809	-0.9930416255247223	-1.0492231842606112	-1.0846139260669037	-1.0684277298816967	-0.9652460176814668	-0.8689269427113967	-1.0119827490700355	-1.1553263570289798	-1.0697288109534608	-0.9605176676596324	-1.1079738890064437	-0.7638172853523099	-0.9835130914947796	-1.0673272398700036	-0.9734681454418588	-0.8613678213116237	-0.982433001465166	0.007903044456802455	0.1455053198891375	-0.08412986839819592	0.10443711015555213	0.0659494393511788	0.09567417386309562	0.0692731562031399	0.1332556328955964	0.26935320335331037	-0.07428561434528125	0.07575503881875245	0.22324610475527995	0.0859947284165307	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr20:23618557..23618671,-__1579.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:23618557..23618671,-__1579.1.0.0	rs73318135	0.6715547658429342	1.0192248897594562	0.5230380130876308	0.3631289879372547	0.7093297417865935	0.9757923128780832	0.4596155531945002	0.5491272591340634	0.6109457416750302	0.7633066470589598	0.8245152327549147	0.659465759255258	0.6774204086970564	1.1373053697823492	1.2537058713426958	0.8919548769905861	0.9117175627129342	0.7793857052414517	1.177641611602526	1.1322217954143623	0.8364073456110079	0.7867766839368535	0.7889431579618651	0.949238241002378	1.3657438726501308	1.0009201745207617	0.46575060393941503	0.2344809815832396	0.3689168639029553	0.5485885747756796	0.0700559634548582	0.20184929872444268	0.6726062422198621	0.2872800864769446	0.17583094226182328	0.025636510902905307	0.1247230082474633	0.7062781133948728	0.32349976582370515	0.136115392203	0.276771967065	0.581967350665	0.0583274625199	0.468411351413	0.554657938956	0.320413072024	0.519249062249	0.628827692687	0.536806685117	0.248198866138	0.609889042629	0.163705822091	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr20:23618557..23618671,-__1579.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:23618557..23618671,-__1579.1.0.0	rs71334202	0.6715547658429342	1.0192248897594562	0.5230380130876308	0.3631289879372547	0.7093297417865935	0.9757923128780832	0.4596155531945002	0.5491272591340634	0.6109457416750302	0.7633066470589598	0.8245152327549147	0.659465759255258	0.6774204086970564	1.6070278318748525	1.4190128335120953	0.9972080237949827	0.5944999648603246	1.6106640395319685	1.260552990195628	1.0325055176438904	1.3629638144919394	1.3272341500358482	1.2269217791937845	1.363543076401242	1.3868021949000615	1.2657446847030516	0.9354730660319184	0.39978794375263904	0.474170010707352	0.23137097692306996	0.901334297745375	0.28476067731754484	0.5728899644493902	0.813836555357876	0.716288408360818	0.46361513213482475	0.5390278436463273	0.7273364356448035	0.5883242760059949	0.0187859264625	0.105664631095	0.361218104761	0.216719559135	0.0374126139833	0.253741740693	0.116187990183	0.237368605078	0.0267271087754	0.170821264488	0.0201846528804	0.129198935732	8.67501809602e-06	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.00726966516446	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr20:23618557..23618671,-__1579.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:23618557..23618671,-__1579.1.0.0	rs5030707	0.6715547658429342	1.0192248897594562	0.5230380130876308	0.3631289879372547	0.7093297417865935	0.9757923128780832	0.4596155531945002	0.5491272591340634	0.6109457416750302	0.7633066470589598	0.8245152327549147	0.659465759255258	0.6774204086970564	0.2633243982200546	0.6081176604215578	0.7690704838700689	0.047712321860574856	0.6147799452151419	0.3930488685044552	0.41016386323996024	0.5588807117283437	0.4303814932861987	0.5522449816970673	0.6910135604328786	0.6854731417140215	0.5020176191825271	-0.40823036762287956	-0.41110722933789845	0.24603247078243817	-0.31541666607667984	-0.09454979657145157	-0.582743444373628	-0.04945168995453997	0.009753452594280398	-0.18056424838883156	-0.21106166536189253	-0.13350167232203602	0.02600738245876355	-0.17540278951452962	0.397602565759	0.0785847853765	0.493479697885	1.0	0.662555609067	0.333666485083	0.967868365621	0.60051573606	0.696989544957	0.572794651112	0.919784795402	0.412754243182	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr20:23618557..23618671,-__1579.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:23618557..23618671,-__1579.1.0.0	rs73318135,rs71334202,rs5030707	0.6715547658429342	1.0192248897594562	0.5230380130876308	0.3631289879372547	0.7093297417865935	0.9757923128780832	0.4596155531945002	0.5491272591340634	0.6109457416750302	0.7633066470589598	0.8245152327549147	0.659465759255258	0.6774204086970564	1.5480938531355308	1.6966027925671086	1.3310304316196695	1.2687521823299257	1.4757449494374142	1.560620604094673	1.1894853470954683	0.9584139932743203	1.4103294993594842	1.286997458093716	1.2816292806962335	1.2642944871246635	1.3559995732356838	0.8765390872925967	0.6773779028076523	0.8079924185320387	0.905623194392671	0.7664152076508207	0.5848282912165899	0.7298697939009681	0.40928673414025696	0.7993837576844539	0.5236908110347562	0.4571140479413188	0.6048287278694056	0.6785791645386273	0.00849533044186	0.00372807519702	0.226876581559	0.0638838408606	0.00153065306427	0.0276615481105	0.0374147936077	0.119339994516	0.00251850159852	0.0148073726126	0.0959193233604	0.0531733827136	1.36542449291e-11	1	0.753071189799	1	1	0.313783878175	1	1	1	0.518811329295	1	1	1	3.0995135989e-09	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr20:25228655..25228769,+__1580.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:25228655..25228769,+__1580.1.0.0	rs6132822	-0.5729701546115576	-0.4531675625762186	0.734169275720975	0.36509409389063374	-0.8659322426784235	0.6515997118476916	0.04017501971903427	0.26953930172783525	0.2120159957573564	0.5864601013467181	-0.2577397744484986	2.515581024870038	0.2687353992137987	1.3634545431120377	1.2206595993990417	-0.19032464394324367	-0.09515755542216066	1.3185172712253208	1.3167762829478389	1.2485706213597327	0.3501606059849576	1.5904841882268852	-0.1971974886668424	2.0209079478295604	0.11589415274116366	0.8385621270661909	1.9364246977235955	1.6738271619752603	-0.9244939196642187	-0.4602516493127944	2.1844495139037443	0.6651765711001473	1.2083956016406985	0.08062130425712233	1.3784681924695288	-0.7836575900135605	2.278647722278059	-2.3996868721288744	0.5698267278523924	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr20:32077843..32077957,+__1582.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:32077843..32077957,+__1582.1.0.0	rs187449369	0.9876106735567894	2.123948203749794	-0.895115550707799	0.04737149688945941		-1.9597876669159116	-0.20259529107404972	0.3114428863169316	1.5186367348240657		-0.9218039466865425	-1.3873803032732281	-0.037767276332049085	2.5701483209328657	1.9680117784178552	2.4614306218556736	2.3537584917386103	2.840513800803804	2.692551357435838	1.8402785999493585	1.7139588630091875	0.1750010127072605	0.5488105332224527	2.6769073379525805	0.7321907895009382	1.881130125627202	1.5825376473760762	-0.15593642533193863	3.3565461725634727	2.306386994849151		4.6523390243517495	2.042873891023408	1.402515976692256	-1.3436357221168052		3.598711284639123	2.119571092774166	1.9561909936820658	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr20:32077843..32077957,+__1582.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:32077843..32077957,+__1582.1.0.0	rs75667555	0.9876106735567894	2.123948203749794	-0.895115550707799	0.04737149688945941		-1.9597876669159116	-0.20259529107404972	0.3114428863169316	1.5186367348240657		-0.9218039466865425	-1.3873803032732281	-0.037767276332049085	-0.010665582066617309	0.8469110759424783			1.5875976548848603	0.2525846984017713	0.14219728302214762	0.5880950563680517	-2.570849455549169	-0.4009385791848159	-0.870554673186599	-1.0649259852409492	-0.15005485066088411	-0.9982762556234067	-1.2770371278073156				2.212372365317683	0.34479257409619735	0.2766521700511201	-4.0894861903732345		0.05124927349994357	0.322454318032279	-0.3946598591008418	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr20:32077843..32077957,+__1582.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:32077843..32077957,+__1582.1.0.0	rs187449369,rs75667555	0.9876106735567894	2.123948203749794	-0.895115550707799	0.04737149688945941		-1.9597876669159116	-0.20259529107404972	0.3114428863169316	1.5186367348240657		-0.9218039466865425	-1.3873803032732281	-0.037767276332049085	0.011587594041613173	-1.32394189082141	-0.4859271844767923	0.7619456224390336	0.43057625093229596	-0.46015314079590813	0.9354399838732532	-0.7729340532231417	-0.4933579431730415	0.3676144961488836	-0.012656503298855842	-1.2332741307159407	-0.18959007492250088	-0.9760230795151763	-3.447890094571204	0.40918836623100674	0.7145741255495742		1.4996345261200035	1.138035274947303	-1.0843769395400733	-2.011994677997107		0.9091474433876867	0.15410617255728742	-0.26955988828306987	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr20:3776356..3776470,+__1583.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:3776356..3776470,+__1583.1.0.0	rs3761219	-0.6282040777938563	-0.0585839090127713	-0.5844260866781674	-0.0769989487051816	-0.4650856187951833	-0.0827480567285122	-0.4912312238083518	-0.4107620895066754	-0.5736248885760636	0.26258717698786144	-0.25663286893510595	-0.3239347047096781	-0.30747044135514046	-0.2377560427843493	-0.09670326239537752	-0.02029747053654432	-0.021361940724117782	-0.028574296632303414	-0.02107572454495619	-0.4955184321261447	-0.27004214289392126	-0.2574294144818752	0.14039279174240618	-0.26794722615145466	0.027991858463636703	-0.12902677525541678	0.39044803500950703	-0.03811935338260622	0.5641286161416231	0.05563700798106382	0.43651132216287986	0.06167233218355601	-0.00428720831779289	0.14071994661275417	0.31619547409418847	-0.12219438524545526	-0.011314357216348714	0.35192656317331483	0.1784436660997237	0.444064484515	0.88258056334	0.0286240283844	0.662555609067	0.13967914143	0.554657938956	0.493479697885	0.978575937473	0.657696241675	0.701958331003	0.375513989452	0.460209502412	0.629927015475	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr20:3776356..3776470,+__1583.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:3776356..3776470,+__1583.1.0.0	rs3761220	-0.6282040777938563	-0.0585839090127713	-0.5844260866781674	-0.0769989487051816	-0.4650856187951833	-0.0827480567285122	-0.4912312238083518	-0.4107620895066754	-0.5736248885760636	0.26258717698786144	-0.25663286893510595	-0.3239347047096781	-0.30747044135514046	-0.4161464113414017	-0.2455833159912235	-0.3255338139908817	-0.3779363701754537	-0.2577491575020339	-0.6990384685710979	-0.48468367133358736	-0.3741569610266182	-0.252253743824459	-0.3355616118240809	-0.09678964385241033	-0.7608971851713249	-0.38552752955038105	0.21205766645245466	-0.1869994069784522	0.2588922726872857	-0.3009374214702721	0.20733646129314937	-0.6162904118425857	0.006547552474764462	0.0366051284800572	0.32137114475160466	-0.5981487888119423	0.1598432250826956	-0.43696248046164676	-0.07805708819524061	0.706946403854	0.967868733231	0.946473618223	0.119339994516	0.468411351413	0.129198935732	0.90381429355	0.279742372288	0.935789553219	0.0412580447575	0.301187193336	0.0224514477182	0.453602211666	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr20:3776356..3776470,+__1583.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:3776356..3776470,+__1583.1.0.0	rs3761219,rs3761220	-0.6282040777938563	-0.0585839090127713	-0.5844260866781674	-0.0769989487051816	-0.4650856187951833	-0.0827480567285122	-0.4912312238083518	-0.4107620895066754	-0.5736248885760636	0.26258717698786144	-0.25663286893510595	-0.3239347047096781	-0.30747044135514046	-0.2938750150473609	-0.13927917266703171	0.07941827925919663	0.14066840892270233	0.30156627323048085	-0.2285274259913509	0.08706990327339464	-0.3181068364505504	0.2691242420228805	-0.18179701985511576	0.2638346051982978	0.05429003667946404	0.00286552321458393	0.33432906274649543	-0.08069526365426041	0.6638443659373641	0.21766735762788392	0.7666518920256642	-0.1457793692628387	0.5783011270817464	0.09265525305612504	0.8427491305989441	-0.4443841968429772	0.5204674741334038	0.37822474138914214	0.3103359645697244	0.519249062249	0.967868733231	0.0120431385799	0.957167318493	0.00389134425826	0.914457985151	0.125844655769	0.63839046467	0.333666485083	0.164611994543	0.104229562843	0.619322774121	0.1867578152	1	1	1	1	0.797725572943	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr20:3776877..3776991,+__1584.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:3776877..3776991,+__1584.1.0.0	rs6116042	-0.6299016717869247	-0.9266884663474242	-0.5981904988492206	-1.5437118893512092	-1.1146698165380566	-0.7922881329154171	-1.003635308071906	-0.6616879327682319	-0.6918654247221362	-1.0355558425604539	-0.9440599129631264	-0.866083452815926	-0.9006948624741695	-1.052065923497537	-0.8497405706576879	-1.3484415128605685	-1.108772158996934	-0.9495153172871108	-1.2898624068223916	-1.054761676601362	-1.135075231292363	-1.3830804501806166	-1.0511481923913306	-0.8983524734446974	-0.7246822022087723	-1.0704581763534475	-0.4221642517106122	0.07694789568973626	-0.7502510140113479	0.43493973035427524	0.16515449925094583	-0.4975742739069745	-0.05112636852945607	-0.4733872985241312	-0.6912150254584805	-0.015592349830876762	0.04570743951842904	0.1414012506071537	-0.16976331387927823	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr20:62372641..62372755,+__1585.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr20:62372641..62372755,+__1585.1.0.0	rs4809221	-0.7482664998409597	-0.818879907017199	-1.0432123879332076	-1.0285569061005042	-0.7538286306698011	-0.8734483012085716	-0.5322395912367518	-0.5126729068244946	-0.4032467026541318	-0.7082321547376451	-0.3379044411998219	-0.5417863040368629	-0.6918562277883292	-0.6547628540177608	-0.6188731103362063	-0.7196663728019571	-0.5278581729578206	-0.3446169998211305	-0.5426624781736521	-0.474530840330443	-0.07300417532293164	-0.6969268474284539	-0.4846056195436284	-0.8974816744665013	-0.8305671994795636	-0.572129695390004	0.09350364582319892	0.20000679668099275	0.3235460151312505	0.5006987331426836	0.4092116308486706	0.33078582303491955	0.05770875090630878	0.439668731501563	-0.2936801447743221	0.2236265351940167	-0.5595772332666794	-0.2887808954427007	0.11972653239832519	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.861430881609	0.809021331888	0.85089220831	0.361218104761	0.428242856315	0.672324307433	NA__no_active_tile	0.428242856315	0.216719559135	0.75443970302	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:30445916..30446030,-__1586.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:30445916..30446030,-__1586.1.0.0	rs2070610	1.9306121218747763	1.9810484590103987	1.5320842145534752	1.2818129322210814	1.5939420603746466	1.6885564541232878	1.4230634920618304	1.6809714591436817	1.7864732461419845	1.7791357569895765	1.6500080976897649	2.127872217896762	1.704631709340105	1.5002874308148413	1.676956366923391	1.567031642883998	1.5433127321356288	1.7327892201282757	1.771186638867172	1.7354519743593635	1.7324456245611588	1.573545001914109	1.5602816894333364	1.7666973161446942	1.8937494317709223	1.6711445891614074	-0.430324691059935	-0.3040920920870078	0.03494742833052289	0.2614997999145474	0.13884715975362916	0.08263018474388417	0.31238848229753313	0.05147416541747707	-0.21292824422787548	-0.21885406755624004	0.1166892184549293	-0.2341227861258397	-0.033487120178697906	0.0932701621097	0.320413072024	0.706946403854	0.628827692687	0.412754243182	0.412754243182	0.595849425807	0.354199901149	0.170821264488	0.125844655769	0.301187193336	0.270885072145	0.0867488016608	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:30445916..30446030,-__1586.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:30445916..30446030,-__1586.1.0.0	rs2012645	1.9306121218747763	1.9810484590103987	1.5320842145534752	1.2818129322210814	1.5939420603746466	1.6885564541232878	1.4230634920618304	1.6809714591436817	1.7864732461419845	1.7791357569895765	1.6500080976897649	2.127872217896762	1.704631709340105	1.6204448511357006	1.5246668186075654	1.0481831067122074	1.3238084410183124	1.5895711789678149	1.4954221972159822	1.2699629921196736	1.7328569406894143	1.3972810131602318	1.5623532637920532	1.5619572934660682	1.4589997205875125	1.465458984789378	-0.3101672707390757	-0.45638164040283336	-0.48390110784126783	0.04199550879723102	-0.004370881406831728	-0.19313425690730557	-0.1531004999421568	0.05188548154573258	-0.38919223298175276	-0.2167824931975233	-0.08805080422369671	-0.6688724973092495	-0.23917272455072744	0.0426112802219	0.0658387268341	0.0856734395523	0.581963029585	0.0258200569765	0.0499532058383	0.420456664513	0.160571027722	0.119339994516	0.0361990958252	0.113101776132	0.00175684955224	1.30717991671e-06	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0010954167702	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr21:30445916..30446030,-__1586.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:30445916..30446030,-__1586.1.0.0	rs2070610,rs2012645	1.9306121218747763	1.9810484590103987	1.5320842145534752	1.2818129322210814	1.5939420603746466	1.6885564541232878	1.4230634920618304	1.6809714591436817	1.7864732461419845	1.7791357569895765	1.6500080976897649	2.127872217896762	1.704631709340105	0.9801918245291321	0.9158051675125018	0.7681212601975564	0.4878065563742814	0.6711109629212897	0.8405107304935712	1.185676175920053	1.3241004904033036	1.0282662200932557	1.0980875678114808	0.9790636939284166	0.9899554313529818	0.9390580067948188	-0.9504202973456441	-1.0652432914978969	-0.7639629543559188	-0.7940063758468	-0.9228310974533569	-0.8480457236297166	-0.23738731614177744	-0.35687096874037816	-0.7582070260487288	-0.6810481891780957	-0.6709444037613482	-1.13791678654378	-0.7655737025452868	0.00993701022923	0.00668210963275	0.0216734048733	0.02911414697	0.000751093855117	0.00167824394514	0.0583274625199	0.0638899216795	0.00628638586805	0.001756635469	0.00784715402968	0.00133155906714	5.22179088981e-17	1	1	1	1	0.153974240299	0.337327032974	1	1	1	0.365380177551	1	0.274301167831	1.18534653199e-14	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:34697198..34697312,+__1587.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:34697198..34697312,+__1587.1.0.0	rs2850015	0.5055235710918549	0.7062145402121184	0.4704444392340772	0.4072241695728756	0.5393378245258571	0.4836642811143241	0.6126900941059228	0.5268161354418144	0.7259190539722626	0.6866939294973673	0.636886006552864	0.5931107451972017	0.5745437325432116	2.6985390160963516	3.003682442103988	2.552756396070117	2.531351299506289	2.473728565121419	2.7168473940129476	2.5144586930011585	2.8219033187318985	2.484358333932715	2.7835493389166333	2.7462087833847093	2.7316327816027997	2.6715846968734187	2.1930154450044967	2.29746790189187	2.08231195683604	2.1241271299334135	1.9343907405955618	2.2331831128986237	1.9017685988952358	2.295087183290084	1.7584392799604525	2.096855409419266	2.109322776831845	2.1385220364055977	2.097040964330207	1.77352777696e-08	1.0003458139e-09	1.31407978866e-07	5.8094165088e-08	6.10128619781e-09	1.02132784807e-06	9.09010852208e-09	9.98335414644e-06	6.10128619781e-09	8.39899322416e-09	5.1947018217e-09	5.52754458971e-10	6.27996509916e-80	1.25565766609e-05	7.44257285542e-07	9.7898944255e-05	4.28153996698e-05	4.71019294471e-06	0.000780294475925	6.71759019782e-06	0.00725789846446	4.71629423091e-06	6.59320968096e-06	3.99472570089e-06	4.30595723538e-07	5.2626107531e-77	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:34697198..34697312,+__1587.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:34697198..34697312,+__1587.1.0.0	rs115105316	0.5055235710918549	0.7062145402121184	0.4704444392340772	0.4072241695728756	0.5393378245258571	0.4836642811143241	0.6126900941059228	0.5268161354418144	0.7259190539722626	0.6866939294973673	0.636886006552864	0.5931107451972017	0.5745437325432116	0.7657973118756233	0.7444561951714913	0.7625637915421479	0.5479164022999697	0.8685392803124239	0.7823876603016064	0.6608282168969071	0.6451357004948957	0.9564921192863438	0.9315045430868063	0.7820195852791615	0.6854697913796226	0.7610925498272499	0.2602737407837684	0.03824165495937293	0.29211935230807073	0.14069223272709414	0.3292014557865668	0.29872337918728237	0.048138122790984283	0.11831956505308128	0.23057306531408117	0.244810613589439	0.1451335787262975	0.09235904618242086	0.1865488172840383	0.188220673538	0.554657938956	0.154655491485	0.732052639825	0.0399413890972	0.382791178922	0.978575692288	0.79863356553	0.265084565602	0.0350255264852	0.216709037621	0.333666485083	0.125010110008	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr21:34697198..34697312,+__1587.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:34697198..34697312,+__1587.1.0.0	rs2850015,rs115105316	0.5055235710918549	0.7062145402121184	0.4704444392340772	0.4072241695728756	0.5393378245258571	0.4836642811143241	0.6126900941059228	0.5268161354418144	0.7259190539722626	0.6866939294973673	0.636886006552864	0.5931107451972017	0.5745437325432116	2.6155713712921127	3.0264276941351826	2.623092074407941	2.4344205901384686	2.4856502060340118	2.8448052432086186	2.6165888618498307	2.9221795417742906	2.7992261936905187	2.9474538529014853	2.7566006032862505	2.886610064629255	2.746552191445664	2.110047800200258	2.3202131539230644	2.1526476351738637	2.027196420565593	1.9463123815081547	2.3611409620942947	2.003898767743908	2.3953634063324762	2.0733071397182563	2.260759923404118	2.1197145967333864	2.293499319432053	2.172008458902452	5.52754458971e-10	3.59934781305e-10	5.1947018217e-09	1.75892558936e-07	1.26262090221e-10	7.76607345153e-10	7.15823092226e-09	5.88658815831e-07	3.6020412458e-11	1.79534902262e-10	9.09364429293e-09	1.05773099098e-10	5.64696363488e-93	1.0723436504e-07	7.27068258236e-08	1.03374566252e-06	3.32436936388e-05	2.58837284953e-08	1.56098076376e-07	1.43164618445e-06	0.000114788469087	7.42020496636e-09	3.73432596705e-08	1.86419708005e-06	2.17892584141e-08	1.28186074512e-90	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:34775656..34775770,+__1588.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:34775656..34775770,+__1588.1.0.0	rs17882748	0.14481922919811874	-0.7237050000352129	0.3986527159068477			-0.8034860644692579	0.15451826903607696	1.7743508761901563	-0.6799757272291042	-0.5766828500908949		0.1580643640824278	-0.017049354156760264	0.8964762748794045	-0.3215153527836649	0.24055498734038608	0.8277164579433749	-0.4755936909338134	0.5084444540874131	-0.9975677961034464	-0.4967679648366972	-0.21281229931838197	-0.11993311191147273	0.2523757836757045	0.5206452943611388	0.05183525303332879	0.7516570456812858	0.402189647251548	-0.15809772856646162			1.311930518556671	-1.1520860651395233	-2.2711188410268535	0.4671634279107222	0.4567497381794222		0.362580930278711	0.018996519236169043	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:34775698..34775812,+__1589.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:34775698..34775812,+__1589.1.0.0	rs17882748	-0.031123869901899727	0.1482297914495179	0.878614676084835	1.4945812918705066	-0.8059998784822948	-0.08859848630874456	0.1000652327035625	0.441575995080306	1.0344834218542924	0.40965195893345185	0.36943762842033023	-0.7465085700105981	0.26703409930777217	0.7613164937723229	0.03777764781376816	-0.19254749873044474	-0.02883563608010281	0.02764056958443117	0.8273314573586451	0.09400455101489984	-1.1900704882033744	0.3877155527352718	-1.4341136007119646	-0.01793213008222727	-0.2637599871063052	-0.08262275571958999	0.7924403636742227	-0.11045214363574973	-1.0711621748152798	-1.5234169279506093	0.833640448066726	0.9159299436673897	-0.006060681688662667	-1.6316464832836803	-0.6467678691190206	-1.8437655596454166	-0.3873697585025575	0.4827485829042929	-0.34965685502736216	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:37432813..37432927,-__1590.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:37432813..37432927,-__1590.1.0.0	rs7280136	2.4332345233279025	2.9148121639968787	2.3599803344071315	2.264515303271659	2.888039613184965	2.126246434671157	1.7490472631775877	2.746038708263264	2.5306857909352	2.5829661691615264	2.5175357647325844	2.143704125677758	2.438067182900635	2.2702877494601514	2.5775539770346296	1.938045918112087	1.4003254443827335	2.0795274333733635	2.6606728454920967	1.8964675012387404	1.950323364257327	1.9224549569329832	2.384555502105719	1.9011513645120228	1.6257512688506008	2.050593110479371	-0.16294677386775103	-0.3372581869622491	-0.42193441629504447	-0.8641898588889256	-0.8085121798116015	0.5344264108209398	0.14742023806115268	-0.795715344005937	-0.6082308340022169	-0.19841066705580745	-0.6163844002205616	-0.5179528568271572	-0.38747407242126325	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr21:37432813..37432927,-__1590.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:37432813..37432927,-__1590.1.0.0	rs7280136,rs117080190	2.4332345233279025	2.9148121639968787	2.3599803344071315	2.264515303271659	2.888039613184965	2.126246434671157	1.7490472631775877	2.746038708263264	2.5306857909352	2.5829661691615264	2.5175357647325844	2.143704125677758	2.438067182900635	2.5126562073617333	3.329137404756311	2.469295945063057	2.4249160788603037	2.40395221880777	2.6397018040163625	2.2831692949900826	2.3453091567770668	2.8658175522293465	2.3535109521316766	2.5095400030039032	3.4196354527412325	2.62972017256157	0.07942168403383087	0.4143252407594322	0.10931561065592543	0.16040077558864452	-0.48408739437719506	0.5134553693452055	0.5341220318124948	-0.40072955148619727	0.33513176129414646	-0.22945521702984983	-0.007995761728681217	1.2759313270634745	0.1916529896609359	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:38444804..38444918,-__1591.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:38444804..38444918,-__1591.1.0.0	rs73200245	-0.7614154347853155	-1.3615886711908094	-1.3230413708138777	-1.6497137775620634	-1.4252877004283153	-1.455741254257653	-1.0269977603354077	-1.7120814330018979	-1.6848295735140146	-1.4190324174460782	-1.548285135207488	-1.53795042587518	-1.408830412868175	-1.151115433809909	-1.1450955813531556	-1.6336678679909598	-1.3083391697634439	-1.2599996249848875	-1.295320073776261	-1.29286423042265	-1.178130567266896	-1.0110341386446815	-1.3495089932750872	-1.2639531873120484	-1.1982781572588879	-1.257275585488239	-0.3896999990245935	0.2164930898376538	-0.310626497177082	0.3413746077986195	0.16528807544342783	0.1604211804813922	-0.2658664700872424	0.5339508657350018	0.6737954348693331	0.069523424170991	0.2843319478954396	0.3396722686162921	0.15155482737993609	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:38444804..38444918,-__1591.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:38444804..38444918,-__1591.1.0.0	rs2298682	-0.7614154347853155	-1.3615886711908094	-1.3230413708138777	-1.6497137775620634	-1.4252877004283153	-1.455741254257653	-1.0269977603354077	-1.7120814330018979	-1.6848295735140146	-1.4190324174460782	-1.548285135207488	-1.53795042587518	-1.408830412868175	-1.2886314729326835	-0.994028272418504	-1.3732490764966419	-0.9021613097977466	-1.6361448018760907	-1.2529122466609368	-1.4400950895511087	-1.4703920334758198	-1.5758232146977216	-1.2329156021356842	-1.4898570141352856	-1.4071692648315366	-1.3386149499174802	-0.5272160381473681	0.3675603987723054	-0.050207705682764114	0.7475524677643168	-0.21085710144777536	0.2028290075967163	-0.41309732921570097	0.24168939952607804	0.10900635881629306	0.18611681531039403	0.05842812107220241	0.13078116104364335	0.07021546295069507	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr21:38444804..38444918,-__1591.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:38444804..38444918,-__1591.1.0.0	rs73200245,rs2298682	-0.7614154347853155	-1.3615886711908094	-1.3230413708138777	-1.6497137775620634	-1.4252877004283153	-1.455741254257653	-1.0269977603354077	-1.7120814330018979	-1.6848295735140146	-1.4190324174460782	-1.548285135207488	-1.53795042587518	-1.408830412868175	-0.7778237781514442	-1.0701155100962874	-1.0487312601062797	-1.3427387012048169	-1.207502709525642	-1.206543539668259	-1.359832029644859	-1.4915893970661778	-1.2255421825278072	-1.4125687692305602	-1.1430468937659477	-1.449723181668111	-1.227979829388016	-0.01640834336612873	0.29147316109452204	0.27431011070759803	0.3069750763572465	0.21778499090267323	0.24919771458939421	-0.33283426930945126	0.2204920359357201	0.4592873909862074	0.006463648215518036	0.4052382414415403	0.08822724420706884	0.18085058348015903	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:38444987..38445101,-__1592.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:38444987..38445101,-__1592.1.0.0	rs2298683	-1.7694030630350097	-1.4041898995688458	-1.952242811753235	-1.6712308127930384	-1.6723367385622592	-1.4208735584446095	-1.6735488571961672	-1.6040335301869573	-1.154965359046985	-1.3101306637055268	-1.4206304212562688	-1.6438797427289435	-1.558122121523154	-1.5651658608681065	-1.086097665937956	-1.1006311955819807	-1.7483533473769806	-0.9629499776452171	-1.6713474437228193	-1.7709021477410702	-1.412512643934683	-1.45909178959898	-1.3992094966030852	-1.3567971464510296	-1.4225860402925423	-1.4129703963128708	0.20423720216690322	0.3180922336308898	0.8516116161712544	-0.07712253458394214	0.7093867609170421	-0.2504738852782098	-0.09735329054490305	0.19152088625227437	-0.30412643055199484	-0.08907883289755847	0.06383327480523926	0.22129370243640123	0.145151725210283	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:38444987..38445101,-__1592.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:38444987..38445101,-__1592.1.0.0	rs115864164	-1.7694030630350097	-1.4041898995688458	-1.952242811753235	-1.6712308127930384	-1.6723367385622592	-1.4208735584446095	-1.6735488571961672	-1.6040335301869573	-1.154965359046985	-1.3101306637055268	-1.4206304212562688	-1.6438797427289435	-1.558122121523154	-1.0481065210874179	-1.456395847131	-1.1639169673257048	-1.4414916301667988	-1.458831240271366	-1.317827882750535	-1.4346037565191458	-1.6640828576101272	-1.202741236531294	-1.2289944442890697	-1.4094266330893357	-0.9933741900442272	-1.3183161005680017	0.7212965419475919	-0.05220594756215413	0.7883258444275303	0.2297391826262396	0.21350549829089327	0.10304567569407452	0.23894510067702135	-0.06004932742316993	-0.04777587748430889	0.0811362194164571	0.011203788166933126	0.6505055526847163	0.23980602095515202	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr21:38444987..38445101,-__1592.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:38444987..38445101,-__1592.1.0.0	rs7280542,rs2298683,rs115864164,rs2298684	-1.7694030630350097	-1.4041898995688458	-1.952242811753235	-1.6712308127930384	-1.6723367385622592	-1.4208735584446095	-1.6735488571961672	-1.6040335301869573	-1.154965359046985	-1.3101306637055268	-1.4206304212562688	-1.6438797427289435	-1.558122121523154	-1.5666969560019695	-1.3791110495937136	-1.50431102443122	-1.3128332957330902	-1.489149927974565	-1.76540262697346	-1.1497214127911108	-1.199408180826278	-1.4941063320101882	-1.517292384488877	-1.3015512886563878	-1.0087563983159995	-1.3906950731497385	0.20270610703304026	0.02507884997513221	0.4479317873220152	0.35839751705994827	0.18318681058769415	-0.34452906852885046	0.5238274444050564	0.4046253493606793	-0.3391409729632031	-0.20716172078335027	0.11907913259988101	0.635123344412944	0.16742704837341557	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:40555305..40555419,-__1593.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:40555305..40555419,-__1593.1.0.0	rs13052882	0.36111036280140296	0.14947117115667644	-0.24896168964920273	0.3627713195839929	-0.387088999082496	-0.3180551503265219	-0.311801777774257	-0.11491290291438855	-0.2753597180455473	-0.1093846536797905	0.16197998571649536	-0.013436633026733712	-0.06197239043669748	0.8818159338601597	-0.10057608474535383	0.30791795220795604	-0.3314302988695625	1.6216216748674803	0.7990869622770107	0.3212537362541679	0.4660938237303908	0.010891974694762477	0.18846807510230434	0.5474953724535693	0.09274815371811254	0.4004489396292498	0.5207055710587567	-0.25004725590203025	0.5568796418571588	-0.6942016184535553	2.0087106739499765	1.1171421126035326	0.6330555140284249	0.5810067266447794	0.2862516927403098	0.29785272878209484	0.3855153867370739	0.10618478674484626	0.46242133006594727	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:40555305..40555419,-__1593.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:40555305..40555419,-__1593.1.0.0	rs59618845	0.36111036280140296	0.14947117115667644	-0.24896168964920273	0.3627713195839929	-0.387088999082496	-0.3180551503265219	-0.311801777774257	-0.11491290291438855	-0.2753597180455473	-0.1093846536797905	0.16197998571649536	-0.013436633026733712	-0.06197239043669748	0.2935441234112958	0.483720309720335	0.6395748183849782	1.734776765931121	0.6012600470157794	-0.44257797334124327	-0.30647120877749184	-0.44221771744904254	0.32211849813687404	0.4535730251406906	0.145155747310076	-0.093514126264194	0.2824118591015982	-0.06756623939010714	0.33424913856365857	0.8885365080341809	1.3720054463471283	0.9883490460982753	-0.1245228230147214	0.00533056899676515	-0.327304814534654	0.5974782161824214	0.5629576788204811	-0.016824238406419362	-0.08007749323746029	0.34438424953829566	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr21:40555305..40555419,-__1593.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:40555305..40555419,-__1593.1.0.0	rs13052882,rs59618845	0.36111036280140296	0.14947117115667644	-0.24896168964920273	0.3627713195839929	-0.387088999082496	-0.3180551503265219	-0.311801777774257	-0.11491290291438855	-0.2753597180455473	-0.1093846536797905	0.16197998571649536	-0.013436633026733712	-0.06197239043669748	-1.2093591037256708	0.07856832962967773	-0.5227910756816649	-1.6387797482602	-0.11120579439263824	-1.2640837946101375	-0.6131550830326742	0.3157841368674199	1.0247972682500477	-2.0134587123352468	0.159396771100301	0.6716683745249022	-0.42688486930549036	-1.5704694665270738	-0.0709028415269987	-0.2738293860324622	-2.001551067844193	0.2758832046898578	-0.9460286442836157	-0.3013533052584172	0.43069703978180846	1.300156986295595	-1.9040740586554563	-0.002583214616194346	0.685105007551636	-0.3649124788687928	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:42742369..42742483,+__1594.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:42742369..42742483,+__1594.1.0.0	rs2297279	-0.9606560162150503	-1.018807272427794	-0.9938424645947312	-0.827445519289631	-0.9943782363169744	-1.0254852711389475	-1.1773276146234628	-0.6890580489127036	-1.1334683288177414	-0.8958938953150624	-0.7950258596978196	-1.1510851961569784	-0.9718728102922415	-0.8365476109740376	-0.5682538249458433	-0.4906536187717482	-0.6216737692966112	-0.6338277558919039	-0.6222784337711291	-0.6506258619197258	-0.5239730165677747	-0.5028811365352301	-0.6095864985230804	-0.5561588362961505	-0.4590070811978697	-0.5896222870575921	0.12410840524101263	0.4505534474819506	0.5031888458229831	0.20577174999301973	0.36055048042507054	0.40320683736781837	0.526701752703737	0.16508503234492888	0.6305871922825113	0.2863073967919819	0.2388670234016691	0.6920781149591086	0.3822505232346493	NA__no_active_tile	0.0808926541269	0.0399413890972	0.132617817397	0.536806685117	0.172922942709	0.166665831608	NA__no_active_tile	0.0619890035232	0.793450583062	0.098612947331	0.0601351299193	0.00114385025953	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	0.958546517485	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr21:42798088..42798202,+__1595.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr21:42798088..42798202,+__1595.1.0.0	rs464138	0.4715158792533031	0.470286858769001	0.7496170806670919	1.0043164983639732	0.6072148570996202	0.9762232774983519	1.274485915973934	1.5138404362927709	0.7555271605663596	0.5273527394575157	0.7370563434429205	1.087308279717352	0.847895443925183	0.3445367749579473	0.5840581880249386	0.2048079469581721	0.07068440441387917	0.31280207126535	0.47841775045307955	0.5970843856868552	0.6689976495651585	0.4424252681358395	0.5936797822169037	0.532319179364794	0.5683516746279396	0.4498470896392381	-0.1269791042953558	0.11377132925593758	-0.5448091337089198	-0.933632093950094	-0.2944127858342702	-0.49780552704527237	-0.6774015302870787	-0.8448427867276124	-0.3131018924305201	0.06632704275938794	-0.20473716407812648	-0.5189566050894125	-0.39804835428594476	0.572794651112	0.226876581559	0.397602565759	0.364754193662	0.687084607526	0.696989544957	0.237368605078	0.43610705851	0.8931878581	0.444059269006	0.510577925344	0.412754243182	0.484541610913	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:20004220..20004334,-__1596.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:20004220..20004334,-__1596.1.0.0	rs2286480	1.0107572462011205	1.4514204941092608	0.601952289692768	-0.149486440583638	0.1413366418731091	0.01919463869186233	-0.7127122650628971	1.151631193360056	1.7665893874417289	0.2547844625088865	-0.4686252110450061	0.143167222109477	0.43416747160806063	-0.626591753361033	-0.6114597950024321	-0.0958842951692603	0.2411492620029147	-0.6105906082851017	-0.7838928323985016	0.6034125260599671	-1.7489040385500485	-2.0641119653868105	-1.122395584082708	-0.3860398774318244	-0.7085829137383037	-0.6594909896119284	-1.6373489995621535	-2.0628802891116926	-0.6978365848620284	0.39063570258655267	-0.7519272501582108	-0.8030874710903639	1.3161247911228642	-2.9005352319101045	-3.830701352828539	-1.3771800465915944	0.08258533361318171	-0.8517501358477807	-1.093658461219989	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr22:20004220..20004334,-__1596.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:20004220..20004334,-__1596.1.0.0	rs530521113,rs2286480	1.0107572462011205	1.4514204941092608	0.601952289692768	-0.149486440583638	0.1413366418731091	0.01919463869186233	-0.7127122650628971	1.151631193360056	1.7665893874417289	0.2547844625088865	-0.4686252110450061	0.143167222109477	0.43416747160806063	0.1276775545803255	0.7456940920641607	-0.08001740458940709	-1.386490097848852	-0.4104151956072185	0.2919768728590204	0.2657966824549781	-1.5942523694560093	0.6688895564075451	0.4585219960345903	0.2489008638555229	-0.9612408926545551	-0.13541319515832492	-0.883079691620795	-0.7057264020451001	-0.6819696942821751	-1.2370036572652139	-0.5517518374803276	0.2727822341671581	0.9785089475178752	-2.7458835628160654	-1.0976998310341837	0.20373753352570384	0.717526074900529	-1.1044081147640321	-0.5695806667663856	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:21984276..21984390,-__1597.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:21984276..21984390,-__1597.1.0.0	rs3747093	1.1195989811534186	1.6672711686466548	1.2799112858362196	1.6224969520778922	-0.5480643566896102	0.4129816393456302	2.2007366246801685	0.4275471925572176	0.5222613857263619	1.5836276575495989	0.3381820557922406	1.229359696297166	0.9879925235810797	0.8293418758726148	-0.3331117979187732	-1.2086849938910853	-1.3732637455209002	0.7200334467331494	0.2772572638320759	0.558648675049912	-0.2118033124690032	0.9362226539977798	-0.23620676783733774	-0.3681671437042531	-0.30736301661848686	-0.05975807187285898	-0.29025710528080384	-2.000382966565428	-2.4885962797273047	-2.9957606975987927	1.2680978034227595	-0.13572437551355432	-1.6420879496302565	-0.6393505050262208	0.4139612682714179	-1.8198344253869365	-0.7063491994964937	-1.5367227129156529	-1.0477505954539388	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:24999088..24999202,+__1598.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:24999088..24999202,+__1598.1.0.0	rs2073398	-0.4003759562137137	-0.3074704336300253	-0.2743002365543161	-0.763045452714068	-0.6834762410843115	-0.5427935415003254	-0.43817695910349685	-0.6904674156683461	-0.6019820602466337	-0.2881500049678608	-0.3074752231998336	-0.29739549042645264	-0.4662590846091154	-0.6272819117112449	-0.769939869524616	-0.7727703350956868	-0.8008275998603205	-0.6413835823033952	-0.8699545270738932	-0.6344353376656003	-1.0711197857791166	-0.7830018886576386	-0.9187972020343615	-0.5314686384938784	-0.6880104640105489	-0.7590825951841916	-0.22690595549753123	-0.4624694358945907	-0.4984700985413707	-0.0377821471462525	0.04209265878091628	-0.32716098557356776	-0.19625837856210349	-0.38065237011077047	-0.18101982841100495	-0.6306471970665007	-0.22399341529404476	-0.39061497358409625	-0.29282351057507644	0.951818833033	0.0316863885398	0.0267271087754	0.861430881609	0.408929232264	0.361218104761	0.248198866138	0.104229562843	0.809021331888	0.00668210963275	0.113101776132	0.0932701621097	0.0131882565886	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr22:24999088..24999202,+__1598.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:24999088..24999202,+__1598.1.0.0	rs2073398,rs73879095	-0.4003759562137137	-0.3074704336300253	-0.2743002365543161	-0.763045452714068	-0.6834762410843115	-0.5427935415003254	-0.43817695910349685	-0.6904674156683461	-0.6019820602466337	-0.2881500049678608	-0.3074752231998336	-0.29739549042645264	-0.4662590846091154	-0.9216774842293951	-0.7331161284077141	-0.8340243951651342	-0.8498960847569813	-0.8287216211072547	-0.6187121782516014	-1.017590421338104	-0.6635762194075486	-0.743096770907083	-0.8321464005136708	-0.5504352081877438	-0.7481917497497417	-0.7784320551684978	-0.5213015280156814	-0.4256456947776888	-0.559724158610818	-0.08685063204291332	-0.14524538002294318	-0.07591863675127597	-0.5794134622346071	0.0268911962607975	-0.14111471066044934	-0.54399639554581	-0.24295998498791022	-0.45079625932328904	-0.3121729705593825	0.472534754287	0.110080523892	0.0763307839553	0.460214637573	0.60051573606	0.946473618223	0.0399413890972	0.609889042629	0.788281320858	0.0198252990072	0.0986283746992	0.166665831608	0.0430680966914	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:32021734..32021848,-__1600.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:32021734..32021848,-__1600.1.0.0	rs11556539	-0.12316225575443296	0.0822112442765644	-0.09887389290364505	-0.004243501919148851	-0.04037880128491719	-0.09839213887392732	-0.10128868995673584	-0.19016797095184987	0.2032013691133041	-0.10156642181756383	0.1378086282306998	-0.09800149523988541	-0.036071160590128167	-0.24898684048949168	0.22643351071391593	-0.0704725251026804	-0.0828028933429808	0.12781390094285594	0.05522126609064473	-0.14573544958256926	-0.005433326088012381	-0.02670920093047329	-0.11151227192931168	0.1480498430414613	0.05194197250671134	-0.006849334514160856	-0.12582458473505873	0.14422226643735153	0.028401367800964653	-0.07855939142383195	0.16819270222777313	0.15361340496457204	-0.044446759625833415	0.18473464486383748	-0.2299105700437774	-0.009945850111747853	0.010241214810761484	0.14994346774659675	0.029221826075967308	0.978575937473	0.554657938956	0.829896383209	0.747262025795	0.0932701621097	0.727009731456	0.696989544957	0.63839046467	0.609889042629	0.706946403854	0.90381429355	0.8931878581	0.982528896419	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:32034427..32034541,-__1601.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:32034427..32034541,-__1601.1.0.0	rs76684125	-1.33032333895294	-1.4735434220343435	-1.6945358596450135	-1.3905885971954124	-1.1392903170091229	-1.3143430050330085	-1.457350133560095	-1.3838928050726964	-0.7507883021651264	-1.7696052502450257	-1.3301886358876012	-1.317865878380172	-1.3626929620983799	-0.9149931710812382	-1.578850476846017	-0.6817669067383951	-0.8935746864332355	-1.111872862868531	-1.4251720182755292	-0.8840043317865918	-0.5799096169129623	-1.17892751408665	-1.5573222717360613	-1.523457195714835	-1.1852254964457223	-1.1262563790771474	0.41533016787170185	-0.10530705481167346	1.0127689529066184	0.49701391076217694	0.027417454140591824	-0.1108290132425207	0.5733458017735031	0.8039831881597341	-0.4281392119215236	0.21228297850896438	-0.1932685598272339	0.1326403819344497	0.23643658302123235	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:32034427..32034541,-__1601.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:32034427..32034541,-__1601.1.0.0	rs9306268	-1.33032333895294	-1.4735434220343435	-1.6945358596450135	-1.3905885971954124	-1.1392903170091229	-1.3143430050330085	-1.457350133560095	-1.3838928050726964	-0.7507883021651264	-1.7696052502450257	-1.3301886358876012	-1.317865878380172	-1.3626929620983799	-0.6405805750523299	-0.6373536647264174	-1.2054627907545705	-0.8164374362901441	-0.7640047772817827	-0.5787335015205666	-1.0381273859778175	-0.4697528987383661	-0.588283194670652	-0.534049939803986	-0.8784736965237894	-0.8215131064600786	-0.7477310806500417	0.6897427639006102	0.8361897573079261	0.489073068890443	0.5741511609052683	0.37528553972734013	0.7356095035124419	0.4192227475822774	0.9141399063343303	0.16250510749447433	1.2355553104410397	0.4517149393638118	0.4963527719200934	0.6149618814483381	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr22:32034427..32034541,-__1601.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:32034427..32034541,-__1601.1.0.0	rs76684125,rs9306268,rs73881400	-1.33032333895294	-1.4735434220343435	-1.6945358596450135	-1.3905885971954124	-1.1392903170091229	-1.3143430050330085	-1.457350133560095	-1.3838928050726964	-0.7507883021651264	-1.7696052502450257	-1.3301886358876012	-1.317865878380172	-1.3626929620983799	-1.0396619392903508	-1.4406347730358022	-0.8336493681352376	-0.9193071191489985	-0.885343865652048	-0.8875273094157013	-0.3969227727285347	-0.6943723876273462	-1.4373895323835595	-1.1179159272448516	-0.6115024404695724	-1.453750832978413	-0.9764981890092012	0.2906613996625893	0.03290864899854129	0.8608864915097759	0.47128147804641385	0.25394645135707483	0.42681569561730714	1.0604273608315602	0.6895204174453502	-0.6866012302184331	0.6516893230001741	0.7186861954180288	-0.13588495459824101	0.38619477308917843	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:32870634..32870748,+__1602.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:32870634..32870748,+__1602.1.0.0	rs2072813	0.5533782224217906	0.6059626733861632	0.4840937030484489	0.22436732021824687	1.1482845963865034	0.7596538966598468	0.6329767698489138	-0.06535518587782715	0.8705658021931743	0.9871010243129654	0.7493771730512044	0.35203387436997713	0.6085366558349506	0.8576175748957148	0.3424447404097197	0.4398413370287261	0.7947710101193324	1.1452208084852695	0.8329606112211869	0.8109221018649976	0.2806611327570473	0.8427957897975243	0.4350682417987833	1.1261653600468624	1.0782063869576008	0.748889591281897	0.3042393524739242	-0.2635179329764435	-0.04425236601972282	0.5704036899010855	-0.00306378790123385	0.07330671456134008	0.17794533201608376	0.3460163186348745	-0.027770012395649912	-0.5520327825141822	0.37678818699565797	0.7261725125876237	0.14035293544694646	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:35653411..35653525,+__1603.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:35653411..35653525,+__1603.1.0.0	rs5755674	2.4245291737332035	2.8416698279817636	2.4702880351717944	2.376206003222058	2.5638851423905056	2.5336414739245448	2.613719358164462	2.7775658964480483	2.694827185336724	2.733359705626353	2.588108159098481	2.771926605341443	2.6158105472032815	2.2640012785061265	2.7486589105466646	2.1463200436075356	1.9775337311944594	2.1832340445948724	2.2022517540135866	2.2634711380974943	2.496895992737621	2.2307227000269076	2.316239557860965	2.536234015712247	2.507357662022533	2.3227434024100844	-0.160527895227077	-0.09301091743509904	-0.3239679915642588	-0.3986722720275986	-0.3806510977956332	-0.3313897199109581	-0.3502482200669679	-0.28066990371042744	-0.4641044853098162	-0.4171201477653881	-0.051874143386234195	-0.2645689433189098	-0.29306714479319734	0.0565651674203	0.288805731951	0.0174727290303	0.0125089884503	0.0362033618716	0.0129907246043	0.0198252990072	0.045430560235	0.0658387268341	0.00357181666747	0.563691144959	0.375513989452	3.84418228105e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	3.22142475152e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:38004967..38005081,+__1604.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:38004967..38005081,+__1604.1.0.0	rs13053965	0.06493162525598326	0.9910140880093572	-0.23708827048780304	-0.7948233406327821	-0.16645809972726336	-0.25349121743121805	0.6416740347099611	-1.5962109959477058	0.4459508447985127	-0.05271604664141222	0.16933443371103976	-0.44244181808330874	-0.10252706353888663	-0.4507492013196317	-0.4923198129129496	0.06621257723668572	-0.645467164072194	-0.3583300162135949	-0.23573100581473572	-0.3495064112123754	-0.759566587659957	-0.586355318238573	-0.2708707430515485	-0.06464883177651487	-0.7979192771231091	-0.4121043160132081	-0.515680826575615	-1.4833339009223068	0.30330084772448873	0.1493561765605882	-0.19187191648633153	0.017760211616482335	-0.9911804459223366	0.8366444082877488	-1.0323061630370858	-0.2181546964101363	-0.23398326548755463	-0.3554774590398003	-0.3095772524743216	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:41777866..41777980,+__1605.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:41777866..41777980,+__1605.1.0.0	rs2234058	0.7284330272264964	0.5987401853315992	0.32813123680493506	0.431243150851515	0.7495911385216235	0.8284220879046907	0.7908104043095107	1.212679741981633	0.8734600280637157	1.136039580695226	0.7891334073605571	0.8931649738846703	0.7799874135780144	0.6804916595539483	0.9101092631137471	0.8348986629931499	0.7116699127231461	0.8862522438957142	0.8212120504044844	0.904002742859741	1.1008888096138851	0.8957566369361376	0.8573039944240564	0.805377452244129	0.7718965313516342	0.8483216633428143	-0.047941367672548085	0.31136907778214784	0.5067674261882148	0.28042676187163107	0.1366611053740907	-0.007210037500206323	0.11319233855023036	-0.11179093236774795	0.022296608872421908	-0.27873558627116957	0.016244044883571895	-0.12126844253303615	0.06833424976480003	0.79863356553	0.368322877114	0.132622250874	0.0499532058383	0.978575937473	0.79863356553	0.591208103411	0.935789553219	0.76769033028	0.0906800339379	0.648013768535	0.412754243182	0.709131124513	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:41777866..41777980,+__1605.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:41777866..41777980,+__1605.1.0.0	rs2234059	0.7284330272264964	0.5987401853315992	0.32813123680493506	0.431243150851515	0.7495911385216235	0.8284220879046907	0.7908104043095107	1.212679741981633	0.8734600280637157	1.136039580695226	0.7891334073605571	0.8931649738846703	0.7799874135780144	1.1663558329674077	1.278499282338391	1.1325680938442082	0.9139239927231996	1.274287631794863	1.255928757816596	1.2520022639656492	1.4158021121765636	1.2899901212580505	1.3210182910409178	1.2519052135043456	1.3057632570747297	1.2381704042087436	0.43792280574091136	0.6797590970067917	0.8044368570392731	0.4826808418716846	0.5246964932732395	0.42750666991190533	0.4611918596561385	0.2031223701949305	0.41653009319433476	0.1849787103456919	0.46277180614378843	0.4125982831900594	0.45818299063072904	0.0426112802219	0.0327677521954	0.00654737116888	0.0156538458129	0.00883703695038	0.0129907246043	0.00480682187369	0.0103298859694	0.0168468410067	0.0249397487324	0.0168468410067	0.0531733827136	8.6741064023e-14	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	7.26890116513e-11	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr22:41777866..41777980,+__1605.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:41777866..41777980,+__1605.1.0.0	rs2234058,rs2234059	0.7284330272264964	0.5987401853315992	0.32813123680493506	0.431243150851515	0.7495911385216235	0.8284220879046907	0.7908104043095107	1.212679741981633	0.8734600280637157	1.136039580695226	0.7891334073605571	0.8931649738846703	0.7799874135780144	1.24986133501216	1.5307173631381268	1.2445252414383883	1.2005548959190582	1.2170517999381794	1.1513154483801582	1.3732840018984411	1.3646827119266984	1.2190321603467331	1.2373175573807123	1.2012087086852987	1.253924462491288	1.27028964054627	0.5214283077856635	0.9319771778065276	0.9163940046334532	0.7693117450675432	0.46746066141655584	0.32289336047546746	0.5824735975889305	0.15200296994506535	0.3455721322830174	0.10127797668548633	0.41207530132474157	0.36075948860661766	0.4903022269682557	0.000827700533168	1.84173011953e-05	0.000587432962331	0.000137117000352	0.0072436377838	0.0120431385799	0.00086866520518	0.0129907246043	0.00641629102443	0.0658387268341	0.0286240283844	0.00522462344006	2.01524626273e-21	0.160573903435	0.00372029484145	0.116899159504	0.0259151130665	1	1	0.173733041036	1	1	1	1	1	4.57460901639e-19	not sig	sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:41940330..41940444,-__1606.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:41940330..41940444,-__1606.1.0.0	rs11554327	1.6746455193116059	0.7304876810910069	0.8082630040833797	3.310188926444645	0.48450753200970464	0.5267761799077287	-0.11304344473065164	0.4309152815628203	1.9026734342860243	-0.119056812217191	0.5923734691379171	0.3149876244569756	0.878643199611997	0.5840157152590532	0.7036538380929545	0.17024388783202854	-1.3207170670110584	-1.2550773902456809	-0.21338322946265328	-0.375233446472285	-0.06968848114309541	-0.3247386996255621	-0.1971974886668424	-1.1472447221247914	0.0910675192985535	-0.279524963689115	-1.0906298040525528	-0.02683384299805247	-0.6380191162513511	-4.630905993455704	-1.7395849222553856	-0.740159409370382	-0.26219000174163337	-0.5006037627059157	-2.2274121339115864	-0.07814067644965139	-1.7396181912627084	-0.2239201051584221	-1.1581681633011123	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr22:41940330..41940444,-__1606.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:41940330..41940444,-__1606.1.0.0	rs11554327,rs482402	1.6746455193116059	0.7304876810910069	0.8082630040833797	3.310188926444645	0.48450753200970464	0.5267761799077287	-0.11304344473065164	0.4309152815628203	1.9026734342860243	-0.119056812217191	0.5923734691379171	0.3149876244569756	0.878643199611997	-0.14284926475466736	0.014125957722480376	-1.8697793647619387	-0.49490706330834955		-0.3485801791202696	0.11050766012114191	-1.9071472282886253	-0.8945813221363825	-0.6858273664122382	-0.8398929614964681	-1.7483533473769806	-0.8006622254374816	-1.8174947840662732	-0.7163617233685265	-2.6780423688453183	-3.805095989752995		-0.8753563590279984	0.22355110485179355	-2.3380625098514454	-2.797254756422407	-0.5667705541950472	-1.4322664306343853	-2.063340971833956	-1.7151359402860507	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:41940439..41940553,-__1607.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:41940439..41940553,-__1607.1.0.0	rs28623192	0.7442180909992234	1.220325079989648	1.0941865600945828	1.0102332795007871	1.1430440570585456	1.1139912323780274	1.274432552797301	1.2051371170147436	1.3048556510862208	1.3065502737282209	1.4799359326171986	1.0834184078239435	1.165027352924037	1.174018594328596	1.449455507564222	1.1164182826852502	1.0827207772605596	1.1040361329483273	1.2468292438666209	1.3837264140442276	1.4098520548060613	1.1546415222794044	1.4207099987900689	1.46748540725766	1.2394214578672482	1.2707762828081874	0.4298005033293725	0.22913042757457402	0.022231722590667413	0.07248749775977248	-0.03900792411021836	0.13283801148859342	0.10929386124692653	0.20471493779131777	-0.1502141288068164	0.11415972506184802	-0.012450525359538611	0.15600305004330473	0.1057489298841503	0.0698833862508	0.265084565602	0.788281320858	0.628827692687	0.850890521471	0.259364756733	0.397602565759	0.188220673538	0.60051573606	0.572794651112	1.0	0.420456664513	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr22:41940439..41940553,-__1607.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:41940439..41940553,-__1607.1.0.0	rs482402,rs28623192	0.7442180909992234	1.220325079989648	1.0941865600945828	1.0102332795007871	1.1430440570585456	1.1139912323780274	1.274432552797301	1.2051371170147436	1.3048556510862208	1.3065502737282209	1.4799359326171986	1.0834184078239435	1.165027352924037	0.9264916726173251	1.1910824094097454	1.0901569462224359	0.9091220063250092	0.8188540759523539	1.022631642341943	1.056351374486701	1.2567558323138859	1.1811856313914477	1.1368590921653823	1.123386947175527	1.1027925583508826	1.0679725157293867	0.1822735816181017	-0.029242670579902486	-0.004029613872146953	-0.10111127317577795	-0.3241899811061917	-0.0913595900360844	-0.21808117831060003	0.051618715299142304	-0.12367001969477309	-0.16969118156283858	-0.3565489854416717	0.019374150526939138	-0.0970548371946503	0.248198866138	0.63839046467	0.8931878581	0.63839046467	0.00883626072059	0.581963029585	0.677233097055	0.716953652062	0.510582765025	0.0808926541269	0.0548474154937	0.925117039075	0.343938852358	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:42343064..42343178,-__1608.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:42343064..42343178,-__1608.1.0.0	rs6002555	-1.5179433748363784	-1.5272989003565047	-1.3395475601981217	-1.366893018463223	-1.5741772923444475	-1.0428401155452496	-0.9794741295951447	-1.2829602109266176	-1.6783428627232393	-1.3723400126206435	-1.33138546010942	-1.3603488516830802	-1.364462649116839	-1.0628528165615898	-1.4304186372578036	-1.2256850402613373	-1.4695138720900118	-1.6636184988309286	-1.4190816216769102	-1.0832058135510145	-1.2937494102987128	-1.8624978753058876	-1.2947173227183517	-1.6981041580804483	-1.866594777373453	-1.4475033203338707	0.4550905582747886	0.09688026309870112	0.11386251993678442	-0.10262085362678874	-0.08944120648648113	-0.37624150613166063	-0.10373168395586985	-0.010789199372095215	-0.18415501258264833	0.07762268990229182	-0.3667186979710284	-0.5062459256903729	-0.0830406712170316	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr22:50964836..50964950,-__1609.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr22:50964836..50964950,-__1609.1.0.0	rs131804	-0.8115862128855719	-1.0032068405041366	0.9284980023077504	-0.2994428486030883	-0.009926936129599292	-0.17914553466471336	0.559760852090933	-1.011438993897383	0.11558091886518984	0.3606402658601242	-0.8074624869691984	0.16482312552171074	-0.1660755574173319	1.6072543791026594	0.7202206303795546	1.5977694238399611	1.12619091166426	1.779347325248915	0.007182102156892412	2.974051447844842	1.472832192330201	1.7214358608347182	1.1420473827034678	0.21250373245416196	-0.3873496783442705	1.164457142517947	2.418840591988231	1.7234274708836912	0.6692714215322108	1.4256337602673483	1.7892742613785142	0.18632763682160577	2.4142905957539087	2.484271186227584	1.6058549419695285	0.7814071168433436	1.0199662194233603	-0.5521728038659812	1.330532699935279	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:100428198..100428312,+__1610.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:100428198..100428312,+__1610.1.0.0	rs72919417	0.3898410810443414	0.4150985572162587	0.28687608223320427	0.4222660338694073	0.5005815878099572	0.5431276511249981	0.4883444631811806	0.9085728927348966	0.416091070251536	0.7048122562640565	0.5672038088565379	0.9767274614035399	0.5516285788324929	0.4763270514375674	0.5930923647809626	0.495431340375795	0.6910215551173562	0.5596416326301389	0.5615710210533392	0.5067739391559997	0.6626206725138918	0.8427121920783665	0.7054272574148832	0.6910135604328786	0.540358832448524	0.6104992849533086	0.08648597039322597	0.1779938075647039	0.20855525814259074	0.2687555212479489	0.05906004482018168	0.01844336992834117	0.018429475974819087	-0.24595222022100482	0.42662112182683043	0.0006150011508266884	0.12380975157634078	-0.43636862895501594	0.05887070612081572	0.973221425691	0.375513989452	0.581967350665	0.226876581559	0.989287003123	0.88258056334	0.87199428352	0.624065454014	0.0959193233604	0.809021331888	0.154655491485	0.460214637573	0.901232905468	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:105587821..105587935,-__1611.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:105587821..105587935,-__1611.1.0.0	rs7649466	-0.9490690504512469	0.9649482076210392	-1.313204855944157	0.015089042172886109	-2.109693590828305	-0.3581353869078547	-1.0800215767257977	-1.277473207244202	-0.04675993668067761	-0.3333717075577279	-0.8515318335402329	-1.17747008775828	-0.709724498653713	0.3698784552294441	-0.1356729297793586	-0.4907001146588238	-0.8762863826225327	0.129372726469391	-0.5547579186412831	0.6304083027533253	-1.0647353114786824	-2.34237553305566	-0.40354378808324887	-0.8515318335402329	-0.19031283317660838	-0.48168809671535584	1.318947505680691	-1.1006211374003978	0.8225047412853331	-0.8913754247954188	2.239066317297696	-0.19662253173342842	1.7104298794791228	0.2127378957655197	-2.2956155963749825	-0.07017208052552099	0.0	0.9871572545816716	0.22803640193835717	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:105587821..105587935,-__1611.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:105587821..105587935,-__1611.1.0.0	rs566393142	-0.9490690504512469	0.9649482076210392	-1.313204855944157	0.015089042172886109	-2.109693590828305	-0.3581353869078547	-1.0800215767257977	-1.277473207244202	-0.04675993668067761	-0.3333717075577279	-0.8515318335402329	-1.17747008775828	-0.709724498653713	-0.2561100326671794	0.14896367441247466	-0.5836619642734608	-0.40243178140460784	-0.22086289045055527	-0.029578074400217105	0.5857787034828396	-0.3255338139908817	-0.5022701639728321	-0.3004154120448846	-0.08416298231241744	-0.5771931662924525	-0.2122898253261812	0.6929590177840674	-0.8159845332085645	0.7295428916706961	-0.4175208235774939	1.8888307003777498	0.3285573125076376	1.6658002802086371	0.9519393932533204	-0.45551022729215446	0.03295629551284329	0.7673688512278154	0.6002769214658275	0.49743467332753183	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr3:105587821..105587935,-__1611.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:105587821..105587935,-__1611.1.0.0	rs7649466,rs566393142	-0.9490690504512469	0.9649482076210392	-1.313204855944157	0.015089042172886109	-2.109693590828305	-0.3581353869078547	-1.0800215767257977	-1.277473207244202	-0.04675993668067761	-0.3333717075577279	-0.8515318335402329	-1.17747008775828	-0.709724498653713	-1.0139584404886075	-0.4974948375326169	-0.20607603594012092	-0.3731019051610901	-0.19508694055088777	-0.7342958962626693	-0.2287649321963829	-0.14510564211225546	-0.6129046710304392	-0.8368380853118467	-1.0691798517327622	0.1637365993819319	-0.47908921991147896	-0.0648893900373606	-1.462443045153656	1.1071288200040361	-0.3881909473339762	1.9146066502774173	-0.37616050935481465	0.8512566445294147	1.1323675651319467	-0.5661447343497616	-0.5034663777541188	-0.21764801819252932	1.341206687140212	0.2306352787422341	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr3:134204792..134204906,-__1612.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr3:134204792..134204906,-__1612.1.0.0	rs2370576	1.895235354266041	2.560077692891533	1.9054353978350695	1.9377576538525862	2.1252843524292864	2.4419990998844705	1.8949456279930652	2.448418136276229	2.3287771696871538	2.336585220346506	2.1642020971296367	2.216371164717127	2.1879240806090587	2.1240881583737283	2.433795306767668	2.0590442204495765	1.8963019450918264	2.1072477668896292	2.051031228187238	1.8526819742700933	2.291287375830088	2.1257031038215564	2.0468556348566374	1.9241894108814144	2.391276117314445	2.108625186894492	0.22885280410768738	-0.1262823861238651	0.15360882261450692	-0.04145570876075988	-0.018036585539657146	-0.39096787169723246	-0.04226365372297192	-0.15713076044614116	-0.2030740658655974	-0.2897295854898685	-0.24001268624822236	0.17490495259731764	-0.079298893714567	0.716953652062	0.619326784864	0.957167318493	0.476688253492	0.476688253492	0.0906800339379	0.506273276989	0.21176555971	0.326996172605	0.456141411048	0.554657938956	0.737113058664	0.565539394643	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr3:134204792..134204906,-__1612.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr3:134204792..134204906,-__1612.1.0.0	rs74375630,rs2370576	1.895235354266041	2.560077692891533	1.9054353978350695	1.9377576538525862	2.1252843524292864	2.4419990998844705	1.8949456279930652	2.448418136276229	2.3287771696871538	2.336585220346506	2.1642020971296367	2.216371164717127	2.1879240806090587	2.1086662699538796	2.227267877739788	1.9599779021514405	2.129441812110479	2.108787737750376	2.22840220457396	2.0253651108371997	2.120681872713565	2.047122779311945	2.084751579706339	1.981468544982363	2.3794212157322163	2.1167795756302956	0.21343091568783867	-0.33280981515174535	0.05454250431637098	0.19168415825789253	-0.016496614678910504	-0.21359689531051052	0.13041948284413452	-0.3277362635626644	-0.2816543903752087	-0.25183364064016667	-0.18273355214727371	0.16305005101508918	-0.07114450497876283	0.706946403854	0.288805731951	1.0	0.476688253492	0.428242856315	0.107123399254	0.554657938956	0.2650790955	0.197395731844	0.226876581559	0.382791178922	0.978575937473	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr3:134204786..134204900,+__1613.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr3:134204786..134204900,+__1613.1.0.0	rs2370576	1.582547582419899	2.017804416239674	1.6161414237833855	1.454971845110431	1.6481127187185591	1.8306387686498105	1.5451845044109183	1.7495042364649553	1.5500209136712353	1.6057313653548373	1.5550801051686651	1.51197800610836	1.6389763238417279	1.7940969348851832	1.7387880940789513	1.8524210347948697	1.965389021915596	1.893598738505155	1.8694562510387978	1.334508266797743	1.6665226641568682	1.8244548129405724	1.8522108869975025	1.4716959169918076	1.7829131841071344	1.7538379839341818	0.21154935246528428	-0.2790163221607229	0.2362796110114842	0.5104171768051651	0.2454860197865958	0.0388174823889873	-0.21067623761317522	-0.08298157230808711	0.27443389926933714	0.24647952164266518	-0.08338418817685755	0.2709351779987743	0.1148616600924542	0.554657938956	0.506273276989	0.361218104761	0.237368605078	0.216719559135	0.727009731456	0.519249062249	0.737113058664	0.202104162379	0.0638899216795	0.361218104761	0.242741268695	0.134858384471	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.flip.sense__chr3:134204786..134204900,+__1613.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr3:134204786..134204900,+__1613.1.0.0	rs74375630,rs2370576	1.582547582419899	2.017804416239674	1.6161414237833855	1.454971845110431	1.6481127187185591	1.8306387686498105	1.5451845044109183	1.7495042364649553	1.5500209136712353	1.6057313653548373	1.5550801051686651	1.51197800610836	1.6389763238417279	1.5978298763112366	1.9895362064023159	1.571291810044186	1.6901490353518918	1.743799381252206	1.6402619957980233	1.661693405968426	1.4913219106127178	1.5506221472120412	1.6946959386606189	1.5901038733061352	1.5883993364479851	1.6508087431139817	0.015282293891337728	-0.028268209837358338	-0.0448496137391996	0.23517719024146078	0.09568666253364677	-0.1903767728517871	0.11650890155750782	-0.25818232585223755	0.0006012335408058789	0.08896457330578156	0.0350237681374701	0.07642133033962506	0.011832419272254424	0.375513989452	0.648013768535	0.677233097055	0.333666485083	0.232080506959	0.967868733231	0.375513989452	0.788281320858	0.840380101088	0.122558611289	0.202104162379	0.175053819161	0.472335906847	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:134204822..134204936,+__1614.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:134204822..134204936,+__1614.1.0.0	rs2370576	2.5465291527296783	2.7212841557721266	2.2664686489854136	2.485706309644735	2.4810106869589337	2.5485518729377867	2.506892407196677	2.1507561765840326	2.3393814678190106	2.420186375469847	2.5154297483329304	2.3264092429542673	2.4423838537821196	2.2697680322589915	2.7057595744413074	2.107107858532829	2.034094870532193	2.3607297089897847	2.3849303405475775	2.1713705902424665	2.4087816302896243	2.348188929782757	2.3496632835355307	2.3297009845671095	2.437207156465422	2.325608580015466	-0.2767611204706868	-0.015524581330819132	-0.15936079045258467	-0.4516114391125421	-0.12028097796914894	-0.16362153239020927	-0.33552181695421046	0.2580254537055917	0.008807461963746377	-0.07052309193431627	-0.18572876376582093	0.11079791351115453	-0.11677527376665382	0.21176555971	0.777966336216	0.696989544957	0.188220673538	0.340423946445	0.420456664513	0.368322877114	0.63839046467	0.79863356553	0.809021331888	0.368322877114	0.935789553219	0.708048002083	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:134204992..134205106,+__1615.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:134204992..134205106,+__1615.1.0.0	rs1874883	-0.4464257361244345	-0.33991573521551866	-1.898585953792581	-0.9226553818784877	-1.131725645948872	-0.6542033106756546	-0.22746564856515142	-0.6666652726489485	-1.0059393882838783	0.10093727826513624	-1.441431082329376	-1.4097578265227617	-0.8369861419767107	-0.4252513525011628	-0.6100493844682431	-0.9741278347641793	-0.5608680841218932	-0.8438318369369707	-1.234234502227315	-0.522756065735977	-0.6489850203250015	-0.541014729313584	-1.0288593587275188	-0.796191034236535	-1.0817101390498591	-0.7723232785340199	0.021174383623271675	-0.27013364925272443	0.9244581190284018	0.3617872977565946	0.2878938090119013	-0.5800311915516603	-0.2952904171708256	0.017680252323946988	0.46492465897029434	-1.129796636992655	0.6452400480928409	0.3280476874729026	0.06466286344269072	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:134316577..134316691,+__1616.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:134316577..134316691,+__1616.1.0.0	rs13071253	-1.4594740396825572	-1.1548907363474064	-1.197653914476676	-1.1993177013910525	-1.0369344701138388	-1.3326754500111384	-1.6455818597997416	-1.2101654324429831	-1.3493348048318246	-1.2375050237376755	-1.2509912818021678	-1.070546896995266	-1.2620893009693608	-1.3337356366167794	-1.5801700475383371	-1.042924188391634	-0.9744742271085847	-1.2644997668624856	-0.9708744494539412	-1.0782031822739313	-1.3440243477681832	-1.2632055863405571	-1.4952688236231764	-1.4893902544310644	-0.7917555150983618	-1.2190438354589197	0.12573840306577777	-0.42527931119093076	0.15472972608504199	0.22484347428246787	-0.22756529674864678	0.3618010005571972	0.5673786775258103	-0.1338589153252001	0.08612921849126742	-0.2577637998855009	-0.23839897262889664	0.2787913818969042	0.043045465510440965	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:142607993..142608107,-__1617.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:142607993..142608107,-__1617.1.0.0	rs2196900	0.3409605731412111	0.4851560867668213	0.20253392675092607	0.09816254244133238	0.2881542543563421	0.3207084913883348	-0.0026376944547400107	0.2444369475019587	0.07753703487565035	0.3564008420255555	0.34446171502628475	0.1860446686620704	0.2451599490401456	0.10880693631210116	0.063292491760608	0.03221089556263537	-0.12763579876880796	-0.045921172642728124	-0.0662611737497217	0.16747317156746067	-0.21523122857758326	0.24501021292742858	0.1869342611815628	-0.010536040673995292	-0.19842665436922116	0.011642991710811594	-0.23215363682910994	-0.4218635950062133	-0.1703230311882907	-0.22579834121014034	-0.3340754269990702	-0.3869696651380565	0.17011086602220069	-0.45966817607954197	0.16747317805177825	-0.1694665808439927	-0.35499775570028	-0.38447132303129156	-0.233516957329334	0.288805731951	0.0484028718114	0.162586850726	0.301187193336	0.113101776132	0.0362033618716	0.840380101088	0.183752894264	0.60051573606	0.143314270352	0.0333181634109	0.259370210024	0.00208544221015	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:156878514..156878628,-__1618.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:156878514..156878628,-__1618.1.0.0	rs111941847	0.5510999873979521	0.6300309512014033	0.5401354986382234	0.45276478095258643	0.805680015292329	0.40281427995309155	0.5607753987665064	0.5492494234057701	0.5692685012527443	0.7895566438448434	0.6458318409842552	0.5970518390509242	0.5911882633950525	-1.1454601057575198	-1.413382834181924	-0.5233090002263351	-0.9205075123028988	-1.3446460633383162	-1.2369702738386292	-1.25674090695194	-1.3480410270010312	-0.9422080647777956	-1.2297903984791825	-0.9281316095641821	-1.0388574026307735	-1.1106704332542108	-1.6965600931554718	-2.0434137853833274	-1.0634444988645586	-1.3732722932554853	-2.1503260786306453	-1.6397845537917208	-1.8175163057184465	-1.8972904504068013	-1.5114765660305398	-2.019347042324026	-1.5739634505484372	-1.6359092416816976	-1.7018586966492633	0.00993701022923	4.1480046148e-07	0.00240905380364	0.000392957862114	5.49047958631e-07	8.9082802627e-07	0.000392957862114	0.000144763512967	5.30832986734e-05	1.093294991e-06	1.25214566711e-06	0.00043495277549	9.54220258917e-42	1	0.000308611543341	1	0.289609944378	0.000423865024063	0.00068059261207	0.290395860102	0.105243073927	0.0410333898745	0.000858236567933	0.000962900018011	0.338828212107	7.99636576973e-39	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:156878514..156878628,-__1618.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:156878514..156878628,-__1618.1.0.0	rs6441117	0.5510999873979521	0.6300309512014033	0.5401354986382234	0.45276478095258643	0.805680015292329	0.40281427995309155	0.5607753987665064	0.5492494234057701	0.5692685012527443	0.7895566438448434	0.6458318409842552	0.5970518390509242	0.5911882633950525	-0.23906615725523306	-0.2807602143386654	-0.3728384050009359	-0.4682401326280046	-0.44592678499714733	-0.19476219403563955	-0.2948278267216289	-0.4218988971846418	-0.257208635839427	-0.2137194371459541	-0.22590358316177794	-0.28522017157729235	-0.308364369990529	-0.7901661446531851	-0.9107911655400687	-0.9129739036391593	-0.9210049135805911	-1.2516068002894762	-0.597576473988731	-0.8556032254881353	-0.9711483205904119	-0.8264771370921713	-1.0032760809907975	-0.8717354241460331	-0.8822720106282165	-0.8995526333855816	0.00313710581496	6.66706650175e-05	0.0125089884503	0.000911503005752	5.49047958631e-07	0.00300328973882	0.00146142948273	3.33944592614e-05	1.84173011953e-05	8.34895163788e-05	4.11448729888e-06	2.34778603013e-07	4.431974469e-37	1	0.049602974773	1	0.671777715239	0.000423865024063	1	1	0.0242777718831	0.014236573824	0.0655392703574	0.00316404073284	0.000182892531747	3.71399460503e-34	not sig	sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:156878514..156878628,-__1618.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:156878514..156878628,-__1618.1.0.0	rs35295311	0.5510999873979521	0.6300309512014033	0.5401354986382234	0.45276478095258643	0.805680015292329	0.40281427995309155	0.5607753987665064	0.5492494234057701	0.5692685012527443	0.7895566438448434	0.6458318409842552	0.5970518390509242	0.5911882633950525	0.5054147111418693	0.49238444503120704	0.7383509850185799	0.3988897907197616	0.18656970596987466	0.6349128579509203	0.4750442988997801	0.5420824450877623	0.598358858416953	0.6672699910472321	0.7310705200958232	0.766129758614021	0.5613731973328153	-0.04568527625608276	-0.13764650617019625	0.19821548638035646	-0.053874990232824826	-0.6191103093224544	0.2320985779978288	-0.08573109986672628	-0.007166978318007833	0.029090357164208713	-0.1222866527976113	0.08523867911156802	0.1690779195630968	-0.029815066062237067	0.935789553219	0.967868365621	0.30750859871	0.320413072024	0.132622250874	0.116187990183	0.405136064622	0.967868733231	0.978575937473	0.545696106059	0.824663761487	0.536806685117	0.920065443834	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr3:156878514..156878628,-__1618.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:156878514..156878628,-__1618.1.0.0	rs111941847,rs6441117,rs35295311	0.5510999873979521	0.6300309512014033	0.5401354986382234	0.45276478095258643	0.805680015292329	0.40281427995309155	0.5607753987665064	0.5492494234057701	0.5692685012527443	0.7895566438448434	0.6458318409842552	0.5970518390509242	0.5911882633950525	-0.8285771490419728	-0.8290642256057547	-1.0347732942990646	-0.5623181643993426	-0.6208216389240062	-1.0744815085522723	-0.9249664789414128	-1.106637486959905	-0.6644107643026801	-1.1064492079828787	-1.2329871661128038	-0.8710774626364536	-0.9047137123132121	-1.3796771364399247	-1.4590951768071578	-1.574908792937288	-1.015082945351929	-1.4265016542163353	-1.477295788505364	-1.4857418777079192	-1.655886910365675	-1.2336792655554243	-1.896005851827722	-1.878819007097059	-1.4681293016873778	-1.4959019757082646	3.97876883146e-05	2.71629941636e-05	1.43307835393e-06	0.00086866520518	4.99679411993e-08	1.6390141405e-06	2.97338861431e-06	6.26237314719e-08	8.27992768152e-06	1.8732392437e-06	1.06544395451e-08	1.24743585738e-08	1.83784738759e-58	0.00771881153304	0.00548692482105	0.000285182592432	0.164177723779	1.02434279458e-05	0.00032944184224	0.000594677722861	1.2211627637e-05	0.00170566510239	0.000389633762689	2.18416010675e-06	2.56971786621e-06	4.17191356984e-56	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:191000168..191000282,-__1619.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:191000168..191000282,-__1619.1.0.0	rs7633752	-1.9132444552492052	-1.5307211277854758	-1.781466645303284	-1.4333540151635902	-1.7709021477410702	-1.5008562949141164	-1.4981222472541216	-1.6599328291924476	-1.6451654507507822	-1.8264846376291923	-1.5431517314767038	-1.7338418582160016	-1.653103620056333	-1.5892137206419013	-1.7172060544021506	-1.3600983065798706	-1.6708530143839042	-2.135684145893881	-1.8141784913267944	-1.5604940589738117	-1.7066593196371245	-1.7591729358325416	-2.141918591040485	-1.884763813105843	-2.0097557162453032	-1.7791665140053006	0.3240307346073039	-0.18648492661667482	0.4213683387234133	-0.23749899922031403	-0.36478199815281065	-0.313322196412678	-0.062371811719690085	-0.046726490444676916	-0.1140074850817594	-0.31543395341129266	-0.34161208162913925	-0.2759138580293017	-0.12606289394896836	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr3:191000168..191000282,-__1619.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:191000168..191000282,-__1619.1.0.0	rs7633752,rs55762859	-1.9132444552492052	-1.5307211277854758	-1.781466645303284	-1.4333540151635902	-1.7709021477410702	-1.5008562949141164	-1.4981222472541216	-1.6599328291924476	-1.6451654507507822	-1.8264846376291923	-1.5431517314767038	-1.7338418582160016	-1.653103620056333	-1.7522112949995234	-2.0579483084768184	-1.6483894844600435	-1.675755828926458	-1.6660984176852798	-1.7392812409994984	-1.7077724360537083	-1.7767110878768844	-1.9377117326071944	-1.876194718716936	-1.9286096231848544	-1.45239473815182	-1.768256576011585	0.16103316024968173	-0.5272271806913427	0.1330771608432404	-0.24240181376286785	0.10480373005579047	-0.238424946085382	-0.20965018879958675	-0.11677825868443681	-0.2925462818564122	-0.049710081087743774	-0.3854578917081506	0.2814471200641815	-0.11515295595525238	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:42306220..42306334,-__1620.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:42306220..42306334,-__1620.1.0.0	rs1799923	-0.08186303229908452	0.29693284756146165	-0.06365007987476735	0.2428824026333729	0.2433683716718748	-0.096946506656857	-0.25659029196216304	-0.013186996312301934	0.17030124922673562	0.10324598094444713	0.14072223689386132	0.1499321694651457	0.0695956959409771	0.32047319623082837	0.2748922616157635	0.4269023375521924	0.047044925163035295	0.21923651639333608	0.16408761451372922	-0.008223363689573871	-0.04505592264717322	0.25905328553901946	0.2105044628720844	0.38628745508726925	0.16481951804449707	0.201668523889584	0.4023362285299129	-0.022040585945698132	0.49055241742695976	-0.1958374774703376	-0.024131855278538727	0.2610341211705862	0.24836692827258916	-0.03186892633487129	0.08875203631228384	0.10725848192763728	0.24556521819340793	0.014887348579351367	0.1320728279486069	0.48504462162	0.436112310787	0.166665831608	0.76769033028	0.79863356553	0.390154148302	0.989287003123	0.706946403854	0.677233097055	0.925117039075	0.375513989452	0.677233097055	0.925998526695	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr3:48481587..48481701,+__1621.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr3:48481587..48481701,+__1621.1.0.0	rs3774808	3.346618804214769	3.8059990813326365	3.1524052634716995	2.9926500187839524	3.225589913738877	3.314910527278991	3.1839357663126586	3.4619223978147913	3.434201855586069	3.481783718030294	3.4108298199672773	3.43834305653536	3.3540991852556146	3.062745214943776	3.5837606117869836	3.1439542706214176	2.9551976488159153	3.085226732486575	3.0720015325505186	2.8894854272264485	3.169914258608695	3.2515519963837978	3.1842746328363223	3.296038602848445	3.2678686442743645	3.1635016311152717	-0.2838735892709927	-0.22223846954565296	-0.008450992850281835	-0.037452369968037136	-0.14036318125230185	-0.24290899472847238	-0.2944503390862101	-0.2920081392060965	-0.18264985920227117	-0.2975090851939717	-0.11479121711883211	-0.17047441226099558	-0.190597554140343	0.216719559135	0.63839046467	0.354199901149	0.501992688725	0.179364149792	0.202104162379	0.405136064622	0.197395731844	0.158583637061	0.368322877114	0.405136064622	0.572794651112	0.0730733017732	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:49044691..49044805,+__1622.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:49044691..49044805,+__1622.1.0.0	rs71324929	-1.2755202875275868	-1.2111161178166818	-0.988528685611485	-1.4407716480190318	-0.927364197532446	-1.2677196782666622	-1.715374738792022	-0.9139616338016038	-1.7066824257627966	-1.4923850030062717	-1.2931571493957812	-1.2887599081168348	-1.2934451228041004	-1.1089018522507263	-1.2760647404116905	-1.4124866983536946	-1.2907587391119906	-1.1321465529912034	-1.4025923100211806	-1.0182153551561934	-0.9485117810664433	-1.321193100885427	-1.3899727881065036	-1.365495003479058	-1.3906170941487144	-1.2547463346652354	0.1666184352768605	-0.06494862259500866	-0.42395801274220957	0.15001290890704122	-0.20478235545875734	-0.13487263175451836	0.6971593836358285	-0.034550147264839515	0.38548932487736964	0.10241221489976815	-0.07233785408327686	-0.10185718603187954	0.03869878813886485	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:49044691..49044805,+__1622.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:49044691..49044805,+__1622.1.0.0	rs6781790	-1.2755202875275868	-1.2111161178166818	-0.988528685611485	-1.4407716480190318	-0.927364197532446	-1.2677196782666622	-1.715374738792022	-0.9139616338016038	-1.7066824257627966	-1.4923850030062717	-1.2931571493957812	-1.2887599081168348	-1.2934451228041004	-1.2884083155956438	-1.3302318125772596	-0.950114317567683	-1.401966784886743	-1.5296921862358752	-1.5837699735213158	-1.4145021931135409	-1.45909178959898	-1.4719841181875832	-1.108523370070414	-1.2208107595097983	-1.2286436816127524	-1.332311608539799	-0.012888028068057	-0.11911569476057782	0.03841436804380194	0.038804863132288814	-0.6023279887034292	-0.31605029525465356	0.3008725456784811	-0.5451301557973761	0.23469830757521337	0.38386163293585773	0.07234638988598285	0.06011622650408244	-0.038866485735698786	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr3:49044691..49044805,+__1622.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:49044691..49044805,+__1622.1.0.0	rs71324929,rs6781790	-1.2755202875275868	-1.2111161178166818	-0.988528685611485	-1.4407716480190318	-0.927364197532446	-1.2677196782666622	-1.715374738792022	-0.9139616338016038	-1.7066824257627966	-1.4923850030062717	-1.2931571493957812	-1.2887599081168348	-1.2934451228041004	-1.0601746752965222	-1.242633509038393	-0.9352858733010856	-1.206177442256989	-0.757655941372782	-1.2586666676593214	-1.4320343202657893	-0.9817822854659355	-0.8978098801298096	-1.2128893747865084	-1.1275563463935838	-1.5184814170611487	-1.1359289777523225	0.21534561223106463	-0.031517391221711266	0.0532428123103994	0.2345942057620427	0.169708256159664	0.009053010607340761	0.2833404185262327	-0.06782065166433171	0.808872545632987	0.27949562821976337	0.16560080300219737	-0.22972150894431387	0.1575161450517779	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:49208964..49209078,+__1623.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:49208964..49209078,+__1623.1.0.0	rs34571182	0.5080885716061462	-0.23187440917391905	0.22198151667221813	-1.638416859086	0.13864242958463413	0.24605322030374907	0.3994831852195129	-0.7572315967512758	0.20369022155979943	-0.10874088501410431	-1.154980320414921	-0.751218312186628	-0.24371026980673238	0.8256015849783773	-0.24762413614643614	-0.8589444284748394	0.19084440565436908	0.8757696730129867	-0.4197995356388134	0.7966674809894411	0.6098263282856409	-1.0872027887358422	0.748409866502051	0.22385749562415103	0.5429213666219737	0.18336060938942164	0.31751301337223115	-0.015749726972517086	-1.0809259451470576	1.829261264740369	0.7371272434283526	-0.6658527559425624	0.39718429576992814	1.3670579250369168	-1.2908930102956417	0.8571507515161553	1.378837816039072	1.2941396788086017	0.42707087919615394	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:49208964..49209078,+__1623.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:49208964..49209078,+__1623.1.0.0	rs13096406	0.5080885716061462	-0.23187440917391905	0.22198151667221813	-1.638416859086	0.13864242958463413	0.24605322030374907	0.3994831852195129	-0.7572315967512758	0.20369022155979943	-0.10874088501410431	-1.154980320414921	-0.751218312186628	-0.24371026980673238	0.6990012042348632	0.1715862029764818	0.2536549762492277	0.5819916496194578	-0.01076339422248341	0.17389803646052382	-0.1433932282392475	-0.18481756387684686	-0.2960637054086363	-0.6696482298727796	0.06196161918661128	-0.004687379542296172	0.052726682297072974	0.19091263262871705	0.40346061215040085	0.031673459577009594	2.2204085087054577	-0.14940582380711753	-0.07215518384322525	-0.5428764134587605	0.5724140328744289	-0.49975392696843574	-0.5609073448586753	1.2169419396015322	0.7465309326443319	0.29643695210380533	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr3:49208964..49209078,+__1623.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:49208964..49209078,+__1623.1.0.0	rs34571182,rs13096406	0.5080885716061462	-0.23187440917391905	0.22198151667221813	-1.638416859086	0.13864242958463413	0.24605322030374907	0.3994831852195129	-0.7572315967512758	0.20369022155979943	-0.10874088501410431	-1.154980320414921	-0.751218312186628	-0.24371026980673238	0.46883764174420955	-0.018899389243243248	0.6108679357912618	-0.9959997887979912	0.08304839325269026	-0.11747739331294119	0.0043197282707686056	-0.0648951133785136	-0.44040624653188826	-1.2128893747865084	-0.22635635184348735	-0.7491202763637602	-0.22158085293328364	-0.03925092986193662	0.2129750199306758	0.38888641911904365	0.6424170702880088	-0.055594036331943875	-0.36353061361669026	-0.39516345694874433	0.6923364833727622	-0.6440964680916876	-1.104148489772404	0.9286239685714336	0.0020980358228678275	0.022129416873448753	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:49395692..49395806,-__1624.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:49395692..49395806,-__1624.1.0.0	rs1800668	-0.9691100359534512	-0.9272612221767482	-1.0854415813443965	-0.9515377731660519	-1.1251809530001515	-1.2814190920235013	-1.2450147915900174	-0.622329175836808	-0.9169373447881546	-1.1911199428034358	-1.0795591273316516	-1.1324971815430096	-1.0439506851297813	-0.7908508297255677	-0.6187033821744572	-0.5112074569530356	-1.3082008130320841	-0.7219425660681575	-0.8121716476649743	-0.9899366942531553	-0.9429886341628974	-1.289213255278948	-0.8931817072004458	-0.7548340615778795	-1.0364715509686713	-0.8891418832550227	0.1782592062278835	0.30855784000229103	0.5742341243913609	-0.3566630398660322	0.403238386931994	0.46924744435852705	0.25507809733686204	-0.32065945832608933	-0.37227591049079334	0.29793823560299004	0.32472506575377214	0.09602563057433833	0.15480880187475868	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.270885072145	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.270885072145	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr3:49395692..49395806,-__1624.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:49395692..49395806,-__1624.1.0.0	rs8179169,rs1800668	-0.9691100359534512	-0.9272612221767482	-1.0854415813443965	-0.9515377731660519	-1.1251809530001515	-1.2814190920235013	-1.2450147915900174	-0.622329175836808	-0.9169373447881546	-1.1911199428034358	-1.0795591273316516	-1.1324971815430096	-1.0439506851297813	-0.2486886930461451	-1.0645423718739448	-0.5780397278261674	-0.7501662990292584	-1.0687310891827522	-0.7096823678747837	-1.1315748546063218	-0.7090024559060399	-0.7112306570496814	-1.5814459743647038	-0.9312898236268021	-0.8230198803308365	-0.8589511828931197	0.7204213429073061	-0.13728114969719662	0.5074018535182291	0.20137147413679357	0.05644986381739936	0.5717367241487177	0.11343993698369559	-0.08667328006923192	0.20570668773847323	-0.390326031561268	0.14826930370484948	0.3094773012121731	0.1849995022366617	0.170821264488	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.170821264488	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:49395727..49395841,-__1625.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:49395727..49395841,-__1625.1.0.0	rs1800668	1.5323632654041703	1.5356161163522253	1.125619005777465	0.9858645614755348	1.285576102861958	1.4772464244694712	1.3111136085802735	1.3418405176816595	1.5305811479343188	1.5639080871868514	1.5142064289516233	1.362049783916338	1.3804987542159906	1.4170131533521586	1.643921580962997	1.560200171364826	1.241819394846166	1.3628626867716283	1.515465443214124	1.1099993955611633	1.4679517036164995	1.4257316436065257	1.5014789952403442	1.5258615631769057	1.3929215949484597	1.43043561055515	-0.11535011205201173	0.10830546461077173	0.4345811655873608	0.2559548333706312	0.07728658390967036	0.03821901874465272	-0.20111421301911014	0.12611118593484005	-0.10484950432779305	-0.06242909194650714	0.011655134225282415	0.030871811032121776	0.049936856339159084	0.361218104761	0.536806685117	0.706946403854	0.88258056334	0.605190125793	0.510577925344	0.226876581559	0.581967350665	0.0258200569765	0.276771967065	0.29495293544	0.354199901149	0.259793442752	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr3:49449566..49449680,+__1626.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr3:49449566..49449680,+__1626.1.0.0	rs940045	2.3501806273662025	2.5621118597174886	2.2250377143077467	2.110002391751425	2.2776348229577446	2.3703179438643156	2.190222837409198	2.676780809871956	2.4098158925862982	2.449682275216955	2.4749110243535055	2.492489392191496	2.3824322992995275	2.1925551869660413	2.3208388764304995	1.989159336811532	1.8148846575548625	2.1443733110406082	2.0695808854198487	2.1881844787826563	2.2902552779683627	2.304210044985644	2.2702222429833205	2.4548255609865315	2.1333968355830213	2.1810405579594105	-0.15762544040016113	-0.2412729832869891	-0.23587837749621476	-0.2951177341965623	-0.1332615119171363	-0.30073705844446685	-0.0020383586265415587	-0.3865255319035934	-0.10560584760065428	-0.1794600322336346	-0.020085463366974032	-0.35909255660847483	-0.20139174134011692	0.914457985151	0.221756412245	0.0548474154937	0.206893929435	0.375513989452	0.0638899216795	0.727009731456	0.13967914143	0.687084607526	0.0638899216795	0.390154148302	0.216719559135	0.0360514500523	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:52321773..52321887,+__1628.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:52321773..52321887,+__1628.1.0.0	rs13065677	3.3840495550903693	3.947304219451644	3.2517988890321674	3.1548279369904817	3.4482783007980533	3.4758671113557944	3.0736791561127923	3.697452230397369	3.602545973878694	3.5423778363027694	3.537716206130196	3.550179596375095	3.4721730843262857	3.6603982478417336	4.101417826249183	3.620966855972673	3.294209258894226	3.662373889582122	3.730714321113267	3.601439013419164	3.774453795432663	3.806723024086089	3.8154654197600064	3.756674293815561	3.8155402886945295	3.7200313529051017	0.2763486927513643	0.1541136067975395	0.36916796694050547	0.1393813219037443	0.21409558878406854	0.25484720975747255	0.5277598573063718	0.0770015650352942	0.20417705020739518	0.27308758345723705	0.21895808768536495	0.2653606923194345	0.24785826857881602	0.116187990183	0.166665831608	0.0107365258413	0.147021540231	0.088148079887	0.0440018610392	0.125844655769	0.397602565759	0.242741268695	0.0120431385799	0.0399413890972	0.0286240283844	8.48887484802e-07	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.000711367712264	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr3:52869196..52869310,-__1629.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr3:52869196..52869310,-__1629.1.0.0	rs2276823	-0.5171621583647761	-0.5073332711477463	-0.34972097439699146	-0.41878630863787814	-0.4924842496478154	-0.255398471623415	-0.4035977854381234	-0.1958191539722977	-0.30874837432301827	-0.38802608512358716	-0.19709575133141644	-0.18376012464245783	-0.3514943923874603	-0.35102892504715366	-0.2205423775341421	-0.21020834384748405	-0.2317097981075577	-0.40451179877023524	-0.45308230793701876	-0.2773131172081736	-0.36689210149561	-0.31505068687913285	-0.3884855892104669	-0.1536402104593351	-0.14224372943450075	-0.2928924154942342	0.16613323331762242	0.2867908936136042	0.1395126305495074	0.18707651053032043	0.08797245087758016	-0.19768383631360376	0.12628466822994983	-0.1710729475233123	-0.006302312556114575	-0.0004595040868797251	0.04345554087208134	0.04151639520795708	0.05860197689322605	0.706946403854	0.428242856315	0.696989544957	0.390154148302	0.840380101088	0.536806685117	0.957167318493	0.63839046467	0.777966336216	0.63839046467	0.648013768535	0.706946403854	0.953127844466	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:103422408..103422522,+__1630.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:103422408..103422522,+__1630.1.0.0	rs72696119	0.0834658705586626	0.0631636499134177	-0.10619689102158193	-0.13957806580618304	-0.03459776364861918	-0.029769156432790544	-0.09276376816910209	0.101441488689735	-0.08361774198085893	0.005336940753817207	0.08314831452217226	0.4872143925507182	0.028103939160782274	0.19557359798259547	0.5830110250581985	-0.08401413980072828	0.031179299900490582	0.12445673899266912	-0.08982746137667276	-0.33011472221749594	0.47816134499074403	0.17402008680375114	0.4239586656452028	0.21836722280893295	0.15908924924408155	0.15698840900264743	0.11210772742393287	0.5198473751447807	0.022182751220853655	0.17075736570667363	0.15905450264128831	-0.060058304943882215	-0.23735095404839385	0.376719856301009	0.25763782878461006	0.4186217248913856	0.1352189082867607	-0.32812514330663667	0.12888446984186516	0.326996172605	0.119339994516	0.536806685117	0.460214637573	0.609889042629	0.978575937473	0.814223811841	0.313917214294	0.340423946445	0.192768091005	0.727009731456	0.510582765025	0.549424791687	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:103422436..103422550,+__1631.