
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3384] =>      3384 nucs 'mol-32-1e71-059116_3384'

Score:        3384
Aligned:      3384        nucs
Identic:      3384 (100%) nucs =>      2609 (100%)       775 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77119041,77121649] EXCISED REGION [77121651,77122425]
 second seq =>  [       1,    2609] EXCISED REGION [    2610,    3384]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77121650,77121650]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [77121650,77121661] to [77121651,77121662]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77119041 TTCCCAAGAAACTAAAAATAGAACTAGCATTTGATCCAGCAATGCCACTACTGGGTATGT 77119100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCCCAAGAAACTAAAAATAGAACTAGCATTTGATCCAGCAATGCCACTACTGGGTATGT 60

 77119101 ATCCATAGGAAAGGAAATCAGTATATCAAAGGGATACCTGCACCCCCATGTTTACTGCAG 77119160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCCATAGGAAAGGAAATCAGTATATCAAAGGGATACCTGCACCCCCATGTTTACTGCAG 120

 77119161 CACAATAGCAAAGTTATGGAATCAACCTAAGCATCCATCAACAGACGAACAGATCAAGAA 77119220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACAATAGCAAAGTTATGGAATCAACCTAAGCATCCATCAACAGACGAACAGATCAAGAA 180

 77119221 AATGTGGTATTAGGCCAGGCGCAGTGGCTTGCGCCTGTAATCCTACCACTTTGGGAGGCT 77119280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGTGGTATTAGGCCAGGCGCAGTGGCTTGCGCCTGTAATCCTACCACTTTGGGAGGCT 240

 77119281 GCGGCAGGTGGATCAGTTGAGCTCAGGAGTTGGAGGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 77119340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCGGCAGGTGGATCAGTTGAGCTCAGGAGTTGGAGGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 300

 77119341 AAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCGCACACCTGTA 77119400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCGCACACCTGTA 360

 77119401 ATCCCAGCTACTCGAGACGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCTGGGAGGTTGCAGTAA 77119460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCCCAGCTACTCGAGACGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCTGGGAGGTTGCAGTAA 420

 77119461 GCCAAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCGACAGAGAAAGACTCCATCTCAAAGAA 77119520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCAAGATTGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCGACAGAGAAAGACTCCATCTCAAAGAA 480

 77119521 AAAAAAAATGTGGTGTGTATACACAATGGAATACTACTCCACCATAAAAAAGAATGAAAT 77119580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAAAAATGTGGTGTGTATACACAATGGAATACTACTCCACCATAAAAAAGAATGAAAT 540

 77119581 CATGTTACTTGCAGCAATATGGATGGAACTGGAAGTTATTATGTGAAATAAGCCAGGCAC 77119640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATGTTACTTGCAGCAATATGGATGGAACTGGAAGTTATTATGTGAAATAAGCCAGGCAC 600

 77119641 AGAAAGACAAATATGGCATGTTCTCATATGTGGGAGCTAAAAAAATTGAACTCAGGGAGG 77119700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAAAGACAAATATGGCATGTTCTCATATGTGGGAGCTAAAAAAATTGAACTCAGGGAGG 660

 77119701 TACAGAGTAGAATGGCAGATACCAGAGGCTGGGAAGAGTGTATGTGTGTGTGTTGTGGTG 77119760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACAGAGTAGAATGGCAGATACCAGAGGCTGGGAAGAGTGTATGTGTGTGTGTTGTGGTG 720

 77119761 GGCGGGGTGGGGGGGAGGGGTGCGGGAGCGGGCAATGAAGAGAGGTCAGTTAATGGGTAC 77119820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGCGGGGTGGGGGGGAGGGGTGCGGGAGCGGGCAATGAAGAGAGGTCAGTTAATGGGTAC 780

 77119821 ACTCATACAGTTAGAAGGAGTAAGATCTAATGTTCCATAGCAGAGTAGCGTGACTATAAT 77119880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTCATACAGTTAGAAGGAGTAAGATCTAATGTTCCATAGCAGAGTAGCGTGACTATAAT 840

 77119881 TAACAAAAATGTATTACATATTTCAAAACAGCTAGAAGAGAGGACTTGAAATGTTCCCAA 77119940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAACAAAAATGTATTACATATTTCAAAACAGCTAGAAGAGAGGACTTGAAATGTTCCCAA 900

 77119941 CATATAGAAATGATAAATACTCAAGGTGATGGATACTCCAACTATCCTGACTTGATCATT 77120000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATATAGAAATGATAAATACTCAAGGTGATGGATACTCCAACTATCCTGACTTGATCATT 960

 77120001 CTATGAATCTAACAAAATATCACATGTACCCCATAAATATGTACAAATATTATGTTATCA 77120060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTATGAATCTAACAAAATATCACATGTACCCCATAAATATGTACAAATATTATGTTATCA 1020

 77120061 GTAAAAAAACTAAGGTAGAAAAAAATGGGTTTTCTATTTTTACAAATCACTAACAGAAGT 77120120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTAAAAAAACTAAGGTAGAAAAAAATGGGTTTTCTATTTTTACAAATCACTAACAGAAGT 1080

 77120121 TATGTGTTACCTTGTTAAAATAAATGGAATTAAAAATTGTAATTTCCAAAAATAACTGCA 77120180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATGTGTTACCTTGTTAAAATAAATGGAATTAAAAATTGTAATTTCCAAAAATAACTGCA 1140

 77120181 GCCTAAATAGTAGAGAATTAAAAAGCAATTTTTTTTTTTGAGACAAAGTCTAGCTCTGTC 77120240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCTAAATAGTAGAGAATTAAAAAGCAATTTTTTTTTTTGAGACAAAGTCTAGCTCTGTC 1200

 77120241 ACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGCTCACTACAACCTCCTGGCTCACTACAACCTCCACCTCC 77120300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGCTCACTACAACCTCCTGGCTCACTACAACCTCCACCTCC 1260

 77120301 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGAC 77120360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGAC 1320

 77120361 ACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGG 77120420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGG 1380

 77120421 CTGGTGTCGAACTCCTGACCTGAAGTGATCCCCACGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 77120480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGGTGTCGAACTCCTGACCTGAAGTGATCCCCACGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 1440

 77120481 TTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCAATTTCTTAAACTCCAGAAATTGTTTCCTT 77120540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCAATTTCTTAAACTCCAGAAATTGTTTCCTT 1500

 77120541 TAGTCTAATAAATCCTAAATGCACTAACCTTTTAGGTTACAACATTTTTATAAATGCACT 77120600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGTCTAATAAATCCTAAATGCACTAACCTTTTAGGTTACAACATTTTTATAAATGCACT 1560

 77120601 GATTTTGATTTGTGGAGATGGCTAAGTGAGACTGGAATATGAATAGCACAATGAATGATA 77120660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATTTTGATTTGTGGAGATGGCTAAGTGAGACTGGAATATGAATAGCACAATGAATGATA 1620

 77120661 TACTGTAAAATGGAAACATTAAGCCATTTTTTTCAACATTTACCGAATACCCGTTATGTG 77120720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TACTGTAAAATGGAAACATTAAGCCATTTTTTTCAACATTTACCGAATACCCGTTATGTG 1680

 77120721 CTTAGCACTGATAGCTACAGGATATGGCTCTGCCATTAACTAAGTAGTAACTATATTCTT 77120780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTAGCACTGATAGCTACAGGATATGGCTCTGCCATTAACTAAGTAGTAACTATATTCTT 1740

 77120781 TTATTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTG 77120840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTATTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTG 1800

 77120841 CAGTGGCGCGATCTCAGATCACTACAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGC 77120900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGTGGCGCGATCTCAGATCACTACAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGC 1860

 77120901 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCATGCCCGTCTAATTTTTGT 77120960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCATGCCCGTCTAATTTTTGT 1920

 77120961 TGTTTTTTTTTTGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATATCCTG 77121020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTTTTTTTTTTGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATATCCTG 1980

 77121021 ACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACC 77121080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACC 2040

 77121081 GCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTCTAC 77121140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTCTAC 2100

 77121141 TGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATAC 77121200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATAC 2160

 77121201 AAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCT 77121260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCT 2220

 77121261 GAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGA 77121320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGA 2280

 77121321 AAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGT 77121380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGT 2340

 77121381 GGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACCCGAGG 77121440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACCCGAGG 2400

 77121441 TCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCTGTCTCTACTAAAAATTAA 77121500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCTGTCTCTACTAAAAATTAA 2460

 77121501 AAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTGAGG 77121560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTGAGG 2520

 77121561 CACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCCAGC 77121620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCCAGC 2580

 77121621 CTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATT 77121649
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATT 2609

EXCISED REGION

 77121651 AAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAG 77121710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 AAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAG 2669

 77121711 AGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAA 77121770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 AGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAA 2729

 77121771 GTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTC 77121830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 GTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTC 2789

 77121831 TGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCT 77121890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 TGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCT 2849

 77121891 CTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCAC 77121950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 CTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCAC 2909

 77121951 ATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGT 77122010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 ATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGT 2969

 77122011 ATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAG 77122070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 ATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAG 3029

 77122071 ATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGG 77122130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 ATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGG 3089

 77122131 CCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACA 77122190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 CCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACA 3149

 77122191 GCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAA 77122250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 GCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAA 3209

 77122251 TATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATT 77122310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 TATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATT 3269

 77122311 CTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACT 77122370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 CTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACT 3329

 77122371 TGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGG 77122425
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 TGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGG 3384

Alignment time is 2.74373 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3256] =>      3256 nucs 'mol-32-1e87-081420_3256'

Score:        3234
Aligned:      3256        nucs
Identic:      3254 (100%) nucs =>      1514 (100%)      1740 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77122067,77123580] EXCISED REGION [77123582,77125322]
 second seq =>  [       1,    1514] EXCISED REGION [    1516,    3256]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77123581,77123581]
 second seq =>         1 nucs [1515,1515]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [77125285,77125285]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1515,1515] to [1516,1516]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77122067 AGAGATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTC 77122126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTC 60

 77122127 CTGGCCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGT 77122186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGGCCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGT 120

 77122187 AACAGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGA 77122246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACAGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGA 180

 77122247 CTAATATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAA 77122306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAATATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAA 240

 77122307 GATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTG 77122366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTG 300

 77122367 CACTTGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGC 77122426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACTTGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGC 360

 77122427 CCCCTCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTC 77122486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCCTCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTC 420

 77122487 TGAGCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAA 77122546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAA 480

 77122547 CTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCA 77122606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCA 540

 77122607 CAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGG 77122666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGG 600

 77122667 ATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGC 77122726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGC 660

 77122727 AAAGGGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTC 77122786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGGGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTC 720

 77122787 CTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGG 77122846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGG 780

 77122847 TCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAA 77122906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAA 840

 77122907 ACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTT 77122966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTT 900

 77122967 GGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGA 77123026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGA 960

 77123027 GTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACT 77123086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACT 1020

 77123087 CAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACA 77123146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACA 1080

 77123147 TAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGG 77123206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGG 1140

 77123207 AGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAA 77123266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAA 1200

 77123267 GTAGGGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAA 77123326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTAGGGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAA 1260

 77123327 TTTTGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCAT 77123386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCAT 1320

 77123387 GTAGAAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGG 77123446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAGAAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGG 1380

 77123447 TAAGTGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTG 77123506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAGTGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTG 1440

 77123507 GAATGTAAAGGGGGTATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAA 77123566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAATGTAAAGGGGGTATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAA 1500

 77123567 GTGTCATTAATGAT 77123580
          ||||||||||||||
     1501 GTGTCATTAATGAT 1514

EXCISED REGION

 77123582 CAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATA 77123641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 CAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATA 1575

 77123642 ATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAG 77123701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 ATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAG 1635

 77123702 CTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACA 77123761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 CTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACA 1695

 77123762 CATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATATGCAAGGGGAAA 77123821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 CATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATATGCAAGGGGAAA 1755

 77123822 GAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATC 77123881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 GAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATC 1815

 77123882 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 77123941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 1875

 77123942 TGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGG 77124001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 TGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGG 1935

 77124002 TGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAATCCAGG 77124061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 TGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAATCCAGG 1995

 77124062 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGGGCAACAGAGCG 77124121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGGGCAACAGAGCG 2055

 77124122 AGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTAACCAGGCGTGG 77124181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 AGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTAACCAGGCGTGG 2115

 77124182 TGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATTGCTTGAACCC 77124241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 TGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATTGCTTGAACCC 2175

 77124242 AAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 77124301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 AAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 2235

 77124302 AGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCATGATTGACAGAGCAG 77124361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 AGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCATGATTGACAGAGCAG 2295

 77124362 GTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAACAACAAAAGATCTACT 77124421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 GTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAACAACAAAAGATCTACT 2355

 77124422 TTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAAGATGGACCAGAAACT 77124481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 TTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAAGATGGACCAGAAACT 2415

 77124482 TAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTGTAAAAACTCTTTTTT 77124541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 TAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTGTAAAAACTCTTTTTT 2475

 77124542 TGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTCACTGGAACCTCCGCT 77124601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 TGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTCACTGGAACCTCCGCT 2535

 77124602 TCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTGGGATTACGGGCGCCC 77124661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 TCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTGGGATTACGGGCGCCC 2595

 77124662 GCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCA 77124721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 GCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCA 2655

 77124722 GGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 77124781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 GGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 2715

 77124782 GATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAGACATTGGCTTAGGCA 77124841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 GATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAGACATTGGCTTAGGCA 2775

 77124842 AAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAACAAAAATAAATAAATGGG 77124901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 AAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAACAAAAATAAATAAATGGG 2835

 77124902 ACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAATCTGCAGAGTAAACCAAC 77124961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 ACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAATCTGCAGAGTAAACCAAC 2895

 77124962 AACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCTGACAAAGGACTAATATCCA 77125021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 AACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCTGACAAAGGACTAATATCCA 2955

 77125022 GAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACAAACAATCCCATCAAAAAAT 77125081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 GAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACAAACAATCCCATCAAAAAAT 3015

 77125082 GGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGCCAACATCACTA 77125141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 GGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGCCAACATCACTA 3075

 77125142 ATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTACACCCGCAAGAATGGTCATA 77125201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 ATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTACACCCGCAAGAATGGTCATA 3135

 77125202 ATTAAAGC-AAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAAAAACAAAGATGTGGTGTGG 77125260
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 ATTAAAGCAAAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAAAAACAAAGATGTGGTGTGG 3195

 77125261 ATGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAACCAC 77125320
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 ATGTAGTGAAAAGGGAACACTTTT-ACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAACCAC 3254

 77125321 TA 77125322
          ||
     3255 TA 3256

Alignment time is 2.6599 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2931] =>      2931 nucs 'mol-32-1f63-206067_2931'

Score:        2909
Aligned:      2931        nucs
Identic:      2929 (100%) nucs =>       629 (100%)      2300 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77121021,77121649] EXCISED REGION [77121651,77123952]
 second seq =>  [       1,     629] EXCISED REGION [     630,    2931]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77121650,77121650]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [77123581,77123581]
 second seq =>         1 nucs [2560,2560]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [77121650,77121661] to [77121651,77121662]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77121021 ACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACC 77121080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACC 60

 77121081 GCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTCTAC 77121140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTCTAC 120

 77121141 TGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATAC 77121200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATAC 180

 77121201 AAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCT 77121260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCT 240

 77121261 GAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGA 77121320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGA 300

 77121321 AAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGT 77121380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGT 360

 77121381 GGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACCCGAGG 77121440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACCCGAGG 420

 77121441 TCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCTGTCTCTACTAAAAATTAA 77121500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCTGTCTCTACTAAAAATTAA 480

 77121501 AAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTGAGG 77121560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTGAGG 540

 77121561 CACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCCAGC 77121620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCCAGC 600

 77121621 CTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATT 77121649
          |||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATT 629

EXCISED REGION

 77121651 AAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAG 77121710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      630 AAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAG 689

 77121711 AGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAA 77121770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 AGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAA 749

 77121771 GTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTC 77121830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 GTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTC 809

 77121831 TGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCT 77121890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 TGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCT 869

 77121891 CTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCAC 77121950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 CTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCAC 929

 77121951 ATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGT 77122010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 ATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGT 989

 77122011 ATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAG 77122070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 ATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAG 1049

 77122071 ATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGG 77122130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 ATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGG 1109

 77122131 CCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACA 77122190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 CCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACA 1169

 77122191 GCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAA 77122250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 GCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAA 1229

 77122251 TATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATT 77122310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 TATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATT 1289

 77122311 CTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACT 77122370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 CTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACT 1349

 77122371 TGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCC 77122430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 TGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCC 1409

 77122431 TCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAG 77122490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 TCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAG 1469

 77122491 CAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCT 77122550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 CAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCT 1529

 77122551 GCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAA 77122610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 GCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAA 1589

 77122611 GCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCT 77122670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 GCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCT 1649

 77122671 GTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAG 77122730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 GTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAG 1709

 77122731 GGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCT 77122790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 GGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCT 1769

 77122791 CCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTG 77122850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 CCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTG 1829

 77122851 GCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTG 77122910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 GCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTG 1889

 77122911 ATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGAT 77122970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 ATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGAT 1949

 77122971 TGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAG 77123030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 TGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAG 2009

 77123031 TAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGA 77123090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 TAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGA 2069

 77123091 AGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGC 77123150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 AGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGC 2129

 77123151 AAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTG 77123210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 AAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTG 2189

 77123211 TCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAG 77123270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 TCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAG 2249

 77123271 GGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTT 77123330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 GGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTT 2309

 77123331 GTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAG 77123390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 GTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAG 2369

 77123391 AAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAG 77123450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 AAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAG 2429

 77123451 TGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAAT 77123510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 TGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAAT 2489

 77123511 GTAAAGGGGGTATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGT 77123570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 GTAAAGGGGGTATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGT 2549

 77123571 CATTAATGATACAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAA 77123630
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2550 CATTAATGATCCAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAGACAGTTTAA 2609

 77123631 TTTGGGATATAATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGC 77123690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 TTTGGGATATAATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGC 2669

 77123691 ATTATATCCAGCTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATA 77123750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 ATTATATCCAGCTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATA 2729

 77123751 TGAATTAGACACATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATAT 77123810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 TGAATTAGACACATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATAT 2789

 77123811 GCAAGGGGAAAGAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCA 77123870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 GCAAGGGGAAAGAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCA 2849

 77123871 CGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTT 77123930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 CGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTT 2909

 77123931 TGAGACCAGCCTGGCCAATACG 77123952
          ||||||||||||||||||||||
     2910 TGAGACCAGCCTGGCCAATACG 2931

Alignment time is 2.58195 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2594] =>      2594 nucs 'mol-32-2076-064566_2594'

Score:        2593
Aligned:      2593        nucs
Identic:      2593 (100%) nucs =>      1324 (100%)      1269 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77122257,77123580] EXCISED REGION [77123582,77124850]
 second seq =>  [       1,    1324] EXCISED REGION [    1326,    2594]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77123581,77123581]
 second seq =>         1 nucs [1325,1325]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1325,1325] to [1326,1326]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77122257 CCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATTCTGACC 77122316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATTCTGACC 60

 77122317 CTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACTTGATGG 77122376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACTTGATGG 120

 77122377 ATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCTCCCAG 77122436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCTCCCAG 180

 77122437 GAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAGCAATCA 77122496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAGCAATCA 240

 77122497 GCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCTGCACCC 77122556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCTGCACCC 300

 77122557 CGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAAGCTGGC 77122616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAAGCTGGC 360

 77122617 TGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCTGTTTAG 77122676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCTGTTTAG 420

 77122677 GCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAGGGGAGG 77122736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAGGGGAGG 480

 77122737 CACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCTCCCATA 77122796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCTCCCATA 540

 77122797 ATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTG 77122856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTG 600

 77122857 CTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTGATCTCA 77122916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTGATCTCA 660

 77122917 AGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGATTGCCCT 77122976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGATTGCCCT 720

 77122977 ATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAGTAAAGT 77123036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAGTAAAGT 780

 77123037 CCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGTTA 77123096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGTTA 840

 77123097 AGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGCAAGACC 77123156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGCAAGACC 900

 77123157 CAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTGTCATAT 77123216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTGTCATAT 960

 77123217 TTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAG 77123276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAG 1020

 77123277 AACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTTGTTTAA 77123336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTTGTTTAA 1080

 77123337 ACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAGAAAAAA 77123396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAGAAAAAA 1140

 77123397 CTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAGTGGACC 77123456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAGTGGACC 1200

 77123457 AGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAATGTAAAG 77123516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAATGTAAAG 1260

 77123517 GGGGTATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGTCATTAA 77123576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGGGTATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGTCATTAA 1320

 77123577 TGAT 77123580
          ||||
     1321 TGAT 1324

EXCISED REGION

 77123582 CAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATA 77123641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 CAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATA 1385

 77123642 ATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAG 77123701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 ATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAG 1445

 77123702 CTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACA 77123761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 CTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACA 1505

 77123762 CATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATATGCAAGGGGAAA 77123821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 CATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATATGCAAGGGGAAA 1565

 77123822 GAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATC 77123881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 GAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATC 1625

 77123882 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 77123941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 1685

 77123942 TGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGG 77124001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 TGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGG 1745

 77124002 TGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAATCCAGG 77124061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 TGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAATCCAGG 1805

 77124062 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGGGCAACAGAGCG 77124121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGGGCAACAGAGCG 1865

 77124122 AGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTAACCAGGCGTGG 77124181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 AGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTAACCAGGCGTGG 1925

 77124182 TGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATTGCTTGAACCC 77124241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATTGCTTGAACCC 1985

 77124242 AAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 77124301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 AAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 2045

 77124302 AGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCATGATTGACAGAGCAG 77124361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 AGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCATGATTGACAGAGCAG 2105

 77124362 GTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAACAACAAAAGATCTACT 77124421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAACAACAAAAGATCTACT 2165

 77124422 TTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAAGATGGACCAGAAACT 77124481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 TTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAAGATGGACCAGAAACT 2225

 77124482 TAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTGTAAAAACTCTTTTTT 77124541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTGTAAAAACTCTTTTTT 2285

 77124542 TGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTCACTGGAACCTCCGCT 77124601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 TGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTCACTGGAACCTCCGCT 2345

