
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2037] =>      2037 nucs 'mol-32-1e66-019253_2037'

Score:        2025
Aligned:      2036        nucs
Identic:      2035 (100%) nucs =>       232 (100%)      1803 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91678952,91679183] EXCISED REGION [91679184,91680987]
 second seq =>  [       1,     232] EXCISED REGION [     234,    2037]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [233,233]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [1494,1494]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        15 nucs [233,247] to [234,248]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91678952 GCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTA 91679011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTA 60

 91679012 GTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTT 91679071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTT 120

 91679072 TGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTT 91679131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTT 180

 91679132 GTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATG 91679183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATG 232

EXCISED REGION

 91679184 TTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAAT 91679243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      234 TTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAAT 293

 91679244 GTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCT 91679303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      294 GTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCT 353

 91679304 TTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGA 91679363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      354 TTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGA 413

 91679364 TGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGG 91679423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      414 TGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGG 473

 91679424 TTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCT 91679483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      474 TTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCT 533

 91679484 CGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCT 91679543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 CGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCT 593

 91679544 TTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCT 91679603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 TTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCT 653

 91679604 CTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAA 91679663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 CTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAA 713

 91679664 GGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCAT 91679723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 GGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCAT 773

 91679724 CCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTT 91679783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 CCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTT 833

 91679784 TACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAA 91679843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 TACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAA 893

 91679844 CAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCC 91679903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 CAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCC 953

 91679904 AAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGG 91679963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 AAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGG 1013

 91679964 GCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGG 91680023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 GCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGG 1073

 91680024 GAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTG 91680083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 GAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTG 1133

 91680084 GCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAG 91680143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 GCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAG 1193

 91680144 GAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGAT 91680203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 GAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGAT 1253

 91680204 TGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCT 91680263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 TGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCT 1313

 91680264 TTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGA 91680323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGA 1373

 91680324 TATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTG 91680383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTG 1433

 91680384 TATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 91680443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 1493

 91680444 TTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTG 91680503
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 CTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTG 1553

 91680504 GGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTG 91680563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 GGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTG 1613

 91680564 CCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTT 91680623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 CCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTT 1673

 91680624 AGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAG 91680683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 AGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAG 1733

 91680684 GGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATC 91680743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 GGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATC 1793

 91680744 CTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGA 91680803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 CTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGA 1853

 91680804 GAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGA 91680863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 GAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGA 1913

 91680864 GAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAAT 91680923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 GAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAAT 1973

 91680924 GAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGG 91680983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 GAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGG 2033

 91680984 GTTA 91680987
          ||||
     2034 GTTA 2037

Alignment time is 2.79295 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    8469] =>      8469 nucs 'mol-32-1e71-057911_8469'

Score:        8457
Aligned:      8468        nucs
Identic:      8467 (100%) nucs =>      2717 (100%)      5750 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91677727,91680443] EXCISED REGION [91680445,91686195]
 second seq =>  [       1,    2717] EXCISED REGION [    2719,    8469]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [2718,2718]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [91680443,91680449] to [91680444,91680450]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91680443,91680443] to [91680445,91680445]
 second seq =>         1 nucs [2717,2717] to [2719,2719]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91677727 TGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTG 91677786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTG 60

 91677787 TTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTT 91677846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTT 120

 91677847 CTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 91677906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 180

 91677907 GCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAG 91677966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAG 240

 91677967 CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTAT 91678026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTAT 300

 91678027 TTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGT 91678086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGT 360

 91678087 GATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAG 91678146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAG 420

 91678147 CCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTG 91678206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTG 480

 91678207 ATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTG 91678266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTG 540

 91678267 TTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTT 91678326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTT 600

 91678327 TTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATT 91678386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATT 660

 91678387 AGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTT 91678446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTT 720

 91678447 ACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTA 91678506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTA 780

 91678507 TTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAG 91678566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAG 840

 91678567 CCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTT 91678626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTT 900

 91678627 AGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCC 91678686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCC 960

 91678687 AGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTA 91678746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTA 1020

 91678747 TACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTT 91678806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTT 1080

 91678807 GGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTG 91678866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTG 1140

 91678867 TACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCC 91678926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCC 1200

 91678927 AGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGT 91678986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGT 1260

 91678987 ATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAA 91679046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAA 1320

 91679047 TTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTAT 91679106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTAT 1380

 91679107 CCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGA 91679166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGA 1440

 91679167 ATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGA 91679226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGA 1500

 91679227 GTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGAT 91679286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGAT 1560

 91679287 AATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTT 91679346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTT 1620

 91679347 TAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCT 91679406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCT 1680

 91679407 GAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTT 91679466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTT 1740

 91679467 TGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACAT 91679526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACAT 1800

 91679527 AGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTG 91679586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTG 1860

 91679587 ACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCT 91679646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCT 1920

 91679647 CTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAA 91679706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAA 1980

 91679707 TGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAA 91679766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAA 2040

 91679767 CCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCC 91679826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCC 2100

 91679827 AGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGA 91679886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGA 2160

 91679887 CAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCAC 91679946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCAC 2220

 91679947 AGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGG 91680006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGG 2280

 91680007 TAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCA 91680066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCA 2340

 91680067 AACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTC 91680126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTC 2400

 91680127 TGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTT 91680186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTT 2460

 91680187 AAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGG 91680246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGG 2520

 91680247 AGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTA 91680306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTA 2580

 91680307 GCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAA 91680366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAA 2640

 91680367 AGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGA 91680426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGA 2700

 91680427 ATCAAAGGTGACTCCAT 91680443
          |||||||||||||||||
     2701 ATCAAAGGTGACTCCAT 2717

EXCISED REGION

 91680445 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 91680504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 2778

 91680505 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 91680564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 2838

 91680565 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 91680624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 2898

 91680625 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 91680684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 2958

 91680685 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 91680744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 3018

 91680745 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 91680804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 3078

 91680805 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 91680864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 3138

 91680865 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 91680924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 3198

 91680925 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 91680984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 3258

 91680985 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 91681044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 3318

 91681045 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 91681104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 3378

 91681105 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 91681164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 3438

 91681165 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 91681224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 3498

 91681225 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATT 91681284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATT 3558

 91681285 TACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAA 91681344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 TACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAA 3618

 91681345 ACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTG 91681404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 ACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTG 3678

 91681405 ACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTA 91681464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 ACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTA 3738

 91681465 TTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATC 91681524
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 TTTTTAGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATC 3798

 91681525 GAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATT 91681584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 GAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATT 3858

 91681585 TTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGA 91681644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 TTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGA 3918

 91681645 AATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAAC 91681704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 AATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAAC 3978

 91681705 AGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGC 91681764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 AGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGC 4038

 91681765 TGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTAT 91681824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 TGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTAT 4098

 91681825 CCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCA 91681884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 CCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCA 4158

 91681885 AGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCAC 91681944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 AGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCAC 4218

 91681945 TTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTA 91682004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 TTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTA 4278

 91682005 TCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCT 91682064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 TCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCT 4338

 91682065 TTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAA 91682124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 TTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAA 4398

 91682125 ACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCC 91682184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 ACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCC 4458

 91682185 CTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAA 91682244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 CTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAA 4518

 91682245 GACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAA 91682304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 GACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAA 4578

 91682305 TATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGAT 91682364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 TATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGAT 4638

 91682365 TTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGA 91682424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 TTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGA 4698

 91682425 CCAATATAGCAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATT 91682484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 CCAATATAGCAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATT 4758

 91682485 TTTCATAGTTACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGTTT 91682544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 TTTCATAGTTACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGTTT 4818

 91682545 GCTAATCTAAAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATTGATAGCTGTA 91682604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 GCTAATCTAAAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATTGATAGCTGTA 4878

 91682605 CATGGTACACTTGGTATAGTATAACTTCTCATAACCGTTAATTATTTTATTGCCATTATT 91682664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 CATGGTACACTTGGTATAGTATAACTTCTCATAACCGTTAATTATTTTATTGCCATTATT 4938

 91682665 GCTATTAGTACCAGTAATAACACTCTTCCAATGGAAAATATTTTTCTGAAAACTCATAAA 91682724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 GCTATTAGTACCAGTAATAACACTCTTCCAATGGAAAATATTTTTCTGAAAACTCATAAA 4998

 91682725 TATAATAATATTCATTGTTTCAGAAATTAGCTAAAAGTAGGACCTATGAAGTATTATGGT 91682784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 TATAATAATATTCATTGTTTCAGAAATTAGCTAAAAGTAGGACCTATGAAGTATTATGGT 5058

 91682785 GCTGGTTAACATAACATGTAGTTAGTGAAATCACCAATAAATGAAGACATGACATATAAT 91682844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 GCTGGTTAACATAACATGTAGTTAGTGAAATCACCAATAAATGAAGACATGACATATAAT 5118

 91682845 CTAAATTATATTATATTTGCATAGTCTAAATTATATTATGTATGGCATATGTCCATACTC 91682904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 CTAAATTATATTATATTTGCATAGTCTAAATTATATTATGTATGGCATATGTCCATACTC 5178

 91682905 CATCCTAAGAAATCCAATTCTTTTAATAATTGTAATAGAATTGATTGAGCTTGCTATTAG 91682964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 CATCCTAAGAAATCCAATTCTTTTAATAATTGTAATAGAATTGATTGAGCTTGCTATTAG 5238

 91682965 AGTGTTTAACTGTACTCTTGAAATGGGTTTTACTAAAAGAGATATGGAAAATTTTATTTA 91683024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 AGTGTTTAACTGTACTCTTGAAATGGGTTTTACTAAAAGAGATATGGAAAATTTTATTTA 5298

 91683025 TGAGCTTCAAATGAGCATCTAATCTACTAGTGTCATTGTAATTTCTCATACAAGTGTACA 91683084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 TGAGCTTCAAATGAGCATCTAATCTACTAGTGTCATTGTAATTTCTCATACAAGTGTACA 5358

 91683085 AATGATAGCGCAGCATCTCTTTCAGGTGTTATATTCAGAATCATAATAAAACTCTTGCAG 91683144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 AATGATAGCGCAGCATCTCTTTCAGGTGTTATATTCAGAATCATAATAAAACTCTTGCAG 5418

 91683145 AATATATGTGTGCATCAAAATGAAATGACAATGAATTTTCTCTCGAAATTGATAGCACGT 91683204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 AATATATGTGTGCATCAAAATGAAATGACAATGAATTTTCTCTCGAAATTGATAGCACGT 5478

 91683205 ATTAGCATAAATTGAACTGTGCAACTGTGTCCATAACAGGCTGAGTGATGTAGCAGTTGA 91683264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 ATTAGCATAAATTGAACTGTGCAACTGTGTCCATAACAGGCTGAGTGATGTAGCAGTTGA 5538

 91683265 TTGCTTTGTACACATTCTTGTGTTTTGCCTTCTGTTTTCCTTGCTGTGTGTTATTCTCTC 91683324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 TTGCTTTGTACACATTCTTGTGTTTTGCCTTCTGTTTTCCTTGCTGTGTGTTATTCTCTC 5598

 91683325 TTCCGTCCCACCAAGGTGAGAGTAAATTTTTCCCTTCCTGGCTTTATTGCTTGAAGATAA 91683384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 TTCCGTCCCACCAAGGTGAGAGTAAATTTTTCCCTTCCTGGCTTTATTGCTTGAAGATAA 5658

 91683385 TAGAGTAAGGCAGGAGCATGTGCAAGGCAAAAGTACCTGTTGTCATCATTGCCCTTTTCC 91683444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 TAGAGTAAGGCAGGAGCATGTGCAAGGCAAAAGTACCTGTTGTCATCATTGCCCTTTTCC 5718

 91683445 GGTGTCCCTCTTTATTTCCTTCTGTGTCTTTGATATTCCAGGCAAAACTCTTTTATAACA 91683504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5719 GGTGTCCCTCTTTATTTCCTTCTGTGTCTTTGATATTCCAGGCAAAACTCTTTTATAACA 5778

 91683505 CTTCATGCCATGGCCCCTTCCAGCTACAGATAGGACAGGTGGTTGAATGGCTAGCACTCC 91683564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 CTTCATGCCATGGCCCCTTCCAGCTACAGATAGGACAGGTGGTTGAATGGCTAGCACTCC 5838

 91683565 ATGAGCTTTATTCATGTATATTTATAAAAGTGCAATTTCTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTT 91683624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 ATGAGCTTTATTCATGTATATTTATAAAAGTGCAATTTCTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTT 5898

 91683625 TTATATTATAGCAAACTCTTGTACATTTACTTACTTATTTTCTTTCAGTGATCATGCTAG 91683684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 TTATATTATAGCAAACTCTTGTACATTTACTTACTTATTTTCTTTCAGTGATCATGCTAG 5958

 91683685 TATGGTTGTGCTATCTGAAAATCTAGCCTTTTAGCTTCCTAGATGATATACTTAATATGA 91683744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 TATGGTTGTGCTATCTGAAAATCTAGCCTTTTAGCTTCCTAGATGATATACTTAATATGA 6018

 91683745 CTAAATAAATCCAGCCTGTACCACAACTGTCAAAACACCTGGAAATTTATAATTTCACCA 91683804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 CTAAATAAATCCAGCCTGTACCACAACTGTCAAAACACCTGGAAATTTATAATTTCACCA 6078

 91683805 TCTCTTCAGAGCAAGAGAGCTTTTGTGACAAATATGGTAGGGTGAATACGGAGCAGATAA 91683864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 TCTCTTCAGAGCAAGAGAGCTTTTGTGACAAATATGGTAGGGTGAATACGGAGCAGATAA 6138

 91683865 ACCCATATACTCTGACTTTCAATAAAGCAAGAGGGGATAACACTTCATAGAGACCAGATA 91683924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 ACCCATATACTCTGACTTTCAATAAAGCAAGAGGGGATAACACTTCATAGAGACCAGATA 6198

 91683925 CCACTCTATCAAGGTTACTGAATGGACTATGTCCTGTACCAGATGTGATGCCTCAATGTG 91683984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6199 CCACTCTATCAAGGTTACTGAATGGACTATGTCCTGTACCAGATGTGATGCCTCAATGTG 6258

 91683985 ACCAAATCCATTCTAGATGCCTCAAAGCTGGTTTTTTTGGACCTGCATTTTTTTGTGAAA 91684044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 ACCAAATCCATTCTAGATGCCTCAAAGCTGGTTTTTTTGGACCTGCATTTTTTTGTGAAA 6318

 91684045 AATAAAATGCTAACTTATAGGGAAAATGATAACTAATTTTCTTGGCAGTGGTCAATAACT 91684104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 AATAAAATGCTAACTTATAGGGAAAATGATAACTAATTTTCTTGGCAGTGGTCAATAACT 6378

 91684105 GGAGCTAGCATAAATAGCCGTTGGATTTATTTAGGAGAAGTTAACTCAGAATATAAGTGG 91684164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 GGAGCTAGCATAAATAGCCGTTGGATTTATTTAGGAGAAGTTAACTCAGAATATAAGTGG 6438

 91684165 CTTTCCCCTTCTACCTGTATCATAAAGCCTACCTTGACCAATGAGAAATCCAACAGTATT 91684224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 CTTTCCCCTTCTACCTGTATCATAAAGCCTACCTTGACCAATGAGAAATCCAACAGTATT 6498

 91684225 TGAAAATAAACTCCTGAGAACATAGGACGCAAACTAAGATAAGCAAATTACAGTTGTTAT 91684284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 TGAAAATAAACTCCTGAGAACATAGGACGCAAACTAAGATAAGCAAATTACAGTTGTTAT 6558

 91684285 GCTCTCAATTGGCCTATAAAAATAAACAGTTTGAGAAATCTGTGTCTCCTACAGAACCAC 91684344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 GCTCTCAATTGGCCTATAAAAATAAACAGTTTGAGAAATCTGTGTCTCCTACAGAACCAC 6618

 91684345 ACTGACCAGATAGCACAGATGAGACAGCTAGCACCCTGATCATTAATGTCACAGGTAATT 91684404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 ACTGACCAGATAGCACAGATGAGACAGCTAGCACCCTGATCATTAATGTCACAGGTAATT 6678

 91684405 TTGTTGTTGGTTACTAGTATCTGCCATACATACCCTTCAGGAATTAAATGGGCCATCTTT 91684464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6679 TTGTTGTTGGTTACTAGTATCTGCCATACATACCCTTCAGGAATTAAATGGGCCATCTTT 6738

 91684465 GAAAGCCAAGGTCAAGGAGTGAAATTTTAAAATAATAATCCACCCCCAGCTAACGAAAAG 91684524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6739 GAAAGCCAAGGTCAAGGAGTGAAATTTTAAAATAATAATCCACCCCCAGCTAACGAAAAG 6798

 91684525 CTAGGACAGGTAGTGTTTTCATTGCTTTTGTATTCAGGCCCTTCTCGTAGTATGCTGTGC 91684584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6799 CTAGGACAGGTAGTGTTTTCATTGCTTTTGTATTCAGGCCCTTCTCGTAGTATGCTGTGC 6858

 91684585 CTTATGAGGGGAAGAGAGACCCTTGATTTTCAAGGAGGGTGAGTGGGTGGGAGTGCTCCT 91684644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6859 CTTATGAGGGGAAGAGAGACCCTTGATTTTCAAGGAGGGTGAGTGGGTGGGAGTGCTCCT 6918

 91684645 ATGGGGGATGTATATCATGACAAATAATGGGCTCTTAAAAATTACACCTCCTTACTACCC 91684704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6919 ATGGGGGATGTATATCATGACAAATAATGGGCTCTTAAAAATTACACCTCCTTACTACCC 6978

 91684705 TGATTCTCTGAAGCCCATAGCGGTGCCATGCATAGCCTTGTTGAGAATTGCTGCCTAGTG 91684764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6979 TGATTCTCTGAAGCCCATAGCGGTGCCATGCATAGCCTTGTTGAGAATTGCTGCCTAGTG 7038

 91684765 AGCCTCACTGACAGGTAATAGTAATGCATTCAGGTTTGTTGATAAGGAGAAAAGGTTTAG 91684824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7039 AGCCTCACTGACAGGTAATAGTAATGCATTCAGGTTTGTTGATAAGGAGAAAAGGTTTAG 7098

 91684825 AAGTAATTGATAACTTTTCTTCCAATATAAGTTTTCTTAAAACTTCTAGTATGTTGTTAA 91684884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7099 AAGTAATTGATAACTTTTCTTCCAATATAAGTTTTCTTAAAACTTCTAGTATGTTGTTAA 7158

 91684885 ACAACAGAGAAATAAGCGCTCTGAGTCTTGGGAGATTCTGTCTGTGTACAAGCATGAACT 91684944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7159 ACAACAGAGAAATAAGCGCTCTGAGTCTTGGGAGATTCTGTCTGTGTACAAGCATGAACT 7218

 91684945 ATGCTCCATATGAGAACATGAGCCTTGTCATCTGCTTTAAATGTCATTGGAGAACAGTTA 91685004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7219 ATGCTCCATATGAGAACATGAGCCTTGTCATCTGCTTTAAATGTCATTGGAGAACAGTTA 7278

 91685005 TCAATGACTACTTTCCCAGGGTTAAAATTAATAAACTTGAGCTTATTGTATTGCAAGCTT 91685064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7279 TCAATGACTACTTTCCCAGGGTTAAAATTAATAAACTTGAGCTTATTGTATTGCAAGCTT 7338

 91685065 CTTTAGGATTTCACCCACTGTGAAAATATCATTTAAATAACATTTTACCGAACTTCAGGA 91685124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7339 CTTTAGGATTTCACCCACTGTGAAAATATCATTTAAATAACATTTTACCGAACTTCAGGA 7398

 91685125 CTTCTTGTAAAATTTTGTGACAGTTCATCTTAATATGCGTAATATTTCTGTTCTGATTCC 91685184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7399 CTTCTTGTAAAATTTTGTGACAGTTCATCTTAATATGCGTAATATTTCTGTTCTGATTCC 7458

 91685185 ATTTTTGAACTTTTGTACTCTATTTTTATCTGTAGGATGGAGATAATGCTAGACAAAATT 91685244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7459 ATTTTTGAACTTTTGTACTCTATTTTTATCTGTAGGATGGAGATAATGCTAGACAAAATT 7518

 91685245 CAGAACAAAAGTATGTAATTTGAAAAATAACTGTTAAGAATTAATACTATGCAATTTCCC 91685304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7519 CAGAACAAAAGTATGTAATTTGAAAAATAACTGTTAAGAATTAATACTATGCAATTTCCC 7578

 91685305 ATGGCAATTGATTACGTGTTTGTTCAGAAGTTTGGCACAGTTGCTTGATTAAAATATTAA 91685364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7579 ATGGCAATTGATTACGTGTTTGTTCAGAAGTTTGGCACAGTTGCTTGATTAAAATATTAA 7638

 91685365 TTTTCCAATTTCAATTGAGCAGTTTATGAATTTTACTTTATGGTGTTTACTTTCTCTGAT 91685424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7639 TTTTCCAATTTCAATTGAGCAGTTTATGAATTTTACTTTATGGTGTTTACTTTCTCTGAT 7698

 91685425 AATGTCAATGTTTTTCACTAATTATGTCCAAGGGTGAGCTACCTTGGCCAATAGAACAAC 91685484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7699 AATGTCAATGTTTTTCACTAATTATGTCCAAGGGTGAGCTACCTTGGCCAATAGAACAAC 7758

 91685485 TTGGTTTCAGGTAATTTGTTCTTTTCAGTGGCTGTAAATGTATTGGCTATGTGGTTGAAC 91685544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7759 TTGGTTTCAGGTAATTTGTTCTTTTCAGTGGCTGTAAATGTATTGGCTATGTGGTTGAAC 7818

 91685545 TTTGACCATTTCTCTGACAATAATTTGCAACCTCCATGAGATCAGTCATAAATCCATAGT 91685604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7819 TTTGACCATTTCTCTGACAATAATTTGCAACCTCCATGAGATCAGTCATAAATCCATAGT 7878

 91685605 CAATTATGTGTTAGAAAATATATTAAAAAGCCTCAGAGGAACAAAATTATGTCATTTCTG 91685664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7879 CAATTATGTGTTAGAAAATATATTAAAAAGCCTCAGAGGAACAAAATTATGTCATTTCTG 7938

 91685665 TTGTGGAAGATTGGTTTAAAATAGGTCTTACAAATATTATGAAAATACAACTTACTGTAA 91685724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7939 TTGTGGAAGATTGGTTTAAAATAGGTCTTACAAATATTATGAAAATACAACTTACTGTAA 7998

 91685725 TCATACTGCAGTTTGTCATATGTGGTTCATTGTTATGAGGCAGTAAGGTGATGGCAGAGG 91685784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7999 TCATACTGCAGTTTGTCATATGTGGTTCATTGTTATGAGGCAGTAAGGTGATGGCAGAGG 8058

 91685785 CAGCACTATATATAGCACATAAATAAAAATAAATCAGGTTTACAACTCTGTTTGCAACCA 91685844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8059 CAGCACTATATATAGCACATAAATAAAAATAAATCAGGTTTACAACTCTGTTTGCAACCA 8118

 91685845 TCTGTAATGCATGGTAGCATATGTTTTATAGTTTTATTGAGAGAATACATCTTTTAATTC 91685904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8119 TCTGTAATGCATGGTAGCATATGTTTTATAGTTTTATTGAGAGAATACATCTTTTAATTC 8178

 91685905 TCAAAACTTTGAGTTTGAAAGCTCATCTGTGATAGAAACTAATGGTTGAATTACAAGCTA 91685964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8179 TCAAAACTTTGAGTTTGAAAGCTCATCTGTGATAGAAACTAATGGTTGAATTACAAGCTA 8238

 91685965 AAGTGAATTTCATTTTACTTATTCTTCTAATCAGTTTACAAAGTGCAGCTTTACCTGCAG 91686024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8239 AAGTGAATTTCATTTTACTTATTCTTCTAATCAGTTTACAAAGTGCAGCTTTACCTGCAG 8298

 91686025 GAGGCATTCTTCCTTTTCTTTTTTTAAAAGATGAAATGTAAAAGAAAGCTTACCTCAACT 91686084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8299 GAGGCATTCTTCCTTTTCTTTTTTTAAAAGATGAAATGTAAAAGAAAGCTTACCTCAACT 8358

 91686085 TTACTATATAATATTGTCTCTTGGAAATGAAAAGTGCAGGATTTCTAACAGTCTCCTTCA 91686144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8359 TTACTATATAATATTGTCTCTTGGAAATGAAAAGTGCAGGATTTCTAACAGTCTCCTTCA 8418

 91686145 AGTTGTAATTGAAAACAGTAAATTGTCTCCATATTTTCTTTAATACCTGTA 91686195
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8419 AGTTGTAATTGAAAACAGTAAATTGTCTCCATATTTTCTTTAATACCTGTA 8469

Alignment time is 10.7546 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2724] =>      2724 nucs 'mol-32-1e87-021797_2724'

Score:        2582
Aligned:      2725        nucs
Identic:      2712 (100%) nucs =>      2083 (100%)       629 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91676042,91678133] EXCISED REGION [91680094,91680726]
 second seq =>  [       1,    2091] EXCISED REGION [    2092,    2724]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1960 nucs [91678134,91680093]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91678134,91678134] to [91680094,91680094]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91676042 TCATTGACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTG 91676101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCATTGACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTG 60

 91676102 AATAGTTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATAC 91676161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATAGTTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATAC 120

 91676162 AGGTATATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGC 91676221
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGTATATTGCACGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGC 180

 91676222 ATAGTATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGA 91676281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAGTATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGA 240

 91676282 CCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTT 91676341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTT 300

 91676342 ATAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGG 91676401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGG 360

 91676402 CCTCCAGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACA 91676461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTCCAGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACA 420

 91676462 TAGTATTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATT 91676521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGTATTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATT 480

 91676522 TACGTTGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATA 91676581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACGTTGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATA 540

 91676582 TGTCTTTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTG 91676641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTCTTTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTG 600

 91676642 GGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGG 91676701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGG 660

 91676702 CTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTG 91676761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTG 720

 91676762 TGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTT 91676821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTT 780

 91676822 TTCATATTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTAC 91676881
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCATATTGTGCTTGCAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTAC 840

 91676882 TTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTA 91676941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTA 900

 91676942 TAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTA 91677001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTA 960

 91677002 AAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTT 91677061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTT 1020

 91677062 ATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTA 91677121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTA 1080

 91677122 GAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGG 91677181
          ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||.||||||.||||.||||||||||
     1081 GAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT-AAATTTTTTTTCACTTTTTTTTTCCAGAGG 1139

 91677182 TTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAG 91677241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAG 1199

 91677242 ATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCC 91677301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCC 1259

 91677302 CTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCC 91677361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCC 1319

 91677362 TTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCT 91677421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCT 1379

 91677422 ATTCCTGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATG 91677481
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATTCCTGAGTTACTTAACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATG 1439

 91677482 TGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATT 91677541
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATT 1499

 91677542 TATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTG 91677601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTG 1559

 91677602 TGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGG 91677661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGG 1619

 91677662 GTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAG 91677721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAG 1679

 91677722 GAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAA 91677781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAA 1739

 91677782 AAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATT 91677841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 AAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATT 1799

 91677842 TATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTG 91677901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTG 1859

 91677902 CAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGC 91677961
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1860 CAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACACCATTCTCCTGC 1919

 91677962 CTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTT 91678021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTT 1979

 91678022 TGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAC 91678081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGAC 2039

 91678082 CTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 91678133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 2091

EXCISED REGION

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2092 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTGTAGGAAGATTTTG 2151

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 2211

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 2271

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2272 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTTAG 2331

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 2391

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 91680453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 2451

 91680454 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 91680513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2452 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGCTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 2511

 91680514 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTC 91680573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2512 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTGTC 2571

 91680574 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 91680633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 2631

 91680634 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 91680693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 2691

 91680694 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAA 91680726
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAA 2724

Alignment time is 3.42664 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2447] =>      2447 nucs 'mol-32-1f21-111814_2447'

Score:        2446
Aligned:      2446        nucs
Identic:      2446 (100%) nucs =>      1359 (100%)      1087 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91679085,91680443] EXCISED REGION [91680445,91681531]
 second seq =>  [       1,    1359] EXCISED REGION [    1361,    2447]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [1360,1360]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [91680443,91680449] to [91680444,91680450]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91680443,91680443] to [91680445,91680445]
 second seq =>         1 nucs [1359,1359] to [1361,1361]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91679085 CCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGA 91679144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGA 60

 91679145 TTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTG 91679204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTG 120

 91679205 AGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGG 91679264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGG 180

 91679265 GTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTT 91679324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTT 240

 91679325 GTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACA 91679384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACA 300

 91679385 TGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTC 91679444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTC 360

 91679445 AAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACC 91679504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACC 420

 91679505 TGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCT 91679564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCT 480

 91679565 AGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGT 91679624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGT 540

 91679625 TCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAA 91679684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAA 600

 91679685 ATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCT 91679744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCT 660

 91679745 ATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGT 91679804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGT 720

 91679805 AGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTAT 91679864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTAT 780

 91679865 ACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGC 91679924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGC 840

 91679925 TGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGA 91679984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGA 900

 91679985 GAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTC 91680044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTC 960

 91680045 TAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGT 91680104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGT 1020

 91680105 TATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGT 91680164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGT 1080

 91680165 GGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAA 91680224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAA 1140

 91680225 TTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAAT 91680284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAAT 1200

 91680285 TACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGT 91680344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGT 1260

 91680345 GTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATC 91680404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATC 1320

 91680405 CTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 91680443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 1359

EXCISED REGION

 91680445 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 91680504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 1420

 91680505 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 91680564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 1480

 91680565 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 91680624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 1540

 91680625 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 91680684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 1600

 91680685 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 91680744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 1660

 91680745 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 91680804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 1720

 91680805 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 91680864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 1780

 91680865 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 91680924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 1840

 91680925 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 91680984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 1900

 91680985 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 91681044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 1960

 91681045 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 91681104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 2020

 91681105 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 91681164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 2080

 91681165 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 91681224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 2140

 91681225 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATT 91681284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATT 2200

 91681285 TACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAA 91681344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 TACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAA 2260

 91681345 ACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTG 91681404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 ACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTG 2320

 91681405 ACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTA 91681464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 ACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTA 2380

 91681465 TTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATC 91681524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 TTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATC 2440

 91681525 GAACTAT 91681531
          |||||||
     2441 GAACTAT 2447

Alignment time is 3.05858 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    6509] =>      6509 nucs 'mol-32-23c5-029127_6509'

Score:        6508
Aligned:      6508        nucs
Identic:      6508 (100%) nucs =>      4336 (100%)      2172 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91676108,91680443] EXCISED REGION [91680445,91682616]
 second seq =>  [       1,    4336] EXCISED REGION [    4338,    6509]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [4337,4337]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [91680443,91680449] to [91680444,91680450]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91680443,91680443] to [91680445,91680445]
 second seq =>         1 nucs [4336,4336] to [4338,4338]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91676108 TTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTAT 91676167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTAT 60

 91676168 ATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTA 91676227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTA 120

 91676228 TCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAG 91676287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAG 180

 91676288 TGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTG 91676347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTG 240

 91676348 AGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCA 91676407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCA 300

 91676408 GCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTAT 91676467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTAT 360

 91676468 TCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTT 91676527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTT 420

 91676528 GGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTT 91676587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTT 480

 91676588 TATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAA 91676647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAA 540

 91676648 ACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAAC 91676707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAAC 600

 91676708 TAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTA 91676767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTA 660

 91676768 TCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATA 91676827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATA 720

 91676828 TTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCC 91676887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCC 780

 91676888 CACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATT 91676947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATT 840

 91676948 CTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTT 91677007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTT 900

 91677008 TTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGA 91677067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGA 960

 91677068 CAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTT 91677127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTT 1020

 91677128 CTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTG 91677187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTG 1080

 91677188 GGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTG 91677247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTG 1140

 91677248 GTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACT 91677307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACT 1200

 91677308 CCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCA 91677367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCA 1260

 91677368 TCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCT 91677427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCT 1320

 91677428 GAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTA 91677487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTA 1380

 91677488 TATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCA 91677547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCA 1440

 91677548 CTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGC 91677607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGC 1500

 91677608 TATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGAT 91677667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGAT 1560

 91677668 ATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCT 91677727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCT 1620

 91677728 GCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGT 91677787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGT 1680

 91677788 TCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTC 91677847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTC 1740

 91677848 TTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 91677907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 1800

 91677908 CACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGC 91677967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGC 1860

 91677968 CTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATT 91678027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATT 1920

 91678028 TCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTG 91678087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTG 1980

 91678088 ATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGC 91678147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGC 2040

 91678148 CTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGA 91678207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGA 2100

 91678208 TTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGT 91678267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGT 2160

 91678268 TTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTT 91678327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTT 2220

 91678328 TTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTA 91678387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTA 2280

 91678388 GTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTA 91678447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTA 2340

 91678448 CTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTAT 91678507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTAT 2400

 91678508 TTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGC 91678567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGC 2460

 91678568 CAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTA 91678627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTA 2520

 91678628 GATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCA 91678687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCA 2580

 91678688 GTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTAT 91678747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTAT 2640

 91678748 ACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTG 91678807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTG 2700

 91678808 GGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGT 91678867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGT 2760

 91678868 ACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCA 91678927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCA 2820

 91678928 GATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTA 91678987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTA 2880

 91678988 TGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAAT 91679047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAAT 2940

 91679048 TGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATC 91679107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATC 3000

 91679108 CATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAA 91679167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAA 3060

 91679168 TTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAG 91679227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAG 3120

 91679228 TGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATA 91679287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATA 3180

 91679288 ATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTT 91679347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTT 3240

 91679348 AAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTG 91679407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTG 3300

 91679408 AAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTT 91679467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTT 3360

 91679468 GGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATA 91679527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATA 3420

 91679528 GAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGA 91679587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGA 3480

 91679588 CTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTC 91679647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTC 3540

 91679648 TGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAAT 91679707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAAT 3600

 91679708 GTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAAC 91679767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAAC 3660

 91679768 CTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCA 91679827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCA 3720

 91679828 GAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGAC 91679887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGAC 3780

 91679888 AGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACA 91679947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACA 3840

 91679948 GAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGT 91680007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGT 3900

 91680008 AGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAA 91680067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAA 3960

 91680068 ACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCT 91680127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCT 4020

 91680128 GAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTA 91680187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTA 4080

 91680188 AGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGA 91680247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGA 4140

 91680248 GACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAG 91680307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAG 4200

 91680308 CAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAA 91680367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAA 4260

 91680368 GTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAA 91680427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAA 4320

 91680428 TCAAAGGTGACTCCAT 91680443
          ||||||||||||||||
     4321 TCAAAGGTGACTCCAT 4336

EXCISED REGION

 91680445 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 91680504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4338 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 4397

 91680505 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 91680564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4398 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 4457

 91680565 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 91680624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4458 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 4517

 91680625 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 91680684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4518 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 4577

 91680685 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 91680744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4578 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 4637

 91680745 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 91680804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4638 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 4697

 91680805 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 91680864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4698 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 4757

 91680865 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 91680924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4758 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 4817

 91680925 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 91680984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4818 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 4877

 91680985 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 91681044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4878 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 4937

 91681045 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 91681104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4938 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 4997

 91681105 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 91681164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 5057

 91681165 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 91681224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 5117

 91681225 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATT 91681284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5118 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATT 5177

 91681285 TACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAA 91681344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5178 TACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAA 5237

 91681345 ACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTG 91681404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 ACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTG 5297

 91681405 ACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTA 91681464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 ACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTA 5357

 91681465 TTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATC 91681524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 TTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATC 5417

 91681525 GAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATT 91681584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5418 GAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATT 5477

 91681585 TTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGA 91681644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5478 TTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGA 5537

 91681645 AATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAAC 91681704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5538 AATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAAC 5597

 91681705 AGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGC 91681764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5598 AGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGC 5657

 91681765 TGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTAT 91681824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5658 TGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTAT 5717

 91681825 CCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCA 91681884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5718 CCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCA 5777

 91681885 AGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCAC 91681944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5778 AGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCAC 5837

 91681945 TTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTA 91682004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5838 TTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTA 5897

 91682005 TCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCT 91682064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5898 TCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCT 5957

 91682065 TTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAA 91682124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5958 TTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAA 6017

 91682125 ACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCC 91682184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6018 ACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCC 6077

 91682185 CTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAA 91682244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6078 CTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAA 6137

 91682245 GACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAA 91682304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6138 GACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAA 6197

 91682305 TATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGAT 91682364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6198 TATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGAT 6257

 91682365 TTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGA 91682424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6258 TTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGA 6317

 91682425 CCAATATAGCAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATT 91682484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6318 CCAATATAGCAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATT 6377

 91682485 TTTCATAGTTACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGTTT 91682544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6378 TTTCATAGTTACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGTTT 6437

 91682545 GCTAATCTAAAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATTGATAGCTGTA 91682604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6438 GCTAATCTAAAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATTGATAGCTGTA 6497

 91682605 CATGGTACACTT 91682616
          ||||||||||||
     6498 CATGGTACACTT 6509

Alignment time is 7.98424 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    6925] =>      6925 nucs 'mol-32-2874-058609_6925'

Score:        6902
Aligned:      6924        nucs
Identic:      6922 (100%) nucs =>      1299 (100%)      5623 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91679145,91680443] EXCISED REGION [91680445,91686069]
 second seq =>  [       1,    1299] EXCISED REGION [    1301,    6925]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [1300,1300]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [91680443,91680449] to [91680444,91680450]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91680443,91680443] to [91680445,91680445]
 second seq =>         1 nucs [1299,1299] to [1301,1301]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91679145 TTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTG 91679204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTG 60

 91679205 AGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGG 91679264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGG 120

 91679265 GTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTT 91679324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTT 180

 91679325 GTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACA 91679384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACA 240

 91679385 TGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTC 91679444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTC 300

 91679445 AAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACC 91679504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACC 360

 91679505 TGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCT 91679564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCT 420

 91679565 AGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGT 91679624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGT 480

 91679625 TCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAA 91679684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAA 540

 91679685 ATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCT 91679744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCT 600

 91679745 ATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGT 91679804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGT 660

 91679805 AGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTAT 91679864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTAT 720

 91679865 ACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGC 91679924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGC 780

 91679925 TGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGA 91679984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGA 840

 91679985 GAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTC 91680044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTC 900

 91680045 TAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGT 91680104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGT 960

 91680105 TATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGT 91680164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGT 1020

 91680165 GGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAA 91680224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAA 1080

 91680225 TTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAAT 91680284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAAT 1140

 91680285 TACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGT 91680344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGT 1200

 91680345 GTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATC 91680404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATC 1260

 91680405 CTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 91680443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 1299

EXCISED REGION

 91680445 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 91680504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 1360

 91680505 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 91680564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 1420

 91680565 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 91680624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 1480

 91680625 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 91680684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 1540

 91680685 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 91680744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 1600

 91680745 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 91680804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 1660

 91680805 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 91680864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 1720

 91680865 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 91680924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 1780

 91680925 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 91680984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 1840

 91680985 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 91681044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 1900

 91681045 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 91681104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 1960

 91681105 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 91681164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 2020

 91681165 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 91681224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 2080

 91681225 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATT 91681284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATT 2140

 91681285 TACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAA 91681344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 TACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAA 2200

 91681345 ACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTG 91681404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 ACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTG 2260

 91681405 ACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTA 91681464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 ACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTA 2320

 91681465 TTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATC 91681524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 TTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATC 2380

 91681525 GAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATT 91681584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 GAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATT 2440

 91681585 TTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGA 91681644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 TTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGA 2500

 91681645 AATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAAC 91681704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 AATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAAC 2560

 91681705 AGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGC 91681764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 AGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGC 2620

 91681765 TGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTAT 91681824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 TGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTAT 2680

 91681825 CCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCA 91681884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 CCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCA 2740

 91681885 AGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCAC 91681944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 AGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCAC 2800

 91681945 TTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTA 91682004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 TTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTA 2860

 91682005 TCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCT 91682064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 TCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCT 2920

 91682065 TTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAA 91682124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 TTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAA 2980

 91682125 ACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCC 91682184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 ACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCC 3040

 91682185 CTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAA 91682244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 CTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAA 3100

 91682245 GACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAA 91682304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 GACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAA 3160

 91682305 TATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGAT 91682364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 TATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGAT 3220

 91682365 TTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGA 91682424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 TTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGA 3280

 91682425 CCAATATAGCAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATT 91682484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 CCAATATAGCAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATT 3340

