
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [122962809,122983684] =>     20876 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2098] =>      2098 nucs 'mol-32-1f21-070414_2098'

Score:        2075
Aligned:      2099        nucs
Identic:      2096 (100%) nucs =>       590 (100%)      1506 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [122972873,122973462] EXCISED REGION [122973471,122974979]
 second seq =>  [        1,      590] EXCISED REGION [      593,     2098]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [122973463,122973470]
 second seq =>         2 nucs [591,592]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [122973463,122973463] to [122973471,122973471]
 second seq =>         1 nucs [590,590] to [592,592]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [122973463,122973463] to [122973470,122973470]
 second seq =>         1 nucs [591,591] to [592,592]

122972873 GATTACAGGCGTGAGCCATTGCACCCGGCCACTTCATTTCTTTTTAGTGCTGAATAATAT 122972932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTACAGGCGTGAGCCATTGCACCCGGCCACTTCATTTCTTTTTAGTGCTGAATAATAT 60

122972933 TCCGTTGTCTGGATATGCCACAGTTTATTTATCCATTCATCTACTGAAGGACATCTCAGT 122972992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCGTTGTCTGGATATGCCACAGTTTATTTATCCATTCATCTACTGAAGGACATCTCAGT 120

122972993 TTCTTCCAAATTTTGGCAATTATAAATAAGGCTGCTATAAACATACATACGCTTTTTATT 122973052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTTCCAAATTTTGGCAATTATAAATAAGGCTGCTATAAACATACATACGCTTTTTATT 180

122973053 TGTGATTGGTTAAGGACCAGGAAAAAAGAAAAAAAATCATGTATGTGCAAGTTTTTGTGA 122973112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTGATTGGTTAAGGACCAGGAAAAAAGAAAAAAAATCATGTATGTGCAAGTTTTTGTGA 240

122973113 GGGCAAGAATTTTCAATTGATTTGGATAAATACCAAGGAGTGTGATTGCTGGATTATGTG 122973172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGCAAGAATTTTCAATTGATTTGGATAAATACCAAGGAGTGTGATTGCTGGATTATGTG 300

122973173 GTAGGAATATGTTTAGTTTTCTAAAAAACTGTCAGTTGTCTTCCAAAGTGTCTGTCCTAC 122973232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTAGGAATATGTTTAGTTTTCTAAAAAACTGTCAGTTGTCTTCCAAAGTGTCTGTCCTAC 360

122973233 TTTGCATTCCCACCAGCAACAAATGAGAGTTCCTCTTGCTCCACATCCTCATCAGCATTT 122973292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGCATTCCCACCAGCAACAAATGAGAGTTCCTCTTGCTCCACATCCTCATCAGCATTT 420

122973293 GGTGTTGTCAGTGTTCTGAATTGTGACCACTCTAACTAGGTATGCAGTGGTATTTCATTG 122973352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTGTTGTCAGTGTTCTGAATTGTGACCACTCTAACTAGGTATGCAGTGGTATTTCATTG 480

122973353 TTGCTTTAATTTGCATTCAGCTAACAACATATGATGTAGAACATCTTTTAATATGCTTAT 122973412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGCTTTAATTTGCATTCAGCTAACAACATATGATGTAGAACATCTTTTAATATGCTTAT 540

122973413 TTGACATCTGTATGTCTTATTTATTGAGGTTATCTGTTCAGGTCTTTGGC 122973462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGACATCTGTATGTCTTATTTATTGAGGTTATCTGTTCAGGTCTTTGGC 590

EXCISED REGION

122973471 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGCAGGAGTCTCACTGTGTTGCCTAGGCTGGAGTG 122973530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGCAGGAGTCTCACTGTGTTGCCTAGGCTGGAGTG 652

122973531 CAGTGGTGCTATCTAGGCTCACTGCAACCTCCACCTTCCCAGTTCAAGCACTTCTCCCTG 122973590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 CAGTGGTGCTATCTAGGCTCACTGCAACCTCCACCTTCCCAGTTCAAGCACTTCTCCCTG 712

122973591 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTATATGCTCCCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTG 122973650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTATATGCTCCCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTG 772

122973651 TATTTTTAGTAGGGATGGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTAGAACTCCTGACTT 122973710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TATTTTTAGTAGGGATGGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTAGAACTCCTGACTT 832

122973711 CAAATGATCCACCCACCTCGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATCACAGGCGTGAGCCACTGCA 122973770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 CAAATGATCCACCCACCTCGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATCACAGGCGTGAGCCACTGCA 892

122973771 CCCCACCTGTAGTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTCTGAGACGGAGTCTCACTCA 122973830
          |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 CCCCACCTGTAGTTTTC--TTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTCTGAGACGGAGTCTCACTCA 950

