
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [128490437,128512439] =>     22003 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2828] =>      2828 nucs 'mol-32-2110-084461_2828'

Score:        2786
Aligned:      2821        nucs
Identic:      2817 (100%) nucs =>       237 (100%)      2580 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [128500201,128500437] EXCISED REGION [128502440,128505021]
 second seq =>  [        1,      237] EXCISED REGION [      245,     2828]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2002 nucs [128500438,128502439]
 second seq =>         7 nucs [238,244]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [128500437,128500437] to [128502439,128502439]
 second seq =>         1 nucs [238,238] to [245,245]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [128500437,128500437] to [128502440,128502440]
 second seq =>         1 nucs [237,237] to [245,245]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

128500201 CTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATGAATAAATAAAAA 128500260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATGAATAAATAAAAA 60

128500261 AGAAAGAAAGAAAGATAGGGGAATATATTTTGGAGAACAATTAGCAATCTCTACCACAGA 128500320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAAAGAAAGAAAGATAGGGGAATATATTTTGGAGAACAATTAGCAATCTCTACCACAGA 120

128500321 TAAGTATAAGGCTTCCACATATGATTGTACATTTTGTGGATTTAAGAAGGCTGAGAGAAA 128500380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAGTATAAGGCTTCCACATATGATTGTACATTTTGTGGATTTAAGAAGGCTGAGAGAAA 180

128500381 GAAGGGAGATGAAATCTAGTTTGTGTCCACTATCCACACCAGTGCACCCTAGCTTAA 128500437
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAGGGAGATGAAATCTAGTTTGTGTCCACTATCCACACCAGTGCACCCTAGCTTAA 237

EXCISED REGION

128502440 ACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAG 128502499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      245 ACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAG 304

128502500 TGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGG 128502559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 TGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGG 364

128502560 CATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCA 128502619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 CATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCA 424

128502620 AACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCC 128502679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 AACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCC 484

128502680 TTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCA 128502739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 TTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCA 544

128502740 TGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCT 128502799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 TGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCT 604

128502800 GGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTT 128502859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 GGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTT 664

128502860 CCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTA 128502919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 CCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTA 724

128502920 AAAAT--TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 128502977
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 AAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 784

128502978 GTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATCCATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGT 128503037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 GTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATCCATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGT 844

128503038 CATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTCCATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACA 128503097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 CATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTCCATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACA 904

128503098 TAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCAATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAG 128503157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 TAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCAATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAG 964

128503158 CAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCTCCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCT 128503217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 CAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCTCCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCT 1024

128503218 GCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCCTCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCA 128503277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 GCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCCTCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCA 1084

128503278 CCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCTCTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAG 128503337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 CCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCTCTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAG 1144

128503338 ATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGCACTGCACAACGTCTCTATTATGTATAT 128503397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 ATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGCACTGCACAACGTCTCTATTATGTATAT 1204

128503398 ACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCAGATTTAGCAAATAAAAATATGGGACAC 128503457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 ACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCAGATTTAGCAAATAAAAATATGGGACAC 1264

128503458 CCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGAATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCAT 128503517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 CCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGAATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCAT 1324

128503518 GTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTATTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACT 128503577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 GTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTATTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACT 1384

128503578 GGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTGACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGG 128503637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 GGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTGACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGG 1444

128503638 CAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCTTTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCT 128503697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 CAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCTTTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCT 1504

128503698 TAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAACTCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGT 128503757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 TAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAACTCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGT 1564

128503758 GGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATGTACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAA 128503817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 GGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATGTACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAA 1624

128503818 ACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGGTTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGA 128503877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 ACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGGTTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGA 1684

128503878 TTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAA 128503937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 TTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAA 1744

128503938 CACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCCACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTA 128503997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 CACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCCACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTA 1804

128503998 ATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGGCAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGC 128504057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 ATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGGCAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGC 1864

128504058 CTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTGCCCTCGAACATCGGA 128504117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1865 CTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTGCCCTCGAACATTGGA 1924

128504118 CTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGGTTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCA 128504177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 CTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGGTTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCA 1984

128504178 GCCTACTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTAATACTTAGCAAACTCATATATATATAT 128504237
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 GCCTATTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTAATACTTAGCAAACTCATATATATATAT 2044

128504238 TCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGACTAATACAAATAGGTATTATTATCTTCA 128504297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 TCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGACTAATACAAATAGGTATTATTATCTTCA 2104

128504298 TTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGGAATGACTTACCCAAGACCATGTCATAT 128504357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 TTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGGAATGACTTACCCAAGACCATGTCATAT 2164

128504358 GATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTCTCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTA 128504417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 GATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTCTCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTA 2224

128504418 AACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACAGATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAA 128504477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 AACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACAGATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAA 2284

128504478 AACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATACTTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGA 128504537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 AACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATACTTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGA 2344

128504538 CTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCTTGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGA 128504597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 CTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCTTGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGA 2404

128504598 ATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGACTGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAA 128504657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 ATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGACTGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAA 2464

128504658 AGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAAACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATT 128504717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 AGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAAACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATT 2524

128504718 ATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGCGTATGTATAGCAGTTGACAATATCAGC 128504777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 ATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGCGTATGTATAGCAGTTGACAATATCAGC 2584

128504778 CACATTATTAGTTTGGTTTCCTCTGCTTGGCTAGCTTTTCAGTTGGGGTAAGTCTGCATT 128504837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 CACATTATTAGTTTGGTTTCCTCTGCTTGGCTAGCTTTTCAGTTGGGGTAAGTCTGCATT 2644

128504838 TCCTGTCTCAGCACTTATGAAGAAGTGGCAGTAACAGTAAAACTTATATTAACTTGTGCC 128504897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 TCCTGTCTCAGCACTTATGAAGAAGTGGCAGTAACAGTAAAACTTATATTAACTTGTGCC 2704

128504898 CAAGTAATAAGCCCTCTGTTAATTGAAATTTTTCTGCACTTAGCTCTTATGGGAAAAAAA 128504957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 CAAGTAATAAGCCCTCTGTTAATTGAAATTTTTCTGCACTTAGCTCTTATGGGAAAAAAA 2764

128504958 GAGGCAATTATGTAAAGATGATGGACTGACAAACATTTTTCCCCAGAAGCCTCTGGCACT 128505017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 GAGGCAATTATGTAAAGATGATGGACTGACAAACATTTTTCCCCAGAAGCCTCTGGCACT 2824

128505018 GGTC 128505021
          ||||
     2825 GGTC 2828

Alignment time is 2.77152 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [128490437,128512439] =>     22003 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2693] =>      2693 nucs 'mol-32-21ec-045838_2693'

Score:        2653
Aligned:      2686        nucs
Identic:      2683 (100%) nucs =>       896 (100%)      1787 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [128499542,128500437] EXCISED REGION [128502440,128504229]
 second seq =>  [        1,      896] EXCISED REGION [      904,     2693]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2002 nucs [128500438,128502439]
 second seq =>         7 nucs [897,903]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [128500437,128500437] to [128502439,128502439]
 second seq =>         1 nucs [897,897] to [904,904]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [128500437,128500437] to [128502440,128502440]
 second seq =>         1 nucs [896,896] to [904,904]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

128499542 ATATATATGTGAATTAAGAGCATTGGCAGTGACCTGGTTGACACTGGAGACTATTATTCT 128499601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATATATGTGAATTAAGAGCATTGGCAGTGACCTGGTTGACACTGGAGACTATTATTCT 60

128499602 AAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTGATATATGGGAG 128499661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTGATATATGGGAG 120

128499662 CTAAGCTATGAGGACACAAAGGCATAAGAATGATATGGTGGACTTTGGGGACTTGAGGGG 128499721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAAGCTATGAGGACACAAAGGCATAAGAATGATATGGTGGACTTTGGGGACTTGAGGGG 180

128499722 AAGAGTGGAAGCGGGGTGAGGGATAAAAAGACTACAAACATGGCTCAGTGTATGGTGAGT 128499781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGAGTGGAAGCGGGGTGAGGGATAAAAAGACTACAAACATGGCTCAGTGTATGGTGAGT 240

128499782 GTATACTGCACCAAAATCTCACAAATCACCACTAAAGAACTCACTCATGTAACCAAATAA 128499841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTATACTGCACCAAAATCTCACAAATCACCACTAAAGAACTCACTCATGTAACCAAATAA 300

128499842 CACCTGTACCCCAATAACATATAGAAATATAAAATTAATTAATTAGATATAAATGAATAA 128499901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACCTGTACCCCAATAACATATAGAAATATAAAATTAATTAATTAGATATAAATGAATAA 360

128499902 AAGAAAAAAGAATTGGGGTTCTATTGCTGATCAAGAAACGGGAATATTGCTGGGTGCGGT 128499961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGAAAAAAGAATTGGGGTTCTATTGCTGATCAAGAAACGGGAATATTGCTGGGTGCGGT 420

128499962 GGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTCAAGGCCA 128500021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTCAAGGCCA 480

128500022 GGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCATCTCTACTTAAAAAAAAAAAA 128500081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCATCTCTACTTAAAAAAAAAAAA 540

128500082 ATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCTTGCTTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTG 128500141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCTTGCTTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTG 600

128500142 AGGCATGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAGCCTAGATGACACCAC 128500201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGCATGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAGCCTAGATGACACCAC 660

128500202 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATGAATAAATAAAAAA 128500261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATGAATAAATAAAAAA 720

128500262 GAAAGAAAGAAAGATAGGGGAATATATTTTGGAGAACAATTAGCAATCTCTACCACAGAT 128500321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAAGAAAGAAAGATAGGGGAATATATTTTGGAGAACAATTAGCAATCTCTACCACAGAT 780

128500322 AAGTATAAGGCTTCCACATATGATTGTACATTTTGTGGATTTAAGAAGGCTGAGAGAAAG 128500381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGTATAAGGCTTCCACATATGATTGTACATTTTGTGGATTTAAGAAGGCTGAGAGAAAG 840

128500382 AAGGGAGATGAAATCTAGTTTGTGTCCACTATCCACACCAGTGCACCCTAGCTTAA 128500437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGGGAGATGAAATCTAGTTTGTGTCCACTATCCACACCAGTGCACCCTAGCTTAA 896

EXCISED REGION

128502440 ACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAG 128502499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 ACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAG 963

128502500 TGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGG 128502559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 TGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGG 1023

128502560 CATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCA 128502619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 CATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCA 1083

128502620 AACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCC 128502679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 AACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCC 1143

128502680 TTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCA 128502739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 TTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCA 1203

128502740 TGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCT 128502799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 TGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCT 1263

128502800 GGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTT 128502859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 GGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTT 1323

128502860 CCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTA 128502919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 CCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTA 1383

128502920 AAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 128502979
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1384 AAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 1443

128502980 GTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATCCATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGTCA 128503039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 GTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATCCATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGTCA 1503

128503040 TTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTCCATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACATA 128503099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 TTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTCCATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACATA 1563

128503100 AGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCAATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAGCA 128503159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 AGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCAATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAGCA 1623

128503160 GCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCTCCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCTGC 128503219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 GCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCTCCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCTGC 1683

128503220 TTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCCTCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCACC 128503279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCCTCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCACC 1743

128503280 TACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCTCTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAGAT 128503339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 TACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCTCTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAGAT 1803

128503340 AGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGCACTGCACAACGTCTCTATTATGTATATAC 128503399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGCACTGCACAACGTCTCTATTATGTATATAC 1863

128503400 TTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCAGATTTAGCAAATAAAAATATGGGACACCC 128503459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 TTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCAGATTTAGCAAATAAAAATATGGGACACCC 1923

128503460 ATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGAATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCATGT 128503519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 ATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGAATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCATGT 1983

128503520 GCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTATTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACTGG 128503579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 GCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTATTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACTGG 2043

128503580 GCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTGACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGGCA 128503639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 GCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTGACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGGCA 2103

128503640 GCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCTTTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCTTA 128503699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 GCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCTTTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCTTA 2163

128503700 GCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAACTCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGTGG 128503759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 GCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAACTCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGTGG 2223

128503760 GTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATGTACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAAAC 128503819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 GTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATGTACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAAAC 2283

128503820 CCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGGTTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGATT 128503879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 CCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGGTTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGATT 2343

128503880 GAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAACA 128503939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 GAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAACA 2403

128503940 CTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCCACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTAAT 128503999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCCACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTAAT 2463

128504000 CAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGGCAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGCCT 128504059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 CAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGGCAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGCCT 2523

128504060 AGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTGCCCTCGAACATCGGACT 128504119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2524 AGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTGCCCTCGAACATTGGACT 2583

128504120 CCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGGTTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCAGC 128504179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 CCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGGTTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCAGC 2643

128504180 CTACTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTAATACTTAGCAAACTCATAT 128504229
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CTATTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTAATACTTAGCAAACTCATAT 2693

Alignment time is 2.62174 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [128490437,128512439] =>     22003 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2835] =>      2835 nucs 'mol-32-2202-041713_2835'

Score:        2835
Aligned:      2835        nucs
Identic:      2835 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [128499607,128502441]
 second seq =>  [        1,     2835]

128499607 AAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTGATATATGGGAGCTAAG 128499666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTGATATATGGGAGCTAAG 60

128499667 CTATGAGGACACAAAGGCATAAGAATGATATGGTGGACTTTGGGGACTTGAGGGGAAGAG 128499726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTATGAGGACACAAAGGCATAAGAATGATATGGTGGACTTTGGGGACTTGAGGGGAAGAG 120

128499727 TGGAAGCGGGGTGAGGGATAAAAAGACTACAAACATGGCTCAGTGTATGGTGAGTGTATA 128499786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGAAGCGGGGTGAGGGATAAAAAGACTACAAACATGGCTCAGTGTATGGTGAGTGTATA 180

128499787 CTGCACCAAAATCTCACAAATCACCACTAAAGAACTCACTCATGTAACCAAATAACACCT 128499846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGCACCAAAATCTCACAAATCACCACTAAAGAACTCACTCATGTAACCAAATAACACCT 240

128499847 GTACCCCAATAACATATAGAAATATAAAATTAATTAATTAGATATAAATGAATAAAAGAA 128499906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTACCCCAATAACATATAGAAATATAAAATTAATTAATTAGATATAAATGAATAAAAGAA 300

128499907 AAAAGAATTGGGGTTCTATTGCTGATCAAGAAACGGGAATATTGCTGGGTGCGGTGGCTC 128499966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAGAATTGGGGTTCTATTGCTGATCAAGAAACGGGAATATTGCTGGGTGCGGTGGCTC 360

128499967 ATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTCAAGGCCAGGAGT 128500026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTCAAGGCCAGGAGT 420

128500027 TCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCATCTCTACTTAAAAAAAAAAAAATACA 128500086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCATCTCTACTTAAAAAAAAAAAAATACA 480

128500087 AAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCTTGCTTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGCA 128500146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCTTGCTTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGCA 540

128500147 TGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAGCCTAGATGACACCACTGCAC 128500206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAGCCTAGATGACACCACTGCAC 600

128500207 TCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATGAATAAATAAAAAAGAAAG 128500266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATGAATAAATAAAAAAGAAAG 660

128500267 AAAGAAAGATAGGGGAATATATTTTGGAGAACAATTAGCAATCTCTACCACAGATAAGTA 128500326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGAAAGATAGGGGAATATATTTTGGAGAACAATTAGCAATCTCTACCACAGATAAGTA 720

128500327 TAAGGCTTCCACATATGATTGTACATTTTGTGGATTTAAGAAGGCTGAGAGAAAGAAGGG 128500386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAGGCTTCCACATATGATTGTACATTTTGTGGATTTAAGAAGGCTGAGAGAAAGAAGGG 780

128500387 AGATGAAATCTAGTTTGTGTCCACTATCCACACCAGTGCACCCTAGCTTAAGGTTTAGTC 128500446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGATGAAATCTAGTTTGTGTCCACTATCCACACCAGTGCACCCTAGCTTAAGGTTTAGTC 840

128500447 AGCCCAGAAGAAGGGCTATACTAGTCTGCTTTGCATTGTTATAAAGTAATACCTGACACT 128500506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCCCAGAAGAAGGGCTATACTAGTCTGCTTTGCATTGTTATAAAGTAATACCTGACACT 900

128500507 GGGTAAATTATAAGGAAAAGAGGTTTATTTGGTTCCCAGTTCTGCATGGTGTCAGCATCT 128500566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGTAAATTATAAGGAAAAGAGGTTTATTTGGTTCCCAGTTCTGCATGGTGTCAGCATCT 960

128500567 GTTGAGCTTCTGATGAGGCCTCAGGAAACTTTTACTTATGGTAAAAGGCAACGGGGGAGC 128500626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTGAGCTTCTGATGAGGCCTCAGGAAACTTTTACTTATGGTAAAAGGCAACGGGGGAGC 1020

128500627 ACTCATGTCACACGGAGAGAGAGAGAGCAAGAGAGAGAGAAAGAAAAGGAGGAGATGCCA 128500686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTCATGTCACACGGAGAGAGAGAGAGCAAGAGAGAGAGAAAGAAAAGGAGGAGATGCCA 1080

128500687 GGCTCTTTTAAACAACTATTAATAGCTGTCACATGAACATAGAATGTGAACTCCTTCATC 128500746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCTCTTTTAAACAACTATTAATAGCTGTCACATGAACATAGAATGTGAACTCCTTCATC 1140

128500747 ATCAAAGGGAAGGCACAAAGGGACCTTTGCCTCCATGAAGGATCTGCCTCCATGACCCAA 128500806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATCAAAGGGAAGGCACAAAGGGACCTTTGCCTCCATGAAGGATCTGCCTCCATGACCCAA 1200

128500807 ACACCTCTCAGTATGCCCCATCTCCAACATTGGGGATCACATTTCAACATGAGATTTGTT 128500866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACACCTCTCAGTATGCCCCATCTCCAACATTGGGGATCACATTTCAACATGAGATTTGTT 1260

128500867 GGCAATAAATATCCAAGCTATATCAGGTGCCTTTTTGTATTGAGTTGGGCCATACAAAAT 128500926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCAATAAATATCCAAGCTATATCAGGTGCCTTTTTGTATTGAGTTGGGCCATACAAAAT 1320

128500927 TGTCATTTTCATAGATCAAATATGATAAAAAGTCAGCAATTTAATATGGTTGGACCAGTA 128500986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTCATTTTCATAGATCAAATATGATAAAAAGTCAGCAATTTAATATGGTTGGACCAGTA 1380

128500987 ATTCATCAGCCCAGAAAGGACACCTTTTTGTAATTCTCACAAACGTACCTGTGATAGAGC 128501046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTCATCAGCCCAGAAAGGACACCTTTTTGTAATTCTCACAAACGTACCTGTGATAGAGC 1440

