
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   5814] =>      5814 nucs 'mol-32-1e66-062179_5814'

Score:        5418
Aligned:      5869        nucs
Identic:      5774 ( 98%) nucs =>      2515 ( 98%)      3259 ( 98%)
Gaps:           80 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1908546,1911076] EXCISED REGION [1911676,1914988]
 second seq =>  [      1,   2547] EXCISED REGION [   2548,   5814]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       599 nucs [1911077,1911675]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [1911077,1911101] to [1911676,1911700]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1908546 ATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTTTGTATGTATATATGTGTGTCTACAT 1908605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTTTGTATGTATATATGTGTGTCTACAT 60

  1908606 GCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACATATATTGTATATGTATA----T 1908661
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |
       61 GCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACATAT--TGTATATGTATAAATAT 118

  1908662 ACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATTGTATATGTATAAATATA 1908721
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      119 ACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATTGTATATGTATGAATATA 178

  1908722 CATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCATATACACATATATGTGTA 1908781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      179 CATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCATATACACATATACGTGTA 238

  1908782 TATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATA 1908841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 TATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATA 298

  1908842 TGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACACACAAAT 1908901
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
      299 TGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACACA--AAT 356

  1908902 ATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTA 1908961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 ATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTA 416

  1908962 TTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACG 1909021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 TTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACG 476

  1909022 GTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCC 1909081
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 GTGAAATGGTTTTCACCTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCC 536

  1909082 CCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATG 1909141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 CCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATG 596

  1909142 GTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAA 1909201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 GTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAA 656

  1909202 GAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATA 1909261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 GAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATA 716

  1909262 TTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAA 1909321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 TTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAA 776

  1909322 CAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGG 1909381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 CAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGG 836

  1909382 CCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAAT 1909441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 CCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAAT 896

  1909442 CCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCC 1909501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      897 CCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGTGTGTGCCTGTAATCC 956

  1909502 CATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGT 1909561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 CATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGT 1016

  1909562 GAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAA 1909621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 GAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAA 1076

  1909622 AAAA--------AAAAAA----AAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGG 1909669
          ||||        ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 AAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGG 1136

  1909670 TGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGG 1909729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 TGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGG 1196

  1909730 TCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACG 1909789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 TCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACG 1256

  1909790 TTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGA 1909849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 TTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGA 1316

  1909850 ACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTG 1909909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 ACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTG 1376

  1909910 TGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTT 1909969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTT 1436

  1909970 TCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGT 1910029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 TCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGT 1496

  1910030 GCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTG 1910089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 GCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTG 1556

  1910090 GCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAAT 1910149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 GCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAAT 1616

  1910150 TGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCA 1910209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 TGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCA 1676

  1910210 CACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGC 1910269
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1677 CACTGGGGAAACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCACTGAAACAGCGGTTGAAGCAGC 1736

  1910270 GTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAG 1910329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 GTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAG 1796

  1910330 GAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTC 1910389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 GAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTC 1856

  1910390 TTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACC 1910449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACC 1916

  1910450 AAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAA 1910509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 AAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAA 1976

  1910510 GGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCT----G 1910565
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |
     1977 GGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCAC----ACGTG 2032

  1910566 TAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGAC 1910625
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 TAACCCCAGCACTTGCGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGAC 2092

  1910626 CAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGT 1910685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 CAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGT 2152

  1910686 GGTGGC--AGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGA 1910743
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 GGTGG-TTAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGA 2211

  1910744 ACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGA 1910803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 ACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGA 2271

  1910804 CAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAA---TTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAG 1910860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||
     2272 CAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAG 2331

  1910861 GAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGA 1910920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 GAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGA 2391

  1910921 CTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAA 1910980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 CTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAA 2451

  1910981 GGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCA 1911040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 GGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCA 2511

  1911041 ACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 1911076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 ACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 2547

EXCISED REGION

  1911676 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1911735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 2607

  1911736 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1911795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 2667

  1911796 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1911855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 2727

  1911856 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1911915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 2787

  1911916 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1911975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAGTGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 2847

  1911976 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1912035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 2907

  1912036 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1912095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 2967

  1912096 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1912155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 3027

  1912156 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1912215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 3087

  1912216 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1912275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 3147

  1912276 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 1912335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 3207

  1912336 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 1912395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 3267

  1912396 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 1912455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 3327

  1912456 GCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 1912515
          |.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 GTGATACAGAGATGAAAGATTGATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 3387

  1912516 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 1912575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 3447

  1912576 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 1912635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 3507

  1912636 TAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGT 1912695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 TAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGT 3567

  1912696 GGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGT 1912755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 GGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGT 3627

  1912756 AGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAGAT 1912815
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||
     3628 AGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT---------AGAT 3678

  1912816 AGATAGATAGAAACATAGATGATAGGAGACAGGTACATAGATATCTGGATGGATAGATAG 1912875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 AGATAGATAGAAACATAGATGATAGGAGACAGGTACATAGATATCTGGATGGATAGATAG 3738

  1912876 GAGATAGACGACAGATAGATAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAGATAATAGATAAG 1912935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 GAGATAGACGACAGATAGATAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAGATAATAGATAAG 3798

  1912936 TAAATAGGTAGATAGTAGACAGAGATAGAAGATAGATAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTA 1912995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 TAAATAGGTAGATAGTAGACAGAGATAGAAGATAGATAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTA 3858

  1912996 GATAGGTAGATAGAAAAGTAACTGGTAGATAGATAGAAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGGT 1913055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 GATAGGTAGATAGAAAAGTAACTGGTAGATAGATAGAAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGGT 3918

  1913056 AGATAGAAAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATAG 1913115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 AGATAGAAAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATAG 3978

  1913116 ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGATAGATAGTAGATAGATAG 1913175
          |||||||                       |||||||||||||||||||    |||||||
     3979 ATAGATA-----------------------GATAGACAAAGATAGATAG----TAGATAG 4011

  1913176 TAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGAGATAGATGATAGATAGG 1913235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 TAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGAGATAGATGATAGATAGG 4071

  1913236 AGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATAGAGCCATATACACTGAG 1913295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 AGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATAGAGCCATATACACTGAG 4131

  1913296 GTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGATGTATATATAGAGAGAGA 1913355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 GTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGATGTATATATAGAGAGAGA 4191

  1913356 ACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTGTGTCACTGCGTACATTT 1913415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 ACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTGTGTCACTGCGTACATTT 4251

  1913416 TCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTCCCAGGGGTAAAGGGGTG 1913475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 TCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTCCCAGGGGTAAAGGGGTG 4311

  1913476 TGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCAGCCTCACACACAAACCC 1913535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4312 TGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCAGCCCCACACACAAACCC 4371

  1913536 CACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCTGGATTTCCTGGAGAGGC 1913595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 CACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCTGGATTTCCTGGAGAGGC 4431

  1913596 TCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCTCCAGTTTGGTCACCAAG 1913655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 TCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCTCCAGTTTGGTCACCAAG 4491

  1913656 AGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGTGGGTTGAGTAGATGGTG 1913715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4492 AGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGTGGGTTGAGTAGATGGTG 4551

  1913716 TCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAGGGCTGCGTGGACAGTGC 1913775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 TCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAGGGCTGCGTGGACAGTGC 4611

  1913776 ACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGACTCCGGGTCCACCACAT 1913835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 ACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGACTCCGGGTCCACCACAT 4671

  1913836 TGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAGTCCCTTCCTCACCTGAG 1913895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 TGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAGTCCCTTCCTCACCTGAG 4731

  1913896 CCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCCAGTCTATCTACTTATCT 1913955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 CCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCCAGTCTATCTACTTATCT 4791

  1913956 ATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATCTAT 1914015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 ATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATCTAT 4851

  1914016 ATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTATTATCTATCTATATCTAT 1914075
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||
     4852 ATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTAT----TATCTATATCTAT 4907

  1914076 CTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCTATTTATCTATCTAGCTA 1914135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4908 CTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCTATTTATCTATCTAGCTA 4967

  1914136 TCTATGTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATATATCTATGTATCTATGTATTATG 1914195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4968 TCTATGTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATGTATCTATGTATCTATGTATTATG 5027

  1914196 TATCTATCTTCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTATCTCTATCTATCATCTATGTA 1914255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     5028 TATCTATCTTCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTATCTCTATCTATCAGCTATGTA 5087

  1914256 TCTCTCTATCTAGCTATCTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATCTATGTATGTAT 1914315
          |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||
     5088 TCTCTCTATCTAGCTATCTATGTATCTAG----TATCTATCTAGCTATCTATGTATGTAT 5143

  1914316 CTATGTATTATCTATCTTCTATCTATCCATCCATATATCTATCATCAGTCAATCAATCCT 1914375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5144 CTATGTATTATCTATCTTCTATCTATCCATCCATATATCTATCATCAGTCAATCAATCCT 5203

  1914376 TTCATCGCTGTATCGCTCTATCCAGGTATCTTATCTATTTATTTTTCTCTTTCTATATTT 1914435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5204 TTCATCGCTGTATCGCTCTATCCAGGTATCTTATCTATTTATTTTTCTCTTTCTATATTT 5263

  1914436 CTGTATCTCTAACTCATCTATATACAGTCATCCCTTGTTATCTGTGAGGGATTGGTTCCA 1914495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5264 CTGTATCTCTAACTCATCTATATACAGTCATCCCTTGTTATCTGTGAGGGATTGGTTCCA 5323

  1914496 GGACACACGACAGATAATAGTAAAATTCATGGATGTGGCTGATATAAAATGGTGTAGTAT 1914555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5324 GGACACACGACAGATAATAGTAAAATTCATGGATGTGGCTGATATAAAATGGTGTAGTAT 5383

  1914556 TTGCATATTAGCTATGCACATCCTTCCAAATACCTTCAATTGCCTCTATATTACTTATAA 1914615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5384 TTGCATATTAGCTATGCACATCCTTCCAAATACCTTCAATTGCCTCTATATTACTTATAA 5443

  1914616 TACTTAATACAATGTAAGTGCTATGTAAATAGTTACTATACCATATTGTTCAGGGAATAA 1914675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5444 TACTTAATACAATGTAAGTGCTATGTAAATAGTTACTATACCATATTGTTCAGGGAATAA 5503

  1914676 TGTTTTAAAAAGTCTGTACATGTTCAGTACAGATGCATTTTTTTCCAAATATTTTTCATC 1914735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5504 TGTTTTAAAAAGTCTGTACATGTTCAGTACAGATGCATTTTTTTCCAAATATTTTTCATC 5563

  1914736 TGTGGTTGGTTGAATCCACGGATTTGGAAGCCACAGATATGAACAGCCAACTCTGTGTGA 1914795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 TGTGGTTGGTTGAATCCACGGATTTGGAAGCCACAGATATGAACAGCCAACTCTGTGTGA 5623

  1914796 GTGTGTGGGTATATATACATATGTATGTGTGTATACATGTATATGTATATATGTATGTGT 1914855
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     5624 GTGTGTGGGTATATATACATATGTATGTGTGTATACATGTATATGTATATACGTATGTGT 5683

  1914856 ATATATGTATGTGTGTATATGTGTATATATGTGCGTATAGATGTATGTGTGTATATATGT 1914915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5684 ATATATGTATGTGTGTATATGTGTATATATGTGCGTATAGATGTATGTGTGTATATATGT 5743

  1914916 ACATGTATATATGTGTGAGTGTATATATGTGTGTGTATATGTATATGTGCATTTATATGT 1914975
          ||||||||||||||.||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
     5744 ACATGTATATATGTATGAGTGTATATA--TGTGTGTATATGTATATGTGCATTTATATGT 5801

  1914976 ATATATGTATATG 1914988
          |||||||||||||
     5802 ATATATGTATATG 5814

Alignment time is 7.92573 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   2593] =>      2593 nucs 'mol-32-1e66-062179_2593'

Score:        2394
Aligned:      2565        nucs
Identic:      2538 ( 99%) nucs =>      1072 ( 99%)      1466 ( 99%)
Gaps:           20 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1908546,1909625] EXCISED REGION [1909629,1911101]
 second seq =>  [      1,   1080] EXCISED REGION [   1096,   2572]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [1909626,1909628]
 second seq =>        15 nucs [1081,1095]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        22 nucs [1909617,1909638] to [1909620,1909641]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [1909617,1909625] to [1909629,1909637]
 second seq =>         9 nucs [1072,1080] to [1096,1104]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1909626,1909626] to [1909628,1909628]
 second seq =>         1 nucs [1081,1081] to [1095,1095]

  1908546 ATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTTTGTATGTATATATGTGTGTCTACAT 1908605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTTTGTATGTATATATGTGTGTCTACAT 60

  1908606 GCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACATATATTGTATATGTATA----T 1908661
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |
       61 GCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACATAT--TGTATATGTATAAATAT 118

  1908662 ACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATTGTATATGTATAAATATA 1908721
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      119 ACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATTGTATATGTATGAATATA 178

  1908722 CATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCATATACACATATATGTGTA 1908781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      179 CATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCATATACACATATACGTGTA 238

  1908782 TATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATA 1908841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 TATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATA 298

  1908842 TGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACACACAAAT 1908901
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
      299 TGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACACA--AAT 356

  1908902 ATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTA 1908961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 ATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTA 416

  1908962 TTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACG 1909021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 TTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACG 476

  1909022 GTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCC 1909081
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 GTGAAATGGTTTTCACCTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCC 536

  1909082 CCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATG 1909141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 CCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATG 596

  1909142 GTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAA 1909201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 GTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAA 656

  1909202 GAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATA 1909261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 GAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATA 716

  1909262 TTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAA 1909321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 TTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAA 776

  1909322 CAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGG 1909381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 CAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGG 836

  1909382 CCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAAT 1909441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 CCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAAT 896

  1909442 CCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCC 1909501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      897 CCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGTGTGTGCCTGTAATCC 956

  1909502 CATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGT 1909561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 CATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGT 1016

  1909562 GAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAA 1909621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 GAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAA 1076

  1909622 AAAA 1909625
          ||||
     1077 AAAA 1080

EXCISED REGION

  1909629 AAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTC 1909688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 AAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTC 1155

  1909689 CAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCA 1909748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 CAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCA 1215

  1909749 AGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAA 1909808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 AGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAA 1275

  1909809 AACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCA 1909868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 AACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCA 1335

  1909869 ATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTG 1909928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 ATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTG 1395

  1909929 GAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCA 1909988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 GAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCA 1455

  1909989 GCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTT 1910048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 GCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTT 1515

  1910049 CTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACA 1910108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 CTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACA 1575

  1910109 TTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGC 1910168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 TTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGC 1635

  1910169 AAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACC 1910228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1636 AAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGAAACTGGGACC 1695

  1910229 AGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAAC 1910288
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 AGATCCAAAGCCAGCAGCACTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAAC 1755

  1910289 AGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTA 1910348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 AGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTA 1815

  1910349 AATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACAC 1910408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 AATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACAC 1875

  1910409 ACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACAT 1910468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 ACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACAT 1935

  1910469 TGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAA 1910528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 TGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAA 1995

  1910529 AAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCC---TGTAACCCCAGCACTTGGGGAG 1910585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||.||||
     1996 AAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCAC---ACGTGTAACCCCAGCACTTGCGGAG 2052

  1910586 GCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGA 1910645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 GCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGA 2112

  1910646 AACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGC--AGGTATCTGTCA 1910703
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||
     2113 AACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGG-TTAGGTATCTGTCA 2171

  1910704 TCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGC 1910763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGC 2231

  1910764 AGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCA 1910823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 AGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCA 2291

  1910824 AAAAAAAAAAA---ATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATC 1910880
          |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 AAAAAAAAAAAAATATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATC 2351

  1910881 CACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGAT 1910940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 CACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGAT 2411

  1910941 GACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTG 1911000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 GACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTG 2471

  1911001 AAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGG 1911060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 AAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGG 2531

  1911061 GACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAG 1911101
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 GACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAG 2572

Alignment time is 11.417 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   5207] =>      5207 nucs 'mol-32-1e87-181665_5207'

Score:        5162
Aligned:      5184        nucs
Identic:      5182 (100%) nucs =>      3262 (100%)      1920 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1909831,1913094] EXCISED REGION [1913099,1915018]
 second seq =>  [     25,   3287] EXCISED REGION [   3288,   5207]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [1913095,1913098]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        47 nucs [1913095,1913141] to [1913099,1913145]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [1913092,1913094] to [1913099,1913101]
 second seq =>         3 nucs [3285,3287] to [3288,3290]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1909831 GCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAG 1909890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       25 GCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAG 84

  1909891 CCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTAT 1909950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       85 CCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTAT 144

  1909951 GAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTT 1910010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      145 GAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTT 204

  1910011 CCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCC 1910070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      205 CCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCC 264

  1910071 CAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCT 1910130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      265 CAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCT 324

  1910131 GAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAAT 1910190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 GAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAAT 384

  1910191 TTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTG 1910250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 TTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTG 444

  1910251 AAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCG 1910310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 AAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCG 504

  1910311 TGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGT 1910370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 TGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGT 564

  1910371 CTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCT 1910430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 CTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCT 624

  1910431 CAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCA 1910490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 CAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCA 684

  1910491 GTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCAC 1910550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 GTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCAC 744

  1910551 GGTGGCTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGG 1910610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 GGTGGCTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGG 804

  1910611 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAA 1910670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAA 864

  1910671 AAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAG 1910730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 AAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAG 924

  1910731 GAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCT 1910790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 GAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCT 984

  1910791 TCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAGTAGTGTAC 1910850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 TCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAGTAGTGTAC 1044

  1910851 AAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACAC 1910910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 AAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACAC 1104

  1910911 ACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGA 1910970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 ACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGA 1164

  1910971 TTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAG 1911030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 TTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAG 1224

  1911031 TTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTG 1911090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 TTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTG 1284

  1911091 CTGGCTGCAAGTACAGGATCTCAAACATGGTTTATCTATGTTGCCTATATTTTTTGGAGA 1911150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 CTGGCTGCAAGTACAGGATCTCAAACATGGTTTATCTATGTTGCCTATATTTTTTGGAGA 1344

  1911151 GGAAGCGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTG 1911210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 GGAAGCGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTG 1404

  1911211 TAACCCCAGCACTTGGGGAGGCCGAGGCTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAGTTCGAGAC 1911270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 TAACCCCAGCACTTGGGGAGGCCGAGGCTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAGTTCGAGAC 1464

  1911271 CAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCAT 1911330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 CAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCAT 1524

  1911331 GGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGTTACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAATTGCTTGAAC 1911390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 GGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGTTACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAATTGCTTGAAC 1584

  1911391 CCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGAGTGACA 1911450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 CCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGAGTGACA 1644

  1911451 GAGCAAGACTGGCTCAAAAAAAAAATTATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGTAGGAGAGAA 1911510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 GAGCAAGACTGGCTCAAAAAAAAAATTATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGTAGGAGAGAA 1704

  1911511 GACTGGGAAGATTGGCATCTTGGGAAGATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTGAGTTATGAC 1911570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 GACTGGGAAGATTGGCATCTTGGGAAGATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTGAGTTATGAC 1764

  1911571 TGGAAGGGAGGCTTCAGGTACTCGGAGGAAACATGGGGATTAAAAGCACAAGAAAACAGT 1911630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 TGGAAGGGAGGCTTCAGGTACTCGGAGGAAACATGGGGATTAAAAGCACAAGAAAACAGT 1824

  1911631 CATTTTGCAACAGGAATATATCTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGGACCCATTGC 1911690
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 CATTTTGCAACAGGAATACATCTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGGACCCATTGC 1884

  1911691 TGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGGGCAGAATCA 1911750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 TGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGGGCAGAATCA 1944

  1911751 CCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCCATTCTGGAG 1911810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 CCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCCATTCTGGAG 2004

  1911811 ACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGATCTCCAGCCT 1911870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 ACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGATCTCCAGCCT 2064

  1911871 AGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAAGAAGGGACT 1911930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 AGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAAGAAGGGACT 2124

  1911931 TGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAAACGAGGTTT 1911990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 TGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAAACGAGGTTT 2184

  1911991 CTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAACTAATTTGAG 1912050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 CTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAACTAATTTGAG 2244

  1912051 TAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCAGAGAGATGG 1912110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 TAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCAGAGAGATGG 2304

  1912111 AGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGGAGGCGCGCG 1912170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 AGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGGAGGCGCGCG 2364

  1912171 TGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTTTGCTCTCAG 1912230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 TGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTTTGCTCTCAG 2424

  1912231 ACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGATTGAAGGTATCTGGA 1912290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 ACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGATTGAAGGTATCTGGA 2484

  1912291 AAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAAGGGACATCCATGAAT 1912350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 AAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAAGGGACATCCATGAAT 2544

  1912351 TTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGATAACAAGGGATGACTG 1912410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 TTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGATAACAAGGGATGACTG 2604

  1912411 TATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGGGCGATACAGAGATGA 1912470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 TATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGGGCGATACAGAGATGA 2664

  1912471 AAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAGATAAATACATAGATA 1912530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 AAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAGATAAATACATAGATA 2724

  1912531 CATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACATAGATAGATGATAGA 1912590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 CATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACATAGATAGATGATAGA 2784

  1912591 AAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAATAGATAGTAGACAGA 1912650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 AAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAATAGATAGTAGACAGA 2844

  1912651 AGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGTGGTAGATAGATAGAT 1912710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 AGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGTGGTAGATAGATAGAT 2904

  1912711 AGAAGACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGA 1912770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 AGAAGACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGA 2964

  1912771 TGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAGATAGATAGATAGAAACA 1912830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     2965 TGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA-GATAGATAGATAGAAACA 3023

  1912831 TAGATGATAGGAGACAGGTACATAGATATCTGGATGGATAGATAGGAGATAGACGACAGA 1912890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 TAGATGATAGGAGACAGGTACATAGATATCTGGATGGATAGATAGGAGATAGACGACAGA 3083

  1912891 TAGATAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAGATAATAGATAAGTAAATAGGTAGATAG 1912950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 TAGATAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAGATAATAGATAAGTAAATAGGTAGATAG 3143

  1912951 TAGACAGAGATAGAAGATAGATAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGGTAGATAGAA 1913010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 TAGACAGAGATAGAAGATAGATAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGGTAGATAGAA 3203

  1913011 AAGTAACTGGTAGATAGATAGAAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGGTAGATAGAAAGACAGT 1913070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 AAGTAACTGGTAGATAGATAGAAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGGTAGATAGAAAGACAGT 3263

  1913071 AGACAGGTAGCTGTGTAGACAGAT 1913094
          ||||||||||||||||||||||||
     3264 AGACAGGTAGCTGTGTAGACAGAT 3287

EXCISED REGION

  1913099 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGAT 1913158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGAT 3347

  1913159 AGATAGTAGATAGATAGTAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGA 1913218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 AGATAGTAGATAGATAGTAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGA 3407

  1913219 GATAGATGATAGATAGGAGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATA 1913278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 GATAGATGATAGATAGGAGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATA 3467

  1913279 GAGCCATATACACTGAGGTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGAT 1913338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 GAGCCATATACACTGAGGTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGAT 3527

  1913339 GTATATATAGAGAGAGAACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTG 1913398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 GTATATATAGAGAGAGAACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTG 3587

  1913399 TGTCACTGCGTACATTTTCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTC 1913458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 TGTCACTGCGTACATTTTCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTC 3647

  1913459 CCAGGGGTAAAGGGGTGTGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCA 1913518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 CCAGGGGTAAAGGGGTGTGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCA 3707

  1913519 GCCTCACACACAAACCCCACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCT 1913578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 GCCTCACACACAAACCCCACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCT 3767

  1913579 GGATTTCCTGGAGAGGCTCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCT 1913638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 GGATTTCCTGGAGAGGCTCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCT 3827

  1913639 CCAGTTTGGTCACCAAGAGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGT 1913698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 CCAGTTTGGTCACCAAGAGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGT 3887

  1913699 GGGTTGAGTAGATGGTGTCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAG 1913758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 GGGTTGAGTAGATGGTGTCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAG 3947

  1913759 GGCTGCGTGGACAGTGCACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGA 1913818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 GGCTGCGTGGACAGTGCACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGA 4007

  1913819 CTCCGGGTCCACCACATTGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAG 1913878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 CTCCGGGTCCACCACATTGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAG 4067

  1913879 TCCCTTCCTCACCTGAGCCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCC 1913938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 TCCCTTCCTCACCTGAGCCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCC 4127

  1913939 AGTCTATCTACTTATCTATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCT 1913998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 AGTCTATCTACTTATCTATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCT 4187

  1913999 ATCTACTATCTATCTATATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTAT 1914058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 ATCTACTATCTATCTATATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTAT 4247

  1914059 TATCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCT 1914118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4248 TATCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCT 4307

  1914119 ATTTATCTATCTAGCTATCTATGTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATATATCTA 1914178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4308 ATTTATCTATCTAGCTATCTATGTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATATATCTA 4367

  1914179 TGTATCTATGTATTATGTATCTATCTTCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTATCTC 1914238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 TGTATCTATGTATTATGTATCTATCTTCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTATCTC 4427

  1914239 TATCTATCATCTATGTATCTCTCTATCTAGCTATCTATGTATCTAGTATCTATCTATCTA 1914298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 TATCTATCATCTATGTATCTCTCTATCTAGCTATCTATGTATCTAGTATCTATCTATCTA 4487

  1914299 GCTATCTATGTATGTATCTATGTATTATCTATCTTCTATCTATCCATCCATATATCTATC 1914358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 GCTATCTATGTATGTATCTATGTATTATCTATCTTCTATCTATCCATCCATATATCTATC 4547

  1914359 ATCAGTCAATCAATCCTTTCATCGCTGTATCGCTCTATCCAGGTATCTTATCTATTTATT 1914418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4548 ATCAGTCAATCAATCCTTTCATCGCTGTATCGCTCTATCCAGGTATCTTATCTATTTATT 4607

  1914419 TTTCTCTTTCTATATTTCTGTATCTCTAACTCATCTATATACAGTCATCCCTTGTTATCT 1914478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4608 TTTCTCTTTCTATATTTCTGTATCTCTAACTCATCTATATACAGTCATCCCTTGTTATCT 4667

  1914479 GTGAGGGATTGGTTCCAGGACACACGACAGATAATAGTAAAATTCATGGATGTGGCTGAT 1914538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4668 GTGAGGGATTGGTTCCAGGACACACGACAGATAATAGTAAAATTCATGGATGTGGCTGAT 4727

  1914539 ATAAAATGGTGTAGTATTTGCATATTAGCTATGCACATCCTTCCAAATACCTTCAATTGC 1914598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4728 ATAAAATGGTGTAGTATTTGCATATTAGCTATGCACATCCTTCCAAATACCTTCAATTGC 4787

  1914599 CTCTATATTACTTATAATACTTAATACAATGTAAGTGCTATGTAAATAGTTACTATACCA 1914658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4788 CTCTATATTACTTATAATACTTAATACAATGTAAGTGCTATGTAAATAGTTACTATACCA 4847

  1914659 TATTGTTCAGGGAATAATGTTTTAAAAAGTCTGTACATGTTCAGTACAGATGCATTTTTT 1914718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4848 TATTGTTCAGGGAATAATGTTTTAAAAAGTCTGTACATGTTCAGTACAGATGCATTTTTT 4907

  1914719 TCCAAATATTTTTCATCTGTGGTTGGTTGAATCCACGGATTTGGAAGCCACAGATATGAA 1914778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4908 TCCAAATATTTTTCATCTGTGGTTGGTTGAATCCACGGATTTGGAAGCCACAGATATGAA 4967

  1914779 CAGCCAACTCTGTGTGAGTGTGTGGGTATATATACATATGTATGTGTGTATACATGTATA 1914838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4968 CAGCCAACTCTGTGTGAGTGTGTGGGTATATATACATATGTATGTGTGTATACATGTATA 5027

  1914839 TGTATATATGTATGTGTATATATGTATGTGTGTATATGTGTATATATGTGCGTATAGATG 1914898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5028 TGTATATATGTATGTGTATATATGTATGTGTGTATATGTGTATATATGTGCGTATAGATG 5087

  1914899 TATGTGTGTATATATGTACATGTATATATGTGTGAGTGTATATATGTGTGTGTATATGTA 1914958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5088 TATGTGTGTATATATGTACATGTATATATGTGTGAGTGTATATATGTGTGTGTATATGTA 5147

  1914959 TATGTGCATTTATATGTATATATGTATATGTGCATATATGTATGTGTATATATGTACACG 1915018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5148 TATGTGCATTTATATGTATATATGTATATGTGCATATATGTATGTGTATATATGTACACG 5207

Alignment time is 4.04134 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   3396] =>      3396 nucs 'mol-32-1f00-071667_3396'

Score:        3375
Aligned:      3397        nucs
Identic:      3395 (100%) nucs =>      2028 (100%)      1367 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1910742,1912771] EXCISED REGION [1913099,1914465]
 second seq =>  [      1,   2029] EXCISED REGION [   2030,   3396]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       327 nucs [1912772,1913098]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        40 nucs [1912772,1912811] to [1913099,1913138]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [1912769,1912771] to [1913099,1913101]
 second seq =>         3 nucs [2027,2029] to [2030,2032]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [1912772,1912775] to [1913095,1913098]
 second seq =>         0 nucs

  1910742 GAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGT 1910801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGT 60

  1910802 GACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGG 1910861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
       61 GACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAA-TTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGG 119

  1910862 AGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGAC 1910921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 AGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGAC 179

  1910922 TCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAG 1910981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 TCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAG 239

  1910982 GCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAA 1911041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 GCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAA 299

  1911042 CAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAG 1911101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 CAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAG 359

  1911102 TACAGGATCTCAAACATGGTTTATCTATGTTGCCTATATTTTTTGGAGAGGAAGCGGGCT 1911161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 TACAGGATCTCAAACATGGTTTATCTATGTTGCCTATATTTTTTGGAGAGGAAGCGGGCT 419

  1911162 TGCTTTGTTTAAAAAATTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGTAACCCCAGCA 1911221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TGCTTTGTTTAAAAAATTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGTAACCCCAGCA 479

  1911222 CTTGGGGAGGCCGAGGCTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 1911281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 CTTGGGGAGGCCGAGGCTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 539

  1911282 ACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGGGCA 1911341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 ACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGGGCA 599

  1911342 CCTGTAATTCCAGTTACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAATTGCTTGAACCCGGGAGGCGG 1911401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CCTGTAATTCCAGTTACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAATTGCTTGAACCCGGGAGGCGG 659

  1911402 AGGTTGCAGCGAGCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCAAGACTG 1911461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 AGGTTGCAGCGAGCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCAAGACTG 719

  1911462 GCTCAAAAAAAAAATTATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGTAGGAGAGAAGACTGGGAAGA 1911521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GCTCAAAAAAAAAATTATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGTAGGAGAGAAGACTGGGAAGA 779

  1911522 TTGGCATCTTGGGAAGATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTGAGTTATGACTGGAAGGGAGG 1911581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTGGCATCTTGGGAAGATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTGAGTTATGACTGGAAGGGAGG 839

  1911582 CTTCAGGTACTCGGAGGAAACATGGGGATTAAAAGCACAAGAAAACAGTCATTTTGCAAC 1911641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CTTCAGGTACTCGGAGGAAACATGGGGATTAAAAGCACAAGAAAACAGTCATTTTGCAAC 899

  1911642 AGGAATATATCTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGC 1911701
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AGGAATACATCTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGC 959

  1911702 ACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCA 1911761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCA 1019

  1911762 CCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGG 1911821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGG 1079

  1911822 GTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCA 1911881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCA 1139

  1911882 GGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTC 1911941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTC 1199

  1911942 TATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCAT 1912001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCAT 1259

  1912002 TCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGG 1912061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGG 1319

  1912062 TGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAG 1912121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAG 1379

  1912122 CCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGT 1912181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGT 1439

  1912182 TAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCA 1912241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCA 1499

  1912242 GAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGATTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGT 1912301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGATTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGT 1559

  1912302 GGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAAGGGACATCCATGAATTTTACTAGCAT 1912361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAAGGGACATCCATGAATTTTACTAGCAT 1619

  1912362 CTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGATAACAAGGGATGACTGTATATAGATGA 1912421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGATAACAAGGGATGACTGTATATAGATGA 1679

  1912422 CTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGGGCGATACAGAGATGAAAGATTAATTG 1912481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGGGCGATACAGAGATGAAAGATTAATTG 1739

  1912482 ATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAGATAAATACATAGATACATAGATAGAC 1912541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAGATAAATACATAGATACATAGATAGAC 1799

  1912542 GACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACATAGATAGATGATAGAAAGATAGATGA 1912601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACATAGATAGATGATAGAAAGATAGATGA 1859

  1912602 TAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAATAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGT 1912661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAATAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGT 1919

  1912662 AGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGTGGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGT 1912721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGTGGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGT 1979

  1912722 CGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGAT 1912771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGAT 2029

EXCISED REGION

  1913099 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGAT 1913158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGAT 2089

  1913159 AGATAGTAGATAGATAGTAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGA 1913218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 AGATAGTAGATAGATAGTAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGA 2149

  1913219 GATAGATGATAGATAGGAGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATA 1913278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 GATAGATGATAGATAGGAGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATA 2209

  1913279 GAGCCATATACACTGAGGTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGAT 1913338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 GAGCCATATACACTGAGGTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGAT 2269

  1913339 GTATATATAGAGAGAGAACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTG 1913398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 GTATATATAGAGAGAGAACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTG 2329

  1913399 TGTCACTGCGTACATTTTCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTC 1913458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 TGTCACTGCGTACATTTTCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTC 2389