 91682485 TTTCATAGTTACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGTTT 91682544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 TTTCATAGTTACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGTTT 3400

 91682545 GCTAATCTAAAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATTGATAGCTGTA 91682604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 GCTAATCTAAAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATTGATAGCTGTA 3460

 91682605 CATGGTACACTTGGTATAGTATAACTTCTCATAACCGTTAATTATTTTATTGCCATTATT 91682664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 CATGGTACACTTGGTATAGTATAACTTCTCATAACCGTTAATTATTTTATTGCCATTATT 3520

 91682665 GCTATTAGTACCAGTAATAACACTCTTCCAATGGAAAATATTTTTCTGAAAACTCATAAA 91682724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 GCTATTAGTACCAGTAATAACACTCTTCCAATGGAAAATATTTTTCTGAAAACTCATAAA 3580

 91682725 TATAATAATATTCATTGTTTCAGAAATTAGCTAAAAGTAGGACCTATGAAGTATTATGGT 91682784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 TATAATAATATTCATTGTTTCAGAAATTAGCTAAAAGTAGGACCTATGAAGTATTATGGT 3640

 91682785 GCTGGTTAACATAACATGTAGTTAGTGAAATCACCAATAAATGAAGACATGACATATAAT 91682844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 GCTGGTTAACATAACATGTAGTTAGTGAAATCACCAATAAATGAAGACATGACATATAAT 3700

 91682845 CTAAATTATATTATATTTGCATAGTCTAAATTATATTATGTATGGCATATGTCCATACTC 91682904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 CTAAATTATATTATATTTGCATAGTCTAAATTATATTATGTATGGCATATGTCCATACTC 3760

 91682905 CATCCTAAGAAATCCAATTCTTTTAATAATTGTAATAGAATTGATTGAGCTTGCTATTAG 91682964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 CATCCTAAGAAATCCAATTCTTTTAATAATTGTAATAGAATTGATTGAGCTTGCTATTAG 3820

 91682965 AGTGTTTAACTGTACTCTTGAAATGGGTTTTACTAAAAGAGATATGGAAAATTTTATTTA 91683024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 AGTGTTTAACTGTACTCTTGAAATGGGTTTTACTAAAAGAGATATGGAAAATTTTATTTA 3880

 91683025 TGAGCTTCAAATGAGCATCTAATCTACTAGTGTCATTGTAATTTCTCATACAAGTGTACA 91683084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 TGAGCTTCAAATGAGCATCTAATCTACTAGTGTCATTGTAATTTCTCATACAAGTGTACA 3940

 91683085 AATGATAGCGCAGCATCTCTTTCAGGTGTTATATTCAGAATCATAATAAAACTCTTGCAG 91683144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 AATGATAGCGCAGCATCTCTTTCAGGTGTTATATTCAGAATCATAATAAAACTCTTGCAG 4000

 91683145 AATATATGTGTGCATCAAAATGAAATGACAATGAATTTTCTCTCGAAATTGATAGCACGT 91683204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 AATATATGTGTGCATCAAAATGAAATGACAATGAATTTTCTCTCGAAATTGATAGCACGT 4060

 91683205 ATTAGCATAAATTGAACTGTGCAACTGTGTCCATAACAGGCTGAGTGATGTAGCAGTTGA 91683264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 ATTAGCATAAATTGAACTGTGCAACTGTGTCCATAACAGGCTGAGTGATGTAGCAGTTGA 4120

 91683265 TTGCTTTGTACACATTCTTGTGTTTTGCCTTCTGTTTTCCTTGCTGTGTGTTATTCTCTC 91683324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 TTGCTTTGTACACATTCTTGTGTTTTGCCTTCTGTTTTCCTTGCTGTGTGTTATTCTCTC 4180

 91683325 TTCCGTCCCACCAAGGTGAGAGTAAATTTTTCCCTTCCTGGCTTTATTGCTTGAAGATAA 91683384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 TTCCGTCCCACCAAGGTGAGAGTAAATTTTTCCCTTCCTGGCTTTATTGCTTGAAGATAA 4240

 91683385 TAGAGTAAGGCAGGAGCATGTGCAAGGCAAAAGTACCTGTTGTCATCATTGCCCTTTTCC 91683444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 TAGAGTAAGGCAGGAGCATGTGCAAGGCAAAAGTACCTGTTGTCATCATTGCCCTTTTCC 4300

 91683445 GGTGTCCCTCTTTATTTCCTTCTGTGTCTTTGATATTCCAGGCAAAACTCTTTTATAACA 91683504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 GGTGTCCCTCTTTATTTCCTTCTGTGTCTTTGATATTCCAGGCAAAACTCTTTTATAACA 4360

 91683505 CTTCATGCCATGGCCCCTTCCAGCTACAGATAGGACAGGTGGTTGAATGGCTAGCACTCC 91683564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 CTTCATGCCATGGCCCCTTCCAGCTACAGATAGGACAGGTGGTTGAATGGCTAGCACTCC 4420

 91683565 ATGAGCTTTATTCATGTATATTTATAAAAGTGCAATTTCTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTT 91683624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 ATGAGCTTTATTCATGTATATTTATAAAAGTGCAATTTCTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTT 4480

 91683625 TTATATTATAGCAAACTCTTGTACATTTACTTACTTATTTTCTTTCAGTGATCATGCTAG 91683684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 TTATATTATAGCAAACTCTTGTACATTTACTTACTTATTTTCTTTCAGTGATCATGCTAG 4540

 91683685 TATGGTTGTGCTATCTGAAAATCTAGCCTTTTAGCTTCCTAGATGATATACTTAATATGA 91683744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 TATGGTTGTGCTATCTGAAAATCTAGCCTTTTAGCTTCCTAGATGATATACTTAATATGA 4600

 91683745 CTAAATAAATCCAGCCTGTACCACAACTGTCAAAACACCTGGAAATTTATAATTTCACCA 91683804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 CTAAATAAATCCAGCCTGTACCACAACTGTCAAAACACCTGGAAATTTATAATTTCACCA 4660

 91683805 TCTCTTCAGAGCAAGAGAGCTTTTGTGACAAATATGGTAGGGTGAATACGGAGCAGATAA 91683864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 TCTCTTCAGAGCAAGAGAGCTTTTGTGACAAATATGGTAGGGTGAATACGGAGCAGATAA 4720

 91683865 ACCCATATACTCTGACTTTCAATAAAGCAAGAGGGGATAACACTTCATAGAGACCAGATA 91683924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 ACCCATATACTCTGACTTTCAATAAAGCAAGAGGGGATAACACTTCATAGAGACCAGATA 4780

 91683925 CCACTCTATCAAGGTTACTGAATGGACTATGTCCTGTACCAGATGTGATGCCTCAATGTG 91683984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 CCACTCTATCAAGGTTACTGAATGGACTATGTCCTGTACCAGATGTGATGCCTCAATGTG 4840

 91683985 ACCAAATCCATTCTAGATGCCTCAAAGCTGGTTTTTTTGGACCTGCATTTTTTTGTGAAA 91684044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 ACCAAATCCATTCTAGATGCCTCAAAGCTGGTTTTTTTGGACCTGCATTTTTTTGTGAAA 4900

 91684045 AATAAAATGCTAACTTATAGGGAAAATGATAACTAATTTTCTTGGCAGTGGTCAATAACT 91684104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 AATAAAATGCTAACTTATAGGGAAAATGATAACTAATTTTCTTGGCAGTGGTCAATAACT 4960

 91684105 GGAGCTAGCATAAATAGCCGTTGGATTTATTTAGGAGAAGTTAACTCAGAATATAAGTGG 91684164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 GGAGCTAGCATAAATAGCCGTTGGATTTATTTAGGAGAAGTTAACTCAGAATATAAGTGG 5020

 91684165 CTTTCCCCTTCTACCTGTATCATAAAGCCTACCTTGACCAATGAGAAATCCAACAGTATT 91684224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 CTTTCCCCTTCTACCTGTATCATAAAGCCTACCTTGACCAATGAGAAATCCAACAGTATT 5080

 91684225 TGAAAATAAACTCCTGAGAACATAGGACGCAAACTAAGATAAGCAAATTACAGTTGTTAT 91684284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 TGAAAATAAACTCCTGAGAACATAGGACGCAAACTAAGATAAGCAAATTACAGTTGTTAT 5140

 91684285 GCTCTCAATTGGCCTATAAAAATAAACAGTTTGAGAAATCTGTGTCTCCTACAGAACCAC 91684344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 GCTCTCAATTGGCCTATAAAAATAAACAGTTTGAGAAATCTGTGTCTCCTACAGAACCAC 5200

 91684345 ACTGACCAGATAGCACAGATGAGACAGCTAGCACCCTGATCATTAATGTCACAGGTAATT 91684404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 ACTGACCAGATAGCACAGATGAGACAGCTAGCACCCTGATCATTAATGTCACAGGTAATT 5260

 91684405 TTGTTGTTGGTTACTAGTATCTGCCATACATACCCTTCAGGAATTAAATGGGCCATCTTT 91684464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 TTGTTGTTGGTTACTAGTATCTGCCATACATACCCTTCAGGAATTAAATGGGCCATCTTT 5320

 91684465 GAAAGCCAAGGTCAAGGAGTGAAATTTTAAAATAATAATCCACCCCCAGCTAACGAAAAG 91684524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 GAAAGCCAAGGTCAAGGAGTGAAATTTTAAAATAATAATCCACCCCCAGCTAACGAAAAG 5380

 91684525 CTAGGACAGGTAGTGTTTTCATTGCTTTTGTATTCAGGCCCTTCTCGTAGTATGCTGTGC 91684584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 CTAGGACAGGTAGTGTTTTCATTGCTTTTGTATTCAGGCCCTTCTCGTAGTATGCTGTGC 5440

 91684585 CTTATGAGGGGAAGAGAGACCCTTGATTTTCAAGGAGGGTGAGTGGGTGGGAGTGCTCCT 91684644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 CTTATGAGGGGAAGAGAGACCCTTGATTTTCAAGGAGGGTGAGTGGGTGGGAGTGCTCCT 5500

 91684645 ATGGGGGATGTATATCATGACAAATAATGGGCTCTTAAAAATTACACCTCCTTACTACCC 91684704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 ATGGGGGATGTATATCATGACAAATAATGGGCTCTTAAAAATTACACCTCCTTACTACCC 5560

 91684705 TGATTCTCTGAAGCCCATAGCGGTGCCATGCATAGCCTTGTTGAGAATTGCTGCCTAGTG 91684764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 TGATTCTCTGAAGCCCATAGCGGTGCCATGCATAGCCTTGTTGAGAATTGCTGCCTAGTG 5620

 91684765 AGCCTCACTGACAGGTAATAGTAATGCATTCAGGTTTGTTGATAAGGAGAAAAGGTTTAG 91684824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 AGCCTCACTGACAGGTAATAGTAATGCATTCAGGTTTGTTGATAAGGAGAAAAGGTTTAG 5680

 91684825 AAGTAATTGATAACTTTTCTTCCAATATAAGTTTTCTTAAAACTTCTAGTATGTTGTTAA 91684884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 AAGTAATTGATAACTTTTCTTCCAATATAAGTTTTCTTAAAACTTCTAGTATGTTGTTAA 5740

 91684885 ACAACAGAGAAATAAGCGCTCTGAGTCTTGGGAGATTCTGTCTGTGTACAAGCATGAACT 91684944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 ACAACAGAGAAATAAGCGCTCTGAGTCTTGGGAGATTCTGTCTGTGTACAAGCATGAACT 5800

 91684945 ATGCTCCATATGAGAACATGAGCCTTGTCATCTGCTTTAAATGTCATTGGAGAACAGTTA 91685004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5801 ATGCTCCATATGAGAACATGAGCCTTGTCATCTGCTTTAAATGTCATTGGAGAACAGTTA 5860

 91685005 TCAATGACTACTTTCCCAGGGTTAAAATTAATAAACTTGAGCTTATTGTATTGCAAGCTT 91685064
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5861 TCAATGACTACTTTCCCAGGGTTGAAATTAATAAACTTGAGCTTATTGTATTGCAAGCTT 5920

 91685065 CTTTAGGATTTCACCCACTGTGAAAATATCATTTAAATAACATTTTACCGAACTTCAGGA 91685124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5921 CTTTAGGATTTCACCCACTGTGAAAATATCATTTAAATAACATTTTACCGAACTTCAGGA 5980

 91685125 CTTCTTGTAAAATTTTGTGACAGTTCATCTTAATATGCGTAATATTTCTGTTCTGATTCC 91685184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5981 CTTCTTGTAAAATTTTGTGACAGTTCATCTTAATATGCGTAATATTTCTGTTCTGATTCC 6040

 91685185 ATTTTTGAACTTTTGTACTCTATTTTTATCTGTAGGATGGAGATAATGCTAGACAAAATT 91685244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6041 ATTTTTGAACTTTTGTACTCTATTTTTATCTGTAGGATGGAGATAATGCTAGACAAAATT 6100

 91685245 CAGAACAAAAGTATGTAATTTGAAAAATAACTGTTAAGAATTAATACTATGCAATTTCCC 91685304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6101 CAGAACAAAAGTATGTAATTTGAAAAATAACTGTTAAGAATTAATACTATGCAATTTCCC 6160

 91685305 ATGGCAATTGATTACGTGTTTGTTCAGAAGTTTGGCACAGTTGCTTGATTAAAATATTAA 91685364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6161 ATGGCAATTGATTACGTGTTTGTTCAGAAGTTTGGCACAGTTGCTTGATTAAAATATTAA 6220

 91685365 TTTTCCAATTTCAATTGAGCAGTTTATGAATTTTACTTTATGGTGTTTACTTTCTCTGAT 91685424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6221 TTTTCCAATTTCAATTGAGCAGTTTATGAATTTTACTTTATGGTGTTTACTTTCTCTGAT 6280

 91685425 AATGTCAATGTTTTTCACTAATTATGTCCAAGGGTGAGCTACCTTGGCCAATAGAACAAC 91685484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6281 AATGTCAATGTTTTTCACTAATTATGTCCAAGGGTGAGCTACCTTGGCCAATAGAACAAC 6340

 91685485 TTGGTTTCAGGTAATTTGTTCTTTTCAGTGGCTGTAAATGTATTGGCTATGTGGTTGAAC 91685544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6341 TTGGTTTCAGGTAATTTGTTCTTTTCAGTGGCTGTAAATGTATTGGCTATGTGGTTGAAC 6400

 91685545 TTTGACCATTTCTCTGACAATAATTTGCAACCTCCATGAGATCAGTCATAAATCCATAGT 91685604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6401 TTTGACCATTTCTCTGACAATAATTTGCAACCTCCATGAGATCAGTCATAAATCCATAGT 6460

 91685605 CAATTATGTGTTAGAAAATATATTAAAAAGCCTCAGAGGAACAAAATTATGTCATTTCTG 91685664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6461 CAATTATGTGTTAGAAAATATATTAAAAAGCCTCAGAGGAACAAAATTATGTCATTTCTG 6520

 91685665 TTGTGGAAGATTGGTTTAAAATAGGTCTTACAAATATTATGAAAATACAACTTACTGTAA 91685724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6521 TTGTGGAAGATTGGTTTAAAATAGGTCTTACAAATATTATGAAAATACAACTTACTGTAA 6580

 91685725 TCATACTGCAGTTTGTCATATGTGGTTCATTGTTATGAGGCAGTAAGGTGATGGCAGAGG 91685784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6581 TCATACTGCAGTTTGTCATATGTGGTTCATTGTTATGAGGCAGTAAGGTGATGGCAGAGG 6640

 91685785 CAGCACTATATATAGCACATAAATAAAAATAAATCAGGTTTACAACTCTGTTTGCAACCA 91685844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6641 CAGCACTATATATAGCACATAAATAAAAATAAATCAGGTTTACAACTCTGTTTGCAACCA 6700

 91685845 TCTGTAATGCATGGTAGCATATGTTTTATAGTTTTATTGAGAGAATACATCTTTTAATTC 91685904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6701 TCTGTAATGCATGGTAGCATATGTTTTATAGTTTTATTGAGAGAATACATCTTTTAATTC 6760

 91685905 TCAAAACTTTGAGTTTGAAAGCTCATCTGTGATAGAAACTAATGGTTGAATTACAAGCTA 91685964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6761 TCAAAACTTTGAGTTTGAAAGCTCATCTGTGATAGAAACTAATGGTTGAATTACAAGCTA 6820

 91685965 AAGTGAATTTCATTTTACTTATTCTTCTAATCAGTTTACAAAGTGCAGCTTTACCTGCAG 91686024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6821 AAGTGAATTTCATTTTACTTATTCTTCTAATCAGTTTACAAAGTGCAGCTTTACCTGCAG 6880

 91686025 GAGGCATTCTTCCTTTTCTTTTTTTAAAAGATGAAATGTAAAAGA 91686069
          |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     6881 GAGGCATTCTTCCTTCTCTTTTTTTAAAAGATGAAATGTAAAAGA 6925

Alignment time is 8.57845 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3094] =>      3094 nucs 'mol-32-2b34-054208_3094'

Score:        3094
Aligned:      3094        nucs
Identic:      3094 (100%) nucs =>      1084 (100%)      2010 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91676050,91677133] EXCISED REGION [91677136,91679145]
 second seq =>  [       1,    1084] EXCISED REGION [    1085,    3094]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [91677134,91677135]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [91677134,91677149] to [91677136,91677151]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91677134,91677134] to [91677135,91677135]
 second seq =>         0 nucs

 91676050 TCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTTT 91676109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTTT 60

 91676110 ATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATAT 91676169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATAT 120

 91676170 TGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATC 91676229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATC 180

 91676230 CAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTG 91676289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTG 240

 91676290 TCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAG 91676349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAG 300

 91676350 AACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGC 91676409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGC 360

 91676410 TTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTC 91676469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTC 420

 91676470 CATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGG 91676529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGG 480

 91676530 TTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTA 91676589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTA 540

 91676590 TGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAAC 91676649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAAC 600

 91676650 GGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTA 91676709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTA 660

 91676710 ATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATC 91676769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATC 720

 91676770 TCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATT 91676829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATT 780

 91676830 GTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCA 91676889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCA 840

 91676890 CTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCT 91676949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCT 900

 91676950 GGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTT 91677009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTT 960

 91677010 ATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACA 91677069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACA 1020

 91677070 GTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCT 91677129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCT 1080

 91677130 TTTC 91677133
          ||||
     1081 TTTC 1084

EXCISED REGION

 91677136 TTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAG 91677195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 TTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAG 1144

 91677196 GTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACAC 91677255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 GTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACAC 1204

 91677256 ATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCC 91677315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 ATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCC 1264

 91677316 ACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATA 91677375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 ACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATA 1324

 91677376 GCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACT 91677435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 GCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACT 1384

 91677436 TTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTC 91677495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 TTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTC 1444

 91677496 CTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGA 91677555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 CTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGA 1504

 91677556 TTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACA 91677615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 TTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACA 1564

 91677616 TGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTA 91677675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 TGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTA 1624

 91677676 GTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATG 91677735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 GTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATG 1684

 91677736 TTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTT 91677795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 TTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTT 1744

 91677796 CACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTC 91677855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 CACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTC 1804

 91677856 TTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATAT 91677915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 TTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATAT 1864

 91677916 CGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAG 91677975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 CGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAG 1924

 91677976 TAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAG 91678035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 TAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAG 1984

 91678036 AGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCC 91678095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 AGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCC 2044

 91678096 GCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTT 91678155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 GCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTT 2104

 91678156 TTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATT 91678215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 TTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATT 2164

 91678216 TCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTC 91678275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 TCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTC 2224

 91678276 TTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTG 91678335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 TTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTG 2284

 91678336 TTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTG 91678395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 TTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTG 2344

 91678396 TCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTG 91678455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 TCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTG 2404

 91678456 ATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTT 91678515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 ATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTT 2464

 91678516 GTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCT 91678575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 GTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCT 2524

 91678576 AGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAG 91678635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 AGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAG 2584

 91678636 TCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATT 91678695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 TCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATT 2644

 91678696 CTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGC 91678755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 CTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGC 2704

 91678756 CACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATT 91678815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 CACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATT 2764

 91678816 TCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCT 91678875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 TCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCT 2824

 91678876 GTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTA 91678935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 GTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTA 2884

 91678936 CTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGG 91678995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 CTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGG 2944

 91678996 GGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGA 91679055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 GGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGA 3004

 91679056 ATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATA 91679115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 ATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATA 3064

 91679116 AGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGAT 91679145
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 AGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGAT 3094

Alignment time is 4.38456 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    7609] =>      7609 nucs 'mol-32-2b3f-043189_7609'

Score:        7608
Aligned:      7608        nucs
Identic:      7608 (100%) nucs =>      5510 (100%)      2098 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91674934,91680443] EXCISED REGION [91680445,91682542]
 second seq =>  [       1,    5510] EXCISED REGION [    5512,    7609]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [5511,5511]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [91680443,91680449] to [91680444,91680450]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91680443,91680443] to [91680445,91680445]
 second seq =>         1 nucs [5510,5510] to [5512,5512]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91674934 TTCCCAAAATGTTAGAATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCTCTCTCTCCCCCTTT 91674993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCCCAAAATGTTAGAATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCTCTCTCTCCCCCTTT 60

 91674994 TCTTTTGAATTCTTTGGATTTGTTTTTCATATTCCACTTTAATATATCTGTTGACCTCTG 91675053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTTTGAATTCTTTGGATTTGTTTTTCATATTCCACTTTAATATATCTGTTGACCTCTG 120

 91675054 ACTATGTCTCCTGTATTATTTCTTAGTGCTTGCGCTAGGCCTGATAATATACATACCTAA 91675113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTATGTCTCCTGTATTATTTCTTAGTGCTTGCGCTAGGCCTGATAATATACATACCTAA 180

 91675114 CCTTTCACAGTTTACTCAGAGTTATATTTTACTACCATAGTAAAAATGTGGAAGTTTTAC 91675173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTTTCACAGTTTACTCAGAGTTATATTTTACTACCATAGTAAAAATGTGGAAGTTTTAC 240

 91675174 CATGGAGTTTATCTTTTCCCACAAACCTTTTTGTTATAGTTGTCATATGGGTTACAACTA 91675233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGGAGTTTATCTTTTCCCACAAACCTTTTTGTTATAGTTGTCATATGGGTTACAACTA 300

 91675234 TGTACACTGATTGCAATGATCATACATAATTTAAGGAATTTAAGAAAAGAAAATTTAGTT 91675293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTACACTGATTGCAATGATCATACATAATTTAAGGAATTTAAGAAAAGAAAATTTAGTT 360

 91675294 TTGTATTACCCATTTTTTATTATTCATCTTTCTCTTACTTTATTCCTGAAATTTTTTCCT 91675353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGTATTACCCATTTTTTATTATTCATCTTTCTCTTACTTTATTCCTGAAATTTTTTCCT 420

 91675354 ACAGGCCTTCAAATCAACTTTTTATTAGTTACAACAATGAAATTGAATATTTAATTTTTT 91675413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGGCCTTCAAATCAACTTTTTATTAGTTACAACAATGAAATTGAATATTTAATTTTTT 480

 91675414 CTCTTAAGAACGAGATTTAATAAATTCAACTTCATGTAATTTTCCTTCAGCCTGAGATCT 91675473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTTAAGAACGAGATTTAATAAATTCAACTTCATGTAATTTTCCTTCAGCCTGAGATCT 540

 91675474 TTCGGCAATGAGTTCTGTGAGTTTCCCTTCATCTACGAATGCCTTTCTTTATCCTTCATC 91675533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCGGCAATGAGTTCTGTGAGTTTCCCTTCATCTACGAATGCCTTTCTTTATCCTTCATC 600

 91675534 CCAAGGAGGGTTTTTAATGGATATTTAATGGATATAAAGTTTTACATTAGCAGTTAGTTG 91675593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAAGGAGGGTTTTTAATGGATATTTAATGGATATAAAGTTTTACATTAGCAGTTAGTTG 660

 91675594 CTTTCTTTCATCATTTTAAGATACCATCTCACTATTTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATG 91675653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTCTTTCATCATTTTAAGATACCATCTCACTATTTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATG 720

 91675654 AGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCATTAATTATAATGAATTATTTTTCTCTAG 91675713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCATTAATTATAATGAATTATTTTTCTCTAG 780

 91675714 CTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCTTGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGA 91675773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCTTGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGA 840

 91675774 TTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAGCTAATGAATATGTAATTTTGTTTCT 91675833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAGCTAATGAATATGTAATTTTGTTTCT 900

 91675834 CATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTCACATTTTTTTTATGGAGCAATCACT 91675893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTCACATTTTTTTTATGGAGCAATCACT 960

 91675894 TTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATTTTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTG 91675953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATTTTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTG 1020

 91675954 TTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTG 91676013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTG 1080

 91676014 GATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCT 91676073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCT 1140

 91676074 GCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAA 91676133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAA 1200

 91676134 CTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATA 91676193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATA 1260

 91676194 CAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTA 91676253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTA 1320

 91676254 GCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCC 91676313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCC 1380

 91676314 ATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGT 91676373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGT 1440

 91676374 TTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAAC 91676433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAAC 1500

 91676434 ATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATT 91676493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATT 1560

 91676494 TTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAAT 91676553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAAT 1620

 91676554 AATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTT 91676613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTT 1680

 91676614 AGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTG 91676673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTG 1740

 91676674 AGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATG 91676733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATG 1800

 91676734 TAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTT 91676793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTT 1860

 91676794 CTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTC 91676853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTC 1920

 91676854 TTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTT 91676913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTT 1980

 91676914 TTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTT 91676973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTT 2040

 91676974 TATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTAC 91677033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTAC 2100

 91677034 TTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATA 91677093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATA 2160

 91677094 CCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAA 91677153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAA 2220

 91677154 ATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATG 91677213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATG 2280

 91677214 GATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTAC 91677273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTAC 2340

 91677274 ACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCC 91677333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCC 2400

 91677334 CCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATG 91677393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATG 2460

 91677394 AGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATC 91677453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATC 2520

 91677454 TCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAG 91677513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAG 2580

 91677514 TATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTT 91677573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTT 2640

 91677574 GGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTT 91677633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTT 2700

 91677634 TTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAA 91677693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAA 2760

 91677694 ATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTA 91677753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTA 2820

 91677754 CTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAAC 91677813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAAC 2880

 91677814 GTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGA 91677873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGA 2940

 91677874 GTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCT 91677933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCT 3000

 91677934 GCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCA 91677993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCA 3060

 91677994 CCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATG 91678053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATG 3120

 91678054 TTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGT 91678113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGT 3180

 91678114 GCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTT 91678173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTT 3240

 91678174 GCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGAT 91678233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGAT 3300

 91678234 GTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATT 91678293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATT 3360

 91678294 CATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTA 91678353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTA 3420

 91678354 ATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCA 91678413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCA 3480

 91678414 AAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTG 91678473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTG 3540

 91678474 CAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCT 91678533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCT 3600

 91678534 TTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATG 91678593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATG 3660

 91678594 TTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAG 91678653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAG 3720

 91678654 TTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGC 91678713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGC 3780

 91678714 CAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTT 91678773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTT 3840

 91678774 GCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTG 91678833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTG 3900

 91678834 TTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCC 91678893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCC 3960

 91678894 TTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGC 91678953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGC 4020

 91678954 TTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGT 91679013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGT 4080

 91679014 TCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTG 91679073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTG 4140

 91679074 GCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGT 91679133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGT 4200

 91679134 GTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTT 91679193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTT 4260

 91679194 TTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGT 91679253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGT 4320

 91679254 ATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTT 91679313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTT 4380

 91679314 AACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATT 91679373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATT 4440

 91679374 AATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATA 91679433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATA 4500

 91679434 GTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTC 91679493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTC 4560

 91679494 GTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACA 91679553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACA 4620

 91679554 TTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTT 91679613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTT 4680

 91679614 TCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTAC 91679673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTAC 4740

 91679674 ATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGT 91679733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGT 4800

 91679734 GTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAG 91679793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAG 4860

 91679794 AGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTAT 91679853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTAT 4920

 91679854 ATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGG 91679913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGG 4980

 91679914 GGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACC 91679973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACC 5040

 91679974 CAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAAT 91680033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAAT 5100

 91680034 CTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGA 91680093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGA 5160

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 5220

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 5280

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 5340

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 5400

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 5460

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 91680443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 5510

EXCISED REGION

 91680445 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 91680504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5512 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 5571

 91680505 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 91680564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5572 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 5631

 91680565 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 91680624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5632 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 5691

 91680625 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 91680684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5692 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 5751

 91680685 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 91680744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5752 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 5811

 91680745 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 91680804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5812 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 5871

 91680805 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 91680864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5872 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 5931

 91680865 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 91680924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5932 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 5991

 91680925 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 91680984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5992 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 6051

 91680985 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 91681044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6052 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 6111

 91681045 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 91681104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6112 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 6171

 91681105 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 91681164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6172 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 6231

 91681165 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 91681224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6232 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 6291

 91681225 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATT 91681284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6292 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATT 6351

 91681285 TACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAA 91681344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6352 TACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAA 6411

 91681345 ACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTG 91681404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6412 ACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTG 6471

 91681405 ACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTA 91681464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6472 ACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTA 6531

 91681465 TTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATC 91681524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6532 TTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATC 6591

 91681525 GAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATT 91681584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6592 GAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATT 6651

 91681585 TTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGA 91681644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6652 TTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGA 6711

 91681645 AATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAAC 91681704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6712 AATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAAC 6771

 91681705 AGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGC 91681764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6772 AGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGC 6831

 91681765 TGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTAT 91681824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6832 TGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTAT 6891

 91681825 CCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCA 91681884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6892 CCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCA 6951

 91681885 AGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCAC 91681944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6952 AGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCAC 7011

 91681945 TTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTA 91682004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7012 TTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTA 7071

 91682005 TCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCT 91682064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7072 TCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCT 7131

 91682065 TTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAA 91682124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7132 TTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAA 7191

 91682125 ACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCC 91682184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7192 ACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCC 7251

 91682185 CTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAA 91682244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7252 CTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAA 7311

 91682245 GACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAA 91682304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7312 GACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAA 7371

 91682305 TATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGAT 91682364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7372 TATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGAT 7431

 91682365 TTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGA 91682424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7432 TTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGA 7491

 91682425 CCAATATAGCAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATT 91682484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7492 CCAATATAGCAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATT 7551

 91682485 TTTCATAGTTACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGT 91682542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7552 TTTCATAGTTACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGT 7609

Alignment time is 9.79946 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    7355] =>      7355 nucs 'mol-32-2b3f-062842_7355'

Score:        7095
Aligned:      7356        nucs
Identic:      7329 (100%) nucs =>      1493 (100%)      5836 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91676636,91678133] EXCISED REGION [91680094,91685946]
 second seq =>  [       1,    1497] EXCISED REGION [    1498,    7355]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1960 nucs [91678134,91680093]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91678134,91678134] to [91680094,91680094]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91676636 CTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCC 91676695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCC 60

 91676696 ACATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACA 91676755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACA 120

 91676756 ACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGA 91676815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGA 180

 91676816 GCATTTTTCATATTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTC 91676875
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCATTTTTCATATTGTGCTTGCAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTC 240

 91676876 AAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAAT 91676935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAAT 300

 91676936 TCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCA 91676995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCA 360

 91676996 GTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGT 91677055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGT 420

 91677056 CTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAA 91677115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAA 480

 91677116 CCCGTAGAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTC 91677175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
      481 CCCGTAGAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT-AAATTTTATTTCACATTTTATTTC 539

 91677176 CAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATT 91677235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 CAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATT 599

 91677236 TCTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTT 91677295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TCTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTT 659

 91677296 TTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCT 91677355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCT 719

 91677356 TATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGG 91677415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGG 779

 91677416 TTTTCTATTCCTGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTG 91677475
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTTTCTATTCCTGAGTTACTTAACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTG 839

 91677476 CAAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAA 91677535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      840 CAAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATAAAACACAA 899

 91677536 TTTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGC 91677595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TTTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGC 959

 91677596 AAATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTC 91677655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AAATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTC 1019

 91677656 CTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTT 91677715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTT 1079

 91677716 TTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACC 91677775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACC 1139

 91677776 ATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTAT 91677835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTAT 1199

 91677836 TTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCT 91677895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCT 1259

 91677896 GGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTC 91677955
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1260 GGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACACCATTC 1319

 91677956 TCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAAT 91678015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAAT 1379

 91678016 TATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCT 91678075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCT 1439

 91678076 CCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 91678133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 1497

EXCISED REGION

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1498 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTGTAGGAAGATTTTG 1557

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 1617

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 1677

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1678 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTTAG 1737

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 1797

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 91680453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 1857

 91680454 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 91680513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1858 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGCTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 1917

 91680514 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTC 91680573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1918 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTGTC 1977

 91680574 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 91680633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 2037

 91680634 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 91680693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 2097

 91680694 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCCTAAGATATT 91680753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2098 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTACTGATCCTAAGATATT 2157

 91680754 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 91680813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 2217

 91680814 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 91680873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 2277

 91680874 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 91680933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 2337

 91680934 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 91680993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 2397

 91680994 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 91681053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 2457

 91681054 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 91681113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 2517

 91681114 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 91681173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 2577

 91681174 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 91681233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 2637

 91681234 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTACAGAGCT 91681293
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2638 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTATAGAGCT 2697

 91681294 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 91681353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 2757

 91681354 TCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAA 91681413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAA 2817

 91681414 TGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTATTTTTGGAC 91681473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 TGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTATTTTTGGAC 2877

 91681474 TACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATCGAACTATGT 91681533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATCGAACTATGT 2937

 91681534 TTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATTTTAACAATA 91681593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATTTTAACAATA 2997

 91681594 TAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGAAATTATTAA 91681653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGAAATTATTAA 3057

 91681654 AATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAACAGGGTATTG 91681713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 AATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAACAGGGTATTG 3117

 91681714 CATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGCTGAAAATAC 91681773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 CATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGCTGAAAATAC 3177

 91681774 TAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTATCCAATGTTC 91681833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 TAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTATCCAATGTTC 3237

 91681834 TTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCC 91681893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 TTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCC 3297

 91681894 AACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCACTTTACTATT 91681953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 AACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCACTTTACTATT 3357

 91681954 GAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTATCTTCTTTC 91682013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTATCTTCTTTC 3417

 91682014 CTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCTTTTCTCCTT 91682073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCTTTTCTCCTT 3477

 91682074 CCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAAACTTAAGTG 91682133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 CCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAAACTTAAGTG 3537

 91682134 TTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCCCTATAATTA 91682193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 TTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCCCTATAATTA 3597

 91682194 TTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAAGACATAATT 91682253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAAGACATAATT 3657

 91682254 CTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAATATTGTATC 91682313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 CTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAATATTGTATC 3717

 91682314 CTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGATTTATTTAAT 91682373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 CTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGATTTATTTAAT 3777

 91682374 GAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGACCAATATAG 91682433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 GAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGACCAATATAG 3837

 91682434 CAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATTTTTCATAGT 91682493
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 CAAAAATTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATTTTTCATAGT 3897

 91682494 TACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGTTTGCTAATCTA 91682553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 TACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGTTTGCTAATCTA 3957

 91682554 AAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATTGATAGCTGTACATGGTACA 91682613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 AAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATTGATAGCTGTACATGGTACA 4017

 91682614 CTTGGTATAGTATAACTTCTCATAACCGTTAATTATTTTATTGCCATTATTGCTATTAGT 91682673
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4018 CCTGGTATAGTATAACTTCTCATAACCGTTAATTATTTTATTGCCATTATTGCTCTTAGT 4077

 91682674 ACCAGTAATAACACTCTTCCAATGGAAAATATTTTTCTGAAAACTCATAAATATAATAAT 91682733
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4078 ACCAGTAATAACACTCTTCCAATGGAAAATATTATTCTGAAAACTCATAAATATAATAAT 4137

 91682734 ATTCATTGTTTCAGAAATTAGCTAAAAGTAGGACCTATGAAGTATTATGGTGCTGGTTAA 91682793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 ATTCATTGTTTCAGAAATTAGCTAAAAGTAGGACCTATGAAGTATTATGGTGCTGGTTAA 4197

 91682794 CATAACATGTAGTTAGTGAAATCACCAATAAATGAAGACATGACATATAATCTAAATTAT 91682853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 CATAACATGTAGTTAGTGAAATCACCAATAAATGAAGACATGACATATAATCTAAATTAT 4257

 91682854 ATTATATTTGCATAGTCTAA-----ATTATATTATGTATGGCATATGTCCATACTCCATC 91682908
          ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 ATTATATTTGCATAGTCTAAATTATATTATATTATGTATGGCATATGTCCATACTCCATC 4317

 91682909 CTAAGAAATCCAATTCTTTTAATAATTGTAATAGAATTGATTGAGCTTGCTATTAGAGTG 91682968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 CTAAGAAATCCAATTCTTTTAATAATTGTAATAGAATTGATTGAGCTTGCTATTAGAGTG 4377

 91682969 TTTAACTGTACTCTTGAAATGGGTTTTACTAAAAGAGATATGGAAAATTTTATTTATGAG 91683028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TTTAACTGTACTCTTGAAATGGGTTTTACTAAAAGAGATATGGAAAATTTTATTTATGAG 4437

 91683029 CTTCAAATGAGCATCTAATCTACTAGTGTCATTGTAATTTCTCATACAAGTGTACAAATG 91683088
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CTTCAAATGAGCATCTAATCTACTAATGTCATTGTAATTTCTCATACAAGTGTACAAATG 4497

 91683089 ATAGCGCAGCATCTCTTTCAGGTGTTATATTCAGAATCATAATAAAACTCTTGCAGAATA 91683148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 ATAGCGCAGCATCTCTTTCAGGTGTTATATTCAGAATCATAATAAAACTCTTGCAGAATA 4557

 91683149 TATGTGTGCATCAAAATGAAATGACAATGAATTTTCTCTCGAAATTGATAGCACGTATTA 91683208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 TATGTGTGCATCAAAATGAAATGACAATGAATTTTCTCTCGAAATTGATAGCACGTATTA 4617

 91683209 GCATAAATTGAACTGTGCAACTGTGTCCATAACAGGCTGAGTGATGTAGCAGTTGATTGC 91683268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 GCATAAATTGAACTGTGCAACTGTGTCCATAACAGGCTGAGTGATGTAGCAGTTGATTGC 4677

 91683269 TTTGTACACATTCTTGTGTTTTGCCTTCTGTTTTCCTTGCTGTGTGTTATTCTCTCTTCC 91683328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 TTTGTACACATTCTTGTGTTTTGCCTTCTGTTTTCCTTGCTGTGTGTTATTCTCTCTTCC 4737

 91683329 GTCCCACCAAGGTGAGAGTAAATTTTTCCCTTCCTGGCTTTATTGCTTGAAGATAATAGA 91683388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 GTCCCACCAAGGTGAGAGTAAATTTTTCCCTTCCTGGCTTTATTGCTTGAAGATAATAGA 4797

 91683389 GTAAGGCAGGAGCATGTGCAAGGCAAAAGTACCTGTTGTCATCATTGCCCTTTTCCGGTG 91683448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 GTAAGGCAGGAGCATGTGCAAGGCAAAAGTACCTGTTGTCATCATTGCCCTTTTCCGGTG 4857

 91683449 TCCCTCTTTATTTCCTTCTGTGTCTTTGATATTCCAGGCAAAACTCTTTTATAACACTTC 91683508
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4858 TCCCTCTTTATTTCCTTCTGTGTCTTTGATATTACAGGCAAAACTCTTTTATAACACTTC 4917

 91683509 ATGCCATGGCCCCTTCCAGCTACAGATAGGACAGGTGGTTGAATGGCTAGCACTCCATGA 91683568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 ATGCCATGGCCCCTTCCAGCTACAGATAGGACAGGTGGTTGAATGGCTAGCACTCCATGA 4977

 91683569 GCTTTATTCATGTATATTTATAAAAGTGCAATTTCTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTAT 91683628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 GCTTTATTCATGTATATTTATAAAAGTGCAATTTCTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTAT 5037

 91683629 ATTATAGCAAACTCTTGTACATTTACTTACTTATTTTCTTTCAGTGATCATGCTAGTATG 91683688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 ATTATAGCAAACTCTTGTACATTTACTTACTTATTTTCTTTCAGTGATCATGCTAGTATG 5097

 91683689 GTTGTGCTATCTGAAAATCTAGCCTTTTAGCTTCCTAGATGATATACTTAATATGACTAA 91683748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 GTTGTGCTATCTGAAAATCTAGCCTTTTAGCTTCCTAGATGATATACTTAATATGACTAA 5157