128501047 AATTGTACAAATGTCTCCAATTGTCCATCTTCATCTTCCCTGTAGCTATGTCTTTTGTAA 128501106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATTGTACAAATGTCTCCAATTGTCCATCTTCATCTTCCCTGTAGCTATGTCTTTTGTAA 1500

128501107 TGTGGCTTGCAGCCTTTCCCATCAAGAGGTAGAGTCAATTTCCTCAACCCTTGAATCTGA 128501166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTGGCTTGCAGCCTTTCCCATCAAGAGGTAGAGTCAATTTCCTCAACCCTTGAATCTGA 1560

128501167 GCTGGCCATGTGGCTTGTTTGACCAGTGGAGTAAGATGGAAGTAAAGATGTGCCAGTACT 128501226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCTGGCCATGTGGCTTGTTTGACCAGTGGAGTAAGATGGAAGTAAAGATGTGCCAGTACT 1620

128501227 GAATCCAGGCCTCAAGAGGCCTCACATGCTTCTTCTCTCACTCTTTCAGAACCTTGTCAG 128501286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAATCCAGGCCTCAAGAGGCCTCACATGCTTCTTCTCTCACTCTTTCAGAACCTTGTCAG 1680

128501287 GACCATGTGAAAAAGCCCAGGGTAGACCATCGGAGGAAGGCCCTCCTAGACCATCCTACA 128501346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GACCATGTGAAAAAGCCCAGGGTAGACCATCGGAGGAAGGCCCTCCTAGACCATCCTACA 1740

128501347 GCCAGCCAACCCGCAAACATTTTCGACATTTCAGCCAAGATCAACAGATCTGCCTATCTG 128501406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCCAGCCAACCCGCAAACATTTTCGACATTTCAGCCAAGATCAACAGATCTGCCTATCTG 1800

128501407 ACCCACAGCTGATCACTGACACATGAGTGAGCCCAGCTAAAACTAGATTCATCCAGCTGA 128501466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACCCACAGCTGATCACTGACACATGAGTGAGCCCAGCTAAAACTAGATTCATCCAGCTGA 1860

128501467 TTCACAGACTCATGAACGATAATAAATAAATACTCTTTAAGCCTCTAATTTTGGGGGTGG 128501526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTCACAGACTCATGAACGATAATAAATAAATACTCTTTAAGCCTCTAATTTTGGGGGTGG 1920

128501527 TTTGTTAGATAAGCAATAGTTAACTGCTACAGTGTCATATGTACTAACAACATCCCTGTG 128501586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTGTTAGATAAGCAATAGTTAACTGCTACAGTGTCATATGTACTAACAACATCCCTGTG 1980

128501587 TAGCTATTAGTATTCGCCTCATTTTATAGCTAACTGAGCTTAGTAGTTAAGTGATTTGCC 128501646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAGCTATTAGTATTCGCCTCATTTTATAGCTAACTGAGCTTAGTAGTTAAGTGATTTGCC 2040

128501647 TAAAGTCACACAACTAGTTAATACAGGGACAGCCAGGATTCTAAACCAGCCTGTCTATAG 128501706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAAAGTCACACAACTAGTTAATACAGGGACAGCCAGGATTCTAAACCAGCCTGTCTATAG 2100

128501707 ACCCTGTGATCATAACCATTACTCTATATGACCATAGCACTACTCTAACTAATGAGGAAG 128501766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACCCTGTGATCATAACCATTACTCTATATGACCATAGCACTACTCTAACTAATGAGGAAG 2160

128501767 AGGCAGGCCCCATTTGTACCCAGTGGCTAAATGCTAGATGTTTAACAATCAGCTCTCTGG 128501826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGCAGGCCCCATTTGTACCCAGTGGCTAAATGCTAGATGTTTAACAATCAGCTCTCTGG 2220

128501827 CAAGAGGACGCCCTGATTTGTAGTACTTGCTGATTTCCATGATGTAAATACTCCCACCAT 128501886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAAGAGGACGCCCTGATTTGTAGTACTTGCTGATTTCCATGATGTAAATACTCCCACCAT 2280

128501887 GGCCAATCTCAAATCTACAACTTGACATCACTGAACACACAGTTGAGAAGATATATGCAA 128501946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGCCAATCTCAAATCTACAACTTGACATCACTGAACACACAGTTGAGAAGATATATGCAA 2340

128501947 TAACACACCATTATAGTACTTCCACCATACAAATATAAGTAAACAATCTCGAGAGCATAG 128502006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAACACACCATTATAGTACTTCCACCATACAAATATAAGTAAACAATCTCGAGAGCATAG 2400

128502007 ATAATAGTAAAATGTAGTAAAAGAACATTTTACTGTTTTGAGTTATAAGTTTTGAGTATG 128502066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATAATAGTAAAATGTAGTAAAAGAACATTTTACTGTTTTGAGTTATAAGTTTTGAGTATG 2460

128502067 TGTTGCCTTTGTTTCAATGTAATTTAACTGTACATTTATATATTAATTTATTTTTAATGG 128502126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGTTGCCTTTGTTTCAATGTAATTTAACTGTACATTTATATATTAATTTATTTTTAATGG 2520

128502127 CTGTGTTTAAAAACCGGATTGCAAAATTTTCTTAAAATTTAACATTTGGCTCTTGTGAGC 128502186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGTGTTTAAAAACCGGATTGCAAAATTTTCTTAAAATTTAACATTTGGCTCTTGTGAGC 2580

128502187 CAGTATGAGCCATTTCTAGCACACCCTTTGCTAAGGGTCATAGTCTAATCATCCAGCCAT 128502246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAGTATGAGCCATTTCTAGCACACCCTTTGCTAAGGGTCATAGTCTAATCATCCAGCCAT 2640

128502247 TTGACCTGCTCGGCAAATTTGTTGCTTCCTCCTATAAACCTACACCTATTTGCCCACCCC 128502306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTGACCTGCTCGGCAAATTTGTTGCTTCCTCCTATAAACCTACACCTATTTGCCCACCCC 2700

128502307 TCCAGCCCTCCAAATGTGTATGAATTAGCTGAATATTTATAGCTTGGCCTGTACCCTGGG 128502366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCCAGCCCTCCAAATGTGTATGAATTAGCTGAATATTTATAGCTTGGCCTGTACCCTGGG 2760

128502367 ACCTCGGTCCATATGTCAGCATTTCTTTAACCTCTTCTATTTGTCTTTTCAGTCTATACC 128502426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACCTCGGTCCATATGTCAGCATTTCTTTAACCTCTTCTATTTGTCTTTTCAGTCTATACC 2820

128502427 ACACTTTTGGTTAAC 128502441
          |||||||||||||||
     2821 ACACTTTTGGTTAAC 2835

Alignment time is 2.41576 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [128490437,128512439] =>     22003 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     3796] =>      3796 nucs 'mol-32-220d-024055_3796'

Score:        3785
Aligned:      3796        nucs
Identic:      3795 (100%) nucs =>      2680 (100%)      1115 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [128500269,128502948] EXCISED REGION [128502951,128504066]
 second seq =>  [        1,     2680] EXCISED REGION [     2681,     3796]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [128502949,128502950]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        31 nucs [128502949,128502979] to [128502951,128502981]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

128500269 AGAAAGATAGGGGAATATATTTTGGAGAACAATTAGCAATCTCTACCACAGATAAGTATA 128500328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAAAGATAGGGGAATATATTTTGGAGAACAATTAGCAATCTCTACCACAGATAAGTATA 60

128500329 AGGCTTCCACATATGATTGTACATTTTGTGGATTTAAGAAGGCTGAGAGAAAGAAGGGAG 128500388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGCTTCCACATATGATTGTACATTTTGTGGATTTAAGAAGGCTGAGAGAAAGAAGGGAG 120

128500389 ATGAAATCTAGTTTGTGTCCACTATCCACACCAGTGCACCCTAGCTTAAGGTTTAGTCAG 128500448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGAAATCTAGTTTGTGTCCACTATCCACACCAGTGCACCCTAGCTTAAGGTTTAGTCAG 180

128500449 CCCAGAAGAAGGGCTATACTAGTCTGCTTTGCATTGTTATAAAGTAATACCTGACACTGG 128500508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCAGAAGAAGGGCTATACTAGTCTGCTTTGCATTGTTATAAAGTAATACCTGACACTGG 240

128500509 GTAAATTATAAGGAAAAGAGGTTTATTTGGTTCCCAGTTCTGCATGGTGTCAGCATCTGT 128500568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTAAATTATAAGGAAAAGAGGTTTATTTGGTTCCCAGTTCTGCATGGTGTCAGCATCTGT 300

128500569 TGAGCTTCTGATGAGGCCTCAGGAAACTTTTACTTATGGTAAAAGGCAACGGGGGAGCAC 128500628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAGCTTCTGATGAGGCCTCAGGAAACTTTTACTTATGGTAAAAGGCAACGGGGGAGCAC 360

128500629 TCATGTCACACGGAGAGAGAGAGAGCAAGAGAGAGAGAAAGAAAAGGAGGAGATGCCAGG 128500688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCATGTCACACGGAGAGAGAGAGAGCAAGAGAGAGAGAAAGAAAAGGAGGAGATGCCAGG 420

128500689 CTCTTTTAAACAACTATTAATAGCTGTCACATGAACATAGAATGTGAACTCCTTCATCAT 128500748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTTTTAAACAACTATTAATAGCTGTCACATGAACATAGAATGTGAACTCCTTCATCAT 480

128500749 CAAAGGGAAGGCACAAAGGGACCTTTGCCTCCATGAAGGATCTGCCTCCATGACCCAAAC 128500808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAAGGGAAGGCACAAAGGGACCTTTGCCTCCATGAAGGATCTGCCTCCATGACCCAAAC 540

128500809 ACCTCTCAGTATGCCCCATCTCCAACATTGGGGATCACATTTCAACATGAGATTTGTTGG 128500868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCTCTCAGTATGCCCCATCTCCAACATTGGGGATCACATTTCAACATGAGATTTGTTGG 600

128500869 CAATAAATATCCAAGCTATATCAGGTGCCTTTTTGTATTGAGTTGGGCCATACAAAATTG 128500928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAATAAATATCCAAGCTATATCAGGTGCCTTTTTGTATTGAGTTGGGCCATACAAAATTG 660

128500929 TCATTTTCATAGATCAAATATGATAAAAAGTCAGCAATTTAATATGGTTGGACCAGTAAT 128500988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCATTTTCATAGATCAAATATGATAAAAAGTCAGCAATTTAATATGGTTGGACCAGTAAT 720

128500989 TCATCAGCCCAGAAAGGACACCTTTTTGTAATTCTCACAAACGTACCTGTGATAGAGCAA 128501048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCATCAGCCCAGAAAGGACACCTTTTTGTAATTCTCACAAACGTACCTGTGATAGAGCAA 780

128501049 TTGTACAAATGTCTCCAATTGTCCATCTTCATCTTCCCTGTAGCTATGTCTTTTGTAATG 128501108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGTACAAATGTCTCCAATTGTCCATCTTCATCTTCCCTGTAGCTATGTCTTTTGTAATG 840

128501109 TGGCTTGCAGCCTTTCCCATCAAGAGGTAGAGTCAATTTCCTCAACCCTTGAATCTGAGC 128501168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGCTTGCAGCCTTTCCCATCAAGAGGTAGAGTCAATTTCCTCAACCCTTGAATCTGAGC 900

128501169 TGGCCATGTGGCTTGTTTGACCAGTGGAGTAAGATGGAAGTAAAGATGTGCCAGTACTGA 128501228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGCCATGTGGCTTGTTTGACCAGTGGAGTAAGATGGAAGTAAAGATGTGCCAGTACTGA 960

128501229 ATCCAGGCCTCAAGAGGCCTCACATGCTTCTTCTCTCACTCTTTCAGAACCTTGTCAGGA 128501288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCCAGGCCTCAAGAGGCCTCACATGCTTCTTCTCTCACTCTTTCAGAACCTTGTCAGGA 1020

128501289 CCATGTGAAAAAGCCCAGGGTAGACCATCGGAGGAAGGCCCTCCTAGACCATCCTACAGC 128501348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCATGTGAAAAAGCCCAGGGTAGACCATCGGAGGAAGGCCCTCCTAGACCATCCTACAGC 1080

128501349 CAGCCAACCCGCAAACATTTTCGACATTTCAGCCAAGATCAACAGATCTGCCTATCTGAC 128501408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGCCAACCCGCAAACATTTTCGACATTTCAGCCAAGATCAACAGATCTGCCTATCTGAC 1140

128501409 CCACAGCTGATCACTGACACATGAGTGAGCCCAGCTAAAACTAGATTCATCCAGCTGATT 128501468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCACAGCTGATCACTGACACATGAGTGAGCCCAGCTAAAACTAGATTCATCCAGCTGATT 1200

128501469 CACAGACTCATGAACGATAATAAATAAATACTCTTTAAGCCTCTAATTTTGGGGGTGGTT 128501528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACAGACTCATGAACGATAATAAATAAATACTCTTTAAGCCTCTAATTTTGGGGGTGGTT 1260

128501529 TGTTAGATAAGCAATAGTTAACTGCTACAGTGTCATATGTACTAACAACATCCCTGTGTA 128501588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTTAGATAAGCAATAGTTAACTGCTACAGTGTCATATGTACTAACAACATCCCTGTGTA 1320

128501589 GCTATTAGTATTCGCCTCATTTTATAGCTAACTGAGCTTAGTAGTTAAGTGATTTGCCTA 128501648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTATTAGTATTCGCCTCATTTTATAGCTAACTGAGCTTAGTAGTTAAGTGATTTGCCTA 1380

128501649 AAGTCACACAACTAGTTAATACAGGGACAGCCAGGATTCTAAACCAGCCTGTCTATAGAC 128501708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGTCACACAACTAGTTAATACAGGGACAGCCAGGATTCTAAACCAGCCTGTCTATAGAC 1440

128501709 CCTGTGATCATAACCATTACTCTATATGACCATAGCACTACTCTAACTAATGAGGAAGAG 128501768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCTGTGATCATAACCATTACTCTATATGACCATAGCACTACTCTAACTAATGAGGAAGAG 1500

128501769 GCAGGCCCCATTTGTACCCAGTGGCTAAATGCTAGATGTTTAACAATCAGCTCTCTGGCA 128501828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCAGGCCCCATTTGTACCCAGTGGCTAAATGCTAGATGTTTAACAATCAGCTCTCTGGCA 1560

128501829 AGAGGACGCCCTGATTTGTAGTACTTGCTGATTTCCATGATGTAAATACTCCCACCATGG 128501888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGAGGACGCCCTGATTTGTAGTACTTGCTGATTTCCATGATGTAAATACTCCCACCATGG 1620

128501889 CCAATCTCAAATCTACAACTTGACATCACTGAACACACAGTTGAGAAGATATATGCAATA 128501948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCAATCTCAAATCTACAACTTGACATCACTGAACACACAGTTGAGAAGATATATGCAATA 1680

128501949 ACACACCATTATAGTACTTCCACCATACAAATATAAGTAAACAATCTCGAGAGCATAGAT 128502008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACACACCATTATAGTACTTCCACCATACAAATATAAGTAAACAATCTCGAGAGCATAGAT 1740

128502009 AATAGTAAAATGTAGTAAAAGAACATTTTACTGTTTTGAGTTATAAGTTTTGAGTATGTG 128502068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATAGTAAAATGTAGTAAAAGAACATTTTACTGTTTTGAGTTATAAGTTTTGAGTATGTG 1800

128502069 TTGCCTTTGTTTCAATGTAATTTAACTGTACATTTATATATTAATTTATTTTTAATGGCT 128502128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGCCTTTGTTTCAATGTAATTTAACTGTACATTTATATATTAATTTATTTTTAATGGCT 1860

128502129 GTGTTTAAAAACCGGATTGCAAAATTTTCTTAAAATTTAACATTTGGCTCTTGTGAGCCA 128502188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGTTTAAAAACCGGATTGCAAAATTTTCTTAAAATTTAACATTTGGCTCTTGTGAGCCA 1920

128502189 GTATGAGCCATTTCTAGCACACCCTTTGCTAAGGGTCATAGTCTAATCATCCAGCCATTT 128502248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTATGAGCCATTTCTAGCACACCCTTTGCTAAGGGTCATAGTCTAATCATCCAGCCATTT 1980

128502249 GACCTGCTCGGCAAATTTGTTGCTTCCTCCTATAAACCTACACCTATTTGCCCACCCCTC 128502308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GACCTGCTCGGCAAATTTGTTGCTTCCTCCTATAAACCTACACCTATTTGCCCACCCCTC 2040

128502309 CAGCCCTCCAAATGTGTATGAATTAGCTGAATATTTATAGCTTGGCCTGTACCCTGGGAC 128502368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGCCCTCCAAATGTGTATGAATTAGCTGAATATTTATAGCTTGGCCTGTACCCTGGGAC 2100

128502369 CTCGGTCCATATGTCAGCATTTCTTTAACCTCTTCTATTTGTCTTTTCAGTCTATACCAC 128502428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTCGGTCCATATGTCAGCATTTCTTTAACCTCTTCTATTTGTCTTTTCAGTCTATACCAC 2160

128502429 ACTTTTGGTTAACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATATTTCTTTAT 128502488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTTTTGGTTAACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATATTTCTTTAT 2220

128502489 TTATTCTACAGTGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACCTACACTTT 128502548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTATTCTACAGTGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACCTACACTTT 2280

128502549 CAAGGATGCGGCATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCCCCTCACCT 128502608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAAGGATGCGGCATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCCCCTCACCT 2340

128502609 TCCTGATAGCAAACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGAGAGCCTAA 128502668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCCTGATAGCAAACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGAGAGCCTAA 2400

128502669 TACTTTTGTCCTTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCAACAGTCCA 128502728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TACTTTTGTCCTTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCAACAGTCCA 2460

128502729 ACAGTCTTCCATGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGTGGTGATCT 128502788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACAGTCTTCCATGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGTGGTGATCT 2520

128502789 TCGGCCCTTCTGGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATGCAGTCGTT 128502848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCGGCCCTTCTGGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATGCAGTCGTT 2580

128502849 TGAAGAGGCTTCCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCCCAAGGCTT 128502908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGAAGAGGCTTCCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCCCAAGGCTT 2640

128502909 AACTGGGTTTAAAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 128502948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AACTGGGTTTAAAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 2680

EXCISED REGION

128502951 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATC 128503010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATC 2740

128503011 CATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGTCATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTC 128503070
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2741 CATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGTCATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAACAGTC 2800

128503071 CATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACATAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCA 128503130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 CATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACATAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCA 2860

128503131 ATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAGCAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCT 128503190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 ATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAGCAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCT 2920

128503191 CCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCTGCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCC 128503250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 CCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCTGCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCC 2980

128503251 TCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCACCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCT 128503310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 TCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCACCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCT 3040

128503311 CTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAGATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGC 128503370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 CTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAGATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGC 3100

