
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     5293] =>      5293 nucs 'mol-32-1e87-129716_5293'

Score:        5293
Aligned:      5293        nucs
Identic:      5293 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126326495,126331787]
 second seq =>  [        1,     5293]

126326495 CTCTGTATTCATTTAAGAAATTGAATGTCAAGGAAAACTGACAAAAAAAGGGAAACAGGT 126326554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCTGTATTCATTTAAGAAATTGAATGTCAAGGAAAACTGACAAAAAAAGGGAAACAGGT 60

126326555 AGAAGTATGGGAATGAAGGTGAAGGGAAATATACGGATGGTGATAATTCATTGTGCATCG 126326614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAAGTATGGGAATGAAGGTGAAGGGAAATATACGGATGGTGATAATTCATTGTGCATCG 120

126326615 TATTTTAGAAGATGTAGTAATAGTAAATGAAACAATTCAGATGGAATAAAACAAAGAAAA 126326674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTTTAGAAGATGTAGTAATAGTAAATGAAACAATTCAGATGGAATAAAACAAAGAAAA 180

126326675 ATTTTGGTATCTCTTTATTCTAGTTATTATATTTTTTGTACATTCATAAGTTGAGGCTAT 126326734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTTGGTATCTCTTTATTCTAGTTATTATATTTTTTGTACATTCATAAGTTGAGGCTAT 240

126326735 CATTAAAGAAGATATTAAAGGTAAAATAATATTTCATTAGGGTACTGTAGAGCTTCACTG 126326794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATTAAAGAAGATATTAAAGGTAAAATAATATTTCATTAGGGTACTGTAGAGCTTCACTG 300

126326795 GATAAATTCTGGCTAAATAACAAAAATTGACCTAAGAAGTGAGCATATCAGTTGGATCTT 126326854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATAAATTCTGGCTAAATAACAAAAATTGACCTAAGAAGTGAGCATATCAGTTGGATCTT 360

126326855 GAGCCAAAGATCTGATAAGGGCACTCAATAAGACTCTCAGTAAAAAGTGAATTGACCCAA 126326914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGCCAAAGATCTGATAAGGGCACTCAATAAGACTCTCAGTAAAAAGTGAATTGACCCAA 420

126326915 GGGAAATTCTTGCACCTTCTATAGAAAGGTGGATAAAAATACCCTTATAGAACTTTTTCT 126326974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGAAATTCTTGCACCTTCTATAGAAAGGTGGATAAAAATACCCTTATAGAACTTTTTCT 480

126326975 ATCAGAAGATTGATAAGTTGATAGAAAAACAAAGGAGTTATCAAACAAAAACCAAAAATA 126327034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCAGAAGATTGATAAGTTGATAGAAAAACAAAGGAGTTATCAAACAAAAACCAAAAATA 540

126327035 AAACTAATAAAAACATTCCTCATCACAGACGGATCTATGAAAATGAATACAGAAGAATAA 126327094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACTAATAAAAACATTCCTCATCACAGACGGATCTATGAAAATGAATACAGAAGAATAA 600

126327095 AAAAATATTATCAGGGTGATTCACAGGAGTTTCTAAAAAATGTGCATTTCAGTTCCTGAA 126327154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAATATTATCAGGGTGATTCACAGGAGTTTCTAAAAAATGTGCATTTCAGTTCCTGAA 660

126327155 ACATGAATATATGTTAGATTTTATGGCAAAGGAAAATTAAGATTGTGAATCAATTGACCT 126327214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATGAATATATGTTAGATTTTATGGCAAAGGAAAATTAAGATTGTGAATCAATTGACCT 720

126327215 TAAAATAGGAGATTATCCTGTATTATCTTGTTAGGCTCAATGTAAACAAAATGGTCTTGA 126327274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAAATAGGAGATTATCCTGTATTATCTTGTTAGGCTCAATGTAAACAAAATGGTCTTGA 780

126327275 AATGTGGAAGTGGGAGGCAGAAGAGAAGTCAATGTCATACTGAGGCAGAAGCAAAGGAAA 126327334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATGTGGAAGTGGGAGGCAGAAGAGAAGTCAATGTCATACTGAGGCAGAAGCAAAGGAAA 840

126327335 AATCAGTTAGGTAGATAGCTAAGGCTAGTCCTCAGAAAAGCAGCCTGCCTGAAAAATCTC 126327394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATCAGTTAGGTAGATAGCTAAGGCTAGTCCTCAGAAAAGCAGCCTGCCTGAAAAATCTC 900

126327395 AGCTACAGGCAAAAATTTAGCAGCCTGGGAAAACTCAGACTGCACCTGCACAGATAAGCA 126327454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCTACAGGCAAAAATTTAGCAGCCTGGGAAAACTCAGACTGCACCTGCACAGATAAGCA 960

126327455 GGCAGGTTCCAGCACAGAAGCCTTTTGTTTTTTGTGTTATTAACGGGCTCCCAGGACAAA 126327514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCAGGTTCCAGCACAGAAGCCTTTTGTTTTTTGTGTTATTAACGGGCTCCCAGGACAAA 1020

126327515 ATTTTCTCTCCTTTTCAGACATGTTCATGGTGGGTTCTGTGGAAACTTGCATAAGGAGGA 126327574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTTCTCTCCTTTTCAGACATGTTCATGGTGGGTTCTGTGGAAACTTGCATAAGGAGGA 1080

126327575 GGAGGTCTCACCTAAAACAAACCCACAGTTACACAAACAAGTGGCGCTTTGTGCTTTCCT 126327634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGAGGTCTCACCTAAAACAAACCCACAGTTACACAAACAAGTGGCGCTTTGTGCTTTCCT 1140

126327635 AGAGATAAACCCACAGCTGCGTAAGAGGAGTTGTGCAGACAGCTTCACCGATAAGTTACT 126327694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAGATAAACCCACAGCTGCGTAAGAGGAGTTGTGCAGACAGCTTCACCGATAAGTTACT 1200

126327695 CAAACAGCTACAGAGATGAGAAGAGTTTCTCATAAAGTTTTTGGATTCAACTGTGTAAAC 126327754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAACAGCTACAGAGATGAGAAGAGTTTCTCATAAAGTTTTTGGATTCAACTGTGTAAAC 1260

126327755 GGCAACCCACTTGGGCTCCCCTCTCTACTGTGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCTTATTGCAC 126327814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCAACCCACTTGGGCTCCCCTCTCTACTGTGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCTTATTGCAC 1320

126327815 TTTTGTTCCAATATGACCCTTTGTGTCCATGCTCCTTAATTCTCTTGGTCATGAGACAAC 126327874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTGTTCCAATATGACCCTTTGTGTCCATGCTCCTTAATTCTCTTGGTCATGAGACAAC 1380

126327875 GAGCTTTTATAACACCTTAGACAATCAGACCAGTGACCACTGACCTGTTTTAATAGTGAT 126327934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGCTTTTATAACACCTTAGACAATCAGACCAGTGACCACTGACCTGTTTTAATAGTGAT 1440

126327935 GCAATGGGAGAAAGACTCCATCTATTCATTAATATCTCTGAAGATGGAAGGAGATGAGTA 126327994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCAATGGGAGAAAGACTCCATCTATTCATTAATATCTCTGAAGATGGAAGGAGATGAGTA 1500

126327995 GCTGAGAAATTTGGGCAGCCTCTAGAAACTGAACAAGGCAAGGAAACAGATTGTCCTCTA 126328054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTGAGAAATTTGGGCAGCCTCTAGAAACTGAACAAGGCAAGGAAACAGATTGTCCTCTA 1560

126328055 GAACCTTCAAAATAGACAGCCAGAGTAAACCTTAATTTTATCCCAGTAAAACTCATTTTG 126328114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAACCTTCAAAATAGACAGCCAGAGTAAACCTTAATTTTATCCCAGTAAAACTCATTTTG 1620

126328115 ATCCTCTGACTCCCAGAGCTGTAGCAGAATACATTTACATTGTTTTAAGCCAATAAGTCT 126328174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATCCTCTGACTCCCAGAGCTGTAGCAGAATACATTTACATTGTTTTAAGCCAATAAGTCT 1680

126328175 GTAGCAATTTTTTACAGCAGGAATAGGAATCTAACATAGCATGTATTGGGGGGAATAAAG 126328234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTAGCAATTTTTTACAGCAGGAATAGGAATCTAACATAGCATGTATTGGGGGGAATAAAG 1740

126328235 GAAATTTAAGTCCCCCCTTTATATATGTAACCAGTAAACTGAAGATGAATTAACATTTTT 126328294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAAATTTAAGTCCCCCCTTTATATATGTAACCAGTAAACTGAAGATGAATTAACATTTTT 1800

126328295 AATATTATAAAAATTGAAGTAAATACATTCTAATGCTAAATATTAAAATAGAGAAAATGA 126328354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATATTATAAAAATTGAAGTAAATACATTCTAATGCTAAATATTAAAATAGAGAAAATGA 1860

126328355 GATTAATGACTAATTGATCTTGAAATAGGTAAGACATTTGTAAGTATTAAATCAGTTTTG 126328414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATTAATGACTAATTGATCTTGAAATAGGTAAGACATTTGTAAGTATTAAATCAGTTTTG 1920

126328415 ACCTTATTAAATATTTTAGTAATAAAATTTCTTTGAACTAAGTCACAAAGAAAATAGCAA 126328474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACCTTATTAAATATTTTAGTAATAAAATTTCTTTGAACTAAGTCACAAAGAAAATAGCAA 1980

126328475 GGTAGAAAAACTACTAGAAACAAATGTGAGAAGTGAGGGCAATATATTTTATATATAAAG 126328534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGTAGAAAAACTACTAGAAACAAATGTGAGAAGTGAGGGCAATATATTTTATATATAAAG 2040

126328535 GTTTATAATACATCAAAACGAACTCTTTACTCTCTAGAGAAACACATGCAAGGAACATGA 126328594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTTTATAATACATCAAAACGAACTCTTTACTCTCTAGAGAAACACATGCAAGGAACATGA 2100

126328595 ATTGACAATTAAAAAAGAAAATAAAATAATAAACATGAAATCAAGTTTTACTTTAAAAAG 126328654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTGACAATTAAAAAAGAAAATAAAATAATAAACATGAAATCAAGTTTTACTTTAAAAAG 2160

126328655 TAATGACAATAGAATATATAACATTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAGAATGTATG 126328714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAATGACAATAGAATATATAACATTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAGAATGTATG 2220

126328715 CAATCTATCACAGCTTACCTAACCTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGTGTTAA 126328774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAATCTATCACAGCTTACCTAACCTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGTGTTAA 2280

126328775 CAATAATATTTTCATGAAGTTAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAGTGTTT 126328834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAATAATATTTTCATGAAGTTAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAGTGTTT 2340

126328835 ATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAATTAAACATTCTATTAACTGTTATTAATTAAA 126328894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAATTAAACATTCTATTAACTGTTATTAATTAAA 2400

126328895 TAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGAAATAC 126328954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGAAATAC 2460

126328955 ATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAACGGACA 126329014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAACGGACA 2520

126329015 ACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATTCATTA 126329074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATTCATTA 2580

126329075 ATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGAT 126329134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGAT 2640

126329135 AATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGT 126329194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGT 2700

126329195 GGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTG 126329254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTG 2760

126329255 GTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTAT 126329314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTAT 2820

126329315 AAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACA 126329374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACA 2880

126329375 AAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTT 126329434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTT 2940

126329435 GTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTT 126329494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTT 3000

126329495 TTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 126329554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 3060

126329555 GCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGC 126329614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGC 3120

126329615 CTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTT 126329674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTT 3180

126329675 TAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTG 126329734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTG 3240

126329735 ATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGC 126329794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGC 3300

126329795 CTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACT 126329854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACT 3360

126329855 GGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTA 126329914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTA 3420

126329915 TAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATG 126329974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATG 3480

126329975 AGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGA 126330034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGA 3540

126330035 ACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGT 126330094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGT 3600

126330095 AACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTAT 126330154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTAT 3660

126330155 GAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACT 126330214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACT 3720

126330215 AAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTA 126330274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTA 3780

126330275 CCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACT 126330334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACT 3840

126330335 ATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTA 126330394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTA 3900

126330395 CTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAAT 126330454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAAT 3960

126330455 GCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAA 126330514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAA 4020

126330515 GCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCT 126330574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCT 4080

126330575 GCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAG 126330634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAG 4140

126330635 TGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGT 126330694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGT 4200

126330695 CTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGAC 126330754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGAC 4260

126330755 TGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAA 126330814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAA 4320

126330815 AGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCA 126330874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCA 4380

126330875 GGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGG 126330934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGG 4440

126330935 CTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGG 126330994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGG 4500

126330995 GCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAG 126331054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAG 4560

126331055 AACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATA 126331114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATA 4620

126331115 AACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACA 126331174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACA 4680

126331175 GAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGT 126331234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGT 4740

126331235 GATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCT 126331294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCT 4800

126331295 TCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAG 126331354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAG 4860

126331355 AACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAA 126331414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAA 4920

126331415 TTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAGAAA 126331474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAGAAA 4980

126331475 GAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATTACT 126331534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATTACT 5040

126331535 AGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTCATC 126331594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTCATC 5100

126331595 TTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATTAAC 126331654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATTAAC 5160

126331655 AGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAACAAA 126331714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAACAAA 5220

126331715 ATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTG 126331774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTG 5280

126331775 AAATAATAAGAGC 126331787
          |||||||||||||
     5281 AAATAATAAGAGC 5293

Alignment time is 5.69738 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     3009] =>      3009 nucs 'mol-32-1e87-186127_3009'

Score:        3009
Aligned:      3009        nucs
Identic:      3009 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126327234,126330242]
 second seq =>  [        1,     3009]

126327234 GTATTATCTTGTTAGGCTCAATGTAAACAAAATGGTCTTGAAATGTGGAAGTGGGAGGCA 126327293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTATTATCTTGTTAGGCTCAATGTAAACAAAATGGTCTTGAAATGTGGAAGTGGGAGGCA 60

126327294 GAAGAGAAGTCAATGTCATACTGAGGCAGAAGCAAAGGAAAAATCAGTTAGGTAGATAGC 126327353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAGAGAAGTCAATGTCATACTGAGGCAGAAGCAAAGGAAAAATCAGTTAGGTAGATAGC 120

126327354 TAAGGCTAGTCCTCAGAAAAGCAGCCTGCCTGAAAAATCTCAGCTACAGGCAAAAATTTA 126327413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAGGCTAGTCCTCAGAAAAGCAGCCTGCCTGAAAAATCTCAGCTACAGGCAAAAATTTA 180

126327414 GCAGCCTGGGAAAACTCAGACTGCACCTGCACAGATAAGCAGGCAGGTTCCAGCACAGAA 126327473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAGCCTGGGAAAACTCAGACTGCACCTGCACAGATAAGCAGGCAGGTTCCAGCACAGAA 240

126327474 GCCTTTTGTTTTTTGTGTTATTAACGGGCTCCCAGGACAAAATTTTCTCTCCTTTTCAGA 126327533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCTTTTGTTTTTTGTGTTATTAACGGGCTCCCAGGACAAAATTTTCTCTCCTTTTCAGA 300

126327534 CATGTTCATGGTGGGTTCTGTGGAAACTTGCATAAGGAGGAGGAGGTCTCACCTAAAACA 126327593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATGTTCATGGTGGGTTCTGTGGAAACTTGCATAAGGAGGAGGAGGTCTCACCTAAAACA 360

126327594 AACCCACAGTTACACAAACAAGTGGCGCTTTGTGCTTTCCTAGAGATAAACCCACAGCTG 126327653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACCCACAGTTACACAAACAAGTGGCGCTTTGTGCTTTCCTAGAGATAAACCCACAGCTG 420

126327654 CGTAAGAGGAGTTGTGCAGACAGCTTCACCGATAAGTTACTCAAACAGCTACAGAGATGA 126327713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CGTAAGAGGAGTTGTGCAGACAGCTTCACCGATAAGTTACTCAAACAGCTACAGAGATGA 480

126327714 GAAGAGTTTCTCATAAAGTTTTTGGATTCAACTGTGTAAACGGCAACCCACTTGGGCTCC 126327773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAGAGTTTCTCATAAAGTTTTTGGATTCAACTGTGTAAACGGCAACCCACTTGGGCTCC 540

126327774 CCTCTCTACTGTGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCTTATTGCACTTTTGTTCCAATATGACCC 126327833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTCTCTACTGTGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCTTATTGCACTTTTGTTCCAATATGACCC 600

126327834 TTTGTGTCCATGCTCCTTAATTCTCTTGGTCATGAGACAACGAGCTTTTATAACACCTTA 126327893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTGTGTCCATGCTCCTTAATTCTCTTGGTCATGAGACAACGAGCTTTTATAACACCTTA 660

126327894 GACAATCAGACCAGTGACCACTGACCTGTTTTAATAGTGATGCAATGGGAGAAAGACTCC 126327953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GACAATCAGACCAGTGACCACTGACCTGTTTTAATAGTGATGCAATGGGAGAAAGACTCC 720

126327954 ATCTATTCATTAATATCTCTGAAGATGGAAGGAGATGAGTAGCTGAGAAATTTGGGCAGC 126328013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCTATTCATTAATATCTCTGAAGATGGAAGGAGATGAGTAGCTGAGAAATTTGGGCAGC 780

126328014 CTCTAGAAACTGAACAAGGCAAGGAAACAGATTGTCCTCTAGAACCTTCAAAATAGACAG 126328073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCTAGAAACTGAACAAGGCAAGGAAACAGATTGTCCTCTAGAACCTTCAAAATAGACAG 840

126328074 CCAGAGTAAACCTTAATTTTATCCCAGTAAAACTCATTTTGATCCTCTGACTCCCAGAGC 126328133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAGAGTAAACCTTAATTTTATCCCAGTAAAACTCATTTTGATCCTCTGACTCCCAGAGC 900

126328134 TGTAGCAGAATACATTTACATTGTTTTAAGCCAATAAGTCTGTAGCAATTTTTTACAGCA 126328193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTAGCAGAATACATTTACATTGTTTTAAGCCAATAAGTCTGTAGCAATTTTTTACAGCA 960

126328194 GGAATAGGAATCTAACATAGCATGTATTGGGGGGAATAAAGGAAATTTAAGTCCCCCCTT 126328253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAATAGGAATCTAACATAGCATGTATTGGGGGGAATAAAGGAAATTTAAGTCCCCCCTT 1020

126328254 TATATATGTAACCAGTAAACTGAAGATGAATTAACATTTTTAATATTATAAAAATTGAAG 126328313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATATATGTAACCAGTAAACTGAAGATGAATTAACATTTTTAATATTATAAAAATTGAAG 1080

126328314 TAAATACATTCTAATGCTAAATATTAAAATAGAGAAAATGAGATTAATGACTAATTGATC 126328373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAATACATTCTAATGCTAAATATTAAAATAGAGAAAATGAGATTAATGACTAATTGATC 1140

126328374 TTGAAATAGGTAAGACATTTGTAAGTATTAAATCAGTTTTGACCTTATTAAATATTTTAG 126328433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGAAATAGGTAAGACATTTGTAAGTATTAAATCAGTTTTGACCTTATTAAATATTTTAG 1200

126328434 TAATAAAATTTCTTTGAACTAAGTCACAAAGAAAATAGCAAGGTAGAAAAACTACTAGAA 126328493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAATAAAATTTCTTTGAACTAAGTCACAAAGAAAATAGCAAGGTAGAAAAACTACTAGAA 1260

126328494 ACAAATGTGAGAAGTGAGGGCAATATATTTTATATATAAAGGTTTATAATACATCAAAAC 126328553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAAATGTGAGAAGTGAGGGCAATATATTTTATATATAAAGGTTTATAATACATCAAAAC 1320

126328554 GAACTCTTTACTCTCTAGAGAAACACATGCAAGGAACATGAATTGACAATTAAAAAAGAA 126328613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAACTCTTTACTCTCTAGAGAAACACATGCAAGGAACATGAATTGACAATTAAAAAAGAA 1380

126328614 AATAAAATAATAAACATGAAATCAAGTTTTACTTTAAAAAGTAATGACAATAGAATATAT 126328673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATAAAATAATAAACATGAAATCAAGTTTTACTTTAAAAAGTAATGACAATAGAATATAT 1440

126328674 AACATTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAGAATGTATGCAATCTATCACAGCTTACC 126328733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACATTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAGAATGTATGCAATCTATCACAGCTTACC 1500

126328734 TAACCTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGTGTTAACAATAATATTTTCATGAAG 126328793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAACCTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGTGTTAACAATAATATTTTCATGAAG 1560

126328794 TTAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAGTGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCAC 126328853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAGTGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCAC 1620

126328854 ATGTAAACAATTAAACATTCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATTAAAATGAT 126328913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGTAAACAATTAAACATTCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATTAAAATGAT 1680

126328914 ATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTG 126328973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTG 1740

126328974 GGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTA 126329033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTA 1800

126329034 CAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGA 126329093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGA 1860

126329094 GTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCA 126329153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCA 1920

126329154 ATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATG 126329213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATG 1980

126329214 CTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATT 126329273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATT 2040

126329274 CCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCA 126329333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCA 2100

126329334 GCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAA 126329393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAA 2160

126329394 TACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATG 126329453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATG 2220

126329454 TATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTT 126329513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTT 2280

126329514 GAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGC 126329573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGC 2340

126329574 AACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATT 126329633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATT 2400

126329634 ATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCA 126329693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCA 2460

126329694 CCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTC 126329753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTC 2520

126329754 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAA 126329813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAA 2580

126329814 CTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAA 126329873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAA 2640

126329874 AATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCAT 126329933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCAT 2700

126329934 TGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTG 126329993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTG 2760

126329994 GTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCA 126330053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCA 2820

126330054 ACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACC 126330113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACC 2880

126330114 AAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAG 126330173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAG 2940

126330174 AATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGT 126330233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGT 3000

126330234 ATACTGCTC 126330242
          |||||||||
     3001 ATACTGCTC 3009

Alignment time is 3.18323 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2644] =>      2644 nucs 'mol-32-1e87-194443_2644'

Score:        2600
Aligned:      2644        nucs
Identic:      2640 (100%) nucs =>        42 (100%)      2598 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126328829,126328870] EXCISED REGION [126328872,126331473]
 second seq =>  [        1,       42] EXCISED REGION [       44,     2644]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126328871,126328871]
 second seq =>         1 nucs [43,43]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [126329667,126329667]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [126328871,126328871] to [126328872,126328872]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126328829 GTGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAATTAAACA 126328870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAATTAAACA 42

EXCISED REGION

126328872 TCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAAT 126328931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       44 TCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAAT 103

126328932 GTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAA 126328991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      104 GTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAA 163

126328992 GTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAAT 126329051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      164 GTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAAT 223

126329052 AAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAAT 126329111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      224 AAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAAT 283

126329112 AAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTA 126329171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      284 AAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTA 343

126329172 TTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAG 126329231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      344 TTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAG 403

126329232 TCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTC 126329291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      404 TCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTC 463

126329292 ATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAG 126329351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      464 ATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAG 523

126329352 AGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAA 126329411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      524 AGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAA 583

126329412 TTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAA 126329471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      584 TTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAA 643

126329472 ACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCT 126329531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      644 ACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCT 703

126329532 GTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTT 126329591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      704 GTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGT 763

126329592 TCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGT 126329651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      764 TCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGT 823

126329652 ACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 126329711
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      824 ACCCGGCTAATTTTT-TGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 882

126329712 TCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 126329771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      883 TCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 942

126329772 AGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTA 126329831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      943 AGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTA 1002

126329832 TTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAA 126329891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1003 TTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAA 1062

126329892 AAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCA 126329951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1063 AAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCA 1122

126329952 ACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGA 126330011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 ACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGA 1182

126330012 ATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTG 126330071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1183 ATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTG 1242

126330072 CTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCA 126330131
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 CTGGCCATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCA 1302

126330132 CTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTT 126330191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 CTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTT 1362

126330192 GGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGG 126330251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 GGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGG 1422

126330252 GTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGG 126330311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 GTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGG 1482

126330312 TGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGAT 126330371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 TGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGAT 1542

126330372 GAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATG 126330431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 GAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATG 1602

126330432 CAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCC 126330491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 CAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCC 1662

126330492 CGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTC 126330551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 CGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTC 1722

126330552 TGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACT 126330611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 TGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACT 1782

126330612 CACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCAT 126330671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 CACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCAT 1842

126330672 GGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACA 126330731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 GGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACA 1902

126330732 AAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAA 126330791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 AAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAA 1962

126330792 AGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCA 126330851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 AGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCA 2022

126330852 TGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCAC 126330911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 TGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCAC 2082

126330912 ACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATT 126330971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 ACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATT 2142

126330972 TACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTG 126331031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 TACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTG 2202

126331032 ATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATA 126331091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 ATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATA 2262

126331092 AACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACA 126331151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 AACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACA 2322

126331152 CCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCA 126331211
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2323 CCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAGGAACCA 2382

126331212 GTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTA 126331271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 GTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTA 2442

126331272 ATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGA 126331331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 ATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGA 2502

126331332 ATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATT 126331391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 ATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATT 2562

126331392 CAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAA 126331451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 CAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAA 2622

126331452 CCAGACAAGGACCTAACAAGAA 126331473
          ||||||||||||||||||||||
     2623 CCAGACAAGGACCTAACAAGAA 2644

Alignment time is 3.26721 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     6341] =>      6341 nucs 'mol-32-1eea-071803_6341'

Score:        6340
Aligned:      6340        nucs
Identic:      6340 (100%) nucs =>      5732 (100%)       608 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126326626,126332357] EXCISED REGION [126332359,126332966]
 second seq =>  [        1,     5732] EXCISED REGION [     5734,     6341]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126332358,126332358]
 second seq =>         1 nucs [5733,5733]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [5733,5733] to [5734,5734]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126326626 ATGTAGTAATAGTAAATGAAACAATTCAGATGGAATAAAACAAAGAAAAATTTTGGTATC 126326685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTAGTAATAGTAAATGAAACAATTCAGATGGAATAAAACAAAGAAAAATTTTGGTATC 60

126326686 TCTTTATTCTAGTTATTATATTTTTTGTACATTCATAAGTTGAGGCTATCATTAAAGAAG 126326745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTTATTCTAGTTATTATATTTTTTGTACATTCATAAGTTGAGGCTATCATTAAAGAAG 120

126326746 ATATTAAAGGTAAAATAATATTTCATTAGGGTACTGTAGAGCTTCACTGGATAAATTCTG 126326805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATTAAAGGTAAAATAATATTTCATTAGGGTACTGTAGAGCTTCACTGGATAAATTCTG 180

126326806 GCTAAATAACAAAAATTGACCTAAGAAGTGAGCATATCAGTTGGATCTTGAGCCAAAGAT 126326865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTAAATAACAAAAATTGACCTAAGAAGTGAGCATATCAGTTGGATCTTGAGCCAAAGAT 240

126326866 CTGATAAGGGCACTCAATAAGACTCTCAGTAAAAAGTGAATTGACCCAAGGGAAATTCTT 126326925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGATAAGGGCACTCAATAAGACTCTCAGTAAAAAGTGAATTGACCCAAGGGAAATTCTT 300

