
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,  14575] =>     14575 nucs 'mol-32-1e66-007725_14575'

Score:       14269
Aligned:     14423        nucs
Identic:     14409 (100%) nucs =>     13209 (100%)      1200 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5631632,5644853] EXCISED REGION [5644856,5646056]
 second seq =>  [    156,  13374] EXCISED REGION [  13375,  14575]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [5644854,5644855]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5644854,5644854] to [5644856,5644856]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5631632 AGCCAAGATCCCACCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAA 5631691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      156 AGCCAAGATCCCACCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAA 215

  5631692 AAAAAAAAAAAAAAATCAAATATTGAACCAAGTGATTATAAGGTGTATGATTACATGCCT 5631751
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      216 AAAAAAAAAAAAAA-TCAAATATTGAACCAAGTGATTATAAGGTGTATGATTACATGCCT 274

  5631752 AGGTGAGTGGGATACATATGCTAGACTCCAGCTTCCAATCTTCTCTTCCTGGGATATGCC 5631811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      275 AGGTGAGTGGGATACATATGCTAGACTCCAGCTTCCAATCTTCTCTTCCTGGGATATGCC 334

  5631812 CTTTCTTACTCTGTATGAAAGTTTTCATTTTGATTTTCTAATTTGTAAACTTCCTGAAAG 5631871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      335 CTTTCTTACTCTGTATGAAAGTTTTCATTTTGATTTTCTAATTTGTAAACTTCCTGAAAG 394

  5631872 TATGTAAGTTAATTAGGTTAACAAACTTCATTTAAAAGTGAAAATGCCTTTAGGTAAATT 5631931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      395 TATGTAAGTTAATTAGGTTAACAAACTTCATTTAAAAGTGAAAATGCCTTTAGGTAAATT 454

  5631932 AAAGGGCTATCAGTTATACTTCCATAATTTAGAGTGAATTGGTTTAAAAAGTTCTCATGG 5631991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      455 AAAGGGCTATCAGTTATACTTCCATAATTTAGAGTGAATTGGTTTAAAAAGTTCTCATGG 514

  5631992 AGCTGCTAAAAGCTTTGATTTTTGAGAGGCTGTAGATACAAGTAGTTTTATAATAATATG 5632051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      515 AGCTGCTAAAAGCTTTGATTTTTGAGAGGCTGTAGATACAAGTAGTTTTATAATAATATG 574

  5632052 TGAAGATCTACAGGATTTTACAGAGTTGAAGTCTTACAGCTGCTTGAGGGCATTTGAAGG 5632111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      575 TGAAGATCTACAGGATTTTACAGAGTTGAAGTCTTACAGCTGCTTGAGGGCATTTGAAGG 634

  5632112 CAGGGAGACATGCTCGTAGAGATGATAAAACAAGATTTGCTTACCTGAAATTTTGTTAGG 5632171
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      635 CAGGGAGACATGCTCGTATAGATGATAAAACAAGATTTGCTTACCTGAAATTTTGTTAGG 694

  5632172 GCTCACTTAGTAAATCAGGCTCTCTTAGGAGTGATATATTTTAAAAAGAGACAACTAGCC 5632231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      695 GCTCACTTAGTAAATCAGGCTCTCTTAGGAGTGATATATTTTAAAAAGAGACAACTAGCC 754

  5632232 TTGTGGAAGGGACAGTCGTTTAGTAGTCTAAGCTGGTTGTTTCAATGTTCAAAAGAATTG 5632291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      755 TTGTGGAAGGGACAGTCGTTTAGTAGTCTAAGCTGGTTGTTTCAATGTTCAAAAGAATTG 814

  5632292 TGGAAATTGTATGTGTACAGTGATAATTCATAAGACTGAATCTCTATTAAAATCTCTAAC 5632351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      815 TGGAAATTGTATGTGTACAGTGATAATTCATAAGACTGAATCTCTATTAAAATCTCTAAC 874

  5632352 TGTACATTATATGGGTCTTCTAATGAACTTTTATGTACTACTTATACCTACTGTCCTCTA 5632411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      875 TGTACATTATATGGGTCTTCTAATGAACTTTTATGTACTACTTATACCTACTGTCCTCTA 934

  5632412 TTCTAAGTAGGTATTCGGAATTCCACTGTTTAGACTCATATCTCTTCAGAATTATTTCCT 5632471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      935 TTCTAAGTAGGTATTCGGAATTCCACTGTTTAGACTCATATCTCTTCAGAATTATTTCCT 994

  5632472 ACCCCAAATTTGAGAAATACAGTATAGTGTTGTTTATGAACAAAAGAGCCTCTAGATAGT 5632531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 ACCCCAAATTTGAGAAATACAGTATAGTGTTGTTTATGAACAAAAGAGCCTCTAGATAGT 1054

  5632532 TACTTAGCTTTTTTATATTGGAGCCCCAATATTATATTTTGGAGCCCCCCAAATGGTGTT 5632591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 TACTTAGCTTTTTTATATTGGAGCCCCAATATTATATTTTGGAGCCCCCCAAATGGTGTT 1114

  5632592 AAAAAAAGGCTCAGTATGTGTAGGCTAGATTGGGGTGGTAGAGGTAGAACTTGACTGGGG 5632651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 AAAAAAAGGCTCAGTATGTGTAGGCTAGATTGGGGTGGTAGAGGTAGAACTTGACTGGGG 1174

  5632652 GCAGTTGGTACATTTCTGCTAAGGTTATTGTAAAAGGACTAGTTTCAGCTTTGAGGATGA 5632711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 GCAGTTGGTACATTTCTGCTAAGGTTATTGTAAAAGGACTAGTTTCAGCTTTGAGGATGA 1234

  5632712 AACTGTTGCATAAGGTAGGTTATGATTTATGATTGACGTAGGTGTAGTGTGAGATGAATT 5632771
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 AACTGTTGCGTAAGGTAGGTTATGATTTATGATTGACGTAGGTGTAGTGTGAGATGAATT 1294

  5632772 ACATTTTGTACTGTACTGAGGGCCCAGAATTATTCCTTTAATATACTAACTGTGACTATG 5632831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 ACATTTTGTACTGTACTGAGGGCCCAGAATTATTCCTTTAATATACTAACTGTGACTATG 1354

  5632832 AAAGTCTATATATGTGAACATCAGAATGGTATCTTTGAATTTAGCCATTCTAAATTAGAT 5632891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 AAAGTCTATATATGTGAACATCAGAATGGTATCTTTGAATTTAGCCATTCTAAATTAGAT 1414

  5632892 GTATAGACATTCTCGTTTTTCAGGTCACCGACTTTAAACATTTAAATTAGCTTCAGAAGT 5632951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 GTATAGACATTCTCGTTTTTCAGGTCACCGACTTTAAACATTTAAATTAGCTTCAGAAGT 1474

  5632952 ATTTTTGAACATCAACTGTAAAAGACAGATGTGTATAAAAGGGATGAAGAGACATGTTAT 5633011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 ATTTTTGAACATCAACTGTAAAAGACAGATGTGTATAAAAGGGATGAAGAGACATGTTAT 1534

  5633012 ATGTTAGTGTGTTAGATGTTAGTGTGTTAATATAAATCTTGTGAGATATCACTGTTGTAG 5633071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 ATGTTAGTGTGTTAGATGTTAGTGTGTTAATATAAATCTTGTGAGATATCACTGTTGTAG 1594

  5633072 GTAGCTAATAAAAAGCTGAAATGGGCAAATAATTACTAGGCTTATAAAATAAATTATATG 5633131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 GTAGCTAATAAAAAGCTGAAATGGGCAAATAATTACTAGGCTTATAAAATAAATTATATG 1654

  5633132 TCGTTTAGTAATCCTGAGCAAAAACTTAGTTCCCATTGGTATGTGCTAATCATGGAAAAA 5633191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 TCGTTTAGTAATCCTGAGCAAAAACTTAGTTCCCATTGGTATGTGCTAATCATGGAAAAA 1714

  5633192 AACAATGATATGTCAAAAGAACCAAGCTTTGGATCAGGTATGTGATTAACTGTGTTGACC 5633251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 AACAATGATATGTCAAAAGAACCAAGCTTTGGATCAGGTATGTGATTAACTGTGTTGACC 1774

  5633252 TCAGGAAGACCATTTTATTTGTATTTTCCCAGCATTCCCATTTCTCACCCTTTTAACTCT 5633311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 TCAGGAAGACCATTTTATTTGTATTTTCCCAGCATTCCCATTTCTCACCCTTTTAACTCT 1834

  5633312 ATTACTTTCTCCAGAGAGCCTTCTTTATAAATTCACTGCTCTGAAGTCTTCTAGGGTTCA 5633371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 ATTACTTTCTCCAGAGAGCCTTCTTTATAAATTCACTGCTCTGAAGTCTTCTAGGGTTCA 1894

  5633372 CTGTTGATGAAAGAATGGAGTTCAAACTCCTTAGTTTGATATCACAGACACTCCCTTCTT 5633431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 CTGTTGATGAAAGAATGGAGTTCAAACTCCTTAGTTTGATATCACAGACACTCCCTTCTT 1954

  5633432 GGAATGCTCTCTTGCCTCATTTCTGCCTGTCAGAGTATTATCTATCCTTTAACTGCTGTT 5633491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 GGAATGCTCTCTTGCCTCATTTCTGCCTGTCAGAGTATTATCTATCCTTTAACTGCTGTT 2014

  5633492 GAAATCCTTTCTTTATGAGTCATTCTTTACCTACCGTAACCATAAGTGTTCATTTTTCTG 5633551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 GAAATCCTTTCTTTATGAGTCATTCTTTACCTACCGTAACCATAAGTGTTCATTTTTCTG 2074

  5633552 ATGAACTACTGCTTCCCCACTACTGCCAGCTTTGTTGAGGTATAATTGACAAATAAAAAT 5633611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 ATGAACTACTGCTTCCCCACTACTGCCAGCTTTGTTGAGGTATAATTGACAAATAAAAAT 2134

  5633612 TGTATATATTTAAGGTGTGCTGTGCGATACTTAGATCTACCCTGTGAGTTGATAATCACA 5633671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 TGTATATATTTAAGGTGTGCTGTGCGATACTTAGATCTACCCTGTGAGTTGATAATCACA 2194

  5633672 ATCAGTCTAATTAACAGATCCACCATCTCACACAGCTCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGAT 5633731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 ATCAGTCTAATTAACAGATCCACCATCTCACACAGCTCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGAT 2254

  5633732 GAGAACACTTAAGACCTACTCTCTTAGCAAATTTCAAGTATACAATATATGTTAATTATG 5633791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 GAGAACACTTAAGACCTACTCTCTTAGCAAATTTCAAGTATACAATATATGTTAATTATG 2314

  5633792 GAAATAAATGTCATTATTAACGATAGTTACTGGGCCATGCATTAGGTCCCCAGAACGTAT 5633851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 GAAATAAATGTCATTATTAACGATAGTTACTGGGCCATGCATTAGGTCCCCAGAACGTAT 2374

  5633852 TCATCTTATACCTGAAAATTTGTACCTTTGACTGAAATACTCCCATTTCACCCACCTCCC 5633911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 TCATCTTATACCTGAAAATTTGTACCTTTGACTGAAATACTCCCATTTCACCCACCTCCC 2434

  5633912 AGCCCCTGGTAATCATCGTTCTATTCTCTGTTCCTATGAATTTGACGTCTTTATATTCCA 5633971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 AGCCCCTGGTAATCATCGTTCTATTCTCTGTTCCTATGAATTTGACGTCTTTATATTCCA 2494

  5633972 TATATGAGATCATGAAGTTGTTTTTTGTCTTGCTTACTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTT 5634031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 TATATGAGATCATGAAGTTGTTTTTTGTCTTGCTTACTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTT 2554

  5634032 GTCCATGTTGTTGCAGATGGCAGGATTTCCTTGTTTTTTAAAGGCTGAATAATATTTTAT 5634091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 GTCCATGTTGTTGCAGATGGCAGGATTTCCTTGTTTTTTAAAGGCTGAATAATATTTTAT 2614

  5634092 GTGTGTATGTGTGTGTGTTACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGT 5634151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 GTGTGTATGTGTGTGTGTTACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGT 2674

  5634152 TGTTTCTGTATCTTGGCTACTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCT 5634211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 TGTTTCTGTATCTTGGCTACTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCT 2734

  5634212 CTTTGAGATACTGATTTCAATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCA 5634271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 CTTTGAGATACTGATTTCAATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCA 2794

  5634272 TGTGGTAGTCCTGTTTTTAGTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTT 5634331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 TGTGGTAGTCCTGTTTTTAGTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTT 2854

  5634332 GCAGTCCCGTCAATAGTGTACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTT 5634391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 GCAGTCCCGTCAATAGTGTACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTT 2914

  5634392 GTTATGATTTAACTTCTTGATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTT 5634451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 GTTATGATTTAACTTCTTGATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTT 2974

  5634452 GATTTGCATCTCCCTGATGATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTG 5634511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 GATTTGCATCTCCCTGATGATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTG 3034

  5634512 GTAAAACATCTGTTCAGATCTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTT 5634571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 GTAAAACATCTGTTCAGATCTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTT 3094

  5634572 TCTCGGTACTGAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATG 5634631
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 TCTTGGTACTGAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATG 3154

  5634632 TATGGTTTGCAGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTT 5634691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 TATGGTTTGCAGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTT 3214

  5634692 TCTTTACTGTACAATAACTTAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCA 5634751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 TCTTTACTGTACAATAACTTAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCA 3274

  5634752 CCTGTGCTTTCCATGTCATCCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCC 5634811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 CCTGTGCTTTCCATGTCATCCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCC 3334

  5634812 CCTGTTTTCTTCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCT 5634871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 CCTGTTTTCTTCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCT 3394

  5634872 TCTTATTTTAATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATA 5634931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 TCTTATTTTAATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATA 3454

  5634932 TTTTGATACAGGACTATAGTCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCAT 5634991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 TTTTGATACAGGACTATAGTCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCAT 3514

  5634992 CATCACCATTATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATG 5635051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 CATCACCATTATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATG 3574

  5635052 ATCATGGCTTACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCC 5635111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 ATCATGGCTTACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCC 3634

  5635112 TGAGTAGCTGGGAGTACAGATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTG 5635171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 TGAGTAGCTGGGAGTACAGATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTG 3694

  5635172 GTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTC 5635231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 GTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTC 3754

  5635232 AGCCTCCTAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTT 5635291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 AGCCTCCTAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTT 3814

  5635292 TTCTATTTTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGA 5635351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 TTCTATTTTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGA 3874

  5635352 GTTGATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTC 5635411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 GTTGATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTC 3934

  5635412 TAACACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTT 5635471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 TAACACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTT 3994

  5635472 TGTGAAAGATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCAT 5635531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 TGTGAAAGATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCAT 4054

  5635532 TGGTCTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAA 5635591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 TGGTCTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAA 4114

  5635592 TATACTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCT 5635651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 TATACTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCT 4174

  5635652 AATCGTAATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGAT 5635711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 AATCGTAATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGAT 4234

  5635712 CATAGCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGG 5635771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 CATAGCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGG 4294

  5635772 TTTTATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATG 5635831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 TTTTATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATG 4354

  5635832 TAACAAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCA 5635891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 TAACAAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCA 4414

  5635892 TTATGGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGT 5635951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 TTATGGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGT 4474

  5635952 TATAGCAGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTC 5636011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 TATAGCAGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTC 4534

  5636012 TTTCTCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATT 5636071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 TTTCTCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATT 4594

  5636072 GTTTTTCTGTTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATA 5636131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 GTTTTTCTGTTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATA 4654

  5636132 GATTGGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAA 5636191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 GATTGGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAA 4714

  5636192 GATATCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTT 5636251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 GATATCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTT 4774

  5636252 AGTGGCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGT 5636311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 AGTGGCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGT 4834

  5636312 TTTCTTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAG 5636371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4835 TTTCTTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAG 4894

  5636372 TGCAATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCT 5636431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4895 TGCAATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCT 4954

  5636432 GCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTT 5636491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4955 GCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTT 5014

  5636492 GTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCT 5636551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5015 GTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCT 5074

  5636552 CAGTTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACT 5636611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5075 CAGTTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACT 5134

  5636612 CCCAGCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAA 5636671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5135 CCCAGCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAA 5194

  5636672 CTTATTCTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTA 5636731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5195 CTTATTCTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTA 5254

  5636732 AATTTTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAAT 5636791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5255 AATTTTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAAT 5314

  5636792 TTTGCTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTC 5636851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5315 TTTGCTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTC 5374

  5636852 TCCAGCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGT 5636911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5375 TCCAGCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGT 5434

  5636912 GCCTTGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTG 5636971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5435 GCCTTGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTG 5494

  5636972 TCATACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACA 5637031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5495 TCATACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACA 5554

  5637032 CAGTAGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCAC 5637091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5555 CAGTAGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCAC 5614

  5637092 TTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTAC 5637151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5615 TTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTAC 5674

  5637152 TGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCC 5637211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5675 TGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCC 5734

  5637212 ACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATG 5637271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5735 ACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATG 5794

  5637272 TTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAA 5637331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5795 TTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAA 5854

  5637332 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGT 5637391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5855 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGT 5914

  5637392 GCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCT 5637451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5915 GCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCT 5974

  5637452 TCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATT 5637511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5975 TCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATT 6034

  5637512 TTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTG 5637571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6035 TTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTG 6094

  5637572 TACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGG 5637631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6095 TACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGG 6154

  5637632 TAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACA 5637691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6155 TAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACA 6214

  5637692 AATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAAT 5637751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6215 AATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAAT 6274

  5637752 GACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAA 5637811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6275 GACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAA 6334

  5637812 TAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACAC 5637871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6335 TAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACAC 6394

  5637872 TTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCT 5637931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6395 TTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCT 6454

  5637932 TAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATA 5637991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6455 TAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATA 6514

  5637992 TATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTAT 5638051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6515 TATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTAT 6574

  5638052 GAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGT 5638111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6575 GAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGT 6634

  5638112 TTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACC 5638171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6635 TTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACC 6694

  5638172 ATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATT 5638231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6695 ATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATT 6754

  5638232 GTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATA 5638291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6755 GTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATA 6814

  5638292 TTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCT 5638351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6815 TTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCT 6874

  5638352 GGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAG 5638411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6875 GGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAG 6934

  5638412 TAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTT 5638471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6935 TAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTT 6994

  5638472 GGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGT 5638531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6995 GGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGT 7054

  5638532 TCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATC 5638591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7055 TCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATC 7114

  5638592 CATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGAT 5638651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7115 CATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGAT 7174

  5638652 CGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTAT 5638711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7175 CGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTAT 7234

  5638712 TTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTAT 5638771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7235 TTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTAT 7294

  5638772 GTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCT 5638831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7295 GTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCT 7354

  5638832 TTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGG 5638891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     7355 TTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGG 7414

  5638892 CATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTT 5638951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7415 CATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTT 7474

  5638952 ATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAG 5639011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7475 ATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAG 7534

  5639012 TTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCG 5639071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7535 TTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCG 7594

  5639072 TGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATT 5639131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7595 TGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATT 7654

  5639132 CCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCC 5639191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7655 CCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCC 7714

  5639192 ACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTG 5639251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7715 ACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTG 7774

  5639252 TTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTG 5639311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7775 TTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTG 7834

  5639312 TTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGA 5639371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7835 TTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGA 7894

  5639372 ACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTA 5639431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7895 ACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTA 7954

  5639432 GTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAA 5639491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7955 GTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAA 8014

  5639492 GATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGT 5639551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     8015 GATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCTATGTACTGAGGGAAAGAATGT 8074

  5639552 GTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTAT 5639611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8075 GTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTAT 8134

  5639612 AGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGC 5639671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8135 AGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGC 8194

  5639672 TGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCC 5639731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8195 TGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCC 8254

  5639732 TAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTAT 5639791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8255 TAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTAT 8314

  5639792 ATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTT 5639851
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     8315 ATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTTTATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTT 8374

  5639852 TTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCAT 5639911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8375 TTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCAT 8434

  5639912 TGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAA 5639971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8435 TGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAA 8494

  5639972 GTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCT 5640031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8495 GTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCT 8554

  5640032 CTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGG 5640091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8555 CTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGG 8614

  5640092 ACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACT 5640151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8615 ACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACT 8674

  5640152 TGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTT 5640211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8675 TGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTT 8734

  5640212 TTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTAC 5640271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8735 TTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTAC 8794

  5640272 TGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCA 5640331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8795 TGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCA 8854

  5640332 AACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACT 5640391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8855 AACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACT 8914

  5640392 TCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCT 5640451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8915 TCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCT 8974

  5640452 CCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTC 5640511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8975 CCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTC 9034

  5640512 ATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATC 5640571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9035 ATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATC 9094

  5640572 ATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTAC 5640631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9095 ATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTAC 9154

  5640632 TCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGT 5640691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9155 TCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGT 9214

  5640692 TGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAAC 5640751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9215 TGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAAC 9274

  5640752 TCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGT 5640811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9275 TCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGT 9334

  5640812 CTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTC 5640871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9335 CTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTC 9394

  5640872 TAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTC 5640931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9395 TAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTC 9454

  5640932 TCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGT 5640991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9455 TCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGT 9514

  5640992 ATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAA 5641051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9515 ATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAA 9574

  5641052 ACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTG 5641111
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     9575 ACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTT-G 9633

  5641112 GACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCA 5641171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9634 GACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCA 9693

  5641172 AGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTA 5641231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9694 AGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTA 9753

  5641232 CAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCAC 5641291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9754 CAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCAC 9813

  5641292 TGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCA 5641351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9814 TGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCA 9873

  5641352 AAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTA 5641411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9874 AAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTA 9933

  5641412 GGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTA 5641471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9934 GGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTA 9993

  5641472 GGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTA 5641531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9994 GGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTA 10053

  5641532 CTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATG 5641591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10054 CTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATG 10113

  5641592 CTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGC 5641651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10114 CTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGC 10173

  5641652 CTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCT 5641711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10174 CTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCT 10233

  5641712 GATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTA 5641771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10234 GATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTA 10293

  5641772 AAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATC 5641831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10294 AAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATC 10353

  5641832 TTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACAT 5641891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10354 TTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACAT 10413

  5641892 ATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCAT 5641951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10414 ATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCAT 10473

  5641952 GTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAA 5642011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10474 GTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAA 10533

  5642012 GAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAG 5642071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10534 GAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAG 10593

  5642072 AAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTG 5642131
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10594 AAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTG 10653

  5642132 CAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTA 5642191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10654 CAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTA 10713

  5642192 CCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCT 5642251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10714 CCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCT 10773

  5642252 GTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCC 5642311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10774 GTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCC 10833

  5642312 ACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCA 5642371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10834 ACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCA 10893

  5642372 AGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTA 5642431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10894 AGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTA 10953

  5642432 CCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCC 5642491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10954 CCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCC 11013

  5642492 CCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCT 5642551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11014 CCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCT 11073

  5642552 TAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACA 5642611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11074 TAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACA 11133

  5642612 AAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACC 5642671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11134 AAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACC 11193

  5642672 ACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGT 5642731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11194 ACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGT 11253

  5642732 TTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGA 5642791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11254 TTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGA 11313

  5642792 CTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCA 5642851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11314 CTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCA 11373

  5642852 TTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGT 5642911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11374 TTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGT 11433

  5642912 CTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTA 5642971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11434 CTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTA 11493

  5642972 TGAATAGAAGATATTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTG 5643031
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11494 TGAATAGAAGATCTTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTG 11553

  5643032 GCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAG 5643091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11554 GCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAG 11613

  5643092 GAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATA 5643151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11614 GAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATA 11673

  5643152 AAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGG 5643211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11674 AAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGG 11733

  5643212 TGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAAT 5643271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11734 TGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAAT 11793

  5643272 CTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCA 5643331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11794 CTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCA 11853

  5643332 TGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTA 5643391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11854 TGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTA 11913

  5643392 TACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGT 5643451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11914 TACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGT 11973

  5643452 GAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAA 5643511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11974 GAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAA 12033

  5643512 AAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGG 5643571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12034 AAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGG 12093

  5643572 GCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTC 5643631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12094 GCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTC 12153

  5643632 TCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGAT 5643691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12154 TCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGAT 12213

  5643692 TGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGT 5643751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12214 TGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGT 12273

  5643752 TCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACA 5643811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12274 TCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACA 12333

  5643812 ATTTAAAAATATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGAT 5643871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12334 ATTTAAAAATATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGAT 12393

  5643872 TTCTTACTCATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTT 5643931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12394 TTCTTACTCATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTT 12453

  5643932 ACAATTGCTTTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTA 5643991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12454 ACAATTGCTTTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTA 12513

  5643992 TTTCAACCATAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAAT 5644051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12514 TTTCAACCATAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAAT 12573

  5644052 ACTGTAGAATTTGCTATGGTTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCT 5644111
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
    12574 ACTGTAGAATTTGCTATGGTTTAAATTTT-AAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCT 12632

  5644112 AAGTGTACATTGATTTTTAGTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTT 5644171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12633 AAGTGTACATTGATTTTTAGTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTT 12692

  5644172 TTAGAACATTTATATCAGCCTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCC 5644231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12693 TTAGAACATTTATATCAGCCTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCC 12752

  5644232 CATTCCAGCCTTAGAAAACCTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAA 5644291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12753 CATTCCAGCCTTAGAAAACCTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAA 12812

  5644292 TTTTCATATCATTGGAATCATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCAT 5644351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12813 TTTTCATATCATTGGAATCATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCAT 12872

  5644352 AATGTTTTTGAGGTGCATCCAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAA 5644411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12873 AATGTTTTTGAGGTGCATCCAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAA 12932

  5644412 GGGATACAAGTGCAGTTTTTTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTT 5644471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12933 GGGATACAAGTGCAGTTTTTTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTT 12992

  5644472 AGTGTAATCATCAGCTAAAGAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATC 5644531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12993 AGTGTAATCATCAGCTAAAGAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATC 13052

  5644532 CCCTTCTCATCCTTCTGAGTCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGT 5644591
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13053 CCCTTCTCATCCTTCTGAGTCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGT 13112

  5644592 ATTCCTTTTTGTTGCTGAATATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCAT 5644651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13113 ATTCCTTTTTGTTGCTGAATATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCAT 13172

  5644652 TCACCAGTTGACAGGTATTTGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGA 5644711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13173 TCACCAGTTGACAGGTATTTGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGA 13232

  5644712 GTAATACTGCTGTAAACATTTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAG 5644771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13233 GTAATACTGCTGTAAACATTTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAG 13292

  5644772 AGAGATACCTAGGAGTGCAACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTG 5644831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13293 AGAGATACCTAGGAGTGCAACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTG 13352

  5644832 CAAAACTTTGTTCCAAAGTGAC 5644853
          ||||||||||||||||||||||
    13353 CAAAACTTTGTTCCAAAGTGAC 13374

EXCISED REGION

  5644856 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 5644915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13375 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 13434

  5644916 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 5644975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13435 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 13494

  5644976 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 5645035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13495 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 13554

  5645036 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 5645095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13555 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 13614

  5645096 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 5645155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13615 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 13674

  5645156 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 5645215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13675 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 13734

  5645216 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 5645275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13735 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 13794

  5645276 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 5645335
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13795 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 13854

  5645336 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 5645395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13855 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 13914

  5645396 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 5645455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13915 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 13974

  5645456 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 5645515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13975 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 14034

  5645516 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 5645575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    14035 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 14094

  5645576 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 5645635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    14095 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 14154

  5645636 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 5645695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    14155 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 14214

  5645696 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 5645755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    14215 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 14274

  5645756 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 5645815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    14275 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 14334

  5645816 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 5645875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    14335 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 14394

  5645876 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 5645935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    14395 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 14454

  5645936 GGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAGA 5645995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    14455 GGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAGA 14514

  5645996 AATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACAG 5646055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    14515 AATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACAG 14574

  5646056 T 5646056
          |
    14575 T 14575

Alignment time is 17.4278 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   4136] =>      4136 nucs 'mol-32-1e87-111924_4136'

Score:        4092
Aligned:      4136        nucs
Identic:      4132 (100%) nucs =>       647 (100%)      3485 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5640986,5641632] EXCISED REGION [5642811,5646298]
 second seq =>  [      1,    647] EXCISED REGION [    648,   4136]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1178 nucs [5641633,5642810]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5641633,5641633] to [5642811,5642811]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5640986 TATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGAT 5641045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGAT 60

  5641046 AAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTT 5641105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTT 120

  5641106 TTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTC 5641165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTC 180

  5641166 ACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTG 5641225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTG 240

  5641226 GGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG 5641285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG 300

  5641286 TTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGC 5641345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGC 360

  5641346 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCT 5641405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCT 420

  5641406 TCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTT 5641465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTT 480

  5641466 TCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTT 5641525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTT 540

  5641526 TCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTA 5641585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTA 600

  5641586 GGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCT 5641632
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCT 647

EXCISED REGION

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      648 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 707

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      708 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 767

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      768 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 827

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      828 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 887

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      888 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 947

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      948 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 1007

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1008 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 1067

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1068 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 1127

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1128 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 1187

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 1247

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 1307

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 1367

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 1427

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 1487

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 1547

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 1607

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 1667

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5643890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 1727

  5643891 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5643950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 1787

  5643951 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5644010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 1847

  5644011 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5644070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 1907

  5644071 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5644130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 1967

  5644131 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5644190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 2027

  5644191 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5644250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 2087

  5644251 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5644310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 2147

  5644311 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5644370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 2207

  5644371 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5644430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 2267

  5644431 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 2327

  5644491 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5644550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 2387

  5644551 TCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 5644610
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 TCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 2447

  5644611 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 5644670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 2507

  5644671 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 5644730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 2567

  5644731 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 5644790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 2627

  5644791 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 5644850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 2687

  5644851 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 5644910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 2747

  5644911 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 5644970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 2807

  5644971 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 5645030
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATCTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 2867

  5645031 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 5645090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 2927

  5645091 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 5645150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 2987

  5645151 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 5645210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 3047

  5645211 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 5645270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 3107

  5645271 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 5645330
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 3167

  5645331 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 5645390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 3227

  5645391 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 5645450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 3287

  5645451 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 5645510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 3347

  5645511 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 5645570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 3407

  5645571 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 5645630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 3467

  5645631 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 5645690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 3527

  5645691 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 5645750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 3587

  5645751 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 5645810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 3647

  5645811 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 5645870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 3707

  5645871 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 5645930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 3767

  5645931 CATTTGGTTATTCTATAGG-TTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATG 5645989
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 CATTTGGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATG 3827

  5645990 TTAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCA 5646049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 TTAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCA 3887

  5646050 ATACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGA 5646109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 ATACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGA 3947

  5646110 TTGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGG 5646169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 TTGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGG 4007

  5646170 TTATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGT 5646229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 TTATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGT 4067

  5646230 GTCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGC 5646289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 GTCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGC 4127

  5646290 TTCATGTAT 5646298
          |||||||||
     4128 TTCATGTAT 4136

Alignment time is 5.12959 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   4623] =>      4623 nucs 'mol-32-1eea-001388_4623'

Score:        4589
Aligned:      4622        nucs
Identic:      4619 (100%) nucs =>       109 (100%)      4510 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5639421,5639529] EXCISED REGION [5639531,5644043]
 second seq =>  [      1,    109] EXCISED REGION [    111,   4623]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5639530,5639530]
 second seq =>         1 nucs [110,110]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5639529,5639529] to [5639530,5639530]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5639421 ATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTT 5639480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTT 60

  5639481 GAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATC 5639529
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATC 109

EXCISED REGION

  5639531 ATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATC 5639590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      111 ATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATC 170

  5639591 TGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTG 5639650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      171 TGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTG 230

  5639651 TCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAG 5639710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      231 TCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAG 290

  5639711 GTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGC 5639770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      291 GTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGC 350

  5639771 ATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATG 5639830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      351 ATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTTTATAATG 410

  5639831 ACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTAC 5639890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      411 ACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTAC 470

  5639891 TCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCT 5639950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      471 TCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCT 530

  5639951 ATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTT 5640010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      531 ATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTT 590

  5640011 TTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAA 5640070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      591 TTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAA 650

  5640071 TGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGT 5640130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      651 TGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGT 710

  5640131 GGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGC 5640190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 GGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGC 770

  5640191 TATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTT 5640250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 TATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTT 830

  5640251 TACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAA 5640310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 TACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAA 890

  5640311 CACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAA 5640370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 CACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAA 950

  5640371 TTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTA 5640430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 TTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTA 1010

  5640431 ACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGT 5640490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 ACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGT 1070

  5640491 TATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAAT 5640550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 TATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAAT 1130

  5640551 AACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTG 5640610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 AACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTG 1190

  5640611 TAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTG 5640670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 TAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTG 1250

  5640671 TGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTC 5640730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 TGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTC 1310

  5640731 TTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATG 5640790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 TTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATG 1370

  5640791 AACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATA 5640850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 AACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATA 1430

  5640851 TTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTT 5640910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 TTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTT 1490

  5640911 TCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCA 5640970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 TCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCA 1550

  5640971 GAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCT 5641030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 GAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCT 1610

  5641031 TTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTA 5641090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 TTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTA 1670

  5641091 GTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTG 5641150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 GTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTG 1730

  5641151 GTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAG 5641210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 GTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAG 1790

  5641211 CCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTT 5641270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 CCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTT 1850

  5641271 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGA 5641330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGA 1910

  5641331 TCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCC 5641390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 TCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCC 1970

  5641391 GCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTT 5641450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 GCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTT 2030

  5641451 GAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTT 5641510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 GAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTT 2090

  5641511 CTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTT 5641570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 CTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTT 2150

  5641571 TCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCT 5641630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 TCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCT 2210

  5641631 CTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCA 5641690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 CTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCA 2270

  5641691 ATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTT 5641750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 ATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTT 2330

  5641751 AGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCT 5641810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 AGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCT 2390

  5641811 GAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAA 5641870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 GAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAA 2450

  5641871 TTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACT 5641930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 TTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACT 2510

  5641931 TAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTT 5641990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 TAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTT 2570

  5641991 CATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTG 5642050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 CATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTG 2630

  5642051 TTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGC 5642110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2631 TTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGC 2690

  5642111 CCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAAT 5642170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 CCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAAT 2750

  5642171 CTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCC 5642230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 CTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCC 2810

  5642231 AAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTT 5642290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 AAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTT 2870

  5642291 GATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAG 5642350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 GATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAG 2930

  5642351 CAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTC 5642410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 CAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTC 2990

  5642411 ACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTT 5642470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 ACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTT 3050

  5642471 CCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCC 5642530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 CCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCC 3110

  5642531 AGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGC 5642590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 AGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGC 3170

  5642591 AGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGA 5642650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 AGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGA 3230

  5642651 GAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGC 5642710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 GAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGC 3290

  5642711 CGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATAT 5642770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 CGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATAT 3350

  5642771 TTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAAT 5642830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 TTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAAT 3410

  5642831 TTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATT 5642890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 TTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATT 3470

  5642891 GTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAAT 5642950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 GTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAAT 3530

  5642951 GGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGAAGGAATACAATAAAAACAAT 5643010
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3531 GGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATCTTATGAAGGAATACAATAAAAACAAT 3590

  5643011 TTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGT 5643070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 TTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGT 3650

  5643071 GGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCA 5643130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 GGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCA 3710

  5643131 TCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCT 5643190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 TCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCT 3770

  5643191 CAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAA 5643250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 CAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAA 3830

  5643251 ACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGG 5643310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 ACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGG 3890

  5643311 CTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGT 5643370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 CTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGT 3950

  5643371 GATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGC 5643430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 GATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGC 4010

  5643431 CTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACA 5643490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 CTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACA 4070

  5643491 GGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATA 5643550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 GGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATA 4130

  5643551 ATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAAC 5643610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 ATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAAC 4190

  5643611 TAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAA 5643670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 TAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAA 4250

  5643671 AAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGAT 5643730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 AAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGAT 4310

  5643731 ATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAG 5643790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 ATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAG 4370

  5643791 AAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATG 5643850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 AAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATG 4430

  5643851 AGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGA 5643910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 AGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGA 4490

  5643911 GAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTG 5643970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 GAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTG 4550

  5643971 TCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAAT 5644030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 TCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAAT 4610

  5644031 TTGGATATTATTG 5644043
          |||||||||||||
     4611 TTGGATATTATTG 4623

Alignment time is 6.20602 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   2952] =>      2952 nucs 'mol-32-1f00-159934_2952'

Score:        2940
Aligned:      2951        nucs
Identic:      2950 (100%) nucs =>       433 (100%)      2517 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5639097,5639529] EXCISED REGION [5639531,5642048]
 second seq =>  [      1,    433] EXCISED REGION [    435,   2952]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5639530,5639530]
 second seq =>         1 nucs [434,434]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5639529,5639529] to [5639530,5639530]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5639097 GGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACC 5639156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACC 60

  5639157 TCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTT 5639216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTT 120

  5639217 TTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCA 5639276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCA 180

  5639277 TAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTT 5639336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTT 240

  5639337 CTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTT 5639396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTT 300

  5639397 TATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGAT 5639456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGAT 360

  5639457 GCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAA 5639516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAA 420

  5639517 TCCTTAAGTGATC 5639529
          |||||||||||||
      421 TCCTTAAGTGATC 433

EXCISED REGION

  5639531 ATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATC 5639590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 ATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATC 494

  5639591 TGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTG 5639650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 TGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTG 554

  5639651 TCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAG 5639710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 TCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAG 614

  5639711 GTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGC 5639770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 GTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGC 674

  5639771 ATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATG 5639830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      675 ATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTTTATAATG 734

  5639831 ACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTAC 5639890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 ACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTAC 794

  5639891 TCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCT 5639950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 TCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCT 854

  5639951 ATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTT 5640010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 ATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTT 914

  5640011 TTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAA 5640070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 TTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAA 974

  5640071 TGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGT 5640130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 TGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGT 1034

  5640131 GGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGC 5640190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 GGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGC 1094

  5640191 TATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTT 5640250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 TATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTT 1154

  5640251 TACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAA 5640310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 TACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAA 1214

  5640311 CACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAA 5640370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 CACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAA 1274

  5640371 TTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTA 5640430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 TTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTA 1334

  5640431 ACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGT 5640490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 ACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGT 1394

  5640491 TATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAAT 5640550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 TATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAAT 1454

  5640551 AACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTG 5640610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 AACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTG 1514

  5640611 TAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTG 5640670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 TAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTG 1574

  5640671 TGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTC 5640730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 TGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTC 1634

  5640731 TTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATG 5640790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 TTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATG 1694

  5640791 AACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATA 5640850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 AACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATA 1754

  5640851 TTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTT 5640910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 TTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTT 1814

  5640911 TCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCA 5640970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 TCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCA 1874

  5640971 GAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCT 5641030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 GAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCT 1934

  5641031 TTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTA 5641090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 TTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTA 1994

  5641091 GTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTG 5641150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 GTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTG 2054

  5641151 GTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAG 5641210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 GTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAG 2114

  5641211 CCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTT 5641270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 CCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTT 2174

  5641271 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGA 5641330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGA 2234

  5641331 TCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCC 5641390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 TCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCC 2294

  5641391 GCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTT 5641450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 GCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTT 2354

  5641451 GAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTT 5641510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 GAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTT 2414

  5641511 CTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTT 5641570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 CTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTT 2474

  5641571 TCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCT 5641630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 TCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCT 2534

  5641631 CTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCA 5641690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 CTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCA 2594

  5641691 ATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTT 5641750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 ATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTT 2654

  5641751 AGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCT 5641810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 AGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCT 2714

  5641811 GAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAA 5641870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 GAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAA 2774

  5641871 TTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACT 5641930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 TTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACT 2834

  5641931 TAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTT 5641990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 TAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTT 2894

  5641991 CATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCT 5642048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 CATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCT 2952

Alignment time is 4.1285 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3634] =>      3634 nucs 'mol-32-1f21-094236_3634'

Score:        3601
Aligned:      3634        nucs
Identic:      3631 (100%) nucs =>        30 (100%)      3601 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5640415,5640444] EXCISED REGION [5640446,5644049]
 second seq =>  [      1,     30] EXCISED REGION [     32,   3634]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5640445,5640445]
 second seq =>         1 nucs [31,31]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [5641097,5641097]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5640444,5640444] to [5640445,5640445]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5640443,5640444] to [5640446,5640447]
 second seq =>         2 nucs [29,30] to [32,33]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5640415 ATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGT 5640444
          ||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGT 30

EXCISED REGION

  5640446 GTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTT 5640505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       32 GTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTT 91

  5640506 CGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATA 5640565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       92 CGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATA 151

  5640566 AGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTA 5640625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      152 AGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTA 211

  5640626 AACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCA 5640685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      212 AACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCA 271

  5640686 GCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTG 5640745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      272 GCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTG 331

  5640746 AACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATT 5640805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      332 AACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATT 391

  5640806 TTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATA 5640865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      392 TTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATA 451

  5640866 CTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCC 5640925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      452 CTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCC 511

  5640926 ACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTC 5640985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      512 ACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTC 571

  5640986 TATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGAT 5641045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      572 TATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGAT 631

  5641046 AAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTT 5641105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
      632 AAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTC-TTTTTTTT 690

  5641106 TTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTC 5641165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      691 TTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTC 750

  5641166 ACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTG 5641225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      751 ACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTG 810

  5641226 GGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG 5641285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      811 GGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG 870

  5641286 TTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGC 5641345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      871 TTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGC 930

  5641346 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCT 5641405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      931 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCT 990

  5641406 TCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTT 5641465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      991 TCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTT 1050

  5641466 TCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTT 5641525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1051 TCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTT 1110

  5641526 TCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTA 5641585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1111 TCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTA 1170

  5641586 GGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCA 5641645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1171 GGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCA 1230

  5641646 AGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGA 5641705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1231 AGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGA 1290

  5641706 GACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGA 5641765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1291 GACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGA 1350

  5641766 TTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGT 5641825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 TTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGT 1410

  5641826 GTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGG 5641885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 GTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGG 1470

  5641886 TCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGG 5641945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 TCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGG 1530

  5641946 GGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGC 5642005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 GGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGC 1590

  5642006 ATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTT 5642065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 ATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTT 1650

  5642066 TTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGG 5642125
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1651 TTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGG 1710