128503371 ACTGCACAACGTCTCTATTATGTATATACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCA 128503430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 ACTGCACAACGTCTCTATTATGTATATACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCA 3160

128503431 GATTTAGCAAATAAAAATATGGGACACCCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGA 128503490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 GATTTAGCAAATAAAAATATGGGACACCCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGA 3220

128503491 ATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCATGTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTA 128503550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 ATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCATGTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTA 3280

128503551 TTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACTGGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTG 128503610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 TTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACTGGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTG 3340

128503611 ACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGGCAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCT 128503670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 ACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGGCAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCT 3400

128503671 TTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCTTAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAAC 128503730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 TTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCTTAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAAC 3460

128503731 TCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGTGGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATG 128503790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 TCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGTGGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATG 3520

128503791 TACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAAACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGG 128503850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 TACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAAACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGG 3580

128503851 TTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGATTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGT 128503910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 TTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGATTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGT 3640

128503911 CTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAACACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCC 128503970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 CTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAACACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCC 3700

128503971 ACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTAATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGG 128504030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 ACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTAATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGG 3760

128504031 CAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGCCTAGCCTCC 128504066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 CAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGCCTAGCCTCC 3796

Alignment time is 3.66662 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [128490437,128512439] =>     22003 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     3629] =>      3629 nucs 'mol-32-22bd-051436_3629'

Score:        3629
Aligned:      3629        nucs
Identic:      3629 (100%) nucs =>      1680 (100%)      1949 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [128501269,128502948] EXCISED REGION [128502951,128504899]
 second seq =>  [        1,     1680] EXCISED REGION [     1681,     3629]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [128502949,128502950]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        31 nucs [128502949,128502979] to [128502951,128502981]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

128501269 CTTTCAGAACCTTGTCAGGACCATGTGAAAAAGCCCAGGGTAGACCATCGGAGGAAGGCC 128501328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTCAGAACCTTGTCAGGACCATGTGAAAAAGCCCAGGGTAGACCATCGGAGGAAGGCC 60

128501329 CTCCTAGACCATCCTACAGCCAGCCAACCCGCAAACATTTTCGACATTTCAGCCAAGATC 128501388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCCTAGACCATCCTACAGCCAGCCAACCCGCAAACATTTTCGACATTTCAGCCAAGATC 120

128501389 AACAGATCTGCCTATCTGACCCACAGCTGATCACTGACACATGAGTGAGCCCAGCTAAAA 128501448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACAGATCTGCCTATCTGACCCACAGCTGATCACTGACACATGAGTGAGCCCAGCTAAAA 180

128501449 CTAGATTCATCCAGCTGATTCACAGACTCATGAACGATAATAAATAAATACTCTTTAAGC 128501508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAGATTCATCCAGCTGATTCACAGACTCATGAACGATAATAAATAAATACTCTTTAAGC 240

128501509 CTCTAATTTTGGGGGTGGTTTGTTAGATAAGCAATAGTTAACTGCTACAGTGTCATATGT 128501568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCTAATTTTGGGGGTGGTTTGTTAGATAAGCAATAGTTAACTGCTACAGTGTCATATGT 300

128501569 ACTAACAACATCCCTGTGTAGCTATTAGTATTCGCCTCATTTTATAGCTAACTGAGCTTA 128501628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTAACAACATCCCTGTGTAGCTATTAGTATTCGCCTCATTTTATAGCTAACTGAGCTTA 360

128501629 GTAGTTAAGTGATTTGCCTAAAGTCACACAACTAGTTAATACAGGGACAGCCAGGATTCT 128501688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTAGTTAAGTGATTTGCCTAAAGTCACACAACTAGTTAATACAGGGACAGCCAGGATTCT 420

128501689 AAACCAGCCTGTCTATAGACCCTGTGATCATAACCATTACTCTATATGACCATAGCACTA 128501748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAACCAGCCTGTCTATAGACCCTGTGATCATAACCATTACTCTATATGACCATAGCACTA 480

128501749 CTCTAACTAATGAGGAAGAGGCAGGCCCCATTTGTACCCAGTGGCTAAATGCTAGATGTT 128501808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTAACTAATGAGGAAGAGGCAGGCCCCATTTGTACCCAGTGGCTAAATGCTAGATGTT 540

128501809 TAACAATCAGCTCTCTGGCAAGAGGACGCCCTGATTTGTAGTACTTGCTGATTTCCATGA 128501868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAACAATCAGCTCTCTGGCAAGAGGACGCCCTGATTTGTAGTACTTGCTGATTTCCATGA 600

128501869 TGTAAATACTCCCACCATGGCCAATCTCAAATCTACAACTTGACATCACTGAACACACAG 128501928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTAAATACTCCCACCATGGCCAATCTCAAATCTACAACTTGACATCACTGAACACACAG 660

128501929 TTGAGAAGATATATGCAATAACACACCATTATAGTACTTCCACCATACAAATATAAGTAA 128501988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGAGAAGATATATGCAATAACACACCATTATAGTACTTCCACCATACAAATATAAGTAA 720

128501989 ACAATCTCGAGAGCATAGATAATAGTAAAATGTAGTAAAAGAACATTTTACTGTTTTGAG 128502048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACAATCTCGAGAGCATAGATAATAGTAAAATGTAGTAAAAGAACATTTTACTGTTTTGAG 780

128502049 TTATAAGTTTTGAGTATGTGTTGCCTTTGTTTCAATGTAATTTAACTGTACATTTATATA 128502108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTATAAGTTTTGAGTATGTGTTGCCTTTGTTTCAATGTAATTTAACTGTACATTTATATA 840

128502109 TTAATTTATTTTTAATGGCTGTGTTTAAAAACCGGATTGCAAAATTTTCTTAAAATTTAA 128502168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAATTTATTTTTAATGGCTGTGTTTAAAAACCGGATTGCAAAATTTTCTTAAAATTTAA 900

128502169 CATTTGGCTCTTGTGAGCCAGTATGAGCCATTTCTAGCACACCCTTTGCTAAGGGTCATA 128502228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATTTGGCTCTTGTGAGCCAGTATGAGCCATTTCTAGCACACCCTTTGCTAAGGGTCATA 960

128502229 GTCTAATCATCCAGCCATTTGACCTGCTCGGCAAATTTGTTGCTTCCTCCTATAAACCTA 128502288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCTAATCATCCAGCCATTTGACCTGCTCGGCAAATTTGTTGCTTCCTCCTATAAACCTA 1020

128502289 CACCTATTTGCCCACCCCTCCAGCCCTCCAAATGTGTATGAATTAGCTGAATATTTATAG 128502348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACCTATTTGCCCACCCCTCCAGCCCTCCAAATGTGTATGAATTAGCTGAATATTTATAG 1080

128502349 CTTGGCCTGTACCCTGGGACCTCGGTCCATATGTCAGCATTTCTTTAACCTCTTCTATTT 128502408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTGGCCTGTACCCTGGGACCTCGGTCCATATGTCAGCATTTCTTTAACCTCTTCTATTT 1140

128502409 GTCTTTTCAGTCTATACCACACTTTTGGTTAACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGG 128502468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCTTTTCAGTCTATACCACACTTTTGGTTAACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGG 1200

128502469 TGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAGTGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAA 128502528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAGTGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAA 1260

128502529 AGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGGCATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTT 128502588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGGCATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTT 1320

128502589 CACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCAAACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTC 128502648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCAAACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTC 1380

128502649 GTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCCTTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACAC 128502708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCCTTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACAC 1440

128502709 CCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCATGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGC 128502768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCATGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGC 1500

128502769 AAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCTGGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGG 128502828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCTGGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGG 1560

128502829 ATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTTCCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTC 128502888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTTCCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTC 1620

128502889 TGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTAAAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 128502948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTAAAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 1680

EXCISED REGION

128502951 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATC 128503010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATC 1740

128503011 CATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGTCATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTC 128503070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGTCATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTC 1800

128503071 CATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACATAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCA 128503130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACATAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCA 1860

128503131 ATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAGCAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCT 128503190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAGCAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCT 1920

128503191 CCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCTGCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCC 128503250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCTGCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCC 1980

128503251 TCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCACCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCT 128503310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCACCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCT 2040

128503311 CTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAGATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGC 128503370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAGATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGC 2100

128503371 ACTGCACAACGTCTCTATTATGTATATACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCA 128503430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACTGCACAACGTCTCTATTATGTATATACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCA 2160

128503431 GATTTAGCAAATAAAAATATGGGACACCCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGA 128503490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GATTTAGCAAATAAAAATATGGGACACCCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGA 2220

128503491 ATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCATGTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTA 128503550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCATGTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTA 2280

128503551 TTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACTGGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTG 128503610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACTGGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTG 2340

128503611 ACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGGCAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCT 128503670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGGCAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCT 2400

128503671 TTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCTTAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAAC 128503730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCTTAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAAC 2460

128503731 TCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGTGGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATG 128503790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGTGGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATG 2520

128503791 TACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAAACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGG 128503850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAAACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGG 2580

128503851 TTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGATTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGT 128503910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGATTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGT 2640

128503911 CTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAACACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCC 128503970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAACACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCC 2700

128503971 ACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTAATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGG 128504030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTAATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGG 2760

128504031 CAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGCCTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCT 128504090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGCCTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCT 2820

128504091 GGATGCTTCCTGCCCTCGAACATCGGACTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGG 128504150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGATGCTTCCTGCCCTCGAACATCGGACTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGG 2880

128504151 TTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCAGCCTACTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTA 128504210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCAGCCTACTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTA 2940

128504211 ATACTTAGCAAACTCATATATATATATTCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGAC 128504270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATACTTAGCAAACTCATATATATATATTCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGAC 3000

128504271 TAATACAAATAGGTATTATTATCTTCATTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGG 128504330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TAATACAAATAGGTATTATTATCTTCATTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGG 3060

128504331 AATGACTTACCCAAGACCATGTCATATGATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTC 128504390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AATGACTTACCCAAGACCATGTCATATGATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTC 3120

128504391 TCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTAAACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACA 128504450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTAAACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACA 3180

128504451 GATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAAAACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATAC 128504510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAAAACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATAC 3240

128504511 TTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGACTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCT 128504570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGACTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCT 3300

128504571 TGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGAATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGAC 128504630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGAATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGAC 3360

128504631 TGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAAAGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAA 128504690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAAAGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAA 3420

128504691 ACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATTATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGC 128504750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATTATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGC 3480

128504751 GTATGTATAGCAGTTGACAATATCAGCCACATTATTAGTTTGGTTTCCTCTGCTTGGCTA 128504810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTATGTATAGCAGTTGACAATATCAGCCACATTATTAGTTTGGTTTCCTCTGCTTGGCTA 3540

128504811 GCTTTTCAGTTGGGGTAAGTCTGCATTTCCTGTCTCAGCACTTATGAAGAAGTGGCAGTA 128504870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GCTTTTCAGTTGGGGTAAGTCTGCATTTCCTGTCTCAGCACTTATGAAGAAGTGGCAGTA 3600

128504871 ACAGTAAAACTTATATTAACTTGTGCCCA 128504899
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACAGTAAAACTTATATTAACTTGTGCCCA 3629

Alignment time is 3.45766 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [128490437,128512439] =>     22003 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     5274] =>      5274 nucs 'mol-32-2378-047966_5274'

Score:        5274
Aligned:      5274        nucs
Identic:      5274 (100%) nucs =>      2820 (100%)      2454 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [128500129,128502948] EXCISED REGION [128502951,128505404]
 second seq =>  [        1,     2820] EXCISED REGION [     2821,     5274]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [128502949,128502950]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        31 nucs [128502949,128502979] to [128502951,128502981]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

128500129 TCTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAGCC 128500188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAGCC 60

128500189 TAGATGACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATG 128500248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGATGACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATG 120

128500249 AATAAATAAAAAAGAAAGAAAGAAAGATAGGGGAATATATTTTGGAGAACAATTAGCAAT 128500308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATAAATAAAAAAGAAAGAAAGAAAGATAGGGGAATATATTTTGGAGAACAATTAGCAAT 180

128500309 CTCTACCACAGATAAGTATAAGGCTTCCACATATGATTGTACATTTTGTGGATTTAAGAA 128500368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCTACCACAGATAAGTATAAGGCTTCCACATATGATTGTACATTTTGTGGATTTAAGAA 240

128500369 GGCTGAGAGAAAGAAGGGAGATGAAATCTAGTTTGTGTCCACTATCCACACCAGTGCACC 128500428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCTGAGAGAAAGAAGGGAGATGAAATCTAGTTTGTGTCCACTATCCACACCAGTGCACC 300

128500429 CTAGCTTAAGGTTTAGTCAGCCCAGAAGAAGGGCTATACTAGTCTGCTTTGCATTGTTAT 128500488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTAGCTTAAGGTTTAGTCAGCCCAGAAGAAGGGCTATACTAGTCTGCTTTGCATTGTTAT 360

128500489 AAAGTAATACCTGACACTGGGTAAATTATAAGGAAAAGAGGTTTATTTGGTTCCCAGTTC 128500548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGTAATACCTGACACTGGGTAAATTATAAGGAAAAGAGGTTTATTTGGTTCCCAGTTC 420

128500549 TGCATGGTGTCAGCATCTGTTGAGCTTCTGATGAGGCCTCAGGAAACTTTTACTTATGGT 128500608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCATGGTGTCAGCATCTGTTGAGCTTCTGATGAGGCCTCAGGAAACTTTTACTTATGGT 480

128500609 AAAAGGCAACGGGGGAGCACTCATGTCACACGGAGAGAGAGAGAGCAAGAGAGAGAGAAA 128500668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAGGCAACGGGGGAGCACTCATGTCACACGGAGAGAGAGAGAGCAAGAGAGAGAGAAA 540

128500669 GAAAAGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACTATTAATAGCTGTCACATGAACATAG 128500728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAAAGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACTATTAATAGCTGTCACATGAACATAG 600

128500729 AATGTGAACTCCTTCATCATCAAAGGGAAGGCACAAAGGGACCTTTGCCTCCATGAAGGA 128500788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATGTGAACTCCTTCATCATCAAAGGGAAGGCACAAAGGGACCTTTGCCTCCATGAAGGA 660

128500789 TCTGCCTCCATGACCCAAACACCTCTCAGTATGCCCCATCTCCAACATTGGGGATCACAT 128500848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTGCCTCCATGACCCAAACACCTCTCAGTATGCCCCATCTCCAACATTGGGGATCACAT 720

128500849 TTCAACATGAGATTTGTTGGCAATAAATATCCAAGCTATATCAGGTGCCTTTTTGTATTG 128500908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCAACATGAGATTTGTTGGCAATAAATATCCAAGCTATATCAGGTGCCTTTTTGTATTG 780

128500909 AGTTGGGCCATACAAAATTGTCATTTTCATAGATCAAATATGATAAAAAGTCAGCAATTT 128500968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTTGGGCCATACAAAATTGTCATTTTCATAGATCAAATATGATAAAAAGTCAGCAATTT 840

128500969 AATATGGTTGGACCAGTAATTCATCAGCCCAGAAAGGACACCTTTTTGTAATTCTCACAA 128501028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATATGGTTGGACCAGTAATTCATCAGCCCAGAAAGGACACCTTTTTGTAATTCTCACAA 900

128501029 ACGTACCTGTGATAGAGCAATTGTACAAATGTCTCCAATTGTCCATCTTCATCTTCCCTG 128501088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACGTACCTGTGATAGAGCAATTGTACAAATGTCTCCAATTGTCCATCTTCATCTTCCCTG 960

128501089 TAGCTATGTCTTTTGTAATGTGGCTTGCAGCCTTTCCCATCAAGAGGTAGAGTCAATTTC 128501148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGCTATGTCTTTTGTAATGTGGCTTGCAGCCTTTCCCATCAAGAGGTAGAGTCAATTTC 1020

128501149 CTCAACCCTTGAATCTGAGCTGGCCATGTGGCTTGTTTGACCAGTGGAGTAAGATGGAAG 128501208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCAACCCTTGAATCTGAGCTGGCCATGTGGCTTGTTTGACCAGTGGAGTAAGATGGAAG 1080

128501209 TAAAGATGTGCCAGTACTGAATCCAGGCCTCAAGAGGCCTCACATGCTTCTTCTCTCACT 128501268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAAGATGTGCCAGTACTGAATCCAGGCCTCAAGAGGCCTCACATGCTTCTTCTCTCACT 1140

128501269 CTTTCAGAACCTTGTCAGGACCATGTGAAAAAGCCCAGGGTAGACCATCGGAGGAAGGCC 128501328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTCAGAACCTTGTCAGGACCATGTGAAAAAGCCCAGGGTAGACCATCGGAGGAAGGCC 1200

128501329 CTCCTAGACCATCCTACAGCCAGCCAACCCGCAAACATTTTCGACATTTCAGCCAAGATC 128501388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCCTAGACCATCCTACAGCCAGCCAACCCGCAAACATTTTCGACATTTCAGCCAAGATC 1260

128501389 AACAGATCTGCCTATCTGACCCACAGCTGATCACTGACACATGAGTGAGCCCAGCTAAAA 128501448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACAGATCTGCCTATCTGACCCACAGCTGATCACTGACACATGAGTGAGCCCAGCTAAAA 1320

128501449 CTAGATTCATCCAGCTGATTCACAGACTCATGAACGATAATAAATAAATACTCTTTAAGC 128501508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTAGATTCATCCAGCTGATTCACAGACTCATGAACGATAATAAATAAATACTCTTTAAGC 1380

128501509 CTCTAATTTTGGGGGTGGTTTGTTAGATAAGCAATAGTTAACTGCTACAGTGTCATATGT 128501568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCTAATTTTGGGGGTGGTTTGTTAGATAAGCAATAGTTAACTGCTACAGTGTCATATGT 1440

128501569 ACTAACAACATCCCTGTGTAGCTATTAGTATTCGCCTCATTTTATAGCTAACTGAGCTTA 128501628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTAACAACATCCCTGTGTAGCTATTAGTATTCGCCTCATTTTATAGCTAACTGAGCTTA 1500

128501629 GTAGTTAAGTGATTTGCCTAAAGTCACACAACTAGTTAATACAGGGACAGCCAGGATTCT 128501688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTAGTTAAGTGATTTGCCTAAAGTCACACAACTAGTTAATACAGGGACAGCCAGGATTCT 1560

128501689 AAACCAGCCTGTCTATAGACCCTGTGATCATAACCATTACTCTATATGACCATAGCACTA 128501748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAACCAGCCTGTCTATAGACCCTGTGATCATAACCATTACTCTATATGACCATAGCACTA 1620

128501749 CTCTAACTAATGAGGAAGAGGCAGGCCCCATTTGTACCCAGTGGCTAAATGCTAGATGTT 128501808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTCTAACTAATGAGGAAGAGGCAGGCCCCATTTGTACCCAGTGGCTAAATGCTAGATGTT 1680