126326926 GCACCTTCTATAGAAAGGTGGATAAAAATACCCTTATAGAACTTTTTCTATCAGAAGATT 126326985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCACCTTCTATAGAAAGGTGGATAAAAATACCCTTATAGAACTTTTTCTATCAGAAGATT 360

126326986 GATAAGTTGATAGAAAAACAAAGGAGTTATCAAACAAAAACCAAAAATAAAACTAATAAA 126327045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATAAGTTGATAGAAAAACAAAGGAGTTATCAAACAAAAACCAAAAATAAAACTAATAAA 420

126327046 AACATTCCTCATCACAGACGGATCTATGAAAATGAATACAGAAGAATAAAAAAATATTAT 126327105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACATTCCTCATCACAGACGGATCTATGAAAATGAATACAGAAGAATAAAAAAATATTAT 480

126327106 CAGGGTGATTCACAGGAGTTTCTAAAAAATGTGCATTTCAGTTCCTGAAACATGAATATA 126327165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGGGTGATTCACAGGAGTTTCTAAAAAATGTGCATTTCAGTTCCTGAAACATGAATATA 540

126327166 TGTTAGATTTTATGGCAAAGGAAAATTAAGATTGTGAATCAATTGACCTTAAAATAGGAG 126327225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTTAGATTTTATGGCAAAGGAAAATTAAGATTGTGAATCAATTGACCTTAAAATAGGAG 600

126327226 ATTATCCTGTATTATCTTGTTAGGCTCAATGTAAACAAAATGGTCTTGAAATGTGGAAGT 126327285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTATCCTGTATTATCTTGTTAGGCTCAATGTAAACAAAATGGTCTTGAAATGTGGAAGT 660

126327286 GGGAGGCAGAAGAGAAGTCAATGTCATACTGAGGCAGAAGCAAAGGAAAAATCAGTTAGG 126327345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGAGGCAGAAGAGAAGTCAATGTCATACTGAGGCAGAAGCAAAGGAAAAATCAGTTAGG 720

126327346 TAGATAGCTAAGGCTAGTCCTCAGAAAAGCAGCCTGCCTGAAAAATCTCAGCTACAGGCA 126327405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGATAGCTAAGGCTAGTCCTCAGAAAAGCAGCCTGCCTGAAAAATCTCAGCTACAGGCA 780

126327406 AAAATTTAGCAGCCTGGGAAAACTCAGACTGCACCTGCACAGATAAGCAGGCAGGTTCCA 126327465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAATTTAGCAGCCTGGGAAAACTCAGACTGCACCTGCACAGATAAGCAGGCAGGTTCCA 840

126327466 GCACAGAAGCCTTTTGTTTTTTGTGTTATTAACGGGCTCCCAGGACAAAATTTTCTCTCC 126327525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCACAGAAGCCTTTTGTTTTTTGTGTTATTAACGGGCTCCCAGGACAAAATTTTCTCTCC 900

126327526 TTTTCAGACATGTTCATGGTGGGTTCTGTGGAAACTTGCATAAGGAGGAGGAGGTCTCAC 126327585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTCAGACATGTTCATGGTGGGTTCTGTGGAAACTTGCATAAGGAGGAGGAGGTCTCAC 960

126327586 CTAAAACAAACCCACAGTTACACAAACAAGTGGCGCTTTGTGCTTTCCTAGAGATAAACC 126327645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTAAAACAAACCCACAGTTACACAAACAAGTGGCGCTTTGTGCTTTCCTAGAGATAAACC 1020

126327646 CACAGCTGCGTAAGAGGAGTTGTGCAGACAGCTTCACCGATAAGTTACTCAAACAGCTAC 126327705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACAGCTGCGTAAGAGGAGTTGTGCAGACAGCTTCACCGATAAGTTACTCAAACAGCTAC 1080

126327706 AGAGATGAGAAGAGTTTCTCATAAAGTTTTTGGATTCAACTGTGTAAACGGCAACCCACT 126327765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAGATGAGAAGAGTTTCTCATAAAGTTTTTGGATTCAACTGTGTAAACGGCAACCCACT 1140

126327766 TGGGCTCCCCTCTCTACTGTGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCTTATTGCACTTTTGTTCCAA 126327825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGGCTCCCCTCTCTACTGTGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCTTATTGCACTTTTGTTCCAA 1200

126327826 TATGACCCTTTGTGTCCATGCTCCTTAATTCTCTTGGTCATGAGACAACGAGCTTTTATA 126327885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATGACCCTTTGTGTCCATGCTCCTTAATTCTCTTGGTCATGAGACAACGAGCTTTTATA 1260

126327886 ACACCTTAGACAATCAGACCAGTGACCACTGACCTGTTTTAATAGTGATGCAATGGGAGA 126327945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACACCTTAGACAATCAGACCAGTGACCACTGACCTGTTTTAATAGTGATGCAATGGGAGA 1320

126327946 AAGACTCCATCTATTCATTAATATCTCTGAAGATGGAAGGAGATGAGTAGCTGAGAAATT 126328005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGACTCCATCTATTCATTAATATCTCTGAAGATGGAAGGAGATGAGTAGCTGAGAAATT 1380

126328006 TGGGCAGCCTCTAGAAACTGAACAAGGCAAGGAAACAGATTGTCCTCTAGAACCTTCAAA 126328065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGGCAGCCTCTAGAAACTGAACAAGGCAAGGAAACAGATTGTCCTCTAGAACCTTCAAA 1440

126328066 ATAGACAGCCAGAGTAAACCTTAATTTTATCCCAGTAAAACTCATTTTGATCCTCTGACT 126328125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATAGACAGCCAGAGTAAACCTTAATTTTATCCCAGTAAAACTCATTTTGATCCTCTGACT 1500

126328126 CCCAGAGCTGTAGCAGAATACATTTACATTGTTTTAAGCCAATAAGTCTGTAGCAATTTT 126328185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCCAGAGCTGTAGCAGAATACATTTACATTGTTTTAAGCCAATAAGTCTGTAGCAATTTT 1560

126328186 TTACAGCAGGAATAGGAATCTAACATAGCATGTATTGGGGGGAATAAAGGAAATTTAAGT 126328245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTACAGCAGGAATAGGAATCTAACATAGCATGTATTGGGGGGAATAAAGGAAATTTAAGT 1620

126328246 CCCCCCTTTATATATGTAACCAGTAAACTGAAGATGAATTAACATTTTTAATATTATAAA 126328305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCCCCTTTATATATGTAACCAGTAAACTGAAGATGAATTAACATTTTTAATATTATAAA 1680

126328306 AATTGAAGTAAATACATTCTAATGCTAAATATTAAAATAGAGAAAATGAGATTAATGACT 126328365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATTGAAGTAAATACATTCTAATGCTAAATATTAAAATAGAGAAAATGAGATTAATGACT 1740

126328366 AATTGATCTTGAAATAGGTAAGACATTTGTAAGTATTAAATCAGTTTTGACCTTATTAAA 126328425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATTGATCTTGAAATAGGTAAGACATTTGTAAGTATTAAATCAGTTTTGACCTTATTAAA 1800

126328426 TATTTTAGTAATAAAATTTCTTTGAACTAAGTCACAAAGAAAATAGCAAGGTAGAAAAAC 126328485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATTTTAGTAATAAAATTTCTTTGAACTAAGTCACAAAGAAAATAGCAAGGTAGAAAAAC 1860

126328486 TACTAGAAACAAATGTGAGAAGTGAGGGCAATATATTTTATATATAAAGGTTTATAATAC 126328545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TACTAGAAACAAATGTGAGAAGTGAGGGCAATATATTTTATATATAAAGGTTTATAATAC 1920

126328546 ATCAAAACGAACTCTTTACTCTCTAGAGAAACACATGCAAGGAACATGAATTGACAATTA 126328605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATCAAAACGAACTCTTTACTCTCTAGAGAAACACATGCAAGGAACATGAATTGACAATTA 1980

126328606 AAAAAGAAAATAAAATAATAAACATGAAATCAAGTTTTACTTTAAAAAGTAATGACAATA 126328665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAAAGAAAATAAAATAATAAACATGAAATCAAGTTTTACTTTAAAAAGTAATGACAATA 2040

126328666 GAATATATAACATTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAGAATGTATGCAATCTATCAC 126328725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAATATATAACATTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAGAATGTATGCAATCTATCAC 2100

126328726 AGCTTACCTAACCTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGTGTTAACAATAATATTT 126328785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGCTTACCTAACCTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGTGTTAACAATAATATTT 2160

126328786 TCATGAAGTTAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAGTGTTTATTAAAGTGTG 126328845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCATGAAGTTAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAGTGTTTATTAAAGTGTG 2220

126328846 TGGTGCACATGTAAACAATTAAACATTCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATT 126328905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGGTGCACATGTAAACAATTAAACATTCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATT 2280

126328906 AAAATGATATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTA 126328965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAATGATATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTA 2340

126328966 CAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAA 126329025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAA 2400

126329026 ATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTT 126329085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTT 2460

126329086 TCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCT 126329145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCT 2520

126329146 ACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAA 126329205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAA 2580

126329206 TAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGT 126329265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGT 2640

126329266 ATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATA 126329325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATA 2700

126329326 ATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTA 126329385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTA 2760

126329386 TAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAG 126329445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAG 2820

126329446 GATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTT 126329505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTT 2880

126329506 TTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAG 126329565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAG 2940

126329566 TTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAG 126329625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAG 3000

126329626 CTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATG 126329685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATG 3060

126329686 GGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCC 126329745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCC 3120

126329746 TCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTC 126329805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTC 3180

126329806 TTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACC 126329865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACC 3240

126329866 CAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAA 126329925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAA 3300

126329926 TTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAG 126329985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAG 3360

126329986 CAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTG 126330045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTG 3420

126330046 CCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAAT 126330105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAAT 3480

126330106 GGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAA 126330165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAA 3540

126330166 AGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGT 126330225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGT 3600

126330226 ACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAA 126330285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAA 3660

126330286 CATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAA 126330345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAA 3720

126330346 AATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTT 126330405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTT 3780

126330406 CCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAA 126330465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAA 3840

126330466 CTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGG 126330525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGG 3900

126330526 AGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCA 126330585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCA 3960

126330586 AGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACA 126330645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACA 4020

126330646 TGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAA 126330705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAA 4080

126330706 CCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACA 126330765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACA 4140

126330766 AAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCA 126330825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCA 4200

126330826 AACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGG 126330885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGG 4260

126330886 CATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCAT 126330945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCAT 4320

126330946 TTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCAC 126331005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCAC 4380

126331006 CACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGA 126331065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGA 4440

126331066 AAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATC 126331125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATC 4500

126331126 TTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTT 126331185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTT 4560

126331186 TTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGC 126331245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGC 4620

126331246 TCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACA 126331305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACA 4680

126331306 CAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCA 126331365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCA 4740

126331366 ATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACA 126331425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACA 4800

126331426 AGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAG 126331485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAG 4860

126331486 GTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAA 126331545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAA 4920

126331546 CTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACA 126331605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACA 4980

126331606 AGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAA 126331665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAA 5040

126331666 CATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCC 126331725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCC 5100

126331726 TCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGA 126331785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGA 5160

126331786 GCTATATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGT 126331845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GCTATATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGT 5220

126331846 CATTGAAGATCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTA 126331905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CATTGAAGATCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTA 5280

126331906 CTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTATCCAAAT 126331965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTATCCAAAT 5340

126331966 TGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATCTTATAATTATAAAA 126332025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATCTTATAATTATAAAA 5400

126332026 ACCTAAAGATTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAG 126332085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ACCTAAAGATTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAG 5460

126332086 GATACAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAACAGCAAACAATCTG 126332145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GATACAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAACAGCAAACAATCTG 5520

126332146 AAAAAAAAATGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAATATAAAATACCTAG 126332205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AAAAAAAAATGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAATATAAAATACCTAG 5580

126332206 TAATAAATTTAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTATAAAACACGGATGA 126332265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TAATAAATTTAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTATAAAACACGGATGA 5640

126332266 AAGAAATCCAAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCATGAATGAAAAAAATT 126332325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 AAGAAATCCAAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCATGAATGAAAAAAATT 5700

126332326 AATATTGTTAAAACGGCAATTTAACAATTTGC 126332357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AATATTGTTAAAACGGCAATTTAACAATTTGC 5732

EXCISED REGION

126332359 GATTCAATGCAATCCCTATCAAAATACCAATGACATTCCTTATAGAAAAAGAAAACAAAT 126332418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5734 GATTCAATGCAATCCCTATCAAAATACCAATGACATTCCTTATAGAAAAAGAAAACAAAT 5793

126332419 CCTAAAATTTGTATGAAAACACAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAA 126332478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5794 CCTAAAATTTGTATGAAAACACAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAA 5853

126332479 GGACAAAGCTGGAGGCAGCACACTACCTGAATTCAAGATTTACTACAAAGCTATAGTAAC 126332538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5854 GGACAAAGCTGGAGGCAGCACACTACCTGAATTCAAGATTTACTACAAAGCTATAGTAAC 5913

126332539 CAACTAGTACTGGCATAAAAACAGGCACATTGACCAATGGAACAAAATGGAGAACCTACA 126332598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5914 CAACTAGTACTGGCATAAAAACAGGCACATTGACCAATGGAACAAAATGGAGAACCTACA 5973

126332599 TATAAATCCACAGTGAACTAATTTTCAACAAATGCACCAGGAACATACAGTAGGAAAGGG 126332658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5974 TATAAATCCACAGTGAACTAATTTTCAACAAATGCACCAGGAACATACAGTAGGAAAGGG 6033

126332659 ATGTTGTCTTCAGTAAATAGTGCTAGGAAAACTGCATAACAAAAATCAAGTCAAAATATA 126332718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6034 ATGTTGTCTTCAGTAAATAGTGCTAGGAAAACTGCATAACAAAAATCAAGTCAAAATATA 6093

126332719 CTAAAGACTTAAATCTAAGGCTTGAACCTATGATACTACTAGAAAAAAACATTGGGGAAA 126332778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6094 CTAAAGACTTAAATCTAAGGCTTGAACCTATGATACTACTAGAAAAAAACATTGGGGAAA 6153

126332779 TGCTTTGGGACATTGGTCTAGGCAAAACTTTTTGTAAGACCTCCCTCAAAAGCACAGACA 126332838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6154 TGCTTTGGGACATTGGTCTAGGCAAAACTTTTTGTAAGACCTCCCTCAAAAGCACAGACA 6213

126332839 ATCAAAGCAGACATGGACAAATGGGACTACATGAAGCTAAAAAGGTTCTGCACATTAAAG 126332898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6214 ATCAAAGCAGACATGGACAAATGGGACTACATGAAGCTAAAAAGGTTCTGCACATTAAAG 6273

126332899 AAAACAATCAGCAAAGTGAACAGACAACCTACAGAATGGAAGAAAATATTTGCAAACTAC 126332958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6274 AAAACAATCAGCAAAGTGAACAGACAACCTACAGAATGGAAGAAAATATTTGCAAACTAC 6333

126332959 TTACCTAA 126332966
          ||||||||
     6334 TTACCTAA 6341

Alignment time is 7.57698 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     3943] =>      3943 nucs 'mol-32-2110-086643_3943'

Score:        3943
Aligned:      3943        nucs
Identic:      3943 (100%) nucs =>      2254 (100%)      1689 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126330812,126333065] EXCISED REGION [126333067,126334755]
 second seq =>  [        1,     2254] EXCISED REGION [     2255,     3943]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126333066,126333066]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [126333066,126333077] to [126333067,126333078]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126330812 CAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCC 126330871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCC 60

126330872 TCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTT 126330931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTT 120

126330932 GGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACC 126330991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACC 180

126330992 TGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATA 126331051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATA 240

126331052 AAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGA 126331111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGA 300

126331112 ATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAA 126331171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAA 360

126331172 ACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGAC 126331231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGAC 420

126331232 AGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGA 126331291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGA 480

126331292 TCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAG 126331351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAG 540

126331352 AAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGC 126331411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGC 600

126331412 AAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAG 126331471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAG 660

126331472 AAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATT 126331531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATT 720

126331532 ACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTC 126331591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTC 780

126331592 ATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATT 126331651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATT 840

126331652 AACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAAC 126331711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAAC 900

126331712 AAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATAC 126331771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATAC 960

126331772 CTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAA 126331831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAA 1020

126331832 AATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACTTT 126331891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACTTT 1080

126331892 TATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGG 126331951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGG 1140

126331952 CTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATC 126332011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATC 1200

126332012 TTATAATTATAAAAACCTAAAGATTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATT 126332071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTATAATTATAAAAACCTAAAGATTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATT 1260

126332072 CAGTAAAGTTTCAGGATACAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAA 126332131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGTAAAGTTTCAGGATACAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAA 1320

126332132 CAGCAAACAATCTGAAAAAAAAATGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAA 126332191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGCAAACAATCTGAAAAAAAAATGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAA 1380

126332192 TATAAAATACCTAGTAATAAATTTAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTA 126332251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATAAAATACCTAGTAATAAATTTAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTA 1440

126332252 TAAAACACGGATGAAAGAAATCCAAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCAT 126332311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAAAACACGGATGAAAGAAATCCAAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCAT 1500

126332312 GAATGAAAAAAATTAATATTGTTAAAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAATGCAAT 126332371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAATGAAAAAAATTAATATTGTTAAAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAATGCAAT 1560

126332372 CCCTATCAAAATACCAATGACATTCCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTGTA 126332431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCCTATCAAAATACCAATGACATTCCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTGTA 1620

126332432 TGAAAACACAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTGGA 126332491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAAAACACAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTGGA 1680

126332492 GGCAGCACACTACCTGAATTCAAGATTTACTACAAAGCTATAGTAACCAACTAGTACTGG 126332551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGCAGCACACTACCTGAATTCAAGATTTACTACAAAGCTATAGTAACCAACTAGTACTGG 1740

126332552 CATAAAAACAGGCACATTGACCAATGGAACAAAATGGAGAACCTACATATAAATCCACAG 126332611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATAAAAACAGGCACATTGACCAATGGAACAAAATGGAGAACCTACATATAAATCCACAG 1800

126332612 TGAACTAATTTTCAACAAATGCACCAGGAACATACAGTAGGAAAGGGATGTTGTCTTCAG 126332671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGAACTAATTTTCAACAAATGCACCAGGAACATACAGTAGGAAAGGGATGTTGTCTTCAG 1860

126332672 TAAATAGTGCTAGGAAAACTGCATAACAAAAATCAAGTCAAAATATACTAAAGACTTAAA 126332731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAAATAGTGCTAGGAAAACTGCATAACAAAAATCAAGTCAAAATATACTAAAGACTTAAA 1920

126332732 TCTAAGGCTTGAACCTATGATACTACTAGAAAAAAACATTGGGGAAATGCTTTGGGACAT 126332791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTAAGGCTTGAACCTATGATACTACTAGAAAAAAACATTGGGGAAATGCTTTGGGACAT 1980

126332792 TGGTCTAGGCAAAACTTTTTGTAAGACCTCCCTCAAAAGCACAGACAATCAAAGCAGACA 126332851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGTCTAGGCAAAACTTTTTGTAAGACCTCCCTCAAAAGCACAGACAATCAAAGCAGACA 2040

126332852 TGGACAAATGGGACTACATGAAGCTAAAAAGGTTCTGCACATTAAAGAAAACAATCAGCA 126332911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGGACAAATGGGACTACATGAAGCTAAAAAGGTTCTGCACATTAAAGAAAACAATCAGCA 2100

126332912 AAGTGAACAGACAACCTACAGAATGGAAGAAAATATTTGCAAACTACTTACCTAACGAGG 126332971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGTGAACAGACAACCTACAGAATGGAAGAAAATATTTGCAAACTACTTACCTAACGAGG 2160

126332972 GATTAATAATCAGAATGTATAAGAAGCTTAAAAAACTCAATAGCAAAAAAATCCACTTAA 126333031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GATTAATAATCAGAATGTATAAGAAGCTTAAAAAACTCAATAGCAAAAAAATCCACTTAA 2220

126333032 AATGAGCAAAATAAATGATCTCTTGACATTTCTC 126333065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATGAGCAAAATAAATGATCTCTTGACATTTCTC 2254

EXCISED REGION

126333067 AAAAAAAAAAAAGACATACAAATGGCCAACAGGTCTATAAAAAATGCTAAACATTGCTAA 126333126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 AAAAAAAAAAAAGACATACAAATGGCCAACAGGTCTATAAAAAATGCTAAACATTGCTAA 2314

126333127 TCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACTACAAGGAGATATCATCTCACCCCAATTAAATTGG 126333186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 TCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACTACAAGGAGATATCATCTCACCCCAATTAAATTGG 2374

126333187 CTTTTATCCAAAAGACAGGTAAAAATGAATGTTGGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAAAGC 126333246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 CTTTTATCCAAAAGACAGGTAAAAATGAATGTTGGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAAAGC 2434

126333247 TAATACACTATTGGTAGGAATGTAAATAGTATTGTTAGTATGCAGAAGAGTATGGAGAGT 126333306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 TAATACACTATTGGTAGGAATGTAAATAGTATTGTTAGTATGCAGAAGAGTATGGAGAGT 2494

126333307 TCTCAAAAATCTAAAAATAGAAATAACGTACAATACAGCAATTTCACTACTGGGCATATA 126333366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 TCTCAAAAATCTAAAAATAGAAATAACGTACAATACAGCAATTTCACTACTGGGCATATA 2554

126333367 TTCATGAAAAGAAAATCAATATATTGAAAAGACATCTTCGCTCTCATGTAAAGCACTATT 126333426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 TTCATGAAAAGAAAATCAATATATTGAAAAGACATCTTCGCTCTCATGTAAAGCACTATT 2614

126333427 TGCAATAGCCAAAATATAGAAATGACGTAAATACCTATCAAAGGAAGAAAGGATAAAGAA 126333486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 TGCAATAGCCAAAATATAGAAATGACGTAAATACCTATCAAAGGAAGAAAGGATAAAGAA 2674

126333487 AGCATTGTACATATACACAAATTGTATTCGGCCATTAAAGGAATGAAATCCTAGTATTTG 126333546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 AGCATTGTACATATACACAAATTGTATTCGGCCATTAAAGGAATGAAATCCTAGTATTTG 2734

126333547 CAGCAAAATGGATGGAACTGAAGGTCATTATGTTAAATGAAATAAGTCAAGCACAGAAAG 126333606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 CAGCAAAATGGATGGAACTGAAGGTCATTATGTTAAATGAAATAAGTCAAGCACAGAAAG 2794

126333607 ACAAATATCACACATTTTTATACATATGTGGGTATAAAAGTGGTCATGAAAATAGAGAGT 126333666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 ACAAATATCACACATTTTTATACATATGTGGGTATAAAAGTGGTCATGAAAATAGAGAGT 2854

126333667 TGATTGGCAGTTACCAGAAGCCAGGGAGGGTAGTGGGTGAGGGGATGAAGACAAGTTGAT 126333726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 TGATTGGCAGTTACCAGAAGCCAGGGAGGGTAGTGGGTGAGGGGATGAAGACAAGTTGAT 2914

126333727 TAATGGGTACAAATATGCAGTTTGAAGAAAGATTTAGTGTTAAAAGAACAGCAGGGTGAA 126333786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 TAATGGGTACAAATATGCAGTTTGAAGAAAGATTTAGTGTTAAAAGAACAGCAGGGTGAA 2974

126333787 TAGAGTTTACAAAAGTCTAATGTATATTTCAAAATAGCTAAAAGAGAAGAACTCAAATGG 126333846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 TAGAGTTTACAAAAGTCTAATGTATATTTCAAAATAGCTAAAAGAGAAGAACTCAAATGG 3034

126333847 TTCTAGCATAAAGAAAAGGCAAATATTCCAGACAACAGATATCCCAAGTACACTGTTTTG 126333906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 TTCTAGCATAAAGAAAAGGCAAATATTCCAGACAACAGATATCCCAAGTACACTGTTTTG 3094

126333907 ATCTTTACAAATTATGTGAATATTAAATTATCACATGTACCCTATTACTATGTACATGTG 126333966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 ATCTTTACAAATTATGTGAATATTAAATTATCACATGTACCCTATTACTATGTACATGTG 3154

126333967 TTATGCATCAATAAATAAAAGAAGTAAAAGCACACAGAGCATTCACCAAGAAAGACCATA 126334026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 TTATGCATCAATAAATAAAAGAAGTAAAAGCACACAGAGCATTCACCAAGAAAGACCATA 3214

126334027 TGCTGGGCTATAAAATAAGTCTTGATAAATTTTGAAAGACTCAAATTTTGATTTTTGTAT 126334086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 TGCTGGGCTATAAAATAAGTCTTGATAAATTTTGAAAGACTCAAATTTTGATTTTTGTAT 3274

126334087 ATGCTGTAAGGAAGGGATCTGGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAGCTAGTTGTCTCAGC 126334146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 ATGCTGTAAGGAAGGGATCTGGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAGCTAGTTGTCTCAGC 3334

126334147 ACCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTCCCCATTGCCTGTGTCAACTTTGTCAAAGATCAG 126334206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 ACCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTCCCCATTGCCTGTGTCAACTTTGTCAAAGATCAG 3394

126334207 ATGGTTATAGGTGTGCAGCTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCTTTTGCATTGGTTTATGTC 126334266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 ATGGTTATAGGTGTGCAGCTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCTTTTGCATTGGTTTATGTC 3454

126334267 TGTTTTTGTACCAGTACTATGCTGTTTTAGTTATTGTAGGCTTGTAATATAGTTTAAGGT 126334326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 TGTTTTTGTACCAGTACTATGCTGTTTTAGTTATTGTAGGCTTGTAATATAGTTTAAGGT 3514

126334327 CGGATAACATGATGCCTCCACCTTTGTTCTTTTTGCATAGGATTACCTTGGCTATTTGGG 126334386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 CGGATAACATGATGCCTCCACCTTTGTTCTTTTTGCATAGGATTACCTTGGCTATTTGGG 3574

126334387 CTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAAATAGTTTTTTCTAGCTCTGTGAAGAATGTCA 126334446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 CTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAAATAGTTTTTTCTAGCTCTGTGAAGAATGTCA 3634

126334447 TTGATAGTTTGATAGGAATAGCATTGAATCTGTAATTTGCTTGGGCAGTATGGCCATTTT 126334506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 TTGATAGTTTGATAGGAATAGCATTGAATCTGTAATTTGCTTGGGCAGTATGGCCATTTT 3694

126334507 GACAATATTGATTTTCCAATTCATGAGTATGGAATGTTTTTCCCTTTGTTTGTGTCATCT 126334566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 GACAATATTGATTTTCCAATTCATGAGTATGGAATGTTTTTCCCTTTGTTTGTGTCATCT 3754

126334567 CTGATTTCTTTCAGCAGTGTTTTGTAATTCTTGTGGTAGAGATCTTTCACCTCCCTGGTT 126334626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 CTGATTTCTTTCAGCAGTGTTTTGTAATTCTTGTGGTAGAGATCTTTCACCTCCCTGGTT 3814