 91683749 ATAAATCCAGCCTGTACCACAACTGTCAAAACACCTGGAAATTTATAATTTCACCATCTC 91683808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 ATAAATCCAGCCTGTACCACAACTGTCAAAACACCTGGAAATTTATAATTTCACCATCTC 5217

 91683809 TTCAGAGCAAGAGAGCTTTTGTGACAAATATGGTAGGGTGAATACGGAGCAGATAAACCC 91683868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 TTCAGAGCAAGAGAGCTTTTGTGACAAATATGGTAGGGTGAATACGGAGCAGATAAACCC 5277

 91683869 ATATACTCTGACTTTCAATAAAGCAAGAGGGGATAACACTTCATAGAGACCAGATACCAC 91683928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 ATATACTCTGACTTTCAATAAAGCAAGAGGGGATAACACTTCATAGAGACCAGATACCAC 5337

 91683929 TCTATCAAGGTTACTGAATGGACTATGTCCTGTACCAGATGTGATGCCTCAATGTGACCA 91683988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 TCTATCAAGGTTACTGAATGGACTATGTCCTGTACCAGATGTGATGCCTCAATGTGACCA 5397

 91683989 AATCCATTCTAGATGCCTCAAAGCTGGTTTTTTTGGACCTGCATTTTTTTGTGAAAAATA 91684048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 AATCCATTCTAGATGCCTCAAAGCTGGTTTTTTTGGACCTGCATTTTTTTGTGAAAAATA 5457

 91684049 AAATGCTAACTTATAGGGAAAATGATAACTAATTTTCTTGGCAGTGGTCAATAACTGGAG 91684108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 AAATGCTAACTTATAGGGAAAATGATAACTAATTTTCTTGGCAGTGGTCAATAACTGGAG 5517

 91684109 CTAGCATAAATAGCCGTTGGATTTATTTAGGAGAAGTTAACTCAGAATATAAGTGGCTTT 91684168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 CTAGCATAAATAGCCGTTGGATTTATTTAGGAGAAGTTAACTCAGAATATAAGTGGCTTT 5577

 91684169 CCCCTTCTACCTGTATCATAAAGCCTACCTTGACCAATGAGAAATCCAACAGTATTTGAA 91684228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 CCCCTTCTACCTGTATCATAAAGCCTACCTTGACCAATGAGAAATCCAACAGTATTTGAA 5637

 91684229 AATAAACTCCTGAGAACATAGGACGCAAACTAAGATAAGCAAATTACAGTTGTTATGCTC 91684288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 AATAAACTCCTGAGAACATAGGACGCAAACTAAGATAAGCAAATTACAGTTGTTATGCTC 5697

 91684289 TCAATTGGCCTATAAAAATAAACAGTTTGAGAAATCTGTGTCTCCTACAGAACCACACTG 91684348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 TCAATTGGCCTATAAAAATAAACAGTTTGAGAAATCTGTGTCTCCTACAGAACCACACTG 5757

 91684349 ACCAGATAGCACAGATGAGACAGCTAGCACCCTGATCATTAATGTCACAGGTAATTTTGT 91684408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 ACCAGATAGCACAGATGAGACAGCTAGCACCCTGATCATTAATGTCACAGGTAATTTTGT 5817

 91684409 TGTTGGTTACTAGTATCTGCCATACATACCCTTCAGGAATTAAATGGGCCATCTTTGAAA 91684468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 TGTTGGTTACTAGTATCTGCCATACATACCCTTCAGGAATTAAATGGGCCATCTTTGAAA 5877

 91684469 GCCAAGGTCAAGGAGTGAAATTTTAAAATAATAATCCACCCCCAGCTAACGAAAAGCTAG 91684528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 GCCAAGGTCAAGGAGTGAAATTTTAAAATAATAATCCACCCCCAGCTAACGAAAAGCTAG 5937

 91684529 GACAGGTAGTGTTTTCATTGCTTTTGTATTCAGGCCCTTCTCGTAGTATGCTGTGCCTTA 91684588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 GACAGGTAGTGTTTTCATTGCTTTTGTATTCAGGCCCTTCTCGTAGTATGCTGTGCCTTA 5997

 91684589 TGAGGGGAAGAGAGACCCTTGATTTTCAAGGAGGGTGAGTGGGTGGGAGTGCTCCTATGG 91684648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 TGAGGGGAAGAGAGACCCTTGATTTTCAAGGAGGGTGAGTGGGTGGGAGTGCTCCTATGG 6057

 91684649 GGGATGTATATCATGACAAATAATGGGCTCTTAAAAATTACACCTCCTTACTACCCTGAT 91684708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 GGGATGTATATCATGACAAATAATGGGCTCTTAAAAATTACACCTCCTTACTACCCTGAT 6117

 91684709 TCTCTGAAGCCCATAGCGGTGCCATGCATAGCCTTGTTGAGAATTGCTGCCTAGTGAGCC 91684768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 TCTCTGAAGCCCATAGCGGTGCCATGCATAGCCTTGTTGAGAATTGCTGCCTAGTGAGCC 6177

 91684769 TCACTGACAGGTAATAGTAATGCATTCAGGTTTGTTGATAAGGAGAAAAGGTTTAGAAGT 91684828
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 TCACTGACAGGTAATAGTAACGCATTCAGGTTTGTTGATAAGGAGAAAAGGTTTAGAAGT 6237

 91684829 AATTGATAACTTTTCTTCCAATATAAGTTTTCTTAAAACTTCTAGTATGTTGTTAAACAA 91684888
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 AATTGATAACTTTTCTTCCAATACAAGTTTTCTTAAAACTTCTAGTATGTTGTTAAACAA 6297

 91684889 CAGAGAAATAAGCGCTCTGAGTCTTGGGAGATTCTGTCTGTGTACAAGCATGAACTATGC 91684948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 CAGAGAAATAAGCGCTCTGAGTCTTGGGAGATTCTGTCTGTGTACAAGCATGAACTATGC 6357

 91684949 TCCATATGAGAACATGAGCCTTGTCATCTGCTTTAAATGTCATTGGAGAACAGTTATCAA 91685008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 TCCATATGAGAACATGAGCCTTGTCATCTGCTTTAAATGTCATTGGAGAACAGTTATCAA 6417

 91685009 TGACTACTTTCCCAGGGTTAAAATTAATAAACTTGAGCTTATTGTATTGCAAGCTTCTTT 91685068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 TGACTACTTTCCCAGGGTTAAAATTAATAAACTTGAGCTTATTGTATTGCAAGCTTCTTT 6477

 91685069 AGGATTTCACCCACTGTGAAAATATCATTTAAATAACATTTTACCGAACTTCAGGACTTC 91685128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6478 AGGATTTCACCCACTGTGAAAATATCATTTAAATAACATTTTACCGAACTTCAGGACTTC 6537

 91685129 TTGTAAAATTTTGTGACAGTTCATCTTAATATGCGTAATATTTCTGTTCTGATTCCATTT 91685188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     6538 TTGTAAAATTTTGTGACAGTTCATCTTAATATGCATAATATTTCTGTTCTGATTCCATTT 6597

 91685189 TTGAACTTTTGTACTCTATTTTTATCTGTAGGATGGAGATAATGCTAGACAAAATTCAGA 91685248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 TTGAACTTTTGTACTCTATTTTTATCTGTAGGATGGAGATAATGCTAGACAAAATTCAGA 6657

 91685249 ACAAAAGTATGTAATTTGAAAAATAACTGTTAAGAATTAATACTATGCAATTTCCCATGG 91685308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 ACAAAAGTATGTAATTTGAAAAATAACTGTTAAGAATTAATACTATGCAATTTCCCATGG 6717

 91685309 CAATTGATTACGTGTTTGTTCAGAAGTTTGGCACAGTTGCTTGATTAAAATATTAATTTT 91685368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6718 CAATTGATTACGTGTTTGTTCAGAAGTTTGGCACAGTTGCTTGATTAAAATATTAATTTT 6777

 91685369 CCAATTTCAATTGAGCAGTTTATGAATTTTACTTTATGGTGTTTACTTTCTCTGATAATG 91685428
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6778 CCAGTTTCAATTGAGCAGTTTATGAATTTTACTTTATGGTGTTTACTTTCTCTGATAATG 6837

 91685429 TCAATGTTTTTCACTAATTATGTCCAAGGGTGAGCTACCTTGGCCAATAGAACAACTTGG 91685488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6838 TCAATGTTTTTCACTAATTATGTCCAAGGGTGAGCTACCTTGGCCAATAGAACAACTTGG 6897

 91685489 TTTCAGGTAATTTGTTCTTTTCAGTGGCTGTAAATGTATTGGCTATGTGGTTGAACTTTG 91685548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6898 TTTCAGGTAATTTGTTCTTTTCAGTGGCTGTAAATGTATTGGCTATGTGGTTGAACTTTG 6957

 91685549 ACCATTTCTCTGACAATAATTTGCAACCTCCATGAGATCAGTCATAAATCCATAGTCAAT 91685608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6958 ACCATTTCTCTGACAATAATTTGCAACCTCCATGAGATCAGTCATAAATCCATAGTCAAT 7017

 91685609 TATGTGTTAGAAAATATATTAAAAAGCCTCAGAGGAACAAAATTATGTCATTTCTGTTGT 91685668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7018 TATGTGTTAGAAAATATATTAAAAAGCCTCAGAGGAACAAAATTATGTCATTTCTGTTGT 7077

 91685669 GGAAGATTGGTTTAAAATAGGTCTTACAAATATTATGAAAATACAACTTACTGTAATCAT 91685728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7078 GGAAGATTGGTTTAAAATAGGTCTTACAAATATTATGAAAATACAACTTACTGTAATCAT 7137

 91685729 ACTGCAGTTTGTCATATGTGGTTCATTGTTATGAGGCAGTAAGGTGATGGCAGAGGCAGC 91685788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7138 ACTGCAGTTTGTCATATGTGGTTCATTGTTATGAGGCAGTAAGGTGATGGCAGAGGCAGC 7197

 91685789 ACTATATATAGCACATAAATAAAAATAAATCAGGTTTACAACTCTGTTTGCAACCATCTG 91685848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7198 ACTATATATAGCACATAAATAAAAATAAATCAGGTTTACAACTCTGTTTGCAACCATCTG 7257

 91685849 TAATGCATGGTAGCATATGTTTTATAGTTTTATTGAGAGAATACATCTTTTAATTCTCAA 91685908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7258 TAATGCATGGTAGCATATGTTTTATAGTTTTATTGAGAGAATACATCTTTTAATTCTCAA 7317

 91685909 AACTTTGAGTTTGAAAGCTCATCTGTGATAGAAACTAA 91685946
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     7318 AACTTTGAGTTTGAAAGCTCATCTCTGATAGAAACTAA 7355

Alignment time is 9.47994 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3378] =>      3378 nucs 'mol-32-2dff-047666_3378'

Score:        3258
Aligned:      3379        nucs
Identic:      3368 (100%) nucs =>      1542 (100%)      1826 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91676587,91678133] EXCISED REGION [91680094,91681925]
 second seq =>  [       1,    1546] EXCISED REGION [    1547,    3378]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1960 nucs [91678134,91680093]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91678134,91678134] to [91680094,91680094]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91676587 TTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCA 91676646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCA 60

 91676647 AACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAA 91676706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAA 120

 91676707 CTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGT 91676766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGT 180

 91676767 ATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCAT 91676826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCAT 240

 91676827 ATTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGC 91676886
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTGTGCTTGCAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGC 300

 91676887 CCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGAT 91676946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGAT 360

 91676947 TCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATT 91677006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATT 420

 91677007 TTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAG 91677066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAG 480

 91677067 ACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATT 91677126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATT 540

 91677127 TCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTT 91677186
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT-AAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTT 599

 91677187 GGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTT 91677246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTT 659

 91677247 GGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCAC 91677306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCAC 719

 91677307 TCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGC 91677366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGC 779

 91677367 ATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCC 91677426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 ATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCC 839

 91677427 TGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATT 91677486
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TGAGTTACTTAACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATT 899

 91677487 ATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTC 91677546
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 ATATCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTC 959

 91677547 ACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTG 91677606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTG 1019

 91677607 CTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGA 91677666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGA 1079

 91677667 TATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATC 91677726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATC 1139

 91677727 TGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTG 91677786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTG 1199

 91677787 TTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTT 91677846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTT 1259

 91677847 CTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 91677906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 1319

 91677907 GCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAG 91677966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1320 GCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAG 1379

 91677967 CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTAT 91678026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTAT 1439

 91678027 TTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGT 91678086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGT 1499

 91678087 GATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 91678133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 1546

EXCISED REGION

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1547 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTGTAGGAAGATTTTG 1606

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 1666

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 1726

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1727 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTTAG 1786

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 1846

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 91680453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 1906

 91680454 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 91680513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1907 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGCTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 1966

 91680514 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTC 91680573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1967 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTGTC 2026

 91680574 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 91680633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 2086

 91680634 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 91680693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 2146

 91680694 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCCTAAGATATT 91680753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2147 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTACTGATCCTAAGATATT 2206

 91680754 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 91680813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 2266

 91680814 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 91680873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 2326

 91680874 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 91680933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 2386

 91680934 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 91680993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 2446

 91680994 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 91681053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 2506

 91681054 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 91681113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 2566

 91681114 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 91681173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 2626

 91681174 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 91681233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 2686

 91681234 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTACAGAGCT 91681293
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2687 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTATAGAGCT 2746

 91681294 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 91681353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 2806

 91681354 TCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAA 91681413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 TCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAA 2866

 91681414 TGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTATTTTTGGAC 91681473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 TGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTATTTTTGGAC 2926

 91681474 TACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATCGAACTATGT 91681533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 TACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATCGAACTATGT 2986

 91681534 TTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATTTTAACAATA 91681593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 TTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATTTTAACAATA 3046

 91681594 TAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGAAATTATTAA 91681653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 TAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGAAATTATTAA 3106

 91681654 AATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAACAGGGTATTG 91681713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 AATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAACAGGGTATTG 3166

 91681714 CATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGCTGAAAATAC 91681773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 CATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGCTGAAAATAC 3226

 91681774 TAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTATCCAATGTTC 91681833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 TAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTATCCAATGTTC 3286

 91681834 TTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCC 91681893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 TTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCC 3346

 91681894 AACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGG 91681925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 AACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGG 3378

Alignment time is 4.90956 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    6365] =>      6365 nucs 'mol-32-2e0a-024719_6365'

Score:        6159
Aligned:      6365        nucs
Identic:      6343 (100%) nucs =>       596 (100%)      5747 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91677537,91678133] EXCISED REGION [91680094,91685856]
 second seq =>  [       1,     597] EXCISED REGION [     598,    6365]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1960 nucs [91678134,91680093]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91678134,91678134] to [91680094,91680094]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91677537 TTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCA 91677596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCA 60

 91677597 AATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCC 91677656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCC 120

 91677657 TCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTT 91677716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTT 180

 91677717 TTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCA 91677776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCA 240

 91677777 TGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATT 91677836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATT 300

 91677837 TTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTG 91677896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTG 360

 91677897 GAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCT 91677956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      361 GAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACACCATTCT 420

 91677957 CCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATT 91678016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATT 480

 91678017 ATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTC 91678076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTC 540

 91678077 CTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 91678133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 597

EXCISED REGION

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      598 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTGTAGGAAGATTTTG 657

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 717

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 777

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      778 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTTAG 837

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 897

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 91680453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 957

 91680454 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 91680513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      958 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGCTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 1017

 91680514 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTC 91680573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1018 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTGTC 1077

 91680574 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 91680633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 1137

 91680634 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 91680693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 1197

 91680694 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCCTAAGATATT 91680753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1198 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTACTGATCCTAAGATATT 1257

 91680754 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 91680813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 1317

 91680814 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 91680873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 1377

 91680874 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 91680933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 1437

 91680934 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 91680993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 1497

 91680994 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 91681053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 1557

 91681054 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 91681113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 1617

 91681114 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 91681173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 1677

 91681174 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 91681233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 1737

 91681234 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTACAGAGCT 91681293
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1738 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTATAGAGCT 1797

 91681294 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 91681353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 1857

 91681354 TCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAA 91681413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAA 1917

 91681414 TGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTATTTTTGGAC 91681473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTATTTTTGGAC 1977

 91681474 TACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATCGAACTATGT 91681533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATCGAACTATGT 2037

 91681534 TTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATTTTAACAATA 91681593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATTTTAACAATA 2097

 91681594 TAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGAAATTATTAA 91681653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGAAATTATTAA 2157

 91681654 AATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAACAGGGTATTG 91681713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 AATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAACAGGGTATTG 2217

 91681714 CATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGCTGAAAATAC 91681773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 CATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGCTGAAAATAC 2277

 91681774 TAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTATCCAATGTTC 91681833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTATCCAATGTTC 2337

 91681834 TTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCC 91681893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCC 2397

 91681894 AACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCACTTTACTATT 91681953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 AACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCACTTTACTATT 2457

 91681954 GAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTATCTTCTTTC 91682013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 GAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTATCTTCTTTC 2517

 91682014 CTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCTTTTCTCCTT 91682073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 CTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCTTTTCTCCTT 2577

 91682074 CCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAAACTTAAGTG 91682133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAAACTTAAGTG 2637

 91682134 TTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCCCTATAATTA 91682193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCCCTATAATTA 2697

 91682194 TTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAAGACATAATT 91682253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAAGACATAATT 2757

 91682254 CTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAATATTGTATC 91682313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 CTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAATATTGTATC 2817

 91682314 CTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGATTTATTTAAT 91682373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 CTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGATTTATTTAAT 2877

 91682374 GAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGACCAATATAG 91682433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 GAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGACCAATATAG 2937

 91682434 CAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATTTTTCATAGT 91682493
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 CAAAAATTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATTTTTCATAGT 2997

 91682494 TACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGTTTGCTAATCTA 91682553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGTTTGCTAATCTA 3057

 91682554 AAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATTGATAGCTGTACATGGTACA 91682613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 AAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATTGATAGCTGTACATGGTACA 3117

 91682614 CTTGGTATAGTATAACTTCTCATAACCGTTAATTATTTTATTGCCATTATTGCTATTAGT 91682673
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3118 CCTGGTATAGTATAACTTCTCATAACCGTTAATTATTTTATTGCCATTATTGCTCTTAGT 3177

 91682674 ACCAGTAATAACACTCTTCCAATGGAAAATATTTTTCTGAAAACTCATAAATATAATAAT 91682733
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3178 ACCAGTAATAACACTCTTCCAATGGAAAATATTATTCTGAAAACTCATAAATATAATAAT 3237

 91682734 ATTCATTGTTTCAGAAATTAGCTAAAAGTAGGACCTATGAAGTATTATGGTGCTGGTTAA 91682793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 ATTCATTGTTTCAGAAATTAGCTAAAAGTAGGACCTATGAAGTATTATGGTGCTGGTTAA 3297

 91682794 CATAACATGTAGTTAGTGAAATCACCAATAAATGAAGACATGACATATAATCTAAATTAT 91682853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CATAACATGTAGTTAGTGAAATCACCAATAAATGAAGACATGACATATAATCTAAATTAT 3357

 91682854 ATTATATTTGCATAGTCTAA-----ATTATATTATGTATGGCATATGTCCATACTCCATC 91682908
          ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 ATTATATTTGCATAGTCTAAATTATATTATATTATGTATGGCATATGTCCATACTCCATC 3417

 91682909 CTAAGAAATCCAATTCTTTTAATAATTGTAATAGAATTGATTGAGCTTGCTATTAGAGTG 91682968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CTAAGAAATCCAATTCTTTTAATAATTGTAATAGAATTGATTGAGCTTGCTATTAGAGTG 3477

 91682969 TTTAACTGTACTCTTGAAATGGGTTTTACTAAAAGAGATATGGAAAATTTTATTTATGAG 91683028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 TTTAACTGTACTCTTGAAATGGGTTTTACTAAAAGAGATATGGAAAATTTTATTTATGAG 3537

 91683029 CTTCAAATGAGCATCTAATCTACTAGTGTCATTGTAATTTCTCATACAAGTGTACAAATG 91683088
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 CTTCAAATGAGCATCTAATCTACTAATGTCATTGTAATTTCTCATACAAGTGTACAAATG 3597

 91683089 ATAGCGCAGCATCTCTTTCAGGTGTTATATTCAGAATCATAATAAAACTCTTGCAGAATA 91683148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 ATAGCGCAGCATCTCTTTCAGGTGTTATATTCAGAATCATAATAAAACTCTTGCAGAATA 3657

 91683149 TATGTGTGCATCAAAATGAAATGACAATGAATTTTCTCTCGAAATTGATAGCACGTATTA 91683208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 TATGTGTGCATCAAAATGAAATGACAATGAATTTTCTCTCGAAATTGATAGCACGTATTA 3717

 91683209 GCATAAATTGAACTGTGCAACTGTGTCCATAACAGGCTGAGTGATGTAGCAGTTGATTGC 91683268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 GCATAAATTGAACTGTGCAACTGTGTCCATAACAGGCTGAGTGATGTAGCAGTTGATTGC 3777

 91683269 TTTGTACACATTCTTGTGTTTTGCCTTCTGTTTTCCTTGCTGTGTGTTATTCTCTCTTCC 91683328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TTTGTACACATTCTTGTGTTTTGCCTTCTGTTTTCCTTGCTGTGTGTTATTCTCTCTTCC 3837

 91683329 GTCCCACCAAGGTGAGAGTAAATTTTTCCCTTCCTGGCTTTATTGCTTGAAGATAATAGA 91683388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 GTCCCACCAAGGTGAGAGTAAATTTTTCCCTTCCTGGCTTTATTGCTTGAAGATAATAGA 3897

 91683389 GTAAGGCAGGAGCATGTGCAAGGCAAAAGTACCTGTTGTCATCATTGCCCTTTTCCGGTG 91683448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 GTAAGGCAGGAGCATGTGCAAGGCAAAAGTACCTGTTGTCATCATTGCCCTTTTCCGGTG 3957

 91683449 TCCCTCTTTATTTCCTTCTGTGTCTTTGATATTCCAGGCAAAACTCTTTTATAACACTTC 91683508
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3958 TCCCTCTTTATTTCCTTCTGTGTCTTTGATATTACAGGCAAAACTCTTTTATAACACTTC 4017

 91683509 ATGCCATGGCCCCTTCCAGCTACAGATAGGACAGGTGGTTGAATGGCTAGCACTCCATGA 91683568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 ATGCCATGGCCCCTTCCAGCTACAGATAGGACAGGTGGTTGAATGGCTAGCACTCCATGA 4077

 91683569 GCTTTATTCATGTATATTTATAAAAGTGCAATTTCTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTAT 91683628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 GCTTTATTCATGTATATTTATAAAAGTGCAATTTCTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTAT 4137

 91683629 ATTATAGCAAACTCTTGTACATTTACTTACTTATTTTCTTTCAGTGATCATGCTAGTATG 91683688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 ATTATAGCAAACTCTTGTACATTTACTTACTTATTTTCTTTCAGTGATCATGCTAGTATG 4197

 91683689 GTTGTGCTATCTGAAAATCTAGCCTTTTAGCTTCCTAGATGATATACTTAATATGACTAA 91683748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 GTTGTGCTATCTGAAAATCTAGCCTTTTAGCTTCCTAGATGATATACTTAATATGACTAA 4257

 91683749 ATAAATCCAGCCTGTACCACAACTGTCAAAACACCTGGAAATTTATAATTTCACCATCTC 91683808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 ATAAATCCAGCCTGTACCACAACTGTCAAAACACCTGGAAATTTATAATTTCACCATCTC 4317

 91683809 TTCAGAGCAAGAGAGCTTTTGTGACAAATATGGTAGGGTGAATACGGAGCAGATAAACCC 91683868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 TTCAGAGCAAGAGAGCTTTTGTGACAAATATGGTAGGGTGAATACGGAGCAGATAAACCC 4377

 91683869 ATATACTCTGACTTTCAATAAAGCAAGAGGGGATAACACTTCATAGAGACCAGATACCAC 91683928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 ATATACTCTGACTTTCAATAAAGCAAGAGGGGATAACACTTCATAGAGACCAGATACCAC 4437

 91683929 TCTATCAAGGTTACTGAATGGACTATGTCCTGTACCAGATGTGATGCCTCAATGTGACCA 91683988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 TCTATCAAGGTTACTGAATGGACTATGTCCTGTACCAGATGTGATGCCTCAATGTGACCA 4497

 91683989 AATCCATTCTAGATGCCTCAAAGCTGGTTTTTTTGGACCTGCATTTTTTTGTGAAAAATA 91684048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 AATCCATTCTAGATGCCTCAAAGCTGGTTTTTTTGGACCTGCATTTTTTTGTGAAAAATA 4557

 91684049 AAATGCTAACTTATAGGGAAAATGATAACTAATTTTCTTGGCAGTGGTCAATAACTGGAG 91684108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 AAATGCTAACTTATAGGGAAAATGATAACTAATTTTCTTGGCAGTGGTCAATAACTGGAG 4617

 91684109 CTAGCATAAATAGCCGTTGGATTTATTTAGGAGAAGTTAACTCAGAATATAAGTGGCTTT 91684168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 CTAGCATAAATAGCCGTTGGATTTATTTAGGAGAAGTTAACTCAGAATATAAGTGGCTTT 4677

 91684169 CCCCTTCTACCTGTATCATAAAGCCTACCTTGACCAATGAGAAATCCAACAGTATTTGAA 91684228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 CCCCTTCTACCTGTATCATAAAGCCTACCTTGACCAATGAGAAATCCAACAGTATTTGAA 4737

 91684229 AATAAACTCCTGAGAACATAGGACGCAAACTAAGATAAGCAAATTACAGTTGTTATGCTC 91684288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 AATAAACTCCTGAGAACATAGGACGCAAACTAAGATAAGCAAATTACAGTTGTTATGCTC 4797

 91684289 TCAATTGGCCTATAAAAATAAACAGTTTGAGAAATCTGTGTCTCCTACAGAACCACACTG 91684348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TCAATTGGCCTATAAAAATAAACAGTTTGAGAAATCTGTGTCTCCTACAGAACCACACTG 4857

 91684349 ACCAGATAGCACAGATGAGACAGCTAGCACCCTGATCATTAATGTCACAGGTAATTTTGT 91684408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 ACCAGATAGCACAGATGAGACAGCTAGCACCCTGATCATTAATGTCACAGGTAATTTTGT 4917

 91684409 TGTTGGTTACTAGTATCTGCCATACATACCCTTCAGGAATTAAATGGGCCATCTTTGAAA 91684468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 TGTTGGTTACTAGTATCTGCCATACATACCCTTCAGGAATTAAATGGGCCATCTTTGAAA 4977

 91684469 GCCAAGGTCAAGGAGTGAAATTTTAAAATAATAATCCACCCCCAGCTAACGAAAAGCTAG 91684528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 GCCAAGGTCAAGGAGTGAAATTTTAAAATAATAATCCACCCCCAGCTAACGAAAAGCTAG 5037

 91684529 GACAGGTAGTGTTTTCATTGCTTTTGTATTCAGGCCCTTCTCGTAGTATGCTGTGCCTTA 91684588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 GACAGGTAGTGTTTTCATTGCTTTTGTATTCAGGCCCTTCTCGTAGTATGCTGTGCCTTA 5097

 91684589 TGAGGGGAAGAGAGACCCTTGATTTTCAAGGAGGGTGAGTGGGTGGGAGTGCTCCTATGG 91684648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 TGAGGGGAAGAGAGACCCTTGATTTTCAAGGAGGGTGAGTGGGTGGGAGTGCTCCTATGG 5157

 91684649 GGGATGTATATCATGACAAATAATGGGCTCTTAAAAATTACACCTCCTTACTACCCTGAT 91684708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 GGGATGTATATCATGACAAATAATGGGCTCTTAAAAATTACACCTCCTTACTACCCTGAT 5217

 91684709 TCTCTGAAGCCCATAGCGGTGCCATGCATAGCCTTGTTGAGAATTGCTGCCTAGTGAGCC 91684768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 TCTCTGAAGCCCATAGCGGTGCCATGCATAGCCTTGTTGAGAATTGCTGCCTAGTGAGCC 5277

 91684769 TCACTGACAGGTAATAGTAATGCATTCAGGTTTGTTGATAAGGAGAAAAGGTTTAGAAGT 91684828
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 TCACTGACAGGTAATAGTAACGCATTCAGGTTTGTTGATAAGGAGAAAAGGTTTAGAAGT 5337

 91684829 AATTGATAACTTTTCTTCCAATATAAGTTTTCTTAAAACTTCTAGTATGTTGTTAAACAA 91684888
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 AATTGATAACTTTTCTTCCAATACAAGTTTTCTTAAAACTTCTAGTATGTTGTTAAACAA 5397

 91684889 CAGAGAAATAAGCGCTCTGAGTCTTGGGAGATTCTGTCTGTGTACAAGCATGAACTATGC 91684948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 CAGAGAAATAAGCGCTCTGAGTCTTGGGAGATTCTGTCTGTGTACAAGCATGAACTATGC 5457

 91684949 TCCATATGAGAACATGAGCCTTGTCATCTGCTTTAAATGTCATTGGAGAACAGTTATCAA 91685008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 TCCATATGAGAACATGAGCCTTGTCATCTGCTTTAAATGTCATTGGAGAACAGTTATCAA 5517

 91685009 TGACTACTTTCCCAGGGTTAAAATTAATAAACTTGAGCTTATTGTATTGCAAGCTTCTTT 91685068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 TGACTACTTTCCCAGGGTTAAAATTAATAAACTTGAGCTTATTGTATTGCAAGCTTCTTT 5577

 91685069 AGGATTTCACCCACTGTGAAAATATCATTTAAATAACATTTTACCGAACTTCAGGACTTC 91685128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 AGGATTTCACCCACTGTGAAAATATCATTTAAATAACATTTTACCGAACTTCAGGACTTC 5637

 91685129 TTGTAAAATTTTGTGACAGTTCATCTTAATATGCGTAATATTTCTGTTCTGATTCCATTT 91685188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5638 TTGTAAAATTTTGTGACAGTTCATCTTAATATGCATAATATTTCTGTTCTGATTCCATTT 5697

 91685189 TTGAACTTTTGTACTCTATTTTTATCTGTAGGATGGAGATAATGCTAGACAAAATTCAGA 91685248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 TTGAACTTTTGTACTCTATTTTTATCTGTAGGATGGAGATAATGCTAGACAAAATTCAGA 5757

 91685249 ACAAAAGTATGTAATTTGAAAAATAACTGTTAAGAATTAATACTATGCAATTTCCCATGG 91685308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 ACAAAAGTATGTAATTTGAAAAATAACTGTTAAGAATTAATACTATGCAATTTCCCATGG 5817

 91685309 CAATTGATTACGTGTTTGTTCAGAAGTTTGGCACAGTTGCTTGATTAAAATATTAATTTT 91685368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 CAATTGATTACGTGTTTGTTCAGAAGTTTGGCACAGTTGCTTGATTAAAATATTAATTTT 5877

 91685369 CCAATTTCAATTGAGCAGTTTATGAATTTTACTTTATGGTGTTTACTTTCTCTGATAATG 91685428
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 CCAGTTTCAATTGAGCAGTTTATGAATTTTACTTTATGGTGTTTACTTTCTCTGATAATG 5937

 91685429 TCAATGTTTTTCACTAATTATGTCCAAGGGTGAGCTACCTTGGCCAATAGAACAACTTGG 91685488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 TCAATGTTTTTCACTAATTATGTCCAAGGGTGAGCTACCTTGGCCAATAGAACAACTTGG 5997

 91685489 TTTCAGGTAATTTGTTCTTTTCAGTGGCTGTAAATGTATTGGCTATGTGGTTGAACTTTG 91685548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 TTTCAGGTAATTTGTTCTTTTCAGTGGCTGTAAATGTATTGGCTATGTGGTTGAACTTTG 6057

 91685549 ACCATTTCTCTGACAATAATTTGCAACCTCCATGAGATCAGTCATAAATCCATAGTCAAT 91685608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 ACCATTTCTCTGACAATAATTTGCAACCTCCATGAGATCAGTCATAAATCCATAGTCAAT 6117

 91685609 TATGTGTTAGAAAATATATTAAAAAGCCTCAGAGGAACAAAATTATGTCATTTCTGTTGT 91685668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 TATGTGTTAGAAAATATATTAAAAAGCCTCAGAGGAACAAAATTATGTCATTTCTGTTGT 6177

 91685669 GGAAGATTGGTTTAAAATAGGTCTTACAAATATTATGAAAATACAACTTACTGTAATCAT 91685728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 GGAAGATTGGTTTAAAATAGGTCTTACAAATATTATGAAAATACAACTTACTGTAATCAT 6237

 91685729 ACTGCAGTTTGTCATATGTGGTTCATTGTTATGAGGCAGTAAGGTGATGGCAGAGGCAGC 91685788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 ACTGCAGTTTGTCATATGTGGTTCATTGTTATGAGGCAGTAAGGTGATGGCAGAGGCAGC 6297

 91685789 ACTATATATAGCACATAAATAAAAATAAATCAGGTTTACAACTCTGTTTGCAACCATCTG 91685848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 ACTATATATAGCACATAAATAAAAATAAATCAGGTTTACAACTCTGTTTGCAACCATCTG 6357

 91685849 TAATGCAT 91685856
          ||||||||
     6358 TAATGCAT 6365

Alignment time is 8.467 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3903] =>      3903 nucs 'mol-32-2e15-208100_3903'

Score:        3903
Aligned:      3903        nucs
Identic:      3903 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91675376,91679278]
 second seq =>  [       1,    3903]

 91675376 TATTAGTTACAACAATGAAATTGAATATTTAATTTTTTCTCTTAAGAACGAGATTTAATA 91675435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTAGTTACAACAATGAAATTGAATATTTAATTTTTTCTCTTAAGAACGAGATTTAATA 60

 91675436 AATTCAACTTCATGTAATTTTCCTTCAGCCTGAGATCTTTCGGCAATGAGTTCTGTGAGT 91675495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTCAACTTCATGTAATTTTCCTTCAGCCTGAGATCTTTCGGCAATGAGTTCTGTGAGT 120

 91675496 TTCCCTTCATCTACGAATGCCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGGTTTTTAATGGAT 91675555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCCCTTCATCTACGAATGCCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGGTTTTTAATGGAT 180

 91675556 ATTTAATGGATATAAAGTTTTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCATCATTTTAAGAT 91675615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTAATGGATATAAAGTTTTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCATCATTTTAAGAT 240

 91675616 ACCATCTCACTATTTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAAT 91675675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCATCTCACTATTTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAAT 300

 91675676 TATTGTTCCATTAATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCT 91675735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTGTTCCATTAATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCT 360

 91675736 ATTGTTAGAAGCTTGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTT 91675795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTGTTAGAAGCTTGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTT 420

 91675796 GGGGGTTGCTGAGCTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGG 91675855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGGGTTGCTGAGCTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGG 480

 91675856 TCCTAATTTCTTCACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCA 91675915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTAATTTCTTCACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCA 540

 91675916 AAGACATTTATTTTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTC 91675975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGACATTTATTTTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTC 600

 91675976 TTTTTTCAATCTTTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCT 91676035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTTCAATCTTTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCT 660

 91676036 TCAAGTTCATTGACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATAT 91676095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAAGTTCATTGACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATAT 720

 91676096 TATGTGAATAGTTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATG 91676155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATGTGAATAGTTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATG 780

 91676156 TTATACAGGTATATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGT 91676215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTATACAGGTATATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGT 840

 91676216 AAAAGCATAGTATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCA 91676275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAGCATAGTATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCA 900

 91676276 AATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTC 91676335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTC 960

 91676336 CCACTTATAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGA 91676395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCACTTATAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGA 1020

 91676396 TAATGGCCTCCAGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATT 91676455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAATGGCCTCCAGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATT 1080

 91676456 GCTACATAGTATTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATG 91676515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTACATAGTATTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATG 1140

 91676516 GGCATTTACGTTGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACT 91676575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCATTTACGTTGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACT 1200

 91676576 TGCATATGTCTTTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGA 91676635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCATATGTCTTTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGA 1260

 91676636 CTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCC 91676695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCC 1320

 91676696 ACATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACA 91676755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACA 1380

 91676756 ACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGA 91676815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGA 1440

 91676816 GCATTTTTCATATTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTC 91676875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCATTTTTCATATTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTC 1500

 91676876 AAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAAT 91676935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAAT 1560

 91676936 TCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCA 91676995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCA 1620

 91676996 GTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGT 91677055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGT 1680

 91677056 CTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAA 91677115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAA 1740

 91677116 CCCGTAGAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTC 91677175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCCGTAGAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTC 1800

 91677176 CAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATT 91677235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATT 1860

 91677236 TCTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTT 91677295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTT 1920

 91677296 TTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCT 91677355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCT 1980

 91677356 TATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGG 91677415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGG 2040

 91677416 TTTTCTATTCCTGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTG 91677475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTCTATTCCTGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTG 2100

 91677476 CAAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAA 91677535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAA 2160

 91677536 TTTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGC 91677595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGC 2220

 91677596 AAATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTC 91677655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTC 2280

 91677656 CTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTT 91677715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTT 2340

 91677716 TTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACC 91677775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACC 2400

 91677776 ATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTAT 91677835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTAT 2460

 91677836 TTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCT 91677895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCT 2520

 91677896 GGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTC 91677955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTC 2580

 91677956 TCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAAT 91678015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAAT 2640

 91678016 TATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCT 91678075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCT 2700

 91678076 CCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCC 91678135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCC 2760

 91678136 ACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCA 91678195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCA 2820

 91678196 CTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTG 91678255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTG 2880

 91678256 TCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTG 91678315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTG 2940

 91678316 ATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGA 91678375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGA 3000

 91678376 TTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGG 91678435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGG 3060

 91678436 GTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTA 91678495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTA 3120

 91678496 AATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGT 91678555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGT 3180

 91678556 GTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAG 91678615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAG 3240

 91678616 TTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGA 91678675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGA 3300

 91678676 GATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGT 91678735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGT 3360

 91678736 TGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGC 91678795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGC 3420

 91678796 TGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTAT 91678855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTAT 3480

 91678856 TTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAAT 91678915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAAT 3540

 91678916 ATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTT 91678975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTT 3600

 91678976 TGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAA 91679035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAA 3660

 91679036 TCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAAT 91679095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAAT 3720

 91679096 ATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGC 91679155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGC 3780

 91679156 AGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCA 91679215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCA 3840

 91679216 TATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTA 91679275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTA 3900

 91679276 ATC 91679278
          |||
     3901 ATC 3903

Alignment time is 4.78299 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3218] =>      3218 nucs 'mol-32-2e4c-038672_3218'

Score:        3218
Aligned:      3218        nucs
Identic:      3218 (100%) nucs =>      1189 (100%)      2029 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91675945,91677133] EXCISED REGION [91677135,91679163]
 second seq =>  [       1,    1189] EXCISED REGION [    1190,    3218]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91677134,91677134]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [91677134,91677150] to [91677135,91677151]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91675945 TTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTCTTCTCTCTCTGTTC 91676004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTCTTCTCTCTCTGTTC 60

 91676005 TTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACTCTTGCCTCTGTCAT 91676064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACTCTTGCCTCTGTCAT 120

 91676065 CTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTTTATTTATCTGTGTTTT 91676124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTTTATTTATCTGTGTTTT 180

 91676125 GTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATATTGCATGCCATGGGGC 91676184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATATTGCATGCCATGGGGC 240

 91676185 CTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCAATAGGTAGTTTTT 91676244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCAATAGGTAGTTTTT 300

 91676245 CTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTC 91676304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTC 360

 91676305 TTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAACATGTGGTATTTG 91676364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAACATGTGGTATTTG 420

 91676365 GTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTTTATTTACGTTTCT 91676424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTTTATTTACGTTTCT 480

 91676425 GCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCATTGTGTATAGGCA 91676484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCATTGTGTATAGGCA 540

 91676485 CTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCCATGTCTTTGCT 91676544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCCATGTCTTTGCT 600

 91676545 ATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTATGGCAGAACGATTTA 91676604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTATGGCAGAACGATTTA 660

 91676605 CATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTA 91676664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTA 720

 91676665 AGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACT 91676724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACT 780

 91676725 AACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGA 91676784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGA 840

 91676785 TTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGCTTGTAGGTCAC 91676844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGCTTGTAGGTCAC 900

 91676845 ACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTT 91676904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTT 960

 91676905 GTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTT 91676964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTT 1020

 91676965 GGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTAT 91677024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTAT 1080

 91677025 AGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGC 91677084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGC 1140

 91677085 TGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTC 91677133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTC 1189

EXCISED REGION

 91677135 TTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACA 91677194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 TTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACA 1249