128501809 TAACAATCAGCTCTCTGGCAAGAGGACGCCCTGATTTGTAGTACTTGCTGATTTCCATGA 128501868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAACAATCAGCTCTCTGGCAAGAGGACGCCCTGATTTGTAGTACTTGCTGATTTCCATGA 1740

128501869 TGTAAATACTCCCACCATGGCCAATCTCAAATCTACAACTTGACATCACTGAACACACAG 128501928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTAAATACTCCCACCATGGCCAATCTCAAATCTACAACTTGACATCACTGAACACACAG 1800

128501929 TTGAGAAGATATATGCAATAACACACCATTATAGTACTTCCACCATACAAATATAAGTAA 128501988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGAGAAGATATATGCAATAACACACCATTATAGTACTTCCACCATACAAATATAAGTAA 1860

128501989 ACAATCTCGAGAGCATAGATAATAGTAAAATGTAGTAAAAGAACATTTTACTGTTTTGAG 128502048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACAATCTCGAGAGCATAGATAATAGTAAAATGTAGTAAAAGAACATTTTACTGTTTTGAG 1920

128502049 TTATAAGTTTTGAGTATGTGTTGCCTTTGTTTCAATGTAATTTAACTGTACATTTATATA 128502108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTATAAGTTTTGAGTATGTGTTGCCTTTGTTTCAATGTAATTTAACTGTACATTTATATA 1980

128502109 TTAATTTATTTTTAATGGCTGTGTTTAAAAACCGGATTGCAAAATTTTCTTAAAATTTAA 128502168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTAATTTATTTTTAATGGCTGTGTTTAAAAACCGGATTGCAAAATTTTCTTAAAATTTAA 2040

128502169 CATTTGGCTCTTGTGAGCCAGTATGAGCCATTTCTAGCACACCCTTTGCTAAGGGTCATA 128502228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATTTGGCTCTTGTGAGCCAGTATGAGCCATTTCTAGCACACCCTTTGCTAAGGGTCATA 2100

128502229 GTCTAATCATCCAGCCATTTGACCTGCTCGGCAAATTTGTTGCTTCCTCCTATAAACCTA 128502288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTCTAATCATCCAGCCATTTGACCTGCTCGGCAAATTTGTTGCTTCCTCCTATAAACCTA 2160

128502289 CACCTATTTGCCCACCCCTCCAGCCCTCCAAATGTGTATGAATTAGCTGAATATTTATAG 128502348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACCTATTTGCCCACCCCTCCAGCCCTCCAAATGTGTATGAATTAGCTGAATATTTATAG 2220

128502349 CTTGGCCTGTACCCTGGGACCTCGGTCCATATGTCAGCATTTCTTTAACCTCTTCTATTT 128502408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTGGCCTGTACCCTGGGACCTCGGTCCATATGTCAGCATTTCTTTAACCTCTTCTATTT 2280

128502409 GTCTTTTCAGTCTATACCACACTTTTGGTTAACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGG 128502468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTCTTTTCAGTCTATACCACACTTTTGGTTAACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGG 2340

128502469 TGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAGTGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAA 128502528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAGTGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAA 2400

128502529 AGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGGCATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTT 128502588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGGCATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTT 2460

128502589 CACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCAAACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTC 128502648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCAAACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTC 2520

128502649 GTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCCTTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACAC 128502708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCCTTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACAC 2580

128502709 CCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCATGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGC 128502768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCATGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGC 2640

128502769 AAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCTGGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGG 128502828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCTGGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGG 2700

128502829 ATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTTCCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTC 128502888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTTCCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTC 2760

128502889 TGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTAAAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 128502948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTAAAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 2820

EXCISED REGION

128502951 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATC 128503010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATC 2880

128503011 CATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGTCATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTC 128503070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGTCATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTC 2940

128503071 CATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACATAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCA 128503130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACATAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCA 3000

128503131 ATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAGCAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCT 128503190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAGCAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCT 3060

128503191 CCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCTGCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCC 128503250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCTGCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCC 3120

128503251 TCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCACCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCT 128503310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCACCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCT 3180

128503311 CTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAGATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGC 128503370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAGATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGC 3240

128503371 ACTGCACAACGTCTCTATTATGTATATACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCA 128503430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACTGCACAACGTCTCTATTATGTATATACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCA 3300

128503431 GATTTAGCAAATAAAAATATGGGACACCCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGA 128503490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GATTTAGCAAATAAAAATATGGGACACCCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGA 3360

128503491 ATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCATGTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTA 128503550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCATGTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTA 3420

128503551 TTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACTGGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTG 128503610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACTGGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTG 3480

128503611 ACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGGCAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCT 128503670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGGCAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCT 3540

128503671 TTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCTTAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAAC 128503730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCTTAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAAC 3600

128503731 TCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGTGGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATG 128503790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGTGGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATG 3660

128503791 TACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAAACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGG 128503850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAAACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGG 3720

128503851 TTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGATTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGT 128503910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGATTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGT 3780

128503911 CTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAACACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCC 128503970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAACACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCC 3840

128503971 ACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTAATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGG 128504030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTAATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGG 3900

128504031 CAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGCCTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCT 128504090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGCCTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCT 3960

128504091 GGATGCTTCCTGCCCTCGAACATCGGACTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGG 128504150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GGATGCTTCCTGCCCTCGAACATCGGACTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGG 4020

128504151 TTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCAGCCTACTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTA 128504210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCAGCCTACTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTA 4080

128504211 ATACTTAGCAAACTCATATATATATATTCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGAC 128504270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATACTTAGCAAACTCATATATATATATTCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGAC 4140

128504271 TAATACAAATAGGTATTATTATCTTCATTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGG 128504330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TAATACAAATAGGTATTATTATCTTCATTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGG 4200

128504331 AATGACTTACCCAAGACCATGTCATATGATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTC 128504390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AATGACTTACCCAAGACCATGTCATATGATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTC 4260

128504391 TCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTAAACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACA 128504450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTAAACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACA 4320

128504451 GATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAAAACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATAC 128504510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAAAACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATAC 4380

128504511 TTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGACTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCT 128504570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGACTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCT 4440

128504571 TGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGAATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGAC 128504630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGAATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGAC 4500

128504631 TGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAAAGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAA 128504690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAAAGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAA 4560

128504691 ACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATTATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGC 128504750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATTATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGC 4620

128504751 GTATGTATAGCAGTTGACAATATCAGCCACATTATTAGTTTGGTTTCCTCTGCTTGGCTA 128504810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GTATGTATAGCAGTTGACAATATCAGCCACATTATTAGTTTGGTTTCCTCTGCTTGGCTA 4680

128504811 GCTTTTCAGTTGGGGTAAGTCTGCATTTCCTGTCTCAGCACTTATGAAGAAGTGGCAGTA 128504870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GCTTTTCAGTTGGGGTAAGTCTGCATTTCCTGTCTCAGCACTTATGAAGAAGTGGCAGTA 4740

128504871 ACAGTAAAACTTATATTAACTTGTGCCCAAGTAATAAGCCCTCTGTTAATTGAAATTTTT 128504930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ACAGTAAAACTTATATTAACTTGTGCCCAAGTAATAAGCCCTCTGTTAATTGAAATTTTT 4800

128504931 CTGCACTTAGCTCTTATGGGAAAAAAAGAGGCAATTATGTAAAGATGATGGACTGACAAA 128504990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CTGCACTTAGCTCTTATGGGAAAAAAAGAGGCAATTATGTAAAGATGATGGACTGACAAA 4860

128504991 CATTTTTCCCCAGAAGCCTCTGGCACTGGTCTATTCAGTCCAATTTCCTGTACTACCTAT 128505050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CATTTTTCCCCAGAAGCCTCTGGCACTGGTCTATTCAGTCCAATTTCCTGTACTACCTAT 4920

128505051 TTCCATGTAGAGTTCTAGAGGTAATGAGAAATCATCTCTTTGACCCTTGAAAAGGGCCCA 128505110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTCCATGTAGAGTTCTAGAGGTAATGAGAAATCATCTCTTTGACCCTTGAAAAGGGCCCA 4980

128505111 GCTCTCTACTAGGTGCTATGAGGCCCAAAAGGGGTAGAAAGCAACTAATATTTATGACGT 128505170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GCTCTCTACTAGGTGCTATGAGGCCCAAAAGGGGTAGAAAGCAACTAATATTTATGACGT 5040

128505171 GACTACTATGAATATTTCTGGAAGAATACTCAAGAAGCTGGTGACTGTGGATTTCTCCTG 128505230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GACTACTATGAATATTTCTGGAAGAATACTCAAGAAGCTGGTGACTGTGGATTTCTCCTG 5100

128505231 GGAGGAAAGCTGAGTGACTAGGGCACAAGAGTGAAAAGGAGGCTAGCTCTGCACTGCATC 128505290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GGAGGAAAGCTGAGTGACTAGGGCACAAGAGTGAAAAGGAGGCTAGCTCTGCACTGCATC 5160

128505291 CCCTTGTGTACATTTTGAATTTTGTAACGCAAACTTGCATTACCTAATCAAAGAAATTAT 128505350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CCCTTGTGTACATTTTGAATTTTGTAACGCAAACTTGCATTACCTAATCAAAGAAATTAT 5220

128505351 TTTTCAATGCCCACCATGTTTTTTGCATGATCTAATTAATTCTCATAATGACCC 128505404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TTTTCAATGCCCACCATGTTTTTTGCATGATCTAATTAATTCTCATAATGACCC 5274

Alignment time is 5.01164 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [128490437,128512439] =>     22003 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     6066] =>      6066 nucs 'mol-32-29b3-016570_6066'

Score:        5980
Aligned:      6059        nucs
Identic:      6051 (100%) nucs =>       776 (100%)      5275 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [128499662,128500437] EXCISED REGION [128502440,128507720]
 second seq =>  [        1,      776] EXCISED REGION [      784,     6066]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2002 nucs [128500438,128502439]
 second seq =>         7 nucs [777,783]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [128500437,128500437] to [128502439,128502439]
 second seq =>         1 nucs [777,777] to [784,784]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [128500437,128500437] to [128502440,128502440]
 second seq =>         1 nucs [776,776] to [784,784]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

128499662 CTAAGCTATGAGGACACAAAGGCATAAGAATGATATGGTGGACTTTGGGGACTTGAGGGG 128499721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTAAGCTATGAGGACACAAAGGCATAAGAATGATATGGTGGACTTTGGGGACTTGAGGGG 60

128499722 AAGAGTGGAAGCGGGGTGAGGGATAAAAAGACTACAAACATGGCTCAGTGTATGGTGAGT 128499781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGAGTGGAAGCGGGGTGAGGGATAAAAAGACTACAAACATGGCTCAGTGTATGGTGAGT 120

128499782 GTATACTGCACCAAAATCTCACAAATCACCACTAAAGAACTCACTCATGTAACCAAATAA 128499841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTATACTGCACCAAAATCTCACAAATCACCACTAAAGAACTCACTCATGTAACCAAATAA 180

128499842 CACCTGTACCCCAATAACATATAGAAATATAAAATTAATTAATTAGATATAAATGAATAA 128499901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACCTGTACCCCAATAACATATAGAAATATAAAATTAATTAATTAGATATAAATGAATAA 240

128499902 AAGAAAAAAGAATTGGGGTTCTATTGCTGATCAAGAAACGGGAATATTGCTGGGTGCGGT 128499961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGAAAAAAGAATTGGGGTTCTATTGCTGATCAAGAAACGGGAATATTGCTGGGTGCGGT 300

128499962 GGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTCAAGGCCA 128500021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTCAAGGCCA 360

128500022 GGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCATCTCTACTTAAAAAAAAAAAA 128500081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCATCTCTACTTAAAAAAAAAAAA 420

128500082 ATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCTTGCTTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTG 128500141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCTTGCTTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTG 480

128500142 AGGCATGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAGCCTAGATGACACCAC 128500201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGCATGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAGCCTAGATGACACCAC 540

128500202 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATGAATAAATAAAAAA 128500261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATGAATAAATAAAAAA 600

128500262 GAAAGAAAGAAAGATAGGGGAATATATTTTGGAGAACAATTAGCAATCTCTACCACAGAT 128500321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAAGAAAGAAAGATAGGGGAATATATTTTGGAGAACAATTAGCAATCTCTACCACAGAT 660

128500322 AAGTATAAGGCTTCCACATATGATTGTACATTTTGTGGATTTAAGAAGGCTGAGAGAAAG 128500381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGTATAAGGCTTCCACATATGATTGTACATTTTGTGGATTTAAGAAGGCTGAGAGAAAG 720

128500382 AAGGGAGATGAAATCTAGTTTGTGTCCACTATCCACACCAGTGCACCCTAGCTTAA 128500437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGGGAGATGAAATCTAGTTTGTGTCCACTATCCACACCAGTGCACCCTAGCTTAA 776

EXCISED REGION

128502440 ACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAG 128502499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 ACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAG 843

128502500 TGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGG 128502559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 TGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGG 903

128502560 CATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCA 128502619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 CATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCA 963

128502620 AACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCC 128502679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 AACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCC 1023

128502680 TTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCA 128502739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 TTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCA 1083

128502740 TGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCT 128502799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 TGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCT 1143

128502800 GGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTT 128502859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 GGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTT 1203

128502860 CCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTA 128502919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTA 1263

128502920 AAAAT--TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 128502977
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 AAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 1323

128502978 GTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATCCATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGT 128503037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 GTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATCCATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGT 1383

128503038 CATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTCCATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACA 128503097
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 CATTGTGTGATATAGAATAAACATTTAAAAGTCCATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACA 1443

128503098 TAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCAATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAG 128503157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 TAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCAATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAG 1503

128503158 CAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCTCCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCT 128503217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 CAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCTCCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCT 1563

128503218 GCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCCTCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCA 128503277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 GCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCCTCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCA 1623

128503278 CCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCTCTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAG 128503337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 CCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCTCTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAG 1683

128503338 ATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGCACTGCACAACGTCTCTATTATGTATAT 128503397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 ATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGCACTGCACAACGTCTCTATTATGTATAT 1743

128503398 ACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCAGATTTAGCAAATAAAAATATGGGACAC 128503457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 ACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCAGATTTAGCAAATAAAAATATGGGACAC 1803

128503458 CCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGAATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCAT 128503517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 CCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGAATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCAT 1863

128503518 GTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTATTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACT 128503577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 GTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTATTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACT 1923

128503578 GGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTGACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGG 128503637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 GGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTGACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGG 1983

128503638 CAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCTTTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCT 128503697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 CAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCTTTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCT 2043

128503698 TAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAACTCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGT 128503757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 TAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAACTCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGT 2103

128503758 GGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATGTACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAA 128503817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 GGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATGTACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAA 2163

128503818 ACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGGTTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGA 128503877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 ACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGGTTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGA 2223

128503878 TTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAA 128503937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 TTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAA 2283

128503938 CACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCCACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTA 128503997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 CACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCCACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTA 2343

128503998 ATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGGCAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGC 128504057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 ATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGGCAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGC 2403

128504058 CTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTGCCCTCGAACATCGGA 128504117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2404 CTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTGCCCTCGAACATTGGA 2463

128504118 CTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGGTTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCA 128504177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 CTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGGTTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCA 2523

128504178 GCCTACTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTAATACTTAGCAAACTCATATATATATAT 128504237
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 GCCTATTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTAATACTTAGCAAACTCATATATATATAT 2583

128504238 TCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGACTAATACAAATAGGTATTATTATCTTCA 128504297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGACTAATACAAATAGGTATTATTATCTTCA 2643

128504298 TTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGGAATGACTTACCCAAGACCATGTCATAT 128504357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 TTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGGAATGACTTACCCAAGACCATGTCATAT 2703

128504358 GATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTCTCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTA 128504417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 GATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTCTCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTA 2763

128504418 AACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACAGATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAA 128504477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 AACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACAGATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAA 2823

128504478 AACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATACTTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGA 128504537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 AACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATACTTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGA 2883

128504538 CTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCTTGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGA 128504597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 CTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCTTGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGA 2943

128504598 ATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGACTGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAA 128504657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 ATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGACTGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAA 3003

128504658 AGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAAACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATT 128504717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 AGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAAACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATT 3063

128504718 ATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGCGTATGTATAGCAGTTGACAATATCAGC 128504777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 ATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGCGTATGTATAGCAGTTGACAATATCAGC 3123

128504778 CACATTATTAGTTTGGTTTCCTCTGCTTGGCTAGCTTTTCAGTTGGGGTAAGTCTGCATT 128504837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 CACATTATTAGTTTGGTTTCCTCTGCTTGGCTAGCTTTTCAGTTGGGGTAAGTCTGCATT 3183

128504838 TCCTGTCTCAGCACTTATGAAGAAGTGGCAGTAACAGTAAAACTTATATTAACTTGTGCC 128504897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 TCCTGTCTCAGCACTTATGAAGAAGTGGCAGTAACAGTAAAACTTATATTAACTTGTGCC 3243

128504898 CAAGTAATAAGCCCTCTGTTAATTGAAATTTTTCTGCACTTAGCTCTTATGGGAAAAAAA 128504957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 CAAGTAATAAGCCCTCTGTTAATTGAAATTTTTCTGCACTTAGCTCTTATGGGAAAAAAA 3303

128504958 GAGGCAATTATGTAAAGATGATGGACTGACAAACATTTTTCCCCAGAAGCCTCTGGCACT 128505017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 GAGGCAATTATGTAAAGATGATGGACTGACAAACATTTTTCCCCAGAAGCCTCTGGCACT 3363

128505018 GGTCTATTCAGTCCAATTTCCTGTACTACCTATTTCCATGTAGAGTTCTAGAGGTAATGA 128505077
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 GGTCTATTCAGTCCAATTTCCTGTACTATCTATTTCCATGTAGAGTTCTAGAGGTAATGA 3423

128505078 GAAATCATCTCTTTGACCCTTGAAAAGGGCCCAGCTCTCTACTAGGTGCTATGAGGCCCA 128505137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 GAAATCATCTCTTTGACCCTTGAAAAGGGCCCAGCTCTCTACTAGGTGCTATGAGGCCCA 3483

128505138 AAAGGGGTAGAAAGCAACTAATATTTATGACGTGACTACTATGAATATTTCTGGAAGAAT 128505197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 AAAGGGGTAGAAAGCAACTAATATTTATGACGTGACTACTATGAATATTTCTGGAAGAAT 3543

128505198 ACTCAAGAAGCTGGTGACTGTGGATTTCTCCTGGGAGGAAAGCTGAGTGACTAGGGCACA 128505257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 ACTCAAGAAGCTGGTGACTGTGGATTTCTCCTGGGAGGAAAGCTGAGTGACTAGGGCACA 3603