126334627 AGTTGTATTCCTAGATATTTTATTGTTGTGGCTATTGTGAATGATATTGAATGCATGATT 126334686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 AGTTGTATTCCTAGATATTTTATTGTTGTGGCTATTGTGAATGATATTGAATGCATGATT 3874

126334687 TGGCTCTCAGCTTGGACATTGTTGGTGTACCTGCACATGTATCCCTGAAACTGAAATAAA 126334746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 TGGCTCTCAGCTTGGACATTGTTGGTGTACCTGCACATGTATCCCTGAAACTGAAATAAA 3934

126334747 GGTTAAAAT 126334755
          |||||||||
     3935 GGTTAAAAT 3943

Alignment time is 4.78824 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     5040] =>      5040 nucs 'mol-32-220d-017258_5040'

Score:        4986
Aligned:      5041        nucs
Identic:      5036 (100%) nucs =>      4363 (100%)       673 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126328451,126332817] EXCISED REGION [126332822,126333495]
 second seq =>  [        1,     4367] EXCISED REGION [     4368,     5040]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [126332818,126332821]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [126332818,126332821] to [126332822,126332825]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [126332818,126332818] to [126332821,126332821]
 second seq =>         0 nucs

126328451 ACTAAGTCACAAAGAAAATAGCAAGGTAGAAAAACTACTAGAAACAAATGTGAGAAGTGA 126328510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTAAGTCACAAAGAAAATAGCAAGGTAGAAAAACTACTAGAAACAAATGTGAGAAGTGA 60

126328511 GGGCAATATATTTTATATATAAAGGTTTATAATACATCAAAACGAACTCTTTACTCTCTA 126328570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGCAATATATTTTATATATAAAGGTTTATAATACATCAAAACGAACTCTTTACTCTCTA 120

126328571 GAGAAACACATGCAAGGAACATGAATTGACAATTAAAAAAGAAAATAAAATAATAAACAT 126328630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAAACACATGCAAGGAACATGAATTGACAATTAAAAAAGAAAATAAAATAATAAACAT 180

126328631 GAAATCAAGTTTTACTTTAAAAAGTAATGACAATAGAATATATAACATTGATTTAGATGT 126328690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAATCAAGTTTTACTTTAAAAAGTAATGACAATAGAATATATAACATTGATTTAGATGT 240

126328691 TTGGATCTAGAATCAGAATGTATGCAATCTATCACAGCTTACCTAACCTTTCTTTGCTTC 126328750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGGATCTAGAATCAGAATGTATGCAATCTATCACAGCTTACCTAACCTTTCTTTGCTTC 300

126328751 AATTTCTTCACCTCTAAGTGTTAACAATAATATTTTCATGAAGTTAATGTCAGAAATGAA 126328810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTTCTTCACCTCTAAGTGTTAACAATAATATTTTCATGAAGTTAATGTCAGAAATGAA 360

126328811 TGAGTGAAACTATGCAAAGTGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAATTAAACA 126328870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAGTGAAACTATGCAAAGTGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAATTAAACA 420

126328871 TTCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAA 126328930
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAA 480

126328931 TGTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTA 126328990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTA 540

126328991 AGTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAA 126329050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAA 600

126329051 TAAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAA 126329110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAA 660

126329111 TAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATT 126329170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATT 720

126329171 ATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCA 126329230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCA 780

126329231 GTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTT 126329290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTT 840

126329291 CATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATA 126329350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATA 900

126329351 GAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGA 126329410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGA 960

126329411 ATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATA 126329470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATA 1020

126329471 AACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTC 126329530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTC 1080

126329531 TGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGT 126329590
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1081 TGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGG 1140

126329591 TTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTG 126329650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTG 1200

126329651 TACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG 126329710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG 1260

126329711 GTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 126329770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 1320

126329771 CAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACT 126329830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACT 1380

126329831 ATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGA 126329890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGA 1440

126329891 AAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACC 126329950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACC 1500

126329951 AACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGG 126330010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGG 1560

126330011 AATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTT 126330070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTT 1620

126330071 GCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCC 126330130
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTGGCCATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCC 1680

126330131 ACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTT 126330190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTT 1740

126330191 TGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATG 126330250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATG 1800

126330251 GGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAG 126330310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAG 1860

126330311 GTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGA 126330370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGA 1920

126330371 TGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATAT 126330430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATAT 1980

126330431 GCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTC 126330490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTC 2040

126330491 CCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACT 126330550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACT 2100

126330551 CTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAAC 126330610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAAC 2160

126330611 TCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCA 126330670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCA 2220

126330671 TGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACAC 126330730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACAC 2280

126330731 AAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGA 126330790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGA 2340

126330791 AAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACC 126330850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACC 2400

126330851 ATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCA 126330910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCA 2460

126330911 CACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCAT 126330970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCAT 2520

126330971 TTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGT 126331030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGT 2580

126331031 GATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAAT 126331090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAAT 2640

126331091 AAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTAC 126331150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTAC 2700

126331151 ACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACC 126331210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2701 ACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAGGAACC 2760

126331211 AGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGT 126331270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGT 2820

126331271 AATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTG 126331330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTG 2880

126331331 AATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAAT 126331390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAAT 2940

126331391 TCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAA 126331450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAA 3000

126331451 ACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGAT 126331510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGAT 3060

126331511 GCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCAT 126331570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCAT 3120

126331571 TCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTG 126331630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTG 3180

126331631 ACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATA 126331690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATA 3240

126331691 GATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGA 126331750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGA 3300

126331751 CTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTA 126331810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTA 3360

126331811 ATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAG 126331870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAG 3420

126331871 GATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTA 126331930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTA 3480

126331931 TGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCA 126331990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCA 3540

126331991 GTGTTTACAGATTACATAATCTTATAATTATAAAAACCTAAAGATTCCATCAGAAAAACT 126332050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTGTTTACAGATTACATAATCTTATAATTATAAAAACCTAAAGATTCCATCAGAAAAACT 3600

126332051 GTTTGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGATACAAAATCAACATACAAAAATC 126332110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTTTGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGATACAAAATCAACATACAAAAATC 3660

126332111 AGTAGGATATATTTATGCCAACAGCAAACAATCTGAAAAAAAAATGAAGAAAGCAATCCC 126332170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGTAGGATATATTTATGCCAACAGCAAACAATCTGAAAAAAAAATGAAGAAAGCAATCCC 3720

126332171 AGTTACAGTAGTTACAAAGAATATAAAATACCTAGTAATAAATTTAACCAAATAACTGAA 126332230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AGTTACAGTAGTTACAAAGAATATAAAATACCTAGTAATAAATTTAACCAAATAACTGAA 3780

126332231 AAATCGATACAAGGAAAACTATAAAACACGGATGAAAGAAATCCAAGAGGATACAAAAAA 126332290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAATCGATACAAGGAAAACTATAAAACACGGATGAAAGAAATCCAAGAGGATACAAAAAA 3840

126332291 GAAAAGATATTTCATGGTCATGAATGAAAAAAATTAATATTGTTAAAACGGCAATTTAAC 126332350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GAAAAGATATTTCATGGTCATGAATGAAAAAAATTAATATTGTTAAAACGGCAATTTAAC 3900

126332351 AATTTGCAGATTCAATGCAATCCCTATCAAAATACCAATGACATTCCTTATAGAAAAAGA 126332410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AATTTGCAGATTCAATGCAATCCCTATCAAAATACCAATGACATTCCTTATAGAAAAAGA 3960

126332411 AAACAAATCCTAAAATTTGTATGAAAACACAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCAATCTTG 126332470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAACAAATCCTAAAATTTGTATGAAAACACAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCAATCTTG 4020

126332471 AGCAAAAAGGACAAAGCTGGAGGCAGCACACTACCTGAATTCAAGATTTACTACAAAGCT 126332530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGCAAAAAGGACAAAGCTGGAGGCAGCACACTACCTGAATTCAAGATTTACTACAAAGCT 4080

126332531 ATAGTAACCAACTAGTACTGGCATAAAAACAGGCACATTGACCAATGGAACAAAATGGAG 126332590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATAGTAACCAACTAGTACTGGCATAAAAACAGGCACATTGACCAATGGAACAAAATGGAG 4140

126332591 AACCTACATATAAATCCACAGTGAACTAATTTTCAACAAATGCACCAGGAACATACAGTA 126332650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AACCTACATATAAATCCACAGTGAACTAATTTTCAACAAATGCACCAGGAACATACAGTA 4200

126332651 GGAAAGGGATGTTGTCTTCAGTAAATAGTGCTAGGAAAACTGCATAACAAAAATCAAGTC 126332710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GGAAAGGGATGTTGTCTTCAGTAAATAGTGCTAGGAAAACTGCATAACAAAAATCAAGTC 4260

126332711 AAAATATACTAAAGACTTAAATCTAAGGCTTGAACCTATGATACTACTAGAAAAAAACAT 126332770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AAAATATACTAAAGACTTAAATCTAAGGCTTGAACCTATGATACTACTAGAAAAAAACAT 4320

126332771 TGGGGAAATGCTTTGGGACATTGGTCTAGGCAAAACTTTTTGTAAGA 126332817
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGGGGAAATGCTTTGGGACATTGGTCTAGGCAAAACTTTTTGTAAGA 4367

EXCISED REGION

126332822 CCTCAAAAGCACAGACAATCAAAGCAGACATGGACAAATGGGACTACATGAAGCTAAAAA 126332881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 CCTCAAAAGCACAGACAATCAAAGCAGACATGGACAAATGGGACTACATGAAGCTAAAAA 4427

126332882 GGTTCTGCACATTAAAGAAAACAATCAGCAAAGTGAACAGACAACCTACAGAATGGAAGA 126332941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 GGTTCTGCACATTAAAGAAAACAATCAGCAAAGTGAACAGACAACCTACAGAATGGAAGA 4487

126332942 AAATATTTGCAAACTACTTACCTAACGAGGGATTAATAATCAGAATGTATAAGAAGCTTA 126333001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 AAATATTTGCAAACTACTTACCTAACGAGGGATTAATAATCAGAATGTATAAGAAGCTTA 4547

126333002 AAAAACTCAATAGCAAAAAAATCCACTTAAAATGAGCAAAATAAATGATCTCTTGACATT 126333061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4548 AAAAACTCAATAGCAAAAAAATCCACTTAAAATGAGCAAAATAAATGATCTCTTGACATT 4607

126333062 TCTCAAAAAAAAAAAAAGACATACAAATGGCCAACAGGTCTATAAAAAATGCTAAACATT 126333121
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4608 TCTC-AAAAAAAAAAAAGACATACAAATGGCCAACAGGTCTATAAAAAATGCTAAACATT 4666

126333122 GCTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACTACAAGGAGATATCATCTCACCCCAATTAA 126333181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4667 GCTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACTACAAGGAGATATCATCTCACCCCAATTAA 4726

126333182 ATTGGCTTTTATCCAAAAGACAGGTAAAAATGAATGTTGGTGAGGATGTGGAGATAAGGG 126333241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4727 ATTGGCTTTTATCCAAAAGACAGGTAAAAATGAATGTTGGTGAGGATGTGGAGATAAGGG 4786

126333242 AAAGCTAATACACTATTGGTAGGAATGTAAATAGTATTGTTAGTATGCAGAAGAGTATGG 126333301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4787 AAAGCTAATACACTATTGGTAGGAATGTAAATAGTATTGTTAGTATGCAGAAGAGTATGG 4846

126333302 AGAGTTCTCAAAAATCTAAAAATAGAAATAACGTACAATACAGCAATTTCACTACTGGGC 126333361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4847 AGAGTTCTCAAAAATCTAAAAATAGAAATAACGTACAATACAGCAATTTCACTACTGGGC 4906

126333362 ATATATTCATGAAAAGAAAATCAATATATTGAAAAGACATCTTCGCTCTCATGTAAAGCA 126333421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4907 ATATATTCATGAAAAGAAAATCAATATATTGAAAAGACATCTTCGCTCTCATGTAAAGCA 4966

126333422 CTATTTGCAATAGCCAAAATATAGAAATGACGTAAATACCTATCAAAGGAAGAAAGGATA 126333481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4967 CTATTTGCAATAGCCAAAATATAGAAATGACGTAAATACCTATCAAAGGAAGAAAGGATA 5026

126333482 AAGAAAGCATTGTA 126333495
          ||||||||||||||
     5027 AAGAAAGCATTGTA 5040

Alignment time is 6.04348 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2765] =>      2765 nucs 'mol-32-220d-026756_2765'

Score:        2765
Aligned:      2765        nucs
Identic:      2765 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126329172,126331936]
 second seq =>  [        1,     2765]

126329172 TTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAG 126329231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAG 60

126329232 TCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTC 126329291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTC 120

126329292 ATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAG 126329351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAG 180

126329352 AGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAA 126329411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAA 240

126329412 TTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAA 126329471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAA 300

126329472 ACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCT 126329531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCT 360

126329532 GTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTT 126329591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTT 420

126329592 TCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGT 126329651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGT 480

126329652 ACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 126329711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 540

126329712 TCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 126329771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 600

126329772 AGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTA 126329831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTA 660

126329832 TTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAA 126329891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAA 720

126329892 AAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCA 126329951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCA 780

126329952 ACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGA 126330011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGA 840

126330012 ATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTG 126330071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTG 900

126330072 CTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCA 126330131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCA 960

126330132 CTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTT 126330191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTT 1020

126330192 GGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGG 126330251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGG 1080

126330252 GTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGG 126330311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGG 1140

126330312 TGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGAT 126330371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGAT 1200

126330372 GAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATG 126330431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATG 1260

126330432 CAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCC 126330491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCC 1320

126330492 CGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTC 126330551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTC 1380

126330552 TGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACT 126330611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACT 1440

126330612 CACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCAT 126330671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCAT 1500

126330672 GGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACA 126330731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACA 1560

126330732 AAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAA 126330791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAA 1620

126330792 AGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCA 126330851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCA 1680

126330852 TGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCAC 126330911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCAC 1740

126330912 ACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATT 126330971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATT 1800

126330972 TACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTG 126331031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTG 1860

126331032 ATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATA 126331091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATA 1920

126331092 AACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACA 126331151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACA 1980

126331152 CCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCA 126331211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCA 2040

126331212 GTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTA 126331271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTA 2100

126331272 ATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGA 126331331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGA 2160

126331332 ATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATT 126331391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATT 2220

126331392 CAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAA 126331451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAA 2280

126331452 CCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATG 126331511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATG 2340

126331512 CAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATT 126331571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATT 2400

126331572 CACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGA 126331631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGA 2460

126331632 CAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAG 126331691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAG 2520

126331692 ATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGAC 126331751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGAC 2580

126331752 TGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTAA 126331811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTAA 2640

126331812 TATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAGG 126331871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAGG 2700

126331872 ATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTAT 126331931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTAT 2760

126331932 GCAAG 126331936
          |||||
     2761 GCAAG 2765

Alignment time is 2.94933 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     4972] =>      4972 nucs 'mol-32-2218-032286_4972'

Score:        4972
Aligned:      4972        nucs
Identic:      4972 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126327692,126332663]
 second seq =>  [        1,     4972]

126327692 ACTCAAACAGCTACAGAGATGAGAAGAGTTTCTCATAAAGTTTTTGGATTCAACTGTGTA 126327751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTCAAACAGCTACAGAGATGAGAAGAGTTTCTCATAAAGTTTTTGGATTCAACTGTGTA 60

126327752 AACGGCAACCCACTTGGGCTCCCCTCTCTACTGTGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCTTATTG 126327811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACGGCAACCCACTTGGGCTCCCCTCTCTACTGTGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCTTATTG 120

126327812 CACTTTTGTTCCAATATGACCCTTTGTGTCCATGCTCCTTAATTCTCTTGGTCATGAGAC 126327871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACTTTTGTTCCAATATGACCCTTTGTGTCCATGCTCCTTAATTCTCTTGGTCATGAGAC 180

126327872 AACGAGCTTTTATAACACCTTAGACAATCAGACCAGTGACCACTGACCTGTTTTAATAGT 126327931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACGAGCTTTTATAACACCTTAGACAATCAGACCAGTGACCACTGACCTGTTTTAATAGT 240

126327932 GATGCAATGGGAGAAAGACTCCATCTATTCATTAATATCTCTGAAGATGGAAGGAGATGA 126327991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATGCAATGGGAGAAAGACTCCATCTATTCATTAATATCTCTGAAGATGGAAGGAGATGA 300

126327992 GTAGCTGAGAAATTTGGGCAGCCTCTAGAAACTGAACAAGGCAAGGAAACAGATTGTCCT 126328051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTAGCTGAGAAATTTGGGCAGCCTCTAGAAACTGAACAAGGCAAGGAAACAGATTGTCCT 360

126328052 CTAGAACCTTCAAAATAGACAGCCAGAGTAAACCTTAATTTTATCCCAGTAAAACTCATT 126328111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAGAACCTTCAAAATAGACAGCCAGAGTAAACCTTAATTTTATCCCAGTAAAACTCATT 420

126328112 TTGATCCTCTGACTCCCAGAGCTGTAGCAGAATACATTTACATTGTTTTAAGCCAATAAG 126328171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGATCCTCTGACTCCCAGAGCTGTAGCAGAATACATTTACATTGTTTTAAGCCAATAAG 480

126328172 TCTGTAGCAATTTTTTACAGCAGGAATAGGAATCTAACATAGCATGTATTGGGGGGAATA 126328231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTGTAGCAATTTTTTACAGCAGGAATAGGAATCTAACATAGCATGTATTGGGGGGAATA 540

126328232 AAGGAAATTTAAGTCCCCCCTTTATATATGTAACCAGTAAACTGAAGATGAATTAACATT 126328291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGGAAATTTAAGTCCCCCCTTTATATATGTAACCAGTAAACTGAAGATGAATTAACATT 600

126328292 TTTAATATTATAAAAATTGAAGTAAATACATTCTAATGCTAAATATTAAAATAGAGAAAA 126328351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTAATATTATAAAAATTGAAGTAAATACATTCTAATGCTAAATATTAAAATAGAGAAAA 660

126328352 TGAGATTAATGACTAATTGATCTTGAAATAGGTAAGACATTTGTAAGTATTAAATCAGTT 126328411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAGATTAATGACTAATTGATCTTGAAATAGGTAAGACATTTGTAAGTATTAAATCAGTT 720

126328412 TTGACCTTATTAAATATTTTAGTAATAAAATTTCTTTGAACTAAGTCACAAAGAAAATAG 126328471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGACCTTATTAAATATTTTAGTAATAAAATTTCTTTGAACTAAGTCACAAAGAAAATAG 780

126328472 CAAGGTAGAAAAACTACTAGAAACAAATGTGAGAAGTGAGGGCAATATATTTTATATATA 126328531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAGGTAGAAAAACTACTAGAAACAAATGTGAGAAGTGAGGGCAATATATTTTATATATA 840

126328532 AAGGTTTATAATACATCAAAACGAACTCTTTACTCTCTAGAGAAACACATGCAAGGAACA 126328591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGGTTTATAATACATCAAAACGAACTCTTTACTCTCTAGAGAAACACATGCAAGGAACA 900

126328592 TGAATTGACAATTAAAAAAGAAAATAAAATAATAAACATGAAATCAAGTTTTACTTTAAA 126328651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAATTGACAATTAAAAAAGAAAATAAAATAATAAACATGAAATCAAGTTTTACTTTAAA 960

126328652 AAGTAATGACAATAGAATATATAACATTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAGAATGT 126328711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGTAATGACAATAGAATATATAACATTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAGAATGT 1020

126328712 ATGCAATCTATCACAGCTTACCTAACCTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGTGT 126328771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGCAATCTATCACAGCTTACCTAACCTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGTGT 1080

126328772 TAACAATAATATTTTCATGAAGTTAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAGTG 126328831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAACAATAATATTTTCATGAAGTTAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAGTG 1140

126328832 TTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAATTAAACATTCTATTAACTGTTATTAATT 126328891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAATTAAACATTCTATTAACTGTTATTAATT 1200

126328892 AAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGAAA 126328951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGAAA 1260

126328952 TACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAACGG 126329011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAACGG 1320

126329012 ACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATTCA 126329071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATTCA 1380

126329072 TTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCA 126329131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCA 1440

126329132 GATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACA 126329191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACA 1500

126329192 GGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCT 126329251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCT 1560

126329252 GTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAAC 126329311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAAC 1620

126329312 TATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCT 126329371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCT 1680

126329372 ACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTG 126329431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTG 1740

126329432 GTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTT 126329491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTT 1800

126329492 GTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCA 126329551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCA 1860

126329552 GTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTC 126329611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTC 1920

126329612 AGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTT 126329671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTT 1980

126329672 TTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAG 126329731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAG 2040

126329732 GTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCC 126329791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCC 2100

126329792 GGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACT 126329851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACT 2160

126329852 ACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGT 126329911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGT 2220

126329912 TTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAA 126329971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAA 2280

126329972 ATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAAT 126330031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAAT 2340

126330032 GGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAA 126330091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAA 2400

126330092 AGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGC 126330151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGC 2460

126330152 TATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAG 126330211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAG 2520

126330212 ACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAA 126330271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAA 2580

126330272 TTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAA 126330331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAA 2640

126330332 ACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAAT 126330391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAAT 2700

126330392 TTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCA 126330451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCA 2760

126330452 AATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAA 126330511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAA 2820

126330512 AAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACAT 126330571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACAT 2880

126330572 TCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAA 126330631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAA 2940

126330632 AAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACA 126330691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACA 3000

126330692 TGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAG 126330751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAG 3060

126330752 GACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGC 126330811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGC 3120

126330812 CAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCC 126330871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCC 3180

126330872 TCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTT 126330931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTT 3240

126330932 GGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACC 126330991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACC 3300

126330992 TGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATA 126331051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATA 3360

126331052 AAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGA 126331111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGA 3420

126331112 ATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAA 126331171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAA 3480

126331172 ACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGAC 126331231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGAC 3540

126331232 AGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGA 126331291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGA 3600

126331292 TCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAG 126331351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAG 3660

126331352 AAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGC 126331411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGC 3720

126331412 AAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAG 126331471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAG 3780

126331472 AAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATT 126331531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATT 3840

126331532 ACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTC 126331591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTC 3900

126331592 ATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATT 126331651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATT 3960

126331652 AACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAAC 126331711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAAC 4020

126331712 AAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATAC 126331771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATAC 4080

126331772 CTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAA 126331831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAA 4140

126331832 AATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACTTT 126331891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACTTT 4200

126331892 TATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGG 126331951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGG 4260

126331952 CTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATC 126332011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATC 4320

126332012 TTATAATTATAAAAACCTAAAGATTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATT 126332071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTATAATTATAAAAACCTAAAGATTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATT 4380

126332072 CAGTAAAGTTTCAGGATACAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAA 126332131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CAGTAAAGTTTCAGGATACAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAA 4440

126332132 CAGCAAACAATCTGAAAAAAAAATGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAA 126332191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CAGCAAACAATCTGAAAAAAAAATGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAA 4500

126332192 TATAAAATACCTAGTAATAAATTTAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTA 126332251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TATAAAATACCTAGTAATAAATTTAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTA 4560

126332252 TAAAACACGGATGAAAGAAATCCAAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCAT 126332311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TAAAACACGGATGAAAGAAATCCAAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCAT 4620

126332312 GAATGAAAAAAATTAATATTGTTAAAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAATGCAAT 126332371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GAATGAAAAAAATTAATATTGTTAAAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAATGCAAT 4680

126332372 CCCTATCAAAATACCAATGACATTCCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTGTA 126332431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CCCTATCAAAATACCAATGACATTCCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTGTA 4740

126332432 TGAAAACACAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTGGA 126332491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TGAAAACACAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTGGA 4800

126332492 GGCAGCACACTACCTGAATTCAAGATTTACTACAAAGCTATAGTAACCAACTAGTACTGG 126332551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GGCAGCACACTACCTGAATTCAAGATTTACTACAAAGCTATAGTAACCAACTAGTACTGG 4860

126332552 CATAAAAACAGGCACATTGACCAATGGAACAAAATGGAGAACCTACATATAAATCCACAG 126332611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CATAAAAACAGGCACATTGACCAATGGAACAAAATGGAGAACCTACATATAAATCCACAG 4920

126332612 TGAACTAATTTTCAACAAATGCACCAGGAACATACAGTAGGAAAGGGATGTT 126332663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TGAACTAATTTTCAACAAATGCACCAGGAACATACAGTAGGAAAGGGATGTT 4972

Alignment time is 5.15762 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     3105] =>      3105 nucs 'mol-32-2383-143511_3105'

Score:        3071
Aligned:      3104        nucs
Identic:      3101 (100%) nucs =>       193 (100%)      2908 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126328678,126328870] EXCISED REGION [126328872,126331782]
 second seq =>  [        1,      193] EXCISED REGION [      195,     3105]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126328871,126328871]
 second seq =>         1 nucs [194,194]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [126328871,126328871] to [126328872,126328872]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126328678 TTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAGAATGTATGCAATCTATCACAGCTTACCTAAC 126328737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAGAATGTATGCAATCTATCACAGCTTACCTAAC 60

126328738 CTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGTGTTAACAATAATATTTTCATGAAGTTAA 126328797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGTGTTAACAATAATATTTTCATGAAGTTAA 120

126328798 TGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAGTGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGT 126328857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAGTGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGT 180

126328858 AAACAATTAAACA 126328870
          |||||||||||||
      181 AAACAATTAAACA 193

EXCISED REGION

126328872 TCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAAT 126328931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      195 TCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAAT 254

126328932 GTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAA 126328991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      255 GTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAA 314

126328992 GTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAAT 126329051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      315 GTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAAT 374

126329052 AAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAAT 126329111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      375 AAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAAT 434

126329112 AAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTA 126329171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 AAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTA 494

126329172 TTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAG 126329231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 TTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAG 554

126329232 TCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTC 126329291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 TCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTC 614

126329292 ATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAG 126329351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 ATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAG 674

126329352 AGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAA 126329411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 AGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAA 734

126329412 TTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAA 126329471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 TTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAA 794

126329472 ACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCT 126329531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 ACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCT 854

126329532 GTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTT 126329591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      855 GTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGT 914

126329592 TCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGT 126329651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 TCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGT 974

126329652 ACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 126329711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 ACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 1034

126329712 TCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 126329771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 TCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 1094

126329772 AGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTA 126329831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 AGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTA 1154

126329832 TTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAA 126329891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 TTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAA 1214

126329892 AAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCA 126329951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 AAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCA 1274

126329952 ACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGA 126330011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 ACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGA 1334

126330012 ATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTG 126330071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 ATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTG 1394

126330072 CTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCA 126330131
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 CTGGCCATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCA 1454

126330132 CTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTT 126330191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 CTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTT 1514

126330192 GGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGG 126330251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 GGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGG 1574

126330252 GTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGG 126330311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 GTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGG 1634

126330312 TGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGAT 126330371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 TGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGAT 1694

126330372 GAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATG 126330431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 GAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATG 1754

126330432 CAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCC 126330491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 CAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCC 1814

126330492 CGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTC 126330551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 CGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTC 1874

126330552 TGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACT 126330611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 TGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACT 1934