  5642126 TTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTT 5642185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 TTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTT 1770

  5642186 GGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCT 5642245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 GGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCT 1830

  5642246 CTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCT 5642305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 CTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCT 1890

  5642306 GTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCT 5642365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 GTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCT 1950

  5642366 CATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAG 5642425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 CATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAG 2010

  5642426 GCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCT 5642485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 GCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCT 2070

  5642486 CATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAA 5642545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 CATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAA 2130

  5642546 AATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGT 5642605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 AATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGT 2190

  5642606 AACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTG 5642665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 AACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTG 2250

  5642666 GCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTC 5642725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 GCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTC 2310

  5642726 AGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTAC 5642785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 AGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTAC 2370

  5642786 TGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTAT 5642845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 TGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTAT 2430

  5642846 TTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTT 5642905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 TTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTT 2490

  5642906 GAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCA 5642965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 GAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCA 2550

  5642966 TTTTTATGAATAGAAGATATTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGC 5643025
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 TTTTTATGAATAGAAGATCTTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGC 2610

  5643026 ATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGA 5643085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 ATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGA 2670

  5643086 GCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATA 5643145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 GCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATA 2730

  5643146 AAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGG 5643205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 AAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGG 2790

  5643206 CTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGAC 5643265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 CTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGAC 2850

  5643266 TAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCAT 5643325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 TAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCAT 2910

  5643326 AGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATG 5643385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 AGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATG 2970

  5643386 ACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGC 5643445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 ACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGC 3030

  5643446 TGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTC 5643505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 TGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTC 3090

  5643506 TCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTA 5643565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 TCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTA 3150

  5643566 AAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAG 5643625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 AAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAG 3210

  5643626 ATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTA 5643685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 ATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTA 3270

  5643686 TGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTA 5643745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 TGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTA 3330

  5643746 AAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAA 5643805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 AAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAA 3390

  5643806 TTTACAATTTAAAAATATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGT 5643865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 TTTACAATTTAAAAATATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGT 3450

  5643866 TCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTT 5643925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 TCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTT 3510

  5643926 TAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTT 5643985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 TAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTT 3570

  5643986 ACCTTATTTCAACCATAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTA 5644045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 ACCTTATTTCAACCATAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTA 3630

  5644046 GATA 5644049
          ||||
     3631 GATA 3634

Alignment time is 4.87204 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3867] =>      3867 nucs 'mol-32-206b-028435_3867'

Score:        3823
Aligned:      3867        nucs
Identic:      3863 (100%) nucs =>       118 (100%)      3745 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5639705,5639822] EXCISED REGION [5639824,5643572]
 second seq =>  [      1,    118] EXCISED REGION [    120,   3867]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5639823,5639823]
 second seq =>         1 nucs [119,119]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [5641097,5641097]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [118,119] to [119,120]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5639822,5639822] to [5639824,5639824]
 second seq =>         1 nucs [118,118] to [120,120]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5639705 ATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTT 5639764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTT 60

  5639765 GGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGT 5639822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGT 118

EXCISED REGION

  5639824 TATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATA 5639883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 TATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATA 179

  5639884 TAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTT 5639943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 TAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTT 239

  5639944 TCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGAT 5640003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 TCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGAT 299

  5640004 CTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTG 5640063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 CTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTG 359

  5640064 TATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTT 5640123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 TATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTT 419

  5640124 GTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCT 5640183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 GTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCT 479

  5640184 CTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGAT 5640243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 CTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGAT 539

  5640244 TTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGAC 5640303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGAC 599

  5640304 AACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAA 5640363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 AACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAA 659

  5640364 AGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTG 5640423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 AGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTG 719

  5640424 CTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAG 5640483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAG 779

  5640484 TTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACA 5640543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACA 839

  5640544 CTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAAT 5640603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAAT 899

  5640604 AAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTT 5640663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTT 959

  5640664 TTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTA 5640723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTA 1019

  5640724 AATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGT 5640783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 AATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGT 1079

  5640784 GTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTG 5640843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTG 1139

  5640844 AAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTC 5640903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTC 1199

  5640904 AGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCT 5640963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCT 1259

  5640964 GCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTT 5641023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTT 1319

  5641024 AGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCA 5641083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCA 1379

  5641084 TAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAG 5641143
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TAAGGTAGTCTTC-TTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAG 1438

  5641144 TGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCA 5641203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCA 1498

  5641204 GCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTT 5641263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTT 1558

  5641264 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGAC 5641323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGAC 1618

  5641324 CTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCG 5641383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCG 1678

  5641384 CCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCT 5641443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCT 1738

  5641444 CATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAAT 5641503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAAT 1798

  5641504 GAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTT 5641563
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GAACTTTCTACTCCGGTCTCTTACTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTT 1858

  5641564 GCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTG 5641623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTG 1918

  5641624 GTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGC 5641683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGC 1978

  5641684 TTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTT 5641743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTT 2038

  5641744 CAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATA 5641803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATA 2098

  5641804 GAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTA 5641863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTA 2158

  5641864 TTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTG 5641923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTG 2218

  5641924 CCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGT 5641983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGT 2278

  5641984 AGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCT 5642043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 AGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCT 2338

  5642044 GGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGC 5642103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2339 GGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGC 2398

  5642104 CCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGG 5642163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGG 2458

  5642164 ATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACT 5642223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 ATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACT 2518

  5642224 TTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTC 5642283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTC 2578

  5642284 ATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTG 5642343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTG 2638

  5642344 AAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACC 5642403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 AAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACC 2698

  5642404 TATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTA 5642463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTA 2758

  5642464 TGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCT 5642523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCT 2818

  5642524 GGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTG 5642583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTG 2878

  5642584 GCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGG 5642643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGG 2938

  5642644 CAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGG 5642703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 CAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGG 2998

  5642704 CCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGT 5642763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 CCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGT 3058

  5642764 TAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTT 5642823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTT 3118

  5642824 CCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCT 5642883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 CCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCT 3178

  5642884 ATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTAC 5642943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 ATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTAC 3238

  5642944 CATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGAAGGAATACAATAA 5643003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3239 CATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATCTTATGAAGGAATACAATAA 3298

  5643004 AAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGG 5643063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 AAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGG 3358

  5643064 CCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAG 5643123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 CCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAG 3418

  5643124 ACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCT 5643183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 ACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCT 3478

  5643184 GTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGA 5643243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGA 3538

  5643244 TTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCT 5643303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCT 3598

  5643304 TCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAG 5643363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAG 3658

  5643364 TTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAG 5643423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAG 3718

  5643424 TTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAG 5643483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAG 3778

  5643484 GATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAA 5643543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 GATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAA 3838

  5643544 ACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGG 5643572
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3839 ACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGG 3867

Alignment time is 5.16949 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3083] =>      3083 nucs 'mol-32-206b-116446_3083'

Score:        3082
Aligned:      3082        nucs
Identic:      3082 (100%) nucs =>      2217 (100%)       865 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5639880,5642096] EXCISED REGION [5642098,5642962]
 second seq =>  [      1,   2217] EXCISED REGION [   2219,   3083]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5642097,5642097]
 second seq =>         1 nucs [2218,2218]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2218,2219] to [2219,2220]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5639880 TATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTT 5639939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTT 60

  5639940 ATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGT 5639999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGT 120

  5640000 GGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCA 5640059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCA 180

  5640060 TTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCT 5640119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCT 240

  5640120 GGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTT 5640179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTT 300

  5640180 TTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTT 5640239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTT 360

  5640240 TGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCA 5640299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCA 420

  5640300 CGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAAT 5640359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAAT 480

  5640360 TAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCC 5640419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCC 540

  5640420 TCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGA 5640479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGA 600

  5640480 AAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTA 5640539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTA 660

  5640540 CACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACA 5640599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACA 720

  5640600 GAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGT 5640659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGT 780

  5640660 GTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTC 5640719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTC 840

  5640720 ATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATC 5640779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATC 900

  5640780 CAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATG 5640839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATG 960

  5640840 CTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTT 5640899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTT 1020

  5640900 TGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGA 5640959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGA 1080

  5640960 GTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGT 5641019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGT 1140

  5641020 TTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGAT 5641079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGAT 1200

  5641080 GCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCT 5641139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCT 1260

  5641140 GGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTC 5641199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTC 1320

  5641200 TCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAAT 5641259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAAT 1380

  5641260 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCC 5641319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCC 1440

  5641320 TGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCAC 5641379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCAC 1500

  5641380 CGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACC 5641439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACC 1560

  5641440 TTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTT 5641499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTT 1620

  5641500 GAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTAT 5641559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTAT 1680

  5641560 ATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTT 5641619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTT 1740

  5641620 TGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTT 5641679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTT 1800

  5641680 CTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCAT 5641739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCAT 1860

  5641740 TTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGT 5641799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGT 1920

  5641800 GATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATA 5641859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATA 1980

  5641860 GCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTC 5641919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTC 2040

  5641920 CCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGC 5641979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGC 2100

  5641980 TTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCA 5642039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCA 2160

  5642040 GTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGA 5642096
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGA 2217

EXCISED REGION

  5642098 TTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGG 5642157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGG 2278

  5642158 TCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCT 5642217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCT 2338

  5642218 GTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGAT 5642277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGAT 2398

  5642278 GTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTA 5642337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTA 2458

  5642338 GACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCT 5642397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCT 2518

  5642398 ACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCA 5642457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCA 2578

  5642458 GGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATG 5642517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 GGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATG 2638

  5642518 CTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCT 5642577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 CTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCT 2698

  5642578 GTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTC 5642637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTC 2758

  5642638 CACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCT 5642697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 CACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCT 2818

  5642698 GCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATAT 5642757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATAT 2878

  5642758 TATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCA 5642817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCA 2938

  5642818 AAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATA 5642877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 AAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATA 2998

  5642878 CTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATAC 5642937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 CTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATAC 3058

  5642938 TTTTACCATAAATGGAAATCTAGTA 5642962
          |||||||||||||||||||||||||
     3059 TTTTACCATAAATGGAAATCTAGTA 3083

Alignment time is 4.11344 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   4612] =>      4612 nucs 'mol-32-2081-104491_4612'

Score:        4547
Aligned:      4613        nucs
Identic:      4607 (100%) nucs =>      2772 (100%)      1835 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5642077,5644853] EXCISED REGION [5644856,5646691]
 second seq =>  [      1,   2776] EXCISED REGION [   2777,   4612]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [5644854,5644855]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5644854,5644854] to [5644856,5644856]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5642077 TTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGAC 5642136
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGAC 60

  5642137 TCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACG 5642196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACG 120

  5642197 TAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCT 5642256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCT 180

  5642257 GAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCAC 5642316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCAC 240

  5642317 CACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCC 5642376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCC 300

  5642377 TGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATC 5642436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATC 360

  5642437 AGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAA 5642496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAA 420

  5642497 CCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCA 5642556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCA 480

  5642557 ATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATT 5642616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATT 540

  5642617 CTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTAC 5642676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTAC 600

  5642677 CACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATG 5642736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATG 660

  5642737 AATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGG 5642796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGG 720

  5642797 TATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCAT 5642856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCAT 780

  5642857 GACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTT 5642916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      781 GACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTCTTAAACTTGAAAGTCTCTT 840

  5642917 TCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAAT 5642976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAAT 900

  5642977 AGAAGATATTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCA 5643036
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGAAGATCTTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCA 960

  5643037 CACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTT 5643096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTT 1020

  5643097 CAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAA 5643156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAA 1080

  5643157 ATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGA 5643216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGA 1140

  5643217 GGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCT 5643276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCT 1200

  5643277 TTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCA 5643336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCA 1260

  5643337 ATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTA 5643396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTA 1320

  5643397 TTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCC 5643456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCC 1380

  5643457 ATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAA 5643516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAA 1440

  5643517 GTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAAT 5643576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAAT 1500

  5643577 TAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTT 5643636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTT 1560

  5643637 ACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTT 5643696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTT 1620

  5643697 ACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCAC 5643756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCAC 1680

  5643757 CTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTA 5643816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTA 1740

  5643817 AAAATATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTT 5643876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAATATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTT 1800

  5643877 ACTCATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAAT 5643936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTCATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAAT 1860

  5643937 TGCTTTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCA 5643996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGCTTTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCA 1920

  5643997 ACCATAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGT 5644056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACCATAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGT 1980

  5644057 AGAATTTGCTATGGTTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTG 5644116
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGAATTTGCTATGGTTTAAATTTT-AAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTG 2039

  5644117 TACATTGATTTTTAGTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGA 5644176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TACATTGATTTTTAGTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGA 2099

  5644177 ACATTTATATCAGCCTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTC 5644236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ACATTTATATCAGCCTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTC 2159

  5644237 CAGCCTTAGAAAACCTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTC 5644296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CAGCCTTAGAAAACCTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTC 2219

  5644297 ATATCATTGGAATCATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGT 5644356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 ATATCATTGGAATCATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGT 2279

  5644357 TTTTGAGGTGCATCCAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGAT 5644416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TTTTGAGGTGCATCCAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGAT 2339

  5644417 ACAAGTGCAGTTTTTTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGT 5644476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 ACAAGTGCAGTTTTTTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGT 2399

  5644477 AATCATCAGCTAAAGAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTT 5644536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AATCATCAGCTAAAGAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTT 2459

  5644537 CTCATCCTTCTGAGTCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCC 5644596
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CTCATCCTTCTGAGTCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCC 2519

  5644597 TTTTTGTTGCTGAATATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACC 5644656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TTTTTGTTGCTGAATATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACC 2579

  5644657 AGTTGACAGGTATTTGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAAT 5644716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 AGTTGACAGGTATTTGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAAT 2639

  5644717 ACTGCTGTAAACATTTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGA 5644776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 ACTGCTGTAAACATTTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGA 2699

  5644777 TACCTAGGAGTGCAACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAA 5644836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TACCTAGGAGTGCAACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAA 2759

  5644837 CTTTGTTCCAAAGTGAC 5644853
          |||||||||||||||||
     2760 CTTTGTTCCAAAGTGAC 2776

EXCISED REGION

  5644856 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 5644915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 2836

  5644916 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 5644975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 2896

  5644976 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 5645035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 2956

  5645036 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 5645095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 3016

  5645096 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 5645155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 3076

  5645156 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 5645215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 3136

  5645216 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 5645275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 3196

  5645276 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 5645335
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 3256

  5645336 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 5645395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 3316

  5645396 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 5645455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 3376

  5645456 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 5645515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 3436

  5645516 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 5645575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 3496

  5645576 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 5645635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 3556

  5645636 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 5645695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3557 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 3616

  5645696 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 5645755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3617 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 3676

  5645756 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 5645815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3677 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 3736

  5645816 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 5645875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 3796

  5645876 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 5645935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 3856

  5645936 GGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAGA 5645995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 GGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAGA 3916

  5645996 AATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACAG 5646055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 AATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACAG 3976

  5646056 TGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGATTGCCA 5646115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 TGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGATTGCCA 4036

  5646116 TTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGTTATTA 5646175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 TTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGTTATTA 4096

  5646176 ATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTGTCCGT 5646235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 ATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTGTCCGT 4156

  5646236 TGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCTTCATG 5646295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 TGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCTTCATG 4216

  5646296 TATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCATGTAA 5646355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 TATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCATGTAA 4276

  5646356 TGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATAAAATT 5646415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 TGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATAAAATT 4336

  5646416 CTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTGTAATG 5646475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 CTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTGTAATG 4396

  5646476 CATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGGCACAA 5646535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 CATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGGCACAA 4456

  5646536 TTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAATAGGG 5646595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 TTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAATAGGG 4516

  5646596 TATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAGTACCCA 5646655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 TATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAGTACCCA 4576

  5646656 CTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGA 5646691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 CTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGA 4612

Alignment time is 6.2282 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3758] =>      3758 nucs 'mol-32-22d3-033503_3758'

Score:        3725
Aligned:      3758        nucs
Identic:      3755 (100%) nucs =>      1285 (100%)      2470 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5640812,5642096] EXCISED REGION [5642098,5644570]
 second seq =>  [      1,   1285] EXCISED REGION [   1287,   3758]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5642097,5642097]
 second seq =>         1 nucs [1286,1286]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [5644077,5644077]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1286,1287] to [1287,1288]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5640812 CTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTC 5640871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTC 60

  5640872 TAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTC 5640931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTC 120

  5640932 TCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGT 5640991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGT 180

  5640992 ATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAA 5641051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAA 240

  5641052 ACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTG 5641111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTG 300

  5641112 GACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCA 5641171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCA 360

  5641172 AGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTA 5641231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTA 420

  5641232 CAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCAC 5641291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCAC 480

  5641292 TGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCA 5641351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCA 540

  5641352 AAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTA 5641411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTA 600

  5641412 GGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTA 5641471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTA 660

  5641472 GGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTA 5641531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTA 720

  5641532 CTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATG 5641591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATG 780

  5641592 CTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGC 5641651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGC 840

  5641652 CTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCT 5641711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCT 900

  5641712 GATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTA 5641771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTA 960

  5641772 AAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATC 5641831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATC 1020

  5641832 TTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACAT 5641891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACAT 1080

  5641892 ATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCAT 5641951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCAT 1140

  5641952 GTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAA 5642011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAA 1200

  5642012 GAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAG 5642071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAG 1260

  5642072 AAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGA 5642096
          |||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGA 1285

EXCISED REGION

  5642098 TTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGG 5642157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 TTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGG 1346

  5642158 TCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCT 5642217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 TCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCT 1406

  5642218 GTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGAT 5642277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 GTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGAT 1466

  5642278 GTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTA 5642337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 GTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTA 1526

  5642338 GACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCT 5642397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 GACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCT 1586

  5642398 ACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCA 5642457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 ACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCA 1646

  5642458 GGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATG 5642517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 GGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATG 1706

  5642518 CTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCT 5642577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 CTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCT 1766

  5642578 GTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTC 5642637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 GTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTC 1826

  5642638 CACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCT 5642697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 CACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCT 1886

  5642698 GCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATAT 5642757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 GCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATAT 1946

  5642758 TATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCA 5642817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 TATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCA 2006

  5642818 AAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATA 5642877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 AAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATA 2066

  5642878 CTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATAC 5642937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 CTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATAC 2126

  5642938 TTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGAAGGAATA 5642997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2127 TTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATCTTATGAAGGAATA 2186

  5642998 CAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTT 5643057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 CAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTT 2246

  5643058 TGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTAT 5643117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 TGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTAT 2306

  5643118 AGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGC 5643177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 AGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGC 2366

  5643178 ATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATG 5643237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 ATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATG 2426

  5643238 TCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCT 5643297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 TCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCT 2486

  5643298 TTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAAC 5643357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 TTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAAC 2546

  5643358 CAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACA 5643417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 CAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACA 2606

  5643418 GAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCC 5643477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 GAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCC 2666

  5643478 AGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCC 5643537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 AGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCC 2726

  5643538 TGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTG 5643597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 TGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTG 2786

  5643598 CTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAA 5643657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 CTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAA 2846

  5643658 GAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCAT 5643717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 GAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCAT 2906

  5643718 CTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAA 5643777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 CTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAA 2966

  5643778 TTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAATTTACAC 5643837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 TTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAATTTACAC 3026

  5643838 CTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGCATCAATT 5643897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 CTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGCATCAATT 3086

  5643898 GGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAGTTGCTGT 5643957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 GGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAGTTGCTGT 3146

  5643958 CACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATACAAAAATT 5644017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 CACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATACAAAAATT 3206

  5644018 TACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGGTTTAAAT 5644077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     3207 TACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGGTTTAAA- 3265

  5644078 TTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTAGTAAATT 5644137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 TTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTAGTAAATT 3325

  5644138 TATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGCCTTAAAA 5644197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 TATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGCCTTAAAA 3385

  5644198 AGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAACCTTGGCC 5644257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 AGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAACCTTGGCC 3445

  5644258 TACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATCATATGGT 5644317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 TACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATCATATGGT 3505

  5644318 ATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATCCAGGTCA 5644377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 ATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATCCAGGTCA 3565

  5644378 TAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTTTTTACAG 5644437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 TAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTTTTTACAG 3625

  5644438 GGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAAGAATGTG 5644497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 GGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAAGAATGTG 3685

  5644498 CATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAGTCTGGTA 5644557
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3686 CATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAGTCTGATA 3745

  5644558 TCTGTTATTCCAC 5644570
          |||||||||||||
     3746 TCTGTTATTCCAC 3758

Alignment time is 5.07492 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   5643] =>      5643 nucs 'mol-32-2378-017924_5643'

Score:        5557
Aligned:      5656        nucs
Identic:      5638 (100%) nucs =>       104 (100%)      5534 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5641529,5641632] EXCISED REGION [5642811,5648361]
 second seq =>  [      1,    104] EXCISED REGION [    105,   5643]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1178 nucs [5641633,5642810]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5641633,5641633] to [5642811,5642811]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5641529 CTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGC 5641588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGC 60

  5641589 ATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCT 5641632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCT 104

EXCISED REGION

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      105 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 164

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      165 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 224

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      225 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 284

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      285 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 344

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      345 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 404

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      405 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 464

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      465 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 524

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      525 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 584

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      585 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 644

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      645 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 704

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      705 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 764

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      765 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 824

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      825 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 884

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 944

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      945 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 1004

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1005 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 1064

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 1124

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5643890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1125 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 1184

  5643891 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5643950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 1244

  5643951 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5644010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 1304

  5644011 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5644070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 1364

  5644071 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5644130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 1424

  5644131 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5644190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 1484

  5644191 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5644250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 1544

  5644251 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5644310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 1604

  5644311 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5644370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 1664

  5644371 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5644430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 1724

  5644431 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 1784

  5644491 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5644550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 1844

  5644551 TCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 5644610
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 TCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 1904

  5644611 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 5644670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 1964

  5644671 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 5644730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 2024

  5644731 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 5644790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 2084

  5644791 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 5644850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 2144

  5644851 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 5644910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 2204

  5644911 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 5644970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 2264

  5644971 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 5645030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 2324

  5645031 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 5645090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 2384

  5645091 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 5645150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 2444

  5645151 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 5645210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 2504

  5645211 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 5645270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 2564

  5645271 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 5645330
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 2624

  5645331 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 5645390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 2684

  5645391 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 5645450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 2744

  5645451 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 5645510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 2804

  5645511 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 5645570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 2864

  5645571 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 5645630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 2924

  5645631 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 5645690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 2984

  5645691 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 5645750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 3044

  5645751 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 5645810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 3104

  5645811 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 5645870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 3164

  5645871 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 5645930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 3224

  5645931 CATTTGGTTATTCTATAGG-TTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATG 5645989
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 CATTTGGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATG 3284

  5645990 TTAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCA 5646049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 TTAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCA 3344

  5646050 ATACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGA 5646109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 ATACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGA 3404

  5646110 TTGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGG 5646169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 TTGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGG 3464

  5646170 TTATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGT 5646229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 TTATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGT 3524

  5646230 GTCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGC 5646289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 GTCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGC 3584

  5646290 TTCATGTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCC 5646349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 TTCATGTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCC 3644

  5646350 ATGTAATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTAT 5646409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 ATGTAATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTAT 3704

  5646410 AAAATTCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGT 5646469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 AAAATTCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGT 3764

  5646470 GTAATGCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATG 5646529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 GTAATGCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATG 3824

  5646530 GCACAATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCA 5646589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 GCACAATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCA 3884

  5646590 ATAGGGTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAG 5646649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 ATAGGGTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAG 3944

  5646650 TACCCACTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTA 5646709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 TACCCACTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTA 4004

  5646710 TCCCCTCTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGGGTTACATTTTT 5646769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 TCCCCTCTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGGGTTACATTTTT 4064

  5646770 ACTCTCTTTGTAGTAGCCATTGATGCACAGCATTTTCAATTTTGATGAAGTCTGTCTTAC 5646829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 ACTCTCTTTGTAGTAGCCATTGATGCACAGCATTTTCAATTTTGATGAAGTCTGTCTTAC 4124

  5646830 CTATTTTTTTTTGTTGCCTGTGCTTTCAGTATCATATCCAAGAAATTGTTTTCAAATCCA 5646889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 CTATTTTTTTTTGTTGCCTGTGCTTTCAGTATCATATCCAAGAAATTGTTTTCAAATCCA 4184

  5646890 AAGTCATGAAGTTTTTGGCTTGTGTTTTCTTCTAAGAGTTTTATAGGGTGAGGTCTTCTG 5646949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 AAGTCATGAAGTTTTTGGCTTGTGTTTTCTTCTAAGAGTTTTATAGGGTGAGGTCTTCTG 4244

  5646950 TTTAGAGTTTTGATCACTTTGAGACAATTTTTGTATATAGTATAAGATAAGGGTCCAGCT 5647009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 TTTAGAGTTTTGATCACTTTGAGACAATTTTTGTATATAGTATAAGATAAGGGTCCAGCT 4304

  5647010 TTATTTTTTTACATGTGGATATCCAGTTTTCCCAGCACTGTTTGTTGAAAAGACTTTCTT 5647069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 TTATTTTTTTACATGTGGATATCCAGTTTTCCCAGCACTGTTTGTTGAAAAGACTTTCTT 4364

  5647070 TCCTTTTCCCCTTTGAATGGTCTAGGTAGCCTTGTGGAAAATAATTTGACTATTTATGCA 5647129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 TCCTTTTCCCCTTTGAATGGTCTAGGTAGCCTTGTGGAAAATAATTTGACTATTTATGCA 4424

  5647130 AGAGTGTATTTCTGGACTCTGTGTTTTATTCTGTTGGTCTATATGTGTATCCTTGTGCCA 5647189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 AGAGTGTATTTCTGGACTCTGTGTTTTATTCTGTTGGTCTATATGTGTATCCTTGTGCCA 4484

  5647190 GTACGACAGTATTTTGATTGCTGTAGTCTTCTAGTAAGTTTTGATGTCAGGAAATGTGAG 5647249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 GTACGACAGTATTTTGATTGCTGTAGTCTTCTAGTAAGTTTTGATGTCAGGAAATGTGAG 4544

  5647250 ACGTCCAACTTTGTTATTTTCAAGTTTGTTTTGTCTATTCGAGGTCTCTTGGGAATCCAT 5647309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4545 ACGTCCAACTTTGTTATTTTCAAGTTTGTTTTGTCTATTCGAGGTCTCTTGGGAATCCAT 4604

  5647310 ATGAATTTTAGGATGGATTTTTCTGTTTCTGCTAAAAATGCTGTTAGGATTTTGAAAGGA 5647369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4605 ATGAATTTTAGGATGGATTTTTCTGTTTCTGCTAAAAATGCTGTTAGGATTTTGAAAGGA 4664

  5647370 CTTACATTGACTATGTAGATTGCTTTGGGTAGTATTGACATCTTAACAATATTAAATTTT 5647429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4665 CTTACATTGACTATGTAGATTGCTTTGGGTAGTATTGACATCTTAACAGTATTAAATTTT 4724

  5647430 CTAATCCATGAACAGAGGATATCTTTTCATTTATTTGTGTCTAATTTCTTTCAGTGATAT 5647489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4725 CTAATCCATGAACAGAGGATATCTTTTCATTTATTTGTGTCTAATTTCTTTCAGTGATAT 4784

  5647490 TTTGCAGTTTTCACTGTAGAAGTCTTTTGCCTGCTTGGTTAGGTTTAGTCCTAAGTACTT 5647549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4785 TTTGCAGTTTTCACTGTAGAAGTCTTTTGCCTGCTTGGTTAGGTTTAGTCCTAAGTACTT 4844

  5647550 TATTCTTTTTGATGTTACGGTTTGCTGATTTTTCTGTGTTGATTTTGTATTCTGCAGTTT 5647609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4845 TATTCTTTTTGATGTTACGGTTTGCTGATTTTTCTGTGTTGATTTTGTATTCTGCAGTTT 4904

  5647610 TCCTGAATTCATTCATTCTAACAGGTTTGTTGTTGTTGTGGAATCTTTAGAGTCTTTACA 5647669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4905 TCCTGAATTCATTCATTCTAACAGGTTTGTTGTTGTTGTGGAATCTTTAGAGTCTTTACA 4964

  5647670 TATAAGATCATGTCATCTTCAAACATATAATTTTACTTATTCATTTCCAAGTTAGATTTA 5647729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4965 TATAAGATCATGTCATCTTCAAACATATAATTTTACTTATTCATTTCCAAGTTAGATTTA 5024

  5647730 TTTTATTTCATTTCCTTGCTGATTGCTCTGGCTAGGGCTTTAGGTATTACGTTGAATGGA 5647789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5025 TTTTATTTCATTTCCTTGCTGATTGCTCTGGCTAGGGCTTTAGGTATTACGTTGAATGGA 5084

  5647790 AGTGGTAAGAATGGGCATCTTTGTCTTAATTCTGACCTTTGAGGAAAAGCTTTCCATCTT 5647849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5085 AGTGGTAAGAATGGGCATCTTTGTCTTAATTCTGACCTTTGAGGAAAAGCTTTCCATCTT 5144

  5647850 TTCACCATTGAGTTTGATGCTGGTTACAAGTTGTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTGTT 5647909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5145 TTCACCATTGAGTTTGATGCTGGTTACAAGTTGTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTGTT 5204

  5647910 TGTTTTTTGTTTGTGTGTGTGGGGGTGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGT 5647969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5205 TGTTTTTTGTTTGTGTGTGTGGGGGTGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGT 5264

  5647970 GGTGATGGTGGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTAGTGGTTTTTTCTTGCTCTGTTGCCCAGGC 5648029
           ||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5265 -GTGATGGTGGTG------------GTGGTAGTGGTTTTTTCTTGCTCTGTTGCCCAGGC 5311

  5648030 CGGAGTGCAATGGTGTGATCTCGGCTTACTGCAACCGCCACCTCCCGAGTTCAAGCAATT 5648089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 CGGAGTGCAATGGTGTGATCTCGGCTTACTGCAACCGCCACCTCCCGAGTTCAAGCAATT 5371

  5648090 CTTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGCCACCATACCCGACTAA 5648149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5372 CTTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGCCACCATACCCGACTAA 5431

  5648150 TTTCTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGTTCAGACTGGTCTCGAGCTC 5648209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5432 TTTCTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGTTCAGACTGGTCTCGAGCTC 5491

  5648210 CTGACCTCAGGTGATCCACCTGTCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGAGATTACAGCTGTGAGC 5648269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5492 CTGACCTCAGGTGATCCACCTGTCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGAGATTACAGCTGTGAGC 5551

  5648270 CATCATGCCTAGCCAGGTATAGGTTTTTTATATATGGCCTTTTTATTATCTTGAGATAGT 5648329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5552 CATCATGCCTAGCCAGGTATAGGTTTTTTATATATGGCCTTTTTATTATCTTGAGATAGT 5611

  5648330 TTGCTTCTATTCATAGTTTTTTGAGTATTTTT 5648361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     5612 TTGCTTCTATTCATAGTTTTTTGAGTATTTTT 5643

Alignment time is 7.14921 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3483] =>      3483 nucs 'mol-32-285e-022761_3483'

Score:        3440
Aligned:      3484        nucs
Identic:      3480 (100%) nucs =>       329 (100%)      3151 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5640768,5641096] EXCISED REGION [5641098,5644252]
 second seq =>  [      1,    329] EXCISED REGION [    330,   3483]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5641097,5641097]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [5642097,5642097]
 second seq =>         1 nucs [1329,1329]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [5641097,5641109] to [5641098,5641110]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5640768 TGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGT 5640827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGT 60

  5640828 TTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTT 5640887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTT 120

  5640888 GTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGAT 5640947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGAT 180

  5640948 TTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTT 5641007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTT 240

  5641008 TTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGT 5641067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGT 300

  5641068 TTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTC 5641096
          |||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTC 329

EXCISED REGION

  5641098 TTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCAT 5641157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      330 TTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCAT 389

  5641158 CTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTG 5641217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      390 CTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTG 449

  5641218 AGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAG 5641277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      450 AGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAG 509

  5641278 AGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCC 5641337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      510 AGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCC 569

  5641338 GCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGA 5641397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      570 GCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGA 629

  5641398 GGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCA 5641457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      630 GGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCA 689

  5641458 GATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCC 5641517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 GATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCC 749

  5641518 GGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCT 5641577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 GGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCT 809

  5641578 ATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTA 5641637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 ATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTA 869

  5641638 TATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGC 5641697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 TATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGC 929

  5641698 TTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTG 5641757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 TTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTG 989

  5641758 CTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCC 5641817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 CTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCC 1049

  5641818 TTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGC 5641877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 TTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGC 1109

  5641878 CTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCA 5641937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 CTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCA 1169

  5641938 TTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGT 5641997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 TTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGT 1229

  5641998 GTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTAT 5642057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 GTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTAT 1289

  5642058 CTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAA 5642117
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1290 CTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAA 1349

  5642118 TGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAG 5642177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 TGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAG 1409

  5642178 AATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAA 5642237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 AATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAA 1469

  5642238 TGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAA 5642297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 TGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAA 1529

  5642298 GCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCA 5642357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 GCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCA 1589

  5642358 CTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAG 5642417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 CTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAG 1649

  5642418 GCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCA 5642477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 GCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCA 1709

  5642478 GAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATT 5642537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 GAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATT 1769

  5642538 AGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACT 5642597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 AGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACT 1829

  5642598 CAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTG 5642657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 CAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTG 1889

  5642658 CCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAG 5642717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 CCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAG 1949

  5642718 TCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTG 5642777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 TCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTG 2009

  5642778 GAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTT 5642837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 GAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTT 2069

  5642838 CTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTT 5642897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 CTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTT 2129

  5642898 TTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATC 5642957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 TTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATC 2189

  5642958 TAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAA 5643017
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 TAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATCTTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAA 2249

  5643018 GTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGA 5643077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 GTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGA 2309

  5643078 TCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTAT 5643137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 TCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTAT 2369

  5643138 AAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAA 5643197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 AAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAA 2429

  5643198 TCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATG 5643257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 TCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATG 2489

  5643258 AAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTT 5643317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 AAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTT 2549

  5643318 TTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTA 5643377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 TTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTA 2609

  5643378 TATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAG 5643437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 TATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAG 2669

  5643438 GTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAA 5643497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 GTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAA 2729

  5643498 ACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTC 5643557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 ACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTC 2789

  5643558 CTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACC 5643617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 CTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACC 2849

  5643618 TCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTT 5643677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 TCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTT 2909

  5643678 TTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGAC 5643737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 TTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGAC 2969

  5643738 CTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAAT 5643797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 CTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAAT 3029

  5643798 AAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGT 5643857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3030 AAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAATTTACCCCTGCCACAAAATGAGACAGT 3089

  5643858 TTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTT 5643917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 TTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTT 3149

  5643918 CTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCA 5643977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 CTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCA 3209

  5643978 AGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATA 5644037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 AGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATA 3269

  5644038 TTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGGTTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGC 5644097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     3270 TTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGGTTTAAA-TTTTAAGAGCTTTGAGGTGC 3328

  5644098 ATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTAGTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATA 5644157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 ATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTAGTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATA 3388

  5644158 ATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGCCTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCA 5644217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3389 ATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGCCTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCA 3448

  5644218 TCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAACCT 5644252
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3449 TCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAACCT 3483

Alignment time is 4.71046 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   7786] =>      7786 nucs 'mol-32-2b4a-083586_7786'

Score:        7653
Aligned:      7791        nucs
Identic:      7776 (100%) nucs =>      5877 (100%)      1899 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5635742,5641632] EXCISED REGION [5642811,5644710]
 second seq =>  [      1,   5886] EXCISED REGION [   5887,   7786]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1178 nucs [5641633,5642810]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5641633,5641633] to [5642811,5642811]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5635742 GTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACA 5635801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACA 60

  5635802 CGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATG 5635861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATG 120

  5635862 ATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTT 5635921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTT 180

  5635922 TATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGGACTAACACACA 5635981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGGACTAACACACA 240

  5635982 GGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGG 5636041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGG 300

  5636042 CTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTGTTTATGTGAAAATATCATTGA 5636101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      301 CTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTATTTATGTGAAAATATCATTGA 360

  5636102 AATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAAC 5636161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAAC 420

  5636162 AATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTC 5636221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTC 480

  5636222 AGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTA 5636281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTA 540

  5636282 GTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGAC 5636341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGAC 600

  5636342 AAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGC 5636401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGC 660

  5636402 CTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACA 5636461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACA 720

  5636462 GGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCAT 5636521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCAT 780

  5636522 GTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAA 5636581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAA 840

  5636582 GTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTA 5636641
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTA 900

  5636642 GATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATATTGATTTTATATCTTG 5636701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATATTGATTTTATATCTTG 960

  5636702 CAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAA 5636761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAA 1020

  5636762 ATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTAT 5636821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTAT 1080

  5636822 ATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACA 5636881
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCCCCAGCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACA 1140

  5636882 GAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACA 5636941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACA 1200

  5636942 TTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTA 5637001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACATGTGGCACAGCAATTTTTTTTTA 1260

  5637002 AGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATTTATGATTTTTTTGTT 5637061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATTTATGATTTTTTTGTT 1320

  5637062 TGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCA 5637121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCA 1380

  5637122 CAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCT 5637181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCT 1440

  5637182 CCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGT 5637241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGT 1500

  5637242 AATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCT 5637301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCT 1560

  5637302 CAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATA 5637361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATA 1620

  5637362 CCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAAT 5637421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAAT 1680

  5637422 AGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCAT 5637481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCAT 1740

  5637482 AGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAA 5637541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAA 1800

  5637542 ATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCT 5637601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCT 1860

  5637602 ATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTA 5637661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTA 1920

  5637662 GTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCT 5637721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCT 1980

  5637722 CTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAA 5637781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAA 2040

  5637782 TGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTT 5637841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2041 TGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTACAAGTACCATGTT 2100

  5637842 TTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGA 5637901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGA 2160

  5637902 AGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACT 5637961
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACT 2220

  5637962 CAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCC 5638021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCC 2280

  5638022 TTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTT 5638081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTT 2340

  5638082 TTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTA 5638141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTA 2400

  5638142 TCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTT 5638201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTT 2460

  5638202 GTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGA 5638261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGA 2520

  5638262 GGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTC 5638321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTC 2580

  5638322 TTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCC 5638381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCC 2640

  5638382 CTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGT 5638441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGT 2700

  5638442 TGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATT 5638501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATT 2760

  5638502 ACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATC 5638561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATC 2820

  5638562 TTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGC 5638621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGC 2880

  5638622 ATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAAT 5638681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAAT 2940

  5638682 ATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATT 5638741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATT 3000

  5638742 TTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTC 5638801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTC 3060

  5638802 ATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGT 5638861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGT 3120

  5638862 TTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTC 5638921
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTC 3180

  5638922 TTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAAT 5638981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAAT 3240

  5638982 CTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTA 5639041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTA 3300

  5639042 AATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATT 5639101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATT 3360

  5639102 TCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGC 5639161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGC 3420

  5639162 TCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATG 5639221
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATAAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATG 3480

  5639222 GTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACT 5639281
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTGTAGTACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACT 3540

  5639282 TTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAA 5639341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAA 3600

  5639342 TTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATAT 5639401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATAT 3660

  5639402 GATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTG 5639461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTG 3720

  5639462 ATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTT 5639521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTT 3780

  5639522 AAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCT 5639581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCT 3840

  5639582 ATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTT 5639641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTT 3900

  5639642 GAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTAT 5639701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTAT 3960

  5639702 CATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGT 5639761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGT 4020

  5639762 GTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAG 5639821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAG 4080

  5639822 TATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTA 5639881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTA 4140

  5639882 TATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTAT 5639941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTAT 4200

  5639942 TTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGG 5640001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGG 4260

  5640002 ATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATT 5640061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATT 4320

  5640062 TGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGG 5640121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGG 4380

  5640122 TTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTT 5640181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTT 4440

  5640182 CTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTG 5640241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTG 4500

  5640242 ATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACG 5640301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACG 4560

  5640302 ACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTA 5640361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTA 4620

  5640362 AAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTC 5640421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTC 4680

  5640422 TGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAA 5640481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAA 4740

  5640482 AGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACA 5640541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACA 4800

  5640542 CACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGA 5640601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGA 4860

  5640602 ATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGT 5640661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 ATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGT 4920

  5640662 TTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCAT 5640721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCAT 4980

  5640722 TAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCA 5640781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCA 5040

  5640782 GTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCT 5640841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCT 5100

  5640842 TGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTG 5640901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||
     5101 TGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTT----TTTTTG 5156

  5640902 TCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGT 5640961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 TCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGT 5216

  5640962 CTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTT 5641021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 CTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTT 5276

  5641022 TTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGC 5641081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 TTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGC 5336

  5641082 CATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGG 5641141
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 CATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTT-GGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGG 5395

  5641142 AGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTC 5641201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 AGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTC 5455

  5641202 CAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTT 5641261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 CAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTT 5515

  5641262 TTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTG 5641321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5516 TTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTG 5575

  5641322 ACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCG 5641381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5576 ACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCG 5635

  5641382 CGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTT 5641441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5636 CGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTT 5695

  5641442 CTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGA 5641501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5696 CTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGA 5755

  5641502 ATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATAT 5641561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5756 ATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATAT 5815

  5641562 TTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTG 5641621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5816 TTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTG 5875

  5641622 TGGTCTCCTCT 5641632
          |||||||||||
     5876 TGGTCTCCTCT 5886

EXCISED REGION

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5946

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 6006

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 6066

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 6126

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 6186

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 6246

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 6306

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 6366

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 6426

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 6486

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 6546

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 6606

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 6666

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 6726

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 6786

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 6846

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 6906

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5643890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6907 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 6966

  5643891 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5643950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6967 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 7026

  5643951 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5644010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 7086

  5644011 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5644070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 7146

  5644071 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5644130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 7206

  5644131 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5644190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 7266

  5644191 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5644250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7267 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 7326

  5644251 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5644310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7327 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 7386

  5644311 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5644370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 7446

  5644371 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5644430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7447 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 7506

  5644431 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7507 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 7566

  5644491 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5644550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 7626

  5644551 TCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 5644610
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7627 TCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 7686

  5644611 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 5644670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7687 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 7746

  5644671 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTG 5644710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7747 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTG 7786

Alignment time is 9.80221 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   9081] =>      9081 nucs 'mol-32-2dff-071185_9081'

