
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2603] =>      2603 nucs 'mol-32-1f0b-106511_2603'

Score:        2408
Aligned:      2473        nucs
Identic:      2463 (100%) nucs =>       578 (100%)      1885 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78921311,78921889] EXCISED REGION [78926077,78927968]
 second seq =>  [       1,     579] EXCISED REGION [     715,    2603]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [580,714]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78921311 AAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAA 78921370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
        1 AAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAA 60

 78921371 ATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACA 78921430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACA 120

 78921431 TAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAAT 78921490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAAT 180

 78921491 AAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGAT 78921550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGAT 240

 78921551 CCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGA 78921610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGA 300

 78921611 AAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAA 78921670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAA 360

 78921671 TAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAG 78921730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAG 420

 78921731 CCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTG 78921790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTG 480

 78921791 AAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCA 78921850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCA 540

 78921851 TCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 579

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 774

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 834

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 894

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 954

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 1014

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     1015 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 1071

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 1131

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 1191

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 1251

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 1311

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 1371

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 1431

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 1491

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 1551

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 1611

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 1671

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1731

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1791

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1851

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1911

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 1971

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 2031

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2032 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 2091

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 2151

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 2211

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 2271

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2272 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 2331

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 2391

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 2451

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 2511

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 2571

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAG 78927968
          |||||    |||||||||||||||||||||||||
     2572 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAG 2603

Alignment time is 3.90618 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3238] =>      3238 nucs 'mol-32-1f21-035792_3238'

Score:        3070
Aligned:      3103        nucs
Identic:      3100 (100%) nucs =>      2753 (100%)       347 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78919134,78921889] EXCISED REGION [78926077,78926423]
 second seq =>  [       1,    2756] EXCISED REGION [    2892,    3238]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [2757,2891]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78919134 AATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTAT 78919193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTAT 60

 78919194 TAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTA 78919253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTA 120

 78919254 TATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCAC 78919313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCAC 180

 78919314 TCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAAT 78919373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAAT 240

 78919374 AATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCA 78919433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCA 300

 78919434 AGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGA 78919493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGA 360

 78919494 CTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAA 78919553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAA 420

 78919554 ATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTG 78919613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTG 480

 78919614 AATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAG 78919673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAG 540

 78919674 GTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCT 78919733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCT 600

 78919734 CAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCT 78919793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCT 660

 78919794 CCCAAGAAAAACCGAGAACAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCA 78919853
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCAAGAAAAACCGAGAGCAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCA 720

 78919854 GAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAA 78919913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAA 780

 78919914 AAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCA 78919973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCA 840

 78919974 ACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTC 78920033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTC 900

 78920034 ATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATA 78920093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATA 960

 78920094 ATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTA 78920153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTA 1020

 78920154 TGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAAT 78920213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAAT 1080

 78920214 AATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAAT 78920273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAAT 1140

 78920274 TTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACT 78920333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACT 1200

 78920334 CATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAA 78920393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAA 1260

 78920394 TATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAAT 78920453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAAT 1320

 78920454 ACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGG 78920513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGG 1380

 78920514 ATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGAC 78920573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGAC 1440

 78920574 AATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATT 78920633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATT 1500

 78920634 ACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACAC 78920693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACAC 1560

 78920694 CCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAA 78920753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAA 1620

 78920754 TAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTA 78920813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTA 1680

 78920814 ATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACA 78920873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACA 1740

 78920874 AAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATT 78920933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATT 1800

 78920934 CTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAA 78920993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAA 1860

 78920994 TTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGA 78921053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGA 1920

 78921054 TCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGG 78921113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGG 1980

 78921114 CTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAA 78921173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAA 2040

 78921174 TTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAA 78921233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAA 2100

 78921234 ATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGG 78921293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGG 2160

 78921294 AACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATT 78921353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATT 2220

 78921354 AGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGAC 78921413
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGAC 2280

 78921414 TTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAA 78921473
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGATAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAA 2340

 78921474 AATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCC 78921533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCC 2400

 78921534 ACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAA 78921593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAA 2460

 78921594 AATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAA 78921653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAA 2520

 78921654 GAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATC 78921713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATC 2580

 78921714 CTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTAC 78921773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTAC 2640

 78921774 AAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTC 78921833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTC 2700

 78921834 ATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 2756

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 2951

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 3011

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 3071

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 3131

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 3191

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTG 78926423
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTG 3238

Alignment time is 4.57415 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4006] =>      4006 nucs 'mol-32-2202-009704_4006'

Score:        3724
Aligned:      3877        nucs
Identic:      3859 (100%) nucs =>       682 (100%)      3177 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78921206,78921889] EXCISED REGION [78926077,78929265]
 second seq =>  [       1,     684] EXCISED REGION [     820,    4006]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [685,819]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78921206 GTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCAC 78921265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCAC 60

 78921266 ATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAG 78921325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAG 120

 78921326 AGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAA 78921385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAA 180

 78921386 TTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTA 78921445
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      181 TTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGATA 240

 78921446 AACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAA 78921505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAA 300

 78921506 TAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTA 78921565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTA 360

 78921566 TGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATAT 78921625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATAT 420

 78921626 GTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAG 78921685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAG 480

 78921686 CTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGG 78921745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGG 540

 78921746 ATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAA 78921805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAA 600

 78921806 AGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAA 78921865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAA 660

 78921866 AATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||
      661 AATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 684

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 879

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 939

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 999

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 1059

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 1119

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     1120 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 1176

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 1236

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 1296

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 1356

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 1416

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 1476

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 1536

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 1596

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 1656

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 1716

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 1776

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1836

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1896

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1956

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 2016

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 2076

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 2136

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2137 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 2196

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 2256

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 2316

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 2376

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2377 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 2436

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 2496

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 2556

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 2616

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 2676

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 2734

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 2794

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 2854

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 2914

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 2974

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAA-CCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACC 78928293
          |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 GGACATGGATTAAGCT-AAAAGCCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACC 3033

 78928294 AAACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGG 78928353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 AAACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGG 3093

 78928354 GAGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCAT 78928413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 GAGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCAT 3153

 78928414 TAGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGT 78928473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 TAGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGT 3213

 78928474 GTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAA 78928533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 GTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAA 3273

 78928534 AATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGG 78928593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 AATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGG 3333

 78928594 CTTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTA 78928653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 CTTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTA 3393

 78928654 TTATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAG 78928713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 TTATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAG 3453

 78928714 CGGTGTTGAA-TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGT 78928772
          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3454 CGGTGTTGAATTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGT 3513

 78928773 CTTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTT 78928832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 CTTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTT 3573

 78928833 GCATCCCAGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAA 78928892
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 GCATCCCCGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAA 3633

 78928893 TTAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACT 78928952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 TTAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACT 3693

 78928953 TGTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCT 78929012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 TGTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCT 3753

 78929013 CATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTAT 78929072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 CATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTAT 3813

 78929073 TATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCAATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCT 78929132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3814 TATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCCATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCT 3873

 78929133 TTTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTC 78929192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 TTTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTC 3933

 78929193 TTCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATC 78929252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 TTCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATC 3993

 78929253 TTTTAGTTTATTG 78929265
          |||||||||||||
     3994 TTTTAGTTTATTG 4006

Alignment time is 5.57927 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    6784] =>      6784 nucs 'mol-32-238e-035116_6784'

Score:        6476
Aligned:      6651        nucs
Identic:      6631 (100%) nucs =>      3451 (100%)      3180 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78918434,78921889] EXCISED REGION [78926077,78929268]
 second seq =>  [       1,    3456] EXCISED REGION [    3592,    6781]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [3457,3591]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78918434 TTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCT 78918493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCT 60

 78918494 CTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCTTTTAAGCTCCATGATTGTTT 78918553
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
       61 CTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCCTTTAAGCTCCATGATTGTTT 120

 78918554 TCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAG 78918613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAG 180

 78918614 TGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTA 78918673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTA 240

 78918674 CATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGC 78918733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGC 300

 78918734 TTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACT 78918793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACT 360

 78918794 AACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTGCTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAA 78918853
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTACTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAA 420

 78918854 CACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAG 78918913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAG 480

 78918914 CAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTA 78918973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTA 540

 78918974 TCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGT 78919033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGT 600

 78919034 TGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATC 78919093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATC 660

 78919094 TCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACA 78919153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACA 720

 78919154 TTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAA 78919213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAA 780

 78919214 AAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAG 78919273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAG 840

 78919274 AACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCAT 78919333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCAT 900

 78919334 ATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGAT 78919393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGAT 960

 78919394 TGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAG 78919453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAG 1020

 78919454 CCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTC 78919513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTC 1080

 78919514 AACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGC 78919573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGC 1140

 78919574 TGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGG 78919633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGG 1200

 78919634 GCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAAT 78919693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAAT 1260

 78919694 CTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATC 78919753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATC 1320

 78919754 AGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAACA 78919813
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1321 AGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAGCA 1380

 78919814 AGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCC 78919873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCC 1440

 78919874 AAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTA 78919933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTA 1500

 78919934 CCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAA 78919993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAA 1560

 78919994 ATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGT 78920053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGT 1620

 78920054 TGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAA 78920113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAA 1680

 78920114 AAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAA 78920173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAA 1740

 78920174 TTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGG 78920233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGG 1800

 78920234 CTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACG 78920293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACG 1860

 78920294 TCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGT 78920353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGT 1920

 78920354 AAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTC 78920413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTC 1980

 78920414 CAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGAC 78920473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGAC 2040

 78920474 ATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAA 78920533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAA 2100

 78920534 AATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGAC 78920593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGAC 2160

 78920594 TTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCA 78920653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCA 2220

 78920654 ATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGA 78920713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGA 2280

 78920714 TTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACC 78920773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACC 2340

 78920774 CCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTA 78920833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTA 2400

 78920834 AACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACC 78920893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACC 2460

 78920894 ACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTT 78920953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTT 2520

 78920954 GGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCA 78921013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCA 2580

 78921014 GACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAA 78921073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAA 2640

 78921074 TACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACA 78921133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACA 2700

 78921134 GATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGAT 78921193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGAT 2760

 78921194 GTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTA 78921253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTA 2820

 78921254 GAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAA 78921313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAA 2880

 78921314 AAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATT 78921373
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2881 AAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATT 2940

 78921374 GTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAA 78921433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAA 3000

 78921434 ATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAG 78921493
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATAAAATTGATAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAG 3060

 78921494 CACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCT 78921553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCT 3120

 78921554 CATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAA 78921613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAA 3180

 78921614 ATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAG 78921673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAG 3240

 78921674 ACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCC 78921733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCC 3300

 78921734 TGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAA 78921793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAA 3360

 78921794 CTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCA 78921853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCA 3420

 78921854 GTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 3456

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 3651

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 3711

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 3771

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 3831

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 3891

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     3892 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 3948

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 4008

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 4068

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 4128

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 4188

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 4248

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 4308

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 4368

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 4428

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 4488

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 4548

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 4608

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 4668

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 4728

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 4788

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 4848

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 4908

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4909 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 4968

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4969 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 5028

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5029 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 5088

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5089 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 5148

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5149 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 5208

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5209 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 5268

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5269 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 5328

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5329 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 5388

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5389 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 5448

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5449 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 5506

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5507 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 5566

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5567 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 5626

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5627 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 5686

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5687 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 5746

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5747 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 5806

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5807 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 5866

 78928355 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 78928414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5867 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 5926

 78928415 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 78928474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5927 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 5986

 78928475 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 78928534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5987 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 6046

 78928535 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 78928594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6047 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 6106

 78928595 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 78928654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6107 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 6166

 78928655 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 78928714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6167 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 6226

 78928715 GGTGTTGAA-TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTC 78928773
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6227 GGTGTTGAATTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTC 6286

 78928774 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 78928833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6287 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 6346

 78928834 CATCCCAGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 78928893
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6347 CATCCCCGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 6406

 78928894 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 78928953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6407 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 6466

 78928954 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 78929013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6467 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 6526

 78929014 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 78929073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6527 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 6586

 78929074 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCAATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 78929133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6587 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCCATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 6646

 78929134 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 78929193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6647 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 6706

 78929194 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 78929253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6707 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 6766

 78929254 TTTAGTTTATTGGTA 78929268
          |||||||||||||||
     6767 TTTAGTTTATTGGTA 6781

Alignment time is 9.39607 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3190] =>      3190 nucs 'mol-32-238e-035116_3190'

Score:        3088
Aligned:      3191        nucs
Identic:      3180 (100%) nucs =>      1860 (100%)      1320 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78926077,78927941] EXCISED REGION [78927944,78929268]
 second seq =>  [       1,    1862] EXCISED REGION [    1865,    3190]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [78927942,78927943]
 second seq =>         2 nucs [1863,1864]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [78927941,78927942] to [78927943,78927944]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 60

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 120

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 180

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 240

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 300

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
      301 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAG---GT 357

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 417

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 477

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 537

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 597

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 657

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 717

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 777

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 837

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 897

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 957

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1017

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1077

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1137

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1197

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 1257

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 1317

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1318 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 1377

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 1437

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 1497

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 1557

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1558 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 1617

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 1677

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 1737

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 1797

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 1857

 78927937 GGGAG 78927941
          |||||
     1858 GGGAG 1862

EXCISED REGION

 78927944 TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAGCCAGA 78928003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAGCCAGA 1924

 78928004 AATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTATAAATCATG 78928063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 AATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTATAAATCATG 1984

 78928064 CTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAATAGCAAAGAC 78928123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 CTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAATAGCAAAGAC 2044

 78928124 TTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTGGCAAATATA 78928183
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 TTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTGGCAAATATA 2104

 78928184 CACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAGGGACATGGA 78928243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 CACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAGGGACATGGA 2164

 78928244 TTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCAAACACCGCA 78928303
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 TTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCAAACACCGCA 2224

 78928304 TGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGGAGGGGAACA 78928363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 TGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGGAGGGGAACA 2284

 78928364 TCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATTAGGAGAAAT 78928423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 TCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATTAGGAGAAAT 2344

 78928424 GCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTGTATACCTAT 78928483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 GCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTGTATACCTAT 2404

 78928484 GTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAAATAAATAAA 78928543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 GTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAAATAAATAAA 2464

 78928544 TAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGCTTTCTGTTT 78928603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 TAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGCTTTCTGTTT 2524

 78928604 TTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTATTATGTTGAG 78928663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 TTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTATTATGTTGAG 2584

 78928664 GTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGCGGTGTTGAA 78928723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 GTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGCGGTGTTGAA 2644

 78928724 -TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTCTTTAATTCT 78928782
           ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 TTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTCTTTAATTCT 2704

 78928783 GTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTGCATCCCAGG 78928842
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2705 GTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTGCATCCCCGG 2764

 78928843 AATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAATTAGGTTTTC 78928902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 AATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAATTAGGTTTTC 2824

 78928903 TAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTTGTAGTTTTC 78928962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 TAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTTGTAGTTTTC 2884

 78928963 TATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTCATACAATTA 78929022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 TATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTCATACAATTA 2944

 78929023 CTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATTATTAGTTCC 78929082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 CTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATTATTAGTTCC 3004

 78929083 TCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCAATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTTTTCTAGAAT 78929142
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 TCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCCATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTTTTCTAGAAT 3064

 78929143 GCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCTTCCTGGTTC 78929202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 GCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCTTCCTGGTTC 3124

 78929203 AATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCTTTTAGTTTA 78929262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 AATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCTTTTAGTTTA 3184

 78929263 TTGGTA 78929268
          ||||||
     3185 TTGGTA 3190

Alignment time is 4.45013 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3942] =>      3942 nucs 'mol-32-23af-078838_3942'

Score:        3802
Aligned:      3927        nucs
Identic:      3914 (100%) nucs =>      1859 (100%)      2055 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78926077,78927941] EXCISED REGION [78927944,78930003]
 second seq =>  [      10,    1871] EXCISED REGION [    1874,    3935]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [78927942,78927943]
 second seq =>         2 nucs [1872,1873]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [78927941,78927942] to [78927943,78927944]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       10 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 69

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       70 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 129

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      130 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 189

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      190 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 249

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      250 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 309

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
      310 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAG---GT 366

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      367 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 426

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      427 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAACGTTTTCTT 486

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      487 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 546

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 606

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 666

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 726

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 786

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 846

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 906

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 966

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1026

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1086

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1146

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1206

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 1266

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 1326

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1327 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 1386

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 1446

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 1506

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 1566

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1567 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 1626

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 1686

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 1746

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 1806

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 1866

 78927937 GGGAG 78927941
          |||||
     1867 GGGAG 1871

EXCISED REGION

 78927944 TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAGCCAGA 78928003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAGCCAGA 1933

 78928004 AATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTATAAATCATG 78928063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 AATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTATAAATCATG 1993

 78928064 CTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAATAGCAAAGAC 78928123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 CTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAATAGCAAAGAC 2053

 78928124 TTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTGGCAAATATA 78928183
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 TTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTGGCAAATATA 2113

 78928184 CACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAGGGACATGGA 78928243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 CACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAGGGACATGGA 2173

 78928244 TTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCAAACACCGCA 78928303
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 TTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCAAACACCGCA 2233

 78928304 TGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGGAGGGGAACA 78928363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 TGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGGAGGGGAACA 2293

 78928364 TCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATTAGGAGAAAT 78928423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 TCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATTAGGAGAAAT 2353

 78928424 GCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTGTATACCTAT 78928483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 GCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTGTATACCTAT 2413

 78928484 GTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAAATAAATAAA 78928543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 GTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAAATAAATAAA 2473

 78928544 TAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGCTTTCTGTTT 78928603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 TAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGCTTTCTGTTT 2533

 78928604 TTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTATTATGTTGAG 78928663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 TTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTATTATGTTGAG 2593

 78928664 GTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGCGGTGTTGAA 78928723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 GTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGCGGTGTTGAA 2653

 78928724 -TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTCTTTAATTCT 78928782
           ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 TTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTCTTTAATTCT 2713

 78928783 GTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTGCATCCCAGG 78928842
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2714 GTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTGCATCCCCGG 2773

 78928843 AATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAATTAGGTTTTC 78928902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 AATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAATTAGGTTTTC 2833

 78928903 TAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTTGTAGTTTTC 78928962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 TAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTTGTAGTTTTC 2893

 78928963 TATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTCATACAATTA 78929022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 TATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTCATACAATTA 2953

 78929023 CTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATTATTAGTTCC 78929082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 CTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATTATTAGTTCC 3013

 78929083 TCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCAATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTTTTCTAGAAT 78929142
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 TCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCCATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTTTTCTAGAAT 3073

 78929143 GCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCTTCCTGGTTC 78929202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 GCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCTTCCTGGTTC 3133

 78929203 AATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCTTTTAGTTTA 78929262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3134 AATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCTTTTAGTTTA 3193

 78929263 TTGGTA-ATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTATCAGTTGTA 78929321
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 TTGGTATATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTATCAGTTGTA 3253

 78929322 TCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTTCTTAGTCTG 78929381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 TCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTTCTTAGTCTG 3313

 78929382 GCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATTTGTTGGATG 78929441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 GCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATTTGTTGGATG 3373

 78929442 GTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTCAGTGATATG 78929501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 GTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTCAGTGATATG 3433

 78929502 AAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAGTTGTCTTTT 78929561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 AAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAGTTGTCTTTT 3493

 78929562 CGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATAGAGCTTTCA 78929621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 CGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATAGAGCTTTCA 3553

 78929622 ATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTATATTTTTGTA 78929681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 ATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTATATTTTTGTA 3613

 78929682 AAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAATGGATGCATT 78929741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 AAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAATGGATGCATT 3673

 78929742 GTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAATGAACAACT 78929801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 GTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAATGAACAACT 3733

 78929802 ATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAATAAATATCA 78929861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 ATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAATAAATATCA 3793

 78929862 TCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGCATACTTACA 78929921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 TCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGCATACTTACA 3853

 78929922 CATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATA 78929981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 CATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATA 3913

 78929982 CACACAAATACATATATATATA 78930003
          ||||||||||||||||||||||
     3914 CACACAAATACATATATATATA 3935

Alignment time is 5.42873 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    8129] =>      8129 nucs 'mol-32-2874-109069_8129'

Score:        7760
Aligned:      8003        nucs
Identic:      7976 (100%) nucs =>       230 (100%)      7746 (100%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78921660,78921889] EXCISED REGION [78926077,78933845]
 second seq =>  [       1,     230] EXCISED REGION [     366,    8129]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [231,365]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78921660 GAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCA 78921719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCA 60

 78921720 CCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAA 78921779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAA 120

 78921780 GGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTA 78921839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTA 180

 78921840 TGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 230

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 425

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 485

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 545

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 605

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 665

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
      666 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 722

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 782

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 842

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 902

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 962

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 1022

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 1082

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 1142

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 1202

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 1262

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 1322

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1382

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1442

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1502

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1562

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 1622

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 1682

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1683 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 1742

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 1802

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 1862

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 1922

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1923 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 1982

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 2042

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 2102

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 2162

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 2222

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 2280

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 2340

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 2400

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 2460

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 2520

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 2580

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 2640

 78928355 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 78928414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 2700

 78928415 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 78928474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 2760

 78928475 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 78928534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 2820

 78928535 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 78928594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 2880

 78928595 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 78928654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 2940

 78928655 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 78928714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 3000

 78928715 GGTGTTGAA-TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTC 78928773
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3001 GGTGTTGAATTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTC 3060

 78928774 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 78928833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 3120

 78928834 CATCCCAGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 78928893
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CATCCCCGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 3180

 78928894 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 78928953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 3240

 78928954 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 78929013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 3300

 78929014 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 78929073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 3360

 78929074 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCAATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 78929133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCCATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 3420

 78929134 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 78929193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 3480

 78929194 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 78929253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 3540

 78929254 TTTAGTTTATTGGTA-ATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 78929312
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTAGTTTATTGGTATATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 3600

 78929313 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 78929372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 3660

 78929373 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 78929432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 3720

 78929433 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 78929492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 3780

 78929493 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 78929552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 3840

 78929553 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 78929612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 3900

 78929613 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 78929672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 3960

 78929673 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 78929732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 4020

 78929733 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 78929792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 4080

 78929793 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 78929852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 4140

 78929853 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 78929912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 4200

 78929913 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 78929972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 4260

 78929973 ATATATATACACACAAATACATATATATATATAATATATTGTTAGAAGAAAGAAACAAAT 78930032
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ATATATATACACACAAATAC--ATATATATATAATATATTGTTAGAAGAAAGAAACAAAT 4318

 78930033 TTTTATGCTTCATGTCATATAAAATAATTATCATAATAAAAAGATTTTTAAAGTGGTGTA 78930092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TTTTATGCTTCATGTCATATAAAATAATTATCATAATAAAAAGATTTTTAAAGTGGTGTA 4378

 78930093 AAAGCTCAGTGATAACTTTGAATATAAATGGATTAATTTCCTGTATTATTAGACTGGCTT 78930152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 AAAGCTCAGTGATAACTTTGAATATAAATGGATTAATTTCCTGTATTATTAGACTGGCTT 4438

 78930153 TAACAAGAAAATTCCATCTACATATTTTTAACAACAACCACAAAAATTATAATAAAGAAA 78930212
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TAGCAAGAAAATTCCATCTACATATTTTTAACAACAACCACAAAAATTATAATAAAGAAA 4498

 78930213 GGGTTACAATGAATGAATGTTTACAGAGAAATTAGGCAAAGCTGAAGCAACTATGAAAAT 78930272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 GGGTTACAATGAATGAATGTTTACAGAGAAATTAGGCAAAGCTGAAGCAACTATGAAAAT 4558

 78930273 ACCAATAGAAGATACAGTAGAAGTCATGAAATAAACTCTAAAATGACTTGAAATCATTAT 78930332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 ACCAATAGAAGATACAGTAGAAGTCATGAAATAAACTCTAAAATGACTTGAAATCATTAT 4618

 78930333 TTATTTATATTGACAGAATATGTAGTTTCTATTCAATGTGAATGTAAAAATTGATTAATA 78930392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 TTATTTATATTGACAGAATATGTAGTTTCTATTCAATGTGAATGTAAAAATTGATTAATA 4678

 78930393 TTAGCATTTGCTATTTATATTTAAAATATTGGAAATGAGGAGAGCAAGATAAAATACATT 78930452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 TTAGCATTTGCTATTTATATTTAAAATATTGGAAATGAGGAGAGCAAGATAAAATACATT 4738

 78930453 TTTAATGAGAACACTTTCAGTCTTTTTATCTTTAACAGATCCAGAAGACAATATATGGAT 78930512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TTTAATGAGAACACTTTCAGTCTTTTTATCTTTAACAGATCCAGAAGACAATATATGGAT 4798

 78930513 AATATAATCAATACTGTAAACTTGAGTAATGTAGATAAGGTATATTGGTTAAAGTACATG 78930572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 AATATAATCAATACTGTAAACTTGAGTAATGTAGATAAGGTATATTGGTTAAAGTACATG 4858

 78930573 TCATTATACTATACAAAACCCCAAAGAACAGTAGCTAAAATAATATATTTTTCATTCCAT 78930632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 TCATTATACTATACAAAACCCCAAAGAACAGTAGCTAAAATAATATATTTTTCATTCCAT 4918

 78930633 ATAACAACATGAATTTCATAAGCAGTGCAGAGGAGGAACAAAGTCCTGTTTTGGATAAAT 78930692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 ATAACAACATGAATTTCATAAGCAGTGCAGAGGAGGAACAAAGTCCTGTTTTGGATAAAT 4978

 78930693 ATCCAGGTAGTAAACTTTCCTCTTCTAACTTGTTTCTCTGCTTGATTGAAGCTAGCTCAT 78930752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 ATCCAGGTAGTAAACTTTCCTCTTCTAACTTGTTTCTCTGCTTGATTGAAGCTAGCTCAT 5038

 78930753 CATGACTACATTTGCACATTTTATTACAGAGGAGAGGACGAAGAGAAATTGCAGTAGAAG 78930812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 CATGACTACATTTGCACATTTTATTACAGAGGAGAGGACGAAGAGAAATTGCAGTAGAAG 5098

 78930813 TAGTTTTCTGTGTAAAATATAAGATCAAGGATTTACACACATCACTTGTCTTCATAGCCT 78930872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 TAGTTTTCTGTGTAAAATATAAGATCAAGGATTTACACACATCACTTGTCTTCATAGCCT 5158

 78930873 ATTTGCCAGAACTAAGTTGGATGCCCACAACTGTAAGGAATGGTGGAAAAGTCGGAAGCT 78930932
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 ATTTGCCAGAACTAAGTCGGATGCCCACAACTGTAAGGAATGGTGGAAAAGTCGGAAGCT 5218

 78930933 GTGCAAAGTAGCTAAACTGGGGGGGGAGTGGGAGTACAGGTTGCCAGTAGGTTCAAAGGA 78930992
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 GTGCAAAGTAGCTAAACT-GGGGGGGAGTGGGAGTACAGGTTGCCAGTAGGTTCAAAGGA 5277

 78930993 AAATAACACTTCAAGAGAATTGGAAGTCTCTACCACTGAGTGCTTCTCATTTATGAAACT 78931052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 AAATAACACTTCAAGAGAATTGGAAGTCTCTACCACTGAGTGCTTCTCATTTATGAAACT 5337

 78931053 GCTTTATGGCATCTGCATAGGAAATTTTGACAGTTTCTACCAAGTGCCACTAAGACACAT 78931112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 GCTTTATGGCATCTGCATAGGAAATTTTGACAGTTTCTACCAAGTGCCACTAAGACACAT 5397

 78931113 AAATATCATAAATATCCAGAAAACATTGAAAAATCACAAACACAGATAACTAACAGTGAC 78931172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 AAATATCATAAATATCCAGAAAACATTGAAAAATCACAAACACAGATAACTAACAGTGAC 5457

 78931173 ATACAATCTGGTGCCAAATTTTGAAGTGAAAGTCATTGTTTCCCTAAGTGTACTATAAAA 78931232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 ATACAATCTGGTGCCAAATTTTGAAGTGAAAGTCATTGTTTCCCTAAGTGTACTATAAAA 5517

 78931233 CACTCTTCTAACAGATATTAATATGAATTCTGAGAGAAGAATTGTTCTGTACTCAAGAGT 78931292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 CACTCTTCTAACAGATATTAATATGAATTCTGAGAGAAGAATTGTTCTGTACTCAAGAGT 5577

 78931293 TTGGACAATGTCAGTTTTAATCGATTAAAGAGGTTTATTTACTTTAGAGCTTCTCAGAGT 78931352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 TTGGACAATGTCAGTTTTAATCGATTAAAGAGGTTTATTTACTTTAGAGCTTCTCAGAGT 5637

 78931353 CTTTGCTATACTTACATGTATTATGATTCTGCAAGTTGCAGGGAATATCATATACAATAA 78931412
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 CTTTGGTATACTTACATGTATTATGATTCTGCAAGTTGCAGGGAATATCATATACAATAA 5697

 78931413 TTTTCAAACATATTTGACTACACAATTATTTCTATGTCACTGCTGTCAACATTTTTCCAA 78931472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 TTTTCAAACATATTTGACTACACAATTATTTCTATGTCACTGCTGTCAACATTTTTCCAA 5757

 78931473 AATAATGTATCTTCCAAATTAAAAAAATGCTATAAAGCAAATGGAACTAATAAAAAACAA 78931532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 AATAATGTATCTTCCAAATTAAAAAAATGCTATAAAGCAAATGGAACTAATAAAAAACAA 5817

 78931533 AACAAAACAAATATTCATCTGGGCTTTAAATGTTTTGGCTGAAAAAATGTAGGAAGATGC 78931592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 AACAAAACAAATATTCATCTGGGCTTTAAATGTTTTGGCTGAAAAAATGTAGGAAGATGC 5877

 78931593 TTTTTGAAAATTTTATTTTTTCTTACTCAAAGCAATGGGTCTGGACTTCATCAAATGGAC 78931652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 TTTTTGAAAATTTTATTTTTTCTTACTCAAAGCAATGGGTCTGGACTTCATCAAATGGAC 5937

 78931653 AATTCTTTCTGTGTTGCTGAAATATAGTTTTATTTGTGGTGGCTAGAGTACTATTTTAAA 78931712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 AATTCTTTCTGTGTTGCTGAAATATAGTTTTATTTGTGGTGGCTAGAGTACTATTTTAAA 5997

 78931713 AGCTCATTCTTTGTACAAATCTTTCAGATATAATGACTTTAAAAAGCAGAGAAACCAACA 78931772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 AGCTCATTCTTTGTACAAATCTTTCAGATATAATGACTTTAAAAAGCAGAGAAACCAACA 6057

 78931773 CCAGTGAAGTAAGTATATTAATATTTTAGGTGGGGGTTGAAGATAGGGAATTGGCACAGT 78931832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 CCAGTGAAGTAAGTATATTAATATTTTAGGTGGGGGTTGAAGATAGGGAATTGGCACAGT 6117

 78931833 GATTGAATTCTGGGAAAGTATATATAAATTTTTTTTTTTTACCAATCAGACTGAATGTTA 78931892
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 GATTGAATTCTGGGAAAGTATATATAAA-TTTTTTTTTTTACCAATCAGACTGAATGTTA 6176

 78931893 TTGTTTGTAGGAATCACAGGAAGAACAATAAAAGCAGTGCAGAGTATACCACACTTACCT 78931952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 TTGTTTGTAGGAATCACAGGAAGAACAATAAAAGCAGTGCAGAGTATACCACACTTACCT 6236

 78931953 TGTCTTTTTACCACACTGGAACATGACCTGTGAGATAAAGCAAAGACTTTTGTAGTGTTC 78932012
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6237 TGTCTTTTTACCACACTGGAACATGACCTGTGAGATAAAGCAAAGACCTTTGTAGTGTTC 6296

 78932013 CCCTTGATCCTAAGATCTCTTTGCTTCCTAATGCTCTTCTTCTTGACTAGTAATGTAAAC 78932072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 CCCTTGATCCTAAGATCTCTTTGCTTCCTAATGCTCTTCTTCTTGACTAGTAATGTAAAC 6356

 78932073 ATACCTAGTTTCATGGGTAGAGAAATTTGACTCTGGTTAATAACCTAGAGCATAGAATTG 78932132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 ATACCTAGTTTCATGGGTAGAGAAATTTGACTCTGGTTAATAACCTAGAGCATAGAATTG 6416