128505258 AGAGTGAAAAGGAGGCTAGCTCTGCACTGCATCCCCTTGTGTACATTTTGAATTTTGTAA 128505317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 AGAGTGAAAAGGAGGCTAGCTCTGCACTGCATCCCCTTGTGTACATTTTGAATTTTGTAA 3663

128505318 CGCAAACTTGCATTACCTAATCAAAGAAATTATTTTTCAATGCCCACCATGTTTTTTGCA 128505377
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 CACAAACTTGCATTACCTAATCAAAGAAATTATTTTTCAATGCCCACCATGTTTTTTGCA 3723

128505378 TGATCTAATTAATTCTCATAATGACCCTTTGAGGTAAGTATTGTTAACATTCTTATTTTA 128505437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 TGATCTAATTAATTCTCATAATGACCCTTTGAGGTAAGTATTGTTAACATTCTTATTTTA 3783

128505438 TAGAGGGAAAACTGAGGTTCTGAGAGTTTAAGTCACTCACCCCAGCTCATATTATTCTGA 128505497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 TAGAGGGAAAACTGAGGTTCTGAGAGTTTAAGTCACTCACCCCAGCTCATATTATTCTGA 3843

128505498 ACAAGTCCAATCAAGGTCATCAGAACCTCCCAGCTAATCTCTGGGAGGTCAGAGATTGAA 128505557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 ACAAGTCCAATCAAGGTCATCAGAACCTCCCAGCTAATCTCTGGGAGGTCAGAGATTGAA 3903

128505558 CCTGGCCAGAATCTGAACAGGGTCTACATCCCTCCAAAGCTATGCTAGCTATCCTGCTCC 128505617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3904 CCTGGCCAGAATCTGAACAGGGTCTACATCCCTCCAAAGCTATGCTAGCTATCCTGCTCC 3963

128505618 CCAAAGAAGATGAAAACTGAGTATTCAATTGCAAGAAGAATCTTGTTGTAGAACTAAGAC 128505677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3964 CCAAAGAAGATGAAAACTGAGTATTCAATTGCAAGAAGAATCTTGTTGTAGAACTAAGAC 4023

128505678 ATACAATTCTAAACAGTTAATTATATTTCATTAATTGTAAGAAATGCATTTTAAATTTTC 128505737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4024 ATACAATTCTAAACAGTTAATTATATTTCATTAATTGTAAGAAATGCATTTTAAATTTTC 4083

128505738 TGAAATTAAGATATGTCTTCTAAGGGATAGTGTGCTGTAGTATATTTGAAGGTGTTTTGT 128505797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4084 TGAAATTAAGATATGTCTTCTAAGGGATAGTGTGCTGTAGTATATTTGAAGGTGTTTTGT 4143

128505798 TTTTCTCAGTGATTCATAAGATAATGGTACGTGTTCCAACCAATGGCTTCTTGAGGTCAG 128505857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4144 TTTTCTCAGTGATTCATAAGATAATGGTACGTGTTCCAACCAATGGCTTCTTGAGGTCAG 4203

128505858 TGAAATATGGTGCCAATATAGTGCAGAAAATCAAAAAGTCTAAACCAGCAGCACAAGCAG 128505917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4204 TGAAATATGGTGCCAATATAGTGCAGAAAATCAAAAAGTCTAAACCAGCAGCACAAGCAG 4263

128505918 TAAGTGATGTAGGAGCTCTGAAGAAGTAACATCCTCTTCTGTAAGAGTTGCTAGGGTAGG 128505977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4264 TAAGTGATGTAGGAGCTCTGAAGAAGTAACATCCTCTTCTGTAAGAGTTGCTAGGGTAGG 4323

128505978 CTTTATGTTGATTTGAGCTAAGCCTCAACGATTGGGCAGTGTATCTGTTATCTATTGCCA 128506037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4324 CTTTATGTTGATTTGAGCTAAGCCTCAACGATTGGGCAGTGTATCTGTTATCTATTGCCA 4383

128506038 CAAAGTACTGTACAATAAACAACCCCAAAACTCAGTGTCTTAAAACAGCAACCATGTATT 128506097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4384 CAAAGTACTGTACAATAAACAACCCCAAAACTCAGTGTCTTAAAACAGCAACCATGTATT 4443

128506098 TACTATTGCTCTTGAGTTTAGAGATTAGCTGGGAGGTTCTGATGATCTTTATTAGACTTA 128506157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4444 TACTATTGCTCTTGAGTTTAGAGATTAGCTGGGAGGTTCTGATGATCTTTATTAGACTTA 4503

128506158 CTCACTTGTCTATGGTCAGATGAAGGTCAGCTGACTGGTCTTGGCCAGGCTCACTCATGT 128506217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4504 CTCACTTGTCTATGGTCAGATGAAGGTCAGCTGACTGGTCTTGGCCAGGCTCACTCATGT 4563

128506218 CTGCATATCAGCTGACTGTTGGCTGATCTAGAATGCCCTCATTGAGGAAGGGATGGTGTG 128506277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4564 CTGCATATCAGCTGACTGTTGGCTGATCTAGAATGCCCTCATTGAGGAAGGGATGGTGTG 4623

128506278 GCTCTGTTCCATTTGTTTCTCCCATACCCCCAGCAGGCTAGCCTAAGCATGTTCTCATGG 128506337
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4624 GCTCTGTTCCATGTGTTTCTCCCATACCCCCAGCAGGCTAGCCTAAGCATGTTCTCATGG 4683

128506338 ATATAGCAAGAGAGCAAGAGCAGAGATACAAGAGTGAGCAGGAGGAAAGCTGCAAGCATT 128506397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4684 ATATAGCAAGAGAGCAAGAGCAGAGATACAAGAGTGAGCAGGAGGAAAGCTGCAAGCATT 4743

128506398 TTTCTAGCCTTTGTTTGCAACATGTTTGCTAACATCTTGCTGACCAAAGCATGGCATGGC 128506457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4744 TTTCTAGCCTTTGTTTGCAACATGTTTGCTAACATCTTGCTGACCAAAGCATGGCATGGC 4803

128506458 TTAGCCCAAAGATGAGGCAGAACACAGCACCTTTAATGAGAGAAGTGAAGCAATCAGTCT 128506517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4804 TTAGCCCAAAGATGAGGCAGAACACAGCACCTTTAATGAGAGAAGTGAAGCAATCAGTCT 4863

128506518 GTCACAGGTAAGCTTCAGATCTGCAGGTTGAAGAAAGGAGGGCTTTCGTTGCTGGCTAGG 128506577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4864 GTCACAGGTAAGCTTCAGATCTGCAGGTTGAAGAAAGGAGGGCTTTCGTTGCTGGCTAGG 4923

128506578 AGAGATCTTGCAGGGAGAGAGGAGTCATCCAAATGGACTCTGTGTGTCTTTGAGAGAGTT 128506637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4924 AGAGATCTTGCAGGGAGAGAGGAGTCATCCAAATGGACTCTGTGTGTCTTTGAGAGAGTT 4983

128506638 GTTACATTAGCAAAGATAGTACCATTCAAGGTGATAACTGAGATTTTGTAGCAACTATGT 128506697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4984 GTTACATTAGCAAAGATAGTACCATTCAAGGTGATAACTGAGATTTTGTAGCAACTATGT 5043

128506698 TAGCAATGACAATAGGGAATAGTTGTTTGAAACCAGGATAGAGCAATCATCTCGTAAATC 128506757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5044 TAGCAATGACAATAGGGAATAGTTGTTTGAAACCAGGATAGAGCAATCATCTCGTAAATC 5103

128506758 TGACCTCTCCTGCCTCTACCCCTAGAAGTTCCTGAAGCTCAACCATTGAACCCTAAGTTT 128506817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5104 TGACCTCTCCTGCCTCTACCCCTAGAAGTTCCTGAAGCTCAACCATTGAACCCTAAGTTT 5163

128506818 CTGCAAATTATAGTTTGAAATACACTGCATGGGCATTCATAGCCCCAGCAGCAGGCCTAG 128506877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5164 CTGCAAATTATAGTTTGAAATACACTGCATGGGCATTCATAGCCCCAGCAGCAGGCCTAG 5223

128506878 CCTGTCTTTTTTCAGCTTCCTAGAGCAAGCATAATGATGAATTCATTATTTTCTACTTTC 128506937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5224 CCTGTCTTTTTTCAGCTTCCTAGAGCAAGCATAATGATGAATTCATTATTTTCTACTTTC 5283

128506938 CTCATTTTTTCTTTATATTGGATGCGATCTTTCCCTGTTCTAATTGCCCTCACCAGAAAG 128506997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5284 CTCATTTTTTCTTTATATTGGATGCGATCTTTCCCTGTTCTAATTGCCCTCACCAGAAAG 5343

128506998 CATCCTGAATGTCCTTAAGATCCTTCTTCTTATCTACTAATTCAGAATCATTTGTTTTAC 128507057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5344 CATCCTGAATGTCCTTAAGATCCTTCTTCTTATCTACTAATTCAGAATCATTTGTTTTAC 5403

128507058 CATCAGAATTTAATTTTGGGGAATCCCCCAGTCCTCTTCAACGACCCAAGTGTTGCATCC 128507117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5404 CATCAGAATTTAATTTTGGGGAATCCCCCAGTCCTCTTCAACGACCCAAGTGTTGCATCC 5463

128507118 CAAAGCTGTGGCTTTCCCTTAGTCTCCTTTCTACTTTATGTGTATGAAAGAGGAACTTGA 128507177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5464 CAAAGCTGTGGCTTTCCCTTAGTCTCCTTTCTACTTTATGTGTATGAAAGAGGAACTTGA 5523

128507178 TAATTTTTTCCTGTCATTTTTTCTGCTCTCTGGGAAATGACATTATCAACGAGGTAAGAA 128507237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5524 TAATTTTTTCCTGTCATTTTTTCTGCTCTCTGGGAAATGACATTATCAACGAGGTAAGAA 5583

128507238 AAGCAAAGGAAATAACATATTACACACATTGCTTTTATCTGAATAAGCTTCAGGAATTGA 128507297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5584 AAGCAAAGGAAATAACATATTACACACATTGCTTTTATCTGAATAAGCTTCAGGAATTGA 5643

128507298 ACAAGCCCAGTAAAAGCTAGAGATAGACAAGGCTTTCTGGGGAAAGTAAAGTCTGAGCTG 128507357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5644 ACAAGCCCAGTAAAAGCTAGAGATAGACAAGGCTTTCTGGGGAAAGTAAAGTCTGAGCTG 5703

128507358 GACTCTCAAAACAGTGTGGGTTTAGAATGACAAGAATAAATGTGTAAGATTAGTTTATGA 128507417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5704 GACTCTCAAAACAGTGTGGGTTTAGAATGACAAGAATAAATGTGTAAGATTAGTTTATGA 5763

128507418 CAACCTATTCCAAGCTGAAAAGTCTCTGCAAGCCCTGACAAACAAACTATGACATTCTTT 128507477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5764 CAACCTATTCCAAGCTGAAAAGTCTCTGCAAGCCCTGACAAACAAACTATGACATTCTTT 5823

128507478 CAGTAGCTCTGTGAATTACCACCACTAAACCAACCTAGTGATGTTTCTTTGGGAATCATC 128507537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5824 CAGTAGCTCTGTGAATTACCACCACTAAACCAACCTAGTGATGTTTCTTTGGGAATCATC 5883

128507538 ATATATAAAACTGGCATTTGACATAGTGACTACAGCTTGGAGTGTGGGCGCTCTGGCCCT 128507597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5884 ATATATAAAACTGGCATTTGACATAGTGACTACAGCTTGGAGTGTGGGCGCTCTGGCCCT 5943

128507598 AGGAAGTCACCCTCTAGCTCAGCCTTCAAGGTATCTTCCTTATTGATCATGGCAACATTC 128507657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5944 AGGAAGTCACCCTCTAGCTCAGCCTTCAAGGTATCTTCCTTATTGATCATGGCAACATTC 6003

128507658 CTCATGTTTAACTCCCTCCAAGGCCAGAAAAATATCTCCACTTCTCCAGATGAACTTTAG 128507717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6004 CTCATGTTTAACTCCCTCCAAGGCCAGAAAAATATCTCCACTTCTCCAGATGAACTTTAG 6063

128507718 AAA 128507720
          |||
     6064 AAA 6066

Alignment time is 5.77893 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [128490437,128512439] =>     22003 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     3834] =>      3834 nucs 'mol-32-2dff-074449_3834'

Score:        3834
Aligned:      3834        nucs
Identic:      3834 (100%) nucs =>      2028 (100%)      1806 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [128500921,128502948] EXCISED REGION [128502951,128504756]
 second seq =>  [        1,     2028] EXCISED REGION [     2029,     3834]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [128502949,128502950]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        31 nucs [128502949,128502979] to [128502951,128502981]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

128500921 CAAAATTGTCATTTTCATAGATCAAATATGATAAAAAGTCAGCAATTTAATATGGTTGGA 128500980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAAATTGTCATTTTCATAGATCAAATATGATAAAAAGTCAGCAATTTAATATGGTTGGA 60

128500981 CCAGTAATTCATCAGCCCAGAAAGGACACCTTTTTGTAATTCTCACAAACGTACCTGTGA 128501040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGTAATTCATCAGCCCAGAAAGGACACCTTTTTGTAATTCTCACAAACGTACCTGTGA 120

128501041 TAGAGCAATTGTACAAATGTCTCCAATTGTCCATCTTCATCTTCCCTGTAGCTATGTCTT 128501100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGAGCAATTGTACAAATGTCTCCAATTGTCCATCTTCATCTTCCCTGTAGCTATGTCTT 180

128501101 TTGTAATGTGGCTTGCAGCCTTTCCCATCAAGAGGTAGAGTCAATTTCCTCAACCCTTGA 128501160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGTAATGTGGCTTGCAGCCTTTCCCATCAAGAGGTAGAGTCAATTTCCTCAACCCTTGA 240

128501161 ATCTGAGCTGGCCATGTGGCTTGTTTGACCAGTGGAGTAAGATGGAAGTAAAGATGTGCC 128501220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCTGAGCTGGCCATGTGGCTTGTTTGACCAGTGGAGTAAGATGGAAGTAAAGATGTGCC 300

128501221 AGTACTGAATCCAGGCCTCAAGAGGCCTCACATGCTTCTTCTCTCACTCTTTCAGAACCT 128501280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTACTGAATCCAGGCCTCAAGAGGCCTCACATGCTTCTTCTCTCACTCTTTCAGAACCT 360

128501281 TGTCAGGACCATGTGAAAAAGCCCAGGGTAGACCATCGGAGGAAGGCCCTCCTAGACCAT 128501340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTCAGGACCATGTGAAAAAGCCCAGGGTAGACCATCGGAGGAAGGCCCTCCTAGACCAT 420

128501341 CCTACAGCCAGCCAACCCGCAAACATTTTCGACATTTCAGCCAAGATCAACAGATCTGCC 128501400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTACAGCCAGCCAACCCGCAAACATTTTCGACATTTCAGCCAAGATCAACAGATCTGCC 480

128501401 TATCTGACCCACAGCTGATCACTGACACATGAGTGAGCCCAGCTAAAACTAGATTCATCC 128501460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATCTGACCCACAGCTGATCACTGACACATGAGTGAGCCCAGCTAAAACTAGATTCATCC 540

128501461 AGCTGATTCACAGACTCATGAACGATAATAAATAAATACTCTTTAAGCCTCTAATTTTGG 128501520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCTGATTCACAGACTCATGAACGATAATAAATAAATACTCTTTAAGCCTCTAATTTTGG 600

128501521 GGGTGGTTTGTTAGATAAGCAATAGTTAACTGCTACAGTGTCATATGTACTAACAACATC 128501580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGTGGTTTGTTAGATAAGCAATAGTTAACTGCTACAGTGTCATATGTACTAACAACATC 660

128501581 CCTGTGTAGCTATTAGTATTCGCCTCATTTTATAGCTAACTGAGCTTAGTAGTTAAGTGA 128501640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGTGTAGCTATTAGTATTCGCCTCATTTTATAGCTAACTGAGCTTAGTAGTTAAGTGA 720

128501641 TTTGCCTAAAGTCACACAACTAGTTAATACAGGGACAGCCAGGATTCTAAACCAGCCTGT 128501700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTGCCTAAAGTCACACAACTAGTTAATACAGGGACAGCCAGGATTCTAAACCAGCCTGT 780

128501701 CTATAGACCCTGTGATCATAACCATTACTCTATATGACCATAGCACTACTCTAACTAATG 128501760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTATAGACCCTGTGATCATAACCATTACTCTATATGACCATAGCACTACTCTAACTAATG 840

128501761 AGGAAGAGGCAGGCCCCATTTGTACCCAGTGGCTAAATGCTAGATGTTTAACAATCAGCT 128501820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGAAGAGGCAGGCCCCATTTGTACCCAGTGGCTAAATGCTAGATGTTTAACAATCAGCT 900

128501821 CTCTGGCAAGAGGACGCCCTGATTTGTAGTACTTGCTGATTTCCATGATGTAAATACTCC 128501880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCTGGCAAGAGGACGCCCTGATTTGTAGTACTTGCTGATTTCCATGATGTAAATACTCC 960

128501881 CACCATGGCCAATCTCAAATCTACAACTTGACATCACTGAACACACAGTTGAGAAGATAT 128501940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACCATGGCCAATCTCAAATCTACAACTTGACATCACTGAACACACAGTTGAGAAGATAT 1020

128501941 ATGCAATAACACACCATTATAGTACTTCCACCATACAAATATAAGTAAACAATCTCGAGA 128502000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGCAATAACACACCATTATAGTACTTCCACCATACAAATATAAGTAAACAATCTCGAGA 1080

128502001 GCATAGATAATAGTAAAATGTAGTAAAAGAACATTTTACTGTTTTGAGTTATAAGTTTTG 128502060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCATAGATAATAGTAAAATGTAGTAAAAGAACATTTTACTGTTTTGAGTTATAAGTTTTG 1140

128502061 AGTATGTGTTGCCTTTGTTTCAATGTAATTTAACTGTACATTTATATATTAATTTATTTT 128502120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTATGTGTTGCCTTTGTTTCAATGTAATTTAACTGTACATTTATATATTAATTTATTTT 1200

128502121 TAATGGCTGTGTTTAAAAACCGGATTGCAAAATTTTCTTAAAATTTAACATTTGGCTCTT 128502180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAATGGCTGTGTTTAAAAACCGGATTGCAAAATTTTCTTAAAATTTAACATTTGGCTCTT 1260

128502181 GTGAGCCAGTATGAGCCATTTCTAGCACACCCTTTGCTAAGGGTCATAGTCTAATCATCC 128502240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGAGCCAGTATGAGCCATTTCTAGCACACCCTTTGCTAAGGGTCATAGTCTAATCATCC 1320

128502241 AGCCATTTGACCTGCTCGGCAAATTTGTTGCTTCCTCCTATAAACCTACACCTATTTGCC 128502300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCCATTTGACCTGCTCGGCAAATTTGTTGCTTCCTCCTATAAACCTACACCTATTTGCC 1380

