
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2013] =>      2013 nucs 'mol-32-1e66-050887_2013'

Score:        2013
Aligned:      2013        nucs
Identic:      2013 (100%) nucs =>       786 (100%)      1227 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967132,83967917] EXCISED REGION [83970684,83971910]
 second seq =>  [       1,     786] EXCISED REGION [     787,    2013]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83967132 CAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAA 83967191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAA 60

 83967192 TGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACA 83967251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACA 120

 83967252 CTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCT 83967311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCT 180

 83967312 CCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAA 83967371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAA 240

 83967372 ACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAG 83967431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAG 300

 83967432 ATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATC 83967491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATC 360

 83967492 TCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAA 83967551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAA 420

 83967552 CCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATC 83967611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATC 480

 83967612 AGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAAC 83967671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAAC 540

 83967672 ATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAA 83967731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAA 600

 83967732 TCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCC 83967791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCC 660

 83967792 TGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACA 83967851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACA 720

 83967852 AATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGA 83967911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGA 780

 83967912 GGGAAA 83967917
          ||||||
      781 GGGAAA 786

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 846

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 906

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 966

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 1026

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 1086

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 1146

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 1206

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 1266

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 1326

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 1386

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 1446

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 1506

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 1566

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 1626

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 1686

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 1746

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 1806

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 1866

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 1926

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 1986

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGA 83971910
          |||||||||||||||||||||||||||
     1987 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGA 2013

Alignment time is 3.12964 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3649] =>      3649 nucs 'mol-32-1e7c-157545_3649'

Score:        3649
Aligned:      3649        nucs
Identic:      3649 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967182,83970830]
 second seq =>  [       1,    3649]

 83967182 AATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATAT 83967241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATAT 60

 83967242 GCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATG 83967301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATG 120

 83967302 TGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTA 83967361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTA 180

 83967362 TTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTC 83967421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTC 240

 83967422 TGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCAC 83967481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCAC 300

 83967482 TGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAA 83967541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAA 360

 83967542 AATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACAT 83967601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACAT 420

 83967602 TCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAA 83967661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAA 480

 83967662 GTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACA 83967721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACA 540

 83967722 GAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAAC 83967781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAAC 600

 83967782 AATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATT 83967841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATT 660

 83967842 TCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGC 83967901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGC 720

 83967902 AGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAA 83967961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAA 780

 83967962 CTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGATTTTTTTTTTTTTTTT 83968021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGATTTTTTTTTTTTTTTT 840

 83968022 TTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTGCTTGGTCGTTGT 83968081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTGCTTGGTCGTTGT 900

 83968082 TGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGGAAACTTTGCTGA 83968141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGGAAACTTTGCTGA 960

 83968142 ATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTTCAAGGTAAACAA 83968201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTTCAAGGTAAACAA 1020

 83968202 TCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTTGGATGCCCTTTA 83968261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTTGGATGCCCTTTA 1080

 83968262 TTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTTGAAGAGGTGTGG 83968321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTTGAAGAGGTGTGG 1140

 83968322 TGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTTCAACTTTTCCCT 83968381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTTCAACTTTTCCCT 1200

 83968382 ATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTATATTAAGGTATGT 83968441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTATATTAAGGTATGT 1260

 83968442 CCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTGGATTTTGTCAAA 83968501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTGGATTTTGTCAAA 1320

 83968502 TGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAATTCTGTTTATGTG 83968561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAATTCTGTTTATGTG 1380

 83968562 GTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCCTGGTATGAAACC 83968621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCCTGGTATGAAACC 1440

 83968622 CACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTTAGCTAGTATTTC 83968681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTTAGCTAGTATTTC 1500

 83968682 GTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTTTTCTTTGTTATG 83968741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTTTTCTTTGTTATG 1560

 83968742 GCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAATTAGGGAAGGTT 83968801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAATTAGGGAAGGTT 1620

 83968802 CCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATTCTTCTTTGAAT 83968861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATTCTTCTTTGAAT 1680

 83968862 GTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTGTTGGTAATTTT 83968921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTGTTGGTAATTTT 1740

 83968922 TTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATCTAATTCTTCC 83968981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATCTAATTCTTCC 1800

 83968982 TGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCTAGGTTTTCTA 83969041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCTAGGTTTTCTA 1860

 83969042 GTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATTTCAGTGGTGT 83969101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATTTCAGTGGTGT 1920

 83969102 CAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTTT 83969161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTTT 1980

 83969162 TCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAATAACCAGATTT 83969221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAATAACCAGATTT 2040

 83969222 TTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTGCTCTGATCTT 83969281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTGCTCTGATCTT 2100

 83969282 GGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCTT 83969341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCTT 2160

 83969342 GAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTAG 83969401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTAG 2220

 83969402 GGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACTACAAAACACT 83969461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACTACAAAACACT 2280

 83969462 GCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGCTCATGGATGGG 83969521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGCTCATGGATGGG 2340

 83969522 TAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACTTCAATGCAAT 83969581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACTTCAATGCAAT 2400

 83969582 CTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTCTAAAATTCAT 83969641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTCTAAAATTCAT 2460

 83969642 ATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGAACAAATCTGG 83969701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGAACAAATCTGG 2520

 83969702 AGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACCAAAACAGCAT 83969761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACCAAAACAGCAT 2580

 83969762 GGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAATGCAGAAATAA 83969821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAATGCAGAAATAA 2640

 83969822 ACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATAAAGTGGGGAA 83969881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATAAAGTGGGGAA 2700

 83969882 AGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTAGGAGAATGAA 83969941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTAGGAGAATGAA 2760

 83969942 ACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGATTAAGGACTTAAA 83970001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGATTAAGGACTTAAA 2820

 83970002 CCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAACCCTTTTAGAT 83970061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAACCCTTTTAGAT 2880

 83970062 ATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAATAAAAACAAAG 83970121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAATAAAAACAAAG 2940

 83970122 ATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGAACAGTCAACAG 83970181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGAACAGTCAACAG 3000

 83970182 AGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATATGTCTGACAAAGG 83970241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATATGTCTGACAAAGG 3060

 83970242 AATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAAAAAGCAGTCTC 83970301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAAAAAGCAGTCTC 3120

 83970302 ATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGTC 83970361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGTC 3180

 83970362 AGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAAATCAAAATGAC 83970421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAAATCAAAATGAC 3240

 83970422 AATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCAAAAAATAGTAG 83970481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCAAAAAATAGTAG 3300

 83970482 ATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGGGAATGTAAACT 83970541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGGGAATGTAAACT 3360

 83970542 AGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAAGTAGAACTACC 83970601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAAGTAGAACTACC 3420

 83970602 ATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAGTCATTATTTGA 83970661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAGTCATTATTTGA 3480

 83970662 AAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAA 83970721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAA 3540

 83970722 CCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATG 83970781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATG 3600

 83970782 ATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAG 83970830
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAG 3649

Alignment time is 7.68291 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3971] =>      3971 nucs 'mol-32-1e7c-164636_3971'

Score:        3971
Aligned:      3971        nucs
Identic:      3971 (100%) nucs =>      1916 (100%)      2055 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83966090,83968005] EXCISED REGION [83968010,83970064]
 second seq =>  [       1,    1916] EXCISED REGION [    1917,    3971]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [83968006,83968009]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [83968006,83968022] to [83968010,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [83968006,83968007] to [83968008,83968009]
 second seq =>         0 nucs

 83966090 ATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGAT 83966149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGAT 60

 83966150 GTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTA 83966209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTA 120

 83966210 TTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTC 83966269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTC 180

 83966270 ATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAA 83966329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAA 240

 83966330 AAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAA 83966389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAA 300

 83966390 ATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCA 83966449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCA 360

 83966450 GAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGT 83966509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGT 420

 83966510 AGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGG 83966569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGG 480

 83966570 ACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTA 83966629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTA 540

 83966630 AAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAG 83966689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAG 600

 83966690 TGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAA 83966749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAA 660

 83966750 TCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTA 83966809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTA 720

 83966810 GAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCAC 83966869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCAC 780

 83966870 AAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAAT 83966929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAAT 840

 83966930 ATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAA 83966989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAA 900

 83966990 AAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATA 83967049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATA 960

 83967050 CACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGA 83967109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGA 1020

 83967110 ACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGA 83967169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGA 1080

 83967170 GACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATT 83967229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATT 1140

 83967230 GTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATAT 83967289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATAT 1200

 83967290 TTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAAT 83967349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAAT 1260

 83967350 TCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCA 83967409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCA 1320

 83967410 GAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCC 83967469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCC 1380

 83967470 CAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAA 83967529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAA 1440

 83967530 TCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTA 83967589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTA 1500

 83967590 CAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTAT 83967649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTAT 1560

 83967650 GTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGAC 83967709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGAC 1620

 83967710 CACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATA 83967769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATA 1680

 83967770 TGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAA 83967829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAA 1740

 83967830 ATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGA 83967889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGA 1800

 83967890 TACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGA 83967949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGA 1860

 83967950 AAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 83968005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 1916

EXCISED REGION

 83968010 TTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTG 83968069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTG 1976

 83968070 CTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGG 83968129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 CTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGG 2036

 83968130 AAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTT 83968189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 AAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTT 2096

 83968190 CAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTT 83968249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 CAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTT 2156

 83968250 GGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTT 83968309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 GGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTT 2216

 83968310 GAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTT 83968369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 GAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTT 2276

 83968370 CAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTAT 83968429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 CAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTAT 2336

 83968430 ATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTG 83968489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 ATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTG 2396

 83968490 GATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAAT 83968549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 GATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAAT 2456

 83968550 TCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCC 83968609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCC 2516

 83968610 TGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTT 83968669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTT 2576

 83968670 AGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTT 83968729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 AGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTT 2636

 83968730 TTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAA 83968789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 TTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAA 2696

 83968790 TTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAAT 83968849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 TTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAAT 2756

 83968850 TCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTT 83968909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTT 2816

 83968910 GTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTA 83968969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 GTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTA 2876

 83968970 TCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTC 83969029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTC 2936

 83969030 CTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTA 83969089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 CTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTA 2996

 83969090 TTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTT 83969149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTT 3056

 83969150 TCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAA 83969209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAA 3116

 83969210 ATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTC 83969269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 ATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTC 3176

 83969270 TGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTT 83969329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTT 3236

 83969330 CTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGAT 83969389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 CTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGAT 3296

 83969390 GTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAA 83969449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAA 3356

 83969450 CTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATG 83969509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 CTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATG 3416

 83969510 CTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAA 83969569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 CTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAA 3476

 83969570 CTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAAT 83969629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 CTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAAT 3536

 83969630 TCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAA 83969689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAA 3596

 83969690 GAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAA 83969749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 GAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAA 3656

 83969750 CCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACA 83969809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 CCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACA 3716

 83969810 ATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACA 83969869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 ATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACA 3776

 83969870 TAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATG 83969929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATG 3836

 83969930 TAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGAT 83969989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 TAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGAT 3896

 83969990 TAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAA 83970049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 TAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAA 3956

 83970050 ACCCTTTTAGATATC 83970064
          |||||||||||||||
     3957 ACCCTTTTAGATATC 3971

Alignment time is 4.91444 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    4670] =>      4670 nucs 'mol-32-1e7c-203336_4670'

Score:        4670
Aligned:      4670        nucs
Identic:      4670 (100%) nucs =>       105 (100%)      4565 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967901,83968005] EXCISED REGION [83968012,83972576]
 second seq =>  [       1,     105] EXCISED REGION [     106,    4670]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [83968006,83968011]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [83968006,83968020] to [83968012,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [83968006,83968008] to [83968009,83968011]
 second seq =>         0 nucs

 83967901 CAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCA 83967960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCA 60

 83967961 ACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 83968005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 105

EXCISED REGION

 83968012 TTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTGCT 83968071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      106 TTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTGCT 165

 83968072 TGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGGAA 83968131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      166 TGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGGAA 225

 83968132 ACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTTCA 83968191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      226 ACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTTCA 285

 83968192 AGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTTGG 83968251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      286 AGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTTGG 345

 83968252 ATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTTGA 83968311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      346 ATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTTGA 405

 83968312 AGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTTCA 83968371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      406 AGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTTCA 465

 83968372 ACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTATAT 83968431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      466 ACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTATAT 525

 83968432 TAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTGGA 83968491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      526 TAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTGGA 585

 83968492 TTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAATTC 83968551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      586 TTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAATTC 645

 83968552 TGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCCTG 83968611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      646 TGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCCTG 705

 83968612 GTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTTAG 83968671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      706 GTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTTAG 765

 83968672 CTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTTTT 83968731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      766 CTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTTTT 825

 83968732 CTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAATT 83968791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      826 CTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAATT 885

 83968792 AGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATTC 83968851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      886 AGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATTC 945

 83968852 TTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTGT 83968911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      946 TTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTGT 1005

 83968912 TGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATC 83968971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1006 TGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATC 1065

 83968972 TAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCT 83969031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 TAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCT 1125

 83969032 AGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATT 83969091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1126 AGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATT 1185

 83969092 TCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTC 83969151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1186 TCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTC 1245

 83969152 TCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAAT 83969211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1246 TCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAAT 1305

 83969212 AACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTG 83969271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1306 AACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTG 1365

 83969272 CTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCT 83969331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 CTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCT 1425

 83969332 CTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGT 83969391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 CTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGT 1485

 83969392 AGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACT 83969451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 AGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACT 1545

 83969452 ACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGCT 83969511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 ACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGCT 1605

 83969512 CATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACT 83969571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 CATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACT 1665

 83969572 TCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTC 83969631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 TCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTC 1725

 83969632 TAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGA 83969691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 TAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGA 1785

 83969692 ACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACC 83969751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 ACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACC 1845

 83969752 AAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAAT 83969811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 AAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAAT 1905

 83969812 GCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATA 83969871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 GCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATA 1965

 83969872 AAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTA 83969931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 AAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTA 2025

 83969932 GGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGATTA 83969991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 GGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGATTA 2085

 83969992 AGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAAC 83970051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 AGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAAC 2145

 83970052 CCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAAT 83970111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 CCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAAT 2205

 83970112 AAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGAA 83970171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 AAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGAA 2265

 83970172 CAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATATGT 83970231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 CAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATATGT 2325

 83970232 CTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAAA 83970291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 CTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAAA 2385

 83970292 AAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATAT 83970351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 AAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATAT 2445

 83970352 ACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAAA 83970411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 ACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAAA 2505

 83970412 TCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCAA 83970471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 TCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCAA 2565

 83970472 AAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGGG 83970531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 AAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGGG 2625

 83970532 AATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAAG 83970591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 AATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAAG 2685

 83970592 TAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAGT 83970651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 TAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAGT 2745

 83970652 CATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAG 83970711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 CATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAG 2805

 83970712 AATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATA 83970771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 AATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATA 2865

 83970772 TATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGT 83970831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 TATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGT 2925

 83970832 GACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAA 83970891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 GACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAA 2985

 83970892 ACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGA 83970951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 ACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGA 3045

 83970952 TACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTA 83971011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 TACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTA 3105

 83971012 CAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACC 83971071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 CAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACC 3165

 83971072 ACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAAT 83971131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 ACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAAT 3225

 83971132 AAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTA 83971191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 AAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTA 3285

 83971192 AGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGAT 83971251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 AGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGAT 3345

 83971252 CAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAG 83971311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 CAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAG 3405

 83971312 TTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAA 83971371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 TTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAA 3465

 83971372 AAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATAC 83971431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 AAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATAC 3525

 83971432 TACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGA 83971491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 TACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGA 3585

 83971492 AAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCATGA 83971551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 AAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCATGA 3645

 83971552 AGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAG 83971611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 AGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAG 3705

 83971612 TTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATT 83971671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 TTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATT 3765

 83971672 TAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAAT 83971731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 TAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAAT 3825

 83971732 ACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCT 83971791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 ACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCT 3885

 83971792 TGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAAT 83971851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 TGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAAT 3945

 83971852 ATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAA 83971911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 ATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAA 4005

 83971912 GTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTG 83971971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 GTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTG 4065

 83971972 GTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTAT 83972031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 GTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTAT 4125

 83972032 CCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGAT 83972091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 CCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGAT 4185

 83972092 TCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATT 83972151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4186 TCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATT 4245

 83972152 TAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAATTATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAA 83972211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4246 TAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAATTATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAA 4305

 83972212 CAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAATTCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACAT 83972271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4306 CAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAATTCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACAT 4365

 83972272 AGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATAGATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTA 83972331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4366 AGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATAGATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTA 4425

 83972332 ACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAAAAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAG 83972391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4426 ACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAAAAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAG 4485

 83972392 TAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATCATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGT 83972451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4486 TAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATCATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGT 4545

 83972452 GATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTGTTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATG 83972511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4546 GATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTGTTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATG 4605

 83972512 CCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTTAAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTAT 83972571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4606 CCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTTAAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTAT 4665

 83972572 TTTGC 83972576
          |||||
     4666 TTTGC 4670

Alignment time is 4.05731 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2596] =>      2596 nucs 'mol-32-1e87-062607_2596'

Score:        2596
Aligned:      2596        nucs
Identic:      2596 (100%) nucs =>      1122 (100%)      1474 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83966796,83967917] EXCISED REGION [83970684,83972157]
 second seq =>  [       1,    1122] EXCISED REGION [    1123,    2596]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83966796 AAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAG 83966855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAG 60

 83966856 GAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAAC 83966915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAAC 120

 83966916 TTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTA 83966975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTA 180

 83966976 GATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTT 83967035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTT 240

 83967036 CACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATG 83967095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATG 300

 83967096 GAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAA 83967155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAA 360

 83967156 ACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATC 83967215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATC 420

 83967216 AGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTT 83967275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTT 480

 83967276 AGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTG 83967335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTG 540

 83967336 TTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACAC 83967395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACAC 600

 83967396 AGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCT 83967455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCT 660

 83967456 GGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGA 83967515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGA 720

 83967516 AACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATT 83967575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATT 780

 83967576 TCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGAT 83967635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGAT 840

 83967636 AGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCA 83967695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCA 900

 83967696 ATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAA 83967755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAA 960

 83967756 ACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAG 83967815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAG 1020

 83967816 AAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATAC 83967875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATAC 1080

 83967876 CAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 1122

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 1182

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1183 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 1242

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 1302

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 1362

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 1422

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 1482

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 1542

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 1602

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 1662

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 1722

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 1782

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 1842

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 1902

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 1962

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 2022

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 2082

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 2142

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 2202

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 2262

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 2322

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 2382

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 83972003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 2442

 83972004 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 83972063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 2502

 83972064 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 83972123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 2562

 83972124 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGC 83972157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGC 2596

Alignment time is 2.15764 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3024] =>      3024 nucs 'mol-32-1f0b-147945_3024'

Score:        3024
Aligned:      3024        nucs
Identic:      3024 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83968945,83971968]
 second seq =>  [       1,    3024]

 83968945 GCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTA 83969004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTA 60

 83969005 TTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCA 83969064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCA 120

 83969065 TACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCA 83969124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCA 180

 83969125 TTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGT 83969184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGT 240

 83969185 GTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATT 83969244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATT 300

 83969245 TTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGG 83969304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGG 360

 83969305 GTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAG 83969364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAG 420

 83969365 TTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTA 83969424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTA 480

 83969425 CCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACA 83969484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACA 540

 83969485 CAAACAAATGGAAACACATCCCATGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGA 83969544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAACAAATGGAAACACATCCCATGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGA 600

 83969545 CCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCAT 83969604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCAT 660

 83969605 TCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGA 83969664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGA 720

 83969665 TAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCA 83969724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCA 780

 83969725 AACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCAC 83969784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCAC 840

 83969785 GTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTG 83969844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTG 900

 83969845 ATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGT 83969904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGT 960

 83969905 GCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTT 83969964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTT 1020

 83969965 CTACTAAAATCAACTCAAGATGGATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAA 83970024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTACTAAAATCAACTCAAGATGGATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAA 1080

 83970025 AATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCAT 83970084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCAT 1140

 83970085 GACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAA 83970144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAA 1200

 83970145 ACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGC 83970204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGC 1260

 83970205 GTGAGAAAATCTTCACAATCTATATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACA 83970264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGAGAAAATCTTCACAATCTATATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACA 1320

 83970265 AATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACAT 83970324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACAT 1380

 83970325 GAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAA 83970384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAA 1440

 83970385 CATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCT 83970444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCT 1500

 83970445 GAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAAC 83970504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAAC 1560

 83970505 AGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAG 83970564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAG 1620

 83970565 TGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTAC 83970624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTAC 1680

 83970625 TGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGT 83970684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGT 1740

 83970685 TTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCA 83970744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCA 1800

 83970745 ATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAA 83970804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAA 1860

 83970805 AAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAG 83970864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAG 1920

 83970865 TGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGC 83970924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGC 1980

 83970925 CATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGT 83970984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGT 2040

 83970985 GGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAAT 83971044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAAT 2100

 83971045 GGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCAC 83971104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCAC 2160

 83971105 CGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCA 83971164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCA 2220

 83971165 AATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAA 83971224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAA 2280

 83971225 AATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAAC 83971284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAAC 2340

 83971285 AATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACA 83971344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACA 2400

 83971345 AACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGA 83971404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGA 2460

 83971405 TGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAA 83971464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAA 2520

 83971465 TGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATAC 83971524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATAC 2580

 83971525 ACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATG 83971584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATG 2640

 83971585 CAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGT 83971644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGT 2700

 83971645 CTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACT 83971704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACT 2760

 83971705 GTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAA 83971764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAA 2820

 83971765 TATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAAT 83971824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAAT 2880

 83971825 TTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATT 83971884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATT 2940

 83971885 TGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTA 83971944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTA 3000

 83971945 ATAATTAGGTTGTTTGTTCACATA 83971968
          ||||||||||||||||||||||||
     3001 ATAATTAGGTTGTTTGTTCACATA 3024

Alignment time is 2.15159 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    6907] =>      6907 nucs 'mol-32-1f0b-229348_6907'

Score:        6907
Aligned:      6907        nucs
Identic:      6907 (100%) nucs =>      4587 (100%)      2320 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83963419,83968005] EXCISED REGION [83968008,83970327]
 second seq =>  [       1,    4587] EXCISED REGION [    4588,    6907]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [83968006,83968007]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [83968006,83968024] to [83968008,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83968006,83968006] to [83968007,83968007]
 second seq =>         0 nucs

 83963419 GTATTCTGGATATTAGCATTTGTTGGATGAATAGTTTGCAAATATTTGTTCCCATTCTAC 83963478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTATTCTGGATATTAGCATTTGTTGGATGAATAGTTTGCAAATATTTGTTCCCATTCTAC 60

 83963479 AGGTTGTCTCTTCACTCTGTTGATTGCTTCCTTGCTGTGCAGAAGATTTTTGGTGTAATA 83963538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTTGTCTCTTCACTCTGTTGATTGCTTCCTTGCTGTGCAGAAGATTTTTGGTGTAATA 120

 83963539 TAATTCAGTTTGTCTATTTCTTCAAGGAGGACTACAAACCACTGCTCAAGGAAATAAGAG 83963598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATTCAGTTTGTCTATTTCTTCAAGGAGGACTACAAACCACTGCTCAAGGAAATAAGAG 180

 83963599 AGGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATGAGAAAGAATCAATATCATG 83963658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATGAGAAAGAATCAATATCATG 240

 83963659 AAAATGGCCATACTGCCCAAAGTAATTTATAGATTTAATGCTATCGCCATCAAGATACTA 83963718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAATGGCCATACTGCCCAAAGTAATTTATAGATTTAATGCTATCGCCATCAAGATACTA 300

 83963719 TTGACTTTCTTCAAAGAATTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATGGAACCAAAAAAGA 83963778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGACTTTCTTCAAAGAATTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATGGAACCAAAAAAGA 360

 83963779 GCCTGTATAGCCAAGACAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACGTTACCT 83963838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCTGTATAGCCAAGACAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACGTTACCT 420

 83963839 GACTTCAAATATACAAGCCTACAGTAACCAAAACCGCATGGTACTGGTAGGATGTTGAAT 83963898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACTTCAAATATACAAGCCTACAGTAACCAAAACCGCATGGTACTGGTAGGATGTTGAAT 480

 83963899 TTTATCAAATCCCTTTTTTTTTTTTTTTGGTCTATTGAGATGTTCATATGATTTTTGTCT 83963958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTATCAAATCCCTTTTTTTTTTTTTTTGGTCTATTGAGATGTTCATATGATTTTTGTCT 540

 83963959 TTCTTTCTGTTGAGGTGATATATTTATTGATTTGTGTGTGTTCAGTCATCATCCTTGCGT 83964018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTTTCTGTTGAGGTGATATATTTATTGATTTGTGTGTGTTCAGTCATCATCCTTGCGT 600

 83964019 CCCTGGGATAATCCCACTTAGTCATGTTGAGGTGTTGCTGGATTTAGTTTGCTAGTATTT 83964078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCTGGGATAATCCCACTTAGTCATGTTGAGGTGTTGCTGGATTTAGTTTGCTAGTATTT 660

 83964079 TGTAGAGGATTTTTGCATCTATGTTTATCAGGGATACTGGCAGACAGTTTTTCTTGTTGT 83964138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTAGAGGATTTTTGCATCTATGTTTATCAGGGATACTGGCAGACAGTTTTTCTTGTTGT 720

 83964139 TATCTGTTATGTCCTTGTCTGGTTTTGGTATTAGGGTCATTTTGGCCTCATATAATGCGT 83964198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATCTGTTATGTCCTTGTCTGGTTTTGGTATTAGGGTCATTTTGGCCTCATATAATGCGT 780

 83964199 CAGGAAGAGTTCACTCCCTTTCAATGTTTTGGGATAGTATGAGAAGAATCAGTGTTAATT 83964258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGGAAGAGTTCACTCCCTTTCAATGTTTTGGGATAGTATGAGAAGAATCAGTGTTAATT 840

 83964259 CTTTTTATAAGTTTGGTAGAATTAGCTGACTCTGAGCACAGTGCCTAGGGGTTAACACTG 83964318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTTTTATAAGTTTGGTAGAATTAGCTGACTCTGAGCACAGTGCCTAGGGGTTAACACTG 900

 83964319 CTCTGCAAGGAAGAGGTTAAAAAAAAAGTTTGATAGAATTAAGCAGTAAAGCCACCAGGT 83964378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCTGCAAGGAAGAGGTTAAAAAAAAAGTTTGATAGAATTAAGCAGTAAAGCCACCAGGT 960

 83964379 CCTGGGCTTTTCTTTGCTGGGAAACATTTTATTAATGTTATTAATATCAATATTATTATT 83964438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTGGGCTTTTCTTTGCTGGGAAACATTTTATTAATGTTATTAATATCAATATTATTATT 1020

 83964439 TACTATTAATCTGTTCAGGTTTTCTATTTTTTTTTTTTATTCAATCTTGGTAGGTTGTAC 83964498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACTATTAATCTGTTCAGGTTTTCTATTTTTTTTTTTTATTCAATCTTGGTAGGTTGTAC 1080

 83964499 CTCTCCAGAAATTTATCCATCTCCTCTAGGTTTTCTAATTTGTTAGTGTATAACAAAAAA 83964558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCTCCAGAAATTTATCCATCTCCTCTAGGTTTTCTAATTTGTTAGTGTATAACAAAAAA 1140

 83964559 TATTGAAAGTTTAGAACACTGAATGCTTGGCTGTGGCAGATCTGTTCAGCCAAGATCGGG 83964618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATTGAAAGTTTAGAACACTGAATGCTTGGCTGTGGCAGATCTGTTCAGCCAAGATCGGG 1200

 83964619 ACTACTTCAGCTGGCTCTGAGGGTTCAAAGGAGTCTGAGAAGCAAAAATCTTAGTGAACC 83964678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTACTTCAGCTGGCTCTGAGGGTTCAAAGGAGTCTGAGAAGCAAAAATCTTAGTGAACC 1260

 83964679 TCTACCTAGATGTCCCCATCACATGTTAGCTACACCTTTTCCCCACCACGTCCCTGACCT 83964738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTACCTAGATGTCCCCATCACATGTTAGCTACACCTTTTCCCCACCACGTCCCTGACCT 1320

 83964739 CAACTTTACAGACCTACCTCCCCTTGGTTCAGAAATTATGCTGAGTGAGCTTAGGAGAAA 83964798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAACTTTACAGACCTACCTCCCCTTGGTTCAGAAATTATGCTGAGTGAGCTTAGGAGAAA 1380

 83964799 CTATATTGAAATTCATTGCTCAAAATATACACCTGAACTCAAAAATTTCAAAAAGTGCCA 83964858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTATATTGAAATTCATTGCTCAAAATATACACCTGAACTCAAAAATTTCAAAAAGTGCCA 1440

 83964859 TAGATGGACATAACCAACATTACAAGCAAATTTATCTAAAAGTGTATTTGTTACAGTGTT 83964918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAGATGGACATAACCAACATTACAAGCAAATTTATCTAAAAGTGTATTTGTTACAGTGTT 1500

 83964919 GTCTAAAATTTAAAAAAAATTGAAAACAACCAAAATGTCCAAAACTAGGAAGCTGATTAA 83964978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCTAAAATTTAAAAAAAATTGAAAACAACCAAAATGTCCAAAACTAGGAAGCTGATTAA 1560

 83964979 GTCAACTGTAATATCCATTCCAAAGGATACAGAGCTATCAGGAAAATTTATGTTTTACAA 83965038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCAACTGTAATATCCATTCCAAAGGATACAGAGCTATCAGGAAAATTTATGTTTTACAA 1620

 83965039 GTAAACATAAATAGTGATATAGAACATTGCTCATTATCTATTGTTTAACAGAAATTTCAG 83965098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTAAACATAAATAGTGATATAGAACATTGCTCATTATCTATTGTTTAACAGAAATTTCAG 1680

 83965099 GTTACAAATTGGATTATCCCACTTTTATTTTATATATATATATATATATATTCAAACATA 83965158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTACAAATTGGATTATCCCACTTTTATTTTATATATATATATATATATATTCAAACATA 1740

 83965159 TTTATAAAAGCCATGAAAATTTACACAAAAAATGTTAATAATTGTTAGGTCTAAATAGTG 83965218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTATAAAAGCCATGAAAATTTACACAAAAAATGTTAATAATTGTTAGGTCTAAATAGTG 1800

 83965219 TAATAATGCATAAATTTTTTCTTCTACTATAAATTGTATTATAAGTAAAATAATAAAAAT 83965278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAATAATGCATAAATTTTTTCTTCTACTATAAATTGTATTATAAGTAAAATAATAAAAAT 1860

 83965279 GCCTTTGGCATGGGAGCAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCCTACACTGTTCATGCCCCC 83965338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCCTTTGGCATGGGAGCAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCCTACACTGTTCATGCCCCC 1920

 83965339 CACTGGAACACCAAATTTTACCAACTATCTGCATACAGAAAAGTACCATCACACAAAAAA 83965398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACTGGAACACCAAATTTTACCAACTATCTGCATACAGAAAAGTACCATCACACAAAAAA 1980

 83965399 ACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACTTCGTATCACTATAAGAGG 83965458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACTTCGTATCACTATAAGAGG 2040

 83965459 TGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACCATACCTCCCCCATCCCCT 83965518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACCATACCTCCCCCATCCCCT 2100

 83965519 GGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGGAGGGAGAGTGCAGGG 83965578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGGAGGGAGAGTGCAGGG 2160

 83965579 ACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGTGGAGAATAAAGCTGTGTTG 83965638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGTGGAGAATAAAGCTGTGTTG 2220

 83965639 GGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAGAGCAGACTTGATCAA 83965698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAGAGCAGACTTGATCAA 2280

 83965699 GCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATCCACAATCAGAGGAGT 83965758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATCCACAATCAGAGGAGT 2340

 83965759 CCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATATAGAAAATAGGCTCA 83965818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATATAGAAAATAGGCTCA 2400

 83965819 AAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGAAAGAGATAGAAGTAG 83965878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGAAAGAGATAGAAGTAG 2460

 83965879 AAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATACCTAGATAAAGATATCAATA 83965938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATACCTAGATAAAGATATCAATA 2520

 83965939 TTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAAGAAGACTACTTCTA 83965998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAAGAAGACTACTTCTA 2580

 83965999 GACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGATACTAAAATCATCAA 83966058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGATACTAAAATCATCAA 2640

 83966059 GAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGA 83966118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGA 2700

 83966119 AACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACAT 83966178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACAT 2760

 83966179 TTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGAT 83966238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGAT 2820

 83966239 CTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAAT 83966298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAAT 2880

 83966299 GCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAAT 83966358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAAT 2940

 83966359 CATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGG 83966418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGG 3000

 83966419 CACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAA 83966478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAA 3060

 83966479 CGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAA 83966538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAA 3120

 83966539 ATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAA 83966598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAA 3180

 83966599 CCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTT 83966658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTT 3240

 83966659 GGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAA 83966718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAA 3300

 83966719 AAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAA 83966778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAA 3360

 83966779 ATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGAC 83966838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGAC 3420

 83966839 AGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAG 83966898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAG 3480

 83966899 CAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAA 83966958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAA 3540

 83966959 TCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGC 83967018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGC 3600

 83967019 CTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAA 83967078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAA 3660

 83967079 AAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAA 83967138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAA 3720

 83967139 AATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAA 83967198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAA 3780

 83967199 GGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTT 83967258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTT 3840

 83967259 CATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAG 83967318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAG 3900

 83967319 AAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAA 83967378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAA 3960

 83967379 GATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACC 83967438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACC 4020

 83967439 CCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGA 83967498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGA 4080

 83967499 CAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACA 83967558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACA 4140

 83967559 GATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGT 83967618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGT 4200

 83967619 GGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAA 83967678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAA 4260

 83967679 AAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAA 83967738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAA 4320

 83967739 TGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGA 83967798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGA 4380

 83967799 CCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATC 83967858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATC 4440

 83967859 ATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAAT 83967918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAAT 4500

 83967919 TTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATA 83967978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATA 4560

 83967979 TTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 83968005
          |||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 4587

EXCISED REGION

 83968008 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTC 83968067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTC 4647

 83968068 TGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCT 83968127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 TGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCT 4707

 83968128 GGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTT 83968187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 GGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTT 4767

 83968188 TTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGAT 83968247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 TTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGAT 4827

 83968248 TTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATG 83968307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 TTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATG 4887

 83968308 TTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTT 83968367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 TTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTT 4947

 83968368 TTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATT 83968427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 TTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATT 5007

 83968428 ATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGC 83968487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 ATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGC 5067

 83968488 TGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTA 83968547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 TGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTA 5127

 83968548 ATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATC 83968607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5128 ATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATC 5187

 83968608 CCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTG 83968667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 CCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTG 5247

 83968668 TTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGG 83968727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 TTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGG 5307

 83968728 TTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATG 83968787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 TTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATG 5367

 83968788 AATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCA 83968847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5368 AATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCA 5427

 83968848 ATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTT 83968907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5428 ATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTT 5487

 83968908 TTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGG 83968967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5488 TTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGG 5547

 83968968 TATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTC 83969027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5548 TATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTC 5607

 83969028 TCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTG 83969087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5608 TCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTG 5667

 83969088 TATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGAT 83969147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5668 TATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGAT 5727

 83969148 TTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTC 83969207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5728 TTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTC 5787

 83969208 AAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGT 83969267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5788 AAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGT 5847

 83969268 TCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGT 83969327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5848 TCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGT 5907

 83969328 TTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTG 83969387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5908 TTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTG 5967

 83969388 ATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAA 83969447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5968 ATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAA 6027

 83969448 AACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCA 83969507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6028 AACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCA 6087

 83969508 TGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTAC 83969567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6088 TGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTAC 6147

 83969568 AACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACA 83969627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6148 AACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACA 6207

 83969628 ATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAA 83969687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6208 ATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAA 6267

 83969688 AAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTC 83969747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6268 AAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTC 6327

 83969748 AACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGA 83969807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6328 AACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGA 6387

 83969808 CAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAA 83969867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6388 CAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAA 6447

 83969868 CATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACA 83969927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6448 CATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACA 6507

 83969928 TGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGG 83969987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6508 TGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGG 6567

 83969988 ATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAA 83970047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6568 ATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAA 6627

 83970048 AAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATG 83970107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6628 AAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATG 6687

 83970108 CAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAA 83970167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6688 CAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAA 6747

 83970168 GGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTAT 83970227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6748 GGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTAT 6807

 83970228 ATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAA 83970287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6808 ATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAA 6867

 83970288 AAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAA 83970327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6868 AAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAA 6907

Alignment time is 6.07386 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    5118] =>      5118 nucs 'mol-32-2218-008559_5118'