 91677195 GGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACA 91677254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 GGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACA 1309

 91677255 CATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCC 91677314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 CATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCC 1369

 91677315 CACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCAT 91677374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 CACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCAT 1429

 91677375 AGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTAC 91677434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 AGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTAC 1489

 91677435 TTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATT 91677494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 TTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATT 1549

 91677495 CCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTG 91677554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 CCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTG 1609

 91677555 ATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAAC 91677614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 ATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAAC 1669

 91677615 ATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGT 91677674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 ATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGT 1729

 91677675 AGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAAT 91677734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 AGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAAT 1789

 91677735 GTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTT 91677794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 GTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTT 1849

 91677795 TCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTT 91677854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 TCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTT 1909

 91677855 CTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATA 91677914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 CTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATA 1969

 91677915 TCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 91677974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 TCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 2029

 91677975 GTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTA 91678034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 GTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTA 2089

 91678035 GAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCC 91678094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 GAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCC 2149

 91678095 CGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTT 91678154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 CGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTT 2209

 91678155 TTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCAT 91678214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 TTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCAT 2269

 91678215 TTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTT 91678274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 TTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTT 2329

 91678275 CTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTT 91678334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 CTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTT 2389

 91678335 GTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTT 91678394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 GTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTT 2449

 91678395 GTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCT 91678454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 GTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCT 2509

 91678455 GATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTT 91678514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 GATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTT 2569

 91678515 TGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTC 91678574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 TGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTC 2629

 91678575 TAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAA 91678634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 TAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAA 2689

 91678635 GTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCAT 91678694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 GTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCAT 2749

 91678695 TCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCG 91678754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 TCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCG 2809

 91678755 CCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTAT 91678814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 CCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTAT 2869

 91678815 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGC 91678874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGC 2929

 91678875 TGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGT 91678934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 TGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGT 2989

 91678935 ACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTG 91678994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 ACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTG 3049

 91678995 GGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTG 91679054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 GGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTG 3109

 91679055 AATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCAT 91679114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 AATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCAT 3169

 91679115 AAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACAC 91679163
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 AAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACAC 3218

Alignment time is 4.63036 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4675] =>      4675 nucs 'mol-32-2ef1-114980_4675'

Score:        4542
Aligned:      4678        nucs
Identic:      4664 (100%) nucs =>      3422 (100%)      1242 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91674704,91678133] EXCISED REGION [91680094,91681341]
 second seq =>  [       1,    3427] EXCISED REGION [    3428,    4675]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1960 nucs [91678134,91680093]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91678134,91678134] to [91680094,91680094]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91674704 ATTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCAGCTCACTGCAACCTC 91674763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCAGCTCACTGCAACCTC 60

 91674764 TGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGC 91674823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGC 120

 91674824 GCGCGCCACCATACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTT 91674883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCGCGCCACCATACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTT 180

 91674884 TTAGCCCAGGTGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCTTCCCAAAAT 91674943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAGCCCAGGTGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCTTCCCAAAAT 240

 91674944 GTTAGAATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCTCTCTCTCCCCCTTTTCTTTTGAAT 91675003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTAGAATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCTCTCTCTCCCCCTTTTCTTTTGAAT 300

 91675004 TCTTTGGATTTGTTTTTCATATTCCACTTTAATATATCTGTTGACCTCTGACTATGTCTC 91675063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTTTGGATTTGTTTTTCATATTCCACTTTAATATATCTGTTGACCTCTGACTATGTCTC 360

 91675064 CTGTATTATTTCTTAGTGCTTGCGCTAGGCCTGATAATATACATACCTAACCTTTCACAG 91675123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTATTATTTCTTAGTGCTTGCGCTAGGCCTGATAATATACATACCTAACCTTTCACAG 420

 91675124 TTTACTCAGAGTTATATTTTACTACCATAGTAAAAATGTGGAAGTTTTACCATGGAGTTT 91675183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTACTCAGAGTTATATTTTACTACCATAGTAAAAATGTGGAAGTTTTACCATGGAGTTT 480

 91675184 ATCTTTTCCCACAAACCTTTTTGTTATAGTTGTCATATGGGTTACAACTATGTACACTGA 91675243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCTTTTCCCACAAACCTTTTTGTTATAGTTGTCATATGGGTTACAACTATGTACACTGA 540

 91675244 TTGCAATGATCATACATAATTTAAGGAATTTAAGAAAAGAAAATTTAGTTTTGTATTACC 91675303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGCAATGATCATACATAATTTAAGGAATTTAAGAAAAGAAAATTTAGTTTTGTATTACC 600

 91675304 CATTTTTTATTATTCATCTTTCTCTTACTTTATTCCTGAAATTTTTTCCTACAGGCCTTC 91675363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATTTTTTATTATTCATCTTTCTCTTACTTTATTCCTGAAATTTTTTCCTACAGGCCTTC 660

 91675364 AAATCAACTTTTTATTAGTTACAACAATGAAATTGAATATTTAATTTTTTCTCTTAAGAA 91675423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATCAACTTTTTATTAGTTACAACAATGAAATTGAATATTTAATTTTTTCTCTTAAGAA 720

 91675424 CGAGATTTAATAAATTCAACTTCATGTAATTTTCCTTCAGCCTGAGATCTTTCGGCAATG 91675483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGAGATTTAATAAATTCAACTTCATGTAATTTTCCTTCAGCCTGAGATCTTTCGGCAATG 780

 91675484 AGTTCTGTGAGTTTCCCTTCATCTACGAATGCCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGG 91675543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTTCTGTGAGTTTCCCTTCATCTACGAATGCCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGG 840

 91675544 TTTTTAATGGATATTTAATGGATATAAAGTTTTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCA 91675603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTTAATGGATATTTAATGGATATAAAGTTTTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCA 900

 91675604 TCATTTTAAGATACCATCTCACTATTTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATT 91675663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCATTTTAAGATACCATCTCACTATTTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATT 960

 91675664 GGTAATTCAAATTATTGTTCCATTAATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATA 91675723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTAATTCAAATTATTGTTCCATTAATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATA 1020

 91675724 TTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCTTGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAG 91675783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCTTGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAG 1080

 91675784 TTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAGCTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCT 91675843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAGCTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCT 1140

 91675844 GGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTCACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTT 91675903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTCACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTT 1200

 91675904 CCTGAGACTTCAAAGACATTTATTTTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAG 91675963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTGAGACTTCAAAGACATTTATTTTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAG 1260

 91675964 CTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTT 91676023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTT 1320

 91676024 ATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATC 91676083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATC 1380

 91676084 ACATGATCATATTATGTGAATAGTTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTT 91676143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACATGATCATATTATGTGAATAGTTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTT 1440

 91676144 CAGGGGCACATGTTATACAGGTATATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTT 91676203
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGGGGCACATGTTATACAGGTATATTGCACGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTT 1500

 91676204 TGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCAC 91676263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCAC 1560

 91676264 TCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTC 91676323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTC 1620

 91676324 AAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTA 91676383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTA 1680

 91676384 GTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCAT 91676443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCAT 1740

 91676444 TCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGT 91676503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGT 1800

 91676504 GTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAA 91676563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAA 1860

 91676564 TGAACATACACTTGCATATGTCTTTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATAC 91676623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGAACATACACTTGCATATGTCTTTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATAC 1920

 91676624 CCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCC 91676683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCC 1980

 91676684 ACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCC 91676743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCC 2040

 91676744 CTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGAT 91676803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGAT 2100

 91676804 CAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAA 91676863
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGCTTGCAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAA 2160

 91676864 AAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTA 91676923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTA 2220

 91676924 ATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGAT 91676983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGAT 2280

 91676984 ATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAA 91677043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAA 2340

 91677044 GAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGT 91677103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGT 2400

 91677104 GAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTC 91677163
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||
     2401 GAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTT---AAATTTTATTTC 2457

 91677164 ACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTT 91677223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 ACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTT 2517

 91677224 TTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAA 91677283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAA 2577

 91677284 ATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCA 91677343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 ATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCA 2637

 91677344 TTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAA 91677403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAA 2697

 91677404 TATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCA 91677463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2698 TATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACTTAACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCA 2757

 91677464 TCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGG 91677523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2758 TCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGG 2817

 91677524 TATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATAT 91677583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 TATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATAT 2877

 91677584 TTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAA 91677643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAA 2937

 91677644 TGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTC 91677703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTC 2997

 91677704 TACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACA 91677763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACA 3057

 91677764 CTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTT 91677823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 CTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTT 3117

 91677824 TTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCT 91677883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 TTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCT 3177

 91677884 ATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGG 91677943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 ATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGG 3237

 91677944 TTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAA 91678003
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 TTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAA 3297

 91678004 GGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGA 91678063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 GGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGA 3357

 91678064 TGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 91678123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 3417

 91678124 CAGGCTTGAG 91678133
          ||||||||||
     3418 CAGGCTTGAG 3427

EXCISED REGION

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3428 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTGTAGGAAGATTTTG 3487

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 3547

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 3607

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3608 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTTAG 3667

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 3727

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 91680453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 3787

 91680454 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 91680513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3788 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGCTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 3847

 91680514 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTC 91680573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3848 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTGTC 3907

 91680574 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 91680633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 3967

 91680634 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 91680693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 4027

 91680694 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCCTAAGATATT 91680753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4028 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTACTGATCCTAAGATATT 4087

 91680754 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 91680813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 4147

 91680814 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 91680873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 4207

 91680874 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 91680933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 4267

 91680934 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 91680993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 4327

 91680994 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 91681053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 4387

 91681054 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 91681113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 4447

 91681114 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 91681173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 4507

 91681174 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 91681233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 4567

 91681234 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTACAGAGCT 91681293
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4568 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTATAGAGCT 4627

 91681294 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTT 91681341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTT 4675

Alignment time is 6.17426 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2637] =>      2637 nucs 'mol-32-2efc-109607_2637'

Score:        2592
Aligned:      2636        nucs
Identic:      2632 (100%) nucs =>       450 (100%)      2182 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91678734,91679183] EXCISED REGION [91679184,91681369]
 second seq =>  [       1,     450] EXCISED REGION [     452,    2637]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [451,451]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [91679986,91679986]
 second seq =>         1 nucs [1254,1254]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        15 nucs [451,465] to [452,466]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91678734 GTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTG 91678793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTG 60

 91678794 GCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCT 91678853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCT 120

 91678854 ATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTA 91678913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTA 180

 91678914 ATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTT 91678973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTT 240

 91678974 TTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGG 91679033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGG 300

 91679034 AATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACA 91679093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACA 360

 91679094 ATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCA 91679153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCA 420

 91679154 GCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATG 91679183
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATG 450

EXCISED REGION

 91679184 TTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAAT 91679243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      452 TTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAAT 511

 91679244 GTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCT 91679303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      512 GTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCT 571

 91679304 TTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGA 91679363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      572 TTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGA 631

 91679364 TGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGG 91679423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      632 TGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGG 691

 91679424 TTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCT 91679483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      692 TTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCT 751

 91679484 CGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCT 91679543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 CGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCT 811

 91679544 TTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCT 91679603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 TTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCT 871

 91679604 CTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAA 91679663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      872 CTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAA 931

 91679664 GGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCAT 91679723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 GGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCAT 991

 91679724 CCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTT 91679783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 CCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTT 1051

 91679784 TACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAA 91679843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 TACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAA 1111

 91679844 CAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCC 91679903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 CAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCC 1171

 91679904 AAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGG 91679963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 AAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGG 1231

 91679964 GCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGG 91680023
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 GCTTGAGACCCAAACCTTTGAGGAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGG 1291

 91680024 GAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTG 91680083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 GAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTG 1351

 91680084 GCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAG 91680143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 GCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAG 1411

 91680144 GAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGAT 91680203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 GAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGAT 1471

 91680204 TGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCT 91680263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 TGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCT 1531

 91680264 TTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGA 91680323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 TTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGA 1591

 91680324 TATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTG 91680383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 TATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTG 1651

 91680384 TATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 91680443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 TATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 1711

 91680444 TTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTG 91680503
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 CTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTG 1771

 91680504 GGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTG 91680563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 GGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTG 1831

 91680564 CCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTT 91680623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 CCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTT 1891

 91680624 AGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAG 91680683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 AGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAG 1951

 91680684 GGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATC 91680743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 GGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATC 2011

 91680744 CTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGA 91680803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 CTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGA 2071

 91680804 GAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGA 91680863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 GAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGA 2131

 91680864 GAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAAT 91680923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 GAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAAT 2191

 91680924 GAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGG 91680983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 GAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGG 2251

 91680984 GTTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATC 91681043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 GTTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATC 2311

 91681044 TAGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTT 91681103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 TAGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTT 2371

 91681104 CGGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCA 91681163
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CGGCAAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCA 2431

 91681164 GCCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCT 91681223
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 GCCGCTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCT 2491

 91681224 CAAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTAT 91681283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 CAAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTAT 2551

 91681284 TTACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGA 91681343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 TTACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGA 2611

 91681344 AACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAA 91681369
          ||||||||||||||||||||||||||
     2612 AACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAA 2637

Alignment time is 3.99814 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2831] =>      2831 nucs 'mol-32-2f07-017529_2831'

Score:        2819
Aligned:      2830        nucs
Identic:      2829 (100%) nucs =>       664 (100%)      2165 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91678520,91679183] EXCISED REGION [91679184,91681349]
 second seq =>  [       1,     664] EXCISED REGION [     666,    2831]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [665,665]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [1926,1926]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        15 nucs [665,679] to [666,680]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91678520 TTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAA 91678579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAA 60

 91678580 GGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCT 91678639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCT 120

 91678640 TGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTC 91678699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTC 180

 91678700 TACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACT 91678759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACT 240

 91678760 TTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTG 91678819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTG 300

 91678820 GGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTT 91678879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTT 360

 91678880 TGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTT 91678939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTT 420

 91678940 TTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGA 91678999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGA 480

 91679000 TTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTT 91679059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTT 540

 91679060 GTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTG 91679119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTG 600

 91679120 TGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCA 91679179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCA 660

 91679180 AATG 91679183
          ||||
      661 AATG 664

EXCISED REGION

 91679184 TTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAAT 91679243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 TTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAAT 725

 91679244 GTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCT 91679303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 GTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCT 785

 91679304 TTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGA 91679363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 TTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGA 845

 91679364 TGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGG 91679423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 TGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGG 905

 91679424 TTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCT 91679483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 TTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCT 965

 91679484 CGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCT 91679543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 CGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCT 1025

 91679544 TTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCT 91679603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 TTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCT 1085

 91679604 CTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAA 91679663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 CTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAA 1145

 91679664 GGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCAT 91679723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 GGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCAT 1205

 91679724 CCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTT 91679783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 CCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTT 1265

 91679784 TACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAA 91679843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 TACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAA 1325

 91679844 CAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCC 91679903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 CAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCC 1385

 91679904 AAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGG 91679963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 AAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGG 1445

 91679964 GCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGG 91680023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 GCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGG 1505

 91680024 GAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTG 91680083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 GAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTG 1565

 91680084 GCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAG 91680143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 GCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAG 1625

 91680144 GAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGAT 91680203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 GAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGAT 1685

 91680204 TGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCT 91680263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 TGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCT 1745

 91680264 TTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGA 91680323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 TTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGA 1805

 91680324 TATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTG 91680383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTG 1865

 91680384 TATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 91680443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 TATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 1925

 91680444 TTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTG 91680503
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 CTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTG 1985

 91680504 GGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTG 91680563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 GGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTG 2045

 91680564 CCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTT 91680623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 CCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTT 2105

 91680624 AGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAG 91680683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 AGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAG 2165

 91680684 GGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATC 91680743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 GGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATC 2225

 91680744 CTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGA 91680803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 CTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGA 2285

 91680804 GAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGA 91680863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 GAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGA 2345

 91680864 GAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAAT 91680923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 GAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAAT 2405

 91680924 GAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGG 91680983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 GAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGG 2465

 91680984 GTTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATC 91681043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 GTTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATC 2525

 91681044 TAGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTT 91681103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 TAGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTT 2585

 91681104 CGGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCA 91681163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 CGGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCA 2645

 91681164 GCCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCT 91681223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 GCCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCT 2705

 91681224 CAAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTAT 91681283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 CAAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTAT 2765

 91681284 TTACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGA 91681343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 TTACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGA 2825

 91681344 AACATT 91681349
          ||||||
     2826 AACATT 2831

Alignment time is 4.21754 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3621] =>      3621 nucs 'mol-32-2f1d-024036_3621'

Score:        3604
Aligned:      3615        nucs
Identic:      3614 (100%) nucs =>      1187 (100%)      2427 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91677997,91679183] EXCISED REGION [91679184,91681611]
 second seq =>  [       6,    1192] EXCISED REGION [    1194,    3621]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1193,1193]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [2454,2454]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        15 nucs [1193,1207] to [1194,1208]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91677997 GCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTA 91678056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        6 GCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTA 65

 91678057 GCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 91678116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       66 GCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 125

 91678117 GGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCA 91678176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      126 GGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCA 185

 91678177 GGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTT 91678236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 GGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTT 245

 91678237 GAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCAT 91678296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 GAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCAT 305

 91678297 GTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATT 91678356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 GTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATT 365

 91678357 CGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAG 91678416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 CGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAG 425

 91678417 ATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAG 91678476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 ATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAG 485

 91678477 AAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTT 91678536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 AAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTT 545

 91678537 GGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTA 91678596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 GGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTA 605

 91678597 TCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTG 91678656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 TCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTG 665

 91678657 ATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAA 91678716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 ATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAA 725

 91678717 TTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCT 91678776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 TTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCT 785

 91678777 TTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTC 91678836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 TTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTC 845

 91678837 CATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTA 91678896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 CATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTA 905

 91678897 TAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTT 91678956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 TAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTT 965

 91678957 GGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCT 91679016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 GGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCT 1025

 91679017 GTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCA 91679076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 GTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCA 1085

 91679077 GCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTT 91679136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 GCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTT 1145

 91679137 GTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATG 91679183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 GTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATG 1192

EXCISED REGION

 91679184 TTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAAT 91679243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 TTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAAT 1253

 91679244 GTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCT 91679303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 GTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCT 1313

 91679304 TTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGA 91679363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGA 1373

 91679364 TGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGG 91679423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGG 1433

 91679424 TTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCT 91679483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCT 1493

 91679484 CGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCT 91679543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 CGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCT 1553

 91679544 TTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCT 91679603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 TTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCT 1613

 91679604 CTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAA 91679663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 CTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAA 1673

 91679664 GGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCAT 91679723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 GGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCAT 1733

 91679724 CCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTT 91679783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 CCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTT 1793

 91679784 TACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAA 91679843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 TACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAA 1853

 91679844 CAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCC 91679903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 CAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCC 1913

 91679904 AAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGG 91679963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 AAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGG 1973

 91679964 GCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGG 91680023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 GCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGG 2033

 91680024 GAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTG 91680083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 GAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTG 2093

 91680084 GCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAG 91680143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 GCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAG 2153

 91680144 GAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGAT 91680203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 GAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGAT 2213

 91680204 TGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCT 91680263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 TGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCT 2273

 91680264 TTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGA 91680323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 TTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGA 2333

 91680324 TATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTG 91680383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 TATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTG 2393

 91680384 TATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 91680443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 TATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 2453

 91680444 TTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTG 91680503
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 CTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTG 2513

 91680504 GGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTG 91680563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 GGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTG 2573

 91680564 CCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTT 91680623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 CCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTT 2633

 91680624 AGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAG 91680683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 AGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAG 2693

 91680684 GGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATC 91680743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 GGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATC 2753

 91680744 CTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGA 91680803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 CTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGA 2813

 91680804 GAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGA 91680863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 GAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGA 2873

 91680864 GAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAAT 91680923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 GAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAAT 2933

 91680924 GAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGG 91680983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 GAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGG 2993

 91680984 GTTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATC 91681043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 GTTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATC 3053

 91681044 TAGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTT 91681103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 TAGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTT 3113

 91681104 CGGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCA 91681163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 CGGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCA 3173

 91681164 GCCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCT 91681223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 GCCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCT 3233

 91681224 CAAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTAT 91681283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 CAAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTAT 3293

 91681284 TTACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGA 91681343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 TTACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGA 3353

 91681344 AACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTT 91681403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 AACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTT 3413

 91681404 GACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATT 91681463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 GACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATT 3473

 91681464 ATTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCAT 91681523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 ATTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCAT 3533

 91681524 CGAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAAT 91681583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 CGAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAAT 3593

 91681584 TTTAACAATATAATAACTAATATCAATG 91681611
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3594 TTTAACAATATAATAACTAATATCAATG 3621

Alignment time is 5.02685 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2845] =>      2845 nucs 'mol-32-2fc2-018395_2845'

Score:        2822
Aligned:      2844        nucs
Identic:      2842 (100%) nucs =>       667 (100%)      2175 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91679777,91680443] EXCISED REGION [91680445,91682621]
 second seq =>  [       1,     667] EXCISED REGION [     669,    2845]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [668,668]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [91680443,91680449] to [91680444,91680450]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91680443,91680443] to [91680445,91680445]
 second seq =>         1 nucs [667,667] to [669,669]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91679777 TTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTA 91679836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTA 60

 91679837 GTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCA 91679896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCA 120

 91679897 ACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTT 91679956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTT 180

 91679957 TCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATC 91680016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATC 240

 91680017 TGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTC 91680076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTC 300

 91680077 AGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACT 91680136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACT 360

 91680137 CTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACA 91680196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACA 420

 91680197 ACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTA 91680256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTA 480

 91680257 GAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATG 91680316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATG 540

 91680317 TGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAA 91680376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAA 600

 91680377 TATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTG 91680436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTG 660

 91680437 ACTCCAT 91680443
          |||||||
      661 ACTCCAT 667

EXCISED REGION

 91680445 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 91680504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      669 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 728

 91680505 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 91680564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      729 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 788

 91680565 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 91680624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 848

 91680625 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 91680684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 908

 91680685 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 91680744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 968

 91680745 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 91680804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 1028

 91680805 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 91680864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 1088

 91680865 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 91680924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 1148

 91680925 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 91680984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 1208

 91680985 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 91681044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 1268

 91681045 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 91681104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 1328

 91681105 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 91681164
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 GGCAAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 1388

 91681165 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 91681224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 1448

 91681225 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATT 91681284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATT 1508

 91681285 TACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAA 91681344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 TACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAA 1568

 91681345 ACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTG 91681404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 ACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTG 1628

 91681405 ACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTA 91681464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 ACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTA 1688

 91681465 TTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATC 91681524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 TTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATC 1748

 91681525 GAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATT 91681584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 GAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATT 1808

 91681585 TTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGA 91681644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 TTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGA 1868

 91681645 AATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAAC 91681704
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 AATTATTAAAATAAACCATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAAC 1928

 91681705 AGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGC 91681764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 AGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGC 1988

 91681765 TGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTAT 91681824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 TGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTAT 2048

 91681825 CCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCA 91681884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 CCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCA 2108

 91681885 AGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCAC 91681944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 AGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCAC 2168

 91681945 TTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTA 91682004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 TTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTA 2228

 91682005 TCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCT 91682064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 TCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCT 2288

 91682065 TTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAA 91682124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 TTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAA 2348

 91682125 ACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCC 91682184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 ACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCC 2408

 91682185 CTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAA 91682244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 CTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAA 2468

 91682245 GACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAA 91682304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 GACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAA 2528

 91682305 TATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGAT 91682364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 TATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGAT 2588

 91682365 TTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGA 91682424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 TTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGA 2648

 91682425 CCAATATAGCAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATT 91682484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 CCAATATAGCAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATT 2708

 91682485 TTTCATAGTTACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGTTT 91682544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 TTTCATAGTTACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGTTT 2768

 91682545 GCTAATCTAAAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATTGATAGCTGTA 91682604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 GCTAATCTAAAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATTGATAGCTGTA 2828

 91682605 CATGGTACACTTGGTAT 91682621
          |||||||||||||||||
     2829 CATGGTACACTTGGTAT 2845

Alignment time is 4.00123 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3170] =>      3170 nucs 'mol-32-2fc2-151406_3170'

Score:        3169
Aligned:      3169        nucs
Identic:      3169 (100%) nucs =>      2324 (100%)       845 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91678120,91680443] EXCISED REGION [91680445,91681289]
 second seq =>  [       1,    2324] EXCISED REGION [    2326,    3170]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [2325,2325]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [91680443,91680449] to [91680444,91680450]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91680443,91680443] to [91680445,91680445]
 second seq =>         1 nucs [2324,2324] to [2326,2326]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91678120 ATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGA 91678179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGA 60

 91678180 GTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAG 91678239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAG 120

 91678240 GCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTA 91678299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTA 180

 91678300 CTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGT 91678359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGT 240

 91678360 TTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATT 91678419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATT 300

 91678420 TTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAG 91678479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAG 360

 91678480 CTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGG 91678539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGG 420

 91678540 TTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCT 91678599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCT 480

 91678600 TGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATT 91678659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATT 540

 91678660 TTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTA 91678719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTA 600

 91678720 TCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTG 91678779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTG 660

 91678780 TCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCAT 91678839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCAT 720

 91678840 TTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAG 91678899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAG 780

 91678900 TATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGC 91678959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGC 840

 91678960 TATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTG 91679019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTG 900

 91679020 AAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCA 91679079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCA 960

 91679080 TGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTC 91679139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTC 1020

 91679140 TGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTC 91679199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTC 1080

 91679200 CCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCC 91679259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCC 1140

 91679260 TCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGG 91679319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGG 1200

 91679320 CAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCA 91679379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCA 1260

 91679380 GTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAG 91679439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAG 1320

 91679440 GTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGG 91679499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGG 1380

 91679500 GAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTG 91679559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTG 1440

 91679560 TTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACT 91679619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACT 1500

 91679620 GAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATG 91679679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATG 1560

 91679680 GACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCT 91679739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCT 1620

 91679740 TCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCT 91679799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCT 1680

 91679800 CGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGG 91679859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGG 1740

 91679860 GCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACC 91679919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACC 1800

 91679920 TCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACC 91679979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACC 1860

 91679980 TTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCT 91680039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCT 1920

 91680040 GGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACT 91680099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACT 1980

 91680100 GTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAA 91680159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAA 2040

 91680160 GAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACA 91680219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACA 2100

 91680220 ATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGG 91680279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGG 2160

 91680280 TGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATA 91680339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATA 2220

 91680340 GATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGT 91680399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGT 2280

 91680400 GTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 91680443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 2324

EXCISED REGION

 91680445 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 91680504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 2385

 91680505 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 91680564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 2445

 91680565 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 91680624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 2505

 91680625 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 91680684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 2565

 91680685 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 91680744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 2625

 91680745 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 91680804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 2685

 91680805 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 91680864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 2745

 91680865 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 91680924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 2805

 91680925 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 91680984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 2865

 91680985 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 91681044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 2925

 91681045 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 91681104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 2985

 91681105 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 91681164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 3045

 91681165 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 91681224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 3105

 91681225 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATT 91681284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATT 3165

 91681285 TACAG 91681289
          |||||
     3166 TACAG 3170

Alignment time is 4.38871 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    5243] =>      5243 nucs 'mol-32-2fee-328549_5243'

Score:        5220
Aligned:      5242        nucs
Identic:      5240 (100%) nucs =>       229 (100%)      5011 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91675707,91675935] EXCISED REGION [91675937,91680949]
 second seq =>  [       1,     229] EXCISED REGION [     231,    5243]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91675936,91675936]
 second seq =>         1 nucs [230,230]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91675935,91675935] to [91675936,91675936]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [91675934,91675935] to [91675937,91675938]
 second seq =>         2 nucs [228,229] to [231,232]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91675707 TCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCTTGATTGTGGTGTATCTGG 91675766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCTTGATTGTGGTGTATCTGG 60

 91675767 GCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAGCTAATGAATATGTAATTT 91675826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAGCTAATGAATATGTAATTT 120

 91675827 TGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTCACATTTTTTTTATGGAGC 91675886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTCACATTTTTTTTATGGAGC 180

 91675887 AATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATTTTAAAACT 91675935
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATTTTAAAACT 229

EXCISED REGION

 91675937 CTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTCTTCTCT 91675996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      231 CTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTCTTCTCT 290

 91675997 CTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACTCTTGCC 91676056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      291 CTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACTCTTGCC 350

 91676057 TCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTTTATTTATC 91676116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      351 TCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTTTATTTATC 410

 91676117 TGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATATTGCATGC 91676176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      411 TGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATATTGCATGC 470

 91676177 CATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCAATAGG 91676236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      471 CATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCAATAGG 530

 91676237 TAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTCTATTG 91676296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      531 TAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTCTATTG 590

 91676297 TTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAACATGT 91676356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      591 TTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAACATGT 650

 91676357 GGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTTTATTT 91676416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      651 GGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTTTATTT 710

 91676417 ACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCATTGTG 91676476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 ACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCATTGTG 770

 91676477 TATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCCATG 91676536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 TATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCCATG 830

 91676537 TCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTATGGCAGA 91676596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 TCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTATGGCAGA 890

 91676597 ACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTAATT 91676656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 ACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTAATT 950

 91676657 CTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTTATA 91676716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 CTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTTATA 1010

 91676717 TTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCATTGC 91676776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 TTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCATTGC 1070

 91676777 GGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGCTTG 91676836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 GGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGCTTG 1130

 91676837 TAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTTTTA 91676896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 TAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTTTTA 1190

 91676897 ATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATATT 91676956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 ATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATATT 1250

 91676957 AGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTGAT 91677016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 AGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTGAT 1310

 91677017 TATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGATTT 91677076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 TATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGATTT 1370

 91677077 TAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTCTTT 91677136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 TAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTCTTT 1430

 91677137 TTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAGG 91677196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 TTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAGG 1490

 91677197 TAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACACA 91677256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 TAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACACA 1550

 91677257 TCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCCA 91677316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 TCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCCA 1610

 91677317 CCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATAG 91677376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 CCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATAG 1670

 91677377 CTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACTT 91677436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 CTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACTT 1730

 91677437 TACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTCC 91677496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 TACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTCC 1790

 91677497 TTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGAT 91677556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 TTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGAT 1850

 91677557 TGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACAT 91677616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 TGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACAT 1910

 91677617 GCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAG 91677676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 GCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAG 1970

 91677677 TGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGT 91677736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 TGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGT 2030

 91677737 TTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTC 91677796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 TTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTC 2090

 91677797 ACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCT 91677856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 ACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCT 2150

 91677857 TTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATC 91677916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 TTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATC 2210

 91677917 GGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGT 91677976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 GGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGT 2270

 91677977 AGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGA 91678036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 AGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGA 2330

 91678037 GACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCG 91678096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 GACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCG 2390

 91678097 CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTT 91678156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTT 2450

 91678157 TTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTT 91678216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 TTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTT 2510

 91678217 CCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCT 91678276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 CCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCT 2570

 91678277 TTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGT 91678336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 TTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGT 2630

 91678337 TTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGT 91678396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 TTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGT 2690

 91678397 CAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGA 91678456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 CAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGA 2750

 91678457 TTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTG 91678516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 TTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTG 2810

 91678517 TTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTA 91678576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 TTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTA 2870

 91678577 GAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGT 91678636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 GAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGT 2930

 91678637 CCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTC 91678696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 CCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTC 2990

 91678697 TTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCC 91678756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 TTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCC 3050

 91678757 ACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTT 91678816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 ACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTT 3110

 91678817 CTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTG 91678876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 CTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTG 3170

 91678877 TTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTAC 91678936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 TTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTAC 3230

 91678937 TTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGG 91678996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 TTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGG 3290

 91678997 GGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAA 91679056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 GGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAA 3350

 91679057 TTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAA 91679116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 TTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAA 3410

 91679117 GTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTG 91679176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 GTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTG 3470

 91679177 GCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTAT 91679236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 GCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTAT 3530

 91679237 GTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATT 91679296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 GTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATT 3590

 91679297 TTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTT 91679356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3591 TTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAGATTTTTAAAGGCTTT 3650

 91679357 CCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGG 91679416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 CCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGG 3710

 91679417 TTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTC 91679476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 TTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTC 3770

 91679477 TCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGG 91679536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 TCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGG 3830

 91679537 AGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCT 91679596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 AGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCT 3890

 91679597 GGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCT 91679656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 GGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCT 3950

 91679657 TTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGA 91679716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 TTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGA 4010

 91679717 AACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCC 91679776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 AACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCC 4070

 91679777 TTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTA 91679836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 TTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTA 4130

 91679837 GTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCA 91679896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 GTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCA 4190

 91679897 ACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTT 91679956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 ACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTT 4250

 91679957 TCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATC 91680016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 TCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATC 4310

 91680017 TGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTC 91680076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 TGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTC 4370

 91680077 AGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACT 91680136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 AGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACT 4430

 91680137 CTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACA 91680196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 CTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACA 4490

 91680197 ACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTA 91680256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 ACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTA 4550

 91680257 GAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATG 91680316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 GAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATG 4610

 91680317 TGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAA 91680376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 TGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAA 4670

 91680377 TATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTG 91680436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 TATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTG 4730

 91680437 ACTCCATTTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGA 91680496
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 ACTCCATCTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGA 4790

 91680497 AGACTTGGGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTT 91680556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 AGACTTGGGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTT 4850

 91680557 TGTCGTGCCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCT 91680616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 TGTCGTGCCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCT 4910

 91680617 GTATTTTAGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCA 91680676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 GTATTTTAGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCA 4970

 91680677 TAAGAAGGGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGT 91680736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 TAAGAAGGGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGT 5030

 91680737 ATTGATCCTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGT 91680796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 ATTGATCCTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGT 5090

 91680797 AGACTGAGAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGT 91680856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 AGACTGAGAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGT 5150

 91680857 CACATGAGAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCT 91680916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5151 CACATGAGAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCT 5210

 91680917 AGAAAATGAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCT 91680949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 AGAAAATGAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCT 5243

Alignment time is 7.02591 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    5748] =>      5748 nucs 'mol-32-2ff9-357368_5748'

Score:        5617
Aligned:      5749        nucs
Identic:      5737 (100%) nucs =>      3412 (100%)      2325 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91674716,91678133] EXCISED REGION [91680094,91682424]
 second seq =>  [       1,    3417] EXCISED REGION [    3418,    5748]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1960 nucs [91678134,91680093]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91678134,91678134] to [91680094,91680094]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91674716 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGT 91674775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGT 60

 91674776 TCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCGCGCCACCAT 91674835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCGCGCCACCAT 120

 91674836 ACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCCAGGTG 91674895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCCAGGTG 180

 91674896 GTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCTTCCCAAAATGTTAGAATTACA 91674955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCTTCCCAAAATGTTAGAATTACA 240

 91674956 GGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCTCTCTCTCCCCCTTTTCTTTTGAATTCTTTGGATTTG 91675015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCTCTCTCTCCCCCTTTTCTTTTGAATTCTTTGGATTTG 300

 91675016 TTTTTCATATTCCACTTTAATATATCTGTTGACCTCTGACTATGTCTCCTGTATTATTTC 91675075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTCATATTCCACTTTAATATATCTGTTGACCTCTGACTATGTCTCCTGTATTATTTC 360

 91675076 TTAGTGCTTGCGCTAGGCCTGATAATATACATACCTAACCTTTCACAGTTTACTCAGAGT 91675135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAGTGCTTGCGCTAGGCCTGATAATATACATACCTAACCTTTCACAGTTTACTCAGAGT 420

 91675136 TATATTTTACTACCATAGTAAAAATGTGGAAGTTTTACCATGGAGTTTATCTTTTCCCAC 91675195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATATTTTACTACCATAGTAAAAATGTGGAAGTTTTACCATGGAGTTTATCTTTTCCCAC 480

 91675196 AAACCTTTTTGTTATAGTTGTCATATGGGTTACAACTATGTACACTGATTGCAATGATCA 91675255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAACCTTTTTGTTATAGTTGTCATATGGGTTACAACTATGTACACTGATTGCAATGATCA 540

 91675256 TACATAATTTAAGGAATTTAAGAAAAGAAAATTTAGTTTTGTATTACCCATTTTTTATTA 91675315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TACATAATTTAAGGAATTTAAGAAAAGAAAATTTAGTTTTGTATTACCCATTTTTTATTA 600

 91675316 TTCATCTTTCTCTTACTTTATTCCTGAAATTTTTTCCTACAGGCCTTCAAATCAACTTTT 91675375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCATCTTTCTCTTACTTTATTCCTGAAATTTTTTCCTACAGGCCTTCAAATCAACTTTT 660

 91675376 TATTAGTTACAACAATGAAATTGAATATTTAATTTTTTCTCTTAAGAACGAGATTTAATA 91675435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATTAGTTACAACAATGAAATTGAATATTTAATTTTTTCTCTTAAGAACGAGATTTAATA 720

 91675436 AATTCAACTTCATGTAATTTTCCTTCAGCCTGAGATCTTTCGGCAATGAGTTCTGTGAGT 91675495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATTCAACTTCATGTAATTTTCCTTCAGCCTGAGATCTTTCGGCAATGAGTTCTGTGAGT 780

 91675496 TTCCCTTCATCTACGAATGCCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGGTTTTTAATGGAT 91675555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCCCTTCATCTACGAATGCCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGGTTTTTAATGGAT 840

 91675556 ATTTAATGGATATAAAGTTTTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCATCATTTTAAGAT 91675615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTTAATGGATATAAAGTTTTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCATCATTTTAAGAT 900

 91675616 ACCATCTCACTATTTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAAT 91675675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACCATCTCACTATTTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAAT 960

 91675676 TATTGTTCCATTAATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCT 91675735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATTGTTCCATTAATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCT 1020

 91675736 ATTGTTAGAAGCTTGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTT 91675795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTGTTAGAAGCTTGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTT 1080

 91675796 GGGGGTTGCTGAGCTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGG 91675855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGGGTTGCTGAGCTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGG 1140

 91675856 TCCTAATTTCTTCACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCA 91675915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCCTAATTTCTTCACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCA 1200

 91675916 AAGACATTTATTTTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTC 91675975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGACATTTATTTTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTC 1260

 91675976 TTTTTTCAATCTTTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCT 91676035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTTTCAATCTTTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCT 1320

 91676036 TCAAGTTCATTGACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATAT 91676095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAAGTTCATTGACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATAT 1380

 91676096 TATGTGAATAGTTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATG 91676155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATGTGAATAGTTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATG 1440

 91676156 TTATACAGGTATATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGT 91676215
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTATACAGGTATATTGCACGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGT 1500

 91676216 AAAAGCATAGTATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCA 91676275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAAGCATAGTATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCA 1560

 91676276 AATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTC 91676335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTC 1620

 91676336 CCACTTATAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGA 91676395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCACTTATAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGA 1680

 91676396 TAATGGCCTCCAGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATT 91676455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAATGGCCTCCAGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATT 1740

 91676456 GCTACATAGTATTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATG 91676515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTACATAGTATTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATG 1800

 91676516 GGCATTTACGTTGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACT 91676575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGCATTTACGTTGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACT 1860

 91676576 TGCATATGTCTTTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGA 91676635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGCATATGTCTTTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGA 1920

 91676636 CTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCC 91676695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCC 1980

 91676696 ACATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACA 91676755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACA 2040

 91676756 ACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGA 91676815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGA 2100

 91676816 GCATTTTTCATATTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTC 91676875
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCATTTTTCATATTGTGCTTGCAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTC 2160

 91676876 AAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAAT 91676935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAAT 2220

 91676936 TCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCA 91676995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCA 2280

 91676996 GTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGT 91677055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGT 2340

 91677056 CTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAA 91677115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAA 2400

 91677116 CCCGTAGAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTC 91677175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     2401 CCCGTAGAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT-AAATTTTATTTCACATTTTATTTC 2459

 91677176 CAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATT 91677235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATT 2519

 91677236 TCTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTT 91677295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TCTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTT 2579

 91677296 TTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCT 91677355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCT 2639

 91677356 TATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGG 91677415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGG 2699

 91677416 TTTTCTATTCCTGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTG 91677475
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TTTTCTATTCCTGAGTTACTTAACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTG 2759

 91677476 CAAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAA 91677535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2760 CAAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATAAAACACAA 2819

 91677536 TTTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGC 91677595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TTTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGC 2879

 91677596 AAATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTC 91677655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AAATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTC 2939

 91677656 CTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTT 91677715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTT 2999

 91677716 TTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACC 91677775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACC 3059

