
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    5827] =>      5827 nucs 'mol-32-1eea-029278_5827'

Score:        5790
Aligned:      5823        nucs
Identic:      5820 (100%) nucs =>      4307 (100%)      1513 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38381827,38386136] EXCISED REGION [38386137,38387649]
 second seq =>  [       1,    4310] EXCISED REGION [    4315,    5827]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [4311,4314]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [4311,4349] to [4315,4353]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38386136,38386136] to [38386137,38386137]
 second seq =>         1 nucs [4310,4310] to [4315,4315]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38381827 TCGCAACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAT 38381886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCGCAACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAT 60

 38381887 TTTTTTAACTTTTTATCTTGAGATAAATGTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGAAGTAATAC 38381946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTTAACTTTTTATCTTGAGATAAATGTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGAAGTAATAC 120

 38381947 AGAGAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTACCTAGTTTCCCTTAATAGTAACATCTTTCCTAA 38382006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTACCTAGTTTCCCTTAATAGTAACATCTTTCCTAA 180

 38382007 CTATAGTACAATATCACAGCCAGGAAATTGATGTTGATACAGTCTACCAAACTTATTCAG 38382066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTATAGTACAATATCACAGCCAGGAAATTGATGTTGATACAGTCTACCAAACTTATTCAG 240

 38382067 ATCTCACCAGTTATACATGCAGTCATGTGTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTTTTATCACA 38382126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCTCACCAGTTATACATGCAGTCATGTGTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTTTTATCACA 300

 38382127 TTTGTAGCGTTATGTGATCACCACTATAGTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTGTGGTGGCC 38382186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGTAGCGTTATGTGATCACCACTATAGTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTGTGGTGGCC 360

 38382187 CATGCCTATAGTCCCACATAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAAAAGTTTG 38382246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATGCCTATAGTCCCACATAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAAAAGTTTG 420

 38382247 AGTCCAGCCTGGGCAACATAGTGCGATCCTGTCTCTACAATAATATTAATAATAATGAAA 38382306
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTCCAGCCTGGGCAACATAGTGCGATCATGTCTCTACAATAATATTAATAATAATGAAA 480

 38382307 TTTAAAAAATACAGAACAGTCCCATTACAAGGAACTCCTTATGCACCCTTTATAGCCACA 38382366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAAAAAATACAGAACAGTCCCATTACAAGGAACTCCTTATGCACCCTTTATAGCCACA 540

 38382367 GCCACCTCCCTTCTGCCACCACCACCCGCCAATCCCTAGCAACCATTAATCTGGTTTCCA 38382426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCACCTCCCTTCTGCCACCACCACCCGCCAATCCCTAGCAACCATTAATCTGGTTTCCA 600

 38382427 CAACTATGATTTTGTCATTTCAAGAATGTTATATAAAATTCATTCATTATGGACTGAATA 38382486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAACTATGATTTTGTCATTTCAAGAATGTTATATAAAATTCATTCATTATGGACTGAATA 660

 38382487 AAATCATGTGGTATGTAAACTTTTGAGATTACCTTTTTTTACTCAGCATAATTCCCTGGA 38382546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATCATGTGGTATGTAAACTTTTGAGATTACCTTTTTTTACTCAGCATAATTCCCTGGA 720

 38382547 GATCCGTCTAGGTTGTTATGCATATTGATAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGAGTAGTATT 38382606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATCCGTCTAGGTTGTTATGCATATTGATAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGAGTAGTATT 780

 38382607 TCATGGTATGGATATACCACAGTTAAGTGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTC 38382666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCATGGTATGGATATACCACAGTTAAGTGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTC 840

 38382667 CAGTTTTTGAATATTATAACATCCACGTACTTTTTTTGTGTGTGAACATACATTTTCATT 38382726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      841 CAGTTTTTGAATATTATAACATCCACGTACTTTTTTTGTGTGTGAACATATATTTTCATT 900

 38382727 TCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAATTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGT 38382786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAATTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGT 960

 38382787 TTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCAGAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGC 38382846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCAGAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGC 1020

 38382847 AATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACATTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGC 38382906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACATTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGC 1080

 38382907 AACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACTAGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTC 38382966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACTAGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTC 1140

 38382967 ACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTTCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACAC 38383026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTTCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACAC 1200

 38383027 CTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCA 38383086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCA 1260

 38383087 TCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTT 38383146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTT 1320

 38383147 CCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTA 38383206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTA 1380

 38383207 AATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTT 38383266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTT 1440

 38383267 AGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAG 38383326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAG 1500

 38383327 TCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTC 38383386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTC 1560

 38383387 ACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGA 38383446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGA 1620

 38383447 CCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTAAGTCAGTGAAAC 38383506
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1621 CCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTTAGTCAGTGAAAC 1680

 38383507 AGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACAT 38383566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACAT 1740

 38383567 GCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATA 38383626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATA 1800

 38383627 AGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAA 38383686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAA 1860

 38383687 TAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAAC 38383746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAAC 1920

 38383747 CTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACC 38383806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACC 1980

 38383807 TCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTG 38383866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTG 2040

 38383867 ACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAG 38383926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAG 2100

 38383927 TCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGA 38383986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGA 2160

 38383987 TATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATA 38384046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATA 2220

 38384047 CAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAAC 38384106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAAC 2280

 38384107 ACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGG 38384166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGG 2340

 38384167 AATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCG 38384226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCG 2400

 38384227 CCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATA 38384286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATA 2460

 38384287 ACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATA 38384346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATA 2520

 38384347 CAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATA 38384406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATA 2580

 38384407 ATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATC 38384466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATC 2640

 38384467 ATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTA 38384526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTA 2700

 38384527 TTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGG 38384586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGG 2760

 38384587 TTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTG 38384646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTG 2820

 38384647 TTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAG 38384706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAG 2880

 38384707 TGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGT 38384766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGT 2940

 38384767 GAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAG 38384826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAG 3000

 38384827 TTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTC 38384886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTC 3060

 38384887 TTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCC 38384946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCC 3120

 38384947 AATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCA 38385006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCA 3180

 38385007 ATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACA 38385066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACA 3240

 38385067 TACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCA 38385126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCA 3300

 38385127 TCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGG 38385186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGG 3360

 38385187 TATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCAT 38385246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCAT 3420

 38385247 ATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTAT 38385306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTAT 3480

 38385307 AATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGA 38385366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGA 3540

 38385367 TCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTA 38385426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTA 3600

 38385427 CATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTT 38385486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTT 3660

 38385487 TTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTT 38385546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTT 3720

 38385547 TGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCC 38385606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCC 3780

 38385607 ATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATC 38385666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATC 3840

 38385667 TACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATAC 38385726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATAC 3900

 38385727 TAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCA 38385786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCA 3960

 38385787 GTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGA 38385846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGA 4020

 38385847 GTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTG 38385906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTG 4080

 38385907 GGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTA 38385966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTA 4140

 38385967 CACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCAT 38386026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCAT 4200

 38386027 GGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGC 38386086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGC 4260

 38386087 AAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 38386136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 4310

EXCISED REGION

 38386137 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 38386196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 4374

 38386197 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 38386256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 4434

 38386257 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 38386316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 4494

 38386317 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 38386376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 4554

 38386377 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 38386436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 4614

 38386437 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 38386496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4615 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 4674

 38386497 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 38386556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4675 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 4734

 38386557 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 38386616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 4794

 38386617 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 38386676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 4854

 38386677 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 38386736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4855 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 4914

 38386737 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 38386796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 4974

 38386797 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 38386856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4975 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 5034

 38386857 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 38386916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5035 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 5094

 38386917 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 38386976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5095 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 5154

 38386977 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 38387036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5155 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 5214

 38387037 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 38387096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5215 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 5274

 38387097 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 38387156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5275 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 5334

 38387157 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 38387216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5335 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 5394

 38387217 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 38387276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5395 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 5454

 38387277 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 38387336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5455 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 5514

 38387337 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 38387396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5515 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 5574

 38387397 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 38387456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5575 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 5634

 38387457 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 38387516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5635 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 5694

 38387517 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 38387576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5695 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 5754

 38387577 GACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATT 38387636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5755 GACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATT 5814

 38387637 TGCATTTCTCTGA 38387649
          |||||||||||||
     5815 TGCATTTCTCTGA 5827

Alignment time is 4.44071 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    6116] =>      6116 nucs 'mol-32-1f58-226014_6116'

Score:        6090
Aligned:      6112        nucs
Identic:      6110 (100%) nucs =>      4374 (100%)      1736 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38381761,38386136] EXCISED REGION [38386137,38387872]
 second seq =>  [       1,    4376] EXCISED REGION [    4381,    6116]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [4377,4380]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [4377,4415] to [4381,4419]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38386136,38386136] to [38386137,38386137]
 second seq =>         1 nucs [4376,4376] to [4381,4381]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38381761 GCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTACCATCAGAGTGAACAGGCAACCCACAAAATAAGAGA 38381820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTACCATCAGAGTGAACAGGCAACCCACAAAATAAGAGA 60

 38381821 AAATTTTCGCAACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAATGAACTCA 38381880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATTTTCGCAACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAATGAACTCA 120

 38381881 AACAATTTTTTTAACTTTTTATCTTGAGATAAATGTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGAAG 38381940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACAATTTTTTTAACTTTTTATCTTGAGATAAATGTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGAAG 180

 38381941 TAATACAGAGAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTACCTAGTTTCCCTTAATAGTAACATCTT 38382000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATACAGAGAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTACCTAGTTTCCCTTAATAGTAACATCTT 240

 38382001 TCCTAACTATAGTACAATATCACAGCCAGGAAATTGATGTTGATACAGTCTACCAAACTT 38382060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCTAACTATAGTACAATATCACAGCCAGGAAATTGATGTTGATACAGTCTACCAAACTT 300

 38382061 ATTCAGATCTCACCAGTTATACATGCAGTCATGTGTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTTTT 38382120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCAGATCTCACCAGTTATACATGCAGTCATGTGTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTTTT 360

 38382121 ATCACATTTGTAGCGTTATGTGATCACCACTATAGTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTGTG 38382180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCACATTTGTAGCGTTATGTGATCACCACTATAGTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTGTG 420

 38382181 GTGGCCCATGCCTATAGTCCCACATAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAAA 38382240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGGCCCATGCCTATAGTCCCACATAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAAA 480

 38382241 AGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATAGTGCGATCCTGTCTCTACAATAATATTAATAATA 38382300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATAGTGCGATCCTGTCTCTACAATAATATTAATAATA 540

 38382301 ATGAAATTTAAAAAATACAGAACAGTCCCATTACAAGGAACTCCTTATGCACCCTTTATA 38382360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGAAATTTAAAAAATACAGAACAGTCCCATTACAAGGAACTCCTTATGCACCCTTTATA 600

 38382361 GCCACAGCCACCTCCCTTCTGCCACCACCACCCGCCAATCCCTAGCAACCATTAATCTGG 38382420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCACAGCCACCTCCCTTCTGCCACCACCACCCGCCAATCCCTAGCAACCATTAATCTGG 660

 38382421 TTTCCACAACTATGATTTTGTCATTTCAAGAATGTTATATAAAATTCATTCATTATGGAC 38382480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTCCACAACTATGATTTTGTCATTTCAAGAATGTTATATAAAATTCATTCATTATGGAC 720

 38382481 TGAATAAAATCATGTGGTATGTAAACTTTTGAGATTACCTTTTTTTACTCAGCATAATTC 38382540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAATAAAATCATGTGGTATGTAAACTTTTGAGATTACCTTTTTTTACTCAGCATAATTC 780

 38382541 CCTGGAGATCCGTCTAGGTTGTTATGCATATTGATAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGAGT 38382600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTGGAGATCCGTCTAGGTTGTTATGCATATTGATAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGAGT 840

 38382601 AGTATTTCATGGTATGGATATACCACAGTTAAGTGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGT 38382660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTATTTCATGGTATGGATATACCACAGTTAAGTGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGT 900

 38382661 CATTTCCAGTTTTTGAATATTATAACATCCACGTACTTTTTTTGTGTGTGAACATACATT 38382720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      901 CATTTCCAGTTTTTGAATATTATAACATCCACGTACTTTTTTTGTGTGTGAACATATATT 960

 38382721 TTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAATTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTG 38382780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAATTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTG 1020

 38382781 TTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCAGAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCC 38382840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCAGAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCC 1080

 38382841 TTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACATTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGA 38382900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACATTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGA 1140

 38382901 TATAGCAACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACTAGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTT 38382960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATAGCAACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACTAGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTT 1200

 38382961 GTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTTCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATT 38383020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTTCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATT 1260

 38383021 TCACACCTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCT 38383080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCACACCTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCT 1320

 38383081 TGACCATCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCT 38383140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGACCATCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCT 1380

 38383141 GGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAA 38383200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAA 1440

 38383201 AATTTAAATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGAT 38383260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATTTAAATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGAT 1500

 38383261 AAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCA 38383320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCA 1560

 38383321 ATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATC 38383380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATC 1620

 38383381 TATTTCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTT 38383440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATTTCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTT 1680

 38383441 CTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTAAGTCAG 38383500
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1681 CTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTTAGTCAG 1740

 38383501 TGAAACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAA 38383560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGAAACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAA 1800

 38383561 GCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGA 38383620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGA 1860

 38383621 AGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAG 38383680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAG 1920

 38383681 TGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTT 38383740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTT 1980

 38383741 TAAAACCTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAAT 38383800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAAAACCTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAAT 2040

 38383801 ATGACCTCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGC 38383860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATGACCTCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGC 2100

 38383861 TTTCTGACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTT 38383920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTCTGACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTT 2160

 38383921 TCATAGTCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAA 38383980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCATAGTCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAA 2220

 38383981 AGAAGATATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGG 38384040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGAAGATATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGG 2280

 38384041 AAAATACAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATA 38384100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAATACAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATA 2340

 38384101 AAAAACACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCT 38384160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAAACACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCT 2400

 38384161 GATAGGAATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCC 38384220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GATAGGAATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCC 2460

 38384221 TCATCGCCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACC 38384280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCATCGCCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACC 2520

 38384281 TCCATAACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTG 38384340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCCATAACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTG 2580

 38384341 TGGATACAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATG 38384400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGATACAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATG 2640

 38384401 GTGATAATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACT 38384460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTGATAATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACT 2700

 38384461 ACAATCATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAA 38384520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACAATCATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAA 2760

 38384521 CTTTTATTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCAT 38384580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTTTTATTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCAT 2820

 38384581 GGGAGGTTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGT 38384640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGGAGGTTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGT 2880

 38384641 TTTTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGG 38384700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGG 2940

 38384701 CCCCAGTGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTT 38384760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCCCAGTGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTT 3000

 38384761 GTAAGTGAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAAT 38384820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTAAGTGAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAAT 3060

 38384821 TTTTAGTTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAAT 38384880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTTAGTTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAAT 3120

 38384881 AAGTTCTTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACT 38384940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAGTTCTTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACT 3180

 38384941 GTGCCCAATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAA 38385000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTGCCCAATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAA 3240

 38385001 AGTCCAATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTG 38385060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGTCCAATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTG 3300

 38385061 AGAACATACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTA 38385120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGAACATACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTA 3360

 38385121 ATTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATT 38385180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATT 3420

 38385181 CCATGGTATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGG 38385240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CCATGGTATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGG 3480

 38385241 TTCCATATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTT 38385300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTCCATATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTT 3540

 38385301 TCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAAC 38385360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAAC 3600

 38385361 AGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACT 38385420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACT 3660

 38385421 AGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACAT 38385480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACAT 3720

 38385481 CTATTTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTG 38385540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTATTTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTG 3780

 38385541 TGATTTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTG 38385600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGATTTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTG 3840

 38385601 TTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCC 38385660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCC 3900

 38385661 AAAATCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGT 38385720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAAATCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGT 3960

 38385721 ATATACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTC 38385780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATATACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTC 4020

 38385781 AGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGA 38385840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGA 4080

 38385841 AAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAAC 38385900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAAC 4140

 38385901 TAATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAA 38385960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TAATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAA 4200

 38385961 GCCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCT 38386020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GCCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCT 4260

 38386021 GGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCAT 38386080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCAT 4320

 38386081 TTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 38386136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 4376

EXCISED REGION

 38386137 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 38386196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 4440

 38386197 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 38386256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 4500

 38386257 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 38386316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 4560

 38386317 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 38386376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 4620

 38386377 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 38386436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 4680

 38386437 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 38386496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 4740

 38386497 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 38386556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 4800

 38386557 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 38386616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 4860

 38386617 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 38386676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 4920

 38386677 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 38386736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 4980

 38386737 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 38386796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 5040

 38386797 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 38386856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 5100

 38386857 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 38386916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 5160

 38386917 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 38386976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 5220

 38386977 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 38387036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 5280

 38387037 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 38387096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 5340

 38387097 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 38387156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 5400

 38387157 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 38387216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 5460

 38387217 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 38387276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 5520

 38387277 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 38387336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 5580

 38387337 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 38387396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 5640

 38387397 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 38387456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 5700

 38387457 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 38387516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 5760

 38387517 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 38387576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 5820

 38387577 GACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATT 38387636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 GACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATT 5880

 38387637 TGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAA 38387696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAA 5940

 38387697 ATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTT 38387756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 ATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTT 6000

 38387757 GATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGA 38387816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 GATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGA 6060

 38387817 GACGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGAT 38387872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 GACGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGAT 6116

Alignment time is 4.67293 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    5048] =>      5048 nucs 'mol-32-23ba-051147_5048'

Score:        5033
Aligned:      5044        nucs
Identic:      5043 (100%) nucs =>      3114 (100%)      1929 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38383022,38386136] EXCISED REGION [38386137,38388065]
 second seq =>  [       1,    3115] EXCISED REGION [    3120,    5048]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [3116,3119]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [3116,3154] to [3120,3158]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38386136,38386136] to [38386137,38386137]
 second seq =>         1 nucs [3115,3115] to [3120,3120]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38383022 CACACCTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTT 38383081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACACCTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTT 60

 38383082 GACCATCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTG 38383141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACCATCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTG 120

 38383142 GCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAA 38383201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAA 180

 38383202 ATTTAAATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATA 38383261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTAAATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATA 240

 38383262 AGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAA 38383321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAA 300

 38383322 TTGAGTCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCT 38383381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGAGTCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCT 360

 38383382 ATTTCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTC 38383441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTC 420

 38383442 TGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTAAGTCAGT 38383501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      421 TGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTTAGTCAGT 480

 38383502 GAAACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAG 38383561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAG 540

 38383562 CACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAA 38383621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAA 600

 38383622 GCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGT 38383681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGT 660

 38383682 GAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTT 38383741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTT 720

 38383742 AAAACCTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATA 38383801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAACCTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATA 780

 38383802 TGACCTCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCT 38383861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGACCTCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCT 840

 38383862 TTCTGACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTT 38383921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTGACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTT 900

 38383922 CATAGTCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAA 38383981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATAGTCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAA 960

 38383982 GAAGATATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGA 38384041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAAGATATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGA 1020

 38384042 AAATACAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAA 38384101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAATACAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAA 1080

 38384102 AAAACACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTG 38384161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAACACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTG 1140

 38384162 ATAGGAATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCT 38384221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAGGAATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCT 1200

 38384222 CATCGCCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCT 38384281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATCGCCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCT 1260

 38384282 CCATAACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGT 38384341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCATAACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGT 1320

 38384342 GGATACAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGG 38384401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGATACAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGG 1380

 38384402 TGATAATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTA 38384461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGATAATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTA 1440

 38384462 CAATCATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAAC 38384521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAATCATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAAC 1500

 38384522 TTTTATTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATG 38384581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTATTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATG 1560

 38384582 GGAGGTTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTT 38384641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAGGTTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTT 1620

 38384642 TTTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGC 38384701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGC 1680

 38384702 CCCAGTGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTG 38384761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCAGTGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTG 1740

 38384762 TAAGTGAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATT 38384821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAAGTGAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATT 1800

 38384822 TTTAGTTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATA 38384881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTAGTTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATA 1860

 38384882 AGTTCTTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTG 38384941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGTTCTTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTG 1920

 38384942 TGCCCAATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAA 38385001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGCCCAATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAA 1980

 38385002 GTCCAATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGA 38385061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTCCAATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGA 2040

 38385062 GAACATACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAA 38385121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAACATACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAA 2100

 38385122 TTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTC 38385181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTC 2160

 38385182 CATGGTATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGT 38385241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATGGTATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGT 2220

 38385242 TCCATATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTT 38385301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCCATATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTT 2280

 38385302 CGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACA 38385361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACA 2340

 38385362 GTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTA 38385421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTA 2400

 38385422 GTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATC 38385481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATC 2460