  1913459 CCAGGGGTAAAGGGGTGTGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCA 1913518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 CCAGGGGTAAAGGGGTGTGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCA 2449

  1913519 GCCTCACACACAAACCCCACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCT 1913578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 GCCTCACACACAAACCCCACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCT 2509

  1913579 GGATTTCCTGGAGAGGCTCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCT 1913638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 GGATTTCCTGGAGAGGCTCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCT 2569

  1913639 CCAGTTTGGTCACCAAGAGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGT 1913698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 CCAGTTTGGTCACCAAGAGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGT 2629

  1913699 GGGTTGAGTAGATGGTGTCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAG 1913758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 GGGTTGAGTAGATGGTGTCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAG 2689

  1913759 GGCTGCGTGGACAGTGCACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGA 1913818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 GGCTGCGTGGACAGTGCACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGA 2749

  1913819 CTCCGGGTCCACCACATTGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAG 1913878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 CTCCGGGTCCACCACATTGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAG 2809

  1913879 TCCCTTCCTCACCTGAGCCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCC 1913938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 TCCCTTCCTCACCTGAGCCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCC 2869

  1913939 AGTCTATCTACTTATCTATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCT 1913998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 AGTCTATCTACTTATCTATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCT 2929

  1913999 ATCTACTATCTATCTATATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTAT 1914058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 ATCTACTATCTATCTATATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTAT 2989

  1914059 TATCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCT 1914118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 TATCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCT 3049

  1914119 ATTTATCTATCTAGCTATCTATGTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATATATCTA 1914178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 ATTTATCTATCTAGCTATCTATGTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATATATCTA 3109

  1914179 TGTATCTATGTATTATGTATCTATCTTCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTATCTC 1914238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 TGTATCTATGTATTATGTATCTATCTTCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTATCTC 3169

  1914239 TATCTATCATCTATGTATCTCTCTATCTAGCTATCTATGTATCTAGTATCTATCTATCTA 1914298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 TATCTATCATCTATGTATCTCTCTATCTAGCTATCTATGTATCTAGTATCTATCTATCTA 3229

  1914299 GCTATCTATGTATGTATCTATGTATTATCTATCTTCTATCTATCCATCCATATATCTATC 1914358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 GCTATCTATGTATGTATCTATGTATTATCTATCTTCTATCTATCCATCCATATATCTATC 3289

  1914359 ATCAGTCAATCAATCCTTTCATCGCTGTATCGCTCTATCCAGGTATCTTATCTATTTATT 1914418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 ATCAGTCAATCAATCCTTTCATCGCTGTATCGCTCTATCCAGGTATCTTATCTATTTATT 3349

  1914419 TTTCTCTTTCTATATTTCTGTATCTCTAACTCATCTATATACAGTCA 1914465
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 TTTCTCTTTCTATATTTCTGTATCTCTAACTCATCTATATACAGTCA 3396

Alignment time is 2.5894 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   2654] =>      2654 nucs 'mol-32-2081-063063_2654'

Score:        2643
Aligned:      2654        nucs
Identic:      2653 (100%) nucs =>      1509 (100%)      1144 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1911262,1912771] EXCISED REGION [1913099,1914242]
 second seq =>  [      1,   1510] EXCISED REGION [   1511,   2654]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       327 nucs [1912772,1913098]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        40 nucs [1912772,1912811] to [1913099,1913138]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [1912769,1912771] to [1913099,1913101]
 second seq =>         3 nucs [1508,1510] to [1511,1513]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [1912772,1912775] to [1913095,1913098]
 second seq =>         0 nucs

  1911262 GTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 1911321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 60

  1911322 GCTGGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGTTACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAAT 1911381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTGGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGTTACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAAT 120

  1911382 TGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCC 1911441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCC 180

  1911442 TGAGTGACAGAGCAAGACTGGCTCAAAAAAAAAATTATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGT 1911501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAGTGACAGAGCAAGACTGGCTCAAAAAAAAAATTATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGT 240

  1911502 AGGAGAGAAGACTGGGAAGATTGGCATCTTGGGAAGATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTG 1911561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGAGAGAAGACTGGGAAGATTGGCATCTTGGGAAGATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTG 300

  1911562 AGTTATGACTGGAAGGGAGGCTTCAGGTACTCGGAGGAAACATGGGGATTAAAAGCACAA 1911621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTTATGACTGGAAGGGAGGCTTCAGGTACTCGGAGGAAACATGGGGATTAAAAGCACAA 360

  1911622 GAAAACAGTCATTTTGCAACAGGAATATATCTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGG 1911681
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAAACAGTCATTTTGCAACAGGAATACATCTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGG 420

  1911682 ACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGG 1911741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGG 480

  1911742 GCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCC 1911801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCC 540

  1911802 ATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGAT 1911861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGAT 600

  1911862 CTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAA 1911921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAA 660

  1911922 GAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAA 1911981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAA 720

  1911982 ACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAAC 1912041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAAC 780

  1912042 TAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCA 1912101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCA 840

  1912102 GAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGG 1912161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGG 900

  1912162 AGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTT 1912221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTT 960

  1912222 TGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGATTGAAG 1912281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGATTGAAG 1020

  1912282 GTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAAGGGACA 1912341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAAGGGACA 1080

  1912342 TCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGATAACAAG 1912401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGATAACAAG 1140

  1912402 GGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGGGCGATA 1912461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGGGCGATA 1200

  1912462 CAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAGATAAAT 1912521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAGATAAAT 1260

  1912522 ACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACATAGATA 1912581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACATAGATA 1320

  1912582 GATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAATAGATA 1912641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAATAGATA 1380

  1912642 GTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGTGGTAGA 1912701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGTGGTAGA 1440

  1912702 TAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGTAGCTGT 1912761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGTAGCTGT 1500

  1912762 GTAGACAGAT 1912771
          ||||||||||
     1501 GTAGACAGAT 1510

EXCISED REGION

  1913099 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGAT 1913158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGAT 1570

  1913159 AGATAGTAGATAGATAGTAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGA 1913218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 AGATAGTAGATAGATAGTAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGA 1630

  1913219 GATAGATGATAGATAGGAGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATA 1913278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 GATAGATGATAGATAGGAGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATA 1690

  1913279 GAGCCATATACACTGAGGTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGAT 1913338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 GAGCCATATACACTGAGGTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGAT 1750

  1913339 GTATATATAGAGAGAGAACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTG 1913398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 GTATATATAGAGAGAGAACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTG 1810

  1913399 TGTCACTGCGTACATTTTCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTC 1913458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 TGTCACTGCGTACATTTTCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTC 1870

  1913459 CCAGGGGTAAAGGGGTGTGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCA 1913518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 CCAGGGGTAAAGGGGTGTGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCA 1930

  1913519 GCCTCACACACAAACCCCACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCT 1913578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 GCCTCACACACAAACCCCACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCT 1990

  1913579 GGATTTCCTGGAGAGGCTCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCT 1913638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 GGATTTCCTGGAGAGGCTCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCT 2050

  1913639 CCAGTTTGGTCACCAAGAGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGT 1913698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 CCAGTTTGGTCACCAAGAGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGT 2110

  1913699 GGGTTGAGTAGATGGTGTCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAG 1913758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 GGGTTGAGTAGATGGTGTCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAG 2170

  1913759 GGCTGCGTGGACAGTGCACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGA 1913818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 GGCTGCGTGGACAGTGCACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGA 2230

  1913819 CTCCGGGTCCACCACATTGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAG 1913878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 CTCCGGGTCCACCACATTGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAG 2290

  1913879 TCCCTTCCTCACCTGAGCCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCC 1913938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 TCCCTTCCTCACCTGAGCCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCC 2350

  1913939 AGTCTATCTACTTATCTATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCT 1913998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 AGTCTATCTACTTATCTATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCT 2410

  1913999 ATCTACTATCTATCTATATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTAT 1914058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 ATCTACTATCTATCTATATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTAT 2470

  1914059 TATCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCT 1914118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 TATCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCT 2530

  1914119 ATTTATCTATCTAGCTATCTATGTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATATATCTA 1914178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 ATTTATCTATCTAGCTATCTATGTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATATATCTA 2590

  1914179 TGTATCTATGTATTATGTATCTATCTTCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTATCTC 1914238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 TGTATCTATGTATTATGTATCTATCTTCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTATCTC 2650

  1914239 TATC 1914242
          ||||
     2651 TATC 2654

Alignment time is 3.35584 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   2966] =>      2966 nucs 'mol-32-2105-016166_2966'

Score:        2966
Aligned:      2966        nucs
Identic:      2966 (100%) nucs =>      1212 (100%)      1754 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1908405,1909616] EXCISED REGION [1909618,1911371]
 second seq =>  [      1,   1212] EXCISED REGION [   1213,   2966]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [1909617,1909617]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        24 nucs [1909617,1909640] to [1909618,1909641]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1908405 GGAGAATCGCTTGAACCTCGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCTATCGTGCCACTGCACTCC 1908464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGAGAATCGCTTGAACCTCGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCTATCGTGCCACTGCACTCC 60

  1908465 AGCCTGGGCGGCAGAGCCAGTCTCAAAATATATATATATAAATATATATATATGTGTGTG 1908524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCCTGGGCGGCAGAGCCAGTCTCAAAATATATATATATAAATATATATATATGTGTGTG 120

  1908525 TGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTTTGTA 1908584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTTTGTA 180

  1908585 TGTATATATGTGTGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACAT 1908644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTATATATGTGTGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACAT 240

  1908645 ATATTGTATATGTATATACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATT 1908704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATTGTATATGTATATACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATT 300

  1908705 GTATATGTATAAATATACATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCAT 1908764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTATATGTATAAATATACATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCAT 360

  1908765 ATACACATATATGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATAT 1908824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATACACATATATGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATAT 420

  1908825 GTATACACAAGCATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACA 1908884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTATACACAAGCATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACA 480

  1908885 CACACACACACACAAATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTA 1908944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACACACACACACAAATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTA 540

  1908945 CCTGGTGGAAGAAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATG 1909004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTGGTGGAAGAAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATG 600

  1909005 GGTGTACTTCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCC 1909064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTGTACTTCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCC 660

  1909065 TCTTTGCCTTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGAT 1909124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTTTGCCTTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGAT 720

  1909125 GCGTCCAGGGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAAC 1909184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCGTCCAGGGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAAC 780

  1909185 ATGCTATGAAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTT 1909244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGCTATGAAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTT 840

  1909245 ATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACA 1909304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACA 900

  1909305 GATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAAT 1909364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAAT 960

  1909365 CTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCT 1909424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCT 1020

  1909425 GGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTG 1909484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTG 1080

  1909485 GCGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAG 1909544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAG 1140

  1909545 GAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGC 1909604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGC 1200

  1909605 AAGACCCCGTCT 1909616
          ||||||||||||
     1201 AAGACCCCGTCT 1212

EXCISED REGION

  1909618 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCAT 1909677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCAT 1272

  1909678 GCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCT 1909737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 GCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCT 1332

  1909738 GCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCT 1909797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 GCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCT 1392

  1909798 CGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAG 1909857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 CGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAG 1452

  1909858 AAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCA 1909917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 AAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCA 1512

  1909918 GGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCC 1909977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 GGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCC 1572

  1909978 TCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGG 1910037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 TCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGG 1632

  1910038 AAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAG 1910097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 AAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAG 1692

  1910098 GAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAAT 1910157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 GAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAAT 1752

  1910158 CTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGG 1910217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 CTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGG 1812

  1910218 ATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAAC 1910277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 ATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAAC 1872

  1910278 AGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCT 1910337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 AGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCT 1932

  1910338 GTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTC 1910397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 GTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTC 1992

  1910398 TACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCT 1910457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 TACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCT 2052

  1910458 ATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTT 1910517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 ATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTT 2112

  1910518 GCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAACCCCAGCAC 1910577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 GCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAACCCCAGCAC 2172

  1910578 TTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAA 1910637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 TTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAA 2232

  1910638 CATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTAT 1910697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 CATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTAT 2292

  1910698 CTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGA 1910757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 CTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGA 2352

  1910758 GGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCT 1910817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 GGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCT 2412

  1910818 GTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTA 1910877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 GTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTA 2472

  1910878 ATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAA 1910937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 ATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAA 2532

  1910938 GATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGA 1910997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 GATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGA 2592

  1910998 GTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGC 1911057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 GTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGC 2652

  1911058 AGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGTACAGGATCTCAAACA 1911117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 AGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGTACAGGATCTCAAACA 2712

  1911118 TGGTTTATCTATGTTGCCTATATTTTTTGGAGAGGAAGCGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAA 1911177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 TGGTTTATCTATGTTGCCTATATTTTTTGGAGAGGAAGCGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAA 2772

  1911178 TTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCCGAGG 1911237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 TTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCCGAGG 2832

  1911238 CTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCG 1911297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 CTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCG 2892

  1911298 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGTTA 1911357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGTTA 2952

  1911358 CTCAGGAGGCCAAG 1911371
          ||||||||||||||
     2953 CTCAGGAGGCCAAG 2966

Alignment time is 2.6225 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   2828] =>      2828 nucs 'mol-32-2383-109763_2828'

Score:        2628
Aligned:      2836        nucs
Identic:      2795 ( 99%) nucs =>      1824 ( 98%)       971 (100%)
Gaps:           32 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1909240,1911076] EXCISED REGION [1911676,1912650]
 second seq =>  [      1,   1853] EXCISED REGION [   1854,   2828]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       599 nucs [1911077,1911675]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [1911077,1911101] to [1911676,1911700]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1909240 CTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTT 1909299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTT 60

  1909300 TAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCT 1909359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCT 120

  1909360 GTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCC 1909419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCC 180

  1909420 ATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCA 1909479
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCC-CTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCA 239

  1909480 TGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAA 1909539
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 TGGTGGTGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAA 299

  1909540 CCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGAC 1909599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 CCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGAC 359

  1909600 AGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAAAA---------------AAAAAAAAAAAAAACAG 1909644
          ||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||||||
      360 AGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAA--CAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAAAACAG 417

  1909645 AATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGC 1909704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 AATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGC 477

  1909705 CGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCA 1909764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 CGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCA 537

  1909765 CTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGT 1909824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 CTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGT 597

  1909825 TTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCAC 1909884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 TTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCAC 657

  1909885 TTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGG 1909944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      658 TTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGTG 717

  1909945 TCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCA 1910004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 TCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCA 777

  1910005 TTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCC 1910064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 TTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCC 837

  1910065 CCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATA 1910124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 CCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATA 897

  1910125 CGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCT 1910184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 CGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCT 957

  1910185 GGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCA 1910244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      958 GGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGAAACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCA 1017

  1910245 GCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCG 1910304
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 GCACTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCG 1077

  1910305 CAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTT 1910364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 CAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTT 1137

  1910365 GGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGG 1910424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 GGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGG 1197

  1910425 ATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATC 1910484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 ATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATC 1257

  1910485 TTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCC 1910544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCC 1317

  1910545 AGGCACGGTGGCTCACGCCT----GTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGA 1910600
          ||||||||||||||||        ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1318 AGGCACGGTGGCTCAC----ACGTGTAACCCCAGCACTTGCGGAGGCTGAGGCTGGCGGA 1373

  1910601 TCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACT 1910660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACT 1433

  1910661 AAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGC--AGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGG 1910718
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
     1434 AAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGG-TTAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGG 1492

  1910719 AGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTG 1910778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 AGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTG 1552

  1910779 CGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAA--- 1910835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
     1553 CGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATA 1612

  1910836 TTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGT 1910895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 TTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGT 1672

  1910896 TCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAA 1910955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAA 1732

  1910956 GGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAA 1911015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 GGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAA 1792

  1911016 GGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCA 1911075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 GGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCA 1852

  1911076 G 1911076
          |
     1853 G 1853

EXCISED REGION

  1911676 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1911735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1913

  1911736 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1911795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1973

  1911796 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1911855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 2033

  1911856 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1911915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 2093

  1911916 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1911975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAGTGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 2153

  1911976 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1912035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 2213

  1912036 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1912095
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 GCCAACTGATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 2273

  1912096 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1912155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 2333

  1912156 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1912215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 2393

  1912216 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1912275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 2453

  1912276 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 1912335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 2513

  1912336 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 1912395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 2573

  1912396 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 1912455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 2633

  1912456 GCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 1912515
          |.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 GTGATACAGAGATGAAAGATTGATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 2693

  1912516 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 1912575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 2753

  1912576 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 1912635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 2813

  1912636 TAGATAGTAGACAGA 1912650
          |||||||||||||||
     2814 TAGATAGTAGACAGA 2828

Alignment time is 4.41268 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   3895] =>      3895 nucs 'mol-32-2b55-059860_3895'

Score:        3854
Aligned:      3865        nucs
Identic:      3864 (100%) nucs =>      1017 (100%)      2847 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1908596,1909612] EXCISED REGION [1909617,1912464]
 second seq =>  [      1,   1017] EXCISED REGION [   1020,   3867]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [1909613,1909616]
 second seq =>         2 nucs [1018,1019]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1017,1017] to [1019,1019]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1908596 GTGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACATATATTGTATAT 1908655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACATATATTGTATAT 60

  1908656 GTATATACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATTGTATATGTATA 1908715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTATATACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATTGTATATGTATA 120

  1908716 AATATACATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCATATACACATATA 1908775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATATACATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCATATACACATATA 180

  1908776 TGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAG 1908835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAG 240

  1908836 CATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACAC 1908895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACAC 300

  1908896 ACAAATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAG 1908955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAAATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAG 360

  1908956 AAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCC 1909015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCC 420

  1909016 CTCACGGTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTT 1909075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCACGGTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTT 480

  1909076 CTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGG 1909135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGG 540

  1909136 GCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAA 1909195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAA 600

  1909196 AAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGA 1909255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGA 660

  1909256 TGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAG 1909315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAG 720

  1909316 TATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTT 1909375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTT 780

  1909376 GGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGA 1909435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGA 840

  1909436 TGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGCCTG 1909495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGCCTG 900

  1909496 TAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGT 1909555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGT 960

  1909556 TGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCC 1909612
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCC 1017

EXCISED REGION

  1909617 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCA 1909676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCA 1079

  1909677 TGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGC 1909736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGC 1139

  1909737 TGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTC 1909796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTC 1199

  1909797 TCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAA 1909856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAA 1259

  1909857 GAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGC 1909916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGC 1319

  1909917 AGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGC 1909976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGC 1379

  1909977 CTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTG 1910036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTG 1439

  1910037 GAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATA 1910096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATA 1499

  1910097 GGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAA 1910156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAA 1559

  1910157 TCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGG 1910216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGG 1619

  1910217 GATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAA 1910276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAA 1679

  1910277 CAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGC 1910336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGC 1739

  1910337 TGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCT 1910396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCT 1799

  1910397 CTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATC 1910456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATC 1859

  1910457 TATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCT 1910516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCT 1919

  1910517 TGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAACCCCAGCA 1910576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAACCCCAGCA 1979

  1910577 CTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 1910636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 2039

  1910637 ACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTA 1910696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTA 2099

  1910697 TCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGG 1910756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGG 2159

  1910757 AGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTC 1910816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTC 2219

  1910817 TGTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCT 1910876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TGTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCT 2279

  1910877 AATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGA 1910936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGA 2339

  1910937 AGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGG 1910996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGG 2399

  1910997 AGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGG 1911056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGG 2459

  1911057 CAGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGTACAGGATCTCAAAC 1911116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CAGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGTACAGGATCTCAAAC 2519

  1911117 ATGGTTTATCTATGTTGCCTATATTTTTTGGAGAGGAAGCGGGCTTGCTTTGTTTAAAAA 1911176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ATGGTTTATCTATGTTGCCTATATTTTTTGGAGAGGAAGCGGGCTTGCTTTGTTTAAAAA 2579

  1911177 ATTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCCGAG 1911236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 ATTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCCGAG 2639

  1911237 GCTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCC 1911296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GCTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCC 2699

  1911297 GTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGTT 1911356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGTT 2759

  1911357 ACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAATTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGCC 1911416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 ACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAATTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGCC 2819

  1911417 GAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCAAGACTGGCTCAAAAAAAAAAT 1911476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCAAGACTGGCTCAAAAAAAAAAT 2879

  1911477 TATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGTAGGAGAGAAGACTGGGAAGATTGGCATCTTGGGAA 1911536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGTAGGAGAGAAGACTGGGAAGATTGGCATCTTGGGAA 2939

  1911537 GATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTGAGTTATGACTGGAAGGGAGGCTTCAGGTACTCGGA 1911596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTGAGTTATGACTGGAAGGGAGGCTTCAGGTACTCGGA 2999

  1911597 GGAAACATGGGGATTAAAAGCACAAGAAAACAGTCATTTTGCAACAGGAATATATCTGGC 1911656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3000 GGAAACATGGGGATTAAAAGCACAAGAAAACAGTCATTTTGCAACAGGAATACATCTGGC 3059

  1911657 AGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACC 1911716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACC 3119

  1911717 TGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTT 1911776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTT 3179

  1911777 TAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACAT 1911836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACAT 3239

  1911837 CAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAG 1911896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAG 3299

  1911897 GTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCA 1911956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCA 3359

  1911957 GGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTT 1912016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTT 3419

  1912017 CCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTC 1912076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 CCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTC 3479

  1912077 GCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTG 1912136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTG 3539

  1912137 ACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGT 1912196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 ACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGT 3599

  1912197 TGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGA 1912256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGA 3659

  1912257 GGATGGAATATAGAGGTGATTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAAT 1912316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 GGATGGAATATAGAGGTGATTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAAT 3719

  1912317 ATTACACCATTTTATATAAGGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTG 1912376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 ATTACACCATTTTATATAAGGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTG 3779

  1912377 ACATCAATCCTCCACAGATAACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAA 1912436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 ACATCAATCCTCCACAGATAACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAA 3839

  1912437 AGATATATAGAGAGATAGGGCGATACAG 1912464
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3840 AGATATATAGAGAGATAGGGCGATACAG 3867

Alignment time is 8.90966 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   2418] =>      2418 nucs 'mol-32-2fee-217782_2418'

Score:        2302
Aligned:      2423        nucs
Identic:      2403 ( 99%) nucs =>      1397 ( 99%)      1006 (100%)
Gaps:           14 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1909672,1911076] EXCISED REGION [1911676,1912684]
 second seq =>  [      1,   1409] EXCISED REGION [   1410,   2418]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       599 nucs [1911077,1911675]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [1911077,1911101] to [1911676,1911700]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1909672 GCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTC 1909731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTC 60

  1909732 GAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTT 1909791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTT 120

  1909792 CTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAAC 1909851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAAC 180

  1909852 TTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTG 1909911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTG 240

  1909912 GTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTC 1909971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTC 300

  1909972 TGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGC 1910031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGC 360

  1910032 CTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGC 1910091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGC 420

  1910092 ACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTG 1910151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTG 480

  1910152 GGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACA 1910211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACA 540

  1910212 CTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGT 1910271
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      541 CTGGGGAAACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCACTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGT 600

  1910272 TCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGA 1910331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGA 660

  1910332 AAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTT 1910391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTT 720

  1910392 ATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAA 1910451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAA 780

  1910452 GCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGG 1910511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGG 840

  1910512 GGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCT----GTA 1910567
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||
      841 GGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCAC----ACGTGTA 896

  1910568 ACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCA 1910627
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 ACCCCAGCACTTGCGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCA 956

  1910628 GCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGG 1910687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 GCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGG 1016

  1910688 TGGC--AGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAAC 1910745
          |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 TGG-TTAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAAC 1075

  1910746 CCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACA 1910805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 CCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACA 1135

  1910806 GTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAA---TTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGA 1910862
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
     1136 GTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGA 1195

  1910863 GAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACT 1910922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 GAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACT 1255

  1910923 CGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGG 1910982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 CGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGG 1315

  1910983 CTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAAC 1911042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 CTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAAC 1375

  1911043 AGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 1911076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 AGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 1409

EXCISED REGION

  1911676 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1911735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1469

  1911736 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1911795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1529

  1911796 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1911855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1589

  1911856 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1911915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1649

  1911916 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1911975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAGTGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1709

  1911976 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1912035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1769

  1912036 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1912095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1829

  1912096 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1912155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1889

  1912156 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1912215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1949

  1912216 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1912275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 2009

  1912276 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 1912335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 2069

  1912336 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 1912395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 2129

  1912396 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 1912455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 2189

  1912456 GCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 1912515
          |.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 GTGATACAGAGATGAAAGATTGATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 2249

  1912516 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 1912575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 2309

  1912576 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 1912635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 2369

  1912636 TAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGAT 1912684
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 TAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGAT 2418

Alignment time is 1.8053 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   3685] =>      3685 nucs 'mol-32-2fee-219106_3685'

Score:        3411
Aligned:      3699        nucs
Identic:      3645 ( 99%) nucs =>      2660 ( 98%)       985 (100%)
Gaps:           42 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1908394,1911076] EXCISED REGION [1911676,1912663]
 second seq =>  [      1,   2697] EXCISED REGION [   2698,   3685]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       599 nucs [1911077,1911675]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [1911077,1911101] to [1911676,1911700]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1908394 AGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTCGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCTATCGTGC 1908453
          |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
        1 AGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTATCGTGC 60

  1908454 CACTGCACTCCAGCCTGGGCGGCAGAGCCAGTCTCAAAATATATATATATAAATATATAT 1908513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTGCACTCCAGCCTGGGCGGCAGAGCCAGTCTCAAAATATATATATATAAATATATAT 120

  1908514 ATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATGTATGTGTGTATATCTACATGCAC 1908573
          ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AT----GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATGTATGTGTGTATATCTACATGCAC 176

  1908574 ACGAGTTTGTATGTATATATGTGTGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTA 1908633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      177 ACGAGTTTGTATGTATATATGTGTGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTA 236

  1908634 TATGTAGACATATATTGTATATGTATA----TACATATATGTATACACATACACGTGTAT 1908689
          |||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||
      237 TATGTAGACATAT--TGTATATGTATAAATATACATATATGTATACACATACACGTGTAT 294

  1908690 ATGTATACATATATTGTATATGTATAAATATACATATATGTATACATATACACGTGTATG 1908749
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      295 ATGTATACATATATTGTATATGTATGAATATACATATATGTATACATATACACGTGTATG 354

  1908750 TGTATACATATGCATATACACATATATGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACA 1908809
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      355 TGTATACATATGCATATACACATATACGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACA 414

  1908810 CATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTAT 1908869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      415 CATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTAT 474

  1908870 GCATGCAGACACACACACACACACACACAAATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGAC 1908929
          |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
      475 GCATGCAGACACACACACACACACACA--AATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGAC 532

  1908930 TTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGA 1908989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      533 TTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGA 592

  1908990 AGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAG 1909049
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      593 AGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCACCTTCTCAGGGAG 652

  1909050 AGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACA 1909109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 AGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACA 712

  1909110 TAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGC 1909169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 TAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGC 772

  1909170 TTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGAT 1909229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGAT 832

  1909230 GTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTT 1909289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 GTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTT 892

  1909290 ATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTG 1909349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 ATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTG 952

  1909350 GCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGA 1909409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 GCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGA 1012

  1909410 GATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATT 1909469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 GATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATT 1072

  1909470 AGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 1909529
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 AGTCAAGTCATGGTGGTGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 1132

  1909530 ATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAG 1909589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 ATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAG 1192

  1909590 CCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAAA---------------AAAAAAAA 1909634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||
     1193 CCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAA-CAAAAAACAAAAAACAAAAAAAA 1251

  1909635 AAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCAC 1909694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 AAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCAC 1311

  1909695 TTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCA 1909754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 TTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCA 1371

  1909755 CGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAG 1909814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 CGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAG 1431

  1909815 AAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTA 1909874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 AAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTA 1491

  1909875 TCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATC 1909934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 TCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATC 1551

  1909935 TGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAG 1909994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 TGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAG 1611

  1909995 CCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCT 1910054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 CCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCT 1671

  1910055 CCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGT 1910114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 CCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGT 1731

  1910115 AGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGG 1910174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 AGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGG 1791

  1910175 AGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCC 1910234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1792 AGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGAAACTGGGACCAGATCC 1851

  1910235 AAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTT 1910294
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 AAAGCCAGCAGCACTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTT 1911

  1910295 GTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTC 1910354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 GTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTC 1971

  1910355 TCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGAT 1910414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 TCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGAT 2031

  1910415 GTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTA 1910474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 GTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTA 2091

  1910475 TCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATT 1910534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 TCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATT 2151

  1910535 ATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCT----GTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGA 1910590
          ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||.|||||||||
     2152 ATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCAC----ACGTGTAACCCCAGCACTTGCGGAGGCTGA 2207

  1910591 GGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCC 1910650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 GGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCC 2267

  1910651 CGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGC--AGGTATCTGTCATCCCA 1910708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||
     2268 CGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGG-TTAGGTATCTGTCATCCCA 2326

  1910709 GCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 1910768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 GCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 2386

  1910769 GCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAA 1910828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 GCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAA 2446

  1910829 AAAAAAA---TTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAG 1910885
          |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 AAAAAAAATATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAG 2506

  1910886 AGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAA 1910945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 AGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAA 2566

  1910946 GAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAAT 1911005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 GAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAAT 2626

  1911006 GAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCT 1911065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 GAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCT 2686

  1911066 CCAAATCCCAG 1911076
          |||||||||||
     2687 CCAAATCCCAG 2697

EXCISED REGION

  1911676 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1911735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 2757

  1911736 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1911795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 2817

  1911796 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1911855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 2877

  1911856 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1911915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 2937

  1911916 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1911975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAGTGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 2997

  1911976 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1912035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 3057

  1912036 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1912095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 3117

  1912096 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1912155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 3177

  1912156 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1912215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 3237

  1912216 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1912275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 3297

  1912276 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 1912335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 3357

  1912336 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 1912395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 3417

  1912396 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 1912455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 3477

  1912456 GCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 1912515
          |.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 GTGATACAGAGATGAAAGATTGATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 3537

  1912516 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 1912575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 3597

  1912576 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 1912635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 3657

  1912636 TAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAG 1912663
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3658 TAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAG 3685

Alignment time is 2.71456 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   3100] =>      3100 nucs 'mol-32-300f-290477_3100'

Score:        2924
Aligned:      3100        nucs
Identic:      3066 ( 99%) nucs =>      2288 ( 99%)       778 (100%)
Gaps:           28 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1908777,1911076] EXCISED REGION [1911676,1912454]
 second seq =>  [      8,   2321] EXCISED REGION [   2322,   3100]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       599 nucs [1911077,1911675]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [1911077,1911101] to [1911676,1911700]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1908777 GTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAGC 1908836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        8 GTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAGC 67

  1908837 ATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACACA 1908896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       68 ATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACACA 127

  1908897 CAAATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGA 1908956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      128 --AATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGA 185

  1908957 AACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCC 1909016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 AACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCC 245

  1909017 TCACGGTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTC 1909076
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 TCACGGTGAAATGGTTTTCACCTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTC 305

  1909077 TCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGG 1909136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 TCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGG 365

  1909137 CCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAA 1909196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 CCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAA 425

  1909197 AGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGAT 1909256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 AGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGAT 485

  1909257 GTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGT 1909316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 GTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGT 545

  1909317 ATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTG 1909376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 ATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTG 605

  1909377 GGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGAT 1909436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 GGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGAT 665

  1909437 GAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGCCTGT 1909496
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      666 GAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGTGTGTGCCTGT 725

  1909497 AATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTT 1909556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 AATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTT 785

  1909557 GCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCT 1909616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 GCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCT 845

  1909617 AAAAAAAAA--------AAAAAA----AAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGG 1909664
          |||||||||        ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 AAAAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGG 905

  1909665 TGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCA 1909724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 TGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCA 965

  1909725 GGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAG 1909784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 GGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAG 1025

  1909785 CGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGC 1909844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 CGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGC 1085

  1909845 GCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCC 1909904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 GCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCC 1145

  1909905 AGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTT 1909964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 AGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTT 1205

  1909965 CTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAG 1910024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 CTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAG 1265

  1910025 TTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGT 1910084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 TTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGT 1325

  1910085 GCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGT 1910144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 GCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGT 1385

  1910145 GAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCC 1910204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 GAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCC 1445

  1910205 ATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAA 1910264
          ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1446 ATTCACACTGGGGAAACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCACTGAAACAGCGGTTGAA 1505

  1910265 GCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTC 1910324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 GCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTC 1565

  1910325 ATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCAT 1910384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 ATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCAT 1625

  1910385 GAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAA 1910444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 GAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAA 1685

  1910445 TCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGG 1910504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 TCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGG 1745

  1910505 AGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCT 1910564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
     1746 AGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCAC---- 1801

  1910565 ----GTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTC 1910620
              ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 ACGTGTAACCCCAGCACTTGCGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTC 1861

  1910621 GAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCA 1910680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 GAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCA 1921

  1910681 GGCGTGGTGGC--AGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTG 1910738
          ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 GGCGTGGTGG-TTAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTG 1980

  1910739 CTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTG 1910798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTG 2040

  1910799 GGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAA---TTTGAAGTAGTGTACAAGAA 1910855
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||
     2041 GGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATATTTGAAGTAGTGTACAAGAA 2100

  1910856 TGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAG 1910915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAG 2160

  1910916 ACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGA 1910975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGA 2220

  1910976 AGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATT 1911035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATT 2280

  1911036 TTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 1911076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 2321

EXCISED REGION

  1911676 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1911735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 2381

  1911736 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1911795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 2441

  1911796 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1911855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 2501

  1911856 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1911915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 2561

  1911916 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1911975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAGTGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 2621