 91677776 ATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTAT 91677835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 ATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTAT 3119

 91677836 TTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCT 91677895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCT 3179

 91677896 GGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTC 91677955
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3180 GGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACACCATTC 3239

 91677956 TCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAAT 91678015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAAT 3299

 91678016 TATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCT 91678075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCT 3359

 91678076 CCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 91678133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 CCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 3417

EXCISED REGION

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3418 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTGTAGGAAGATTTTG 3477

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 3537

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 3597

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3598 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTTAG 3657

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 3717

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 91680453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 3777

 91680454 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 91680513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3778 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGCTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 3837

 91680514 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTC 91680573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3838 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTGTC 3897

 91680574 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 91680633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 3957

 91680634 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 91680693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 4017

 91680694 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCCTAAGATATT 91680753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4018 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTACTGATCCTAAGATATT 4077

 91680754 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 91680813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 4137

 91680814 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 91680873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 4197

 91680874 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 91680933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 4257

 91680934 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 91680993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 4317

 91680994 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 91681053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 4377

 91681054 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 91681113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 4437

 91681114 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 91681173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 4497

 91681174 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 91681233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 4557

 91681234 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTACAGAGCT 91681293
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4558 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTATAGAGCT 4617

 91681294 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 91681353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 4677

 91681354 TCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAA 91681413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 TCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAA 4737

 91681414 TGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTATTTTTGGAC 91681473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 TGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTATTTTTGGAC 4797

 91681474 TACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATCGAACTATGT 91681533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATCGAACTATGT 4857

 91681534 TTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATTTTAACAATA 91681593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 TTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATTTTAACAATA 4917

 91681594 TAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGAAATTATTAA 91681653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 TAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGAAATTATTAA 4977

 91681654 AATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAACAGGGTATTG 91681713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 AATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAACAGGGTATTG 5037

 91681714 CATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGCTGAAAATAC 91681773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 CATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGCTGAAAATAC 5097

 91681774 TAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTATCCAATGTTC 91681833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 TAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTATCCAATGTTC 5157

 91681834 TTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCC 91681893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 TTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCC 5217

 91681894 AACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCACTTTACTATT 91681953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 AACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCACTTTACTATT 5277

 91681954 GAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTATCTTCTTTC 91682013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 GAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTATCTTCTTTC 5337

 91682014 CTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCTTTTCTCCTT 91682073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 CTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCTTTTCTCCTT 5397

 91682074 CCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAAACTTAAGTG 91682133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 CCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAAACTTAAGTG 5457

 91682134 TTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCCCTATAATTA 91682193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 TTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCCCTATAATTA 5517

 91682194 TTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAAGACATAATT 91682253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 TTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAAGACATAATT 5577

 91682254 CTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAATATTGTATC 91682313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 CTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAATATTGTATC 5637

 91682314 CTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGATTTATTTAAT 91682373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 CTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGATTTATTTAAT 5697

 91682374 GAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGA 91682424
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 GAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGA 5748

Alignment time is 7.70622 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2331] =>      2331 nucs 'mol-32-2ff9-357368_2331'

Score:        2275
Aligned:      2330        nucs
Identic:      2325 (100%) nucs =>        46 (100%)      2279 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91680094,91680139] EXCISED REGION [91680141,91682424]
 second seq =>  [       1,      46] EXCISED REGION [      48,    2331]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91680140,91680140]
 second seq =>         1 nucs [47,47]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91680139,91680139] to [91680141,91680141]
 second seq =>         1 nucs [46,46] to [48,48]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTT 91680139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTT 46

EXCISED REGION

 91680141 TAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTT 91680200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       48 TAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTT 107

 91680201 GATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAA 91680260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      108 GATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAA 167

 91680261 GCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGC 91680320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      168 GCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGC 227

 91680321 AGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATA 91680380
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      228 AGATATTTGTTAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATA 287

 91680381 TTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTC 91680440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      288 TTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTC 347

 91680441 CATTTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGAC 91680500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      348 CATTTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGCTGAAGAC 407

 91680501 TTGGGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTC 91680560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      408 TTGGGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTC 467

 91680561 GTGCCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTAT 91680620
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      468 GTGCCTTTTTGTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTAT 527

 91680621 TTTAGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAG 91680680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      528 TTTAGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAG 587

 91680681 AAGGGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTG 91680740
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      588 AAGGGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTACTG 647

 91680741 ATCCTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGAC 91680800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      648 ATCCTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGAC 707

 91680801 TGAGAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACA 91680860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      708 TGAGAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACA 767

 91680861 TGAGAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAA 91680920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      768 TGAGAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAA 827

 91680921 AATGAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAG 91680980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      828 AATGAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAG 887

 91680981 AGGGTTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGG 91681040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      888 AGGGTTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGG 947

 91681041 ATCTAGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATT 91681100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      948 ATCTAGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATT 1007

 91681101 TTTCGGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTT 91681160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1008 TTTCGGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTT 1067

 91681161 TCAGCCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAA 91681220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1068 TCAGCCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAA 1127

 91681221 CCTCAAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAG 91681280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1128 CCTCAAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAG 1187

 91681281 TATTTACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATT 91681340
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 TATTTATAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATT 1247

 91681341 TGAAACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGA 91681400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 TGAAACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGA 1307

 91681401 GTTGACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGC 91681460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 GTTGACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGC 1367

 91681461 ATTATTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTG 91681520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 ATTATTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTG 1427

 91681521 CATCGAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCAC 91681580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 CATCGAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCAC 1487

 91681581 AATTTTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTT 91681640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 AATTTTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTT 1547

 91681641 AGGAAATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAA 91681700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 AGGAAATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAA 1607

 91681701 AAACAGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCT 91681760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 AAACAGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCT 1667

 91681761 AAGCTGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATT 91681820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 AAGCTGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATT 1727

 91681821 TTATCCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTG 91681880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 TTATCCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTG 1787

 91681881 CCCAAGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTG 91681940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 CCCAAGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTG 1847

 91681941 CCACTTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGC 91682000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 CCACTTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGC 1907

 91682001 ATTATCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCC 91682060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 ATTATCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCC 1967

 91682061 TTCTTTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAG 91682120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 TTCTTTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAG 2027

 91682121 GAAAACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCT 91682180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 GAAAACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCT 2087

 91682181 TCCCCTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTT 91682240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 TCCCCTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTT 2147

 91682241 GGAAGACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCT 91682300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 GGAAGACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCT 2207

 91682301 CTAATATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCA 91682360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 CTAATATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCA 2267

 91682361 AGATTTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTA 91682420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 AGATTTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTA 2327

 91682421 TTGA 91682424
          ||||
     2328 TTGA 2331

Alignment time is 3.50736 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2625] =>      2625 nucs 'mol-32-3004-372573_2625'

Score:        2603
Aligned:      2625        nucs
Identic:      2623 (100%) nucs =>      1069 (100%)      1554 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91678115,91679183] EXCISED REGION [91679185,91680740]
 second seq =>  [       1,    1069] EXCISED REGION [    1070,    2625]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91679184,91679184]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [91680367,91680367]
 second seq =>         1 nucs [2252,2252]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [91679184,91679197] to [91679185,91679198]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91678115 CTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTG 91678174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTG 60

 91678175 CAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATG 91678234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATG 120

 91678235 TTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTC 91678294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTC 180

 91678295 ATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAA 91678354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAA 240

 91678355 TTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAA 91678414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAA 300

 91678415 AGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGC 91678474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGC 360

 91678475 AGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTT 91678534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTT 420

 91678535 TTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGT 91678594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGT 480

 91678595 TATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGT 91678654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGT 540

 91678655 TGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCC 91678714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCC 600

 91678715 AATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTG 91678774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTG 660

 91678775 CTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGT 91678834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGT 720

 91678835 TCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCT 91678894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCT 780

 91678895 TATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCT 91678954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCT 840

 91678955 TTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTT 91679014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTT 900

 91679015 CTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGG 91679074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGG 960

 91679075 CAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTG 91679134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTG 1020

 91679135 TTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATG 91679183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATG 1069

EXCISED REGION

 91679185 TTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATG 91679244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 TTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATG 1129

 91679245 TTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTT 91679304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 TTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTT 1189

 91679305 TATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGAT 91679364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 TATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGAT 1249

 91679365 GTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGT 91679424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 GTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGT 1309

 91679425 TATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTC 91679484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 TATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTC 1369

 91679485 GTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTT 91679544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 GTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTT 1429

 91679545 TAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTC 91679604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 TAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTC 1489

 91679605 TATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAG 91679664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 TATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAG 1549

 91679665 GGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATC 91679724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 GGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATC 1609

 91679725 CCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTT 91679784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 CCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTT 1669

 91679785 ACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAAC 91679844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 ACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAAC 1729

 91679845 AAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCA 91679904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 AAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCA 1789

 91679905 AACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGG 91679964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 AACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGG 1849

 91679965 CTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGG 91680024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 CTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGG 1909

 91680025 AAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGG 91680084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 AAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGG 1969

 91680085 CTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGG 91680144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 CTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGG 2029

 91680145 AAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATT 91680204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 AAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATT 2089

 91680205 GCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTT 91680264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 GCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTT 2149

 91680265 TTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGAT 91680324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 TTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGAT 2209

 91680325 ATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGT 91680384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2210 ATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAATGTTCCCTAATATATTGT 2269

 91680385 ATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATT 91680444
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2270 ATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATC 2329

 91680445 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 91680504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 2389

 91680505 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 91680564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 2449

 91680565 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 91680624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 2509

 91680625 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 91680684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 2569

 91680685 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTG 91680740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTG 2625

Alignment time is 3.67593 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4835] =>      4835 nucs 'mol-32-3025-049519_4835'

Score:        4813
Aligned:      4835        nucs
Identic:      4833 (100%) nucs =>      1228 (100%)      3605 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91675906,91677133] EXCISED REGION [91677135,91680740]
 second seq =>  [       1,    1228] EXCISED REGION [    1229,    4835]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91677134,91677134]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [4539,4539]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [91677134,91677150] to [91677135,91677151]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91675906 TGAGACTTCAAAGACATTTATTTTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCT 91675965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAGACTTCAAAGACATTTATTTTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCT 60

 91675966 CTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTAT 91676025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTAT 120

 91676026 TGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCAC 91676085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCAC 180

 91676086 ATGATCATATTATGTGAATAGTTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCA 91676145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGATCATATTATGTGAATAGTTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCA 240

 91676146 GGGGCACATGTTATACAGGTATATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTG 91676205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGGCACATGTTATACAGGTATATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTG 300

 91676206 TCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTC 91676265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTC 360

 91676266 TCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAA 91676325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAA 420

 91676326 AGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGT 91676385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGT 480

 91676386 TTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTC 91676445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTC 540

 91676446 TCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGT 91676505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGT 600

 91676506 TCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATG 91676565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATG 660

 91676566 AACATACACTTGCATATGTCTTTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCC 91676625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACATACACTTGCATATGTCTTTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCC 720

 91676626 AATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCAC 91676685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCAC 780

 91676686 ACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCT 91676745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCT 840

 91676746 CTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCA 91676805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCA 900

 91676806 GTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAA 91676865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAA 960

 91676866 GTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAAT 91676925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAAT 1020

 91676926 TTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATAT 91676985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATAT 1080

 91676986 TGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGA 91677045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGA 1140

 91677046 AATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGA 91677105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGA 1200

 91677106 AATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTC 91677133
          ||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTC 1228

EXCISED REGION

 91677135 TTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACA 91677194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 TTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACA 1288

 91677195 GGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACA 91677254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 GGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACA 1348

 91677255 CATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCC 91677314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 CATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCC 1408

 91677315 CACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCAT 91677374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 CACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCAT 1468

 91677375 AGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTAC 91677434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 AGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTAC 1528

 91677435 TTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATT 91677494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 TTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATT 1588

 91677495 CCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTG 91677554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 CCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTG 1648

 91677555 ATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAAC 91677614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 ATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAAC 1708

 91677615 ATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGT 91677674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 ATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGT 1768

 91677675 AGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAAT 91677734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 AGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAAT 1828

 91677735 GTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTT 91677794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 GTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTT 1888

 91677795 TCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTT 91677854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 TCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTT 1948

 91677855 CTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATA 91677914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 CTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATA 2008

 91677915 TCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 91677974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 TCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 2068

 91677975 GTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTA 91678034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 GTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTA 2128

 91678035 GAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCC 91678094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 GAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCC 2188

 91678095 CGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTT 91678154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 CGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTT 2248

 91678155 TTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCAT 91678214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 TTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCAT 2308

 91678215 TTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTT 91678274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 TTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTT 2368

 91678275 CTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTT 91678334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 CTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTT 2428

 91678335 GTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTT 91678394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 GTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTT 2488

 91678395 GTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCT 91678454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 GTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCT 2548

 91678455 GATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTT 91678514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 GATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTT 2608

 91678515 TGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTC 91678574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 TGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTC 2668

 91678575 TAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAA 91678634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 TAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAA 2728

 91678635 GTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCAT 91678694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 GTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCAT 2788

 91678695 TCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCG 91678754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 TCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCG 2848

 91678755 CCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTAT 91678814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2849 CCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTAT 2908

 91678815 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGC 91678874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2909 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGC 2968

 91678875 TGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGT 91678934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 TGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGT 3028

 91678935 ACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTG 91678994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3029 ACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTG 3088

 91678995 GGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTG 91679054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 GGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTG 3148

 91679055 AATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCAT 91679114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 AATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCAT 3208

 91679115 AAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTAT 91679174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3209 AAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTAT 3268

 91679175 TGGCAAATG-TTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTT 91679233
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 TGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTT 3328

 91679234 TATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTG 91679293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 TATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTG 3388

 91679294 ATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGC 91679353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3389 ATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGC 3448

 91679354 TTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTC 91679413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3449 TTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTC 3508

 91679414 AGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCT 91679473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3509 AGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCT 3568

 91679474 CTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTA 91679533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3569 CTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTA 3628

 91679534 TGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTT 91679593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 TGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTT 3688

 91679594 TCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGA 91679653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3689 TCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGA 3748

 91679654 GCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGA 91679713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3749 GCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGA 3808

 91679714 GGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCT 91679773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 GGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCT 3868

 91679774 TCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATT 91679833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3869 TCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATT 3928

 91679834 TTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACT 91679893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 TTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACT 3988

 91679894 GCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAG 91679953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 GCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAG 4048

 91679954 GTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGT 91680013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 GTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGT 4108

 91680014 ATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGAT 91680073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 ATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGAT 4168

 91680074 TTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATC 91680133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4169 TTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATC 4228

 91680134 ACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGG 91680193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4229 ACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGG 4288

 91680194 ACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTAC 91680253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4289 ACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTAC 4348

 91680254 TTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAG 91680313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4349 TTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAG 4408

 91680314 ATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCC 91680373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4409 ATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCC 4468

 91680374 TAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAG 91680433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4469 TAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAG 4528

 91680434 GTGACTCCATTTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGG 91680493
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4529 GTGACTCCATCTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGG 4588

 91680494 TGAAGACTTGGGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGG 91680553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4589 TGAAGACTTGGGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGG 4648

 91680554 GTTTGTCGTGCCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGG 91680613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4649 GTTTGTCGTGCCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGG 4708

 91680614 GCTGTATTTTAGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAA 91680673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4709 GCTGTATTTTAGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAA 4768

 91680674 CCATAAGAAGGGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTG 91680733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4769 CCATAAGAAGGGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTG 4828

 91680734 GGTATTG 91680740
          |||||||
     4829 GGTATTG 4835

Alignment time is 6.45962 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3565] =>      3565 nucs 'mol-32-3030-179585_3565'

Score:        3422
Aligned:      3567        nucs
Identic:      3553 (100%) nucs =>      2678 (100%)       875 ( 99%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91675447,91678133] EXCISED REGION [91680094,91680973]
 second seq =>  [       1,    2685] EXCISED REGION [    2686,    3565]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1960 nucs [91678134,91680093]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91678134,91678134] to [91680094,91680094]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91675447 ATGTAATTTTCCTTCAGCCTGAGATCTTTCGGCAATGAGTTCTGTGAGTTTCCCTTCATC 91675506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTAATTTTCCTTCAGCCTGAGATCTTTCGGCAATGAGTTCTGTGAGTTTCCCTTCATC 60

 91675507 TACGAATGCCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGGTTTTTAATGGATATTTAATGGAT 91675566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACGAATGCCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGGTTTTTAATGGATATTTAATGGAT 120

 91675567 ATAAAGTTTTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCATCATTTTAAGATACCATCTCACT 91675626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAAAGTTTTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCATCATTTTAAGATACCATCTCACT 180

 91675627 ATTTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCAT 91675686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCAT 240

 91675687 TAATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAG 91675746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAG 300

 91675747 CTTGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTG 91675806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTG 360

 91675807 AGCTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCT 91675866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCT 420

 91675867 TCACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTAT 91675926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTAT 480

 91675927 TTTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATC 91675986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATC 540

 91675987 TTTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATT 91676046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATT 600

 91676047 GACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAG 91676106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAG 660

 91676107 TTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTA 91676166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTA 720

 91676167 TATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGT 91676226
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATTGCACGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGT 780

 91676227 ATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTA 91676286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTA 840

 91676287 GTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGT 91676346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGT 900

 91676347 GAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCC 91676406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCC 960

 91676407 AGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTA 91676466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTA 1020

 91676467 TTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGT 91676526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGT 1080

 91676527 TGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCT 91676586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCT 1140

 91676587 TTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCA 91676646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCA 1200

 91676647 AACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAA 91676706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAA 1260

 91676707 CTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGT 91676766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGT 1320

 91676767 ATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCAT 91676826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCAT 1380

 91676827 ATTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGC 91676886
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTGTGCTTGCAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGC 1440

 91676887 CCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGAT 91676946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGAT 1500

 91676947 TCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATT 91677006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATT 1560

 91677007 TTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAG 91677066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAG 1620

 91677067 ACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATT 91677126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATT 1680

 91677127 TCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTT 91677186
          |||||||||||||||||||||||  |||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
     1681 TCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTT--AAATTTTTTTTCACATTTTTTTTCCAGAGGTTTTT 1738

 91677187 GGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTT 91677246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTT 1798

 91677247 GGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCAC 91677306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCAC 1858

 91677307 TCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGC 91677366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGC 1918

 91677367 ATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCC 91677426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCC 1978

 91677427 TGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATT 91677486
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TGAGTTACTTAACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATT 2038

 91677487 ATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTC 91677546
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 ATATCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTC 2098

 91677547 ACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTG 91677606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 ACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTG 2158

 91677607 CTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGA 91677666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGA 2218

 91677667 TATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATC 91677726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATC 2278

 91677727 TGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTG 91677786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTG 2338

 91677787 TTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTT 91677846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTT 2398

 91677847 CTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 91677906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 2458

 91677907 GCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAG 91677966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2459 GCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAG 2518

 91677967 CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTAT 91678026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTAT 2578

 91678027 TTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGT 91678086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGT 2638

 91678087 GATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 91678133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 2685

EXCISED REGION

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2686 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTGTAGGAAGATTTTG 2745

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 2805

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 2865

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2866 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTTAG 2925

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 2985

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 91680453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 3045

 91680454 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 91680513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3046 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGCTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 3105

 91680514 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTC 91680573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3106 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTGTC 3165

 91680574 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 91680633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 3225

 91680634 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 91680693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 3285

 91680694 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCCTAAGATATT 91680753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3286 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTACTGATCCTAAGATATT 3345

 91680754 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 91680813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 3405

 91680814 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 91680873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 3465

 91680874 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 91680933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 3525

 91680934 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGC 91680973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGC 3565

Alignment time is 5.10534 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2034] =>      2034 nucs 'mol-32-3046-090590_2034'

Score:        2011
Aligned:      2033        nucs
Identic:      2031 (100%) nucs =>      1155 (100%)       876 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91679210,91680364] EXCISED REGION [91680366,91681243]
 second seq =>  [       1,    1155] EXCISED REGION [    1157,    2034]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91680365,91680365]
 second seq =>         1 nucs [1156,1156]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [91680365,91680366] to [91680366,91680367]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91679210 CTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCT 91679269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCT 60

 91679270 ATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCT 91679329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCT 120

 91679330 AGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCAT 91679389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCAT 180

 91679390 GATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAAC 91679449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAAC 240

 91679450 CCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGA 91679509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGA 300

 91679510 TTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGAC 91679569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGAC 360

 91679570 TGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAG 91679629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAG 420

 91679630 CTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTG 91679689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTG 480

 91679690 TGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTT 91679749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTT 540

 91679750 TTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTG 91679809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTG 600

 91679810 CCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGG 91679869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGG 660

 91679870 GCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTG 91679929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTG 720

 91679930 CTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGC 91679989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGC 780

 91679990 AGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAA 91680049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAA 840

 91680050 GTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCA 91680109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCA 900

 91680110 GCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCAT 91680169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCAT 960

 91680170 GATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGA 91680229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGA 1020

 91680230 CTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAG 91680289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAG 1080

 91680290 TTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTT 91680349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTT 1140

 91680350 GAAGATACAGCCAAC 91680364
          |||||||||||||||
     1141 GAAGATACAGCCAAC 1155

EXCISED REGION

 91680366 AAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGG 91680425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 AAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGG 1216

 91680426 AATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATT 91680485
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1217 AATCAAAGGTGACTCCATCTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATT 1276

 91680486 AGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGG 91680545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 AGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGG 1336

 91680546 AAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGA 91680605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 AAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGA 1396

 91680606 TATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGG 91680665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 TATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGG 1456

 91680666 GTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGA 91680725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 GTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGA 1516

 91680726 AAAGTCTGGGTATTGATCCTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAA 91680785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 AAAGTCTGGGTATTGATCCTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAA 1576

 91680786 ATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGC 91680845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 ATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGC 1636

 91680846 AGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAA 91680905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 AGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAA 1696

 91680906 ATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTG 91680965
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 ATGTAGAGTCCAGAAAATGAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTG 1756

 91680966 ATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTG 91681025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 ATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTG 1816

 91681026 GAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGA 91681085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 GAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGA 1876

 91681086 GTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATT 91681145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 GTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATT 1936

 91681146 AATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCA 91681205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 AATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCA 1996

 91681206 ATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAATAGAATTGAC 91681243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 ATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAATAGAATTGAC 2034

Alignment time is 3.17033 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3195] =>      3195 nucs 'mol-32-30eb-224060_3195'

Score:        3194
Aligned:      3194        nucs
Identic:      3194 (100%) nucs =>      2375 (100%)       819 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91678069,91680443] EXCISED REGION [91680445,91681263]
 second seq =>  [       1,    2375] EXCISED REGION [    2377,    3195]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [2376,2376]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [91680443,91680449] to [91680444,91680450]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91680443,91680443] to [91680445,91680445]
 second seq =>         1 nucs [2375,2375] to [2377,2377]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91678069 TTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 91678128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 60

 91678129 TTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGG 91678188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGG 120

 91678189 TATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTC 91678248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTC 180

 91678249 ATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCA 91678308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCA 240

 91678309 CTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCC 91678368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCC 300

 91678369 TTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCAC 91678428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCAC 360

 91678429 TCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGT 91678488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGT 420

 91678489 TTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTC 91678548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTC 480

 91678549 ATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATT 91678608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATT 540

 91678609 TTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAA 91678668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAA 600

 91678669 AGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTAC 91678728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTAC 660

 91678729 CATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATC 91678788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATC 720

 91678789 AGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATG 91678848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATG 780

 91678849 TGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTC 91678908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTC 840

 91678909 AGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGC 91678968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGC 900

 91678969 TCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAG 91679028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAG 960

 91679029 GGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTT 91679088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTT 1020

 91679089 TCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTC 91679148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTC 1080

 91679149 TCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAA 91679208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAA 1140

 91679209 TCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTC 91679268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTC 1200

 91679269 TATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTC 91679328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTC 1260

 91679329 TAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCA 91679388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCA 1320

 91679389 TGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAA 91679448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAA 1380

 91679449 CCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGG 91679508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGG 1440

 91679509 ATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGA 91679568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGA 1500

 91679569 CTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTA 91679628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTA 1560

 91679629 GCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCT 91679688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCT 1620

 91679689 GTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGT 91679748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGT 1680

 91679749 TTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTT 91679808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTT 1740

 91679809 GCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTG 91679868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTG 1800

 91679869 GGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGT 91679928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGT 1860

 91679929 GCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAG 91679988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAG 1920

 91679989 CAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGA 91680048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGA 1980

 91680049 AGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATC 91680108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATC 2040

 91680109 AGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCA 91680168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCA 2100

 91680169 TGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGG 91680228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGG 2160

 91680229 ACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACA 91680288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACA 2220

 91680289 GTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTT 91680348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTT 2280

 91680349 TGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTC 91680408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTC 2340

 91680409 TTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 91680443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 2375

EXCISED REGION

 91680445 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 91680504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 2436

 91680505 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 91680564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 2496

 91680565 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 91680624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 2556

 91680625 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 91680684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 2616

 91680685 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 91680744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 2676

 91680745 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 91680804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 2736

 91680805 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 91680864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 2796

 91680865 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 91680924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 2856

 91680925 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 91680984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 2916

 91680985 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 91681044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 2976

 91681045 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 91681104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 3036

 91681105 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 91681164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 3096

 91681165 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 91681224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 3156

 91681225 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAAT 91681263
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAAT 3195

Alignment time is 4.61166 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2222] =>      2222 nucs 'mol-32-314e-172185_2222'

Score:        2222
Aligned:      2222        nucs
Identic:      2222 (100%) nucs =>      1529 (100%)       693 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91677655,91679183] EXCISED REGION [91679186,91679878]
 second seq =>  [       1,    1529] EXCISED REGION [    1530,    2222]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [91679184,91679185]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [91679184,91679196] to [91679186,91679198]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91679184,91679184] to [91679185,91679185]
 second seq =>         0 nucs

 91677655 CCTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTT 91677714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTT 60

 91677715 TTTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAAC 91677774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAAC 120

 91677775 CATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTA 91677834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTA 180

 91677835 TTTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGC 91677894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGC 240

 91677895 TGGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATT 91677954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATT 300

 91677955 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAA 91678014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAA 360

 91678015 TTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATC 91678074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATC 420

 91678075 TCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGC 91678134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGC 480

 91678135 CACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGC 91678194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGC 540

 91678195 ACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTT 91678254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTT 600

 91678255 GTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTT 91678314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTT 660

 91678315 GATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAG 91678374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAG 720

 91678375 ATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAG 91678434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAG 780

 91678435 GGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATT 91678494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATT 840

 91678495 AAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAG 91678554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAG 900

 91678555 TGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATA 91678614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATA 960

 91678615 GTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAG 91678674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAG 1020

 91678675 AGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTG 91678734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTG 1080

 91678735 TTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGG 91678794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGG 1140

 91678795 CTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTA 91678854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTA 1200

 91678855 TTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAA 91678914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAA 1260

 91678915 TATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTT 91678974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTT 1320

 91678975 TTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGA 91679034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGA 1380

 91679035 ATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAA 91679094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAA 1440

 91679095 TATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAG 91679154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAG 1500

 91679155 CAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATG 91679183
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATG 1529

EXCISED REGION

 91679186 TTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGT 91679245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 TTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGT 1589

 91679246 TATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTT 91679305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 TATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTT 1649

 91679306 ATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATG 91679365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 ATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATG 1709

 91679366 TCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTT 91679425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 TCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTT 1769

 91679426 ATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCG 91679485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 ATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCG 1829

 91679486 TGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTT 91679545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 TGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTT 1889

 91679546 AGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCT 91679605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 AGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCT 1949

 91679606 ATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGG 91679665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 ATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGG 2009

 91679666 GAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCC 91679725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 GAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCC 2069

 91679726 CTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTA 91679785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 CTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTA 2129

 91679786 CCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACA 91679845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 CCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACA 2189

 91679846 AGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTAC 91679878
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 AGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTAC 2222

Alignment time is 3.34182 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3867] =>      3867 nucs 'mol-32-3159-177861_3867'

Score:        3747
Aligned:      3868        nucs
Identic:      3857 (100%) nucs =>      2673 (100%)      1184 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91675455,91678133] EXCISED REGION [91680094,91681282]
 second seq =>  [       1,    2678] EXCISED REGION [    2679,    3867]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1960 nucs [91678134,91680093]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91678134,91678134] to [91680094,91680094]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91675455 TTCCTTCAGCCTGAGATCTTTCGGCAATGAGTTCTGTGAGTTTCCCTTCATCTACGAATG 91675514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCCTTCAGCCTGAGATCTTTCGGCAATGAGTTCTGTGAGTTTCCCTTCATCTACGAATG 60

 91675515 CCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGGTTTTTAATGGATATTTAATGGATATAAAGTT 91675574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGGTTTTTAATGGATATTTAATGGATATAAAGTT 120

 91675575 TTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCATCATTTTAAGATACCATCTCACTATTTTCTG 91675634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCATCATTTTAAGATACCATCTCACTATTTTCTG 180

 91675635 GCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCATTAATTATA 91675694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCATTAATTATA 240

 91675695 ATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCTTGATTG 91675754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCTTGATTG 300

 91675755 TGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAGCTAATG 91675814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAGCTAATG 360

 91675815 AATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTCACATTT 91675874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTCACATTT 420

 91675875 TTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATTTTAAAAC 91675934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATTTTAAAAC 480

 91675935 TTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTCTTCT 91675994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTCTTCT 540

 91675995 CTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACTCTTG 91676054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACTCTTG 600

 91676055 CCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTTTATTTA 91676114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTTTATTTA 660

 91676115 TCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATATTGCAT 91676174
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      661 TCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATATTGCAC 720

 91676175 GCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCAATA 91676234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCAATA 780

 91676235 GGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTCTAT 91676294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTCTAT 840

 91676295 TGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAACAT 91676354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAACAT 900

 91676355 GTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTTTAT 91676414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTTTAT 960

 91676415 TTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCATTG 91676474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCATTG 1020

 91676475 TGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCCA 91676534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCCA 1080

 91676535 TGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTATGGCA 91676594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTATGGCA 1140

 91676595 GAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTAA 91676654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTAA 1200

 91676655 TTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTTA 91676714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTTA 1260

 91676715 TATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCATT 91676774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCATT 1320

 91676775 GCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGCT 91676834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGCT 1380

 91676835 TGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTTT 91676894
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTTT 1440

 91676895 TAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATA 91676954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATA 1500

 91676955 TTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTG 91677014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTG 1560

 91677015 ATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGAT 91677074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGAT 1620

 91677075 TTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTCT 91677134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTCT 1680

 91677135 TTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACA 91677194
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTTTTTTTTTTTTT-AAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACA 1739

 91677195 GGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACA 91677254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACA 1799

 91677255 CATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCC 91677314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCC 1859

 91677315 CACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCAT 91677374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 CACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCAT 1919

 91677375 AGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTAC 91677434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTAC 1979

 91677435 TTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATT 91677494
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TTAACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATT 2039

 91677495 CCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTG 91677554
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTG 2099

 91677555 ATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAAC 91677614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAAC 2159

 91677615 ATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGT 91677674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGT 2219

 91677675 AGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAAT 91677734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAAT 2279

 91677735 GTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTT 91677794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTT 2339

 91677795 TCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTT 91677854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTT 2399

 91677855 CTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATA 91677914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATA 2459

 91677915 TCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 91677974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2460 TCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 2519

 91677975 GTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTA 91678034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTA 2579

 91678035 GAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCC 91678094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCC 2639

 91678095 CGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 91678133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 2678

EXCISED REGION

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2679 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTGTAGGAAGATTTTG 2738

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 2798

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 2858

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2859 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTTAG 2918

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2919 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 2978

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 91680453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2979 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 3038

 91680454 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 91680513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3039 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGCTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 3098

 91680514 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTC 91680573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3099 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTGTC 3158

 91680574 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 91680633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3159 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 3218

 91680634 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 91680693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3219 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 3278

 91680694 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCCTAAGATATT 91680753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3279 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTACTGATCCTAAGATATT 3338

 91680754 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 91680813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3339 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 3398

 91680814 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 91680873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3399 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 3458

 91680874 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 91680933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3459 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 3518

 91680934 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 91680993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3519 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 3578

 91680994 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 91681053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3579 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 3638

 91681054 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 91681113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3639 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 3698

 91681114 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 91681173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3699 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 3758

 91681174 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 91681233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3759 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 3818

 91681234 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTA 91681282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3819 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTA 3867

Alignment time is 5.22562 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2786] =>      2786 nucs 'mol-32-3185-000671_2786'

Score:        2785
Aligned:      2785        nucs
Identic:      2785 (100%) nucs =>      2409 (100%)       376 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91678035,91680443] EXCISED REGION [91680445,91680820]
 second seq =>  [       1,    2409] EXCISED REGION [    2411,    2786]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [2410,2410]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [91680443,91680449] to [91680444,91680450]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91680443,91680443] to [91680445,91680445]
 second seq =>         1 nucs [2409,2409] to [2411,2411]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91678035 GAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCC 91678094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCC 60

 91678095 CGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTT 91678154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTT 120

 91678155 TTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCAT 91678214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCAT 180

 91678215 TTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTT 91678274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTT 240

 91678275 CTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTT 91678334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTT 300

 91678335 GTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTT 91678394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTT 360

 91678395 GTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCT 91678454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCT 420

 91678455 GATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTT 91678514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTT 480

 91678515 TGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTC 91678574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTC 540

 91678575 TAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAA 91678634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAA 600

 91678635 GTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCAT 91678694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCAT 660

 91678695 TCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCG 91678754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCG 720

 91678755 CCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTAT 91678814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTAT 780

 91678815 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGC 91678874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGC 840

 91678875 TGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGT 91678934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGT 900

 91678935 ACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTG 91678994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTG 960

 91678995 GGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTG 91679054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTG 1020

 91679055 AATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCAT 91679114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCAT 1080

 91679115 AAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTAT 91679174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTAT 1140

 91679175 TGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTT 91679234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTT 1200

 91679235 ATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGA 91679294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGA 1260

 91679295 TTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCT 91679354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCT 1320

 91679355 TTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCA 91679414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCA 1380

 91679415 GGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTC 91679474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTC 1440

 91679475 TCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTAT 91679534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTAT 1500

 91679535 GGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTT 91679594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTT 1560

 91679595 CTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAG 91679654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAG 1620

 91679655 CTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAG 91679714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAG 1680

 91679715 GAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTT 91679774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTT 1740

 91679775 CCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTT 91679834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTT 1800

 91679835 TAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTG 91679894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTG 1860

 91679895 CAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGG 91679954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGG 1920

 91679955 TTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTA 91680014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTA 1980

 91680015 TCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATT 91680074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATT 2040

 91680075 TCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCA 91680134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCA 2100

 91680135 CTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGA 91680194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGA 2160

 91680195 CAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACT 91680254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACT 2220

 91680255 TAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGA 91680314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGA 2280

 91680315 TGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCT 91680374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCT 2340

 91680375 AATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGG 91680434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGG 2400

 91680435 TGACTCCAT 91680443
          |||||||||
     2401 TGACTCCAT 2409

EXCISED REGION

 91680445 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 91680504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 2470

 91680505 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 91680564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 2530

 91680565 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 91680624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 2590

 91680625 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 91680684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 2650

 91680685 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 91680744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 2710

 91680745 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 91680804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 2770

 91680805 AAGAGGTTAGTATGAT 91680820
          ||||||||||||||||
     2771 AAGAGGTTAGTATGAT 2786

Alignment time is 4.17988 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2912] =>      2912 nucs 'mol-32-3190-106848_2912'

Score:        2824
Aligned:      2912        nucs
Identic:      2904 (100%) nucs =>       486 (100%)      2418 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91677647,91678133] EXCISED REGION [91680094,91682518]
 second seq =>  [       1,     487] EXCISED REGION [     488,    2912]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1960 nucs [91678134,91680093]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91678134,91678134] to [91680094,91680094]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91677647 CTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTAC 91677706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTAC 60

 91677707 TTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTC 91677766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTC 120

 91677767 CCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTT 91677826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTT 180

 91677827 ATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATT 91677886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATT 240

 91677887 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTC 91677946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTC 300

 91677947 ACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGC 91678006
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGC 360

 91678007 CCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGG 91678066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGG 420

 91678067 TCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 91678126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 480

 91678127 GCTTGAG 91678133
          |||||||
      481 GCTTGAG 487

EXCISED REGION

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      488 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTGTAGGAAGATTTTG 547

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 607

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 667

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      668 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTTAG 727

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      728 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 787

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 91680453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 847

 91680454 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 91680513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      848 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGCTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 907

 91680514 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTC 91680573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      908 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTGTC 967

 91680574 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 91680633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 1027

 91680634 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 91680693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 1087

 91680694 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCCTAAGATATT 91680753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1088 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTACTGATCCTAAGATATT 1147

 91680754 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 91680813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 1207

 91680814 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 91680873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 1267

 91680874 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 91680933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 1327

 91680934 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 91680993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 1387

 91680994 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 91681053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 1447

 91681054 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 91681113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 1507

 91681114 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 91681173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 1567

 91681174 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 91681233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 1627

 91681234 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTACAGAGCT 91681293
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1628 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTATAGAGCT 1687

 91681294 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 91681353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 1747

 91681354 TCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAA 91681413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 TCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAA 1807

 91681414 TGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTATTTTTGGAC 91681473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 TGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTATTTTTGGAC 1867

 91681474 TACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATCGAACTATGT 91681533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 TACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATCGAACTATGT 1927

 91681534 TTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATTTTAACAATA 91681593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 TTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATTTTAACAATA 1987

 91681594 TAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGAAATTATTAA 91681653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 TAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGAAATTATTAA 2047

 91681654 AATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAACAGGGTATTG 91681713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 AATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAACAGGGTATTG 2107

 91681714 CATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGCTGAAAATAC 91681773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 CATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGCTGAAAATAC 2167

 91681774 TAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTATCCAATGTTC 91681833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 TAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTATCCAATGTTC 2227

 91681834 TTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCC 91681893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 TTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCC 2287

 91681894 AACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCACTTTACTATT 91681953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 AACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCACTTTACTATT 2347

 91681954 GAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTATCTTCTTTC 91682013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 GAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTATCTTCTTTC 2407

 91682014 CTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCTTTTCTCCTT 91682073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 CTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCTTTTCTCCTT 2467

 91682074 CCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAAACTTAAGTG 91682133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 CCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAAACTTAAGTG 2527

 91682134 TTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCCCTATAATTA 91682193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 TTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCCCTATAATTA 2587

 91682194 TTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAAGACATAATT 91682253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 TTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAAGACATAATT 2647

 91682254 CTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAATATTGTATC 91682313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 CTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAATATTGTATC 2707

 91682314 CTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGATTTATTTAAT 91682373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 CTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGATTTATTTAAT 2767

 91682374 GAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGACCAATATAG 91682433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 GAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGACCAATATAG 2827

 91682434 CAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATTTTTCATAGT 91682493
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 CAAAAATTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATTTTTCATAGT 2887

 91682494 TACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAAT 91682518
          |||||||||||||||||||||||||
     2888 TACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAAT 2912

Alignment time is 4.1914 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2255] =>      2255 nucs 'mol-32-321f-058971_2255'

Score:        2189
Aligned:      2255        nucs
Identic:      2249 (100%) nucs =>        98 (100%)      2151 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91678036,91678133] EXCISED REGION [91680094,91682250]
 second seq =>  [       1,      98] EXCISED REGION [      99,    2255]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1960 nucs [91678134,91680093]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91678134,91678134] to [91680094,91680094]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91678036 AGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCC 91678095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCC 60

 91678096 GCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 91678133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 98

EXCISED REGION

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
       99 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTGTAGGAAGATTTTG 158

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      159 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 218

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      219 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 278

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      279 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTTAG 338

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      339 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 398

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 91680453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      399 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 458

 91680454 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 91680513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      459 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGCTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 518

 91680514 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTC 91680573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      519 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTGTC 578

 91680574 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 91680633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      579 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 638

 91680634 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 91680693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      639 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 698

 91680694 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCCTAAGATATT 91680753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      699 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTACTGATCCTAAGATATT 758

 91680754 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 91680813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      759 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 818

 91680814 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 91680873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      819 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 878

 91680874 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 91680933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      879 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 938

 91680934 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 91680993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      939 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 998

 91680994 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 91681053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      999 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 1058

 91681054 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 91681113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1059 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 1118

 91681114 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 91681173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1119 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 1178

 91681174 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 91681233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1179 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 1238

 91681234 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTACAGAGCT 91681293
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1239 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTATAGAGCT 1298