 77124602 TCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTGGGATTACGGGCGCCC 77124661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 TCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTGGGATTACGGGCGCCC 2405

 77124662 GCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCA 77124721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 GCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCA 2465

 77124722 GGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 77124781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 GGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 2525

 77124782 GATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAGACATTGGCTTAGGCA 77124841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 GATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAGACATTGGCTTAGGCA 2585

 77124842 AAGAATTCA 77124850
          |||||||||
     2586 AAGAATTCA 2594

Alignment time is 2.16603 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3685] =>      3685 nucs 'mol-32-2076-080299_3685'

Score:        3685
Aligned:      3685        nucs
Identic:      3685 (100%) nucs =>       369 (100%)      3316 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77119840,77120208] EXCISED REGION [77120210,77123525]
 second seq =>  [       1,     369] EXCISED REGION [     370,    3685]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77120209,77120209]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [77120209,77120218] to [77120210,77120219]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77119840 GTAAGATCTAATGTTCCATAGCAGAGTAGCGTGACTATAATTAACAAAAATGTATTACAT 77119899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAAGATCTAATGTTCCATAGCAGAGTAGCGTGACTATAATTAACAAAAATGTATTACAT 60

 77119900 ATTTCAAAACAGCTAGAAGAGAGGACTTGAAATGTTCCCAACATATAGAAATGATAAATA 77119959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTCAAAACAGCTAGAAGAGAGGACTTGAAATGTTCCCAACATATAGAAATGATAAATA 120

 77119960 CTCAAGGTGATGGATACTCCAACTATCCTGACTTGATCATTCTATGAATCTAACAAAATA 77120019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCAAGGTGATGGATACTCCAACTATCCTGACTTGATCATTCTATGAATCTAACAAAATA 180

 77120020 TCACATGTACCCCATAAATATGTACAAATATTATGTTATCAGTAAAAAAACTAAGGTAGA 77120079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCACATGTACCCCATAAATATGTACAAATATTATGTTATCAGTAAAAAAACTAAGGTAGA 240

 77120080 AAAAAATGGGTTTTCTATTTTTACAAATCACTAACAGAAGTTATGTGTTACCTTGTTAAA 77120139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAAATGGGTTTTCTATTTTTACAAATCACTAACAGAAGTTATGTGTTACCTTGTTAAA 300

 77120140 ATAAATGGAATTAAAAATTGTAATTTCCAAAAATAACTGCAGCCTAAATAGTAGAGAATT 77120199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAAATGGAATTAAAAATTGTAATTTCCAAAAATAACTGCAGCCTAAATAGTAGAGAATT 360

 77120200 AAAAAGCAA 77120208
          |||||||||
      361 AAAAAGCAA 369

EXCISED REGION

 77120210 TTTTTTTTTTGAGACAAAGTCTAGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGCTCACTAC 77120269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 TTTTTTTTTTGAGACAAAGTCTAGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGCTCACTAC 429

 77120270 AACCTCCTGGCTCACTACAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCC 77120329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 AACCTCCTGGCTCACTACAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCC 489

 77120330 TCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTA 77120389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 TCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTA 549

 77120390 GTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTGAAGTGAT 77120449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 GTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTGAAGTGAT 609

 77120450 CCCCACGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCT 77120509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 CCCCACGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCT 669

 77120510 CAATTTCTTAAACTCCAGAAATTGTTTCCTTTAGTCTAATAAATCCTAAATGCACTAACC 77120569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 CAATTTCTTAAACTCCAGAAATTGTTTCCTTTAGTCTAATAAATCCTAAATGCACTAACC 729

 77120570 TTTTAGGTTACAACATTTTTATAAATGCACTGATTTTGATTTGTGGAGATGGCTAAGTGA 77120629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 TTTTAGGTTACAACATTTTTATAAATGCACTGATTTTGATTTGTGGAGATGGCTAAGTGA 789

 77120630 GACTGGAATATGAATAGCACAATGAATGATATACTGTAAAATGGAAACATTAAGCCATTT 77120689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 GACTGGAATATGAATAGCACAATGAATGATATACTGTAAAATGGAAACATTAAGCCATTT 849

 77120690 TTTTCAACATTTACCGAATACCCGTTATGTGCTTAGCACTGATAGCTACAGGATATGGCT 77120749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 TTTTCAACATTTACCGAATACCCGTTATGTGCTTAGCACTGATAGCTACAGGATATGGCT 909

 77120750 CTGCCATTAACTAAGTAGTAACTATATTCTTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGAGAT 77120809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 CTGCCATTAACTAAGTAGTAACTATATTCTTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGAGAT 969

 77120810 GGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGATCACTACAAGC 77120869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 GGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGATCACTACAAGC 1029

 77120870 TCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAG 77120929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 TCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAG 1089

 77120930 GCGCACACCACCATGCCCGTCTAATTTTTGTTGTTTTTTTTTTGTAGAGACAGGGTTTCA 77120989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 GCGCACACCACCATGCCCGTCTAATTTTTGTTGTTTTTTTTTTGTAGAGACAGGGTTTCA 1149

 77120990 CCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCC 77121049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 CCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCC 1209

 77121050 AAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGA 77121109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 AAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGA 1269

 77121110 GACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAA 77121169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 GACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAA 1329

 77121170 CAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTG 77121229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 CAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTG 1389

 77121230 GAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATT 77121289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 GAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATT 1449

 77121290 TTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTG 77121349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 TTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTG 1509

 77121350 CTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT 77121409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 CTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT 1569

 77121410 TGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACCCGAGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACA 77121469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 TGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACCCGAGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACA 1629

 77121470 TGGCGAAACCCCTGTCTCTACTAAAAATTAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTG 77121529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 TGGCGAAACCCCTGTCTCTACTAAAAATTAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTG 1689

 77121530 CCTGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCA 77121589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 CCTGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCA 1749

 77121590 GTGAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATT 77121649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 GTGAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATT 1809

 77121650 AAAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAA 77121709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 AAAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAA 1869

 77121710 GAGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAA 77121769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 GAGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAA 1929

 77121770 AGTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATT 77121829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 AGTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATT 1989

 77121830 CTGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATC 77121889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 CTGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATC 2049

 77121890 TCTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCA 77121949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 TCTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCA 2109

 77121950 CATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTG 77122009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 CATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTG 2169

 77122010 TATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGA 77122069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 TATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGA 2229

 77122070 GATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTG 77122129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 GATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTG 2289

 77122130 GCCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAAC 77122189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 GCCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAAC 2349

 77122190 AGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTA 77122249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 AGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTA 2409

 77122250 ATATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGAT 77122309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 ATATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGAT 2469

 77122310 TCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCAC 77122369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 TCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCAC 2529

 77122370 TTGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCC 77122429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 TTGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCC 2589

 77122430 CTCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGA 77122489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 CTCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGA 2649

 77122490 GCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTC 77122549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 GCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTC 2709

 77122550 TGCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAA 77122609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 TGCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAA 2769

 77122610 AGCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATC 77122669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 AGCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATC 2829

 77122670 TGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAA 77122729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 TGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAA 2889

 77122730 GGGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTC 77122789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 GGGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTC 2949

 77122790 TCCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCT 77122849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 TCCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCT 3009

 77122850 GGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACT 77122909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 GGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACT 3069

 77122910 GATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGA 77122969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 GATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGA 3129

 77122970 TTGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTA 77123029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 TTGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTA 3189

 77123030 GTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAG 77123089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 GTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAG 3249

 77123090 AAGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAG 77123149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 AAGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAG 3309

 77123150 CAAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGT 77123209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 CAAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGT 3369

 77123210 GTCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTA 77123269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 GTCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTA 3429

 77123270 GGGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTT 77123329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 GGGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTT 3489

 77123330 TGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTA 77123389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 TGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTA 3549

 77123390 GAAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAA 77123449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 GAAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAA 3609

 77123450 GTGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAA 77123509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 GTGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAA 3669

 77123510 TGTAAAGGGGGTATGG 77123525
          ||||||||||||||||
     3670 TGTAAAGGGGGTATGG 3685

Alignment time is 3.08895 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2256] =>      2256 nucs 'mol-32-20fa-068430_2256'

Score:        2255
Aligned:      2255        nucs
Identic:      2255 (100%) nucs =>      1046 (100%)      1209 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77122535,77123580] EXCISED REGION [77123582,77124790]
 second seq =>  [       1,    1046] EXCISED REGION [    1048,    2256]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77123581,77123581]
 second seq =>         1 nucs [1047,1047]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1047,1047] to [1048,1048]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77122535 TATCCTTAAAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAAC 77122594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATCCTTAAAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAAC 60

 77122595 TCCAGTCTCCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTC 77122654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCAGTCTCCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTC 120

 77122655 TTGATGAATTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTC 77122714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGATGAATTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTC 180

 77122715 TCCCTCCACAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAG 77122774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCCTCCACAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAG 240

 77122775 AGCTTGGTGTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCT 77122834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCTTGGTGTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCT 300

 77122835 TAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCA 77122894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCA 360

 77122895 CTGCAGCCTCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCA 77122954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGCAGCCTCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCA 420

 77122955 CTGGCCCTCTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGC 77123014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGCCCTCTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGC 480

 77123015 TACTTGTTGTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTA 77123074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACTTGTTGTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTA 540

 77123075 ATCCCAGCTACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTA 77123134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCCCAGCTACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTA 600

 77123135 GCCAGGGCAACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGA 77123194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCAGGGCAACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGA 660

 77123195 CTCTGACTCAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTT 77123254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTGACTCAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTT 720

 77123255 GTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAA 77123314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAA 780

 77123315 AAGAAAACTTAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACT 77123374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAAAACTTAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACT 840

 77123375 TATTAATACCATGTAGAAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCG 77123434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATTAATACCATGTAGAAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCG 900

 77123435 CTAAATGGAAGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGA 77123494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTAAATGGAAGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGA 960

 77123495 ATGTGAGCCTTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAA 77123554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGTGAGCCTTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAA 1020

 77123555 GATGACAAAGAAGTGTCATTAATGAT 77123580
          ||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATGACAAAGAAGTGTCATTAATGAT 1046

EXCISED REGION

 77123582 CAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATA 77123641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1048 CAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATA 1107

 77123642 ATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAG 77123701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 ATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAG 1167

 77123702 CTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACA 77123761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 CTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACA 1227

 77123762 CATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATATGCAAGGGGAAA 77123821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 CATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATATGCAAGGGGAAA 1287

 77123822 GAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATC 77123881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 GAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATC 1347

 77123882 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 77123941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 1407

 77123942 TGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGG 77124001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 TGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGG 1467

 77124002 TGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAATCCAGG 77124061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 TGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAATCCAGG 1527

 77124062 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGGGCAACAGAGCG 77124121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGGGCAACAGAGCG 1587

 77124122 AGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTAACCAGGCGTGG 77124181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 AGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTAACCAGGCGTGG 1647

 77124182 TGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATTGCTTGAACCC 77124241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 TGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATTGCTTGAACCC 1707

 77124242 AAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 77124301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 AAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 1767

 77124302 AGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCATGATTGACAGAGCAG 77124361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 AGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCATGATTGACAGAGCAG 1827

 77124362 GTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAACAACAAAAGATCTACT 77124421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 GTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAACAACAAAAGATCTACT 1887

 77124422 TTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAAGATGGACCAGAAACT 77124481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 TTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAAGATGGACCAGAAACT 1947

 77124482 TAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTGTAAAAACTCTTTTTT 77124541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 TAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTGTAAAAACTCTTTTTT 2007

 77124542 TGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTCACTGGAACCTCCGCT 77124601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 TGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTCACTGGAACCTCCGCT 2067

 77124602 TCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTGGGATTACGGGCGCCC 77124661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 TCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTGGGATTACGGGCGCCC 2127

 77124662 GCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCA 77124721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 GCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCA 2187

 77124722 GGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 77124781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 GGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 2247

 77124782 GATTACAGG 77124790
          |||||||||
     2248 GATTACAGG 2256

Alignment time is 1.87015 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2150] =>      2150 nucs 'mol-32-287f-037051_2150'

Score:        2150
Aligned:      2150        nucs
Identic:      2150 (100%) nucs =>       658 (100%)      1492 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77120992,77121649] EXCISED REGION [77121651,77123142]
 second seq =>  [       1,     658] EXCISED REGION [     659,    2150]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77121650,77121650]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [77121650,77121661] to [77121651,77121662]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77120992 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAA 77121051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAA 60

 77121052 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGA 77121111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGA 120

 77121112 CTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAACA 77121171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAACA 180

 77121172 GAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTGGA 77121231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTGGA 240

 77121232 AAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATTTT 77121291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATTTT 300

 77121292 GAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCT 77121351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCT 360

 77121352 GACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTG 77121411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTG 420

 77121412 GGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACCCGAGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATG 77121471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACCCGAGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATG 480

 77121472 GCGAAACCCCTGTCTCTACTAAAAATTAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCC 77121531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCGAAACCCCTGTCTCTACTAAAAATTAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCC 540

 77121532 TGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGT 77121591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGT 600

 77121592 GAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATT 77121649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATT 658

EXCISED REGION

 77121651 AAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAG 77121710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 AAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAG 718

 77121711 AGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAA 77121770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 AGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAA 778

 77121771 GTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTC 77121830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTC 838

 77121831 TGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCT 77121890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 TGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCT 898

 77121891 CTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCAC 77121950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 CTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCAC 958

 77121951 ATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGT 77122010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 ATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGT 1018

 77122011 ATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAG 77122070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 ATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAG 1078

 77122071 ATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGG 77122130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 ATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGG 1138

 77122131 CCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACA 77122190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACA 1198

 77122191 GCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAA 77122250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 GCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAA 1258

 77122251 TATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATT 77122310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 TATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATT 1318

 77122311 CTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACT 77122370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 CTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACT 1378

 77122371 TGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCC 77122430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 TGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCC 1438

 77122431 TCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAG 77122490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAG 1498

 77122491 CAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCT 77122550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 CAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCT 1558

 77122551 GCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAA 77122610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAA 1618

 77122611 GCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCT 77122670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 GCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCT 1678

 77122671 GTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAG 77122730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 GTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAG 1738

 77122731 GGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCT 77122790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCT 1798

 77122791 CCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTG 77122850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTG 1858

 77122851 GCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTG 77122910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTG 1918

 77122911 ATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGAT 77122970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGAT 1978

 77122971 TGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAG 77123030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAG 2038

 77123031 TAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGA 77123090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGA 2098

 77123091 AGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGC 77123142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 AGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGC 2150

Alignment time is 1.7957 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2723] =>      2723 nucs 'mol-32-2afd-058740_2723'

Score:        2723
Aligned:      2723        nucs
Identic:      2723 (100%) nucs =>       384 (100%)      2339 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77121002,77121385] EXCISED REGION [77123867,77126205]
 second seq =>  [       1,     384] EXCISED REGION [     385,    2723]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2481 nucs [77121386,77123866]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        32 nucs [77121386,77121417] to [77123867,77123898]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77121002 GGATGGTCTCGATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 77121061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGATGGTCTCGATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 60

 77121062 TTACAGGCGTGAGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGACTGTCAAACA 77121121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTACAGGCGTGAGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGACTGTCAAACA 120

 77121122 ACTACAGAGCTAACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAACAGAAATTTAAG 77121181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTACAGAGCTAACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAACAGAAATTTAAG 180

 77121182 GCAAGTGATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTGGAAAAGTTGAGA 77121241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAAGTGATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTGGAAAAGTTGAGA 240

 77121242 AAGCTTACAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATTTTGAGAGTGGAG 77121301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCTTACAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATTTTGAGAGTGGAG 300

 77121302 AGAAAGCAGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCTGACATACGAG 77121361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAAAGCAGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCTGACATACGAG 360

 77121362 AGTGCATCAGGCCAGGCGTGGTGT 77121385
          ||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGCATCAGGCCAGGCGTGGTGT 384

EXCISED REGION

 77123867 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGG 77123926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGG 444

 77123927 AGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGT 77123986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 AGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGT 504

 77123987 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAA 77124046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAA 564

 77124047 TCACTTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGT 77124106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 TCACTTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGT 624

 77124107 CTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAA 77124166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 CTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAA 684

 77124167 ATTAACCAGGCGTGGTGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGA 77124226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 ATTAACCAGGCGTGGTGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGA 744

 77124227 AAATTGCTTGAACCCAAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTC 77124286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 AAATTGCTTGAACCCAAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTC 804

 77124287 CAGCCTGGGCAACAGAGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCA 77124346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 CAGCCTGGGCAACAGAGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCA 864

 77124347 TGATTGACAGAGCAGGTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAAC 77124406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 TGATTGACAGAGCAGGTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAAC 924

 77124407 AACAAAAGATCTACTTTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAA 77124466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 AACAAAAGATCTACTTTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAA 984

 77124467 GATGGACCAGAAACTTAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTG 77124526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 GATGGACCAGAAACTTAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTG 1044

 77124527 TAAAAACTCTTTTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTC 77124586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 TAAAAACTCTTTTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTC 1104

 77124587 ACTGGAACCTCCGCTTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTG 77124646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 ACTGGAACCTCCGCTTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTG 1164

 77124647 GGATTACGGGCGCCCGCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTT 77124706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 GGATTACGGGCGCCCGCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTT 1224

 77124707 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGC 77124766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGC 1284

 77124767 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAG 77124826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAG 1344

 77124827 ACATTGGCTTAGGCAAAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAACAA 77124886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 ACATTGGCTTAGGCAAAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAACAA 1404

 77124887 AAATAAATAAATGGGACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAATCT 77124946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 AAATAAATAAATGGGACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAATCT 1464

 77124947 GCAGAGTAAACCAACAACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCTGACA 77125006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 GCAGAGTAAACCAACAACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCTGACA 1524

 77125007 AAGGACTAATATCCAGAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACAAACA 77125066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 AAGGACTAATATCCAGAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACAAACA 1584

 77125067 ATCCCATCAAAAAATGGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATACAAA 77125126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 ATCCCATCAAAAAATGGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATACAAA 1644

 77125127 TGGCCAACATCACTAATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTACACCC 77125186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 TGGCCAACATCACTAATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTACACCC 1704

 77125187 GCAAGAATGGTCATAATTAAAGCAAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAAAAACA 77125246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 GCAAGAATGGTCATAATTAAAGCAAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAAAAACA 1764

 77125247 AAGATGTGGTGTGGATGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAATGTAA 77125306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 AAGATGTGGTGTGGATGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAATGTAA 1824

 77125307 ACTAGTACAACCACTATGGAAAACAGTATGGAAATTCCTTAAAGAACTCAAAGTAGAACT 77125366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 ACTAGTACAACCACTATGGAAAACAGTATGGAAATTCCTTAAAGAACTCAAAGTAGAACT 1884

 77125367 ACTATTTGACCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAGTCATTATA 77125426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 ACTATTTGACCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAGTCATTATA 1944

 77125427 TGAAAAAGACACATACACATGCATATTTATAGCAGCACAATTCACAATTGCAAAGATATG 77125486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 TGAAAAAGACACATACACATGCATATTTATAGCAGCACAATTCACAATTGCAAAGATATG 2004

 77125487 GAACCAACCTAAGTGTCCATCAGCCAATGAGTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATAAAT 77125546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 GAACCAACCTAAGTGTCCATCAGCCAATGAGTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATAAAT 2064

 77125547 CATGGAATACTACTCAGTCATAAGAAGGAATGAAATAATGTATTTTGCAGCAATTTGGAT 77125606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 CATGGAATACTACTCAGTCATAAGAAGGAATGAAATAATGTATTTTGCAGCAATTTGGAT 2124

 77125607 GGAGCGGGAGGTCATTATTCTAAGTGAAGTAACTTAGGAACGGAAAACCAAATATCGTTA 77125666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 GGAGCGGGAGGTCATTATTCTAAGTGAAGTAACTTAGGAACGGAAAACCAAATATCGTTA 2184

 77125667 TGTTCTCACTTATGAGTAGGAGTTAAACTATGAGGATGCAAAGGCATAAGATTGATATAA 77125726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 TGTTCTCACTTATGAGTAGGAGTTAAACTATGAGGATGCAAAGGCATAAGATTGATATAA 2244

 77125727 TGGACGTTGGGAACTTTGGGGGAAAAAGGGTCAGAGGGGGATGAAGGATTAAAGACTACG 77125786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 TGGACGTTGGGAACTTTGGGGGAAAAAGGGTCAGAGGGGGATGAAGGATTAAAGACTACG 2304

 77125787 TATTTGGGTACAGTGTACGCTGCTCAGGGGATGGGTGTACCAAAATCCAGAAATCACCAC 77125846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 TATTTGGGTACAGTGTACGCTGCTCAGGGGATGGGTGTACCAAAATCCAGAAATCACCAC 2364

 77125847 TAAAGAACTTATCCATGTAACCAAAAACCACCTGTTGCCCCAAAACTATTGAAATAAAAA 77125906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 TAAAGAACTTATCCATGTAACCAAAAACCACCTGTTGCCCCAAAACTATTGAAATAAAAA 2424

 77125907 TAAAAATTTTAAAAAAGAGGTAAGGGGATAAAGATATCTATAGTATAGATAGCTATACTA 77125966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 TAAAAATTTTAAAAAAGAGGTAAGGGGATAAAGATATCTATAGTATAGATAGCTATACTA 2484

 77125967 AAGACTTCAATATTACATAATGGTGGGACTCGTGCTGTGATTTAAAAAATTCCTTAATAA 77126026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 AAGACTTCAATATTACATAATGGTGGGACTCGTGCTGTGATTTAAAAAATTCCTTAATAA 2544

 77126027 ATTATATACTTAAAATGGTTAAAATGATAAAGTTTGTTTTATATATTTTACTACAATAAA 77126086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 ATTATATACTTAAAATGGTTAAAATGATAAAGTTTGTTTTATATATTTTACTACAATAAA 2604

 77126087 AATGTATGTTATTTAAATACTACTCAATTTCCATATTCTAGTAGGTTAGCATTGATAACT 77126146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 AATGTATGTTATTTAAATACTACTCAATTTCCATATTCTAGTAGGTTAGCATTGATAACT 2664