126330612 CACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCAT 126330671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 CACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCAT 1994

126330672 GGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACA 126330731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 GGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACA 2054

126330732 AAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAA 126330791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 AAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAA 2114

126330792 AGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCA 126330851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 AGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCA 2174

126330852 TGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCAC 126330911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 TGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCAC 2234

126330912 ACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATT 126330971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 ACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATT 2294

126330972 TACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTG 126331031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 TACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTG 2354

126331032 ATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATA 126331091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 ATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATA 2414

126331092 AACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACA 126331151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 AACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACA 2474

126331152 CCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCA 126331211
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2475 CCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAGGAACCA 2534

126331212 GTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTA 126331271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 GTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTA 2594

126331272 ATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGA 126331331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 ATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGA 2654

126331332 ATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATT 126331391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 ATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATT 2714

126331392 CAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAA 126331451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 CAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAA 2774

126331452 CCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATG 126331511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 CCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATG 2834

126331512 CAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATT 126331571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 CAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATT 2894

126331572 CACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGA 126331631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 CACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGA 2954

126331632 CAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAG 126331691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 CAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAG 3014

126331692 ATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGAC 126331751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 ATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGAC 3074

126331752 TGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATA 126331782
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 TGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATA 3105

Alignment time is 3.73405 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2199] =>      2199 nucs 'mol-32-2399-079413_2199'

Score:        2199
Aligned:      2199        nucs
Identic:      2199 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126329024,126331222]
 second seq =>  [        1,     2199]

126329024 AAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGT 126329083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGT 60

126329084 TTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATG 126329143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATG 120

126329144 CTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAA 126329203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAA 180

126329204 AATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTT 126329263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTT 240

126329264 GTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGA 126329323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGA 300

126329324 TAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAG 126329383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAG 360

126329384 TATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACA 126329443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACA 420

126329444 AGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGT 126329503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGT 480

126329504 TTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCC 126329563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCC 540

126329564 AGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGT 126329623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGT 600

126329624 AGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGA 126329683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGA 660

126329684 TGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCG 126329743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCG 720

126329744 CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATT 126329803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATT 780

126329804 TCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTA 126329863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTA 840

126329864 CCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAG 126329923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAG 900

126329924 AATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAA 126329983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAA 960

126329984 AGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAAT 126330043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAAT 1020

126330044 TGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGA 126330103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGA 1080

126330104 ATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACA 126330163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACA 1140

126330164 AAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGG 126330223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGG 1200

126330224 GTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAAC 126330283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAAC 1260

126330284 AACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATT 126330343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATT 1320

126330344 AAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACC 126330403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACC 1380

126330404 TTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAG 126330463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAG 1440

126330464 AACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAAT 126330523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAAT 1500

126330524 GGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACAC 126330583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACAC 1560

126330584 CAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGA 126330643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGA 1620

126330644 CATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTT 126330703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTT 1680

126330704 AACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGA 126330763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGA 1740

126330764 CAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGC 126330823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGC 1800

126330824 CAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTG 126330883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTG 1860

126330884 GGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTC 126330943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTC 1920

126330944 ATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTC 126331003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTC 1980

126331004 ACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAA 126331063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAA 2040

126331064 GAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTA 126331123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTA 2100

126331124 TCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATAT 126331183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATAT 2160

126331184 TTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCC 126331222
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCC 2199

Alignment time is 2.30461 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     7263] =>      7263 nucs 'mol-32-23ba-053600_7263'

Score:        7263
Aligned:      7263        nucs
Identic:      7263 (100%) nucs =>      6819 (100%)       444 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126326247,126333065] EXCISED REGION [126333067,126333510]
 second seq =>  [        1,     6819] EXCISED REGION [     6820,     7263]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126333066,126333066]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [126333066,126333077] to [126333067,126333078]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126326247 AGTTTCCACTAACTATATGGCTGAAAAAGCAGGAGTGAAAACAACAATATCAATAAACTC 126326306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTTTCCACTAACTATATGGCTGAAAAAGCAGGAGTGAAAACAACAATATCAATAAACTC 60

126326307 TTTATGTATTACTACATGAAATAGAGAAGTGCTACCAATTTGTTGGAAGGGACATGACAT 126326366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTATGTATTACTACATGAAATAGAGAAGTGCTACCAATTTGTTGGAAGGGACATGACAT 120

126326367 GATCCATAAAAAGAGACAGTTGTACTAACTATCTTGCATCTGTATCAACCAGAAACTTGA 126326426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATCCATAAAAAGAGACAGTTGTACTAACTATCTTGCATCTGTATCAACCAGAAACTTGA 180

126326427 ATTGTGATTTTTAAATTGTAAATATACTATTTTGAAGAAACCAATTATTTTGCTCTTTCC 126326486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTGTGATTTTTAAATTGTAAATATACTATTTTGAAGAAACCAATTATTTTGCTCTTTCC 240

126326487 CCATATCTCTCTGTATTCATTTAAGAAATTGAATGTCAAGGAAAACTGACAAAAAAAGGG 126326546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCATATCTCTCTGTATTCATTTAAGAAATTGAATGTCAAGGAAAACTGACAAAAAAAGGG 300

126326547 AAACAGGTAGAAGTATGGGAATGAAGGTGAAGGGAAATATACGGATGGTGATAATTCATT 126326606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAACAGGTAGAAGTATGGGAATGAAGGTGAAGGGAAATATACGGATGGTGATAATTCATT 360

126326607 GTGCATCGTATTTTAGAAGATGTAGTAATAGTAAATGAAACAATTCAGATGGAATAAAAC 126326666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGCATCGTATTTTAGAAGATGTAGTAATAGTAAATGAAACAATTCAGATGGAATAAAAC 420

126326667 AAAGAAAAATTTTGGTATCTCTTTATTCTAGTTATTATATTTTTTGTACATTCATAAGTT 126326726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAGAAAAATTTTGGTATCTCTTTATTCTAGTTATTATATTTTTTGTACATTCATAAGTT 480

126326727 GAGGCTATCATTAAAGAAGATATTAAAGGTAAAATAATATTTCATTAGGGTACTGTAGAG 126326786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGGCTATCATTAAAGAAGATATTAAAGGTAAAATAATATTTCATTAGGGTACTGTAGAG 540

126326787 CTTCACTGGATAAATTCTGGCTAAATAACAAAAATTGACCTAAGAAGTGAGCATATCAGT 126326846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTCACTGGATAAATTCTGGCTAAATAACAAAAATTGACCTAAGAAGTGAGCATATCAGT 600

126326847 TGGATCTTGAGCCAAAGATCTGATAAGGGCACTCAATAAGACTCTCAGTAAAAAGTGAAT 126326906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGATCTTGAGCCAAAGATCTGATAAGGGCACTCAATAAGACTCTCAGTAAAAAGTGAAT 660

126326907 TGACCCAAGGGAAATTCTTGCACCTTCTATAGAAAGGTGGATAAAAATACCCTTATAGAA 126326966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGACCCAAGGGAAATTCTTGCACCTTCTATAGAAAGGTGGATAAAAATACCCTTATAGAA 720

126326967 CTTTTTCTATCAGAAGATTGATAAGTTGATAGAAAAACAAAGGAGTTATCAAACAAAAAC 126327026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTTTTCTATCAGAAGATTGATAAGTTGATAGAAAAACAAAGGAGTTATCAAACAAAAAC 780

126327027 CAAAAATAAAACTAATAAAAACATTCCTCATCACAGACGGATCTATGAAAATGAATACAG 126327086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAAAATAAAACTAATAAAAACATTCCTCATCACAGACGGATCTATGAAAATGAATACAG 840

126327087 AAGAATAAAAAAATATTATCAGGGTGATTCACAGGAGTTTCTAAAAAATGTGCATTTCAG 126327146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGAATAAAAAAATATTATCAGGGTGATTCACAGGAGTTTCTAAAAAATGTGCATTTCAG 900

126327147 TTCCTGAAACATGAATATATGTTAGATTTTATGGCAAAGGAAAATTAAGATTGTGAATCA 126327206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCCTGAAACATGAATATATGTTAGATTTTATGGCAAAGGAAAATTAAGATTGTGAATCA 960

126327207 ATTGACCTTAAAATAGGAGATTATCCTGTATTATCTTGTTAGGCTCAATGTAAACAAAAT 126327266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTGACCTTAAAATAGGAGATTATCCTGTATTATCTTGTTAGGCTCAATGTAAACAAAAT 1020

126327267 GGTCTTGAAATGTGGAAGTGGGAGGCAGAAGAGAAGTCAATGTCATACTGAGGCAGAAGC 126327326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTCTTGAAATGTGGAAGTGGGAGGCAGAAGAGAAGTCAATGTCATACTGAGGCAGAAGC 1080

126327327 AAAGGAAAAATCAGTTAGGTAGATAGCTAAGGCTAGTCCTCAGAAAAGCAGCCTGCCTGA 126327386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGGAAAAATCAGTTAGGTAGATAGCTAAGGCTAGTCCTCAGAAAAGCAGCCTGCCTGA 1140

126327387 AAAATCTCAGCTACAGGCAAAAATTTAGCAGCCTGGGAAAACTCAGACTGCACCTGCACA 126327446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAATCTCAGCTACAGGCAAAAATTTAGCAGCCTGGGAAAACTCAGACTGCACCTGCACA 1200

126327447 GATAAGCAGGCAGGTTCCAGCACAGAAGCCTTTTGTTTTTTGTGTTATTAACGGGCTCCC 126327506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATAAGCAGGCAGGTTCCAGCACAGAAGCCTTTTGTTTTTTGTGTTATTAACGGGCTCCC 1260

126327507 AGGACAAAATTTTCTCTCCTTTTCAGACATGTTCATGGTGGGTTCTGTGGAAACTTGCAT 126327566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGACAAAATTTTCTCTCCTTTTCAGACATGTTCATGGTGGGTTCTGTGGAAACTTGCAT 1320

126327567 AAGGAGGAGGAGGTCTCACCTAAAACAAACCCACAGTTACACAAACAAGTGGCGCTTTGT 126327626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGGAGGAGGAGGTCTCACCTAAAACAAACCCACAGTTACACAAACAAGTGGCGCTTTGT 1380

126327627 GCTTTCCTAGAGATAAACCCACAGCTGCGTAAGAGGAGTTGTGCAGACAGCTTCACCGAT 126327686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTTTCCTAGAGATAAACCCACAGCTGCGTAAGAGGAGTTGTGCAGACAGCTTCACCGAT 1440

126327687 AAGTTACTCAAACAGCTACAGAGATGAGAAGAGTTTCTCATAAAGTTTTTGGATTCAACT 126327746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGTTACTCAAACAGCTACAGAGATGAGAAGAGTTTCTCATAAAGTTTTTGGATTCAACT 1500

126327747 GTGTAAACGGCAACCCACTTGGGCTCCCCTCTCTACTGTGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCT 126327806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGTAAACGGCAACCCACTTGGGCTCCCCTCTCTACTGTGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCT 1560

126327807 TATTGCACTTTTGTTCCAATATGACCCTTTGTGTCCATGCTCCTTAATTCTCTTGGTCAT 126327866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATTGCACTTTTGTTCCAATATGACCCTTTGTGTCCATGCTCCTTAATTCTCTTGGTCAT 1620

126327867 GAGACAACGAGCTTTTATAACACCTTAGACAATCAGACCAGTGACCACTGACCTGTTTTA 126327926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAGACAACGAGCTTTTATAACACCTTAGACAATCAGACCAGTGACCACTGACCTGTTTTA 1680

126327927 ATAGTGATGCAATGGGAGAAAGACTCCATCTATTCATTAATATCTCTGAAGATGGAAGGA 126327986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAGTGATGCAATGGGAGAAAGACTCCATCTATTCATTAATATCTCTGAAGATGGAAGGA 1740

126327987 GATGAGTAGCTGAGAAATTTGGGCAGCCTCTAGAAACTGAACAAGGCAAGGAAACAGATT 126328046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATGAGTAGCTGAGAAATTTGGGCAGCCTCTAGAAACTGAACAAGGCAAGGAAACAGATT 1800

126328047 GTCCTCTAGAACCTTCAAAATAGACAGCCAGAGTAAACCTTAATTTTATCCCAGTAAAAC 126328106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTCCTCTAGAACCTTCAAAATAGACAGCCAGAGTAAACCTTAATTTTATCCCAGTAAAAC 1860

126328107 TCATTTTGATCCTCTGACTCCCAGAGCTGTAGCAGAATACATTTACATTGTTTTAAGCCA 126328166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCATTTTGATCCTCTGACTCCCAGAGCTGTAGCAGAATACATTTACATTGTTTTAAGCCA 1920

126328167 ATAAGTCTGTAGCAATTTTTTACAGCAGGAATAGGAATCTAACATAGCATGTATTGGGGG 126328226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAAGTCTGTAGCAATTTTTTACAGCAGGAATAGGAATCTAACATAGCATGTATTGGGGG 1980

126328227 GAATAAAGGAAATTTAAGTCCCCCCTTTATATATGTAACCAGTAAACTGAAGATGAATTA 126328286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAATAAAGGAAATTTAAGTCCCCCCTTTATATATGTAACCAGTAAACTGAAGATGAATTA 2040

126328287 ACATTTTTAATATTATAAAAATTGAAGTAAATACATTCTAATGCTAAATATTAAAATAGA 126328346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACATTTTTAATATTATAAAAATTGAAGTAAATACATTCTAATGCTAAATATTAAAATAGA 2100

126328347 GAAAATGAGATTAATGACTAATTGATCTTGAAATAGGTAAGACATTTGTAAGTATTAAAT 126328406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAAAATGAGATTAATGACTAATTGATCTTGAAATAGGTAAGACATTTGTAAGTATTAAAT 2160

126328407 CAGTTTTGACCTTATTAAATATTTTAGTAATAAAATTTCTTTGAACTAAGTCACAAAGAA 126328466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGTTTTGACCTTATTAAATATTTTAGTAATAAAATTTCTTTGAACTAAGTCACAAAGAA 2220

126328467 AATAGCAAGGTAGAAAAACTACTAGAAACAAATGTGAGAAGTGAGGGCAATATATTTTAT 126328526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATAGCAAGGTAGAAAAACTACTAGAAACAAATGTGAGAAGTGAGGGCAATATATTTTAT 2280

126328527 ATATAAAGGTTTATAATACATCAAAACGAACTCTTTACTCTCTAGAGAAACACATGCAAG 126328586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATATAAAGGTTTATAATACATCAAAACGAACTCTTTACTCTCTAGAGAAACACATGCAAG 2340

126328587 GAACATGAATTGACAATTAAAAAAGAAAATAAAATAATAAACATGAAATCAAGTTTTACT 126328646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAACATGAATTGACAATTAAAAAAGAAAATAAAATAATAAACATGAAATCAAGTTTTACT 2400

126328647 TTAAAAAGTAATGACAATAGAATATATAACATTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAG 126328706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTAAAAAGTAATGACAATAGAATATATAACATTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAG 2460

126328707 AATGTATGCAATCTATCACAGCTTACCTAACCTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTA 126328766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATGTATGCAATCTATCACAGCTTACCTAACCTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTA 2520

126328767 AGTGTTAACAATAATATTTTCATGAAGTTAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCA 126328826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGTGTTAACAATAATATTTTCATGAAGTTAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCA 2580

126328827 AAGTGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAATTAAACATTCTATTAACTGTTAT 126328886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAGTGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAATTAAACATTCTATTAACTGTTAT 2640

126328887 TAATTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTG 126328946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAATTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTG 2700

126328947 AGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATA 126329006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATA 2760

126329007 AACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTC 126329066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTC 2820

126329067 ATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGT 126329126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGT 2880

126329127 ACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACA 126329186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACA 2940

126329187 ACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATAT 126329246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATAT 3000

126329247 ACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGC 126329306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGC 3060

126329307 CAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCT 126329366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCT 3120

126329367 TTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGT 126329426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGT 3180

126329427 TTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTT 126329486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTT 3240

126329487 GTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 126329546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 3300

126329547 GTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCT 126329606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCT 3360

126329607 GCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTT 126329666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTT 3420

126329667 ATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGAC 126329726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGAC 3480

126329727 CTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCG 126329786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCG 3540

126329787 CGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATT 126329846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATT 3600

126329847 CCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACA 126329906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACA 3660

126329907 CACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATC 126329966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATC 3720

126329967 AACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCAT 126330026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCAT 3780

126330027 AAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTA 126330086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTA 3840

126330087 AGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGC 126330146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGC 3900

126330147 TAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGAT 126330206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGAT 3960

126330207 AAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTC 126330266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTC 4020

126330267 AGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCC 126330326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCC 4080

126330327 CTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATT 126330386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATT 4140

126330387 TGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTAT 126330446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTAT 4200

126330447 GACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAA 126330506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAA 4260

126330507 GCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCC 126330566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCC 4320

126330567 CACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGT 126330626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGT 4380

126330627 AGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGG 126330686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGG 4440

126330687 AGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCC 126330746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCC 4500

126330747 CTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAAC 126330806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAAC 4560

126330807 TCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTT 126330866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTT 4620

126330867 ATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTC 126330926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 ATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTC 4680

126330927 CCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGT 126330986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGT 4740

126330987 GAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAG 126331046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAG 4800

126331047 TGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAA 126331106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAA 4860

126331107 TTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAAC 126331166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAAC 4920

126331167 AGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAAC 126331226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAAC 4980

126331227 AAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTT 126331286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTT 5040

126331287 AGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATT 126331346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATT 5100

126331347 TAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTA 126331406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTA 5160

126331407 CTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTA 126331466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTA 5220

126331467 ACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAA 126331526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAA 5280

126331527 AAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGG 126331586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGG 5340

126331587 AATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATC 126331646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATC 5400

126331647 AGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTAT 126331706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTAT 5460

126331707 CAAACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAG 126331766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CAAACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAG 5520

126331767 CATACCTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAG 126331826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CATACCTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAG 5580

126331827 AGAAAAATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACC 126331886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AGAAAAATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACC 5640

126331887 ACTTTTATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAAT 126331946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 ACTTTTATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAAT 5700

126331947 AAAGGCTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACA 126332006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AAAGGCTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACA 5760

126332007 TAATCTTATAATTATAAAAACCTAAAGATTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAAC 126332066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TAATCTTATAATTATAAAAACCTAAAGATTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAAC 5820

126332067 AAATTCAGTAAAGTTTCAGGATACAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTAT 126332126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 AAATTCAGTAAAGTTTCAGGATACAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTAT 5880

126332127 GCCAACAGCAAACAATCTGAAAAAAAAATGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACA 126332186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GCCAACAGCAAACAATCTGAAAAAAAAATGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACA 5940

126332187 AAGAATATAAAATACCTAGTAATAAATTTAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAA 126332246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 AAGAATATAAAATACCTAGTAATAAATTTAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAA 6000

126332247 AACTATAAAACACGGATGAAAGAAATCCAAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATG 126332306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 AACTATAAAACACGGATGAAAGAAATCCAAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATG 6060

126332307 GTCATGAATGAAAAAAATTAATATTGTTAAAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAAT 126332366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 GTCATGAATGAAAAAAATTAATATTGTTAAAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAAT 6120

126332367 GCAATCCCTATCAAAATACCAATGACATTCCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAAT 126332426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 GCAATCCCTATCAAAATACCAATGACATTCCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAAT 6180

126332427 TTGTATGAAAACACAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAG 126332486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TTGTATGAAAACACAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAG 6240

126332487 CTGGAGGCAGCACACTACCTGAATTCAAGATTTACTACAAAGCTATAGTAACCAACTAGT 126332546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CTGGAGGCAGCACACTACCTGAATTCAAGATTTACTACAAAGCTATAGTAACCAACTAGT 6300

126332547 ACTGGCATAAAAACAGGCACATTGACCAATGGAACAAAATGGAGAACCTACATATAAATC 126332606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 ACTGGCATAAAAACAGGCACATTGACCAATGGAACAAAATGGAGAACCTACATATAAATC 6360

126332607 CACAGTGAACTAATTTTCAACAAATGCACCAGGAACATACAGTAGGAAAGGGATGTTGTC 126332666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 CACAGTGAACTAATTTTCAACAAATGCACCAGGAACATACAGTAGGAAAGGGATGTTGTC 6420

126332667 TTCAGTAAATAGTGCTAGGAAAACTGCATAACAAAAATCAAGTCAAAATATACTAAAGAC 126332726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 TTCAGTAAATAGTGCTAGGAAAACTGCATAACAAAAATCAAGTCAAAATATACTAAAGAC 6480

126332727 TTAAATCTAAGGCTTGAACCTATGATACTACTAGAAAAAAACATTGGGGAAATGCTTTGG 126332786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 TTAAATCTAAGGCTTGAACCTATGATACTACTAGAAAAAAACATTGGGGAAATGCTTTGG 6540

126332787 GACATTGGTCTAGGCAAAACTTTTTGTAAGACCTCCCTCAAAAGCACAGACAATCAAAGC 126332846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 GACATTGGTCTAGGCAAAACTTTTTGTAAGACCTCCCTCAAAAGCACAGACAATCAAAGC 6600

126332847 AGACATGGACAAATGGGACTACATGAAGCTAAAAAGGTTCTGCACATTAAAGAAAACAAT 126332906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 AGACATGGACAAATGGGACTACATGAAGCTAAAAAGGTTCTGCACATTAAAGAAAACAAT 6660

126332907 CAGCAAAGTGAACAGACAACCTACAGAATGGAAGAAAATATTTGCAAACTACTTACCTAA 126332966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 CAGCAAAGTGAACAGACAACCTACAGAATGGAAGAAAATATTTGCAAACTACTTACCTAA 6720

126332967 CGAGGGATTAATAATCAGAATGTATAAGAAGCTTAAAAAACTCAATAGCAAAAAAATCCA 126333026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 CGAGGGATTAATAATCAGAATGTATAAGAAGCTTAAAAAACTCAATAGCAAAAAAATCCA 6780

126333027 CTTAAAATGAGCAAAATAAATGATCTCTTGACATTTCTC 126333065
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 CTTAAAATGAGCAAAATAAATGATCTCTTGACATTTCTC 6819

EXCISED REGION

126333067 AAAAAAAAAAAAGACATACAAATGGCCAACAGGTCTATAAAAAATGCTAAACATTGCTAA 126333126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6820 AAAAAAAAAAAAGACATACAAATGGCCAACAGGTCTATAAAAAATGCTAAACATTGCTAA 6879

126333127 TCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACTACAAGGAGATATCATCTCACCCCAATTAAATTGG 126333186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6880 TCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACTACAAGGAGATATCATCTCACCCCAATTAAATTGG 6939

126333187 CTTTTATCCAAAAGACAGGTAAAAATGAATGTTGGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAAAGC 126333246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6940 CTTTTATCCAAAAGACAGGTAAAAATGAATGTTGGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAAAGC 6999

126333247 TAATACACTATTGGTAGGAATGTAAATAGTATTGTTAGTATGCAGAAGAGTATGGAGAGT 126333306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7000 TAATACACTATTGGTAGGAATGTAAATAGTATTGTTAGTATGCAGAAGAGTATGGAGAGT 7059

126333307 TCTCAAAAATCTAAAAATAGAAATAACGTACAATACAGCAATTTCACTACTGGGCATATA 126333366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7060 TCTCAAAAATCTAAAAATAGAAATAACGTACAATACAGCAATTTCACTACTGGGCATATA 7119

126333367 TTCATGAAAAGAAAATCAATATATTGAAAAGACATCTTCGCTCTCATGTAAAGCACTATT 126333426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7120 TTCATGAAAAGAAAATCAATATATTGAAAAGACATCTTCGCTCTCATGTAAAGCACTATT 7179

126333427 TGCAATAGCCAAAATATAGAAATGACGTAAATACCTATCAAAGGAAGAAAGGATAAAGAA 126333486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7180 TGCAATAGCCAAAATATAGAAATGACGTAAATACCTATCAAAGGAAGAAAGGATAAAGAA 7239

126333487 AGCATTGTACATATACACAAATTG 126333510
          ||||||||||||||||||||||||
     7240 AGCATTGTACATATACACAAATTG 7263

Alignment time is 8.56583 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     3516] =>      3516 nucs 'mol-32-2869-006928_3516'

Score:        3515
Aligned:      3515        nucs
Identic:      3515 (100%) nucs =>      2528 (100%)       987 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126331000,126333527] EXCISED REGION [126333529,126334515]
 second seq =>  [        1,     2528] EXCISED REGION [     2530,     3516]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126333528,126333528]
 second seq =>         1 nucs [2529,2529]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [126333528,126333528] to [126333529,126333529]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126331000 AGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCT 126331059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCT 60

126331060 CTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAA 126331119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAA 120

126331120 CTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAA 126331179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAA 180

126331180 ATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATAT 126331239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATAT 240

126331240 GTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAG 126331299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAG 300

126331300 ATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTA 126331359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTA 360

126331360 ATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCAC 126331419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCAC 420

126331420 TATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAA 126331479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAA 480

126331480 CTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCA 126331539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCA 540

126331540 GCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGG 126331599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGG 600

126331600 GACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAAC 126331659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAAC 660

126331660 CAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCA 126331719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCA 720

126331720 ACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATA 126331779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATA 780

126331780 ATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAG 126331839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAG 840

126331840 TCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGT 126331899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGT 900

126331900 ATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTAT 126331959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTAT 960

126331960 CCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATCTTATAATT 126332019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATCTTATAATT 1020

126332020 ATAAAAACCTAAAGATTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAG 126332079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATAAAAACCTAAAGATTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAG 1080

126332080 TTTCAGGATACAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAACAGCAAAC 126332139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTCAGGATACAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAACAGCAAAC 1140

126332140 AATCTGAAAAAAAAATGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAATATAAAAT 126332199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATCTGAAAAAAAAATGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAATATAAAAT 1200

126332200 ACCTAGTAATAAATTTAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTATAAAACAC 126332259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCTAGTAATAAATTTAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTATAAAACAC 1260

126332260 GGATGAAAGAAATCCAAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCATGAATGAAA 126332319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGATGAAAGAAATCCAAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCATGAATGAAA 1320

126332320 AAAATTAATATTGTTAAAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAATGCAATCCCTATCA 126332379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAATTAATATTGTTAAAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAATGCAATCCCTATCA 1380

126332380 AAATACCAATGACATTCCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTGTATGAAAACA 126332439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAATACCAATGACATTCCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTGTATGAAAACA 1440

126332440 CAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTGGAGGCAGCAC 126332499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTGGAGGCAGCAC 1500

126332500 ACTACCTGAATTCAAGATTTACTACAAAGCTATAGTAACCAACTAGTACTGGCATAAAAA 126332559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTACCTGAATTCAAGATTTACTACAAAGCTATAGTAACCAACTAGTACTGGCATAAAAA 1560

126332560 CAGGCACATTGACCAATGGAACAAAATGGAGAACCTACATATAAATCCACAGTGAACTAA 126332619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGGCACATTGACCAATGGAACAAAATGGAGAACCTACATATAAATCCACAGTGAACTAA 1620