Score:        8993
Aligned:      9081        nucs
Identic:      9073 (100%) nucs =>       394 (100%)      8679 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5634181,5634574] EXCISED REGION [5634576,5643262]
 second seq =>  [      1,    394] EXCISED REGION [    396,   9081]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5634575,5634575]
 second seq =>         1 nucs [395,395]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [5641097,5641097]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [394,394] to [395,395]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5634181 TGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATACTGATTTCAATTCCTTTGG 5634240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATACTGATTTCAATTCCTTTGG 60

  5634241 ATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTTTTAGTTTGAGGAA 5634300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTTTTAGTTTGAGGAA 120

  5634301 CTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAGTGTACAGGGAGGG 5634360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAGTGTACAGGGAGGG 180

  5634361 GATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTCTTGATAATAGATA 5634420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTCTTGATAATAGATA 240

  5634421 TCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTGATGATTAGTGTAT 5634480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTGATGATTAGTGTAT 300

  5634481 TGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCAGATCTCTTGTCCA 5634540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCAGATCTCTTGTCCA 360

  5634541 TTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCT 5634574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCT 394

EXCISED REGION

  5634576 GGTACTGAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATG 5634635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      396 GGTACTGAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATG 455

  5634636 GTTTGCAGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTT 5634695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      456 GTTTGCAGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTT 515

  5634696 TACTGTACAATAACTTAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTG 5634755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      516 TACTGTACAATAACTTAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTG 575

  5634756 TGCTTTCCATGTCATCCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTG 5634815
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 TGCCTTCCATGTCATCCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTG 635

  5634816 TTTTCTTCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTT 5634875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      636 TTTTCTTCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTT 695

  5634876 ATTTTAATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTT 5634935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 ATTTTAATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTT 755

  5634936 GATACAGGACTATAGTCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATC 5634995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 GATACAGGACTATAGTCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATC 815

  5634996 ACCATTATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCA 5635055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 ACCATTATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCA 875

  5635056 TGGCTTACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAG 5635115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 TGGCTTACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAG 935

  5635116 TAGCTGGGAGTACAGATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCT 5635175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 TAGCTGGGAGTACAGATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCT 995

  5635176 TGCTGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCC 5635235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 TGCTGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCC 1055

  5635236 TCCTAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCT 5635295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 TCCTAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCT 1115

  5635296 ATTTTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTG 5635355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 ATTTTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTG 1175

  5635356 ATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAAC 5635415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 ATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAAC 1235

  5635416 ACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTG 5635475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 ACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTG 1295

  5635476 AAAGATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGT 5635535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 AAAGATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGT 1355

  5635536 CTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATA 5635595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 CTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATA 1415

  5635596 CTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATC 5635655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 CTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATC 1475

  5635656 GTAATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATA 5635715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 GTAATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATA 1535

  5635716 GCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTT 5635775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 GCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTT 1595

  5635776 ATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAAC 5635835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 ATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAAC 1655

  5635836 AAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTAT 5635895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 AAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTAT 1715

  5635896 GGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATA 5635955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 GGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATA 1775

  5635956 GCAGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTC 5636015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 GCAGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTC 1835

  5636016 TCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTT 5636075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 TCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTT 1895

  5636076 TTCTGTTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATT 5636135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 TTCTGTTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATT 1955

  5636136 GGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATA 5636195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 GGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATA 2015

  5636196 TCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTG 5636255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 TCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTG 2075

  5636256 GCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTC 5636315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 GCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTC 2135

  5636316 TTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCA 5636375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 TTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCA 2195

  5636376 ATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCC 5636435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 ATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCC 2255

  5636436 CAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTAT 5636495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 CAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTAT 2315

  5636496 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGT 5636555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGT 2375

  5636556 TGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCA 5636615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 TGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCA 2435

  5636616 GCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTA 5636675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 GCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTA 2495

  5636676 TTCTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATT 5636735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 TTCTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATT 2555

  5636736 TTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTG 5636795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 TTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTG 2615

  5636796 CTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCA 5636855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 CTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCA 2675

  5636856 GCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCT 5636915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 GCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCT 2735

  5636916 TGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCAT 5636975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 TGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCAT 2795

  5636976 ACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGT 5637035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 ACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGT 2855

  5637036 AGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCA 5637095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 AGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCA 2915

  5637096 GTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGG 5637155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 GTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGG 2975

  5637156 CTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTG 5637215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 CTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTG 3035

  5637216 CACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGC 5637275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 CACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGC 3095

  5637276 CCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGC 5637335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 CCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGC 3155

  5637336 TGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAA 5637395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 TGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAA 3215

  5637396 TTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCAT 5637455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 TTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCAT 3275

  5637456 GTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGA 5637515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 GTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGA 3335

  5637516 CTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACC 5637575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 CTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACC 3395

  5637576 CATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAAT 5637635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 CATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAAT 3455

  5637636 CATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATA 5637695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 CATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATA 3515

  5637696 AGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACC 5637755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 AGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACC 3575

  5637756 TCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGT 5637815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 TCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGT 3635

  5637816 ACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCC 5637875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 ACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCC 3695

  5637876 AGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGA 5637935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3696 AGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGA 3755

  5637936 GGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATG 5637995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 GGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATG 3815

  5637996 GCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAG 5638055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 GCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAG 3875

  5638056 GGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTG 5638115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 GGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTG 3935

  5638116 GTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCC 5638175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 GTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCC 3995

  5638176 TTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTG 5638235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 TTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTG 4055

  5638236 AATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGA 5638295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 AATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGA 4115

  5638296 CCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCC 5638355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 CCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCC 4175

  5638356 TCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGT 5638415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 TCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGT 4235

  5638416 ATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGC 5638475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 ATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGC 4295

  5638476 TTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAG 5638535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4296 TTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAG 4355

  5638536 GTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATT 5638595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 GTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATT 4415

  5638596 TCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTT 5638655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4416 TCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTT 4475

  5638656 TGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTG 5638715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 TGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTG 4535

  5638716 GTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTT 5638775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 GTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTT 4595

  5638776 CTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTAT 5638835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 CTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTAT 4655

  5638836 TATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATC 5638895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4656 TATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATC 4715

  5638896 ATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTC 5638955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 ATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTC 4775

  5638956 TCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCA 5639015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 TCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCA 4835

  5639016 TGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCC 5639075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4836 TGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCC 4895

  5639076 CAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTG 5639135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4896 CAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTG 4955

  5639136 AGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTA 5639195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4956 AGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTA 5015

  5639196 TACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAA 5639255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5016 TACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAA 5075

  5639256 TACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTC 5639315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5076 TACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTC 5135

  5639316 AATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACAT 5639375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5136 AATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACAT 5195

  5639376 ATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTT 5639435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5196 ATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTT 5255

  5639436 AACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATT 5639495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5256 AACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATT 5315

  5639496 TGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGT 5639555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5316 TGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCTATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGT 5375

  5639556 TCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTG 5639615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5376 TCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTG 5435

  5639616 CAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAA 5639675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5436 CAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAA 5495

  5639676 AGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAAT 5639735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5496 AGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAAT 5555

  5639736 AATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTC 5639795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5556 AATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTC 5615

  5639796 TATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGT 5639855
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5616 TATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTTTATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGT 5675

  5639856 CTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGC 5639915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5676 CTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGC 5735

  5639916 ATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGT 5639975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5736 ATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGT 5795

  5639976 GTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGT 5640035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5796 GTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGT 5855

  5640036 CTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTT 5640095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5856 CTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTT 5915

  5640096 CTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCT 5640155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5916 CTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCT 5975

  5640156 GTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTAT 5640215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5976 GTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTAT 6035

  5640216 GTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTC 5640275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6036 GTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTC 6095

  5640276 TTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACA 5640335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6096 TTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACA 6155

  5640336 CACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCAT 5640395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6156 CACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCAT 6215

  5640396 CCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTT 5640455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6216 CCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTT 6275

  5640456 ATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCA 5640515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6276 ATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCA 6335

  5640516 GTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTG 5640575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6336 GTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTG 6395

  5640576 TTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAA 5640635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6396 TTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAA 6455

  5640636 GTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTA 5640695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6456 GTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTA 6515

  5640696 CCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCC 5640755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6516 CCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCC 6575

  5640756 TTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGT 5640815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6576 TTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGT 6635

  5640816 GAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAG 5640875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6636 GAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAG 6695

  5640876 GTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCT 5640935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6696 GTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCT 6755

  5640936 GGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGT 5640995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6756 GGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGT 6815

  5640996 TATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTA 5641055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6816 TATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTA 6875

  5641056 TCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACG 5641115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     6876 TCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTC-TTTTTTTTTTTTTGGACG 6934

  5641116 GGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCT 5641175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6935 GGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCT 6994

  5641176 CTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGG 5641235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6995 CTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGG 7054

  5641236 CGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTG 5641295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7055 CGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTG 7114

  5641296 TTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGT 5641355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7115 TTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGT 7174

  5641356 GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTT 5641415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7175 GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTT 7234

  5641416 AAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTT 5641475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7235 AAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTT 7294

  5641476 TGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTC 5641535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7295 TGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTC 7354

  5641536 CTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTC 5641595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7355 CTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTC 7414

  5641596 ACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGT 5641655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7415 ACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGT 7474

  5641656 CTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATG 5641715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7475 CTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATG 7534

  5641716 CATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAA 5641775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7535 CATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAA 7594

  5641776 TTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCA 5641835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7595 TTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCA 7654

  5641836 ATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCT 5641895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7655 ATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCT 7714

  5641896 ATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTT 5641955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7715 ATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTT 7774

  5641956 TCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGG 5642015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7775 TCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGG 7834

  5642016 TAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGT 5642075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7835 TAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGT 7894

  5642076 CTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGA 5642135
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7895 CTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGA 7954

  5642136 CTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCAC 5642195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7955 CTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCAC 8014

  5642196 GTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGC 5642255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8015 GTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGC 8074

  5642256 TGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCA 5642315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8075 TGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCA 8134

  5642316 CCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGC 5642375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8135 CCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGC 8194

  5642376 CTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCAT 5642435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8195 CTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCAT 8254

  5642436 CAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAA 5642495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8255 CAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAA 8314

  5642496 ACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGC 5642555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8315 ACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGC 8374

  5642556 AATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAAT 5642615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8375 AATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAAT 8434

  5642616 TCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTA 5642675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8435 TCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTA 8494

  5642676 CCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTAT 5642735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8495 CCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTAT 8554

  5642736 GAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAG 5642795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8555 GAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAG 8614

  5642796 GTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCA 5642855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8615 GTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCA 8674

  5642856 TGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCT 5642915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8675 TGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCT 8734

  5642916 TTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAA 5642975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8735 TTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAA 8794

  5642976 TAGAAGATATTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTC 5643035
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8795 TAGAAGATCTTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTC 8854

  5643036 ACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGT 5643095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8855 ACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGT 8914

  5643096 TCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAA 5643155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8915 TCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAA 8974

  5643156 AATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGG 5643215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8975 AATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGG 9034

  5643216 AGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGAT 5643262
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9035 AGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGAT 9081

Alignment time is 10.8065 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   9517] =>      9517 nucs 'mol-32-2e15-050450_9517'

Score:        9361
Aligned:      9521        nucs
Identic:      9504 (100%) nucs =>      5661 (100%)      3843 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5635958,5641632] EXCISED REGION [5642811,5646655]
 second seq =>  [      1,   5671] EXCISED REGION [   5672,   9517]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1178 nucs [5641633,5642810]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5641633,5641633] to [5642811,5642811]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5635958 AGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTC 5636017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTC 60

  5636018 AAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTT 5636077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTT 120

  5636078 CTGTTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGG 5636137
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTATTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGG 180

  5636138 TTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATC 5636197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATC 240

  5636198 CAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGC 5636257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGC 300

  5636258 GGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTT 5636317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTT 360

  5636318 TTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAAT 5636377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAAT 420

  5636378 GGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCA 5636437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCA 480

  5636438 GCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTT 5636497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTT 540

  5636498 TTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTG 5636557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTG 600

  5636558 ATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGC 5636617
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      601 ATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGC 660

  5636618 CATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATT 5636677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATT 720

  5636678 CTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTT 5636737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTT 780

  5636738 TTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCT 5636797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCT 840

  5636798 TTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGC 5636857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      841 TTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCCCCAGC 900

  5636858 TAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTG 5636917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTG 960

  5636918 TACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATAC 5636977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATAC 1020

  5636978 GTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAG 5637037
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAG 1080

  5637038 GTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGT 5637097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGT 1140

  5637098 TGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCT 5637157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCT 1200

  5637158 CAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCA 5637217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCA 1260

  5637218 CTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCC 5637277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCC 1320

  5637278 ACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTG 5637337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTG 1380

  5637338 GGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATT 5637397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATT 1440

  5637398 TGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGT 5637457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGT 1500

  5637458 TCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACT 5637517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACT 1560

  5637518 GTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCA 5637577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCA 1620

  5637578 TTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCA 5637637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCA 1680

  5637638 TCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAG 5637697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAG 1740

  5637698 TGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTC 5637757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTC 1800

  5637758 TAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTAC 5637817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTAC 1860

  5637818 TCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAG 5637877
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCCATTATGTACAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAG 1920

  5637878 TACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGAGG 5637937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1921 TACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGAGG 1980

  5637938 AAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGC 5637997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGC 2040

  5637998 TTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGG 5638057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGG 2100

  5638058 ATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGT 5638117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGT 2160

  5638118 CCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTT 5638177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTT 2220

  5638178 GCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAA 5638237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAA 2280

  5638238 TCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACC 5638297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACC 2340

  5638298 TGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTC 5638357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTC 2400

  5638358 ATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTAT 5638417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTAT 2460

  5638418 TGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTT 5638477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTT 2520

  5638478 TTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGT 5638537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGT 2580

  5638538 TTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTC 5638597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTC 2640

  5638598 CTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTG 5638657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTG 2700

  5638658 AATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGT 5638717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGT 2760

  5638718 TTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCT 5638777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCT 2820

  5638778 TTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTA 5638837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTA 2880

  5638838 TTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCAT 5638897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2881 TTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCAT 2940

  5638898 TAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTC 5638957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTC 3000

  5638958 CAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATG 5639017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATG 3060

  5639018 TGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCA 5639077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCA 3120

  5639078 GCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAG 5639137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAG 3180

  5639138 CTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATA 5639197
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3181 CTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATAAGCCACTATA 3240

  5639198 CCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATA 5639257
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAGTACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATA 3300

  5639258 CTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAA 5639317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAA 3360

  5639318 TAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATAT 5639377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATAT 3420

  5639378 TGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAA 5639437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAA 3480

  5639438 CTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTG 5639497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTG 3540

  5639498 TGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTC 5639557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTC 3600

  5639558 TGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCA 5639617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCA 3660

  5639618 GATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAG 5639677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAG 3720

  5639678 TGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAA 5639737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAA 3780

  5639738 TGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTA 5639797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTA 3840

  5639798 TTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCT 5639857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCT 3900

  5639858 TGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCAT 5639917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCAT 3960

  5639918 GTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGT 5639977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGT 4020

  5639978 TTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCT 5640037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCT 4080

  5640038 TTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCT 5640097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCT 4140

  5640098 GCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGT 5640157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGT 4200

  5640158 GTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGT 5640217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGT 4260

  5640218 TTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTT 5640277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTT 4320

  5640278 ATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACA 5640337
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ATAACCCATTATTTTAAACTCACGGCAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACA 4380

  5640338 CACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCC 5640397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCC 4440

  5640398 CTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTAT 5640457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTAT 4500

  5640458 GTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGT 5640517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGT 4560

  5640518 CTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTT 5640577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTT 4620

  5640578 AGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGT 5640637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGT 4680

  5640638 AGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACC 5640697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACC 4740

  5640698 TTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTT 5640757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTT 4800

  5640758 TAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGA 5640817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGA 4860

  5640818 AGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGT 5640877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGT 4920

  5640878 AAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGG 5640937
          ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AAATGCTTTTGTTT----TTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGG 4976

  5640938 CCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTA 5640997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 CCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTA 5036

  5640998 TTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATC 5641057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 TTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATC 5096

  5641058 CTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGG 5641117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 CTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGG 5156

  5641118 GTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCT 5641177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 GTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCT 5216

  5641178 GCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCG 5641237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 GCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCG 5276

  5641238 CCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTT 5641297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 CCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTT 5336

  5641298 AGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGC 5641357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 AGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGC 5396

  5641358 TGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAA 5641417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 TGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAA 5456

  5641418 ATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTG 5641477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 ATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTG 5516

  5641478 GGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCT 5641537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 GGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCT 5576

  5641538 CTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCAC 5641597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 CTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCAC 5636

  5641598 TGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCT 5641632
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 TGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCT 5671

EXCISED REGION

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5731

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5732 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5791

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5792 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5851

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5852 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5911

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5912 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5971

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5972 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 6031

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6032 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 6091

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6092 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 6151

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6152 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 6211

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6212 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 6271

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6272 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 6331

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6332 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 6391

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6392 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 6451

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6452 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 6511

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6512 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 6571

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6572 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 6631

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6632 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 6691

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5643890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6692 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 6751

  5643891 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5643950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6752 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 6811

  5643951 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5644010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6812 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 6871

  5644011 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5644070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6872 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 6931

  5644071 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5644130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6932 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 6991

  5644131 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5644190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6992 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 7051

  5644191 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5644250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7052 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 7111

  5644251 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5644310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7112 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 7171

  5644311 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5644370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7172 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 7231

  5644371 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5644430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7232 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 7291

  5644431 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7292 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 7351

  5644491 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5644550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7352 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 7411

  5644551 TCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 5644610
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7412 TCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 7471

  5644611 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 5644670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7472 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 7531

  5644671 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 5644730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7532 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 7591

  5644731 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 5644790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7592 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 7651

  5644791 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 5644850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7652 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 7711

  5644851 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 5644910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7712 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 7771

  5644911 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 5644970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7772 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 7831

  5644971 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 5645030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7832 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 7891

  5645031 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 5645090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7892 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 7951

  5645091 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 5645150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7952 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 8011

  5645151 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 5645210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8012 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 8071

  5645211 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 5645270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8072 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 8131

  5645271 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 5645330
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     8132 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 8191

  5645331 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 5645390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8192 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 8251

  5645391 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 5645450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8252 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 8311

  5645451 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 5645510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8312 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 8371

  5645511 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 5645570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8372 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 8431

  5645571 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 5645630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8432 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 8491

  5645631 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 5645690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8492 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 8551

  5645691 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 5645750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8552 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 8611

  5645751 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 5645810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8612 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 8671

  5645811 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 5645870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8672 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 8731

  5645871 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 5645930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8732 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 8791

  5645931 CATTTGGTTATTCTATAGG-TTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATG 5645989
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8792 CATTTGGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATG 8851

  5645990 TTAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCA 5646049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8852 TTAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCA 8911

  5646050 ATACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGA 5646109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8912 ATACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGA 8971

  5646110 TTGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGG 5646169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8972 TTGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGG 9031

  5646170 TTATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGT 5646229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9032 TTATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGT 9091

  5646230 GTCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGC 5646289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9092 GTCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGC 9151

  5646290 TTCATGTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCC 5646349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9152 TTCATGTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCC 9211

  5646350 ATGTAATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTAT 5646409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9212 ATGTAATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTAT 9271

  5646410 AAAATTCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGT 5646469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9272 AAAATTCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGT 9331

  5646470 GTAATGCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATG 5646529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9332 GTAATGCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATG 9391

  5646530 GCACAATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCA 5646589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9392 GCACAATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCA 9451

  5646590 ATAGGGTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAG 5646649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9452 ATAGGGTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAG 9511

  5646650 TACCCA 5646655
          ||||||
     9512 TACCCA 9517

Alignment time is 11.7408 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3846] =>      3846 nucs 'mol-32-2e15-050450_3846'

Score:        3823
Aligned:      3845        nucs
Identic:      3843 (100%) nucs =>      1744 (100%)      2099 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5642811,5644554] EXCISED REGION [5644556,5646655]
 second seq =>  [      1,   1744] EXCISED REGION [   1746,   3846]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5644555,5644555]
 second seq =>         1 nucs [1745,1745]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3140,3140]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5644554,5644554] to [5644555,5644555]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 60

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 120

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 180

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 240

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 300

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 360

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 420

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 480

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 540

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 600

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 660

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 720

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 780

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 840

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 900

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 960

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 1020

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5643890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 1080

  5643891 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5643950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 1140

  5643951 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5644010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 1200

  5644011 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5644070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 1260

  5644071 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5644130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 1320

  5644131 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5644190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 1380

  5644191 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5644250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 1440

  5644251 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5644310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 1500

  5644311 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5644370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 1560

  5644371 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5644430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 1620

  5644431 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 1680

  5644491 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5644550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 1740

  5644551 TCTG 5644554
          ||||
     1741 TCTG 1744

EXCISED REGION

  5644556 TATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAATATTT 5644615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 TATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAATATTT 1805

  5644616 TTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATTTGAGT 5644675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATTTGAGT 1865

  5644676 CATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACATTTGTA 5644735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACATTTGTA 1925

  5644736 TACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCAACTAC 5644795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCAACTAC 1985

  5644796 TAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGTGACTG 5644855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGTGACTG 2045

  5644856 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 5644915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 2105

  5644916 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 5644975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 2165

  5644976 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 5645035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 2225

  5645036 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 5645095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 2285

  5645096 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 5645155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 2345

  5645156 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 5645215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 2405

  5645216 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 5645275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 2465

  5645276 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 5645335
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 2525

  5645336 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 5645395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 2585

  5645396 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 5645455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 2645

  5645456 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 5645515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 2705

  5645516 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 5645575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 2765

  5645576 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 5645635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 2825

  5645636 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 5645695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 2885

  5645696 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 5645755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 2945

  5645756 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 5645815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 3005

  5645816 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 5645875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 3065

  5645876 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 5645935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 3125

  5645936 GGTTATTCTATAGG-TTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAG 5645994
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 GGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAG 3185

  5645995 AAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACA 5646054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 AAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACA 3245

  5646055 GTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGATTGCC 5646114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 GTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGATTGCC 3305

  5646115 ATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGTTATT 5646174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 ATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGTTATT 3365

  5646175 AATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTGTCCG 5646234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 AATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTGTCCG 3425

  5646235 TTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCTTCAT 5646294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 TTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCTTCAT 3485

  5646295 GTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCATGTA 5646354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 GTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCATGTA 3545

  5646355 ATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATAAAAT 5646414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 ATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATAAAAT 3605

  5646415 TCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTGTAAT 5646474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 TCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTGTAAT 3665

  5646475 GCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGGCACA 5646534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 GCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGGCACA 3725

  5646535 ATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAATAGG 5646594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 ATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAATAGG 3785

  5646595 GTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAGTACCC 5646654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 GTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAGTACCC 3845

  5646655 A 5646655
          |
     3846 A 3846

Alignment time is 5.29733 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   8528] =>      8528 nucs 'mol-32-2e20-031674_8528'

Score:        8472
Aligned:      8527        nucs
Identic:      8522 (100%) nucs =>       947 (100%)      7575 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5633628,5634574] EXCISED REGION [5634576,5642155]
 second seq =>  [      1,    947] EXCISED REGION [    949,   8528]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5634575,5634575]
 second seq =>         1 nucs [948,948]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [947,947] to [948,948]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5633628 GTGCTGTGCGATACTTAGATCTACCCTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTCTAATTAACA 5633687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCTGTGCGATACTTAGATCTACCCTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTCTAATTAACA 60

  5633688 GATCCACCATCTCACACAGCTCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACACTTAAGACC 5633747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATCCACCATCTCACACAGCTCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACACTTAAGACC 120

  5633748 TACTCTCTTAGCAAATTTCAAGTATACAATATATGTTAATTATGGAAATAAATGTCATTA 5633807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACTCTCTTAGCAAATTTCAAGTATACAATATATGTTAATTATGGAAATAAATGTCATTA 180

  5633808 TTAACGATAGTTACTGGGCCATGCATTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTTATACCTGAA 5633867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAACGATAGTTACTGGGCCATGCATTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTTATACCTGAA 240

  5633868 AATTTGTACCTTTGACTGAAATACTCCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCTGGTAATCAT 5633927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTTGTACCTTTGACTGAAATACTCCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCTGGTAATCAT 300

  5633928 CGTTCTATTCTCTGTTCCTATGAATTTGACGTCTTTATATTCCATATATGAGATCATGAA 5633987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGTTCTATTCTCTGTTCCTATGAATTTGACGTCTTTATATTCCATATATGAGATCATGAA 360

  5633988 GTTGTTTTTTGTCTTGCTTACTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATGTTGTTGCAG 5634047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTGTTTTTTGTCTTGCTTACTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATGTTGTTGCAG 420

  5634048 ATGGCAGGATTTCCTTGTTTTTTAAAGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTATGTGTGTGT 5634107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGGCAGGATTTCCTTGTTTTTTAAAGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTATGTGTGTGT 480

  5634108 GTTACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCTGTATCTTGG 5634167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCTGTATCTTGG 540

  5634168 CTACTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATACTGATT 5634227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATACTGATT 600

  5634228 TCAATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTT 5634287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTT 660

  5634288 TTAGTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAG 5634347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAGTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAG 720

  5634348 TGTACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTC 5634407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTC 780

  5634408 TTGATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTG 5634467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTG 840

  5634468 ATGATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCA 5634527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCA 900

  5634528 GATCTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCT 5634574
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATCTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCT 947

EXCISED REGION

  5634576 GGTACTGAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATG 5634635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 GGTACTGAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATG 1008

  5634636 GTTTGCAGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTT 5634695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 GTTTGCAGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTT 1068

  5634696 TACTGTACAATAACTTAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTG 5634755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 TACTGTACAATAACTTAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTG 1128

  5634756 TGCTTTCCATGTCATCCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTG 5634815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 TGCTTTCCATGTCATCCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTG 1188

  5634816 TTTTCTTCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTT 5634875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 TTTTCTTCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTT 1248

  5634876 ATTTTAATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTT 5634935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 ATTTTAATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTT 1308

  5634936 GATACAGGACTATAGTCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATC 5634995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 GATACAGGACTATAGTCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATC 1368

  5634996 ACCATTATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCA 5635055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 ACCATTATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCA 1428

  5635056 TGGCTTACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAG 5635115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 TGGCTTACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAG 1488

  5635116 TAGCTGGGAGTACAGATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCT 5635175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 TAGCTGGGAGTACAGATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCT 1548

  5635176 TGCTGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCC 5635235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 TGCTGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCC 1608

  5635236 TCCTAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCT 5635295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 TCCTAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCT 1668

  5635296 ATTTTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTG 5635355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 ATTTTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTG 1728

  5635356 ATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAAC 5635415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 ATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAAC 1788

  5635416 ACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTG 5635475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 ACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTG 1848

  5635476 AAAGATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGT 5635535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 AAAGATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGT 1908

  5635536 CTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATA 5635595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 CTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATA 1968

  5635596 CTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATC 5635655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 CTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATC 2028

  5635656 GTAATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATA 5635715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 GTAATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATA 2088

  5635716 GCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTT 5635775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 GCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTT 2148

  5635776 ATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAAC 5635835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 ATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAAC 2208

  5635836 AAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTAT 5635895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 AAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTAT 2268

  5635896 GGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATA 5635955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 GGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATA 2328

  5635956 GCAGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTC 5636015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 GCAGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTC 2388

  5636016 TCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTT 5636075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 TCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTT 2448

  5636076 TTCTGTTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATT 5636135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 TTCTGTTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATT 2508

  5636136 GGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATA 5636195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 GGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATA 2568

  5636196 TCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTG 5636255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 TCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTG 2628

  5636256 GCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTC 5636315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 GCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTC 2688

  5636316 TTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCA 5636375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 TTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCA 2748

  5636376 ATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCC 5636435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 ATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCC 2808

  5636436 CAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTAT 5636495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 CAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTAT 2868

  5636496 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGT 5636555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGT 2928

  5636556 TGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCA 5636615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 TGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCA 2988

  5636616 GCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTA 5636675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 GCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTA 3048

  5636676 TTCTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATT 5636735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 TTCTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATT 3108

  5636736 TTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTG 5636795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 TTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTG 3168

  5636796 CTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCA 5636855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 CTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCA 3228

  5636856 GCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCT 5636915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 GCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCT 3288

  5636916 TGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCAT 5636975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 TGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCAT 3348

  5636976 ACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGT 5637035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 ACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGT 3408

  5637036 AGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCA 5637095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 AGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCA 3468

  5637096 GTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGG 5637155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 GTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGG 3528

  5637156 CTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTG 5637215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 CTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTG 3588

  5637216 CACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGC 5637275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 CACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGC 3648

  5637276 CCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGC 5637335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 CCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGC 3708

  5637336 TGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAA 5637395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 TGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAA 3768

  5637396 TTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCAT 5637455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 TTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCAT 3828

  5637456 GTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGA 5637515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 GTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGA 3888

  5637516 CTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACC 5637575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 CTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACC 3948

  5637576 CATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAAT 5637635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 CATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAAT 4008

  5637636 CATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATA 5637695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 CATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATA 4068

  5637696 AGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACC 5637755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 AGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACC 4128

  5637756 TCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGT 5637815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 TCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGT 4188

  5637816 ACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCC 5637875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 ACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCC 4248

  5637876 AGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGA 5637935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4249 AGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGA 4308

  5637936 GGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATG 5637995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 GGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATG 4368

  5637996 GCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAG 5638055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 GCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAG 4428

  5638056 GGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTG 5638115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 GGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTG 4488

  5638116 GTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCC 5638175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 GTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCC 4548

  5638176 TTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTG 5638235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 TTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTG 4608

  5638236 AATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGA 5638295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 AATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGA 4668

  5638296 CCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCC 5638355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 CCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCC 4728

  5638356 TCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGT 5638415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 TCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGT 4788

  5638416 ATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGC 5638475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 ATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGC 4848

  5638476 TTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAG 5638535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 TTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAG 4908

  5638536 GTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATT 5638595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4909 GTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATT 4968

  5638596 TCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTT 5638655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4969 TCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTT 5028

  5638656 TGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTG 5638715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5029 TGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTG 5088

  5638716 GTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTT 5638775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5089 GTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTT 5148

  5638776 CTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTAT 5638835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5149 CTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTAT 5208

  5638836 TATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATC 5638895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5209 TATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATC 5268

  5638896 ATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTC 5638955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5269 ATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTC 5328

  5638956 TCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCA 5639015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5329 TCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCA 5388

  5639016 TGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCC 5639075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5389 TGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCC 5448

  5639076 CAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTG 5639135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5449 CAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTG 5508

  5639136 AGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTA 5639195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5509 AGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTA 5568

  5639196 TACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAA 5639255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5569 TACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAA 5628

  5639256 TACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTC 5639315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5629 TACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTC 5688

  5639316 AATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACAT 5639375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5689 AATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACAT 5748

  5639376 ATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTT 5639435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5749 ATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTT 5808

  5639436 AACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATT 5639495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5809 AACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATT 5868

  5639496 TGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGT 5639555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5869 TGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCTATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGT 5928

  5639556 TCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTG 5639615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5929 TCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTG 5988

  5639616 CAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAA 5639675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5989 CAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAA 6048

  5639676 AGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAAT 5639735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6049 AGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAAT 6108

  5639736 AATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTC 5639795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6109 AATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTC 6168

  5639796 TATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGT 5639855
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6169 TATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTTTATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGT 6228

  5639856 CTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGC 5639915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6229 CTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGC 6288

  5639916 ATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGT 5639975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6289 ATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGT 6348

  5639976 GTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGT 5640035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6349 GTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGT 6408

  5640036 CTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTT 5640095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6409 CTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTT 6468

  5640096 CTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCT 5640155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6469 CTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCT 6528

  5640156 GTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTAT 5640215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6529 GTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTAT 6588

  5640216 GTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTC 5640275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6589 GTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTC 6648

  5640276 TTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACA 5640335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6649 TTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACA 6708

  5640336 CACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCAT 5640395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6709 CACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCAT 6768

  5640396 CCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTT 5640455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6769 CCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTT 6828

  5640456 ATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCA 5640515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6829 ATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCA 6888

  5640516 GTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTG 5640575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6889 GTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTG 6948

  5640576 TTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAA 5640635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6949 TTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAA 7008

  5640636 GTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTA 5640695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7009 GTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTA 7068

  5640696 CCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCC 5640755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7069 CCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCC 7128

  5640756 TTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGT 5640815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7129 TTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGT 7188

  5640816 GAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAG 5640875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7189 GAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAG 7248

  5640876 GTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCT 5640935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7249 GTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCT 7308

  5640936 GGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGT 5640995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7309 GGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGT 7368

  5640996 TATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTA 5641055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7369 TATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTA 7428

  5641056 TCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACG 5641115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7429 TCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACG 7488

  5641116 GGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCT 5641175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7489 GGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCT 7548

  5641176 CTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGG 5641235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7549 CTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGG 7608

  5641236 CGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTG 5641295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7609 CGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTG 7668

  5641296 TTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGT 5641355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7669 TTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGT 7728

  5641356 GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTT 5641415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7729 GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTT 7788

  5641416 AAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTT 5641475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7789 AAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTT 7848

  5641476 TGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTC 5641535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7849 TGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTC 7908

  5641536 CTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTC 5641595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7909 CTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTC 7968

  5641596 ACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGT 5641655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7969 ACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGT 8028

  5641656 CTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATG 5641715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8029 CTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATG 8088

  5641716 CATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAA 5641775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8089 CATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAA 8148

  5641776 TTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCA 5641835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8149 TTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCA 8208

  5641836 ATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCT 5641895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8209 ATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCT 8268

  5641896 ATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTT 5641955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8269 ATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTT 8328

  5641956 TCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGG 5642015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8329 TCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGG 8388

  5642016 TAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGT 5642075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8389 TAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGT 8448

  5642076 CTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGA 5642135
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8449 CTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGA 8508

  5642136 CTCAGAGGTACTGCCTTGGT 5642155
          ||||||||||||||||||||
     8509 CTCAGAGGTACTGCCTTGGT 8528

Alignment time is 10.516 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,  10076] =>     10076 nucs 'mol-32-2e4c-089780_10076'

Score:        9875
Aligned:     10070        nucs
Identic:     10049 (100%) nucs =>      9005 (100%)      1044 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5632599,5641621] EXCISED REGION [5642811,5643855]
 second seq =>  [      1,   9020] EXCISED REGION [   9032,  10076]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1189 nucs [5641622,5642810]
 second seq =>        11 nucs [9021,9031]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>      1178 nucs [5641633,5642810]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5641621,5641621] to [5642811,5642811]
 second seq =>         1 nucs [9020,9020] to [9032,9032]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5632599 GGCTCAGTATGTGTAGGCTAGATTGGGGTGGTAGAGGTAGAACTTGACTGGGGGCAGTTG 5632658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTCAGTATGTGTAGGCTAGATTGGGGTGGTAGAGGTAGAACTTGACTGGGGGCAGTTG 60

  5632659 GTACATTTCTGCTAAGGTTATTGTAAAAGGACTAGTTTCAGCTTTGAGGATGAAACTGTT 5632718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTACATTTCTGCTAAGGTTATTGTAAAAGGACTAGTTTCAGCTTTGAGGATGAAACTGTT 120

  5632719 GCATAAGGTAGGTTATGATTTATGATTGACGTAGGTGTAGTGTGAGATGAATTACATTTT 5632778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCATAAGGTAGGTTATGATTTATGATTGACGTAGGTGTAGTGTGAGATGAATTACATTTT 180

  5632779 GTACTGTACTGAGGGCCCAGAATTATTCCTTTAATATACTAACTGTGACTATGAAAGTCT 5632838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTACTGTACTGAGGGCCCAGAATTATTCCTTTAATATACTAACTGTGACTATGAAAGTCT 240

  5632839 ATATATGTGAACATCAGAATGGTATCTTTGAATTTAGCCATTCTAAATTAGATGTATAGA 5632898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATATGTGAACATCAGAATGGTATCTTTGAATTTAGCCATTCTAAATTAGATGTATAGA 300

  5632899 CATTCTCGTTTTTCAGGTCACCGACTTTAAACATTTAAATTAGCTTCAGAAGTATTTTTG 5632958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATTCTCGTTTTTCAGGTCACCGACTTTAAACATTTAAATTAGCTTCAGAAGTATTTTTG 360

  5632959 AACATCAACTGTAAAAGACAGATGTGTATAAAAGGGATGAAGAGACATGTTATATGTTAG 5633018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACATCAACTGTAAAAGACAGATGTGTATAAAAGGGATGAAGAGACATGTTATATGTTAG 420

  5633019 TGTGTTAGATGTTAGTGTGTTAATATAAATCTTGTGAGATATCACTGTTGTAGGTAGCTA 5633078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGTTAGATGTTAGTGTGTTAATATAAATCTTGTGAGATATCACTGTTGTAGGTAGCTA 480

  5633079 ATAAAAAGCTGAAATGGGCAAATAATTACTAGGCTTATAAAATAAATTATATGTCGTTTA 5633138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATAAAAAGCTGAAATGGGCAAATAATTACTAGGCTTATAAAATAAATTATATGTCGTTTA 540

  5633139 GTAATCCTGAGCAAAAACTTAGTTCCCATTGGTATGTGCTAATCATGGAAAAAAACAATG 5633198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTAATCCTGAGCAAAAACTTAGTTCCCATTGGTATGTGCTAATCATGGAAAAAAACAATG 600

  5633199 ATATGTCAAAAGAACCAAGCTTTGGATCAGGTATGTGATTAACTGTGTTGACCTCAGGAA 5633258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATATGTCAAAAGAACCAAGCTTTGGATCAGGTATGTGATTAACTGTGTTGACCTCAGGAA 660

  5633259 GACCATTTTATTTGTATTTTCCCAGCATTCCCATTTCTCACCCTTTTAACTCTATTACTT 5633318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GACCATTTTATTTGTATTTTCCCAGCATTCCCATTTCTCACCCTTTTAACTCTATTACTT 720

  5633319 TCTCCAGAGAGCCTTCTTTATAAATTCACTGCTCTGAAGTCTTCTAGGGTTCACTGTTGA 5633378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTCCAGAGAGCCTTCTTTATAAATTCACTGCTCTGAAGTCTTCTAGGGTTCACTGTTGA 780

  5633379 TGAAAGAATGGAGTTCAAACTCCTTAGTTTGATATCACAGACACTCCCTTCTTGGAATGC 5633438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAAAGAATGGAGTTCAAACTCCTTAGTTTGATATCACAGACACTCCCTTCTTGGAATGC 840

  5633439 TCTCTTGCCTCATTTCTGCCTGTCAGAGTATTATCTATCCTTTAACTGCTGTTGAAATCC 5633498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTCTTGCCTCATTTCTGCCTGTCAGAGTATTATCTATCCTTTAACTGCTGTTGAAATCC 900

  5633499 TTTCTTTATGAGTCATTCTTTACCTACCGTAACCATAAGTGTTCATTTTTCTGATGAACT 5633558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTCTTTATGAGTCATTCTTTACCTACCGTAACCATAAGTGTTCATTTTTCTGATGAACT 960

  5633559 ACTGCTTCCCCACTACTGCCAGCTTTGTTGAGGTATAATTGACAAATAAAAATTGTATAT 5633618
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTGCTTCCCCACTACTGCCAGCTTTGTTGACGTATAATTGACAAATAAAAATTGTATAT 1020

  5633619 ATTTAAGGTGTGCTGTGCGATACTTAGATCTACCCTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTC 5633678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTAAGGTGTGCTGTGCGATACTTAGATCTACCCTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTC 1080

  5633679 TAATTAACAGATCCACCATCTCACACAGCTCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACA 5633738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATTAACAGATCCACCATCTCACACAGCTCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACA 1140

  5633739 CTTAAGACCTACTCTCTTAGCAAATTTCAAGTATACAATATATGTTAATTATGGAAATAA 5633798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTAAGACCTACTCTCTTAGCAAATTTCAAGTATACAATATATGTTAATTATGGAAATAA 1200

  5633799 ATGTCATTATTAACGATAGTTACTGGGCCATGCATTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTT 5633858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGTCATTATTAACGATAGTTACTGGGCCATGCATTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTT 1260

  5633859 ATACCTGAAAATTTGTACCTTTGACTGAAATACTCCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCT 5633918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATACCTGAAAATTTGTACCTTTGACTGAAATACTCCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCT 1320

  5633919 GGTAATCATCGTTCTATTCTCTGTTCCTATGAATTTGACGTCTTTATATTCCATATATGA 5633978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTAATCATCGTTCTATTCTCTGTTCCTATGAATTTGACGTCTTTATATTCCATATATGA 1380

  5633979 GATCATGAAGTTGTTTTTTGTCTTGCTTACTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATG 5634038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATCATGAAGTTGTTTTTTGTCTTGCTTACTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATG 1440

  5634039 TTGTTGCAGATGGCAGGATTTCCTTGTTTTTTAAAGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTA 5634098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGTTGCAGATGGCAGGATTTCCTTGTTTTTTAAAGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTA 1500

  5634099 TGTGTGTGTGTTACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCT 5634158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTGTGTGTGTTACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCT 1560

  5634159 GTATCTTGGCTACTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAG 5634218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTATCTTGGCTACTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAG 1620

  5634219 ATACTGATTTCAATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTA 5634278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATACTGATTTCAATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTA 1680

  5634279 GTCCTGTTTTTAGTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCC 5634338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTCCTGTTTTTAGTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCC 1740

  5634339 CGTCAATAGTGTACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGA 5634398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CGTCAATAGTGTACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGA 1800

  5634399 TTTAACTTCTTGATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGC 5634458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTAACTTCTTGATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGC 1860

  5634459 ATCTCCCTGATGATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAAC 5634518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATCTCCCTGATGATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAAC 1920

  5634519 ATCTGTTCAGATCTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTCGGT 5634578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1921 ATCTGTTCAGATCTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTTGGT 1980

  5634579 ACTGAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTT 5634638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTGAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTT 2040

  5634639 TGCAGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTAC 5634698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCAGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTAC 2100

  5634699 TGTACAATAACTTAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGC 5634758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTACAATAACTTAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGC 2160

  5634759 TTTCCATGTCATCCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTT 5634818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTCCATGTCATCCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTT 2220