 77126147 ACATTTTATGGTTAGCTCAAGTTTAACTTTTAGTTTGCTACTCTAGATCTTACATAAGA 77126205
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 ACATTTTATGGTTAGCTCAAGTTTAACTTTTAGTTTGCTACTCTAGATCTTACATAAGA 2723

Alignment time is 2.21667 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    8189] =>      8189 nucs 'mol-32-2b3f-048193_8189'

Score:        8188
Aligned:      8188        nucs
Identic:      8188 (100%) nucs =>      3352 (100%)      4836 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77120229,77123580] EXCISED REGION [77123582,77128417]
 second seq =>  [       1,    3352] EXCISED REGION [    3354,    8189]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77123581,77123581]
 second seq =>         1 nucs [3353,3353]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3353,3353] to [3354,3354]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77120229 TCTAGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGCTCACTACAACCTCCTGGCTCACTACA 77120288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTAGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGCTCACTACAACCTCCTGGCTCACTACA 60

 77120289 ACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTA 77120348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTA 120

 77120349 CAGGTGCCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGATTTCACC 77120408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGGTGCCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGATTTCACC 180

 77120409 ATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTGAAGTGATCCCCACGCCTTGGCCTCCC 77120468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTGAAGTGATCCCCACGCCTTGGCCTCCC 240

 77120469 AAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCAATTTCTTAAACTCCAGA 77120528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCAATTTCTTAAACTCCAGA 300

 77120529 AATTGTTTCCTTTAGTCTAATAAATCCTAAATGCACTAACCTTTTAGGTTACAACATTTT 77120588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTGTTTCCTTTAGTCTAATAAATCCTAAATGCACTAACCTTTTAGGTTACAACATTTT 360

 77120589 TATAAATGCACTGATTTTGATTTGTGGAGATGGCTAAGTGAGACTGGAATATGAATAGCA 77120648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATAAATGCACTGATTTTGATTTGTGGAGATGGCTAAGTGAGACTGGAATATGAATAGCA 420

 77120649 CAATGAATGATATACTGTAAAATGGAAACATTAAGCCATTTTTTTCAACATTTACCGAAT 77120708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATGAATGATATACTGTAAAATGGAAACATTAAGCCATTTTTTTCAACATTTACCGAAT 480

 77120709 ACCCGTTATGTGCTTAGCACTGATAGCTACAGGATATGGCTCTGCCATTAACTAAGTAGT 77120768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCCGTTATGTGCTTAGCACTGATAGCTACAGGATATGGCTCTGCCATTAACTAAGTAGT 540

 77120769 AACTATATTCTTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCC 77120828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACTATATTCTTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCC 600

 77120829 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGATCACTACAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAG 77120888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGATCACTACAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAG 660

 77120889 CCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCATGCCCG 77120948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACACCACCATGCCCG 720

 77120949 TCTAATTTTTGTTGTTTTTTTTTTGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGT 77121008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTAATTTTTGTTGTTTTTTTTTTGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGT 780

 77121009 CTCGATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 77121068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCGATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 840

 77121069 CGTGAGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGACTGTCAAACAACTACAG 77121128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CGTGAGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGACTGTCAAACAACTACAG 900

 77121129 AGCTAACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTG 77121188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCTAACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTG 960

 77121189 ATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTA 77121248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTA 1020

 77121249 CAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGC 77121308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGC 1080

 77121309 AGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCTGACATACGAGAGTGCAT 77121368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCTGACATACGAGAGTGCAT 1140

 77121369 CAGGCCAGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCA 77121428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGGCCAGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCA 1200

 77121429 GATCACCCGAGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCTGTCTCT 77121488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATCACCCGAGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCTGTCTCT 1260

 77121489 ACTAAAAATTAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTC 77121548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACTAAAAATTAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTC 1320

 77121549 TGGAGGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCA 77121608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGAGGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCA 1380

 77121609 CCGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATTAAAAAAAAAAAAAGAGTGC 77121668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATTAAAAAAAAAAAAAGAGTGC 1440

 77121669 ATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGAC 77121728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGAC 1500

 77121729 TAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATCT 77121788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATCT 1560

 77121789 AGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCCA 77121848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCCA 1620

 77121849 TTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCTCTGATCTCTCAAAAGCTG 77121908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCTCTGATCTCTCAAAAGCTG 1680

 77121909 TGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCACATCTTGTGGACAAGGGCC 77121968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCACATCTTGTGGACAAGGGCC 1740

 77121969 CTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGTATATCTTTGGAAGATAGT 77122028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGTATATCTTTGGAAGATAGT 1800

 77122029 TGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAGATCTAACTTAACTGACTC 77122088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAGATCTAACTTAACTGACTC 1860

 77122089 CGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGCCATAGGCTGAACTAACT 77122148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGCCATAGGCTGAACTAACT 1920

 77122149 TTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAGA 77122208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAGA 1980

 77122209 CCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAATATTAGCCACAAGATGAA 77122268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAATATTAGCCACAAGATGAA 2040

 77122269 AAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTG 77122328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTG 2100

 77122329 CTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACTTGATGGATCAGCTGACAC 77122388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACTTGATGGATCAGCTGACAC 2160

 77122389 CACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCAG 77122448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCAG 2220

 77122449 CACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGCT 77122508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGCT 2280

 77122509 CACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGG 77122568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGG 2340

 77122569 GAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAAT 77122628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAAT 2400

 77122629 ACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAG 77122688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAG 2460

 77122689 TGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTAT 77122748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTAT 2520

 77122749 CCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATT 77122808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATT 2580

 77122809 GGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTA 77122868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTA 2640

 77122869 GAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCT 77122928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCT 2700

 77122929 GATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGG 77122988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGG 2760

 77122989 GTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGA 77123048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGA 2820

 77123049 GCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGAT 77123108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGAT 2880

 77123109 TACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAA 77123168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAA 2940

 77123169 CAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCA 77123228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCA 3000

 77123229 TCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCCT 77123288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCCT 3060

 77123289 TCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTCC 77123348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTCC 3120

 77123349 CAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAGAAAAAACTCTGGGAAATG 77123408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAGAAAAAACTCTGGGAAATG 3180

 77123409 TTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGTT 77123468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGTT 3240

 77123469 ACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCTA 77123528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCTA 3300

 77123529 TGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGTCATTAATGAT 77123580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGTCATTAATGAT 3352

EXCISED REGION

 77123582 CAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATA 77123641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 CAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATA 3413

 77123642 ATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAG 77123701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 ATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAG 3473

 77123702 CTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACA 77123761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 CTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACA 3533

 77123762 CATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATATGCAAGGGGAAA 77123821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 CATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATATGCAAGGGGAAA 3593

 77123822 GAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATC 77123881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 GAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATC 3653

 77123882 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 77123941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 3713

 77123942 TGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGG 77124001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 TGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGG 3773

 77124002 TGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAATCCAGG 77124061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 TGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAATCCAGG 3833

 77124062 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGGGCAACAGAGCG 77124121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGGGCAACAGAGCG 3893

 77124122 AGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTAACCAGGCGTGG 77124181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 AGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTAACCAGGCGTGG 3953

 77124182 TGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATTGCTTGAACCC 77124241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 TGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATTGCTTGAACCC 4013

 77124242 AAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 77124301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 AAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 4073

 77124302 AGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCATGATTGACAGAGCAG 77124361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 AGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCATGATTGACAGAGCAG 4133

 77124362 GTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAACAACAAAAGATCTACT 77124421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 GTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAACAACAAAAGATCTACT 4193

 77124422 TTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAAGATGGACCAGAAACT 77124481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 TTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAAGATGGACCAGAAACT 4253

 77124482 TAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTGTAAAAACTCTTTTTT 77124541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 TAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTGTAAAAACTCTTTTTT 4313

 77124542 TGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTCACTGGAACCTCCGCT 77124601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 TGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTCACTGGAACCTCCGCT 4373

 77124602 TCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTGGGATTACGGGCGCCC 77124661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 TCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTGGGATTACGGGCGCCC 4433

 77124662 GCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCA 77124721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 GCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCA 4493

 77124722 GGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 77124781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 GGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 4553

 77124782 GATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAGACATTGGCTTAGGCA 77124841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 GATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAGACATTGGCTTAGGCA 4613

 77124842 AAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAACAAAAATAAATAAATGGG 77124901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 AAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAACAAAAATAAATAAATGGG 4673

 77124902 ACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAATCTGCAGAGTAAACCAAC 77124961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 ACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAATCTGCAGAGTAAACCAAC 4733

 77124962 AACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCTGACAAAGGACTAATATCCA 77125021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 AACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCTGACAAAGGACTAATATCCA 4793

 77125022 GAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACAAACAATCCCATCAAAAAAT 77125081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 GAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACAAACAATCCCATCAAAAAAT 4853

 77125082 GGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGCCAACATCACTA 77125141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 GGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGCCAACATCACTA 4913

 77125142 ATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTACACCCGCAAGAATGGTCATA 77125201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 ATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTACACCCGCAAGAATGGTCATA 4973

 77125202 ATTAAAGCAAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAAAAACAAAGATGTGGTGTGGA 77125261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 ATTAAAGCAAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAAAAACAAAGATGTGGTGTGGA 5033

 77125262 TGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAACCACT 77125321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 TGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAACCACT 5093

 77125322 ATGGAAAACAGTATGGAAATTCCTTAAAGAACTCAAAGTAGAACTACTATTTGACCCAGC 77125381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 ATGGAAAACAGTATGGAAATTCCTTAAAGAACTCAAAGTAGAACTACTATTTGACCCAGC 5153

 77125382 AATCCCACTACTGGGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAGTCATTATATGAAAAAGACACATA 77125441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 AATCCCACTACTGGGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAGTCATTATATGAAAAAGACACATA 5213

 77125442 CACATGCATATTTATAGCAGCACAATTCACAATTGCAAAGATATGGAACCAACCTAAGTG 77125501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 CACATGCATATTTATAGCAGCACAATTCACAATTGCAAAGATATGGAACCAACCTAAGTG 5273

 77125502 TCCATCAGCCAATGAGTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATAAATCATGGAATACTACTC 77125561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 TCCATCAGCCAATGAGTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATAAATCATGGAATACTACTC 5333

 77125562 AGTCATAAGAAGGAATGAAATAATGTATTTTGCAGCAATTTGGATGGAGCGGGAGGTCAT 77125621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 AGTCATAAGAAGGAATGAAATAATGTATTTTGCAGCAATTTGGATGGAGCGGGAGGTCAT 5393

 77125622 TATTCTAAGTGAAGTAACTTAGGAACGGAAAACCAAATATCGTTATGTTCTCACTTATGA 77125681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 TATTCTAAGTGAAGTAACTTAGGAACGGAAAACCAAATATCGTTATGTTCTCACTTATGA 5453

 77125682 GTAGGAGTTAAACTATGAGGATGCAAAGGCATAAGATTGATATAATGGACGTTGGGAACT 77125741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 GTAGGAGTTAAACTATGAGGATGCAAAGGCATAAGATTGATATAATGGACGTTGGGAACT 5513

 77125742 TTGGGGGAAAAAGGGTCAGAGGGGGATGAAGGATTAAAGACTACGTATTTGGGTACAGTG 77125801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 TTGGGGGAAAAAGGGTCAGAGGGGGATGAAGGATTAAAGACTACGTATTTGGGTACAGTG 5573

 77125802 TACGCTGCTCAGGGGATGGGTGTACCAAAATCCAGAAATCACCACTAAAGAACTTATCCA 77125861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 TACGCTGCTCAGGGGATGGGTGTACCAAAATCCAGAAATCACCACTAAAGAACTTATCCA 5633

 77125862 TGTAACCAAAAACCACCTGTTGCCCCAAAACTATTGAAATAAAAATAAAAATTTTAAAAA 77125921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 TGTAACCAAAAACCACCTGTTGCCCCAAAACTATTGAAATAAAAATAAAAATTTTAAAAA 5693

 77125922 AGAGGTAAGGGGATAAAGATATCTATAGTATAGATAGCTATACTAAAGACTTCAATATTA 77125981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 AGAGGTAAGGGGATAAAGATATCTATAGTATAGATAGCTATACTAAAGACTTCAATATTA 5753

 77125982 CATAATGGTGGGACTCGTGCTGTGATTTAAAAAATTCCTTAATAAATTATATACTTAAAA 77126041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 CATAATGGTGGGACTCGTGCTGTGATTTAAAAAATTCCTTAATAAATTATATACTTAAAA 5813

 77126042 TGGTTAAAATGATAAAGTTTGTTTTATATATTTTACTACAATAAAAATGTATGTTATTTA 77126101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 TGGTTAAAATGATAAAGTTTGTTTTATATATTTTACTACAATAAAAATGTATGTTATTTA 5873

 77126102 AATACTACTCAATTTCCATATTCTAGTAGGTTAGCATTGATAACTACATTTTATGGTTAG 77126161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 AATACTACTCAATTTCCATATTCTAGTAGGTTAGCATTGATAACTACATTTTATGGTTAG 5933

 77126162 CTCAAGTTTAACTTTTAGTTTGCTACTCTAGATCTTACATAAGAGCAATCCCATTTAATG 77126221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 CTCAAGTTTAACTTTTAGTTTGCTACTCTAGATCTTACATAAGAGCAATCCCATTTAATG 5993

 77126222 TCTTATAGCCACTGAAAAAAATATATTCCACTTTCACTATATTTTACCTATTTTTATATA 77126281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 TCTTATAGCCACTGAAAAAAATATATTCCACTTTCACTATATTTTACCTATTTTTATATA 6053

 77126282 GCAGAATAAACCAAAGATCTTACCATCTGAAATACATCAGAGCCTTCATCAAAATCCACC 77126341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 GCAGAATAAACCAAAGATCTTACCATCTGAAATACATCAGAGCCTTCATCAAAATCCACC 6113

 77126342 ATGGCAAAAAATATCCTGTTGGTGAATGCACTGGAGTATCGCCAGGAGTTTGCCAGGATC 77126401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 ATGGCAAAAAATATCCTGTTGGTGAATGCACTGGAGTATCGCCAGGAGTTTGCCAGGATC 6173

 77126402 TGGAATTCTTCATCAGCTTGCCTGGATGCAATGAGATTCGTAAAGATAACATATAAAACA 77126461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6174 TGGAATTCTTCATCAGCTTGCCTGGATGCAATGAGATTCGTAAAGATAACATATAAAACA 6233

 77126462 ATTTTTGAAAGCAATCTCGTTTATCATCAGTAAAACAGGTCCAAGCAAGCAATAGCAGGT 77126521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 ATTTTTGAAAGCAATCTCGTTTATCATCAGTAAAACAGGTCCAAGCAAGCAATAGCAGGT 6293

 77126522 TTTCCAATGGGAGAAATAATAAAAAACACTGACAAGTAGGTCAGACTCTGCTGACAGGGT 77126581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6294 TTTCCAATGGGAGAAATAATAAAAAACACTGACAAGTAGGTCAGACTCTGCTGACAGGGT 6353

 77126582 TAAGACAAATCTTGTTTTGGCATAAGAGAAGCCTTATCCCAAGTTAGGGATTTCATGAGA 77126641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 TAAGACAAATCTTGTTTTGGCATAAGAGAAGCCTTATCCCAAGTTAGGGATTTCATGAGA 6413

 77126642 AGTAGTAATTACCTGACTCCGCTTCATACTTTGTGCCTGTTTCTTATCCCAAAACTCTTT 77126701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 AGTAGTAATTACCTGACTCCGCTTCATACTTTGTGCCTGTTTCTTATCCCAAAACTCTTT 6473

 77126702 CAACAATCATTGGAAATATATAGCTAATCGCCTCTACAATAACTTTCCATACCCTAAATT 77126761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 CAACAATCATTGGAAATATATAGCTAATCGCCTCTACAATAACTTTCCATACCCTAAATT 6533

 77126762 ACTTCTAAGAGTTCAAAGACAAGACAGAAGTGTATTCCCTAAAGAAAGCAGAAATACAAT 77126821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 ACTTCTAAGAGTTCAAAGACAAGACAGAAGTGTATTCCCTAAAGAAAGCAGAAATACAAT 6593

 77126822 ATTAATTCATTTTTAAAAATCTAAAGTGCAAAAGCTACTTGGTAAATAACACAATCAGAT 77126881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6594 ATTAATTCATTTTTAAAAATCTAAAGTGCAAAAGCTACTTGGTAAATAACACAATCAGAT 6653

 77126882 AAATTATTAGGATGAAAGATAAGAAGAGTCTAGGAATTGAAATTAATTGAGGCCAGCTCA 77126941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6654 AAATTATTAGGATGAAAGATAAGAAGAGTCTAGGAATTGAAATTAATTGAGGCCAGCTCA 6713

 77126942 TACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGCT 77127001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6714 TACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGCT 6773

 77127002 CAAGACAAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGTCTCTATTAAAAATACAAAAATTAGGC 77127061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6774 CAAGACAAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGTCTCTATTAAAAATACAAAAATTAGGC 6833

 77127062 CAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACGTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCA 77127121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6834 CAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACGTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCA 6893

 77127122 CAAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCTATCTCTACCAAAAA 77127181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6894 CAAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCTATCTCTACCAAAAA 6953

 77127182 TACAAAAATTAACCGGGCATGGTGGCAGGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGA 77127241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6954 TACAAAAATTAACCGGGCATGGTGGCAGGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGA 7013

 77127242 GGCAAGAGAATGGCTTGAATCCGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCACACCACT 77127301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7014 GGCAAGAGAATGGCTTGAATCCGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCACACCACT 7073

 77127302 GCACTCCAGCCTGGGCGACACAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAATTATTGAAACCTCA 77127361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7074 GCACTCCAGCCTGGGCGACACAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAATTATTGAAACCTCA 7133

 77127362 AGTCATCTTTGAATTTTTCCATATCTCCCATATGCTTTCAGTTCTCATGATCTGTCAATT 77127421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7134 AGTCATCTTTGAATTTTTCCATATCTCCCATATGCTTTCAGTTCTCATGATCTGTCAATT 7193

 77127422 CTCATTTGCGATAAAAGTTTCACTCCATATCCTCCTATTTTTATTGCTATCATCTAAGGT 77127481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7194 CTCATTTGCGATAAAAGTTTCACTCCATATCCTCCTATTTTTATTGCTATCATCTAAGGT 7253

 77127482 CAGATTTTTGTTATCTAATAGTAGGATATTTAAAAATACTGACTCTGGTTTCTCCTCCTT 77127541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7254 CAGATTTTTGTTATCTAATAGTAGGATATTTAAAAATACTGACTCTGGTTTCTCCTCCTT 7313

 77127542 CAATCCTTCTTTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCT 77127601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7314 CAATCCTTCTTTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCT 7373

 77127602 CCATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGTCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCT 77127661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7374 CCATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGTCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCT 7433

 77127662 CCTAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCATCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 77127721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7434 CCTAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCATCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 7493

 77127722 TAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAATCCTGTCCTCAGGTGATC 77127781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7494 TAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAATCCTGTCCTCAGGTGATC 7553

 77127782 CGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCCT 77127841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7554 CGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCCT 7613

 77127842 CCTCCAATCCTTACACTGCAATATACATCCATCTTCCTAAATTACTACTTTCCTGAAACA 77127901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7614 CCTCCAATCCTTACACTGCAATATACATCCATCTTCCTAAATTACTACTTTCCTGAAACA 7673

 77127902 CTTCTCAGAAATCACTGTTGCTTTCTTATTACCTTCAGAATACATTCTCTAATCTCTTTC 77127961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7674 CTTCTCAGAAATCACTGTTGCTTTCTTATTACCTTCAGAATACATTCTCTAATCTCTTTC 7733

 77127962 ACTAGTTATTGAAGGTTCTTTATCACATAGCTTCAAATAATACATCTAGTTTTTATCTAG 77128021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7734 ACTAGTTATTGAAGGTTCTTTATCACATAGCTTCAAATAATACATCTAGTTTTTATCTAG 7793

 77128022 TCTTACTACTAATCAATCTCAAACAGTAACCTTTAGTCCCAATATTTTATTTACTCCTAT 77128081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7794 TCTTACTACTAATCAATCTCAAACAGTAACCTTTAGTCCCAATATTTTATTTACTCCTAT 7853

 77128082 CCCTGTACCCTTGTGTACATCATGCTTCTAACCAGAATATCCTGCCTGTATCAACATCTT 77128141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7854 CCCTGTACCCTTGTGTACATCATGCTTCTAACCAGAATATCCTGCCTGTATCAACATCTT 7913

 77128142 ATCCATTTGTCTAGCCCTAGCACAAGTCTTATTTCCTCCATCAGGCCAATCCAAATCACT 77128201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7914 ATCCATTTGTCTAGCCCTAGCACAAGTCTTATTTCCTCCATCAGGCCAATCCAAATCACT 7973

 77128202 CCTATTAACCTTCTTTCCTGAAATTTTACAGTATTTATTATATGTACAGTTGATCTGGTA 77128261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7974 CCTATTAACCTTCTTTCCTGAAATTTTACAGTATTTATTATATGTACAGTTGATCTGGTA 8033

 77128262 CTTAATCACAAATTGCCTTATATTGCCATCTAAATTTTCATATGTGTAACTCATTTCCTT 77128321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8034 CTTAATCACAAATTGCCTTATATTGCCATCTAAATTTTCATATGTGTAACTCATTTCCTT 8093

 77128322 AACCAGATGATAAGGGTAGGTTATCTATTTTACAATTCTCATCCCAACAGCACCACAACT 77128381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8094 AACCAGATGATAAGGGTAGGTTATCTATTTTACAATTCTCATCCCAACAGCACCACAACT 8153

 77128382 ACAGTATAATTCATGTTGCTGTTGTTTAATTTTTAT 77128417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8154 ACAGTATAATTCATGTTGCTGTTGTTTAATTTTTAT 8189

Alignment time is 6.55479 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4656] =>      4656 nucs 'mol-32-2b3f-063808_4656'