 78932133 ACATGTTTGGTGACTTTTTTCTGCCTGTCATTTCTTTACTGAGGCAGTAGAGGCAGAATA 78932192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 ACATGTTTGGTGACTTTTTTCTGCCTGTCATTTCTTTACTGAGGCAGTAGAGGCAGAATA 6476

 78932193 CCTAACTGTACCAAACTCTAAAAATATTACAGACTTCAGATCTGAAAAAGAGAATCCTCC 78932252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 CCTAACTGTACCAAACTCTAAAAATATTACAGACTTCAGATCTGAAAAAGAGAATCCTCC 6536

 78932253 ACCTCCAATACCTATATGGGCCTCTTCTGTAAGTCTGTCTCTGTTTTGCTAGCATGTGCA 78932312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6537 ACCTCCAATACCTATATGGGCCTCTTCTGTAAGTCTATCTCTGTTTTGCTAGCATGTGCA 6596

 78932313 ACAATAGGACTGAGGAGTGGCCAAGGAGAAGCATTAGTTGGGGTGATAAATGGAGCTAGG 78932372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 ACAATAGGACTGAGGAGTGGCCAAGGAGAAGCATTAGTTGGGGTGATAAATGGAGCTAGG 6656

 78932373 ATATGAGTGTTTAGGTGTAGCTTCATGAAGCCTTTTGCAATGTGTAATAGAGCTAGGGGT 78932432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 ATATGAGTGTTTAGGTGTAGCTTCATGAAGCCTTTTGCAATGTGTAATAGAGCTAGGGGT 6716

 78932433 GGGAAAAGAAGGAAGACCTGCCAAATATGGAAAAACAGAGGACAGAGGCTAGCTCTCCCA 78932492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 GGGAAAAGAAGGAAGACCTGCCAAATATGGAAAAACAGAGGACAGAGGCTAGCTCTCCCA 6776

 78932493 GCAGTGGAACCTCAAGGCATGCTTTAAAGACAATTATAAACTCTAACCTGACTCTTCAAT 78932552
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 GCAGTGGAACCTCAAGGCATGCTCTAAAGACAATTATAAACTCTAACCTGACTCTTCAAT 6836

 78932553 TCAATATAGAAGTGTATTCTTCCAGTTATGATAAGATACCATAATTTAAAAGTTTTTAGG 78932612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 TCAATATAGAAGTGTATTCTTCCAGTTATGATAAGATACCATAATTTAAAAGTTTTTAGG 6896

 78932613 GTTTATTTGTAAGTTTTAGATATTTATACATATAGATTGCCAGCTTTCATTTGAACCCTT 78932672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 GTTTATTTGTAAGTTTTAGATATTTATACATATAGATTGCCAGCTTTCATTTGAACCCTT 6956

 78932673 GCCTGAGACACTGCCAATGTTAAAGGAAGGTCTCAGGAGAAGAATAGAAATCATATAAAA 78932732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 GCCTGAGACACTGCCAATGTTAAAGGAAGGTCTCAGGAGAAGAATAGAAATCATATAAAA 7016

 78932733 TTCCTTTGAGCAAATGCATTTCTTAAAATATTAATATGTTATCTCACTATAATTGCTATT 78932792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 TTCCTTTGAGCAAATGCATTTCTTAAAATATTAATATGTTATCTCACTATAATTGCTATT 7076

 78932793 AAAATCAACAAAATCTGGCATACAGAAATAACAGTGTGGGAGGATTTTACTTTGGATAGG 78932852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 AAAATCAACAAAATCTGGCATACAGAAATAACAGTGTGGGAGGATTTTACTTTGGATAGG 7136

 78932853 ATGCTCATATATTCTAAATAGATTACAAGATAGCTAAAACCTTAAGGATGAGAAGATACT 78932912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 ATGCTCATATATTCTAAATAGATTACAAGATAGCTAAAACCTTAAGGATGAGAAGATACT 7196

 78932913 ATTTATAGTTACAGAATGAAAAAAACATTCTAGACAAAAGACATAAGTTTTACAAAAGTC 78932972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 ATTTATAGTTACAGAATGAAAAAAACATTCTAGACAAAAGACATAAGTTTTACAAAAGTC 7256

 78932973 CTCGGACCACAGCACAGTCAAATTAAATCTCAAGATTAAAAAATTCACTCAAAACCACAC 78933032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 CTCGGACCACAGCACAGTCAAATTAAATCTCAAGATTAAAAAATTCACTCAAAACCACAC 7316

 78933033 AACTACATGGAAACTGACCAAGCTGTTCCTGAATGGCCTTTGAGTAAATAATGAAATTAA 78933092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 AACTACATGGAAACTGACCAAGCTGTTCCTGAATGGCCTTTGAGTAAATAATGAAATTAA 7376

 78933093 GGCAGAGAACAAGAAGTTATTCGAAACTAATGAGAATAAAGATACAACATACCAGAATTT 78933152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 GGCAGAGAACAAGAAGTTATTCGAAACTAATGAGAATAAAGATACAACATACCAGAATTT 7436

 78933153 CTGGGACACAGCTAAAGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATGCTCACATCAA 78933212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 CTGGGACACAGCTAAAGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATGCTCACATCAA 7496

 78933213 AAAGCTAGAAAGATCTCAAGTTAACAAGCTAACATCACAACTAAAAGAACAAGAAAATCA 78933272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 AAAGCTAGAAAGATCTCAAGTTAACAAGCTAACATCACAACTAAAAGAACAAGAAAATCA 7556

 78933273 AAAGCAAACAAACCCCAAAGCTAGCATGAGACAAGAAATAATCAAGATCAGACTTGACCT 78933332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7557 AAAGCAAACAAACCCCAAAGCTAGCATGAGACAAGAAATAATCAAGATCAGACTTGACCT 7616

 78933333 GAAGGAGTCACAGACATTAAAAAAAAAAAAAGAACTTAAAAATCAATGAATCCAGGAGCC 78933392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7617 GAAGGAGTCACAGACATTAAAAAAAAAAAAAGAACTTAAAAATCAATGAATCCAGGAGCC 7676

 78933393 ATTTTTATTGAAAAAAATAAACTAATAAAATAGACTGCTAGATAGACTAATAAAGAAGGA 78933452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7677 ATTTTTATTGAAAAAAATAAACTAATAAAATAGACTGCTAGATAGACTAATAAAGAAGGA 7736

 78933453 AAAAAGAGAACATTCAAAAGAACACAATCAGAAATGATCAGAGGGATATCATCACTGATG 78933512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7737 AAAAAGAGAACATTCAAAAGAACACAATCAGAAATGATCAGAGGGATATCATCACTGATG 7796

 78933513 CCGTAGAAATACATCAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTATGCACATAAACTAGA 78933572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7797 CCGTAGAAATACATCAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTATGCACATAAACTAGA 7856

 78933573 AAATCTAGAAATAAATGGATAAATTCTTGGACACATACACTCTCCCAAGACTGAAAGAGA 78933632
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7857 AAATCTAGAAATAAATGGGTAAATTCTTGGACACATACACTCTCCCAAGACTGAAAGAGA 7916

 78933633 AAGAAATGGAATCTCTGAATAGAACAATAATGAGCTCTGAAACTGAGGCAGGAATAAGTA 78933692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7917 AAGAAATGGAATCTCTGAATAGAACAATAATGAGCTCTGAAACTGAGGCAGGAATAAGTA 7976

 78933693 GCCTACCAACAAGTGTATTAAGATAAACAACTGAATTCTACCAGAGGCACAAAGATGGGC 78933752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7977 GCCTACCAACAAGTGTATTAAGATAAACAACTGAATTCTACCAGAGGCACAAAGATGGGC 8036

 78933753 TGGTACCATTCCTACTCAAAGTATTCCAATAAACTAAAAAAGAGAGACTCCTTTCTAACT 78933812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8037 TGGTACCATTCCTACTCAAAGTATTCCAATAAACTAAAAAAGAGAGACTCCTTTCTAACT 8096

 78933813 CTTTCTATGAGGCCAGTATCATCCTGATTCCAA 78933845
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     8097 CTTTCTATGAGGCCAGTATCATCCTGATTCCAA 8129

Alignment time is 11.4612 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3329] =>      3329 nucs 'mol-32-2895-013920_3329'

Score:        3149
Aligned:      3197        nucs
Identic:      3191 (100%) nucs =>      1732 (100%)      1459 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78920156,78921889] EXCISED REGION [78926077,78927539]
 second seq =>  [       1,    1734] EXCISED REGION [    1870,    3329]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [1735,1869]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78920156 CAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAA 78920215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAA 60

 78920216 TCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTT 78920275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTT 120

 78920276 TTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCA 78920335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCA 180

 78920336 TTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATA 78920395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATA 240

 78920396 TAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATAC 78920455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATAC 300

 78920456 GGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGAT 78920515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGAT 360

 78920516 TCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAA 78920575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAA 420

 78920576 TTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTAC 78920635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTAC 480

 78920636 AAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCC 78920695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCC 540

 78920696 AACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATA 78920755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATA 600

 78920756 ACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAAT 78920815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAAT 660

 78920816 AAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAA 78920875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAA 720

 78920876 ACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCT 78920935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCT 780

 78920936 AAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATT 78920995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATT 840

 78920996 ATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATC 78921055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATC 900

 78921056 TATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCT 78921115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCT 960

 78921116 GAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATT 78921175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATT 1020

 78921176 TACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAAT 78921235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAAT 1080

 78921236 GTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAA 78921295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAA 1140

 78921296 CTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAG 78921355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAG 1200

 78921356 AGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTT 78921415
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTT 1260

 78921416 TGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAA 78921475
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGATAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAA 1320

 78921476 TAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCAC 78921535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCAC 1380

 78921536 AGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAA 78921595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAA 1440

 78921596 TATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGA 78921655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGA 1500

 78921656 AATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCT 78921715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCT 1560

 78921716 ATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAA 78921775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAA 1620

 78921776 AGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCAT 78921835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCAT 1680

 78921836 TCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 1734

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 1929

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 1989

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 2049

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 2109

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 2169

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     2170 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 2226

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 2286

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 2346

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 2406

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 2466

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 2526

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 2586

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 2646

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 2706

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 2766

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 2826

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 2886

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 2946

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 3006

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 3066

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 3126

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 3186

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3187 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 3246

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 3306

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATG 78927539
          |||||||||||||||||||||||
     3307 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATG 3329

Alignment time is 4.72739 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    7821] =>      7821 nucs 'mol-32-2895-051403_7821'

Score:        7575
Aligned:      7689        nucs
Identic:      7677 (100%) nucs =>      6187 (100%)      1490 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78915695,78921889] EXCISED REGION [78926077,78927570]
 second seq =>  [       1,    6195] EXCISED REGION [    6331,    7821]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [6196,6330]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78915695 GCAGAAGCTTTTTAGTTTAATTAAGTCCCATCTATTTATATTTGTTTTTCTTGTGTTTGC 78915754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAGAAGCTTTTTAGTTTAATTAAGTCCCATCTATTTATATTTGTTTTTCTTGTGTTTGC 60

 78915755 TTTTGGGTTCCTGGTCATGAAGCCTTGGCCTAAGCCAATGTCTAGAAAGGTTTTTCCAAT 78915814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTGGGTTCCTGGTCATGAAGCCTTGGCCTAAGCCAATGTCTAGAAAGGTTTTTCCAAT 120

 78915815 ATTATCTACTAAAACTTTTATGGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCTTTGATCCATCTTGA 78915874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTATCTACTAAAACTTTTATGGTTTCAGGTCTTAGATTTAAGTCTTTGATCCATCTTGA 180

 78915875 GTAGATTTTTGTATATGGTGAGAGATGAGGATCCAGATTCATTTGTCTACTTGTGGCTTG 78915934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTAGATTTTTGTATATGGTGAGAGATGAGGATCCAGATTCATTTGTCTACTTGTGGCTTG 240

 78915935 ACAATTATTACAGCATGATTTGTTGAATAGGGTGTCCTTTTCCCACTTTGTGTTTTTGCT 78915994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAATTATTACAGCATGATTTGTTGAATAGGGTGTCCTTTTCCCACTTTGTGTTTTTGCT 300

 78915995 TGCTTTGTCGAATATCAGTTGACTGTAAGTATTTGGCTTTATTTCTGGGATATTAATTCT 78916054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCTTTGTCGAATATCAGTTGACTGTAAGTATTTGGCTTTATTTCTGGGATATTAATTCT 360

 78916055 GTTCCATTAGTCTATACACCTGTTTTTATATCAGTAACATGCTGTTTCAGTGACCATGGT 78916114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTCCATTAGTCTATACACCTGTTTTTATATCAGTAACATGCTGTTTCAGTGACCATGGT 420

 78916115 CTTATAGAATAGTTTGAAGTCTGTCAACGTAATGCCTCCACATTTGTTCTATTTGCTTAG 78916174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTATAGAATAGTTTGAAGTCTGTCAACGTAATGCCTCCACATTTGTTCTATTTGCTTAG 480

 78916175 TTTTGCTTTGGCTCTGTGGGGCACTTTTTTGGTTCTATATGAATATTATAATTTTTTTAG 78916234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTGCTTTGGCTCTGTGGGGCACTTTTTTGGTTCTATATGAATATTATAATTTTTTTAG 540

 78916235 TTTCTTGAAAAATGATGGTGGTATCTTGATGGGAATTGCATTGAATTTGTAGATAGCTTT 78916294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTCTTGAAAAATGATGGTGGTATCTTGATGGGAATTGCATTGAATTTGTAGATAGCTTT 600

 78916295 TGGCAGTATAGTCATTTTCACAATATTGATTCTACCCATCCATGTGTATGGGATGTGTTT 78916354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGCAGTATAGTCATTTTCACAATATTGATTCTACCCATCCATGTGTATGGGATGTGTTT 660

 78916355 CCATTTGTTTGTGTCATCTATGATTTCTTTCAGCAGTGTTTTGTAGTTTTTCTTGTAGAG 78916414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCATTTGTTTGTGTCATCTATGATTTCTTTCAGCAGTGTTTTGTAGTTTTTCTTGTAGAG 720

 78916415 GTCAAGTATATTCCCAAGTATTTTATTTCTTCACAGCTATTGTAAAAGGGCTTGTGTTTT 78916474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTCAAGTATATTCCCAAGTATTTTATTTCTTCACAGCTATTGTAAAAGGGCTTGTGTTTT 780

 78916475 TTGATTCTCAGCTTGGTTGCTGTTGGTGTATAGCAGGGCTACTGATTTATGTACATTAAG 78916534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGATTCTCAGCTTGGTTGCTGTTGGTGTATAGCAGGGCTACTGATTTATGTACATTAAG 840

 78916535 TTTGCATCCTGAAAGTTTGCTGAATTCATTTATTAGTTCTAGGAGCTTTTAGGATAATCT 78916594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTGCATCCTGAAAGTTTGCTGAATTCATTTATTAGTTCTAGGAGCTTTTAGGATAATCT 900

 78916595 TTAGGGCTTTCTAGGTATATGATCATGTCATCAGCAAAGAGGAACAGTTTGACTTCCTCT 78916654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAGGGCTTTCTAGGTATATGATCATGTCATCAGCAAAGAGGAACAGTTTGACTTCCTCT 960

 78916655 TTACCGATTTGGATGCCTTTATATCATTCTCTTGTCTGATTGCTCAGGCTAGGGCTTCCA 78916714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTACCGATTTGGATGCCTTTATATCATTCTCTTGTCTGATTGCTCAGGCTAGGGCTTCCA 1020

 78916715 GTACTATATTGAAGAGAAATGGTGAAAATGTGCATTTTTGTCTTCCTCCAGTTCTCAGGG 78916774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTACTATATTGAAGAGAAATGGTGAAAATGTGCATTTTTGTCTTCCTCCAGTTCTCAGGG 1080

 78916775 GTAATGTTTTCAACTTTTCCCAGGTCAGTATAATGATGTCTGTGTGTTTGTCATAGTTGG 78916834
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTAATGCTTTCAACTTTTCCCAGGTCAGTATAATGATGTCTGTGTGTTTGTCATAGTTGG 1140

 78916835 CTTTTATTACCTTAAGGTATGTCCCTTCTATGCCAATTTTGCTGAGGGTTTTAGTCATAA 78916894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTTATTACCTTAAGGTATGTCCCTTCTATGCCAATTTTGCTGAGGGTTTTAGTCATAA 1200

 78916895 AGGGATGCTGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGAGTCTATTGAGATGATCATGTGATTTT 78916954
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1201 AGGGATGCTGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGAGTCTATTGAGATGATCACGTGATTTT 1260

 78916955 TGTTTTTACTTCTGTTTGTGAGGTGTATCACATTTATTGACTTGCATATGTTAAACCATT 78917014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTTTTTACTTCTGTTTGTGAGGTGTATCACATTTATTGACTTGCATATGTTAAACCATT 1320

 78917015 CCTGCATTCCTGGTCTCTAACACACTTGATCATGGCAGATTATCTTTTTGGTATGCTATT 78917074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1321 CCTGCATTCCTGGTCTCTAACACACTTGATCATGGCAGATTATCTTTTTGATATGCTATT 1380

 78917075 GGATTCAGTTAGCGAGTAATTTGTTGAGGATTTTTGCATATGTTCATCAGGAATATTATT 78917134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGATTCAGTTAGCGAGTAATTTGTTGAGGATTTTTGCATATGTTCATCAGGAATATTATT 1440

 78917135 CTGTAGTTTTATTTTCTGTTATGTCCTTTCTTGTTTTGGGTATTATGGTGATACTGGATT 78917194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGTAGTTTTATTTTCTGTTATGTCCTTTCTTGTTTTGGGTATTATGGTGATACTGGATT 1500

 78917195 CATAGAATGACTTACAAAAGATTCCTTCTTTCTCTATCTTGTGGAATAGTGTCCATAGTA 78917254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CATAGAATGACTTACAAAAGATTCCTTCTTTCTCTATCTTGTGGAATAGTGTCCATAGTA 1560

 78917255 CTGGTACCAATTCTTCTTTGAATGCCTGATAAAATTCATCTGTGAATCCATCTGGTAGTG 78917314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGGTACCAATTCTTCTTTGAATGCCTGATAAAATTCATCTGTGAATCCATCTGGTAGTG 1620

 78917315 AACATTTTTTTGTTAGTAATATTTTAATTACCATTTTAATCTTGCTGCTTGTTATTGGTG 78917374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACATTTTTTTGTTAGTAATATTTTAATTACCATTTTAATCTTGCTGCTTGTTATTGGTG 1680

 78917375 TGTTCAGAGTTTCTATTTCTTCCTGGTTTAATCTAGAAGTGTTGTATATTTACAGAAATG 78917434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGTTCAGAGTTTCTATTTCTTCCTGGTTTAATCTAGAAGTGTTGTATATTTACAGAAATG 1740

 78917435 TATCCATCTCCTCCAGGTTTTCTAGATTATACAAGTAAATGTGTTCATAGTAGCCTGGTA 78917494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATCCATCTCCTCCAGGTTTTCTAGATTATACAAGTAAATGTGTTCATAGTAGCCTGGTA 1800

 78917495 TTTTTGTATTAATTGCACACATTCTCTTTTTTATCTTCCCCCTTTTGTGCATTTTCTTGT 78917554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTTGTATTAATTGCACACATTCTCTTTTTTATCTTCCCCCTTTTGTGCATTTTCTTGT 1860

 78917555 TTTATTTATACTTTTATATTTTATTTCTCTCCACTTTTGGCATATCAGTTTTATTTATTT 78917614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTATTTATACTTTTATATTTTATTTCTCTCCACTTTTGGCATATCAGTTTTATTTATTT 1920

 78917615 TAAATTATTTTGGAGATTGTCAAGAGCTCATAAAACACATTTCTCACTAAGCTATGTGCT 78917674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAAATTATTTTGGAGATTGTCAAGAGCTCATAAAACACATTTCTCACTAAGCTATGTGCT 1980

 78917675 TTAAACAATTACTATGCCACTTCACAAGTAGTACAACTAACTTTTAAGAGAATCTCCCTA 78917734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTAAACAATTACTATGCCACTTCACAAGTAGTACAACTAACTTTTAAGAGAATCTCCCTA 2040

 78917735 CATTATTTCTCATTTCCTTTATAAAATTATTGTCATTCATTTCACATATTCATATATTAG 78917794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATTATTTCTCATTTCCTTTATAAAATTATTGTCATTCATTTCACATATTCATATATTAG 2100

 78917795 AATGAATTAATACCTTGTTACTCTTATTACTTTGAACATATAGTTATCTATAACATCAAT 78917854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATGAATTAATACCTTGTTACTCTTATTACTTTGAACATATAGTTATCTATAACATCAAT 2160

 78917855 TTAAAAAATGTTTTATATTTCATCTAATTATTCATCAGTTATATTCTTTATATTGATCTG 78917914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTAAAAAATGTTTTATATTTCATCTAATTATTCATCAGTTATATTCTTTATATTGATCTG 2220

 78917915 AGTTTTGACCTATGTCATTTTCTTGTTATTTGAGAGACTTCCTTTAACATTTCTTGCAGG 78917974
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGTTTTGACCTACGTCATTTTCTTGTTATTTGAGAGACTTCCTTTAACATTTCTTGCAGG 2280

 78917975 GCATATTTACTGGTGATACATTACCTTGGTTTTTCTTTTTCTGAGAAAAGTACTTGTCCT 78918034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCATATTTACTGGTGATACATTACCTTGGTTTTTCTTTTTCTGAGAAAAGTACTTGTCCT 2340

 78918035 TCACATTTGGAGGAAAATTTCACTGGATAGAGAATTTTATGTGTGTGTTTTATTCTTTCA 78918094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCACATTTGGAGGAAAATTTCACTGGATAGAGAATTTTATGTGTGTGTTTTATTCTTTCA 2400

 78918095 ACGCTGTAAATATTTCACCATACCCTCTTCATAATTGCATAATTTCTGGTGAAAAATCTG 78918154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACGCTGTAAATATTTCACCATACCCTCTTCATAATTGCATAATTTCTGGTGAAAAATCTG 2460

 78918155 ATGTAATTCCTTTATTTGACCTAGAGGTCAACAGCTTTTATTTTTCCTTATTGTATTTTC 78918214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATGTAATTCCTTTATTTGACCTAGAGGTCAACAGCTTTTATTTTTCCTTATTGTATTTTC 2520

 78918215 CAAGATTTCCCCTGTCTTTAATTTTTATCAATTTTATTATTATATGCTTAGGTACTTATA 78918274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAAGATTTCCCCTGTCTTTAATTTTTATCAATTTTATTATTATATGCTTAGGTACTTATA 2580

 78918275 TTTAATGTATTTATCCTGATTGGCATTTTATGACCTTTCTGGATCTGTAGTTTATTATTT 78918334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTAATGTATTTATCCTGATTGGCATTTTATGACCTTTCTGGATCTGTAGTTTATTATTT 2640

 78918335 GTCACTAATTTTGGAAAAGTTTCAGCTTTATTAATTCATTTTTATTTTTCTGCTGCTTTA 78918394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTCACTAATTTTGGAAAAGTTTCAGCTTTATTAATTCATTTTTATTTTTCTGCTGCTTTA 2700

 78918395 TTTTTCTCTTTTTTTCTCTGGTGTTCCCATTATATATATTTGACACCTTCTTAAATTGCT 78918454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTTTCTCTTTTTTTCTCTGGTGTTCCCATTATATATATTTGACACCTTCTTAAATTGCT 2760

 78918455 TTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTA 78918514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTA 2820

 78918515 AAATTTCTATTGACATGCTTTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATAC 78918574
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAATTTCTATTGACATGCCTTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATAC 2880

 78918575 TAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATAT 78918634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATAT 2940

 78918635 TTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAGT 78918694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAGT 3000

 78918695 ATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGC 78918754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGC 3060

 78918755 AGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAAG 78918814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAAG 3120

 78918815 TACCTCTGCTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAGA 78918874
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TACCTCTACTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAGA 3180

 78918875 CGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCAT 78918934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCAT 3240

 78918935 TTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGCC 78918994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGCC 3300

 78918995 CAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCT 78919054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCT 3360

 78919055 TCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAAA 78919114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAAA 3420

 78919115 TATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGA 78919174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGA 3480

 78919175 AAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAA 78919234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAA 3540

 78919235 AATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCA 78919294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCA 3600

 78919295 CATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAG 78919354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAG 3660

 78919355 CAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAA 78919414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAA 3720

 78919415 CTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACA 78919474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACA 3780

 78919475 GAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAA 78919534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAA 3840

 78919535 TGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGA 78919594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGA 3900

 78919595 ACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGA 78919654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGA 3960

 78919655 AGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCT 78919714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCT 4020

 78919715 TTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCA 78919774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCA 4080

 78919775 AAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAACAAGAATTTAACAACAAAGACCA 78919834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4081 AAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAGCAAGAATTTAACAACAAAGACCA 4140

 78919835 TACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCAC 78919894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCAC 4200

 78919895 AAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGC 78919954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGC 4260

 78919955 TCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGA 78920014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGA 4320

 78920015 ATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACC 78920074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACC 4380

 78920075 CAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTT 78920134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTT 4440

 78920135 CTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAG 78920194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAG 4500

 78920195 TAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACA 78920254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACA 4560

 78920255 GAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAA 78920314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAA 4620

 78920315 AGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACT 78920374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACT 4680

 78920375 TGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTG 78920434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTG 4740

 78920435 ACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCC 78920494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCC 4800

 78920495 CAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAG 78920554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAG 4860

 78920555 CTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAG 78920614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAG 4920

 78920615 AAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACT 78920674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACT 4980

 78920675 ATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTT 78920734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 ATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTT 5040

 78920735 GGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGA 78920794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGA 5100

 78920795 TAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTT 78920854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTT 5160

 78920855 TAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCA 78920914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCA 5220

 78920915 TCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAAT 78920974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAAT 5280

 78920975 AAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATA 78921034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATA 5340

 78921035 GAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTT 78921094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTT 5400

 78921095 ATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATT 78921154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATT 5460

 78921155 AATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGA 78921214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGA 5520

 78921215 AGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAAT 78921274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAAT 5580

 78921275 TTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAG 78921334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAG 5640

 78921335 AAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAA 78921394
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 AAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAA 5700

 78921395 AAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAG 78921454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAG 5760

 78921455 CTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGA 78921514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGA 5820

 78921515 TTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACT 78921574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACT 5880

 78921575 CTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCT 78921634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCT 5940

 78921635 CCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAAT 78921694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAAT 6000

 78921695 TGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGC 78921754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGC 6060

 78921755 TGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAG 78921814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAG 6120

 78921815 AGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCA 78921874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 AGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCA 6180

 78921875 GAGACATAATGAAGA 78921889
          |||||||||||||||
     6181 GAGACATAATGAAGA 6195

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6331 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 6390

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6391 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 6450

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6451 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 6510

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6511 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 6570

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6571 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 6630

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     6631 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 6687

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6688 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 6747

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6748 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 6807

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6808 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 6867

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6868 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 6927

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6928 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 6987

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6988 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 7047

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7048 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 7107

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7108 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 7167

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7168 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 7227

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7228 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 7287

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7288 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 7347

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7348 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 7407

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7408 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 7467

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7468 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 7527

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7528 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 7587

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7588 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 7647

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     7648 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 7707

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7708 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 7767

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACA 78927570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7768 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACA 7821

Alignment time is 10.713 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    8129] =>      8129 nucs 'mol-32-2afd-051960_8129'

Score:        7814
Aligned:      8002        nucs
Identic:      7980 (100%) nucs =>      2788 (100%)      5192 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78919100,78921889] EXCISED REGION [78926077,78931284]
 second seq =>  [       1,    2790] EXCISED REGION [    2926,    8129]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [2791,2925]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78919100 AGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTT 78919159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTT 60

 78919160 TGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATG 78919219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATG 120

 78919220 AGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAA 78919279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAA 180

 78919280 AATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAA 78919339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAA 240

 78919340 TCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATG 78919399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATG 300

 78919400 AAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTA 78919459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTA 360

 78919460 AGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGA 78919519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGA 420

 78919520 TCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGG 78919579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGG 480

 78919580 GAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCT 78919639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCT 540

 78919640 AATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTG 78919699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTG 600

 78919700 GTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCC 78919759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCC 660

 78919760 CAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAACAAGAATT 78919819
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      661 CAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAGCAAGAATT 720

 78919820 TAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATG 78919879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATG 780

 78919880 AGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTA 78919939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTA 840

 78919940 AATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATA 78919999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATA 900

 78920000 GACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAAC 78920059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAAC 960

 78920060 TCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAG 78920119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAG 1020

 78920120 ATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAA 78920179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAA 1080

 78920180 ATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTT 78920239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTT 1140

 78920240 GAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAG 78920299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAG 1200

 78920300 AAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAG 78920359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAG 1260

 78920360 AGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATC 78920419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATC 1320

 78920420 TCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATA 78920479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATA 1380

 78920480 CAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAA 78920539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAA 1440

 78920540 AAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATC 78920599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATC 1500

 78920600 CCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAA 78920659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAA 1560

 78920660 GAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTG 78920719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTG 1620

 78920720 AAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTG 78920779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTG 1680

 78920780 ACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTA 78920839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTA 1740

 78920840 ACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAA 78920899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAA 1800

 78920900 TACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCAC 78920959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCAC 1860

 78920960 AAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCAC 78921019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCAC 1920

 78921020 AGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATG 78921079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATG 1980

 78921080 GAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATT 78921139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATT 2040

 78921140 TAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCC 78921199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCC 2100

 78921200 AAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGA 78921259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGA 2160

 78921260 TCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAG 78921319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAG 2220

 78921320 TGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTG 78921379
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2221 TGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTG 2280

 78921380 CAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAA 78921439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAA 2340

 78921440 TTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAAT 78921499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAAT 2400

 78921500 CAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGA 78921559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGA 2460

 78921560 ATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGG 78921619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGG 2520

 78921620 GGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAAT 78921679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAAT 2580

 78921680 ATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCT 78921739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCT 2640

 78921740 AAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTT 78921799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTT 2700

 78921800 TAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAA 78921859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAA 2760

 78921860 TACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 2790

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 2985

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 3045

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 3105

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 3165

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 3225

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     3226 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 3282

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 3342

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 3402

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 3462

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 3522

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 3582

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 3642

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 3702

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 3762

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 3822

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 3882

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 3942

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 4002

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 4062

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 4122

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 4182

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 4242

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4243 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 4302

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 4362

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 4422

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 4482

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4483 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 4542

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 4602

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 4662

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 4722

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 4782

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 4840

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 4900

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 4960

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 5020

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 5080

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 5140

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 5200

 78928355 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 78928414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 5260

 78928415 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 78928474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 5320

 78928475 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 78928534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 5380

 78928535 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 78928594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 5440

 78928595 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 78928654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 5500

 78928655 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 78928714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 5560

 78928715 GGTGTTGAA-TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTC 78928773
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5561 GGTGTTGAATTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTC 5620

 78928774 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 78928833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 5680

 78928834 CATCCCAGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 78928893
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 CATCCCCGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 5740

 78928894 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 78928953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 5800

 78928954 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 78929013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5801 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 5860

 78929014 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 78929073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5861 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 5920

 78929074 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCAATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 78929133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5921 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCCATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 5980

 78929134 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 78929193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5981 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 6040

 78929194 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 78929253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6041 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 6100

 78929254 TTTAGTTTATTGGTA-ATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 78929312
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6101 TTTAGTTTATTGGTATATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 6160

 78929313 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 78929372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6161 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 6220

 78929373 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 78929432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6221 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 6280

 78929433 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 78929492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6281 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 6340

 78929493 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 78929552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6341 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 6400

 78929553 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 78929612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6401 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 6460

 78929613 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 78929672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6461 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 6520

 78929673 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 78929732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6521 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 6580

 78929733 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 78929792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6581 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 6640

 78929793 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 78929852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6641 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 6700

 78929853 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 78929912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6701 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 6760

 78929913 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 78929972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6761 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 6820

 78929973 ATATATATACACACAAATACATATATATATATAATATATTGTTAGAAGAAAGAAACAAAT 78930032
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6821 ATATATATACACACAAATAC--ATATATATATAATATATTGTTAGAAGAAAGAAACAAAT 6878

 78930033 TTTTATGCTTCATGTCATATAAAATAATTATCATAATAAAAAGATTTTTAAAGTGGTGTA 78930092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6879 TTTTATGCTTCATGTCATATAAAATAATTATCATAATAAAAAGATTTTTAAAGTGGTGTA 6938