126332620 TTTTCAACAAATGCACCAGGAACATACAGTAGGAAAGGGATGTTGTCTTCAGTAAATAGT 126332679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTCAACAAATGCACCAGGAACATACAGTAGGAAAGGGATGTTGTCTTCAGTAAATAGT 1680

126332680 GCTAGGAAAACTGCATAACAAAAATCAAGTCAAAATATACTAAAGACTTAAATCTAAGGC 126332739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTAGGAAAACTGCATAACAAAAATCAAGTCAAAATATACTAAAGACTTAAATCTAAGGC 1740

126332740 TTGAACCTATGATACTACTAGAAAAAAACATTGGGGAAATGCTTTGGGACATTGGTCTAG 126332799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTGAACCTATGATACTACTAGAAAAAAACATTGGGGAAATGCTTTGGGACATTGGTCTAG 1800

126332800 GCAAAACTTTTTGTAAGACCTCCCTCAAAAGCACAGACAATCAAAGCAGACATGGACAAA 126332859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCAAAACTTTTTGTAAGACCTCCCTCAAAAGCACAGACAATCAAAGCAGACATGGACAAA 1860

126332860 TGGGACTACATGAAGCTAAAAAGGTTCTGCACATTAAAGAAAACAATCAGCAAAGTGAAC 126332919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGGACTACATGAAGCTAAAAAGGTTCTGCACATTAAAGAAAACAATCAGCAAAGTGAAC 1920

126332920 AGACAACCTACAGAATGGAAGAAAATATTTGCAAACTACTTACCTAACGAGGGATTAATA 126332979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGACAACCTACAGAATGGAAGAAAATATTTGCAAACTACTTACCTAACGAGGGATTAATA 1980

126332980 ATCAGAATGTATAAGAAGCTTAAAAAACTCAATAGCAAAAAAATCCACTTAAAATGAGCA 126333039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCAGAATGTATAAGAAGCTTAAAAAACTCAATAGCAAAAAAATCCACTTAAAATGAGCA 2040

126333040 AAATAAATGATCTCTTGACATTTCTCAAAAAAAAAAAAAGACATACAAATGGCCAACAGG 126333099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAATAAATGATCTCTTGACATTTCTCAAAAAAAAAAAAAGACATACAAATGGCCAACAGG 2100

126333100 TCTATAAAAAATGCTAAACATTGCTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACTACAAGGA 126333159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTATAAAAAATGCTAAACATTGCTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACTACAAGGA 2160

126333160 GATATCATCTCACCCCAATTAAATTGGCTTTTATCCAAAAGACAGGTAAAAATGAATGTT 126333219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GATATCATCTCACCCCAATTAAATTGGCTTTTATCCAAAAGACAGGTAAAAATGAATGTT 2220

126333220 GGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAAAGCTAATACACTATTGGTAGGAATGTAAATAGTATT 126333279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAAAGCTAATACACTATTGGTAGGAATGTAAATAGTATT 2280

126333280 GTTAGTATGCAGAAGAGTATGGAGAGTTCTCAAAAATCTAAAAATAGAAATAACGTACAA 126333339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTTAGTATGCAGAAGAGTATGGAGAGTTCTCAAAAATCTAAAAATAGAAATAACGTACAA 2340

126333340 TACAGCAATTTCACTACTGGGCATATATTCATGAAAAGAAAATCAATATATTGAAAAGAC 126333399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TACAGCAATTTCACTACTGGGCATATATTCATGAAAAGAAAATCAATATATTGAAAAGAC 2400

126333400 ATCTTCGCTCTCATGTAAAGCACTATTTGCAATAGCCAAAATATAGAAATGACGTAAATA 126333459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATCTTCGCTCTCATGTAAAGCACTATTTGCAATAGCCAAAATATAGAAATGACGTAAATA 2460

126333460 CCTATCAAAGGAAGAAAGGATAAAGAAAGCATTGTACATATACACAAATTGTATTCGGCC 126333519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCTATCAAAGGAAGAAAGGATAAAGAAAGCATTGTACATATACACAAATTGTATTCGGCC 2520

126333520 ATTAAAGG 126333527
          ||||||||
     2521 ATTAAAGG 2528

EXCISED REGION

126333529 ATGAAATCCTAGTATTTGCAGCAAAATGGATGGAACTGAAGGTCATTATGTTAAATGAAA 126333588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 ATGAAATCCTAGTATTTGCAGCAAAATGGATGGAACTGAAGGTCATTATGTTAAATGAAA 2589

126333589 TAAGTCAAGCACAGAAAGACAAATATCACACATTTTTATACATATGTGGGTATAAAAGTG 126333648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 TAAGTCAAGCACAGAAAGACAAATATCACACATTTTTATACATATGTGGGTATAAAAGTG 2649

126333649 GTCATGAAAATAGAGAGTTGATTGGCAGTTACCAGAAGCCAGGGAGGGTAGTGGGTGAGG 126333708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 GTCATGAAAATAGAGAGTTGATTGGCAGTTACCAGAAGCCAGGGAGGGTAGTGGGTGAGG 2709

126333709 GGATGAAGACAAGTTGATTAATGGGTACAAATATGCAGTTTGAAGAAAGATTTAGTGTTA 126333768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 GGATGAAGACAAGTTGATTAATGGGTACAAATATGCAGTTTGAAGAAAGATTTAGTGTTA 2769

126333769 AAAGAACAGCAGGGTGAATAGAGTTTACAAAAGTCTAATGTATATTTCAAAATAGCTAAA 126333828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 AAAGAACAGCAGGGTGAATAGAGTTTACAAAAGTCTAATGTATATTTCAAAATAGCTAAA 2829

126333829 AGAGAAGAACTCAAATGGTTCTAGCATAAAGAAAAGGCAAATATTCCAGACAACAGATAT 126333888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 AGAGAAGAACTCAAATGGTTCTAGCATAAAGAAAAGGCAAATATTCCAGACAACAGATAT 2889

126333889 CCCAAGTACACTGTTTTGATCTTTACAAATTATGTGAATATTAAATTATCACATGTACCC 126333948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 CCCAAGTACACTGTTTTGATCTTTACAAATTATGTGAATATTAAATTATCACATGTACCC 2949

126333949 TATTACTATGTACATGTGTTATGCATCAATAAATAAAAGAAGTAAAAGCACACAGAGCAT 126334008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 TATTACTATGTACATGTGTTATGCATCAATAAATAAAAGAAGTAAAAGCACACAGAGCAT 3009

126334009 TCACCAAGAAAGACCATATGCTGGGCTATAAAATAAGTCTTGATAAATTTTGAAAGACTC 126334068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 TCACCAAGAAAGACCATATGCTGGGCTATAAAATAAGTCTTGATAAATTTTGAAAGACTC 3069

126334069 AAATTTTGATTTTTGTATATGCTGTAAGGAAGGGATCTGGTTTCAATCTTCTGCATATAG 126334128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 AAATTTTGATTTTTGTATATGCTGTAAGGAAGGGATCTGGTTTCAATCTTCTGCATATAG 3129

126334129 CTAGCTAGTTGTCTCAGCACCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTCCCCATTGCCTGTGTC 126334188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 CTAGCTAGTTGTCTCAGCACCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTCCCCATTGCCTGTGTC 3189

126334189 AACTTTGTCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGCAGCTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCT 126334248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 AACTTTGTCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGCAGCTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCT 3249

126334249 TTTGCATTGGTTTATGTCTGTTTTTGTACCAGTACTATGCTGTTTTAGTTATTGTAGGCT 126334308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 TTTGCATTGGTTTATGTCTGTTTTTGTACCAGTACTATGCTGTTTTAGTTATTGTAGGCT 3309

126334309 TGTAATATAGTTTAAGGTCGGATAACATGATGCCTCCACCTTTGTTCTTTTTGCATAGGA 126334368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 TGTAATATAGTTTAAGGTCGGATAACATGATGCCTCCACCTTTGTTCTTTTTGCATAGGA 3369

126334369 TTACCTTGGCTATTTGGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAAATAGTTTTTTCTA 126334428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 TTACCTTGGCTATTTGGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAAATAGTTTTTTCTA 3429

126334429 GCTCTGTGAAGAATGTCATTGATAGTTTGATAGGAATAGCATTGAATCTGTAATTTGCTT 126334488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 GCTCTGTGAAGAATGTCATTGATAGTTTGATAGGAATAGCATTGAATCTGTAATTTGCTT 3489

126334489 GGGCAGTATGGCCATTTTGACAATATT 126334515
          |||||||||||||||||||||||||||
     3490 GGGCAGTATGGCCATTTTGACAATATT 3516

Alignment time is 4.58869 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     6529] =>      6529 nucs 'mol-32-2edb-074306_6529'

Score:        6484
Aligned:      6484        nucs
Identic:      6484 (100%) nucs =>      6474 (100%)        10 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126326045,126332518] EXCISED REGION [126340167,126340176]
 second seq =>  [        1,     6474] EXCISED REGION [     6505,     6514]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      7648 nucs [126332519,126340166]
 second seq =>        30 nucs [6475,6504]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>      1855 nucs [126332519,126334373]
 second seq =>         3 nucs [6475,6477]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [6473,6474] to [6503,6504]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126326045 TGAAAAAAGTCTTTTCTTTTATGCTTACACTAATAAAAAATAAAACAAAATATAAAAAAG 126326104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAAAAAAGTCTTTTCTTTTATGCTTACACTAATAAAAAATAAAACAAAATATAAAAAAG 60

126326105 AGAACCCATAATACCACCTAAACCTAAAATTAAATTACCTTTGCCACCTAAAAAAATTCC 126326164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAACCCATAATACCACCTAAACCTAAAATTAAATTACCTTTGCCACCTAAAAAAATTCC 120

126326165 CGGCAAAAAAAAAAACAAACAGGTAAACAAACTAAAATAATAAAAACAAAACATATGACC 126326224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGGCAAAAAAAAAAACAAACAGGTAAACAAACTAAAATAATAAAAACAAAACATATGACC 180

126326225 TCAATTTTTATAACCTACAAAGAGTTTCCACTAACTATATGGCTGAAAAAGCAGGAGTGA 126326284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAATTTTTATAACCTACAAAGAGTTTCCACTAACTATATGGCTGAAAAAGCAGGAGTGA 240

126326285 AAACAACAATATCAATAAACTCTTTATGTATTACTACATGAAATAGAGAAGTGCTACCAA 126326344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACAACAATATCAATAAACTCTTTATGTATTACTACATGAAATAGAGAAGTGCTACCAA 300

126326345 TTTGTTGGAAGGGACATGACATGATCCATAAAAAGAGACAGTTGTACTAACTATCTTGCA 126326404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGTTGGAAGGGACATGACATGATCCATAAAAAGAGACAGTTGTACTAACTATCTTGCA 360

126326405 TCTGTATCAACCAGAAACTTGAATTGTGATTTTTAAATTGTAAATATACTATTTTGAAGA 126326464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGTATCAACCAGAAACTTGAATTGTGATTTTTAAATTGTAAATATACTATTTTGAAGA 420

126326465 AACCAATTATTTTGCTCTTTCCCCATATCTCTCTGTATTCATTTAAGAAATTGAATGTCA 126326524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACCAATTATTTTGCTCTTTCCCCATATCTCTCTGTATTCATTTAAGAAATTGAATGTCA 480

126326525 AGGAAAACTGACAAAAAAAGGGAAACAGGTAGAAGTATGGGAATGAAGGTGAAGGGAAAT 126326584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGAAAACTGACAAAAAAAGGGAAACAGGTAGAAGTATGGGAATGAAGGTGAAGGGAAAT 540

126326585 ATACGGATGGTGATAATTCATTGTGCATCGTATTTTAGAAGATGTAGTAATAGTAAATGA 126326644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATACGGATGGTGATAATTCATTGTGCATCGTATTTTAGAAGATGTAGTAATAGTAAATGA 600

126326645 AACAATTCAGATGGAATAAAACAAAGAAAAATTTTGGTATCTCTTTATTCTAGTTATTAT 126326704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACAATTCAGATGGAATAAAACAAAGAAAAATTTTGGTATCTCTTTATTCTAGTTATTAT 660

126326705 ATTTTTTGTACATTCATAAGTTGAGGCTATCATTAAAGAAGATATTAAAGGTAAAATAAT 126326764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTTTTGTACATTCATAAGTTGAGGCTATCATTAAAGAAGATATTAAAGGTAAAATAAT 720

126326765 ATTTCATTAGGGTACTGTAGAGCTTCACTGGATAAATTCTGGCTAAATAACAAAAATTGA 126326824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTCATTAGGGTACTGTAGAGCTTCACTGGATAAATTCTGGCTAAATAACAAAAATTGA 780

126326825 CCTAAGAAGTGAGCATATCAGTTGGATCTTGAGCCAAAGATCTGATAAGGGCACTCAATA 126326884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTAAGAAGTGAGCATATCAGTTGGATCTTGAGCCAAAGATCTGATAAGGGCACTCAATA 840

126326885 AGACTCTCAGTAAAAAGTGAATTGACCCAAGGGAAATTCTTGCACCTTCTATAGAAAGGT 126326944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGACTCTCAGTAAAAAGTGAATTGACCCAAGGGAAATTCTTGCACCTTCTATAGAAAGGT 900

126326945 GGATAAAAATACCCTTATAGAACTTTTTCTATCAGAAGATTGATAAGTTGATAGAAAAAC 126327004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGATAAAAATACCCTTATAGAACTTTTTCTATCAGAAGATTGATAAGTTGATAGAAAAAC 960

126327005 AAAGGAGTTATCAAACAAAAACCAAAAATAAAACTAATAAAAACATTCCTCATCACAGAC 126327064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAGGAGTTATCAAACAAAAACCAAAAATAAAACTAATAAAAACATTCCTCATCACAGAC 1020

126327065 GGATCTATGAAAATGAATACAGAAGAATAAAAAAATATTATCAGGGTGATTCACAGGAGT 126327124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGATCTATGAAAATGAATACAGAAGAATAAAAAAATATTATCAGGGTGATTCACAGGAGT 1080

126327125 TTCTAAAAAATGTGCATTTCAGTTCCTGAAACATGAATATATGTTAGATTTTATGGCAAA 126327184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTAAAAAATGTGCATTTCAGTTCCTGAAACATGAATATATGTTAGATTTTATGGCAAA 1140

126327185 GGAAAATTAAGATTGTGAATCAATTGACCTTAAAATAGGAGATTATCCTGTATTATCTTG 126327244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAAAATTAAGATTGTGAATCAATTGACCTTAAAATAGGAGATTATCCTGTATTATCTTG 1200

126327245 TTAGGCTCAATGTAAACAAAATGGTCTTGAAATGTGGAAGTGGGAGGCAGAAGAGAAGTC 126327304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTAGGCTCAATGTAAACAAAATGGTCTTGAAATGTGGAAGTGGGAGGCAGAAGAGAAGTC 1260

126327305 AATGTCATACTGAGGCAGAAGCAAAGGAAAAATCAGTTAGGTAGATAGCTAAGGCTAGTC 126327364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATGTCATACTGAGGCAGAAGCAAAGGAAAAATCAGTTAGGTAGATAGCTAAGGCTAGTC 1320

126327365 CTCAGAAAAGCAGCCTGCCTGAAAAATCTCAGCTACAGGCAAAAATTTAGCAGCCTGGGA 126327424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCAGAAAAGCAGCCTGCCTGAAAAATCTCAGCTACAGGCAAAAATTTAGCAGCCTGGGA 1380

126327425 AAACTCAGACTGCACCTGCACAGATAAGCAGGCAGGTTCCAGCACAGAAGCCTTTTGTTT 126327484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAACTCAGACTGCACCTGCACAGATAAGCAGGCAGGTTCCAGCACAGAAGCCTTTTGTTT 1440

126327485 TTTGTGTTATTAACGGGCTCCCAGGACAAAATTTTCTCTCCTTTTCAGACATGTTCATGG 126327544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTGTGTTATTAACGGGCTCCCAGGACAAAATTTTCTCTCCTTTTCAGACATGTTCATGG 1500

126327545 TGGGTTCTGTGGAAACTTGCATAAGGAGGAGGAGGTCTCACCTAAAACAAACCCACAGTT 126327604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGGTTCTGTGGAAACTTGCATAAGGAGGAGGAGGTCTCACCTAAAACAAACCCACAGTT 1560

126327605 ACACAAACAAGTGGCGCTTTGTGCTTTCCTAGAGATAAACCCACAGCTGCGTAAGAGGAG 126327664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACACAAACAAGTGGCGCTTTGTGCTTTCCTAGAGATAAACCCACAGCTGCGTAAGAGGAG 1620

126327665 TTGTGCAGACAGCTTCACCGATAAGTTACTCAAACAGCTACAGAGATGAGAAGAGTTTCT 126327724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGTGCAGACAGCTTCACCGATAAGTTACTCAAACAGCTACAGAGATGAGAAGAGTTTCT 1680

126327725 CATAAAGTTTTTGGATTCAACTGTGTAAACGGCAACCCACTTGGGCTCCCCTCTCTACTG 126327784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATAAAGTTTTTGGATTCAACTGTGTAAACGGCAACCCACTTGGGCTCCCCTCTCTACTG 1740

126327785 TGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCTTATTGCACTTTTGTTCCAATATGACCCTTTGTGTCCAT 126327844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCTTATTGCACTTTTGTTCCAATATGACCCTTTGTGTCCAT 1800

126327845 GCTCCTTAATTCTCTTGGTCATGAGACAACGAGCTTTTATAACACCTTAGACAATCAGAC 126327904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCTCCTTAATTCTCTTGGTCATGAGACAACGAGCTTTTATAACACCTTAGACAATCAGAC 1860

126327905 CAGTGACCACTGACCTGTTTTAATAGTGATGCAATGGGAGAAAGACTCCATCTATTCATT 126327964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGTGACCACTGACCTGTTTTAATAGTGATGCAATGGGAGAAAGACTCCATCTATTCATT 1920

126327965 AATATCTCTGAAGATGGAAGGAGATGAGTAGCTGAGAAATTTGGGCAGCCTCTAGAAACT 126328024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATATCTCTGAAGATGGAAGGAGATGAGTAGCTGAGAAATTTGGGCAGCCTCTAGAAACT 1980

126328025 GAACAAGGCAAGGAAACAGATTGTCCTCTAGAACCTTCAAAATAGACAGCCAGAGTAAAC 126328084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAACAAGGCAAGGAAACAGATTGTCCTCTAGAACCTTCAAAATAGACAGCCAGAGTAAAC 2040

126328085 CTTAATTTTATCCCAGTAAAACTCATTTTGATCCTCTGACTCCCAGAGCTGTAGCAGAAT 126328144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTTAATTTTATCCCAGTAAAACTCATTTTGATCCTCTGACTCCCAGAGCTGTAGCAGAAT 2100

126328145 ACATTTACATTGTTTTAAGCCAATAAGTCTGTAGCAATTTTTTACAGCAGGAATAGGAAT 126328204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACATTTACATTGTTTTAAGCCAATAAGTCTGTAGCAATTTTTTACAGCAGGAATAGGAAT 2160

126328205 CTAACATAGCATGTATTGGGGGGAATAAAGGAAATTTAAGTCCCCCCTTTATATATGTAA 126328264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTAACATAGCATGTATTGGGGGGAATAAAGGAAATTTAAGTCCCCCCTTTATATATGTAA 2220

126328265 CCAGTAAACTGAAGATGAATTAACATTTTTAATATTATAAAAATTGAAGTAAATACATTC 126328324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCAGTAAACTGAAGATGAATTAACATTTTTAATATTATAAAAATTGAAGTAAATACATTC 2280

126328325 TAATGCTAAATATTAAAATAGAGAAAATGAGATTAATGACTAATTGATCTTGAAATAGGT 126328384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAATGCTAAATATTAAAATAGAGAAAATGAGATTAATGACTAATTGATCTTGAAATAGGT 2340

126328385 AAGACATTTGTAAGTATTAAATCAGTTTTGACCTTATTAAATATTTTAGTAATAAAATTT 126328444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAGACATTTGTAAGTATTAAATCAGTTTTGACCTTATTAAATATTTTAGTAATAAAATTT 2400

126328445 CTTTGAACTAAGTCACAAAGAAAATAGCAAGGTAGAAAAACTACTAGAAACAAATGTGAG 126328504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTTGAACTAAGTCACAAAGAAAATAGCAAGGTAGAAAAACTACTAGAAACAAATGTGAG 2460

126328505 AAGTGAGGGCAATATATTTTATATATAAAGGTTTATAATACATCAAAACGAACTCTTTAC 126328564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAGTGAGGGCAATATATTTTATATATAAAGGTTTATAATACATCAAAACGAACTCTTTAC 2520

126328565 TCTCTAGAGAAACACATGCAAGGAACATGAATTGACAATTAAAAAAGAAAATAAAATAAT 126328624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCTCTAGAGAAACACATGCAAGGAACATGAATTGACAATTAAAAAAGAAAATAAAATAAT 2580

126328625 AAACATGAAATCAAGTTTTACTTTAAAAAGTAATGACAATAGAATATATAACATTGATTT 126328684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAACATGAAATCAAGTTTTACTTTAAAAAGTAATGACAATAGAATATATAACATTGATTT 2640

126328685 AGATGTTTGGATCTAGAATCAGAATGTATGCAATCTATCACAGCTTACCTAACCTTTCTT 126328744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGATGTTTGGATCTAGAATCAGAATGTATGCAATCTATCACAGCTTACCTAACCTTTCTT 2700

126328745 TGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGTGTTAACAATAATATTTTCATGAAGTTAATGTCAGA 126328804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGTGTTAACAATAATATTTTCATGAAGTTAATGTCAGA 2760

126328805 AATGAATGAGTGAAACTATGCAAAGTGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAAT 126328864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AATGAATGAGTGAAACTATGCAAAGTGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAAT 2820

126328865 TAAACATTCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATT 126328924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAAACATTCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATT 2880

126328925 ACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGAT 126328984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGAT 2940

126328985 TGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAA 126329044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAA 3000

126329045 ATTAAATAAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGA 126329104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATTAAATAAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGA 3060

126329105 TGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAA 126329164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAA 3120

126329165 CAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAG 126329224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAG 3180

126329225 AAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATG 126329284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATG 3240

126329285 TCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCAC 126329344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCAC 3300

126329345 GGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGT 126329404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGT 3360

126329405 ATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAA 126329464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAA 3420

126329465 ACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTC 126329524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTC 3480

126329525 TTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCT 126329584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCT 3540

126329585 CCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCA 126329644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCA 3600

126329645 CCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCC 126329704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCC 3660

126329705 AGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 126329764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 3720

126329765 GGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGA 126329824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGA 3780

126329825 ACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATT 126329884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATT 3840

126329885 ATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTAT 126329944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTAT 3900

126329945 TAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACA 126330004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACA 3960

126330005 ACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGAT 126330064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGAT 4020

126330065 GGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTAT 126330124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTAT 4080

126330125 GTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAAT 126330184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAAT 4140

126330185 GGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAG 126330244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAG 4200

126330245 GTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAG 126330304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAG 4260

126330305 GTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACA 126330364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACA 4320

126330365 AAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAAC 126330424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAAC 4380

126330425 AAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAA 126330484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAA 4440

126330485 TAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACT 126330544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACT 4500

126330545 TACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCC 126330604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCC 4560

126330605 CCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCA 126330664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCA 4620

126330665 CAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAA 126330724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAA 4680

126330725 GTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGT 126330784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGT 4740

126330785 CCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAAC 126330844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAAC 4800

126330845 AGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCC 126330904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCC 4860

126330905 TTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCC 126330964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCC 4920

126330965 ATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTA 126331024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTA 4980

126331025 GGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATA 126331084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATA 5040

126331085 GAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAG 126331144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAG 5100

126331145 AAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAA 126331204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAA 5160

126331205 AGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAA 126331264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAA 5220

126331265 AATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTA 126331324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTA 5280

126331325 CTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTT 126331384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTT 5340

126331385 AAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGAT 126331444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGAT 5400

126331445 ATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAA 126331504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAA 5460

126331505 ATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAA 126331564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 ATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAA 5520

126331565 GATCATTCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACAC 126331624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GATCATTCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACAC 5580

126331625 AAATTGACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACT 126331684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AAATTGACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACT 5640

126331685 TCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTA 126331744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTA 5700

126331745 ATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCA 126331804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCA 5760

126331805 CAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAA 126331864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAA 5820

126331865 GACAAGGATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAG 126331924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 GACAAGGATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAG 5880

126331925 CAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAA 126331984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAA 5940

126331985 TGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATCTTATAATTATAAAAACCTAAAGATTCCATCAGA 126332044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATCTTATAATTATAAAAACCTAAAGATTCCATCAGA 6000

126332045 AAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGATACAAAATCAACATACA 126332104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 AAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGATACAAAATCAACATACA 6060

126332105 AAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAACAGCAAACAATCTGAAAAAAAAATGAAGAAAGC 126332164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 AAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAACAGCAAACAATCTGAAAAAAAAATGAAGAAAGC 6120

126332165 AATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAATATAAAATACCTAGTAATAAATTTAACCAAATA 126332224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 AATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAATATAAAATACCTAGTAATAAATTTAACCAAATA 6180

126332225 ACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTATAAAACACGGATGAAAGAAATCCAAGAGGATAC 126332284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 ACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTATAAAACACGGATGAAAGAAATCCAAGAGGATAC 6240

126332285 AAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCATGAATGAAAAAAATTAATATTGTTAAAACGGCAA 126332344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 AAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCATGAATGAAAAAAATTAATATTGTTAAAACGGCAA 6300

126332345 TTTAACAATTTGCAGATTCAATGCAATCCCTATCAAAATACCAATGACATTCCTTATAGA 126332404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TTTAACAATTTGCAGATTCAATGCAATCCCTATCAAAATACCAATGACATTCCTTATAGA 6360

126332405 AAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTGTATGAAAACACAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCA 126332464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 AAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTGTATGAAAACACAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCA 6420

126332465 ATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTGGAGGCAGCACACTACCTGAATTCAAGATT 126332518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 ATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTGGAGGCAGCACACTACCTGAATTCAAGATT 6474

EXCISED REGION

126340167 CATACAAATT 126340176
          ||||||||||
     6505 CATACAAATT 6514

Alignment time is 8.10646 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     5356] =>      5356 nucs 'mol-32-2f28-026143_5356'

Score:        5311
Aligned:      5355        nucs
Identic:      5351 (100%) nucs =>      1082 (100%)      4269 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126327147,126328228] EXCISED REGION [126328230,126332502]
 second seq =>  [        1,     1082] EXCISED REGION [     1084,     5356]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126328229,126328229]
 second seq =>         1 nucs [1083,1083]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [126328228,126328228] to [126328229,126328229]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126327147 TTCCTGAAACATGAATATATGTTAGATTTTATGGCAAAGGAAAATTAAGATTGTGAATCA 126327206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCCTGAAACATGAATATATGTTAGATTTTATGGCAAAGGAAAATTAAGATTGTGAATCA 60

126327207 ATTGACCTTAAAATAGGAGATTATCCTGTATTATCTTGTTAGGCTCAATGTAAACAAAAT 126327266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTGACCTTAAAATAGGAGATTATCCTGTATTATCTTGTTAGGCTCAATGTAAACAAAAT 120