Score:        4625
Aligned:      4658        nucs
Identic:      4655 (100%) nucs =>      3519 (100%)      1136 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77117864,77121385] EXCISED REGION [77123867,77125002]
 second seq =>  [       1,    3520] EXCISED REGION [    3521,    4656]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2481 nucs [77121386,77123866]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        32 nucs [77121386,77121417] to [77123867,77123898]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77117864 AAGCTAAAAAGCTTCTGCAAAGCAAAGGAAACAACAAAGTGAAGAGACAATCTGTTGAAT 77117923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGCTAAAAAGCTTCTGCAAAGCAAAGGAAACAACAAAGTGAAGAGACAATCTGTTGAAT 60

 77117924 GGGAGAAAATATTTACAAACTATTCATTCAACAAGGAACTAATGTCCAGAATATACAAAA 77117983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGAGAAAATATTTACAAACTATTCATTCAACAAGGAACTAATGTCCAGAATATACAAAA 120

 77117984 AATTCAAACAACTCTAAAAAGAAAATAAAACAAAAACAAAAACAAAAAAAATTCAAATCA 77118043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTCAAACAACTCTAAAAAGAAAATAAAACAAAAACAAAAACAAAAAAAATTCAAATCA 180

 77118044 CTCAACAGTAAAAAAGCAAATAATCCCATTAAAAAGTGGACAAAGGACATGAATAGACAT 77118103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCAACAGTAAAAAAGCAAATAATCCCATTAAAAAGTGGACAAAGGACATGAATAGACAT 240

 77118104 TTCTCAAAAGAAGACACACATGGCCAACAGGTGTATGAAAAAATACTCAACATCACTCAT 77118163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCTCAAAAGAAGACACACATGGCCAACAGGTGTATGAAAAAATACTCAACATCACTCAT 300

 77118164 CATCAGGGAAACGCAAATCAAATCTACAGTGAGATATCATCTTCTCCCAGTTAGAATGGC 77118223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATCAGGGAAACGCAAATCAAATCTACAGTGAGATATCATCTTCTCCCAGTTAGAATGGC 360

 77118224 CATTATTATTATTATTAGAAAAGCTCCTTTTCTGCTCATCTGTCTGTTGCCTCCTTGCAA 77118283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATTATTATTATTATTAGAAAAGCTCCTTTTCTGCTCATCTGTCTGTTGCCTCCTTGCAA 420

 77118284 TACATTTTCCTACTTTCTCTAATAAATCTGCCTTTCTTTACCTTAAACGAACAAACAAAC 77118343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACATTTTCCTACTTTCTCTAATAAATCTGCCTTTCTTTACCTTAAACGAACAAACAAAC 480

 77118344 AAAAACAGATGCAAGGATATGGAGAAAAGGGAACTCACGGCCAGGCACGGTGGCTCATTC 77118403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAACAGATGCAAGGATATGGAGAAAAGGGAACTCACGGCCAGGCACGGTGGCTCATTC 540

 77118404 CTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGA 77118463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGA 600

 77118464 GATCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGG 77118523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGG 660

 77118524 TGTGGTGATGTGCGCCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGATACTGAGGCAGGAGAATCGCTTG 77118583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTGGTGATGTGCGCCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGATACTGAGGCAGGAGAATCGCTTG 720

 77118584 AACCCAGGAAGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAAATCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGT 77118643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACCCAGGAAGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAAATCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGT 780

 77118644 GAGACTCCATCTCAAAAAAAAAGGGAACTCATACACTGTTGGTGGGAAATTAAATTAGTA 77118703
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGACTCCATCTCAAAAAAAA-GGGAACTCATACACTGTTGGTGGGAAATTAAATTAGTA 839

 77118704 TAGCCACTATGAAAAACAGTATAAGGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGTA 77118763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TAGCCACTATGAAAAACAGTATAAGGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGTA 899

 77118764 CTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCATGGCTAAC 77118823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCATGGCTAAC 959

 77118824 ACGGTGAAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGTG 77118883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ACGGTGAAGCCCCATCTCTACTAAAAAATACAACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGTG 1019

 77118884 CACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC 77118943
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC 1079

 77118944 GGAGCTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGCACTCCAGAGGGAGACTCCG 77119003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GGAGCTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGCACTCCAGAGGGAGACTCCG 1139

 77119004 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACAGTATAAAGATTTCCCAAGAAACTAAAAATAGAA 77119063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACAGTATAAAGATTTCCCAAGAAACTAAAAATAGAA 1199

 77119064 CTAGCATTTGATCCAGCAATGCCACTACTGGGTATGTATCCATAGGAAAGGAAATCAGTA 77119123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CTAGCATTTGATCCAGCAATGCCACTACTGGGTATGTATCCATAGGAAAGGAAATCAGTA 1259

 77119124 TATCAAAGGGATACCTGCACCCCCATGTTTACTGCAGCACAATAGCAAAGTTATGGAATC 77119183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TATCAAAGGGATACCTGCACCCCCATGTTTACTGCAGCACAATAGCAAAGTTATGGAATC 1319

 77119184 AACCTAAGCATCCATCAACAGACGAACAGATCAAGAAAATGTGGTATTAGGCCAGGCGCA 77119243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AACCTAAGCATCCATCAACAGACGAACAGATCAAGAAAATGTGGTATTAGGCCAGGCGCA 1379

 77119244 GTGGCTTGCGCCTGTAATCCTACCACTTTGGGAGGCTGCGGCAGGTGGATCAGTTGAGCT 77119303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GTGGCTTGCGCCTGTAATCCTACCACTTTGGGAGGCTGCGGCAGGTGGATCAGTTGAGCT 1439

 77119304 CAGGAGTTGGAGGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATA 77119363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CAGGAGTTGGAGGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATA 1499

 77119364 CAAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCGAGACGCTGA 77119423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CAAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCGAGACGCTGA 1559

 77119424 GGCAGGAGAATGGCTTGAACCTGGGAGGTTGCAGTAAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTC 77119483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GGCAGGAGAATGGCTTGAACCTGGGAGGTTGCAGTAAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTC 1619

 77119484 TAGCCTGGGCGACAGAGAAAGACTCCATCTCAAAGAAAAAAAAAATGTGGTGTGTATACA 77119543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TAGCCTGGGCGACAGAGAAAGACTCCATCTCAAAGAAAAAAAAAATGTGGTGTGTATACA 1679

 77119544 CAATGGAATACTACTCCACCATAAAAAAGAATGAAATCATGTTACTTGCAGCAATATGGA 77119603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CAATGGAATACTACTCCACCATAAAAAAGAATGAAATCATGTTACTTGCAGCAATATGGA 1739

 77119604 TGGAACTGGAAGTTATTATGTGAAATAAGCCAGGCACAGAAAGACAAATATGGCATGTTC 77119663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TGGAACTGGAAGTTATTATGTGAAATAAGCCAGGCACAGAAAGACAAATATGGCATGTTC 1799

 77119664 TCATATGTGGGAGCTAAAAAAATTGAACTCAGGGAGGTACAGAGTAGAATGGCAGATACC 77119723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TCATATGTGGGAGCTAAAAAAATTGAACTCAGGGAGGTACAGAGTAGAATGGCAGATACC 1859

 77119724 AGAGGCTGGGAAGAGTGTATGTGTGTGTGTTGTGGTGGGCGGGGTGGGGGGGAGGGGTGC 77119783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AGAGGCTGGGAAGAGTGTATGTGTGTGTGTTGTGGTGGGCGGGGTGGGGGGGAGGGGTGC 1919

 77119784 GGGAGCGGGCAATGAAGAGAGGTCAGTTAATGGGTACACTCATACAGTTAGAAGGAGTAA 77119843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GGGAGCGGGCAATGAAGAGAGGTCAGTTAATGGGTACACTCATACAGTTAGAAGGAGTAA 1979

 77119844 GATCTAATGTTCCATAGCAGAGTAGCGTGACTATAATTAACAAAAATGTATTACATATTT 77119903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GATCTAATGTTCCATAGCAGAGTAGCGTGACTATAATTAACAAAAATGTATTACATATTT 2039

 77119904 CAAAACAGCTAGAAGAGAGGACTTGAAATGTTCCCAACATATAGAAATGATAAATACTCA 77119963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CAAAACAGCTAGAAGAGAGGACTTGAAATGTTCCCAACATATAGAAATGATAAATACTCA 2099

 77119964 AGGTGATGGATACTCCAACTATCCTGACTTGATCATTCTATGAATCTAACAAAATATCAC 77120023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AGGTGATGGATACTCCAACTATCCTGACTTGATCATTCTATGAATCTAACAAAATATCAC 2159

 77120024 ATGTACCCCATAAATATGTACAAATATTATGTTATCAGTAAAAAAACTAAGGTAGAAAAA 77120083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ATGTACCCCATAAATATGTACAAATATTATGTTATCAGTAAAAAAACTAAGGTAGAAAAA 2219

 77120084 AATGGGTTTTCTATTTTTACAAATCACTAACAGAAGTTATGTGTTACCTTGTTAAAATAA 77120143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AATGGGTTTTCTATTTTTACAAATCACTAACAGAAGTTATGTGTTACCTTGTTAAAATAA 2279

 77120144 ATGGAATTAAAAATTGTAATTTCCAAAAATAACTGCAGCCTAAATAGTAGAGAATTAAAA 77120203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 ATGGAATTAAAAATTGTAATTTCCAAAAATAACTGCAGCCTAAATAGTAGAGAATTAAAA 2339

 77120204 AGCAATTTTTTTTTTTGAGACAAAGTCTAGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGCT 77120263
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AGCAATTTTTTTTTT-GAGACAAAGTCTAGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGCGGCT 2398

 77120264 CACTACAACCTCCTGGCTCACTACAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTC 77120323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CACTACAACCTCCTGGCTCACTACAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTC 2458

 77120324 TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTGTA 77120383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTGTA 2518

 77120384 TTTTTAGTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTGA 77120443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TTTTTAGTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGACCTGA 2578

 77120444 AGTGATCCCCACGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCC 77120503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AGTGATCCCCACGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCC 2638

 77120504 TGGCCTCAATTTCTTAAACTCCAGAAATTGTTTCCTTTAGTCTAATAAATCCTAAATGCA 77120563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGGCCTCAATTTCTTAAACTCCAGAAATTGTTTCCTTTAGTCTAATAAATCCTAAATGCA 2698

 77120564 CTAACCTTTTAGGTTACAACATTTTTATAAATGCACTGATTTTGATTTGTGGAGATGGCT 77120623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 CTAACCTTTTAGGTTACAACATTTTTATAAATGCACTGATTTTGATTTGTGGAGATGGCT 2758

 77120624 AAGTGAGACTGGAATATGAATAGCACAATGAATGATATACTGTAAAATGGAAACATTAAG 77120683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AAGTGAGACTGGAATATGAATAGCACAATGAATGATATACTGTAAAATGGAAACATTAAG 2818

 77120684 CCATTTTTTTCAACATTTACCGAATACCCGTTATGTGCTTAGCACTGATAGCTACAGGAT 77120743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CCATTTTTTTCAACATTTACCGAATACCCGTTATGTGCTTAGCACTGATAGCTACAGGAT 2878

 77120744 ATGGCTCTGCCATTAACTAAGTAGTAACTATATTCTTTTATTTATTTATTTATTTATTTT 77120803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 ATGGCTCTGCCATTAACTAAGTAGTAACTATATTCTTTTATTTATTTATTTATTTATTTT 2938

 77120804 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGATCACT 77120863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGATCACT 2998

 77120864 ACAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 77120923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 ACAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 3058

 77120924 CTACAGGCGCACACCACCATGCCCGTCTAATTTTTGTTGTTTTTTTTTTGTAGAGACAGG 77120983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CTACAGGCGCACACCACCATGCCCGTCTAATTTTTGTTGTTTTTTTTTTGTAGAGACAGG 3118

 77120984 GTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGG 77121043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGG 3178

 77121044 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCT 77121103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCT 3238

 77121104 AAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGATAAAT 77121163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 AAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGATAAAT 3298

 77121164 GTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTT 77121223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTT 3358

 77121224 TATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGC 77121283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGC 3418

 77121284 AGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCA 77121343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCA 3478

 77121344 ACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGTGGTGT 77121385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 ACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGTGGTGT 3520

EXCISED REGION

 77123867 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGG 77123926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGG 3580

 77123927 AGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGT 77123986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 AGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGT 3640

 77123987 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAA 77124046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAA 3700

 77124047 TCACTTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGT 77124106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 TCACTTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGT 3760

 77124107 CTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAA 77124166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 CTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAA 3820

 77124167 ATTAACCAGGCGTGGTGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGA 77124226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 ATTAACCAGGCGTGGTGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGA 3880

 77124227 AAATTGCTTGAACCCAAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTC 77124286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 AAATTGCTTGAACCCAAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTC 3940

 77124287 CAGCCTGGGCAACAGAGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCA 77124346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 CAGCCTGGGCAACAGAGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCA 4000

 77124347 TGATTGACAGAGCAGGTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAAC 77124406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 TGATTGACAGAGCAGGTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAAC 4060

 77124407 AACAAAAGATCTACTTTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAA 77124466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 AACAAAAGATCTACTTTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAA 4120

 77124467 GATGGACCAGAAACTTAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTG 77124526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 GATGGACCAGAAACTTAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTG 4180

 77124527 TAAAAACTCTTTTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTC 77124586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 TAAAAACTCTTTTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTC 4240

 77124587 ACTGGAACCTCCGCTTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTG 77124646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 ACTGGAACCTCCGCTTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTG 4300

 77124647 GGATTACGGGCGCCCGCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTT 77124706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 GGATTACGGGCGCCCGCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTT 4360

 77124707 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGC 77124766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGC 4420

 77124767 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAG 77124826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAG 4480

 77124827 ACATTGGCTTAGGCAAAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAACAA 77124886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 ACATTGGCTTAGGCAAAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAACAA 4540

 77124887 AAATAAATAAATGGGACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAATCT 77124946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 AAATAAATAAATGGGACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAATCT 4600

 77124947 GCAGAGTAAACCAACAACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCT 77125002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 GCAGAGTAAACCAACAACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCT 4656

Alignment time is 3.74471 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2668] =>      2668 nucs 'mol-32-2e4c-034609_2668'

Score:        2656
Aligned:      2667        nucs
Identic:      2666 (100%) nucs =>      2267 (100%)       399 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77121013,77123279] EXCISED REGION [77123281,77123680]
 second seq =>  [       1,    2267] EXCISED REGION [    2269,    2668]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77123280,77123280]
 second seq =>         1 nucs [2268,2268]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [77123280,77123280] to [77123281,77123281]
 second seq =>         1 nucs [2267,2267] to [2268,2268]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77121013 ATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTG 77121072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTG 60

 77121073 AGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCT 77121132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCT 120

 77121133 AACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATAT 77121192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATAT 180

 77121193 AACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGG 77121252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGG 240

 77121253 GAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGAC 77121312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGAC 300

 77121313 AGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGG 77121372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGG 360

 77121373 CCAGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATC 77121432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCAGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATC 420

 77121433 ACCCGAGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCTGTCTCTACTA 77121492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCCGAGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCTGTCTCTACTA 480

 77121493 AAAATTAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTCTGGA 77121552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAATTAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTCTGGA 540

 77121553 GGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACCGC 77121612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACCGC 600

 77121613 ACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATTAAAAAAAAAAAAAGAGTGCATCA 77121672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATTAAAAAAAAAAAAAGAGTGCATCA 660

 77121673 AAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGACTAAG 77121732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGACTAAG 720

 77121733 GAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATCTAGCC 77121792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATCTAGCC 780

 77121793 AAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCCATTGG 77121852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCCATTGG 840

 77121853 AAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCTCTGATCTCTCAAAAGCTGTGTT 77121912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCTCTGATCTCTCAAAAGCTGTGTT 900

 77121913 GGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCACATCTTGTGGACAAGGGCCCTAA 77121972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCACATCTTGTGGACAAGGGCCCTAA 960

 77121973 CTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGTATATCTTTGGAAGATAGTTGAA 77122032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGTATATCTTTGGAAGATAGTTGAA 1020

 77122033 ATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAGATCTAACTTAACTGACTCCGAC 77122092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAGATCTAACTTAACTGACTCCGAC 1080

 77122093 TTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGCCATAGGCTGAACTAACTTTAG 77122152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGCCATAGGCTGAACTAACTTTAG 1140

 77122153 GAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTC 77122212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTC 1200

 77122213 CTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAATATTAGCCACAAGATGAAAAAT 77122272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAATATTAGCCACAAGATGAAAAAT 1260

 77122273 TATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCC 77122332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCC 1320

 77122333 TAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACTTGATGGATCAGCTGACACCACC 77122392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACTTGATGGATCAGCTGACACCACC 1380

 77122393 CAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCAGCACA 77122452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCAGCACA 1440

 77122453 TGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGCTCACT 77122512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGCTCACT 1500

 77122513 GGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGA 77122572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGA 1560

 77122573 CTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTT 77122632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTT 1620

 77122633 TCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAA 77122692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAA 1680

 77122693 CCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTATCCAT 77122752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTATCCAT 1740

 77122753 TACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCC 77122812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCC 1800

 77122813 CTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGT 77122872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGT 1860

 77122873 GCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATC 77122932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATC 1920

 77122933 CAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTT 77122992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTT 1980

 77122993 GGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCA 77123052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCA 2040

 77123053 GGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACT 77123112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACT 2100

 77123113 TGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAA 77123172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAA 2160

 77123173 CAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCA 77123232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCA 2220

 77123233 TGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAGAAC 77123279
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAGAAC 2267

EXCISED REGION

 77123281 TAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTTGTTTAAACCA 77123340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 TAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTTGTTTAAACCA 2328

 77123341 GGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAGAAAAAACTCT 77123400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 GGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAGAAAAAACTCT 2388

 77123401 GGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAGTGGACCAGTT 77123460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 GGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAGTGGACCAGTT 2448

 77123461 AAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAATGTAAAGGGGG 77123520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 AAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAATGTAAAGGGGG 2508

 77123521 TATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGTCATTAATGAT 77123580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 TATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGTCATTAATGAT 2568

 77123581 ACAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATAT 77123640
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 CCAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATAT 2628

 77123641 AATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGT 77123680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 AATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGT 2668

Alignment time is 2.11617 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    5297] =>      5297 nucs 'mol-32-2f33-014672_5297'

Score:        5274
Aligned:      5296        nucs
Identic:      5294 (100%) nucs =>       262 (100%)      5032 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77121501,77121762] EXCISED REGION [77121764,77126796]
 second seq =>  [       1,     262] EXCISED REGION [     264,    5297]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77121763,77121763]
 second seq =>         1 nucs [263,263]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3710,3710]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [77121763,77121764] to [77121764,77121765]
 second seq =>         2 nucs [261,262] to [262,263]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77121501 AAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTGAGG 77121560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTGAGG 60

 77121561 CACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCCAGC 77121620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCCAGC 120

 77121621 CTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATTAAAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAATAT 77121680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATTAAAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAATAT 180

 77121681 GATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATTCTG 77121740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATTCTG 240

 77121741 GCTTCAGTCTATACACTACTCC 77121762
          ||||||||||||||||||||||
      241 GCTTCAGTCTATACACTACTCC 262

EXCISED REGION

 77121764 TTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGA 77121823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      264 TTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGA 323

 77121824 GAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTT 77121883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      324 GAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTT 383

 77121884 AACATCTCTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTT 77121943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      384 AACATCTCTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTT 443

 77121944 TCTGCACATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGA 77122003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      444 TCTGCACATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGA 503

 77122004 TATTTGTATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGT 77122063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      504 TATTTGTATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGT 563

 77122064 GAAAGAGATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCA 77122123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      564 GAAAGAGATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCA 623

 77122124 TTCCTGGCCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGAC 77122183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      624 TTCCTGGCCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGAC 683

 77122184 TGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTA 77122243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      684 TGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTA 743

 77122244 GGACTAATATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTA 77122303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      744 GGACTAATATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTA 803

 77122304 CAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACT 77122363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 CAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACT 863

 77122364 CTGCACTTGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGT 77122423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 CTGCACTTGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGT 923

 77122424 GGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAAT 77122483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 GGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAAT 983

 77122484 CTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAA 77122543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 CTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAA 1043

 77122544 AAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTC 77122603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 AAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTC 1103

 77122604 CCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAAT 77122663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 CCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAAT 1163

 77122664 TGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCAC 77122723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 TGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCAC 1223

 77122724 AGCAAAGGGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTG 77122783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 AGCAAAGGGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTG 1283

 77122784 TTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTG 77122843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 TTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTG 1343

 77122844 GGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCT 77122903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 GGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCT 1403

 77122904 CAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTC 77122963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 CAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTC 1463

 77122964 TTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTG 77123023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 TTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTG 1523

 77123024 TGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCT 77123083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 TGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCT 1583

 77123084 ACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCA 77123143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 ACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCA 1643

 77123144 ACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTC 77123203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 ACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTC 1703

 77123204 AGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTG 77123263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 AGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTG 1763

 77123264 CAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACT 77123323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 CAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACT 1823

 77123324 TAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATAC 77123383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 TAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATAC 1883

 77123384 CATGTAGAAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGA 77123443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 CATGTAGAAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGA 1943

 77123444 AGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCC 77123503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 AGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCC 2003

 77123504 TTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAA 77123563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 TTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAA 2063

 77123564 GAAGTGTCATTAATGATACAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAAC 77123623
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 GAAGTGTCATTAATGATCCAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAAC 2123

 77123624 AGTTTAATTTGGGATATAATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATA 77123683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 AGTTTAATTTGGGATATAATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATA 2183

 77123684 GCAAGGCATTATATCCAGCTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTC 77123743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 GCAAGGCATTATATCCAGCTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTC 2243

 77123744 AAATATATGAATTAGACACATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTA 77123803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 AAATATATGAATTAGACACATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTA 2303

 77123804 TTTATATGCAAGGGGAAAGAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGG 77123863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 TTTATATGCAAGGGGAAAGAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGG 2363

 77123864 TGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTC 77123923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 TGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTC 2423

 77123924 AGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAA 77123983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 AGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAA 2483

 77123984 AGTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAA 77124043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 AGTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAA 2543

 77124044 GAATCACTTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCT 77124103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 GAATCACTTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCT 2603

 77124104 AGTCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAA 77124163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 AGTCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAA 2663

 77124164 AAAATTAACCAGGCGTGGTGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCA 77124223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 AAAATTAACCAGGCGTGGTGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCA 2723