128502301 CACCCCTCCAGCCCTCCAAATGTGTATGAATTAGCTGAATATTTATAGCTTGGCCTGTAC 128502360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACCCCTCCAGCCCTCCAAATGTGTATGAATTAGCTGAATATTTATAGCTTGGCCTGTAC 1440

128502361 CCTGGGACCTCGGTCCATATGTCAGCATTTCTTTAACCTCTTCTATTTGTCTTTTCAGTC 128502420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCTGGGACCTCGGTCCATATGTCAGCATTTCTTTAACCTCTTCTATTTGTCTTTTCAGTC 1500

128502421 TATACCACACTTTTGGTTAACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATAT 128502480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATACCACACTTTTGGTTAACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATAT 1560

128502481 TTCTTTATTTATTCTACAGTGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACC 128502540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTTTATTTATTCTACAGTGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACC 1620

128502541 TACACTTTCAAGGATGCGGCATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCC 128502600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TACACTTTCAAGGATGCGGCATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCC 1680

128502601 CCTCACCTTCCTGATAGCAAACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGA 128502660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCTCACCTTCCTGATAGCAAACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGA 1740

128502661 GAGCCTAATACTTTTGTCCTTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCA 128502720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAGCCTAATACTTTTGTCCTTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCA 1800

128502721 ACAGTCCAACAGTCTTCCATGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGT 128502780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACAGTCCAACAGTCTTCCATGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGT 1860

128502781 GGTGATCTTCGGCCCTTCTGGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATG 128502840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGTGATCTTCGGCCCTTCTGGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATG 1920

128502841 CAGTCGTTTGAAGAGGCTTCCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCC 128502900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGTCGTTTGAAGAGGCTTCCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCC 1980

128502901 CAAGGCTTAACTGGGTTTAAAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 128502948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAGGCTTAACTGGGTTTAAAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 2028

EXCISED REGION

128502951 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATC 128503010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATC 2088

128503011 CATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGTCATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTC 128503070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 CATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGTCATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTC 2148

128503071 CATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACATAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCA 128503130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 CATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACATAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCA 2208

128503131 ATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAGCAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCT 128503190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 ATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAGCAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCT 2268

128503191 CCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCTGCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCC 128503250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 CCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCTGCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCC 2328

128503251 TCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCACCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCT 128503310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 TCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCACCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCT 2388

128503311 CTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAGATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGC 128503370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 CTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAGATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGC 2448

128503371 ACTGCACAACGTCTCTATTATGTATATACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCA 128503430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 ACTGCACAACGTCTCTATTATGTATATACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCA 2508

128503431 GATTTAGCAAATAAAAATATGGGACACCCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGA 128503490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 GATTTAGCAAATAAAAATATGGGACACCCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGA 2568

128503491 ATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCATGTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTA 128503550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 ATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCATGTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTA 2628

128503551 TTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACTGGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTG 128503610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 TTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACTGGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTG 2688

128503611 ACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGGCAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCT 128503670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 ACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGGCAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCT 2748

128503671 TTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCTTAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAAC 128503730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 TTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCTTAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAAC 2808

128503731 TCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGTGGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATG 128503790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 TCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGTGGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATG 2868

128503791 TACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAAACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGG 128503850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 TACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAAACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGG 2928

128503851 TTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGATTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGT 128503910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 TTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGATTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGT 2988

128503911 CTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAACACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCC 128503970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 CTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAACACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCC 3048

128503971 ACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTAATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGG 128504030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 ACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTAATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGG 3108

128504031 CAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGCCTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCT 128504090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 CAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGCCTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCT 3168

128504091 GGATGCTTCCTGCCCTCGAACATCGGACTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGG 128504150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 GGATGCTTCCTGCCCTCGAACATCGGACTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGG 3228

128504151 TTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCAGCCTACTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTA 128504210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 TTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCAGCCTACTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTA 3288

128504211 ATACTTAGCAAACTCATATATATATATTCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGAC 128504270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 ATACTTAGCAAACTCATATATATATATTCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGAC 3348

128504271 TAATACAAATAGGTATTATTATCTTCATTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGG 128504330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 TAATACAAATAGGTATTATTATCTTCATTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGG 3408

128504331 AATGACTTACCCAAGACCATGTCATATGATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTC 128504390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 AATGACTTACCCAAGACCATGTCATATGATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTC 3468

128504391 TCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTAAACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACA 128504450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 TCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTAAACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACA 3528

128504451 GATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAAAACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATAC 128504510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 GATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAAAACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATAC 3588

128504511 TTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGACTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCT 128504570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 TTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGACTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCT 3648

128504571 TGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGAATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGAC 128504630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 TGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGAATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGAC 3708

128504631 TGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAAAGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAA 128504690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 TGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAAAGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAA 3768

128504691 ACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATTATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGC 128504750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 ACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATTATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGC 3828

128504751 GTATGT 128504756
          ||||||
     3829 GTATGT 3834

Alignment time is 3.82256 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [128490437,128512439] =>     22003 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     4583] =>      4583 nucs 'mol-32-2e15-048675_4583'

Score:        4508
Aligned:      4576        nucs
Identic:      4569 (100%) nucs =>       869 (100%)      3700 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [128499569,128500437] EXCISED REGION [128502440,128506144]
 second seq =>  [        1,      869] EXCISED REGION [      877,     4583]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2002 nucs [128500438,128502439]
 second seq =>         7 nucs [870,876]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [128500437,128500437] to [128502439,128502439]
 second seq =>         1 nucs [870,870] to [877,877]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [128500437,128500437] to [128502440,128502440]
 second seq =>         1 nucs [869,869] to [877,877]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

128499569 AGTGACCTGGTTGACACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAAC 128499628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGACCTGGTTGACACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAAC 60

128499629 CAAACATTGTATGTTCTCACTGATATATGGGAGCTAAGCTATGAGGACACAAAGGCATAA 128499688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAACATTGTATGTTCTCACTGATATATGGGAGCTAAGCTATGAGGACACAAAGGCATAA 120

128499689 GAATGATATGGTGGACTTTGGGGACTTGAGGGGAAGAGTGGAAGCGGGGTGAGGGATAAA 128499748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAATGATATGGTGGACTTTGGGGACTTGAGGGGAAGAGTGGAAGCGGGGTGAGGGATAAA 180

128499749 AAGACTACAAACATGGCTCAGTGTATGGTGAGTGTATACTGCACCAAAATCTCACAAATC 128499808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGACTACAAACATGGCTCAGTGTATGGTGAGTGTATACTGCACCAAAATCTCACAAATC 240

128499809 ACCACTAAAGAACTCACTCATGTAACCAAATAACACCTGTACCCCAATAACATATAGAAA 128499868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCACTAAAGAACTCACTCATGTAACCAAATAACACCTGTACCCCAATAACATATAGAAA 300

128499869 TATAAAATTAATTAATTAGATATAAATGAATAAAAGAAAAAAGAATTGGGGTTCTATTGC 128499928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATAAAATTAATTAATTAGATATAAATGAATAAAAGAAAAAAGAATTGGGGTTCTATTGC 360

128499929 TGATCAAGAAACGGGAATATTGCTGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTT 128499988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATCAAGAAACGGGAATATTGCTGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTT 420

128499989 GGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTCAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACAT 128500048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTCAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACAT 480

128500049 GATGAAACCCCATCTCTACTTAAAAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGC 128500108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATGAAACCCCATCTCTACTTAAAAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGC 540

128500109 GCTTGCTTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACCCGGGA 128500168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTTGCTTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACCCGGGA 600

128500169 GGCAGAAGTTGCAGTGAGCCTAGATGACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGA 128500228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCAGAAGTTGCAGTGAGCCTAGATGACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGA 660

128500229 GACTCTGTCTCAAAAAAATGAATAAATAAAAAAGAAAGAAAGAAAGATAGGGGAATATAT 128500288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GACTCTGTCTCAAAAAAATGAATAAATAAAAAAGAAAGAAAGAAAGATAGGGGAATATAT 720

128500289 TTTGGAGAACAATTAGCAATCTCTACCACAGATAAGTATAAGGCTTCCACATATGATTGT 128500348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTGGAGAACAATTAGCAATCTCTACCACAGATAAGTATAAGGCTTCCACATATGATTGT 780

128500349 ACATTTTGTGGATTTAAGAAGGCTGAGAGAAAGAAGGGAGATGAAATCTAGTTTGTGTCC 128500408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACATTTTGTGGATTTAAGAAGGCTGAGAGAAAGAAGGGAGATGAAATCTAGTTTGTGTCC 840

128500409 ACTATCCACACCAGTGCACCCTAGCTTAA 128500437
          |||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTATCCACACCAGTGCACCCTAGCTTAA 869

EXCISED REGION

128502440 ACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAG 128502499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 ACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAG 936

128502500 TGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGG 128502559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 TGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGG 996

128502560 CATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCA 128502619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 CATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCA 1056

128502620 AACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCC 128502679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 AACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCC 1116

128502680 TTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCA 128502739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 TTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCA 1176

128502740 TGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCT 128502799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 TGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCT 1236

128502800 GGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTT 128502859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 GGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTT 1296

128502860 CCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTA 128502919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 CCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTA 1356

128502920 AAAAT--TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 128502977
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 AAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 1416

128502978 GTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATCCATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGT 128503037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 GTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATCCATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGT 1476

128503038 CATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTCCATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACA 128503097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 CATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTCCATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACA 1536

128503098 TAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCAATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAG 128503157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 TAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCAATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAG 1596

128503158 CAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCTCCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCT 128503217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 CAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCTCCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCT 1656

128503218 GCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCCTCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCA 128503277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 GCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCCTCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCA 1716

128503278 CCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCTCTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAG 128503337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 CCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCTCTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAG 1776

128503338 ATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGCACTGCACAACGTCTCTATTATGTATAT 128503397
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 ATAGAATTAATCAATTCTAACATGAGGAATTGCACTGCACAACGTCTCTATTATGTATAT 1836

128503398 ACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCAGATTTAGCAAATAAAAATATGGGACAC 128503457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 ACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCAGATTTAGCAAATAAAAATATGGGACAC 1896

128503458 CCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGAATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCAT 128503517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 CCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGAATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCAT 1956

128503518 GTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTATTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACT 128503577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 GTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTATTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACT 2016

128503578 GGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTGACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGG 128503637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 GGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTGACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGG 2076

128503638 CAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCTTTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCT 128503697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 CAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCTTTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCT 2136

128503698 TAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAACTCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGT 128503757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 TAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAACTCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGT 2196

128503758 GGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATGTACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAA 128503817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 GGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATGTACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAA 2256

128503818 ACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGGTTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGA 128503877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 ACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGGTTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGA 2316

128503878 TTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAA 128503937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 TTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAA 2376

128503938 CACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCCACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTA 128503997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 CACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCCACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTA 2436

128503998 ATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGGCAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGC 128504057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 ATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGGCAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGC 2496

128504058 CTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTGCCCTCGAACATCGGA 128504117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2497 CTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTGCCCTCGAACATTGGA 2556

128504118 CTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGGTTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCA 128504177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 CTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGGTTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCA 2616

128504178 GCCTACTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTAATACTTAGCAAACTCATATATATATAT 128504237
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 GCCTATTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTAATACTTAGCAAACTCATATATATATAT 2676

128504238 TCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGACTAATACAAATAGGTATTATTATCTTCA 128504297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 TCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGACTAATACAAATAGGTATTATTATCTTCA 2736

128504298 TTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGGAATGACTTACCCAAGACCATGTCATAT 128504357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 TTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGGAATGACTTACCCAAGACCATGTCATAT 2796

128504358 GATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTCTCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTA 128504417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 GATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTCTCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTA 2856

128504418 AACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACAGATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAA 128504477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 AACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACAGATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAA 2916

128504478 AACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATACTTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGA 128504537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 AACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATACTTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGA 2976

128504538 CTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCTTGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGA 128504597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 CTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCTTGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGA 3036

128504598 ATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGACTGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAA 128504657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 ATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGACTGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAA 3096

128504658 AGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAAACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATT 128504717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 AGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAAACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATT 3156

128504718 ATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGCGTATGTATAGCAGTTGACAATATCAGC 128504777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 ATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGCGTATGTATAGCAGTTGACAATATCAGC 3216

128504778 CACATTATTAGTTTGGTTTCCTCTGCTTGGCTAGCTTTTCAGTTGGGGTAAGTCTGCATT 128504837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 CACATTATTAGTTTGGTTTCCTCTGCTTGGCTAGCTTTTCAGTTGGGGTAAGTCTGCATT 3276

128504838 TCCTGTCTCAGCACTTATGAAGAAGTGGCAGTAACAGTAAAACTTATATTAACTTGTGCC 128504897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 TCCTGTCTCAGCACTTATGAAGAAGTGGCAGTAACAGTAAAACTTATATTAACTTGTGCC 3336

128504898 CAAGTAATAAGCCCTCTGTTAATTGAAATTTTTCTGCACTTAGCTCTTATGGGAAAAAAA 128504957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 CAAGTAATAAGCCCTCTGTTAATTGAAATTTTTCTGCACTTAGCTCTTATGGGAAAAAAA 3396

128504958 GAGGCAATTATGTAAAGATGATGGACTGACAAACATTTTTCCCCAGAAGCCTCTGGCACT 128505017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 GAGGCAATTATGTAAAGATGATGGACTGACAAACATTTTTCCCCAGAAGCCTCTGGCACT 3456

128505018 GGTCTATTCAGTCCAATTTCCTGTACTACCTATTTCCATGTAGAGTTCTAGAGGTAATGA 128505077
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 GGTCTATTCAGTCCAATTTCCTGTACTATCTATTTCCATGTAGAGTTCTAGAGGTAATGA 3516

128505078 GAAATCATCTCTTTGACCCTTGAAAAGGGCCCAGCTCTCTACTAGGTGCTATGAGGCCCA 128505137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 GAAATCATCTCTTTGACCCTTGAAAAGGGCCCAGCTCTCTACTAGGTGCTATGAGGCCCA 3576

128505138 AAAGGGGTAGAAAGCAACTAATATTTATGACGTGACTACTATGAATATTTCTGGAAGAAT 128505197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 AAAGGGGTAGAAAGCAACTAATATTTATGACGTGACTACTATGAATATTTCTGGAAGAAT 3636

128505198 ACTCAAGAAGCTGGTGACTGTGGATTTCTCCTGGGAGGAAAGCTGAGTGACTAGGGCACA 128505257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 ACTCAAGAAGCTGGTGACTGTGGATTTCTCCTGGGAGGAAAGCTGAGTGACTAGGGCACA 3696

128505258 AGAGTGAAAAGGAGGCTAGCTCTGCACTGCATCCCCTTGTGTACATTTTGAATTTTGTAA 128505317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 AGAGTGAAAAGGAGGCTAGCTCTGCACTGCATCCCCTTGTGTACATTTTGAATTTTGTAA 3756

128505318 CGCAAACTTGCATTACCTAATCAAAGAAATTATTTTTCAATGCCCACCATGTTTTTTGCA 128505377
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 CACAAACTTGCATTACCTAATCAAAGAAATTATTTTTCAATGCCCACCATGTTTTTTGCA 3816

128505378 TGATCTAATTAATTCTCATAATGACCCTTTGAGGTAAGTATTGTTAACATTCTTATTTTA 128505437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 TGATCTAATTAATTCTCATAATGACCCTTTGAGGTAAGTATTGTTAACATTCTTATTTTA 3876

128505438 TAGAGGGAAAACTGAGGTTCTGAGAGTTTAAGTCACTCACCCCAGCTCATATTATTCTGA 128505497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 TAGAGGGAAAACTGAGGTTCTGAGAGTTTAAGTCACTCACCCCAGCTCATATTATTCTGA 3936

128505498 ACAAGTCCAATCAAGGTCATCAGAACCTCCCAGCTAATCTCTGGGAGGTCAGAGATTGAA 128505557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 ACAAGTCCAATCAAGGTCATCAGAACCTCCCAGCTAATCTCTGGGAGGTCAGAGATTGAA 3996

128505558 CCTGGCCAGAATCTGAACAGGGTCTACATCCCTCCAAAGCTATGCTAGCTATCCTGCTCC 128505617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 CCTGGCCAGAATCTGAACAGGGTCTACATCCCTCCAAAGCTATGCTAGCTATCCTGCTCC 4056

128505618 CCAAAGAAGATGAAAACTGAGTATTCAATTGCAAGAAGAATCTTGTTGTAGAACTAAGAC 128505677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 CCAAAGAAGATGAAAACTGAGTATTCAATTGCAAGAAGAATCTTGTTGTAGAACTAAGAC 4116

128505678 ATACAATTCTAAACAGTTAATTATATTTCATTAATTGTAAGAAATGCATTTTAAATTTTC 128505737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 ATACAATTCTAAACAGTTAATTATATTTCATTAATTGTAAGAAATGCATTTTAAATTTTC 4176

128505738 TGAAATTAAGATATGTCTTCTAAGGGATAGTGTGCTGTAGTATATTTGAAGGTGTTTTGT 128505797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 TGAAATTAAGATATGTCTTCTAAGGGATAGTGTGCTGTAGTATATTTGAAGGTGTTTTGT 4236

128505798 TTTTCTCAGTGATTCATAAGATAATGGTACGTGTTCCAACCAATGGCTTCTTGAGGTCAG 128505857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 TTTTCTCAGTGATTCATAAGATAATGGTACGTGTTCCAACCAATGGCTTCTTGAGGTCAG 4296

128505858 TGAAATATGGTGCCAATATAGTGCAGAAAATCAAAAAGTCTAAACCAGCAGCACAAGCAG 128505917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 TGAAATATGGTGCCAATATAGTGCAGAAAATCAAAAAGTCTAAACCAGCAGCACAAGCAG 4356

128505918 TAAGTGATGTAGGAGCTCTGAAGAAGTAACATCCTCTTCTGTAAGAGTTGCTAGGGTAGG 128505977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 TAAGTGATGTAGGAGCTCTGAAGAAGTAACATCCTCTTCTGTAAGAGTTGCTAGGGTAGG 4416

128505978 CTTTATGTTGATTTGAGCTAAGCCTCAACGATTGGGCAGTGTATCTGTTATCTATTGCCA 128506037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 CTTTATGTTGATTTGAGCTAAGCCTCAACGATTGGGCAGTGTATCTGTTATCTATTGCCA 4476

128506038 CAAAGTACTGTACAATAAACAACCCCAAAACTCAGTGTCTTAAAACAGCAACCATGTATT 128506097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 CAAAGTACTGTACAATAAACAACCCCAAAACTCAGTGTCTTAAAACAGCAACCATGTATT 4536