  5634819 TCTTCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATT 5634878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCTTCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATT 2280

  5634879 TTAATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTTGAT 5634938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTAATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTTGAT 2340

  5634939 ACAGGACTATAGTCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATCACC 5634998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACAGGACTATAGTCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATCACC 2400

  5634999 ATTATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGG 5635058
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTATTATTTTGAAACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGG 2460

  5635059 CTTACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAG 5635118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTTACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAG 2520

  5635119 CTGGGAGTACAGATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGC 5635178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGGGAGTACAGATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGC 2580

  5635179 TGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCC 5635238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCC 2640

  5635239 TAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATT 5635298
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCGCCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATT 2700

  5635299 TTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATA 5635358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATA 2760

  5635359 GTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACT 5635418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACT 2820

  5635419 ATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAA 5635478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAA 2880

  5635479 GATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTA 5635538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTA 2940

  5635539 TGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTT 5635598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTT 3000

  5635599 TGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTA 5635658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTA 3060

  5635659 ATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCG 5635718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCG 3120

  5635719 GGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATA 5635778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATA 3180

  5635779 AGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAG 5635838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAG 3240

  5635839 TGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGA 5635898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGA 3300

  5635899 ACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCA 5635958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCA 3360

  5635959 GTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCA 5636018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCA 3420

  5636019 AGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTC 5636078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTC 3480

  5636079 TGTTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGT 5636138
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TATTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGT 3540

  5636139 TTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCC 5636198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCC 3600

  5636199 AGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCG 5636258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCG 3660

  5636259 GTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTT 5636318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTT 3720

  5636319 TTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATG 5636378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATG 3780

  5636379 GAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAG 5636438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAG 3840

  5636439 CCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTT 5636498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTT 3900

  5636499 TAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGA 5636558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGA 3960

  5636559 TCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCC 5636618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3961 TCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCC 4020

  5636619 ATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTC 5636678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTC 4080

  5636679 TTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTT 5636738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTT 4140

  5636739 TGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTT 5636798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTT 4200

  5636799 TTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCT 5636858
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4201 TTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCCCCAGCT 4260

  5636859 AGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGT 5636918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGT 4320

  5636919 ACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACG 5636978
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4321 ACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACA 4380

  5636979 TGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGG 5637038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGG 4440

  5637039 TATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTT 5637098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTT 4500

  5637099 GCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTC 5637158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTC 4560

  5637159 AAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCAC 5637218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCAC 4620

  5637219 TTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCA 5637278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCA 4680

  5637279 CGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGG 5637338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGG 4740

  5637339 GATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTT 5637398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTT 4800

  5637399 GTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTT 5637458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTT 4860

  5637459 CCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTG 5637518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTG 4920

  5637519 TAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCAT 5637578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCAT 4980

  5637579 TAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCAT 5637638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCAT 5040

  5637639 CTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGT 5637698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGT 5100

  5637699 GAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCT 5637758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCT 5160

  5637759 AGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACT 5637818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACT 5220

  5637819 CCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGT 5637878
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CCATTATGTACAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGT 5280

  5637879 ACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGAGGA 5637938
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5281 ACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGAGGA 5340

  5637939 AAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCT 5637998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCT 5400

  5637999 TTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGA 5638058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGA 5460

  5638059 TGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTC 5638118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTC 5520

  5638119 CTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTG 5638178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTG 5580

  5638179 CATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAAT 5638238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAAT 5640

  5638239 CTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCT 5638298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCT 5700

  5638299 GTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCA 5638358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCA 5760

  5638359 TAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATT 5638418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATT 5820

  5638419 GGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTT 5638478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 GGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTT 5880

  5638479 TCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTT 5638538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTT 5940

  5638539 TTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCC 5638598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCC 6000

  5638599 TCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGA 5638658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGA 6060

  5638659 ATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTT 5638718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 ATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTT 6120

  5638719 TTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTT 5638778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTT 6180

  5638779 TGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTAT 5638838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTAT 6240

  5638839 TTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCATT 5638898
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6241 TTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCATT 6300

  5638899 AGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCC 5638958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 AGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCC 6360

  5638959 AGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGT 5639018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 AGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGT 6420

  5639019 GATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAG 5639078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 GATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAG 6480

  5639079 CTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGC 5639138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGC 6540

  5639139 TCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATAC 5639198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6541 TCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATAAGCCACTATAC 6600

  5639199 CCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATAC 5639258
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 CCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAGTACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATAC 6660

  5639259 TGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAAT 5639318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 TGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAAT 6720

  5639319 AAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATT 5639378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 AAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATT 6780

  5639379 GTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAAC 5639438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 GTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAAC 6840

  5639439 TCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGT 5639498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 TCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGT 6900

  5639499 GACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCT 5639558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 GACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCT 6960

  5639559 GCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAG 5639618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 GCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAG 7020

  5639619 ATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGT 5639678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 ATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGT 7080

  5639679 GAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAAT 5639738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 GAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAAT 7140

  5639739 GTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTAT 5639798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 GTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTAT 7200

  5639799 TGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTT 5639858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 TGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTT 7260

  5639859 GAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATG 5639918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 GAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATG 7320

  5639919 TAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTT 5639978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 TAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTT 7380

  5639979 TCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTT 5640038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 TCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTT 7440

  5640039 TTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTG 5640098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 TTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTG 7500

  5640099 CCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTG 5640158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 CCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTG 7560

  5640159 TTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTT 5640218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 TTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTT 7620

  5640219 TTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTA 5640278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 TTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTA 7680

  5640279 TAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACAC 5640338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 TAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACAC 7740

  5640339 ACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCC 5640398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 ACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCC 7800

  5640399 TCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATG 5640458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 TCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATG 7860

  5640459 TCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTC 5640518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 TCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTC 7920

  5640519 TTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTA 5640578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 TTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTA 7980

  5640579 GGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTA 5640638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 GGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTA 8040

  5640639 GAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCT 5640698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 GAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCT 8100

  5640699 TCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTT 5640758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 TCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTT 8160

  5640759 AGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAA 5640818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 AGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAA 8220

  5640819 GGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTA 5640878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 GGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTA 8280

  5640879 AATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGC 5640938
          |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 AATGCTTTTGTTT----TTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGC 8336

  5640939 CTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTAT 5640998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8337 CTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTAT 8396

  5640999 TTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCC 5641058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8397 TTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCC 8456

  5641059 TTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGG 5641118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     8457 TTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTT-GGACGGGG 8515

  5641119 TCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTG 5641178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8516 TCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTG 8575

  5641179 CCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGC 5641238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8576 CCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGC 8635

  5641239 CCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTA 5641298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8636 CCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTA 8695

  5641299 GCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCA--TGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTG 5641356
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
     8696 GCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTG 8755

  5641357 CTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTA 5641416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8756 CTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTA 8815

  5641417 AATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTT 5641476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8816 AATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTT 8875

  5641477 GGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCC 5641536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8876 GGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCC 8935

  5641537 TCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCA 5641596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8936 TCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCA 8995

  5641597 CTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTG 5641621
          |||||||||||||||||||||||||
     8996 CTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTG 9020

EXCISED REGION

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9032 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 9091

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9092 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 9151

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9152 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 9211

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9212 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 9271

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9272 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 9331

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9332 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 9391

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9392 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 9451

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9452 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 9511

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9512 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 9571

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9572 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 9631

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9632 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 9691

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9692 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 9751

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9752 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 9811

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9812 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 9871

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9872 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 9931

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9932 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 9991

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9992 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 10051

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACA 5643855
          |||||.|||||||||||||||||||
    10052 TTTACCCCTGCCACAAAATGAGACA 10076

Alignment time is 12.5037 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   5140] =>      5140 nucs 'mol-32-2ee6-107838_5140'

Score:        5085
Aligned:      5140        nucs
Identic:      5135 (100%) nucs =>       190 (100%)      4945 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5638688,5638877] EXCISED REGION [5638879,5643828]
 second seq =>  [      1,    190] EXCISED REGION [    192,   5140]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5638878,5638878]
 second seq =>         1 nucs [191,191]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [5641097,5641097]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5638877,5638877] to [5638878,5638878]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5638688 TTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTT 5638747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTT 60

  5638748 ATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCA 5638807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCA 120

  5638808 AGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTC 5638867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTC 180

  5638868 TTGCTTTTCT 5638877
          ||||||||||
      181 TTGCTTTTCT 190

EXCISED REGION

  5638879 GTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGAC 5638938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      192 GTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGAC 251

  5638939 AGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCC 5638998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      252 AGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCC 311

  5638999 TCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAG 5639058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      312 TCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAG 371

  5639059 TTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGG 5639118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      372 TTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGG 431

  5639119 CTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGAT 5639178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      432 CTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGAT 491

  5639179 TCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCT 5639238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      492 TCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCT 551

  5639239 ATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTT 5639298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      552 ATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTT 611

  5639299 CCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCAT 5639358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      612 CCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCAT 671

  5639359 TGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTC 5639418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      672 TGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTC 731

  5639419 TTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTT 5639478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 TTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTT 791

  5639479 TTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTG 5639538
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      792 TTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCTATGTACTG 851

  5639539 AGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGT 5639598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 AGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGT 911

  5639599 CCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAG 5639658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 CCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAG 971

  5639659 TTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCT 5639718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 TTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCT 1031

  5639719 CTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTAC 5639778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 CTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTAC 1091

  5639779 ATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTT 5639838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1092 ATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTTTATAATGACATTCTT 1151

  5639839 TGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTC 5639898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 TGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTC 1211

  5639899 TTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATAC 5639958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 TTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATAC 1271

  5639959 CTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCC 5640018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 CTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCC 1331

  5640019 ATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTA 5640078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 ATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTA 1391

  5640079 TTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCG 5640138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 TTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCG 1451

  5640139 TTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTT 5640198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 TTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTT 1511

  5640199 AATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGA 5640258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 AATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGA 1571

  5640259 GACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATT 5640318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 GACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATT 1631

  5640319 GTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACT 5640378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 GTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACT 1691

  5640379 CTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTT 5640438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 CTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTT 1751

  5640439 GTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTT 5640498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 GTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTT 1811

  5640499 ATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTA 5640558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 ATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTA 1871

  5640559 TAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTG 5640618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 TAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTG 1931

  5640619 CTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACT 5640678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 CTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACT 1991

  5640679 ATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTT 5640738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 ATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTT 2051

  5640739 CAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCT 5640798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 CAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCT 2111

  5640799 CAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACT 5640858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 CAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACT 2171

  5640859 GGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATA 5640918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 GGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATA 2231

  5640919 TTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATT 5640978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 TTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATT 2291

  5640979 GGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTAT 5641038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 GGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTAT 2351

  5641039 CCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTT 5641098
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     2352 CCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTC-T 2410

  5641099 TTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATC 5641158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 TTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATC 2470

  5641159 TCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGA 5641218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 TCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGA 2530

  5641219 GTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGA 5641278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 GTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGA 2590

  5641279 GATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCG 5641338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 GATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCG 2650

  5641339 CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAG 5641398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAG 2710

  5641399 GTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAG 5641458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 GTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAG 2770

  5641459 ATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCG 5641518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 ATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCG 2830

  5641519 GTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTA 5641578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 GTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTA 2890

  5641579 TTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTAT 5641638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 TTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTAT 2950

  5641639 ATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCT 5641698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 ATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCT 3010

  5641699 TTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGC 5641758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 TTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGC 3070

  5641759 TGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCT 5641818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 TGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCT 3130

  5641819 TCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCC 5641878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 TCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCC 3190

  5641879 TGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCAT 5641938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 TGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCAT 3250

  5641939 TTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTG 5641998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 TTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTG 3310

  5641999 TGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATC 5642058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 TGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATC 3370

  5642059 TGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAAT 5642118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3371 TGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAAT 3430

  5642119 GCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGA 5642178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 GCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGA 3490

  5642179 ATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAAT 5642238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 ATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAAT 3550

  5642239 GGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAG 5642298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 GGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAG 3610

  5642299 CACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCAC 5642358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 CACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCAC 3670

  5642359 TGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGG 5642418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 TGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGG 3730

  5642419 CCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAG 5642478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 CCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAG 3790

  5642479 AGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTA 5642538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 AGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTA 3850

  5642539 GAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTC 5642598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3851 GAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTC 3910

  5642599 AAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGC 5642658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3911 AAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGC 3970

  5642659 CTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGT 5642718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3971 CTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGT 4030

  5642719 CATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGG 5642778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4031 CATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGG 4090

  5642779 AGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTC 5642838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4091 AGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTC 4150

  5642839 TTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTT 5642898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4151 TTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTT 4210

  5642899 TAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCT 5642958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4211 TAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCT 4270

  5642959 AGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAG 5643018
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4271 AGTACCATTTTTATGAATAGAAGATCTTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAG 4330

  5643019 TCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGAT 5643078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4331 TCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGAT 4390

  5643079 CACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATA 5643138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4391 CACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATA 4450

  5643139 AAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAAT 5643198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4451 AAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAAT 4510

  5643199 CTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGA 5643258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4511 CTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGA 4570

  5643259 AGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTT 5643318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4571 AGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTT 4630

  5643319 TTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTAT 5643378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4631 TTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTAT 4690

  5643379 ATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGG 5643438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4691 ATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGG 4750

  5643439 TTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAA 5643498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4751 TTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAA 4810

  5643499 CCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCC 5643558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4811 CCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCC 4870

  5643559 TTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCT 5643618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4871 TTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCT 4930

  5643619 CATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTT 5643678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4931 CATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTT 4990

  5643679 TTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACC 5643738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4991 TTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACC 5050

  5643739 TGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATA 5643798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5051 TGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATA 5110

  5643799 AAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGG 5643828
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     5111 AAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGG 5140

Alignment time is 6.65231 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   6552] =>      6552 nucs 'mol-32-2f28-015058_6552'

Score:        6469
Aligned:      6535        nucs
Identic:      6529 (100%) nucs =>      3734 (100%)      2795 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5641116,5644853] EXCISED REGION [5644856,5647652]
 second seq =>  [      1,   3737] EXCISED REGION [   3738,   6534]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [5644854,5644855]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5644854,5644854] to [5644856,5644856]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5641116 GGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCT 5641175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCT 60

  5641176 CTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGG 5641235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGG 120

  5641236 CGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTG 5641295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTG 180

  5641296 TTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGT 5641355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGT 240

  5641356 GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTT 5641415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTT 300

  5641416 AAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTT 5641475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTT 360

  5641476 TGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTC 5641535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTC 420

  5641536 CTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTC 5641595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTC 480

  5641596 ACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGT 5641655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGT 540

  5641656 CTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATG 5641715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATG 600

  5641716 CATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAA 5641775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAA 660

  5641776 TTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCA 5641835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCA 720

  5641836 ATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCT 5641895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCT 780

  5641896 ATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTT 5641955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTT 840

  5641956 TCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGG 5642015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGG 900

  5642016 TAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGT 5642075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGT 960

  5642076 CTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGA 5642135
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGA 1020

  5642136 CTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCAC 5642195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCAC 1080

  5642196 GTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGC 5642255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGC 1140

  5642256 TGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCA 5642315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCA 1200

  5642316 CCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGC 5642375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGC 1260

  5642376 CTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCAT 5642435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCAT 1320

  5642436 CAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAA 5642495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAA 1380

  5642496 ACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGC 5642555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGC 1440

  5642556 AATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAAT 5642615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAAT 1500

  5642616 TCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTA 5642675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTA 1560

  5642676 CCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTAT 5642735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTAT 1620

  5642736 GAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAG 5642795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAG 1680

  5642796 GTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCA 5642855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCA 1740

  5642856 TGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCT 5642915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCT 1800

  5642916 TTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAA 5642975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAA 1860

  5642976 TAGAAGATATTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTC 5643035
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAGAAGATCTTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTC 1920

  5643036 ACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGT 5643095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGT 1980

  5643096 TCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAA 5643155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAA 2040

  5643156 AATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGG 5643215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGG 2100

  5643216 AGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCC 5643275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCC 2160

  5643276 TTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTC 5643335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTC 2220

  5643336 AATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACT 5643395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACT 2280

  5643396 ATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGC 5643455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGC 2340

  5643456 CATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAA 5643515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAA 2400

  5643516 AGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAA 5643575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAA 2460

  5643576 TTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCT 5643635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCT 2520

  5643636 TACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTT 5643695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTT 2580

  5643696 TACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCA 5643755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCA 2640

  5643756 CCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTT 5643815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTT 2700

  5643816 AAAAATATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCT 5643875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAAATATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCT 2760

  5643876 TACTCATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAA 5643935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TACTCATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAA 2820

  5643936 TTGCTTTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTC 5643995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGCTTTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTC 2880

  5643996 AACCATAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTG 5644055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AACCATAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTG 2940

  5644056 TAGAATTTGCTATGGTTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGT 5644115
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAGAATTTGCTATGGTTTAAATTTT-AAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGT 2999

  5644116 GTACATTGATTTTTAGTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAG 5644175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 GTACATTGATTTTTAGTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAG 3059

  5644176 AACATTTATATCAGCCTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATT 5644235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AACATTTATATCAGCCTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATT 3119

  5644236 CCAGCCTTAGAAAACCTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTT 5644295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 CCAGCCTTAGAAAACCTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTT 3179

  5644296 CATATCATTGGAATCATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATG 5644355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CATATCATTGGAATCATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATG 3239

  5644356 TTTTTGAGGTGCATCCAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGA 5644415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TTTTTGAGGTGCATCCAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGA 3299

  5644416 TACAAGTGCAGTTTTTTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTG 5644475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TACAAGTGCAGTTTTTTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTG 3359

  5644476 TAATCATCAGCTAAAGAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCT 5644535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TAATCATCAGCTAAAGAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCT 3419

  5644536 TCTCATCCTTCTGAGTCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTC 5644595
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TCTCATCCTTCTGAGTCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTC 3479

  5644596 CTTTTTGTTGCTGAATATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCAC 5644655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 CTTTTTGTTGCTGAATATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCAC 3539

  5644656 CAGTTGACAGGTATTTGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAA 5644715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CAGTTGACAGGTATTTGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAA 3599

  5644716 TACTGCTGTAAACATTTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAG 5644775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TACTGCTGTAAACATTTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAG 3659

  5644776 ATACCTAGGAGTGCAACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAA 5644835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 ATACCTAGGAGTGCAACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAA 3719

  5644836 ACTTTGTTCCAAAGTGAC 5644853
          ||||||||||||||||||
     3720 ACTTTGTTCCAAAGTGAC 3737

EXCISED REGION

  5644856 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 5644915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3738 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 3797

  5644916 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 5644975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3798 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 3857

  5644976 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 5645035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3858 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 3917

  5645036 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 5645095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3918 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 3977

  5645096 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 5645155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3978 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 4037

  5645156 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 5645215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4038 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 4097

  5645216 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 5645275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4098 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 4157

  5645276 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 5645335
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4158 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 4217

  5645336 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 5645395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4218 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 4277

  5645396 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 5645455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4278 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 4337

  5645456 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 5645515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4338 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 4397

  5645516 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 5645575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4398 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 4457

  5645576 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 5645635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4458 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 4517

  5645636 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 5645695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4518 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 4577

  5645696 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 5645755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4578 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 4637

  5645756 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 5645815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4638 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 4697

  5645816 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 5645875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4698 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 4757

  5645876 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 5645935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4758 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 4817

  5645936 GGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAGA 5645995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4818 GGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAGA 4877

  5645996 AATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACAG 5646055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4878 AATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACAG 4937

  5646056 TGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGATTGCCA 5646115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4938 TGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGATTGCCA 4997

  5646116 TTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGTTATTA 5646175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 TTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGTTATTA 5057

  5646176 ATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTGTCCGT 5646235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 ATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTGTCCGT 5117

  5646236 TGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCTTCATG 5646295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5118 TGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCTTCATG 5177

  5646296 TATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCATGTAA 5646355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5178 TATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCATGTAA 5237

  5646356 TGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATAAAATT 5646415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 TGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATAAAATT 5297

  5646416 CTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTGTAATG 5646475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 CTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTGTAATG 5357

  5646476 CATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGGCACAA 5646535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 CATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGGCACAA 5417

  5646536 TTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAATAGGG 5646595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5418 TTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAATAGGG 5477

  5646596 TATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAGTACCCA 5646655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5478 TATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAGTACCCA 5537

  5646656 CTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTATCCCCT 5646715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5538 CTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTATCCCCT 5597

  5646716 CTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGGGTTACATTTTTACTCTC 5646775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5598 CTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGGGTTACATTTTTACTCTC 5657

  5646776 TTTGTAGTAGCCATTGATGCACAGCATTTTCAATTTTGATGAAGTCTGTCTTACCTATTT 5646835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5658 TTTGTAGTAGCCATTGATGCACAGCATTTTCAATTTTGATGAAGTCTGTCTTACCTACTT 5717

  5646836 TTTTTTGTTGCCTGTGCTTTCAGTATCATATCCAAGAAATTGTTTTCAAATCCAAAGTCA 5646895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5718 TTTTTTGTTGCCTGTGCTTTCAGTATCATATCCAAGAAATTGTTTTCAAATCCAAAGTCA 5777

  5646896 TGAAGTTTTTGGCTTGTGTTTTCTTCTAAGAGTTTTATAGGGTGAGGTCTTCTGTTTAGA 5646955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5778 TGAAGTTTTTGGCTTGTGTTTTCTTCTAAGAGTTTTATAGGGTGAGGTCTTCTGTTTAGA 5837

  5646956 GTTTTGATCACTTTGAGACAATTTTTGTATATAGTATAAGATAAGGGTCCAGCTTTATTT 5647015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5838 GTTTTGATCACTTTGAGACAATTTTTGTATATAGTATAAGATAAGGGTCCAGCTTTATTT 5897

  5647016 TTTTACATGTGGATATCCAGTTTTCCCAGCACTGTTTGTTGAAAAGACTTTCTTTCCTTT 5647075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5898 TTTTACATGTGGATATCCAGTTTTCCCAGCACTGTTTGTTGAAAAGACTTTCTTTCCTTT 5957

  5647076 TCCCCTTTGAATGGTCTAGGTAGCCTTGTGGAAAATAATTTGACTATTTATGCAAGAGTG 5647135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5958 TCCCCTTTGAATGGTCTAGGTAGCCTTGTGGAAAATAATTTGACTATTTATGCAAGAGTG 6017

  5647136 TATTTCTGGACTCTGTGTTTTATTCTGTTGGTCTATATGTGTATCCTTGTGCCAGTACGA 5647195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6018 TATTTCTGGACTCTGTGTTTTATTCTGTTGGTCTATATGTGTATCCTTGTGCCAGTACGA 6077

  5647196 CAGTATTTTGATTGCTGTAGTCTTCTAGTAAGTTTTGATGTCAGGAAATGTGAGACGTCC 5647255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6078 CAGTATTTTGATTGCTGTAGTCTTCTAGTAAGTTTTGATGTCAGGAAATGTGAGACGTCC 6137

  5647256 AACTTTGTTATTTTCAAGTTTGTTTTGTCTATTCGAGGTCTCTTGGGAATCCATATGAAT 5647315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6138 AACTTTGTTATTTTCAAGTTTGTTTTGTCTATTCGAGGTCTCTTGGGAATCCATATGAAT 6197

  5647316 TTTAGGATGGATTTTTCTGTTTCTGCTAAAAATGCTGTTAGGATTTTGAAAGGACTTACA 5647375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6198 TTTAGGATGGATTTTTCTGTTTCTGCTAAAAATGCTGTTAGGATTTTGAAAGGACTTACA 6257

  5647376 TTGACTATGTAGATTGCTTTGGGTAGTATTGACATCTTAACAATATTAAATTTTCTAATC 5647435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6258 TTGACTATGTAGATTGCTTTGGGTAGTATTGACATCTTAACAATATTAAATTTTCTAATC 6317

  5647436 CATGAACAGAGGATATCTTTTCATTTATTTGTGTCTAATTTCTTTCAGTGATATTTTGCA 5647495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6318 CATGAACAGAGGATATCTTTTCATTTATTTGTGTCTAATTTCTTTCAGTGATATTTTGCA 6377

  5647496 GTTTTCACTGTAGAAGTCTTTTGCCTGCTTGGTTAGGTTTAGTCCTAAGTACTTTATTCT 5647555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6378 GTTTTCACTGTAGAAGTCTTTTGCCTGCTTGGTTAGGTTTAGTCCTAAGTACTTTATTCT 6437

  5647556 TTTTGATGTTACGGTTTGCTGATTTTTCTGTGTTGATTTTGTATTCTGCAGTTTTCCTGA 5647615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6438 TTTTGATGTTACGGTTTGCTGATTTTTCTGTGTTGATTTTGTATTCTGCAGTTTTCCTGA 6497

  5647616 ATTCATTCATTCTAACAGGTTTGTTGTTGTTGTGGAA 5647652
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6498 ATTCATTCATTCTAACAGGTTTGTTGTTGTTGTGGAA 6534

Alignment time is 8.42811 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   5882] =>      5882 nucs 'mol-32-2f3e-073410_5882'

Score:        5806
Aligned:      5883        nucs
Identic:      5876 (100%) nucs =>      4013 (100%)      1863 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5640836,5644853] EXCISED REGION [5644856,5646719]
 second seq =>  [      1,   4017] EXCISED REGION [   4018,   5882]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [5644854,5644855]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5644854,5644854] to [5644856,5644856]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5640836 CATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTT 5640895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTT 60

  5640896 TTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTG 5640955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTG 120

  5640956 AAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTG 5641015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTG 180

  5641016 CCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTAT 5641075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTAT 240

  5641076 AGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCA 5641135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCA 300

  5641136 GGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCC 5641195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCC 360

  5641196 ATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGC 5641255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGC 420

  5641256 TAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGAT 5641315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGAT 480

  5641316 CTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAG 5641375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAG 540

  5641376 CCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGT 5641435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGT 600

  5641436 AACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCC 5641495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCC 660

  5641496 CTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTC 5641555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTC 720

  5641556 TTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTT 5641615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTT 780

  5641616 CTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTT 5641675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTT 840

  5641676 TCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTT 5641735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTT 900

  5641736 GCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAA 5641795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      901 GCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTGTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAA 960

  5641796 ATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAA 5641855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAA 1020

  5641856 CATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATT 5641915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATT 1080

  5641916 GGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTG 5641975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTG 1140

  5641976 ATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTT 5642035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTT 1200

  5642036 TGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGG 5642095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGG 1260

  5642096 ACTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGT 5642155
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGT 1320

  5642156 GGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTT 5642215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTT 1380

  5642216 CTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGG 5642275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGG 1440

  5642276 ATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGT 5642335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGT 1500

  5642336 TAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGG 5642395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGG 1560

  5642396 CTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGC 5642455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGC 1620

  5642456 CAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAA 5642515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAA 1680

  5642516 TGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTT 5642575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTT 1740

  5642576 CTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTG 5642635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTG 1800

  5642636 TCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTT 5642695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTT 1860

  5642696 CTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCAT 5642755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCAT 1920

  5642756 ATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAG 5642815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAG 1980

  5642816 CAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCA 5642875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCA 2040

  5642876 TACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTAT 5642935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTAT 2100

  5642936 ACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGAAGGAA 5642995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2101 ACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATCTTATGAAGGAA 2160

  5642996 TACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACT 5643055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACT 2220

  5643056 TTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGT 5643115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGT 2280

  5643116 ATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGT 5643175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGT 2340

  5643176 GCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGA 5643235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGA 2400

  5643236 TGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTG 5643295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTG 2460

  5643296 CTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGA 5643355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGA 2520

  5643356 ACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTA 5643415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTA 2580

  5643416 CAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAAC 5643475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAAC 2640

  5643476 CCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTT 5643535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTT 2700

  5643536 CCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGG 5643595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGG 2760

  5643596 TGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTG 5643655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTG 2820

  5643656 AAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTC 5643715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTC 2880

  5643716 ATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGC 5643775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGC 2940

  5643776 AATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAATTTAC 5643835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAATTTAC 3000

  5643836 ACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGCATCAA 5643895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGCATCAA 3060

  5643896 TTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAGTTGCT 5643955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAGTTGCT 3120

  5643956 GTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATACAAAAA 5644015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATACAAAAA 3180

  5644016 TTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGGTTTAA 5644075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGGTTTAA 3240

  5644076 ATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTAGTAAA 5644135
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATTTT-AAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTAGTAAA 3299

  5644136 TTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGCCTTAA 5644195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGCCTTAA 3359

  5644196 AAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAACCTTGG 5644255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 AAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAACCTTGG 3419

  5644256 CCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATCATATG 5644315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 CCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATCATATG 3479

  5644316 GTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATCCAGGT 5644375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATCCAGGT 3539

  5644376 CATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTTTTTAC 5644435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTTTTTAC 3599

  5644436 AGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAAGAATG 5644495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 AGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAAGAATG 3659

  5644496 TGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAGTCTGG 5644555
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3660 TGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAGTCTGA 3719

  5644556 TATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAATATTT 5644615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAATATTT 3779

  5644616 TTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATTTGAGT 5644675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATTTGAGT 3839

  5644676 CATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACATTTGTA 5644735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 CATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACATTTGTA 3899

  5644736 TACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCAACTAC 5644795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCAACTAC 3959

  5644796 TAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGTGAC 5644853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGTGAC 4017

EXCISED REGION

  5644856 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 5644915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 4077

  5644916 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 5644975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 4137

  5644976 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 5645035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 4197

  5645036 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 5645095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 4257

  5645096 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 5645155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 4317

  5645156 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 5645215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 4377

  5645216 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 5645275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 4437

  5645276 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 5645335
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 4497

  5645336 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 5645395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 4557

  5645396 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 5645455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 4617

  5645456 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 5645515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 4677

  5645516 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 5645575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 4737

  5645576 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 5645635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 4797

  5645636 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 5645695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 4857

  5645696 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 5645755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 4917

  5645756 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 5645815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 4977

  5645816 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 5645875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 5037

  5645876 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 5645935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 5097

  5645936 GGTTATTCTATAGG-TTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAG 5645994
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 GGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAG 5157

  5645995 AAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACA 5646054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 AAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACA 5217

  5646055 GTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGATTGCC 5646114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 GTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGATTGCC 5277

  5646115 ATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGTTATT 5646174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 ATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGTTATT 5337

  5646175 AATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTGTCCG 5646234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 AATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTGTCCG 5397

  5646235 TTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCTTCAT 5646294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 TTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCTTCAT 5457

  5646295 GTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCATGTA 5646354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 GTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCATGTA 5517

  5646355 ATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATAAAAT 5646414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 ATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATAAAAT 5577

  5646415 TCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTGTAAT 5646474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 TCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTGTAAT 5637

  5646475 GCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGGCACA 5646534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 GCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGGCACA 5697

  5646535 ATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAATAGG 5646594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 ATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAATAGG 5757

  5646595 GTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAGTACCC 5646654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 GTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAGTACCC 5817

  5646655 ACTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTATCCCC 5646714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 ACTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTATCCCC 5877

  5646715 TCTTG 5646719
          |||||
     5878 TCTTG 5882

Alignment time is 7.51679 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   2413] =>      2413 nucs 'mol-32-2fb7-095868_2413'

Score:        2391
Aligned:      2413        nucs
Identic:      2411 (100%) nucs =>       558 (100%)      1853 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5642426,5642983] EXCISED REGION [5642985,5644839]
 second seq =>  [      1,    558] EXCISED REGION [    560,   2413]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5642984,5642984]
 second seq =>         1 nucs [559,559]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [5644077,5644077]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5642983,5642983] to [5642985,5642985]
 second seq =>         1 nucs [558,558] to [560,560]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5642426 GCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCT 5642485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCT 60

  5642486 CATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAA 5642545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAA 120

  5642546 AATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGT 5642605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGT 180

  5642606 AACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTG 5642665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTG 240

  5642666 GCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTC 5642725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTC 300

  5642726 AGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTAC 5642785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTAC 360

  5642786 TGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTAT 5642845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTAT 420

  5642846 TTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTT 5642905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTT 480

  5642906 GAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCA 5642965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCA 540

  5642966 TTTTTATGAATAGAAGAT 5642983
          ||||||||||||||||||
      541 TTTTTATGAATAGAAGAT 558

EXCISED REGION

  5642985 TTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTA 5643044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      560 TTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTA 619

  5643045 ACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCA 5643104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 ACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCA 679

  5643105 GTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTG 5643164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      680 GTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTG 739

  5643165 GCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTT 5643224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 GCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTT 799

  5643225 TGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATT 5643284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 TGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATT 859

  5643285 TGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAAC 5643344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 TGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAAC 919

  5643345 ACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATT 5643404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 ACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATT 979

  5643405 TTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGC 5643464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 TTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGC 1039

  5643465 ACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAA 5643524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 ACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAA 1099

  5643525 AAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTT 5643584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 AAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTT 1159

  5643585 TTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAAT 5643644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 TTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAAT 1219

  5643645 AAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGT 5643704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 AAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGT 1279

  5643705 ATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTA 5643764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 ATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTA 1339

  5643765 GTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATT 5643824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 GTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATT 1399

  5643825 TTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGA 5643884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 TTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGA 1459

  5643885 GCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCC 5643944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 GCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCC 1519

  5643945 TTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAA 5644004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 TTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAA 1579

  5644005 TCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTG 5644064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 TCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTG 1639

  5644065 CTATGGTTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGA 5644124
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 CTATGGTTTAAA-TTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGA 1698

  5644125 TTTTTAGTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTAT 5644184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 TTTTTAGTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTAT 1758

  5644185 ATCAGCCTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTA 5644244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 ATCAGCCTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTA 1818

  5644245 GAAAACCTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATT 5644304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 GAAAACCTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATT 1878

  5644305 GGAATCATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGG 5644364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 GGAATCATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGG 1938

  5644365 TGCATCCAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGC 5644424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 TGCATCCAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGC 1998

  5644425 AGTTTTTTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCA 5644484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 AGTTTTTTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCA 2058

  5644485 GCTAAAGAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCT 5644544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 GCTAAAGAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCT 2118

  5644545 TCTGAGTCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTT 5644604
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 TCTGAGTCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTT 2178

  5644605 GCTGAATATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACA 5644664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 GCTGAATATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACA 2238

  5644665 GGTATTTGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGT 5644724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 GGTATTTGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGT 2298

  5644725 AAACATTTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGG 5644784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 AAACATTTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGG 2358

  5644785 AGTGCAACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTT 5644839
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 AGTGCAACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTT 2413

Alignment time is 3.49806 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   7123] =>      7123 nucs 'mol-32-2fc2-008815_7123'

Score:        7055
Aligned:      7127        nucs
Identic:      7118 (100%) nucs =>      1967 (100%)      5151 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5639662,5641632] EXCISED REGION [5642811,5647965]
 second seq =>  [      1,   1967] EXCISED REGION [   1968,   7123]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1178 nucs [5641633,5642810]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5641633,5641633] to [5642811,5642811]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5639662 GGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTC 5639721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTC 60

  5639722 TCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATA 5639781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATA 120

  5639782 TGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGT 5639841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGT 180

  5639842 CTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTT 5639901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTT 240

  5639902 TGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTT 5639961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTT 300

  5639962 TGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATT 5640021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATT 360

  5640022 CACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTG 5640081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTG 420

  5640082 ATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTC 5640141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTC 480

  5640142 TTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAAT 5640201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAAT 540

  5640202 TTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGAC 5640261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGAC 600

  5640262 TTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTA 5640321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTA 660

  5640322 TAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTA 5640381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTA 720

  5640382 CACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTT 5640441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTT 780

  5640442 TGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATT 5640501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATT 840

  5640502 GGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAA 5640561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAA 900

  5640562 AATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTG 5640621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTG 960

  5640622 TGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATT 5640681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATT 1020

  5640682 ACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAG 5640741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAG 1080

  5640742 ATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAG 5640801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAG 1140

  5640802 CATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGA 5640861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGA 1200

  5640862 TATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTG 5640921
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTT----TTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTG 1256

  5640922 TGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGA 5640981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 TGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGA 1316

  5640982 GCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCT 5641041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 GCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCT 1376

  5641042 TGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTT 5641101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTT 1436

  5641102 TTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCA 5641161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 TTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCA 1496

  5641162 GCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTA 5641221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 GCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTA 1556

  5641222 CCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAT 5641281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 CCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAT 1616

  5641282 GGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCT 5641341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 GGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCT 1676

  5641342 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTA 5641401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTA 1736

  5641402 CTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATA 5641461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 CTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATA 1796

  5641462 TCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTC 5641521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 TCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTC 1856

  5641522 TCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTT 5641581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTT 1916

  5641582 TTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCT 5641632
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCT 1967

EXCISED REGION

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 2027

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 TCTCATACTACCCATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 2087

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 2147

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 2207

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 2267

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 2327

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 2387

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 2447

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 2507

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 2567

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 2627

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 2687

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 2747

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 2807

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 2867

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 2927

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 2987

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5643890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 3047

  5643891 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5643950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 3107

  5643951 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5644010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 3167

  5644011 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5644070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 3227

  5644071 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5644130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 3287

  5644131 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5644190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 3347

  5644191 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5644250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 3407

  5644251 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5644310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 3467

  5644311 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5644370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 3527

  5644371 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5644430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 3587

  5644431 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 3647

  5644491 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5644550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 3707

  5644551 TCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 5644610
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 TCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 3767

  5644611 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 5644670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 3827

  5644671 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 5644730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 3887

  5644731 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 5644790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 3947

  5644791 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 5644850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 4007

  5644851 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 5644910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 4067

  5644911 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 5644970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 4127

  5644971 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 5645030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 4187

  5645031 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 5645090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 4247

  5645091 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 5645150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4248 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 4307

  5645151 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 5645210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4308 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 4367

  5645211 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 5645270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 4427

  5645271 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 5645330
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 4487

  5645331 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 5645390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 4547

  5645391 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 5645450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4548 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 4607

  5645451 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 5645510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4608 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 4667

  5645511 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 5645570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4668 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 4727

  5645571 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 5645630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4728 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 4787

  5645631 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 5645690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4788 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 4847

  5645691 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 5645750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4848 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 4907

  5645751 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 5645810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4908 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 4967

  5645811 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 5645870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4968 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 5027

  5645871 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 5645930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5028 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 5087

  5645931 CATTTGGTTATTCTATAGG-TTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATG 5645989
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5088 CATTTGGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATG 5147

  5645990 TTAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCA 5646049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5148 TTAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCA 5207

  5646050 ATACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGA 5646109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5208 ATACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGA 5267

  5646110 TTGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGG 5646169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5268 TTGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGG 5327

  5646170 TTATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGT 5646229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5328 TTATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGT 5387

  5646230 GTCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGC 5646289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5388 GTCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGC 5447

  5646290 TTCATGTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCC 5646349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5448 TTCATGTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCC 5507

  5646350 ATGTAATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTAT 5646409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5508 ATGTAATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTAT 5567

  5646410 AAAATTCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGT 5646469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5568 AAAATTCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGT 5627

  5646470 GTAATGCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATG 5646529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5628 GTAATGCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATG 5687

  5646530 GCACAATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCA 5646589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5688 GCACAATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCA 5747

  5646590 ATAGGGTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAG 5646649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5748 ATAGGGTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAG 5807

  5646650 TACCCACTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTA 5646709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5808 TACCCACTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTA 5867

  5646710 TCCCCTCTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGGGTTACATTTTT 5646769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5868 TCCCCTCTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGGGTTACATTTTT 5927

  5646770 ACTCTCTTTGTAGTAGCCATTGATGCACAGCATTTTCAATTTTGATGAAGTCTGTCTTAC 5646829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5928 ACTCTCTTTGTAGTAGCCATTGATGCACAGCATTTTCAATTTTGATGAAGTCTGTCTTAC 5987

  5646830 CTATTTTTTTTTGTTGCCTGTGCTTTCAGTATCATATCCAAGAAATTGTTTTCAAATCCA 5646889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5988 CTATTTTTTTTTGTTGCCTGTGCTTTCAGTATCATATCCAAGAAATTGTTTTCAAATCCA 6047

  5646890 AAGTCATGAAGTTTTTGGCTTGTGTTTTCTTCTAAGAGTTTTATAGGGTGAGGTCTTCTG 5646949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6048 AAGTCATGAAGTTTTTGGCTTGTGTTTTCTTCTAAGAGTTTTATAGGGTGAGGTCTTCTG 6107

  5646950 TTTAGAGTTTTGATCACTTTGAGACAATTTTTGTATATAGTATAAGATAAGGGTCCAGCT 5647009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6108 TTTAGAGTTTTGATCACTTTGAGACAATTTTTGTATATAGTATAAGATAAGGGTCCAGCT 6167

  5647010 TTATTTTTTTACATGTGGATATCCAGTTTTCCCAGCACTGTTTGTTGAAAAGACTTTCTT 5647069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6168 TTATTTTTTTACATGTGGATATCCAGTTTTCCCAGCACTGTTTGTTGAAAAGACTTTCTT 6227

  5647070 TCCTTTTCCCCTTTGAATGGTCTAGGTAGCCTTGTGGAAAATAATTTGACTATTTATGCA 5647129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6228 TCCTTTTCCCCTTTGAATGGTCTAGGTAGCCTTGTGGAAAATAATTTGACTATTTATGCA 6287

  5647130 AGAGTGTATTTCTGGACTCTGTGTTTTATTCTGTTGGTCTATATGTGTATCCTTGTGCCA 5647189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6288 AGAGTGTATTTCTGGACTCTGTGTTTTATTCTGTTGGTCTATATGTGTATCCTTGTGCCA 6347

  5647190 GTACGACAGTATTTTGATTGCTGTAGTCTTCTAGTAAGTTTTGATGTCAGGAAATGTGAG 5647249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6348 GTACGACAGTATTTTGATTGCTGTAGTCTTCTAGTAAGTTTTGATGTCAGGAAATGTGAG 6407

  5647250 ACGTCCAACTTTGTTATTTTCAAGTTTGTTTTGTCTATTCGAGGTCTCTTGGGAATCCAT 5647309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6408 ACGTCCAACTTTGTTATTTTCAAGTTTGTTTTGTCTATTCGAGGTCTCTTGGGAATCCAT 6467

  5647310 ATGAATTTTAGGATGGATTTTTCTGTTTCTGCTAAAAATGCTGTTAGGATTTTGAAAGGA 5647369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6468 ATGAATTTTAGGATGGATTTTTCTGTTTCTGCTAAAAATGCTGTTAGGATTTTGAAAGGA 6527