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:103422436..103422550,+__1631.1.0.0	rs72696119	0.7716525830251293	1.1988384907584146	0.45883646165093755	0.6458383471313358	0.6783333626064876	0.7754727301850186	1.0558975396536376	0.9861828255847578	0.8095325390392942	1.0427623298234172	0.9324187521488403	1.0528227584631078	0.8673823933391983	0.8708685234093269	1.227830453972991	0.7116699127231461	0.617904552444775	0.8946949829725767	0.7345804027690228	0.959448698674872	0.7257012169369413	0.8091816104763286	0.8847565585291216	1.040192925667382	1.0497423485237958	0.8772143489250235	0.09921594038419757	0.02899196321457631	0.2528334510722085	-0.027933794686560764	0.21636162036608908	-0.0408923274159958	-0.0964488409787656	-0.26048160864781644	-0.00035092856296559116	-0.1580057712942956	0.1077741735185418	-0.0030804099393120232	0.00983195558582512	0.554657938956	0.978575937473	0.716953652062	0.452098798395	0.657696241675	0.716953652062	0.819442862795	0.840380101088	0.925117039075	0.819442862795	0.460214637573	0.856156710108	0.994563726042	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:108910965..108911079,+__1632.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:108910965..108911079,+__1632.1.0.0	rs760202	3.9779658652961873	1.287302322439787	1.981814981094786	0.422670252019248	3.157315759333246	2.165969821037028	2.161095754575015	1.010634394505446	0.5963091191052796	0.5403626841056423	1.1370280985060766	0.5788381779929653	1.5847756025008917	-0.6405805750523299	-1.4178654763947078	-0.4882041846252511	-1.166442420772918	-0.7043664887036565	-0.043367499723715966	0.27281686085106543	0.042002359833115656	0.16742966972784382	0.33313660513648724	0.25223673438728855	0.30692882965259277	-0.2571896321403488	-4.618546440348517	-2.705167798834495	-2.470019165720037	-1.589112672792166	-3.8616822480369026	-2.2093373207607443	-1.8882788937239494	-0.9686320346723303	-0.42887944937743583	-0.20722607896915501	-0.884791364118788	-0.27190934834037256	-1.8419652346412407	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:108910965..108911079,+__1632.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:108910965..108911079,+__1632.1.0.0	rs28703310	3.9779658652961873	1.287302322439787	1.981814981094786	0.422670252019248	3.157315759333246	2.165969821037028	2.161095754575015	1.010634394505446	0.5963091191052796	0.5403626841056423	1.1370280985060766	0.5788381779929653	1.5847756025008917	-0.5031329834794298	0.6535859067604496	-4.33340978420721	0.0160620593945271	-1.530371402802575	-0.6775184754515291	-1.3113064091468645	0.20780669832597146	-2.1750559275494776	-1.282851317770811	-0.13880797292949476	-1.4310459340168442	-1.0421704619061072	-4.481098848775617	-0.6337164156793375	-6.315224765301996	-0.4066081926247209	-4.687687162135822	-2.843488296488557	-3.4724021637218794	-0.8028276961794745	-2.7713650466547572	-1.8232140018764533	-1.2758360714355712	-2.0098841120098094	-2.626946064407	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:108910965..108911079,+__1632.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:108910965..108911079,+__1632.1.0.0	rs17550794	3.9779658652961873	1.287302322439787	1.981814981094786	0.422670252019248	3.157315759333246	2.165969821037028	2.161095754575015	1.010634394505446	0.5963091191052796	0.5403626841056423	1.1370280985060766	0.5788381779929653	1.5847756025008917	0.3966284481561477	1.0334692531402632	-0.2018960427022018	1.7437942544515281	0.36161930693396577	-0.01930692128746897	0.03148985003505054	0.042207466265710814	0.22704929303934346	0.5775461179459083	1.0907379577566223	-0.4227678811116044	0.4050475918852721	-3.58133741714004	-0.2538330692995239	-2.1837110237969877	1.3211240024322801	-2.79569645239928	-2.185276742324497	-2.1296059045399645	-0.9684269282397351	-0.36925982606593616	0.03718343384026601	-0.046290140749454256	-1.0016060591045697	-1.17972801061562	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr4:108910965..108911079,+__1632.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:108910965..108911079,+__1632.1.0.0	rs760202,rs28703310,rs17550794	3.9779658652961873	1.287302322439787	1.981814981094786	0.422670252019248	3.157315759333246	2.165969821037028	2.161095754575015	1.010634394505446	0.5963091191052796	0.5403626841056423	1.1370280985060766	0.5788381779929653	1.5847756025008917	-1.087575495258019	0.29168285263119254	-0.719913221472108	0.3716852628590272	0.2574005435406658	-0.9059612596706332	-0.8174322049650322	-0.27614096769365065	-0.1265245677811407	-0.23485530548202266	-0.5291841611799274	0.478805320984078	-0.2748344336239642	-5.065541360554207	-0.9956194698085945	-2.701728202566894	-0.05098498916022082	-2.8999152157925803	-3.071931080707661	-2.978527959540047	-1.2867753621990965	-0.7228336868864204	-0.775217989587665	-1.666212259686004	-0.10003285700888731	-1.8596100361248569	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:15964808..15964922,-__1633.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:15964808..15964922,-__1633.1.0.0	rs4698433	-1.409833199888294	-1.4646276028765297	-1.3173298964711526	-1.3632174098963725	-1.2963584693874046	-1.170860308015805	-1.2683193255981586	-1.206985831887038	-1.4893189663454107	-1.1924762169930858	-1.1717745611697068	-1.0876502610710443	-1.2865626708000002	-1.3234685940346296	-1.466822490167344	-1.3330363831968104	-1.385145627952193	-1.8467032413890758	-1.4233904076947832	-1.500916413687334	-1.4644287349828382	-1.45909178959898	-1.386763783802115	-1.5701448718704103	-1.5904520447597612	-1.4791970319280228	0.08636460585366446	-0.0021948872908141848	-0.015706486725657776	-0.02192821805582046	-0.5503447720016712	-0.2525300996789781	-0.23259708808917545	-0.2574429030958003	0.03022717674643083	-0.19428756680902914	-0.3983703107007035	-0.5028017836887169	-0.19263436112802265	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:1723169..1723283,+__1634.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:1723169..1723283,+__1634.1.0.0	rs182961105	-0.72870809220171	-0.737744561523011	-1.987929588269959	-1.2495730145442823	-1.099312224053445	-0.4940144724301722	-0.8737506498787386	-1.2257730039687742	-1.49521114507057	-1.7180267314341555	-1.6163515799229875	-1.005109141092893	-1.1859586836992249	-0.787724988373933	-0.9383292015430578	-1.4932560800790575	-1.1574895884615737	-1.8822510482135533	-0.9373183866411182	-1.101184214327784	-2.0332739928359995	-1.2696256897580855	-1.1407514607233675	-1.2347289456915924	-1.4705473263085638	-1.2872067435798071	-0.059016896172223055	-0.20058464002004672	0.4946735081909015	0.09208342608270859	-0.7829388241601083	-0.443303914210946	-0.22743356444904528	-0.8075009888672253	0.22558545531248453	0.577275270710788	0.3816226342313951	-0.4654381852156708	-0.10124805988058233	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:1723169..1723283,+__1634.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:1723169..1723283,+__1634.1.0.0	rs3134866	-0.72870809220171	-0.737744561523011	-1.987929588269959	-1.2495730145442823	-1.099312224053445	-0.4940144724301722	-0.8737506498787386	-1.2257730039687742	-1.49521114507057	-1.7180267314341555	-1.6163515799229875	-1.005109141092893	-1.1859586836992249	-1.03074729677315	-0.17494207178636156	-0.24171287691417945	-0.658191967039728	-1.4212017901513387	-0.7109655293547474	-0.9004890843381345	-0.28042980599292144	0.07850031791056422	-1.215211346247011	-0.40104513382489804	-0.9987878874073246	-0.6629353726599359	-0.30203920457143996	0.5628024897366495	1.7462167113557796	0.5913810475045542	-0.32188956609789376	-0.21695105692457523	-0.026738434459395832	0.9453431979758528	1.5737114629811342	0.5028153851871444	1.2153064460980896	0.006321253685568351	0.5230233110392891	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr4:1723169..1723283,+__1634.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:1723169..1723283,+__1634.1.0.0	rs182961105,rs3134866,rs3134865	-0.72870809220171	-0.737744561523011	-1.987929588269959	-1.2495730145442823	-1.099312224053445	-0.4940144724301722	-0.8737506498787386	-1.2257730039687742	-1.49521114507057	-1.7180267314341555	-1.6163515799229875	-1.005109141092893	-1.1859586836992249	-0.5216917800249803	-0.7684766370819222	-0.5901493097748964	0.2030932167387396	-0.8099230891739136	-0.6853514361386268	-1.2313539068318975	-0.9134911780038976	-0.47672886516439006	-0.3216082584747672	-0.5286719465344171	-0.17988732164883245	-0.5686867093428168	0.20701631217672967	-0.03073207555891111	1.3977802784950626	1.4526662312830219	0.28938913487953133	-0.1913369637084546	-0.35760325695315887	0.31228182596487664	1.0184822799061801	1.3964184729593883	1.0876796333885705	0.8252218194440605	0.617271974356408	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:38784576..38784690,-__1635.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:38784576..38784690,-__1635.1.0.0	rs10012016	-0.4146271154188925	-0.18027111861050865	-0.5691585164251747	-0.2938868229494008	-0.3271452184622009	-0.2357611619109515	-0.5757405433202106	-0.026751120326920442	-0.27240967527649973	-0.32890668290940306	-0.21902883585841382	-0.2844535850047767	-0.31067836637277946	-0.3354304281386167	0.012229346609995261	-0.1286909545513568	-0.091783345328785	-0.04023475113240972	0.0010483849561961495	-0.18323705008199595	0.08103142432626162	-0.26990723376181547	0.05876754300468395	-0.2569484572165392	-0.23324625301990826	-0.11553348119452417	0.07919668728027585	0.1925004652205039	0.44046756187381786	0.2021034776206158	0.2869104673297912	0.23680954686714767	0.39250349323821465	0.10778254465318206	0.0025024415146842616	0.387674225914087	-0.03791962135812538	0.05120733198486843	0.19514488517825526	0.468411351413	0.237368605078	0.232080506959	0.122558611289	0.0156538458129	0.129198935732	0.0698833862508	0.288805731951	0.809021331888	0.183752894264	0.716953652062	0.21176555971	0.00856173252641	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:38784576..38784690,-__1635.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:38784576..38784690,-__1635.1.0.0	rs10012017	-0.4146271154188925	-0.18027111861050865	-0.5691585164251747	-0.2938868229494008	-0.3271452184622009	-0.2357611619109515	-0.5757405433202106	-0.026751120326920442	-0.27240967527649973	-0.32890668290940306	-0.21902883585841382	-0.2844535850047767	-0.31067836637277946	-0.13513751276187067	0.20997447368456612	-0.14269633805913862	-0.6998158583269148	-0.037020133835223124	7.18525568094916e-05	-0.19605908409476827	-0.01148762615636939	0.006334752921195525	-0.03954466284838879	-0.09732181915623891	0.07262419826705284	-0.0891731464841074	0.27948960265702183	0.3902455922950748	0.42646217836603606	-0.405929035377514	0.2901250846269778	0.235833014467761	0.3796814592254424	0.015263494170551051	0.27874442819769524	0.28936202006101425	0.1217070167021749	0.35707778327182954	0.22150521988867208	0.0719809426143	0.0906800339379	0.0374147936077	0.493479697885	0.00919097005605	0.0201846528804	0.0137430253656	0.270885072145	0.13967914143	0.0785847853765	0.107123399254	0.00275115621019	6.04441912075e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	5.06522322319e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr4:38784576..38784690,-__1635.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:38784576..38784690,-__1635.1.0.0	rs10034903	-0.4146271154188925	-0.18027111861050865	-0.5691585164251747	-0.2938868229494008	-0.3271452184622009	-0.2357611619109515	-0.5757405433202106	-0.026751120326920442	-0.27240967527649973	-0.32890668290940306	-0.21902883585841382	-0.2844535850047767	-0.31067836637277946	-0.33737709926447546	0.025945666982137777	-0.09495546952510406	-0.43724719522676053	-0.3418334892068833	-0.20017380337585267	-0.19125150015757758	-0.17508608926521413	0.01978827939606233	-0.3720463383759852	-0.1944121056104141	-0.1342214596955865	-0.20273921694380445	0.07725001615441707	0.20621678559264642	0.47420304690007065	-0.1433603722773597	-0.014688270744682375	0.03558735853509884	0.38448904316263305	-0.14833496893829368	0.29219795467256204	-0.04313965546658216	0.024616730247999707	0.1502321253091902	0.10793914942897499	0.657696241675	0.276771967065	0.0306357720046	0.957167318493	0.276771967065	0.581967350665	0.125844655769	0.829896383209	0.63839046467	0.727009731456	0.677233097055	0.232080506959	0.473394042096	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr4:38784576..38784690,-__1635.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr4:38784576..38784690,-__1635.1.0.0	rs10012016,rs10012017,rs10034903	-0.4146271154188925	-0.18027111861050865	-0.5691585164251747	-0.2938868229494008	-0.3271452184622009	-0.2357611619109515	-0.5757405433202106	-0.026751120326920442	-0.27240967527649973	-0.32890668290940306	-0.21902883585841382	-0.2844535850047767	-0.31067836637277946	-0.4552302827110395	-0.6902491273415347	-0.502279688006625	-0.830967602246498	-0.2751025800580468	-0.30859948651103963	-0.43204685748034066	-0.08518095880035015	-0.19479432184562112	-0.38654469715586837	-0.25016179608887956	-0.321433731806922	-0.39438259417106375	-0.04060316729214697	-0.509978008731026	0.06687882841854964	-0.5370807792970972	0.05204263840415413	-0.07283832460008813	0.14369368583986997	-0.05842983847342971	0.07761535343087861	-0.05763801424646531	-0.031132960230465745	-0.036980146802145286	-0.08370422779828433	0.819442862795	0.29495293544	0.819442862795	0.248198866138	0.829896383209	0.861430881609	0.633597542154	0.925117039075	0.978575937473	0.591208103411	0.946473618223	0.85089220831	0.996485341773	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:131563449..131563563,-__1636.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:131563449..131563563,-__1636.1.0.0	rs113823725	-0.3564700858058635	-0.6989296175714096	-0.6735931336836395	-1.041880218805896	-0.8944991926488417	-1.0902615909016418	-1.1157260817961907	-1.0549773531156963	-0.645110098518106	-0.8067360573934274	-0.8656349014207263	-0.4733366336029953	-0.8097629137720362	-0.5529140809937118	-1.3888275694135697	-1.0270115060367664	-1.4732091043330229	-1.1356578356844595	-1.4341785778414495	-1.0724352911120825	-0.9807472095370948	-0.8477628946156051	-1.1033425625214717	-1.01378432121136	-1.0346090087996087	-1.0887066635083504	-0.19644399518784827	-0.6898979518421601	-0.3534183723531269	-0.4313288855271269	-0.24115864303561785	-0.34391698693980777	0.04329079068410824	0.07423014357860147	-0.2026527960974991	-0.2966065051280443	-0.14814941979063367	-0.5612723751966133	-0.27894374973631403	0.170821264488	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.170821264488	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:135382964..135383078,+__1637.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:135382964..135383078,+__1637.1.0.0	rs1442	-1.6992345417445625	-1.7392812409994984	-1.6116503426466078	-1.4958647628954225	-1.4336834851780969	-1.6732923687328518	-1.5852700671761122	-1.2630417718798563	-1.7384356622878099	-1.5095622463263785	-1.8226567942616672	-1.9230838589628272	-1.624588095257641	-0.8769213964007104	-1.0246951720180308	-1.5313678424421115	-1.546456148346553	-1.2480904295105764	-1.574435848401328	-1.4338514153188562	-1.6203459901961752	-1.6946110564614256	-1.5580589269499037	-1.7800034572837804	-1.5177266977502932	-1.4505470317566456	0.822313145343852	0.7145860689814676	0.08028250020449623	-0.05059138545113062	0.1855930556675205	0.0988565203315237	0.151418651857256	-0.35730421831631887	0.043824605826384255	-0.04849668062352519	0.04265333697788676	0.40535716121253396	0.17404106350099555	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:140027180..140027294,-__1638.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:140027180..140027294,-__1638.1.0.0	rs778593	-0.19576151141125422	0.20465165831875087	0.10673517231681584	-0.20813506767824977	0.1177602392357259	-0.021416726002687358	0.048466148222040754	-0.05068184288015936	0.29764889463503685	0.06742208673706002	0.11264138563634477	0.0036717324442997468	0.040250180797810335	-0.1252460065708101	-0.21768580353614547	-0.1160574824404307	-0.3921690767526683	-0.1914776652673228	-0.17313662952136344	-0.30741986813198496	-0.11532818765796282	0.011012682446283013	0.060059594826097705	0.009548481043814738	-0.15523204967114484	-0.1427610009361365	0.07051550484044414	-0.42233746185489635	-0.22279265475724652	-0.18403400907441855	-0.30923790450304867	-0.1517199035186761	-0.3558860163540257	-0.06464634477780346	-0.28663621218875385	-0.007362491910962311	-0.10309290459253002	-0.1589037821154446	-0.18301118173394681	0.609889042629	0.143314270352	0.657696241675	0.301187193336	0.313917214294	0.202104162379	0.0350255264852	0.619326784864	0.13967914143	0.788281320858	0.188220673538	0.132622250874	0.0414286659155	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:140186577..140186691,+__1639.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:140186577..140186691,+__1639.1.0.0	rs4151680	-1.168560636869996	-1.5258242422088708	-1.3453184511275984	-1.0639772579100546	-1.4263588624418375	-1.2540773304524557	-0.9773161453301984	-1.5367497340708318	-1.3547256005657753	-1.2128893747865084	-1.2087278794675274	-1.7558469147050215	-1.319197702494723	-1.1154728356503891	-1.2285094717120608	-1.3715989879259944	-1.2058467128432528	-1.2547916616970718	-0.8773499020510935	-0.8416608969033377	-0.7935188062627153	-0.9171748783136056	-1.560875998869978	-1.4319705073344178	-1.7579650339303754	-1.1963946411245243	0.05308780121960677	0.29731477049681	-0.026280536798396037	-0.14186945493319825	0.17156720074476572	0.3767274284013622	0.13565524842686072	0.7432309278081165	0.43755072225216973	-0.3479866240834697	-0.22324262786689042	-0.002118119225353876	0.12280306137019864	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:156390202..156390316,-__1640.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:156390202..156390316,-__1640.1.0.0	rs6882076	-0.7802658826043918	-0.7296947909925002	-1.199651337819738	-0.4517593476829838	-0.6356874683037527	-0.8849168606382594	-0.454163471295272	-0.8817602102313914	-0.7432377440288955	-0.5589311360519956	-0.6551326400383475	-1.1589721316899493	-0.7611810851147899	-1.023657148682131	-0.7849490879349663	-1.163817024742244	-0.7572211294830593	-1.2384885142568018	-0.6683835597996339	-0.9844655954075656	-1.235484888275916	-1.1914852094144115	-0.9265886036610663	-0.9593465678108718	-1.2215981512497522	-1.0129571233932018	-0.2433912660777393	-0.055254296942466086	0.03583431307749407	-0.3054617818000755	-0.6028010459530492	0.21653330083862543	-0.5303021241122936	-0.35372467804452457	-0.44824746538551596	-0.3676574676090707	-0.3042139277725243	-0.06262601955980296	-0.2517760382784119	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.412754243182	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.412754243182	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:159846053..159846167,-__1641.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:159846053..159846167,-__1641.1.0.0	rs17057781	3.4669033666779803	3.979366517374195	3.204069122539323	3.0247552108733107	3.3828281866065106	3.380574000466231	3.149273817796341	3.3980725537820256	3.301901133564832	3.4198334128475407	3.4530260367781604	3.3194590536051125	3.373338534409297	3.5945195468773616	4.061936794525128	3.445878488512041	3.200258886715668	3.599206369052938	3.4856075846269565	3.4139620557130135	3.6697908919540954	3.4638024230591915	3.5808953829965864	3.5585462504159535	3.5298495198110467	3.550354516188331	0.12761618019938137	0.0825702771509329	0.24180936597271785	0.17550367584235715	0.21637818244642748	0.10503358416072572	0.2646882379166726	0.2717183381720698	0.16190128949435945	0.16106197014904566	0.10552021363779307	0.21039046620593416	0.17701598177903477	0.493479697885	0.119339994516	0.0678362651725	0.104229562843	0.107123399254	0.202104162379	0.0678362651725	0.158583637061	0.301187193336	0.265084565602	0.405136064622	0.0906800339379	0.000588783424168	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.493400509453	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:172198163..172198277,-__1642.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:172198163..172198277,-__1642.1.0.0	rs117012610	0.45078800901928917	0.5999383095817508	0.2916707942737141	0.32681551514526774	0.23084992968770174	0.4011649881793655	0.26086557969702256	0.7897986064931833	0.5956131700008497	0.24978862676810035	0.394579277816996	0.5125448908173653	0.4253681414567172	0.7898053828408851	0.7314289911851639	0.7784262501558159	0.4624035549169503	0.6866515301550542	0.7801892240078921	0.8988415439022261	0.8399542074864121	0.4438942655824076	0.8126259166654002	0.6044570134131542	0.6592295766226149	0.7073256214111647	0.3390173738215959	0.13149068160341315	0.4867554558821018	0.13558803977168254	0.45580160046735246	0.3790242358285266	0.6379759642052036	0.0501556009932288	-0.1517189044184421	0.5628372898972999	0.2098777355961582	0.14668468580524963	0.28195747995444753	0.563691144959	0.619326784864	0.232075162485	0.85089220831	0.202104162379	0.840380101088	0.545696106059	0.90381429355	0.510582765025	0.313917214294	0.259370210024	0.493479697885	0.639022224076	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:172198163..172198277,-__1642.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:172198163..172198277,-__1642.1.0.0	rs34163272	0.45078800901928917	0.5999383095817508	0.2916707942737141	0.32681551514526774	0.23084992968770174	0.4011649881793655	0.26086557969702256	0.7897986064931833	0.5956131700008497	0.24978862676810035	0.394579277816996	0.5125448908173653	0.4253681414567172	0.42544417326985745	-0.056779565451838654	-0.07658666977808015	0.25083526016784313	0.2561191103363021	0.4069123053517915	0.028598496040862436	0.29163933760813837	0.24295205535006476	0.19045483087411702	0.09254769600240058	0.11923310020867217	0.1809475108316776	-0.02534383574943172	-0.6567178750335894	-0.36825746405179427	-0.07598025497742461	0.025269180648600342	0.005747317172425992	-0.23226708365616014	-0.49815926888504497	-0.3526611146507849	-0.05933379589398333	-0.3020315818145954	-0.39331179060869315	-0.2444206306250396	0.8931878581	0.0177919446404	0.179359171012	0.452098798395	0.925117039075	0.747262025795	0.129198935732	0.183752894264	0.265084565602	0.510582765025	0.412754243182	0.0856734395523	0.123468166822	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr5:172198163..172198277,-__1642.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:172198163..172198277,-__1642.1.0.0	rs117012610,rs34163272	0.45078800901928917	0.5999383095817508	0.2916707942737141	0.32681551514526774	0.23084992968770174	0.4011649881793655	0.26086557969702256	0.7897986064931833	0.5956131700008497	0.24978862676810035	0.394579277816996	0.5125448908173653	0.4253681414567172	0.8312784222333635	1.1835433533001758	0.6419085552267367	0.13727224386798678	0.5732005276634043	0.5161805633444015	0.6149917128233909	0.9664636963311972	0.9444799205662056	0.9071042350971966	0.5392856665932765	0.7379312016973253	0.7161366748953885	0.3804904132140743	0.583605043718425	0.3502377609530226	-0.18954327127728096	0.3423505979757026	0.11501557516503602	0.35412613312636837	0.17666508983801388	0.3488667505653559	0.6573156083290963	0.1447063887762805	0.22538631087995997	0.2907685334386712	0.0774477122405	0.0638899216795	0.0362012288315	0.326996172605	0.0350255264852	0.501992688725	0.129198935732	0.197395731844	0.0741297894045	0.0168468410067	0.0906800339379	0.677233097055	5.32785625385e-05	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.0120942336962	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:177019193..177019307,+__1643.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:177019193..177019307,+__1643.1.0.0	rs57960711	-0.05177862658929185	0.1986340073598981	0.23956708017026063	-0.07563998472142631	0.1362245001927996	0.10572066327033383	0.2000069286526028	0.31303082680253824	0.18685076180607152	0.343594297772666	0.2906748427774595	0.24193718884686566	0.17740187386173148	0.916963970059668	1.1260534626508392	0.9132425037898618	0.6942990403537546	0.9750568770462774	0.9148879561426368	0.6540861681426041	0.9994991737377954	1.0774678801759223	1.031137058328394	0.9482980570696904	0.8275313226463455	0.9232102891786491	0.9687425966489599	0.927419455290941	0.6736754236196012	0.7699390250751809	0.8388323768534778	0.809167292872303	0.4540792394900013	0.6864683469352572	0.8906171183698508	0.687542760555728	0.6576232142922309	0.5855941337994799	0.7458084153169177	0.000170183141363	5.31875791367e-06	4.98941474284e-06	6.04095401414e-06	6.10128619781e-09	1.53272450794e-06	0.00342117348194	6.04095401414e-06	0.000413457613232	2.79850783474e-05	0.000116396943443	0.000161276729747	1.6814514748e-45	0.120489664085	0.00395715588777	0.00371711398341	0.00445218310842	4.71019294471e-06	0.00117100152407	1	0.00439177356828	0.319602735029	0.0219682865027	0.0895092495077	0.125634572473	1.40905633588e-42	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	not sig	sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:179125324..179125438,+__1644.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:179125324..179125438,+__1644.1.0.0	rs4701195	0.24513033175769824	0.3925697635029566	0.18768029534948258	0.20130949572346918	0.3026191355374337	0.2655399575554594	0.23698027512818157	-0.059389243525495135	0.14850643843948497	0.18645205972020634	0.28109388260393475	0.34024309927287477	0.22739462425547388	-0.15552802169054564	0.047837760999799875	0.003814073379618218	-0.06937892388586052	-0.16043180117313416	-0.19348913538419796	-0.13700329461866656	-0.22365363168828403	-0.053072892838031266	-0.04469874367601616	0.03632622054410489	-0.16412357034219505	-0.09278349669778402	-0.40065835344824385	-0.3447320025031567	-0.18386622196986435	-0.2706884196093297	-0.46305093671056785	-0.4590290929396573	-0.3739835697468481	-0.1642643881627889	-0.20157933127751623	-0.23115080339622252	-0.24476766205982986	-0.5043666696150698	-0.320178120953258	0.0583274625199	0.0601351299193	0.162586850726	0.125844655769	0.00313710581496	0.0125089884503	0.0484054419273	0.175053819161	0.183752894264	0.0565651674203	0.107123399254	0.00210630874131	1.05039664324e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	8.80232387036e-06	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:58571872..58571986,-__1645.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:58571872..58571986,-__1645.1.0.0	rs13328226	-1.1515753394396873	-1.2082852246867573	-1.2621641487836754	-1.1857209702698512	-1.1294884703262813	-1.266455703800383	-1.3711772400475795	-1.1427392503477265	-1.1228187841458444	-0.9492173319174958	-1.3301886358876012	-1.563714604723171	-1.2236288086980045	-1.287948495333849	-1.114599940212665	-1.2653866666419242	-1.086422144047513	-1.2930914445539503	-0.8814615288211879	-1.324718679833425	-1.2328082646514622	-1.1512157635472082	-1.2565566084066109	-0.8631642170823535	-0.8923284577877442	-1.1374751842433244	-0.13637315589416166	0.0936852844740923	-0.0032225178582487857	0.09929882622233821	-0.163602974227669	0.3849941749791951	0.04645856021415451	-0.0900690143037357	-0.028396979401363875	-0.3073392764891151	0.4670244188052477	0.6713861469354268	0.08615362445468004	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:58571872..58571986,-__1645.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:58571872..58571986,-__1645.1.0.0	rs528418672	-1.1515753394396873	-1.2082852246867573	-1.2621641487836754	-1.1857209702698512	-1.1294884703262813	-1.266455703800383	-1.3711772400475795	-1.1427392503477265	-1.1228187841458444	-0.9492173319174958	-1.3301886358876012	-1.563714604723171	-1.2236288086980045	-1.1666050400998909	-1.3149765200220616	-1.1344674895114917	-1.3155970996180741	-1.0223979644119527	-0.9154497682414222	-1.003345822273499	-1.2701455566113213	-1.2052629759156468	-1.091453423461751	-1.1672808004671176	-0.9154782285987426	-1.1268717241027477	-0.015029700660203593	-0.1066912953353043	0.12769665927218377	-0.1298761293482229	0.10709050591432856	0.35100593555896076	0.36783141777408046	-0.12740630626359484	-0.08244419176980244	-0.1422360915442552	0.1629078354204836	0.6482363761244283	0.09675708459525685	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr5:58571872..58571986,-__1645.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:58571872..58571986,-__1645.1.0.0	rs13328226,rs528418672	-1.1515753394396873	-1.2082852246867573	-1.2621641487836754	-1.1857209702698512	-1.1294884703262813	-1.266455703800383	-1.3711772400475795	-1.1427392503477265	-1.1228187841458444	-0.9492173319174958	-1.3301886358876012	-1.563714604723171	-1.2236288086980045	-1.2626044836933055	-1.3613256862943326	-1.0884582463181485	-1.0639532945733603	-1.2349070089973837	-1.3781539899324011	-1.3030279581571593	-1.0808382163857897	-1.2388623003443928	-1.1197803015714007	-1.1214959213907176	-0.9999261492162298	-1.1877777964062184	-0.1110291442536182	-0.15304046160757534	0.17370590246552697	0.12176767569649094	-0.1054185386711024	-0.11169828613201815	0.06814928189042013	0.0619010339619368	-0.11604351619854847	-0.17056296965390494	0.20869271449688354	0.5637884555069411	0.035851012291786	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:83016639..83016753,-__1646.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:83016639..83016753,-__1646.1.0.0	rs72772959	-0.8920969446542548	-1.121909628565585	-1.1424345131270548	-0.8847863721430347	-0.972442655556468	-0.8422234431841242	-1.1441102587849126	-1.072451990564017	-0.8245363030877524	-0.9912731454912218	-0.8887558476665471	-0.6481818468789301	-0.9521002458086586	-1.3863215668833702	-1.0143533038267762	-1.4830618175502917	-1.0564509694010515	-1.2001826894967775	-1.1084139776184179	-1.50109583362675	-1.2507332319941187	-0.976077877020022	-1.4095186142339924	-1.4275457368718527	-1.3524542724414852	-1.2638508242470754	-0.49422462222911534	0.10755632473880872	-0.34062730442323685	-0.17166459725801686	-0.2277400339403095	-0.26619053443429364	-0.35698557484183735	-0.1782812414301016	-0.15154157393226964	-0.4182454687427706	-0.5387898892053056	-0.7042724255625551	-0.31175057843841697	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:83016639..83016753,-__1646.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:83016639..83016753,-__1646.1.0.0	rs3734092	-0.8920969446542548	-1.121909628565585	-1.1424345131270548	-0.8847863721430347	-0.972442655556468	-0.8422234431841242	-1.1441102587849126	-1.072451990564017	-0.8245363030877524	-0.9912731454912218	-0.8887558476665471	-0.6481818468789301	-0.9521002458086586	-0.6693576601889883	-1.2915477888613294	-1.0000621599689956	-0.912867319125948	-0.9461711196433938	-1.1810154953691336	-1.1824487354787416	-0.7126468170083086	-0.6459159688323708	-1.0220768132995517	-1.0555564102530566	-0.8812189148101623	-0.9584071002366651	0.22273928446526647	-0.1696381602957444	0.14237235315805918	-0.028080946982913302	0.026271535913074184	-0.3387920521850094	-0.03833847669382906	0.3598051735557085	0.1786203342553816	-0.030803667808329882	-0.16680056258650944	-0.23303706793123224	-0.0063068544280064824	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0808926541269	0.375513989452	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.112438516422	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr5:83016639..83016753,-__1646.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:83016639..83016753,-__1646.1.0.0	rs72772959,rs3734092	-0.8920969446542548	-1.121909628565585	-1.1424345131270548	-0.8847863721430347	-0.972442655556468	-0.8422234431841242	-1.1441102587849126	-1.072451990564017	-0.8245363030877524	-0.9912731454912218	-0.8887558476665471	-0.6481818468789301	-0.9521002458086586	-1.1169240547804808	-1.4021608037649618	-1.1612821714962145	-1.3035913218441832	-1.2050503569318638	-0.9734681454418588	-1.3022958442077386	-0.9035563956500439	-1.313204855944157	-1.3613256862943326	-1.2882566405404834	-1.1018258660929872	-1.2027451785824421	-0.22482711012622603	-0.2802511751993768	-0.018847658369159692	-0.41880494970114857	-0.23260770137539577	-0.13124470225773455	-0.158185585422826	0.1688955949139732	-0.48866855285640454	-0.3700525408031108	-0.39950079287393625	-0.45364401921405706	-0.2506449327737836	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:94982403..94982517,+__1647.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:94982403..94982517,+__1647.1.0.0	rs11958444	1.1341569177031754	1.0116870103599302	0.9684818215487412	0.8578408097623453	0.9842747459233172	0.6992177213781933	1.1288202669243692	1.004415484253071	1.0323231411625258	0.9138015873169416	1.0349257398761282	1.2989628127930146	1.005742338250146	0.8451497550220789	1.3067209760789238	1.1077307287894396	0.656841510673384	0.9351201974339545	1.0917031489974558	1.1238764605042633	1.3428282986983957	1.045376249864806	1.102587562168632	1.2176262178378567	1.0453372140354038	1.0684081933420495	-0.2890071626810965	0.29503396571899354	0.13924890724069838	-0.2009992990889613	-0.04915454848936274	0.39248542761926253	-0.004943806420105945	0.3384128144453247	0.01305310870228027	0.18878597485169046	0.1827004779617285	-0.2536255987576108	0.06266585509190342	0.117751513663	0.79863356553	0.809021331888	0.313917214294	0.412754243182	0.840380101088	0.572790257636	0.788278954998	0.242741268695	0.468411351413	0.572794651112	0.0258200569765	0.415429147851	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr5:94982403..94982517,+__1647.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:94982403..94982517,+__1647.1.0.0	rs112180629	1.1341569177031754	1.0116870103599302	0.9684818215487412	0.8578408097623453	0.9842747459233172	0.6992177213781933	1.1288202669243692	1.004415484253071	1.0323231411625258	0.9138015873169416	1.0349257398761282	1.2989628127930146	1.005742338250146	1.7732694959890791	1.1967743660604857	1.0813701999196814	1.4161478239314762	1.1345004512031185	0.5188754495445281	0.9824036445669024	0.9029512516046695	1.1750273072701476	1.1836670761308488	1.363543076401242	1.3491364356950968	1.1731388815264399	0.6391125782859037	0.18508735570055546	0.11288837837094023	0.5583070141691309	0.15022570527980128	-0.18034227183366514	-0.14641662235746677	-0.10146423264840154	0.14270416610762182	0.26986548881390715	0.3286173365251137	0.05017362290208216	0.16739654327629358	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr5:94982403..94982517,+__1647.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr5:94982403..94982517,+__1647.1.0.0	rs11958444,rs112180629	1.1341569177031754	1.0116870103599302	0.9684818215487412	0.8578408097623453	0.9842747459233172	0.6992177213781933	1.1288202669243692	1.004415484253071	1.0323231411625258	0.9138015873169416	1.0349257398761282	1.2989628127930146	1.005742338250146	0.941052496436424	1.2528065076806882	0.7546963948138038	0.9770608894212928	1.2358757773822455	1.137453663460891	0.8359857245203379	0.8360765268478771	0.7431240710670377	1.11104858629088	1.0007479101326844	1.4411190270134184	1.022253964588965	-0.19310442126675142	0.241119497320758	-0.2137854267349374	0.11922007965894743	0.2516010314589283	0.43823594208269767	-0.2928345424040313	-0.1683389574051939	-0.28919907009548806	0.1972469989739385	-0.034177829743443855	0.1421562142204038	0.016511626338818985	0.624065454014	0.716953652062	0.978575937473	0.757455001208	0.777966336216	0.563691144959	0.819438800318	0.667432913386	0.554648875068	0.545696106059	0.87199428352	0.436112310787	0.97997077724	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:111580462..111580576,+__1648.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:111580462..111580576,+__1648.1.0.0	rs11153277	1.605302641653124	1.8485807471762534	1.5602937166601254	1.4073591439646498	1.6397135351539247	1.7056768624404177	1.6039544882643084	1.7914191513141093	1.7238484658036808	1.6120212574835644	1.8090399237370325	1.6593835254260174	1.6638827882564342	1.5627732133177976	1.7217085366350147	1.431970320358205	1.2046773158892625	1.5642897529010271	1.513510096942241	1.4665430511497828	1.5776292603601116	1.5378762830792292	1.439912934543045	1.5528957588299002	1.4856385785768493	1.5049520918818724	-0.04252942833532636	-0.12687221054123876	-0.12832339630192036	-0.20268182807538726	-0.07542378225289759	-0.19216676549817668	-0.13741143711452564	-0.2137898909539977	-0.1859721827244516	-0.17210832294051936	-0.2561441649071323	-0.17374494684916808	-0.1589306963745618	0.628827692687	0.270885072145	0.265084565602	0.301187193336	0.183752894264	0.0932701621097	0.129198935732	0.0763307839553	0.232080506959	0.0374147936077	0.0338805621681	0.0531733827136	0.000221996683085	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.186033220425	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:127898239..127898353,+__1649.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:127898239..127898353,+__1649.1.0.0	rs9388590	-1.1700214116001202	-1.1233648466207826	-0.9613608733666738	-1.5742578405960093	-1.2354234084030753	-1.0137043254029094	-1.4160994823416848	-1.6632590648494443	-0.8616226135007798	-1.5242961407788516	-1.1440098820428457	-0.7060515133512082	-1.1994559502378654	-1.4127582291589282	-0.8530349963861805	-1.1675049760501608	-1.2472250818445705	-1.1731621422231715	-1.133681542553358	-1.2407409737009818	-1.1599332386899546	-1.2688137515816926	-0.9467374726028026	-1.3422088496099558	-1.1888094025800302	-1.1778842214151488	-0.24273681755880805	0.2703298502346021	-0.20614410268348704	0.3270327587514388	0.062261266179903796	-0.11997721715044851	0.17535850864070301	0.5033258261594897	-0.4071911380809128	0.577558668176049	-0.19819896756711008	-0.482757889228822	0.02157172882271649	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:170102090..170102204,-__1651.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:170102090..170102204,-__1651.1.0.0	rs74900588	2.6505477137909192	2.561026149236073	2.488595959406469	2.3389201116005838	2.607716780295937	2.639148942633685	2.5955221187400768	2.588284183391687	2.5921023172695454	2.7190889970276757	2.674068371345573	2.738562751389032	2.599465366343938	2.565850500625795	2.8793390574638877	2.6615259914227356	2.1529499692223446	2.645806508549462	2.653294999266382	2.7156544858761014	3.037515238877799	2.9018252953450663	2.8617369931045693	2.8146188326557504	3.0052128327386765	2.7412775587623806	-0.08469721316512446	0.3183129082278149	0.17293003201626655	-0.18597014237823917	0.03808972825352486	0.014146056632696968	0.1201323671360246	0.44923105548611186	0.30972297807552085	0.1426479960768936	0.14055046131017734	0.26665008134964463	0.1418121924184427	0.79863356553	0.648013768535	0.554657938956	0.747262025795	0.591208103411	0.510582765025	0.989287003123	0.192768091005	0.428242856315	0.788281320858	0.946473618223	0.76769033028	0.972956713508	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:170102142..170102256,+__1652.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:170102142..170102256,+__1652.1.0.0	rs74900588	3.7696164930418696	4.117464488405353	3.447304150851286	3.2836887098325787	3.743644723343901	3.8057534889365	3.379680917394236	3.752729896283443	3.8344418688937214	3.8751958371155975	3.824484565174113	3.894873018732664	3.727406513167105	3.646565229957094	4.06226358931376	3.524849338736945	3.165915765620216	3.6864237466475203	3.7407727961868407	3.3925029747697577	3.7752959591649464	3.880973736408133	3.7212059984929073	3.778960027758969	3.8194571732926783	3.682932194695814	-0.12305126308477554	-0.055200899091592426	0.07754518788565878	-0.11777294421236251	-0.05722097669638071	-0.06498069274965923	0.012822057375521556	0.022566062881503424	0.04653186751441174	-0.1539898386226901	-0.04552453741514384	-0.07541584543998558	-0.044474318471291206	0.347268461228	0.545696106059	0.757455001208	0.527990680582	0.361218104761	0.354199901149	0.677233097055	0.657696241675	0.375513989452	0.361218104761	0.501992688725	0.301187193336	0.435664117379	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:24495001..24495115,+__1653.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:24495001..24495115,+__1653.1.0.0	rs115424863	-0.7530125045550546	-0.4895613137097134	-0.4577241021846426	-0.9519792546804998	-0.8900480555312692	-1.288335346671566	-1.241289457540165	-0.6172163087725797	0.03001243167516618	-0.6665999064253385	-0.3151223449091032	-0.47522847187419603	-0.6763420529315801	-0.9903806824767343	-0.5484358778126509	-0.2673207196338713	-1.2747576299131445	-0.7167235018130145	-0.8893144363051848	-1.3405692857587146	-1.4807674556054196	-1.1931844501535678	-0.679876771889983	-1.458624857857124	-1.4770493087178105	-1.0264170814947684	-0.23736817792167964	-0.05887456410293751	0.19040338255077133	-0.32277837523264463	0.17332455371825473	0.3990209103663811	-0.09927982821854964	-0.8635511468328398	-1.223196881828734	-0.01327686546464446	-1.1435025129480207	-1.0018208368436143	-0.3500750285631881	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:24495001..24495115,+__1653.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:24495001..24495115,+__1653.1.0.0	rs4646830	-0.7530125045550546	-0.4895613137097134	-0.4577241021846426	-0.9519792546804998	-0.8900480555312692	-1.288335346671566	-1.241289457540165	-0.6172163087725797	0.03001243167516618	-0.6665999064253385	-0.3151223449091032	-0.47522847187419603	-0.6763420529315801	-0.9083722765248277	-0.5553472964151963	-1.0590107603281962	-0.899314444586894	-0.8374804191932242	-1.2333851498498039	-1.427989463428291	-0.943048121464773	-0.7396588769912409	-1.1830725473375412	-0.9821305595108756	-0.9173811060028066	-0.973849251802806	-0.15535977196977302	-0.06578598270548291	-0.6012866581435536	0.052664810093605796	0.052567636338044954	0.054950196821762054	-0.18670000588812607	-0.3258318126921933	-0.7696713086664071	-0.5164726409122027	-0.6670082146017724	-0.4421526341286106	-0.29750719887122573	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:24495001..24495115,+__1653.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:24495001..24495115,+__1653.1.0.0	rs4646831	-0.7530125045550546	-0.4895613137097134	-0.4577241021846426	-0.9519792546804998	-0.8900480555312692	-1.288335346671566	-1.241289457540165	-0.6172163087725797	0.03001243167516618	-0.6665999064253385	-0.3151223449091032	-0.47522847187419603	-0.6763420529315801	0.3120575245608212	-0.647788566059954	-0.8375708832731176	-0.8406269734306466	-0.7743037861500572	-0.7109655293547474	-1.0509629289014495	-0.27504555581286705	-0.6267193658956899	-0.41544161241894517	-0.7224573734436713	-0.300402790099871	-0.574185653356683	1.065070029115876	-0.15822725235024065	-0.37984678108847497	0.11135228124985319	0.11574426938121196	0.5773698173168185	0.19032652863871546	0.34217075295971267	-0.6567317975708561	0.25115829400639333	-0.40733502853456816	0.17482568177432506	0.10215639957489714	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr6:24495001..24495115,+__1653.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:24495001..24495115,+__1653.1.0.0	rs4646829,rs115424863,rs4646830,rs4646831	-0.7530125045550546	-0.4895613137097134	-0.4577241021846426	-0.9519792546804998	-0.8900480555312692	-1.288335346671566	-1.241289457540165	-0.6172163087725797	0.03001243167516618	-0.6665999064253385	-0.3151223449091032	-0.47522847187419603	-0.6763420529315801	-1.1678590578730974	-0.8004352624090285	-1.0862568040557683	-0.8048556262994856	-0.7864181227446486	-1.1141149421713676	-1.032286885350037	-1.3035850844394503	-1.022173955409751	-0.8706146101469627	-0.8991640275977054	-1.2453897642411267	-1.0110961785615358	-0.41484655331804277	-0.3108739486993151	-0.6285327018711258	0.14712362838101423	0.10362993278662058	0.17422040450019827	0.20900257219012786	-0.6863687756668706	-1.0521863870849173	-0.20401470372162422	-0.5840416826886022	-0.7701612923669306	-0.3347541256299556	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:24495029..24495143,+__1654.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:24495029..24495143,+__1654.1.0.0	rs4646830	-0.6373416150636382	-0.3456939224477622	-0.6331177848488702	-0.46945135525993786	-0.6142751369404281	-0.6741375949092508	-0.2002060297886364	-0.33228636562766917	-0.29120991653493555	-0.48973684141365337	-0.44800344227212163	-0.4576394022763854	-0.4660916172819407	-0.9070328782038568	-0.3136330995875688	-0.2383801487921656	-0.44012275431720776	-0.5243090600723624	-0.584525450364929	-0.5123756661808865	-0.42972981345121536	-0.3989017907110905	-0.26752861363433905	-0.5685204584868995	-0.4981913244883144	-0.4736042548575697	-0.26969126314021863	0.032060822860193405	0.39473763605670453	0.0293286009427301	0.08996607686806568	0.08961214454432187	-0.31216963639225004	-0.09744344782354619	-0.10769187417615494	0.22220822777931432	-0.12051701621477784	-0.04055192221192899	-0.007512637575628894	0.24003896129	0.893186642743	0.21176555971	0.701958331003	0.946473618223	0.333666485083	0.861429311442	0.914457985151	0.840380101088	0.288805731951	0.354199901149	0.85089220831	0.925943263512	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:24495029..24495143,+__1654.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:24495029..24495143,+__1654.1.0.0	rs4646831	-0.6373416150636382	-0.3456939224477622	-0.6331177848488702	-0.46945135525993786	-0.6142751369404281	-0.6741375949092508	-0.2002060297886364	-0.33228636562766917	-0.29120991653493555	-0.48973684141365337	-0.44800344227212163	-0.4576394022763854	-0.4660916172819407	-0.6082569303094075	-0.2951836661511113	-0.41069808929578105	-0.5490438425558554	-0.5008495442532493	-0.2952388133081718	-0.28180886329852983	-0.5648297842060681	-0.4140156686208031	-0.351606656004373	-0.23496154620178442	-0.4272343703175072	-0.4111439812102202	0.02908468475423065	0.0505102562966509	0.2224196955530891	-0.0795924872959175	0.11342559268717878	0.37889878160107904	-0.08160283350989342	-0.23254341857839894	-0.12280575208586753	0.13813018540928035	0.21304189607033722	0.03040503195887817	0.05494763607172056	0.510582765025	0.5192442797	0.809021331888	0.788281320858	0.581967350665	0.436112310787	0.893185427345	0.893186642743	0.347268461228	0.226876581559	0.0698833862508	0.687084607526	0.732777189	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr6:24495029..24495143,+__1654.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:24495029..24495143,+__1654.1.0.0	rs4646830,rs4646831	-0.6373416150636382	-0.3456939224477622	-0.6331177848488702	-0.46945135525993786	-0.6142751369404281	-0.6741375949092508	-0.2002060297886364	-0.33228636562766917	-0.29120991653493555	-0.48973684141365337	-0.44800344227212163	-0.4576394022763854	-0.4660916172819407	-0.6097644045049734	-0.2356543541329424	-0.30054275205141096	-0.4027448413253407	-0.3893426714883517	-0.6044351411005907	-0.0860276827299043	-0.22210171029582493	-0.4252037055223447	-0.2268722356419925	-0.08875549243165091	-0.2568872866618037	-0.32069435649059425	0.0275772105586648	0.11003956831481981	0.3325750327974592	0.06670651393459714	0.2249324654520764	0.06970245380866014	0.11417834705873212	0.11018465533184424	-0.13399378898740916	0.2628646057716609	0.3592479498404707	0.20075211561458167	0.1453972607913465	0.914457985151	0.809019187976	0.237368605078	0.472534754287	0.468406259835	0.382791178922	0.468406259835	0.276771967065	0.727009731456	0.219222323973	0.00641629102443	0.536806685117	0.26676288999	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:26189305..26189419,-__1655.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:26189305..26189419,-__1655.1.0.0	rs13204572	1.7875757192606931	2.0555166221783043	1.2522525189815144	1.3645658424394955	1.3539059695317748	1.119681270078272	1.6544807726803623	3.1807541473721925	1.4209288050570308	1.3838271258484791	1.042970973673529	1.3756452644261632	1.5826754192939845	1.8452594212757796	1.8118895068580114	1.1632377484404084	1.1227387346805564	1.396764854036181	1.0316278732645001	1.5904393009233977	3.348115129080006	1.2405632725904003	1.3979668471346267	1.1304879767398877	1.3443571402291337	1.5352873171044077	0.057683702015086435	-0.2436271153202929	-0.08901477054110596	-0.24182710775893912	0.042858884504406225	-0.08805339681377178	-0.06404147175696462	0.16736098170781366	-0.18036553246663045	0.0141397212861476	0.08751700306635857	-0.03128812419702953	-0.04738810218957682	0.677233097055	0.326996172605	0.460214637573	0.493479697885	0.925117039075	0.368322877114	0.436112310787	0.687084607526	0.87199428352	0.554657938956	0.452098798395	0.752350373358	0.819262715204	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr6:26189305..26189419,-__1655.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:26189305..26189419,-__1655.1.0.0	rs79868973,rs78735537,rs13204572	1.7875757192606931	2.0555166221783043	1.2522525189815144	1.3645658424394955	1.3539059695317748	1.119681270078272	1.6544807726803623	3.1807541473721925	1.4209288050570308	1.3838271258484791	1.042970973673529	1.3756452644261632	1.5826754192939845	1.9295224954869985	1.9096503327664722	1.20299701094567	1.0228183855967452	1.5142243350108444	1.1273835020092422	1.5602057759118424	3.42789932688372	1.4323509903739384	1.184072728441122	1.0683493563398103	1.3040199610022363	1.5569578500640535	0.14194677622630536	-0.1458662894118321	-0.04925550803584433	-0.3417474568427503	0.16031836547906964	0.007702231930970305	-0.09427499676851991	0.2471451795115276	0.01142218531690764	-0.199754397407357	0.02537838266628123	-0.07162530342392692	-0.025717569229930737	0.777966336216	0.60051573606	0.79863356553	0.192768091005	0.519249062249	0.687084607526	0.563691144959	0.829896383209	0.978575937473	0.129198935732	0.747262025795	0.519249062249	0.889964618883	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:27775672..27775786,-__1656.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:27775672..27775786,-__1656.1.0.0	rs200485	-1.5444664507514525	-1.2690413119101305	-1.5850826853556639	-1.2780278514992545	-1.2363954882358454	-1.5149588268951206	-1.3828169188437474	-1.218133388798383	-1.7499426916212546	-1.4185010665100077	-1.3824946296637912	-1.4195256306441508	-1.416615578394067	-1.2916575901889105	-1.0570943649554143	-1.188606034597801	-1.3855785423797178	-1.2230030875231408	-1.313900484956356	-1.2938344038583476	-0.9878606974509969	-1.0823299020777686	-1.1855107249228338	-1.203198752718662	-1.0917231928035087	-1.1920248148694548	0.25280886056254204	0.21194694695471616	0.396476650757863	-0.10755069088046332	0.013392400712704644	0.2010583419387646	0.08898251498539977	0.23027269134738604	0.667612789543486	0.2329903415871739	0.17929587694512916	0.3278024378406421	0.22459076352461202	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr6:27775672..27775786,-__1656.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:27775672..27775786,-__1656.1.0.0	rs200484,rs200485	-1.5444664507514525	-1.2690413119101305	-1.5850826853556639	-1.2780278514992545	-1.2363954882358454	-1.5149588268951206	-1.3828169188437474	-1.218133388798383	-1.7499426916212546	-1.4185010665100077	-1.3824946296637912	-1.4195256306441508	-1.416615578394067	-1.3754970362698078	-1.415471783182022	-1.3893188915452541	-1.3919644709627779	-1.4538382571856006	-1.513414455342978	-1.5277050089567417	-1.3624864060614943	-1.1167220081364566	-1.3525055113787599	-1.001076216149156	-1.3230754008941554	-1.3519229538387671	0.1689694144816447	-0.14643047127189157	0.19576379381040976	-0.1139366194635234	-0.21744276894975512	0.0015443715521425982	-0.1448880901129943	-0.14435301726311134	0.633220683484798	0.06599555513124788	0.38141841351463524	0.0964502297499954	0.06469262455529982	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:27835331..27835445,-__1657.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:27835331..27835445,-__1657.1.0.0	rs200949	1.1679080629234528	1.365670101951071	1.5091712313182508	0.8914351889351948	1.4042351390173349	1.2830674249680785	1.2472649654088288	1.7078585694492432	1.4217694404075223	1.4348759245138498	1.5893709148225168	1.5755469894336012	1.383181162762412	1.3390059715377056	1.774772525928699	1.2290252774695936	1.210554177735029	1.1420938840289394	1.234167844296035	1.4776499228326896	1.3876373881716362	1.4087261885733058	1.7137189647355398	1.3267480966215246	1.7992496964422553	1.4202791615310797	0.17109790861425278	0.40910242397762797	-0.28014595384865726	0.31911898879983425	-0.26214125498839547	-0.04889958067204336	0.23038495742386078	-0.320221181277607	-0.013043251834216507	0.27884304022168993	-0.2626228182009922	0.22370270700865413	0.03709799876866734	0.333666485083	0.914457985151	0.591208103411	0.313917214294	1.0	0.476688253492	0.460214637573	0.510577925344	0.687084607526	0.416589617895	0.609889042629	0.265084565602	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:29648861..29648975,-__1659.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:29648861..29648975,-__1659.1.0.0	rs2747432	1.1229824716237204	0.5224752016528018	0.5225554191656755	0.6728929689036932	1.000592886674582	0.7641637435621341	1.1587310302566471	0.797301952820472	1.1327235319019489	1.1488544759995438	0.7214974596174302	1.3439263814020983	0.9090581269650623	1.2214999214051483	1.375029668373716	0.5975171953306218	2.193705428345399	2.2029796830997435	2.5236634890567355	2.7347181056151197	0.7741594308765741	1.926843211040606	1.9768898791326164	1.8767947249944172	0.7545547650297995	1.6798629585250413	0.09851744978142785	0.8525544667209142	0.07496177616494626	1.5208124594417058	1.2023867964251616	1.7594997454946015	1.5759870753584726	-0.023142521943897876	0.7941196791386571	0.8280354031330726	1.155297265376987	-0.5893716163722988	0.7708048315599793	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:29648861..29648975,-__1659.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:29648861..29648975,-__1659.1.0.0	rs62392956	1.1229824716237204	0.5224752016528018	0.5225554191656755	0.6728929689036932	1.000592886674582	0.7641637435621341	1.1587310302566471	0.797301952820472	1.1327235319019489	1.1488544759995438	0.7214974596174302	1.3439263814020983	0.9090581269650623	1.3989816498814098	0.3424447404097197	1.367651971907887	0.6146676927118956	1.639031734863331	1.2437874187002431	1.1107257852249413	0.7972513701170936	1.2379473402462242	1.6969972507180158	0.12486058575502981	1.2962338471545491	1.072548448974195	0.2759991782576894	-0.18003046124308214	0.8450965527422115	-0.058225276191797626	0.6384388481887491	0.479623675138109	-0.04800524503170589	-5.058270337843229e-05	0.10522380834427536	0.548142774718472	-0.5966368738624004	-0.047692534247549156	0.16349032200913274	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:29648861..29648975,-__1659.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:29648861..29648975,-__1659.1.0.0	rs416571	1.1229824716237204	0.5224752016528018	0.5225554191656755	0.6728929689036932	1.000592886674582	0.7641637435621341	1.1587310302566471	0.797301952820472	1.1327235319019489	1.1488544759995438	0.7214974596174302	1.3439263814020983	0.9090581269650623	-0.014580641278651052	-0.5658622536368247	0.1070653313418351	-0.512998183730049	-0.09456332815130336		0.5336454357227189	-2.3113486019557463	-0.26258170481250764	-1.3068001844438772	-0.5387848898351364	-2.725735959097437	-0.6993222708979071	-1.1375631129023716	-1.0883374552896266	-0.4154900878238404	-1.1858911526337423	-1.0951562148258853		-0.6250855945339282	-3.108650554776218	-1.3953052367144565	-2.455654660443421	-1.2602823494525666	-4.069662340499535	-1.6215526145359627	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr6:29648861..29648975,-__1659.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:29648861..29648975,-__1659.1.0.0	rs2747432,rs62392956,rs416571	1.1229824716237204	0.5224752016528018	0.5225554191656755	0.6728929689036932	1.000592886674582	0.7641637435621341	1.1587310302566471	0.797301952820472	1.1327235319019489	1.1488544759995438	0.7214974596174302	1.3439263814020983	0.9090581269650623	0.2808027925252425	1.4569707632151498	1.161135117498153	0.372146497737637	0.09922179168099793	0.8225902690543903	0.8512527947059392	0.9090529530503878	0.5634554060081288	0.6993285505163417	1.323123013554077	0.5888140862622862	0.7606578363173941	-0.8421796790984779	0.934495561562348	0.6385796983324775	-0.3007464711660562	-0.901371094993584	0.05842652549225613	-0.30747823555070797	0.1117510002299158	-0.56926812589382	-0.44952592548320214	0.6016255539366469	-0.7551122951398122	-0.148400290647668	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:30851134..30851248,+__1661.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:30851134..30851248,+__1661.1.0.0	rs9380200	-1.3198142060741418	-1.4446371364158042	-1.1829312519324982	-1.5541589309366517	-1.3706616766343789	-1.3131672498651377	-1.2902219108032238	-1.1948129913239585	-1.486060780372923	-1.3986782327357663	-1.216744081518975	-1.4878263538663623	-1.3549762335399853	-1.0331900306218718	-1.1111731487104273	-0.9179840670561163	-1.0891360754413029	-1.0852014943555055	-1.0050217172967544	-1.055567983755383	-1.0999570894424522	-1.3172775284949865	-1.028663784087813	-1.1716231510994393	-1.0591976912616192	-1.0811661468019726	0.28662417545227004	0.3334639877053769	0.2649471848763818	0.46502285549534883	0.2854601822788734	0.3081455325683833	0.23465392704784072	0.09485590188150628	0.16878325187793664	0.3700144486479533	0.04512093041953569	0.4286286626047431	0.2738100867380125	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:31462631..31462745,+__1663.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:31462631..31462745,+__1663.1.0.0	rs41293856	0.28029887249364277	0.3386622024893524	0.0955938930782219	0.2573136981714537	-0.13907565863941163	0.18947335698831458	0.42950493820377245	0.19824927613891624	0.15593349593315967	0.0514363782900022	0.14896367441247466	0.08375586716655072	0.1741758328938708	-0.7691839935066046	-0.9245364556017273	-0.8963926536568803	-0.8957117574824331	-1.0146741328749784	-0.7535025054040918	-1.3614054059643526	-0.6315319989147539	-0.4854271343383499	-1.375649358932411	-1.294742919416124	-1.0405552718405555	-0.9536094656611049	-1.0494828660002473	-1.2631986580910797	-0.9919865467351021	-1.1530254556538868	-0.8755984742355668	-0.9429758623924064	-1.790910344168125	-0.8297812750536702	-0.6413606302715096	-1.4270857372224133	-1.4437065938285987	-1.1243111390071063	-1.1277852985549761	0.60051573606	0.0327677521954	0.0120431385799	0.0380311339455	0.000122929124497	0.0103298859694	0.0741297894045	0.162586850726	0.197395731844	0.00406065558642	0.0468981580933	0.0610532783728	1.05555404186e-09	1	1	1	1	0.0949012841119	1	1	1	1	1	1	1	8.84554287077e-07	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:31462631..31462745,+__1663.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:31462631..31462745,+__1663.1.0.0	rs2534684	0.28029887249364277	0.3386622024893524	0.0955938930782219	0.2573136981714537	-0.13907565863941163	0.18947335698831458	0.42950493820377245	0.19824927613891624	0.15593349593315967	0.0514363782900022	0.14896367441247466	0.08375586716655072	0.1741758328938708	0.07167241904575636	0.08372538859636472	0.22124133931117013	0.07563552824913088	0.14776063711419718	0.19673796996373955	0.14065317514463568	0.13245986695975953	0.15480100602560048	0.2544484659010828	0.10168086701736613	-0.39379416452875987	0.09891854156667029	-0.2086264534478864	-0.2549368138929877	0.1256474462329482	-0.18167816992232283	0.2868362957536088	0.007264612975424967	-0.28885176305913673	-0.06578940917915671	-0.001132489907559181	0.20301208761108058	-0.047282807395108525	-0.4775500316953106	-0.0752572913272005	0.682148641351	0.696989544957	0.581967350665	0.563691144959	0.412754243182	0.935789553219	0.0959193233604	0.946473618223	0.989287003123	0.657696241675	0.581967350665	0.545696106059	0.958145167719	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr6:31462631..31462745,+__1663.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:31462631..31462745,+__1663.1.0.0	rs41293856,rs2534684	0.28029887249364277	0.3386622024893524	0.0955938930782219	0.2573136981714537	-0.13907565863941163	0.18947335698831458	0.42950493820377245	0.19824927613891624	0.15593349593315967	0.0514363782900022	0.14896367441247466	0.08375586716655072	0.1741758328938708	-0.8317229617140685	-0.6433548981867465	-1.062828628479835	-0.5767336694805629	-0.7389159992698812	-0.8300793840101269	-0.7691839935066046	-0.6918864409298598	-0.28614377970973937	-1.0245350740425172	-0.9554364565135492	-1.0650838955982334	-0.7896587651201438	-1.1120218342077113	-0.9820171006760989	-1.1584225215580568	-0.8340473676520166	-0.5998403406304695	-1.0195527409984415	-1.198688931710377	-0.890135717068776	-0.442077275642899	-1.0759714523325195	-1.1044001309260238	-1.1488397627647842	-0.9638345980140145	0.340423946445	0.0741297894045	0.320413072024	0.563691144959	0.0986283746992	0.0327677521954	0.333666485083	0.382791178922	0.21176555971	0.13611090909	0.0374147936077	0.288805731951	0.00153086002686	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.347505226096	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:31620429..31620543,-__1664.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:31620429..31620543,-__1664.1.0.0	rs3117582	-0.5669446621421438	-0.2964899079793416	-0.5417547732482592	-0.7852557019111627	-0.46287214455642844	-0.5999410533057219	-0.504348000424737	-0.31529407345567817	-0.5280705838011946	-0.5449551854534005	-1.0902600649089076	-0.6217898935218001	-0.5714980037257313	-1.2253311332097885	-0.9250257745009975	-0.7888688391632909	-0.7918918284140025	-1.1204666372228311	-0.9387437515980179	-1.1462726330840167	-0.9423965611902864	-0.9616024294623078	-0.8530840005552538	-0.9011009512015148	-1.0158295173653666	-0.9675511714139731	-0.6583864710676447	-0.6285358665216559	-0.2471140659150317	-0.006636126502839845	-0.6575944926664027	-0.33880269829229603	-0.6419246326592797	-0.6271024877346082	-0.43353184566111314	-0.3081288151018533	0.1891591137073928	-0.3940396238435665	-0.39605316768824156	NA__no_active_tile	0.00501128780378	0.0906800339379	0.0932701621097	0.0619890035232	0.0583274625199	0.055697973287	0.0412580447575	0.0286240283844	0.216719559135	NA__no_active_tile	0.179364149792	6.86238166931e-07	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	0.000575067583888	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:32119681..32119795,-__1665.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:32119681..32119795,-__1665.1.0.0	rs529889365		0.9886499877852429			-0.1241517719811702	0.40673248746014445	-1.0098205963663784	-0.5042018733723462		0.5247772832477028	-0.6811645190454666	0.48329500298694233	0.010514500089333877																											NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:32119681..32119795,-__1665.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:32119681..32119795,-__1665.1.0.0	rs192471087		0.9886499877852429			-0.1241517719811702	0.40673248746014445	-1.0098205963663784	-0.5042018733723462		0.5247772832477028	-0.6811645190454666	0.48329500298694233	0.010514500089333877	2.8310303471333085	-0.3715412481861858	1.5404873436312074	1.9711388821997335	0.5532762791974837	2.4826908821651257	0.08730973410559356	0.20342629255223452	2.2217519202634683	1.840903537468377	1.6672561279077496	-0.08388957968367172	1.2453200432295353		-1.3601912359714288			0.6774280511786539	2.075958394704981	1.097130330471972	0.7076281659245808		1.3161262542206744	2.3484206469532163	-0.5671845826706141	0.7869145031015045	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr6:32119681..32119795,-__1665.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:32119681..32119795,-__1665.1.0.0	rs529889365,rs192471087		0.9886499877852429			-0.1241517719811702	0.40673248746014445	-1.0098205963663784	-0.5042018733723462		0.5247772832477028	-0.6811645190454666	0.48329500298694233	0.010514500089333877	0.6242843361722149	0.20205235962123128	1.3531937866326875	0.478673088150924	0.4821742197821756	1.2658201074409392	1.7610509643796328	2.6204758375411186	-1.1141149421713676	1.6905644657802574	2.001393971186012	1.4383154976429942	1.0669903076799017		-0.7865976281640117			0.6063259917633458	0.8590876199807947	2.770871560746011	3.1246777109134647		1.1657871825325548	2.6825584902314783	0.9550204946560519	1.4222164278324614	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.0.0	rs1049070	-1.6595174162750443	-1.8878992734937299	-1.8538459145029096	-1.6719310450109275	-2.0048709375943745	-1.5746121628807828	-1.7877564319675423	-2.2101829174038286	-1.8580191122236616	-1.9638377935902465	-1.8828108605918819	-2.0112691087786048	-1.863879414526128	-2.000196429744083	-1.8910827077092003	-1.82217699632366	-1.1630022149148762	-2.040623220658466	-1.9818230500113811	-2.1254227600907614	-1.7454440903430182	-1.6939990510891094	-1.8806305143046145	-1.7564966662162171	-1.7989580075351468	-1.8249879757450447	-0.3406790134690385	-0.0031834342154704043	0.03166891817924955	0.5089288300960513	-0.035752283064091284	-0.4072108871305984	-0.33766632812321906	0.4647388270608104	0.16402006113455214	0.08320727928563199	0.1263141943756647	0.21231110124345798	0.038891438781083365	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.0.0	rs67147537	-1.6595174162750443	-1.8878992734937299	-1.8538459145029096	-1.6719310450109275	-2.0048709375943745	-1.5746121628807828	-1.7877564319675423	-2.2101829174038286	-1.8580191122236616	-1.9638377935902465	-1.8828108605918819	-2.0112691087786048	-1.863879414526128	-1.6238268737202146	-1.6156876309962032	-1.6352151081184552	-1.6954845573886759	-1.8637037475218807	-1.7716798431776657	-2.046423307717157	-1.6108929859024304	-1.8282093743250976	-1.5330406198851245	-1.9454404164262842	-2.1023621158824617	-1.7726638817551372	0.03569054255482973	0.2722116424975267	0.21863080638445442	-0.023553512377748387	0.1411671900724938	-0.19706768029688293	-0.25866687574961467	0.5992899315013982	0.029809737898564004	0.43079717370512194	-0.06262955583440233	-0.09109300710385693	0.0912155327709903	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.0.0	rs3210146	-1.6595174162750443	-1.8878992734937299	-1.8538459145029096	-1.6719310450109275	-2.0048709375943745	-1.5746121628807828	-1.7877564319675423	-2.2101829174038286	-1.8580191122236616	-1.9638377935902465	-1.8828108605918819	-2.0112691087786048	-1.863879414526128	-1.8739277920554176	-2.158900872452581	-2.05720549746311	-1.6556288460365298	-1.9836877644113118	-1.5106785564221745	-1.878665053809299	-1.70174913647256	-1.724087607412786	-2.144222886269711	-1.9683461515128369	-2.703132590243526	-1.946686062880154	-0.21441037578037325	-0.271001598958851	-0.2033595829602004	0.016302198974397664	0.02118317318306273	0.06393360645860824	-0.09090862184175674	0.5084337809312685	0.13393150481087557	-0.18038509267946456	-0.08553529092095502	-0.6918634814649214	-0.0828066483540258	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.0.0	rs3891175	-1.6595174162750443	-1.8878992734937299	-1.8538459145029096	-1.6719310450109275	-2.0048709375943745	-1.5746121628807828	-1.7877564319675423	-2.2101829174038286	-1.8580191122236616	-1.9638377935902465	-1.8828108605918819	-2.0112691087786048	-1.863879414526128	-1.8892060605633887	-1.7543571100836008	-1.8776532895101292	-1.792788651607507	-2.0214409604343984	-2.1386726941697853	-1.7822123182259486	-1.5097197020752466	-1.767252145796381	-1.68007548540136	-2.168071028302531	-1.6083492151922332	-1.8324832217802092	-0.22968864428834435	0.13354216341012903	-0.023807375007219633	-0.1208576065965794	-0.016570022840023846	-0.5640605312890026	0.0055441137415936925	0.7004632153285819	0.09076696642728055	0.2837623081888865	-0.285260167710649	0.4029198935863716	0.031396192745918705	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.5.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.0.0	rs117403290	-1.6595174162750443	-1.8878992734937299	-1.8538459145029096	-1.6719310450109275	-2.0048709375943745	-1.5746121628807828	-1.7877564319675423	-2.2101829174038286	-1.8580191122236616	-1.9638377935902465	-1.8828108605918819	-2.0112691087786048	-1.863879414526128	-1.8891674162507863	-1.3078565689910944	-1.4727815416335448	-1.7840661075395756	-1.6168609797515507	-1.585050772062731	-1.7076191747642042	-1.3710569559174244	-1.623500000415586	-1.7731268776536102	-1.785550823709055	-1.6036777754264517	-1.6266929161763013	-0.22964999997574198	0.5800427045026355	0.3810643728693648	-0.11213506252864813	0.38800995784282377	-0.010438609181948166	0.08013725720333809	0.8391259614864042	0.2345191118080756	0.19071091593663625	0.09726003688282692	0.40759133335215303	0.23718649834982664	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.6.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.0.0	rs9274526	-1.6595174162750443	-1.8878992734937299	-1.8538459145029096	-1.6719310450109275	-2.0048709375943745	-1.5746121628807828	-1.7877564319675423	-2.2101829174038286	-1.8580191122236616	-1.9638377935902465	-1.8828108605918819	-2.0112691087786048	-1.863879414526128	-1.5846437062364798	-1.636902490588888	-1.3535441591418893	-1.6092370526300792	-1.7181401381679589	-1.6399425277248352	-1.7406012001459492	-1.2849126564336246	-1.6259869687514417	-1.5707495819907218	-1.6956999544282279	-1.3916510088544074	-1.571000953757875	0.07487371003856458	0.25099678290484184	0.5003017553610203	0.06269399238084827	0.28673079942641566	-0.06533036484405241	0.04715523182159309	0.9252702609702039	0.2320321434722199	0.3930882115995247	0.187110906163654	0.6196180999241974	0.29287846076825264	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.7.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.0.0	rs9274527	-1.6595174162750443	-1.8878992734937299	-1.8538459145029096	-1.6719310450109275	-2.0048709375943745	-1.5746121628807828	-1.7877564319675423	-2.2101829174038286	-1.8580191122236616	-1.9638377935902465	-1.8828108605918819	-2.0112691087786048	-1.863879414526128	-1.2546259775505022	-1.406954897707192	-1.8459500453771827	-1.3653140951971716	-1.7658207723005708	-1.6761642799135954	-1.811558739810513	-1.4171285483973335	-1.4269984146486103	-1.6999426013288197	-1.7421026872936332	-1.5120791233271396	-1.577053348571022	0.40489143872454214	0.4809443757865379	0.007895869125726929	0.30661694981375587	0.23905016529380374	-0.10155211703281264	-0.02380230784297077	0.7930543690064951	0.43102069757505124	0.26389519226142677	0.1407081732982487	0.4991899854514652	0.2868260659551059	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.8.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.0.0	rs281860823	-1.6595174162750443	-1.8878992734937299	-1.8538459145029096	-1.6719310450109275	-2.0048709375943745	-1.5746121628807828	-1.7877564319675423	-2.2101829174038286	-1.8580191122236616	-1.9638377935902465	-1.8828108605918819	-2.0112691087786048	-1.863879414526128	-1.6097352849379216	-1.8164262961468312	-1.6718957613788739	-1.7740374254240332	-1.7931999297017018	-1.448663106006253	-1.7419002455963803	-1.5267804413771298	-1.8341469213959765	-1.6357921574011398	-1.6228009869447335	-1.8817790179397456	-1.6964297978542267	0.049782131337122726	0.07147297734689873	0.18195015312403573	-0.10210638041310571	0.21167100789267268	0.12594905687452984	0.045856186371161956	0.6834024760266988	0.023872190827685102	0.32804563618910665	0.26000987364714834	0.1294900908388592	0.16744961667190117	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.9.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.0.0	rs281860822	-1.6595174162750443	-1.8878992734937299	-1.8538459145029096	-1.6719310450109275	-2.0048709375943745	-1.5746121628807828	-1.7877564319675423	-2.2101829174038286	-1.8580191122236616	-1.9638377935902465	-1.8828108605918819	-2.0112691087786048	-1.863879414526128	-1.2814500556118258	-0.9852879778454577	-1.0932653925195657	-1.3769524295862599	-1.3406303101796215	-1.2441483980121402	-1.068358944294408	-1.2342017072595863	-1.6250910135717407	-1.324993445919949	-1.0549474802144403	-1.431477725175789	-1.255067073349232	0.37806736066321855	0.9026112956482721	0.7605805219833439	0.29497861542466763	0.664240627414753	0.3304637648686426	0.7193974876731344	0.9759812101442422	0.23292809865192088	0.6388443476702974	0.8278633803774416	0.5797913836028157	0.6088123411768958	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.9.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:32634399..32634513,-__1666.1.0.0	rs1049053,rs1049070,rs67147537,rs3210146,rs3891175,rs117403290,rs9274526,rs9274527,rs281860823,rs281860822,rs71542466,rs28746851,rs9274528	-1.6595174162750443	-1.8878992734937299	-1.8538459145029096	-1.6719310450109275	-2.0048709375943745	-1.5746121628807828	-1.7877564319675423	-2.2101829174038286	-1.8580191122236616	-1.9638377935902465	-1.8828108605918819	-2.0112691087786048	-1.863879414526128	-1.7629834063459553	-1.5608107365411263	-1.8731826770421964	-1.7453560226725617	-2.1755841927677526	-2.3801813247586834	-1.81299496389202	-1.9104897949653548	-1.821704443403168	-2.244218479536954	-1.532829021757846	-1.9752631845837305	-1.8996331873556125	-0.10346599007091095	0.32708853695260354	-0.019336762539286845	-0.07342497766163425	-0.1707132551733781	-0.8055691618779006	-0.02523853192447767	0.2996931224384738	0.03631466882049361	-0.28038068594670773	0.3499818388340359	0.03600592419487425	-0.03575377282948459	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:34759793..34759907,+__1667.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:34759793..34759907,+__1667.1.0.0	rs13215181	0.5950817498826856	-0.4601766320709096	-0.42707451171481414	0.0160620593945271	-0.2862677337874613	0.34076913284632865	0.37949231935105	0.3564284139188148	0.15414341894371225	-0.10485785127166958	-0.7870069868140833	0.04962374389031463	-0.0144819064526254	-0.016466074134711833	0.1286700653589517	0.45925317106593505	-0.5767336694805629	0.06261405651755847	-0.90670820841343	-0.0028252209457902966	-0.017959946340303304	-0.730347329467496	-0.24128975250970555	-0.6286679560641965	-1.1250691544249536	-0.2996275015698921	-0.6115478240173974	0.5888466974298613	0.8863276827807491	-0.59279572887509	0.34888179030501976	-1.2474773412597586	-0.3823175402968403	-0.3743883602591181	-0.8844907484112083	-0.13643190123803597	0.15833903074988687	-1.1746928983152682	-0.28514559511726667	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:34759793..34759907,+__1667.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:34759793..34759907,+__1667.1.0.0	rs6934662	0.5950817498826856	-0.4601766320709096	-0.42707451171481414	0.0160620593945271	-0.2862677337874613	0.34076913284632865	0.37949231935105	0.3564284139188148	0.15414341894371225	-0.10485785127166958	-0.7870069868140833	0.04962374389031463	-0.0144819064526254	0.3789217597280485	-0.22448417454344197	-1.565663461344266	-0.17314986128981835	-0.41989275015914396	-0.8525921674361301	-0.8127046476192393	-0.470013683622793	-0.5681722059468783	-1.3477920618633916	-0.26474299799775586	-1.9988553684060033	-0.693261801708401	-0.2161599901546371	0.23569245752746762	-1.138588949629452	-0.18921192068434545	-0.13362501637168267	-1.1933613002824588	-1.1921969669702892	-0.8264420975416078	-0.7223156248905906	-1.242934210591722	0.5222639888163274	-2.048479112296318	-0.6787798952557758	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr6:34759793..34759907,+__1667.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:34759793..34759907,+__1667.1.0.0	rs13215181,rs6934662	0.5950817498826856	-0.4601766320709096	-0.42707451171481414	0.0160620593945271	-0.2862677337874613	0.34076913284632865	0.37949231935105	0.3564284139188148	0.15414341894371225	-0.10485785127166958	-0.7870069868140833	0.04962374389031463	-0.0144819064526254	-0.51113210226176	-0.4409907062501231	0.38414766506654413	0.1942275928286014	0.07221246725268483	-1.2805344777030558	-0.2775421799690609	0.7051790579561321	-1.144154277680033	-0.526460496772012	0.5088246168426745	-1.3125679367533918	-0.3023992314535667	-1.1062138521444456	0.019185925820786487	0.8112221767813583	0.1781655334340743	0.3584802010401461	-1.6213036105493845	-0.6570344993201109	0.3487506440373173	-1.2982976966237454	-0.42160264550034243	1.2958316036567579	-1.3621916806437064	-0.2879173250009413	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:42928412..42928526,+__1668.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:42928412..42928526,+__1668.1.0.0	rs10948059	-1.3756786232316833	-1.4054753567149654	-1.0534347057261535	-1.470148238573867	-1.618898031609787	-1.3776960542144807	-1.2427008695329311	-1.0993088671994755	-1.0649684990123447	-1.1363350693690006	-1.38537932225407	-1.1444237178119356	-1.2812039462708913	-1.2015809456072384	-1.1236013826203242	-0.9971931268122418	-1.3555486492189806	-1.4767963536278368	-1.2725295206548257	-0.9384973436902251	-0.8880487227936518	-1.3032597603859644	-1.2971786008182282	-1.0297694385345249	-0.9776724176559202	-1.155139688534997	0.17409767762444495	0.2818739740946412	0.05624157891391168	0.11459958935488634	0.14210167798195017	0.105166533559655	0.30420352584270605	0.21126014440582375	-0.23829126137361967	-0.16084353144922758	0.35560988371954516	0.16675130015601547	0.12606425773589439	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:42946884..42946998,-__1669.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:42946884..42946998,-__1669.1.0.0	rs9462859	2.3069316145919747	2.579098343868111	2.1502798240015517	2.0003383509168846	2.5081406153954804	2.4034987890888404	2.1166616095528052	2.184231313187782	2.724872946796024	2.2348028264866118	2.474999539525749	2.1893485319697503	2.3227670254484636	2.1386306014761383	2.4247979781144764	2.4393342639340605	2.1420900107653553	2.3960226637675848	2.40151020939552	2.2039401076293457	2.671746058565772	2.3976294475440754	2.4905410854811834	2.604144356618386	2.1154542849159563	2.368820089017321	-0.16830101311583645	-0.1543003657536346	0.2890544399325088	0.1417516598484707	-0.11211795162789562	-0.001988579693320336	0.08727849807654042	0.48751474537799	-0.32724349925194884	0.2557382589945716	0.12914481709263725	-0.073894247053794	0.04605306356885741	0.994643258212	0.436112310787	0.914457985151	0.468411351413	0.298053645387	0.591208103411	0.667432913386	0.87199428352	0.60051573606	0.468411351413	0.452098798395	0.48504462162	0.92421102213	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:42946923..42947037,-__1670.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:42946923..42947037,-__1670.1.0.0	rs9462859	2.4591042395276705	2.8962006984215503	2.3972669771357618	2.4023959753557786	2.588560237081327	2.551446305143007	2.6682950546988593	2.5507890407274605	2.7618039640082443	2.407126572353776	2.682991238025977	2.5385160127315225	2.5753746929342447	2.677867544494639	2.796716214277516	2.4480987200851816	2.2823800469999243	2.5978461867451057	2.4879927098086463	2.127552907217864	2.812527321779734	2.637128902061786	2.791527256708441	2.7250156866146824	2.8129188915076333	2.599797699025096	0.2187633049669686	-0.0994844841440341	0.050831742949419834	-0.1200159283558544	0.009285949663778492	-0.0634535953343609	-0.5407421474809952	0.2617382810522737	-0.1246750619464585	0.38440068435466523	0.042024448588705354	0.2744028787761108	0.024423006090851573	0.476688253492	0.79863356553	0.716953652062	0.638386621154	0.716953652062	0.79863356553	0.777966336216	0.66743649171	0.716953652062	0.63839046467	0.572794651112	0.527990680582	0.943716287294	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:42946923..42947037,-__1670.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:42946923..42947037,-__1670.1.0.0	rs9462860	2.4591042395276705	2.8962006984215503	2.3972669771357618	2.4023959753557786	2.588560237081327	2.551446305143007	2.6682950546988593	2.5507890407274605	2.7618039640082443	2.407126572353776	2.682991238025977	2.5385160127315225	2.5753746929342447	3.168964894982265	3.375769822452169	2.8225745389896613	2.5904168648617025	2.8902161937141937	2.8984053462587167	2.74432843316691	2.9492399296846643	3.1213730274286	2.907122284369356	3.1638294230387736	2.958720419484834	2.9659134315359865	0.7098606554545945	0.4795691240306188	0.4253075618538995	0.18802088950592388	0.3016559566328665	0.3469590411157095	0.07603337846805092	0.3984508889572038	0.35956906342035566	0.49999571201558	0.4808381850127965	0.4202044067533115	0.39053873860174254	0.00192430688789	0.00883703695038	0.0168468410067	0.0565623393196	0.00480682187369	0.0120431385799	0.0267271087754	0.0216734048733	0.0232568344756	0.0216734048733	0.00275115621019	0.0316863885398	1.22737237981e-14	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1.02853805428e-11	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr6:42946923..42947037,-__1670.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:42946923..42947037,-__1670.1.0.0	rs9462859,rs9462860	2.4591042395276705	2.8962006984215503	2.3972669771357618	2.4023959753557786	2.588560237081327	2.551446305143007	2.6682950546988593	2.5507890407274605	2.7618039640082443	2.407126572353776	2.682991238025977	2.5385160127315225	2.5753746929342447	2.769092433072208	3.1489541908812972	2.5446671229234044	2.4385720832731357	2.8432532720604753	2.9140468273552202	2.662755867523451	2.9597712578406186	3.0379247874201014	2.752664351941607	2.9370945439649923	2.9657996233648363	2.831216363468446	0.30998819354453744	0.252753492459747	0.1474001457876426	0.03617610791735704	0.2546930349791481	0.36260052221221306	-0.0055391871754082445	0.4089822171131581	0.27612082341185706	0.3455377795878314	0.2541033059390152	0.42728361063331377	0.25584167053420104	0.301187193336	0.527990680582	0.107123399254	0.716950551484	0.237368605078	0.122558611289	0.687084607526	0.320413072024	0.224300750114	0.354199901149	0.237368605078	0.29495293544	0.0608789455792	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr6:49430931..49431045,-__1671.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr6:49430931..49431045,-__1671.1.0.0	rs3729619	2.3192862374955343	2.8291351582902156	2.3668754459350567	2.301154106842284	2.4831802830264578	2.676565585005352	2.4042332480285777	2.8078473170090597	2.4907090876307336	2.6891378394435312	2.6157192557498794	2.802109553482653	2.5654960931616113	2.7415768236062394	3.2132521648730634	2.8350417781064774	2.522302094113238	2.9988336321224462	2.9620965072797887	2.5451392462572207	3.02552173389262	2.9637922101351974	3.0446901480985185	3.068669535632136	2.842010758957419	2.896910552756197	0.42229058611070514	0.38411700658284786	0.4681663321714207	0.22114798727095408	0.5156533490959885	0.2855309222744369	0.14090599822864291	0.21767441688356026	0.4730831225044638	0.3555523086549872	0.45295027988225645	0.039901205474766055	0.3314144595945858	0.000827700533168	0.00816548763477	0.000481108176159	0.0276615481105	1.20184897547e-05	0.00616002497902	0.0187859264625	0.0386605553759	0.000179550689913	0.00406065558642	0.00313710581496	0.0181189115857	4.49205435435e-21	0.586011977483	1	0.358425591238	1	0.0092782740906	1	1	1	0.138792683303	1	1	1	3.76434154895e-18	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:76311664..76311778,+__1672.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:76311664..76311778,+__1672.1.0.0	rs71561434	-0.3756208430537764	-0.7532237056225976	-0.3865299781293673	-1.1078205890007429	-0.7588903795831665	-1.3225603041831624	-0.6361857849519519	-0.8178458052314158	-1.039046930576938	-0.9190727261777102	-1.4029775534695064	-0.9924308392576047	-0.876017119936495	-0.5874286598756999	-0.5503693768310289	-1.271159697473837	-1.094835301054765	-0.9808875187760576	-1.1134585249866895	-1.394012528778692	-1.005554250725198	-1.1144532313667312	-0.8236214346956672	-1.0708236523496066	-0.8578986676339485	-0.9887085703789934	-0.2118078168219235	0.20285432879156862	-0.8846297193444698	0.012985287945977975	-0.2219971391928911	0.20910177919647288	-0.7578267438267401	-0.18770844549378218	-0.07540630078979316	0.09545129148204301	0.33215390111989973	0.13453217162365616	-0.11269145044249847	0.170821264488	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0412580447575	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0287077842137	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:76311664..76311778,+__1672.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:76311664..76311778,+__1672.1.0.0	rs189124093	-0.3756208430537764	-0.7532237056225976	-0.3865299781293673	-1.1078205890007429	-0.7588903795831665	-1.3225603041831624	-0.6361857849519519	-0.8178458052314158	-1.039046930576938	-0.9190727261777102	-1.4029775534695064	-0.9924308392576047	-0.876017119936495	-0.4912025860861231	-0.3358325174880765	-0.7048832510160193	-0.7972322280149837	-0.6452235646518683	-0.6879655844095245	-1.2357713487205204	-0.6847314063325284	-0.7077658923275151	-0.7850734662890613	-0.547732517516241	-0.5103602249678859	-0.677814548985029	-0.1155817430323467	0.41739118813452103	-0.31835327288665205	0.31058836098575915	0.11366681493129827	0.6345947197736379	-0.5995855637685685	0.13311439889888743	0.331281038249423	0.13399925988864891	0.8552450359532654	0.48207061428971876	0.19820257095146607	0.935789553219	0.253741740693	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.66743649171	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.420456664513	NA__no_active_tile	0.221756412245	0.354199901149	0.491765446406	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	1	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr6:76311664..76311778,+__1672.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:76311664..76311778,+__1672.1.0.0	rs71561434,rs189124093	-0.3756208430537764	-0.7532237056225976	-0.3865299781293673	-1.1078205890007429	-0.7588903795831665	-1.3225603041831624	-0.6361857849519519	-0.8178458052314158	-1.039046930576938	-0.9190727261777102	-1.4029775534695064	-0.9924308392576047	-0.876017119936495	-0.7264992460717641	-0.8893112650255617	-1.0100861094082203	-1.094355950449271	-1.235715606012417	-1.0809159679146298	-1.0322940199313908	-0.9256752774494512	-1.0495356754215488	-0.8697387585359444	-1.1569740803381476	-1.020305753312205	-1.0076173091558793	-0.3508784030179877	-0.13608755940296413	-0.623556131278853	0.013464638551471841	-0.4768252264292505	0.24164433626853254	-0.3961082349794389	-0.1078294722180354	-0.010488744844610709	0.049333967641765786	0.24600347313135873	-0.027874914054600408	-0.13160018921938432	0.237368605078	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.202104162379	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.136702921923	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr6:80816276..80816390,+__1673.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr6:80816276..80816390,+__1673.1.0.0	rs2298307	0.2857048732309633	0.5140049967821945	0.3614605956410445	0.2836858217582603	0.23926554571840336	0.34893383983831994	0.22156700643813584	0.6594627670924857	0.47034672399101285	0.46464900588881	0.3771859611118654	0.2710234654124648	0.37477421690866336	0.2023003554007804	0.28677895784566126	0.2248190681188474	0.29795048260864254	0.35735424538751226	0.39174712775254117	0.24838929963014625	0.5671564858058363	0.13532584731164973	0.1286621979108409	0.22032006896720913	0.4548915369561499	0.29297463947465147	-0.08340451783018288	-0.2272260389365332	-0.1366415275221971	0.01426466085038225	0.1180886996691089	0.04281328791422123	0.026822293192010405	-0.09230628128664942	-0.3350208766793631	-0.3359868079779691	-0.1568658921446563	0.18386807154368512	-0.08179957743401194	0.519249062249	0.581967350665	0.221756412245	0.925117039075	0.90381429355	0.476688253492	0.428242856315	0.757455001208	0.0583274625199	0.202104162379	0.143314270352	0.777966336216	0.4986638388	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:105172602..105172716,+__1674.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:105172602..105172716,+__1674.1.0.0	rs818620	-0.5972857409643261	-0.5761203294817789	-0.4553849555373867	-0.6517900030056235	-0.5733775663705586	-0.7112924023601441	-0.6960061551767421	-0.6382937920630519	-0.4746949853005771	-0.4621269505210539	-0.555099694025959	-0.508946611678307	-0.5750349322071256	-0.3804067248274454	-0.1960115737277228	-0.22807105860592355	-0.4998271589867078	-0.40062973270479946	-0.3873107570868626	-0.6502314728454386	-0.3772051007657892	-0.42778645645874	-0.4636931860574259	-0.3491056172281884	-0.4817385631071581	-0.40350145020018346	0.21687901613688065	0.3801087557540561	0.22731389693146317	0.1519628440189157	0.17274783366575913	0.32398164527328155	0.04577468233130355	0.2610886912972627	0.04690852884183705	-0.0015662355363719738	0.20599407679777065	0.02720804857114889	0.17153348200694227	0.113101776132	0.0601351299193	0.132622250874	0.375513989452	0.0774477122405	0.0426112802219	0.382791178922	0.179364149792	0.333666485083	0.107123399254	0.0808926541269	0.581967350665	0.000489843709264	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.410489028363	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:22862398..22862512,-__1675.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:22862398..22862512,-__1675.1.0.0	rs2270105	2.323789886840819	2.5724450343574445	2.4206292873126865	2.1594438283997692	2.3361640201148925	2.415007318639713	2.7303535794094116	2.756318115613744	2.6788958010301407	2.6636013791828264	2.6384189929452253	2.6374517372383437	2.527709915090418	1.8933755448025298	2.1412055622409882	2.0520003826491	1.9481620244596827	2.170254668446048	2.2084199569717478	2.3684922051755524	2.4997892953198786	2.389972878427149	2.289743073450284	2.2822770604066096	2.2721763361781964	2.2096557490439803	-0.4304143420382893	-0.4312394721164563	-0.36862890466358644	-0.21128180394008655	-0.16590935166884435	-0.2065873616679652	-0.3618613742338592	-0.2565288202938656	-0.2889229226029917	-0.3738583057325422	-0.3561419325386157	-0.36527540106014733	-0.3180541660464375	0.00240905380364	0.00784715402968	0.0145358169752	0.0832552515755	0.0107365258413	0.00342117348194	0.0296152123457	0.0350255264852	0.00937182550479	0.00883703695038	0.0129907246043	0.0125089884503	6.50330138039e-15	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	5.44976655677e-12	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:22862432..22862546,-__1676.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:22862432..22862546,-__1676.1.0.0	rs2270105	2.957840684341837	3.4357946551802074	2.838124729616033	2.512765916854052	2.9224095127693106	2.9616170011770304	2.8488005030908354	3.1694907201709066	2.9861482014930765	2.987457250857672	2.941889584451501	3.1601440324865644	2.976873566040752	2.98698790663659	3.3723283747774766	2.754979031818864	2.841279204703042	3.2000740769959264	3.049905281407375	2.9876033496772836	3.2089976478656927	3.2044017292720044	3.1745792965369377	3.0815321618710216	3.2281268585162386	3.090899576673205	0.02914722229475286	-0.06346628040273083	-0.08314569779716896	0.32851328784899003	0.2776645642266158	0.08828828023034463	0.13880284658644815	0.03950692769478614	0.21825352777892792	0.1871220456792657	0.13964257741952046	0.0679828260296742	0.11402601063245217	0.420456664513	0.809021331888	0.60051573606	0.420456664513	0.510582765025	0.788281320858	0.978575937473	0.727009731456	0.554657938956	0.8931878581	0.757455001208	0.861430881609	0.983065330043	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:2595316..2595430,-__1677.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:2595316..2595430,-__1677.1.0.0	rs6960419	2.1751486081265914	2.389726612767734	2.106407024275735	1.9972486742315492	2.1210680837441216	2.185243195668862	2.054503210580849	2.167273396500149	2.230461176288463	2.0619643099809197	2.1139320781517816	2.197765678945326	2.1500618374385065	1.5639080871868514	1.9772536464164492	1.6471166483885291	1.6090303751103976	1.7300767707364857	1.9349778180468256	1.7732694959890791	2.0584753646931087	1.8795173921829305	1.8688770902700511	1.8741633531683357	1.8326143575912528	1.8124400333150248	-0.61124052093974	-0.4124729663512847	-0.459290375887206	-0.3882182991211516	-0.3909913130076359	-0.25026537762203627	-0.28123371459177005	-0.10879803180704029	-0.3509437841055325	-0.19308721971086862	-0.23976872498344592	-0.36515132135407335	-0.33762180412348214	0.0386605553759	0.0601351299193	0.119339994516	0.0362033618716	0.0194743211566	0.188220673538	0.226876581559	0.333666485083	0.248198866138	0.0468981580933	0.0856734395523	0.0638899216795	3.04156279763e-06	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.00254882962442	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:44580865..44580979,-__1678.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:44580865..44580979,-__1678.1.0.0	rs41279633	-1.0671780354233862	-0.8251558272435089	-1.2001206899605492	-1.0005243454326047	-0.995659740843525	-0.6273128740223377	-0.975703210846552	-0.9344993981558463	-0.869708986415864	-0.9260808411283601	-0.7620686338409755	-0.8290919119525125	-0.9177587079388352	-1.0663351895879876	-0.8775142123360852	-0.9901927967336412	-0.8400097656242007	-0.9663475020895766	-0.8704421721181079	-0.9553147195115403	-0.9650440288961942	-0.8648567445738389	-0.8840567436153325	-0.8866527958016313	-1.0345154039779407	-0.9334401729055063	0.0008428458353986201	-0.05235838509257629	0.20992789322690797	0.160514579808404	0.029312238753948394	-0.24312929809577022	0.020388491335011638	-0.030544630740347967	0.004852241842025151	0.0420240975130276	-0.1245841619606558	-0.2054234920254282	-0.01568146496667126	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.60051573606	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.493479697885	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.56691686538	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:80231443..80231557,+__1679.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:80231443..80231557,+__1679.1.0.0	rs1194182	-1.4891096548090874	-1.2464042878229908	-0.9891996322057302	-1.5810021079828742	-1.4013994775353324	-1.8449737210367563	-1.6403063423877606	-1.7727470340824216	-1.696503536421354	-1.3832672379202713	-1.7624159017093974	-1.7729891890102034	-1.548359843577015	-1.6476517326835456	-1.82146847796803	-2.118647636896574	-1.3219345813290713	-1.7364864504949544	-1.555720422151149	-1.2884462084549475	-1.862733396089972	-1.6786295349977944	-2.346018351741461	-1.5264589585507564	-1.425029967420213	-1.6941021432315388	-0.15854207787445818	-0.5750641901450391	-1.1294480046908437	0.25906752665380295	-0.335086972959622	0.28925329888560736	0.3518601339328131	-0.08998636200755028	0.01787400142355966	-0.9627511138211895	0.23595694315864102	0.3479592215899905	-0.14574229965452404	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:94047029..94047143,+__1680.