126327267 GGTCTTGAAATGTGGAAGTGGGAGGCAGAAGAGAAGTCAATGTCATACTGAGGCAGAAGC 126327326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTCTTGAAATGTGGAAGTGGGAGGCAGAAGAGAAGTCAATGTCATACTGAGGCAGAAGC 180

126327327 AAAGGAAAAATCAGTTAGGTAGATAGCTAAGGCTAGTCCTCAGAAAAGCAGCCTGCCTGA 126327386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGGAAAAATCAGTTAGGTAGATAGCTAAGGCTAGTCCTCAGAAAAGCAGCCTGCCTGA 240

126327387 AAAATCTCAGCTACAGGCAAAAATTTAGCAGCCTGGGAAAACTCAGACTGCACCTGCACA 126327446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAATCTCAGCTACAGGCAAAAATTTAGCAGCCTGGGAAAACTCAGACTGCACCTGCACA 300

126327447 GATAAGCAGGCAGGTTCCAGCACAGAAGCCTTTTGTTTTTTGTGTTATTAACGGGCTCCC 126327506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATAAGCAGGCAGGTTCCAGCACAGAAGCCTTTTGTTTTTTGTGTTATTAACGGGCTCCC 360

126327507 AGGACAAAATTTTCTCTCCTTTTCAGACATGTTCATGGTGGGTTCTGTGGAAACTTGCAT 126327566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGACAAAATTTTCTCTCCTTTTCAGACATGTTCATGGTGGGTTCTGTGGAAACTTGCAT 420

126327567 AAGGAGGAGGAGGTCTCACCTAAAACAAACCCACAGTTACACAAACAAGTGGCGCTTTGT 126327626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGGAGGAGGAGGTCTCACCTAAAACAAACCCACAGTTACACAAACAAGTGGCGCTTTGT 480

126327627 GCTTTCCTAGAGATAAACCCACAGCTGCGTAAGAGGAGTTGTGCAGACAGCTTCACCGAT 126327686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTTTCCTAGAGATAAACCCACAGCTGCGTAAGAGGAGTTGTGCAGACAGCTTCACCGAT 540

126327687 AAGTTACTCAAACAGCTACAGAGATGAGAAGAGTTTCTCATAAAGTTTTTGGATTCAACT 126327746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTTACTCAAACAGCTACAGAGATGAGAAGAGTTTCTCATAAAGTTTTTGGATTCAACT 600

126327747 GTGTAAACGGCAACCCACTTGGGCTCCCCTCTCTACTGTGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCT 126327806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGTAAACGGCAACCCACTTGGGCTCCCCTCTCTACTGTGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCT 660

126327807 TATTGCACTTTTGTTCCAATATGACCCTTTGTGTCCATGCTCCTTAATTCTCTTGGTCAT 126327866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATTGCACTTTTGTTCCAATATGACCCTTTGTGTCCATGCTCCTTAATTCTCTTGGTCAT 720

126327867 GAGACAACGAGCTTTTATAACACCTTAGACAATCAGACCAGTGACCACTGACCTGTTTTA 126327926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGACAACGAGCTTTTATAACACCTTAGACAATCAGACCAGTGACCACTGACCTGTTTTA 780

126327927 ATAGTGATGCAATGGGAGAAAGACTCCATCTATTCATTAATATCTCTGAAGATGGAAGGA 126327986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAGTGATGCAATGGGAGAAAGACTCCATCTATTCATTAATATCTCTGAAGATGGAAGGA 840

126327987 GATGAGTAGCTGAGAAATTTGGGCAGCCTCTAGAAACTGAACAAGGCAAGGAAACAGATT 126328046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATGAGTAGCTGAGAAATTTGGGCAGCCTCTAGAAACTGAACAAGGCAAGGAAACAGATT 900

126328047 GTCCTCTAGAACCTTCAAAATAGACAGCCAGAGTAAACCTTAATTTTATCCCAGTAAAAC 126328106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCCTCTAGAACCTTCAAAATAGACAGCCAGAGTAAACCTTAATTTTATCCCAGTAAAAC 960

126328107 TCATTTTGATCCTCTGACTCCCAGAGCTGTAGCAGAATACATTTACATTGTTTTAAGCCA 126328166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCATTTTGATCCTCTGACTCCCAGAGCTGTAGCAGAATACATTTACATTGTTTTAAGCCA 1020

126328167 ATAAGTCTGTAGCAATTTTTTACAGCAGGAATAGGAATCTAACATAGCATGTATTGGGGG 126328226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATAAGTCTGTAGCAATTTTTTACAGCAGGAATAGGAATCTAACATAGCATGTATTGGGGG 1080

126328227 GA 126328228
          ||
     1081 GA 1082

EXCISED REGION

126328230 TAAAGGAAATTTAAGTCCCCCCTTTATATATGTAACCAGTAAACTGAAGATGAATTAACA 126328289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 TAAAGGAAATTTAAGTCCCCCCTTTATATATGTAACCAGTAAACTGAAGATGAATTAACA 1143

126328290 TTTTTAATATTATAAAAATTGAAGTAAATACATTCTAATGCTAAATATTAAAATAGAGAA 126328349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 TTTTTAATATTATAAAAATTGAAGTAAATACATTCTAATGCTAAATATTAAAATAGAGAA 1203

126328350 AATGAGATTAATGACTAATTGATCTTGAAATAGGTAAGACATTTGTAAGTATTAAATCAG 126328409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 AATGAGATTAATGACTAATTGATCTTGAAATAGGTAAGACATTTGTAAGTATTAAATCAG 1263

126328410 TTTTGACCTTATTAAATATTTTAGTAATAAAATTTCTTTGAACTAAGTCACAAAGAAAAT 126328469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 TTTTGACCTTATTAAATATTTTAGTAATAAAATTTCTTTGAACTAAGTCACAAAGAAAAT 1323

126328470 AGCAAGGTAGAAAAACTACTAGAAACAAATGTGAGAAGTGAGGGCAATATATTTTATATA 126328529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 AGCAAGGTAGAAAAACTACTAGAAACAAATGTGAGAAGTGAGGGCAATATATTTTATATA 1383

126328530 TAAAGGTTTATAATACATCAAAACGAACTCTTTACTCTCTAGAGAAACACATGCAAGGAA 126328589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 TAAAGGTTTATAATACATCAAAACGAACTCTTTACTCTCTAGAGAAACACATGCAAGGAA 1443

126328590 CATGAATTGACAATTAAAAAAGAAAATAAAATAATAAACATGAAATCAAGTTTTACTTTA 126328649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 CATGAATTGACAATTAAAAAAGAAAATAAAATAATAAACATGAAATCAAGTTTTACTTTA 1503

126328650 AAAAGTAATGACAATAGAATATATAACATTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAGAAT 126328709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 AAAAGTAATGACAATAGAATATATAACATTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAGAAT 1563

126328710 GTATGCAATCTATCACAGCTTACCTAACCTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGT 126328769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 GTATGCAATCTATCACAGCTTACCTAACCTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGT 1623

126328770 GTTAACAATAATATTTTCATGAAGTTAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAG 126328829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 GTTAACAATAATATTTTCATGAAGTTAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAG 1683

126328830 TGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAATTAAACATTCTATTAACTGTTATTAA 126328889
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1684 TGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAATTAAACACTCTATTAACTGTTATTAA 1743

126328890 TTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGA 126328949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 TTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGA 1803

126328950 AATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAAC 126329009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAAC 1863

126329010 GGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATT 126329069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 GGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATT 1923

126329070 CATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACC 126329129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 CATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACC 1983

126329130 CAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACA 126329189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 CAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACA 2043

126329190 CAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACT 126329249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 CAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACT 2103

126329250 CTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAA 126329309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAA 2163

126329310 ACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTG 126329369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 ACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTG 2223

126329370 CTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTG 126329429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTG 2283

126329430 TGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTT 126329489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 TGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTT 2343

126329490 TTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTG 126329549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 TTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTG 2403

126329550 CAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCC 126329609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2404 CAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCTGTTCTCCTGCC 2463

126329610 TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATG 126329669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATG 2523

126329670 TTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTC 126329729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 TTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTC 2583

126329730 AGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGC 126329789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 AGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGC 2643

126329790 CCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCA 126329849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCA 2703

126329850 CTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACAC 126329909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 CTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACAC 2763

126329910 GTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAAC 126329969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 GTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAAC 2823

126329970 AAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAA 126330029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 AAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAA 2883

126330030 ATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGT 126330089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 ATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGT 2943

126330090 AAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAA 126330149
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 GAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAA 3003

126330150 GCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAA 126330209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 GCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAA 3063

126330210 AGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGA 126330269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 AGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGA 3123

126330270 AATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTA 126330329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 AATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTA 3183

126330330 AAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGA 126330389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 AAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGA 3243

126330390 ATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGAC 126330449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 ATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGAC 3303

126330450 CAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCG 126330509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 CAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCG 3363

126330510 AAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCAC 126330569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 AAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCAC 3423

126330570 ATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGA 126330629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 ATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGA 3483

126330630 AAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGA 126330689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 AAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGA 3543

126330690 CATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTG 126330749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 CATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTG 3603

126330750 AGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCA 126330809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 AGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCA 3663

126330810 GCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATC 126330869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 GCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATC 3723

126330870 CCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCT 126330929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 CCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCT 3783

126330930 TTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAA 126330989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 TTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAA 3843

126330990 CCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGA 126331049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 CCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGA 3903

126331050 TAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTA 126331109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3904 TAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTA 3963

126331110 GAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGA 126331169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3964 GAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGA 4023

126331170 AAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAG 126331229
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4024 AAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAGGAACCAGTAACTAATCCTAACAAG 4083

126331230 ACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGT 126331289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4084 ACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGT 4143

126331290 GATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAA 126331349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4144 GATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAA 4203

126331350 AGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTT 126331409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4204 AGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTT 4263

126331410 GCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACA 126331469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4264 GCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACA 4323

126331470 AGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAA 126331529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4324 AGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAA 4383

126331530 TTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAAT 126331589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4384 TTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAAT 4443

126331590 TCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGA 126331649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4444 TCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGA 4503

126331650 TTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAA 126331709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4504 TTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAA 4563

126331710 ACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCAT 126331769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4564 ACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCAT 4623

126331770 ACCTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGA 126331829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4624 ACCTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGA 4683

126331830 AAAATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACT 126331889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4684 AAAATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACT 4743

126331890 TTTATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAA 126331949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4744 TTTATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAA 4803

126331950 GGCTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAA 126332009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4804 GGCTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAA 4863

126332010 TCTTATAATTATAAAAACCTAAAGATTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAA 126332069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4864 TCTTATAATTATAAAAACCTAAAGATTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAA 4923

126332070 TTCAGTAAAGTTTCAGGATACAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCC 126332129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4924 TTCAGTAAAGTTTCAGGATACAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCC 4983

126332130 AACAGCAAACAATCTGAAAAAAAAATGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAG 126332189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4984 AACAGCAAACAATCTGAAAAAAAAATGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAG 5043

126332190 AATATAAAATACCTAGTAATAAATTTAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAAC 126332249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5044 AATATAAAATACCTAGTAATAAATTTAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAAC 5103

126332250 TATAAAACACGGATGAAAGAAATCCAAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTC 126332309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5104 TATAAAACACGGATGAAAGAAATCCAAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTC 5163

126332310 ATGAATGAAAAAAATTAATATTGTTAAAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAATGCA 126332369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5164 ATGAATGAAAAAAATTAATATTGTTAAAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAATGCA 5223

126332370 ATCCCTATCAAAATACCAATGACATTCCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTG 126332429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5224 ATCCCTATCAAAATACCAATGACATTCCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTG 5283

126332430 TATGAAAACACAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTG 126332489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5284 TATGAAAACACAAAATACCCAAAATAGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTG 5343

126332490 GAGGCAGCACACT 126332502
          |||||||||||||
     5344 GAGGCAGCACACT 5356

Alignment time is 6.78367 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     3277] =>      3277 nucs 'mol-32-2fc2-146710_3277'

Score:        3255
Aligned:      3277        nucs
Identic:      3275 (100%) nucs =>      3066 (100%)       209 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126329750,126332817] EXCISED REGION [126332822,126333030]
 second seq =>  [        1,     3068] EXCISED REGION [     3069,     3277]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [126332818,126332821]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [126332818,126332821] to [126332822,126332825]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [126332818,126332818] to [126332821,126332821]
 second seq =>         0 nucs

126329750 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAA 126329809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAA 60

126329810 AAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAA 126329869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAA 120

126329870 GAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAA 126329929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAA 180

126329930 CCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAA 126329989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAA 240

126329990 TGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTT 126330049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTT 300

126330050 TGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAA 126330109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      301 TGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAA 360

126330110 AACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCA 126330169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCA 420

126330170 TAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAA 126330229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAA 480

126330230 TTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATA 126330289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATA 540

126330290 TCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATA 126330349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATA 600

126330350 AAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCC 126330409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCC 660

126330410 CAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCA 126330469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCA 720

126330470 AATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGG 126330529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGG 780

126330530 GAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCA 126330589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCA 840

126330590 CATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGA 126330649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGA 900

126330650 CAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCA 126330709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCA 960

126330710 AAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGA 126330769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGA 1020

126330770 ACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACA 126330829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACA 1080

126330830 GAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATG 126330889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATG 1140

126330890 AACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGG 126330949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGG 1200

126330950 GAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACC 126331009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACC 1260

126331010 TACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAAT 126331069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAAT 1320

126331070 GTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTC 126331129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTC 1380

126331130 ATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCC 126331189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCC 1440

126331190 AAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCC 126331249
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAATTGGCAAAGCAAGGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCC 1500

126331250 TCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGA 126331309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGA 1560

126331310 AAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTC 126331369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTC 1620

126331370 TACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGC 126331429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGC 1680

126331430 AAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTA 126331489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTA 1740

126331490 ATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCA 126331549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCA 1800

126331550 ACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGA 126331609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGA 1860

126331610 TGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATA 126331669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATA 1920

126331670 AACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCTT 126331729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCTT 1980

126331730 TTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGAGCTA 126331789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGAGCTA 2040

126331790 TATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGTCATT 126331849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGTCATT 2100

126331850 GAAGATCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTACTAC 126331909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAAGATCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTACTAC 2160

126331910 AAGTCCTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTATCCAAATTGGA 126331969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGTCCTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTATCCAAATTGGA 2220

126331970 AAGGAAGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATCTTATAATTATAAAAACCT 126332029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAGGAAGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATCTTATAATTATAAAAACCT 2280

126332030 AAAGATTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGATA 126332089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAGATTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGATA 2340

126332090 CAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAACAGCAAACAATCTGAAAA 126332149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAAAATCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAACAGCAAACAATCTGAAAA 2400

126332150 AAAAATGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAATATAAAATACCTAGTAAT 126332209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAAATGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAATATAAAATACCTAGTAAT 2460

126332210 AAATTTAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTATAAAACACGGATGAAAGA 126332269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAATTTAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTATAAAACACGGATGAAAGA 2520

126332270 AATCCAAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCATGAATGAAAAAAATTAATA 126332329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATCCAAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCATGAATGAAAAAAATTAATA 2580

126332330 TTGTTAAAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAATGCAATCCCTATCAAAATACCAAT 126332389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTGTTAAAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAATGCAATCCCTATCAAAATACCAAT 2640

126332390 GACATTCCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTGTATGAAAACACAAAATACCC 126332449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GACATTCCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTGTATGAAAACACAAAATACCC 2700

126332450 AAAATAGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTGGAGGCAGCACACTACCTGAA 126332509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAATAGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTGGAGGCAGCACACTACCTGAA 2760

126332510 TTCAAGATTTACTACAAAGCTATAGTAACCAACTAGTACTGGCATAAAAACAGGCACATT 126332569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTCAAGATTTACTACAAAGCTATAGTAACCAACTAGTACTGGCATAAAAACAGGCACATT 2820

126332570 GACCAATGGAACAAAATGGAGAACCTACATATAAATCCACAGTGAACTAATTTTCAACAA 126332629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GACCAATGGAACAAAATGGAGAACCTACATATAAATCCACAGTGAACTAATTTTCAACAA 2880

126332630 ATGCACCAGGAACATACAGTAGGAAAGGGATGTTGTCTTCAGTAAATAGTGCTAGGAAAA 126332689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGCACCAGGAACATACAGTAGGAAAGGGATGTTGTCTTCAGTAAATAGTGCTAGGAAAA 2940

126332690 CTGCATAACAAAAATCAAGTCAAAATATACTAAAGACTTAAATCTAAGGCTTGAACCTAT 126332749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTGCATAACAAAAATCAAGTCAAAATATACTAAAGACTTAAATCTAAGGCTTGAACCTAT 3000

126332750 GATACTACTAGAAAAAAACATTGGGGAAATGCTTTGGGACATTGGTCTAGGCAAAACTTT 126332809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GATACTACTAGAAAAAAACATTGGGGAAATGCTTTGGGACATTGGTCTAGGCAAAACTTT 3060

126332810 TTGTAAGA 126332817
          ||||||||
     3061 TTGTAAGA 3068

EXCISED REGION

126332822 CCTCAAAAGCACAGACAATCAAAGCAGACATGGACAAATGGGACTACATGAAGCTAAAAA 126332881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 CCTCAAAAGCACAGACAATCAAAGCAGACATGGACAAATGGGACTACATGAAGCTAAAAA 3128

126332882 GGTTCTGCACATTAAAGAAAACAATCAGCAAAGTGAACAGACAACCTACAGAATGGAAGA 126332941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 GGTTCTGCACATTAAAGAAAACAATCAGCAAAGTGAACAGACAACCTACAGAATGGAAGA 3188

126332942 AAATATTTGCAAACTACTTACCTAACGAGGGATTAATAATCAGAATGTATAAGAAGCTTA 126333001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 AAATATTTGCAAACTACTTACCTAACGAGGGATTAATAATCAGAATGTATAAGAAGCTTA 3248

126333002 AAAAACTCAATAGCAAAAAAATCCACTTA 126333030
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3249 AAAAACTCAATAGCAAAAAAATCCACTTA 3277

Alignment time is 4.16998 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2539] =>      2539 nucs 'mol-32-2fcd-083567_2539'

Score:        2538
Aligned:      2538        nucs
Identic:      2538 (100%) nucs =>       242 (100%)      2296 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126328945,126329186] EXCISED REGION [126329188,126331483]
 second seq =>  [        1,      242] EXCISED REGION [      244,     2539]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126329187,126329187]
 second seq =>         1 nucs [243,243]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [126329186,126329186] to [126329187,126329187]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [126329185,126329186] to [126329188,126329189]
 second seq =>         2 nucs [241,242] to [244,245]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126328945 TGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAA 126329004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAA 60

126329005 TAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAAC 126329064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAAC 120

126329065 TCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGT 126329124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGT 180

126329125 GTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAA 126329184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAA 240

126329185 CA 126329186
          ||
      241 CA 242

EXCISED REGION

126329188 CACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATA 126329247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      244 CACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATA 303

126329248 CTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCC 126329307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 CTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCC 363

126329308 AAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTT 126329367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 AAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTT 423

126329368 TGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTT 126329427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 TGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTT 483

126329428 TGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTG 126329487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTG 543

126329488 TTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAG 126329547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 TTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAG 603

126329548 TGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTG 126329607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 TGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTG 663

126329608 CCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTA 126329667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 CCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTA 723

126329668 TGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACC 126329727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 TGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACC 783

126329728 TCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGC 126329787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 TCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGC 843

126329788 GCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTC 126329847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 GCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTC 903

126329848 CACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACAC 126329907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 CACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACAC 963

126329908 ACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCA 126329967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 ACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCA 1023

126329968 ACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATA 126330027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 ACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATA 1083

126330028 AAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAA 126330087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 AAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAA 1143

126330088 GTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCT 126330147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 GTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCT 1203

126330148 AAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATA 126330207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 AAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATA 1263

126330208 AAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCA 126330267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 AAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCA 1323

126330268 GAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCC 126330327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 GAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCC 1383

126330328 TAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTT 126330387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 TAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTT 1443

126330388 GAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATG 126330447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 GAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATG 1503

126330448 ACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAG 126330507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 ACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAG 1563

126330508 CGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCC 126330567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 CGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCC 1623

126330568 ACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTA 126330627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 ACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTA 1683

126330628 GAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGA 126330687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 GAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGA 1743

126330688 GACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCC 126330747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 GACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCC 1803

126330748 TGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACT 126330807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 TGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACT 1863

126330808 CAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTA 126330867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 CAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTA 1923

126330868 TCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCC 126330927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCC 1983

126330928 CTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTG 126330987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 CTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTG 2043

126330988 AACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGT 126331047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 AACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGT 2103

126331048 GATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAAT 126331107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 GATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAAT 2163

126331108 TAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACA 126331167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 TAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACA 2223

126331168 GAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACA 126331227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 GAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACA 2283

126331228 AGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTA 126331287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 AGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTA 2343

126331288 GTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTT 126331347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 GTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTT 2403

126331348 AAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTAC 126331407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 AAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTAC 2463

126331408 TTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAA 126331467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAA 2523

126331468 CAAGAAAGAAAACTAC 126331483
          ||||||||||||||||
     2524 CAAGAAAGAAAACTAC 2539

Alignment time is 3.56957 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2269] =>      2269 nucs 'mol-32-300f-163254_2269'

Score:        2268
Aligned:      2268        nucs
Identic:      2268 (100%) nucs =>      2133 (100%)       135 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126329151,126331283] EXCISED REGION [126331285,126331419]
 second seq =>  [        1,     2133] EXCISED REGION [     2135,     2269]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126331284,126331284]
 second seq =>         1 nucs [2134,2134]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [126331284,126331285] to [126331285,126331286]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126329151 GCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATT 126329210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATT 60

126329211 ATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGAC 126329270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGAC 120

126329271 ATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTA 126329330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTA 180

126329331 TCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGG 126329390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGG 240

126329391 GAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATAT 126329450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATAT 300

126329451 ATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAA 126329510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAA 360

126329511 TTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCAC 126329570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCAC 420

126329571 TGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGG 126329630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGG 480

126329631 ATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTT 126329690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTT 540

126329691 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGC 126329750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGC 600

126329751 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAA 126329810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAA 660

126329811 AAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAG 126329870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAG 720

126329871 AAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAAC 126329930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAAC 780

126329931 CATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAAT 126329990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAAT 840

126329991 GTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTT 126330050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTT 900

126330051 GCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAA 126330110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAA 960

126330111 ACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCAT 126330170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCAT 1020

126330171 AAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAAT 126330230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAAT 1080

126330231 TGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATAT 126330290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATAT 1140

126330291 CCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAA 126330350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAA 1200

126330351 AGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCC 126330410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCC 1260

126330411 AGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAA 126330470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAA 1320

126330471 ATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGG 126330530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGG 1380

126330531 AAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCAC 126330590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCAC 1440

126330591 ATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGAC 126330650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGAC 1500

126330651 AATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAA 126330710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAA 1560

126330711 AGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAA 126330770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAA 1620

126330771 CTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAG 126330830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAG 1680

126330831 AGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGA 126330890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGA 1740

126330891 ACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGG 126330950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGG 1800

126330951 AAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCT 126331010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCT 1860

126331011 ACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATG 126331070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATG 1920

126331071 TATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCA 126331130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCA 1980

126331131 TGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCA 126331190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCA 2040

126331191 AATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCT 126331250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCT 2100

126331251 CAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAA 126331283
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAA 2133

EXCISED REGION

126331285 TTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCA 126331344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 TTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCA 2194

126331345 TTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGAC 126331404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 TTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGAC 2254

126331405 TACTTGCAAATTCAC 126331419
          |||||||||||||||
     2255 TACTTGCAAATTCAC 2269

Alignment time is 3.29287 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     4597] =>      4597 nucs 'mol-32-3030-043865_4597'

Score:        4541
Aligned:      4596        nucs
Identic:      4591 (100%) nucs =>      1053 (100%)      3538 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126327176,126328228] EXCISED REGION [126328230,126331772]
 second seq =>  [        1,     1053] EXCISED REGION [     1055,     4597]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126328229,126328229]
 second seq =>         1 nucs [1054,1054]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [126328228,126328228] to [126328229,126328229]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126327176 TATGGCAAAGGAAAATTAAGATTGTGAATCAATTGACCTTAAAATAGGAGATTATCCTGT 126327235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGGCAAAGGAAAATTAAGATTGTGAATCAATTGACCTTAAAATAGGAGATTATCCTGT 60

126327236 ATTATCTTGTTAGGCTCAATGTAAACAAAATGGTCTTGAAATGTGGAAGTGGGAGGCAGA 126327295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTATCTTGTTAGGCTCAATGTAAACAAAATGGTCTTGAAATGTGGAAGTGGGAGGCAGA 120

126327296 AGAGAAGTCAATGTCATACTGAGGCAGAAGCAAAGGAAAAATCAGTTAGGTAGATAGCTA 126327355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGAAGTCAATGTCATACTGAGGCAGAAGCAAAGGAAAAATCAGTTAGGTAGATAGCTA 180

126327356 AGGCTAGTCCTCAGAAAAGCAGCCTGCCTGAAAAATCTCAGCTACAGGCAAAAATTTAGC 126327415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGCTAGTCCTCAGAAAAGCAGCCTGCCTGAAAAATCTCAGCTACAGGCAAAAATTTAGC 240

126327416 AGCCTGGGAAAACTCAGACTGCACCTGCACAGATAAGCAGGCAGGTTCCAGCACAGAAGC 126327475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCCTGGGAAAACTCAGACTGCACCTGCACAGATAAGCAGGCAGGTTCCAGCACAGAAGC 300

126327476 CTTTTGTTTTTTGTGTTATTAACGGGCTCCCAGGACAAAATTTTCTCTCCTTTTCAGACA 126327535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTTGTTTTTTGTGTTATTAACGGGCTCCCAGGACAAAATTTTCTCTCCTTTTCAGACA 360

126327536 TGTTCATGGTGGGTTCTGTGGAAACTTGCATAAGGAGGAGGAGGTCTCACCTAAAACAAA 126327595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTCATGGTGGGTTCTGTGGAAACTTGCATAAGGAGGAGGAGGTCTCACCTAAAACAAA 420

126327596 CCCACAGTTACACAAACAAGTGGCGCTTTGTGCTTTCCTAGAGATAAACCCACAGCTGCG 126327655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCACAGTTACACAAACAAGTGGCGCTTTGTGCTTTCCTAGAGATAAACCCACAGCTGCG 480

126327656 TAAGAGGAGTTGTGCAGACAGCTTCACCGATAAGTTACTCAAACAGCTACAGAGATGAGA 126327715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAGAGGAGTTGTGCAGACAGCTTCACCGATAAGTTACTCAAACAGCTACAGAGATGAGA 540

126327716 AGAGTTTCTCATAAAGTTTTTGGATTCAACTGTGTAAACGGCAACCCACTTGGGCTCCCC 126327775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAGTTTCTCATAAAGTTTTTGGATTCAACTGTGTAAACGGCAACCCACTTGGGCTCCCC 600

126327776 TCTCTACTGTGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCTTATTGCACTTTTGTTCCAATATGACCCTT 126327835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTCTACTGTGGAGAGCTTTCTTCCTTAGCTTATTGCACTTTTGTTCCAATATGACCCTT 660