  1911976 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1912035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 2681

  1912036 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1912095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 2741

  1912096 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1912155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 2801

  1912156 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1912215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 2861

  1912216 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1912275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 2921

  1912276 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 1912335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 2981

  1912336 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 1912395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 3041

  1912396 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAG 1912454
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAG 3100

Alignment time is 2.57743 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   2332] =>      2332 nucs 'mol-32-3030-279386_2332'

Score:        2205
Aligned:      2337        nucs
Identic:      2316 ( 99%) nucs =>      1380 ( 99%)       936 (100%)
Gaps:           14 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1909688,1911076] EXCISED REGION [1911676,1912614]
 second seq =>  [      1,   1393] EXCISED REGION [   1394,   2332]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       599 nucs [1911077,1911675]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [1911077,1911101] to [1911676,1911700]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1909688 CCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCC 1909747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCC 60

  1909748 AAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTA 1909807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTA 120

  1909808 AAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGC 1909867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGC 180

  1909868 AATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCT 1909927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCT 240

  1909928 GGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCC 1909987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCC 300

  1909988 AGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCT 1910047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCT 360

  1910048 TCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGAC 1910107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGAC 420

  1910108 ATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAG 1910167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAG 480

  1910168 CAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGAC 1910227
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      481 CAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGAAACTGGGAC 540

  1910228 CAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAA 1910287
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGATCCAAAGCCAGCAGCACTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAA 600

  1910288 CAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTT 1910347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTT 660

  1910348 AAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACA 1910407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACA 720

  1910408 CACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACA 1910467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACA 780

  1910468 TTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTA 1910527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTA 840

  1910528 AAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCT----GTAACCCCAGCACTTGGGG 1910583
          |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||.||
      841 AAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCAC----ACGTGTAACCCCAGCACTTGCGG 896

  1910584 AGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGC 1910643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 AGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGC 956

  1910644 GAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGC--AGGTATCTGT 1910701
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||
      957 GAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGG-TTAGGTATCTGT 1015

  1910702 CATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTT 1910761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 CATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTT 1075

  1910762 GCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCT 1910821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 GCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCT 1135

  1910822 CAAAAAAAAAAAAA---TTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAA 1910878
          ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 CAAAAAAAAAAAAAATATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAA 1195

  1910879 TCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAG 1910938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 TCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAG 1255

  1910939 ATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAG 1910998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1256 ATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGACTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAG 1315

  1910999 TGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCA 1911058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 TGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCA 1375

  1911059 GGGACCTCCAAATCCCAG 1911076
          ||||||||||||||||||
     1376 GGGACCTCCAAATCCCAG 1393

EXCISED REGION

  1911676 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1911735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1453

  1911736 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1911795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1513

  1911796 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1911855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1573

  1911856 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1911915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1633

  1911916 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1911975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAGTGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1693

  1911976 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1912035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1753

  1912036 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1912095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1813

  1912096 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1912155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1873

  1912156 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1912215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1933

  1912216 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1912275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1993

  1912276 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 1912335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 2053

  1912336 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 1912395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 2113

  1912396 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 1912455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 2173

  1912456 GCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 1912515
          |.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 GTGATACAGAGATGAAAGATTGATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 2233

  1912516 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 1912575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 2293

  1912576 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATA 1912614
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATA 2332

Alignment time is 2.08575 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   2976] =>      2976 nucs 'mol-32-314e-187811_2976'

Score:        2964
Aligned:      2975        nucs
Identic:      2974 (100%) nucs =>      1702 (100%)      1272 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1909651,1911352] EXCISED REGION [1911354,1912626]
 second seq =>  [      1,   1702] EXCISED REGION [   1704,   2976]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [1911353,1911353]
 second seq =>         1 nucs [1703,1703]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1909651 GAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGA 1909710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGA 60

  1909711 ATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAG 1909770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAG 120

  1909771 CCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAA 1909830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAA 180

  1909831 GCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAG 1909890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAG 240

  1909891 CCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTAT 1909950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTAT 300

  1909951 GAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTT 1910010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTT 360

  1910011 CCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCC 1910070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCC 420

  1910071 CAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCT 1910130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCT 480

  1910131 GAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAAT 1910190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAAT 540

  1910191 TTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTG 1910250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTG 600

  1910251 AAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCG 1910310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCG 660

  1910311 TGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGT 1910370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGT 720

  1910371 CTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCT 1910430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCT 780

  1910431 CAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCA 1910490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCA 840

  1910491 GTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCAC 1910550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCAC 900

  1910551 GGTGGCTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGG 1910610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTGGCTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGG 960

  1910611 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAA 1910670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAA 1020

  1910671 AAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAG 1910730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAG 1080

  1910731 GAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCT 1910790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCT 1140

  1910791 TCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAGTAGTGTAC 1910850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAGTAGTGTAC 1200

  1910851 AAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACAC 1910910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACAC 1260

  1910911 ACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGA 1910970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGA 1320

  1910971 TTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAG 1911030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAG 1380

  1911031 TTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTG 1911090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTG 1440

  1911091 CTGGCTGCAAGTACAGGATCTCAAACATGGTTTATCTATGTTGCCTATATTTTTTGGAGA 1911150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGGCTGCAAGTACAGGATCTCAAACATGGTTTATCTATGTTGCCTATATTTTTTGGAGA 1500

  1911151 GGAAGCGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTG 1911210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAAGCGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTG 1560

  1911211 TAACCCCAGCACTTGGGGAGGCCGAGGCTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAGTTCGAGAC 1911270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAACCCCAGCACTTGGGGAGGCCGAGGCTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAGTTCGAGAC 1620

  1911271 CAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCAT 1911330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCAT 1680

  1911331 GGTGGTGGGCACCTGTAATTCC 1911352
          ||||||||||||||||||||||
     1681 GGTGGTGGGCACCTGTAATTCC 1702

EXCISED REGION

  1911354 GTTACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAATTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCGA 1911413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 GTTACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAATTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCGA 1763

  1911414 GCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCAAGACTGGCTCAAAAAAAA 1911473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 GCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCAAGACTGGCTCAAAAAAAA 1823

  1911474 AATTATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGTAGGAGAGAAGACTGGGAAGATTGGCATCTTGG 1911533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 AATTATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGTAGGAGAGAAGACTGGGAAGATTGGCATCTTGG 1883

  1911534 GAAGATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTGAGTTATGACTGGAAGGGAGGCTTCAGGTACTC 1911593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 GAAGATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTGAGTTATGACTGGAAGGGAGGCTTCAGGTACTC 1943

  1911594 GGAGGAAACATGGGGATTAAAAGCACAAGAAAACAGTCATTTTGCAACAGGAATATATCT 1911653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1944 GGAGGAAACATGGGGATTAAAAGCACAAGAAAACAGTCATTTTGCAACAGGAATACATCT 2003

  1911654 GGCAGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAA 1911713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 GGCAGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAA 2063

  1911714 ACCTGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCA 1911773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 ACCTGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCA 2123

  1911774 CTTTAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAA 1911833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 CTTTAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAA 2183

  1911834 CATCAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCA 1911893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 CATCAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCA 2243

  1911894 GAGGTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACG 1911953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 GAGGTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACG 2303

  1911954 GCAGGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCAT 1912013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 GCAGGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCAT 2363

  1912014 CTTCCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCAT 1912073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 CTTCCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCAT 2423

  1912074 CTCGCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGC 1912133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 CTCGCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGC 2483

  1912134 TTGACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGT 1912193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 TTGACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGT 2543

  1912194 GGTTGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAG 1912253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 GGTTGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAG 2603

  1912254 CGAGGATGGAATATAGAGGTGATTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCA 1912313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 CGAGGATGGAATATAGAGGTGATTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCA 2663

  1912314 AATATTACACCATTTTATATAAGGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTC 1912373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 AATATTACACCATTTTATATAAGGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTC 2723

  1912374 CTGACATCAATCCTCCACAGATAACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACA 1912433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 CTGACATCAATCCTCCACAGATAACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACA 2783

  1912434 GAAAGATATATAGAGAGATAGGGCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACC 1912493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 GAAAGATATATAGAGAGATAGGGCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACC 2843

  1912494 TGGATGGATAGATAGGAGATAGATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATA 1912553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 TGGATGGATAGATAGGAGATAGATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATA 2903

  1912554 CATAGATAGATAGATACATACATAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGAT 1912613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 CATAGATAGATAGATACATACATAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGAT 2963

  1912614 AGATAATAGATAG 1912626
          |||||||||||||
     2964 AGATAATAGATAG 2976

Alignment time is 7.16194 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   4430] =>      4430 nucs 'mol-32-3159-134335_4430'

Score:        4113
Aligned:      4444        nucs
Identic:      4391 ( 99%) nucs =>      2996 ( 98%)      1395 (100%)
Gaps:           39 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1908057,1911076] EXCISED REGION [1911676,1913074]
 second seq =>  [      1,   3031] EXCISED REGION [   3032,   4430]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       599 nucs [1911077,1911675]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [1911077,1911101] to [1911676,1911700]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1908057 GAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTAAAGTGAGCCGAGATT 1908116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTAAAGTGAGCCGAGATT 60

  1908117 GCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCGAAACTCTGTCTCAAAAAAATAAAGTA 1908176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCGAAACTCTGTCTCAAAAAAATAAAGTA 120

  1908177 AAATAAAATAAAATAAATAAAATAAAGAAAAGGTTCTAAGCCGGTCATGGTGGCTCAAGC 1908236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATAAAATAAAATAAATAAAATAAAGAAAAGGTTCTAAGCCGGTCATGGTGGCTCAAGC 180

  1908237 CTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCTGAGGTGGACAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGA 1908296
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      181 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGACAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAA 240

  1908297 GACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGG 1908356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGG 300

  1908357 GCGTGGTGGCGGGTGCCTGTGATCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTT 1908416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCGTGGTGGCGGGTGCCTGTGATCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTT 360

  1908417 GAACCTCGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCTATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGGC 1908476
          ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAACCTGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGGC 420

  1908477 AGAGCCAGTCTCAAAATATATATATATAAATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 1908536
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
      421 AGAGCCAGTCTCAAAATATATATATATAAATATATATAT----GTGTGTGTGTGTGTGTG 476

  1908537 TGTGTATGTATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTTTGTATGTATATATGTG 1908596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 TGTGTATGTATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTTTGTATGTATATATGTG 536

  1908597 TGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACATATATTGTATATG 1908656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||
      537 TGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACATAT--TGTATATG 594

  1908657 TATA----TACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATTGTATATGT 1908712
          ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      595 TATAAATATACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATTGTATATGT 654

  1908713 ATAAATATACATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCATATACACAT 1908772
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      655 ATGAATATACATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCATATACACAT 714

  1908773 ATATGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACAC 1908832
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 ATACGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACAC 774

  1908833 AAGCATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACA 1908892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 AAGCATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACA 834

  1908893 CACACAAATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGG 1908952
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 CACA--AATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGG 892

  1908953 AAGAAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACT 1909012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 AAGAAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACT 952

  1909013 TCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCC 1909072
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCACCTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCC 1012

  1909073 TTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAG 1909132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 TTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAG 1072

  1909133 GGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATG 1909192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 GGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATG 1132

  1909193 AAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGT 1909252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 AAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGT 1192

  1909253 AGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAA 1909312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 AGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAA 1252

  1909313 AAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCAC 1909372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 AAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCAC 1312

  1909373 TTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACA 1909432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 TTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACA 1372

  1909433 TGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGC 1909492
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1373 TGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGTGTGTGC 1432

  1909493 CTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGA 1909552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 CTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGA 1492

  1909553 GGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCC 1909612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 GGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCC 1552

  1909613 GTCTAAAAAAAAA--------AAAAAA----AAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGC 1909660
          |||||||||||||        ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||
     1553 GTCTAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGC 1612

  1909661 CAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAG 1909720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 CAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAG 1672

  1909721 CCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGAT 1909780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 CCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGAT 1732

  1909781 GGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTAC 1909840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 GGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTAC 1792

  1909841 CTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTT 1909900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 CTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTT 1852

  1909901 AGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCA 1909960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 AGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCA 1912

  1909961 CGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGG 1910020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 CGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGG 1972

  1910021 GCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCT 1910080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 GCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCT 2032

  1910081 GTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATG 1910140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 GTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATG 2092

  1910141 GAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCC 1910200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 GAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCC 2152

  1910201 TCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGT 1910260
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2153 TCCCATTCACACTGGGGAAACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCACTGAAACAGCGGT 2212

  1910261 TGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATT 1910320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 TGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATT 2272

  1910321 CCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATAT 1910380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 CCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATAT 2332

  1910381 CCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGA 1910440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 CCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGA 2392

  1910441 AGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGT 1910500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 AGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGT 2452

  1910501 GGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCAC 1910560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 GGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCAC 2512

  1910561 GCCT----GTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGA 1910616
                  ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 ----ACGTGTAACCCCAGCACTTGCGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGA 2568

  1910617 GTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 1910676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 GTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 2628

  1910677 GCCAGGCGTGGTGGC--AGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 1910734
          ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 GCCAGGCGTGGTGG-TTAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 2687

  1910735 ACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAG 1910794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 ACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAG 2747

  1910795 TCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAT--TTGAAGTAGTGTACAA 1910852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||
     2748 TCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATATTTGAAGTAGTGTACAA 2807

  1910853 GAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACAC 1910912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 GAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACAC 2867

  1910913 GAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATT 1910972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 GAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATT 2927

  1910973 GGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTT 1911032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 GGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTT 2987

  1911033 ATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 1911076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 ATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 3031

EXCISED REGION

  1911676 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1911735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 3091

  1911736 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1911795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 3151

  1911796 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1911855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 3211

  1911856 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1911915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 3271

  1911916 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1911975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAGTGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 3331

  1911976 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1912035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 3391

  1912036 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1912095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 3451

  1912096 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1912155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3452 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 3511

  1912156 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1912215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3512 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 3571

  1912216 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1912275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 3631

  1912276 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 1912335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 3691

  1912336 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 1912395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3692 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 3751

  1912396 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 1912455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3752 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 3811

  1912456 GCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 1912515
          |.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3812 GTGATACAGAGATGAAAGATTGATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 3871

  1912516 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 1912575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3872 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 3931

  1912576 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 1912635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3932 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 3991

  1912636 TAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGT 1912695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3992 TAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGT 4051

  1912696 GGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGT 1912755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4052 GGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGT 4111

  1912756 AGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAGAT 1912815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     4112 AGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT-AGAT 4170

  1912816 -AGATAGATAGAAACATAGATGATAGGAGACAGGTACATAGATATCTGGATGGATAGATA 1912874
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 AAGATAGATAGAAACATAGATGATAGGAGACAGGTACATAGATATCTGGATGGATAGATA 4230

  1912875 GGAGATAGACGACAGATAGATAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAGATAATAGATAA 1912934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 GGAGATAGACGACAGATAGATAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAGATAATAGATAA 4290

  1912935 GTAAATAGGTAGATAGTAGACAGAGATAGAAGATAGATAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGT 1912994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 GTAAATAGGTAGATAGTAGACAGAGATAGAAGATAGATAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGT 4350

  1912995 AGATAGGTAGATAGAAAAGTAACTGGTAGATAGATAGAAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGG 1913054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 AGATAGGTAGATAGAAAAGTAACTGGTAGATAGATAGAAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGG 4410

  1913055 TAGATAGAAAGACAGTAGAC 1913074
          ||||||||||||||||||||
     4411 TAGATAGAAAGACAGTAGAC 4430

Alignment time is 3.2416 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   2956] =>      2956 nucs 'mol-32-3185-068042_2956'

Score:        2767
Aligned:      2961        nucs
Identic:      2927 ( 99%) nucs =>      2068 ( 99%)       859 (100%)
Gaps:           25 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1908998,1911076] EXCISED REGION [1911676,1912537]
 second seq =>  [      1,   2094] EXCISED REGION [   2095,   2956]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       599 nucs [1911077,1911675]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [1911077,1911101] to [1911676,1911700]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1908998 TAAGATGGGTGTACTTCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCT 1909057
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
        1 TAAGATGGGTGTACTTCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCACCTTCTCAGGGAGAGAAGTCT 60

  1909058 TATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCAT 1909117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCAT 120

  1909118 TTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAA 1909177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAA 180

  1909178 AGACAACATGCTATGAAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTT 1909237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGACAACATGCTATGAAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTT 240

  1909238 ATCTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAAT 1909297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAAT 300

  1909298 TTTAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGC 1909357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGC 360

  1909358 CTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGG 1909417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGG 420

  1909418 CCATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGT 1909477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGT 480

  1909478 CATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTG 1909537
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATGGTGGTGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTG 540

  1909538 AACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCG 1909597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCG 600

  1909598 ACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAA--------AAAAAA----AAAAAAAAAACAGA 1909645
          ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    ||||||||||||||
      601 ACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAAACAGA 660

  1909646 ATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCC 1909705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCC 720

  1909706 GGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCAC 1909765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCAC 780

  1909766 TCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTT 1909825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTT 840

  1909826 TAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACT 1909885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACT 900

  1909886 TTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGT 1909945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGT 960

  1909946 CGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCAT 1910005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      961 CGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGTCTGTAGGCAT 1020

  1910006 TGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCC 1910065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCC 1080

  1910066 CATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATAC 1910125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATAC 1140

  1910126 GTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTG 1910185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTG 1200

  1910186 GGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAG 1910245
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGAAACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAG 1260

  1910246 CATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGC 1910305
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGC 1320

  1910306 AGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTG 1910365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTG 1380

  1910366 GGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGA 1910425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGA 1440

  1910426 TACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCT 1910485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCT 1500

  1910486 TGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCA 1910545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCA 1560

  1910546 GGCACGGTGGCTCACGCCT----GTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT 1910601
          |||||||||||||||        ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1561 GGCACGGTGGCTCAC----ACGTGTAACCCCAGCACTTGCGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT 1616

  1910602 CACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTA 1910661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 CACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTA 1676

  1910662 AAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGC--AGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGA 1910719
          |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||
     1677 AAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGG-TTAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGA 1735

  1910720 GGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGC 1910779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 GGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGC 1795

  1910780 GCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAT--T 1910837
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
     1796 GCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATATT 1855

  1910838 TGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTC 1910897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 TGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTC 1915

  1910898 ATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGG 1910957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 ATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGG 1975

  1910958 CCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGG 1911017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGG 2035

  1911018 CACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 1911076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 2094

EXCISED REGION

  1911676 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1911735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 2154

  1911736 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1911795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 2214

  1911796 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1911855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 2274

  1911856 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1911915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 2334

  1911916 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1911975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAGTGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 2394

  1911976 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1912035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 2454

  1912036 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1912095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 2514

  1912096 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1912155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 2574

  1912156 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1912215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 2634

  1912216 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1912275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 2694

  1912276 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 1912335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 2754

  1912336 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 1912395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 2814

  1912396 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 1912455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 2874

  1912456 GCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 1912515
          |.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 GTGATACAGAGATGAAAGATTGATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 2934

  1912516 ATAAATACATAGATACATAGAT 1912537
          ||||||||||||||||||||||
     2935 ATAAATACATAGATACATAGAT 2956

Alignment time is 2.15324 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   2518] =>      2518 nucs 'mol-32-3185-232516_2518'

Score:        2374
Aligned:      2525        nucs
Identic:      2490 ( 99%) nucs =>      1751 ( 98%)       739 (100%)
Gaps:           30 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1909315,1911076] EXCISED REGION [1911676,1912415]
 second seq =>  [      1,   1778] EXCISED REGION [   1779,   2518]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       599 nucs [1911077,1911675]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [1911077,1911101] to [1911676,1911700]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1909315 GTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTT 1909374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTT 60

  1909375 TGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATG 1909434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATG 120

  1909435 ATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGCCT 1909494
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      121 ATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGTGTGTGCCT 180

  1909495 GTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGG 1909554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGG 240

  1909555 TTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGT 1909614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGT 300

  1909615 CTAAAAAAAAAAA---------------AAAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAG 1909659
          |||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTAAAAAAAAA--CAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAG 358

  1909660 CCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGA 1909719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 CCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGA 418

  1909720 GCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGA 1909779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 GCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGA 478

  1909780 TGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTA 1909839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 TGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTA 538

  1909840 CCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACT 1909899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACT 598

  1909900 TAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATC 1909959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATC 658

  1909960 ACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATG 1910019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 ACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATG 718

  1910020 GGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTC 1910079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 GGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTC 778

  1910080 TGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAAT 1910139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 TGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAAT 838

  1910140 GGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGC 1910199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 GGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGC 898

  1910200 CTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGG 1910259
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      899 CTCCCATTCACACTGGGGAAACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCACTGAAACAGCGG 958

  1910260 TTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCAT 1910319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 TTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCAT 1018

  1910320 TCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATA 1910379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATA 1078

  1910380 TCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAG 1910439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 TCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAG 1138

  1910440 AAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTG 1910499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 AAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTG 1198

  1910500 TGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCA 1910559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCA 1258

  1910560 CGCCT----GTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 1910615
          |        ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 C----ACGTGTAACCCCAGCACTTGCGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 1314

  1910616 AGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 1910675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 AGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 1374

  1910676 AGCCAGGCGTGGTGGC--AGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAG 1910733
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 AGCCAGGCGTGGTGG-TTAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAG 1433

  1910734 AACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCA 1910793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 AACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCA 1493

  1910794 GTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAT--TTGAAGTAGTGTACA 1910851
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||
     1494 GTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATATTTGAAGTAGTGTACA 1553

  1910852 AGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACA 1910911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 AGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACA 1613

  1910912 CGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGAT 1910971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 CGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGAT 1673

  1910972 TGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGT 1911031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 TGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGT 1733

  1911032 TATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 1911076
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 TATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 1778

EXCISED REGION

  1911676 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1911735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1838

  1911736 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1911795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1898

  1911796 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1911855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1958

  1911856 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1911915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 2018

  1911916 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1911975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAGTGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 2078

  1911976 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1912035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 2138

  1912036 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1912095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 2198

  1912096 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1912155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 2258

  1912156 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1912215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2259 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 2318

  1912216 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1912275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 2378

  1912276 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 1912335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 2438

  1912336 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 1912395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 2498

  1912396 AACAAGGGATGACTGTATAT 1912415
          ||||||||||||||||||||
     2499 AACAAGGGATGACTGTATAT 2518

Alignment time is 1.92986 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   3181] =>      3181 nucs 'mol-32-32f0-201231_3181'

Score:        3180
Aligned:      3180        nucs
Identic:      3180 (100%) nucs =>      1991 (100%)      1189 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1909658,1911648] EXCISED REGION [1911650,1912838]
 second seq =>  [      1,   1991] EXCISED REGION [   1993,   3181]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [1911649,1911649]
 second seq =>         1 nucs [1992,1992]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1911648,1911648] to [1911650,1911650]
 second seq =>         1 nucs [1991,1991] to [1993,1993]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1909658 AGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTT 1909717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTT 60

  1909718 GAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGT 1909777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGT 120

  1909778 GATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTG 1909837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTG 180

  1909838 TACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAA 1909897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAA 240

  1909898 CTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACA 1909957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACA 300

  1909958 TCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGA 1910017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGA 360

  1910018 TGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATC 1910077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATC 420

  1910078 TCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAA 1910137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAA 480

  1910138 ATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAA 1910197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAA 540

  1910198 GCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGC 1910257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGC 600

  1910258 GGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGC 1910317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGC 660

  1910318 ATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAA 1910377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAA 720

  1910378 TATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGT 1910437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGT 780

  1910438 AGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTT 1910497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTT 840

  1910498 TGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCT 1910557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCT 900

  1910558 CACGCCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAG 1910617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACGCCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAG 960

  1910618 TTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG 1910677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG 1020

  1910678 CCAGGCGTGGTGGCAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACT 1910737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCAGGCGTGGTGGCAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACT 1080

  1910738 GCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCT 1910797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCT 1140

  1910798 GGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAGTAGTGTACAAGAATG 1910857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAGTAGTGTACAAGAATG 1200

  1910858 TAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGAC 1910917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGAC 1260

  1910918 TGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAG 1910977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAG 1320

  1910978 GAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTT 1911037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTT 1380

  1911038 GCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGCTG 1911097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGCTG 1440

  1911098 CAAGTACAGGATCTCAAACATGGTTTATCTATGTTGCCTATATTTTTTGGAGAGGAAGCG 1911157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAGTACAGGATCTCAAACATGGTTTATCTATGTTGCCTATATTTTTTGGAGAGGAAGCG 1500

  1911158 GGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGTAACCCC 1911217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGTAACCCC 1560

  1911218 AGCACTTGGGGAGGCCGAGGCTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTG 1911277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCACTTGGGGAGGCCGAGGCTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTG 1620

  1911278 GCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTG 1911337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTG 1680

  1911338 GGCACCTGTAATTCCAGTTACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAATTGCTTGAACCCGGGAG 1911397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGCACCTGTAATTCCAGTTACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAATTGCTTGAACCCGGGAG 1740

  1911398 GCGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCAAG 1911457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCAAG 1800

  1911458 ACTGGCTCAAAAAAAAAATTATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGTAGGAGAGAAGACTGGG 1911517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTGGCTCAAAAAAAAAATTATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGTAGGAGAGAAGACTGGG 1860

  1911518 AAGATTGGCATCTTGGGAAGATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTGAGTTATGACTGGAAGG 1911577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGATTGGCATCTTGGGAAGATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTGAGTTATGACTGGAAGG 1920

  1911578 GAGGCTTCAGGTACTCGGAGGAAACATGGGGATTAAAAGCACAAGAAAACAGTCATTTTG 1911637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAGGCTTCAGGTACTCGGAGGAAACATGGGGATTAAAAGCACAAGAAAACAGTCATTTTG 1980

  1911638 CAACAGGAATA 1911648
          |||||||||||
     1981 CAACAGGAATA 1991

EXCISED REGION

  1911650 ATCTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTC 1911709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 ATCTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTC 2052

  1911710 TCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTT 1911769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 TCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTT 2112

  1911770 TCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTG 1911829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 TCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTG 2172

  1911830 AGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGAT 1911889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 AGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGAT 2232

  1911890 GTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACA 1911949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 GTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACA 2292

  1911950 CACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGC 1912009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 CACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGC 2352

  1912010 TCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCT 1912069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 TCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCT 2412

  1912070 TCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCC 1912129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 TCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCC 2472

  1912130 TCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTA 1912189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 TCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTA 2532

  1912190 AAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAG 1912249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 AAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAG 2592

  1912250 GTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGATTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATA 1912309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 GTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGATTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATA 2652

  1912310 TGCAAATATTACACCATTTTATATAAGGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAG 1912369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 TGCAAATATTACACCATTTTATATAAGGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAG 2712

  1912370 TGTCCTGACATCAATCCTCCACAGATAACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGA 1912429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 TGTCCTGACATCAATCCTCCACAGATAACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGA 2772

  1912430 TACAGAAAGATATATAGAGAGATAGGGCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGA 1912489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 TACAGAAAGATATATAGAGAGATAGGGCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGA 2832

  1912490 TACCTGGATGGATAGATAGGAGATAGATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATA 1912549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 TACCTGGATGGATAGATAGGAGATAGATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATA 2892

  1912550 GATACATAGATAGATAGATACATACATAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGT 1912609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 GATACATAGATAGATAGATACATACATAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGT 2952

  1912610 AGATAGATAATAGATAGATAAGTAAATAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGT 1912669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 AGATAGATAATAGATAGATAAGTAAATAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGT 3012

  1912670 AGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGTGGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTA 1912729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 AGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGTGGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTA 3072

  1912730 GGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGA 1912789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 GGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGA 3132

  1912790 TAGATAGATAGATAGATAGATAAGATAGATAGATAGAAACATAGATGAT 1912838
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 TAGATAGATAGATAGATAGATAAGATAGATAGATAGAAACATAGATGAT 3181

Alignment time is 4.72911 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   6589] =>      6589 nucs 'mol-32-32fb-067758_6589'

Score:        6289
Aligned:      6560        nucs
Identic:      6519 ( 99%) nucs =>      5052 ( 99%)      1467 ( 99%)
Gaps:           28 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1904556,1909625] EXCISED REGION [1909628,1911101]
 second seq =>  [      1,   5070] EXCISED REGION [   5086,   6563]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [1909626,1909627]
 second seq =>        15 nucs [5071,5085]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        23 nucs [1909617,1909639] to [1909619,1909641]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [1909617,1909625] to [1909628,1909636]
 second seq =>         9 nucs [5062,5070] to [5086,5094]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1909626,1909626] to [1909627,1909627]
 second seq =>         1 nucs [5071,5071] to [5085,5085]

  1904556 GTATAGCCATTACCTCCATCTCCTTCCAGAACATTCAACATTCCCCATGCTGTATAGCCA 1904615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTATAGCCATTACCTCCATCTCCTTCCAGAACATTCAACATTCCCCATGCTGTATAGCCA 60

  1904616 TTACCTCCATCTCCTTCCAGAACATTCTAATCACCCTAAATGGAGACCTTGTACCTATTA 1904675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTACCTCCATCTCCTTCCAGAACATTCTAATCACCCTAAATGGAGACCTTGTACCTATTA 120

  1904676 AGCCCTCACTCCTCCTTTTCCCAACCCATGCAAACCCCTAATCTACTTTCTATCTCTAGG 1904735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCCCTCACTCCTCCTTTTCCCAACCCATGCAAACCCCTAATCTACTTTCTATCTCTAGG 180

  1904736 GATTCATTCCTTCTAGACATTTCACATAAATGGAATAACCCAAGGTGTGGCTTATTTATA 1904795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTCATTCCTTCTAGACATTTCACATAAATGGAATAACCCAAGGTGTGGCTTATTTATA 240

  1904796 TCTGGCTTCATTTACTGAACATAATGTTCTCAAAGTACACTCACATAGCAGCGTGTGTCA 1904855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGGCTTCATTTACTGAACATAATGTTCTCAAAGTACACTCACATAGCAGCGTGTGTCA 300

  1904856 GGATTTCATTGTGTTTGATGGCTGTTTCATATTCCACCATATGGATAGACGCCATTTTGT 1904915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGATTTCATTGTGTTTGATGGCTGTTTCATATTCCACCATATGGATAGACGCCATTTTGT 360

  1904916 TTCTCCATTCACCTATGGGTGAACATTTGGGTTGTATTTACCCGTTGGTGATTGGGAAGA 1904975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTCCATTCACCTATGGGTGAACATTTGGGTTGTATTTACCCGTTGGTGATTGGGAAGA 420

  1904976 ATGCTGCTATGAATAATTGGATACGTATTTTTGTTTGAACATTTGTGCTATGCTCTGAAG 1905035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGCTGCTATGAATAATTGGATACGTATTTTTGTTTGAACATTTGTGCTATGCTCTGAAG 480

  1905036 GTTTCTGTGTCCCCAAAGTTCATATGAGGAAAGCTAATACTCAAGGTGATAGTATTAAGA 1905095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTTCTGTGTCCCCAAAGTTCATATGAGGAAAGCTAATACTCAAGGTGATAGTATTAAGA 540

  1905096 GGTGGAACCCTTGGAAAGTGATGAGGTCAAGAGAATGGAAGCTCCATGGATGGGATGAGT 1905155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTGGAACCCTTGGAAAGTGATGAGGTCAAGAGAATGGAAGCTCCATGGATGGGATGAGT 600

  1905156 GCTCTTATCAAAAGAACCCCAGAGAGCTCCTTTTTTTCCTTCTACCATGCAAGGACACAG 1905215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTCTTATCAAAAGAACCCCAGAGAGCTCCTTTTTTTCCTTCTACCATGCAAGGACACAG 660

  1905216 CAAGAAGGTGCCATCTACGAACCAGGAACTGGGTTCTTACCAGACACTGAATCTTCTATG 1905275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAGAAGGTGCCATCTACGAACCAGGAACTGGGTTCTTACCAGACACTGAATCTTCTATG 720

  1905276 TCTTGATTTTGGACATCCAACTTCCAGAACTGTGAGCAATAAACATCTGGTGTTCAAAAG 1905335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTTGATTTTGGACATCCAACTTCCAGAACTGTGAGCAATAAACATCTGGTGTTCAAAAG 780

  1905336 CCACCCAGTCTAAAGTATTTTGTTACAGCAACATACAAAAAGACAGTGGCCCCCAAAATC 1905395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCACCCAGTCTAAAGTATTTTGTTACAGCAACATACAAAAAGACAGTGGCCCCCAAAATC 840

  1905396 TCCTCTCATCACAAGGAGCCCCCTTCACTTCACCCACAAAGGAGGCAAGATTTGAGGTCA 1905455
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      841 TCCTCTCATCACAAGGAGCCCCCTTCACTTCACCCACAAAGGAGGCAAGATCTGAGGTCA 900

  1905456 TCAGGCTCCCAACCAAGGGACTGGGTGTTCTGATCTATGTTTTAACTTTTCAATCAAGTA 1905515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGGCTCCCAACCAAGGGACTGGGTGTTCTGATCTATGTTTTAACTTTTCAATCAAGTA 960

  1905516 CATCACTTCCAGCTGGGACTCTGGGTCTAGCACAGGGAGAAATAAAGTGTGAACCATCAT 1905575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATCACTTCCAGCTGGGACTCTGGGTCTAGCACAGGGAGAAATAAAGTGTGAACCATCAT 1020

  1905576 TACAAGCTCAGGGAGGGAGGGAGAAAGTGCAAATCGAAGAGCTGGAAAATCATCGAGCCA 1905635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACAAGCTCAGGGAGGGAGGGAGAAAGTGCAAATCGAAGAGCTGGAAAATCATCGAGCCA 1080