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:94047029..94047143,+__1680.1.0.0	rs1800238	-1.6483041426356853	-1.918646904358658	-1.1266027282362376	-1.5783104935471617	-1.9937318561248665	-1.6889412052423012	-1.881394696976588	-1.9955403840252632	-2.4121332090806806	-2.1832004599096164	-1.914625423620049	-1.6950818324920387	-1.8363761113540955	-1.872222694313456	-1.7823777526690407	-1.5976449541665576	-1.8916706253708657	-1.97290337751656	-1.6543073115151	-1.6895256231058875	-1.4699893039616079	-1.9534959471101911	-1.8771386778505863	-1.7873940667723194	-1.6004500467894796	-1.7624266984284709	-0.22391855167777064	0.13626915168961728	-0.47104222593031997	-0.31336013182370404	0.02082847860830639	0.03463389372720127	0.1918690738707005	0.5255510800636554	0.4586372619704895	0.3060617820590301	0.12723135684772968	0.09463178570255915	0.07394941292562456	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:99156342..99156456,+__1681.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:99156342..99156456,+__1681.1.0.0	rs6947941	0.029586407376687	-0.4193782765633454	-0.3553884894209253	-0.043525015345899615	-0.26886570679425476	-0.2035854217169058	-0.4999458281790138	0.009060291560208027	-0.1415897085184334	-0.07146936121915845	-0.07944850255900295	0.010840787973972846	-0.1694757352838393	-0.08016407538459222	-0.19342638432987969	-0.6059831619161129	-0.7018192824512415	0.013220749130327966	-0.7068638787559379	-0.4231024123124708	-0.2849997779594415	-0.6708086105816782	-0.0016499616754463951	-0.4723608843978189	-0.3619543289194474	-0.37415933412947827	-0.10975048276127922	0.22595189223346573	-0.2505946724951876	-0.6582942671053419	0.2820864559245827	-0.5032784570390321	0.07684341586654297	-0.2940600695196495	-0.5292189020632447	0.06981939954371205	-0.392912381838816	-0.37279511689342026	-0.204683598845639	0.619326784864	0.716953652062	0.493479697885	0.788281320858	0.85089220831	0.162582040005	0.30750859871	0.21176555971	0.468406259835	0.586575008857	0.0932701621097	0.166665831608	0.308333978815	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr7:99156396..99156510,+__1682.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:99156396..99156510,+__1682.1.0.0	rs6947941	0.029194967176366344	0.03837774583038639	-0.04054646486101493	0.06290302667783389	0.11653407793919622	0.021399835735465292	0.142288833652519	0.21979862407223585	0.2693895329772081	0.1974253133517116	0.34851410138633604	-0.04384295096272835	0.11345305358129297	0.21797044558715128	0.31215947071186323	0.1757366157029523	0.08921948555966873	0.3455005243934508	0.2758744820683755	0.14384882284848818	0.06939177834265632	0.1378638854667361	0.3175506348131496	0.3188627844685729	-0.05314588823782124	0.19590275347710365	0.18877547841078493	0.27378172488147684	0.21628308056396722	0.026316458881834842	0.22896644645425457	0.2544746463329102	0.001559989195969197	-0.15040684572957952	-0.13152564751047197	0.120125321461438	-0.029651316917763126	-0.00930293727509289	0.08244969989581068	0.716953652062	0.265084565602	0.8931878581	1.0	0.66743649171	0.333666485083	0.554657938956	0.861430881609	0.301187193336	0.361218104761	0.983930924304	0.777966336216	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr7:99156396..99156510,+__1682.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr7:99156396..99156510,+__1682.1.0.0	rs6947941,rs6947974	0.029194967176366344	0.03837774583038639	-0.04054646486101493	0.06290302667783389	0.11653407793919622	0.021399835735465292	0.142288833652519	0.21979862407223585	0.2693895329772081	0.1974253133517116	0.34851410138633604	-0.04384295096272835	0.11345305358129297	0.06085559791317435	0.3192501684636264	0.27270001381974496	0.037745096677446535	0.2806611327570473	0.2855709952267931	0.2253392029793811	0.0799544714872496	0.40082627674745214	0.2942663837959037	0.2889452679274065	0.4027896117225897	0.24574201829315132	0.03166063073680801	0.28087242263324	0.3132464786807599	-0.025157930000387352	0.16412705481785106	0.2641711594913278	0.0830503693268621	-0.13984415258498625	0.13143674377024406	0.0968410704441921	-0.05956883345892955	0.44663256268531804	0.13228896471185833	0.935789553219	0.397602565759	0.829896383209	0.87199428352	0.914457985151	0.390154148302	0.716950551484	0.716953652062	0.60051573606	0.687084607526	0.706946403854	0.340423946445	0.968965393835	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.flip.sense__chr8:11351839..11351953,+__1683.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.flip.sense__chr8:11351839..11351953,+__1683.1.0.0	rs922483	-0.8984743221782442	-0.21084952126523274	-0.3696903738201224	-0.9405632607238296	-0.5560382868794321	-0.4531276841604445	-0.6935210286395019	-0.4396443015944258	-0.3162828617743422	-0.6051824725767834	-0.5392469673281598	-0.4657503916939672	-0.5406976227195405	-0.2972695898540178	-0.44755029451448236	-0.9017342342031667	-0.3728384050009359	-0.47992719364154224	-0.6380525726857256	-0.5083846138007412	-0.4770890373021314	-0.35424595885962884	-0.6334218607803309	-0.3209818261383227	-0.4736479607603979	-0.49209529562845195	0.6012047323242264	-0.23670077324924962	-0.5320438603830443	0.5677248557228937	0.07611109323788989	-0.18492488852528105	0.18513641483876075	-0.03744473570770562	-0.03796309708528661	-0.028239388203547544	0.2182651411898371	-0.007897569066430687	0.048602327091088526	0.326996172605	0.226876581559	0.276771967065	0.0832552515755	0.60051573606	0.519249062249	0.63839046467	0.914457985151	0.87199428352	0.79863356553	0.420456664513	0.788281320858	0.659580477766	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:11665858..11665972,+__1684.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:11665858..11665972,+__1684.1.0.0	rs113733106	-0.08016407538459222	0.49788675624158013	-0.11204819097218427	0.16729387246854116	0.4209959581896762	-0.3213346439514429	-0.4285707133666605	-0.9393813180098345	-0.6231428781636361	0.3308065094437446	-0.3054346879308172	-0.8957117574824331	-0.19073376407650486	1.7323224999921247	0.9710684931602852	0.6478608812123529	1.619976086764513	0.9074306736426033	-0.4992987713664251	2.314379213022028	0.271485435191625	1.0145908391991347	0.8841425010098465	1.4844009189782446	1.8183453637628368	1.0972253445474307	1.812486575376717	0.4731817369187051	0.7599090721845372	1.4526822142959719	0.4864347154529271	-0.1779641274149822	2.7429499263886887	1.2108667532014594	1.6377337173627708	0.5533359915661018	1.7898356069090617	2.71405712124527	1.2879591086239357	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:11665858..11665972,+__1684.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:11665858..11665972,+__1684.1.0.0	rs1032577	-0.08016407538459222	0.49788675624158013	-0.11204819097218427	0.16729387246854116	0.4209959581896762	-0.3213346439514429	-0.4285707133666605	-0.9393813180098345	-0.6231428781636361	0.3308065094437446	-0.3054346879308172	-0.8957117574824331	-0.19073376407650486	0.4736589185995684	-0.30059542946846135	-0.12013518617271306	0.16544035919017763	-0.2201866022143276	0.74228266887543	-0.6154695609032667	-1.1175997729211569	-0.28529352296080124	1.0657433617934655	2.327912937703196	0.4872984596712608	0.2169213859326976	0.5538229939841606	-0.7984821857100415	-0.008086995200528788	-0.0018535132783635277	-0.6411825604040038	1.0636173128268729	-0.18689884753660613	-0.17821845491132238	0.3378493552028349	0.7349368523497208	2.633347625634013	1.383010217153694	0.4076551500092025	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr8:11665858..11665972,+__1684.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:11665858..11665972,+__1684.1.0.0	rs141005971,rs113733106,rs1032577	-0.08016407538459222	0.49788675624158013	-0.11204819097218427	0.16729387246854116	0.4209959581896762	-0.3213346439514429	-0.4285707133666605	-0.9393813180098345	-0.6231428781636361	0.3308065094437446	-0.3054346879308172	-0.8957117574824331	-0.19073376407650486	0.7730414931682469	0.4510969060093047	-0.6735931336836395	-0.3870296446537464	1.1365108284326677	-0.4538284336692322	-0.31922881905076755	-0.6235346331225343	0.1436419059383319	0.5721916512891271	-0.6960061551767421	-0.16780523839898154	-0.020378606076497108	0.8532055685528391	-0.04678985023227544	-0.5615449427114552	-0.5543235171222876	0.7155148702429914	-0.1324937897177893	0.10934189431589297	0.31584668488730017	0.766784784101968	0.24138514184538246	-0.39057146724592495	0.7279065190834516	0.17035515800000778	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:11665897..11666011,+__1685.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:11665897..11666011,+__1685.1.0.0	rs113733106	-0.2794271846443284	-0.029621361219229807	-0.3320140821674881	-0.5767336694805629	0.21886785309872692	-0.20352481932683741	0.07386254325132417	-0.6240840643603439	0.06004119816994171	0.09187749136570332	-0.3889939887898281	-0.3212610468600651	-0.1925842609135823	-0.4500765679724428	-0.32696985224573616	-0.5224592453732131	-0.4674436195162418	-0.5466972817459421	-0.5609064351755859	-0.19450130534800741	-0.2413572492830345	-0.5432980587950995	0.0013746757585337138	-0.4375748973390641	-0.14170850698800094	-0.36930152866865296	-0.17064938332811436	-0.29734849102650635	-0.19044516320572497	0.10929004996432112	-0.765565134844669	-0.3573816158487485	-0.2683638485993316	0.38272681507730943	-0.6033392569650412	-0.0905028156071696	-0.04858090854923597	0.17955253987206418	-0.17671726775507057	0.276771967065	0.170821264488	0.179364149792	0.192768091005	0.00133155906714	0.0601351299193	0.154655491485	0.809021331888	0.0140036728837	0.0499532058383	0.19276299732	0.581967350665	0.000148561095457	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.124494197993	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:11665897..11666011,+__1685.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:11665897..11666011,+__1685.1.0.0	rs1032577	-0.2794271846443284	-0.029621361219229807	-0.3320140821674881	-0.5767336694805629	0.21886785309872692	-0.20352481932683741	0.07386254325132417	-0.6240840643603439	0.06004119816994171	0.09187749136570332	-0.3889939887898281	-0.3212610468600651	-0.1925842609135823	-0.6849968146786074	-0.23698121270341277	-0.10648006350070337	-0.2290061290483557	-0.24294303606164547	0.05474443776690674	-0.2486886930461451	-0.09733634757659898	-0.4186615578513853	-0.4892039863285924	-0.36649261529173305	-0.08205785614003476	-0.26234198953835897	-0.405569630034279	-0.20735985148418296	0.22553401866678474	0.3477275404322072	-0.4618108891603724	0.25826925709374415	-0.3225512362974693	0.5267477167837449	-0.478702756021327	-0.5810814776942957	0.022501373498095056	0.23920319072003038	-0.06975772862477667	0.248198866138	0.8931878581	0.188220673538	0.63839046467	0.677233097055	0.0856734395523	0.609889042629	0.154655491485	0.379136386009	0.390154148302	0.428237569536	0.397602565759	0.223046016147	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr8:11665897..11666011,+__1685.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:11665897..11666011,+__1685.1.0.0	rs113733106,rs1032577	-0.2794271846443284	-0.029621361219229807	-0.3320140821674881	-0.5767336694805629	0.21886785309872692	-0.20352481932683741	0.07386254325132417	-0.6240840643603439	0.06004119816994171	0.09187749136570332	-0.3889939887898281	-0.3212610468600651	-0.1925842609135823	-0.46059261673616914	-0.20127690329757877	-0.616158586600195	-0.3669414825231128	-0.6910283603051793	-0.546531696192813	-0.5401034852434214	-0.2620251910598983	-0.6847784813549646	-0.5038897042448531	-0.5447352545275199	-0.6237062637799619	-0.503480668822139	-0.18116543209184072	-0.17165554207834896	-0.28414450443270683	0.2097921869574501	-0.9098962134039063	-0.34300687686597564	-0.6139660284947456	0.3620588733004456	-0.7448196795249062	-0.5957671956105565	-0.15574126573769181	-0.30244521691989673	-0.3108964079085566	0.0678362651725	0.354199901149	0.405136064622	0.527990680582	0.00220311126631	0.361218104761	0.0906800339379	0.333666485083	0.0386605553759	0.000751093855117	0.129194552482	0.101398170673	1.71863569963e-05	1	1	1	1	0.451637809594	1	1	1	1	0.156227521864	1	1	0.00390130303817	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:143695803..143695917,-__1686.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:143695803..143695917,-__1686.1.0.0	rs28420666	-0.7360162535196544	-0.2675781237346864	-1.4070970132040144	-0.9052731789126487	-0.3819122177032074	-1.8354446046674116	-1.194171554662463	-0.7213152356246553	-1.0074456599803427	-0.30062339812566113	-0.6743340985380848	-0.29426136054804425	-0.8104560582684059	-0.8913883991483467	-0.07655056522921794	0.0763405828632754	-1.0125618515004926	0.28576614968155	-0.3868674467668445	-0.008515070630443461	-0.6846808033738121	-0.5745006315071428	0.5132899782477478	-0.009628430066374122	-0.16784215297456778	-0.24476155336705574	-0.15537214562869228	0.1910275585054685	1.4834375960672899	-0.10728867258784391	0.6676783673847574	1.448577157900567	1.1856564840320194	0.036634432250843174	0.43294502847319993	0.813913376373409	0.6647056684717106	0.12641920757347647	0.5656945049013503	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:143761835..143761949,+__1687.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:143761835..143761949,+__1687.1.0.0	rs2294008	-1.570756267376674	-1.2913128006591235	-1.4360358975849523	-1.4556640519069948	-1.4579449980167496	-1.6396045108060595	-1.59150735997062	-1.046722365695906	-1.4759072092390544	-1.2472639212786947	-1.2798197159305023	-1.4440810610545634	-1.4113850132933246	-1.3215610107434086	-1.2329176785555018	-0.7803498329170858	-1.5500354649070116	-1.1691346045005482	-1.521843815758768	-0.9908605397324428	-1.339354470434778	-1.1504912894280834	-1.1995794301074263	-1.5142977583504014	-1.2882179916662546	-1.2548869905918094	0.24919525663326536	0.05839512210362163	0.6556860646678665	-0.09437141300001683	0.2888103935162014	0.11776069504729159	0.6006468202381772	-0.292632104738872	0.32541591981097095	0.047684491171268384	-0.2344780424198991	0.15586306938830874	0.15649802270151533	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:144660465..144660579,-__1688.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:144660465..144660579,-__1688.1.0.0	rs61544471	2.1430150437377056	2.353427454841252	2.0521871608823394	1.7890007788198077	2.14829050756923	2.2503607484784203	2.288669059343587	1.8778039385052667	2.193471375959518	2.2817246689166213	2.072014140103807	2.2156972615521697	2.13880517822581	1.0091646071527758	0.6362012293090991	0.9625593346237264	0.2776812135483251	0.7984081877026333	0.5275073544508975	0.757333640401354	0.6843552394456507	0.9604155449148846	0.8947866646398746	0.5968678925164888	1.3479164985099896	0.7877664506013082	-1.1338504365849298	-1.717226225532153	-1.089627826258613	-1.5113195652714826	-1.3498823198665968	-1.7228533940275228	-1.531335418942233	-1.193448699059616	-1.2330558310446333	-1.3869380042767467	-1.4751462475873183	-0.8677807630421801	-1.3510387276245022	0.0894031725958	0.0565651674203	0.175048880887	0.107123399254	0.0327677521954	0.0134887989876	0.158583637061	0.162586850726	0.0678362651725	0.276771967065	0.113101776132	0.0808926541269	2.41987701056e-06	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.00202785693485	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr8:144660465..144660579,-__1688.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:144660465..144660579,-__1688.1.0.0	rs61544471,rs896949	2.1430150437377056	2.353427454841252	2.0521871608823394	1.7890007788198077	2.14829050756923	2.2503607484784203	2.288669059343587	1.8778039385052667	2.193471375959518	2.2817246689166213	2.072014140103807	2.2156972615521697	2.13880517822581	1.210997411783011	1.0162992328757838	0.9766971728263012	1.0062031439927743	0.6194929887659201	1.6393237255685555	1.0139834195490862	1.257108489884864	1.0869363053955392	0.9480122677876889	0.7948016451455452	1.1054111430881426	1.0562722455552678	-0.9320176319546947	-1.3371282219654683	-1.0754899880560382	-0.7827976348270334	-1.52879751880331	-0.6110370229098647	-1.2746856397945008	-0.6206954486204028	-1.1065350705639787	-1.3337124011289325	-1.277212494958262	-1.1102861184640271	-1.0825329326705428	0.340423946445	0.179364149792	0.424328713503	NA__not_enough_barcodes	0.132622250874	0.66743649171	0.989287003123	0.898497645189	0.132622250874	0.29495293544	0.510582765025	0.0412580447575	0.27419758721	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:144679754..144679868,-__1689.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:144679754..144679868,-__1689.1.0.0	rs62522168	0.5253015810221945	0.08645517494371446	-0.1686991123535797	-0.7199749030418277	0.3414332032170506	-0.3485801791202696	-0.013378940977021588	-0.406628171556389	-0.5334513400234814	-0.15135140576631478	0.0773592794900893	-0.3612549385645099	-0.13939747939419542	0.016699651249969954	-0.9417611977419308	-0.6807441895913335	-1.525629577228651	-0.19051219567985223	-0.01961847003836916	-1.2357713487205204	-0.755037109265934	-0.9824220811470039	-0.4082764623262679	-1.2947674438606076	-1.104529832255561	-0.7601975213838386	-0.5086019297722245	-1.0282163726856453	-0.5120450772377538	-0.8056546741868233	-0.5319453988969028	0.3289617090819005	-1.2223924077434989	-0.34840893770954506	-0.44897074112352253	-0.2569250565599531	-1.3721267233506969	-0.7432748936910512	-0.620800041989643	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:145020573..145020687,-__1690.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:145020573..145020687,-__1690.1.0.0	rs12549853	-0.5978045864297781	-0.6084691653014818	-0.6167498845109555	-0.5152796723054656	-0.4532557062791456	-0.6025978639475273	-0.6911683527424026	-0.6275615563437483	-0.5484358778126509	-0.4452518654422864	-0.5026888137683215	-0.643699036250887	-0.5710801984278876	-0.6358892684212398	-0.7157043593472933	-0.7680131679151051	-0.46214080333588875	-0.5016652993243861	-0.6402050151556369	-0.37346265676798107	-0.48356428902813187	-0.5129279387517546	-0.4995108823017741	-0.4902189071522172	-0.5987623069300552	-0.556838741202622	-0.038084681991461755	-0.1072351940458115	-0.15126328340414963	0.053138868969576813	-0.04840959304524051	-0.037607151208109535	0.31770569597442155	0.14399726731561646	0.03550793906089633	-0.054259016859487696	0.01246990661610431	0.044936729320831814	0.014241457225265555	0.248198866138	0.581967350665	0.519249062249	0.706946403854	0.8931878581	0.687084607526	0.0856734395523	0.648010011537	0.925117039075	0.752350373358	0.687084607526	0.628827692687	0.863763952908	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:145159037..145159151,-__1691.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:145159037..145159151,-__1691.1.0.0	rs11136255	-0.4767209444107178	-0.3825949830139951	-0.517981706674508	-0.7203127030960307	-0.4753129359416002	-0.6009991298785811	-0.5010301263214474	-0.278099298761114	-0.4008722868586688	-0.3227682136624962	-0.6203823332349577	-0.5576758244105183	-0.4878958738553863	-0.6484946532320912	-0.6555123842563042	-0.5386606488159924	-0.7533423096835067	-0.4544412339282249	-0.3119428441966859	-0.5965984130919577	-0.3521362479970535	-0.6096468145092016	-0.5682629206915815	-0.40047777204710144	-0.49060157396765847	-0.5316764847014465	-0.17177370882137344	-0.2729174012423091	-0.020678942141484358	-0.033029606587476	0.020871702013375293	0.2890562856818952	-0.09556828677051032	-0.07403694923593951	-0.20877452765053273	-0.24549470702908527	0.21990456118785628	0.06707425044285986	-0.04378061084606034	0.282745459933	0.428242856315	0.914457985151	0.737113058664	0.60051573606	0.0240855495486	0.591208103411	0.519249062249	0.216719559135	0.320413072024	0.226876581559	0.493479697885	0.261747113127	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr8:145159037..145159151,-__1691.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:145159037..145159151,-__1691.1.0.0	rs74667328,rs11136255	-0.4767209444107178	-0.3825949830139951	-0.517981706674508	-0.7203127030960307	-0.4753129359416002	-0.6009991298785811	-0.5010301263214474	-0.278099298761114	-0.4008722868586688	-0.3227682136624962	-0.6203823332349577	-0.5576758244105183	-0.4878958738553863	-0.5369122490619164	-0.36506347092769537	-0.3595652468371414	-0.7078272551827639	-0.528515617473902	-0.4710060061003556	-0.4202796809436474	-0.34483781672306024	-0.577716664852645	-0.6675527749363512	-0.35569170526917115	-0.6498449528708339	-0.4987344534316236	-0.060191304651198596	0.017531512086299716	0.15841645983736663	0.012485447913266778	-0.05320268153230179	0.12999312377822547	0.08075044537779996	-0.06673851796194624	-0.17684437799397612	-0.34478456127385504	0.2646906279657866	-0.09216912846031555	-0.01083857957623735	0.536806685117	0.60051573606	0.677229610811	NA__no_active_tile	0.265084565602	0.320413072024	0.840380101088	0.519249062249	0.536806685117	0.0338805621681	0.104229562843	0.935789553219	0.414702352154	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:145742837..145742951,-__1693.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:145742837..145742951,-__1693.1.0.0	rs2306386	1.304928457736552	1.157438692362608	0.9846864175068832	0.8965332661965539	1.4145859423611578	0.8786186040988874	0.4807722764772717	0.9476973884987925	1.1574586237411264	1.0687542835585186	1.5868857393386866	1.0906883716693108	1.0807540052955291	1.6746455193116059	1.4915533120347315	0.6160257635207742	0.20372601044062832	0.6582007704166637	0.5822975341681949	0.5515854201974614	0.7972511780221074	0.916243082415228	1.170075530247661	0.6446839665784764	1.3742804388977603	0.8900473771876077	0.3697170615750538	0.3341146196721234	-0.36866065398610903	-0.6928072557559256	-0.7563851719444941	-0.2963210699306925	0.07081314372018965	-0.15044621047668505	-0.2412155413258984	0.10132124668914244	-0.9422017727602102	0.28359206722844954	-0.19070662810792136	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:145747848..145747962,+__1694.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:145747848..145747962,+__1694.1.0.0	rs13277542	1.0349994801206224	0.14563724078980467	-0.7351944880027533	0.9678436696233327	0.18547838717747117	-0.3131349981511466	-1.881394696976588	-0.3176486386134126	-0.595995802689033	-1.0381908920487757	-0.3950449179276265	-0.29612241735313377	-0.26989733950426986	1.244616531819834	0.8468529406381766	1.874383442971749	1.9455579278946442	-0.10891072196947406	1.3271924005338118	1.7228213189991939	0.8237218933778215	0.9283549450437216	2.5943136306549928	1.1745484197242249	2.416343225726248	1.3991496629512454	0.20961705169921152	0.701215699848372	2.609577930974502	0.9777142582713115	-0.2943891091469452	1.6403273986849585	3.6042160159757817	1.1413705319912342	1.5243507477327545	3.6325045227037682	1.5695933376518514	2.7124656430793816	1.669047002455515	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:145752382..145752496,-__1695.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:145752382..145752496,-__1695.1.0.0	rs2721142	-0.09374365183695435	0.029762218573445992	1.6326575702170918	1.59439980843738	0.09922179168099793	0.9646801380008279	1.0086591222245125	1.9874712171306492	0.9956762347781449	0.3716062786166712	0.19307838891698675	0.6636566858357638	0.7872604835479597	0.8237239573489419	1.7545548561174853	0.007903543614062371	0.884540659020343	0.3716883963810157	-0.8110488943616788	1.6212871759927998	0.5767836347538058	0.1436419059383319	1.3733966848676584	1.5035216945635597	0.014382583449021803	0.6886980164737788	0.9174676091858962	1.7247926375440392	-1.6247540266030294	-0.7098591494170371	0.27246660470001777	-1.7757290323625066	0.6126280537682873	-1.4106875823768434	-0.852034328839813	1.0017904062509873	1.310443305646573	-0.649274102386742	-0.09856246707418093	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:38033976..38034090,-__1696.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:38033976..38034090,-__1696.1.0.0	rs2270376	2.793318519628922	3.2366879798543566	2.814349844321915	2.6962943844951246	2.8094737092583184	2.853037042618819	2.6464065691766754	2.899119336072279	2.8049145113637857	2.8880750084573834	2.9093525287140016	2.96722598671555	2.859854618389761	2.9443422918708837	3.399276573688491	2.844326094948544	2.6955700955307096	3.0720108445331427	3.010481587737846	2.771568329211375	3.007295766598117	2.9950310738074286	3.047438736244587	3.1215934334346063	3.0259688252312458	2.9945753044030816	0.15102377224196184	0.16258859383413427	0.029976250626628786	-0.0007242889644150097	0.26253713527482425	0.15744454511902672	0.12516176003469948	0.10817643052583792	0.19011656244364294	0.15936372778720376	0.21224090472060464	0.05874283851569562	0.13472068601332043	0.390154148302	0.170821264488	0.375513989452	0.581967350665	0.119339994516	0.29495293544	0.493479697885	0.545696106059	0.179364149792	0.154655491485	0.248198866138	0.326996172605	0.0410735001254	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:38034215..38034329,-__1697.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:38034215..38034329,-__1697.1.0.0	rs55962869	-0.29525016405173543	-0.20345576434319496	-0.7435752306392569	-0.3091148269864743	-0.15366610004546088	-0.14646193689886305	-0.45994050833601774	-0.0507478207564848	-0.22874172369275705	-0.15452631327702981	0.025472976124555364	-0.26917850000623816	-0.2490988260757465	-0.4406389249955416	-0.25691077274788976	0.013502675044843574	-0.32902252645197316	-0.23505773234246172	-0.2554783897073049	0.050946503655341355	-0.16940045291464903	-0.1927781234253842	0.02832321157415585	-0.05238916872181985	-0.1537483914323555	-0.16605434103875322	-0.14538876094380615	-0.053455008404694804	0.7570779056841005	-0.019907699465498863	-0.08139163229700083	-0.10901645280844185	0.5108870119913591	-0.11865263215816424	0.03596360026737286	0.18284952485118566	-0.07786214484637521	0.11543010857388267	0.08304448503699323	0.638386621154	0.595849425807	0.143309689892	0.619326784864	0.696989544957	0.154655491485	0.0638899216795	0.919784795402	0.657696241675	0.914457985151	0.682148641351	0.577368064655	0.683949070775	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:49984823..49984937,+__1698.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:49984823..49984937,+__1698.1.0.0	rs6983929	-1.2663086483419368	-1.2215240887047258	-1.4490177178182695	-1.538618447066154	-1.735277553591669	-1.2289469127232868	-1.3738096437829692	-1.2199409286181457	-1.0378709603800005	-1.090296554359087	-1.413148034133874	-1.4520297923243897	-1.3355657734870423	-1.650944778463631	-1.6630273452713489	-1.5828397031260164	-1.504758299695405	-1.34034863347779	-1.2974302182786883	-1.5607356996446886	-1.2286448057986248	-1.562079831076392	-1.5099656529469188	-1.5013785772186636	-1.4245826351895357	-1.4855613483489751	-0.3846361301216943	-0.44150325656662304	-0.13382198530774692	0.03386014737074894	0.3949289201138788	-0.0684833055554015	-0.1869260558617194	-0.008703877180479047	-0.5242088706963914	-0.41966909858783175	-0.08823054308478961	0.027447157134854017	-0.14999557486193293	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:6795793..6795907,-__1699.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:6795793..6795907,-__1699.1.0.0	rs10089687	-2.2565850309411752	-1.8602959665295093	-1.6953178204735726	-1.5623059498435796	-1.7228268267437783	-1.7780458441139921	-1.756734513088758	-1.2542731557379134	-1.789187162400693	-1.5411283695772189	-1.9797360531012078	-1.6405146989698782	-1.7364126159601065	-2.051188146976428	-1.9006771166596828	-1.5760219346907427	-1.5432051824753683	-2.1829037438111114	-1.8618543610547449	-2.059080417314461	-1.5766028192460988	-1.7535293895561384	-2.101632215123414	-1.7054710067141885	-2.023978314098893	-1.8613453873101058	0.2053968839647471	-0.040381150130173404	0.1192958857828299	0.019100767368211313	-0.4600769170673331	-0.08380851694075275	-0.30234590422570307	-0.32232966350818537	0.035657772844554625	-0.5605038455461953	0.2742650463870193	-0.38346361512901495	-0.12493277134999964	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:6795793..6795907,-__1699.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:6795793..6795907,-__1699.1.0.0	rs2741677	-2.2565850309411752	-1.8602959665295093	-1.6953178204735726	-1.5623059498435796	-1.7228268267437783	-1.7780458441139921	-1.756734513088758	-1.2542731557379134	-1.789187162400693	-1.5411283695772189	-1.9797360531012078	-1.6405146989698782	-1.7364126159601065	-1.6002139166016045	-1.763532702316878	-1.7912914140628209	-1.3779419851239416	-2.046489619494765	-1.26421398992317	-1.5829420969515118	-1.7062494818500018	-1.8410870372651393	-2.085979414065804	-1.9282456723314028	-2.0039757000289433	-1.7493469191679987	0.6563711143395707	0.09676326421263126	-0.09597359358924828	0.184363964719638	-0.32366279275098675	0.5138318541908222	0.17379241613724616	-0.4519763261120884	-0.05189987486444636	-0.544851044488585	0.051490380769805055	-0.3634610010590651	-0.012934303207892203	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr8:6795793..6795907,-__1699.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:6795793..6795907,-__1699.1.0.0	rs10089687,rs2741677	-2.2565850309411752	-1.8602959665295093	-1.6953178204735726	-1.5623059498435796	-1.7228268267437783	-1.7780458441139921	-1.756734513088758	-1.2542731557379134	-1.789187162400693	-1.5411283695772189	-1.9797360531012078	-1.6405146989698782	-1.7364126159601065	-1.4754082963122648	-1.4923464462979528	-2.0652291331263233	-1.839571530209962	-1.7390335195971025	-1.6553240225998849	-1.6596141100405168	-1.3755049293843111	-1.5818580394926083	-2.099653818338095	-1.4716756143451235	-1.6438797427289435	-1.6749249335394243	0.7811767346289105	0.3679495202315566	-0.3699113126527507	-0.2772655803663824	-0.01620669285332421	0.12272182151410727	0.0971204030482411	-0.1212317736463977	0.2073291229080847	-0.5585254487608762	0.5080604387560843	-0.0033650437590653226	0.06148768242068233	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:8559367..8559481,+__1700.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:8559367..8559481,+__1700.1.0.0	rs11783670														1.976895887472391	2.2456931769957356	1.9656989295536174	1.8417255577341551	2.130193712280714	1.0663038896388295	1.16779682440254	0.7581558221195738	-0.40003383946510657	1.107768419639416	2.1351325844862794	1.258271848669313	1.4378002344606216														NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:8559367..8559481,+__1700.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:8559367..8559481,+__1700.1.0.0	rs11776987														1.3887596225135541	2.4718699041346657	0.45401799338499116	1.1090969665717954	-0.5295728528417911	-0.20764952627502867	-1.6711388071046802	-0.2344642185241016	0.25396362748676143	0.7663808131025345	1.000576105680228	-0.5416227809444276	0.35501807059870844														NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr8:8559367..8559481,+__1700.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:8559367..8559481,+__1700.1.0.0	rs11783670,rs11776987														0.5080885716061462	0.8007504522999528	3.5147142104048186	3.5145363005284764	0.9925790844454214	0.05010628706162823	1.3291850929943065	-0.5980837651856029	1.5394797638958106	1.695692331327027	4.071265831028004	1.5600677958314009	1.5815318296864493														NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:95961559..95961673,-__1701.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:95961559..95961673,-__1701.1.0.0	rs10097617	0.7948215961419992	-0.4835470812583254	0.2838812712579512	-2.711460089699258	-0.7417849457678187	-0.4640597063791789	-0.7710344073236471	0.2835000587873507	-0.09861160787466883	0.47405114007711496	-1.888403746419932	-1.5547490875618146	-0.573116383835019	1.1018882420062126	0.34655461994226483	1.4658394308706988	0.818922755255751	1.450798846033328	0.02238958465658003	0.5371579307631535	1.092562398972182	0.7213454087356548	0.5035233562017891	0.5686307817630986	-0.03784932959803722	0.7159803354668898	0.3070666458642134	0.8301017012005902	1.1819581596127475	3.530382844955009	2.192583791801147	0.48644929103575896	1.3081923380868008	0.8090623401848314	0.8199570166103236	0.029472216124674155	2.4570345281830304	1.5168997579637775	1.2890967193019085	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:96037145..96037259,+__1702.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:96037145..96037259,+__1702.1.0.0	rs77790737	0.6770354508371621	0.19225580641111928	0.5151764949036733	0.629859264478158	0.11447564712109165	0.08332047403268111	0.4816858037787175	-0.3849162582116388	0.5384314717953849	1.1363510912759434	0.6370535825361459	0.5175192178880125	0.4281873372372042	0.31142437009449847	-0.4727730687615954	-0.7486020873857678	-0.3291855184430474	-0.8115150706989955	0.006008722519971754	0.18638670741831653	0.6994517342736136	-0.7764777944440255	-0.11185513788721724	0.08736112013632047	0.5359008707558035	-0.11865626270184372	-0.36561108074266363	-0.6650288751727147	-1.2637785822894412	-0.9590447829212054	-0.9259907178200872	-0.07731175151270936	-0.29529909636040097	1.0843679924852525	-1.3149092662394104	-1.2482062291631606	-0.5496924623998254	0.018381652867791032	-0.546843599939048	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:99129460..99129574,+__1703.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:99129460..99129574,+__1703.1.0.0	rs2071598	0.23949690539685425	0.579139372937406	0.7152845965386297	0.2537538737312722	0.6847460241188685	0.7274778009572437	0.9670862217876087	0.73978695152516	0.3619240607942005	0.6583391411972235	0.6986927916615246	0.5823798262901807	0.6006756305780144	0.0508498642738211	0.3598530458538169	0.35109183763161794	0.6018565138246185	0.4917312148839205	0.6999647342023754	0.5664649270994693	0.7936874581578176	0.6121910270060844	0.5990307152688018	0.5927884116178063	0.5578163428715964	0.5231105077243122	-0.18864704112303315	-0.21928632708358914	-0.3641927589070118	0.3481026400933463	-0.19301480923494801	-0.02751306675486831	-0.40062129468813945	0.05390050663265755	0.25026696621188393	-0.05930842592842167	-0.10590438004371838	-0.024563483418584275	-0.0775651228537022	0.696989544957	0.493479697885	0.116187990183	0.861430881609	0.432161939034	0.554657938956	0.0362033618716	0.962516753025	0.147021540231	0.572794651112	0.60051573606	0.63839046467	0.509863074286	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:99129460..99129574,+__1703.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:99129460..99129574,+__1703.1.0.0	rs77277723	0.23949690539685425	0.579139372937406	0.7152845965386297	0.2537538737312722	0.6847460241188685	0.7274778009572437	0.9670862217876087	0.73978695152516	0.3619240607942005	0.6583391411972235	0.6986927916615246	0.5823798262901807	0.6006756305780144	0.21748680002725868	0.5364398106101231	0.21345820546311106	0.2171489490928894	0.5175778551479663	0.3795362564500731	0.5240464275571205	0.926990188257572	0.5192653315730823	0.4499830283801667	0.47952392854837644	0.45897376019647196	0.453369211775351	-0.02201010536959558	-0.04269956232728289	-0.5018263910755187	-0.036604924638382774	-0.16716816897090225	-0.3479415445071706	-0.4430397942304882	0.1872032367324119	0.15734127077888183	-0.2083561128170568	-0.2191688631131482	-0.12340606609370874	-0.14730641880266346	0.347268461228	0.840380101088	0.147021540231	0.809021331888	0.88258056334	1.0	0.657696241675	0.648013768535	0.0832552515755	0.989287003123	0.727009731456	0.727009731456	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr8:99129460..99129574,+__1703.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:99129460..99129574,+__1703.1.0.0	rs80085618	0.23949690539685425	0.579139372937406	0.7152845965386297	0.2537538737312722	0.6847460241188685	0.7274778009572437	0.9670862217876087	0.73978695152516	0.3619240607942005	0.6583391411972235	0.6986927916615246	0.5823798262901807	0.6006756305780144	-0.14824864321613293	0.19262222940840595	0.09880994679855776	0.09055062917026706	0.17997080486811712	0.4413341278381433	0.4867025993433294	0.23310854082404928	0.4796325856905699	0.3507633738820494	0.05265620490421749	0.4866324390689525	0.24537790321504382	-0.38774554861298716	-0.3865171435290001	-0.6164746497400719	-0.1632032445610051	-0.5047752192507514	-0.2861436731191004	-0.48038362244427935	-0.5066784107011107	0.1177085248963694	-0.30757576731517405	-0.6460365867573071	-0.09574738722122822	-0.3552977273629705	0.30750859871	0.253741740693	0.0168468410067	0.468411351413	0.21176555971	0.216719559135	0.0362033618716	0.0856734395523	0.957167318493	0.192768091005	0.125844655769	0.527990680582	0.00801856828762	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr8:99129460..99129574,+__1703.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr8:99129460..99129574,+__1703.1.0.0	rs2071598,rs77277723,rs80085618	0.23949690539685425	0.579139372937406	0.7152845965386297	0.2537538737312722	0.6847460241188685	0.7274778009572437	0.9670862217876087	0.73978695152516	0.3619240607942005	0.6583391411972235	0.6986927916615246	0.5823798262901807	0.6006756305780144	0.3040583400742814	0.6049360328372287	0.476952402626037	0.3250106576596698	0.41222601997494496	0.28027941132094447	0.5220686690644549	0.9095476565151941	0.4946279092822106	0.23116239183779175	0.4913206676515317	0.6488473145316329	0.47508645611466016	0.06456143467742714	0.025796659899822716	-0.23833219391259275	0.07125678392839763	-0.2725200041439236	-0.4471983896362992	-0.4450175527231538	0.16976070499003404	0.13270384848801015	-0.42717674935943173	-0.20737212400999294	0.06646748824145221	-0.1255891744633542	0.628827692687	0.946473618223	0.276771967065	0.925117039075	0.226876581559	0.202104162379	0.288805731951	0.90381429355	0.87199428352	0.179364149792	0.493479697885	0.85089220831	0.821716890137	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:113800715..113800829,-__1704.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:113800715..113800829,-__1704.1.0.0	rs28700160	-0.005186988065588375	-0.3406453395865892	-1.7444167809176458	-1.2002237071743334	-1.315942878146731	-0.7696859725656616	-1.4252255086758985	-1.1601871183938648	-1.5784545497841882	-1.368892651236186	-1.214911664447984	-1.5341965245135152	-1.1381641402923488	-0.8490575273472392	-0.8720772772125803	-1.4211921012451194	-1.1569321249704825	-1.33032333895294	-1.094789173296457	-0.0954523186223493	-1.1499742109467388	-1.513330775308547	-1.134407389084103	-0.6856194720070543	-1.1921631822703742	-1.0412765742719987	-0.8438705392816508	-0.5314319376259911	0.32322467967252644	0.043291582203850876	-0.014380460806209028	-0.32510320073079535	1.3297731900535492	0.010212907447125996	0.06512377447564122	0.23448526215208298	0.5292921924409297	0.34203334224314097	0.0968875660203501	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:123691397..123691511,-__1705.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:123691397..123691511,-__1705.1.0.0	rs115683713	2.329402903890426	0.6059626733861632	1.088140022818834	0.7167315032456455	0.1687439189074697	1.1300793003302088	0.6347842436116774	-0.28717248325691125	0.6719193095805723	0.8637870438339085	0.7849092727691941	0.5247507222009321	0.7693365359431769	1.598966400449943	0.8974422173059441	-0.07096498306961617	0.5412237470406307	0.7484664695781196	0.9674301830531108	0.586306511552662	-0.026250644673876125	0.4403808335660089	0.891180168914488	-0.13737352230140343	0.13299761990136202	0.547483750109781	-0.7304365034404829	0.2914795439197809	-1.1591050058884502	-0.1755077562050148	0.5797225506706498	-0.16264911727709797	-0.0484777320590154	0.26092183858303514	-0.23153847601456345	0.02739312508057956	-0.9222827950705975	-0.39175310229957006	-0.2218527858333956	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:123691397..123691511,-__1705.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:123691397..123691511,-__1705.1.0.0	rs1930786	2.329402903890426	0.6059626733861632	1.088140022818834	0.7167315032456455	0.1687439189074697	1.1300793003302088	0.6347842436116774	-0.28717248325691125	0.6719193095805723	0.8637870438339085	0.7849092727691941	0.5247507222009321	0.7693365359431769	0.4104577583821534	-0.5428554632734413	0.5187300306386308	0.5167191938146247	0.9279828265602066	0.5917613575301783	0.16997975960777695	-0.22573451802273775	0.9956762347781449	0.07493945601858698	-0.03673298438929637	0.751595729291572	0.3460432817446999	-1.9189451455082727	-1.1488181366596044	-0.5694099921802033	-0.20001230943102077	0.7592389076527368	-0.5383179428000304	-0.46480448400390045	0.0614379652341735	0.3237569251975726	-0.7888475878153215	-0.8216422571584905	0.22684500709063993	-0.4232932541984768	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr9:123691397..123691511,-__1705.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:123691397..123691511,-__1705.1.0.0	rs115683713,rs1930786	2.329402903890426	0.6059626733861632	1.088140022818834	0.7167315032456455	0.1687439189074697	1.1300793003302088	0.6347842436116774	-0.28717248325691125	0.6719193095805723	0.8637870438339085	0.7849092727691941	0.5247507222009321	0.7693365359431769	0.5420753003704579	0.14896367441247466	-0.22466041988051344	0.5637130618102613	0.17153891797297366	0.622449894060638	0.6772331053318211	0.14261855746231808	0.09816254244133238	0.2852767441153448	-0.3705748913512286	-0.43945814663524735	0.1847781950092194	-1.7873276035199681	-0.4569989989736885	-1.3128004426993476	-0.15301844143538423	0.002794999065503956	-0.5076294062695708	0.04244886172014373	0.42979104071922936	-0.57375676713924	-0.5785102997185636	-1.1554841641204228	-0.9642088688361794	-0.5845583409339573	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:131580660..131580774,+__1706.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:131580660..131580774,+__1706.1.0.0	rs2997922	0.8464875531978755	1.1516406197736448	0.9364812413520376	0.8895285973537663	1.0147536460520943	0.9859378233923086	0.911489172748831	1.0139163797897526	0.8874026248377973	0.7804541444333548	0.9587376092166979	1.0351247206556202	0.9509961777336483	0.8390937205511402	1.2567917079610418	0.8878263607482264	0.9767411172685985	0.8554705370615343	0.8861864939862367	0.8773768521047278	0.974130409944992	0.8715280211843999	0.9065865581949486	0.9151427494811857	0.8591001268759372	0.9254978879469141	-0.007393832646735321	0.10515108818739693	-0.04865488060381118	0.08721251991483214	-0.15928310899055997	-0.0997513294060719	-0.03411232064410319	-0.03978596984476057	-0.015874603653397434	0.1261324137615938	-0.04359485973551225	-0.17602459377968305	-0.025498289786734334	0.788281320858	0.444064484515	0.978575937473	0.79863356553	0.253741740693	0.452098798395	0.581967350665	0.978575937473	0.572794651112	0.563691144959	0.957167318493	0.88258056334	0.991184439971	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:131873149..131873263,+__1707.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:131873149..131873263,+__1707.1.0.0	rs3814492	0.8036998371955442	1.095751901008485	0.8617641933299092	0.9100856740380376	1.0518315618763734	1.2493685201019475	0.957795540944492	1.166515679091398	1.194062057440843	1.0808450778249554	1.016582615356544	1.1457261077159875	1.0445023971603764	0.9815715091272798	1.1229867955329509	1.0635810690156076	0.7342460281767097	1.143132509312743	1.0693034848815046	1.101067441901783	1.0175763845910692	1.2179843575020577	1.0942681573690765	1.1853998182411556	0.9819300856478034	1.0594206367749786	0.1778716719317356	0.027234894524465814	0.2018168756856984	-0.17583964586132794	0.09130094743636952	-0.18006503522044293	0.14327190095729092	-0.14893929450032872	0.023922300061214763	0.01342307954412103	0.16881720288461155	-0.1637960220681841	0.014918239614601989	0.192768091005	0.368322877114	0.79863356553	0.783116642561	0.510582765025	0.737113058664	0.476688253492	0.221756412245	0.88258056334	0.30750859871	0.436112310787	0.628827692687	0.625099697227	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr9:131873149..131873263,+__1707.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:131873149..131873263,+__1707.1.0.0	rs3814492,rs3118625	0.8036998371955442	1.095751901008485	0.8617641933299092	0.9100856740380376	1.0518315618763734	1.2493685201019475	0.957795540944492	1.166515679091398	1.194062057440843	1.0808450778249554	1.016582615356544	1.1457261077159875	1.0445023971603764	0.8636497132254979	1.1344584700838132	0.9861619892737818	0.7392091186218939	1.2427187771230885	1.2905826129523483	0.9243663426229792	0.9875048256777947	0.9657441996555847	1.1142671294127031	1.0109996556777208	1.1343965157770144	1.0328382791753516	0.05994987602995372	0.0387065690753281	0.12439779594387268	-0.17087655541614377	0.19088721524671515	0.041214092850400785	-0.03342919832151281	-0.17901085341360323	-0.22831785778525826	0.03342205158774769	-0.005582959678823274	-0.011329591938973094	-0.011664117985024694	0.476688253492	0.476688253492	0.428242856315	0.60051573606	0.270885072145	0.347268461228	0.777966336216	0.13967914143	0.476688253492	0.452098798395	0.946473618223	0.354199901149	0.465078912698	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:131903859..131903973,+__1708.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:131903859..131903973,+__1708.1.0.0	rs3124512	0.6582253128092056	0.8356688219527878	0.8022862021911088	0.4847838064453752	0.5949333090170663	0.39521323875737413	0.4061878460736471	0.49150597353517705	0.6304572270601669	0.6646843294232452	0.6816802358466754	0.432794881349631	0.5898684320384551	-0.9695627049903006	-1.0245350740425172	-0.8657397642944474	-1.1654392969702199	-1.1882297090536331	-1.194706559015722	-1.3697031326897757	-0.9258670235710852	-1.0433587256630563	-1.0781185674447318	-1.1091457766115902	-1.0721318029781657	-1.0838781781104372	-1.627788017799506	-1.860203895995305	-1.6680259664855561	-1.6502231034155952	-1.7831630180706994	-1.589919797773096	-1.7758909787634227	-1.4173729971062623	-1.6738159527232233	-1.742802896867977	-1.7908260124582656	-1.5049266843277966	-1.673746610148892	2.94200293519e-09	1.94976411988e-09	2.71058914141e-09	1.45948915094e-08	7.76607345153e-10	2.28223838549e-11	7.40729972622e-11	4.27540069337e-10	2.77664329956e-10	2.33346554357e-10	2.32766076754e-08	3.92318326428e-10	4.95852765602e-97	2.08293807811e-06	1.45062450519e-06	2.01938891035e-06	1.07564350424e-05	5.99540870458e-07	1.74363012651e-08	5.47399449767e-08	3.10821630408e-07	2.14634527056e-07	1.8317704517e-07	1.78997113024e-05	3.05615976287e-07	4.15524617574e-94	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:131903859..131903973,+__1708.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:131903859..131903973,+__1708.1.0.0	rs6478867	0.6582253128092056	0.8356688219527878	0.8022862021911088	0.4847838064453752	0.5949333090170663	0.39521323875737413	0.4061878460736471	0.49150597353517705	0.6304572270601669	0.6646843294232452	0.6816802358466754	0.432794881349631	0.5898684320384551	-0.1220764074178692	-0.019658395089578423	-0.03999638493940158	-0.16004253017099937	-0.16177327876051245	-0.1984062335652168	-0.18283820360867953	-0.1563397899808664	0.0016049722233113656	0.10008761308477705	-0.042490119511952584	-0.22586486002365297	-0.10064946814672009	-0.7803017202270748	-0.8553272170423663	-0.8422825871305104	-0.6448263366163746	-0.7567065877775787	-0.5936194723225909	-0.5890260496823266	-0.6478457635160435	-0.6288522548368556	-0.5645967163384681	-0.724170355358628	-0.658659741373284	-0.6905179001851751	9.98335414644e-06	3.33944592614e-05	5.31875791367e-06	0.00210630874131	1.63168639115e-05	2.48534577241e-05	2.48534577241e-05	3.33944592614e-05	2.48534577241e-05	9.98335414644e-06	7.05457685779e-05	4.11448729888e-06	1.35184198874e-44	0.00706821473568	0.0248454776905	0.00396247464568	1	0.0125966189397	0.0189880417012	0.0183667052581	0.0242777718831	0.0192117228208	0.00783693300495	0.0542496960364	0.00320518560583	1.13284358656e-41	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr9:131903859..131903973,+__1708.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:131903859..131903973,+__1708.1.0.0	rs3124512,rs6478867	0.6582253128092056	0.8356688219527878	0.8022862021911088	0.4847838064453752	0.5949333090170663	0.39521323875737413	0.4061878460736471	0.49150597353517705	0.6304572270601669	0.6646843294232452	0.6816802358466754	0.432794881349631	0.5898684320384551	-1.3462910029721047	-1.490031686398516	-1.281742410488759	-1.3146407507056055	-1.319666784164191	-1.5991692678618885	-1.1849960680306686	-1.0445932036450025	-1.2378846434709798	-1.424293705258083	-1.7333920852721345	-1.3111610705313632	-1.3573218898999413	-2.00451631578131	-2.3257005083513036	-2.0840286126798677	-1.7994245571509806	-1.9146000931812572	-1.9943825066192626	-1.5911839141043158	-1.5360991771801795	-1.8683418705311468	-2.088978034681328	-2.41507232111881	-1.7439559518809942	-1.9471903219383966	2.50122068192e-11	5.66002570384e-11	9.67857429079e-11	2.94200293519e-09	3.6020412458e-11	6.55420316999e-10	7.76607345153e-10	1.26262090221e-10	8.23367049956e-12	1.31220928624e-11	3.00264373047e-11	2.28223838549e-11	7.14673946572e-109	4.85236812293e-09	1.14332519217e-08	1.92603628387e-08	5.56038554751e-07	7.3841845539e-09	1.31739483717e-07	1.55321469031e-07	2.46211075931e-08	1.69613612291e-09	2.72939531538e-09	6.15541964746e-09	4.70141107411e-09	1.62230985872e-106	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:131904224..131904338,+__1709.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:131904224..131904338,+__1709.1.0.0	rs17486478	0.19319633047912826	0.2992533938667088	0.0123393894787798	0.3295625438919841	0.4062014521210937	0.010493819529795315	-0.08466986621856391	0.15596370169489304	-0.053962511661477766	0.13037131000701627	0.1551500564423242	0.3152968830851268	0.15576637522640074	0.2979164060110465	0.650995004337136	-0.0890895399419847	0.3211081678418011	0.038210153760168064	0.19008475786782877	0.01272699102742262	0.4347911927851604	0.3863935382269876	0.3404918565906383	0.5278410922470002	0.16938252083398478	0.2734043451322658	0.10472007553191826	0.3517416104704272	-0.1014289294207645	-0.00845437605018301	-0.36799129836092564	0.17959093833803347	0.09739685724598654	0.27882749109026733	0.44035604988846533	0.21012054658362203	0.37269103580467594	-0.14591436225114204	0.11763796990586507	0.60051573606	0.66743649171	0.788281320858	0.591208103411	0.206893929435	0.340423946445	0.619326784864	0.166665831608	0.0125089884503	0.119339994516	0.493479697885	1.0	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:131904224..131904338,+__1709.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:131904224..131904338,+__1709.1.0.0	rs2297111	0.19319633047912826	0.2992533938667088	0.0123393894787798	0.3295625438919841	0.4062014521210937	0.010493819529795315	-0.08466986621856391	0.15596370169489304	-0.053962511661477766	0.13037131000701627	0.1551500564423242	0.3152968830851268	0.15576637522640074	-0.4722655055474281	-0.1188935583311374	-0.3550630003877073	-0.11432985175597367	0.05419274154373871	0.1350477069315752	-0.08147748310140789	-0.2344642185241016	-0.07931763627696581	-0.13908382037016867	-0.041615978543513656	-0.21657989685068588	-0.13865420843448137	-0.6654618360265563	-0.4181469521978462	-0.3674023898664871	-0.44389239564795774	-0.352008710577355	0.12455388740177988	0.003192383117156028	-0.39042792021899464	-0.025355124615488042	-0.26945513037718494	-0.19676603498583786	-0.5318767799358127	-0.29442058366088203	0.0201846528804	0.188220673538	0.170821264488	0.232080506959	0.0808926541269	0.572794651112	0.788281320858	0.0678362651725	0.747262025795	0.563691144959	0.199734666592	0.179364149792	0.015653619365	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr9:131904224..131904338,+__1709.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:131904224..131904338,+__1709.1.0.0	rs17486478,rs2297111,rs10988226	0.19319633047912826	0.2992533938667088	0.0123393894787798	0.3295625438919841	0.4062014521210937	0.010493819529795315	-0.08466986621856391	0.15596370169489304	-0.053962511661477766	0.13037131000701627	0.1551500564423242	0.3152968830851268	0.15576637522640074	0.06604153202982856	0.4982486940747948	0.18880391854031514	0.03844401616669932	-0.11940929523910798	-0.3082051347855828	-0.21070018598160495	-0.13493460054800432	-0.09090801976944542	0.15497339220569195	-0.07309253334037374	0.2601861648777184	0.022453995685910735	-0.12715479844929972	0.19899530020808598	0.17646452906153534	-0.2911185277252848	-0.5256107473602016	-0.31869895431537815	-0.12603031976304102	-0.29089830224289737	-0.03694550810796765	0.024602082198675684	-0.22824258978269796	-0.05511071820740843	-0.13331237954048997	1.0	0.382791178922	0.259370210024	0.840380101088	0.375513989452	0.545696106059	0.125844655769	0.967868365621	0.536806685117	0.390154148302	0.788281320858	0.468411351413	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:27529773..27529887,-__1710.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:27529773..27529887,-__1710.1.0.0	rs3202601	0.3966284481561477	-2.0066740596928034	2.070292395201132	2.0189132886833785	-0.317609618855537	0.4665473331268838	0.28705563604600515	-0.15650791770355982	0.08680609715867671	-0.8660276083385985	0.6593379347113542	-0.7596745673276479	0.15659061343045264	-0.8373872787857654	-0.9862463195140392	-0.5767448671815747	-0.3822286072309405	-0.15726547284896544	-1.1011747636741285	-1.4118513252385672	-1.3681469177662315	-0.4570147540140356	-1.050477099001047	-0.2760453723601864	-0.3361180818037839	-0.7450584049516054	-1.234015726941913	1.0204277401787643	-2.6470372623827068	-2.401141895914319	0.16034414600657157	-1.5677220968010124	-1.6989069612845724	-1.2116390000626718	-0.5438208511727123	-0.18444949066244853	-0.9353833070715405	0.42355648552386405	-0.9016490183820581	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:27529773..27529887,-__1710.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:27529773..27529887,-__1710.1.0.0	rs3736319	0.3966284481561477	-2.0066740596928034	2.070292395201132	2.0189132886833785	-0.317609618855537	0.4665473331268838	0.28705563604600515	-0.15650791770355982	0.08680609715867671	-0.8660276083385985	0.6593379347113542	-0.7596745673276479	0.15659061343045264	0.6731313866346236	1.0653698416528417	0.155893752816908	1.0553188170414154	1.4689604192044647	2.0163542877942846	0.6549449506040464	1.0210721530140796	0.5696590703582384	0.0299147092176201	0.8794198927349347	0.2567460776252248	0.8205654465582235	0.2765029384784759	3.072043901345645	-1.914398642384224	-0.9635944716419631	1.7865700380600018	1.549806954667401	0.3678893145580413	1.1775800707176394	0.48285297319956166	0.8959423175562186	0.22008195802358055	1.0164206449528728	0.6639748331277708	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr9:27529773..27529887,-__1710.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:27529773..27529887,-__1710.1.0.0	rs3202601,rs3736319	0.3966284481561477	-2.0066740596928034	2.070292395201132	2.0189132886833785	-0.317609618855537	0.4665473331268838	0.28705563604600515	-0.15650791770355982	0.08680609715867671	-0.8660276083385985	0.6593379347113542	-0.7596745673276479	0.15659061343045264	-0.016466074134711833	-0.912591444838713	0.3696996960831578	0.1094544771096246	-0.4161709008489806	-1.6538482785285187	-0.5569653330408785	-0.5783742764364079	0.4224168875149168	-0.5724877759972323	0.36943762842033023	0.1717269434551223	-0.2720140376035243	-0.4130945222908595	1.0940826148540905	-1.7005926991179743	-1.9094588115737539	-0.0985612819934436	-2.1203956116554026	-0.8440209690868836	-0.4218663587328481	0.3356107903562401	0.29353983234136616	-0.2899003062910239	0.9314015107827702	-0.4286046510339769	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:35538551..35538665,+__1711.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:35538551..35538665,+__1711.1.0.0	rs1322126	-0.17723287598092818	0.09610196727000317	0.012943345113615601	-0.06051176599110979	-0.023272182216647383	-0.30734455337707856	-0.0858177765989652	-0.120386854648185	0.012652597357544329	-0.16661814933908994	-0.22699346887269614	-0.14026482471061597	-0.09889537849951276	-1.0389586881366935	-0.8900475659981059	-1.3214668099703497	-1.0274724677484037	-0.9224534226406323	-1.0458066769247	-1.2659927222962344	-0.8772607043588391	-1.2916034775154148	-1.2612651871875433	-1.0761969440815318	-0.8378394885315071	-1.0713636796158297	-0.8617258121557653	-0.9861495332681091	-1.3344101550839653	-0.966960701757294	-0.899181240423985	-0.7384621235476215	-1.1801749456972692	-0.7568738497106541	-1.3042560748729592	-1.0946470378484534	-0.8492034752088357	-0.6975746638208912	-0.9724683011163169	0.00784715402968	0.000505862288815	4.46687275285e-05	0.00105204507021	0.000152810281165	0.000587432962331	0.000288590960955	0.029613347289	0.000122951138804	4.77249641218e-07	0.00327633608155	0.00668210963275	3.40535286375e-29	1	0.376361542879	0.0332782020087	0.775357216745	0.117969537059	0.448798783221	0.213268720146	1	0.0950412302957	0.000374640968356	1	1	2.85368569982e-26	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:86595464..86595578,-__1712.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:86595464..86595578,-__1712.1.0.0	rs296888	1.9400313850403388	2.0966825667931697	1.9009984911907818	1.6338247105284534	1.9716554983357422	2.029318138893359	1.795013245412074	2.0024361671430118	1.998544608723347	2.0342352492282503	1.9955873566943536	1.9310381017551086	1.9441137933114991	1.8771512731903508	2.1133905061839187	1.7589734804840216	1.681046481952278	1.8936120906647362	1.9201627248659796	1.8192263606868315	2.0143224968249367	2.1411489428620865	2.0684730066216694	2.0468066934676186	1.9755229306465356	1.9424864157042467	-0.06288011184998799	0.016707939390748994	-0.1420250107067602	0.047221771423824555	-0.07804340767100593	-0.10915541402737938	0.024213115274757557	0.011886329681924934	0.14260433413873952	0.034237757393419166	0.051219336773264956	0.04448482889142702	-0.001627377607252234	0.76769033028	0.85089220831	0.361218104761	0.978575937473	0.648013768535	0.716953652062	0.925117039075	0.989287003123	0.777966336216	0.935789553219	0.925117039075	0.747262025795	0.999850706249	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr9:86595464..86595578,-__1712.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:86595464..86595578,-__1712.1.0.0	rs296888,rs296889	1.9400313850403388	2.0966825667931697	1.9009984911907818	1.6338247105284534	1.9716554983357422	2.029318138893359	1.795013245412074	2.0024361671430118	1.998544608723347	2.0342352492282503	1.9955873566943536	1.9310381017551086	1.9441137933114991	1.9251435208200292	2.167319075319199	1.775973387524921	1.6415798532603854	1.969169951659996	1.8965494774352174	2.016670817833554	2.070870614105756	2.1013190791765695	2.1271444833602726	2.14152530591329	2.13441575439895	1.997306776734012	-0.014887864220309632	0.0706365085260292	-0.12502510366586073	0.007755142731932008	-0.0024855466757460754	-0.1327686614581416	0.2216575724214802	0.06843444696274403	0.10277447045322252	0.09290923413202234	0.14593794921893632	0.20337765264384156	0.05319298342251252	0.819442862795	0.66743649171	0.935789553219	0.8931878581	0.747262025795	0.967868733231	0.554657938956	0.696989544957	0.648013768535	0.452098798395	0.935789553219	0.232080506959	0.991890402576	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:86595660..86595774,+__1713.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:86595660..86595774,+__1713.1.0.0	rs188055179	-1.4005628707637352	-1.5331402546045787	-1.4691959405258463	-1.5908574471730548	-1.8082693010207185	-1.5422472441929145	-1.1873516238091633	-0.8887702795914817	-1.161250762190478	-1.2990184546792871	-1.0728032929210305	-1.3383838683660767	-1.357654278319864	-1.4908563688215986	-1.1528244750244099	-1.525565704512015	-1.1439451211447795	-1.5575709498513783	-1.5575274175312277	-1.6475142502089473	-1.0203565545268196	-1.0022864139724372	-1.5916955168143934	-1.1343502251996649	-1.0120215550543379	-1.3197095460551673	-0.09029349805786335	0.3803157795801688	-0.056369763986168664	0.44691232602827524	0.25069835116934014	-0.015280173338313219	-0.460162626399784	-0.13158627493533792	0.15896434821804073	-0.29267706213510625	-0.06154693227863439	0.3263623133117388	0.03794473226469633	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__mrna.noflip.NA__chr9:86595660..86595774,+__1713.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:86595660..86595774,+__1713.1.0.0	rs296890	-1.4005628707637352	-1.5331402546045787	-1.4691959405258463	-1.5908574471730548	-1.8082693010207185	-1.5422472441929145	-1.1873516238091633	-0.8887702795914817	-1.161250762190478	-1.2990184546792871	-1.0728032929210305	-1.3383838683660767	-1.357654278319864	-1.4109295264355892	-1.503614017767861	-1.3989973632632375	-1.6925570233994893	-1.3731293506890614	-1.4490635445566653	-1.474340194173823	-1.5380217280552526	-1.4222914360708494	-1.7138273240125372	-1.8091887389776273	-1.6948578604982265	-1.5400681756583519	-0.01036665567185402	0.029526236836717734	0.07019857726260881	-0.10169957622643455	0.4351399503316571	0.09318369963624917	-0.28698857036465975	-0.6492514484637709	-0.26104067388037144	-0.4148088693332501	-0.7363854460565968	-0.3564739921321498	-0.1824138973384879	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__mrna.noflip.NA__chr9:86595660..86595774,+__1713.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__mrna.noflip.NA__chr9:86595660..86595774,+__1713.1.0.0	rs188055179,rs296890	-1.4005628707637352	-1.5331402546045787	-1.4691959405258463	-1.5908574471730548	-1.8082693010207185	-1.5422472441929145	-1.1873516238091633	-0.8887702795914817	-1.161250762190478	-1.2990184546792871	-1.0728032929210305	-1.3383838683660767	-1.357654278319864	-0.9216632622551157	-0.9005750099657205	-1.38392890951381	-1.4553547202834678	-1.283683535549467	-1.4741005519328234	-1.1251409905116248	-1.10133581086079	-1.24926175332925	-1.168386100986285	-1.3006484177636224	-1.0035053812269907	-1.1972987036815805	0.47889960850861946	0.6325652446388582	0.08526703101203625	0.13550272688958698	0.5245857654712516	0.06814669226009107	0.06221063329753851	-0.21256553126930833	-0.08801099113877209	0.13063235369300208	-0.2278451248425919	0.33487848713908597	0.16035557463828315	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
CONTROL_SNP_INDIV__control.flip.sense__chr1:153518247..153518361,-__1714.1.1.0	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr1:153518247..153518361,-__1714.1.0.0	rsFakeS100A4-28	0.1960137191433065	0.2631693257229295	0.26515704614783564	0.1363525838192855	0.14687493406932053	0.1880856972035255	0.04262650265015148	0.2097623925496527	0.180814697044815	0.2511833162915699	0.18622752567023484	0.14536198605981387	0.18430247719770346	-1.3013202494887326	-1.3717752062561834	-1.3181584680914336	-1.204858876952739	-1.1723705573754346	-1.190354922738022	-1.3587267829055258	-1.3245125302615794	-1.2071067998806266	-1.2874810419330138	-1.3776360748429577	-1.2945332886337932	-1.2840695666133368	-1.497333968632039	-1.634944531979113	-1.5833155142392692	-1.3412114607720245	-1.3192454914447551	-1.3784406199415473	-1.4013532855556774	-1.5342749228112322	-1.3879214969254416	-1.5386643582245838	-1.5638636005131925	-1.4398952746936071	-1.4683720438110404	3.58433774644e-17	1.02953110031e-18	1.27811402186e-16	1.24195447265e-16	3.92181936266e-20	3.3025293308e-19	6.4195776821e-16	5.19433686681e-21	9.0031711571e-21	3.40629617844e-19	9.0031711571e-21	8.11081483387e-20	3.76073131601e-203	2.53771112448e-14	7.65971138629e-16	9.52194946285e-14	9.15320446344e-14	3.02764454797e-17	2.52313240873e-16	4.74406790707e-13	3.77628290217e-18	6.95945130444e-18	2.67394250008e-16	6.92343861981e-18	6.31832475559e-17	3.15149284281e-200	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
CONTROL_SNP_INDIV__control.flip.sense__chr1:153518247..153518361,-__1714.1.2.0	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr1:153518247..153518361,-__1714.1.0.0	rsFakeS100A4-29	0.1960137191433065	0.2631693257229295	0.26515704614783564	0.1363525838192855	0.14687493406932053	0.1880856972035255	0.04262650265015148	0.2097623925496527	0.180814697044815	0.2511833162915699	0.18622752567023484	0.14536198605981387	0.18430247719770346	-1.050671050377459	-0.7974982051238616	-0.7605199395632681	-0.9164013387516288	-0.876675256798292	-1.0685885853836572	-0.9300616058880247	-0.9438160528631336	-0.8572012445345054	-0.8808589961256083	-0.9813728422833436	-0.9394269627046198	-0.9169243400331167	-1.2466847695207655	-1.060667530846791	-1.0256769857111037	-1.0527539225709144	-1.0235501908676126	-1.2566742825871826	-0.9726881085381761	-1.1535784454127864	-1.0380159415793204	-1.1320423124171781	-1.1676003679535785	-1.0847889487644338	-1.1012268172308202	4.60082482261e-12	4.17136450067e-14	2.6362308922e-12	4.36575867766e-09	3.37156721631e-15	1.36104880749e-15	1.63862011251e-09	7.20847785744e-15	2.23569476581e-15	5.26055920158e-18	1.60659416293e-15	2.15788878429e-14	6.45091050874e-143	3.25738397441e-09	3.1034951885e-11	1.96399201469e-09	3.21756414544e-06	2.60284989099e-12	1.03984128892e-12	1.21094026314e-06	5.24056340236e-12	1.72819205397e-12	4.12953897324e-15	1.23547091129e-12	1.68099536296e-11	5.40586300632e-140	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
CONTROL_SNP_PLUS_HAPLO__control.flip.sense__chr1:153518247..153518361,-__1714.1.2.1	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr1:153518247..153518361,-__1714.1.0.0	rsFakeS100A4-28,rsFakeS100A4-29	0.1960137191433065	0.2631693257229295	0.26515704614783564	0.1363525838192855	0.14687493406932053	0.1880856972035255	0.04262650265015148	0.2097623925496527	0.180814697044815	0.2511833162915699	0.18622752567023484	0.14536198605981387	0.18430247719770346	-1.1468407343387441	-1.1549078332780907	-1.0258868317112257	-0.9971678120695993	-1.111872862868531	-1.1322565913788856	-1.1567662422720943	-1.1268853473782086	-1.0027888192816767	-1.102957722459391	-1.192707716239317	-1.0087603774863314	-1.0966499075635079	-1.3428544534820506	-1.4180771590010202	-1.2910438778590614	-1.1335203958888846	-1.2587477969378515	-1.320342288582411	-1.199392744922246	-1.3366477399278613	-1.1836035163264917	-1.354141038750961	-1.3789352419095517	-1.1541223635461453	-1.2809523847612116	8.84989705752e-16	4.39583170471e-18	1.44799430623e-14	6.62430899829e-13	5.75340442153e-19	8.47329271172e-15	1.79402357177e-15	8.06219395014e-19	4.71223863011e-21	3.56558113282e-20	8.22663738143e-18	5.26055920158e-18	2.65515156803e-183	1.71688002916e-13	8.87958004351e-16	2.8815086694e-12	1.25199440068e-10	1.17944790641e-16	1.70313183506e-12	3.58804714354e-13	1.57212782028e-16	9.70721157802e-19	7.41640875626e-18	1.68646066319e-15	1.08367519552e-15	6.02719405942e-181	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
CONTROL_SNP_INDIV__control.flip.sense__chr11:5248266..5248380,-__1715.1.1.0	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr11:5248266..5248380,-__1715.1.0.0	rsFakeHBB-28	-0.9748103725555748	-0.9871869193281926	-0.9803564724268422	-1.0288593587275188	-1.0707162386485138	-1.1833602349438381	-1.2906925443188513	-1.0026533432679756	-1.2294816919791258	-1.2014274465478891	-1.2078303049782608	-1.1388384207816076	-1.1080177790420158	-1.6497933357334582	-1.4719319572100156	-1.4443478804003602	-1.5037414483307168	-1.7335966796850817	-1.4721104141582226	-1.4528738225090905	-1.375460878734237	-1.5874921137405211	-1.6364196652825336	-1.5065317170028218	-1.601613044792777	-1.5363260797983196	-0.6749829631778834	-0.484745037881823	-0.463991407973518	-0.474882089603198	-0.6628804410365678	-0.2887501792143845	-0.1621812781902392	-0.37280753546626144	-0.3580104217613953	-0.43499221873464444	-0.298701412024561	-0.4627746240111694	-0.4283083007563038	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
CONTROL_SNP_INDIV__control.flip.sense__chr11:5248266..5248380,-__1715.1.2.0	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr11:5248266..5248380,-__1715.1.0.0	rsFakeHBB-29	-0.9748103725555748	-0.9871869193281926	-0.9803564724268422	-1.0288593587275188	-1.0707162386485138	-1.1833602349438381	-1.2906925443188513	-1.0026533432679756	-1.2294816919791258	-1.2014274465478891	-1.2078303049782608	-1.1388384207816076	-1.1080177790420158	-1.6591482197718137	-1.6904498035325437	-1.4296080936589008	-1.4806882198712517	-1.7287018141953783	-1.4897191660736528	-1.5322952423943434	-1.4090949998742541	-1.627742372728472	-1.5044915833480048	-1.584117990056911	-1.4784278213862492	-1.5512071105743146	-0.6843378472162389	-0.7032628842043511	-0.44925162123205864	-0.4518288611437329	-0.6579855755468644	-0.3063589311298147	-0.24160269807549217	-0.4064416566062785	-0.3982606807493463	-0.3030641368001157	-0.37628768507865007	-0.3395894006046416	-0.4431893315322988	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
CONTROL_SNP_INDIV__control.flip.sense__chr11:5248266..5248380,-__1715.1.3.0	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr11:5248266..5248380,-__1715.1.0.0	rsFakeHBB22	-0.9748103725555748	-0.9871869193281926	-0.9803564724268422	-1.0288593587275188	-1.0707162386485138	-1.1833602349438381	-1.2906925443188513	-1.0026533432679756	-1.2294816919791258	-1.2014274465478891	-1.2078303049782608	-1.1388384207816076	-1.1080177790420158	-1.1711785340690457	-1.0268043401697926	-1.2287598719497854	-1.3368698592813044	-1.350895978533143	-1.2977143003059735	-1.150970329579451	-0.9510764638317104	-1.2955475659498596	-1.2846472536585523	-1.2912029306656558	-1.256541523106045	-1.2201840792583598	-0.19636816151347092	-0.039617420841600026	-0.2484033995229432	-0.30801050055378565	-0.2801797398846291	-0.11435406536213533	0.13972221473940039	0.05157687943626521	-0.06606587397073382	-0.08321980711066312	-0.08337262568739501	-0.11770310232443748	-0.11216630021634401	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
CONTROL_SNP_PLUS_HAPLO__control.flip.sense__chr11:5248266..5248380,-__1715.1.3.1	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr11:5248266..5248380,-__1715.1.0.0	rsFakeHBB-28,rsFakeHBB-29,rsFakeHBB22	-0.9748103725555748	-0.9871869193281926	-0.9803564724268422	-1.0288593587275188	-1.0707162386485138	-1.1833602349438381	-1.2906925443188513	-1.0026533432679756	-1.2294816919791258	-1.2014274465478891	-1.2078303049782608	-1.1388384207816076	-1.1080177790420158	-1.6792798621279248	-1.6485659545764673	-1.3363934603915628	-1.5530569964262368	-1.7721278066361714	-1.689227954153265	-1.5927125444880184	-1.5151535070643307	-1.5876102768527665	-1.8079919636382833	-1.870030733503159	-1.7762343383116976	-1.6523654498474905	-0.70446948957235	-0.6613790352482747	-0.3560369879647206	-0.5241976376987181	-0.7014115679876576	-0.505867719209427	-0.3020200001691671	-0.5125001637963551	-0.35812858487364063	-0.6065645170903942	-0.6622004285248981	-0.6373959175300901	-0.5443476708054745	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr1:169073251..169073365,+__1716.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr1:169073251..169073365,+__1716.1.0.0	rs1320976	-1.6451883833857097	-1.7248271266202864	-1.519533309805959	-1.6658334374665411	-1.829594140440045	-1.704966192263258	-1.6974239070728725	-1.3278021072847264	-1.6882433253776792	-1.9531639133875347	-1.7618923003401485	-1.5725706032248414	-1.6742532288891336	-1.730051049106961	-1.6134586611091986	-1.509881874873918	-2.0242137389977675	-1.95287254625364	-1.5286314274733384	-1.6528055672450825	-1.8148047822054487	-1.7711914321542257	-1.8727708473315818	-1.96436649622614	-1.7178035818226496	-1.7627376670666628	-0.08486266572125123	0.11136846551108781	0.009651434932040903	-0.35838030153122635	-0.12327840581359495	0.1763347647899196	0.044618339827789955	-0.48700267492072236	-0.08294810677654652	0.08039306605595287	-0.20247419588599147	-0.14523297859780815	-0.08848443817752916	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr1:169073251..169073365,+__1716.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr1:169073251..169073365,+__1716.1.0.0	rs1320976,rs1892092	-1.6451883833857097	-1.7248271266202864	-1.519533309805959	-1.6658334374665411	-1.829594140440045	-1.704966192263258	-1.6974239070728725	-1.3278021072847264	-1.6882433253776792	-1.9531639133875347	-1.7618923003401485	-1.5725706032248414	-1.6742532288891336	-2.0075612729069405	-1.8496366731643579	-1.8538939759801516	-1.5616968972894425	-2.0207859229605636	-1.816749266106928	-1.8154467629621744	-1.629422657503043	-1.8007083466159415	-1.8127839161217143	-1.7788717296564673	-1.9748718021556146	-1.826869101951945	-0.3623728895212308	-0.1248095465440715	-0.3343606661741927	0.10413654017709861	-0.1911917825205185	-0.11178307384367003	-0.11802285588930195	-0.3016205502183167	-0.1124650212382623	0.1403799972658204	-0.016979429316318795	-0.4023011989307732	-0.15261587306281146	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr2:130031310..130031424,-__1717.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr2:130031310..130031424,-__1717.1.0.0	rs837874	-1.2874534421811674	-1.6919667950273323	-1.654333942285625	-1.2315121719722217	-1.6940614116542938	-1.5948673467206398	-1.6206345443857566	-1.5738216483112657	-1.4743015155551484	-1.2968108231688058	-1.6644798717595792	-1.6751956112201865	-1.538286593686835	-1.8668608933963315	-1.1090942609634447	-1.657185699861752	-1.5874128828976417	-2.032081157142436	-1.547028624764023	-2.0561030568020033	-1.8361132717664788	-1.3877467141003177	-1.3585135570212328	-1.455610317514029	-1.4939296708226775	-1.6156400089210308	-0.5794074512151641	0.5828725340638876	-0.002851757576127101	-0.35590071092541997	-0.3380197454881424	0.04783872195661676	-0.43546851241624673	-0.26229162345521306	0.08655480145483074	-0.06170273385242697	0.20886955424555032	0.18126594039750898	-0.07735341523419549	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr2:162101170..162101284,+__1718.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr2:162101170..162101284,+__1718.1.0.0	rs11678980	-0.047647295946704894	0.10447909624148977	-0.22758036481652827	-0.4459645044311412	-0.049180245356524745	-0.14896651279692627	-0.21413018514152388	0.16648824009674812	0.17420700248252788	0.15205917463823188	-0.17332428760965254	-0.07254538584314285	-0.06517543904026225	-0.5808088404378234	-0.6975713632471929	-0.3811605707801301	-0.7590301081608775	-0.45467511939677	-0.14093002061209425	-0.6481467719451799	-0.2444533701102165	-0.09076099002679153	-0.5916081682559623	-0.4357603605185167	-1.0029223428092187	-0.5023190021917311	-0.5331615444911185	-0.8020504594886827	-0.15358020596360183	-0.31306560372973624	-0.40549487404024526	0.008036492184832017	-0.434016586803656	-0.4109416102069646	-0.2649679925093194	-0.7436673428941942	-0.26243607290886417	-0.9303769569660758	-0.4371435631514689	0.390154148302	0.747262025795	0.563691144959	0.340401835887	0.510582765025	0.788281320858	0.609889042629	0.48504462162	0.60051573606	0.468411351413	0.967868733231	0.197395731844	0.753909425546	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr2:165697165..165697279,+__1719.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr2:165697165..165697279,+__1719.1.0.0	rs11903961	-1.7261752651312616	-1.7228954759314639	-1.7242293107754678	-1.898939703458553	-1.7237256712328315	-1.427528100766321	-2.186171491212713	-1.4293912596560574	-1.4604539994401207	-1.6622521380134898	-2.1131540177603987	-2.07671602507115	-1.7626360382041524	-2.1060564040172656	-1.691194662738406	-2.1046569874075565	-1.2902744765954932	-1.6011641023380885	-1.794558937460683	-1.584683927414157	-1.6163515799229875	-1.4506112904957207	-1.784473540604825	-1.7340875222676122	-1.4851326080580582	-1.6869371699434046	-0.37988113888600394	0.03170081319305784	-0.38042767663208865	0.6086652268630597	0.12256156889474301	-0.367030836694362	0.601487563798556	-0.1869603202669301	0.00984270894439998	-0.12222140259133529	0.3790664954927865	0.5915834170130916	0.07569886826074788	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr2:175412030..175412144,+__1720.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr2:175412030..175412144,+__1720.1.0.0	rs9789707	-0.664426995213052	-0.8370941082624223	-0.907695514747612	-0.6423130168181925	-0.8461763288803924	-0.5636501103339524	-0.9386424692681122	-0.8098480436749848	-0.7458858947546169	-0.7133075095925507	-1.0276988217153733	-0.8609506680794575	-0.7964741234450599	-0.23793152201987114	-0.4312250953072405	-0.6845512579547393	-0.31684587289321176	-0.5049317937271312	-0.8686585734458968	-0.6793647101577619	-0.8269946986226574	-0.838775552375715	-0.1474417341338267	-0.15136892623982307	-0.4412352883585191	-0.5107770854363661	0.42649547319318093	0.40586901295518174	0.22314425679287275	0.3254671439249808	0.34124453515326125	-0.3050084631119444	0.25927775911035034	-0.017146654947672646	-0.09288965762109813	0.5658657754587241	0.8763298954755503	0.4197153797209384	0.2856970380086938	0.0531733827136	NA__no_active_tile	0.340423946445	0.861430881609	0.122558611289	0.967868733231	0.0719809426143	NA__no_active_tile	0.861429311442	0.428242856315	0.0362012288315	0.935789553219	0.366019663242	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr2:25643882..25643996,+__1721.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr2:25643882..25643996,+__1721.1.0.0	rs17745923	-1.644268850882896	-1.7908300822940006	-1.5895538739483823	-1.7373931698886462	-1.7975306973354808	-1.5839094584536213	-1.7835351052446689	-1.8685696267108207	-1.9311901921235968	-1.6752154961352872	-1.5310211456569074	-1.6486191088572972	-1.7151364006276335	-1.772850731392394	-1.4915893970661778	-1.8507547462808127	-1.4433509297164075	-1.8705925840860391	-1.8104393452571048	-1.5857628459705604	-1.4673738011594044	-1.6803136618539891	-2.322867442122329	-1.6260773839573615	-1.7530952781575557	-1.7229223455850111	-0.12858188050949804	0.2992406852278229	-0.2612008723324304	0.2940422401722387	-0.07306188675055836	-0.22652988680348352	0.19777225927410846	0.4011958255514163	0.25087653026960766	-0.6476519459870418	-0.09505623830045407	-0.10447616930025849	-0.007785944957377555	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Antisense.noflip.NA__chr3:17085693..17085807,-__1722.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Antisense.noflip.NA__chr3:17085693..17085807,-__1722.1.0.0	rs11926952	-1.5838383013028867	-1.5385714587514445	-1.8092797975569592	-1.5550814749908366	-1.6475418251757006	-1.6163515799229875	-1.622984552162909	-1.613043852647141	-1.5405194728535485	-2.007617340063182	-1.9092273378149835	-1.8652074769790354	-1.692438705851801	-1.918269322420244	-1.6387126345351832	-1.7204442970345042	-1.8390212032340205	-1.7313610710736604	-1.9125226951949676	-1.5858133384265898	-1.9889421550043551	-1.803731581441421	-1.8723305250310558	-1.9366123859587558	-1.6491861053497832	-1.7997456095587119	-0.33443102111735734	-0.10014117578373871	0.08883550052245504	-0.2839397282431839	-0.08381924589795986	-0.29617111527198015	0.03717121373631915	-0.3758983023572142	-0.2632121085878725	0.13528681503212603	-0.027385048143772295	0.21602137162925228	-0.10730690370691054	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr5:147618008..147618122,+__1723.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:147618008..147618122,+__1723.1.0.0	rs10055415	-1.3787344169397928	-1.9937318561248665	-1.5233995864931487	-1.365562175727554	-1.973130614154971	-1.436709569542667	-1.8192982682234224	-1.3269815254578603	-1.839400645780725	-2.2690223334404167	-1.3649948577515014	-1.2583057549323784	-1.6291059670474421	-1.4558886389875219	-1.4587564482645887	-1.439841150664967	-1.756915445194526	-1.6823032828416211	-1.7644955154399533	-1.8674464245622044	-1.2494623170103463	-1.7967320826662303	-1.7755530401006976	-1.3711140925271814	-1.4845360363904423	-1.5919203728875233	-0.07715422204772904	0.5349754078602778	0.08355843582818157	-0.3913532694669719	0.2908273313133498	-0.32778594589728627	-0.048148156338782	0.07751920844751403	0.04266856311449474	0.4934692933397191	-0.006119234775679994	-0.2262302814580639	0.03718559415991866	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr5:72446430..72446544,-__1724.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr5:72446430..72446544,-__1724.1.0.0	rs550298	0.029730835401810735	0.22451479599653482	0.17748995962789987	0.10467967704479268	0.009231606286743741	0.12664673091671477	0.3694239387907362	0.35999531090788184	0.3763166203737016	0.22397685063939043	0.3755482757797033	0.2954942577699104	0.22275407162798502	-0.17448501161810126	0.1554173855574072	-0.15672029498725265	0.1043010721234847	0.02162820867527619	-0.2417393286561763	0.08055263349332328	0.2575292453696584	0.03221266623604659	0.4756400390285076	0.1347628307216016	0.07971538365036451	0.06406790246617833	-0.204215847019912	-0.06909741043912762	-0.3342102546151525	-0.00037860492130797896	0.012396602388532447	-0.36838605957289106	-0.2888713052974129	-0.10246606553822346	-0.34410395413765504	0.25166318838911717	-0.24078544505810168	-0.21577887411954588	-0.15868616916180672	0.696989544957	0.628827692687	0.221756412245	0.591208103411	0.48504462162	0.48504462162	0.216719559135	0.76769033028	0.0115927323179	0.347268461228	0.0145358169752	0.0484054419273	0.0339510079962	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr7:15727960..15728074,+__1725.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr7:15727960..15728074,+__1725.1.0.0	rs3807879	-1.4775282339530342	-1.293907028786277	-1.76065693909819	-1.7030809343283917	-1.8305800516779884	-1.3890660762926696	-1.278988520873151	-1.3498691739426318	-1.32269187845362	-1.9514402310952383	-1.504652125483647	-1.5617770287755475	-1.5353531852300326	-1.5616774577344605	-1.3161966470850284	-1.4776534738516736	-1.4702552510933904	-1.5393091292099483	-1.5573029353882342	-1.4755752502566142	-1.4601586473644126	-1.4095317847310782	-1.7245599941066752	-1.6285517086535157	-1.619966576961761	-1.5200615713697327	-0.08414922378142631	-0.022289618298751313	0.28300346524651654	0.2328256832350013	0.2912709224680401	-0.16823685909556452	-0.1965867293834631	-0.11028947342178075	-0.0868399062774583	0.2268802369885632	-0.12389958316986882	-0.05818954818621358	0.015291613860299536	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr8:65730122..65730236,-__1726.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:65730122..65730236,-__1726.1.0.0	rs6472155	-1.7163163856151442	-1.4631586132079446	-1.5564783535137767	-1.799579281970996	-1.7040009661866546	-1.6603942747975269	-1.645924036470439	-1.6820127614542526	-1.5249232621793278	-1.888106876059292	-1.746291281999658	-1.8140730588372227	-1.6834382626910196	-1.4609643762808742	-1.9296241192073254	-1.5181512396139072	-1.4247625876006424	-1.9463654444676404	-1.9387369847110283	-1.1992072418026876	-1.5434033994354317	-1.9154651089059516	-1.7762683795260952	-1.4551009788747427	-1.5358897507712077	-1.6369949675997946	0.25535200933427005	-0.46646550599938075	0.038327113899869536	0.3748166943703535	-0.24236447828098573	-0.2783427099135014	0.4467167946677515	0.1386093620188209	-0.39054184672662373	0.11183849653319688	0.29119030312491545	0.278183308066015	0.0464432950912251	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr8:65730122..65730236,-__1726.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:65730122..65730236,-__1726.1.0.0	rs13280968	-1.7163163856151442	-1.4631586132079446	-1.5564783535137767	-1.799579281970996	-1.7040009661866546	-1.6603942747975269	-1.645924036470439	-1.6820127614542526	-1.5249232621793278	-1.888106876059292	-1.746291281999658	-1.8140730588372227	-1.6834382626910196	-2.411656155505367	-2.2800350918803867	-1.8962361201712936	-2.053450276053406	-2.0344967003174643	-1.984930458131437	-1.7070596156123796	-1.6856718922430058	-2.2156376794534447	-2.147689201828479	-1.8820952816819967	-2.193150557322893	-2.0410090858501295	-0.6953397698902228	-0.8168764786724421	-0.3397577666575169	-0.2538709940824102	-0.3304957341308097	-0.3245361833339102	-0.061135579141940566	-0.00365913078875324	-0.6907144172741169	-0.25958232576918694	-0.13580399968233858	-0.3790774984856702	-0.3575708231591099	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr8:65730122..65730236,-__1726.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:65730122..65730236,-__1726.1.0.0	rs6472155,rs13280968	-1.7163163856151442	-1.4631586132079446	-1.5564783535137767	-1.799579281970996	-1.7040009661866546	-1.6603942747975269	-1.645924036470439	-1.6820127614542526	-1.5249232621793278	-1.888106876059292	-1.746291281999658	-1.8140730588372227	-1.6834382626910196	-2.290348200346139	-1.6994366269613388	-1.947912657756529	-1.191029804458449	-2.366467723997864	-1.8540550584267677	-1.7259095819901225	-1.8009534330124015	-1.4884284453247878	-1.6964433473459881	-2.2382648483188676	-2.0530551990776416	-1.862692077251408	-0.5740318147309948	-0.2362780137533942	-0.3914343042427524	0.6085494775125468	-0.6624667578112093	-0.19366078362924077	-0.0799855455196834	-0.11894067155814891	0.036494816854540035	0.19166352871330394	-0.4919735663192095	-0.23898214024041886	-0.17925381456038844	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr8:71383261..71383375,+__1727.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:71383261..71383375,+__1727.1.0.0	rs6989313	-1.239831832677227	-1.4253078210731012	-1.5388541380902536	-1.2351262243906405	-1.3523366551755158	-1.266455703800383	-0.9184824066563052	-0.9022781464176302	-1.5274417894512515	-1.5552932797505976	-1.3555354414352747	-1.4075413803281387	-1.3103737349371933	-1.6017682584375121	-1.4087672476722837	-1.2267340836291358	-1.2203117813396909	-1.2657405212955857	-1.5694335071216374	-1.354404493994469	-0.8717672579830367	-1.2091884984690595	-1.5854629527290898	-1.4173161999747348	-1.343881574162924	-1.33956469806743	-0.36193642576028506	0.016540573400817493	0.3121200544611178	0.014814443050949588	0.08659613387993015	-0.30297780332125446	-0.43592208733816384	0.030510888434593486	0.318253290982192	-0.030169672978492157	-0.06178075853946008	0.06365980616521472	-0.029190963130236697	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr8:75015646..75015760,+__1728.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:75015646..75015760,+__1728.1.0.0	rs73687139	-1.4296459702980986	-1.4402188951803359	-1.3950249680079378	-1.6079197735862607	-1.3507630419481138	-2.2215506142670067	-1.7218792067999633	-1.366582749393126	-1.655202473934741	-1.6088735253584512	-1.6468806238425653	-1.0992443337488367	-1.5453155146971198	-1.786976482332297	-1.2390224058150756	-1.7669551476346348	-1.452884106715306	-1.8425448362141164	-1.5884237634700296	-1.3630719892525154	-1.5693888714956277	-1.8147489589347354	-1.4718648352840895	-1.4127582291589282	-1.3374367181204825	-1.5538396953689864	-0.3573305120341983	0.20119648936526024	-0.37193017962669694	0.1550356668709547	-0.49178179426600255	0.6331268507969772	0.35880721754744793	-0.2028061221025017	-0.15954648499999435	0.13700869007436167	0.23412239468363705	-0.2381923843716458	-0.00852418067186674	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr8:75015646..75015760,+__1728.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:75015646..75015760,+__1728.1.0.0	rs16938790	-1.4296459702980986	-1.4402188951803359	-1.3950249680079378	-1.6079197735862607	-1.3507630419481138	-2.2215506142670067	-1.7218792067999633	-1.366582749393126	-1.655202473934741	-1.6088735253584512	-1.6468806238425653	-1.0992443337488367	-1.5453155146971198	-1.6628381358473716	-1.3847416233117829	-1.7533429415575839	-1.1569321249704825	-2.134621771830082	-1.4589022162161596	-1.4568939208634117	-1.3475815197412597	-1.5640986571755493	-1.5182875800590012	-1.5908941246093466	-1.6600114374883888	-1.5574288378058683	-0.23319216554927302	0.055477271868553	-0.358317973549646	0.4509876486157782	-0.7838587298819684	0.7626483980508472	0.2649852859365516	0.019001229651866236	0.09110381675919177	0.09058594529944997	0.055986499233218634	-0.5607671037395521	-0.012113323108748575	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr8:75015646..75015760,+__1728.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:75015646..75015760,+__1728.1.0.0	rs73687139,rs16938790	-1.4296459702980986	-1.4402188951803359	-1.3950249680079378	-1.6079197735862607	-1.3507630419481138	-2.2215506142670067	-1.7218792067999633	-1.366582749393126	-1.655202473934741	-1.6088735253584512	-1.6468806238425653	-1.0992443337488367	-1.5453155146971198	-1.736073564437471	-1.7763944362937638	-1.3740881605880573	-1.5632661077309742	-1.627742372728472	-1.0240432530115375	-1.5783104935471617	-1.458699699957804	-1.5860902604020237	-1.2687525694413764	-1.72122172960996	-1.4635779994144427	-1.5148550539302539	-0.3064275941393724	-0.33617554111342796	0.020936807419880576	0.04465366585528652	-0.2769793307803583	1.1975073612554692	0.14356871325280163	-0.09211695056467795	0.06911221353271735	0.3401209559170748	-0.07434110576739461	-0.364333665665606	0.030460460766866076	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Lincrna.noflip.NA__chr8:9183551..9183665,+__1729.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:9183551..9183665,+__1729.1.0.0	rs4841132	-1.9173381890707264	-1.8097969919075378	-1.6336568903317783	-1.5424461129236595	-2.01737670642924	-1.6001364210609264	-1.5692518558496968	-1.4827963154904162	-1.6307378612125953	-1.9979838247704151	-1.5290210671810625	-1.5044097054500583	-1.6862459951398427	-1.3566786502904642	-1.2296983943450321	-1.1800467577176532	-1.2317771227260594	-1.3502040437287741	-1.544072210288275	-1.645932675974482	-1.3203675853458035	-1.509331716816417	-1.250621097062243	-1.5260204791315592	-1.3432176283592634	-1.3739973634821687	0.5606595387802622	0.5800985975625057	0.4536101326141251	0.3106689901976001	0.6671726627004659	0.056064210772651446	-0.07668082012478505	0.1624287301446128	0.12140614439617825	0.7473627277081722	0.0030005880495032056	0.16119207709079486	0.31224863165767386	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Lincrna.noflip.NA__chr8:9183551..9183665,+__1729.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Lincrna.noflip.NA__chr8:9183551..9183665,+__1729.1.0.0	rs4841132,rs4841133	-1.9173381890707264	-1.8097969919075378	-1.6336568903317783	-1.5424461129236595	-2.01737670642924	-1.6001364210609264	-1.5692518558496968	-1.4827963154904162	-1.6307378612125953	-1.9979838247704151	-1.5290210671810625	-1.5044097054500583	-1.6862459951398427	-1.474616780477988	-1.4285532300665056	-1.5387266871544767	-1.5520472341719511	-1.6214340240998815	-1.5597801106275315	-1.4360318764481377	-1.4536551151250072	-1.4315120567176094	-1.310095159837446	-1.4716473816005666	-1.6763493414472161	-1.4962040831478598	0.44272140859273845	0.38124376184103226	0.09493020317730161	-0.0096011212482916	0.3959426823293586	0.040356310433394826	0.13321997940155916	0.029141200365409015	0.19922580449498595	0.6878886649329692	0.057373685580495826	-0.1719396359971579	0.19004191199198295	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:155164494..155164608,+__1733.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:155164494..155164608,+__1733.1.0.0	rs78836239	-0.008579987459732541	0.6733701013984231	0.6784893937937078	-0.43051616475457233	0.10325670623369002	0.2525846984017713	0.6485504687905825	0.07974580664124786	1.8233248776485311	-0.8400990100332252	0.7718965313516342	0.3040583400742814	0.3380068135071949	1.389822599529098	0.9348657702043184	0.7591751268194378	0.3527273232181698	1.1201364987885696	1.1938180814338422	1.2713794845379	1.2889995166098158	-0.14664437937523292	0.8080493098705714	1.3092700681854508	1.5634096966477038	0.9870840913724702	1.3984025869888306	0.26149566880589525	0.08068573302573001	0.7832434879727421	1.0168797925548796	0.9412333830320709	0.6228290157473175	1.2092537099685678	-1.9699692570237641	1.6481483199037967	0.5373735368338166	1.2593513565734225	0.6490772778652754	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:167587092..167587206,+__1735.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:167587092..167587206,+__1735.1.0.0	rs74383300	-0.34908319772526925	-0.38100360305175096	-0.21026108025831192	-0.5393413450471869	-0.30995254043748666	-0.6038732509146567	-0.466857293896349	-0.3364569825684808	-0.24337211679433574	-0.3641034616845469	-0.38816235441985275	-0.17596073234320833	-0.3640356632617863	-0.5780584505108158	-0.4776211691165035	-0.3717485399012661	-0.6349295367898073	-0.5778914235740144	-0.4332659520333183	-0.7341538883590822	-0.5858043961581918	-0.6338900453090024	-0.2794271846443284	-0.8792739466693195	-0.3591038079325854	-0.5454306950831862	-0.2289752527855466	-0.09661756606475252	-0.1614874596429542	-0.09558819174262045	-0.2679388831365277	0.1706072988813384	-0.26729659446273324	-0.24934741358971102	-0.39051792851466666	0.08467627704021846	-0.4911115922494667	-0.18314307558937706	-0.18139503182139993	0.382791178922	0.809021331888	0.572794651112	0.777966336216	0.154655491485	0.989287003123	0.777966336216	0.468411351413	0.248198866138	0.48504462162	0.0209174885683	0.175053819161	0.477850606084	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:209833463..209833577,+__1737.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:209833463..209833577,+__1737.1.0.0	rs12030611	-1.3419882209241207	-1.3184236055505671	-1.6618508432478225	-1.2439914790099684	-1.5612581849597722	-1.497409855533224	-1.62117174602841	-1.5116820219036895	-1.5947537881662968	-1.6008126611391509	-1.4775311871929908	-1.2507760650887312	-1.4734708048953955	-1.7175079420628734	-1.4385475665049157	-1.5819671679691794	-1.3473394412255602	-1.5637850426477367	-1.465675232111205	-1.25142418555956	-1.681968659208771	-1.185884104575011	-1.3180602473759693	-1.2548616487109219	-1.6801450923872532	-1.4572638608615798	-0.37551972113875265	-0.12012396095434852	0.07988367527864315	-0.10334796221559173	-0.0025268576879644566	0.03173462342201905	0.36974756046885005	-0.17028663730508153	0.4088696835912857	0.2827524137631816	0.22266953848206894	-0.429369027298522	0.016206944033815635	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr1:209833463..209833577,+__1737.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:209833463..209833577,+__1737.1.0.0	rs12030610,rs12030611	-1.3419882209241207	-1.3184236055505671	-1.6618508432478225	-1.2439914790099684	-1.5612581849597722	-1.497409855533224	-1.62117174602841	-1.5116820219036895	-1.5947537881662968	-1.6008126611391509	-1.4775311871929908	-1.2507760650887312	-1.4734708048953955	-1.6698114213406674	-1.0355923856534135	-1.1885164363054317	-1.3194440787501942	-1.656853135125497	-1.355854508107654	-1.4102584371469074	-1.5422472441929145	-1.2624816099052496	-1.8787529026257588	-1.4036024737716466	-1.3873803032732281	-1.4258995780165469	-0.32782320041654667	0.28283121989715365	0.4733344069423908	-0.07545259974022578	-0.09559495016572472	0.14155534742556997	0.21091330888150273	-0.03056522228922498	0.33227217826104716	-0.2779402414866079	0.07392871342134422	-0.13660423818449696	0.04757122687884846	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:21651297..21651411,+__1738.