122973831 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGACACAATCTCAGCTCATTGTAACCTCCGCCTTCCGGA 122973890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGACACAATCTCAGCTCATTGTAACCTCCGCCTTCCGGA 1010

122973891 GCCACCGTGCCTGGACCCGTAGTTTTCTTCATATAAATTTTATACATATTTTGTTAGGTT 122973950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 GCCACCGTGCCTGGACCCGTAGTTTTCTTCATATAAATTTTATACATATTTTGTTAGGTT 1070

122973951 TATATCTAAGTATTTTTCTTTTTTCTTCCACTCAATTTTAACAAATCTCAACATTTTGCC 122974010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 TATATCTAAGTATTTTTCTTTTTTCTTCCACTCAATTTTAACAAATCTCAACATTTTGCC 1130

122974011 GTTTTTTTGCCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTCGCCAGGCTGGAGTG 122974070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 GTTTTTTTGCCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTCGCCAGGCTGGAGTG 1190

122974071 CAGTGGCAAAATGTTGGCTCACGGCAACCTCCACCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGC 122974130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 CAGTGGCAAAATGTTGGCTCACGGCAACCTCCACCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGC 1250

122974131 CTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGATGCGTGCCAACACGCCCAGCTATTTTTTGT 122974190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 CTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGATGCGTGCCAACACGCCCAGCTATTTTTTGT 1310

122974191 ATTTTTAGCAGAAACGGGGTTCCACCATGTTCACCAGGATGGTCTCGATATCTTGACCTC 122974250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 ATTTTTAGCAGAAACGGGGTTCCACCATGTTCACCAGGATGGTCTCGATATCTTGACCTC 1370

122974251 ATGATCCATCCCCCTCGGCCTCCCCAAGTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCACCGCACCC 122974310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 ATGATCCATCCCCCTCGGCCTCCCCAAGTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCACCGCACCC 1430

122974311 GGCCCAACATTTTGCCATTTTTGCTTCAGATTGTTTTAAAAATAAAACATTAATAGTACA 122974370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 GGCCCAACATTTTGCCATTTTTGCTTCAGATTGTTTTAAAAATAAAACATTAATAGTACA 1490

122974371 AGAAAAGTATAAATAGACTTGAATTGCCTTGTGTATCTCTCCTCTATCCCATTTCCCTCT 122974430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 AGAAAAGTATAAATAGACTTGAATTGCCTTGTGTATCTCTCCTCTATCCCATTTCCCTCT 1550

122974431 CCCTCCCCCCAAAACACCACTAGAATAATTTGGTATCTATCATTTGTATACATAGTTATA 122974490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 CCCTCCCCCCAAAACACCACTAGAATAATTTGGTATCTATCATTTGTATACATAGTTATA 1610

122974491 GATGCATGATTGTAACGTGGTATCCGTTTTTCTTATAGTATATGTATCTTGTAGTATATG 122974550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 GATGCATGATTGTAACGTGGTATCCGTTTTTCTTATAGTATATGTATCTTGTAGTATATG 1670

122974551 TAGTATATGTTTCATTCTTTCTCTCTTTTTTTTTTTTAGAGACAAAGTCTCACTCTGTCA 122974610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 TAGTATATGTTTCATTCTTTCTCTCTTTTTTTTTTTTAGAGACAAAGTCTCACTCTGTCA 1730

122974611 CCCAAGTGGTGTAAACACAGCTCACTGCAGTGTTGATCTCCTGGGCTCCAGTGATCCCCC 122974670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 CCCAAGTGGTGTAAACACAGCTCACTGCAGTGTTGATCTCCTGGGCTCCAGTGATCCCCC 1790

122974671 TACCTCAGCTGCCTAACTAGCTGGGACTACAGGCCTGCGCCACTATCCCCAGCCAATTTT 122974730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 TACCTCAGCTGCCTAACTAGCTGGGACTACAGGCCTGCGCCACTATCCCCAGCCAATTTT 1850

122974731 TCGTATTTTGGGTAGAGACGAAGTTTCCCCATGTTGCACAGGCTGGTCTCAAACTCCTGG 122974790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 TCGTATTTTGGGTAGAGACGAAGTTTCCCCATGTTGCACAGGCTGGTCTCAAACTCCTGG 1910

122974791 GCTCCAGCAATCTGGCCACCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTATTGGTGTGAGCCACC 122974850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 GCTCCAGCAATCTGGCCACCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTATTGGTGTGAGCCACC 1970

122974851 TCACTTGACCATGACACATGCAACTCATTTTTTTTTTTTTTTGAAACGGAGTTTCAGGCC 122974910
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 TCACTTGACCATGACACATGCAACTCA-TTTTTTTTTTTTTTGAAACGGAGTTTCAGGCC 2029

122974911 GGGCGCAGTGGCTCATACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGCGGCCGAGGCGGGCGGATCAC 122974970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 GGGCGCAGTGGCTCATACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGCGGCCGAGGCGGGCGGATCAC 2089

122974971 AAGATCAGG 122974979
          |||||||||
     2090 AAGATCAGG 2098

Alignment time is 1.92776 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [122962809,122983684] =>     20876 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2068] =>      2068 nucs 'mol-32-338a-106985_2068'

Score:        2047
Aligned:      2069        nucs
Identic:      2067 (100%) nucs =>       940 (100%)      1127 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [122972848,122973787] EXCISED REGION [122973789,122974916]
 second seq =>  [        1,      940] EXCISED REGION [      941,     2068]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [122973788,122973788]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1727,1727]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [122973788,122973805] to [122973789,122973806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

122972848 CCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCACCCGGCCACTTC 122972907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATTGCACCCGGCCACTTC 60

122972908 ATTTCTTTTTAGTGCTGAATAATATTCCGTTGTCTGGATATGCCACAGTTTATTTATCCA 122972967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTCTTTTTAGTGCTGAATAATATTCCGTTGTCTGGATATGCCACAGTTTATTTATCCA 120

122972968 TTCATCTACTGAAGGACATCTCAGTTTCTTCCAAATTTTGGCAATTATAAATAAGGCTGC 122973027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCATCTACTGAAGGACATCTCAGTTTCTTCCAAATTTTGGCAATTATAAATAAGGCTGC 180

122973028 TATAAACATACATACGCTTTTTATTTGTGATTGGTTAAGGACCAGGAAAAAAGAAAAAAA 122973087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATAAACATACATACGCTTTTTATTTGTGATTGGTTAAGGACCAGGAAAAAAGAAAAAAA 240

122973088 ATCATGTATGTGCAAGTTTTTGTGAGGGCAAGAATTTTCAATTGATTTGGATAAATACCA 122973147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCATGTATGTGCAAGTTTTTGTGAGGGCAAGAATTTTCAATTGATTTGGATAAATACCA 300

122973148 AGGAGTGTGATTGCTGGATTATGTGGTAGGAATATGTTTAGTTTTCTAAAAAACTGTCAG 122973207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGAGTGTGATTGCTGGATTATGTGGTAGGAATATGTTTAGTTTTCTAAAAAACTGTCAG 360

122973208 TTGTCTTCCAAAGTGTCTGTCCTACTTTGCATTCCCACCAGCAACAAATGAGAGTTCCTC 122973267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGTCTTCCAAAGTGTCTGTCCTACTTTGCATTCCCACCAGCAACAAATGAGAGTTCCTC 420

122973268 TTGCTCCACATCCTCATCAGCATTTGGTGTTGTCAGTGTTCTGAATTGTGACCACTCTAA 122973327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGCTCCACATCCTCATCAGCATTTGGTGTTGTCAGTGTTCTGAATTGTGACCACTCTAA 480

122973328 CTAGGTATGCAGTGGTATTTCATTGTTGCTTTAATTTGCATTCAGCTAACAACATATGAT 122973387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTAGGTATGCAGTGGTATTTCATTGTTGCTTTAATTTGCATTCAGCTAACAACATATGAT 540

122973388 GTAGAACATCTTTTAATATGCTTATTTGACATCTGTATGTCTTATTTATTGAGGTTATCT 122973447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTAGAACATCTTTTAATATGCTTATTTGACATCTGTATGTCTTATTTATTGAGGTTATCT 600

122973448 GTTCAGGTCTTTGGCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGCAGGAGTCTC 122973507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTCAGGTCTTTGGCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGCAGGAGTCTC 660

122973508 ACTGTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCTATCTAGGCTCACTGCAACCTCCACCTT 122973567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTGTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCTATCTAGGCTCACTGCAACCTCCACCTT 720

122973568 CCCAGTTCAAGCACTTCTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTATATGCTCCCG 122973627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCAGTTCAAGCACTTCTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTATATGCTCCCG 780

122973628 CCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGATGGGGTTTCACCATGTTGCCCA 122973687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGATGGGGTTTCACCATGTTGCCCA 840

122973688 GGCTGGTCTAGAACTCCTGACTTCAAATGATCCACCCACCTCGGCCTTCCAAAGTGCTGG 122973747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCTGGTCTAGAACTCCTGACTTCAAATGATCCACCCACCTCGGCCTTCCAAAGTGCTGG 900

122973748 GATCACAGGCGTGAGCCACTGCACCCCACCTGTAGTTTTC 122973787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATCACAGGCGTGAGCCACTGCACCCCACCTGTAGTTTTC 940

EXCISED REGION

122973789 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTCTGAGACGGAGTCTCACTCAGTCACCCAGGCTGGAGTG 122973848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTCTGAGACGGAGTCTCACTCAGTCACCCAGGCTGGAGTG 1000