128506098 TACTATTGCTCTTGAGTTTAGAGATTAGCTGGGAGGTTCTGATGATC 128506144
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 TACTATTGCTCTTGAGTTTAGAGATTAGCTGGGAGGTTCTGATGATC 4583

Alignment time is 4.55801 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [128490437,128512439] =>     22003 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     4929] =>      4929 nucs 'mol-32-2ef1-002794_4929'

Score:        4854
Aligned:      4922        nucs
Identic:      4915 (100%) nucs =>       842 (100%)      4073 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [128499596,128500437] EXCISED REGION [128502440,128506517]
 second seq =>  [        1,      842] EXCISED REGION [      850,     4929]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2002 nucs [128500438,128502439]
 second seq =>         7 nucs [843,849]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [128500437,128500437] to [128502439,128502439]
 second seq =>         1 nucs [843,843] to [850,850]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [128500437,128500437] to [128502440,128502440]
 second seq =>         1 nucs [842,842] to [850,850]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

128499596 TATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTGATATA 128499655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTGATATA 60

128499656 TGGGAGCTAAGCTATGAGGACACAAAGGCATAAGAATGATATGGTGGACTTTGGGGACTT 128499715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGAGCTAAGCTATGAGGACACAAAGGCATAAGAATGATATGGTGGACTTTGGGGACTT 120

128499716 GAGGGGAAGAGTGGAAGCGGGGTGAGGGATAAAAAGACTACAAACATGGCTCAGTGTATG 128499775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGGGGAAGAGTGGAAGCGGGGTGAGGGATAAAAAGACTACAAACATGGCTCAGTGTATG 180

128499776 GTGAGTGTATACTGCACCAAAATCTCACAAATCACCACTAAAGAACTCACTCATGTAACC 128499835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGAGTGTATACTGCACCAAAATCTCACAAATCACCACTAAAGAACTCACTCATGTAACC 240

128499836 AAATAACACCTGTACCCCAATAACATATAGAAATATAAAATTAATTAATTAGATATAAAT 128499895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATAACACCTGTACCCCAATAACATATAGAAATATAAAATTAATTAATTAGATATAAAT 300

128499896 GAATAAAAGAAAAAAGAATTGGGGTTCTATTGCTGATCAAGAAACGGGAATATTGCTGGG 128499955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAATAAAAGAAAAAAGAATTGGGGTTCTATTGCTGATCAAGAAACGGGAATATTGCTGGG 360

128499956 TGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTCA 128500015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTCA 420

128500016 AGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCATCTCTACTTAAAAAA 128500075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCATCTCTACTTAAAAAA 480

128500076 AAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCTTGCTTGTAATCCCAGCTTCTTGGG 128500135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCTTGCTTGTAATCCCAGCTTCTTGGG 540

128500136 AGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAGCCTAGATGA 128500195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAGCCTAGATGA 600

128500196 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATGAATAAAT 128500255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATGAATAAAT 660

128500256 AAAAAAGAAAGAAAGAAAGATAGGGGAATATATTTTGGAGAACAATTAGCAATCTCTACC 128500315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAAAGAAAGAAAGAAAGATAGGGGAATATATTTTGGAGAACAATTAGCAATCTCTACC 720

128500316 ACAGATAAGTATAAGGCTTCCACATATGATTGTACATTTTGTGGATTTAAGAAGGCTGAG 128500375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACAGATAAGTATAAGGCTTCCACATATGATTGTACATTTTGTGGATTTAAGAAGGCTGAG 780

128500376 AGAAAGAAGGGAGATGAAATCTAGTTTGTGTCCACTATCCACACCAGTGCACCCTAGCTT 128500435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAAAGAAGGGAGATGAAATCTAGTTTGTGTCCACTATCCACACCAGTGCACCCTAGCTT 840

128500436 AA 128500437
          ||
      841 AA 842

EXCISED REGION

128502440 ACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAG 128502499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 ACAAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAG 909

128502500 TGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGG 128502559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 TGATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGG 969

128502560 CATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCA 128502619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 CATTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCA 1029

128502620 AACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCC 128502679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 AACATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCC 1089

128502680 TTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCA 128502739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 TTGTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCA 1149

128502740 TGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCT 128502799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 TGCGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCT 1209

128502800 GGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTT 128502859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 GGAGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTT 1269

128502860 CCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTA 128502919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 CCAGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTA 1329

128502920 AAAAT--TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 128502977
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 AAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 1389

128502978 GTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATCCATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGT 128503037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 GTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATCCATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGT 1449

128503038 CATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTCCATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACA 128503097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 CATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTCCATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACA 1509

128503098 TAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCAATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAG 128503157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 TAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCAATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAG 1569

128503158 CAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCTCCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCT 128503217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 CAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCTCCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCT 1629

128503218 GCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCCTCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCA 128503277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 GCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCCTCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCA 1689

128503278 CCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCTCTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAG 128503337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 CCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCTCTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAG 1749

128503338 ATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGCACTGCACAACGTCTCTATTATGTATAT 128503397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 ATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGCACTGCACAACGTCTCTATTATGTATAT 1809

128503398 ACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCAGATTTAGCAAATAAAAATATGGGACAC 128503457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 ACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCAGATTTAGCAAATAAAAATATGGGACAC 1869

128503458 CCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGAATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCAT 128503517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 CCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGAATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCAT 1929

128503518 GTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTATTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACT 128503577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 GTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTATTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACT 1989

128503578 GGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTGACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGG 128503637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 GGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTGACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGG 2049

128503638 CAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCTTTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCT 128503697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 CAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCTTTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCT 2109

128503698 TAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAACTCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGT 128503757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 TAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAACTCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGT 2169

128503758 GGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATGTACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAA 128503817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 GGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATGTACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAA 2229

128503818 ACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGGTTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGA 128503877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 ACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGGTTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGA 2289

128503878 TTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAA 128503937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 TTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAA 2349

128503938 CACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCCACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTA 128503997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 CACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCCACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTA 2409

128503998 ATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGGCAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGC 128504057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 ATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGGCAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGC 2469

128504058 CTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTGCCCTCGAACATCGGA 128504117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2470 CTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTGCCCTCGAACATTGGA 2529

128504118 CTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGGTTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCA 128504177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 CTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGGTTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCA 2589

128504178 GCCTACTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTAATACTTAGCAAACTCATATATATATAT 128504237
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 GCCTATTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTAATACTTAGCAAACTCATATATATATAT 2649

128504238 TCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGACTAATACAAATAGGTATTATTATCTTCA 128504297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 TCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGACTAATACAAATAGGTATTATTATCTTCA 2709

128504298 TTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGGAATGACTTACCCAAGACCATGTCATAT 128504357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 TTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGGAATGACTTACCCAAGACCATGTCATAT 2769

128504358 GATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTCTCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTA 128504417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 GATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTCTCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTA 2829

128504418 AACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACAGATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAA 128504477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 AACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACAGATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAA 2889

128504478 AACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATACTTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGA 128504537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 AACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATACTTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGA 2949

128504538 CTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCTTGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGA 128504597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 CTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCTTGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGA 3009

128504598 ATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGACTGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAA 128504657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 ATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGACTGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAA 3069

128504658 AGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAAACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATT 128504717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 AGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAAACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATT 3129

128504718 ATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGCGTATGTATAGCAGTTGACAATATCAGC 128504777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 ATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGCGTATGTATAGCAGTTGACAATATCAGC 3189

128504778 CACATTATTAGTTTGGTTTCCTCTGCTTGGCTAGCTTTTCAGTTGGGGTAAGTCTGCATT 128504837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 CACATTATTAGTTTGGTTTCCTCTGCTTGGCTAGCTTTTCAGTTGGGGTAAGTCTGCATT 3249

128504838 TCCTGTCTCAGCACTTATGAAGAAGTGGCAGTAACAGTAAAACTTATATTAACTTGTGCC 128504897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 TCCTGTCTCAGCACTTATGAAGAAGTGGCAGTAACAGTAAAACTTATATTAACTTGTGCC 3309

128504898 CAAGTAATAAGCCCTCTGTTAATTGAAATTTTTCTGCACTTAGCTCTTATGGGAAAAAAA 128504957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 CAAGTAATAAGCCCTCTGTTAATTGAAATTTTTCTGCACTTAGCTCTTATGGGAAAAAAA 3369

128504958 GAGGCAATTATGTAAAGATGATGGACTGACAAACATTTTTCCCCAGAAGCCTCTGGCACT 128505017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 GAGGCAATTATGTAAAGATGATGGACTGACAAACATTTTTCCCCAGAAGCCTCTGGCACT 3429

128505018 GGTCTATTCAGTCCAATTTCCTGTACTACCTATTTCCATGTAGAGTTCTAGAGGTAATGA 128505077
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 GGTCTATTCAGTCCAATTTCCTGTACTATCTATTTCCATGTAGAGTTCTAGAGGTAATGA 3489

128505078 GAAATCATCTCTTTGACCCTTGAAAAGGGCCCAGCTCTCTACTAGGTGCTATGAGGCCCA 128505137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 GAAATCATCTCTTTGACCCTTGAAAAGGGCCCAGCTCTCTACTAGGTGCTATGAGGCCCA 3549

128505138 AAAGGGGTAGAAAGCAACTAATATTTATGACGTGACTACTATGAATATTTCTGGAAGAAT 128505197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 AAAGGGGTAGAAAGCAACTAATATTTATGACGTGACTACTATGAATATTTCTGGAAGAAT 3609

128505198 ACTCAAGAAGCTGGTGACTGTGGATTTCTCCTGGGAGGAAAGCTGAGTGACTAGGGCACA 128505257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 ACTCAAGAAGCTGGTGACTGTGGATTTCTCCTGGGAGGAAAGCTGAGTGACTAGGGCACA 3669

128505258 AGAGTGAAAAGGAGGCTAGCTCTGCACTGCATCCCCTTGTGTACATTTTGAATTTTGTAA 128505317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 AGAGTGAAAAGGAGGCTAGCTCTGCACTGCATCCCCTTGTGTACATTTTGAATTTTGTAA 3729

128505318 CGCAAACTTGCATTACCTAATCAAAGAAATTATTTTTCAATGCCCACCATGTTTTTTGCA 128505377
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 CACAAACTTGCATTACCTAATCAAAGAAATTATTTTTCAATGCCCACCATGTTTTTTGCA 3789

128505378 TGATCTAATTAATTCTCATAATGACCCTTTGAGGTAAGTATTGTTAACATTCTTATTTTA 128505437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 TGATCTAATTAATTCTCATAATGACCCTTTGAGGTAAGTATTGTTAACATTCTTATTTTA 3849

128505438 TAGAGGGAAAACTGAGGTTCTGAGAGTTTAAGTCACTCACCCCAGCTCATATTATTCTGA 128505497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3850 TAGAGGGAAAACTGAGGTTCTGAGAGTTTAAGTCACTCACCCCAGCTCATATTATTCTGA 3909

128505498 ACAAGTCCAATCAAGGTCATCAGAACCTCCCAGCTAATCTCTGGGAGGTCAGAGATTGAA 128505557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 ACAAGTCCAATCAAGGTCATCAGAACCTCCCAGCTAATCTCTGGGAGGTCAGAGATTGAA 3969

128505558 CCTGGCCAGAATCTGAACAGGGTCTACATCCCTCCAAAGCTATGCTAGCTATCCTGCTCC 128505617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 CCTGGCCAGAATCTGAACAGGGTCTACATCCCTCCAAAGCTATGCTAGCTATCCTGCTCC 4029

128505618 CCAAAGAAGATGAAAACTGAGTATTCAATTGCAAGAAGAATCTTGTTGTAGAACTAAGAC 128505677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 CCAAAGAAGATGAAAACTGAGTATTCAATTGCAAGAAGAATCTTGTTGTAGAACTAAGAC 4089

128505678 ATACAATTCTAAACAGTTAATTATATTTCATTAATTGTAAGAAATGCATTTTAAATTTTC 128505737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 ATACAATTCTAAACAGTTAATTATATTTCATTAATTGTAAGAAATGCATTTTAAATTTTC 4149

128505738 TGAAATTAAGATATGTCTTCTAAGGGATAGTGTGCTGTAGTATATTTGAAGGTGTTTTGT 128505797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 TGAAATTAAGATATGTCTTCTAAGGGATAGTGTGCTGTAGTATATTTGAAGGTGTTTTGT 4209

128505798 TTTTCTCAGTGATTCATAAGATAATGGTACGTGTTCCAACCAATGGCTTCTTGAGGTCAG 128505857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 TTTTCTCAGTGATTCATAAGATAATGGTACGTGTTCCAACCAATGGCTTCTTGAGGTCAG 4269

128505858 TGAAATATGGTGCCAATATAGTGCAGAAAATCAAAAAGTCTAAACCAGCAGCACAAGCAG 128505917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 TGAAATATGGTGCCAATATAGTGCAGAAAATCAAAAAGTCTAAACCAGCAGCACAAGCAG 4329

128505918 TAAGTGATGTAGGAGCTCTGAAGAAGTAACATCCTCTTCTGTAAGAGTTGCTAGGGTAGG 128505977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 TAAGTGATGTAGGAGCTCTGAAGAAGTAACATCCTCTTCTGTAAGAGTTGCTAGGGTAGG 4389

128505978 CTTTATGTTGATTTGAGCTAAGCCTCAACGATTGGGCAGTGTATCTGTTATCTATTGCCA 128506037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 CTTTATGTTGATTTGAGCTAAGCCTCAACGATTGGGCAGTGTATCTGTTATCTATTGCCA 4449

128506038 CAAAGTACTGTACAATAAACAACCCCAAAACTCAGTGTCTTAAAACAGCAACCATGTATT 128506097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4450 CAAAGTACTGTACAATAAACAACCCCAAAACTCAGTGTCTTAAAACAGCAACCATGTATT 4509

128506098 TACTATTGCTCTTGAGTTTAGAGATTAGCTGGGAGGTTCTGATGATCTTTATTAGACTTA 128506157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 TACTATTGCTCTTGAGTTTAGAGATTAGCTGGGAGGTTCTGATGATCTTTATTAGACTTA 4569

128506158 CTCACTTGTCTATGGTCAGATGAAGGTCAGCTGACTGGTCTTGGCCAGGCTCACTCATGT 128506217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 CTCACTTGTCTATGGTCAGATGAAGGTCAGCTGACTGGTCTTGGCCAGGCTCACTCATGT 4629

128506218 CTGCATATCAGCTGACTGTTGGCTGATCTAGAATGCCCTCATTGAGGAAGGGATGGTGTG 128506277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4630 CTGCATATCAGCTGACTGTTGGCTGATCTAGAATGCCCTCATTGAGGAAGGGATGGTGTG 4689

128506278 GCTCTGTTCCATTTGTTTCTCCCATACCCCCAGCAGGCTAGCCTAAGCATGTTCTCATGG 128506337
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4690 GCTCTGTTCCATGTGTTTCTCCCATACCCCCAGCAGGCTAGCCTAAGCATGTTCTCATGG 4749

128506338 ATATAGCAAGAGAGCAAGAGCAGAGATACAAGAGTGAGCAGGAGGAAAGCTGCAAGCATT 128506397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4750 ATATAGCAAGAGAGCAAGAGCAGAGATACAAGAGTGAGCAGGAGGAAAGCTGCAAGCATT 4809

128506398 TTTCTAGCCTTTGTTTGCAACATGTTTGCTAACATCTTGCTGACCAAAGCATGGCATGGC 128506457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4810 TTTCTAGCCTTTGTTTGCAACATGTTTGCTAACATCTTGCTGACCAAAGCATGGCATGGC 4869

128506458 TTAGCCCAAAGATGAGGCAGAACACAGCACCTTTAATGAGAGAAGTGAAGCAATCAGTCT 128506517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4870 TTAGCCCAAAGATGAGGCAGAACACAGCACCTTTAATGAGAGAAGTGAAGCAATCAGTCT 4929

Alignment time is 4.71941 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [128490437,128512439] =>     22003 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     5298] =>      5298 nucs 'mol-32-2fb7-203596_5298'

Score:        5298
Aligned:      5298        nucs
Identic:      5298 (100%) nucs =>      1407 (100%)      3891 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [128501542,128502948] EXCISED REGION [128502951,128506841]
 second seq =>  [        1,     1407] EXCISED REGION [     1408,     5298]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [128502949,128502950]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        31 nucs [128502949,128502979] to [128502951,128502981]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

128501542 ATAGTTAACTGCTACAGTGTCATATGTACTAACAACATCCCTGTGTAGCTATTAGTATTC 128501601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAGTTAACTGCTACAGTGTCATATGTACTAACAACATCCCTGTGTAGCTATTAGTATTC 60

128501602 GCCTCATTTTATAGCTAACTGAGCTTAGTAGTTAAGTGATTTGCCTAAAGTCACACAACT 128501661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCTCATTTTATAGCTAACTGAGCTTAGTAGTTAAGTGATTTGCCTAAAGTCACACAACT 120

128501662 AGTTAATACAGGGACAGCCAGGATTCTAAACCAGCCTGTCTATAGACCCTGTGATCATAA 128501721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTTAATACAGGGACAGCCAGGATTCTAAACCAGCCTGTCTATAGACCCTGTGATCATAA 180

128501722 CCATTACTCTATATGACCATAGCACTACTCTAACTAATGAGGAAGAGGCAGGCCCCATTT 128501781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCATTACTCTATATGACCATAGCACTACTCTAACTAATGAGGAAGAGGCAGGCCCCATTT 240

128501782 GTACCCAGTGGCTAAATGCTAGATGTTTAACAATCAGCTCTCTGGCAAGAGGACGCCCTG 128501841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTACCCAGTGGCTAAATGCTAGATGTTTAACAATCAGCTCTCTGGCAAGAGGACGCCCTG 300

128501842 ATTTGTAGTACTTGCTGATTTCCATGATGTAAATACTCCCACCATGGCCAATCTCAAATC 128501901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTGTAGTACTTGCTGATTTCCATGATGTAAATACTCCCACCATGGCCAATCTCAAATC 360

128501902 TACAACTTGACATCACTGAACACACAGTTGAGAAGATATATGCAATAACACACCATTATA 128501961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACAACTTGACATCACTGAACACACAGTTGAGAAGATATATGCAATAACACACCATTATA 420

128501962 GTACTTCCACCATACAAATATAAGTAAACAATCTCGAGAGCATAGATAATAGTAAAATGT 128502021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTACTTCCACCATACAAATATAAGTAAACAATCTCGAGAGCATAGATAATAGTAAAATGT 480

128502022 AGTAAAAGAACATTTTACTGTTTTGAGTTATAAGTTTTGAGTATGTGTTGCCTTTGTTTC 128502081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTAAAAGAACATTTTACTGTTTTGAGTTATAAGTTTTGAGTATGTGTTGCCTTTGTTTC 540

128502082 AATGTAATTTAACTGTACATTTATATATTAATTTATTTTTAATGGCTGTGTTTAAAAACC 128502141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATGTAATTTAACTGTACATTTATATATTAATTTATTTTTAATGGCTGTGTTTAAAAACC 600