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:21651297..21651411,+__1738.1.0.0	rs3026826	-0.49175615036480036	-0.33852060595395395	-0.3251801879207836	-0.46232903163888595	-0.5397323393837969	-0.4425847370485617	-0.4941130841981922	-0.6055627378565571	-0.5663389101963721	-0.4635925318948765	-0.6182562087999003	-0.4363248210848497	-0.4820242788617943	-1.0503894219457948	-0.9697930590036492	-1.0295716407515128	-0.8759034559268656	-1.1372258090759138	-1.032604874872633	-1.0903192003277151	-1.22602192345899	-0.8923259799502063	-0.8148058415968711	-0.9222992882714927	-0.9468756092621688	-0.9990113420369843	-0.5586332715809944	-0.6312724530496953	-0.7043914528307291	-0.41357442428797964	-0.5974934696921168	-0.5900201378240714	-0.5962061161295229	-0.6204591856024329	-0.3259870697538343	-0.3512133097019946	-0.30404307947159237	-0.5105507881773191	-0.5169870631751902	0.000617238254542	0.0232568344756	0.00105204507021	0.0181189115857	4.38725576258e-06	0.000222088887318	6.66706650175e-05	3.75375068986e-05	0.00883703695038	0.00043495277549	0.00993701022923	0.00121241130235	3.43780548778e-27	0.437004684216	1	0.783773577306	1	0.00338696144871	0.169675909911	0.0492696214479	0.0272897675153	1	0.34143792876	1	0.944468404531	2.88088099876e-24	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:21651297..21651411,+__1738.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:21651297..21651411,+__1738.1.0.0	rs12062365	-0.49175615036480036	-0.33852060595395395	-0.3251801879207836	-0.46232903163888595	-0.5397323393837969	-0.4425847370485617	-0.4941130841981922	-0.6055627378565571	-0.5663389101963721	-0.4635925318948765	-0.6182562087999003	-0.4363248210848497	-0.4820242788617943	-0.24415104201487356	-0.3244397734619274	-0.3916552584657901	-0.5317551523071802	-0.4689218892602734	-0.49663866600886875	-0.5380135356525331	-0.49475492805254145	-0.1839196789851384	-0.30630996410585465	-0.4022093872555852	-0.39639661948272653	-0.3982638245877744	0.2476051083499268	0.014080832492026518	-0.06647507054500645	-0.06942612066829423	0.07081045012352355	-0.05405392896030703	-0.04390045145434085	0.11080780980401567	0.38241923121123367	0.15728256778902183	0.2160468215443151	0.03992820160212318	0.0837604542740198	0.276766468575	0.677233097055	0.706946403854	0.762564839604	0.63839046467	0.706946403854	0.452098798395	0.510582765025	0.0249397487324	0.382791178922	0.313917214294	0.935789553219	0.580950697285	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr1:21651297..21651411,+__1738.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:21651297..21651411,+__1738.1.0.0	rs3026826,rs12062365	-0.49175615036480036	-0.33852060595395395	-0.3251801879207836	-0.46232903163888595	-0.5397323393837969	-0.4425847370485617	-0.4941130841981922	-0.6055627378565571	-0.5663389101963721	-0.4635925318948765	-0.6182562087999003	-0.4363248210848497	-0.4820242788617943	-1.147106204694679	-0.9159371750284898	-1.098494208776943	-0.9367136071058496	-1.1643716861177673	-1.1806751817075956	-1.1630711479623574	-0.9577277720005062	-0.8249015907878297	-0.9810612383767643	-0.9429679078820707	-0.7907603403651828	-1.0086490050671697	-0.6553500543298786	-0.5774165690745359	-0.7733140208561593	-0.47438457546696366	-0.6246393467339704	-0.7380904446590338	-0.6689580637641652	-0.35216503414394906	-0.2585626805914576	-0.5174687064818878	-0.32471169908217046	-0.3544355192803331	-0.5266247262053755	0.00139510136839	0.00146142948273	0.00423662678721	0.00175684955224	0.000587432962331	0.0010031111026	0.000189401475032	0.00591301274865	0.0592226654874	0.00153065306427	0.00522462344006	0.00389134425826	1.25026751943e-22	0.270649665468	0.295208755512	0.843088730655	0.332044565374	0.120423757278	0.201625331623	0.0378802950064	1	1	0.318375837368	1	0.801616917202	2.8381072691e-20	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:22233479..22233593,+__1739.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:22233479..22233593,+__1739.1.0.0	rs34160855	-1.4185663747514519	-1.3023672979988543	-1.387706051686591	-1.340252321987406	-1.6242981188305414	-1.355084230268345	-1.351396259891298	-1.3087464893280296	-1.2819663713180156	-1.5598132665413704	-1.557714487889001	-1.5375413527855726	-1.4187877186063733	-1.5805164355115413	-1.4116126690585444	-1.4717955085300594	-1.3628826333415567	-1.3910089227764062	-1.4865843276554163	-1.3958208454802512	-1.3619470664837672	-1.685514312715243	-1.5075955140220136	-1.323021139044477	-1.460108629078281	-1.4532006669747963	-0.16195006076008944	-0.10924537105969012	-0.08408945684346847	-0.022630311354150612	0.23328919605413523	-0.13150009738707125	-0.044424585588953125	-0.05320057715573756	-0.4035479413972274	0.052217752519356786	0.23469334884452397	0.0774327237072916	-0.03441294836842337	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr1:22233479..22233593,+__1739.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:22233479..22233593,+__1739.1.0.0	rs34160855,rs66850327	-1.4185663747514519	-1.3023672979988543	-1.387706051686591	-1.340252321987406	-1.6242981188305414	-1.355084230268345	-1.351396259891298	-1.3087464893280296	-1.2819663713180156	-1.5598132665413704	-1.557714487889001	-1.5375413527855726	-1.4187877186063733	-1.8744401887240094	-1.7175079420628734	-1.5044421296911654	-1.5371620139772417	-1.7184900542164443	-1.678453126902911	-1.9326263452194485	-1.15626826258285	-1.532056008057474	-1.4485273678172632	-1.8069750500585824	-1.6902646854897383	-1.6331010979	-0.45587381397255755	-0.41514064406401907	-0.11673607800457453	-0.19690969198983566	-0.09419193538590287	-0.323368896634566	-0.5812300853281505	0.15247822674517963	-0.2500896367394585	0.11128589872410721	-0.24926056216958137	-0.15272333270416572	-0.21431337929362707	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:121030665..121030779,+__1744.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:121030665..121030779,+__1744.1.0.0	rs78670212	-0.11905347576771413	-0.009931305591258741	0.10800785808244656	0.08167591109494218	-0.022365349052673164	0.08027879761661227	0.14114435054849825	0.27101571570049476	0.30767301082298393	0.10386835463197852	0.07391881040293405	0.23036095907788118	0.10388280313059382	-0.10167167083882526	0.04010423754204159	-0.07164494811672903	0.1427361206551715	0.011135784337529948	0.02154234083826111	0.11119829654995983	0.09063780727957792	0.1485302778624472	0.20470503899147952	0.19901903829635845	0.2890790689649889	0.09044761603018847	0.01738180492888887	0.05003554313330033	-0.1796528061991756	0.06106020956022931	0.03350113339020311	-0.05873645677835117	-0.02994605399853842	-0.18037790842091683	-0.15914273296053671	0.100836684359501	0.1251002278934244	0.05871810988710774	-0.013435187100405333	0.747262025795	0.628823764578	0.166665831608	0.957167318493	0.519249062249	0.226876581559	0.361218104761	0.563691144959	0.226876581559	0.248198866138	0.757455001208	0.460214637573	0.502195548696	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr10:121030665..121030779,+__1744.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:121030665..121030779,+__1744.1.0.0	rs7090417,rs78670212	-0.11905347576771413	-0.009931305591258741	0.10800785808244656	0.08167591109494218	-0.022365349052673164	0.08027879761661227	0.14114435054849825	0.27101571570049476	0.30767301082298393	0.10386835463197852	0.07391881040293405	0.23036095907788118	0.10388280313059382	0.3158956060928707	0.36760747198389687	0.3373623769425612	0.30409078035899706	0.44983709386712417	0.5294890370365505	0.46240991649554775	0.24518052790328415	0.599589668504398	0.42596692039833434	0.5708741988847399	0.38285192861087514	0.41592962725659827	0.43494908186058484	0.37753877757515564	0.22935451886011465	0.22241486926405488	0.47220244291979735	0.4492102394199382	0.32126556594704947	-0.025835187797210613	0.29191665768141406	0.3220985657663558	0.49695538848180587	0.15249096953299396	0.3120468241260045	0.0209174885683	0.00955667721707	0.0832552515755	0.202104162379	0.00753998341959	0.0286240283844	0.136115392203	0.840380101088	0.104229562843	0.00110317967744	0.00389134425826	0.158583637061	2.03483728502e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.229461372907	0.797725572943	1	4.61908063699e-06	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:129862613..129862727,+__1745.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:129862613..129862727,+__1745.1.0.0	rs12571328	-1.3907942022762423	-1.0256855833137055	-0.9948937178849864	-1.1446699420904185	-1.258896946894383	-1.2204558992546182	-1.2607960376297158	-1.141347575429469	-1.119753347566201	-1.1564817825385618	-1.246945594831569	-0.9104096377159616	-1.155927522285486	-1.7738122725556065	-1.4399616353888123	-1.2063266184641468	-1.2964865814257545	-1.9075737626123972	-1.5140319889089628	-1.49170030181685	-1.9927874089236024	-1.2695724176473369	-1.4704047039282182	-1.5047199597534633	-1.6185956395592689	-1.5404977742487018	-0.3830180702793642	-0.41427605207510676	-0.21143290057916042	-0.15181663933533596	-0.6486768157180143	-0.2935760896543447	-0.23090426418713417	-0.8514398334941333	-0.14981907008113593	-0.3139229213896564	-0.2577743649218942	-0.7081860018433073	-0.38457025196321565	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr10:129862613..129862727,+__1745.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:129862613..129862727,+__1745.1.0.0	rs12571328,rs59622882	-1.3907942022762423	-1.0256855833137055	-0.9948937178849864	-1.1446699420904185	-1.258896946894383	-1.2204558992546182	-1.2607960376297158	-1.141347575429469	-1.119753347566201	-1.1564817825385618	-1.246945594831569	-0.9104096377159616	-1.155927522285486	-1.6427642562454106	-1.8022013729753497	-1.616040880302787	-1.3981672167635697	-1.8118841930808804	-1.7366503309653956	-1.8431042132691664	-1.4822136949719893	-1.5042218986440252	-1.8737741957489775	-1.6123524608953923	-1.5875223208496088	-1.6592414195593792	-0.2519700539691683	-0.7765157896616441	-0.6211471624178007	-0.2534972746731512	-0.5529872461864975	-0.5161944317107774	-0.5823081756394506	-0.3408661195425202	-0.3844685510778243	-0.7172924132104157	-0.3654068660638232	-0.6771126831336471	-0.5033138972738933	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:3893812..3893926,+__1746.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:3893812..3893926,+__1746.1.0.0	rs114260824	-1.6689988111801222	-1.407598492719409	-2.128512090769871	-1.7170962132076373	-2.0722485207105823	-2.3318185440548107	-1.9155308778504763	-1.6961340374418827	-1.6191888616896164	-1.8568373703474337	-1.8127891619920447	-1.8586991883242672	-1.8404543475240125	-1.8274840082901833	-2.0028252832315894	-1.7308411128087662	-1.812816449945903	-1.9797789177497904	-1.98902698282162	-1.9593781228868492	-2.0284250991223365	-1.8855178457551316	-2.0619335691896152	-2.008957448933481	-2.125015473760553	-1.9510000262079847	-0.15848519711006115	-0.5952267905121804	0.39767097796110473	-0.09572023673826568	0.09246960296079187	0.34279156123319066	-0.04384724503637294	-0.33229106168045375	-0.2663289840655152	-0.20509619884218155	-0.1961682869414365	-0.2663162854362857	-0.11054567868397214	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:70805370..70805484,+__1747.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:70805370..70805484,+__1747.1.0.0	rs10998536	-1.6039910810943474	-1.5235945734465743	-1.6465902483721435	-1.6978188868730022	-1.7670163462232307	-1.6417697317001996	-1.5260174109421265	-1.6265747036310345	-1.643596399798395	-1.5111524521103954	-1.7309455786921333	-1.6442969260937454	-1.6302803615814438	-1.8261591227267853	-1.720898348482363	-1.5659321514053195	-1.4621548436806098	-1.6252848057620348	-1.8103827877310419	-1.418525395635072	-1.7010329731735385	-1.6222987538925864	-1.7207634125804312	-1.5394761723988108	-1.6277963652154865	-1.6367254277236734	-0.22216804163243786	-0.19730377503578866	0.08065809696682402	0.23566404319239243	0.14173154046119585	-0.1686130560308423	0.10749201530705443	-0.07445826954250401	0.021297645905808515	-0.2096109604700358	0.19146940629332243	0.016500560878258907	-0.006445066142229339	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr10:70805370..70805484,+__1747.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:70805370..70805484,+__1747.1.0.0	rs10998535,rs10998536	-1.6039910810943474	-1.5235945734465743	-1.6465902483721435	-1.6978188868730022	-1.7670163462232307	-1.6417697317001996	-1.5260174109421265	-1.6265747036310345	-1.643596399798395	-1.5111524521103954	-1.7309455786921333	-1.6442969260937454	-1.6302803615814438	-1.4658440738173524	-1.6126134155887246	-1.8174918597125655	-1.6083967742810703	-1.538500370240657	-1.8128928190776419	-1.6156373996554425	-1.7244874125999075	-1.5661482529613853	-1.8092513039575673	-1.6083460708966972	-1.4605809680783324	-1.6366825600722787	0.13814700727699503	-0.08901884214215028	-0.17090161134042203	0.08942211259193189	0.22851597598257367	-0.1711230873774423	-0.089619988713316	-0.09791270896887294	0.07744814683700962	-0.2980988518471719	0.12259950779543605	0.18371595801541307	-0.006402198490834676	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:73397988..73398102,+__1748.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:73397988..73398102,+__1748.1.0.0	rs2894167	-0.6189484538661243	-0.4059221795864783	-0.6686801233972635	-0.6974985450465765	-0.460816211301953	-0.4796213887204287	-0.47302927180229754	-0.4374337722626366	-0.25477801074902523	-0.30479574083479166	-0.39662603731884943	-0.3211978390012962	-0.45994563115731024	-0.6202347049843695	-0.8382404292510244	-0.925984015797196	-0.7893519496446858	-0.46722502795692944	-0.6976445969942857	-0.5467691647769248	-0.9839137279128871	-0.8676619147416796	-0.5968599635431442	-0.7369468430899779	-0.6503406080458526	-0.7267644122282464	-0.0012862511182452074	-0.4323182496645461	-0.25730389239993257	-0.09185340459810931	-0.006408816654976446	-0.21802320827385702	-0.0737398929746273	-0.5464799556502505	-0.6128839039926544	-0.2920642227083525	-0.3403208057711285	-0.32914276904455636	-0.2668187810709364	0.66743649171	0.0267271087754	0.66743649171	0.563691144959	0.967868733231	0.0499532058383	0.226876581559	0.000392957862114	0.0187859264625	0.0658387268341	0.237368605078	0.119339994516	0.00149073398336	1	1	1	1	1	1	1	0.285680365757	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr12:89554519..89554633,+__1759.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr12:89554519..89554633,+__1759.1.0.0	rs10745495	-1.7151608669072314	-1.4033159171385368	-1.3657511141008778	-1.246056500065288	-1.686745204509344	-1.6480601823306842	-1.5114535085556355	-1.2104245809204452	-1.6529440200977588	-1.522436223150275	-1.5493919261616749	-1.2218911887090727	-1.4778026027205688	-1.3598799474893504	-1.1677299925137077	-1.1341145262555639	-1.2132354388586235	-1.3545358459466157	-1.0541111811412338	-1.1502411921226698	-0.9347394048985772	-1.1375919215267598	-1.0097063000475592	-1.0819998830009399	-1.3888955431026353	-1.165565098075353	0.355280919417881	0.23558592462482908	0.23163658784531393	0.03282106120666439	0.3322093585627284	0.5939490011894504	0.3612123164329657	0.27568517602186804	0.515352098570999	0.5127299231027158	0.467392043160735	-0.16700435439356265	0.31223750464521566	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr15:60547778..60547892,+__1763.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr15:60547778..60547892,+__1763.1.0.0	rs16942350	1.0574802745087988	1.1259871379089887	0.9520529978102175	0.7631427831440523	0.8687572005598234	0.9396019959241888	0.7407424754244547	0.6780513591629833	0.9176491172659436	0.9512002349142187	0.9563859387989472	1.0559336852871537	0.9172487667258142	-0.05193261101343596	-0.024737444855666296	0.009239127487902649	-0.031697422275447716	0.16048478048758272	-0.10524919167841848	-0.3464196903003709	-0.3063689615985947	0.14991569340381805	0.19646240888705782	-0.13554957361076547	0.21769223786952996	-0.022346720599734037	-1.1094128855222347	-1.150724582764655	-0.9428138703223148	-0.7948402054195	-0.7082724200722407	-1.0448511876026072	-1.0871621657248256	-0.984420320761578	-0.7677334238621255	-0.7547378260271609	-1.0919355124097128	-0.8382414474176237	-0.939595487325548	1.5208503355e-07	2.13944772067e-06	4.73314572056e-05	0.000481108176159	4.46777109943e-05	4.77393269186e-07	1.06220766775e-05	0.00023411339895	3.14895644184e-05	5.66885732617e-06	7.77665488063e-06	5.12013208431e-07	1.5705327015e-49	0.000107676203754	0.00159174910418	0.0352619356182	0.354576725829	0.0344911928876	0.000364728457658	0.00784971466464	0.170200441037	0.0243414332955	0.00445005300104	0.0059802476032	0.000398858289367	1.31610640386e-46	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr17:25821791..25821905,+__1768.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr17:25821791..25821905,+__1768.1.0.0	rs373645393	-1.361752193557448	-1.0142642459856646	-1.296647024410047	-1.2741403241622322	-1.5139237561323298	-1.2410595534645443	-1.458942514813928	-1.0843837957708558	-1.0931677078157485	-1.5094782584679938	-1.4435531946184286	-1.033534874812787	-1.277070620334334	-1.1809908681982229	-1.3334128087887456	-1.238374783024386	-1.2206781680029255	-1.2047601850074536	-1.0726163009029257	-1.3830815482080845	-0.993730669097945	-1.3195889883138174	-1.107308793656468	-1.2444647872701944	-1.1928390775202955	-1.207653914832622	0.18076132535922507	-0.319148562803081	0.058272241385660895	0.05346215615930672	0.30916357112487614	0.16844325256161863	0.0758609666058434	0.0906531266729107	-0.22642128049806898	0.4021694648115257	0.1990884073482342	-0.15930420270750845	0.06941670550171192	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr17:46102652..46102766,+__1771.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr17:46102652..46102766,+__1771.1.0.0	rs34737931	0.9961747453829412	1.0389400085917146	0.7993317442895534	0.5615416084594562	1.0904603399092774	1.1424709385630294	0.89758053808885	0.890120773743641	1.0017065301345776	1.1614069240589284	1.3178427562933126	0.992337827186636	0.9908262278918265	1.1603184052487896	1.2414412453054036	1.2164262912928063	0.8722475129809504	1.362561376266178	1.384315405012404	1.0484386447279257	1.3676629298498302	1.3734032787857502	0.9888826794191734	1.523248993585298	1.1503988868970505	1.2241121374476298	0.16414365986584845	0.20250123671368891	0.4170945470032529	0.31070590452149416	0.2721010363569005	0.24184446644937463	0.15085810663907573	0.4775421561061892	0.37169674865117264	-0.17252424463975502	0.20540623729198537	0.1580610597104145	0.23328590955580344	0.113101776132	0.0316863885398	0.10711938092	0.00919097005605	0.00263248034207	0.0306357720046	0.0350255264852	0.00641629102443	0.0111573361887	0.861430881609	0.00753998341959	0.125844655769	1.93168185556e-09	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1.61874939496e-06	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr17:46102652..46102766,+__1771.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr17:46102652..46102766,+__1771.1.0.0	rs79541578	0.9961747453829412	1.0389400085917146	0.7993317442895534	0.5615416084594562	1.0904603399092774	1.1424709385630294	0.89758053808885	0.890120773743641	1.0017065301345776	1.1614069240589284	1.3178427562933126	0.992337827186636	0.9908262278918265	0.9965339586970745	1.3250044383968378	1.0742006724842594	1.0436855567408274	1.3281321899735583	1.259294821086986	0.959635439172594	1.2628825823422056	1.2491618575035164	1.0789534192328285	1.1727459571655028	1.1548084639416134	1.1587532797281503	0.00035921331413335533	0.28606442980512314	0.274868928194706	0.4821439482813712	0.23767185006428093	0.1168238825239567	0.06205490108374401	0.37276180859856467	0.24745532736893883	-0.08245350482609992	-0.14509679912780982	0.16247063675497742	0.16792705183632384	0.967868733231	0.147021540231	0.742176245913	0.0832552515755	0.265084565602	0.444064484515	0.226876581559	0.0906800339379	0.166665831608	0.60051573606	0.935789553219	0.301187193336	0.235250430943	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr17:46102652..46102766,+__1771.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr17:46102652..46102766,+__1771.1.0.0	rs34737931,rs79541578	0.9961747453829412	1.0389400085917146	0.7993317442895534	0.5615416084594562	1.0904603399092774	1.1424709385630294	0.89758053808885	0.890120773743641	1.0017065301345776	1.1614069240589284	1.3178427562933126	0.992337827186636	0.9908262278918265	1.029775338467628	1.2768259657483805	0.8825312269911115	1.110923061452073	0.925776793175524	0.9703430963274859	0.96010741954127	1.0997861188190048	1.0899673613170016	1.1956761940426481	1.023086480189198	1.3138396742826814	1.073219894196167	0.03360059308468688	0.23788595715666583	0.08319948270155808	0.5493814529926169	-0.1646835467337534	-0.17212784223554345	0.06252688145242002	0.20966534507536383	0.088260831182424	0.03426926998371971	-0.2947562761041147	0.32150184709604546	0.08239366630434077	0.692027146526	0.156605481197	0.957166828655	0.0565651674203	0.452098798395	0.628827692687	0.452098798395	0.285759223278	0.554657938956	0.657696241675	0.361212608085	0.727009731456	0.493314183178	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr19:2169005..2169119,+__1776.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:2169005..2169119,+__1776.1.0.0	rs7251881	1.1476042526161319	1.3930498862964291	1.2173704779087455	1.0604717124080314	1.3461193470809962	1.352342318607526	1.2669162538714025	1.3298248088441846	1.3990667756837898	1.485428730155381	1.3630435738912041	1.3663541989964612	1.3106326946966902	0.7687970409681815	0.8799762896328586	0.7204529011886975	0.8245668251954121	0.8392777511328726	0.900406837688208	0.7851965731642596	0.7473206650378554	1.0427678340976063	0.877420829093138	0.9079011332601625	1.078974032970764	0.8644215594525014	-0.3788072116479504	-0.5130735966635706	-0.496917576720048	-0.23590488721261926	-0.5068415959481236	-0.4519354809193181	-0.4817196807071429	-0.5825041438063292	-0.35629894158618347	-0.608007901062243	-0.4551424406310416	-0.28738016602569716	-0.4462111352441889	0.0140036728837	0.00201342137527	0.0440018610392	0.0468981580933	8.9082802627e-07	2.13944772067e-06	0.000170183141363	8.8142435835e-06	9.33325531828e-05	2.78491922777e-06	1.06220766775e-05	0.00616002497902	3.14303537734e-32	1	1	1	1	0.00068771923628	0.00163453805859	0.125765341467	0.0064079550852	0.0721460636103	0.0021861615938	0.00816837696496	1	2.63386364621e-29	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	sig	not sig	sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr19:2627581..2627695,+__1777.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:2627581..2627695,+__1777.1.0.0	rs12462730	-1.1396616756352411	-0.9079461838220149	-0.9864060889414936	-1.022157857977025	-1.1378252800340594	-0.8427175443387079	-0.9987124016453195	-1.170329165451422	-0.9823969704938086	-0.9451830955292144	-1.0226390423237464	-0.9528198429419796	-1.009066262427836	-0.7612022125921832	-0.5916081682559623	-0.7790824802820119	-0.7888688391632909	-1.0015337952133	-0.7686714459249482	-0.8921058293596321	-0.8409845880447134	-0.7151364914066426	-0.7681966028604349	-0.7132574622566904	-0.6943944155189203	-0.7762535275732275	0.3784594630430579	0.31633801556605257	0.20732360865948174	0.2332890188137341	0.13629148482075926	0.07404609841375975	0.10660657228568737	0.32934457740670864	0.267260479087166	0.17698649266877953	0.30938158006705596	0.2584254274230593	0.23281273485460843	NA__no_active_tile	0.0140036728837	0.0785847853765	0.136115392203	NA__no_active_tile	0.136115392203	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.107123399254	0.045430560235	0.0258200569765	0.107123399254	1.23558226918e-05	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	0.0103541794157	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr19:49465678..49465792,+__1779.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:49465678..49465792,+__1779.1.0.0	rs79366920	-0.594660250178166	-0.49826601293082146	-0.5523292940859337	-0.5050732543189966	-0.5761417141035666	-0.5256401132570168	-0.7152888169407441	-0.5816184887863586	-0.492728390186773	-0.6277714828771908	-0.6203115964374466	-0.5671247352001298	-0.571412845775262	0.12810023686246313	0.4338561311538128	0.27623290918251386	0.22265883770081368	0.25223293867058794	0.3262562840711346	0.3301925354036782	0.3647360447654071	0.38376712662652335	0.3212266994730346	0.47632272136614334	0.1870821511768349	0.30855538470441224	0.7227604870406292	0.9321221440846342	0.8285622032684475	0.7277320920198103	0.8283746527741546	0.8518963973281514	1.0454813523444222	0.9463545335517657	0.8764955168132964	0.9489981823502254	1.09663431780359	0.7542068863769648	0.8799682304796743	0.000161276729747	7.24718602024e-07	5.01342010717e-05	0.00023411339895	2.13858816101e-10	8.9082802627e-07	8.9082802627e-07	3.60162929514e-07	9.09364429293e-09	1.06544395451e-08	2.03284743013e-07	1.44459868922e-05	3.32776813555e-61	0.114183924661	0.000539190639906	0.0373499797984	0.172541575026	1.6509900603e-07	0.00068059261207	0.000658321911413	0.000261838449757	7.02938703843e-06	8.36373504291e-06	0.000156325967377	0.011253423789	2.78866969759e-58	not sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr2:8628425..8628539,+__1787.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr2:8628425..8628539,+__1787.1.0.0	rs79325160	-1.042730418245966	-1.19187631280744	-1.4516159506131965	-1.3031767356329576	-1.3282886648970678	-1.1417604838363353	-1.1625695762642645	-1.0112178536888083	-1.089074898951834	-0.9575042648948968	-1.3169113792077438	-1.3010198081527977	-1.1914788622661092	-0.9471834274265116	-0.8725338959428718	-0.7352691314349822	-1.0405356588958592	-0.9342851271051247	-1.5233730536876702	-0.9234137900323708	-1.1092474891569408	-0.820619675724905	-0.9314944998573955	-1.0266516517377229	-0.855588731966443	-0.9766830110807332	0.09554699081945439	0.3193424168645683	0.7163468191782143	0.26264107673709836	0.3940035377919431	-0.38161256985133485	0.2391557862318937	-0.09802963546813248	0.26845522322692894	0.026009765037501298	0.29025972747002093	0.4454310761863547	0.21479585118537584	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr21:37670602..37670716,+__1794.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr21:37670602..37670716,+__1794.1.0.0	rs28385572	-0.3956952805489854	-0.1987763645727143	-0.029441277543704788	-0.2094360318014147	-0.175267540534111	-0.28927636165266346	-0.009740878822193537	-0.02564680321744652	-0.066348330740169	-0.05350402107720307	-0.12317949997228225	-0.1417259351952109	-0.14316986047317493	-0.35621769790697655	-0.1863403410469986	0.05243326101806024	-0.22850516731877735	-0.0005706052119280134	0.04323542268325581	-0.1785916062919552	0.05683299192321838	-0.24930792558740444	-0.0297030672160382	-0.08292507792142029	-0.17052052768751635	-0.11084836171370671	0.039477582642008846	0.012436023525715711	0.08187453856176503	-0.01906913551736264	0.174696935322183	0.33251178433591927	-0.16885072746976165	0.0824797951406649	-0.18295959484723545	0.02380095386116487	0.040254422050861965	-0.028794592492305454	0.03232149875946821	0.935789553219	0.829896383209	0.747262025795	0.79863356553	0.554657938956	0.29495293544	0.245454024731	1.0	0.657692573088	0.87199428352	0.8931878581	0.978575937473	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr22:24256287..24256401,+__1796.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr22:24256287..24256401,+__1796.1.0.0	rs61095534	1.2879605091146875	1.7293102345713196	1.2423520193770805	1.3132515194270717	1.4090533247842334	1.5847839676085678	1.7506713379596055	1.4557702503286325	1.4475739406695718	1.664693345351317	1.371676615947917	1.5521555911620784	1.4841043880251732	1.5436063544413923	1.825276398733064	1.5247335757296763	1.3307955696129328	1.64888477200139	1.5657870474319942	1.6824989578657317	1.672703127889804	1.620472463788373	1.7455252911866583	1.9655442447071156	1.8206514625233163	1.6622066054926206	0.25564584532670476	0.09596616416174442	0.28238155635259576	0.017544050185861026	0.23983144721715655	-0.018996920176573617	-0.06817238009387383	0.2169328775611714	0.17289852311880116	0.08083194583534126	0.5938676287591986	0.268495871361238	0.17810221746744714	0.259370210024	0.436112310787	0.248193451531	0.925117039075	0.657696241675	0.648013768535	0.861430881609	0.320413072024	0.197395731844	0.0658387268341	0.00883703695038	0.333666485083	0.136312944443	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr3:152878296..152878410,+__1798.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr3:152878296..152878410,+__1798.1.0.0	rs192987417	-0.32222302738611514	-0.4306391667139066	-0.08087162660007384	-0.5048305246080177	-0.33805627793344706	-0.24569850002922816	-0.3289737127761003	-0.23291539583202975	-0.36329071934617274	-0.23319858637965266	-0.4817385631071581	-0.0841044558130114	-0.3038783797104095	-0.1873958206163859	0.035466561266639766	0.1665044468191136	-0.4427707582996641	-0.6076120557232476	-0.605261748286245	-0.5992860487747521	-0.41547354017558674	-0.3290447718476077	-0.07236299541933004	-0.12378321279446525	-0.5998301545921568	-0.315070841536974	0.13482720676972923	0.4661057279805464	0.24737607341918744	0.06205976630835358	-0.26955577778980055	-0.35956324825701685	-0.2703123359986518	-0.182558144343557	0.03424594749856502	0.16083559096032263	0.3579553503126929	-0.5157256987791454	-0.011192461826564535	0.925115329705	0.727009731456	0.270885072145	0.301187193336	0.158583637061	0.0785847853765	0.354199901149	0.122558611289	0.76769033028	0.657696241675	0.829896383209	0.0129907246043	0.179802735127	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr3:171858465..171858579,+__1800.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr3:171858465..171858579,+__1800.1.0.0	rs6445040	0.7759316118876394	1.1193842017982785	0.6875945833365805	0.573916650315871	0.8513168841200751	0.876952734449827	0.1984866167902343	0.664583694334399	0.6676493317649376	0.7880494861658947	0.6865203503331112	0.5548611471996551	0.703770607708042	-1.2184542254892123	-1.1551796735491822	-1.4082312855891677	-1.2498829810007912	-1.1238205752321446	-1.3479055411986005	-1.2938506640869765	-1.5493252081914257	-1.1350810702681189	-1.1304606685208496	-1.6359202669155368	-1.2246139750918834	-1.289393844594491	-1.9943858373768517	-2.274563875347461	-2.0958258689257483	-1.8237996313166622	-1.9751374593522197	-2.2248582756484274	-1.4923372808772108	-2.2139089025258247	-1.8027304020330566	-1.9185101546867442	-2.322440617248648	-1.7794751222915384	-1.9931644523025327	7.40729972622e-11	5.66002570384e-11	8.85463967688e-11	1.65189624759e-09	2.77664329956e-10	3.28900554275e-11	2.11771295059e-09	6.19216123946e-11	3.28900554275e-11	1.43964254557e-11	7.40729972622e-11	1.15574606291e-10	2.52389041771e-107	5.24436820616e-08	4.21105912365e-08	6.59670655928e-08	1.21744753447e-06	2.14356862726e-07	2.51280023466e-08	1.56498987049e-06	4.50170122109e-08	2.54240128455e-08	1.13011939827e-08	5.69621348946e-08	9.00326183006e-08	2.11502017004e-104	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:11324047..11324161,+__1811.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:11324047..11324161,+__1811.1.0.0	rs6903357	-1.6770537515886583	-1.871449474292465	-1.6034697000254694	-1.739908227191587	-2.01710596381423	-2.0461887643505974	-1.2476743033612296	-1.7567269152812535	-1.9293919544923877	-1.9269335491041728	-1.6175005312973791	-1.9557624927488366	-1.7824304689623551	-1.6625146428287625	-2.151917152704424	-1.487221878281393	-2.2040621676845897	-1.8186688610027264	-1.6544942714255342	-1.871564095936757	-1.990784396425871	-1.746643785072994	-2.1751497996253253	-1.6953802679263628	-1.6535879783371437	-1.8426657747709905	0.014539108759895836	-0.28046767841195885	0.11624782174407633	-0.4641539404930026	0.19843710281150373	0.3916944929250632	-0.6238897925755273	-0.23405748114461744	0.18274816941939376	-0.24821625052115248	-0.07787973662898362	0.30217451441169296	-0.06023530580863471	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:143247956..143248070,+__1812.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:143247956..143248070,+__1812.1.0.0	rs117695610	1.006507204248616	1.0862332268345485	0.5733206159605642	0.3433986134304777	0.6918045667857927	0.6962993688299965	0.4215002926687532	0.4876843396840608	0.8741383535463121	0.7677844796236641	0.6604386931919021	0.8933690256358156	0.708539898370042	0.3435578107788277	0.1057007438479613	-0.14365871223308613	0.20746129003463154	0.34789050030545904	0.226952973350981	0.17236023946155218	-0.06968848114309541	0.23889850191791864	0.4611363638566341	0.09529904814313275	0.2548410325401033	0.186729275905085	-0.6629493934697883	-0.9805324829865871	-0.7169793281936503	-0.13593732339584613	-0.3439140664803337	-0.4693463954790156	-0.24914005320720103	-0.5573728208271562	-0.6352398516283935	-0.30664811576703005	-0.5651396450487693	-0.6385279930957122	-0.5218106224649569	0.152714648871	0.0156538458129	0.119339994516	0.809021331888	0.0906800339379	0.150801701171	0.259370210024	0.088148079887	0.340396307916	0.270879586965	0.29495293544	0.29495293544	0.0020399842629	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:143247956..143248070,+__1812.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:143247956..143248070,+__1812.1.0.0	rs7772306	1.006507204248616	1.0862332268345485	0.5733206159605642	0.3433986134304777	0.6918045667857927	0.6962993688299965	0.4215002926687532	0.4876843396840608	0.8741383535463121	0.7677844796236641	0.6604386931919021	0.8933690256358156	0.708539898370042	0.40082976940361137	0.7818227544385946	0.6868283468004639	-0.10599759978872399	0.2266293645320036	0.17653742903975442	0.2972817020213806	0.31262743271069465	0.5258031269609295	0.31098157787444186	0.5737136973262856	0.07826796894288635	0.3554437975218602	-0.6056774348450047	-0.30441047239595387	0.11350773083989973	-0.44939621321920165	-0.4651752022537891	-0.5197619397902421	-0.12421859064737262	-0.17505690697336612	-0.34833522658538263	-0.4568029017492223	-0.08672499586561644	-0.8151010566929292	-0.3530961008481817	0.216719559135	0.265084565602	0.677233097055	0.633597542154	0.250954198416	0.0583274625199	0.514901630041	0.357692665759	0.270874101673	0.282739949934	0.687084607526	0.175053819161	0.0825279140737	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr6:143247956..143248070,+__1812.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:143247956..143248070,+__1812.1.0.0	rs117695610,rs7772306	1.006507204248616	1.0862332268345485	0.5733206159605642	0.3433986134304777	0.6918045667857927	0.6962993688299965	0.4215002926687532	0.4876843396840608	0.8741383535463121	0.7677844796236641	0.6604386931919021	0.8933690256358156	0.708539898370042	-0.03159773651032718	0.40944313701276164	-0.030090928845347645	-0.13056984268355634	0.3832598547850187	-0.010165895766679164	0.1562175911352325	0.43118568951657815	-0.05307329306259236	0.05312747482953647	0.5309693651488206	-0.2114850700413121	0.12476836212651114	-1.0381049407589433	-0.6767900898217869	-0.6034115448059119	-0.47396845611403404	-0.308544712000774	-0.7064652645966757	-0.26528270153352074	-0.05649865016748262	-0.9272116466089044	-0.7146570047941276	-0.12946932804308142	-1.1048540956771276	-0.583771536243531	0.0741297894045	0.0145358169752	0.113101776132	0.195066735841	0.0601351299193	0.00883703695038	0.253741740693	0.0327677521954	0.0181162663925	0.0129896873246	0.390154148302	0.00105204507021	5.43242382533e-09	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.216721284463	1.23316020835e-06	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:130586299..130586413,+__1818.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:130586299..130586413,+__1818.1.0.0	rs77116959	-0.06367105006320553	-0.141836180272189	-0.3280519364046002	-0.3956162612596638	-0.2622205637143136	-0.2953575860433493	-0.4108791925640635	-0.2358435893008104	-0.3165622547912644	-0.2440611896539353	-0.2667775513919415	-0.21419085684470093	-0.2645890176920031	-0.7304062492237398	-0.2965977551043912	-0.5951723532754986	-0.3723803918407875	-0.6494530625123114	-0.3696151766407141	-0.4602711772314364	-0.406628171556389	-0.03565028464367651	-0.4069350757117315	-0.2657088525574637	-0.3479625565549867	-0.41139842557109385	-0.6667351991605343	-0.15476157483220218	-0.2671204168708984	0.023235869418876343	-0.38723249879799776	-0.07425759059736481	-0.04939198466737288	-0.17078458225557858	0.28091197014758784	-0.16287388605779618	0.0010686988344777992	-0.13377169971028577	-0.14680940787909075	0.428242856315	0.829896383209	0.79863356553	0.368322877114	0.259370210024	0.76769033028	0.85089220831	0.687084607526	0.116187990183	0.276771967065	0.819442862795	0.368322877114	0.685889434335	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:151541708..151541822,+__1820.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:151541708..151541822,+__1820.1.0.0	rs60002611	2.815171105270591	3.143498405185638	2.600069890511852	2.4820195378505723	2.811315125227763	2.815538368519289	2.556737769412047	2.8727294792565594	2.5830998889449805	2.787757470180817	2.643262939794978	2.7407866704262283	2.737665554215109	-0.8081913385865848	-0.6673311408015357	-0.6718903976135577	-0.6517784822942005	-0.7467186037621218	-0.5542945354560715	-0.7032083189419225	-0.6399730784654112	-0.783551773809396	-0.672198408309541	-0.6487032081221125	-0.711313102698772	-0.688262699071769	-3.6233624438571757	-3.8108295459871737	-3.2719602881254097	-3.1337980201447726	-3.5580337289898845	-3.3698329039753605	-3.2599460883539697	-3.512702557721971	-3.3666516627543768	-3.459955878490358	-3.2919661479170905	-3.452099773125	-3.425928253286878	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	4.13422537663e-122	4.39804167873e-09	4.62167091663e-09	4.6278828399e-09	4.5781874537e-09	4.79560476833e-09	4.74590938213e-09	4.59061130025e-09	4.51606822095e-09	4.8018166916e-09	4.8763597709e-09	4.7769689985e-09	4.83908823125e-09	3.46448086561e-119	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:151541708..151541822,+__1820.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:151541708..151541822,+__1820.1.0.0	rs56797687	2.815171105270591	3.143498405185638	2.600069890511852	2.4820195378505723	2.811315125227763	2.815538368519289	2.556737769412047	2.8727294792565594	2.5830998889449805	2.787757470180817	2.643262939794978	2.7407866704262283	2.737665554215109	2.9848251113642963	3.4251623660164725	2.8453470908876004	2.6267085741495046	2.9528522341553067	3.042997378757188	2.8355014212612026	3.0738834394507775	2.9288845769628535	2.9406250643826493	2.91246286776744	2.974260725808824	2.961959237580343	0.1696540060937055	0.28166396083083445	0.24527720037574818	0.14468903629893237	0.1415371089275439	0.22745901023789905	0.27876365184915564	0.20115396019421805	0.345784688017873	0.15286759420183227	0.26919992797246195	0.23347405538259558	0.22429368336523334	0.259370210024	0.0531733827136	0.468411351413	0.619326784864	0.183752894264	0.0296152123457	0.253741740693	0.265084565602	0.0296152123457	0.129198935732	0.0296152123457	0.0678362651725	0.000152476977948	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.12777570752	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr7:151541708..151541822,+__1820.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:151541708..151541822,+__1820.1.0.0	rs60002611,rs56797687	2.815171105270591	3.143498405185638	2.600069890511852	2.4820195378505723	2.811315125227763	2.815538368519289	2.556737769412047	2.8727294792565594	2.5830998889449805	2.787757470180817	2.643262939794978	2.7407866704262283	2.737665554215109	-0.6400202070403218	-0.44209865405005466	-0.29528431958025825	-0.422667699566175	-0.42176732544035356	-0.24198731632309473	-0.5798179163743531	-0.4401120310081047	-0.5668426468607434	-0.5926108593145405	-0.3839113948603905	-0.4225100425679651	-0.454135867748863	-3.4551913123109124	-3.5855970592356927	-2.8953542100921106	-2.904687237416747	-3.2330824506681166	-3.0575256848423837	-3.1365556857864	-3.312841510264664	-3.149942535805724	-3.3803683294953575	-3.0271743346553683	-3.1632967129941933	-3.191801421963973	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	6.21192327504e-12	4.13422537663e-122	1.20511311536e-09	1.25480850156e-09	1.23617273173e-09	1.17405349898e-09	1.27344427138e-09	1.24859657828e-09	1.24238465501e-09	1.21132503863e-09	1.27965619466e-09	1.29208004121e-09	1.27344427138e-09	1.27965619466e-09	9.38469160494e-120	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr8:134911743..134911857,+__1822.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr8:134911743..134911857,+__1822.1.0.0	rs12681880	-1.6644683179875495	-1.4617581134955393	-1.4018115973260192	-1.3862526280865357	-1.631866420883505	-1.638737600162758	-1.453240909834114	-1.2998776719267013	-1.6450973682882988	-1.5006662893857103	-1.6828598933295567	-1.689250699775939	-1.537990625873519	-2.2060892620156896	-2.00618352586093	-2.190848024755872	-1.8009866431477821	-2.2692117810267085	-2.2442095565966875	-2.0972994758985575	-1.6579309061745913	-1.7404966374260296	-2.20211268461347	-2.1401365357089412	-1.978785301890962	-2.0445241945930186	-0.5416209440281401	-0.5444254123653907	-0.7890364274298527	-0.4147340150612464	-0.6373453601432035	-0.6054719564339295	-0.6440585660644436	-0.35805323424788993	-0.09539926913773078	-0.7014463952277596	-0.4572766423793846	-0.28953460211502313	-0.5065335687194995	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr9:29214211..29214325,+__1827.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr9:29214211..29214325,+__1827.1.0.0	rs1928658	-1.0174653314962157	-0.6594548778238462	-0.7110832859677289	-0.5677884717468972	-1.0458794376591058	-0.7757555021008717	-0.8465397089600882	-0.68981806705554	-0.9380970193895677	-0.7556804947547495	-0.9900254817415106	-0.9971613374549252	-0.8328957513459204	-1.0342164045280031	-1.2563459939273727	-1.352676913936142	-1.4349275007383828	-1.2407830756090823	-1.2772530025165199	-1.0046740520547248	-0.8795817829779132	-1.0366828941719604	-1.276254073637459	-1.0418999145635486	-1.498585903944148	-1.1944901260504381	-0.016751073031787467	-0.5968911161035265	-0.6415936279684132	-0.8671390289914856	-0.19490363794997645	-0.5014975004156481	-0.1581343430946366	-0.18976371592237318	-0.09858587478239267	-0.5205735788827095	-0.051874432822037964	-0.5014245664892228	-0.36159437470451755	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0267271087754	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0267271087754	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chrX:23971444..23971558,+__1829.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chrX:23971444..23971558,+__1829.1.0.0	rs2023680	-1.5830842823282714	-1.5499219016634926	-1.3448153131022849	-1.8802502783439703	-1.5392586908075323	-1.4249871010558182	-1.3995495151568271	-1.4274592564997783	-1.5820724738546783	-1.3758238761805477	-1.6687736273293694	-1.4605809680783324	-1.5197147737000753	-1.6077187436374871	-1.5534278886104194	-1.4883551749031982	-1.4216020779446699	-1.5919883291490968	-1.5154635590204428	-1.5601805063080667	-1.4007682505140897	-1.4095680864753928	-1.5856497101437934	-1.5914393314227255	-1.3936602172252512	-1.5099851562795525	-0.02463446130921576	-0.00350598694692672	-0.14353986180091338	0.45864820039930043	-0.05272963834156452	-0.09047645796462467	-0.16063099115123958	0.02669100598568863	0.17250438737928553	-0.20982583396324572	0.07733429590664387	0.06692075085308113	0.009729617420522437	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr1:198625715..198625829,+__1831.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:198625715..198625829,+__1831.1.0.0	rs11810527	-2.0907665280083987	-1.6115714110119455	-1.9324169305745644	-1.4174434719246338	-1.8138670305613207	-1.6331419069576891	-1.7877678524946774	-1.656040706436789	-1.9388587745049897	-1.5628879677948024	-1.5498547073541522	-1.4436413974896989	-1.703188223759472	-1.675863883365365	-1.6338914245650735	-1.5876102768527665	-1.6598803168364455	-1.5959927767003999	-1.5674665539800408	-1.5049464888263664	-1.3576867846803573	-1.6119056215611398	-1.5339817747530298	-1.6018367909420093	-1.6955859522364642	-1.585554053774955	0.4149026446430337	-0.02232001355312807	0.344806653721798	-0.24243684491181172	0.21787425386092085	0.06567535297764837	0.282821363668311	0.2983539217564317	0.32695315294384986	0.028906193041772665	-0.05198208358785705	-0.25194455474676536	0.11763416998451699	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr1:209601386..209601500,+__1833.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:209601386..209601500,+__1833.1.0.0	rs71636118	-0.5786714446905863	-0.40821937178468193	-0.2987384032715362	-0.3771298534034557	-0.3642508865897477	-0.2362178262727536	-0.3536333989810264	-0.3501810336504128	-0.4659909624725005	-0.2074545493250116	-0.19585973012337982	-0.24518059061416353	-0.34012733759827135	-1.0590445579494445	-0.6996424200809496	-0.8931021246269931	-1.1470724054350807	-0.4483420318853676	-0.6789682042628461	-0.6943223468823998	-0.7739864466678124	-0.38596218882023714	-0.36733479654971446	-0.7612022125921832	-0.6063633293113164	-0.7096119220886954	-0.48037311325885823	-0.29142304829626764	-0.5943637213554569	-0.769942552031625	-0.0840911452956199	-0.44275037799009254	-0.3406889479013734	-0.42380541301739955	0.08002877365226335	-0.15988024722470287	-0.5653424824688034	-0.3611827386971529	-0.36948458449042404	0.0499532058383	0.150801701171	0.216719559135	0.00883703695038	0.572794651112	0.150801701171	0.150801701171	0.0468981580933	0.88258056334	0.183752894264	0.132622250874	0.143314270352	0.000561589712824	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.470612179347	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr1:209601386..209601500,+__1833.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:209601386..209601500,+__1833.1.0.0	rs140255985	-0.5786714446905863	-0.40821937178468193	-0.2987384032715362	-0.3771298534034557	-0.3642508865897477	-0.2362178262727536	-0.3536333989810264	-0.3501810336504128	-0.4659909624725005	-0.2074545493250116	-0.19585973012337982	-0.24518059061416353	-0.34012733759827135	-0.9954667384690372	-0.4967302731887636	-0.7381791660585668	-1.1295052213553545	-0.7325172152777768	-0.8818761217928073	-0.6168583663870691	-0.9084490043316398	-0.859852798402826	-0.5416991285272533	-0.8086692275117635	-0.7130059754402898	-0.7852341030619289	-0.4167952937784509	-0.08851090140408169	-0.4394407627870306	-0.7523753679518987	-0.3682663286880291	-0.6456582955200537	-0.26322496740604273	-0.558267970681227	-0.39386183593032553	-0.3342445792022417	-0.6128094973883838	-0.46782538482612623	-0.4451067654636576	0.0187859264625	0.226876581559	0.0316863885398	0.00522462344006	0.0168468410067	0.00544559218276	0.0499532058383	0.0174727290303	0.0484054419273	0.044708952363	0.0129907246043	0.104229562843	4.04187967597e-11	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	3.38709516846e-08	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr1:209601386..209601500,+__1833.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:209601386..209601500,+__1833.1.0.0	rs150350901	-0.5786714446905863	-0.40821937178468193	-0.2987384032715362	-0.3771298534034557	-0.3642508865897477	-0.2362178262727536	-0.3536333989810264	-0.3501810336504128	-0.4659909624725005	-0.2074545493250116	-0.19585973012337982	-0.24518059061416353	-0.34012733759827135	-0.7183813571182487	-0.6035827991752181	-0.3657999066834663	-0.6187770271860635	-0.3677266847897251	-0.3461809842416781	-0.347616537170836	-0.3403280158241745	-0.12330203335897047	-0.3078585878395728	-0.23892464001157848	-0.46890585941480956	-0.40394870273452854	-0.1397099124276624	-0.19536342739053614	-0.06706150341193007	-0.24164717378260786	-0.003475798199977398	-0.1099631579689245	0.006016861810190399	0.00985301782623832	0.34268892911353	-0.10040403851456123	-0.043064909888198666	-0.22372526880064603	-0.06382136513625712	0.66743649171	0.397602565759	0.819442862795	0.87199428352	0.737113058664	0.783116642561	0.757455001208	0.63839046467	0.420456664513	0.60051573606	0.468411351413	0.586575008857	0.920772167076	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr1:209601386..209601500,+__1833.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:209601386..209601500,+__1833.1.0.0	rs138101558	-0.5786714446905863	-0.40821937178468193	-0.2987384032715362	-0.3771298534034557	-0.3642508865897477	-0.2362178262727536	-0.3536333989810264	-0.3501810336504128	-0.4659909624725005	-0.2074545493250116	-0.19585973012337982	-0.24518059061416353	-0.34012733759827135	0.02477447080207455	-0.17245723681084138	-0.112268248913905	-0.3296661110916186	-0.22086289045055527	-0.2449296105855495	-0.18159374842283094	0.10352030470186112	-0.12084475090827572	-0.1775334045907666	-0.08091966717464863	-0.13228055322660004	-0.13708845388930466	0.6034459154926608	0.23576213497384055	0.18647015435763123	0.04746374231183709	0.14338799613919243	-0.0087117843127959	0.17203965055819548	0.45370133835227394	0.34514621156422476	0.02992114473424498	0.11494006294873119	0.11290003738756349	0.2030388837089667	0.0856734395523	0.340423946445	0.282739949934	0.696989544957	0.197395731844	0.829896383209	0.436112310787	0.119339994516	0.192768091005	0.914457985151	0.183752894264	0.162586850726	0.0990353146051	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr1:209601386..209601500,+__1833.1.4.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:209601386..209601500,+__1833.1.0.0	rs71636118,rs140255985,rs150350901,rs138101558	-0.5786714446905863	-0.40821937178468193	-0.2987384032715362	-0.3771298534034557	-0.3642508865897477	-0.2362178262727536	-0.3536333989810264	-0.3501810336504128	-0.4659909624725005	-0.2074545493250116	-0.19585973012337982	-0.24518059061416353	-0.34012733759827135	-0.6674669407272367	-0.4207459534618796	-0.2866125089728136	-0.7328164323947751	-0.817688206047356	-0.7809106750708579	-0.6004371314379942	-0.6093643190508279	-0.5128486479683245	-0.5308620346113865	-0.40648799258771606	-0.2854764829989751	-0.5543097771108453	-0.08879549603665038	-0.012526581677197668	0.012125894298722628	-0.35568657899131945	-0.45343731945760835	-0.5446928487981043	-0.24680373245696774	-0.2591832854004151	-0.04685768549582403	-0.32340748528637486	-0.21062826246433625	-0.04029589238481157	-0.2141824395125739	0.619326784864	0.545696106059	0.829896383209	0.288805731951	0.183752894264	0.0678362651725	0.0945835346132	0.154655491485	0.412754243182	0.265084565602	0.188220673538	0.545696106059	0.0553485370908	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr10:30782546..30782660,+__1844.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr10:30782546..30782660,+__1844.1.0.0	rs11008068	-0.7642315904010681	-0.8622661437791475	-0.6213327319878832	-0.6007200421572785	-0.7689048848322324	-0.4873957833791529	-0.893548487754771	-0.9085807758590991	-0.8002223280111851	-0.5764453009981084	-0.7575193681765535	-0.8188508854093031	-0.7383348602288152	-1.4313920679256622	-1.1707262000975374	-0.9264478735525492	-1.088007446242989	-1.0671408648280816	-1.0954620975062617	-1.2213585654188748	-1.3097871675060373	-1.2188665079366485	-0.9476896425094818	-1.4036355036452086	-1.4843210768485422	-1.1970695845014898	-0.6671604775245941	-0.3084600563183899	-0.305115141564666	-0.4872874040857105	-0.29823597999584917	-0.6080663141271088	-0.32781007766410375	-0.40120639164693817	-0.41864417992546343	-0.3712443415113734	-0.6461161354686551	-0.6654701914392391	-0.4587347242726743	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0785847853765	0.0107365258413	0.0932701621097	0.00146142948273	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00139510136839	0.00133155906714	0.00460947122508	0.00327633608155	4.14863222805e-12	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	3.4765538071e-09	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:30831727..30831841,+__1845.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:30831727..30831841,+__1845.1.0.0	rs2370116	-1.3253864573325538	-1.4398554907222816	-1.4819349661879635	-1.178691094025625	-1.199651337819738	-1.2545209118571543	-0.879624596914744	-1.119990852604276	-1.1590067380947204	-1.311262033871654	-1.0094694729863247	-1.333134663838983	-1.2243773846880017	-1.2289944442890697	-0.9312688147071414	-0.9443048755298026	-1.0882752338709567	-1.2531317537315418	-1.423411761891015	-0.6370971557881966	-1.1026859907329043	-1.0098523212886608	-1.101640458548332	-1.2086866054613368	-1.1264329703741005	-1.0879818655177547	0.0963920130434841	0.5085866760151402	0.5376300906581609	0.09041586015466829	-0.05348041591180386	-0.16889085003386062	0.24252744112654745	0.017304861871371813	0.14915441680605968	0.20962157532332215	-0.19921713247501205	0.20670169346488243	0.1363955191702467	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr11:109957839..109957953,+__1850.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr11:109957839..109957953,+__1850.1.0.0	rs12283871	-0.18512936405299096	-0.05966797730341474	-0.017492970848828775	-0.09209405614642567	-0.17817102536190893	-0.2289808710678744	-0.255472341708147	-0.122092485119429	0.10259927261118582	-0.20920841402801335	-0.042166384004445265	0.056091152881427464	-0.10264878867907207	-0.4186615578513853	-0.575426671123725	-0.41068052768605856	-0.5540191029971784	-0.5127099157192836	-0.5747269696238924	-0.6265393776935462	-0.3072042054362969	-0.48377129722166073	-0.37824680912508	-0.3853311127004557	-0.47999925327974646	-0.47560973337152573	-0.23353219379839435	-0.5157586938203103	-0.3931875568372298	-0.4619250468507527	-0.33453889035737466	-0.34574609855601796	-0.3710670359853992	-0.1851117203168679	-0.5863705698328465	-0.16903839509706667	-0.34316472869601045	-0.536090406161174	-0.3729609446924537	0.147021540231	0.0362033618716	0.253741740693	0.122558611289	0.0111573361887	0.154655491485	0.116187990183	0.840380101088	0.00105204507021	0.143314270352	0.0194743211566	0.0986283746992	3.05905043122e-06	1	1	1	1	1	1	1	1	0.813230839272	1	1	1	0.00256348426136	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr12:124907771..124907885,+__1854.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr12:124907771..124907885,+__1854.1.0.0	rs76843111	-0.5998606358794148	-0.5781600629063561	-0.45120631912679454	-0.9568663882036605	-0.8196124158103096	-1.1041143857906037	-0.7229509321587534	-0.727356425869218	-0.8225499991037023	-0.922043187846553	-0.8482902258093517	-1.092600281433168	-0.8038009383281571	-0.9555029851673029	-0.8461859374547372	-1.3377895897223009	-1.1994673678944547	-1.272412762117848	-1.2485255117964695	-0.9894669274613728	-1.3980028136446003	-1.4704715769664733	-1.6234577668640549	-1.2668388598081146	-1.217841824502554	-1.2354969936166902	-0.35564234928788807	-0.2680258745483811	-0.8865832705955063	-0.2426009796907942	-0.4528003463075384	-0.1444111260058658	-0.2665159953026194	-0.6706463877753823	-0.647921577862771	-0.7014145790175018	-0.41854863399876296	-0.12524154306938606	-0.43169605528853316	NA__no_active_tile	0.136115392203	0.0638899216795	NA__no_active_tile	0.0484054419273	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00672078908795	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr13:31288941..31289055,+__1858.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr13:31288941..31289055,+__1858.1.0.0	rs9579637	-1.6414120183934529	-1.4451826701697323	-1.657843019849143	-1.6285457519752833	-1.5854862276213968	-1.5120915945329478	-1.5795183647629976	-1.6803136618539891	-1.3547241098606566	-1.3519874727182661	-1.5470004068255785	-1.5798357397215497	-1.5469950865237492	-1.6534814527485255	-1.5126461455058977	-1.7129865648905578	-1.5484106761257632	-1.8269064883484334	-1.5334929909395631	-1.5875504701464298	-1.5205651350106717	-1.8071844486355575	-1.6515345242177681	-1.6457957676429658	-1.5483223030657478	-1.6290730806064904	-0.012069434355072683	-0.06746347533616537	-0.05514354504141483	0.08013507584952007	-0.2414202607270366	-0.021401396406615314	-0.008032105383432242	0.15974852684331742	-0.4524603387749009	-0.299547051499502	-0.09879536081738727	0.03151343665580186	-0.08207799408274065	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr13:70523606..70523720,+__1859.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr13:70523606..70523720,+__1859.1.0.0	rs56335733	-1.9026328616435408	-1.6204373233662208	-1.5797673684925955	-1.9007264170115112	-1.7717650810607433	-1.6361813530865148	-1.536590474266083	-1.486838738414126	-1.7189973689227316	-1.9852322687786368	-1.680625905515485	-1.9948666458506084	-1.7345551505340664	-1.894909958289464	-1.6390898025055147	-1.4326813985632978	-1.6820258781613124	-2.331391574649309	-2.091776342547519	-1.9161177396379088	-1.7729243095565634	-1.8198672719869262	-1.7788794384210374	-2.2367746174974656	-1.8882883996330408	-1.87372722762078	0.007722903354076882	-0.01865247913929391	0.14708596992929768	0.2187005388501988	-0.5596264935885658	-0.4555949894610043	-0.3795272653718258	-0.2860855711424375	-0.10086990306419463	0.20635283035759944	-0.5561487119819806	0.10657824621756751	-0.1391720770867135	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr13:70523606..70523720,+__1859.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr13:70523606..70523720,+__1859.1.0.0	rs144739943	-1.9026328616435408	-1.6204373233662208	-1.5797673684925955	-1.9007264170115112	-1.7717650810607433	-1.6361813530865148	-1.536590474266083	-1.486838738414126	-1.7189973689227316	-1.9852322687786368	-1.680625905515485	-1.9948666458506084	-1.7345551505340664	-1.7103495133768327	-1.7237877241357578	-1.9842637310403837	-2.063200567126953	-2.3565717253518463	-1.801609238552866	-1.5865595783344257	-1.959309310561909	-1.6795024613113139	-1.694667528919508	-1.880140160286429	-1.7483533473769806	-1.849026240531267	0.19228334826670812	-0.10335040076953694	-0.4044963625477882	-0.16247415011544186	-0.5848066442911031	-0.16542788546635112	-0.04996910406834276	-0.4724705721477831	0.03949490761141772	0.2905647398591289	-0.19951425477094387	0.2465132984736278	-0.1144710899972007	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr13:70523606..70523720,+__1859.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr13:70523606..70523720,+__1859.1.0.0	rs56335733,rs144739943	-1.9026328616435408	-1.6204373233662208	-1.5797673684925955	-1.9007264170115112	-1.7717650810607433	-1.6361813530865148	-1.536590474266083	-1.486838738414126	-1.7189973689227316	-1.9852322687786368	-1.680625905515485	-1.9948666458506084	-1.7345551505340664	-1.6459760136451953	-1.947799258969774	-1.8606708077616236	-1.3101635712861368	-1.914925021203922	-1.5404869927161404	-2.047965909608521	-1.6890295719042245	-1.7910407193211106	-1.9205732210159274	-2.0594594847761836	-1.8482540720958034	-1.7980287203587135	0.25665684799834554	-0.3273619356035531	-0.28090343926902817	0.5905628457253744	-0.14315994014317868	0.09569436037037438	-0.511375435342438	-0.2021908334900986	-0.07204335039837906	0.06465904776270937	-0.3788335792606985	0.14661257375480496	-0.06347356982464712	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr14:102414536..102414650,+__1860.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr14:102414536..102414650,+__1860.1.0.0	rs73345604	1.3183347820875824	1.5976879896577225	1.2025079013070261	1.2724341837281232	1.6104718908784528	1.4828434613044172	1.3162511530157746	1.5850812422528	1.2014052561161634	1.3008208192701953	1.5938485234164148	1.2304037204384837	1.392674243622763	1.3848757638583375	1.6707500471879202	1.2555257368820754	1.1663616142675939	1.5637970614826058	1.3057172556042433	1.211776759664737	1.4227527712907833	1.2934531173653268	1.4301072801158576	1.272350897254919	1.240123713351498	1.351466001527158	0.06654098177075518	0.07306205753019768	0.053017835575049244	-0.10607256946052934	-0.046674829395846995	-0.1771262057001739	-0.10447439335103748	-0.16232847096201675	0.09204786124916331	0.1292864608456623	-0.3214976261614959	0.009719992913014286	-0.04120824209560486	0.412754243182	0.747262025795	0.696989544957	0.591208103411	0.390154148302	0.301187193336	0.747262025795	0.809021331888	0.788271856943	0.978575937473	0.519249062249	0.648013768535	0.932812201477	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr14:62070715..62070829,+__1863.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr14:62070715..62070829,+__1863.1.0.0	rs8022877	-1.4533301468396749	-1.4712286208154455	-1.376578905305851	-1.4174434719246338	-1.2798240438817177	-1.666037494291366	-1.4112317597360686	-1.5161738971908447	-1.5115689647831474	-1.3726879321659604	-1.5813552187499715	-1.8984087248832835	-1.4963224317139971	-1.5723539336391976	-1.5667548505607112	-1.64465295217863	-1.6713739262937823	-1.7077724360537083	-1.519533309805959	-1.5800953636960695	-1.602555352026097	-1.789744877839492	-1.6391412471352882	-1.7818053134378755	-1.725523490413659	-1.6501089210900393	-0.11902378679952275	-0.0955262297452657	-0.2680740468727789	-0.2539304543691485	-0.42794839217199065	0.14650418448540714	-0.16886360396000089	-0.08638145483525217	-0.2781759130563446	-0.2664533149693278	-0.20045009468790398	0.17288523446962456	-0.153786489376042	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr14:62070715..62070829,+__1863.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr14:62070715..62070829,+__1863.1.0.0	rs117530266	-1.4533301468396749	-1.4712286208154455	-1.376578905305851	-1.4174434719246338	-1.2798240438817177	-1.666037494291366	-1.4112317597360686	-1.5161738971908447	-1.5115689647831474	-1.3726879321659604	-1.5813552187499715	-1.8984087248832835	-1.4963224317139971	-1.3898817858521988	-1.7307203828202473	-1.9663722166963868	-1.2633439769133312	-1.480936083185301	-1.3159817030282288	-1.5456407764995543	-1.7292310220016702	-1.4644184542709178	-1.7694760580194022	-1.5896790445325404	-1.723806751004611	-1.5807906879020324	0.06344836098747608	-0.25949176200480184	-0.5897933113905358	0.1540994950113026	-0.20111203930358323	0.35005579126313724	-0.1344090167634857	-0.2130571248108255	0.047150510512229626	-0.3967881258534418	-0.00832382578256885	0.1746019738786726	-0.08446825618803538	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr14:62070715..62070829,+__1863.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr14:62070715..62070829,+__1863.1.0.0	rs8022877,rs117530266	-1.4533301468396749	-1.4712286208154455	-1.376578905305851	-1.4174434719246338	-1.2798240438817177	-1.666037494291366	-1.4112317597360686	-1.5161738971908447	-1.5115689647831474	-1.3726879321659604	-1.5813552187499715	-1.8984087248832835	-1.4963224317139971	-1.8124682029482744	-1.8940870561058132	-2.3156582988862784	-2.2808607152390583	-2.162533413321862	-1.4291316725699028	-1.8031141216978135	-1.8072057131293116	-2.0544557682184497	-2.1728739698368824	-2.312801319962465	-1.6216482157762626	-1.9722365389743641	-0.3591380561085995	-0.4228584352903677	-0.9390793935804274	-0.8634172433144245	-0.8827093694401442	0.23690582172146324	-0.39188236196174486	-0.29103181593846683	-0.5428868034353023	-0.800186037670922	-0.7314461012124933	0.2767605091070209	-0.4759141072603674	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr16:85202704..85202818,+__1874.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr16:85202704..85202818,+__1874.1.0.0	rs533810956	0.9637108864774699	0.2887762124361271	-0.4795732201105705	-0.9563091227580722	-0.6996552719724584	-0.2500864254556325	-1.0091545659328778	-0.5626289297375902	-0.1798293889140934	-1.1007632319030536	-0.41195755190723926	-0.24051556405935887	-0.3864988478197791	-0.6405805750523299	-0.9862595496673867	-0.5774137816964604	-0.7990058743144154	-0.735148669075962	-1.5614745908924696	-0.5468174307974556	-1.1120219353327623	-0.5317376975516795	-0.8209150267698113	-0.6134833739420844	-0.8709811738560047	-0.816319973245735	-1.6042914615297998	-1.2750357621035138	-0.09784056158588988	0.15730324844365684	-0.03549339710350363	-1.3113881654368371	0.4623371351354222	-0.5493930055951721	-0.35190830863758615	0.27984820513324227	-0.20152582203484515	-0.6304656097966459	-0.429821125425956	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr17:25416486..25416600,+__1877.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr17:25416486..25416600,+__1877.1.0.0	rs111504552	1.5202903379328976	1.7868967847101511	1.4593434894972943	1.2643297231894715	1.3738985864327817	1.341140786016485	1.655858232550756	2.3724904397898303	1.5982546759961807	1.5468383331820514	1.4077179097881205	1.496594607211232	1.568637825524771	1.3925854342510897	1.7753038100633458	1.3256439334638843	1.236247263007282	1.4332279726592656	1.3135295237863092	1.4048686130673924	2.1710087582872655	1.4276979169403798	1.4332002766185807	1.3322711050948945	1.6163520982472943	1.4884947254572485	-0.12770490368180787	-0.01159297464680531	-0.13369955603341	-0.028082460182189406	0.05932938622648387	-0.027611262230175848	-0.2509896194833636	-0.20148168150256485	-0.1705567590558008	-0.1136380565634707	-0.07544680469322596	0.11975749103606237	-0.08014310006752234	0.237368605078	0.66743649171	0.563691144959	0.727009731456	0.946473618223	0.333666485083	0.0583274625199	0.101398170673	0.122558611289	0.333666485083	0.242741268695	0.788281320858	0.220613469082	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr17:25416486..25416600,+__1877.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr17:25416486..25416600,+__1877.1.0.0	rs73258460	1.5202903379328976	1.7868967847101511	1.4593434894972943	1.2643297231894715	1.3738985864327817	1.341140786016485	1.655858232550756	2.3724904397898303	1.5982546759961807	1.5468383331820514	1.4077179097881205	1.496594607211232	1.568637825524771	1.1409602751112797	1.322447229221614	1.262506789637806	0.8337493824434592	0.9891562589605163	0.9760149433250468	1.2740598999928683	2.007518288034608	1.1431342279427836	0.9044806051416296	1.1336469215237375	1.168195372560558	1.1796558494913256	-0.37933006282161785	-0.46444955548853706	-0.19683669985948837	-0.43058034074601226	-0.38474232747226544	-0.3651258426914382	-0.38179833255788775	-0.36497215175522246	-0.455120448053397	-0.6423577280404218	-0.27407098826438303	-0.3283992346506739	-0.3889819760334454	0.0129907246043	0.00668210963275	0.0932701621097	0.00139510136839	0.00146142948273	0.000354775949455	0.000481108176159	0.00816548763477	9.33325531828e-05	4.46777109943e-05	0.00423662678721	0.00480682187369	5.57041172022e-23	1	1	1	1	1	0.271048825384	0.355538942181	1	0.0721460636103	0.0350720031305	1	1	4.66800502155e-20	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr17:25416486..25416600,+__1877.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr17:25416486..25416600,+__1877.1.0.0	rs111504552,rs73258460	1.5202903379328976	1.7868967847101511	1.4593434894972943	1.2643297231894715	1.3738985864327817	1.341140786016485	1.655858232550756	2.3724904397898303	1.5982546759961807	1.5468383331820514	1.4077179097881205	1.496594607211232	1.568637825524771	1.249761932043787	1.4871840126995475	0.9676921945863028	0.8916944341432085	1.2442615594975823	0.9906031441197485	1.214974000434208	1.8400274697229637	1.1618991205628968	1.2993672649602064	1.1179192185970637	1.2975031669494754	1.2302406265264159	-0.27052840588911065	-0.29971277201060365	-0.49165129491099147	-0.372635289046263	-0.1296370269351994	-0.35053764189673653	-0.44088423211654804	-0.5324629700668666	-0.43635555543328386	-0.24747106822184506	-0.28979869119105683	-0.1990914402617565	-0.3383971989983552	0.0856734395523	0.0140036728837	0.0111573361887	0.0232568344756	0.0638899216795	0.00086866520518	0.0107365258413	0.000681115576796	0.00567496309713	0.0316863885398	0.0156538458129	0.0267271087754	1.07519182224e-14	1	1	1	1	1	0.174601706241	1	0.132817537475	1	1	1	1	2.44068543649e-12	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr18:11860124..11860238,+__1883.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr18:11860124..11860238,+__1883.1.0.0	rs7228231	0.19422978609150382	0.19788279789277424	0.405425432371921	0.0570813450095551	0.26981853244560733	0.2668136485560411	-0.20205348115675686	-0.0609511639005782	0.26826784065861337	0.3262073346038129	0.278829889084743	0.28276096741199286	0.19035941075576915	0.2524788598426099	0.3121525923533095	0.35542583987670007	0.23874710393414378	0.19847025172152183	0.3129546034843044	-0.24467405617124116	0.04299310219159813	0.48184565646751637	0.3042473662231173	0.2583985110239153	0.3284233285443424	0.23678859662431984	0.058249073751106106	0.11426979446053526	-0.04999959249522096	0.1816657589245887	-0.0713482807240855	0.046140954928263256	-0.042620575014484297	0.10394426609217633	0.213577815808903	-0.021959968380695583	-0.020431378060827676	0.04566236113234956	0.04642918586855069	0.747262025795	0.536806685117	0.572794651112	0.510582765025	0.326996172605	0.757455001208	0.747262025795	0.840380101088	0.226876581559	0.609889042629	0.861430881609	0.619326784864	0.863702784287	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr18:60903781..60903895,+__1885.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr18:60903781..60903895,+__1885.1.0.0	rs4987773	-0.9789831315310431	-1.2222363085335537	-1.4191291654917748	-1.4865248976443748	-1.510809447731025	-1.3869905930853856	-1.5090415750360657	-1.640073496465956	-1.7572329955407948	-1.6934012386953332	-1.7787807165342322	-1.4605809680783324	-1.4869820445306559	-1.1798744119158222	-1.2692552549608607	-1.415211778199817	-1.0943296137234029	-1.3983020116323117	-1.24720798069418	-1.4545546089620973	-0.9874274196513784	-1.8594459823782383	-1.5686563172031671	-0.9328216620266174	-1.4426678772288746	-1.3208129098813972	-0.2008912803847791	-0.047018946427306973	0.003917387291957786	0.3921952839209719	0.11250743609871328	0.1397826123912056	0.05448696607396841	0.6526460768145776	-0.10221298683744351	0.1247449214921661	0.8459590545076148	0.017913090849457802	0.16616913464925864	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr18:72695351..72695465,+__1886.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr18:72695351..72695465,+__1886.1.0.0	rs9963429	-1.0817509980751316	-1.23125172881735	-1.4381015849306036	-1.0839292686019262	-1.196475660805143	-1.1345875534225405	-1.4419251832665112	-1.3573257627587707	-1.1882406387225402	-1.3586623892027876	-1.0805530369737706	-1.2950215654937052	-1.2406521142558984	-1.3510841260054902	-1.3502170933394282	-1.296767462722757	-1.155989739775773	-1.4569853396112031	-1.251586771618431	-0.9895111980835284	-1.206557438529348	-1.1546021583926367	-1.5384284729657751	-1.1897293665891717	-1.3336836660076865	-1.2729285694701022	-0.2693331279303586	-0.11896536452207829	0.14133412220784658	-0.07206047117384684	-0.26050967880606013	-0.11699921819589054	0.4524139851829828	0.15076832422942266	0.033638480329903464	-0.17976608376298753	-0.10917632961540114	-0.038662100513981335	-0.032276455214204074	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr2:222826943..222827057,+__1890.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr2:222826943..222827057,+__1890.1.0.0	rs142598361	-1.5935520649650639	-1.6645451223359815	-1.6367686154973755	-1.414802069786235	-1.742832428707028	-1.7649841699308038	-2.042819524179733	-1.5808646986058594	-1.5954764382296955	-2.0507632735069072	-1.6978160484003144	-1.6232141403329496	-1.7007032162064952	-1.4537190074528734	-1.2774480151150425	-1.390650837180358	-1.1685365344226293	-1.5919883291490968	-1.5495393005280167	-1.397284766792509	-1.4933478478701827	-1.548043464892202	-1.629091752280975	-1.4207051884462327	-1.662668773117873	-1.465251984770666	0.13983305751219044	0.38709710722093904	0.24611777831701742	0.24626553536360563	0.1508440995579312	0.21544486940278706	0.6455347573872241	0.08751685073567672	0.047432973337493634	0.4216715212259323	0.2771108599540817	-0.03945463278492345	0.2354512314358297	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr20:45989631..45989745,+__1892.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr20:45989631..45989745,+__1892.1.0.0	rs6063101	-1.1870393553551564	-1.0422426536883442	-0.6848158046188836	-0.5122965707272602	-1.274477212271155	-1.0399983305474287	-1.095454242716439	-0.7826135097229759	-1.3417721967841068	-1.2201961836681083	-0.9780224868761492	-1.0062723595960004	-1.0137667422143337	-1.149668878058594	-0.5972164400109453	-1.2617506554701898	-1.2502126037059975	-1.0514750770329202	-0.787097131666682	-1.1520380017963343	-0.7134165216220323	-0.8424218514406551	-1.145956140759996	-0.7391053854205566	-1.0148597397004917	-0.9754348688904496	0.0373704772965624	0.4450262136773989	-0.5769348508513062	-0.7379160329787373	0.22300213523823476	0.2529011988807467	-0.05658375907989521	0.06919698810094366	0.4993503453434517	0.07424004290811226	0.23891710145559264	-0.008587380104491338	0.0383318733238844	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr20:45989631..45989745,+__1892.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr20:45989631..45989745,+__1892.1.0.0	rs6018425	-1.1870393553551564	-1.0422426536883442	-0.6848158046188836	-0.5122965707272602	-1.274477212271155	-1.0399983305474287	-1.095454242716439	-0.7826135097229759	-1.3417721967841068	-1.2201961836681083	-0.9780224868761492	-1.0062723595960004	-1.0137667422143337	-0.8148227476194296	-1.2116795391080541	-0.7504854630255128	-1.2601316950208337	-0.978543307835064	-1.3181466765520342	-1.7053259931856015	-1.2177259643800182	-1.02546866087668	-1.0090900164528922	-1.1300422708313596	-1.3984876657323035	-1.1516625000516487	0.37221660773572673	-0.16943688541970992	-0.0656696584066292	-0.7478351242935735	0.2959339044360909	-0.2781483460046055	-0.6098717504691624	-0.4351124546570423	0.31630353590742666	0.21110616721521613	-0.15201978395521032	-0.3922153061363032	-0.13789575783731467	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr20:45989631..45989745,+__1892.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr20:45989631..45989745,+__1892.1.0.0	rs6063101,rs6018425	-1.1870393553551564	-1.0422426536883442	-0.6848158046188836	-0.5122965707272602	-1.274477212271155	-1.0399983305474287	-1.095454242716439	-0.7826135097229759	-1.3417721967841068	-1.2201961836681083	-0.9780224868761492	-1.0062723595960004	-1.0137667422143337	-0.8372886745392516	-1.060960398230705	-1.1480349151574083	-0.8788008783444239	-1.1370823298751862	-0.8288634815938645	-0.8457999106607712	-1.239074081430639	-1.0296346867505357	-0.9104712873243788	-1.4615194374384193	-1.0529629858223322	-1.035874422263993	0.34975068081590477	-0.018717744542360748	-0.4632191105385247	-0.3665043076171637	0.13739488239596875	0.21113484895356427	0.2496543320556679	-0.45646057170766297	0.31213751003357104	0.30972489634372957	-0.48349695056227004	-0.0466906262263318	-0.022107680049658972	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr22:39350183..39350297,+__1897.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr22:39350183..39350297,+__1897.1.0.0	rs17370615	-0.10123080752710675	-0.1223957567049688	0.24876868204184316	0.19584571547321716	0.1615041886613111	0.21312217724692092	0.28887137112931555	0.37113594671573114	0.18644476494648018	0.46971874063485486	0.30138924800126776	0.31741993845038863	0.21088285075577126	-0.23220692145460964	-0.25072061022410314	-0.049284036541416436	-0.18481418519222204	-0.06504528717924542	-0.16968248976740227	0.4246793440122347	0.17218901565507225	0.08814390512906686	0.024311842846260267	0.09316806938306173	-0.14102867459722815	-0.024190835660877597	-0.13097611392750289	-0.12832485351913434	-0.2980527185832596	-0.3806599006654392	-0.2265494758405565	-0.3828046670143232	0.13580797288291918	-0.1989469310606589	-0.09830085981741332	-0.4454068977885946	-0.20822117861820605	-0.45844861304761675	-0.23507368641664886	0.288805731951	0.301187193336	0.0763307839553	0.0785847853765	0.216719559135	0.510582765025	0.788281320858	0.30750859871	0.405136064622	0.00641629102443	0.340423946445	0.0932701621097	0.00534549886408	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr22:50978212..50978326,+__1898.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr22:50978212..50978326,+__1898.1.0.0	rs5770871	1.1155305197681915	1.2309818739894758	0.7754952761215148	0.6216135924054929	0.9143687610202464	1.1267338692818865	0.8210134433202028	1.010487277123303	0.9443595290925306	1.0965994239308614	1.1413534283532751	1.220856847311254	1.0016161534765196	1.4078702971742127	1.7181949177779399	1.4149934661695105	1.3363324344537153	1.4249006457421793	1.3394535491587058	1.3000626559517054	1.4981634691478267	1.5085108944715766	1.4813027372564438	1.687440225906229	1.6270519074888323	1.4786897667249062	0.29233977740602124	0.4872130437884641	0.6394981900479957	0.7147188420482224	0.5105318847219329	0.2127196798768194	0.4790492126315027	0.4876761920245236	0.564151365379046	0.3847033133255824	0.546086797552954	0.40619506017757834	0.4770736132483869	0.00287470049861	0.0010031111026	0.000956291509096	0.00849533044186	1.63168639115e-05	0.0531733827136	0.000956291509096	0.00501178746069	0.000648445766563	0.0698833862508	0.000587432962331	0.0129907246043	9.26813159929e-22	1	0.746314660336	0.712437174277	1	0.0125966189397	1	0.706699425222	1	0.501248577553	1	0.451735948032	1	7.7666942802e-19	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr22:50978212..50978326,+__1898.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr22:50978212..50978326,+__1898.1.0.0	rs116110924	1.1155305197681915	1.2309818739894758	0.7754952761215148	0.6216135924054929	0.9143687610202464	1.1267338692818865	0.8210134433202028	1.010487277123303	0.9443595290925306	1.0965994239308614	1.1413534283532751	1.220856847311254	1.0016161534765196	0.8632278463205695	0.9763684264063579	0.7154435581968182	0.5413578691104297	0.7665262183813821	0.8710888918618839	0.708249243456469	0.857195982817258	1.0031159215096157	0.950550490495423	0.9785864654302706	0.9793697224292992	0.8509233863679814	-0.25230267344762203	-0.2546134475831179	-0.06005171792469666	-0.08025572329506314	-0.14784254263886432	-0.2556449774200026	-0.11276419986373376	-0.15329129430604516	0.05875639241708508	-0.14604893343543845	-0.16276696292300452	-0.24148712488195478	-0.15069276710853818	0.63839046467	0.340423946445	0.757455001208	0.63839046467	0.563691144959	0.107123399254	0.436112310787	0.0808926541269	0.581967350665	0.150801701171	0.545696106059	0.0986283746992	0.146210474293	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr22:50978212..50978326,+__1898.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr22:50978212..50978326,+__1898.1.0.0	rs5770871,rs116110924	1.1155305197681915	1.2309818739894758	0.7754952761215148	0.6216135924054929	0.9143687610202464	1.1267338692818865	0.8210134433202028	1.010487277123303	0.9443595290925306	1.0965994239308614	1.1413534283532751	1.220856847311254	1.0016161534765196	1.4889083526376403	1.7584963978187882	1.323765568295227	1.3059492606362721	1.4439987915127706	1.3044121628099925	1.3734966345528061	1.5471318586224143	1.5913126470923742	1.7341531648551134	1.6439767681777662	1.6451370250670108	1.513394886006515	0.3733778328694488	0.5275145238293124	0.5482702921737121	0.6843356682307793	0.5296300304925241	0.17767829352810605	0.5524831912326034	0.5366445814991112	0.6469531179998436	0.637553740924252	0.502623339824491	0.42428017775575677	0.5117787325299951	3.97876883146e-05	0.000116396943443	0.000260017581797	3.85703616239e-06	6.43635880739e-06	0.0129907246043	0.000137117000352	0.000129852144011	1.35890743059e-05	0.00023411339895	0.000170183141363	0.000648445766563	3.57675481344e-37	0.00771881153304	0.0235121825755	0.0517434987777	0.000728979834692	0.00131945355551	1	0.0274234000704	0.0253211680821	0.00279934930701	0.0486955869816	0.0348875439794	0.133579827912	8.11923342652e-35	sig	sig	not sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr3:124553965..124554079,+__1899.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr3:124553965..124554079,+__1899.1.0.0	rs112075131	-0.22421890991429677	-0.10858665248170024	-0.16047627158312106	-0.34459089454524894	-0.47129693264008043	-0.07563476230296662	-0.48883661622279106	-0.13715190373849664	-0.5848323150474822	-0.2239036949912497	-0.32889400097866983	-0.44478162268840843	-0.29943371476120934	-0.0008212112806054623	-0.013023169865560687	0.1656676885832085	-0.029337786845148688	-0.1869213761096425	0.145155747310076	-0.07052952039277346	-0.16618558057463811	-0.0883893478560742	0.039561692401408236	-0.08442630161861131	0.05048745921018808	-0.019896808919847804	0.2233976986336913	0.09556348261613956	0.3261439601663295	0.31525310770010023	0.28437555653043795	0.2207905096130426	0.4183070958300176	-0.02903367683614147	0.496442967191408	0.26346538739265796	0.24446769936005852	0.49526908189859653	0.27953690584136154	0.452098798395	0.195066735841	0.452098798395	0.125844655769	0.288805731951	0.101398170673	0.175053819161	0.777966336216	0.0601351299193	0.253741740693	0.276771967065	0.188220673538	0.0109569660458	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr3:194298972..194299086,+__1900.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr3:194298972..194299086,+__1900.1.0.0	rs79537050	-0.4857885072149988	-0.4254641693570238	-0.6582288616923095	-0.49729875607818075	-0.43661890694574684	-0.2674656537526202	-0.7753895087110093	-0.35687277935179096	-0.6358295546952124	-0.615381983797285	-0.41594446844591426	-0.6038725982765474	-0.5145129790265532	-1.0164545812144021	-1.157387847238435	-1.2457271408293158	-0.823524694263871	-1.0267884366602675	-1.0815819403649996	-1.169402986716236	-0.9809363847284764	-0.8947951679479389	-0.9435734317641793	-1.0083672399251156	-0.9318365823250729	-1.0233647028315256	-0.5306660739994034	-0.7319236778814111	-0.5874982791370063	-0.32622593818569023	-0.5901695297145206	-0.8141162866123793	-0.3940134780052268	-0.6240636053766855	-0.2589656132527265	-0.32819144796689426	-0.5924227714792013	-0.32796398404852556	-0.5088517238049726	0.00480682187369	0.00501178746069	0.0145358169752	0.162586850726	0.00210630874131	0.000457487620218	NA__no_active_tile	0.00522462344006	0.0103298859694	0.0338805621681	0.0286240283844	0.0484054419273	4.04536639247e-14	1	1	1	1	1	0.349520541846	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	3.39001703689e-11	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769808..185769922,+__1904.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769808..185769922,+__1904.1.0.0	rs4862429	-1.0389575213921676	-1.1151917788097347	-1.5772042431365545	-1.4031012811342773	-1.5041288498465666	-1.287541268684773	-1.8054319915419983	-1.2046686238244981	-1.2753654513084836	-1.369667872296941	-1.3815020468111094	-1.3390975153251783	-1.3584882036760233	-1.2971400155495816	-1.2543962387429963	-1.2349323437586641	-1.3220804480049753	-1.3099749335881774	-1.4019336800600186	-1.1606612864914088	-1.0654560355311284	-1.2094575408793842	-1.2948271228507495	-1.2175030600269448	-1.3342339623165516	-1.258549722316715	-0.258182494157414	-0.13920445993326158	0.3422718993778904	0.08102083312930208	0.19415391625838918	-0.1143924113752457	0.6447707050505895	0.1392125882933697	0.06590791042909938	0.07484074944619157	0.1639989867841647	0.004863553008626731	0.0999384813593085	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769808..185769922,+__1904.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769808..185769922,+__1904.1.0.0	rs28711909	-1.0389575213921676	-1.1151917788097347	-1.5772042431365545	-1.4031012811342773	-1.5041288498465666	-1.287541268684773	-1.8054319915419983	-1.2046686238244981	-1.2753654513084836	-1.369667872296941	-1.3815020468111094	-1.3390975153251783	-1.3584882036760233	-1.3542407699833734	-1.7444478833087915	-1.6863696496440146	-1.7059944675042282	-1.7642252135077832	-1.5157519437350764	-1.5922519426371515	-1.4143963376305089	-1.6223145180083365	-1.5859631291061953	-1.3663857086462796	-1.6901286311786667	-1.5868725162408672	-0.3152832485912058	-0.6292561044990568	-0.1091654065074601	-0.3028931863699509	-0.2600963636612166	-0.22821067505030346	0.21318004890484676	-0.20972771380601074	-0.3469490666998529	-0.2162952568092542	0.015116338164829823	-0.35103111585348845	-0.2283843125648436	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769808..185769922,+__1904.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769808..185769922,+__1904.1.0.0	rs4862430	-1.0389575213921676	-1.1151917788097347	-1.5772042431365545	-1.4031012811342773	-1.5041288498465666	-1.287541268684773	-1.8054319915419983	-1.2046686238244981	-1.2753654513084836	-1.369667872296941	-1.3815020468111094	-1.3390975153251783	-1.3584882036760233	-1.407223540756028	-1.4615565973831846	-1.3783500169818148	-1.627342564920366	-1.5703417870010399	-1.41027853733425	-1.189542754177767	-1.284819915396556	-1.3997480633212218	-1.334003262762003	-1.3191716139122611	-1.3298023874845053	-1.3926817534525833	-0.3682660193638605	-0.3463648185734498	0.1988542261547397	-0.22424128378608876	-0.0662129371544733	-0.12273726864947698	0.6158892373642313	-0.08015129157205791	-0.12438261201273826	0.035664609534938	0.06233043289884832	0.00929512784067299	-0.034193549776559605	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769808..185769922,+__1904.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769808..185769922,+__1904.1.0.0	rs4862429,rs28711909,rs4862430	-1.0389575213921676	-1.1151917788097347	-1.5772042431365545	-1.4031012811342773	-1.5041288498465666	-1.287541268684773	-1.8054319915419983	-1.2046686238244981	-1.2753654513084836	-1.369667872296941	-1.3815020468111094	-1.3390975153251783	-1.3584882036760233	-1.7638261430566584	-1.5157971385433542	-1.4311457853265512	-1.7285280489170336	-1.8982991237379854	-1.7765465456445386	-1.4362728282132615	-1.2688909447702124	-1.7017992449721833	-1.762624281745531	-1.7742134747903238	-1.2697366725203636	-1.6106400193531663	-0.7248686216644908	-0.40060535973361944	0.14605845781000326	-0.32542676778275625	-0.3941702738914188	-0.4890052769597657	0.3691591633287368	-0.06422232094571423	-0.4264337936636997	-0.39295640944859	-0.3927114279792143	0.06936084280481469	-0.2521518156771429	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr4:2803065..2803179,+__1905.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr4:2803065..2803179,+__1905.1.0.0	rs13146103	-1.2241618633527276	-1.4953353337205446	-1.262516131406124	-1.159892827111871	-1.560698923211561	-1.5903084948855148	-1.6190486854814994	-1.6678494603955714	-1.3054102455034435	-1.313433775568912	-1.2706946999484714	-1.0630691885615746	-1.3777016357623177	-1.3765423838033946	-1.1764558959410651	-0.8858298013390205	-1.222071398288341	-1.1055523322337732	-1.3082541050484977	-1.2585706776870365	-1.0993673976825504	-1.3422844505213276	-1.2476902584168406	-1.301402642589708	-0.8817736507561516	-1.1838162495256421	-0.15238052045066697	0.31887943777947947	0.3766863300671035	-0.06217857117647019	0.45514659097778765	0.28205438983701714	0.36047800779446293	0.5684820627130209	-0.036874205017884076	0.0657435171520715	-0.030707942641236663	0.18129553780542307	0.1938853862366757	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr5:131832669..131832783,+__1907.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr5:131832669..131832783,+__1907.1.0.0	rs2706386	1.0459646366961906	1.3844858440343697	1.38699038554559	1.0947374419844889	1.233520982255517	1.3095294100306927	1.5096591416960905	1.562767559501283	1.4639097718870913	1.4117316830315394	1.3734209106506494	1.3890283977353026	1.3471455137540673	0.9367879851837677	1.1263964313722843	1.171704976547544	1.0881109661418313	0.9828840221683077	1.221112096093269	1.266134423495748	1.577015765909361	1.2867449508676585	1.1841361527707988	1.0950068484067996	1.144056435978372	1.1733409212446453	-0.10917665151242284	-0.2580894126620854	-0.21528540899804605	-0.00662647584265752	-0.25063696008720937	-0.08841731393742358	-0.2435247182003426	0.014248206408078001	-0.17716482101943276	-0.22759553026074064	-0.2784140622438498	-0.2449719617569306	-0.17380459250942193	0.216719559135	0.179364149792	0.0785847853765	0.628827692687	0.0232568344756	0.13967914143	0.088148079887	0.30750859871	0.0468981580933	0.0374147936077	0.0103298859694	0.0258200569765	4.19715833224e-06	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.00351721868242	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr5:135309235..135309349,+__1909.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr5:135309235..135309349,+__1909.1.0.0	rs2520434	0.29238426594349176	0.546097318823362	0.2239401809984253	0.2756678474628621	0.423380206899595	0.5237422380108345	0.6318470997035758	0.5907829090407917	0.458170849731358	0.4797845738874592	0.5316782426307535	0.3989100988985493	0.44803215266925484	-0.8261742841151483	-0.6541186732586386	-0.8241772450667473	-0.6061377627947679	-0.782359096401326	-0.4364532684600297	-0.38271971605631944	-0.549434501126866	-0.5022633228277834	-0.8341609288303098	-0.604139671975976	-0.6316187034177891	-0.6361464311943085	-1.1185585500586401	-1.2002159920820006	-1.0481174260651727	-0.88180561025763	-1.205739303300921	-0.9601955064708643	-1.0145668157598953	-1.1402174101676577	-0.9604341725591414	-1.313945502717769	-1.1358179146067293	-1.0305288023163384	-1.0841785838635631	5.31875791367e-06	7.77665488063e-06	4.46777109943e-05	0.000827700533168	1.5208503355e-07	2.03284743013e-07	9.98335414644e-06	7.24718602024e-07	2.48534577241e-05	1.31407978866e-07	3.61506667287e-06	0.000179550689913	7.71718700558e-52	0.00376568060288	0.00578583123119	0.0332848946908	0.610015292945	0.000117409645901	0.000155309543662	0.00737769871422	0.000526870423672	0.0192117228208	0.00010315526341	0.00277998627144	0.139869987442	6.46700271067e-49	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521821..47521935,+__1916.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521821..47521935,+__1916.1.0.0	rs2941540	-1.2581834125691969	-0.782906924096537	-0.7769132900976644	-1.0160688693014084	-0.8342092489167221	-0.9814998497538345	-0.7759223430231317	-0.8268189344490731	-0.9149088478776386	-0.8720234457140652	-0.9853715425223248	-0.8039625824318184	-0.9023991075627845	-1.1714498338919583	-1.3723173965220723	-1.3379125758073949	-1.1941334975511797	-1.35088991751015	-1.2787758540725678	-1.284144119346836	-1.239672494361396	-1.2080940611589863	-1.3236296343708944	-1.2996712562810224	-1.1401047743988804	-1.2667329512727783	0.08673357867723852	-0.5894104724255353	-0.5609992857097305	-0.17806462824977132	-0.516680668593428	-0.29727600431873324	-0.5082217763237042	-0.41285355991232286	-0.2931852132813477	-0.4516061886568292	-0.3142997137586976	-0.33614219196706197	-0.3643338437099935	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0698833862508	0.0698833862508	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521821..47521935,+__1916.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521821..47521935,+__1916.1.0.0	rs28428869	-1.2581834125691969	-0.782906924096537	-0.7769132900976644	-1.0160688693014084	-0.8342092489167221	-0.9814998497538345	-0.7759223430231317	-0.8268189344490731	-0.9149088478776386	-0.8720234457140652	-0.9853715425223248	-0.8039625824318184	-0.9023991075627845	-1.2931091089470124	-1.2377344019707692	-1.3874977231321786	-1.259737129322968	-1.2931571493957812	-1.3851167916176355	-1.511944300201075	-1.1922679004296313	-1.1464353611640707	-1.5098788478158167	-1.4348553721827195	-1.133165362322364	-1.3154082873751685	-0.03492569637781551	-0.4548274778742323	-0.6105844330345142	-0.2436682600215596	-0.4589479004790591	-0.4036169418638009	-0.7360219571779434	-0.3654489659805582	-0.23152651328643215	-0.6378554021017515	-0.4494838296603947	-0.3292027798905457	-0.4130091798123839	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0362033618716	0.0362033618716	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521821..47521935,+__1916.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521821..47521935,+__1916.1.0.0	rs116659474	-1.2581834125691969	-0.782906924096537	-0.7769132900976644	-1.0160688693014084	-0.8342092489167221	-0.9814998497538345	-0.7759223430231317	-0.8268189344490731	-0.9149088478776386	-0.8720234457140652	-0.9853715425223248	-0.8039625824318184	-0.9023991075627845	-1.6368680197794707	-1.253951176665156	-1.3262249319566703	-1.296599879399905	-1.4565658424588053	-1.3602936790102378	-1.3359502239201848	-1.4184853232863892	-1.4117688993542399	-1.4382695618636419	-1.281264034406497	-1.3942954399530814	-1.38421141767119	-0.37868460721027386	-0.47104425256861915	-0.5493116418590059	-0.28053101009849657	-0.6223565935420832	-0.37879382925640326	-0.5600278808970531	-0.5916663888373161	-0.4968600514766013	-0.5662461161495767	-0.2958924918841721	-0.590332857521263	-0.48181231010840536	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0129907246043	0.0129907246043	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521821..47521935,+__1916.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521821..47521935,+__1916.1.0.0	rs2964954	-1.2581834125691969	-0.782906924096537	-0.7769132900976644	-1.0160688693014084	-0.8342092489167221	-0.9814998497538345	-0.7759223430231317	-0.8268189344490731	-0.9149088478776386	-0.8720234457140652	-0.9853715425223248	-0.8039625824318184	-0.9023991075627845	-1.081554914215383	-0.9444704065438466	-1.3741797915053273	-1.1587051501221095	-1.1527146251974805	-1.0637910586760966	-0.9320556147795602	-0.9089340555966932	-0.7924710892986517	-1.0990268386902518	-1.0228369741606724	-0.8219130097382106	-1.0293877940436902	0.17662849835381378	-0.16156348244730967	-0.5972665014076629	-0.14263628082070112	-0.31850537628075837	-0.08229120892226205	-0.15613327175642855	-0.0821151211476201	0.12243775857898687	-0.22700339297618655	-0.03746543163834759	-0.01795042730639218	-0.1269886864809057	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.282745459933	0.282745459933	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521821..47521935,+__1916.1.5.