Score:        5118
Aligned:      5118        nucs
Identic:      5118 (100%) nucs =>      3072 (100%)      2046 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83964934,83968005] EXCISED REGION [83968008,83970053]
 second seq =>  [       1,    3072] EXCISED REGION [    3073,    5118]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [83968006,83968007]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [83968006,83968024] to [83968008,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83968006,83968006] to [83968007,83968007]
 second seq =>         0 nucs

 83964934 AAAATTGAAAACAACCAAAATGTCCAAAACTAGGAAGCTGATTAAGTCAACTGTAATATC 83964993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAATTGAAAACAACCAAAATGTCCAAAACTAGGAAGCTGATTAAGTCAACTGTAATATC 60

 83964994 CATTCCAAAGGATACAGAGCTATCAGGAAAATTTATGTTTTACAAGTAAACATAAATAGT 83965053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTCCAAAGGATACAGAGCTATCAGGAAAATTTATGTTTTACAAGTAAACATAAATAGT 120

 83965054 GATATAGAACATTGCTCATTATCTATTGTTTAACAGAAATTTCAGGTTACAAATTGGATT 83965113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATATAGAACATTGCTCATTATCTATTGTTTAACAGAAATTTCAGGTTACAAATTGGATT 180

 83965114 ATCCCACTTTTATTTTATATATATATATATATATATTCAAACATATTTATAAAAGCCATG 83965173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCCCACTTTTATTTTATATATATATATATATATATTCAAACATATTTATAAAAGCCATG 240

 83965174 AAAATTTACACAAAAAATGTTAATAATTGTTAGGTCTAAATAGTGTAATAATGCATAAAT 83965233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAATTTACACAAAAAATGTTAATAATTGTTAGGTCTAAATAGTGTAATAATGCATAAAT 300

 83965234 TTTTTCTTCTACTATAAATTGTATTATAAGTAAAATAATAAAAATGCCTTTGGCATGGGA 83965293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTCTTCTACTATAAATTGTATTATAAGTAAAATAATAAAAATGCCTTTGGCATGGGA 360

 83965294 GCAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCCTACACTGTTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAA 83965353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCCTACACTGTTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAA 420

 83965354 TTTTACCAACTATCTGCATACAGAAAAGTACCATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGAT 83965413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTACCAACTATCTGCATACAGAAAAGTACCATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGAT 480

 83965414 AAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACTTCGTATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAG 83965473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACTTCGTATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAG 540

 83965474 GAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACCATACCTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTG 83965533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACCATACCTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTG 600

 83965534 GTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGGAGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACAC 83965593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGGAGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACAC 660

 83965594 TGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGTGGAGAATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATT 83965653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGTGGAGAATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATT 720

 83965654 CGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAGAGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATT 83965713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAGAGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATT 780

 83965714 AGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATCCACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAA 83965773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATCCACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAA 840

 83965774 TAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATATAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAA 83965833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATATAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAA 900

 83965834 GAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGAAAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAG 83965893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGAAAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAG 960

 83965894 GGATAATAACAGAGAACTTCCCATACCTAGATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAG 83965953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGATAATAACAGAGAACTTCCCATACCTAGATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAG 1020

 83965954 GTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCA 83966013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCA 1080

 83966014 AACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAAC 83966073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAAC 1140

 83966074 ATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAA 83966133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAA 1200

 83966134 AAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGC 83966193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGC 1260

 83966194 ATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACA 83966253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACA 1320

 83966254 AAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCT 83966313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCT 1380

 83966314 TCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTG 83966373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTG 1440

 83966374 ACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGG 83966433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGG 1500

 83966434 TAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAAC 83966493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAAC 1560

 83966494 CACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACA 83966553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACA 1620

 83966554 ACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAG 83966613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAG 1680

 83966614 CGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGT 83966673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGT 1740

 83966674 TTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCC 83966733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCC 1800

 83966734 TTATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAA 83966793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAA 1860

 83966794 TTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAA 83966853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAA 1920

 83966854 AGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCA 83966913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCA 1980

 83966914 ACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAG 83966973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAG 2040

 83966974 TAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACAT 83967033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACAT 2100

 83967034 TTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAA 83967093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAA 2160

 83967094 TGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGAC 83967153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGAC 2220

 83967154 AAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCA 83967213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCA 2280

 83967214 TCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCT 83967273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCT 2340

 83967274 TTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGAC 83967333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGAC 2400

 83967334 TGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAAC 83967393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAAC 2460

 83967394 ACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAG 83967453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAG 2520

 83967454 CTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAA 83967513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAA 2580

 83967514 GAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACA 83967573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACA 2640

 83967574 TTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGG 83967633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGG 2700

 83967634 ATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATAT 83967693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATAT 2760

 83967694 CAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGG 83967753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGG 2820

 83967754 AAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGA 83967813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGA 2880

 83967814 AGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACAT 83967873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACAT 2940

 83967874 ACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTG 83967933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTG 3000

 83967934 CCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGT 83967993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGT 3060

 83967994 TTGTTTGATTGA 83968005
          ||||||||||||
     3061 TTGTTTGATTGA 3072

EXCISED REGION

 83968008 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTC 83968067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTC 3132

 83968068 TGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCT 83968127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 TGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCT 3192

 83968128 GGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTT 83968187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 GGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTT 3252

 83968188 TTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGAT 83968247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 TTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGAT 3312

 83968248 TTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATG 83968307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 TTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATG 3372

 83968308 TTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTT 83968367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 TTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTT 3432

 83968368 TTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATT 83968427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 TTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATT 3492

 83968428 ATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGC 83968487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 ATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGC 3552

 83968488 TGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTA 83968547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 TGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTA 3612

 83968548 ATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATC 83968607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 ATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATC 3672

 83968608 CCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTG 83968667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 CCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTG 3732

 83968668 TTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGG 83968727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 TTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGG 3792

 83968728 TTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATG 83968787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 TTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATG 3852

 83968788 AATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCA 83968847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 AATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCA 3912

 83968848 ATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTT 83968907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 ATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTT 3972

 83968908 TTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGG 83968967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3973 TTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGG 4032

 83968968 TATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTC 83969027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 TATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTC 4092

 83969028 TCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTG 83969087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4093 TCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTG 4152

 83969088 TATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGAT 83969147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4153 TATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGAT 4212

 83969148 TTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTC 83969207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4213 TTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTC 4272

 83969208 AAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGT 83969267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4273 AAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGT 4332

 83969268 TCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGT 83969327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4333 TCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGT 4392

 83969328 TTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTG 83969387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4393 TTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTG 4452

 83969388 ATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAA 83969447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4453 ATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAA 4512

 83969448 AACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCA 83969507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4513 AACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCA 4572

 83969508 TGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTAC 83969567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4573 TGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTAC 4632

 83969568 AACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACA 83969627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4633 AACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACA 4692

 83969628 ATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAA 83969687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4693 ATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAA 4752

 83969688 AAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTC 83969747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4753 AAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTC 4812

 83969748 AACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGA 83969807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4813 AACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGA 4872

 83969808 CAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAA 83969867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4873 CAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAA 4932

 83969868 CATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACA 83969927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4933 CATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACA 4992

 83969928 TGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGG 83969987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4993 TGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGG 5052

 83969988 ATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAA 83970047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5053 ATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAA 5112

 83970048 AAACCC 83970053
          ||||||
     5113 AAACCC 5118

Alignment time is 4.13033 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3908] =>      3908 nucs 'mol-32-229c-027727_3908'

Score:        3908
Aligned:      3908        nucs
Identic:      3908 (100%) nucs =>       206 (100%)      3702 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967712,83967917] EXCISED REGION [83970684,83974385]
 second seq =>  [       1,     206] EXCISED REGION [     207,    3908]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83967712 CAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATG 83967771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATG 60

 83967772 AAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAAT 83967831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAAT 120

 83967832 TGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATA 83967891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATA 180

 83967892 CAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          ||||||||||||||||||||||||||
      181 CAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 206

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      207 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 266

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      267 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 326

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      327 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 386

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      387 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 446

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      447 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 506

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      507 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 566

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      567 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 626

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      627 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 686

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      687 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 746

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 806

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 866

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 926

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 986

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 1046

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 1106

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 1166

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 1226

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 1286

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 1346

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 1406

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 1466

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 83972003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 1526

 83972004 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 83972063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 1586

 83972064 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 83972123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 1646

 83972124 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 83972183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 1706

 83972184 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 83972243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 1766

 83972244 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 83972303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 1826

 83972304 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 83972363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 1886

 83972364 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATC 83972423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATC 1946

 83972424 ATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTG 83972483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 ATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTG 2006

 83972484 TTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTT 83972543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 TTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTT 2066

 83972544 AAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCA 83972603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 AAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCA 2126

 83972604 AAAAATAGAGTAGTGAAATAAACCCTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAG 83972663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 AAAAATAGAGTAGTGAAATAAACCCTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAG 2186

 83972664 TCCAGACAGACTTATTACATCTTTAGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTG 83972723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 TCCAGACAGACTTATTACATCTTTAGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTG 2246

 83972724 AAATAAATTCTAAACAATGCAACATTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAA 83972783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 AAATAAATTCTAAACAATGCAACATTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAA 2306

 83972784 GATAAGAATTCTTTCATAAAGCATAACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAA 83972843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 GATAAGAATTCTTTCATAAAGCATAACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAA 2366

 83972844 TATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTTGTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAA 83972903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 TATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTTGTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAA 2426

 83972904 TACGATTCAAACAAGATCACATTGCATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTA 83972963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 TACGATTCAAACAAGATCACATTGCATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTA 2486

 83972964 TGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTTCTTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTG 83973023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 TGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTTCTTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTG 2546

 83973024 TCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTGAATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACA 83973083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 TCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTGAATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACA 2606

 83973084 CGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCCTGAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTG 83973143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 CGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCCTGAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTG 2666

 83973144 AGCAGATTCAAATTGAATTTTTCAGTAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATC 83973203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 AGCAGATTCAAATTGAATTTTTCAGTAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATC 2726

 83973204 ATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGTATCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCC 83973263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 ATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGTATCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCC 2786

 83973264 TGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCG 83973323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 TGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCG 2846

 83973324 CGCACCTATAATCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAG 83973383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 CGCACCTATAATCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAG 2906

 83973384 GCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAA 83973443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 GCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAA 2966

 83973444 AACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAATTGATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCAT 83973503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 AACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAATTGATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCAT 3026

 83973504 TCCTTAGGAATTTCTTTACCTAATGGTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCA 83973563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 TCCTTAGGAATTTCTTTACCTAATGGTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCA 3086

 83973564 TTACATTTTTAGGGGTTGCAAATGGCATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAA 83973623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 TTACATTTTTAGGGGTTGCAAATGGCATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAA 3146

 83973624 TAATTAATAATCTGTAACGCATCTATAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTC 83973683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 TAATTAATAATCTGTAACGCATCTATAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTC 3206

 83973684 CACTTAGATGAAATAATGAAAAAGGTGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTAT 83973743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 CACTTAGATGAAATAATGAAAAAGGTGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTAT 3266

 83973744 CCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTGTCTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCC 83973803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 CCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTGTCTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCC 3326

 83973804 AGAAATATTTGAAAGGGAATGGGTTTGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAAC 83973863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 AGAAATATTTGAAAGGGAATGGGTTTGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAAC 3386

 83973864 AGAGAACATGCCCTAATGAAATTTAAGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCA 83973923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 AGAGAACATGCCCTAATGAAATTTAAGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCA 3446

 83973924 CAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATTAAAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAA 83973983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 CAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATTAAAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAA 3506

 83973984 CAGGGAAGTTTAAATTATATAATAAATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAA 83974043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 CAGGGAAGTTTAAATTATATAATAAATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAA 3566

 83974044 AGGTTCTATCATCCTTATATGTTATGCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAAT 83974103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 AGGTTCTATCATCCTTATATGTTATGCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAAT 3626

 83974104 AAAATCAAAGAAGCACAGAAAACTAGTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGA 83974163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 AAAATCAAAGAAGCACAGAAAACTAGTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGA 3686

 83974164 AGCATAACAATAAAGAAAAAACTATTCTAAAAAATGATATTTTTATTTTATAAAAATACA 83974223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 AGCATAACAATAAAGAAAAAACTATTCTAAAAAATGATATTTTTATTTTATAAAAATACA 3746

 83974224 CAAATTTTAATAAGTTGGTCAATCCTAACATAAAAGGTAAATGACAACTTGAAAAAAATT 83974283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 CAAATTTTAATAAGTTGGTCAATCCTAACATAAAAGGTAAATGACAACTTGAAAAAAATT 3806

 83974284 ACATAAAATATTCTCAATATATAAGAAGCTCTTCCAGGCAAGCCCATTCATAGTAAAATA 83974343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 ACATAAAATATTCTCAATATATAAGAAGCTCTTCCAGGCAAGCCCATTCATAGTAAAATA 3866

 83974344 AAATGCTCAAAAAATGATGAAACACATGCAAATTAAAACACA 83974385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 AAATGCTCAAAAAATGATGAAACACATGCAAATTAAAACACA 3908

Alignment time is 3.22136 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3183] =>      3183 nucs 'mol-32-22de-015957_3183'

Score:        3183
Aligned:      3183        nucs
Identic:      3183 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967481,83970663]
 second seq =>  [       1,    3183]

 83967481 CTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATA 83967540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATA 60

 83967541 AAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACA 83967600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACA 120

 83967601 TTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCA 83967660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCA 180

 83967661 AGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAAC 83967720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAAC 240

 83967721 AGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAA 83967780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAA 300

 83967781 CAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAAT 83967840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAAT 360

 83967841 TTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAG 83967900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAG 420

 83967901 CAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCA 83967960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCA 480

 83967961 ACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGATTTTTTTTTTTTTTT 83968020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGATTTTTTTTTTTTTTT 540

 83968021 TTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTGCTTGGTCGTTG 83968080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTGCTTGGTCGTTG 600

 83968081 TTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGGAAACTTTGCTG 83968140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGGAAACTTTGCTG 660

 83968141 AATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTTCAAGGTAAACA 83968200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTTCAAGGTAAACA 720

 83968201 ATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTTGGATGCCCTTT 83968260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTTGGATGCCCTTT 780

 83968261 ATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTTGAAGAGGTGTG 83968320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTTGAAGAGGTGTG 840

 83968321 GTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTTCAACTTTTCCC 83968380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTTCAACTTTTCCC 900

 83968381 TATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTATATTAAGGTATG 83968440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTATATTAAGGTATG 960

 83968441 TCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTGGATTTTGTCAA 83968500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTGGATTTTGTCAA 1020

 83968501 ATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAATTCTGTTTATGT 83968560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAATTCTGTTTATGT 1080

 83968561 GGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCCTGGTATGAAAC 83968620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCCTGGTATGAAAC 1140

 83968621 CCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTTAGCTAGTATTT 83968680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTTAGCTAGTATTT 1200

 83968681 CGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTTTTCTTTGTTAT 83968740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTTTTCTTTGTTAT 1260

 83968741 GGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAATTAGGGAAGGT 83968800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAATTAGGGAAGGT 1320

 83968801 TCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATTCTTCTTTGAA 83968860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATTCTTCTTTGAA 1380

 83968861 TGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTGTTGGTAATTT 83968920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTGTTGGTAATTT 1440

 83968921 TTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATCTAATTCTTC 83968980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATCTAATTCTTC 1500

 83968981 CTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCTAGGTTTTCT 83969040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCTAGGTTTTCT 1560

 83969041 AGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATTTCAGTGGTG 83969100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATTTCAGTGGTG 1620

 83969101 TCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTT 83969160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTT 1680

 83969161 TTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAATAACCAGATT 83969220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAATAACCAGATT 1740

 83969221 TTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTGCTCTGATCT 83969280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTGCTCTGATCT 1800

 83969281 TGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCT 83969340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCT 1860

 83969341 TGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTA 83969400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTA 1920

 83969401 GGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACTACAAAACAC 83969460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACTACAAAACAC 1980

 83969461 TGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGCTCATGGATGG 83969520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGCTCATGGATGG 2040

 83969521 GTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACTTCAATGCAA 83969580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACTTCAATGCAA 2100

 83969581 TCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTCTAAAATTCA 83969640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTCTAAAATTCA 2160

 83969641 TATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGAACAAATCTG 83969700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGAACAAATCTG 2220

 83969701 GAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACCAAAACAGCA 83969760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACCAAAACAGCA 2280

 83969761 TGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAATGCAGAAATA 83969820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAATGCAGAAATA 2340

 83969821 AACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATAAAGTGGGGA 83969880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATAAAGTGGGGA 2400

 83969881 AAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTAGGAGAATGA 83969940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTAGGAGAATGA 2460

 83969941 AACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGATTAAGGACTTAA 83970000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGATTAAGGACTTAA 2520

 83970001 ACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAACCCTTTTAGA 83970060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAACCCTTTTAGA 2580

 83970061 TATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAATAAAAACAAA 83970120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAATAAAAACAAA 2640

 83970121 GATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGAACAGTCAACA 83970180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGAACAGTCAACA 2700

 83970181 GAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATATGTCTGACAAAG 83970240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATATGTCTGACAAAG 2760

 83970241 GAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAAAAAGCAGTCT 83970300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAAAAAGCAGTCT 2820

 83970301 CATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGT 83970360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGT 2880

 83970361 CAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAAATCAAAATGA 83970420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAAATCAAAATGA 2940

 83970421 CAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCAAAAAATAGTA 83970480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCAAAAAATAGTA 3000

 83970481 GATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGGGAATGTAAAC 83970540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGGGAATGTAAAC 3060

 83970541 TAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAAGTAGAACTAC 83970600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAAGTAGAACTAC 3120

 83970601 CATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAGTCATTATTTG 83970660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAGTCATTATTTG 3180

 83970661 AAA 83970663
          |||
     3181 AAA 3183

Alignment time is 2.28891 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    5123] =>      5123 nucs 'mol-32-2383-004046_5123'

Score:        5123
Aligned:      5123        nucs
Identic:      5123 (100%) nucs =>      1234 (100%)      3889 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83966772,83968005] EXCISED REGION [83968008,83971896]
 second seq =>  [       1,    1234] EXCISED REGION [    1235,    5123]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [83968006,83968007]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [83968006,83968024] to [83968008,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83968006,83968006] to [83968007,83968007]
 second seq =>         0 nucs

 83966772 ACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAA 83966831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAA 60

 83966832 GGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAAC 83966891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAAC 120

 83966892 AAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAAC 83966951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAAC 180

 83966952 TCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATG 83967011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATG 240

 83967012 TTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGA 83967071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGA 300

 83967072 TGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGT 83967131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGT 360

 83967132 CAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAA 83967191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAA 420

 83967192 TGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACA 83967251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACA 480

 83967252 CTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCT 83967311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCT 540

 83967312 CCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAA 83967371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAA 600

 83967372 ACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAG 83967431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAG 660

 83967432 ATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATC 83967491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATC 720

 83967492 TCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAA 83967551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAA 780

 83967552 CCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATC 83967611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATC 840

 83967612 AGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAAC 83967671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAAC 900

 83967672 ATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAA 83967731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAA 960

 83967732 TCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCC 83967791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCC 1020

 83967792 TGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACA 83967851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACA 1080

 83967852 AATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGA 83967911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGA 1140

 83967912 GGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTT 83967971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTT 1200

 83967972 AGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 83968005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 1234

EXCISED REGION

 83968008 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTC 83968067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTC 1294

 83968068 TGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCT 83968127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 TGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCT 1354

 83968128 GGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTT 83968187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 GGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTT 1414

 83968188 TTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGAT 83968247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 TTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGAT 1474

 83968248 TTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATG 83968307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 TTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATG 1534

 83968308 TTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTT 83968367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 TTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTT 1594

 83968368 TTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATT 83968427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 TTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATT 1654

 83968428 ATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGC 83968487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 ATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGC 1714

 83968488 TGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTA 83968547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 TGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTA 1774

 83968548 ATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATC 83968607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 ATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATC 1834

 83968608 CCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTG 83968667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 CCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTG 1894

 83968668 TTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGG 83968727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 TTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGG 1954

 83968728 TTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATG 83968787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 TTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATG 2014

 83968788 AATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCA 83968847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 AATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCA 2074

 83968848 ATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTT 83968907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 ATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTT 2134

 83968908 TTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGG 83968967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 TTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGG 2194

 83968968 TATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTC 83969027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 TATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTC 2254

 83969028 TCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTG 83969087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 TCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTG 2314

 83969088 TATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGAT 83969147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 TATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGAT 2374

 83969148 TTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTC 83969207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 TTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTC 2434

 83969208 AAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGT 83969267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 AAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGT 2494

 83969268 TCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGT 83969327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 TCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGT 2554

 83969328 TTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTG 83969387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 TTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTG 2614

 83969388 ATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAA 83969447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 ATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAA 2674

 83969448 AACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCA 83969507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 AACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCA 2734

 83969508 TGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTAC 83969567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 TGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTAC 2794

 83969568 AACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACA 83969627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 AACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACA 2854

 83969628 ATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAA 83969687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 ATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAA 2914

 83969688 AAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTC 83969747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 AAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTC 2974

 83969748 AACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGA 83969807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 AACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGA 3034

 83969808 CAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAA 83969867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 CAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAA 3094

 83969868 CATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACA 83969927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 CATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACA 3154

 83969928 TGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGG 83969987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 TGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGG 3214

 83969988 ATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAA 83970047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 ATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAA 3274

 83970048 AAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATG 83970107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 AAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATG 3334

 83970108 CAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAA 83970167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 CAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAA 3394

 83970168 GGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTAT 83970227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 GGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTAT 3454

 83970228 ATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAA 83970287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 ATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAA 3514

 83970288 AAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAG 83970347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 AAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAG 3574

 83970348 ATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATG 83970407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 ATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATG 3634

 83970408 CAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAAC 83970467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 CAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAAC 3694

 83970468 TCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGG 83970527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 TCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGG 3754

 83970528 TGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTA 83970587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 TGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTA 3814

 83970588 AAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGG 83970647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 AAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGG 3874

 83970648 GAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATT 83970707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 GAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATT 3934

 83970708 GCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGG 83970767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 GCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGG 3994

 83970768 AATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTT 83970827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 AATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTT 4054

 83970828 AAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAA 83970887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 AAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAA 4114

 83970888 CCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGA 83970947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 CCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGA 4174

 83970948 ATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAG 83971007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 ATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAG 4234

 83971008 ACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAAT 83971067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 ACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAAT 4294

 83971068 CACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAA 83971127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 CACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAA 4354

 83971128 AAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATC 83971187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 AAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATC 4414

 83971188 TTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAA 83971247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 TTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAA 4474

 83971248 GGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGA 83971307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 GGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGA 4534

 83971308 AAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAG 83971367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 AAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAG 4594

 83971368 AAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTG 83971427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 AAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTG 4654

 83971428 ATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAAT 83971487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 ATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAAT 4714

 83971488 TGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACC 83971547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 TGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACC 4774

 83971548 ATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAA 83971607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 ATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAA 4834

 83971608 AAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAA 83971667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4835 AAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAA 4894

 83971668 CATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGG 83971727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4895 CATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGG 4954

 83971728 GAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAAT 83971787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4955 GAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAAT 5014

 83971788 AGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTT 83971847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5015 AGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTT 5074

 83971848 TAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGT 83971896
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5075 TAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGT 5123

Alignment time is 4.21122 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2857] =>      2857 nucs 'mol-32-287f-018948_2857'

Score:        2806
Aligned:      2806        nucs
Identic:      2806 (100%) nucs =>       880 (100%)      1926 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967038,83967917] EXCISED REGION [83970684,83972609]
 second seq =>  [      52,     931] EXCISED REGION [     932,    2857]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83967038 CCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGA 83967097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       52 CCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGA 111

 83967098 AACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAAC 83967157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      112 AACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAAC 171

 83967158 ACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAG 83967217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      172 ACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAG 231

 83967218 AATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAG 83967277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      232 AATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAG 291

 83967278 CTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTT 83967337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      292 CTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTT 351

 83967338 CTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAG 83967397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      352 CTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAG 411

 83967398 AGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGG 83967457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      412 AGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGG 471

 83967458 AGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAA 83967517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      472 AGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAA 531

 83967518 CATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTC 83967577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      532 CATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTC 591

 83967578 ATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAG 83967637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 ATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAG 651

 83967638 ACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAAT 83967697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      652 ACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAAT 711

 83967698 GTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAAC 83967757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 GTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAAC 771

 83967758 TATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAA 83967817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 TATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAA 831

 83967818 ATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCA 83967877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 ATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCA 891

 83967878 AAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 AAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 931

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 991

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 1051

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 1111

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 1171

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 1231

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 1291

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 1351

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 1411

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 1471

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 1531

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 1591

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 1651

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 1711

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 1771

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 1831

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 1891

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 1951

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 2011

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 2071

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 2131

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 2191

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 83972003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 2251

 83972004 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 83972063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 2311

 83972064 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 83972123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 2371

 83972124 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 83972183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 2431

 83972184 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 83972243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 2491

 83972244 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 83972303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 2551

 83972304 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 83972363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 2611

 83972364 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATC 83972423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATC 2671

 83972424 ATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTG 83972483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 ATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTG 2731

 83972484 TTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTT 83972543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 TTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTT 2791

 83972544 AAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCA 83972603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 AAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCA 2851

 83972604 AAAAAT 83972609
          ||||||
     2852 AAAAAT 2857

Alignment time is 2.35676 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    4772] =>      4772 nucs 'mol-32-287f-086619_4772'

Score:        4750
Aligned:      4772        nucs
Identic:      4770 (100%) nucs =>      1056 (100%)      3714 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83966861,83967917] EXCISED REGION [83970684,83974398]
 second seq =>  [       1,    1057] EXCISED REGION [    1058,    4772]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83966861 GAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATC 83966920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATC 60

 83966921 AATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGA 83966980
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATAATAATATTGAATGTAAATAAACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGA 120

 83966981 ATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCT 83967040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCT 180

 83967041 ATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAAC 83967100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAAC 240

 83967101 CAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACT 83967160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACT 300

 83967161 GTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAAT 83967220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAAT 360

 83967221 ATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTC 83967280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTC 420

 83967281 TAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTG 83967340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTG 480

 83967341 ACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGA 83967400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGA 540

 83967401 AGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGA 83967460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGA 600

 83967461 CCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACAT 83967520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACAT 660

 83967521 AGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATC 83967580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATC 720

 83967581 CAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACC 83967640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACC 780

 83967641 ATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTC 83967700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTC 840

 83967701 TTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTAT 83967760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTAT 900

 83967761 ATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATT 83967820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATT 960

 83967821 AAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAA 83967880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAA 1020

 83967881 CCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 1057

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 1117

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 1177

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 1237

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1238 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTACGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 1297

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 1357

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 1417

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 1477

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 1537

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 1597

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 1657

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 1717

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 1777

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 1837

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 1897

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 1957

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 2017

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 2077

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 2137

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 2197

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 2257

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 2317

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 83972003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 2377

 83972004 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 83972063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 2437

 83972064 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 83972123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 2497

 83972124 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 83972183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 2557

 83972184 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 83972243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 2617

 83972244 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 83972303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 2677

 83972304 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 83972363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 2737

 83972364 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATC 83972423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATC 2797

 83972424 ATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTG 83972483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 ATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTG 2857

 83972484 TTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTT 83972543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 TTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTT 2917

 83972544 AAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCA 83972603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 AAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCA 2977

 83972604 AAAAATAGAGTAGTGAAATAAACCCTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAG 83972663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 AAAAATAGAGTAGTGAAATAAACCCTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAG 3037

 83972664 TCCAGACAGACTTATTACATCTTTAGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTG 83972723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 TCCAGACAGACTTATTACATCTTTAGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTG 3097

 83972724 AAATAAATTCTAAACAATGCAACATTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAA 83972783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 AAATAAATTCTAAACAATGCAACATTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAA 3157

 83972784 GATAAGAATTCTTTCATAAAGCATAACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAA 83972843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 GATAAGAATTCTTTCATAAAGCATAACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAA 3217

 83972844 TATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTTGTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAA 83972903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 TATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTTGTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAA 3277

 83972904 TACGATTCAAACAAGATCACATTGCATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTA 83972963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 TACGATTCAAACAAGATCACATTGCATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTA 3337

 83972964 TGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTTCTTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTG 83973023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 TGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTTCTTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTG 3397

 83973024 TCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTGAATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACA 83973083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 TCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTGAATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACA 3457

 83973084 CGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCCTGAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTG 83973143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 CGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCCTGAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTG 3517

 83973144 AGCAGATTCAAATTGAATTTTTCAGTAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATC 83973203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 AGCAGATTCAAATTGAATTTTTCAGTAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATC 3577

 83973204 ATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGTATCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCC 83973263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 ATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGTATCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCC 3637

 83973264 TGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCG 83973323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 TGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCG 3697

 83973324 CGCACCTATAATCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAG 83973383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 CGCACCTATAATCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAG 3757

 83973384 GCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAA 83973443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 GCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAA 3817

 83973444 AACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAATTGATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCAT 83973503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 AACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAATTGATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCAT 3877

 83973504 TCCTTAGGAATTTCTTTACCTAATGGTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCA 83973563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 TCCTTAGGAATTTCTTTACCTAATGGTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCA 3937

 83973564 TTACATTTTTAGGGGTTGCAAATGGCATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAA 83973623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 TTACATTTTTAGGGGTTGCAAATGGCATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAA 3997

 83973624 TAATTAATAATCTGTAACGCATCTATAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTC 83973683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 TAATTAATAATCTGTAACGCATCTATAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTC 4057

 83973684 CACTTAGATGAAATAATGAAAAAGGTGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTAT 83973743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 CACTTAGATGAAATAATGAAAAAGGTGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTAT 4117

 83973744 CCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTGTCTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCC 83973803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 CCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTGTCTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCC 4177

 83973804 AGAAATATTTGAAAGGGAATGGGTTTGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAAC 83973863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 AGAAATATTTGAAAGGGAATGGGTTTGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAAC 4237

 83973864 AGAGAACATGCCCTAATGAAATTTAAGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCA 83973923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4238 AGAGAACATGCCCTAATGAAATTTAAGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCA 4297

 83973924 CAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATTAAAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAA 83973983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4298 CAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATTAAAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAA 4357

 83973984 CAGGGAAGTTTAAATTATATAATAAATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAA 83974043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4358 CAGGGAAGTTTAAATTATATAATAAATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAA 4417

 83974044 AGGTTCTATCATCCTTATATGTTATGCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAAT 83974103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4418 AGGTTCTATCATCCTTATATGTTATGCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAAT 4477

 83974104 AAAATCAAAGAAGCACAGAAAACTAGTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGA 83974163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4478 AAAATCAAAGAAGCACAGAAAACTAGTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGA 4537

 83974164 AGCATAACAATAAAGAAAAAACTATTCTAAAAAATGATATTTTTATTTTATAAAAATACA 83974223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4538 AGCATAACAATAAAGAAAAAACTATTCTAAAAAATGATATTTTTATTTTATAAAAATACA 4597

 83974224 CAAATTTTAATAAGTTGGTCAATCCTAACATAAAAGGTAAATGACAACTTGAAAAAAATT 83974283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4598 CAAATTTTAATAAGTTGGTCAATCCTAACATAAAAGGTAAATGACAACTTGAAAAAAATT 4657

 83974284 ACATAAAATATTCTCAATATATAAGAAGCTCTTCCAGGCAAGCCCATTCATAGTAAAATA 83974343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4658 ACATAAAATATTCTCAATATATAAGAAGCTCTTCCAGGCAAGCCCATTCATAGTAAAATA 4717

 83974344 AAATGCTCAAAAAATGATGAAACACATGCAAATTAAAACACAATAGAATTCTATG 83974398
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4718 AAATGCTCAAAAAATGATGAAACACATGCAAATTAAAACACAATAGAATTCTATG 4772

Alignment time is 3.94437 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    4540] =>      4540 nucs 'mol-32-288a-014940_4540'

Score:        4518
Aligned:      4540        nucs
Identic:      4538 (100%) nucs =>       778 (100%)      3760 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967227,83968005] EXCISED REGION [83968008,83971768]
 second seq =>  [       1,     779] EXCISED REGION [     780,    4540]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [83968006,83968007]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [83968006,83968024] to [83968008,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83968006,83968006] to [83968007,83968007]
 second seq =>         0 nucs

 83967227 ATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAA 83967286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAA 60

 83967287 TATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAG 83967346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAG 120

 83967347 AATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAAT 83967406
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTCAAAATACTTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAAT 180

 83967407 TCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACA 83967466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACA 240

 83967467 CCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACT 83967526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACT 300

 83967527 TAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGG 83967586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGG 360

 83967587 CTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGT 83967646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGT 420

 83967647 TATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCC 83967706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCC 480

 83967707 GACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAAT 83967766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAAT 540

 83967767 ATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAA 83967826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAA 600

 83967827 AAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATG 83967886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATG 660

 83967887 AGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAA 83967946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAA 720

 83967947 AGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 83968005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 779

EXCISED REGION

 83968008 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTC 83968067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTC 839

 83968068 TGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCT 83968127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCT 899

 83968128 GGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTT 83968187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTT 959

 83968188 TTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGAT 83968247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGAT 1019

 83968248 TTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATG 83968307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATG 1079

 83968308 TTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTT 83968367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTT 1139

 83968368 TTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATT 83968427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATT 1199

 83968428 ATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGC 83968487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGC 1259

 83968488 TGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTA 83968547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTA 1319

 83968548 ATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATC 83968607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 ATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATC 1379

 83968608 CCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTG 83968667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTG 1439

 83968668 TTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGG 83968727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGG 1499

 83968728 TTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATG 83968787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATG 1559

 83968788 AATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCA 83968847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCA 1619

 83968848 ATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTT 83968907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 ATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTT 1679

 83968908 TTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGG 83968967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGG 1739

 83968968 TATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTC 83969027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTC 1799

 83969028 TCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTG 83969087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTG 1859

 83969088 TATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGAT 83969147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGAT 1919

 83969148 TTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTC 83969207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTC 1979

 83969208 AAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGT 83969267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGT 2039

 83969268 TCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGT 83969327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGT 2099

 83969328 TTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTG 83969387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTG 2159

 83969388 ATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAA 83969447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAA 2219

 83969448 AACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCA 83969507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCA 2279

 83969508 TGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTAC 83969567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTAC 2339

 83969568 AACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACA 83969627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACA 2399

 83969628 ATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAA 83969687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 ATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAA 2459

 83969688 AAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTC 83969747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 AAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTC 2519

 83969748 AACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGA 83969807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGA 2579

 83969808 CAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAA 83969867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAA 2639

 83969868 CATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACA 83969927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACA 2699

 83969928 TGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGG 83969987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGG 2759

 83969988 ATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAA 83970047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 ATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAA 2819

 83970048 AAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATG 83970107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATG 2879

 83970108 CAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAA 83970167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAA 2939

 83970168 GGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTAT 83970227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTAT 2999

 83970228 ATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAA 83970287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 ATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAA 3059

 83970288 AAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAG 83970347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAG 3119

 83970348 ATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATG 83970407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 ATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATG 3179

 83970408 CAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAAC 83970467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAAC 3239

 83970468 TCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGG 83970527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGG 3299

 83970528 TGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTA 83970587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTA 3359

 83970588 AAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGG 83970647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 AAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGG 3419

 83970648 GAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATT 83970707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 GAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATT 3479

 83970708 GCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGG 83970767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGG 3539

 83970768 AATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTT 83970827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTT 3599

 83970828 AAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAA 83970887
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 AAGTGACCTGGACGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAA 3659

 83970888 CCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGA 83970947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGA 3719

 83970948 ATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAG 83971007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 ATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAG 3779

 83971008 ACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAAT 83971067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 ACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAAT 3839

 83971068 CACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAA 83971127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 CACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAA 3899

 83971128 AAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATC 83971187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 AAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATC 3959

 83971188 TTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAA 83971247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAA 4019

 83971248 GGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGA 83971307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 GGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGA 4079

 83971308 AAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAG 83971367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAG 4139

 83971368 AAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTG 83971427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 AAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTG 4199

 83971428 ATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAAT 83971487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 ATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAAT 4259

 83971488 TGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACC 83971547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACC 4319

 83971548 ATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAA 83971607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 ATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAA 4379

 83971608 AAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAA 83971667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 AAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAA 4439

 83971668 CATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGG 83971727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 CATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGG 4499

 83971728 GAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATC 83971768
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 GAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATC 4540

Alignment time is 3.66683 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    5265] =>      5265 nucs 'mol-32-288a-069489_5265'