 91681294 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 91681353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 1358

 91681354 TCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAA 91681413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 TCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAA 1418

 91681414 TGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTATTTTTGGAC 91681473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 TGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTATTTTTGGAC 1478

 91681474 TACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATCGAACTATGT 91681533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 TACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATCGAACTATGT 1538

 91681534 TTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATTTTAACAATA 91681593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1539 TTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATTTTAACAATA 1598

 91681594 TAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGAAATTATTAA 91681653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 TAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGAAATTATTAA 1658

 91681654 AATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAACAGGGTATTG 91681713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 AATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAACAGGGTATTG 1718

 91681714 CATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGCTGAAAATAC 91681773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 CATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGCTGAAAATAC 1778

 91681774 TAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTATCCAATGTTC 91681833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 TAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTATCCAATGTTC 1838

 91681834 TTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCC 91681893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 TTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCC 1898

 91681894 AACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCACTTTACTATT 91681953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 AACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCACTTTACTATT 1958

 91681954 GAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTATCTTCTTTC 91682013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 GAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTATCTTCTTTC 2018

 91682014 CTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCTTTTCTCCTT 91682073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 CTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCTTTTCTCCTT 2078

 91682074 CCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAAACTTAAGTG 91682133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 CCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAAACTTAAGTG 2138

 91682134 TTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCCCTATAATTA 91682193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 TTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCCCTATAATTA 2198

 91682194 TTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAAGACATA 91682250
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 TTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAAGACATA 2255

Alignment time is 3.24521 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3235] =>      3235 nucs 'mol-32-321f-121658_3235'

Score:        3234
Aligned:      3234        nucs
Identic:      3234 (100%) nucs =>      2951 (100%)       283 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91677493,91680443] EXCISED REGION [91680445,91680727]
 second seq =>  [       1,    2951] EXCISED REGION [    2953,    3235]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [2952,2952]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [91680443,91680449] to [91680444,91680450]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91680443,91680443] to [91680445,91680445]
 second seq =>         1 nucs [2951,2951] to [2953,2953]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91677493 TTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGT 91677552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGT 60

 91677553 TGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGA 91677612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGA 120

 91677613 ACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCG 91677672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCG 180

 91677673 GTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACA 91677732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACA 240

 91677733 ATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCT 91677792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCT 300

 91677793 TTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTAT 91677852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTAT 360

 91677853 TTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGA 91677912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGA 420

 91677913 TATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 91677972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 480

 91677973 AAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAG 91678032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAG 540

 91678033 TAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTG 91678092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTG 600

 91678093 CCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGAT 91678152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGAT 660

 91678153 TTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGC 91678212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGC 720

 91678213 ATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATC 91678272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATC 780

 91678273 TTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTT 91678332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTT 840

 91678333 TTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTT 91678392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTT 900

 91678393 TTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTG 91678452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTG 960

 91678453 CTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATC 91678512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATC 1020

 91678513 TTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATG 91678572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATG 1080

 91678573 TCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTT 91678632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTT 1140

 91678633 AAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTC 91678692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTC 1200

 91678693 ATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTT 91678752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTT 1260

 91678753 CGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTT 91678812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTT 1320

 91678813 ATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCAT 91678872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCAT 1380

 91678873 GCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTT 91678932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTT 1440

 91678933 GTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAAC 91678992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAAC 1500

 91678993 TGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTAT 91679052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTAT 1560

 91679053 TGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTC 91679112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTC 1620

 91679113 ATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCT 91679172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCT 1680

 91679173 ATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTT 91679232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTT 1740

 91679233 TTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCT 91679292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCT 1800

 91679293 GATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGG 91679352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGG 1860

 91679353 CTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTT 91679412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTT 1920

 91679413 CAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTC 91679472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTC 1980

 91679473 TCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATT 91679532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATT 2040

 91679533 ATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTT 91679592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTT 2100

 91679593 TTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCG 91679652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCG 2160

 91679653 AGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATG 91679712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATG 2220

 91679713 AGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCC 91679772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCC 2280

 91679773 TTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGAT 91679832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGAT 2340

 91679833 TTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAAC 91679892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAAC 2400

 91679893 TGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGA 91679952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGA 2460

 91679953 GGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGG 91680012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGG 2520

 91680013 TATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGA 91680072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGA 2580

 91680073 TTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGAT 91680132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGAT 2640

 91680133 CACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATG 91680192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATG 2700

 91680193 GACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTA 91680252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTA 2760

 91680253 CTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTA 91680312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTA 2820

 91680313 GATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCC 91680372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCC 2880

 91680373 CTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAA 91680432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAA 2940

 91680433 GGTGACTCCAT 91680443
          |||||||||||
     2941 GGTGACTCCAT 2951

EXCISED REGION

 91680445 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 91680504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 3012

 91680505 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 91680564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 3072

 91680565 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 91680624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 3132

 91680625 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 91680684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 3192

 91680685 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAA 91680727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAA 3235

Alignment time is 4.53154 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4547] =>      4547 nucs 'mol-32-3235-251884_4547'

Score:        4395
Aligned:      4549        nucs
Identic:      4535 (100%) nucs =>      3274 (100%)      1261 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91674852,91678133] EXCISED REGION [91680094,91681360]
 second seq =>  [       1,    3280] EXCISED REGION [    3281,    4547]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1960 nucs [91678134,91680093]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91678134,91678134] to [91680094,91680094]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91674852 TGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCCAGGTGGTCTTGATCTCCTGAC 91674911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
        1 TGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCC-AGGTGGTCTTGATCTCCTGAC 59

 91674912 CTCGTGATCCACCCGCCTCAGCTTCCCAAAATGTTAGAATTACAGGCGTGAGCCACCACG 91674971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       60 CTCGTGATCCACCCGCCTCAGCTTCCCAAAATGTTAGAATTACAGGCGTGAGCCACCACG 119

 91674972 CCCAGCCTCTCTCTCCCCCTTTTCTTTTGAATTCTTTGGATTTGTTTTTCATATTCCACT 91675031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 CCCAGCCTCTCTCTCCCCCTTTTCTTTTGAATTCTTTGGATTTGTTTTTCATATTCCACT 179

 91675032 TTAATATATCTGTTGACCTCTGACTATGTCTCCTGTATTATTTCTTAGTGCTTGCGCTAG 91675091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 TTAATATATCTGTTGACCTCTGACTATGTCTCCTGTATTATTTCTTAGTGCTTGCGCTAG 239

 91675092 GCCTGATAATATACATACCTAACCTTTCACAGTTTACTCAGAGTTATATTTTACTACCAT 91675151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 GCCTGATAATATACATACCTAACCTTTCACAGTTTACTCAGAGTTATATTTTACTACCAT 299

 91675152 AGTAAAAATGTGGAAGTTTTACCATGGAGTTTATCTTTTCCCACAAACCTTTTTGTTATA 91675211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 AGTAAAAATGTGGAAGTTTTACCATGGAGTTTATCTTTTCCCACAAACCTTTTTGTTATA 359

 91675212 GTTGTCATATGGGTTACAACTATGTACACTGATTGCAATGATCATACATAATTTAAGGAA 91675271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 GTTGTCATATGGGTTACAACTATGTACACTGATTGCAATGATCATACATAATTTAAGGAA 419

 91675272 TTTAAGAAAAGAAAATTTAGTTTTGTATTACCCATTTTTTATTATTCATCTTTCTCTTAC 91675331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TTTAAGAAAAGAAAATTTAGTTTTGTATTACCCATTTTTTATTATTCATCTTTCTCTTAC 479

 91675332 TTTATTCCTGAAATTTTTTCCTACAGGCCTTCAAATCAACTTTTTATTAGTTACAACAAT 91675391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TTTATTCCTGAAATTTTTTCCTACAGGCCTTCAAATCAACTTTTTATTAGTTACAACAAT 539

 91675392 GAAATTGAATATTTAATTTTTTCTCTTAAGAACGAGATTTAATAAATTCAACTTCATGTA 91675451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GAAATTGAATATTTAATTTTTTCTCTTAAGAACGAGATTTAATAAATTCAACTTCATGTA 599

 91675452 ATTTTCCTTCAGCCTGAGATCTTTCGGCAATGAGTTCTGTGAGTTTCCCTTCATCTACGA 91675511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 ATTTTCCTTCAGCCTGAGATCTTTCGGCAATGAGTTCTGTGAGTTTCCCTTCATCTACGA 659

 91675512 ATGCCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGGTTTTTAATGGATATTTAATGGATATAAA 91675571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 ATGCCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGGTTTTTAATGGATATTTAATGGATATAAA 719

 91675572 GTTTTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCATCATTTTAAGATACCATCTCACTATTTT 91675631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GTTTTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCATCATTTTAAGATACCATCTCACTATTTT 779

 91675632 CTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCATTAATT 91675691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCATTAATT 839

 91675692 ATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCTTGA 91675751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 ATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCTTGA 899

 91675752 TTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAGCTA 91675811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAGCTA 959

 91675812 ATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTCACA 91675871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTCACA 1019

 91675872 TTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATTTTAA 91675931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATTTTAA 1079

 91675932 AACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTCT 91675991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTCT 1139

 91675992 TCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACTC 91676051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACTC 1199

 91676052 TTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTTTAT 91676111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTTTAT 1259

 91676112 TTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATATTG 91676171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATATTG 1319

 91676172 CATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCA 91676231
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CACGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCA 1379

 91676232 ATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTC 91676291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTC 1439

 91676292 TATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAA 91676351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAA 1499

 91676352 CATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTT 91676411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTT 1559

 91676412 TATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCA 91676471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCA 1619

 91676472 TTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTT 91676531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTT 1679

 91676532 CCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTATG 91676591
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CCATGTCTTTGCTATTGTGGATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTATG 1739

 91676592 GCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGG 91676651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGG 1799

 91676652 TAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAAT 91676711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAAT 1859

 91676712 TTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTC 91676771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTC 1919

 91676772 ATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGT 91676831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 ATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGT 1979

 91676832 GCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACT 91676891
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GCTTGCAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACT 2039

 91676892 TTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGG 91676951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGG 2099

 91676952 ATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTAT 91677011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTAT 2159

 91677012 TTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGT 91677071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGT 2219

 91677072 GATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTT 91677131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTT 2279

 91677132 TCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGA 91677191
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TCTTTTTTTTTTTTTTTTT-AAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGA 2338

 91677192 ACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTAC 91677251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTAC 2398

 91677252 ACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCC 91677311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCC 2458

 91677312 TCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCT 91677371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCT 2518

 91677372 CATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGT 91677431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 CATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGT 2578

 91677432 TACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATC 91677491
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TACTTAACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATC 2638

 91677492 ATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGG 91677551
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 ATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGG 2698

 91677552 TTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATG 91677611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATG 2758

 91677612 AACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTC 91677671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTC 2818

 91677672 GGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCAC 91677731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCAC 2878

 91677732 AATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCC 91677791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCC 2938

 91677792 TTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTA 91677851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTA 2998

 91677852 TTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACG 91677911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACG 3058

 91677912 ATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 91677971
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3059 ATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 3118

 91677972 CAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTA 91678031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 CAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTA 3178

 91678032 GTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCT 91678091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCT 3238

 91678092 GCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 91678133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 3280

EXCISED REGION

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3281 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTGTAGGAAGATTTTG 3340

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 3400

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 3460

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3461 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTTAG 3520

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 3580

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 91680453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 3640

 91680454 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 91680513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3641 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGCTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 3700

 91680514 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTC 91680573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3701 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTGTC 3760

 91680574 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 91680633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 3820

 91680634 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 91680693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 3880

 91680694 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCCTAAGATATT 91680753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3881 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTACTGATCCTAAGATATT 3940

 91680754 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 91680813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 4000

 91680814 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 91680873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 4060

 91680874 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 91680933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 4120

 91680934 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 91680993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 4180

 91680994 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 91681053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 4240

 91681054 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 91681113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 4300

 91681114 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 91681173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 4360

 91681174 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 91681233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 4420

 91681234 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTACAGAGCT 91681293
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4421 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTATAGAGCT 4480

 91681294 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 91681353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 4540

 91681354 TCCTGTC 91681360
          |||||||
     4541 TCCTGTC 4547

Alignment time is 6.09079 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2903] =>      2903 nucs 'mol-32-3395-046517_2903'

Score:        2886
Aligned:      2897        nucs
Identic:      2896 (100%) nucs =>      1645 (100%)      1251 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91675508,91677152] EXCISED REGION [91677160,91678411]
 second seq =>  [       1,    1645] EXCISED REGION [    1652,    2903]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [91677153,91677159]
 second seq =>         6 nucs [1646,1651]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [91677148,91677152] to [91677155,91677159]
 second seq =>         3 nucs [1646,1648] to [1652,1654]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91677153,91677153] to [91677159,91677159]
 second seq =>         3 nucs [1646,1648] to [1649,1651]

 91675508 ACGAATGCCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGGTTTTTAATGGATATTTAATGGATA 91675567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACGAATGCCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGGTTTTTAATGGATATTTAATGGATA 60

 91675568 TAAAGTTTTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCATCATTTTAAGATACCATCTCACTA 91675627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAAGTTTTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCATCATTTTAAGATACCATCTCACTA 120

 91675628 TTTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCATT 91675687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCATT 180

 91675688 AATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGC 91675747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGC 240

 91675748 TTGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGA 91675807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGA 300

 91675808 GCTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTT 91675867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTT 360

 91675868 CACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATT 91675927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATT 420

 91675928 TTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCT 91675987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCT 480

 91675988 TTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTG 91676047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTG 540

 91676048 ACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGT 91676107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGT 600

 91676108 TTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTAT 91676167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTAT 660

 91676168 ATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTA 91676227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTA 720

 91676228 TCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAG 91676287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAG 780

 91676288 TGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTG 91676347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTG 840

 91676348 AGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCA 91676407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCA 900

 91676408 GCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTAT 91676467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTAT 960

 91676468 TCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTT 91676527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTT 1020

 91676528 GGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTT 91676587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTT 1080

 91676588 TATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAA 91676647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAA 1140

 91676648 ACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAAC 91676707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAAC 1200

 91676708 TAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTA 91676767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTA 1260

 91676768 TCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATA 91676827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATA 1320

 91676828 TTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCC 91676887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCC 1380

 91676888 CACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATT 91676947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATT 1440

 91676948 CTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTT 91677007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTT 1500

 91677008 TTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGA 91677067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGA 1560

 91677068 CAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTT 91677127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTT 1620

 91677128 CTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTA 91677152
          |||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTA 1645

EXCISED REGION

 91677160 TTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAG 91677219
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 TTTCACATTTTTTTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAG 1711

 91677220 ATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTA 91677279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 ATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTA 1771

 91677280 CCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGG 91677339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 CCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGG 1831

 91677340 TCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAG 91677399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 TCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAG 1891

 91677400 AAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAAT 91677459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 AAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAAT 1951

 91677460 TCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCC 91677519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 TCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCC 2011

 91677520 ATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTAT 91677579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 ATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTAT 2071

 91677580 ATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGT 91677639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 ATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGT 2131

 91677640 ATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATA 91677699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 ATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATA 2191

 91677700 TTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTT 91677759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 TTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTT 2251

 91677760 TACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTAT 91677819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 TACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTAT 2311

 91677820 TTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCA 91677879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 TTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCA 2371

 91677880 CTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCC 91677939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCC 2431

 91677940 CAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCC 91677999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 CAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCC 2491

 91678000 ACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCC 91678059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 ACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCC 2551

 91678060 AGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 91678119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 AGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 2611

 91678120 ATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGA 91678179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 ATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGA 2671

 91678180 GTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAG 91678239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 GTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAG 2731

 91678240 GCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTA 91678299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 GCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTA 2791

 91678300 CTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGT 91678359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 CTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGT 2851

 91678360 TTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTG 91678411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 TTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTG 2903

Alignment time is 4.07245 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3757] =>      3757 nucs 'mol-32-3403-102485_3757'

Score:        3593
Aligned:      3760        nucs
Identic:      3744 (100%) nucs =>      2509 (100%)      1235 ( 99%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91675617,91678133] EXCISED REGION [91680094,91681336]
 second seq =>  [       1,    2515] EXCISED REGION [    2516,    3757]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1960 nucs [91678134,91680093]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91678134,91678134] to [91680094,91680094]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91675617 CCATCTCACTATTTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATT 91675676
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCATCTCACTATTTTATGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATT 60

 91675677 ATTGTTCCATTAATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTA 91675736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTGTTCCATTAATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTA 120

 91675737 TTGTTAGAAGCTTGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTG 91675796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTTAGAAGCTTGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTG 180

 91675797 GGGGTTGCTGAGCTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGT 91675856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGGTTGCTGAGCTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGT 240

 91675857 CCTAATTTCTTCACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAA 91675916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTAATTTCTTCACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAA 300

 91675917 AGACATTTATTTTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCT 91675976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGACATTTATTTTAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCT 360

 91675977 TTTTTCAATCTTTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTT 91676036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTCAATCTTTCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTT 420

 91676037 CAAGTTCATTGACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATT 91676096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAGTTCATTGACTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATT 480

 91676097 ATGTGAATAGTTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGT 91676156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGTGAATAGTTTATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGT 540

 91676157 TATACAGGTATATTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTA 91676216
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATACAGGTATATTGCACGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTA 600

 91676217 AAAGCATAGTATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAA 91676276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAGCATAGTATCCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAA 660

 91676277 ATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCC 91676336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCC 720

 91676337 CACTTATAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGAT 91676396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACTTATAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGAT 780

 91676397 AATGGCCTCCAGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTG 91676456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATGGCCTCCAGCTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTG 840

 91676457 CTACATAGTATTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGG 91676516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTACATAGTATTCCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGG 900

 91676517 GCATTTACGTTGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTT 91676576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCATTTACGTTGGTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTT 960

 91676577 GCATATGTCTTTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGAC 91676636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCATATGTCTTTATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGAC 1020

 91676637 TGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCA 91676696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCTGGGTCAAACGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCA 1080

 91676697 CATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAA 91676756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATGGCTGAACTAATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAA 1140

 91676757 CATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAG 91676816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTGTGAGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAG 1200

 91676817 CATTTTTCATATTGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCA 91676876
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATTTTTCATATTGTGCTTGCAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCA 1260

 91676877 AGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATT 91676936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTACTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATT 1320

 91676937 CCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAG 91676996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAG 1380

 91676997 TTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTC 91677056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTC 1440

 91677057 TACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAAC 91677116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAAC 1500

 91677117 CCGTAGAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCC 91677176
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     1501 CCGTAGAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTT--AAATTTTATTTCACATTTTATTTCC 1558

 91677177 AGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTT 91677236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 AGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTT 1618

 91677237 CTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTT 91677296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTT 1678

 91677297 TATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTT 91677356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTT 1738

 91677357 ATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGT 91677416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 ATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGT 1798

 91677417 TTTCTATTCCTGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGC 91677476
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TTTCTATTCCTGAGTTACTTAACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGC 1858

 91677477 AAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAAT 91677536
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1859 AAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATAAAACACAAT 1918

 91677537 TTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCA 91677596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCA 1978

 91677597 AATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCC 91677656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCC 2038

 91677657 TCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTT 91677716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTT 2098

 91677717 TTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCA 91677776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCA 2158

 91677777 TGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATT 91677836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATT 2218

 91677837 TTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTG 91677896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTG 2278

 91677897 GAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCT 91677956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2279 GAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACACCATTCT 2338

 91677957 CCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATT 91678016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATT 2398

 91678017 ATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTC 91678076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTC 2458

 91678077 CTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 91678133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 2515

EXCISED REGION

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2516 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTGTAGGAAGATTTTG 2575

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 2635

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 2695

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2696 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTTAG 2755

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 2815

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 91680453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 2875

 91680454 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 91680513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2876 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGCTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 2935

 91680514 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTC 91680573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2936 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTGTC 2995

 91680574 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 91680633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2996 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGCATTTTAGGAGAGATG 3055

 91680634 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 91680693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 3115

 91680694 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCCTAAGATATT 91680753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3116 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTACTGATCCTAAGATATT 3175

 91680754 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 91680813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 3235

 91680814 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 91680873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 3295

 91680874 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 91680933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 3355

 91680934 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 91680993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 3415

 91680994 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 91681053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 3475

 91681054 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 91681113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 3535

 91681114 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 91681173
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 ACATAGATTGCA-TTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 3594

 91681174 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 91681233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 3654

 91681234 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTACAGAGCT 91681293
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3655 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTATAGAGCT 3714

 91681294 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGC 91681336
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGC 3757

Alignment time is 5.08953 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    9159] =>      9159 nucs 'mol-32-3492-121038_9159'

Score:        9137
Aligned:      9159        nucs
Identic:      9157 (100%) nucs =>       214 (100%)      8943 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91676920,91677133] EXCISED REGION [91677135,91686079]
 second seq =>  [       1,     214] EXCISED REGION [     215,    9159]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91677134,91677134]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [3524,3524]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [91677134,91677150] to [91677135,91677151]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91676920 GTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTT 91676979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTT 60

 91676980 AGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGT 91677039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGT 120

 91677040 GAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCT 91677099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCT 180

 91677100 CAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTC 91677133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTC 214

EXCISED REGION

 91677135 TTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACA 91677194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      215 TTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACA 274

 91677195 GGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACA 91677254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      275 GGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACA 334

 91677255 CATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCC 91677314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      335 CATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCC 394

 91677315 CACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCAT 91677374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      395 CACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCAT 454

 91677375 AGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTAC 91677434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      455 AGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTAC 514

 91677435 TTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATT 91677494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      515 TTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATT 574

 91677495 CCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTG 91677554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      575 CCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTG 634

 91677555 ATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAAC 91677614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      635 ATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAAC 694

 91677615 ATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGT 91677674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      695 ATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGT 754

 91677675 AGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAAT 91677734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      755 AGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAAT 814

 91677735 GTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTT 91677794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      815 GTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTT 874

 91677795 TCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTT 91677854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      875 TCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTT 934

 91677855 CTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATA 91677914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      935 CTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATA 994

 91677915 TCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 91677974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 TCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 1054

 91677975 GTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTA 91678034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 GTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTA 1114

 91678035 GAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCC 91678094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 GAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCC 1174

 91678095 CGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTT 91678154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 CGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTT 1234

 91678155 TTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCAT 91678214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 TTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCAT 1294

 91678215 TTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTT 91678274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 TTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTT 1354

 91678275 CTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTT 91678334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 CTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTT 1414

 91678335 GTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTT 91678394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 GTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTT 1474

 91678395 GTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCT 91678454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 GTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCT 1534

 91678455 GATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTT 91678514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 GATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTT 1594

 91678515 TGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTC 91678574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 TGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTC 1654

 91678575 TAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAA 91678634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 TAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAA 1714

 91678635 GTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCAT 91678694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 GTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCAT 1774

 91678695 TCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCG 91678754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 TCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCG 1834

 91678755 CCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTAT 91678814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 CCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTAT 1894

 91678815 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGC 91678874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGC 1954

 91678875 TGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGT 91678934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 TGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGT 2014

 91678935 ACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTG 91678994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 ACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTG 2074

 91678995 GGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTG 91679054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 GGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTG 2134

 91679055 AATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCAT 91679114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 AATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCAT 2194

 91679115 AAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTAT 91679174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 AAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTAT 2254

 91679175 TGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTT 91679234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 TGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTT 2314

 91679235 ATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGA 91679294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 ATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGA 2374

 91679295 TTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCT 91679354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 TTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCT 2434

 91679355 TTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCA 91679414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 TTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCA 2494

 91679415 GGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTC 91679474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 GGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTC 2554

 91679475 TCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTAT 91679534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 TCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTAT 2614

 91679535 GGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTT 91679594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 GGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTT 2674

 91679595 CTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAG 91679654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 CTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAG 2734

 91679655 CTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAG 91679714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 CTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAG 2794

 91679715 GAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTT 91679774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 GAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTT 2854

 91679775 CCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTT 91679834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 CCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTT 2914

 91679835 TAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTG 91679894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 TAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTG 2974

 91679895 CAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGG 91679954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 CAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGG 3034

 91679955 TTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTA 91680014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 TTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTA 3094

 91680015 TCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATT 91680074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 TCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATT 3154

 91680075 TCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCA 91680134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 TCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCA 3214

 91680135 CTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGA 91680194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 CTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGA 3274

 91680195 CAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACT 91680254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 CAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACT 3334

 91680255 TAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGA 91680314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 TAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGA 3394

 91680315 TGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCT 91680374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 TGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCT 3454

 91680375 AATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGG 91680434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 AATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGG 3514

 91680435 TGACTCCATTTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGT 91680494
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 TGACTCCATCTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGT 3574

 91680495 GAAGACTTGGGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGG 91680554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 GAAGACTTGGGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGG 3634

 91680555 TTTGTCGTGCCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGG 91680614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 TTTGTCGTGCCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGG 3694

 91680615 CTGTATTTTAGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAAC 91680674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 CTGTATTTTAGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAAC 3754

 91680675 CATAAGAAGGGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGG 91680734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 CATAAGAAGGGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGG 3814

 91680735 GTATTGATCCTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAA 91680794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 GTATTGATCCTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAA 3874

 91680795 GTAGACTGAGAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAA 91680854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 GTAGACTGAGAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAA 3934

 91680855 GTCACATGAGAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGT 91680914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 GTCACATGAGAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGT 3994

 91680915 CTAGAAAATGAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCA 91680974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 CTAGAAAATGAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCA 4054

 91680975 CCACAGAGGGTTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAA 91681034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 CCACAGAGGGTTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAA 4114

 91681035 GTCTGGATCTAGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGA 91681094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 GTCTGGATCTAGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGA 4174

 91681095 AATATTTTTCGGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTG 91681154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 AATATTTTTCGGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTG 4234

 91681155 GTTCTTTCAGCCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACC 91681214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 GTTCTTTCAGCCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACC 4294

 91681215 TATTAACCTCAAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGT 91681274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 TATTAACCTCAAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGT 4354

 91681275 AAATAGTATTTACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAA 91681334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4355 AAATAGTATTTACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGACATTGCTGCAA 4414

 91681335 GCAATTTGAAACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCA 91681394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 GCAATTTGAAACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCA 4474

 91681395 ACCAGAGTTGACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTG 91681454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 ACCAGAGTTGACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTG 4534

 91681455 TCCTGCATTATTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAA 91681514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 TCCTGCATTATTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAA 4594

 91681515 AATTTGCATCGAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAA 91681574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 AATTTGCATCGAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAA 4654

 91681575 AGGCACAATTTTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATAC 91681634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 AGGCACAATTTTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATAC 4714

 91681635 TATTTTAGGAAATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAA 91681694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 TATTTTAGGAAATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAA 4774

 91681695 TGGCAAAAACAGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCA 91681754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 TGGCAAAAACAGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCA 4834

 91681755 TAATCTAAGCTGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAG 91681814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4835 TAATCTAAGCTGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAG 4894

 91681815 TTGATTTTATCCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAAT 91681874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4895 TTGATTTTATCCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAAT 4954

 91681875 GACCTGCCCAAGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTA 91681934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4955 GACCTGCCCAAGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTA 5014

 91681935 CTATTGCCACTTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAA 91681994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5015 CTATTGCCACTTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAA 5074

 91681995 CGTTGCATTATCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTC 91682054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5075 CGTTGCATTATCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTC 5134

 91682055 TTTCCCTTCTTTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTA 91682114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5135 TTTCCCTTCTTTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTA 5194

 91682115 AGAAAGGAAAACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTA 91682174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5195 AGAAAGGAAAACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTA 5254

 91682175 GTAGCTTCCCCTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAA 91682234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5255 GTAGCTTCCCCTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAA 5314

 91682235 CCATTTGGAAGACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAA 91682294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5315 CCATTTGGAAGACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAA 5374

 91682295 TAACCTCTAATATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAAT 91682354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5375 TAACCTCTAATATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAAT 5434

 91682355 AAATCAAGATTTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGT 91682414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5435 AAATCAAGATTTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGT 5494

 91682415 GGGCTATTGACCAATATAGCAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTT 91682474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5495 GGGCTATTGACCAATATAGCAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTT 5554

 91682475 AAATTCTATTTTTCATAGTTACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGA 91682534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5555 AAATTCTATTTTTCATAGTTACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGA 5614

 91682535 TCCTTAGTTTGCTAATCTAAAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATT 91682594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5615 TCCTTAGTTTGCTAATCTAAAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATT 5674

 91682595 GATAGCTGTACATGGTACACTTGGTATAGTATAACTTCTCATAACCGTTAATTATTTTAT 91682654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5675 GATAGCTGTACATGGTACACTTGGTATAGTATAACTTCTCATAACCGTTAATTATTTTAT 5734

 91682655 TGCCATTATTGCTATTAGTACCAGTAATAACACTCTTCCAATGGAAAATATTTTTCTGAA 91682714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5735 TGCCATTATTGCTATTAGTACCAGTAATAACACTCTTCCAATGGAAAATATTTTTCTGAA 5794

 91682715 AACTCATAAATATAATAATATTCATTGTTTCAGAAATTAGCTAAAAGTAGGACCTATGAA 91682774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5795 AACTCATAAATATAATAATATTCATTGTTTCAGAAATTAGCTAAAAGTAGGACCTATGAA 5854

 91682775 GTATTATGGTGCTGGTTAACATAACATGTAGTTAGTGAAATCACCAATAAATGAAGACAT 91682834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5855 GTATTATGGTGCTGGTTAACATAACATGTAGTTAGTGAAATCACCAATAAATGAAGACAT 5914

 91682835 GACATATAATCTAAATTATATTATATTTGCATAGTCTAAATTATATTATGTATGGCATAT 91682894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5915 GACATATAATCTAAATTATATTATATTTGCATAGTCTAAATTATATTATGTATGGCATAT 5974

 91682895 GTCCATACTCCATCCTAAGAAATCCAATTCTTTTAATAATTGTAATAGAATTGATTGAGC 91682954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5975 GTCCATACTCCATCCTAAGAAATCCAATTCTTTTAATAATTGTAATAGAATTGATTGAGC 6034

 91682955 TTGCTATTAGAGTGTTTAACTGTACTCTTGAAATGGGTTTTACTAAAAGAGATATGGAAA 91683014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6035 TTGCTATTAGAGTGTTTAACTGTACTCTTGAAATGGGTTTTACTAAAAGAGATATGGAAA 6094

 91683015 ATTTTATTTATGAGCTTCAAATGAGCATCTAATCTACTAGTGTCATTGTAATTTCTCATA 91683074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6095 ATTTTATTTATGAGCTTCAAATGAGCATCTAATCTACTAGTGTCATTGTAATTTCTCATA 6154

 91683075 CAAGTGTACAAATGATAGCGCAGCATCTCTTTCAGGTGTTATATTCAGAATCATAATAAA 91683134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6155 CAAGTGTACAAATGATAGCGCAGCATCTCTTTCAGGTGTTATATTCAGAATCATAATAAA 6214

 91683135 ACTCTTGCAGAATATATGTGTGCATCAAAATGAAATGACAATGAATTTTCTCTCGAAATT 91683194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6215 ACTCTTGCAGAATATATGTGTGCATCAAAATGAAATGACAATGAATTTTCTCTCGAAATT 6274

 91683195 GATAGCACGTATTAGCATAAATTGAACTGTGCAACTGTGTCCATAACAGGCTGAGTGATG 91683254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6275 GATAGCACGTATTAGCATAAATTGAACTGTGCAACTGTGTCCATAACAGGCTGAGTGATG 6334

 91683255 TAGCAGTTGATTGCTTTGTACACATTCTTGTGTTTTGCCTTCTGTTTTCCTTGCTGTGTG 91683314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6335 TAGCAGTTGATTGCTTTGTACACATTCTTGTGTTTTGCCTTCTGTTTTCCTTGCTGTGTG 6394

 91683315 TTATTCTCTCTTCCGTCCCACCAAGGTGAGAGTAAATTTTTCCCTTCCTGGCTTTATTGC 91683374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6395 TTATTCTCTCTTCCGTCCCACCAAGGTGAGAGTAAATTTTTCCCTTCCTGGCTTTATTGC 6454

 91683375 TTGAAGATAATAGAGTAAGGCAGGAGCATGTGCAAGGCAAAAGTACCTGTTGTCATCATT 91683434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6455 TTGAAGATAATAGAGTAAGGCAGGAGCATGTGCAAGGCAAAAGTACCTGTTGTCATCATT 6514

 91683435 GCCCTTTTCCGGTGTCCCTCTTTATTTCCTTCTGTGTCTTTGATATTCCAGGCAAAACTC 91683494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6515 GCCCTTTTCCGGTGTCCCTCTTTATTTCCTTCTGTGTCTTTGATATTCCAGGCAAAACTC 6574

 91683495 TTTTATAACACTTCATGCCATGGCCCCTTCCAGCTACAGATAGGACAGGTGGTTGAATGG 91683554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6575 TTTTATAACACTTCATGCCATGGCCCCTTCCAGCTACAGATAGGACAGGTGGTTGAATGG 6634

 91683555 CTAGCACTCCATGAGCTTTATTCATGTATATTTATAAAAGTGCAATTTCTTTTTCTTTCT 91683614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6635 CTAGCACTCCATGAGCTTTATTCATGTATATTTATAAAAGTGCAATTTCTTTTTCTTTCT 6694

 91683615 TTCTTTCTTTTTATATTATAGCAAACTCTTGTACATTTACTTACTTATTTTCTTTCAGTG 91683674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6695 TTCTTTCTTTTTATATTATAGCAAACTCTTGTACATTTACTTACTTATTTTCTTTCAGTG 6754

 91683675 ATCATGCTAGTATGGTTGTGCTATCTGAAAATCTAGCCTTTTAGCTTCCTAGATGATATA 91683734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6755 ATCATGCTAGTATGGTTGTGCTATCTGAAAATCTAGCCTTTTAGCTTCCTAGATGATATA 6814

 91683735 CTTAATATGACTAAATAAATCCAGCCTGTACCACAACTGTCAAAACACCTGGAAATTTAT 91683794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6815 CTTAATATGACTAAATAAATCCAGCCTGTACCACAACTGTCAAAACACCTGGAAATTTAT 6874

 91683795 AATTTCACCATCTCTTCAGAGCAAGAGAGCTTTTGTGACAAATATGGTAGGGTGAATACG 91683854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6875 AATTTCACCATCTCTTCAGAGCAAGAGAGCTTTTGTGACAAATATGGTAGGGTGAATACG 6934

 91683855 GAGCAGATAAACCCATATACTCTGACTTTCAATAAAGCAAGAGGGGATAACACTTCATAG 91683914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6935 GAGCAGATAAACCCATATACTCTGACTTTCAATAAAGCAAGAGGGGATAACACTTCATAG 6994

 91683915 AGACCAGATACCACTCTATCAAGGTTACTGAATGGACTATGTCCTGTACCAGATGTGATG 91683974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6995 AGACCAGATACCACTCTATCAAGGTTACTGAATGGACTATGTCCTGTACCAGATGTGATG 7054

 91683975 CCTCAATGTGACCAAATCCATTCTAGATGCCTCAAAGCTGGTTTTTTTGGACCTGCATTT 91684034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7055 CCTCAATGTGACCAAATCCATTCTAGATGCCTCAAAGCTGGTTTTTTTGGACCTGCATTT 7114

 91684035 TTTTGTGAAAAATAAAATGCTAACTTATAGGGAAAATGATAACTAATTTTCTTGGCAGTG 91684094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7115 TTTTGTGAAAAATAAAATGCTAACTTATAGGGAAAATGATAACTAATTTTCTTGGCAGTG 7174

 91684095 GTCAATAACTGGAGCTAGCATAAATAGCCGTTGGATTTATTTAGGAGAAGTTAACTCAGA 91684154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7175 GTCAATAACTGGAGCTAGCATAAATAGCCGTTGGATTTATTTAGGAGAAGTTAACTCAGA 7234

 91684155 ATATAAGTGGCTTTCCCCTTCTACCTGTATCATAAAGCCTACCTTGACCAATGAGAAATC 91684214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7235 ATATAAGTGGCTTTCCCCTTCTACCTGTATCATAAAGCCTACCTTGACCAATGAGAAATC 7294

 91684215 CAACAGTATTTGAAAATAAACTCCTGAGAACATAGGACGCAAACTAAGATAAGCAAATTA 91684274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7295 CAACAGTATTTGAAAATAAACTCCTGAGAACATAGGACGCAAACTAAGATAAGCAAATTA 7354

 91684275 CAGTTGTTATGCTCTCAATTGGCCTATAAAAATAAACAGTTTGAGAAATCTGTGTCTCCT 91684334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7355 CAGTTGTTATGCTCTCAATTGGCCTATAAAAATAAACAGTTTGAGAAATCTGTGTCTCCT 7414

 91684335 ACAGAACCACACTGACCAGATAGCACAGATGAGACAGCTAGCACCCTGATCATTAATGTC 91684394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7415 ACAGAACCACACTGACCAGATAGCACAGATGAGACAGCTAGCACCCTGATCATTAATGTC 7474

 91684395 ACAGGTAATTTTGTTGTTGGTTACTAGTATCTGCCATACATACCCTTCAGGAATTAAATG 91684454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7475 ACAGGTAATTTTGTTGTTGGTTACTAGTATCTGCCATACATACCCTTCAGGAATTAAATG 7534

 91684455 GGCCATCTTTGAAAGCCAAGGTCAAGGAGTGAAATTTTAAAATAATAATCCACCCCCAGC 91684514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7535 GGCCATCTTTGAAAGCCAAGGTCAAGGAGTGAAATTTTAAAATAATAATCCACCCCCAGC 7594

 91684515 TAACGAAAAGCTAGGACAGGTAGTGTTTTCATTGCTTTTGTATTCAGGCCCTTCTCGTAG 91684574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7595 TAACGAAAAGCTAGGACAGGTAGTGTTTTCATTGCTTTTGTATTCAGGCCCTTCTCGTAG 7654

 91684575 TATGCTGTGCCTTATGAGGGGAAGAGAGACCCTTGATTTTCAAGGAGGGTGAGTGGGTGG 91684634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7655 TATGCTGTGCCTTATGAGGGGAAGAGAGACCCTTGATTTTCAAGGAGGGTGAGTGGGTGG 7714

 91684635 GAGTGCTCCTATGGGGGATGTATATCATGACAAATAATGGGCTCTTAAAAATTACACCTC 91684694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7715 GAGTGCTCCTATGGGGGATGTATATCATGACAAATAATGGGCTCTTAAAAATTACACCTC 7774

 91684695 CTTACTACCCTGATTCTCTGAAGCCCATAGCGGTGCCATGCATAGCCTTGTTGAGAATTG 91684754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7775 CTTACTACCCTGATTCTCTGAAGCCCATAGCGGTGCCATGCATAGCCTTGTTGAGAATTG 7834

 91684755 CTGCCTAGTGAGCCTCACTGACAGGTAATAGTAATGCATTCAGGTTTGTTGATAAGGAGA 91684814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7835 CTGCCTAGTGAGCCTCACTGACAGGTAATAGTAATGCATTCAGGTTTGTTGATAAGGAGA 7894

 91684815 AAAGGTTTAGAAGTAATTGATAACTTTTCTTCCAATATAAGTTTTCTTAAAACTTCTAGT 91684874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7895 AAAGGTTTAGAAGTAATTGATAACTTTTCTTCCAATATAAGTTTTCTTAAAACTTCTAGT 7954

 91684875 ATGTTGTTAAACAACAGAGAAATAAGCGCTCTGAGTCTTGGGAGATTCTGTCTGTGTACA 91684934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7955 ATGTTGTTAAACAACAGAGAAATAAGCGCTCTGAGTCTTGGGAGATTCTGTCTGTGTACA 8014

 91684935 AGCATGAACTATGCTCCATATGAGAACATGAGCCTTGTCATCTGCTTTAAATGTCATTGG 91684994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8015 AGCATGAACTATGCTCCATATGAGAACATGAGCCTTGTCATCTGCTTTAAATGTCATTGG 8074

 91684995 AGAACAGTTATCAATGACTACTTTCCCAGGGTTAAAATTAATAAACTTGAGCTTATTGTA 91685054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8075 AGAACAGTTATCAATGACTACTTTCCCAGGGTTAAAATTAATAAACTTGAGCTTATTGTA 8134

 91685055 TTGCAAGCTTCTTTAGGATTTCACCCACTGTGAAAATATCATTTAAATAACATTTTACCG 91685114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8135 TTGCAAGCTTCTTTAGGATTTCACCCACTGTGAAAATATCATTTAAATAACATTTTACCG 8194