  1905636 GCCCAACTGTTGGGAGATTGGGGATTCTTTGTGCACGGAGCAGAAACAATCTCCTGCACG 1905695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCCCAACTGTTGGGAGATTGGGGATTCTTTGTGCACGGAGCAGAAACAATCTCCTGCACG 1140

  1905696 GGGTGGCGGCTTGGGCCAGGACTTCTCGGCATTGAGGAGTTACAGAGCTGTTTTGTAGCT 1905755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGTGGCGGCTTGGGCCAGGACTTCTCGGCATTGAGGAGTTACAGAGCTGTTTTGTAGCT 1200

  1905756 AAACCGACTTTCATTCCAAGCACTTCTACAGAGAACGAAATCAAACAGCGGTGATGATGG 1905815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAACCGACTTTCATTCCAAGCACTTCTACAGAGAACGAAATCAAACAGCGGTGATGATGG 1260

  1905816 GATCCCCAGGCCCGGCCAGTGATCTGCTTAATTACTGACCAGGGAAGCTTCAGTAGCTTA 1905875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATCCCCAGGCCCGGCCAGTGATCTGCTTAATTACTGACCAGGGAAGCTTCAGTAGCTTA 1320

  1905876 ATTGGATTGATGGGCACAGTGCCTAGTCCTCCACCCACTGGTCCCAGAGATTTTTATGGA 1905935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTGGATTGATGGGCACAGTGCCTAGTCCTCCACCCACTGGTCCCAGAGATTTTTATGGA 1380

  1905936 TAGCATGCTGATCTTCCATGCCCTGAGGCTTGGGGTCCTGTGTCCAGCATTCCCCACCAA 1905995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGCATGCTGATCTTCCATGCCCTGAGGCTTGGGGTCCTGTGTCCAGCATTCCCCACCAA 1440

  1905996 CTGGGCAGATGCTGCTGGATTTATGTCAACAGCGAGTTCTGCAGGCACACCTCTAAAACA 1906055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGGGCAGATGCTGCTGGATTTATGTCAACAGCGAGTTCTGCAGGCACACCTCTAAAACA 1500

  1906056 CAGTCTCATAGTGTCTTCTGTTTTCAGGAACAAATACAAATTTTCTTCTCACATAAGTTA 1906115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGTCTCATAGTGTCTTCTGTTTTCAGGAACAAATACAAATTTTCTTCTCACATAAGTTA 1560

  1906116 TATCATGAACATGAGCATTTAACAAGGGACGGTGTGTGTGTGCGAGCACGTACATGTTGT 1906175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATCATGAACATGAGCATTTAACAAGGGACGGTGTGTGTGTGCGAGCACGTACATGTTGT 1620

  1906176 ATGTTGTGTGTTTTGTGTGTGTATGAGAGAGACACCACAGACACACTAGCCCCATGAAAG 1906235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGTTGTGTGTTTTGTGTGTGTATGAGAGAGACACCACAGACACACTAGCCCCATGAAAG 1680

  1906236 GCCAGGGCAGTGAGGCCTGGACCATGGTCTGCTAAGGACCTGGTGTGGCACACTGATGGT 1906295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCCAGGGCAGTGAGGCCTGGACCATGGTCTGCTAAGGACCTGGTGTGGCACACTGATGGT 1740

  1906296 TATCACAAGTGGCCTGGGAGGTGTTCTGTTGGCCCCAGGGGTTCACTGACCATCATCACA 1906355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATCACAAGTGGCCTGGGAGGTGTTCTGTTGGCCCCAGGGGTTCACTGACCATCATCACA 1800

  1906356 GGTGGCCTGTGATGTGTTGACTTGGTGGGGCCCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTAG 1906415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGTGGCCTGTGATGTGTTGACTTGGTGGGGCCCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTAG 1860

  1906416 AGGTGATCTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGGTGACCACTGCCGGTAGCCTGGGAGGTGGT 1906475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGTGATCTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGGTGACCACTGCCGGTAGCCTGGGAGGTGGT 1920

  1906476 CTGTTGACCTTGGGGACTCATTGATGACCATTACAGGTGGCCTGGGAGATGGTCTGTTGA 1906535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGTTGACCTTGGGGACTCATTGATGACCATTACAGGTGGCCTGGGAGATGGTCTGTTGA 1980

  1906536 CCCTGGGGAGTCACTGATGACCATTTCAAGTGGTCTGTTGACCTTGGGGGCTCACTGACG 1906595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCCTGGGGAGTCACTGATGACCATTTCAAGTGGTCTGTTGACCTTGGGGGCTCACTGACG 2040

  1906596 GCCATTGCAGGTTGTCTGGGAGGTGGTGTGTTGACCTTGTGGGCTCACTGATGGCCATTG 1906655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCCATTGCAGGTTGTCTGGGAGGTGGTGTGTTGACCTTGTGGGCTCACTGATGGCCATTG 2100

  1906656 CTGGTGGCCTTGGCGATGATGGTCTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGGTGACCACTGCAGG 1906715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTGGTGGCCTTGGCGATGATGGTCTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGGTGACCACTGCAGG 2160

  1906716 TGGGCTGGGAAGTGGTCTGTTGACCTGGGGACTCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTG 1906775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGGCTGGGAAGTGGTCTGTTGACCTGGGGACTCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTG 2220

  1906776 GAGATGGTTTGTTGACCTTGGGGACTCACCACCATTGCAGGTGACTTGGAGATGGTTTGT 1906835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGATGGTTTGTTGACCTTGGGGACTCACCACCATTGCAGGTGACTTGGAGATGGTTTGT 2280

  1906836 TGACCTTGGGGACTCACTGACCACCACTGCAGGTGACTTGGGAGATGGTTTGTTGACCCT 1906895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGACCTTGGGGACTCACTGACCACCACTGCAGGTGACTTGGGAGATGGTTTGTTGACCCT 2340

  1906896 GGGGACTCACTGGTGACCATTACAGGTGGGCTGGGAAGTGGTCTCTTGACCTGGGGACTC 1906955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGGGACTCACTGGTGACCATTACAGGTGGGCTGGGAAGTGGTCTCTTGACCTGGGGACTC 2400

  1906956 ACTGACCACCACTGTTGGTGGCCTTGGAGATGGTTTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGATG 1907015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTGACCACCACTGTTGGTGGCCTTGGAGATGGTTTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGATG 2460

  1907016 ACCATTGCAGGTGGCCTGGGGGATGGCCTATTGACTGGGCACATCCTACTGATTCACTGC 1907075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACCATTGCAGGTGGCCTGGGGGATGGCCTATTGACTGGGCACATCCTACTGATTCACTGC 2520

  1907076 AGAAGACGGGCAATTTGCTGAGCACCTAGAAGGGCCT----ATCAGTGCCAGGGTTAGTG 1907131
          |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||
     2521 AGAAGGCGGGCAATTTGCTGAGCACCTAGAAGGGCCTGACTATCAGTGCCAGGGTTAGTG 2580

  1907132 GGTCCAACCTCAAGGTCCTGCACCTAGAGGACCTAACACAGACAATGTTCTGCTGGCTGC 1907191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGTCCAACCTCAAGGTCCTGCACCTAGAGGACCTAACACAGACAATGTTCTGCTGGCTGC 2640

  1907192 TGAACACTTGGACCTAACCCTGACCATCTTCTGCACATTGCCCAGGACTAGTTGGCCCCA 1907251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGAACACTTGGACCTAACCCTGACCATCTTCTGCACATTGCCCAGGACTAGTTGGCCCCA 2700

  1907252 CTTCTTCTCTTCTCAGAGCCCACGATAGGCCCTGTGGTCACTCCCTCTGCAGAGGTGGAA 1907311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTTCTTCTCTTCTCAGAGCCCACGATAGGCCCTGTGGTCACTCCCTCTGCAGAGGTGGAA 2760

  1907312 CTGAAATTCCCTCAGGTCACATTCCTGGTTATGCAGGAAGCTGAGAATGAGACAGGAATT 1907371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTGAAATTCCCTCAGGTCACATTCCTGGTTATGCAGGAAGCTGAGAATGAGACAGGAATT 2820

  1907372 CCAAACCCAGGTCAGTGGCCTAAATATGGTCCTGTGGGTCTGACCACAGGCAGTTACAAG 1907431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCAAACCCAGGTCAGTGGCCTAAATATGGTCCTGTGGGTCTGACCACAGGCAGTTACAAG 2880

  1907432 GCTGGAACCCAGGGGAAAGCTGCCTTCCCACATCGCGCTGGGTGCACACCTGGAGCATTA 1907491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCTGGAACCCAGGGGAAAGCTGCCTTCCCACATCGCGCTGGGTGCACACCTGGAGCATTA 2940

  1907492 CACAGCTTGGGGGGATGAAGGGTAAGACCTCAGGCCCCTGGGCAGCCATGCTCTTATGAG 1907551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CACAGCTTGGGGGGATGAAGGGTAAGACCTCAGGCCCCTGGGCAGCCATGCTCTTATGAG 3000

  1907552 TATGTATATCCTGGAGCAGGTCCTGCCACTTCAGGCCTCCTTACTAGTGGTGGAAGAGGC 1907611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TATGTATATCCTGGAGCAGGTCCTGCCACTTCAGGCCTCCTTACTAGTGGTGGAAGAGGC 3060

  1907612 AGGTGCCTGAGCCCCTCTTCCCCATTCTGACTTGTACCTTTTGACTCCTAGCCCTTTCCA 1907671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGGTGCCTGAGCCCCTCTTCCCCATTCTGACTTGTACCTTTTGACTCCTAGCCCTTTCCA 3120

  1907672 CTCTCCCTCCCCAGACCTCCTAGTTCAGGACATGCCTGAACACCTCCGGTAACCTTCCCA 1907731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTCTCCCTCCCCAGACCTCCTAGTTCAGGACATGCCTGAACACCTCCGGTAACCTTCCCA 3180

  1907732 TGTGTAGTTTCCAGTATACCAAGAGGAGCTTGTGCGGTGGTTGAGCTTTAAGCAGCAGAA 1907791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGTGTAGTTTCCAGTATACCAAGAGGAGCTTGTGCGGTGGTTGAGCTTTAAGCAGCAGAA 3240

  1907792 AGTTTCTCAGCAATTTGCCTCGTATATATTGGTATTGGTGTGCTCCAGGGAGACAGAACC 1907851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGTTTCTCAGCAATTTGCCTCGTATATATTGGTATTGGTGTGCTCCAGGGAGACAGAACC 3300

  1907852 AATTGTATCATTTCACGATAAGAAGAGGTTCTAAGTCGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTC 1907911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AATTGTATCATTTCACGATAAGAAGAGGTTCTAAGTCGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTC 3360

  1907912 ATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTG 1907971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTG 3420

  1907972 GCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTG 1908031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTG 3480

  1908032 GGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAG 1908091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAG 3540

  1908092 GTGGAGGTTAAAGTGAGCCGAGATTGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCGA 1908151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTGGAGGTTAAAGTGAGCCGAGATTGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCGA 3600

  1908152 AACTCTGTCTCAAAAAAATAAAGTAAAATAAAATAAAATAAATAAAATAAAGAAAAGGTT 1908211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AACTCTGTCTCAAAAAAATAAAGTAAAATAAAATAAAATAAATAAAATAAAGAAAAGGTT 3660

  1908212 CTAAGCCGGTCATGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCTGAGGTGGAC 1908271
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3661 CTAAGCCGGTCATGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGAC 3720

  1908272 AGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCT 1908331
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCT 3780

  1908332 ACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTGATCCCAGCTGCTTG 1908391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTGATCCCAGCTGCTTG 3840

  1908392 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTCGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCTATCGT 1908451
          |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
     3841 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTATCGT 3900

  1908452 GCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGGCAGAGCCAGTCTCAAAATATATATATATAAATATAT 1908511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGGCAGAGCCAGTCTCAAAATATATATATATAAATATAT 3960

  1908512 ATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATGTATGTGTGTATATCTACATGC 1908571
          ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATAT----GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATGTATGTGTGTATATCTACATGC 4016

  1908572 ACACGAGTTTGTATGTATATATGTGTGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATG 1908631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 ACACGAGTTTGTATGTATATATGTGTGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATG 4076

  1908632 TATATGTAGACATATATTGTATATGTATA----TACATATATGTATACACATACACGTGT 1908687
          |||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||
     4077 TATATGTAGACATAT--TGTATATGTATAAATATACATATATGTATACACATACACGTGT 4134

  1908688 ATATGTATACATATATTGTATATGTATAAATATACATATATGTATACATATACACGTGTA 1908747
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 ATATGTATACATATATTGTATATGTATGAATATACATATATGTATACATATACACGTGTA 4194

  1908748 TGTGTATACATATGCATATACACATATATGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATA 1908807
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 TGTGTATACATATGCATATACACATATACGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATA 4254

  1908808 CACATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGT 1908867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 CACATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGT 4314

  1908868 ATGCATGCAGACACACACACACACACACACAAATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGG 1908927
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
     4315 ATGCATGCAGACACACACACACACACACA--AATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGG 4372

  1908928 ACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGA 1908987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 ACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGA 4432

  1908988 GAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGG 1909047
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4433 GAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCACCTTCTCAGGG 4492

  1909048 AGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCA 1909107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 AGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCA 4552

  1909108 CATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTA 1909167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 CATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTA 4612

  1909168 GCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTG 1909227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 GCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTG 4672

  1909228 ATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTG 1909287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 ATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTG 4732

  1909288 TTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGG 1909347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 TTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGG 4792

  1909348 TGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAA 1909407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 TGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAA 4852

  1909408 GAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAA 1909467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 GAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAA 4912

  1909468 TTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA 1909527
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 TTAGTCAAGTCATGGTGGTGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA 4972

  1909528 GAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTAC 1909587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 GAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTAC 5032

  1909588 AGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAA 1909625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 AGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAA 5070

EXCISED REGION

  1909628 AAAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATT 1909687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5086 AAAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATT 5145

  1909688 CCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCC 1909747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5146 CCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCC 5205

  1909748 AAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTA 1909807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5206 AAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTA 5265

  1909808 AAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGC 1909867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5266 AAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGC 5325

  1909868 AATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCT 1909927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5326 AATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCT 5385

  1909928 GGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCC 1909987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5386 GGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCC 5445

  1909988 AGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCT 1910047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5446 AGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCT 5505

  1910048 TCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGAC 1910107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5506 TCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGAC 5565

  1910108 ATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAG 1910167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5566 ATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAG 5625

  1910168 CAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGAC 1910227
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     5626 CAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGAAACTGGGAC 5685

  1910228 CAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAA 1910287
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5686 CAGATCCAAAGCCAGCAGCACTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAA 5745

  1910288 CAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTT 1910347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5746 CAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTT 5805

  1910348 AAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACA 1910407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5806 AAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACA 5865

  1910408 CACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACA 1910467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5866 CACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACA 5925

  1910468 TTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTA 1910527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5926 TTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTA 5985

  1910528 AAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCC---TGTAACCCCAGCACTTGGGGA 1910584
          |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||.|||
     5986 AAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCAC---ACGTGTAACCCCAGCACTTGCGGA 6042

  1910585 GGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCG 1910644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 GGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCG 6102

  1910645 AAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGC--AGGTATCTGTC 1910702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||
     6103 AAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGG-TTAGGTATCTGTC 6161

  1910703 ATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTG 1910762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6162 ATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTG 6221

  1910763 CAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTC 1910822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6222 CAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTC 6281

  1910823 AAAAAAAAAAAA---ATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAAT 1910879
          ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6282 AAAAAAAAAAAAAATATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAAT 6341

  1910880 CCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGA 1910939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6342 CCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGA 6401

  1910940 TGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGT 1910999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6402 TGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGT 6461

  1911000 GAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAG 1911059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6462 GAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAG 6521

  1911060 GGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAG 1911101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6522 GGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAG 6563

Alignment time is 8.66398 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   6141] =>      6141 nucs 'mol-32-331c-157450_6141'

Score:        6130
Aligned:      6141        nucs
Identic:      6140 (100%) nucs =>      3493 (100%)      2647 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1906149,1909641] EXCISED REGION [1909643,1912290]
 second seq =>  [      1,   3493] EXCISED REGION [   3494,   6141]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [1909642,1909642]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [1911649,1911649]
 second seq =>         1 nucs [5500,5500]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1909641,1909641] to [1909643,1909643]
 second seq =>         1 nucs [3493,3493] to [3494,3494]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1906149 GTGTGTGTGCGAGCACGTACATGTTGTATGTTGTGTGTTTTGTGTGTGTATGAGAGAGAC 1906208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGTGTGCGAGCACGTACATGTTGTATGTTGTGTGTTTTGTGTGTGTATGAGAGAGAC 60

  1906209 ACCACAGACACACTAGCCCCATGAAAGGCCAGGGCAGTGAGGCCTGGACCATGGTCTGCT 1906268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCACAGACACACTAGCCCCATGAAAGGCCAGGGCAGTGAGGCCTGGACCATGGTCTGCT 120

  1906269 AAGGACCTGGTGTGGCACACTGATGGTTATCACAAGTGGCCTGGGAGGTGTTCTGTTGGC 1906328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGGACCTGGTGTGGCACACTGATGGTTATCACAAGTGGCCTGGGAGGTGTTCTGTTGGC 180

  1906329 CCCAGGGGTTCACTGACCATCATCACAGGTGGCCTGTGATGTGTTGACTTGGTGGGGCCC 1906388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCAGGGGTTCACTGACCATCATCACAGGTGGCCTGTGATGTGTTGACTTGGTGGGGCCC 240

  1906389 ACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTAGAGGTGATCTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGGTG 1906448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTAGAGGTGATCTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGGTG 300

  1906449 ACCACTGCCGGTAGCCTGGGAGGTGGTCTGTTGACCTTGGGGACTCATTGATGACCATTA 1906508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCACTGCCGGTAGCCTGGGAGGTGGTCTGTTGACCTTGGGGACTCATTGATGACCATTA 360

  1906509 CAGGTGGCCTGGGAGATGGTCTGTTGACCCTGGGGAGTCACTGATGACCATTTCAAGTGG 1906568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGGTGGCCTGGGAGATGGTCTGTTGACCCTGGGGAGTCACTGATGACCATTTCAAGTGG 420

  1906569 TCTGTTGACCTTGGGGGCTCACTGACGGCCATTGCAGGTTGTCTGGGAGGTGGTGTGTTG 1906628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTGTTGACCTTGGGGGCTCACTGACGGCCATTGCAGGTTGTCTGGGAGGTGGTGTGTTG 480

  1906629 ACCTTGTGGGCTCACTGATGGCCATTGCTGGTGGCCTTGGCGATGATGGTCTGTTGACCC 1906688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCTTGTGGGCTCACTGATGGCCATTGCTGGTGGCCTTGGCGATGATGGTCTGTTGACCC 540

  1906689 CAGGGGCTCACTGGTGACCACTGCAGGTGGGCTGGGAAGTGGTCTGTTGACCTGGGGACT 1906748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGGGGCTCACTGGTGACCACTGCAGGTGGGCTGGGAAGTGGTCTGTTGACCTGGGGACT 600

  1906749 CACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTGGAGATGGTTTGTTGACCTTGGGGACTCACCACC 1906808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTGGAGATGGTTTGTTGACCTTGGGGACTCACCACC 660

  1906809 ATTGCAGGTGACTTGGAGATGGTTTGTTGACCTTGGGGACTCACTGACCACCACTGCAGG 1906868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTGCAGGTGACTTGGAGATGGTTTGTTGACCTTGGGGACTCACTGACCACCACTGCAGG 720

  1906869 TGACTTGGGAGATGGTTTGTTGACCCTGGGGACTCACTGGTGACCATTACAGGTGGGCTG 1906928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGACTTGGGAGATGGTTTGTTGACCCTGGGGACTCACTGGTGACCATTACAGGTGGGCTG 780

  1906929 GGAAGTGGTCTCTTGACCTGGGGACTCACTGACCACCACTGTTGGTGGCCTTGGAGATGG 1906988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAAGTGGTCTCTTGACCTGGGGACTCACTGACCACCACTGTTGGTGGCCTTGGAGATGG 840

  1906989 TTTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGATGACCATTGCAGGTGGCCTGGGGGATGGCCTATTG 1907048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGATGACCATTGCAGGTGGCCTGGGGGATGGCCTATTG 900

  1907049 ACTGGGCACATCCTACTGATTCACTGCAGAAGACGGGCAATTTGCTGAGCACCTAGAAGG 1907108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTGGGCACATCCTACTGATTCACTGCAGAAGACGGGCAATTTGCTGAGCACCTAGAAGG 960

  1907109 GCCTATCAGTGCCAGGGTTAGTGGGTCCAACCTCAAGGTCCTGCACCTAGAGGACCTAAC 1907168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCTATCAGTGCCAGGGTTAGTGGGTCCAACCTCAAGGTCCTGCACCTAGAGGACCTAAC 1020

  1907169 ACAGACAATGTTCTGCTGGCTGCTGAACACTTGGACCTAACCCTGACCATCTTCTGCACA 1907228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACAGACAATGTTCTGCTGGCTGCTGAACACTTGGACCTAACCCTGACCATCTTCTGCACA 1080

  1907229 TTGCCCAGGACTAGTTGGCCCCACTTCTTCTCTTCTCAGAGCCCACGATAGGCCCTGTGG 1907288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGCCCAGGACTAGTTGGCCCCACTTCTTCTCTTCTCAGAGCCCACGATAGGCCCTGTGG 1140

  1907289 TCACTCCCTCTGCAGAGGTGGAACTGAAATTCCCTCAGGTCACATTCCTGGTTATGCAGG 1907348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCACTCCCTCTGCAGAGGTGGAACTGAAATTCCCTCAGGTCACATTCCTGGTTATGCAGG 1200

  1907349 AAGCTGAGAATGAGACAGGAATTCCAAACCCAGGTCAGTGGCCTAAATATGGTCCTGTGG 1907408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGCTGAGAATGAGACAGGAATTCCAAACCCAGGTCAGTGGCCTAAATATGGTCCTGTGG 1260

  1907409 GTCTGACCACAGGCAGTTACAAGGCTGGAACCCAGGGGAAAGCTGCCTTCCCACATCGCG 1907468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTCTGACCACAGGCAGTTACAAGGCTGGAACCCAGGGGAAAGCTGCCTTCCCACATCGCG 1320

  1907469 CTGGGTGCACACCTGGAGCATTACACAGCTTGGGGGGATGAAGGGTAAGACCTCAGGCCC 1907528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGGGTGCACACCTGGAGCATTACACAGCTTGGGGGGATGAAGGGTAAGACCTCAGGCCC 1380

  1907529 CTGGGCAGCCATGCTCTTATGAGTATGTATATCCTGGAGCAGGTCCTGCCACTTCAGGCC 1907588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGGGCAGCCATGCTCTTATGAGTATGTATATCCTGGAGCAGGTCCTGCCACTTCAGGCC 1440

  1907589 TCCTTACTAGTGGTGGAAGAGGCAGGTGCCTGAGCCCCTCTTCCCCATTCTGACTTGTAC 1907648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCTTACTAGTGGTGGAAGAGGCAGGTGCCTGAGCCCCTCTTCCCCATTCTGACTTGTAC 1500

  1907649 CTTTTGACTCCTAGCCCTTTCCACTCTCCCTCCCCAGACCTCCTAGTTCAGGACATGCCT 1907708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTTTGACTCCTAGCCCTTTCCACTCTCCCTCCCCAGACCTCCTAGTTCAGGACATGCCT 1560

  1907709 GAACACCTCCGGTAACCTTCCCATGTGTAGTTTCCAGTATACCAAGAGGAGCTTGTGCGG 1907768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAACACCTCCGGTAACCTTCCCATGTGTAGTTTCCAGTATACCAAGAGGAGCTTGTGCGG 1620

  1907769 TGGTTGAGCTTTAAGCAGCAGAAAGTTTCTCAGCAATTTGCCTCGTATATATTGGTATTG 1907828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGTTGAGCTTTAAGCAGCAGAAAGTTTCTCAGCAATTTGCCTCGTATATATTGGTATTG 1680

  1907829 GTGTGCTCCAGGGAGACAGAACCAATTGTATCATTTCACGATAAGAAGAGGTTCTAAGTC 1907888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGTGCTCCAGGGAGACAGAACCAATTGTATCATTTCACGATAAGAAGAGGTTCTAAGTC 1740

  1907889 GGGCGCAGTGGCTCACACCTGTCATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGCTGAG 1907948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGCGCAGTGGCTCACACCTGTCATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGCTGAG 1800

  1907949 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACA 1908008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACA 1860

  1908009 AAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA 1908068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA 1920

  1908069 GGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTAAAGTGAGCCGAGATTGCGCCATTGCAC 1908128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTAAAGTGAGCCGAGATTGCGCCATTGCAC 1980

  1908129 TCCAGCCTGGGTGACAAGAGCGAAACTCTGTCTCAAAAAAATAAAGTAAAATAAAATAAA 1908188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCAGCCTGGGTGACAAGAGCGAAACTCTGTCTCAAAAAAATAAAGTAAAATAAAATAAA 2040

  1908189 ATAAATAAAATAAAGAAAAGGTTCTAAGCCGGTCATGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAG 1908248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATAAATAAAATAAAGAAAAGGTTCTAAGCCGGTCATGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAG 2100

  1908249 CATTTTGGGAGGCTGAGGTGGACAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGC 1908308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CATTTTGGGAGGCTGAGGTGGACAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGC 2160

  1908309 CAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGG 1908368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGG 2220

  1908369 GTGCCTGTGATCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTCGGAGG 1908428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTGCCTGTGATCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTCGGAGG 2280

  1908429 TGGAGATTGCAGTGAGCTATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGGCAGAGCCAGTCTC 1908488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGGAGATTGCAGTGAGCTATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGGCAGAGCCAGTCTC 2340

  1908489 AAAATATATATATATAAATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATA 1908548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAATATATATATATAAATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATA 2400

  1908549 TGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTTTGTATGTATATATGTGTGTCTACATGCA 1908608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTTTGTATGTATATATGTGTGTCTACATGCA 2460

  1908609 TGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACATATATTGTATATGTATATACATATA 1908668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACATATATTGTATATGTATATACATATA 2520

  1908669 TGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATTGTATATGTATAAATATACATATAT 1908728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATTGTATATGTATAAATATACATATAT 2580

  1908729 GTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCATATACACATATATGTGTATATGTAT 1908788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCATATACACATATATGTGTATATGTAT 2640

  1908789 AAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATATGTGTAT 1908848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATATGTGTAT 2700

  1908849 GTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACACACAAATATACGTC 1908908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACACACAAATATACGTC 2760

  1908909 CAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTATTCTCTT 1908968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTATTCTCTT 2820

  1908969 AACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACGGTGAAAT 1909028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACGGTGAAAT 2880

  1909029 GGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCCCCATTTT 1909088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCCCCATTTT 2940

  1909089 CCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATGGTCTGTC 1909148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATGGTCTGTC 3000

  1909149 ACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAAGAAAAAA 1909208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAAGAAAAAA 3060

  1909209 TCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAG 1909268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAG 3120

  1909269 ATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGT 1909328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGT 3180

  1909329 GAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGC 1909388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGC 3240

  1909389 GGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACT 1909448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACT 3300

  1909449 CTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCATCTAC 1909508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCATCTAC 3360

  1909509 TCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGA 1909568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGA 3420

  1909569 GATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAAAAA 1909628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAAAAA 3480

  1909629 AAAAAAAAAAAAA 1909641
          |||||||||||||
     3481 AAAAAAAAAAAAA 3493

EXCISED REGION

  1909643 AGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAG 1909702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 AGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAG 3553

  1909703 GCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGG 1909762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 GCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGG 3613

  1909763 CACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGA 1909822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 CACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGA 3673

  1909823 GTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTC 1909882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 GTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTC 3733

  1909883 ACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGG 1909942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 ACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGG 3793

  1909943 GGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGG 1910002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 GGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGG 3853

  1910003 CATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACC 1910062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 CATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACC 3913

  1910063 CCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAA 1910122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3914 CCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAA 3973

  1910123 TACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAAT 1910182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3974 TACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAAT 4033

  1910183 CTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAG 1910242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4034 CTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAG 4093

  1910243 CAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACAC 1910302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4094 CAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACAC 4153

  1910303 CGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGAC 1910362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4154 CGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGAC 4213

  1910363 TTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTC 1910422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 TTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTC 4273

  1910423 GGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTA 1910482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4274 GGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTA 4333

  1910483 TCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGG 1910542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 TCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGG 4393

  1910543 CCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC 1910602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 CCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC 4453

  1910603 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAA 1910662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAA 4513

  1910663 AAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGC 1910722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 AAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGC 4573

  1910723 TGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCC 1910782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 TGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCC 4633

  1910783 ACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAG 1910842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 ACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAG 4693

  1910843 TAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTAT 1910902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 TAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTAT 4753

  1910903 AAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTG 1910962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 AAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTG 4813

  1910963 ACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAA 1911022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 ACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAA 4873

  1911023 GAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGG 1911082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 GAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGG 4933

  1911083 ACCCATTGCTGGCTGCAAGTACAGGATCTCAAACATGGTTTATCTATGTTGCCTATATTT 1911142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 ACCCATTGCTGGCTGCAAGTACAGGATCTCAAACATGGTTTATCTATGTTGCCTATATTT 4993

  1911143 TTTGGAGAGGAAGCGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCT 1911202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 TTTGGAGAGGAAGCGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCT 5053

  1911203 CACACCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCCGAGGCTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAG 1911262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 CACACCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCCGAGGCTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAG 5113

  1911263 TTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG 1911322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 TTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG 5173

  1911323 CTGGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGTTACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAATT 1911382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 CTGGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGTTACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAATT 5233

  1911383 GCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCT 1911442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 GCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCT 5293

  1911443 GAGTGACAGAGCAAGACTGGCTCAAAAAAAAAATTATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGTA 1911502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 GAGTGACAGAGCAAGACTGGCTCAAAAAAAAAATTATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGTA 5353

  1911503 GGAGAGAAGACTGGGAAGATTGGCATCTTGGGAAGATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTGA 1911562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 GGAGAGAAGACTGGGAAGATTGGCATCTTGGGAAGATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTGA 5413

  1911563 GTTATGACTGGAAGGGAGGCTTCAGGTACTCGGAGGAAACATGGGGATTAAAAGCACAAG 1911622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 GTTATGACTGGAAGGGAGGCTTCAGGTACTCGGAGGAAACATGGGGATTAAAAGCACAAG 5473

  1911623 AAAACAGTCATTTTGCAACAGGAATATATCTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGGA 1911682
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 AAAACAGTCATTTTGCAACAGGAATACATCTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGGA 5533

  1911683 CCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGGG 1911742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 CCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGGG 5593

  1911743 CAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCCA 1911802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 CAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCCA 5653

  1911803 TTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGATC 1911862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 TTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGATC 5713

  1911863 TCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAAG 1911922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 TCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAAG 5773

  1911923 AAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAAA 1911982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 AAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAAA 5833

  1911983 CGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAACT 1912042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 CGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAACT 5893

  1912043 AATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCAG 1912102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5894 AATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCAG 5953

  1912103 AGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGGA 1912162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5954 AGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGGA 6013

  1912163 GGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTTT 1912222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6014 GGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTTT 6073

  1912223 GCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGATTGAAGG 1912282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6074 GCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGATTGAAGG 6133

  1912283 TATCTGGA 1912290
          ||||||||
     6134 TATCTGGA 6141

Alignment time is 6.1132 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   9088] =>      9088 nucs 'mol-32-33b6-074967_9088'

Score:        8740
Aligned:      9101        nucs
Identic:      9042 ( 99%) nucs =>      8150 ( 99%)       892 (100%)
Gaps:           43 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1902901,1911076] EXCISED REGION [1911676,1912570]
 second seq =>  [      1,   8193] EXCISED REGION [   8194,   9088]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       599 nucs [1911077,1911675]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [1911077,1911101] to [1911676,1911700]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1902901 TCTGTTCGTTTACTGAAAGCAAAAGAAGAAAAGTGAGGAAGGGATTATACAAAGAAAGTG 1902960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGTTCGTTTACTGAAAGCAAAAGAAGAAAAGTGAGGAAGGGATTATACAAAGAAAGTG 60

  1902961 ACTGAAAAATTCTGAAAATATCTGTTTTCATAAGATAAGAGCTTTATTCTAGTTCTGAAC 1903020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTGAAAAATTCTGAAAATATCTGTTTTCATAAGATAAGAGCTTTATTCTAGTTCTGAAC 120

  1903021 ATATAATCATAGTCATCATTGTCCTTATTTAAATAAAAACAGCTAGCTGGGCAACTTAGT 1903080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATAATCATAGTCATCATTGTCCTTATTTAAATAAAAACAGCTAGCTGGGCAACTTAGT 180

  1903081 CTCATTGAAATTCCTGAGATCTTCATTCTTTCTTGGTATTTGGCTGAAAAAAGAATAAGT 1903140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCATTGAAATTCCTGAGATCTTCATTCTTTCTTGGTATTTGGCTGAAAAAAGAATAAGT 240

  1903141 TTATCTCATTCTTTTCCCAAAGTATAGCACAAGGTTGAGAGCCTGGACTCGTGGCATGCA 1903200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATCTCATTCTTTTCCCAAAGTATAGCACAAGGTTGAGAGCCTGGACTCGTGGCATGCA 300

  1903201 TACCTAATGAGACCGTTGTATTACTTGGGGTGAAACTCCTTCCATTTGACTTGATGTAGT 1903260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACCTAATGAGACCGTTGTATTACTTGGGGTGAAACTCCTTCCATTTGACTTGATGTAGT 360