126327836 TGTGTCCATGCTCCTTAATTCTCTTGGTCATGAGACAACGAGCTTTTATAACACCTTAGA 126327895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTGTCCATGCTCCTTAATTCTCTTGGTCATGAGACAACGAGCTTTTATAACACCTTAGA 720

126327896 CAATCAGACCAGTGACCACTGACCTGTTTTAATAGTGATGCAATGGGAGAAAGACTCCAT 126327955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAATCAGACCAGTGACCACTGACCTGTTTTAATAGTGATGCAATGGGAGAAAGACTCCAT 780

126327956 CTATTCATTAATATCTCTGAAGATGGAAGGAGATGAGTAGCTGAGAAATTTGGGCAGCCT 126328015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTATTCATTAATATCTCTGAAGATGGAAGGAGATGAGTAGCTGAGAAATTTGGGCAGCCT 840

126328016 CTAGAAACTGAACAAGGCAAGGAAACAGATTGTCCTCTAGAACCTTCAAAATAGACAGCC 126328075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAGAAACTGAACAAGGCAAGGAAACAGATTGTCCTCTAGAACCTTCAAAATAGACAGCC 900

126328076 AGAGTAAACCTTAATTTTATCCCAGTAAAACTCATTTTGATCCTCTGACTCCCAGAGCTG 126328135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGAGTAAACCTTAATTTTATCCCAGTAAAACTCATTTTGATCCTCTGACTCCCAGAGCTG 960

126328136 TAGCAGAATACATTTACATTGTTTTAAGCCAATAAGTCTGTAGCAATTTTTTACAGCAGG 126328195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGCAGAATACATTTACATTGTTTTAAGCCAATAAGTCTGTAGCAATTTTTTACAGCAGG 1020

126328196 AATAGGAATCTAACATAGCATGTATTGGGGGGA 126328228
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATAGGAATCTAACATAGCATGTATTGGGGGGA 1053

EXCISED REGION

126328230 TAAAGGAAATTTAAGTCCCCCCTTTATATATGTAACCAGTAAACTGAAGATGAATTAACA 126328289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 TAAAGGAAATTTAAGTCCCCCCTTTATATATGTAACCAGTAAACTGAAGATGAATTAACA 1114

126328290 TTTTTAATATTATAAAAATTGAAGTAAATACATTCTAATGCTAAATATTAAAATAGAGAA 126328349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 TTTTTAATATTATAAAAATTGAAGTAAATACATTCTAATGCTAAATATTAAAATAGAGAA 1174

126328350 AATGAGATTAATGACTAATTGATCTTGAAATAGGTAAGACATTTGTAAGTATTAAATCAG 126328409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 AATGAGATTAATGACTAATTGATCTTGAAATAGGTAAGACATTTGTAAGTATTAAATCAG 1234

126328410 TTTTGACCTTATTAAATATTTTAGTAATAAAATTTCTTTGAACTAAGTCACAAAGAAAAT 126328469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 TTTTGACCTTATTAAATATTTTAGTAATAAAATTTCTTTGAACTAAGTCACAAAGAAAAT 1294

126328470 AGCAAGGTAGAAAAACTACTAGAAACAAATGTGAGAAGTGAGGGCAATATATTTTATATA 126328529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 AGCAAGGTAGAAAAACTACTAGAAACAAATGTGAGAAGTGAGGGCAATATATTTTATATA 1354

126328530 TAAAGGTTTATAATACATCAAAACGAACTCTTTACTCTCTAGAGAAACACATGCAAGGAA 126328589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 TAAAGGTTTATAATACATCAAAACGAACTCTTTACTCTCTAGAGAAACACATGCAAGGAA 1414

126328590 CATGAATTGACAATTAAAAAAGAAAATAAAATAATAAACATGAAATCAAGTTTTACTTTA 126328649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 CATGAATTGACAATTAAAAAAGAAAATAAAATAATAAACATGAAATCAAGTTTTACTTTA 1474

126328650 AAAAGTAATGACAATAGAATATATAACATTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAGAAT 126328709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 AAAAGTAATGACAATAGAATATATAACATTGATTTAGATGTTTGGATCTAGAATCAGAAT 1534

126328710 GTATGCAATCTATCACAGCTTACCTAACCTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGT 126328769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 GTATGCAATCTATCACAGCTTACCTAACCTTTCTTTGCTTCAATTTCTTCACCTCTAAGT 1594

126328770 GTTAACAATAATATTTTCATGAAGTTAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAG 126328829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 GTTAACAATAATATTTTCATGAAGTTAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAG 1654

126328830 TGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAATTAAACATTCTATTAACTGTTATTAA 126328889
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1655 TGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACATGTAAACAATTAAACACTCTATTAACTGTTATTAA 1714

126328890 TTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGA 126328949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 TTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGA 1774

126328950 AATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAAC 126329009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 AATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAAC 1834

126329010 GGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATT 126329069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 GGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATT 1894

126329070 CATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACC 126329129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 CATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACC 1954

126329130 CAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACA 126329189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 CAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACA 2014

126329190 CAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACT 126329249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 CAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACT 2074

126329250 CTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAA 126329309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 CTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAA 2134

126329310 ACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTG 126329369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 ACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTG 2194

126329370 CTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTG 126329429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 CTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTG 2254

126329430 TGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTT 126329489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 TGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTT 2314

126329490 TTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTG 126329549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 TTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTG 2374

126329550 CAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCC 126329609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2375 CAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCTGTTCTCCTGCC 2434

126329610 TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATG 126329669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATG 2494

126329670 TTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTC 126329729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 TTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTC 2554

126329730 AGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGC 126329789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 AGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGC 2614

126329790 CCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCA 126329849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 CCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCA 2674

126329850 CTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACAC 126329909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 CTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACAC 2734

126329910 GTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAAC 126329969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 GTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAAC 2794

126329970 AAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAA 126330029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 AAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAA 2854

126330030 ATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGT 126330089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 ATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGT 2914

126330090 AAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAA 126330149
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 GAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAA 2974

126330150 GCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAA 126330209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2975 GCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGATGAGATAAA 3034

126330210 AGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGA 126330269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 AGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGA 3094

126330270 AATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTA 126330329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 AATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTA 3154

126330330 AAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGA 126330389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 AAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGA 3214

126330390 ATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGAC 126330449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 ATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGAC 3274

126330450 CAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCG 126330509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 CAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCG 3334

126330510 AAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCAC 126330569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 AAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCAC 3394

126330570 ATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGA 126330629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 ATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGA 3454

126330630 AAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGA 126330689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 AAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGA 3514

126330690 CATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTG 126330749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 CATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTG 3574

126330750 AGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCA 126330809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 AGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCA 3634

126330810 GCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATC 126330869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 GCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATC 3694

126330870 CCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCT 126330929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 CCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCT 3754

126330930 TTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAA 126330989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 TTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAA 3814

126330990 CCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGA 126331049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 CCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGA 3874

126331050 TAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTA 126331109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 TAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTA 3934

126331110 GAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGA 126331169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 GAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGA 3994

126331170 AAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAG 126331229
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3995 AAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAGGAACCAGTAACTAATCCTAACAAG 4054

126331230 ACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGT 126331289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 ACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGT 4114

126331290 GATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAA 126331349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 GATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAA 4174

126331350 AGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTT 126331409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 AGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTT 4234

126331410 GCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACA 126331469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 GCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACA 4294

126331470 AGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAA 126331529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 AGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAA 4354

126331530 TTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAAT 126331589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 TTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAAT 4414

126331590 TCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGA 126331649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 TCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGA 4474

126331650 TTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAA 126331709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 TTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAA 4534

126331710 ACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCAT 126331769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 ACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCAT 4594

126331770 ACC 126331772
          |||
     4595 ACC 4597

Alignment time is 6.1291 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     4131] =>      4131 nucs 'mol-32-3030-227469_4131'

Score:        4131
Aligned:      4131        nucs
Identic:      4131 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126328795,126332925]
 second seq =>  [        1,     4131]

126328795 TAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAGTGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACA 126328854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATGTCAGAAATGAATGAGTGAAACTATGCAAAGTGTTTATTAAAGTGTGTGGTGCACA 60

126328855 TGTAAACAATTAAACATTCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATTAAAATGATA 126328914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTAAACAATTAAACATTCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATTAAAATGATA 120

126328915 TAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGG 126328974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGG 180

126328975 GGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTAC 126329034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTAC 240

126329035 AAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAG 126329094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAG 300

126329095 TGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAA 126329154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAA 360

126329155 TTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGC 126329214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGC 420

126329215 TGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTC 126329274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTC 480

126329275 CACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAG 126329334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAG 540

126329335 CGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAAT 126329394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAAT 600

126329395 ACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGT 126329454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGT 660

126329455 ATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTG 126329514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTG 720

126329515 AGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCA 126329574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCA 780

126329575 ACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTA 126329634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTA 840

126329635 TAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCAC 126329694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCAC 900

126329695 CATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCC 126329754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCC 960

126329755 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAAC 126329814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAAC 1020

126329815 TAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAA 126329874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAA 1080

126329875 ATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATT 126329934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATT 1140

126329935 GCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGG 126329994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGG 1200

126329995 TGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAA 126330054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAA 1260

126330055 CAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCA 126330114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCA 1320

126330115 AATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGA 126330174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGA 1380

126330175 ATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTA 126330234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTA 1440

126330235 TACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCAT 126330294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCAT 1500

126330295 GTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAA 126330354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAA 1560

126330355 AAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAA 126330414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAA 1620

126330415 AAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATAT 126330474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATAT 1680

126330475 GAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGA 126330534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGA 1740

126330535 AAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGA 126330594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGA 1800

126330595 AAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATG 126330654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATG 1860

126330655 AGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGA 126330714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGA 1920

126330715 AGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTAC 126330774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTAC 1980

126330775 CATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTG 126330834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTG 2040

126330835 GCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTC 126330894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTC 2100

126330895 CTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGG 126330954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGG 2160

126330955 GCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAG 126331014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAG 2220

126331015 CTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATA 126331074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATA 2280

126331075 CAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGC 126331134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGC 2340

126331135 TAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATT 126331194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATT 2400

126331195 GGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAAC 126331254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAAC 2460

126331255 AATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGC 126331314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGC 2520

126331315 AATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTC 126331374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTC 2580

126331375 AAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAA 126331434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAA 2640

126331435 TTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATA 126331494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATA 2700

126331495 ATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAAC 126331554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAAC 2760

126331555 ACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTT 126331614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTT 2820

126331615 GAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTA 126331674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTA 2880

126331675 TATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCTTTTGAT 126331734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCTTTTGAT 2940

126331735 AAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGAGCTATATAT 126331794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGAGCTATATAT 3000

126331795 GACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGTCATTGAAGA 126331854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGTCATTGAAGA 3060

126331855 TCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTACTACAAGTC 126331914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTACTACAAGTC 3120

126331915 CTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTATCCAAATTGGAAAGGA 126331974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTATCCAAATTGGAAAGGA 3180

126331975 AGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATCTTATAATTATAAAAACCTAAAGA 126332034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATCTTATAATTATAAAAACCTAAAGA 3240

126332035 TTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGATACAAAA 126332094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGATACAAAA 3300

126332095 TCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAACAGCAAACAATCTGAAAAAAAAA 126332154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAACAGCAAACAATCTGAAAAAAAAA 3360

126332155 TGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAATATAAAATACCTAGTAATAAATT 126332214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAATATAAAATACCTAGTAATAAATT 3420

126332215 TAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTATAAAACACGGATGAAAGAAATCC 126332274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTATAAAACACGGATGAAAGAAATCC 3480

126332275 AAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCATGAATGAAAAAAATTAATATTGTT 126332334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCATGAATGAAAAAAATTAATATTGTT 3540

126332335 AAAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAATGCAATCCCTATCAAAATACCAATGACAT 126332394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAATGCAATCCCTATCAAAATACCAATGACAT 3600

126332395 TCCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTGTATGAAAACACAAAATACCCAAAAT 126332454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTGTATGAAAACACAAAATACCCAAAAT 3660

126332455 AGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTGGAGGCAGCACACTACCTGAATTCAA 126332514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTGGAGGCAGCACACTACCTGAATTCAA 3720

126332515 GATTTACTACAAAGCTATAGTAACCAACTAGTACTGGCATAAAAACAGGCACATTGACCA 126332574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GATTTACTACAAAGCTATAGTAACCAACTAGTACTGGCATAAAAACAGGCACATTGACCA 3780

126332575 ATGGAACAAAATGGAGAACCTACATATAAATCCACAGTGAACTAATTTTCAACAAATGCA 126332634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATGGAACAAAATGGAGAACCTACATATAAATCCACAGTGAACTAATTTTCAACAAATGCA 3840

126332635 CCAGGAACATACAGTAGGAAAGGGATGTTGTCTTCAGTAAATAGTGCTAGGAAAACTGCA 126332694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CCAGGAACATACAGTAGGAAAGGGATGTTGTCTTCAGTAAATAGTGCTAGGAAAACTGCA 3900

126332695 TAACAAAAATCAAGTCAAAATATACTAAAGACTTAAATCTAAGGCTTGAACCTATGATAC 126332754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TAACAAAAATCAAGTCAAAATATACTAAAGACTTAAATCTAAGGCTTGAACCTATGATAC 3960

126332755 TACTAGAAAAAAACATTGGGGAAATGCTTTGGGACATTGGTCTAGGCAAAACTTTTTGTA 126332814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TACTAGAAAAAAACATTGGGGAAATGCTTTGGGACATTGGTCTAGGCAAAACTTTTTGTA 4020

126332815 AGACCTCCCTCAAAAGCACAGACAATCAAAGCAGACATGGACAAATGGGACTACATGAAG 126332874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGACCTCCCTCAAAAGCACAGACAATCAAAGCAGACATGGACAAATGGGACTACATGAAG 4080

126332875 CTAAAAAGGTTCTGCACATTAAAGAAAACAATCAGCAAAGTGAACAGACAA 126332925
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTAAAAAGGTTCTGCACATTAAAGAAAACAATCAGCAAAGTGAACAGACAA 4131

Alignment time is 4.81957 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2130] =>      2130 nucs 'mol-32-3164-232275_2130'

Score:        2129
Aligned:      2129        nucs
Identic:      2129 (100%) nucs =>       683 (100%)      1446 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126329097,126329779] EXCISED REGION [126329781,126331226]
 second seq =>  [        1,      683] EXCISED REGION [      685,     2130]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126329780,126329780]
 second seq =>         1 nucs [684,684]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [683,683] to [684,684]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126329097 TGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATT 126329156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATT 60

126329157 AAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTG 126329216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTG 120

126329217 AGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCA 126329276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCA 180

126329277 CTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCG 126329336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCG 240

126329337 GTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATAC 126329396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATAC 300

126329397 TTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTAT 126329456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTAT 360

126329457 GCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAG 126329516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAG 420

126329517 ATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAAC 126329576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAAC 480

126329577 CTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATA 126329636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATA 540

126329637 GGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCA 126329696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCA 600

126329697 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCA 126329756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCA 660

126329757 AAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 126329779
          |||||||||||||||||||||||
      661 AAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 683

EXCISED REGION

126329781 CCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACA 126329840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 CCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTGATACA 744

126329841 GCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATA 126329900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 GCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATA 804

126329901 TATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATG 126329960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 TATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATG 864

126329961 CCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTC 126330020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 CCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATACTACTC 924

126330021 ATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATT 126330080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 ATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATT 984

126330081 ATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGT 126330140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 ATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGT 1044

126330141 TGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGG 126330200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 TGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGG 1104

126330201 TGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAA 126330260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 TGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAA 1164

126330261 AATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCT 126330320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 AATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCT 1224

126330321 GTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAA 126330380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 GTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAA 1284

126330381 GCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGG 126330440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 GCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGG 1344

126330441 GATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAG 126330500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 GATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAG 1404

126330501 AGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATT 126330560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 AGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCAATATT 1464

126330561 CATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTC 126330620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 CATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTC 1524

126330621 TACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCT 126330680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 TACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCT 1584

126330681 CTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAA 126330740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 CTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAA 1644

126330741 ATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATC 126330800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 ATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATC 1704

126330801 TGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGA 126330860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 TGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGA 1764

126330861 AATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGC 126330920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 AATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGC 1824

126330921 ATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGG 126330980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 ATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGG 1884

126330981 TTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTG 126331040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 TTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTG 1944

126331041 ATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACA 126331100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 ATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACA 2004

126331101 GGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGA 126331160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 GGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGA 2064

126331161 AACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAAT 126331220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 AACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAAT 2124

126331221 CCTAAC 126331226
          ||||||
     2125 CCTAAC 2130

Alignment time is 2.97384 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2358] =>      2358 nucs 'mol-32-316f-067920_2358'

Score:        2358
Aligned:      2358        nucs
Identic:      2358 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126328996,126331353]
 second seq =>  [        1,     2358]

126328996 TTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAA 126329055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAA 60

126329056 TATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAA 126329115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAA 120

126329116 CACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGA 126329175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGA 180

126329176 TTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCAC 126329235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCAC 240

126329236 AAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTT 126329295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTT 300

126329296 ATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTT 126329355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTT 360

126329356 GGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTC 126329415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTC 420

126329416 TGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGT 126329475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGT 480

126329476 TTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCT 126329535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCT 540

126329536 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAA 126329595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGTTTCAA 600

126329596 GCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCC 126329655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTGTACCC 660

126329656 GGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTC 126329715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTC 720

126329716 GAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 126329775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 780

126329776 ATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTG 126329835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACTATTTG 840

126329836 ATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAG 126329895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGAAAAAG 900

126329896 TCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCT 126329955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACCAACCT 960

126329956 AAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATAC 126330015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGGAATAC 1020

126330016 TACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGG 126330075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTTGCTGG 1080

126330076 CCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTA 126330135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCCACTTA 1140

126330136 TAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAG 126330195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTTTGGAG 1200

126330196 GGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGC 126330255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATGGGTGC 1260

126330256 ACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGT 126330315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAGGTGGT 1320

126330316 TACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAA 126330375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGATGAAA 1380

126330376 TAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGT 126330435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATATGCAGT 1440

126330436 GTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGG 126330495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTCCCGGG 1500

126330496 GCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCA 126330555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACTCTGCA 1560

126330556 ATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACT 126330615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAACTCACT 1620

126330616 ATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGT 126330675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCATGGGT 1680

126330676 TCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAA 126330735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAA 1740

126330736 GATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTA 126330795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTA 1800

126330796 TTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCT 126330855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCT 1860

126330856 GTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTG 126330915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTG 1920

126330916 CTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACT 126330975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACT 1980

126330976 ACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCT 126331035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCT 2040

126331036 CAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACC 126331095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACC 2100

126331096 AGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCA 126331155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCA 2160

126331156 CAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAA 126331215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAA 2220

126331216 CTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTT 126331275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTT 2280

126331276 TACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTC 126331335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTC 2340

126331336 TACCAATCATTTAAAGAA 126331353
          ||||||||||||||||||
     2341 TACCAATCATTTAAAGAA 2358

Alignment time is 2.91571 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     3842] =>      3842 nucs 'mol-32-3185-202815_3842'

Score:        3831
Aligned:      3842        nucs
Identic:      3841 (100%) nucs =>      1146 (100%)      2695 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126330709,126331854] EXCISED REGION [126331856,126334551]
 second seq =>  [        1,     1146] EXCISED REGION [     1148,     3842]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126331855,126331855]
 second seq =>         1 nucs [1147,1147]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [126333066,126333066]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1147,1147] to [1148,1148]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126330709 AAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAG 126330768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAGGAAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAG 60

126330769 AACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAAC 126330828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACTACCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAAC 120

126330829 AGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCAT 126330888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGTGGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCAT 180

126330889 GAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTG 126330948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAACTCCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTG 240

126330949 GGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCAC 126331008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAAGGGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCAC 300

126331009 CTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAA 126331068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTACAGCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAA 360

126331069 TGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTT 126331128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTATACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTT 420

126331129 CATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTC 126331188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATGGCTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTC 480

126331189 CAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCC 126331248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAATTGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCC 540

126331249 CTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAG 126331308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCAACAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAG 600

126331309 AAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATT 126331368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAGCAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATT 660

126331369 CTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGG 126331428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTACTCAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGG 720

126331429 CAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTT 126331488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAAGAATTGCCCTGATATCAAAACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTT 780

126331489 AATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTC 126331548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATATAATCAATAAAAATAGATGCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTC 840

126331549 AACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGG 126331608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACAACACACTAAAAAGATCATTCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGG 900

126331609 ATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACAT 126331668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGGTTGAACATACACAAATTGACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACAT 960

126331669 AAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCT 126331728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAACTATATTATCACTTCAATAGATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCT 1020

126331729 TTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGAGCT 126331788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGATAAAAATGCTAATCAGACTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGAGCT 1080

126331789 ATATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGTCAT 126331848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATATGACAAACCCACAGCTAATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGTCAT 1140

126331849 TGAAGA 126331854
          ||||||
     1141 TGAAGA 1146

EXCISED REGION

126331856 CTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTACTACAAGTCC 126331915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 CTGAAACAAGACAAGGATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTACTACAAGTCC 1207

126331916 TGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAA 126331975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 TGGCTAAAGCAATTATGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAA 1267

126331976 GCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATCTTATAATTATAAAAACCTAAAGAT 126332035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 GCAGTCAAATGAGCAGTGTTTACAGATTACATAATCTTATAATTATAAAAACCTAAAGAT 1327

126332036 TCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGATACAAAAT 126332095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 TCCATCAGAAAAACTGTTTGAAATGATAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAGGATACAAAAT 1387

126332096 CAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAACAGCAAACAATCTGAAAAAAAAAT 126332155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 CAACATACAAAAATCAGTAGGATATATTTATGCCAACAGCAAACAATCTGAAAAAAAAAT 1447

126332156 GAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAATATAAAATACCTAGTAATAAATTT 126332215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 GAAGAAAGCAATCCCAGTTACAGTAGTTACAAAGAATATAAAATACCTAGTAATAAATTT 1507

126332216 AACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTATAAAACACGGATGAAAGAAATCCA 126332275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 AACCAAATAACTGAAAAATCGATACAAGGAAAACTATAAAACACGGATGAAAGAAATCCA 1567

126332276 AGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCATGAATGAAAAAAATTAATATTGTTA 126332335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 AGAGGATACAAAAAAGAAAAGATATTTCATGGTCATGAATGAAAAAAATTAATATTGTTA 1627

126332336 AAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAATGCAATCCCTATCAAAATACCAATGACATT 126332395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 AAACGGCAATTTAACAATTTGCAGATTCAATGCAATCCCTATCAAAATACCAATGACATT 1687

126332396 CCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTGTATGAAAACACAAAATACCCAAAATA 126332455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 CCTTATAGAAAAAGAAAACAAATCCTAAAATTTGTATGAAAACACAAAATACCCAAAATA 1747

126332456 GCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTGGAGGCAGCACACTACCTGAATTCAAG 126332515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 GCCAAAGCAATCTTGAGCAAAAAGGACAAAGCTGGAGGCAGCACACTACCTGAATTCAAG 1807

126332516 ATTTACTACAAAGCTATAGTAACCAACTAGTACTGGCATAAAAACAGGCACATTGACCAA 126332575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 ATTTACTACAAAGCTATAGTAACCAACTAGTACTGGCATAAAAACAGGCACATTGACCAA 1867

126332576 TGGAACAAAATGGAGAACCTACATATAAATCCACAGTGAACTAATTTTCAACAAATGCAC 126332635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 TGGAACAAAATGGAGAACCTACATATAAATCCACAGTGAACTAATTTTCAACAAATGCAC 1927

126332636 CAGGAACATACAGTAGGAAAGGGATGTTGTCTTCAGTAAATAGTGCTAGGAAAACTGCAT 126332695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 CAGGAACATACAGTAGGAAAGGGATGTTGTCTTCAGTAAATAGTGCTAGGAAAACTGCAT 1987

126332696 AACAAAAATCAAGTCAAAATATACTAAAGACTTAAATCTAAGGCTTGAACCTATGATACT 126332755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 AACAAAAATCAAGTCAAAATATACTAAAGACTTAAATCTAAGGCTTGAACCTATGATACT 2047

126332756 ACTAGAAAAAAACATTGGGGAAATGCTTTGGGACATTGGTCTAGGCAAAACTTTTTGTAA 126332815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 ACTAGAAAAAAACATTGGGGAAATGCTTTGGGACATTGGTCTAGGCAAAACTTTTTGTAA 2107

126332816 GACCTCCCTCAAAAGCACAGACAATCAAAGCAGACATGGACAAATGGGACTACATGAAGC 126332875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 GACCTCCCTCAAAAGCACAGACAATCAAAGCAGACATGGACAAATGGGACTACATGAAGC 2167

126332876 TAAAAAGGTTCTGCACATTAAAGAAAACAATCAGCAAAGTGAACAGACAACCTACAGAAT 126332935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 TAAAAAGGTTCTGCACATTAAAGAAAACAATCAGCAAAGTGAACAGACAACCTACAGAAT 2227

126332936 GGAAGAAAATATTTGCAAACTACTTACCTAACGAGGGATTAATAATCAGAATGTATAAGA 126332995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 GGAAGAAAATATTTGCAAACTACTTACCTAACGAGGGATTAATAATCAGAATGTATAAGA 2287

126332996 AGCTTAAAAAACTCAATAGCAAAAAAATCCACTTAAAATGAGCAAAATAAATGATCTCTT 126333055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 AGCTTAAAAAACTCAATAGCAAAAAAATCCACTTAAAATGAGCAAAATAAATGATCTCTT 2347

126333056 GACATTTCTCAAAAAAAAAAAAAGACATACAAATGGCCAACAGGTCTATAAAAAATGCTA 126333115
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 GACATTTCTC-AAAAAAAAAAAAGACATACAAATGGCCAACAGGTCTATAAAAAATGCTA 2406

126333116 AACATTGCTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACTACAAGGAGATATCATCTCACCCC 126333175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 AACATTGCTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACTACAAGGAGATATCATCTCACCCC 2466

126333176 AATTAAATTGGCTTTTATCCAAAAGACAGGTAAAAATGAATGTTGGTGAGGATGTGGAGA 126333235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 AATTAAATTGGCTTTTATCCAAAAGACAGGTAAAAATGAATGTTGGTGAGGATGTGGAGA 2526

126333236 TAAGGGAAAGCTAATACACTATTGGTAGGAATGTAAATAGTATTGTTAGTATGCAGAAGA 126333295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 TAAGGGAAAGCTAATACACTATTGGTAGGAATGTAAATAGTATTGTTAGTATGCAGAAGA 2586

126333296 GTATGGAGAGTTCTCAAAAATCTAAAAATAGAAATAACGTACAATACAGCAATTTCACTA 126333355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 GTATGGAGAGTTCTCAAAAATCTAAAAATAGAAATAACGTACAATACAGCAATTTCACTA 2646

126333356 CTGGGCATATATTCATGAAAAGAAAATCAATATATTGAAAAGACATCTTCGCTCTCATGT 126333415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 CTGGGCATATATTCATGAAAAGAAAATCAATATATTGAAAAGACATCTTCGCTCTCATGT 2706