 38385482 TATTTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGT 38385541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATTTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGT 2520

 38385542 GATTTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGT 38385601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GATTTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGT 2580

 38385602 TGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCA 38385661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCA 2640

 38385662 AAATCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTA 38385721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAATCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTA 2700

 38385722 TATACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCA 38385781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TATACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCA 2760

 38385782 GAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAA 38385841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAA 2820

 38385842 AATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACT 38385901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACT 2880

 38385902 AATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAG 38385961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAG 2940

 38385962 CCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTG 38386021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTG 3000

 38386022 GGCATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATT 38386081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGCATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATT 3060

 38386082 TGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 38386136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 3115

EXCISED REGION

 38386137 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 38386196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 3179

 38386197 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 38386256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 3239

 38386257 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 38386316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 3299

 38386317 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 38386376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 3359

 38386377 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 38386436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 3419

 38386437 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 38386496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 3479

 38386497 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 38386556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 3539

 38386557 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 38386616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 3599

 38386617 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 38386676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 3659

 38386677 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 38386736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 3719

 38386737 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 38386796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 3779

 38386797 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 38386856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 3839

 38386857 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 38386916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 3899

 38386917 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 38386976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 3959

 38386977 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 38387036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 4019

 38387037 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 38387096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 4079

 38387097 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 38387156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 4139

 38387157 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 38387216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 4199

 38387217 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 38387276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 4259

 38387277 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 38387336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 4319

 38387337 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 38387396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 4379

 38387397 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 38387456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 4439

 38387457 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 38387516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 4499

 38387517 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 38387576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 4559

 38387577 GACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATT 38387636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 GACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATT 4619

 38387637 TGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAA 38387696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 TGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAA 4679

 38387697 ATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTT 38387756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 ATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTT 4739

 38387757 GATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGA 38387816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 GATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGA 4799

 38387817 GACGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTA 38387876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 GACGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTA 4859

 38387877 GTTTCTTTTGCCGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCT 38387936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 GTTTCTTTTGCCGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCT 4919

 38387937 TTTGTTGCCGTTGCTTTTTGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACC 38387996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 TTTGTTGCCGTTGCTTTTTGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACC 4979

 38387997 ATTGTGAAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCC 38388056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 ATTGTGAAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCC 5039

 38388057 AGCCATCCC 38388065
          |||||||||
     5040 AGCCATCCC 5048

Alignment time is 3.88591 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    6307] =>      6307 nucs 'mol-32-288a-023309_6307'

Score:        6270
Aligned:      6303        nucs
Identic:      6300 (100%) nucs =>      4844 (100%)      1456 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38381290,38386136] EXCISED REGION [38386137,38387592]
 second seq =>  [       1,    4847] EXCISED REGION [    4852,    6307]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [4848,4851]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [4848,4886] to [4852,4890]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38386136,38386136] to [38386137,38386137]
 second seq =>         1 nucs [4847,4847] to [4852,4852]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38381290 TCTCTGATGGCCAGTGATGGTGAGCATTTTTTCATGTGTTTTTTGGCTGCATAAATGTCT 38381349
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTTTTTTGGCTGCATAAATGTCT 60

 38381350 TCTTTTGAGAAGTGTCTGCACATCTCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTAAATGGAACA 38381409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTTTGAGAAGTGTCTGCACATCTCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTAAATGGAACA 120

 38381410 GAACAGAGCCCTCAGAAATAACACCGCATATCTACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTG 38381469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAACAGAGCCCTCAGAAATAACACCGCATATCTACAACTATCTGATCTTTGACAAACCTG 180

 38381470 AGAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAACGGTGCTGGGAAAACTGGA 38381529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAACGGTGCTGGGAAAACTGGA 240

 38381530 TAGCCATATGGAGAAAGCTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATT 38381589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGCCATATGGAGAAAGCTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATT 300

 38381590 CAAGATGGATTAAAGACTTAAACGTTAGACCTAAAACCATAAAAACTCTAGAAGAAAACC 38381649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAGATGGATTAAAGACTTAAACGTTAGACCTAAAACCATAAAAACTCTAGAAGAAAACC 360

 38381650 TAGGCATTACCATTCAGGGGACAGGCACGGGCAAGGACTTCATGTCTGAAACACCAAAAG 38381709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGGCATTACCATTCAGGGGACAGGCACGGGCAAGGACTTCATGTCTGAAACACCAAAAG 420

 38381710 CAATGGCAACAAAAGCCAAAATTGATGAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCA 38381769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATGGCAACAAAAGCCAAAATTGATGAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCA 480

 38381770 CAGCAAAAGAAACTACCATCAGAGTGAACAGGCAACCCACAAAATAAGAGAAAATTTTCG 38381829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGCAAAAGAAACTACCATCAGAGTGAACAGGCAACCCACAAAATAAGAGAAAATTTTCG 540

 38381830 CAACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAATTTT 38381889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAATTTT 600

 38381890 TTTAACTTTTTATCTTGAGATAAATGTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGAAGTAATACAGA 38381949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTAACTTTTTATCTTGAGATAAATGTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGAAGTAATACAGA 660

 38381950 GAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTACCTAGTTTCCCTTAATAGTAACATCTTTCCTAACTA 38382009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTACCTAGTTTCCCTTAATAGTAACATCTTTCCTAACTA 720

 38382010 TAGTACAATATCACAGCCAGGAAATTGATGTTGATACAGTCTACCAAACTTATTCAGATC 38382069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGTACAATATCACAGCCAGGAAATTGATGTTGATACAGTCTACCAAACTTATTCAGATC 780

 38382070 TCACCAGTTATACATGCAGTCATGTGTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTTTTATCACATTT 38382129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCACCAGTTATACATGCAGTCATGTGTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTTTTATCACATTT 840

 38382130 GTAGCGTTATGTGATCACCACTATAGTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTGTGGTGGCCCAT 38382189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTAGCGTTATGTGATCACCACTATAGTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTGTGGTGGCCCAT 900

 38382190 GCCTATAGTCCCACATAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAAAAGTTTGAGT 38382249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCCTATAGTCCCACATAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAAAAGTTTGAGT 960

 38382250 CCAGCCTGGGCAACATAGTGCGATCCTGTCTCTACAATAATATTAATAATAATGAAATTT 38382309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCAGCCTGGGCAACATAGTGCGATCCTGTCTCTACAATAATATTAATAATAATGAAATTT 1020

 38382310 AAAAAATACAGAACAGTCCCATTACAAGGAACTCCTTATGCACCCTTTATAGCCACAGCC 38382369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAAATACAGAACAGTCCCATTACAAGGAACTCCTTATGCACCCTTTATAGCCACAGCC 1080

 38382370 ACCTCCCTTCTGCCACCACCACCCGCCAATCCCTAGCAACCATTAATCTGGTTTCCACAA 38382429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCTCCCTTCTGCCACCACCACCCGCCAATCCCTAGCAACCATTAATCTGGTTTCCACAA 1140

 38382430 CTATGATTTTGTCATTTCAAGAATGTTATATAAAATTCATTCATTATGGACTGAATAAAA 38382489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTATGATTTTGTCATTTCAAGAATGTTATATAAAATTCATTCATTATGGACTGAATAAAA 1200

 38382490 TCATGTGGTATGTAAACTTTTGAGATTACCTTTTTTTACTCAGCATAATTCCCTGGAGAT 38382549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCATGTGGTATGTAAACTTTTGAGATTACCTTTTTTTACTCAGCATAATTCCCTGGAGAT 1260

 38382550 CCGTCTAGGTTGTTATGCATATTGATAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGAGTAGTATTTCA 38382609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCGTCTAGGTTGTTATGCATATTGATAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGAGTAGTATTTCA 1320

 38382610 TGGTATGGATATACCACAGTTAAGTGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTCCAG 38382669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGTATGGATATACCACAGTTAAGTGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTCCAG 1380

 38382670 TTTTTGAATATTATAACATCCACGTACTTTTTTTGTGTGTGAACATACATTTTCATTTCT 38382729
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1381 TTTTTGAATATTATAACATCCACGTACTTTTTTTGTGTGTGAACATATATTTTCATTTCT 1440

 38382730 CTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAATTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGTTTG 38382789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAATTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGTTTG 1500

 38382790 TAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCAGAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGCAAT 38382849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCAGAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGCAAT 1560

 38382850 GTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACATTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGCAAC 38382909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACATTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGCAAC 1620

 38382910 TTTTTTTTGTAATATGATCTGACTAGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTCACC 38382969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTTTTTGTAATATGATCTGACTAGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTCACC 1680

 38382970 AGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTTCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACACCTA 38383029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTTCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACACCTA 1740

 38383030 TGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCATCC 38383089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCATCC 1800

 38383090 TTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTTCCT 38383149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTTCCT 1860

 38383150 TTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTAAAT 38383209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTAAAT 1920

 38383210 ACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTTAGG 38383269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTTAGG 1980

 38383270 GACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAGTCA 38383329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAGTCA 2040

 38383330 CAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTCACA 38383389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTCACA 2100

 38383390 ACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGACCA 38383449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGACCA 2160

 38383450 GAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTAAGTCAGTGAAACAGA 38383509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2161 GAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTTAGTCAGTGAAACAGA 2220

 38383510 TTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCA 38383569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCA 2280

 38383570 CAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGC 38383629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGC 2340

 38383630 CCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAA 38383689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAA 2400

 38383690 TAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACCTC 38383749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACCTC 2460

 38383750 TGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCTCT 38383809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCTCT 2520

 38383810 TTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGACA 38383869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGACA 2580

 38383870 TGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGTCA 38383929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGTCA 2640

 38383930 GCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGATAT 38383989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGATAT 2700

 38383990 CCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATACAA 38384049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATACAA 2760

 38384050 ATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACACC 38384109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACACC 2820

 38384110 CACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGAAT 38384169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGAAT 2880

 38384170 GTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGCCT 38384229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGCCT 2940

 38384230 AGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAACA 38384289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAACA 3000

 38384290 CATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATACAG 38384349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATACAG 3060

 38384350 GATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAATA 38384409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAATA 3120

 38384410 ATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCATG 38384469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCATG 3180

 38384470 AAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTATTT 38384529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTATTT 3240

 38384530 TAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGTTG 38384589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGTTG 3300

 38384590 TTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGTTT 38384649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGTTT 3360

 38384650 TTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGTGT 38384709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGTGT 3420

 38384710 CTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTGAG 38384769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTGAG 3480

 38384770 AACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGTTT 38384829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGTTT 3540

 38384830 TTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCTTT 38384889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCTTT 3600

 38384890 AATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCAAT 38384949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCAAT 3660

 38384950 GTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAATG 38385009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAATG 3720

 38385010 TATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACATAC 38385069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACATAC 3780

 38385070 AATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCATCC 38385129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCATCC 3840

 38385130 AGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTAT 38385189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTAT 3900

 38385190 ATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATATT 38385249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATATT 3960

 38385250 TTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATAAT 38385309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATAAT 4020

 38385310 GACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGATCT 38385369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGATCT 4080

 38385370 ACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTACAT 38385429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTACAT 4140

 38385430 TCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTTTT 38385489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTTTT 4200

 38385490 TTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTTGA 38385549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTTGA 4260

 38385550 TTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCATT 38385609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCATT 4320

 38385610 TGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCTAC 38385669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCTAC 4380

 38385670 AAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACTAA 38385729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACTAA 4440

 38385730 CCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAGTT 38385789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAGTT 4500

 38385790 TTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAGTA 38385849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAGTA 4560

 38385850 AACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGGGA 38385909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGGGA 4620

 38385910 TGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTACAC 38385969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTACAC 4680

 38385970 AAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATGGT 38386029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATGGT 4740

 38386030 GGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAA 38386089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAA 4800

 38386090 GGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 38386136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 4847

EXCISED REGION

 38386137 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 38386196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 4911

 38386197 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 38386256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 4971

 38386257 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 38386316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4972 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 5031

 38386317 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 38386376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5032 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 5091

 38386377 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 38386436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5092 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 5151

 38386437 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 38386496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5152 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 5211

 38386497 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 38386556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5212 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 5271

 38386557 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 38386616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5272 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 5331

 38386617 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 38386676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 5391

 38386677 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 38386736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 5451

 38386737 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 38386796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5452 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 5511

 38386797 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 38386856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5512 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 5571

 38386857 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 38386916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5572 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 5631

 38386917 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 38386976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5632 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 5691

 38386977 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 38387036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5692 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 5751

 38387037 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 38387096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5752 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 5811

 38387097 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 38387156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5812 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 5871

 38387157 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 38387216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5872 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 5931

 38387217 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 38387276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5932 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 5991

 38387277 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 38387336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5992 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 6051

 38387337 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 38387396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6052 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 6111

 38387397 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 38387456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6112 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 6171

 38387457 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 38387516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6172 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 6231

 38387517 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 38387576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6232 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 6291

 38387577 GACTTTTTAATGATCG 38387592
          ||||||||||||||||
     6292 GACTTTTTAATGATCG 6307

Alignment time is 4.73486 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    6209] =>      6209 nucs 'mol-32-2e57-001535_6209'

Score:        6201
Aligned:      6201        nucs
Identic:      6201 (100%) nucs =>      1888 (100%)      4313 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38381860,38383747] EXCISED REGION [38383748,38388060]
 second seq =>  [       1,    1888] EXCISED REGION [    1897,    6209]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [1889,1896]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         9 nucs [1889,1897] to [1897,1905]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1889,1889] to [1896,1896]

 38381860 CCAGAATCTACAATGAACTCAAACAATTTTTTTAACTTTTTATCTTGAGATAAATGTAGA 38381919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGAATCTACAATGAACTCAAACAATTTTTTTAACTTTTTATCTTGAGATAAATGTAGA 60

 38381920 TTTGCATGCAGGTTTAAGAAGTAATACAGAGAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTACCTAGT 38381979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGCATGCAGGTTTAAGAAGTAATACAGAGAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTACCTAGT 120

 38381980 TTCCCTTAATAGTAACATCTTTCCTAACTATAGTACAATATCACAGCCAGGAAATTGATG 38382039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCCCTTAATAGTAACATCTTTCCTAACTATAGTACAATATCACAGCCAGGAAATTGATG 180

 38382040 TTGATACAGTCTACCAAACTTATTCAGATCTCACCAGTTATACATGCAGTCATGTGTGTG 38382099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGATACAGTCTACCAAACTTATTCAGATCTCACCAGTTATACATGCAGTCATGTGTGTG 240

 38382100 TATTTAGTTCTATGCAGTTTTATCACATTTGTAGCGTTATGTGATCACCACTATAGTCAA 38382159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATTTAGTTCTATGCAGTTTTATCACATTTGTAGCGTTATGTGATCACCACTATAGTCAA 300

 38382160 GATAGAGAATAGCTGGGTGTGGTGGCCCATGCCTATAGTCCCACATAGGAGGCTGAGGCA 38382219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATAGAGAATAGCTGGGTGTGGTGGCCCATGCCTATAGTCCCACATAGGAGGCTGAGGCA 360

 38382220 GGAGGATTGCTTGAGCCCAAAAGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATAGTGCGATCCTGTC 38382279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAGGATTGCTTGAGCCCAAAAGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATAGTGCGATCCTGTC 420

 38382280 TCTACAATAATATTAATAATAATGAAATTTAAAAAATACAGAACAGTCCCATTACAAGGA 38382339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTACAATAATATTAATAATAATGAAATTTAAAAAATACAGAACAGTCCCATTACAAGGA 480

 38382340 ACTCCTTATGCACCCTTTATAGCCACAGCCACCTCCCTTCTGCCACCACCACCCGCCAAT 38382399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTCCTTATGCACCCTTTATAGCCACAGCCACCTCCCTTCTGCCACCACCACCCGCCAAT 540

 38382400 CCCTAGCAACCATTAATCTGGTTTCCACAACTATGATTTTGTCATTTCAAGAATGTTATA 38382459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCTAGCAACCATTAATCTGGTTTCCACAACTATGATTTTGTCATTTCAAGAATGTTATA 600

 38382460 TAAAATTCATTCATTATGGACTGAATAAAATCATGTGGTATGTAAACTTTTGAGATTACC 38382519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAAATTCATTCATTATGGACTGAATAAAATCATGTGGTATGTAAACTTTTGAGATTACC 660

 38382520 TTTTTTTACTCAGCATAATTCCCTGGAGATCCGTCTAGGTTGTTATGCATATTGATAGCA 38382579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTTTTACTCAGCATAATTCCCTGGAGATCCGTCTAGGTTGTTATGCATATTGATAGCA 720

 38382580 TGTTCCTTTTTACAGCTGAGTAGTATTTCATGGTATGGATATACCACAGTTAAGTGTTCA 38382639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTTCCTTTTTACAGCTGAGTAGTATTTCATGGTATGGATATACCACAGTTAAGTGTTCA 780

 38382640 CTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTCCAGTTTTTGAATATTATAACATCCACGTACTTT 38382699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTCCAGTTTTTGAATATTATAACATCCACGTACTTT 840

 38382700 TTTTGTGTGTGAACATACATTTTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAATTGCT 38382759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTGTGTGTGAACATACATTTTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAATTGCT 900

 38382760 GTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCAGAGTA 38382819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCAGAGTA 960

 38382820 GCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACATTATC 38382879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACATTATC 1020

 38382880 ATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGCAACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACTAGATAT 38382939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGCAACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACTAGATAT 1080

 38382940 GTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTTCTAGG 38382999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTTCTAGG 1140

 38383000 CCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACACCTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTTC 38383059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACACCTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTTC 1200

 38383060 TTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCATCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTATG 38383119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCATCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTATG 1260

 38383120 TGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATATG 38383179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATATG 1320

 38383180 CAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTAAATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAAA 38383239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTAAATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAAA 1380

 38383240 AAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATATA 38383299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATATA 1440

 38383300 AAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAAG 38383359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAAG 1500

 38383360 AGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTC 38383419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTC 1560

 38383420 TCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGC 38383479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGC 1620

 38383480 CACGTAGGTAATGTAAGTCAGTGAAACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCT 38383539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACGTAGGTAATGTAAGTCAGTGAAACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCT 1680

 38383540 GGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCC 38383599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCC 1740

 38383600 TCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTA 38383659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTA 1800

 38383660 ATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGA 38383719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGA 1860

 38383720 GCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACC 38383747
          ||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACC 1888

EXCISED REGION

 38383748 TCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCT 38383807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 TCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCT 1956

 38383808 CTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGA 38383867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 CTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGA 2016

 38383868 CATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGT 38383927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 CATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGT 2076

 38383928 CAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGAT 38383987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 CAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGAT 2136

 38383988 ATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATAC 38384047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 ATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATAC 2196

 38384048 AAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACA 38384107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 AAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACA 2256

 38384108 CCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGA 38384167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 CCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGA 2316

 38384168 ATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGC 38384227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 ATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGC 2376

 38384228 CTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAA 38384287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 CTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAA 2436

 38384288 CACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATAC 38384347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 CACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATAC 2496

 38384348 AGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAA 38384407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 AGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAA 2556

 38384408 TAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCA 38384467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 TAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCA 2616

 38384468 TGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTAT 38384527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 TGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTAT 2676

 38384528 TTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGT 38384587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 TTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGT 2736

 38384588 TGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGT 38384647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 TGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGT 2796

 38384648 TTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGT 38384707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 TTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGT 2856

 38384708 GTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTG 38384767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 GTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTG 2916

 38384768 AGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGT 38384827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 AGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGT 2976

 38384828 TTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCT 38384887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCT 3036

 38384888 TTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCA 38384947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 TTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCA 3096

 38384948 ATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAA 38385007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 ATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAA 3156

 38385008 TGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACAT 38385067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 TGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACAT 3216

 38385068 ACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCAT 38385127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 ACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCAT 3276

 38385128 CCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGT 38385187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 CCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGT 3336

 38385188 ATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATA 38385247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 ATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATA 3396

 38385248 TTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATA 38385307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 TTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATA 3456

 38385308 ATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGAT 38385367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 ATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGAT 3516

 38385368 CTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTAC 38385427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 CTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTAC 3576

 38385428 ATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTT 38385487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 ATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTT 3636

 38385488 TTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTT 38385547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 TTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTT 3696

 38385548 GATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCA 38385607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 GATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCA 3756

 38385608 TTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCT 38385667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 TTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCT 3816

 38385668 ACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACT 38385727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 ACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACT 3876

 38385728 AACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAG 38385787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 AACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAG 3936

 38385788 TTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAG 38385847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 TTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAG 3996

 38385848 TAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGG 38385907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 TAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGG 4056

 38385908 GATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTAC 38385967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 GATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTAC 4116

 38385968 ACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATG 38386027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 ACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATG 4176

 38386028 GTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCA 38386087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 GTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCA 4236

 38386088 AAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAA 38386147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 AAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAA 4296

 38386148 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGT 38386207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGT 4356