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521821..47521935,+__1916.1.0.0	rs2964955	-1.2581834125691969	-0.782906924096537	-0.7769132900976644	-1.0160688693014084	-0.8342092489167221	-0.9814998497538345	-0.7759223430231317	-0.8268189344490731	-0.9149088478776386	-0.8720234457140652	-0.9853715425223248	-0.8039625824318184	-0.9023991075627845	-0.9874943124241808	-0.7286812690616972	-0.7599190891614418	-0.7598684341015235	-0.9212800162885487	-1.1562447775678648	-1.0786720984879734	-0.9552734873650389	-0.765836481773553	-0.9740490949940697	-0.8251098274095221	-0.95077508230393	-0.9052669975782788	0.270689100145016	0.05422565503483978	0.016994200936222614	0.2562004351998849	-0.08707076737182662	-0.17474492781403028	-0.30274975546484173	-0.12845455291596586	0.14907236610408559	-0.10202564928000446	0.16026171511280274	-0.14681249987211165	-0.002867890015494081	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.206893929435	0.609889042629	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.63839046467	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.288805731951	0.355517414326	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521821..47521935,+__1916.1.5.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521821..47521935,+__1916.1.0.0	rs2941540,rs28428869,rs116659474,rs2964954,rs2964955	-1.2581834125691969	-0.782906924096537	-0.7769132900976644	-1.0160688693014084	-0.8342092489167221	-0.9814998497538345	-0.7759223430231317	-0.8268189344490731	-0.9149088478776386	-0.8720234457140652	-0.9853715425223248	-0.8039625824318184	-0.9023991075627845	-1.2228200693516704	-1.22365809856464	-1.2176809757788178	-1.4815554588193671	-1.4773191427352699	-1.4364111767190337	-1.3152203427922124	-1.1789438884669243	-1.1005341871300618	-1.6416641132311818	-1.3293529083744364	-1.5263059232786786	-1.345955523770191	0.03536334321752643	-0.44075117446810297	-0.44076768568115343	-0.46548658951795874	-0.6431098938185478	-0.4549113269651992	-0.5392979997690808	-0.35212495401785127	-0.1856253392524232	-0.7696406675171166	-0.3439813658521116	-0.7223433408468602	-0.4435564162074066	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	9.33325531828e-05	9.33325531828e-05	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0192265059557	0.0211864895725	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr8:145026364..145026478,+__1918.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr8:145026364..145026478,+__1918.1.0.0	rs554799884	0.5651469543318324	0.7640382926767211	0.9010278382335533	0.6032953358361064	0.7181067673853452	0.6766206666552863	0.8552602602668068	1.0015361382874748	0.9191977649945419	0.8534495460932653	0.9603919518002613	0.8107710219008928	0.8024035448718406	1.0400479995679843	1.172382677024371	1.1208257744109023	1.082976721015179	1.0890664767931946	1.17712978899544	1.1391197033168412	1.249344705846989	1.3019982688224507	1.2819153316167322	1.225407588074055	1.3394927015001046	1.1849756447486868	0.47490104523615195	0.40834438434764997	0.219797936177349	0.47968138517907266	0.3709597094078494	0.5005091223401537	0.2838594430500344	0.2478085675595143	0.38280050382790887	0.4284657855234669	0.26501563627379365	0.5287216795992118	0.3825720998768463	0.00275115621019	0.0619890035232	0.162586850726	0.00240905380364	0.000392957862114	2.96882111052e-05	0.0181189115857	0.0072436377838	0.000104264461287	2.79850783474e-05	0.00441948685714	0.000617238254542	1.44802726844e-22	1	1	1	1	0.303363469552	0.0226817932844	1	1	0.0805964285749	0.0219682865027	1	0.480828600288	1.21344685096e-19	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr8:145026364..145026478,+__1918.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr8:145026364..145026478,+__1918.1.0.0	rs11778018	0.5651469543318324	0.7640382926767211	0.9010278382335533	0.6032953358361064	0.7181067673853452	0.6766206666552863	0.8552602602668068	1.0015361382874748	0.9191977649945419	0.8534495460932653	0.9603919518002613	0.8107710219008928	0.8024035448718406	0.353994282220806	0.7618584117967467	0.6031367984112237	0.5736491480618512	0.6627736298073972	0.6345002035104648	0.6863915850289747	0.8168577623099527	0.7252330002323607	0.7239544343894566	0.6902657623818118	0.7166214044795087	0.6624363685525463	-0.2111526721110264	-0.0021798808799743385	-0.29789103982232956	-0.029646187774255206	-0.055333137577948	-0.04212046314482154	-0.1688686752378321	-0.18467837597752212	-0.19396476476218116	-0.12949511170380867	-0.27012618941844946	-0.09414961742138406	-0.1399671763192944	0.0719809426143	0.30750859871	0.0209174885683	0.493479697885	0.706946403854	0.657696241675	0.313917214294	0.282745459933	0.265084565602	0.420456664513	0.0832552515755	0.282745459933	0.0230177581785	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr8:145026364..145026478,+__1918.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr8:145026364..145026478,+__1918.1.0.0	rs554799884,rs11778018	0.5651469543318324	0.7640382926767211	0.9010278382335533	0.6032953358361064	0.7181067673853452	0.6766206666552863	0.8552602602668068	1.0015361382874748	0.9191977649945419	0.8534495460932653	0.9603919518002613	0.8107710219008928	0.8024035448718406	0.9628266651422842	1.059431254103701	1.0419876466386975	0.8952731831546503	1.122368440429928	1.1223199197849185	0.947615891160106	1.194464197268172	1.0937609774212351	1.097498569368799	1.0663128419860584	1.1162868258650083	1.0600122010269633	0.39767971081045184	0.2953929614269799	0.14095980840514422	0.2919778473185439	0.4042616730445827	0.4456992531296322	0.09235563089329923	0.1929280589806972	0.17456321242669326	0.2440490232755338	0.10592089018579709	0.3055158039641155	0.2576086561551226	0.00522462344006	0.183752894264	0.66743649171	0.21176555971	0.00153065306427	0.000354775949455	0.253741740693	0.116187990183	0.0316863885398	0.0140036728837	0.270885072145	0.00695778717972	1.59995089303e-08	1	1	1	1	0.313783878175	0.0713099658405	1	1	1	1	1	1	3.63188852717e-06	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr9:140024178..140024292,+__1924.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr9:140024178..140024292,+__1924.1.0.0	rs114500218	0.6334777648860174	0.7448341874509831	0.8957653985729231	0.6008217537277213	0.9369119750080842	0.8135421463411419	0.9102563380961329	1.018889250340471	1.1988896728992606	0.9151980131237925	0.9000608724704264	1.0680774748640525	0.886393737315084	0.4000351448796904	0.6865306149728718	0.5682226286504078	0.7316885989371864	0.7253961890810728	0.8124834696165132	1.0626276952511668	0.7111233287370466	1.0851870021110517	1.1755323747454691	0.7870486841131905	0.9052142722270387	0.804257500276892	-0.23344262000632698	-0.05830357247811124	-0.3275427699225153	0.13086684520946512	-0.21151578592701137	-0.001058676724628671	0.15237135715503392	-0.3077659216034243	-0.11370267078820895	0.26033436162167667	-0.11301218835723592	-0.16286320263701382	-0.08213623703819174	0.188220673538	0.361212608085	0.154655491485	0.840380101088	0.0730423337339	0.727009731456	0.76769033028	0.232080506959	0.390154148302	0.436112310787	0.232080506959	0.737113058664	0.222303246809	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr9:140024178..140024292,+__1924.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr9:140024178..140024292,+__1924.1.0.0	rs73569567	0.6334777648860174	0.7448341874509831	0.8957653985729231	0.6008217537277213	0.9369119750080842	0.8135421463411419	0.9102563380961329	1.018889250340471	1.1988896728992606	0.9151980131237925	0.9000608724704264	1.0680774748640525	0.886393737315084	0.35809526715442297	0.9109785346683625	0.7054921456653183	0.5578610018586656	0.655863177849543	0.7581054060434282	0.661772826138933	1.030438056375833	0.7493215863255379	1.0047643857358177	1.0319793146181244	1.0594173737742625	0.7903407563506875	-0.2753824977315944	0.16614434721737947	-0.19027325290760488	-0.04296075186905568	-0.28104879715854125	-0.055436740297713616	-0.24848351195719998	0.011548806035362125	-0.4495680865737227	0.08956637261202527	0.131918442147698	-0.008660101089789984	-0.09605298096439648	0.0574378409847	0.840378298479	0.501992688725	0.493479697885	0.129194552482	0.819442862795	0.30750859871	0.809021331888	0.197395731844	0.90381429355	0.978575937473	0.60051573606	0.746170728041	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr9:140024178..140024292,+__1924.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr9:140024178..140024292,+__1924.1.0.0	rs114500218,rs73569567	0.6334777648860174	0.7448341874509831	0.8957653985729231	0.6008217537277213	0.9369119750080842	0.8135421463411419	0.9102563380961329	1.018889250340471	1.1988896728992606	0.9151980131237925	0.9000608724704264	1.0680774748640525	0.886393737315084	0.2675577438167755	0.3975284371114091	0.3877407302095792	0.19479906466473093	0.3739344911077639	0.732856139465443	0.49484089147306254	0.48106684956164614	0.9400027357419236	0.7333567189187016	0.7550057705926664	0.7654537780579815	0.5436786125601404	-0.3659200210692419	-0.34730575033957395	-0.5080246683633439	-0.4060226890629903	-0.5629774839003203	-0.08068600687569882	-0.4154154466230704	-0.5378224007788248	-0.258886937157337	-0.18184129420509088	-0.14505510187776005	-0.30262369680607093	-0.3427151247549436	0.188220673538	0.016239497389	0.0374147936077	0.716953652062	0.000336960528981	0.577368064655	0.0129907246043	0.0240855495486	0.405136064622	0.154655491485	0.175053819161	0.232080506959	1.31481729625e-05	1	1	1	1	0.0690769084411	1	1	1	1	1	1	1	0.00298463526249	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:16508562..16508676,+__1930.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:16508562..16508676,+__1930.1.0.0	rs12723168	-0.8868626750003821	-0.7669081827564521	-0.9394269627046198	-0.8329950349111711	-0.8332334773330627	-0.5984746657405463	-0.6561393775362231	-0.5060649296845431	-0.44456764109557023	-0.8225499991037023	-0.6637479440551783	-0.6240840643603439	-0.7145879128568163	-0.7144675121569529	-0.5367006497762237	-0.6875414075131216	-0.7413345525591726	-0.9602406358253742	-0.46765384775586893	-0.6612807917618726	-0.479931483202832	-0.5032399346658336	-0.4302940959958401	-0.5890178682171096	-0.5087147827153644	-0.6067014635121306	0.17239516284342915	0.23020753298022845	0.25188555519149813	0.09166048235199853	-0.12700715849231148	0.13082081798467737	-0.00514141422564951	0.026133446481711065	-0.05867229357026338	0.3922559031078622	0.07473007583806879	0.1153692816449795	0.10788644934468576	NA__no_active_tile	0.412754243182	0.412754243182	0.501992688725	0.925117039075	0.333666485083	0.554657938956	0.788281320858	0.989287003123	0.259370210024	0.79863356553	0.333666485083	0.859432233204	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:228962833..228962947,+__1931.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:228962833..228962947,+__1931.1.0.0	rs6695176	-1.8500732459015286	-1.571640538964269	-1.336983521831709	-1.610875527508147	-1.6292039715752975	-1.5861573379825042	-1.3724460657062671	-1.367635914016384	-1.677348671206234	-1.4028865069918366	-1.569083830132112	-1.3989390024538588	-1.5311061778558457	-1.8250471984498775	-1.7598910489548514	-1.7412648515965503	-1.8490715830799052	-2.1599029377112355	-1.9831139804008082	-1.9521242355003887	-1.6904039899990657	-1.8010489783618153	-1.8352541947189172	-1.6914226008274014	-1.5664481988687848	-1.8212494832058	0.025026047451651046	-0.18825050999058246	-0.4042813297648413	-0.23819605557175816	-0.530698966135938	-0.396956642418304	-0.5796781697941216	-0.32276807598268165	-0.12370030715558133	-0.43236768772708056	-0.12233877069528942	-0.167509196414926	-0.2901433053499544	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:2478447..2478561,+__1932.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:2478447..2478561,+__1932.1.0.0	rs2477678	0.5172738961640957	0.932934936203732	0.2881285117180444	0.9443159638155161	0.8235104501575736	0.4964101348997654	0.5046104765630962	0.8392567638902142	0.4132770305338883	0.6398126395021143	0.6143746435939209	0.8232154624356391	0.6530934091231334	0.5037578367554746	0.7562566554892901	0.2283365156071836	0.37315650207826134	0.9720640142741788	1.0613349506541914	0.7627152763726092	0.5361999755489845	0.8149449148773955	0.56629920408332	0.6647495101571017	0.5690522439344537	0.6507389666527038	-0.013516059408621106	-0.17667828071444192	-0.05979199611086078	-0.5711594617372547	0.14855356411660514	0.564924815754426	0.25810479980951295	-0.30305678834122973	0.4016678843435072	-0.07351343541879429	0.0503748665631808	-0.2541632185011854	-0.002354442470429652	0.687084607526	0.514901630041	0.989287003123	0.581967350665	0.788281320858	0.476688253492	0.397602565759	1.0	0.595849425807	0.572794651112	0.452098798395	0.554653407081	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:25051126..25051240,+__1933.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:25051126..25051240,+__1933.1.0.0	rs1002706	1.191496721538115	1.438665191086216	1.1229412340053284	1.1179106925447926	1.1771402731467746	1.232337525681101	1.2914321459943623	1.3825401334530096	1.3791908835554234	1.3081281171013135	1.33617363867763	1.3540555737635565	1.2776676775456355	1.1095947773854142	1.4167544338714437	1.2355879237019691	1.0633475436685669	1.1663889217647214	1.2543309990048457	1.1083681167048232	1.2270362636894188	1.2829677252080982	1.3190083140332973	1.3288952423315257	1.271548721910922	1.231985748606254	-0.08190194415270069	-0.021910757214772314	0.11264668969664071	-0.05456314887622571	-0.010751351382053187	0.021993473323744572	-0.18306402928953913	-0.15550386976359087	-0.0962231583473252	0.010880196931983832	-0.007278396346104277	-0.0825068518526344	-0.04568192893938139	0.747262025795	0.861430881609	0.66743649171	0.619326784864	0.757455001208	0.925117039075	0.628827692687	0.301187193336	0.925117039075	0.657696241675	0.989287003123	0.628827692687	0.994950686751	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:25051126..25051240,+__1933.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:25051126..25051240,+__1933.1.0.0	rs1316829	1.191496721538115	1.438665191086216	1.1229412340053284	1.1179106925447926	1.1771402731467746	1.232337525681101	1.2914321459943623	1.3825401334530096	1.3791908835554234	1.3081281171013135	1.33617363867763	1.3540555737635565	1.2776676775456355	0.7913027391740581	1.1696754814448265	0.8294861317174196	0.7998671479940438	1.0922995517762517	0.8852852429118665	0.9929154781716102	1.2354626782939597	1.0872878898125387	1.0714240224992984	1.0644064280758634	1.1138261787378907	1.0111032475508024	-0.4001939823640568	-0.2689897096413896	-0.29345510228790883	-0.3180435445507488	-0.0848407213705229	-0.3470522827692346	-0.2985166678227521	-0.1470774551590499	-0.29190299374288475	-0.23670409460201514	-0.27176721060176656	-0.24022939502566576	-0.26656442999483293	0.0249397487324	0.00816548763477	0.0350255264852	0.0232568344756	0.147021540231	0.00372847011721	0.0338805621681	0.0601351299193	0.104229562843	0.0499532058383	0.0267271087754	0.0134887989876	5.89087813205e-11	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	4.93655587466e-08	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr1:25051126..25051240,+__1933.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:25051126..25051240,+__1933.1.0.0	rs1002706,rs1316829	1.191496721538115	1.438665191086216	1.1229412340053284	1.1179106925447926	1.1771402731467746	1.232337525681101	1.2914321459943623	1.3825401334530096	1.3791908835554234	1.3081281171013135	1.33617363867763	1.3540555737635565	1.2776676775456355	0.9618182017681081	1.099299385388239	0.933142451447398	0.7600863824376083	1.0308137655549028	1.0600859729822214	1.0641142907124546	1.2809178547181017	1.0666599280587863	1.2560704537784741	1.0070794800062615	1.0265013339531373	1.0455491250671411	-0.22967851977000686	-0.33936580569797714	-0.18979878255793037	-0.3578243101071843	-0.14632650759187182	-0.1722515526988797	-0.22731785528190773	-0.10162227873490792	-0.3125309554966371	-0.05205766332283934	-0.3290941586713685	-0.3275542398104192	-0.23211855247849414	0.0484054419273	0.0362033618716	0.0583274625199	0.0125089884503	0.0741297894045	0.0201846528804	0.0565651674203	0.253741740693	0.0267271087754	0.0619890035232	0.0134887989876	0.000911503005752	1.53029040577e-10	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.187769619185	3.47375922111e-08	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:90101790..90101904,+__1934.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:90101790..90101904,+__1934.1.0.0	rs10801756	-0.6520680974615087	-0.8916987212855844	-0.650456041815681	-0.7905418852744052	-0.7614122564487036	-0.5765540757104315	-1.1655858684589968	-0.9525262983436219	-0.6557426852939774	-0.584712597198356	-0.5444159876193985	-0.5461900565955744	-0.7309920476255197	-0.8146637159469292	-0.7784211397034826	-0.908903258982527	-0.8247648658619469	-0.7362573337809832	-0.6298206628572329	-1.0733376481360843	-1.029823890012318	-0.8747789697774329	-0.9119868605875447	-0.7691741617101384	-0.5624364027982989	-0.8261974091795766	-0.16259561848542048	0.11327758158210177	-0.25844721716684604	-0.034222980587541696	0.025154922667720347	-0.053266587146801436	0.09224822032291247	-0.0772975916686961	-0.21903628448345547	-0.32727426338918875	-0.22475817409073995	-0.01624634620272447	-0.09520536155405664	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.136115392203	NA__no_active_tile	0.390154148302	0.819442862795	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.132622250874	0.368322877114	0.192768091005	0.978575937473	0.387459151909	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:43633193..43633307,+__1936.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:43633193..43633307,+__1936.1.0.0	rs2505514	-0.8591376527901148	-0.417654744592709	-0.615565590654591	-0.7362602335457948	-0.577501043680338	-0.6068737063514165	-0.8523783295869507	-0.8729106773528146	-0.9924129081089683	-0.776108666224838	-0.7816579405717701	-0.5678305804820847	-0.7213576728285326	-0.6208301946308948	-0.6077609129772036	-0.7364564810865961	-0.8483927493110321	-0.9538553338107554	-0.5988122520284935	-0.5438534532608791	-0.5834431423490772	-0.7821878975848295	-0.5033345417479609	-0.5574110198252669	-0.6638370687731789	-0.6666812539488473	0.23830745815921994	-0.19010616838449457	-0.12089089043200507	-0.1121325157652373	-0.3763542901304173	0.008061454322922934	0.3085248763260716	0.28946753500373734	0.21022501052413878	0.2727741244768771	0.2242469207465032	-0.09600648829109426	0.0546764188796852	NA__no_active_tile	0.687084607526	0.716953652062	NA__no_active_tile	0.242741268695	0.861430881609	0.270885072145	0.313917214294	0.914457985151	0.420456664513	0.777966336216	0.79863356553	0.838542020079	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:73790800..73790914,+__1937.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:73790800..73790914,+__1937.1.0.0	rs1245531	-1.7399684056923936	-1.7757474118868917	-1.6678030808191042	-1.5553342261340126	-1.876086570315992	-2.047830449075379	-1.5840455221441387	-1.3002364019728436	-1.654832042052081	-1.7650085969229914	-1.6876486606251997	-1.6588864803448986	-1.6927856539988273	-1.9299118686444574	-1.737933887796494	-1.8868549539916746	-1.6201971065662548	-1.9064425907893388	-1.8769754016062707	-1.9884858189272716	-1.6117667368282822	-1.6180887607707404	-2.0923754656283324	-1.8819412858233147	-1.7696855353534762	-1.8267216177271586	-0.18994346295206377	0.03781352409039762	-0.21905187317257035	-0.0648628804322422	-0.030356020473346845	0.17085504746910818	-0.40444029678313287	-0.3115303348554386	0.036743281281340634	-0.32736686870534104	-0.19429262519811497	-0.11079905500857756	-0.1339359637283318	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:74091890..74092004,+__1938.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:74091890..74092004,+__1938.1.0.0	rs9415066	0.7788127921056659	1.0418575962197771	0.5720783352583174	0.4902729052046755	0.8161953834514809	0.6480651444146552	1.549885006705993	1.5704793854526684	0.7984183091950516	0.8420061438048541	0.9703208937598352	0.8088689537419546	0.9072717374429108	0.5031679060376821	0.6823235935260805	0.3487441329775299	0.4016603542935351	0.5568295729827888	0.5093369360602172	1.2234551976960153	1.4057624471636292	0.8514904644795201	0.5065575282480426	0.48138371116297396	0.4431985007760838	0.6594925287836748	-0.27564488606798376	-0.3595340026936966	-0.22333420228078754	-0.0886125509111404	-0.2593658104686921	-0.138728208354438	-0.32642980900997776	-0.16471693828903922	0.053072155284468514	-0.3354486155568115	-0.48893718259686125	-0.36567045296587075	-0.24777920865923586	0.333666485083	0.113101776132	0.253741740693	0.737113058664	0.840380101088	0.288805731951	0.107123399254	0.405136064622	1.0	0.428242856315	0.116187990183	0.0548474154937	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:74091890..74092004,+__1938.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:74091890..74092004,+__1938.1.0.0	rs9416016	0.7788127921056659	1.0418575962197771	0.5720783352583174	0.4902729052046755	0.8161953834514809	0.6480651444146552	1.549885006705993	1.5704793854526684	0.7984183091950516	0.8420061438048541	0.9703208937598352	0.8088689537419546	0.9072717374429108	0.5662524885896933	0.7391954147290125	0.1848301259309525	0.1383727353344874	0.682815125999896	0.5125684873568059	1.3511205428381192	1.53942572402629	0.6638107837763673	0.6509402979541307	0.8316128571478694	0.597788790950645	0.704894447886189	-0.21256030351597255	-0.3026621814907646	-0.3872482093273649	-0.3519001698701881	-0.13338025745158488	-0.1354966570578493	-0.19876446386787383	-0.03105366142637833	-0.13460752541868437	-0.1910658458507234	-0.13870803661196585	-0.2110801627913096	-0.20237728955672163	0.519249062249	0.30750859871	0.183752894264	0.63839046467	0.90381429355	0.476688253492	0.87199428352	0.648013768535	0.716953652062	0.412754243182	0.527990680582	0.861430881609	0.827381119391	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr10:74091890..74092004,+__1938.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:74091890..74092004,+__1938.1.0.0	rs9415066,rs9416016	0.7788127921056659	1.0418575962197771	0.5720783352583174	0.4902729052046755	0.8161953834514809	0.6480651444146552	1.549885006705993	1.5704793854526684	0.7984183091950516	0.8420061438048541	0.9703208937598352	0.8088689537419546	0.9072717374429108	0.8998467141424119	0.5822112109561066	0.21319820565912004	0.3541481561795291	0.46462326019075667	0.541995282995593	0.4531588990558709	0.364536875399089	-0.018378765341704583	1.192028083937657	-0.13880797292949476	0.03707129992600903	0.4121359375142453	0.12103392203674601	-0.4596463852636705	-0.35888012959919735	-0.13612474902514637	-0.35157212326072423	-0.10606986141906227	-1.096726107650122	-1.2059425100535794	-0.8167970745367562	0.35002194013280286	-1.10912886668933	-0.7717976538159456	-0.49513579992866547	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.536806685117	NA__not_enough_barcodes	0.829894465792	NA__not_enough_barcodes	0.770268948823	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:81046410..81046524,+__1939.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:81046410..81046524,+__1939.1.0.0	rs1250566	-0.7516579377055832	-0.93886920053619	-0.7894591236709226	-0.9326137432915576	-0.7743807038341628	-0.6524851375995131	-0.7751001262746449	-0.6856194720070543	-0.7768496305235459	-0.6541703310966005	-0.8666263732758129	-0.7761064008425339	-0.7811615150548435	-1.0420969014667536	-1.024742083763524	-1.0024506926193968	-1.0986681672921321	-0.9340910570883382	-0.9506090678998405	-1.1268670520037494	-1.064971478271621	-1.0281960762573195	-0.8960705933376643	-0.925429123099482	-0.927594819682859	-1.0018155927318901	-0.2904389637611704	-0.08587288322733388	-0.21299156894847415	-0.16605442400057457	-0.15971035325417537	-0.29812393030032736	-0.3517669257291045	-0.3793520062645668	-0.2513464457337735	-0.24190026224106376	-0.058802749823669065	-0.15148841884032505	-0.2206540776770465	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.253741740693	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0808926541269	0.468411351413	NA__no_active_tile	0.132622250874	0.0518049542972	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr11:69453865..69453979,+__1940.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr11:69453865..69453979,+__1940.1.0.0	rs1944129	0.24288069756463557	0.33464704490471875	0.12484431394106449	0.1759192653360387	0.2251031075935975	0.37928661647060374	0.3826263821233147	0.6085589304392217	0.41534961499548917	0.4980547629199168	0.5479919554694213	0.5164803970889449	0.3709785907372473	0.14390162887693597	0.1723035391609552	0.1787974454331619	0.19099366393510767	0.22076596572639634	0.20443326980946167	0.37041218488230765	0.635364111224797	0.5355227250470105	0.44367583515394926	0.43857355222721467	0.412062193288257	0.3289005095637962	-0.0989790686876996	-0.16234350574376355	0.053953131492097406	0.015074398599068978	-0.004337141867201161	-0.17485334666114208	-0.01221419724100703	0.026805180785575256	0.12017311005152131	-0.05437892776596753	-0.10941840324220659	-0.10441820380068789	-0.04207808117345104	0.29495293544	0.368322877114	0.361218104761	0.545696106059	0.716953652062	0.248198866138	0.282745459933	0.347268461228	0.777966336216	0.581967350665	0.125844655769	0.326996172605	0.208495154076	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr12:56752816..56752930,+__1943.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr12:56752816..56752930,+__1943.1.0.0	rs57870697	-1.5057480773011873	-1.4993997052371286	-1.8556301454457018	-1.2722277646858584	-1.5213692679311592	-1.4595062102030538	-1.398294804225226	-1.3413411546344443	-1.8000810002331527	-1.55032294463829	-1.8388017156326686	-1.7379058057255796	-1.565052382991121	-1.0809757711182268	-0.9270564595004028	-1.1309644790517415	-0.9398342078612845	-0.9745363936746618	-1.067921802460699	-1.4103027939843935	-1.0743963312487645	-1.2132354388586235	-0.9846540153528924	-1.239449658731944	-1.0500672724605138	-1.0911162186920123	0.42477230618296047	0.5723432457367258	0.7246656663939604	0.33239355682457394	0.5468328742564974	0.3915844077423549	-0.012007989759167614	0.2669448233856797	0.5868455613745291	0.5656689292853976	0.5993520569007247	0.6878385332650658	0.4739361642991085	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr12:69726870..69726984,+__1945.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr12:69726870..69726984,+__1945.1.0.0	rs11177602	-1.6616812575739064	-1.395641599405582	-1.1767297987103575	-1.7213285287933862	-1.6365551115681831	-1.3448761876444297	-1.7385226475864903	-1.7175458758359043	-1.5763460231495232	-1.6883712555835548	-1.525745658221842	-1.7180258228372418	-1.5751141472425332	-1.8166258768721668	-1.9884505556238898	-1.7075954433247844	-1.7190110466306043	-1.6489790590477638	-1.7016537499793758	-1.430291336601711	-1.5637977117261745	-1.7397070607624419	-1.7317982737479212	-1.6500070672238831	-1.6819206945721383	-1.6983198230094043	-0.15494461929826042	-0.5928089562183079	-0.5308656446144269	0.0023174821627818254	-0.012423947479580644	-0.35677756233494606	0.3082313109847794	0.1537481641097298	-0.16336103761291865	-0.04342701816436634	-0.12426140900204108	0.03610512826510348	-0.12320567576687112	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050140..21050254,+__1946.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050140..21050254,+__1946.1.0.0	rs7324188	1.1228645063426204	1.102729164222056	1.1691515665794676	0.9452325208165064	1.1227099640253608	1.3493779886254655	1.3835022752670867	1.5098596036298713	1.3950229179954656	1.4852413443845571	1.4392405948153355	1.438402761929376	1.2886112673860974	1.2497291706521247	1.4465567207440295	1.333277575381905	1.1342535588973968	1.3325217238682407	1.3631075541776516	1.496114326960699	1.5445305398064348	1.2586053840372022	1.249654194423292	1.306041738676475	1.3469581552597534	1.3384458869071005	0.12686466430950438	0.3438275565219735	0.16412600880243744	0.18902103808089032	0.20981175984287992	0.013729565552186074	0.11261205169361221	0.03467093617656358	-0.1364175339582634	-0.23558714996126517	-0.1331988561388604	-0.09144460666962262	0.04983461952100299	0.436112310787	0.382791178922	0.819442862795	0.456141411048	0.76769033028	0.706946403854	0.687084607526	0.510582765025	0.0808926541269	0.925117039075	0.527990680582	0.253741740693	0.676123437269	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050140..21050254,+__1946.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050140..21050254,+__1946.1.0.0	rs35891640	1.1228645063426204	1.102729164222056	1.1691515665794676	0.9452325208165064	1.1227099640253608	1.3493779886254655	1.3835022752670867	1.5098596036298713	1.3950229179954656	1.4852413443845571	1.4392405948153355	1.438402761929376	1.2886112673860974	1.8428166023775985	2.104946932396396	1.9134619456089967	1.9022238959107467	1.9391101298337052	2.0764337792430103	2.099512987341213	2.114869101435652	2.1363311346368423	2.0306414176150445	2.02192957127348	2.0819823981833143	2.022021657988	0.7199520960349781	1.00221776817434	0.7443103790295291	0.9569913750942403	0.8164001658083444	0.7270557906175448	0.7160107120741264	0.6050094978057807	0.7413082166413767	0.5454000732304873	0.5826889764581447	0.6435796362539383	0.7334103906019026	0.000303956631358	7.89440729856e-05	0.0216734048733	0.00423662678721	0.000413457613232	0.00616002497902	0.00086866520518	6.29975961399e-05	0.000751093855117	0.000617238254542	0.00883703695038	0.00139510136839	3.52801872202e-26	0.215201295002	0.0587343903013	1	1	0.319189277415	1	0.641943586628	0.0457992523937	0.580595550006	0.484532029816	1	1	2.95647968905e-23	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050140..21050254,+__1946.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050140..21050254,+__1946.1.0.0	rs7324189	1.1228645063426204	1.102729164222056	1.1691515665794676	0.9452325208165064	1.1227099640253608	1.3493779886254655	1.3835022752670867	1.5098596036298713	1.3950229179954656	1.4852413443845571	1.4392405948153355	1.438402761929376	1.2886112673860974	0.9482980570696904	1.3022809934032982	0.8733002521754553	0.8918162463661103	1.242050953702043	1.3304899582395984	1.2903455413154652	1.2997941040264915	1.153350789311709	1.233445285549685	1.2975533304024567	1.2107387348745267	1.1727886872030442	-0.17456644927292997	0.19955182918124215	-0.29585131440401236	-0.053416274450396095	0.11934098967668216	-0.01888803038586717	-0.0931567339516215	-0.21006549960337972	-0.24167212868375665	-0.2517960588348722	-0.14168726441287882	-0.22766402705484934	-0.11582258018305329	0.405136064622	0.994643319531	0.0959193233604	0.716953652062	0.742179092338	0.436112310787	0.248198866138	0.619326784864	0.0412580447575	0.282745459933	0.301187193336	0.0374147936077	0.199618143258	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050140..21050254,+__1946.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050140..21050254,+__1946.1.0.0	rs7324188,rs35891640,rs7324189	1.1228645063426204	1.102729164222056	1.1691515665794676	0.9452325208165064	1.1227099640253608	1.3493779886254655	1.3835022752670867	1.5098596036298713	1.3950229179954656	1.4852413443845571	1.4392405948153355	1.438402761929376	1.2886112673860974	2.3543751858481823	2.4887923899983533	2.3647900981497525	2.1710796631606377	2.207882929349257	2.303018990095674	2.5481665909726505	2.522937193259476	2.3050336645006704	2.5710702902937643	2.4605437684357594	2.4088022363629418	2.392207750035593	1.231510679505562	1.3860632257762973	1.1956385315702849	1.2258471423441313	1.085172965323896	0.9536410014702086	1.1646643157055638	1.013077589629605	0.9100107465052047	1.0858289459092072	1.0213031736204239	0.9703994744335658	1.103596482649496	2.97338861431e-06	2.60794292158e-06	0.000354775949455	4.21654944787e-05	9.53931849178e-07	4.67965309508e-06	2.34155615835e-05	2.70962217641e-07	8.8142435835e-06	4.45036519739e-07	9.38141513904e-06	2.44178879239e-06	1.24272069113e-52	0.000576837391176	0.000526804470159	0.0706004139416	0.00796927845647	0.000195556029082	0.000940610272111	0.00468311231671	5.28376324399e-05	0.0018157341782	9.25675961057e-05	0.0019231901035	0.000503008491232	2.82097596888e-50	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr14:101159663..101159777,+__1948.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr14:101159663..101159777,+__1948.1.0.0	rs9671394	3.348260221346651	3.964857336664691	3.0839653451155344	2.8878057649078626	3.1470194475220774	3.330064167000172	2.566194479911138	2.8129443797862868	3.343089242268876	3.3989892034698954	3.4250059826865478	3.451659614008258	3.2299879320573326	3.2624142431160816	3.6935649990108352	3.1121400615385792	2.948711507294976	3.1644140321790113	3.2048749826694705	2.465799478393509	2.6711423995400367	3.224376028161337	3.246956131254721	3.155495262589942	3.3036575902018512	3.1211288929958627	-0.08584597823056939	-0.27129233765385585	0.02817471642304481	0.06090574238711355	0.017394584656933887	-0.1251891843307016	-0.10039500151762892	-0.14180198024625001	-0.11871321410753888	-0.1520330722151746	-0.2695107200966058	-0.1480020238064066	-0.10885903906146994	0.536806685117	0.648013768535	1.0	0.809021331888	0.444064484515	0.125844655769	0.397602565759	0.162586850726	0.320413072024	0.253741740693	0.202104162379	0.333666485083	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr14:75741690..75741804,+__1950.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr14:75741690..75741804,+__1950.1.0.0	rs1569328	-1.3795705266439233	-1.2251867794831748	-1.0908619294298847	-1.509291076928038	-1.2492136752968572	-1.3957703786189448	-1.2123497833711887	-1.1602690261088071	-0.8995335995799383	-1.350355519605679	-1.5141904337312524	-1.4700738128299666	-1.2880555451356377	-1.588754292658011	-1.6008113455331812	-1.357724421277699	-1.2755230966302897	-1.62145656203954	-1.4985579484958982	-1.1430849146087132	-1.347950105306527	-1.6719497372598844	-1.637638756592837	-1.4416425339958403	-1.5895015561697674	-1.4812162725473492	-0.2091837660140876	-0.3756245660500064	-0.2668624918478144	0.23376798029774837	-0.3722428867426828	-0.10278756987695337	0.0692648687624755	-0.18768107919771992	-0.7724161376799461	-0.2872832369871581	0.07254789973541209	-0.11942774333980077	-0.19316072741171111	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr16:66556179..66556293,+__1951.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr16:66556179..66556293,+__1951.1.0.0	rs56886347	-1.0161686241008996	-1.1349991067752014	-1.197552517840473	-0.7480227067559463	-1.1361213839187652	-1.221797214763835	-1.209091823608776	-0.7758916479295036	-1.461288833894557	-1.0219042384611623	-0.8214771327532603	-0.9057225003856884	-1.054169810932339	-1.3579539685194517	-1.1685850093075556	-1.3321618738649703	-0.9989331478108578	-1.4148076543014352	-1.1533872514146233	-1.2132715755227341	-1.4505012600128635	-1.170396267812838	-1.8560185256862858	-1.469984056124499	-1.580612843356326	-1.3472177861445367	-0.34178534441855213	-0.03358590253235416	-0.13460935602449742	-0.25091044105491156	-0.27868627038267	0.06840996334921168	-0.004179751913958141	-0.6746096120833599	0.2908925660817192	-0.8341142872251235	-0.6485069233712387	-0.6748903429706377	-0.2930479752121977	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr16:75410781..75410895,+__1952.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr16:75410781..75410895,+__1952.1.0.0	rs8056080	-1.3062026628367285	-1.2108366571728748	-1.5372050660505545	-1.0028121389855986	-1.2628342928581542	-1.2677196782666622	-1.4831284879205948	-1.3410270772753459	-0.8523693811480251	-1.2867369844257384	-1.4496228119801615	-1.1534958641136277	-1.2628325919195056	-0.9899547147421528	-1.863793807839692	-1.2830211540092442	-1.0784796307073148	-1.5520852848286164	-1.055036919789891	-1.3238717424204751	-0.7911758786644917	-1.4750169720768815	-1.3334597069383196	-1.6296786699433088	-1.7337224761008618	-1.3424414131717706	0.3162479480945757	-0.6529571506668173	0.2541839120413103	-0.07566749172171616	-0.2892509919704622	0.2126827584767712	0.1592567455001197	0.5498511986108542	-0.6226475909288565	-0.04672272251258125	-0.18005585796314727	-0.5802266119872341	-0.0796088212522653	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr18:21417660..21417774,+__1953.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr18:21417660..21417774,+__1953.1.0.0	rs4800516	-1.0545995370387033	-0.8421200256599775	-1.0063878012104461	-1.1035398136429058	-0.9324871400543513	-0.9097067904711904	-1.0241919885611956	-1.1218083859971535	-1.175391698436675	-1.047955387599651	-0.817496610638512	-0.9720602972578851	-1.0006454563807206	-1.2467284463143509	-1.4323877408015628	-1.0781170544186238	-1.2767402989629497	-1.1122354472943476	-1.0813084525285124	-1.2040353689878056	-1.4784451212428351	-1.0013289116132544	-0.949569489193629	-1.1096650738030425	-0.9150962503295573	-1.1571381379575394	-0.19212890927564752	-0.5902677151415854	-0.07172925320817769	-0.17320048532004395	-0.17974830723999635	-0.17160166205732197	-0.17984338042660997	-0.3566367352456816	0.17406278682342058	0.09838589840602197	-0.2921684631645305	0.056964046928327794	-0.15649268157681873	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr19:44287212..44287326,+__1954.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:44287212..44287326,+__1954.1.0.0	rs62116962	-0.7610920979618238	-0.3846739654090242	-0.7624822413388298	-0.4723994623523599	-0.3758240835140509	-0.7395437283478302	-0.3410016082811597	-0.24458605010731468	-0.5932804940310277	-0.4581462611552622	-0.46727677085812913	-0.4676005618778304	-0.5056589437695536	-1.0034790036809829	-0.6978187841338219	-0.9448410619485138	-0.7251300527232419	-1.1245363162146305	-0.9669189830404084	-0.7858725260293262	-0.4276466717941334	-0.8231455722971119	-0.9392673148608868	-0.5403761223292299	-0.6065438705888958	-0.7987980233034321	-0.2423869057191591	-0.3131448187247977	-0.182358820609684	-0.252730590370882	-0.7487122327005795	-0.22737525469257813	-0.4448709177481665	-0.18306062168681872	-0.22986507826608427	-0.4811210537056246	-0.0730993514711008	-0.13894330871106542	-0.2931390795338784	0.125844655769	0.129198935732	0.354177864137	0.460214637573	0.30750859871	0.472534754287	0.0374147936077	0.840380101088	0.192768091005	0.0156538458129	0.333666485083	0.716953652062	0.0218855284689	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr19:47793086..47793200,+__1955.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:47793086..47793200,+__1955.1.0.0	rs10853782	-1.1457363487885386	-0.6593911118140382	-0.6985551324990191	-1.1241601425736096	-0.8009767176826547	-0.8740000278878999	-0.9600163517944074	-0.8540390695899438	-0.7763660766520109	-1.0352559015615317	-0.8860662394683771	-0.7232658272232999	-0.8781524122946109	-1.383670722953152	-0.9158714112114843	-1.1224928342489673	-1.1008754273271881	-1.3246926699615384	-1.1720508651875716	-1.2246028684490011	-1.0874892803601466	-1.0759927091853037	-1.2005236876264511	-1.14276046919192	-1.2456644043650515	-1.166390612505648	-0.23793437416461338	-0.2564802993974461	-0.42393770174994816	0.023284715246421506	-0.5237159522788838	-0.29805083729967174	-0.26458651665459376	-0.23345021077020278	-0.2996266325332928	-0.16526778606491943	-0.25669422972354283	-0.5223985771417516	-0.2882382002110371	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0678362651725	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0678362651725	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.253741740693	0.0176206073221	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr19:47793086..47793200,+__1955.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:47793086..47793200,+__1955.1.0.0	rs10853783	-1.1457363487885386	-0.6593911118140382	-0.6985551324990191	-1.1241601425736096	-0.8009767176826547	-0.8740000278878999	-0.9600163517944074	-0.8540390695899438	-0.7763660766520109	-1.0352559015615317	-0.8860662394683771	-0.7232658272232999	-0.8781524122946109	0.03876575228227091	0.07426540499930753	-0.04661011275112026	-0.09631315584243713	-0.01410911474514498	-0.24326787178958198	-0.2211058568961058	-0.0026380534565523086	0.023789778637670376	-0.06272814844143451	0.18095947229867748	-0.1267620358631925	-0.04131282846397026	1.1845021010708094	0.7336565168133458	0.6519450197478989	1.0278469867311726	0.7868676029375097	0.6307321560983179	0.7389104948983016	0.8514010161333915	0.8001558552896813	0.9725277531200972	1.0670257117670547	0.5965037913601074	0.8368395838306407	1.1701294631e-06	5.30937746215e-05	3.75375068986e-05	5.66885732617e-06	8.8142435835e-06	7.05457685779e-05	0.000337013519112	2.34778603013e-07	1.33967727792e-06	6.04095401414e-06	1.34942162e-08	2.63751008552e-05	1.5611241309e-51	0.000828451659877	0.0395017683184	0.0279654426394	0.00417794784939	0.00680459604646	0.0538969671935	0.249052990624	0.00017068404439	0.00103557053583	0.0047421489011	1.03770522578e-05	0.0205462035662	1.3082220217e-48	sig	sig	sig	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr19:47793086..47793200,+__1955.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:47793086..47793200,+__1955.1.0.0	rs10853784	-1.1457363487885386	-0.6593911118140382	-0.6985551324990191	-1.1241601425736096	-0.8009767176826547	-0.8740000278878999	-0.9600163517944074	-0.8540390695899438	-0.7763660766520109	-1.0352559015615317	-0.8860662394683771	-0.7232658272232999	-0.8781524122946109	-0.8308228369995768	-0.6959634865507616	-0.6357867644244534	-0.5895089117707126	-0.7367763150315076	-0.5127746892107607	-0.8367592146670595	-0.6480627734240032	-0.7364390572986629	-0.7527337511714863	-0.6603160144848779	-0.7483216335422571	-0.6986887873813433	0.31491351178896176	-0.03657237473672337	0.06276836807456576	0.534651230802897	0.06420040265114701	0.36122533867713913	0.12325713712734787	0.2059762961659406	0.03992701935334797	0.28252215039004536	0.22575022498349928	-0.025055806318957208	0.1794636249132676	NA__no_active_tile	0.727009731456	0.397602565759	0.0374147936077	0.265084565602	0.0148073726126	NA__no_active_tile	0.0719809426143	0.79863356553	0.0638868812625	0.192768091005	0.957167318493	0.0399870885343	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr19:47793086..47793200,+__1955.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:47793086..47793200,+__1955.1.0.0	rs10853782,rs10853783,rs10853784	-1.1457363487885386	-0.6593911118140382	-0.6985551324990191	-1.1241601425736096	-0.8009767176826547	-0.8740000278878999	-0.9600163517944074	-0.8540390695899438	-0.7763660766520109	-1.0352559015615317	-0.8860662394683771	-0.7232658272232999	-0.8781524122946109	-0.5721446236756726	-0.5332627772237675	-0.7928751349007457	-0.8180617120439035	-0.5257841847227789	-0.4225162192810553	-0.5917839855922951	-0.3143598100565117	-0.5141101918330083	-0.3526650827988388	-0.5185274362857063	-0.42492376673790855	-0.5317512437626827	0.5735917251128659	0.12612833459027073	-0.09432000240172655	0.3060984305297061	0.2751925329598758	0.45148380860684456	0.3682323662021123	0.5396792595334321	0.2622558848190025	0.6825908187626929	0.36753880318267085	0.29834206048539136	0.3464011685319282	0.00313710581496	0.361218104761	0.476688253492	NA__no_active_tile	0.0426112802219	0.0240855495486	0.170821264488	0.00753998341959	0.147021540231	0.00883703695038	0.0187859264625	0.0548474154937	8.75721469574e-08	0.608598528103	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1.98788773593e-05	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr2:113840940..113841054,+__1956.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr2:113840940..113841054,+__1956.1.0.0	rs75151153	-1.1201367488701046	-1.1694248714249276	-1.1736868917528227	-1.174620290772605	-1.2139112047482954	-1.1774767711561673	-1.0557056823110536	-1.2876748911725813	-1.363449730900332	-1.3202695165111034	-1.1911908984978274	-1.2258670035440615	-1.2061178751384902	-1.280034326318138	-1.1838001286672368	-1.4436342546445686	-1.1247912657959471	-1.3677934408547978	-1.1214365790970402	-1.3145672621901947	-1.1394903829990728	-1.2300942887147766	-1.5454233228205756	-1.3743925027497883	-1.166914595778651	-1.2743643625525658	-0.15989757744803335	-0.014375257242309258	-0.2699473628917459	0.049829024976657976	-0.15388223610650242	0.056040192059127136	-0.25886157987914116	0.14818450817350848	0.1333554421855554	-0.22515380630947224	-0.18320160425196086	0.05895240776541044	-0.06824648741407548	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr2:113840940..113841054,+__1956.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr2:113840940..113841054,+__1956.1.0.0	rs6734238	-1.1201367488701046	-1.1694248714249276	-1.1736868917528227	-1.174620290772605	-1.2139112047482954	-1.1774767711561673	-1.0557056823110536	-1.2876748911725813	-1.363449730900332	-1.3202695165111034	-1.1911908984978274	-1.2258670035440615	-1.2061178751384902	-0.9612184714103249	-1.4729362805735922	-1.2035173559680894	-1.3019374472573149	-1.2347959146993501	-1.2945030567575064	-1.316496786972295	-1.1843734266491586	-1.311257746265201	-1.3056591174319152	-1.4152154524712866	-1.2113740758000158	-1.2677737610213375	0.1589182774597797	-0.3035114091486646	-0.029830464215266694	-0.12731715648470976	-0.020884709951054736	-0.1170262856013391	-0.26079110466124145	0.1033014645234227	0.05219198463513086	0.014610399079188152	-0.2240245539734591	0.014492927744045758	-0.06165588588284735	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr2:113840940..113841054,+__1956.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr2:113840940..113841054,+__1956.1.0.0	rs113990868,rs75151153,rs6734238	-1.1201367488701046	-1.1694248714249276	-1.1736868917528227	-1.174620290772605	-1.2139112047482954	-1.1774767711561673	-1.0557056823110536	-1.2876748911725813	-1.363449730900332	-1.3202695165111034	-1.1911908984978274	-1.2258670035440615	-1.2061178751384902	-1.4708149750288664	-1.2389665514189265	-1.2882814465246741	-1.2574822417709082	-1.076790619115071	-1.1678492843050914	-1.1336003618466561	-1.227131379156158	-1.231384642595322	-1.1144666300040265	-1.3314112827421223	-1.2567468665618517	-1.2329105234224729	-0.35067822615876176	-0.06954167999399896	-0.11459455477185143	-0.08286195099830307	0.1371205856332245	0.00962748685107595	-0.07789467953560258	0.06054351201642327	0.13206508830500985	0.2058028865070769	-0.14022038424429484	-0.03087986301779022	-0.0267926482839827	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr2:28583975..28584089,+__1958.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr2:28583975..28584089,+__1958.1.0.0	rs7585998	0.12879620972931533	-0.1494427699537725	0.046388261182768196	0.2616730285009992	0.16002714371369414	0.23111903257296618	-0.2388561561832819	-0.32355028556541066	-0.11781795831973985	-0.16441826559622466	0.03821542395634698	-0.13198241568395958	-0.021654062637191596	0.0035592962934452403	0.01977309822862592	0.1403742140006994	0.0444184707900616	0.0013911834793230628	-0.06667454487079186	-0.20776760942482966	-0.32727640517960566	-0.20055130163239165	-0.23835683212312464	-0.1346749864954877	-0.15180255891097771	-0.09313233132042113	-0.1252369134358701	0.16921586818239842	0.0939859528179312	-0.2172545577109376	-0.15863596023437107	-0.297793577443758	0.03108854675845224	-0.0037261196141950004	-0.08273334331265181	-0.07393856652689998	-0.17289041045183468	-0.01982014322701814	-0.07147826868322955	0.591208103411	0.727009731456	0.87199428352	0.420456664513	0.248198866138	0.0249397487324	0.788281320858	0.436112310787	0.107123399254	0.333666485083	0.0286240283844	0.242741268695	0.0968346362105	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr20:25218571..25218685,+__1959.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr20:25218571..25218685,+__1959.1.0.0	rs6132819	4.015884410995085	4.234545914018517	3.6363919777330143	3.4191779329593404	3.905361016493738	4.062341038982442	3.426250490715997	3.834587125685913	4.063165461341057	4.130023344020338	4.075049069531147	4.147602530640604	3.912531692759766	4.091416176096604	4.382848129905055	3.7827495492267698	3.5052484543340285	3.963734752384556	4.056942213226902	3.5581368855593265	4.009459266175414	4.224192982191413	4.173423799452638	4.130267831065811	4.25112248514817	4.010795210397224	0.07553176510151882	0.14830221588653814	0.1463575714937555	0.08607052137468818	0.05837373589081807	-0.00539882575553996	0.1318863948433293	0.17487214048950062	0.16102752085035643	0.04340045543229998	0.05521876153466376	0.10351995450756579	0.09826351763745789	0.375513989452	0.226876581559	0.206893929435	0.147021540231	0.301187193336	0.829896383209	0.282745459933	0.116187990183	0.175053819161	0.554657938956	0.747262025795	0.088148079887	0.0483969391889	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr20:25218571..25218685,+__1959.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr20:25218571..25218685,+__1959.1.0.0	rs115761750	4.015884410995085	4.234545914018517	3.6363919777330143	3.4191779329593404	3.905361016493738	4.062341038982442	3.426250490715997	3.834587125685913	4.063165461341057	4.130023344020338	4.075049069531147	4.147602530640604	3.912531692759766	3.849496584541267	4.135331237852882	3.7293201879883577	3.369348025642844	3.7447938674117083	3.7516636246243356	3.226760129923986	3.6832205550609505	3.7909721881128577	3.899295382103994	3.737833796321724	3.9793203338844485	3.741446326122446	-0.16638782645381767	-0.09921467616563451	0.09292821025534348	-0.0498299073164965	-0.16056714908202974	-0.3106774143581066	-0.19949036079201132	-0.15136657062496273	-0.27219327322819886	-0.23072796191634382	-0.3372152732094231	-0.16828219675615586	-0.17108536663731977	0.0327677521954	0.122558611289	0.301187193336	0.248198866138	0.0156538458129	0.0150857114019	0.0484054419273	0.0499532058383	0.0258200569765	0.0150857114019	0.00501178746069	0.237368605078	1.40534680335e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1.17768062121e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr20:25218571..25218685,+__1959.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr20:25218571..25218685,+__1959.1.0.0	rs6132819,rs115761750	4.015884410995085	4.234545914018517	3.6363919777330143	3.4191779329593404	3.905361016493738	4.062341038982442	3.426250490715997	3.834587125685913	4.063165461341057	4.130023344020338	4.075049069531147	4.147602530640604	3.912531692759766	3.774194898593846	4.215493072618434	3.413016396003253	3.2254390276095766	3.6873797836627977	3.637791556348734	3.0993598421268085	3.4590586301725663	3.5752965710369153	3.7123662332729688	3.6931175223597577	3.8264545821436355	3.609914009662441	-0.24168951240123882	-0.019052841400082343	-0.22337558172976113	-0.1937389053497638	-0.21798123283094029	-0.42454948263370795	-0.3268906485891887	-0.3755284955133469	-0.48786889030414127	-0.4176571107473692	-0.38193154717138933	-0.3211479484969688	-0.3026176830973249	0.00133155906714	0.158583637061	0.00695778717972	0.00480682187369	0.000199758557674	5.62183900058e-05	0.000505862288815	0.000392957862114	3.54084840538e-05	0.000246746816615	9.98335414644e-06	0.00175684955224	6.06508608063e-28	0.258322459026	1	1	0.908489334127	0.0409505043232	0.0112998963912	0.101172457763	0.0766267831122	0.00729414771508	0.0513233378558	0.00204658760002	0.361911007762	1.3767745403e-25	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr21:45616226..45616340,+__1961.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr21:45616226..45616340,+__1961.1.0.0	rs4317019	0.5619858370934072	0.686224621967703	0.4469257118787456	0.6296482826311268	0.7173599814013536	0.6124175514504556	0.6885184903778102	0.7273771246122301	0.7660424023795759	0.7977761381163408	0.8883448523816581	0.8447324113989384	0.6972794504741121	0.5775947528483338	0.7072892374618476	0.3127197712455804	0.3836425520198783	0.3867050605276732	0.5657502208270335	0.5346188994105696	0.6911552994156022	0.6273611615568212	0.6168069074472309	0.6750468168192765	0.5810828087566333	0.55498112402804	0.015608915754926622	0.021064615494144623	-0.13420594063316515	-0.24600573061124853	-0.3306549208736804	-0.0466673306234221	-0.1538995909672406	-0.03622182519662798	-0.13868124082275468	-0.18096923066910997	-0.21329803556238158	-0.2636496026423051	-0.14229832644607207	0.60051573606	0.527990680582	0.175053819161	0.554653407081	0.0249397487324	0.188220673538	0.0986283746992	0.282745459933	0.536806685117	0.179364149792	0.706946403854	0.045430560235	0.019460858573	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr21:45616226..45616340,+__1961.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr21:45616226..45616340,+__1961.1.0.0	rs4456788	0.5619858370934072	0.686224621967703	0.4469257118787456	0.6296482826311268	0.7173599814013536	0.6124175514504556	0.6885184903778102	0.7273771246122301	0.7660424023795759	0.7977761381163408	0.8883448523816581	0.8447324113989384	0.6972794504741121	0.9245065207080441	1.048284270253982	0.9354775153647814	0.5075420677901853	0.6826161084955726	0.6886943780636658	0.7006345164895218	0.8152665174812858	0.9217359061960988	1.0931985851907837	0.9876588391903418	1.1259742213860156	0.8692991205508566	0.36252068361463685	0.3620596482862791	0.48855180348603583	-0.12210621484094153	-0.03474387290578096	0.07627682661321022	0.012116026111711586	0.08788939286905562	0.15569350381652292	0.2954224470744429	0.09931398680868375	0.28124180998707715	0.17201967007674446	0.326996172605	0.390154148302	0.226876581559	0.903813197854	0.88258056334	0.819442862795	0.88258056334	0.957167318493	0.333666485083	0.436112310787	0.619326784864	0.192768091005	0.855991199817	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr21:45616226..45616340,+__1961.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr21:45616226..45616340,+__1961.1.0.0	rs4317019,rs4456788	0.5619858370934072	0.686224621967703	0.4469257118787456	0.6296482826311268	0.7173599814013536	0.6124175514504556	0.6885184903778102	0.7273771246122301	0.7660424023795759	0.7977761381163408	0.8883448523816581	0.8447324113989384	0.6972794504741121	0.9256352087149801	1.1373529652246495	0.6265929227808537	0.5749100565668408	0.8703806493615591	0.8368941841564341	0.6553683549291254	1.0081845354638619	0.8900141004266007	1.0206782801239314	0.9295514108760907	0.9334749425419957	0.8674198009305769	0.36364937162157285	0.4511283432569465	0.17966721090210808	-0.05473822606428602	0.15302066796020553	0.2244766327059785	-0.033150135448684837	0.28080741085163174	0.12397169804702479	0.2229021420075905	0.041206558494432666	0.0887425311430573	0.1701403504564648	0.143314270352	0.0763307839553	0.63839046467	0.989286880498	0.113101776132	0.428242856315	0.840380101088	0.737113058664	0.390154148302	0.276771967065	0.501992688725	0.861430881609	0.570869050537	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr22:29261115..29261229,+__1962.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr22:29261115..29261229,+__1962.1.0.0	rs5762870	0.9226158945720714	1.3708659956588514	1.0453372140354038	0.9129632017398964	1.0246925850380784	1.0140991314982293	0.9193865494014808	1.2467524133134982	1.0747499389036304	1.1490823660041911	1.332028335562862	1.2515877781845897	1.1053467836593986	0.8603118597235049	1.2083690204710238	1.0100839928818708	0.959544261142532	1.0229284165533206	1.1044360819629022	0.9446045841156558	1.4183144432252504	1.1779234878313452	1.2814735617046664	1.152431493255714	1.0380812553808876	1.0982085381873896	-0.0623040348485665	-0.16249697518782757	-0.03525322115353302	0.04658105940263557	-0.0017641684847577999	0.09033695046467294	0.025218034714175053	0.17156202991175218	0.1031735489277148	0.1323911957004753	-0.1795968423071479	-0.21350652280370208	-0.007138245472009086	0.60051573606	0.326996172605	0.648013768535	0.382791178922	0.397602565759	0.914457985151	0.829896383209	0.320413072024	0.354199901149	0.468411351413	0.591208103411	0.282745459933	0.578639481275	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr22:41418056..41418170,+__1964.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr22:41418056..41418170,+__1964.1.0.0	rs926914	-0.993740443815378	-0.8372839373663314	-0.6917477546512026	-1.17166310157912	-0.97370455873338	-0.9385126471081	-0.9003883736604446	-0.9501488457517135	-0.8654260817201163	-1.4050326691494015	-1.0505440406110462	-1.1568585089562733	-0.9945875802585421	-1.1398063708962525	-1.2350640775082156	-1.0068350045755181	-1.5714444934602438	-1.7184163359116333	-1.0454580281645338	-1.543527349443346	-0.9721190957187612	-1.3348658502637847	-1.4932851097581483	-1.3039716136897799	-1.1281762401360511	-1.2910807974605225	-0.1460659270808745	-0.3977801401418841	-0.31508724992431547	-0.39978139188112394	-0.7447117771782533	-0.10694538105643381	-0.6431389757829014	-0.02197024996704766	-0.4694397685436684	-0.08825244060874682	-0.25342757307873365	0.02868226882022218	-0.29649321720198	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr22:50342708..50342822,+__1965.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr22:50342708..50342822,+__1965.1.0.0	rs28573373	-1.2074897203286334	-0.9358526541189944	-1.2033999650351905	-1.2457268469098646	-1.019286433380814	-1.0853252570365064	-1.3336297903000975	-0.8957759250918688	-1.2214778703279219	-1.06204345989631	-1.2281284918348494	-1.1838710471297524	-1.1351672884492336	-1.187424468075319	-1.1078590741233172	-0.8556103044545365	-0.6783147184919467	-1.1370005140490473	-1.2612149210041301	-0.79923898053463	-0.8525504864701074	-1.137394442512924	-1.3092789304318417	-1.115932445172934	-1.321896199667708	-1.0636429570823702	0.02006525225331446	-0.17200642000432276	0.3477896605806541	0.5674121284179179	-0.1177140806682333	-0.17588966396762373	0.5343908097654675	0.043225438621761314	0.08408342781499778	-0.24723547053553174	0.1121960466619154	-0.13802515253795566	0.07152433136686343	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr3:15450961..15451075,+__1967.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr3:15450961..15451075,+__1967.1.0.0	rs13081119	-1.2366959280218348	-0.4835859165722095	-1.1855517276694976	-1.0283572795442697	-1.2556482560058582	-1.1406246647097815	-0.9192809585151449	-1.1524109096145336	-0.9225321356909231	-1.1990556414403444	-1.2256377582089275	-1.0227341824213754	-1.0643429465345584	-1.0145013966492478	-0.8973538978363201	-1.1716517096393109	-0.9729730218939934	-0.9224534226406323	-0.7215101413076077	-0.7825460029283485	-1.0899362906723067	-0.6650857284971488	-0.932228535077521	-0.9623071189195991	-1.2909884522370798	-0.9519613098582597	0.22219453137258705	-0.41376798126411063	0.0139000180301867	0.055384257650276325	0.3331948333652258	0.4191145234021738	0.13673495558679638	0.062474618942226945	0.2574464071937743	0.26682710636282336	0.2633306392893284	-0.26825426981570444	0.11238163667629868	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr3:46446745..46446859,+__1968.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr3:46446745..46446859,+__1968.1.0.0	rs11574429	-1.5868505124186547	-1.645184563966251	-1.7107060051317777	-1.6328308288892908	-1.9136920042195782	-1.6249031975645738	-1.9458414214452866	-1.6434373496562416	-1.4152523268964747	-1.9720180263275515	-1.602074280221667	-1.5357109309149264	-1.6857084539710232	-1.4107676111736906	-1.577726815320307	-1.5665561513471262	-1.7271300576730813	-1.7006524803014382	-1.6456657706509767	-1.6308149173054614	-1.3211931841215923	-1.8004441656505312	-1.32674165188644	-1.3844089867543432	-1.380167918773956	-1.5393558092465789	0.17608290124496406	0.067457748645944	0.1441498537846515	-0.09429922878379049	0.21303952391813996	-0.020762573086402947	0.31502650413982525	0.3222441655346493	-0.3851918387540565	0.6452763744411114	0.21766529346732377	0.15554301214097044	0.14635264472444415	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr5:40487230..40487344,+__1970.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr5:40487230..40487344,+__1970.1.0.0	rs7725052	-1.0916029365239048	-1.0900963765122442	-0.8733234511190521	-1.0951137410375444	-1.1655799612748643	-0.9724193600842428	-1.5642224315306694	-1.3176879895048854	-1.200611279312767	-1.1976409624409277	-1.1793376464362453	-1.2730733551384483	-1.1683924575763165	-1.2542731557379134	-1.0113307425631437	-1.1037972117354322	-1.0129511024594016	-1.286227381915678	-0.6501184526971093	-1.154403826111147	-1.2695086332668495	-1.1198548499324872	-0.9933004084325616	-1.3181466765520342	-1.029788920331877	-1.100308446811303	-0.1626702192140086	0.07876563394910052	-0.23047376061638014	0.08216263857814288	-0.12064742064081369	0.32230090738713346	0.40981860541952253	0.04817935623803593	0.08075642938027983	0.20434055400836604	-0.13880903011578893	0.24328443480657125	0.06808401076501343	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:160137769..160137883,+__1972.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:160137769..160137883,+__1972.1.0.0	rs73802631	-1.6939299336455664	-1.931257661168512	-1.8401717800919513	-1.8505633010732234	-2.074214396992354	-1.8227256258441296	-1.8865844588052276	-1.818264554965157	-1.901708280301396	-1.8464952867215785	-2.0593570424599634	-1.8696979473634971	-1.88291418911938	-1.5921422336426063	-1.4961827746093246	-1.5937959916583235	-1.2763385118297703	-1.5921725345831619	-1.6902646854897383	-1.4681916638576578	-1.6147903433152904	-1.4511646089933248	-1.5547857738958613	-1.8823833363405529	-2.043403514634826	-1.6046346644042033	0.10178770000296011	0.43507488655918736	0.24637578843362773	0.5742247892434531	0.4820418624091922	0.13246094035439127	0.41839279494756987	0.20347421164986668	0.45054367130807127	0.2917095128257172	0.17697370611941055	-0.1737055672713288	0.27827952471517653	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:26126471..26126585,+__1973.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:26126471..26126585,+__1973.1.0.0	rs73393406	0.37763541425973546	0.6568869451502997	0.7243157527699461	0.5693437979254933	0.36161930693396577	0.5219081737771737	0.4416243007802527	0.5431706382161202	0.644151622562455	0.6919202038510596	0.6831297110238462	0.752485738242925	0.580682633791106	-0.0361530583694722	-0.2740032190092471	-0.045010418094566434	-0.4922621246740995	-0.5435212895289425	-0.26633448915863434	-0.6496018726672371	-0.4963158425973936	-0.19805048415880466	-0.10483021469592282	-0.29050372399987856	-0.3450932567743153	-0.31180666614404284	-0.41378847262920765	-0.9308901641595468	-0.7693261708645125	-1.0616059225995929	-0.9051405964629082	-0.788242662935808	-1.09122617344749	-1.0394864808135138	-0.8422021067212596	-0.7967504185469824	-0.9736334350237248	-1.0975789950172403	-0.892489299935149	0.0785847853765	9.86556518966e-05	0.00153065306427	0.00300328973882	0.00023411339895	0.00201342137527	0.000246746816615	3.14895644184e-05	0.000222088887318	2.96882111052e-05	0.000373410950373	5.62183900058e-05	2.25841681723e-30	1	0.0733998050111	1	1	0.180735543989	1	0.182345897478	0.0228929133322	0.171674709897	0.0233052457176	0.287153020837	0.0437941258145	1.89255329284e-27	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	not sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:26126471..26126585,+__1973.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:26126471..26126585,+__1973.1.0.0	rs198817	0.37763541425973546	0.6568869451502997	0.7243157527699461	0.5693437979254933	0.36161930693396577	0.5219081737771737	0.4416243007802527	0.5431706382161202	0.644151622562455	0.6919202038510596	0.6831297110238462	0.752485738242925	0.580682633791106	0.5077218489745711	0.5205572749908357	0.5765675295956497	0.5070343111607011	0.7028228780361104	0.5356800419304903	0.35650203391859764	0.5215715533824427	0.7663319098295172	0.7544862324814781	0.7685876444456362	0.7727866872543405	0.6075541621666977	0.1300864347148356	-0.13632967015946396	-0.14774822317429637	-0.0623094867647922	0.34120357110214466	0.013771868153316658	-0.08512226686165508	-0.021599084833677562	0.1221802872670622	0.06256602863041849	0.08545793342178998	0.020300949011415548	0.026871528375591498	0.382791178922	0.882577894566	0.382791178922	0.609889042629	0.0583274625199	0.687084607526	0.48504462162	0.727009731456	0.253741740693	0.925117039075	0.716953652062	0.8931878581	0.802834996123	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr6:26126471..26126585,+__1973.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:26126471..26126585,+__1973.1.0.0	rs73393406,rs198817	0.37763541425973546	0.6568869451502997	0.7243157527699461	0.5693437979254933	0.36161930693396577	0.5219081737771737	0.4416243007802527	0.5431706382161202	0.644151622562455	0.6919202038510596	0.6831297110238462	0.752485738242925	0.580682633791106	-0.049109926163199535	-0.1082876549949115	-0.06904478012605628	-0.17340055391490491	-0.26261983021688795	-0.06534937260547263	-0.28033633642290423	-0.2654163584537142	0.0989754694985896	-0.10879176103475503	-0.06607961373770517	-0.012735295411812156	-0.11351633446531117	-0.426745340422935	-0.7651746001452111	-0.7933605328960024	-0.7427443518403982	-0.6242391371508538	-0.5872575463826464	-0.721960637203157	-0.8085869966698345	-0.5451761530638654	-0.8007119648858146	-0.7492093247615514	-0.7652210336547371	-0.6941989682564172	0.0194743211566	0.000587432962331	0.000956291509096	0.0350255264852	0.00133155906714	0.00695778717972	0.0156538458129	0.0156538458129	0.000481108176159	5.30937746215e-05	4.46777109943e-05	9.86556518966e-05	4.62093098672e-24	1	0.118661458391	0.19030201031	1	0.272969608764	1	1	1	0.0991082842887	0.0110435051213	0.00915893075384	0.0203230642907	1.04895133399e-21	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:30650001..30650115,+__1974.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30650001..30650115,+__1974.1.0.0	rs9262142	0.6497258969431867	0.8926310777961014	0.7185941150125842	-0.08313541407100251	0.5356800419304903	0.44575453254261466	0.2993704334562903	0.3951995592469584	0.5513485314425107	0.3964654340629508	0.6609942878894215	0.4199520952688165	0.49021504929341025	-0.3708624620706316	-0.3272368825224137	-0.8318280454831457	-0.720928906255951	-0.9777587242081387	-0.8581654702969906	-0.7924541169704464	-0.625246782274032	-1.038981391326165	-0.7178028846684468	-0.8205608446370639	-0.7173418381657486	-0.7332640290732645	-1.0205883590138183	-1.2198679603185152	-1.5504221604957298	-0.6377934921849484	-1.513438766138629	-1.3039200028396052	-1.0918245504267368	-1.0204463415209903	-1.5903299227686758	-1.1142683187313975	-1.4815551325264855	-1.137293933434565	-1.223479078366675	0.0286240283844	0.000210645996816	0.000681115576796	0.0412580447575	9.33325531828e-05	0.000681115576796	0.00883703695038	0.000179550689913	1.73367966396e-05	3.97876883146e-05	2.63751008552e-05	0.00183882744533	1.08991328097e-28	1	0.156720621631	0.507431104713	1	0.0720527310572	0.520372300672	1	0.130533351567	0.0134013438024	0.031233335327	0.0202824525576	1	9.13347329454e-26	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:30720294..30720408,+__1975.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30720294..30720408,+__1975.1.0.0	rs28780111	-1.3996663143574688	-1.275353945831506	-1.2331597521126607	-1.4075554076661185	-1.439130152289085	-1.349737217286218	-1.336222162803498	-1.0737707297552013	-1.4971790189171674	-1.6184582789526734	-1.4484307807713888	-1.1383219413165184	-1.3514154751716252	-1.0518149472979337	-1.3429936300689713	-1.1554204616330301	-1.14793885061504	-1.2856551885448944	-1.437104779563418	-1.0951712774177351	-1.0993779079402548	-1.3742205578398463	-1.1618251168532892	-1.3441133762298838	-1.3792839220060533	-1.2395766680008624	0.3478513670595351	-0.06763968423746536	0.07773929047963057	0.25961655705107844	0.15347496374419056	-0.08736756227719988	0.24105088538576291	-0.025607178185053536	0.12295846107732111	0.4566331620993842	0.10431740454150495	-0.2409619806895349	0.11183880717076285	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:30731404..30731518,+__1976.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30731404..30731518,+__1976.1.0.0	rs77580845	0.17461291625568562	0.41863787923966733	0.5133635734393198	0.40341158485113104	0.4462103425404513	0.5706980558455615	0.6425292412549772	0.6879805015144523	0.636343513140872	0.6178774198248516	0.7023544873643064	0.6649791568269461	0.5399165560081852	-0.1867725152332122	-0.3708386677131632	-0.22119535217457875	-0.14416142432942686	-0.3766792568121953	-0.2517753799116269	-0.060968260264864356	-0.38005884063305617	-0.3831760878583993	-0.12475831384444622	-0.19227476243214398	-0.09991598800088605	-0.2327145707673333	-0.3613854314888978	-0.7894765469528305	-0.7345589256138986	-0.547573009180558	-0.8228895993526466	-0.8224734357571885	-0.7034975015198416	-1.0680393421475085	-1.0195196009992713	-0.7426357336692978	-0.8946292497964503	-0.7648951448278322	-0.7726311267755186	0.0296152123457	0.000531799681309	0.000373410950373	0.0120431385799	0.000373410950373	0.000104264461287	4.21654944787e-05	6.31017334604e-07	9.53931849178e-07	1.20184897547e-05	4.38836124619e-06	4.46777109943e-05	2.95194589873e-37	1	0.395658962894	0.278191158028	1	0.288273253688	0.0796580484233	0.0311603004197	0.000458749602257	0.000737389319415	0.00943451445741	0.00337464979832	0.0348039368646	2.47373066313e-34	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:30731404..30731518,+__1976.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30731404..30731518,+__1976.1.0.0	rs111325731	0.17461291625568562	0.41863787923966733	0.5133635734393198	0.40341158485113104	0.4462103425404513	0.5706980558455615	0.6425292412549772	0.6879805015144523	0.636343513140872	0.6178774198248516	0.7023544873643064	0.6649791568269461	0.5399165560081852	0.10327739947649013	0.4249268458891042	0.3657013593185421	0.46899742730414473	0.3314410068044094	0.455691111581472	0.36072593709249223	0.7112137705485841	0.5695741003849417	0.5419074759257975	0.5860656777443531	0.5659049907172622	0.4571189252322994	-0.07133551677919549	0.006288966649436845	-0.14766221412077774	0.06558584245301369	-0.11476933573604187	-0.11500694426408953	-0.281803304162485	0.02323326903413181	-0.06676941275593029	-0.0759699438990541	-0.11628880961995325	-0.09907416610968389	-0.08279763077588574	0.957167318493	0.935789553219	0.978575937473	0.809021331888	0.48504462162	0.519249062249	0.0619890035232	0.978575937473	0.609889042629	0.452098798395	0.313917214294	0.563691144959	0.969109253849	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:30731404..30731518,+__1976.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30731404..30731518,+__1976.1.0.0	rs13214831	0.17461291625568562	0.41863787923966733	0.5133635734393198	0.40341158485113104	0.4462103425404513	0.5706980558455615	0.6425292412549772	0.6879805015144523	0.636343513140872	0.6178774198248516	0.7023544873643064	0.6649791568269461	0.5399165560081852	0.04958439545821408	0.20181177336410866	0.1641027933075172	0.21414448519253595	0.13578902628663594	0.24610611134759652	0.6267717466950016	0.3462476070318191	0.32266451730273227	0.45636012617680377	0.45324192987882206	0.4428110248852972	0.304969628077257	-0.12502852079747154	-0.21682610587555867	-0.3492607801318026	-0.1892670996585951	-0.3104213162538153	-0.324591944497965	-0.01575749455997566	-0.3417328944826332	-0.31367899583813974	-0.1615172936480478	-0.24911255748548433	-0.22216813194164886	-0.2349469279309282	0.747262025795	0.129198935732	0.313917214294	0.554657938956	0.125844655769	0.0565651674203	0.154655491485	0.0763307839553	0.0959193233604	0.259370210024	0.0412580447575	0.340423946445	0.00179630615684	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr6:30731404..30731518,+__1976.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30731404..30731518,+__1976.1.0.0	rs77580845,rs111325731,rs13214831	0.17461291625568562	0.41863787923966733	0.5133635734393198	0.40341158485113104	0.4462103425404513	0.5706980558455615	0.6425292412549772	0.6879805015144523	0.636343513140872	0.6178774198248516	0.7023544873643064	0.6649791568269461	0.5399165560081852	-0.7489212960295344	-0.4077865538989842	-0.7942251621409957	-0.7412184482974877	-0.673501495878938	-0.5358006917322091	-0.6593448567671807	-0.36943127287678323	-0.16250872160306484	-0.38745618269160276	-0.3641105310678625	-0.5646711880334869	-0.5340813667515109	-0.92353421228522	-0.8264244331386515	-1.3075887355803155	-1.1446300331486188	-1.1197118384193894	-1.1064987475777706	-1.301874098022158	-1.0574117743912357	-0.7988522347439369	-1.0053336025164543	-1.066465018432169	-1.229650344860433	-1.073997922759696	0.000911503005752	7.67455399458e-05	2.13944772067e-06	2.79850783474e-05	5.66885732617e-06	2.78491922777e-06	4.45036519739e-07	4.98941474284e-06	1.2780782346e-05	6.76305944647e-07	1.41381335903e-07	2.1848397723e-07	3.47807732603e-53	0.176831583116	0.0155025990691	0.000425750096413	0.00528917980767	0.00116211575186	0.000559768764781	8.90073039478e-05	0.000972935874853	0.00263284116327	0.000140671636487	2.898317386e-05	4.50076993095e-05	7.89523553008e-51	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:30737519..30737633,+__1977.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30737519..30737633,+__1977.1.0.0	rs13217914	2.6166834505408154	2.801116222085973	2.349197182062952	2.3293846970731344	2.4123205659004103	2.4566565933591216	1.8867394052514856	2.154152673213124	2.3809447697649784	2.555365640203375	2.464566793995057	2.5295420472945436	2.411389170062081	1.8667527998928461	1.903669973026056	1.8297822750931876	1.734418078597244	1.7935392770706293	1.7813136975476898	1.2739389600065265	1.4327611459856582	1.678381635244317	1.88437628429093	1.6833445576665897	1.8129842975479948	1.7229385818308058	-0.7499306506479693	-0.8974462490599171	-0.5194149069697644	-0.5949666184758904	-0.618781288829781	-0.6753428958114318	-0.6128004452449591	-0.721391527227466	-0.7025631345206613	-0.6709893559124449	-0.7812222363284671	-0.7165577497465487	-0.6884505882312751	4.77393269186e-07	2.1848397723e-07	4.21654944787e-05	4.73314572056e-05	5.1947018217e-09	4.29483083715e-08	1.1701294631e-06	2.03284743013e-07	9.09364429293e-09	1.02132784807e-06	3.86551195752e-07	2.78491922777e-06	2.5697155785e-64	0.000337994434584	0.000162552079059	0.0314132933866	0.0348832839605	4.01030980636e-06	3.28125075958e-05	0.000864725673234	0.00014778800817	7.02938703843e-06	0.000801742360734	0.000297257869533	0.00216945207843	2.15342165479e-61	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:30737519..30737633,+__1977.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30737519..30737633,+__1977.1.0.0	rs3095337	2.6166834505408154	2.801116222085973	2.349197182062952	2.3293846970731344	2.4123205659004103	2.4566565933591216	1.8867394052514856	2.154152673213124	2.3809447697649784	2.555365640203375	2.464566793995057	2.5295420472945436	2.411389170062081	1.7847985073807437	1.895498098074214	1.676856369922477	1.4788856055636603	1.81778444462483	1.828552586278457	1.3586172746494718	1.3398087012328141	1.684138859730457	1.7967941198241504	1.7038905183520188	1.7672659248305689	1.677740917538655	-0.8318849431600717	-0.9056181240117591	-0.672340812140475	-0.8504990915094741	-0.5945361212755804	-0.6281040070806645	-0.5281221306020139	-0.81434397198031	-0.6968059100345214	-0.7585715203792245	-0.7606762756430381	-0.7622761224639747	-0.7336482525234255	5.49047958631e-07	3.86551195752e-07	1.44459868922e-05	2.60794292158e-06	1.06544395451e-08	8.39899322416e-09	2.34155615835e-05	2.03284743013e-07	7.83613533137e-08	1.05403470168e-07	8.9082802627e-07	5.31875791367e-06	2.20269690335e-64	0.000388725954711	0.000287594089639	0.0107622602347	0.0019220539332	8.22522732883e-06	6.41683082326e-06	0.0173041000102	0.00014778800817	6.05733261115e-05	8.27417240823e-05	0.000685046752202	0.00414331241475	1.845860005e-61	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr6:30737519..30737633,+__1977.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30737519..30737633,+__1977.1.0.0	rs13217914,rs3095337	2.6166834505408154	2.801116222085973	2.349197182062952	2.3293846970731344	2.4123205659004103	2.4566565933591216	1.8867394052514856	2.154152673213124	2.3809447697649784	2.555365640203375	2.464566793995057	2.5295420472945436	2.411389170062081	1.0640733365698434	1.229618259574559	0.8812944200728412	0.8913942652476631	1.0299354069456124	1.086179200813782	0.5974474766716368	0.599869877454619	0.8338419872974552	1.0353539481840999	0.9201102840560189	0.7870414486193853	0.9130133259589598	-1.552610113970972	-1.571497962511414	-1.4679027619901108	-1.4379904318254715	-1.382385158954798	-1.3704773925453395	-1.289291928579849	-1.5542827957585053	-1.5471027824675232	-1.520011692019275	-1.544456509939038	-1.7425005986751583	-1.498375844103121	9.67857429079e-11	3.94417375905e-11	6.55420316999e-10	8.4513782373e-10	6.82483302974e-12	6.21192327504e-12	5.07485509439e-10	3.6020412458e-11	1.08960636655e-11	3.28900554275e-11	2.74073014017e-11	3.6020412458e-11	6.24612370511e-111	1.87764341241e-08	7.96723099328e-09	1.30428643083e-07	1.59731048685e-07	1.3990907711e-09	1.24859657828e-09	1.01497101888e-07	7.02398042932e-09	2.2445891151e-09	6.84113152892e-09	5.61849678736e-09	7.42020496636e-09	1.41787008106e-108	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:31705830..31705944,+__1978.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:31705830..31705944,+__1978.1.0.0	rs3101018	-0.16871899573728588	-0.10580835328776658	-0.2440701006064087	-0.12262004072548385	0.04304472874736076	0.06336115989211973	0.09946474581442448	0.08108692393494456	-0.2666359340926548	0.17301122866875598	0.26325220432047136	0.22501248392332185	0.0033650042376498954	-1.205429673791783	-0.8473674910072733	-1.385774127619606	-0.8892941226604283	-1.263336741609125	-1.0350977159093855	-1.1837591599132844	-1.1336393628760124	-1.1814255923010897	-0.9628069972205003	-1.08429006710257	-1.087209132911923	-1.1049525154102484	-1.036710678054497	-0.7415591377195067	-1.1417040270131973	-0.7666740819349445	-1.3063814703564858	-1.0984588758015053	-1.2832239057277088	-1.214726286810957	-0.9147896582084349	-1.1358182258892564	-1.3475422714230412	-1.3122216168352447	-1.1083175196478983	2.32766076754e-08	5.49047958631e-07	2.44114216019e-06	0.000481108176159	1.75236973871e-06	1.35890743059e-05	3.60162929514e-07	2.03284743013e-07	2.28582318034e-06	1.25214566711e-06	2.13944772067e-06	1.093294991e-06	1.88106494348e-58	1.64798382342e-05	0.000408491681222	0.00181865090935	0.354576725829	0.00135282943828	0.0103820527697	0.000266160404911	0.00014778800817	0.0017669413184	0.000982934348685	0.00164523529719	0.000851676797987	1.57633242264e-55	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.0.0	rs4380799	-0.8351240383225004	-1.1706334591918834	-0.9323399365627142	-0.7345371595757658	-1.2421834598841075	-0.8321464005136708	-0.7901643382346835	-0.9560952089153656	-0.977396834327655	-0.7995888374836106	-1.0836360421380788	-0.9322749724242596	-0.9405100572978581	-0.9758452431303376	-1.0163988287335748	-1.0210790775685372	-1.285899991912258	-0.994806208210363	-1.0774004129428922	-0.9296093461241711	-1.362550770333954	-1.1665308468245656	-0.9618040356904376	-1.2256377582089275	-1.1792361818739956	-1.0997332251295013	-0.14072120480783723	0.15423463045830865	-0.08873914100582303	-0.5513628323364922	0.24737725167374447	-0.2452540124292214	-0.13944500788948766	-0.4064555614185885	-0.18913401249691064	-0.16221519820682695	-0.14200171607084866	-0.24696120944973599	-0.15922316783164325	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.0.0	rs9270894	-0.8351240383225004	-1.1706334591918834	-0.9323399365627142	-0.7345371595757658	-1.2421834598841075	-0.8321464005136708	-0.7901643382346835	-0.9560952089153656	-0.977396834327655	-0.7995888374836106	-1.0836360421380788	-0.9322749724242596	-0.9405100572978581	-1.3712911294592298	-1.173839312860982	-1.197552517840473	-1.390300414585525	-1.2070415789572972	-1.345526826853455	-1.0281141907491005	-1.028003105127359	-0.8770765580131408	-1.1697404853458826	-1.1410813776806898	-1.50732352742491	-1.2030742520748372	-0.5361670911367294	-0.003205853669098646	-0.2652125812777587	-0.6557632550097591	0.035141880926810254	-0.5133804263397842	-0.23794985251441703	-0.07190789621199345	0.10032027631451423	-0.37015164786227195	-0.057445335542611	-0.5750485550006503	-0.26256419477697907	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.0.0	rs9270895	-0.8351240383225004	-1.1706334591918834	-0.9323399365627142	-0.7345371595757658	-1.2421834598841075	-0.8321464005136708	-0.7901643382346835	-0.9560952089153656	-0.977396834327655	-0.7995888374836106	-1.0836360421380788	-0.9322749724242596	-0.9405100572978581	-0.9294445393238665	-0.7037423841499194	-0.9359539427447825	-1.0986127410035469	-1.2258730714479003	-1.2702418846579362	-1.0957009299540963	-1.0613902535102684	-1.0567602333453523	-1.1260021814491923	-1.0331854633723991	-1.0846457184518097	-1.0517961119509225	-0.09432050100136613	0.46689107504196403	-0.003614006182068308	-0.36407558142778107	0.016310388436207246	-0.43809548414426536	-0.30553659171941283	-0.1052950445949028	-0.07936339901769729	-0.32641334396558164	0.05045057876567971	-0.15237074602755007	-0.11128605465306456	NA__no_active_tile	0.00210630874131	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00210630874131	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.0.0	rs9270896	-0.8351240383225004	-1.1706334591918834	-0.9323399365627142	-0.7345371595757658	-1.2421834598841075	-0.8321464005136708	-0.7901643382346835	-0.9560952089153656	-0.977396834327655	-0.7995888374836106	-1.0836360421380788	-0.9322749724242596	-0.9405100572978581	-0.9855517913379404	-1.2424859658326706	-1.4985066457545986	-0.9580080225447004	-1.0359538771048789	-1.4500038805620372	-1.2309719358661524	-0.6868828114500092	-0.7571948780405227	-1.0170626523885686	-0.9184539775580534	-0.8716630136558523	-1.0543949543413322	-0.15042775301543998	-0.07185250664078713	-0.5661667091918844	-0.2234708629689346	0.20622958277922865	-0.6178574800483664	-0.44080759763146893	0.2692123974653564	0.22020195628713235	-0.21747381490495798	0.1651820645800255	0.060611958768407304	-0.11388489704347408	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.5.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.0.0	rs9270897	-0.8351240383225004	-1.1706334591918834	-0.9323399365627142	-0.7345371595757658	-1.2421834598841075	-0.8321464005136708	-0.7901643382346835	-0.9560952089153656	-0.977396834327655	-0.7995888374836106	-1.0836360421380788	-0.9322749724242596	-0.9405100572978581	-0.620844677868529	-0.6680109753521892	-0.5277645780042428	-0.9539538058083781	-0.8293808079986429	-0.6803977896606521	-0.3809654423476986	-0.621155009754967	-0.3753580353369309	-0.9910687831051922	-0.4105939262952295	-0.5350512076022548	-0.6328787532612422	0.21427936045397133	0.5026224838396942	0.4045753585584714	-0.21941664623261226	0.4128026518854646	0.15174861085301872	0.4091988958869849	0.33494019916039863	0.6020387989907241	-0.19147994562158155	0.6730421158428493	0.39722376482200483	0.30763130403661565	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.87199428352	0.619322774121	NA__no_active_tile	0.0101308914712	NA__no_active_tile	0.101398170673	NA__no_active_tile	0.14057065259	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.6.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.0.0	rs4566915	-0.8351240383225004	-1.1706334591918834	-0.9323399365627142	-0.7345371595757658	-1.2421834598841075	-0.8321464005136708	-0.7901643382346835	-0.9560952089153656	-0.977396834327655	-0.7995888374836106	-1.0836360421380788	-0.9322749724242596	-0.9405100572978581	-1.6656380849384689	-1.0707285372689928	-1.0646585289367267	-1.6453892760131292	-1.4747377543852658	-1.238124368505527	-1.2254076713094382	-1.148212225540878	-0.9905094871315805	-1.1055039264218585	-1.2203202019069117	-1.477453639430965	-1.277223641815812	-0.8305140466159685	0.09990492192289069	-0.13231859237401256	-0.9108521164373634	-0.23255429450115828	-0.40597796799185615	-0.4352433330747547	-0.1921170166255124	-0.013112652803925484	-0.3059150889382478	-0.13668415976883286	-0.5451786670067054	-0.3367135845179539	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.7.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.0.0	rs9270898	-0.8351240383225004	-1.1706334591918834	-0.9323399365627142	-0.7345371595757658	-1.2421834598841075	-0.8321464005136708	-0.7901643382346835	-0.9560952089153656	-0.977396834327655	-0.7995888374836106	-1.0836360421380788	-0.9322749724242596	-0.9405100572978581	0.7366106361146393	0.9116551463897586	1.0736234980804689	0.9755772512105296	0.8306922906913545	0.9536899937168264	1.0304271849764053	1.1983526181284618	0.9853897894505532	0.9230938218934004	0.8793379779049765	0.8808192311039202	0.948272453305108	1.5717346744371397	2.082288605581642	2.005963434643183	1.7101144107862956	2.072875750575462	1.7858363942304973	1.8205915232110887	2.1544478270438274	1.9627866237782081	1.722682659377011	1.9629740200430552	1.8130942035281798	1.8887825106029659	1.1701294631e-06	3.86551195752e-07	2.91018140898e-07	1.06220766775e-05	2.03219739795e-07	9.38141513904e-06	1.73329520427e-05	1.05403470168e-07	5.38827834679e-08	5.8094165088e-08	1.25214566711e-06	2.13944772067e-06	3.47336533957e-62	0.000828451659877	0.000287594089639	0.000216808514969	0.00782847051128	0.000156885639121	0.00716740116623	0.0128090515596	7.66283228125e-05	4.16513916207e-05	4.56039195941e-05	0.000962900018011	0.0016666297744	2.91068015456e-59	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.8.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.0.0	rs4367411	-0.8351240383225004	-1.1706334591918834	-0.9323399365627142	-0.7345371595757658	-1.2421834598841075	-0.8321464005136708	-0.7901643382346835	-0.9560952089153656	-0.977396834327655	-0.7995888374836106	-1.0836360421380788	-0.9322749724242596	-0.9405100572978581	-0.907695514747612	-1.1748716731290825	-1.4191291654917748	-1.5674097015152693	-0.7467077046277971	-1.1813212494349599	-1.2596302516967022	-1.0863256767899965	-0.9804832232319955	-0.9337067267138082	-1.1908546539995568	-1.0660242526817751	-1.126179982838361	-0.07257147642511164	-0.004238213937199031	-0.4867892289290606	-0.8328725419395034	0.4954757552563104	-0.349174848921289	-0.4694659134620187	-0.13023046787463088	-0.0030863889043405424	-0.13411788923019752	-0.10721861186147796	-0.13374928025751553	-0.1856699255405029	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.9.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.0.0	rs9270900	-0.8351240383225004	-1.1706334591918834	-0.9323399365627142	-0.7345371595757658	-1.2421834598841075	-0.8321464005136708	-0.7901643382346835	-0.9560952089153656	-0.977396834327655	-0.7995888374836106	-1.0836360421380788	-0.9322749724242596	-0.9405100572978581	-1.1974364227182603	-1.6858929348292073	-1.565663461344266	-0.8342001095035911	-1.5188771313149667	-1.3205189041482797	-1.451208794720439	-1.4124395806751988	-1.3459376977397495	-1.2479440159400463	-1.9762195598676888	-1.2780233371422116	-1.4028634958286588	-0.36231238439575997	-0.5152594756373239	-0.6333235247815517	-0.09966294992782532	-0.2766936714308592	-0.4883725036346088	-0.6610444564857556	-0.4563443717598332	-0.36854086341209447	-0.4483551784564357	-0.89258351772961	-0.345748364717952	-0.46235343853080096	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.10.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.0.0	rs9270901	-0.8351240383225004	-1.1706334591918834	-0.9323399365627142	-0.7345371595757658	-1.2421834598841075	-0.8321464005136708	-0.7901643382346835	-0.9560952089153656	-0.977396834327655	-0.7995888374836106	-1.0836360421380788	-0.9322749724242596	-0.9405100572978581	-1.257089066966313	-1.28792966564947	-0.7627404353295044	-0.8952600453887295	-0.9255967181420257	-0.44504822370999286	-0.5303150648173492	-0.6379957264582916	-0.8582516470352273	-0.7316106943028576	-1.2256377582089275	-0.5107988004350658	-0.8390228205369795	-0.4219650286438127	-0.11729620645758665	0.16959950123320977	-0.16072288581296368	0.3165867417420818	0.387098176803678	0.2598492734173342	0.318099482457074	0.11914518729242773	0.06797814318075301	-0.14200171607084866	0.42147617198919385	0.10148723676087838	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.10.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571851..32571965,+__1979.1.0.0	rs4380799,rs9270894,rs9270895,rs9270896,rs9270897,rs4566915,rs9270898,rs4367411,rs9270900,rs9270901,rs17425622,rs9270902	-0.8351240383225004	-1.1706334591918834	-0.9323399365627142	-0.7345371595757658	-1.2421834598841075	-0.8321464005136708	-0.7901643382346835	-0.9560952089153656	-0.977396834327655	-0.7995888374836106	-1.0836360421380788	-0.9322749724242596	-0.9405100572978581	1.1142641985437118	1.0704811239706669	1.209178919357092	0.6511012442046036	1.0132525682849178	1.1220329097603956	1.3785058962034311	1.163421566889936	1.2596393270205883	1.1821995604081297	1.3626841550697428	1.2352802400455978	1.1468368091465677	1.9493882368662123	2.2411145831625503	2.141518855919806	1.3856384037803693	2.2554360281690253	1.9541793102740663	2.168670234438115	2.1195167758053017	2.2370361613482435	1.9817883978917403	2.4463201972078217	2.1675552124698574	2.087346866444426	2.15438690979e-08	1.7063912625e-08	1.5208503355e-07	1.8732392437e-06	6.26237314719e-08	3.61506667287e-06	7.77479363285e-06	6.10128619781e-09	3.46395922999e-09	8.39899322416e-09	1.22116804654e-07	2.94200293519e-09	4.30827240489e-74	4.179510605e-06	3.44691035025e-06	3.02649216765e-05	0.000354042217059	1.28378649517e-05	0.000726628401248	0.00155495872657	1.18975080857e-06	7.13575601377e-07	1.74699059062e-06	2.5033944954e-05	6.06052604649e-07	9.77977835911e-72	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.0.0	rs9271164	-0.9277968011397196	-0.8111113332683576	-0.7831555727462507	-0.997152914819877	-0.9637611177247388	-1.2034712274987658	-0.79722826383065	-0.3755520372424805	-1.0614981154186052	-0.769695185528547	-1.2741344646890371	-0.8733747712339799	-0.9031609837617509	-1.1098343338727072	-1.2109060329867485	-1.1960421932875491	-1.1769444742014266	-1.237175294188931	-1.3410443485923091	-0.6531990265423683	-1.277473207244202	-1.3205189041482797	-1.2576779356844878	-1.043374372470087	-1.0413754052129327	-1.1554637940360022	-0.18203753273298762	-0.3997946997183909	-0.41288662054129843	-0.17979155938154956	-0.2734141764641921	-0.13757312109354336	0.14402923728828176	-0.9019211700017216	-0.2590207887296745	-0.48798275015594084	0.2307600922189501	-0.16800063397895282	-0.2523028102742517	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.0.0	rs9271165	-0.9277968011397196	-0.8111113332683576	-0.7831555727462507	-0.997152914819877	-0.9637611177247388	-1.2034712274987658	-0.79722826383065	-0.3755520372424805	-1.0614981154186052	-0.769695185528547	-1.2741344646890371	-0.8733747712339799	-0.9031609837617509	-0.7959229928416359	-1.1647379200114458	-0.641471209056983	-1.2556072078222942	-0.7487140241453322	-1.3955459213798938	-1.0595116982632233	-0.9012193151628526	-1.1826999594979375	-1.5908941246093466	-1.3089921041856891	-1.363350467564974	-1.117388912045134	0.1318738082980837	-0.3536265867430882	0.14168436368926773	-0.2584542930024172	0.21504709357940666	-0.19207469388112797	-0.2622834344325733	-0.5256672779203722	-0.12120184407933232	-0.8211989390807997	-0.03485763949665199	-0.489975696330994	-0.21422792828338322	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.0.0	rs9271166	-0.9277968011397196	-0.8111113332683576	-0.7831555727462507	-0.997152914819877	-0.9637611177247388	-1.2034712274987658	-0.79722826383065	-0.3755520372424805	-1.0614981154186052	-0.769695185528547	-1.2741344646890371	-0.8733747712339799	-0.9031609837617509	-0.43968574212472344	-1.1233648466207826	-0.9763934061407942	-0.6104134377147599	-1.1944398166351662	-1.2352250140631698	-1.4248112243524353	-0.5729647518489251	-0.969816275888229	-1.3628593372361328	-1.3955053524167382	-0.9802559577568042	-1.0238112635665548	0.4881110590149962	-0.312253513352425	-0.19323783339454348	0.38673947710511714	-0.23067869891042736	-0.031753786564403974	-0.6275829605217853	-0.19741271460644466	0.09168183953037612	-0.5931641517075859	-0.1213708877277011	-0.1068811865228243	-0.12065027980480429	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.0.0	rs56245106	-0.9277968011397196	-0.8111113332683576	-0.7831555727462507	-0.997152914819877	-0.9637611177247388	-1.2034712274987658	-0.79722826383065	-0.3755520372424805	-1.0614981154186052	-0.769695185528547	-1.2741344646890371	-0.8733747712339799	-0.9031609837617509	-1.0348941347703586	-1.154299945020075	-1.35947788961729	-1.6791042337513211	-1.0029700056938684	-0.820783643651727	-1.6744849198417247	-1.298967874371789	-0.9554364565135492	-0.8121716476649743	-1.3703783820097095	-1.4563664319821465	-1.2182779637407113	-0.107097333630639	-0.34318861175171744	-0.5763223168710394	-0.6819513189314441	-0.03920888796912958	0.3826875838470388	-0.8772566560110746	-0.9234158371293084	0.10606165890505592	-0.042476462136427307	-0.09624391732067239	-0.5829916607481667	-0.3151169799789603	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.5.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.0.0	rs13206219	-0.9277968011397196	-0.8111113332683576	-0.7831555727462507	-0.997152914819877	-0.9637611177247388	-1.2034712274987658	-0.79722826383065	-0.3755520372424805	-1.0614981154186052	-0.769695185528547	-1.2741344646890371	-0.8733747712339799	-0.9031609837617509	-0.8425973330576993	-1.2726885233773388	-1.3527594324751275	-0.969816275888229	-1.0160562978471879	-1.2101667151176434	-0.3825606879059253	-1.1797439400636474	-1.3378139213440985	-0.9246589046325998	-0.8562021215450097	-1.1978348847916425	-1.0452415865038456	0.08519946808202028	-0.46157719010898124	-0.5696038597288768	0.02733663893164795	-0.05229518012244905	-0.006695487618877616	0.41466757592472475	-0.8041919028211668	-0.2763158059254933	-0.15496371910405282	0.4179323431440274	-0.3244601135576626	-0.142080602742095	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.6.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.0.0	rs9271168	-0.9277968011397196	-0.8111113332683576	-0.7831555727462507	-0.997152914819877	-0.9637611177247388	-1.2034712274987658	-0.79722826383065	-0.3755520372424805	-1.0614981154186052	-0.769695185528547	-1.2741344646890371	-0.8733747712339799	-0.9031609837617509	-1.0198390435042373	-0.6646943320519634	-0.9141300693965044	-1.429267192102122	-0.7867074175128164	-1.0280369122464688	-1.183165769177668	-0.7277600688017606	-1.096278227356805	-0.7148145454133229	-1.104825058431619	-1.1792361818739956	-0.9873962348224402	-0.09204224236451763	0.14641700121639423	-0.13097449665025374	-0.43211427728224505	0.17705370021192246	0.17543431525229702	-0.385937505347018	-0.3522080315592801	-0.034780111938199854	0.05488064011522409	0.16930940625741808	-0.3058614106400157	-0.08423525106068952	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.7.