 78930093 AAAGCTCAGTGATAACTTTGAATATAAATGGATTAATTTCCTGTATTATTAGACTGGCTT 78930152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6939 AAAGCTCAGTGATAACTTTGAATATAAATGGATTAATTTCCTGTATTATTAGACTGGCTT 6998

 78930153 TAACAAGAAAATTCCATCTACATATTTTTAACAACAACCACAAAAATTATAATAAAGAAA 78930212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6999 TAACAAGAAAATTCCATCTACATATTTTTAACAACAACCACAAAAATTATAATAAAGAAA 7058

 78930213 GGGTTACAATGAATGAATGTTTACAGAGAAATTAGGCAAAGCTGAAGCAACTATGAAAAT 78930272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7059 GGGTTACAATGAATGAATGTTTACAGAGAAATTAGGCAAAGCTGAAGCAACTATGAAAAT 7118

 78930273 ACCAATAGAAGATACAGTAGAAGTCATGAAATAAACTCTAAAATGACTTGAAATCATTAT 78930332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7119 ACCAATAGAAGATACAGTAGAAGTCATGAAATAAACTCTAAAATGACTTGAAATCATTAT 7178

 78930333 TTATTTATATTGACAGAATATGTAGTTTCTATTCAATGTGAATGTAAAAATTGATTAATA 78930392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7179 TTATTTATATTGACAGAATATGTAGTTTCTATTCAATGTGAATGTAAAAATTGATTAATA 7238

 78930393 TTAGCATTTGCTATTTATATTTAAAATATTGGAAATGAGGAGAGCAAGATAAAATACATT 78930452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7239 TTAGCATTTGCTATTTATATTTAAAATATTGGAAATGAGGAGAGCAAGATAAAATACATT 7298

 78930453 TTTAATGAGAACACTTTCAGTCTTTTTATCTTTAACAGATCCAGAAGACAATATATGGAT 78930512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7299 TTTAATGAGAACACTTTCAGTCTTTTTATCTTTAACAGATCCAGAAGACAATATATGGAT 7358

 78930513 AATATAATCAATACTGTAAACTTGAGTAATGTAGATAAGGTATATTGGTTAAAGTACATG 78930572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7359 AATATAATCAATACTGTAAACTTGAGTAATGTAGATAAGGTATATTGGTTAAAGTACATG 7418

 78930573 TCATTATACTATACAAAACCCCAAAGAACAGTAGCTAAAATAATATATTTTTCATTCCAT 78930632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7419 TCATTATACTATACAAAACCCCAAAGAACAGTAGCTAAAATAATATATTTTTCATTCCAT 7478

 78930633 ATAACAACATGAATTTCATAAGCAGTGCAGAGGAGGAACAAAGTCCTGTTTTGGATAAAT 78930692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7479 ATAACAACATGAATTTCATAAGCAGTGCAGAGGAGGAACAAAGTCCTGTTTTGGATAAAT 7538

 78930693 ATCCAGGTAGTAAACTTTCCTCTTCTAACTTGTTTCTCTGCTTGATTGAAGCTAGCTCAT 78930752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7539 ATCCAGGTAGTAAACTTTCCTCTTCTAACTTGTTTCTCTGCTTGATTGAAGCTAGCTCAT 7598

 78930753 CATGACTACATTTGCACATTTTATTACAGAGGAGAGGACGAAGAGAAATTGCAGTAGAAG 78930812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7599 CATGACTACATTTGCACATTTTATTACAGAGGAGAGGACGAAGAGAAATTGCAGTAGAAG 7658

 78930813 TAGTTTTCTGTGTAAAATATAAGATCAAGGATTTACACACATCACTTGTCTTCATAGCCT 78930872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7659 TAGTTTTCTGTGTAAAATATAAGATCAAGGATTTACACACATCACTTGTCTTCATAGCCT 7718

 78930873 ATTTGCCAGAACTAAGTTGGATGCCCACAACTGTAAGGAATGGTGGAAAAGTCGGAAGCT 78930932
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7719 ATTTGCCAGAACTAAGTCGGATGCCCACAACTGTAAGGAATGGTGGAAAAGTCGGAAGCT 7778

 78930933 GTGCAAAGTAGCTAAACTGGGGGGGGAGTGGGAGTACAGGTTGCCAGTAGGTTCAAAGGA 78930992
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7779 GTGCAAAGTAGCTAAACT-GGGGGGGAGTGGGAGTACAGGTTGCCAGTAGGTTCAAAGGA 7837

 78930993 AAATAACACTTCAAGAGAATTGGAAGTCTCTACCACTGAGTGCTTCTCATTTATGAAACT 78931052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7838 AAATAACACTTCAAGAGAATTGGAAGTCTCTACCACTGAGTGCTTCTCATTTATGAAACT 7897

 78931053 GCTTTATGGCATCTGCATAGGAAATTTTGACAGTTTCTACCAAGTGCCACTAAGACACAT 78931112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7898 GCTTTATGGCATCTGCATAGGAAATTTTGACAGTTTCTACCAAGTGCCACTAAGACACAT 7957

 78931113 AAATATCATAAATATCCAGAAAACATTGAAAAATCACAAACACAGATAACTAACAGTGAC 78931172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7958 AAATATCATAAATATCCAGAAAACATTGAAAAATCACAAACACAGATAACTAACAGTGAC 8017

 78931173 ATACAATCTGGTGCCAAATTTTGAAGTGAAAGTCATTGTTTCCCTAAGTGTACTATAAAA 78931232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8018 ATACAATCTGGTGCCAAATTTTGAAGTGAAAGTCATTGTTTCCCTAAGTGTACTATAAAA 8077

 78931233 CACTCTTCTAACAGATATTAATATGAATTCTGAGAGAAGAATTGTTCTGTAC 78931284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8078 CACTCTTCTAACAGATATTAATATGAATTCTGAGAGAAGAATTGTTCTGTAC 8129

Alignment time is 11.063 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2790] =>      2790 nucs 'mol-32-2afd-051960_2790'

Score:        2778
Aligned:      2789        nucs
Identic:      2788 (100%) nucs =>       711 (100%)      2077 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78919100,78919810] EXCISED REGION [78919812,78921889]
 second seq =>  [       1,     711] EXCISED REGION [     713,    2790]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [78919811,78919811]
 second seq =>         1 nucs [712,712]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [78919810,78919810] to [78919811,78919811]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78919100 AGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTT 78919159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTT 60

 78919160 TGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATG 78919219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATG 120

 78919220 AGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAA 78919279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAA 180

 78919280 AATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAA 78919339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAA 240

 78919340 TCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATG 78919399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATG 300

 78919400 AAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTA 78919459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTA 360

 78919460 AGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGA 78919519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGA 420

 78919520 TCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGG 78919579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGG 480

 78919580 GAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCT 78919639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCT 540

 78919640 AATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTG 78919699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTG 600

 78919700 GTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCC 78919759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCC 660

 78919760 CAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGA 78919810
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGA 711

EXCISED REGION

 78919812 CAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCT 78919871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 CAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCT 772

 78919872 CCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCT 78919931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 CCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCT 832

 78919932 TACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTG 78919991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTG 892

 78919992 AAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAA 78920051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 AAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAA 952

 78920052 GTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGAC 78920111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 GTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGAC 1012

 78920112 AAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATAC 78920171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 AAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATAC 1072

 78920172 AATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACT 78920231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 AATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACT 1132

 78920232 GGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAA 78920291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 GGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAA 1192

 78920292 CGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAG 78920351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 CGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAG 1252

 78920352 GTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTT 78920411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 GTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTT 1312

 78920412 TCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAG 78920471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 TCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAG 1372

 78920472 ACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGC 78920531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 ACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGC 1432

 78920532 AAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAG 78920591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 AAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAG 1492

 78920592 ACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTG 78920651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 ACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTG 1552

 78920652 CAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTA 78920711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 CAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTA 1612

 78920712 GATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCA 78920771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 GATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCA 1672

 78920772 CCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACT 78920831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 CCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACT 1732

 78920832 TAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAA 78920891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 TAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAA 1792

 78920892 CCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGC 78920951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 CCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGC 1852

 78920952 TTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTAT 78921011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 TTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTAT 1912

 78921012 CAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAA 78921071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 CAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAA 1972

 78921072 AATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGA 78921131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 AATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGA 2032

 78921132 CAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGG 78921191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 CAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGG 2092

 78921192 ATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGT 78921251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 ATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGT 2152

 78921252 TAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAA 78921311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 TAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAA 2212

 78921312 AAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAA 78921371
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2213 AAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAA 2272

 78921372 TTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACAT 78921431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 TTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACAT 2332

 78921432 AAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATA 78921491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 AAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATA 2392

 78921492 AGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATC 78921551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 AGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATC 2452

 78921552 CTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAA 78921611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 CTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAA 2512

 78921612 AAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAAT 78921671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 AAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAAT 2572

 78921672 AGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGC 78921731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 AGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGC 2632

 78921732 CCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGA 78921791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 CCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGA 2692

 78921792 AACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCAT 78921851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 AACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCAT 2752

 78921852 CAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 CAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 2790

Alignment time is 3.83737 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2901] =>      2901 nucs 'mol-32-2e0a-005224_2901'

Score:        2695
Aligned:      2771        nucs
Identic:      2760 (100%) nucs =>       475 (100%)      2285 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78921415,78921889] EXCISED REGION [78926077,78928370]
 second seq =>  [       1,     475] EXCISED REGION [     611,    2901]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [476,610]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78921415 TTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAA 78921474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAA 60

 78921475 ATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCA 78921534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCA 120

 78921535 CAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAA 78921594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAA 180

 78921595 ATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAG 78921654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAG 240

 78921655 AAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCC 78921714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCC 300

 78921715 TATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACA 78921774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACA 360

 78921775 AAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCA 78921834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCA 420

 78921835 TTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 475

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 670

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 730

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 790

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 850

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 910

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
      911 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 967

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 1027

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 1087

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 1147

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 1207

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 1267

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 1327

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 1387

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 1447

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 1507

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 1567

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1627

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1687

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1747

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1807

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 1867

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 1927

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1928 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 1987

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 2047

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 2107

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 2167

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2168 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 2227

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 2287

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 2347

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 2407

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 2467

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 2525

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 2585

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 2645

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 2705

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 2765

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 2825

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 2885

 78928355 AGGGGAACATCACACA 78928370
          ||||||||||||||||
     2886 AGGGGAACATCACACA 2901

Alignment time is 3.97736 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4941] =>      4941 nucs 'mol-32-2e0a-124184_4941'

Score:        4728
Aligned:      4809        nucs
Identic:      4800 (100%) nucs =>      3431 (100%)      1369 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78918454,78921889] EXCISED REGION [78926077,78927449]
 second seq =>  [       1,    3436] EXCISED REGION [    3572,    4941]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [3437,3571]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78918454 TTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCTCTTTGCATTTTAGTTTTTTT 78918513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCTCTTTGCATTTTAGTTTTTTT 60

 78918514 AAAATTTCTATTGACATGCTTTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATA 78918573
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAATTTCTATTGACATGCCTTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATA 120

 78918574 CTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATA 78918633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATA 180

 78918634 TTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAG 78918693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAG 240

 78918694 TATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAG 78918753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAG 300

 78918754 CAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAA 78918813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAA 360

 78918814 GTACCTCTGCTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAG 78918873
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTACCTCTACTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAG 420

 78918874 ACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCA 78918933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCA 480

 78918934 TTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGC 78918993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGC 540

 78918994 CCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTC 78919053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTC 600

 78919054 TTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAA 78919113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAA 660

 78919114 ATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAG 78919173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAG 720

 78919174 AAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTA 78919233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTA 780

 78919234 AAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGC 78919293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGC 840

 78919294 ACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAA 78919353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAA 900

 78919354 GCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACA 78919413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACA 960

 78919414 ACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCAC 78919473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCAC 1020

 78919474 AGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAA 78919533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAA 1080

 78919534 ATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGG 78919593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGG 1140

 78919594 AACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCG 78919653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCG 1200

 78919654 AAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATC 78919713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATC 1260

 78919714 TTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACC 78919773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACC 1320

 78919774 AAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAACAAGAATTTAACAACAAAGACC 78919833
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1321 AAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAGCAAGAATTTAACAACAAAGACC 1380

 78919834 ATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCA 78919893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCA 1440

 78919894 CAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAG 78919953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAG 1500

 78919954 CTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAG 78920013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAG 1560

 78920014 AATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAAC 78920073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAAC 1620

 78920074 CCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACT 78920133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACT 1680

 78920134 TCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGA 78920193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGA 1740

 78920194 GTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGAC 78920253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGAC 1800

 78920254 AGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAA 78920313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAA 1860

 78920314 AAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAAC 78920373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAAC 1920

 78920374 TTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATT 78920433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATT 1980

 78920434 GACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCC 78920493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCC 2040

 78920494 CCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTA 78920553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTA 2100

 78920554 GCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAA 78920613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAA 2160

 78920614 GAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAAC 78920673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAAC 2220

 78920674 TATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCT 78920733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCT 2280

 78920734 TGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAG 78920793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAG 2340

 78920794 ATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATT 78920853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATT 2400

 78920854 TTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTC 78920913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTC 2460

 78920914 ATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAA 78920973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAA 2520

 78920974 TAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATAT 78921033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATAT 2580

 78921034 AGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCT 78921093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCT 2640

 78921094 TATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAAT 78921153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAAT 2700

 78921154 TAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAG 78921213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAG 2760

 78921214 AAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAA 78921273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAA 2820

 78921274 TTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCA 78921333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCA 2880

 78921334 GAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTA 78921393
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTA 2940

 78921394 AAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTA 78921453
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2941 AAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGATAAACCATTA 3000

 78921454 GCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAG 78921513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAG 3060

 78921514 ATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAAC 78921573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAAC 3120

 78921574 TCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATC 78921633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATC 3180

 78921634 TCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAA 78921693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAA 3240

 78921694 TTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAG 78921753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAG 3300

 78921754 CTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAA 78921813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAA 3360

 78921814 GAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGC 78921873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGC 3420

 78921874 AGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||
     3421 AGAGACATAATGAAGA 3436

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 3631

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 3691

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3692 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 3751

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3752 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 3811

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3812 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 3871

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     3872 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 3928

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 3988

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 4048

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 4108

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 4168

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4169 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 4228

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4229 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 4288

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4289 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 4348

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4349 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 4408

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4409 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 4468

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4469 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 4528

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4529 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 4588

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4589 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 4648

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4649 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 4708

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4709 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 4768

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4769 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 4828

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4829 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 4888

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCT 78927449
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4889 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCT 4941

Alignment time is 6.76869 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    7511] =>      7511 nucs 'mol-32-2e57-015946_7511'

Score:        7195
Aligned:      7381        nucs
Identic:      7360 (100%) nucs =>      3451 (100%)      3909 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78918434,78921889] EXCISED REGION [78926077,78929997]
 second seq =>  [       1,    3456] EXCISED REGION [    3592,    7511]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [3457,3591]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78918434 TTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCT 78918493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCT 60

 78918494 CTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCTTTTAAGCTCCATGATTGTTT 78918553
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
       61 CTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCCTTTAAGCTCCATGATTGTTT 120

 78918554 TCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAG 78918613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAG 180

 78918614 TGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTA 78918673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTA 240

 78918674 CATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGC 78918733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGC 300

 78918734 TTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACT 78918793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACT 360

 78918794 AACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTGCTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAA 78918853
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTACTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAA 420

 78918854 CACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAG 78918913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAG 480

 78918914 CAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTA 78918973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTA 540

 78918974 TCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGT 78919033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGT 600

 78919034 TGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATC 78919093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATC 660

 78919094 TCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACA 78919153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACA 720

 78919154 TTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAA 78919213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAA 780

 78919214 AAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAG 78919273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAG 840

 78919274 AACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCAT 78919333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCAT 900

 78919334 ATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGAT 78919393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGAT 960

 78919394 TGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAG 78919453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAG 1020

 78919454 CCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTC 78919513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTC 1080

 78919514 AACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGC 78919573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGC 1140

 78919574 TGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGG 78919633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGG 1200

 78919634 GCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAAT 78919693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAAT 1260

 78919694 CTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATC 78919753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATC 1320

 78919754 AGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAACA 78919813
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1321 AGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAGCA 1380

 78919814 AGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCC 78919873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCC 1440

 78919874 AAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTA 78919933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTA 1500

 78919934 CCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAA 78919993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAA 1560

 78919994 ATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGT 78920053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGT 1620

 78920054 TGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAA 78920113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAA 1680

 78920114 AAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAA 78920173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAA 1740

 78920174 TTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGG 78920233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGG 1800

 78920234 CTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACG 78920293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACG 1860

 78920294 TCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGT 78920353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGT 1920

 78920354 AAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTC 78920413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTC 1980

 78920414 CAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGAC 78920473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGAC 2040

 78920474 ATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAA 78920533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAA 2100

 78920534 AATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGAC 78920593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGAC 2160

 78920594 TTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCA 78920653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCA 2220

 78920654 ATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGA 78920713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGA 2280

 78920714 TTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACC 78920773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACC 2340

 78920774 CCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTA 78920833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTA 2400

 78920834 AACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACC 78920893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACC 2460

 78920894 ACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTT 78920953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTT 2520

 78920954 GGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCA 78921013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCA 2580

 78921014 GACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAA 78921073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAA 2640

 78921074 TACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACA 78921133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACA 2700

 78921134 GATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGAT 78921193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGAT 2760

 78921194 GTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTA 78921253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTA 2820

 78921254 GAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAA 78921313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAA 2880

 78921314 AAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATT 78921373
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2881 AAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATT 2940

 78921374 GTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAA 78921433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAA 3000

 78921434 ATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAG 78921493
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATAAAATTGATAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAG 3060

 78921494 CACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCT 78921553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCT 3120

 78921554 CATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAA 78921613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAA 3180

 78921614 ATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAG 78921673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAG 3240

 78921674 ACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCC 78921733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCC 3300

 78921734 TGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAA 78921793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAA 3360

 78921794 CTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCA 78921853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCA 3420

 78921854 GTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 3456

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 3651

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 3711

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 3771

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 3831

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 3891

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     3892 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 3948

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 4008

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 4068

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 4128

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 4188

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 4248

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 4308

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 4368

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 4428

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 4488

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 4548

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 4608

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 4668

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 4728

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 4788

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 4848

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 4908

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4909 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 4968

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4969 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 5028

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5029 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 5088

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5089 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 5148

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5149 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 5208

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5209 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 5268

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5269 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 5328

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5329 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 5388

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5389 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 5448

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5449 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 5506

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5507 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 5566

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5567 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 5626

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5627 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 5686

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5687 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 5746

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5747 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 5806

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5807 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 5866

 78928355 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 78928414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5867 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 5926

 78928415 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 78928474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5927 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 5986

 78928475 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 78928534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5987 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 6046

 78928535 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 78928594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6047 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 6106

 78928595 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 78928654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6107 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 6166

 78928655 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 78928714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6167 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 6226

 78928715 GGTGTTGAA-TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTC 78928773
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6227 GGTGTTGAATTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTC 6286

 78928774 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 78928833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6287 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 6346

 78928834 CATCCCAGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 78928893
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6347 CATCCCCGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 6406

 78928894 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 78928953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6407 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 6466

 78928954 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 78929013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6467 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 6526

 78929014 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 78929073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6527 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 6586

 78929074 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCAATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 78929133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6587 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCCATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 6646

 78929134 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 78929193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6647 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 6706

 78929194 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 78929253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6707 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 6766

 78929254 TTTAGTTTATTGGTA-ATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 78929312
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6767 TTTAGTTTATTGGTATATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 6826

 78929313 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 78929372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6827 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 6886

 78929373 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 78929432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6887 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 6946

 78929433 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 78929492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6947 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 7006

 78929493 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 78929552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7007 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 7066

 78929553 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 78929612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7067 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 7126

 78929613 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 78929672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7127 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 7186

 78929673 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 78929732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7187 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 7246

 78929733 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 78929792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7247 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 7306

 78929793 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 78929852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7307 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 7366

 78929853 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 78929912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7367 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 7426

 78929913 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 78929972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7427 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 7486

 78929973 ATATATATACACACAAATACATATA 78929997
          |||||||||||||||||||||||||
     7487 ATATATATACACACAAATACATATA 7511

Alignment time is 10.2431 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3456] =>      3456 nucs 'mol-32-2e57-015946_3456'

Score:        3411
Aligned:      3455        nucs
Identic:      3451 (100%) nucs =>        99 (100%)      3352 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78918434,78918532] EXCISED REGION [78918534,78921889]
 second seq =>  [       1,      99] EXCISED REGION [     101,    3456]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [78918533,78918533]
 second seq =>         1 nucs [100,100]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [78918533,78918535] to [78918534,78918536]
 second seq =>         1 nucs [99,99] to [100,100]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78918434 TTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCT 78918493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCT 60

 78918494 CTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGC 78918532
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGC 99

EXCISED REGION

 78918534 TTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGAC 78918593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      101 TTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGAC 160

 78918594 AATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTAC 78918653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      161 AATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTAC 220

 78918654 AGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCA 78918713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      221 AGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCA 280

 78918714 TTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTG 78918773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      281 TTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTG 340

 78918774 ATGGTACTATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTGCTTCTGATATG 78918833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      341 ATGGTACTATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTACTTCTGATATG 400

 78918834 AATATAGACACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAA 78918893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      401 AATATAGACACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAA 460

 78918894 CACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTAT 78918953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      461 CACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTAT 520

 78918954 GTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGA 78919013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 GTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGA 580

 78919014 AGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGT 78919073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 AGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGT 640

 78919074 AGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGT 78919133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 AGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGT 700

 78919134 AATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTAT 78919193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 AATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTAT 760

 78919194 TAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTA 78919253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 TAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTA 820

 78919254 TATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCAC 78919313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 TATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCAC 880

 78919314 TCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAAT 78919373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 TCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAAT 940

 78919374 AATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCA 78919433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 AATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCA 1000

 78919434 AGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGA 78919493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 AGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGA 1060

 78919494 CTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAA 78919553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 CTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAA 1120

 78919554 ATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTG 78919613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 ATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTG 1180

 78919614 AATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAG 78919673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 AATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAG 1240

 78919674 GTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCT 78919733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 GTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCT 1300

 78919734 CAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCT 78919793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 CAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCT 1360

 78919794 CCCAAGAAAAACCGAGAACAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCA 78919853
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 CCCAAGAAAAACCGAGAGCAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCA 1420

 78919854 GAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAA 78919913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 GAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAA 1480

 78919914 AAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCA 78919973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 AAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCA 1540

 78919974 ACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTC 78920033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 ACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTC 1600

 78920034 ATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATA 78920093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 ATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATA 1660

 78920094 ATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTA 78920153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 ATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTA 1720

 78920154 TGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAAT 78920213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 TGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAAT 1780

 78920214 AATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAAT 78920273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 AATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAAT 1840

 78920274 TTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACT 78920333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 TTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACT 1900

 78920334 CATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAA 78920393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 CATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAA 1960

 78920394 TATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAAT 78920453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 TATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAAT 2020

 78920454 ACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGG 78920513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 ACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGG 2080

 78920514 ATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGAC 78920573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 ATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGAC 2140

 78920574 AATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATT 78920633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 AATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATT 2200

 78920634 ACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACAC 78920693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 ACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACAC 2260

 78920694 CCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAA 78920753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 CCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAA 2320

 78920754 TAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTA 78920813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 TAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTA 2380

 78920814 ATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACA 78920873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 ATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACA 2440

 78920874 AAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATT 78920933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 AAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATT 2500

 78920934 CTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAA 78920993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 CTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAA 2560

 78920994 TTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGA 78921053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGA 2620

 78921054 TCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGG 78921113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 TCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGG 2680

 78921114 CTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAA 78921173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 CTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAA 2740

 78921174 TTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAA 78921233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 TTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAA 2800

 78921234 ATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGG 78921293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 ATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGG 2860

 78921294 AACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATT 78921353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 AACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATT 2920

 78921354 AGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGAC 78921413
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 AGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGAC 2980

 78921414 TTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAA 78921473
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 TTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGATAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAA 3040

 78921474 AATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCC 78921533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 AATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCC 3100

 78921534 ACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAA 78921593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 ACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAA 3160

 78921594 AATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAA 78921653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 AATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAA 3220

 78921654 GAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATC 78921713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 GAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATC 3280

 78921714 CTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTAC 78921773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 CTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTAC 3340

 78921774 AAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTC 78921833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 AAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTC 3400

 78921834 ATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 ATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 3456

Alignment time is 4.74869 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    7527] =>      7527 nucs 'mol-32-2edb-180209_7527'

Score:        7214
Aligned:      7389        nucs
Identic:      7369 (100%) nucs =>      3454 (100%)      3915 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78918432,78921889] EXCISED REGION [78926077,78930003]
 second seq =>  [       1,    3458] EXCISED REGION [    3594,    7519]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [3459,3593]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78918432 ATTTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTT 78918491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTT 60

 78918492 CTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCTTTTAAGCTCCATGATTGT 78918551
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
       61 CTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCCTTTAAGCTCCATGATTGT 120

 78918552 TTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTAC 78918611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTAC 180

 78918612 AGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACT 78918671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACT 240

 78918672 TACATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACT 78918731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACT 300

 78918732 GCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACA 78918791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACA 360

 78918792 CTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTGCTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAG 78918851
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTACTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAG 420

 78918852 AACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGA 78918911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGA 480

 78918912 AGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTT 78918971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTT 540

 78918972 TATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAA 78919031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAA 600

 78919032 GTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCA 78919091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCA 660

 78919092 TCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGA 78919151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGA 720

 78919152 CATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATG 78919211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATG 780

 78919212 AAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATA 78919271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATA 840

 78919272 AGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGC 78919331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGC 900

 78919332 ATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAG 78919391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAG 960

 78919392 ATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGC 78919451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGC 1020

 78919452 AGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTT 78919511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTT 1080

 78919512 TCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGG 78919571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGG 1140

 78919572 GCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCT 78919631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCT 1200

 78919632 GGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGA 78919691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGA 1260

 78919692 ATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAA 78919751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAA 1320

 78919752 TCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAA 78919811
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1321 TCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAG 1380

 78919812 CAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCT 78919871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCT 1440

 78919872 CCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCT 78919931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCT 1500

 78919932 TACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTG 78919991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTG 1560

 78919992 AAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAA 78920051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAA 1620

 78920052 GTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGAC 78920111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGAC 1680

 78920112 AAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATAC 78920171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATAC 1740

 78920172 AATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACT 78920231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACT 1800

 78920232 GGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAA 78920291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAA 1860

 78920292 CGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAG 78920351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAG 1920

 78920352 GTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTT 78920411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTT 1980

 78920412 TCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAG 78920471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAG 2040

 78920472 ACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGC 78920531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGC 2100

 78920532 AAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAG 78920591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAG 2160

 78920592 ACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTG 78920651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTG 2220

 78920652 CAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTA 78920711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTA 2280

 78920712 GATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCA 78920771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCA 2340

 78920772 CCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACT 78920831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACT 2400

 78920832 TAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAA 78920891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAA 2460

 78920892 CCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGC 78920951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGC 2520

 78920952 TTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTAT 78921011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTAT 2580

 78921012 CAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAA 78921071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAA 2640

 78921072 AATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGA 78921131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGA 2700

 78921132 CAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGG 78921191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGG 2760

 78921192 ATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGT 78921251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGT 2820

 78921252 TAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAA 78921311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAA 2880

 78921312 AAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAA 78921371
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2881 AAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAA 2940

 78921372 TTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACAT 78921431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACAT 3000

 78921432 AAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATA 78921491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATA 3060

 78921492 AGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATC 78921551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATC 3120

 78921552 CTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAA 78921611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAA 3180

 78921612 AAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAAT 78921671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAAT 3240

 78921672 AGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGC 78921731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGC 3300

 78921732 CCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGA 78921791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGA 3360

 78921792 AACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCAT 78921851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCAT 3420

 78921852 CAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 3458

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 3653

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 3713

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 3773

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 3833

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 3893

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     3894 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 3950

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 4010

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 4070

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 4130

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 4190

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 4250

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 4310

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 4370

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 4430

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 4490

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 4550

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 4610

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 4670

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 4730

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 4790

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 4850

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 4910

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4911 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 4970

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 5030

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 5090

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 5150

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5151 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 5210

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 5270

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5271 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 5330

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5331 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 5390

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5391 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 5450

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5451 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 5508

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5509 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 5568

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5569 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 5628

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5629 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 5688

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5689 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 5748

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5749 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 5808

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5809 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 5868

 78928355 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 78928414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5869 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 5928

 78928415 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 78928474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5929 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 5988

 78928475 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 78928534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5989 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 6048

 78928535 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 78928594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6049 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 6108

 78928595 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 78928654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6109 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 6168

 78928655 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 78928714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6169 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 6228

 78928715 GGTGTTGAA-TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTC 78928773
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6229 GGTGTTGAATTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTC 6288

 78928774 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 78928833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6289 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 6348

 78928834 CATCCCAGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 78928893
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6349 CATCCCCGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 6408

 78928894 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 78928953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6409 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 6468

 78928954 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 78929013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6469 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 6528

 78929014 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 78929073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6529 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 6588

 78929074 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCAATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 78929133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6589 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCCATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 6648

 78929134 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 78929193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6649 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 6708

 78929194 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 78929253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6709 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 6768

 78929254 TTTAGTTTATTGGTA-ATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 78929312
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6769 TTTAGTTTATTGGTATATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 6828

 78929313 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 78929372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6829 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 6888

 78929373 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 78929432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6889 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 6948

 78929433 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 78929492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6949 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 7008

 78929493 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 78929552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7009 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 7068

 78929553 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 78929612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7069 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 7128

 78929613 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 78929672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7129 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 7188

 78929673 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 78929732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7189 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 7248

 78929733 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 78929792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7249 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 7308

 78929793 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 78929852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7309 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 7368

 78929853 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 78929912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7369 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 7428

 78929913 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 78929972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7429 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 7488

 78929973 ATATATATACACACAAATACATATATATATA 78930003
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     7489 ATATATATACACACAAATACATATATATATA 7519

Alignment time is 10.2205 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3458] =>      3458 nucs 'mol-32-2edb-180209_3458'

Score:        3424
Aligned:      3457        nucs
Identic:      3454 (100%) nucs =>       101 (100%)      3353 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78918432,78918532] EXCISED REGION [78918534,78921889]
 second seq =>  [       1,     101] EXCISED REGION [     103,    3458]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [78918533,78918533]
 second seq =>         1 nucs [102,102]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [78918533,78918535] to [78918534,78918536]
 second seq =>         1 nucs [101,101] to [102,102]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78918432 ATTTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTT 78918491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTT 60

 78918492 CTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGC 78918532
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGC 101

EXCISED REGION

 78918534 TTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGAC 78918593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      103 TTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGAC 162

 78918594 AATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTAC 78918653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      163 AATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTAC 222

 78918654 AGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCA 78918713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      223 AGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCA 282

 78918714 TTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTG 78918773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      283 TTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTG 342

 78918774 ATGGTACTATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTGCTTCTGATATG 78918833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      343 ATGGTACTATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTACTTCTGATATG 402

 78918834 AATATAGACACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAA 78918893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      403 AATATAGACACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAA 462

 78918894 CACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTAT 78918953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      463 CACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTAT 522

 78918954 GTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGA 78919013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      523 GTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGA 582

 78919014 AGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGT 78919073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      583 AGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGT 642

 78919074 AGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGT 78919133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      643 AGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGT 702

 78919134 AATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTAT 78919193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      703 AATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTAT 762

 78919194 TAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTA 78919253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      763 TAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTA 822

 78919254 TATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCAC 78919313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      823 TATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCAC 882

 78919314 TCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAAT 78919373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      883 TCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAAT 942

 78919374 AATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCA 78919433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      943 AATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCA 1002

 78919434 AGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGA 78919493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1003 AGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGA 1062

 78919494 CTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAA 78919553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1063 CTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAA 1122

 78919554 ATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTG 78919613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 ATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTG 1182

 78919614 AATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAG 78919673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1183 AATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAG 1242

 78919674 GTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCT 78919733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 GTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCT 1302