  5647370 CTTACATTGACTATGTAGATTGCTTTGGGTAGTATTGACATCTTAACAATATTAAATTTT 5647429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6528 CTTACATTGACTATGTAGATTGCTTTGGGTAGTATTGACATCTTAACAGTATTAAATTTT 6587

  5647430 CTAATCCATGAACAGAGGATATCTTTTCATTTATTTGTGTCTAATTTCTTTCAGTGATAT 5647489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6588 CTAATCCATGAACAGAGGATATCTTTTCATTTATTTGTGTCTAATTTCTTTCAGTGATAT 6647

  5647490 TTTGCAGTTTTCACTGTAGAAGTCTTTTGCCTGCTTGGTTAGGTTTAGTCCTAAGTACTT 5647549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6648 TTTGCAGTTTTCACTGTAGAAGTCTTTTGCCTGCTTGGTTAGGTTTAGTCCTAAGTACTT 6707

  5647550 TATTCTTTTTGATGTTACGGTTTGCTGATTTTTCTGTGTTGATTTTGTATTCTGCAGTTT 5647609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6708 TATTCTTTTTGATGTTACGGTTTGCTGATTTTTCTGTGTTGATTTTGTATTCTGCAGTTT 6767

  5647610 TCCTGAATTCATTCATTCTAACAGGTTTGTTGTTGTTGTGGAATCTTTAGAGTCTTTACA 5647669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6768 TCCTGAATTCATTCATTCTAACAGGTTTGTTGTTGTTGTGGAATCTTTAGAGTCTTTACA 6827

  5647670 TATAAGATCATGTCATCTTCAAACATATAATTTTACTTATTCATTTCCAAGTTAGATTTA 5647729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6828 TATAAGATCATGTCATCTTCAAACATATAATTTTACTTATTCATTTCCAAGTTAGATTTA 6887

  5647730 TTTTATTTCATTTCCTTGCTGATTGCTCTGGCTAGGGCTTTAGGTATTACGTTGAATGGA 5647789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6888 TTTTATTTCATTTCCTTGCTGATTGCTCTGGCTAGGGCTTTAGGTATTACGTTGAATGGA 6947

  5647790 AGTGGTAAGAATGGGCATCTTTGTCTTAATTCTGACCTTTGAGGAAAAGCTTTCCATCTT 5647849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6948 AGTGGTAAGAATGGGCATCTTTGTCTTAATTCTGACCTTTGAGGAAAAGCTTTCCATCTT 7007

  5647850 TTCACCATTGAGTTTGATGCTGGTTACAAGTTGTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTGTT 5647909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7008 TTCACCATTGAGTTTGATGCTGGTTACAAGTTGTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTGTT 7067

  5647910 TGTTTTTTGTTTGTGTGTGTGGGGGTGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGG 5647965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7068 TGTTTTTTGTTTGTGTGTGTGGGGGTGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGG 7123

Alignment time is 8.97959 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   9732] =>      9732 nucs 'mol-32-2fe3-274422_9732'

Score:        9643
Aligned:      9731        nucs
Identic:      9723 (100%) nucs =>       203 (100%)      9520 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5634097,5634299] EXCISED REGION [5634301,5643828]
 second seq =>  [      1,    203] EXCISED REGION [    205,   9732]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5634300,5634300]
 second seq =>         1 nucs [204,204]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5634299,5634299] to [5634300,5634300]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5634097 TATGTGTGTGTGTTACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTT 5634156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGTGTGTGTGTTACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTT 60

  5634157 CTGTATCTTGGCTACTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTG 5634216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGTATCTTGGCTACTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTG 120

  5634217 AGATACTGATTTCAATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGG 5634276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGATACTGATTTCAATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGG 180

  5634277 TAGTCCTGTTTTTAGTTTGAGGA 5634299
          |||||||||||||||||||||||
      181 TAGTCCTGTTTTTAGTTTGAGGA 203

EXCISED REGION

  5634301 CTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAGTGTACAGGGAGGG 5634360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      205 CTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAGTGTACAGGGAGGG 264

  5634361 GATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTCTTGATAATAGATA 5634420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      265 GATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTCTTGATAATAGATA 324

  5634421 TCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTGATGATTAGTGTAT 5634480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 TCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTGATGATTAGTGTAT 384

  5634481 TGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCAGATCTCTTGTCCA 5634540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 TGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCAGATCTCTTGTCCA 444

  5634541 TTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTCGGTACTGAGTTGTATGAGTTCCTTA 5634600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      445 TTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTTGGTACTGAGTTGTATGAGTTCCTTA 504

  5634601 CATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTTTGCAGATATTTTCTCCTATTCC 5634660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 CATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTTTGCAGATATTTTCTCCTATTCC 564

  5634661 ATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTACTGTACAATAACTTAATTTCATG 5634720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 ATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTACTGTACAATAACTTAATTTCATG 624

  5634721 TAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGCTTTCCATGTCATCCAAAATACC 5634780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 TAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGCTTTCCATGTCATCCAAAATACC 684

  5634781 ATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTTTCTTCTAGGATTTGCATGGTTT 5634840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 ATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTTTCTTCTAGGATTTGCATGGTTT 744

  5634841 CAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATTTTAATTTTTGTGGGTACATAGT 5634900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 CAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATTTTAATTTTTGTGGGTACATAGT 804

  5634901 AGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTTGATACAGGACTATAGTCACCCTGTT 5634960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 AGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTTGATACAGGACTATAGTCACCCTGTT 864

  5634961 GTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATCACCATTATTATTTTGAGACAGGGTC 5635020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 GTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATCACCATTATTATTTTGAGACAGGGTC 924

  5635021 TCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGGCTTACTGCAGCCTCGACCTCTT 5635080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 TCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGGCTTACTGCAGCCTCGACCTCTT 984

  5635081 GGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAGCTGGGAGTACAGATGCATGCCA 5635140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 GGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAGCTGGGAGTACAGATGCATGCCA 1044

  5635141 CCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCA 5635200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 CCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCA 1104

  5635201 GACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTAAAGTGCTAGGATTACAAGCA 5635260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 GACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTAAAGTGCTAGGATTACAAGCA 1164

  5635261 TGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTTTTGTACCCATTAACCATCCT 5635320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 TGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTTTTGTACCCATTAACCATCCT 1224

  5635321 TCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTT 5635380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 TCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTT 1284

  5635381 CCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTT 5635440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 CCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTT 1344

  5635441 GCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGATTGACTATATATGCATGCGT 5635500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 GCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGATTGACTATATATGCATGCGT 1404

  5635501 GGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTA 5635560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 GGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTA 1464

  5635561 CCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTT 5635620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 CCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTT 1524

  5635621 GGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATCCTCATAATCCCCATGTATG 5635680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 GGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATCCTCATAATCCCCATGTATG 1584

  5635681 GAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCT 5635740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 GAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCT 1644

  5635741 TGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTAC 5635800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 TGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTAC 1704

  5635801 ACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCAT 5635860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 ACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCAT 1764

  5635861 GATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATCTATTCAACCTTTCT 5635920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 GATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATCTATTCAACCTTTCT 1824

  5635921 TTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGGACTAACACAC 5635980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 TTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGGACTAACACAC 1884

  5635981 AGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGG 5636040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 AGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGG 1944

  5636041 GCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTGTTTATGTGAAAATATCATTG 5636100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 GCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTGTTTATGTGAAAATATCATTG 2004

  5636101 AAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAA 5636160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 AAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAA 2064

  5636161 CAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTT 5636220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 CAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTT 2124

  5636221 CAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTT 5636280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 CAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTT 2184

  5636281 AGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGA 5636340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 AGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGA 2244

  5636341 CAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAG 5636400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 CAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAG 2304

  5636401 CCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAC 5636460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 CCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAC 2364

  5636461 AGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCA 5636520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 AGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCA 2424

  5636521 TGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAA 5636580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 TGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAA 2484

  5636581 AGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTT 5636640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 AGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTT 2544

  5636641 AGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATATTGATTTTATATCTT 5636700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 AGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATATTGATTTTATATCTT 2604

  5636701 GCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTA 5636760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 GCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTA 2664

  5636761 AATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTA 5636820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 AATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTA 2724

  5636821 TATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCAC 5636880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 TATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCAC 2784

  5636881 AGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATGTTTAATAAAC 5636940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 AGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATGTTTAATAAAC 2844

  5636941 ATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTT 5637000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 ATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTT 2904

  5637001 AAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATTTATGATTTTTTTGT 5637060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 AAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATTTATGATTTTTTTGT 2964

  5637061 TTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGC 5637120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 TTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGC 3024

  5637121 ACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCC 5637180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 ACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCC 3084

  5637181 TCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTG 5637240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 TCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTG 3144

  5637241 TAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGC 5637300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 TAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGC 3204

  5637301 TCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTAT 5637360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 TCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTAT 3264

  5637361 ACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAA 5637420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 ACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAA 3324

  5637421 TAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCA 5637480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 TAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCA 3384

  5637481 TAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCA 5637540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 TAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCA 3444

  5637541 AATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCC 5637600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 AATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCC 3504

  5637601 TATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATT 5637660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 TATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATT 3564

  5637661 AGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTC 5637720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 AGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTC 3624

  5637721 TCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAA 5637780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 TCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAA 3684

  5637781 ATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCATGT 5637840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 ATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCATGT 3744

  5637841 TTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTG 5637900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 TTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTG 3804

  5637901 AAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATAC 5637960
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 AAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATAC 3864

  5637961 TCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTC 5638020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 TCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTC 3924

  5638021 CTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCT 5638080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 CTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCT 3984

  5638081 TTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGT 5638140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 TTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGT 4044

  5638141 ATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACT 5638200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 ATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACT 4104

  5638201 TGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTG 5638260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 TGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTG 4164

  5638261 AGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGT 5638320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 AGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGT 4224

  5638321 CTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTC 5638380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 CTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTC 4284

  5638381 CCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTG 5638440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 CCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTG 4344

  5638441 TTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTAT 5638500
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 TTAGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTAT 4404

  5638501 TACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAAT 5638560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 TACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAAT 4464

  5638561 CTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGG 5638620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 CTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGG 4524

  5638621 CATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAA 5638680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 CATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAA 4584

  5638681 TATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAAT 5638740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 TATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAAT 4644

  5638741 TTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTT 5638800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 TTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTT 4704

  5638801 CATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTG 5638860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 CATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTG 4764

  5638861 TTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTT 5638920
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 TTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTT 4824

  5638921 CTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAA 5638980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 CTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAA 4884

  5638981 TCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCT 5639040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 TCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCT 4944

  5639041 AAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGAT 5639100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 AAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGAT 5004

  5639101 TTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGG 5639160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 TTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGG 5064

  5639161 CTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTAT 5639220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 CTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTAT 5124

  5639221 GGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAAC 5639280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5125 GGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAAC 5184

  5639281 TTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTA 5639340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5185 TTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTA 5244

  5639341 ATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATA 5639400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5245 ATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATA 5304

  5639401 TGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTT 5639460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5305 TGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTT 5364

  5639461 GATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCT 5639520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5365 GATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCT 5424

  5639521 TAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTC 5639580
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5425 TAAGTGATCTATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTC 5484

  5639581 TATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGT 5639640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5485 TATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGT 5544

  5639641 TGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTA 5639700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5545 TGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTA 5604

  5639701 TCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTG 5639760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5605 TCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTG 5664

  5639761 TGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCA 5639820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5665 TGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCA 5724

  5639821 GTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTT 5639880
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5725 GTTTATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTT 5784

  5639881 ATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTA 5639940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5785 ATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTA 5844

  5639941 TTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTG 5640000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5845 TTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTG 5904

  5640001 GATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCAT 5640060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5905 GATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCAT 5964

  5640061 TTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTG 5640120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5965 TTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTG 6024

  5640121 GTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTT 5640180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6025 GTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTT 6084

  5640181 TCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTT 5640240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6085 TCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTT 6144

  5640241 GATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCAC 5640300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6145 GATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCAC 6204

  5640301 GACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATT 5640360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6205 GACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATT 6264

  5640361 AAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCT 5640420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6265 AAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCT 6324

  5640421 CTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAA 5640480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6325 CTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAA 6384

  5640481 AAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTAC 5640540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6385 AAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTAC 6444

  5640541 ACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAG 5640600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6445 ACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAG 6504

  5640601 AATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTG 5640660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6505 AATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTG 6564

  5640661 TTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCA 5640720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6565 TTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCA 6624

  5640721 TTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCC 5640780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6625 TTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCC 6684

  5640781 AGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGC 5640840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6685 AGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGC 6744

  5640841 TTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTT 5640900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6745 TTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTT 6804

  5640901 GTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAG 5640960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6805 GTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAG 6864

  5640961 TCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTT 5641020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6865 TCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTT 6924

  5641021 TTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATG 5641080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6925 TTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATG 6984

  5641081 CCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTG 5641140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6985 CCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTG 7044

  5641141 GAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCT 5641200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7045 GAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCT 7104

  5641201 CCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATT 5641260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7105 CCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATT 7164

  5641261 TTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCT 5641320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7165 TTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCT 7224

  5641321 GACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACC 5641380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7225 GACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACC 7284

  5641381 GCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCT 5641440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7285 GCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCT 7344

  5641441 TCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTG 5641500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7345 TCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTG 7404

  5641501 AATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATA 5641560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7405 AATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATA 7464

  5641561 TTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTT 5641620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7465 TTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTT 7524

  5641621 GTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTC 5641680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7525 GTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTC 7584

  5641681 TGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATT 5641740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7585 TGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATT 7644

  5641741 TTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTG 5641800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7645 TTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTG 7704

  5641801 ATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAG 5641860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7705 ATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAG 7764

  5641861 CTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCC 5641920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7765 CTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCC 7824

  5641921 CTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCT 5641980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7825 CTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCT 7884

  5641981 TGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAG 5642040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7885 TGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAG 7944

  5642041 TCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTG 5642100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7945 TCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTG 8004

  5642101 GGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCT 5642160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8005 GGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCT 8064

  5642161 TGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTT 5642220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8065 TGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTT 8124

  5642221 ACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTG 5642280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8125 ACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTG 8184

  5642281 TTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGAC 5642340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8185 TTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGAC 8244

  5642341 CTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACC 5642400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8245 CTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACC 8304

  5642401 ACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGT 5642460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8305 ACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGT 8364

  5642461 TTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTG 5642520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8365 TTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTG 8424

  5642521 TCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTT 5642580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8425 TCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTT 8484

  5642581 GTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCAC 5642640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8485 GTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCAC 8544

  5642641 AGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCC 5642700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8545 AGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCC 8604

  5642701 TGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTAT 5642760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8605 TGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTAT 8664

  5642761 AGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAG 5642820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8665 AGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAG 8724

  5642821 TTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTA 5642880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8725 TTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTA 8784

  5642881 CCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTT 5642940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8785 CCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTT 8844

  5642941 TACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGAAGGAATACAA 5643000
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     8845 TACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATCTTATGAAGGAATACAA 8904

  5643001 TAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGG 5643060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8905 TAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGG 8964

  5643061 GGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGG 5643120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8965 GGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGG 9024

  5643121 GAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATG 5643180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9025 GAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATG 9084

  5643181 CCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCT 5643240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9085 CCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCT 9144

  5643241 TGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTT 5643300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9145 TGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTT 9204

  5643301 TCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAG 5643360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9205 TCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAG 9264

  5643361 GAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAG 5643420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9265 GAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAG 9324

  5643421 TAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGC 5643480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9325 TAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGC 9384

  5643481 CAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGC 5643540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9385 CAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGC 9444

  5643541 CAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTT 5643600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9445 CAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTT 9504

  5643601 AAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAG 5643660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9505 AAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAG 9564

  5643661 GAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCATCTA 5643720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9565 GAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCATCTA 9624

  5643721 AAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTT 5643780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9625 AAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTT 9684

  5643781 ATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGG 5643828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9685 ATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGG 9732

Alignment time is 11.9002 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   8935] =>      8935 nucs 'mol-32-2ff9-346602_8935'

Score:        8813
Aligned:      8940        nucs
Identic:      8926 (100%) nucs =>      4204 (100%)      4722 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5637419,5641632] EXCISED REGION [5642811,5647535]
 second seq =>  [      1,   4209] EXCISED REGION [   4210,   8935]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1178 nucs [5641633,5642810]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5641633,5641633] to [5642811,5642811]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5637419 AATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACT 5637478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACT 60

  5637479 CATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTAT 5637538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTAT 120

  5637539 CAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTT 5637598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTT 180

  5637599 CCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCA 5637658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCA 240

  5637659 TTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTC 5637718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTC 300

  5637719 TCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGT 5637778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGT 360

  5637779 AAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCAT 5637838
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      361 AAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTACAAGTACCAT 420

  5637839 GTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAG 5637898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAG 480

  5637899 TGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACAT 5637958
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACAT 540

  5637959 ACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGT 5638018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGT 600

  5638019 TCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATG 5638078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATG 660

  5638079 CTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGAT 5638138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGAT 720

  5638139 GTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCA 5638198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCA 780

  5638199 CTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGT 5638258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGT 840

  5638259 TGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGT 5638318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGT 900

  5638319 GTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTAC 5638378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTAC 960

  5638379 TCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTT 5638438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTT 1020

  5638439 TGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTT 5638498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTT 1080

  5638499 ATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCA 5638558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCA 1140

  5638559 ATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATT 5638618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATT 1200

  5638619 GGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGT 5638678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGT 1260

  5638679 AATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCA 5638738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCA 1320

  5638739 ATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTC 5638798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTC 1380

  5638799 TTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGT 5638858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGT 1440

  5638859 TGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTT 5638918
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTT 1500

  5638919 TTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGC 5638978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGC 1560

  5638979 AATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCC 5639038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCC 1620

  5639039 CTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGG 5639098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGG 1680

  5639099 ATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTC 5639158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTC 1740

  5639159 GGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTT 5639218
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATAAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTT 1800

  5639219 ATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATA 5639278
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGGTGTAGTACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATA 1860

  5639279 ACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCT 5639338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCT 1920

  5639339 TAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTA 5639398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTA 1980

  5639399 TATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGC 5639458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGC 2040

  5639459 TTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATC 5639518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATC 2100

  5639519 CTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGT 5639578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGT 2160

  5639579 TCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTT 5639638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTT 2220

  5639639 GTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGC 5639698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGC 2280

  5639699 TATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGG 5639758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGG 2340

  5639759 TGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCT 5639818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCT 2400

  5639819 CAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTAT 5639878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTAT 2460

  5639879 TTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCT 5639938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCT 2520

  5639939 TATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAG 5639998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAG 2580

  5639999 TGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCC 5640058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCC 2640

  5640059 ATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTC 5640118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTC 2700

  5640119 TGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGT 5640178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGT 2760

  5640179 TTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTT 5640238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTT 2820

  5640239 TTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTC 5640298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTC 2880

  5640299 ACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAA 5640358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAA 2940

  5640359 TTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCC 5640418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCC 3000

  5640419 CTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTG 5640478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTG 3060

  5640479 AAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTT 5640538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTT 3120

  5640539 ACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTAC 5640598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTAC 3180

  5640599 AGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTG 5640658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTG 3240

  5640659 TGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGT 5640718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGT 3300

  5640719 CATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGAT 5640778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGAT 3360

  5640779 CCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCAT 5640838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCAT 3420

  5640839 GCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTT 5640898
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||
     3421 GCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTT----TTT 3476

  5640899 TTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAG 5640958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 TTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAG 3536

  5640959 AGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCG 5641018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 AGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCG 3596

  5641019 TTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGA 5641078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 TTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGA 3656

  5641079 TGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGC 5641138
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     3657 TGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTT-GGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGC 3715

  5641139 TGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATT 5641198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 TGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATT 3775

  5641199 CTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAA 5641258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 CTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAA 3835

  5641259 TTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTC 5641318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 TTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTC 3895

  5641319 CTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCA 5641378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 CTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCA 3955

  5641379 CCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAAC 5641438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 CCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAAC 4015

  5641439 CTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTT 5641498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 CTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTT 4075

  5641499 TGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTA 5641558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 TGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTA 4135

  5641559 TATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTT 5641618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 TATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTT 4195

  5641619 TTGTGGTCTCCTCT 5641632
          ||||||||||||||
     4196 TTGTGGTCTCCTCT 4209

EXCISED REGION

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 4269

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 4329

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 4389

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 4449

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4450 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 4509

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 4569

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 4629

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4630 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 4689

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4690 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 4749

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4750 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 4809

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4810 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 4869

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4870 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 4929

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4930 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 4989

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4990 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5049

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5050 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5109

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5110 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5169

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5170 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5229

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5643890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5230 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5289

  5643891 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5643950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5290 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5349

  5643951 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5644010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5350 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5409

  5644011 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5644070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5410 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5469

  5644071 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5644130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5470 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5529

  5644131 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5644190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5530 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5589

  5644191 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5644250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5590 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5649

  5644251 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5644310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5650 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5709

  5644311 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5644370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5710 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5769

  5644371 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5644430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5770 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5829

  5644431 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5830 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5889

  5644491 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5644550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5890 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5949

  5644551 TCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 5644610
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5950 TCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 6009

  5644611 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 5644670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6010 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 6069

  5644671 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 5644730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6070 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 6129

  5644731 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 5644790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6130 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 6189

  5644791 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 5644850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6190 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 6249

  5644851 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 5644910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6250 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 6309

  5644911 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 5644970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6310 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 6369

  5644971 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 5645030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6370 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 6429

  5645031 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 5645090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6430 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 6489

  5645091 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 5645150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6490 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 6549

  5645151 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 5645210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6550 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 6609

  5645211 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 5645270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6610 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 6669

  5645271 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 5645330
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6670 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 6729

  5645331 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 5645390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6730 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 6789

  5645391 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 5645450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6790 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 6849

  5645451 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 5645510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6850 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 6909

  5645511 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 5645570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6910 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 6969

  5645571 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 5645630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6970 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 7029

  5645631 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 5645690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7030 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 7089

  5645691 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 5645750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7090 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 7149

  5645751 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 5645810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7150 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 7209

  5645811 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 5645870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7210 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 7269

  5645871 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 5645930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7270 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 7329

  5645931 CATTTGGTTATTCTATAGG-TTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATG 5645989
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7330 CATTTGGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATG 7389

  5645990 TTAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCA 5646049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7390 TTAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCA 7449

  5646050 ATACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGA 5646109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7450 ATACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGA 7509

  5646110 TTGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGG 5646169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7510 TTGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGG 7569

  5646170 TTATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGT 5646229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7570 TTATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGT 7629

  5646230 GTCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGC 5646289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7630 GTCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGC 7689

  5646290 TTCATGTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCC 5646349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7690 TTCATGTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCC 7749

  5646350 ATGTAATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTAT 5646409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7750 ATGTAATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTAT 7809

  5646410 AAAATTCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGT 5646469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7810 AAAATTCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGT 7869

  5646470 GTAATGCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATG 5646529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7870 GTAATGCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATG 7929

  5646530 GCACAATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCA 5646589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7930 GCACAATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCA 7989

  5646590 ATAGGGTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAG 5646649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7990 ATAGGGTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAG 8049

  5646650 TACCCACTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTA 5646709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8050 TACCCACTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTA 8109

  5646710 TCCCCTCTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGGGTTACATTTTT 5646769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8110 TCCCCTCTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGGGTTACATTTTT 8169

  5646770 ACTCTCTTTGTAGTAGCCATTGATGCACAGCATTTTCAATTTTGATGAAGTCTGTCTTAC 5646829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8170 ACTCTCTTTGTAGTAGCCATTGATGCACAGCATTTTCAATTTTGATGAAGTCTGTCTTAC 8229

  5646830 CTATTTTTTTTTGTTGCCTGTGCTTTCAGTATCATATCCAAGAAATTGTTTTCAAATCCA 5646889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8230 CTATTTTTTTTTGTTGCCTGTGCTTTCAGTATCATATCCAAGAAATTGTTTTCAAATCCA 8289

  5646890 AAGTCATGAAGTTTTTGGCTTGTGTTTTCTTCTAAGAGTTTTATAGGGTGAGGTCTTCTG 5646949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8290 AAGTCATGAAGTTTTTGGCTTGTGTTTTCTTCTAAGAGTTTTATAGGGTGAGGTCTTCTG 8349

  5646950 TTTAGAGTTTTGATCACTTTGAGACAATTTTTGTATATAGTATAAGATAAGGGTCCAGCT 5647009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8350 TTTAGAGTTTTGATCACTTTGAGACAATTTTTGTATATAGTATAAGATAAGGGTCCAGCT 8409

  5647010 TTATTTTTTTACATGTGGATATCCAGTTTTCCCAGCACTGTTTGTTGAAAAGACTTTCTT 5647069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8410 TTATTTTTTTACATGTGGATATCCAGTTTTCCCAGCACTGTTTGTTGAAAAGACTTTCTT 8469

  5647070 TCCTTTTCCCCTTTGAATGGTCTAGGTAGCCTTGTGGAAAATAATTTGACTATTTATGCA 5647129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8470 TCCTTTTCCCCTTTGAATGGTCTAGGTAGCCTTGTGGAAAATAATTTGACTATTTATGCA 8529

  5647130 AGAGTGTATTTCTGGACTCTGTGTTTTATTCTGTTGGTCTATATGTGTATCCTTGTGCCA 5647189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8530 AGAGTGTATTTCTGGACTCTGTGTTTTATTCTGTTGGTCTATATGTGTATCCTTGTGCCA 8589

  5647190 GTACGACAGTATTTTGATTGCTGTAGTCTTCTAGTAAGTTTTGATGTCAGGAAATGTGAG 5647249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8590 GTACGACAGTATTTTGATTGCTGTAGTCTTCTAGTAAGTTTTGATGTCAGGAAATGTGAG 8649

  5647250 ACGTCCAACTTTGTTATTTTCAAGTTTGTTTTGTCTATTCGAGGTCTCTTGGGAATCCAT 5647309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8650 ACGTCCAACTTTGTTATTTTCAAGTTTGTTTTGTCTATTCGAGGTCTCTTGGGAATCCAT 8709

  5647310 ATGAATTTTAGGATGGATTTTTCTGTTTCTGCTAAAAATGCTGTTAGGATTTTGAAAGGA 5647369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8710 ATGAATTTTAGGATGGATTTTTCTGTTTCTGCTAAAAATGCTGTTAGGATTTTGAAAGGA 8769

  5647370 CTTACATTGACTATGTAGATTGCTTTGGGTAGTATTGACATCTTAACAATATTAAATTTT 5647429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     8770 CTTACATTGACTATGTAGATTGCTTTGGGTAGTATTGACATCTTAACAGTATTAAATTTT 8829

  5647430 CTAATCCATGAACAGAGGATATCTTTTCATTTATTTGTGTCTAATTTCTTTCAGTGATAT 5647489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8830 CTAATCCATGAACAGAGGATATCTTTTCATTTATTTGTGTCTAATTTCTTTCAGTGATAT 8889

  5647490 TTTGCAGTTTTCACTGTAGAAGTCTTTTGCCTGCTTGGTTAGGTTT 5647535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8890 TTTGCAGTTTTCACTGTAGAAGTCTTTTGCCTGCTTGGTTAGGTTT 8935

Alignment time is 10.9083 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   4210] =>      4210 nucs 'mol-32-2ff9-346602_4210'

Score:        4145
Aligned:      4211        nucs
Identic:      4205 (100%) nucs =>      3461 (100%)       744 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5637419,5640884] EXCISED REGION [5640889,5641633]
 second seq =>  [      1,   3466] EXCISED REGION [   3467,   4210]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [5640885,5640888]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [5640885,5640891] to [5640889,5640895]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5640884,5640884] to [5640889,5640889]
 second seq =>         1 nucs [3466,3466] to [3467,3467]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5637419 AATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACT 5637478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACT 60

  5637479 CATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTAT 5637538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTAT 120

  5637539 CAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTT 5637598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTT 180

  5637599 CCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCA 5637658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCA 240

  5637659 TTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTC 5637718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTC 300

  5637719 TCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGT 5637778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGT 360

  5637779 AAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCAT 5637838
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      361 AAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTACAAGTACCAT 420

  5637839 GTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAG 5637898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAG 480

  5637899 TGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACAT 5637958
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACAT 540

  5637959 ACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGT 5638018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGT 600

  5638019 TCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATG 5638078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATG 660

  5638079 CTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGAT 5638138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGAT 720

  5638139 GTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCA 5638198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCA 780

  5638199 CTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGT 5638258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGT 840

  5638259 TGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGT 5638318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGT 900

  5638319 GTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTAC 5638378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTAC 960

  5638379 TCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTT 5638438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTT 1020

  5638439 TGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTT 5638498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTT 1080

  5638499 ATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCA 5638558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCA 1140

  5638559 ATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATT 5638618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATT 1200

  5638619 GGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGT 5638678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGT 1260

  5638679 AATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCA 5638738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCA 1320

  5638739 ATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTC 5638798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTC 1380

  5638799 TTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGT 5638858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGT 1440

  5638859 TGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTT 5638918
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTT 1500

  5638919 TTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGC 5638978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGC 1560

  5638979 AATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCC 5639038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCC 1620

  5639039 CTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGG 5639098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGG 1680

  5639099 ATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTC 5639158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTC 1740

  5639159 GGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTT 5639218
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATAAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTT 1800

  5639219 ATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATA 5639278
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGGTGTAGTACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATA 1860

  5639279 ACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCT 5639338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCT 1920

  5639339 TAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTA 5639398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTA 1980

  5639399 TATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGC 5639458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGC 2040

  5639459 TTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATC 5639518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATC 2100

  5639519 CTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGT 5639578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGT 2160

  5639579 TCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTT 5639638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTT 2220

  5639639 GTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGC 5639698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGC 2280

  5639699 TATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGG 5639758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGG 2340

  5639759 TGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCT 5639818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCT 2400

  5639819 CAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTAT 5639878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTAT 2460

  5639879 TTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCT 5639938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCT 2520

  5639939 TATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAG 5639998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAG 2580

  5639999 TGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCC 5640058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCC 2640

  5640059 ATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTC 5640118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTC 2700

  5640119 TGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGT 5640178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGT 2760

  5640179 TTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTT 5640238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTT 2820

  5640239 TTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTC 5640298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTC 2880

  5640299 ACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAA 5640358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAA 2940

  5640359 TTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCC 5640418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCC 3000

  5640419 CTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTG 5640478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTG 3060

  5640479 AAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTT 5640538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTT 3120

  5640539 ACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTAC 5640598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTAC 3180

  5640599 AGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTG 5640658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTG 3240

  5640659 TGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGT 5640718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGT 3300

  5640719 CATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGAT 5640778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGAT 3360

  5640779 CCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCAT 5640838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCAT 3420

  5640839 GCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCT 5640884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCT 3466

EXCISED REGION

  5640889 TTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATT 5640948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 TTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATT 3526

  5640949 TTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTT 5641008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 TTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTT 3586

  5641009 TCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTT 5641068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 TCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTT 3646

  5641069 TGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTG 5641128
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 TGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTC-TTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTG 3705

  5641129 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGT 5641188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGT 3765

  5641189 TCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCAC 5641248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 TCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCAC 3825

  5641249 ACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGG 5641308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 ACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGG 3885

  5641309 TCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 5641368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 TCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 3945

  5641369 GCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGC 5641428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 GCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGC 4005

  5641429 GTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCT 5641488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 GTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCT 4065

  5641489 CTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCA 5641548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 CTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCA 4125

  5641549 ATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATT 5641608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 ATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATT 4185

  5641609 CTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTG 5641633
          |||||||||||||||||||||||||
     4186 CTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTG 4210

Alignment time is 5.48207 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   9569] =>      9569 nucs 'mol-32-3004-135247_9569'

Score:        9414
Aligned:      9574        nucs
Identic:      9557 (100%) nucs =>      7386 (100%)      2171 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5634231,5641632] EXCISED REGION [5642811,5644982]
 second seq =>  [      1,   7397] EXCISED REGION [   7398,   9569]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1178 nucs [5641633,5642810]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5641633,5641633] to [5642811,5642811]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5634231 ATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTTTTA 5634290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTTTTA 60

  5634291 GTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAGTGT 5634350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAGTGT 120

  5634351 ACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTCTTG 5634410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTCTTG 180

  5634411 ATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTGATG 5634470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTGATG 240

  5634471 ATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCAGAT 5634530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCAGAT 300

  5634531 CTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTCGGTACTGAGTTGTAT 5634590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      301 CTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTTGGTACTGAGTTGTAT 360

  5634591 GAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTTTGCAGATATTTT 5634650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTTTGCAGATATTTT 420

  5634651 CTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTACTGTACAATAACT 5634710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTACTGTACAATAACT 480

  5634711 TAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGCTTTCCATGTCAT 5634770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGCTTTCCATGTCAT 540

  5634771 CCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTTTCTTCTAGGATT 5634830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTTTCTTCTAGGATT 600

  5634831 TGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATTTTAATTTTTGTG 5634890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATTTTAATTTTTGTG 660

  5634891 GGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTTGATACAGGACTATAG 5634950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTTGATACAGGACTATAG 720

  5634951 TCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATCACCATTATTATTTTG 5635010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATCACCATTATTATTTTG 780

  5635011 AGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGGCTTACTGCAGCC 5635070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGGCTTACTGCAGCC 840

  5635071 TCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAGCTGGGAGTACAG 5635130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAGCTGGGAGTACAG 900

  5635131 ATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGCTGTGTTGCCCAG 5635190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGCTGTGTTGCCCAG 960

  5635191 GCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTAAAGTGCTAGG 5635250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTAAAGTGCTAGG 1020

  5635251 ATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTTTTGTACCCAT 5635310
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTACAAGCATGGGCCGCCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTTTTGTACCCAT 1080

  5635311 TAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGTGTAAGATAAG 5635370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGTGTAAGATAAG 1140

  5635371 GGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATGGTGTTGAAA 5635430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATGGTGTTGAAA 1200

  5635431 AGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGATTGACTATAT 5635490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGATTGACTATAT 1260

  5635491 ATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGTATCTCTTTT 5635550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGTATCTCTTTT 1320

  5635551 TATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGAAATCAGGTT 5635610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGAAATCAGGTT 1380

  5635611 GATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATCCTCATAATC 5635670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATCCTCATAATC 1440

  5635671 CCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGAGTTTTCCTC 5635730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGAGTTTTCCTC 1500

  5635731 ATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTGACTG 5635790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTGACTG 1560

  5635791 TTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCC 5635850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCC 1620

  5635851 CTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATCTATT 5635910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATCTATT 1680

  5635911 CAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGG 5635970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGG 1740

  5635971 ACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGG 5636030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGG 1800

  5636031 CTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTGTTTATGTGAA 5636090
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1801 CTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTATTTATGTGAA 1860

  5636091 AATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAGTAGG 5636150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAGTAGG 1920

  5636151 GACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTTATTT 5636210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTTATTT 1980

  5636211 GTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATT 5636270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATT 2040

  5636271 CTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGT 5636330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGT 2100

  5636331 TTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAA 5636390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAA 2160

  5636391 CTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAG 5636450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAG 2220

  5636451 CTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAG 5636510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAG 2280

  5636511 GGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTC 5636570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTC 2340

  5636571 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCATGTTTTCTTAA 5636630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2341 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCATGTTTTCTTAA 2400

  5636631 TTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATATTGAT 5636690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATATTGAT 2460

  5636691 TTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTA 5636750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTA 2520

  5636751 GGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAAC 5636810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAAC 2580

  5636811 TACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAGATTATAAGTT 5636870
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2581 TACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCCCCAGCTAGATTATAAGTT 2640

  5636871 TCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATG 5636930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATG 2700

  5636931 TTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTGTGGCACAGCA 5636990
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2701 TTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACATGTGGCACAGCA 2760

  5636991 ATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATTTATG 5637050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATTTATG 2820

  5637051 ATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGA 5637110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGA 2880

  5637111 GTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCC 5637170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCC 2940

  5637171 TGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTT 5637230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTT 3000

  5637231 TTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGA 5637290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGA 3060

  5637291 ACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 5637350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 3120

  5637351 GAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGT 5637410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGT 3180

  5637411 TCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCA 5637470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCA 3240

  5637471 TATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGT 5637530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGT 3300

  5637531 TGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCA 5637590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCA 3360

  5637591 CCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTT 5637650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTT 3420

  5637651 TATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGA 5637710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGA 3480

  5637711 TGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCAT 5637770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCAT 3540

  5637771 GTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCA 5637830
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3541 GTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTACA 3600

  5637831 AGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAAT 5637890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAAT 3660

  5637891 AACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGT 5637950
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3661 AACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGT 3720

  5637951 TTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTG 5638010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTG 3780

  5638011 AGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTT 5638070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTT 3840

  5638071 ATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTT 5638130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTT 3900

  5638131 GATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAAT 5638190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAAT 3960

  5638191 AAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTG 5638250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTG 4020

  5638251 TATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTT 5638310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTT 4080

  5638311 ATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTT 5638370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTT 4140

  5638371 AGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTT 5638430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTT 4200

  5638431 TAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGA 5638490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGA 4260

  5638491 GACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTC 5638550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTC 4320

  5638551 ATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCC 5638610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCC 4380

  5638611 AGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTA 5638670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTA 4440

  5638671 TCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAG 5638730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAG 4500

  5638731 GTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCA 5638790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCA 4560

  5638791 TTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAA 5638850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAA 4620

  5638851 TTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATT 5638910
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATT 4680

  5638911 TGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGC 5638970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGC 4740

  5638971 AGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACC 5639030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACC 4800

  5639031 TCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTA 5639090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTA 4860

  5639091 GAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTG 5639150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTG 4920

  5639151 CCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTT 5639210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4921 CCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATAAGCCACTATACCCGGCCATTTTT 4980

  5639211 CTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGT 5639270
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CTTCTTTTATGGTGTAGTACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGT 5040

  5639271 CTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGT 5639330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGT 5100

  5639331 TTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCA 5639390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCA 5160

  5639391 AGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGA 5639450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGA 5220

  5639451 GAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATAT 5639510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATAT 5280

  5639511 GAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGA 5639570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGA 5340

  5639571 TGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGAT 5639630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGAT 5400

  5639631 GTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAG 5639690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAG 5460

  5639691 TCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTA 5639750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTA 5520

  5639751 TATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGAC 5639810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGAC 5580

  5639811 TCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTT 5639870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTT 5640

  5639871 GTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTT 5639930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTT 5700

  5639931 CATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAA 5639990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 CATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAA 5760

  5639991 CAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAG 5640050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAG 5820

  5640051 TTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATAT 5640110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATAT 5880

  5640111 ATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTG 5640170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 ATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTG 5940

  5640171 AAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGT 5640230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 AAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGT 6000

  5640231 TGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATT 5640290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATT 6060

  5640291 TTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTA 5640350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTA 6120

  5640351 AAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAA 5640410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 AAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAA 6180

  5640411 CTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACT 5640470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 CTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACT 6240

  5640471 ATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAG 5640530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 ATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAG 6300

  5640531 AGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTT 5640590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 AGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTT 6360

  5640591 GAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATA 5640650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 GAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATA 6420

  5640651 CTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTC 5640710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 CTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTC 6480

  5640711 TTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGA 5640770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 TTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGA 6540

  5640771 GGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTC 5640830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 GGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTC 6600

  5640831 TCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTT 5640890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTT 6660

  5640891 TGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTT 5640950
          |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 T----TTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTT 6716

  5640951 TACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTC 5641010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 TACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTC 6776

  5641011 TCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTG 5641070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 TCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTG 6836

  5641071 TTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTC 5641130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     6837 TTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTT-GGACGGGGTCTTGCTCTGTC 6895

  5641131 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTC 5641190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6896 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTC 6955

  5641191 ACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACAC 5641250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6956 ACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACAC 7015

  5641251 CCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTC 5641310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7016 CCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTC 7075

  5641311 TCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 5641370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7076 TCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 7135

  5641371 ATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGT 5641430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7136 ATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGT 7195

  5641431 TCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCT 5641490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7196 TCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCT 7255

  5641491 TATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAAT 5641550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7256 TATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAAT 7315

  5641551 ACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCT 5641610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7316 ACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCT 7375

  5641611 TTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCT 5641632
          ||||||||||||||||||||||
     7376 TTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCT 7397

EXCISED REGION

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7398 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 7457

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7458 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 7517

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7518 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 7577

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7578 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 7637

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7638 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 7697

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7698 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 7757

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7758 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 7817

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7818 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 7877

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7878 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 7937

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7938 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 7997

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7998 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 8057

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8058 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 8117

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8118 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 8177

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8178 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 8237

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8238 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 8297

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8298 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 8357

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8358 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 8417

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5643890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8418 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 8477

  5643891 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5643950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8478 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 8537

  5643951 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5644010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8538 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 8597

  5644011 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5644070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8598 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 8657

  5644071 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5644130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8658 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 8717

  5644131 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5644190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8718 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 8777

  5644191 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5644250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8778 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 8837

  5644251 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5644310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8838 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 8897

  5644311 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5644370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8898 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 8957

  5644371 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5644430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8958 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 9017

  5644431 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9018 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 9077

  5644491 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5644550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9078 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 9137

  5644551 TCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 5644610
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9138 TCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 9197

  5644611 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 5644670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9198 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 9257

  5644671 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 5644730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9258 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 9317

  5644731 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 5644790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9318 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 9377

  5644791 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 5644850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9378 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 9437

  5644851 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 5644910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9438 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 9497

  5644911 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 5644970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9498 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 9557

  5644971 TAAAAAATGTTT 5644982
          ||||||||||||
     9558 TAAAAAATGTTT 9569

Alignment time is 11.8133 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   2172] =>      2172 nucs 'mol-32-3004-135247_2172'

Score:        2171
Aligned:      2171        nucs
Identic:      2171 (100%) nucs =>      1744 (100%)       427 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5642811,5644554] EXCISED REGION [5644556,5644982]
 second seq =>  [      1,   1744] EXCISED REGION [   1746,   2172]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5644555,5644555]
 second seq =>         1 nucs [1745,1745]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5644554,5644554] to [5644555,5644555]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 60

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 120

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 180

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 240

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 300

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 360

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 420

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 480

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 540

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 600

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 660

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 720

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 780

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 840

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 900

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 960

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 1020

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5643890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 1080

  5643891 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5643950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 1140

  5643951 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5644010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 1200