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.0.0	rs673336	-0.9277968011397196	-0.8111113332683576	-0.7831555727462507	-0.997152914819877	-0.9637611177247388	-1.2034712274987658	-0.79722826383065	-0.3755520372424805	-1.0614981154186052	-0.769695185528547	-1.2741344646890371	-0.8733747712339799	-0.9031609837617509	-0.7221510921189673	-1.1453888145476223	-1.427527218414271	-0.6533546633292637	-1.0345724649341586	-1.0368449099256474	-1.5758943595837476	-1.1303329792688048	-0.6130534058299005	-1.0870951818131636	-0.9649607953334292	-0.7687852367919177	-1.0133300934909075	0.2056457090207523	-0.3342774812792647	-0.6443716456680204	0.34379825149061327	-0.07081134720941973	0.1666263175731184	-0.7786660957530975	-0.7547809420263243	0.44844470958870464	-0.31739999628461657	0.30917366935560797	0.1045895344420622	-0.11016910972915701	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.7.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577762..32577876,+__1980.1.0.0	rs9271164,rs9271165,rs9271166,rs56245106,rs13206219,rs9271168,rs673336,rs60080738	-0.9277968011397196	-0.8111113332683576	-0.7831555727462507	-0.997152914819877	-0.9637611177247388	-1.2034712274987658	-0.79722826383065	-0.3755520372424805	-1.0614981154186052	-0.769695185528547	-1.2741344646890371	-0.8733747712339799	-0.9031609837617509	-0.7957364094753704	-0.8304683186508508	-1.2097982362022677	-1.3994527593969077	-1.5396311478981524	-1.4876802366321156	-0.6522101906366008	-1.881729953909852	-1.4011303374109834	-0.8457071515181511	-1.3433232972806437	-1.8331126836813607	-1.2683317268911047	0.13206039166434924	-0.019356985382493197	-0.426642663456017	-0.4022998445770307	-0.5758700301734135	-0.2842090091333498	0.14501807319404925	-1.5061779166673714	-0.3396322219923782	-0.07601196598960414	-0.06918883259160657	-0.9597379124473808	-0.3651707431293539	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:86114662..86114776,+__1981.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:86114662..86114776,+__1981.1.0.0	rs9450269	-0.9817545438674018	-1.1946484688619727	-0.9060774040274752	-0.90369460169142	-1.435692468490054	-1.3696616412972422	-1.673769398855069	-1.3845793283551515	-1.2662998863410473	-1.3291545142260723	-1.5683987447965893	-1.0023298991438083	-1.2513384083294419	-1.3317006141195304	-1.4959143646818638	-1.6529100001357564	-1.8302508080244888	-1.3628939637500646	-2.2116964064665283	-1.401072871039903	-1.6409785315696528	-1.8888597282110275	-1.7476186422449913	-1.6253067539242083	-1.5142084470851809	-1.6419509276044328	-0.34994607025212865	-0.30126589581989105	-0.7468325961082812	-0.9265562063330688	0.0727985047399895	-0.8420347651692861	0.27269652781516607	-0.25639920321450127	-0.6225598418699803	-0.41846412801891897	-0.056908009127619064	-0.5118785479413726	-0.390612519274991	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:86114662..86114776,+__1981.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:86114662..86114776,+__1981.1.0.0	rs9450270	-0.9817545438674018	-1.1946484688619727	-0.9060774040274752	-0.90369460169142	-1.435692468490054	-1.3696616412972422	-1.673769398855069	-1.3845793283551515	-1.2662998863410473	-1.3291545142260723	-1.5683987447965893	-1.0023298991438083	-1.2513384083294419	-1.6371773445893907	-1.2622137354699816	-1.758105426881372	-1.47685093881212	-1.7293117794119017	-1.5705683260700969	-1.7013923028491136	-1.4835041858875693	-1.6557548653656982	-1.7028156645315873	-1.9333499544022883	-1.5493033865839383	-1.6216956592379212	-0.6554228007219889	-0.06756526660800888	-0.8520280228538969	-0.5731563371207	-0.2936193109218477	-0.20090668477285467	-0.027622903994044545	-0.09892485753241775	-0.38945497902465087	-0.37366115030551494	-0.36495120960569905	-0.54697348744013	-0.3703572509084796	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr6:86114662..86114776,+__1981.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:86114662..86114776,+__1981.1.0.0	rs9450269,rs9450270	-0.9817545438674018	-1.1946484688619727	-0.9060774040274752	-0.90369460169142	-1.435692468490054	-1.3696616412972422	-1.673769398855069	-1.3845793283551515	-1.2662998863410473	-1.3291545142260723	-1.5683987447965893	-1.0023298991438083	-1.2513384083294419	-1.0964045939608371	-1.3727464630782595	-1.3709142419632696	-1.1474995155768546	-1.5308288026516068	-0.9816456043540284	-0.9632042448403868	-1.034371304124127	-1.6727968794946673	-1.0487498811931835	-1.4451404327634099	-1.5035165175700094	-1.2639848734642198	-0.11465005009343532	-0.1780979942162868	-0.46483683793579444	-0.24380491388543457	-0.09513633416155276	0.38801603694321385	0.7105651540146822	0.3502080242310246	-0.40649699315362	0.2804046330328889	0.12325831203317938	-0.501186618426201	-0.012646465134777999	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:1894873..1894987,+__1982.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:1894873..1894987,+__1982.1.0.0	rs11768541	-0.7834481287942459	-0.8655321536607915	-0.7804728625138799	-1.04509397171848	-1.249255014396737	-1.0655386970499974	-1.0663487950282176	-1.1706857982919612	-0.9088442288778482	-0.7387901976350546	-0.9356977125495471	-0.6115536399794539	-0.9351051000413512	-1.3614443893977055	-0.8325697743918488	-0.9737497055265142	-0.6059396342626765	-1.1076948278624488	-1.1459255507536892	-0.631727907975335	-1.1319048538160288	-1.128586173128133	-0.94451543038748	-1.1671653535930455	-0.918575738507	-0.995816611633492	-0.5779962606034597	0.03296237926894274	-0.19327684301263426	0.43915433745580346	0.14156018653428815	-0.08038685370369181	0.4346208870528826	0.03878094447593239	-0.21974194425028482	-0.20572523275242538	-0.23146764104349837	-0.30702209852754614	-0.06071151159214092	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:75947478..75947592,+__1983.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:75947478..75947592,+__1983.1.0.0	rs7787526	1.7740128787245086	2.054387244172082	1.9690140675441894	1.4698049890888205	1.9625397858568796	1.9331315731304224	1.8870750733932764	1.945414436802797	1.9415053384733931	2.0168432671074767	1.956557539781958	1.9932395535907497	1.9086271456388797	2.110336208462602	2.5857854839528978	2.074626239961512	2.0397217919842228	2.248628717502121	2.249883141873503	2.2332919253157284	2.420141807936914	2.3104397053685624	2.3784707407295045	2.52602306108464	2.3586023553720814	2.2946625982953575	0.3363233297380934	0.5313982397808159	0.10561217241732246	0.5699168028954023	0.2860889316452413	0.3167515687430804	0.346216851922452	0.4747273711341169	0.36893436689516923	0.36162747362202774	0.569465521302682	0.36536280178133174	0.38603545265647793	0.270885072145	0.545696106059	0.677233097055	0.0856734395523	0.412754243182	0.104229562843	0.563691144959	0.107123399254	0.166665831608	0.276771967065	0.13967914143	0.340423946445	0.0214141284127	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr8:39797592..39797706,+__1984.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr8:39797592..39797706,+__1984.1.0.0	rs11773975	-1.1040153028896544	-1.1250142237289293	-1.3395007762659312	-1.479516940265416	-1.3452234435580817	-1.4242664730982897	-1.5595318578231987	-1.253245265617102	-1.422244438591445	-1.3723419699354698	-1.3872838858724468	-1.2036660264810566	-1.334654217010585	-1.5846598388195599	-1.287677539841499	-1.520329537984415	-1.2677776610329876	-1.4364578889710131	-1.1685045339927738	-1.0947296486304112	-1.3225273437305625	-1.3893629533827343	-1.179519210257865	-0.9388058939340288	-1.1717155549388913	-1.2801723004597287	-0.4806445359299054	-0.16266331611256968	-0.18082876171848383	0.2117392792324284	-0.09123444541293146	0.2557619391055159	0.4648022091927875	-0.06928207811346043	0.0328814852087107	0.19282275967760465	0.448477991938418	0.03195047154216524	0.05448191655085663	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr8:39797592..39797706,+__1984.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr8:39797592..39797706,+__1984.1.0.0	rs11773975,rs11777082	-1.1040153028896544	-1.1250142237289293	-1.3395007762659312	-1.479516940265416	-1.3452234435580817	-1.4242664730982897	-1.5595318578231987	-1.253245265617102	-1.422244438591445	-1.3723419699354698	-1.3872838858724468	-1.2036660264810566	-1.334654217010585	-1.5375286057021194	-1.212179040251735	-1.5462963596132602	-1.46517082578517	-1.5284474775002572	-1.2780387729333054	-1.3538915993989589	-1.5812171109488027	-1.520416479586233	-1.415211778199817	-1.4001967036545457	-1.5523768733862209	-1.4492476355800354	-0.4335133028124649	-0.08716481652280561	-0.20679558334732895	0.01434611448024592	-0.18322403394217557	0.14622770016498432	0.20564025842423983	-0.32797184533170065	-0.09817204099478793	-0.042869808264347276	-0.012912817782098962	-0.3487108469051643	-0.11459341856945034	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr9:35604089..35604203,+__1985.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr9:35604089..35604203,+__1985.1.0.0	rs2297877	1.381827910103988	1.7367531172918724	1.697720710179535	1.5983109953635366	1.6840389756499636	1.748685906630866	1.5535043070607495	1.8485337381454867	1.7910457658766954	1.7441777139018368	1.7067411006184328	1.733770421909039	1.6854258885610003	1.684616063341678	2.115146652688184	1.658974073110531	1.564586735767917	1.6929264158566002	1.6675408418580473	1.8080851712027932	1.8529390925657463	1.7179905951074481	1.688552177741654	1.66599391532601	1.74113370770129	1.7382071201889915	0.3027881532376899	0.3783935353963117	-0.038746637069004164	-0.03372425959561953	0.008887440206636565	-0.08114506477281869	0.25458086414204373	0.004405354420259577	-0.07305517076924728	-0.05562553616018295	-0.04074718529242283	0.007363285792250984	0.05278123162799142	0.188220673538	0.29495293544	0.554657938956	0.545696106059	0.609889042629	0.460214637573	0.412754243182	0.946473618223	0.829896383209	0.66743649171	0.90381429355	0.87199428352	0.88870762539	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr9:35604089..35604203,+__1985.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr9:35604089..35604203,+__1985.1.0.0	rs77724180	1.381827910103988	1.7367531172918724	1.697720710179535	1.5983109953635366	1.6840389756499636	1.748685906630866	1.5535043070607495	1.8485337381454867	1.7910457658766954	1.7441777139018368	1.7067411006184328	1.733770421909039	1.6854258885610003	1.6313780462040952	1.8614610046925972	1.628338432346307	1.5925302140278923	1.756547710164327	1.646349152794671	1.5496590058008586	1.8547544962211582	1.7424109819067897	1.683567722947417	1.686901066645293	1.7072633129510497	1.6950967622252044	0.24955013610010712	0.1247078874007248	-0.06938227783322803	-0.005780781335644303	0.07250873451436335	-0.102336753836195	-0.0038453012598909098	0.006220758075671462	-0.048634783969905726	-0.06060999095441977	-0.019840033973139715	-0.026507108957989356	0.009670873664204493	1.0	0.48504462162	0.66743649171	0.405136064622	0.76769033028	0.436112310787	0.657696241675	0.29495293544	0.79863356553	0.245454024731	0.978575937473	0.88258056334	1.0	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr9:35604089..35604203,+__1985.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr9:35604089..35604203,+__1985.1.0.0	rs2297877,rs77724180	1.381827910103988	1.7367531172918724	1.697720710179535	1.5983109953635366	1.6840389756499636	1.748685906630866	1.5535043070607495	1.8485337381454867	1.7910457658766954	1.7441777139018368	1.7067411006184328	1.733770421909039	1.6854258885610003	1.6481087898291151	1.8460170395346571	1.6620156058712114	1.5054019616140386	1.7530908728824435	1.6785493158058566	1.6296483440250404	1.838531943498619	1.7067530267485067	1.7407203381322711	1.6359162139119476	1.7378766533255106	1.6985525087649351	0.26628087972512704	0.1092639222427847	-0.03570510430832363	-0.092909033749498	0.06905189723247984	-0.07013659082500934	0.07614403696429095	-0.01000179464686779	-0.08429273912818869	-0.0034573757695657292	-0.07082488670648512	0.004106231416471484	0.013126620203934644	0.460214637573	0.757455001208	0.563691144959	0.237368605078	0.63839046467	0.519249062249	0.747262025795	0.183752894264	0.76769033028	0.677233097055	0.412754243182	0.747262025795	0.703109511175	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chrX:154029200..154029314,+__1987.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chrX:154029200..154029314,+__1987.1.0.0	rs139322603	-0.8733234511190521	-1.002919219035469	-0.7999047840833126	-0.8262532448621436	-1.213925536807272	-0.6466136474708528	-0.714583711575158	-1.221047252537413	-0.6692258859735958	-0.9060235258061308	-0.6405276251427579	-0.7426042767034141	-0.8547460134263809	-1.9193485348541235	-1.6147903433152904	-1.863128670444774	-1.5904272777518742	-1.5609807418600936	-1.0930462896921962	-1.3888955431026353	-1.5962109959477058	-1.6165429735756751	-1.3783255865789021	-1.3199416545555065	-1.3297883264300427	-1.5226189115090687	-1.0460250837350715	-0.6118711242798214	-1.0632238863614614	-0.7641740328897306	-0.3470552050528215	-0.4464326422213434	-0.6743118315274773	-0.3751637434102928	-0.9473170876020793	-0.47230206077277137	-0.6794140294127486	-0.5871840497266286	-0.6678728980826873	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00275115621019	0.00201342137527	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0046090035735	NA__no_active_tile	0.0099361616164	6.03746088465e-08	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	5.05939222134e-05	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr11:65244960..65245074,+__1989.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr11:65244960..65245074,+__1989.1.0.0	rs116873289	1.896870701608382	1.9680693815094772	1.4171776250238288	1.3910813156246027	1.2481355214210994	1.1934186271203417	1.951354448177591	2.1252760603514345	0.698602970477584	1.5117402235119939	1.4689722953263458	0.9223387003066831	1.4827531558716138	0.7066135889722371	0.24978862676810035	0.4910164299264769	0.27342708748112843	0.47040748419255507	0.4228097876351592	0.4078735302746901	-0.2182040015490853	0.03442552364122018	0.14532153514111423	-0.07006887315203282	0.7828754622700328	0.3080238484667997	-1.1902571126361448	-1.7182807547413768	-0.9261611950973518	-1.1176542281434743	-0.7777280372285443	-0.7706088394851826	-1.543480917902901	-2.34348006190052	-0.6641774468363638	-1.3664186883708798	-1.5390411684783787	-0.13946323803665028	-1.174729307404814	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr12:92996492..92996606,+__1992.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr12:92996492..92996606,+__1992.1.0.0	rs17662633	-1.8954843408540474	-1.813935950387868	-1.7794981444711957	-1.8903348993228002	-1.8334700615236015	-1.771196660080994	-1.8386707875765136	-1.971078581005444	-1.2281844646136475	-1.8891702143090647	-1.7299021408779938	-1.5456407764995543	-1.7655472517935602	-1.6860545395118374	-1.640183100237844	-1.322278594518001	-1.4949905272630222	-2.163848007358086	-1.7222604988323407	-1.2374695797045043	-1.6200615795562667	-1.8452215276208368	-1.9153078063447204	-2.003797857744346	-2.0328652807906873	-1.7236949082902078	0.20942980134221	0.17375285015002406	0.4572195499531948	0.395344372059778	-0.33037794583448443	0.04893616124865341	0.6012012078720093	0.35101700144917736	-0.6170370630071893	-0.026137592035655688	-0.27389571686635206	-0.48722450429113295	0.04185234350335271	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:145114645..145114759,+__1994.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:145114645..145114759,+__1994.1.0.0	rs587750395	-0.7074427122040378	-0.968045957111189	-0.9926364478937295	-1.1670363645329616	-1.1017676593515402	-1.0679135268323554	-1.2561052101528638	-1.0611050936603348	-1.2437164506514455	-1.3922560455072672	-1.1957706840058242	-1.301083778417697	-1.1212399941934372	-1.4665056939234085	-1.5388423874295178	-1.4814958981021207	-1.8118150249454916	-1.4565434006705291	-1.534713472731424	-1.3606646106583913	-1.4568971905257522	-1.536998138243268	-1.1830327734687418	-1.3822124851465798	-1.420929463155441	-1.4692208782500558	-0.7590629817193707	-0.5707964303183288	-0.48885945020839117	-0.6447786604125301	-0.3547757413189889	-0.4667999458990686	-0.10455940050552748	-0.3957920968654174	-0.2932816875918225	0.20922327203852542	-0.1864418011407556	-0.11984568473774404	-0.3479808840566183	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:145114645..145114759,+__1994.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:145114645..145114759,+__1994.1.0.0	rs112458770	-0.7074427122040378	-0.968045957111189	-0.9926364478937295	-1.1670363645329616	-1.1017676593515402	-1.0679135268323554	-1.2561052101528638	-1.0611050936603348	-1.2437164506514455	-1.3922560455072672	-1.1957706840058242	-1.301083778417697	-1.1212399941934372	-1.092904636498296	-0.8349546652253337	-0.9540352049793412	-0.9753280760911567	-0.8229734420424147	-0.9980050167603878	-1.0284062447648064	-0.8687441975174364	-0.9148896258711592	-0.8402062354565623	-0.9344341173037102	-0.9855526693714008	-0.9375361776568338	-0.3854619242942582	0.13309129188585533	0.03860124291438827	0.19170828844180487	0.27879421730912546	0.06990851007196763	0.22769896538805745	0.19236089614289842	0.32882682478028635	0.552049810050705	0.261336566702114	0.3155311090462961	0.1837038165366034	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0832552515755	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0832552515755	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:145114645..145114759,+__1994.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:145114645..145114759,+__1994.1.0.0	rs587731868	-0.7074427122040378	-0.968045957111189	-0.9926364478937295	-1.1670363645329616	-1.1017676593515402	-1.0679135268323554	-1.2561052101528638	-1.0611050936603348	-1.2437164506514455	-1.3922560455072672	-1.1957706840058242	-1.301083778417697	-1.1212399941934372	-1.2016374962209075	-1.3839890361876086	-1.2685696196337146	-1.4647573377883045	-1.1528839576844185	-1.0279124974883769	-1.3099205416737891	-1.0876257997541465	-1.4509343057443476	-1.1919807317392075	-1.1333732509521137	-1.1286634671299454	-1.2335206701664065	-0.4941947840168698	-0.4159430790764196	-0.2759331717399851	-0.29772097325534297	-0.05111629833287834	0.040001029343978534	-0.053815331520925325	-0.02652070609381174	-0.20721785509290203	0.20027531376805974	0.06239743305371048	0.1724203112877516	-0.11228067597296955	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr1:145114645..145114759,+__1994.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:145114645..145114759,+__1994.1.0.0	rs587750395,rs112458770,rs587731868	-0.7074427122040378	-0.968045957111189	-0.9926364478937295	-1.1670363645329616	-1.1017676593515402	-1.0679135268323554	-1.2561052101528638	-1.0611050936603348	-1.2437164506514455	-1.3922560455072672	-1.1957706840058242	-1.301083778417697	-1.1212399941934372	-0.8956961430654717	-0.6188809724488321	-1.4162029524809558	-0.8105057801828377	-1.1603320708204863	-1.0007036334024337	-0.8306482230862605	-0.9140374621492704	-0.8154557447889121	-0.7657203558966132	-0.7897079543423834	-0.8426580235447882	-0.9050457763507703	-0.18825343086143398	0.3491649846623569	-0.42356650458722633	0.35653058435012386	-0.05856441146894609	0.06720989342992167	0.4254569870666033	0.1470676315110644	0.4282607058625334	0.626535689610654	0.4060627296634408	0.4584257548729087	0.2161942178426667	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:128171201..128171315,+__2008.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:128171201..128171315,+__2008.1.0.0	rs79328924	0.2029352455694373	0.15886776782704093	0.3905918358570977	-0.28617119112558537	0.034171550474316886	0.22027381485334208	-0.010557405725522384	0.1145683535601459	-0.10009891134587123	0.589065356743536	0.30916482901860554	-0.12011050506656422	0.12522506171999825	0.01586326963700319	-0.19006252399960738	-0.11002445890209699	0.10587985308372293	0.14529560365806649	0.24953631124022355	-0.25642481737263034	0.3796729627038293	-0.11967383575750301	0.09751153217409388	0.18238467011725404	-0.15443329211364498	0.02879377287239256	-0.1870719759324341	-0.3489302918266483	-0.5006162947591947	0.3920510442093083	0.1111240531837496	0.02926249638688147	-0.24586741164710796	0.2651046091436834	-0.019574924411631778	-0.49155382456944213	-0.1267801589013515	-0.03432278704708076	-0.09643128884760571	0.957166828655	0.408929232264	0.925117039075	0.333666485083	0.829896383209	0.861430881609	0.60051573606	NA__not_enough_barcodes	0.259370210024	0.460214637573	0.706946403854	0.657696241675	0.934152827207	1	1	1	1	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:128171201..128171315,+__2008.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:128171201..128171315,+__2008.1.0.0	rs570024273	0.2029352455694373	0.15886776782704093	0.3905918358570977	-0.28617119112558537	0.034171550474316886	0.22027381485334208	-0.010557405725522384	0.1145683535601459	-0.10009891134587123	0.589065356743536	0.30916482901860554	-0.12011050506656422	0.12522506171999825	-0.3816073110830591	-0.16756893061217815	-0.5007848507098049	-0.40154817894042405	0.04510991091791289	-0.3064985652503821	-0.5392469673281598	-0.658862475852796	0.025398937838804723	-0.09858934496552021	-0.0977746108166489	0.1398294179608446	-0.24517858073678425	-0.5845425566524964	-0.3264366984392191	-0.8913766865669026	-0.11537698781483868	0.010938360443596001	-0.5267723801037242	-0.5286895616026375	-0.773430829412942	0.12549784918467596	-0.6876547017090562	-0.40693943983525444	0.2599399230274088	-0.37040364245678253	NA__not_enough_barcodes	0.221756412245	0.677233097055	0.672324307433	0.64319083408	0.550163470011	NA__not_enough_barcodes	0.129198935732	0.563691144959	0.364754193662	0.90381429355	0.677233097055	0.63377191272	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	1	1	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr17:7746118..7746232,+__2011.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr17:7746118..7746232,+__2011.1.0.0	rs114555032	-0.7940637229689527	-0.5349673821915422	-0.52869022419312	-0.7882937927600069	-0.6762422653435327	-0.756788283736519	-1.059796273437403	-0.4635551757411262	-0.6094750750476395	-0.8655206857878228	-0.31899226391751057	-0.70954562232948	-0.6754942306212214	-0.6808408557278447	-0.5386718753123735	-0.4589748295141564	-0.756442974432527	-0.7547026927217678	-0.6574622290510981	-0.7575814511006018	-0.8525072511271463	-0.7700952704360814	-0.48603285609191815	-0.8248401152872752	-0.3328296682657156	-0.6559151724223754	0.11322286724110797	-0.0037044931208313203	0.06971539467896354	0.031850818327479935	-0.07846042737823511	0.09932605468542088	0.3022148223368011	-0.3889520753860201	-0.16062019538844186	0.37948782969590467	-0.5058478513697646	0.37671595406376446	0.019579058198845794	0.648013768535	0.436112310787	0.132622250874	0.8931878581	0.382791178922	0.581967350665	0.0484054419273	0.197395731844	0.989287003123	0.197390602198	0.122558611289	0.0491716185004	0.148023203185	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:224180311..224180425,+__2012.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:224180311..224180425,+__2012.1.0.0	rs11800372	3.78405205188354	4.078808519716764	3.558641411767155	3.2952444117641173	3.740551416622785	3.7597797687929075	3.435607851528208	3.973269275134834	3.8430370966403293	3.835337614934765	3.7624973274382776	3.9065412452610824	3.747780665957064	3.4482783007980533	3.9730620571307953	3.2549047078518742	3.1230764462323464	3.5207005592740246	3.5069886359393703	3.2313340323442428	3.67822417266631	3.554905438903756	3.525087852362756	3.4880248584684708	3.5646501545154323	3.489103101373953	-0.3357737510854868	-0.10574646258596898	-0.30373670391528096	-0.17216796553177094	-0.21985085734876053	-0.25279113285353727	-0.20427381918396526	-0.29504510246852433	-0.2881316577365731	-0.31024976257200887	-0.2744724689698068	-0.34189109074565005	-0.25867756458311114	0.0224529881577	0.206893929435	0.179364149792	0.132622250874	0.0306357720046	0.0440018610392	0.202104162379	0.0565651674203	0.045430560235	0.0601351299193	0.101398170673	0.101398170673	7.76700793874e-07	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.000650875265266	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:224180311..224180425,+__2012.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:224180311..224180425,+__2012.1.0.0	rs138562231	3.78405205188354	4.078808519716764	3.558641411767155	3.2952444117641173	3.740551416622785	3.7597797687929075	3.435607851528208	3.973269275134834	3.8430370966403293	3.835337614934765	3.7624973274382776	3.9065412452610824	3.747780665957064	3.738162289921184	4.134350968510586	3.5401402682537206	3.18006482046792	3.7150391281578274	3.6765629003326312	3.4188703291313933	3.829294890569856	3.72538001835395	3.7602859346701583	3.6929501162149325	3.770231827707935	3.6817777910243414	-0.04588976196235617	0.05554244879382164	-0.01850114351343457	-0.11517959129619726	-0.025512288464957678	-0.08321686846027632	-0.016737522396814697	-0.14397438456497813	-0.1176570782863795	-0.07505168026460662	-0.06954721122334506	-0.1363094175531474	-0.06600287493272265	0.493479697885	0.677233097055	0.777966336216	0.476688253492	0.390154148302	0.476688253492	0.989287003123	0.648013768535	0.354199901149	0.460214637573	0.978575937473	0.48504462162	0.92583765967	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr1:224180311..224180425,+__2012.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:224180311..224180425,+__2012.1.0.0	rs11800372,rs138562231	3.78405205188354	4.078808519716764	3.558641411767155	3.2952444117641173	3.740551416622785	3.7597797687929075	3.435607851528208	3.973269275134834	3.8430370966403293	3.835337614934765	3.7624973274382776	3.9065412452610824	3.747780665957064	3.4024732557331054	3.759793981099242	3.243701775684487	2.9339431643691523	3.315049473019206	3.295254174322632	2.9502812396100433	3.3560993889871362	3.430547340146101	3.6173860336183936	3.4073385959591986	3.38523260782002	3.34142508586406	-0.38157879615043466	-0.31901453861752227	-0.3149396360826682	-0.36130124739496505	-0.42550194360357896	-0.46452559447027575	-0.48532661191816473	-0.617169886147698	-0.4124897564942285	-0.21795158131637127	-0.35515873147907895	-0.5213086374410625	-0.40635558009300404	0.00591301274865	0.0150857114019	0.0832552515755	0.0362033618716	0.00357181666747	0.00695778717972	0.00849533044186	0.00167824394514	0.00251850159852	0.0338805621681	0.0763307839553	0.00501178746069	3.46124449707e-15	1	1	1	1	0.732222416831	1	1	0.327257569303	0.518811329295	1	1	1	7.85702500836e-13	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr21:30375049..30375163,+__2014.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr21:30375049..30375163,+__2014.1.0.0	rs1537093	3.0597512487394924	3.3952318280224896	2.9795105680184824	2.8809593804239473	3.0624253044831966	2.951867786803203	2.929062827566126	2.973002550113959	3.157224033714538	3.043411353284184	3.133557833598307	3.043360964319713	3.050780473257303	2.954676756199901	3.231103100644284	2.8359999547621495	2.6499431179504014	3.017679764529557	3.171204506000487	2.930167062527717	3.237610310814255	3.1685751401670057	3.136842054961921	3.1748939557660996	3.201915046972723	3.0592175642747086	-0.10507449253959145	-0.1641287273782055	-0.14351061325633285	-0.2310162624735459	-0.04474553995363939	0.21933671919728415	0.0011042349615912883	0.2646077607002959	0.011351106452467619	0.09343070167773693	0.04133612216779259	0.1585540826530103	0.008437091017405307	0.989287003123	0.619326784864	0.609884951243	0.420456664513	0.90381429355	0.197395731844	0.788281320858	0.237368605078	0.63839046467	0.347268461228	0.87199428352	0.393862283952	0.878753773568	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr21:30375049..30375163,+__2014.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr21:30375049..30375163,+__2014.1.0.0	rs1537093,rs73190197	3.0597512487394924	3.3952318280224896	2.9795105680184824	2.8809593804239473	3.0624253044831966	2.951867786803203	2.929062827566126	2.973002550113959	3.157224033714538	3.043411353284184	3.133557833598307	3.043360964319713	3.050780473257303	2.840120878130009	3.285022426942363	2.6750349264529127	2.587993356710843	2.7976590537028265	2.8143881901298116	2.8313028511549483	3.012925428315164	2.909651305976232	2.973510149292469	2.9403543458100323	3.064921169081238	2.8944070068082373	-0.21963037060948354	-0.11020940108012667	-0.3044756415655696	-0.2929660237131042	-0.2647662507803701	-0.1374795966733915	-0.09775997641117762	0.03992287820120488	-0.24757272773830596	-0.06990120399171484	-0.19320348778827467	0.021560204761525092	-0.15637346644906572	0.468411351413	0.563691144959	0.628823764578	0.66743649171	0.253741740693	0.757455001208	0.706946403854	0.935789553219	0.572794651112	0.829896383209	0.527990680582	0.90381429355	0.942304559917	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr9:73035037..73035151,+__2015.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr9:73035037..73035151,+__2015.1.0.0	rs190469198	0.9371471679040817	1.4575969974566156	1.3178960027414997	1.04523809990395	1.0257943071805928	1.1984361149778302	0.7853073231695836	1.5014058054834256	1.0488744916079251	1.1526191742197878	1.2179957461667572	0.9359972980815252	1.1353590440744645	0.6653414663400247	1.2366513829028962	0.7312513035558881	0.9157516171047053	1.1385233848640772	0.7412615446354072	0.5797647852079809	0.7858659990686774	0.16469630046366435	0.8599786213891418	1.0217221925407698	0.5889352186566792	0.7858119847274927	-0.27180570156405703	-0.22094561455371942	-0.5866446991856116	-0.12948648279924457	0.11272907768348439	-0.45717457034242304	-0.2055425379616027	-0.7155398064147482	-0.8841781911442608	-0.29264055283064594	-0.19627355362598742	-0.347062079424846	-0.3495470593469719	0.175053819161	0.368322877114	0.8931878581	0.202104162379	0.11007645226	0.957167318493	0.382785732326	0.935789553219	0.405136064622	0.63839046467	0.175053819161	0.925117039075	0.664735005655	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:7764678..7764792,+__2018.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:7764678..7764792,+__2018.1.0.0	rs112280848	0.8998467141424119	0.4736873589179535	0.17199524877544597	0.754905778613126	1.4933152557741065	1.5348280857260252	0.10174901553027756	-0.7486381433447798	0.05954642135275355	-0.526460496772012	0.5486814780199385	0.20298289436147826	0.4138699675913938	0.17420700248252788	0.4158411520381469	-0.38869139740049596	0.024338747596796745	0.14547518014035754	-0.3322968177056357	1.0653094045735592	-0.9992284634152676	0.017205491598092166	-0.016443272318842017	-0.4094042370763023	-0.04800870305745086	-0.029307992712042832	-0.7256397116598841	-0.05784620687980657	-0.5606866461759419	-0.7305670310163292	-1.347840075633749	-1.867124903431661	0.9635603890432816	-0.25059032007048776	-0.04234092975466139	0.51001722445317	-0.9580857150962407	-0.2509915974189291	-0.44317796030343654	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr12:52542521..52542635,+__2022.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr12:52542521..52542635,+__2022.1.0.0	rs78559902	-0.8379289601705785	-0.7671711657030649	-0.6422396185055947	-1.2484054436662742	-0.5228165844787868	-1.0818629920447718	-0.7661339849627469	-0.8686585734458968	-0.7853194388997236	-0.7454296636556098	-0.8444588572221208	-1.0645330007867981	-0.8479131902951638	-0.7980611610688894	-0.7320991186544064	-0.6162634459421805	-1.0318629465461626	-0.62373314673602	-0.8882449150224168	-0.8868155825725499	-0.9377507028229737	-0.6056686178572597	-0.5371644808337588	-0.9231770370033474	-0.98408751005414	-0.7970773887595087	0.03986779910168914	0.03507204704865852	0.025976172563414224	0.21654249712011153	-0.10091656225723322	0.193618077022355	-0.12068159760980302	-0.06909212937707687	0.17965082104246388	0.20826518282185102	-0.07871817978122664	0.08044549073265816	0.050835801535655145	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.657696241675	NA__no_active_tile	0.903813197854	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.572794651112	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.862820262284	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:12493279..12493393,-__2024.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:12493279..12493393,-__2024.1.0.0	rs79995089	-1.2669834140078882	-0.8916545259156954	-1.6362541975889209	-1.6599537468500491	-1.6848211010446157	-1.0604085329025121	-1.2696927739876591	-1.2483852775072635	-1.3441803381834037	-1.3376253570686922	-1.3787344169397928	-0.9550426971754106	-1.3111446982643253	-1.3288548826368345	-1.242633509038393	-1.9614098683343206	-1.3279060681526054	-1.5035165175700094	-1.0373774096989783	-1.7355785739380716	-1.5999741947031643	-1.4351707851036684	-1.6377425669261856	-1.3717068908795775	-1.5053581220942558	-1.4739357824230055	-0.061871468628946324	-0.3509789831226977	-0.32515567074539975	0.3320476786974438	0.18130458347460632	0.023031123203533843	-0.46588579995041246	-0.3515889171959008	-0.0909904469202647	-0.30011720985749335	0.007027526060215283	-0.5503154249188452	-0.16279108415868007	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:155164465..155164579,-__2026.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:155164465..155164579,-__2026.1.0.0	rs12411216	0.5073950841715841	0.19225580641111928	-0.08791381655781805	0.2691416300977864	-0.4743734548513568	0.3443432940408541	-0.2472893510448019	0.18693361340550385	0.37122334900127363	-0.013132121064058533	0.7121856009891538	-0.5697376951508365	0.0992526616207003	1.1260027284184222	0.9348657702043184	1.4944791573091625	0.29147337400755763	1.5609367268980103	0.5477446086135724	-0.3501483714622489	-0.2612025891159079	-0.2954854195511587	1.3727853139699395	1.2144190183519603	0.7587325506493261	0.6995502390244129	0.6186076442468381	0.7426099637931991	1.5823929738669804	0.022331743909771218	2.035310181749367	0.20340131457271832	-0.10285902041744702	-0.44813620252141173	-0.6667087685524323	1.385917435033998	0.5022334173628065	1.3284702458001627	0.6002975774037126	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:155164465..155164579,-__2026.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:155164465..155164579,-__2026.1.0.0	rs78836239	0.5073950841715841	0.19225580641111928	-0.08791381655781805	0.2691416300977864	-0.4743734548513568	0.3443432940408541	-0.2472893510448019	0.18693361340550385	0.37122334900127363	-0.013132121064058533	0.7121856009891538	-0.5697376951508365	0.0992526616207003	0.8677352483247277	0.323550900330316	0.7605880246687566	-0.1566753608378243	1.0189452957786873	0.05035142454238604	0.3296295277183617	0.43141121701454094	-0.7717970300003001	-0.3537047315534365	0.04716718908917289	-0.47488006326334553	0.17269347015100356	0.3603401641531436	0.13129509391919675	0.8485018412265747	-0.4258169909356107	1.493318750630044	-0.29399186949846806	0.5769188787631636	0.2444776036090371	-1.1430203790015736	-0.340572610489378	-0.6650184118999809	0.09485763188749097	0.07344080853030327	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr1:155164465..155164579,-__2026.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:155164465..155164579,-__2026.1.0.0	rs12411216,rs78836239	0.5073950841715841	0.19225580641111928	-0.08791381655781805	0.2691416300977864	-0.4743734548513568	0.3443432940408541	-0.2472893510448019	0.18693361340550385	0.37122334900127363	-0.013132121064058533	0.7121856009891538	-0.5697376951508365	0.0992526616207003	0.8617061122556042	1.2681445006539938	-0.18102554216322908	0.9690289800027428	0.9349452464241851	0.26883711412312183	-0.8668091960236131	-0.8421156645792175	0.8376093659057675	-0.2654019545470622	-0.2918476453082	-0.5407901149935255	0.1793567668125474	0.35431102808402015	1.0758886942428745	-0.09311172560541103	0.6998873499049565	1.409318701275542	-0.07550617991773229	-0.6195198449788112	-1.0290492779847213	0.4663860169044939	-0.2522698334830037	-1.0040332462973538	0.028947580157311026	0.0801041051918471	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:209833398..209833512,-__2030.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:209833398..209833512,-__2030.1.0.0	rs7542165	-1.7589039955065793	-1.0377307818034942	-2.2337192296649926	-2.3766709029880437	-1.6543000931748137	-1.3569199005919332	-1.1326167428245006	-0.9984807014935632	-1.717969686611512	-2.0829006938818804	-1.50732862460589	-0.9234294017604864	-1.5650808962423073	1.2361084737805486	-1.1801120192813794	-2.73579940570947	-0.9279260512582967	0.17286920073560486	-2.430822017350606	-1.0334800778739501	-4.9621537779662965	-4.758722315836519	-3.1784550759579115	0.38287832146301726	-0.6174738690528563	-1.6694240511923424	2.995012469287128	-0.14238123747788523	-0.5020801760444775	1.448744851729747	1.8271692939104187	-1.0739021167586726	0.09913666495055051	-3.9636730764727335	-3.0407526292250076	-1.0955543820760312	1.8902069460689073	0.3059555327076301	-0.1043431549500355	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:209833398..209833512,-__2030.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:209833398..209833512,-__2030.1.0.0	rs12030610	-1.7589039955065793	-1.0377307818034942	-2.2337192296649926	-2.3766709029880437	-1.6543000931748137	-1.3569199005919332	-1.1326167428245006	-0.9984807014935632	-1.717969686611512	-2.0829006938818804	-1.50732862460589	-0.9234294017604864	-1.5650808962423073	1.3858688145324303	-0.5485950262563809	1.0977757608315069	0.06657630116836782	0.08395986929115964	0.10415160170393054	-1.0789821896173255	-0.7634217646832128	0.348396983521445	-0.8121716476649743	-1.0162353401910613	0.2728632030597799	-0.0716511195253612	3.1447728100390098	0.4891357555471133	3.331494990496499	2.4432472041564117	1.7382599624659734	1.4610715022958638	0.05363455320717514	0.2350589368103504	2.066366670132957	1.270729046216906	0.4910932844148286	1.1962926048202662	1.493429776716946	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:209833398..209833512,-__2030.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:209833398..209833512,-__2030.1.0.0	rs12030611	-1.7589039955065793	-1.0377307818034942	-2.2337192296649926	-2.3766709029880437	-1.6543000931748137	-1.3569199005919332	-1.1326167428245006	-0.9984807014935632	-1.717969686611512	-2.0829006938818804	-1.50732862460589	-0.9234294017604864	-1.5650808962423073	-1.3670301120026886	-0.9811715479633347	-0.5001477397766948	-1.5361201221511194	-0.98771736811	-1.2218051575883881	-1.8726697437929833	-2.63226262778726	-1.2035190255209147	-2.083010404608466	-1.1851521928369322	-1.693675412603146	-1.4386901212284942	0.39187388350389063	0.056559233840159484	1.733571489888298	0.8405507808369244	0.6665827250648138	0.1351147430035451	-0.7400530009684827	-1.6337819262936968	0.5144506610905972	-0.00010971072658572112	0.3221764317689577	-0.7702460108426595	0.12639077501381346	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr1:209833398..209833512,-__2030.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:209833398..209833512,-__2030.1.0.0	rs7542165,rs12030610,rs12030611	-1.7589039955065793	-1.0377307818034942	-2.2337192296649926	-2.3766709029880437	-1.6543000931748137	-1.3569199005919332	-1.1326167428245006	-0.9984807014935632	-1.717969686611512	-2.0829006938818804	-1.50732862460589	-0.9234294017604864	-1.5650808962423073	-2.0117598253470983	-1.6356554786990758	-2.0893616406793543	-1.499623275420683	-1.5462146780811203	-2.010069494895004	-2.6687058626193725	-1.5928939108246023	-1.7371704636999556	-1.7847755924680784	-1.8203577640530715	-1.8440884474442496	-1.853389702852639	-0.252855829840519	-0.5979246968955816	0.14435758898563833	0.8770476275673607	0.1080854150936934	-0.653149594303071	-1.5360891197948718	-0.5944132093310391	-0.0192007770884437	0.298125101413802	-0.3130291394471816	-0.9206590456837632	-0.28830880661033137	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:21651289..21651403,-__2031.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:21651289..21651403,-__2031.1.0.0	rs3026826	-1.5819715961169725	-1.6105490676814018	-1.4031711612399058	-1.5949384844807009	-1.5439581579958406	-1.4977530252650544	-1.4464007691817582	-1.4732727335289777	-1.4027417327002936	-1.419336811020712	-1.5422918593037043	-1.3850077933117655	-1.4917827659855905	-1.5328422794863124	-1.4686315630754903	-1.7521657139302198	-1.4345471804292618	-1.798930803169215	-1.903297476628329	-1.8089291611454805	-1.620000031354262	-1.5431629134306588	-1.8110621589071858	-1.4418894733425762	-1.7374184594913236	-1.6544064345325264	0.049129316630660114	0.14191750460591157	-0.348994552690314	0.1603913040514391	-0.2549726451733745	-0.40554445136327466	-0.36252839196372233	-0.14672729782528426	-0.14042118073036525	-0.39172534788647373	0.10040238596112805	-0.3524106661795581	-0.16262366854693566	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:21651289..21651403,-__2031.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:21651289..21651403,-__2031.1.0.0	rs12062365	-1.5819715961169725	-1.6105490676814018	-1.4031711612399058	-1.5949384844807009	-1.5439581579958406	-1.4977530252650544	-1.4464007691817582	-1.4732727335289777	-1.4027417327002936	-1.419336811020712	-1.5422918593037043	-1.3850077933117655	-1.4917827659855905	-1.3697963988442168	-1.2520111390383928	-1.4882399465062592	-1.6929781024503123	-1.4911850923167844	-1.5730287480680911	-1.3211383816873188	-1.3594714613578354	-1.521958862948544	-1.2804756724663229	-1.3516237586685758	-1.363350467564974	-1.4221048359931359	0.2121751972727557	0.35853792864300904	-0.08506878526635342	-0.09803961796961147	0.05277306567905615	-0.07527572280303674	0.1252623874944394	0.11380127217114233	-0.11921713024825054	0.1388611385543892	0.1906681006351285	0.021657325746791578	0.06967792999245498	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr1:21651289..21651403,-__2031.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:21651289..21651403,-__2031.1.0.0	rs3026826,rs12062365	-1.5819715961169725	-1.6105490676814018	-1.4031711612399058	-1.5949384844807009	-1.5439581579958406	-1.4977530252650544	-1.4464007691817582	-1.4732727335289777	-1.4027417327002936	-1.419336811020712	-1.5422918593037043	-1.3850077933117655	-1.4917827659855905	-1.7697586527414764	-1.4313350231103918	-2.0803067303632896	-1.4317312024747246	-1.9153462519676998	-1.7140865972874395	-1.8023082932678194	-1.64551008988966	-1.7877093816686014	-2.0881758405966826	-1.7937986931305734	-1.7133127339470084	-1.7644482908704475	-0.1877870566245039	0.17921404457100998	-0.6771355691233838	0.16320728200597623	-0.37138809397185923	-0.21633357202238512	-0.3559075240860612	-0.17223735636068227	-0.3849676489683078	-0.6688390295759705	-0.2515068338268691	-0.32830494063524296	-0.2726655248848566	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:223914381..223914495,-__2034.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:223914381..223914495,-__2034.1.0.0	rs7525446	-1.1189216449060928	-1.0930905241963336	-1.5887109953745089	-1.061308701195951	-1.0664323187958837	-1.3934663305228931	-1.372988308720999	-1.335211932332378	-1.3537726921361877	-1.0991682489559478	-0.9913654121419606	-1.502475650110601	-1.248076063282478	-1.307615923836154	-1.1018295904493602	-1.2745838420827271	-1.0734973288358105	-0.9390227323192524	-1.1678996118779579	-1.423842107652335	-0.7837441084283157	-1.4787825549185418	-1.1082044958854562	-1.3473394412255602	-1.3515305656269079	-1.1964910252615317	-0.1886942789300612	-0.008739066253026673	0.31412715329178176	-0.012188627639859506	0.12740958647663136	0.22556671864493527	-0.050853798931336014	0.5514678239040622	-0.12500986278235415	-0.00903624692950844	-0.35597402908359954	0.15094508448369304	0.051585038020946515	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:26678049..26678163,-__2035.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:26678049..26678163,-__2035.1.0.0	rs113446185	-0.98525879888482	-1.4804166220501398	-1.3095833515499222	-1.8277354912767532	-1.8818529866105091	-1.1277183436890559	-1.3454363276282524	-1.260360354258671	-1.4918901560616027	-1.4978475825006483	-1.4352549994964865	-1.4131194082795924	-1.4213728685238711	-1.1031228657393937	-0.88318004715009	-1.0442045158102515	-1.2563368750417272	-1.1037583136479776	-0.6845808764646619	-1.248045681436293	-1.1966246127332625	-1.2168592712831567	-0.9754023474096752	-1.3347172494886792	-1.2792464720618653	-1.110506594022253	-0.11786406685457362	0.5972365749000498	0.2653788357396707	0.571398616235026	0.7780946729625315	0.44313746722439395	0.09739064619195936	0.0637357415254085	0.27503088477844595	0.5224452350909731	0.10053775000780729	0.1338729362177271	0.31086627450161836	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:121030597..121030711,-__2037.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:121030597..121030711,-__2037.1.0.0	rs7090417	0.7058460485023098	0.9666175865098889	0.6931530025730659	0.7942950238569759	0.7505219483451349	0.7852201094647487	0.6602072783175613	0.9247950499122055	0.9939280506334844	0.7911563967497293	0.726528831935294	0.7737449314458339	0.7971678548538527	0.6207686283688966	0.9211428251540886	0.7581847682115985	0.5717982999105999	0.7376840017687065	0.8568976910335561	0.7156887637377756	0.5484619461518437	0.8674712320637441	0.657201904328353	0.9151789195447754	0.9263983580963798	0.7580731115308598	-0.08507742013341324	-0.04547476135580031	0.06503176563853263	-0.22249672394637598	-0.012837946576428338	0.07167758156880732	0.05548148542021425	-0.3763331037603618	-0.12645681856974034	-0.13395449242137625	0.18865008760948132	0.15265342665054593	-0.0390947433229929	0.747262025795	0.727009731456	0.716953652062	0.326996172605	0.63839046467	0.361218104761	0.628823764578	0.0174727290303	0.550163470011	0.87199428352	0.21176555971	0.150801701171	0.391131502383	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:3893845..3893959,-__2039.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:3893845..3893959,-__2039.1.0.0	rs114260824	-1.8327692475732724	-1.2295779577331907	-1.922843125316827	-1.823340808599424	-1.657256823641096	-1.3494223331129216	-1.8058142695214814	-1.6598428818440885	-2.1621493532082923	-1.4771071209789628	-1.5725730646386578	-1.7815481411999592	-1.6895204272806812	-1.5093634262019722	-1.5137790601889185	-1.8768840248267005	-1.7206364406840295	-1.9374813283399468	-1.738889943511028	-1.4346357827018337	-1.3850053233369346	-1.5415501629905346	-1.9791737600226025	-1.9044993495113922	-1.7521224575342975	-1.6911684216541827	0.32340582137130025	-0.2842011024557278	0.045959100490126525	0.1027043679153945	-0.28022450469885074	-0.3894676103981065	0.3711784868196477	0.27483755850715386	0.6205991902177577	-0.5020666390436397	-0.33192628487273446	0.029425683665661673	-0.0016479943735014195	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:3893845..3893959,-__2039.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:3893845..3893959,-__2039.1.0.0	rs7897359	-1.8327692475732724	-1.2295779577331907	-1.922843125316827	-1.823340808599424	-1.657256823641096	-1.3494223331129216	-1.8058142695214814	-1.6598428818440885	-2.1621493532082923	-1.4771071209789628	-1.5725730646386578	-1.7815481411999592	-1.6895204272806812	-1.6577514391629227	-1.88580261985445	-1.6357928214198703	-1.4449811697154133	-1.442300281495963	-2.033853623944613	-1.4700581741509853	-1.6019272789517012	-1.6395290553883726	-1.3693039941524936	-2.1997852606286132	-1.6099084232886889	-1.6659161785128405	0.17501780841034975	-0.6562246621212593	0.28705030389695674	0.3783596388840107	0.21495654214513316	-0.6844312908316914	0.3357560953704961	0.057915602892387286	0.5226202978199197	0.1078031268264692	-0.6272121959899555	0.1716397179112703	0.023604248767840563	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr10:3893845..3893959,-__2039.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:3893845..3893959,-__2039.1.0.0	rs114260824,rs7897359	-1.8327692475732724	-1.2295779577331907	-1.922843125316827	-1.823340808599424	-1.657256823641096	-1.3494223331129216	-1.8058142695214814	-1.6598428818440885	-2.1621493532082923	-1.4771071209789628	-1.5725730646386578	-1.7815481411999592	-1.6895204272806812	-1.4929363629714976	-1.9439389193265104	-1.8741088657107743	-1.6029014370310986	-1.9498414353128204	-2.0749917443573564	-1.4677158565270698	-2.1299447384556505	-1.7885230518776938	-1.5137625717115772	-1.7603157213888412	-1.5571006384414094	-1.7630067785926915	0.33983288460177485	-0.7143609615933197	0.04873425960605271	0.2204393715683255	-0.29258461167172434	-0.7255694112444349	0.33809841299441157	-0.470101856611562	0.3736263013305985	-0.03665545073261445	-0.18774265675018342	0.22444750275854974	-0.07348635131201049	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:73397977..73398091,-__2041.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:73397977..73398091,-__2041.1.0.0	rs2894167	-0.21627456753962848	-0.42991077567807257	-0.4224615363151695	-0.7213972298027658	-0.1858231273768751	-0.2198057846221663	-0.17619907800450432	-0.3230453615269895	-0.4596935584579469	-0.5896735705825961	-0.19371928703978086	-0.21335831872812164	-0.34594684963955147	-1.0429796518550511	-0.7867699336998593	-0.8744023107479919	-0.5758095293929388	-0.736534267404175	-0.6864534218306929	-1.155606549787325	-0.8996509907524866	-0.5720996536637678	-0.860836349476944	-0.76762139478786	-1.0235570989843492	-0.8318600960319534	-0.8267050843154227	-0.3568591580217867	-0.45194077443282243	0.14558770040982694	-0.5507111400272999	-0.46664763720852664	-0.9794074717828206	-0.5766056292254971	-0.1124060952058209	-0.2711627788943479	-0.573902107748079	-0.8101987802562276	-0.4859132463924021	0.00460947122508	0.0187859264625	0.0832552515755	0.88258056334	0.0209174885683	0.0426112802219	0.0785847853765	0.0150857114019	0.107123399254	0.0658387268341	0.00115660425805	0.0306357720046	4.72187912047e-09	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.889428674441	1	3.95693470295e-06	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr12:89554557..89554671,-__2052.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr12:89554557..89554671,-__2052.1.0.0	rs10745495	-0.04688598147702282	0.24668291641597484	0.048207196258407636	-0.2566627521311021	-0.0015328264041370445	-0.0833547864027479	-0.02972373679164904	-0.4919981989205753	0.1416984814341861	0.10924798455925627	-0.14490466838968422	0.11323014392463404	-0.03299968566037164	-0.5554404024014075	-0.2423258113252117	-0.15396070792591313	-0.40022330932935984	-0.6176383556548355	-0.35431936340869363	-0.5737055828528491	-0.5791166281289898	-0.23934536480036525	-0.5382077731742715	-0.3673254761678627	-0.27363616084861786	-0.40793707800153145	-0.5085544209243846	-0.48900872774118653	-0.20216790418432076	-0.14356055719825772	-0.6161055292506984	-0.27096457700594573	-0.5439818460612	-0.0871184292084145	-0.38104384623455134	-0.6474557577335278	-0.2224208077781785	-0.3868663047732519	-0.3749373923411598	0.270885072145	0.119339994516	0.648013768535	0.197395731844	0.0267271087754	0.0374147936077	0.301187193336	0.983930924304	0.122558611289	0.143314270352	0.122558611289	0.183752894264	0.00630390455696	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr16:2918201..2918315,-__2059.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr16:2918201..2918315,-__2059.1.0.0	rs114157180	2.958642536482124	3.4423388907054946	2.604977985716601	2.4101494903242	2.6374833776785316	2.89058783861583	2.955279492659498	3.7006906056301325	3.0064070742859768	3.0706064856516395	3.01406553570778	3.1623780574180715	2.987800614239657	2.3580614053051345	2.504712946770109	1.9174022444617973	1.8598675097872126	2.1396905338463847	2.1614704395544764	2.3816530819719346	2.8383408154193486	2.4447552264381263	2.347180535139828	2.420466209324738	2.388909335359962	2.3135425236149207	-0.6005811311769893	-0.9376259439353856	-0.6875757412548038	-0.5502819805369874	-0.49779284383214684	-0.7291173990613538	-0.5736264106875635	-0.862349790210784	-0.5616518478478505	-0.7234259505118117	-0.5935993263830417	-0.7734687220581096	-0.6742580906247356	0.00153065306427	0.00327633608155	0.0107365258413	0.0468981580933	0.00183860515565	7.05457685779e-05	0.0107365258413	0.00220311126631	0.000199758557674	0.000222088887318	0.00043495277549	0.000116396943443	4.81162378022e-25	1	1	1	1	1	0.0538969671935	1	1	0.154413365082	0.174339776545	0.334478684352	0.0906732189422	4.03214072783e-22	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr16:2918201..2918315,-__2059.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr16:2918201..2918315,-__2059.1.0.0	rs17660212	2.958642536482124	3.4423388907054946	2.604977985716601	2.4101494903242	2.6374833776785316	2.89058783861583	2.955279492659498	3.7006906056301325	3.0064070742859768	3.0706064856516395	3.01406553570778	3.1623780574180715	2.987800614239657	2.6177437562343027	2.8071758649455756	2.219457832765311	2.1879214337128974	2.4300051449837716	2.4728295834156357	2.4507438687395693	3.0040574867257845	2.6424517176234126	2.606343604109866	2.868535302908511	2.4682427551522412	2.5646256959430733	-0.34089878024782116	-0.635163025759919	-0.38552015295128994	-0.22222805661130263	-0.20747823269475996	-0.4177582552001944	-0.5045356239199288	-0.696633118904348	-0.3639553566625642	-0.46426288154177353	-0.1455302327992687	-0.6941353022658303	-0.4231749182965834	0.0115927323179	0.0719809426143	0.136115392203	0.107123399254	0.154650770421	0.00460947122508	0.0350255264852	0.00275115621019	0.0168468410067	0.00993701022923	0.045430560235	0.000956291509096	5.54906282331e-12	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.744951085586	4.65011464593e-09	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr16:2918201..2918315,-__2059.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr16:2918201..2918315,-__2059.1.0.0	rs114157180,rs17660212	2.958642536482124	3.4423388907054946	2.604977985716601	2.4101494903242	2.6374833776785316	2.89058783861583	2.955279492659498	3.7006906056301325	3.0064070742859768	3.0706064856516395	3.01406553570778	3.1623780574180715	2.987800614239657	2.1076203206567263	2.67883478252023	2.0953382502778752	1.8607500635088143	1.84378362342367	1.8526819742700933	2.296830263606055	2.3589070115823	2.0941068442863	2.176383710084389	2.4224857716576373	2.5080508744934433	2.191314457530628	-0.8510222158253975	-0.7635041081852645	-0.5096397354387259	-0.5493994268153857	-0.7936997542548616	-1.0379058643457368	-0.6584492290534429	-1.3417835940478327	-0.9123002299996767	-0.8942227755672505	-0.5915797640501426	-0.6543271829246282	-0.7964861567090287	0.00133155906714	0.00883703695038	0.0156538458129	0.0678362651725	0.000319883151355	3.33944592614e-05	0.00160288548718	2.60794292158e-06	5.62183900058e-05	3.97876883146e-05	0.00210630874131	0.00043495277549	3.38938635229e-28	0.258322459026	1	1	1	0.0655760460278	0.00671228631155	0.320577097435	0.000508548869708	0.0115809883412	0.00827583916945	0.431793291968	0.089600271751	7.69390701969e-26	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr16:3200555..3200669,-__2060.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr16:3200555..3200669,-__2060.1.0.0	rs115131411	-0.28839209742966376	-0.2560206699386823	-0.3309210060344129	-0.2934925994324862	-0.1769289788285376	-0.16865536090305785	-0.22026417799819464	0.14939856597089846	-0.02019497098336403	-0.12498097016179359	0.057085446718385335	-0.04956059754510908	-0.14357728471383482	-0.16053272551128842	-0.09987049705047196	-0.36606104614396706	-0.4762721698066777	-0.06786585775352745	-0.11463941327325514	0.028180404187793426	-0.17249819490591467	-0.3833311791862022	-0.15020635706174432	-0.13333952084846173	-0.15237918123043226	-0.18740131154867912	0.12785937191837535	0.15615017288821031	-0.03514004010955418	-0.1827795703741915	0.10906312107501014	0.05401594762980272	0.24844458218598808	-0.3218967608768131	-0.36313620820283815	-0.025225386899950727	-0.19042496756684707	-0.10281858368532318	-0.04382402683484427	0.809021331888	0.572794651112	0.930450938691	0.747262025795	0.657696241675	0.313917214294	0.382791178922	0.0959193233604	0.088148079887	0.657696241675	0.253741740693	0.696989544957	0.549150703229	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr16:3200555..3200669,-__2060.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr16:3200555..3200669,-__2060.1.0.0	rs115131411,rs2735515	-0.28839209742966376	-0.2560206699386823	-0.3309210060344129	-0.2934925994324862	-0.1769289788285376	-0.16865536090305785	-0.22026417799819464	0.14939856597089846	-0.02019497098336403	-0.12498097016179359	0.057085446718385335	-0.04956059754510908	-0.14357728471383482	-0.540572741703025	-0.5976834730108096	-0.5714895236396139	-0.28150234487210346	-0.10696690090740182	-0.3622717295369381	-0.46506405882384916	-0.21897797723172757	-0.18513078921473913	-0.15010792236093912	-0.21649631730416385	-0.1473905245971971	-0.3203045252668756	-0.2521806442733613	-0.3416628030721273	-0.24056851760520104	0.011990254560382718	0.06996207792113576	-0.19361636863388024	-0.24479988082565451	-0.36837654320262603	-0.1649358182313751	-0.025126952199145527	-0.2735817640225492	-0.09782992705208801	-0.1767272405530408	0.226876581559	0.382791178922	0.253741740693	0.819442862795	0.840380101088	0.116187990183	0.150801701171	0.179364149792	0.436112310787	0.648013768535	0.132622250874	0.368322877114	0.113940891749	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr17:9687985..9688099,-__2067.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr17:9687985..9688099,-__2067.1.0.0	rs78741090	-1.958287075090676	-2.0770687951303985	-2.1141604505216325	-1.8952446886468184	-2.195567071778962	-1.8056596835911938	-2.337092638276349	-1.767375504575684	-2.0876474386926542	-1.7712204000582543	-2.3973915581024174	-2.043226638120418	-2.0374951618821218	-1.573498196159963	-1.7590294604019734	-1.9979388214976144	-1.3173042859729205	-1.887693713162456	-1.7419386402631891	-1.6268236419502529	-2.256210017157206	-1.9542241787712271	-1.8768376676074525	-2.06996903574591	-1.7218901367034722	-1.8152798162828032	0.384788878930713	0.31803933472842516	0.11622162902401811	0.5779404026738979	0.3078733586165059	0.06372104332800466	0.710268996326096	-0.4888345125815221	0.13342325992142712	-0.1056172675491982	0.32742252235650726	0.3213365014169458	0.22221534559931835	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr19:2169044..2169158,-__2069.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:2169044..2169158,-__2069.1.0.0	rs7251881	-0.9139665951988795	-0.8122731682399504	-1.049357443826727	-1.1600643447189516	-0.7790075071366488	-0.9307556816949487	-1.333449826678103	-1.0810816912747803	-0.9112363484148952	-1.1506908582378608	-1.164607759092532	-0.5766833365876477	-0.9885978800918269	-1.1859462887492846	-0.8237832824920893	-0.7990943229375481	-1.0016709162053712	-0.9224534226406323	-0.8668091443542763	-1.22412048281095	-0.7929167447963484	-0.8460999801892846	-1.2004809208331615	-0.6675917726259488	-0.8199199230125065	-0.9292406001372835	-0.2719796935504052	-0.011510114252138881	0.2502631208891789	0.1583934285135804	-0.14344591550398356	0.06394653734067246	0.10932934386715298	0.2881649464784318	0.06513636822561064	-0.04979006259530072	0.49701598646658307	-0.2432365864248588	0.059357279954543596	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0668282302407	0.29495293544	0.074699658249	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr19:2169044..2169158,-__2069.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:2169044..2169158,-__2069.1.0.0	rs7256735	-0.9139665951988795	-0.8122731682399504	-1.049357443826727	-1.1600643447189516	-0.7790075071366488	-0.9307556816949487	-1.333449826678103	-1.0810816912747803	-0.9112363484148952	-1.1506908582378608	-1.164607759092532	-0.5766833365876477	-0.9885978800918269	-0.6351245751874461	-0.42692715159294026	-0.6476637377334641	-0.7089870506651533	-0.8898906585036223	-1.5800241176850018	-0.6382570974456789	-0.6218133640623791	-0.9081590820617836	-0.728238834018514	-0.6461690530594968	-0.7946715990717433	-0.7688271934239354	0.2788420200114333	0.3853460166470102	0.40169370609326294	0.45107729405379826	-0.11088315136697346	-0.6492684359900531	0.695192729232424	0.4592683272124012	0.003077266353111563	0.4224520242193468	0.5184387060330351	-0.21798826248409564	0.21977068666789176	NA__no_active_tile	0.214221741399	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0741297894045	0.229462716724	0.757455001208	0.127138739095	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr19:2169044..2169158,-__2069.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:2169044..2169158,-__2069.1.0.0	rs7251881,rs7256735	-0.9139665951988795	-0.8122731682399504	-1.049357443826727	-1.1600643447189516	-0.7790075071366488	-0.9307556816949487	-1.333449826678103	-1.0810816912747803	-0.9112363484148952	-1.1506908582378608	-1.164607759092532	-0.5766833365876477	-0.9885978800918269	-0.6874398875485915	-0.7892588500474287	-1.234983750666973	-1.2959823034444158	-1.2301478931694994	-0.5530805055400605	-1.2155748594006028	-0.9261137835046034	-0.8657397642944474	-0.7202838337710178	-1.0193140359815758	-0.8261097077511945	-0.9470024312600344	0.22652670765028793	0.023014318192521754	-0.18562630684024595	-0.1359179587254642	-0.45114038603285056	0.3776751761548882	0.11787496727750013	0.15496790777017688	0.04549658412044777	0.430407024466843	0.14529372311095612	-0.24942637116354682	0.04159544883179286	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0232568344756	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.493479697885	0.0779209020113	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr19:2627596..2627710,-__2070.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:2627596..2627710,-__2070.1.0.0	rs12462730	-0.524997211798319	-0.04032588700945452	-0.3498256232522974	-0.26106063905369953	-0.06251481024781376	-0.2471958951985436	-0.5899985979225344	-0.5694878535860508	-0.3868674467668445	-0.2043115337608705	-0.11762113285041327	-0.232621684329715	-0.29890235964804635	-0.3965454776979407	-0.4016792739759639	-0.33275637289239557	-0.2537756450658564	-0.09674360029056703	-0.17997773286919283	-0.7441314562688425	-0.6865047889161828	-0.05091794865843635	-0.3063692612966141	-0.1262925135513784	-0.16040684956254725	-0.3113417434204932	0.12845173410037836	-0.3613533869665094	0.01706925035990181	0.0072849939878431025	-0.03422879004275327	0.06721816232935077	-0.15413285834630808	-0.11701693533013202	0.33594949810840813	-0.10205772753574363	-0.00867138070096514	0.07221483476716775	-0.012439383772446806	0.925117039075	0.136115392203	0.737113058664	0.536806685117	0.428242856315	0.527990680582	0.501992688725	0.237368605078	0.420456664513	0.572794651112	0.757455001208	0.809021331888	0.698742244771	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr19:45228582..45228696,-__2071.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:45228582..45228696,-__2071.1.0.0	rs10422766	-0.8620508570465685	-0.5980837651856029	-0.6972291026356725	-0.5984746657405463	-0.5367381714189694	-0.4765222288875549	-0.45821121385978164	-0.6977925666180897	0.0055461136426684	-0.3774761982498132	-0.6349006280546556	-0.251786790463879	-0.5153100062098721	-0.5208811577444287	-0.5621972262882469	-0.26777415551409794	-0.6371893460365097	-0.4945765218853396	-0.3849346929111208	-0.7939491355458941	-0.18234316252642105	-0.19156842416201866	-0.9601863073411152	-0.27865523106573564	-0.7442923018247471	-0.501545638570473	0.3411696993021398	0.035886538897356046	0.42945494712157456	-0.038714680295963366	0.042161649533629775	0.0915875359764341	-0.33573792168611244	0.5154494040916687	-0.19711453780468707	-0.582710109091302	0.35624539698892	-0.4925055113608682	0.013764367639399163	NA__no_active_tile	0.76769033028	0.60051573606	NA__no_active_tile	0.882579228976	0.493479697885	0.320413072024	0.536806685117	0.66743649171	0.120936669873	0.737113058664	0.0362033618716	0.485353088672	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr19:45228582..45228696,-__2071.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:45228582..45228696,-__2071.1.0.0	rs12460865	-0.8620508570465685	-0.5980837651856029	-0.6972291026356725	-0.5984746657405463	-0.5367381714189694	-0.4765222288875549	-0.45821121385978164	-0.6977925666180897	0.0055461136426684	-0.3774761982498132	-0.6349006280546556	-0.251786790463879	-0.5153100062098721	-0.6178143495222428	-0.564141147037137	-0.34179727881979016	-0.528480974497317	-0.5338026972192286	-0.3572962110208323	-0.03778564910601767	0.051202681577914716	-0.4977014518504481	-0.2677018703503376	-0.09563926526281763	-0.05582224205288819	-0.3205650379300952	0.24423650752432569	0.033942618148465886	0.35543182381588234	0.0699936912432293	0.0029354741997408285	0.1192260178667226	0.42042556475376397	0.7489952481960045	-0.5032475654931166	0.10977432789947561	0.539261362791838	0.19596454841099079	0.19474496827977691	NA__no_active_tile	0.788281320858	0.452098798395	0.845630974801	0.925116184404	0.8931878581	0.914457985151	0.177194263566	0.170821264488	0.554657938956	0.333666485083	0.648013768535	0.883833740002	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr19:45228582..45228696,-__2071.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:45228582..45228696,-__2071.1.0.0	rs10422766,rs12460865	-0.8620508570465685	-0.5980837651856029	-0.6972291026356725	-0.5984746657405463	-0.5367381714189694	-0.4765222288875549	-0.45821121385978164	-0.6977925666180897	0.0055461136426684	-0.3774761982498132	-0.6349006280546556	-0.251786790463879	-0.5153100062098721	-0.4486399449794359	-0.4588308766501338	-0.8835796342432206	-0.4792524949581587	-0.9224534226406323	-0.5729647518489251	-0.5959443963121074	-0.6556621571560439	-0.8577816231576798	-0.09508606765451903	-0.6548051440891819	-0.3536986439079537	-0.581558263133166	0.4134109120671326	0.13925288853546913	-0.1863505316075481	0.11922217078238762	-0.38571525122166295	-0.09644252296137024	-0.13773318245232574	0.042130409462045826	-0.8633277368003482	0.28239013059529416	-0.019904516034526254	-0.10191185344407472	-0.06624825692329392	NA__no_active_tile	0.60051573606	0.188220673538	0.79863356553	0.119335765104	0.313917214294	0.493479697885	NA__no_active_tile	0.0869000376912	0.572794651112	NA__no_active_tile	0.1527099507	0.110353202374	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr19:49465680..49465794,-__2072.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:49465680..49465794,-__2072.1.0.0	rs79366920	-0.1319049245796755	0.021698660907326545	-0.010441629830812628	-0.24436284722386376	-0.18271778479199133	0.005715463251263571	-0.30739448783745266	-0.27069279299414073	-0.033954667607385865	-0.2114242871065085	-0.09125138886324938	-0.06806831124743074	-0.12706658316032673	0.36729825392618287	0.4174023014151591	0.5588049270760123	0.5441408420837555	0.5670262495835079	0.6225291023189556	0.2614010684191058	0.29703663405375275	0.3603608640131168	0.4819176147215769	0.4884646029020268	0.35534276495031064	0.4434771021219552	0.4992031785058584	0.3957036405078326	0.5692465569068249	0.7885036893076192	0.7497440343754992	0.616813639067692	0.5687955562565585	0.5677294270478934	0.39431553162050265	0.6933419018280854	0.5797159917652762	0.4234110761977414	0.5705436852822819	0.00342117348194	0.0201846528804	0.0249397487324	0.0140036728837	8.27992768152e-06	4.67965309508e-06	0.000303956631358	0.000222088887318	0.00641629102443	0.000827700533168	0.000303956631358	0.000531799681309	7.84231423032e-27	1	1	1	1	0.00639210417013	0.00357525496464	0.224623950574	0.161458621081	1	0.649744918537	0.233742649515	0.41427195174	6.57185932501e-24	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr2:136893852..136893966,-__2075.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr2:136893852..136893966,-__2075.1.0.0	rs16832995	-1.8267132207999452	-1.5827950042730414	-1.6728905535992555	-2.1482940789466607	-1.9895336376753758	-1.8805070998487816	-1.610648352907072	-1.351698194826895	-1.6256725855148797	-2.0494285466398336	-2.081180540822176	-1.4217632380954282	-1.7700937544957789	-2.203341425668738	-2.213129583274128	-1.7662969221764677	-1.8613119892724803	-1.9399194232297516	-1.7948191573738423	-2.03727929377166	-1.7577293636719007	-1.9665456926531903	-1.7782513665289017	-2.14636960394516	-1.9354030966459712	-1.9500330765176825	-0.3766282048687928	-0.6303345790010866	-0.09340636857721218	0.2869820896741804	0.049614214445624194	0.08568794247493927	-0.4266309408645881	-0.4060311688450058	-0.34087310713831065	0.27117718011093195	-0.06518906312298389	-0.5136398585505431	-0.17993932202190396	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr20:30249477..30249591,-__2082.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr20:30249477..30249591,-__2082.1.0.0	rs113827843	0.2843169716301792	0.4043378941978091	0.5729744582550711	0.3745719200547943	0.43417807200232456	0.40823459422737707	0.49105952991443863	0.6778676217964312	0.5906997399679241	0.5513494663452579	0.7344781727555181	0.5551790079380061	0.5066039540904277	-0.2822486402666352	0.00831142270823648	-0.21093064698047365	-0.02123003410178605	0.12059469024450375	0.13087872135308026	-0.041148813871455324	0.2590608513855729	0.18133021376009267	0.2203342267865994	0.13307714421318428	-0.08514382228893477	0.03440710941183205	-0.5665656118968144	-0.3960264714895726	-0.7839051052355448	-0.3958019541565803	-0.3135833817578208	-0.2773558728742968	-0.532208343785894	-0.41880677041085834	-0.40936952620783146	-0.3310152395586585	-0.6014010285423338	-0.6403228302269409	-0.47219684467859563	0.147021540231	0.0583274625199	0.00849533044186	0.0194743211566	0.114632560059	0.0832517220182	0.0344469162732	0.110080523892	0.21176555971	0.13967914143	0.0658387268341	0.0678362651725	1.93079581944e-07	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.000161800689669	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr20:48887185..48887299,-__2084.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr20:48887185..48887299,-__2084.1.0.0	rs17196752	-0.7634217646832128	-0.6181188117683519	-1.0929580778906076	-0.8575324706511446	-0.7749727990990141	-0.7760558879938929	-1.1924377973632168	-0.7093110862025062	-0.8287803204169205	-0.973606098463788	-0.8666263732758129	-0.5680079400984245	-0.8351524523255742	-0.9704963989073209	-0.6720920284151952	-0.6805220551872626	-0.9805015836469495	-1.0399410258428083	-1.1632647672691812	-0.8756582128471742	-1.277503749017165	-0.8978098801298096	-0.6883301546908999	-1.0524368281887344	-0.7877257911232998	-0.9238568729388167	-0.2070746342241081	-0.05397321664684329	0.412436022703345	-0.12296911299580493	-0.2649682267437943	-0.38720887927528824	0.3167795845160426	-0.5681926628146589	-0.06902955971288904	0.2852759437728881	-0.18581045491292147	-0.2197178510248753	-0.08870442061324231	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0412580447575	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.197395731844	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.361212608085	NA__no_active_tile	0.60051573606	0.0894929941731	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr20:52201599..52201713,-__2085.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr20:52201599..52201713,-__2085.1.0.0	rs2741374	-1.4247625876006424	-1.3371920168807503	-1.3799443813962835	-1.1699377776602122	-1.040501040887568	-1.7266270643755202	-1.5979716795166599	-1.0989344128850709	-1.8468523865359752	-1.7107479385487607	-1.8123911317127233	-1.6135759081573768	-1.4799531938464618	-1.1992613814990456	-1.2750138610500628	-1.4733542707969634	-2.0531586066450416	-1.6237884660079305	-1.6073385238858164	-1.5978830972805116	-1.0786975673286894	-1.5602892426810382	-1.7152640324195956	-1.6379439734696482	-1.7257431922565551	-1.5456446846100749	0.22550120610159685	0.06217815583068753	-0.09340988940067985	-0.8832208289848293	-0.5832874251203626	0.11928854048970372	8.858223614827132e-05	0.0202368455563815	0.286563143854937	-0.0045160938708348475	0.1744471582430751	-0.11216728409917831	-0.06569149076361291	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr22:24256203..24256317,-__2089.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr22:24256203..24256317,-__2089.1.0.0	rs78056593	2.8077090146105386	2.863194076137008	2.568391904796373	2.409496912531882	2.670308854455108	2.692781056465538	2.745088360725229	2.8814741187593578	2.7563199659994426	2.665420986188132	2.8439964025429236	2.7821987496879483	2.7238650335749566	1.2285234635179707	1.3794617142400192	1.2698018265970685	1.122939501424097	1.388004923255506	1.4321774601983654	1.5334569405391338	1.1441359829161506	1.4576048218868904	1.258124737583641	1.2304276504669196	1.1334133686018322	1.2981726992689662	-1.5791855510925679	-1.4837323618969886	-1.2985900781993045	-1.2865574111077849	-1.2823039311996018	-1.2606035962671727	-1.2116314201860954	-1.7373381358432072	-1.2987151441125522	-1.407296248604491	-1.613568752076004	-1.6487853810861162	-1.4256923343059906	1.31760160382e-05	1.25214566711e-06	3.33944592614e-05	2.48534577241e-05	3.97876883146e-05	0.000137117000352	0.000715310039185	8.81215823517e-06	1.06220766775e-05	6.03947467088e-06	1.63168639115e-05	6.8564559793e-06	5.38481537556e-46	0.00932861935503	0.000931596376333	0.0248788721498	0.0183169983427	0.0307160953789	0.104757388269	0.528614118958	0.00640643903697	0.00821086527167	0.00474098761664	0.012547668348	0.00534117920787	4.51247528472e-43	sig	sig	sig	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr3:152878293..152878407,-__2091.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr3:152878293..152878407,-__2091.1.0.0	rs192987417	-0.7435752306392569	-0.9394884475630167	-0.791961502301834	-0.8312959242134328	-0.5547061980327952	-0.6680912427166829	-0.8638878147999993	-0.8912046496801278	-0.601370071405278	-0.8363122919224788	-0.8708634964385676	-0.7893887539055974	-0.7818454686349224	-0.8222014791084972	-0.9126683432044472	-0.9203840978153961	-0.8436033194401951	-0.8724436392009225	-0.7455691586994437	-1.0927427523801407	-0.8584730628877999	-0.8687305784761788	-0.7810077570043235	-0.7429902667424159	-0.5889046362931494	-0.8374765909377425	-0.07862624846924027	0.02682010435856952	-0.12842259551356205	-0.012307395226762274	-0.3177374411681273	-0.07747791598276088	-0.22885493758014142	0.032731586792327905	-0.26736050707090087	0.055304534918155346	0.12787322969615178	0.200484117612448	-0.0556311223028202	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.288805731951	0.957167318493	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.545696106059	NA__no_active_tile	0.840380101088	0.242741268695	0.759416636265	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr3:171858429..171858543,-__2093.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr3:171858429..171858543,-__2093.1.0.0	rs6445040	1.1385753797891143	1.2457806877157647	1.0828299015399645	0.9533555148097146	1.0461000914943046	1.1094826008905816	0.7948546284489424	0.9822259816878354	0.959661573963217	1.0431227170971282	0.9871955957734172	1.0558748898435422	1.0332549635877941	-1.1372530793917606	-1.030158549442306	-1.159179029036319	-1.1528902719261218	-0.8626393439562965	-0.9113006923981702	-1.2907766719682146	-1.1675299389198672	-1.0810477435839236	-1.1013171199602982	-0.8352855630963156	-1.1742949772177886	-1.0753060817414484	-2.275828459180875	-2.2759392371580707	-2.242008930576284	-2.1062457867358364	-1.908739435450601	-2.0207832932887517	-2.085631300417157	-2.149755920607703	-2.0407093175471407	-2.1444398370574262	-1.8224811588697327	-2.230169867061331	-2.108561045329242	9.04126082625e-12	1.95964013752e-10	8.2291786864e-12	2.08206006271e-11	9.04126082625e-12	8.23367049956e-12	6.19216123946e-11	5.52754458971e-10	9.04126082625e-12	9.04126082625e-12	7.40729972622e-11	9.92630722464e-12	5.47915587108e-115	6.40121266499e-09	1.45797226232e-07	6.13073812137e-09	1.53447826621e-08	6.97985335787e-09	6.29052426166e-09	4.57600715596e-08	4.01852491672e-07	6.98889461869e-09	7.09738974861e-09	5.69621348946e-08	7.73259332799e-09	4.59153261997e-112	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:143247973..143248087,-__2105.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:143247973..143248087,-__2105.1.0.0	rs117695610	1.2667034410599136	1.3937069825884856	1.3270828441298816	1.2262704944501486	1.2048200857629692	1.4343920320409822	1.2419516670340869	1.1870083927636066	1.3996615870069768	1.3512375825873637	1.309434518972052	1.3416611865405628	1.3069942345780858	1.101256393336919	1.3560164949943614	0.95857376520403	0.8410332714201167	1.259754616587057	1.173585405489086	1.071748714397636	1.1309214031455204	1.2891750478426847	1.2957973107586078	1.4305426901633158	1.360964909644537	1.1891141685819895	-0.16544704772299457	-0.03769048759412419	-0.3685090789258516	-0.38523722303003183	0.054934530824087835	-0.26080662655189624	-0.1702029526364508	-0.056086989618086225	-0.11048653916429219	-0.05544027182875588	0.12110817119126382	0.019303723103974324	-0.11788006599609646	0.79863356553	0.967868733231	0.301187193336	0.79863356553	0.60051573606	0.170821264488	0.727009731456	0.405136064622	0.591208103411	0.510582765025	0.829896383209	0.85089220831	0.922302228724	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:143247973..143248087,-__2105.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:143247973..143248087,-__2105.1.0.0	rs7772306	1.2667034410599136	1.3937069825884856	1.3270828441298816	1.2262704944501486	1.2048200857629692	1.4343920320409822	1.2419516670340869	1.1870083927636066	1.3996615870069768	1.3512375825873637	1.309434518972052	1.3416611865405628	1.3069942345780858	1.244616531819834	1.5310405046457392	1.204844326343969	1.0502899546713442	1.2056706803068282	1.267852840302768	1.1304208320271962	1.1947210807491946	1.3471978610538207	1.3257423499049283	1.256038269454307	1.4437809077518926	1.2668513449193188	-0.022086909240079722	0.13733352205725358	-0.12223851778591266	-0.17598053977880435	0.0008505945438590512	-0.1665391917382142	-0.11153083500689065	0.007712687985587996	-0.05246372595315618	-0.025495232682435365	-0.05339624951774491	0.10211972121132984	-0.0401428896587673	0.667432913386	0.536806685117	0.967868733231	0.757455001208	0.788281320858	0.29495293544	0.840380101088	0.536806685117	0.85089220831	0.861430881609	0.946473618223	0.554657938956	0.991710535739	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr6:143247973..143248087,-__2105.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:143247973..143248087,-__2105.1.0.0	rs117695610,rs7772306	1.2667034410599136	1.3937069825884856	1.3270828441298816	1.2262704944501486	1.2048200857629692	1.4343920320409822	1.2419516670340869	1.1870083927636066	1.3996615870069768	1.3512375825873637	1.309434518972052	1.3416611865405628	1.3069942345780858	1.0563840522185501	1.3719142277460232	1.0705594273894103	0.8974135976144353	1.112230818334014	1.1360025117240824	1.024804305608333	1.1253200696713037	1.1233772226231866	1.1017747556517303	1.2110542826652952	1.074213071977824	1.1087540286020159	-0.21031938884136347	-0.021792754842462347	-0.2565234167404713	-0.3288568968357133	-0.09258926742895524	-0.2983895203168998	-0.21714736142575397	-0.06168832309230288	-0.2762843643837902	-0.24946282693563337	-0.09838023630675674	-0.26744811456273876	-0.1982402059760701	0.420456664513	0.737113058664	0.397602565759	0.48504462162	0.320413072024	0.0426112802219	0.242741268695	0.696989544957	0.154655491485	0.107123399254	0.619326784864	0.270885072145	0.083024273044	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:151541671..151541785,-__2113.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:151541671..151541785,-__2113.1.0.0	rs60002611	-0.1249668333028552	-0.08445305764117361	-0.05479362828513862	0.2741599023743644	0.021103379326883616	0.13686023305933426	-0.07863956327799244	-0.06337773806271645	-0.12716257713751689	0.2733368141631681	0.1529131735474581	-0.05624346453188369	0.02239472001932763	-1.1403934539166825	-1.1692313987879925	-1.8663070637556205	-1.4971160904183345	-1.5793162133755005	-1.2631225344473542	-1.2542731557379134	-1.7002916426227817	-1.6120891636504182	-1.5346723807063176	-1.6534453458661234	-1.0590677620945999	-1.44411051711497	-1.0154266206138272	-1.0847783411468188	-1.8115134354704818	-1.7712759927926989	-1.600419592702384	-1.3999827675066885	-1.175633592459921	-1.6369139045600651	-1.4849265865129013	-1.8080091948694856	-1.8063585194135814	-1.0028242975627162	-1.4665052371342977	0.00641629102443	0.000373410950373	4.46777109943e-05	0.000152810281165	0.000505862288815	2.00209749007e-06	0.00175684955224	0.000210645996816	9.38141513904e-06	1.84173011953e-05	0.000392957862114	5.01342010717e-05	2.7498892801e-36	1	0.277817747078	0.0332848946908	0.112621177218	0.390525686965	0.00152960248242	1	0.153139639685	0.00725183390248	0.0144575814383	0.302184595966	0.0390545426349	2.30440721672e-33	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr7:151541671..151541785,-__2113.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:151541671..151541785,-__2113.1.0.0	rs60002611,rs56797687	-0.1249668333028552	-0.08445305764117361	-0.05479362828513862	0.2741599023743644	0.021103379326883616	0.13686023305933426	-0.07863956327799244	-0.06337773806271645	-0.12716257713751689	0.2733368141631681	0.1529131735474581	-0.05624346453188369	0.02239472001932763	-1.5389696868481388	-1.5482182465156908	-1.4638283040252886	-1.6433133702091685	-1.8575252719668316	-1.7796906726174972	-1.6784865192346685	-1.6211739396799798	-1.6991049807635037	-1.5874062103761823	-1.9554641191034174	-1.587591716920619	-1.6633977531884157	-1.4140028535452835	-1.4637651888745173	-1.40903467574015	-1.9174732725835328	-1.8786286512937151	-1.9165509056768315	-1.5998469559566761	-1.5577962016172633	-1.5719424036259868	-1.8607430245393504	-2.1083772926508755	-1.5313482523887354	-1.6857924732077432	0.00230397578633	1.53542809806e-05	3.14895644184e-05	2.79850783474e-05	1.7063912625e-08	2.78491922777e-06	0.00023411339895	1.99366201481e-08	3.86551195752e-07	3.41788294666e-08	1.25214566711e-06	2.44178879239e-06	1.70380952447e-54	0.446971302547	0.00310156475808	0.00626642331927	0.00528917980767	3.49810208812e-06	0.000559768764781	0.04682267979	3.88764092889e-06	7.96295463248e-05	7.10919652905e-06	0.000256689861758	0.000503008491232	3.86764762055e-52	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr8:134911741..134911855,-__2115.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr8:134911741..134911855,-__2115.1.0.0	rs12681880	-1.8216412738023589	-1.8445245320020747	-1.8107435579597122	-1.6080989074267138	-1.8893498466543919	-1.575339207542371	-1.4353272986008465	-1.5984744662899166	-1.6548092419830773	-1.722930326732445	-1.7765378142525288	-1.422901021495096	-1.6800564578951276	-1.6014770492216637	-1.5589823607756395	-1.25666406558393	-1.3562091115619959	-1.3462400301694788	-1.3496471252296987	-1.0390938441933606	-0.9641517523393524	-1.1543233889585904	-1.5187007607132692	-1.4088933916149988	-1.3238658650914477	-1.323187395454452	0.22016422458069518	0.2855421712264352	0.5540794923757821	0.25188979586471794	0.5431098164849131	0.22569208231267224	0.3962334544074859	0.6343227139505643	0.5004858530244869	0.20422956601917575	0.36764442263752994	0.09903515640364824	0.35686906244067557	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chrX:23971400..23971514,-__2122.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chrX:23971400..23971514,-__2122.1.0.0	rs2023680	-1.0598061231487388	-1.655717197089429	-0.8328798902425226	-1.9098184339822204	-1.3002746104233474	-1.4006336237152135	-1.3002746104233474	-1.7811658986945826	-1.2726481451549227	-1.47691233869038	-1.3087539780030277	-1.4101714621796742	-1.3924213593122836	-1.352683286410802	-1.5420933511409087	-1.4752852328223658	-1.2019503323064598	-1.7486383963108731	-1.532242287711443	-1.6510263481161749	-1.4211788680838584	-1.9601918874034054	-1.6550633858778123	-1.1411010368775285	-1.7934639785391648	-1.5395765326333999	-0.29287716326206326	0.11362384594852037	-0.6424053425798432	0.7078681016757606	-0.4483637858875258	-0.1316086639962295	-0.3507517376928275	0.35998703061072423	-0.6875437422484827	-0.17815104718743235	0.16765294112549922	-0.3832925163594907	-0.14715517332111586	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr1:203259616..203259730,-__2125.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:203259616..203259730,-__2125.1.0.0	rs139025601	-0.42820212437868316	-0.07867629146821016	-0.3518399795656758	0.0066595947997947005	-0.5666239399422641	-0.8783478307402927	-0.5790456277421137	-0.5436043660250732	-0.5257377341277051	-0.628552090990178	-0.7870069868140833	-0.6030752548575861	-0.49700438598767255	-0.867464842580133	-0.5167560513881168	-0.5329565692401419	-0.5221441888280248	-1.3628939637500646	-1.1076545702466392	-1.4686957378167933	-0.8112635492010093	-0.6013321993108277	-0.7972103145169158	-0.6032661365193531	-0.3021220277607421	-0.7911466792632301	-0.43926271820144985	-0.4380797599199066	-0.1811165896744661	-0.5288037836278195	-0.7962700238078004	-0.2293067395063465	-0.8896501100746796	-0.26765918317593607	-0.07559446518312263	-0.16865822352673787	0.1837408502947302	0.30095322709684397	-0.29414229327555763	NA__no_active_tile	0.909133064849	NA__not_enough_barcodes	0.221756412245	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	0.29495293544	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.983930924304	0.861357408132	NA__no_active_tile	1	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr1:203259616..203259730,-__2125.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:203259616..203259730,-__2125.1.0.0	rs12095315	-0.42820212437868316	-0.07867629146821016	-0.3518399795656758	0.0066595947997947005	-0.5666239399422641	-0.8783478307402927	-0.5790456277421137	-0.5436043660250732	-0.5257377341277051	-0.628552090990178	-0.7870069868140833	-0.6030752548575861	-0.49700438598767255	-0.670334071930111	-0.45247492759316454	-0.43214441328525655	-0.5837600218705812	-0.4555931406429719	-0.5203976159429862	-0.8806527489975738	-0.8819551147033926	-0.8619936453466357	-0.6463113814254879	-0.3378202914425194	-0.42482604108570743	-0.5956886178555324	-0.2421319475514278	-0.3737986361249544	-0.08030443371958074	-0.5904196166703759	0.11103079929929222	0.3579502147973065	-0.3016071212554602	-0.3383507486783194	-0.3362559112189306	-0.017759290435309993	0.4491866953715639	0.17824921377187863	-0.09868423186785984	0.550163470011	0.510582765025	0.989287003123	0.0187859264625	0.946473618223	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.523601007454	0.619326784864	0.147021540231	0.619326784864	0.703376613064	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr1:203259616..203259730,-__2125.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:203259616..203259730,-__2125.1.0.0	rs139025601,rs12095315	-0.42820212437868316	-0.07867629146821016	-0.3518399795656758	0.0066595947997947005	-0.5666239399422641	-0.8783478307402927	-0.5790456277421137	-0.5436043660250732	-0.5257377341277051	-0.628552090990178	-0.7870069868140833	-0.6030752548575861	-0.49700438598767255	-0.1713194222448713	-0.7488619151840983	-0.4459645044311412	-0.21732429328308606	0.29312957269949047	-0.15638458013315765	-0.5846928431768538	-0.4626552284952577	-0.08705402531149584	-0.05071393905601166	-0.021577508432275797	-0.26546679106665394	-0.2432404565096177	0.25688270213381187	-0.6701856237158881	-0.09412452486546541	-0.22398388808288075	0.8597535126417546	0.721963250607135	-0.005647215434740116	0.08094913752981553	0.4386837088162092	0.5778381519341663	0.7654294783818075	0.3376084637909321	0.2537639294780549	0.347262941929	0.343829805771	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	0.259370210024	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	0.0619830296882	NA__not_enough_barcodes	0.408929232264	0.0756484938165	1	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	1	NA__not_enough_barcodes	1	1	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr1:209601309..209601423,-__2126.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:209601309..209601423,-__2126.1.0.0	rs78638208	-0.5207880270183218	-0.5164109866409635	-0.5218422853905564	-0.7891565106667244	-0.1293270580144034	-0.2267741496231289	-0.5447900945545455	-0.21535522118913705	-0.297652748180554	-0.055546360154207414	-0.37594178022695496	-0.7179751218455598	-0.4092966952920882	-0.05659094116582351	-0.5063105154587333	-0.27798641828490034	-0.4570573040676913	-0.26680041321871634	-0.012546490045209042	-0.4676077672366304	-0.3306426011808698	-0.4516632816656629	-0.2093414875061079	0.02481619256187091	-0.40057931683042186	-0.2843591953415746	0.4641970858524983	0.01010047118223023	0.2438558671056561	0.33209920659903314	-0.13747335520431295	0.21422765957791984	0.07718232731791513	-0.11528737999173275	-0.1540105334851089	-0.15379512735190048	0.40075797278882586	0.3173958050151379	0.12493749995051344	0.0619890035232	0.935789553219	0.37190218233	0.0678362651725	0.591208103411	0.687084607526	0.757455001208	0.83513271997	0.657696241675	0.361218104761	0.460214637573	0.333666485083	0.508690650732	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr1:209601309..209601423,-__2126.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:209601309..209601423,-__2126.1.0.0	rs71636118	-0.5207880270183218	-0.5164109866409635	-0.5218422853905564	-0.7891565106667244	-0.1293270580144034	-0.2267741496231289	-0.5447900945545455	-0.21535522118913705	-0.297652748180554	-0.055546360154207414	-0.37594178022695496	-0.7179751218455598	-0.4092966952920882	-0.5472301417910351	0.011831190225439622	-0.17886297623887998	-0.3489598585746053	-0.06023216574407544	-0.49193491814002105	-0.4702168612762391	-0.440252130528312	-0.02116457680429381	0.2193415043141328	-0.23631310059980248	-0.5420770880473232	-0.2588392602670846	-0.0264421147727133	0.5282421768664032	0.34297930915167646	0.4401966520921191	0.06909489227032795	-0.2651607685168922	0.07457323327830645	-0.22489690933917497	0.2764881713762602	0.27488786446834024	0.13962867962715247	0.17589803379823654	0.1504574350250035	0.829896383209	0.0153662938375	0.30750859871	0.137883884654	0.397602565759	0.819442862795	0.545696106059	0.983930924304	0.501992688725	0.79863356553	0.209314265508	0.737110160717	0.588964046297	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr1:209601309..209601423,-__2126.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:209601309..209601423,-__2126.1.0.0	rs78638208,rs71636118	-0.5207880270183218	-0.5164109866409635	-0.5218422853905564	-0.7891565106667244	-0.1293270580144034	-0.2267741496231289	-0.5447900945545455	-0.21535522118913705	-0.297652748180554	-0.055546360154207414	-0.37594178022695496	-0.7179751218455598	-0.4092966952920882	-0.3584576513383617	-0.026381616197115758	-0.11325150589493505	-0.40350413458905265	-0.09901523617510938	-0.2313494052200749	-0.09233195385524501	-0.22026852575623249	-0.09825736870268274	-0.2910157616622057	-0.72924152295443	-0.4920554444014076	-0.26292751056223773	0.16233037567996011	0.49002937044384776	0.4085907794956214	0.3856523760776718	0.030311821839294012	-0.004575255596946021	0.4524581406993005	-0.004913304567095433	0.19939537947787123	-0.2354694015079983	-0.35329974272747505	0.2259196774441522	0.1463691847298503	0.657696241675	0.143314270352	0.129198935732	0.116187990183	0.444064484515	0.737113058664	0.452098798395	0.989287003123	0.420456664513	0.188220673538	0.3303093589	0.476688253492	0.29240362206	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr1:33446867..33446981,-__2132.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:33446867..33446981,-__2132.1.0.0	rs10798922	1.3996013213670422	1.4387087176348272	1.098246402046551	1.333737639180187	1.3307235852514077	1.4084599444270818	0.9307354778951904	1.2924045144913343	1.3309591716430371	1.5207775945354547	1.487822265013935	1.4768861210886837	1.3374218962145612	1.5167092919993754	1.5425826089137624	1.5360175622209258	1.1825574836673793	1.5488779055729416	1.6232573568935695	1.1035812319892941	1.3970364799142998	1.449128791588596	1.6604264361189098	1.4578412813603687	1.4351567987673954	1.4544311024172345	0.11710797063233325	0.1038738912789352	0.4377711601743748	-0.1511801555128076	0.21815432032153392	0.21479741246648776	0.17284575409410374	0.10463196542296549	0.11816961994555886	0.13964884158345514	-0.029980983653566273	-0.04172932232128823	0.11700920620267384	0.265084565602	0.829896383209	0.313917214294	0.66743649171	0.0959193233604	0.282745459933	0.428242856315	0.957167318493	0.563691144959	0.216719559135	0.978575937473	0.757455001208	0.721300830326	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr1:33446867..33446981,-__2132.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:33446867..33446981,-__2132.1.0.0	rs10914634	1.3996013213670422	1.4387087176348272	1.098246402046551	1.333737639180187	1.3307235852514077	1.4084599444270818	0.9307354778951904	1.2924045144913343	1.3309591716430371	1.5207775945354547	1.487822265013935	1.4768861210886837	1.3374218962145612	1.4699658107228837	1.653704299096877	1.5690178225584483	1.2287624150067498	1.7063141768323096	1.5996806627546545	1.3840468981040157	1.3740486009804318	1.540574406759693	1.853184483828972	1.7207709189231726	1.6978123395826163	1.5664902362625686	0.0703644893558415	0.2149955814620499	0.47077142051189735	-0.10497522417343719	0.3755905915809019	0.1912207183275727	0.4533114202088253	0.08164408648909749	0.2096152351166558	0.33240688929351725	0.23294865390923758	0.22092621849393268	0.22906834004800766	0.0906800339379	0.591208103411	0.0386605553759	0.313917214294	0.0333181634109	0.412754243182	0.0125089884503	0.66743649171	0.175053819161	0.0619890035232	0.288805731951	0.0181189115857	0.000183075761309	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.153417487977	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr1:33446867..33446981,-__2132.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr1:33446867..33446981,-__2132.1.0.0	rs10798922,rs10914634	1.3996013213670422	1.4387087176348272	1.098246402046551	1.333737639180187	1.3307235852514077	1.4084599444270818	0.9307354778951904	1.2924045144913343	1.3309591716430371	1.5207775945354547	1.487822265013935	1.4768861210886837	1.3374218962145612	2.0272726197409034	2.1504046805597565	1.9956512401466828	2.314821728927926	2.1198814391015564	2.1005417907956656	1.7382578343521933	1.893959510851171	2.2188235666132194	2.3554685398641766	2.401251151775858	2.1657522039796078	2.1235071922257265	0.6276712983738613	0.7116959629249293	0.8974048381001318	0.9810840897477389	0.7891578538501487	0.6920818463685838	0.8075223564570029	0.6015549963598368	0.8878643949701823	0.8346909453287219	0.9134288867619229	0.6888660828909241	0.7860852960111653	0.000457487620218	0.00160288548718	0.00406065558642	0.00300328973882	1.06220766775e-05	0.00121241130235	0.00023411339895	0.0181189115857	0.000129852144011	0.000337013519112	0.00023411339895	0.000129852144011	2.4870576394e-29	0.0887525983223	0.32378286841	0.808070461697	0.567621760637	0.00217752571888	0.243694671773	0.04682267979	1	0.0267495416662	0.0700988119752	0.0479932467847	0.0267495416662	5.64562084143e-27	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	not sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:47800396..47800510,-__2134.