122973849 CAGTGACACAATCTCAGCTCATTGTAACCTCCGCCTTCCGGAGCCACCGTGCCTGGACCC 122973908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 CAGTGACACAATCTCAGCTCATTGTAACCTCCGCCTTCCGGAGCCACCGTGCCTGGACCC 1060

122973909 GTAGTTTTCTTCATATAAATTTTATACATATTTTGTTAGGTTTATATCTAAGTATTTTTC 122973968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 GTAGTTTTCTTCATATAAATTTTATACATATTTTGTTAGGTTTATATCTAAGTATTTTTC 1120

122973969 TTTTTTCTTCCACTCAATTTTAACAAATCTCAACATTTTGCCGTTTTTTTGCCTTTTTTT 122974028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     1121 TTTTTTCTTCCACTCAATTTTAACAAATCTCAACATTTTGCCGTTTTTTTGCC-TTTTTT 1179

122974029 TTTTTTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAAATGTTGGC 122974088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 TTTTTTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAAATGTTGGC 1239

122974089 TCACGGCAACCTCCACCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGC 122974148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 TCACGGCAACCTCCACCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGC 1299

122974149 TGGGACTACAGATGCGTGCCAACACGCCCAGCTATTTTTTGTATTTTTAGCAGAAACGGG 122974208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 TGGGACTACAGATGCGTGCCAACACGCCCAGCTATTTTTTGTATTTTTAGCAGAAACGGG 1359

122974209 GTTCCACCATGTTCACCAGGATGGTCTCGATATCTTGACCTCATGATCCATCCCCCTCGG 122974268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 GTTCCACCATGTTCACCAGGATGGTCTCGATATCTTGACCTCATGATCCATCCCCCTCGG 1419

122974269 CCTCCCCAAGTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCACCGCACCCGGCCCAACATTTTGCCAT 122974328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 CCTCCCCAAGTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCACCGCACCCGGCCCAACATTTTGCCAT 1479

122974329 TTTTGCTTCAGATTGTTTTAAAAATAAAACATTAATAGTACAAGAAAAGTATAAATAGAC 122974388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 TTTTGCTTCAGATTGTTTTAAAAATAAAACATTAATAGTACAAGAAAAGTATAAATAGAC 1539

122974389 TTGAATTGCCTTGTGTATCTCTCCTCTATCCCATTTCCCTCTCCCTCCCCCCAAAACACC 122974448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 TTGAATTGCCTTGTGTATCTCTCCTCTATCCCATTTCCCTCTCCCTCCCCCCAAAACACC 1599

122974449 ACTAGAATAATTTGGTATCTATCATTTGTATACATAGTTATAGATGCATGATTGTAACGT 122974508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 ACTAGAATAATTTGGTATCTATCATTTGTATACATAGTTATAGATGCATGATTGTAACGT 1659

122974509 GGTATCCGTTTTTCTTATAGTATATGTATCTTGTAGTATATGTAGTATATGTTTCATTCT 122974568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 GGTATCCGTTTTTCTTATAGTATATGTATCTTGTAGTATATGTAGTATATGTTTCATTCT 1719

122974569 TTCTCTC-TTTTTTTTTTTTAGAGACAAAGTCTCACTCTGTCACCCAAGTGGTGTAAACA 122974627
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 TTCTCTCTTTTTTTTTTTTTAGAGACAAAGTCTCACTCTGTCACCCAAGTGGTGTAAACA 1779

122974628 CAGCTCACTGCAGTGTTGATCTCCTGGGCTCCAGTGATCCCCCTACCTCAGCTGCCTAAC 122974687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 CAGCTCACTGCAGTGTTGATCTCCTGGGCTCCAGTGATCCCCCTACCTCAGCTGCCTAAC 1839

122974688 TAGCTGGGACTACAGGCCTGCGCCACTATCCCCAGCCAATTTTTCGTATTTTGGGTAGAG 122974747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 TAGCTGGGACTACAGGCCTGCGCCACTATCCCCAGCCAATTTTTCGTATTTTGGGTAGAG 1899

122974748 ACGAAGTTTCCCCATGTTGCACAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCCAGCAATCTGGCC 122974807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 ACGAAGTTTCCCCATGTTGCACAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCCAGCAATCTGGCC 1959

122974808 ACCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTATTGGTGTGAGCCACCTCACTTGACCATGACAC 122974867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 ACCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTATTGGTGTGAGCCACCTCACTTGACCATGACAC 2019

122974868 ATGCAACTCATTTTTTTTTTTTTTTGAAACGGAGTTTCAGGCCGGGCGC 122974916
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 ATGCAACTCATTTTTTTTTTTTTTTGAAACGGAGTTTCAGGCCGGGCGC 2068

Alignment time is 1.5415 s