  5644011 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5644070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 1260

  5644071 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5644130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 1320

  5644131 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5644190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 1380

  5644191 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5644250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 1440

  5644251 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5644310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 1500

  5644311 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5644370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 1560

  5644371 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5644430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 1620

  5644431 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 1680

  5644491 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5644550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 1740

  5644551 TCTG 5644554
          ||||
     1741 TCTG 1744

EXCISED REGION

  5644556 TATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAATATTT 5644615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 TATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAATATTT 1805

  5644616 TTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATTTGAGT 5644675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATTTGAGT 1865

  5644676 CATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACATTTGTA 5644735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACATTTGTA 1925

  5644736 TACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCAACTAC 5644795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCAACTAC 1985

  5644796 TAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGTGACTG 5644855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGTGACTG 2045

  5644856 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 5644915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 2105

  5644916 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 5644975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 2165

  5644976 AATGTTT 5644982
          |||||||
     2166 AATGTTT 2172

Alignment time is 3.00736 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,  11529] =>     11529 nucs 'mol-32-300f-149438_11529'

Score:       11398
Aligned:     11530        nucs
Identic:     11518 (100%) nucs =>       439 (100%)     11079 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5631691,5632129] EXCISED REGION [5632131,5643221]
 second seq =>  [      1,    439] EXCISED REGION [    441,  11529]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5632130,5632130]
 second seq =>         1 nucs [440,440]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [5637227,5637227]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5632129,5632129] to [5632131,5632131]
 second seq =>         1 nucs [439,439] to [441,441]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5631691 AAAAAAAAAAAAAAAATCAAATATTGAACCAAGTGATTATAAGGTGTATGATTACATGCC 5631750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAAAAAAAAAAATCAAATATTGAACCAAGTGATTATAAGGTGTATGATTACATGCC 60

  5631751 TAGGTGAGTGGGATACATATGCTAGACTCCAGCTTCCAATCTTCTCTTCCTGGGATATGC 5631810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGGTGAGTGGGATACATATGCTAGACTCCAGCTTCCAATCTTCTCTTCCTGGGATATGC 120

  5631811 CCTTTCTTACTCTGTATGAAAGTTTTCATTTTGATTTTCTAATTTGTAAACTTCCTGAAA 5631870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTTTCTTACTCTGTATGAAAGTTTTCATTTTGATTTTCTAATTTGTAAACTTCCTGAAA 180

  5631871 GTATGTAAGTTAATTAGGTTAACAAACTTCATTTAAAAGTGAAAATGCCTTTAGGTAAAT 5631930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTATGTAAGTTAATTAGGTTAACAAACTTCATTTAAAAGTGAAAATGCCTTTAGGTAAAT 240

  5631931 TAAAGGGCTATCAGTTATACTTCCATAATTTAGAGTGAATTGGTTTAAAAAGTTCTCATG 5631990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAAGGGCTATCAGTTATACTTCCATAATTTAGAGTGAATTGGTTTAAAAAGTTCTCATG 300

  5631991 GAGCTGCTAAAAGCTTTGATTTTTGAGAGGCTGTAGATACAAGTAGTTTTATAATAATAT 5632050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGCTGCTAAAAGCTTTGATTTTTGAGAGGCTGTAGATACAAGTAGTTTTATAATAATAT 360

  5632051 GTGAAGATCTACAGGATTTTACAGAGTTGAAGTCTTACAGCTGCTTGAGGGCATTTGAAG 5632110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGAAGATCTACAGGATTTTACAGAGTTGAAGTCTTACAGCTGCTTGAGGGCATTTGAAG 420

  5632111 GCAGGGAGACATGCTCGTA 5632129
          |||||||||||||||||||
      421 GCAGGGAGACATGCTCGTA 439

EXCISED REGION

  5632131 AGATGATAAAACAAGATTTGCTTACCTGAAATTTTGTTAGGGCTCACTTAGTAAATCAGG 5632190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      441 AGATGATAAAACAAGATTTGCTTACCTGAAATTTTGTTAGGGCTCACTTAGTAAATCAGG 500

  5632191 CTCTCTTAGGAGTGATATATTTTAAAAAGAGACAACTAGCCTTGTGGAAGGGACAGTCGT 5632250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      501 CTCTCTTAGGAGTGATATATTTTAAAAAGAGACAACTAGCCTTGTGGAAGGGACAGTCGT 560

  5632251 TTAGTAGTCTAAGCTGGTTGTTTCAATGTTCAAAAGAATTGTGGAAATTGTATGTGTACA 5632310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      561 TTAGTAGTCTAAGCTGGTTGTTTCAATGTTCAAAAGAATTGTGGAAATTGTATGTGTACA 620

  5632311 GTGATAATTCATAAGACTGAATCTCTATTAAAATCTCTAACTGTACATTATATGGGTCTT 5632370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      621 GTGATAATTCATAAGACTGAATCTCTATTAAAATCTCTAACTGTACATTATATGGGTCTT 680

  5632371 CTAATGAACTTTTATGTACTACTTATACCTACTGTCCTCTATTCTAAGTAGGTATTCGGA 5632430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      681 CTAATGAACTTTTATGTACTACTTATACCTACTGTCCTCTATTCTAAGTAGGTATTCGGA 740

  5632431 ATTCCACTGTTTAGACTCATATCTCTTCAGAATTATTTCCTACCCCAAATTTGAGAAATA 5632490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      741 ATTCCACTGTTTAGACTCATATCTCTTCAGAATTATTTCCTACCCCAAATTTGAGAAATA 800

  5632491 CAGTATAGTGTTGTTTATGAACAAAAGAGCCTCTAGATAGTTACTTAGCTTTTTTATATT 5632550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      801 CAGTATAGTGTTGTTTATGAACAAAAGAGCCTCTAGATAGTTACTTAGCTTTTTTATATT 860

  5632551 GGAGCCCCAATATTATATTTTGGAGCCCCCCAAATGGTGTTAAAAAAAGGCTCAGTATGT 5632610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 GGAGCCCCAATATTATATTTTGGAGCCCCCCAAATGGTGTTAAAAAAAGGCTCAGTATGT 920

  5632611 GTAGGCTAGATTGGGGTGGTAGAGGTAGAACTTGACTGGGGGCAGTTGGTACATTTCTGC 5632670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      921 GTAGGCTAGATTGGGGTGGTAGAGGTAGAACTTGACTGGGGGCAGTTGGTACATTTCTGC 980

  5632671 TAAGGTTATTGTAAAAGGACTAGTTTCAGCTTTGAGGATGAAACTGTTGCATAAGGTAGG 5632730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      981 TAAGGTTATTGTAAAAGGACTAGTTTCAGCTTTGAGGATGAAACTGTTGCGTAAGGTAGG 1040

  5632731 TTATGATTTATGATTGACGTAGGTGTAGTGTGAGATGAATTACATTTTGTACTGTACTGA 5632790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1041 TTATGATTTATGATTGACGTAGGTGTAGTGTGAGATGAATTACATTTTGTACTGTACTGA 1100

  5632791 GGGCCCAGAATTATTCCTTTAATATACTAACTGTGACTATGAAAGTCTATATATGTGAAC 5632850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1101 GGGCCCAGAATTATTCCTTTAATATACTAACTGTGACTATGAAAGTCTATATATGTGAAC 1160

  5632851 ATCAGAATGGTATCTTTGAATTTAGCCATTCTAAATTAGATGTATAGACATTCTCGTTTT 5632910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1161 ATCAGAATGGTATCTTTGAATTTAGCCATTCTAAATTAGATGTATAGACATTCTCGTTTT 1220

  5632911 TCAGGTCACCGACTTTAAACATTTAAATTAGCTTCAGAAGTATTTTTGAACATCAACTGT 5632970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1221 TCAGGTCACCGACTTTAAACATTTAAATTAGCTTCAGAAGTATTTTTGAACATCAACTGT 1280

  5632971 AAAAGACAGATGTGTATAAAAGGGATGAAGAGACATGTTATATGTTAGTGTGTTAGATGT 5633030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1281 AAAAGACAGATGTGTATAAAAGGGATGAAGAGACATGTTATATGTTAGTGTGTTAGATGT 1340

  5633031 TAGTGTGTTAATATAAATCTTGTGAGATATCACTGTTGTAGGTAGCTAATAAAAAGCTGA 5633090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1341 TAGTGTGTTAATATAAATCTTGTGAGATATCACTGTTGTAGGTAGCTAATAAAAAGCTGA 1400

  5633091 AATGGGCAAATAATTACTAGGCTTATAAAATAAATTATATGTCGTTTAGTAATCCTGAGC 5633150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1401 AATGGGCAAATAATTACTAGGCTTATAAAATAAATTATATGTCGTTTAGTAATCCTGAGC 1460

  5633151 AAAAACTTAGTTCCCATTGGTATGTGCTAATCATGGAAAAAAACAATGATATGTCAAAAG 5633210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1461 AAAAACTTAGTTCCCATTGGTATGTGCTAATCATGGAAAAAAACAATGATATGTCAAAAG 1520

  5633211 AACCAAGCTTTGGATCAGGTATGTGATTAACTGTGTTGACCTCAGGAAGACCATTTTATT 5633270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1521 AACCAAGCTTTGGATCAGGTATGTGATTAACTGTGTTGACCTCAGGAAGACCATTTTATT 1580

  5633271 TGTATTTTCCCAGCATTCCCATTTCTCACCCTTTTAACTCTATTACTTTCTCCAGAGAGC 5633330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1581 TGTATTTTCCCAGCATTCCCATTTCTCACCCTTTTAACTCTATTACTTTCTCCAGAGAGC 1640

  5633331 CTTCTTTATAAATTCACTGCTCTGAAGTCTTCTAGGGTTCACTGTTGATGAAAGAATGGA 5633390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1641 CTTCTTTATAAATTCACTGCTCTGAAGTCTTCTAGGGTTCACTGTTGATGAAAGAATGGA 1700

  5633391 GTTCAAACTCCTTAGTTTGATATCACAGACACTCCCTTCTTGGAATGCTCTCTTGCCTCA 5633450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1701 GTTCAAACTCCTTAGTTTGATATCACAGACACTCCCTTCTTGGAATGCTCTCTTGCCTCA 1760

  5633451 TTTCTGCCTGTCAGAGTATTATCTATCCTTTAACTGCTGTTGAAATCCTTTCTTTATGAG 5633510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1761 TTTCTGCCTGTCAGAGTATTATCTATCCTTTAACTGCTGTTGAAATCCTTTCTTTATGAG 1820

  5633511 TCATTCTTTACCTACCGTAACCATAAGTGTTCATTTTTCTGATGAACTACTGCTTCCCCA 5633570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1821 TCATTCTTTACCTACCGTAACCATAAGTGTTCATTTTTCTGATGAACTACTGCTTCCCCA 1880

  5633571 CTACTGCCAGCTTTGTTGAGGTATAATTGACAAATAAAAATTGTATATATTTAAGGTGTG 5633630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1881 CTACTGCCAGCTTTGTTGAGGTATAATTGACAAATAAAAATTGTATATATTTAAGGTGTG 1940

  5633631 CTGTGCGATACTTAGATCTACCCTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTCTAATTAACAGAT 5633690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 CTGTGCGATACTTAGATCTACCCTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTCTAATTAACAGAT 2000

  5633691 CCACCATCTCACACAGCTCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACACTTAAGACCTAC 5633750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 CCACCATCTCACACAGCTCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACACTTAAGACCTAC 2060

  5633751 TCTCTTAGCAAATTTCAAGTATACAATATATGTTAATTATGGAAATAAATGTCATTATTA 5633810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 TCTCTTAGCAAATTTCAAGTATACAATATATGTTAATTATGGAAATAAATGTCATTATTA 2120

  5633811 ACGATAGTTACTGGGCCATGCATTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTTATACCTGAAAAT 5633870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 ACGATAGTTACTGGGCCATGCATTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTTATACCTGAAAAT 2180

  5633871 TTGTACCTTTGACTGAAATACTCCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCTGGTAATCATCGT 5633930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 TTGTACCTTTGACTGAAATACTCCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCTGGTAATCATCGT 2240

  5633931 TCTATTCTCTGTTCCTATGAATTTGACGTCTTTATATTCCATATATGAGATCATGAAGTT 5633990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 TCTATTCTCTGTTCCTATGAATTTGACGTCTTTATATTCCATATATGAGATCATGAAGTT 2300

  5633991 GTTTTTTGTCTTGCTTACTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATGTTGTTGCAGATG 5634050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 GTTTTTTGTCTTGCTTACTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATGTTGTTGCAGATG 2360

  5634051 GCAGGATTTCCTTGTTTTTTAAAGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTATGTGTGTGTGTT 5634110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 GCAGGATTTCCTTGTTTTTTAAAGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTATGTGTGTGTGTT 2420

  5634111 ACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCTGTATCTTGGCTA 5634170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 ACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCTGTATCTTGGCTA 2480

  5634171 CTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATACTGATTTCA 5634230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 CTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATACTGATTTCA 2540

  5634231 ATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTTTTA 5634290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 ATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTTTTA 2600

  5634291 GTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAGTGT 5634350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 GTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAGTGT 2660

  5634351 ACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTCTTG 5634410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 ACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTCTTG 2720

  5634411 ATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTGATG 5634470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 ATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTGATG 2780

  5634471 ATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCAGAT 5634530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 ATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCAGAT 2840

  5634531 CTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTCGGTACTGAGTTGTAT 5634590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2841 CTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTTGGTACTGAGTTGTAT 2900

  5634591 GAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTTTGCAGATATTTT 5634650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 GAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTTTGCAGATATTTT 2960

  5634651 CTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTACTGTACAATAACT 5634710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 CTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTACTGTACAATAACT 3020

  5634711 TAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGCTTTCCATGTCAT 5634770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 TAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGCTTTCCATGTCAT 3080

  5634771 CCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTTTCTTCTAGGATT 5634830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 CCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTTTCTTCTAGGATT 3140

  5634831 TGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATTTTAATTTTTGTG 5634890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 TGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATTTTAATTTTTGTG 3200

  5634891 GGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTTGATACAGGACTATAG 5634950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 GGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTTGATACAGGACTATAG 3260

  5634951 TCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATCACCATTATTATTTTG 5635010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 TCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATCACCATTATTATTTTG 3320

  5635011 AGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGGCTTACTGCAGCC 5635070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 AGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGGCTTACTGCAGCC 3380

  5635071 TCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAGCTGGGAGTACAG 5635130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 TCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAGCTGGGAGTACAG 3440

  5635131 ATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGCTGTGTTGCCCAG 5635190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 ATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGCTGTGTTGCCCAG 3500

  5635191 GCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTAAAGTGCTAGG 5635250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 GCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTAAAGTGCTAGG 3560

  5635251 ATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTTTTGTACCCAT 5635310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 ATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTTTTGTACCCAT 3620

  5635311 TAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGTGTAAGATAAG 5635370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 TAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGTGTAAGATAAG 3680

  5635371 GGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATGGTGTTGAAA 5635430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3681 GGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATGGTGTTGAAA 3740

  5635431 AGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGATTGACTATAT 5635490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 AGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGATTGACTATAT 3800

  5635491 ATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGTATCTCTTTT 5635550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 ATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGTATCTCTTTT 3860

  5635551 TATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGAAATCAGGTT 5635610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 TATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGAAATCAGGTT 3920

  5635611 GATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATCCTCATAATC 5635670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3921 GATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATCCTCATAATC 3980

  5635671 CCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGAGTTTTCCTC 5635730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3981 CCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGAGTTTTCCTC 4040

  5635731 ATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTGACTG 5635790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4041 ATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTGACTG 4100

  5635791 TTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCC 5635850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4101 TTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCC 4160

  5635851 CTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATCTATT 5635910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4161 CTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATCTATT 4220

  5635911 CAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGG 5635970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4221 CAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGG 4280

  5635971 ACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGG 5636030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4281 ACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGG 4340

  5636031 CTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTGTTTATGTGAA 5636090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4341 CTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTGTTTATGTGAA 4400

  5636091 AATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAGTAGG 5636150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4401 AATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAGTAGG 4460

  5636151 GACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTTATTT 5636210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4461 GACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTTATTT 4520

  5636211 GTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATT 5636270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4521 GTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATT 4580

  5636271 CTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGT 5636330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4581 CTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGT 4640

  5636331 TTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAA 5636390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4641 TTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAA 4700

  5636391 CTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAG 5636450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4701 CTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAG 4760

  5636451 CTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAG 5636510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4761 CTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAG 4820

  5636511 GGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTC 5636570
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4821 GGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCTTGCCTC 4880

  5636571 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCATGTTTTCTTAA 5636630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4881 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCATGTTTTCTTAA 4940

  5636631 TTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATATTGAT 5636690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4941 TTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATATTGAT 5000

  5636691 TTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTA 5636750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5001 TTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTA 5060

  5636751 GGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAAC 5636810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5061 GGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAAC 5120

  5636811 TACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAGATTATAAGTT 5636870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5121 TACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAGATTATAAGTT 5180

  5636871 TCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATG 5636930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5181 TCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATG 5240

  5636931 TTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTGTGGCACAGCA 5636990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5241 TTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTGTGGCACAGCA 5300

  5636991 ATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATTTATG 5637050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5301 ATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATTTATG 5360

  5637051 ATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGA 5637110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5361 ATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGA 5420

  5637111 GTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCC 5637170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5421 GTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCC 5480

  5637171 TGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTT 5637230
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     5481 TGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAA-TTT 5539

  5637231 TTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGA 5637290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5540 TTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGA 5599

  5637291 ACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 5637350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5600 ACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 5659

  5637351 GAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGT 5637410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5660 GAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGT 5719

  5637411 TCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCA 5637470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5720 TCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCA 5779

  5637471 TATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGT 5637530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5780 TATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGT 5839

  5637531 TGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCA 5637590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5840 TGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCA 5899

  5637591 CCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTT 5637650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5900 CCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTT 5959

  5637651 TATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGA 5637710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5960 TATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGA 6019

  5637711 TGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCAT 5637770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6020 TGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCAT 6079

  5637771 GTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCA 5637830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6080 GTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCA 6139

  5637831 AGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAAT 5637890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6140 AGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAAT 6199

  5637891 AACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGT 5637950
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6200 AACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGT 6259

  5637951 TTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTG 5638010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6260 TTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTG 6319

  5638011 AGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTT 5638070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 AGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTT 6379

  5638071 ATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTT 5638130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6380 ATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTT 6439

  5638131 GATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAAT 5638190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6440 GATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAAT 6499

  5638191 AAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTG 5638250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6500 AAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTG 6559

  5638251 TATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTT 5638310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6560 TATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTT 6619

  5638311 ATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTT 5638370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6620 ATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTT 6679

  5638371 AGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTT 5638430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6680 AGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTT 6739

  5638431 TAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGA 5638490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6740 TAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGA 6799

  5638491 GACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTC 5638550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6800 GACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTC 6859

  5638551 ATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCC 5638610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6860 ATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCC 6919

  5638611 AGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTA 5638670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6920 AGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTA 6979

  5638671 TCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAG 5638730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6980 TCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAG 7039

  5638731 GTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCA 5638790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7040 GTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCA 7099

  5638791 TTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAA 5638850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7100 TTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAA 7159

  5638851 TTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATT 5638910
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     7160 TTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATT 7219

  5638911 TGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGC 5638970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7220 TGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGC 7279

  5638971 AGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACC 5639030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7280 AGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACC 7339

  5639031 TCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTA 5639090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7340 TCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTA 7399

  5639091 GAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTG 5639150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7400 GAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTG 7459

  5639151 CCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTT 5639210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7460 CCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTT 7519

  5639211 CTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGT 5639270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7520 CTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGT 7579

  5639271 CTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGT 5639330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7580 CTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGT 7639

  5639331 TTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCA 5639390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7640 TTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCA 7699

  5639391 AGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGA 5639450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7700 AGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGA 7759

  5639451 GAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATAT 5639510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     7760 GAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTATGATTTGTGACCTATCATAT 7819

  5639511 GAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGA 5639570
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7820 GAGCAATCCTTAAGTGATCTATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGA 7879

  5639571 TGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGAT 5639630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7880 TGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGAT 7939

  5639631 GTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAG 5639690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7940 GTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAG 7999

  5639691 TCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTA 5639750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8000 TCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTA 8059

  5639751 TATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGAC 5639810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8060 TATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGAC 8119

  5639811 TCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTT 5639870
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8120 TCTTTTCTCAGTTTATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTT 8179

  5639871 GTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTT 5639930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8180 GTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTT 8239

  5639931 CATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAA 5639990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8240 CATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAA 8299

  5639991 CAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAG 5640050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8300 CAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAG 8359

  5640051 TTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATAT 5640110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8360 TTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATAT 8419

  5640111 ATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTG 5640170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8420 ATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTG 8479

  5640171 AAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGT 5640230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8480 AAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGT 8539

  5640231 TGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATT 5640290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8540 TGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATT 8599

  5640291 TTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTA 5640350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8600 TTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTA 8659

  5640351 AAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAA 5640410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8660 AAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAA 8719

  5640411 CTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACT 5640470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8720 CTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACT 8779

  5640471 ATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAG 5640530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8780 ATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAG 8839

  5640531 AGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTT 5640590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8840 AGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTT 8899

  5640591 GAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATA 5640650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8900 GAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATA 8959

  5640651 CTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTC 5640710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8960 CTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTC 9019

  5640711 TTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGA 5640770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9020 TTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGA 9079

  5640771 GGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTC 5640830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9080 GGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTC 9139

  5640831 TCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTT 5640890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9140 TCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTT 9199

  5640891 TGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTT 5640950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9200 TGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTT 9259

  5640951 TACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTC 5641010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9260 TACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTC 9319

  5641011 TCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTG 5641070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9320 TCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTG 9379

  5641071 TTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTC 5641130
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     9380 TTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTC-TTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTC 9438

  5641131 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTC 5641190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9439 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTC 9498

  5641191 ACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACAC 5641250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9499 ACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACAC 9558

  5641251 CCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTC 5641310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9559 CCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTC 9618

  5641311 TCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 5641370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9619 TCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 9678

  5641371 ATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGT 5641430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9679 ATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGT 9738

  5641431 TCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCT 5641490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9739 TCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCT 9798

  5641491 TATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAAT 5641550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9799 TATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAAT 9858

  5641551 ACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCT 5641610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9859 ACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCT 9918

  5641611 TTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAA 5641670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9919 TTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAA 9978

  5641671 TTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGT 5641730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9979 TTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGT 10038

  5641731 TGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGT 5641790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10039 TGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGT 10098

  5641791 TTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTC 5641850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10099 TTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTC 10158

  5641851 CTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCA 5641910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10159 CTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCA 10218

  5641911 GGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTG 5641970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10219 GGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTG 10278

  5641971 ATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTA 5642030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10279 ATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTA 10338

  5642031 GTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCG 5642090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10339 GTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCG 10398

  5642091 AAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCC 5642150
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10399 AAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCC 10458

  5642151 TTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTT 5642210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10459 TTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTT 10518

  5642211 CTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAAC 5642270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10519 CTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAAC 10578

  5642271 TAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGC 5642330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10579 TAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGC 10638

  5642331 TGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCA 5642390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10639 TGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCA 10698

  5642391 CCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAG 5642450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10699 CCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAG 10758

  5642451 CCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCC 5642510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10759 CCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCC 10818

  5642511 AGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATT 5642570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10819 AGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATT 10878

  5642571 CTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTC 5642630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10879 CTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTC 10938

  5642631 CCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGT 5642690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10939 CCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGT 10998

  5642691 GGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAA 5642750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10999 GGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAA 11058

  5642751 TCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATA 5642810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11059 TCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATA 11118

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11119 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 11178

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11179 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 11238

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
    11239 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATCTTATGA 11298

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11299 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 11358

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11359 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 11418

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11419 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 11478

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATT 5643221
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11479 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATT 11529

Alignment time is 14.1159 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   5319] =>      5319 nucs 'mol-32-301a-208650_5319'

Score:        5274
Aligned:      5318        nucs
Identic:      5314 (100%) nucs =>       858 (100%)      4456 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5637068,5637925] EXCISED REGION [5637927,5642386]
 second seq =>  [      1,    858] EXCISED REGION [    860,   5319]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5637926,5637926]
 second seq =>         1 nucs [859,859]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [859,859] to [860,860]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5637068 TTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCT 5637127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCT 60

  5637128 CAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAG 5637187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAG 120

  5637188 TAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTT 5637247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTT 180

  5637248 TTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTG 5637307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTG 240

  5637308 ATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGC 5637367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGC 300

  5637368 CATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTA 5637427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTA 360

  5637428 TTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTAT 5637487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTAT 420

  5637488 TTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTA 5637547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTA 480

  5637548 GGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCC 5637607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCC 540

  5637608 CCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAA 5637667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAA 600

  5637668 TTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGC 5637727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGC 660

  5637728 CTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCG 5637787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCG 720

  5637788 GATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTT 5637847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTT 780

  5637848 ATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGG 5637907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGG 840

  5637908 GCATCTTTGTCGTGTTCC 5637925
          ||||||||||||||||||
      841 GCATCTTTGTCGTGTTCC 858

EXCISED REGION

  5637927 GATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTG 5637986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 GATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTG 919

  5637987 TTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTT 5638046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 TTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTT 979

  5638047 TTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCAT 5638106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 TTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCAT 1039

  5638107 ATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTT 5638166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 ATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTT 1099

  5638167 GAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAAT 5638226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 GAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAAT 1159

  5638227 ATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAG 5638286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 ATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAG 1219

  5638287 AAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTA 5638346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 AAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTA 1279

  5638347 ATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGT 5638406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 ATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGT 1339

  5638407 TTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAG 5638466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 TTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAG 1399

  5638467 GTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAG 5638526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 GTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAG 1459

  5638527 TCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGAT 5638586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 TCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGAT 1519

  5638587 TTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTG 5638646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 TTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTG 1579

  5638647 ATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTA 5638706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 ATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTA 1639

  5638707 TTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAAC 5638766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 TTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAAC 1699

  5638767 TTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTC 5638826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 TTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTC 1759

  5638827 CATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTA 5638886
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1760 CATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTA 1819

  5638887 AGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTC 5638946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 AGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTC 1879

  5638947 TCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTC 5639006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 TCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTC 1939

  5639007 CCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGC 5639066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 CCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGC 1999

  5639067 CACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTC 5639126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 CACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTC 2059

  5639127 AAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCAT 5639186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 AAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCAT 2119

  5639187 GAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTT 5639246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 GAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTT 2179

  5639247 CTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATC 5639306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 CTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATC 2239

  5639307 ATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATT 5639366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 ATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATT 2299

  5639367 CAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGAT 5639426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 CAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGAT 2359

  5639427 TTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATAT 5639486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 TTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATAT 2419

  5639487 TTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAG 5639546
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2420 TTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCTATGTACTGAGGGAAAG 2479

  5639547 AATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGT 5639606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 AATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGT 2539

  5639607 TGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTC 5639666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 TGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTC 2599

  5639667 AGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTT 5639726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 AGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTT 2659

  5639727 AGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATT 5639786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 AGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATT 2719

  5639787 GTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCAC 5639846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2720 GTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTTTATAATGACATTCTTTGTCTCAC 2779

  5639847 AATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTT 5639906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 AATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTT 2839

  5639907 TCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTAT 5639966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 TCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTAT 2899

  5639967 GTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCC 5640026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 GTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCC 2959

  5640027 ACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAG 5640086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 ACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAG 3019

  5640087 TAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCT 5640146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 TAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCT 3079

  5640147 TTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTT 5640206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 TTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTT 3139

  5640207 GCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCA 5640266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 GCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCA 3199

  5640267 AGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGC 5640326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 AGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGC 3259

  5640327 AGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTT 5640386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 AGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTT 3319

  5640387 TAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTG 5640446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 TAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTG 3379

  5640447 TTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTC 5640506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 TTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTC 3439

  5640507 GTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAA 5640566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 GTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAA 3499

  5640567 GAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAA 5640626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 GAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAA 3559

  5640627 ACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAG 5640686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 ACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAG 3619

  5640687 CGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGA 5640746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 CGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGA 3679

  5640747 ACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTT 5640806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 ACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTT 3739

  5640807 TTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATAC 5640866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 TTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATAC 3799

  5640867 TGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCA 5640926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 TGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCA 3859

  5640927 CTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCT 5640986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 CTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCT 3919

  5640987 ATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATA 5641046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 ATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATA 3979

  5641047 AAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTT 5641106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 AAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTT 4039

  5641107 TTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCA 5641166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 TTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCA 4099

  5641167 CTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGG 5641226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 CTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGG 4159

  5641227 GACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT 5641286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4160 GACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT 4219

  5641287 TTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCC 5641346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 TTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCC 4279

  5641347 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTT 5641406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4280 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTT 4339

  5641407 CTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTT 5641466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4340 CTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTT 4399

  5641467 CTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTT 5641526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4400 CTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTT 4459

  5641527 CTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAG 5641586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 CTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAG 4519

  5641587 GCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAA 5641646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 GCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAA 4579

  5641647 GTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAG 5641706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 GTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAG 4639

  5641707 ACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGAT 5641766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 ACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGAT 4699

  5641767 TTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTG 5641826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 TTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTG 4759

  5641827 TTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGT 5641886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 TTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGT 4819

  5641887 CACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGG 5641946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 CACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGG 4879

  5641947 GTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCA 5642006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 GTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCA 4939

  5642007 TCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTT 5642066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 TCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTT 4999

  5642067 TTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGT 5642126
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     5000 TTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGT 5059

  5642127 TTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTG 5642186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5060 TTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTG 5119

  5642187 GATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTC 5642246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5120 GATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTC 5179

  5642247 TCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTG 5642306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5180 TCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTG 5239

  5642307 TTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTC 5642366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5240 TTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTC 5299

  5642367 ATCCAAGGCCTGCTGTCACC 5642386
          ||||||||||||||||||||
     5300 ATCCAAGGCCTGCTGTCACC 5319

Alignment time is 6.91727 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   6051] =>      6051 nucs 'mol-32-3046-259604_6051'

Score:        5946
Aligned:      6012        nucs
Identic:      6006 (100%) nucs =>       797 (100%)      5209 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5637129,5637925] EXCISED REGION [5637927,5643141]
 second seq =>  [      1,    797] EXCISED REGION [    799,   6013]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5637926,5637926]
 second seq =>         1 nucs [798,798]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>      5191 nucs [5643142,5648332]
 second seq =>        28 nucs [6014,6041]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [798,798] to [799,799]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5637129 AGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGT 5637188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGT 60

  5637189 AGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTT 5637248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTT 120

  5637249 TATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGA 5637308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGA 180

  5637309 TCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCC 5637368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCC 240

  5637369 ATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTAT 5637428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTAT 300

  5637429 TCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATT 5637488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATT 360

  5637489 TTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAG 5637548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAG 420

  5637549 GTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCC 5637608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCC 480

  5637609 CAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAAT 5637668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAAT 540

  5637669 TGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCC 5637728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCC 600

  5637729 TTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGG 5637788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGG 660

  5637789 ATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTA 5637848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTA 720

  5637849 TCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGG 5637908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGG 780

  5637909 CATCTTTGTCGTGTTCC 5637925
          |||||||||||||||||
      781 CATCTTTGTCGTGTTCC 797

EXCISED REGION

  5637927 GATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTG 5637986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 GATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTG 858

  5637987 TTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTT 5638046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 TTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTT 918

  5638047 TTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCAT 5638106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 TTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCAT 978

  5638107 ATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTT 5638166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 ATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTT 1038

  5638167 GAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAAT 5638226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 GAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAAT 1098

  5638227 ATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAG 5638286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 ATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAG 1158

  5638287 AAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTA 5638346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 AAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTA 1218

  5638347 ATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGT 5638406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 ATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGT 1278

  5638407 TTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAG 5638466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 TTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAG 1338

  5638467 GTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAG 5638526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 GTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAG 1398

  5638527 TCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGAT 5638586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 TCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGAT 1458

  5638587 TTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTG 5638646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 TTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTG 1518

  5638647 ATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTA 5638706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 ATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTA 1578

  5638707 TTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAAC 5638766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 TTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAAC 1638

  5638767 TTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTC 5638826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 TTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTC 1698

  5638827 CATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTA 5638886
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1699 CATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTA 1758

  5638887 AGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTC 5638946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 AGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTC 1818

  5638947 TCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTC 5639006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 TCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTC 1878

  5639007 CCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGC 5639066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 CCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGC 1938

  5639067 CACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTC 5639126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 CACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTC 1998

  5639127 AAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCAT 5639186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 AAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCAT 2058

  5639187 GAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTT 5639246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 GAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTT 2118

  5639247 CTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATC 5639306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 CTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATC 2178

  5639307 ATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATT 5639366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 ATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATT 2238

  5639367 CAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGAT 5639426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 CAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGAT 2298

  5639427 TTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATAT 5639486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 TTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATAT 2358

  5639487 TTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAG 5639546
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2359 TTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCTATGTACTGAGGGAAAG 2418

  5639547 AATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGT 5639606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 AATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGT 2478

  5639607 TGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTC 5639666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 TGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTC 2538

  5639667 AGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTT 5639726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 AGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTT 2598

  5639727 AGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATT 5639786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 AGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATT 2658

  5639787 GTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCAC 5639846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2659 GTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTTTATAATGACATTCTTTGTCTCAC 2718

  5639847 AATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTT 5639906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 AATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTT 2778

  5639907 TCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTAT 5639966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 TCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTAT 2838

  5639967 GTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCC 5640026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 GTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCC 2898

  5640027 ACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAG 5640086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 ACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAG 2958

  5640087 TAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCT 5640146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 TAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCT 3018

  5640147 TTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTT 5640206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 TTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTT 3078

  5640207 GCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCA 5640266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 GCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCA 3138

  5640267 AGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGC 5640326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 AGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGC 3198

  5640327 AGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTT 5640386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 AGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTT 3258

  5640387 TAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTG 5640446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 TAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTG 3318

  5640447 TTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTC 5640506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 TTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTC 3378

  5640507 GTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAA 5640566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 GTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAA 3438

  5640567 GAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAA 5640626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 GAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAA 3498

  5640627 ACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAG 5640686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 ACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAG 3558

  5640687 CGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGA 5640746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 CGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGA 3618

  5640747 ACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTT 5640806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 ACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTT 3678

  5640807 TTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATAC 5640866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 TTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATAC 3738

  5640867 TGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCA 5640926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 TGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCA 3798

  5640927 CTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCT 5640986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 CTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCT 3858

  5640987 ATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATA 5641046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 ATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATA 3918

  5641047 AAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTT 5641106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 AAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTT 3978

  5641107 TTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCA 5641166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 TTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCA 4038

  5641167 CTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGG 5641226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 CTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGG 4098

  5641227 GACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT 5641286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 GACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT 4158

  5641287 TTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCC 5641346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 TTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCC 4218

  5641347 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTT 5641406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTT 4278

  5641407 CTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTT 5641466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 CTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTT 4338

  5641467 CTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTT 5641526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 CTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTT 4398

  5641527 CTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAG 5641586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 CTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAG 4458

  5641587 GCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAA 5641646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 GCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAA 4518

  5641647 GTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAG 5641706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 GTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAG 4578

  5641707 ACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGAT 5641766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4579 ACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTCGAT 4638

  5641767 TTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTG 5641826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 TTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTG 4698

  5641827 TTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGT 5641886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 TTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGT 4758

  5641887 CACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGG 5641946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 CACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGG 4818

  5641947 GTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCA 5642006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 GTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCA 4878

  5642007 TCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTT 5642066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 TCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTT 4938

  5642067 TTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGT 5642126
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4939 TTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGT 4998

  5642127 TTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTG 5642186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 TTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTG 5058

  5642187 GATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTC 5642246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 GATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTC 5118

  5642247 TCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTG 5642306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 TCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTG 5178

  5642307 TTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTC 5642366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 TTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTC 5238

  5642367 ATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGG 5642426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 ATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGG 5298

  5642427 CTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTC 5642486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 CTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTC 5358

  5642487 ATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAA 5642546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 ATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAA 5418

  5642547 ATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTA 5642606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 ATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTA 5478

  5642607 ACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGG 5642666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 ACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGG 5538

  5642667 CCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCA 5642726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 CCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCA 5598

  5642727 GGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACT 5642786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 GGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACT 5658

  5642787 GTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATT 5642846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 GTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATT 5718

  5642847 TCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTG 5642906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5719 TCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTG 5778

  5642907 AAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCAT 5642966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 AAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCAT 5838

  5642967 TTTTATGAATAGAAGATATTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCA 5643026
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 TTTTATGAATAGAAGATCTTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCA 5898

  5643027 TGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAG 5643086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 TGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAG 5958

  5643087 CCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAA 5643141
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 CCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAA 6013

Alignment time is 7.42499 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   9894] =>      9894 nucs 'mol-32-310c-149117_9894'

Score:        9751
Aligned:      9894        nucs
Identic:      9881 (100%) nucs =>      9139 (100%)       742 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5631733,5640884] EXCISED REGION [5640889,5641630]
 second seq =>  [      1,   9152] EXCISED REGION [   9153,   9894]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [5640885,5640888]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [5640885,5640891] to [5640889,5640895]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5640884,5640884] to [5640889,5640889]
 second seq =>         1 nucs [9152,9152] to [9153,9153]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5631733 GGTGTATGATTACATGCCTAGGTGAGTGGGATACATATGCTAGACTCCAGCTTCCAATCT 5631792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTGTATGATTACATGCCTAGGTGAGTGGGATACATATGCTAGACTCCAGCTTCCAATCT 60

  5631793 TCTCTTCCTGGGATATGCCCTTTCTTACTCTGTATGAAAGTTTTCATTTTGATTTTCTAA 5631852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCTTCCTGGGATATGCCCTTTCTTACTCTGTATGAAAGTTTTCATTTTGATTTTCTAA 120

  5631853 TTTGTAAACTTCCTGAAAGTATGTAAGTTAATTAGGTTAACAAACTTCATTTAAAAGTGA 5631912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGTAAACTTCCTGAAAGTATGTAAGTTAATTAGGTTAACAAACTTCATTTAAAAGTGA 180

  5631913 AAATGCCTTTAGGTAAATTAAAGGGCTATCAGTTATACTTCCATAATTTAGAGTGAATTG 5631972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATGCCTTTAGGTAAATTAAAGGGCTATCAGTTATACTTCCATAATTTAGAGTGAATTG 240

  5631973 GTTTAAAAAGTTCTCATGGAGCTGCTAAAAGCTTTGATTTTTGAGAGGCTGTAGATACAA 5632032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTTAAAAAGTTCTCATGGAGCTGCTAAAAGCTTTGATTTTTGAGAGGCTGTAGATACAA 300

  5632033 GTAGTTTTATAATAATATGTGAAGATCTACAGGATTTTACAGAGTTGAAGTCTTACAGCT 5632092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTAGTTTTATAATAATATGTGAAGATCTACAGGATTTTACAGAGTTGAAGTCTTACAGCT 360

  5632093 GCTTGAGGGCATTTGAAGGCAGGGAGACATGCTCGTAGAGATGATAAAACAAGATTTGCT 5632152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTTGAGGGCATTTGAAGGCAGGGAGACATGCTCGTAGAGATGATAAAACAAGATTTGCT 420

  5632153 TACCTGAAATTTTGTTAGGGCTCACTTAGTAAATCAGGCTCTCTTAGGAGTGATATATTT 5632212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACCTGAAATTTTGTTAGGGCTCACTTAGTAAATCAGGCTCTCTTAGGAGTGATATATTT 480

  5632213 TAAAAAGAGACAACTAGCCTTGTGGAAGGGACAGTCGTTTAGTAGTCTAAGCTGGTTGTT 5632272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAAAAGAGACAACTAGCCTTGTGGAAGGGACAGTCGTTTAGTAGTCTAAGCTGGTTGTT 540

  5632273 TCAATGTTCAAAAGAATTGTGGAAATTGTATGTGTACAGTGATAATTCATAAGACTGAAT 5632332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAATGTTCAAAAGAATTGTGGAAATTGTATGTGTACAGTGATAATTCATAAGACTGAAT 600

  5632333 CTCTATTAAAATCTCTAACTGTACATTATATGGGTCTTCTAATGAACTTTTATGTACTAC 5632392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCTATTAAAATCTCTAACTGTACATTATATGGGTCTTCTAATGAACTTTTATGTACTAC 660

  5632393 TTATACCTACTGTCCTCTATTCTAAGTAGGTATTCGGAATTCCACTGTTTAGACTCATAT 5632452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTATACCTACTGTCCTCTATTCTAAGTAGGTATTCGGAATTCCACTGTTTAGACTCATAT 720

  5632453 CTCTTCAGAATTATTTCCTACCCCAAATTTGAGAAATACAGTATAGTGTTGTTTATGAAC 5632512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      721 CTCTTCAGAATTATTTCCTACCCCAAATTTGAGAAATACAGTATAGTGTTGTTTTTGAAC 780

  5632513 AAAAGAGCCTCTAGATAGTTACTTAGCTTTTTTATATTGGAGCCCCAATATTATATTTTG 5632572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAGAGCCTCTAGATAGTTACTTAGCTTTTTTATATTGGAGCCCCAATATTATATTTTG 840

  5632573 GAGCCCCCCAAATGGTGTTAAAAAAAGGCTCAGTATGTGTAGGCTAGATTGGGGTGGTAG 5632632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGCCCCCCAAATGGTGTTAAAAAAAGGCTCAGTATGTGTAGGCTAGATTGGGGTGGTAG 900

  5632633 AGGTAGAACTTGACTGGGGGCAGTTGGTACATTTCTGCTAAGGTTATTGTAAAAGGACTA 5632692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGTAGAACTTGACTGGGGGCAGTTGGTACATTTCTGCTAAGGTTATTGTAAAAGGACTA 960

  5632693 GTTTCAGCTTTGAGGATGAAACTGTTGCATAAGGTAGGTTATGATTTATGATTGACGTAG 5632752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTTCAGCTTTGAGGATGAAACTGTTGCATAAGGTAGGTTATGATTTATGATTGACGTAG 1020

  5632753 GTGTAGTGTGAGATGAATTACATTTTGTACTGTACTGAGGGCCCAGAATTATTCCTTTAA 5632812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTGTAGTGTGAGATGAATTACATTTTGTACTGTACTGAGGGCCCAGAATTATTCCTTTAA 1080