128502142 GGATTGCAAAATTTTCTTAAAATTTAACATTTGGCTCTTGTGAGCCAGTATGAGCCATTT 128502201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGATTGCAAAATTTTCTTAAAATTTAACATTTGGCTCTTGTGAGCCAGTATGAGCCATTT 660

128502202 CTAGCACACCCTTTGCTAAGGGTCATAGTCTAATCATCCAGCCATTTGACCTGCTCGGCA 128502261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTAGCACACCCTTTGCTAAGGGTCATAGTCTAATCATCCAGCCATTTGACCTGCTCGGCA 720

128502262 AATTTGTTGCTTCCTCCTATAAACCTACACCTATTTGCCCACCCCTCCAGCCCTCCAAAT 128502321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATTTGTTGCTTCCTCCTATAAACCTACACCTATTTGCCCACCCCTCCAGCCCTCCAAAT 780

128502322 GTGTATGAATTAGCTGAATATTTATAGCTTGGCCTGTACCCTGGGACCTCGGTCCATATG 128502381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGTATGAATTAGCTGAATATTTATAGCTTGGCCTGTACCCTGGGACCTCGGTCCATATG 840

128502382 TCAGCATTTCTTTAACCTCTTCTATTTGTCTTTTCAGTCTATACCACACTTTTGGTTAAC 128502441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAGCATTTCTTTAACCTCTTCTATTTGTCTTTTCAGTCTATACCACACTTTTGGTTAAC 900

128502442 AAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAGTG 128502501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAATCTATGTCTACTCCCCCACTGGGTGAAGTCCATATTTCTTTATTTATTCTACAGTG 960

128502502 ATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGGCA 128502561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCTCATTTGTATTCTAGCTTCAGAAAAGGCCCACTACCTACACTTTCAAGGATGCGGCA 1020

128502562 TTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCAAA 128502621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTAGACAATAGCTGCATTTTCTCCTTCACATCATACCCCCTCACCTTCCTGATAGCAAA 1080

128502622 CATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCCTT 128502681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATCTCTGCCCTGTCAGCCATCCCCTCGTCACACGGAGAGAGCCTAATACTTTTGTCCTT 1140

128502682 GTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCATG 128502741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGGTCCAATTTATCCACCACCCACACCCCCTCCCCCCAACAGTCCAACAGTCTTCCATG 1200

128502742 CGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCTGG 128502801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGATATCTGTACATTTCACAAATAAGCAAGTATTAATGTGGTGATCTTCGGCCCTTCTGG 1260

128502802 AGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTTCC 128502861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTTGACACAGGCAACTTTGGTCTAGGATCAGCTTCATGCAGTCGTTTGAAGAGGCTTCC 1320

128502862 AGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTAAA 128502921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAAGAATTGATTCCATGAATTTTCTCTGCTATACAGCCCAAGGCTTAACTGGGTTTAAA 1380

128502922 AATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 128502948
          |||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 1407

EXCISED REGION

128502951 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATC 128503010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTTTAACCTTAATCCTTGGGCTCAAATC 1467

128503011 CATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGTCATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTC 128503070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 CATTCCCATATTCTCCTTGGCTAACGTCATTGTGGGATATAGAATAAACATTTAAAAGTC 1527

128503071 CATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACATAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCA 128503130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 CATATAAGGCCCTTCATGAAGCCCACATAAGTCTCTTTCCAGGGACTTCAAATCTTCTCA 1587

128503131 ATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAGCAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCT 128503190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 ATCTCTACCTCACATTTGACATTTCAGCAGCACTGAAAAGCCTGGAGTTGCTTACACTCT 1647

128503191 CCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCTGCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCC 128503250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 CCAGGGTGTTTCTTGCCTTGTGCTGCTGCTTTTCTCTCTGCCTGAAATGCCCTCTGCTCC 1707

128503251 TCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCACCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCT 128503310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 TCTCTCCACCCCAAACAAACATATTCACCTACCAAATGCTTGTGCCTCTCTTCACAACCT 1767

128503311 CTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAGATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGC 128503370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 CTGTGAAGCCTTCTCTGATATTTTGAGATAGAATTAATCAATTCTAACATGAAGAATTGC 1827

128503371 ACTGCACAACGTCTCTATTATGTATATACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCA 128503430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 ACTGCACAACGTCTCTATTATGTATATACTTCTACTATCACGTGACACATAGGGTTGCCA 1887

128503431 GATTTAGCAAATAAAAATATGGGACACCCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGA 128503490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 GATTTAGCAAATAAAAATATGGGACACCCATTTTAAAGTTGAACTTCAGATAAACAATGA 1947

128503491 ATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCATGTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTA 128503550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 ATAAGTTTTAGTATAAGTATGTCCCATGTGCTATTTGGGATATATTTAAGCTAAAAATTA 2007

128503551 TTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACTGGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTG 128503610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 TTATTTATCTTAAATTCAAACTTAACTGGGCATCCTGTATTTTATCTGGCAATTCTAGTG 2067

128503611 ACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGGCAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCT 128503670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 ACACACCATGCTAGTGTTTCTCTTTGGCAGCTCAGCTATGAGTTCCTTGAGGGAAGGGCT 2127

128503671 TTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCTTAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAAC 128503730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 TTTTGAATTTGTTCACCTATGTATCCTTAGCACAATTCAGTCCTTAGCACACAGTAAAAC 2187

128503731 TCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGTGGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATG 128503790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 TCACAAAATGGTGTTGGAACAACATGTGGGTACTGTTTAAACCATTTGAACTAGTTTATG 2247

128503791 TACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAAACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGG 128503850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 TACATCATCTTATTGAGTCTCACAAAAACCCAGTGAAGGCGGGAAAAAATAGTGTGATGG 2307

128503851 TTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGATTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGT 128503910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 TTAATACTGAGTGTCAACTTGATTGGATTGAAGGATACAAAGTATTGATCCTGGGTGTGT 2367

128503911 CTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAACACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCC 128503970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 CTGTGAGGGTGTTGCAAAGGAGATTAACACTTGAGTCAGTGGGCTAGGAAAGACAGACCC 2427

128503971 ACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTAATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGG 128504030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 ACCCTTAATCTGGGTGGGCACAATCTAATCAGCTGCCAGCATGGCTAGAATATAAGCAGG 2487

128504031 CAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGCCTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCT 128504090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 CAGAAAAATGTGAAAAGAGAGACGGGCCTAGCCTCCCAGCCTACATCTTTCTCCCATGCT 2547

128504091 GGATGCTTCCTGCCCTCGAACATCGGACTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGG 128504150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 GGATGCTTCCTGCCCTCGAACATCGGACTCCAGGTTCTTCAGTTTTGGGACTCAGACAGG 2607

128504151 TTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCAGCCTACTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTA 128504210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 TTCTCCTTGCTCCTCAGCCTGCAGGCAGCCTACTGTGGAACCTTGTGATCATGTGAGCTA 2667

128504211 ATACTTAGCAAACTCATATATATATATTCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGAC 128504270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 ATACTTAGCAAACTCATATATATATATTCCATTAGTTCTATCCCTCCAGAGAACCCTGAC 2727

128504271 TAATACAAATAGGTATTATTATCTTCATTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGG 128504330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 TAATACAAATAGGTATTATTATCTTCATTGTACTAATAATGAAACCAGGGGACAGAGAGG 2787

128504331 AATGACTTACCCAAGACCATGTCATATGATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTC 128504390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 AATGACTTACCCAAGACCATGTCATATGATCATGACAGAGCCAGAACTCAGCCCAGGTTC 2847

128504391 TCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTAAACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACA 128504450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 TCCTGACTCCCTAGTTCTTTCCACTTAAACCACATTGCTGTTTTTCTGTGTGTGGCCACA 2907

128504451 GATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAAAACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATAC 128504510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 GATTTTATGCAACTTTGCAATTTTCAAAACTATTCCTAAGCTTTAAATAAATGATCATAC 2967

128504511 TTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGACTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCT 128504570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 TTGCTTTGGCTTTAAATGATATTATGACTCCACTGGTATAGCAGTGGTTTTAATATAGCT 3027

128504571 TGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGAATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGAC 128504630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 TGAGGTGTTTGAAGTTGAGCCTAGTGAATTTTTAATTAGGTATCAATCAAATCGAGAGAC 3087

128504631 TGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAAAGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAA 128504690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 TGGTTATAAAGCATCGTTTTCCAGTAAAGTCAGCAACATGGTAAATGATTTTATTGGTAA 3147

128504691 ACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATTATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGC 128504750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 ACCATGAGCTTTCTTTACATATTTATTATTATTATGTCAATATGGGTTTCCTCTATCTGC 3207

128504751 GTATGTATAGCAGTTGACAATATCAGCCACATTATTAGTTTGGTTTCCTCTGCTTGGCTA 128504810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 GTATGTATAGCAGTTGACAATATCAGCCACATTATTAGTTTGGTTTCCTCTGCTTGGCTA 3267

128504811 GCTTTTCAGTTGGGGTAAGTCTGCATTTCCTGTCTCAGCACTTATGAAGAAGTGGCAGTA 128504870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 GCTTTTCAGTTGGGGTAAGTCTGCATTTCCTGTCTCAGCACTTATGAAGAAGTGGCAGTA 3327

128504871 ACAGTAAAACTTATATTAACTTGTGCCCAAGTAATAAGCCCTCTGTTAATTGAAATTTTT 128504930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 ACAGTAAAACTTATATTAACTTGTGCCCAAGTAATAAGCCCTCTGTTAATTGAAATTTTT 3387

128504931 CTGCACTTAGCTCTTATGGGAAAAAAAGAGGCAATTATGTAAAGATGATGGACTGACAAA 128504990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 CTGCACTTAGCTCTTATGGGAAAAAAAGAGGCAATTATGTAAAGATGATGGACTGACAAA 3447

128504991 CATTTTTCCCCAGAAGCCTCTGGCACTGGTCTATTCAGTCCAATTTCCTGTACTACCTAT 128505050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 CATTTTTCCCCAGAAGCCTCTGGCACTGGTCTATTCAGTCCAATTTCCTGTACTACCTAT 3507

128505051 TTCCATGTAGAGTTCTAGAGGTAATGAGAAATCATCTCTTTGACCCTTGAAAAGGGCCCA 128505110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 TTCCATGTAGAGTTCTAGAGGTAATGAGAAATCATCTCTTTGACCCTTGAAAAGGGCCCA 3567

128505111 GCTCTCTACTAGGTGCTATGAGGCCCAAAAGGGGTAGAAAGCAACTAATATTTATGACGT 128505170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 GCTCTCTACTAGGTGCTATGAGGCCCAAAAGGGGTAGAAAGCAACTAATATTTATGACGT 3627

128505171 GACTACTATGAATATTTCTGGAAGAATACTCAAGAAGCTGGTGACTGTGGATTTCTCCTG 128505230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 GACTACTATGAATATTTCTGGAAGAATACTCAAGAAGCTGGTGACTGTGGATTTCTCCTG 3687

128505231 GGAGGAAAGCTGAGTGACTAGGGCACAAGAGTGAAAAGGAGGCTAGCTCTGCACTGCATC 128505290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 GGAGGAAAGCTGAGTGACTAGGGCACAAGAGTGAAAAGGAGGCTAGCTCTGCACTGCATC 3747

128505291 CCCTTGTGTACATTTTGAATTTTGTAACGCAAACTTGCATTACCTAATCAAAGAAATTAT 128505350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 CCCTTGTGTACATTTTGAATTTTGTAACGCAAACTTGCATTACCTAATCAAAGAAATTAT 3807

128505351 TTTTCAATGCCCACCATGTTTTTTGCATGATCTAATTAATTCTCATAATGACCCTTTGAG 128505410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 TTTTCAATGCCCACCATGTTTTTTGCATGATCTAATTAATTCTCATAATGACCCTTTGAG 3867

128505411 GTAAGTATTGTTAACATTCTTATTTTATAGAGGGAAAACTGAGGTTCTGAGAGTTTAAGT 128505470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 GTAAGTATTGTTAACATTCTTATTTTATAGAGGGAAAACTGAGGTTCTGAGAGTTTAAGT 3927

128505471 CACTCACCCCAGCTCATATTATTCTGAACAAGTCCAATCAAGGTCATCAGAACCTCCCAG 128505530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 CACTCACCCCAGCTCATATTATTCTGAACAAGTCCAATCAAGGTCATCAGAACCTCCCAG 3987

128505531 CTAATCTCTGGGAGGTCAGAGATTGAACCTGGCCAGAATCTGAACAGGGTCTACATCCCT 128505590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 CTAATCTCTGGGAGGTCAGAGATTGAACCTGGCCAGAATCTGAACAGGGTCTACATCCCT 4047

128505591 CCAAAGCTATGCTAGCTATCCTGCTCCCCAAAGAAGATGAAAACTGAGTATTCAATTGCA 128505650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 CCAAAGCTATGCTAGCTATCCTGCTCCCCAAAGAAGATGAAAACTGAGTATTCAATTGCA 4107

128505651 AGAAGAATCTTGTTGTAGAACTAAGACATACAATTCTAAACAGTTAATTATATTTCATTA 128505710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 AGAAGAATCTTGTTGTAGAACTAAGACATACAATTCTAAACAGTTAATTATATTTCATTA 4167

128505711 ATTGTAAGAAATGCATTTTAAATTTTCTGAAATTAAGATATGTCTTCTAAGGGATAGTGT 128505770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 ATTGTAAGAAATGCATTTTAAATTTTCTGAAATTAAGATATGTCTTCTAAGGGATAGTGT 4227

128505771 GCTGTAGTATATTTGAAGGTGTTTTGTTTTTCTCAGTGATTCATAAGATAATGGTACGTG 128505830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 GCTGTAGTATATTTGAAGGTGTTTTGTTTTTCTCAGTGATTCATAAGATAATGGTACGTG 4287

128505831 TTCCAACCAATGGCTTCTTGAGGTCAGTGAAATATGGTGCCAATATAGTGCAGAAAATCA 128505890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 TTCCAACCAATGGCTTCTTGAGGTCAGTGAAATATGGTGCCAATATAGTGCAGAAAATCA 4347

128505891 AAAAGTCTAAACCAGCAGCACAAGCAGTAAGTGATGTAGGAGCTCTGAAGAAGTAACATC 128505950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 AAAAGTCTAAACCAGCAGCACAAGCAGTAAGTGATGTAGGAGCTCTGAAGAAGTAACATC 4407

128505951 CTCTTCTGTAAGAGTTGCTAGGGTAGGCTTTATGTTGATTTGAGCTAAGCCTCAACGATT 128506010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 CTCTTCTGTAAGAGTTGCTAGGGTAGGCTTTATGTTGATTTGAGCTAAGCCTCAACGATT 4467

128506011 GGGCAGTGTATCTGTTATCTATTGCCACAAAGTACTGTACAATAAACAACCCCAAAACTC 128506070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 GGGCAGTGTATCTGTTATCTATTGCCACAAAGTACTGTACAATAAACAACCCCAAAACTC 4527

128506071 AGTGTCTTAAAACAGCAACCATGTATTTACTATTGCTCTTGAGTTTAGAGATTAGCTGGG 128506130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 AGTGTCTTAAAACAGCAACCATGTATTTACTATTGCTCTTGAGTTTAGAGATTAGCTGGG 4587

128506131 AGGTTCTGATGATCTTTATTAGACTTACTCACTTGTCTATGGTCAGATGAAGGTCAGCTG 128506190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 AGGTTCTGATGATCTTTATTAGACTTACTCACTTGTCTATGGTCAGATGAAGGTCAGCTG 4647

128506191 ACTGGTCTTGGCCAGGCTCACTCATGTCTGCATATCAGCTGACTGTTGGCTGATCTAGAA 128506250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 ACTGGTCTTGGCCAGGCTCACTCATGTCTGCATATCAGCTGACTGTTGGCTGATCTAGAA 4707

128506251 TGCCCTCATTGAGGAAGGGATGGTGTGGCTCTGTTCCATTTGTTTCTCCCATACCCCCAG 128506310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 TGCCCTCATTGAGGAAGGGATGGTGTGGCTCTGTTCCATTTGTTTCTCCCATACCCCCAG 4767

128506311 CAGGCTAGCCTAAGCATGTTCTCATGGATATAGCAAGAGAGCAAGAGCAGAGATACAAGA 128506370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 CAGGCTAGCCTAAGCATGTTCTCATGGATATAGCAAGAGAGCAAGAGCAGAGATACAAGA 4827

128506371 GTGAGCAGGAGGAAAGCTGCAAGCATTTTTCTAGCCTTTGTTTGCAACATGTTTGCTAAC 128506430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 GTGAGCAGGAGGAAAGCTGCAAGCATTTTTCTAGCCTTTGTTTGCAACATGTTTGCTAAC 4887

128506431 ATCTTGCTGACCAAAGCATGGCATGGCTTAGCCCAAAGATGAGGCAGAACACAGCACCTT 128506490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 ATCTTGCTGACCAAAGCATGGCATGGCTTAGCCCAAAGATGAGGCAGAACACAGCACCTT 4947

128506491 TAATGAGAGAAGTGAAGCAATCAGTCTGTCACAGGTAAGCTTCAGATCTGCAGGTTGAAG 128506550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 TAATGAGAGAAGTGAAGCAATCAGTCTGTCACAGGTAAGCTTCAGATCTGCAGGTTGAAG 5007

128506551 AAAGGAGGGCTTTCGTTGCTGGCTAGGAGAGATCTTGCAGGGAGAGAGGAGTCATCCAAA 128506610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 AAAGGAGGGCTTTCGTTGCTGGCTAGGAGAGATCTTGCAGGGAGAGAGGAGTCATCCAAA 5067

128506611 TGGACTCTGTGTGTCTTTGAGAGAGTTGTTACATTAGCAAAGATAGTACCATTCAAGGTG 128506670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 TGGACTCTGTGTGTCTTTGAGAGAGTTGTTACATTAGCAAAGATAGTACCATTCAAGGTG 5127

128506671 ATAACTGAGATTTTGTAGCAACTATGTTAGCAATGACAATAGGGAATAGTTGTTTGAAAC 128506730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5128 ATAACTGAGATTTTGTAGCAACTATGTTAGCAATGACAATAGGGAATAGTTGTTTGAAAC 5187

128506731 CAGGATAGAGCAATCATCTCGTAAATCTGACCTCTCCTGCCTCTACCCCTAGAAGTTCCT 128506790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 CAGGATAGAGCAATCATCTCGTAAATCTGACCTCTCCTGCCTCTACCCCTAGAAGTTCCT 5247

128506791 GAAGCTCAACCATTGAACCCTAAGTTTCTGCAAATTATAGTTTGAAATACA 128506841
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 GAAGCTCAACCATTGAACCCTAAGTTTCTGCAAATTATAGTTTGAAATACA 5298

Alignment time is 5.06203 s