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:47800396..47800510,-__2134.1.0.0	rs116403805	1.6472023721378912	1.855731274256633	1.7066964703521692	1.29210924657751	1.6263778845953067	1.6254025740728646	1.4408731687793788	1.6237140653127462	1.580745421325524	1.6992204221662641	1.6920872123088713	1.7180279765412623	1.6256823407022016	0.7012449666664377	0.9717596754863124	1.1709412982296743	0.8198634583864829	0.9665365343226046	0.9430721010189396	0.9804555611091449	1.0650778629803364	1.0639018033091223	1.137000731824259	1.1393355243906549	0.9029049074771512	0.9885078687667598	-0.9459574054714536	-0.8839715987703206	-0.5357551721224949	-0.472245788191027	-0.6598413502727022	-0.682330473053925	-0.4604176076702339	-0.5586362023324098	-0.5168436180164018	-0.5622196903420051	-0.5527516879182164	-0.815123069064111	-0.6371744719354416	4.98941474284e-06	2.48534577241e-05	0.00023411339895	0.00406023278348	3.17406127568e-06	0.000152810281165	0.0134887989876	0.00127069654712	0.00078853414695	1.53272450794e-06	0.00078853414695	6.66706650175e-05	2.43321077345e-35	0.00353250563793	0.0184909725468	0.174414482218	1	0.00245037530483	0.11674705481	1	0.923796389754	0.609536895593	0.00120318873873	0.606382759005	0.0519364480486	2.03903062815e-32	sig	sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr10:30782567..30782681,-__2137.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr10:30782567..30782681,-__2137.1.0.0	rs11008068	-0.4265504975477963	-0.614669736369835	-0.5528264500910238	-0.3305738260306185	-0.6430923529549459	-0.6445931960821788	-0.9164910560880002	-1.0800978155342482	-0.6409060440951028	-0.43940821062881885	-0.5621099361360695	-0.6720683817060615	-0.6269489586053917	-0.7695958091690587	-0.5388519769924883	-0.5321767579908565	-0.5589137121243984	-0.6095342630068191	-0.7225147226851121	-0.9627084246168688	-0.9358322911868768	-0.7088546564382044	-0.7174108096699346	-0.6399829271461835	-0.9016333503416784	-0.7165008084473734	-0.3430453116212624	0.0758177593773467	0.020649692100167316	-0.22833988609377992	0.03355808994812681	-0.07792152660293328	-0.046217368528868596	0.1442655243473714	-0.06794861234310168	-0.2780025990411158	-0.07787299101011402	-0.22956496863561682	-0.08955184984198168	0.37190218233	0.591208103411	0.85089220831	0.0741297894045	0.8931878581	0.989287003123	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.460214637573	0.696989544957	0.8931878581	0.428242856315	0.923599387988	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr11:109957771..109957885,-__2143.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr11:109957771..109957885,-__2143.1.0.0	rs10891052	-1.2269270876183862	-0.8942580136944448	-1.0828765808920613	-1.3799743993297493	-1.2956671296842779	-1.6183546926571735	-1.1940159084591797	-1.5342196853629793	-1.4303827003851497	-1.4898628399367018	-1.231230198582018	-0.968816665066959	-1.2788821584724235	-1.5626678945386319	-1.1596851911799249	-1.3630171564352054	-1.315497312879542	-1.048069109052725	-1.5497788476014969	-1.4942928331705625	-1.0389878346961987	-1.6406768608906144	-1.475106133961777	-1.4236965196074454	-1.4932784913939445	-1.3803961821173392	-0.33574080692024566	-0.26542717748548006	-0.2801405755431441	0.06447708645020733	0.2475980206315529	0.0685758450556766	-0.3002769247113828	0.49523185066678055	-0.21029416050546468	0.014756705974924733	-0.19246632102542738	-0.5244618263269856	-0.10151402364491569	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr12:121714905..121715019,-__2146.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr12:121714905..121715019,-__2146.1.0.0	rs1612131	0.6393788532443538	0.6869300692248941	0.5310576147454028	0.45171882439966926	0.6546703852218331	0.527029979593627	0.46680745381041344	0.48334317008367544	0.8004774872457354	1.0027137731598859	0.6544350591823642	0.8509319278559718	0.6457912164806521	0.011587594041613173	0.16842096103191057	0.22175873234559193	0.09607886006057792	0.1860171993225843	0.18042423079711864	0.09400455101489984	-0.10766823162147372	0.49061376464378165	0.3105862779233627	0.3634822735854668	0.5735682999014984	0.21573954275391097	-0.6277912592027407	-0.5185091081929836	-0.30929888239981085	-0.35563996433909134	-0.46865318589924876	-0.3466057487965083	-0.3728029027955136	-0.5910114017051492	-0.3098637226019538	-0.6921274952365232	-0.2909527855968974	-0.27736362795447345	-0.43005167372674125	0.00753998341959	0.0296152123457	0.162582040005	0.412754243182	0.00201342137527	0.0181189115857	0.088148079887	0.0072436377838	0.00275115621019	0.00043495277549	0.00567496309713	0.0906800339379	1.24343836643e-12	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.34143792876	1	1	1.04200135106e-09	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr12:121714905..121715019,-__2146.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr12:121714905..121715019,-__2146.1.0.0	rs11615578	0.6393788532443538	0.6869300692248941	0.5310576147454028	0.45171882439966926	0.6546703852218331	0.527029979593627	0.46680745381041344	0.48334317008367544	0.8004774872457354	1.0027137731598859	0.6544350591823642	0.8509319278559718	0.6457912164806521	0.1872244424592825	0.32129769678374476	0.24531982931244461	-0.039807684204488575	0.4324754864656927	0.1493732381601243	-0.06424083167878933	0.017619359954773192	0.29811154863257283	0.505700299204068	0.3872168916148166	0.7856428202416794	0.26882775807882675	-0.45215441078507135	-0.3656323724411493	-0.2857377854329582	-0.4915265086041578	-0.22219489875614035	-0.3776567414335027	-0.5310482854892028	-0.46572381012890224	-0.5023659386131626	-0.49701347395581785	-0.2672181675675476	-0.06528910761429241	-0.3769634584018255	0.00240905380364	0.0531733827136	0.0959193233604	0.116187990183	0.0232568344756	0.0678362651725	0.000222088887318	0.088148079887	0.000170183141363	0.00146142948273	0.0350255264852	0.375513989452	2.2763344308e-12	1	1	1	1	1	1	0.164123687728	1	0.131551568273	1	1	1	1.90756825301e-09	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr12:121714905..121715019,-__2146.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr12:121714905..121715019,-__2146.1.0.0	rs1612131,rs11615578	0.6393788532443538	0.6869300692248941	0.5310576147454028	0.45171882439966926	0.6546703852218331	0.527029979593627	0.46680745381041344	0.48334317008367544	0.8004774872457354	1.0027137731598859	0.6544350591823642	0.8509319278559718	0.6457912164806521	-0.12033146966617415	-0.019528216530875886	0.1802460320916473	-0.16656475707117338	0.0937988647840176	0.05683912746326263	-0.3145849117245905	-0.4049108750545666	0.16994036427983544	0.06511573650539282	0.1477058054526844	0.37823638568517476	0.005496840517886205	-0.759710322910528	-0.70645828575577	-0.3508115826537555	-0.6182835814708426	-0.5608715204378155	-0.4701908521303643	-0.7813923655350039	-0.888254045138242	-0.6305371229659	-0.937598036654493	-0.5067292537296798	-0.47269554217079707	-0.640294375962766	0.00201342137527	0.000681115576796	0.0181189115857	0.0741297894045	0.00406065558642	0.00389134425826	5.62183900058e-05	0.00192430688789	2.79850783474e-05	2.48534577241e-05	0.00784715402968	0.00220311126631	2.44451457541e-24	0.390603746802	0.137585346513	1	1	0.832434395216	0.78216019591	0.0112436780012	0.375239843139	0.00576492613957	0.00516951920662	1	0.45384092086	5.54904808619e-22	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr12:124907699..124907813,-__2147.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr12:124907699..124907813,-__2147.1.0.0	rs150305452	-1.2001381576492027	-1.0451442271346465	-1.0787930288655732	-0.9887285486267221	-0.73440661745624	-0.9601943084128867	-0.8648556178220919	-0.7987621877544298	-0.7186587505329067	-0.7870068046735681	-1.004255980931861	-0.6467222905400158	-0.9023055433666786	-1.1291433703922622	-0.6909901034604067	-0.7861905390210695	-0.6613513779966569	-0.6212476549362593	-0.856960487121559	-0.7567990025541871	-0.8414435084496467	-0.6052308401103685	-0.6703908376663072	-0.7982492211924253	-0.593330083700522	-0.7509439188834724	0.07099478725694053	0.3541541236742398	0.29260248984450365	0.3273771706300652	0.1131589625199807	0.10323382129132763	0.10805661526790478	-0.04268132069521691	0.11342791042253819	0.11661596700726085	0.20600675973943572	0.05339220683949386	0.15136162448320617	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.147021540231	0.21176555971	0.30750859871	NA__no_active_tile	0.412754243182	0.30750859871	0.179364149792	0.60051573606	0.078795589152	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr12:24673490..24673604,-__2148.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr12:24673490..24673604,-__2148.1.0.0	rs12322912	-1.2991426703581113	-1.2924687070256713	-2.038761965218096	-1.6497137775620634	-1.4889894713725471	-1.724603449659426	-1.8477227604032016	-1.3225273437305625	-1.6349540411147707	-1.1323492938234334	-1.0238079026036124	-1.2757445800890517	-1.477565496913379	-0.5146539001632082	-1.371715336529042	-1.1604907303796799	-1.3164684609889221	-1.092691150544307	-0.995106729501024	-1.4247858281071308	-1.2911710317258018	-1.1404870311273896	-0.6209580646063612	-0.7870069868140833	-1.0357881747076565	-1.0626102854328836	0.784488770194903	-0.07924662950337069	0.8782712348384163	0.33324531657314127	0.39629832082824	0.7294967201584021	0.42293693229607077	0.031356312004760634	0.49446700998738113	0.5113912292170723	0.2368009157895291	0.23995640538139518	0.41495521148049513	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr13:70523521..70523635,-__2152.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr13:70523521..70523635,-__2152.1.0.0	rs142219449	-1.162930884876472	-1.0298184059474278	-1.4524646855432846	-1.3994851714956973	-1.893786426263949	-1.6117750428219542	-1.2796095979639486	-1.3053193613682743	-1.2678035932495588	-1.3838647119548322	-1.613495947867365	-1.5373831453348945	-1.4114780812239716	-1.6308987938496888	-0.9588639393493572	-1.2362595059554151	-1.148201896417368	-1.1949934422751036	-1.2611736771711646	-1.4493876985629628	-1.0617556099770624	-1.5172213077952483	-1.3173867907797268	-1.3086521684642836	-1.3800806268824608	-1.2887396214566533	-0.46796790897321694	0.07095446659807059	0.21620517958786944	0.25128327507832937	0.6987929839888454	0.3506013656507896	-0.16977810059901421	0.2435637513912119	-0.2494177145456895	0.06647792117510543	0.3048437794030814	0.1573025184524337	0.12273845976731801	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr13:70523521..70523635,-__2152.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr13:70523521..70523635,-__2152.1.0.0	rs150616481	-1.162930884876472	-1.0298184059474278	-1.4524646855432846	-1.3994851714956973	-1.893786426263949	-1.6117750428219542	-1.2796095979639486	-1.3053193613682743	-1.2678035932495588	-1.3838647119548322	-1.613495947867365	-1.5373831453348945	-1.4114780812239716	-1.7679859829409608	-1.7488225459717601	-1.4702717983569529	-1.8309879782440088	-1.5991551804254718	-1.821474366590638	-2.0205848165398415	-1.5459779298333989	-1.3423735957506202	-1.5282025920104951	-1.8010343885822275	-1.5133796238987285	-1.665854233262092	-0.6050550980644889	-0.7190041400243323	-0.017807112813668313	-0.43150280674831154	0.2946312458384772	-0.20969932376868394	-0.7409752185758929	-0.24065856846512457	-0.07457000250106138	-0.14433788005566295	-0.1875384407148626	0.02400352143616602	-0.25437615203812053	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr13:70523521..70523635,-__2152.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr13:70523521..70523635,-__2152.1.0.0	rs140672984	-1.162930884876472	-1.0298184059474278	-1.4524646855432846	-1.3994851714956973	-1.893786426263949	-1.6117750428219542	-1.2796095979639486	-1.3053193613682743	-1.2678035932495588	-1.3838647119548322	-1.613495947867365	-1.5373831453348945	-1.4114780812239716	-1.1138477675613747	-1.327560178024953	-1.210619297285538	-1.1748779239552705	-1.3253146824177948	-1.6832076536486427	-1.587095911680059	-1.3225150759629685	-1.0494539545705404	-1.6957383855360941	-1.3402909543399844	-1.6678994836256473	-1.374868439050739	0.04908311731509718	-0.2977417720775253	0.24184538825774649	0.22460724754042682	0.5684717438461542	-0.0714326108266885	-0.30748631371611035	-0.017195714594694156	0.21834963867901847	-0.31187367358126195	0.2732049935273806	-0.13051633829075282	0.03660964217323256	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr13:70523521..70523635,-__2152.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr13:70523521..70523635,-__2152.1.0.0	rs74090639	-1.162930884876472	-1.0298184059474278	-1.4524646855432846	-1.3994851714956973	-1.893786426263949	-1.6117750428219542	-1.2796095979639486	-1.3053193613682743	-1.2678035932495588	-1.3838647119548322	-1.613495947867365	-1.5373831453348945	-1.4114780812239716	-1.957850889119129	-1.4851767350755471	-2.1270301293734666	-1.3869557178840384	-1.62848610934659	-1.9304029228572448	-2.0978105118945924	-1.8763618226463885	-1.6589688592824388	-1.9451084169555457	-1.7413877924726813	-1.566582554256133	-1.7835102050969829	-0.7949200042426572	-0.45535832912811935	-0.674565443830182	0.012529453611658914	0.2653003169173589	-0.31862788003529063	-0.8182009139306439	-0.5710424612781142	-0.39116526603287993	-0.5612437050007135	-0.12789184460531633	-0.0291994089212384	-0.37203212387301154	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr13:70523521..70523635,-__2152.1.4.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr13:70523521..70523635,-__2152.1.0.0	rs142219449,rs150616481,rs140672984,rs74090639	-1.162930884876472	-1.0298184059474278	-1.4524646855432846	-1.3994851714956973	-1.893786426263949	-1.6117750428219542	-1.2796095979639486	-1.3053193613682743	-1.2678035932495588	-1.3838647119548322	-1.613495947867365	-1.5373831453348945	-1.4114780812239716	-1.6249013011886355	-2.001600090482297	-1.4549623152548996	-1.8868436472080123	-1.9106546018679769	-2.1054367934913363	-1.5514386860440248	-1.5383289266298048	-1.4645550156240157	-1.7953085266093238	-1.621710832567305	-1.7117024464358583	-1.722286931950291	-0.4619704163121636	-0.9717816845348692	-0.002497629711615046	-0.48735847571231505	-0.01686817560402787	-0.4936617506693821	-0.2718290880800762	-0.2330095652615305	-0.19675142237445686	-0.41144381465449165	-0.00821488469994014	-0.17431930110096383	-0.31080885072631936	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr16:11734182..11734296,-__2163.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr16:11734182..11734296,-__2163.1.0.0	rs1344534	-1.4189203105950985	-1.2943889736130771	-0.8920052002769685	-1.2350119242259958	-0.9763710840238272	-1.0359137454206773	-1.0818629920447718	-1.0820391486184946	-1.0494548688313632	-1.1402093535223807	-1.1618457870853884	-1.0951137410375444	-1.1219280941079657	-0.3793582671614576	-0.1799109386772558	-0.18179701985511576	-0.65687767954241	-0.37989167280429303	-0.25729096306191546	-0.3885015745366878	-0.771335007671148	-0.23429529382069275	-0.4576659255686718	-0.46830405274072784	-0.3406740751744019	-0.3913252058845648	1.0395620434336408	1.1144780349358214	0.7102081804218527	0.5781342446835858	0.5964794112195342	0.7786227823587618	0.693361417508084	0.31070414094734655	0.8151595750106704	0.6825434279537089	0.6935417343446606	0.7544396658631425	0.7306028882234008	0.00342117348194	0.00406065558642	0.00668210963275	0.00753998341959	0.00423662678721	0.000648445766563	0.00591301274865	NA__no_active_tile	0.00240905380364	0.00139510136839	0.00591301274865	0.00127069654712	8.17307573428e-20	1	1	1	1	1	0.495412565654	1	NA__no_active_tile	1	1	1	0.989872610204	6.84903746532e-17	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr17:25416252..25416366,-__2170.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr17:25416252..25416366,-__2170.1.0.0	rs11867203	-0.9247130989200636	-1.0176579583004477	-1.202509727804468	-1.2647524038051488	-1.1977073776209852	-1.2218220672445925	-1.2621971760222652	-0.9913965758019178	-1.2337067671216864	-0.9739957334244288	-1.0853206894625618	-1.4384696506958996	-1.1511874355187055	-1.3258703173937523	-0.9858126173254735	-0.9958636922680171	-0.9363374127458504	-1.4834968728247713	-1.0749226493741362	-1.4173713235848382	-1.1329296734879934	-1.387253470648421	-1.3280800419139476	-1.2214859981807522	-1.4326566149236553	-1.2268400570559672	-0.4011572184736887	0.03184534097497416	0.206646035536451	0.3284149910592984	-0.28578949520378605	0.14689941787045635	-0.15517414756257297	-0.1415330976860757	-0.1535467035267346	-0.3540843084895188	-0.13616530871819044	0.005813035772244346	-0.07565262153726192	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr18:11860123..11860237,-__2176.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr18:11860123..11860237,-__2176.1.0.0	rs7228231	3.563444180223417	3.929558158683103	3.1872186154359987	3.0875818716946655	3.417315286035623	3.5553808633130775	2.7968122214800273	3.1427403091450614	3.5019908090020038	3.574022754498934	3.5310008764297	3.649933273395586	3.411416601611433	3.3348777941359167	3.841183195399081	3.0790265165932795	2.875437397806037	3.2223414280776046	3.336260621774225	2.620279088616967	2.904158800334719	3.234670071424354	3.2696923580088226	3.285329937112797	3.3745379574747805	3.198149597229882	-0.22856638608750046	-0.08837496328402228	-0.10819209884271919	-0.21214447388862867	-0.19497385795801847	-0.21912024153885223	-0.17653313286306016	-0.23858150881034224	-0.26732073757764985	-0.3043303964901112	-0.24567093931690298	-0.2753953159208056	-0.2132670043815511	0.609889042629	0.657696241675	0.390154148302	0.162586850726	0.216719559135	0.259370210024	0.179364149792	0.119339994516	0.253741740693	0.382791178922	0.276771967065	0.444064484515	0.0471385104634	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr18:60903818..60903932,-__2178.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr18:60903818..60903932,-__2178.1.0.0	rs4987773	-1.9555852751013476	-1.6004918420695575	-1.5206628447091197	-1.1534415668381903	-1.5487577262948515	-1.4095137954492913	-1.5225217682986996	-1.3792064753807605	-1.692513142389912	-1.505747672088224	-1.7694818425121048	-1.3803311372619609	-1.5365212573661682	-1.6685812079183808	-1.3158168225393552	-1.3861155266552667	-1.5175639353482961	-1.5048130679325518	-1.6115005132300295	-1.3809486890998715	-1.118088508730457	-1.3172687553458595	-1.400895718961065	-1.2961640752003025	-1.5082337200016873	-1.4188325450802601	0.2870040671829668	0.28467501953020236	0.134547318053853	-0.3641223685101058	0.04394465836229977	-0.20198671778073818	0.1415730791988281	0.2611179666503034	0.3752443870440525	0.104851953127159	0.4733177673118023	-0.12790258273972643	0.11768871228590806	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr2:222826970..222827084,-__2183.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr2:222826970..222827084,-__2183.1.0.0	rs142598361	-1.8816875785816174	-1.2588234581337117	-1.5413247829526868	-1.7125792386557979	-1.9715502293418283	-1.0981601100488017	-1.0462174075033868	-1.172748957939002	-1.3626750037883182	-1.7016895451774547	-1.665025406075689	-1.6167330284368937	-1.5024345622195991	-1.6614407832448772	-1.548358169001796	-2.072907676991324	-1.974290467029026	-2.1272118065464065	-2.141561897727529	-2.270195214914615	-2.043994315661944	-1.6143659001160597	-2.32785618812066	-1.7711121990557666	-1.9884070559507296	-1.9618084728633949	0.2202467953367402	-0.28953471086808436	-0.5315828940386373	-0.26171122837322813	-0.15566157720457818	-1.0434017876787274	-1.2239778074112284	-0.8712453577229418	-0.25169089632774155	-0.6261666429432053	-0.1060867929800775	-0.37167402751383594	-0.4593739106437955	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr20:25214097..25214211,-__2184.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr20:25214097..25214211,-__2184.1.0.0	rs76774926	-0.8304683186508508	-1.235435628627015	-1.1736369653157919	-1.297492645974626	-0.7384909542129138	-0.6465502297564587	-0.3680843972261417	-0.5747109827422028	-0.8234175765692354	-1.4022009885300144	-1.3925025790417325	-0.9900480808669835	-0.9560866122928305	-0.7042912259809059	-0.575027799629028	-1.2231233826767498	-0.9198983458787772	-1.2964020877041809	-1.0173330902547564	-0.9616416732997486	-1.0360082042052294	-1.200030721996735	-0.8263857168757465	-1.1985153530074772	-0.6834131747767604	-0.9701725646905079	0.12617709266994492	0.660407828997987	-0.049486417360957935	0.37759430009584893	-0.5579111334912671	-0.3707828604982977	-0.5935572760736069	-0.46129722146302665	-0.3766131454274996	0.5758152716542679	0.19398722603425522	0.30663490609022304	-0.014085952397677412	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr20:25214097..25214211,-__2184.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr20:25214097..25214211,-__2184.1.0.0	rs115377036	-0.8304683186508508	-1.235435628627015	-1.1736369653157919	-1.297492645974626	-0.7384909542129138	-0.6465502297564587	-0.3680843972261417	-0.5747109827422028	-0.8234175765692354	-1.4022009885300144	-1.3925025790417325	-0.9900480808669835	-0.9560866122928305	-0.03320382862670854	-1.1460991828806555	-0.8592554334503953	-0.8821227245987355	-1.1564525501940957	-0.7337726743292605	-1.3803022179138429	-0.7964143637591752	-1.1914852094144115	-1.0285323740040915	-1.1985153530074772	-0.5667443080396675	-0.9144083516848763	0.7972644900241422	0.08933644574635946	0.3143815318653965	0.41536992137589057	-0.4179615959811819	-0.08722244457280182	-1.012217820687701	-0.2217033810169724	-0.3680676328451761	0.3736686145259229	0.19398722603425522	0.423303772827316	0.041678260607954154	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr20:25214097..25214211,-__2184.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr20:25214097..25214211,-__2184.1.0.0	rs76774926,rs115377036	-0.8304683186508508	-1.235435628627015	-1.1736369653157919	-1.297492645974626	-0.7384909542129138	-0.6465502297564587	-0.3680843972261417	-0.5747109827422028	-0.8234175765692354	-1.4022009885300144	-1.3925025790417325	-0.9900480808669835	-0.9560866122928305	-1.1137400901687593	-0.24069023530433376	-0.9034879637936669	-0.3479212226666453	-1.120083331557596	-0.3298117280081991	-1.1790407538116576	-0.9215332652074286	-0.9107643170633959	-1.2802612468929828	-0.873106929261253	-1.047811251500379	-0.8556876946030249	-0.2832717715179085	0.9947453933226812	0.27014900152212495	0.9495714233079808	-0.3815923773446822	0.3167385017482596	-0.8109563565855159	-0.34682228246522584	-0.08734674049416047	0.12193974163703158	0.5193956497804795	-0.05776317063339553	0.1003989176898058	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr20:45989575..45989689,-__2185.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr20:45989575..45989689,-__2185.1.0.0	rs6063101	-0.357273264888004	-0.25253337224919803	-0.27364853371589254	-0.3588505479634216	-0.5076664173481766	-0.27779920468407626	-0.4146551515104896	-0.13413245567755977	-0.1591105065482928	-0.23639559568774482	-0.3253296613294693	-0.1259957704877861	-0.2852825401741759	-0.4722496828116931	-0.17003182281597046	-0.5413730567881896	-0.4625803880310162	-0.32363547403747744	-0.46788828128901927	-0.5461321305964563	-0.22120751826076007	-0.2809849389472294	-0.30740777185447477	-0.21038976909178303	-0.20933179331466006	-0.35110105231989414	-0.11497641792368912	0.08250154943322757	-0.26772452307229705	-0.10372984006759461	0.1840309433106992	-0.190089076604943	-0.13147697908596667	-0.0870750625832003	-0.12187443239893661	-0.07101217616672995	0.11493989223768625	-0.08333602282687397	-0.0658185121457182	0.147021540231	0.8931878581	0.545696106059	0.527990680582	0.79863356553	0.519249062249	0.107123399254	0.609889042629	0.563691144959	0.354199901149	0.914457985151	0.354199901149	0.622667391491	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr22:39350132..39350246,-__2190.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr22:39350132..39350246,-__2190.1.0.0	rs17370615	-0.10287866433023468	0.1664797812276163	0.14597146980924097	-0.08581514225043586	-0.08687528271321512	-0.20524773266763646	0.2039408635848362	0.11817614867446688	0.028711858165355507	0.13007519947370366	0.037506056895217285	0.20044792182839197	0.04587437314144222	-0.7835283764128516	-0.4050939052399761	-0.5527190745153711	-0.6465199932990621	-0.22855899516765096	-0.5897757523445314	-0.30153141441401105	-0.11787457282025277	-0.6840369643971799	-0.4655809354963684	-0.3645241035106902	-0.37422224649187785	-0.45949719450915194	-0.6806497120826169	-0.5715736864675924	-0.6986905443246121	-0.5607048510486262	-0.14168371245443584	-0.3845280196768949	-0.5054722779988472	-0.23605072149471965	-0.7127488225625354	-0.5956561349700721	-0.4020301604059075	-0.5746701683202698	-0.5053715676505941	0.0168468410067	0.00086866520518	0.0531733827136	0.0374147936077	0.0619890035232	0.0386605553759	0.00641629102443	0.101398170673	0.0145358169752	0.0209174885683	0.00275115621019	0.00441948685714	1.31302532338e-13	1	0.646286912654	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1.10031522099e-10	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr3:124553929..124554043,-__2192.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr3:124553929..124554043,-__2192.1.0.0	rs112075131	-1.5420023504772384	-1.0842184398374684	-1.3274866922619126	-1.157894954679041	-1.4535110914767382	-1.1519145839349827	-1.2548721379669576	-1.1496474686303104	-1.1411531021968815	-1.1898588194187605	-1.5331928084892672	-1.163003155734852	-1.2623963004253678	-1.5525039026166088	-1.0531384488791296	-1.391185913050755	-1.0469374221461443	-1.2327180911566096	-0.8947706523096177	-1.047501594921938	-0.8362548703305851	-1.1117759641005223	-1.0116803599317619	-1.3005929268131058	-0.8638175885783883	-1.1119064779029306	-0.010501552139370318	0.0310799909583388	-0.06369922078884227	0.11095753253289664	0.2207930003201286	0.257143931625365	0.20737054304501967	0.3133925982997253	0.029377138096359223	0.17817845948699862	0.2325998816761614	0.2991855671564636	0.150489822522437	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr4:122611996..122612110,-__2196.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr4:122611996..122612110,-__2196.1.0.0	rs114678898	0.6927291147493781	0.7485867238045321	0.6697130798768542	0.16796399431356798	0.5190651876229007	0.5504344588211374	0.3795158096407828	0.02394479432894379	0.6557231641735733	0.4112878879245396	0.47074839294383364	0.4738003632429809	0.4802927476202521	-0.7365769973561282	-0.5427360592731748	-0.9373183866411182	-0.7007914717201735	-0.7587628493505032	-0.8681913369514651	-0.8009237674868991	-1.1243386814771628	-1.2293201786963892	-1.054123223109814	-0.8264395302436267	-0.6845227754724494	-0.8553371048149088	-1.4293061121055064	-1.2913227830777068	-1.6070314665179724	-0.8687554660337415	-1.2778280369734039	-1.4186257957726025	-1.1804395771276819	-1.1482834758061065	-1.8850433428699627	-1.4654111110343537	-1.2971879231874603	-1.1583231387154305	-1.3356298524351606	0.00287470049861	3.54084840538e-05	6.8564559793e-06	0.00220311126631	1.12997083356e-05	0.000222088887318	0.00201342137527	0.00115660425805	1.8732392437e-06	5.66746118355e-06	7.77665488063e-06	2.48534577241e-05	7.02762628069e-39	1	0.026343912136	0.00510805970458	1	0.00872337483512	0.169675909911	1	0.840851295603	0.00144801393538	0.00444895702909	0.0059802476032	0.0193608435671	5.88915082322e-36	not sig	sig	sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769805..185769919,-__2197.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769805..185769919,-__2197.1.0.0	rs4862429	-0.7961172972409173	-1.1443377210588872	-1.0987065532280766	-0.8864928411312338	-1.1723188960252895	-1.1556106746328711	-1.0727095514924994	-1.0142287566837425	-0.9282939596849076	-0.7450404552596319	-0.8973538978363201	-1.0307609931812056	-0.9951642997879652	-0.8647764304643151	-0.8812626534075088	-0.7757555021008717	-0.7460592196592394	-0.8421846088781797	-0.7828466301547747	-0.9850432096915284	-0.8489090826566688	-0.8862609458038726	-0.7945626143869542	-0.8863906497791005	-0.8519151681454131	-0.8454972262607022	-0.06865913322339778	0.26307506765137845	0.3229510511272049	0.14043362147199445	0.3301342871471098	0.3727640444780964	0.08766634180097099	0.1653196740270737	0.042033013881034975	-0.049522159127322274	0.010963248057219599	0.1788458250357925	0.14966707352726297	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.757455001208	NA__no_active_tile	0.0374147936077	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.914457985151	0.989287003123	0.259370210024	0.807248741263	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769805..185769919,-__2197.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769805..185769919,-__2197.1.0.0	rs28711909	-0.7961172972409173	-1.1443377210588872	-1.0987065532280766	-0.8864928411312338	-1.1723188960252895	-1.1556106746328711	-1.0727095514924994	-1.0142287566837425	-0.9282939596849076	-0.7450404552596319	-0.8973538978363201	-1.0307609931812056	-0.9951642997879652	-1.707521826036687	-1.3266745148333088	-1.3537198255006881	-1.7058775934956043	-1.6331221915068848	-1.4059958559895789	-1.6876389003700045	-1.386574260222028	-1.5945893842218486	-1.8519335189072637	-1.5261105332767924	-1.343281311681414	-1.5435866430035086	-0.9114045287957696	-0.18233679377442158	-0.2550132722726115	-0.8193847523643705	-0.46080329548159527	-0.25038518135670773	-0.6149293488775052	-0.37234550353828544	-0.666295424536941	-1.1068930636476317	-0.6287566354404722	-0.31252031850020834	-0.5484223432155434	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769805..185769919,-__2197.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769805..185769919,-__2197.1.0.0	rs4862430	-0.7961172972409173	-1.1443377210588872	-1.0987065532280766	-0.8864928411312338	-1.1723188960252895	-1.1556106746328711	-1.0727095514924994	-1.0142287566837425	-0.9282939596849076	-0.7450404552596319	-0.8973538978363201	-1.0307609931812056	-0.9951642997879652	-1.1800822482627071	-1.1702912261580274	-0.9459241828286294	-0.8204188105459487	-1.1144533965282108	-1.288146530800781	-1.2210631135858128	-1.145602533073981	-1.247148476251131	-0.8014533016273553	-1.033161168032919	-1.2149689348863209	-1.098559493548485	-0.38396495102178985	-0.025953505099140184	0.1527823703994472	0.06607403058528516	0.05786549949707864	-0.13253585616790975	-0.1483535620933134	-0.1313737763902385	-0.3188545165662233	-0.05641284636772337	-0.13580727019659877	-0.18420794170511523	-0.1033951937605201	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769805..185769919,-__2197.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr4:185769805..185769919,-__2197.1.0.0	rs4862429,rs28711909,rs4862430	-0.7961172972409173	-1.1443377210588872	-1.0987065532280766	-0.8864928411312338	-1.1723188960252895	-1.1556106746328711	-1.0727095514924994	-1.0142287566837425	-0.9282939596849076	-0.7450404552596319	-0.8973538978363201	-1.0307609931812056	-0.9951642997879652	-1.5142272596246906	-1.5546085338501476	-1.392807194555004	-1.397907928509024	-1.456693820973659	-1.3589631524746761	-1.4741653972408177	-1.4063514154724723	-1.4750530671259872	-1.0622442559606673	-1.50014522291981	-1.1399833401125377	-1.3944292157349578	-0.7181099623837733	-0.41027081279126043	-0.29410064132692737	-0.5114150873777901	-0.2843749249483696	-0.203352477841805	-0.4014558457483184	-0.39212265878872987	-0.5467591074410796	-0.3172038007010354	-0.6027913250834899	-0.10922234693133204	-0.39926491594699254	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr4:2803053..2803167,-__2198.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr4:2803053..2803167,-__2198.1.0.0	rs13146103	-1.2830178344296521	-1.4824717597380408	-1.0069582611381118	-1.3278417987224045	-1.2958598059865154	-1.020506600394384	-1.520491000609481	-1.3556458523552093	-1.3220354445439326	-1.6473682814374204	-1.0314454112452875	-1.4798046780500385	-1.3144538940542065	-1.298436037495291	-1.3402942084673848	-1.3077655435799331	-1.516906890738868	-1.5082773401216618	-1.5313033766969402	-1.1261894076015135	-1.3515305656269079	-1.45909178959898	-1.45239473815182	-1.5652283584518116	-1.0984572153092442	-1.3796562893200297	-0.015418203065638902	0.142177551270656	-0.3008072824418213	-0.1890650920164636	-0.2124175341351464	-0.5107967763025563	0.3943015930079674	0.004115286728301415	-0.13705634505504727	0.19497354328560035	-0.5337829472065241	0.38134746274079423	-0.06520239526582321	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr5:131832624..131832738,-__2200.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr5:131832624..131832738,-__2200.1.0.0	rs2706386	0.3923405290543465	0.5924871092408874	0.5902934989008566	0.4649238070927063	0.5386164818888235	0.602150637356768	0.8343307675191995	0.8377886514247797	0.530023021423488	0.6095878480025718	0.6306658621697803	0.6532310853546124	0.6063699416190683	0.3637340734656725	0.4736589185995684	0.414402595437572	0.2500489554164263	0.5046104765630962	0.6215878584702228	0.6869627829684792	0.7750670254776976	0.6388169158321845	0.5487237646856179	0.74228266887543	0.6467589448323054	0.5555545817186894	-0.02860645558867403	-0.11882819064131905	-0.17589090346328456	-0.21487485167628	-0.034006005325727284	0.019437221113454806	-0.1473679845507203	-0.06272162594708208	0.10879389440869647	-0.06086408331695392	0.11161680670564977	-0.006472140522306935	-0.05081535990037892	0.527990680582	0.90381429355	0.170821264488	0.66743649171	0.85089220831	0.840380101088	0.29495293544	0.978575937473	0.8931878581	0.572794651112	0.301187193336	0.581967350665	0.943540900319	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr5:172199513..172199627,-__2203.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr5:172199513..172199627,-__2203.1.0.0	rs322380	-0.543907637894579	-0.3713549074710352	-0.5254747632644182	-0.08855010835903336	-0.3459816041459257	-0.2902035217013442	-0.3031761237413954	-0.17314986128981835	-0.3201201147495195	-0.11911513744854857	-0.2052026488063396	-0.3329968079336141	-0.30160276973379757	-0.4123492159379013	-0.44223478562958435	-0.26237277223343447	-0.31292540278838	-0.15218712637517326	-0.6495195915551487	-0.6216639143127414	-0.4126883674524715	-0.3534882737284564	-0.5967056127749842	-0.4394149483212265	-0.5598609103976137	-0.4346175767922596	0.13155842195667766	-0.07087987815854913	0.26310199103098375	-0.22437529442934662	0.19379447777075245	-0.3593160698538045	-0.31848779057134596	-0.23953850616265315	-0.03336815897893691	-0.47759047532643567	-0.23421229951488692	-0.22686410246399957	-0.13301480705846205	0.468411351413	0.706946403854	0.90381429355	0.501992688725	0.30750859871	0.30750859871	0.242741268695	0.333660951583	0.657692573088	0.00327633608155	0.107123399254	0.405136064622	0.115232961488	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr5:172199513..172199627,-__2203.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr5:172199513..172199627,-__2203.1.0.0	rs322380,rs3763067	-0.543907637894579	-0.3713549074710352	-0.5254747632644182	-0.08855010835903336	-0.3459816041459257	-0.2902035217013442	-0.3031761237413954	-0.17314986128981835	-0.3201201147495195	-0.11911513744854857	-0.2052026488063396	-0.3329968079336141	-0.30160276973379757	0.02792575370127768	0.026499171896310385	-0.11935981748802185	-0.5934998049752127	-0.3033538151564377	-0.3502460387785568	-0.3562525525625715	-0.4804438921038356	-0.2369656420790062	-0.3643433781611127	-0.140142386100267	-0.30781793566777077	-0.26650002812293366	0.5718333915958567	0.3978540793673456	0.4061149457763964	-0.5049496966161794	0.04262778898948799	-0.06004251707721259	-0.05307642882117608	-0.30729403081401724	0.08315447267051332	-0.2452282407125641	0.0650602627060726	0.02517887226584331	0.03510274161086387	0.00544559218276	0.113101776132	0.0678362651725	0.48504462162	0.777966336216	0.716953652062	0.967868733231	0.206893929435	0.648010011537	0.677233097055	0.60051573606	0.989287003123	0.555251530564	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr5:25910701..25910815,-__2204.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr5:25910701..25910815,-__2204.1.0.0	rs34237895	-1.4197990214689153	-1.134531684374985	-1.210961439595873	-1.2853443062321455	-1.41083131144625	-1.7204472449750785	-1.1645558993151892	-1.9042027047143304	-1.7653851145293509	-1.2797066945090603	-1.0659564778660984	-1.7742134747903238	-1.4279946144848001	-1.3325759901313243	-1.3716726007071862	-1.6047275464193462	-1.4272316124796518	-1.3451369175413803	-1.4589071126704818	-1.4157425293924986	-0.96581392379399	-1.1949934422751036	-1.8013220696757175	-1.957229657768667	-1.9073143081272024	-1.4818889759152125	0.08722303133759102	-0.23714091633220113	-0.39376610682347324	-0.14188730624750634	0.06569439390486975	0.2615401323045967	-0.25118663007730935	0.9383887809203404	0.5703916722542473	-0.5216153751666572	-0.8912731799025686	-0.1331008333368786	-0.05389436143041245	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521819..47521933,-__2209.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521819..47521933,-__2209.1.0.0	rs2941540	-1.1753842851447351	-1.1703613104542225	-0.8691196954732292	-1.289184191848579	-1.2055271510548669	-1.0808747155014227	-1.1984771387063389	-1.492833438607776	-1.1293893740656458	-1.6192414349055315	-1.3181466765520342	-0.8413484611517938	-1.199157322788848	-0.7069925834313543	-1.1268833427250116	-1.040578829533054	-0.7863574092369908	-0.7220078206738406	-0.8787759333750649	-1.0554991070156403	-0.9067930487851545	-0.7306789358824719	-1.12563118922211	-1.1880015534770618	-1.1716231510994393	-0.9533185753714327	0.46839170171338085	0.043477967729210976	-0.17145913405982482	0.5028267826115881	0.48351933038102624	0.2020987821263578	0.14297803169069856	0.5860403898226214	0.39871043818317387	0.4936102456834215	0.1301451230749724	-0.3302746899476454	0.2458387474174151	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521819..47521933,-__2209.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521819..47521933,-__2209.1.0.0	rs28428869	-1.1753842851447351	-1.1703613104542225	-0.8691196954732292	-1.289184191848579	-1.2055271510548669	-1.0808747155014227	-1.1984771387063389	-1.492833438607776	-1.1293893740656458	-1.6192414349055315	-1.3181466765520342	-0.8413484611517938	-1.199157322788848	-1.3292076470277665	-1.1433184450798926	-1.1019200076917028	-1.14864018068204	-1.1223623647238032	-1.3033688632095828	-1.1901107282600976	-1.3301576723791746	-1.091782749513018	-0.8992423445520447	-1.1513348312041118	-1.2944430834433152	-1.1754907431472124	-0.15382336188303136	0.027042865374329983	-0.23280031221847364	0.1405440111665388	0.08316478633106361	-0.22249414770816012	0.008366410446241312	0.16267576622860136	0.037606624552627865	0.7199990903534869	0.16681184534792237	-0.4530946222915213	0.023666579641635477	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521819..47521933,-__2209.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521819..47521933,-__2209.1.0.0	rs116659474	-1.1753842851447351	-1.1703613104542225	-0.8691196954732292	-1.289184191848579	-1.2055271510548669	-1.0808747155014227	-1.1984771387063389	-1.492833438607776	-1.1293893740656458	-1.6192414349055315	-1.3181466765520342	-0.8413484611517938	-1.199157322788848	-1.0521280903592551	-1.1375279435730563	-0.785254919793303	-1.2203385596085978	-1.5738413908069069	-1.392081868933635	-0.9050944605229124	-1.515534930377181	-1.1996487451437678	-1.2762758210123448	-1.792644734404338	-1.2443179500498065	-1.2578907845487586	0.12325619478548	0.032833366881166226	0.08386477567992623	0.06884563223998108	-0.36831423975204003	-0.3112071534322123	0.29338267818342645	-0.022701491769405058	-0.07025937107812208	0.3429656138931867	-0.4744980578523037	-0.40296948889801265	-0.05873346175991076	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521819..47521933,-__2209.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521819..47521933,-__2209.1.0.0	rs2964954	-1.1753842851447351	-1.1703613104542225	-0.8691196954732292	-1.289184191848579	-1.2055271510548669	-1.0808747155014227	-1.1984771387063389	-1.492833438607776	-1.1293893740656458	-1.6192414349055315	-1.3181466765520342	-0.8413484611517938	-1.199157322788848	-0.9967668177407032	-1.1124750857146877	-0.8837380886036673	-1.239449658731944	-1.4931358186318502	-0.7844472617454658	-1.374911793553701	-0.9176320071937774	-1.4653012040269116	-0.7007943720286695	-1.0970751497655222	-0.7593419012195092	-1.0687557632463676	0.17861746740403195	0.057886224739534864	-0.014618393130438112	0.049734533116635005	-0.28760866757698333	0.2964274537559569	-0.1764346548473621	0.5752014314139986	-0.3359118299612658	0.9184470628768621	0.22107152678651198	0.08200655993228467	0.13040155954248056	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521819..47521933,-__2209.1.5.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521819..47521933,-__2209.1.0.0	rs2964955	-1.1753842851447351	-1.1703613104542225	-0.8691196954732292	-1.289184191848579	-1.2055271510548669	-1.0808747155014227	-1.1984771387063389	-1.492833438607776	-1.1293893740656458	-1.6192414349055315	-1.3181466765520342	-0.8413484611517938	-1.199157322788848	-1.2131879009609303	-0.9705785078328744	-0.8513238068382115	-0.6146497147352882	-0.593674960857504	-1.0712527047227498	-0.5146806906326212	-1.1676876431677916	-0.9415596933190856	-1.1907559167391837	-1.1614841292501814	-1.225096483760462	-0.9596610127347404	-0.03780361581619518	0.19978280262134818	0.017795888635017687	0.6745344771132907	0.6118521901973628	0.009622010778672863	0.6837964480737176	0.32514579543998434	0.18782968074656015	0.42848551816634783	0.1566625473018528	-0.38374802260866825	0.23949631005410765	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521819..47521933,-__2209.1.5.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:47521819..47521933,-__2209.1.0.0	rs2941540,rs28428869,rs116659474,rs2964954,rs2964955	-1.1753842851447351	-1.1703613104542225	-0.8691196954732292	-1.289184191848579	-1.2055271510548669	-1.0808747155014227	-1.1984771387063389	-1.492833438607776	-1.1293893740656458	-1.6192414349055315	-1.3181466765520342	-0.8413484611517938	-1.199157322788848	-1.7125659464004785	-1.0480661326742362	-1.0951426766540466	-1.6411890977824042	-1.6733138566924466	-1.5465696089014944	-1.7790962594485469	-1.8129671723168608	-1.5978963830143162	-1.2302238244886927	-1.296184377243399	-1.3257567295026729	-1.479914338759966	-0.5371816612557434	0.12229517777998633	-0.22602298118081743	-0.3520049059338253	-0.46778670563757974	-0.46569489340007175	-0.580619120742208	-0.3201337337090848	-0.4685070089486705	0.3890176104168388	0.021962299308635247	-0.484408268350879	-0.2807570159711183	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr8:59309383..59309497,-__2213.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr8:59309383..59309497,-__2213.1.0.0	rs16923436	-1.2273366068103857	-1.3276916744322431	-1.2775638518104773	-1.4683990068742296	-1.4885259583659392	-1.4443702397260183	-1.6228302377740085	-1.2656972729003295	-1.45909178959898	-1.385191636379409	-1.6630273452713489	-1.4267198247404078	-1.4213704537236478	-1.0886117374272595	-0.7325154710845561	-1.0376066884497883	-1.2770491485474105	-0.9178375143516104	-1.3213265046329044	-1.2123801367291986	-1.3921630647284686	-1.295458205420289	-1.3639554852751683	-1.3053694043017825	-1.064657808610116	-1.167410930796546	0.13872486938312623	0.5951762033476871	0.23995716336068895	0.19134985832681917	0.5706884440143287	0.12304373509311395	0.41045010104480983	-0.1264657918281391	0.1636335841786909	0.021236151104240708	0.3576579409695664	0.3620620161302919	0.25395952292710205	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr9:140024186..140024300,-__2217.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr9:140024186..140024300,-__2217.1.0.0	rs114500218	-0.3663901892298328	0.18866717415297607	-0.4652483539459262	-0.2074545493250116	-0.4266390892104951	-0.0923641569378797	0.4379217861844505	0.4169739693786138	0.5268957473904945	0.2393019082919832	-0.5919167759985472	0.4672435181073326	0.01058258240484651	0.7352865413351632	0.9488282946108584	-0.3519706159358323	0.09973686049843788	-0.023282037420979618	0.8334887530637647	1.006504572445306	0.3393351147807717	0.20234177960077915	0.7672673992207749	0.8261726238584116	0.7539439498648081	0.5114711029935219	1.101676730564996	0.7601611204578823	0.11327773801009389	0.3071914098234495	0.4033570517895155	0.9258529100016444	0.5685827862608555	-0.07763885459784209	-0.32455396778971535	0.5279654909287917	1.4180893998569588	0.28670043175747545	0.5008885205886755	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr9:140024186..140024300,-__2217.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr9:140024186..140024300,-__2217.1.0.0	rs73569567	-0.3663901892298328	0.18866717415297607	-0.4652483539459262	-0.2074545493250116	-0.4266390892104951	-0.0923641569378797	0.4379217861844505	0.4169739693786138	0.5268957473904945	0.2393019082919832	-0.5919167759985472	0.4672435181073326	0.01058258240484651	0.9874466669847629	0.5789345157843869	-0.15314330498554488	0.7399015884595816	-0.0131411797180397	0.12029088999479574	0.01190760316190988	0.33529769817085403	-0.6330500244166697	0.4910642890656398	-0.27808429540430385	0.2305832687290185	0.2015006429855326	1.3538368562145957	0.39026734163141086	0.31210504896038127	0.9473561377845933	0.4134979094924554	0.21265504693267545	-0.4260141830225406	-0.08167627120775978	-1.1599457718071642	0.25176238077365665	0.31383248059424335	-0.23666024937831412	0.19091806058068614	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr9:140024186..140024300,-__2217.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr9:140024186..140024300,-__2217.1.0.0	rs114500218,rs73569567	-0.3663901892298328	0.18866717415297607	-0.4652483539459262	-0.2074545493250116	-0.4266390892104951	-0.0923641569378797	0.4379217861844505	0.4169739693786138	0.5268957473904945	0.2393019082919832	-0.5919167759985472	0.4672435181073326	0.01058258240484651	0.6348934671867434	0.15318365044308788	0.17295695943382894	0.08385276088602665	0.4800138273188149	-0.5817729709524128	0.10042692749835809	-0.15298673799950202	0.31058188422587457	-0.5864259776579732	0.23122602384713686	-0.08083551362567375	0.06375952505035913	1.0012836564165761	-0.03548352370988819	0.6382053133797552	0.29130731021103823	0.90665291652931	-0.48940881401453307	-0.3374948586860924	-0.5699607073781159	-0.21631386316461992	-0.8257278859499564	0.8231427998456841	-0.5480790317330063	0.05317694264551262	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr9:140134851..140134965,-__2218.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr9:140134851..140134965,-__2218.1.0.0	rs28575921	-0.3704704884992886	0.3946475732453515		-1.1434553242744534		-0.871129558884846	0.6635620951344917	0.47291999536231605	0.411531967736152			-1.9769627822038178	-0.3024195652980118	-0.23598518727825854	-0.5883193808911704	-0.607678562014131	0.8754775880754768	-0.367755027397636	-1.0953326703757555	-0.22804661430090065	-1.1122322343022888	0.0055461136426684	-0.17378741714446636	-0.6397827523828444	-0.4475990041912638	-0.38462459571338087	0.13448530122103006	-0.9829669541365219		2.01893291234993		-0.22420311149090955	-0.8916087094353924	-1.5851522296646048	-0.40598585409348364			1.529363778012554	-0.050891858404674806	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr9:36731622..36731736,-__2219.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr9:36731622..36731736,-__2219.1.0.0	rs12338282	1.3205613734976722	1.696426181844462	1.5361362308644684	1.7995923777140397	1.6669379803077984	1.7185866678177852	1.962737282324813	2.3548950494768714	2.1815707999996645	2.0012289274565536	1.8555466586855789	2.2424329311096205	1.8613877050916112	1.6975474589448476	2.1321569988791333	1.911389156158927	1.9117119584227478	2.0895662401739594	2.1411775045835126	2.3201487283297357	2.4171342573835988	2.4015828998249087	2.4656417071849286	2.1399877066220814	2.5364488578239075	2.1803744561943574	0.3769860854471754	0.4357308170346714	0.37525292529445853	0.11211958070870809	0.42262825986616104	0.4225908367657274	0.3574114460049227	0.06223920790672732	0.22001209982524417	0.464412779728375	0.2844410479365025	0.294015926714287	0.3189867511027467	0.129198935732	0.0156538458129	0.0181189115857	0.0763307839553	0.0129907246043	0.0111573361887	0.00230397578633	0.0386605553759	0.0440018610392	0.00955750115232	0.116187990183	0.00993701022923	5.95405817018e-12	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	4.98950074661e-09	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr9:36731622..36731736,-__2219.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr9:36731622..36731736,-__2219.1.0.0	rs12351855	1.3205613734976722	1.696426181844462	1.5361362308644684	1.7995923777140397	1.6669379803077984	1.7185866678177852	1.962737282324813	2.3548950494768714	2.1815707999996645	2.0012289274565536	1.8555466586855789	2.2424329311096205	1.8613877050916112	1.5029418477382634	1.8239067620757194	1.504201919295936	1.6265622646545173	1.8169402321431183	1.8944198802118701	2.1431369926083264	2.4720921409611916	2.3938514057942166	2.321499195062252	1.9715094684549486	2.477274808080171	1.995694743090044	0.18238047424059123	0.12748058023125752	-0.031934311568532436	-0.17303011305952243	0.1500022518353199	0.1758332123940849	0.18039971028351331	0.11719709148432012	0.2122806057945521	0.3202702676056983	0.11596280976936968	0.2348418769705507	0.13430703799843358	0.563691144959	0.397602565759	0.706946403854	0.957167318493	0.221756412245	0.253741740693	0.270885072145	0.158583637061	0.166665831608	0.0932701621097	0.840380101088	0.150801701171	0.177747243094	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr9:36731622..36731736,-__2219.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr9:36731622..36731736,-__2219.1.0.0	rs12338282,rs12351855	1.3205613734976722	1.696426181844462	1.5361362308644684	1.7995923777140397	1.6669379803077984	1.7185866678177852	1.962737282324813	2.3548950494768714	2.1815707999996645	2.0012289274565536	1.8555466586855789	2.2424329311096205	1.8613877050916112	1.7850829617371669	2.2468669977560265	2.1400461588475554	2.1615240961314157	2.1163100480421178	2.305540671020584	2.471025373391609	2.779512679142668	2.587642488003964	2.469506751859101	2.2044396280998635	2.51759554020316	2.3154244495196026	0.46452158823949463	0.5504408159115646	0.6039099279830871	0.36193171841737604	0.44937206773431937	0.5869540032027989	0.5082880910667962	0.4246176296657964	0.4060716880042996	0.4682778244025476	0.3488929694142846	0.2751626090935395	0.454036744427992	0.00480682187369	0.0129907246043	0.00287470049861	0.00263248034207	0.00240905380364	0.00441948685714	0.00342117348194	0.00591301274865	0.00460947122508	0.00139510136839	0.0194743211566	0.00511669748634	9.23128912527e-20	0.932523443495	1	0.572065399223	0.49753878465	0.493856029746	0.888316858285	0.684234696389	1	0.949551072367	0.290181084625	1	1	2.09550263144e-17	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:16508454..16508568,-__2223.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:16508454..16508568,-__2223.1.0.0	rs12057222	1.898930576689053	2.027492844861708	2.003667489173486	1.9300807258563293	1.8057033809272878	2.0718487494677253	1.6661791299233295	1.8904038705994328	2.0918906884073802	2.024853024260952	1.9382701338641373	2.0373509851666576	1.948889299933123	2.278742672971625	2.443920678966528	2.0450593103141976	1.9697981991559328	2.21221148847756	2.194055643474119	2.0512004755088067	2.1828540327637818	2.3973948323174796	2.2112234780024083	2.3192098477862597	2.390709065772149	2.2246983104592375	0.37981209628257195	0.41642783410482	0.041391821140711826	0.03971747329960351	0.40650810755027234	0.12220689400639362	0.3850213455854772	0.29245016216434894	0.3055041439100994	0.1863704537414561	0.38093971392212245	0.35335808060549123	0.275809010526114	0.361212608085	0.452098798395	0.840380101088	0.989287003123	0.0548474154937	0.301187193336	0.0601351299193	0.0619890035232	0.554657938956	0.333666485083	0.452098798395	0.162586850726	0.137070052552	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:228962862..228962976,-__2224.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:228962862..228962976,-__2224.1.0.0	rs6695176	-1.0994137534076756	-1.304554730572719	-0.947372852110315	-1.0499558846791122	-1.0206228922553446	-1.0577311182974047	-1.2516053452833356	-1.1955808256428206	-1.0694154306360713	-1.2936274438505948	-0.9642330907066604	-1.0084656268125571	-1.1052149161878841	-1.0898342312684397	-1.3601651230258502	-0.9876556917265916	-1.1808531596435934	-1.1401126607135446	-0.8493111657109016	-0.9625336550997168	-0.7512429922016464	-1.3751132040431997	-0.7328159599651777	-1.1030825527313377	-1.1052134204621316	-1.0531611513826775	0.009579522139235852	-0.05561039245313126	-0.040282839616276656	-0.13089727496448123	-0.11948976845819992	0.20841995258650314	0.2890716901836188	0.4443378334411743	-0.30569777340712845	0.5608114838854171	-0.1388494620246773	-0.09674779364957442	0.05205376480520666	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.170821264488	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.170821264488	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:25051083..25051197,-__2226.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:25051083..25051197,-__2226.1.0.0	rs1002707	0.8721512018618223	0.9812007661587252	0.9916069167515876	0.7382699826988831	0.8344957633233853	1.0287837705485567	0.9555037327755109	0.9495614554792412	0.8415328611574305	0.9665365343226046	0.8676632932675061	1.0185448681914098	0.9204875955447221	0.2848684000587818	0.3164756256789346	0.3081127066515533	0.3475045504013554	0.3160082979888262	0.33578138396169693	0.26740174660064997	0.5167392959404699	0.5173772835126333	0.4636733769948639	0.45804175314929796	0.6068557662379639	0.39490334893141893	-0.5872828018030405	-0.6647251404797906	-0.6834942101000343	-0.3907654322975277	-0.518487465334559	-0.6930023865868598	-0.688101986174861	-0.43282215953877134	-0.3241555776447972	-0.5028631573277407	-0.40962154011820817	-0.4116891019534459	-0.5255842466133029	0.000392957862114	0.000116396943443	0.00300328973882	0.0187859264625	0.00210630874131	5.31875791367e-06	2.44178879239e-06	0.00210630874131	0.000457487620218	0.000260017581797	0.00389134425826	1.20184897547e-05	1.74459062563e-31	0.278214166377	0.0865993259216	1	1	1	0.00406353104604	0.00180448191757	1	0.353637930428	0.204113801711	1	0.00936240351888	1.46196694428e-28	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:25051083..25051197,-__2226.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:25051083..25051197,-__2226.1.0.0	rs1002706	0.8721512018618223	0.9812007661587252	0.9916069167515876	0.7382699826988831	0.8344957633233853	1.0287837705485567	0.9555037327755109	0.9495614554792412	0.8415328611574305	0.9665365343226046	0.8676632932675061	1.0185448681914098	0.9204875955447221	0.7762721564719346	0.9411263702396953	1.0590067829157477	0.7246454643571326	1.0848432440055298	0.9651296495353385	0.8235346795063494	1.0777344292174114	1.02950942556768	0.9623641828280722	1.0401504916864495	1.0235327676756683	0.9589874703339175	-0.09587904538988767	-0.04007439591902995	0.06739986616416005	-0.013624518341750491	0.2503474806821445	-0.06365412101321821	-0.13196905326916153	0.12817297373817016	0.18797656441024946	-0.004172351494532323	0.17248719841894333	0.0049878994842584845	0.03849987478919548	0.657696241675	0.452098798395	0.840380101088	0.85089220831	0.0959193233604	0.436112310787	0.563691144959	0.60051573606	0.259370210024	0.747262025795	0.242741268695	0.368322877114	0.529677728435	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr1:25051083..25051197,-__2226.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:25051083..25051197,-__2226.1.0.0	rs1002707,rs1002706	0.8721512018618223	0.9812007661587252	0.9916069167515876	0.7382699826988831	0.8344957633233853	1.0287837705485567	0.9555037327755109	0.9495614554792412	0.8415328611574305	0.9665365343226046	0.8676632932675061	1.0185448681914098	0.9204875955447221	0.3402834394444305	0.5699764027030366	0.4696680086078391	0.37650066440135777	0.4299688649812815	0.36665827938210527	0.4395583790813523	0.32547259929807404	0.37752372036818416	0.4621334049946205	0.41163031469876	0.5030046801686106	0.4226982298441377	-0.5318677624173918	-0.4112243634556886	-0.5219389081437485	-0.36176931829752534	-0.40452689834210376	-0.6621254911664515	-0.5159453536941586	-0.6240888561811672	-0.4640091407892464	-0.504403129327984	-0.45603297856874614	-0.5155401880227992	-0.49778936570058424	0.000116396943443	0.00423662678721	0.00993701022923	0.0515422504639	0.00327633608155	2.20570481755e-05	0.0010031111026	0.000110173251151	0.00480682187369	0.00327633608155	0.000152810281165	2.44178879239e-06	2.10863981684e-27	0.022581007028	0.855798611017	1	1	0.671648896719	0.00443346668327	0.20062222052	0.0214837839745	0.990205305979	0.681477904963	0.0313261076388	0.000503008491232	4.78661238422e-25	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:90101801..90101915,-__2227.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:90101801..90101915,-__2227.1.0.0	rs10801756	1.808566221340463	1.9552617092349522	1.948651218155591	1.616589664865583	1.6913146573944258	1.689229115703153	0.7578702347977753	0.8563794777359838	1.5040299357142222	1.5348655969823115	1.5222877923630365	1.607944718372209	1.5410825285549754	1.708010732823106	1.799081999603652	1.5010230670701916	1.388006170644013	1.6665566945616628	1.5445190019225576	0.6848623959286533	0.7220020270709562	1.29784349265609	1.4899126877772333	1.5006754498622383	1.5151421606804276	1.4014696567167315	-0.10055548851735696	-0.15617970963130023	-0.44762815108539944	-0.2285834942215701	-0.024757962832762992	-0.14471011378059528	-0.07300783886912199	-0.1343774506650276	-0.20618644305813216	-0.04495290920507822	-0.021612342500798132	-0.09280255769178147	-0.1396128718382437	0.493479697885	0.29495293544	0.129198935732	0.270885072145	0.619326784864	0.914457985151	0.444064484515	0.727009731456	0.333666485083	0.85089220831	0.412754243182	0.861430881609	0.648062132948	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:17255060..17255174,-__2228.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:17255060..17255174,-__2228.1.0.0	rs10795464	-1.5557262420862903	-2.322271630209165	-1.9146715599245607	-1.1699956501529314	-1.6053126390973347	-1.981475342736376	-1.8111788123440367	-1.6088735253584512	-1.6530502534249445	-1.8720731451146664	-1.48755055798744	-2.0091786045473707	-1.7492798302486303	-1.4865897122671474	-1.297750478710334	-1.5598556082742867	-1.587233657994628	-1.4008529240214649	-1.6816821312245689	-1.119545281828829	-1.5310447099431583	-1.8826187658829636	-1.50431102443122	-1.8372251376883275	-1.6159516878835678	-1.5420550933458745	0.06913652981914287	1.024521151498831	0.354815951650274	-0.4172380078416966	0.2044597150758698	0.29979321151180716	0.6916335305152077	0.07782881541529285	-0.22956851245801912	0.3677621206834465	-0.34967457970088756	0.39322691666380294	0.207224736902756	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:43633199..43633313,-__2229.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:43633199..43633313,-__2229.1.0.0	rs2505514	-0.5246231183294006	-0.5805897222340807	-0.5316844689579605	-0.4190054940227218	-0.3141543982465839	-0.25976930239353213	-0.5468175148953683	-0.17284668956190075	-0.39440083994846753	-0.18138201469809853	-0.43090019077435926	-0.2308847482336843	-0.3822548751913466	-0.9589637625585546	-0.7317354847175509	-0.9804293355625506	-1.092135740516584	-0.4704850989569211	-0.6106808195001827	-0.9799851670514136	-1.0538794514184056	-0.7241557583631707	-0.6495719099078612	-0.789270510655893	-1.0061154289008447	-0.8372840390091612	-0.4343406442291541	-0.15114576248347023	-0.4487448666045901	-0.6731302464938621	-0.15633070071033717	-0.3509115171066506	-0.43316765215604525	-0.8810327618565048	-0.32975491841470317	-0.4681898952097626	-0.3583703198815338	-0.7752306806671604	-0.45502916381781455	0.216719559135	NA__no_active_tile	0.397602565759	0.13967914143	0.809021331888	0.044708952363	0.0785847853765	0.0249397487324	0.856156710108	0.390154148302	0.150801701171	0.347268461228	0.0178515167669	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:73790766..73790880,-__2230.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:73790766..73790880,-__2230.1.0.0	rs1245531	-1.2534560310213125	-1.1488363184747414	-1.4334204213058928	-1.6178687063588146	-1.4407716480190318	-1.6844116414829853	-1.3759163664065177	-1.232731361211418	-1.3510696593989764	-1.6628535976481147	-1.486699079810499	-1.4984628951723424	-1.4322081438592207	-1.7501925476097844	-1.5814182238094512	-1.7680613309561108	-1.5481241856316383	-1.6036305926303651	-1.745724866161384	-1.6861555602659153	-1.6287577675285563	-1.3547362739603606	-1.7698093763015048	-1.8374057893621276	-1.413154930627638	-1.6405976204037362	-0.49673651658847184	-0.43258190533470975	-0.3346409096502181	0.0697445207271763	-0.16285894461133332	-0.061313224678398726	-0.3102391938593976	-0.39602640631713837	-0.003666614561384174	-0.10695577865339012	-0.3507067095516285	0.08530796454470435	-0.2083894765445158	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr10:73790766..73790880,-__2230.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:73790766..73790880,-__2230.1.0.0	rs1245532,rs1245531	-1.2534560310213125	-1.1488363184747414	-1.4334204213058928	-1.6178687063588146	-1.4407716480190318	-1.6844116414829853	-1.3759163664065177	-1.232731361211418	-1.3510696593989764	-1.6628535976481147	-1.486699079810499	-1.4984628951723424	-1.4322081438592207	-1.643516626438568	-1.7730382701866418	-1.5682383630550254	-1.7621342145138235	-1.7848252347296134	-1.992304736165025	-1.6205291490147187	-1.8393969307418478	-1.5575644574226628	-1.6770825704157617	-1.4102343715304575	-1.7506407739030525	-1.6982921415097667	-0.3900605954172556	-0.6242019517119004	-0.13481794174913264	-0.14426550815500883	-0.3440535867105816	-0.30789309468203974	-0.24461278260820096	-0.6066655695304299	-0.20649479802368642	-0.014228972767647008	0.0764647082800416	-0.25217787873071007	-0.26608399765054597	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:74091836..74091950,-__2231.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:74091836..74091950,-__2231.1.0.0	rs9415066	-0.8895239388497579	-0.858311728651274	-0.904871949598553	-1.258690738791528	-0.7001868464239727	-1.5712289353666833	-0.5631560345154926	-0.22035340055820296	-0.9231028198249599	-0.79028272567081	-0.8729701742667783	-0.6521045923852431	-0.8503986570752713	-1.1082044958854562	-0.8758057746352422	-1.2785704034703937	-0.9529518562612148	-0.8007989258684516	-1.212630563031253	-0.2398902797725529	-0.2568750928131892	-1.256969495216509	-0.9489752010249145	-0.6894534744376805	-0.7088541487113502	-0.8608316425940173	-0.21868055703569833	-0.0174940459839682	-0.37369845387184075	0.3057388825303132	-0.10061207944447892	0.35859837233543024	0.32326575474293967	-0.03652169225498625	-0.333866675391549	-0.15869247535410447	0.1835166998290978	-0.05674955632610712	-0.010432985518746015	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.175053819161	0.687084607526	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.376031943721	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr10:74091836..74091950,-__2231.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:74091836..74091950,-__2231.1.0.0	rs9415066,rs9416016	-0.8895239388497579	-0.858311728651274	-0.904871949598553	-1.258690738791528	-0.7001868464239727	-1.5712289353666833	-0.5631560345154926	-0.22035340055820296	-0.9231028198249599	-0.79028272567081	-0.8729701742667783	-0.6521045923852431	-0.8503986570752713	-0.8825376335491186	-0.814762224160079	-0.6299565025122086	-1.2235594112366943	-1.2281770454822305	-1.1088004882151954	-0.3014301776065204	-0.2931462259994445	-0.6903707229701006	-0.7903181324320708	-0.7155303710638989	-0.6039393869202161	-0.773544026845648	0.006986305300639262	0.04354950449119499	0.2749154470863444	0.035131327554833724	-0.5279901990582578	0.4624284471514879	0.26172585690897215	-0.07279282544124155	0.2327320968548593	-3.540676126079223e-05	0.1574398032028793	0.048165205465027006	0.07685463022962315	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.197395731844	0.510582765025	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.154655491485	NA__no_active_tile	0.143900286177	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr10:81046390..81046504,-__2232.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr10:81046390..81046504,-__2232.1.0.0	rs1250566	-0.7753208420129405	-0.7096353353314981	-0.692857736012359	-0.9475924887533684	-0.7299376008105068	-0.6468730572469186	-0.90212210043476	-0.5093815031000878	-0.4936911810494002	-0.7957705045564353	-0.6891085428934828	-0.3575617236955845	-0.687487717991445	-0.7857620768992024	-0.2998033188585826	-0.4479066695716871	-0.608485716387181	-0.4904394251832652	-0.4720591441193033	-0.46419488891723826	-0.3247393704657505	-0.5448778252236874	-0.43331275445335254	-0.3716147084598123	-0.3879363376897827	-0.46926101968573714	-0.010441234886261919	0.40983201647291556	0.24495106644067188	0.33910677236618747	0.23949817562724163	0.1748139131276153	0.4379272115175218	0.18464213263433726	-0.051186644174287255	0.36245775010308273	0.31749383443367046	-0.03037461399419822	0.21822669830570807	NA__no_active_tile	0.0115927323179	0.333666485083	0.436112310787	0.0959193233604	0.405136064622	0.0619890035232	0.814225899608	0.76769033028	0.0386605553759	0.0906800339379	0.628827692687	0.0162214018886	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr11:69453844..69453958,-__2233.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr11:69453844..69453958,-__2233.1.0.0	rs1944129	0.7103832341517721	0.7898044233323733	0.5830868692570799	0.2514141543555202	0.6198647329165804	0.9276695598525186	1.0366467773847368	0.8090263191093655	0.8317143966786107	0.7313867405211736	0.8240053235079904	0.7387594893203211	0.7378135016990036	0.9005114154706974	0.8582199180626946	0.8343395303897232	0.744675887629311	0.7070008798140752	0.776806803323008	0.5398435178699761	0.9391902471017834	0.2868727261627258	0.7178833576448573	0.5791413115955455	0.6909749015029455	0.7146217080472786	0.19012818131892528	0.06841549473032127	0.25125266113264333	0.4932617332737908	0.08713614689749483	-0.15086275652951064	-0.4968032595147607	0.13016392799241794	-0.544841670515885	-0.01350338287631625	-0.2448640119124449	-0.0477845878173756	-0.023191793651724968	0.408929232264	0.706946403854	0.978575937473	0.113101776132	0.978575937473	0.340423946445	0.088148079887	0.677233097055	0.197395731844	0.978575937473	0.737113058664	0.591208103411	0.869278243441	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr12:115106263..115106377,-__2234.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr12:115106263..115106377,-__2234.1.0.0	rs71807	-1.354728937506797	-1.278066048638344	-1.1279399557973375	-1.8628484938150198	-1.6208732706708844	-1.6466170182373017	-1.7005969393321687	-1.7473069006279054	-1.4379218075439733	-1.812257751748612	-1.5390952793797723	-1.2634892954226191	-1.532645141560061	-1.6583448857893563	-1.4728047314109873	-1.4707625837095646	-1.8918967245195915	-1.5511207851839695	-2.0631077180550954	-1.6455818597997416	-2.1141604505216325	-0.9924919905264398	-1.5450979636842748	-1.7895040526946806	-1.3125679367533918	-1.625620140220727	-0.30361594828255933	-0.1947386827726434	-0.34282262791222706	-0.02904823070457163	0.06975248548691493	-0.41649069981779374	0.055015079532427125	-0.3668535498937271	0.4454298170175335	0.26715978806433727	-0.2504087733149083	-0.049078641330772665	-0.09297499866066587	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr12:53268001..53268115,-__2235.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr12:53268001..53268115,-__2235.1.0.0	rs147181250	0.8602485354364603	-0.05071393905601166	1.072737687312245	0.4596875880598646	0.1991153093084029	1.0120653720600292	0.3851540300519443	-0.0059561398196613475	0.9517196459034536	0.2129274085049399	0.8085554293660722	1.0495878019389606	0.5795940607555582	0.005564651793007552	-0.464164855042053	0.2589391991086666	0.38195490778421237	0.2705406415255662	-0.20764952627502867	-0.11400771822399584	1.5667120985999037	1.57859265382647	0.2658231844737084	0.9350543780334366	0.9062289500637324	0.4486323804723022	-0.8546838836434527	-0.41345091598604133	-0.8137984882035784	-0.07773268027565222	0.07142533221716327	-1.2197148983350579	-0.4991617482759402	1.572668238419565	0.6268730079230165	0.05289577596876849	0.12649894866736444	-0.14335885187522823	-0.13096168028325614	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr12:53268001..53268115,-__2235.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr12:53268001..53268115,-__2235.1.0.0	rs2638517,rs147181250	0.8602485354364603	-0.05071393905601166	1.072737687312245	0.4596875880598646	0.1991153093084029	1.0120653720600292	0.3851540300519443	-0.0059561398196613475	0.9517196459034536	0.2129274085049399	0.8085554293660722	1.0495878019389606	0.5795940607555582	1.5050676636482083	1.186554787786838	2.6955597880843185	-0.13056984268355634	1.3622728044079968	1.3763186834045753	1.761575669885124		0.40201559246293295	2.6063941315875305	0.949238241002378	0.7184237475003593	1.3120773879169734	0.644819128211748	1.2372687268428497	1.6228221007720736	-0.590257430743421	1.163157495099594	0.3642533113445461	1.3764216398331797		-0.5497040534405206	2.393466723082591	0.1406828116363058	-0.3311640544386013	0.6792514907454859	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr12:6291398..6291512,-__2237.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr12:6291398..6291512,-__2237.1.0.0	rs11829968	-0.9957513140507084	-1.1725693677960218	-1.1323492938234334	-1.1570887539766346	-1.3001953956316363	-1.0982683320953035	-0.9838388935347366	-0.9601999926687081	-0.967912686084145	-1.2050701207666652	-0.7594208816994645	-1.0721318029781657	-1.0670664029254686	-1.023572503297257	-1.1364701780038318	-1.2143781312118147	-1.0884313956561624	-1.3499776103866346	-0.8711493991565507	-1.2729067016212081	-1.0552913492470346	-1.0925012148501991	-1.451934649169719	-1.417973328982297	-0.8845389942784775	-1.1549271213217656	-0.027821189246548528	0.03609918979219007	-0.08202883738838129	0.06865735832047215	-0.04978221475499822	0.22711893293875285	-0.2890678080864715	-0.09509135657832646	-0.12458852876605409	-0.24686452840305373	-0.6585524472828326	0.1875928086996882	-0.08786071839629694	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050090..21050204,-__2239.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050090..21050204,-__2239.1.0.0	rs7329823	0.2591079740596114	0.6250768148225309	0.668449486286967	0.3521989916239585	0.5226224066864759	0.7435346104016383	0.7859915704597492	0.7456710182540895	0.7697854760014596	0.5633204185513301	0.9449871139702389	0.8913904408706507	0.6560113601657249	1.589121389475757	1.9093689000921739	1.6165440946405645	1.5220843059521416	1.554458713873701	1.6344268082869622	1.9245649826127709	1.7620032343133007	1.538395043441308	1.6693196270691724	1.425263343645145	1.5298365435752783	1.63961558224819	1.3300134154161456	1.2842920852696431	0.9480946083535975	1.169885314328183	1.0318363071872252	0.8908921978853239	1.1385734121530215	1.0163322160592112	0.7686095674398484	1.1059992085178423	0.480276229674906	0.6384461027046276	0.9836042220824646	4.77393269186e-07	6.76305944647e-07	0.000104264461287	5.66885732617e-06	5.88658815831e-07	2.15438690979e-08	1.75892558936e-07	0.000137117000352	1.35890743059e-05	1.75236973871e-06	0.000116396943443	0.000889602493713	2.92549969266e-52	0.000337994434584	0.000503171622818	0.0776770236589	0.00417794784939	0.000454444605821	1.64595159908e-05	0.000129984601053	0.099684059256	0.0105043544384	0.00137561024488	0.0895092495077	0.693000342602	2.45156874245e-49	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050090..21050204,-__2239.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050090..21050204,-__2239.1.0.0	rs7324188	0.2591079740596114	0.6250768148225309	0.668449486286967	0.3521989916239585	0.5226224066864759	0.7435346104016383	0.7859915704597492	0.7456710182540895	0.7697854760014596	0.5633204185513301	0.9449871139702389	0.8913904408706507	0.6560113601657249	0.11166613572454874	0.21871573404611108	-0.05030084816336195	-0.1267239443214842	0.09042987433914998	0.3742232553847533	0.23433549440210602	0.3752298754815514	0.21247898162078738	0.35678295413992256	0.27834035369343424	0.22549169399950172	0.1917224633622517	-0.14744183833506264	-0.40636108077641975	-0.718750334450329	-0.4789229359454427	-0.4321925323473259	-0.36931135501688495	-0.5516560760576432	-0.37044114277253815	-0.5573064943806723	-0.20653746441140752	-0.6666467602768047	-0.6658987468711489	-0.46428889680347346	0.757452311924	0.0296152123457	0.0249397487324	0.326996172605	0.141483179219	0.13967914143	0.0120431385799	0.0440018610392	0.0296152123457	0.125844655769	0.0057923255826	0.039939114746	4.45615579685e-07	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.000373425855776	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050090..21050204,-__2239.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050090..21050204,-__2239.1.0.0	rs35891640	0.2591079740596114	0.6250768148225309	0.668449486286967	0.3521989916239585	0.5226224066864759	0.7435346104016383	0.7859915704597492	0.7456710182540895	0.7697854760014596	0.5633204185513301	0.9449871139702389	0.8913904408706507	0.6560113601657249	1.9931312701065953	2.094975651788434	1.8667810407964576	1.730565084797934	1.9482345954504523	2.016699571731902	1.9606975045303212	2.3384325229749807	2.0196343489987996	2.0039049713413477	1.9643754666004662	2.1131441016415993	2.004214677563274	1.734023296046984	1.4698988369659034	1.1983315545094906	1.3783660931739754	1.4256121887639766	1.2731649613302636	1.1747059340705719	1.5927615047208912	1.2498488729973398	1.4405845527900176	1.0193883526302274	1.2217536607709487	1.3482033173975492	5.8094165088e-08	9.84020831162e-09	1.5208503355e-07	3.12503971844e-07	5.52754458971e-10	3.46395922999e-09	5.52754458971e-10	4.99679411993e-08	1.57825746834e-08	7.40729972622e-11	1.99366201481e-08	6.60792836258e-09	1.02594468341e-84	4.11306688823e-05	7.32111498385e-06	0.000113303349995	0.000230315427249	4.26726442325e-07	2.64646485171e-06	4.08485545179e-07	3.63266932519e-05	1.21999302302e-05	5.81473028508e-08	1.53312608939e-05	5.14757619445e-06	8.59741644698e-82	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050090..21050204,-__2239.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050090..21050204,-__2239.1.0.0	rs7324189	0.2591079740596114	0.6250768148225309	0.668449486286967	0.3521989916239585	0.5226224066864759	0.7435346104016383	0.7859915704597492	0.7456710182540895	0.7697854760014596	0.5633204185513301	0.9449871139702389	0.8913904408706507	0.6560113601657249	0.08621875102876751	0.4882815725203187	0.5975171953306218	0.21426779291850115	0.6919650565616171	0.682702335573796	0.9192182255042357	0.9613032910405244	0.5625006579563756	0.7028808859228239	0.6790621828140142	0.6627729787116443	0.6040575771569368	-0.17288922303084386	-0.13679524230221218	-0.07093229095634523	-0.13793119870545736	0.16934264987514125	-0.06083227482784226	0.1332266550444865	0.21563227278643482	-0.20728481804508403	0.13956046737149386	-0.26592493115622473	-0.22861746215900636	-0.0519537830087883	0.840380101088	0.727009731456	0.742179092338	0.861430881609	0.452098798395	0.732052639825	0.788276589059	0.253741740693	0.536806685117	0.282745459933	0.259370210024	0.609884951243	0.816458469531	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050090..21050204,-__2239.1.4.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr13:21050090..21050204,-__2239.1.0.0	rs7329823,rs7324188,rs35891640,rs7324189	0.2591079740596114	0.6250768148225309	0.668449486286967	0.3521989916239585	0.5226224066864759	0.7435346104016383	0.7859915704597492	0.7456710182540895	0.7697854760014596	0.5633204185513301	0.9449871139702389	0.8913904408706507	0.6560113601657249	2.2227296203653895	2.370078564778939	2.2100216822902388	1.991966125297185	2.104157436346599	2.089399837492791	2.089558046041458	2.007929753667926	2.2220372202865053	2.3969489662920713	2.346971326711766	2.1581246572370674	2.184160269733995	1.963621646305778	1.7450017499564083	1.5415721960032718	1.6397671336732265	1.5815350296601234	1.3458652270911526	1.3035664755817087	1.2622587354138366	1.4522517442850456	1.8336285477407412	1.4019842127415272	1.2667342163664168	1.5281489095682697	3.30166096949e-10	3.46395922999e-09	6.55420316999e-10	3.68889472684e-08	7.40729972622e-11	8.85463967688e-11	1.39854909491e-09	3.98069788177e-08	1.08804472643e-09	1.08960636655e-11	9.67857429079e-11	1.2859458219e-09	1.33379833542e-97	6.40522228081e-08	6.99719764457e-07	1.30428643083e-07	6.97201103372e-06	1.51849644387e-08	1.77978257505e-08	2.79709818981e-07	7.76236086946e-06	2.24137213645e-07	2.26638124243e-09	1.98410772961e-08	2.64904839311e-07	3.0277222214e-95	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr13:24528318..24528432,-__2240.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr13:24528318..24528432,-__2240.1.0.0	rs73457071	-1.262724795383399	-1.2975182078903449	-1.3486192147119451	-1.225450063359944	-0.9627353939705343	-1.208607715990495	-1.232278822836704	-1.442804251379685	-1.1243938259111452	-1.0219419511207308	-0.970358539296192	-1.094434776799639	-1.1826556298875632	-1.0647003002693087	-0.7374415714590157	-0.6274513611495971	-0.5306919865605493	-0.7985631176151283	-0.8924016260775257	-0.6848216489928141	-0.5132622408345764	-0.8653438183107693	-0.7921203485257736	-0.6735516139013854	-0.6525738188201433	-0.7360769543763821	0.19802449511409037	0.5600766364313292	0.721167853562348	0.6947580767993948	0.164172276355406	0.3162060899129694	0.54745717384389	0.9295420105451087	0.2590500076003759	0.2298216025949572	0.2968069253948066	0.44186095797949565	0.44657867551118097	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.379136386009	0.90381429355	0.747262025795	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.13611090909	0.259370210024	0.485461917178	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr13:24528318..24528432,-__2240.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr13:24528318..24528432,-__2240.1.0.0	rs79204554	-1.262724795383399	-1.2975182078903449	-1.3486192147119451	-1.225450063359944	-0.9627353939705343	-1.208607715990495	-1.232278822836704	-1.442804251379685	-1.1243938259111452	-1.0219419511207308	-0.970358539296192	-1.094434776799639	-1.1826556298875632	-1.1755212262037842	-0.966479273019359	-1.205410689843455	-1.000068722466412	-0.8823435110950476	-0.7784431954232619	-0.9595871522820536	-0.8477866234912751	-0.7725368440666024	-0.7922715335619785	-0.8158424758814207	-0.7356977742576656	-0.9109990851326929	0.08720356917961491	0.3310389348709859	0.14320852486849023	0.22538134089353212	0.08039188287548671	0.4301645205672332	0.2726916705546505	0.59501762788841	0.35185698184454284	0.22967041755875228	0.1545160634147713	0.3587370025419734	0.2716565447548703	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr13:24528318..24528432,-__2240.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr13:24528318..24528432,-__2240.1.0.0	rs12876699	-1.262724795383399	-1.2975182078903449	-1.3486192147119451	-1.225450063359944	-0.9627353939705343	-1.208607715990495	-1.232278822836704	-1.442804251379685	-1.1243938259111452	-1.0219419511207308	-0.970358539296192	-1.094434776799639	-1.1826556298875632	-0.9498999759963724	-1.215431609046013	-0.8809691687409351	-1.0608535157796335	-1.2351765193535962	-1.4130455867460432	-1.3069289276698597	-1.0342925568437482	-0.9807678661115642	-0.8982691184774417	-1.0154350235161165	-1.1520870999235346	-1.0952630806837382	0.31282481938702666	0.08208659884433178	0.46765004597101	0.16459654758031061	-0.27244112538306187	-0.2044378707555481	-0.0746501048331556	0.40851169453593683	0.14362595979958104	0.1236728326432891	-0.045076484219924495	-0.05765232312389568	0.08739254920382504	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr13:24528318..24528432,-__2240.1.3.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr13:24528318..24528432,-__2240.1.0.0	rs73457071,rs79204554,rs12876699	-1.262724795383399	-1.2975182078903449	-1.3486192147119451	-1.225450063359944	-0.9627353939705343	-1.208607715990495	-1.232278822836704	-1.442804251379685	-1.1243938259111452	-1.0219419511207308	-0.970358539296192	-1.094434776799639	-1.1826556298875632	-1.1291329042020564	-1.0854415813443965	-1.0006543321410155	-1.3012950045057934	-1.3773384451573556	-1.2773996602055497	-0.9017734346638944	-1.2917668135755451	-1.3263604785998564	-1.142685988233818	-1.3079396806209396	-1.0721318029781657	-1.1844933438523657	0.13359189118134274	0.2120766265459484	0.3479648825709296	-0.07584494114584928	-0.4146030511868213	-0.06879194421505463	0.3305053881728097	0.15103743780413992	-0.20196665268871117	-0.12074403711308723	-0.3375811413247476	0.022302973821473282	-0.0018377139648022938	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr14:101159639..101159753,-__2241.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr14:101159639..101159753,-__2241.1.0.0	rs9671394	2.432979974280926	2.907773519857037	2.327880852818895	2.301023114750154	2.4125142527598786	2.409650153666363	1.469804346200613	1.8606422776417078	2.364221200410997	2.4232734190165024	2.260296746862605	2.366257185321757	2.2946930869656197	1.7979371278113685	2.1384065085346657	1.8037808406733733	1.6516955237403597	1.7773370428041773	1.832219501574493	1.1502649919934391	1.0985047817228004	1.815261544655271	1.7939348150364405	1.6799745226082692	1.8560032823707413	1.6996100402937835	-0.6350428464695577	-0.7693670113223714	-0.5241000121455217	-0.6493275910097944	-0.6351772099557014	-0.5774306520918697	-0.31953935420717383	-0.7621374959189073	-0.5489596557557259	-0.6293386039800619	-0.5803222242543358	-0.5102539029510158	-0.5950830466718365	0.000751093855117	5.95166561664e-05	0.00086866520518	0.00167824394514	0.000303956631358	4.98941474284e-06	0.0316863885398	1.2780782346e-05	0.000911503005752	3.85703616239e-06	0.00133155906714	0.00160288548718	6.13132689214e-32	0.531774449423	0.0442803921878	0.647155577859	1	0.234654519409	0.00381191286353	1	0.00929162876551	0.704591823446	0.00302777338748	1	1	5.13805193562e-29	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr14:55574540..55574654,-__2242.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr14:55574540..55574654,-__2242.1.0.0	rs17253695	-1.2783768868793808	-1.3547548180873905	-1.2448502318764865	-1.8607226221878117	-1.2270168305495506	-1.2263172393271422	-1.3279707427856922	-1.4866003038501965	-1.7974946119733242	-1.7788990330385	-1.0631796644635692	-1.615259730102915	-1.4384535595934966	-0.7717060130381239	-0.9218904162296593	-1.4167068550345523	-1.2556072078222942	-1.0435311656847022	-1.3410814026424633	-1.2552832653305144	-1.4967055581843216	-1.0216701433687887	-1.0538404807532062	-1.4600085926063129	-0.6698457290052695	-1.142323069141684	0.5066708738412569	0.43286440185773123	-0.17185662315806582	0.6051154143655175	0.1834856648648484	-0.11476416331532113	0.07268747745517778	-0.010105254334125124	0.7758244686045355	0.7250585522852937	-0.39682892814274373	0.9454140010976455	0.29613049045181256	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr14:75741656..75741770,-__2243.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr14:75741656..75741770,-__2243.1.0.0	rs1569328	-0.8773738251019603	-1.118865224384555	-0.8786375956778376	-1.2363867383899643	-1.1525957884401978	-1.0031949593903409	-1.1494045308924759	-1.1157877024561884	-1.0102853382097177	-0.8278783424116845	-0.9239239107295167	-0.9155254523897418	-1.0174882840395152	-1.1637162069748497	-1.111348700897254	-1.2189462649988725	-1.6701626879444906	-1.140171560905082	-1.1116513152114322	-1.0711886798521182	-1.1366511877528689	-1.1125912482139477	-1.3004249896484312	-1.0872100859873786	-1.099191536018507	-1.1852712053671028	-0.2863423818728894	0.007516523487300919	-0.3403086693210349	-0.43377594955452636	0.01242422753511585	-0.10845635582109137	0.07821585104035766	-0.020863485296680473	-0.10230591000423006	-0.4725466472367468	-0.16328617525786182	-0.18366608362876513	-0.16778292132758765	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.00480682187369	0.113101776132	NA__no_active_tile	0.00360767791159	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr16:75410614..75410728,-__2245.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr16:75410614..75410728,-__2245.1.0.0	rs8054586	-1.6154137909273425	-1.1092009215630774	-1.1672595272806987	-1.2025201049998508	-1.448047981875736	-1.3551162586159213	-1.061440596657854	-1.564672361455988	-1.6957894377322091	-1.2030931634229145	-1.3571501287869927	-1.7784302789851747	-1.3798445460253135	-0.8624893657868179	-1.6103828116667844	-1.5239344507492218	-1.5587062220493746	-1.7184900542164443	-1.0257168713038107	-1.1158747995558118	-1.226424391948182	-1.27671944480606	-2.303916774737212	-1.3913546437922584	-1.8051857155620856	-1.4515996288478386	0.7529244251405246	-0.5011818901037071	-0.35667492346852314	-0.35618611704952374	-0.2704420723407084	0.3293993873121106	-0.05443420289795786	0.338247969507806	0.4190699929261492	-1.1008236113142973	-0.03420451500526567	-0.02675543657691093	-0.07175508282252531	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr18:21417670..21417784,-__2246.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr18:21417670..21417784,-__2246.1.0.0	rs4800516	-0.37824023538882845	-0.25364243905920747	-0.34145971873668096	-0.6762613174584697	-0.5383776726247882	-0.5185144660406557	-0.5568050995485014	-0.7558722950074408	-0.5623307553498282	-0.5516919732344587	-0.4907315465215982	-0.6101821044602412	-0.5195091352858916	-0.8415425562496943	-0.6809212668800146	-0.6735931336836395	-0.6205582965702102	-0.5250761008096	-0.39262771114074224	-0.7330610908891858	-0.7518200243537737	-0.4982737051718765	-0.35923330711676105	-0.5985998098217548	-0.5345918563344485	-0.6008249049184752	-0.46330232086086587	-0.42727882782080717	-0.3321334149469585	0.055703020888259513	0.013301571815188207	0.1258867548999134	-0.17625599134068437	0.004052270653667089	0.06405705017795171	0.19245866611769769	-0.10786826330015653	0.07559024812579274	-0.08131576963258351	0.113101776132	0.116187990183	0.162586850726	0.657696241675	0.677233097055	0.572794651112	0.809021331888	0.757455001208	0.716953652062	0.232080506959	0.313917214294	0.716953652062	0.404714804001	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr19:44287119..44287233,-__2247.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr19:44287119..44287233,-__2247.1.0.0	rs118025673	-0.6792519111135478	-0.21613702028984857	-0.3020557957095506	-0.5312551653294401	-0.15547724033814703	-0.17866543048558214	-0.27405072375500983	-0.4960371037953133	-0.3494588494558093	-0.07996987606314976	-0.39789830066247656	-0.1876515641932608	-0.3206590817659279	-0.15381153173416542	0.23122602384713686	0.09521195575238163	0.015089042172886109	0.08528368447991945	-0.19315847010664006	-0.18284304328074985	0.09701805079557496	0.3211260393708085	0.017209844440312226	-0.023728454534651573	-0.2154980300830628	0.007760425926645838	0.5254403793793824	0.44736304413698547	0.3972677514619322	0.5463442075023262	0.2407609248180665	-0.014493039621057913	0.09120768047425998	0.5930551545908882	0.6705848888266178	0.09717972050346199	0.374169846127825	-0.027846465889802025	0.32841950769257383	0.175048880887	0.340423946445	0.285759223278	0.63839046467	0.652843982252	0.87199428352	0.829894465792	0.0515422504639	0.0906800339379	0.757455001208	0.468411351413	0.809021331888	0.437126500482	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr2:113840934..113841048,-__2249.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr2:113840934..113841048,-__2249.1.0.0	rs75151153	-1.1117854904450066	-0.6556885705619409	-0.7626323639663506	-0.8259548211875408	-0.7842114343375863	-0.7071147994426624	-0.9672890779969587	-0.7440102870998617	-0.7915009982264762	-0.9035228400743762	-0.6890367648746578	-0.6777883862339191	-0.8017113195372781	-1.0439962475469016	-1.0825227154473385	-0.9144566500678393	-0.8385904682693165	-0.945138319161126	-0.8844401412505409	-0.9604153866263586	-0.8949462985364116	-0.8218144678003901	-0.8972230838709978	-0.9648955178612266	-0.8247540834586664	-0.922766114991426	0.06778924289810506	-0.4268341448853976	-0.15182428610148868	-0.01263564708177567	-0.16092688482353967	-0.1773253418078785	0.006873691370600121	-0.1509360114365499	-0.030313469573913898	0.006299756203378415	-0.2758587529865688	-0.14696569722474728	-0.12105479545414803	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.188220673538	0.527990680582	0.226876581559	0.60051573606	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.554657938956	0.88258056334	NA__no_active_tile	0.591208103411	0.537240525233	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr2:113840934..113841048,-__2249.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr2:113840934..113841048,-__2249.1.0.0	rs6734238	-1.1117854904450066	-0.6556885705619409	-0.7626323639663506	-0.8259548211875408	-0.7842114343375863	-0.7071147994426624	-0.9672890779969587	-0.7440102870998617	-0.7915009982264762	-0.9035228400743762	-0.6890367648746578	-0.6777883862339191	-0.8017113195372781	-0.9655681517921786	-0.8159069748755258	-0.8219960913046286	-0.8783006665480193	-0.9775517024814556	-0.8229734420424147	-0.5818572722061435	-0.7951372954824611	-0.8342001095035911	-0.9985519357763694	-0.7714928696191047	-0.7989560988215212	-0.8385410508711179	0.14621733865282804	-0.16021840431358492	-0.059363727338277994	-0.05234584536047848	-0.1933402681438693	-0.11585864259975232	0.38543180579081526	-0.051127008382599426	-0.0426991112771149	-0.09502909570199314	-0.08245610474444687	-0.12116771258760206	-0.036829731333839676	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.914457985151	0.935789553219	0.420456664513	0.935789553219	0.129198935732	NA__no_active_tile	0.914457985151	0.444064484515	0.677233097055	0.809021331888	0.96996554558	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr2:113840934..113841048,-__2249.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr2:113840934..113841048,-__2249.1.0.0	rs113990868,rs75151153,rs6734238	-1.1117854904450066	-0.6556885705619409	-0.7626323639663506	-0.8259548211875408	-0.7842114343375863	-0.7071147994426624	-0.9672890779969587	-0.7440102870998617	-0.7915009982264762	-0.9035228400743762	-0.6890367648746578	-0.6777883862339191	-0.8017113195372781	-0.4780564156021009	-0.5143145847845721	-0.4884719926153377	-0.5143485207339054	-0.403375237440617	-0.3814412950181518	-0.4690036306747727	-0.3757864504468167	-0.4466962714793262	-0.38112509449947846	-0.3864581534991933	-0.19901361133110973	-0.41984093817711515	0.6337290748429057	0.1413739857773687	0.2741603713510129	0.31160630045363547	0.38083619689696935	0.3256735044245106	0.49828544732218605	0.36822383665304503	0.34480472674715	0.5223977455748978	0.3025786113754645	0.4787747749028094	0.38187038136016294	0.00275115621019	0.265084565602	0.175053819161	0.0906800339379	0.0194743211566	0.0276615481105	0.0134887989876	0.0719809426143	0.0515422504639	0.00423662678721	0.0162407194134	0.000956291509096	2.17772460058e-11	0.533724304777	1	1	1	1	1	1	1	1	0.88121837174	1	0.196996050874	4.94343484332e-09	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr2:241796855..241796969,-__2250.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr2:241796855..241796969,-__2250.1.0.0	rs35918150	-0.5411254479258459	-0.9666045045917394	-0.5737735100748051	-0.6267739689387328	-0.6557805032258677	-1.054824052601478	-0.7424583693028319	-0.7274061180534033	-0.6603453756968456	-0.9980655703607619	-1.1991649093597183	-0.7215151701377114	-0.7889864583558118	-0.6676759757705995	-0.8935749042754142	-0.6014544148232701	-0.8659587324809219	-0.9371277348585587	-0.8960092853221717	-0.6381732760155376	-0.8430225252590806	-1.01378432121136	-1.024767095989627	-1.1268465824750828	-1.1731225062245176	-0.890126446225512	-0.1265505278447535	0.07302960031632522	-0.027680904748464963	-0.2391847635421891	-0.28134723163269104	0.15881476727930632	0.1042850932872943	-0.11561640720567734	-0.3534389455145144	-0.026701525628864964	0.07231832688463546	-0.45160733608680625	-0.10113998786970002	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.510582765025	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.510582765025	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr2:241796855..241796969,-__2250.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr2:241796855..241796969,-__2250.1.0.0	rs4401206	-0.5411254479258459	-0.9666045045917394	-0.5737735100748051	-0.6267739689387328	-0.6557805032258677	-1.054824052601478	-0.7424583693028319	-0.7274061180534033	-0.6603453756968456	-0.9980655703607619	-1.1991649093597183	-0.7215151701377114	-0.7889864583558118	-0.2202181927633588	-0.07379173848197497	-0.7098934151082446	-0.4444546072887914	-0.7231839753539723	-0.5250850966161016	-0.5179774872026851	-0.6660428205966589	-0.4727463105441708	-0.4832737100779279	-0.3679185813831849	-0.4029453719249637	-0.4672942756118362	0.32090725516248714	0.8928127661097645	-0.1361199050334394	0.18231936164994145	-0.0674034721281046	0.5297389559853765	0.22448088210014683	0.0613632974567444	0.18759906515267477	0.5147918602828341	0.8312463279765334	0.31856979821274767	0.32169218274397554	0.393862283952	0.242741268695	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	0.364754193662	0.554657938956	0.692027146526	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.657696241675	0.248198866138	NA__no_active_tile	0.360126327094	1	1	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	1	1	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__no_active_tile	1	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr2:241796855..241796969,-__2250.