Score:        5210
Aligned:      5265        nucs
Identic:      5260 (100%) nucs =>      4388 (100%)       872 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83963526,83967917] EXCISED REGION [83970684,83971555]
 second seq =>  [       1,    4393] EXCISED REGION [    4394,    5265]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83963526 TTTTGGTGTAATATAATTCAGTTTGTCTATTTCTTCAAGGAGGACTACAAACCACTGCTC 83963585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTGGTGTAATATAATTCAGTTTGTCTATTTCTTCAAGGAGGACTACAAACCACTGCTC 60

 83963586 AAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATGAGAAAG 83963645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATGAGAAAG 120

 83963646 AATCAATATCATGAAAATGGCCATACTGCCCAAAGTAATTTATAGATTTAATGCTATCGC 83963705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATCAATATCATGAAAATGGCCATACTGCCCAAAGTAATTTATAGATTTAATGCTATCGC 180

 83963706 CATCAAGATACTATTGACTTTCTTCAAAGAATTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATG 83963765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATCAAGATACTATTGACTTTCTTCAAAGAATTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATG 240

 83963766 GAACCAAAAAAGAGCCTGTATAGCCAAGACAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGG 83963825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAACCAAAAAAGAGCCTGTATAGCCAAGACAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGG 300

 83963826 CATCACGTTACCTGACTTCAAATATACAAGCCTACAGTAACCAAAACCGCATGGTACTGG 83963885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATCACGTTACCTGACTTCAAATATACAAGCCTACAGTAACCAAAACCGCATGGTACTGG 360

 83963886 TAGGATGTTGAATTTTATCAAATCCCTTTTTTTTTTTTTTTGGTCTATTGAGATGTTCAT 83963945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGGATGTTGAATTTTATCAAATCCCTTTTTTTTTTTTTTTGGTCTATTGAGATGTTCAT 420

 83963946 ATGATTTTTGTCTTTCTTTCTGTTGAGGTGATATATTTATTGATTTGTGTGTGTTCAGTC 83964005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGATTTTTGTCTTTCTTTCTGTTGAGGTGATATATTTATTGATTTGTGTGTGTTCAGTC 480

 83964006 ATCATCCTTGCGTCCCTGGGATAATCCCACTTAGTCATGTTGAGGTGTTGCTGGATTTAG 83964065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCATCCTTGCGTCCCTGGGATAATCCCACTTAGTCATGTTGAGGTGTTGCTGGATTTAG 540

 83964066 TTTGCTAGTATTTTGTAGAGGATTTTTGCATCTATGTTTATCAGGGATACTGGCAGACAG 83964125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTGCTAGTATTTTGTAGAGGATTTTTGCATCTATGTTTATCAGGGATACTGGCAGACAG 600

 83964126 TTTTTCTTGTTGTTATCTGTTATGTCCTTGTCTGGTTTTGGTATTAGGGTCATTTTGGCC 83964185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTCTTGTTGTTATCTGTTATGTCCTTGTCTGGTTTTGGTATTAGGGTCATTTTGGCC 660

 83964186 TCATATAATGCGTCAGGAAGAGTTCACTCCCTTTCAATGTTTTGGGATAGTATGAGAAGA 83964245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCATATAATGCGTCAGGAAGAGTTCACTCCCTTTCAATGTTTTGGGATAGTATGAGAAGA 720

 83964246 ATCAGTGTTAATTCTTTTTATAAGTTTGGTAGAATTAGCTGACTCTGAGCACAGTGCCTA 83964305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCAGTGTTAATTCTTTTTATAAGTTTGGTAGAATTAGCTGACTCTGAGCACAGTGCCTA 780

 83964306 GGGGTTAACACTGCTCTGCAAGGAAGAGGTTAAAAAAAAAGTTTGATAGAATTAAGCAGT 83964365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGGTTAACACTGCTCTGCAAGGAAGAGGTTAAAAAAAAAGTTTGATAGAATTAAGCAGT 840

 83964366 AAAGCCACCAGGTCCTGGGCTTTTCTTTGCTGGGAAACATTTTATTAATGTTATTAATAT 83964425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGCCACCAGGTCCTGGGCTTTTCTTTGCTGGGAAACATTTTATTAATGTTATTAATAT 900

 83964426 CAATATTATTATTTACTATTAATCTGTTCAGGTTTTCTATTTTTTTTTTTT-ATTCAATC 83964484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
      901 CAATATTATTATTTACTATTAATCTGTTCAGGTTTTCTATTTTTTTTTTTTGATTCAATC 960

 83964485 TTGGTAGGTTGTACCTCTCCAGAAATTTATCCATCTCCTCTAGGTTTTCTAATTTGTTAG 83964544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGGTAGGTTGTACCTCTCCAGAAATTTATCCATCTCCTCTAGGTTTTCTAATTTGTTAG 1020

 83964545 TGTATAACAAAAAATATTGAAAGTTTAGAACACTGAATGCTTGGCTGTGGCAGATCTGTT 83964604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTATAACAAAAAATATTGAAAGTTTAGAACACTGAATGCTTGGCTGTGGCAGATCTGTT 1080

 83964605 CAGCCAAGATCGGGACTACTTCAGCTGGCTCTGAGGGTTCAAAGGAGTCTGAGAAGCAAA 83964664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGCCAAGATCGGGACTACTTCAGCTGGCTCTGAGGGTTCAAAGGAGTCTGAGAAGCAAA 1140

 83964665 AATCTTAGTGAACCTCTACCTAGATGTCCCCATCACATGTTAGCTACACCTTTTCCCCAC 83964724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATCTTAGTGAACCTCTACCTAGATGTCCCCATCACATGTTAGCTACACCTTTTCCCCAC 1200

 83964725 CACGTCCCTGACCTCAACTTTACAGACCTACCTCCCCTTGGTTCAGAAATTATGCTGAGT 83964784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACGTCCCTGACCTCAACTTTACAGACCTACCTCCCCTTGGTTCAGAAATTATGCTGAGT 1260

 83964785 GAGCTTAGGAGAAACTATATTGAAATTCATTGCTCAAAATATACACCTGAACTCAAAAAT 83964844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGCTTAGGAGAAACTATATTGAAATTCATTGCTCAAAATATACACCTGAACTCAAAAAT 1320

 83964845 TTCAAAAAGTGCCATAGATGGACATAACCAACATTACAAGCAAATTTATCTAAAAGTGTA 83964904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCAAAAAGTGCCATAGATGGACATAACCAACATTACAAGCAAATTTATCTAAAAGTGTA 1380

 83964905 TTTGTTACAGTGTTGTCTAAAATTTAAAAAAAATTGAAAACAACCAAAATGTCCAAAACT 83964964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTGTTACAGTGTTGTCTAAAATTTAAAAAAAATTGAAAACAACCAAAATGTCCAAAACT 1440

 83964965 AGGAAGCTGATTAAGTCAACTGTAATATCCATTCCAAAGGATACAGAGCTATCAGGAAAA 83965024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGAAGCTGATTAAGTCAACTGTAATATCCATTCCAAAGGATACAGAGCTATCAGGAAAA 1500

 83965025 TTTATGTTTTACAAGTAAACATAAATAGTGATATAGAACATTGCTCATTATCTATTGTTT 83965084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTATGTTTTACAAGTAAACATAAATAGTGATATAGAACATTGCTCATTATCTATTGTTT 1560

 83965085 AACAGAAATTTCAGGTTACAAATTGGATTATCCCACTTTTATTTTATATATATATATATA 83965144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACAGAAATTTCAGGTTACAAATTGGATTATCCCACTTTTATTTTATATATATATATATA 1620

 83965145 TATATTCAAACATATTTATAAAAGCCATGAAAATTTACACAAAAAATGTTAATAATTGTT 83965204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATATTCAAACATATTTATAAAAGCCATGAAAATTTACACAAAAAATGTTAATAATTGTT 1680

 83965205 AGGTCTAAATAGTGTAATAATGCATAAATTTTTTCTTCTACTATAAATTGTATTATAAGT 83965264
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGTCTAAATAGTGTAATAATGCATAAGTTTTTTCTTCTACTATAAATTGTATTATAAGT 1740

 83965265 AAAATAATAAAAATGCCTTTGGCATGGGAGCAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCCTACA 83965324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAATAATAAAAATGCCTTTGGCATGGGAGCAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCCTACA 1800

 83965325 CTGTTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAATTTTACCAACTATCTGCATACAGAAAAGTAC 83965384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGTTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAATTTTACCAACTATCTGCATACAGAAAAGTAC 1860

 83965385 CATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACTTCGT 83965444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACTTCGT 1920

 83965445 ATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACCATAC 83965504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACCATAC 1980

 83965505 CTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGGA 83965564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGGA 2040

 83965565 GGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGTGGAGA 83965624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2041 GGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGCGGAGA 2100

 83965625 ATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAGA 83965684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAGA 2160

 83965685 GCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATCC 83965744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATCC 2220

 83965745 ACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATAT 83965804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATAT 2280

 83965805 AGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGAA 83965864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGAA 2340

 83965865 AGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATACCTAGA 83965924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATACCTAGA 2400

 83965925 TAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAA 83965984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAA 2460

 83965985 GAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGAT 83966044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGAT 2520

 83966045 ACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCA 83966104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCA 2580

 83966105 GACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATA 83966164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATA 2640

 83966165 AAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAA 83966224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAA 2700

 83966225 GGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCT 83966284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCT 2760

 83966285 GTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAAT 83966344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAAT 2820

 83966345 GAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAG 83966404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAG 2880

 83966405 AAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATA 83966464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATA 2940

 83966465 GTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGA 83966524
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTATAACATTGTAACGGTGGTATATAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGA 3000

 83966525 TAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAA 83966584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAA 3060

 83966585 ATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTT 83966644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTT 3120

 83966645 ATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCT 83966704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCT 3180

 83966705 AATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACAA 83966764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACAA 3240

 83966765 TGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTC 83966824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTC 3300

 83966825 ACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAAC 83966884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAAC 3360

 83966885 AAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAG 83966944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAG 3420

 83966945 ACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAA 83967004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAA 3480

 83967005 TGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACAT 83967064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACAT 3540

 83967065 AAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATA 83967124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATA 3600

 83967125 TTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAAT 83967184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAAT 3660

 83967185 TATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCA 83967244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCA 3720

 83967245 CCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGT 83967304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGT 3780

 83967305 GGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTT 83967364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTT 3840

 83967365 TAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGT 83967424
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3841 TAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAGTTCCTTCTCTGT 3900

 83967425 GAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGG 83967484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGG 3960

 83967485 AAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAAT 83967544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAAT 4020

 83967545 AAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCT 83967604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCT 4080

 83967605 TCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTT 83967664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTT 4140

 83967665 CTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAA 83967724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAA 4200

 83967725 CTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAAT 83967784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAAT 4260

 83967785 ATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCT 83967844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCT 4320

 83967845 TGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGT 83967904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGT 4380

 83967905 ACTAAGAGGGAAA 83967917
          |||||||||||||
     4381 ACTAAGAGGGAAA 4393

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 4453

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 4513

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 4573

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 4633

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 4693

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 4753

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 4813

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 4873

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 4933

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 4993

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 5053

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 5113

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 5173

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 5233

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAA 83971555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAA 5265

Alignment time is 4.36524 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    6972] =>      6972 nucs 'mol-32-2895-119653_6972'

Score:        6962
Aligned:      6973        nucs
Identic:      6972 (100%) nucs =>       550 (100%)      6422 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967455,83968005] EXCISED REGION [83968008,83974429]
 second seq =>  [       1,     550] EXCISED REGION [     551,    6972]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [83968006,83968007]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [83968006,83968024] to [83968008,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83968006,83968006] to [83968007,83968007]
 second seq =>         0 nucs

 83967455 TGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAG 83967514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAG 60

 83967515 AAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACAT 83967574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACAT 120

 83967575 TTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGA 83967634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGA 180

 83967635 TAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATC 83967694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATC 240

 83967695 AATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGA 83967754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGA 300

 83967755 AACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAA 83967814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAA 360

 83967815 GAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATA 83967874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATA 420

 83967875 CCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGC 83967934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGC 480

 83967935 CTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTT 83967994
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTACATCAATAAAGAAAAA-CCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTT 539

 83967995 TGTTTGATTGA 83968005
          |||||||||||
      540 TGTTTGATTGA 550

EXCISED REGION

 83968008 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTC 83968067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTC 610

 83968068 TGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCT 83968127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 TGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCT 670

 83968128 GGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTT 83968187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 GGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTT 730

 83968188 TTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGAT 83968247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 TTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGAT 790

 83968248 TTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATG 83968307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 TTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATG 850

 83968308 TTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTT 83968367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 TTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTT 910

 83968368 TTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATT 83968427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 TTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATT 970

 83968428 ATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGC 83968487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 ATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGC 1030

 83968488 TGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTA 83968547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 TGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTA 1090

 83968548 ATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATC 83968607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 ATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATC 1150

 83968608 CCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTG 83968667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 CCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTG 1210

 83968668 TTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGG 83968727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 TTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGG 1270

 83968728 TTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATG 83968787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 TTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATG 1330

 83968788 AATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCA 83968847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 AATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCA 1390

 83968848 ATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTT 83968907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 ATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTT 1450

 83968908 TTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGG 83968967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 TTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGG 1510

 83968968 TATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTC 83969027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 TATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTC 1570

 83969028 TCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTG 83969087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 TCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTG 1630

 83969088 TATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGAT 83969147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 TATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGAT 1690

 83969148 TTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTC 83969207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 TTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTC 1750

 83969208 AAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGT 83969267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 AAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGT 1810

 83969268 TCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGT 83969327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 TCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGT 1870

 83969328 TTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTG 83969387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 TTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTG 1930

 83969388 ATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAA 83969447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 ATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAA 1990

 83969448 AACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCA 83969507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 AACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCA 2050

 83969508 TGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTAC 83969567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 TGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTAC 2110

 83969568 AACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACA 83969627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 AACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACA 2170

 83969628 ATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAA 83969687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 ATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAA 2230

 83969688 AAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTC 83969747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 AAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTC 2290

 83969748 AACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGA 83969807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 AACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGA 2350

 83969808 CAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAA 83969867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 CAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAA 2410

 83969868 CATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACA 83969927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 CATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACA 2470

 83969928 TGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGG 83969987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 TGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGG 2530

 83969988 ATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAA 83970047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 ATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAA 2590

 83970048 AAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATG 83970107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 AAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATG 2650

 83970108 CAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAA 83970167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 CAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAA 2710

 83970168 GGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTAT 83970227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 GGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTAT 2770

 83970228 ATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAA 83970287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 ATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAA 2830

 83970288 AAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAG 83970347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 AAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAG 2890

 83970348 ATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATG 83970407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 ATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATG 2950

 83970408 CAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAAC 83970467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 CAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAAC 3010

 83970468 TCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGG 83970527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 TCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGG 3070

 83970528 TGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTA 83970587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 TGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTA 3130

 83970588 AAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGG 83970647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 AAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGG 3190

 83970648 GAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATT 83970707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 GAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATT 3250

 83970708 GCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGG 83970767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 GCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGG 3310

 83970768 AATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTT 83970827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 AATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTT 3370

 83970828 AAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAA 83970887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 AAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAA 3430

 83970888 CCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGA 83970947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 CCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGA 3490

 83970948 ATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAG 83971007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 ATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAG 3550

 83971008 ACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAAT 83971067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 ACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAAT 3610

 83971068 CACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAA 83971127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 CACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAA 3670

 83971128 AAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATC 83971187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 AAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATC 3730

 83971188 TTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAA 83971247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 TTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAA 3790

 83971248 GGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGA 83971307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 GGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGA 3850

 83971308 AAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAG 83971367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3851 AAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAG 3910

 83971368 AAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTG 83971427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3911 AAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTG 3970

 83971428 ATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAAT 83971487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3971 ATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAAT 4030

 83971488 TGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACC 83971547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4031 TGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACC 4090

 83971548 ATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAA 83971607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4091 ATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAA 4150

 83971608 AAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAA 83971667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4151 AAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAA 4210

 83971668 CATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGG 83971727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4211 CATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGG 4270

 83971728 GAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAAT 83971787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4271 GAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAAT 4330

 83971788 AGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTT 83971847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4331 AGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTT 4390

 83971848 TAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTT 83971907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4391 TAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTT 4450

 83971908 AGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACAT 83971967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4451 AGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACAT 4510

 83971968 AGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTC 83972027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4511 AGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTC 4570

 83972028 CTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGC 83972087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4571 CTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGC 4630

 83972088 AGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGCGGAC 83972147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4631 AGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGCGGAC 4690

 83972148 TATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAATTATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAAT 83972207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4691 TATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAATTATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAAT 4750

 83972208 TTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAATTCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAA 83972267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4751 TTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAATTCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAA 4810

 83972268 ACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATAGATACTTTTTATATCTCTACATTG 83972327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4811 ACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATAGATACTTTTTATATCTCTACATTG 4870

 83972328 TCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAAAAAACTAAGCAGCCATTCATCTAC 83972387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4871 TCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAAAAAACTAAGCAGCCATTCATCTAC 4930

 83972388 TTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATCATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTT 83972447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4931 TTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATCATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTT 4990

 83972448 GGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTGTTGTACAATATTGTGAATGTACTT 83972507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4991 GGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTGTTGTACAATATTGTGAATGTACTT 5050

 83972508 AATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTTAAAATGGCAAGTTTTATGTTATGA 83972567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5051 AATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTTAAAATGGCAAGTTTTATGTTATGA 5110

 83972568 GTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCAAAAAATAGAGTAGTGAAATAAACC 83972627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5111 GTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCAAAAAATAGAGTAGTGAAATAAACC 5170

 83972628 CTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAGTCCAGACAGACTTATTACATCTTT 83972687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5171 CTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAGTCCAGACAGACTTATTACATCTTT 5230

 83972688 AGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTGAAATAAATTCTAAACAATGCAACA 83972747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5231 AGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTGAAATAAATTCTAAACAATGCAACA 5290

 83972748 TTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAAGATAAGAATTCTTTCATAAAGCAT 83972807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5291 TTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAAGATAAGAATTCTTTCATAAAGCAT 5350

 83972808 AACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAATATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTT 83972867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5351 AACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAATATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTT 5410

 83972868 GTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAATACGATTCAAACAAGATCACATTG 83972927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5411 GTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAATACGATTCAAACAAGATCACATTG 5470

 83972928 CATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTATGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTT 83972987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5471 CATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTATGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTT 5530

 83972988 CTTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTGTCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTG 83973047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5531 CTTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTGTCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTG 5590

 83973048 AATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACACGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCC 83973107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5591 AATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACACGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCC 5650

 83973108 TGAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTGAGCAGATTCAAATTGAATTTTTCA 83973167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5651 TGAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTGAGCAGATTCAAATTGAATTTTTCA 5710

 83973168 GTAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATCATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGT 83973227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5711 GTAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATCATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGT 5770

 83973228 ATCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCCTGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCT 83973287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5771 ATCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCCTGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCT 5830

 83973288 ACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCGCACCTATAATCCCAACTACTTG 83973347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5831 ACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCGCACCTATAATCCCAACTACTTG 5890

 83973348 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAGGCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGAT 83973407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5891 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAGGCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGAT 5950

 83973408 CGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAAAACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAAT 83973467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5951 CGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAAAACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAAT 6010

 83973468 TGATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCATTCCTTAGGAATTTCTTTACCTAAT 83973527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6011 TGATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCATTCCTTAGGAATTTCTTTACCTAAT 6070

 83973528 GGTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCATTACATTTTTAGGGGTTGCAAATG 83973587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6071 GGTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCATTACATTTTTAGGGGTTGCAAATG 6130

 83973588 GCATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAATAATTAATAATCTGTAACGCATCT 83973647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6131 GCATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAATAATTAATAATCTGTAACGCATCT 6190

 83973648 ATAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTCCACTTAGATGAAATAATGAAAAAG 83973707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6191 ATAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTCCACTTAGATGAAATAATGAAAAAG 6250

 83973708 GTGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTATCCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTG 83973767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6251 GTGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTATCCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTG 6310

 83973768 TCTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCCAGAAATATTTGAAAGGGAATGGGT 83973827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6311 TCTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCCAGAAATATTTGAAAGGGAATGGGT 6370

 83973828 TTGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAACAGAGAACATGCCCTAATGAAATTT 83973887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6371 TTGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAACAGAGAACATGCCCTAATGAAATTT 6430

 83973888 AAGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCACAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATT 83973947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6431 AAGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCACAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATT 6490

 83973948 AAAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAACAGGGAAGTTTAAATTATATAATA 83974007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6491 AAAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAACAGGGAAGTTTAAATTATATAATA 6550

 83974008 AATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAAAGGTTCTATCATCCTTATATGTTA 83974067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6551 AATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAAAGGTTCTATCATCCTTATATGTTA 6610

 83974068 TGCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAATAAAATCAAAGAAGCACAGAAAACT 83974127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6611 TGCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAATAAAATCAAAGAAGCACAGAAAACT 6670

 83974128 AGTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGAAGCATAACAATAAAGAAAAAACTA 83974187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6671 AGTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGAAGCATAACAATAAAGAAAAAACTA 6730

 83974188 TTCTAAAAAATGATATTTTTATTTTATAAAAATACACAAATTTTAATAAGTTGGTCAATC 83974247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6731 TTCTAAAAAATGATATTTTTATTTTATAAAAATACACAAATTTTAATAAGTTGGTCAATC 6790

 83974248 CTAACATAAAAGGTAAATGACAACTTGAAAAAAATTACATAAAATATTCTCAATATATAA 83974307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6791 CTAACATAAAAGGTAAATGACAACTTGAAAAAAATTACATAAAATATTCTCAATATATAA 6850

 83974308 GAAGCTCTTCCAGGCAAGCCCATTCATAGTAAAATAAAATGCTCAAAAAATGATGAAACA 83974367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6851 GAAGCTCTTCCAGGCAAGCCCATTCATAGTAAAATAAAATGCTCAAAAAATGATGAAACA 6910

 83974368 CATGCAAATTAAAACACAATAGAATTCTATGTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTAAACGGA 83974427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6911 CATGCAAATTAAAACACAATAGAATTCTATGTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTAAACGGA 6970

 83974428 GT 83974429
          ||
     6971 GT 6972

Alignment time is 6.19185 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2112] =>      2112 nucs 'mol-32-29ea-021683_2112'

Score:        2112
Aligned:      2112        nucs
Identic:      2112 (100%) nucs =>       853 (100%)      1259 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967153,83968005] EXCISED REGION [83968008,83969266]
 second seq =>  [       1,     853] EXCISED REGION [     854,    2112]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [83968006,83968007]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [83968006,83968024] to [83968008,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83968006,83968006] to [83968007,83968007]
 second seq =>         0 nucs

 83967153 CAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGC 83967212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGC 60

 83967213 ATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTC 83967272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTC 120

 83967273 TTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGA 83967332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGA 180

 83967333 CTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAA 83967392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAA 240

 83967393 CACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGA 83967452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGA 300

 83967453 GCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAA 83967512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAA 360

 83967513 AGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAAC 83967572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAAC 420

 83967573 ATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAG 83967632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAG 480

 83967633 GATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATA 83967692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATA 540

 83967693 TCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTG 83967752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTG 600

 83967753 GAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTG 83967812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTG 660

 83967813 AAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACA 83967872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACA 720

 83967873 TACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGT 83967932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGT 780

 83967933 GCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATG 83967992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATG 840

 83967993 TTTGTTTGATTGA 83968005
          |||||||||||||
      841 TTTGTTTGATTGA 853

EXCISED REGION

 83968008 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTC 83968067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      854 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTC 913

 83968068 TGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCT 83968127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      914 TGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCT 973

 83968128 GGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTT 83968187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      974 GGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTT 1033

 83968188 TTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGAT 83968247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1034 TTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGAT 1093

 83968248 TTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATG 83968307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1094 TTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATG 1153

 83968308 TTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTT 83968367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1154 TTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTT 1213

 83968368 TTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATT 83968427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1214 TTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATT 1273

 83968428 ATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGC 83968487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1274 ATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGC 1333

 83968488 TGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTA 83968547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 TGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTA 1393

 83968548 ATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATC 83968607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 ATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATC 1453

 83968608 CCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTG 83968667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 CCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTG 1513

 83968668 TTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGG 83968727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 TTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGG 1573

 83968728 TTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATG 83968787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 TTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATG 1633

 83968788 AATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCA 83968847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 AATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCA 1693

 83968848 ATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTT 83968907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 ATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTT 1753

 83968908 TTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGG 83968967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 TTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGG 1813

 83968968 TATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTC 83969027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 TATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTC 1873

 83969028 TCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTG 83969087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 TCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTG 1933

 83969088 TATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGAT 83969147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 TATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGAT 1993

 83969148 TTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTC 83969207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 TTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTC 2053

 83969208 AAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAG 83969266
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 AAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAG 2112

Alignment time is 2.02946 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2198] =>      2198 nucs 'mol-32-2ef1-145879_2198'

Score:        2198
Aligned:      2198        nucs
Identic:      2198 (100%) nucs =>       752 (100%)      1446 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967166,83967917] EXCISED REGION [83970684,83972129]
 second seq =>  [       1,     752] EXCISED REGION [     753,    2198]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83967166 AAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAAT 83967225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAAT 60

 83967226 GATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATA 83967285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATA 120

 83967286 ATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGA 83967345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGA 180

 83967346 GAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAA 83967405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAA 240

 83967406 TTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAAC 83967465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAAC 300

 83967466 ACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGAC 83967525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGAC 360

 83967526 TTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACG 83967585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACG 420

 83967586 GCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATG 83967645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATG 480

 83967646 TTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTC 83967705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTC 540

 83967706 CGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAA 83967765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAA 600

 83967766 TATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAA 83967825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAA 660

 83967826 AAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTAT 83967885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTAT 720

 83967886 GAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 752

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      753 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 812

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      813 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 872

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      873 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 932

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      933 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 992

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      993 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 1052

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 1112

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 1172

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 1232

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 1292

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 1352

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 1412

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 1472

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 1532

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 1592

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 1652

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 1712

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 1772

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 1832

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 1892

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 1952

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 2012

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 83972003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 2072

 83972004 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 83972063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 2132

 83972064 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 83972123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 2192

 83972124 AATATC 83972129
          ||||||
     2193 AATATC 2198

Alignment time is 2.87755 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3839] =>      3839 nucs 'mol-32-2f07-093634_3839'

Score:        3817
Aligned:      3839        nucs
Identic:      3837 (100%) nucs =>      2715 (100%)      1122 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83965201,83967917] EXCISED REGION [83970684,83971805]
 second seq =>  [       1,    2717] EXCISED REGION [    2718,    3839]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83965201 TGTTAGGTCTAAATAGTGTAATAATGCATAAATTTTTTCTTCTACTATAAATTGTATTAT 83965260
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTTAGGTCTAAATAGTGTAATAATGCATAAGTTTTTTCTTCTACTATAAATTGTATTAT 60

 83965261 AAGTAAAATAATAAAAATGCCTTTGGCATGGGAGCAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCC 83965320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTAAAATAATAAAAATGCCTTTGGCATGGGAGCAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCC 120

 83965321 TACACTGTTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAATTTTACCAACTATCTGCATACAGAAAA 83965380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACACTGTTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAATTTTACCAACTATCTGCATACAGAAAA 180

 83965381 GTACCATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACT 83965440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTACCATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACT 240

 83965441 TCGTATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACC 83965500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCGTATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACC 300

 83965501 ATACCTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTG 83965560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATACCTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTG 360

 83965561 GGGAGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGTG 83965620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      361 GGGAGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGCG 420

 83965621 GAGAATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGA 83965680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGAATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGA 480

 83965681 AAGAGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAA 83965740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGAGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAA 540

 83965741 ATCCACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAG 83965800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCCACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAG 600

 83965801 ATATAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAG 83965860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATATAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAG 660

 83965861 AGAAAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATACC 83965920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAAAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATACC 720

 83965921 TAGATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACT 83965980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACT 780

 83965981 CAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAAA 83966040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAAA 840

 83966041 GGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGC 83966100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGC 900

 83966101 AGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGT 83966160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGT 960

 83966161 GATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCA 83966220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCA 1020

 83966221 TGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAA 83966280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAA 1080

 83966281 ACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGT 83966340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGT 1140

 83966341 TAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAA 83966400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAA 1200

 83966401 GAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAG 83966460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAG 1260

 83966461 AATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAA 83966520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAA 1320

 83966521 ATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATG 83966580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATG 1380

 83966581 AGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGG 83966640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGG 1440

 83966641 TTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTC 83966700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTC 1500

 83966701 ATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACAT 83966760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACAT 1560

 83966761 ACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCAC 83966820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCAC 1620

 83966821 TTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGA 83966880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGA 1680

 83966881 AAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAA 83966940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAA 1740

 83966941 ATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGAC 83967000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGAC 1800

 83967001 CCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAA 83967060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAA 1860

 83967061 ACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGC 83967120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGC 1920

 83967121 TATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGG 83967180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGG 1980

 83967181 TAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATA 83967240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATA 2040

 83967241 TGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACAT 83967300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACAT 2100

 83967301 GTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCT 83967360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCT 2160

 83967361 ATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCT 83967420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCT 2220

 83967421 CTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCA 83967480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCA 2280

 83967481 CTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATA 83967540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATA 2340

 83967541 AAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACA 83967600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACA 2400

 83967601 TTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCA 83967660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCA 2460

 83967661 AGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAAC 83967720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAAC 2520

 83967721 AGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAA 83967780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAA 2580

 83967781 CAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAAT 83967840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAAT 2640

 83967841 TTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAG 83967900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAG 2700

 83967901 CAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          |||||||||||||||||
     2701 CAGTACTAAGAGGGAAA 2717

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 2777

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 2837

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 2897

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 2957

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 3017

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 3077

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 3137

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 3197

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 3257

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 3317

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3318 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 3377

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 3437

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3438 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 3497

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3498 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 3557

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3558 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 3617

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3618 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 3677

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3678 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 3737

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3738 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 3797

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTC 83971805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3798 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTC 3839

Alignment time is 3.38613 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3513] =>      3513 nucs 'mol-32-2fb7-148049_3513'

Score:        3512
Aligned:      3512        nucs
Identic:      3512 (100%) nucs =>      2958 (100%)       554 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83968645,83971602] EXCISED REGION [83971604,83972157]
 second seq =>  [       1,    2958] EXCISED REGION [    2960,    3513]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [83971603,83971603]
 second seq =>         1 nucs [2959,2959]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83971603,83971603] to [83971604,83971604]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [83971601,83971602] to [83971604,83971605]
 second seq =>         2 nucs [2957,2958] to [2960,2961]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83968645 TTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGT 83968704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGT 60

 83968705 TCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAA 83968764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAA 120

 83968765 GGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAA 83968824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAA 180

 83968825 TCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAA 83968884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAA 240

 83968885 TCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCT 83968944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCT 300

 83968945 GCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTA 83969004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTA 360

 83969005 TTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCA 83969064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCA 420

 83969065 TACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCA 83969124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCA 480

 83969125 TTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGT 83969184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGT 540

 83969185 GTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATT 83969244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATT 600

 83969245 TTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGG 83969304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGG 660

 83969305 GTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAG 83969364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAG 720

 83969365 TTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTA 83969424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTA 780

 83969425 CCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACA 83969484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACA 840

 83969485 CAAACAAATGGAAACACATCCCATGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGA 83969544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAACAAATGGAAACACATCCCATGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGA 900

 83969545 CCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCAT 83969604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCAT 960

 83969605 TCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGA 83969664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGA 1020

 83969665 TAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCA 83969724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCA 1080

 83969725 AACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCAC 83969784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCAC 1140

 83969785 GTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTG 83969844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTG 1200

 83969845 ATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGT 83969904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGT 1260

 83969905 GCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTT 83969964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTT 1320

 83969965 CTACTAAAATCAACTCAAGATGGATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAA 83970024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTACTAAAATCAACTCAAGATGGATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAA 1380

 83970025 AATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCAT 83970084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCAT 1440

 83970085 GACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAA 83970144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAA 1500

 83970145 ACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGC 83970204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGC 1560

 83970205 GTGAGAAAATCTTCACAATCTATATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACA 83970264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTGAGAAAATCTTCACAATCTATATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACA 1620

 83970265 AATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACAT 83970324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACAT 1680

 83970325 GAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAA 83970384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAA 1740

 83970385 CATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCT 83970444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCT 1800

 83970445 GAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAAC 83970504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAAC 1860

 83970505 AGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAG 83970564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAG 1920

 83970565 TGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTAC 83970624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTAC 1980

 83970625 TGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGT 83970684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGT 2040

 83970685 TTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCA 83970744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCA 2100

 83970745 ATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAA 83970804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAA 2160

 83970805 AAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAG 83970864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAG 2220

 83970865 TGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGC 83970924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGC 2280

 83970925 CATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGT 83970984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGT 2340

 83970985 GGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAAT 83971044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAAT 2400

 83971045 GGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCAC 83971104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCAC 2460

 83971105 CGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCA 83971164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCA 2520

 83971165 AATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAA 83971224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAA 2580

 83971225 AATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAAC 83971284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAAC 2640

 83971285 AATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACA 83971344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACA 2700

 83971345 AACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGA 83971404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGA 2760

 83971405 TGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAA 83971464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAA 2820

 83971465 TGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATAC 83971524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATAC 2880

 83971525 ACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATG 83971584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATG 2940

 83971585 CAATGAGATCAAAGTCAT 83971602
          ||||||||||||||||||
     2941 CAATGAGATCAAAGTCAT 2958

EXCISED REGION

 83971604 ATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTAC 83971663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 ATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTAC 3019

 83971664 CAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAG 83971723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 CAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAG 3079

 83971724 GAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTA 83971783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 GAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTA 3139

 83971784 AAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAA 83971843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 AAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAA 3199

 83971844 ATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAAT 83971903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 ATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAAT 3259

 83971904 GTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTC 83971963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 GTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTC 3319

 83971964 ACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAAT 83972023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 ACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAAT 3379

 83972024 GTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACC 83972083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 GTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACC 3439

 83972084 TAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGC 83972143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 TAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGC 3499

 83972144 GGACTATTTAAAGC 83972157
          ||||||||||||||
     3500 GGACTATTTAAAGC 3513

Alignment time is 3.20809 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2288] =>      2288 nucs 'mol-32-2fb7-171355_2288'

Score:        2275
Aligned:      2286        nucs
Identic:      2285 (100%) nucs =>       845 (100%)      1440 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967073,83967917] EXCISED REGION [83970684,83972124]
 second seq =>  [       3,     847] EXCISED REGION [     848,    2288]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83967073 GGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTC 83967132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        3 GGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTC 62

 83967133 AGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAAT 83967192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       63 AGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAAT 122

 83967193 GATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACAC 83967252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      123 GATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACAC 182

 83967253 TGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTC 83967312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      183 TGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTC 242

 83967313 CAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAA 83967372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      243 CAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAA 302

 83967373 CTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGA 83967432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      303 CTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGA 362

 83967433 TAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCT 83967492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      363 TAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCT 422

 83967493 CCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAAC 83967552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      423 CCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAAC 482

 83967553 CTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCA 83967612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 CTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCA 542

 83967613 GCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACA 83967672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 GCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACA 602

 83967673 TTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAAT 83967732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      603 TTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAAT 662

 83967733 CAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCT 83967792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      663 CAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCT 722

 83967793 GAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAA 83967852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 GAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAA 782

 83967853 ATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAG 83967912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 ATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAG 842

 83967913 GGAAA 83967917
          |||||
      843 GGAAA 847

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      848 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 907

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 967

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 1027

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 1087

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 1147

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 1207

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 1267

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 1327

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 1387

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 1447

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 1507

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 1567

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 1627

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 1687

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 1747

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 1807

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 1867

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1868 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCCAATCAATGCA 1927

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 1987

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 2047

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 2107

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 83972003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 2167

 83972004 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 83972063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 2227

 83972064 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 83972123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 2287

 83972124 A 83972124
          |
     2288 A 2288

Alignment time is 2.38242 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    4181] =>      4181 nucs 'mol-32-2fcd-161450_4181'

Score:        4171
Aligned:      4182        nucs
Identic:      4181 (100%) nucs =>       935 (100%)      3246 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967071,83968005] EXCISED REGION [83968011,83971257]
 second seq =>  [       1,     935] EXCISED REGION [     936,    4181]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [83968006,83968010]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [83968006,83968021] to [83968011,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [83968006,83968007] to [83968009,83968010]
 second seq =>         0 nucs

 83967071 ATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATG 83967130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATG 60

 83967131 TCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATA 83967190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATA 120

 83967191 ATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAAC 83967250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAAC 180

 83967251 ACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGC 83967310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGC 240