  5632813 TATACTAACTGTGACTATGAAAGTCTATATATGTGAACATCAGAATGGTATCTTTGAATT 5632872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATACTAACTGTGACTATGAAAGTCTATATATGTGAACATCAGAATGGTATCTTTGAATT 1140

  5632873 TAGCCATTCTAAATTAGATGTATAGACATTCTCGTTTTTCAGGTCACCGACTTTAAACAT 5632932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGCCATTCTAAATTAGATGTATAGACATTCTCGTTTTTCAGGTCACCGACTTTAAACAT 1200

  5632933 TTAAATTAGCTTCAGAAGTATTTTTGAACATCAACTGTAAAAGACAGATGTGTATAAAAG 5632992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTAAATTAGCTTCAGAAGTATTTTTGAACATCAACTGTAAAAGACAGATGTGTATAAAAG 1260

  5632993 GGATGAAGAGACATGTTATATGTTAGTGTGTTAGATGTTAGTGTGTTAATATAAATCTTG 5633052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGATGAAGAGACATGTTATATGTTAGTGTGTTAGATGTTAGTGTGTTAATATAAATCTTG 1320

  5633053 TGAGATATCACTGTTGTAGGTAGCTAATAAAAAGCTGAAATGGGCAAATAATTACTAGGC 5633112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAGATATCACTGTTGTAGGTAGCTAATAAAAAGCTGAAATGGGCAAATAATTACTAGGC 1380

  5633113 TTATAAAATAAATTATATGTCGTTTAGTAATCCTGAGCAAAAACTTAGTTCCCATTGGTA 5633172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTATAAAATAAATTATATGTCGTTTAGTAATCCTGAGCAAAAACTTAGTTCCCATTGGTA 1440

  5633173 TGTGCTAATCATGGAAAAAAACAATGATATGTCAAAAGAACCAAGCTTTGGATCAGGTAT 5633232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTGCTAATCATGGAAAAAAACAATGATATGTCAAAAGAACCAAGCTTTGGATCAGGTAT 1500

  5633233 GTGATTAACTGTGTTGACCTCAGGAAGACCATTTTATTTGTATTTTCCCAGCATTCCCAT 5633292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGATTAACTGTGTTGACCTCAGGAAGACCATTTTATTTGTATTTTCCCAGCATTCCCAT 1560

  5633293 TTCTCACCCTTTTAACTCTATTACTTTCTCCAGAGAGCCTTCTTTATAAATTCACTGCTC 5633352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTCACCCTTTTAACTCTATTACTTTCTCCAGAGAGCCTTCTTTATAAATTCACTGCTC 1620

  5633353 TGAAGTCTTCTAGGGTTCACTGTTGATGAAAGAATGGAGTTCAAACTCCTTAGTTTGATA 5633412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAAGTCTTCTAGGGTTCACTGTTGATGAAAGAATGGAGTTCAAACTCCTTAGTTTGATA 1680

  5633413 TCACAGACACTCCCTTCTTGGAATGCTCTCTTGCCTCATTTCTGCCTGTCAGAGTATTAT 5633472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCACAGACACTCCCTTCTTGGAATGCTCTCTTGCCTCATTTCTGCCTGTCAGAGTATTAT 1740

  5633473 CTATCCTTTAACTGCTGTTGAAATCCTTTCTTTATGAGTCATTCTTTACCTACCGTAACC 5633532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTATCCTTTAACTGCTGTTGAAATCCTTTCTTTATGAGTCATTCTTTACCTACCGTAACC 1800

  5633533 ATAAGTGTTCATTTTTCTGATGAACTACTGCTTCCCCACTACTGCCAGCTTTGTTGAGGT 5633592
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1801 ATAAGTGTTCATTTTTCTGATGAACTACTGCTTCCCCACTACTGCCAGCTTTGTTGACGT 1860

  5633593 ATAATTGACAAATAAAAATTGTATATATTTAAGGTGTGCTGTGCGATACTTAGATCTACC 5633652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATAATTGACAAATAAAAATTGTATATATTTAAGGTGTGCTGTGCGATACTTAGATCTACC 1920

  5633653 CTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTCTAATTAACAGATCCACCATCTCACACAGCTCCCT 5633712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTCTAATTAACAGATCCACCATCTCACACAGCTCCCT 1980

  5633713 CTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACACTTAAGACCTACTCTCTTAGCAAATTTCAAGTAT 5633772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACACTTAAGACCTACTCTCTTAGCAAATTTCAAGTAT 2040

  5633773 ACAATATATGTTAATTATGGAAATAAATGTCATTATTAACGATAGTTACTGGGCCATGCA 5633832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACAATATATGTTAATTATGGAAATAAATGTCATTATTAACGATAGTTACTGGGCCATGCA 2100

  5633833 TTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTTATACCTGAAAATTTGTACCTTTGACTGAAATACT 5633892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTTATACCTGAAAATTTGTACCTTTGACTGAAATACT 2160

  5633893 CCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCTGGTAATCATCGTTCTATTCTCTGTTCCTATGAAT 5633952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCTGGTAATCATCGTTCTATTCTCTGTTCCTATGAAT 2220

  5633953 TTGACGTCTTTATATTCCATATATGAGATCATGAAGTTGTTTTTTGTCTTGCTTACTTAG 5634012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGACGTCTTTATATTCCATATATGAGATCATGAAGTTGTTTTTTGTCTTGCTTACTTAG 2280

  5634013 TATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATGTTGTTGCAGATGGCAGGATTTCCTTGTTTTTTAA 5634072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATGTTGTTGCAGATGGCAGGATTTCCTTGTTTTTTAA 2340

  5634073 AGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTATGTGTGTGTGTTACATTTTCTTTATCCATTCATC 5634132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTATGTGTGTGTGTTACATTTTCTTTATCCATTCATC 2400

  5634133 TATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCTGTATCTTGGCTACTTTGAATAATGCTGCAATGAA 5634192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCTGTATCTTGGCTACTTTGAATAATGCTGCAATGAA 2460

  5634193 TATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATACTGATTTCAATTCCTTTGGATATATACCTAG 5634252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATACTGATTTCAATTCCTTTGGATATATACCTAG 2520

  5634253 AAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTTTTAGTTTGAGGAACTTCTGTTTTCC 5634312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTTTTAGTTTGAGGAACTTCTGTTTTCC 2580

  5634313 ATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAGTGTACAGGGAGGGGATCCCTTTTCT 5634372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAGTGTACAGGGAGGGGATCCCTTTTCT 2640

  5634373 CCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTCTTGATAATAGATATCCTAACAGGTG 5634432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTCTTGATAATAGATATCCTAACAGGTG 2700

  5634433 TGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTGATGATTAGTGTATTGAGCACCTATT 5634492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTGATGATTAGTGTATTGAGCACCTATT 2760

  5634493 GGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCAGATCTCTTGTCCATTTTTAAATTAG 5634552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCAGATCTCTTGTCCATTTTTAAATTAG 2820

  5634553 GTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTCGGTACTGAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCTTGAAT 5634612
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTTGGTACTGAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCTTGAAT 2880

  5634613 ATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTTTGCAGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTTGCTTT 5634672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTTTGCAGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTTGCTTT 2940

  5634673 TTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTACTGTACAATAACTTAATTTCATGTAATCCTACTTG 5634732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTACTGTACAATAACTTAATTTCATGTAATCCTACTTG 3000

  5634733 TTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGCTTTCCATGTCATCCAAAATACCATCGTGAAAACA 5634792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGCTTTCCATGTCATCCAAAATACCATCGTGAAAACA 3060

  5634793 GATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTTTCTTCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTTTACAT 5634852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTTTCTTCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTTTACAT 3120

  5634853 TTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATTTTAATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTGTGTAT 5634912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATTTTAATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTGTGTAT 3180

  5634913 TTGTGGGGTATATGGGATATTTTGATACAGGACTATAGTCACCCTGTTGTACTATCAAAT 5634972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTGTGGGGTATATGGGATATTTTGATACAGGACTATAGTCACCCTGTTGTACTATCAAAT 3240

  5634973 ACTAGATTTTATTCATCATCATCACCATTATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCAC 5635032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACTAGATTTTATTCATCATCATCACCATTATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCAC 3300

  5635033 TCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGGCTTACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCAAGCAA 5635092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGGCTTACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCAAGCAA 3360

  5635093 TTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAGCTGGGAGTACAGATGCATGCCACCATGCCTAGTT 5635152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAGCTGGGAGTACAGATGCATGCCACCATGCCTAGTT 3420

  5635153 AATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACA 5635212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACA 3480

  5635213 CAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCACCACA 5635272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3481 CAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCGCCACA 3540

  5635273 CCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTC 5635332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTC 3600

  5635333 CGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCA 5635392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCA 3660

  5635393 TGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTT 5635452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTT 3720

  5635453 TTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCT 5635512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCT 3780

  5635513 GGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTT 5635572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTT 3840

  5635573 GATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCC 5635632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCC 3900

  5635633 CCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACC 5635692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACC 3960

  5635693 TGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAG 5635752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAG 4020

  5635753 TTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTC 5635812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTC 4080

  5635813 TCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTT 5635872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTT 4140

  5635873 CCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACC 5635932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACC 4200

  5635933 AAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGAC 5635992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGAC 4260

  5635993 ACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTT 5636052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTT 4320

  5636053 TTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTGTTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAG 5636112
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTATTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAG 4380

  5636113 AGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTC 5636172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTC 4440

  5636173 TTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCA 5636232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCA 4500

  5636233 TCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAG 5636292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAG 4560

  5636293 CTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCT 5636352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCT 4620

  5636353 CTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCT 5636412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCT 4680

  5636413 GGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCA 5636472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCA 4740

  5636473 CCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGC 5636532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGC 4800

  5636533 TGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 5636592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 4860

  5636593 ATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTG 5636652
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 ATAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTG 4920

  5636653 TTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTA 5636712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTA 4980

  5636713 AATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTA 5636772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTA 5040

  5636773 TGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTT 5636832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTT 5100

  5636833 TGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTT 5636892
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TGCACTTATGCTTTATTTCCCCAGCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTT 5160

  5636893 AATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATT 5636952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATT 5220

  5636953 AATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGT 5637012
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AATGAATTTAAGGTATTTGTCATACATGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGT 5280

  5637013 TTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGT 5637072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGT 5340

  5637073 TTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCT 5637132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCT 5400

  5637133 CACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCT 5637192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCT 5460

  5637193 GGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATA 5637252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATA 5520

  5637253 GAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCA 5637312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCA 5580

  5637313 TCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGA 5637372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGA 5640

  5637373 GATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCAT 5637432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCAT 5700

  5637433 CCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAA 5637492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 CCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAA 5760

  5637493 AATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCA 5637552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 AATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCA 5820

  5637553 TACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGT 5637612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGT 5880

  5637613 TACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTT 5637672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTT 5940

  5637673 TTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGC 5637732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGC 6000

  5637733 TTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCT 5637792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCT 6060

  5637793 CATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCA 5637852
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6061 CATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTACAAGTACCATGTTTTCTTTATCCA 6120

  5637853 TCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATC 5637912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATC 6180

  5637913 TTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATAC 5637972
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATAC 6240

  5637973 TAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCA 5638032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCA 6300

  5638033 GTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCA 5638092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 GTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCA 6360

  5638093 GTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATT 5638152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 GTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATT 6420

  5638153 GATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGA 5638212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 GATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGA 6480

  5638213 ATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACA 5638272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 ATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACA 6540

  5638273 TCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGT 5638332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 TCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGT 6600

  5638333 TTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTA 5638392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTA 6660

  5638393 TTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGC 5638452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 TTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGC 6720

  5638453 AGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAAT 5638512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 AGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAAT 6780

  5638513 CTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTG 5638572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 CTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTG 6840

  5638573 TATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCT 5638632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 TATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCT 6900

  5638633 CATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCT 5638692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 CATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCT 6960

  5638693 TATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTT 5638752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 TATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTT 7020

  5638753 TTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTA 5638812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 TTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTA 7080

  5638813 ATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCT 5638872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 ATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCT 7140

  5638873 TTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTC 5638932
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 TTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTC 7200

  5638933 TGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACT 5638992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 TGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACT 7260

  5638993 GTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGA 5639052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 GTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGA 7320

  5639053 CTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTT 5639112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 CTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTT 7380

  5639113 CCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGC 5639172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 CCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGC 7440

  5639173 TAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTT 5639232
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     7441 TAGGATTCAGGCATAAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAGTACTT 7500

  5639233 ATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTT 5639292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 ATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTT 7560

  5639293 GTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTG 5639352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 GTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTG 7620

  5639353 ACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAA 5639412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 ACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAA 7680

  5639413 TTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCA 5639472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 TTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCA 7740

  5639473 GTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCAT 5639532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 GTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCAT 7800

  5639533 GTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTG 5639592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 GTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTG 7860

  5639593 TTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTC 5639652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 TTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTC 7920

  5639653 TGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGT 5639712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 TGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGT 7980

  5639713 CTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCAT 5639772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 CTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCAT 8040

  5639773 ATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGAC 5639832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 ATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGAC 8100

  5639833 ATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTC 5639892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 ATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTC 8160

  5639893 CTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTAT 5639952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 CTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTAT 8220

  5639953 GCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTT 5640012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 GCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTT 8280

  5640013 TCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATG 5640072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 TCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATG 8340

  5640073 CTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGG 5640132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 CTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGG 8400

  5640133 TCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTA 5640192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 TCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTA 8460

  5640193 TGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTA 5640252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 TGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTA 8520

  5640253 CTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACA 5640312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 CTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACA 8580

  5640313 CTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATT 5640372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 CTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATT 8640

  5640373 AAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAAC 5640432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 AAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAAC 8700

  5640433 TTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTA 5640492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 TTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTA 8760

  5640493 TTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAA 5640552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 TTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAA 8820

  5640553 CACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTA 5640612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 CACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTA 8880

  5640613 ATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTG 5640672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8881 ATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTG 8940

  5640673 CTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTT 5640732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8941 CTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTT 9000

  5640733 TTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAA 5640792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9001 TTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAA 9060

  5640793 CTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATT 5640852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9061 CTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATT 9120

  5640853 TTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCT 5640884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     9121 TTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCT 9152

EXCISED REGION

  5640889 TTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATT 5640948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9153 TTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATT 9212

  5640949 TTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTT 5641008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9213 TTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTT 9272

  5641009 TCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTT 5641068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9273 TCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTT 9332

  5641069 TGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTG 5641128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9333 TGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTG 9392

  5641129 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGT 5641188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9393 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGT 9452

  5641189 TCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCAC 5641248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9453 TCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCAC 9512

  5641249 ACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGG 5641308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9513 ACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGG 9572

  5641309 TCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 5641368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9573 TCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 9632

  5641369 GCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGC 5641428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9633 GCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGC 9692

  5641429 GTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCT 5641488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9693 GTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCT 9752

  5641489 CTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCA 5641548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9753 CTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCA 9812

  5641549 ATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATT 5641608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9813 ATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATT 9872

  5641609 CTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCT 5641630
          ||||||||||||||||||||||
     9873 CTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCT 9894

Alignment time is 12.1558 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   6952] =>      6952 nucs 'mol-32-314e-270806_6952'

Score:        6879
Aligned:      6945        nucs
Identic:      6939 (100%) nucs =>      1195 (100%)      5744 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5636731,5637925] EXCISED REGION [5637934,5643683]
 second seq =>  [      1,   1195] EXCISED REGION [   1204,   6952]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [5637926,5637933]
 second seq =>         8 nucs [1196,1203]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1195,1196] to [1203,1204]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5637926,5637926] to [5637933,5637933]
 second seq =>         0 nucs

  5636731 AAATTTTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAA 5636790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATTTTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAA 60

  5636791 TTTTGCTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTT 5636850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTGCTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTT 120

  5636851 CTCCAGCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAG 5636910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCCAGCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAG 180

  5636911 TGCCTTGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTT 5636970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCCTTGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTT 240

  5636971 GTCATACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAAC 5637030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCATACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAAC 300

  5637031 ACAGTAGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCA 5637090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAGTAGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCA 360

  5637091 CTTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTA 5637150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTA 420

  5637151 CTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCC 5637210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCC 480

  5637211 CACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCAT 5637270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCAT 540

  5637271 GTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAA 5637330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAA 600

  5637331 AGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCG 5637390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCG 660

  5637391 TGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACC 5637450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACC 720

  5637451 TTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTAT 5637510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTAT 780

  5637511 TTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTT 5637570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTT 840

  5637571 GTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTG 5637630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTG 900

  5637631 GTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCAC 5637690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCAC 960

  5637691 AAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAA 5637750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAA 1020

  5637751 TGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGA 5637810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGA 1080

  5637811 ATAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACA 5637870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACA 1140

  5637871 CTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCC 5637925
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCC 1195

EXCISED REGION

  5637934 GAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATA 5637993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 GAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATA 1263

  5637994 TGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGA 5638053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 TGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGA 1323

  5638054 AGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTT 5638113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 AGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTT 1383

  5638114 TGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCAT 5638173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 TGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCAT 1443

  5638174 CCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGT 5638233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 CCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGT 1503

  5638234 TGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATT 5638293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 TGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATT 1563

  5638294 GACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGG 5638353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 GACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGG 1623

  5638354 CCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTA 5638413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 CCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTA 1683

  5638414 GTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGG 5638473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 GTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGG 1743

  5638474 GCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTC 5638533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 GCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTC 1803

  5638534 AGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCA 5638593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCA 1863

  5638594 TTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCG 5638653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 TTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCG 1923

  5638654 TTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTT 5638713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTT 1983

  5638714 TGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGT 5638773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGT 2043

  5638774 TTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTT 5638833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 TTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTT 2103

  5638834 ATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCA 5638893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2104 ATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCA 2163

  5638894 TCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTAT 5638953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 TCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTAT 2223

  5638954 TCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTT 5639013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 TCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTT 2283

  5639014 CATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTG 5639073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 CATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTG 2343

  5639074 CCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCC 5639133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCC 2403

  5639134 TGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCAC 5639193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 TGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCAC 2463

  5639194 TATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTT 5639253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTT 2523

  5639254 AATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTT 5639313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 AATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTT 2583

  5639314 TCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAAC 5639373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAAC 2643

  5639374 ATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGT 5639433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 ATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGT 2703

  5639434 TTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGA 5639493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 TTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGA 2763

  5639494 TTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGT 5639553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2764 TTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCTATGTACTGAGGGAAAGAATGTGT 2823

  5639554 GTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAG 5639613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 GTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAG 2883

  5639614 TGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTG 5639673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 TGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTG 2943

  5639674 AAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTA 5639733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 AAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTA 3003

  5639734 ATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATAT 5639793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 ATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATAT 3063

  5639794 TCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTT 5639853
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 TCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTTTATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTT 3123

  5639854 GTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTG 5639913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 GTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTG 3183

  5639914 GCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGT 5639973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 GCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGT 3243

  5639974 GTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCT 5640033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 GTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCT 3303

  5640034 GTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGAC 5640093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 GTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGAC 3363

  5640094 TTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTG 5640153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 TTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTG 3423

  5640154 CTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTT 5640213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 CTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTT 3483

  5640214 ATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTG 5640273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 ATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTG 3543

  5640274 TCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAA 5640333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 TCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAA 3603

  5640334 CACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTC 5640393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 CACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTC 3663

  5640394 ATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCC 5640453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 ATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCC 3723

  5640454 TTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCAT 5640513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 TTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCAT 3783

  5640514 CAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCAT 5640573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 CAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCAT 3843

  5640574 TGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTC 5640633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 TGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTC 3903

  5640634 AAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTG 5640693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3904 AAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTG 3963

  5640694 TACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTC 5640753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3964 TACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTC 4023

  5640754 CCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCT 5640813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4024 CCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCT 4083

  5640814 GTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTA 5640873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4084 GTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTA 4143

  5640874 AGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTC 5640933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4144 AGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTC 4203

  5640934 CTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTAT 5640993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4204 CTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTAT 4263

  5640994 GTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAAC 5641053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4264 GTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAAC 4323

  5641054 TATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGA 5641113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     4324 TATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTC-TTTTTTTTTTTTTGGA 4382

  5641114 CGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAG 5641173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 CGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAG 4442

  5641174 CTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACA 5641233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 CTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACA 4502

  5641234 GGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTG 5641293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 GGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTG 4562

  5641294 TGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAA 5641353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 TGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAA 4622

  5641354 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGG 5641413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGG 4682

  5641414 TTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGG 5641473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 TTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGG 4742

  5641474 TTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACT 5641533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 TTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACT 4802

  5641534 TCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCT 5641593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 TCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCT 4862

  5641594 TCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCT 5641653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 TCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCT 4922

  5641654 GTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGA 5641713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 GTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGA 4982

  5641714 TGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAA 5641773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 TGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAA 5042

  5641774 AATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTT 5641833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5043 AATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTT 5102

  5641834 CAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATAT 5641893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 CAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATAT 5162

  5641894 CTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGT 5641953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5163 CTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGT 5222

  5641954 TTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGA 5642013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5223 TTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGA 5282

  5642014 GGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAA 5642073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5283 GGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAA 5342

  5642074 GTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCA 5642133
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5343 GTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCA 5402

  5642134 GACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACC 5642193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5403 GACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACC 5462

  5642194 ACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGT 5642253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5463 ACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGT 5522

  5642254 GCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCAC 5642313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5523 GCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCAC 5582

  5642314 CACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAG 5642373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5583 CACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAG 5642

  5642374 GCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACC 5642433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5643 GCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACC 5702

  5642434 ATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCC 5642493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5703 ATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCC 5762

  5642494 AAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTA 5642553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5763 AAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTA 5822

  5642554 GCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAA 5642613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5823 GCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAA 5882

  5642614 ATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCAC 5642673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5883 ATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCAC 5942

  5642674 TACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTT 5642733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5943 TACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTT 6002

  5642734 ATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACT 5642793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6003 ATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACT 6062

  5642794 AGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATT 5642853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6063 AGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATT 6122

  5642854 CATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCT 5642913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6123 CATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCT 6182

  5642914 CTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATG 5642973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6183 CTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATG 6242

  5642974 AATAGAAGATATTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGC 5643033
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6243 AATAGAAGATCTTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGC 6302

  5643034 TCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGA 5643093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6303 TCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGA 6362

  5643094 GTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAA 5643153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6363 GTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAA 6422

  5643154 AAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTG 5643213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6423 AAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTG 6482

  5643214 GGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCT 5643273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6483 GGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCT 6542

  5643274 CCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATG 5643333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6543 CCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATG 6602

  5643334 TCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATA 5643393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6603 TCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATA 6662

  5643394 CTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGA 5643453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6663 CTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGA 6722

  5643454 GCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAA 5643513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6723 GCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAA 6782

  5643514 AAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGC 5643573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6783 AAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGC 6842

  5643574 AATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTC 5643633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6843 AATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTC 6902

  5643634 CTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCC 5643683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6903 CTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCC 6952

Alignment time is 8.64704 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,  10158] =>     10158 nucs 'mol-32-3159-013613_10158'

Score:       10014
Aligned:     10163        nucs
Identic:     10147 (100%) nucs =>      6332 (100%)      3815 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5635287,5641632] EXCISED REGION [5642811,5646627]
 second seq =>  [      1,   6341] EXCISED REGION [   6342,  10158]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1178 nucs [5641633,5642810]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5641633,5641633] to [5642811,5642811]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5635287 ATTTTTTCTATTTTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTT 5635346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTTTTCTATTTTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTT 60

  5635347 CTTGAGTTGATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGT 5635406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTGAGTTGATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGT 120

  5635407 TTTTCTAACACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAG 5635466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTCTAACACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAG 180

  5635467 CACTTTGTGAAAGATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGT 5635526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACTTTGTGAAAGATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGT 240

  5635527 TGCATTGGTCTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTT 5635586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCATTGGTCTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTT 300

  5635587 TGTAATATACTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCA 5635646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTAATATACTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCA 360

  5635647 TCTCTAATCGTAATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCAT 5635706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTCTAATCGTAATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCAT 420

  5635707 TAGATCATAGCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCT 5635766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGATCATAGCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCT 480

  5635767 GATGGTTTTATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCA 5635826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATGGTTTTATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCA 540

  5635827 GCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACC 5635886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACC 600

  5635887 AGCCATTATGGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAG 5635946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCCATTATGGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAG 660

  5635947 TTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGT 5636006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGT 720

  5636007 TGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTA 5636066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTA 780

  5636067 GGATTGTTTTTCTGTTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAAT 5636126
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGATTGTTTTTCTATTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAAT 840

  5636127 CCATAGATTGGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAA 5636186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCATAGATTGGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAA 900

  5636187 CATAAGATATCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGG 5636246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATAAGATATCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGG 960

  5636247 TGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGT 5636306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGT 1020

  5636307 ATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGC 5636366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGC 1080

  5636367 TGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATT 5636426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATT 1140

  5636427 CTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAA 5636486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAA 1200

  5636487 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCT 5636546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCT 1260

  5636547 GACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCA 5636606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCA 1320

  5636607 CCACTCCCAGCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAA 5636666
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCACGCCCAGCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAA 1380

  5636667 CACAACTTATTCTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAG 5636726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACAACTTATTCTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAG 1440

  5636727 TTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAG 5636786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAG 1500

  5636787 ACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTT 5636846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTT 1560

  5636847 ATTTCTCCAGCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCT 5636906
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTCCCCAGCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCT 1620

  5636907 ATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGT 5636966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGT 1680

  5636967 ATTTGTCATACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGA 5637026
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTTGTCATACATGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGA 1740

  5637027 GAACACAGTAGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGT 5637086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAACACAGTAGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGT 1800

  5637087 TTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTG 5637146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTG 1860

  5637147 CCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGT 5637206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGT 1920

  5637207 GCCCCACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCA 5637266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCCCCACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCA 1980

  5637267 CCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTC 5637326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTC 2040

  5637327 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACT 5637386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACT 2100

  5637387 AGCGTGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTT 5637446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGCGTGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTT 2160

  5637447 AACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAA 5637506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAA 2220

  5637507 TTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTT 5637566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTT 2280

  5637567 TTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCC 5637626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCC 2340

  5637627 TCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATC 5637686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATC 2400

  5637687 CCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAAC 5637746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAAC 2460

  5637747 ATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAA 5637806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAA 2520

  5637807 CTGAATAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATG 5637866
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGAATAGTACTCCATTATGTACAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATG 2580

  5637867 GACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCA 5637926
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2581 GACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCG 2640

  5637927 GATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTG 5637986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTG 2700

  5637987 TTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTT 5638046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTT 2760

  5638047 TTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCAT 5638106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCAT 2820

  5638107 ATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTT 5638166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTT 2880

  5638167 GAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAAT 5638226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAAT 2940

  5638227 ATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAG 5638286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAG 3000

  5638287 AAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTA 5638346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTA 3060

  5638347 ATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGT 5638406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGT 3120

  5638407 TTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAG 5638466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAG 3180

  5638467 GTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAG 5638526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAG 3240

  5638527 TCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGAT 5638586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGAT 3300

  5638587 TTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTG 5638646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTG 3360

  5638647 ATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTA 5638706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTA 3420

  5638707 TTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAAC 5638766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAAC 3480

  5638767 TTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTC 5638826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTC 3540

  5638827 CATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTA 5638886
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3541 CATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTA 3600

  5638887 AGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTC 5638946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTC 3660

  5638947 TCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTC 5639006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTC 3720

  5639007 CCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGC 5639066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGC 3780

  5639067 CACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTC 5639126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTC 3840

  5639127 AAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCAT 5639186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCAT 3900

  5639187 GAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTT 5639246
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3901 AAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAGTACTTATAGCTATAAATTT 3960

  5639247 CTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATC 5639306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATC 4020

  5639307 ATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATT 5639366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATT 4080

  5639367 CAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGAT 5639426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGAT 4140

  5639427 TTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATAT 5639486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATAT 4200

  5639487 TTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAG 5639546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAG 4260

  5639547 AATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGT 5639606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGT 4320

  5639607 TGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTC 5639666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTC 4380

  5639667 AGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTT 5639726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTT 4440

  5639727 AGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATT 5639786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATT 4500

  5639787 GTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCAC 5639846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCAC 4560

  5639847 AATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTT 5639906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTT 4620

  5639907 TCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTAT 5639966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTAT 4680

  5639967 GTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCC 5640026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCC 4740

  5640027 ACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAG 5640086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAG 4800

  5640087 TAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCT 5640146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCT 4860

  5640147 TTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTT 5640206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTT 4920

  5640207 GCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCA 5640266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCA 4980

  5640267 AGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGC 5640326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGC 5040

  5640327 AGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTT 5640386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTT 5100

  5640387 TAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTG 5640446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTG 5160

  5640447 TTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTC 5640506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTC 5220

  5640507 GTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAA 5640566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAA 5280

  5640567 GAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAA 5640626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAA 5340

  5640627 ACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAG 5640686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 ACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAG 5400

  5640687 CGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGA 5640746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGA 5460

  5640747 ACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTT 5640806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 ACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTT 5520

  5640807 TTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATAC 5640866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATAC 5580

  5640867 TGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCA 5640926
          |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTT----TTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCA 5636

  5640927 CTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCT 5640986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 CTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCT 5696

  5640987 ATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATA 5641046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 ATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATA 5756

  5641047 AAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTT 5641106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 AAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTT 5816

  5641107 TTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCA 5641166
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 TTT-GGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCA 5875

  5641167 CTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGG 5641226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5876 CTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGG 5935

  5641227 GACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT 5641286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5936 GACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT 5995

  5641287 TTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCC 5641346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5996 TTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCC 6055

  5641347 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTT 5641406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6056 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTT 6115

  5641407 CTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTT 5641466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6116 CTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTT 6175

  5641467 CTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTT 5641526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6176 CTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTT 6235

  5641527 CTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAG 5641586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6236 CTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAG 6295

  5641587 GCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCT 5641632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6296 GCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCT 6341

EXCISED REGION

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6342 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 6401

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6402 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 6461

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6462 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 6521

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6522 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 6581

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6582 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 6641

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6642 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 6701

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6702 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 6761

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6762 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 6821

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6822 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 6881

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6882 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 6941

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6942 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 7001

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7002 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 7061

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7062 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 7121

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7122 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 7181

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7182 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 7241

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7242 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 7301

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7302 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 7361

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5643890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7362 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 7421

  5643891 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5643950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7422 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 7481

  5643951 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5644010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7482 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 7541

  5644011 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5644070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7542 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 7601

  5644071 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5644130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7602 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 7661

  5644131 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5644190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7662 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 7721

  5644191 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5644250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7722 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 7781

  5644251 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5644310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7782 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 7841

  5644311 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5644370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7842 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 7901

  5644371 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5644430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7902 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 7961

  5644431 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7962 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 8021

  5644491 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5644550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8022 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 8081

  5644551 TCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 5644610
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8082 TCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 8141

  5644611 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 5644670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8142 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 8201

  5644671 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 5644730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8202 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 8261

  5644731 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 5644790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8262 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 8321

  5644791 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 5644850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8322 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 8381

  5644851 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 5644910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8382 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 8441

  5644911 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 5644970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8442 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 8501

  5644971 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 5645030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8502 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 8561

  5645031 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 5645090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8562 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 8621

  5645091 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 5645150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8622 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 8681

  5645151 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 5645210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8682 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 8741

  5645211 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 5645270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8742 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 8801

  5645271 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 5645330
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     8802 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 8861

  5645331 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 5645390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8862 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 8921

  5645391 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 5645450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8922 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 8981

  5645451 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 5645510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8982 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 9041

  5645511 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 5645570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9042 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 9101

  5645571 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 5645630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9102 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 9161

  5645631 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 5645690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9162 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 9221

  5645691 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 5645750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9222 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 9281

  5645751 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 5645810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9282 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 9341

  5645811 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 5645870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9342 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 9401

  5645871 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 5645930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9402 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 9461

  5645931 CATTTGGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGT 5645990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9462 CATTTGGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGT 9521

  5645991 TAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAA 5646050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9522 TAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAA 9581

  5646051 TACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGAT 5646110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9582 TACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGAT 9641

  5646111 TGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGT 5646170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9642 TGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGT 9701

  5646171 TATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTG 5646230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9702 TATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTG 9761

  5646231 TCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCT 5646290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9762 TCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCT 9821

  5646291 TCATGTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCA 5646350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9822 TCATGTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCA 9881

  5646351 TGTAATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATA 5646410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9882 TGTAATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATA 9941

  5646411 AAATTCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTG 5646470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9942 AAATTCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTG 10001

  5646471 TAATGCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGG 5646530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10002 TAATGCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGG 10061

  5646531 CACAATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAA 5646590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10062 CACAATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAA 10121

  5646591 TAGGGTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCA 5646627
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10122 TAGGGTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCA 10158

Alignment time is 12.2739 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3817] =>      3817 nucs 'mol-32-3159-013613_3817'

Score:        3805
Aligned:      3816        nucs
Identic:      3815 (100%) nucs =>      1744 (100%)      2071 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5642811,5644554] EXCISED REGION [5644556,5646627]
 second seq =>  [      1,   1744] EXCISED REGION [   1746,   3817]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5644555,5644555]
 second seq =>         1 nucs [1745,1745]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5644554,5644554] to [5644555,5644555]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 60

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 120

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 180

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 240

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 300

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 360

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 420

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 480

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 540

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 600

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 660

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 720

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 780

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 840

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 900

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 960

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 1020

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5643890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 1080

  5643891 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5643950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 1140

  5643951 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5644010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 1200

  5644011 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5644070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 1260

  5644071 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5644130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 1320

  5644131 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5644190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 1380

  5644191 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5644250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 1440

  5644251 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5644310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 1500

  5644311 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5644370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 1560

  5644371 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5644430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 1620

  5644431 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 1680

  5644491 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5644550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 1740

  5644551 TCTG 5644554
          ||||
     1741 TCTG 1744

EXCISED REGION

  5644556 TATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAATATTT 5644615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 TATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAATATTT 1805

  5644616 TTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATTTGAGT 5644675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATTTGAGT 1865

  5644676 CATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACATTTGTA 5644735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACATTTGTA 1925

  5644736 TACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCAACTAC 5644795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCAACTAC 1985

  5644796 TAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGTGACTG 5644855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGTGACTG 2045

  5644856 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 5644915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 2105

  5644916 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 5644975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 2165

  5644976 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 5645035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 2225

  5645036 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 5645095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 2285

  5645096 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 5645155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 2345

  5645156 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 5645215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 2405

  5645216 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 5645275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 2465

  5645276 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 5645335
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 2525

  5645336 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 5645395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 2585

  5645396 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 5645455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 2645

  5645456 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 5645515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 2705

  5645516 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 5645575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 2765

  5645576 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 5645635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 2825

  5645636 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 5645695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 2885

  5645696 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 5645755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 2945

  5645756 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 5645815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 3005

  5645816 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 5645875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 3065

  5645876 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 5645935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 3125

  5645936 GGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAGA 5645995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 GGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAGA 3185

  5645996 AATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACAG 5646055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 AATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACAG 3245

  5646056 TGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGATTGCCA 5646115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 TGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGATTGCCA 3305

  5646116 TTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGTTATTA 5646175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 TTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGTTATTA 3365

  5646176 ATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTGTCCGT 5646235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 ATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTGTCCGT 3425

  5646236 TGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCTTCATG 5646295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 TGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCTTCATG 3485

  5646296 TATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCATGTAA 5646355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 TATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCATGTAA 3545

  5646356 TGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATAAAATT 5646415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 TGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATAAAATT 3605

  5646416 CTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTGTAATG 5646475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 CTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTGTAATG 3665

  5646476 CATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGGCACAA 5646535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 CATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGGCACAA 3725

  5646536 TTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAATAGGG 5646595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 TTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAATAGGG 3785

  5646596 TATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCA 5646627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 TATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCA 3817

Alignment time is 5.25328 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   9273] =>      9273 nucs 'mol-32-316f-168292_9273'

Score:        9118
Aligned:      9278        nucs
Identic:      9261 (100%) nucs =>      8568 (100%)       693 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5633048,5641632] EXCISED REGION [5642811,5643503]
 second seq =>  [      1,   8580] EXCISED REGION [   8581,   9273]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1178 nucs [5641633,5642810]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5641633,5641633] to [5642811,5642811]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5633048 TCTTGTGAGATATCACTGTTGTAGGTAGCTAATAAAAAGCTGAAATGGGCAAATAATTAC 5633107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTGTGAGATATCACTGTTGTAGGTAGCTAATAAAAAGCTGAAATGGGCAAATAATTAC 60

  5633108 TAGGCTTATAAAATAAATTATATGTCGTTTAGTAATCCTGAGCAAAAACTTAGTTCCCAT 5633167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGGCTTATAAAATAAATTATATGTCGTTTAGTAATCCTGAGCAAAAACTTAGTTCCCAT 120

  5633168 TGGTATGTGCTAATCATGGAAAAAAACAATGATATGTCAAAAGAACCAAGCTTTGGATCA 5633227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGTATGTGCTAATCATGGAAAAAAACAATGATATGTCAAAAGAACCAAGCTTTGGATCA 180

  5633228 GGTATGTGATTAACTGTGTTGACCTCAGGAAGACCATTTTATTTGTATTTTCCCAGCATT 5633287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTATGTGATTAACTGTGTTGACCTCAGGAAGACCATTTTATTTGTATTTTCCCAGCATT 240

  5633288 CCCATTTCTCACCCTTTTAACTCTATTACTTTCTCCAGAGAGCCTTCTTTATAAATTCAC 5633347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCATTTCTCACCCTTTTAACTCTATTACTTTCTCCAGAGAGCCTTCTTTATAAATTCAC 300

  5633348 TGCTCTGAAGTCTTCTAGGGTTCACTGTTGATGAAAGAATGGAGTTCAAACTCCTTAGTT 5633407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCTCTGAAGTCTTCTAGGGTTCACTGTTGATGAAAGAATGGAGTTCAAACTCCTTAGTT 360

  5633408 TGATATCACAGACACTCCCTTCTTGGAATGCTCTCTTGCCTCATTTCTGCCTGTCAGAGT 5633467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATATCACAGACACTCCCTTCTTGGAATGCTCTCTTGCCTCATTTCTGCCTGTCAGAGT 420

  5633468 ATTATCTATCCTTTAACTGCTGTTGAAATCCTTTCTTTATGAGTCATTCTTTACCTACCG 5633527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTATCTATCCTTTAACTGCTGTTGAAATCCTTTCTTTATGAGTCATTCTTTACCTACCG 480

  5633528 TAACCATAAGTGTTCATTTTTCTGATGAACTACTGCTTCCCCACTACTGCCAGCTTTGTT 5633587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAACCATAAGTGTTCATTTTTCTGATGAACTACTGCTTCCCCACTACTGCCAGCTTTGTT 540

  5633588 GAGGTATAATTGACAAATAAAAATTGTATATATTTAAGGTGTGCTGTGCGATACTTAGAT 5633647
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACGTATAATTGACAAATAAAAATTGTATATATTTAAGGTGTGCTGTGCGATACTTAGAT 600

  5633648 CTACCCTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTCTAATTAACAGATCCACCATCTCACACAGC 5633707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTACCCTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTCTAATTAACAGATCCACCATCTCACACAGC 660

  5633708 TCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACACTTAAGACCTACTCTCTTAGCAAATTTCA 5633767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACACTTAAGACCTACTCTCTTAGCAAATTTCA 720

  5633768 AGTATACAATATATGTTAATTATGGAAATAAATGTCATTATTAACGATAGTTACTGGGCC 5633827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTATACAATATATGTTAATTATGGAAATAAATGTCATTATTAACGATAGTTACTGGGCC 780

  5633828 ATGCATTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTTATACCTGAAAATTTGTACCTTTGACTGAA 5633887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGCATTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTTATACCTGAAAATTTGTACCTTTGACTGAA 840

  5633888 ATACTCCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCTGGTAATCATCGTTCTATTCTCTGTTCCTA 5633947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATACTCCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCTGGTAATCATCGTTCTATTCTCTGTTCCTA 900

  5633948 TGAATTTGACGTCTTTATATTCCATATATGAGATCATGAAGTTGTTTTTTGTCTTGCTTA 5634007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAATTTGACGTCTTTATATTCCATATATGAGATCATGAAGTTGTTTTTTGTCTTGCTTA 960

  5634008 CTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATGTTGTTGCAGATGGCAGGATTTCCTTGTTT 5634067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATGTTGTTGCAGATGGCAGGATTTCCTTGTTT 1020

  5634068 TTTAAAGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTATGTGTGTGTGTTACATTTTCTTTATCCAT 5634127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTAAAGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTATGTGTGTGTGTTACATTTTCTTTATCCAT 1080

  5634128 TCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCTGTATCTTGGCTACTTTGAATAATGCTGCA 5634187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCTGTATCTTGGCTACTTTGAATAATGCTGCA 1140

  5634188 ATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATACTGATTTCAATTCCTTTGGATATATA 5634247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATACTGATTTCAATTCCTTTGGATATATA 1200

  5634248 CCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTTTTAGTTTGAGGAACTTCTGT 5634307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTTTTAGTTTGAGGAACTTCTGT 1260

  5634308 TTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAGTGTACAGGGAGGGGATCCCT 5634367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAGTGTACAGGGAGGGGATCCCT 1320

  5634368 TTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTCTTGATAATAGATATCCTAAC 5634427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTCTTGATAATAGATATCCTAAC 1380

  5634428 AGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTGATGATTAGTGTATTGAGCAC 5634487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTGATGATTAGTGTATTGAGCAC 1440

  5634488 CTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCAGATCTCTTGTCCATTTTTAA 5634547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCAGATCTCTTGTCCATTTTTAA 1500

  5634548 ATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTCGGTACTGAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCT 5634607
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTTGGTACTGAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCT 1560

  5634608 TGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTTTGCAGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTT 5634667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTTTGCAGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTT 1620

  5634668 GCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTACTGTACAATAACTTAATTTCATGTAATCCT 5634727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTACTGTACAATAACTTAATTTCATGTAATCCT 1680

  5634728 ACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGCTTTCCATGTCATCCAAAATACCATCGTGA 5634787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGCTTTCCATGTCATCCAAAATACCATCGTGA 1740

  5634788 AAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTTTCTTCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTT 5634847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTTTCTTCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTT 1800

  5634848 TACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATTTTAATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTG 5634907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATTTTAATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTG 1860