 91685115 AACTTCAGGACTTCTTGTAAAATTTTGTGACAGTTCATCTTAATATGCGTAATATTTCTG 91685174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8195 AACTTCAGGACTTCTTGTAAAATTTTGTGACAGTTCATCTTAATATGCGTAATATTTCTG 8254

 91685175 TTCTGATTCCATTTTTGAACTTTTGTACTCTATTTTTATCTGTAGGATGGAGATAATGCT 91685234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8255 TTCTGATTCCATTTTTGAACTTTTGTACTCTATTTTTATCTGTAGGATGGAGATAATGCT 8314

 91685235 AGACAAAATTCAGAACAAAAGTATGTAATTTGAAAAATAACTGTTAAGAATTAATACTAT 91685294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8315 AGACAAAATTCAGAACAAAAGTATGTAATTTGAAAAATAACTGTTAAGAATTAATACTAT 8374

 91685295 GCAATTTCCCATGGCAATTGATTACGTGTTTGTTCAGAAGTTTGGCACAGTTGCTTGATT 91685354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8375 GCAATTTCCCATGGCAATTGATTACGTGTTTGTTCAGAAGTTTGGCACAGTTGCTTGATT 8434

 91685355 AAAATATTAATTTTCCAATTTCAATTGAGCAGTTTATGAATTTTACTTTATGGTGTTTAC 91685414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8435 AAAATATTAATTTTCCAATTTCAATTGAGCAGTTTATGAATTTTACTTTATGGTGTTTAC 8494

 91685415 TTTCTCTGATAATGTCAATGTTTTTCACTAATTATGTCCAAGGGTGAGCTACCTTGGCCA 91685474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8495 TTTCTCTGATAATGTCAATGTTTTTCACTAATTATGTCCAAGGGTGAGCTACCTTGGCCA 8554

 91685475 ATAGAACAACTTGGTTTCAGGTAATTTGTTCTTTTCAGTGGCTGTAAATGTATTGGCTAT 91685534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8555 ATAGAACAACTTGGTTTCAGGTAATTTGTTCTTTTCAGTGGCTGTAAATGTATTGGCTAT 8614

 91685535 GTGGTTGAACTTTGACCATTTCTCTGACAATAATTTGCAACCTCCATGAGATCAGTCATA 91685594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8615 GTGGTTGAACTTTGACCATTTCTCTGACAATAATTTGCAACCTCCATGAGATCAGTCATA 8674

 91685595 AATCCATAGTCAATTATGTGTTAGAAAATATATTAAAAAGCCTCAGAGGAACAAAATTAT 91685654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8675 AATCCATAGTCAATTATGTGTTAGAAAATATATTAAAAAGCCTCAGAGGAACAAAATTAT 8734

 91685655 GTCATTTCTGTTGTGGAAGATTGGTTTAAAATAGGTCTTACAAATATTATGAAAATACAA 91685714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8735 GTCATTTCTGTTGTGGAAGATTGGTTTAAAATAGGTCTTACAAATATTATGAAAATACAA 8794

 91685715 CTTACTGTAATCATACTGCAGTTTGTCATATGTGGTTCATTGTTATGAGGCAGTAAGGTG 91685774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8795 CTTACTGTAATCATACTGCAGTTTGTCATATGTGGTTCATTGTTATGAGGCAGTAAGGTG 8854

 91685775 ATGGCAGAGGCAGCACTATATATAGCACATAAATAAAAATAAATCAGGTTTACAACTCTG 91685834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8855 ATGGCAGAGGCAGCACTATATATAGCACATAAATAAAAATAAATCAGGTTTACAACTCTG 8914

 91685835 TTTGCAACCATCTGTAATGCATGGTAGCATATGTTTTATAGTTTTATTGAGAGAATACAT 91685894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8915 TTTGCAACCATCTGTAATGCATGGTAGCATATGTTTTATAGTTTTATTGAGAGAATACAT 8974

 91685895 CTTTTAATTCTCAAAACTTTGAGTTTGAAAGCTCATCTGTGATAGAAACTAATGGTTGAA 91685954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8975 CTTTTAATTCTCAAAACTTTGAGTTTGAAAGCTCATCTGTGATAGAAACTAATGGTTGAA 9034

 91685955 TTACAAGCTAAAGTGAATTTCATTTTACTTATTCTTCTAATCAGTTTACAAAGTGCAGCT 91686014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9035 TTACAAGCTAAAGTGAATTTCATTTTACTTATTCTTCTAATCAGTTTACAAAGTGCAGCT 9094

 91686015 TTACCTGCAGGAGGCATTCTTCCTTTTCTTTTTTTAAAAGATGAAATGTAAAAGAAAGCT 91686074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9095 TTACCTGCAGGAGGCATTCTTCCTTTTCTTTTTTTAAAAGATGAAATGTAAAAGAAAGCT 9154

 91686075 TACCT 91686079
          |||||
     9155 TACCT 9159

Alignment time is 11.7444 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4508] =>      4508 nucs 'mol-32-349d-096585_4508'

Score:        4480
Aligned:      4480        nucs
Identic:      4480 (100%) nucs =>      1509 (100%)      2971 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91674671,91676179] EXCISED REGION [91676181,91679151]
 second seq =>  [      28,    1536] EXCISED REGION [    1538,    4508]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91676180,91676180]
 second seq =>         1 nucs [1537,1537]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [91676180,91676182] to [91676181,91676183]
 second seq =>         1 nucs [1536,1536] to [1537,1537]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91674671 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAG 91674730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       28 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGATTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAG 87

 91674731 TGCAGTGGCACCATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCT 91674790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       88 TGCAGTGGCACCATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCT 147

 91674791 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCGCGCCACCATACCCAGCTAATTTTT 91674850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      148 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCGCGCCACCATACCCAGCTAATTTTT 207

 91674851 TTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCCAGGTGGTCTTGATCTCCTGA 91674910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      208 TTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTTTTAGCCCAGGTGGTCTTGATCTCCTGA 267

 91674911 CCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCTTCCCAAAATGTTAGAATTACAGGCGTGAGCCACCAC 91674970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      268 CCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCTTCCCAAAATGTTAGAATTACAGGCGTGAGCCACCAC 327

 91674971 GCCCAGCCTCTCTCTCCCCCTTTTCTTTTGAATTCTTTGGATTTGTTTTTCATATTCCAC 91675030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      328 GCCCAGCCTCTCTCTCCCCCTTTTCTTTTGAATTCTTTGGATTTGTTTTTCATATTCCAC 387

 91675031 TTTAATATATCTGTTGACCTCTGACTATGTCTCCTGTATTATTTCTTAGTGCTTGCGCTA 91675090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      388 TTTAATATATCTGTTGACCTCTGACTATGTCTCCTGTATTATTTCTTAGTGCTTGCGCTA 447

 91675091 GGCCTGATAATATACATACCTAACCTTTCACAGTTTACTCAGAGTTATATTTTACTACCA 91675150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      448 GGCCTGATAATATACATACCTAACCTTTCACAGTTTACTCAGAGTTATATTTTACTACCA 507

 91675151 TAGTAAAAATGTGGAAGTTTTACCATGGAGTTTATCTTTTCCCACAAACCTTTTTGTTAT 91675210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      508 TAGTAAAAATGTGGAAGTTTTACCATGGAGTTTATCTTTTCCCACAAACCTTTTTGTTAT 567

 91675211 AGTTGTCATATGGGTTACAACTATGTACACTGATTGCAATGATCATACATAATTTAAGGA 91675270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      568 AGTTGTCATATGGGTTACAACTATGTACACTGATTGCAATGATCATACATAATTTAAGGA 627

 91675271 ATTTAAGAAAAGAAAATTTAGTTTTGTATTACCCATTTTTTATTATTCATCTTTCTCTTA 91675330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      628 ATTTAAGAAAAGAAAATTTAGTTTTGTATTACCCATTTTTTATTATTCATCTTTCTCTTA 687

 91675331 CTTTATTCCTGAAATTTTTTCCTACAGGCCTTCAAATCAACTTTTTATTAGTTACAACAA 91675390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      688 CTTTATTCCTGAAATTTTTTCCTACAGGCCTTCAAATCAACTTTTTATTAGTTACAACAA 747

 91675391 TGAAATTGAATATTTAATTTTTTCTCTTAAGAACGAGATTTAATAAATTCAACTTCATGT 91675450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      748 TGAAATTGAATATTTAATTTTTTCTCTTAAGAACGAGATTTAATAAATTCAACTTCATGT 807

 91675451 AATTTTCCTTCAGCCTGAGATCTTTCGGCAATGAGTTCTGTGAGTTTCCCTTCATCTACG 91675510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      808 AATTTTCCTTCAGCCTGAGATCTTTCGGCAATGAGTTCTGTGAGTTTCCCTTCATCTACG 867

 91675511 AATGCCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGGTTTTTAATGGATATTTAATGGATATAA 91675570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      868 AATGCCTTTCTTTATCCTTCATCCCAAGGAGGGTTTTTAATGGATATTTAATGGATATAA 927

 91675571 AGTTTTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCATCATTTTAAGATACCATCTCACTATTT 91675630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      928 AGTTTTACATTAGCAGTTAGTTGCTTTCTTTCATCATTTTAAGATACCATCTCACTATTT 987

 91675631 TCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCATTAAT 91675690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      988 TCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCATTAAT 1047

 91675691 TATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCTTG 91675750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1048 TATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCTTG 1107

 91675751 ATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAGCT 91675810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 ATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAGCT 1167

 91675811 AATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTCAC 91675870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 AATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTCAC 1227

 91675871 ATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATTTTA 91675930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 ATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATTTTA 1287

 91675931 AAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTC 91675990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 AAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTTTC 1347

 91675991 TTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACT 91676050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 TTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGACT 1407

 91676051 CTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTTTA 91676110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 CTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTTTA 1467

 91676111 TTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATATT 91676170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 TTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATATT 1527

 91676171 GCATGCCAT 91676179
          |||||||||
     1528 GCATGCCAT 1536

EXCISED REGION

 91676181 GGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCAATAGGTAGT 91676240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 GGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTATCCAATAGGTAGT 1597

 91676241 TTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCC 91676300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 TTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGTGTCTATTGTTCC 1657

 91676301 TTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAACATGTGGTA 91676360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGAGAACATGTGGTA 1717

 91676361 TTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTTTATTTACGT 91676420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 TTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTTTATTTACGT 1777

 91676421 TTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCATTGTGTATA 91676480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 TTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATTCCATTGTGTATA 1837

 91676481 GGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCCATGTCTT 91676540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 GGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCCATGTCTT 1897

 91676541 TGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTATGGCAGAACGA 91676600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 TGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTATGGCAGAACGA 1957

 91676601 TTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTAC 91676660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 TTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTAATTCTAC 2017

 91676661 TTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTTATATTCC 91676720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTTATATTCC 2077

 91676721 GACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTT 91676780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 GACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCATTGCGGTT 2137

 91676781 TTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGCTTGTAGG 91676840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 TTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGCTTGTAGG 2197

 91676841 TCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGG 91676900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTTTTAATGG 2257

 91676901 AGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATATTAGAC 91676960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 AGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGATATTAGAC 2317

 91676961 CTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTGATTATC 91677020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 CTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTTGATTATC 2377

 91677021 TTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGATTTTAAG 91677080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 TTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGATTTTAAG 2437

 91677081 CAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTCTTTTTTT 91677140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 CAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTCTTTTTTT 2497

 91677141 TTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGT 91677200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 TTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGT 2557

 91677201 TTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACACATCAC 91677260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 TTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACACATCAC 2617

 91677261 CCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCT 91677320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 CCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCT 2677

 91677321 TTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTA 91677380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 TTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTA 2737

 91677381 GCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACTTTACT 91677440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 GCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACTTTACT 2797

 91677441 TAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTCCTTTT 91677500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 TAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTCCTTTT 2857

 91677501 TATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGATTGAT 91677560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 TATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGATTGAT 2917

 91677561 GGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACATGCGT 91677620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 GGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACATGCGT 2977

 91677621 GTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGG 91677680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 GTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGG 3037

 91677681 ATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTC 91677740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 ATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTC 3097

 91677741 CATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCA 91677800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 CATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCA 3157

 91677801 CATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCTTTAT 91677860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 CATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCTTTAT 3217

 91677861 TTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCT 91677920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 TTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCT 3277

 91677921 CACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCT 91677980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 CACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCT 3337

 91677981 GGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACG 91678040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 GGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACG 3397

 91678041 GGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTC 91678100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 GGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTC 3457

 91678101 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTAT 91678160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTAT 3517

 91678161 TATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTT 91678220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 TATGGCAATTCTTGCAGGAGTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTT 3577

 91678221 GATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTG 91678280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 GATAATTAGTGATGTTGAGGCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTG 3637

 91678281 AGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTG 91678340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 AGAATTGTCCATTCATGTACTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTG 3697

 91678341 TTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGG 91678400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 TTTTTTTCTGTTAATTCGTTTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGG 3757

 91678401 TGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGT 91678460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 TGTATAGATTGCAAAGATTTTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGT 3817

 91678461 TTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTT 91678520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 TTCCTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTT 3877

 91678521 TGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAG 91678580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 TGTTGCATTTGCTTTTGGGTTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAG 3937

 91678581 GGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTT 91678640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 GGTTTTTCCAATGTTATCTTGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTT 3997

 91678641 GTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCT 91678700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 GTTGCATCTTAAGTTGATTTTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCT 4057

 91678701 ACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTT 91678760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 ACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTT 4117

 91678761 TATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGG 91678820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 TATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGG 4177

 91678821 GTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTT 91678880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 GTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTT 4237

 91678881 GGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTT 91678940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4238 GGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTT 4297

 91678941 TGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGAT 91679000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4298 TGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGAT 4357

 91679001 TGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTG 91679060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4358 TGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTG 4417

 91679061 TAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGT 91679120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4418 TAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGT 4477

 91679121 GGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCT 91679151
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     4478 GGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCT 4508

Alignment time is 6.13219 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    7164] =>      7164 nucs 'mol-32-349d-106028_7164'

Score:        7130
Aligned:      7163        nucs
Identic:      7160 (100%) nucs =>      1434 (100%)      5726 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91678695,91680128] EXCISED REGION [91680130,91685858]
 second seq =>  [       1,    1434] EXCISED REGION [    1436,    7164]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91680129,91680129]
 second seq =>         1 nucs [1435,1435]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1434,1435] to [1435,1436]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91680128,91680128] to [91680130,91680130]
 second seq =>         1 nucs [1434,1434] to [1436,1436]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91678695 TCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCG 91678754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTATCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCG 60

 91678755 CCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTAT 91678814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTGTCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTAT 120

 91678815 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGC 91678874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGC 180

 91678875 TGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGT 91678934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAGTATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGT 240

 91678935 ACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTG 91678994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGCTATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTG 300

 91678995 GGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTG 91679054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTGAAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTG 360

 91679055 AATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCAT 91679114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCATGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCAT 420

 91679115 AAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTAT 91679174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTCTGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTAT 480

 91679175 TGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTT 91679234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTT 540

 91679235 ATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGA 91679294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGTTAAATGTTATATAGTATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGA 600

 91679295 TTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCT 91679354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCT 660

 91679355 TTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCA 91679414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCCTATGATGTCTAGATTAATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCA 720

 91679415 GGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTC 91679474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTC 780

 91679475 TCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTAT 91679534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTAT 840

 91679535 GGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTT 91679594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTT 900

 91679595 CTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAG 91679654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAG 960

 91679655 CTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAG 91679714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAG 1020

 91679715 GAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTT 91679774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTT 1080

 91679775 CCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTT 91679834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTT 1140

 91679835 TAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTG 91679894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGTTATAACAAGTGGTATATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTG 1200

 91679895 CAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGG 91679954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAACCCTCCAAACATGAGGGGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGG 1260

 91679955 TTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTA 91680014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTA 1320

 91680015 TCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATT 91680074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATT 1380

 91680075 TCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTG 91680128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTG 1434

EXCISED REGION

 91680130 GATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAG 91680189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 GATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAG 1495

 91680190 ATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGA 91680249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 ATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGA 1555

 91680250 CTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCA 91680309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 CTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCA 1615

 91680310 GTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGT 91680369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 GTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGT 1675

 91680370 TCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATC 91680429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 TCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATC 1735

 91680430 AAAGGTGACTCCATTTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAG 91680489
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 AAAGGTGACTCCATCTTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAG 1795

 91680490 ACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGA 91680549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 ACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGA 1855

 91680550 TTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATA 91680609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 TTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATA 1915

 91680610 CAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTT 91680669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTT 1975

 91680670 TAAACCATAAGAAGGGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAG 91680729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 TAAACCATAAGAAGGGATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAG 2035

 91680730 TCTGGGTATTGATCCTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCA 91680789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 TCTGGGTATTGATCCTAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCA 2095

 91680790 GCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGAT 91680849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 GCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGAT 2155

 91680850 CAGAAGTCACATGAGAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGT 91680909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 CAGAAGTCACATGAGAAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGT 2215

 91680910 AGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTT 91680969
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 AGAGTCCAGAAAATGAGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTT 2275

 91680970 TAGCACCACAGAGGGTTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAG 91681029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TAGCACCACAGAGGGTTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAG 2335

 91681030 TGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTC 91681089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 TGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTC 2395

 91681090 AAGGAAATATTTTTCGGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATA 91681149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 AAGGAAATATTTTTCGGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATA 2455

 91681150 TGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAG 91681209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAG 2515

 91681210 ATACCTATTAACCTCAAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAG 91681269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 ATACCTATTAACCTCAAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAG 2575

 91681270 AGCGTAAATAGTATTTACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGC 91681329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 AGCGTAAATAGTATTTACAGAGCTAAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGC 2635

 91681330 TGCAAGCAATTTGAAACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGA 91681389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 TGCAAGCAATTTGAAACATTACTGTCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGA 2695

 91681390 GAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACA 91681449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 GAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAATGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACA 2755

 91681450 ATTTGTCCTGCATTATTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAA 91681509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 ATTTGTCCTGCATTATTTTTGGACTACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAA 2815

 91681510 GGAAAAATTTGCATCGAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAA 91681569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 GGAAAAATTTGCATCGAACTATGTTTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAA 2875

 91681570 TATAAAGGCACAATTTTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAAT 91681629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 TATAAAGGCACAATTTTAACAATATAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAAT 2935

 91681630 AATACTATTTTAGGAAATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGA 91681689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 AATACTATTTTAGGAAATTATTAAAATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGA 2995

 91681690 TGAAATGGCAAAAACAGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTA 91681749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 TGAAATGGCAAAAACAGGGTATTGCATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTA 3055

 91681750 TCTCATAATCTAAGCTGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCT 91681809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 TCTCATAATCTAAGCTGAAAATACTAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCT 3115

 91681810 TGGAGTTGATTTTATCCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTAT 91681869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 TGGAGTTGATTTTATCCAATGTTCTTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTAT 3175

 91681870 ATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTT 91681929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 ATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCCAACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTT 3235

 91681930 CAGTACTATTGCCACTTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCA 91681989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 CAGTACTATTGCCACTTTACTATTGAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCA 3295

 91681990 GAAAACGTTGCATTATCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTT 91682049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 GAAAACGTTGCATTATCTTCTTTCCTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTT 3355

 91682050 CCTTCTTTCCCTTCTTTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTT 91682109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 CCTTCTTTCCCTTCTTTTCTCCTTCCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTT 3415

 91682110 CTTTAAGAAAGGAAAACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTA 91682169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 CTTTAAGAAAGGAAAACTTAAGTGTTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTA 3475

 91682170 TTTTAGTAGCTTCCCCTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACC 91682229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 TTTTAGTAGCTTCCCCTATAATTATTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACC 3535

 91682230 TAAAACCATTTGGAAGACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTA 91682289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 TAAAACCATTTGGAAGACATAATTCTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTA 3595

 91682290 AAAAATAACCTCTAATATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTAC 91682349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 AAAAATAACCTCTAATATTGTATCCTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTAC 3655

 91682350 TAAATAAATCAAGATTTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTT 91682409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 TAAATAAATCAAGATTTATTTAATGAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTT 3715

 91682410 TCTGTGGGCTATTGACCAATATAGCAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACA 91682469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 TCTGTGGGCTATTGACCAATATAGCAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACA 3775

 91682470 GTTTTAAATTCTATTTTTCATAGTTACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACC 91682529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 GTTTTAAATTCTATTTTTCATAGTTACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACC 3835

 91682530 TCTGATCCTTAGTTTGCTAATCTAAAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAG 91682589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 TCTGATCCTTAGTTTGCTAATCTAAAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAG 3895

 91682590 TAATTGATAGCTGTACATGGTACACTTGGTATAGTATAACTTCTCATAACCGTTAATTAT 91682649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 TAATTGATAGCTGTACATGGTACACTTGGTATAGTATAACTTCTCATAACCGTTAATTAT 3955

 91682650 TTTATTGCCATTATTGCTATTAGTACCAGTAATAACACTCTTCCAATGGAAAATATTTTT 91682709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 TTTATTGCCATTATTGCTATTAGTACCAGTAATAACACTCTTCCAATGGAAAATATTTTT 4015

 91682710 CTGAAAACTCATAAATATAATAATATTCATTGTTTCAGAAATTAGCTAAAAGTAGGACCT 91682769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 CTGAAAACTCATAAATATAATAATATTCATTGTTTCAGAAATTAGCTAAAAGTAGGACCT 4075

 91682770 ATGAAGTATTATGGTGCTGGTTAACATAACATGTAGTTAGTGAAATCACCAATAAATGAA 91682829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 ATGAAGTATTATGGTGCTGGTTAACATAACATGTAGTTAGTGAAATCACCAATAAATGAA 4135

 91682830 GACATGACATATAATCTAAATTATATTATATTTGCATAGTCTAAATTATATTATGTATGG 91682889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 GACATGACATATAATCTAAATTATATTATATTTGCATAGTCTAAATTATATTATGTATGG 4195

 91682890 CATATGTCCATACTCCATCCTAAGAAATCCAATTCTTTTAATAATTGTAATAGAATTGAT 91682949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 CATATGTCCATACTCCATCCTAAGAAATCCAATTCTTTTAATAATTGTAATAGAATTGAT 4255

 91682950 TGAGCTTGCTATTAGAGTGTTTAACTGTACTCTTGAAATGGGTTTTACTAAAAGAGATAT 91683009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 TGAGCTTGCTATTAGAGTGTTTAACTGTACTCTTGAAATGGGTTTTACTAAAAGAGATAT 4315

 91683010 GGAAAATTTTATTTATGAGCTTCAAATGAGCATCTAATCTACTAGTGTCATTGTAATTTC 91683069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 GGAAAATTTTATTTATGAGCTTCAAATGAGCATCTAATCTACTAGTGTCATTGTAATTTC 4375

 91683070 TCATACAAGTGTACAAATGATAGCGCAGCATCTCTTTCAGGTGTTATATTCAGAATCATA 91683129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 TCATACAAGTGTACAAATGATAGCGCAGCATCTCTTTCAGGTGTTATATTCAGAATCATA 4435

 91683130 ATAAAACTCTTGCAGAATATATGTGTGCATCAAAATGAAATGACAATGAATTTTCTCTCG 91683189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 ATAAAACTCTTGCAGAATATATGTGTGCATCAAAATGAAATGACAATGAATTTTCTCTCG 4495

 91683190 AAATTGATAGCACGTATTAGCATAAATTGAACTGTGCAACTGTGTCCATAACAGGCTGAG 91683249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 AAATTGATAGCACGTATTAGCATAAATTGAACTGTGCAACTGTGTCCATAACAGGCTGAG 4555

 91683250 TGATGTAGCAGTTGATTGCTTTGTACACATTCTTGTGTTTTGCCTTCTGTTTTCCTTGCT 91683309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 TGATGTAGCAGTTGATTGCTTTGTACACATTCTTGTGTTTTGCCTTCTGTTTTCCTTGCT 4615

 91683310 GTGTGTTATTCTCTCTTCCGTCCCACCAAGGTGAGAGTAAATTTTTCCCTTCCTGGCTTT 91683369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 GTGTGTTATTCTCTCTTCCGTCCCACCAAGGTGAGAGTAAATTTTTCCCTTCCTGGCTTT 4675

 91683370 ATTGCTTGAAGATAATAGAGTAAGGCAGGAGCATGTGCAAGGCAAAAGTACCTGTTGTCA 91683429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 ATTGCTTGAAGATAATAGAGTAAGGCAGGAGCATGTGCAAGGCAAAAGTACCTGTTGTCA 4735

 91683430 TCATTGCCCTTTTCCGGTGTCCCTCTTTATTTCCTTCTGTGTCTTTGATATTCCAGGCAA 91683489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 TCATTGCCCTTTTCCGGTGTCCCTCTTTATTTCCTTCTGTGTCTTTGATATTCCAGGCAA 4795

 91683490 AACTCTTTTATAACACTTCATGCCATGGCCCCTTCCAGCTACAGATAGGACAGGTGGTTG 91683549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 AACTCTTTTATAACACTTCATGCCATGGCCCCTTCCAGCTACAGATAGGACAGGTGGTTG 4855

 91683550 AATGGCTAGCACTCCATGAGCTTTATTCATGTATATTTATAAAAGTGCAATTTCTTTTTC 91683609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 AATGGCTAGCACTCCATGAGCTTTATTCATGTATATTTATAAAAGTGCAATTTCTTTTTC 4915

 91683610 TTTCTTTCTTTCTTTTTATATTATAGCAAACTCTTGTACATTTACTTACTTATTTTCTTT 91683669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 TTTCTTTCTTTCTTTTTATATTATAGCAAACTCTTGTACATTTACTTACTTATTTTCTTT 4975

 91683670 CAGTGATCATGCTAGTATGGTTGTGCTATCTGAAAATCTAGCCTTTTAGCTTCCTAGATG 91683729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 CAGTGATCATGCTAGTATGGTTGTGCTATCTGAAAATCTAGCCTTTTAGCTTCCTAGATG 5035

 91683730 ATATACTTAATATGACTAAATAAATCCAGCCTGTACCACAACTGTCAAAACACCTGGAAA 91683789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 ATATACTTAATATGACTAAATAAATCCAGCCTGTACCACAACTGTCAAAACACCTGGAAA 5095

 91683790 TTTATAATTTCACCATCTCTTCAGAGCAAGAGAGCTTTTGTGACAAATATGGTAGGGTGA 91683849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 TTTATAATTTCACCATCTCTTCAGAGCAAGAGAGCTTTTGTGACAAATATGGTAGGGTGA 5155

 91683850 ATACGGAGCAGATAAACCCATATACTCTGACTTTCAATAAAGCAAGAGGGGATAACACTT 91683909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 ATACGGAGCAGATAAACCCATATACTCTGACTTTCAATAAAGCAAGAGGGGATAACACTT 5215

 91683910 CATAGAGACCAGATACCACTCTATCAAGGTTACTGAATGGACTATGTCCTGTACCAGATG 91683969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5216 CATAGAGACCAGATACCACTCTATCAAGGTTACTGAATGGACTATGTCCTGTACCAGATG 5275

 91683970 TGATGCCTCAATGTGACCAAATCCATTCTAGATGCCTCAAAGCTGGTTTTTTTGGACCTG 91684029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 TGATGCCTCAATGTGACCAAATCCATTCTAGATGCCTCAAAGCTGGTTTTTTTGGACCTG 5335

 91684030 CATTTTTTTGTGAAAAATAAAATGCTAACTTATAGGGAAAATGATAACTAATTTTCTTGG 91684089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5336 CATTTTTTTGTGAAAAATAAAATGCTAACTTATAGGGAAAATGATAACTAATTTTCTTGG 5395

 91684090 CAGTGGTCAATAACTGGAGCTAGCATAAATAGCCGTTGGATTTATTTAGGAGAAGTTAAC 91684149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 CAGTGGTCAATAACTGGAGCTAGCATAAATAGCCGTTGGATTTATTTAGGAGAAGTTAAC 5455

 91684150 TCAGAATATAAGTGGCTTTCCCCTTCTACCTGTATCATAAAGCCTACCTTGACCAATGAG 91684209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 TCAGAATATAAGTGGCTTTCCCCTTCTACCTGTATCATAAAGCCTACCTTGACCAATGAG 5515

 91684210 AAATCCAACAGTATTTGAAAATAAACTCCTGAGAACATAGGACGCAAACTAAGATAAGCA 91684269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5516 AAATCCAACAGTATTTGAAAATAAACTCCTGAGAACATAGGACGCAAACTAAGATAAGCA 5575

 91684270 AATTACAGTTGTTATGCTCTCAATTGGCCTATAAAAATAAACAGTTTGAGAAATCTGTGT 91684329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5576 AATTACAGTTGTTATGCTCTCAATTGGCCTATAAAAATAAACAGTTTGAGAAATCTGTGT 5635

 91684330 CTCCTACAGAACCACACTGACCAGATAGCACAGATGAGACAGCTAGCACCCTGATCATTA 91684389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5636 CTCCTACAGAACCACACTGACCAGATAGCACAGATGAGACAGCTAGCACCCTGATCATTA 5695

 91684390 ATGTCACAGGTAATTTTGTTGTTGGTTACTAGTATCTGCCATACATACCCTTCAGGAATT 91684449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5696 ATGTCACAGGTAATTTTGTTGTTGGTTACTAGTATCTGCCATACATACCCTTCAGGAATT 5755

 91684450 AAATGGGCCATCTTTGAAAGCCAAGGTCAAGGAGTGAAATTTTAAAATAATAATCCACCC 91684509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5756 AAATGGGCCATCTTTGAAAGCCAAGGTCAAGGAGTGAAATTTTAAAATAATAATCCACCC 5815

 91684510 CCAGCTAACGAAAAGCTAGGACAGGTAGTGTTTTCATTGCTTTTGTATTCAGGCCCTTCT 91684569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5816 CCAGCTAACGAAAAGCTAGGACAGGTAGTGTTTTCATTGCTTTTGTATTCAGGCCCTTCT 5875

 91684570 CGTAGTATGCTGTGCCTTATGAGGGGAAGAGAGACCCTTGATTTTCAAGGAGGGTGAGTG 91684629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5876 CGTAGTATGCTGTGCCTTATGAGGGGAAGAGAGACCCTTGATTTTCAAGGAGGGTGAGTG 5935

 91684630 GGTGGGAGTGCTCCTATGGGGGATGTATATCATGACAAATAATGGGCTCTTAAAAATTAC 91684689
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5936 GGTGGGAGTGCTCCTATGGGGGATGTACATCATGACAAATAATGGGCTCTTAAAAATTAC 5995

 91684690 ACCTCCTTACTACCCTGATTCTCTGAAGCCCATAGCGGTGCCATGCATAGCCTTGTTGAG 91684749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5996 ACCTCCTTACTACCCTGATTCTCTGAAGCCCATAGCGGTGCCATGCATAGCCTTGTTGAG 6055

 91684750 AATTGCTGCCTAGTGAGCCTCACTGACAGGTAATAGTAATGCATTCAGGTTTGTTGATAA 91684809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6056 AATTGCTGCCTAGTGAGCCTCACTGACAGGTAATAGTAATGCATTCAGGTTTGTTGATAA 6115

 91684810 GGAGAAAAGGTTTAGAAGTAATTGATAACTTTTCTTCCAATATAAGTTTTCTTAAAACTT 91684869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6116 GGAGAAAAGGTTTAGAAGTAATTGATAACTTTTCTTCCAATATAAGTTTTCTTAAAACTT 6175

 91684870 CTAGTATGTTGTTAAACAACAGAGAAATAAGCGCTCTGAGTCTTGGGAGATTCTGTCTGT 91684929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6176 CTAGTATGTTGTTAAACAACAGAGAAATAAGCGCTCTGAGTCTTGGGAGATTCTGTCTGT 6235

 91684930 GTACAAGCATGAACTATGCTCCATATGAGAACATGAGCCTTGTCATCTGCTTTAAATGTC 91684989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6236 GTACAAGCATGAACTATGCTCCATATGAGAACATGAGCCTTGTCATCTGCTTTAAATGTC 6295

 91684990 ATTGGAGAACAGTTATCAATGACTACTTTCCCAGGGTTAAAATTAATAAACTTGAGCTTA 91685049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6296 ATTGGAGAACAGTTATCAATGACTACTTTCCCAGGGTTAAAATTAATAAACTTGAGCTTA 6355

 91685050 TTGTATTGCAAGCTTCTTTAGGATTTCACCCACTGTGAAAATATCATTTAAATAACATTT 91685109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6356 TTGTATTGCAAGCTTCTTTAGGATTTCACCCACTGTGAAAATATCATTTAAATAACATTT 6415

 91685110 TACCGAACTTCAGGACTTCTTGTAAAATTTTGTGACAGTTCATCTTAATATGCGTAATAT 91685169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6416 TACCGAACTTCAGGACTTCTTGTAAAATTTTGTGACAGTTCATCTTAATATGCGTAATAT 6475

 91685170 TTCTGTTCTGATTCCATTTTTGAACTTTTGTACTCTATTTTTATCTGTAGGATGGAGATA 91685229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6476 TTCTGTTCTGATTCCATTTTTGAACTTTTGTACTCTATTTTTATCTGTAGGATGGAGATA 6535

 91685230 ATGCTAGACAAAATTCAGAACAAAAGTATGTAATTTGAAAAATAACTGTTAAGAATTAAT 91685289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6536 ATGCTAGACAAAATTCAGAACAAAAGTATGTAATTTGAAAAATAACTGTTAAGAATTAAT 6595

 91685290 ACTATGCAATTTCCCATGGCAATTGATTACGTGTTTGTTCAGAAGTTTGGCACAGTTGCT 91685349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6596 ACTATGCAATTTCCCATGGCAATTGATTACGTGTTTGTTCAGAAGTTTGGCACAGTTGCT 6655

 91685350 TGATTAAAATATTAATTTTCCAATTTCAATTGAGCAGTTTATGAATTTTACTTTATGGTG 91685409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6656 TGATTAAAATATTAATTTTCCAATTTCAATTGAGCAGTTTATGAATTTTACTTTATGGTG 6715

 91685410 TTTACTTTCTCTGATAATGTCAATGTTTTTCACTAATTATGTCCAAGGGTGAGCTACCTT 91685469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6716 TTTACTTTCTCTGATAATGTCAATGTTTTTCACTAATTATGTCCAAGGGTGAGCTACCTT 6775

 91685470 GGCCAATAGAACAACTTGGTTTCAGGTAATTTGTTCTTTTCAGTGGCTGTAAATGTATTG 91685529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6776 GGCCAATAGAACAACTTGGTTTCAGGTAATTTGTTCTTTTCAGTGGCTGTAAATGTATTG 6835

 91685530 GCTATGTGGTTGAACTTTGACCATTTCTCTGACAATAATTTGCAACCTCCATGAGATCAG 91685589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6836 GCTATGTGGTTGAACTTTGACCATTTCTCTGACAATAATTTGCAACCTCCATGAGATCAG 6895

 91685590 TCATAAATCCATAGTCAATTATGTGTTAGAAAATATATTAAAAAGCCTCAGAGGAACAAA 91685649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6896 TCATAAATCCATAGTCAATTATGTGTTAGAAAATATATTAAAAAGCCTCAGAGGAACAAA 6955

 91685650 ATTATGTCATTTCTGTTGTGGAAGATTGGTTTAAAATAGGTCTTACAAATATTATGAAAA 91685709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6956 ATTATGTCATTTCTGTTGTGGAAGATTGGTTTAAAATAGGTCTTACAAATATTATGAAAA 7015

 91685710 TACAACTTACTGTAATCATACTGCAGTTTGTCATATGTGGTTCATTGTTATGAGGCAGTA 91685769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7016 TACAACTTACTGTAATCATACTGCAGTTTGTCATATGTGGTTCATTGTTATGAGGCAGTA 7075

 91685770 AGGTGATGGCAGAGGCAGCACTATATATAGCACATAAATAAAAATAAATCAGGTTTACAA 91685829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7076 AGGTGATGGCAGAGGCAGCACTATATATAGCACATAAATAAAAATAAATCAGGTTTACAA 7135

 91685830 CTCTGTTTGCAACCATCTGTAATGCATGG 91685858
          |||||||||||||||||||||||||||||
     7136 CTCTGTTTGCAACCATCTGTAATGCATGG 7164

Alignment time is 9.18156 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    8308] =>      8308 nucs 'mol-32-34a8-159256_8308'

Score:        8035
Aligned:      8311        nucs
Identic:      8281 (100%) nucs =>      2496 (100%)      5785 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91675629,91678133] EXCISED REGION [91680094,91685894]
 second seq =>  [       1,    2502] EXCISED REGION [    2503,    8308]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1960 nucs [91678134,91680093]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91678134,91678134] to [91680094,91680094]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91675629 TTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCATTA 91675688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCATTA 60

 91675689 ATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCT 91675748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCT 120

 91675749 TGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAG 91675808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAG 180

 91675809 CTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTC 91675868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTC 240

 91675869 ACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATTT 91675928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATTT 300

 91675929 TAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTT 91675988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTT 360

 91675989 TCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGA 91676048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGA 420

 91676049 CTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTT 91676108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTT 480

 91676109 TATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATA 91676168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATA 540

 91676169 TTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTAT 91676228
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGCACGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTAT 600

 91676229 CCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGT 91676288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGT 660

 91676289 GTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGA 91676348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGA 720

 91676349 GAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAG 91676408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAG 780

 91676409 CTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATT 91676468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATT 840

 91676469 CCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTG 91676528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTG 900

 91676529 GTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTT 91676588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTT 960

 91676589 ATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAA 91676648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAA 1020

 91676649 CGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACT 91676708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACT 1080

 91676709 AATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTAT 91676768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTAT 1140

 91676769 CTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATAT 91676828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATAT 1200

 91676829 TGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCC 91676888
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTGCTTGCAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCC 1260

 91676889 ACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTC 91676948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTC 1320

 91676949 TGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTT 91677008
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1321 TGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAGTTTT 1380

 91677009 TATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGAC 91677068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGAC 1440

 91677069 AGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTC 91677128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTC 1500

 91677129 TTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGG 91677188
          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTCTTTTTTTTTTTTTTT---AAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGG 1557

 91677189 GGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGG 91677248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 GGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGG 1617

 91677249 TACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTC 91677308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTC 1677

 91677309 CCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCAT 91677368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCAT 1737

 91677369 CCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTG 91677428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 CCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTG 1797

 91677429 AGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTAT 91677488
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 AGTTACTTAACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTAT 1857

 91677489 ATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCAC 91677548
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 ATCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCAC 1917

 91677549 TGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCT 91677608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCT 1977

 91677609 ATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATA 91677668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 ATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATA 2037

 91677669 TTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTG 91677728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTG 2097

 91677729 CACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTT 91677788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 CACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTT 2157

 91677789 CCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCT 91677848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 CCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCT 2217

 91677849 TTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 91677908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 2277

 91677909 ACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCC 91677968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2278 ACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCC 2337

 91677969 TCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTT 91678028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTT 2397

 91678029 CTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGA 91678088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGA 2457

 91678089 TCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 91678133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAG 2502

EXCISED REGION

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2503 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTGTAGGAAGATTTTG 2562

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 2622

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 2682

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2683 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTTAG 2742

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 2802

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 91680453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCAC 2862

 91680454 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 91680513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2863 CTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGCTGAAGACTTGGGAAGAAGAA 2922

 91680514 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTC 91680573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2923 AGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTGTC 2982

 91680574 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 91680633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 ATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTAGGAGAGATG 3042

 91680634 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 91680693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 TGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGGGATGAGATC 3102

 91680694 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCCTAAGATATT 91680753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3103 ACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTACTGATCCTAAGATATT 3162

 91680754 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 91680813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 TCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAGAAGAGGTTA 3222

 91680814 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 91680873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 GTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAGAAGCTATTT 3282

 91680874 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 91680933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 CAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATGAGATCTGTG 3342

 91680934 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 91680993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 AAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGGTTATTTGTG 3402

 91680994 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 91681053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 ACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCTAGTAGGTTC 3462

 91681054 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 91681113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 AAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTCGGCGAACAA 3522

 91681114 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 91681173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 ACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAGCCACTGTAT 3582

 91681174 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 91681233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 TTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTCAAAGTATAA 3642

 91681234 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTACAGAGCT 91681293
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3643 TAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGAGCGTAAATAGTATTTATAGAGCT 3702

 91681294 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 91681353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 AAGGACATTTCAGTAGTTCTAGACTTCAGGCATTGCTGCAAGCAATTTGAAACATTACTG 3762

 91681354 TCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAA 91681413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 TCCTGTCTTTAAAAAACAATGCAAGGTAGAGAAAGAGAGCAACCAGAGTTGACTAAGAAA 3822