 83967311 TCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGA 83967370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGA 300

 83967371 AACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGA 83967430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGA 360

 83967431 GATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGAT 83967490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGAT 420

 83967491 CTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGA 83967550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGA 480

 83967551 ACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCAT 83967610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCAT 540

 83967611 CAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAA 83967670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAA 600

 83967671 CATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAA 83967730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAA 660

 83967731 ATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTC 83967790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTC 720

 83967791 CTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAAC 83967850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAAC 780

 83967851 AAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAG 83967910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAG 840

 83967911 AGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGT 83967970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGT 900

 83967971 TAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 83968005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 935

EXCISED REGION

 83968011 TTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTGC 83968070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 TTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTGC 995

 83968071 TTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGGA 83968130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 TTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGGA 1055

 83968131 AACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTTC 83968190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 AACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTTC 1115

 83968191 AAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTTG 83968250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 AAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTTG 1175

 83968251 GATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTTG 83968310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 GATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTTG 1235

 83968311 AAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTTC 83968370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 AAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTTC 1295

 83968371 AACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTATA 83968430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 AACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTATA 1355

 83968431 TTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTGG 83968490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 TTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTGG 1415

 83968491 ATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAATT 83968550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 ATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAATT 1475

 83968551 CTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCCT 83968610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 CTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCCT 1535

 83968611 GGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTTA 83968670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 GGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTTA 1595

 83968671 GCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTTT 83968730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 GCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTTT 1655

 83968731 TCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAAT 83968790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 TCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAAT 1715

 83968791 TAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATT 83968850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 TAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATT 1775

 83968851 CTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTG 83968910
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     1776 CTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAA-TTTTTTTTG 1834

 83968911 TTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTAT 83968970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 TTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTAT 1894

 83968971 CTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCC 83969030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 CTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCC 1954

 83969031 TAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTAT 83969090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 TAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTAT 2014

 83969091 TTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTT 83969150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 TTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTT 2074

 83969151 CTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAA 83969210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 CTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAA 2134

 83969211 TAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCT 83969270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 TAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCT 2194

 83969271 GCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTC 83969330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 GCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTC 2254

 83969331 TCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATG 83969390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 TCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATG 2314

 83969391 TAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAAC 83969450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 TAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAAC 2374

 83969451 TACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGC 83969510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 TACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGC 2434

 83969511 TCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAAC 83969570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 TCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAAC 2494

 83969571 TTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATT 83969630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 TTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATT 2554

 83969631 CTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAG 83969690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 CTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAG 2614

 83969691 AACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAAC 83969750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 AACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAAC 2674

 83969751 CAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAA 83969810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 CAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAA 2734

 83969811 TGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACAT 83969870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 TGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACAT 2794

 83969871 AAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGT 83969930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 AAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGT 2854

 83969931 AGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGATT 83969990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 AGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGATT 2914

 83969991 AAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAA 83970050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 AAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAA 2974

 83970051 CCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAA 83970110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 CCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAA 3034

 83970111 TAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGA 83970170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 TAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGA 3094

 83970171 ACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATATG 83970230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 ACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATATG 3154

 83970231 TCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAA 83970290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 TCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAA 3214

 83970291 AAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATA 83970350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 AAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATA 3274

 83970351 TACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAA 83970410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 TACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAA 3334

 83970411 ATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCA 83970470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 ATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCA 3394

 83970471 AAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGG 83970530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 AAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGG 3454

 83970531 GAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAA 83970590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 GAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAA 3514

 83970591 GTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAG 83970650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 GTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAG 3574

 83970651 TCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCA 83970710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 TCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCA 3634

 83970711 GAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAAT 83970770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 GAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAAT 3694

 83970771 ATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAG 83970830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 ATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAG 3754

 83970831 TGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCA 83970890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 TGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCA 3814

 83970891 AACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATG 83970950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 AACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATG 3874

 83970951 ATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACT 83971010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 ATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACT 3934

 83971011 ACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCAC 83971070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 ACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCAC 3994

 83971071 CACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAA 83971130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 CACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAA 4054

 83971131 TAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTT 83971190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 TAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTT 4114

 83971191 AAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGA 83971250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 AAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGA 4174

 83971251 TCAGAGC 83971257
          |||||||
     4175 TCAGAGC 4181

Alignment time is 3.93152 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,   11235] =>     11235 nucs 'mol-32-2fd8-030924_11235'

Score:       11204
Aligned:     11237        nucs
Identic:     11234 (100%) nucs =>      6999 (100%)      4235 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83961004,83968005] EXCISED REGION [83968010,83972244]
 second seq =>  [       1,    7000] EXCISED REGION [    7001,   11235]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [83968006,83968009]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [83968006,83968022] to [83968010,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [83968006,83968007] to [83968008,83968009]
 second seq =>         0 nucs

 83961004 CTTTGAAAAACATTTTTTCAAAGAAATTGCGAAAACCCACTTTCCAGGTCTTAACATCCT 83961063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTGAAAAACATTTTTTCAAAGAAATTGCGAAAACCCACTTTCCAGGTCTTAACATCCT 60

 83961064 CAATGCAGTCTAGTGTTAAAACATGCTTTACAGATAATTCAGATGATGAGTACAGAATCA 83961123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATGCAGTCTAGTGTTAAAACATGCTTTACAGATAATTCAGATGATGAGTACAGAATCA 120

 83961124 TTGTCTTAGAAAATATAAAGGTCCCTTATGGCTAAGATCACTTTTGAATTATCTTCTGCA 83961183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTCTTAGAAAATATAAAGGTCCCTTATGGCTAAGATCACTTTTGAATTATCTTCTGCA 180

 83961184 GAAAGGAAGGTGGTATATCTTTATGGATATTCCCAAAAAACAGCCCACAAGCCTTTCCTG 83961243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAGGAAGGTGGTATATCTTTATGGATATTCCCAAAAAACAGCCCACAAGCCTTTCCTG 240

 83961244 GTGACCCATCTCTACAACATTGTGGTGAAGAGAACCCTGAACTAAAAGTCAGAAGACTTT 83961303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGACCCATCTCTACAACATTGTGGTGAAGAGAACCCTGAACTAAAAGTCAGAAGACTTT 300

 83961304 TAGTCAAAGCAATGGCTGGTCCTTACTCAGGCTGTGACCCAAAACAAATAAATTATCCAG 83961363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGTCAAAGCAATGGCTGGTCCTTACTCAGGCTGTGACCCAAAACAAATAAATTATCCAG 360

 83961364 CCCTCAATGTAAATGAGGCAGGTCCTTCAAACTTGGCCTGGCTGATATCTATGTTTGGTG 83961423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCTCAATGTAAATGAGGCAGGTCCTTCAAACTTGGCCTGGCTGATATCTATGTTTGGTG 420

 83961424 TGACCTTTATTTCTTGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTAGATGGAGTTTTGCTCTTGTT 83961483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGACCTTTATTTCTTGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTAGATGGAGTTTTGCTCTTGTT 480

 83961484 GCCCAGGCTGGAAAGCAATGACATGATCTCAGCTCACCACAAACTCCGCCTCCCGGGTTC 83961543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCCAGGCTGGAAAGCAATGACATGATCTCAGCTCACCACAAACTCCGCCTCCCGGGTTC 540

 83961544 AAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGCGCCACCACGC 83961603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCATGCGCCACCACGC 600

 83961604 TCAGCTAATTTTGTATTTCCTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCT 83961663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAGCTAATTTTGTATTTCCTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCT 660

 83961664 CGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACTCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGC 83961723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACTCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGC 720

 83961724 CATTAGCCACGGCGCCCAGCCGATTATTTTCTTTTTTTTAAATGATGCTTTTATCACTTT 83961783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATTAGCCACGGCGCCCAGCCGATTATTTTCTTTTTTTTAAATGATGCTTTTATCACTTT 780

 83961784 TATACAGAGAGTAGATACACATCAAAAATAAATAAACTGTCTGATACTAAAGAAAGCAGT 83961843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATACAGAGAGTAGATACACATCAAAAATAAATAAACTGTCTGATACTAAAGAAAGCAGT 840

 83961844 GGGTCATATGTATTGTTTTATTTTGTTTTTTAAATCATGGCAGCAGTTATCTTCAAGATA 83961903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGTCATATGTATTGTTTTATTTTGTTTTTTAAATCATGGCAGCAGTTATCTTCAAGATA 900

 83961904 AGTATTCTCTCTTTTAAGTGATTATCTTAAGAGACTAAGTAGTCTTACACCAGTTAATAT 83961963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTATTCTCTCTTTTAAGTGATTATCTTAAGAGACTAAGTAGTCTTACACCAGTTAATAT 960

 83961964 GGCACATGCAAAACTTCACTCCATTACCTTAGAACCTCCTTTCATTTTTTTCTAACAGTA 83962023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCACATGCAAAACTTCACTCCATTACCTTAGAACCTCCTTTCATTTTTTTCTAACAGTA 1020

 83962024 ATAGTTTTACCCAAATCATTCAATTTACTCACCAGATTGGCCAAATAGAACTTATGATTG 83962083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATAGTTTTACCCAAATCATTCAATTTACTCACCAGATTGGCCAAATAGAACTTATGATTG 1080

 83962084 TTCCCCCAAATCAGAGTAGCATTGAAGGATGAAGATGGTTATCACTGGGGATACATCAGA 83962143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCCCCCAAATCAGAGTAGCATTGAAGGATGAAGATGGTTATCACTGGGGATACATCAGA 1140

 83962144 TCATGTCCTTAGCCTTCACACATAGTTACAAAAGGACAGACAAAAATGCTTAAGTAATAA 83962203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCATGTCCTTAGCCTTCACACATAGTTACAAAAGGACAGACAAAAATGCTTAAGTAATAA 1200

 83962204 GAGAGTAGGGGAAGAAAAAAGTGTTTTTCTCCCACCCATCTTAGGTTCATTGAGTAGAGC 83962263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGAGTAGGGGAAGAAAAAAGTGTTTTTCTCCCACCCATCTTAGGTTCATTGAGTAGAGC 1260

 83962264 TCTGCAAATTAGACTGACAAAAGGACTGATTAACAAGAGGAAAAACAAACAGAAGTTTAC 83962323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTGCAAATTAGACTGACAAAAGGACTGATTAACAAGAGGAAAAACAAACAGAAGTTTAC 1320

 83962324 TAACACATGCGTTGTGCATACACGTGGGAGCACTCATAATGAGTAACTCAAAGGGGGTGA 83962383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAACACATGCGTTGTGCATACACGTGGGAGCACTCATAATGAGTAACTCAAAGGGGGTGA 1380

 83962384 TTAGAACTTAGGGTTATATAGCATCTTTTAAATTTGATACATTATTATACATATTTATAA 83962443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1381 TTAGAACTTAGGGTTATATAGCATCTTTTAAATTTGATACATTATTATACAGATTTATAA 1440

 83962444 GATACATGTGATATTTTCATACATACATACAATGATTAATGATCAAATCAGGCTATTTAG 83962503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATACATGTGATATTTTCATACATACATACAATGATTAATGATCAAATCAGGCTATTTAG 1500

 83962504 TATATCTATCCCTCAAACATTTATTATTTATTTCTGTTGGGAACATTTCAACTCTTCTCT 83962563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATATCTATCCCTCAAACATTTATTATTTATTTCTGTTGGGAACATTTCAACTCTTCTCT 1560

 83962564 ACTAGTTCTTTGGAAATATATAATAAATTATTGTTAACTATAGTCACCCTACTCTGTTAC 83962623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTAGTTCTTTGGAAATATATAATAAATTATTGTTAACTATAGTCACCCTACTCTGTTAC 1620

 83962624 TGAACATTAGAACTTATTCCTTCTAACTGTATACTCCTACCCATTAACAAACCTCACTTC 83962683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAACATTAGAACTTATTCCTTCTAACTGTATACTCCTACCCATTAACAAACCTCACTTC 1680

 83962684 ATCCCCACCCACCCCCACCCTTTCCAGCCTCATTCTATTTTCTATCACCATAATAAGATC 83962743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCCCCACCCACCCCCACCCTTTCCAGCCTCATTCTATTTTCTATCACCATAATAAGATC 1740

 83962744 AACTGTTTTAGCGCCCACATATGAATGGGAACATGTGATATTTGTCTTTCTGGGCCTGGC 83962803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACTGTTTTAGCGCCCACATATGAATGGGAACATGTGATATTTGTCTTTCTGGGCCTGGC 1800

 83962804 TTACTTTATTTAACATAATCATCTCCAGTTCCTTCTAGGCTACTGCAAATGACAGGATTT 83962863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTACTTTATTTAACATAATCATCTCCAGTTCCTTCTAGGCTACTGCAAATGACAGGATTT 1860

 83962864 CATTCATTTTAACAGCTGAATAGCATTTCATTATGTATATATACCACATTTTCTTTATCC 83962923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATTCATTTTAACAGCTGAATAGCATTTCATTATGTATATATACCACATTTTCTTTATCC 1920

 83962924 ATTCGTCGATTGACAGACACATAGGTTGATGCCATATCTTGGCTATTGTGAATAGTACGG 83962983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTCGTCGATTGACAGACACATAGGTTGATGCCATATCTTGGCTATTGTGAATAGTACGG 1980

 83962984 CAATAAACATGGGGGTGAAAGTACCCCTTAAATATACTGATTTCCTTCCCTTTGAATAAA 83963043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAATAAACATGGGGGTGAAAGTACCCCTTAAATATACTGATTTCCTTCCCTTTGAATAAA 2040

 83963044 TAGGCAGTAATGGGATTGGTGGATTGTATGGTCACTCTGTTTTTAGTTTTTTTGAGAAAC 83963103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAGGCAGTAATGGGATTGGTGGATTGTATGGTCACTCTGTTTTTAGTTTTTTTGAGAAAC 2100

 83963104 CTCCATACTGTTTTCCATAATGGCTATATTAATTTACATTCCCACCAACAGTATATAAGA 83963163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTCCATACTGTTTTCCATAATGGCTATATTAATTTACATTCCCACCAACAGTATATAAGA 2160

 83963164 GTCCCTTTTCTCTGCATACTTGCCAGCATATGTTATTTTTTTTCTTTTTGATAATAGCCA 83963223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTCCCTTTTCTCTGCATACTTGCCAGCATATGTTATTTTTTTTCTTTTTGATAATAGCCA 2220

 83963224 TTCTAACTGGTGTAAGATGATATCACATTGTGATTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTA 83963283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCTAACTGGTGTAAGATGATATCACATTGTGATTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTA 2280

 83963284 GTGATGTTGAGTGTTTTTTCACATATCTGTTGGCCATTTGCATATCTTCTTTTCAGCAAT 83963343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTGATGTTGAGTGTTTTTTCACATATCTGTTGGCCATTTGCATATCTTCTTTTCAGCAAT 2340

 83963344 GTCTATTCGGATCCTTTGCCCACTTTCCAATGGGAGTATTTGTTTTTTGTTATTGAGTTG 83963403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTCTATTCGGATCCTTTGCCCACTTTCCAATGGGAGTATTTGTTTTTTGTTATTGAGTTG 2400

 83963404 TTGGGAGTTCCTTGGGTATTCTGGATATTAGCATTTGTTGGATGAATAGTTTGCAAATAT 83963463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTGGGAGTTCCTTGGGTATTCTGGATATTAGCATTTGTTGGATGAATAGTTTGCAAATAT 2460

 83963464 TTGTTCCCATTCTACAGGTTGTCTCTTCACTCTGTTGATTGCTTCCTTGCTGTGCAGAAG 83963523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTGTTCCCATTCTACAGGTTGTCTCTTCACTCTGTTGATTGCTTCCTTGCTGTGCAGAAG 2520

 83963524 ATTTTTGGTGTAATATAATTCAGTTTGTCTATTTCTTCAAGGAGGACTACAAACCACTGC 83963583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTTTTGGTGTAATATAATTCAGTTTGTCTATTTCTTCAAGGAGGACTACAAACCACTGC 2580

 83963584 TCAAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATGAGAA 83963643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCAAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATGAGAA 2640

 83963644 AGAATCAATATCATGAAAATGGCCATACTGCCCAAAGTAATTTATAGATTTAATGCTATC 83963703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGAATCAATATCATGAAAATGGCCATACTGCCCAAAGTAATTTATAGATTTAATGCTATC 2700

 83963704 GCCATCAAGATACTATTGACTTTCTTCAAAGAATTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATA 83963763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCCATCAAGATACTATTGACTTTCTTCAAAGAATTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATA 2760

 83963764 TGGAACCAAAAAAGAGCCTGTATAGCCAAGACAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGA 83963823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGGAACCAAAAAAGAGCCTGTATAGCCAAGACAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGA 2820

 83963824 GGCATCACGTTACCTGACTTCAAATATACAAGCCTACAGTAACCAAAACCGCATGGTACT 83963883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGCATCACGTTACCTGACTTCAAATATACAAGCCTACAGTAACCAAAACCGCATGGTACT 2880

 83963884 GGTAGGATGTTGAATTTTATCAAATCCCTTTTTTTTTTTTTTTGGTCTATTGAGATGTTC 83963943
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2881 GGTAGGATGTTGAATTTTATCAAATCCCTTTTTTTTTTTTTT-GGTCTATTGAGATGTTC 2939

 83963944 ATATGATTTTTGTCTTTCTTTCTGTTGAGGTGATATATTTATTGATTTGTGTGTGTTCAG 83964003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 ATATGATTTTTGTCTTTCTTTCTGTTGAGGTGATATATTTATTGATTTGTGTGTGTTCAG 2999

 83964004 TCATCATCCTTGCGTCCCTGGGATAATCCCACTTAGTCATGTTGAGGTGTTGCTGGATTT 83964063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TCATCATCCTTGCGTCCCTGGGATAATCCCACTTAGTCATGTTGAGGTGTTGCTGGATTT 3059

 83964064 AGTTTGCTAGTATTTTGTAGAGGATTTTTGCATCTATGTTTATCAGGGATACTGGCAGAC 83964123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AGTTTGCTAGTATTTTGTAGAGGATTTTTGCATCTATGTTTATCAGGGATACTGGCAGAC 3119

 83964124 AGTTTTTCTTGTTGTTATCTGTTATGTCCTTGTCTGGTTTTGGTATTAGGGTCATTTTGG 83964183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AGTTTTTCTTGTTGTTATCTGTTATGTCCTTGTCTGGTTTTGGTATTAGGGTCATTTTGG 3179

 83964184 CCTCATATAATGCGTCAGGAAGAGTTCACTCCCTTTCAATGTTTTGGGATAGTATGAGAA 83964243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CCTCATATAATGCGTCAGGAAGAGTTCACTCCCTTTCAATGTTTTGGGATAGTATGAGAA 3239

 83964244 GAATCAGTGTTAATTCTTTTTATAAGTTTGGTAGAATTAGCTGACTCTGAGCACAGTGCC 83964303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GAATCAGTGTTAATTCTTTTTATAAGTTTGGTAGAATTAGCTGACTCTGAGCACAGTGCC 3299

 83964304 TAGGGGTTAACACTGCTCTGCAAGGAAGAGGTTAAAAAAAAAGTTTGATAGAATTAAGCA 83964363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TAGGGGTTAACACTGCTCTGCAAGGAAGAGGTTAAAAAAAAAGTTTGATAGAATTAAGCA 3359

 83964364 GTAAAGCCACCAGGTCCTGGGCTTTTCTTTGCTGGGAAACATTTTATTAATGTTATTAAT 83964423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GTAAAGCCACCAGGTCCTGGGCTTTTCTTTGCTGGGAAACATTTTATTAATGTTATTAAT 3419

 83964424 ATCAATATTATTATTTACTATTAATCTGTTCAGGTTTTCTATTTTTTTTTTTTATTCAAT 83964483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 ATCAATATTATTATTTACTATTAATCTGTTCAGGTTTTCTATTTTTTTTTTTTATTCAAT 3479

 83964484 CTTGGTAGGTTGTACCTCTCCAGAAATTTATCCATCTCCTCTAGGTTTTCTAATTTGTTA 83964543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 CTTGGTAGGTTGTACCTCTCCAGAAATTTATCCATCTCCTCTAGGTTTTCTAATTTGTTA 3539

 83964544 GTGTATAACAAAAAATATTGAAAGTTTAGAACACTGAATGCTTGGCTGTGGCAGATCTGT 83964603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 GTGTATAACAAAAAATATTGAAAGTTTAGAACACTGAATGCTTGGCTGTGGCAGATCTGT 3599

 83964604 TCAGCCAAGATCGGGACTACTTCAGCTGGCTCTGAGGGTTCAAAGGAGTCTGAGAAGCAA 83964663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TCAGCCAAGATCGGGACTACTTCAGCTGGCTCTGAGGGTTCAAAGGAGTCTGAGAAGCAA 3659

 83964664 AAATCTTAGTGAACCTCTACCTAGATGTCCCCATCACATGTTAGCTACACCTTTTCCCCA 83964723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 AAATCTTAGTGAACCTCTACCTAGATGTCCCCATCACATGTTAGCTACACCTTTTCCCCA 3719

 83964724 CCACGTCCCTGACCTCAACTTTACAGACCTACCTCCCCTTGGTTCAGAAATTATGCTGAG 83964783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 CCACGTCCCTGACCTCAACTTTACAGACCTACCTCCCCTTGGTTCAGAAATTATGCTGAG 3779

 83964784 TGAGCTTAGGAGAAACTATATTGAAATTCATTGCTCAAAATATACACCTGAACTCAAAAA 83964843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TGAGCTTAGGAGAAACTATATTGAAATTCATTGCTCAAAATATACACCTGAACTCAAAAA 3839

 83964844 TTTCAAAAAGTGCCATAGATGGACATAACCAACATTACAAGCAAATTTATCTAAAAGTGT 83964903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TTTCAAAAAGTGCCATAGATGGACATAACCAACATTACAAGCAAATTTATCTAAAAGTGT 3899

 83964904 ATTTGTTACAGTGTTGTCTAAAATTTAAAAAAAATTGAAAACAACCAAAATGTCCAAAAC 83964963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 ATTTGTTACAGTGTTGTCTAAAATTTAAAAAAAATTGAAAACAACCAAAATGTCCAAAAC 3959

 83964964 TAGGAAGCTGATTAAGTCAACTGTAATATCCATTCCAAAGGATACAGAGCTATCAGGAAA 83965023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TAGGAAGCTGATTAAGTCAACTGTAATATCCATTCCAAAGGATACAGAGCTATCAGGAAA 4019

 83965024 ATTTATGTTTTACAAGTAAACATAAATAGTGATATAGAACATTGCTCATTATCTATTGTT 83965083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 ATTTATGTTTTACAAGTAAACATAAATAGTGATATAGAACATTGCTCATTATCTATTGTT 4079

 83965084 TAACAGAAATTTCAGGTTACAAATTGGATTATCCCACTTTTATTTTATATATATATATAT 83965143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 TAACAGAAATTTCAGGTTACAAATTGGATTATCCCACTTTTATTTTATATATATATATAT 4139

 83965144 ATATATTCAAACATATTTATAAAAGCCATGAAAATTTACACAAAAAATGTTAATAATTGT 83965203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 ATATATTCAAACATATTTATAAAAGCCATGAAAATTTACACAAAAAATGTTAATAATTGT 4199

 83965204 TAGGTCTAAATAGTGTAATAATGCATAAATTTTTTCTTCTACTATAAATTGTATTATAAG 83965263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TAGGTCTAAATAGTGTAATAATGCATAAATTTTTTCTTCTACTATAAATTGTATTATAAG 4259

 83965264 TAAAATAATAAAAATGCCTTTGGCATGGGAGCAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCCTAC 83965323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TAAAATAATAAAAATGCCTTTGGCATGGGAGCAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCCTAC 4319

 83965324 ACTGTTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAATTTTACCAACTATCTGCATACAGAAAAGTA 83965383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 ACTGTTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAATTTTACCAACTATCTGCATACAGAAAAGTA 4379

 83965384 CCATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACTTCG 83965443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 CCATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACTTCG 4439

 83965444 TATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACCATA 83965503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACCATA 4499

 83965504 CCTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGG 83965563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 CCTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGG 4559

 83965564 AGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGTGGAG 83965623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 AGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGTGGAG 4619

 83965624 AATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAG 83965683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 AATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAG 4679

 83965684 AGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATC 83965743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 AGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATC 4739

 83965744 CACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATA 83965803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 CACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATA 4799

 83965804 TAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGA 83965863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 TAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGA 4859

 83965864 AAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATACCTAG 83965923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 AAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATACCTAG 4919

 83965924 ATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAA 83965983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 ATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAA 4979

 83965984 AGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGA 83966043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 AGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGA 5039

 83966044 TACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGC 83966103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 TACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGC 5099

 83966104 AGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGAT 83966163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 AGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGAT 5159

 83966164 AAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGA 83966223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 AAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGA 5219

 83966224 AGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAAACC 83966283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 AGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAAACC 5279

 83966284 TGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAA 83966343
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     5280 TGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAA-GGATGTTAA 5338

 83966344 TGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAA 83966403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 TGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAA 5398

 83966404 GAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAAT 83966463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 GAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAAT 5458

 83966464 AGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATG 83966523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 AGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATG 5518

 83966524 ATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGA 83966583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 ATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGA 5578

 83966584 AATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTT 83966643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 AATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTT 5638

 83966644 TATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATC 83966703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 TATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATC 5698

 83966704 TAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACA 83966763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 TAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACA 5758

 83966764 ATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTT 83966823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 ATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTT 5818

 83966824 CACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAA 83966883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 CACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAA 5878

 83966884 CAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATA 83966943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 CAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATA 5938

 83966944 GACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCA 83967003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 GACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCA 5998

 83967004 ATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACA 83967063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 ATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACA 6058

 83967064 TAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTAT 83967123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 TAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTAT 6118

 83967124 ATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAA 83967183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 ATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAA 6178

 83967184 TTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGC 83967243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 TTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGC 6238

 83967244 ACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTG 83967303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 ACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTG 6298

 83967304 TGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATT 83967363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 TGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATT 6358

 83967364 TTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTG 83967423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 TTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTG 6418

 83967424 TGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTG 83967483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 TGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTG 6478

 83967484 GAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAA 83967543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 GAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAA 6538

 83967544 TAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTC 83967603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 TAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTC 6598

 83967604 TTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGT 83967663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 TTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGT 6658

 83967664 TCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGA 83967723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 TCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGA 6718

 83967724 ACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAA 83967783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 ACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAA 6778

 83967784 TATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTC 83967843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 TATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTC 6838

 83967844 TTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAG 83967903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 TTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAG 6898

 83967904 TACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACT 83967963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6899 TACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACT 6958

 83967964 CCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 83968005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 CCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 7000

EXCISED REGION

 83968010 TTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTG 83968069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7001 TTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTG 7060

 83968070 CTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGG 83968129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7061 CTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGG 7120

 83968130 AAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTT 83968189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7121 AAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTT 7180

 83968190 CAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTT 83968249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7181 CAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTT 7240

 83968250 GGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTT 83968309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7241 GGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTT 7300

 83968310 GAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTT 83968369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7301 GAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTT 7360

 83968370 CAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTAT 83968429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7361 CAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTAT 7420

 83968430 ATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTG 83968489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7421 ATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTG 7480

 83968490 GATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAAT 83968549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7481 GATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAAT 7540

 83968550 TCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCC 83968609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7541 TCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCC 7600

 83968610 TGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTT 83968669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7601 TGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTT 7660

 83968670 AGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTT 83968729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7661 AGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTT 7720

 83968730 TTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAA 83968789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7721 TTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAA 7780

 83968790 TTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAAT 83968849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7781 TTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAAT 7840

 83968850 TCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTT 83968909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7841 TCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTT 7900

 83968910 GTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTA 83968969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7901 GTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTA 7960

 83968970 TCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTC 83969029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7961 TCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTC 8020

 83969030 CTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTA 83969089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8021 CTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTA 8080

 83969090 TTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTT 83969149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8081 TTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTT 8140

 83969150 TCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAA 83969209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8141 TCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAA 8200

 83969210 ATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTC 83969269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8201 ATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTC 8260

 83969270 TGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTT 83969329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8261 TGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTT 8320

 83969330 CTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGAT 83969389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8321 CTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGAT 8380

 83969390 GTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAA 83969449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8381 GTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAA 8440

 83969450 CTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATG 83969509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8441 CTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATG 8500

 83969510 CTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAA 83969569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8501 CTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAA 8560

 83969570 CTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAAT 83969629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8561 CTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAAT 8620

 83969630 TCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAA 83969689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8621 TCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAA 8680

 83969690 GAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAA 83969749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8681 GAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAA 8740

 83969750 CCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACA 83969809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8741 CCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACA 8800

 83969810 ATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACA 83969869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8801 ATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACA 8860

 83969870 TAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATG 83969929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8861 TAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATG 8920

 83969930 TAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGAT 83969989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8921 TAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGAT 8980

 83969990 TAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAA 83970049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8981 TAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAA 9040

 83970050 ACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCA 83970109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9041 ACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCA 9100

 83970110 ATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGG 83970169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9101 ATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGG 9160

 83970170 AACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATAT 83970229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9161 AACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATAT 9220

 83970230 GTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAA 83970289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9221 GTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAA 9280

 83970290 AAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGAT 83970349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9281 AAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGAT 9340

 83970350 ATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCA 83970409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9341 ATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCA 9400

 83970410 AATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTC 83970469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9401 AATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTC 9460

 83970470 AAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTG 83970529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9461 AAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTG 9520

 83970530 GGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAA 83970589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9521 GGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAA 9580

 83970590 AGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGA 83970649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9581 AGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGA 9640

 83970650 GTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGC 83970709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9641 GTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGC 9700

 83970710 AGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAA 83970769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9701 AGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAA 9760

 83970770 TATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAA 83970829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9761 TATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAA 9820

 83970830 GTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACC 83970889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9821 GTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACC 9880

 83970890 AAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAAT 83970949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9881 AAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAAT 9940

 83970950 GATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGAC 83971009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9941 GATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGAC 10000

 83971010 TACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCA 83971069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10001 TACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCA 10060

 83971070 CCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAA 83971129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10061 CCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAA 10120

 83971130 ATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTT 83971189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10121 ATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTT 10180

 83971190 TAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGG 83971249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10181 TAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGG 10240

 83971250 ATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAAA 83971309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10241 ATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAAA 10300

 83971310 AGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAA 83971369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10301 AGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAA 10360

 83971370 AAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGAT 83971429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10361 AAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGAT 10420

 83971430 ACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATTG 83971489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10421 ACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATTG 10480

 83971490 GAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCAT 83971549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10481 GAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCAT 10540

 83971550 GAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAA 83971609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10541 GAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAA 10600

 83971610 AGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACA 83971669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10601 AGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACA 10660

 83971670 TTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGA 83971729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10661 TTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGA 10720

 83971730 ATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAG 83971789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10721 ATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAG 10780

 83971790 CTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTA 83971849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10781 CTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTA 10840

 83971850 ATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAG 83971909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10841 ATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAG 10900

 83971910 AAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAG 83971969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10901 AAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAG 10960

 83971970 TGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCT 83972029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10961 TGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCT 11020

 83972030 ATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAG 83972089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11021 ATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAG 11080

 83972090 ATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTA 83972149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11081 ATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTA 11140

 83972150 TTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAATTATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTT 83972209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11141 TTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAATTATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTT 11200

 83972210 AACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAATT 83972244
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11201 AACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAATT 11235

Alignment time is 9.80633 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2231] =>      2231 nucs 'mol-32-3004-221926_2231'

Score:        2231
Aligned:      2231        nucs
Identic:      2231 (100%) nucs =>       946 (100%)      1285 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83966972,83967917] EXCISED REGION [83970684,83971968]
 second seq =>  [       1,     946] EXCISED REGION [     947,    2231]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83966972 AGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACAC 83967031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACAC 60

 83967032 ATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCC 83967091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCC 120

 83967092 AATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAG 83967151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAG 180

 83967152 ACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAG 83967211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAG 240

 83967212 CATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCT 83967271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCT 300

 83967272 CTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATG 83967331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATG 360

 83967332 ACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTA 83967391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTA 420

 83967392 ACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAG 83967451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAG 480

 83967452 AGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACA 83967511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACA 540

 83967512 AAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAA 83967571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAA 600

 83967572 CATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAA 83967631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAA 660

 83967632 GGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAAT 83967691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAAT 720

 83967692 ATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTT 83967751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTT 780

 83967752 GGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGT 83967811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGT 840

 83967812 GAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAAC 83967871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAAC 900

 83967872 ATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 946

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      947 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 1006

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1007 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 1066

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 1126

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 1186

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 1246

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 1306

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 1366

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 1426

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 1486

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 1546

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 1606

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 1666

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 1726

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 1786

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 1846

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 1906

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 1966

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 2026

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 2086

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 2146

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 2206

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATA 83971968
          |||||||||||||||||||||||||
     2207 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATA 2231

Alignment time is 1.78411 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    5091] =>      5091 nucs 'mol-32-301a-081112_5091'

Score:        5080
Aligned:      5091        nucs
Identic:      5090 (100%) nucs =>       837 (100%)      4253 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967169,83968005] EXCISED REGION [83968011,83972264]
 second seq =>  [       1,     837] EXCISED REGION [     838,    5091]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [83968006,83968010]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [83968006,83968021] to [83968011,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [83968006,83968007] to [83968009,83968010]
 second seq =>         0 nucs

 83967169 AGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGAT 83967228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGAT 60

 83967229 TGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATA 83967288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATA 120

 83967289 TTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAA 83967348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAA 180

 83967349 TTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTC 83967408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTC 240

 83967409 AGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACC 83967468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACC 300

 83967469 CCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTA 83967528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTA 360

 83967529 ATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCT 83967588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCT 420

 83967589 ACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTA 83967648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTA 480

 83967649 TGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGA 83967708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGA 540

 83967709 CCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATAT 83967768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATAT 600

 83967769 ATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAA 83967828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAA 660

 83967829 AATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAG 83967888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAG 720

 83967889 ATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAG 83967948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAG 780

 83967949 AAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 83968005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 837

EXCISED REGION

 83968011 TTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTGC 83968070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTGC 897

 83968071 TTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGGA 83968130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 TTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGGA 957

 83968131 AACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTTC 83968190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 AACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTTC 1017

 83968191 AAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTTG 83968250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTTG 1077

 83968251 GATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTTG 83968310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTTG 1137

 83968311 AAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTTC 83968370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 AAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTTC 1197

 83968371 AACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTATA 83968430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 AACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTATA 1257

 83968431 TTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTGG 83968490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTGG 1317

 83968491 ATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAATT 83968550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 ATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAATT 1377

 83968551 CTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCCT 83968610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCCT 1437

 83968611 GGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTTA 83968670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 GGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTTA 1497

 83968671 GCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTTT 83968730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTTT 1557

 83968731 TCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAAT 83968790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAAT 1617

 83968791 TAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATT 83968850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATT 1677

 83968851 CTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTG 83968910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTG 1737

 83968911 TTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTAT 83968970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTAT 1797

 83968971 CTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCC 83969030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 CTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCC 1857

 83969031 TAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTAT 83969090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTAT 1917

 83969091 TTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTT 83969150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTT 1977

 83969151 CTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAA 83969210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 CTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAA 2037

 83969211 TAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCT 83969270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCT 2097

 83969271 GCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTC 83969330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 GCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTC 2157

 83969331 TCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATG 83969390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATG 2217

 83969391 TAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAAC 83969450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAAC 2277

 83969451 TACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGC 83969510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGC 2337

 83969511 TCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAAC 83969570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAAC 2397

 83969571 TTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATT 83969630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATT 2457

 83969631 CTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAG 83969690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 CTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAG 2517

 83969691 AACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAAC 83969750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 AACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAAC 2577

 83969751 CAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAA 83969810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAA 2637

 83969811 TGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACAT 83969870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACAT 2697

 83969871 AAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGT 83969930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 AAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGT 2757

 83969931 AGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGATT 83969990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 AGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGATT 2817

 83969991 AAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAA 83970050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 AAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAA 2877

 83970051 CCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAA 83970110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 CCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAA 2937

 83970111 TAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGA 83970170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGA 2997

 83970171 ACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATATG 83970230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 ACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATATG 3057

 83970231 TCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAA 83970290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 TCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAA 3117

 83970291 AAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATA 83970350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 AAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATA 3177

 83970351 TACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAA 83970410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 TACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAA 3237

 83970411 ATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCA 83970470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 ATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCA 3297

 83970471 AAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGG 83970530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 AAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGG 3357

 83970531 GAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAA 83970590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAA 3417

 83970591 GTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAG 83970650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 GTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAG 3477

 83970651 TCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCA 83970710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 TCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCA 3537

 83970711 GAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAAT 83970770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 GAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAAT 3597

 83970771 ATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAG 83970830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 ATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAG 3657