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr2:241796855..241796969,-__2250.1.0.0	rs35918150,rs4401206	-0.5411254479258459	-0.9666045045917394	-0.5737735100748051	-0.6267739689387328	-0.6557805032258677	-1.054824052601478	-0.7424583693028319	-0.7274061180534033	-0.6603453756968456	-0.9980655703607619	-1.1991649093597183	-0.7215151701377114	-0.7889864583558118	-0.7998231389309464	-0.444180054002527	-0.4652483539459262	-0.622698741964311	-0.8085241743276226	-0.34703173996676734	-0.9574399356099996	-0.7155303710638989	-0.9520254890528316	-0.6099427531385045	-0.36030480520135183	-0.6465199932990621	-0.6441057958753125	-0.2586976910051004	0.5224244505892124	0.10852515612887897	0.004075226974421864	-0.1527436711017549	0.7077923126347108	-0.2149815663071677	0.011875746989504332	-0.291680113355986	0.3881228172222574	0.8388601041583665	0.07499517683864931	0.14488066248049938	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.197395731844	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.197395731844	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__not_enough_barcodes	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr20:25218583..25218697,-__2252.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr20:25218583..25218697,-__2252.1.0.0	rs6132819	2.3040116964156603	2.597498523293339	2.0452400760768987	1.9359787032005913	2.2133881857811772	2.250316708932938	1.757368462163282	1.8521621144230334	2.154461728530609	2.3266451427365955	2.3090527110539387	2.271476606505641	2.1681333882594758	2.5717484303120406	2.7099478272016704	2.21787869908496	2.11383054198099	2.2896028015033574	2.3012267557511255	1.9373819439446174	2.2107324439844414	2.3087544341685833	2.4189012004156485	2.4502720842085557	2.4094632935657714	2.3283117046768136	0.2677367338963803	0.11244930390833119	0.1726386230080612	0.17785183878039867	0.07621461572218013	0.05091004681818756	0.18001348178133547	0.358570329561408	0.15429270563797415	0.09225605767905298	0.14121937315461697	0.1379866870601303	0.16017831641733807	0.248198866138	0.545696106059	0.333666485083	0.242741268695	0.382791178922	0.657696241675	0.340423946445	0.232080506959	0.476688253492	0.527990680582	0.501992688725	0.288805731951	0.172731831965	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr20:25218583..25218697,-__2252.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr20:25218583..25218697,-__2252.1.0.0	rs115761750	2.3040116964156603	2.597498523293339	2.0452400760768987	1.9359787032005913	2.2133881857811772	2.250316708932938	1.757368462163282	1.8521621144230334	2.154461728530609	2.3266451427365955	2.3090527110539387	2.271476606505641	2.1681333882594758	1.807783307275996	1.9389735554429586	1.520487652136154	1.4663378614213842	1.6299750285637398	1.619677577655659	1.2007487272856268	1.3878181162345808	1.7049468107963461	1.7719389177444687	1.6756638943307223	1.7532332841062426	1.6231320610828233	-0.4962283891396644	-0.6585249678503806	-0.5247524239407446	-0.46964084177920706	-0.5834131572174375	-0.630639131277279	-0.5566197348776551	-0.4643439981884525	-0.449514917734263	-0.5547062249921269	-0.6333888167232165	-0.5182433223993985	-0.5450013271766522	4.73314572056e-05	7.89440729856e-05	0.00275115621019	0.00327633608155	1.84173011953e-05	5.66885732617e-06	2.34155615835e-05	3.97876883146e-05	7.89440729856e-05	1.6390141405e-06	1.06220766775e-05	7.46332826159e-05	7.50448645253e-41	0.0335106717016	0.0587343903013	1	1	0.0142181565228	0.00433100699719	0.0173041000102	0.0289256494047	0.0610237684179	0.00128662610029	0.00816837696496	0.0581393271578	6.28875964722e-38	sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr20:25218583..25218697,-__2252.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr20:25218583..25218697,-__2252.1.0.0	rs6132819,rs115761750	2.3040116964156603	2.597498523293339	2.0452400760768987	1.9359787032005913	2.2133881857811772	2.250316708932938	1.757368462163282	1.8521621144230334	2.154461728530609	2.3266451427365955	2.3090527110539387	2.271476606505641	2.1681333882594758	1.7987678723405525	2.089256045633573	1.5709690952706312	1.40306004789225	1.512434403707973	1.5704135115653572	0.9820300930109673	1.0162867597338554	1.491473244520051	1.5390720674868301	1.5597972912973008	1.6490419608272027	1.515216866107212	-0.5052438240751078	-0.508242477659766	-0.4742709808062675	-0.5329186553083414	-0.7009537820732041	-0.6799031973675806	-0.7753383691523146	-0.835875354689178	-0.6629884840105582	-0.7875730752497654	-0.7492554197566379	-0.6224346456784384	-0.6529165221522634	1.8732392437e-06	5.01342010717e-05	0.0010031111026	0.00287470049861	2.00209749007e-06	2.34778603013e-07	1.73367966396e-05	2.60794292158e-06	8.27992768152e-06	3.98069788177e-08	4.77393269186e-07	3.85703616239e-06	8.79200274523e-51	0.000363408413278	0.0101271086165	0.199619109418	0.543318394237	0.000410429985465	4.71904992056e-05	0.00346735932792	0.000508548869708	0.00170566510239	8.27985159409e-06	9.78656201831e-05	0.000794549449453	1.99578462317e-48	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr20:52268970..52269084,-__2253.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr20:52268970..52269084,-__2253.1.0.0	rs2041278	0.8041983415750544	1.0383079277487657	0.8987120965905608	0.6082681378724832	0.9974778238417822	0.9476854184671648	1.0778847658146071	1.039541540085585	1.1511180514794646	0.6458018610499332	0.9609962990041324	1.1136818659539205	0.9403061774569544	0.7755348323318872	1.3115449185598567	0.980497914801317	0.7189331812331023	0.8757095642598535	1.115356423016503	1.3048504565169792	1.1080520452785996	1.1529719099430138	1.0080998848879876	1.0456457977917064	0.98771332880731	1.0320758547856765	-0.028663509243167185	0.273236990811091	0.08178581821075614	0.11066504336061911	-0.12176825958192872	0.16767100454933814	0.22696569070237205	0.0685105051930146	0.0018538584635492406	0.36229802383805443	0.084649498787574	-0.1259685371466105	0.09176967732872184	0.510582765025	0.967868733231	0.819442862795	0.788281320858	0.326996172605	0.154655491485	0.85089220831	0.76769033028	0.747262025795	0.248198866138	0.967868733231	0.88258056334	0.977142184604	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr21:45616235..45616349,-__2254.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr21:45616235..45616349,-__2254.1.0.0	rs4317019	1.2885043735988535	1.5922491975262725	1.3748310400084418	1.1586527131735416	1.3101089123477558	1.3406319346814048	1.4631567066671383	1.4744347534184161	1.4674674064123616	1.432247341983993	1.5566005357141055	1.520514186456864	1.4149499251657625	1.2252161174728913	1.2880323794662598	0.7952962074441633	0.7265378409667469	0.941214939523831	0.9415105257015861	1.0023516337439848	1.3412873126669336	1.0771874275923037	1.2771249322928375	1.3919323249721018	1.2439237362770594	1.1043012815100581	-0.06328825612596223	-0.30421681806001266	-0.5795348325642785	-0.4321148722067947	-0.3688939728239249	-0.39912140897981874	-0.4608050729231534	-0.13314744075148255	-0.39027997882005794	-0.15512240969115543	-0.16466821074200366	-0.27659045017980466	-0.3106486436557041	0.777966336216	0.657696241675	0.0741297894045	0.175053819161	0.0276615481105	0.21176555971	0.0741297894045	0.510582765025	0.202104162379	0.88258056334	0.788281320858	0.0932701621097	0.0558195780449	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr21:45616235..45616349,-__2254.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr21:45616235..45616349,-__2254.1.0.0	rs4456788	1.2885043735988535	1.5922491975262725	1.3748310400084418	1.1586527131735416	1.3101089123477558	1.3406319346814048	1.4631567066671383	1.4744347534184161	1.4674674064123616	1.432247341983993	1.5566005357141055	1.520514186456864	1.4149499251657625	0.4536496647898728	0.665087092360313	0.4783458304777231	0.4447342466554402	0.5419882823948028	0.720957049854032	0.8225494938117496	0.7598056688046212	0.6738965894923444	0.9553029857311266	0.8232774358851908	0.8267112460092737	0.6805254655222076	-0.8348547088089807	-0.9271621051659594	-0.8964852095307188	-0.7139184665181013	-0.768120629952953	-0.6196748848273729	-0.6406072128553887	-0.7146290846137949	-0.7935708169200172	-0.47694435625286635	-0.7333230998289147	-0.6938029404475904	-0.7344244596435548	0.000413457613232	0.000587432962331	0.00192430688789	0.00043495277549	3.97876883146e-05	0.00389134425826	0.000345733883015	5.66885732617e-06	6.29975961399e-05	0.00078853414695	0.000373410950373	2.44178879239e-06	2.44447360248e-34	0.292727990169	0.437050123974	1	0.320560195536	0.0307160953789	1	0.255497339548	0.00412125927612	0.0486971418162	0.618999305356	0.287153020837	0.00190215346927	2.04846887888e-31	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	not sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr21:45616235..45616349,-__2254.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr21:45616235..45616349,-__2254.1.0.0	rs4317019,rs4456788	1.2885043735988535	1.5922491975262725	1.3748310400084418	1.1586527131735416	1.3101089123477558	1.3406319346814048	1.4631567066671383	1.4744347534184161	1.4674674064123616	1.432247341983993	1.5566005357141055	1.520514186456864	1.4149499251657625	0.690567154379822	0.94298729423018	0.6992072854911713	0.33667327627486615	0.5054264199810187	0.4957291872736317	0.5751182981686729	0.567796659751898	0.5412800512447999	0.5823785689370959	0.6810581826425931	0.6573945238915415	0.6063014085222743	-0.5979372192190315	-0.6492619032960925	-0.6756237545172705	-0.8219794368986755	-0.8046824923667372	-0.8449027474077732	-0.8880384084984654	-0.9066380936665182	-0.9261873551675617	-0.849868773046897	-0.8755423530715124	-0.8631196625653226	-0.8086485166434881	0.000827700533168	0.00167824394514	0.000222088887318	1.84173011953e-05	1.75892558936e-07	7.05457685779e-05	5.31875791367e-06	1.94976411988e-09	3.85703616239e-06	1.25214566711e-06	1.20184897547e-05	3.12503971844e-07	6.47614091645e-50	0.160573903435	0.339005276919	0.0441956885764	0.00348086992591	3.60579745818e-05	0.0141796994842	0.00106375158273	3.80204003377e-07	0.000794549449453	0.00026044629876	0.00246379039971	6.43758181999e-05	1.47008398803e-47	not sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr22:41047707..41047821,-__2256.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr22:41047707..41047821,-__2256.1.0.0	rs7293100	-0.7397283398125691	-0.7997354771811421	-0.6293202632986665	-0.8111113332683576	-0.8059683661366335	-0.7970086466695592	-0.8161800931183255	-0.7664635319517384	-0.645286159484788	-0.5596525594533522	-0.8931290598886689	-0.6126585106894399	-0.7396868617461033	-0.655875214524861	-0.5900477032403524	-0.338162751986927	-0.7177016432423463	-0.469789580383003	-0.4859271844767923	-0.634214484853065	-0.8494974182380429	-0.7390694158883316	-0.7937728751154602	-0.546783176108209	-0.6186383377379007	-0.6199566488162743	0.08385312528770816	0.20968777394078975	0.2911575113117395	0.0934096900260113	0.33617878575363047	0.3110814621927669	0.18196560826526054	-0.08303388628630448	-0.09378325640354368	-0.234120315662108	0.34634588378045983	-0.005979827048460784	0.1197302129298291	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.119339994516	0.188220673538	0.282745459933	NA__no_active_tile	0.63839046467	0.978575937473	0.170821264488	0.861430881609	0.481568945763	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr22:41047707..41047821,-__2256.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr22:41047707..41047821,-__2256.1.0.0	rs7284768	-0.7397283398125691	-0.7997354771811421	-0.6293202632986665	-0.8111113332683576	-0.8059683661366335	-0.7970086466695592	-0.8161800931183255	-0.7664635319517384	-0.645286159484788	-0.5596525594533522	-0.8931290598886689	-0.6126585106894399	-0.7396868617461033	-0.9077502889160302	-0.3852673814793952	-0.518276822214671	-0.5767336694805629	-0.5356845628738469	-0.3825606879059253	-0.6245109823583315	-0.31729389228393123	-0.4513299332894616	-0.5764521412253046	-0.6492798024547576	-0.6045280164684166	-0.5441390150792196	-0.16802194910346102	0.4144680957017469	0.11104344108399555	0.23437766378779468	0.27028380326278656	0.4144479587636339	0.19166911075999404	0.4491696396678072	0.19395622619532638	-0.0167995817719524	0.24384925743391128	0.008130494221023299	0.19554784666688388	NA__no_active_tile	0.104229562843	0.116187990183	0.476688253492	0.119339994516	0.0134887989876	0.162586850726	0.0103298859694	0.444064484515	0.935789553219	0.375508523987	0.609889042629	0.00891666640591	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.flip.sense__chr22:41047707..41047821,-__2256.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr22:41047707..41047821,-__2256.1.0.0	rs7293100,rs7284768	-0.7397283398125691	-0.7997354771811421	-0.6293202632986665	-0.8111113332683576	-0.8059683661366335	-0.7970086466695592	-0.8161800931183255	-0.7664635319517384	-0.645286159484788	-0.5596525594533522	-0.8931290598886689	-0.6126585106894399	-0.7396868617461033	-0.38541092910177555	-0.4346217085089852	-0.6065941515284035	-0.4144151471359727	-0.4917228493090178	-0.5231454517422649	-0.4759874246786288	-0.35904385359895863	-0.7134246593062579	-0.3982405734279351	-0.27206842537101195	-0.6432846992674279	-0.47649665608138675	0.3543174107107936	0.36511376867215695	0.02272611177026307	0.3966961861323849	0.3142455168276157	0.2738631949272943	0.3401926684396967	0.4074196783527798	-0.06813849982146991	0.16141198602541712	0.6210606345176569	-0.030626188577988045	0.26319020566471674	0.0220586796764	0.248193451531	0.861430881609	0.143314270352	0.0440018610392	0.183752894264	0.248198866138	0.375513989452	0.946473618223	0.375513989452	0.0249397487324	0.354199901149	0.0173297566933	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr22:50976713..50976827,-__2259.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr22:50976713..50976827,-__2259.1.0.0	rs131788	-1.0030818957867598	-1.2566393088358772	-1.4417114400846105	-1.294602105935681	-0.9765281023818214	-1.5508889138290811	-1.0545292386679543	-0.948786157330594	-1.049022068255386	-0.9078961384570827	-1.0394671765569825	-1.0786725590511645	-1.1334854254310829	-1.0542128793213728	-0.5963894450639502	-1.180570789429597	-0.7715731913513104	-0.7251089944495461	-0.922043187846553	-1.0022082751834724	-0.8981114104465494	-1.181896257824	-0.8548197863381449	-0.9339404502468	-0.7041627645139114	-0.9020864526679341	-0.051130983534612984	0.660249863771927	0.2611406506550136	0.5230289145843705	0.2514191079322753	0.6288457259825281	0.0523209634844819	0.05067474688404461	-0.13287418956861408	0.0530763521189378	0.10552672631018256	0.3745097945372532	0.23139897276314894	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr22:50976713..50976827,-__2259.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr22:50976713..50976827,-__2259.1.0.0	rs112188865	-1.0030818957867598	-1.2566393088358772	-1.4417114400846105	-1.294602105935681	-0.9765281023818214	-1.5508889138290811	-1.0545292386679543	-0.948786157330594	-1.049022068255386	-0.9078961384570827	-1.0394671765569825	-1.0786725590511645	-1.1334854254310829	-0.932699600669399	-1.2903144441648358	-1.0025870746025376	-1.5323688839493435	-0.8762863826225327	-1.1224613972633082	-0.951677262136907	-0.6908309392341394	-0.8780210273883974	-0.6071983399939648	-1.4066583849276781	-1.1974330328284317	-1.0407113974817894	0.07038229511736072	-0.033675135328958605	0.4391243654820729	-0.23776677801366253	0.10024171975928875	0.42842751656577294	0.10285197653104738	0.2579552180964546	0.17100104086698853	0.30069779846311795	-0.36719120837069563	-0.11876047377726717	0.09277402794929329	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.13967914143	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.13967914143	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr22:50976713..50976827,-__2259.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr22:50976713..50976827,-__2259.1.0.0	rs131788,rs112188865	-1.0030818957867598	-1.2566393088358772	-1.4417114400846105	-1.294602105935681	-0.9765281023818214	-1.5508889138290811	-1.0545292386679543	-0.948786157330594	-1.049022068255386	-0.9078961384570827	-1.0394671765569825	-1.0786725590511645	-1.1334854254310829	-0.6848942819778302	-0.8454230610474356	-0.7097013681565286	-1.017951502639698	-0.9948483596276878	-1.0152826646546829	-0.8017164117653207	-0.6210428442571259	-0.8255870100804974	-0.7875992159560318	-0.7180452177756051	-0.9460211363909048	-0.8306760895274458	0.31818761380892957	0.41121624778844157	0.7320100719280819	0.276650603295983	-0.01832025724586639	0.5356062491743983	0.2528128269026336	0.32774331307346816	0.2234350581748885	0.12029692250105095	0.32142195878137736	0.13265142266025975	0.3028093359036372	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.248198866138	NA__no_active_tile	0.0986283746992	NA__no_active_tile	0.0818552650212	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr3:46446676..46446790,-__2261.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr3:46446676..46446790,-__2261.1.0.0	rs11574428	-1.7022973328780409	-2.380896861360176	-2.157130882989951	-1.6023736559027912	-1.6708217694930143	-1.778851551318536	-1.2866308208788233	-1.813644962604854	-1.5817917685260068	-1.7452190840346342	-1.945863101377407	-1.7516271408402508	-1.7847624110170406	-2.082100882254274	-1.713481630874094	-1.9148926569105469	-2.27190061379337	-2.473270032618002	-1.6363486120595347	-1.8192982682234224	-1.9414034062259384	-1.8382729291719282	-2.2085568318551596	-2.3384963161148233	-2.060815176433581	-2.0249031130445565	-0.3798035493762333	0.6674152304860819	0.24223822607940404	-0.6695269578905787	-0.8024482631249876	0.14250293925900115	-0.5326674473445991	-0.12775844362108435	-0.2564811606459214	-0.4633377478205254	-0.3926332147374163	-0.3091880355933301	-0.24014070202751578	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr5:40410488..40410602,-__2262.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr5:40410488..40410602,-__2262.1.0.0	rs11742570	-2.3043566412588583	-1.7514596782871836	-2.1142486975621555	-1.8199626479363444	-2.019611462751343	-1.8175734565799508	-1.9183284627354547	-1.550977211292741	-1.55032294463829	-2.1025957607685233	-1.7692106264878489	-2.075904553893165	-1.899546012015988	-1.534143896747311	-1.4671227327463812	-1.9373861297758856	-2.019194114502976	-1.7957729303417973	-1.8281538561539463	-1.7586665985009695	-1.5307213794771102	-1.6008815699085504	-1.6592061842999026	-1.772675483699851	-1.8604845656989335	-1.730367453487801	0.7702127445115472	0.28433694554080247	0.17686256778626985	-0.1992314665666317	0.22383853240954554	-0.01058039957399548	0.15966186423448514	0.02025583181563073	-0.05055862527026034	0.44338957646862065	-0.0034648572120021814	0.21541998819423158	0.16917855852818695	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr5:40487152..40487266,-__2263.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr5:40487152..40487266,-__2263.1.0.0	rs79418419	-1.4067870227117265	-1.2303095367347858	-1.42838527251955	-1.4568720553201329	-1.2789252942895006	-1.1235047649012473	-1.2663651189877605	-1.3534321632598054	-1.4137612726772963	-1.3150311476968102	-1.241648100022076	-1.3638725589535756	-1.3232411923395224	-1.6806867856198977	-1.32341564106814	-1.2647897297087471	-1.6332562034069857	-1.4360853609781221	-1.0831210914959448	-1.2062850346746996	-1.5029849650842326	-1.2635548772161396	-1.4574599449665149	-1.1544501781944243	-1.3054663697380728	-1.3592963485126601	-0.2738997629081712	-0.09310610433335409	0.1635955428108029	-0.17638414808685288	-0.15716006668862148	0.04038367340530247	0.06008008431306089	-0.1495528018244272	0.15020639546115677	-0.1424287972697047	0.08719792182765174	0.05840618921550278	-0.036055156173137835	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr6:11299464..11299578,-__2264.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr6:11299464..11299578,-__2264.1.0.0	rs7770716	0.3378883006613566	0.4828692110609527	0.32662383482568214	0.3520389019480007	0.19696369589864837	0.5131496201775915	0.5117345673666711	0.5044892294939446	0.5816446659760031	0.6884411105871009	0.5626375081816124	0.5239357757616039	0.4652013684949307	0.311290134779558	0.60417098715702	0.46632317804601764	0.44742559562523276	0.5403323089154446	0.561480751044107	0.5059213955325206	0.6807010381549782	0.48273697463299486	0.394951908478288	0.688173652108909	0.5737804823183069	0.5214407005661148	-0.026598165881798586	0.12130177609606729	0.1396993432203355	0.09538669367723207	0.3433686130167962	0.048331130866515526	-0.005813171834150532	0.1762118086610336	-0.0989076913430082	-0.2934892021088129	0.12553614392729662	0.04984470655670303	0.05623933207118414	0.88258056334	0.967868733231	0.777966336216	0.957167318493	0.0678362651725	0.840380101088	0.914457985151	0.216719559135	0.90381429355	0.29495293544	0.412754243182	0.925117039075	0.985840833123	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:160137774..160137888,-__2265.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:160137774..160137888,-__2265.1.0.0	rs73802631	-1.3349632115895775	-1.2729326379914754	-1.2232042947331838	-1.6613480174228195	-1.7661657570996907	-2.190566218157361	-1.8955391103293644	-2.014498541817727	-1.7999741773102478	-1.7725900409450048	-1.584290357682117	-1.1873667727002923	-1.6419532614815717	-1.3300887071350833	-1.4651688389213346	-1.571956434361223	-1.8536284937735992	-1.8939038122710048	-1.7346936807456734	-1.7615706571583674	-1.3982925352151816	-1.5803612872484558	-1.1935256794296316	-1.8216107186814074	-1.6973253253481868	-1.6085105141907625	0.004874504454494222	-0.19223620092985927	-0.3487521396280391	-0.19228047635077972	-0.1277380551713141	0.45587253741168765	0.13396845317099704	0.6162060066025452	0.21961289006179197	0.5790643615153732	-0.23732036099929044	-0.5099585526478945	0.03344274729080935	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:26126481..26126595,-__2266.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:26126481..26126595,-__2266.1.0.0	rs73393406	0.27876104734388274	0.3797494253011371	0.17823532854555946	0.29844201887179966	0.2756187846754089	0.15615489431592885	0.03241711801538092	0.06781706536863741	0.4317605618338835	0.4393837025326235	0.3178234971052144	0.19139064543775672	0.25396284077893444	0.17520154420690304	0.528281601750122	0.19830256840952706	0.29229406882965603	0.11937961477240597	0.32845830293013745	-0.10213721141001833	0.3249327431113501	0.13808577856760804	0.3997263080307265	0.2759668626357058	0.3230438678124573	0.2501280041372151	-0.1035595031369797	0.14853217644898487	0.020067239863967606	-0.006147950042143635	-0.15623916990300293	0.1723034086142086	-0.13455432942539924	0.2571156777427127	-0.2936747832662755	-0.03965739450189698	-0.0418566344695086	0.1316532223747006	-0.0038348366417193525	0.87199428352	0.368322877114	0.696989544957	0.8931878581	0.76769033028	0.412754243182	0.460214637573	0.493479697885	0.136115392203	0.829896383209	0.628827692687	0.166665831608	0.734547463384	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:26126481..26126595,-__2266.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:26126481..26126595,-__2266.1.0.0	rs198817	0.27876104734388274	0.3797494253011371	0.17823532854555946	0.29844201887179966	0.2756187846754089	0.15615489431592885	0.03241711801538092	0.06781706536863741	0.4317605618338835	0.4393837025326235	0.3178234971052144	0.19139064543775672	0.25396284077893444	-0.05116905611663943	0.3678651895079998	0.12806798369450084	0.4119823169429495	0.31349453558846524	0.34482035461799193	0.16978550967580966	0.2936140843504928	0.5427489284174358	0.3814907706080948	0.3283102813432528	0.5486565243815749	0.314972285250994	-0.32993010346052215	-0.011884235793137299	-0.050167344851058615	0.11354029807114985	0.03787575091305634	0.18866546030206308	0.13736839166042875	0.2257970189818554	0.11098836658355232	-0.05789293192452871	0.010486784238038394	0.3572658789438181	0.06100944447205962	0.914457985151	0.497721583794	0.648013768535	0.777966336216	0.150801701171	0.0499532058383	0.188220673538	0.259370210024	0.175053819161	0.978575937473	0.519249062249	0.0386605553759	0.250861848673	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr6:26126481..26126595,-__2266.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:26126481..26126595,-__2266.1.0.0	rs73393406,rs198817	0.27876104734388274	0.3797494253011371	0.17823532854555946	0.29844201887179966	0.2756187846754089	0.15615489431592885	0.03241711801538092	0.06781706536863741	0.4317605618338835	0.4393837025326235	0.3178234971052144	0.19139064543775672	0.25396284077893444	0.17882438402152878	0.09180643277605888	0.14563198788304374	0.048180327265434336	0.0770694123767176	0.1147233748243793	0.028923157274506728	0.18506262101140816	0.28434618953187785	0.15800089803099754	0.17703671125315168	0.10692456632140512	0.1330441718808758	-0.09993666332235396	-0.2879429925250782	-0.03260334066251572	-0.25026169160636536	-0.1985493722986913	-0.04143151949154955	-0.0034939607408741927	0.11724555564277075	-0.14741437230200566	-0.28138280450162595	-0.14078678585206272	-0.0844660791163516	-0.12091866889805862	0.90381429355	0.259370210024	0.967868733231	0.136115392203	0.90381429355	0.840380101088	0.978575937473	0.696989544957	0.510582765025	0.375513989452	0.282745459933	0.563691144959	0.945315916284	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:30720242..30720356,-__2268.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30720242..30720356,-__2268.1.0.0	rs28780111	-1.4613836193680592	-1.4096959347282176	-1.1443205265200866	-1.3281381533885768	-1.5521835617214603	-1.1172920198973484	-1.2118294778074208	-1.1081649660230817	-1.3454645270995513	-1.4157203609429387	-1.3434633991831586	-1.4114514680312746	-1.3207590012259312	-1.5407907055418661	-1.7452377423391	-1.4294998735205284	-1.680049144938644	-1.4873026541455563	-1.310760091552676	-1.5008753517053384	-1.8056232591171977	-1.5377332242281017	-1.395023191107031	-1.2430805956119775	-1.680093010599102	-1.5296724037005933	-0.07940708617380698	-0.33554180761088226	-0.2851793470004418	-0.35191099155006733	0.06488090757590403	-0.19346807165532764	-0.2890458738979176	-0.697458293094116	-0.19226869712855033	0.020697169835907747	0.10038280357118112	-0.26864154256782746	-0.20891340247466209	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:30731366..30731480,-__2269.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30731366..30731480,-__2269.1.0.0	rs3095338	1.2496478932234125	1.2731378712909116	1.0331231069134743	1.1506003777441363	1.4143289283734934	1.4652018621777465	1.6060155781314587	1.702825306618565	1.6208662329500112	1.5499589171139245	1.6682757676812923	1.6287262281872854	1.446892339200476	1.1624411271350108	1.6568569159228372	1.227424111351086	1.2600556900393414	1.5324537827633335	1.4125124498853705	1.8388581334294896	1.672070769448385	1.7294457423679102	1.6317342434752964	1.4841069420207234	1.5984907090469127	1.5172042180738081	-0.08720676608840172	0.38371904463192563	0.19430100443761167	0.10945531229520511	0.1181248543898401	-0.052689412292376	0.23284255529803088	-0.030754537170180063	0.10857950941789896	0.08177532636137186	-0.1841688256605689	-0.030235519140372702	0.07031187887333207	0.8931878581	0.253741740693	0.687084607526	0.8931878581	0.83513271997	0.978575937473	0.757455001208	0.716953652062	0.657696241675	0.914457985151	0.188220673538	0.809021331888	0.992025043989	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:30731366..30731480,-__2269.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30731366..30731480,-__2269.1.0.0	rs77580845	1.2496478932234125	1.2731378712909116	1.0331231069134743	1.1506003777441363	1.4143289283734934	1.4652018621777465	1.6060155781314587	1.702825306618565	1.6208662329500112	1.5499589171139245	1.6682757676812923	1.6287262281872854	1.446892339200476	0.5637408086205524	1.0401845879896636	0.7428281228605125	0.6667541031089921	0.6113442989775851	0.7059129301087836	1.027144843165292	1.1490074079532833	0.9053402886858446	0.9560722440016212	1.1168760337964398	0.9392454082617493	0.8687042564608599	-0.6859070846028601	-0.23295328330124798	-0.29029498405296184	-0.4838462746351442	-0.8029846293959083	-0.7592889320689629	-0.5788707349661666	-0.5538178986652817	-0.7155259442641666	-0.5938866731123034	-0.5513997338848524	-0.6894808199255361	-0.5781880827396161	0.000337013519112	0.0286240283844	0.00441948685714	0.00522462344006	1.35890743059e-05	0.000303956631358	9.33325531828e-05	0.000161276729747	0.000137117000352	2.79850783474e-05	5.12013208431e-07	0.000137117000352	1.43608625251e-33	0.238605571531	1	1	1	0.0104907653641	0.232222866358	0.0689727568021	0.117248182526	0.105991441272	0.0219682865027	0.000393738157283	0.106814143274	1.2034402796e-30	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr6:30731366..30731480,-__2269.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30731366..30731480,-__2269.1.0.0	rs3095338,rs77580845,rs111325731	1.2496478932234125	1.2731378712909116	1.0331231069134743	1.1506003777441363	1.4143289283734934	1.4652018621777465	1.6060155781314587	1.702825306618565	1.6208662329500112	1.5499589171139245	1.6682757676812923	1.6287262281872854	1.446892339200476	0.7545202345794089	1.0091921162203308	0.7718713474530756	0.8153035753352733	0.8333322333197697	0.9793915796752457	1.1025663482986197	0.9502856788666065	1.2199437519449936	1.1941132406799135	1.1360655246186013	1.1802285188034631	0.9955678458162751	-0.49512765864400365	-0.2639457550705808	-0.2612517594603987	-0.33529680240886295	-0.5809966950537238	-0.4858102825025008	-0.503449229832839	-0.7525396277519585	-0.4009224810050176	-0.355845676434011	-0.5322102430626909	-0.4484977093838223	-0.45132449338420083	0.00641629102443	0.0194743211566	0.0267271087754	0.0531733827136	0.00192430688789	0.000911503005752	0.00127069654712	0.000116396943443	0.00784715402968	0.00078853414695	2.63751008552e-05	0.00357181666747	5.91406428831e-22	1	1	1	1	0.394482912018	0.183212104156	0.254139309423	0.0226974039714	1	0.164015102566	0.00540689567531	0.735794233499	1.34249259345e-19	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:30737487..30737601,-__2270.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30737487..30737601,-__2270.1.0.0	rs13217914	2.8389908661541385	3.3655302185906137	2.592421227679053	2.5752159592033497	2.8241149866288024	2.861391954407228	2.3375345703636854	2.4774400387942848	2.7482292389914678	2.830963759138431	2.7578357491164756	2.8163487913545806	2.7521681133685085	1.9472575616984535	2.4468200234310613	1.8803154229858332	1.995666389990832	1.962392087371993	2.113254941317715	1.5935448222323043	1.6519620819138652	2.1601622199155566	2.000447414623499	1.9038017238765235	2.111054679422433	1.9805566140650057	-0.891733304455685	-0.9187101951595524	-0.7121058046932196	-0.5795495692125177	-0.8617228992568093	-0.7481370130895133	-0.7439897481313811	-0.8254779568804196	-0.5880670190759112	-0.830516344514932	-0.8540340252399521	-0.7052941119321474	-0.7716114993035035	5.66746118355e-06	1.22116804654e-07	3.14895644184e-05	0.000152810281165	1.99366201481e-08	6.74946443676e-08	5.95166561664e-05	1.43307835393e-06	4.67965309508e-06	8.31753679404e-07	8.9082802627e-07	1.1701294631e-06	2.02877393192e-57	0.00401256251795	9.08549026622e-05	0.0234597254917	0.112621177218	1.53910707544e-05	5.15659082968e-05	0.0439828089069	0.00104184796331	0.0036173718425	0.000652926638332	0.000685046752202	0.000911530851758	1.70011255495e-54	sig	sig	sig	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:30737487..30737601,-__2270.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30737487..30737601,-__2270.1.0.0	rs3095337	2.8389908661541385	3.3655302185906137	2.592421227679053	2.5752159592033497	2.8241149866288024	2.861391954407228	2.3375345703636854	2.4774400387942848	2.7482292389914678	2.830963759138431	2.7578357491164756	2.8163487913545806	2.7521681133685085	2.5659987708668757	2.8862101999540117	2.3842435211256303	2.3878090057320485	2.5823813592820763	2.647280049422034	2.0869009009442983	2.374729808346858	2.7200292548288263	2.609807462769611	2.5392422117972324	2.4629994044962524	2.520635995797146	-0.27299209528726287	-0.479320018636602	-0.2081777065534225	-0.1874069534713012	-0.2417336273467261	-0.21411190498519428	-0.25063366941938714	-0.10271023044742655	-0.028199984162641467	-0.22115629636881984	-0.21859353731924314	-0.3533493868583282	-0.23153211757136294	0.0374126139833	0.00406065558642	0.0515422504639	0.0959193233604	0.0240855495486	0.0440018610392	0.13967914143	0.29495293544	0.436112310787	0.0276615481105	0.0619890035232	0.0224529881577	6.49079781134e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	5.4392885659e-05	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr6:30737487..30737601,-__2270.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:30737487..30737601,-__2270.1.0.0	rs13217914,rs3095337	2.8389908661541385	3.3655302185906137	2.592421227679053	2.5752159592033497	2.8241149866288024	2.861391954407228	2.3375345703636854	2.4774400387942848	2.7482292389914678	2.830963759138431	2.7578357491164756	2.8163487913545806	2.7521681133685085	2.0788026396973223	2.1048160677148067	2.049848449578354	1.8289872653216332	2.0440433237965223	1.857039010429486	1.6647532784961752	1.3988363526811218	1.9778048686533067	1.9294361090843326	1.9286688009522335	2.0700086172448025	1.9110870653041747	-0.7601882264568163	-1.260714150875807	-0.5425727781006988	-0.7462286938817164	-0.7800716628322801	-1.004352943977742	-0.6727812918675102	-1.078603686113163	-0.770424370338161	-0.9015276500540983	-0.8291669481642421	-0.7463401741097782	-0.8410810480643347	2.71471868483e-08	4.29483083715e-08	6.04095401414e-06	1.20184897547e-05	4.07565079322e-09	2.71058914141e-09	8.27992768152e-06	8.44119998598e-08	7.83613533137e-08	3.46395922999e-09	1.5208503355e-07	4.1480046148e-07	4.51253068782e-71	5.26655424857e-06	8.67555829103e-06	0.00120214984881	0.00227149456363	8.35508412611e-07	5.44828417424e-07	0.0016559855363	1.64603399727e-05	1.61424387826e-05	7.20503519837e-07	3.11774318778e-05	8.54488950648e-05	1.02434446613e-68	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.0.0	rs9270891	-0.2627312351348872	0.17875003086880625	0.003608419522120803	0.003925775890384499	0.014120409191423933	0.11148437897505555	0.12515624743341375	-0.005995103791373626	0.2529718344206337	0.1368608387820466	0.3170083389702336	0.048849231378747554	0.07700076387555045	-0.3817502484377576	-0.020913486035271798	0.18580712115596884	-0.1862097991335932	0.024485954296604585	0.03605028098849613	0.027054858495022812	0.16100757696915163	-0.16940045291464903	0.1213764861822495	0.14605092390834193	-0.09581289712291338	-0.012687806804029136	-0.1190190133028704	-0.19966351690407805	0.18219870163384805	-0.1901355750239777	0.010365545105180653	-0.07543409798655942	-0.09810138893839093	0.16700268076052527	-0.42237228733528276	-0.015484352599797108	-0.1709574150618917	-0.14466212850166094	-0.08968857067957958	0.347268461228	0.361218104761	0.468411351413	0.88258056334	0.935788819786	0.706946403854	0.727009731456	0.0719809426143	0.0426112802219	0.809021331888	0.510582765025	0.248198866138	0.507801986415	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.0.0	rs28383183	-0.2627312351348872	0.17875003086880625	0.003608419522120803	0.003925775890384499	0.014120409191423933	0.11148437897505555	0.12515624743341375	-0.005995103791373626	0.2529718344206337	0.1368608387820466	0.3170083389702336	0.048849231378747554	0.07700076387555045	0.061784115342159274	0.16942840702933273	0.15381680137797407	0.0814399899139138	0.12733183292089478	0.5550179209828613	0.17910771785540022	-0.023401173540334008	0.28017827678588736	0.5582383888185117	0.05994074545759478	0.10884692687080644	0.19264416248458358	0.3245153504770465	-0.00932162383947352	0.15020838185585328	0.0775142140235293	0.11321142372947085	0.44353354200780576	0.053951470421986475	-0.017406069748960383	0.027206442365253658	0.42137755003646515	-0.25706759351263886	0.05999769549205888	0.11564339860903311	0.368322877114	0.48504462162	0.253741740693	0.0698833862508	0.368322877114	0.0499532058383	0.221756412245	0.354199901149	0.510582765025	0.0548474154937	0.563691144959	0.452098798395	0.0192603266351	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.0.0	rs9270892	-0.2627312351348872	0.17875003086880625	0.003608419522120803	0.003925775890384499	0.014120409191423933	0.11148437897505555	0.12515624743341375	-0.005995103791373626	0.2529718344206337	0.1368608387820466	0.3170083389702336	0.048849231378747554	0.07700076387555045	-0.3487191913954964	-0.027470983120694886	-0.1698979574208345	-0.1520291156212395	-0.11050517152503322	0.029221179970009267	-0.1026453900508232	0.02552295368899319	0.0023816140082789754	-0.03722487039703716	0.07594091092882324	0.06464346377669264	-0.06256521309653014	-0.08598795626060918	-0.20622101398950113	-0.1735063769429553	-0.155954891511624	-0.12462558071645716	-0.08226319900504628	-0.22780163748423693	0.03151805748036682	-0.25059022041235474	-0.17408570917908378	-0.24106742804141038	0.015794232397945085	-0.1395659769720806	0.79863356553	0.221756412245	0.270885072145	0.591208103411	0.116187990183	0.63839046467	0.687084607526	0.390154148302	0.259370210024	0.282745459933	0.265084565602	0.978575937473	0.412837228362	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.0.0	rs9469192	-0.2627312351348872	0.17875003086880625	0.003608419522120803	0.003925775890384499	0.014120409191423933	0.11148437897505555	0.12515624743341375	-0.005995103791373626	0.2529718344206337	0.1368608387820466	0.3170083389702336	0.048849231378747554	0.07700076387555045	-0.5520385501205776	-0.23605464751628932	-0.12687814449788595	-0.06226326456005864	-0.01204500413577328	0.10401836003780487	-0.029583340085371387	-0.1166756997728267	0.08466051743694798	0.1298942196934233	0.08250076495547731	-0.13400946659641502	-0.07237285459679536	-0.28930731498569034	-0.4148046783850956	-0.13048656402000675	-0.06618904045044313	-0.026165413327197212	-0.007466018937250671	-0.15473958751878514	-0.11068059598145308	-0.16831131698368573	-0.00696661908862331	-0.2345075740147563	-0.18285869797516258	-0.14937361847234584	0.110080523892	0.375513989452	0.48504462162	0.545696106059	0.87199428352	0.989287003123	0.85089220831	0.8931878581	0.368322877114	0.501992688725	0.536806685117	0.510582765025	0.878343303924	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.5.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.0.0	rs4380799	-0.2627312351348872	0.17875003086880625	0.003608419522120803	0.003925775890384499	0.014120409191423933	0.11148437897505555	0.12515624743341375	-0.005995103791373626	0.2529718344206337	0.1368608387820466	0.3170083389702336	0.048849231378747554	0.07700076387555045	-0.11805820269276507	0.29449059402600497	0.04397527407966195	0.10714013484911646	0.2585006597383073	0.250150700967018	0.4215002926687532	0.2867992337040985	0.15514056180812055	0.15031841379513816	0.2316502384032721	0.27509836004069305	0.1963921884489516	0.14467303244212215	0.11574056315719872	0.040366854557541146	0.10321435895873196	0.2443802505468834	0.1386663219919625	0.29634404523533947	0.2927943374954721	-0.09783127261251315	0.013457575013091555	-0.08535810056696153	0.2262491286619455	0.11939142457340117	0.13967914143	0.687084607526	0.696989544957	0.119339994516	0.0440018610392	0.116187990183	0.0140036728837	0.00300328973882	0.657696241675	0.581967350665	0.527990680582	0.0808926541269	0.00229831137357	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.6.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.0.0	rs9270894	-0.2627312351348872	0.17875003086880625	0.003608419522120803	0.003925775890384499	0.014120409191423933	0.11148437897505555	0.12515624743341375	-0.005995103791373626	0.2529718344206337	0.1368608387820466	0.3170083389702336	0.048849231378747554	0.07700076387555045	-0.44640910541493	-0.45998840797344953	-0.2503525964179285	-0.6543257262169192	-0.4752962315623652	-0.5453181632561918	-0.5113086978194794	-0.30815866545150405	-0.2404364011973204	-0.4581462611552622	-0.19316704281325767	-0.145894421633241	-0.3907334767426542	-0.1836778702800428	-0.6387384388422558	-0.25396101594004933	-0.6582515021073037	-0.48941664075378916	-0.6568025422312473	-0.6364649452528932	-0.3021635616601304	-0.4934082356179541	-0.5950070999373088	-0.5101753817834913	-0.19474365301198857	-0.46773424061820457	0.326996172605	0.00210630874131	0.221756412245	0.0168468410067	0.00300328973882	0.0808926541269	0.0945835346132	0.361218104761	0.0240855495486	0.000648445766563	0.0145358169752	0.104229562843	1.25769079772e-09	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.509029926752	1	1	1.05394488849e-06	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.7.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.0.0	rs9270895	-0.2627312351348872	0.17875003086880625	0.003608419522120803	0.003925775890384499	0.014120409191423933	0.11148437897505555	0.12515624743341375	-0.005995103791373626	0.2529718344206337	0.1368608387820466	0.3170083389702336	0.048849231378747554	0.07700076387555045	-0.9267178816316219	-0.6080688779375711	-0.8437284782727759	-0.6873794349785223	-0.5781600629063561	-0.6101587421637921	-0.6572373396681741	-0.752499186720482	-0.7119441235003814	-0.45397257260715584	-0.870922277120305	-0.5611384764670153	-0.688493954497846	-0.6639866464967348	-0.7868189088063774	-0.8473368977948966	-0.6913052108689067	-0.5922804720977801	-0.7216431211388477	-0.7823935871015879	-0.7465040829291084	-0.9649159579210151	-0.5908334113892024	-1.1879306160905387	-0.6099877078457628	-0.7654947183733966	5.9493467545e-05	7.05457685779e-05	0.000110173251151	0.0426112802219	0.000413457613232	0.000288590960955	2.96882111052e-05	0.00127069654712	5.38827834679e-08	0.000116396943443	1.1701294631e-06	0.000303908161958	2.56353226493e-37	0.0421213750219	0.0524860518219	0.0820790721079	1	0.319189277415	0.22048349417	0.0219395880068	0.923796389754	4.16513916207e-05	0.0913716006028	0.000899829557127	0.236744458165	2.14824003801e-34	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig	sig	not sig	sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.8.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.0.0	rs9270896	-0.2627312351348872	0.17875003086880625	0.003608419522120803	0.003925775890384499	0.014120409191423933	0.11148437897505555	0.12515624743341375	-0.005995103791373626	0.2529718344206337	0.1368608387820466	0.3170083389702336	0.048849231378747554	0.07700076387555045	-0.4460295705158934	0.04101277568523633	-0.2710938178226196	-0.22860462639134727	-0.01774282406908467	0.0542629834676914	-0.02010603723461485	-0.01556517894428939	0.11328406184988951	0.0764040314626289	0.2312746231596241	0.09868660762028267	-0.03201808097770803	-0.1832983353810062	-0.13773725518356994	-0.2747022373447404	-0.23253040228173177	-0.031863233260508605	-0.057221395507364145	-0.1452622846680286	-0.009570075152915764	-0.1396877725707442	-0.0604568073194177	-0.08573371581060951	0.049837376241535114	-0.10901884485325845	0.452098798395	0.48504462162	0.226871263542	0.925117039075	0.914457985151	0.554657938956	0.85089220831	0.60051573606	0.727009731456	0.554657938956	0.777966336216	0.563691144959	0.92559706521	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.9.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.0.0	rs9270897	-0.2627312351348872	0.17875003086880625	0.003608419522120803	0.003925775890384499	0.014120409191423933	0.11148437897505555	0.12515624743341375	-0.005995103791373626	0.2529718344206337	0.1368608387820466	0.3170083389702336	0.048849231378747554	0.07700076387555045	0.8092529575770527	1.0686871169781644	0.994382074690298	0.9630690376801702	1.124922454860429	1.306041738676475	1.2328260174059185	0.9964416996380682	1.0970921097532549	1.2179843575020577	1.2520261509668502	1.1294476182088098	1.099347777828129	1.07198419271194	0.8899370861093582	0.9907736551681773	0.9591432617897857	1.110802045669005	1.1945573597014196	1.1076697699725047	1.0024368034294417	0.8441202753326211	1.081123518720011	0.9350178119966166	1.0805983868300622	1.0223470139525783	1.2780782346e-05	7.76461476868e-07	9.98335414644e-06	3.38768884882e-06	9.09364429293e-09	3.30166096949e-10	6.55420316999e-10	1.39854909491e-09	1.06544395451e-08	7.13508168948e-10	3.19261187764e-09	8.39899322416e-09	3.89873683426e-78	0.00904879390093	0.00057768733879	0.0074375988391	0.00249672668158	7.02029339414e-06	2.52246898069e-07	4.84355614262e-07	1.016745192e-06	8.23588176837e-06	5.60103912624e-07	2.4551185339e-06	6.54281572162e-06	3.26714146711e-75	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.10.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.0.0	rs4566915	-0.2627312351348872	0.17875003086880625	0.003608419522120803	0.003925775890384499	0.014120409191423933	0.11148437897505555	0.12515624743341375	-0.005995103791373626	0.2529718344206337	0.1368608387820466	0.3170083389702336	0.048849231378747554	0.07700076387555045	-0.2920428935928306	-0.07442026709142452	0.1735608834847761	-0.09848434851450064	-0.1204673523722081	0.11155646525674157	0.23152486176716713	0.4015131582580394	0.12445673899266912	0.021433224256046508	0.17941646004132925	0.12292605903001383	0.06508108245965159	-0.029311658457943368	-0.2531702979602308	0.16995246396265531	-0.10241012440488513	-0.13458776156363203	7.208628168602071e-05	0.10636861433375339	0.40750826204941304	-0.12851509542796458	-0.1154276145260001	-0.13759187892890437	0.07407682765126627	-0.011919681415898858	0.64319083408	0.320413072024	0.444064484515	0.468411351413	0.978575937473	0.428242856315	0.265084565602	0.0072436377838	0.757455001208	0.747262025795	0.563691144959	0.420456664513	0.474199141107	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.11.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.0.0	rs9270898	-0.2627312351348872	0.17875003086880625	0.003608419522120803	0.003925775890384499	0.014120409191423933	0.11148437897505555	0.12515624743341375	-0.005995103791373626	0.2529718344206337	0.1368608387820466	0.3170083389702336	0.048849231378747554	0.07700076387555045	2.0923023723554945	2.448956524553704	2.1296116184817073	1.9443401734082137	2.136504744317704	2.3639306688304753	2.281316566941718	2.508918613940578	2.3322954292293283	2.388711321361937	2.33956405491452	2.445037101514657	2.2842907658208365	2.3550336074903817	2.270206493684898	2.1260031989595864	1.9404143975178292	2.12238433512628	2.2524462898554196	2.156160319508304	2.5149137177319516	2.0793235948086948	2.2518504825798904	2.022555715944286	2.3961878701359094	2.2072900019452857	8.4513782373e-10	1.64454151912e-10	5.17270678372e-11	3.75770817515e-09	2.74073014017e-11	1.05773099098e-10	1.5791721093e-11	1.31220928624e-11	8.85463967688e-11	1.19584464128e-11	1.5791721093e-11	5.66002570384e-11	1.61526856558e-109	5.98357579201e-07	1.22353889022e-07	3.85366655387e-08	2.76943092509e-06	2.11584366821e-08	8.08106477106e-08	1.16700818877e-08	9.53976151096e-09	6.84463647023e-08	9.38738043409e-09	1.21438335205e-08	4.40916002329e-08	1.35359505795e-106	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.11.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32571807..32571921,-__2272.1.0.0	rs28383182,rs9270891,rs28383183,rs9270892,rs9469192,rs4380799,rs9270894,rs9270895,rs9270896,rs9270897,rs4566915,rs9270898	-0.2627312351348872	0.17875003086880625	0.003608419522120803	0.003925775890384499	0.014120409191423933	0.11148437897505555	0.12515624743341375	-0.005995103791373626	0.2529718344206337	0.1368608387820466	0.3170083389702336	0.048849231378747554	0.07700076387555045	1.4752773583098662	1.9626781898585148	1.6161299425087152	1.617711857720599	1.6873848546200956	1.7849691206198308	1.7618628117704767	2.126332553296012	1.7549418766107785	1.8729729835889344	1.878095373792132	2.007330638508828	1.795473963433732	1.7380085934447533	1.7839281589897085	1.6125215229865943	1.6137860818302143	1.6732644454286716	1.6734847416447753	1.6367065643370629	2.1323276570873855	1.5019700421901447	1.7361121448068877	1.5610870348218984	1.9584814071300805	1.7184731995581812	1.50613596217e-10	1.05773099098e-10	1.2865021608e-09	2.33346554357e-10	2.08206006271e-11	2.74073014017e-11	2.50122068192e-11	6.82483302974e-12	1.73191865036e-11	6.82483302974e-12	3.00264373047e-11	1.08960636655e-11	1.98199731817e-112	2.9219037666e-08	2.13661660177e-08	2.5601393e-07	4.41024987734e-08	4.26822312855e-09	5.50886758175e-09	5.00244136385e-09	1.3308424408e-09	3.56775241974e-09	1.41956527019e-09	6.15541964746e-09	2.2445891151e-09	4.49913391225e-110	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577663..32577777,-__2273.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577663..32577777,-__2273.1.0.0	rs17840121	0.8320760000747582	0.9751504234686376	0.7834667322956208	0.6844804469900541	0.9115377297257603	0.9106369979160717	0.8019416443239873	1.0737003297511547	0.8744988935794159	1.1048642338476011	0.9652483834078458	0.9060526027850904	0.9019712015138333	0.676205489481184	1.048979296359652	0.6763170843660317	0.5663267607517135	0.9320782540809496	0.8525369080374108	0.8485227055261663	1.0973800950914194	1.0484561712104399	1.128370739500435	0.9615607379148291	1.1197910922205834	0.9130437778784012	-0.15587051059357426	0.07382887289101447	-0.10714964792958914	-0.11815368623834055	0.02054052435518927	-0.05810008987866089	0.046581061202178975	0.023679765340264725	0.17395727763102398	0.023506505652833853	-0.0036876454930167	0.213738489435493	0.011072576364568062	0.989287003123	0.420456664513	0.840380101088	0.648013768535	0.809021331888	0.677233097055	0.914457985151	0.747262025795	0.79863356553	0.914457985151	0.757455001208	0.226876581559	0.99530866023	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577663..32577777,-__2273.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577663..32577777,-__2273.1.0.0	rs35406945	0.8320760000747582	0.9751504234686376	0.7834667322956208	0.6844804469900541	0.9115377297257603	0.9106369979160717	0.8019416443239873	1.0737003297511547	0.8744988935794159	1.1048642338476011	0.9652483834078458	0.9060526027850904	0.9019712015138333	1.0591042208621382	1.4751746716792968	1.0854647673750095	0.9711144723526277	1.037422137336106	1.2059467541627313	1.275710855238173	1.3514909994881181	1.313516497960095	1.1645638836373775	1.4523831790677741	1.420148459859075	1.2343367415848767	0.22702822078737994	0.5000242482106593	0.3019980350793887	0.28663402536257365	0.1258844076103458	0.29530975624665967	0.4737692109141858	0.2777906697369634	0.43901760438067916	0.05969964978977638	0.48713479565992834	0.5140958570739846	0.33236554007104374	0.0719809426143	0.00300328973882	0.0808926541269	0.088148079887	0.368322877114	0.0276615481105	0.0232568344756	0.0426112802219	0.0719809426143	0.192768091005	0.00641629102443	0.0531733827136	1.15003582101e-08	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	9.63730018003e-06	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577663..32577777,-__2273.1.3.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577663..32577777,-__2273.1.0.0	rs9271161	0.8320760000747582	0.9751504234686376	0.7834667322956208	0.6844804469900541	0.9115377297257603	0.9106369979160717	0.8019416443239873	1.0737003297511547	0.8744988935794159	1.1048642338476011	0.9652483834078458	0.9060526027850904	0.9019712015138333	1.3691618380950143	1.5615606804387336	1.1718159680106726	0.9859726925706349	1.222958283646574	1.2496808057130075	1.2251743194843736	1.4346782481752935	1.3706491215968506	1.5007998624664753	1.5060562317091102	1.5018043428115142	1.3416926995598544	0.5370858380202561	0.5864102569700961	0.38834923571505175	0.30149224558058085	0.3114205539208137	0.3390438077969359	0.4232326751603863	0.36097791842413884	0.4961502280174347	0.3959356286188742	0.5408078483012644	0.5957517400264238	0.4397214980460215	5.62183900058e-05	0.000104264461287	0.00160288548718	0.0316863885398	0.00313710581496	0.00153065306427	0.00357181666747	0.00115660425805	0.000337013519112	0.000681115576796	8.82815218607e-05	0.000161276729747	5.82847423665e-28	0.0398026201241	0.0775727591976	1	1	1	1	1	0.840851295603	0.260511450273	0.534675727785	0.0678884903109	0.125634572473	4.88426141031e-25	sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577663..32577777,-__2273.1.4.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577663..32577777,-__2273.1.0.0	rs9271162	0.8320760000747582	0.9751504234686376	0.7834667322956208	0.6844804469900541	0.9115377297257603	0.9106369979160717	0.8019416443239873	1.0737003297511547	0.8744988935794159	1.1048642338476011	0.9652483834078458	0.9060526027850904	0.9019712015138333	0.9479648965155854	1.143545964601238	0.8935573961452031	0.8244420945271	0.8558898202511183	0.753199806300392	0.8001305917256877	1.0688013540562518	0.8722607618476284	0.8481155802975359	0.9501721306286929	0.9989029310934727	0.9130819439991589	0.11588889644082712	0.16839554113260047	0.11009066384958233	0.13996164753704599	-0.05564790947464204	-0.1574371916156797	-0.0018110525982996117	-0.004898975694902941	-0.0022381317317875515	-0.25674865355006526	-0.015076252779152921	0.09285032830838236	0.011110742485325684	0.460214637573	0.158583637061	0.405136064622	0.510582765025	0.519249062249	0.609889042629	0.375513989452	0.788281320858	0.85089220831	0.628827692687	0.476688253492	0.493479697885	0.590305186339	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577663..32577777,-__2273.1.5.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577663..32577777,-__2273.1.0.0	rs9271163	0.8320760000747582	0.9751504234686376	0.7834667322956208	0.6844804469900541	0.9115377297257603	0.9106369979160717	0.8019416443239873	1.0737003297511547	0.8744988935794159	1.1048642338476011	0.9652483834078458	0.9060526027850904	0.9019712015138333	1.127046949041223	1.124426342300395	0.9442119859748433	0.8503668671382959	0.9059100403687186	1.0340897013772528	0.9763125782144098	1.1644408778010984	1.1174462185528669	1.126441138636219	1.2609995666792395	1.1032646549338256	1.0612464100848658	0.2949709489664647	0.1492759188317575	0.16074525367922254	0.16588642014824184	-0.005627689357041721	0.12345270346118109	0.17437093389042246	0.09074054804994369	0.24294732497345095	0.021576904788617846	0.2957511832713937	0.19721205214873527	0.15927520857103247	0.132622250874	0.183752894264	0.326996172605	0.253741740693	0.840380101088	0.777966336216	0.563691144959	0.48504462162	0.226876581559	0.619326784864	0.0808926541269	0.188220673538	0.125827028724	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577663..32577777,-__2273.1.5.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr6:32577663..32577777,-__2273.1.0.0	rs17840121,rs35406945,rs9271161,rs9271162,rs9271163	0.8320760000747582	0.9751504234686376	0.7834667322956208	0.6844804469900541	0.9115377297257603	0.9106369979160717	0.8019416443239873	1.0737003297511547	0.8744988935794159	1.1048642338476011	0.9652483834078458	0.9060526027850904	0.9019712015138333	0.8490739238072755	0.9232875190701331	0.6480323987506305	0.6379742998822888	0.7736764508248499	0.85164673498355	0.6916973522544871	1.0040295848549214	0.8577405082033913	1.0229624735270648	0.9190742368297271	1.0556306385343643	0.852902176793557	0.016997923732517295	-0.051862904398504495	-0.13543433354499035	-0.04650614710776524	-0.13786127890091038	-0.05899026293252163	-0.11024429206950015	-0.06967074489623326	-0.016758385376024587	-0.08190176032053631	-0.04617414657811869	0.14957803574927397	-0.049069024720276154	0.609889042629	0.819442862795	0.452098798395	0.935789553219	0.468411351413	0.978575937473	0.29495293544	0.493479697885	0.696989544957	0.412754243182	0.967868733231	0.368322877114	0.952745002626	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:1894829..1894943,-__2275.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:1894829..1894943,-__2275.1.0.0	rs11768541	-0.526965115653568	-0.2543029982615541	-0.5930391980490103	-0.2879798064080352	-0.3143075419408844	-0.33325600429905666	-0.6625214398599298	-0.4983204088759831	-0.6142453623378992	-0.48792536065873937	-0.5330385128747036	-0.3759707035877961	-0.4568227044005966	-0.47081344488479593	-0.4144604667398064	-0.7443341751777808	-0.5573654844469077	-0.4243688240739016	-0.392627568674833	-0.31815429071021956	-0.3537047315534365	-0.2536269220560434	-0.6392628201724283	-0.7696459242391825	-0.3766716374893235	-0.4762530241848883	0.05615167076877203	-0.1601574684782523	-0.1512949771287705	-0.2693856780388725	-0.11006128213301719	-0.05937156437577634	0.3443671491497103	0.1446156773225466	0.36061844028185575	-0.15133745951368893	-0.23660741136447894	-0.0007009339015273675	-0.019430319784291616	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.793450583062	0.840380101088	0.536806685117	0.66743649171	0.468411351413	0.354199901149	0.347268461228	0.798631310048	0.989286880498	0.925117039075	0.972564097526	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:75947352..75947466,-__2276.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:75947352..75947466,-__2276.1.0.0	rs73703127	0.2607433112408409	0.6599858985135552	0.3831307061260881	0.0907668923937364	0.3606837907935516	0.3525868289262485	0.5544787166073875	0.6612418899831825	0.6177144056749673	0.5653858827258381	0.4403808335660089	0.5289957665515415	0.45634124359191214	0.17384777681388108	0.31723606265944354	0.042002359833115656	-0.09949473892649607	0.1843422385319432	0.2675013988688437	0.4962233763717806	0.7120892482595309	0.15707150395836997	0.2802038198655185	0.255232357526062	0.23566725071205916	0.25182688787283763	-0.0868955344269598	-0.3427498358541116	-0.34112834629297245	-0.1902616313202325	-0.17634155226160841	-0.08508543005740477	-0.058255340235606856	0.05084735827634845	-0.4606429017165973	-0.2851820628603196	-0.18514847603994689	-0.2933285158394823	-0.2045143557190745	0.279742372288	0.0240855495486	0.122558611289	0.757455001208	0.221756412245	0.206893929435	0.747262025795	0.777966336216	0.162586850726	0.0201846528804	0.519249062249	0.0499532058383	0.012110083712	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr9:35604021..35604135,-__2278.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr9:35604021..35604135,-__2278.1.0.0	rs2297876	-0.7161056347202236	-0.7199456162467822	-0.4878878506122085	-0.5229364482973817	-0.6046354258945523	-0.5737055828528491	-1.1261300202218212	-0.27986551548333416	-0.26724985530332146	-0.8206960335340663	-0.8465774263376249	-0.9676943612458728	-0.6611191475625031	-0.5519177569728871	-0.5943723744482514	-0.59637891556469	-0.804722982269044	-0.5733775663705586	-0.7159990429629732	-0.6700720953561209	-0.632157146746868	-0.6326730812857952	-0.25484711297295015	-0.7181338946503044	-0.7819039147594774	-0.6272129903633268	0.16418787774733645	0.1255732417985308	-0.10849106495248151	-0.2817865339716623	0.031257859523993736	-0.14229346011012411	0.4560579248657003	-0.3522916312635338	-0.3654232259824738	0.5658489205611161	0.12844353168732048	0.18579044648639542	0.03390615719917648	NA__no_active_tile	0.727009731456	0.88258056334	0.382791178922	0.536806685117	0.925117039075	NA__no_active_tile	0.747262025795	0.476688253492	0.188220673538	0.216719559135	NA__no_active_tile	0.743874667775	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr9:35604021..35604135,-__2278.1.1.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr9:35604021..35604135,-__2278.1.0.0	rs2297876,rs2297877	-0.7161056347202236	-0.7199456162467822	-0.4878878506122085	-0.5229364482973817	-0.6046354258945523	-0.5737055828528491	-1.1261300202218212	-0.27986551548333416	-0.26724985530332146	-0.8206960335340663	-0.8465774263376249	-0.9676943612458728	-0.6611191475625031	-0.7226297864689242	-0.8996447175704699	-0.18577079806377578	-0.9032367926912075	-0.7751642877995495	-0.6043199310348291	-0.719640300792834	-0.5932080166244499	-0.6036101642807753	-0.6209580646063612	-0.5306052635920662	-0.8886301666875035	-0.6706181908510621	-0.00652415174870058	-0.17969910132368772	0.30211705254843274	-0.38030034439382576	-0.17052886190499716	-0.030614348181979945	0.40648971942898715	-0.3133425011411157	-0.33636030897745384	0.19973796892770512	0.3159721627455587	0.07906419455836933	-0.009499043288558976	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.326996172605	0.216719559135	0.687084607526	0.60051573606	NA__no_active_tile	0.829896383209	0.170821264488	0.444064484515	0.0808926541269	NA__no_active_tile	0.236882497222	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr9:90407774..90407888,-__2279.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr9:90407774..90407888,-__2279.1.0.0	rs9410966	-0.3728732550206604	-0.44646833636555894	-0.7856723091049962	-0.4311384187886325	-0.6244323283588626	-0.4665701733572881	-0.813331081754318	-0.6523355028577664	-0.5692016930706446	-0.3947338262335329	-0.8542701539442099	-0.4812456445193149	-0.5743560602813155	-0.5702013451478758	-0.36931144176759845	-0.494815361940284	-0.7533052053508418	-0.6211652239147809	-0.8093586850075412	-0.6165391028871187	-0.8100195541982049	-0.4996341295502846	-0.7290542020567046	-0.6834283258056457	-0.5079416432027122	-0.622064518402466	-0.19732809012721542	0.07715689459796049	0.29085694716471217	-0.32216678656220926	0.0032671044440817365	-0.34278851165025304	0.19679197886719935	-0.1576840513404385	0.06956756352036003	-0.33432037582317164	0.1708418281385642	-0.026695998683397282	-0.0477084581211506	0.361218104761	0.519249062249	0.216719559135	0.412754243182	0.861430881609	0.150801701171	0.662551985265	NA__no_active_tile	0.56368668121	0.0565651674203	0.545696106059	0.382791178922	0.230517101997	1	1	1	1	1	1	1	NA__no_active_tile	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chrX:154029191..154029305,-__2280.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chrX:154029191..154029305,-__2280.1.0.0	rs139322603	0.6529980626871308	0.8564921641695151	0.840442050546691	0.5501004380646983	0.9518682616314194	0.8927725277735512	1.050497548749572	0.7307627514423952	1.0425978083089766	1.1381994635517554	0.9461752812555878	0.9873513115536652	0.8866881391445799	-1.223929400496317	-1.0213292803034224	-1.1978592621873811	-1.5366857594416237	-1.440136195507884	-1.5068997706393952	-1.6381726634863618	-1.5001395006440583	-1.3450208546406068	-1.2186052317691052	-1.0457779115022983	-1.3347691551021597	-1.3341104154767178	-1.8769274631834478	-1.8778214444729375	-2.038301312734072	-2.086786197506322	-2.3920044571393033	-2.3996722984129466	-2.688670212235934	-2.2309022520864534	-2.3876186629495835	-2.356804695320861	-1.9919531927578862	-2.322120466655825	-2.220798554621298	5.38827834679e-08	1.64454151912e-10	1.15295548984e-08	2.44178879239e-06	7.24718602024e-07	3.30166096949e-10	1.79481890187e-09	1.1701294631e-06	2.94200293519e-09	1.26262090221e-10	3.41788294666e-08	8.23367049956e-12	3.17439435268e-85	3.81490106952e-05	1.22353889022e-07	8.58951839929e-06	0.00179959833999	0.000559482760763	2.52246898069e-07	1.32637116848e-06	0.000850684119676	2.2741682689e-06	9.91157408234e-08	2.62835198598e-05	6.41402931916e-09	2.66014246755e-82	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr11:65244968..65245082,-__2282.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr11:65244968..65245082,-__2282.1.0.0	rs116873289	0.6483991178961519	1.3532573454739942	-0.2641408108652438	0.40276147442925814	1.8945210521334024	0.4003074150946589	0.8172266869858179	1.201324687710429	0.7687812136686705	0.7173646613069694	0.5039286883624738	1.1149380368612625	0.7965557974214872	0.5361075893272153	-0.11459861106325211	-0.9886481434413495	-0.020965772168328525	-0.17069767160164184	-0.06909047418606909	-0.18094194562712354	0.26105126194075584	-0.1522456114413495	-0.1775334045907666	-0.21166320456230492	-0.00012643096356055686	-0.10744603486481462	-0.11229152856893665	-1.4678559565372464	-0.7245073325761058	-0.42372724659758665	-2.065218723735044	-0.469397889280728	-0.9981686326129414	-0.9402734257696732	-0.92102682511002	-0.894898065897736	-0.7155918929247788	-1.115064467824823	-0.9040018322863017	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:145114583..145114697,-__2287.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:145114583..145114697,-__2287.1.0.0	rs587750395	-1.0499117577317016	-1.3566149339904476	-1.3641764760721249	-1.3970630930072028	-1.4615168470888316	-1.4440056683285256	-1.553259415400003	-1.6555434127709847	-1.6707139290485933	-1.340557886115708	-1.1804357831376984	-1.2778193833482827	-1.395968215503342	-1.7129250721322975	-1.3555408066499601	-1.031595947779525	-1.6265098157895068	-1.205880477413408	-1.5696707418179683	-1.3752120395466034	-1.0570391565162371	-1.3667359123965945	-1.0132734928968476	-1.404792330451457	-1.581072347169673	-1.35835401171334	-0.6630133144005959	0.0010741273404875074	0.3325805282926	-0.22944672278230405	0.2556363696754236	-0.12566507348944267	0.17804737585339958	0.5985042562547476	0.30397801665199875	0.32728439321886027	-0.22435654731375854	-0.30325296382139033	0.03761420379000215	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:145114583..145114697,-__2287.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:145114583..145114697,-__2287.1.0.0	rs112458770	-1.0499117577317016	-1.3566149339904476	-1.3641764760721249	-1.3970630930072028	-1.4615168470888316	-1.4440056683285256	-1.553259415400003	-1.6555434127709847	-1.6707139290485933	-1.340557886115708	-1.1804357831376984	-1.2778193833482827	-1.395968215503342	-0.8917994793458441	-0.6474538445822144	-0.6969167919321521	-1.0010176242021305	-0.9312395509956596	-0.8073873326126945	-0.8916241820970273	-0.9696665208098088	-1.1493050970835987	-1.0259535102930146	-0.9949074661676098	-0.8069044359396469	-0.9011813196717835	0.1581122783858575	0.7091610894082332	0.6672596841399728	0.3960454688050723	0.530277296093172	0.6366183357158312	0.6616352333029757	0.685876891961176	0.5214088319649945	0.3146043758226933	0.18552831697008854	0.4709149474086358	0.4947868958315585	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0115927323179	0.0115927323179	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr1:145114583..145114697,-__2287.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:145114583..145114697,-__2287.1.0.0	rs587750395,rs112458770,rs587731868	-1.0499117577317016	-1.3566149339904476	-1.3641764760721249	-1.3970630930072028	-1.4615168470888316	-1.4440056683285256	-1.553259415400003	-1.6555434127709847	-1.6707139290485933	-1.340557886115708	-1.1804357831376984	-1.2778193833482827	-1.395968215503342	-1.019442873047051	-0.7639952703127246	-0.7428691790021967	-0.8003539364176506	-0.9876572475846561	-0.9835130914947796	-0.863967156274821	-1.0327195840292638	-0.9853757608427486	-1.0900140256086739	-1.1603506215977326	-0.8929168818580522	-0.9435979690058627	0.030468884684650588	0.592619663677723	0.6213072970699282	0.5967091565895521	0.47385959950417544	0.460492576833746	0.689292259125182	0.6228238287417209	0.6853381682058447	0.25054386050703403	0.020085161539965757	0.38490250149023053	0.4523702464974795	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0115927323179	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	0.0115927323179	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	1	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.flip.sense__chr19:42037894..42038008,-__2293.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.flip.sense__chr19:42037894..42038008,-__2293.1.0.0	rs12462897	1.608764506314503	1.5498074749330017	1.3786527207866286	1.0362124882189594	1.4918610968848105	1.3754567981759305	1.2778503094960691	1.7686591562604796	1.2422487835161715	1.3650945731966666	1.413169772190567	1.425438968845368	1.4111013874015963	1.4197247798120418	1.5389426540556637	1.2861961512422149	0.9491267278822668	1.1944821545624469	1.1490406822421424	0.9827783304446857	1.7160298107068537	1.0889402775040071	1.2393817437875858	1.0342705548035078	1.1361336395190282	1.2279206255468702	-0.18903972650246126	-0.010864820877338088	-0.09245656954441372	-0.08708576033669257	-0.2973789423223636	-0.22641611593378808	-0.2950719790513835	-0.05262934555362597	-0.1533085060121644	-0.1257128294090808	-0.3788992173870591	-0.2893053293263397	-0.1831807618547259	0.206893929435	0.619326784864	0.493479697885	0.76769033028	0.0658387268341	0.340423946445	0.0906800339379	0.648013768535	0.66743649171	0.150801701171	0.0658387268341	0.188220673538	0.0509519712617	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:128171109..128171223,-__2301.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:128171109..128171223,-__2301.1.0.0	rs10242420														-0.7304062492237398	-0.2356543541329424	-0.8084717956842524	1.0946034662202002	1.9764868184124749	0.2525846984017713	-0.16433995100979237	1.2089884620651727	0.4639386894663313	2.1911147464224836	1.8096312222441384	-1.6837181275496602	0.4478964688026821														NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:128171109..128171223,-__2301.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:128171109..128171223,-__2301.1.0.0	rs185107921														0.18435370141021107	0.7645548014636533	-0.7675514874431801	-0.04819558870033571	1.3400267442675746	0.4338632661975025	1.1887840296827268	-0.1690221014790378	0.5876429878080511	-0.1378348008744036	-1.2904896498584484	0.4312182171538451	0.2097791766356799														NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr7:128171109..128171223,-__2301.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:128171109..128171223,-__2301.1.0.0	rs10242420,rs185107921														1.3631199670534968	0.353837008777375	0.24763353955868234	-0.6612189267307177	-1.3351105978104045	-1.2350203270241968	-0.5976843708711959	-1.024987205175188	0.1162824390546365	0.3024360743310415	0.23222265370929063	-0.31968090649195724	-0.21318088763492807														NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__not_enough_barcodes	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:224180275..224180389,-__2305.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:224180275..224180389,-__2305.1.0.0	rs11800372	3.345514050330888	3.924396347688959	3.308929335826295	3.0102830940038086	3.4303410098867673	3.568596921997698	3.2931773965173243	3.7707063961973786	3.6218444026433794	3.52590753993383	3.623575027443952	3.6404216313692004	3.505307762819957	3.2616208499841886	3.9026085435789053	3.1652984820164125	2.9548778563645923	3.230953421724915	3.324046387916346	3.1456818320136843	3.3626909203456563	3.561673808881686	3.4964263416707206	3.4571403309705646	3.482941139327939	3.362163326232968	-0.08389320034669945	-0.021787804110053877	-0.14363085380988228	-0.05540523763921623	-0.1993875881618523	-0.24455053408135186	-0.14749556450364	-0.40801547585172226	-0.060170593761693425	-0.029481198263109576	-0.1664346964733876	-0.15748049204126158	-0.1431444365869892	0.143314270352	0.519249062249	0.301187193336	0.301187193336	0.0209174885683	0.104229562843	0.326996172605	0.0548474154937	0.166665831608	0.259370210024	0.0986283746992	0.110080523892	0.000437492349776	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.366618589112	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr1:224180275..224180389,-__2305.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:224180275..224180389,-__2305.1.0.0	rs138562231	3.345514050330888	3.924396347688959	3.308929335826295	3.0102830940038086	3.4303410098867673	3.568596921997698	3.2931773965173243	3.7707063961973786	3.6218444026433794	3.52590753993383	3.623575027443952	3.6404216313692004	3.505307762819957	3.643092615108742	4.150374658100287	3.572691906710095	3.3034814634759577	3.73431221117413	3.6272455859585317	3.4634762806884254	3.9682771753058104	3.7841327224903996	3.800223496251161	3.7742886831908224	3.8287367641925534	3.7208611302205767	0.29757856477785394	0.2259783104113282	0.26376257088380006	0.29319836947214917	0.30397120128736255	0.05864866396083368	0.17029888417110106	0.1975707791084318	0.1622883198470202	0.27431595631733074	0.15071365574687023	0.188315132823353	0.21555336740061956	0.347268461228	0.143314270352	0.107123399254	0.104229562843	0.13967914143	0.412754243182	0.110080523892	0.0763307839553	0.143314270352	0.192768091005	0.301187193336	0.253741740693	0.000723456891246	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.606256874864	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr1:224180275..224180389,-__2305.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr1:224180275..224180389,-__2305.1.0.0	rs11800372,rs138562231	3.345514050330888	3.924396347688959	3.308929335826295	3.0102830940038086	3.4303410098867673	3.568596921997698	3.2931773965173243	3.7707063961973786	3.6218444026433794	3.52590753993383	3.623575027443952	3.6404216313692004	3.505307762819957	3.239156192948488	3.7855950440681583	3.144176789459957	2.80844565303814	3.3580628629765124	3.3577275850754016	3.1339571159050363	3.461143210411941	3.42945909152644	3.259684242789157	3.4325008132279513	3.4944337757634623	3.325361864765887	-0.10635785738240022	-0.1388013036208009	-0.16475254636633796	-0.2018374409656687	-0.07227814691025491	-0.21086933692229648	-0.159220280612288	-0.3095631857854375	-0.19238531111693957	-0.2662232971446734	-0.1910742142160009	-0.14598785560573813	-0.17994589805406971	0.110080523892	0.412754243182	0.221756412245	0.166665831608	0.166665831608	0.132622250874	0.326996172605	0.0698833862508	0.0959193233604	0.143314270352	0.206893929435	0.242741268695	0.000696143804796	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.158024643689	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr7:111722002..111722116,-__2306.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr7:111722002..111722116,-__2306.1.0.0	rs73210930	-1.0591746279353353	-0.9747469259269497	-1.5053637008000527	-1.3509027028324407	-1.0655801483203864	-1.5557146714960297	-1.1194991152588427	-0.9175881751304518	-1.1359265097187854	-1.0712391069082676	-1.553471848344582	-0.818170025702019	-1.1772814631978452	-0.9873292287054546	-1.0080127315346592	-1.4334172308861448	-1.111227601677469	-1.2734216953496464	-0.9705674297325679	-1.3235265735825965	-1.2515646445462987	-0.9521417384278317	-1.4192703267294333	-1.0312934843881565	-0.9802095788278293	-1.1451651886990073	0.07184539922988076	-0.03326580560770953	0.07194646991390785	0.23967510115497181	-0.20784154702926005	0.5851472417634618	-0.2040274583237538	-0.3339764694158469	0.18378477129095372	-0.3480312198211657	0.5221783639564255	-0.1620395531258103	0.03211627449883792	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr21:30375086..30375200,-__2307.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr21:30375086..30375200,-__2307.1.0.0	rs1537093	2.2354413079558153	2.3759804447318507	2.019329372846304	1.8922625157269375	2.1809389235045478	2.2716312208394713	2.0399796135942445	2.3972178273416036	2.2486339141446807	2.1776014840706073	2.17790108962517	2.314456664257387	2.1942811982198847	2.2752380056876373	2.612215403204687	2.236445745059022	2.0179603353103066	2.199771007197787	2.1788000083480803	2.3253876584254294	2.3853375071422827	2.400354687174444	2.374660687476976	2.406052408273955	2.3009521474616905	2.3094313000635247	0.03979669773182204	0.23623495847283627	0.21711637221271785	0.12569781958336912	0.018832083693239188	-0.09283121249139104	0.28540804483118487	-0.011880320199320948	0.1517207730297634	0.1970592034063685	0.22815131864878513	-0.013504516795696642	0.11515010184363982	0.166665831608	0.0468981580933	0.0832552515755	0.13967914143	0.206893929435	0.493479697885	0.0906800339379	0.609889042629	0.0306357720046	0.088148079887	0.132622250874	0.716953652062	0.000944415752587	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	0.791420400668	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr21:30375086..30375200,-__2307.1.2.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr21:30375086..30375200,-__2307.1.0.0	rs73190197	2.2354413079558153	2.3759804447318507	2.019329372846304	1.8922625157269375	2.1809389235045478	2.2716312208394713	2.0399796135942445	2.3972178273416036	2.2486339141446807	2.1776014840706073	2.17790108962517	2.314456664257387	2.1942811982198847	2.220877027537634	2.6438666291933	2.1443548353803137	2.0115557014004257	2.2543744048452115	2.3373813540758963	2.1251064661879675	2.3328787709652574	2.2947544641377244	2.2486099661408243	2.416343225726248	2.281969461762294	2.2760060256127583	-0.014564280418181141	0.2678861844614495	0.1250254625340097	0.11929318567348823	0.07343548134066369	0.06575013323642498	0.08512685259372299	-0.06433905637634618	0.046120549993043713	0.07100848207021704	0.238442136101078	-0.03248720249509329	0.08172482739287311	0.861430881609	0.0412580447575	0.519249062249	0.493479697885	0.282745459933	0.326996172605	0.66743649171	0.819442862795	0.527990680582	0.609889042629	0.581967350665	0.819442862795	0.632768919334	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_PLUS_HAPLO__Enhancer.noflip.NA__chr21:30375086..30375200,-__2307.1.2.1	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr21:30375086..30375200,-__2307.1.0.0	rs1537093,rs73190197	2.2354413079558153	2.3759804447318507	2.019329372846304	1.8922625157269375	2.1809389235045478	2.2716312208394713	2.0399796135942445	2.3972178273416036	2.2486339141446807	2.1776014840706073	2.17790108962517	2.314456664257387	2.1942811982198847	2.5678983056516462	2.8936362718412347	2.431679633644911	2.16767440975451	2.5963305726559067	2.5187125287411813	2.172279015552532	2.6836230717389173	2.5386497035568074	2.486305838285059	2.5791205993589883	2.5816604666417593	2.518130868118621	0.3324569976958309	0.5176558271093841	0.41235026079860715	0.2754118940275727	0.41539164915135895	0.24708130790171	0.1322994019582877	0.28640524439731374	0.2900157894121267	0.30870435421445164	0.4012195097338185	0.26720380238437214	0.32384966989873615	0.0531733827136	0.00342117348194	0.0296152123457	0.132622250874	0.00263248034207	0.00753998341959	0.0719809426143	0.0412580447575	0.0216734048733	0.0658387268341	0.00480682187369	0.0763307839553	8.96427436487e-12	1	0.691077043353	1	1	0.539658470123	1	1	1	1	1	0.985398484106	1	2.03489028083e-09	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chr9:73035001..73035115,-__2308.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chr9:73035001..73035115,-__2308.1.0.0	rs190469198	1.5453012770130967	1.6990331490799169	1.3505826100460616	1.0647377221571803	1.5475251889691617	1.33904059290985	0.9795282925177053	1.0076625378433166	1.4468362252873628	1.4858966574017995	1.3504838240577781	1.2884077365331907	1.3420863178180351	1.6476818592369773	1.8620452091764528	1.5440981066474588	1.271440521041535	1.3765549383868332	1.3880249877972488	0.9328341974332056	1.196600331914391	1.241884311893274	1.303999851486282	1.1844578767442202	1.567050615298901	1.3763894005880648	0.10238058222388058	0.1630120600965359	0.19351549660139722	0.2067027988843546	-0.1709702505823285	0.04898439488739892	-0.04669409508449973	0.18893779407107436	-0.2049519133940887	-0.1818968059155175	-0.1660259473135579	0.27864287876571026	0.03430308277002996	0.696989544957	0.30750859871	0.0374147936077	0.0484054419273	0.563691144959	0.320413072024	0.382791178922	0.175053819161	0.405130687876	0.850890521471	0.861430881609	0.0583274625199	0.0897447639996	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig
WILDTYPE_SNP_INDIV__Enhancer.noflip.NA__chrX:125606684..125606798,-__2309.1.1.0	WILDTYPE_BUT_HAS_SNP__Enhancer.noflip.NA__chrX:125606684..125606798,-__2309.1.0.0	rs73561503	-2.352274849341525	-1.9953380152877853	-2.290775064616232	-1.8388730094570516	-2.3186496943595802	-1.7309407532031929	-1.6427025087815375	-1.6073366782083771	-1.7741402512732396	-2.1506624702203982	-1.95245622262533	-2.0362835940217137	-1.9742027592829972	-1.567073839571617	-1.5642149954420523	-1.538929991952949	-1.7537545228747646	-1.5554691083083358	-1.9227223836628984	-1.8280058424305088	-1.6656478978196556	-1.9044106311423177	-1.892208029241413	-1.9712562632713935	-1.787061148501392	-1.7458962211849414	0.785201009769908	0.431123019845733	0.7518450726632828	0.08511848658228693	0.7631805860512444	-0.19178163045970553	-0.18530333364897134	-0.0583112196112785	-0.13027037986907808	0.2584544409789853	-0.018800040646063554	0.24922244552032158	0.22830653809805537	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
CONTROL_SNP_INDIV__control.flip.sense__chr17:33571488..33571603,+__2316.1.1.0	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr17:33571488..33571603,+__2316.1.0.0	rs11080327	-0.7235329421902538	-0.6989296175714096	-0.6826264266027818	-0.7340138644254948	-0.6328848505191044	-0.5039924432394891	-0.8003929935429412	-0.5632890907400917	-0.5348588097678326	-0.5577115266320154	-0.5788238322317732	-0.754250295647354	-0.6471088910925452	0.13039723796228841	0.23505406550168834	0.5037103734040215	0.8452345831757841	0.5824717618318573	0.9784034336922016	1.633778218703143	1.849207676116852	1.0722567922579522	0.9405757843088073	0.5290130482771973	1.2144852249752627	0.8762156833505882	0.8539301801525422	0.9339836830730979	1.1863368000068033	1.579248447601279	1.2153566123509618	1.4823958769316907	2.4341712122460843	2.4124967668569437	1.6071156020257849	1.4982873109408228	1.1078368805089704	1.9687355206226167	1.523324574443133	4.89961167363e-07	3.340599596e-11	5.54039310333e-11	1.00310876064e-15	2.78431580189e-15	2.9747052239e-18	6.94984599324e-24	1.24254497414e-26	1.9460569728e-20	1.02420991117e-20	3.65828236778e-14	3.73283371337e-22	6.81694344619e-178	0.000346892506493	2.48540609942e-08	4.12759286198e-08	7.39291156592e-13	2.14949179906e-12	2.27267479106e-15	5.135936189e-21	9.03330196197e-24	1.50430203997e-17	8.04004780269e-18	2.81321914083e-11	2.90787746272e-19	5.71259860791e-175	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
CONTROL_SNP_PLUS_HAPLO__control.flip.sense__chr17:33571488..33571603,+__2316.1.1.1	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr17:33571488..33571603,+__2316.1.0.0	rs11870371,rs11080327	-0.7235329421902538	-0.6989296175714096	-0.6826264266027818	-0.7340138644254948	-0.6328848505191044	-0.5039924432394891	-0.8003929935429412	-0.5632890907400917	-0.5348588097678326	-0.5577115266320154	-0.5788238322317732	-0.754250295647354	-0.6471088910925452	-0.3711988707286923	-0.2255910261883829	0.001059747890158575	0.240994615759204	0.0936591655619447	0.2719652660637904	0.9284066512680123	1.198934617888422	0.5172523135773955	0.4592666269867113	0.10001609580066763	0.7048448814887724	0.326634173780667	0.3523340714615615	0.4733385913830267	0.6836861744929404	0.9750084801846988	0.726544016081049	0.7759577093032795	1.7287996448109535	1.7622237086285137	1.0521111233452283	1.0169781536187266	0.6788399280324409	1.4590951771361265	0.973743064873212	0.0238737524126	0.000235901721363	1.96303271006e-06	9.83907195041e-10	4.40387871064e-08	8.83985526114e-10	3.01966014781e-18	1.13323402377e-22	7.98663113707e-13	2.3363786752e-14	7.89041822323e-07	6.98150389888e-16	1.90047481336e-99	1	0.0476521477154	0.000390643509302	1.85958459863e-07	9.0279513568e-06	1.77681090749e-07	6.03932029563e-16	2.20980634635e-20	1.64524601424e-10	4.85966764441e-12	0.000161753573576	1.43818980317e-13	4.31407782632e-97	not sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
CONTROL_SNP_INDIV__control.flip.sense__chr2:61378128..61378243,+__2317.1.1.0	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr2:61378128..61378243,+__2317.1.0.0	rs1617806	-1.2933408802948858	-1.0434357465779285	-1.4338514153188562	-1.4843210768485422	-1.4760126990554838	-1.3172204949364812	-1.3116346866681856	-1.1514425372144919	-1.2416816046042347	-1.446701686482125	-1.2933336758434293	-1.3715262216809263	-1.3220418937937977	-1.326181163616967	-1.6434939216065856	-1.4689291518065886	-1.384366375263257	-1.577324914583507	-1.4826089640489726	-1.6455818597997416	-1.1657715741875707	-1.4081075853139062	-1.4889242456702707	-1.6031188853693834	-1.6048105412105542	-1.4832682652064422	-0.03284028332208111	-0.6000581750286571	-0.03507773648773238	0.0999547015852853	-0.10131221552802328	-0.1653884691124914	-0.333947173131556	-0.014329036973078857	-0.16642598070967152	-0.04222255918814577	-0.3097852095259541	-0.23328431952962791	-0.1612263714126445	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
CONTROL_SNP_INDIV__control.flip.sense__chr2:61378128..61378243,+__2317.1.2.0	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr2:61378128..61378243,+__2317.1.0.0	rs10177445	-1.2933408802948858	-1.0434357465779285	-1.4338514153188562	-1.4843210768485422	-1.4760126990554838	-1.3172204949364812	-1.3116346866681856	-1.1514425372144919	-1.2416816046042347	-1.446701686482125	-1.2933336758434293	-1.3715262216809263	-1.3220418937937977	-1.4598906354676673	-1.2815418217023213	-1.384527974926194	-1.4070090456129423	-1.4219623883624788	-1.3328532414100818	-1.4730315628911204	-1.255788569322598	-1.262600860275681	-1.3233370352707765	-1.4454355619178831	-1.1970888412968101	-1.353755628204713	-0.16654975517278148	-0.23810607512439286	0.04932344039266212	0.07731203123559993	0.05405031069300503	-0.01563274647360058	-0.16139687622293475	-0.10434603210810622	-0.02091925567144637	0.12336465121134843	-0.15210188607445385	0.17443738038411616	-0.03171373441091537	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
CONTROL_SNP_PLUS_HAPLO__control.flip.sense__chr2:61378128..61378243,+__2317.1.2.1	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr2:61378128..61378243,+__2317.1.0.0	rs1617806,rs10177445	-1.2933408802948858	-1.0434357465779285	-1.4338514153188562	-1.4843210768485422	-1.4760126990554838	-1.3172204949364812	-1.3116346866681856	-1.1514425372144919	-1.2416816046042347	-1.446701686482125	-1.2933336758434293	-1.3715262216809263	-1.3220418937937977	-1.3920974094365794	-1.2914914340757833	-1.5718160646983446	-1.6085779868009191	-1.3175856935253991	-1.5015671704693911	-1.3772629534867915	-1.402673941950913	-1.3732240794025443	-1.5190683399561498	-1.5835633532104243	-1.4653097498396837	-1.4503531814044102	-0.09875652914169364	-0.24805568749785478	-0.13796464937948838	-0.12425690995237693	0.1584270055300847	-0.18434667553290995	-0.0656282668186059	-0.25123140473642125	-0.1315424747983096	-0.07236665347402482	-0.290229677366995	-0.09378352815875735	-0.12831128761061275	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
CONTROL_SNP_INDIV__control.flip.sense__chr16:67993585..67993700,+__2318.1.1.0	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr16:67993585..67993700,+__2318.1.0.0	rs3785098	-0.2322010079751997	-0.3678539267244577	-0.1413303191669053	-0.2714260325354485	-0.1586973923370325	-0.3605119554970313	-0.4544936687548178	-0.6007544519169875	-0.26406526913037087	-0.2608597962655473	-0.3002835639563277	-0.1820981754488355	-0.2995479633090801	-0.03981026571158839	0.1267944209247275	0.06410967471632058	-0.05540670166978144	0.03914922960186438	-0.06708418741980626	-0.21430648644228856	-0.03263982317842963	0.026322475152052733	-0.11512873282684187	-0.06558495533888495	0.1481070167131699	-0.015456527956623828	0.19239074226361133	0.4946483476491852	0.20543999388322587	0.21601933086566705	0.19784662193889688	0.29342776807722504	0.24018718231252922	0.5681146287385579	0.2903877442824236	0.1457310634387054	0.23469860861744277	0.3302051921620054	0.28409143535245635	0.0473974678083	0.00623375589462	0.0958414204444	0.426532050234	0.0663593468066	0.00138565198002	0.0505323135365	0.00200070245683	0.000389025089339	0.0152506494054	0.0220287482662	0.00126001883417	1.62274289485e-13	1	1	1	1	1	1	1	1	0.300716394059	1	1	0.981554671815	1.35985854589e-10	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	not sig	sig	not sig
CONTROL_SNP_INDIV__control.flip.sense__chr17:76375037..76375152,+__2319.1.1.0	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr17:76375037..76375152,+__2319.1.0.0	rs4490057	-1.0334238063464238	-0.9426254745177612	-1.4135659620018344	-1.0643630298408275	-1.247514861874134	-1.2736147442278014	-1.0216600498992614	-1.2244711600188596	-1.2509398949006494	-1.0655141297325912	-1.0583890358145622	-1.3998188334677342	-1.16632508188687	-1.23998727864219	-0.9190365015103156	-1.1274430479771331	-1.234170011830196	-1.0503394771777683	-1.1069877994926	-0.970384098751792	-1.2479088897591364	-1.0657186860942978	-1.1361785392725983	-1.3410630843972808	-1.2112972024038502	-1.1375428847757632	-0.2065634722957661	0.02358897300744567	0.28612291402470125	-0.1698069819893684	0.19717538469636575	0.16662694473520134	0.05127595114746941	-0.023437729740276803	0.18522120880635162	-0.07066440954000708	-0.2826740485827186	0.18852163106388398	0.028782197111106838	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__no_active_tile	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs	NA__too_many_rep_NAs
CONTROL_SNP_INDIV__control.flip.sense__chr9:104195642..104195756,+__2320.1.1.0	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr9:104195642..104195756,+__2320.1.0.0	rsFakeAldoB102	0.05020674234249069	0.20443963964149975	0.4009091876821969	0.18248272748358357	0.3779240668957808	0.37838380619449696	0.7370604819649517	0.6955683545499729	0.5252391293058428	0.689421781684262	0.5764549804401597	0.618255938775081	0.4530289030800266	-1.2331211383835492	-0.9863414310018179	-0.8881128751201204	-1.0627025703288198	-1.0262327205202522	-0.9533901641039532	-0.7257817068491886	-0.7901904982929194	-0.8289255467607008	-0.9814003017579916	-0.678741971073719	-0.8864174332990542	-0.9201131964576739	-1.28332788072604	-1.1907810706433177	-1.2890220628023172	-1.2451852978124034	-1.404156787416033	-1.3317739702984501	-1.4628421888141403	-1.4857588528428924	-1.3541646760665436	-1.6708220834422538	-1.2551969515138788	-1.5046733720741352	-1.3731420995377004	2.46237501958e-16	6.30128990667e-13	4.19275598362e-15	7.38276542924e-16	7.61601941155e-20	2.18522202358e-22	2.17212328036e-23	4.02286515687e-23	2.18506884316e-22	2.11309520424e-22	4.41006999834e-22	1.1922087605e-22	8.47251621184e-214	1.74336151386e-13	4.68815969057e-10	3.1236032078e-12	5.44109812135e-13	5.87956698572e-17	1.66950962602e-19	1.60519910418e-20	2.92462296904e-20	1.68905821577e-19	1.65877973533e-19	3.39134382873e-19	9.28730624428e-20	7.09996858552e-211	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
CONTROL_SNP_INDIV__control.flip.sense__chr9:104195642..104195756,+__2320.1.2.0	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr9:104195642..104195756,+__2320.1.0.0	rsFakeAldoB101	0.05020674234249069	0.20443963964149975	0.4009091876821969	0.18248272748358357	0.3779240668957808	0.37838380619449696	0.7370604819649517	0.6955683545499729	0.5252391293058428	0.689421781684262	0.5764549804401597	0.618255938775081	0.4530289030800266	-1.0853206894625618	-1.0745401728072543	-0.8589444284748394	-0.7673417189442779	-0.7481306812189487	-0.8810216433254312	-0.6624737664110862	-0.5224441733890376	-0.5234713691583573	-0.6633702995783936	-0.7822183052166274	-0.6451872639293225	-0.7678720426596781	-1.1355274318050526	-1.2789798124487541	-1.2598536161570364	-0.9498244464278616	-1.1260547481147294	-1.259405449519928	-1.399534248376038	-1.2180125279390106	-1.0487104984642002	-1.3527920812626557	-1.3586732856567871	-1.2634432027044036	-1.2209009457397046	2.5108958314e-12	1.14250792754e-09	5.55965492129e-13	1.03644716266e-11	4.93544105352e-15	1.32166148415e-17	2.07454158818e-20	5.92824187479e-18	6.71421341902e-20	2.70001800875e-19	9.05604417992e-17	2.26744079697e-18	1.35574416418e-167	1.77771424863e-09	8.50025898087e-07	4.14194291636e-10	7.63861558881e-09	3.81016049332e-12	1.00974937389e-14	1.53308623366e-17	4.30983184297e-15	5.19008697291e-17	2.11951413687e-16	6.96409797436e-14	1.76633638084e-15	1.13611360958e-164	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
CONTROL_SNP_INDIV__control.flip.sense__chr9:104195642..104195756,+__2320.1.3.0	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr9:104195642..104195756,+__2320.1.0.0	rsFakeAldoB124	0.05020674234249069	0.20443963964149975	0.4009091876821969	0.18248272748358357	0.3779240668957808	0.37838380619449696	0.7370604819649517	0.6955683545499729	0.5252391293058428	0.689421781684262	0.5764549804401597	0.618255938775081	0.4530289030800266	1.7488070213755282	2.0060981304529273	1.8205815865333195	1.6898039451249136	1.9853140320655238	1.9481758550851578	2.485462897191367	2.620191911447489	2.2047439897334034	2.2874113872593083	2.279486659863595	2.24928917605172	2.1104472160153542	1.6986002790330375	1.8016584908114275	1.4196723988511226	1.50732121764133	1.607389965169743	1.569792048890661	1.7484024152264155	1.9246235568975163	1.6795048604275604	1.5979896055750462	1.7030316794234355	1.631033237276639	1.657418312935328	1.86058096684e-26	3.80882968778e-27	2.09862798256e-23	2.17212328036e-23	5.31742331714e-27	3.28276894958e-27	7.1488946248e-27	1.24254497414e-26	1.28907110177e-26	2.93612280338e-27	1.28907110177e-26	5.31787809093e-27	3.04135077434e-292	1.31729132452e-23	2.83376928771e-24	1.56347784701e-20	1.60085485762e-20	4.10505080083e-24	2.50803547748e-24	5.28303312773e-24	9.03330196197e-24	9.96451961665e-24	2.30485640066e-24	9.91295677257e-24	4.14262703283e-24	2.54865194889e-289	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
CONTROL_SNP_PLUS_HAPLO__control.flip.sense__chr9:104195642..104195756,+__2320.1.3.1	CONTROL_BUT_HAS_SNP__control.flip.sense__chr9:104195642..104195756,+__2320.1.0.0	rsFakeAldoB102,rsFakeAldoB101,rsFakeAldoB124	0.05020674234249069	0.20443963964149975	0.4009091876821969	0.18248272748358357	0.3779240668957808	0.37838380619449696	0.7370604819649517	0.6955683545499729	0.5252391293058428	0.689421781684262	0.5764549804401597	0.618255938775081	0.4530289030800266	1.9957227378041964	2.1802113619851116	2.1077929196276246	1.8728112146449625	2.178833384732104	2.194788389308379	2.608682569863414	2.8661895606801533	2.40837574466865	2.4534231830980726	2.4622217472222694	2.453711181032394	2.315230332888944	1.9455159954617056	1.9757717223436118	1.7068837319454278	1.6903284871613788	1.8009093178363231	1.816404583113882	1.8716220878984626	2.17062120613018	1.8831366153628069	1.7640014014138106	1.8857667667821096	1.8354552422573132	1.8622014298089178	1.11272477226e-26	3.16293281152e-27	1.20942883707e-23	1.1922087605e-22	2.17926752778e-27	4.25747697994e-27	5.31787809093e-27	7.69686491782e-27	1.38736692542e-26	1.67790147653e-27	6.63962975483e-27	7.69686491782e-27	6.18451651471e-293	2.15868605819e-24	6.38912427927e-25	2.40676338577e-21	2.25327455734e-20	4.46749843194e-25	8.55752872967e-25	1.06357561819e-24	1.50088865898e-24	2.85797586636e-24	3.49003507117e-25	1.36112409974e-24	1.58555417307e-24	1.40388524884e-290	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig	sig