 77124224 GGAAAATTGCTTGAACCCAAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCA 77124283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 GGAAAATTGCTTGAACCCAAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCA 2783

 77124284 CTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGG 77124343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 CTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGG 2843

 77124344 TCATGATTGACAGAGCAGGTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCA 77124403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 TCATGATTGACAGAGCAGGTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCA 2903

 77124404 AACAACAAAAGATCTACTTTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACT 77124463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 AACAACAAAAGATCTACTTTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACT 2963

 77124464 CAAGATGGACCAGAAACTTAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACA 77124523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 CAAGATGGACCAGAAACTTAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACA 3023

 77124524 TTGTAAAAACTCTTTTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGG 77124583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 TTGTAAAAACTCTTTTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGG 3083

 77124584 CTCACTGGAACCTCCGCTTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAG 77124643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 CTCACTGGAACCTCCGCTTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAG 3143

 77124644 TTGGGATTACGGGCGCCCGCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGA 77124703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 TTGGGATTACGGGCGCCCGCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGA 3203

 77124704 GTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTT 77124763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 GTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTT 3263

 77124764 GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTC 77124823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTC 3323

 77124824 CAGACATTGGCTTAGGCAAAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAA 77124883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 CAGACATTGGCTTAGGCAAAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAA 3383

 77124884 CAAAAATAAATAAATGGGACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAA 77124943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 CAAAAATAAATAAATGGGACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAA 3443

 77124944 TCTGCAGAGTAAACCAACAACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCTG 77125003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 TCTGCAGAGTAAACCAACAACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCTG 3503

 77125004 ACAAAGGACTAATATCCAGAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACAA 77125063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 ACAAAGGACTAATATCCAGAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACAA 3563

 77125064 ACAATCCCATCAAAAAATGGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATAC 77125123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 ACAATCCCATCAAAAAATGGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATAC 3623

 77125124 AAATGGCCAACATCACTAATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTACA 77125183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 AAATGGCCAACATCACTAATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTACA 3683

 77125184 CCCGCAAGAATGGTCATAATTAAAGC-AAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAAA 77125242
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 CCCGCAAGAATGGTCATAATTAAAGCAAAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAAA 3743

 77125243 AACAAAGATGTGGTGTGGATGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAAT 77125302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 AACAAAGATGTGGTGTGGATGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAAT 3803

 77125303 GTAAACTAGTACAACCACTATGGAAAACAGTATGGAAATTCCTTAAAGAACTCAAAGTAG 77125362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 GTAAACTAGTACAACCACTATGGAAAACAGTATGGAAATTCCTTAAAGAACTCAAAGTAG 3863

 77125363 AACTACTATTTGACCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAGTCAT 77125422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 AACTACTATTTGACCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAGTCAT 3923

 77125423 TATATGAAAAAGACACATACACATGCATATTTATAGCAGCACAATTCACAATTGCAAAGA 77125482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 TATATGAAAAAGACACATACACATGCATATTTATAGCAGCACAATTCACAATTGCAAAGA 3983

 77125483 TATGGAACCAACCTAAGTGTCCATCAGCCAATGAGTGGATAAAGAAAATGTGGTACATAT 77125542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 TATGGAACCAACCTAAGTGTCCATCAGCCAATGAGTGGATAAAGAAAATGTGGTACATAT 4043

 77125543 AAATCATGGAATACTACTCAGTCATAAGAAGGAATGAAATAATGTATTTTGCAGCAATTT 77125602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 AAATCATGGAATACTACTCAGTCATAAGAAGGAATGAAATAATGTATTTTGCAGCAATTT 4103

 77125603 GGATGGAGCGGGAGGTCATTATTCTAAGTGAAGTAACTTAGGAACGGAAAACCAAATATC 77125662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 GGATGGAGCGGGAGGTCATTATTCTAAGTGAAGTAACTTAGGAACGGAAAACCAAATATC 4163

 77125663 GTTATGTTCTCACTTATGAGTAGGAGTTAAACTATGAGGATGCAAAGGCATAAGATTGAT 77125722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 GTTATGTTCTCACTTATGAGTAGGAGTTAAACTATGAGGATGCAAAGGCATAAGATTGAT 4223

 77125723 ATAATGGACGTTGGGAACTTTGGGGGAAAAAGGGTCAGAGGGGGATGAAGGATTAAAGAC 77125782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 ATAATGGACGTTGGGAACTTTGGGGGAAAAAGGGTCAGAGGGGGATGAAGGATTAAAGAC 4283

 77125783 TACGTATTTGGGTACAGTGTACGCTGCTCAGGGGATGGGTGTACCAAAATCCAGAAATCA 77125842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 TACGTATTTGGGTACAGTGTACGCTGCTCAGGGGATGGGTGTACCAAAATCCAGAAATCA 4343

 77125843 CCACTAAAGAACTTATCCATGTAACCAAAAACCACCTGTTGCCCCAAAACTATTGAAATA 77125902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 CCACTAAAGAACTTATCCATGTAACCAAAAACCACCTGTTGCCCCAAAACTATTGAAATA 4403

 77125903 AAAATAAAAATTTTAAAAAAGAGGTAAGGGGATAAAGATATCTATAGTATAGATAGCTAT 77125962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 AAAATAAAAATTTTAAAAAAGAGGTAAGGGGATAAAGATATCTATAGTATAGATAGCTAT 4463

 77125963 ACTAAAGACTTCAATATTACATAATGGTGGGACTCGTGCTGTGATTTAAAAAATTCCTTA 77126022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4464 ACTAAAGACTTCAATATTACATAATGGTGGGACTCGTGCTGTGATTTAAAAAATTCCTTA 4523

 77126023 ATAAATTATATACTTAAAATGGTTAAAATGATAAAGTTTGTTTTATATATTTTACTACAA 77126082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 ATAAATTATATACTTAAAATGGTTAAAATGATAAAGTTTGTTTTATATATTTTACTACAA 4583

 77126083 TAAAAATGTATGTTATTTAAATACTACTCAATTTCCATATTCTAGTAGGTTAGCATTGAT 77126142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 TAAAAATGTATGTTATTTAAATACTACTCAATTTCCATATTCTAGTAGGTTAGCATTGAT 4643

 77126143 AACTACATTTTATGGTTAGCTCAAGTTTAACTTTTAGTTTGCTACTCTAGATCTTACATA 77126202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 AACTACATTTTATGGTTAGCTCAAGTTTAACTTTTAGTTTGCTACTCTAGATCTTACATA 4703

 77126203 AGAGCAATCCCATTTAATGTCTTATAGCCACTGAAAAAAATATATTCCACTTTCACTATA 77126262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 AGAGCAATCCCATTTAATGTCTTATAGCCACTGAAAAAAATATATTCCACTTTCACTATA 4763

 77126263 TTTTACCTATTTTTATATAGCAGAATAAACCAAAGATCTTACCATCTGAAATACATCAGA 77126322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4764 TTTTACCTATTTTTATATAGCAGAATAAACCAAAGATCTTACCATCTGAAATACATCAGA 4823

 77126323 GCCTTCATCAAAATCCACCATGGCAAAAAATATCCTGTTGGTGAATGCACTGGAGTATCG 77126382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4824 GCCTTCATCAAAATCCACCATGGCAAAAAATATCCTGTTGGTGAATGCACTGGAGTATCG 4883

 77126383 CCAGGAGTTTGCCAGGATCTGGAATTCTTCATCAGCTTGCCTGGATGCAATGAGATTCGT 77126442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4884 CCAGGAGTTTGCCAGGATCTGGAATTCTTCATCAGCTTGCCTGGATGCAATGAGATTCGT 4943

 77126443 AAAGATAACATATAAAACAATTTTTGAAAGCAATCTCGTTTATCATCAGTAAAACAGGTC 77126502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4944 AAAGATAACATATAAAACAATTTTTGAAAGCAATCTCGTTTATCATCAGTAAAACAGGTC 5003

 77126503 CAAGCAAGCAATAGCAGGTTTTCCAATGGGAGAAATAATAAAAAACACTGACAAGTAGGT 77126562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5004 CAAGCAAGCAATAGCAGGTTTTCCAATGGGAGAAATAATAAAAAACACTGACAAGTAGGT 5063

 77126563 CAGACTCTGCTGACAGGGTTAAGACAAATCTTGTTTTGGCATAAGAGAAGCCTTATCCCA 77126622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5064 CAGACTCTGCTGACAGGGTTAAGACAAATCTTGTTTTGGCATAAGAGAAGCCTTATCCCA 5123

 77126623 AGTTAGGGATTTCATGAGAAGTAGTAATTACCTGACTCCGCTTCATACTTTGTGCCTGTT 77126682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5124 AGTTAGGGATTTCATGAGAAGTAGTAATTACCTGACTCCGCTTCATACTTTGTGCCTGTT 5183

 77126683 TCTTATCCCAAAACTCTTTCAACAATCATTGGAAATATATAGCTAATCGCCTCTACAATA 77126742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5184 TCTTATCCCAAAACTCTTTCAACAATCATTGGAAATATATAGCTAATCGCCTCTACAATA 5243

 77126743 ACTTTCCATACCCTAAATTACTTCTAAGAGTTCAAAGACAAGACAGAAGTGTAT 77126796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5244 ACTTTCCATACCCTAAATTACTTCTAAGAGTTCAAAGACAAGACAGAAGTGTAT 5297

Alignment time is 4.26223 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2779] =>      2779 nucs 'mol-32-2fcd-222148_2779'

Score:        2758
Aligned:      2780        nucs
Identic:      2778 (100%) nucs =>        47 (100%)      2731 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77121030,77121076] EXCISED REGION [77121078,77123810]
 second seq =>  [       1,      47] EXCISED REGION [      48,    2779]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77121077,77121077]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [77123581,77123581]
 second seq =>         1 nucs [2550,2550]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [77121077,77121077] to [77121078,77121078]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77121030 TCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCC 77121076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCC 47

EXCISED REGION

 77121078 ACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTC 77121137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       48 ACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTC 107

 77121138 TACTGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAA 77121197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      108 TACTGTAAGACAAAATGTGGATAAATGTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAA 167

 77121198 TACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTA 77121257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      168 TACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTTTATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTA 227

 77121258 TCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGA 77121317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      228 TCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGCAGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGA 287

 77121318 AGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGG 77121377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      288 AGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGG 347

 77121378 CGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACCCG 77121437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      348 CGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACCCG 407

 77121438 AGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCTGTCTCTACTAAAAAT 77121497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      408 AGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCTGTCTCTACTAAAAAT 467

 77121498 TAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTG 77121557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      468 TAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTG 527

 77121558 AGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCC 77121617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      528 AGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCC 587

 77121618 AGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATTAAAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAA 77121677
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      588 AGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATT-AAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAA 646

 77121678 TATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATT 77121737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      647 TATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATT 706

 77121738 CTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATG 77121797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      707 CTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATG 766

 77121798 CTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGT 77121857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      767 CTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGT 826

 77121858 ATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCTCTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAG 77121917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      827 ATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCTCTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAG 886

 77121918 ACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCACATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCC 77121977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      887 ACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCACATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCC 946

 77121978 TTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGTATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGC 77122037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      947 TTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGTATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGC 1006

 77122038 CTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAGATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGT 77122097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1007 CTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAGATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGT 1066

 77122098 TCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGCCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAA 77122157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 TCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGCCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAA 1126

 77122158 ACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCT 77122217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 ACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCT 1186

 77122218 TGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAATATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGG 77122277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 TGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAATATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGG 1246

 77122278 TTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATA 77122337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 TTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATA 1306

 77122338 TCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACTTGATGGATCAGCTGACACCACCCAGAT 77122397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 TCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACTTGATGGATCAGCTGACACCACCCAGAT 1366

 77122398 CAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAG 77122457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 CAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAG 1426

 77122458 ACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTT 77122517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 ACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTT 1486

 77122518 CCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGAC 77122577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 CCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGAC 1546

 77122578 TTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCT 77122637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 TTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCT 1606

 77122638 ATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCT 77122697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 ATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCT 1666

 77122698 TGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTATCCATTACAG 77122757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 TGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTATCCATTACAG 1726

 77122758 AAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTT 77122817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 AAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTT 1786

 77122818 TGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGA 77122877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 TGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGA 1846

 77122878 GGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCC 77122937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 GGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCC 1906

 77122938 TTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGA 77122997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 TTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGA 1966

 77122998 ACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCAT 77123057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 ACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCAT 2026

 77123058 GGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGC 77123117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 GGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGC 2086

 77123118 CCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCA 77123177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 CCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCA 2146

 77123178 AAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAA 77123237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 AAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAA 2206

 77123238 CTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTT 77123297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 CTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTT 2266

 77123298 TTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTAT 77123357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 TTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTAT 2326

 77123358 TTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAGAAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAG 77123417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 TTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAGAAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAG 2386

 77123418 GCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTA 77123477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 GCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTA 2446

 77123478 GCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCTATGACACACG 77123537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 GCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCTATGACACACG 2506

 77123538 TTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGTCATTAATGATACAGAACATAAGATGAG 77123597
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2507 TTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGTCATTAATGATCCAGAACATAAGATGAG 2566

 77123598 GCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATAATAAATTTTTAGATTG 77123657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 GCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATAATAAATTTTTAGATTG 2626

 77123658 GGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAGCTTTTTCCTTTTATGT 77123717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 GGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAGCTTTTTCCTTTTATGT 2686

 77123718 TTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACACATTTATAAACAAAGA 77123777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 TTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACACATTTATAAACAAAGA 2746

 77123778 CAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATAT 77123810
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 CAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATAT 2779

Alignment time is 2.21998 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2530] =>      2530 nucs 'mol-32-2fd8-231648_2530'

Score:        2529
Aligned:      2529        nucs
Identic:      2529 (100%) nucs =>      1904 (100%)       625 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77121677,77123580] EXCISED REGION [77123582,77124206]
 second seq =>  [       1,    1904] EXCISED REGION [    1906,    2530]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77123581,77123581]
 second seq =>         1 nucs [1905,1905]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1905,1905] to [1906,1906]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77121677 ATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGACTAAGGAAT 77121736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGACTAAGGAAT 60

 77121737 TCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAAT 77121796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAAT 120

 77121797 GCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAG 77121856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAG 180

 77121857 TATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCTCTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGA 77121916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCTCTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGA 240

 77121917 GACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCACATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGC 77121976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCACATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGC 300

 77121977 CTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGTATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGG 77122036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGTATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGG 360

 77122037 CCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAGATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGG 77122096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAGATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGG 420

 77122097 TTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGCCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGA 77122156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGCCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGA 480

 77122157 AACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTC 77122216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTC 540

 77122217 TTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAATATTAGCCACAAGATGAAAAATTATG 77122276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAATATTAGCCACAAGATGAAAAATTATG 600

 77122277 GTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAT 77122336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAT 660

 77122337 ATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACTTGATGGATCAGCTGACACCACCCAGA 77122396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACTTGATGGATCAGCTGACACCACCCAGA 720

 77122397 TCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAA 77122456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAA 780

 77122457 GACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCT 77122516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCT 840

 77122517 TCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGA 77122576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGA 900

 77122577 CTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTC 77122636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTC 960

 77122637 TATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCC 77122696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCC 1020

 77122697 TTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTATCCATTACA 77122756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTATCCATTACA 1080

 77122757 GAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCT 77122816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCT 1140

 77122817 TTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAG 77122876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAG 1200

 77122877 AGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGC 77122936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGC 1260

 77122937 CTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGG 77122996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGG 1320

 77122997 AACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCA 77123056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCA 1380

 77123057 TGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAG 77123116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAG 1440

 77123117 CCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGC 77123176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGC 1500

 77123177 AAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAA 77123236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAA 1560

 77123237 ACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCT 77123296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCT 1620

 77123297 TTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTA 77123356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTA 1680

 77123357 TTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAGAAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCA 77123416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAGAAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCA 1740

 77123417 GGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATT 77123476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATT 1800

 77123477 AGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCTATGACACAC 77123536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCTATGACACAC 1860

 77123537 GTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGTCATTAATGAT 77123580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGTCATTAATGAT 1904

EXCISED REGION

 77123582 CAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATA 77123641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 CAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATA 1965

 77123642 ATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAG 77123701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 ATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAG 2025

 77123702 CTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACA 77123761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 CTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACA 2085

 77123762 CATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATATGCAAGGGGAAA 77123821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 CATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATATGCAAGGGGAAA 2145

 77123822 GAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATC 77123881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 GAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATC 2205

 77123882 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 77123941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 2265

 77123942 TGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGG 77124001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 TGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGG 2325

 77124002 TGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAATCCAGG 77124061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 TGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAATCCAGG 2385

 77124062 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGGGCAACAGAGCG 77124121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGGGCAACAGAGCG 2445

 77124122 AGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTAACCAGGCGTGG 77124181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 AGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTAACCAGGCGTGG 2505

 77124182 TGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTA 77124206
          |||||||||||||||||||||||||
     2506 TGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTA 2530

Alignment time is 2.04036 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4947] =>      4947 nucs 'mol-32-2fe3-147859_4947'

Score:        4935
Aligned:      4946        nucs
Identic:      4945 (100%) nucs =>      1913 (100%)      3032 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77121668,77123580] EXCISED REGION [77123582,77126613]
 second seq =>  [       1,    1913] EXCISED REGION [    1915,    4947]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77123581,77123581]
 second seq =>         1 nucs [1914,1914]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3543,3543]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1914,1914] to [1915,1915]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77121668 CATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGA 77121727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGA 60

 77121728 CTAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATC 77121787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATC 120

 77121788 TAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCC 77121847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCC 180

 77121848 ATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCTCTGATCTCTCAAAAGCT 77121907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCTCTGATCTCTCAAAAGCT 240

 77121908 GTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCACATCTTGTGGACAAGGGC 77121967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCACATCTTGTGGACAAGGGC 300

 77121968 CCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGTATATCTTTGGAAGATAG 77122027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGTATATCTTTGGAAGATAG 360

 77122028 TTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAGATCTAACTTAACTGACT 77122087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAGATCTAACTTAACTGACT 420

 77122088 CCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGCCATAGGCTGAACTAAC 77122147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGCCATAGGCTGAACTAAC 480

 77122148 TTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAG 77122207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAG 540

 77122208 ACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAATATTAGCCACAAGATGA 77122267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAATATTAGCCACAAGATGA 600

 77122268 AAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACT 77122327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACT 660

 77122328 GCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACTTGATGGATCAGCTGACA 77122387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACTTGATGGATCAGCTGACA 720

 77122388 CCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCA 77122447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCA 780

 77122448 GCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGC 77122507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGC 840

 77122508 TCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGG 77122567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGG 900

 77122568 GGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAA 77122627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAA 960

 77122628 TACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAA 77122687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAA 1020

 77122688 GTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTA 77122747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTA 1080

 77122748 TCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCAT 77122807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCAT 1140

 77122808 TGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCT 77122867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCT 1200

 77122868 AGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCC 77122927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCC 1260

 77122928 TGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGG 77122987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGG 1320

 77122988 GGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTG 77123047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTG 1380

 77123048 AGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGA 77123107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGA 1440

 77123108 TTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGCAAGACCCAATCTCAAAA 77123167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGCAAGACCCAATCTCAAAA 1500

 77123168 ACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGC 77123227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGC 1560

 77123228 ATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCC 77123287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCC 1620

 77123288 TTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTC 77123347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTC 1680

 77123348 CCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAGAAAAAACTCTGGGAAAT 77123407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAGAAAAAACTCTGGGAAAT 1740

 77123408 GTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGT 77123467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGT 1800

 77123468 TACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCT 77123527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCT 1860

 77123528 ATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGTCATTAATGAT 77123580
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGTCATTAATGAT 1913

EXCISED REGION

 77123582 CAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATA 77123641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 CAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATA 1974

 77123642 ATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAG 77123701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 ATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAG 2034

 77123702 CTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACA 77123761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 CTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACA 2094

 77123762 CATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATATGCAAGGGGAAA 77123821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 CATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATATGCAAGGGGAAA 2154

 77123822 GAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATC 77123881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 GAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATC 2214

 77123882 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 77123941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 2274

 77123942 TGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGG 77124001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 TGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGG 2334

 77124002 TGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAATCCAGG 77124061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 TGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAATCCAGG 2394

 77124062 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGGGCAACAGAGCG 77124121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGGGCAACAGAGCG 2454

 77124122 AGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTAACCAGGCGTGG 77124181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 AGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTAACCAGGCGTGG 2514

 77124182 TGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATTGCTTGAACCC 77124241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 TGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATTGCTTGAACCC 2574

 77124242 AAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 77124301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 AAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 2634

 77124302 AGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCATGATTGACAGAGCAG 77124361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 AGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCATGATTGACAGAGCAG 2694

 77124362 GTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAACAACAAAAGATCTACT 77124421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 GTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAACAACAAAAGATCTACT 2754

 77124422 TTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAAGATGGACCAGAAACT 77124481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 TTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAAGATGGACCAGAAACT 2814

 77124482 TAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTGTAAAAACTCTTTTTT 77124541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 TAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTGTAAAAACTCTTTTTT 2874

 77124542 TGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTCACTGGAACCTCCGCT 77124601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 TGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTCACTGGAACCTCCGCT 2934

 77124602 TCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTGGGATTACGGGCGCCC 77124661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 TCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTGGGATTACGGGCGCCC 2994

 77124662 GCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCA 77124721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 GCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCA 3054

 77124722 GGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 77124781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 GGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 3114

 77124782 GATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAGACATTGGCTTAGGCA 77124841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 GATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAGACATTGGCTTAGGCA 3174

 77124842 AAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAACAAAAATAAATAAATGGG 77124901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 AAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAACAAAAATAAATAAATGGG 3234

 77124902 ACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAATCTGCAGAGTAAACCAAC 77124961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 ACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAATCTGCAGAGTAAACCAAC 3294

 77124962 AACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCTGACAAAGGACTAATATCCA 77125021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 AACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCTGACAAAGGACTAATATCCA 3354

 77125022 GAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACAAACAATCCCATCAAAAAAT 77125081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 GAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACAAACAATCCCATCAAAAAAT 3414