 83970831 TGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCA 83970890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 TGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCA 3717

 83970891 AACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATG 83970950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 AACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATG 3777

 83970951 ATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACT 83971010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 ATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACT 3837

 83971011 ACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCAC 83971070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 ACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCAC 3897

 83971071 CACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAA 83971130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 CACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAA 3957

 83971131 TAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTT 83971190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 TAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTT 4017

 83971191 AAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGA 83971250
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 AAGAACTAGAAAAGCAGTAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGA 4077

 83971251 TCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAA 83971310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAA 4137

 83971311 GTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAA 83971370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 GTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAA 4197

 83971371 AAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATA 83971430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 AAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATA 4257

 83971431 CTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGG 83971490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 CTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGG 4317

 83971491 AAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCATG 83971550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 AAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCATG 4377

 83971551 AAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAA 83971610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 AAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAA 4437

 83971611 GTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACAT 83971670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 GTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACAT 4497

 83971671 TTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAA 83971730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 TTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAA 4557

 83971731 TACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGC 83971790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 TACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGC 4617

 83971791 TTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAA 83971850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAA 4677

 83971851 TATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGA 83971910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 TATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGA 4737

 83971911 AGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGT 83971970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 AGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGT 4797

 83971971 GGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTA 83972030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 GGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTA 4857

 83972031 TCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGA 83972090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 TCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGA 4917

 83972091 TTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTAT 83972150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 TTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTAT 4977

 83972151 TTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAATTATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTA 83972210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 TTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAATTATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTA 5037

 83972211 ACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAATTCTAAGTAAGCTTGAGCTCAG 83972264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 ACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAATTCTAAGTAAGCTTGAGCTCAG 5091

Alignment time is 4.14219 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    6431] =>      6431 nucs 'mol-32-3025-168315_6431'

Score:        6409
Aligned:      6431        nucs
Identic:      6429 (100%) nucs =>      1843 (100%)      4586 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83966075,83967917] EXCISED REGION [83970684,83975271]
 second seq =>  [       1,    1843] EXCISED REGION [    1844,    6431]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83966075 TAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAA 83966134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAA 60

 83966135 AGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCA 83966194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCA 120

 83966195 TATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAA 83966254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAA 180

 83966255 AAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTT 83966314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTT 240

 83966315 CAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGA 83966374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGA 300

 83966375 CTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGT 83966434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGT 360

 83966435 AATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACC 83966494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACC 420

 83966495 ACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAA 83966554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAA 480

 83966555 CTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGC 83966614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGC 540

 83966615 GGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTT 83966674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTT 600

 83966675 TTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCT 83966734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCT 660

 83966735 TATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAAT 83966794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAAT 720

 83966795 TAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAA 83966854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAA 780

 83966855 GGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAA 83966914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAA 840

 83966915 CTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGT 83966974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGT 900

 83966975 AGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATT 83967034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATT 960

 83967035 TCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAAT 83967094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAAT 1020

 83967095 GGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACA 83967154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACA 1080

 83967155 AACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCAT 83967214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCAT 1140

 83967215 CAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTT 83967274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTT 1200

 83967275 TAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACT 83967334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACT 1260

 83967335 GTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACA 83967394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACA 1320

 83967395 CAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGC 83967454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGC 1380

 83967455 TGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAG 83967514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAG 1440

 83967515 AAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACAT 83967574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACAT 1500

 83967575 TTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGA 83967634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGA 1560

 83967635 TAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATC 83967694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATC 1620

 83967695 AATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGA 83967754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGA 1680

 83967755 AACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAA 83967814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAA 1740

 83967815 GAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATA 83967874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATA 1800

 83967875 CCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 1843

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 1903

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 1963

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 2023

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 2083

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 2143

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 2203

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 2263

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 2323

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 2383

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 2443

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 2503

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 2563

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 2623

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 2683

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 2743

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 2803

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 2863

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 2923

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 2983

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 3043

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 3103

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 83972003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 3163

 83972004 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 83972063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 3223

 83972064 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 83972123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 3283

 83972124 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 83972183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 3343

 83972184 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 83972243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 3403

 83972244 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 83972303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 3463

 83972304 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 83972363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 3523

 83972364 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATC 83972423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATC 3583

 83972424 ATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTG 83972483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 ATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTG 3643

 83972484 TTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTT 83972543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 TTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTT 3703

 83972544 AAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCA 83972603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 AAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCA 3763

 83972604 AAAAATAGAGTAGTGAAATAAACCCTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAG 83972663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3764 AAAAATAGAGTAGTGAAATAAACCCTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAG 3823

 83972664 TCCAGACAGACTTATTACATCTTTAGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTG 83972723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3824 TCCAGACAGACTTATTACATCTTTAGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTG 3883

 83972724 AAATAAATTCTAAACAATGCAACATTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAA 83972783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3884 AAATAAATTCTAAACAATGCAACATTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAA 3943

 83972784 GATAAGAATTCTTTCATAAAGCATAACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAA 83972843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3944 GATAAGAATTCTTTCATAAAGCATAACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAA 4003

 83972844 TATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTTGTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAA 83972903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4004 TATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTTGTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAA 4063

 83972904 TACGATTCAAACAAGATCACATTGCATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTA 83972963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4064 TACGATTCAAACAAGATCACATTGCATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTA 4123

 83972964 TGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTTCTTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTG 83973023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4124 TGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTTCTTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTG 4183

 83973024 TCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTGAATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACA 83973083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4184 TCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTGAATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACA 4243

 83973084 CGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCCTGAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTG 83973143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4244 CGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCCTGAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTG 4303

 83973144 AGCAGATTCAAATTGAATTTTTCAGTAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATC 83973203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4304 AGCAGATTCAAATTGAATTTTTCAGTAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATC 4363

 83973204 ATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGTATCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCC 83973263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4364 ATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGTATCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCC 4423

 83973264 TGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCG 83973323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4424 TGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCG 4483

 83973324 CGCACCTATAATCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAG 83973383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4484 CGCACCTATAATCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAG 4543

 83973384 GCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAA 83973443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4544 GCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAA 4603

 83973444 AACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAATTGATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCAT 83973503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4604 AACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAATTGATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCAT 4663

 83973504 TCCTTAGGAATTTCTTTACCTAATGGTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCA 83973563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4664 TCCTTAGGAATTTCTTTACCTAATGGTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCA 4723

 83973564 TTACATTTTTAGGGGTTGCAAATGGCATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAA 83973623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4724 TTACATTTTTAGGGGTTGCAAATGGCATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAA 4783

 83973624 TAATTAATAATCTGTAACGCATCTATAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTC 83973683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4784 TAATTAATAATCTGTAACGCATCTATAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTC 4843

 83973684 CACTTAGATGAAATAATGAAAAAGGTGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTAT 83973743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4844 CACTTAGATGAAATAATGAAAAAGGTGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTAT 4903

 83973744 CCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTGTCTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCC 83973803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4904 CCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTGTCTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCC 4963

 83973804 AGAAATATTTGAAAGGGAATGGGTTTGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAAC 83973863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4964 AGAAATATTTGAAAGGGAATGGGTTTGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAAC 5023

 83973864 AGAGAACATGCCCTAATGAAATTTAAGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCA 83973923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5024 AGAGAACATGCCCTAATGAAATTTAAGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCA 5083

 83973924 CAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATTAAAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAA 83973983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5084 CAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATTAAAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAA 5143

 83973984 CAGGGAAGTTTAAATTATATAATAAATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAA 83974043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5144 CAGGGAAGTTTAAATTATATAATAAATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAA 5203

 83974044 AGGTTCTATCATCCTTATATGTTATGCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAAT 83974103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5204 AGGTTCTATCATCCTTATATGTTATGCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAAT 5263

 83974104 AAAATCAAAGAAGCACAGAAAACTAGTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGA 83974163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5264 AAAATCAAAGAAGCACAGAAAACTAGTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGA 5323

 83974164 AGCATAACAATAAAGAAAAAACTATTCTAAAAAATGATATTTTTATTTTATAAAAATACA 83974223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5324 AGCATAACAATAAAGAAAAAACTATTCTAAAAAATGATATTTTTATTTTATAAAAATACA 5383

 83974224 CAAATTTTAATAAGTTGGTCAATCCTAACATAAAAGGTAAATGACAACTTGAAAAAAATT 83974283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5384 CAAATTTTAATAAGTTGGTCAATCCTAACATAAAAGGTAAATGACAACTTGAAAAAAATT 5443

 83974284 ACATAAAATATTCTCAATATATAAGAAGCTCTTCCAGGCAAGCCCATTCATAGTAAAATA 83974343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5444 ACATAAAATATTCTCAATATATAAGAAGCTCTTCCAGGCAAGCCCATTCATAGTAAAATA 5503

 83974344 AAATGCTCAAAAAATGATGAAACACATGCAAATTAAAACACAATAGAATTCTATGTTTTT 83974403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5504 AAATGCTCAAAAAATGATGAAACACATGCAAATTAAAACACAATAGAATTCTATGTTTTT 5563

 83974404 CTTTCTTTTTTTTTTTTAAACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA 83974463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 CTTTCTTTTTTTTTTTTAAACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA 5623

 83974464 CAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCT 83974523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5624 CAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCT 5683

 83974524 CCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCGCCCACCACACGTCCGAATAATTTTTCGTATTTTTAG 83974583
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5684 CCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACACGTCCGAATAATTTTTCGTATTTTTAG 5743

 83974584 TAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTCGTGATCCA 83974643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5744 TAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTCGTGATCCA 5803

 83974644 CCTGCCTCAGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCAGCCTCTG 83974703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5804 CCTGCCTCAGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCAGCCTCTG 5863

 83974704 TTTTTCTTTAAAACTGACACCAAATTTCTCTAATATTAAAGCCTAGCATTGGAACTGGTA 83974763
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     5864 TTTTTCTTTAAAACTGACACCAAATTTCTCTAATATTAAAGTCTAGCATTGGAACTGGTA 5923

 83974764 TGGGAAATAGAAAACTCATGCTCTACTGAGGAAATCATACAACAGTATAATTTTTATGAA 83974823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 TGGGAAATAGAAAACTCATGCTCTACTGAGGAAATCATACAACAGTATAATTTTTATGAA 5983

 83974824 GAACAACTTGGTATCAGGAATAATAAATCTTCAAAATATTCTTACCCTTTGAGCCAAAAT 83974883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 GAACAACTTGGTATCAGGAATAATAAATCTTCAAAATATTCTTACCCTTTGAGCCAAAAT 6043

 83974884 ATCCCTTAATATATATTTAGATTTTCTTTGTTCTGTAATTAAGCCACTACAATAACAACT 83974943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6044 ATCCCTTAATATATATTTAGATTTTCTTTGTTCTGTAATTAAGCCACTACAATAACAACT 6103

 83974944 AATCCTTTCTAGAATTTTTTTTGAAGACATAAACACAGAGGTACATAAATATTTGTGTGC 83975003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6104 AATCCTTTCTAGAATTTTTTTTGAAGACATAAACACAGAGGTACATAAATATTTGTGTGC 6163

 83975004 AGGCCGTGCACGGTGGCTCATGCCTATAATCCTAGCACTTGGGGAGGCCAAGTAGACCAC 83975063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 AGGCCGTGCACGGTGGCTCATGCCTATAATCCTAGCACTTGGGGAGGCCAAGTAGACCAC 6223

 83975064 TTGAGCCTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGAGCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACAAAAA 83975123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6224 TTGAGCCTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGAGCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACAAAAA 6283

 83975124 ATACAAAAATTAGACAGGCATGGTGGTGCATTCCTGTAGTCCCAACTACTTGGGAGGCTG 83975183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6284 ATACAAAAATTAGACAGGCATGGTGGTGCATTCCTGTAGTCCCAACTACTTGGGAGGCTG 6343

 83975184 AGGTGGGAGGATCACCTGAGCCCAGGGAGGTATGGGCTGCAGTGAGCTGTGGTTGTGCCA 83975243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6344 AGGTGGGAGGATCACCTGAGCCCAGGGAGGTATGGGCTGCAGTGAGCTGTGGTTGTGCCA 6403

 83975244 CTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAA 83975271
          ||||||||||||||||||||||||||||
     6404 CTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAA 6431

Alignment time is 5.47286 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    6327] =>      6327 nucs 'mol-32-3030-024278_6327'

Score:        6316
Aligned:      6327        nucs
Identic:      6326 (100%) nucs =>      2537 (100%)      3789 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83965380,83967917] EXCISED REGION [83970684,83974472]
 second seq =>  [       1,    2538] EXCISED REGION [    2539,    6327]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83965380 AGTACCATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAAC 83965439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTACCATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAAC 60

 83965440 TTCGTATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACAC 83965499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCGTATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACAC 120

 83965500 CATACCTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTT 83965559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATACCTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTT 180

 83965560 GGGGAGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGT 83965619
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      181 GGGGAGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGC 240

 83965620 GGAGAATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGG 83965679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAGAATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGG 300

 83965680 AAAGAGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAA 83965739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGAGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAA 360

 83965740 AATCCACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAA 83965799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATCCACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAA 420

 83965800 GATATAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCA 83965859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATATAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCA 480

 83965860 GAGAAAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATAC 83965919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGAAAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATAC 540

 83965920 CTAGATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAAC 83965979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAGATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAAC 600

 83965980 TCAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAA 83966039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAA 660

 83966040 AGGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAG 83966099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAG 720

 83966100 CAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAG 83966159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAG 780

 83966160 TGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGC 83966219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGC 840

 83966220 ATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCA 83966279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCA 900

 83966280 AACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATG 83966339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATG 960

 83966340 TTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGA 83966399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGA 1020

 83966400 AGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACA 83966459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACA 1080

 83966460 GAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTA 83966519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTA 1140

 83966520 AATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAAT 83966579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAAT 1200

 83966580 GAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAG 83966639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAG 1260

 83966640 GTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGT 83966699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGT 1320

 83966700 CATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACA 83966759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACA 1380

 83966760 TACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCA 83966819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCA 1440

 83966820 CTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAG 83966879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAG 1500

 83966880 AAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTA 83966939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTA 1560

 83966940 AATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGA 83966999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGA 1620

 83967000 CCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAA 83967059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAA 1680

 83967060 AACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAG 83967119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAG 1740

 83967120 CTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAG 83967179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAG 1800

 83967180 GTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATAT 83967239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATAT 1860

 83967240 ATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACA 83967299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACA 1920

 83967300 TGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACC 83967359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACC 1980

 83967360 TATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTC 83967419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTC 2040

 83967420 TCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGC 83967479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGC 2100

 83967480 ACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCAT 83967539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCAT 2160

 83967540 AAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACAC 83967599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACAC 2220

 83967600 ATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGC 83967659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGC 2280

 83967660 AAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAA 83967719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAA 2340

 83967720 CAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAA 83967779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAA 2400

 83967780 ACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAA 83967839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAA 2460

 83967840 TTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAA 83967899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAA 2520

 83967900 GCAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          ||||||||||||||||||
     2521 GCAGTACTAAGAGGGAAA 2538

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 2598

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 2658

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 2718

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 2778

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 2838

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 2898

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 2958

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 3018

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 3078

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 3138

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 3198

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 3258

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 3318

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 3378

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 3438

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 3498

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 3558

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 3618

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 3678

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 3738

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 3798

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 83972003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 3858

 83972004 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 83972063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 3918

 83972064 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 83972123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 3978

 83972124 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 83972183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 4038

 83972184 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 83972243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 4098

 83972244 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 83972303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 4158

 83972304 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 83972363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 4218

 83972364 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATC 83972423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATC 4278

 83972424 ATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTG 83972483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 ATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTG 4338

 83972484 TTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTT 83972543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 TTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTT 4398

 83972544 AAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCA 83972603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 AAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCA 4458

 83972604 AAAAATAGAGTAGTGAAATAAACCCTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAG 83972663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 AAAAATAGAGTAGTGAAATAAACCCTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAG 4518

 83972664 TCCAGACAGACTTATTACATCTTTAGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTG 83972723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 TCCAGACAGACTTATTACATCTTTAGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTG 4578

 83972724 AAATAAATTCTAAACAATGCAACATTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAA 83972783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 AAATAAATTCTAAACAATGCAACATTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAA 4638

 83972784 GATAAGAATTCTTTCATAAAGCATAACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAA 83972843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 GATAAGAATTCTTTCATAAAGCATAACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAA 4698

 83972844 TATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTTGTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAA 83972903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 TATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTTGTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAA 4758

 83972904 TACGATTCAAACAAGATCACATTGCATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTA 83972963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 TACGATTCAAACAAGATCACATTGCATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTA 4818

 83972964 TGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTTCTTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTG 83973023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 TGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTTCTTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTG 4878

 83973024 TCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTGAATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACA 83973083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 TCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTGAATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACA 4938

 83973084 CGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCCTGAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTG 83973143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 CGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCCTGAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTG 4998

 83973144 AGCAGATTCAAATTGAATTTTTCAGTAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATC 83973203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 AGCAGATTCAAATTGAATTTTTCAGTAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATC 5058

 83973204 ATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGTATCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCC 83973263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 ATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGTATCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCC 5118

 83973264 TGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCG 83973323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 TGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCG 5178

 83973324 CGCACCTATAATCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAG 83973383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 CGCACCTATAATCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAG 5238

 83973384 GCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAA 83973443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 GCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAA 5298

 83973444 AACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAATTGATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCAT 83973503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 AACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAATTGATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCAT 5358

 83973504 TCCTTAGGAATTTCTTTACCTAATGGTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCA 83973563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 TCCTTAGGAATTTCTTTACCTAATGGTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCA 5418

 83973564 TTACATTTTTAGGGGTTGCAAATGGCATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAA 83973623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 TTACATTTTTAGGGGTTGCAAATGGCATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAA 5478

 83973624 TAATTAATAATCTGTAACGCATCTATAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTC 83973683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 TAATTAATAATCTGTAACGCATCTATAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTC 5538

 83973684 CACTTAGATGAAATAATGAAAAAGGTGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTAT 83973743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 CACTTAGATGAAATAATGAAAAAGGTGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTAT 5598

 83973744 CCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTGTCTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCC 83973803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 CCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTGTCTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCC 5658

 83973804 AGAAATATTTGAAAGGGAATGGGTTTGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAAC 83973863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 AGAAATATTTGAAAGGGAATGGGTTTGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAAC 5718

 83973864 AGAGAACATGCCCTAATGAAATTTAAGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCA 83973923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5719 AGAGAACATGCCCTAATGAAATTTAAGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCA 5778

 83973924 CAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATTAAAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAA 83973983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 CAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATTAAAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAA 5838

 83973984 CAGGGAAGTTTAAATTATATAATAAATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAA 83974043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 CAGGGAAGTTTAAATTATATAATAAATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAA 5898

 83974044 AGGTTCTATCATCCTTATATGTTATGCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAAT 83974103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 AGGTTCTATCATCCTTATATGTTATGCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAAT 5958

 83974104 AAAATCAAAGAAGCACAGAAAACTAGTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGA 83974163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 AAAATCAAAGAAGCACAGAAAACTAGTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGA 6018

 83974164 AGCATAACAATAAAGAAAAAACTATTCTAAAAAATGATATTTTTATTTTATAAAAATACA 83974223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 AGCATAACAATAAAGAAAAAACTATTCTAAAAAATGATATTTTTATTTTATAAAAATACA 6078

 83974224 CAAATTTTAATAAGTTGGTCAATCCTAACATAAAAGGTAAATGACAACTTGAAAAAAATT 83974283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 CAAATTTTAATAAGTTGGTCAATCCTAACATAAAAGGTAAATGACAACTTGAAAAAAATT 6138

 83974284 ACATAAAATATTCTCAATATATAAGAAGCTCTTCCAGGCAAGCCCATTCATAGTAAAATA 83974343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 ACATAAAATATTCTCAATATATAAGAAGCTCTTCCAGGCAAGCCCATTCATAGTAAAATA 6198

 83974344 AAATGCTCAAAAAATGATGAAACACATGCAAATTAAAACACAATAGAATTCTATGTTTTT 83974403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6199 AAATGCTCAAAAAATGATGAAACACATGCAAATTAAAACACAATAGAATTCTATGTTTTT 6258

 83974404 CTTTCTTTTTTTTTTTTAAACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA 83974463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 CTTTCTTTTTTTTTTTTAAACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA 6318

 83974464 CAATCTCGG 83974472
          |||||||||
     6319 CAATCTCGG 6327

Alignment time is 5.40074 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2546] =>      2546 nucs 'mol-32-3030-024278_2546'

Score:        2545
Aligned:      2545        nucs
Identic:      2545 (100%) nucs =>       239 (100%)      2306 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83965380,83965618] EXCISED REGION [83965620,83967925]
 second seq =>  [       1,     239] EXCISED REGION [     241,    2546]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [83965619,83965619]
 second seq =>         1 nucs [240,240]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83965618,83965618] to [83965620,83965620]
 second seq =>         1 nucs [239,239] to [241,241]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83965380 AGTACCATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAAC 83965439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTACCATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAAC 60

 83965440 TTCGTATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACAC 83965499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCGTATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACAC 120

 83965500 CATACCTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTT 83965559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATACCTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTT 180

 83965560 GGGGAGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAG 83965618
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGGAGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAG 239

EXCISED REGION

 83965620 GGAGAATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGG 83965679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAGAATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGG 300

 83965680 AAAGAGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAA 83965739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGAGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAA 360

 83965740 AATCCACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAA 83965799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATCCACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAA 420

 83965800 GATATAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCA 83965859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATATAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCA 480

 83965860 GAGAAAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATAC 83965919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGAAAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATAC 540

 83965920 CTAGATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAAC 83965979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAGATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAAC 600

 83965980 TCAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAA 83966039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAA 660

 83966040 AGGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAG 83966099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAG 720

 83966100 CAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAG 83966159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAG 780

 83966160 TGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGC 83966219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGC 840

 83966220 ATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCA 83966279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCA 900

 83966280 AACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATG 83966339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATG 960

 83966340 TTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGA 83966399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGA 1020

 83966400 AGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACA 83966459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACA 1080

 83966460 GAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTA 83966519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTA 1140

 83966520 AATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAAT 83966579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAAT 1200

 83966580 GAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAG 83966639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAG 1260

 83966640 GTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGT 83966699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGT 1320

 83966700 CATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACA 83966759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACA 1380

 83966760 TACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCA 83966819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCA 1440

 83966820 CTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAG 83966879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAG 1500

 83966880 AAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTA 83966939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTA 1560

 83966940 AATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGA 83966999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGA 1620

 83967000 CCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAA 83967059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAA 1680

 83967060 AACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAG 83967119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAG 1740

 83967120 CTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAG 83967179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAG 1800

 83967180 GTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATAT 83967239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATAT 1860

 83967240 ATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACA 83967299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACA 1920

 83967300 TGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACC 83967359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACC 1980

 83967360 TATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTC 83967419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTC 2040

 83967420 TCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGC 83967479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGC 2100

 83967480 ACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCAT 83967539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCAT 2160

 83967540 AAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACAC 83967599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACAC 2220

 83967600 ATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGC 83967659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGC 2280

 83967660 AAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAA 83967719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAA 2340

 83967720 CAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAA 83967779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAA 2400

 83967780 ACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAA 83967839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAA 2460

 83967840 TTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAA 83967899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAA 2520

 83967900 GCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGC 83967925
          ||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGC 2546

Alignment time is 2.06361 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    4984] =>      4984 nucs 'mol-32-3030-084268_4984'

Score:        4951
Aligned:      4984        nucs
Identic:      4981 (100%) nucs =>       883 (100%)      4098 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967123,83968005] EXCISED REGION [83968010,83972110]
 second seq =>  [       1,     883] EXCISED REGION [     884,    4984]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [83968006,83968009]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [83968006,83968022] to [83968010,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [83968006,83968007] to [83968008,83968009]
 second seq =>         0 nucs

 83967123 TATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTA 83967182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTA 60

 83967183 ATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATG 83967242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATG 120

 83967243 CACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGT 83967302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGT 180

 83967303 GTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTAT 83967362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTAT 240

 83967363 TTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCT 83967422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCT 300

 83967423 GTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACT 83967482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACT 360

 83967483 GGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAA 83967542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAA 420

 83967543 ATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATT 83967602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATT 480

 83967603 CTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAG 83967662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAG 540

 83967663 TTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAG 83967722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAG 600

 83967723 AACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACA 83967782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACA 660

 83967783 ATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTT 83967842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTT 720

 83967843 CTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCA 83967902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCA 780

 83967903 GTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAAC 83967962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAAC 840

 83967963 TCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 83968005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 883

EXCISED REGION

 83968010 TTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTG 83968069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      884 TTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTG 943

 83968070 CTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGG 83968129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 CTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGG 1003

 83968130 AAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTT 83968189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1004 AAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTT 1063

 83968190 CAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTT 83968249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 CAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTT 1123

 83968250 GGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTT 83968309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 GGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTT 1183

 83968310 GAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTT 83968369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 GAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTT 1243

 83968370 CAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTAT 83968429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 CAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTAT 1303

 83968430 ATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTG 83968489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 ATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTG 1363

 83968490 GATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAAT 83968549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 GATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAAT 1423

 83968550 TCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCC 83968609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 TCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCC 1483

 83968610 TGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTT 83968669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 TGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTT 1543

 83968670 AGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTT 83968729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 AGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTT 1603

 83968730 TTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAA 83968789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 TTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAA 1663

 83968790 TTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAAT 83968849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 TTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAAT 1723

 83968850 TCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTT 83968909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 TCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTT 1783

 83968910 GTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTA 83968969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 GTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTA 1843

 83968970 TCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTC 83969029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 TCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTC 1903

 83969030 CTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTA 83969089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 CTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTA 1963

 83969090 TTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTT 83969149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 TTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTT 2023

 83969150 TCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAA 83969209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 TCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAA 2083

 83969210 ATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTC 83969269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 ATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTC 2143

 83969270 TGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTT 83969329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 TGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTT 2203

 83969330 CTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGAT 83969389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 CTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGAT 2263

 83969390 GTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAA 83969449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 GTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAA 2323

 83969450 CTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATG 83969509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 CTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATG 2383

 83969510 CTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAA 83969569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 CTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAA 2443

 83969570 CTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAAT 83969629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 CTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAAT 2503

 83969630 TCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAA 83969689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 TCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAA 2563

 83969690 GAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAA 83969749
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 GAATAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAA 2623

 83969750 CCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACA 83969809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 CCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACA 2683

 83969810 ATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACA 83969869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 ATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACA 2743

 83969870 TAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATG 83969929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 TAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATG 2803

 83969930 TAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGAT 83969989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 TAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGAT 2863

 83969990 TAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAA 83970049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 TAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAA 2923

 83970050 ACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCA 83970109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 ACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCA 2983

 83970110 ATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGG 83970169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 ATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGG 3043

 83970170 AACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATAT 83970229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 AACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATAT 3103

 83970230 GTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAA 83970289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 GTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAA 3163

 83970290 AAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGAT 83970349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 AAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGAT 3223

 83970350 ATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCA 83970409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 ATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCA 3283

 83970410 AATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTC 83970469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 AATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTC 3343

 83970470 AAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTG 83970529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 AAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTG 3403

 83970530 GGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAA 83970589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 GGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAA 3463

 83970590 AGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGA 83970649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 AGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGA 3523

 83970650 GTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGC 83970709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 GTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGC 3583

 83970710 AGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAA 83970769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 AGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAA 3643

 83970770 TATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAA 83970829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 TATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAA 3703

 83970830 GTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACC 83970889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 GTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACC 3763

 83970890 AAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAAT 83970949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3764 AAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAAT 3823

 83970950 GATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGAC 83971009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3824 GATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGAC 3883

 83971010 TACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCA 83971069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3884 TACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCA 3943

 83971070 CCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAA 83971129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3944 CCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAA 4003

 83971130 ATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTT 83971189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4004 ATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTT 4063

 83971190 TAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGG 83971249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4064 TAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGG 4123

 83971250 ATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAAA 83971309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4124 ATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAAA 4183

 83971310 AGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAA 83971369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4184 AGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAA 4243

 83971370 AAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGAT 83971429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4244 AAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGAT 4303

 83971430 ACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATTG 83971489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4304 ACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATTG 4363

 83971490 GAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCAT 83971549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4364 GAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCAT 4423

 83971550 GAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAA 83971609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4424 GAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAA 4483

 83971610 AGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACA 83971669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4484 AGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACA 4543

 83971670 TTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGA 83971729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4544 TTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGA 4603

 83971730 ATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAG 83971789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4604 ATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAG 4663

 83971790 CTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTA 83971849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4664 CTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTA 4723

 83971850 ATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAG 83971909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4724 ATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAG 4783

 83971910 AAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAG 83971969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4784 AAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAG 4843

 83971970 TGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCT 83972029
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4844 TGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGGTCCT 4903

 83972030 ATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAG 83972089
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4904 ATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGTAG 4963

 83972090 ATTCTGACATAGCTTCCCGTA 83972110
          |||||||||||||||||||||
     4964 ATTCTGACATAGCTTCCCGTA 4984

Alignment time is 4.77747 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3632] =>      3632 nucs 'mol-32-3046-279206_3632'

Score:        3621
Aligned:      3632        nucs
Identic:      3631 (100%) nucs =>       357 (100%)      3274 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967649,83968005] EXCISED REGION [83968008,83971282]
 second seq =>  [       1,     357] EXCISED REGION [     358,    3632]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [83968006,83968007]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [83968006,83968024] to [83968008,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83968006,83968006] to [83968007,83968007]
 second seq =>         0 nucs

 83967649 TGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGA 83967708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGA 60

 83967709 CCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATAT 83967768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATAT 120

 83967769 ATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAA 83967828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAA 180

 83967829 AATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAG 83967888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAG 240

 83967889 ATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAG 83967948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAG 300

 83967949 AAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 83968005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 357

EXCISED REGION

 83968008 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTC 83968067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTC 417

 83968068 TGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCT 83968127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 TGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCT 477

 83968128 GGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTT 83968187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 GGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTT 537

 83968188 TTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGAT 83968247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGAT 597

 83968248 TTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATG 83968307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 TTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATG 657

 83968308 TTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTT 83968367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 TTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTT 717

 83968368 TTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATT 83968427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 TTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATT 777

 83968428 ATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGC 83968487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 ATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGC 837

 83968488 TGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTA 83968547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      838 TGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGGGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTA 897

 83968548 ATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATC 83968607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 ATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATC 957

 83968608 CCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTG 83968667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 CCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTG 1017

 83968668 TTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGG 83968727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 TTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGG 1077

 83968728 TTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATG 83968787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 TTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATG 1137

 83968788 AATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCA 83968847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 AATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCA 1197

 83968848 ATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTT 83968907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 ATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTT 1257

 83968908 TTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGG 83968967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGG 1317

 83968968 TATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTC 83969027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTC 1377

 83969028 TCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTG 83969087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 TCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTG 1437

 83969088 TATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGAT 83969147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGAT 1497

 83969148 TTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTC 83969207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTC 1557

 83969208 AAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGT 83969267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 AAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGT 1617

 83969268 TCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGT 83969327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGT 1677

 83969328 TTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTG 83969387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 TTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTG 1737

 83969388 ATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAA 83969447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 ATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAA 1797

 83969448 AACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCA 83969507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 AACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCA 1857

 83969508 TGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTAC 83969567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTAC 1917

 83969568 AACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACA 83969627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 AACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACA 1977

 83969628 ATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAA 83969687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 ATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAA 2037

 83969688 AAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTC 83969747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 AAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTC 2097

 83969748 AACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGA 83969807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 AACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGA 2157

 83969808 CAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAA 83969867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 CAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAA 2217

 83969868 CATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACA 83969927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 CATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACA 2277

 83969928 TGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGG 83969987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGG 2337

 83969988 ATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAA 83970047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 ATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAA 2397

 83970048 AAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATG 83970107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 AAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATG 2457

 83970108 CAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAA 83970167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 CAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAA 2517

 83970168 GGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTAT 83970227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTAT 2577

 83970228 ATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAA 83970287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 ATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAA 2637

 83970288 AAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAG 83970347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 AAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAG 2697

 83970348 ATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATG 83970407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 ATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATG 2757

 83970408 CAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAAC 83970467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 CAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAAC 2817

 83970468 TCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGG 83970527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 TCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGG 2877

 83970528 TGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTA 83970587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTA 2937

 83970588 AAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGG 83970647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 AAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGG 2997

 83970648 GAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATT 83970707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 GAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATT 3057

 83970708 GCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGG 83970767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 GCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGG 3117

 83970768 AATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTT 83970827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 AATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTT 3177

 83970828 AAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAA 83970887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAA 3237

 83970888 CCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGA 83970947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 CCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGA 3297

 83970948 ATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAG 83971007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 ATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAG 3357

 83971008 ACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAAT 83971067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 ACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAAT 3417

 83971068 CACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAA 83971127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAA 3477

 83971128 AAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATC 83971187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 AAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATC 3537

 83971188 TTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAA 83971247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 TTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAA 3597

 83971248 GGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAA 83971282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 GGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAA 3632

Alignment time is 2.88651 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2441] =>      2441 nucs 'mol-32-30eb-081690_2441'

Score:        2441
Aligned:      2441        nucs
Identic:      2441 (100%) nucs =>      1959 (100%)       482 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83965959,83967917] EXCISED REGION [83970684,83971165]
 second seq =>  [       1,    1959] EXCISED REGION [    1960,    2441]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83965959 AGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTC 83966018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTC 60

 83966019 CCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAA 83966078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAA 120

 83966079 ACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAG 83966138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAG 180

 83966139 AGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATC 83966198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATC 240

 83966199 CAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGC 83966258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGC 300

 83966259 TGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGT 83966318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGT 360

 83966319 ATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCT 83966378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCT 420

 83966379 TGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATA 83966438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATA 480

 83966439 GTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTC 83966498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTC 540

 83966499 TTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTT 83966558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTT 600

 83966559 TTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGG 83966618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGG 660

 83966619 AGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTG 83966678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTG 720

 83966679 CATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATG 83966738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATG 780

 83966739 ATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAA 83966798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAA 840

 83966799 GCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAA 83966858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAA 900

 83966859 GAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTA 83966918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTA 960

 83966919 TCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGAT 83966978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGAT 1020

 83966979 GAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCAC 83967038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCAC 1080

 83967039 CTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAA 83967098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAA 1140

 83967099 ACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACA 83967158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACA 1200

 83967159 CTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGA 83967218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGA 1260

 83967219 ATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGC 83967278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGC 1320

 83967279 TCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTC 83967338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTC 1380

 83967339 TGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGA 83967398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGA 1440

 83967399 GAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGA 83967458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGA 1500

 83967459 GACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAAC 83967518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAAC 1560

 83967519 ATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCA 83967578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCA 1620

 83967579 TCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGA 83967638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGA 1680

 83967639 CCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATG 83967698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATG 1740

 83967699 TCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACT 83967758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACT 1800

 83967759 ATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAA 83967818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAA 1860

 83967819 TTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAA 83967878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAA 1920

 83967879 AACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 1959

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 2019

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 2079

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 2139

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 2199

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 2259

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 2319

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 2379

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 2439

 83971164 AA 83971165
          ||
     2440 AA 2441

Alignment time is 2.81176 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    6927] =>      6927 nucs 'mol-32-310c-054026_6927'

Score:        6859
Aligned:      6927        nucs
Identic:      6920 (100%) nucs =>      3186 (100%)      3734 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83964729,83967917] EXCISED REGION [83970684,83974419]
 second seq =>  [       1,    3191] EXCISED REGION [    3192,    6927]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83964729 TCCCTGACCTCAACTTTACAGACCTACCTCCCCTTGGTTCAGAAATTATGCTGAGTGAGC 83964788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCCTGACCTCAACTTTACAGACCTACCTCCCCTTGGTTCAGAAATTATGCTGAGTGAGC 60

 83964789 TTAGGAGAAACTATATTGAAATTCATTGCTCAAAATATACACCTGAACTCAAAAATTTCA 83964848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAGGAGAAACTATATTGAAATTCATTGCTCAAAATATACACCTGAACTCAAAAATTTCA 120

 83964849 AAAAGTGCCATAGATGGACATAACCAACATTACAAGCAAATTTATCTAAAAGTGTATTTG 83964908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAGTGCCATAGATGGACATAACCAACATTACAAGCAAATTTATCTAAAAGTGTATTTG 180

 83964909 TTACAGTGTTGTCTAAAATTTAAAAAAAATTGAAAACAACCAAAATGTCCAAAACTAGGA 83964968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTACAGTGTTGTCTAAAATTTAAAAAAAATTGAAAACAACCAAAATGTCCAAAACTAGGA 240