 78919734 CAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCT 78919793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 CAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCT 1362

 78919794 CCCAAGAAAAACCGAGAACAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCA 78919853
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 CCCAAGAAAAACCGAGAGCAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCA 1422

 78919854 GAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAA 78919913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 GAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAA 1482

 78919914 AAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCA 78919973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 AAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCA 1542

 78919974 ACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTC 78920033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 ACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTC 1602

 78920034 ATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATA 78920093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 ATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATA 1662

 78920094 ATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTA 78920153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 ATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTA 1722

 78920154 TGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAAT 78920213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 TGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAAT 1782

 78920214 AATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAAT 78920273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 AATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAAT 1842

 78920274 TTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACT 78920333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 TTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACT 1902

 78920334 CATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAA 78920393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 CATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAA 1962

 78920394 TATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAAT 78920453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 TATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAAT 2022

 78920454 ACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGG 78920513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 ACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGG 2082

 78920514 ATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGAC 78920573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 ATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGAC 2142

 78920574 AATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATT 78920633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 AATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATT 2202

 78920634 ACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACAC 78920693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 ACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACAC 2262

 78920694 CCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAA 78920753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 CCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAA 2322

 78920754 TAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTA 78920813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 TAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTA 2382

 78920814 ATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACA 78920873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 ATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACA 2442

 78920874 AAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATT 78920933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 AAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATT 2502

 78920934 CTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAA 78920993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 CTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAA 2562

 78920994 TTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGA 78921053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 TTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGA 2622

 78921054 TCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGG 78921113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 TCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGG 2682

 78921114 CTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAA 78921173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 CTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAA 2742

 78921174 TTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAA 78921233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 TTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAA 2802

 78921234 ATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGG 78921293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 ATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGG 2862

 78921294 AACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATT 78921353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 AACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATT 2922

 78921354 AGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGAC 78921413
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 AGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGAC 2982

 78921414 TTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAA 78921473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 TTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAA 3042

 78921474 AATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCC 78921533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 AATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCC 3102

 78921534 ACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAA 78921593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 ACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAA 3162

 78921594 AATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAA 78921653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 AATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAA 3222

 78921654 GAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATC 78921713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 GAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATC 3282

 78921714 CTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTAC 78921773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 CTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTAC 3342

 78921774 AAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTC 78921833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 AAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTC 3402

 78921834 ATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 ATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 3458

Alignment time is 4.73466 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2348] =>      2348 nucs 'mol-32-2f12-030746_2348'

Score:        2162
Aligned:      2210        nucs
Identic:      2204 (100%) nucs =>       564 (100%)      1640 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78921325,78921889] EXCISED REGION [78926077,78927721]
 second seq =>  [       1,     565] EXCISED REGION [     701,    2342]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [566,700]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78921325 GAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATA 78921384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
        1 GAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATA 60

 78921385 ATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGT 78921444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGT 120

 78921445 AAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAA 78921504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAA 180

 78921505 ATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACT 78921564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACT 240

 78921565 ATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATA 78921624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATA 300

 78921625 TGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAA 78921684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAA 360

 78921685 GCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATG 78921744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATG 420

 78921745 GATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAA 78921804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAA 480

 78921805 AAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCA 78921864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCA 540

 78921865 AAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          |||||||||||||||||||||||||
      541 AAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 565

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 760

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 820

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 880

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 940

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 1000

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     1001 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 1057

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 1117

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 1177

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 1237

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 1297

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 1357

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 1417

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 1477

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 1537

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 1597

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 1657

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1717

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1777

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1837

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1897

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 1957

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 2017

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2018 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 2077

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 2137

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 2197

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 2257

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2258 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 2317

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTG 78927721
          |||||||||||||||||||||||||
     2318 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTG 2342

Alignment time is 3.23366 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    8671] =>      8671 nucs 'mol-32-2f1d-010940_8671'

Score:        8313
Aligned:      8545        nucs
Identic:      8519 (100%) nucs =>      1439 (100%)      7080 (100%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78920450,78921889] EXCISED REGION [78926077,78933177]
 second seq =>  [       1,    1440] EXCISED REGION [    1576,    8671]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [1441,1575]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78920450 AAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCT 78920509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCT 60

 78920510 TTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGAC 78920569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGAC 120

 78920570 AGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGG 78920629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGG 180

 78920630 CATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATAC 78920689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATAC 240

 78920690 ACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAAC 78920749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAAC 300

 78920750 ACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATA 78920809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATA 360

 78920810 ACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATC 78920869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATC 420

 78920870 TACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACA 78920929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACA 480

 78920930 TATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATT 78920989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATT 540

 78920990 GAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAG 78921049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAG 600

 78921050 AAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTC 78921109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTC 660

 78921110 CTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAG 78921169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAG 720

 78921170 ACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAG 78921229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAG 780

 78921230 CTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTA 78921289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTA 840

 78921290 AAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAA 78921349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAA 900

 78921350 AATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTA 78921409
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTA 960

 78921410 AGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGA 78921469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGA 1020

 78921470 AAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGA 78921529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGA 1080

 78921530 TCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATT 78921589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATT 1140

 78921590 AGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACA 78921649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACA 1200

 78921650 GGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAA 78921709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAA 1260

 78921710 AATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGAT 78921769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGAT 1320

 78921770 GTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTA 78921829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTA 1380

 78921830 CCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 1440

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 1635

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 1695

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 1755

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 1815

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 1875

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     1876 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 1932

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 1992

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 2052

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 2112

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 2172

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 2232

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 2292

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 2352

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 2412

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 2472

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 2532

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 2592

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 2652

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 2712

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 2772

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 2832

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 2892

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2893 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 2952

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 3012

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 3072

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 3132

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3133 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 3192

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 3252

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 3312

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 3372

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 3432

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 3490

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 3550

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 3610

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 3670

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 3730

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 3790

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 3850

 78928355 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 78928414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3851 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 3910

 78928415 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 78928474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3911 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 3970

 78928475 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 78928534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3971 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 4030

 78928535 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 78928594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4031 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 4090

 78928595 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 78928654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4091 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 4150

 78928655 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 78928714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4151 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 4210

 78928715 GGTGTTGAA-TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTC 78928773
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4211 GGTGTTGAATTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTC 4270

 78928774 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 78928833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4271 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 4330

 78928834 CATCCCAGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 78928893
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4331 CATCCCCGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 4390

 78928894 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 78928953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4391 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 4450

 78928954 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 78929013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4451 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 4510

 78929014 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 78929073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4511 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 4570

 78929074 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCAATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 78929133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4571 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCCATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 4630

 78929134 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 78929193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4631 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 4690

 78929194 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 78929253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4691 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 4750

 78929254 TTTAGTTTATTGGTA-ATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 78929312
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4751 TTTAGTTTATTGGTATATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 4810

 78929313 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 78929372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4811 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 4870

 78929373 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 78929432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4871 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 4930

 78929433 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 78929492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4931 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 4990

 78929493 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 78929552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4991 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 5050

 78929553 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 78929612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5051 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 5110

 78929613 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 78929672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5111 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 5170

 78929673 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 78929732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5171 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 5230

 78929733 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 78929792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5231 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 5290

 78929793 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 78929852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5291 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 5350

 78929853 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 78929912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5351 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 5410

 78929913 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 78929972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5411 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 5470

 78929973 ATATATATACACACAAATACATATATATATATAATATATTGTTAGAAGAAAGAAACAAAT 78930032
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5471 ATATATATACACACAAATAC--ATATATATATAATATATTGTTAGAAGAAAGAAACAAAT 5528

 78930033 TTTTATGCTTCATGTCATATAAAATAATTATCATAATAAAAAGATTTTTAAAGTGGTGTA 78930092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5529 TTTTATGCTTCATGTCATATAAAATAATTATCATAATAAAAAGATTTTTAAAGTGGTGTA 5588

 78930093 AAAGCTCAGTGATAACTTTGAATATAAATGGATTAATTTCCTGTATTATTAGACTGGCTT 78930152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5589 AAAGCTCAGTGATAACTTTGAATATAAATGGATTAATTTCCTGTATTATTAGACTGGCTT 5648

 78930153 TAACAAGAAAATTCCATCTACATATTTTTAACAACAACCACAAAAATTATAATAAAGAAA 78930212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5649 TAACAAGAAAATTCCATCTACATATTTTTAACAACAACCACAAAAATTATAATAAAGAAA 5708

 78930213 GGGTTACAATGAATGAATGTTTACAGAGAAATTAGGCAAAGCTGAAGCAACTATGAAAAT 78930272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5709 GGGTTACAATGAATGAATGTTTACAGAGAAATTAGGCAAAGCTGAAGCAACTATGAAAAT 5768

 78930273 ACCAATAGAAGATACAGTAGAAGTCATGAAATAAACTCTAAAATGACTTGAAATCATTAT 78930332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5769 ACCAATAGAAGATACAGTAGAAGTCATGAAATAAACTCTAAAATGACTTGAAATCATTAT 5828

 78930333 TTATTTATATTGACAGAATATGTAGTTTCTATTCAATGTGAATGTAAAAATTGATTAATA 78930392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5829 TTATTTATATTGACAGAATATGTAGTTTCTATTCAATGTGAATGTAAAAATTGATTAATA 5888

 78930393 TTAGCATTTGCTATTTATATTTAAAATATTGGAAATGAGGAGAGCAAGATAAAATACATT 78930452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5889 TTAGCATTTGCTATTTATATTTAAAATATTGGAAATGAGGAGAGCAAGATAAAATACATT 5948

 78930453 TTTAATGAGAACACTTTCAGTCTTTTTATCTTTAACAGATCCAGAAGACAATATATGGAT 78930512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5949 TTTAATGAGAACACTTTCAGTCTTTTTATCTTTAACAGATCCAGAAGACAATATATGGAT 6008

 78930513 AATATAATCAATACTGTAAACTTGAGTAATGTAGATAAGGTATATTGGTTAAAGTACATG 78930572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6009 AATATAATCAATACTGTAAACTTGAGTAATGTAGATAAGGTATATTGGTTAAAGTACATG 6068

 78930573 TCATTATACTATACAAAACCCCAAAGAACAGTAGCTAAAATAATATATTTTTCATTCCAT 78930632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6069 TCATTATACTATACAAAACCCCAAAGAACAGTAGCTAAAATAATATATTTTTCATTCCAT 6128

 78930633 ATAACAACATGAATTTCATAAGCAGTGCAGAGGAGGAACAAAGTCCTGTTTTGGATAAAT 78930692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6129 ATAACAACATGAATTTCATAAGCAGTGCAGAGGAGGAACAAAGTCCTGTTTTGGATAAAT 6188

 78930693 ATCCAGGTAGTAAACTTTCCTCTTCTAACTTGTTTCTCTGCTTGATTGAAGCTAGCTCAT 78930752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6189 ATCCAGGTAGTAAACTTTCCTCTTCTAACTTGTTTCTCTGCTTGATTGAAGCTAGCTCAT 6248

 78930753 CATGACTACATTTGCACATTTTATTACAGAGGAGAGGACGAAGAGAAATTGCAGTAGAAG 78930812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6249 CATGACTACATTTGCACATTTTATTACAGAGGAGAGGACGAAGAGAAATTGCAGTAGAAG 6308

 78930813 TAGTTTTCTGTGTAAAATATAAGATCAAGGATTTACACACATCACTTGTCTTCATAGCCT 78930872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6309 TAGTTTTCTGTGTAAAATATAAGATCAAGGATTTACACACATCACTTGTCTTCATAGCCT 6368

 78930873 ATTTGCCAGAACTAAGTTGGATGCCCACAACTGTAAGGAATGGTGGAAAAGTCGGAAGCT 78930932
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6369 ATTTGCCAGAACTAAGTCGGATGCCCACAACTGTAAGGAATGGTGGAAAAGTCGGAAGCT 6428

 78930933 GTGCAAAGTAGCTAAACTGGGGGGGGAGTGGGAGTACAGGTTGCCAGTAGGTTCAAAGGA 78930992
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6429 GTGCAAAGTAGCTAAACT-GGGGGGGAGTGGGAGTACAGGTTGCCAGTAGGTTCAAAGGA 6487

 78930993 AAATAACACTTCAAGAGAATTGGAAGTCTCTACCACTGAGTGCTTCTCATTTATGAAACT 78931052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6488 AAATAACACTTCAAGAGAATTGGAAGTCTCTACCACTGAGTGCTTCTCATTTATGAAACT 6547

 78931053 GCTTTATGGCATCTGCATAGGAAATTTTGACAGTTTCTACCAAGTGCCACTAAGACACAT 78931112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6548 GCTTTATGGCATCTGCATAGGAAATTTTGACAGTTTCTACCAAGTGCCACTAAGACACAT 6607

 78931113 AAATATCATAAATATCCAGAAAACATTGAAAAATCACAAACACAGATAACTAACAGTGAC 78931172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6608 AAATATCATAAATATCCAGAAAACATTGAAAAATCACAAACACAGATAACTAACAGTGAC 6667

 78931173 ATACAATCTGGTGCCAAATTTTGAAGTGAAAGTCATTGTTTCCCTAAGTGTACTATAAAA 78931232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6668 ATACAATCTGGTGCCAAATTTTGAAGTGAAAGTCATTGTTTCCCTAAGTGTACTATAAAA 6727

 78931233 CACTCTTCTAACAGATATTAATATGAATTCTGAGAGAAGAATTGTTCTGTACTCAAGAGT 78931292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6728 CACTCTTCTAACAGATATTAATATGAATTCTGAGAGAAGAATTGTTCTGTACTCAAGAGT 6787

 78931293 TTGGACAATGTCAGTTTTAATCGATTAAAGAGGTTTATTTACTTTAGAGCTTCTCAGAGT 78931352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6788 TTGGACAATGTCAGTTTTAATCGATTAAAGAGGTTTATTTACTTTAGAGCTTCTCAGAGT 6847

 78931353 CTTTGCTATACTTACATGTATTATGATTCTGCAAGTTGCAGGGAATATCATATACAATAA 78931412
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6848 CTTTGGTATACTTACATGTATTATGATTCTGCAAGTTGCAGGGAATATCATATACAATAA 6907

 78931413 TTTTCAAACATATTTGACTACACAATTATTTCTATGTCACTGCTGTCAACATTTTTCCAA 78931472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6908 TTTTCAAACATATTTGACTACACAATTATTTCTATGTCACTGCTGTCAACATTTTTCCAA 6967

 78931473 AATAATGTATCTTCCAAATTAAAAAAATGCTATAAAGCAAATGGAACTAATAAAAAACAA 78931532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6968 AATAATGTATCTTCCAAATTAAAAAAATGCTATAAAGCAAATGGAACTAATAAAAAACAA 7027

 78931533 AACAAAACAAATATTCATCTGGGCTTTAAATGTTTTGGCTGAAAAAATGTAGGAAGATGC 78931592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7028 AACAAAACAAATATTCATCTGGGCTTTAAATGTTTTGGCTGAAAAAATGTAGGAAGATGC 7087

 78931593 TTTTTGAAAATTTTATTTTTTCTTACTCAAAGCAATGGGTCTGGACTTCATCAAATGGAC 78931652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7088 TTTTTGAAAATTTTATTTTTTCTTACTCAAAGCAATGGGTCTGGACTTCATCAAATGGAC 7147

 78931653 AATTCTTTCTGTGTTGCTGAAATATAGTTTTATTTGTGGTGGCTAGAGTACTATTTTAAA 78931712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7148 AATTCTTTCTGTGTTGCTGAAATATAGTTTTATTTGTGGTGGCTAGAGTACTATTTTAAA 7207

 78931713 AGCTCATTCTTTGTACAAATCTTTCAGATATAATGACTTTAAAAAGCAGAGAAACCAACA 78931772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7208 AGCTCATTCTTTGTACAAATCTTTCAGATATAATGACTTTAAAAAGCAGAGAAACCAACA 7267

 78931773 CCAGTGAAGTAAGTATATTAATATTTTAGGTGGGGGTTGAAGATAGGGAATTGGCACAGT 78931832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7268 CCAGTGAAGTAAGTATATTAATATTTTAGGTGGGGGTTGAAGATAGGGAATTGGCACAGT 7327

 78931833 GATTGAATTCTGGGAAAGTATATATAAATTTTTTTTTTTTACCAATCAGACTGAATGTTA 78931892
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     7328 GATTGAATTCTGGGAAAGTATATATAAA-TTTTTTTTTTTACCAATCAGACTGAATGTTA 7386

 78931893 TTGTTTGTAGGAATCACAGGAAGAACAATAAAAGCAGTGCAGAGTATACCACACTTACCT 78931952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 TTGTTTGTAGGAATCACAGGAAGAACAATAAAAGCAGTGCAGAGTATACCACACTTACCT 7446

 78931953 TGTCTTTTTACCACACTGGAACATGACCTGTGAGATAAAGCAAAGACTTTTGTAGTGTTC 78932012
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     7447 TGTCTTTTTACCACACTGGAACATGACCTGTGAGATAAAGCAAAGACCTTTGTAGTGTTC 7506

 78932013 CCCTTGATCCTAAGATCTCTTTGCTTCCTAATGCTCTTCTTCTTGACTAGTAATGTAAAC 78932072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7507 CCCTTGATCCTAAGATCTCTTTGCTTCCTAATGCTCTTCTTCTTGACTAGTAATGTAAAC 7566

 78932073 ATACCTAGTTTCATGGGTAGAGAAATTTGACTCTGGTTAATAACCTAGAGCATAGAATTG 78932132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 ATACCTAGTTTCATGGGTAGAGAAATTTGACTCTGGTTAATAACCTAGAGCATAGAATTG 7626

 78932133 ACATGTTTGGTGACTTTTTTCTGCCTGTCATTTCTTTACTGAGGCAGTAGAGGCAGAATA 78932192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7627 ACATGTTTGGTGACTTTTTTCTGCCTGTCATTTCTTTACTGAGGCAGTAGAGGCAGAATA 7686

 78932193 CCTAACTGTACCAAACTCTAAAAATATTACAGACTTCAGATCTGAAAAAGAGAATCCTCC 78932252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7687 CCTAACTGTACCAAACTCTAAAAATATTACAGACTTCAGATCTGAAAAAGAGAATCCTCC 7746

 78932253 ACCTCCAATACCTATATGGGCCTCTTCTGTAAGTCTGTCTCTGTTTTGCTAGCATGTGCA 78932312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     7747 ACCTCCAATACCTATATGGGCCTCTTCTGTAAGTCTATCTCTGTTTTGCTAGCATGTGCA 7806

 78932313 ACAATAGGACTGAGGAGTGGCCAAGGAGAAGCATTAGTTGGGGTGATAAATGGAGCTAGG 78932372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7807 ACAATAGGACTGAGGAGTGGCCAAGGAGAAGCATTAGTTGGGGTGATAAATGGAGCTAGG 7866

 78932373 ATATGAGTGTTTAGGTGTAGCTTCATGAAGCCTTTTGCAATGTGTAATAGAGCTAGGGGT 78932432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7867 ATATGAGTGTTTAGGTGTAGCTTCATGAAGCCTTTTGCAATGTGTAATAGAGCTAGGGGT 7926

 78932433 GGGAAAAGAAGGAAGACCTGCCAAATATGGAAAAACAGAGGACAGAGGCTAGCTCTCCCA 78932492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7927 GGGAAAAGAAGGAAGACCTGCCAAATATGGAAAAACAGAGGACAGAGGCTAGCTCTCCCA 7986

 78932493 GCAGTGGAACCTCAAGGCATGCTTTAAAGACAATTATAAACTCTAACCTGACTCTTCAAT 78932552
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7987 GCAGTGGAACCTCAAGGCATGCTCTAAAGACAATTATAAACTCTAACCTGACTCTTCAAT 8046

 78932553 TCAATATAGAAGTGTATTCTTCCAGTTATGATAAGATACCATAATTTAAAAGTTTTTAGG 78932612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8047 TCAATATAGAAGTGTATTCTTCCAGTTATGATAAGATACCATAATTTAAAAGTTTTTAGG 8106

 78932613 GTTTATTTGTAAGTTTTAGATATTTATACATATAGATTGCCAGCTTTCATTTGAACCCTT 78932672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8107 GTTTATTTGTAAGTTTTAGATATTTATACATATAGATTGCCAGCTTTCATTTGAACCCTT 8166

 78932673 GCCTGAGACACTGCCAATGTTAAAGGAAGGTCTCAGGAGAAGAATAGAAATCATATAAAA 78932732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8167 GCCTGAGACACTGCCAATGTTAAAGGAAGGTCTCAGGAGAAGAATAGAAATCATATAAAA 8226

 78932733 TTCCTTTGAGCAAATGCATTTCTTAAAATATTAATATGTTATCTCACTATAATTGCTATT 78932792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8227 TTCCTTTGAGCAAATGCATTTCTTAAAATATTAATATGTTATCTCACTATAATTGCTATT 8286

 78932793 AAAATCAACAAAATCTGGCATACAGAAATAACAGTGTGGGAGGATTTTACTTTGGATAGG 78932852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8287 AAAATCAACAAAATCTGGCATACAGAAATAACAGTGTGGGAGGATTTTACTTTGGATAGG 8346

 78932853 ATGCTCATATATTCTAAATAGATTACAAGATAGCTAAAACCTTAAGGATGAGAAGATACT 78932912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8347 ATGCTCATATATTCTAAATAGATTACAAGATAGCTAAAACCTTAAGGATGAGAAGATACT 8406

 78932913 ATTTATAGTTACAGAATGAAAAAAACATTCTAGACAAAAGACATAAGTTTTACAAAAGTC 78932972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8407 ATTTATAGTTACAGAATGAAAAAAACATTCTAGACAAAAGACATAAGTTTTACAAAAGTC 8466

 78932973 CTCGGACCACAGCACAGTCAAATTAAATCTCAAGATTAAAAAATTCACTCAAAACCACAC 78933032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8467 CTCGGACCACAGCACAGTCAAATTAAATCTCAAGATTAAAAAATTCACTCAAAACCACAC 8526

 78933033 AACTACATGGAAACTGACCAAGCTGTTCCTGAATGGCCTTTGAGTAAATAATGAAATTAA 78933092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8527 AACTACATGGAAACTGACCAAGCTGTTCCTGAATGGCCTTTGAGTAAATAATGAAATTAA 8586

 78933093 GGCAGAGAACAAGAAGTTATTCGAAACTAATGAGAATAAAGATACAACATACCAGAATTT 78933152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8587 GGCAGAGAACAAGAAGTTATTCGAAACTAATGAGAATAAAGATACAACATACCAGAATTT 8646

 78933153 CTGGGACACAGCTAAAGCAGTGTTA 78933177
          |||||||||||||||||||||||||
     8647 CTGGGACACAGCTAAAGCAGTGTTA 8671

Alignment time is 11.8516 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4789] =>      4789 nucs 'mol-32-2f28-122288_4789'

Score:        4587
Aligned:      4657        nucs
Identic:      4649 (100%) nucs =>      3443 (100%)      1206 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78918442,78921889] EXCISED REGION [78926077,78927285]
 second seq =>  [       1,    3448] EXCISED REGION [    3584,    4789]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [3449,3583]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78918442 TTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCTCTTTGCAT 78918501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCTCTTTGCAT 60

 78918502 TTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCTTTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCCC 78918561
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCCTTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCCC 120

 78918562 AACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTTT 78918621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTTT 180

 78918622 ATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACTC 78918681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACTC 240

 78918682 ATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTTT 78918741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTTT 300

 78918742 TCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACTAACTAAAA 78918801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACTAACTAAAA 360

 78918802 CTATAATTAAAAGTACCTCTGCTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAACACAGAAT 78918861
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTATAATTAAAAGTACCTCTACTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAACACAGAAT 420

 78918862 CAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCCT 78918921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCCT 480

 78918922 CTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACTC 78918981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACTC 540

 78918982 CTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATGT 78919041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATGT 600

 78919042 ATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATAG 78919101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATAG 660

 78919102 ATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTG 78919161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTG 720

 78919162 CATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAG 78919221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAG 780

 78919222 GAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAA 78919281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAA 840

 78919282 TTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATC 78919341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATC 900

 78919342 TATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAA 78919401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAA 960

 78919402 GTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAG 78919461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAG 1020

 78919462 TGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATC 78919521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATC 1080

 78919522 TTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGA 78919581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGA 1140

 78919582 GAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAA 78919641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAA 1200

 78919642 TGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGT 78919701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGT 1260

 78919702 TGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCA 78919761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCA 1320

 78919762 AACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAACAAGAATTTA 78919821
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1321 AACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAGCAAGAATTTA 1380

 78919822 ACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAG 78919881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAG 1440

 78919882 AAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAA 78919941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAA 1500

 78919942 TGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGA 78920001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGA 1560

 78920002 CATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTC 78920061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTC 1620

 78920062 AATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGAT 78920121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGAT 1680

 78920122 CCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAAT 78920181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAAT 1740

 78920182 ATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGA 78920241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGA 1800

 78920242 ATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAA 78920301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAA 1860

 78920302 ATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAG 78920361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAG 1920

 78920362 AAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTC 78920421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTC 1980

 78920422 ACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACA 78920481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACA 2040

 78920482 AGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAA 78920541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAA 2100

 78920542 GTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCC 78920601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCC 2160

 78920602 AGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGA 78920661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGA 2220

 78920662 AGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAA 78920721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAA 2280

 78920722 ATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGAC 78920781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGAC 2340

 78920782 AACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAAC 78920841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAAC 2400

 78920842 ACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAATA 78920901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAATA 2460

 78920902 CATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAA 78920961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAA 2520

 78920962 AGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAG 78921021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAG 2580

 78921022 TGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGA 78921081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGA 2640

 78921082 AATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTA 78921141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTA 2700

 78921142 AAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAA 78921201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAA 2760

 78921202 AGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATC 78921261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATC 2820

 78921262 TCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTG 78921321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTG 2880

 78921322 ACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCA 78921381
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2881 ACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCA 2940

 78921382 ATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATT 78921441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATT 3000

 78921442 GGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCA 78921501
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GATAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCA 3060

 78921502 GAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAAT 78921561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAAT 3120

 78921562 ACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGG 78921621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGG 3180

 78921622 ATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATAT 78921681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATAT 3240

 78921682 CAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAA 78921741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAA 3300

 78921742 ATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTA 78921801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTA 3360

 78921802 AAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATA 78921861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATA 3420

 78921862 CCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 3448

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 3643

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 3703

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 3763

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3764 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 3823

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3824 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 3883

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     3884 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 3940

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 4000

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 4060

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 4120

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 4180

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 4240

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 4300

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 4360

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 4420

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 4480

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 4540

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 4600

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 4660

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 4720

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 4780

 78927277 TTTGTTGAT 78927285
          |||||||||
     4781 TTTGTTGAT 4789

Alignment time is 6.55307 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    5495] =>      5495 nucs 'mol-32-2fe3-070490_5495'

Score:        5256
Aligned:      5365        nucs
Identic:      5351 (100%) nucs =>      3093 (100%)      2258 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78918794,78921889] EXCISED REGION [78926077,78928343]
 second seq =>  [       1,    3096] EXCISED REGION [    3232,    5495]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [3097,3231]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78918794 AACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTGCTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAA 78918853
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTACTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAA 60

 78918854 CACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAG 78918913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAG 120

 78918914 CAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTA 78918973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTA 180

 78918974 TCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGT 78919033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGT 240

 78919034 TGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATC 78919093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATC 300

 78919094 TCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACA 78919153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACA 360

 78919154 TTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAA 78919213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAA 420

 78919214 AAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAG 78919273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAG 480

 78919274 AACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCAT 78919333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCAT 540

 78919334 ATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGAT 78919393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGAT 600

 78919394 TGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAG 78919453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAG 660

 78919454 CCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTC 78919513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTC 720

 78919514 AACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGC 78919573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGC 780

 78919574 TGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGG 78919633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGG 840

 78919634 GCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAAT 78919693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAAT 900

 78919694 CTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATC 78919753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATC 960

 78919754 AGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAACA 78919813
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      961 AGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAGCA 1020

 78919814 AGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCC 78919873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCC 1080

 78919874 AAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTA 78919933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTA 1140

 78919934 CCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAA 78919993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAA 1200

 78919994 ATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGT 78920053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGT 1260

 78920054 TGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAA 78920113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAA 1320

 78920114 AAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAA 78920173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAA 1380

 78920174 TTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGG 78920233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGG 1440

 78920234 CTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACG 78920293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACG 1500

 78920294 TCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGT 78920353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGT 1560

 78920354 AAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTC 78920413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTC 1620

 78920414 CAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGAC 78920473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGAC 1680

 78920474 ATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAA 78920533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAA 1740

 78920534 AATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGAC 78920593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGAC 1800

 78920594 TTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCA 78920653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCA 1860

 78920654 ATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGA 78920713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGA 1920

 78920714 TTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACC 78920773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACC 1980

 78920774 CCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTA 78920833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTA 2040

 78920834 AACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACC 78920893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACC 2100

 78920894 ACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTT 78920953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTT 2160

 78920954 GGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCA 78921013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCA 2220

 78921014 GACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAA 78921073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAA 2280

 78921074 TACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACA 78921133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACA 2340

 78921134 GATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGAT 78921193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGAT 2400

 78921194 GTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTA 78921253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTA 2460

 78921254 GAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAA 78921313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAA 2520

 78921314 AAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATT 78921373
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2521 AAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATT 2580

 78921374 GTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAA 78921433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAA 2640

 78921434 ATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAG 78921493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAG 2700

 78921494 CACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCT 78921553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCT 2760

 78921554 CATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAA 78921613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAA 2820

 78921614 ATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAG 78921673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAG 2880

 78921674 ACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCC 78921733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCC 2940

 78921734 TGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAA 78921793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAA 3000

 78921794 CTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCA 78921853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCA 3060

 78921854 GTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 3096

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 3291

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 3351

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 3411

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3412 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 3471

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 3531

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     3532 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 3588

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 3648

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 3708

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 3768

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 3828

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 3888

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 3948

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 4008

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 4068

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 4128

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 4188

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 4248

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 4308

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 4368

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 4428

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 4488

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 4548

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4549 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 4608

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 4668

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 4728

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 4788

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4789 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 4848

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 4908

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4909 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 4968

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4969 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 5028

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5029 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 5088

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5089 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 5146

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5147 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 5206

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5207 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 5266

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5267 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 5326

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5327 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 5386

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5387 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 5446

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAA 78928343
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5447 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAA 5495

Alignment time is 7.55675 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2264] =>      2264 nucs 'mol-32-2fe3-070490_2264'

Score:        2206
Aligned:      2265        nucs
Identic:      2258 (100%) nucs =>      1860 (100%)       398 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78926077,78927941] EXCISED REGION [78927944,78928343]
 second seq =>  [       1,    1862] EXCISED REGION [    1865,    2264]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [78927942,78927943]
 second seq =>         2 nucs [1863,1864]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [78927941,78927942] to [78927943,78927944]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 60

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 120

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 180

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 240

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 300

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
      301 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAG---GT 357

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 417

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 477

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 537

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 597

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 657

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 717

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 777

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 837

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 897

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 957

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1017

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1077

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1137

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1197

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 1257

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 1317

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1318 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 1377

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 1437

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 1497

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 1557

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1558 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 1617

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 1677

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 1737

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 1797

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 1857

 78927937 GGGAG 78927941
          |||||
     1858 GGGAG 1862

EXCISED REGION

 78927944 TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAGCCAGA 78928003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAGCCAGA 1924

 78928004 AATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTATAAATCATG 78928063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 AATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTATAAATCATG 1984

 78928064 CTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAATAGCAAAGAC 78928123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 CTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAATAGCAAAGAC 2044

 78928124 TTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTGGCAAATATA 78928183
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 TTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTGGCAAATATA 2104

 78928184 CACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAGGGACATGGA 78928243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 CACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAGGGACATGGA 2164

 78928244 TTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCAAACACCGCA 78928303
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 TTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCAAACACCGCA 2224

 78928304 TGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAA 78928343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 TGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAA 2264

Alignment time is 3.12233 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2050] =>      2050 nucs 'mol-32-2fee-314233_2050'

Score:        1881
Aligned:      1918        nucs
Identic:      1913 (100%) nucs =>       684 (100%)      1229 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78921204,78921889] EXCISED REGION [78926077,78927308]
 second seq =>  [       1,     686] EXCISED REGION [     822,    2050]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [687,821]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78921204 CAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTC 78921263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTC 60