 77125082 GGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGCCAACATCACTA 77125141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 GGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGCCAACATCACTA 3474

 77125142 ATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTACACCCGCAAGAATGGTCATA 77125201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 ATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTACACCCGCAAGAATGGTCATA 3534

 77125202 ATTAAAGC-AAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAAAAACAAAGATGTGGTGTGG 77125260
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 ATTAAAGCAAAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAAAAACAAAGATGTGGTGTGG 3594

 77125261 ATGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAACCAC 77125320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 ATGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAACCAC 3654

 77125321 TATGGAAAACAGTATGGAAATTCCTTAAAGAACTCAAAGTAGAACTACTATTTGACCCAG 77125380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 TATGGAAAACAGTATGGAAATTCCTTAAAGAACTCAAAGTAGAACTACTATTTGACCCAG 3714

 77125381 CAATCCCACTACTGGGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAGTCATTATATGAAAAAGACACAT 77125440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 CAATCCCACTACTGGGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAGTCATTATATGAAAAAGACACAT 3774

 77125441 ACACATGCATATTTATAGCAGCACAATTCACAATTGCAAAGATATGGAACCAACCTAAGT 77125500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 ACACATGCATATTTATAGCAGCACAATTCACAATTGCAAAGATATGGAACCAACCTAAGT 3834

 77125501 GTCCATCAGCCAATGAGTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATAAATCATGGAATACTACT 77125560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 GTCCATCAGCCAATGAGTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATAAATCATGGAATACTACT 3894

 77125561 CAGTCATAAGAAGGAATGAAATAATGTATTTTGCAGCAATTTGGATGGAGCGGGAGGTCA 77125620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 CAGTCATAAGAAGGAATGAAATAATGTATTTTGCAGCAATTTGGATGGAGCGGGAGGTCA 3954

 77125621 TTATTCTAAGTGAAGTAACTTAGGAACGGAAAACCAAATATCGTTATGTTCTCACTTATG 77125680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 TTATTCTAAGTGAAGTAACTTAGGAACGGAAAACCAAATATCGTTATGTTCTCACTTATG 4014

 77125681 AGTAGGAGTTAAACTATGAGGATGCAAAGGCATAAGATTGATATAATGGACGTTGGGAAC 77125740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 AGTAGGAGTTAAACTATGAGGATGCAAAGGCATAAGATTGATATAATGGACGTTGGGAAC 4074

 77125741 TTTGGGGGAAAAAGGGTCAGAGGGGGATGAAGGATTAAAGACTACGTATTTGGGTACAGT 77125800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 TTTGGGGGAAAAAGGGTCAGAGGGGGATGAAGGATTAAAGACTACGTATTTGGGTACAGT 4134

 77125801 GTACGCTGCTCAGGGGATGGGTGTACCAAAATCCAGAAATCACCACTAAAGAACTTATCC 77125860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 GTACGCTGCTCAGGGGATGGGTGTACCAAAATCCAGAAATCACCACTAAAGAACTTATCC 4194

 77125861 ATGTAACCAAAAACCACCTGTTGCCCCAAAACTATTGAAATAAAAATAAAAATTTTAAAA 77125920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 ATGTAACCAAAAACCACCTGTTGCCCCAAAACTATTGAAATAAAAATAAAAATTTTAAAA 4254

 77125921 AAGAGGTAAGGGGATAAAGATATCTATAGTATAGATAGCTATACTAAAGACTTCAATATT 77125980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 AAGAGGTAAGGGGATAAAGATATCTATAGTATAGATAGCTATACTAAAGACTTCAATATT 4314

 77125981 ACATAATGGTGGGACTCGTGCTGTGATTTAAAAAATTCCTTAATAAATTATATACTTAAA 77126040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 ACATAATGGTGGGACTCGTGCTGTGATTTAAAAAATTCCTTAATAAATTATATACTTAAA 4374

 77126041 ATGGTTAAAATGATAAAGTTTGTTTTATATATTTTACTACAATAAAAATGTATGTTATTT 77126100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 ATGGTTAAAATGATAAAGTTTGTTTTATATATTTTACTACAATAAAAATGTATGTTATTT 4434

 77126101 AAATACTACTCAATTTCCATATTCTAGTAGGTTAGCATTGATAACTACATTTTATGGTTA 77126160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 AAATACTACTCAATTTCCATATTCTAGTAGGTTAGCATTGATAACTACATTTTATGGTTA 4494

 77126161 GCTCAAGTTTAACTTTTAGTTTGCTACTCTAGATCTTACATAAGAGCAATCCCATTTAAT 77126220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 GCTCAAGTTTAACTTTTAGTTTGCTACTCTAGATCTTACATAAGAGCAATCCCATTTAAT 4554

 77126221 GTCTTATAGCCACTGAAAAAAATATATTCCACTTTCACTATATTTTACCTATTTTTATAT 77126280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 GTCTTATAGCCACTGAAAAAAATATATTCCACTTTCACTATATTTTACCTATTTTTATAT 4614

 77126281 AGCAGAATAAACCAAAGATCTTACCATCTGAAATACATCAGAGCCTTCATCAAAATCCAC 77126340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4615 AGCAGAATAAACCAAAGATCTTACCATCTGAAATACATCAGAGCCTTCATCAAAATCCAC 4674

 77126341 CATGGCAAAAAATATCCTGTTGGTGAATGCACTGGAGTATCGCCAGGAGTTTGCCAGGAT 77126400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4675 CATGGCAAAAAATATCCTGTTGGTGAATGCACTGGAGTATCGCCAGGAGTTTGCCAGGAT 4734

 77126401 CTGGAATTCTTCATCAGCTTGCCTGGATGCAATGAGATTCGTAAAGATAACATATAAAAC 77126460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 CTGGAATTCTTCATCAGCTTGCCTGGATGCAATGAGATTCGTAAAGATAACATATAAAAC 4794

 77126461 AATTTTTGAAAGCAATCTCGTTTATCATCAGTAAAACAGGTCCAAGCAAGCAATAGCAGG 77126520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 AATTTTTGAAAGCAATCTCGTTTATCATCAGTAAAACAGGTCCAAGCAAGCAATAGCAGG 4854

 77126521 TTTTCCAATGGGAGAAATAATAAAAAACACTGACAAGTAGGTCAGACTCTGCTGACAGGG 77126580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4855 TTTTCCAATGGGAGAAATAATAAAAAACACTGACAAGTAGGTCAGACTCTGCTGACAGGG 4914

 77126581 TTAAGACAAATCTTGTTTTGGCATAAGAGAAGC 77126613
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 TTAAGACAAATCTTGTTTTGGCATAAGAGAAGC 4947

Alignment time is 3.93131 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    6141] =>      6141 nucs 'mol-32-2ff9-134557_6141'

Score:        6118
Aligned:      6140        nucs
Identic:      6138 (100%) nucs =>       145 (100%)      5993 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77121017,77121161] EXCISED REGION [77121163,77127156]
 second seq =>  [       1,     145] EXCISED REGION [     147,    6141]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77121162,77121162]
 second seq =>         1 nucs [146,146]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4194,4194]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [77121160,77121161] to [77121161,77121162]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77121017 CCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCC 77121076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCC 60

 77121077 AACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACT 77121136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCTAAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACT 120

 77121137 CTACTGTAAGACAAAATGTGGATAA 77121161
          |||||||||||||||||||||||||
      121 CTACTGTAAGACAAAATGTGGATAA 145

EXCISED REGION

 77121163 TGTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTT 77121222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      147 TGTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTT 206

 77121223 TTATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAG 77121282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      207 TTATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAG 266

 77121283 CAGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATC 77121342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      267 CAGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATC 326

 77121343 AACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCC 77121402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      327 AACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCC 386

 77121403 AGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACCCGAGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTG 77121462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      387 AGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACCCGAGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTG 446

 77121463 GCCAACATGGCGAAACCCCTGTCTCTACTAAAAATTAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTG 77121522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      447 GCCAACATGGCGAAACCCCTGTCTCTACTAAAAATTAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTG 506

 77121523 GCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAG 77121582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      507 GCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAG 566

 77121583 GTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCAC 77121642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      567 GTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCAC 626

 77121643 CTCAATTAAAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTG 77121702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      627 CTCAATTAAAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTG 686

 77121703 GAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCC 77121762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      687 GAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCC 746

 77121763 TTTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATG 77121822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 TTTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATG 806

 77121823 AGAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGT 77121882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 AGAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGT 866

 77121883 TAACATCTCTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGT 77121942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 TAACATCTCTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGT 926

 77121943 TTCTGCACATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGG 77122002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 TTCTGCACATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGG 986

 77122003 ATATTTGTATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAG 77122062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 ATATTTGTATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAG 1046

 77122063 TGAAAGAGATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTC 77122122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 TGAAAGAGATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTC 1106

 77122123 ATTCCTGGCCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGA 77122182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 ATTCCTGGCCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGA 1166

 77122183 CTGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGT 77122242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 CTGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGT 1226

 77122243 AGGACTAATATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCT 77122302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 AGGACTAATATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCT 1286

 77122303 ACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGAC 77122362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 ACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGAC 1346

 77122363 TCTGCACTTGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTG 77122422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 TCTGCACTTGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTG 1406

 77122423 TGGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAA 77122482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 TGGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAA 1466

 77122483 TCTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTA 77122542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 TCTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTA 1526

 77122543 AAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCT 77122602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 AAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCT 1586

 77122603 CCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAA 77122662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 CCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAA 1646

 77122663 TTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCA 77122722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 TTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCA 1706

 77122723 CAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGT 77122782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 CAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGT 1766

 77122783 GTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTT 77122842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 GTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTT 1826

 77122843 GGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCC 77122902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 GGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCC 1886

 77122903 TCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCT 77122962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 TCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCT 1946

 77122963 CTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTT 77123022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 CTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTT 2006

 77123023 GTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGC 77123082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 GTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGC 2066

 77123083 TACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGC 77123142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 TACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGC 2126

 77123143 AACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACT 77123202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 AACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACT 2186

 77123203 CAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTT 77123262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 CAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTT 2246

 77123263 GCAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAAC 77123322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 GCAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAAC 2306

 77123323 TTAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATA 77123382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 TTAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATA 2366

 77123383 CCATGTAGAAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGG 77123442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 CCATGTAGAAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGG 2426

 77123443 AAGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGC 77123502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 AAGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGC 2486

 77123503 CTTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAA 77123562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 CTTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAA 2546

 77123563 AGAAGTGTCATTAATGATACAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAA 77123622
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 AGAAGTGTCATTAATGATCCAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAA 2606

 77123623 CAGTTTAATTTGGGATATAATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTAT 77123682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 CAGTTTAATTTGGGATATAATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTAT 2666

 77123683 AGCAAGGCATTATATCCAGCTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTT 77123742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 AGCAAGGCATTATATCCAGCTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTT 2726

 77123743 CAAATATATGAATTAGACACATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGT 77123802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 CAAATATATGAATTAGACACATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGT 2786

 77123803 ATTTATATGCAAGGGGAAAGAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTG 77123862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 ATTTATATGCAAGGGGAAAGAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTG 2846

 77123863 GTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGT 77123922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 GTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGT 2906

 77123923 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAA 77123982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAA 2966

 77123983 AAGTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGA 77124042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 AAGTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGA 3026

 77124043 AGAATCACTTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTC 77124102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 AGAATCACTTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTC 3086

 77124103 TAGTCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTA 77124162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 TAGTCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTA 3146

 77124163 AAAAATTAACCAGGCGTGGTGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGC 77124222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 AAAAATTAACCAGGCGTGGTGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGC 3206

 77124223 AGGAAAATTGCTTGAACCCAAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGC 77124282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 AGGAAAATTGCTTGAACCCAAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGC 3266

 77124283 ACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAG 77124342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 ACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAG 3326

 77124343 GTCATGATTGACAGAGCAGGTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTC 77124402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 GTCATGATTGACAGAGCAGGTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTC 3386

 77124403 AAACAACAAAAGATCTACTTTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAAC 77124462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 AAACAACAAAAGATCTACTTTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAAC 3446

 77124463 TCAAGATGGACCAGAAACTTAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAAC 77124522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 TCAAGATGGACCAGAAACTTAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAAC 3506

 77124523 ATTGTAAAAACTCTTTTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCG 77124582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 ATTGTAAAAACTCTTTTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCG 3566

 77124583 GCTCACTGGAACCTCCGCTTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTA 77124642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 GCTCACTGGAACCTCCGCTTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTA 3626

 77124643 GTTGGGATTACGGGCGCCCGCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGG 77124702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 GTTGGGATTACGGGCGCCCGCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGG 3686

 77124703 AGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCT 77124762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 AGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCT 3746

 77124763 TGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTT 77124822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 TGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTT 3806

 77124823 CCAGACATTGGCTTAGGCAAAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGA 77124882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 CCAGACATTGGCTTAGGCAAAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGA 3866

 77124883 ACAAAAATAAATAAATGGGACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATA 77124942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 ACAAAAATAAATAAATGGGACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATA 3926

 77124943 ATCTGCAGAGTAAACCAACAACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCT 77125002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 ATCTGCAGAGTAAACCAACAACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCT 3986

 77125003 GACAAAGGACTAATATCCAGAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACA 77125062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 GACAAAGGACTAATATCCAGAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACA 4046

 77125063 AACAATCCCATCAAAAAATGGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATA 77125122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 AACAATCCCATCAAAAAATGGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATA 4106

 77125123 CAAATGGCCAACATCACTAATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTAC 77125182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 CAAATGGCCAACATCACTAATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTAC 4166

 77125183 ACCCGCAAGAATGGTCATAATTAAAGC-AAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAA 77125241
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4167 ACCCGCAAGAATGGTCATAATTAAAGCAAAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAA 4226

 77125242 AAACAAAGATGTGGTGTGGATGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAA 77125301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4227 AAACAAAGATGTGGTGTGGATGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAA 4286

 77125302 TGTAAACTAGTACAACCACTATGGAAAACAGTATGGAAATTCCTTAAAGAACTCAAAGTA 77125361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4287 TGTAAACTAGTACAACCACTATGGAAAACAGTATGGAAATTCCTTAAAGAACTCAAAGTA 4346

 77125362 GAACTACTATTTGACCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAGTCA 77125421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4347 GAACTACTATTTGACCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAGTCA 4406

 77125422 TTATATGAAAAAGACACATACACATGCATATTTATAGCAGCACAATTCACAATTGCAAAG 77125481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4407 TTATATGAAAAAGACACATACACATGCATATTTATAGCAGCACAATTCACAATTGCAAAG 4466

 77125482 ATATGGAACCAACCTAAGTGTCCATCAGCCAATGAGTGGATAAAGAAAATGTGGTACATA 77125541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4467 ATATGGAACCAACCTAAGTGTCCATCAGCCAATGAGTGGATAAAGAAAATGTGGTACATA 4526

 77125542 TAAATCATGGAATACTACTCAGTCATAAGAAGGAATGAAATAATGTATTTTGCAGCAATT 77125601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 TAAATCATGGAATACTACTCAGTCATAAGAAGGAATGAAATAATGTATTTTGCAGCAATT 4586

 77125602 TGGATGGAGCGGGAGGTCATTATTCTAAGTGAAGTAACTTAGGAACGGAAAACCAAATAT 77125661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4587 TGGATGGAGCGGGAGGTCATTATTCTAAGTGAAGTAACTTAGGAACGGAAAACCAAATAT 4646

 77125662 CGTTATGTTCTCACTTATGAGTAGGAGTTAAACTATGAGGATGCAAAGGCATAAGATTGA 77125721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4647 CGTTATGTTCTCACTTATGAGTAGGAGTTAAACTATGAGGATGCAAAGGCATAAGATTGA 4706

 77125722 TATAATGGACGTTGGGAACTTTGGGGGAAAAAGGGTCAGAGGGGGATGAAGGATTAAAGA 77125781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4707 TATAATGGACGTTGGGAACTTTGGGGGAAAAAGGGTCAGAGGGGGATGAAGGATTAAAGA 4766

 77125782 CTACGTATTTGGGTACAGTGTACGCTGCTCAGGGGATGGGTGTACCAAAATCCAGAAATC 77125841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4767 CTACGTATTTGGGTACAGTGTACGCTGCTCAGGGGATGGGTGTACCAAAATCCAGAAATC 4826

 77125842 ACCACTAAAGAACTTATCCATGTAACCAAAAACCACCTGTTGCCCCAAAACTATTGAAAT 77125901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4827 ACCACTAAAGAACTTATCCATGTAACCAAAAACCACCTGTTGCCCCAAAACTATTGAAAT 4886

 77125902 AAAAATAAAAATTTTAAAAAAGAGGTAAGGGGATAAAGATATCTATAGTATAGATAGCTA 77125961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4887 AAAAATAAAAATTTTAAAAAAGAGGTAAGGGGATAAAGATATCTATAGTATAGATAGCTA 4946

 77125962 TACTAAAGACTTCAATATTACATAATGGTGGGACTCGTGCTGTGATTTAAAAAATTCCTT 77126021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4947 TACTAAAGACTTCAATATTACATAATGGTGGGACTCGTGCTGTGATTTAAAAAATTCCTT 5006

 77126022 AATAAATTATATACTTAAAATGGTTAAAATGATAAAGTTTGTTTTATATATTTTACTACA 77126081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5007 AATAAATTATATACTTAAAATGGTTAAAATGATAAAGTTTGTTTTATATATTTTACTACA 5066

 77126082 ATAAAAATGTATGTTATTTAAATACTACTCAATTTCCATATTCTAGTAGGTTAGCATTGA 77126141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5067 ATAAAAATGTATGTTATTTAAATACTACTCAATTTCCATATTCTAGTAGGTTAGCATTGA 5126

 77126142 TAACTACATTTTATGGTTAGCTCAAGTTTAACTTTTAGTTTGCTACTCTAGATCTTACAT 77126201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5127 TAACTACATTTTATGGTTAGCTCAAGTTTAACTTTTAGTTTGCTACTCTAGATCTTACAT 5186

 77126202 AAGAGCAATCCCATTTAATGTCTTATAGCCACTGAAAAAAATATATTCCACTTTCACTAT 77126261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5187 AAGAGCAATCCCATTTAATGTCTTATAGCCACTGAAAAAAATATATTCCACTTTCACTAT 5246

 77126262 ATTTTACCTATTTTTATATAGCAGAATAAACCAAAGATCTTACCATCTGAAATACATCAG 77126321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5247 ATTTTACCTATTTTTATATAGCAGAATAAACCAAAGATCTTACCATCTGAAATACATCAG 5306

 77126322 AGCCTTCATCAAAATCCACCATGGCAAAAAATATCCTGTTGGTGAATGCACTGGAGTATC 77126381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5307 AGCCTTCATCAAAATCCACCATGGCAAAAAATATCCTGTTGGTGAATGCACTGGAGTATC 5366

 77126382 GCCAGGAGTTTGCCAGGATCTGGAATTCTTCATCAGCTTGCCTGGATGCAATGAGATTCG 77126441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5367 GCCAGGAGTTTGCCAGGATCTGGAATTCTTCATCAGCTTGCCTGGATGCAATGAGATTCG 5426

 77126442 TAAAGATAACATATAAAACAATTTTTGAAAGCAATCTCGTTTATCATCAGTAAAACAGGT 77126501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5427 TAAAGATAACATATAAAACAATTTTTGAAAGCAATCTCGTTTATCATCAGTAAAACAGGT 5486

 77126502 CCAAGCAAGCAATAGCAGGTTTTCCAATGGGAGAAATAATAAAAAACACTGACAAGTAGG 77126561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5487 CCAAGCAAGCAATAGCAGGTTTTCCAATGGGAGAAATAATAAAAAACACTGACAAGTAGG 5546

 77126562 TCAGACTCTGCTGACAGGGTTAAGACAAATCTTGTTTTGGCATAAGAGAAGCCTTATCCC 77126621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5547 TCAGACTCTGCTGACAGGGTTAAGACAAATCTTGTTTTGGCATAAGAGAAGCCTTATCCC 5606

 77126622 AAGTTAGGGATTTCATGAGAAGTAGTAATTACCTGACTCCGCTTCATACTTTGTGCCTGT 77126681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5607 AAGTTAGGGATTTCATGAGAAGTAGTAATTACCTGACTCCGCTTCATACTTTGTGCCTGT 5666

 77126682 TTCTTATCCCAAAACTCTTTCAACAATCATTGGAAATATATAGCTAATCGCCTCTACAAT 77126741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5667 TTCTTATCCCAAAACTCTTTCAACAATCATTGGAAATATATAGCTAATCGCCTCTACAAT 5726

 77126742 AACTTTCCATACCCTAAATTACTTCTAAGAGTTCAAAGACAAGACAGAAGTGTATTCCCT 77126801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5727 AACTTTCCATACCCTAAATTACTTCTAAGAGTTCAAAGACAAGACAGAAGTGTATTCCCT 5786

 77126802 AAAGAAAGCAGAAATACAATATTAATTCATTTTTAAAAATCTAAAGTGCAAAAGCTACTT 77126861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5787 AAAGAAAGCAGAAATACAATATTAATTCATTTTTAAAAATCTAAAGTGCAAAAGCTACTT 5846

 77126862 GGTAAATAACACAATCAGATAAATTATTAGGATGAAAGATAAGAAGAGTCTAGGAATTGA 77126921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5847 GGTAAATAACACAATCAGATAAATTATTAGGATGAAAGATAAGAAGAGTCTAGGAATTGA 5906

 77126922 AATTAATTGAGGCCAGCTCATACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGG 77126981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5907 AATTAATTGAGGCCAGCTCATACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGG 5966

 77126982 ATCACCTGAGGTCAGGAGCTCAAGACAAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGTCTCTAT 77127041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5967 ATCACCTGAGGTCAGGAGCTCAAGACAAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGTCTCTAT 6026

 77127042 TAAAAATACAAAAATTAGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACGTTGGG 77127101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6027 TAAAAATACAAAAATTAGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACGTTGGG 6086

 77127102 AGGCTGAGGCAGGCGGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATAT 77127156
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6087 AGGCTGAGGCAGGCGGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATAT 6141

Alignment time is 4.86169 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4028] =>      4028 nucs 'mol-32-3185-096265_4028'