 83964969 AGCTGATTAAGTCAACTGTAATATCCATTCCAAAGGATACAGAGCTATCAGGAAAATTTA 83965028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCTGATTAAGTCAACTGTAATATCCATTCCAAAGGATACAGAGCTATCAGGAAAATTTA 300

 83965029 TGTTTTACAAGTAAACATAAATAGTGATATAGAACATTGCTCATTATCTATTGTTTAACA 83965088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTTTACAAGTAAACATAAATAGTGATATAGAACATTGCTCATTATCTATTGTTTAACA 360

 83965089 GAAATTTCAGGTTACAAATTGGATTATCCCACTTTTATTTTATATATATATATATATATA 83965148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAATTTCAGGTTACAAATTGGATTATCCCACTTTTATTTTATATATATATATATATATA 420

 83965149 T--TCAAACATATTTATAAAAGCCATGAAAATTTACACAAAAAATGTTAATAATTGTTAG 83965206
          |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTCAAACATATTTATAAAAGCCATGAAAATTTACACAAAAAATGTTAATAATTGTTAG 480

 83965207 GTCTAAATAGTGTAATAATGCATAAATTTTTTCTTCTACTATAAATTGTATTATAAGTAA 83965266
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCTAAATAGTGTAATAATGCATAAGTTTTTTCTTCTACTATAAATTGTATTATAAGTAA 540

 83965267 AATAATAAAAATGCCTTTGGCATGGGAGCAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCCTACACT 83965326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATAATAAAAATGCCTTTGGCATGGGAGCAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCCTACACT 600

 83965327 GTTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAATTTTACCAACTATCTGCATACAGAAAAGTACCA 83965386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAATTTTACCAACTATCTGCATACAGAAAAGTACCA 660

 83965387 TCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACTTCGTAT 83965446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACTTCGTAT 720

 83965447 CACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACCATACCT 83965506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACCATACCT 780

 83965507 CCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGGAGG 83965566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGGAGG 840

 83965567 GAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGTGGAGAAT 83965626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      841 GAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGCGGAGAAT 900

 83965627 AAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAGAGC 83965686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAGAGC 960

 83965687 AGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATCCAC 83965746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATCCAC 1020

 83965747 AATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATATAG 83965806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATATAG 1080

 83965807 AAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGAAAG 83965866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGAAAG 1140

 83965867 AGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATACCTAGATA 83965926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATACCTAGATA 1200

 83965927 AAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAAGA 83965986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAAGA 1260

 83965987 AGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGATAC 83966046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGATAC 1320

 83966047 TAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGA 83966106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGA 1380

 83966107 CTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAA 83966166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAA 1440

 83966167 GGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGG 83966226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGG 1500

 83966227 AGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGT 83966286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGT 1560

 83966287 CTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGA 83966346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGA 1620

 83966347 GCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAA 83966406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAA 1680

 83966407 ATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGT 83966466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGT 1740

 83966467 ATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATA 83966526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATA 1800

 83966527 AACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAAT 83966586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAAT 1860

 83966587 CCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTAT 83966646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTAT 1920

 83966647 TAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAA 83966706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAA 1980

 83966707 TGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATG 83966766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATG 2040

 83966767 AATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCAC 83966826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCAC 2100

 83966827 TAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAA 83966886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAA 2160

 83966887 AGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGAC 83966946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGAC 2220

 83966947 TTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATG 83967006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATG 2280

 83967007 ATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAA 83967066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAA 2340

 83967067 ATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATT 83967126
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2341 ATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATC 2400

 83967127 TATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTA 83967186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTA 2460

 83967187 TATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACC 83967246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACC 2520

 83967247 CAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGG 83967306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGG 2580

 83967307 GTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTA 83967366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTA 2640

 83967367 AGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGA 83967426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGA 2700

 83967427 GAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAA 83967486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAA 2760

 83967487 AGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAA 83967546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAA 2820

 83967547 ATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTC 83967606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTC 2880

 83967607 TCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCT 83967666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCT 2940

 83967667 AAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACT 83967726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACT 3000

 83967727 AGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATAT 83967786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATAT 3060

 83967787 GCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTG 83967846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTG 3120

 83967847 AAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTAC 83967906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTAC 3180

 83967907 TAAGAGGGAAA 83967917
          |||||||||||
     3181 TAAGAGGGAAA 3191

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 3251

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 3311

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 3371

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 3431

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 3491

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 3551

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 3611

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 3671

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 3731

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 3791

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 3851

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 3911

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 3971

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 4031

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 4091

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 4151

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 4211

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 4271

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAACAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 4331

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 4391

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 4451

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 83972003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4452 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 4511

 83972004 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 83972063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4512 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 4571

 83972064 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 83972123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4572 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 4631

 83972124 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 83972183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4632 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 4691

 83972184 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 83972243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4692 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 4751

 83972244 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 83972303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4752 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 4811

 83972304 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 83972363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4812 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 4871

 83972364 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATC 83972423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4872 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATC 4931

 83972424 ATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTG 83972483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4932 ATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTG 4991

 83972484 TTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTT 83972543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4992 TTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTT 5051

 83972544 AAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCA 83972603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5052 AAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCA 5111

 83972604 AAAAATAGAGTAGTGAAATAAACCCTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAG 83972663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5112 AAAAATAGAGTAGTGAAATAAACCCTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAG 5171

 83972664 TCCAGACAGACTTATTACATCTTTAGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTG 83972723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5172 TCCAGACAGACTTATTACATCTTTAGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTG 5231

 83972724 AAATAAATTCTAAACAATGCAACATTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAA 83972783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5232 AAATAAATTCTAAACAATGCAACATTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAA 5291

 83972784 GATAAGAATTCTTTCATAAAGCATAACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAA 83972843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5292 GATAAGAATTCTTTCATAAAGCATAACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAA 5351

 83972844 TATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTTGTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAA 83972903
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5352 TATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTTGTCTCTCAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAA 5411

 83972904 TACGATTCAAACAAGATCACATTGCATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTA 83972963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5412 TACGATTCAAACAAGATCACATTGCATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTA 5471

 83972964 TGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTTCTTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTG 83973023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5472 TGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTTCTTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTG 5531

 83973024 TCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTGAATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACA 83973083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5532 TCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTGAATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACA 5591

 83973084 CGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCCTGAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTG 83973143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5592 CGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCCTGAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTG 5651

 83973144 AGCAGATTCAAATTGAATTTTTCAGTAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATC 83973203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5652 AGCAGATTCAAATTGAATTTTTCAGTAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATC 5711

 83973204 ATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGTATCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCC 83973263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5712 ATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGTATCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCC 5771

 83973264 TGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCG 83973323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5772 TGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCG 5831

 83973324 CGCACCTATAATCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAG 83973383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5832 CGCACCTATAATCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAG 5891

 83973384 GCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAA 83973443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5892 GCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAA 5951

 83973444 AACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAATTGATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCAT 83973503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5952 AACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAATTGATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCAT 6011

 83973504 TCCTTAGGAATTTCTTTACCTAATGGTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCA 83973563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6012 TCCTTAGGAATTTCTTTACCTAATGGTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCA 6071

 83973564 TTACATTTTTAGGGGTTGCAAATGGCATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAA 83973623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6072 TTACATTTTTAGGGGTTGCAAATGGCATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAA 6131

 83973624 TAATTAATAATCTGTAACGCATCTATAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTC 83973683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6132 TAATTAATAATCTGTAACGCATCTATAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTC 6191

 83973684 CACTTAGATGAAATAATGAAAAAGGTGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTAT 83973743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6192 CACTTAGATGAAATAATGAAAAAGGTGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTAT 6251

 83973744 CCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTGTCTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCC 83973803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6252 CCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTGTCTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCC 6311

 83973804 AGAAATATTTGAAAGGGAATGGGTTTGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAAC 83973863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6312 AGAAATATTTGAAAGGGAATGGGTTTGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAAC 6371

 83973864 AGAGAACATGCCCTAATGAAATTTAAGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCA 83973923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6372 AGAGAACATGCCCTAATGAAATTTAAGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCA 6431

 83973924 CAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATTAAAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAA 83973983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6432 CAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATTAAAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAA 6491

 83973984 CAGGGAAGTTTAAATTATATAATAAATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAA 83974043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6492 CAGGGAAGTTTAAATTATATAATAAATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAA 6551

 83974044 AGGTTCTATCATCCTTATATGTTATGCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAAT 83974103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6552 AGGTTCTATCATCCTTATATGTTATGCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAAT 6611

 83974104 AAAATCAAAGAAGCACAGAAAACTAGTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGA 83974163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6612 AAAATCAAAGAAGCACAGAAAACTAGTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGA 6671

 83974164 AGCATAACAATAAAGAAAAAACTATTCTAAAAAATGATATTTTTATTTTATAAAAATACA 83974223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6672 AGCATAACAATAAAGAAAAAACTATTCTAAAAAATGATATTTTTATTTTATAAAAATACA 6731

 83974224 CAAATTTTAATAAGTTGGTCAATCCTAACATAAAAGGTAAATGACAACTTGAAAAAAATT 83974283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6732 CAAATTTTAATAAGTTGGTCAATCCTAACATAAAAGGTAAATGACAACTTGAAAAAAATT 6791

 83974284 ACATAAAATATTCTCAATATATAAGAAGCTCTTCCAGGCAAGCCCATTCATAGTAAAATA 83974343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6792 ACATAAAATATTCTCAATATATAAGAAGCTCTTCCAGGCAAGCCCATTCATAGTAAAATA 6851

 83974344 AAATGCTCAAAAAATGATGAAACACATGCAAATTAAAACACAATAGAATTCTATGTTTTT 83974403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6852 AAATGCTCAAAAAATGATGAAACACATGCAAATTAAAACACAATAGAATTCTATGTTTTT 6911

 83974404 CTTTCTTTTTTTTTTT 83974419
          ||||||||||||||||
     6912 CTTTCTTTTTTTTTTT 6927

Alignment time is 5.41443 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3199] =>      3199 nucs 'mol-32-310c-054026_3199'

Score:        3164
Aligned:      3197        nucs
Identic:      3194 (100%) nucs =>       400 (100%)      2794 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83964729,83965128] EXCISED REGION [83965129,83967925]
 second seq =>  [       1,     400] EXCISED REGION [     403,    3199]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [401,402]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        21 nucs [401,421] to [403,423]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83965128,83965128] to [83965129,83965129]
 second seq =>         1 nucs [400,400] to [403,403]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83964729 TCCCTGACCTCAACTTTACAGACCTACCTCCCCTTGGTTCAGAAATTATGCTGAGTGAGC 83964788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCCTGACCTCAACTTTACAGACCTACCTCCCCTTGGTTCAGAAATTATGCTGAGTGAGC 60

 83964789 TTAGGAGAAACTATATTGAAATTCATTGCTCAAAATATACACCTGAACTCAAAAATTTCA 83964848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAGGAGAAACTATATTGAAATTCATTGCTCAAAATATACACCTGAACTCAAAAATTTCA 120

 83964849 AAAAGTGCCATAGATGGACATAACCAACATTACAAGCAAATTTATCTAAAAGTGTATTTG 83964908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAGTGCCATAGATGGACATAACCAACATTACAAGCAAATTTATCTAAAAGTGTATTTG 180

 83964909 TTACAGTGTTGTCTAAAATTTAAAAAAAATTGAAAACAACCAAAATGTCCAAAACTAGGA 83964968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTACAGTGTTGTCTAAAATTTAAAAAAAATTGAAAACAACCAAAATGTCCAAAACTAGGA 240

 83964969 AGCTGATTAAGTCAACTGTAATATCCATTCCAAAGGATACAGAGCTATCAGGAAAATTTA 83965028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCTGATTAAGTCAACTGTAATATCCATTCCAAAGGATACAGAGCTATCAGGAAAATTTA 300

 83965029 TGTTTTACAAGTAAACATAAATAGTGATATAGAACATTGCTCATTATCTATTGTTTAACA 83965088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTTTACAAGTAAACATAAATAGTGATATAGAACATTGCTCATTATCTATTGTTTAACA 360

 83965089 GAAATTTCAGGTTACAAATTGGATTATCCCACTTTTATTT 83965128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAATTTCAGGTTACAAATTGGATTATCCCACTTTTATTT 400

EXCISED REGION

 83965129 TATATATATATATATATATATTCAAACATATTTATAAAAGCCATGAAAATTTACACAAAA 83965188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      403 TATATATATATATATATATATTCAAACATATTTATAAAAGCCATGAAAATTTACACAAAA 462

 83965189 AATGTTAATAATTGTTAGGTCTAAATAGTGTAATAATGCATAAATTTTTTCTTCTACTAT 83965248
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      463 AATGTTAATAATTGTTAGGTCTAAATAGTGTAATAATGCATAAGTTTTTTCTTCTACTAT 522

 83965249 AAATTGTATTATAAGTAAAATAATAAAAATGCCTTTGGCATGGGAGCAGAGCAAGATGAT 83965308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      523 AAATTGTATTATAAGTAAAATAATAAAAATGCCTTTGGCATGGGAGCAGAGCAAGATGAT 582

 83965309 TGAAGAGAATCCTACACTGTTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAATTTTACCAACTATCT 83965368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      583 TGAAGAGAATCCTACACTGTTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAATTTTACCAACTATCT 642

 83965369 GCATACAGAAAAGTACCATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTAC 83965428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      643 GCATACAGAAAAGTACCATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTAC 702

 83965429 CTGGTTTTAACTTCGTATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGA 83965488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      703 CTGGTTTTAACTTCGTATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGA 762

 83965489 ATGGCTAACACCATACCTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAAT 83965548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      763 ATGGCTAACACCATACCTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAAT 822

 83965549 CTGTGCACTTTGGGGAGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGC 83965608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      823 CTGTGCACTTTGGGGAGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGC 882

 83965609 CCTGTCACAGTGGAGAATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAG 83965668
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      883 CCTGTCACAGCGGAGAATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAG 942

 83965669 TCTCTTGATGGAAAGAGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACC 83965728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      943 TCTCTTGATGGAAAGAGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACC 1002

 83965729 AGCTGTTTGAAAATCCACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAG 83965788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1003 AGCTGTTTGAAAATCCACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAG 1062

 83965789 CCTGCCTACAAGATATAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTA 83965848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1063 CCTGCCTACAAGATATAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTA 1122

 83965849 AAGAGGAGGCAGAGAAAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGA 83965908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 AAGAGGAGGCAGAGAAAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGA 1182

 83965909 ACTTCCCATACCTAGATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAA 83965968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1183 ACTTCCCATACCTAGATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAA 1242

 83965969 GCAGATTTAACTCAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATG 83966028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 GCAGATTTAACTCAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATG 1302

 83966029 AGGATAAAGAAAGGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCC 83966088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 AGGATAAAGAAAGGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCC 1362

 83966089 GATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGA 83966148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 GATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGA 1422

 83966149 TGTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGT 83966208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 TGTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGT 1482

 83966209 ATTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTT 83966268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 ATTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTT 1542

 83966269 CATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAA 83966328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 CATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAA 1602

 83966329 AAAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAA 83966388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 AAAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAA 1662

 83966389 AATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTC 83966448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 AATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTC 1722

 83966449 AGAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAG 83966508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 AGAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAG 1782

 83966509 TAGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATG 83966568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 TAGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATG 1842

 83966569 GACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTT 83966628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 GACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTT 1902

 83966629 AAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAA 83966688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 AAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAA 1962

 83966689 GTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAA 83966748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 GTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAA 2022

 83966749 ATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACT 83966808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 ATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACT 2082

 83966809 AGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCA 83966868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 AGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCA 2142

 83966869 CAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAA 83966928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 CAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAA 2202

 83966929 TATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTA 83966988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 TATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTA 2262

 83966989 AAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGAT 83967048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 AAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGAT 2322

 83967049 ACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAG 83967108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 ACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAG 2382

 83967109 AACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAG 83967168
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 AACAAGAGTAGCTATATCTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAG 2442

 83967169 AGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGAT 83967228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 AGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGAT 2502

 83967229 TGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATA 83967288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 TGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATA 2562

 83967289 TTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAA 83967348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 TTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAA 2622

 83967349 TTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTC 83967408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 TTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTC 2682

 83967409 AGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACC 83967468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 AGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACC 2742

 83967469 CCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTA 83967528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 CCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTA 2802

 83967529 ATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCT 83967588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 ATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCT 2862

 83967589 ACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTA 83967648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 ACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTA 2922

 83967649 TGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGA 83967708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 TGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGA 2982

 83967709 CCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATAT 83967768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 CCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATAT 3042

 83967769 ATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAA 83967828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 ATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAA 3102

 83967829 AATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAG 83967888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 AATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAG 3162

 83967889 ATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGC 83967925
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 ATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGC 3199

Alignment time is 2.55378 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2317] =>      2317 nucs 'mol-32-314e-214582_2317'

Score:        2317
Aligned:      2317        nucs
Identic:      2317 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83968942,83971258]
 second seq =>  [       1,    2317]

 83968942 GCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTT 83969001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTT 60

 83969002 GTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGT 83969061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGT 120

 83969062 TCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTT 83969121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTT 180

 83969122 TCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAAT 83969181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAAT 240

 83969182 GGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAA 83969241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAA 300

 83969242 ATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGC 83969301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGC 360

 83969302 TGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGC 83969361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGC 420

 83969362 CAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTA 83969421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTA 480

 83969422 GTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATG 83969481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATG 540

 83969482 ACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAA 83969541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAA 600

 83969542 TGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCAT 83969601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCAT 660

 83969602 CATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCC 83969661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCC 720

 83969662 AGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATT 83969721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATT 780

 83969722 TCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGG 83969781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGG 840

 83969782 CACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAA 83969841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAA 900

 83969842 CTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAAT 83969901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAAT 960

 83969902 GGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCAC 83969961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCAC 1020

 83969962 CTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAA 83970021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAA 1080

 83970022 AAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTT 83970081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTT 1140

 83970082 CATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAAT 83970141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAAT 1200

 83970142 TAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAA 83970201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAA 1260

 83970202 AGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATA 83970261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATA 1320

 83970262 ACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGA 83970321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGA 1380

 83970322 CATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCT 83970381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCT 1440

 83970382 CAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACT 83970441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACT 1500

 83970442 CCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTG 83970501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTG 1560

 83970502 AACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAA 83970561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAA 1620

 83970562 CAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCAC 83970621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCAC 1680

 83970622 TACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCA 83970681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCA 1740

 83970682 TGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAA 83970741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAA 1800

 83970742 TCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCAT 83970801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCAT 1860

 83970802 GAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCT 83970861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCT 1920

 83970862 AAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTA 83970921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTA 1980

 83970922 AGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAG 83970981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAG 2040

 83970982 AGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGT 83971041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGT 2100

 83971042 AATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATAC 83971101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATAC 2160

 83971102 CACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAAT 83971161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAAT 2220

 83971162 TCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACC 83971221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACC 2280

 83971222 CAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCA 83971258
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCA 2317

Alignment time is 1.63919 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3392] =>      3392 nucs 'mol-32-321f-208678_3392'

Score:        3381
Aligned:      3392        nucs
Identic:      3391 (100%) nucs =>      1367 (100%)      2024 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83968622,83969988] EXCISED REGION [83969990,83972014]
 second seq =>  [       1,    1367] EXCISED REGION [    1368,    3392]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [83969989,83969989]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [83971989,83971989]
 second seq =>         1 nucs [3367,3367]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83969989,83969989] to [83969990,83969990]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83968622 CACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTTAGCTAGTATTTC 83968681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTTAGCTAGTATTTC 60

 83968682 GTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTTTTCTTTGTTATG 83968741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTTTTCTTTGTTATG 120

 83968742 GCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAATTAGGGAAGGTT 83968801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAATTAGGGAAGGTT 180

 83968802 CCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATTCTTCTTTGAAT 83968861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATTCTTCTTTGAAT 240

 83968862 GTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTGTTGGTAATTTT 83968921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTGTTGGTAATTTT 300

 83968922 TTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATCTAATTCTTCC 83968981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATCTAATTCTTCC 360

 83968982 TGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCTAGGTTTTCTA 83969041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCTAGGTTTTCTA 420

 83969042 GTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATTTCAGTGGTGT 83969101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATTTCAGTGGTGT 480

 83969102 CAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTTT 83969161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTTT 540

 83969162 TCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAATAACCAGATTT 83969221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAATAACCAGATTT 600

 83969222 TTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTGCTCTGATCTT 83969281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTGCTCTGATCTT 660

 83969282 GGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCTT 83969341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCTT 720

 83969342 GAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTAG 83969401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTAG 780

 83969402 GGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACTACAAAACACT 83969461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACTACAAAACACT 840

 83969462 GCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGCTCATGGATGGG 83969521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGCTCATGGATGGG 900

 83969522 TAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACTTCAATGCAAT 83969581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACTTCAATGCAAT 960

 83969582 CTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTCTAAAATTCAT 83969641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTCTAAAATTCAT 1020

 83969642 ATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGAACAAATCTGG 83969701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGAACAAATCTGG 1080

 83969702 AGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACCAAAACAGCAT 83969761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACCAAAACAGCAT 1140

 83969762 GGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAATGCAGAAATAA 83969821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAATGCAGAAATAA 1200

 83969822 ACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATAAAGTGGGGAA 83969881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATAAAGTGGGGAA 1260

 83969882 AGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTAGGAGAATGAA 83969941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTAGGAGAATGAA 1320

 83969942 ACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGA 83969988
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGA 1367

EXCISED REGION

 83969990 TAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAA 83970049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 TAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAA 1427

 83970050 ACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCA 83970109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 ACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCA 1487

 83970110 ATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGG 83970169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 ATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGG 1547

 83970170 AACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATAT 83970229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 AACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATAT 1607

 83970230 GTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAA 83970289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 GTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAA 1667

 83970290 AAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGAT 83970349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 AAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGAT 1727

 83970350 ATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCA 83970409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 ATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCA 1787

 83970410 AATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTC 83970469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 AATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTC 1847

 83970470 AAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTG 83970529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 AAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTG 1907

 83970530 GGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAA 83970589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 GGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAA 1967

 83970590 AGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGA 83970649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 AGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGA 2027

 83970650 GTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGC 83970709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 GTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGC 2087

 83970710 AGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAA 83970769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 AGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAA 2147

 83970770 TATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAA 83970829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 TATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAA 2207

 83970830 GTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACC 83970889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 GTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACC 2267

 83970890 AAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAAT 83970949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 AAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAAT 2327

 83970950 GATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGAC 83971009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 GATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGAC 2387

 83971010 TACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCA 83971069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 TACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCA 2447

 83971070 CCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAA 83971129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 CCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAA 2507

 83971130 ATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTT 83971189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 ATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTT 2567

 83971190 TAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGG 83971249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 TAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGG 2627

 83971250 ATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAAA 83971309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 ATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAAA 2687

 83971310 AGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAA 83971369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 AGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAA 2747

 83971370 AAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGAT 83971429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 AAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGAT 2807

 83971430 ACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATTG 83971489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 ACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATTG 2867

 83971490 GAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCAT 83971549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 GAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCAT 2927

 83971550 GAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAA 83971609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 GAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAA 2987

 83971610 AGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACA 83971669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 AGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACA 3047

 83971670 TTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGA 83971729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 TTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGA 3107

 83971730 ATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAG 83971789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 ATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAG 3167

 83971790 CTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTA 83971849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 CTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTA 3227

 83971850 ATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAG 83971909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 ATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAG 3287

 83971910 AAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAG 83971969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 AAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAG 3347

 83971970 TGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAG 83972014
          |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3348 TGGTAACTCTCAATATTTTCCTCAATATTATATCTATTTGGAAAG 3392

Alignment time is 2.72332 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3267] =>      3267 nucs 'mol-32-3235-116857_3267'

Score:        3245
Aligned:      3267        nucs
Identic:      3265 (100%) nucs =>      2378 (100%)       887 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83965538,83967917] EXCISED REGION [83970684,83971570]
 second seq =>  [       1,    2380] EXCISED REGION [    2381,    3267]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83965538 AGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGGAGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAA 83965597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGGAGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAA 60

 83965598 TTCAGTGCTGCCCTGTCACAGTGGAGAATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTG 83965657
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCAGTGCTGCCCTGTCACAGCGGAGAATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTG 120

 83965658 CATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAGAGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTG 83965717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAGAGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTG 180

 83965718 AGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATCCACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAG 83965777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATCCACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAG 240

 83965778 AAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATATAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGT 83965837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATATAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGT 300

 83965838 TATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGAAAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGAT 83965897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGAAAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGAT 360

 83965898 AATAACAGAGAACTTCCCATACCTAGATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTA 83965957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATAACAGAGAACTTCCCATACCTAGATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTA 420

 83965958 AAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACT 83966017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACT 480

 83966018 CCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAA 83966077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAA 540

 83966078 AACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGA 83966137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGA 600

 83966138 GAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATAT 83966197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATAT 660

 83966198 CCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAG 83966257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAG 720

 83966258 CTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAG 83966317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAG 780

 83966318 TATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTC 83966377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTC 840

 83966378 TTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAAT 83966437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAAT 900

 83966438 AGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACT 83966497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACT 960

 83966498 CTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTT 83966557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTT 1020

 83966558 TTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGG 83966617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGG 1080

 83966618 GAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTT 83966677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTT 1140

 83966678 GCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTAT 83966737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTAT 1200

 83966738 GATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAA 83966797
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATAGCTTCAAATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAA 1260

 83966798 AGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGA 83966857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGA 1320

 83966858 AGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTT 83966917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTT 1380

 83966918 ATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGA 83966977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGA 1440

 83966978 TGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCA 83967037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCA 1500

 83967038 CCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGA 83967097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGA 1560

 83967098 AACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAAC 83967157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAAC 1620

 83967158 ACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAG 83967217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAG 1680

 83967218 AATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAG 83967277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAG 1740

 83967278 CTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTT 83967337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTT 1800

 83967338 CTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAG 83967397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAG 1860

 83967398 AGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGG 83967457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGG 1920

 83967458 AGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAA 83967517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAA 1980

 83967518 CATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTC 83967577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTC 2040

 83967578 ATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAG 83967637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAG 2100

 83967638 ACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAAT 83967697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAAT 2160

 83967698 GTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAAC 83967757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAAC 2220

 83967758 TATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAA 83967817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAA 2280

 83967818 ATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCA 83967877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCA 2340

 83967878 AAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 2380

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 2440

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 2500

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 2560

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 2620

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 2680

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 2740

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 2800

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 2860

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 2920

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 2980

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 3040

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 3100

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 3160

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 3220

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAAC 83971570
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAAC 3267

Alignment time is 2.63148 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    5015] =>      5015 nucs 'mol-32-3240-067307_5015'

Score:        5005
Aligned:      5016        nucs
Identic:      5015 (100%) nucs =>       878 (100%)      4137 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967128,83968005] EXCISED REGION [83968010,83972147]
 second seq =>  [       1,     878] EXCISED REGION [     879,    5015]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [83968006,83968009]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [83968006,83968022] to [83968010,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [83968006,83968007] to [83968008,83968009]
 second seq =>         0 nucs

 83967128 ATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTAT 83967187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTAT 60

 83967188 ATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCC 83967247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCC 120

 83967248 AACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGG 83967307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGG 180

 83967308 TGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAA 83967367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAA 240

 83967368 GGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAG 83967427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAG 300

 83967428 AGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAA 83967487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAA 360

 83967488 GATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAA 83967547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAA 420

 83967548 TGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCT 83967607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCT 480

 83967608 CATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTA 83967667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTA 540

 83967668 AAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTA 83967727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTA 600

 83967728 GAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATG 83967787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATG 660

 83967788 CTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGA 83967847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGA 720

 83967848 AACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACT 83967907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACT 780

 83967908 AAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTT 83967967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTT 840

 83967968 GGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 83968005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 878

EXCISED REGION

 83968010 TTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTG 83968069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      879 TTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCTG 938

 83968070 CTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGG 83968129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      939 CTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTGG 998

 83968130 AAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTT 83968189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      999 AAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTTT 1058

 83968190 CAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTT 83968249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1059 CAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATTT 1118

 83968250 GGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTT 83968309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1119 GGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGTT 1178

 83968310 GAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTT 83968369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1179 GAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTTT 1238

 83968370 CAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTAT 83968429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1239 CAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTAT 1298

 83968430 ATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTG 83968489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 ATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCTG 1358

 83968490 GATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAAT 83968549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 GATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAAT 1418

 83968550 TCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCC 83968609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 TCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCCC 1478

 83968610 TGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTT 83968669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 TGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGTT 1538

 83968670 AGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTT 83968729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1539 AGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGTT 1598

 83968730 TTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAA 83968789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 TTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAA 1658

 83968790 TTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAAT 83968849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 TTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAAT 1718

 83968850 TCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTT 83968909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     1719 TCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAA-TTTTTTTT 1777

 83968910 GTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTA 83968969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 GTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTA 1837

 83968970 TCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTC 83969029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 TCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTC 1897

 83969030 CTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTA 83969089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 CTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTA 1957

 83969090 TTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTT 83969149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 TTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTT 2017

 83969150 TCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAA 83969209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAA 2077

 83969210 ATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTC 83969269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 ATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTC 2137

 83969270 TGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTT 83969329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 TGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTT 2197

 83969330 CTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGAT 83969389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 CTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGAT 2257

 83969390 GTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAA 83969449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 GTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAA 2317

 83969450 CTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATG 83969509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 CTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATG 2377

 83969510 CTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAA 83969569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 CTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAA 2437

 83969570 CTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAAT 83969629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 CTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAAT 2497

 83969630 TCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAA 83969689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 TCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAA 2557

 83969690 GAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAA 83969749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 GAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAA 2617

 83969750 CCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACA 83969809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 CCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACA 2677

 83969810 ATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACA 83969869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 ATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACA 2737

 83969870 TAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATG 83969929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 TAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATG 2797

 83969930 TAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGAT 83969989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 TAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGAT 2857

 83969990 TAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAA 83970049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 TAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAA 2917

 83970050 ACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCA 83970109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 ACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCA 2977

 83970110 ATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGG 83970169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 ATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGG 3037

 83970170 AACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATAT 83970229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 AACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATAT 3097

 83970230 GTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAA 83970289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 GTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAA 3157

 83970290 AAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGAT 83970349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 AAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGAT 3217

 83970350 ATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCA 83970409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 ATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCA 3277

 83970410 AATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTC 83970469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 AATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTC 3337

 83970470 AAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTG 83970529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 AAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTG 3397

 83970530 GGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAA 83970589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 GGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAA 3457

 83970590 AGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGA 83970649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 AGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGA 3517

 83970650 GTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGC 83970709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 GTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGC 3577

 83970710 AGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAA 83970769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 AGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAA 3637

 83970770 TATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAA 83970829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 TATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAA 3697

 83970830 GTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACC 83970889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 GTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACC 3757

 83970890 AAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAAT 83970949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 AAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAAT 3817

 83970950 GATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGAC 83971009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 GATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGAC 3877

 83971010 TACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCA 83971069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 TACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCA 3937

 83971070 CCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAA 83971129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 CCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAA 3997

 83971130 ATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTT 83971189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 ATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTT 4057

 83971190 TAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGG 83971249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 TAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGG 4117

 83971250 ATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAAA 83971309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 ATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAAA 4177

 83971310 AGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAA 83971369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 AGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAA 4237

 83971370 AAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGAT 83971429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4238 AAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGAT 4297

 83971430 ACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATTG 83971489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4298 ACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATTG 4357

 83971490 GAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCAT 83971549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4358 GAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCAT 4417

 83971550 GAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAA 83971609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4418 GAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAA 4477

 83971610 AGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACA 83971669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4478 AGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACA 4537

 83971670 TTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGA 83971729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4538 TTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGA 4597

 83971730 ATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAG 83971789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4598 ATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAG 4657

 83971790 CTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTA 83971849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4658 CTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTA 4717

 83971850 ATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAG 83971909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4718 ATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAG 4777

 83971910 AAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAG 83971969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4778 AAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAG 4837

 83971970 TGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCT 83972029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4838 TGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCT 4897

 83972030 ATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAG 83972089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4898 ATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAG 4957

 83972090 ATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGCGGAC 83972147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4958 ATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGCGGAC 5015

Alignment time is 4.9362 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    4610] =>      4610 nucs 'mol-32-3240-268767_4610'

Score:        4610
Aligned:      4610        nucs
Identic:      4610 (100%) nucs =>      1130 (100%)      3480 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83966788,83967917] EXCISED REGION [83970684,83974163]
 second seq =>  [       1,    1130] EXCISED REGION [    1131,    4610]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83966788 AAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGAT 83966847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGAT 60

 83966848 GAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGA 83966907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGA 120

 83966908 GTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACAC 83966967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACAC 180

 83966968 ATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAA 83967027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAA 240

 83967028 ACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCA 83967087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCA 300

 83967088 GGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGT 83967147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGT 360

 83967148 AAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAAT 83967207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAAT 420

 83967208 CCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCT 83967267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCT 480

 83967268 CTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATA 83967327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATA 540

 83967328 TATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAA 83967387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAA 600

 83967388 GTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAA 83967447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAA 660

 83967448 TAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATC 83967507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATC 720

 83967508 AACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTAC 83967567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTAC 780

 83967568 AGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTC 83967627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTC 840

 83967628 TCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAA 83967687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAA 900

 83967688 TAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAA 83967747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAA 960

 83967748 TTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGT 83967807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGT 1020

 83967808 CAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATA 83967867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATA 1080

 83967868 CAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 1130

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 1190

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 1250

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 1310

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 1370

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 1430

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 1490

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 1550

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 1610

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 1670

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 1730

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 1790

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 1850

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 1910

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 1970

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 2030

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 2090

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 2150

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 2210

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 2270

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 2330

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 2390

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 83972003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 2450

 83972004 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 83972063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 2510

 83972064 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 83972123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 2570

 83972124 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 83972183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 2630

 83972184 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 83972243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 2690

 83972244 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 83972303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 2750

 83972304 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 83972363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 2810

 83972364 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATC 83972423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATC 2870

 83972424 ATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTG 83972483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 ATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTG 2930

 83972484 TTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTT 83972543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 TTGTACAATATTGTGAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTT 2990

 83972544 AAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCA 83972603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 AAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCA 3050

 83972604 AAAAATAGAGTAGTGAAATAAACCCTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAG 83972663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 AAAAATAGAGTAGTGAAATAAACCCTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAG 3110

 83972664 TCCAGACAGACTTATTACATCTTTAGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTG 83972723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 TCCAGACAGACTTATTACATCTTTAGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTG 3170

 83972724 AAATAAATTCTAAACAATGCAACATTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAA 83972783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 AAATAAATTCTAAACAATGCAACATTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAA 3230

 83972784 GATAAGAATTCTTTCATAAAGCATAACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAA 83972843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 GATAAGAATTCTTTCATAAAGCATAACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAA 3290

 83972844 TATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTTGTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAA 83972903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 TATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTTGTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAA 3350

 83972904 TACGATTCAAACAAGATCACATTGCATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTA 83972963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 TACGATTCAAACAAGATCACATTGCATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTA 3410

 83972964 TGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTTCTTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTG 83973023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 TGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTTCTTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTG 3470

 83973024 TCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTGAATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACA 83973083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 TCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTGAATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACA 3530

 83973084 CGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCCTGAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTG 83973143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 CGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCCTGAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTG 3590

 83973144 AGCAGATTCAAATTGAATTTTTCAGTAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATC 83973203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 AGCAGATTCAAATTGAATTTTTCAGTAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATC 3650

 83973204 ATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGTATCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCC 83973263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 ATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGTATCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCC 3710

 83973264 TGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCG 83973323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 TGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCG 3770

 83973324 CGCACCTATAATCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAG 83973383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 CGCACCTATAATCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAG 3830

 83973384 GCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAA 83973443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 GCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAA 3890

 83973444 AACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAATTGATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCAT 83973503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 AACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAATTGATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCAT 3950

 83973504 TCCTTAGGAATTTCTTTACCTAATGGTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCA 83973563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 TCCTTAGGAATTTCTTTACCTAATGGTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCA 4010

 83973564 TTACATTTTTAGGGGTTGCAAATGGCATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAA 83973623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 TTACATTTTTAGGGGTTGCAAATGGCATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAA 4070

 83973624 TAATTAATAATCTGTAACGCATCTATAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTC 83973683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 TAATTAATAATCTGTAACGCATCTATAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTC 4130

 83973684 CACTTAGATGAAATAATGAAAAAGGTGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTAT 83973743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 CACTTAGATGAAATAATGAAAAAGGTGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTAT 4190

 83973744 CCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTGTCTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCC 83973803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 CCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTGTCTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCC 4250