 78921264 ACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGAC 78921323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGAC 120

 78921324 AGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAAT 78921383
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAAT 180

 78921384 AATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGG 78921443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      181 AATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGA 240

 78921444 TAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGA 78921503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGA 300

 78921504 AATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATAC 78921563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATAC 360

 78921564 TATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGAT 78921623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGAT 420

 78921624 ATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCA 78921683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCA 480

 78921684 AGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAAT 78921743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAAT 540

 78921744 GGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAA 78921803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAA 600

 78921804 AAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACC 78921863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACC 660

 78921864 AAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 686

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 881

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 941

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 1001

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 1061

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 1121

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     1122 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 1178

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1179 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 1238

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1239 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 1298

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 1358

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 1418

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 1478

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 1538

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1539 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 1598

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 1658

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 1718

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 1778

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1838

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1898

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1958

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 2018

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGA 78927308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGA 2050

Alignment time is 2.82063 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4326] =>      4326 nucs 'mol-32-2ff9-176026_4326'

Score:        4065
Aligned:      4196        nucs
Identic:      4180 (100%) nucs =>       271 (100%)      3909 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78921619,78921889] EXCISED REGION [78926077,78929997]
 second seq =>  [       1,     271] EXCISED REGION [     407,    4326]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [272,406]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78921619 GGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAA 78921678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAA 60

 78921679 TATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTC 78921738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTC 120

 78921739 TAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATT 78921798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATT 180

 78921799 TTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAA 78921858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAA 240

 78921859 ATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          |||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 271

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      407 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 466

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      467 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 526

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      527 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 586

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      587 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 646

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      647 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 706

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
      707 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 763

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      764 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 823

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      824 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 883

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      884 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 943

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 1003

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1004 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 1063

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 1123

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 1183

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 1243

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 1303

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 1363

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1423

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1483

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1543

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1603

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 1663

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 1723

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1724 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 1783

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 1843

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 1903

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 1963

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1964 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 2023

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 2083

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 2143

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 2203

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 2263

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 2321

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 2381

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 2441

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 2501

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 2561

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 2621

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 2681

 78928355 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 78928414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 2741

 78928415 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 78928474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 2801

 78928475 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 78928534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 2861

 78928535 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 78928594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 2921

 78928595 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 78928654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 2981

 78928655 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 78928714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 3041

 78928715 GGTGTTGAA-TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTC 78928773
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3042 GGTGTTGAATTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTC 3101

 78928774 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 78928833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 3161

 78928834 CATCCCAGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 78928893
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 CATCCCCGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 3221

 78928894 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 78928953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 3281

 78928954 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 78929013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 3341

 78929014 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 78929073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 3401

 78929074 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCAATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 78929133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3402 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCCATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 3461

 78929134 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 78929193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 3521

 78929194 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 78929253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 3581

 78929254 TTTAGTTTATTGGTA-ATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 78929312
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 TTTAGTTTATTGGTATATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 3641

 78929313 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 78929372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 3701

 78929373 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 78929432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 3761

 78929433 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 78929492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 3821

 78929493 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 78929552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 3881

 78929553 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 78929612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 3941

 78929613 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 78929672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 4001

 78929673 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 78929732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 4061

 78929733 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 78929792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 4121

 78929793 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 78929852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 4181

 78929853 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 78929912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 4241

 78929913 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 78929972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 4301

 78929973 ATATATATACACACAAATACATATA 78929997
          |||||||||||||||||||||||||
     4302 ATATATATACACACAAATACATATA 4326

Alignment time is 5.88712 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3391] =>      3391 nucs 'mol-32-300f-047089_3391'

Score:        3130
Aligned:      3261        nucs
Identic:      3245 (100%) nucs =>       570 (100%)      2675 ( 99%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78921319,78921889] EXCISED REGION [78926077,78928763]
 second seq =>  [       1,     571] EXCISED REGION [     707,    3391]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [572,706]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78921319 GTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTT 78921378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
        1 GTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTT 60

 78921379 GCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAA 78921438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAA 120

 78921439 ATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAA 78921498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAA 180

 78921499 TCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAG 78921558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAG 240

 78921559 AATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTG 78921618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTG 300

 78921619 GGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAA 78921678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAA 360

 78921679 TATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTC 78921738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTC 420

 78921739 TAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATT 78921798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATT 480

 78921799 TTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAA 78921858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAA 540

 78921859 ATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          |||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 571

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      707 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 766

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      767 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 826

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      827 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 886

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      887 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 946

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      947 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 1006

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     1007 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 1063

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 1123

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 1183

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 1243

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 1303

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 1363

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 1423

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 1483

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 1543

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1544 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTCCTACTGGTATTTTGATAG 1603

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 1663

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1723

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1783

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1784 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTGTTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1843

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1903

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 1963

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 2023

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2024 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 2083

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 2143

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 2203

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 2263

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2264 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 2323

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 2383

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 2443

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 2503

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 2563

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 2621

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 2681

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 2741

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 2801

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 2861

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 2921

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 2981

 78928355 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 78928414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 3041

 78928415 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 78928474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 3101

 78928475 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 78928534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 3161

 78928535 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 78928594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 3221

 78928595 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 78928654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 3281

 78928655 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 78928714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 3341

 78928715 GGTGTTGAA-TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATA 78928763
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3342 GGTGTTGAATTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATA 3391

Alignment time is 4.68133 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    6639] =>      6639 nucs 'mol-32-3030-235299_6639'

Score:        6356
Aligned:      6509        nucs
Identic:      6491 (100%) nucs =>      3565 (100%)      2926 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78918321,78921889] EXCISED REGION [78926077,78929013]
 second seq =>  [       1,    3569] EXCISED REGION [    3705,    6639]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [3570,3704]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78918321 GTAGTTTATTATTTGTCACTAATTTTGGAAAAGTTTCAGCTTTATTAATTCATTTTTATT 78918380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAGTTTATTATTTGTCACTAATTTTGGAAAAGTTTCAGCTTTATTAATTCATTTTTATT 60

 78918381 TTTCTGCTGCTTTATTTTTCTCTTTTTTTCTCTGGTGTTCCCATTATATATATTTGACAC 78918440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCTGCTGCTTTATTTTTCTCTTTTTTTCTCTGGTGTTCCCATTATATATATTTGACAC 120

 78918441 CTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCTCTTTGCA 78918500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCTCTTTGCA 180

 78918501 TTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCTTTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCC 78918560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCCTTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCC 240

 78918561 CAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTT 78918620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTT 300

 78918621 TATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACT 78918680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACT 360

 78918681 CATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTT 78918740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTT 420

 78918741 TTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACTAACTAAA 78918800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACTAACTAAA 480

 78918801 ACTATAATTAAAAGTACCTCTGCTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAACACAGAA 78918860
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTATAATTAAAAGTACCTCTACTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAACACAGAA 540

 78918861 TCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCC 78918920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCC 600

 78918921 TCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACT 78918980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACT 660

 78918981 CCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATG 78919040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATG 720

 78919041 TATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATA 78919100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATA 780

 78919101 GATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTT 78919160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTT 840

 78919161 GCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGA 78919220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGA 900

 78919221 GGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAA 78919280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAA 960

 78919281 ATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAAT 78919340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAAT 1020

 78919341 CTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGA 78919400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGA 1080

 78919401 AGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAA 78919460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAA 1140

 78919461 GTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGAT 78919520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGAT 1200

 78919521 CTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGG 78919580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGG 1260

 78919581 AGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTA 78919640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTA 1320

 78919641 ATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGG 78919700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGG 1380

 78919701 TTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCC 78919760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCC 1440

 78919761 AAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAACAAGAATTT 78919820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1441 AAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAGCAAGAATTT 1500

 78919821 AACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGA 78919880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGA 1560

 78919881 GAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAA 78919940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAA 1620

 78919941 ATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAG 78920000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAG 1680

 78920001 ACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACT 78920060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACT 1740

 78920061 CAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGA 78920120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGA 1800

 78920121 TCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAA 78920180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAA 1860

 78920181 TATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTG 78920240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTG 1920

 78920241 AATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGA 78920300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGA 1980

 78920301 AATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGA 78920360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGA 2040

 78920361 GAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCT 78920420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCT 2100

 78920421 CACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATAC 78920480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATAC 2160

 78920481 AAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAA 78920540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAA 2220

 78920541 AGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATCC 78920600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATCC 2280

 78920601 CAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAG 78920660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAG 2340

 78920661 AAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGA 78920720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGA 2400

 78920721 AATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGA 78920780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGA 2460

 78920781 CAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAA 78920840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAA 2520

 78920841 CACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAAT 78920900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAAT 2580

 78920901 ACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACA 78920960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACA 2640

 78920961 AAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCACA 78921020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCACA 2700

 78921021 GTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATGG 78921080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATGG 2760

 78921081 AAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATTT 78921140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATTT 2820

 78921141 AAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCA 78921200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCA 2880

 78921201 AAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGAT 78921260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGAT 2940

 78921261 CTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGT 78921320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGT 3000

 78921321 GACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGC 78921380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3001 GACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGC 3060

 78921381 AATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAAT 78921440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAAT 3120

 78921441 TGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATC 78921500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATC 3180

 78921501 AGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAA 78921560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAA 3240

 78921561 TACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGG 78921620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGG 3300

 78921621 GATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATA 78921680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATA 3360

 78921681 TCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTA 78921740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTA 3420

 78921741 AATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTT 78921800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTT 3480

 78921801 AAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAAT 78921860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAAT 3540

 78921861 ACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 3569

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 3764

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 3824

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 3884

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 3944

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 4004

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     4005 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 4061

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 4121

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 4181

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 4241

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 4301

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 4361

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 4421

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 4481

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 4541

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 4601

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 4661

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 4721

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 4781

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 4841

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4842 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 4901

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 4961

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4962 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 5021

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5022 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 5081

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 5141

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5142 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 5201

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5202 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 5261

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5262 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 5321

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 5381

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5382 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 5441

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 5501

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5502 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 5561

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5562 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 5619

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5620 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 5679

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5680 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 5739

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5740 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 5799

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5800 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 5859

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5860 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 5919

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5920 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 5979

 78928355 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 78928414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5980 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 6039

 78928415 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 78928474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6040 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 6099

 78928475 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 78928534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6100 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 6159

 78928535 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 78928594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6160 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 6219

 78928595 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 78928654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6220 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 6279

 78928655 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 78928714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6280 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 6339

 78928715 GGTGTTGAA-TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTC 78928773
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6340 GGTGTTGAATTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTC 6399

 78928774 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 78928833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6400 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 6459

 78928834 CATCCCAGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 78928893
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6460 CATCCCCGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 6519

 78928894 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 78928953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6520 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 6579

 78928954 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 78929013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6580 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 6639

Alignment time is 9.22328 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2935] =>      2935 nucs 'mol-32-3030-235299_2935'

Score:        2844
Aligned:      2936        nucs
Identic:      2926 (100%) nucs =>      1860 (100%)      1066 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78926077,78927941] EXCISED REGION [78927944,78929013]
 second seq =>  [       1,    1862] EXCISED REGION [    1865,    2935]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [78927942,78927943]
 second seq =>         2 nucs [1863,1864]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [78927941,78927942] to [78927943,78927944]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 60

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 120

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 180

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 240

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 300

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
      301 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAG---GT 357

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 417

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 477

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 537

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 597

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 657

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 717

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 777

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 837

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 897

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 957

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1017

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1077

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1137

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1197

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 1257

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 1317

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1318 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 1377

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 1437

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 1497

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 1557

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1558 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 1617

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 1677

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 1737

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 1797

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 1857

 78927937 GGGAG 78927941
          |||||
     1858 GGGAG 1862

EXCISED REGION

 78927944 TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAGCCAGA 78928003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAGCCAGA 1924

 78928004 AATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTATAAATCATG 78928063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 AATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTATAAATCATG 1984

 78928064 CTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAATAGCAAAGAC 78928123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 CTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAATAGCAAAGAC 2044

 78928124 TTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTGGCAAATATA 78928183
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 TTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTGGCAAATATA 2104

 78928184 CACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAGGGACATGGA 78928243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 CACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAGGGACATGGA 2164

 78928244 TTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCAAACACCGCA 78928303
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 TTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCAAACACCGCA 2224

 78928304 TGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGGAGGGGAACA 78928363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 TGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGGAGGGGAACA 2284

 78928364 TCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATTAGGAGAAAT 78928423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 TCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATTAGGAGAAAT 2344

 78928424 GCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTGTATACCTAT 78928483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 GCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTGTATACCTAT 2404

 78928484 GTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAAATAAATAAA 78928543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 GTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAAATAAATAAA 2464

 78928544 TAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGCTTTCTGTTT 78928603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 TAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGCTTTCTGTTT 2524

 78928604 TTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTATTATGTTGAG 78928663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 TTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTATTATGTTGAG 2584

 78928664 GTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGCGGTGTTGAA 78928723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 GTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGCGGTGTTGAA 2644

 78928724 -TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTCTTTAATTCT 78928782
           ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 TTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTCTTTAATTCT 2704

 78928783 GTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTGCATCCCAGG 78928842
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2705 GTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTGCATCCCCGG 2764

 78928843 AATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAATTAGGTTTTC 78928902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 AATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAATTAGGTTTTC 2824

 78928903 TAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTTGTAGTTTTC 78928962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 TAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTTGTAGTTTTC 2884

 78928963 TATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 78929013
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 TATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 2935

Alignment time is 4.05535 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    9392] =>      9392 nucs 'mol-32-303b-251389_9392'

Score:        9113
Aligned:      9260        nucs
Identic:      9245 (100%) nucs =>      8017 (100%)      1228 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78913862,78921889] EXCISED REGION [78926077,78927308]
 second seq =>  [       1,    8028] EXCISED REGION [    8164,    9392]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [8029,8163]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78913862 GAGAATGACGGTTTCCCGCTTCATCCATGTGCCTGCAAAGGACATGAACTCATCCTTTTT 78913921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGAATGACGGTTTCCCGCTTCATCCATGTGCCTGCAAAGGACATGAACTCATCCTTTTT 60

 78913922 TATGGCTGCATATATTCCATGGTGTATATGTGACACATTTTTTTTTATCCAATCTATCAT 78913981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATGGCTGCATATATTCCATGGTGTATATGTGACACATTTTTTTTTATCCAATCTATCAT 120

 78913982 TGATGGGCATTTGGATTGGTTCCAAGTCTTTGCTGTTGTGAACAGTGCTGGAATAAACAC 78914041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      121 TGATGGGCATTTGGATTGGTTCCAAGTCTTTGCTCTTGTGAACAGTGCTGGAATAAACAC 180

 78914042 ATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGATAATAAATGCATCAGGCAGAAAATTAGTAATGAT 78914101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGATAATAAATGCATCAGGCAGAAAATTAGTAATGAT 240

 78914102 ATTTTTGACCTGATATATTATGCATCATTCTGTAATATATTTTTAAGTTCCATTTAAATC 78914161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTTTTGACCTGATATATTATGCATCATTCTGTAATATATTTTTAAGTTCCATTTAAATC 300

 78914162 CATGCAATAAATAGTTATAATCAGGTTGAAAATGTCATTACTAATTTTCTGCCTGCTGCA 78914221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATGCAATAAATAGTTATAATCAGGTTGAAAATGTCATTACTAATTTTCTGCCTGCTGCA 360

 78914222 TTTATTATCTACTGAAAGAAGGGTGTGTGTGTTGAAGTCTCCAACTCTAATCATGGATTC 78914281
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      361 TTTATTATCTACTGAAAGAAGGGTGTGTGTGTTGAAGTCTCCAACTCTAGTCATGGATTC 420

 78914282 GTCTATTTCTCCTTGCCATTTTACTAGTTTTTTCTACATACATTTTAACTCTCTATTATT 78914341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCTATTTCTCCTTGCCATTTTACTAGTTTTTTCTACATACATTTTAACTCTCTATTATT 480

 78914342 AAGTGCATACATATTAATGATTGCTATGTCTTCTTGAAAAACTCTTTTATAATTATGTAT 78914401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGTGCATACATATTAATGATTGCTATGTCTTCTTGAAAAACTCTTTTATAATTATGTAT 540

 78914402 ACCTGTTTTTATCTTTTATAATTTTCTTTTCTCTGGTTTGCTCTGAAATTAATATAGCTA 78914461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCTGTTTTTATCTTTTATAATTTTCTTTTCTCTGGTTTGCTCTGAAATTAATATAGCTA 600

 78914462 CCCTTTCTCTCTCTTTGTTATTGCGAGCATGACATATCTTTCTCTGTTTCTTTACTTTTT 78914521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCTTTCTCTCTCTTTGTTATTGCGAGCATGACATATCTTTCTCTGTTTCTTTACTTTTT 660

 78914522 AATCTACCAGTGCCATTATATTTAAAGGGAGTTTCTTGAAGACAACATCTTATAAATGTT 78914581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATCTACCAGTGCCATTATATTTAAAGGGAGTTTCTTGAAGACAACATCTTATAAATGTT 720

 78914582 GGGTCCTTTTTTGCTTTTTGTTTTCATCTACTTTGCCAGTCTCTGTCTTTGATTTAATCT 78914641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGTCCTTTTTTGCTTTTTGTTTTCATCTACTTTGCCAGTCTCTGTCTTTGATTTAATCT 780

 78914642 ACTTAAACCATTTCATATTTAAAGTGATTATTGATATAGTTGGACTAATGTTTACCATGG 78914701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTTAAACCATTTCATATTTAAAGTGATTATTGATATAGTTGGACTAATGTTTACCATGG 840

 78914702 CTGTTTTTTAAATTTGCACTATTATTATTTCCACAGATTTTTGGGGAACAGGTGGTGTTT 78914761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGTTTTTTAAATTTGCACTATTATTATTTCCACAGATTTTTGGGGAACAGGTGGTGTTT 900

 78914762 GGTTACGTGGACAAGTTTGTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTAGTGCACCCATCACCCAA 78914821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTTACGTGGACAAGTTTGTTAGTGGTGATTTCTGAGATTTTAGTGCACCCATCACCCAA 960

 78914822 GCAGTGTACCCTGTATCCAATGTGCAGTCTTTTATCGCTCATCCCCCTCTCACCCTTTCC 78914881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCAGTGTACCCTGTATCCAATGTGCAGTCTTTTATCGCTCATCCCCCTCTCACCCTTTCC 1020

 78914882 CCTGTGTCCCCAAAGTCCATTGTATCATTCTTATGCTTTTGCTTCCTCATAGTTTAGCTA 78914941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTGTGTCCCCAAAGTCCATTGTATCATTCTTATGCTTTTGCTTCCTCATAGTTTAGCTA 1080

 78914942 CCACATTTGAATGAGGACATACAATGTTTGGTTTTCCATTTCCGAGTGACTTCACCTAGA 78915001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCACATTTGAATGAGGACATACAATGTTTGGTTTTCCATTTCCGAGTGACTTCACCTAGA 1140

 78915002 ATAATGAACTCCAATTCCATCCAGGTTGCTGCAAATGCCATTATTTTGTTCCTTTTTATG 78915061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAATGAACTCCAATTCCATCCAGGTTGCTGCAAATGCCATTATTTTGTTCCTTTTTATG 1200

 78915062 GCTGAGTATGTATATCTTACATTTTCTTTATCCACTCGTTGATTGATGGGCATCTGGATC 78915121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTGAGTATGTATATCTTACATTTTCTTTATCCACTCGTTGATTGATGGGCATCTGGATC 1260

 78915122 TGGGTGGTTCCACATTTTTGTAATTGTGAATGGTGATGCTATAAACGTGTGTGCAAGTAT 78915181
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGGTGGTTCCATATTTTTGTAATTGTGAATGGTGATGCTATAAACGTGTGTGCAAGTAT 1320

 78915182 CTTTTTCATAAAATAACTTATTTTCCTCTGGGTAGATACCCAGGAGTGGGATTGCTGGAT 78915241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTTTTCATAAAATAACTTATTTTCCTCTGGGTAGATACCCAGGAGTGGGATTGCTGGAT 1380

 78915242 CAAACGGTAGATCTAGTTTTAGTTATTTAAGGAATCTCCACACTGTTTTCCATAGTGGTT 78915301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAACGGTAGATCTAGTTTTAGTTATTTAAGGAATCTCCACACTGTTTTCCATAGTGGTT 1440

 78915302 TTACTAGTTTACATTTCCACCAACAGTGTAAACGTGTTTCCTTTTCACCACATCCATGCC 78915361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTACTAGTTTACATTTCCACCAACAGTGTAAACGTGTTTCCTTTTCACCACATCCATGCC 1500

 78915362 AACATCTATTTTTTTTTAATTTTTTGATTATGGCCATTATTGCAGAAGTAAGGTGGTATT 78915421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACATCTATTTTTTTTTAATTTTTTGATTATGGCCATTATTGCAGAAGTAAGGTGGTATT 1560

 78915422 GCATTGTGGCTTTAATTTGCAGTTCCCTGATCATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCATG 78915481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCATTGTGGCTTTAATTTGCAGTTCCCTGATCATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCATG 1620

 78915482 TTTGTAGGTCATTTGTATATCTTCTTTTGAGACTTGTATATTCATGTCCTTAGCCCACGT 78915541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGTAGGTCATTTGTATATCTTCTTTTGAGACTTGTATATTCATGTCCTTAGCCCACGT 1680

 78915542 TTTGATGGGATTGTTTGTTTGTTTGTTTTTCTTGCTTATCTATTTGAGTTCCTTGTAGAT 78915601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTGATGGGATTGTTTGTTTGTTTGTTTTTCTTGCTTATCTATTTGAGTTCCTTGTAGAT 1740

 78915602 TCCGGATATTAGTACTTTGTCAGATATATAGATTGCGAAGATTTTCTCCCACTCTGTGGG 78915661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCGGATATTAGTACTTTGTCAGATATATAGATTGCGAAGATTTTCTCCCACTCTGTGGG 1800

 78915662 TTGTCTGATTACTCTGCTTACTTTTTCTTCTGTGCAGAAGCTTTTTAGTTTAATTAAGTC 78915721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGTCTGATTACTCTGCTTACTTTTTCTTCTGTGCAGAAGCTTTTTAGTTTAATTAAGTC 1860

 78915722 CCATCTATTTATATTTGTTTTTCTTGTGTTTGCTTTTGGGTTCCTGGTCATGAAGCCTTG 78915781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCATCTATTTATATTTGTTTTTCTTGTGTTTGCTTTTGGGTTCCTGGTCATGAAGCCTTG 1920

 78915782 GCCTAAGCCAATGTCTAGAAAGGTTTTTCCAATATTATCTACTAAAACTTTTATGGTTTC 78915841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCCTAAGCCAATGTCTAGAAAGGTTTTTCCAATATTATCTACTAAAACTTTTATGGTTTC 1980

 78915842 AGGTCTTAGATTTAAGTCTTTGATCCATCTTGAGTAGATTTTTGTATATGGTGAGAGATG 78915901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGGTCTTAGATTTAAGTCTTTGATCCATCTTGAGTAGATTTTTGTATATGGTGAGAGATG 2040

 78915902 AGGATCCAGATTCATTTGTCTACTTGTGGCTTGACAATTATTACAGCATGATTTGTTGAA 78915961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGGATCCAGATTCATTTGTCTACTTGTGGCTTGACAATTATTACAGCATGATTTGTTGAA 2100

 78915962 TAGGGTGTCCTTTTCCCACTTTGTGTTTTTGCTTGCTTTGTCGAATATCAGTTGACTGTA 78916021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGGGTGTCCTTTTCCCACTTTGTGTTTTTGCTTGCTTTGTCGAATATCAGTTGACTGTA 2160

 78916022 AGTATTTGGCTTTATTTCTGGGATATTAATTCTGTTCCATTAGTCTATACACCTGTTTTT 78916081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGTATTTGGCTTTATTTCTGGGATATTAATTCTGTTCCATTAGTCTATACACCTGTTTTT 2220

 78916082 ATATCAGTAACATGCTGTTTCAGTGACCATGGTCTTATAGAATAGTTTGAAGTCTGTCAA 78916141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATATCAGTAACATGCTGTTTCAGTGACCATGGTCTTATAGAATAGTTTGAAGTCTGTCAA 2280

 78916142 CGTAATGCCTCCACATTTGTTCTATTTGCTTAGTTTTGCTTTGGCTCTGTGGGGCACTTT 78916201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CGTAATGCCTCCACATTTGTTCTATTTGCTTAGTTTTGCTTTGGCTCTGTGGGGCACTTT 2340

 78916202 TTTGGTTCTATATGAATATTATAATTTTTTTAGTTTCTTGAAAAATGATGGTGGTATCTT 78916261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTGGTTCTATATGAATATTATAATTTTTTTAGTTTCTTGAAAAATGATGGTGGTATCTT 2400

 78916262 GATGGGAATTGCATTGAATTTGTAGATAGCTTTTGGCAGTATAGTCATTTTCACAATATT 78916321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GATGGGAATTGCATTGAATTTGTAGATAGCTTTTGGCAGTATAGTCATTTTCACAATATT 2460

 78916322 GATTCTACCCATCCATGTGTATGGGATGTGTTTCCATTTGTTTGTGTCATCTATGATTTC 78916381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GATTCTACCCATCCATGTGTATGGGATGTGTTTCCATTTGTTTGTGTCATCTATGATTTC 2520

 78916382 TTTCAGCAGTGTTTTGTAGTTTTTCTTGTAGAGGTCAAGTATATTCCCAAGTATTTTATT 78916441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTCAGCAGTGTTTTGTAGTTTTTCTTGTAGAGGTCAAGTATATTCCCAAGTATTTTATT 2580

 78916442 TCTTCACAGCTATTGTAAAAGGGCTTGTGTTTTTTGATTCTCAGCTTGGTTGCTGTTGGT 78916501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCTTCACAGCTATTGTAAAAGGGCTTGTGTTTTTTGATTCTCAGCTTGGTTGCTGTTGGT 2640

 78916502 GTATAGCAGGGCTACTGATTTATGTACATTAAGTTTGCATCCTGAAAGTTTGCTGAATTC 78916561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTATAGCAGGGCTACTGATTTATGTACATTAAGTTTGCATCCTGAAAGTTTGCTGAATTC 2700

 78916562 ATTTATTAGTTCTAGGAGCTTTTAGGATAATCTTTAGGGCTTTCTAGGTATATGATCATG 78916621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATTTATTAGTTCTAGGAGCTTTTAGGATAATCTTTAGGGCTTTCTAGGTATATGATCATG 2760

 78916622 TCATCAGCAAAGAGGAACAGTTTGACTTCCTCTTTACCGATTTGGATGCCTTTATATCAT 78916681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCATCAGCAAAGAGGAACAGTTTGACTTCCTCTTTACCGATTTGGATGCCTTTATATCAT 2820

 78916682 TCTCTTGTCTGATTGCTCAGGCTAGGGCTTCCAGTACTATATTGAAGAGAAATGGTGAAA 78916741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCTCTTGTCTGATTGCTCAGGCTAGGGCTTCCAGTACTATATTGAAGAGAAATGGTGAAA 2880

 78916742 ATGTGCATTTTTGTCTTCCTCCAGTTCTCAGGGGTAATGTTTTCAACTTTTCCCAGGTCA 78916801
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2881 ATGTGCATTTTTGTCTTCCTCCAGTTCTCAGGGGTAATGCTTTCAACTTTTCCCAGGTCA 2940

 78916802 GTATAATGATGTCTGTGTGTTTGTCATAGTTGGCTTTTATTACCTTAAGGTATGTCCCTT 78916861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTATAATGATGTCTGTGTGTTTGTCATAGTTGGCTTTTATTACCTTAAGGTATGTCCCTT 3000

 78916862 CTATGCCAATTTTGCTGAGGGTTTTAGTCATAAAGGGATGCTGGATTTTGTCAAATGCTT 78916921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTATGCCAATTTTGCTGAGGGTTTTAGTCATAAAGGGATGCTGGATTTTGTCAAATGCTT 3060

 78916922 TTTCTGAGTCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGTTTTTACTTCTGTTTGTGAGGTGTA 78916981
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTCTGAGTCTATTGAGATGATCACGTGATTTTTGTTTTTACTTCTGTTTGTGAGGTGTA 3120

 78916982 TCACATTTATTGACTTGCATATGTTAAACCATTCCTGCATTCCTGGTCTCTAACACACTT 78917041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCACATTTATTGACTTGCATATGTTAAACCATTCCTGCATTCCTGGTCTCTAACACACTT 3180

 78917042 GATCATGGCAGATTATCTTTTTGGTATGCTATTGGATTCAGTTAGCGAGTAATTTGTTGA 78917101
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GATCATGGCAGATTATCTTTTTGATATGCTATTGGATTCAGTTAGCGAGTAATTTGTTGA 3240

 78917102 GGATTTTTGCATATGTTCATCAGGAATATTATTCTGTAGTTTTATTTTCTGTTATGTCCT 78917161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGATTTTTGCATATGTTCATCAGGAATATTATTCTGTAGTTTTATTTTCTGTTATGTCCT 3300

 78917162 TTCTTGTTTTGGGTATTATGGTGATACTGGATTCATAGAATGACTTACAAAAGATTCCTT 78917221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTCTTGTTTTGGGTATTATGGTGATACTGGATTCATAGAATGACTTACAAAAGATTCCTT 3360

 78917222 CTTTCTCTATCTTGTGGAATAGTGTCCATAGTACTGGTACCAATTCTTCTTTGAATGCCT 78917281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTTTCTCTATCTTGTGGAATAGTGTCCATAGTACTGGTACCAATTCTTCTTTGAATGCCT 3420

 78917282 GATAAAATTCATCTGTGAATCCATCTGGTAGTGAACATTTTTTTGTTAGTAATATTTTAA 78917341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GATAAAATTCATCTGTGAATCCATCTGGTAGTGAACATTTTTTTGTTAGTAATATTTTAA 3480

 78917342 TTACCATTTTAATCTTGCTGCTTGTTATTGGTGTGTTCAGAGTTTCTATTTCTTCCTGGT 78917401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTACCATTTTAATCTTGCTGCTTGTTATTGGTGTGTTCAGAGTTTCTATTTCTTCCTGGT 3540

 78917402 TTAATCTAGAAGTGTTGTATATTTACAGAAATGTATCCATCTCCTCCAGGTTTTCTAGAT 78917461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTAATCTAGAAGTGTTGTATATTTACAGAAATGTATCCATCTCCTCCAGGTTTTCTAGAT 3600

 78917462 TATACAAGTAAATGTGTTCATAGTAGCCTGGTATTTTTGTATTAATTGCACACATTCTCT 78917521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TATACAAGTAAATGTGTTCATAGTAGCCTGGTATTTTTGTATTAATTGCACACATTCTCT 3660

 78917522 TTTTTATCTTCCCCCTTTTGTGCATTTTCTTGTTTTATTTATACTTTTATATTTTATTTC 78917581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTTTATCTTCCCCCTTTTGTGCATTTTCTTGTTTTATTTATACTTTTATATTTTATTTC 3720

 78917582 TCTCCACTTTTGGCATATCAGTTTTATTTATTTTAAATTATTTTGGAGATTGTCAAGAGC 78917641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCTCCACTTTTGGCATATCAGTTTTATTTATTTTAAATTATTTTGGAGATTGTCAAGAGC 3780

 78917642 TCATAAAACACATTTCTCACTAAGCTATGTGCTTTAAACAATTACTATGCCACTTCACAA 78917701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCATAAAACACATTTCTCACTAAGCTATGTGCTTTAAACAATTACTATGCCACTTCACAA 3840

 78917702 GTAGTACAACTAACTTTTAAGAGAATCTCCCTACATTATTTCTCATTTCCTTTATAAAAT 78917761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GTAGTACAACTAACTTTTAAGAGAATCTCCCTACATTATTTCTCATTTCCTTTATAAAAT 3900

 78917762 TATTGTCATTCATTTCACATATTCATATATTAGAATGAATTAATACCTTGTTACTCTTAT 78917821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TATTGTCATTCATTTCACATATTCATATATTAGAATGAATTAATACCTTGTTACTCTTAT 3960

 78917822 TACTTTGAACATATAGTTATCTATAACATCAATTTAAAAAATGTTTTATATTTCATCTAA 78917881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TACTTTGAACATATAGTTATCTATAACATCAATTTAAAAAATGTTTTATATTTCATCTAA 4020