 38386208 CCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCA 38386267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 CCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCA 4416

 38386268 GTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTAC 38386327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 GTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTAC 4476

 38386328 AAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGC 38386387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 AAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGC 4536

 38386388 CTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGT 38386447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 CTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGT 4596

 38386448 TGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTG 38386507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 TGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTG 4656

 38386508 CACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTG 38386567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 CACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTG 4716

 38386568 GAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCT 38386627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 GAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCT 4776

 38386628 TCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTG 38386687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 TCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTG 4836

 38386688 GGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCC 38386747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 GGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCC 4896

 38386748 TTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAA 38386807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 TTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAA 4956

 38386808 TGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATG 38386867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 TGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATG 5016

 38386868 ACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGA 38386927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 ACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGA 5076

 38386928 TAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGT 38386987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 TAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGT 5136

 38386988 AACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAA 38387047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 AACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAA 5196

 38387048 ATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCAC 38387107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 ATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCAC 5256

 38387108 TATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTAC 38387167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5257 TATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTAC 5316

 38387168 TTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTT 38387227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 TTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTT 5376

 38387228 ACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTG 38387287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5377 ACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTG 5436

 38387288 TTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCC 38387347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 TTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCC 5496

 38387348 TAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAA 38387407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 TAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAA 5556

 38387408 CTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCC 38387467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5557 CTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCC 5616

 38387468 TCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAGCCCCAACAGTG 38387527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5617 TCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAGCCCCAACAGTG 5676

 38387528 TGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAAT 38387587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5677 TGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAAT 5736

 38387588 GATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCT 38387647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5737 GATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCT 5796

 38387648 GATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTATTCTTT 38387707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5797 GATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTATTCTTT 5856

 38387708 TGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGATTTTTTCTT 38387767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5857 TGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGATTTTTTCTT 5916

 38387768 GTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGAGACGGGTAGAT 38387827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5917 GTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGAGACGGGTAGAT 5976

 38387828 TGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGC 38387887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5977 TGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGC 6036

 38387888 CGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCTTTTGTTGCCGT 38387947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6037 CGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCTTTTGTTGCCGT 6096

 38387948 TGCTTTTTGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGAAAGA 38388007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6097 TGCTTTTTGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGAAAGA 6156

 38388008 CAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCCAGCC 38388060
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6157 CAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCCAGCC 6209

Alignment time is 4.69716 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2102] =>      2102 nucs 'mol-32-30f6-000292_2102'

Score:        2101
Aligned:      2101        nucs
Identic:      2101 (100%) nucs =>       615 (100%)      1486 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38385422,38386036] EXCISED REGION [38386038,38387523]
 second seq =>  [       1,     615] EXCISED REGION [     617,    2102]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [38386037,38386037]
 second seq =>         1 nucs [616,616]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38386037,38386037] to [38386038,38386038]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38385422 GTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATC 38385481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATC 60

 38385482 TATTTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGT 38385541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGT 120

 38385542 GATTTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGT 38385601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATTTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGT 180

 38385602 TGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCA 38385661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCA 240

 38385662 AAATCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTA 38385721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTA 300

 38385722 TATACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCA 38385781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCA 360

 38385782 GAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAA 38385841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAA 420

 38385842 AATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACT 38385901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACT 480

 38385902 AATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAG 38385961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAG 540

 38385962 CCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTG 38386021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTG 600

 38386022 GGCATGGTGGCTTGT 38386036
          |||||||||||||||
      601 GGCATGGTGGCTTGT 615

EXCISED REGION

 38386038 ACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCA 38386097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      617 ACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCA 676

 38386098 AGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAATAAATAAATA 38386157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      677 AGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAATAAATAAATA 736

 38386158 AATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGTCCTAGCTACT 38386217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      737 AATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGTCCTAGCTACT 796

 38386218 AGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCAGTGAGTCATG 38386277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      797 AGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCAGTGAGTCATG 856

 38386278 TTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTACAAAAAAAGGA 38386337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      857 TTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTACAAAAAAAGGA 916

 38386338 TTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGCCTCTGTGGGT 38386397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      917 TTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGCCTCTGTGGGT 976

 38386398 GGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGTTGGGTGGTTA 38386457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      977 GGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGTTGGGTGGTTA 1036

 38386458 CATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTGCACATTTTAC 38386517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 CATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTGCACATTTTAC 1096

 38386518 TATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTGGAAAAAAAAA 38386577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1097 TATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTGGAAAAAAAAA 1156

 38386578 AGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCTTCACACAGGG 38386637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 AGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCTTCACACAGGG 1216

 38386638 AAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTGGGCTAGTTCC 38386697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1217 AAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTGGGCTAGTTCC 1276

 38386698 CACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCCTTCTTTCCCC 38386757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 CACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCCTTCTTTCCCC 1336

 38386758 AGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAATGACTTTGGA 38386817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 AGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAATGACTTTGGA 1396

 38386818 GTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATGACTTTGAGGA 38386877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 GTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATGACTTTGAGGA 1456

 38386878 AATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGATAATACCTTC 38386937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 AATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGATAATACCTTC 1516

 38386938 TTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGTAACACCCATA 38386997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 TTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGTAACACCCATA 1576

 38386998 TGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAAATGTCTGAAC 38387057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 TGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAAATGTCTGAAC 1636

 38387058 ATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCACTATTCTAAGA 38387117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 ATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCACTATTCTAAGA 1696

 38387118 CTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTACTTTTAGAAAA 38387177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 CTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTACTTTTAGAAAA 1756

 38387178 ATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTTACTTGACATA 38387237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 ATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTTACTTGACATA 1816

 38387238 GATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTGTTTGCAAGTA 38387297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 GATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTGTTTGCAAGTA 1876

 38387298 ATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCCTAGGCTTACA 38387357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 ATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCCTAGGCTTACA 1936

 38387358 GAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAACTTAAAGTAG 38387417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 GAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAACTTAAAGTAG 1996

 38387418 GAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCCTCAAGATCCA 38387477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 GAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCCTCAAGATCCA 2056

 38387478 AAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAGCCCCAAC 38387523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 AAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAGCCCCAAC 2102

Alignment time is 1.58062 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2225] =>      2225 nucs 'mol-32-3101-106101_2225'

Score:        2225
Aligned:      2225        nucs
Identic:      2225 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38385267,38387491]
 second seq =>  [       1,    2225]

 38385267 TGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGG 38385326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGG 60

 38385327 GTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAG 38385386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAG 120

 38385387 GAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAA 38385446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAA 180

 38385447 AAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTTGATTATG 38385506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTTGATTATG 240

 38385507 GCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTTGATTTACATTTCCCTGATA 38385566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTTGATTTACATTTCCCTGATA 300

 38385567 ATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTT 38385626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTT 360

 38385627 CACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCTACAAAGAACTCAAATAAAT 38385686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCTACAAAGAACTCAAATAAAT 420

 38385687 CAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAATGCATGT 38385746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAATGCATGT 480

 38385747 ATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGT 38385806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGT 540

 38385807 TAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGG 38385866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGG 600

 38385867 TATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATGG 38385926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATGG 660

 38385927 ATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTGT 38385986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTGT 720

 38385987 ATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATT 38386046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATT 780

 38386047 CCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCA 38386106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCA 840

 38386107 TGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA 38386166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA 900

 38386167 ATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCT 38386226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCT 960

 38386227 GAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCA 38386286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCA 1020

 38386287 CTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTT 38386346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTT 1080

 38386347 CAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACT 38386406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACT 1140

 38386407 GACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTA 38386466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTA 1200

 38386467 TATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAA 38386526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAA 1260

 38386527 ATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGG 38386586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGG 1320

 38386587 ACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGT 38386646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGT 1380

 38386647 CAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAA 38386706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAA 1440

 38386707 ATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTC 38386766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTC 1500

 38386767 CTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAA 38386826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAA 1560

 38386827 CATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTAC 38386886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTAC 1620

 38386887 TGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTA 38386946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTA 1680

 38386947 TCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCA 38387006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCA 1740

 38387007 ATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTT 38387066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTT 1800

 38387067 TCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGA 38387126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGA 1860

 38387127 AGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTT 38387186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTT 1920

 38387187 CCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGG 38387246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGG 1980

 38387247 GAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATG 38387306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATG 2040

 38387307 ATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAG 38387366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAG 2100

 38387367 GTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACC 38387426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACC 2160

 38387427 AATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGG 38387486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGG 2220

 38387487 GAAAG 38387491
          |||||
     2221 GAAAG 2225

Alignment time is 1.4886 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    7477] =>      7477 nucs 'mol-32-321f-283001_7477'

Score:        7429
Aligned:      7473        nucs
Identic:      7469 (100%) nucs =>      4228 (100%)      3241 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38381907,38386136] EXCISED REGION [38386137,38389378]
 second seq =>  [       1,    4230] EXCISED REGION [    4235,    7477]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [4231,4234]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [4231,4269] to [4235,4273]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38386136,38386136] to [38386137,38386137]
 second seq =>         1 nucs [4230,4230] to [4235,4235]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38381907 AGATAAATGTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGAAGTAATACAGAGAGGAAGATCCCGTTTA 38381966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATAAATGTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGAAGTAATACAGAGAGGAAGATCCCGTTTA 60

 38381967 CTGTTTACCTAGTTTCCCTTAATAGTAACATCTTTCCTAACTATAGTACAATATCACAGC 38382026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGTTTACCTAGTTTCCCTTAATAGTAACATCTTTCCTAACTATAGTACAATATCACAGC 120

 38382027 CAGGAAATTGATGTTGATACAGTCTACCAAACTTATTCAGATCTCACCAGTTATACATGC 38382086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGGAAATTGATGTTGATACAGTCTACCAAACTTATTCAGATCTCACCAGTTATACATGC 180

 38382087 AGTCATGTGTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTTTTATCACATTTGTAGCGTTATGTGATCA 38382146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTCATGTGTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTTTTATCACATTTGTAGCGTTATGTGATCA 240

 38382147 CCACTATAGTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTGTGGTGGCCCATGCCTATAGTCCCACATA 38382206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCACTATAGTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTGTGGTGGCCCATGCCTATAGTCCCACATA 300

 38382207 GGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAAAAGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATA 38382266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAAAAGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATA 360

 38382267 GTGCGATCCTGTCTCTACAATAATATTAATAATAATGAAATTTAAAAAATACAGAACAGT 38382326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGCGATCCTGTCTCTACAATAATATTAATAATAATGAAATTTAAAAAATACAGAACAGT 420

 38382327 CCCATTACAAGGAACTCCTTATGCACCCTTTATAGCCACAGCCACCTCCCTTCTGCCACC 38382386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCATTACAAGGAACTCCTTATGCACCCTTTATAGCCACAGCCACCTCCCTTCTGCCACC 480

 38382387 ACCACCCGCCAATCCCTAGCAACCATTAATCTGGTTTCCACAACTATGATTTTGTCATTT 38382446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCACCCGCCAATCCCTAGCAACCATTAATCTGGTTTCCACAACTATGATTTTGTCATTT 540

 38382447 CAAGAATGTTATATAAAATTCATTCATTATGGACTGAATAAAATCATGTGGTATGTAAAC 38382506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAGAATGTTATATAAAATTCATTCATTATGGACTGAATAAAATCATGTGGTATGTAAAC 600

 38382507 TTTTGAGATTACCTTTTTTTACTCAGCATAATTCCCTGGAGATCCGTCTAGGTTGTTATG 38382566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTGAGATTACCTTTTTTTACTCAGCATAATTCCCTGGAGATCCGTCTAGGTTGTTATG 660

 38382567 CATATTGATAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGAGTAGTATTTCATGGTATGGATATACCAC 38382626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATATTGATAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGAGTAGTATTTCATGGTATGGATATACCAC 720

 38382627 AGTTAAGTGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTCCAGTTTTTGAATATTATAAC 38382686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTTAAGTGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTCCAGTTTTTGAATATTATAAC 780

 38382687 ATCCACGTACTTTTTTTGTGTGTGAACATACATTTTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCAA 38382746
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCCACGTACTTTTTTTGTGTGTGAACATATATTTTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCAA 840

 38382747 GAGTGAAATTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGTT 38382806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGTGAAATTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGTT 900

 38382807 CTTTTTCAGAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGTG 38382866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTTTTCAGAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGTG 960

 38382867 TCTCTACATTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGCAACTTTTTTTTGTAATATGA 38382926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTCTACATTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGCAACTTTTTTTTGTAATATGA 1020

 38382927 TCTGACTAGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCTT 38382986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTGACTAGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCTT 1080

 38382987 CAGAGCTTCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACACCTATGTCAAATGGTGAGGGG 38383046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGAGCTTCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACACCTATGTCAAATGGTGAGGGG 1140

 38383047 ATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCATCCTTCATGAGATGGAGAAG 38383106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCATCCTTCATGAGATGGAGAAG 1200

 38383107 AAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACT 38383166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACT 1260

 38383167 CCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTAAATACATTTTCTGCAAGATA 38383226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTAAATACATTTTCTGCAAGATA 1320

 38383227 TTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAA 38383286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAA 1380

 38383287 GGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACAT 38383346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACAT 1440

 38383347 TCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTCACAACACTCATAGGGAAATA 38383406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTCACAACACTCATAGGGAAATA 1500

 38383407 ATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCA 38383466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCA 1560

 38383467 TGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTAAGTCAGTGAAACAGATTGGGAATAAGACAATA 38383526
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTTAGTCAGTGAAACAGATTGGGAATAAGACAATA 1620

 38383527 GGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTA 38383586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTA 1680

 38383587 CTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTT 38383646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTT 1740

 38383647 ATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCT 38383706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCT 1800

 38383707 TCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACCTCTGGCCTTGAAGAGTAGG 38383766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACCTCTGGCCTTGAAGAGTAGG 1860

 38383767 CAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCTCTTTCAGCCTAGCTTTGGG 38383826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCTCTTTCAGCCTAGCTTTGGG 1920

 38383827 TAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGACATGCACTTAGAATGAAGA 38383886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGACATGCACTTAGAATGAAGA 1980

 38383887 TTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGTCAGCCAACAATAGTAAAAA 38383946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGTCAGCCAACAATAGTAAAAA 2040

 38383947 TATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGATATCCAAATTGCCAATAAAT 38384006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGATATCCAAATTGCCAATAAAT 2100

 38384007 ATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATACAAATTAAAACCACAGTGAG 38384066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATACAAATTAAAACCACAGTGAG 2160

 38384067 ATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACACCCACTCAAGTGTGGGTGA 38384126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACACCCACTCAAGTGTGGGTGA 2220

 38384127 AGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGAATGTAAACTTGTACATCCT 38384186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGAATGTAAACTTGTACATCCT 2280

 38384187 TGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGCCTAGCAATTTCTTTTTTTC 38384246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGCCTAGCAATTTCTTTTTTTC 2340

 38384247 AGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAACACATTAAGTTGAACTTAC 38384306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAACACATTAAGTTGAACTTAC 2400

 38384307 AGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATACAGGATATTTCTATAGGAAA 38384366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATACAGGATATTTCTATAGGAAA 2460

 38384367 CAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAATAATTAATGCTTAGGATTC 38384426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAATAATTAATGCTTAGGATTC 2520

 38384427 AACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCATGAAATATTCCATATTTTC 38384486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCATGAAATATTCCATATTTTC 2580

 38384487 CTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTATTTTAGGTTTAGGGGTACAT 38384546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTATTTTAGGTTTAGGGGTACAT 2640

 38384547 GTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGTTGTTGTACAGATTTTGTCA 38384606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGTTGTTGTACAGATTTTGTCA 2700

 38384607 CCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTCTC 38384666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTCTC 2760

 38384667 CTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGTGTCTGTTATTCTCCTCTAT 38384726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGTGTCTGTTATTCTCCTCTAT 2820

 38384727 GTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTGAGAACATGTGGTACTTGGT 38384786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTGAGAACATGTGGTACTTGGT 2880

 38384787 TTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGTTTTTTTATTTCAATAGGCT 38384846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGTTTTTTTATTTCAATAGGCT 2940

 38384847 TTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCTTTAATGGTGATTTCTGAGA 38384906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCTTTAATGGTGATTTCTGAGA 3000

 38384907 TTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCAATGTGTAGTATTTTATCCC 38384966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCAATGTGTAGTATTTTATCCC 3060

 38384967 TCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAATGTATCATTCTTATGCCTT 38385026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAATGTATCATTCTTATGCCTT 3120

 38385027 TGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACATACAATGCTTGGTTTTCCAT 38385086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACATACAATGCTTGGTTTTCCAT 3180

 38385087 TCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCC 38385146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCC 3240

 38385147 ATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATATACACCACATTTTCTT 38385206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATATACACCACATTTTCTT 3300

 38385207 TATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATATTTTTGCAATTACAAATTG 38385266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATATTTTTGCAATTACAAATTG 3360

 38385267 TGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGG 38385326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGG 3420

 38385327 GTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAG 38385386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAG 3480

 38385387 GAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAA 38385446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAA 3540

 38385447 AAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTTGATTATG 38385506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTTGATTATG 3600

 38385507 GCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTTGATTTACATTTCCCTGATA 38385566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTTGATTTACATTTCCCTGATA 3660

 38385567 ATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTT 38385626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTT 3720

 38385627 CACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCTACAAAGAACTCAAATAAAT 38385686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCTACAAAGAACTCAAATAAAT 3780

 38385687 CAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAATGCATGT 38385746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAATGCATGT 3840

 38385747 ATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGT 38385806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGT 3900

 38385807 TAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGG 38385866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGG 3960

 38385867 TATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATGG 38385926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATGG 4020

 38385927 ATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTGT 38385986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTGT 4080

 38385987 ATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATT 38386046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATT 4140

 38386047 CCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCA 38386106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCA 4200

 38386107 TGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 38386136
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 4230

EXCISED REGION

 38386137 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 38386196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 4294

 38386197 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 38386256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 4354

 38386257 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 38386316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 4414

 38386317 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 38386376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 4474

 38386377 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 38386436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 4534

 38386437 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 38386496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 4594

 38386497 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 38386556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 4654

 38386557 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 38386616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 4714

 38386617 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 38386676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 4774

 38386677 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 38386736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 4834

 38386737 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 38386796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4835 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 4894

 38386797 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 38386856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4895 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 4954

 38386857 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 38386916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4955 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 5014

 38386917 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 38386976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5015 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 5074

 38386977 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 38387036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5075 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 5134

 38387037 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 38387096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5135 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 5194

 38387097 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 38387156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5195 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 5254

 38387157 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 38387216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5255 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 5314

 38387217 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 38387276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5315 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 5374

 38387277 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 38387336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5375 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 5434

 38387337 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 38387396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5435 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 5494

 38387397 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 38387456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5495 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 5554

 38387457 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 38387516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5555 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 5614

 38387517 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 38387576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5615 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 5674

 38387577 GACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATT 38387636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5675 GACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATT 5734

 38387637 TGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAA 38387696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5735 TGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAA 5794

 38387697 ATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTT 38387756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5795 ATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTT 5854

 38387757 GATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGA 38387816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5855 GATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGA 5914

 38387817 GACGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTA 38387876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5915 GACGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTA 5974

 38387877 GTTTCTTTTGCCGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCT 38387936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5975 GTTTCTTTTGCCGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCT 6034

 38387937 TTTGTTGCCGTTGCTTTTTGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACC 38387996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6035 TTTGTTGCCGTTGCTTTTTGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACC 6094

 38387997 ATTGTGAAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCC 38388056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6095 ATTGTGAAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCC 6154

 38388057 AGCCATCCCATTACTGGGTATTTACCCAAAGGATTATAAATCATGCTGCTATAAAGACAC 38388116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6155 AGCCATCCCATTACTGGGTATTTACCCAAAGGATTATAAATCATGCTGCTATAAAGACAC 6214

 38388117 ATGCACACGTATGTTTATTGTGGCACTATTCACAATAGCAAACACTTGGAACCAACCCAA 38388176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6215 ATGCACACGTATGTTTATTGTGGCACTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAA 6274

 38388177 ATGTCCATCAATGATAGACTGGATTAAG-AAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTA 38388235
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     6275 ATGTCCATCAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTA 6334

 38388236 TGCAGCCATAAAAAAGGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAGCTGGAAAC 38388295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6335 TGCAGCCATAAAAAAGGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAGCTGGAAAC 6394

 38388296 TATCATTCTGAGCAAACTATCGCTAGGACAGAAAACCAAACACTACATGTTCTCACTCAT 38388355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6395 TATCATTCTGAGCAAACTATCGCTAGGACAGAAAACCAAACACTACATGTTCTCACTCAT 6454

 38388356 AGGTGGGAATTGAAGAATGAGAACACCTGGACACAGGATGGGGAACGTCACACACCAGGG 38388415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6455 AGGTGGGAATTGAAGAATGAGAACACCTGGACACAGGATGGGGAACGTCACACACCAGGG 6514