 83973804 AGAAATATTTGAAAGGGAATGGGTTTGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAAC 83973863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 AGAAATATTTGAAAGGGAATGGGTTTGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAAC 4310

 83973864 AGAGAACATGCCCTAATGAAATTTAAGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCA 83973923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 AGAGAACATGCCCTAATGAAATTTAAGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCA 4370

 83973924 CAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATTAAAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAA 83973983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 CAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATTAAAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAA 4430

 83973984 CAGGGAAGTTTAAATTATATAATAAATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAA 83974043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 CAGGGAAGTTTAAATTATATAATAAATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAA 4490

 83974044 AGGTTCTATCATCCTTATATGTTATGCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAAT 83974103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 AGGTTCTATCATCCTTATATGTTATGCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAAT 4550

 83974104 AAAATCAAAGAAGCACAGAAAACTAGTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGA 83974163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 AAAATCAAAGAAGCACAGAAAACTAGTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGA 4610

Alignment time is 3.71366 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    5152] =>      5152 nucs 'mol-32-32f0-098265_5152'

Score:        5152
Aligned:      5152        nucs
Identic:      5152 (100%) nucs =>      1013 (100%)      4139 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83966993,83968005] EXCISED REGION [83968009,83972147]
 second seq =>  [       1,    1013] EXCISED REGION [    1014,    5152]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [83968006,83968008]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [83968006,83968023] to [83968009,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83968006,83968006] to [83968008,83968008]
 second seq =>         0 nucs

 83966993 AACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACAC 83967052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACAC 60

 83967053 ATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACA 83967112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACA 120

 83967113 AGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGAC 83967172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGAC 180

 83967173 AAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTC 83967232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTC 240

 83967233 AATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTG 83967292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTG 300

 83967293 CTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCA 83967352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCA 360

 83967353 AAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAA 83967412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAA 420

 83967413 TTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAA 83967472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAA 480

 83967473 TTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCT 83967532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCT 540

 83967533 GCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAG 83967592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAG 600

 83967593 AATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTC 83967652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTC 660

 83967653 ACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCAC 83967712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCAC 720

 83967713 AATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGA 83967772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGA 780

 83967773 AAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATT 83967832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATT 840

 83967833 GAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATAC 83967892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATAC 900

 83967893 AACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAA 83967952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAA 960

 83967953 AACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 83968005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 1013

EXCISED REGION

 83968009 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCT 83968068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCTCT 1073

 83968069 GCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTG 83968128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 GCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATCTG 1133

 83968129 GAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTT 83968188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 GAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGTTT 1193

 83968189 TCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATT 83968248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 TCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGATT 1253

 83968249 TGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGT 83968308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 TGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTATGT 1313

 83968309 TGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTT 83968368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGTTT 1373

 83968369 TCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTA 83968428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTATTA 1433

 83968429 TATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCT 83968488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATGCT 1493

 83968489 GGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAA 83968548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 GGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTTAA 1553

 83968549 TTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCC 83968608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 TTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCATCC 1613

 83968609 CTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGT 83968668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 CTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTTGT 1673

 83968669 TAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGT 83968728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 TAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATGGT 1733

 83968729 TTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGA 83968788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 TTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGA 1793

 83968789 ATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAA 83968848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 ATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAA 1853

 83968849 TTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTT 83968908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 TTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTT 1913

 83968909 TGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGT 83968968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 TGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGT 1973

 83968969 ATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCT 83969028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 ATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCT 2033

 83969029 CCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGT 83969088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 CCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGT 2093

 83969089 ATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATT 83969148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 ATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATT 2153

 83969149 TTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCA 83969208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 TTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCA 2213

 83969209 AATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTT 83969268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 AATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTT 2273

 83969269 CTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTT 83969328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 CTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTT 2333

 83969329 TCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGA 83969388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 TCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGA 2393

 83969389 TGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAA 83969448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 TGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAA 2453

 83969449 ACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCAT 83969508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 ACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCAT 2513

 83969509 GCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACA 83969568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 GCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACA 2573

 83969569 ACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAA 83969628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 ACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAA 2633

 83969629 TTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAA 83969688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 TTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAA 2693

 83969689 AGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCA 83969748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 AGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCA 2753

 83969749 ACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGAC 83969808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 ACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGAC 2813

 83969809 AATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAAC 83969868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 AATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAAC 2873

 83969869 ATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACAT 83969928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 ATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACAT 2933

 83969929 GTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGA 83969988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 GTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGA 2993

 83969989 TTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAA 83970048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 TTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAA 3053

 83970049 AACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGC 83970108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 AACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGC 3113

 83970109 AATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAG 83970168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 AATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAG 3173

 83970169 GAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATA 83970228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 GAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATA 3233

 83970229 TGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAA 83970288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 TGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAA 3293

 83970289 AAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGA 83970348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 AAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGA 3353

 83970349 TATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGC 83970408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGC 3413

 83970409 AAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACT 83970468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 AAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACT 3473

 83970469 CAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGT 83970528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 CAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGT 3533

 83970529 GGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAA 83970588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 GGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAA 3593

 83970589 AAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGG 83970648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 AAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGG 3653

 83970649 AGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTG 83970708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 AGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTG 3713

 83970709 CAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGA 83970768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 CAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGA 3773

 83970769 ATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTA 83970828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 ATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTA 3833

 83970829 AGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAAC 83970888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 AGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAAC 3893

 83970889 CAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAA 83970948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 CAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAA 3953

 83970949 TGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGA 83971008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 TGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGA 4013

 83971009 CTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATC 83971068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 CTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATC 4073

 83971069 ACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAA 83971128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 ACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAA 4133

 83971129 AATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCT 83971188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 AATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCT 4193

 83971189 TTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAG 83971248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 TTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAG 4253

 83971249 GATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAA 83971308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 GATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAA 4313

 83971309 AAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGA 83971368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 AAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGA 4373

 83971369 AAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGA 83971428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 AAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGA 4433

 83971429 TACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATT 83971488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 TACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATT 4493

 83971489 GGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCA 83971548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 GGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCA 4553

 83971549 TGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAA 83971608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 TGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAA 4613

 83971609 AAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAAC 83971668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 AAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAAC 4673

 83971669 ATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGG 83971728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 ATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGG 4733

 83971729 AATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATA 83971788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 AATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATA 4793

 83971789 GCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTT 83971848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 GCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTT 4853

 83971849 AATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTA 83971908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 AATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTA 4913

 83971909 GAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATA 83971968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 GAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATA 4973

 83971969 GTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCC 83972028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 GTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCC 5033

 83972029 TATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGCA 83972088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 TATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGCA 5093

 83972089 GATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGCGGAC 83972147
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 GATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGCGGAC 5152

Alignment time is 4.08726 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2053] =>      2053 nucs 'mol-32-3306-098930_2053'

Score:        2053
Aligned:      2053        nucs
Identic:      2053 (100%) nucs =>       770 (100%)      1283 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967148,83967917] EXCISED REGION [83970684,83971966]
 second seq =>  [       1,     770] EXCISED REGION [     771,    2053]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83967148 AAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAAT 83967207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAAT 60

 83967208 CCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCT 83967267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCT 120

 83967268 CTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATA 83967327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATA 180

 83967328 TATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAA 83967387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAA 240

 83967388 GTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAA 83967447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAA 300

 83967448 TAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATC 83967507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATC 360

 83967508 AACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTAC 83967567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTAC 420

 83967568 AGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTC 83967627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTC 480

 83967628 TCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAA 83967687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAA 540

 83967688 TAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAA 83967747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAA 600

 83967748 TTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGT 83967807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGT 660

 83967808 CAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATA 83967867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATA 720

 83967868 CAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 770

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 830

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 890

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 950

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 1010

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 1070

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 1130

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 1190

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 1250

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 1310

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 1370

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 1430

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 1490

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 1550

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 1610

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 1670

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 1730

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 1790

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 1850

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 1910

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 1970

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 2030

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACA 83971966
          |||||||||||||||||||||||
     2031 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACA 2053

Alignment time is 1.64363 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3066] =>      3066 nucs 'mol-32-3306-234431_3066'

Score:        3055
Aligned:      3066        nucs
Identic:      3065 (100%) nucs =>      1350 (100%)      1715 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83966568,83967917] EXCISED REGION [83970684,83972399]
 second seq =>  [       1,    1350] EXCISED REGION [    1351,    3066]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83966568 GGACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACT 83966627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACT 60

 83966628 TAAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATA 83966687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATA 120

 83966688 AGTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCA 83966747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCA 180

 83966748 AATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCAC 83966807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCAC 240

 83966808 TAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACC 83966867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACC 300

 83966868 ACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATA 83966927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATA 360

 83966928 ATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATT 83966987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATT 420

 83966988 AAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGA 83967047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGA 480

 83967048 TACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAA 83967107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAA 540

 83967108 GAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAA 83967167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAA 600

 83967168 GAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGA 83967227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGA 660

 83967228 TTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAAT 83967287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAAT 720

 83967288 ATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGA 83967347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGA 780

 83967348 ATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATT 83967407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATT 840

 83967408 CAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACAC 83967467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACAC 900

 83967468 CCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTT 83967527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTT 960

 83967528 AATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGC 83967587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGC 1020

 83967588 TACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTT 83967647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTT 1080

 83967648 ATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCG 83967707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCG 1140

 83967708 ACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATA 83967767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATA 1200

 83967768 TATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAA 83967827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAA 1260

 83967828 AAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGA 83967887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGA 1320

 83967888 GATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 1350

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 1410

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 1470

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 1530

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 1590

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 1650

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 1710

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 1770

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 1830

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 1890

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 1950

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 2010

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 2070

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 2130

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 2190

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 2250

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 2310

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 2370

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 2430

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 2490

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 2550

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 2610

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 83972003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 2670

 83972004 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 83972063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 2730

 83972064 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 83972123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 2790

 83972124 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 83972183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 AATATCTATGTAGAAAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAAT 2850

 83972184 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 83972243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 TATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAAT 2910

 83972244 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 83972303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 TCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATA 2970

 83972304 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 83972363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 GATACTTTTTATATCTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAA 3030

 83972364 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTTAGTAGATGTT 83972399
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3031 AAAACTAAGCAGCCATTCATCTACTCAGTAGATGTT 3066

Alignment time is 2.44885 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    6519] =>      6519 nucs 'mol-32-3487-112515_6519'

Score:        6452
Aligned:      6520        nucs
Identic:      6513 (100%) nucs =>      5163 (100%)      1350 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83962751,83967917] EXCISED REGION [83970684,83972033]
 second seq =>  [       1,    5169] EXCISED REGION [    5170,    6519]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83962751 TTAGCGCCCACATATGAATGGGAACATGTGATATTTGTCTTTCTGGGCCTGGCTTACTTT 83962810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAGCGCCCACATATGAATGGGAACATGTGATATTTGTCTTTCTGGGCCTGGCTTACTTT 60

 83962811 ATTTAACATAATCATCTCCAGTTCCTTCTAGGCTACTGCAAATGACAGGATTTCATTCAT 83962870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTAACATAATCATCTCCAGTTCCTTCTAGGCTACTGCAAATGACAGGATTTCATTCAT 120

 83962871 TTTAACAGCTGAATAGCATTTCATTATGTATATATACCACATTTTCTTTATCCATTCGTC 83962930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTAACAGCTGAATAGCATTTCATTATGTATATATACCACATTTTCTTTATCCATTCGTC 180

 83962931 GATTGACAGACACATAGGTTGATGCCATATCTTGGCTATTGTGAATAGTACGGCAATAAA 83962990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTGACAGACACATAGGTTGATGCCATATCTTGGCTATTGTGAATAGTACGGCAATAAA 240

 83962991 CATGGGGGTGAAAGTACCCCTTAAATATACTGATTTCCTTCCCTTTGAATAAATAGGCAG 83963050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGGGGGTGAAAGTACCCCTTAAATATACTGATTTCCTTCCCTTTGAATAAATAGGCAG 300

 83963051 TAATGGGATTGGTGGATTGTATGGTCACTCTGTTTTTAGTTTTTTTGAGAAACCTCCATA 83963110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAATGGGATTGGTGGATTGTATGGTCACTCTGTTTTTAGTTTTTTTGAGAAACCTCCATA 360

 83963111 CTGTTTTCCATAATGGCTATATTAATTTACATTCCCACCAACAGTATATAAGAGTCCCTT 83963170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTTTTCCATAATGGCTATATTAATTTACATTCCCACCAACAGTATATAAGAGTCCCTT 420

 83963171 TTCTCTGCATACTTGCCAGCATATGTTATTTTTTTTCTTTTTGATAATAGCCATTCTAAC 83963230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCTCTGCATACTTGCCAGCATATGTTATTTTTTTTCTTTTTGATAATAGCCATTCTAAC 480

 83963231 TGGTGTAAGATGATATCACATTGTGATTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTAGTGATGT 83963290
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGCGTAAGATGATATCACATTGTGATTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATTAGTGATGT 540

 83963291 TGAGTGTTTTTTCACATATCTGTTGGCCATTTGCATATCTTCTTTTCAGCAATGTCTATT 83963350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAGTGTTTTTTCACATATCTGTTGGCCATTTGCATATCTTCTTTTCAGCAATGTCTATT 600

 83963351 CGGATCCTTTGCCCACTTTCCAATGGGAGTATTTGTTTTTTGTTATTGAGTTGTTGGGAG 83963410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CGGATCCTTTGCCCACTTTCCAATGGGAGTATTTGTTTTTTGTTATTGAGTTGTTGGGAG 660

 83963411 TTCCTTGGGTATTCTGGATATTAGCATTTGTTGGATGAATAGTTTGCAAATATTTGTTCC 83963470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCCTTGGGTATTCTGGATATTAGCATTTGTTGGATGAATAGTTTGCAAATATTTGTTCC 720

 83963471 CATTCTACAGGTTGTCTCTTCACTCTGTTGATTGCTTCCTTGCTGTGCAGAAGATTTTTG 83963530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATTCTACAGGTTGTCTCTTCACTCTGTTGATTGCTTCCTTGCTGTGCAGAAGATTTTTG 780

 83963531 GTGTAATATAATTCAGTTTGTCTATTTCTTCAAGGAGGACTACAAACCACTGCTCAAGGA 83963590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGTAATATAATTCAGTTTGTCTATTTCTTCAAGGAGGACTACAAACCACTGCTCAAGGA 840

 83963591 AATAAGAGAGGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATGAGAAAGAATCA 83963650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATAAGAGAGGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATGAGAAAGAATCA 900

 83963651 ATATCATGAAAATGGCCATACTGCCCAAAGTAATTTATAGATTTAATGCTATCGCCATCA 83963710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATATCATGAAAATGGCCATACTGCCCAAAGTAATTTATAGATTTAATGCTATCGCCATCA 960

 83963711 AGATACTATTGACTTTCTTCAAAGAATTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATGGAACC 83963770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGATACTATTGACTTTCTTCAAAGAATTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATGGAACC 1020

 83963771 AAAAAAGAGCCTGTATAGCCAAGACAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCA 83963830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAAAGAGCCTGTATAGCCAAGACAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCA 1080

 83963831 CGTTACCTGACTTCAAATATACAAGCCTACAGTAACCAAAACCGCATGGTACTGGTAGGA 83963890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CGTTACCTGACTTCAAATATACAAGCCTACAGTAACCAAAACCGCATGGTACTGGTAGGA 1140

 83963891 TGTTGAATTTTATCAAATCCCTTTTTTTTTTTTTTTGGTCTATTGAGATGTTCATATGAT 83963950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTGAATTTTATCAAATCCCTTTTTTTTTTTTTT-GGTCTATTGAGATGTTCATATGAT 1199

 83963951 TTTTGTCTTTCTTTCTGTTGAGGTGATATATTTATTGATTTGTGTGTGTTCAGTCATCAT 83964010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTTTGTCTTTCTTTCTGTTGAGGTGATATATTTATTGATTTGTGTGTGTTCAGTCATCAT 1259

 83964011 CCTTGCGTCCCTGGGATAATCCCACTTAGTCATGTTGAGGTGTTGCTGGATTTAGTTTGC 83964070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CCTTGCGTCCCTGGGATAATCCCACTTAGTCATGTTGAGGTGTTGCTGGATTTAGTTTGC 1319

 83964071 TAGTATTTTGTAGAGGATTTTTGCATCTATGTTTATCAGGGATACTGGCAGACAGTTTTT 83964130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TAGTATTTTGTAGAGGATTTTTGCATCTATGTTTATCAGGGATACTGGCAGACAGTTTTT 1379

 83964131 CTTGTTGTTATCTGTTATGTCCTTGTCTGGTTTTGGTATTAGGGTCATTTTGGCCTCATA 83964190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CTTGTTGTTATCTGTTATGTCCTTGTCTGGTTTTGGTATTAGGGTCATTTTGGCCTCATA 1439

 83964191 TAATGCGTCAGGAAGAGTTCACTCCCTTTCAATGTTTTGGGATAGTATGAGAAGAATCAG 83964250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TAATGCGTCAGGAAGAGTTCACTCCCTTTCAATGTTTTGGGATAGTATGAGAAGAATCAG 1499

 83964251 TGTTAATTCTTTTTATAAGTTTGGTAGAATTAGCTGACTCTGAGCACAGTGCCTAGGGGT 83964310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TGTTAATTCTTTTTATAAGTTTGGTAGAATTAGCTGACTCTGAGCACAGTGCCTAGGGGT 1559

 83964311 TAACACTGCTCTGCAAGGAAGAGGTTAAAAAAAAAGTTTGATAGAATTAAGCAGTAAAGC 83964370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TAACACTGCTCTGCAAGGAAGAGGTTAAAAAAAAAGTTTGATAGAATTAAGCAGTAAAGC 1619

 83964371 CACCAGGTCCTGGGCTTTTCTTTGCTGGGAAACATTTTATTAATGTTATTAATATCAATA 83964430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CACCAGGTCCTGGGCTTTTCTTTGCTGGGAAACATTTTATTAATGTTATTAATATCAATA 1679

 83964431 TTATTATTTACTATTAATCTGTTCAGGTTTTCTATTTTTTTTTTTT-ATTCAATCTTGGT 83964489
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     1680 TTATTATTTACTATTAATCTGTTCAGGTTTTCTATTTTTTTTTTTTGATTCAATCTTGGT 1739

 83964490 AGGTTGTACCTCTCCAGAAATTTATCCATCTCCTCTAGGTTTTCTAATTTGTTAGTGTAT 83964549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 AGGTTGTACCTCTCCAGAAATTTATCCATCTCCTCTAGGTTTTCTAATTTGTTAGTGTAT 1799

 83964550 AACAAAAAATATTGAAAGTTTAGAACACTGAATGCTTGGCTGTGGCAGATCTGTTCAGCC 83964609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AACAAAAAATATTGAAAGTTTAGAACACTGAATGCTTGGCTGTGGCAGATCTGTTCAGCC 1859

 83964610 AAGATCGGGACTACTTCAGCTGGCTCTGAGGGTTCAAAGGAGTCTGAGAAGCAAAAATCT 83964669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AAGATCGGGACTACTTCAGCTGGCTCTGAGGGTTCAAAGGAGTCTGAGAAGCAAAAATCT 1919

 83964670 TAGTGAACCTCTACCTAGATGTCCCCATCACATGTTAGCTACACCTTTTCCCCACCACGT 83964729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TAGTGAACCTCTACCTAGATGTCCCCATCACATGTTAGCTACACCTTTTCCCCACCACGT 1979

 83964730 CCCTGACCTCAACTTTACAGACCTACCTCCCCTTGGTTCAGAAATTATGCTGAGTGAGCT 83964789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CCCTGACCTCAACTTTACAGACCTACCTCCCCTTGGTTCAGAAATTATGCTGAGTGAGCT 2039

 83964790 TAGGAGAAACTATATTGAAATTCATTGCTCAAAATATACACCTGAACTCAAAAATTTCAA 83964849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TAGGAGAAACTATATTGAAATTCATTGCTCAAAATATACACCTGAACTCAAAAATTTCAA 2099

 83964850 AAAGTGCCATAGATGGACATAACCAACATTACAAGCAAATTTATCTAAAAGTGTATTTGT 83964909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AAAGTGCCATAGATGGACATAACCAACATTACAAGCAAATTTATCTAAAAGTGTATTTGT 2159

 83964910 TACAGTGTTGTCTAAAATTTAAAAAAAATTGAAAACAACCAAAATGTCCAAAACTAGGAA 83964969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TACAGTGTTGTCTAAAATTTAAAAAAAATTGAAAACAACCAAAATGTCCAAAACTAGGAA 2219

 83964970 GCTGATTAAGTCAACTGTAATATCCATTCCAAAGGATACAGAGCTATCAGGAAAATTTAT 83965029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GCTGATTAAGTCAACTGTAATATCCATTCCAAAGGATACAGAGCTATCAGGAAAATTTAT 2279

 83965030 GTTTTACAAGTAAACATAAATAGTGATATAGAACATTGCTCATTATCTATTGTTTAACAG 83965089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GTTTTACAAGTAAACATAAATAGTGATATAGAACATTGCTCATTATCTATTGTTTAACAG 2339

 83965090 AAATTTCAGGTTACAAATTGGATTATCCCACTTTTATTTTATATATATATATATATATAT 83965149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AAATTTCAGGTTACAAATTGGATTATCCCACTTTTATTTTATATATATATATATATATAT 2399

 83965150 --TCAAACATATTTATAAAAGCCATGAAAATTTACACAAAAAATGTTAATAATTGTTAGG 83965207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 ATTCAAACATATTTATAAAAGCCATGAAAATTTACACAAAAAATGTTAATAATTGTTAGG 2459

 83965208 TCTAAATAGTGTAATAATGCATAAATTTTTTCTTCTACTATAAATTGTATTATAAGTAAA 83965267
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TCTAAATAGTGTAATAATGCATAAGTTTTTTCTTCTACTATAAATTGTATTATAAGTAAA 2519

 83965268 ATAATAAAAATGCCTTTGGCATGGGAGCAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCCTACACTG 83965327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ATAATAAAAATGCCTTTGGCATGGGAGCAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCCTACACTG 2579

 83965328 TTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAATTTTACCAACTATCTGCATACAGAAAAGTACCAT 83965387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAATTTTACCAACTATCTGCATACAGAAAAGTACCAT 2639

 83965388 CACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACTTCGTATC 83965447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CACACAAAAAAACACAAAAATCAGATAAGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACTTCGTATC 2699

 83965448 ACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACCATACCTC 83965507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGGAAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACCATACCTC 2759

 83965508 CCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGGAGGG 83965567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGGTGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGGAGGG 2819

 83965568 AGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGTGGAGAATA 83965627
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2820 AGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACTGAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGCGGAGAATA 2879

 83965628 AAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAGAGCA 83965687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTCGTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAGAGCA 2939

 83965688 GACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATCCACA 83965747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTAGTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATCCACA 2999

 83965748 ATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATATAGA 83965807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 ATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAATAAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATATAGA 3059

 83965808 AAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGAAAGA 83965867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAGAGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGAAAGA 3119

 83965868 GATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATACCTAGATAA 83965927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGGGATAATAACAGAGAACTTCCCATACCTAGATAA 3179

 83965928 AGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAAGAA 83965987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 AGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGGTTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAAGAA 3239

 83965988 GACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGATACT 83966047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GACTACTTCTAGACATTTAATAATCAAACTCCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGATACT 3299

 83966048 AAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGAC 83966107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAAAACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGAC 3359

 83966108 TTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAAG 83966167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGAGAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAAG 3419

 83966168 GAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGGA 83966227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 GAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATATCCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGGA 3479

 83966228 GAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGTC 83966287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAGCTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGTC 3539

 83966288 TTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGAG 83966347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAGTATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGAG 3599

 83966348 CAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAAA 83966407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAAA 3659

 83966408 TCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGTA 83966467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGTA 3719

 83966468 TAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATAA 83966527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATAA 3779

 83966528 ACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAATC 83966587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 ACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAATC 3839

 83966588 CAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTATT 83966647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 CAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTATT 3899

 83966648 AGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAAT 83966707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 AGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAAT 3959

 83966708 GGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATGA 83966767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 GGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATGA 4019

 83966768 ATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACT 83966827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 ATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACT 4079

 83966828 AAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAA 83966887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAA 4139

 83966888 GAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACT 83966947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 GAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACT 4199

 83966948 TAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGA 83967007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGA 4259

 83967008 TATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAA 83967067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAA 4319

 83967068 TGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTT 83967127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 TGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTT 4379

 83967128 ATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTAT 83967187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 ATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTAT 4439

 83967188 ATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCC 83967247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 ATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCC 4499

 83967248 AACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGG 83967307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 AACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGG 4559

 83967308 TGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAA 83967367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 TGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAA 4619

 83967368 GGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAG 83967427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 GGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAG 4679

 83967428 AGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAA 83967487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 AGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAA 4739

 83967488 GATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAA 83967547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 GATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAA 4799

 83967548 TGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCT 83967607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 TGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCT 4859

 83967608 CATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTA 83967667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 CATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTA 4919

 83967668 AAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTA 83967727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 AAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTA 4979

 83967728 GAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATG 83967787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 GAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATG 5039

 83967788 CTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGA 83967847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 CTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGA 5099

 83967848 AACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACT 83967907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 AACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACT 5159

 83967908 AAGAGGGAAA 83967917
          ||||||||||
     5160 AAGAGGGAAA 5169

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5170 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 5229

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5230 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 5289

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5290 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 5349

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5350 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 5409

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5410 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 5469

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5470 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 5529

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5530 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 5589

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5590 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 5649

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5650 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 5709

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5710 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 5769

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5770 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 5829

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5830 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 5889

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5890 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 5949

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5950 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 6009

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6010 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 6069

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6070 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 6129

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6130 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 6189

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6190 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 6249

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6250 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 6309

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6310 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 6369

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6370 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 6429

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 83972003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6430 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 6489

 83972004 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCC 83972033
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     6490 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCC 6519

Alignment time is 5.18404 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    7637] =>      7637 nucs 'mol-32-34a8-125142_7637'

Score:        7626
Aligned:      7637        nucs
Identic:      7636 (100%) nucs =>       722 (100%)      6914 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83965295,83966016] EXCISED REGION [83966018,83972932]
 second seq =>  [       1,     722] EXCISED REGION [     724,    7637]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [83966017,83966017]
 second seq =>         1 nucs [723,723]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [83968006,83968006]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [722,725] to [723,726]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83966016,83966016] to [83966018,83966018]
 second seq =>         1 nucs [722,722] to [724,724]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83965295 CAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCCTACACTGTTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAAT 83965354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGAGCAAGATGATTGAAGAGAATCCTACACTGTTCATGCCCCCCACTGGAACACCAAAT 60

 83965355 TTTACCAACTATCTGCATACAGAAAAGTACCATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATA 83965414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTACCAACTATCTGCATACAGAAAAGTACCATCACACAAAAAAACACAAAAATCAGATA 120

 83965415 AGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACTTCGTATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGG 83965474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCAATCACAGTACCTGGTTTTAACTTCGTATCACTATAAGAGGTGTTGAGGAGGGCAGG 180

 83965475 AAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACCATACCTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGG 83965534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGACTGTCTTGAATGGCTAACACCATACCTCCCCCATCCCCTGGCAGTGACTATGTGG 240

 83965535 TGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGGAGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACT 83965594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCAGAGAGAGAATCTGTGCACTTTGGGGAGGGAGAGTGCAGGGACAGGGAGACTACACT 300

 83965595 GAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGTGGAGAATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTC 83965654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAATTCAGTGCTGCCCTGTCACAGTGGAGAATAAAGCTGTGTTGGGCTCAGCTAGCATTC 360

 83965655 GTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAGAGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTA 83965714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGCATGGAAAGAGTCTCTTGATGGAAAGAGCAGACTTGATCAAGCAGAAGAAAGAATTA 420

 83965715 GTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATCCACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAAT 83965774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGAGCTTGAAACCAGCTGTTTGAAAATCCACAATCAGAGGAGTCCAAAGAATAAAGAAT 480

 83965775 AAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATATAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAG 83965834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGAAACAATGAAGCCTGCCTACAAGATATAGAAAATAGGCTCAAAAGGGCAAATCTAAG 540

 83965835 AGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGAAAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGG 83965894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTTATTGGCCTTAAAGAGGAGGCAGAGAAAGAGATAGAAGTAGAAAGTTTATTCAAAGG 600

 83965895 GATAATAACAGAGAACTTCCCATACCTAGATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGG 83965954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATAATAACAGAGAACTTCCCATACCTAGATAAAGATATCAATATTCAAGTACAAGAAGG 660

 83965955 TTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAA 83966014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAAAGAGAACCAAGCAGATTTAACTCAAAGAAGACTACTTCTAGACATTTAATAATCAA 720

 83966015 AC 83966016
          ||
      721 AC 722

EXCISED REGION

 83966018 CCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAA 83966077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 CCCAAAGGATGAGGATAAAGAAAGGATACTAAAATCATCAAGAGAAAAGAAATAACATAA 783

 83966078 AACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGA 83966137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 AACAGAGCTCCGATATATCTAGCAGCAGACTTTTTAGTGGAAACCTTATAAGCCAAAAGA 843

 83966138 GAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATAT 83966197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 GAGTGGCATGATGTATTTAAAGTGATAAAGGAAAAAAACATTTACCCTAGAATAGCATAT 903

 83966198 CCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAG 83966257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 CCAGTCAAAGTATTCTTCAAGCATGAAGGAGAAACAAAGATCTTCCAAGACAAACAAAAG 963

 83966258 CTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAG 83966317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 CTGAGGGATTTCATCAACACCAAACCTGTCTTACAAGAAATGCTAAAGGATGTTCTTCAG 1023

 83966318 TATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTC 83966377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 TATGGAAAAAAAAAAAAGGATGTTAATGAGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTC 1083

 83966378 TTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAAT 83966437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 TTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGAAATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAAT 1143

 83966438 AGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACT 83966497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 AGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAGTATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACT 1203

 83966498 CTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTT 83966557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGATAAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTT 1263

 83966558 TTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGG 83966617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 TTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAATCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGG 1323

 83966618 GAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTT 83966677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 GAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTATTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTT 1383

 83966678 GCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTAT 83966737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 GCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTAATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTAT 1443

 83966738 GATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAA 83966797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 GATAACTTCAAATCAAAAAACATACAATGAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAA 1503

 83966798 AGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGA 83966857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 AGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCACTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGA 1563

 83966858 AGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTT 83966917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 AGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACAAAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTT 1623

 83966918 ATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGA 83966977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 ATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGACTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGA 1683

 83966978 TGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCA 83967037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAATGATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCA 1743

 83967038 CCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGA 83967097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 CCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGA 1803

 83967098 AACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAAC 83967157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAAC 1863

 83967158 ACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAG 83967217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 ACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAG 1923

 83967218 AATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAG 83967277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 AATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAG 1983

 83967278 CTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTT 83967337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 CTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTT 2043

 83967338 CTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAG 83967397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 CTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAG 2103

 83967398 AGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGG 83967457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 AGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGG 2163

 83967458 AGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAA 83967517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 AGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAA 2223

 83967518 CATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTC 83967577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTC 2283

 83967578 ATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAG 83967637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 ATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAG 2343

 83967638 ACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAAT 83967697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 ACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAAT 2403

 83967698 GTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAAC 83967757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 GTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAAC 2463

 83967758 TATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAA 83967817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAA 2523

 83967818 ATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCA 83967877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 ATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCA 2583

 83967878 AAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTA 83967937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 AAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTATAGCTGTAAGTGCCTA 2643

 83967938 CATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGT 83967997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCCTAAGTTTATGTTTGT 2703

 83967998 TTGATTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGA 83968057
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 TTGATTGA-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGA 2762

 83968058 CTTGATTCTCTGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAA 83968117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 CTTGATTCTCTGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAA 2822

 83968118 TCTTGTATCTGGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGC 83968177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 TCTTGTATCTGGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGC 2882

 83968178 CCTTAGGGTTTTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCT 83968237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 CCTTAGGGTTTTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCT 2942

 83968238 CTTTACTGATTTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTC 83968297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 CTTTACTGATTTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTC 3002

 83968298 CAGTACTATGTTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAG 83968357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 CAGTACTATGTTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAG 3062

 83968358 AGGGAATGTTTTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGAT 83968417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 AGGGAATGTTTTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGAT 3122

 83968418 GGCTTTTATTATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCAT 83968477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 GGCTTTTATTATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCAT 3182

 83968478 AAAGGGATGCTGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATT 83968537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 AAAGGGATGCTGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATT 3242

 83968538 TTTGCTTTTAATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCA 83968597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 TTTGCTTTTAATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCA 3302

 83968598 TCCCTGCATCCCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTG 83968657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 TCCCTGCATCCCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTG 3362

 83968658 TTGGATTTTGTTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCT 83968717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 TTGGATTTTGTTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCT 3422

 83968718 TGGTCTATGGTTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCT 83968777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 TGGTCTATGGTTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCT 3482

 83968778 TCATAGAATGAATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGG 83968837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 TCATAGAATGAATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGG 3542

 83968838 ATTGGTACCAATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCA 83968897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 ATTGGTACCAATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCA 3602

 83968898 GAATTTTTTTTTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGT 83968957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 GAATTTTTTTTTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGT 3662

 83968958 CGGTTCAGGGTATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATT 83969017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 CGGTTCAGGGTATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATT 3722

 83969018 TATCCATCTCTCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAA 83969077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 TATCCATCTCTCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAA 3782

 83969078 TAATCTTTTGTATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGG 83969137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 TAATCTTTTGTATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGG 3842

 83969138 TTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTAC 83969197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 TTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTAC 3902

 83969198 TTATCTTTTCAAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAAT 83969257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 TTATCTTTTCAAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAAT 3962

 83969258 TTCATTTAGTTCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGT 83969317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 TTCATTTAGTTCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGT 4022

 83969318 TTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTC 83969377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 TTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTC 4082

 83969378 AGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGT 83969437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 AGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGT 4142

 83969438 ATTCATGGAAAACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAA 83969497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 ATTCATGGAAAACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAA 4202

 83969498 ACACATCCCATGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAA 83969557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4203 ACACATCCCATGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAA 4262

 83969558 AGCAATCTACAACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATT 83969617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4263 AGCAATCTACAACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATT 4322

 83969618 AGAAAAAACAATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAG 83969677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 AGAAAAAACAATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAG 4382

 83969678 ATTAAGCAAAAAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAA 83969737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 ATTAAGCAAAAAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAA 4442

 83969738 GGCCATAGTCAACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGA 83969797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 GGCCATAGTCAACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGA 4502

 83969798 ACAGAATAGACAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAG 83969857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 ACAGAATAGACAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAG 4562

 83969858 CAAACAAAAACATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTG 83969917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 CAAACAAAAACATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTG 4622

 83969918 GCTAGCCACATGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAA 83969977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 GCTAGCCACATGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAA 4682

 83969978 CTCAAGATGGATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGAT 83970037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 CTCAAGATGGATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGAT 4742

 83970038 AAAATTGGAAAAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCA 83970097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 AAAATTGGAAAAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCA 4802

 83970098 AAAGAAAATGCAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTT 83970157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 AAAGAAAATGCAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTT 4862

 83970158 GCCCGGAAAAGGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTT 83970217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 GCCCGGAAAAGGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTT 4922

 83970218 CACAATCTATATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAAT 83970277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 CACAATCTATATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAAT 4982

 83970278 CAGTAAGAAAAAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTC 83970337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 CAGTAAGAAAAAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTC 5042

 83970338 TCAAAAGAAGATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGAT 83970397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5043 TCAAAAGAAGATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGAT 5102

 83970398 CAGGGAAATGCAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCAT 83970457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 CAGGGAAATGCAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCAT 5162

 83970458 AATCAAAAACTCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCT 83970517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5163 AATCAAAAACTCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCT 5222

 83970518 ACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCA 83970577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5223 ACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCA 5282

 83970578 TAAAGAACTAAAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCC 83970637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5283 TAAAGAACTAAAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCC 5342

 83970638 AGAGGAAAGGGAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACA 83970697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5343 AGAGGAAAGGGAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACA 5402

 83970698 AATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAA 83970757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5403 AATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAA 5462

 83970758 GAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTA 83970817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5463 GAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTA 5522

 83970818 ATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAG 83970877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5523 ATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAG 5582

 83970878 GAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAA 83970937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5583 GAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAA 5642

 83970938 AGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAA 83970997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5643 AGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAA 5702

 83970998 GGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACA 83971057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5703 GGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACA 5762

 83971058 TCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATA 83971117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5763 TCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATA 5822

 83971118 ACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTA 83971177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5823 ACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTA 5882

 83971178 ATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAA 83971237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5883 ATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAA 5942