 78917882 TTATTCATCAGTTATATTCTTTATATTGATCTGAGTTTTGACCTATGTCATTTTCTTGTT 78917941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4021 TTATTCATCAGTTATATTCTTTATATTGATCTGAGTTTTGACCTACGTCATTTTCTTGTT 4080

 78917942 ATTTGAGAGACTTCCTTTAACATTTCTTGCAGGGCATATTTACTGGTGATACATTACCTT 78918001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATTTGAGAGACTTCCTTTAACATTTCTTGCAGGGCATATTTACTGGTGATACATTACCTT 4140

 78918002 GGTTTTTCTTTTTCTGAGAAAAGTACTTGTCCTTCACATTTGGAGGAAAATTTCACTGGA 78918061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GGTTTTTCTTTTTCTGAGAAAAGTACTTGTCCTTCACATTTGGAGGAAAATTTCACTGGA 4200

 78918062 TAGAGAATTTTATGTGTGTGTTTTATTCTTTCAACGCTGTAAATATTTCACCATACCCTC 78918121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TAGAGAATTTTATGTGTGTGTTTTATTCTTTCAACGCTGTAAATATTTCACCATACCCTC 4260

 78918122 TTCATAATTGCATAATTTCTGGTGAAAAATCTGATGTAATTCCTTTATTTGACCTAGAGG 78918181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTCATAATTGCATAATTTCTGGTGAAAAATCTGATGTAATTCCTTTATTTGACCTAGAGG 4320

 78918182 TCAACAGCTTTTATTTTTCCTTATTGTATTTTCCAAGATTTCCCCTGTCTTTAATTTTTA 78918241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TCAACAGCTTTTATTTTTCCTTATTGTATTTTCCAAGATTTCCCCTGTCTTTAATTTTTA 4380

 78918242 TCAATTTTATTATTATATGCTTAGGTACTTATATTTAATGTATTTATCCTGATTGGCATT 78918301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TCAATTTTATTATTATATGCTTAGGTACTTATATTTAATGTATTTATCCTGATTGGCATT 4440

 78918302 TTATGACCTTTCTGGATCTGTAGTTTATTATTTGTCACTAATTTTGGAAAAGTTTCAGCT 78918361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTATGACCTTTCTGGATCTGTAGTTTATTATTTGTCACTAATTTTGGAAAAGTTTCAGCT 4500

 78918362 TTATTAATTCATTTTTATTTTTCTGCTGCTTTATTTTTCTCTTTTTTTCTCTGGTGTTCC 78918421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTATTAATTCATTTTTATTTTTCTGCTGCTTTATTTTTCTCTTTTTTTCTCTGGTGTTCC 4560

 78918422 CATTATATATATTTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCAC 78918481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CATTATATATATTTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTCAC 4620

 78918482 TTTAATTTTTCTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCTTTTAAGCT 78918541
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4621 TTTAATTTTTCTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCCTTTAAGCT 4680

 78918542 CCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCA 78918601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCA 4740

 78918602 TTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTA 78918661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTA 4800

 78918662 TCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACT 78918721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACT 4860

 78918722 CTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACT 78918781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACT 4920

 78918782 ATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTGCTTCTGATATGAATATAGA 78918841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4921 ATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTACTTCTGATATGAATATAGA 4980

 78918842 CACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACT 78918901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACT 5040

 78918902 CAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTC 78918961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTC 5100

 78918962 CACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATG 78919021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATG 5160

 78919022 ACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAG 78919081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAG 5220

 78919082 CTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAA 78919141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAA 5280

 78919142 GAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTC 78919201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTC 5340

 78919202 AGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAG 78919261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAG 5400

 78919262 ATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAAT 78919321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAAT 5460

 78919322 ATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAG 78919381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 ATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAG 5520

 78919382 TTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTC 78919441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTC 5580

 78919442 AACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAA 78919501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAA 5640

 78919502 CCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGC 78919561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGC 5700

 78919562 AGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTAT 78919621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTAT 5760

 78919622 GGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGAT 78919681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGAT 5820

 78919682 ACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTT 78919741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 ACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTT 5880

 78919742 ATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAA 78919801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 ATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAA 5940

 78919802 AAACCGAGAACAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAAC 78919861
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 AAACCGAGAGCAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAAC 6000

 78919862 CTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAG 78919921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAG 6060

 78919922 AGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCT 78919981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 AGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCT 6120

 78919982 GTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGAT 78920041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 GTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGAT 6180

 78920042 TGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGA 78920101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGA 6240

 78920102 ACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGT 78920161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 ACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGT 6300

 78920162 TTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAG 78920221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAG 6360

 78920222 CTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAA 78920281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 CTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAA 6420

 78920282 ATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCA 78920341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 ATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCA 6480

 78920342 TTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCC 78920401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 TTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCC 6540

 78920402 CCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAA 78920461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 CCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAA 6600

 78920462 CTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCT 78920521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 CTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCT 6660

 78920522 AGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACC 78920581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 AGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACC 6720

 78920582 AATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATG 78920641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 AATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATG 6780

 78920642 ATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATT 78920701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 ATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATT 6840

 78920702 GAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTG 78920761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 GAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTG 6900

 78920762 GAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAA 78920821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 GAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAA 6960

 78920822 ACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCA 78920881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 ACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCA 7020

 78920882 CACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATC 78920941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 CACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATC 7080

 78920942 AACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCA 78921001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 AACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCA 7140

 78921002 AGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAA 78921061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 AGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAA 7200

 78921062 AAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATAT 78921121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 AAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATAT 7260

 78921122 CAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAA 78921181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 CAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAA 7320

 78921182 AATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTA 78921241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 AATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTA 7380

 78921242 ATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAA 78921301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 ATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAA 7440

 78921302 ATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAA 78921361
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     7441 ATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAA 7500

 78921362 AGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCT 78921421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 AGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCT 7560

 78921422 TCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGT 78921481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 TCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGT 7620

 78921482 GATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAAT 78921541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 GATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAAT 7680

 78921542 ACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGA 78921601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 ACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGA 7740

 78921602 GGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGA 78921661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 GGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGA 7800

 78921662 AACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACC 78921721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 AACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACC 7860

 78921722 CACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGG 78921781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 CACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGG 7920

 78921782 AACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATG 78921841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 AACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATG 7980

 78921842 AAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 AAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 8028

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8164 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 8223

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8224 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 8283

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8284 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 8343

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8344 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 8403

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8404 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 8463

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     8464 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 8520

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 8580

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 8640

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 8700

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 8760

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 8820

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 8880

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8881 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 8940

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8941 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 9000

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9001 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 9060

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9061 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 9120

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9121 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 9180

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9181 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 9240

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9241 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 9300

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     9301 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAGATTTACTGAA 9360

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGA 78927308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     9361 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGA 9392

Alignment time is 12.7726 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    5847] =>      5847 nucs 'mol-32-30eb-143086_5847'

Score:        5586
Aligned:      5717        nucs
Identic:      5701 (100%) nucs =>      3394 (100%)      2307 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78918491,78921889] EXCISED REGION [78926077,78928392]
 second seq =>  [       1,    3399] EXCISED REGION [    3535,    5847]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [3400,3534]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78918491 TCTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCTTTTAAGCTCCATGATTG 78918550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
        1 TCTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCCTTTAAGCTCCATGATTG 60

 78918551 TTTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTA 78918610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTA 120

 78918611 CAGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTAC 78918670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTAC 180

 78918671 TTACATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAAC 78918730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTACATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAAC 240

 78918731 TGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCAC 78918790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCAC 300

 78918791 ACTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTGCTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGA 78918850
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTACTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGA 360

 78918851 GAACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAG 78918910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAG 420

 78918911 AAGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCT 78918970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCT 480

 78918971 TTATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAA 78919030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAA 540

 78919031 AGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCC 78919090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCC 600

 78919091 ATCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATG 78919150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATG 660

 78919151 ACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAAT 78919210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAAT 720

 78919211 GAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTAT 78919270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTAT 780

 78919271 AAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAG 78919330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAG 840

 78919331 CATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAA 78919390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAA 900

 78919391 GATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTG 78919450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTG 960

 78919451 CAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATT 78919510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATT 1020

 78919511 TTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGG 78919570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGG 1080

 78919571 GGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTC 78919630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTC 1140

 78919631 TGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGG 78919690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGG 1200

 78919691 AATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGA 78919750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGA 1260

 78919751 ATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGA 78919810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGA 1320

 78919811 ACAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCC 78919870
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCC 1380

 78919871 TCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCC 78919930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCC 1440

 78919931 TTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCT 78919990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCT 1500

 78919991 GAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAA 78920050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAA 1560

 78920051 AGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGA 78920110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGA 1620

 78920111 CAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATA 78920170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATA 1680

 78920171 CAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGAC 78920230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGAC 1740

 78920231 TGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAA 78920290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAA 1800

 78920291 ACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGA 78920350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGA 1860

 78920351 GGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTT 78920410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTT 1920

 78920411 TTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCA 78920470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCA 1980

 78920471 GACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATG 78920530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATG 2040

 78920531 CAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACA 78920590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACA 2100

 78920591 GACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGT 78920650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGT 2160

 78920651 GCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCT 78920710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCT 2220

 78920711 AGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTC 78920770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTC 2280

 78920771 ACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCAC 78920830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCAC 2340

 78920831 TTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACA 78920890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACA 2400

 78920891 ACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATG 78920950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATG 2460

 78920951 CTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTA 78921010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTA 2520

 78921011 TCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAA 78921070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAA 2580

 78921071 AAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAG 78921130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAG 2640

 78921131 ACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGG 78921190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGG 2700

 78921191 GATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAG 78921250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAG 2760

 78921251 TTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGA 78921310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGA 2820

 78921311 AAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAA 78921370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2821 AAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAA 2880

 78921371 ATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACA 78921430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACA 2940

 78921431 TAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAAT 78921490
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAAATAAAATTGATAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAAT 3000

 78921491 AAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGAT 78921550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGAT 3060

 78921551 CCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGA 78921610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGA 3120

 78921611 AAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAA 78921670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAA 3180

 78921671 TAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAG 78921730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAG 3240

 78921731 CCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTG 78921790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTG 3300

 78921791 AAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCA 78921850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCA 3360

 78921851 TCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 3399

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 3594

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 3654

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 3714

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 3774

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 3834

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     3835 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 3891

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 3951

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 4011

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 4071

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 4131

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 4191

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 4251

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 4311

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 4371

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 4431

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 4491

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4492 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 4551

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 4611

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 4671

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 4731

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 4791

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 4851

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4852 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 4911

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 4971

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4972 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 5031

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5032 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 5091

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5092 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 5151

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5152 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 5211

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5212 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 5271

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5272 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 5331

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 5391

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 5449

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5450 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 5509

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5510 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 5569

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5570 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 5629

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5630 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 5689

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5690 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 5749

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5750 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 5809

 78928355 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGG 78928392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5810 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGG 5847

Alignment time is 8.32084 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2313] =>      2313 nucs 'mol-32-30eb-143086_2313'

Score:        2255
Aligned:      2314        nucs
Identic:      2307 (100%) nucs =>      1860 (100%)       447 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78926077,78927941] EXCISED REGION [78927944,78928392]
 second seq =>  [       1,    1862] EXCISED REGION [    1865,    2313]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [78927942,78927943]
 second seq =>         2 nucs [1863,1864]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [78927941,78927942] to [78927943,78927944]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 60

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 120

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 180

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 240

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 300

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
      301 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAG---GT 357

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 417

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 477

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 537

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 597

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 657

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 717

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 777

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 837

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 897

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 957

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1017

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1077

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1137

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1197

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 1257

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 1317

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1318 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 1377

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 1437

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 1497

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 1557

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1558 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 1617

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 1677

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 1737

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 1797

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 1857

 78927937 GGGAG 78927941
          |||||
     1858 GGGAG 1862

EXCISED REGION

 78927944 TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAGCCAGA 78928003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAGCCAGA 1924

 78928004 AATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTATAAATCATG 78928063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 AATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTATAAATCATG 1984

 78928064 CTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAATAGCAAAGAC 78928123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 CTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAATAGCAAAGAC 2044

 78928124 TTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTGGCAAATATA 78928183
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 TTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTGGCAAATATA 2104

 78928184 CACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAGGGACATGGA 78928243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 CACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAGGGACATGGA 2164

 78928244 TTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCAAACACCGCA 78928303
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 TTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCAAACACCGCA 2224

 78928304 TGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGGAGGGGAACA 78928363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 TGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGGAGGGGAACA 2284

 78928364 TCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGG 78928392
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2285 TCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGG 2313

Alignment time is 3.21516 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    7109] =>      7109 nucs 'mol-32-30f6-082314_7109'

Score:        6863
Aligned:      6977        nucs
Identic:      6965 (100%) nucs =>      5502 (100%)      1463 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78916380,78921889] EXCISED REGION [78926077,78927543]
 second seq =>  [       1,    5510] EXCISED REGION [    5646,    7109]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [5511,5645]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78916380 TCTTTCAGCAGTGTTTTGTAGTTTTTCTTGTAGAGGTCAAGTATATTCCCAAGTATTTTA 78916439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTTCAGCAGTGTTTTGTAGTTTTTCTTGTAGAGGTCAAGTATATTCCCAAGTATTTTA 60

 78916440 TTTCTTCACAGCTATTGTAAAAGGGCTTGTGTTTTTTGATTCTCAGCTTGGTTGCTGTTG 78916499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCTTCACAGCTATTGTAAAAGGGCTTGTGTTTTTTGATTCTCAGCTTGGTTGCTGTTG 120

 78916500 GTGTATAGCAGGGCTACTGATTTATGTACATTAAGTTTGCATCCTGAAAGTTTGCTGAAT 78916559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGTATAGCAGGGCTACTGATTTATGTACATTAAGTTTGCATCCTGAAAGTTTGCTGAAT 180

 78916560 TCATTTATTAGTTCTAGGAGCTTTTAGGATAATCTTTAGGGCTTTCTAGGTATATGATCA 78916619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCATTTATTAGTTCTAGGAGCTTTTAGGATAATCTTTAGGGCTTTCTAGGTATATGATCA 240

 78916620 TGTCATCAGCAAAGAGGAACAGTTTGACTTCCTCTTTACCGATTTGGATGCCTTTATATC 78916679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTCATCAGCAAAGAGGAACAGTTTGACTTCCTCTTTACCGATTTGGATGCCTTTATATC 300

 78916680 ATTCTCTTGTCTGATTGCTCAGGCTAGGGCTTCCAGTACTATATTGAAGAGAAATGGTGA 78916739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCTCTTGTCTGATTGCTCAGGCTAGGGCTTCCAGTACTATATTGAAGAGAAATGGTGA 360

 78916740 AAATGTGCATTTTTGTCTTCCTCCAGTTCTCAGGGGTAATGTTTTCAACTTTTCCCAGGT 78916799
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      361 AAATGTGCATTTTTGTCTTCCTCCAGTTCTCAGGGGTAATGCTTTCAACTTTTCCCAGGT 420

 78916800 CAGTATAATGATGTCTGTGTGTTTGTCATAGTTGGCTTTTATTACCTTAAGGTATGTCCC 78916859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGTATAATGATGTCTGTGTGTTTGTCATAGTTGGCTTTTATTACCTTAAGGTATGTCCC 480

 78916860 TTCTATGCCAATTTTGCTGAGGGTTTTAGTCATAAAGGGATGCTGGATTTTGTCAAATGC 78916919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTATGCCAATTTTGCTGAGGGTTTTAGTCATAAAGGGATGCTGGATTTTGTCAAATGC 540

 78916920 TTTTTCTGAGTCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGTTTTTACTTCTGTTTGTGAGGTG 78916979
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTCTGAGTCTATTGAGATGATCACGTGATTTTTGTTTTTACTTCTGTTTGTGAGGTG 600

 78916980 TATCACATTTATTGACTTGCATATGTTAAACCATTCCTGCATTCCTGGTCTCTAACACAC 78917039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATCACATTTATTGACTTGCATATGTTAAACCATTCCTGCATTCCTGGTCTCTAACACAC 660

 78917040 TTGATCATGGCAGATTATCTTTTTGGTATGCTATTGGATTCAGTTAGCGAGTAATTTGTT 78917099
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGATCATGGCAGATTATCTTTTTGATATGCTATTGGATTCAGTTAGCGAGTAATTTGTT 720

 78917100 GAGGATTTTTGCATATGTTCATCAGGAATATTATTCTGTAGTTTTATTTTCTGTTATGTC 78917159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGGATTTTTGCATATGTTCATCAGGAATATTATTCTGTAGTTTTATTTTCTGTTATGTC 780

 78917160 CTTTCTTGTTTTGGGTATTATGGTGATACTGGATTCATAGAATGACTTACAAAAGATTCC 78917219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTTCTTGTTTTGGGTATTATGGTGATACTGGATTCATAGAATGACTTACAAAAGATTCC 840

 78917220 TTCTTTCTCTATCTTGTGGAATAGTGTCCATAGTACTGGTACCAATTCTTCTTTGAATGC 78917279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTTTCTCTATCTTGTGGAATAGTGTCCATAGTACTGGTACCAATTCTTCTTTGAATGC 900

 78917280 CTGATAAAATTCATCTGTGAATCCATCTGGTAGTGAACATTTTTTTGTTAGTAATATTTT 78917339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGATAAAATTCATCTGTGAATCCATCTGGTAGTGAACATTTTTTTGTTAGTAATATTTT 960

 78917340 AATTACCATTTTAATCTTGCTGCTTGTTATTGGTGTGTTCAGAGTTTCTATTTCTTCCTG 78917399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATTACCATTTTAATCTTGCTGCTTGTTATTGGTGTGTTCAGAGTTTCTATTTCTTCCTG 1020

 78917400 GTTTAATCTAGAAGTGTTGTATATTTACAGAAATGTATCCATCTCCTCCAGGTTTTCTAG 78917459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTTAATCTAGAAGTGTTGTATATTTACAGAAATGTATCCATCTCCTCCAGGTTTTCTAG 1080

 78917460 ATTATACAAGTAAATGTGTTCATAGTAGCCTGGTATTTTTGTATTAATTGCACACATTCT 78917519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTATACAAGTAAATGTGTTCATAGTAGCCTGGTATTTTTGTATTAATTGCACACATTCT 1140

 78917520 CTTTTTTATCTTCCCCCTTTTGTGCATTTTCTTGTTTTATTTATACTTTTATATTTTATT 78917579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTTTTATCTTCCCCCTTTTGTGCATTTTCTTGTTTTATTTATACTTTTATATTTTATT 1200

 78917580 TCTCTCCACTTTTGGCATATCAGTTTTATTTATTTTAAATTATTTTGGAGATTGTCAAGA 78917639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTCTCCACTTTTGGCATATCAGTTTTATTTATTTTAAATTATTTTGGAGATTGTCAAGA 1260

 78917640 GCTCATAAAACACATTTCTCACTAAGCTATGTGCTTTAAACAATTACTATGCCACTTCAC 78917699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTCATAAAACACATTTCTCACTAAGCTATGTGCTTTAAACAATTACTATGCCACTTCAC 1320

 78917700 AAGTAGTACAACTAACTTTTAAGAGAATCTCCCTACATTATTTCTCATTTCCTTTATAAA 78917759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGTAGTACAACTAACTTTTAAGAGAATCTCCCTACATTATTTCTCATTTCCTTTATAAA 1380

 78917760 ATTATTGTCATTCATTTCACATATTCATATATTAGAATGAATTAATACCTTGTTACTCTT 78917819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTATTGTCATTCATTTCACATATTCATATATTAGAATGAATTAATACCTTGTTACTCTT 1440

 78917820 ATTACTTTGAACATATAGTTATCTATAACATCAATTTAAAAAATGTTTTATATTTCATCT 78917879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTACTTTGAACATATAGTTATCTATAACATCAATTTAAAAAATGTTTTATATTTCATCT 1500

 78917880 AATTATTCATCAGTTATATTCTTTATATTGATCTGAGTTTTGACCTATGTCATTTTCTTG 78917939
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1501 AATTATTCATCAGTTATATTCTTTATATTGATCTGAGTTTTGACCTACGTCATTTTCTTG 1560

 78917940 TTATTTGAGAGACTTCCTTTAACATTTCTTGCAGGGCATATTTACTGGTGATACATTACC 78917999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTATTTGAGAGACTTCCTTTAACATTTCTTGCAGGGCATATTTACTGGTGATACATTACC 1620

 78918000 TTGGTTTTTCTTTTTCTGAGAAAAGTACTTGTCCTTCACATTTGGAGGAAAATTTCACTG 78918059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGGTTTTTCTTTTTCTGAGAAAAGTACTTGTCCTTCACATTTGGAGGAAAATTTCACTG 1680

 78918060 GATAGAGAATTTTATGTGTGTGTTTTATTCTTTCAACGCTGTAAATATTTCACCATACCC 78918119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GATAGAGAATTTTATGTGTGTGTTTTATTCTTTCAACGCTGTAAATATTTCACCATACCC 1740

 78918120 TCTTCATAATTGCATAATTTCTGGTGAAAAATCTGATGTAATTCCTTTATTTGACCTAGA 78918179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTTCATAATTGCATAATTTCTGGTGAAAAATCTGATGTAATTCCTTTATTTGACCTAGA 1800

 78918180 GGTCAACAGCTTTTATTTTTCCTTATTGTATTTTCCAAGATTTCCCCTGTCTTTAATTTT 78918239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGTCAACAGCTTTTATTTTTCCTTATTGTATTTTCCAAGATTTCCCCTGTCTTTAATTTT 1860

 78918240 TATCAATTTTATTATTATATGCTTAGGTACTTATATTTAATGTATTTATCCTGATTGGCA 78918299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATCAATTTTATTATTATATGCTTAGGTACTTATATTTAATGTATTTATCCTGATTGGCA 1920

 78918300 TTTTATGACCTTTCTGGATCTGTAGTTTATTATTTGTCACTAATTTTGGAAAAGTTTCAG 78918359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTATGACCTTTCTGGATCTGTAGTTTATTATTTGTCACTAATTTTGGAAAAGTTTCAG 1980

 78918360 CTTTATTAATTCATTTTTATTTTTCTGCTGCTTTATTTTTCTCTTTTTTTCTCTGGTGTT 78918419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTTATTAATTCATTTTTATTTTTCTGCTGCTTTATTTTTCTCTTTTTTTCTCTGGTGTT 2040

 78918420 CCCATTATATATATTTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTC 78918479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCCATTATATATATTTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGCAGTTATTAGTTATTCTTTCTC 2100

 78918480 ACTTTAATTTTTCTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCTTTTAAG 78918539
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2101 ACTTTAATTTTTCTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAATTTCTATTGACATGCCTTTAAG 2160

 78918540 CTCCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTT 78918599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTT 2220

 78918600 CATTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTC 78918659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CATTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTC 2280

 78918660 TATCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGA 78918719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TATCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGA 2340

 78918720 CTCTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTA 78918779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTCTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTA 2400

 78918780 CTATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTGCTTCTGATATGAATATA 78918839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2401 CTATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTACTTCTGATATGAATATA 2460

 78918840 GACACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAA 78918899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GACACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAA 2520

 78918900 CTCAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCT 78918959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTCAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCT 2580

 78918960 TCCACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTA 78919019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCCACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTA 2640

 78919020 TGACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAG 78919079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAG 2700

 78919080 AGCTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACT 78919139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGCTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACT 2760

 78919140 AAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGT 78919199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGT 2820

 78919200 TCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAAT 78919259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAAT 2880

 78919260 AGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACA 78919319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACA 2940

 78919320 ATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATA 78919379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATA 3000

 78919380 AGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGG 78919439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGG 3060

 78919440 TCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAA 78919499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAA 3120

 78919500 AACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGAT 78919559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGAT 3180

 78919560 GCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCT 78919619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCT 3240

 78919620 ATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAG 78919679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAG 3300

 78919680 ATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTG 78919739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTG 3360

 78919740 TTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAG 78919799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAG 3420

 78919800 AAAAACCGAGAACAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGA 78919859
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAAAACCGAGAGCAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGA 3480

 78919860 ACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCA 78919919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCA 3540

 78919920 AGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATT 78919979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATT 3600

 78919980 CTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAG 78920039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAG 3660

 78920040 ATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAA 78920099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAA 3720

 78920100 GAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAAT 78920159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAAT 3780

 78920160 GTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAG 78920219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAG 3840

 78920220 AGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTA 78920279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTA 3900

 78920280 AAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGG 78920339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGG 3960

 78920340 CATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGT 78920399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGT 4020

 78920400 CCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAG 78920459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAG 4080

 78920460 AACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCAC 78920519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCAC 4140

 78920520 CTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAA 78920579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAA 4200

 78920580 CCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAA 78920639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAA 4260

 78920640 TGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACA 78920699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACA 4320

 78920700 TTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAG 78920759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAG 4380

 78920760 TGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAG 78920819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAG 4440

 78920820 AAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACAC 78920879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACAC 4500

 78920880 CACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGA 78920939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGA 4560

 78920940 TCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATAC 78920999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATAC 4620

 78921000 CAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATC 78921059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATC 4680

 78921060 AAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAAT 78921119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAAT 4740

 78921120 ATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACC 78921179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACC 4800

 78921180 AAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCT 78921239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCT 4860

 78921240 TAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAG 78921299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAG 4920

 78921300 AAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAG 78921359
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4921 AAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAA 4980

 78921360 AAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTT 78921419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTT 5040

 78921420 CTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAG 78921479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAG 5100

 78921480 GTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAA 78921539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAA 5160

 78921540 ATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATA 78921599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATA 5220

 78921600 GAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATG 78921659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATG 5280

 78921660 GAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCA 78921719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCA 5340

 78921720 CCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAA 78921779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAA 5400

 78921780 GGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTA 78921839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTA 5460

 78921840 TGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 5510

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5646 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 5705

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5706 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 5765

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5766 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 5825

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5826 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 5885

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5886 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 5945

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     5946 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 6002

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6003 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 6062

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6063 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 6122

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6123 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 6182

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6183 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 6242

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6243 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 6302

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6303 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 6362

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6363 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 6422

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6423 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 6482

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6483 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 6542

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6543 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 6602

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6603 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 6662

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6663 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 6722

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6723 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 6782

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6783 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 6842

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6843 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 6902

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6903 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 6962

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6963 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 7022

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7023 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 7082

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGAT 78927543
          |||||||||||||||||||||||||||
     7083 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGAT 7109

Alignment time is 9.94055 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2608] =>      2608 nucs 'mol-32-30f6-142934_2608'

Score:        2439
Aligned:      2476        nucs
Identic:      2471 (100%) nucs =>      1278 (100%)      1193 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78920610,78921889] EXCISED REGION [78926077,78927272]
 second seq =>  [       1,    1280] EXCISED REGION [    1416,    2608]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [1281,1415]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78920610 TTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCC 78920669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCC 60

 78920670 TAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTC 78920729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTC 120

 78920730 TTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAG 78920789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAG 180

 78920790 ACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACC 78920849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACC 240

 78920850 AATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCT 78920909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCT 300

 78920910 TCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGC 78920969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGC 360

 78920970 TCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAA 78921029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAA 420

 78921030 ATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAAC 78921089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAAC 480

 78921090 AGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTG 78921149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTG 540

 78921150 AAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGT 78921209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGT 600

 78921210 TAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTA 78921269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTA 660

 78921270 ACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCA 78921329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCA 720

 78921330 AGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTA 78921389
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTA 780

 78921390 TTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACC 78921449
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      781 TTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGATAAACC 840

 78921450 ATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAAC 78921509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAAC 900

 78921510 AAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAG 78921569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAG 960

 78921570 CAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTAC 78921629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTAC 1020

 78921630 CATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCT 78921689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCT 1080

 78921690 GAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTT 78921749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTT 1140

 78921750 ACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGA 78921809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGA 1200

 78921810 GGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATC 78921869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATC 1260

 78921870 TGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||
     1261 TGGCAGAGACATAATGAAGA 1280

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 1475

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 1535

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 1595

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 1655

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 1715

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     1716 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 1772

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 1832

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 1892

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 1952

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 2012

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 2072

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 2132

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 2192

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 2252

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 2312

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 2372

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 2432

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 2492

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 2552

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTAC 78927272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTAC 2608

Alignment time is 3.61048 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4204] =>      4204 nucs 'mol-32-3101-210311_4204'

Score:        4013
Aligned:      4072        nucs
Identic:      4065 (100%) nucs =>      3326 (100%)       739 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78918560,78921889] EXCISED REGION [78926077,78926818]
 second seq =>  [       1,    3330] EXCISED REGION [    3466,    4204]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [3331,3465]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78918560 CCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTT 78918619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTT 60

 78918620 TTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTACATGAC 78918679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTACATGAC 120

 78918680 TCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCT 78918739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCT 180

 78918740 TTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACTAACTAA 78918799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACTAACTAA 240

 78918800 AACTATAATTAAAAGTACCTCTGCTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAACACAGA 78918859
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACTATAATTAAAAGTACCTCTACTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAACACAGA 300

 78918860 ATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAGCAAATC 78918919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAGCAAATC 360

 78918920 CTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTAC 78918979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTAC 420

 78918980 TCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGTTGCTAT 78919039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGTTGCTAT 480

 78919040 GTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCAT 78919099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCAT 540

 78919100 AGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTT 78919159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTT 600

 78919160 TGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATG 78919219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATG 660

 78919220 AGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAA 78919279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAA 720

 78919280 AATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAA 78919339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAA 780

 78919340 TCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATG 78919399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATG 840

 78919400 AAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTA 78919459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTA 900

 78919460 AGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGA 78919519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGA 960

 78919520 TCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGG 78919579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGG 1020

 78919580 GAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCT 78919639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCT 1080

 78919640 AATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTG 78919699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTG 1140

 78919700 GTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCC 78919759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCC 1200

 78919760 CAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAACAAGAATT 78919819
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1201 CAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAGCAAGAATT 1260

 78919820 TAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATG 78919879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATG 1320

 78919880 AGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTA 78919939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTA 1380

 78919940 AATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATA 78919999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATA 1440

 78920000 GACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAAC 78920059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAAC 1500

 78920060 TCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAG 78920119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAG 1560

 78920120 ATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAA 78920179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAA 1620

 78920180 ATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTT 78920239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTT 1680

 78920240 GAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAG 78920299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAG 1740

 78920300 AAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAG 78920359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAG 1800

 78920360 AGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATC 78920419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATC 1860

 78920420 TCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATA 78920479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATA 1920

 78920480 CAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAA 78920539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAA 1980

 78920540 AAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATC 78920599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATC 2040

 78920600 CCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAA 78920659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAA 2100

 78920660 GAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTG 78920719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTG 2160

 78920720 AAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTG 78920779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTG 2220

 78920780 ACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTA 78920839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTA 2280

 78920840 ACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAA 78920899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAA 2340

 78920900 TACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCAC 78920959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCAC 2400

 78920960 AAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCAC 78921019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCAC 2460

 78921020 AGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATG 78921079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATG 2520

 78921080 GAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATT 78921139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATT 2580

 78921140 TAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCC 78921199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCC 2640

 78921200 AAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGA 78921259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGA 2700

 78921260 TCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAG 78921319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAG 2760

 78921320 TGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTG 78921379
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2761 TGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTG 2820

 78921380 CAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAA 78921439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAA 2880

 78921440 TTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAAT 78921499
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTGATAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAAT 2940

 78921500 CAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGA 78921559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGA 3000

 78921560 ATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGG 78921619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGG 3060

 78921620 GGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAAT 78921679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAAT 3120

 78921680 ATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCT 78921739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCT 3180

 78921740 AAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTT 78921799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTT 3240

 78921800 TAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAA 78921859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAA 3300

 78921860 TACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 3330

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 3525

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 3585

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 3645

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 3705

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 3765

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     3766 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 3822

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 3882

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 3942

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 4002

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 4062

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 4122

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 4182

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTAC 78926818
          ||||||||||||||||||||||
     4183 GTGTTTATTTTTATGTCAGTAC 4204

Alignment time is 5.83937 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,   10042] =>     10042 nucs 'mol-32-310c-162887_10042'

Score:        9630
Aligned:      9917        nucs
Identic:      9886 (100%) nucs =>       717 (100%)      9169 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78921171,78921889] EXCISED REGION [78926077,78935270]
 second seq =>  [       1,     719] EXCISED REGION [     855,   10042]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [720,854]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78921171 CAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGC 78921230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGC 60

 78921231 TAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAA 78921290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAA 120