Score:        4027
Aligned:      4027        nucs
Identic:      4027 (100%) nucs =>      2268 (100%)      1759 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77121313,77123580] EXCISED REGION [77123582,77125340]
 second seq =>  [       1,    2268] EXCISED REGION [    2270,    4028]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77123581,77123581]
 second seq =>         1 nucs [2269,2269]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2269,2269] to [2270,2270]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77121313 AGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGG 77121372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCAACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGG 60

 77121373 CCAGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATC 77121432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATC 120

 77121433 ACCCGAGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCTGTCTCTACTA 77121492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCCGAGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCTGTCTCTACTA 180

 77121493 AAAATTAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTCTGGA 77121552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAATTAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCCAGATACTCTGGA 240

 77121553 GGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACCGC 77121612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACCGC 300

 77121613 ACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATTAAAAAAAAAAAAAGAGTGCATCA 77121672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATTAAAAAAAAAAAAAGAGTGCATCA 360

 77121673 AAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGACTAAG 77121732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAGAGCACATGAAATTAGGACTAAG 420

 77121733 GAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATCTAGCC 77121792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAAGTGTGTTCTATGGAATCTAGCC 480

 77121793 AAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCCATTGG 77121852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTCTGTGTATTAGAGCCCCCATTGG 540

 77121853 AAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCTCTGATCTCTCAAAAGCTGTGTT 77121912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCTCTGATCTCTCAAAAGCTGTGTT 600

 77121913 GGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCACATCTTGTGGACAAGGGCCCTAA 77121972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCACATCTTGTGGACAAGGGCCCTAA 660

 77121973 CTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGTATATCTTTGGAAGATAGTTGAA 77122032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGTATATCTTTGGAAGATAGTTGAA 720

 77122033 ATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAGATCTAACTTAACTGACTCCGAC 77122092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAGATCTAACTTAACTGACTCCGAC 780

 77122093 TTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGCCATAGGCTGAACTAACTTTAG 77122152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGCCATAGGCTGAACTAACTTTAG 840

 77122153 GAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTC 77122212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACAGCCCTTTCCCAAAGCAGACCTC 900

 77122213 CTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAATATTAGCCACAAGATGAAAAAT 77122272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAATATTAGCCACAAGATGAAAAAT 960

 77122273 TATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCC 77122332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCC 1020

 77122333 TAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACTTGATGGATCAGCTGACACCACC 77122392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACTTGATGGATCAGCTGACACCACC 1080

 77122393 CAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCAGCACA 77122452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCTCCCAGGAACTGACTCAGCACA 1140

 77122453 TGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGCTCACT 77122512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAGCAATCAGCACTCCTGGCTCACT 1200

 77122513 GGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGA 77122572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCTGCACCCCGAATGCTCGGGGAGA 1260

 77122573 CTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTT 77122632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAAGCTGGCTGTGCATGAAATACTT 1320

 77122633 TCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAA 77122692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCTGTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAA 1380

 77122693 CCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTATCCAT 77122752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAGGGGAGGCACACTTACTATCCAT 1440

 77122753 TACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCC 77122812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCTCCCATAATGCAGCCCATTGGCC 1500

 77122813 CTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGT 77122872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTGGCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGT 1560

 77122873 GCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATC 77122932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTGATCTCAAGCAATCCTCCTGATC 1620

 77122933 CAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTT 77122992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGATTGCCCTATGGGAAATGGGGTTT 1680

 77122993 GGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCA 77123052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAGTAAAGTCCTTTAACTTGAGCCA 1740

 77123053 GGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACT 77123112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGTTAAGGTGCAAGGATTACT 1800

 77123113 TGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAA 77123172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGCAAGACCCAATCTCAAAAACAAA 1860

 77123173 CAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCA 77123232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTGTCATATTTTCTGCCAGCATCCA 1920

 77123233 TGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCCTTCCC 77123292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAGGGTAAGAACTTAGATCCTTCCC 1980

 77123293 AGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAG 77123352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTTGTTTAAACCAGGGTTTCCCAAG 2040

 77123353 TTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAGAAAAAACTCTGGGAAATGTTAT 77123412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAGAAAAAACTCTGGGAAATGTTAT 2100

 77123413 AGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGTTACTG 77123472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAGTGGACCAGTTAAAAGGTTACTG 2160

 77123473 CATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCTATGAC 77123532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAATGTAAAGGGGGTATGGCTATGAC 2220

 77123533 ACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGTCATTAATGAT 77123580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGTCATTAATGAT 2268

EXCISED REGION

 77123582 CAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATA 77123641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 CAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAATTTGGGATATA 2329

 77123642 ATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAG 77123701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 ATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGCATTATATCCAG 2389

 77123702 CTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACA 77123761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 CTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATATGAATTAGACA 2449

 77123762 CATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATATGCAAGGGGAAA 77123821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 CATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATATGCAAGGGGAAA 2509

 77123822 GAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATC 77123881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 GAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATC 2569

 77123882 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 77123941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 2629

 77123942 TGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGG 77124001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 TGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGG 2689

 77124002 TGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAATCCAGG 77124061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 TGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAATCCAGG 2749

 77124062 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGGGCAACAGAGCG 77124121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 AGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGGGCAACAGAGCG 2809

 77124122 AGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTAACCAGGCGTGG 77124181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 AGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTAACCAGGCGTGG 2869

 77124182 TGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATTGCTTGAACCC 77124241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 TGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATTGCTTGAACCC 2929

 77124242 AAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 77124301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 AAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 2989

 77124302 AGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCATGATTGACAGAGCAG 77124361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 AGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCATGATTGACAGAGCAG 3049

 77124362 GTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAACAACAAAAGATCTACT 77124421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 GTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAACAACAAAAGATCTACT 3109

 77124422 TTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAAGATGGACCAGAAACT 77124481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 TTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAAGATGGACCAGAAACT 3169

 77124482 TAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTGTAAAAACTCTTTTTT 77124541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 TAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTGTAAAAACTCTTTTTT 3229

 77124542 TGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTCACTGGAACCTCCGCT 77124601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 TGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTCACTGGAACCTCCGCT 3289

 77124602 TCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTGGGATTACGGGCGCCC 77124661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 TCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTGGGATTACGGGCGCCC 3349

 77124662 GCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCA 77124721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 GCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCA 3409

 77124722 GGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 77124781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 GGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 3469

 77124782 GATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAGACATTGGCTTAGGCA 77124841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 GATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAGACATTGGCTTAGGCA 3529

 77124842 AAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAACAAAAATAAATAAATGGG 77124901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 AAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAACAAAAATAAATAAATGGG 3589

 77124902 ACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAATCTGCAGAGTAAACCAAC 77124961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3590 ACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAATCTGCAGAGTAAACCAAC 3649

 77124962 AACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCTGACAAAGGACTAATATCCA 77125021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 AACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCTGACAAAGGACTAATATCCA 3709

 77125022 GAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACAAACAATCCCATCAAAAAAT 77125081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3710 GAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACAAACAATCCCATCAAAAAAT 3769

 77125082 GGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGCCAACATCACTA 77125141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3770 GGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGCCAACATCACTA 3829

 77125142 ATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTACACCCGCAAGAATGGTCATA 77125201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3830 ATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTACACCCGCAAGAATGGTCATA 3889

 77125202 ATTAAAGCAAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAAAAACAAAGATGTGGTGTGGA 77125261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3890 ATTAAAGCAAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAAAAACAAAGATGTGGTGTGGA 3949

 77125262 TGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAACCACT 77125321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3950 TGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAACCACT 4009

 77125322 ATGGAAAACAGTATGGAAA 77125340
          |||||||||||||||||||
     4010 ATGGAAAACAGTATGGAAA 4028

Alignment time is 3.20271 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    6748] =>      6748 nucs 'mol-32-340e-007946_6748'

Score:        6694
Aligned:      6749        nucs
Identic:      6744 (100%) nucs =>      1545 (100%)      5199 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77119840,77121385] EXCISED REGION [77123867,77129068]
 second seq =>  [       1,    1547] EXCISED REGION [    1548,    6748]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2481 nucs [77121386,77123866]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        32 nucs [77121386,77121417] to [77123867,77123898]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77119840 GTAAGATCTAATGTTCCATAGCAGAGTAGCGTGACTATAATTAACAAAAATGTATTACAT 77119899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAAGATCTAATGTTCCATAGCAGAGTAGCGTGACTATAATTAACAAAAATGTATTACAT 60

 77119900 ATTTCAAAACAGCTAGAAGAGAGGACTTGAAATGTTCCCAACATATAGAAATGATAAATA 77119959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTCAAAACAGCTAGAAGAGAGGACTTGAAATGTTCCCAACATATAGAAATGATAAATA 120

 77119960 CTCAAGGTGATGGATACTCCAACTATCCTGACTTGATCATTCTATGAATCTAACAAAATA 77120019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCAAGGTGATGGATACTCCAACTATCCTGACTTGATCATTCTATGAATCTAACAAAATA 180

 77120020 TCACATGTACCCCATAAATATGTACAAATATTATGTTATCAGTAAAAAAACTAAGGTAGA 77120079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCACATGTACCCCATAAATATGTACAAATATTATGTTATCAGTAAAAAAACTAAGGTAGA 240

 77120080 AAAAAATGGGTTTTCTATTTTTACAAATCACTAACAGAAGTTATGTGTTACCTTGTTAAA 77120139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAAATGGGTTTTCTATTTTTACAAATCACTAACAGAAGTTATGTGTTACCTTGTTAAA 300

 77120140 ATAAATGGAATTAAAAATTGTAATTTCCAAAAATAACTGCAGCCTAAATAGTAGAGAATT 77120199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAAATGGAATTAAAAATTGTAATTTCCAAAAATAACTGCAGCCTAAATAGTAGAGAATT 360

 77120200 AAAAAGCAATTTTTTTTTTT-GAGACAAAGTCTAGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAG 77120258
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAAGCAATTTTTTTTTTTTGAGACAAAGTCTAGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAG 420

 77120259 CGGCTCACTACAACCTCCTGGCTCACTACAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTC 77120318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CGGCTCACTACAACCTCCTGGCTCACTACAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTC 480

 77120319 CTGTCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGACACCACACCTGGCTAATTT 77120378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGTCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGACACCACACCTGGCTAATTT 540

 77120379 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGA 77120438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCGAACTCCTGA 600

 77120439 CCTGAAGTGATCCCCACGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACC 77120498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTGAAGTGATCCCCACGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACC 660

 77120499 ATGCCTGGCCTCAATTTCTTAAACTCCAGAAATTGTTTCCTTTAGTCTAATAAATCCTAA 77120558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGCCTGGCCTCAATTTCTTAAACTCCAGAAATTGTTTCCTTTAGTCTAATAAATCCTAA 720

 77120559 ATGCACTAACCTTTTAGGTTACAACATTTTTATAAATGCACTGATTTTGATTTGTGGAGA 77120618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGCACTAACCTTTTAGGTTACAACATTTTTATAAATGCACTGATTTTGATTTGTGGAGA 780

 77120619 TGGCTAAGTGAGACTGGAATATGAATAGCACAATGAATGATATACTGTAAAATGGAAACA 77120678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGCTAAGTGAGACTGGAATATGAATAGCACAATGAATGATATACTGTAAAATGGAAACA 840

 77120679 TTAAGCCATTTTTTTCAACATTTACCGAATACCCGTTATGTGCTTAGCACTGATAGCTAC 77120738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAAGCCATTTTTTTCAACATTTACCGAATACCCGTTATGTGCTTAGCACTGATAGCTAC 900

 77120739 AGGATATGGCTCTGCCATTAACTAAGTAGTAACTATATTCTTTTATTTATTTATTTATTT 77120798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGATATGGCTCTGCCATTAACTAAGTAGTAACTATATTCTTTTATTTATTTATTTATTT 960

 77120799 ATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGA 77120858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGA 1020

 77120859 TCACTACAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGC 77120918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCACTACAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGC 1080

 77120919 TGGGACTACAGGCGCACACCACCATGCCCGTCTAATTTTTGTTGTTTTTTTTTTGTAGAG 77120978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1081 TGGGACTACAGGCGCACACCACCATGCCCGTCTAATTTTTGTTGGTTTTTTTTTGTAGAG 1140

 77120979 ACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGC 77121038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGC 1200

 77121039 CTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTAT 77121098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTAT 1260

 77121099 ATTCTAAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGA 77121158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTCTAAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGA 1320

 77121159 TAAATGTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCA 77121218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAATGTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCA 1380

 77121219 CTTTTTATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATG 77121278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTTTTATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATG 1440

 77121279 TAAGCAGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAAC 77121338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAAGCAGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAAC 1500

 77121339 AATCAACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGTGGTGT 77121385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATCAACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGTGGTGT 1547

EXCISED REGION

 77123867 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGG 77123926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGG 1607

 77123927 AGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGT 77123986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 AGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGT 1667

 77123987 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAA 77124046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAA 1727

 77124047 TCACTTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGT 77124106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 TCACTTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGT 1787

 77124107 CTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAA 77124166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 CTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAA 1847

 77124167 ATTAACCAGGCGTGGTGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGA 77124226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 ATTAACCAGGCGTGGTGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGA 1907

 77124227 AAATTGCTTGAACCCAAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTC 77124286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 AAATTGCTTGAACCCAAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTC 1967

 77124287 CAGCCTGGGCAACAGAGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCA 77124346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 CAGCCTGGGCAACAGAGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCA 2027

 77124347 TGATTGACAGAGCAGGTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAAC 77124406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 TGATTGACAGAGCAGGTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAAC 2087

 77124407 AACAAAAGATCTACTTTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAA 77124466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 AACAAAAGATCTACTTTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAA 2147

 77124467 GATGGACCAGAAACTTAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTG 77124526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 GATGGACCAGAAACTTAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTG 2207

 77124527 TAAAAACTCTTTTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTC 77124586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 TAAAAACTCTTTTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTC 2267

 77124587 ACTGGAACCTCCGCTTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTG 77124646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 ACTGGAACCTCCGCTTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTG 2327

 77124647 GGATTACGGGCGCCCGCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTT 77124706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 GGATTACGGGCGCCCGCCACCACACCCGGATAATTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGAGTT 2387

 77124707 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGC 77124766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATTAAACTCTTGACCTCGAGTGATCTGACCACCTTGGC 2447

 77124767 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAG 77124826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGATCCACCATGCCCAGCTGAAAAACTCTTCCAG 2507

 77124827 ACATTGGCTTAGGCAAAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAATGCAACAAGAACAA 77124886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2508 ACATTGGCTTAGGCAAAGAATTCATGGCTAAGACCCCAAAAGCAAAAGCAACAAGAACAA 2567

 77124887 AAATAAATAAATGGGACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAATCT 77124946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 AAATAAATAAATGGGACCTAATTTAACTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAAGGAATAATCT 2627

 77124947 GCAGAGTAAACCAACAACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCTGACA 77125006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 GCAGAGTAAACCAACAACCCACAGAGTGGGAGAAAATATTTGCAAACTGTGCATCTGACA 2687

 77125007 AAGGACTAATATCCAGAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACAAACA 77125066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 AAGGACTAATATCCAGAATCTACAAAGTACTCAAACAAATCAGCAAGAGGAAAACAAACA 2747

 77125067 ATCCCATCAAAAAATGGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATACAAA 77125126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 ATCCCATCAAAAAATGGGTAAAGGACAAGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGATATACAAA 2807

 77125127 TGGCCAACATCACTAATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTACACCC 77125186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 TGGCCAACATCACTAATTATCAGGGAAATCAAAACCACAATGAAATACTACTTTACACCC 2867

 77125187 GCAAGAATGGTCATAATTAAAGCAAAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAAAAACA 77125246
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 GCAAGAATGGTCATAATTAAAGC-AAAAAAAAAACACAAAAAACAAAACAAAAAAAAACA 2926

 77125247 AAGATGTGGTGTGGATGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAATGTAA 77125306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 AAGATGTGGTGTGGATGTAGTGAAAAGGGAACACTTTTAACACTGCTGGTGGGAATGTAA 2986

 77125307 ACTAGTACAACCACTATGGAAAACAGTATGGAAATTCCTTAAAGAACTCAAAGTAGAACT 77125366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 ACTAGTACAACCACTATGGAAAACAGTATGGAAATTCCTTAAAGAACTCAAAGTAGAACT 3046

 77125367 ACTATTTGACCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAGTCATTATA 77125426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 ACTATTTGACCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAGTCATTATA 3106

 77125427 TGAAAAAGACACATACACATGCATATTTATAGCAGCACAATTCACAATTGCAAAGATATG 77125486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 TGAAAAAGACACATACACATGCATATTTATAGCAGCACAATTCACAATTGCAAAGATATG 3166

 77125487 GAACCAACCTAAGTGTCCATCAGCCAATGAGTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATAAAT 77125546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 GAACCAACCTAAGTGTCCATCAGCCAATGAGTGGATAAAGAAAATGTGGTACATATAAAT 3226

 77125547 CATGGAATACTACTCAGTCATAAGAAGGAATGAAATAATGTATTTTGCAGCAATTTGGAT 77125606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 CATGGAATACTACTCAGTCATAAGAAGGAATGAAATAATGTATTTTGCAGCAATTTGGAT 3286

 77125607 GGAGCGGGAGGTCATTATTCTAAGTGAAGTAACTTAGGAACGGAAAACCAAATATCGTTA 77125666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 GGAGCGGGAGGTCATTATTCTAAGTGAAGTAACTTAGGAACGGAAAACCAAATATCGTTA 3346

 77125667 TGTTCTCACTTATGAGTAGGAGTTAAACTATGAGGATGCAAAGGCATAAGATTGATATAA 77125726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 TGTTCTCACTTATGAGTAGGAGTTAAACTATGAGGATGCAAAGGCATAAGATTGATATAA 3406

 77125727 TGGACGTTGGGAACTTTGGGGGAAAAAGGGTCAGAGGGGGATGAAGGATTAAAGACTACG 77125786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 TGGACGTTGGGAACTTTGGGGGAAAAAGGGTCAGAGGGGGATGAAGGATTAAAGACTACG 3466

 77125787 TATTTGGGTACAGTGTACGCTGCTCAGGGGATGGGTGTACCAAAATCCAGAAATCACCAC 77125846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 TATTTGGGTACAGTGTACGCTGCTCAGGGGATGGGTGTACCAAAATCCAGAAATCACCAC 3526

 77125847 TAAAGAACTTATCCATGTAACCAAAAACCACCTGTTGCCCCAAAACTATTGAAATAAAAA 77125906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3527 TAAAGAACTTATCCATGTAACCAAAAACCACCCGTTGCCCCAAAACTATTGAAATAAAAA 3586

 77125907 TAAAAATTTTAAAAAAGAGGTAAGGGGATAAAGATATCTATAGTATAGATAGCTATACTA 77125966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 TAAAAATTTTAAAAAAGAGGTAAGGGGATAAAGATATCTATAGTATAGATAGCTATACTA 3646

 77125967 AAGACTTCAATATTACATAATGGTGGGACTCGTGCTGTGATTTAAAAAATTCCTTAATAA 77126026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 AAGACTTCAATATTACATAATGGTGGGACTCGTGCTGTGATTTAAAAAATTCCTTAATAA 3706

 77126027 ATTATATACTTAAAATGGTTAAAATGATAAAGTTTGTTTTATATATTTTACTACAATAAA 77126086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 ATTATATACTTAAAATGGTTAAAATGATAAAGTTTGTTTTATATATTTTACTACAATAAA 3766

 77126087 AATGTATGTTATTTAAATACTACTCAATTTCCATATTCTAGTAGGTTAGCATTGATAACT 77126146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 AATGTATGTTATTTAAATACTACTCAATTTCCATATTCTAGTAGGTTAGCATTGATAACT 3826

 77126147 ACATTTTATGGTTAGCTCAAGTTTAACTTTTAGTTTGCTACTCTAGATCTTACATAAGAG 77126206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 ACATTTTATGGTTAGCTCAAGTTTAACTTTTAGTTTGCTACTCTAGATCTTACATAAGAG 3886

 77126207 CAATCCCATTTAATGTCTTATAGCCACTGAAAAAAATATATTCCACTTTCACTATATTTT 77126266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 CAATCCCATTTAATGTCTTATAGCCACTGAAAAAAATATATTCCACTTTCACTATATTTT 3946

 77126267 ACCTATTTTTATATAGCAGAATAAACCAAAGATCTTACCATCTGAAATACATCAGAGCCT 77126326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 ACCTATTTTTATATAGCAGAATAAACCAAAGATCTTACCATCTGAAATACATCAGAGCCT 4006

 77126327 TCATCAAAATCCACCATGGCAAAAAATATCCTGTTGGTGAATGCACTGGAGTATCGCCAG 77126386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 TCATCAAAATCCACCATGGCAAAAAATATCCTGTTGGTGAATGCACTGGAGTATCGCCAG 4066

 77126387 GAGTTTGCCAGGATCTGGAATTCTTCATCAGCTTGCCTGGATGCAATGAGATTCGTAAAG 77126446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 GAGTTTGCCAGGATCTGGAATTCTTCATCAGCTTGCCTGGATGCAATGAGATTCGTAAAG 4126

 77126447 ATAACATATAAAACAATTTTTGAAAGCAATCTCGTTTATCATCAGTAAAACAGGTCCAAG 77126506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4127 ATAACATATAAAACAATTTTTGAAAGCAATCTCGTTTATCATCAGTAAAACAGGTCCAAG 4186

 77126507 CAAGCAATAGCAGGTTTTCCAATGGGAGAAATAATAAAAAACACTGACAAGTAGGTCAGA 77126566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 CAAGCAATAGCAGGTTTTCCAATGGGAGAAATAATAAAAAACACTGACAAGTAGGTCAGA 4246

 77126567 CTCTGCTGACAGGGTTAAGACAAATCTTGTTTTGGCATAAGAGAAGCCTTATCCCAAGTT 77126626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4247 CTCTGCTGACAGGGTTAAGACAAATCTTGTTTTGGCATAAGAGAAGCCTTATCCCAAGTT 4306

 77126627 AGGGATTTCATGAGAAGTAGTAATTACCTGACTCCGCTTCATACTTTGTGCCTGTTTCTT 77126686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 AGGGATTTCATGAGAAGTAGTAATTACCTGACTCCGCTTCATACTTTGTGCCTGTTTCTT 4366