126333416 AAAGCACTATTTGCAATAGCCAAAATATAGAAATGACGTAAATACCTATCAAAGGAAGAA 126333475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 AAAGCACTATTTGCAATAGCCAAAATATAGAAATGACGTAAATACCTATCAAAGGAAGAA 2766

126333476 AGGATAAAGAAAGCATTGTACATATACACAAATTGTATTCGGCCATTAAAGGAATGAAAT 126333535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 AGGATAAAGAAAGCATTGTACATATACACAAATTGTATTCGGCCATTAAAGGAATGAAAT 2826

126333536 CCTAGTATTTGCAGCAAAATGGATGGAACTGAAGGTCATTATGTTAAATGAAATAAGTCA 126333595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 CCTAGTATTTGCAGCAAAATGGATGGAACTGAAGGTCATTATGTTAAATGAAATAAGTCA 2886

126333596 AGCACAGAAAGACAAATATCACACATTTTTATACATATGTGGGTATAAAAGTGGTCATGA 126333655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 AGCACAGAAAGACAAATATCACACATTTTTATACATATGTGGGTATAAAAGTGGTCATGA 2946

126333656 AAATAGAGAGTTGATTGGCAGTTACCAGAAGCCAGGGAGGGTAGTGGGTGAGGGGATGAA 126333715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 AAATAGAGAGTTGATTGGCAGTTACCAGAAGCCAGGGAGGGTAGTGGGTGAGGGGATGAA 3006

126333716 GACAAGTTGATTAATGGGTACAAATATGCAGTTTGAAGAAAGATTTAGTGTTAAAAGAAC 126333775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 GACAAGTTGATTAATGGGTACAAATATGCAGTTTGAAGAAAGATTTAGTGTTAAAAGAAC 3066

126333776 AGCAGGGTGAATAGAGTTTACAAAAGTCTAATGTATATTTCAAAATAGCTAAAAGAGAAG 126333835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 AGCAGGGTGAATAGAGTTTACAAAAGTCTAATGTATATTTCAAAATAGCTAAAAGAGAAG 3126

126333836 AACTCAAATGGTTCTAGCATAAAGAAAAGGCAAATATTCCAGACAACAGATATCCCAAGT 126333895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 AACTCAAATGGTTCTAGCATAAAGAAAAGGCAAATATTCCAGACAACAGATATCCCAAGT 3186

126333896 ACACTGTTTTGATCTTTACAAATTATGTGAATATTAAATTATCACATGTACCCTATTACT 126333955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 ACACTGTTTTGATCTTTACAAATTATGTGAATATTAAATTATCACATGTACCCTATTACT 3246

126333956 ATGTACATGTGTTATGCATCAATAAATAAAAGAAGTAAAAGCACACAGAGCATTCACCAA 126334015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 ATGTACATGTGTTATGCATCAATAAATAAAAGAAGTAAAAGCACACAGAGCATTCACCAA 3306

126334016 GAAAGACCATATGCTGGGCTATAAAATAAGTCTTGATAAATTTTGAAAGACTCAAATTTT 126334075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 GAAAGACCATATGCTGGGCTATAAAATAAGTCTTGATAAATTTTGAAAGACTCAAATTTT 3366

126334076 GATTTTTGTATATGCTGTAAGGAAGGGATCTGGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAGCTA 126334135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 GATTTTTGTATATGCTGTAAGGAAGGGATCTGGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAGCTA 3426

126334136 GTTGTCTCAGCACCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTCCCCATTGCCTGTGTCAACTTTG 126334195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 GTTGTCTCAGCACCATTTATTGAATAGGGAGTCCTTTCCCCATTGCCTGTGTCAACTTTG 3486

126334196 TCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGCAGCTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCTTTTGCAT 126334255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 TCAAAGATCAGATGGTTATAGGTGTGCAGCTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCTTTTGCAT 3546

126334256 TGGTTTATGTCTGTTTTTGTACCAGTACTATGCTGTTTTAGTTATTGTAGGCTTGTAATA 126334315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 TGGTTTATGTCTGTTTTTGTACCAGTACTATGCTGTTTTAGTTATTGTAGGCTTGTAATA 3606

126334316 TAGTTTAAGGTCGGATAACATGATGCCTCCACCTTTGTTCTTTTTGCATAGGATTACCTT 126334375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 TAGTTTAAGGTCGGATAACATGATGCCTCCACCTTTGTTCTTTTTGCATAGGATTACCTT 3666

126334376 GGCTATTTGGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAAATAGTTTTTTCTAGCTCTGT 126334435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 GGCTATTTGGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAAATAGTTTTTTCTAGCTCTGT 3726

126334436 GAAGAATGTCATTGATAGTTTGATAGGAATAGCATTGAATCTGTAATTTGCTTGGGCAGT 126334495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 GAAGAATGTCATTGATAGTTTGATAGGAATAGCATTGAATCTGTAATTTGCTTGGGCAGT 3786

126334496 ATGGCCATTTTGACAATATTGATTTTCCAATTCATGAGTATGGAATGTTTTTCCCT 126334551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 ATGGCCATTTTGACAATATTGATTTTCCAATTCATGAGTATGGAATGTTTTTCCCT 3842

Alignment time is 5.01847 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2712] =>      2712 nucs 'mol-32-3240-061126_2712'

Score:        2689
Aligned:      2711        nucs
Identic:      2709 (100%) nucs =>       594 (100%)      2115 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126328996,126329589] EXCISED REGION [126329591,126331707]
 second seq =>  [        1,      594] EXCISED REGION [      596,     2712]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126329590,126329590]
 second seq =>         1 nucs [595,595]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [126329590,126329591] to [126329591,126329592]
 second seq =>         1 nucs [594,594] to [595,595]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126328996 TTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAA 126329055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAA 60

126329056 TATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAA 126329115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAA 120

126329116 CACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGA 126329175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGA 180

126329176 TTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCAC 126329235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCAC 240

126329236 AAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTT 126329295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTT 300

126329296 ATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTT 126329355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTT 360

126329356 GGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTC 126329415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTC 420

126329416 TGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGT 126329475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGT 480

126329476 TTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCT 126329535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCT 540

126329536 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAG 126329589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAG 594

EXCISED REGION

126329591 TTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTG 126329650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 TTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTG 655

126329651 TACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG 126329710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 TACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG 715

126329711 GTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 126329770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 GTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 775

126329771 CAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACT 126329830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 CAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACT 835

126329831 ATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGA 126329890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 ATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGA 895

126329891 AAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACC 126329950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 AAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACC 955

126329951 AACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGG 126330010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 AACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGG 1015

126330011 AATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTT 126330070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 AATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTT 1075

126330071 GCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCC 126330130
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 GCTGGCCATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCC 1135

126330131 ACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTT 126330190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 ACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTT 1195

126330191 TGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATG 126330250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 TGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATG 1255

126330251 GGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAG 126330310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 GGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAG 1315

126330311 GTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGA 126330370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 GTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGA 1375

126330371 TGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATAT 126330430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 TGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATAT 1435

126330431 GCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTC 126330490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 GCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTC 1495

126330491 CCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACT 126330550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 CCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACT 1555

126330551 CTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAAC 126330610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 CTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAAC 1615

126330611 TCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCA 126330670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 TCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCA 1675

126330671 TGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACAC 126330730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 TGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACAC 1735

126330731 AAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGA 126330790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 AAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGA 1795

126330791 AAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACC 126330850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 AAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACC 1855

126330851 ATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCA 126330910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 ATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCA 1915

126330911 CACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCAT 126330970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCAT 1975

126330971 TTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGT 126331030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 TTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGT 2035

126331031 GATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAAT 126331090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 GATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAAT 2095

126331091 AAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTAC 126331150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 AAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTAC 2155

126331151 ACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACC 126331210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2156 ACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAGGAACC 2215

126331211 AGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGT 126331270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 AGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGT 2275

126331271 AATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTG 126331330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 AATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTG 2335

126331331 AATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAAT 126331390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 AATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAAT 2395

126331391 TCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAA 126331450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAA 2455

126331451 ACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGAT 126331510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 ACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGAT 2515

126331511 GCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCAT 126331570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 GCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCAT 2575

126331571 TCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTG 126331630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 TCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTG 2635

126331631 ACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATA 126331690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 ACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATA 2695

126331691 GATGCTGAAAAAGTATC 126331707
          |||||||||||||||||
     2696 GATGCTGAAAAAGTATC 2712

Alignment time is 3.81605 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     3127] =>      3127 nucs 'mol-32-331c-137635_3127'

Score:        3097
Aligned:      3119        nucs
Identic:      3117 (100%) nucs =>       718 (100%)      2399 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126328872,126329589] EXCISED REGION [126329591,126331991]
 second seq =>  [        8,      725] EXCISED REGION [      727,     3127]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126329590,126329590]
 second seq =>         1 nucs [726,726]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [126329590,126329591] to [126329591,126329592]
 second seq =>         1 nucs [725,725] to [726,726]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126328872 TCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAAT 126328931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        8 TCTATTAACTGTTATTAATTAAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAAT 67

126328932 GTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAA 126328991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       68 GTTGGCAAGGGGTTGAGAAATACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAA 127

126328992 GTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAAT 126329051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      128 GTCTTTGTGCAAATAAACGGACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAAT 187

126329052 AAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAAT 126329111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      188 AAAATATTATAACTCATTCATTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAAT 247

126329112 AAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTA 126329171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      248 AAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTA 307

126329172 TTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAG 126329231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 TTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAG 367

126329232 TCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTC 126329291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 TCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTC 427

126329292 ATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAG 126329351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 ATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAG 487

126329352 AGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAA 126329411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 AGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAA 547

126329412 TTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAA 126329471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 TTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAA 607

126329472 ACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCT 126329531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 ACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCT 667

126329532 GTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAG 126329589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 GTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAG 725

EXCISED REGION

126329591 TTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTG 126329650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 TTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTG 786

126329651 TACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG 126329710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 TACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG 846

126329711 GTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 126329770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 GTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 906

126329771 CAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACT 126329830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 CAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACT 966

126329831 ATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGA 126329890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 ATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGA 1026

126329891 AAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACC 126329950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 AAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACC 1086

126329951 AACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGG 126330010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 AACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGG 1146

126330011 AATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTT 126330070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 AATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTT 1206

126330071 GCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCC 126330130
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 GCTGGCCATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCC 1266

126330131 ACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTT 126330190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 ACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTT 1326

126330191 TGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATG 126330250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 TGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATG 1386

126330251 GGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAG 126330310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 GGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAG 1446

126330311 GTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGA 126330370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 GTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGA 1506

126330371 TGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATAT 126330430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 TGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATAT 1566

126330431 GCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTC 126330490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 GCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTC 1626

126330491 CCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACT 126330550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 CCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACT 1686

126330551 CTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAAC 126330610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 CTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAAC 1746

126330611 TCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCA 126330670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 TCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCA 1806

126330671 TGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACAC 126330730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 TGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACAC 1866

126330731 AAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGA 126330790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 AAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGA 1926

126330791 AAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACC 126330850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 AAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACC 1986

126330851 ATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCA 126330910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 ATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCA 2046

126330911 CACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCAT 126330970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 CACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCAT 2106

126330971 TTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGT 126331030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 TTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGT 2166

126331031 GATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAAT 126331090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 GATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAAT 2226

126331091 AAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTAC 126331150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 AAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTAC 2286

126331151 ACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACC 126331210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2287 ACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAGGAACC 2346

126331211 AGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGT 126331270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 AGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGT 2406

126331271 AATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTG 126331330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 AATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTG 2466

126331331 AATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAAT 126331390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 AATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAAT 2526

126331391 TCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAA 126331450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 TCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAA 2586

126331451 ACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGAT 126331510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 ACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGAT 2646

126331511 GCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCAT 126331570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 GCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCAT 2706

126331571 TCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTG 126331630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 TCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGACACAAGGATGGTTGAACATACACAAATTG 2766

126331631 ACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATA 126331690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 ACAAGTATGAAACATCAGATTAACAGAACCAAGAACATAAACTATATTATCACTTCAATA 2826

126331691 GATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGA 126331750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 GATGCTGAAAAAGTATCAAACAAAATTCAACATCCTCTTTTGATAAAAATGCTAATCAGA 2886

126331751 CTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTA 126331810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 CTGGCTAAGAAAAAAGCATACCTGAAATAATAAGAGCTATATATGACAAACCCACAGCTA 2946

126331811 ATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAG 126331870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 ATATCATATGGGACAGAGAAAAATTAAAGTCCTGTCATTGAAGATCTGAAACAAGACAAG 3006

126331871 GATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTA 126331930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 GATACCCACTTTCACCACTTTTATTCAGTATGGTACTACAAGTCCTGGCTAAAGCAATTA 3066

126331931 TGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCA 126331990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 TGCAAGAGAAGTAAATAAAGGCTGCCTATCCAAATTGGAAAGGAAGCAGTCAAATGAGCA 3126

126331991 G 126331991
          |
     3127 G 3127

Alignment time is 4.31717 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2468] =>      2468 nucs 'mol-32-33ab-049197_2468'

Score:        2445
Aligned:      2467        nucs
Identic:      2465 (100%) nucs =>       698 (100%)      1767 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126328892,126329589] EXCISED REGION [126329591,126331359]
 second seq =>  [        1,      698] EXCISED REGION [      700,     2468]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126329590,126329590]
 second seq =>         1 nucs [699,699]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [126329590,126329591] to [126329591,126329592]
 second seq =>         1 nucs [698,698] to [699,699]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126328892 AAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGAAA 126328951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATAAATGCAATTAAAATGATATAGAAAAATTACACAATGTTGGCAAGGGGTTGAGAAA 60

126328952 TACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAACGG 126329011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACATTCTCATCTACAGGTTTGGGGAATTTGATTGATTAAGTCTTTGTGCAAATAAACGG 120

126329012 ACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATTCA 126329071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAACATGCACCAAATGTTTTACAAAGTGAAAAATTAAATAAAATATTATAACTCATTCA 180

126329072 TTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCA 126329131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAATATTATGTTTTCCTTAGAGTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCA 240

126329132 GATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACA 126329191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACA 300

126329192 GGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCT 126329251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCT 360

126329252 GTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAAC 126329311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAAC 420

126329312 TATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCT 126329371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCT 480

126329372 ACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTG 126329431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTG 540

126329432 GTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTT 126329491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTT 600

126329492 GTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCA 126329551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCA 660

126329552 GTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAG 126329589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCCAG 698

EXCISED REGION

126329591 TTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTG 126329650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      700 TTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTG 759

126329651 TACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG 126329710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      760 TACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG 819

126329711 GTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 126329770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 GTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 879

126329771 CAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACT 126329830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 CAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACT 939

126329831 ATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGA 126329890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 ATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGA 999

126329891 AAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACC 126329950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 AAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACC 1059

126329951 AACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGG 126330010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 AACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGG 1119

126330011 AATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTT 126330070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 AATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTT 1179

126330071 GCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCC 126330130
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 GCTGGCCATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCC 1239

126330131 ACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTT 126330190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 ACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTT 1299

126330191 TGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATG 126330250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 TGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATG 1359

126330251 GGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAG 126330310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 GGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAG 1419

126330311 GTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGA 126330370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 GTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGA 1479

126330371 TGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATAT 126330430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 TGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATAT 1539

126330431 GCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTC 126330490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 GCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTC 1599

126330491 CCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACT 126330550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 CCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACT 1659

126330551 CTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAAC 126330610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 CTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAAC 1719

126330611 TCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCA 126330670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 TCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCA 1779

126330671 TGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACAC 126330730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 TGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACAC 1839

126330731 AAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGA 126330790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 AAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGA 1899

126330791 AAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACC 126330850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 AAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACC 1959

126330851 ATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCA 126330910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 ATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCA 2019

126330911 CACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCAT 126330970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 CACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCAT 2079

126330971 TTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGT 126331030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 TTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGT 2139

126331031 GATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAAT 126331090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 GATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAAT 2199

126331091 AAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTAC 126331150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 AAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTAC 2259

126331151 ACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACC 126331210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2260 ACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAGGAACC 2319

126331211 AGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGT 126331270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 AGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGT 2379

126331271 AATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTG 126331330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 AATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTG 2439

126331331 AATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTA 126331359
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2440 AATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTA 2468

Alignment time is 3.50266 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2499] =>      2499 nucs 'mol-32-33b6-046065_2499'

Score:        2476
Aligned:      2498        nucs
Identic:      2496 (100%) nucs =>       486 (100%)      2010 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126329104,126329589] EXCISED REGION [126329591,126331602]
 second seq =>  [        1,      486] EXCISED REGION [      488,     2499]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [126329590,126329590]
 second seq =>         1 nucs [487,487]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [126329590,126329591] to [126329591,126329592]
 second seq =>         1 nucs [486,486] to [487,487]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

126329104 ATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGA 126329163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCAATTAAAAAGA 60

126329164 ACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAA 126329223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATGCTGAGTTAAA 120

126329224 GAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATAT 126329283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATTCCACTCATAT 180

126329284 GTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCA 126329343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCAGCGGTTTCCA 240

126329344 CGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAG 126329403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAATACTTTTGAG 300

126329404 TATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAA 126329463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATGTATGCATTAA 360

126329464 AACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGT 126329523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTTGAGATGGAGT 420

126329524 CTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACC 126329583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGCAACCTCCACC 480

126329584 TCCCAG 126329589
          ||||||
      481 TCCCAG 486

EXCISED REGION

126329591 TTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTG 126329650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 TTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCTCCCACCACTG 547

126329651 TACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG 126329710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 TACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG 607

126329711 GTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 126329770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 GTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 667

126329771 CAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACT 126329830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 CAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAACTAAATGTAGAACTACT 727

126329831 ATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGA 126329890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      728 ATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAAAATAAGTCATTATATGA 787

126329891 AAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACC 126329950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 AAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCATTGCAAAACTATTAAACC 847

126329951 AACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGG 126330010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      848 AACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTGGTGTATATACAACTTGG 907

126330011 AATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTT 126330070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 AATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCAACAACTTGGATGGAGTT 967

126330071 GCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCC 126330130
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 GCTGGCCATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAATATTGTATGTTCCC 1027

126330131 ACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTT 126330190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 ACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAGAATAATATAATGGACTT 1087

126330191 TGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATG 126330250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 TGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGTATACTGCTCAGGTGATG 1147

126330251 GGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAG 126330310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 GGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCATGTAATAAAAGGTACAG 1207

126330311 GTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGA 126330370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 GTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGAAAAACAAAACAAAATGA 1267

126330371 TGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATAT 126330430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 TGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGAAAAGAAAAAACAAATAT 1327

126330431 GCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTC 126330490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 GCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATATGAAGATGAAATAGTTC 1387

126330491 CCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACT 126330550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 CCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAGAAAATTGAACTTACACT 1447

126330551 CTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAAC 126330610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 CTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATGAAAATTTTTCCCCCAAC 1507

126330611 TCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCA 126330670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 TCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAATGAGCTTCCTCACAATCA 1567

126330671 TGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACAC 126330730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 TGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGGAAGCCTTGCAAGTACAC 1627

126330731 AAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGA 126330790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 AAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTACCATCCTCAGTCCTGGA 1687

126330791 AAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACC 126330850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 AAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGTGGCTGCTCAACAGCACC 1747

126330851 ATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCA 126330910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 ATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACTCCTACCCAGCCTTCTCA 1807

126330911 CACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCAT 126330970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 CACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAGGGCAGTGCTCCATTCAT 1867

126330971 TTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGT 126331030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 TTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACAGCTGCAAAGTAGGCAGT 1927

126331031 GATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAAT 126331090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 GATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTATACAGTAAAATAGAAAAT 1987

126331091 AAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTAC 126331150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 AAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGGCTAAGATACAGAAGTAC 2047

126331151 ACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAAGAACC 126331210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2048 ACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAATTGGCAAAGCAAGGAACC 2107

126331211 AGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGT 126331270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 AGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAACAATAATTCAAAATAGT 2167

126331271 AATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTG 126331330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 AATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAGCAATTCATTTACTGCTG 2227

126331331 AATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAAT 126331390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 AATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACTCAAATTTTTTTAAAAAT 2287

126331391 TCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAA 126331450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 TCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTCACTATACAAGGCAAGAATTGCCCTGATATCAAA 2347

126331451 ACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGAT 126331510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 ACCAGACAAGGACCTAACAAGAAAGAAAACTACAGGTTAATATAATCAATAAAAATAGAT 2407

126331511 GCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCAT 126331570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 GCAAAAATTCTCAAAAAAATTACTAGCCAGCCTAACTCAACAACACACTAAAAAGATCAT 2467

126331571 TCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGAC 126331602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 TCACCATAATCAGTGGAATTCATCTTGGGGAC 2499

Alignment time is 3.53566 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [126320224,126341256] =>     21033 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2324] =>      2324 nucs 'mol-32-340e-132170_2324'

Score:        2324
Aligned:      2324        nucs
Identic:      2324 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [126329094,126331417]
 second seq =>  [        1,     2324]

126329094 GTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCA 126329153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGAATGGATGAAAATAAAACACCATTGTGTACCCAGATAATGGAATGCTACACGGCA 60

126329154 ATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATG 126329213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTAAAAAGAACAAATTATTGATTCACAAAACAACACAGGTGGATCTCAAAATAATTATG 120

126329214 CTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATT 126329273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGAGTTAAAGAAGGCAGTCACAAATATTATATACTCTGTGGTTTTATTTGTATGACATT 180

126329274 CCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCA 126329333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCACTCATATGTCATTTCATTTATATGAAAAGCCAAACTATAAAGATGGATAATGTATCA 240

126329334 GCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAA 126329393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCGGTTTCCACGGCATAGAGTTGGGGGAAGGCTTTGCTACAAAGAGGCAGTATAAGGGAA 300

126329394 TACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATG 126329453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACTTTTGAGTATTAGAATTTCTGGTATCCTGTTTGTGGTTGTGATTACAAGGATATATG 360

126329454 TATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTT 126329513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATGCATTAAAACTATAAACGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTT 420

126329514 GAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGC 126329573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTCCCAGTTCACTGC 480

126329574 AACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATT 126329633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACCTCCACCTCCCAGTTTCAAGCTGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATT 540

126329634 ATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCA 126329693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAGGCTCCCACCACTGTACCCGGCTAATTTTTATGTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCA 600

126329694 CCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTC 126329753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATTTGCCCGCCTCGGCCTC 660

126329754 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAA 126329813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGAGATTTCTTAAAAAA 720

126329814 CTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAA 126329873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTAAATGTAGAACTACTATTTGATACAGCAATTCCACTACTGGCTATTTACCCAAAGAAA 780

126329874 AATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCAT 126329933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATAAGTCATTATATGAAAAAGTCATATATACACACGTTTATAGAAGCAGAATTAACCAT 840

126329934 TGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTG 126329993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCAAAACTATTAAACCAACCTAAATGCCCATCAACAAATGAGTGGACAAAGCAAATGTG 900

126329994 GTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCA 126330053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGTATATACAACTTGGAATACTACTCATCCATAAAATGGAACAAGTAATTGCCTTTGCA 960

126330054 ACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACC 126330113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACAACTTGGATGGAGTTGCTGGCCATTATTCTAAGTAAAGTAACTCAGGAATGGAAAACC 1020

126330114 AAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAG 126330173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAATATTGTATGTTCCCACTTATAAGTTGGAGCTAAGCTATGAGCACACAAAAGCATAAG 1080

126330174 AATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGT 126330233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATAATATAATGGACTTTGGAGGGGGGTGAGATAAAAGACTAAACATTGGGTACAATTGT 1140

126330234 ATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCA 126330293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATACTGCTCAGGTGATGGGTGCACCAAAATCTCAGAAATTACCACTAAACAACATATCCA 1200

126330294 TGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGA 126330353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTAATAAAAGGTACAGGTGGTTACCTGTACCCCTAAAACTATCAAAATTAAAATAAAGA 1260

126330354 AAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGA 126330413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAACAAAACAAAATGATGAAATAGAAGCAATTTGAATTTACTGCTTACCTTCCCCCAGA 1320

126330414 AAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATA 126330473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAGAAAAAACAAATATGCAGTGTAGGGATTATGACCAAATGCAACCCAGAACTCAAATA 1380

126330474 TGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAG 126330533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGAAGATGAAATAGTTCCCGGGGCCAGAGAAAAGCGAAAAAGCTTCAAATGGAGGGGAAG 1440

126330534 AAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATG 126330593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAATTGAACTTACACTCTGCAATATTCATCCCCACATTCTGCTCAACACCAAGCACATG 1500

126330594 AAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAAT 126330653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAATTTTTCCCCCAACTCACTATTTCTACAGTAGAAAAAGTGAGATTGACATGGACAAT 1560

126330654 GAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGG 126330713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGCTTCCTCACAATCATGGGTTCCCTCTCAGGAGACATGTCTCTACCTTAACCCAAAGG 1620

126330714 AAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTA 126330773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGCCTTGCAAGTACACAAAAAGATAAATATCCCTGAGGACTGGCAGAGACAAAGAACTA 1680

126330774 CCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGT 126330833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCATCCTCAGTCCTGGAAAGTATTATCTGTAACTCAGCCAAAGGAGATGCCAAACAGAGT 1740

126330834 GGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACT 126330893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCTGCTCAACAGCACCATGCTGTAGAAATTTTATCCCTCAGGGCCCCTGGGCATGAACT 1800

126330894 CCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAG 126330953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCTACCCAGCCTTCTCACACTGCTGGCATATTCCCTTTGGGCTCTCTCTCATTTGGGAAG 1860

126330954 GGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACA 126331013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGCAGTGCTCCATTCATTTACTACAGGTTAGGTGAACCTGGGCTTAAGTCACCACCTACA 1920

126331014 GCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTAT 126331073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTGCAAAGTAGGCAGTGATCTCAGTGATCTAGTGATAAAGAACCTCTAAGAAAATGTAT 1980

126331074 ACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGG 126331133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACAGTAAAATAGAAAATAAACCAGACAGGAAAATTAGAATAAACAACTTATCTTTCATGG 2040

126331134 CTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAAT 126331193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTAAGATACAGAAGTACACCCACAAGAAACAACAGAAAACAGAGAAATATTTTTCCAAAT 2100

126331194 TGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAA 126331253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGCAAAGCAAAGAACCAGTAACTAATCCTAACAAGACAGTGATATGTGAGCTCCCTCAA 2160

126331254 CAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAG 126331313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAATAATTCAAAATAGTAATTTTACAGAAATTTAGTGATCTTCAAGATAACACAGAAAAG 2220

126331314 CAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACT 126331373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAATTCATTTACTGCTGAATTCTACCAATCATTTAAAGAAGAACTAATACCAATTCTACT 2280

126331374 CAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTC 126331417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAAATTTTTTTAAAAATTCAAGAGGAGAGACTACTTGCAAATTC 2324

Alignment time is 3.01077 s