 91681414 TGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTATTTTTGGAC 91681473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 TGTATTTTCATCAATGTCATGAATATTGTAATAACAATTTGTCCTGCATTATTTTTGGAC 3882

 91681474 TACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATCGAACTATGT 91681533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 TACATTTTTAGGACTGATATGTGTGTTTCAAATTAAGGAAAAATTTGCATCGAACTATGT 3942

 91681534 TTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATTTTAACAATA 91681593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 TTTCATTTAGATGACAAAAACAAAGATAATGAATAATATAAAGGCACAATTTTAACAATA 4002

 91681594 TAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGAAATTATTAA 91681653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 TAATAACTAATATCAATGCTTATTGTTGCATAAAATAATACTATTTTAGGAAATTATTAA 4062

 91681654 AATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAACAGGGTATTG 91681713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 AATAAAACATTTATATTCATGAATTTGAAAATATGATGAAATGGCAAAAACAGGGTATTG 4122

 91681714 CATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGCTGAAAATAC 91681773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 CATATTTTTAATAAGCCCTTTAAAAATAATATGGTATCTCATAATCTAAGCTGAAAATAC 4182

 91681774 TAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTATCCAATGTTC 91681833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 TAGAGGAAATAGTATAATTTTATTCGAAAGGGACCTTGGAGTTGATTTTATCCAATGTTC 4242

 91681834 TTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCC 91681893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 TTCCTTTATAAACATAGCAATTTAGATGCAAAGTATATAATGACCTGCCCAAGGTAGCCC 4302

 91681894 AACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCACTTTACTATT 91681953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 AACTAATTTGGACAATGTTTGGTATTCTGTGGTGTTCAGTACTATTGCCACTTTACTATT 4362

 91681954 GAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTATCTTCTTTC 91682013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 GAGAATTATGTTAGAGAAGCAATTGAAACATATGCAGAAAACGTTGCATTATCTTCTTTC 4422

 91682014 CTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCTTTTCTCCTT 91682073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 CTCTATCCTCCCCTTCACTCCCTGCCTTTCTCCTTTCCTTCTTTCCCTTCTTTTCTCCTT 4482

 91682074 CCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAAACTTAAGTG 91682133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4483 CCTCCAGTTTCAGCTTTATAAAAAAATTTTCCTCTTCTTTAAGAAAGGAAAACTTAAGTG 4542

 91682134 TTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCCCTATAATTA 91682193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 TTAGTGAAGTGGGAGAAAGTTGAGAAAGGAGAATTATTTTAGTAGCTTCCCCTATAATTA 4602

 91682194 TTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAAGACATAATT 91682253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 TTTACCTTCATGCCTATGCACATGCACACACATACCTAAAACCATTTGGAAGACATAATT 4662

 91682254 CTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAATATTGTATC 91682313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 CTAAAAGCATTAAGTTTCCAAATTTTTTCTAGTTTAAAAAATAACCTCTAATATTGTATC 4722

 91682314 CTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGATTTATTTAAT 91682373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 CTGGGACAGAAAGCAATAACAGTAACCATGCTTTACTAAATAAATCAAGATTTATTTAAT 4782

 91682374 GAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGACCAATATAG 91682433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 GAACTTCAGATTAATCATGTTCCGAGGTTTCACTTTTCTGTGGGCTATTGACCAATATAG 4842

 91682434 CAAAAGTTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATTTTTCATAGT 91682493
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 CAAAAATTTAGTGTCATATGAGTGCAGACAGGCACAGTTTTAAATTCTATTTTTCATAGT 4902

 91682494 TACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGTTTGCTAATCTA 91682553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4903 TACTAGTTTTTTAAAGTTTGCAAATGATTTAACACCTCTGATCCTTAGTTTGCTAATCTA 4962

 91682554 AAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATTGATAGCTGTACATGGTACA 91682613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4963 AAATATAAGGGTGATAATAATGCTTATTTTGTAAAGTAATTGATAGCTGTACATGGTACA 5022

 91682614 CTTGGTATAGTATAACTTCTCATAACCGTTAATTATTTTATTGCCATTATTGCTATTAGT 91682673
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     5023 CCTGGTATAGTATAACTTCTCATAACCGTTAATTATTTTATTGCCATTATTGCTCTTAGT 5082

 91682674 ACCAGTAATAACACTCTTCCAATGGAAAATATTTTTCTGAAAACTCATAAATATAATAAT 91682733
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5083 ACCAGTAATAACACTCTTCCAATGGAAAATATTATTCTGAAAACTCATAAATATAATAAT 5142

 91682734 ATTCATTGTTTCAGAAATTAGCTAAAAGTAGGACCTATGAAGTATTATGGTGCTGGTTAA 91682793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5143 ATTCATTGTTTCAGAAATTAGCTAAAAGTAGGACCTATGAAGTATTATGGTGCTGGTTAA 5202

 91682794 CATAACATGTAGTTAGTGAAATCACCAATAAATGAAGACATGACATATAATCTAAATTAT 91682853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5203 CATAACATGTAGTTAGTGAAATCACCAATAAATGAAGACATGACATATAATCTAAATTAT 5262

 91682854 ATTATATTTGCATAGTCTAA-----ATTATATTATGTATGGCATATGTCCATACTCCATC 91682908
          ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5263 ATTATATTTGCATAGTCTAAATTATATTATATTATGTATGGCATATGTCCATACTCCATC 5322

 91682909 CTAAGAAATCCAATTCTTTTAATAATTGTAATAGAATTGATTGAGCTTGCTATTAGAGTG 91682968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5323 CTAAGAAATCCAATTCTTTTAATAATTGTAATAGAATTGATTGAGCTTGCTATTAGAGTG 5382

 91682969 TTTAACTGTACTCTTGAAATGGGTTTTACTAAAAGAGATATGGAAAATTTTATTTATGAG 91683028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5383 TTTAACTGTACTCTTGAAATGGGTTTTACTAAAAGAGATATGGAAAATTTTATTTATGAG 5442

 91683029 CTTCAAATGAGCATCTAATCTACTAGTGTCATTGTAATTTCTCATACAAGTGTACAAATG 91683088
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5443 CTTCAAATGAGCATCTAATCTACTAATGTCATTGTAATTTCTCATACAAGTGTACAAATG 5502

 91683089 ATAGCGCAGCATCTCTTTCAGGTGTTATATTCAGAATCATAATAAAACTCTTGCAGAATA 91683148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5503 ATAGCGCAGCATCTCTTTCAGGTGTTATATTCAGAATCATAATAAAACTCTTGCAGAATA 5562

 91683149 TATGTGTGCATCAAAATGAAATGACAATGAATTTTCTCTCGAAATTGATAGCACGTATTA 91683208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5563 TATGTGTGCATCAAAATGAAATGACAATGAATTTTCTCTCGAAATTGATAGCACGTATTA 5622

 91683209 GCATAAATTGAACTGTGCAACTGTGTCCATAACAGGCTGAGTGATGTAGCAGTTGATTGC 91683268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5623 GCATAAATTGAACTGTGCAACTGTGTCCATAACAGGCTGAGTGATGTAGCAGTTGATTGC 5682

 91683269 TTTGTACACATTCTTGTGTTTTGCCTTCTGTTTTCCTTGCTGTGTGTTATTCTCTCTTCC 91683328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5683 TTTGTACACATTCTTGTGTTTTGCCTTCTGTTTTCCTTGCTGTGTGTTATTCTCTCTTCC 5742

 91683329 GTCCCACCAAGGTGAGAGTAAATTTTTCCCTTCCTGGCTTTATTGCTTGAAGATAATAGA 91683388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 GTCCCACCAAGGTGAGAGTAAATTTTTCCCTTCCTGGCTTTATTGCTTGAAGATAATAGA 5802

 91683389 GTAAGGCAGGAGCATGTGCAAGGCAAAAGTACCTGTTGTCATCATTGCCCTTTTCCGGTG 91683448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 GTAAGGCAGGAGCATGTGCAAGGCAAAAGTACCTGTTGTCATCATTGCCCTTTTCCGGTG 5862

 91683449 TCCCTCTTTATTTCCTTCTGTGTCTTTGATATTCCAGGCAAAACTCTTTTATAACACTTC 91683508
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5863 TCCCTCTTTATTTCCTTCTGTGTCTTTGATATTACAGGCAAAACTCTTTTATAACACTTC 5922

 91683509 ATGCCATGGCCCCTTCCAGCTACAGATAGGACAGGTGGTTGAATGGCTAGCACTCCATGA 91683568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5923 ATGCCATGGCCCCTTCCAGCTACAGATAGGACAGGTGGTTGAATGGCTAGCACTCCATGA 5982

 91683569 GCTTTATTCATGTATATTTATAAAAGTGCAATTTCTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTAT 91683628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5983 GCTTTATTCATGTATATTTATAAAAGTGCAATTTCTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTAT 6042

 91683629 ATTATAGCAAACTCTTGTACATTTACTTACTTATTTTCTTTCAGTGATCATGCTAGTATG 91683688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 ATTATAGCAAACTCTTGTACATTTACTTACTTATTTTCTTTCAGTGATCATGCTAGTATG 6102

 91683689 GTTGTGCTATCTGAAAATCTAGCCTTTTAGCTTCCTAGATGATATACTTAATATGACTAA 91683748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6103 GTTGTGCTATCTGAAAATCTAGCCTTTTAGCTTCCTAGATGATATACTTAATATGACTAA 6162

 91683749 ATAAATCCAGCCTGTACCACAACTGTCAAAACACCTGGAAATTTATAATTTCACCATCTC 91683808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6163 ATAAATCCAGCCTGTACCACAACTGTCAAAACACCTGGAAATTTATAATTTCACCATCTC 6222

 91683809 TTCAGAGCAAGAGAGCTTTTGTGACAAATATGGTAGGGTGAATACGGAGCAGATAAACCC 91683868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6223 TTCAGAGCAAGAGAGCTTTTGTGACAAATATGGTAGGGTGAATACGGAGCAGATAAACCC 6282

 91683869 ATATACTCTGACTTTCAATAAAGCAAGAGGGGATAACACTTCATAGAGACCAGATACCAC 91683928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6283 ATATACTCTGACTTTCAATAAAGCAAGAGGGGATAACACTTCATAGAGACCAGATACCAC 6342

 91683929 TCTATCAAGGTTACTGAATGGACTATGTCCTGTACCAGATGTGATGCCTCAATGTGACCA 91683988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6343 TCTATCAAGGTTACTGAATGGACTATGTCCTGTACCAGATGTGATGCCTCAATGTGACCA 6402

 91683989 AATCCATTCTAGATGCCTCAAAGCTGGTTTTTTTGGACCTGCATTTTTTTGTGAAAAATA 91684048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6403 AATCCATTCTAGATGCCTCAAAGCTGGTTTTTTTGGACCTGCATTTTTTTGTGAAAAATA 6462

 91684049 AAATGCTAACTTATAGGGAAAATGATAACTAATTTTCTTGGCAGTGGTCAATAACTGGAG 91684108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6463 AAATGCTAACTTATAGGGAAAATGATAACTAATTTTCTTGGCAGTGGTCAATAACTGGAG 6522

 91684109 CTAGCATAAATAGCCGTTGGATTTATTTAGGAGAAGTTAACTCAGAATATAAGTGGCTTT 91684168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6523 CTAGCATAAATAGCCGTTGGATTTATTTAGGAGAAGTTAACTCAGAATATAAGTGGCTTT 6582

 91684169 CCCCTTCTACCTGTATCATAAAGCCTACCTTGACCAATGAGAAATCCAACAGTATTTGAA 91684228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6583 CCCCTTCTACCTGTATCATAAAGCCTACCTTGACCAATGAGAAATCCAACAGTATTTGAA 6642

 91684229 AATAAACTCCTGAGAACATAGGACGCAAACTAAGATAAGCAAATTACAGTTGTTATGCTC 91684288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6643 AATAAACTCCTGAGAACATAGGACGCAAACTAAGATAAGCAAATTACAGTTGTTATGCTC 6702

 91684289 TCAATTGGCCTATAAAAATAAACAGTTTGAGAAATCTGTGTCTCCTACAGAACCACACTG 91684348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6703 TCAATTGGCCTATAAAAATAAACAGTTTGAGAAATCTGTGTCTCCTACAGAACCACACTG 6762

 91684349 ACCAGATAGCACAGATGAGACAGCTAGCACCCTGATCATTAATGTCACAGGTAATTTTGT 91684408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6763 ACCAGATAGCACAGATGAGACAGCTAGCACCCTGATCATTAATGTCACAGGTAATTTTGT 6822

 91684409 TGTTGGTTACTAGTATCTGCCATACATACCCTTCAGGAATTAAATGGGCCATCTTTGAAA 91684468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6823 TGTTGGTTACTAGTATCTGCCATACATACCCTTCAGGAATTAAATGGGCCATCTTTGAAA 6882

 91684469 GCCAAGGTCAAGGAGTGAAATTTTAAAATAATAATCCACCCCCAGCTAACGAAAAGCTAG 91684528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6883 GCCAAGGTCAAGGAGTGAAATTTTAAAATAATAATCCACCCCCAGCTAACGAAAAGCTAG 6942

 91684529 GACAGGTAGTGTTTTCATTGCTTTTGTATTCAGGCCCTTCTCGTAGTATGCTGTGCCTTA 91684588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6943 GACAGGTAGTGTTTTCATTGCTTTTGTATTCAGGCCCTTCTCGTAGTATGCTGTGCCTTA 7002

 91684589 TGAGGGGAAGAGAGACCCTTGATTTTCAAGGAGGGTGAGTGGGTGGGAGTGCTCCTATGG 91684648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7003 TGAGGGGAAGAGAGACCCTTGATTTTCAAGGAGGGTGAGTGGGTGGGAGTGCTCCTATGG 7062

 91684649 GGGATGTATATCATGACAAATAATGGGCTCTTAAAAATTACACCTCCTTACTACCCTGAT 91684708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7063 GGGATGTATATCATGACAAATAATGGGCTCTTAAAAATTACACCTCCTTACTACCCTGAT 7122

 91684709 TCTCTGAAGCCCATAGCGGTGCCATGCATAGCCTTGTTGAGAATTGCTGCCTAGTGAGCC 91684768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7123 TCTCTGAAGCCCATAGCGGTGCCATGCATAGCCTTGTTGAGAATTGCTGCCTAGTGAGCC 7182

 91684769 TCACTGACAGGTAATAGTAATGCATTCAGGTTTGTTGATAAGGAGAAAAGGTTTAGAAGT 91684828
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7183 TCACTGACAGGTAATAGTAACGCATTCAGGTTTGTTGATAAGGAGAAAAGGTTTAGAAGT 7242

 91684829 AATTGATAACTTTTCTTCCAATATAAGTTTTCTTAAAACTTCTAGTATGTTGTTAAACAA 91684888
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7243 AATTGATAACTTTTCTTCCAATACAAGTTTTCTTAAAACTTCTAGTATGTTGTTAAACAA 7302

 91684889 CAGAGAAATAAGCGCTCTGAGTCTTGGGAGATTCTGTCTGTGTACAAGCATGAACTATGC 91684948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7303 CAGAGAAATAAGCGCTCTGAGTCTTGGGAGATTCTGTCTGTGTACAAGCATGAACTATGC 7362

 91684949 TCCATATGAGAACATGAGCCTTGTCATCTGCTTTAAATGTCATTGGAGAACAGTTATCAA 91685008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7363 TCCATATGAGAACATGAGCCTTGTCATCTGCTTTAAATGTCATTGGAGAACAGTTATCAA 7422

 91685009 TGACTACTTTCCCAGGGTTAAAATTAATAAACTTGAGCTTATTGTATTGCAAGCTTCTTT 91685068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7423 TGACTACTTTCCCAGGGTTAAAATTAATAAACTTGAGCTTATTGTATTGCAAGCTTCTTT 7482

 91685069 AGGATTTCACCCACTGTGAAAATATCATTTAAATAACATTTTACCGAACTTCAGGACTTC 91685128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7483 AGGATTTCACCCACTGTGAAAATATCATTTAAATAACATTTTACCGAACTTCAGGACTTC 7542

 91685129 TTGTAAAATTTTGTGACAGTTCATCTTAATATGCGTAATATTTCTGTTCTGATTCCATTT 91685188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     7543 TTGTAAAATTTTGTGACAGTTCATCTTAATATGCATAATATTTCTGTTCTGATTCCATTT 7602

 91685189 TTGAACTTTTGTACTCTATTTTTATCTGTAGGATGGAGATAATGCTAGACAAAATTCAGA 91685248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7603 TTGAACTTTTGTACTCTATTTTTATCTGTAGGATGGAGATAATGCTAGACAAAATTCAGA 7662

 91685249 ACAAAAGTATGTAATTTGAAAAATAACTGTTAAGAATTAATACTATGCAATTTCCCATGG 91685308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7663 ACAAAAGTATGTAATTTGAAAAATAACTGTTAAGAATTAATACTATGCAATTTCCCATGG 7722

 91685309 CAATTGATTACGTGTTTGTTCAGAAGTTTGGCACAGTTGCTTGATTAAAATATTAATTTT 91685368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7723 CAATTGATTACGTGTTTGTTCAGAAGTTTGGCACAGTTGCTTGATTAAAATATTAATTTT 7782

 91685369 CCAATTTCAATTGAGCAGTTTATGAATTTTACTTTATGGTGTTTACTTTCTCTGATAATG 91685428
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7783 CCAGTTTCAATTGAGCAGTTTATGAATTTTACTTTATGGTGTTTACTTTCTCTGATAATG 7842

 91685429 TCAATGTTTTTCACTAATTATGTCCAAGGGTGAGCTACCTTGGCCAATAGAACAACTTGG 91685488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7843 TCAATGTTTTTCACTAATTATGTCCAAGGGTGAGCTACCTTGGCCAATAGAACAACTTGG 7902

 91685489 TTTCAGGTAATTTGTTCTTTTCAGTGGCTGTAAATGTATTGGCTATGTGGTTGAACTTTG 91685548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7903 TTTCAGGTAATTTGTTCTTTTCAGTGGCTGTAAATGTATTGGCTATGTGGTTGAACTTTG 7962

 91685549 ACCATTTCTCTGACAATAATTTGCAACCTCCATGAGATCAGTCATAAATCCATAGTCAAT 91685608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7963 ACCATTTCTCTGACAATAATTTGCAACCTCCATGAGATCAGTCATAAATCCATAGTCAAT 8022

 91685609 TATGTGTTAGAAAATATATTAAAAAGCCTCAGAGGAACAAAATTATGTCATTTCTGTTGT 91685668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8023 TATGTGTTAGAAAATATATTAAAAAGCCTCAGAGGAACAAAATTATGTCATTTCTGTTGT 8082

 91685669 GGAAGATTGGTTTAAAATAGGTCTTACAAATATTATGAAAATACAACTTACTGTAATCAT 91685728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8083 GGAAGATTGGTTTAAAATAGGTCTTACAAATATTATGAAAATACAACTTACTGTAATCAT 8142

 91685729 ACTGCAGTTTGTCATATGTGGTTCATTGTTATGAGGCAGTAAGGTGATGGCAGAGGCAGC 91685788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8143 ACTGCAGTTTGTCATATGTGGTTCATTGTTATGAGGCAGTAAGGTGATGGCAGAGGCAGC 8202

 91685789 ACTATATATAGCACATAAATAAAAATAAATCAGGTTTACAACTCTGTTTGCAACCATCTG 91685848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8203 ACTATATATAGCACATAAATAAAAATAAATCAGGTTTACAACTCTGTTTGCAACCATCTG 8262

 91685849 TAATGCATGGTAGCATATGTTTTATAGTTTTATTGAGAGAATACAT 91685894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8263 TAATGCATGGTAGCATATGTTTTATAGTTTTATTGAGAGAATACAT 8308

Alignment time is 10.3008 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2503] =>      2503 nucs 'mol-32-34a8-159256_2503'

Score:        2437
Aligned:      2503        nucs
Identic:      2497 (100%) nucs =>      1502 (100%)       995 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91675629,91677133] EXCISED REGION [91677137,91678134]
 second seq =>  [       1,    1505] EXCISED REGION [    1506,    2503]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [91677134,91677136]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [91677134,91677148] to [91677137,91677151]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91677134,91677134] to [91677136,91677136]
 second seq =>         0 nucs

 91675629 TTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCATTA 91675688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCTGGCCTTCATGGCTTTTAATGAGAGAACATTGGTAATTCAAATTATTGTTCCATTA 60

 91675689 ATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCT 91675748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTATAATGAATTATTTTTCTCTAGCTACTTAATATTTTCTTTCTCTATTGTTAGAAGCT 120

 91675749 TGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAG 91675808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGATTGTGGTGTATCTGGGCATTGATTTCTTTGAGTTTATCATGGTTGGGGGTTGCTGAG 180

 91675809 CTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTC 91675868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAATGAATATGTAATTTTGTTTCTCATCAAATCTGGAAGTTTTTGGTCCTAATTTCTTC 240

 91675869 ACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATTT 91675928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACATTTTTTTTATGGAGCAATCACTTTTTCTTCTTCCTGAGACTTCAAAGACATTTATTT 300

 91675929 TAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTT 91675988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAAACTTCTGAGATTTTCCCACTGTTTCCTGAAGCTCTTCTCAGTCTTTTTTCAATCTT 360

 91675989 TCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGA 91676048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTTCTCTCTCTGTTCTTCAGATTGGATAATTGTTATTGATCTGTCTTCAAGTTCATTGA 420

 91676049 CTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTT 91676108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTTGCCTCTGTCATCTCCGTTCTGCTCTCAATCACATGATCATATTATGTGAATAGTT 480

 91676109 TATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATA 91676168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATTTATCTGTGTTTTGTTTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGCACATGTTATACAGGTATA 540

 91676169 TTGCATGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTAT 91676228
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGCACGCCATGGGGCCTTGGTATACAGATTATTTTGTCACCCAAGTAAAAGCATAGTAT 600

 91676229 CCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGT 91676288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAATAGGTAGTTTTTCTCTCCTTAGCCTCCTCACTCTCCACCATCAAATAGACCCTAGT 660

 91676289 GTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGA 91676348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTCTATTGTTCCTTTCTTTGTGTCCATATGTACTCAAAGTTTAGCTCCCACTTATAGTGA 720

 91676349 GAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAG 91676408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTTCTGTGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAG 780

 91676409 CTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATT 91676468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTTATTTACGTTTCTGCAAAGAACATGATCTCATTCTCTTTTTATTGCTACATAGTATT 840

 91676469 CCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTG 91676528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCATTGTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTG 900

 91676529 GTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTT 91676588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTT 960

 91676589 ATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAA 91676648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGGCAGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAA 1020

 91676649 CGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACT 91676708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CGGTAATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACT 1080

 91676709 AATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTAT 91676768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTTATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTAT 1140

 91676769 CTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATAT 91676828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATAT 1200

 91676829 TGTGCTTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCC 91676888
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTGCTTGCAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCC 1260

 91676889 ACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTC 91676948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACTTTTTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTC 1320

 91676949 TGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTT 91677008
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1321 TGGATATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAGTTTT 1380

 91677009 TATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGAC 91677068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTTGATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGAC 1440

 91677069 AGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTC 91677128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTGATTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTC 1500

 91677129 TTTTC 91677133
          |||||
     1501 TTTTC 1505

EXCISED REGION

 91677137 TTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAGG 91677196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 TTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTATTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAGG 1565

 91677197 TAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACACA 91677256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 TAGTTTTCAGTTACATGGATAAGATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACACA 1625

 91677257 TCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCCA 91677316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TCACCCCAGCAGTGTACACTGTACCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCCA 1685

 91677317 CCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATAG 91677376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 CCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGGTCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATAG 1745

 91677377 CTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACTT 91677436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 CTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAGAAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACTT 1805

 91677437 TACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTCC 91677496
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 AACTTAGAATAATGATCTCCAATTCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTCC 1865

 91677497 TTTTTATGGCTGAATAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGAT 91677556
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 TTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGAT 1925

 91677557 TGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACAT 91677616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TGATGGGCATTTGAGTTGGTTATATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACAT 1985

 91677617 GCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAG 91677676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 GCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGTATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAG 2045

 91677677 TGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGT 91677736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TGGGATTGCTGGATCAAATGATATTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGT 2105

 91677737 TTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTC 91677796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 TTTCCATAGTGGTTGTACTAGTTTACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTC 2165

 91677797 ACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCT 91677856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 ACCACATCCACGCCAACGTCTATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCT 2225

 91677857 TTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATC 91677916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TTATTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATC 2285

 91677917 GGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGT 91677976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2286 GGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGT 2345

 91677977 AGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGA 91678036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 AGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGA 2405

 91678037 GACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCG 91678096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 GACGGGATTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCG 2465

 91678097 CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGC 91678134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGC 2503

Alignment time is 3.15319 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4141] =>      4141 nucs 'mol-32-34b3-039657_4141'

Score:        4122
Aligned:      4133        nucs
Identic:      4132 (100%) nucs =>       676 (100%)      3456 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91676474,91677149] EXCISED REGION [91677160,91680616]
 second seq =>  [       1,     676] EXCISED REGION [     685,    4141]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [91677150,91677159]
 second seq =>         8 nucs [677,684]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [91677150,91677151] to [91677160,91677161]
 second seq =>         5 nucs [672,676] to [680,684]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [91677147,91677149] to [91677160,91677162]
 second seq =>         3 nucs [674,676] to [685,687]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [91677150,91677152] to [91677157,91677159]
 second seq =>         0 nucs

 91676474 GTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCC 91676533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTATAGGCACTACGTATTTTTATCTGGTGTTCCATTGATGGGCATTTACGTTGGTTCC 60

 91676534 ATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTATGGC 91676593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGTCTTTGCTATTGTGAATAATGCTGCAATGAACATACACTTGCATATGTCTTTATGGC 120

 91676594 AGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTA 91676653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAACGATTTACATTCCTTTAGGTATATACCCAATGATGAGACTGCTGGGTCAAACGGTA 180

 91676654 ATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTT 91676713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTCTACTTTAAGTTATTTGAGAAGTCCCCACACTGCTTTCCACATGGCTGAACTAATTT 240

 91676714 ATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCAT 91676773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATTCCGACTAACAATATGTAACTCTTCCCTCTTCTCCACAACATTGTGAGTATCTCAT 300

 91676774 TGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGC 91676833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGCTGAGCATTTTTCATATTGTGC 360

 91676834 TTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTT 91676893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGTAGGTCACACGTATGTCTTATTTTGAAAAGTATTTGTTCAAGTACTTTGCCCACTTT 420

 91676894 TTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGAT 91676953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAATGGAGTTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAATTCCTTATAGATTCTGGAT 480

 91676954 ATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTT 91677013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTAGACCTTTGGAATTGTTTATTTTAGATATTGAATTTTCAGTTCTAAAATTTTTATTT 540

 91677014 GATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGA 91677073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATTATCTTATAGTTTCTACTTCTGTGAAAGAAATAGAATGTCTACTTATTAGACAGTGA 600

 91677074 TTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTC 91677133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTAAGCAGCTGTTATATACCGGCTCAGTGAAATAAATGAACCCGTAGAATTTCTTTTC 660

 91677134 TTTTTTTTTTTTTTTT 91677149
          ||||||||||||||||
      661 TTTTTTTTTTTTTTTT 676

EXCISED REGION

 91677160 TTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAG 91677219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 TTTCACATTTTATTTCCAGAGGTTTTTGGGGAACAGGTAGTTTTCAGTTACATGGATAAG 744

 91677220 ATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTA 91677279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 ATTTTTAGTGATGATTTCTGAGATTTTGGTACACACATCACCCCAGCAGTGTACACTGTA 804

 91677280 CCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGG 91677339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 CCAAATTTGTAGTCTTTTATCCCTCACTCCCCTCCCACCCTTTCTCCTGAGTCCCCAGGG 864

 91677340 TCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAG 91677399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 TCCATTGTATCATTCTTATGCCTTTGCATCCTCATAGCTTAGCTCCCAGTTATGAGTGAG 924

 91677400 AAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAAT 91677459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 AAAATATGATATTTGGTTTTCTATTCCTGAGTTACTTTACTTAGAATAATGATCTCCAAT 984

 91677460 TCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCC 91677519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 TCCATCCTGATTGCTGCAAATGTGATTATATCATTCCTTTTTATGGCTGAATAGTATTCC 1044

 91677520 ATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTAT 91677579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 ATGGTATAAAACACAATTTATTTATTCACTGGTTGATTGATGGGCATTTGAGTTGGTTAT 1104

 91677580 ATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGT 91677639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 ATATTTTTGAAATCGCAAATTGTGCTGCTATGAACATGCGTGTGCAAGTATTTTTTTCGT 1164

 91677640 ATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATA 91677699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 ATAATGACTTATTTTCCTCTGGGTAGATATTCGGTAGTGGGATTGCTGGATCAAATGATA 1224

 91677700 TTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTT 91677759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 TTTCTACTTTTAGTTTTTTAAGGAATCTGCACAATGTTTTCCATAGTGGTTGTACTAGTT 1284

 91677760 TACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTAT 91677819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 TACACTCCCACCAACCATGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCACGCCAACGTCTAT 1344

 91677820 TTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCA 91677879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 TTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGAGACGGAGTCTCA 1404

 91677880 CTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCC 91677939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 CTCTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATCGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCC 1464

 91677940 CAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCC 91677999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 CAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCC 1524

 91678000 ACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCC 91678059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 ACAAGGCCCGGCTAATTATTTTTGTATTTCTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTAGCC 1584

 91678060 AGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 91678119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 AGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 1644

 91678120 ATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGA 91678179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 ATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCAGCCTGATTTTTTTATTATGGCAATTCTTGCAGGA 1704

 91678180 GTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAG 91678239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 GTAAGGTGGTATTGCACTGTAGTTTTGATTTGCATTTCCTTGATAATTAGTGATGTTGAG 1764

 91678240 GCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTA 91678299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 GCTTTTTTCATGTTTGTCGGCCATTTGTTTATCTTCTTTTGAGAATTGTCCATTCATGTA 1824

 91678300 CTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGT 91678359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 CTTAGCCCACTTTTTGATAGGATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTGTTAATTCGT 1884

 91678360 TTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATT 91678419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 TTGAGTTCCTTGTAGATTCTGGACATTAGTCTTTTGTCAGGTGTATAGATTGCAAAGATT 1944

 91678420 TTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAG 91678479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 TTCTTCCACTCTGAGGGTTGTCTGTTTACTCTGCTGATTGTTTCCTTTGCTGTGCAGAAG 2004

 91678480 CTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGG 91678539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 CTCTTCAGTTTAATTAAATCTCACCTATTTATCTTTGTTTTTGTTGCATTTGCTTTTGGG 2064

 91678540 TTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCT 91678599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 TTCTAGGTCATGAAGTGTTTGCCTAAGCCAATGTCTAGAAGGGTTTTTCCAATGTTATCT 2124

 91678600 TGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATT 91678659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 TGCAGAATTTTTATAGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCCTTGTTGCATCTTAAGTTGATT 2184

 91678660 TTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTA 91678719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 TTTATAAAAAGTGAGAGATGAGGATCCAGTTTCATTCTTCTACATGTGGCTTGCCAATTA 2244

 91678720 TCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTG 91678779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 TCCCAGTACCATTTGTTGAATAGGGTATACTTTCGCCACTTTATGTTTTTGTTTGCTTTG 2304

 91678780 TCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCAT 91678839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 TCAAAGATCAGTTGGCTGTAAGTATTTGGGTTTATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCAT 2364

 91678840 TTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAG 91678899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 TTGTCTATGTGCCTATTTTTATACCTGTACCATGCTGTTTTGGTGATTATGGCCTTATAG 2424

 91678900 TATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGC 91678959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 TATAAAGTCAGGTAATATGATGCCTCCAGATTTGTACTTTTTGCTTAGACTTGCTTTGGC 2484

 91678960 TATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTG 91679019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 TATGCGGGCTCTTTTTTGGTTTCATGTATGAACTGGGGGATTGTTTTTTCTAGTTCTGTG 2544

 91679020 AAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCA 91679079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 AAGAATGAGGGTGGAATCTGATGGGAATTGTATTGAATTTGTAGATTGCTTTTGGCAGCA 2604

 91679080 TGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTC 91679139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 TGGTACCTTTCACAATATTGATTCTATCCATTCATAAGTGTGGAATTTGTTTGTGTTGTC 2664

 91679140 TGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTC 91679199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 TGTGATTTCTCTCAGCAGGAACACAGAATTTCTATTGGCAAATGTTTTTTTTTTTTTTTC 2724

 91679200 CCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCC 91679259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 CCTTGAGAATCTCTCATATTTTCCTGAGTGTTTTTATGTTAAATGTTATATAGTATAGCC 2784

 91679260 TCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGG 91679319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 TCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTTAACCGG 2844

 91679320 CAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCA 91679379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 CAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATTAATCCA 2904

 91679380 GTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAG 91679439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 GTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATAGTTCAG 2964

 91679440 GTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGG 91679499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 GTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTCGTAGGG 3024

 91679500 GAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTG 91679559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 GAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACATTTCTG 3084

 91679560 TTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACT 91679619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 TTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTTTCAACT 3144

 91679620 GAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATG 91679679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 GAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTACATTATG 3204

 91679680 GACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCT 91679739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 GACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGTGTTGCT 3264

 91679740 TCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCT 91679799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 TCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAGAGTCCT 3324

 91679800 CGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGG 91679859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 CGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTATATATGG 3384

 91679860 GCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACC 91679919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 GCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGGGGCACC 3444

 91679920 TCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACC 91679979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 TCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACCCAAACC 3504

 91679980 TTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCT 91680039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 TTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAATCTGGCT 3564

 91680040 GGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACT 91680099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 GGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGACAAACT 3624

 91680100 GTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAA 91680159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 GTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTGAGCAAA 3684

 91680160 GAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACA 91680219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 GAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGGAAAACA 3744

 91680220 ATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGG 91680279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 ATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAATGTAGG 3804

 91680280 TGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATA 91680339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 TGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAGATTATA 3864

 91680340 GATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGT 91680399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 GATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGATATGTGT 3924

 91680400 GTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATTTTTTTTCACCTAAGA 91680459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3925 GTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCATCTTTTTTCACCTAAGA 3984

 91680460 AAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAAAGTTTG 91680519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 AAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGGGAAGAAGAAAGTTTG 4044

 91680520 GAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTCATGTAA 91680579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 GAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGCCTTTTTCTCATGTAA 4104

 91680580 ATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCT 91680616
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 ATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCT 4141

Alignment time is 5.18368 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [91668133,91690093] =>     21961 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2017] =>      2017 nucs 'mol-32-34c9-049645_2017'

Score:        2016
Aligned:      2016        nucs
Identic:      2016 (100%) nucs =>      1190 (100%)       826 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [91679254,91680443] EXCISED REGION [91680445,91681270]
 second seq =>  [       1,    1190] EXCISED REGION [    1192,    2017]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [91680444,91680444]
 second seq =>         1 nucs [1191,1191]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [91680443,91680449] to [91680444,91680450]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [91680443,91680443] to [91680445,91680445]
 second seq =>         1 nucs [1190,1190] to [1192,1192]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 91679254 ATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTT 91679313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAGCCTCTGGGTTCTATTTTAATCATCTGGATAATGCTGATTTTTTTCTTTATTTGTTT 60

 91679314 AACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATT 91679373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACCGGCAGTTGTTCTAGTATCTGTTAAATTTTTAAAGGCTTTCCTATGATGTCTAGATT 120

 91679374 AATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATA 91679433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATCCAGTACATGCATGATTCAGGGGATAATCTGAAGTTCAGGTTTTAGGTTATATCATA 180

 91679434 GTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTC 91679493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTCAGGTTTCAAAACCCCTTACTATCCTGCTTTGGGTCTCTCTCTGGCTCGTGCAGTTC 240

 91679494 GTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACA 91679553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTAGGGGAACCTGGGATTTGTGTGGGTTCACATAGAATTATGGAGTCCCTTTAGTTAACA 300

 91679554 TTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTT 91679613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCTGTTTCTAGGACTGCTGCTACATTCTCTGACTCTTTTCTGGTTCCTCTATGCATTT 360

 91679614 TCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTAC 91679673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAACTGAAGTTCTAGCTGTCAGCTCTATACCTCTGTCGAGCTTTGCAAAGGGAGCTTAC 420

 91679674 ATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGT 91679733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTATGGACAAATCTGTGAGACAAAGGGAAAAATGTATGAGGAAACTCATCCCTGAGTGT 480

 91679734 GTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAG 91679793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTGCTTCTCTATGTTTTGACTCTTTTTCTAAACCTGCCTTCCTTTTGTTTACCTTTCAG 540

 91679794 AGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTAT 91679853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTCCTCGGGTAGTTGCCTTTTGTATATTTTCCAGAGATTTTAGTTATAACAAGTGGTAT 600

 91679854 ATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGG 91679913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATATGGGCTATACTGGGCTTACTACATTTTGGACAGAACTGCAACCCTCCAAACATGAGG 660

 91679914 GGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACC 91679973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCACCTCAGCTGGTGCTTATGTTTATGAGCACAGAGGAGGTTTCTCTGGGCTTGAGACC 720

 91679974 CAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAAT 91680033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAAACCTTTGAGAAGCAGATGCTGGCTAACTGGTAGTGGTATCTGTGAGGGAAGTGTAAT 780

 91680034 CTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGA 91680093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGGCTGGTTCTAGAAGTGTTGGAGAAACTGCAAACTGATTTCAGCAGTGGCTCCTGGGA 840

 91680094 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 91680153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAACTGTCGTTATCAGCATAAAAAAGAGAGTCTGAGATCACTCTTATAGGAAGATTTTG 900

 91680154 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 91680213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCAAAGAAGTGGCATGATCTAATGTATGTTTTAAGATGGACAACTTGATTGCTATTGGG 960

 91680214 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 91680273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAACAATAAATTGGACTGGAGCAAAAAGAAGGAGACTACTTAGAAAGCTTTTGAAATAA 1020

 91680274 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 91680333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTAGGTGAATTACAGTTTATACAAGGATCGTAGCAGTAGATGTGGCAGATATTTGTCAG 1080

 91680334 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 91680393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTATAGATGTGTTTTGAAGATACAGCCAACAAAGTTCCCTAATATATTGTATGTGTGAT 1140

 91680394 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 91680443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGTGTGTATCCTTCTTTAATAATAATGAAGGAATCAAAGGTGACTCCAT 1190

EXCISED REGION

 91680445 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 91680504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 TTTTTTCACCTAAGAAAATAGAAGTTTGCATTTTTCAAATTAGAGACGGTGAAGACTTGG 1251

 91680505 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 91680564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 GAAGAAGAAAGTTTGGAGTTTAGAAGAAAAGGTTGCAGGGGAAGATTGGGTTTGTCGTGC 1311

 91680565 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 91680624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 CTTTTTCTCATGTAAATAGAAGTGTTATGTAGACATTTAGATATACAGGGCTGTATTTTA 1371

 91680625 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 91680684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 GGAGAGATGTGTTGGCTTGGAATAAAGAGTATACAAATGGGGTTTTAAACCATAAGAAGG 1431

 91680685 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 91680744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 GATGAGATCACTTAGGGTACGAGTACAGATGGAGAAGATGAAAAGTCTGGGTATTGATCC 1491

 91680745 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 91680804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 TAAGATATTTCAACTTTTAGAAATAGAGGAGGTAAGAAGAAATCAGCTAAGTAGACTGAG 1551

 91680805 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 91680864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 AAGAGGTTAGTATGATGTAAGTGAAAAACTAAACCAATGGCAGATCAGAAGTCACATGAG 1611

 91680865 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 91680924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 AAGCTATTTCAAGAAAGGAGAAGCATGATCAACAATGTCAAATGTAGAGTCTAGAAAATG 1671

 91680925 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 91680984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 AGATCTGTGAAGTAAAATTAGATCTGACAAATAACTATTTGATTTTAGCACCACAGAGGG 1731

 91680985 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 91681044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 TTATTTGTGACCTTGATAAGAGAATTTTCAGTGTAATATTGGAAGTGAAAGTCTGGATCT 1791

 91681045 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 91681104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 AGTAGGTTCAAGATGGAAAGGGGAGCAGAGAAATTGTATGAGTTCAAGGAAATATTTTTC 1851

 91681105 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 91681164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 GGCGAACAAACATAGATTGCATTTGGATTAAAAATGTTATTAATATGCTGGTTCTTTCAG 1911

 91681165 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 91681224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 CCACTGTATTTTTTTGTTACTATTAAGCTATTAGACAATCAATAGATACCTATTAACCTC 1971

 91681225 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGA 91681270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 AAAGTATAATAGAATTGACCAAAATGTTCTGCTCTTAATAAATAGA 2017

Alignment time is 2.50529 s