 83971238 GAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATT 83971297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5943 GAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATT 6002

 83971298 AACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAG 83971357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6003 AACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAG 6062

 83971358 GCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAAC 83971417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6063 GCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAAC 6122

 83971418 ATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATAT 83971477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6123 ATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATAT 6182

 83971478 GCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCA 83971537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6183 GCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCA 6242

 83971538 AGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAA 83971597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6243 AGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAA 6302

 83971598 GTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAA 83971657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6303 GTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAA 6362

 83971658 TTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATA 83971717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6363 TTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATA 6422

 83971718 GGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCC 83971777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6423 GGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCCTCTCACCC 6482

 83971778 CAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACA 83971837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6483 CAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAATTTTAATATTGACA 6542

 83971838 AGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTA 83971897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6543 AGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAATTTGAAAATCGGGTA 6602

 83971898 TGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGT 83971957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6603 TGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCTAATAATTAGGTTGT 6662

 83971958 TTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAA 83972017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6663 TTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATCTATTTGGAAAGGAA 6722

 83972018 AAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACA 83972077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6723 AAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTCATTTAAAAATGACA 6782

 83972078 CCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGA 83972137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6783 CCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAAAATATCTATGTAGA 6842

 83972138 AAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAATTATTGCCAGAGTTT 83972197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6843 AAAAGCGGACTATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAATTATTGCCAGAGTTT 6902

 83972198 GTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAATTCTAAGTAAGCTTG 83972257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6903 GTAAGAAAATTTAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAATTCTAAGTAAGCTTG 6962

 83972258 AGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATAGATACTTTTTATAT 83972317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6963 AGCTCAGAAAACATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATAGATACTTTTTATAT 7022

 83972318 CTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAAAAAACTAAGCAGCC 83972377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7023 CTCTACATTGTCTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAAAAAACTAAGCAGCC 7082

 83972378 ATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATCATTAAAAATTTCCC 83972437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7083 ATTCATCTACTTAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATCATTAAAAATTTCCC 7142

 83972438 CATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTGTTGTACAATATTGT 83972497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7143 CATCTCTTTTGGGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTGTTGTACAATATTGT 7202

 83972498 GAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTTAAAATGGCAAGTTT 83972557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7203 GAATGTACTTAATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTTAAAATGGCAAGTTT 7262

 83972558 TATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCAAAAAATAGAGTAGT 83972617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7263 TATGTTATGAGTATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCAAAAAATAGAGTAGT 7322

 83972618 GAAATAAACCCTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAGTCCAGACAGACTTA 83972677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7323 GAAATAAACCCTCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAGTCCAGACAGACTTA 7382

 83972678 TTACATCTTTAGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTGAAATAAATTCTAAA 83972737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7383 TTACATCTTTAGCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTGAAATAAATTCTAAA 7442

 83972738 CAATGCAACATTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAAGATAAGAATTCTTT 83972797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7443 CAATGCAACATTTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAAGATAAGAATTCTTT 7502

 83972798 CATAAAGCATAACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAATATTCCGTGTTCAA 83972857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7503 CATAAAGCATAACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAATATTCCGTGTTCAA 7562

 83972858 ATTGCTCGTTGTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAATACGATTCAAACAA 83972917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7563 ATTGCTCGTTGTCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAATACGATTCAAACAA 7622

 83972918 GATCACATTGCATTT 83972932
          |||||||||||||||
     7623 GATCACATTGCATTT 7637

Alignment time is 6.00324 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2350] =>      2350 nucs 'mol-32-34be-121480_2350'

Score:        2350
Aligned:      2350        nucs
Identic:      2350 (100%) nucs =>       891 (100%)      1459 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967027,83967917] EXCISED REGION [83970684,83972142]
 second seq =>  [       1,     891] EXCISED REGION [     892,    2350]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83967027 AACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCC 83967086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATAAATGGATGGAAAAAAAATCCC 60

 83967087 AGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATG 83967146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATATTTATGTCAGATAAAATAGATG 120

 83967147 TAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAA 83967206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGGTCAA 180

 83967207 TCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATC 83967266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATATATC 240

 83967267 TCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGAT 83967326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAACAGAT 300

 83967327 ATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCA 83967386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATATTCA 360

 83967387 AGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACA 83967446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAATACA 420

 83967447 ATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCAT 83967506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGATCAT 480

 83967507 CAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTA 83967566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATATTTA 540

 83967567 CAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATT 83967626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGATAATT 600

 83967627 CTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAA 83967686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAATAAA 660

 83967687 ATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAA 83967746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAGAGAA 720

 83967747 ATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAG 83967806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAGTGAG 780

 83967807 TCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAAT 83967866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGAAAAT 840

 83967867 ACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 83967917
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAA 891

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 951

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 1011

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 1071

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 1131

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 1191

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 1251

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 1311

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 1371

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 1431

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 83971283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAA 1491

 83971284 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 83971343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 CAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGAC 1551

 83971344 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 83971403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 AAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAG 1611

 83971404 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 83971463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 ATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACA 1671

 83971464 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 83971523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 ATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATA 1731

 83971524 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 83971583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 CACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACAT 1791

 83971584 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 83971643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 GCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATG 1851

 83971644 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 83971703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 TCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAAC 1911

 83971704 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 83971763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 TGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCA 1971

 83971764 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 83971823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 ATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAATGAAA 2031

 83971824 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 83971883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTACCAAAT 2091

 83971884 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 83971943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 TTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACTCCTCT 2151

 83971944 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 83972003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 AATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATTATATC 2211

 83972004 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 83972063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 TATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTGCTTTC 2271

 83972064 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 83972123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 ATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGATGCTAA 2331

 83972124 AATATCTATGTAGAAAAAG 83972142
          |||||||||||||||||||
     2332 AATATCTATGTAGAAAAAG 2350

Alignment time is 1.87665 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    5772] =>      5772 nucs 'mol-32-34c9-025681_5772'

Score:        5771
Aligned:      5771        nucs
Identic:      5771 (100%) nucs =>      3389 (100%)      2382 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83968759,83972147] EXCISED REGION [83972149,83974530]
 second seq =>  [       1,    3389] EXCISED REGION [    3391,    5772]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [83972148,83972148]
 second seq =>         1 nucs [3390,3390]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3389,3389] to [3390,3390]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83968759 TATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTC 83968818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAATGAATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTC 60

 83968819 ATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGC 83968878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACCAATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGC 120

 83968879 TGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAAT 83968938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTTTTTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAAT 180

 83968939 CTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGG 83968998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGGGTATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGG 240

 83968999 GTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGG 83969058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCTCTCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGG 300

 83969059 TGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCT 83969118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTTGTATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCT 360

 83969119 GTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCT 83969178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGATTTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCT 420

 83969179 AATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGT 83969238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTTCAAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGT 480

 83969239 TAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTT 83969298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAGTTCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTT 540

 83969299 TGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAA 83969358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTGTTTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAA 600

 83969359 TGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTC 83969418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTTGATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTC 660

 83969419 TTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAG 83969478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGAAAACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAG 720

 83969479 ATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGA 83969538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGACACAAACAAATGGAAACACATCCCATGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGA 780

 83969539 AAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCAC 83969598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTACAACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCAC 840

 83969599 CATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAG 83969658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAACAATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAG 900

 83969659 CCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTG 83969718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAAAAAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTG 960

 83969719 ATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAAT 83969778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGTCAACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAAT 1020

 83969779 AGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGC 83969838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAGACAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGC 1080

 83969839 AAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACA 83969898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAAACATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACA 1140

 83969899 AATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCT 83969958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCACATGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCT 1200

 83969959 CACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTA 83970018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATGGATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTA 1260

 83970019 TAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGA 83970078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGAAAAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGA 1320

 83970079 TTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTT 83970138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAATGCAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTT 1380

 83970139 AATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCA 83970198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAAAGGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCA 1440

 83970199 CAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCT 83970258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTATATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCT 1500

 83970259 ATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAA 83970318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAAAAAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAA 1560

 83970319 GGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAAT 83970378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAAGATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAAT 1620

 83970379 GCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTAT 83970438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAATGCAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTAT 1680

 83970439 ACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCT 83970498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAACTCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCT 1740

 83970499 GTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGA 83970558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTGGTGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGA 1800

 83970559 AAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCC 83970618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACTAAAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCC 1860

 83970619 CACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACAC 83970678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAGGGAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACAC 1920

 83970679 GCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCAT 83970738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCAT 1980

 83970739 CAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCAC 83970798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCAC 2040

 83970799 CATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTAT 83970858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTAT 2100

 83970859 TCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAG 83970918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAG 2160

 83970919 CTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGG 83970978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGG 2220

 83970979 AAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCC 83971038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCC 2280

 83971039 GGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAA 83971098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAA 2340

 83971099 TACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAA 83971158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TACCACCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAA 2400

 83971159 AATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAA 83971218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAA 2460

 83971219 ACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAAT 83971278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAAT 2520

 83971279 GAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAAC 83971338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATGAAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAAC 2580

 83971339 TTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAAT 83971398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAAGAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAAT 2640

 83971399 CGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGG 83971458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACTGATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGG 2700

 83971459 CTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCT 83971518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAATTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCT 2760

 83971519 ATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAAT 83971578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATATACACACAACCTACCAAGATTGAACCATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAAT 2820

 83971579 AACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACC 83971638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATAAAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACC 2880

 83971639 CAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACC 83971698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAAACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACC 2940

 83971699 CAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCA 83971758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAGGGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCA 3000

 83971759 ATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAA 83971818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATGCAATATCCTCTCACCCCAGTTAAAATAGCTTGTATCCAAAAGTCAGGCAATAACAAA 3060

 83971819 TGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTAC 83971878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGAAATTTTAATATTGACAAGTGAAATTTTAATATTAAAAAAGGTAAGATAGTGAATTAC 3120

 83971879 CAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACT 83971938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAAATTTGAAAATCGGGTATGGAATGTTTAGAAGTGCTGTTTAGAACAAAGAACCAAACT 3180

 83971939 CCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATT 83971998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCTCTAATAATTAGGTTGTTTGTTCACATAGTGGTAACTCTCAATATTTTTCTCAATATT 3240

 83971999 ATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTG 83972058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATATCTATTTGGAAAGGAAAAAAATGTTCCTATCCAGCAATCAAAAAAATTCTGGCTGTG 3300

 83972059 CTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGAT 83972118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTTTCATTTAAAAATGACACCTACCTAGCAGATTCTGACATAGCTTCCCGTAAGTTAGAT 3360

 83972119 GCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGCGGAC 83972147
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GCTAAAATATCTATGTAGAAAAAGCGGAC 3389

EXCISED REGION

 83972149 ATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAATTATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATT 83972208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 ATTTAAAGCAAAATAAAATATTAAGATAGAAAAATTATTGCCAGAGTTTGTAAGAAAATT 3450

 83972209 TAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAATTCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAA 83972268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 TAACAAACATCATTGCCAAAGGAATTTGAGAGAATTCTAAGTAAGCTTGAGCTCAGAAAA 3510

 83972269 CATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATAGATACTTTTTATATCTCTACATTGT 83972328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 CATAGCCTACCTTGATAAAAATAAATTTAAAAATAGATACTTTTTATATCTCTACATTGT 3570

 83972329 CTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAAAAAACTAAGCAGCCATTCATCTACT 83972388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 CTAACCCCTGATTTAAAGACAAATGGGATAAATAAAAAACTAAGCAGCCATTCATCTACT 3630

 83972389 TAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATCATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTG 83972448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 TAGTAGATGTTGCTTTAATGGTTAGTATTTTTATCATTAAAAATTTCCCCATCTCTTTTG 3690

 83972449 GGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTGTTGTACAATATTGTGAATGTACTTA 83972508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 GGTGATGAGAAAAGTCCTGGAATTAGTGGTAATTGTTGTACAATATTGTGAATGTACTTA 3750

 83972509 ATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTTAAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAG 83972568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 ATGCCGCTGAATTGTATATACACTGGAAAATGGTTAAAATGGCAAGTTTTATGTTATGAG 3810

 83972569 TATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCAAAAAATAGAGTAGTGAAATAAACCC 83972628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 TATTTTGCCACAATAAAAAATAAATAATTTCACCAAAAAATAGAGTAGTGAAATAAACCC 3870

 83972629 TCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAGTCCAGACAGACTTATTACATCTTTA 83972688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 TCATGGACCCATCACCCATCTTCTACAATTATTAGTCCAGACAGACTTATTACATCTTTA 3930

 83972689 GCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTGAAATAAATTCTAAACAATGCAACAT 83972748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 GCTTTAGTCCCTCCATCCCACACTGCATTATTTTGAAATAAATTCTAAACAATGCAACAT 3990

 83972749 TTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAAGATAAGAATTCTTTCATAAAGCATA 83972808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 TTCATCCATAATTATTTCAGTTCATTTCTCTAAAAGATAAGAATTCTTTCATAAAGCATA 4050

 83972809 ACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAATATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTTG 83972868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 ACTATTATCAGATATAGTTCCTTAATATCACCAAATATTCCGTGTTCAAATTGCTCGTTG 4110

 83972869 TCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAATACGATTCAAACAAGATCACATTGC 83972928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 TCTCACAGTGTTTGTTGATTTGGTTACGTGTGAAATACGATTCAAACAAGATCACATTGC 4170

 83972929 ATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTATGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTTC 83972988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 ATTTGGTTGTTATGTGTCTTTTGTTATCTAATCTATGAATTCCCCTCCTTTTTTATTTTC 4230

 83972989 TTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTGTCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTGA 83973048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 TTCACAATTTAACATTGGGCAAATTGGGTTGTTTGTCCTGTAAATTTTCTTGCATTCTGA 4290

 83973049 ATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACACGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCCT 83973108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 ATTTTGCTGATTAAATCCTCATGATATTTTTAACACGTTCTTCTATCCCCTGTGTCCCCT 4350

 83973109 GAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTGAGCAGATTCAAATTGAATTTTTCAG 83973168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 GAAAACTATGAATAGTAGTTAGATCTAGAGTCCTGAGCAGATTCAAATTGAATTTTTCAG 4410

 83973169 TAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATCATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGTA 83973228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 TAAGAATATTTCAAAGTTATGTTGTAAATCCCATCATGAGGTATGTAGTACTTGGTTGTA 4470

 83973229 TCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCCTGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCTA 83973288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4471 TCTTCTTTCATTGTGTTAAAATTGATTGACCAGCCTGGCTAACATGGTTAGCCGTTTCTA 4530

 83973289 CTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCGCACCTATAATCCCAACTACTTGG 83973348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 CTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGCGCACCTATAATCCCAACTACTTGG 4590

 83973349 GAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAGGCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGATC 83973408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4591 GAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCAGGAGGCAAAGGTTGCGGTCAGCTGAGATC 4650

 83973409 GCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAAAACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAATT 83973468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4651 GCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGCAAAACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAATT 4710

 83973469 GATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCATTCCTTAGGAATTTCTTTACCTAATG 83973528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4711 GATCAATGAGTTTAGATGTTATCAGTCATAGCCATTCCTTAGGAATTTCTTTACCTAATG 4770

 83973529 GTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCATTACATTTTTAGGGGTTGCAAATGG 83973588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4771 GTCTTAGCAGCCATTAATAATACCGCATAGATTCATTACATTTTTAGGGGTTGCAAATGG 4830

 83973589 CATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAATAATTAATAATCTGTAACGCATCTA 83973648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4831 CATATTTAAATTCTGTCATTCATTCTTCTTTGAAATAATTAATAATCTGTAACGCATCTA 4890

 83973649 TAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTCCACTTAGATGAAATAATGAAAAAGG 83973708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4891 TAAAGAAAGACTTTACCTCATCACCTATTTGGTTCCACTTAGATGAAATAATGAAAAAGG 4950

 83973709 TGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTATCCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTGT 83973768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 TGGGATACTTGATTTAAAGGGAGCAAGAGAACTATCCCCAAAATCTCCAGTCAGACTTGT 5010

 83973769 CTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCCAGAAATATTTGAAAGGGAATGGGTT 83973828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5011 CTATTAGTACAAATGAGCAGCCCTTACGTATTCCCAGAAATATTTGAAAGGGAATGGGTT 5070

 83973829 TGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAACAGAGAACATGCCCTAATGAAATTTA 83973888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5071 TGGTGGGGATGAGTAACTGGAGATCCTGCTCCAACAGAGAACATGCCCTAATGAAATTTA 5130

 83973889 AGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCACAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATTA 83973948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5131 AGTAGTTACTATTAAAATGACCCAGCCGATACCCACAGGCTCCTGAGGCATGAGAAATTA 5190

 83973949 AAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAACAGGGAAGTTTAAATTATATAATAA 83974008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5191 AAGTTACATTAGGTTTTGGCATACTATCAAATTAACAGGGAAGTTTAAATTATATAATAA 5250

 83974009 ATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAAAGGTTCTATCATCCTTATATGTTAT 83974068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5251 ATTAGACTAATACTATTACAAAAATATTTGAAGAAAGGTTCTATCATCCTTATATGTTAT 5310

 83974069 GCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAATAAAATCAAAGAAGCACAGAAAACTA 83974128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5311 GCCAAAAAGCACCAGATGAATTAAATATAAGAAATAAAATCAAAGAAGCACAGAAAACTA 5370

 83974129 GTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGAAGCATAACAATAAAGAAAAAACTAT 83974188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5371 GTGAATATTTATTTGACTTTGTAATAAAATTTTGAAGCATAACAATAAAGAAAAAACTAT 5430

 83974189 TCTAAAAAATGATATTTTTATTTTATAAAAATACACAAATTTTAATAAGTTGGTCAATCC 83974248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5431 TCTAAAAAATGATATTTTTATTTTATAAAAATACACAAATTTTAATAAGTTGGTCAATCC 5490

 83974249 TAACATAAAAGGTAAATGACAACTTGAAAAAAATTACATAAAATATTCTCAATATATAAG 83974308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5491 TAACATAAAAGGTAAATGACAACTTGAAAAAAATTACATAAAATATTCTCAATATATAAG 5550

 83974309 AAGCTCTTCCAGGCAAGCCCATTCATAGTAAAATAAAATGCTCAAAAAATGATGAAACAC 83974368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5551 AAGCTCTTCCAGGCAAGCCCATTCATAGTAAAATAAAATGCTCAAAAAATGATGAAACAC 5610

 83974369 ATGCAAATTAAAACACAATAGAATTCTATGTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTAAACGGAG 83974428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5611 ATGCAAATTAAAACACAATAGAATTCTATGTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTAAACGGAG 5670

 83974429 TCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCG 83974488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5671 TCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCG 5730

 83974489 CCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGT 83974530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5731 CCTCCCGGGTTCAGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGT 5772

Alignment time is 4.55576 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    4630] =>      4630 nucs 'mol-32-34c9-051343_4630'

Score:        4615
Aligned:      4626        nucs
Identic:      4625 (100%) nucs =>       863 (100%)      3762 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83967143,83968005] EXCISED REGION [83968007,83971769]
 second seq =>  [       1,     863] EXCISED REGION [     864,    4626]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [83968006,83968006]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [83969541,83969541]
 second seq =>         1 nucs [2398,2398]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [83968006,83968025] to [83968007,83968026]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83967143 GATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGG 83967202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATTATATAATGATAAAGGGG 60

 83967203 TCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATA 83967262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCACCCAACACTGTGTTCATA 120

 83967263 TATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAAC 83967322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTGGGTGCTCCAGGAGAAAC 180

 83967323 AGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATA 83967382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTTAAGGAAACTAAAAGATA 240

 83967383 TTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAA 83967442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTGAGAGAGATAAACCCCAA 300

 83967443 TACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGA 83967502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGAAAGATCTCCCAGACAGA 360

 83967503 TCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATA 83967562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATAAATGAACCTAACAGATA 420

 83967563 TTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGAT 83967622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTTCTCATCAGCATGTGGAT 480

 83967623 AATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAA 83967682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTCTAAAACATTCAAAAAAA 540

 83967683 TAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAG 83967742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAACTAGAAATCAATAATGAG 600

 83967743 AGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAG 83967802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATATGCTCCTGAATGACCAG 660

 83967803 TGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGA 83967862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTTGAAACAAATGATCATGA 720

 83967863 AAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTAT 83967922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTAT 780

 83967923 AGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCC 83967982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCTGTAAGTGCCTACATCAATAAAGAAAAAACCTTCAACTCCTTGGTTAGGTATATTCC 840

 83967983 TAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 83968005
          |||||||||||||||||||||||
      841 TAAGTTTATGTTTGTTTGATTGA 863

EXCISED REGION

 83968007 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCT 83968066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCTATTGTAAAAGGGGCTGAGTTCTTGACTTGATTCT 923

 83968067 CTGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATC 83968126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 CTGCTTGGTCGTTGTTGGTGTATAGATGAGCTACTGATTTTTGCACATTAATCTTGTATC 983

 83968127 TGGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGT 83968186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 TGGAAACTTTGCTGAATTCTTTTATCAGTTCTGGGAGCTTTCTGGAGAAGCCCTTAGGGT 1043

 83968187 TTTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGA 83968246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 TTTCAAGGTAAACAATCCTATCGTCAGCATACAGTGACAGTTTGACTTCCTCTTTACTGA 1103

 83968247 TTTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTAT 83968306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 TTTGGATGCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGTTTCCAGTACTAT 1163

 83968307 GTTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGT 83968366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 GTTGAAGAGGTGTGGTGAGAGTGGACATCCTCGTCTTGTTCTAGTTCTCAGAGGGAATGT 1223

 83968367 TTTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTAT 83968426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 TTTCAACTTTTCCCTATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGTTTATCATAGATGGCTTTTAT 1283

 83968427 TATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATG 83968486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 TATATTAAGGTATGTCCCTTGTATGCCAGTTTTGCTGAGAGCTTTAATCATAAAGGGATG 1343

 83968487 CTGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTT 83968546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 CTGGATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCATGTGATTTTTGCTTTT 1403

 83968547 AATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCAT 83968606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 AATTCTGTTTATGTGGTATATCACATTGATTGACTTGCATATGTTCAACCATCCCTGCAT 1463

 83968607 CCCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTT 83968666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 CCCTGGTATGAAACCCACTTGATTATGGTGGATTACCTTTTTGATATGTTGTTGGATTTT 1523

 83968667 GTTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATG 83968726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 GTTAGCTAGTATTTCGTTAAGGATTTTATCATCTATGTTCATCAAGGATCTTGGTCTATG 1583

 83968727 GTTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAAT 83968786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 GTTTTCTTTGTTATGGCCTTTCCTGGTTTTGGTATTAAGGTGATGCTGTCTTCATAGAAT 1643

 83968787 GAATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACC 83968846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 GAATTAGGGAAGGTTCCTTCTTTTTCTATCTCATGGAATCGTGTCAAAAGGATTGGTACC 1703

 83968847 AATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTT 83968906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 AATTCTTCTTTGAATGTCTGGTGGAATTCTGCTGTAAATCATCTGGTCCCAGAATTTTTT 1763

 83968907 TTTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGG 83968966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 TTTGTTGGTAATTTTTTAATTACCATTTCAATCTTGCTGCTTGTCATTGGTCGGTTCAGG 1823

 83968967 GTATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCT 83969026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 GTATCTAATTCTTCCTGATTTAAGCTAAGAGGGTTGTATTTTTCAGGAATTTATCCATCT 1883

 83969027 CTCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTT 83969086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 CTCCTAGGTTTTCTAGTTTATGTGTGTAAAGGTGTTCATACTAGCCTTGAATAATCTTTT 1943

 83969087 GTATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGA 83969146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 GTATTTCAGTGGTGTCAGTTGTAACATCTCCTGTTTCATTTCTTAGTGAGGTTAGTTGGA 2003

 83969147 TTTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTT 83969206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 TTTTCTCTCTTCTTTTCTTGGTTAATCTTGCTAATGGTGTGTCAATTTTACTTATCTTTT 2063

 83969207 CAAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAG 83969266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 CAAATAACCAGATTTTTGCTTCATTTATCAGTTAAATTTTCTTGTTTCAATTTCATTTAG 2123

 83969267 TTCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTG 83969326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 TTCTGCTCTGATCTTGGTTGCTTCCCTTCTTTTGCTGGGTTTGGATTTGGTTTATTCTTG 2183

 83969327 TTTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTT 83969386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 TTTCTCTAGTTCCTTGAGGTGTGACCTTAGAATGCCAGTTTGTGCTTTTTCAGTCTTTTT 2243

 83969387 GATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGA 83969446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 GATGTAGGCGTTTAGGGATATGAACTTTCCTCTTAGTACCACTTTTGCCGTATTCATGGA 2303

 83969447 AAACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCC 83969506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 AAACTACAAAACACTGCTAGAAGAAATCATAGATGACACAAACAAATGGAAACACATCCC 2363

 83969507 ATGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCAAAAGCAATCTA 83969566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2364 ATGCTCATGGATGGGTAGAATCAATATTGTGAAAGTGACCATACTGCCAAAAGCAATCTA 2423

 83969567 CAACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAAC 83969626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 CAACTTCAATGCAATCTCCATCAAAATACCACCATCATTCTTCACAGAATTAGAAAAAAC 2483

 83969627 AATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAA 83969686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 AATTCTAAAATTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCAGATAGCTAAAGCAAGATTAAGCAA 2543

 83969687 AAAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGT 83969746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 AAAGAACAAATCTGGAGGCAACACGCTACCTGATTTCAAACTATGCTATAAGGCCATAGT 2603

 83969747 CAACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAG 83969806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 CAACCAAAACAGCATGGTACTGGTATAAAAATAGGCACGTAGGCCAATGGAACAGAATAG 2663

 83969807 ACAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAA 83969866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 ACAATGCAGAAATAAACCCAAATACTTACAGCAAACTGATCATTGACAAAGCAAACAAAA 2723

 83969867 ACATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCAC 83969926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 ACATAAAGTGGGGAAAGGGCATCCTTCCAACAAATGGTGCTGGGATAACTGGCTAGCCAC 2783

 83969927 ATGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATG 83969986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 ATGTAGGAGAATGAAACTGCATCCTCGTCTCTCACCTTCTACTAAAATCAACTCAAGATG 2843

 83969987 GATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGA 83970046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 GATTAAGGACTTAAACCTAAGACCCCAAACTATAAAAAAATTCTAGAAGATAAAATTGGA 2903

 83970047 AAAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAAT 83970106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 AAAACCCTTTTAGATATCGGCTTAGGCAAGGATTTCATGACCAAGAATCCAAAAGAAAAT 2963

 83970107 GCAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAA 83970166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 GCAATAAAAACAAAGATAAATAGCTGGGACTTAATTAAACTAAAGGGCTTTGCCCGGAAA 3023

 83970167 AGGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTA 83970226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 AGGAACAGTCAACAGAGTAAACAGACAACCCACAAAGCGTGAGAAAATCTTCACAATCTA 3083

 83970227 TATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAA 83970286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 TATGTCTGACAAAGGAATAATATCCAGAATCTATAACAAATTCAAACAAATCAGTAAGAA 3143

 83970287 AAAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAA 83970346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 AAAAAAAGCAGTCTCATCAAAAAGGGGGCTAAGGACATGAATAGACAATTCTCAAAAGAA 3203

 83970347 GATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAAT 83970406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 GATATACAAATGGTCAGCAAACAAGAAAAAATGCTCAACATCACTAGTGATCAGGGAAAT 3263

 83970407 GCAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAA 83970466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 GCAAATCAAAATGACAATGCAATAGCACTTATACTCCTGAAGAGTGGCCATAATCAAAAA 3323

 83970467 CTCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTG 83970526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 CTCAAAAAATAGTAGATGTTGGCATGGATGCTGTGAACAGGGGAGAATTCTACACTGCTG 3383

 83970527 GTGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACT 83970586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 GTGGGAATGTAAACTAGTACAGCCACTACAGAAAACAGTGTGGAGATTCCATAAAGAACT 3443

 83970587 AAAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAG 83970646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 AAAAGTAGAACTACCATTTGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCACCCAGAGGAAAG 3503

 83970647 GGAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTAT 83970706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 GGAGTCATTATTTGAAAAAGATACTTGCACACGCATGTTTATAGCAGCACAAATCACTAT 3563

 83970707 TGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTG 83970766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 TGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATCAATGAGTGGATAAAGAAACTGTG 3623

 83970767 GAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTT 83970826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 GAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGAAAAGGAATGAATTAATAGCATTT 3683

 83970827 TAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAA 83970886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 TAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAA 3743

 83970887 ACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAG 83970946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 ACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAGCCATGAGGACCCAAAGGCATAAG 3803

 83970947 AATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAA 83971006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 AATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAGTGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAA 3863

 83971007 GACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAA 83971066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 GACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAATGGGTGCACCAACATCCCACAAA 3923

 83971067 TCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGA 83971126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 TCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCACCGGTACCCCAATAACATATGGA 3983

 83971127 AAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGAT 83971186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 AAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTCAAATAAAAAACCTAATGATGGAT 4043

 83971187 CTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATA 83971246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 CTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCAAAATTAGAAGAAAAGAAATAATA 4103

 83971247 AGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATG 83971306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 AGGATCAGAGCAGAAATAAATCAATTTGAAATGAAAACAATACAAAAGATTAACAAAATG 4163

 83971307 AAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAA 83971366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 AAAAGTTGATTTTTTTGAAGAGATAAACAAACTTGACAAACATTTAGTCAGGCTAACTAA 4223

 83971367 GAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACT 83971426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 GAAAAAAGAGGGAAAACCCAAATTAAAAAAATCGGAGATGAAAAAGGAAACATTACAACT 4283

 83971427 GATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAA 83971486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 GATACTACAGAAATTCAAAGGATCATTAGTGGCTACAATGAACAATTATATGCCAGTAAA 4343

 83971487 TTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAAC 83971546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 TTGGAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATCCCTATATACACACAACCTACCAAGATTGAAC 4403

 83971547 CATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATA 83971606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 CATGAAGAAATCCAAAGCCTAAACAGACCAATAACATGCAATGAGATCAAAGTCATAATA 4463

 83971607 AAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAA 83971666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4464 AAAAGTTTCCCAGTAAAGAAAAGCCTGCGACCCAATGTCTTCACTGCCGAATTCTACCAA 4523

 83971667 ACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAG 83971726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 ACATTTAAATAAAAAGTAATACCAATCCTACCCAAACTGTTCCAAAAAATAGGGAAGGAG 4583

 83971727 GGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCC 83971769
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 GGAATACTTCCAAGTTCAGCATATGCTAATCAATGCAATATCC 4626

Alignment time is 3.66104 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83957917,83980683] =>     22767 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2141] =>      2141 nucs 'mol-32-34d4-193380_2141'

Score:        2141
Aligned:      2141        nucs
Identic:      2141 (100%) nucs =>      1572 (100%)       569 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83966346,83967917] EXCISED REGION [83970684,83971252]
 second seq =>  [       1,    1572] EXCISED REGION [    1573,    2141]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2766 nucs [83967918,83970683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [83967918,83967925] to [83970684,83970691]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83966346 AGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGA 83966405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCAAGAAGGAATCATCTTTATGCTTTGACTCTTGTCTGTAAAAATAAAAAAGAAGAAGA 60

 83966406 AATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAG 83966465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATCATCTGAAGGCACAAAACTCATTGGTAATAGTAAGCACTCAGAAAAACACAGAATAG 120

 83966466 TATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGAT 83966525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAACATTGTAACGGTGGTATGTAAACCACTCTTGTCTTAAGTAGAAAGACTAAATGAT 180

 83966526 AAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAA 83966585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAACCAATGAAAAATAATAACTAAAACAACTTTTTAAGACATGGACAGCACAATGAGAAA 240

 83966586 TCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTA 83966645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCAGAGAAATAACCAAGAGTTAAAAAGCGGGGAGACCAACTTAAAATTTAGAGGTTTTA 300

 83966646 TTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTA 83966705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAGTTTTCCTTTGGCATGTTGGCTTGTTTTTGCATGCAATAAGTGTTCATTGTCATCTA 360

 83966706 ATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACAAT 83966765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGGGTTGTAAAAAAATATTTGCAAGCCTTATGATAACTTCAAATCAAAAAACATACAAT 420

 83966766 GAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCA 83966825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAATACACAAAAAATAAAAGTCAAGAAATTAAAGCATACCACTAGAGAAAATCACTTTCA 480

 83966826 CTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACA 83966885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTAAAAGGAAGACAGGAAGGATGAACAAAGGAAGAGAAGACCACAAATAGCCAGAAAACA 540

 83966886 AAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGA 83966945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGAACAAAATAGCAGGAGTGAGTTCCAACTTATCAATAATAATATTGAATGTAAATAGA 600

 83966946 CTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAAT 83967005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTAACTCTCCAATCAAAACACATACAGTAGATGAATGGATTAAAAAAACAAGACCCAAT 660

 83967006 GATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATA 83967065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATATGTTGTTGCCTATCAGAAACACATTTCACCTATAAAGATACACATAGAAAAACATA 720

 83967066 AATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATAT 83967125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATGGATGGAAAAAAAATCCCAGGCCAATGGAAACCAAAAAAGAACAAGAGTAGCTATAT 780

 83967126 TTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATT 83967185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTATGTCAGATAAAATAGATGTAAAGACAAACACTGTAAGAAGAGACAAAGAAGGTAATT 840

 83967186 ATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCAC 83967245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATATAATGATAAAGGGGTCAATCCAGCATCAGAATATAATGATTGTCAATATATATGCAC 900

 83967246 CCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTG 83967305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAACACTGTGTTCATATATCTCTCTCTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTACATGTGTG 960

 83967306 GGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTT 83967365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTGCTCCAGGAGAAACAGATATATGACTGTTCTGACAGAGAATTCAAAATACCTATTTT 1020

 83967366 AAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTG 83967425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGGAAACTAAAAGATATTCAAGTTAACACAGAGAAGGAATTCAGAATTCCTTCTCTGTG 1080

 83967426 AGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGA 83967485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAGAGATAAACCCCAATACAATAAGAGCTGGAGACCAACACCCCAATTTCAGCACTGGA 1140

 83967486 AAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATA 83967545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGATCTCCCAGACAGATCATCAACAAAGAAACATAGGACTTAATCTGCACCATAAAATA 1200

 83967546 AATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTT 83967605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATGAACCTAACAGATATTTACAGAACATTTCATCCAACGGCTACAGAATACACATTCTT 1260

 83967606 CTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTC 83967665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCATCAGCATGTGGATAATTCTCAAGGATAGACCATATGTTATGTCACAAAGCAAGTTC 1320

 83967666 TAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAAC 83967725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAAACATTCAAAAAAATAAAATAATATCAATGTCTTCTCCGACCACAATAGAACAGAAC 1380

 83967726 TAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATA 83967785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGAAATCAATAATGAGAGAAATTTTGGAAACTATATAAATATATGAAAAGTAAACAATA 1440

 83967786 TGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTT 83967845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGCTCCTGAATGACCAGTGAGTCAGTGAAGAAATTAAGAAAAAAATTGAAAAAATTTCTT 1500

 83967846 GAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTA 83967905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAACAAATGATCATGAAAATACAACATACCAAAACCTATGAGATACAACGAAAGCAGTA 1560

 83967906 CTAAGAGGGAAA 83967917
          ||||||||||||
     1561 CTAAGAGGGAAA 1572

EXCISED REGION

 83970684 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 83970743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 TTTATAGCAGCACAAATCACTATTGCAGAATAGTGGAACCAACCCAAATGCCCATCAATC 1632

 83970744 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 83970803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 AATGAGTGGATAAAGAAACTGTGGAATATATATGCATGATGGAATATTACTCCACCATGA 1692

 83970804 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 83970863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 AAAGGAATGAATTAATAGCATTTTAAGTGACCTGGATGAGACTGGAGACTATTATTCTAA 1752

 83970864 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 83970923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 GTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACCAAACATTGTATGTTCTCACTATGTGGGAGCTAAG 1812

 83970924 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 83970983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 CCATGAGGACCCAAAGGCATAAGAATGATACAATGGACTTTGGGGACTTGTGGGGAAGAG 1872

 83970984 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 83971043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 TGGTAGGAGGGCAAGGGATAAAAGACTACAGATATGGCGCAGTGTATACTGCTCCGGTAA 1932

 83971044 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 83971103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 TGGGTGCACCAACATCCCACAAATCACCACTAAAGAACTTACTCATGTAAGCAAATACCA 1992

 83971104 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 83971163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 CCGGTACCCCAATAACATATGGAAAAATAAATAAATAAATAAATGAAAACGAAAAAATTC 2052

 83971164 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 83971223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 AAATAAAAAACCTAATGATGGATCTTTAAGAACTAGAAAAGCAATAGCCAACCAAACCCA 2112

 83971224 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATC 83971252
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2113 AAATTAGAAGAAAAGAAATAATAAGGATC 2141

Alignment time is 1.71512 s