 77126687 ATCCCAAAACTCTTTCAACAATCATTGGAAATATATAGCTAATCGCCTCTACAATAACTT 77126746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 ATCCCAAAACTCTTTCAACAATCATTGGAAATATATAGCTAATCGCCTCTACAATAACTT 4426

 77126747 TCCATACCCTAAATTACTTCTAAGAGTTCAAAGACAAGACAGAAGTGTATTCCCTAAAGA 77126806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 TCCATACCCTAAATTACTTCTAAGAGTTCAAAGACAAGACAGAAGTGTATTCCCTAAAGA 4486

 77126807 AAGCAGAAATACAATATTAATTCATTTTTAAAAATCTAAAGTGCAAAAGCTACTTGGTAA 77126866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4487 AAGCAGAAATACAATATTAATTCATTTTTAAAAATCTAAAGTGCAAAAGCTACTTGGTAA 4546

 77126867 ATAACACAATCAGATAAATTATTAGGATGAAAGATAAGAAGAGTCTAGGAATTGAAATTA 77126926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4547 ATAACACAATCAGATAAATTATTAGGATGAAAGATAAGAAGAGTCTAGGAATTGAAATTA 4606

 77126927 ATTGAGGCCAGCTCATACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCAC 77126986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4607 ATTGAGGCCAGCTCATACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCAC 4666

 77126987 CTGAGGTCAGGAGCTCAAGACAAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGTCTCTATTAAAA 77127046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4667 CTGAGGTCAGGAGCTCAAGACAAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGTCTCTATTAAAA 4726

 77127047 ATACAAAAATTAGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACGTTGGGAGGCT 77127106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4727 ATACAAAAATTAGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACGTTGGGAGGCT 4786

 77127107 GAGGCAGGCGGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCC 77127166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4787 GAGGCAGGCGGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCC 4846

 77127167 TATCTCTACCAAAAATACAAAAATTAACCGGGCATGGTGGCAGGCACCTGTAGTCTCAGC 77127226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4847 TATCTCTACCAAAAATACAAAAATTAACCGGGCATGGTGGCAGGCACCTGTAGTCTCAGC 4906

 77127227 TACTCGGGAGGCTGAGGCAAGAGAATGGCTTGAATCCGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGC 77127286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4907 TACTCGGGAGGCTGAGGCAAGAGAATGGCTTGAATCCGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGC 4966

 77127287 CGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACACAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAA 77127346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4967 CGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACACAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAA 5026

 77127347 ATTATTGAAACCTCAAGTCATCTTTGAATTTTTCCATATCTCCCATATGCTTTCAGTTCT 77127406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5027 ATTATTGAAACCTCAAGTCATCTTTGAATTTTTCCATATCTCCCATATGCTTTCAGTTCT 5086

 77127407 CATGATCTGTCAATTCTCATTTGCGATAAAAGTTTCACTCCATATCCTCCTATTTTTATT 77127466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5087 CATGATCTGTCAATTCTCATTTGCGATAAAAGTTTCACTCCATATCCTCCTATTTTTATT 5146

 77127467 GCTATCATCTAAGGTCAGATTTTTGTTATCTAATAGTAGGATATTTAAAAATACTGACTC 77127526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5147 GCTATCATCTAAGGTCAGATTTTTGTTATCTAATAGTAGGATATTTAAAAATACTGACTC 5206

 77127527 TGGTTTCTCCTCCTTCAATCCTTCTTTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTGGCCCAGGC 77127586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5207 TGGTTTCTCCTCCTTCAATCCTTCTTTTTTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTGGCCCAGGC 5266

 77127587 TGGAGTGCAGTGGCTCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGTCTCAAGCAATT 77127646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5267 TGGAGTGCAGTGGCTCCATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGTCTCAAGCAATT 5326

 77127647 CTCCTGCCTCAGCCTCCTAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCATCATGCCCAGCTAA 77127706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5327 CTCCTGCCTCAGCCTCCTAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCATCATGCCCAGCTAA 5386

 77127707 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAATCC 77127766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5387 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAATCC 5446

 77127767 TGTCCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCC 77127826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5447 TGTCCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCC 5506

 77127827 ACCGTGCCCGGCCCTCCTCCAATCCTTACACTGCAATATACATCCATCTTCCTAAATTAC 77127886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5507 ACCGTGCCCGGCCCTCCTCCAATCCTTACACTGCAATATACATCCATCTTCCTAAATTAC 5566

 77127887 TACTTTCCTGAAACACTTCTCAGAAATCACTGTTGCTTTCTTATTACCTTCAGAATACAT 77127946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5567 TACTTTCCTGAAACACTTCTCAGAAATCACTGTTGCTTTCTTATTACCTTCAGAATACAT 5626

 77127947 TCTCTAATCTCTTTCACTAGTTATTGAAGGTTCTTTATCACATAGCTTCAAATAATACAT 77128006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5627 TCTCTAATCTCTTTCACTAGTTATTGAAGGTTCTTTATCACATAGCTTCAAATAATACAT 5686

 77128007 CTAGTTTTTATCTAGTCTTACTACTAATCAATCTCAAACAGTAACCTTTAGTCCCAATAT 77128066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5687 CTAGTTTTTATCTAGTCTTACTACTAATCAATCTCAAACAGTAACCTTTAGTCCCAATAT 5746

 77128067 TTTATTTACTCCTATCCCTGTACCCTTGTGTACATCATGCTTCTAACCAGAATATCCTGC 77128126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5747 TTTATTTACTCCTATCCCTGTACCCTTGTGTACATCATGCTTCTAACCAGAATATCCTGC 5806

 77128127 CTGTATCAACATCTTATCCATTTGTCTAGCCCTAGCACAAGTCTTATTTCCTCCATCAGG 77128186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5807 CTGTATCAACATCTTATCCATTTGTCTAGCCCTAGCACAAGTCTTATTTCCTCCATCAGG 5866

 77128187 CCAATCCAAATCACTCCTATTAACCTTCTTTCCTGAAATTTTACAGTATTTATTATATGT 77128246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5867 CCAATCCAAATCACTCCTATTAACCTTCTTTCCTGAAATTTTACAGTATTTATTATATGT 5926

 77128247 ACAGTTGATCTGGTACTTAATCACAAATTGCCTTATATTGCCATCTAAATTTTCATATGT 77128306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5927 ACAGTTGATCTGGTACTTAATCACAAATTGCCTTATATTGCCATCTAAATTTTCATATGT 5986

 77128307 GTAACTCATTTCCTTAACCAGATGATAAGGGTAGGTTATCTATTTTACAATTCTCATCCC 77128366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5987 GTAACTCATTTCCTTAACCAGATGATAAGGGTAGGTTATCTATTTTACAATTCTCATCCC 6046

 77128367 AACAGCACCACAACTACAGTATAATTCATGTTGCTGTTGTTTAATTTTTATTTGTTGAAT 77128426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6047 AACAGCACCACAACTACAGTATAATTCATGTTGCTGTTGTTTAATTTTTATTTGTTGAAT 6106

 77128427 GAGTGTAGAAAAATTTGAGTTAATATTAAATTTGGTCTCATAGAAAATAAGATGCCAGTA 77128486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6107 GAGTGTAGAAAAATTTGAGTTAATATTAAATTTGGTCTCATAGAAAATAAGATGCCAGTA 6166

 77128487 AAAACTTAGGTTAGTAAGAATTCCATTAATTTGCATTTAATAGAGAATTATGAAGGAGTT 77128546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6167 AAAACTTAGGTTAGTAAGAATTCCATTAATTTGCATTTAATAGAGAATTATGAAGGAGTT 6226

 77128547 TGTGTTTGTTCCCTGCTATTTTTGTATACTCTTGATTGCTACTGAGTGAACTGACGGAAT 77128606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6227 TGTGTTTGTTCCCTGCTATTTTTGTATACTCTTGATTGCTACTGAGTGAACTGACGGAAT 6286

 77128607 TAGAAGTAATTCTAGATTTCAAGTTTATTCATAGTTATTACTTACGATTCCTTTTTCTTC 77128666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6287 TAGAAGTAATTCTAGATTTCAAGTTTATTCATAGTTATTACTTACGATTCCTTTTTCTTC 6346

 77128667 TTTTATTTATTTTTAATTTATATTCAGCACATACTCCACAAAATAAGCACTATGGAACCA 77128726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6347 TTTTATTTATTTTTAATTTATATTCAGCACATACTCCACAAAATAAGCACTATGGAACCA 6406

 77128727 AATACCTTGACTATACCCTAGCTCCAGGGAGAAAATCGTTAAAGAAAAGTTATCAAGGCT 77128786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6407 AATACCTTGACTATACCCTAGCTCCAGGGAGAAAATCGTTAAAGAAAAGTTATCAAGGCT 6466

 77128787 TGGGGTGGCAGAACACACCATTCTGAAACAAGCTGTCTATTCCTTTGCATGGCTATCAGG 77128846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6467 TGGGGTGGCAGAACACACCATTCTGAAACAAGCTGTCTATTCCTTTGCATGGCTATCAGG 6526

 77128847 CTGTCAGAATCTGGAGAACCTCCAAGTTTTTACTAAACTAATTCTTCATACAGTAGCTTT 77128906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6527 CTGTCAGAATCTGGAGAACCTCCAAGTTTTTACTAAACTAATTCTTCATACAGTAGCTTT 6586

 77128907 GTCATTTTATTTAAAGTTAATTACCAGATCAGATACACTGATCTAAAAATATAAATAAAA 77128966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6587 GTCATTTTATTTAAAGTTAATTACCAGATCAGATACACTGATCTAAAAATATAAATAAAA 6646

 77128967 AGACACTAAAAAGCAAAAGCTATTTTATTTTTTAGTATCCACCATTTTGAATTGTTCATG 77129026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6647 AGACACTAAAAAGCAAAAGCTATTTTATTTTTTAGTATCCACCATTTTGAATTGTTCATG 6706

 77129027 GTGTTTTTATTTAACAGAATAGCAATCTTTGCTCCTAAGATC 77129068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6707 GTGTTTTTATTTAACAGAATAGCAATCTTTGCTCCTAAGATC 6748

Alignment time is 5.38866 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [77111385,77133866] =>     22482 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4170] =>      4170 nucs 'mol-32-34be-160430_4170'

Score:        4141
Aligned:      4163        nucs
Identic:      4161 (100%) nucs =>       906 (100%)      3255 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [77120504,77121409] EXCISED REGION [77121411,77124667]
 second seq =>  [       1,     906] EXCISED REGION [     908,    4164]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [77121410,77121410]
 second seq =>         1 nucs [907,907]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [77121408,77121409] to [77121409,77121410]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 77120504 TGGCCTCAATTTCTTAAACTCCAGAAATTGTTTCCTTTAGTCTAATAAATCCTAAATGCA 77120563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGCCTCAATTTCTTAAACTCCAGAAATTGTTTCCTTTAGTCTAATAAATCCTAAATGCA 60

 77120564 CTAACCTTTTAGGTTACAACATTTTTATAAATGCACTGATTTTGATTTGTGGAGATGGCT 77120623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAACCTTTTAGGTTACAACATTTTTATAAATGCACTGATTTTGATTTGTGGAGATGGCT 120

 77120624 AAGTGAGACTGGAATATGAATAGCACAATGAATGATATACTGTAAAATGGAAACATTAAG 77120683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGTGAGACTGGAATATGAATAGCACAATGAATGATATACTGTAAAATGGAAACATTAAG 180

 77120684 CCATTTTTTTCAACATTTACCGAATACCCGTTATGTGCTTAGCACTGATAGCTACAGGAT 77120743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCATTTTTTTCAACATTTACCGAATACCCGTTATGTGCTTAGCACTGATAGCTACAGGAT 240

 77120744 ATGGCTCTGCCATTAACTAAGTAGTAACTATATTCTTTTATTTATTTATTTATTTATTTT 77120803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGGCTCTGCCATTAACTAAGTAGTAACTATATTCTTTTATTTATTTATTTATTTATTTT 300

 77120804 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGATCACT 77120863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGATCACT 360

 77120864 ACAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 77120923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 420

 77120924 CTACAGGCGCACACCACCATGCCCGTCTAATTTTTGTTGTTTTTTTTTTGTAGAGACAGG 77120983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTACAGGCGCACACCACCATGCCCGTCTAATTTTTGTTGTTTTTTTTTTGTAGAGACAGG 480

 77120984 GTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGG 77121043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATATCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGG 540

 77121044 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCT 77121103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACCGCACCTGGCTGTAACTATATTCT 600

 77121104 AAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGATAAAT 77121163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGGGAGACTGTCAAACAACTACAGAGCTAACTCTACTGTAAGACAAAATGTGGATAAAT 660

 77121164 GTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTT 77121223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTATAACAGAAATTTAAGGCAAGTGATATAACAATACAAGAAAAGGAGTGACTCACTTTT 720

 77121224 TATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGC 77121283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATCTGGAAAAGTTGAGAAAGCTTACAGGGAGTATCTGAAACAAGGCTTAAAATGTAAGC 780

 77121284 AGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCA 77121343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAATTTTGAGAGTGGAGAGAAAGCAGACAGGGAAGAAAATTGTTGTAACCCAACAATCA 840

 77121344 ACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCA 77121403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAGTGCTGACATACGAGAGTGCATCAGGCCAGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCA 900

 77121404 GCACTT 77121409
          ||||||
      901 GCACTT 906

EXCISED REGION

 77121411 GGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACCCGAGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAT 77121470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 GGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACCCGAGGTCAGGGGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAT 967

 77121471 GGCGAAACCCCTGTCTCTACTAAAAATTAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGC 77121530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 GGCGAAACCCCTGTCTCTACTAAAAATTAAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCGTGC 1027

 77121531 CTGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAG 77121590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 CTGTAATCCCAGATACTCTGGAGGCTGAGGCACGAGAATCGCTTGAGCAGAGGTTGGCAG 1087

 77121591 TGAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATTA 77121650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 TGAGCCGAGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCACCTCAATTA 1147

 77121651 AAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAG 77121710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 AAAAAAAAAAAAGAGTGCATCAAAGAATATGATTATGGGAAAGGTGTGACTGGAGTAAAG 1207

 77121711 AGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAA 77121770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 AGCACATGAAATTAGGACTAAGGAATTCTGGCTTCAGTCTATACACTACTCCTTTCAAAA 1267

 77121771 GTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTC 77121830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 GTGTGTTCTATGGAATCTAGCCAAATGCTCCATTAAGTGGTCCAATAATATGAGAAATTC 1327

 77121831 TGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCT 77121890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 TGTGTATTAGAGCCCCCATTGGAAAGTATAACACATATCAGCATCAGCATGTTAACATCT 1387

 77121891 CTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCAC 77121950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 CTGATCTCTCAAAAGCTGTGTTGGGAGACAATTCTTCATGAGTTTCTCATGTTTCTGCAC 1447

 77121951 ATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGT 77122010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 ATCTTGTGGACAAGGGCCCTAACTGCCTTTGTTCTGGACAATCTTCTCAAGGATATTTGT 1507

 77122011 ATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAG 77122070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 ATATCTTTGGAAGATAGTTGAAATGGCCTTCGCAAAATTATGACTGAGACAGTGAAAGAG 1567

 77122071 ATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGG 77122130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 ATCTAACTTAACTGACTCCGACTTGGTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGG 1627

 77122131 CCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACA 77122190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 CCATAGGCTGAACTAACTTTAGGAGAAACTTAGTTTATAGTTTAAACAAAGACTGTAACA 1687

 77122191 GCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAA 77122250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 GCCCTTTCCCAAAGCAGACCTCCTTCTTGCCTGAGAACTAGATTGCCTTTGTAGGACTAA 1747

 77122251 TATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATT 77122310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 TATTAGCCACAAGATGAAAAATTATGGTTTAGGAGTCATGTAGCTAGAGGCTACAAGATT 1807

 77122311 CTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACT 77122370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 CTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAATATCATCGCTTGAGATATTTTGCAGACTCTGCACT 1867

 77122371 TGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCC 77122430
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1868 TGATGGATCAGCTGACACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTAGCCCCC 1927

 77122431 TCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAG 77122490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 TCCCAGGAACTGACTCAGCACATGAAGACACCTTTAACTCCCTATGATTTAATCTCTGAG 1987

 77122491 CAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCT 77122550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 CAATCAGCACTCCTGGCTCACTGGCTTCCCCCCACCCACGAAGCTATCCTTAAAAACTCT 2047

 77122551 GCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAA 77122610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 GCACCCCGAATGCTCGGGGAGACTGACTTGAGTAATAATAAAACTCCAGTCTCCCACAAA 2107

 77122611 GCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCT 77122670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 GCTGGCTGTGCATGAAATACTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGATCT 2167

 77122671 GTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAG 77122730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 GTTTAGGCAGCAGCAAAGTGAACCCCTTGGGCGGTTACACAGTCTCCCTCCACAGCAAAG 2227

 77122731 GGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCT 77122790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 GGGAGGCACACTTACTATCCATTACAGAAAATGTGGGTTCCCAGAGCTTGGTGTTCCTCT 2287

 77122791 CCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTG 77122850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 CCCATAATGCAGCCCATTGGCCCTCTTTGTTATTGTTGTTTTCTTAAGAGTTGGGGTCTG 2347

 77122851 GCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTG 77122910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 GCTCTGCTGCTCAGGCTAGAGTGCAGAGGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAAACTG 2407

 77122911 ATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGAT 77122970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 ATCTCAAGCAATCCTCCTGATCCAGCCTTCCGAGTAGCTGACCACTGGCCCTCTTTGGAT 2467

 77122971 TGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAG 77123030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 TGCCCTATGGGAAATGGGGTTTGGGGAACCTATGACATTTTGGCTACTTGTTGTGAGTAG 2527

 77123031 TAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGA 77123090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 TAAAGTCCTTTAACTTGAGCCAGGCATGGTGGCACAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGA 2587

 77123091 AGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGC 77123150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 AGGTTAAGGTGCAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACTAGCCAGGGCAACATAGC 2647

 77123151 AAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTG 77123210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 AAGACCCAATCTCAAAAACAAACAGCAAAAAGTCCTTTGCTGGACTCTGACTCAGGAGTG 2707

 77123211 TCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAG 77123270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 TCATATTTTCTGCCAGCATCCATGAAACTGTGGCAGGTTAACTTGTTAGCTTGCAAGTAG 2767

 77123271 GGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTT 77123330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 GGTAAGAACTTAGATCCTTCCCAGCTTTTGAACCCTGAAGTAAAAAGAAAACTTAATTTT 2827

 77123331 GTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAG 77123390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 GTTTAAACCAGGGTTTCCCAAGTTTATTTTTTTCCAAGAATACTTATTAATACCATGTAG 2887

 77123391 AAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAG 77123450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 AAAAAACTCTGGGAAATGTTATAGCAGGCAATATGGACAGAGCGCTAAATGGAAGGTAAG 2947

 77123451 TGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAAT 77123510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 TGGACCAGTTAAAAGGTTACTGCATTAGCTTGAATGAGAGATGAATGTGAGCCTTGGAAT 3007

 77123511 GTAAAGGGGGTATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGT 77123570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 GTAAAGGGGGTATGGCTATGACACACGTTGTACAAGAAGATGAAGATGACAAAGAAGTGT 3067

 77123571 CATTAATGATACAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAA 77123630
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 CATTAATGATCCAGAACATAAGATGAGGCTTGGGTGAAAGTGGAAGAGAAAACAGTTTAA 3127

 77123631 TTTGGGATATAATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGC 77123690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 TTTGGGATATAATAAATTTTTAGATTGGGAAGTCATTCATATGAAGATGTATAGCAAGGC 3187

 77123691 ATTATATCCAGCTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATA 77123750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 ATTATATCCAGCTTTTTCCTTTTATGTTTGATACAATTGAGTAAAATATGTTCAAATATA 3247

 77123751 TGAATTAGACACATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATAT 77123810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 TGAATTAGACACATTTATAAACAAAGACAAAATTGAATCTATGTCCTTAAGTATTTATAT 3307

 77123811 GCAAGGGGAAAGAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCA 77123870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 GCAAGGGGAAAGAACTAGTAGAGATGCTGAAGCTAAAAATGGACCAGGTGTGGTGGCTCA 3367

 77123871 CGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTT 77123930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 CGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTT 3427

 77123931 TGAGACCAGCCTGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCC 77123990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 TGAGACCAGCCTGGCCAATACGGTGAAACCCCATCTGTACTCAAAATACAAAAAGTAGCC 3487

 77123991 AGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCAC 77124050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 AGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCAC 3547

 77124051 TTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGG 77124110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 TTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAAGCCACTGCACTCTAGTCTGG 3607

 77124111 GCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTA 77124170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 GCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAACCTGAAACTAAAAAGAAAAATTAAAAAATTA 3667

 77124171 ACCAGGCGTGGTGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAAAT 77124230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 ACCAGGCGTGGTGGCAAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAAAT 3727

 77124231 TGCTTGAACCCAAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGC 77124290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 TGCTTGAACCCAAAAGGCAGAGGCTGCCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGC 3787

 77124291 CTGGGCAACAGAGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCATGAT 77124350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 CTGGGCAACAGAGCGGGACTCTTGTCTCAAAAACAAAAAATAGTTGTGAGAGGTCATGAT 3847

 77124351 TGACAGAGCAGGTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAACAACA 77124410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 TGACAGAGCAGGTGGGTATGTGATCCAGGGCCCAGGAAAAAGGTTCAGTTTCAAACAACA 3907

 77124411 AAAGATCTACTTTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAAGATG 77124470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 AAAGATCTACTTTTCTACTAAGACTAGAGGTAAGGGGACAAAAGAAATCAACTCAAGATG 3967

 77124471 GACCAGAAACTTAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTGTAAA 77124530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 GACCAGAAACTTAAATCTAAGACCTGAAACCATAAAAATTCTAGAAGATAACATTGTAAA 4027

 77124531 AACTCTTTTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTCACTG 77124590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 AACTCTTTTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGCAATCTCGGCTCACTG 4087

 77124591 GAACCTCCGCTTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTGGGAT 77124650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 GAACCTCCGCTTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCATCCCGAGTAGTTGGGAT 4147

 77124651 TACGGGCGCCCGCCACC 77124667
          |||||||||||||||||
     4148 TACGGGCGCCCGCCACC 4164

Alignment time is 3.30783 s