  1903261 TATTTTCTTTTTCTTGCAAGGGAAGCAAACTTTGGGTTCTACCTGGGTCTTCCTTAAGCA 1903320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATTTTCTTTTTCTTGCAAGGGAAGCAAACTTTGGGTTCTACCTGGGTCTTCCTTAAGCA 420

  1903321 TCAGGTGTGTTTCAAATGGATAGATTTAATAATAATTGATCCACTAATAATTGATCCACT 1903380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAGGTGTGTTTCAAATGGATAGATTTAATAATAATTGATCCACTAATAATTGATCCACT 480

  1903381 GGGCAATGATTTTTTAAATGTTTGTTTTCAAATTTAAAACAATGCCTCAAGTTTAGAAAT 1903440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGCAATGATTTTTTAAATGTTTGTTTTCAAATTTAAAACAATGCCTCAAGTTTAGAAAT 540

  1903441 GCCTCTCCTCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGA 1903500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCTCTCCTCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGA 600

  1903501 GGCGGGTAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGAACAGCCTGGCCAACATGGTGAATCCC 1903560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCGGGTAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGAACAGCCTGGCCAACATGGTGAATCCC 660

  1903561 CATCTCTACTAAATATAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCAGCT 1903620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATCTCTACTAAATATAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCAGCT 720

  1903621 ACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGAGATGTGGAGGTTGCAGTGAGCT 1903680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGAGATGTGGAGGTTGCAGTGAGCT 780

  1903681 GAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAAACGGAAAACTCCATCTCAAAAAAA 1903740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAAACGGAAAACTCCATCTCAAAAAAA 840

  1903741 AAAATGCCTCTCCTCTTCTAATTACCTCCCATCCCTCTCCCACTTCAAAGATCCTCATTC 1903800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAATGCCTCTCCTCTTCTAATTACCTCCCATCCCTCTCCCACTTCAAAGATCCTCATTC 900

  1903801 TGATTTTTCAAGGCTGAGTTCTGGGTTGGCAGGACAGTCTTGAATGAGGATCTGAATGTA 1903860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGATTTTTCAAGGCTGAGTTCTGGGTTGGCAGGACAGTCTTGAATGAGGATCTGAATGTA 960

  1903861 GGAGTATTCCTGCAATTAGTCTTCGTTGCCACTAGGAGGTGGTGTGTAGCGGGGTGTCCT 1903920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAGTATTCCTGCAATTAGTCTTCGTTGCCACTAGGAGGTGGTGTGTAGCGGGGTGTCCT 1020

  1903921 TTTGAGTTGACTTGCCAAGAAGACCAGGTGTAGGGTTAAGCATGATTTTCCAAATGGAAG 1903980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGAGTTGACTTGCCAAGAAGACCAGGTGTAGGGTTAAGCATGATTTTCCAAATGGAAG 1080

  1903981 CTTCAGGAAAGCTTCAAAAGATACCTTATGCACTGTAATGCACAGCATTTGATATTAAAA 1904040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTCAGGAAAGCTTCAAAAGATACCTTATGCACTGTAATGCACAGCATTTGATATTAAAA 1140

  1904041 CAATACATAGCATCTTAAACAATACATAGCAAGTGAAGTTTCTCTCAGGCTTCCCTCACA 1904100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAATACATAGCATCTTAAACAATACATAGCAAGTGAAGTTTCTCTCAGGCTTCCCTCACA 1200

  1904101 AAGAGCAAGCCTTGCTTATGGTGTCCTTGTTCTGTCCTATACCTTATCTCAGGCACTGTG 1904160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGAGCAAGCCTTGCTTATGGTGTCCTTGTTCTGTCCTATACCTTATCTCAGGCACTGTG 1260

  1904161 AGCTGGGAATTAAAATTTTCTTTCCTTTTTTTTTTT-GAGACAGAGTCTCGCTCTGCTGC 1904219
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     1261 AGCTGGGAATTAAAATTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGCTGC 1320

  1904220 CCAGGGTGGAGTGCAATGATGCAAACTTGGCTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAA 1904279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAGGGTGGAGTGCAATGATGCAAACTTGGCTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAA 1380

  1904280 GCAATCATCCTGCCTCAGCCTCCTAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGTCACCACACCA 1904339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCAATCATCCTGCCTCAGCCTCCTAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGTCACCACACCA 1440

  1904340 TGCTCATTTTGTATTTTAGTAGAGATGTTGGTTTCACCATGTTGGTCTGGCTGGTCTCAA 1904399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGCTCATTTTGTATTTTAGTAGAGATGTTGGTTTCACCATGTTGGTCTGGCTGGTCTCAA 1500

  1904400 ACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCTACCTCCACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGT 1904459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCTACCTCCACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGT 1560

  1904460 GAGCCACCACACCCAGCTATCTTTACATTTTAATTATGGCAAAATACATATAACATAACA 1904519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGCCACCACACCCAGCTATCTTTACATTTTAATTATGGCAAAATACATATAACATAACA 1620

  1904520 TTTACTACTAGTGACATTCAGAACATTCCCCATGCTGTATAGCCATTACCTCCATCTCCT 1904579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTACTACTAGTGACATTCAGAACATTCCCCATGCTGTATAGCCATTACCTCCATCTCCT 1680

  1904580 TCCAGAACATTCAACATTCCCCATGCTGTATAGCCATTACCTCCATCTCCTTCCAGAACA 1904639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCCAGAACATTCAACATTCCCCATGCTGTATAGCCATTACCTCCATCTCCTTCCAGAACA 1740

  1904640 TTCTAATCACCCTAAATGGAGACCTTGTACCTATTAAGCCCTCACTCCTCCTTTTCCCAA 1904699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTCTAATCACCCTAAATGGAGACCTTGTACCTATTAAGCCCTCACTCCTCCTTTTCCCAA 1800

  1904700 CCCATGCAAACCCCTAATCTACTTTCTATCTCTAGGGATTCATTCCTTCTAGACATTTCA 1904759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCCATGCAAACCCCTAATCTACTTTCTATCTCTAGGGATTCATTCCTTCTAGACATTTCA 1860

  1904760 CATAAATGGAATAACCCAAGGTGTGGCTTATTTATATCTGGCTTCATTTACTGAACATAA 1904819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATAAATGGAATAACCCAAGGTGTGGCTTATTTATATCTGGCTTCATTTACTGAACATAA 1920

  1904820 TGTTCTCAAAGTACACTCACATAGCAGCGTGTGTCAGGATTTCATTGTGTTTGATGGCTG 1904879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTTCTCAAAGTACACTCACATAGCAGCGTGTGTCAGGATTTCATTGTGTTTGATGGCTG 1980

  1904880 TTTCATATTCCACCATATGGATAGACGCCATTTTGTTTCTCCATTCACCTATGGGTGAAC 1904939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTCATATTCCACCATATGGATAGACGCCATTTTGTTTCTCCATTCACCTATGGGTGAAC 2040

  1904940 ATTTGGGTTGTATTTACCCGTTGGTGATTGGGAAGAATGCTGCTATGAATAATTGGATAC 1904999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTTGGGTTGTATTTACCCGTTGGTGATTGGGAAGAATGCTGCTATGAATAATTGGATAC 2100

  1905000 GTATTTTTGTTTGAACATTTGTGCTATGCTCTGAAGGTTTCTGTGTCCCCAAAGTTCATA 1905059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTATTTTTGTTTGAACATTTGTGCTATGCTCTGAAGGTTTCTGTGTCCCCAAAGTTCATA 2160

  1905060 TGAGGAAAGCTAATACTCAAGGTGATAGTATTAAGAGGTGGAACCCTTGGAAAGTGATGA 1905119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGAGGAAAGCTAATACTCAAGGTGATAGTATTAAGAGGTGGAACCCTTGGAAAGTGATGA 2220

  1905120 GGTCAAGAGAATGGAAGCTCCATGGATGGGATGAGTGCTCTTATCAAAAGAACCCCAGAG 1905179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGTCAAGAGAATGGAAGCTCCATGGATGGGATGAGTGCTCTTATCAAAAGAACCCCAGAG 2280

  1905180 AGCTCCTTTTTTTCCTTCTACCATGCAAGGACACAGCAAGAAGGTGCCATCTACGAACCA 1905239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGCTCCTTTTTTTCCTTCTACCATGCAAGGACACAGCAAGAAGGTGCCATCTACGAACCA 2340

  1905240 GGAACTGGGTTCTTACCAGACACTGAATCTTCTATGTCTTGATTTTGGACATCCAACTTC 1905299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGAACTGGGTTCTTACCAGACACTGAATCTTCTATGTCTTGATTTTGGACATCCAACTTC 2400

  1905300 CAGAACTGTGAGCAATAAACATCTGGTGTTCAAAAGCCACCCAGTCTAAAGTATTTTGTT 1905359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGAACTGTGAGCAATAAACATCTGGTGTTCAAAAGCCACCCAGTCTAAAGTATTTTGTT 2460

  1905360 ACAGCAACATACAAAAAGACAGTGGCCCCCAAAATCTCCTCTCATCACAAGGAGCCCCCT 1905419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACAGCAACATACAAAAAGACAGTGGCCCCCAAAATCTCCTCTCATCACAAGGAGCCCCCT 2520

  1905420 TCACTTCACCCACAAAGGAGGCAAGATTTGAGGTCATCAGGCTCCCAACCAAGGGACTGG 1905479
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCACTTCACCCACAAAGGAGGCAAGATCTGAGGTCATCAGGCTCCCAACCAAGGGACTGG 2580

  1905480 GTGTTCTGATCTATGTTTTAACTTTTCAATCAAGTACATCACTTCCAGCTGGGACTCTGG 1905539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTGTTCTGATCTATGTTTTAACTTTTCAATCAAGTACATCACTTCCAGCTGGGACTCTGG 2640

  1905540 GTCTAGCACAGGGAGAAATAAAGTGTGAACCATCATTACAAGCTCAGGGAGGGAGGGAGA 1905599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTCTAGCACAGGGAGAAATAAAGTGTGAACCATCATTACAAGCTCAGGGAGGGAGGGAGA 2700

  1905600 AAGTGCAAATCGAAGAGCTGGAAAATCATCGAGCCAGCCCAACTGTTGGGAGATTGGGGA 1905659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGTGCAAATCGAAGAGCTGGAAAATCATCGAGCCAGCCCAACTGTTGGGAGATTGGGGA 2760

  1905660 TTCTTTGTGCACGGAGCAGAAACAATCTCCTGCACGGGGTGGCGGCTTGGGCCAGGACTT 1905719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTCTTTGTGCACGGAGCAGAAACAATCTCCTGCACGGGGTGGCGGCTTGGGCCAGGACTT 2820

  1905720 CTCGGCATTGAGGAGTTACAGAGCTGTTTTGTAGCTAAACCGACTTTCATTCCAAGCACT 1905779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTCGGCATTGAGGAGTTACAGAGCTGTTTTGTAGCTAAACCGACTTTCATTCCAAGCACT 2880

  1905780 TCTACAGAGAACGAAATCAAACAGCGGTGATGATGGGATCCCCAGGCCCGGCCAGTGATC 1905839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCTACAGAGAACGAAATCAAACAGCGGTGATGATGGGATCCCCAGGCCCGGCCAGTGATC 2940

  1905840 TGCTTAATTACTGACCAGGGAAGCTTCAGTAGCTTAATTGGATTGATGGGCACAGTGCCT 1905899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGCTTAATTACTGACCAGGGAAGCTTCAGTAGCTTAATTGGATTGATGGGCACAGTGCCT 3000

  1905900 AGTCCTCCACCCACTGGTCCCAGAGATTTTTATGGATAGCATGCTGATCTTCCATGCCCT 1905959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGTCCTCCACCCACTGGTCCCAGAGATTTTTATGGATAGCATGCTGATCTTCCATGCCCT 3060

  1905960 GAGGCTTGGGGTCCTGTGTCCAGCATTCCCCACCAACTGGGCAGATGCTGCTGGATTTAT 1906019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAGGCTTGGGGTCCTGTGTCCAGCATTCCCCACCAACTGGGCAGATGCTGCTGGATTTAT 3120

  1906020 GTCAACAGCGAGTTCTGCAGGCACACCTCTAAAACACAGTCTCATAGTGTCTTCTGTTTT 1906079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTCAACAGCGAGTTCTGCAGGCACACCTCTAAAACACAGTCTCATAGTGTCTTCTGTTTT 3180

  1906080 CAGGAACAAATACAAATTTTCTTCTCACATAAGTTATATCATGAACATGAGCATTTAACA 1906139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CAGGAACAAATACAAATTTTCTTCTCACATAAGTTATATCATGAACATGAGCATTTAACA 3240

  1906140 AGGGACGGTGTGTGTGTGCGAGCACGTACATGTTGTATGTTGTGTGTTTTGTGTGTGTAT 1906199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGGGACGGTGTGTGTGTGCGAGCACGTACATGTTGTATGTTGTGTGTTTTGTGTGTGTAT 3300

  1906200 GAGAGAGACACCACAGACACACTAGCCCCATGAAAGGCCAGGGCAGTGAGGCCTGGACCA 1906259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAGAGAGACACCACAGACACACTAGCCCCATGAAAGGCCAGGGCAGTGAGGCCTGGACCA 3360

  1906260 TGGTCTGCTAAGGACCTGGTGTGGCACACTGATGGTTATCACAAGTGGCCTGGGAGGTGT 1906319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGGTCTGCTAAGGACCTGGTGTGGCACACTGATGGTTATCACAAGTGGCCTGGGAGGTGT 3420

  1906320 TCTGTTGGCCCCAGGGGTTCACTGACCATCATCACAGGTGGCCTGTGATGTGTTGACTTG 1906379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCTGTTGGCCCCAGGGGTTCACTGACCATCATCACAGGTGGCCTGTGATGTGTTGACTTG 3480

  1906380 GTGGGGCCCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTAGAGGTGATCTGTTGACCCCAGGGGC 1906439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTGGGGCCCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTAGAGGTGATCTGTTGACCCCAGGGGC 3540

  1906440 TCACTGGTGACCACTGCCGGTAGCCTGGGAGGTGGTCTGTTGACCTTGGGGACTCATTGA 1906499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCACTGGTGACCACTGCCGGTAGCCTGGGAGGTGGTCTGTTGACCTTGGGGACTCATTGA 3600

  1906500 TGACCATTACAGGTGGCCTGGGAGATGGTCTGTTGACCCTGGGGAGTCACTGATGACCAT 1906559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGACCATTACAGGTGGCCTGGGAGATGGTCTGTTGACCCTGGGGAGTCACTGATGACCAT 3660

  1906560 TTCAAGTGGTCTGTTGACCTTGGGGGCTCACTGACGGCCATTGCAGGTTGTCTGGGAGGT 1906619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTCAAGTGGTCTGTTGACCTTGGGGGCTCACTGACGGCCATTGCAGGTTGTCTGGGAGGT 3720

  1906620 GGTGTGTTGACCTTGTGGGCTCACTGATGGCCATTGCTGGTGGCCTTGGCGATGATGGTC 1906679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GGTGTGTTGACCTTGTGGGCTCACTGATGGCCATTGCTGGTGGCCTTGGCGATGATGGTC 3780

  1906680 TGTTGACCCCAGGGGCTCACTGGTGACCACTGCAGGTGGGCTGGGAAGTGGTCTGTTGAC 1906739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGTTGACCCCAGGGGCTCACTGGTGACCACTGCAGGTGGGCTGGGAAGTGGTCTGTTGAC 3840

  1906740 CTGGGGACTCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTGGAGATGGTTTGTTGACCTTGGGGA 1906799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTGGGGACTCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTGGAGATGGTTTGTTGACCTTGGGGA 3900

  1906800 CTCACCACCATTGCAGGTGACTTGGAGATGGTTTGTTGACCTTGGGGACTCACTGACCAC 1906859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTCACCACCATTGCAGGTGACTTGGAGATGGTTTGTTGACCTTGGGGACTCACTGACCAC 3960

  1906860 CACTGCAGGTGACTTGGGAGATGGTTTGTTGACCCTGGGGACTCACTGGTGACCATTACA 1906919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CACTGCAGGTGACTTGGGAGATGGTTTGTTGACCCTGGGGACTCACTGGTGACCATTACA 4020

  1906920 GGTGGGCTGGGAAGTGGTCTCTTGACCTGGGGACTCACTGACCACCACTGTTGGTGGCCT 1906979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GGTGGGCTGGGAAGTGGTCTCTTGACCTGGGGACTCACTGACCACCACTGTTGGTGGCCT 4080

  1906980 TGGAGATGGTTTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGATGACCATTGCAGGTGGCCTGGGGGAT 1907039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TGGAGATGGTTTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGATGACCATTGCAGGTGGCCTGGGGGAT 4140

  1907040 GGCCTATTGACTGGGCACATCCTACTGATTCACTGCAGAAGACGGGCAATTTGCTGAGCA 1907099
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4141 GGCCTATTGACTGGGCACATCCTACTGATTCACTGCAGAAGGCGGGCAATTTGCTGAGCA 4200

  1907100 CCTAGAAGGGCC----TATCAGTGCCAGGGTTAGTGGGTCCAACCTCAAGGTCCTGCACC 1907155
          ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CCTAGAAGGGCCCGACTATCAGTGCCAGGGTTAGTGGGTCCAACCTCAAGGTCCTGCACC 4260

  1907156 TAGAGGACCTAACACAGACAATGTTCTGCTGGCTGCTGAACACTTGGACCTAACCCTGAC 1907215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TAGAGGACCTAACACAGACAATGTTCTGCTGGCTGCTGAACACTTGGACCTAACCCTGAC 4320

  1907216 CATCTTCTGCACATTGCCCAGGACTAGTTGGCCCCACTTCTTCTCTTCTCAGAGCCCACG 1907275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CATCTTCTGCACATTGCCCAGGACTAGTTGGCCCCACTTCTTCTCTTCTCAGAGCCCACG 4380

  1907276 ATAGGCCCTGTGGTCACTCCCTCTGCAGAGGTGGAACTGAAATTCCCTCAGGTCACATTC 1907335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ATAGGCCCTGTGGTCACTCCCTCTGCAGAGGTGGAACTGAAATTCCCTCAGGTCACATTC 4440

  1907336 CTGGTTATGCAGGAAGCTGAGAATGAGACAGGAATTCCAAACCCAGGTCAGTGGCCTAAA 1907395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTGGTTATGCAGGAAGCTGAGAATGAGACAGGAATTCCAAACCCAGGTCAGTGGCCTAAA 4500

  1907396 TATGGTCCTGTGGGTCTGACCACAGGCAGTTACAAGGCTGGAACCCAGGGGAAAGCTGCC 1907455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TATGGTCCTGTGGGTCTGACCACAGGCAGTTACAAGGCTGGAACCCAGGGGAAAGCTGCC 4560

  1907456 TTCCCACATCGCGCTGGGTGCACACCTGGAGCATTACACAGCTTGGGGGGATGAAGGGTA 1907515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTCCCACATCGCGCTGGGTGCACACCTGGAGCATTACACAGCTTGGGGGGATGAAGGGTA 4620

  1907516 AGACCTCAGGCCCCTGGGCAGCCATGCTCTTATGAGTATGTATATCCTGGAGCAGGTCCT 1907575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AGACCTCAGGCCCCTGGGCAGCCATGCTCTTATGAGTATGTATATCCTGGAGCAGGTCCT 4680

  1907576 GCCACTTCAGGCCTCCTTACTAGTGGTGGAAGAGGCAGGTGCCTGAGCCCCTCTTCCCCA 1907635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GCCACTTCAGGCCTCCTTACTAGTGGTGGAAGAGGCAGGTGCCTGAGCCCCTCTTCCCCA 4740

  1907636 TTCTGACTTGTACCTTTTGACTCCTAGCCCTTTCCACTCTCCCTCCCCAGACCTCCTAGT 1907695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTCTGACTTGTACCTTTTGACTCCTAGCCCTTTCCACTCTCCCTCCCCAGACCTCCTAGT 4800

  1907696 TCAGGACATGCCTGAACACCTCCGGTAACCTTCCCATGTGTAGTTTCCAGTATACCAAGA 1907755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TCAGGACATGCCTGAACACCTCCGGTAACCTTCCCATGTGTAGTTTCCAGTATACCAAGA 4860

  1907756 GGAGCTTGTGCGGTGGTTGAGCTTTAAGCAGCAGAAAGTTTCTCAGCAATTTGCCTCGTA 1907815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GGAGCTTGTGCGGTGGTTGAGCTTTAAGCAGCAGAAAGTTTCTCAGCAATTTGCCTCGTA 4920

  1907816 TATATTGGTATTGGTGTGCTCCAGGGAGACAGAACCAATTGTATCATTTCACGATAAGAA 1907875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TATATTGGTATTGGTGTGCTCCAGGGAGACAGAACCAATTGTATCATTTCACGATAAGAA 4980

  1907876 GAGGTTCTAAGTCGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTCATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAG 1907935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GAGGTTCTAAGTCGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTCATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAG 5040

  1907936 GTGGATGGCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTC 1907995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GTGGATGGCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTC 5100

  1907996 TACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCG 1908055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCG 5160

  1908056 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTAAAGTGAGCCGAGAT 1908115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTAAAGTGAGCCGAGAT 5220

  1908116 TGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCGAAACTCTGTCTCAAAAAAATAAAGT 1908175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCGAAACTCTGTCTCAAAAAAATAAAGT 5280

  1908176 AAAATAAAATAAAATAAATAAAATAAAGAAAAGGTTCTAAGCCGGTCATGGTGGCTCAAG 1908235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AAAATAAAATAAAATAAATAAAATAAAGAAAAGGTTCTAAGCCGGTCATGGTGGCTCAAG 5340

  1908236 CCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCTGAGGTGGACAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCG 1908295
          |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5341 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGACAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCA 5400

  1908296 AGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCG 1908355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCG 5460

  1908356 GGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTGATCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCT 1908415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTGATCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCT 5520

  1908416 TGAACCTCGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCTATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGG 1908475
          |||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TGAACCTGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGG 5580

  1908476 CAGAGCCAGTCTCAAAATATATATATATAAATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGT 1908535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||
     5581 CAGAGCCAGTCTCAAAATATATATATATAAATATATATAT----GTGTGTGTGTGTGTGT 5636

  1908536 GTGTGTATGTATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTTTGTATGTATATATGT 1908595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 GTGTGTATGTATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTTTGTATGTATATATGT 5696

  1908596 GTGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACATATATTGTATAT 1908655
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||
     5697 GTGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACATAT--TGTATAT 5754

  1908656 GTATA----TACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATTGTATATG 1908711
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5755 GTATAAATATACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATTGTATATG 5814

  1908712 TATAAATATACATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCATATACACA 1908771
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5815 TATGAATATACATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCATATACACA 5874

  1908772 TATATGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACA 1908831
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5875 TATACGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACA 5934

  1908832 CAAGCATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACAC 1908891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5935 CAAGCATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACAC 5994

  1908892 ACACACAAATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTG 1908951
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5995 ACACA--AATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTG 6052

  1908952 GAAGAAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTAC 1909011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 GAAGAAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTAC 6112

  1909012 TTCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGC 1909071
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 TTCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCACCTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGC 6172

  1909072 CTTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCA 1909131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 CTTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCA 6232

  1909132 GGGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTAT 1909191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6233 GGGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTAT 6292

  1909192 GAAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTG 1909251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6293 GAAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTG 6352

  1909252 TAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAA 1909311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6353 TAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAA 6412

  1909312 AAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCA 1909371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6413 AAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCA 6472

  1909372 CTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAAC 1909431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6473 CTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAAC 6532

  1909432 ATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTG 1909491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6533 ATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGTGTGTG 6592

  1909492 CCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGG 1909551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6593 CCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGG 6652

  1909552 AGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCC 1909611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6653 AGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCC 6712

  1909612 CGTCTAAAAAAAAA--------AAAAAA----AAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAG 1909659
          ||||||||||||||        ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||
     6713 CGTCTAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAG 6772

  1909660 CCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGA 1909719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6773 CCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGA 6832

  1909720 GCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGA 1909779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6833 GCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGA 6892

  1909780 TGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTA 1909839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6893 TGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTA 6952

  1909840 CCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACT 1909899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6953 CCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACT 7012

  1909900 TAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATC 1909959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7013 TAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATC 7072

  1909960 ACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATG 1910019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7073 ACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATG 7132

  1910020 GGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTC 1910079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7133 GGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTC 7192

  1910080 TGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAAT 1910139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7193 TGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAAT 7252

  1910140 GGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGC 1910199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7253 GGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGC 7312

  1910200 CTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGG 1910259
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     7313 CTCCCATTCACACTGGGGAAACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCACTGAAACAGCGG 7372

  1910260 TTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCAT 1910319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7373 TTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCAT 7432

  1910320 TCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATA 1910379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7433 TCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATA 7492

  1910380 TCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAG 1910439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7493 TCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAG 7552

  1910440 AAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTG 1910499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7553 AAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTG 7612

  1910500 TGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCA 1910559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7613 TGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCA 7672

  1910560 CGCCT----GTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 1910615
          |        ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7673 C----ACGTGTAACCCCAGCACTTGCGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 7728

  1910616 AGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 1910675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7729 AGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 7788

  1910676 AGCCAGGCGTGGTGGC--AGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAG 1910733
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7789 AGCCAGGCGTGGTGG-TTAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAG 7847

  1910734 AACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCA 1910793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7848 AACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCA 7907

  1910794 GTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAA---TTTGAAGTAGTGTAC 1910850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||
     7908 GTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATATTTGAAGTAGTGTAC 7967

  1910851 AAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACAC 1910910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7968 AAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACAC 8027

  1910911 ACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGA 1910970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8028 ACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGA 8087

  1910971 TTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAG 1911030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8088 TTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAG 8147

  1911031 TTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 1911076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8148 TTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 8193

EXCISED REGION

  1911676 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1911735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8194 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 8253

  1911736 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1911795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8254 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 8313

  1911796 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1911855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8314 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 8373

  1911856 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1911915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8374 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 8433

  1911916 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1911975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8434 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAGTGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 8493

  1911976 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1912035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8494 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 8553

  1912036 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1912095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8554 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 8613

  1912096 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1912155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8614 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 8673

  1912156 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1912215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8674 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 8733

  1912216 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1912275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8734 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 8793

  1912276 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 1912335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8794 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 8853

  1912336 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 1912395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8854 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 8913

  1912396 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 1912455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8914 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 8973

  1912456 GCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 1912515
          |.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8974 GTGATACAGAGATGAAAGATTGATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 9033

  1912516 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATAC 1912570
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9034 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATAC 9088

Alignment time is 8.95853 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   5806] =>      5806 nucs 'mol-32-349d-024522_5806'

Score:        5415
Aligned:      5840        nucs
Identic:      5767 ( 99%) nucs =>      2283 ( 99%)      3484 ( 99%)
Gaps:           58 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1908782,1911076] EXCISED REGION [1911676,1915196]
 second seq =>  [      1,   2307] EXCISED REGION [   2308,   5806]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       599 nucs [1911077,1911675]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [1911077,1911101] to [1911676,1911700]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1908782 TATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATA 1908841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATA 60

  1908842 TGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACACACAAAT 1908901
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
       61 TGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACACA--AAT 118

  1908902 ATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTA 1908961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      119 ATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTA 178

  1908962 TTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACG 1909021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 TTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACG 238

  1909022 GTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCC 1909081
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 GTGAAATGGTTTTCACCTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCC 298

  1909082 CCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATG 1909141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 CCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATG 358

  1909142 GTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAA 1909201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 GTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAA 418

  1909202 GAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATA 1909261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 GAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATA 478

  1909262 TTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAA 1909321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 TTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAA 538

  1909322 CAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGG 1909381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGG 598

  1909382 CCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAAT 1909441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 CCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAAT 658

  1909442 CCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCC 1909501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      659 CCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGTGTGTGCCTGTAATCC 718

  1909502 CATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGT 1909561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGT 778

  1909562 GAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAA 1909621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAA 838

  1909622 AAAA--------AAAAAA---AAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGT 1909670
          ||||        ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 AAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGT 898

  1909671 GGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGT 1909730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 GGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGT 958

  1909731 CGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGT 1909790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGT 1018

  1909791 TCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAA 1909850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAA 1078

  1909851 CTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGT 1909910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGT 1138

  1909911 GGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTT 1909970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 GGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTT 1198

  1909971 CTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTG 1910030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTG 1258

  1910031 CCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGG 1910090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGG 1318

  1910091 CACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATT 1910150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 CACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATT 1378

  1910151 GGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCAC 1910210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCAC 1438

  1910211 ACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCG 1910270
          ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1439 ACTGGGGAAACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCACTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCG 1498

  1910271 TTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGG 1910330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGG 1558

  1910331 AAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCT 1910390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 AAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCT 1618

  1910391 TATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCA 1910450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCA 1678

  1910451 AGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAG 1910510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAG 1738

  1910511 GGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCT----GT 1910566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||
     1739 GGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCAC----ACGTGT 1794

  1910567 AACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACC 1910626
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 AACCCCAGCACTTGCGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACC 1854

  1910627 AGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTG 1910686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 AGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTG 1914

  1910687 GTGGC--AGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAA 1910744
          ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 GTGG-TTAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAA 1973

  1910745 CCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGAC 1910804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 CCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGAC 2033

  1910805 AGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAT--TTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGA 1910862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
     2034 AGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGA 2093

  1910863 GAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACT 1910922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 GAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACT 2153

  1910923 CGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGG 1910982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 CGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGG 2213

  1910983 CTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAAC 1911042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 CTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAAC 2273

  1911043 AGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 1911076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 AGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 2307

EXCISED REGION

  1911676 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1911735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 2367

  1911736 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1911795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 2427

  1911796 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1911855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 2487

  1911856 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1911915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 2547

  1911916 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1911975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAGTGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 2607

  1911976 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1912035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 2667

  1912036 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1912095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 2727

  1912096 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1912155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 2787

  1912156 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1912215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 2847

  1912216 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1912275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 2907

  1912276 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 1912335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 2967

  1912336 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 1912395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 3027

  1912396 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 1912455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 3087

  1912456 GCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 1912515
          |.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 GTGATACAGAGATGAAAGATTGATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 3147

  1912516 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 1912575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 3207

  1912576 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 1912635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 3267

  1912636 TAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGT 1912695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 TAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGT 3327

  1912696 GGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGT 1912755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 GGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGT 3387

  1912756 AGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAGAT 1912815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     3388 AGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT-AGAT 3446

  1912816 -AGATAGATAGAAACATAGATGATAGGAGACAGGTACATAGATATCTGGATGGATAGATA 1912874
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 AAGATAGATAGAAACATAGATGATAGGAGACAGGTACATAGATATCTGGATGGATAGATA 3506

  1912875 GGAGATAGACGACAGATAGATAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAGATAATAGATAA 1912934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 GGAGATAGACGACAGATAGATAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAGATAATAGATAA 3566

  1912935 GTAAATAGGTAGATAGTAGACAGAGATAGAAGATAGATAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGT 1912994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 GTAAATAGGTAGATAGTAGACAGAGATAGAAGATAGATAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGT 3626

  1912995 AGATAGGTAGATAGAAAAGTAACTGGTAGATAGATAGAAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGG 1913054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 AGATAGGTAGATAGAAAAGTAACTGGTAGATAGATAGAAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGG 3686

  1913055 TAGATAGAAAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATA 1913114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3687 TAGATAGAAAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGAT--------GATAGATAGATA 3738

  1913115 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGATAGATAGTAGATAGATA 1913174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||
     3739 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGATAGATAG----TAGATA 3794

  1913175 GTAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGAGATAGATGATAGATAG 1913234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 GTAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGAGATAGATGATAGATAG 3854

  1913235 GAGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATAGAGCCATATACACTGA 1913294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3855 GAGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATAGAGCCATATACACTGA 3914

  1913295 GGTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGATGTATATATAGAGAGAG 1913354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3915 GGTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGATGTATATATAGAGAGAG 3974

  1913355 AACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTGTGTCACTGCGTACATT 1913414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3975 AACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTGTGTCACTGCGTACATT 4034

  1913415 TTCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTCCCAGGGGTAAAGGGGT 1913474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4035 TTCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTCCCAGGGGTAAAGGGGT 4094

  1913475 GTGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCAGCCTCACACACAAACC 1913534
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4095 GTGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCAGCCCCACACACAAACC 4154

  1913535 CCACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCTGGATTTCCTGGAGAGG 1913594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4155 CCACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCTGGATTTCCTGGAGAGG 4214

  1913595 CTCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCTCCAGTTTGGTCACCAA 1913654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4215 CTCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCTCCAGTTTGGTCACCAA 4274

  1913655 GAGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGTGGGTTGAGTAGATGGT 1913714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4275 GAGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGTGGGTTGAGTAGATGGT 4334

  1913715 GTCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAGGGCTGCGTGGACAGTG 1913774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4335 GTCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAGGGCTGCGTGGACAGTG 4394

  1913775 CACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGACTCCGGGTCCACCACA 1913834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4395 CACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGACTCCGGGTCCACCACA 4454

  1913835 TTGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAGTCCCTTCCTCACCTGA 1913894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4455 TTGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAGTCCCTTCCTCACCTGA 4514

  1913895 GCCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCCAGTCTATCTACTTATC 1913954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4515 GCCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCCAGTCTATCTACTTATC 4574

  1913955 TATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATCTA 1914014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4575 TATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATCTA 4634

  1914015 TATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTATTATCTATCTATATCTA 1914074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||
     4635 TATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTAT----TATCTATATCTA 4690

  1914075 TCTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCTATTTATCTATCTAGCT 1914134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4691 TCTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCTATTTATCTATCTAGCT 4750

  1914135 ATCTATGTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATATATCTATGTATCTATGTATTAT 1914194
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4751 ATCTATGTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATGTATCTATGTATCTATGTATTAT 4810

  1914195 GTATCTATCTTCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTATCTCTATCTATCATCTATGT 1914254
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4811 GTATCTATCTTCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTATCTCTATCTATCAGCTATGT 4870

  1914255 ATCTCTCTATCTAGCTATCTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATCTATGTATGTA 1914314
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
     4871 ATCTCTCTATCTAGCTATCTATGTATCTAG----TATCTATCTAGCTATCTATGTATGTA 4926

  1914315 TCTATGTATTATCTATCTTCTATCTATCCATCCATATATCTATCATCAGTCAATCAATCC 1914374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TCTATGTATTATCTATCTTCTATCTATCCATCCATATATCTATCATCAGTCAATCAATCC 4986

  1914375 TTTCATCGCTGTATCGCTCTATCCAGGTATCTTATCTATTTATTTTTCTCTTTCTATATT 1914434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 TTTCATCGCTGTATCGCTCTATCCAGGTATCTTATCTATTTATTTTTCTCTTTCTATATT 5046

  1914435 TCTGTATCTCTAACTCATCTATATACAGTCATCCCTTGTTATCTGTGAGGGATTGGTTCC 1914494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 TCTGTATCTCTAACTCATCTATATACAGTCATCCCTTGTTATCTGTGAGGGATTGGTTCC 5106

  1914495 AGGACACACGACAGATAATAGTAAAATTCATGGATGTGGCTGATATAAAATGGTGTAGTA 1914554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 AGGACACACGACAGATAATAGTAAAATTCATGGATGTGGCTGATATAAAATGGTGTAGTA 5166

  1914555 TTTGCATATTAGCTATGCACATCCTTCCAAATACCTTCAATTGCCTCTATATTACTTATA 1914614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 TTTGCATATTAGCTATGCACATCCTTCCAAATACCTTCAATTGCCTCTATATTACTTATA 5226

  1914615 ATACTTAATACAATGTAAGTGCTATGTAAATAGTTACTATACCATATTGTTCAGGGAATA 1914674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 ATACTTAATACAATGTAAGTGCTATGTAAATAGTTACTATACCATATTGTTCAGGGAATA 5286

  1914675 ATGTTTTAAAAAGTCTGTACATGTTCAGTACAGATGCATTTTTTTCCAAATATTTTTCAT 1914734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 ATGTTTTAAAAAGTCTGTACATGTTCAGTACAGATGCATTTTTTTCCAAATATTTTTCAT 5346

  1914735 CTGTGGTTGGTTGAATCCACGGATTTGGAAGCCACAGATATGAACAGCCAACTCTGTGTG 1914794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 CTGTGGTTGGTTGAATCCACGGATTTGGAAGCCACAGATATGAACAGCCAACTCTGTGTG 5406

  1914795 AGTGTGTGGGTATATATACATATGTATGTGTGTATACATGTATATGTATATATGTATGTG 1914854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     5407 AGTGTGTGGGTATATATACATATGTATGTGTGTATACATGTATATGTATATACGTATGTG 5466

  1914855 TATATATGTATGTGTGTATATGTGTATATATGTGCGTATAGATGTATGTGTGTATATATG 1914914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TATATATGTATGTGTGTATATGTGTATATATGTGCGTATAGATGTATGTGTGTATATATG 5526

  1914915 TACATGTATATATGTGTGAGTGTATATATGTGTGTGTATATGTATATGTGCATTTATATG 1914974
          |||||||||||||||.||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 TACATGTATATATGTATGAGTGTATATA--TGTGTGTATATGTATATGTGCATTTATATG 5584

  1914975 TATATATGTATATGTGCATATATGTATGTGTATATATGTACACGTATATATGAGTATATA 1915034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5585 TATATATGTATATGTGCATATATGTATGTGTATATATGTACACGTATATATGAGTATATA 5644

  1915035 TGTGATTTGTATATATGTATGTGTATATATGTGC----GTATGTATATGTATATGTGTGT 1915090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||  |||||||||
     5645 TGTGATTTGTATATATGTATGTGTATATATGTGCGTGTGTATGTATATG--TATGTGTGT 5702

  1915091 ATGTTTATATGTACATGTGTATATATGTACATGTGTGTATATATGTATATATGCATGTGT 1915150
          .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
     5703 GTGTTTATATGTACATGTGTATATATGTACATGTGTGTATATATGTATATATGCA--TGT 5760

  1915151 GTATATCTGTCTGCATGTACATGTATGTGTGTATATATGTATATGC 1915196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     5761 GTATATCTGTCTGCATGTACATGTATGTGTGTGTATATGTATATGC 5806

Alignment time is 4.36443 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   2353] =>      2353 nucs 'mol-32-349d-024522_2353'

Score:        2206
Aligned:      2323        nucs
Identic:      2305 ( 99%) nucs =>       840 (100%)      1465 ( 99%)
Gaps:           13 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1908782,1909625] EXCISED REGION [1909630,1911101]
 second seq =>  [      1,    842] EXCISED REGION [    858,   2332]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [1909626,1909629]
 second seq =>        15 nucs [843,857]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        21 nucs [1909617,1909637] to [1909621,1909641]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [1909617,1909625] to [1909630,1909638]
 second seq =>         9 nucs [834,842] to [858,866]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [1909626,1909627] to [1909628,1909629]
 second seq =>         1 nucs [843,843] to [857,857]

  1908782 TATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATA 1908841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATA 60

  1908842 TGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACACACAAAT 1908901
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
       61 TGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACACA--AAT 118

  1908902 ATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTA 1908961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      119 ATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTA 178

  1908962 TTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACG 1909021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 TTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACG 238

  1909022 GTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCC 1909081
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 GTGAAATGGTTTTCACCTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCC 298

  1909082 CCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATG 1909141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 CCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATG 358

  1909142 GTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAA 1909201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 GTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAA 418

  1909202 GAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATA 1909261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 GAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATA 478

  1909262 TTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAA 1909321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 TTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAA 538

  1909322 CAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGG 1909381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGG 598

  1909382 CCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAAT 1909441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 CCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAAT 658

  1909442 CCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCC 1909501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      659 CCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGTGTGTGCCTGTAATCC 718

  1909502 CATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGT 1909561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGT 778

  1909562 GAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAA 1909621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAA 838

  1909622 AAAA 1909625
          ||||
      839 AAAA 842

EXCISED REGION

  1909630 AAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCC 1909689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 AAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCC 917

  1909690 AGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAA 1909749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 AGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAA 977

  1909750 GATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAA 1909809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 GATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAA 1037

  1909810 ACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAA 1909869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 ACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAA 1097

  1909870 TGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGG 1909929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 TGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGG 1157

  1909930 AGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAG 1909989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 AGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAG 1217

  1909990 CCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTC 1910049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 CCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTC 1277

  1910050 TACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACAT 1910109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 TACCTCCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACAT 1337

  1910110 TTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCA 1910169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 TTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCA 1397

  1910170 AATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCA 1910229
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1398 AATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGAAACTGGGACCA 1457

  1910230 GATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACA 1910289
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 GATCCAAAGCCAGCAGCACTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACA 1517

  1910290 GATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAA 1910349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 GATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAA 1577

  1910350 ATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACA 1910409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 ATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACA 1637

  1910410 CAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATT 1910469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 CAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATT 1697

  1910470 GTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAA 1910529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 GTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAA 1757

  1910530 AAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCC---TGTAACCCCAGCACTTGGGGAGG 1910586
          |||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||.|||||
     1758 AAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCAC---ACGTGTAACCCCAGCACTTGCGGAGG 1814

  1910587 CTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAA 1910646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 CTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAA 1874

  1910647 ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGC--AGGTATCTGTCAT 1910704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||
     1875 ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGG-TTAGGTATCTGTCAT 1933

  1910705 CCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCA 1910764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 CCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCA 1993

  1910765 GTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAA 1910824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 GTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAA 2053

  1910825 AAAAAAAAAA--ATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCA 1910882
          ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 AAAAAAAAAAATATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCA 2113

  1910883 CAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGA 1910942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 CAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGA 2173

  1910943 CAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAA 1911002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 CAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAA 2233

  1911003 AATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGA 1911062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 AATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGA 2293

  1911063 CCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAG 1911101
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 CCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAG 2332

Alignment time is 1.83503 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   9826] =>      9826 nucs 'mol-32-34a8-087679_9826'

Score:        9804
Aligned:      9826        nucs
Identic:      9824 (100%) nucs =>      6310 (100%)      3514 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1902904,1909213] EXCISED REGION [1909215,1912730]
 second seq =>  [      1,   6310] EXCISED REGION [   6312,   9826]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [1909214,1909214]
 second seq =>         1 nucs [6311,6311]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [1909617,1909617]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1909213,1909213] to [1909215,1909215]
 second seq =>         1 nucs [6310,6310] to [6312,6312]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1902904 GTTCGTTTACTGAAAGCAAAAGAAGAAAAGTGAGGAAGGGATTATACAAAGAAAGTGACT 1902963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTCGTTTACTGAAAGCAAAAGAAGAAAAGTGAGGAAGGGATTATACAAAGAAAGTGACT 60

  1902964 GAAAAATTCTGAAAATATCTGTTTTCATAAGATAAGAGCTTTATTCTAGTTCTGAACATA 1903023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAAAATTCTGAAAATATCTGTTTTCATAAGATAAGAGCTTTATTCTAGTTCTGAACATA 120

  1903024 TAATCATAGTCATCATTGTCCTTATTTAAATAAAAACAGCTAGCTGGGCAACTTAGTCTC 1903083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATCATAGTCATCATTGTCCTTATTTAAATAAAAACAGCTAGCTGGGCAACTTAGTCTC 180

  1903084 ATTGAAATTCCTGAGATCTTCATTCTTTCTTGGTATTTGGCTGAAAAAAGAATAAGTTTA 1903143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTGAAATTCCTGAGATCTTCATTCTTTCTTGGTATTTGGCTGAAAAAAGAATAAGTTTA 240

  1903144 TCTCATTCTTTTCCCAAAGTATAGCACAAGGTTGAGAGCCTGGACTCGTGGCATGCATAC 1903203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCATTCTTTTCCCAAAGTATAGCACAAGGTTGAGAGCCTGGACTCGTGGCATGCATAC 300

  1903204 CTAATGAGACCGTTGTATTACTTGGGGTGAAACTCCTTCCATTTGACTTGATGTAGTTAT 1903263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTAATGAGACCGTTGTATTACTTGGGGTGAAACTCCTTCCATTTGACTTGATGTAGTTAT 360

  1903264 TTTCTTTTTCTTGCAAGGGAAGCAAACTTTGGGTTCTACCTGGGTCTTCCTTAAGCATCA 1903323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTCTTTTTCTTGCAAGGGAAGCAAACTTTGGGTTCTACCTGGGTCTTCCTTAAGCATCA 420

  1903324 GGTGTGTTTCAAATGGATAGATTTAATAATAATTGATCCACTAATAATTGATCCACTGGG 1903383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTGTGTTTCAAATGGATAGATTTAATAATAATTGATCCACTAATAATTGATCCACTGGG 480

  1903384 CAATGATTTTTTAAATGTTTGTTTTCAAATTTAAAACAATGCCTCAAGTTTAGAAATGCC 1903443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATGATTTTTTAAATGTTTGTTTTCAAATTTAAAACAATGCCTCAAGTTTAGAAATGCC 540

  1903444 TCTCCTCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGC 1903503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCCTCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGC 600

  1903504 GGGTAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGAACAGCCTGGCCAACATGGTGAATCCCCAT 1903563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGTAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGAACAGCCTGGCCAACATGGTGAATCCCCAT 660

  1903564 CTCTACTAAATATAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCAGCTACT 1903623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTACTAAATATAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCAGCTACT 720

  1903624 GGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGAGATGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAG 1903683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGAGATGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAG 780

  1903684 ATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAAACGGAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAA 1903743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAAACGGAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAA 840

  1903744 ATGCCTCTCCTCTTCTAATTACCTCCCATCCCTCTCCCACTTCAAAGATCCTCATTCTGA 1903803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGCCTCTCCTCTTCTAATTACCTCCCATCCCTCTCCCACTTCAAAGATCCTCATTCTGA 900

  1903804 TTTTTCAAGGCTGAGTTCTGGGTTGGCAGGACAGTCTTGAATGAGGATCTGAATGTAGGA 1903863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTTCAAGGCTGAGTTCTGGGTTGGCAGGACAGTCTTGAATGAGGATCTGAATGTAGGA 960

  1903864 GTATTCCTGCAATTAGTCTTCGTTGCCACTAGGAGGTGGTGTGTAGCGGGGTGTCCTTTT 1903923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTATTCCTGCAATTAGTCTTCGTTGCCACTAGGAGGTGGTGTGTAGCGGGGTGTCCTTTT 1020

  1903924 GAGTTGACTTGCCAAGAAGACCAGGTGTAGGGTTAAGCATGATTTTCCAAATGGAAGCTT 1903983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGTTGACTTGCCAAGAAGACCAGGTGTAGGGTTAAGCATGATTTTCCAAATGGAAGCTT 1080

  1903984 CAGGAAAGCTTCAAAAGATACCTTATGCACTGTAATGCACAGCATTTGATATTAAAACAA 1904043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGGAAAGCTTCAAAAGATACCTTATGCACTGTAATGCACAGCATTTGATATTAAAACAA 1140

  1904044 TACATAGCATCTTAAACAATACATAGCAAGTGAAGTTTCTCTCAGGCTTCCCTCACAAAG 1904103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACATAGCATCTTAAACAATACATAGCAAGTGAAGTTTCTCTCAGGCTTCCCTCACAAAG 1200

  1904104 AGCAAGCCTTGCTTATGGTGTCCTTGTTCTGTCCTATACCTTATCTCAGGCACTGTGAGC 1904163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCAAGCCTTGCTTATGGTGTCCTTGTTCTGTCCTATACCTTATCTCAGGCACTGTGAGC 1260

  1904164 TGGGAATTAAAATTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGCTGCCCAG 1904223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGGAATTAAAATTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGCTGCCCAG 1320

  1904224 GGTGGAGTGCAATGATGCAAACTTGGCTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAA 1904283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTGGAGTGCAATGATGCAAACTTGGCTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAA 1380

  1904284 TCATCCTGCCTCAGCCTCCTAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGTCACCACACCATGCT 1904343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCATCCTGCCTCAGCCTCCTAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGTCACCACACCATGCT 1440

  1904344 CATTTTGTATTTTAGTAGAGATGTTGGTTTCACCATGTTGGTCTGGCTGGTCTCAAACTC 1904403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATTTTGTATTTTAGTAGAGATGTTGGTTTCACCATGTTGGTCTGGCTGGTCTCAAACTC 1500

  1904404 CTGATCTCAGGTGATCCACCTACCTCCACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGC 1904463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGATCTCAGGTGATCCACCTACCTCCACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGC 1560

  1904464 CACCACACCCAGCTATCTTTACATTTTAATTATGGCAAAATACATATAACATAACATTTA 1904523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACCACACCCAGCTATCTTTACATTTTAATTATGGCAAAATACATATAACATAACATTTA 1620

  1904524 CTACTAGTGACATTCAGAACATTCCCCATGCTGTATAGCCATTACCTCCATCTCCTTCCA 1904583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTACTAGTGACATTCAGAACATTCCCCATGCTGTATAGCCATTACCTCCATCTCCTTCCA 1680

  1904584 GAACATTCAACATTCCCCATGCTGTATAGCCATTACCTCCATCTCCTTCCAGAACATTCT 1904643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAACATTCAACATTCCCCATGCTGTATAGCCATTACCTCCATCTCCTTCCAGAACATTCT 1740

  1904644 AATCACCCTAAATGGAGACCTTGTACCTATTAAGCCCTCACTCCTCCTTTTCCCAACCCA 1904703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATCACCCTAAATGGAGACCTTGTACCTATTAAGCCCTCACTCCTCCTTTTCCCAACCCA 1800

  1904704 TGCAAACCCCTAATCTACTTTCTATCTCTAGGGATTCATTCCTTCTAGACATTTCACATA 1904763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGCAAACCCCTAATCTACTTTCTATCTCTAGGGATTCATTCCTTCTAGACATTTCACATA 1860

  1904764 AATGGAATAACCCAAGGTGTGGCTTATTTATATCTGGCTTCATTTACTGAACATAATGTT 1904823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATGGAATAACCCAAGGTGTGGCTTATTTATATCTGGCTTCATTTACTGAACATAATGTT 1920

  1904824 CTCAAAGTACACTCACATAGCAGCGTGTGTCAGGATTTCATTGTGTTTGATGGCTGTTTC 1904883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCAAAGTACACTCACATAGCAGCGTGTGTCAGGATTTCATTGTGTTTGATGGCTGTTTC 1980

  1904884 ATATTCCACCATATGGATAGACGCCATTTTGTTTCTCCATTCACCTATGGGTGAACATTT 1904943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATATTCCACCATATGGATAGACGCCATTTTGTTTCTCCATTCACCTATGGGTGAACATTT 2040

  1904944 GGGTTGTATTTACCCGTTGGTGATTGGGAAGAATGCTGCTATGAATAATTGGATACGTAT 1905003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGGTTGTATTTACCCGTTGGTGATTGGGAAGAATGCTGCTATGAATAATTGGATACGTAT 2100

  1905004 TTTTGTTTGAACATTTGTGCTATGCTCTGAAGGTTTCTGTGTCCCCAAAGTTCATATGAG 1905063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTGTTTGAACATTTGTGCTATGCTCTGAAGGTTTCTGTGTCCCCAAAGTTCATATGAG 2160

  1905064 GAAAGCTAATACTCAAGGTGATAGTATTAAGAGGTGGAACCCTTGGAAAGTGATGAGGTC 1905123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAAAGCTAATACTCAAGGTGATAGTATTAAGAGGTGGAACCCTTGGAAAGTGATGAGGTC 2220

  1905124 AAGAGAATGGAAGCTCCATGGATGGGATGAGTGCTCTTATCAAAAGAACCCCAGAGAGCT 1905183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAGAGAATGGAAGCTCCATGGATGGGATGAGTGCTCTTATCAAAAGAACCCCAGAGAGCT 2280

  1905184 CCTTTTTTTCCTTCTACCATGCAAGGACACAGCAAGAAGGTGCCATCTACGAACCAGGAA 1905243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCTTTTTTTCCTTCTACCATGCAAGGACACAGCAAGAAGGTGCCATCTACGAACCAGGAA 2340

  1905244 CTGGGTTCTTACCAGACACTGAATCTTCTATGTCTTGATTTTGGACATCCAACTTCCAGA 1905303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGGGTTCTTACCAGACACTGAATCTTCTATGTCTTGATTTTGGACATCCAACTTCCAGA 2400

  1905304 ACTGTGAGCAATAAACATCTGGTGTTCAAAAGCCACCCAGTCTAAAGTATTTTGTTACAG 1905363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTGTGAGCAATAAACATCTGGTGTTCAAAAGCCACCCAGTCTAAAGTATTTTGTTACAG 2460

  1905364 CAACATACAAAAAGACAGTGGCCCCCAAAATCTCCTCTCATCACAAGGAGCCCCCTTCAC 1905423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAACATACAAAAAGACAGTGGCCCCCAAAATCTCCTCTCATCACAAGGAGCCCCCTTCAC 2520

  1905424 TTCACCCACAAAGGAGGCAAGATTTGAGGTCATCAGGCTCCCAACCAAGGGACTGGGTGT 1905483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTCACCCACAAAGGAGGCAAGATTTGAGGTCATCAGGCTCCCAACCAAGGGACTGGGTGT 2580

  1905484 TCTGATCTATGTTTTAACTTTTCAATCAAGTACATCACTTCCAGCTGGGACTCTGGGTCT 1905543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCTGATCTATGTTTTAACTTTTCAATCAAGTACATCACTTCCAGCTGGGACTCTGGGTCT 2640

  1905544 AGCACAGGGAGAAATAAAGTGTGAACCATCATTACAAGCTCAGGGAGGGAGGGAGAAAGT 1905603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGCACAGGGAGAAATAAAGTGTGAACCATCATTACAAGCTCAGGGAGGGAGGGAGAAAGT 2700

  1905604 GCAAATCGAAGAGCTGGAAAATCATCGAGCCAGCCCAACTGTTGGGAGATTGGGGATTCT 1905663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCAAATCGAAGAGCTGGAAAATCATCGAGCCAGCCCAACTGTTGGGAGATTGGGGATTCT 2760

  1905664 TTGTGCACGGAGCAGAAACAATCTCCTGCACGGGGTGGCGGCTTGGGCCAGGACTTCTCG 1905723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGTGCACGGAGCAGAAACAATCTCCTGCACGGGGTGGCGGCTTGGGCCAGGACTTCTCG 2820

  1905724 GCATTGAGGAGTTACAGAGCTGTTTTGTAGCTAAACCGACTTTCATTCCAAGCACTTCTA 1905783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCATTGAGGAGTTACAGAGCTGTTTTGTAGCTAAACCGACTTTCATTCCAAGCACTTCTA 2880

  1905784 CAGAGAACGAAATCAAACAGCGGTGATGATGGGATCCCCAGGCCCGGCCAGTGATCTGCT 1905843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CAGAGAACGAAATCAAACAGCGGTGATGATGGGATCCCCAGGCCCGGCCAGTGATCTGCT 2940

  1905844 TAATTACTGACCAGGGAAGCTTCAGTAGCTTAATTGGATTGATGGGCACAGTGCCTAGTC 1905903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAATTACTGACCAGGGAAGCTTCAGTAGCTTAATTGGATTGATGGGCACAGTGCCTAGTC 3000

  1905904 CTCCACCCACTGGTCCCAGAGATTTTTATGGATAGCATGCTGATCTTCCATGCCCTGAGG 1905963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTCCACCCACTGGTCCCAGAGATTTTTATGGATAGCATGCTGATCTTCCATGCCCTGAGG 3060

  1905964 CTTGGGGTCCTGTGTCCAGCATTCCCCACCAACTGGGCAGATGCTGCTGGATTTATGTCA 1906023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTTGGGGTCCTGTGTCCAGCATTCCCCACCAACTGGGCAGATGCTGCTGGATTTATGTCA 3120

  1906024 ACAGCGAGTTCTGCAGGCACACCTCTAAAACACAGTCTCATAGTGTCTTCTGTTTTCAGG 1906083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACAGCGAGTTCTGCAGGCACACCTCTAAAACACAGTCTCATAGTGTCTTCTGTTTTCAGG 3180

  1906084 AACAAATACAAATTTTCTTCTCACATAAGTTATATCATGAACATGAGCATTTAACAAGGG 1906143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AACAAATACAAATTTTCTTCTCACATAAGTTATATCATGAACATGAGCATTTAACAAGGG 3240

  1906144 ACGGTGTGTGTGTGCGAGCACGTACATGTTGTATGTTGTGTGTTTTGTGTGTGTATGAGA 1906203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACGGTGTGTGTGTGCGAGCACGTACATGTTGTATGTTGTGTGTTTTGTGTGTGTATGAGA 3300

  1906204 GAGACACCACAGACACACTAGCCCCATGAAAGGCCAGGGCAGTGAGGCCTGGACCATGGT 1906263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAGACACCACAGACACACTAGCCCCATGAAAGGCCAGGGCAGTGAGGCCTGGACCATGGT 3360

  1906264 CTGCTAAGGACCTGGTGTGGCACACTGATGGTTATCACAAGTGGCCTGGGAGGTGTTCTG 1906323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTGCTAAGGACCTGGTGTGGCACACTGATGGTTATCACAAGTGGCCTGGGAGGTGTTCTG 3420

  1906324 TTGGCCCCAGGGGTTCACTGACCATCATCACAGGTGGCCTGTGATGTGTTGACTTGGTGG 1906383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTGGCCCCAGGGGTTCACTGACCATCATCACAGGTGGCCTGTGATGTGTTGACTTGGTGG 3480

  1906384 GGCCCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTAGAGGTGATCTGTTGACCCCAGGGGCTCAC 1906443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GGCCCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTAGAGGTGATCTGTTGACCCCAGGGGCTCAC 3540

  1906444 TGGTGACCACTGCCGGTAGCCTGGGAGGTGGTCTGTTGACCTTGGGGACTCATTGATGAC 1906503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGGTGACCACTGCCGGTAGCCTGGGAGGTGGTCTGTTGACCTTGGGGACTCATTGATGAC 3600

  1906504 CATTACAGGTGGCCTGGGAGATGGTCTGTTGACCCTGGGGAGTCACTGATGACCATTTCA 1906563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CATTACAGGTGGCCTGGGAGATGGTCTGTTGACCCTGGGGAGTCACTGATGACCATTTCA 3660

  1906564 AGTGGTCTGTTGACCTTGGGGGCTCACTGACGGCCATTGCAGGTTGTCTGGGAGGTGGTG 1906623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGTGGTCTGTTGACCTTGGGGGCTCACTGACGGCCATTGCAGGTTGTCTGGGAGGTGGTG 3720

  1906624 TGTTGACCTTGTGGGCTCACTGATGGCCATTGCTGGTGGCCTTGGCGATGATGGTCTGTT 1906683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGTTGACCTTGTGGGCTCACTGATGGCCATTGCTGGTGGCCTTGGCGATGATGGTCTGTT 3780

  1906684 GACCCCAGGGGCTCACTGGTGACCACTGCAGGTGGGCTGGGAAGTGGTCTGTTGACCTGG 1906743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GACCCCAGGGGCTCACTGGTGACCACTGCAGGTGGGCTGGGAAGTGGTCTGTTGACCTGG 3840

  1906744 GGACTCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTGGAGATGGTTTGTTGACCTTGGGGACTCA 1906803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGACTCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTGGAGATGGTTTGTTGACCTTGGGGACTCA 3900

  1906804 CCACCATTGCAGGTGACTTGGAGATGGTTTGTTGACCTTGGGGACTCACTGACCACCACT 1906863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CCACCATTGCAGGTGACTTGGAGATGGTTTGTTGACCTTGGGGACTCACTGACCACCACT 3960

  1906864 GCAGGTGACTTGGGAGATGGTTTGTTGACCCTGGGGACTCACTGGTGACCATTACAGGTG 1906923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GCAGGTGACTTGGGAGATGGTTTGTTGACCCTGGGGACTCACTGGTGACCATTACAGGTG 4020

  1906924 GGCTGGGAAGTGGTCTCTTGACCTGGGGACTCACTGACCACCACTGTTGGTGGCCTTGGA 1906983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GGCTGGGAAGTGGTCTCTTGACCTGGGGACTCACTGACCACCACTGTTGGTGGCCTTGGA 4080

  1906984 GATGGTTTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGATGACCATTGCAGGTGGCCTGGGGGATGGCC 1907043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GATGGTTTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGATGACCATTGCAGGTGGCCTGGGGGATGGCC 4140

  1907044 TATTGACTGGGCACATCCTACTGATTCACTGCAGAAGACGGGCAATTTGCTGAGCACCTA 1907103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TATTGACTGGGCACATCCTACTGATTCACTGCAGAAGACGGGCAATTTGCTGAGCACCTA 4200

  1907104 GAAGGGCCTATCAGTGCCAGGGTTAGTGGGTCCAACCTCAAGGTCCTGCACCTAGAGGAC 1907163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GAAGGGCCTATCAGTGCCAGGGTTAGTGGGTCCAACCTCAAGGTCCTGCACCTAGAGGAC 4260

  1907164 CTAACACAGACAATGTTCTGCTGGCTGCTGAACACTTGGACCTAACCCTGACCATCTTCT 1907223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CTAACACAGACAATGTTCTGCTGGCTGCTGAACACTTGGACCTAACCCTGACCATCTTCT 4320

  1907224 GCACATTGCCCAGGACTAGTTGGCCCCACTTCTTCTCTTCTCAGAGCCCACGATAGGCCC 1907283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GCACATTGCCCAGGACTAGTTGGCCCCACTTCTTCTCTTCTCAGAGCCCACGATAGGCCC 4380

  1907284 TGTGGTCACTCCCTCTGCAGAGGTGGAACTGAAATTCCCTCAGGTCACATTCCTGGTTAT 1907343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGTGGTCACTCCCTCTGCAGAGGTGGAACTGAAATTCCCTCAGGTCACATTCCTGGTTAT 4440

  1907344 GCAGGAAGCTGAGAATGAGACAGGAATTCCAAACCCAGGTCAGTGGCCTAAATATGGTCC 1907403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GCAGGAAGCTGAGAATGAGACAGGAATTCCAAACCCAGGTCAGTGGCCTAAATATGGTCC 4500

  1907404 TGTGGGTCTGACCACAGGCAGTTACAAGGCTGGAACCCAGGGGAAAGCTGCCTTCCCACA 1907463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TGTGGGTCTGACCACAGGCAGTTACAAGGCTGGAACCCAGGGGAAAGCTGCCTTCCCACA 4560

  1907464 TCGCGCTGGGTGCACACCTGGAGCATTACACAGCTTGGGGGGATGAAGGGTAAGACCTCA 1907523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TCGCGCTGGGTGCACACCTGGAGCATTACACAGCTTGGGGGGATGAAGGGTAAGACCTCA 4620

  1907524 GGCCCCTGGGCAGCCATGCTCTTATGAGTATGTATATCCTGGAGCAGGTCCTGCCACTTC 1907583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GGCCCCTGGGCAGCCATGCTCTTATGAGTATGTATATCCTGGAGCAGGTCCTGCCACTTC 4680

  1907584 AGGCCTCCTTACTAGTGGTGGAAGAGGCAGGTGCCTGAGCCCCTCTTCCCCATTCTGACT 1907643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AGGCCTCCTTACTAGTGGTGGAAGAGGCAGGTGCCTGAGCCCCTCTTCCCCATTCTGACT 4740

  1907644 TGTACCTTTTGACTCCTAGCCCTTTCCACTCTCCCTCCCCAGACCTCCTAGTTCAGGACA 1907703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TGTACCTTTTGACTCCTAGCCCTTTCCACTCTCCCTCCCCAGACCTCCTAGTTCAGGACA 4800

  1907704 TGCCTGAACACCTCCGGTAACCTTCCCATGTGTAGTTTCCAGTATACCAAGAGGAGCTTG 1907763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TGCCTGAACACCTCCGGTAACCTTCCCATGTGTAGTTTCCAGTATACCAAGAGGAGCTTG 4860

  1907764 TGCGGTGGTTGAGCTTTAAGCAGCAGAAAGTTTCTCAGCAATTTGCCTCGTATATATTGG 1907823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TGCGGTGGTTGAGCTTTAAGCAGCAGAAAGTTTCTCAGCAATTTGCCTCGTATATATTGG 4920

  1907824 TATTGGTGTGCTCCAGGGAGACAGAACCAATTGTATCATTTCACGATAAGAAGAGGTTCT 1907883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TATTGGTGTGCTCCAGGGAGACAGAACCAATTGTATCATTTCACGATAAGAAGAGGTTCT 4980

  1907884 AAGTCGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTCATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGG 1907943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AAGTCGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTCATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGG 5040

  1907944 CTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAA 1908003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAA 5100

  1908004 ATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCGGGAGGCTG 1908063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 ATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCGGGAGGCTG 5160

  1908064 AGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTAAAGTGAGCCGAGATTGCGCCAT 1908123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTAAAGTGAGCCGAGATTGCGCCAT 5220

  1908124 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCGAAACTCTGTCTCAAAAAAATAAAGTAAAATAAA 1908183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCGAAACTCTGTCTCAAAAAAATAAAGTAAAATAAA 5280

  1908184 ATAAAATAAATAAAATAAAGAAAAGGTTCTAAGCCGGTCATGGTGGCTCAAGCCTGTAAT 1908243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 ATAAAATAAATAAAATAAAGAAAAGGTTCTAAGCCGGTCATGGTGGCTCAAGCCTGTAAT 5340

  1908244 CCCAGCATTTTGGGAGGCTGAGGTGGACAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGC 1908303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CCCAGCATTTTGGGAGGCTGAGGTGGACAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGC 5400

  1908304 CTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGT 1908363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGT 5460

  1908364 GGCGGGTGCCTGTGATCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTC 1908423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GGCGGGTGCCTGTGATCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTC 5520

  1908424 GGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCTATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGGCAGAGCCA 1908483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCTATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGGCAGAGCCA 5580

  1908484 GTCTCAAAATATATATATATAAATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAT 1908543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GTCTCAAAATATATATATATAAATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAT 5640

  1908544 GTATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTTTGTATGTATATATGTGTGTCTAC 1908603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GTATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTTTGTATGTATATATGTGTGTCTAC 5700

  1908604 ATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACATATATTGTATATGTATATAC 1908663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAGACATATATTGTATATGTATATAC 5760

  1908664 ATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATTGTATATGTATAAATATACA 1908723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACATATATTGTATATGTATAAATATACA 5820

  1908724 TATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCATATACACATATATGTGTATA 1908783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATACATATGCATATACACATATATGTGTATA 5880

  1908784 TGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATATG 1908843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TGTATAAATATGCATATATGTATACACATACACGTGTATATGTATACACAAGCATATATG 5940

  1908844 TGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACACACAAATAT 1908903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGCAGACACACACACACACACACACAAATAT 6000

  1908904 ACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTATT 1908963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 ACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGGCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTATT 6060

  1908964 CTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACGGT 1909023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACGGT 6120

  1909024 GAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCCCC 1909083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 GAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGTCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCCCC 6180

  1909084 ATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATGGT 1909143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 ATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGCATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATGGT 6240

  1909144 CTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAAGA 1909203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAGAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAAGA 6300