 78921291 AGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAA 78921350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAA 180

 78921351 ATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAA 78921410
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAA 240

 78921411 GACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAA 78921470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      241 GACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGATAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAA 300

 78921471 AAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGAT 78921530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGAT 360

 78921531 CCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTA 78921590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTA 420

 78921591 GAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAG 78921650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAG 480

 78921651 GAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAA 78921710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAA 540

 78921711 ATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATG 78921770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATG 600

 78921771 TACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTAC 78921830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTAC 660

 78921831 CTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 719

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 914

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 974

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 1034

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 1094

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 1154

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     1155 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 1211

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 1271

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 1331

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 1391

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 1451

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 1511

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 1571

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 1631

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 1691

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 1751

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 1811

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1871

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1931

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1991

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 2051

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 2111

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 2171

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2172 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 2231

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 2291

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 2351

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 2411

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2412 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 2471

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 2531

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 2591

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 2651

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 2711

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 2769

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 2829

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 2889

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 2949

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 3009

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 3069

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 3129

 78928355 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 78928414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 3189

 78928415 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 78928474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 3249

 78928475 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 78928534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 3309

 78928535 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 78928594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 3369

 78928595 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 78928654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 3429

 78928655 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 78928714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 3489

 78928715 GGTGTTGAA-TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTC 78928773
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3490 GGTGTTGAATTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTC 3549

 78928774 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 78928833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 3609

 78928834 CATCCCAGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 78928893
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 CATCCCCGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 3669

 78928894 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 78928953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 3729

 78928954 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 78929013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 3789

 78929014 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 78929073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 3849

 78929074 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCAATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 78929133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3850 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCCATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 3909

 78929134 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 78929193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 3969

 78929194 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 78929253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 4029

 78929254 TTTAGTTTATTGGTA-ATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 78929312
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 TTTAGTTTATTGGTATATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 4089

 78929313 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 78929372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 4149

 78929373 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 78929432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 4209

 78929433 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 78929492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 4269

 78929493 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 78929552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 4329

 78929553 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 78929612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 4389

 78929613 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 78929672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 4449

 78929673 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 78929732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4450 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 4509

 78929733 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 78929792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 4569

 78929793 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 78929852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 4629

 78929853 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 78929912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4630 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 4689

 78929913 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 78929972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4690 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 4749

 78929973 ATATATATACACACAAATACATATATATATATAATATATTGTTAGAAGAAAGAAACAAAT 78930032
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4750 ATATATATACACACAAATAC--ATATATATATAATATATTGTTAGAAGAAAGAAACAAAT 4807

 78930033 TTTTATGCTTCATGTCATATAAAATAATTATCATAATAAAAAGATTTTTAAAGTGGTGTA 78930092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 TTTTATGCTTCATGTCATATAAAATAATTATCATAATAAAAAGATTTTTAAAGTGGTGTA 4867

 78930093 AAAGCTCAGTGATAACTTTGAATATAAATGGATTAATTTCCTGTATTATTAGACTGGCTT 78930152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 AAAGCTCAGTGATAACTTTGAATATAAATGGATTAATTTCCTGTATTATTAGACTGGCTT 4927

 78930153 TAACAAGAAAATTCCATCTACATATTTTTAACAACAACCACAAAAATTATAATAAAGAAA 78930212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 TAACAAGAAAATTCCATCTACATATTTTTAACAACAACCACAAAAATTATAATAAAGAAA 4987

 78930213 GGGTTACAATGAATGAATGTTTACAGAGAAATTAGGCAAAGCTGAAGCAACTATGAAAAT 78930272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 GGGTTACAATGAATGAATGTTTACAGAGAAATTAGGCAAAGCTGAAGCAACTATGAAAAT 5047

 78930273 ACCAATAGAAGATACAGTAGAAGTCATGAAATAAACTCTAAAATGACTTGAAATCATTAT 78930332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 ACCAATAGAAGATACAGTAGAAGTCATGAAATAAACTCTAAAATGACTTGAAATCATTAT 5107

 78930333 TTATTTATATTGACAGAATATGTAGTTTCTATTCAATGTGAATGTAAAAATTGATTAATA 78930392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 TTATTTATATTGACAGAATATGTAGTTTCTATTCAATGTGAATGTAAAAATTGATTAATA 5167

 78930393 TTAGCATTTGCTATTTATATTTAAAATATTGGAAATGAGGAGAGCAAGATAAAATACATT 78930452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 TTAGCATTTGCTATTTATATTTAAAATATTGGAAATGAGGAGAGCAAGATAAAATACATT 5227

 78930453 TTTAATGAGAACACTTTCAGTCTTTTTATCTTTAACAGATCCAGAAGACAATATATGGAT 78930512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5228 TTTAATGAGAACACTTTCAGTCTTTTTATCTTTAACAGATCCAGAAGACAATATATGGAT 5287

 78930513 AATATAATCAATACTGTAAACTTGAGTAATGTAGATAAGGTATATTGGTTAAAGTACATG 78930572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 AATATAATCAATACTGTAAACTTGAGTAATGTAGATAAGGTATATTGGTTAAAGTACATG 5347

 78930573 TCATTATACTATACAAAACCCCAAAGAACAGTAGCTAAAATAATATATTTTTCATTCCAT 78930632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5348 TCATTATACTATACAAAACCCCAAAGAACAGTAGCTAAAATAATATATTTTTCATTCCAT 5407

 78930633 ATAACAACATGAATTTCATAAGCAGTGCAGAGGAGGAACAAAGTCCTGTTTTGGATAAAT 78930692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5408 ATAACAACATGAATTTCATAAGCAGTGCAGAGGAGGAACAAAGTCCTGTTTTGGATAAAT 5467

 78930693 ATCCAGGTAGTAAACTTTCCTCTTCTAACTTGTTTCTCTGCTTGATTGAAGCTAGCTCAT 78930752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5468 ATCCAGGTAGTAAACTTTCCTCTTCTAACTTGTTTCTCTGCTTGATTGAAGCTAGCTCAT 5527

 78930753 CATGACTACATTTGCACATTTTATTACAGAGGAGAGGACGAAGAGAAATTGCAGTAGAAG 78930812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5528 CATGACTACATTTGCACATTTTATTACAGAGGAGAGGACGAAGAGAAATTGCAGTAGAAG 5587

 78930813 TAGTTTTCTGTGTAAAATATAAGATCAAGGATTTACACACATCACTTGTCTTCATAGCCT 78930872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5588 TAGTTTTCTGTGTAAAATATAAGATCAAGGATTTACACACATCACTTGTCTTCATAGCCT 5647

 78930873 ATTTGCCAGAACTAAGTTGGATGCCCACAACTGTAAGGAATGGTGGAAAAGTCGGAAGCT 78930932
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5648 ATTTGCCAGAACTAAGTCGGATGCCCACAACTGTAAGGAATGGTGGAAAAGTCGGAAGCT 5707

 78930933 GTGCAAAGTAGCTAAACTGGGGGGGGAGTGGGAGTACAGGTTGCCAGTAGGTTCAAAGGA 78930992
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5708 GTGCAAAGTAGCTAAACT-GGGGGGGAGTGGGAGTACAGGTTGCCAGTAGGTTCAAAGGA 5766

 78930993 AAATAACACTTCAAGAGAATTGGAAGTCTCTACCACTGAGTGCTTCTCATTTATGAAACT 78931052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 AAATAACACTTCAAGAGAATTGGAAGTCTCTACCACTGAGTGCTTCTCATTTATGAAACT 5826

 78931053 GCTTTATGGCATCTGCATAGGAAATTTTGACAGTTTCTACCAAGTGCCACTAAGACACAT 78931112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 GCTTTATGGCATCTGCATAGGAAATTTTGACAGTTTCTACCAAGTGCCACTAAGACACAT 5886

 78931113 AAATATCATAAATATCCAGAAAACATTGAAAAATCACAAACACAGATAACTAACAGTGAC 78931172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 AAATATCATAAATATCCAGAAAACATTGAAAAATCACAAACACAGATAACTAACAGTGAC 5946

 78931173 ATACAATCTGGTGCCAAATTTTGAAGTGAAAGTCATTGTTTCCCTAAGTGTACTATAAAA 78931232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 ATACAATCTGGTGCCAAATTTTGAAGTGAAAGTCATTGTTTCCCTAAGTGTACTATAAAA 6006

 78931233 CACTCTTCTAACAGATATTAATATGAATTCTGAGAGAAGAATTGTTCTGTACTCAAGAGT 78931292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 CACTCTTCTAACAGATATTAATATGAATTCTGAGAGAAGAATTGTTCTGTACTCAAGAGT 6066

 78931293 TTGGACAATGTCAGTTTTAATCGATTAAAGAGGTTTATTTACTTTAGAGCTTCTCAGAGT 78931352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 TTGGACAATGTCAGTTTTAATCGATTAAAGAGGTTTATTTACTTTAGAGCTTCTCAGAGT 6126

 78931353 CTTTGCTATACTTACATGTATTATGATTCTGCAAGTTGCAGGGAATATCATATACAATAA 78931412
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 CTTTGGTATACTTACATGTATTATGATTCTGCAAGTTGCAGGGAATATCATATACAATAA 6186

 78931413 TTTTCAAACATATTTGACTACACAATTATTTCTATGTCACTGCTGTCAACATTTTTCCAA 78931472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 TTTTCAAACATATTTGACTACACAATTATTTCTATGTCACTGCTGTCAACATTTTTCCAA 6246

 78931473 AATAATGTATCTTCCAAATTAAAAAAATGCTATAAAGCAAATGGAACTAATAAAAAACAA 78931532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 AATAATGTATCTTCCAAATTAAAAAAATGCTATAAAGCAAATGGAACTAATAAAAAACAA 6306

 78931533 AACAAAACAAATATTCATCTGGGCTTTAAATGTTTTGGCTGAAAAAATGTAGGAAGATGC 78931592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 AACAAAACAAATATTCATCTGGGCTTTAAATGTTTTGGCTGAAAAAATGTAGGAAGATGC 6366

 78931593 TTTTTGAAAATTTTATTTTTTCTTACTCAAAGCAATGGGTCTGGACTTCATCAAATGGAC 78931652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 TTTTTGAAAATTTTATTTTTTCTTACTCAAAGCAATGGGTCTGGACTTCATCAAATGGAC 6426

 78931653 AATTCTTTCTGTGTTGCTGAAATATAGTTTTATTTGTGGTGGCTAGAGTACTATTTTAAA 78931712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 AATTCTTTCTGTGTTGCTGAAATATAGTTTTATTTGTGGTGGCTAGAGTACTATTTTAAA 6486

 78931713 AGCTCATTCTTTGTACAAATCTTTCAGATATAATGACTTTAAAAAGCAGAGAAACCAACA 78931772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 AGCTCATTCTTTGTACAAATCTTTCAGATATAATGACTTTAAAAAGCAGAGAAACCAACA 6546

 78931773 CCAGTGAAGTAAGTATATTAATATTTTAGGTGGGGGTTGAAGATAGGGAATTGGCACAGT 78931832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 CCAGTGAAGTAAGTATATTAATATTTTAGGTGGGGGTTGAAGATAGGGAATTGGCACAGT 6606

 78931833 GATTGAATTCTGGGAAAGTATATATAAATTTTTTTTTTTTACCAATCAGACTGAATGTTA 78931892
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 GATTGAATTCTGGGAAAGTATATATAAA-TTTTTTTTTTTACCAATCAGACTGAATGTTA 6665

 78931893 TTGTTTGTAGGAATCACAGGAAGAACAATAAAAGCAGTGCAGAGTATACCACACTTACCT 78931952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6666 TTGTTTGTAGGAATCACAGGAAGAACAATAAAAGCAGTGCAGAGTATACCACACTTACCT 6725

 78931953 TGTCTTTTTACCACACTGGAACATGACCTGTGAGATAAAGCAAAGACTTTTGTAGTGTTC 78932012
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6726 TGTCTTTTTACCACACTGGAACATGACCTGTGAGATAAAGCAAAGACCTTTGTAGTGTTC 6785

 78932013 CCCTTGATCCTAAGATCTCTTTGCTTCCTAATGCTCTTCTTCTTGACTAGTAATGTAAAC 78932072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6786 CCCTTGATCCTAAGATCTCTTTGCTTCCTAATGCTCTTCTTCTTGACTAGTAATGTAAAC 6845

 78932073 ATACCTAGTTTCATGGGTAGAGAAATTTGACTCTGGTTAATAACCTAGAGCATAGAATTG 78932132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6846 ATACCTAGTTTCATGGGTAGAGAAATTTGACTCTGGTTAATAACCTAGAGCATAGAATTG 6905

 78932133 ACATGTTTGGTGACTTTTTTCTGCCTGTCATTTCTTTACTGAGGCAGTAGAGGCAGAATA 78932192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6906 ACATGTTTGGTGACTTTTTTCTGCCTGTCATTTCTTTACTGAGGCAGTAGAGGCAGAATA 6965

 78932193 CCTAACTGTACCAAACTCTAAAAATATTACAGACTTCAGATCTGAAAAAGAGAATCCTCC 78932252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6966 CCTAACTGTACCAAACTCTAAAAATATTACAGACTTCAGATCTGAAAAAGAGAATCCTCC 7025

 78932253 ACCTCCAATACCTATATGGGCCTCTTCTGTAAGTCTGTCTCTGTTTTGCTAGCATGTGCA 78932312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     7026 ACCTCCAATACCTATATGGGCCTCTTCTGTAAGTCTATCTCTGTTTTGCTAGCATGTGCA 7085

 78932313 ACAATAGGACTGAGGAGTGGCCAAGGAGAAGCATTAGTTGGGGTGATAAATGGAGCTAGG 78932372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7086 ACAATAGGACTGAGGAGTGGCCAAGGAGAAGCATTAGTTGGGGTGATAAATGGAGCTAGG 7145

 78932373 ATATGAGTGTTTAGGTGTAGCTTCATGAAGCCTTTTGCAATGTGTAATAGAGCTAGGGGT 78932432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7146 ATATGAGTGTTTAGGTGTAGCTTCATGAAGCCTTTTGCAATGTGTAATAGAGCTAGGGGT 7205

 78932433 GGGAAAAGAAGGAAGACCTGCCAAATATGGAAAAACAGAGGACAGAGGCTAGCTCTCCCA 78932492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7206 GGGAAAAGAAGGAAGACCTGCCAAATATGGAAAAACAGAGGACAGAGGCTAGCTCTCCCA 7265

 78932493 GCAGTGGAACCTCAAGGCATGCTTTAAAGACAATTATAAACTCTAACCTGACTCTTCAAT 78932552
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7266 GCAGTGGAACCTCAAGGCATGCTCTAAAGACAATTATAAACTCTAACCTGACTCTTCAAT 7325

 78932553 TCAATATAGAAGTGTATTCTTCCAGTTATGATAAGATACCATAATTTAAAAGTTTTTAGG 78932612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7326 TCAATATAGAAGTGTATTCTTCCAGTTATGATAAGATACCATAATTTAAAAGTTTTTAGG 7385

 78932613 GTTTATTTGTAAGTTTTAGATATTTATACATATAGATTGCCAGCTTTCATTTGAACCCTT 78932672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7386 GTTTATTTGTAAGTTTTAGATATTTATACATATAGATTGCCAGCTTTCATTTGAACCCTT 7445

 78932673 GCCTGAGACACTGCCAATGTTAAAGGAAGGTCTCAGGAGAAGAATAGAAATCATATAAAA 78932732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7446 GCCTGAGACACTGCCAATGTTAAAGGAAGGTCTCAGGAGAAGAATAGAAATCATATAAAA 7505

 78932733 TTCCTTTGAGCAAATGCATTTCTTAAAATATTAATATGTTATCTCACTATAATTGCTATT 78932792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7506 TTCCTTTGAGCAAATGCATTTCTTAAAATATTAATATGTTATCTCACTATAATTGCTATT 7565

 78932793 AAAATCAACAAAATCTGGCATACAGAAATAACAGTGTGGGAGGATTTTACTTTGGATAGG 78932852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7566 AAAATCAACAAAATCTGGCATACAGAAATAACAGTGTGGGAGGATTTTACTTTGGATAGG 7625

 78932853 ATGCTCATATATTCTAAATAGATTACAAGATAGCTAAAACCTTAAGGATGAGAAGATACT 78932912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7626 ATGCTCATATATTCTAAATAGATTACAAGATAGCTAAAACCTTAAGGATGAGAAGATACT 7685

 78932913 ATTTATAGTTACAGAATGAAAAAAACATTCTAGACAAAAGACATAAGTTTTACAAAAGTC 78932972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7686 ATTTATAGTTACAGAATGAAAAAAACATTCTAGACAAAAGACATAAGTTTTACAAAAGTC 7745

 78932973 CTCGGACCACAGCACAGTCAAATTAAATCTCAAGATTAAAAAATTCACTCAAAACCACAC 78933032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7746 CTCGGACCACAGCACAGTCAAATTAAATCTCAAGATTAAAAAATTCACTCAAAACCACAC 7805

 78933033 AACTACATGGAAACTGACCAAGCTGTTCCTGAATGGCCTTTGAGTAAATAATGAAATTAA 78933092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7806 AACTACATGGAAACTGACCAAGCTGTTCCTGAATGGCCTTTGAGTAAATAATGAAATTAA 7865

 78933093 GGCAGAGAACAAGAAGTTATTCGAAACTAATGAGAATAAAGATACAACATACCAGAATTT 78933152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7866 GGCAGAGAACAAGAAGTTATTCGAAACTAATGAGAATAAAGATACAACATACCAGAATTT 7925

 78933153 CTGGGACACAGCTAAAGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATGCTCACATCAA 78933212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7926 CTGGGACACAGCTAAAGCAGTGTTAAGAGGGAAATTTATAGCACTAAATGCTCACATCAA 7985

 78933213 AAAGCTAGAAAGATCTCAAGTTAACAAGCTAACATCACAACTAAAAGAACAAGAAAATCA 78933272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7986 AAAGCTAGAAAGATCTCAAGTTAACAAGCTAACATCACAACTAAAAGAACAAGAAAATCA 8045

 78933273 AAAGCAAACAAACCCCAAAGCTAGCATGAGACAAGAAATAATCAAGATCAGACTTGACCT 78933332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8046 AAAGCAAACAAACCCCAAAGCTAGCATGAGACAAGAAATAATCAAGATCAGACTTGACCT 8105

 78933333 GAAGGAGTCACAGACATTAAAAAAAAAAAAAGAACTTAAAAATCAATGAATCCAGGAGCC 78933392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8106 GAAGGAGTCACAGACATTAAAAAAAAAAAAAGAACTTAAAAATCAATGAATCCAGGAGCC 8165

 78933393 ATTTTTATTGAAAAAAATAAACTAATAAAATAGACTGCTAGATAGACTAATAAAGAAGGA 78933452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8166 ATTTTTATTGAAAAAAATAAACTAATAAAATAGACTGCTAGATAGACTAATAAAGAAGGA 8225

 78933453 AAAAAGAGAACATTCAAAAGAACACAATCAGAAATGATCAGAGGGATATCATCACTGATG 78933512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8226 AAAAAGAGAACATTCAAAAGAACACAATCAGAAATGATCAGAGGGATATCATCACTGATG 8285

 78933513 CCGTAGAAATACATCAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTATGCACATAAACTAGA 78933572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8286 CCGTAGAAATACATCAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTATGCACATAAACTAGA 8345

 78933573 AAATCTAGAAATAAATGGATAAATTCTTGGACACATACACTCTCCCAAGACTGAAAGAGA 78933632
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8346 AAATCTAGAAATAAATGGGTAAATTCTTGGACACATACACTCTCCCAAGACTGAAAGAGA 8405

 78933633 AAGAAATGGAATCTCTGAATAGAACAATAATGAGCTCTGAAACTGAGGCAGGAATAAGTA 78933692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8406 AAGAAATGGAATCTCTGAATAGAACAATAATGAGCTCTGAAACTGAGGCAGGAATAAGTA 8465

 78933693 GCCTACCAACAAGTGTATTAAGATAAACAACTGAATTCTACCAGAGGCACAAAGATGGGC 78933752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8466 GCCTACCAACAAGTGTATTAAGATAAACAACTGAATTCTACCAGAGGCACAAAGATGGGC 8525

 78933753 TGGTACCATTCCTACTCAAAGTATTCCAATAAACTAAAAAAGAGAGACTCCTTTCTAACT 78933812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8526 TGGTACCATTCCTACTCAAAGTATTCCAATAAACTAAAAAAGAGAGACTCCTTTCTAACT 8585

 78933813 CTTTCTATGAGGCCAGTATCATCCTGATTCCAAAACCTAGCAGAGATACAACAAAAAGAA 78933872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8586 CTTTCTATGAGGCCAGTATCATCCTGATTCCAAAACCTAGCAGAGATACAACAAAAAGAA 8645

 78933873 AAAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATAAACACTGATGCAAAAATCCTCAAGAAAATACTG 78933932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8646 AAAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATAAACACTGATGCAAAAATCCTCAAGAAAATACTG 8705

 78933933 GCAAAGTGAATTTAGCAGCACATTAAGAAACTTATCCACCAAGGTCAGTAAGTTTCATCC 78933992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8706 GCAAAGTGAATTTAGCAGCACATTAAGAAACTTATCCACCAAGGTCAGTAAGTTTCATCC 8765

 78933993 TCGGGATGCAAGGTTGGTTCAACACACTCAAATCAATCAATGTGCTTCATCATATTAACA 78934052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8766 TCGGGATGCAAGGTTGGTTCAACACACTCAAATCAATCAATGTGCTTCATCATATTAACA 8825

 78934053 TACCTAGAGACCAAAACCACATGATTATCTCAATAGATGCAAAGAAGAAAACTTTTGAGA 78934112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8826 TACCTAGAGACCAAAACCACATGATTATCTCAATAGATGCAAAGAAGAAAACTTTTGAGA 8885

 78934113 AATTTCAACATCCCTTCATGTTAAAAGCTCTCAGTAAACTAGGTATTGAAGAAACATACA 78934172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8886 AATTTCAACATCCCTTCATGTTAAAAGCTCTCAGTAAACTAGGTATTGAAGAAACATACA 8945

 78934173 TAAAAATAATAACAGCCATATATGAAAAACCCACAGCCAACATTATACTGTACTGTCAAA 78934232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8946 TAAAAATAATAACAGCCATATATGAAAAACCCACAGCCAACATTATACTGTACTGTCAAA 9005

 78934233 AGTTGGAAGAATTCCCCTTGAAAACTGTCACAAGACAAGGATGCCCTCTCTCACCACTCC 78934292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9006 AGTTGGAAGAATTCCCCTTGAAAACTGTCACAAGACAAGGATGCCCTCTCTCACCACTCC 9065

 78934293 TATTCAACATAATTTTGGAAGTTTTGGCCATGGCAATCAGGCAAGAGAAAGAAATAAAGA 78934352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9066 TATTCAACATAATTTTGGAAGTTTTGGCCATGGCAATCAGGCAAGAGAAAGAAATAAAGA 9125

 78934353 GTATTCAAATAGGAAGAGAGAAAATAAAACTATCTTTGTTTGCAAATTACATGATCCTAT 78934412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9126 GTATTCAAATAGGAAGAGAGAAAATAAAACTATCTTTGTTTGCAAATTACATGATCCTAT 9185

 78934413 ATCTAGAAATCCCCATTGTCTCAGCTCCAAACCTTCTTAAGCTGTTAAGCAACTTCAGAA 78934472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9186 ATCTAGAAATCCCCATTGTCTCAGCTCCAAACCTTCTTAAGCTGTTAAGCAACTTCAGAA 9245

 78934473 AAGTCTCAAGATACAAAATCAATGAGAAAAAAAATGCTAGCATTTCTACACACCAACAAC 78934532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9246 AAGTCTCAAGATACAAAATCAATGAGAAAAAAAATGCTAGCATTTCTACACACCAACAAC 9305

 78934533 AGGCAAGCCAAGAGCCAAATCACAAATGAACTTCCAATCAAAACTGCCACAAAAAGAATA 78934592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9306 AGGCAAGCCAAGAGCCAAATCACAAATGAACTTCCAATCAAAACTGCCACAAAAAGAATA 9365

 78934593 AAATACCTAGGAATATAGCTAAAAAGGGAAGTGAAGGACCTCTTTAAGGAGAACTACAAA 78934652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9366 AAATACCTAGGAATATAGCTAAAAAGGGAAGTGAAGGACCTCTTTAAGGAGAACTACAAA 9425

 78934653 CCACTGCTCAAAGAAATCAGAGAAGACACAAACGGAAAAATATTCCATTTATAATGTCAA 78934712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9426 CCACTGCTCAAAGAAATCAGAGAAGACACAAACGGAAAAATATTCCATTTATAATGTCAA 9485

 78934713 TATAGGAAAAATCAATATTATTAAAAATCAACATTGCAAAAAATCAATATTGTTAAAATG 78934772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9486 TATAGGAAAAATCAATATTATTAAAAATCAACATTGCAAAAAATCAATATTGTTAAAATG 9545

 78934773 GCCATGGACATACTGCCCAAAGCAATTTATACATTCAATGCTATTCTTATTAAACTACTA 78934832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9546 GCCATGGACATACTGCCCAAAGCAATTTATACATTCAATGCTATTCTTATTAAACTACTA 9605

 78934833 TTGACATTCTTCACAGAATTAAAAAAAAAATATTTAAACATTCATATGAAACCAAAAAAG 78934892
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9606 TTGACATTCTTCACAGAATT-AAAAAAAAATATTTAAACATTCATATGAAACCAAAAAAG 9664

 78934893 TGCCGAAATAGCCAAAGAAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGGATCATGCTACC 78934952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9665 TGCCGAAATAGCCAAAGAAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGGATCATGCTACC 9724

 78934953 CAACTTCAAACTATACTACAGGGCTACAGTAATCTACGCAGCCTGGCACTAGTACAAGAG 78935012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9725 CAACTTCAAACTATACTACAGGGCTACAGTAATCTACGCAGCCTGGCACTAGTACAAGAG 9784

 78935013 CAGACACATAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACCCATAAATAAGACTGCACACCTACAA 78935072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9785 CAGACACATAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACCCATAAATAAGACTGCACACCTACAA 9844

 78935073 CCATCTAATCATTGACAAACCTGACAAAAACAATCAATGACAACAAAATTCCCTATTCAA 78935132
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     9845 CCATCTAATCATTGACAAACCTGACAAAAACAATCAATGACAACAAAATTCCCTATTTAA 9904

 78935133 TAAATGGTGCTGAGAGAACAGGCTAGCCATATGCAGAACATATAATCTGGACCCTTTCCT 78935192
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9905 TAAATGGTGCTGGGAGAACAGGCTAGCCATATGCAGAACATATAATCTGGACCCTTTCCT 9964

 78935193 TAAACCATATACAAAAATCAACTCAAAATGGATTAAAGATTTACATGTAAAATTTAAAAC 78935252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9965 TAAACCATATACAAAAATCAACTCAAAATGGATTAAAGATTTACATGTAAAATTTAAAAC 10024

 78935253 TATAAGAACTCTGGAAGA 78935270
          ||||||||||||||||||
    10025 TATAAGAACTCTGGAAGA 10042

Alignment time is 13.8273 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2655] =>      2655 nucs 'mol-32-3159-008033_2655'

Score:        2438
Aligned:      2525        nucs
Identic:      2513 (100%) nucs =>       437 (100%)      2076 ( 99%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78921452,78921889] EXCISED REGION [78926077,78928160]
 second seq =>  [       1,     438] EXCISED REGION [     574,    2655]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [439,573]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78921452 TAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAA 78921511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAA 60

 78921512 AGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCA 78921571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCA 120

 78921572 ACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCA 78921631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCA 180

 78921632 TCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGA 78921691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGA 240

 78921692 AATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTAC 78921751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTAC 300

 78921752 AGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGG 78921811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGG 360

 78921812 AAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTG 78921871
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATCCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTG 420

 78921872 GCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||
      421 GCAGAGACATAATGAAGA 438

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      574 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 633

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      634 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 693

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      694 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 753

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      754 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 813

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      814 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 873

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
      874 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 930

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      931 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 990

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      991 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 1050

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1051 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 1110

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1111 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 1170

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1171 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 1230

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1231 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 1290

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1291 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 1350

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 1410

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 1470

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 1530

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1590

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1650

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1710

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1770

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 1830

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 1890

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1891 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 1950

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 2010

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 2070

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTA- 78927635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2071 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAC 2130

 78927636 TCCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGAC 78927695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2131 TCCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGAC 2190

 78927696 AAAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAA 78927755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 AAAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAA 2250

 78927756 GGCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAA 78927815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 GGCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAA 2310

 78927816 ATGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAA 78927875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 ATGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAA 2370

 78927876 AAGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGT 78927935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 AAGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGT 2430

 78927936 TGGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATC 78927993
          ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 TGGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATC 2488

 78927994 TAGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATT 78928053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 TAGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATT 2548

 78928054 ATAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAA 78928113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 ATAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAA 2608

 78928114 TAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGA 78928160
          |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2609 TAGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGA 2655

Alignment time is 3.68534 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2883] =>      2883 nucs 'mol-32-321f-280126_2883'

Score:        2666
Aligned:      2753        nucs
Identic:      2741 (100%) nucs =>       608 (100%)      2133 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78921280,78921889] EXCISED REGION [78926077,78928217]
 second seq =>  [       1,     610] EXCISED REGION [     746,    2883]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [611,745]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78921280 TTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAA 78921339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAA 60

 78921340 AAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAAC 78921399
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAAC 120

 78921400 AATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGG 78921459
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      121 AATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGATAAACCATTAGCTAGG 180

 78921460 TTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAA 78921519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAA 240

 78921520 TTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTG 78921579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTG 300

 78921580 CACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAA 78921639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAA 360

 78921640 GATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAAC 78921699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAAC 420

 78921700 AAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAAT 78921759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAAT 480

 78921760 TCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGA 78921819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGA 540

 78921820 TTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGAC 78921879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGAC 600

 78921880 ATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||
      601 ATAATGAAGA 610

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      746 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 805

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      806 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 865

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      866 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 925

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      926 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 985

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      986 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 1045

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     1046 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 1102

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 1162

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1163 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 1222

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1223 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 1282

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1283 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 1342

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 1402

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 1462

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 1522

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 1582

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 1642

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 1702

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1762

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1822

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1882

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1942

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 2002

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 2062

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2063 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 2122

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 2182

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 2242

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 2302

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2303 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 2362

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 2422

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 2482

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 2542

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 2602

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 2660

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 2720

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 2780

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 2840

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATG 78928217
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATG 2883

Alignment time is 3.94272 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2083] =>      2083 nucs 'mol-32-3306-130662_2083'

Score:        1914
Aligned:      1951        nucs
Identic:      1946 (100%) nucs =>       367 (100%)      1579 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78921523,78921889] EXCISED REGION [78926077,78927660]
 second seq =>  [       1,     367] EXCISED REGION [     503,    2083]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [368,502]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78921523 CAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCAC 78921582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCAC 60

 78921583 ACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGAT 78921642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGAT 120

 78921643 TGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAG 78921702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAG 180

 78921703 TAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCT 78921762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCT 240

 78921763 ACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTC 78921822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTC 300

 78921823 CTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATA 78921882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATA 360

 78921883 ATGAAGA 78921889
          |||||||
      361 ATGAAGA 367

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      503 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 562

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      563 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 622

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      623 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 682

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 742

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      743 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 802

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
      803 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 859

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 919

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 979

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 1039

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 1099

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 1159

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 1219

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 1279

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 1339

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 1399

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 1459

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1519

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1579

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1639

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1699

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 1759

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 1819

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1820 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 1879

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 1939

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 1999

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2000 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAC 2059

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCC 78927660
          ||||||||||||||||||||||||
     2060 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCC 2083

Alignment time is 2.85239 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4752] =>      4752 nucs 'mol-32-33b6-097088_4752'

Score:        4480
Aligned:      4622        nucs
Identic:      4605 (100%) nucs =>       701 (100%)      3904 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78921188,78921889] EXCISED REGION [78926077,78929992]
 second seq =>  [       1,     702] EXCISED REGION [     838,    4752]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [703,837]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78921188 TGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAG 78921247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAG 60

 78921248 AAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAAT 78921307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAAT 120

 78921308 GGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAAT 78921367
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      121 GGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAAT 180

 78921368 GAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAA 78921427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAA 240

 78921428 ACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCA 78921487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCA 300

 78921488 AATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAA 78921547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAA 360

 78921548 GATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAAC 78921607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAAC 420

 78921608 AGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCT 78921667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCT 480