 38388416 CCTGTTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTAAAT 38388475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6515 CCTGTTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTAAAT 6574

 38388476 GATGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACAGGTATACATATGTAACAAACCTGC 38388535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6575 GATGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACAGGTATACATATGTAACAAACCTGC 6634

 38388536 ACATTGTGCACATGTACCCTAGAACTTAAAGTACAATAATAAAAAAAAAGAGTTTTTATT 38388595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6635 ACATTGTGCACATGTACCCTAGAACTTAAAGTACAATAATAAAAAAAAAGAGTTTTTATT 6694

 38388596 ATTAAAATTGTATGCTCTCACAGGGCAGAAACTATAGCTATTCTTCATTTAAAAAAAAAA 38388655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6695 ATTAAAATTGTATGCTCTCACAGGGCAGAAACTATAGCTATTCTTCATTTAAAAAAAAAA 6754

 38388656 AGAGTATCAGATTTGTGGAGCTCAGACCAACTTCTCTTTCCTGGCTCTCAAACTAGGCAA 38388715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6755 AGAGTATCAGATTTGTGGAGCTCAGACCAACTTCTCTTTCCTGGCTCTCAAACTAGGCAA 6814

 38388716 GGCTAGGAAAGACTGGATGTCTTCGGCTTCCAAAGGGTGGGGCAGGAACCTGGAATTACC 38388775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6815 GGCTAGGAAAGACTGGATGTCTTCGGCTTCCAAAGGGTGGGGCAGGAACCTGGAATTACC 6874

 38388776 TTACACCAAGACTACCCTAATCAGGGAGAGATATTCGCCAAAAGAAAATTGGGGTGCCCT 38388835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6875 TTACACCAAGACTACCCTAATCAGGGAGAGATATTCGCCAAAAGAAAATTGGGGTGCCCT 6934

 38388836 GGGAAGTGGCAGTGGATACTGGGCAGCTGGAAAGTAACAAATATCTACAGGAACACAGGG 38388895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6935 GGGAAGTGGCAGTGGATACTGGGCAGCTGGAAAGTAACAAATATCTACAGGAACACAGGG 6994

 38388896 CACAGTAGTGGAGGGCCAGAAAATACCATTTCCCCCTTCTTAGTGGGTTCTTAAGAGACC 38388955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6995 CACAGTAGTGGAGGGCCAGAAAATACCATTTCCCCCTTCTTAGTGGGTTCTTAAGAGACC 7054

 38388956 TTGTATTTGGAGCTCAACAGCTTTTTGGTGATCCTATTATTAAATTAATCTCAACAACAG 38389015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7055 TTGTATTTGGAGCTCAACAGCTTTTTGGTGATCCTATTATTAAATTAATCTCAACAACAG 7114

 38389016 CTCTGAGCAGTAGAGAGGGACTATCAATTTATTTCCTTATTAGTGACCTGTTCTGTCTCA 38389075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7115 CTCTGAGCAGTAGAGAGGGACTATCAATTTATTTCCTTATTAGTGACCTGTTCTGTCTCA 7174

 38389076 TTGTATTTATTTCTTAACAGTTCAATTGCTTTCTGTGGAGGTTAGCAGGAAGCCCAGAGC 38389135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7175 TTGTATTTATTTCTTAACAGTTCAATTGCTTTCTGTGGAGGTTAGCAGGAAGCCCAGAGC 7234

 38389136 AAATATTTAAGAGCATCATTTGTTATATGTTACATATATTATATATTATATATACTATAT 38389195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7235 AAATATTTAAGAGCATCATTTGTTATATGTTACATATATTATATATTATATATACTATAT 7294

 38389196 TTTTACACATATAAAAGTTAAAAGATTAGGGTGACTTCTTGCACAAATCTTAGTAAAACA 38389255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7295 TTTTACACATATAAAAGTTAAAAGATTAGGGTGACTTCTTGCACAAATCTTAGTAAAACA 7354

 38389256 ACTGTACTAGCTAGTAAGTTATATGCAGTAGTCATTAAAATGTTGAAATATAGGGAAATG 38389315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7355 ACTGTACTAGCTAGTAAGTTATATGCAGTAGTCATTAAAATGTTGAAATATAGGGAAATG 7414

 38389316 TAAATTTTAGCTCATTTAAATATTTCCAGAAAAAATATTTTATTTTCATAGAAATGTTAC 38389375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7415 TAAATTTTAGCTCATTTAAATATTTCCAGAAAAAATATTTTATTTTCATAGAAATGTTAC 7474

 38389376 TTT 38389378
          |||
     7475 TTT 7477

Alignment time is 5.58524 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2357] =>      2357 nucs 'mol-32-322a-072928_2357'

Score:        2342
Aligned:      2353        nucs
Identic:      2352 (100%) nucs =>       965 (100%)      1387 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38385171,38386136] EXCISED REGION [38386137,38387523]
 second seq =>  [       1,     966] EXCISED REGION [     971,    2357]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [967,970]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [967,1005] to [971,1009]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38386136,38386136] to [38386137,38386137]
 second seq =>         1 nucs [966,966] to [971,971]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38385171 GAGTAGTATTCCATGGTATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCA 38385230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTAGTATTCCATGGTATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCA 60

 38385231 TTTGGGCTGGTTCCATATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCA 38385290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGGGCTGGTTCCATATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCA 120

 38385291 AGTATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGC 38385350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGC 180

 38385351 TTGATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGT 38385410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGT 240

 38385411 AGGTTATACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCC 38385470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGTTATACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCC 300

 38385471 ATGCCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGG 38385530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGCCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGG 360

 38385531 CATCGCATTGTGATTTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTT 38385590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATCGCATTGTGATTTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTT 420

 38385591 CATATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGG 38385650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGG 480

 38385651 ACTAATATCCAAAATCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAA 38385710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTAATATCCAAAATCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAA 540

 38385711 ACTTCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGAC 38385770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTTCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGAC 600

 38385771 AAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCC 38385830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCC 660

 38385831 ATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAA 38385890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAA 720

 38385891 TAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTG 38385950
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      721 TAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCCCAAAAACATTAGGTTG 780

 38385951 GGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCA 38386010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCA 840

 38386011 AAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCT 38386070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCT 900

 38386071 GGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTC 38386130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTC 960

 38386131 TCTACA 38386136
          ||||||
      961 TCTACA 966

EXCISED REGION

 38386137 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 38386196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 1030

 38386197 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 38386256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 1090

 38386257 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 38386316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 1150

 38386317 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 38386376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 1210

 38386377 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 38386436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 1270

 38386437 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 38386496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 1330

 38386497 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 38386556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 1390

 38386557 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 38386616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 1450

 38386617 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 38386676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 1510

 38386677 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 38386736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 1570

 38386737 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 38386796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 1630

 38386797 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 38386856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 1690

 38386857 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 38386916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 1750

 38386917 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 38386976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 1810

 38386977 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 38387036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 1870

 38387037 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 38387096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 1930

 38387097 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 38387156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 1990

 38387157 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 38387216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 2050

 38387217 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 38387276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 2110

 38387277 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 38387336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 2170

 38387337 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 38387396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 2230

 38387397 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 38387456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 2290

 38387457 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 38387516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 2350

 38387517 CCCCAAC 38387523
          |||||||
     2351 CCCCAAC 2357

Alignment time is 1.80257 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4975] =>      4975 nucs 'mol-32-3240-208572_4975'

Score:        4967
Aligned:      4967        nucs
Identic:      4967 (100%) nucs =>      1122 (100%)      3845 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38382626,38383747] EXCISED REGION [38383748,38387592]
 second seq =>  [       1,    1122] EXCISED REGION [    1131,    4975]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [1123,1130]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         9 nucs [1123,1131] to [1131,1139]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1123,1123] to [1130,1130]

 38382626 CAGTTAAGTGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTCCAGTTTTTGAATATTATAA 38382685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGTTAAGTGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTCCAGTTTTTGAATATTATAA 60

 38382686 CATCCACGTACTTTTTTTGTGTGTGAACATACATTTTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCA 38382745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATCCACGTACTTTTTTTGTGTGTGAACATACATTTTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCA 120

 38382746 AGAGTGAAATTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGT 38382805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGTGAAATTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGT 180

 38382806 TCTTTTTCAGAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGT 38382865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTTTTCAGAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGT 240

 38382866 GTCTCTACATTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGCAACTTTTTTTTGTAATATG 38382925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCTCTACATTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGCAACTTTTTTTTGTAATATG 300

 38382926 ATCTGACTAGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCT 38382985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCTGACTAGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCT 360

 38382986 TCAGAGCTTCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACACCTATGTCAAATGGTGAGGG 38383045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAGAGCTTCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACACCTATGTCAAATGGTGAGGG 420

 38383046 GATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCATCCTTCATGAGATGGAGAA 38383105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCATCCTTCATGAGATGGAGAA 480

 38383106 GAAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTAC 38383165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTAC 540

 38383166 TCCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTAAATACATTTTCTGCAAGAT 38383225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTAAATACATTTTCTGCAAGAT 600

 38383226 ATTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATA 38383285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATA 660

 38383286 AGGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACA 38383345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACA 720

 38383346 TTCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTCACAACACTCATAGGGAAAT 38383405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTCACAACACTCATAGGGAAAT 780

 38383406 AATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCC 38383465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCC 840

 38383466 ATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTAAGTCAGTGAAACAGATTGGGAATAAGACAAT 38383525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTAAGTCAGTGAAACAGATTGGGAATAAGACAAT 900

 38383526 AGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCT 38383585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCT 960

 38383586 ACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATT 38383645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATT 1020

 38383646 TATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGC 38383705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGC 1080

 38383706 TTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACC 38383747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACC 1122

EXCISED REGION

 38383748 TCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCT 38383807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 TCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCT 1190

 38383808 CTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGA 38383867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 CTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGA 1250

 38383868 CATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGT 38383927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 CATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGT 1310

 38383928 CAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGAT 38383987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 CAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGAT 1370

 38383988 ATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATAC 38384047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 ATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATAC 1430

 38384048 AAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACA 38384107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 AAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACA 1490

 38384108 CCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGA 38384167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 CCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGA 1550

 38384168 ATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGC 38384227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 ATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGC 1610

 38384228 CTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAA 38384287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 CTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAA 1670

 38384288 CACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATAC 38384347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 CACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATAC 1730

 38384348 AGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAA 38384407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 AGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAA 1790

 38384408 TAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCA 38384467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 TAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCA 1850

 38384468 TGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTAT 38384527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 TGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTAT 1910

 38384528 TTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGT 38384587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 TTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGT 1970

 38384588 TGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGT 38384647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 TGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGT 2030

 38384648 TTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGT 38384707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 TTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGT 2090

 38384708 GTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTG 38384767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 GTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTG 2150

 38384768 AGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGT 38384827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 AGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGT 2210

 38384828 TTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCT 38384887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 TTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCT 2270

 38384888 TTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCA 38384947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 TTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCA 2330

 38384948 ATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAA 38385007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 ATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAA 2390

 38385008 TGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACAT 38385067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 TGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACAT 2450

 38385068 ACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCAT 38385127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 ACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCAT 2510

 38385128 CCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGT 38385187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 CCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGT 2570

 38385188 ATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATA 38385247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 ATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATA 2630

 38385248 TTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATA 38385307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 TTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATA 2690

 38385308 ATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGAT 38385367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 ATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGAT 2750

 38385368 CTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTAC 38385427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 CTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTAC 2810

 38385428 ATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTT 38385487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 ATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTT 2870

 38385488 TTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTT 38385547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 TTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTT 2930

 38385548 GATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCA 38385607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 GATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCA 2990

 38385608 TTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCT 38385667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 TTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCT 3050

 38385668 ACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACT 38385727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 ACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACT 3110

 38385728 AACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAG 38385787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 AACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAG 3170

 38385788 TTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAG 38385847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 TTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAG 3230

 38385848 TAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGG 38385907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 TAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGG 3290

 38385908 GATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTAC 38385967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 GATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTAC 3350

 38385968 ACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATG 38386027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 ACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATG 3410

 38386028 GTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCA 38386087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 GTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCA 3470

 38386088 AAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAA 38386147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 AAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAA 3530

 38386148 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGT 38386207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGT 3590

 38386208 CCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCA 38386267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 CCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCA 3650

 38386268 GTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTAC 38386327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 GTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTAC 3710

 38386328 AAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGC 38386387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 AAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGC 3770

 38386388 CTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGT 38386447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 CTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGT 3830

 38386448 TGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTG 38386507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 TGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTG 3890

 38386508 CACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTG 38386567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 CACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTG 3950

 38386568 GAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCT 38386627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 GAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCT 4010

 38386628 TCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTG 38386687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 TCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTG 4070

 38386688 GGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCC 38386747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 GGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCC 4130

 38386748 TTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAA 38386807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 TTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAA 4190

 38386808 TGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATG 38386867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 TGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATG 4250

 38386868 ACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGA 38386927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 ACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGA 4310

 38386928 TAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGT 38386987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 TAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGT 4370

 38386988 AACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAA 38387047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 AACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAA 4430

 38387048 ATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCAC 38387107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 ATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCAC 4490

 38387108 TATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTAC 38387167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 TATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTAC 4550

 38387168 TTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTT 38387227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 TTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTT 4610

 38387228 ACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTG 38387287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 ACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTG 4670

 38387288 TTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCC 38387347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 TTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCC 4730

 38387348 TAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAA 38387407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 TAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAA 4790

 38387408 CTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCC 38387467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 CTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCC 4850

 38387468 TCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAGCCCCAACAGTG 38387527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 TCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAGCCCCAACAGTG 4910

 38387528 TGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAAT 38387587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 TGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAAT 4970

 38387588 GATCG 38387592
          |||||
     4971 GATCG 4975

Alignment time is 3.75893 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4147] =>      4147 nucs 'mol-32-331c-086379_4147'

Score:        4139
Aligned:      4139        nucs
Identic:      4139 (100%) nucs =>       219 (100%)      3920 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38383529,38383747] EXCISED REGION [38383748,38387667]
 second seq =>  [       1,     219] EXCISED REGION [     228,    4147]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [220,227]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         9 nucs [220,228] to [228,236]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [220,220] to [227,227]

 38383529 GAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACT 38383588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACT 60

 38383589 ACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTAT 38383648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTAT 120

 38383649 TTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTC 38383708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTC 180

 38383709 TGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACC 38383747
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACC 219

EXCISED REGION

 38383748 TCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCT 38383807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      228 TCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCT 287

 38383808 CTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGA 38383867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      288 CTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGA 347

 38383868 CATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGT 38383927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      348 CATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGT 407

 38383928 CAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGAT 38383987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      408 CAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGAT 467

 38383988 ATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATAC 38384047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      468 ATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATAC 527

 38384048 AAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACA 38384107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      528 AAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACA 587

 38384108 CCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGA 38384167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      588 CCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGA 647

 38384168 ATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGC 38384227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      648 ATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGC 707

 38384228 CTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAA 38384287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      708 CTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAA 767

 38384288 CACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATAC 38384347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      768 CACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATAC 827

 38384348 AGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAA 38384407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      828 AGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAA 887

 38384408 TAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCA 38384467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      888 TAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCA 947

 38384468 TGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTAT 38384527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      948 TGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTAT 1007

 38384528 TTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGT 38384587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1008 TTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGT 1067

 38384588 TGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGT 38384647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1068 TGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGT 1127

 38384648 TTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGT 38384707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1128 TTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGT 1187

 38384708 GTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTG 38384767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 GTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTG 1247

 38384768 AGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGT 38384827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 AGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGT 1307

 38384828 TTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCT 38384887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 TTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCT 1367

 38384888 TTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCA 38384947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 TTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCA 1427

 38384948 ATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAA 38385007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 ATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAA 1487

 38385008 TGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACAT 38385067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 TGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACAT 1547

 38385068 ACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCAT 38385127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 ACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCAT 1607

 38385128 CCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGT 38385187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 CCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGT 1667

 38385188 ATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATA 38385247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 ATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATA 1727

 38385248 TTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATA 38385307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 TTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATA 1787

 38385308 ATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGAT 38385367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 ATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGAT 1847

 38385368 CTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTAC 38385427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 CTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTAC 1907

 38385428 ATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTT 38385487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 ATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTT 1967

 38385488 TTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTT 38385547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 TTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTT 2027

 38385548 GATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCA 38385607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 GATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCA 2087

 38385608 TTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCT 38385667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 TTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCT 2147

 38385668 ACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACT 38385727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 ACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACT 2207

 38385728 AACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAG 38385787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 AACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAG 2267

 38385788 TTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAG 38385847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 TTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAG 2327

 38385848 TAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGG 38385907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 TAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGG 2387

 38385908 GATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTAC 38385967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 GATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTAC 2447

 38385968 ACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATG 38386027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 ACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATG 2507

 38386028 GTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCA 38386087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 GTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCA 2567

 38386088 AAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAA 38386147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 AAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAA 2627

 38386148 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGT 38386207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGT 2687

 38386208 CCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCA 38386267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 CCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCA 2747

 38386268 GTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTAC 38386327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 GTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTAC 2807

 38386328 AAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGC 38386387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 AAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGC 2867

 38386388 CTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGT 38386447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 CTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGT 2927

 38386448 TGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTG 38386507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 TGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTG 2987

 38386508 CACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTG 38386567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 CACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTG 3047

 38386568 GAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCT 38386627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 GAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCT 3107

 38386628 TCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTG 38386687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 TCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTG 3167

 38386688 GGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCC 38386747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 GGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCC 3227

 38386748 TTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAA 38386807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 TTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAA 3287

 38386808 TGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATG 38386867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 TGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATG 3347

 38386868 ACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGA 38386927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 ACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGA 3407

 38386928 TAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGT 38386987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 TAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGT 3467

 38386988 AACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAA 38387047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 AACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAA 3527

 38387048 ATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCAC 38387107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 ATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCAC 3587

 38387108 TATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTAC 38387167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 TATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTAC 3647

 38387168 TTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTT 38387227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 TTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTT 3707

 38387228 ACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTG 38387287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 ACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTG 3767

 38387288 TTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCC 38387347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 TTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCC 3827

 38387348 TAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAA 38387407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 TAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAA 3887

 38387408 CTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCC 38387467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 CTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCC 3947

 38387468 TCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAGCCCCAACAGTG 38387527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 TCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAGCCCCAACAGTG 4007

 38387528 TGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAAT 38387587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 TGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAAT 4067

 38387588 GATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCT 38387647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 GATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCT 4127

 38387648 GATGGCCAGTGATGATGAGC 38387667
          ||||||||||||||||||||
     4128 GATGGCCAGTGATGATGAGC 4147

Alignment time is 3.14082 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    6632] =>      6632 nucs 'mol-32-331c-101172_6632'

Score:        6556
Aligned:      6626        nucs
Identic:      6609 (100%) nucs =>       224 (100%)      6385 (100%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38381444,38381667] EXCISED REGION [38381678,38388067]
 second seq =>  [       1,     224] EXCISED REGION [     235,    6632]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [38381668,38381677]
 second seq =>        10 nucs [225,234]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [38381668,38381669] to [38381678,38381679]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [38381666,38381667] to [38381678,38381679]
 second seq =>         2 nucs [223,224] to [235,236]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38381444 CAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGAGAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATT 38381503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAACTATCTGATCTTTGACAAACCTGAGAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATT 60

 38381504 TAATAAACGGTGCTGGGAAAACTGGATAGCCATATGGAGAAAGCTGAAACTGGATCCCTT 38381563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAATAAACGGTGCTGGGAAAACTGGATAGCCATATGGAGAAAGCTGAAACTGGATCCCTT 120

 38381564 CCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGACTTAAACGTTAGACCTAA 38381623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGACTTAAACGTTAGACCTAA 180

 38381624 AACCATAAAAACTCTAGAAGAAAACCTAGGCATTACCATTCAGG 38381667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACCATAAAAACTCTAGAAGAAAACCTAGGCATTACCATTCAGG 224

EXCISED REGION

 38381678 GGGCAAGGACTTCATGTCTGAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGCCAAAATTGATG- 38381736
          |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
      235 GGGCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGCCAAAATTGA--C 292

 38381737 -AATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTACCATCAGAGTG 38381795
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      293 AAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTACCATCAGAGTG 352

 38381796 AACAGGCAACCCACAAAATAA--GAGAAAATTTTCGCAACCTACTCATCTGACAAAGGGC 38381853
          |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      353 AACAGGCAACCCACAAAAT--GGGAGAAAATTTTCGCAACCTACTCATCTGACAAAGGGC 410

 38381854 TAATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAATTTTTTTAACTTTTTATCTTGAGATAAA 38381913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      411 TAATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAATTTTTTTAACTTTTTATCTTGAGATAAA 470

 38381914 TGTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGAAGTAATACAGAGAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTA 38381973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      471 TGTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGAAGTAATACAGAGAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTA 530