  1909204 AAAAATCTCT 1909213
          ||||||||||
     6301 AAAAATCTCT 6310

EXCISED REGION

  1909215 TTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGT 1909274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6312 TTCTCAGTTTCTGATGTTTGCTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGT 6371

  1909275 ATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTT 1909334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6372 ATATGTCAATGTGTTATGGAAATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTT 6431

  1909335 CAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGG 1909394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6432 CAGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGG 6491

  1909395 ATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTA 1909454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6492 ATCACAAGGTCAAGAGATCAAGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTA 6551

  1909455 AAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGA 1909514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6552 AAAAGGCAAAAAATTAGTCAAGTCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGA 6611

  1909515 GGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAC 1909574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6612 GGCTGAGGCAGGAGAATGGAGTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAC 6671

  1909575 GCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1909634
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     6672 GCCACTGCACTACAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCCGTCT-AAAAAAAAAAAAAAAAA 6730

  1909635 AAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCAC 1909694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6731 AAAAAAACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCAC 6790

  1909695 TTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCA 1909754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6791 TTTGGGAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCA 6850

  1909755 CGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAG 1909814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6851 CGTCAAGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAG 6910

  1909815 AAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTA 1909874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6911 AAGGGTGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTA 6970

  1909875 TCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATC 1909934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6971 TCTTCTTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATC 7030

  1909935 TGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAG 1909994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7031 TGGATGGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAG 7090

  1909995 CCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCT 1910054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7091 CCTGTAGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCT 7150

  1910055 CCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGT 1910114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7151 CCCATACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGT 7210

  1910115 AGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGG 1910174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7211 AGAGAAAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGG 7270

  1910175 AGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCC 1910234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7271 AGTCAAATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCC 7330

  1910235 AAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTT 1910294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7331 AAAGCCAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTT 7390

  1910295 GTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTC 1910354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7391 GTGGACACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTC 7450

  1910355 TCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGAT 1910414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7451 TCCCTGACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGAT 7510

  1910415 GTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTA 1910474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7511 GTCCACTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTA 7570

  1910475 TCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATT 1910534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7571 TCTATTTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATT 7630

  1910535 ATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCT 1910594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7631 ATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCT 7690

  1910595 GGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTC 1910654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7691 GGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTC 7750

  1910655 TCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTATCTGTCATCCCAGCTACT 1910714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7751 TCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTATCTGTCATCCCAGCTACT 7810

  1910715 CAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAG 1910774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7811 CAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAG 7870

  1910775 ATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAA 1910834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7871 ATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAA 7930

  1910835 ATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAG 1910894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7931 ATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAG 7990

  1910895 TTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAA 1910954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7991 TTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAA 8050

  1910955 AGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAA 1911014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8051 AGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAA 8110

  1911015 AGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCC 1911074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8111 AGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCC 8170

  1911075 AGTTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGTACAGGATCTCAAACATGGTTTATCTATGTTGC 1911134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8171 AGTTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGTACAGGATCTCAAACATGGTTTATCTATGTTGC 8230

  1911135 CTATATTTTTTGGAGAGGAAGCGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATCTGAGGCCAGGCA 1911194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8231 CTATATTTTTTGGAGAGGAAGCGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATCTGAGGCCAGGCA 8290

  1911195 CGGTGGCTCACACCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCCGAGGCTGCTGGATCACATGAG 1911254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8291 CGGTGGCTCACACCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCCGAGGCTGCTGGATCACATGAG 8350

  1911255 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACA 1911314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8351 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACA 8410

  1911315 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGTTACTCAGGAGGCCAAGGCA 1911374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8411 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAATTCCAGTTACTCAGGAGGCCAAGGCA 8470

  1911375 GGACAATTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATTGTGCCATTGCAC 1911434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8471 GGACAATTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATTGTGCCATTGCAC 8530

  1911435 TCCAGCCTGAGTGACAGAGCAAGACTGGCTCAAAAAAAAAATTATTTGAAGTCGTTTACA 1911494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8531 TCCAGCCTGAGTGACAGAGCAAGACTGGCTCAAAAAAAAAATTATTTGAAGTCGTTTACA 8590

  1911495 AGAATGTAGGAGAGAAGACTGGGAAGATTGGCATCTTGGGAAGATGCCAAGAGTTGGAAA 1911554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8591 AGAATGTAGGAGAGAAGACTGGGAAGATTGGCATCTTGGGAAGATGCCAAGAGTTGGAAA 8650

  1911555 GGCCCTGAGTTATGACTGGAAGGGAGGCTTCAGGTACTCGGAGGAAACATGGGGATTAAA 1911614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8651 GGCCCTGAGTTATGACTGGAAGGGAGGCTTCAGGTACTCGGAGGAAACATGGGGATTAAA 8710

  1911615 AGCACAAGAAAACAGTCATTTTGCAACAGGAATATATCTGGCAGGGACCTCCAAATCCCA 1911674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     8711 AGCACAAGAAAACAGTCATTTTGCAACAGGAATACATCTGGCAGGGACCTCCAAATCCCA 8770

  1911675 ATTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGAC 1911734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8771 ATTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGAC 8830

  1911735 CCTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGA 1911794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8831 CCTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGA 8890

  1911795 TTTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGC 1911854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8891 TTTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGC 8950

  1911855 CTTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAAT 1911914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8951 CTTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAAT 9010

  1911915 GAAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTG 1911974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9011 GAAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTG 9070

  1911975 TTTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCC 1912034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9071 TTTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCC 9130

  1912035 TGCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGT 1912094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9131 TGCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGT 9190

  1912095 TAGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTC 1912154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9191 TAGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTC 9250

  1912155 AAGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGG 1912214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9251 AAGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGG 9310

  1912215 ATTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTG 1912274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9311 ATTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTG 9370

  1912275 ATTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATA 1912334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9371 ATTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATA 9430

  1912335 AGGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGA 1912394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9431 AGGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGA 9490

  1912395 TAACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAG 1912454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9491 TAACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAG 9550

  1912455 GGCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATA 1912514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9551 GGCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATA 9610

  1912515 GATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATAC 1912574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9611 GATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATAC 9670

  1912575 ATAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAA 1912634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9671 ATAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAA 9730

  1912635 ATAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAG 1912694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9731 ATAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAG 9790

  1912695 TGGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTAG 1912730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9791 TGGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTAG 9826

Alignment time is 19.7905 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   5630] =>      5630 nucs 'mol-32-34be-132839_5630'

Score:        5591
Aligned:      5619        nucs
Identic:      5614 (100%) nucs =>      4294 (100%)      1320 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1908516,1912810] EXCISED REGION [1912811,1914134]
 second seq =>  [      1,   4295] EXCISED REGION [   4311,   5630]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        15 nucs [4296,4310]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4296,4296] to [4311,4311]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         7 nucs [4296,4302] to [4304,4310]

  1908516 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACAC 1908575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACAC 60

  1908576 GAGTTTGTATGTATATATGTGTGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATA 1908635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGTTTGTATGTATATATGTGTGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATA 120

  1908636 TGTAGACATATATTGTATATGTATATACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTAT 1908695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTAGACATATATTGTATATGTATATACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTAT 180

  1908696 ACATATATTGTATATGTATAAATATACATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATA 1908755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACATATATTGTATATGTATAAATATACATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTATA 240

  1908756 CATATGCATATACACATATATGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACA 1908815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATATGCATATACACATATATGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACACATACA 300

  1908816 CGTGTATATGTATACACAAGCATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGC 1908875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGTGTATATGTATACACAAGCATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATGC 360

  1908876 AGACACACACACACACACACACAAATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGG 1908935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGACACACACACACACACACACAAATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAGG 420

  1908936 CTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATA 1908995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTATA 480

  1908996 TTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGT 1909055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAGT 540

  1909056 CTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGC 1909115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAGC 600

  1909116 ATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAG 1909175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACAG 660

  1909176 AAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGC 1909235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTGC 720

  1909236 TTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAA 1909295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGAA 780

  1909296 ATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCAC 1909355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCAC 840

  1909356 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAA 1909415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCAA 900

  1909416 GGCCATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAA 1909475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCCATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCAA 960

  1909476 GTCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAG 1909535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGAG 1020

  1909536 TGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGG 1909595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGGG 1080

  1909596 CGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTT 1909655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAATAGTGAGTT 1140

  1909656 TCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTAC 1909715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGGAGAATTAC 1200

  1909716 TTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGG 1909775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCAAGGCACTCCAGCCTGG 1260

  1909776 GTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTG 1909835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGGTGAGTTTAAAAGCTTG 1320

  1909836 TGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGA 1909895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTCTTCACTTTCAGCCAGA 1380

  1909896 AACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAA 1909955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGATGGGGGTCGTATGAGAA 1440

  1909956 CATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCC 1910015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGTAGGCATTGCTTCCTCC 1500

  1910016 GATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATA 1910075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCATACCCCCCATCCCAATA 1560

  1910076 TCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGC 1910135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGAAAATACGTGCTGAAGC 1620

  1910136 AAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGAT 1910195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCAAATCTGGGAATTTGAT 1680

  1910196 AAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACA 1910255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGCCAGCAGCATTGAAACA 1740

  1910256 GCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCAT 1910315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGACACCGCAGTCGTGCAT 1800

  1910316 GCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCA 1910375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCTGACTTGGGTGTCTGCA 1860

  1910376 AATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCC 1910435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCACTCGGATACCTCAGCC 1920

  1910436 GTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGT 1910495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTATTTATCTTGCCAGTCGT 1980

  1910496 TTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGG 1910555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGG 2040

  1910556 CTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 1910615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 2100

  1910616 AGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 1910675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 2160

  1910676 AGCCAGGCGTGGTGGCAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 1910735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGCCAGGCGTGGTGGCAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 2220

  1910736 CTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGT 1910795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGT 2280

  1910796 CTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAGTAGTGTACAAGAA 1910855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTTGAAGTAGTGTACAAGAA 2340

  1910856 TGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAG 1910915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGAG 2400

  1910916 ACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGA 1910975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGA 2460

  1910976 AGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATT 1911035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATT 2520

  1911036 TTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGC 1911095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAGTTGTGGACCCATTGCTGGC 2580

  1911096 TGCAAGTACAGGATCTCAAACATGGTTTATCTATGTTGCCTATATTTTTTGGAGAGGAAG 1911155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGCAAGTACAGGATCTCAAACATGGTTTATCTATGTTGCCTATATTTTTTGGAGAGGAAG 2640

  1911156 CGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGTAACC 1911215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATCTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGTAACC 2700

  1911216 CCAGCACTTGGGGAGGCCGAGGCTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCC 1911275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCAGCACTTGGGGAGGCCGAGGCTGCTGGATCACATGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCC 2760

  1911276 TGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGG 1911335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGG 2820

  1911336 TGGGCACCTGTAATTCCAGTTACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAATTGCTTGAACCCGGG 1911395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGGGCACCTGTAATTCCAGTTACTCAGGAGGCCAAGGCAGGACAATTGCTTGAACCCGGG 2880

  1911396 AGGCGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCA 1911455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGGCGGAGGTTGCAGCGAGCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCA 2940

  1911456 AGACTGGCTCAAAAAAAAAATTATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGTAGGAGAGAAGACTG 1911515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGACTGGCTCAAAAAAAAAATTATTTGAAGTCGTTTACAAGAATGTAGGAGAGAAGACTG 3000

  1911516 GGAAGATTGGCATCTTGGGAAGATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTGAGTTATGACTGGAA 1911575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGAAGATTGGCATCTTGGGAAGATGCCAAGAGTTGGAAAGGCCCTGAGTTATGACTGGAA 3060

  1911576 GGGAGGCTTCAGGTACTCGGAGGAAACATGGGGATTAAAAGCACAAGAAAACAGTCATTT 1911635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGGAGGCTTCAGGTACTCGGAGGAAACATGGGGATTAAAAGCACAAGAAAACAGTCATTT 3120

  1911636 TGCAACAGGAATATATCTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGGACCCATTGCTGGCT 1911695
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGCAACAGGAATACATCTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAATTGTGGACCCATTGCTGGCT 3180

  1911696 GCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGGGCAGAATCACCTCC 1911755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACCCTCTGGGCAGAATCACCTCC 3240

  1911756 ATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCCATTCTGGAGACCTG 1911815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGATTTTCCCATTCTGGAGACCTG 3300

  1911816 GATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGATCTCCAGCCTAGCCT 1911875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCCTTTGATCTCCAGCCTAGCCT 3360

  1911876 GAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAAGAAGGGACTTGGTA 1911935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATGAAGGAAGAAGGGACTTGGTA 3420

  1911936 ATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAAACGAGGTTTCTCCC 1911995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGTTTGTAAACGAGGTTTCTCCC 3480

  1911996 TCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAACTAATTTGAGTAGCC 1912055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCTGCCAACTAATTTGAGTAGCC 3540

  1912056 TGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCAGAGAGATGGAGAAA 1912115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTTAGACCAGAGAGATGGAGAAA 3600

  1912116 AACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGGAGGCGCGCGTGGGT 1912175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCAAGAGGGAGGCGCGCGTGGGT 3660

  1912176 TTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTTTGCTCTCAGACTAG 1912235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGATTTCTTTGCTCTCAGACTAG 3720

  1912236 GGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGATTGAAGGTATCTGGAAAGAT 1912295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGATTGAAGGTATCTGGAAAGAT 3780

  1912296 ATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAAGGGACATCCATGAATTTTAC 1912355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAAGGGACATCCATGAATTTTAC 3840

  1912356 TAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGATAACAAGGGATGACTGTATAT 1912415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGATAACAAGGGATGACTGTATAT 3900

  1912416 AGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGGGCGATACAGAGATGAAAGAT 1912475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGGGCGATACAGAGATGAAAGAT 3960

  1912476 TAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAGATAAATACATAGATACATAG 1912535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAGATAAATACATAGATACATAG 4020

  1912536 ATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACATAGATAGATGATAGAAAGAT 1912595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACATAGATAGATGATAGAAAGAT 4080

  1912596 AGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAATAGATAGTAGACAGAAGATA 1912655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAATAGATAGTAGACAGAAGATA 4140

  1912656 GACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGTGGTAGATAGATAGATAGAAG 1912715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGTGGTAGATAGATAGATAGAAG 4200

  1912716 ACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGATGATA 1912775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGATGATA 4260

  1912776 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT 1912810
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT 4295

EXCISED REGION

  1912811 AAGATAGATAGATAGAAACATAGATGATAGGAGACAGGTACATAGATATCTGGATGGATA 1912870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 AAGATAGATAGATAGAAACATAGATGATAGGAGACAGGTACATAGATATCTGGATGGATA 4370

  1912871 GATAGGAGATAGACGACAGATAGATAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAGATAATAG 1912930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 GATAGGAGATAGACGACAGATAGATAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAGATAATAG 4430

  1912931 ATAAGTAAATAGGTAGATAGTAGACAGAGATAGAAGATAGATAGTAGACAAGTAGCTGGT 1912990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 ATAAGTAAATAGGTAGATAGTAGACAGAGATAGAAGATAGATAGTAGACAAGTAGCTGGT 4490

  1912991 AGGTAGATAGGTAGATAGAAAAGTAACTGGTAGATAGATAGAAGACAAGTAGCTGGTAGG 1913050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 AGGTAGATAGGTAGATAGAAAAGTAACTGGTAGATAGATAGAAGACAAGTAGCTGGTAGG 4550

  1913051 TAGGTAGATAGAAAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATA 1913110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||
     4551 TAGGTAGATAGAAAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGAT----GATAGATAGATA 4606

  1913111 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGATAGATAGTAGATA 1913170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4607 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGATAGATAGTAGATA 4666

  1913171 GATAGTAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGAGATAGATGATAG 1913230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4667 GATAGTAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGAGATAGATGATAG 4726

  1913231 ATAGGAGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATAGAGCCATATACA 1913290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4727 ATAGGAGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATAGAGCCATATACA 4786

  1913291 CTGAGGTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGATGTATATATAGAG 1913350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4787 CTGAGGTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGATGTATATATAGAG 4846

  1913351 AGAGAACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTGTGTCACTGCGTA 1913410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4847 AGAGAACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTGTGTCACTGCGTA 4906

  1913411 CATTTTCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTCCCAGGGGTAAAG 1913470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4907 CATTTTCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTCCCAGGGGTAAAG 4966

  1913471 GGGTGTGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCAGCCTCACACACA 1913530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4967 GGGTGTGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCAGCCTCACACACA 5026

  1913531 AACCCCACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCTGGATTTCCTGGA 1913590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5027 AACCCCACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCTGGATTTCCTGGA 5086

  1913591 GAGGCTCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCTCCAGTTTGGTCA 1913650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5087 GAGGCTCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCTCCAGTTTGGTCA 5146

  1913651 CCAAGAGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGTGGGTTGAGTAGA 1913710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5147 CCAAGAGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGTGGGTTGAGTAGA 5206

  1913711 TGGTGTCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAGGGCTGCGTGGAC 1913770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5207 TGGTGTCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAGGGCTGCGTGGAC 5266

  1913771 AGTGCACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGACTCCGGGTCCAC 1913830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5267 AGTGCACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGACTCCGGGTCCAC 5326

  1913831 CACATTGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAGTCCCTTCCTCAC 1913890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5327 CACATTGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAGTCCCTTCCTCAC 5386

  1913891 CTGAGCCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCCAGTCTATCTACT 1913950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5387 CTGAGCCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCCAGTCTATCTACT 5446

  1913951 TATCTATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTA 1914010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5447 TATCTATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTA 5506

  1914011 TCTATATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTATTATCTATCTATA 1914070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5507 TCTATATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTATTATCTATCTATA 5566

  1914071 TCTATCTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCTATTTATCTATCT 1914130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5567 TCTATCTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCTATTTATCTATCT 5626

  1914131 AGCT 1914134
          ||||
     5627 AGCT 5630

Alignment time is 7.31199 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,  11201] =>     11201 nucs 'mol-32-34d4-189772_11201'

Score:       10716
Aligned:     11239        nucs
Identic:     11144 ( 99%) nucs =>      8339 ( 99%)      2805 ( 99%)
Gaps:           74 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1902706,1911076] EXCISED REGION [1911676,1914507]
 second seq =>  [      1,   8389] EXCISED REGION [   8390,  11201]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       599 nucs [1911077,1911675]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [1911077,1911101] to [1911676,1911700]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1902706 TTTCTTTTACAAAATAAAATGTATGTTCAGGCTTTTACTTAATCCATGCTAGTAAGAGCC 1902765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCTTTTACAAAATAAAATGTATGTTCAGGCTTTTACTTAATCCATGCTAGTAAGAGCC 60

  1902766 TGGTTCAAAAATGAGCTGCAGGTTTTTTCAAAGAGAATCACAATCATTTCTGTGGAATAG 1902825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGTTCAAAAATGAGCTGCAGGTTTTTTCAAAGAGAATCACAATCATTTCTGTGGAATAG 120

  1902826 GTGAAGTGAAAGACATTTTTAGAAAGTTTGCATCTTTTTGCAGAGACTTTTAATGAAGGG 1902885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGAAGTGAAAGACATTTTTAGAAAGTTTGCATCTTTTTGCAGAGACTTTTAATGAAGGG 180

  1902886 GTTTATGTTTTCCGCTCTGTTCGTTTACTGAAAGCAAAAGAAGAAAAGTGAGGAAGGGAT 1902945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTTATGTTTTCCGCTCTGTTCGTTTACTGAAAGCAAAAGAAGAAAAGTGAGGAAGGGAT 240

  1902946 TATACAAAGAAAGTGACTGAAAAATTCTGAAAATATCTGTTTTCATAAGATAAGAGCTTT 1903005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATACAAAGAAAGTGACTGAAAAATTCTGAAAATATCTGTTTTCATAAGATAAGAGCTTT 300

  1903006 ATTCTAGTTCTGAACATATAATCATAGTCATCATTGTCCTTATTTAAATAAAAACAGCTA 1903065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCTAGTTCTGAACATATAATCATAGTCATCATTGTCCTTATTTAAATAAAAACAGCTA 360

  1903066 GCTGGGCAACTTAGTCTCATTGAAATTCCTGAGATCTTCATTCTTTCTTGGTATTTGGCT 1903125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTGGGCAACTTAGTCTCATTGAAATTCCTGAGATCTTCATTCTTTCTTGGTATTTGGCT 420

  1903126 GAAAAAAGAATAAGTTTATCTCATTCTTTTCCCAAAGTATAGCACAAGGTTGAGAGCCTG 1903185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAAAAAGAATAAGTTTATCTCATTCTTTTCCCAAAGTATAGCACAAGGTTGAGAGCCTG 480

  1903186 GACTCGTGGCATGCATACCTAATGAGACCGTTGTATTACTTGGGGTGAAACTCCTTCCAT 1903245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACTCGTGGCATGCATACCTAATGAGACCGTTGTATTACTTGGGGTGAAACTCCTTCCAT 540

  1903246 TTGACTTGATGTAGTTATTTTCTTTTTCTTGCAAGGGAAGCAAACTTTGGGTTCTACCTG 1903305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGACTTGATGTAGTTATTTTCTTTTTCTTGCAAGGGAAGCAAACTTTGGGTTCTACCTG 600

  1903306 GGTCTTCCTTAAGCATCAGGTGTGTTTCAAATGGATAGATTTAATAATAATTGATCCACT 1903365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTCTTCCTTAAGCATCAGGTGTGTTTCAAATGGATAGATTTAATAATAATTGATCCACT 660

  1903366 AATAATTGATCCACTGGGCAATGATTTTTTAAATGTTTGTTTTCAAATTTAAAACAATGC 1903425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATAATTGATCCACTGGGCAATGATTTTTTAAATGTTTGTTTTCAAATTTAAAACAATGC 720

  1903426 CTCAAGTTTAGAAATGCCTCTCCTCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGC 1903485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCAAGTTTAGAAATGCCTCTCCTCGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGC 780

  1903486 ACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGAACAGCCTGGCC 1903545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGAACAGCCTGGCC 840

  1903546 AACATGGTGAATCCCCATCTCTACTAAATATAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACATG 1903605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACATGGTGAATCCCCATCTCTACTAAATATAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACATG 900

  1903606 CCTGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGAGATGTGG 1903665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGAGATGTGG 960

  1903666 AGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAAACGGAAAAC 1903725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAAACGGAAAAC 1020

  1903726 TCCATCTCAAAAAAAAAAATGCCTCTCCTCTTCTAATTACCTCCCATCCCTCTCCCACTT 1903785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCATCTCAAAAAAAAAAATGCCTCTCCTCTTCTAATTACCTCCCATCCCTCTCCCACTT 1080

  1903786 CAAAGATCCTCATTCTGATTTTTCAAGGCTGAGTTCTGGGTTGGCAGGACAGTCTTGAAT 1903845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAAGATCCTCATTCTGATTTTTCAAGGCTGAGTTCTGGGTTGGCAGGACAGTCTTGAAT 1140

  1903846 GAGGATCTGAATGTAGGAGTATTCCTGCAATTAGTCTTCGTTGCCACTAGGAGGTGGTGT 1903905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGGATCTGAATGTAGGAGTATTCCTGCAATTAGTCTTCGTTGCCACTAGGAGGTGGTGT 1200

  1903906 GTAGCGGGGTGTCCTTTTGAGTTGACTTGCCAAGAAGACCAGGTGTAGGGTTAAGCATGA 1903965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTAGCGGGGTGTCCTTTTGAGTTGACTTGCCAAGAAGACCAGGTGTAGGGTTAAGCATGA 1260

  1903966 TTTTCCAAATGGAAGCTTCAGGAAAGCTTCAAAAGATACCTTATGCACTGTAATGCACAG 1904025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTCCAAATGGAAGCTTCAGGAAAGCTTCAAAAGATACCTTATGCACTGTAATGCACAG 1320

  1904026 CATTTGATATTAAAACAATACATAGCATCTTAAACAATACATAGCAAGTGAAGTTTCTCT 1904085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATTTGATATTAAAACAATACATAGCATCTTAAACAATACATAGCAAGTGAAGTTTCTCT 1380

  1904086 CAGGCTTCCCTCACAAAGAGCAAGCCTTGCTTATGGTGTCCTTGTTCTGTCCTATACCTT 1904145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGGCTTCCCTCACAAAGAGCAAGCCTTGCTTATGGTGTCCTTGTTCTGTCCTATACCTT 1440

  1904146 ATCTCAGGCACTGTGAGCTGGGAATTAAAATTTTCTTTCCTTTTTTTTTTT-GAGACAGA 1904204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     1441 ATCTCAGGCACTGTGAGCTGGGAATTAAAATTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTGAGACAGA 1500

  1904205 GTCTCGCTCTGCTGCCCAGGGTGGAGTGCAATGATGCAAACTTGGCTCACTGCAACCTTT 1904264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCTCGCTCTGCTGCCCAGGGTGGAGTGCAATGATGCAAACTTGGCTCACTGCAACCTTT 1560

  1904265 GCCTCCTGGGTTCAAGCAATCATCCTGCCTCAGCCTCCTAAGTAGCTGGGATTACAGGCG 1904324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCCTCCTGGGTTCAAGCAATCATCCTGCCTCAGCCTCCTAAGTAGCTGGGATTACAGGCG 1620

  1904325 CCCGTCACCACACCATGCTCATTTTGTATTTTAGTAGAGATGTTGGTTTCACCATGTTGG 1904384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCGTCACCACACCATGCTCATTTTGTATTTTAGTAGAGATGTTGGTTTCACCATGTTGG 1680

  1904385 TCTGGCTGGTCTCAAACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCTACCTCCACCTCCCAAAGTGC 1904444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTGGCTGGTCTCAAACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCTACCTCCACCTCCCAAAGTGC 1740

  1904445 TGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTATCTTTACATTTTAATTATGGCAAAAT 1904504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCAGCTATCTTTACATTTTAATTATGGCAAAAT 1800

  1904505 ACATATAACATAACATTTACTACTAGTGACATTCAGAACATTCCCCATGCTGTATAGCCA 1904564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACATATAACATAACATTTACTACTAGTGACATTCAGAACATTCCCCATGCTGTATAGCCA 1860

  1904565 TTACCTCCATCTCCTTCCAGAACATTCAACATTCCCCATGCTGTATAGCCATTACCTCCA 1904624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTACCTCCATCTCCTTCCAGAACATTCAACATTCCCCATGCTGTATAGCCATTACCTCCA 1920

  1904625 TCTCCTTCCAGAACATTCTAATCACCCTAAATGGAGACCTTGTACCTATTAAGCCCTCAC 1904684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTCCTTCCAGAACATTCTAATCACCCTAAATGGAGACCTTGTACCTATTAAGCCCTCAC 1980

  1904685 TCCTCCTTTTCCCAACCCATGCAAACCCCTAATCTACTTTCTATCTCTAGGGATTCATTC 1904744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1981 TCCTCCTTTTCCCAACCCATGCAAACCCCTAATCTACTTTCTATCTCTAGGGGTTCATTC 2040

  1904745 CTTCTAGACATTTCACATAAATGGAATAACCCAAGGTGTGGCTTATTTATATCTGGCTTC 1904804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTTCTAGACATTTCACATAAATGGAATAACCCAAGGTGTGGCTTATTTATATCTGGCTTC 2100

  1904805 ATTTACTGAACATAATGTTCTCAAAGTACACTCACATAGCAGCGTGTGTCAGGATTTCAT 1904864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTTACTGAACATAATGTTCTCAAAGTACACTCACATAGCAGCGTGTGTCAGGATTTCAT 2160

  1904865 TGTGTTTGATGGCTGTTTCATATTCCACCATATGGATAGACGCCATTTTGTTTCTCCATT 1904924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGTGTTTGATGGCTGTTTCATATTCCACCATATGGATAGACGCCATTTTGTTTCTCCATT 2220

  1904925 CACCTATGGGTGAACATTTGGGTTGTATTTACCCGTTGGTGATTGGGAAGAATGCTGCTA 1904984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CACCTATGGGTGAACATTTGGGTTGTATTTACCCGTTGGTGATTGGGAAGAATGCTGCTA 2280

  1904985 TGAATAATTGGATACGTATTTTTGTTTGAACATTTGTGCTATGCTCTGAAGGTTTCTGTG 1905044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGAATAATTGGATACGTATTTTTGTTTGAACATTTGTGCTATGCTCTGAAGGTTTCTGTG 2340

  1905045 TCCCCAAAGTTCATATGAGGAAAGCTAATACTCAAGGTGATAGTATTAAGAGGTGGAACC 1905104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCCCCAAAGTTCATATGAGGAAAGCTAATACTCAAGGTGATAGTATTAAGAGGTGGAACC 2400

  1905105 CTTGGAAAGTGATGAGGTCAAGAGAATGGAAGCTCCATGGATGGGATGAGTGCTCTTATC 1905164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTGGAAAGTGATGAGGTCAAGAGAATGGAAGCTCCATGGATGGGATGAGTGCTCTTATC 2460

  1905165 AAAAGAACCCCAGAGAGCTCCTTTTTTTCCTTCTACCATGCAAGGACACAGCAAGAAGGT 1905224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAAGAACCCCAGAGAGCTCCTTTTTTTCCTTCTACCATGCAAGGACACAGCAAGAAGGT 2520

  1905225 GCCATCTACGAACCAGGAACTGGGTTCTTACCAGACACTGAATCTTCTATGTCTTGATTT 1905284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCCATCTACGAACCAGGAACTGGGTTCTTACCAGACACTGAATCTTCTATGTCTTGATTT 2580

  1905285 TGGACATCCAACTTCCAGAACTGTGAGCAATAAACATCTGGTGTTCAAAAGCCACCCAGT 1905344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGACATCCAACTTCCAGAACTGTGAGCAATAAACATCTGGTGTTCAAAAGCCACCCAGT 2640

  1905345 CTAAAGTATTTTGTTACAGCAACATACAAAAAGACAGTGGCCCCCAAAATCTCCTCTCAT 1905404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTAAAGTATTTTGTTACAGCAACATACAAAAAGACAGTGGCCCCCAAAATCTCCTCTCAT 2700

  1905405 CACAAGGAGCCCCCTTCACTTCACCCACAAAGGAGGCAAGATTTGAGGTCATCAGGCTCC 1905464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2701 CACAAGGAGCCCCCTTCACTTCACCCACAAAGGAGGCAAGATCTGAGGTCATCAGGCTCC 2760

  1905465 CAACCAAGGGACTGGGTGTTCTGATCTATGTTTTAACTTTTCAATCAAGTACATCACTTC 1905524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAACCAAGGGACTGGGTGTTCTGATCTATGTTTTAACTTTTCAATCAAGTACATCACTTC 2820

  1905525 CAGCTGGGACTCTGGGTCTAGCACAGGGAGAAATAAAGTGTGAACCATCATTACAAGCTC 1905584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAGCTGGGACTCTGGGTCTAGCACAGGGAGAAATAAAGTGTGAACCATCATTACAAGCTC 2880

  1905585 AGGGAGGGAGGGAGAAAGTGCAAATCGAAGAGCTGGAAAATCATCGAGCCAGCCCAACTG 1905644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGGGAGGGAGGGAGAAAGTGCAAATCGAAGAGCTGGAAAATCATCGAGCCAGCCCAACTG 2940

  1905645 TTGGGAGATTGGGGATTCTTTGTGCACGGAGCAGAAACAATCTCCTGCACGGGGTGGCGG 1905704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGGGAGATTGGGGATTCTTTGTGCACGGAGCAGAAACAATCTCCTGCACGGGGTGGCGG 3000

  1905705 CTTGGGCCAGGACTTCTCGGCATTGAGGAGTTACAGAGCTGTTTTGTAGCTAAACCGACT 1905764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTTGGGCCAGGACTTCTCGGCATTGAGGAGTTACAGAGCTGTTTTGTAGCTAAACCGACT 3060

  1905765 TTCATTCCAAGCACTTCTACAGAGAACGAAATCAAACAGCGGTGATGATGGGATCCCCAG 1905824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTCATTCCAAGCACTTCTACAGAGAACGAAATCAAACAGCGGTGATGATGGGATCCCCAG 3120

  1905825 GCCCGGCCAGTGATCTGCTTAATTACTGACCAGGGAAGCTTCAGTAGCTTAATTGGATTG 1905884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCCCGGCCAGTGATCTGCTTAATTACTGACCAGGGAAGCTTCAGTAGCTTAATTGGATTG 3180

  1905885 ATGGGCACAGTGCCTAGTCCTCCACCCACTGGTCCCAGAGATTTTTATGGATAGCATGCT 1905944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATGGGCACAGTGCCTAGTCCTCCACCCACTGGTCCCAGAGATTTTTATGGATAGCATGCT 3240

  1905945 GATCTTCCATGCCCTGAGGCTTGGGGTCCTGTGTCCAGCATTCCCCACCAACTGGGCAGA 1906004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GATCTTCCATGCCCTGAGGCTTGGGGTCCTGTGTCCAGCATTCCCCACCAACTGGGCAGA 3300

  1906005 TGCTGCTGGATTTATGTCAACAGCGAGTTCTGCAGGCACACCTCTAAAACACAGTCTCAT 1906064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGCTGCTGGATTTATGTCAACAGCGAGTTCTGCAGGCACACCTCTAAAACACAGTCTCAT 3360

  1906065 AGTGTCTTCTGTTTTCAGGAACAAATACAAATTTTCTTCTCACATAAGTTATATCATGAA 1906124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGTGTCTTCTGTTTTCAGGAACAAATACAAATTTTCTTCTCACATAAGTTATATCATGAA 3420

  1906125 CATGAGCATTTAACAAGGGACGGTGTGTGTGTGCGAGCACGTACATGTTGTATGTTGTGT 1906184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CATGAGCATTTAACAAGGGACGGTGTGTGTGTGCGAGCACGTACATGTTGTATGTTGTGT 3480