 78921668 GAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAA 78921727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAA 540

 78921728 AAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTA 78921787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTA 600

 78921788 CTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCA 78921847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCA 660

 78921848 GCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 702

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 897

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 957

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 1017

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 1077

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 1137

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     1138 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 1194

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 1254

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 1314

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 1374

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 1434

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 1494

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 1554

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 1614

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 1674

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 1734

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 1794

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1854

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1914

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1974

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 2034

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 2094

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 2154

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2155 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 2214

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 2274

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 2334

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 2394

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2395 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 2454

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 2514

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 2574

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 2634

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 2694

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 2752

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 2812

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 2872

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 2932

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 2992

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 3052

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 3112

 78928355 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 78928414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 3172

 78928415 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 78928474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 3232

 78928475 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 78928534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 3292

 78928535 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 78928594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 3352

 78928595 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 78928654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 3412

 78928655 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 78928714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 3472

 78928715 GGTGTTGAA-TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTC 78928773
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3473 GGTGTTGAATTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTC 3532

 78928774 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 78928833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 3592

 78928834 CATCCCAGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 78928893
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 CATCCCCGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 3652

 78928894 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 78928953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 3712

 78928954 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 78929013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 3772

 78929014 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 78929073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 3832

 78929074 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCAATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 78929133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3833 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCCATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 3892

 78929134 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 78929193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 3952

 78929194 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 78929253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 4012

 78929254 TTTAGTTTATTGGTA-ATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 78929312
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 TTTAGTTTATTGGTATATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 4072

 78929313 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 78929372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 4132

 78929373 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 78929432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 4192

 78929433 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 78929492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 4252

 78929493 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 78929552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 4312

 78929553 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 78929612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 4372

 78929613 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 78929672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 4432

 78929673 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 78929732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 4492

 78929733 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 78929792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 4552

 78929793 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 78929852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 4612

 78929853 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 78929912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 4672

 78929913 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 78929972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 4732

 78929973 ATATATATACACACAAATAC 78929992
          ||||||||||||||||||||
     4733 ATATATATACACACAAATAC 4752

Alignment time is 6.65621 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4588] =>      4588 nucs 'mol-32-33f8-003659_4588'

Score:        4316
Aligned:      4460        nucs
Identic:      4442 (100%) nucs =>       438 (100%)      4004 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78921452,78921889] EXCISED REGION [78926077,78930094]
 second seq =>  [       1,     438] EXCISED REGION [     574,    4588]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [439,573]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78921452 TAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAA 78921511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGCTAGGTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAA 60

 78921512 AGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCA 78921571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGATTAAATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCA 120

 78921572 ACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCA 78921631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTCTGTGCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCA 180

 78921632 TCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGA 78921691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCCCAAGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGA 240

 78921692 AATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTAC 78921751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTGAACAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTAC 300

 78921752 AGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGG 78921811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCTGAATTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGG 360

 78921812 AAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTG 78921871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGAGGGATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTG 420

 78921872 GCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||
      421 GCAGAGACATAATGAAGA 438

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      574 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 633

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      634 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 693

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      694 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 753

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      754 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 813

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      814 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 873

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
      874 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 930

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      931 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 990

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      991 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 1050

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1051 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 1110

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1111 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 1170

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1171 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 1230

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1231 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 1290

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1291 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 1350

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 1410

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 1470

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 1530

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 1590

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 1650

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 1710

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 1770

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 1830

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 1890

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1891 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 1950

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 2010

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 2070

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 2130

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2131 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 2190

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 2250

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 2310

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 2370

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 2430

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 2488

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 2548

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 2608

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 2668

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 2728

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 2788

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 2848

 78928355 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 78928414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2849 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 2908

 78928415 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 78928474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2909 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 2968

 78928475 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 78928534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 3028

 78928535 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 78928594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3029 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 3088

 78928595 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 78928654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 3148

 78928655 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 78928714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 3208

 78928715 GGTGTTGAA-TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTC 78928773
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3209 GGTGTTGAATTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTC 3268

 78928774 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 78928833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 3328

 78928834 CATCCCAGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 78928893
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 CATCCCCGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 3388

 78928894 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 78928953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3389 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 3448

 78928954 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 78929013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3449 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 3508

 78929014 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 78929073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3509 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 3568

 78929074 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCAATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 78929133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3569 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCCATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 3628

 78929134 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 78929193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 3688

 78929194 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 78929253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3689 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 3748

 78929254 TTTAGTTTATTGGTA-ATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 78929312
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3749 TTTAGTTTATTGGTATATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 3808

 78929313 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 78929372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 3868

 78929373 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 78929432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3869 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 3928

 78929433 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 78929492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 3988

 78929493 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 78929552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 4048

 78929553 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 78929612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 4108

 78929613 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 78929672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 4168

 78929673 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 78929732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4169 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 4228

 78929733 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 78929792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4229 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 4288

 78929793 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 78929852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4289 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 4348

 78929853 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 78929912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4349 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 4408

 78929913 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 78929972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4409 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 4468

 78929973 ATATATATACACACAAATACATATATATATATAATATATTGTTAGAAGAAAGAAACAAAT 78930032
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4469 ATATATATACACACAAATAC--ATATATATATAATATATTGTTAGAAGAAAGAAACAAAT 4526

 78930033 TTTTATGCTTCATGTCATATAAAATAATTATCATAATAAAAAGATTTTTAAAGTGGTGTA 78930092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 TTTTATGCTTCATGTCATATAAAATAATTATCATAATAAAAAGATTTTTAAAGTGGTGTA 4586

 78930093 AA 78930094
          ||
     4587 AA 4588

Alignment time is 6.68347 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    7594] =>      7594 nucs 'mol-32-3419-086269_7594'

Score:        7267
Aligned:      7466        nucs
Identic:      7443 (100%) nucs =>      3487 (100%)      3956 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78918399,78921889] EXCISED REGION [78926077,78930047]
 second seq =>  [       1,    3491] EXCISED REGION [    3627,    7594]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4187 nucs [78921890,78926076]
 second seq =>       135 nucs [3492,3626]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78918399 TCTCTTTTTTTCTCTGGTGTTCCCATTATATATATTTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGC 78918458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCTTTTTTTCTCTGGTGTTCCCATTATATATATTTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGC 60

 78918459 AGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAAT 78918518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAAT 120

 78918519 TTCTATTGACATGCTTTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAAT 78918578
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTATTGACATGCCTTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAAT 180

 78918579 ATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTA 78918638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATACACACAAAAGACAATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTA 240

 78918639 TTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAGTATGT 78918698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGAACCTTTCTTACAGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAGTATGT 300

 78918699 TTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAA 78918758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCTACTTTTTTCATTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAA 360

 78918759 TTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACC 78918818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGAAATCCTATTGATGGTACTATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACC 420

 78918819 TCTGCTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAA 78918878
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTACTTCTGATATGAATATAGACACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAA 480

 78918879 CTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCA 78918938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTCACTGCTAAAACACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCA 540

 78918939 AAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGG 78918998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACTCAGTCTCTATGTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGG 600

 78918999 TGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTG 78919058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGCAGAATCTCTGAAGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTG 660

 78919059 TCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATA 78919118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCATCTGAAATGTGTAGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATA 720

 78919119 ACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAA 78919178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTTGACTTTCAGGTAATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAA 780

 78919179 TATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATT 78919238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTAAATATATTATTAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATT 840

 78919239 AAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATT 78919298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAATGGTCTATTTATATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATT 900

 78919299 TTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAA 78919358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCTGAAATGAGCACTCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAA 960

 78919359 TAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTAT 78919418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAACAAAGAGAGAATAATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTAT 1020

 78919419 CAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGA 78919478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGAAGGAAGTGTCAAGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGA 1080

 78919479 GAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCT 78919538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGAACATGTTTTGACTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCT 1140

 78919539 GTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCC 78919598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTATATGGATGGAAAATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCC 1200

 78919599 CAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTG 78919658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAGTGGGGTCCCTGAATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTG 1260

 78919659 AACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTT 78919718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACACAGCTGCAAAGGTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTT 1320

 78919719 AGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAAT 78919778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGTGCCTATTGCTCTCAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAAT 1380

 78919779 CACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAACAAGAATTTAACAACAAAGACCATACA 78919838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACTACTAATAATCTCCCAAGAAAAACCGAGAGCAAGAATTTAACAACAAAGACCATACA 1440

 78919839 CATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGA 78919898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATAGAAAATCTCCAGAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGA 1500

 78919899 TCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCC 78919958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTCTGAAAATTCAAAAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCC 1560

 78919959 CAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCC 78920018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGCAATTGTTCTCAACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCC 1620

 78920019 AGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGG 78920078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGATGAAGGGAGCTCATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGG 1680

 78920079 CAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTG 78920138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAATCCAGTAAAATAATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTG 1740

 78920139 AGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGA 78920198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGCTGAAAAAATTTATGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGA 1800

 78920199 TGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGG 78920258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGAAACTGAAGAAATAATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGG 1860

 78920259 AAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAG 78920318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAACTAAAGAATAATTTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAG 1920

 78920319 AACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGA 78920378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACAAGTGTACAACTCATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGA 1980

 78920379 AAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACAT 78920438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAATATGTTTGAGAATATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACAT 2040

 78920439 GCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAG 78920498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCAAATCTAAGAAATACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAG 2100

 78920499 GCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAG 78920558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCACATAATCTTTGGATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAG 2160

 78920559 AGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGG 78920618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGAGAAGAGACAGACAATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGG 2220

 78920619 ACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTC 78920678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACAATGATGGGCATTACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTC 2280

 78920679 TAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCC 78920738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAAATATATACACACCCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCC 2340

 78920739 TCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAAT 78920798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCCAAAAAAACACAATAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAAT 2400

 78920799 TGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAAC 78920858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGAGGCAAATAACTAATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAAC 2460

 78920859 TAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTG 78920918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TAATAGGCATCTACAAAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTG 2520

 78920919 CACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAAT 78920978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CACATGGGACATATTCTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAAT 2580

 78920979 TAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAA 78921038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAAAAAATATTGAAATTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAA 2640

 78921039 TAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTT 78921098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAAATACCAAGAAGATCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTT 2700

 78921099 GTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATA 78921158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTGAATAACTCCTGGCTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATA 2760

 78921159 AACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGA 78921218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AACATAAACAGACAATTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGA 2820

 78921219 TGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAA 78921278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGTTTATAGAGCTAAATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAA 2880

 78921279 ATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGA 78921338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTTGTGCCTAAAGGAACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGA 2940

 78921339 AAAATTACTAAAATTAGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAA 78921398
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAAATTACTAAAATTAGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAA 3000

 78921399 CAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAG 78921458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAATGAAATTAAGACTTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAG 3060

 78921459 GTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAA 78921518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTTAACAAAGAAAAAAATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAA 3120

 78921519 ATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGT 78921578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATTACAACTGATCCCACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGT 3180

 78921579 GCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCA 78921638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCACACAAATTAGAAAATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCA 3240

 78921639 AGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAA 78921698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGATTGAAACAGGAAGAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAA 3300

 78921699 CAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAA 78921758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CAAGTAGTAAAAATCCTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAA 3360

 78921759 TTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGG 78921818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTCTACCAGATGTACAAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGG 3420

 78921819 ATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGA 78921878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTCCTCCCTACCTCATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGA 3480

 78921879 CATAATGAAGA 78921889
          |||||||||||
     3481 CATAATGAAGA 3491

EXCISED REGION

 78926077 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 78926136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 CATCAACATTTGTTATTGCCAGTGTTTTGGACATAAGCTATTTTAACCGAGATGAGATGA 3686

 78926137 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTTTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 78926196
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 TATCTCATTGTAGTTTCTATTGTTGTCTTGATTTGCATTTCTCTCATGATCAGTGATGTT 3746

 78926197 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 78926256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 GAGCACCTTTTCATATGCCTTTTTTCCATTGGTATATCTCCTTTGAGAAATGCCTATTCA 3806

 78926257 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 78926316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 AATCTTTTACCCATTTTCTTATCAGATTATTAATTTTTATAAATACTTATAGGGTTGTTT 3866

 78926317 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 78926376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 AACCTGCTTATATATTCTGGTGATGAATTCCTTGTCAGATTGGTAGGTTGCAAATATTTT 3926

 78926377 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGCAGAAGGT 78926436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
     3927 ACCCTATTCTGTGTGTTGTCTCTGCACATTGTTTATCGTATCTTTTGCTGTGC---AGGT 3983

 78926437 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 78926496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 TTTGAACTTGATGTAATCCCATTTGTTCATGTTTGCATTGGTTGCCTGTGCATGTGCAAT 4043

 78926497 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 78926556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 ATTTTTCAAGGGATCTTTGTCCAGACCAATGTCCTGGGGGATTTTCCCCAATGTTTTCTT 4103

 78926557 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 78926616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 GTTGTAGTTTTATCACTTGAGGTCATAGATTTAAGTCTTCAATCCGTTTTGATTTGATTT 4163

 78926617 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 78926676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 TTGTATATGGCGAGAGATAGGGATCTGGTTTCATTCTTCTGCCTATGGATATCCAGTTTT 4223

 78926677 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 78926736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 CCTAGCACAATTTATGGAAGCCTCTATCCACTCTCCAATGAATGCTCCTGGCAACTTTGT 4283

 78926737 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 78926796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 CAAAAATGAGTTCACTGTAAGTATGTGGATTTGTTTCTGGATTCTGTTCAATTGGTCTGT 4343

 78926797 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 78926856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 GTGTTTATTTTTATGTCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCTGTGTAGTATAAGTT 4403

 78926857 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 78926916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 GAATTCAGGTAATGTGAGTCCTCCAGTTTAGTTCTCATTGCTAATGACAGCTTTGGCTAT 4463

 78926917 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 78926976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4464 TCTGGGTCTTTTGTGGTTTCATATAAATTTTAAGATTTTTTTCTACTGGTATTTTGATAG 4523

 78926977 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 78927036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 ATATTGTATTGAATCTGTAGATTCTTTTGAGTAGTATGGTCATTTTAACAATATTGACTC 4583

 78927037 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 78927096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 TTCCAATCCACGAACATGGATTTCTTTTTATTTTTTGGAACCCTCCTCAATTTCTTTTAT 4643

 78927097 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 78927156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 CAGCGTCTTATATTATAGAGATCTCTCACTTCTTTGGTAAATTCTTAGGTATTCAATTTT 4703

 78927157 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 78927216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 AAGTATGCCTATTGTAAACGGGATTACTTTTATTATTTATTTTTCCTGTTATTCACTGTT 4763

 78927217 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 78927276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4764 GGTATATGGAGATGCTACTGATTTTTGGATGTTGATTTTGCATCCTGGAAATTTACTGAA 4823

 78927277 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 78927336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4824 TTTGTTGATCAGTTCTAGTAGTTTTCTTGTGAAGTCTTTAGGTTTTTACAAATATAAAAT 4883

 78927337 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 78927396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4884 TATATAGTCTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTTGATGTTCTTTAT 4943

 78927397 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAAACTATAAAAACCTAGGCAAT 78927456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4944 ATCTTTCTATTGTCTGATTGCTCTAACTAGAACTTCCAAGACTATAAAAACCTAGGCAAT 5003

 78927457 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 78927516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5004 ACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAAGATTTCTTGTCCAAAACACCAAAAGCAATGGCA 5063

 78927517 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 78927576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5064 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 5123

 78927577 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 78927636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5124 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 5183

 78927637 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACGAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 78927696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5184 CCATCTAACAAAGGGCTAATACCCAGAATCTACAAGGAATTAAAACAAATTTACAAGACA 5243

 78927697 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 78927756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5244 AAACAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGCAAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 5303

 78927757 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 78927816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5304 GCATTTATGTGGTCAACAAACATATGAAAAAAAGCTCATCATCACTGGTCACTAGAAAAA 5363

 78927817 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 78927876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5364 TGCAAATCAAAACCACAATGAGATATTATATCATACCAATTAGAATGACGATCATTAAAA 5423

 78927877 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 78927936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5424 AGTCAGGAAACAACAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTT 5483

 78927937 GGGAGTG--TAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 78927994
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5484 GGGAG--CATAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 5541

 78927995 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 78928054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5542 AGAGCCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAAAGGATTA 5601

 78928055 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 78928114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5602 TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGCGGCACTGTTCACAAT 5661

 78928115 AGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 78928174
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5662 AGCAAAGACTTGGAACGAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAATGTG 5721

 78928175 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 78928234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5722 GCAAATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAGGATGGTTCACATCCTTTGCAG 5781

 78928235 GGACATGGATTAAGCTGAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 78928294
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5782 GGACATGGATTAAGCTAAAAACCATCATTCTCAGCAAATTAACATAGGAAGAGAAAACCA 5841

 78928295 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 78928354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5842 AACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACAAATGGACACAGGG 5901

 78928355 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 78928414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5902 AGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCAAGTGGTGGGGGGCTAGGGGAGGGATAGCATT 5961

 78928415 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 78928474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5962 AGGAGAAATGCCTAATGTAGATGACGGGTCGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCATGTG 6021

 78928475 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 78928534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6022 TATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAAAA 6081

 78928535 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 78928594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6082 ATAAATAAATAACAGTAGTGACAGTGGGCATCTTTGTCATTTTCCAGATAGAGAAAAGGC 6141

 78928595 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 78928654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6142 TTTCTGTTTTTCCCCATTCAGTATGACACTAGCTATGAGTCTGTCATATATAGCTTTTAT 6201

 78928655 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 78928714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6202 TATGTTGAGGTATATTCCTTCTAAAACCACCAGTTTTTTGAGGGTTTTTTTAAATGAAGC 6261

 78928715 GGTGTTGAA-TTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTCAAATGATCATATGGTTTTGTC 78928773
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6262 GGTGTTGAATTTTATCAAATATTTTTTCAGCATCAATTGAAATGATCATATGGTTTTGTC 6321

 78928774 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 78928833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6322 TTTAATTCTGTTGATATGGGGTATCATGTTAATTTATTTGTATATGTTCAACAATCTTTG 6381

 78928834 CATCCCAGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 78928893
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6382 CATCCCCGGAATAAATCCCTCTTGCTCATGATAAATGATGTTTCTAATGTATTGTTGAAT 6441

 78928894 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 78928953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6442 TAGGTTTTCTAGTATTTTGTTGAGGGTAATTGCACTAATACTGATAAAAGGTATTGACTT 6501

 78928954 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 78929013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6502 GTAGTTTTCTATTTGTGATGTATCTTTGTCTGGCTTTGGTATCAAGGCAATACTGGCCTC 6561

 78929014 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 78929073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6562 ATACAATTACTTTGGAAATATCCCATCCTTTATTCTTGGAATACTTTCTGTAGAATTATT 6621

 78929074 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCAATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 78929133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6622 ATTAGTTCCTCTTTTAATGTTTGGTAACATTCAGCCATGAAGTTATTAGGGCCCGGGCTT 6681

 78929134 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 78929193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6682 TTCTAGAATGCTTTTTATTATGGCTTACATTTTATTGGTTTGTTCAAGTTTTGGATTTCT 6741

 78929194 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 78929253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6742 TCCTGGTTCAATCTTGGTAATTTTTATGTATCTAGGAATTTGTCCACTTCTTCTAGATCT 6801

 78929254 TTTAGTTTATTGGTA-ATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 78929312
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6802 TTTAGTTTATTGGTATATAATTCCTCATAGCCATGAATGACCATTTGAATTTCTGCAGTA 6861

 78929313 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 78929372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6862 TCAGTTGTATCTTTTCCTTTTGCATTTCCAATTTTATTGTTTGAATGTTCTCTATTTTTT 6921

 78929373 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 78929432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6922 CTTAGTCTGGCTAAAGATTTGTCTATTTTGTTTAACTTTTCAAAAAAACAAATTATTATT 6981

 78929433 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 78929492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6982 TGTTGGATGGTGGTGTTGATGATTCAGTACTGTTTCTTCTATCTCTTCAGTGCCTCTTTC 7041

 78929493 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 78929552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7042 AGTGATATGAAGCTAAAACCAGGTACTGTGAGTGCTCACCTGATTTTGGATCTCATGAAG 7101

 78929553 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 78929612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7102 TTGTCTTTTCGGTGCAGATCATTTTTAACTTGGTGTTCTTATGGGGGAAGGCAATCCATA 7161

 78929613 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 78929672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7162 GAGCTTTCAATTCCGCCATCTTTCTCTACATCTGCCCTACAATAATTTCCATATATGTAT 7221

 78929673 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 78929732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7222 ATTTTTGTAAAATAAACATGTATCTAAAATGTCTTTTTTTCAAAAAATAAAACATGAAAT 7281

 78929733 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 78929792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7282 GGATGCATTGTAGTTGAATAAAAATAAATTACCTAAGTCTAGAATTCTAGATTATAGAAA 7341

 78929793 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 78929852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7342 TGAACAACTATGCATTGAAAAATTATAAGGACTCATTTTTGACTTTGAAATATAAAATAA 7401

 78929853 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 78929912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7402 TAAATATCATCATATTTTTAAAATATTAGGTTGTCCATTGGGAGAATAACACACACATGC 7461

 78929913 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 78929972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7462 ATACTTACACATACAAATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAAATATATATGTGTGTAA 7521

 78929973 ATATATATACACACAAATACATATATATATATAATATATTGTTAGAAGAAAGAAACAAAT 78930032
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7522 ATATATATACACACAAATAC--ATATATATATAATATATTGTTAGAAGAAAGAAACAAAT 7579

 78930033 TTTTATGCTTCATGT 78930047
          |||||||||||||||
     7580 TTTTATGCTTCATGT 7594

Alignment time is 10.692 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [78911889,78936076] =>     24188 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3491] =>      3491 nucs 'mol-32-3419-086269_3491'

Score:        3457
Aligned:      3490        nucs
Identic:      3487 (100%) nucs =>       134 (100%)      3353 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [78918399,78918532] EXCISED REGION [78918534,78921889]
 second seq =>  [       1,     134] EXCISED REGION [     136,    3491]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [78918533,78918533]
 second seq =>         1 nucs [135,135]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [78918533,78918535] to [78918534,78918536]
 second seq =>         1 nucs [134,134] to [135,135]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 78918399 TCTCTTTTTTTCTCTGGTGTTCCCATTATATATATTTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGC 78918458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCTTTTTTTCTCTGGTGTTCCCATTATATATATTTGACACCTTCTTAAATTGCTTTGC 60

 78918459 AGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAAT 78918518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTTATTAGTTATTCTTTCTCACTTTAATTTTTCTCTTTGCATTTTAGTTTTTTTAAAAT 120

 78918519 TTCTATTGACATGC 78918532
          ||||||||||||||
      121 TTCTATTGACATGC 134

EXCISED REGION

 78918534 TTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGAC 78918593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      136 TTTAAGCTCCATGATTGTTTTCTTGCCCAACTCCAGTATACTAATATACACACAAAAGAC 195

 78918594 AATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTAC 78918653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      196 AATCTTCATTTCTGTTACAGTGTTTTTTATTTCTAGCATATTTTATTGAACCTTTCTTAC 255

 78918654 AGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCA 78918713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      256 AGTTTCTATCTTTCTACTTACATGACTCATATTTTCTGAGTATGTTTTCTACTTTTTTCA 315

 78918714 TTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTG 78918773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      316 TTAGGACTCTAACCAACTGCTTTTCTTTTCTGCAAATTAGCAGAATTTGAAATCCTATTG 375

 78918774 ATGGTACTATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTGCTTCTGATATG 78918833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      376 ATGGTACTATAATTCACACTAACTAAAACTATAATTAAAAGTACCTCTACTTCTGATATG 435

 78918834 AATATAGACACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAA 78918893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 AATATAGACACCAAAGAGAACACAGAATCAAAGAAAACAGACGAACTTTCACTGCTAAAA 495

 78918894 CACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTAT 78918953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 CACAAACTCAATCACAGAAGCAAATCCTCTGGCACAACCATTTCAAAACTCAGTCTCTAT 555

 78918954 GTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGA 78919013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 GTCTCTTCCACCTTTCTTTATCTTACTCCTCATCCCCAGCCCAGGTGGCAGAATCTCTGA 615

 78919014 AGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGT 78919073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 AGATTATGACAATTTAAAGTTGCTATGTATTTGTTCTTTCTTCTGTCATCTGAAATGTGT 675

 78919074 AGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGT 78919133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 AGGCAGAGCTTATATCCATCTCTCATAGATCCCCTTACAAATATAACTTGACTTTCAGGT 735

 78919134 AATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTAT 78919193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 AATACTAAGAAAGCATGACATTCTTTTGCATAGATAATAGAAAAATATTAAATATATTAT 795

 78919194 TAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTA 78919253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 TAAAGTTCAGTTTAAATGAAAAAATGAGGAGTTATAATTAAAATTAAAATGGTCTATTTA 855

 78919254 TATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCAC 78919313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 TATAATAGATTTGGTATAAGAACTAAAATTAAAATTTGGCACATTTTCTGAAATGAGCAC 915

 78919314 TCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAAT 78919373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 TCAACAATATTAAAAAGCATATTGAATCTATACAATCTAAGCAAATAACAAAGAGAGAAT 975

 78919374 AATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCA 78919433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 AATATAAGTTCAGAAAAGATTGAATGAAGTTTAAAGCACAACTATCAGAAGGAAGTGTCA 1035

 78919434 AGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGA 78919493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 AGATGGTCAACTAGCTGCAGCCAGTAAGTGCTGCTCCCACAGAGAGAGAACATGTTTTGA 1095

 78919494 CTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAA 78919553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 CTACAAAACCAAATATTTTCAACAGATCTTTAGAGAGAAAATGCTGTATATGGATGGAAA 1155

 78919554 ATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTG 78919613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 ATAGATGCAGTCACTGGGGCTGAAGGGAGAGGAAGCTGGGAACCCCAAGTGGGGTCCCTG 1215

 78919614 AATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAG 78919673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 AATGCTATGGCTGGTTCTGGGCTCCTAATGGCACCCAGCGAAGTGAACACAGCTGCAAAG 1275

 78919674 GTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCT 78919733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 GTGAAGATACACAAAGGAATCTTGTGGTTGAGTAAAAATCTTTTTAGTGCCTATTGCTCT 1335

 78919734 CAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCT 78919793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 CAAGTGTTATCTACTGAATCAGAGCCCAAACTGCAACACCAAAATCACTACTAATAATCT 1395

 78919794 CCCAAGAAAAACCGAGAACAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCA 78919853
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 CCCAAGAAAAACCGAGAGCAAGAATTTAACAACAAAGACCATACACATAGAAAATCTCCA 1455

 78919854 GAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAA 78919913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 GAAAGAACCTTTAGCCCTCCAAAATGAGAAAAAGTAAGCACAAGATCTCTGAAAATTCAA 1515

 78919914 AAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCA 78919973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 AAAGCAAGAGTGTCCCCTTACCTCTAAATGAGCTTACTAGCTCCCCAGCAATTGTTCTCA 1575

 78919974 ACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTC 78920033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 ACCATTCTGTATTTTCTGAAATGATAGACATGTAATTCAGAATCCAGATGAAGGGAGCTC 1635

 78920034 ATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATA 78920093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 ATCAAGATTGAGGAGAAAGTTGAAACTCAATCCAAGGAACCCAGGCAATCCAGTAAAATA 1695

 78920094 ATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTA 78920153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 ATTCAAGAACTGAAAGACAAAAAAAGATCCAAACTAAACTTCTTGAGCTGAAAAAATTTA 1755

 78920154 TGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAAT 78920213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 TGCAATGTTTTTTAATACAATTGAAAATATTAACTGAAGAGTAGATGAAACTGAAGAAAT 1815

 78920214 AATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAAT 78920273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 AATCAGAGCTCCAAGACTGGCTTTTTGAATCAAGCCAGACAGAGGAAACTAAAGAATAAT 1875

 78920274 TTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACT 78920333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 TTTTTAAAATGAACAAAACGTCTTAGAAATATTCTTATAAAAGAGAACAAGTGTACAACT 1935

 78920334 CATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAA 78920393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 CATTGGCATTCCTGAGAGGTAAAGAGAGAAAATAAGCAACTTGGAAAATATGTTTGAGAA 1995

 78920394 TATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAAT 78920453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 TATAGTCCCCAATTTTTTTCCAAATCTCACTAGAGAAATTGACATGCAAATCTAAGAAAT 2055

 78920454 ACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGG 78920513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 ACGGAGAACTCCAGCCAGACATTATACAAGATGATCATCCCCAAGGCACATAATCTTTGG 2115

 78920514 ATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGAC 78920573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 ATTCACCTAGGTCAATGCAAAATAAAAAGTCTTAACGGTAGCTAGAGAGAAGAGACAGAC 2175

 78920574 AATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATT 78920633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 AATTAACCAATAAAACAGACTTTATCCCAGCAAAAATTAAGAAGGACAATGATGGGCATT 2235

 78920634 ACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACAC 78920693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 ACAAAATGATAAAGTGTGCAATCAAAGAAGCAATCCTAACTATTCTAAATATATACACAC 2295

 78920694 CCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAA 78920753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 CCAACATTGAGTGACCTAGATTCTTGAAATGGCTTCTTCTTGGCCTCCAAAAAAACACAA 2355

 78920754 TAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTA 78920813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 TAACAGTGGAAGATTTCACCCCACTGACAACATTAGACAGATAATTGAGGCAAATAACTA 2415

 78920814 ATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACA 78920873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 ATAAAGAAACTTTGCACTTAAACTTAACACTTGACCAATTTTAACTAATAGGCATCTACA 2475

 78920874 AAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATT 78920933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 AAACACCACACTCAACAACCACAGAATACATATTCTTCTCATCTGCACATGGGACATATT 2535

 78920934 CTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAA 78920993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 CTAAGATCAACCACATGCTTGGCCACAAAGCAAGGCTCAATAAATTAAAAAATATTGAAA 2595

 78920994 TTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGA 78921053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 TTATACCAAGAAAATTATCAGACCACAGTGTAATAAATATAGAAATAAATACCAAGAAGA 2655

 78921054 TCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGG 78921113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 TCTATCAAAAATGACAAAAATACATGGAAATTAAACAGCTTATTTGTGAATAACTCCTGG 2715

 78921114 CTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAA 78921173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 CTGAATATCAAAATTAGACAGATATTTAAAAATTTGAAATTAATAAACATAAACAGACAA 2775

 78921174 TTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAA 78921233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 TTTACCAAAATGTCTGGGATGTAGCCAAAGCAGTGTTAAGAAGGATGTTTATAGAGCTAA 2835

 78921234 ATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGG 78921293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 ATGTCTTAATGAAGAAGTTAGAAAGATCTCACATTAACAATTTAAATTTGTGCCTAAAGG 2895

 78921294 AACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATT 78921353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 AACTAGAAATAAATGGAAAAAAACAGTGACAGAGCAAGCAGAAGAAAAATTACTAAAATT 2955

 78921354 AGAGAGAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGAC 78921413
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 AGAGAAAAAGTAATGAAATTGTGTTGCAATAATTTATTTAAAAAACAATGAAATTAAGAC 3015

 78921414 TTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAA 78921473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 TTTGTTCTTCACAAACATAAATAAAATTGGTAAACCATTAGCTAGGTTAACAAAGAAAAA 3075

 78921474 AATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCC 78921533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 AATAAGGTGATCCAAATAAGCACAATCAGAAATAACAAAGATTAAATTACAACTGATCCC 3135

 78921534 ACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAA 78921593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 ACAGAAATACAAAAGATCCTCATAGAATACTATGAGCAACTCTGTGCACACAAATTAGAA 3195

 78921594 AATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAA 78921653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 AATATAGAGGAAACAGAAAAATTTGGGGATATGTACCATCTCCCAAGATTGAAACAGGAA 3255

 78921654 GAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATC 78921713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 GAAATGGAAACTCTGAATAGACCAATATCAAGCTCTGAAATTGAACAAGTAGTAAAAATC 3315

 78921714 CTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTAC 78921773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 CTATCACCCACAAAAAGCCCTGGTCTAAATGGATTTACAGCTGAATTCTACCAGATGTAC 3375

 78921774 AAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTC 78921833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 AAAGAAGGAACCTACTGAAACTATTTTAAAAAAGGAGGAAGAGGGATTCCTCCCTACCTC 3435

 78921834 ATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 78921889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 ATTCTATGAAGCCAGCATCAGTGAAATACCAAAATCTGGCAGAGACATAATGAAGA 3491

Alignment time is 4.83125 s