 38381974 CCTAGTTTCCCTTAATAGTAACATCTTTCCTAACTATAGTACAATATCACAGCCAGGAAA 38382033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      531 CCTAGTTTCCCTTAATAGTAACATCTTTCCTAACTATAGTACAATATCACAGCCAGGAAA 590

 38382034 TTGATGTTGATACAGTCTACCAAACTTATTCAGATCTCACCAGTTATACATGCAGTCATG 38382093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      591 TTGATGTTGATACAGTCTACCAAACTTATTCAGATCTCACCAGTTATACATGCAGTCATG 650

 38382094 TGTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTTTTATCACATTTGTAGCGTTATGTGATCACCACTAT 38382153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      651 TGTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTTTTATCACATTTGTAGCGTTATGTGATCACCACTAT 710

 38382154 AGTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTGTGGTGGCCCATGCCTATAGTCCCACATAGGAGGCT 38382213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 AGTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTGTGGTGGCCCATGCCTATAGTCCCACATAGGAGGCT 770

 38382214 GAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAAAAGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATAGTGCGAT 38382273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 GAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAAAAGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATAGTGCGAT 830

 38382274 CCTGTCTCTACAATAATATTAATAATAATGAAATTTAAAAAATACAGAACAGTCCCATTA 38382333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 CCTGTCTCTACAATAATATTAATAATAATGAAATTTAAAAAATACAGAACAGTCCCATTA 890

 38382334 CAAGGAACTCCTTATGCACCCTTTATAGCCACAGCCACCTCCCTTCTGCCACCACCACCC 38382393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 CAAGGAACTCCTTATGCACCCTTTATAGCCACAGCCACCTCCCTTCTGCCACCACCACCC 950

 38382394 GCCAATCCCTAGCAACCATTAATCTGGTTTCCACAACTATGATTTTGTCATTTCAAGAAT 38382453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 GCCAATCCCTAGCAACCATTAATCTGGTTTCCACAACTATGATTTTGTCATTTCAAGAAT 1010

 38382454 GTTATATAAAATTCATTCATTATGGACTGAATAAAATCATGTGGTATGTAAACTTTTGAG 38382513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 GTTATATAAAATTCATTCATTATGGACTGAATAAAATCATGTGGTATGTAAACTTTTGAG 1070

 38382514 ATTACCTTTTTTTACTCAGCATAATTCCCTGGAGATCCGTCTAGGTTGTTATGCATATTG 38382573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 ATTACCTTTTTTTACTCAGCATAATTCCCTGGAGATCCGTCTAGGTTGTTATGCATATTG 1130

 38382574 ATAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGAGTAGTATTTCATGGTATGGATATACCACAGTTAAG 38382633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 ATAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGAGTAGTATTTCATGGTATGGATATACCACAGTTAAG 1190

 38382634 TGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTCCAGTTTTTGAATATTATAACATCCACG 38382693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 TGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTCCAGTTTTTGAATATTATAACATCCACG 1250

 38382694 TACTTTTTTTGTGTGTGAACATACATTTTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAA 38382753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 TACTTTTTTTGTGTGTGAACATACATTTTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAA 1310

 38382754 ATTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTC 38382813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 ATTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTC 1370

 38382814 AGAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTAC 38382873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 AGAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTAC 1430

 38382874 ATTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGCAACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACT 38382933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 ATTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGCAACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACT 1490

 38382934 AGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCT 38382993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 AGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCT 1550

 38382994 TCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACACCTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTT 38383053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 TCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACACCTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTT 1610

 38383054 GTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCATCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGA 38383113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 GTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCATCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGA 1670

 38383114 GTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATA 38383173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 GTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATA 1730

 38383174 GATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTAAATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAG 38383233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 GATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTAAATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAG 1790

 38383234 TAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAA 38383293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 TAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAA 1850

 38383294 TATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGA 38383353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 TATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGA 1910

 38383354 GTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACC 38383413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 GTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACC 1970

 38383414 AGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTAC 38383473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 AGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTAC 2030

 38383474 GGAGGCCACGTAGGTAATGTAAGTCAGTGAAACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTA 38383533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 GGAGGCCACGTAGGTAATGTAAGTCAGTGAAACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTA 2090

 38383534 GGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTAC 38383593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 GGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTAC 2150

 38383594 TCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGA 38383653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 TCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGA 2210

 38383654 CTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAG 38383713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 CTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAG 2270

 38383714 TCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACC--------TCTGGCCTTGAAGAGTAG 38383765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||
     2271 TCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACCTCTGGCCTTCTGGCCTTGAAGAGTAG 2330

 38383766 GCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCTCTTTCAGCCTAGCTTTGG 38383825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 GCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCTCTTTCAGCCTAGCTTTGG 2390

 38383826 GTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGACATGCACTTAGAATGAAG 38383885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 GTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGACATGCACTTAGAATGAAG 2450

 38383886 ATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGTCAGCCAACAATAGTAAAA 38383945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 ATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGTCAGCCAACAATAGTAAAA 2510

 38383946 ATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGATATCCAAATTGCCAATAAA 38384005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 ATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGATATCCAAATTGCCAATAAA 2570

 38384006 TATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATACAAATTAAAACCACAGTGA 38384065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 TATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATACAAATTAAAACCACAGTGA 2630

 38384066 GATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACACCCACTCAAGTGTGGGTG 38384125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 GATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACACCCACTCAAGTGTGGGTG 2690

 38384126 AAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGAATGTAAACTTGTACATCC 38384185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 AAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGAATGTAAACTTGTACATCC 2750

 38384186 TTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGCCTAGCAATTTCTTTTTTT 38384245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 TTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGCCTAGCAATTTCTTTTTTT 2810

 38384246 CAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAACACATTAAGTTGAACTTA 38384305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 CAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAACACATTAAGTTGAACTTA 2870

 38384306 CAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATACAGGATATTTCTATAGGAA 38384365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 CAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATACAGGATATTTCTATAGGAA 2930

 38384366 ACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAATAATTAATGCTTAGGATT 38384425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 ACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAATAATTAATGCTTAGGATT 2990

 38384426 CAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCATGAAATATTCCATATTTT 38384485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 CAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCATGAAATATTCCATATTTT 3050

 38384486 CCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTATTTTAGGTTTAGGGGTACA 38384545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 CCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTATTTTAGGTTTAGGGGTACA 3110

 38384546 TGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGTTGTTGTACAGATTTTGTC 38384605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 TGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGTTGTTGTACAGATTTTGTC 3170

 38384606 ACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTCT 38384665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 ACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTCT 3230

 38384666 CCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGTGTCTGTTATTCTCCTCTA 38384725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 CCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGTGTCTGTTATTCTCCTCTA 3290

 38384726 TGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTGAGAACATGTGGTACTTGG 38384785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 TGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTGAGAACATGTGGTACTTGG 3350

 38384786 TTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGTTTTTTTATTTCAATAGGC 38384845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 TTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGTTTTTTTATTTCAATAGGC 3410

 38384846 TTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCTTTAATGGTGATTTCTGAG 38384905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 TTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCTTTAATGGTGATTTCTGAG 3470

 38384906 ATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCAATGTGTAGTATTTTATCC 38384965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 ATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCAATGTGTAGTATTTTATCC 3530

 38384966 CTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAATGTATCATTCTTATGCCT 38385025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 CTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAATGTATCATTCTTATGCCT 3590

 38385026 TTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACATACAATGCTTGGTTTTCCA 38385085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 TTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACATACAATGCTTGGTTTTCCA 3650

 38385086 TTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGC 38385145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 TTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGC 3710

 38385146 CATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATATACACCACATTTTCT 38385205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 CATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATATACACCACATTTTCT 3770

 38385206 TTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATATTTTTGCAATTACAAATT 38385265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 TTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATATTTTTGCAATTACAAATT 3830

 38385266 GTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTG 38385325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 GTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTG 3890

 38385326 GGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAA 38385385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 GGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAA 3950

 38385386 GGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTA 38385445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 GGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTA 4010

 38385446 AAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTTGATTAT 38385505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 AAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTTGATTAT 4070

 38385506 GGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTTGATTTACATTTCCCTGAT 38385565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 GGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTTGATTTACATTTCCCTGAT 4130

 38385566 AATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCT 38385625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 AATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCT 4190

 38385626 TCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCTACAAAGAACTCAAATAAA 38385685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 TCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCTACAAAGAACTCAAATAAA 4250

 38385686 TCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAATGCATG 38385745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 TCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAATGCATG 4310

 38385746 TATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCG 38385805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 TATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCG 4370

 38385806 TTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGG 38385865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 TTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGG 4430

 38385866 GTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATG 38385925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 GTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATG 4490

 38385926 GATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTG 38385985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 GATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTG 4550

 38385986 TATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAAT 38386045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 TATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAAT 4610

 38386046 TCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGC 38386105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 TCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGC 4670

 38386106 ATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 38386165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 ATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 4730

 38386166 AATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGC 38386225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 AATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGC 4790

 38386226 TGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCC 38386285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 TGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCC 4850

 38386286 ACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGT 38386345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 ACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGT 4910

 38386346 TCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAAC 38386405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 TCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAAC 4970

 38386406 TGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGT 38386465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 TGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGT 5030

 38386466 ATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTA 38386525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 ATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTA 5090

 38386526 AATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTG 38386585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 AATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTG 5150

 38386586 GACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATG 38386645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5151 GACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATG 5210

 38386646 TCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGA 38386705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 TCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGA 5270

 38386706 AATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTT 38386765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5271 AATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTT 5330

 38386766 CCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATA 38386825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5331 CCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATA 5390

 38386826 ACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTA 38386885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5391 ACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTA 5450

 38386886 CTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGT 38386945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5451 CTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGT 5510

 38386946 ATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTC 38387005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5511 ATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTC 5570

 38387006 AATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCT 38387065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5571 AATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCT 5630

 38387066 TTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGG 38387125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5631 TTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGG 5690

 38387126 AAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACT 38387185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5691 AAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACT 5750

 38387186 TCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAG 38387245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5751 TCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAG 5810

 38387246 GGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAAT 38387305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5811 GGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAAT 5870

 38387306 GATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAA 38387365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5871 GATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAA 5930

 38387366 GGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAAC 38387425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5931 GGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAAC 5990

 38387426 CAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGG 38387485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5991 CAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGG 6050

 38387486 GGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAGCCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTC 38387545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6051 GGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAGCCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTC 6110

 38387546 TCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGG 38387605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6111 TCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGG 6170

 38387606 TGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGA 38387665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6171 TGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGA 6230

 38387666 GCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTT 38387725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6231 GCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTT 6290

 38387726 ATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTC 38387785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6291 ATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTC 6350

 38387786 TTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGAGACGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCA 38387845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6351 TTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGAGACGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCA 6410

 38387846 TTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGCCGTGCAGAAGCTCTTCAG 38387905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6411 TTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGCCGTGCAGAAGCTCTTCAG 6470

 38387906 TTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCTTTTGTTGCCGTTGCTTTTTGTGTTTTAGT 38387965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6471 TTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCTTTTGTTGCCGTTGCTTTTTGTGTTTTAGT 6530

 38387966 CATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGAAAGACAGTGTGGCGATTCCTCA 38388025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6531 CATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGAAAGACAGTGTGGCGATTCCTCA 6590

 38388026 AGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCAT 38388067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6591 AGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCAT 6632

Alignment time is 5.00032 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3873] =>      3873 nucs 'mol-32-3332-096780_3873'

Score:        3872
Aligned:      3872        nucs
Identic:      3872 (100%) nucs =>      3653 (100%)       219 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38383730,38387382] EXCISED REGION [38387384,38387602]
 second seq =>  [       1,    3653] EXCISED REGION [    3655,    3873]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [38387383,38387383]
 second seq =>         1 nucs [3654,3654]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3653,3653] to [3654,3654]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38383730 CGCTGCCAGTTTAAAACCTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAA 38383789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGCTGCCAGTTTAAAACCTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAA 60

 38383790 TCCTTATAAATATGACCTCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTC 38383849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCTTATAAATATGACCTCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTC 120

 38383850 GGTGATTAAGCTTTCTGACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGT 38383909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTGATTAAGCTTTCTGACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGT 180

 38383910 GTCATACACTTTCATAGTCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGG 38383969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCATACACTTTCATAGTCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGG 240

 38383970 TGCTTCACGAAAGAAGATATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTAT 38384029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTTCACGAAAGAAGATATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTAT 300

 38384030 TAGTCATGAGGAAAATACAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAA 38384089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGTCATGAGGAAAATACAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAA 360

 38384090 TGATAAATATAAAAAACACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCT 38384149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATAAATATAAAAAACACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCT 420

 38384150 CGTACATTGCTGATAGGAATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAG 38384209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CGTACATTGCTGATAGGAATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAG 480

 38384210 ACATTCCTTCCTCATCGCCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTT 38384269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACATTCCTTCCTCATCGCCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTT 540

 38384270 AACTCATAACCTCCATAACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGA 38384329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACTCATAACCTCCATAACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGA 600

 38384330 AAATTGATCTGTGGATACAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAA 38384389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATTGATCTGTGGATACAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAA 660

 38384390 TGAGTTTGATGGTGATAATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAA 38384449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAGTTTGATGGTGATAATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAA 720

 38384450 TTGGGTTAACTACAATCATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTT 38384509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGGGTTAACTACAATCATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTT 780

 38384510 GTTTTTTTAAACTTTTATTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAA 38384569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTTTTTTAAACTTTTATTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAA 840

 38384570 ACTCATGTCATGGGAGGTTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCC 38384629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTCATGTCATGGGAGGTTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCC 900

 38384630 AACAGTTAGGTTTTTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCAC 38384689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACAGTTAGGTTTTTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCAC 960

 38384690 CCTTGGGTAGGCCCCAGTGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTT 38384749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTTGGGTAGGCCCCAGTGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTT 1020

 38384750 AGCTCCCGCTTGTAAGTGAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTT 38384809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCTCCCGCTTGTAAGTGAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTT 1080

 38384810 TTTTTTTTAATTTTTAGTTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTG 38384869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTTTTTAATTTTTAGTTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTG 1140

 38384870 GTTACATGAATAAGTTCTTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGAT 38384929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTACATGAATAAGTTCTTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGAT 1200

 38384930 CAGTGTACACTGTGCCCAATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCC 38384989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGTGTACACTGTGCCCAATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCC 1260

 38384990 CAAGTCCTCAAAGTCCAATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCC 38385049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAAGTCCTCAAAGTCCAATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCC 1320

 38385050 ACATATGAGTGAGAACATACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAAT 38385109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACATATGAGTGAGAACATACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAAT 1380

 38385110 AATAGTGTCTAATTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGC 38385169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATAGTGTCTAATTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGC 1440

 38385170 TGAGTAGTATTCCATGGTATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGC 38385229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAGTAGTATTCCATGGTATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGC 1500

 38385230 ATTTGGGCTGGTTCCATATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGC 38385289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTTGGGCTGGTTCCATATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGC 1560

 38385290 AAGTATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTG 38385349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGTATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTG 1620

 38385350 CTTGATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATG 38385409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTGATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATG 1680

 38385410 TAGGTTATACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATC 38385469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGGTTATACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATC 1740

 38385470 CATGCCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTG 38385529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATGCCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTG 1800

 38385530 GCATCGCATTGTGATTTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTT 38385589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCATCGCATTGTGATTTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTT 1860

 38385590 TCATATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAG 38385649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCATATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAG 1920

 38385650 GACTAATATCCAAAATCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAA 38385709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GACTAATATCCAAAATCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAA 1980

 38385710 AACTTCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGA 38385769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AACTTCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGA 2040

 38385770 CAAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTC 38385829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTC 2100

 38385830 CATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCA 38385889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCA 2160

 38385890 ATAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTT 38385949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTT 2220

 38385950 GGGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTC 38386009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTC 2280

 38386010 AAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGC 38386069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGC 2340

 38386070 TGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGT 38386129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGT 2400

 38386130 CTCTACAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATG 38386189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTCTACAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATG 2460

 38386190 GTGGCTTGCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCC 38386249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTGGCTTGCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCC 2520

 38386250 CAGGAGGTCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAG 38386309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAGGAGGTCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAG 2580

 38386310 AATGGGAACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGT 38386369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATGGGAACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGT 2640

 38386370 AATTTTAAAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGA 38386429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AATTTTAAAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGA 2700

 38386430 ATGTTCTATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAA 38386489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATGTTCTATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAA 2760

 38386490 CTGTACTCATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAA 38386549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTGTACTCATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAA 2820

 38386550 AATAATAGTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCC 38386609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AATAATAGTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCC 2880

 38386610 CAACCAAACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGT 38386669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CAACCAAACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGT 2940

 38386670 ACTTGAGTGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGT 38386729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACTTGAGTGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGT 3000

 38386730 GCCCGAGAGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACA 38386789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCCCGAGAGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACA 3060

 38386790 TGCTAATGGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTC 38386849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGCTAATGGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTC 3120

 38386850 CCAAATATTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCA 38386909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCAAATATTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCA 3180

 38386910 TCTATAAAATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAA 38386969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCTATAAAATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAA 3240

 38386970 GTGCTCACTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTA 38387029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTGCTCACTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTA 3300

 38387030 TATTCATATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCT 38387089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TATTCATATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCT 3360

 38387090 CCTTAAAGAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAA 38387149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCTTAAAGAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAA 3420

 38387150 GGCCTTAGTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGG 38387209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GGCCTTAGTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGG 3480

 38387210 TAGGTCATAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGG 38387269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TAGGTCATAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGG 3540

 38387270 TGTCATTTAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAG 38387329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGTCATTTAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAG 3600

 38387330 AGGCTGGAAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCT 38387382
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AGGCTGGAAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCT 3653

EXCISED REGION

 38387384 GGCCACACAATTCATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTA 38387443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 GGCCACACAATTCATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTA 3714

 38387444 CATTTGTTTCATTGCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTT 38387503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 CATTTGTTTCATTGCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTT 3774

 38387504 GTCTACTTTGCAGCCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCA 38387563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 GTCTACTTTGCAGCCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCA 3834

 38387564 CCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCGCCATTCTAAC 38387602
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 CCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCGCCATTCTAAC 3873

Alignment time is 2.90271 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4549] =>      4549 nucs 'mol-32-3395-145874_4549'

Score:        4545
Aligned:      4545        nucs
Identic:      4545 (100%) nucs =>      2523 (100%)      2022 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38383614,38386136] EXCISED REGION [38386137,38388158]
 second seq =>  [       1,    2523] EXCISED REGION [    2528,    4549]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [2524,2527]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [2524,2562] to [2528,2566]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38386136,38386136] to [38386137,38386137]
 second seq =>         1 nucs [2523,2523] to [2528,2528]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38383614 AGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACT 38383673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACT 60

 38383674 ATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCT 38383733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCT 120

 38383734 GCCAGTTTAAAACCTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCT 38383793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCAGTTTAAAACCTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCT 180

 38383794 TATAAATATGACCTCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTG 38383853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATAAATATGACCTCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTG 240

 38383854 ATTAAGCTTTCTGACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCA 38383913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTAAGCTTTCTGACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCA 300

 38383914 TACACTTTCATAGTCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCT 38383973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACACTTTCATAGTCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCT 360

 38383974 TCACGAAAGAAGATATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGT 38384033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCACGAAAGAAGATATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGT 420

 38384034 CATGAGGAAAATACAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGAT 38384093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATGAGGAAAATACAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGAT 480

 38384094 AAATATAAAAAACACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTA 38384153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATATAAAAAACACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTA 540

 38384154 CATTGCTGATAGGAATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACAT 38384213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATTGCTGATAGGAATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACAT 600

 38384214 TCCTTCCTCATCGCCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACT 38384273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTTCCTCATCGCCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACT 660

 38384274 CATAACCTCCATAACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAAT 38384333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATAACCTCCATAACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAAT 720

 38384334 TGATCTGTGGATACAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAG 38384393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGATCTGTGGATACAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAG 780

 38384394 TTTGATGGTGATAATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGG 38384453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTGATGGTGATAATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGG 840

 38384454 GTTAACTACAATCATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTT 38384513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTAACTACAATCATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTT 900

 38384514 TTTTAAACTTTTATTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTC 38384573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTAAACTTTTATTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTC 960

 38384574 ATGTCATGGGAGGTTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACA 38384633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGTCATGGGAGGTTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACA 1020

 38384634 GTTAGGTTTTTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTT 38384693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTAGGTTTTTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTT 1080

 38384694 GGGTAGGCCCCAGTGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCT 38384753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGTAGGCCCCAGTGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCT 1140

 38384754 CCCGCTTGTAAGTGAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTT 38384813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCGCTTGTAAGTGAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTT 1200

 38384814 TTTTAATTTTTAGTTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTA 38384873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTAATTTTTAGTTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTA 1260

 38384874 CATGAATAAGTTCTTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGT 38384933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATGAATAAGTTCTTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGT 1320

 38384934 GTACACTGTGCCCAATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAG 38384993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTACACTGTGCCCAATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAG 1380

 38384994 TCCTCAAAGTCCAATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACAT 38385053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCTCAAAGTCCAATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACAT 1440

 38385054 ATGAGTGAGAACATACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATA 38385113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGAGTGAGAACATACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATA 1500

 38385114 GTGTCTAATTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAG 38385173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGTCTAATTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAG 1560

 38385174 TAGTATTCCATGGTATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTT 38385233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGTATTCCATGGTATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTT 1620

 38385234 GGGCTGGTTCCATATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGT 38385293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGGCTGGTTCCATATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGT 1680

 38385294 ATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTG 38385353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTG 1740

 38385354 ATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGG 38385413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGG 1800

 38385414 TTATACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATG 38385473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTATACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATG 1860

 38385474 CCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCAT 38385533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCAT 1920

 38385534 CGCATTGTGATTTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCAT 38385593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CGCATTGTGATTTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCAT 1980

 38385594 ATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACT 38385653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACT 2040

 38385654 AATATCCAAAATCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACT 38385713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATATCCAAAATCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACT 2100

 38385714 TCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAG 38385773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAG 2160

 38385774 AATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATC 38385833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATC 2220

 38385834 AACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAG 38385893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAG 2280

 38385894 AAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGT 38385953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGT 2340

 38385954 GAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAA 38386013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAA 2400

 38386014 ACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGA 38386073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGA 2460

 38386074 GGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCT 38386133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCT 2520

 38386134 ACA 38386136
          |||
     2521 ACA 2523

EXCISED REGION

 38386137 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 38386196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 2587

 38386197 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 38386256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 2647

 38386257 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 38386316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 2707

 38386317 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 38386376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 2767

 38386377 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 38386436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 2827

 38386437 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 38386496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 2887

 38386497 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 38386556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 2947

 38386557 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 38386616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 3007

 38386617 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 38386676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 3067

 38386677 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 38386736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 3127

 38386737 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 38386796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 3187

 38386797 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 38386856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 3247

 38386857 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 38386916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 3307

 38386917 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 38386976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 3367

 38386977 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 38387036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 3427

 38387037 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 38387096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 3487

 38387097 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 38387156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 3547

 38387157 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 38387216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 3607

 38387217 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 38387276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 3667

 38387277 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 38387336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 3727

 38387337 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 38387396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 3787

 38387397 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 38387456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 3847

 38387457 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 38387516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 3907

 38387517 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 38387576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 3967

 38387577 GACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATT 38387636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 GACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATT 4027

 38387637 TGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAA 38387696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 TGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAA 4087

 38387697 ATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTT 38387756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 ATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTT 4147

 38387757 GATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGA 38387816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 GATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGA 4207

 38387817 GACGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTA 38387876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 GACGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTA 4267

 38387877 GTTTCTTTTGCCGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCT 38387936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 GTTTCTTTTGCCGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCT 4327

 38387937 TTTGTTGCCGTTGCTTTTTGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACC 38387996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 TTTGTTGCCGTTGCTTTTTGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACC 4387

 38387997 ATTGTGAAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCC 38388056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 ATTGTGAAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCC 4447

 38388057 AGCCATCCCATTACTGGGTATTTACCCAAAGGATTATAAATCATGCTGCTATAAAGACAC 38388116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 AGCCATCCCATTACTGGGTATTTACCCAAAGGATTATAAATCATGCTGCTATAAAGACAC 4507

 38388117 ATGCACACGTATGTTTATTGTGGCACTATTCACAATAGCAAA 38388158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 ATGCACACGTATGTTTATTGTGGCACTATTCACAATAGCAAA 4549

Alignment time is 3.42958 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    2465] =>      2465 nucs 'mol-32-33b6-083960_2465'

Score:        2454
Aligned:      2454        nucs
Identic:      2454 (100%) nucs =>       383 (100%)      2071 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38385754,38386136] EXCISED REGION [38386137,38388207]
 second seq =>  [       1,     383] EXCISED REGION [     388,    2458]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [384,387]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [384,422] to [388,426]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38386136,38386136] to [38386137,38386137]
 second seq =>         1 nucs [383,383] to [388,388]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38385754 CATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGA 38385813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGA 60

 38385814 AAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTC 38385873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTC 120

 38385874 ATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATC 38385933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATC 180

 38385934 TCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTC 38385993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTC 240

 38385994 CGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAAC 38386053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAAC 300

 38386054 TTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAA 38386113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAA 360

 38386114 CATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 38386136
          |||||||||||||||||||||||
      361 CATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 383

EXCISED REGION

 38386137 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 38386196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      388 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 447

 38386197 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 38386256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      448 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 507

 38386257 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 38386316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      508 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 567

 38386317 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 38386376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      568 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 627

 38386377 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 38386436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      628 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 687

 38386437 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 38386496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      688 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 747

 38386497 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 38386556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      748 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 807

 38386557 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 38386616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      808 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 867

 38386617 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 38386676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      868 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 927

 38386677 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 38386736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      928 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 987

 38386737 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 38386796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      988 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 1047

 38386797 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 38386856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1048 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 1107

 38386857 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 38386916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 1167

 38386917 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 38386976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 1227

 38386977 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 38387036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 1287

 38387037 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 38387096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 1347

 38387097 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 38387156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 1407

 38387157 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 38387216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 1467

 38387217 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 38387276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 1527

 38387277 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 38387336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 1587

 38387337 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 38387396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 1647

 38387397 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 38387456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 1707

 38387457 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 38387516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 1767

 38387517 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 38387576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 1827

 38387577 GACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATT 38387636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 GACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATT 1887

 38387637 TGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAA 38387696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 TGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAA 1947

 38387697 ATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTT 38387756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 ATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTT 2007

 38387757 GATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGA 38387816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 GATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGA 2067

 38387817 GACGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTA 38387876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 GACGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTA 2127

 38387877 GTTTCTTTTGCCGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCT 38387936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 GTTTCTTTTGCCGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCT 2187

 38387937 TTTGTTGCCGTTGCTTTTTGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACC 38387996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 TTTGTTGCCGTTGCTTTTTGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACC 2247

 38387997 ATTGTGAAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCC 38388056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 ATTGTGAAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCC 2307

 38388057 AGCCATCCCATTACTGGGTATTTACCCAAAGGATTATAAATCATGCTGCTATAAAGACAC 38388116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 AGCCATCCCATTACTGGGTATTTACCCAAAGGATTATAAATCATGCTGCTATAAAGACAC 2367

 38388117 ATGCACACGTATGTTTATTGTGGCACTATTCACAATAGCAAACACTTGGAACCAACCCAA 38388176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 ATGCACACGTATGTTTATTGTGGCACTATTCACAATAGCAAACACTTGGAACCAACCCAA 2427

 38388177 ATGTCCATCAATGATAGACTGGATTAAGAAA 38388207
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 ATGTCCATCAATGATAGACTGGATTAAGAAA 2458

Alignment time is 1.87798 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    3606] =>      3606 nucs 'mol-32-33b6-177292_3606'

Score:        3591
Aligned:      3602        nucs
Identic:      3601 (100%) nucs =>      1836 (100%)      1765 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38384300,38386136] EXCISED REGION [38386137,38387901]
 second seq =>  [       1,    1837] EXCISED REGION [    1842,    3606]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1838,1841]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [1838,1876] to [1842,1880]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38386136,38386136] to [38386137,38386137]
 second seq =>         1 nucs [1837,1837] to [1842,1842]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38384300 AACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATACAGGATATTTCTA 38384359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATACAGGATATTTCTA 60

 38384360 TAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAATAATTAATGCTT 38384419
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGGAAACAAATGTAAAACATGAGGCTCAATGAGTTTGATGGTGATAATAATTAATGCTT 120

 38384420 AGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCATGAAATATTCCA 38384479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCATGAAATATTCCA 180

 38384480 TATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTATTTTAGGTTTAGG 38384539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTATTTTAGGTTTAGG 240

 38384540 GGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGTTGTTGTACAGAT 38384599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGTTGTTGTACAGAT 300

 38384600 TTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGTTTTTTTGTTTGT 38384659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGTTTTTTTGTTTGT 360

 38384660 TTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGTGTCTGTTATTCT 38384719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGTGTCTGTTATTCT 420

 38384720 CCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTGAGAACATGTGGT 38384779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTGAGAACATGTGGT 480

 38384780 ACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGTTTTTTTATTTCA 38384839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGTTTTTTTATTTCA 540

 38384840 ATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCTTTAATGGTGATT 38384899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCTTTAATGGTGATT 600

 38384900 TCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCAATGTGTAGTATT 38384959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCAATGTGTAGTATT 660

 38384960 TTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAATGTATCATTCTT 38385019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAATGTATCATTCTT 720

 38385020 ATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACATACAATGCTTGGT 38385079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACATACAATGCTTGGT 780

 38385080 TTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCATCCAGGTTGCTGT 38385139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCATCCAGGTTGCTGT 840

 38385140 GAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATATACACCACA 38385199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATATACACCACA 900

 38385200 TTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATATTTTTGCAATTA 38385259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATATTTTTGCAATTA 960

 38385260 CAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTT 38385319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTT 1020

 38385320 CCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTT 38385379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTT 1080

 38385380 TCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTACATTCCCACCAAC 38385439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTACATTCCCACCAAC 1140

 38385440 AGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTT 38385499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTT 1200

 38385500 GATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTTGATTTACATTTC 38385559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTTGATTTACATTTC 1260

 38385560 CCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGA 38385619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGA 1320

 38385620 AAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCTACAAAGAACTCA 38385679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCTACAAAGAACTCA 1380

 38385680 AATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAA 38385739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAA 1440

 38385740 TGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGAC 38385799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGAC 1500

 38385800 TAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAAC 38385859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAAC 1560

 38385860 TTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAAC 38385919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAAC 1620

 38385920 AGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTAT 38385979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTAT 1680

 38385980 ACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAAC 38386039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAAC 1740

 38386040 TATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAG 38386099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAG 1800

 38386100 ACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 38386136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 1837

EXCISED REGION

 38386137 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 38386196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 1901

 38386197 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 38386256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 1961

 38386257 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 38386316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 2021

 38386317 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 38386376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 2081

 38386377 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 38386436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 2141

 38386437 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 38386496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 2201

 38386497 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 38386556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 2261

 38386557 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 38386616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 2321

 38386617 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 38386676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 2381

 38386677 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 38386736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 2441

 38386737 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 38386796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 2501

 38386797 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 38386856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 2561

 38386857 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 38386916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 2621

 38386917 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 38386976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 2681

 38386977 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 38387036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 2741

 38387037 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 38387096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 2801

 38387097 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 38387156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 2861

 38387157 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 38387216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 2921

 38387217 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 38387276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 2981

 38387277 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 38387336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 3041

 38387337 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 38387396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 3101

 38387397 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 38387456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 3161

 38387457 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 38387516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 3221

 38387517 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 38387576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 3281

 38387577 GACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATT 38387636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 GACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATT 3341

 38387637 TGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAA 38387696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 TGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAA 3401

 38387697 ATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTT 38387756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 ATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTT 3461

 38387757 GATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGA 38387816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 GATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGA 3521

 38387817 GACGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTA 38387876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 GACGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTA 3581

 38387877 GTTTCTTTTGCCGTGCAGAAGCTCT 38387901
          |||||||||||||||||||||||||
     3582 GTTTCTTTTGCCGTGCAGAAGCTCT 3606

Alignment time is 2.74751 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    5457] =>      5457 nucs 'mol-32-33f8-154881_5457'

Score:        5427
Aligned:      5449        nucs
Identic:      5447 (100%) nucs =>      1109 (100%)      4338 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38382639,38383747] EXCISED REGION [38383748,38388087]
 second seq =>  [       1,    1109] EXCISED REGION [    1118,    5457]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [1110,1117]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         9 nucs [1110,1118] to [1118,1126]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1110,1110] to [1117,1117]

 38382639 ACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTCCAGTTTTTGAATATTATAACATCCACGTACTT 38382698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTCCAGTTTTTGAATATTATAACATCCACGTACTT 60

 38382699 TTTTTGTGTGTGAACATACATTTTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAATTGC 38382758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTGTGTGTGAACATACATTTTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAATTGC 120

 38382759 TGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCAGAGT 38382818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCAGAGT 180

 38382819 AGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACATTAT 38382878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACATTAT 240

 38382879 CATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGCAACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACTAGATA 38382938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGCAACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACTAGATA 300

 38382939 TGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTTCTAG 38382998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTTCTAG 360

 38382999 GCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACACCTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTT 38383058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACACCTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTT 420

 38383059 CTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCATCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTAT 38383118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCATCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTAT 480

 38383119 GTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATAT 38383178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATAT 540

 38383179 GCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTAAATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAA 38383238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTAAATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAA 600

 38383239 AAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATAT 38383298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATAT 660

 38383299 AAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAA 38383358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAA 720

 38383359 GAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTT 38383418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTT 780

 38383419 CTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGG 38383478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGG 840

 38383479 CCACGTAGGTAATGTAAGTCAGTGAAACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGC 38383538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCACGTAGGTAATGTAAGTCAGTGAAACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGC 900

 38383539 TGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGC 38383598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGC 960

 38383599 CTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTT 38383658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTT 1020

 38383659 AATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAG 38383718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAG 1080

 38383719 AGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACC 38383747
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACC 1109

EXCISED REGION

 38383748 TCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCT 38383807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 TCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCT 1177

 38383808 CTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGA 38383867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 CTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGA 1237

 38383868 CATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGT 38383927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 CATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGT 1297

 38383928 CAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGAT 38383987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 CAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGAT 1357

 38383988 ATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATAC 38384047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 ATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATAC 1417

 38384048 AAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACA 38384107
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1418 AAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCGCTAAAATGATAAATATAAAAAACA 1477

 38384108 CCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGA 38384167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 CCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGA 1537

 38384168 ATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGC 38384227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 ATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGC 1597

 38384228 CTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAA 38384287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 CTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAA 1657

 38384288 CACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATAC 38384347
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 CACATTAAGTTGGACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATAC 1717

 38384348 AGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAA 38384407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 AGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAA 1777

 38384408 TAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCA 38384467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 TAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCA 1837

 38384468 TGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTAT 38384527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 TGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTAT 1897

 38384528 TTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGT 38384587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 TTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGT 1957

 38384588 TGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGT 38384647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 TGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGT 2017

 38384648 TTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGT 38384707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGT 2077

 38384708 GTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTG 38384767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 GTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTG 2137

 38384768 AGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGT 38384827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 AGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGT 2197

 38384828 TTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCT 38384887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCT 2257

 38384888 TTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCA 38384947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 TTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCA 2317

 38384948 ATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAA 38385007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 ATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAA 2377

 38385008 TGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACAT 38385067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 TGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACAT 2437

 38385068 ACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCAT 38385127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 ACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCAT 2497

 38385128 CCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGT 38385187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 CCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGT 2557

 38385188 ATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATA 38385247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 ATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATA 2617

 38385248 TTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATA 38385307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 TTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATA 2677

 38385308 ATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGAT 38385367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 ATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGAT 2737

 38385368 CTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTAC 38385427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 CTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTAC 2797

 38385428 ATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTT 38385487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 ATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTT 2857

 38385488 TTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTT 38385547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 TTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTT 2917

 38385548 GATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCA 38385607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 GATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCA 2977

 38385608 TTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCT 38385667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 TTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCT 3037

 38385668 ACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACT 38385727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 ACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACT 3097

 38385728 AACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAG 38385787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 AACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAG 3157

 38385788 TTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAG 38385847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 TTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAG 3217

 38385848 TAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGG 38385907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 TAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGG 3277

 38385908 GATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTAC 38385967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 GATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTAC 3337

 38385968 ACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATG 38386027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 ACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATG 3397

 38386028 GTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCA 38386087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 GTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCA 3457

 38386088 AAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAA 38386147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 AAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAA 3517

 38386148 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGT 38386207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGT 3577

 38386208 CCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCA 38386267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 CCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCA 3637

 38386268 GTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTAC 38386327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 GTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTAC 3697

 38386328 AAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGC 38386387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 AAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGC 3757

 38386388 CTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGT 38386447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 CTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGT 3817

 38386448 TGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTG 38386507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 TGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTG 3877

 38386508 CACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTG 38386567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 CACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTG 3937

 38386568 GAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCT 38386627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 GAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCT 3997

 38386628 TCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTG 38386687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 TCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTG 4057

 38386688 GGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCC 38386747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 GGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCC 4117

 38386748 TTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAA 38386807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 TTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAA 4177

 38386808 TGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATG 38386867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 TGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATG 4237

 38386868 ACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGA 38386927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4238 ACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGA 4297

 38386928 TAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGT 38386987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4298 TAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGT 4357

 38386988 AACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAA 38387047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4358 AACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAA 4417

 38387048 ATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCAC 38387107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4418 ATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCAC 4477

 38387108 TATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTAC 38387167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4478 TATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTAC 4537

 38387168 TTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTT 38387227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4538 TTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTT 4597

 38387228 ACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTG 38387287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4598 ACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTG 4657

 38387288 TTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCC 38387347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4658 TTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCC 4717

 38387348 TAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAA 38387407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4718 TAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAA 4777

 38387408 CTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCC 38387467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4778 CTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCC 4837

 38387468 TCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAGCCCCAACAGTG 38387527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4838 TCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAGCCCCAACAGTG 4897

 38387528 TGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAAT 38387587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4898 TGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAAT 4957

 38387588 GATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCT 38387647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4958 GATCGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCT 5017

 38387648 GATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTATTCTTT 38387707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5018 GATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTATTCTTT 5077

 38387708 TGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGATTTTTTCTT 38387767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5078 TGAGAAGTGCCTGTTCTTATCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGATTTTTTCTT 5137

 38387768 GTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGAGACGGGTAGAT 38387827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5138 GTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGTGAGACGGGTAGAT 5197

 38387828 TGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGC 38387887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5198 TGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGC 5257

 38387888 CGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCTTTTGTTGCCGT 38387947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5258 CGTGCAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCTTTTGTTGCCGT 5317

 38387948 TGCTTTTTGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGAAAGA 38388007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5318 TGCTTTTTGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGAAAGA 5377

 38388008 CAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCAT 38388067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5378 CAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCAT 5437

 38388068 TACTGGGTATTTACCCAAAG 38388087
          ||||||||||||||||||||
     5438 TACTGGGTATTTACCCAAAG 5457

Alignment time is 4.15353 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    6895] =>      6895 nucs 'mol-32-34a8-034807_6895'

Score:        6744
Aligned:      6883        nucs
Identic:      6863 (100%) nucs =>      6249 (100%)       614 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38381555,38387814] EXCISED REGION [38387832,38388447]
 second seq =>  [       1,    6262] EXCISED REGION [    6280,    6895]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        17 nucs [38387815,38387831]
 second seq =>        17 nucs [6263,6279]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38381555 GGATCCCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGACTTAAACGT 38381614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGATCCCTTCCTTACACCTTATACAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGACTTAAACGT 60

 38381615 TAGACCTAAAACCATAAAAACTCTAGAAGAAAACCTAGGCATTACCATTCAGGGGACAGG 38381674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGACCTAAAACCATAAAAACTCTAGAAGAAAACCTAGGCATTACCATTCAGGGGACAGG 120

 38381675 CACGGGCAAGGACTTCATGTCTGAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGCCAAAATTGA 38381734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACGGGCAAGGACTTCATGTCTGAAACACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGCCAAAATTGA 180

 38381735 TGAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTACCATCAGAGT 38381794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTACCATCAGAGT 240

 38381795 GAACAGGCAACCCACAAAATAAGAGAAAATTTTCGCAACCTACTCATCTGACAAAGGGCT 38381854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAACAGGCAACCCACAAAATAAGAGAAAATTTTCGCAACCTACTCATCTGACAAAGGGCT 300

 38381855 AATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAATTTTTTTAACTTTTTATCTTGAGATAAAT 38381914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAATTTTTTTAACTTTTTATCTTGAGATAAAT 360

 38381915 GTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGAAGTAATACAGAGAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTAC 38381974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGAAGTAATACAGAGAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTAC 420

 38381975 CTAGTTTCCCTTAATAGTAACATCTTTCCTAACTATAGTACAATATCACAGCCAGGAAAT 38382034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAGTTTCCCTTAATAGTAACATCTTTCCTAACTATAGTACAATATCACAGCCAGGAAAT 480