  1906185 GTTTTGTGTGTGTATGAGAGAGACACCACAGACACACTAGCCCCATGAAAGGCCAGGGCA 1906244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTTTTGTGTGTGTATGAGAGAGACACCACAGACACACTAGCCCCATGAAAGGCCAGGGCA 3540

  1906245 GTGAGGCCTGGACCATGGTCTGCTAAGGACCTGGTGTGGCACACTGATGGTTATCACAAG 1906304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTGAGGCCTGGACCATGGTCTGCTAAGGACCTGGTGTGGCACACTGATGGTTATCACAAG 3600

  1906305 TGGCCTGGGAGGTGTTCTGTTGGCCCCAGGGGTTCACTGACCATCATCACAGGTGGCCTG 1906364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGGCCTGGGAGGTGTTCTGTTGGCCCCAGGGGTTCACTGACCATCATCACAGGTGGCCTG 3660

  1906365 TGATGTGTTGACTTGGTGGGGCCCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTAGAGGTGATCT 1906424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGATGTGTTGACTTGGTGGGGCCCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTAGAGGTGATCT 3720

  1906425 GTTGACCCCAGGGGCTCACTGGTGACCACTGCCGGTAGCCTGGGAGGTGGTCTGTTGACC 1906484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GTTGACCCCAGGGGCTCACTGGTGACCACTGCCGGTAGCCTGGGAGGTGGTCTGTTGACC 3780

  1906485 TTGGGGACTCATTGATGACCATTACAGGTGGCCTGGGAGATGGTCTGTTGACCCTGGGGA 1906544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTGGGGACTCATTGATGACCATTACAGGTGGCCTGGGAGATGGTCTGTTGACCCTGGGGA 3840

  1906545 GTCACTGATGACCATTTCAAGTGGTCTGTTGACCTTGGGGGCTCACTGACGGCCATTGCA 1906604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GTCACTGATGACCATTTCAAGTGGTCTGTTGACCTTGGGGGCTCACTGACGGCCATTGCA 3900

  1906605 GGTTGTCTGGGAGGTGGTGTGTTGACCTTGTGGGCTCACTGATGGCCATTGCTGGTGGCC 1906664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GGTTGTCTGGGAGGTGGTGTGTTGACCTTGTGGGCTCACTGATGGCCATTGCTGGTGGCC 3960

  1906665 TTGGCGATGATGGTCTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGGTGACCACTGCAGGTGGGCTGGG 1906724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTGGCGATGATGGTCTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGGTGACCACTGCAGGTGGGCTGGG 4020

  1906725 AAGTGGTCTGTTGACCTGGGGACTCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTGGAGATGGTT 1906784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAGTGGTCTGTTGACCTGGGGACTCACTGACCACCATTGCTGGTGGCCTTGGAGATGGTT 4080

  1906785 TGTTGACCTTGGGGACTCACCACCATTGCAGGTGACTTGGAGATGGTTTGTTGACCTTGG 1906844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TGTTGACCTTGGGGACTCACCACCATTGCAGGTGACTTGGAGATGGTTTGTTGACCTTGG 4140

  1906845 GGACTCACTGACCACCACTGCAGGTGACTTGGGAGATGGTTTGTTGACCCTGGGGACTCA 1906904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GGACTCACTGACCACCACTGCAGGTGACTTGGGAGATGGTTTGTTGACCCTGGGGACTCA 4200

  1906905 CTGGTGACCATTACAGGTGGGCTGGGAAGTGGTCTCTTGACCTGGGGACTCACTGACCAC 1906964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CTGGTGACCATTACAGGTGGGCTGGGAAGTGGTCTCTTGACCTGGGGACTCACTGACCAC 4260

  1906965 CACTGTTGGTGGCCTTGGAGATGGTTTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGATGACCATTGCA 1907024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CACTGTTGGTGGCCTTGGAGATGGTTTGTTGACCCCAGGGGCTCACTGATGACCATTGCA 4320

  1907025 GGTGGCCTGGGGGATGGCCTATTGACTGGGCACATCCTACTGATTCACTGCAGAAGACGG 1907084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4321 GGTGGCCTGGGGGATGGCCTATTGACTGGGCACATCCTACTGATTCACTGCAGAAGGCGG 4380

  1907085 GCAATTTGCTGAGCACCTAGAAGGGCCT----ATCAGTGCCAGGGTTAGTGGGTCCAACC 1907140
          ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GCAATTTGCTGAGCACCTAGAAGGGCCTGACTATCAGTGCCAGGGTTAGTGGGTCCAACC 4440

  1907141 TCAAGGTCCTGCACCTAGAGGACCTAACACAGACAATGTTCTGCTGGCTGCTGAACACTT 1907200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TCAAGGTCCTGCACCTAGAGGACCTAACACAGACAATGTTCTGCTGGCTGCTGAACACTT 4500

  1907201 GGACCTAACCCTGACCATCTTCTGCACATTGCCCAGGACTAGTTGGCCCCACTTCTTCTC 1907260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GGACCTAACCCTGACCATCTTCTGCACATTGCCCAGGACTAGTTGGCCCCACTTCTTCTC 4560

  1907261 TTCTCAGAGCCCACGATAGGCCCTGTGGTCACTCCCTCTGCAGAGGTGGAACTGAAATTC 1907320
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTCTCAGAGCCCACGATAGGCCCTGTGGTCATTCCCTCTGCAGAGGTGGAACTGAAATTC 4620

  1907321 CCTCAGGTCACATTCCTGGTTATGCAGGAAGCTGAGAATGAGACAGGAATTCCAAACCCA 1907380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CCTCAGGTCACATTCCTGGTTATGCAGGAAGCTGAGAATGAGACAGGAATTCCAAACCCA 4680

  1907381 GGTCAGTGGCCTAAATATGGTCCTGTGGGTCTGACCACAGGCAGTTACAAGGCTGGAACC 1907440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GGTCAGTGGCCTAAATATGGTCCTGTGGGTCTGACCACAGGCAGTTACAAGGCTGGAACC 4740

  1907441 CAGGGGAAAGCTGCCTTCCCACATCGCGCTGGGTGCACACCTGGAGCATTACACAGCTTG 1907500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CAGGGGAAAGCTGCCTTCCCACATCGCGCTGGGTGCACACCTGGAGCATTACACAGCTTG 4800

  1907501 GGGGGATGAAGGGTAAGACCTCAGGCCCCTGGGCAGCCATGCTCTTATGAGTATGTATAT 1907560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GGGGGATGAAGGGTAAGACCTCAGGCCCCTGGGCAGCCATGCTCTTATGAGTATGTATAT 4860

  1907561 CCTGGAGCAGGTCCTGCCACTTCAGGCCTCCTTACTAGTGGTGGAAGAGGCAGGTGCCTG 1907620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CCTGGAGCAGGTCCTGCCACTTCAGGCCTCCTTACTAGTGGTGGAAGAGGCAGGTGCCTG 4920

  1907621 AGCCCCTCTTCCCCATTCTGACTTGTACCTTTTGACTCCTAGCCCTTTCCACTCTCCCTC 1907680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AGCCCCTCTTCCCCATTCTGACTTGTACCTTTTGACTCCTAGCCCTTTCCACTCTCCCTC 4980

  1907681 CCCAGACCTCCTAGTTCAGGACATGCCTGAACACCTCCGGTAACCTTCCCATGTGTAGTT 1907740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CCCAGACCTCCTAGTTCAGGACATGCCTGAACACCTCCGGTAACCTTCCCATGTGTAGTT 5040

  1907741 TCCAGTATACCAAGAGGAGCTTGTGCGGTGGTTGAGCTTTAAGCAGCAGAAAGTTTCTCA 1907800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TCCAGTATACCAAGAGGAGCTTGTGCGGTGGTTGAGCTTTAAGCAGCAGAAAGTTTCTCA 5100

  1907801 GCAATTTGCCTCGTATATATTGGTATTGGTGTGCTCCAGGGAGACAGAACCAATTGTATC 1907860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GCAATTTGCCTCGTATATATTGGTATTGGTGTGCTCCAGGGAGACAGAACCAATTGTATC 5160

  1907861 ATTTCACGATAAGAAGAGGTTCTAAGTCGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTCATCCCAGTA 1907920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATTTCACGATAAGAAGAGGTTCTAAGTCGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTCATCCCAGTA 5220

  1907921 CTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATG 1907980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATG 5280

  1907981 GTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGTGCCTGT 1908040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGTGCCTGT 5340

  1908041 AATTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTT 1908100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AATTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTT 5400

  1908101 AAAGTGAGCCGAGATTGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCGAAACTCTGTC 1908160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AAAGTGAGCCGAGATTGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCGAAACTCTGTC 5460

  1908161 TCAAAAAAATAAAGTAAAATAAAATAAAATAAATAAAATAAAGAAAAGGTTCTAAGCCGG 1908220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TCAAAAAAATAAAGTAAAATAAAATAAAATAAATAAAATAAAGAAAAGGTTCTAAGCCGG 5520

  1908221 TCATGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCTGAGGTGGACAGATCACTT 1908280
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TCATGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGACAGATCACTT 5580

  1908281 GAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAAT 1908340
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAAT 5640

  1908341 ACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTGATCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGA 1908400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 ACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTGATCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGA 5700

  1908401 GGCAGGAGAATCGCTTGAACCTCGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCTATCGTGCCACTGCA 1908460
          ||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTATCGTGCCACTGCA 5760

  1908461 CTCCAGCCTGGGCGGCAGAGCCAGTCTCAAAATATATATATATAAATATATATATATGTG 1908520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |
     5761 CTCCAGCCTGGGCGGCAGAGCCAGTCTCAAAATATATATATATAAATATATATAT----G 5816

  1908521 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTT 1908580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATGTATGTGTGTATATCTACATGCACACGAGTT 5876

  1908581 TGTATGTATATATGTGTGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAG 1908640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 TGTATGTATATATGTGTGTCTACATGCATGAATGTTTGACATATGTACATGTATATGTAG 5936

  1908641 ACATATATTG--TATATGTATA----TACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTA 1908694
          ||||||      ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 ACATAT----TATATATGTATAAATATACATATATGTATACACATACACGTGTATATGTA 5992

  1908695 TACATATATTGTATATGTATAAATATACATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTAT 1908754
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 TACATATATTGTATATGTATGAATATACATATATGTATACATATACACGTGTATGTGTAT 6052

  1908755 ACATATGCATATACACATATATGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACACATAC 1908814
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 ACATATGCATATACACATATACGTGTATATGTATAAATATGCATATATGTATACACATAC 6112

  1908815 ACGTGTATATGTATACACAAGCATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATG 1908874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 ACGTGTATATGTATACACAAGCATATATGTGTATGTATATGTCAAACATGTGTATGCATG 6172

  1908875 CAGACACACACACACACACACACAAATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAG 1908934
          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 CAGACACACACACACACACACA--AATATACGTCCAAAGACAGCATCTGAAGGACTTCAG 6230

  1908935 GCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTAT 1908994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6231 GCTAAACCTACCTGGTGGAAGAAACTATTCTCTTAACTCTCATTTCCAAATGAGAAGTAT 6290

  1908995 ATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCAACTTCTCAGGGAGAGAAG 1909054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6291 ATTTAAGATGGGTGTACTTCCCTCACGGTGAAATGGTTTTCACCTTCTCAGGGAGAGAAG 6350

  1909055 TCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAG 1909114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6351 TCTTATTTCCTCTTTGCCTTTCTCCCCCCATTTTCCCTTTCTTTCCTCTTCCACATAGAG 6410

  1909115 CATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACA 1909174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6411 CATTTTAGATGCGTCCAGGGGGCCATGGTCTGTCACTCACTCACTTCTCTTTAGCTTACA 6470

  1909175 GAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTG 1909234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6471 GAAAGACAACATGCTATGAAAAAGAAAGAAAAAATCTCTCTTCTCAGTTTCTGATGTTTG 6530

  1909235 CTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGA 1909294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6531 CTTATCTGTTATTCTTGTAGATGTATATTGCCAGATTTGTATATGTCAATGTGTTATGGA 6590

  1909295 AATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCA 1909354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6591 AATTTTAACAGATATAAAAAGTATAAACAATAGTGAATTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCA 6650

  1909355 CGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCA 1909414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6651 CGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCA 6710

  1909415 AGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCA 1909474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6711 AGGCCATCCTGGCCAACATGATGAAATCCCCACTCTACTAAAAAGGCAAAAAATTAGTCA 6770

  1909475 AGTCATGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGA 1909534
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6771 AGTCATGGTGGTGTGTGCCTGTAATCCCATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGA 6830

  1909535 GTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGG 1909594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6831 GTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTACAGCCTGG 6890

  1909595 GCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAAAA---------------AAAAAAAAAAAA 1909639
          |||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||
     6891 GCGACAGAGCAAGACCCCGTCTAAAAAAAAA--CAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAA 6948

  1909640 AACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGG 1909699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6949 AACAGAATAGTGAGTTTCAGCCAGGTGTGGTGGCTCATGCCTATGATTCCAGCACTTTGG 7008

  1909700 GAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCA 1909759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7009 GAGGCCGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCA 7068

  1909760 AGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGG 1909819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7069 AGGCACTCCAGCCTGGGTGATGGAGCGACGTTCTGTCTCGAATTTTTAAAACAAGAAGGG 7128

  1909820 TGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTC 1909879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7129 TGAGTTTAAAAGCTTGTGTACCTGCGCAGAACTTCAAGAAAATATTGCAATGTTATCTTC 7188

  1909880 TTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGAT 1909939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7189 TTCACTTTCAGCCAGAAACTTAGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCACCTGGAGATCTGGAT 7248

  1909940 GGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGT 1909999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7249 GGGGGTCGTATGAGAACATCACGTTCTTTTTCTGAGCCTCTGGTATCCAGCCTAGCCTGT 7308

  1910000 AGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCAT 1910059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7309 AGGCATTGCTTCCTCCGATGGGCAGTTTGTGCCTCTGGAAATCACCCTTCTACCTCCCAT 7368

  1910060 ACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGA 1910119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7369 ACCCCCCATCCCAATATCTCTGTGTGCTTGGCACATAGGAGGTGGGACATTTGGTAGAGA 7428

  1910120 AAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCA 1910179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7429 AAATACGTGCTGAAGCAAATGGAGTGAAATTGGGGAATCTGATAGAAGCAAATGGAGTCA 7488

  1910180 AATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGATACTGGGACCAGATCCAAAGC 1910239
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     7489 AATCTGGGAATTTGATAAGCCTCCCATTCACACTGGGGAAACTGGGACCAGATCCAAAGC 7548

  1910240 CAGCAGCATTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGA 1910299
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7549 CAGCAGCACTGAAACAGCGGTTGAAGCAGCGTTCAAACAGTATTGAAACAGATTTGTGGA 7608

  1910300 CACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCT 1910359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7609 CACCGCAGTCGTGCATGCATTCCTCATGAGGAAAGGCTGTCACTCTTTAAATTTCTCCCT 7668

  1910360 GACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCA 1910419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7669 GACTTGGGTGTCTGCAAATATCCATGAGTCTTATTCTCTACGTGGACACACAGATGTCCA 7728

  1910420 CTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTAT 1910479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7729 CTCGGATACCTCAGCCGTAGAAGAATCACCAAGCATCTATGACCCACATTGTTTATCTAT 7788

  1910480 TTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTG 1910539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7789 TTATCTTGCCAGTCGTTTTGTGGGGAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTG 7848

  1910540 AGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCT----GTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTG 1910595
          |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||.||||||||||||||
     7849 AGGCCAGGCACGGTGGCTCAC----ACGTGTAACCCCAGCACTTGCGGAGGCTGAGGCTG 7904

  1910596 GCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCT 1910655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7905 GCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCT 7964

  1910656 CTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGC--AGGTATCTGTCATCCCAGCTAC 1910713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     7965 CTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGG-TTAGGTATCTGTCATCCCAGCTAC 8023

  1910714 TCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAA 1910773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8024 TCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAA 8083

  1910774 GATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAA 1910833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8084 GATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCTGGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAA 8143

  1910834 AA---TTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCAT 1910890
          ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8144 AAATATTTGAAGTAGTGTACAAGAATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCAT 8203

  1910891 CGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTT 1910950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8204 CGAGTTCATTATAAATACACACGAGACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTT 8263

  1910951 GGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAA 1911010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8264 GGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGGAAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAA 8323

  1911011 TTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAA 1911070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8324 TTAAAGGCACAAGAAAACAGTTATTTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAA 8383

  1911071 TCCCAG 1911076
          ||||||
     8384 TCCCAG 8389

EXCISED REGION

  1911676 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1911735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8390 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 8449

  1911736 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1911795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8450 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 8509

  1911796 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1911855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8510 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 8569

  1911856 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1911915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8570 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 8629

  1911916 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1911975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8630 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAGTGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 8689

  1911976 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1912035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8690 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 8749

  1912036 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1912095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8750 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 8809

  1912096 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1912155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8810 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 8869

  1912156 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1912215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8870 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 8929

  1912216 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1912275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8930 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 8989

  1912276 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 1912335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8990 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 9049

  1912336 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 1912395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9050 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 9109

  1912396 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 1912455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9110 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 9169

  1912456 GCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 1912515
          |.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9170 GTGATACAGAGATGAAAGATTGATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 9229

  1912516 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 1912575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9230 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 9289

  1912576 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 1912635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9290 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 9349

  1912636 TAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGT 1912695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9350 TAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGT 9409

  1912696 GGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGT 1912755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9410 GGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGT 9469

  1912756 AGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAGAT 1912815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     9470 AGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT-AGAT 9528

  1912816 -AGATAGATAGAAACATAGATGATAGGAGACAGGTACATAGATATCTGGATGGATAGATA 1912874
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9529 AAGATAGATAGAAACATAGATGATAGGAGACAGGTACATAGATATCTGGATGGATAGATA 9588

  1912875 GGAGATAGACGACAGATAGATAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAGATAATAGATAA 1912934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9589 GGAGATAGACGACAGATAGATAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAGATAATAGATAA 9648

  1912935 GTAAATAGGTAGATAGTAGACAGAGATAGAAGATAGATAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGT 1912994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9649 GTAAATAGGTAGATAGTAGACAGAGATAGAAGATAGATAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGT 9708

  1912995 AGATAGGTAGATAGAAAAGTAACTGGTAGATAGATAGAAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGG 1913054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9709 AGATAGGTAGATAGAAAAGTAACTGGTAGATAGATAGAAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGG 9768

  1913055 TAGATAGAAAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATA 1913114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     9769 TAGATAGAAAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGAT--------GATAGATAGATA 9820

  1913115 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGATAGATAGTAGATAGATA 1913174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||
     9821 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGATAGATAG----TAGATA 9876

  1913175 GTAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGAGATAGATGATAGATAG 1913234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9877 GTAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGAGATAGATGATAGATAG 9936

  1913235 GAGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATAGAGCCATATACACTGA 1913294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9937 GAGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATAGAGCCATATACACTGA 9996

  1913295 GGTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGATGTATATATAGAGAGAG 1913354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9997 GGTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGATGTATATATAGAGAGAG 10056

  1913355 AACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTGTGTCACTGCGTACATT 1913414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10057 AACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTGTGTCACTGCGTACATT 10116

  1913415 TTCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTCCCAGGGGTAAAGGGGT 1913474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10117 TTCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTCCCAGGGGTAAAGGGGT 10176

  1913475 GTGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCAGCCTCACACACAAACC 1913534
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
    10177 GTGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCAGCCCCACACACAAACC 10236

  1913535 CCACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCTGGATTTCCTGGAGAGG 1913594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10237 CCACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCTGGATTTCCTGGAGAGG 10296

  1913595 CTCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCTCCAGTTTGGTCACCAA 1913654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10297 CTCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCTCCAGTTTGGTCACCAA 10356

  1913655 GAGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGTGGGTTGAGTAGATGGT 1913714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10357 GAGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGTGGGTTGAGTAGATGGT 10416

  1913715 GTCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAGGGCTGCGTGGACAGTG 1913774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10417 GTCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAGGGCTGCGTGGACAGTG 10476

  1913775 CACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGACTCCGGGTCCACCACA 1913834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10477 CACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGACTCCGGGTCCACCACA 10536

  1913835 TTGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAGTCCCTTCCTCACCTGA 1913894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10537 TTGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAGTCCCTTCCTCACCTGA 10596

  1913895 GCCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCCAGTCTATCTACTTATC 1913954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10597 GCCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCCAGTCTATCTACTTATC 10656

  1913955 TATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATCTA 1914014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10657 TATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATCTA 10716

  1914015 TATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTATTATCTATCTATATCTA 1914074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||
    10717 TATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTAT----TATCTATATCTA 10772

  1914075 TCTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCTATTTATCTATCTAGCT 1914134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10773 TCTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCTATTTATCTATCTAGCT 10832

  1914135 ATCTATGTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATATATCTATGTATCTATGTATTAT 1914194
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
    10833 ATCTATGTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATGTATCTATGTATCTATGTATTAT 10892

  1914195 GTATCTATCTTCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTATCTCTATCTATCATCTATGT 1914254
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
    10893 GTATCTATCTTCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTATCTCTATCTATCAGCTATGT 10952

  1914255 ATCTCTCTATCTAGCTATCTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATCTATGTATGTA 1914314
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
    10953 ATCTCTCTATCTAGCTATCTATGTATCTAG----TATCTATCTAGCTATCTATGTATGTA 11008

  1914315 TCTATGTATTATCTATCTTCTATCTATCCATCCATATATCTATCATCAGTCAATCAATCC 1914374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11009 TCTATGTATTATCTATCTTCTATCTATCCATCCATATATCTATCATCAGTCAATCAATCC 11068

  1914375 TTTCATCGCTGTATCGCTCTATCCAGGTATCTTATCTATTTATTTTTCTCTTTCTATATT 1914434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11069 TTTCATCGCTGTATCGCTCTATCCAGGTATCTTATCTATTTATTTTTCTCTTTCTATATT 11128

  1914435 TCTGTATCTCTAACTCATCTATATACAGTCATCCCTTGTTATCTGTGAGGGATTGGTTCC 1914494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11129 TCTGTATCTCTAACTCATCTATATACAGTCATCCCTTGTTATCTGTGAGGGATTGGTTCC 11188

  1914495 AGGACACACGACA 1914507
          |||||||||||||
    11189 AGGACACACGACA 11201

Alignment time is 8.08248 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1901076,1921675] =>     20600 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [      1,   3389] =>      3389 nucs 'mol-32-34d4-189772_3389'

Score:        3185
Aligned:      3415        nucs
Identic:      3372 ( 99%) nucs =>       567 ( 97%)      2805 ( 99%)
Gaps:           36 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1910504,1911076] EXCISED REGION [1911676,1914507]
 second seq =>  [      1,    577] EXCISED REGION [    578,   3389]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       599 nucs [1911077,1911675]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [1911077,1911101] to [1911676,1911700]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1910504 GAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCC 1910563
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
        1 GAGGAAGGGGGCTTGCTTTGTTTAAAAAATTATTTGAGGCCAGGCACGGTGGCTCAC--- 57

  1910564 T----GTAACCCCAGCACTTGGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTT 1910619
               ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       58 -ACGTGTAACCCCAGCACTTGCGGAGGCTGAGGCTGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTT 116

  1910620 CGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCC 1910679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      117 CGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCC 176

  1910680 AGGCGTGGTGGC--AGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACT 1910737
          |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      177 AGGCGTGGTGG-TTAGGTATCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACT 235

  1910738 GCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCT 1910797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      236 GCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGTGCTTCAGTCT 295

  1910798 GGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAA---TTTGAAGTAGTGTACAAGA 1910854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||
      296 GGGTGACAGTGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATATTTGAAGTAGTGTACAAGA 355

  1910855 ATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGA 1910914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      356 ATGTAGGAGAGAAAAAAACCCTAATCCACAGAGCATCGAGTTCATTATAAATACACACGA 415

  1910915 GACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGG 1910974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      416 GACTGACTCGTCTTCTCTGGGAAGATGACAAGAGTTGGAAAGGCCCTGACTTGTGATTGG 475

  1910975 AAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTAT 1911034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      476 AAGGAAGGCTTCAGGTACTTGGAGTGAAAATGAGAATTAAAGGCACAAGAAAACAGTTAT 535

  1911035 TTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 1911076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 TTTGCAACAGGAATATATTTGGCAGGGACCTCCAAATCCCAG 577

EXCISED REGION

  1911676 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 1911735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      578 TTGTGGACCCATTGCTGGCTGCAAGCACAGGCTCTCAAACCTGGTTGGGCAGTGGGGACC 637

  1911736 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 1911795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      638 CTCTGGGCAGAATCACCTCCATCCCACCTGGGTTTCCACTTTAAACCCCCCAGTGGGGAT 697

  1911796 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 1911855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      698 TTTCCCATTCTGGAGACCTGGATGGGGTCCTCTGAGAACATCAGGCTCTTTTTCTGAGCC 757

  1911856 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 1911915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      758 TTTGATCTCCAGCCTAGCCTGAATCAGGCTGGATGTCAGAGGTGCATCCTCCTTAGAATG 817

  1911916 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAATGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 1911975
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 AAGGAAGAAGGGACTTGGTAGTGTTCTATGTACACACGGCAGGGTGATGCTTTGGGGTGT 877

  1911976 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 1912035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 TTGTAAACGAGGTTTCTCCCTCTCATTCAGTTGCTCATCTTCCCTTTCACCCACTGCCCT 937

  1912036 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 1912095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 GCCAACTAATTTGAGTAGCCTGATGGTGCTTGCTTCATCTCGCCAGGGGAGGGATGGGTT 997

  1912096 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1912155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 AGACCAGAGAGATGGAGAAAAACCAGCCTCTCCCTCGCTTGACTTCAAGGTCTGTTTTCA 1057

  1912156 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1912215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 AGAGGGAGGCGCGCGTGGGTTTGGGTTAGACCTAAAGTGGTTGATGCTTAGAGGGAGGGA 1117

  1912216 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1912275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 TTTCTTTGCTCTCAGACTAGGGGGCAGAGATGAGGTAGCGAGGATGGAATATAGAGGTGA 1177

  1912276 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 1912335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 TTGAAGGTATCTGGAAAGATATGCGTGGGCAATATGCAAATATTACACCATTTTATATAA 1237

  1912336 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 1912395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 GGGACATCCATGAATTTTACTAGCATCTGCTGAGTGTCCTGACATCAATCCTCCACAGAT 1297

  1912396 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 1912455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 AACAAGGGATGACTGTATATAGATGACTTAGAGATACAGAAAGATATATAGAGAGATAGG 1357

  1912456 GCGATACAGAGATGAAAGATTAATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 1912515
          |.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 GTGATACAGAGATGAAAGATTGATTGATGATAGATACCTGGATGGATAGATAGGAGATAG 1417

  1912516 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 1912575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 ATAAATACATAGATACATAGATAGACGACAGATAGATACATAGATAGATAGATACATACA 1477

  1912576 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 1912635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 TAGATAGATGATAGAAAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAATAGATAGATAAGTAAA 1537

  1912636 TAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGT 1912695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 TAGATAGTAGACAGAAGATAGACAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGATAGTAGAAAAGT 1597

  1912696 GGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGT 1912755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 GGTAGATAGATAGATAGAAGACAAGTCGCTGGTAGGTAAGTAGACAGACAGTAGACAGGT 1657

  1912756 AGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAGAT 1912815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     1658 AGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT-AGAT 1716

  1912816 -AGATAGATAGAAACATAGATGATAGGAGACAGGTACATAGATATCTGGATGGATAGATA 1912874
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 AAGATAGATAGAAACATAGATGATAGGAGACAGGTACATAGATATCTGGATGGATAGATA 1776

  1912875 GGAGATAGACGACAGATAGATAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAGATAATAGATAA 1912934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 GGAGATAGACGACAGATAGATAGATAGATGATAGATGGTAGATAGATAGATAATAGATAA 1836

  1912935 GTAAATAGGTAGATAGTAGACAGAGATAGAAGATAGATAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGT 1912994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 GTAAATAGGTAGATAGTAGACAGAGATAGAAGATAGATAGTAGACAAGTAGCTGGTAGGT 1896

  1912995 AGATAGGTAGATAGAAAAGTAACTGGTAGATAGATAGAAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGG 1913054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 AGATAGGTAGATAGAAAAGTAACTGGTAGATAGATAGAAGACAAGTAGCTGGTAGGTAGG 1956

  1913055 TAGATAGAAAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATA 1913114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     1957 TAGATAGAAAGACAGTAGACAGGTAGCTGTGTAGACAGAT--------GATAGATAGATA 2008

  1913115 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGATAGATAGTAGATAGATA 1913174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||
     2009 GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGACAAAGATAGATAG----TAGATA 2064

  1913175 GTAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGAGATAGATGATAGATAG 1913234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 GTAGATAGAAAGATAGATAGATGGATAGTAGATAGATAGATAGAGATAGATGATAGATAG 2124

  1913235 GAGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATAGAGCCATATACACTGA 1913294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 GAGACAGGTACATAGATTGATGTCGTGTTGATTGACAGATGATAGAGCCATATACACTGA 2184

  1913295 GGTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGATGTATATATAGAGAGAG 1913354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 GGTGTGTACACACACATGTATAAACGCACATTGGATATACAGATGTATATATAGAGAGAG 2244

  1913355 AACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTGTGTCACTGCGTACATT 1913414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 AACCATATGCACAGAGTCATGTACTCATATGCCCCCCACTGCTGTGTCACTGCGTACATT 2304

  1913415 TTCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTCCCAGGGGTAAAGGGGT 1913474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 TTCAGAAATCCACCTATTTCTGAGTCGAGGAAGAACCTGCTCTCCCAGGGGTAAAGGGGT 2364

  1913475 GTGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCAGCCTCACACACAAACC 1913534
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2365 GTGCCGCTCCAGGATGACATGCCACCCTGGTGTTGACTCTTTCAGCCCCACACACAAACC 2424

  1913535 CCACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCTGGATTTCCTGGAGAGG 1913594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 CCACCCGCTGGGTCAGGGTTTACACCCTCTTCAGTGAATGTCCTGGATTTCCTGGAGAGG 2484

  1913595 CTCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCTCCAGTTTGGTCACCAA 1913654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 CTCAGCCAGGCAGGAGGGGACCAGGAGAGGCGCTGGCCATTCCTCCAGTTTGGTCACCAA 2544

  1913655 GAGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGTGGGTTGAGTAGATGGT 1913714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 GAGGTGGGTGGTTTCAGCCTGAAAGATGCACCTGCAGGACCTGTGGGTTGAGTAGATGGT 2604

  1913715 GTCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAGGGCTGCGTGGACAGTG 1913774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 GTCACCTGAGGGGCAGGGGATGACCAGCGTCCCTGGGTGGAGAGGGCTGCGTGGACAGTG 2664

  1913775 CACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGACTCCGGGTCCACCACA 1913834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 CACTCATCCCACCTTGCTGCCCCTCAGTCGCCTGGCCACAGAGACTCCGGGTCCACCACA 2724

  1913835 TTGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAGTCCCTTCCTCACCTGA 1913894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 TTGAACCCCCACTGCCACGATGCCCTTCACCCTTGACGTGAAAGTCCCTTCCTCACCTGA 2784

  1913895 GCCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCCAGTCTATCTACTTATC 1913954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 GCCCGCCAACGTCTCTCCATCCTCACTTCCTCATCTCTGCCCCCAGTCTATCTACTTATC 2844

  1913955 TATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATCTA 1914014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 TATTTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATGTATCTATCTATCTACTATCTATCTA 2904

  1914015 TATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTATTATCTATCTATATCTA 1914074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||
     2905 TATCTATGTATCTATTATCTATCTATATCTATGTATCTATGTAT----TATCTATATCTA 2960

  1914075 TCTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCTATTTATCTATCTAGCT 1914134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 TCTATGTATCTATCTCTATCTACCTATCTATCATCTATGTATCTATTTATCTATCTAGCT 3020

  1914135 ATCTATGTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATATATCTATGTATCTATGTATTAT 1914194
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3021 ATCTATGTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATGTATCTATGTATCTATGTATTAT 3080

  1914195 GTATCTATCTTCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTATCTCTATCTATCATCTATGT 1914254
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3081 GTATCTATCTTCTATCTATATCTATCTATGTATCTATCTATCTCTATCTATCAGCTATGT 3140

  1914255 ATCTCTCTATCTAGCTATCTATGTATCTAGTATCTATCTATCTAGCTATCTATGTATGTA 1914314
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
     3141 ATCTCTCTATCTAGCTATCTATGTATCTAG----TATCTATCTAGCTATCTATGTATGTA 3196

  1914315 TCTATGTATTATCTATCTTCTATCTATCCATCCATATATCTATCATCAGTCAATCAATCC 1914374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 TCTATGTATTATCTATCTTCTATCTATCCATCCATATATCTATCATCAGTCAATCAATCC 3256

  1914375 TTTCATCGCTGTATCGCTCTATCCAGGTATCTTATCTATTTATTTTTCTCTTTCTATATT 1914434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 TTTCATCGCTGTATCGCTCTATCCAGGTATCTTATCTATTTATTTTTCTCTTTCTATATT 3316

  1914435 TCTGTATCTCTAACTCATCTATATACAGTCATCCCTTGTTATCTGTGAGGGATTGGTTCC 1914494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 TCTGTATCTCTAACTCATCTATATACAGTCATCCCTTGTTATCTGTGAGGGATTGGTTCC 3376

  1914495 AGGACACACGACA 1914507
          |||||||||||||
     3377 AGGACACACGACA 3389

Alignment time is 2.64655 s