 38382035 TGATGTTGATACAGTCTACCAAACTTATTCAGATCTCACCAGTTATACATGCAGTCATGT 38382094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGATGTTGATACAGTCTACCAAACTTATTCAGATCTCACCAGTTATACATGCAGTCATGT 540

 38382095 GTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTTTTATCACATTTGTAGCGTTATGTGATCACCACTATA 38382154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTTTTATCACATTTGTAGCGTTATGTGATCACCACTATA 600

 38382155 GTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTGTGGTGGCCCATGCCTATAGTCCCACATAGGAGGCTG 38382214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTGTGGTGGCCCATGCCTATAGTCCCACATAGGAGGCTG 660

 38382215 AGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAAAAGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATAGTGCGATC 38382274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAAAAGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATAGTGCGATC 720

 38382275 CTGTCTCTACAATAATATTAATAATAATGAAATTTAAAAAATACAGAACAGTCCCATTAC 38382334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGTCTCTACAATAATATTAATAATAATGAAATTTAAAAAATACAGAACAGTCCCATTAC 780

 38382335 AAGGAACTCCTTATGCACCCTTTATAGCCACAGCCACCTCCCTTCTGCCACCACCACCCG 38382394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGGAACTCCTTATGCACCCTTTATAGCCACAGCCACCTCCCTTCTGCCACCACCACCCG 840

 38382395 CCAATCCCTAGCAACCATTAATCTGGTTTCCACAACTATGATTTTGTCATTTCAAGAATG 38382454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAATCCCTAGCAACCATTAATCTGGTTTCCACAACTATGATTTTGTCATTTCAAGAATG 900

 38382455 TTATATAAAATTCATTCATTATGGACTGAATAAAATCATGTGGTATGTAAACTTTTGAGA 38382514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTATATAAAATTCATTCATTATGGACTGAATAAAATCATGTGGTATGTAAACTTTTGAGA 960

 38382515 TTACCTTTTTTTACTCAGCATAATTCCCTGGAGATCCGTCTAGGTTGTTATGCATATTGA 38382574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTACCTTTTTTTACTCAGCATAATTCCCTGGAGATCCGTCTAGGTTGTTATGCATATTGA 1020

 38382575 TAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGAGTAGTATTTCATGGTATGGATATACCACAGTTAAGT 38382634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGAGTAGTATTTCATGGTATGGATATACCACAGTTAAGT 1080

 38382635 GTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTCCAGTTTTTGAATATTATAACATCCACGT 38382694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTCCAGTTTTTGAATATTATAACATCCACGT 1140

 38382695 ACTTTTTTTGTGTGTGAACATACATTTTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAA 38382754
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTTTTTTTGTGTGTGAACATATATTTTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAA 1200

 38382755 TTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCA 38382814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCA 1260

 38382815 GAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACA 38382874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACA 1320

 38382875 TTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGCAACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACTA 38382934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGCAACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACTA 1380

 38382935 GATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTT 38382994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTT 1440

 38382995 CTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACACCTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTG 38383054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACACCTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTG 1500

 38383055 TTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCATCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAG 38383114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCATCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAG 1560

 38383115 TTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAG 38383174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAG 1620

 38383175 ATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTAAATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGT 38383234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTAAATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGT 1680

 38383235 AAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAAT 38383294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAAT 1740

 38383295 ATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAG 38383354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAG 1800

 38383355 TTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCA 38383414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCA 1860

 38383415 GTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACG 38383474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACG 1920

 38383475 GAGGCCACGTAGGTAATGTAAGTCAGTGAAACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAG 38383534
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAGGCCACGTAGGTAATGTTAGTCAGTGAAACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAG 1980

 38383535 GGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACT 38383594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACT 2040

 38383595 CAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGAC 38383654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGAC 2100

 38383655 TTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGT 38383714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGT 2160

 38383715 CCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACCTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACA 38383774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAACCTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACA 2220

 38383775 TCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCTCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATT 38383834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCTCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATT 2280

 38383835 GAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGG 38383894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGG 2340

 38383895 ATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGTCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACA 38383954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGTCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACA 2400

 38383955 AAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGATATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAA 38384014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGATATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAA 2460

 38384015 AGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATACAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACT 38384074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATACAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACT 2520

 38384075 ACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGG 38384134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGG 2580

 38384135 AGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGAATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTT 38384194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGAATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTT 2640

 38384195 CTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGCCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATA 38384254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGCCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATA 2700

 38384255 TCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGA 38384314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGA 2760

 38384315 AAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATACAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTA 38384374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATACAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTA 2820

 38384375 AAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATA 38384434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATA 2880

 38384435 TTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATG 38384494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATG 2940

 38384495 ACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTATTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGT 38384554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTATTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGT 3000

 38384555 TTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGTTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTA 38384614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGTTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTA 3060

 38384615 CTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCT 38384674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCT 3120

 38384675 CCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGTGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCAT 38384734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGTGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCAT 3180

 38384735 GTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTGAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTT 38384794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTGAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTT 3240

 38384795 CCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGTTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGG 38384854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGTTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGG 3300

 38384855 AACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCTTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTA 38384914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCTTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTA 3360

 38384915 CACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCAATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACC 38384974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCAATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACC 3420

 38384975 CCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCT 38385034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCT 3480

 38385035 CATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACATACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGT 38385094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACATACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGT 3540

 38385095 TACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTC 38385154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTC 3600

 38385155 ATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATATACACCACATTTTCTTTATCCACT 38385214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGTATATACACCACATTTTCTTTATCCACT 3660

 38385215 CATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTA 38385274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTA 3720

 38385275 TAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATAC 38385334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATAATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATAC 3780

 38385335 CTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCC 38385394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGATCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCC 3840

 38385395 ACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTC 38385454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTC 3900

 38385455 CCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCT 38385514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCT 3960

 38385515 TGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGA 38385574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGA 4020

 38385575 TGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCT 38385634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCT 4080

 38385635 ATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGC 38385694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGC 4140

 38385695 AAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCC 38385754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCC 4200

 38385755 ATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAA 38385814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAA 4260

 38385815 AACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCA 38385874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCA 4320

 38385875 TACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCT 38385934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCT 4380

 38385935 CAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCC 38385994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCC 4440

 38385995 GTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACT 38386054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACT 4500

 38386055 TTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAAC 38386114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAAC 4560

 38386115 ATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA 38386174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA 4620

 38386175 A----ATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGG 38386230
          |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 ATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGG 4680

 38386231 CAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGC 38386290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGC 4740

 38386291 ACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAA 38386350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAA 4800

 38386351 AACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACT 38386410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACT 4860

 38386411 TTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATT 38386470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATT 4920

 38386471 TTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTA 38386530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTA 4980

 38386531 TACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAA 38386590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAA 5040

 38386591 GGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGC 38386650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGC 5100

 38386651 CTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGG 38386710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGG 5160

 38386711 CAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTAC 38386770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTAC 5220

 38386771 CATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATA 38386830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATA 5280

 38386831 GATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTT 38386890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTT 5340

 38386891 CCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCAT 38386950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCAT 5400

 38386951 CATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAA 38387010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAA 5460

 38387011 ATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAA 38387070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 ATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAA 5520

 38387071 AGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAG 38387130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAG 5580

 38387131 TAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCT 38387190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCT 5640

 38387191 CAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAA 38387250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAA 5700

 38387251 GCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCT 38387310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATTTAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCT 5760

 38387311 TTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCA 38387370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGGAAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCA 5820

 38387371 CTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATA 38387430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTCATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATA 5880

 38387431 AACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAA 38387490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 AACGCATGACCTACATTTGTTTCATTGCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAA 5940

 38387491 GAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAGCCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCAC 38387550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 GAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAGCCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCAC 6000

 38387551 ATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGA 38387610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 ATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCGCCATTCTAACTGGTGTGA 6060

 38387611 GATGATATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATT 38387670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 GATGATATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATT 6120

 38387671 TTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTATTCTTTTGAGAAGTGCCTGTTCTTA---T 38387727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||      |
     6121 TTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTATTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTC---ATGT 6177

 38387728 CCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTT 38387787
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||.||||||||||||||.|
     6178 CCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGATTTT--CTTGTACATTTGTTTAAGTTCAT 6235

 38387788 TGTAGATTCAGGATATTAGCCCTTTGT 38387814
          |||||||||.|||||||||||||||||
     6236 TGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGT 6262

EXCISED REGION

 38387832 AAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGCCGTG 38387891
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6280 AAAATTTTCTCCCATTTTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTCTTTTGCCGTG 6339

 38387892 CAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCTTTTGTTGCCGTTGCT 38387951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6340 CAGAAGCTCTTCAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCTATTTTGGCTTTTGTTGCCGTTGCT 6399

 38387952 TTTTGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGAAAGACAGT 38388011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6400 TTTTGTGTTTTAGTCATGAAGTCCTTGCTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGAAAGACAGT 6459

 38388012 GTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACT 38388071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6460 GTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACT 6519

 38388072 GGGTATTTACCCAAAGGATTATAAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACGTATGTT 38388131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6520 GGGTATTTACCCAAAGGATTATAAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACGTATGTT 6579

 38388132 TATTGTGGCACTATTCACAATAGCAAACACTTGGAACCAACCCAAATGTCCATCAATGAT 38388191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6580 TATTGTGGCACTATTCACAATAGCAAACACTTGGAACCAACCCAAATGTCCATCAATGAT 6639

 38388192 AGACTGGATTAAGAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAG 38388251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6640 AGACTGGATTAAGAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAG 6699

 38388252 GATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACTATCATTCTGAGCAAA 38388311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6700 GATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACTATCATTCTGAGCAAA 6759

 38388312 CTATCGCTAGGACAGAAAACCAAACACTACATGTTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAAGA 38388371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6760 CTATCGCTAGGACAGAAAACCAAACACTACATGTTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAAGA 6819

 38388372 ATGAGAACACCTGGACACAGGATGGGGAACGTCACACACCAGGGCCTGTTGTGGGGTGGG 38388431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6820 ATGAGAACACCTGGACACAGGATGGGGAACGTCACACACCAGGGCCTGTTGTGGGGGGGG 6879

 38388432 GGGAGGGGGGAGGGAT 38388447
          ||||||||||||||||
     6880 GGGAGGGGGGAGGGAT 6895

Alignment time is 5.18431 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    5457] =>      5457 nucs 'mol-32-34b3-031730_5457'

Score:        5427
Aligned:      5449        nucs
Identic:      5447 (100%) nucs =>      1929 (100%)      3518 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38381819,38383747] EXCISED REGION [38383748,38387267]
 second seq =>  [       1,    1929] EXCISED REGION [    1938,    5457]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [1930,1937]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         9 nucs [1930,1938] to [1938,1946]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1930,1930] to [1937,1937]

 38381819 GAAAATTTTCGCAACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAATGAACT 38381878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAATTTTCGCAACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAATGAACT 60

 38381879 CAAACAATTTTTTTAACTTTTTATCTTGAGATAAATGTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGA 38381938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAACAATTTTTTTAACTTTTTATCTTGAGATAAATGTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGA 120

 38381939 AGTAATACAGAGAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTACCTAGTTTCCCTTAATAGTAACATC 38381998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTAATACAGAGAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTACCTAGTTTCCCTTAATAGTAACATC 180

 38381999 TTTCCTAACTATAGTACAATATCACAGCCAGGAAATTGATGTTGATACAGTCTACCAAAC 38382058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCCTAACTATAGTACAATATCACAGCCAGGAAATTGATGTTGATACAGTCTACCAAAC 240

 38382059 TTATTCAGATCTCACCAGTTATACATGCAGTCATGTGTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTT 38382118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATTCAGATCTCACCAGTTATACATGCAGTCATGTGTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTT 300

 38382119 TTATCACATTTGTAGCGTTATGTGATCACCACTATAGTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTG 38382178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATCACATTTGTAGCGTTATGTGATCACCACTATAGTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTG 360

 38382179 TGGTGGCCCATGCCTATAGTCCCACATAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCA 38382238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTGGCCCATGCCTATAGTCCCACATAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCA 420

 38382239 AAAGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATAGTGCGATCCTGTCTCTACAATAATATTAATAA 38382298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAGTTTGAGTCCAGCCTGGGCAACATAGTGCGATCCTGTCTCTACAATAATATTAATAA 480

 38382299 TAATGAAATTTAAAAAATACAGAACAGTCCCATTACAAGGAACTCCTTATGCACCCTTTA 38382358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAATGAAATTTAAAAAATACAGAACAGTCCCATTACAAGGAACTCCTTATGCACCCTTTA 540

 38382359 TAGCCACAGCCACCTCCCTTCTGCCACCACCACCCGCCAATCCCTAGCAACCATTAATCT 38382418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGCCACAGCCACCTCCCTTCTGCCACCACCACCCGCCAATCCCTAGCAACCATTAATCT 600

 38382419 GGTTTCCACAACTATGATTTTGTCATTTCAAGAATGTTATATAAAATTCATTCATTATGG 38382478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTTTCCACAACTATGATTTTGTCATTTCAAGAATGTTATATAAAATTCATTCATTATGG 660

 38382479 ACTGAATAAAATCATGTGGTATGTAAACTTTTGAGATTACCTTTTTTTACTCAGCATAAT 38382538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTGAATAAAATCATGTGGTATGTAAACTTTTGAGATTACCTTTTTTTACTCAGCATAAT 720

 38382539 TCCCTGGAGATCCGTCTAGGTTGTTATGCATATTGATAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGA 38382598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCCTGGAGATCCGTCTAGGTTGTTATGCATATTGATAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGA 780

 38382599 GTAGTATTTCATGGTATGGATATACCACAGTTAAGTGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGG 38382658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTAGTATTTCATGGTATGGATATACCACAGTTAAGTGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGG 840

 38382659 GTCATTTCCAGTTTTTGAATATTATAACATCCACGTACTTTTTTTGTGTGTGAACATACA 38382718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCATTTCCAGTTTTTGAATATTATAACATCCACGTACTTTTTTTGTGTGTGAACATACA 900

 38382719 TTTTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAATTGCTGTGTTGTATGATAAACATG 38382778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTCATTTCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAATTGCTGTGTTGTATGATAAACATG 960

 38382779 TGTTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCAGAGTAGCCATACCATTTTCCATTC 38382838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTTTAGTTTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCAGAGTAGCCATACCATTTTCCATTC 1020

 38382839 CCTTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACATTATCATTTCAATACGTGTGTAGT 38382898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTTTAGCAATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACATTATCATTTCAATACGTGTGTAGT 1080

 38382899 GATATAGCAACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACTAGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTC 38382958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATATAGCAACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACTAGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTC 1140

 38382959 TTGTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTTCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAA 38383018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGTTTTCACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTTCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAA 1200

 38383019 TTTCACACCTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCC 38383078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTCACACCTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCC 1260

 38383079 CTTGACCATCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGG 38383138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTGACCATCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGG 1320

 38383139 CTGGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAA 38383198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGGCTTTCCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAA 1380

 38383199 AAAATTTAAATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATG 38383258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAATTTAAATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATG 1440

 38383259 ATAAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTG 38383318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATAAGGTTAGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTG 1500

 38383319 CAATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTA 38383378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAATTGAGTCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTA 1560

 38383379 TCTATTTCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGG 38383438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTATTTCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGG 1620

 38383439 TTCTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTAAGTC 38383498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCTGTGACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTAAGTC 1680

 38383499 AGTGAAACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGA 38383558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGTGAAACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGA 1740

 38383559 AAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGG 38383618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGCACATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGG 1800

 38383619 GAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATC 38383678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAAGCATAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATC 1860

 38383679 AGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAG 38383738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGTGAAAATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAG 1920

 38383739 TTTAAAACC 38383747
          |||||||||
     1921 TTTAAAACC 1929

EXCISED REGION

 38383748 TCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCT 38383807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 TCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACCT 1997

 38383808 CTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGA 38383867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 CTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTGA 2057

 38383868 CATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGT 38383927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 CATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAGT 2117

 38383928 CAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGAT 38383987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 CAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGAT 2177

 38383988 ATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATAC 38384047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 ATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATAC 2237

 38384048 AAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACA 38384107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 AAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAACA 2297

 38384108 CCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGA 38384167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 CCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGGA 2357

 38384168 ATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGC 38384227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 ATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCGC 2417

 38384228 CTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAA 38384287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 CTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATAA 2477

 38384288 CACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATAC 38384347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 CACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATAC 2537

 38384348 AGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAA 38384407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 AGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATAA 2597

 38384408 TAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCA 38384467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 TAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATCA 2657

 38384468 TGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTAT 38384527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 TGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTAT 2717

 38384528 TTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGT 38384587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 TTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGGT 2777

 38384588 TGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGT 38384647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 TGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTGT 2837

 38384648 TTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGT 38384707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 TTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAGT 2897

 38384708 GTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTG 38384767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 GTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGTG 2957

 38384768 AGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGT 38384827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 AGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAGT 3017

 38384828 TTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCT 38384887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 TTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTCT 3077

 38384888 TTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCA 38384947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 TTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCCA 3137

 38384948 ATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAA 38385007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 ATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCAA 3197

 38385008 TGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACAT 38385067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 TGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACAT 3257

 38385068 ACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCAT 38385127
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 ACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTAAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCAT 3317

 38385128 CCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGT 38385187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3318 CCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGGT 3377

 38385188 ATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATA 38385247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 ATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCATA 3437

 38385248 TTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATA 38385307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3438 TTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTATA 3497

 38385308 ATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGAT 38385367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3498 ATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGAT 3557

 38385368 CTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTAC 38385427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3558 CTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTAC 3617

 38385428 ATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTT 38385487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3618 ATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTTT 3677

 38385488 TTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTT 38385547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3678 TTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTTT 3737

 38385548 GATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCA 38385607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3738 GATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCCA 3797

 38385608 TTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCT 38385667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3798 TTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATCT 3857

 38385668 ACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACT 38385727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3858 ACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATACT 3917

 38385728 AACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAG 38385787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3918 AACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCAG 3977

 38385788 TTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAG 38385847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3978 TTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGAG 4037

 38385848 TAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGG 38385907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4038 TAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTGG 4097

 38385908 GATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTAC 38385967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4098 GATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTAC 4157

 38385968 ACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATG 38386027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4158 ACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCATG 4217

 38386028 GTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCA 38386087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4218 GTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGCA 4277

 38386088 AAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAA 38386147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4278 AAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAATAAA 4337

 38386148 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGT 38386207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4338 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTTGCACCTGTAGT 4397

 38386208 CCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCA 38386267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4398 CCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCCAGGCTGCA 4457

 38386268 GTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTAC 38386327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4458 GTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGAACCTGTCTTAC 4517

 38386328 AAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGC 38386387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4518 AAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTAAAACTGGTTGC 4577

 38386388 CTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGT 38386447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4578 CTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCTATATCTTGAGT 4637

 38386448 TGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTG 38386507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4638 TGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACTCATAAAATTTG 4697

 38386508 CACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTG 38386567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4698 CACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATAGTTGGGTCCTG 4757

 38386568 GAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCT 38386627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4758 GAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAAACTATCCAGCT 4817

 38386628 TCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTG 38386687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4818 TCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAGTGCATGTGTTG 4877

 38386688 GGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCC 38386747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4878 GGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAGAGAGAAAATCC 4937

 38386748 TTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAA 38386807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4938 TTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAATGGCTAAGAAAA 4997

 38386808 TGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATG 38386867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 TGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATATTAGCTTGATG 5057

 38386868 ACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGA 38386927
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 ACTTTGAGGATATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAAAATGAGTATGA 5117

 38386928 TAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGT 38386987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5118 TAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCACTTAGCACAGT 5177

 38386988 AACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAA 38387047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5178 AACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCATATAGGGACCAA 5237

 38387048 ATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCAC 38387107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 ATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAAGAACTTTCCAC 5297

 38387108 TATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTAC 38387167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 TATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTAGTGCACATTAC 5357

 38387168 TTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTT 38387227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 TTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCATAGGGTAATTT 5417

 38387228 ACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGA 38387267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5418 ACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGA 5457

Alignment time is 4.07394 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    4215] =>      4215 nucs 'mol-32-34be-179524_4215'

Score:        4200
Aligned:      4211        nucs
Identic:      4210 (100%) nucs =>      2751 (100%)      1459 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38383385,38386136] EXCISED REGION [38386137,38387595]
 second seq =>  [       1,    2752] EXCISED REGION [    2757,    4215]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [2753,2756]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [2753,2791] to [2757,2795]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38386136,38386136] to [38386137,38386137]
 second seq =>         1 nucs [2752,2752] to [2757,2757]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38383385 TCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGT 38383444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGT 60

 38383445 GACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTAAGTCAGTGAA 38383504
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
       61 GACCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTTAGTCAGTGAA 120

 38383505 ACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCAC 38383564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCAC 180

 38383565 ATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCA 38383624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCA 240

 38383625 TAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAA 38383684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAA 300

 38383685 AATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAA 38383744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAA 360

 38383745 ACCTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGA 38383804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGA 420

 38383805 CCTCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTC 38383864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTC 480

 38383865 TGACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCAT 38383924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCAT 540

 38383925 AGTCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAA 38383984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAA 600

 38383985 GATATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAA 38384044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAA 660

 38384045 TACAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAA 38384104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAA 720

 38384105 ACACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATA 38384164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATA 780

 38384165 GGAATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCAT 38384224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCAT 840

 38384225 CGCCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCA 38384284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CGCCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCA 900

 38384285 TAACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGA 38384344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGA 960

 38384345 TACAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGA 38384404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGA 1020

 38384405 TAATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAA 38384464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAA 1080

 38384465 TCATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTT 38384524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTT 1140

 38384525 TATTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGA 38384584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGA 1200

 38384585 GGTTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTT 38384644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGTTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTT 1260

 38384645 TGTTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCC 38384704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCC 1320

 38384705 AGTGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAA 38384764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGTGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAA 1380

 38384765 GTGAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTT 38384824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTT 1440

 38384825 AGTTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGT 38384884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGT 1500

 38384885 TCTTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGC 38384944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGC 1560

 38384945 CCAATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTC 38385004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCAATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTC 1620

 38385005 CAATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAA 38385064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAA 1680

 38385065 CATACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTC 38385124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTC 1740

 38385125 CATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCAT 38385184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCAT 1800

 38385185 GGTATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCC 38385244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGTATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCC 1860

 38385245 ATATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGT 38385304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGT 1920

 38385305 ATAATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTA 38385364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTA 1980

 38385365 GATCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTT 38385424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GATCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTT 2040

 38385425 TACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTAT 38385484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TACATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTAT 2100

 38385485 TTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGAT 38385544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGAT 2160

 38385545 TTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGG 38385604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGG 2220

 38385605 CCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAA 38385664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAA 2280

 38385665 TCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATAT 38385724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATAT 2340

 38385725 ACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAG 38385784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACTAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAG 2400

 38385785 CAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAAT 38385844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAAT 2460

 38385845 GAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAAT 38385904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAGTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAAT 2520

 38385905 TGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCC 38385964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGGGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCC 2580

 38385965 TACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGC 38386024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TACACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGC 2640

 38386025 ATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGA 38386084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGA 2700

 38386085 GCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 38386136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCAAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 2752

EXCISED REGION

 38386137 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 38386196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 2816

 38386197 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 38386256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 2876

 38386257 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 38386316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 2936

 38386317 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 38386376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 2996

 38386377 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 38386436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 3056

 38386437 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 38386496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 3116

 38386497 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 38386556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 3176

 38386557 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 38386616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 3236

 38386617 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 38386676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 3296

 38386677 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 38386736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 3356

 38386737 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 38386796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 3416

 38386797 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 38386856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 3476

 38386857 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 38386916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 3536

 38386917 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 38386976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 3596

 38386977 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 38387036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 3656

 38387037 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 38387096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 3716

 38387097 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 38387156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 3776

 38387157 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 38387216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 3836

 38387217 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 38387276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 3896

 38387277 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 38387336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 3956

 38387337 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 38387396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 4016

 38387397 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 38387456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 4076

 38387457 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 38387516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 4136

 38387517 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 38387576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 4196

 38387577 GACTTTTTAATGATCGCCA 38387595
          |||||||||||||||||||
     4197 GACTTTTTAATGATCGCCA 4215

Alignment time is 3.20634 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38376504,38397331] =>     20828 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [       1,    5770] =>      5770 nucs 'mol-32-34d4-140307_5770'

Score:        5723
Aligned:      5767        nucs
Identic:      5763 (100%) nucs =>      4306 (100%)      1457 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38381827,38386136] EXCISED REGION [38386137,38387593]
 second seq =>  [       1,    4309] EXCISED REGION [    4314,    5770]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [4310,4313]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        39 nucs [4310,4348] to [4314,4352]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38386136,38386136] to [38386137,38386137]
 second seq =>         1 nucs [4309,4309] to [4314,4314]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38381827 TCGCAACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAT 38381886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCGCAACCTACTCATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAT 60

 38381887 TTTTTTAACTTTTTATCTTGAGATAAATGTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGAAGTAATAC 38381946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTTAACTTTTTATCTTGAGATAAATGTAGATTTGCATGCAGGTTTAAGAAGTAATAC 120

 38381947 AGAGAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTACCTAGTTTCCCTTAATAGTAACATCTTTCCTAA 38382006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGAGGAAGATCCCGTTTACTGTTTACCTAGTTTCCCTTAATAGTAACATCTTTCCTAA 180

 38382007 CTATAGTACAATATCACAGCCAGGAAATTGATGTTGATACAGTCTACCAAACTTATTCAG 38382066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTATAGTACAATATCACAGCCAGGAAATTGATGTTGATACAGTCTACCAAACTTATTCAG 240

 38382067 ATCTCACCAGTTATACATGCAGTCATGTGTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTTTTATCACA 38382126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCTCACCAGTTATACATGCAGTCATGTGTGTGTATTTAGTTCTATGCAGTTTTATCACA 300

 38382127 TTTGTAGCGTTATGTGATCACCACTATAGTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTGTGGTGGCC 38382186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGTAGCGTTATGTGATCACCACTATAGTCAAGATAGAGAATAGCTGGGTGTGGTGGCC 360

 38382187 CATGCCTATAGTCCCACATAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAAAAGTTTG 38382246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATGCCTATAGTCCCACATAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAAAAGTTTG 420

 38382247 AGTCCAGCCTGGGCAACATAGTGCGATCCTGTCTCTACAATAATATTAATAATAATGAAA 38382306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTCCAGCCTGGGCAACATAGTGCGATCCTGTCTCTACAATAATATTAATAATAATGAAA 480

 38382307 TTTAAAAAATACAGAACAGTCCCATTACAAGGAACTCCTTATGCACCCTTTATAGCCACA 38382366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAAAAAATACAGAACAGTCCCATTACAAGGAACTCCTTATGCACCCTTTATAGCCACA 540

 38382367 GCCACCTCCCTTCTGCCACCACCACCCGCCAATCCCTAGCAACCATTAATCTGGTTTCCA 38382426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCACCTCCCTTCTGCCACCACCACCCGCCAATCCCTAGCAACCATTAATCTGGTTTCCA 600

 38382427 CAACTATGATTTTGTCATTTCAAGAATGTTATATAAAATTCATTCATTATGGACTGAATA 38382486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAACTATGATTTTGTCATTTCAAGAATGTTATATAAAATTCATTCATTATGGACTGAATA 660

 38382487 AAATCATGTGGTATGTAAACTTTTGAGATTACCTTTTTTTACTCAGCATAATTCCCTGGA 38382546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATCATGTGGTATGTAAACTTTTGAGATTACCTTTTTTTACTCAGCATAATTCCCTGGA 720

 38382547 GATCCGTCTAGGTTGTTATGCATATTGATAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGAGTAGTATT 38382606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATCCGTCTAGGTTGTTATGCATATTGATAGCATGTTCCTTTTTACAGCTGAGTAGTATT 780

 38382607 TCATGGTATGGATATACCACAGTTAAGTGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTC 38382666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCATGGTATGGATATACCACAGTTAAGTGTTCACTCCTTAAAGAGCATTTGGGTCATTTC 840

 38382667 CAGTTTTTGAATATTATAACATCCACGTACTTTTTTTGTGTGTGAACATACATTTTCATT 38382726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      841 CAGTTTTTGAATATTATAACATCCACGTACTTTTTTTGTGTGTGAACATATATTTTCATT 900

 38382727 TCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAATTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGT 38382786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTCTGCGATAAATGCTCAAGAGTGAAATTGCTGTGTTGTATGATAAACATGTGTTTAGT 960

 38382787 TTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCAGAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGC 38382846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGTAAGAAACTGTCATGTTCTTTTTCAGAGTAGCCATACCATTTTCCATTCCCTTTAGC 1020

 38382847 AATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACATTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGC 38382906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATGTATGAGTGGTCCAGTGTCTCTACATTATCATTTCAATACGTGTGTAGTGATATAGC 1080

 38382907 AACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACTAGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTC 38382966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACTTTTTTTTGTAATATGATCTGACTAGATATGTGTAAACTCTGTTCCTTCTTGTTTTC 1140

 38382967 ACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTTCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACAC 38383026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACCAGGGATCTTATTTTCTTCAGAGCTTCTAGGCCTAGGGCCTGCTGAGAAATTTCACAC 1200

 38383027 CTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCA 38383086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTATGTCAAATGGTGAGGGGATCTTTTGTTTTCTTAACACCACCTCGTTCCCCTTGACCA 1260

 38383087 TCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCTTT 38383146
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1261 TCCTTCATGAGATGGAGAAGAAAATGAGTTATGTGGGCTCCATAGCTAATGGCTGGCCTT 1320

 38383147 CCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTA 38383206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTTTTTTAAAGAAACTACTCCTAATAGATATGCAGAGGCTTTGTTCCAAAAAAAATTTA 1380

 38383207 AATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTT 38383266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATACATTTTCTGCAAGATATTTTAAGTAAAAAAAATTCAAGATAAAGAATGATAAGGTT 1440

 38383267 AGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAG 38383326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGGACAAGAGTAAATATAAGGTTTAATATATAAAATGCATGAGGTCTCTTGCAATTGAG 1500

 38383327 TCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTC 38383386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCACAAATTTTCCTGTACATTCGTAGAGTTAAGAGAGAAATGTGGTGAATTATCTATTTC 1560

 38383387 ACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGA 38383446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAACACTCATAGGGAAATAATAAACCAGTTTCTCACAGAAACCCAGCCTGGTTCTGTGA 1620

 38383447 CCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTAAGTCAGTGAAAC 38383506
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1621 CCAGAGTGGAAATTCCCCCATGTCTACGGAGGCCACGTAGGTAATGTTAGTCAGTGAAAC 1680

 38383507 AGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACAT 38383566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGATTGGGAATAAGACAATAGGGAGTAGGGGCTGGGGCTGAGTCAAACTGGAAAGCACAT 1740

 38383567 GCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATA 38383626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCACAGTCTAAGGGCAGCTACTACTACTCAGCCTCAGCCAATATTCCAGAGGGAAGCATA 1800

 38383627 AGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAA 38383686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGCCCTGTGTTGCCAGATTTATTTTGACTTTTAATATATTAGCAACTATATCAGTGAAAA 1860

 38383687 TAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAAC 38383746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAATAACTGAACAAAATGCTTCTGTAGTCCAGAGCTGGTCAATCGCTGCCAGTTTAAAAC 1920

 38383747 CTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACC 38383806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCTGGCCTTGAAGAGTAGGCAGAAACATCTAATGCAAGACAATCCTTATAAATATGACC 1980

 38383807 TCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTG 38383866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTTTCAGCCTAGCTTTGGGTAACTATTGAATGTCACTGAGTCGGTGATTAAGCTTTCTG 2040

 38383867 ACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAG 38383926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACATGCACTTAGAATGAAGATTGTATGGATGGTCAGGTATGGTGTCATACACTTTCATAG 2100

 38383927 TCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGA 38383986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCAGCCAACAATAGTAAAAATATGAACAAAAGACTTGAACAGGTGCTTCACGAAAGAAGA 2160

 38383987 TATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATA 38384046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATCCAAATTGCCAATAAATATATTAAAAGCGCTCAATGTTATTAGTCATGAGGAAAATA 2220

 38384047 CAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAAC 38384106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAAATTAAAACCACAGTGAGATAAAACTACATACTCACTAAAATGATAAATATAAAAAAC 2280

 38384107 ACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGG 38384166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACCCACTCAAGTGTGGGTGAAGATGTGGAGTAATTGGAATGCTCGTACATTGCTGATAGG 2340

 38384167 AATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCG 38384226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATGTAAACTTGTACATCCTTGTCATTTCTAATGAAATTTAAGACATTCCTTCCTCATCG 2400

 38384227 CCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATA 38384286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCTAGCAATTTCTTTTTTTCAGGTCATATCCAAATGTTTATTTAACTCATAACCTCCATA 2460

 38384287 ACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATA 38384346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACACATTAAGTTGAACTTACAGAAACGAAAGTAAAGCATTGGAAAATTGATCTGTGGATA 2520

 38384347 CAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATA 38384406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAGGATATTTCTATAGGAAACAAATGTAAAACATGAGACTCAATGAGTTTGATGGTGATA 2580

 38384407 ATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATC 38384466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATAATTAATGCTTAGGATTCAACTTATATTCTAATTAATCTAATTGGGTTAACTACAATC 2640

 38384467 ATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTA 38384526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGAAATATTCCATATTTTCCTCTTATGACTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTAAACTTTTA 2700

 38384527 TTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGG 38384586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTTAGGTTTAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAACTCATGTCATGGGAGG 2760

 38384587 TTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTG 38384646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGTTGTACAGATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTAGTATCCAACAGTTAGGTTTTTTG 2820

 38384647 TTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAG 38384706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTTTTTGTTTGTTTTTCTCCTCTCCCTCCTCCCATCCGCCACCCTTGGGTAGGCCCCAG 2880

 38384707 TGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGT 38384766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGTCTGTTATTCTCCTCTATGTGTCCATGTGTTCCTATCATTTAGCTCCCGCTTGTAAGT 2940

 38384767 GAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAG 38384826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GAGAACATGTGGTACTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAG 3000

 38384827 TTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTC 38384886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTTTTTATTTCAATAGGCTTTTGGGGGAACAGGTGGTGTTTGGTTACATGAATAAGTTC 3060

 38384887 TTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCC 38384946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTAATGGTGATTTCTGAGATTTTGGTACACCCATCACCTGATCAGTGTACACTGTGCCC 3120

 38384947 AATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCA 38385006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATGTGTAGTATTTTATCCCTCGCCACCCCCACCCTTTCCTCCCAAGTCCTCAAAGTCCA 3180

 38385007 ATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACA 38385066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATGTATCATTCTTATGCCTTTGTGCCCTCATAGCTTAGCTCCCACATATGAGTGAGAACA 3240

 38385067 TACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCA 38385126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TACAATGCTTGGTTTTCCATTCTTGAGTTACTTCACTTAGAATAATAGTGTCTAATTCCA 3300

 38385127 TCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGG 38385186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCCAGGTTGCTGTGAATGCCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATGG 3360

 38385187 TATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCAT 38385246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TATATACACCACATTTTCTTTATCCACTCATTGATTGATGGGCATTTGGGCTGGTTCCAT 3420

 38385247 ATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTAT 38385306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTTTTGCAATTACAAATTGTGCTGCTATAAACATGCATGTGCAAGTATCTTTTTCGTAT 3480

 38385307 AATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGA 38385366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AATGACTTCTTTTCCTCTGGGTAGATACCTAGTAGTGGGGTTGCTTGATCAAACAGTAGA 3540

 38385367 TCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTA 38385426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCTACTTGTAGTTTCTTAAGGAATCTCCACGCTGCTTTCCATGTAGGTTATACTAGTTTA 3600

 38385427 CATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTT 38385486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CATTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCCTTTTCACCACATCCATGCCAACATCTATTT 3660

 38385487 TTTTTTATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTT 38385546
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTTT-ATTTTTTGATTATGGCCATTCTTGCAGGAGTGAGGTGGCATCGCATTGTGATTT 3719

 38385547 TGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCC 38385606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TGATTTACATTTCCCTGATAATTAGTGATGTTGAGCATTTCTTTCATATGCTTGTTGGCC 3779

 38385607 ATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATC 38385666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 ATTTGTATAGAGAAAATCTTCACAGTCTATACATCTGACAAAGGACTAATATCCAAAATC 3839

 38385667 TACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATAC 38385726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TACAAAGAACTCAAATAAATCAGCAAGCAAAAAACAATCCCAAAACTTCTAAGTATATAC 3899

 38385727 TAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCA 38385786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TAACCAAAAGAAATGCATGTATATATCCATAGAAAGACTTGGACAAGAATGTTCAGAGCA 3959

 38385787 GTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGA 38385846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 GTTTTATTCAGACTAGCCGTTAACTGAAAACATCCCAAATGTCCATCAACAAGAAAATGA 4019

 38385847 GTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTG 38385906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 GTAAACAAAAAACTTTGGGGTATATTCATACAGTGAATGAGCAATAGAAAGAACTAATTG 4079

 38385907 GGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTA 38385966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 GGATGCATCCAACAGCATGGATTAATCTCAAAAACATTAGGTTGGGTGAAAGAAGCCCTA 4139

 38385967 CACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCAT 38386026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 CACAAAAGAGTATACACTGTATGATTCCGTTTATATAAGGTTCAAAAACAGGCTGGGCAT 4199

 38386027 GGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGC 38386086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 GGTGGCTTGTAACTATAATTCCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATCATTTGAGC 4259

 38386087 AAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 38386136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 AAAGGAGTTCAAGACCAGCATGGGTAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACA 4309

EXCISED REGION

 38386137 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 38386196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATTAGCCAGTCATGGTGGCTT 4373

 38386197 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 38386256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 GCACCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGG 4433

 38386257 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 38386316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 TCCAGGCTGCAGTGAGTCATGTTTGTGCCACTGCACTCCTACCTGGGTGACAGAATGGGA 4493

 38386317 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 38386376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 ACCTGTCTTACAAAAAAAGGATTTAAAGTTCAAAAACAAGCACAACTTGTTGTAATTTTA 4553

 38386377 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 38386436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 AAACTGGTTGCCTCTGTGGGTGGGGGAACTGACTTTAATTCTGAGAGATGGGAATGTTCT 4613

 38386437 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 38386496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 ATATCTTGAGTTGGGTGGTTACATGTTGTATATTTTTGCTAAAATTTTCCAAACTGTACT 4673

 38386497 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 38386556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 CATAAAATTTGCACATTTTACTATATGTAAATTATACCTCATTAATCTACTAAAATAATA 4733

 38386557 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 38386616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 GTTGGGTCCTGGAAAAAAAAAAGCAACTGGACAAGGACACTGCTAGCCTGGCCCAACCAA 4793

 38386617 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 38386676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 ACTATCCAGCTTCACACAGGGAAGAAATGTCAGCCTCCATGTTGGCATGTTGTACTTGAG 4853

 38386677 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 38386736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 TGCATGTGTTGGGCTAGTTCCCACACAGAAATGGCAAAACATGCTTATAGAGTGCCCGAG 4913

 38386737 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 38386796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 AGAGAAAATCCTTCTTTCCCCAGAAGTTTCCTACCATACAGAGAGGCAGTACATGCTAAT 4973

 38386797 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 38386856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 GGCTAAGAAAATGACTTTGGAGTCAAATAACATAGATTCAAATTTTGTCTTTCCCAAATA 5033

 38386857 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 38386916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 TTAGCTTGATGACTTTGAGGAAATTGTTACTGTTCCAAGCCTCTCATTGCTCATCTATAA 5093

 38386917 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 38386976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 AATGAGTATGATAATACCTTCTTCAAAGTATCATCATGGAGATTGTCTGCAAAGTGCTCA 5153

 38386977 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 38387036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 CTTAGCACAGTAACACCCATATGGTATTCAATAAATTGTAGCATTTCATTCTATATTCAT 5213

 38387037 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 38387096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 ATAGGGACCAAATGTCTGAACATCTACCTTTCAAAGCTTATCTAACATCTTCTCCTTAAA 5273

 38387097 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 38387156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 GAACTTTCCACTATTCTAAGACTCCTAGGAAGAGTAACATACTGAGTTCTTAAGGCCTTA 5333

 38387157 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 38387216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 GTGCACATTACTTTTAGAAAAATATGACTTCCCTCAGAGAGAAGCAAGGTGGGTAGGTCA 5393

 38387217 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 38387276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 TAGGGTAATTTACTTGACATAGATGTAAGGGAAAGCACTGCTAAAGGAAGAGGTGTCATT 5453

 38387277 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 38387336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 TAGGATTCCTGTTTGCAAGTAATTGAAATGATCTTTGGCTTAACAGAAGGCAGAGGCTGG 5513

 38387337 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 38387396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 AAAATCAGGCCTAGGCTTACAGAAACCAAGGTCACTCTGTAGGCCTAGGCCACACAATTC 5573

 38387397 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 38387456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 ATACCAACTAACTTAAAGTAGGAAGTAACCAATAAACGCATGACCTACATTTGTTTCATT 5633

 38387457 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 38387516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 GCATCAATTCCTCAAGATCCAAAGTTTGGGGAAAGAGTATCAGAGTTGTCTACTTTGCAG 5693

 38387517 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 38387576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 CCCCAACAGTGTGAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCT 5753

 38387577 GACTTTTTAATGATCGC 38387593
          |||||||||||||||||
     5754 GACTTTTTAATGATCGC 5770

Alignment time is 4.37787 s