  5634908 TGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTTGATACAGGACTATAGTCACCCTGTTGTACTAT 5634967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTTGATACAGGACTATAGTCACCCTGTTGTACTAT 1920

  5634968 CAAATACTAGATTTTATTCATCATCATCACCATTATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCT 5635027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAAATACTAGATTTTATTCATCATCATCACCATTATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCT 1980

  5635028 GTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGGCTTACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCA 5635087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGGCTTACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCA 2040

  5635088 AGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAGCTGGGAGTACAGATGCATGCCACCATGCC 5635147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAGCTGGGAGTACAGATGCATGCCACCATGCC 2100

  5635148 TAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCT 5635207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCT 2160

  5635208 GGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCA 5635267
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2161 GGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCG 2220

  5635268 CCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCC 5635327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCC 2280

  5635328 CCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCT 5635387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCT 2340

  5635388 TAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGAT 5635447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGAT 2400

  5635448 GTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTA 5635507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTA 2460

  5635508 TTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACT 5635567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACT 2520

  5635568 ATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTA 5635627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTA 2580

  5635628 TTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCA 5635687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCA 2640

  5635688 GGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATA 5635747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATA 2700

  5635748 GTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCT 5635807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCT 2760

  5635808 GTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTA 5635867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTA 2820

  5635868 AGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAA 5635927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAA 2880

  5635928 TTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAAT 5635987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAAT 2940

  5635988 GTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTG 5636047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTG 3000

  5636048 TGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTGTTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCT 5636107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTATTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCT 3060

  5636108 GATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATT 5636167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATT 3120

  5636168 AATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTA 5636227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTA 3180

  5636228 TTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTT 5636287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTT 3240

  5636288 TGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTC 5636347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTC 3300

  5636348 TCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGC 5636407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGC 3360

  5636408 CTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCC 5636467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCC 3420

  5636468 TGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGC 5636527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGC 3480

  5636528 CAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTG 5636587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTG 3540

  5636588 GGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACT 5636647
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGATTATAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACT 3600

  5636648 CATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTT 5636707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTT 3660

  5636708 TACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAA 5636767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAA 3720

  5636768 GATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTA 5636827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTA 3780

  5636828 AGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACT 5636887
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCCCCAGCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACT 3840

  5636888 ATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTA 5636947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTA 3900

  5636948 ATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTT 5637007
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACATGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTT 3960

  5637008 AGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTG 5637067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTG 4020

  5637068 TTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCT 5637127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCT 4080

  5637128 CAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAG 5637187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAG 4140

  5637188 TAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTT 5637247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTT 4200

  5637248 TTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTG 5637307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTG 4260

  5637308 ATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGC 5637367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGC 4320

  5637368 CATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTA 5637427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTA 4380

  5637428 TTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTAT 5637487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTAT 4440

  5637488 TTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTA 5637547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTA 4500

  5637548 GGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCC 5637607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCC 4560

  5637608 CCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAA 5637667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAA 4620

  5637668 TTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGC 5637727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGC 4680

  5637728 CTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCG 5637787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCG 4740

  5637788 GATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTT 5637847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4741 GATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTACAAGTACCATGTTTTCTTT 4800

  5637848 ATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGG 5637907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGG 4860

  5637908 GCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTAT 5637967
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTAT 4920

  5637968 GATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTAT 5638027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTAT 4980

  5638028 ACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAG 5638087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 ACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAG 5040

  5638088 CATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACAT 5638147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACAT 5100

  5638148 TGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCAT 5638207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCAT 5160

  5638208 GATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTT 5638267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTT 5220

  5638268 TCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTC 5638327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTC 5280

  5638328 TGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTC 5638387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTC 5340

  5638388 CTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAAT 5638447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAAT 5400

  5638448 TGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGT 5638507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGT 5460

  5638508 TCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTA 5638567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTA 5520

  5638568 GGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAG 5638627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAG 5580

  5638628 TTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCC 5638687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCC 5640

  5638688 TTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTT 5638747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTT 5700

  5638748 ATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCA 5638807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCA 5760

  5638808 AGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTC 5638867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 AGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTC 5820

  5638868 TTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTG 5638927
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTG 5880

  5638928 TTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTC 5638987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTC 5940

  5638988 TCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGT 5639047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGT 6000

  5639048 TGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCA 5639107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCA 6060

  5639108 TGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAA 5639167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAA 6120

  5639168 AGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAA 5639227
          |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     6121 AGTGCTAGGATTCAGGCATAAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAG 6180

  5639228 TACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGAT 5639287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGAT 6240

  5639288 ATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTG 5639347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 ATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTG 6300

  5639348 CACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTC 5639407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 CACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTC 6360

  5639408 CAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTA 5639467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 CAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTA 6420

  5639468 TTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGA 5639527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 TTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGA 6480

  5639528 TCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAAT 5639587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 TCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAAT 6540

  5639588 ATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTT 5639647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 ATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTT 6600

  5639648 CTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATT 5639707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 CTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATT 6660

  5639708 GAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGG 5639767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 GAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGG 6720

  5639768 TGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATA 5639827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 TGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATA 6780

  5639828 ATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAAT 5639887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 ATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAAT 6840

  5639888 TACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAG 5639947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 TACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAG 6900

  5639948 TCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTG 5640007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 TCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTG 6960

  5640008 TTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATT 5640067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 TTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATT 7020

  5640068 CAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTT 5640127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 CAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTT 7080

  5640128 TGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGG 5640187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 TGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGG 7140

  5640188 TGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGA 5640247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 TGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGA 7200

  5640248 GTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACT 5640307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 GTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACT 7260

  5640308 TAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTG 5640367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 TAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTG 7320

  5640368 TAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTT 5640427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 TAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTT 7380

  5640428 TTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGT 5640487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 TTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGT 7440

  5640488 CGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTAC 5640547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 CGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTAC 7500

  5640548 AATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGA 5640607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 AATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGA 7560

  5640608 GTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCT 5640667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 GTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCT 7620

  5640668 GTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATA 5640727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 GTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATA 7680

  5640728 CTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTG 5640787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 CTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTG 7740

  5640788 ATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGG 5640847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 ATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGG 7800

  5640848 ATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCA 5640907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||
     7801 ATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTT----TTTTTGTCAGCA 7856

  5640908 CTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTG 5640967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7857 CTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTG 7916

  5640968 TCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGA 5641027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7917 TCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGA 7976

  5641028 TCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAG 5641087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7977 TCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAG 8036

  5641088 GTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 5641147
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8037 GTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTT-GGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 8095

  5641148 GTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCT 5641207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8096 GTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCT 8155

  5641208 CAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTA 5641267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8156 CAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTA 8215

  5641268 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCA 5641327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8216 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCA 8275

  5641328 TGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCG 5641387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8276 TGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCG 8335

  5641388 GCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATA 5641447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8336 GCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATA 8395

  5641448 CTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAAC 5641507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8396 CTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAAC 8455

  5641508 TTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCC 5641567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8456 TTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCC 8515

  5641568 TTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCT 5641627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8516 TTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCT 8575

  5641628 CCTCT 5641632
          |||||
     8576 CCTCT 8580

EXCISED REGION

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 8640

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 8700

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 8760

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 8820

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 8880

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8881 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 8940

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8941 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 9000

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9001 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 9060

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9061 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 9120

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9121 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 9180

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9181 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 9240

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTT 5643503
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     9241 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTT 9273

Alignment time is 11.2483 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   4202] =>      4202 nucs 'mol-32-321f-027352_4202'

Score:        4152
Aligned:      4196        nucs
Identic:      4192 (100%) nucs =>      2290 (100%)      1902 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5642561,5644853] EXCISED REGION [5644856,5646758]
 second seq =>  [      8,   2299] EXCISED REGION [   2300,   4202]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [5644854,5644855]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5644854,5644854] to [5644856,5644856]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5642561 GTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTC 5642620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        8 GTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTC 67

  5642621 CCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACA 5642680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       68 CCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACA 127

  5642681 GGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATC 5642740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      128 GGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATC 187

  5642741 ATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATT 5642800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      188 ATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATT 247

  5642801 TTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACT 5642860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      248 TTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACT 307

  5642861 TTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAA 5642920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 TTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAA 367

  5642921 AATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAA 5642980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 AATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAA 427

  5642981 GATATTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACC 5643040
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 GATCTTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACC 487

  5643041 TGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAG 5643100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 TGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAG 547

  5643101 ACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCA 5643160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 ACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCA 607

  5643161 GCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGAT 5643220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 GCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGAT 667

  5643221 TGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTA 5643280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 TGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTA 727

  5643281 AATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATAT 5643340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      728 AATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATAT 787

  5643341 AAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTA 5643400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 AAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTA 847

  5643401 AATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGA 5643460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      848 AATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGA 907

  5643461 TTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTA 5643520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 TTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTA 967

  5643521 TGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGC 5643580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 TGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGC 1027

  5643581 CCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGT 5643640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 CCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGT 1087

  5643641 AAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTT 5643700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 AAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTT 1147

  5643701 CAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGT 5643760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 CAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGT 1207

  5643761 ATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAA 5643820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 ATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAA 1267

  5643821 TATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTC 5643880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 TATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTC 1327

  5643881 ATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCT 5643940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 ATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCT 1387

  5643941 TTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCA 5644000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 TTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCA 1447

  5644001 TAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAA 5644060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 TAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAA 1507

  5644061 TTTGCTATGGTTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACA 5644120
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 TTTGCTATGGTTTAAATTTT-AAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACA 1566

  5644121 TTGATTTTTAGTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACAT 5644180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 TTGATTTTTAGTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACAT 1626

  5644181 TTATATCAGCCTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGC 5644240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 TTATATCAGCCTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGC 1686

  5644241 CTTAGAAAACCTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATAT 5644300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 CTTAGAAAACCTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATAT 1746

  5644301 CATTGGAATCATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTT 5644360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 CATTGGAATCATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTT 1806

  5644361 GAGGTGCATCCAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAA 5644420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 GAGGTGCATCCAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAA 1866

  5644421 GTGCAGTTTTTTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATC 5644480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 GTGCAGTTTTTTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATC 1926

  5644481 ATCAGCTAAAGAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCA 5644540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 ATCAGCTAAAGAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCA 1986

  5644541 TCCTTCTGAGTCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTT 5644600
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 TCCTTCTGAGTCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTT 2046

  5644601 TGTTGCTGAATATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTT 5644660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 TGTTGCTGAATATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTT 2106

  5644661 GACAGGTATTTGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTG 5644720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 GACAGGTATTTGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTG 2166

  5644721 CTGTAAACATTTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACC 5644780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 CTGTAAACATTTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACC 2226

  5644781 TAGGAGTGCAACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTT 5644840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 TAGGAGTGCAACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTT 2286

  5644841 GTTCCAAAGTGAC 5644853
          |||||||||||||
     2287 GTTCCAAAGTGAC 2299

EXCISED REGION

  5644856 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 5644915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 2359

  5644916 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 5644975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 2419

  5644976 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 5645035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 2479

  5645036 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 5645095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 2539

  5645096 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 5645155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 2599

  5645156 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 5645215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 2659

  5645216 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 5645275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 2719

  5645276 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 5645335
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 2779

  5645336 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 5645395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 2839

  5645396 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 5645455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 2899

  5645456 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 5645515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 2959

  5645516 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 5645575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 3019

  5645576 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 5645635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 3079

  5645636 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 5645695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 3139

  5645696 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 5645755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 3199

  5645756 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 5645815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 3259

  5645816 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 5645875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 3319

  5645876 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 5645935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 3379

  5645936 GGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAGA 5645995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 GGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAGA 3439

  5645996 AATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACAG 5646055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 AATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACAG 3499

  5646056 TGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGATTGCCA 5646115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 TGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGATTGCCA 3559

  5646116 TTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGTTATTA 5646175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 TTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGTTATTA 3619

  5646176 ATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTGTCCGT 5646235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 ATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTGTCCGT 3679

  5646236 TGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCTTCATG 5646295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 TGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCTTCATG 3739

  5646296 TATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCATGTAA 5646355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 TATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCATGTAA 3799

  5646356 TGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATAAAATT 5646415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 TGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATAAAATT 3859

  5646416 CTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTGTAATG 5646475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 CTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTGTAATG 3919

  5646476 CATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGGCACAA 5646535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 CATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGGCACAA 3979

  5646536 TTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAATAGGG 5646595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 TTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAATAGGG 4039

  5646596 TATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAGTACCCA 5646655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 TATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAGTACCCA 4099

  5646656 CTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTATCCCCT 5646715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 CTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTATCCCCT 4159

  5646716 CTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGG 5646758
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4160 CTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGG 4202

Alignment time is 5.57064 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,  11406] =>     11406 nucs 'mol-32-322a-295115_11406'

Score:       11228
Aligned:     11410        nucs
Identic:     11391 (100%) nucs =>      6251 (100%)      5140 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5635367,5641632] EXCISED REGION [5642811,5647953]
 second seq =>  [      1,   6262] EXCISED REGION [   6263,  11406]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1178 nucs [5641633,5642810]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5641633,5641633] to [5642811,5642811]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5635367 TAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATGGTGTT 5635426
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
        1 TAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACGCTATGGTGTT 60

  5635427 GAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGATTGACT 5635486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGATTGACT 120

  5635487 ATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGTATCTC 5635546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGTATCTC 180

  5635547 TTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGAAATCA 5635606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGAAATCA 240

  5635607 GGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATCCTCAT 5635666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATCCTCAT 300

  5635667 AATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGAGTTTT 5635726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGAGTTTT 360

  5635727 CCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTG 5635786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTG 420

  5635787 ACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCT 5635846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCT 480

  5635847 TCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATC 5635906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATC 540

  5635907 TATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAA 5635966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAA 600

  5635967 ATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCC 5636026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCC 660

  5636027 TTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTGTTTATG 5636086
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      661 TTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTATTTATG 720

  5636087 TGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAG 5636146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAG 780

  5636147 TAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTT 5636206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTT 840

  5636207 ATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATG 5636266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATG 900

  5636267 TATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTT 5636326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTT 960

  5636327 CTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATC 5636386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATC 1020

  5636387 TCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGA 5636446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGA 1080

  5636447 GTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAG 5636506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAG 1140

  5636507 ACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTG 5636566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTG 1200

  5636567 CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCATGTTTTC 5636626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1201 CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGCCATGTTTTC 1260

  5636627 TTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATAT 5636686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATAT 1320

  5636687 TGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTT 5636746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTT 1380

  5636747 TTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTT 5636806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTT 1440

  5636807 GAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAGATTATA 5636866
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1441 GAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCCCCAGCTAGATTATA 1500

  5636867 AGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAA 5636926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1501 AGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATGGTGCCTTGTACAAGGAA 1560

  5636927 GATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTGTGGCAC 5636986
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1561 GATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACATGTGGCAC 1620

  5636987 AGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATT 5637046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATT 1680

  5637047 TATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGT 5637106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGT 1740

  5637107 TGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCT 5637166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCT 1800

  5637167 GTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAA 5637226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAA 1860

  5637227 TTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTC 5637286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTC 1920

  5637287 TTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 5637346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1980

  5637347 GCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAAT 5637406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAAT 2040

  5637407 CAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAA 5637466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAA 2100

  5637467 TCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACC 5637526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACC 2160

  5637527 CTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTT 5637586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTT 2220

  5637587 CCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCAC 5637646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCAC 2280

  5637647 TCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACAT 5637706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACAT 2340

  5637707 GCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCAT 5637766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCAT 2400

  5637767 CCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATG 5637826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATG 2460

  5637827 TGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTT 5637886
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TACAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTT 2520

  5637887 GAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGAGGAAAGGCTTT 5637946
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2521 GAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGAGGAAAGGCTTT 2580

  5637947 CGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTAT 5638006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTAT 2640

  5638007 GTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAAT 5638066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAAT 2700

  5638067 TTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTC 5638126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTC 2760

  5638127 TGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTG 5638186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTG 2820

  5638187 GAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAG 5638246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAG 2880

  5638247 CTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTT 5638306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTT 2940

  5638307 CTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGA 5638366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGA 3000

  5638367 GTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCT 5638426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCT 3060

  5638427 TCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACT 5638486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACT 3120

  5638487 GGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTT 5638546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTT 3180

  5638547 CTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATT 5638606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATT 3240

  5638607 TTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGC 5638666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGC 3300

  5638667 GGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTT 5638726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTT 3360

  5638727 TAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTT 5638786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTT 3420

  5638787 TGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTA 5638846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTA 3480

  5638847 CTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATT 5638906
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATT 3540

  5638907 TATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGA 5638966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGA 3600

  5638967 GTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCC 5639026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCC 3660

  5639027 CACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTT 5639086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTT 3720

  5639087 TGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAA 5639146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAA 3780

  5639147 TCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCAT 5639206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3781 TCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATAAGCCACTATACCCGGCCAT 3840

  5639207 TTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTG 5639266
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTTTCTTCTTTTATGGTGTAGTACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTG 3900

  5639267 CTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTT 5639326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTT 3960

  5639327 CAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATT 5639386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATT 4020

  5639387 TCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTAT 5639446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTAT 4080

  5639447 GAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATC 5639506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATC 4140

  5639507 ATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTT 5639566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTT 4200

  5639567 TGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTC 5639626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTC 4260

  5639627 CGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTT 5639686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTT 4320

  5639687 GAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTT 5639746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTT 4380

  5639747 TGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGAT 5639806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGAT 4440

  5639807 TGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTA 5639866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTA 4500

  5639867 TTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCT 5639926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCT 4560

  5639927 TTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGG 5639986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGG 4620

  5639987 GCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGG 5640046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGG 4680

  5640047 AGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTG 5640106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTG 4740

  5640107 ATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTT 5640166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTT 4800

  5640167 AGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTAT 5640226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTAT 4860

  5640227 CTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCAT 5640286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCAT 4920

  5640287 TATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTG 5640346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTG 4980

  5640347 TTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACT 5640406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACT 5040

  5640407 TTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTG 5640466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTG 5100

  5640467 TACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACT 5640526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACT 5160

  5640527 TAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTT 5640586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTT 5220

  5640587 ATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGT 5640646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGT 5280

  5640647 TATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGG 5640706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGG 5340

  5640707 TTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTC 5640766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTC 5400

  5640767 TTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTG 5640826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTG 5460

  5640827 TTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTT 5640886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTT 5520

  5640887 TGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGA 5640946
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TGTTT----TTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGA 5576

  5640947 TTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCT 5641006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 TTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCT 5636

  5641007 TTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAG 5641066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 TTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAG 5696

  5641067 TTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTC 5641126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 TTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTC 5756

  5641127 TGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGG 5641186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 TGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGG 5816

  5641187 GTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACC 5641246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 GTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACC 5876

  5641247 ACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAT 5641306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 ACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAT 5936

  5641307 GGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 5641366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 GGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 5996

  5641367 AGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTG 5641426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 AGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTG 6056

  5641427 GCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCT 5641486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 GCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCT 6116

  5641487 CTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGC 5641546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 CTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGC 6176

  5641547 CAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTA 5641606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 CAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTA 6236

  5641607 TTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCT 5641632
          ||||||||||||||||||||||||||
     6237 TTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCT 6262

EXCISED REGION

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6263 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 6322

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6323 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 6382

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6383 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 6442

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6443 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 6502

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6503 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 6562

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6563 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 6622

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6623 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 6682

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6683 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 6742

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6743 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 6802

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6803 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 6862

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6863 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 6922

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6923 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 6982

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6983 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 7042

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7043 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 7102

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7103 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 7162

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7163 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 7222

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7223 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 7282

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5643890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7283 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 7342

  5643891 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5643950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7343 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 7402

  5643951 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5644010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7403 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 7462

  5644011 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5644070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7463 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 7522

  5644071 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5644130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7523 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 7582

  5644131 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5644190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7583 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 7642

  5644191 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5644250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7643 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 7702

  5644251 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5644310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7703 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 7762

  5644311 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5644370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7763 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 7822

  5644371 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5644430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7823 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 7882

  5644431 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7883 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 7942

  5644491 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5644550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7943 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 8002

  5644551 TCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 5644610
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8003 TCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 8062

  5644611 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 5644670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8063 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 8122

  5644671 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 5644730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8123 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 8182

  5644731 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 5644790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8183 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 8242

  5644791 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 5644850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8243 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 8302

  5644851 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 5644910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8303 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 8362

  5644911 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 5644970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8363 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 8422

  5644971 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 5645030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8423 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 8482

  5645031 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 5645090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8483 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 8542

  5645091 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 5645150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8543 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 8602

  5645151 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 5645210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8603 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 8662

  5645211 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 5645270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8663 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 8722

  5645271 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 5645330
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     8723 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 8782

  5645331 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 5645390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8783 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 8842

  5645391 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 5645450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8843 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 8902

  5645451 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 5645510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8903 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 8962

  5645511 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 5645570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8963 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 9022

  5645571 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 5645630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9023 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 9082

  5645631 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 5645690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9083 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 9142

  5645691 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 5645750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9143 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 9202

  5645751 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 5645810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9203 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 9262

  5645811 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 5645870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9263 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 9322

  5645871 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 5645930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9323 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 9382

  5645931 CATTTGGTTATTCTATAGG-TTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATG 5645989
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9383 CATTTGGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATG 9442

  5645990 TTAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCA 5646049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9443 TTAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCA 9502

  5646050 ATACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGA 5646109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9503 ATACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGA 9562

  5646110 TTGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGG 5646169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9563 TTGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGG 9622

  5646170 TTATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGT 5646229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9623 TTATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGT 9682

  5646230 GTCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGC 5646289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9683 GTCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGC 9742

  5646290 TTCATGTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCC 5646349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9743 TTCATGTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCC 9802

  5646350 ATGTAATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTAT 5646409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9803 ATGTAATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTAT 9862

  5646410 AAAATTCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGT 5646469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9863 AAAATTCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGT 9922

  5646470 GTAATGCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATG 5646529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9923 GTAATGCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATG 9982

  5646530 GCACAATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCA 5646589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9983 GCACAATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCA 10042

  5646590 ATAGGGTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAG 5646649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10043 ATAGGGTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAG 10102

  5646650 TACCCACTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTA 5646709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10103 TACCCACTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTA 10162

  5646710 TCCCCTCTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGGGTTACATTTTT 5646769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10163 TCCCCTCTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGGGTTACATTTTT 10222

  5646770 ACTCTCTTTGTAGTAGCCATTGATGCACAGCATTTTCAATTTTGATGAAGTCTGTCTTAC 5646829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10223 ACTCTCTTTGTAGTAGCCATTGATGCACAGCATTTTCAATTTTGATGAAGTCTGTCTTAC 10282

  5646830 CTATTTTTTTTTGTTGCCTGTGCTTTCAGTATCATATCCAAGAAATTGTTTTCAAATCCA 5646889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10283 CTATTTTTTTTTGTTGCCTGTGCTTTCAGTATCATATCCAAGAAATTGTTTTCAAATCCA 10342

  5646890 AAGTCATGAAGTTTTTGGCTTGTGTTTTCTTCTAAGAGTTTTATAGGGTGAGGTCTTCTG 5646949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10343 AAGTCATGAAGTTTTTGGCTTGTGTTTTCTTCTAAGAGTTTTATAGGGTGAGGTCTTCTG 10402

  5646950 TTTAGAGTTTTGATCACTTTGAGACAATTTTTGTATATAGTATAAGATAAGGGTCCAGCT 5647009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10403 TTTAGAGTTTTGATCACTTTGAGACAATTTTTGTATATAGTATAAGATAAGGGTCCAGCT 10462

  5647010 TTATTTTTTTACATGTGGATATCCAGTTTTCCCAGCACTGTTTGTTGAAAAGACTTTCTT 5647069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10463 TTATTTTTTTACATGTGGATATCCAGTTTTCCCAGCACTGTTTGTTGAAAAGACTTTCTT 10522

  5647070 TCCTTTTCCCCTTTGAATGGTCTAGGTAGCCTTGTGGAAAATAATTTGACTATTTATGCA 5647129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10523 TCCTTTTCCCCTTTGAATGGTCTAGGTAGCCTTGTGGAAAATAATTTGACTATTTATGCA 10582

  5647130 AGAGTGTATTTCTGGACTCTGTGTTTTATTCTGTTGGTCTATATGTGTATCCTTGTGCCA 5647189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10583 AGAGTGTATTTCTGGACTCTGTGTTTTATTCTGTTGGTCTATATGTGTATCCTTGTGCCA 10642

  5647190 GTACGACAGTATTTTGATTGCTGTAGTCTTCTAGTAAGTTTTGATGTCAGGAAATGTGAG 5647249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10643 GTACGACAGTATTTTGATTGCTGTAGTCTTCTAGTAAGTTTTGATGTCAGGAAATGTGAG 10702

  5647250 ACGTCCAACTTTGTTATTTTCAAGTTTGTTTTGTCTATTCGAGGTCTCTTGGGAATCCAT 5647309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10703 ACGTCCAACTTTGTTATTTTCAAGTTTGTTTTGTCTATTCGAGGTCTCTTGGGAATCCAT 10762

  5647310 ATGAATTTTAGGATGGATTTTTCTGTTTCTGCTAAAAATGCTGTTAGGATTTTGAAAGGA 5647369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10763 ATGAATTTTAGGATGGATTTTTCTGTTTCTGCTAAAAATGCTGTTAGGATTTTGAAAGGA 10822

  5647370 CTTACATTGACTATGTAGATTGCTTTGGGTAGTATTGACATCTTAACAATATTAAATTTT 5647429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
    10823 CTTACATTGACTATGTAGATTGCTTTGGGTAGTATTGACATCTTAACAGTATTAAATTTT 10882

  5647430 CTAATCCATGAACAGAGGATATCTTTTCATTTATTTGTGTCTAATTTCTTTCAGTGATAT 5647489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10883 CTAATCCATGAACAGAGGATATCTTTTCATTTATTTGTGTCTAATTTCTTTCAGTGATAT 10942

  5647490 TTTGCAGTTTTCACTGTAGAAGTCTTTTGCCTGCTTGGTTAGGTTTAGTCCTAAGTACTT 5647549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10943 TTTGCAGTTTTCACTGTAGAAGTCTTTTGCCTGCTTGGTTAGGTTTAGTCCTAAGTACTT 11002

  5647550 TATTCTTTTTGATGTTACGGTTTGCTGATTTTTCTGTGTTGATTTTGTATTCTGCAGTTT 5647609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11003 TATTCTTTTTGATGTTACGGTTTGCTGATTTTTCTGTGTTGATTTTGTATTCTGCAGTTT 11062

  5647610 TCCTGAATTCATTCATTCTAACAGGTTTGTTGTTGTTGTGGAATCTTTAGAGTCTTTACA 5647669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11063 TCCTGAATTCATTCATTCTAACAGGTTTGTTGTTGTTGTGGAATCTTTAGAGTCTTTACA 11122

  5647670 TATAAGATCATGTCATCTTCAAACATATAATTTTACTTATTCATTTCCAAGTTAGATTTA 5647729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11123 TATAAGATCATGTCATCTTCAAACATATAATTTTACTTATTCATTTCCAAGTTAGATTTA 11182

  5647730 TTTTATTTCATTTCCTTGCTGATTGCTCTGGCTAGGGCTTTAGGTATTACGTTGAATGGA 5647789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11183 TTTTATTTCATTTCCTTGCTGATTGCTCTGGCTAGGGCTTTAGGTATTACGTTGAATGGA 11242

  5647790 AGTGGTAAGAATGGGCATCTTTGTCTTAATTCTGACCTTTGAGGAAAAGCTTTCCATCTT 5647849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11243 AGTGGTAAGAATGGGCATCTTTGTCTTAATTCTGACCTTTGAGGAAAAGCTTTCCATCTT 11302

  5647850 TTCACCATTGAGTTTGATGCTGGTTACAAGTTGTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTGTT 5647909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11303 TTCACCATTGAGTTTGATGCTGGTTACAAGTTGTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTGTT 11362

  5647910 TGTTTTTTGTTTGTGTGTGTGGGGGTGGGTGGTGGTGGTGGTGG 5647953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11363 TGTTTTTTGTTTGTGTGTGTGGGGGTGGGTGGTGGTGGTGGTGG 11406

Alignment time is 13.9551 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   5144] =>      5144 nucs 'mol-32-322a-295115_5144'

Score:        5110
Aligned:      5143        nucs
Identic:      5140 (100%) nucs =>      1744 (100%)      3396 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5642811,5644554] EXCISED REGION [5644556,5647953]
 second seq =>  [      1,   1744] EXCISED REGION [   1746,   5144]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5644555,5644555]
 second seq =>         1 nucs [1745,1745]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3140,3140]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5644554,5644554] to [5644555,5644555]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 60

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 120

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 180

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 240

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 300

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 360

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 420

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 480

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 540

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 600

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 660

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 720

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 780

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 840

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 900

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 960

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 1020

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5643890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 1080

  5643891 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5643950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 1140

  5643951 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5644010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 1200

  5644011 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5644070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 1260

  5644071 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5644130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 1320

  5644131 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5644190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 1380

  5644191 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5644250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 1440

  5644251 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5644310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 1500

  5644311 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5644370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 1560

  5644371 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5644430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 1620

  5644431 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 1680

  5644491 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5644550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 1740

  5644551 TCTG 5644554
          ||||
     1741 TCTG 1744

EXCISED REGION

  5644556 TATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAATATTT 5644615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 TATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAATATTT 1805

  5644616 TTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATTTGAGT 5644675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATTTGAGT 1865

  5644676 CATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACATTTGTA 5644735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACATTTGTA 1925

  5644736 TACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCAACTAC 5644795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCAACTAC 1985

  5644796 TAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGTGACTG 5644855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGTGACTG 2045

  5644856 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 5644915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCGTTCTA 2105

  5644916 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 5644975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGACTAAAA 2165

  5644976 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 5645035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 AATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTTATATA 2225

  5645036 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 5645095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTGTCCAT 2285

  5645096 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 5645155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 TTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGCTCAAG 2345

  5645156 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 5645215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 TGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCATGCCTC 2405

  5645216 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 5645275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 ACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAAC 2465

  5645276 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 5645335
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 TCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGATGCCCA 2525

  5645336 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 5645395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 GACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTTTATAT 2585

  5645396 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 5645455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 GTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAAGTACA 2645

  5645456 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 5645515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 TTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCATTTTCC 2705

  5645516 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 5645575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 CAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCAGTCCC 2765

  5645576 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 5645635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 TGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTCAGACA 2825

  5645636 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 5645695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 AGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGTCTTAA 2885

  5645696 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 5645755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 GTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATGATACT 2945

  5645756 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 5645815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 CCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACACATGG 3005

  5645816 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 5645875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 GCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACAAATAT 3065

  5645876 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 5645935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 CCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTTCATTT 3125

  5645936 GGTTATTCTATAGG-TTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAG 5645994
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 GGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATGTTAAG 3185

  5645995 AAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACA 5646054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 AAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCAATACA 3245

  5646055 GTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGATTGCC 5646114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 GTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGATTGCC 3305

  5646115 ATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGTTATT 5646174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 ATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGGTTATT 3365

  5646175 AATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTGTCCG 5646234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 AATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGTGTCCG 3425

  5646235 TTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCTTCAT 5646294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 TTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGCTTCAT 3485

  5646295 GTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCATGTA 5646354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 GTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCCATGTA 3545

  5646355 ATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATAAAAT 5646414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 ATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTATAAAAT 3605

  5646415 TCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTGTAAT 5646474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 TCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGTGTAAT 3665

  5646475 GCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGGCACA 5646534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 GCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATGGCACA 3725

  5646535 ATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAATAGG 5646594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 ATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCAATAGG 3785

  5646595 GTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAGTACCC 5646654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 GTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAGTACCC 3845

  5646655 ACTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTATCCCC 5646714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 ACTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTATCCCC 3905

  5646715 TCTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGGGTTACATTTTTACTCT 5646774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 TCTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGGGTTACATTTTTACTCT 3965

  5646775 CTTTGTAGTAGCCATTGATGCACAGCATTTTCAATTTTGATGAAGTCTGTCTTACCTATT 5646834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 CTTTGTAGTAGCCATTGATGCACAGCATTTTCAATTTTGATGAAGTCTGTCTTACCTATT 4025

  5646835 TTTTTTTGTTGCCTGTGCTTTCAGTATCATATCCAAGAAATTGTTTTCAAATCCAAAGTC 5646894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 TTTTTTTGTTGCCTGTGCTTTCAGTATCATATCCAAGAAATTGTTTTCAAATCCAAAGTC 4085

  5646895 ATGAAGTTTTTGGCTTGTGTTTTCTTCTAAGAGTTTTATAGGGTGAGGTCTTCTGTTTAG 5646954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 ATGAAGTTTTTGGCTTGTGTTTTCTTCTAAGAGTTTTATAGGGTGAGGTCTTCTGTTTAG 4145

  5646955 AGTTTTGATCACTTTGAGACAATTTTTGTATATAGTATAAGATAAGGGTCCAGCTTTATT 5647014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 AGTTTTGATCACTTTGAGACAATTTTTGTATATAGTATAAGATAAGGGTCCAGCTTTATT 4205

  5647015 TTTTTACATGTGGATATCCAGTTTTCCCAGCACTGTTTGTTGAAAAGACTTTCTTTCCTT 5647074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 TTTTTACATGTGGATATCCAGTTTTCCCAGCACTGTTTGTTGAAAAGACTTTCTTTCCTT 4265

  5647075 TTCCCCTTTGAATGGTCTAGGTAGCCTTGTGGAAAATAATTTGACTATTTATGCAAGAGT 5647134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 TTCCCCTTTGAATGGTCTAGGTAGCCTTGTGGAAAATAATTTGACTATTTATGCAAGAGT 4325

  5647135 GTATTTCTGGACTCTGTGTTTTATTCTGTTGGTCTATATGTGTATCCTTGTGCCAGTACG 5647194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 GTATTTCTGGACTCTGTGTTTTATTCTGTTGGTCTATATGTGTATCCTTGTGCCAGTACG 4385

  5647195 ACAGTATTTTGATTGCTGTAGTCTTCTAGTAAGTTTTGATGTCAGGAAATGTGAGACGTC 5647254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4386 ACAGTATTTTGATTGCTGTAGTCTTCTAGTAAGTTTTGATGTCAGGAAATGTGAGACGTC 4445

  5647255 CAACTTTGTTATTTTCAAGTTTGTTTTGTCTATTCGAGGTCTCTTGGGAATCCATATGAA 5647314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4446 CAACTTTGTTATTTTCAAGTTTGTTTTGTCTATTCGAGGTCTCTTGGGAATCCATATGAA 4505

  5647315 TTTTAGGATGGATTTTTCTGTTTCTGCTAAAAATGCTGTTAGGATTTTGAAAGGACTTAC 5647374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4506 TTTTAGGATGGATTTTTCTGTTTCTGCTAAAAATGCTGTTAGGATTTTGAAAGGACTTAC 4565

  5647375 ATTGACTATGTAGATTGCTTTGGGTAGTATTGACATCTTAACAATATTAAATTTTCTAAT 5647434
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4566 ATTGACTATGTAGATTGCTTTGGGTAGTATTGACATCTTAACAGTATTAAATTTTCTAAT 4625

  5647435 CCATGAACAGAGGATATCTTTTCATTTATTTGTGTCTAATTTCTTTCAGTGATATTTTGC 5647494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4626 CCATGAACAGAGGATATCTTTTCATTTATTTGTGTCTAATTTCTTTCAGTGATATTTTGC 4685

  5647495 AGTTTTCACTGTAGAAGTCTTTTGCCTGCTTGGTTAGGTTTAGTCCTAAGTACTTTATTC 5647554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4686 AGTTTTCACTGTAGAAGTCTTTTGCCTGCTTGGTTAGGTTTAGTCCTAAGTACTTTATTC 4745

  5647555 TTTTTGATGTTACGGTTTGCTGATTTTTCTGTGTTGATTTTGTATTCTGCAGTTTTCCTG 5647614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4746 TTTTTGATGTTACGGTTTGCTGATTTTTCTGTGTTGATTTTGTATTCTGCAGTTTTCCTG 4805

  5647615 AATTCATTCATTCTAACAGGTTTGTTGTTGTTGTGGAATCTTTAGAGTCTTTACATATAA 5647674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4806 AATTCATTCATTCTAACAGGTTTGTTGTTGTTGTGGAATCTTTAGAGTCTTTACATATAA 4865

  5647675 GATCATGTCATCTTCAAACATATAATTTTACTTATTCATTTCCAAGTTAGATTTATTTTA 5647734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4866 GATCATGTCATCTTCAAACATATAATTTTACTTATTCATTTCCAAGTTAGATTTATTTTA 4925

  5647735 TTTCATTTCCTTGCTGATTGCTCTGGCTAGGGCTTTAGGTATTACGTTGAATGGAAGTGG 5647794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4926 TTTCATTTCCTTGCTGATTGCTCTGGCTAGGGCTTTAGGTATTACGTTGAATGGAAGTGG 4985

  5647795 TAAGAATGGGCATCTTTGTCTTAATTCTGACCTTTGAGGAAAAGCTTTCCATCTTTTCAC 5647854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4986 TAAGAATGGGCATCTTTGTCTTAATTCTGACCTTTGAGGAAAAGCTTTCCATCTTTTCAC 5045

  5647855 CATTGAGTTTGATGCTGGTTACAAGTTGTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTGTTTGTTT 5647914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5046 CATTGAGTTTGATGCTGGTTACAAGTTGTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTGTTTGTTT 5105

  5647915 TTTGTTTGTGTGTGTGGGGGTGGGTGGTGGTGGTGGTGG 5647953
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5106 TTTGTTTGTGTGTGTGGGGGTGGGTGGTGGTGGTGGTGG 5144

Alignment time is 6.64675 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,  11045] =>     11045 nucs 'mol-32-331c-125498_11045'

Score:       10946
Aligned:     11045        nucs
Identic:     11036 (100%) nucs =>       489 (100%)     10547 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5632232,5632720] EXCISED REGION [5632722,5643277]
 second seq =>  [      1,    489] EXCISED REGION [    491,  11045]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5632721,5632721]
 second seq =>         1 nucs [490,490]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [5641097,5641097]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5632232 TTGTGGAAGGGACAGTCGTTTAGTAGTCTAAGCTGGTTGTTTCAATGTTCAAAAGAATTG 5632291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGGAAGGGACAGTCGTTTAGTAGTCTAAGCTGGTTGTTTCAATGTTCAAAAGAATTG 60

  5632292 TGGAAATTGTATGTGTACAGTGATAATTCATAAGACTGAATCTCTATTAAAATCTCTAAC 5632351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGAAATTGTATGTGTACAGTGATAATTCATAAGACTGAATCTCTATTAAAATCTCTAAC 120

  5632352 TGTACATTATATGGGTCTTCTAATGAACTTTTATGTACTACTTATACCTACTGTCCTCTA 5632411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTACATTATATGGGTCTTCTAATGAACTTTTATGTACTACTTATACCTACTGTCCTCTA 180

  5632412 TTCTAAGTAGGTATTCGGAATTCCACTGTTTAGACTCATATCTCTTCAGAATTATTTCCT 5632471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTAAGTAGGTATTCGGAATTCCACTGTTTAGACTCATATCTCTTCAGAATTATTTCCT 240

  5632472 ACCCCAAATTTGAGAAATACAGTATAGTGTTGTTTATGAACAAAAGAGCCTCTAGATAGT 5632531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCCCAAATTTGAGAAATACAGTATAGTGTTGTTTATGAACAAAAGAGCCTCTAGATAGT 300

  5632532 TACTTAGCTTTTTTATATTGGAGCCCCAATATTATATTTTGGAGCCCCCCAAATGGTGTT 5632591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACTTAGCTTTTTTATATTGGAGCCCCAATATTATATTTTGGAGCCCCCCAAATGGTGTT 360

  5632592 AAAAAAAGGCTCAGTATGTGTAGGCTAGATTGGGGTGGTAGAGGTAGAACTTGACTGGGG 5632651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAAAAGGCTCAGTATGTGTAGGCTAGATTGGGGTGGTAGAGGTAGAACTTGACTGGGG 420

  5632652 GCAGTTGGTACATTTCTGCTAAGGTTATTGTAAAAGGACTAGTTTCAGCTTTGAGGATGA 5632711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAGTTGGTACATTTCTGCTAAGGTTATTGTAAAAGGACTAGTTTCAGCTTTGAGGATGA 480

  5632712 AACTGTTGC 5632720
          |||||||||
      481 AACTGTTGC 489

EXCISED REGION

  5632722 TAAGGTAGGTTATGATTTATGATTGACGTAGGTGTAGTGTGAGATGAATTACATTTTGTA 5632781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 TAAGGTAGGTTATGATTTATGATTGACGTAGGTGTAGTGTGAGATGAATTACATTTTGTA 550

  5632782 CTGTACTGAGGGCCCAGAATTATTCCTTTAATATACTAACTGTGACTATGAAAGTCTATA 5632841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 CTGTACTGAGGGCCCAGAATTATTCCTTTAATATACTAACTGTGACTATGAAAGTCTATA 610

  5632842 TATGTGAACATCAGAATGGTATCTTTGAATTTAGCCATTCTAAATTAGATGTATAGACAT 5632901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 TATGTGAACATCAGAATGGTATCTTTGAATTTAGCCATTCTAAATTAGATGTATAGACAT 670

  5632902 TCTCGTTTTTCAGGTCACCGACTTTAAACATTTAAATTAGCTTCAGAAGTATTTTTGAAC 5632961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 TCTCGTTTTTCAGGTCACCGACTTTAAACATTTAAATTAGCTTCAGAAGTATTTTTGAAC 730

  5632962 ATCAACTGTAAAAGACAGATGTGTATAAAAGGGATGAAGAGACATGTTATATGTTAGTGT 5633021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 ATCAACTGTAAAAGACAGATGTGTATAAAAGGGATGAAGAGACATGTTATATGTTAGTGT 790

  5633022 GTTAGATGTTAGTGTGTTAATATAAATCTTGTGAGATATCACTGTTGTAGGTAGCTAATA 5633081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 GTTAGATGTTAGTGTGTTAATATAAATCTTGTGAGATATCACTGTTGTAGGTAGCTAATA 850

  5633082 AAAAGCTGAAATGGGCAAATAATTACTAGGCTTATAAAATAAATTATATGTCGTTTAGTA 5633141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 AAAAGCTGAAATGGGCAAATAATTACTAGGCTTATAAAATAAATTATATGTCGTTTAGTA 910

  5633142 ATCCTGAGCAAAAACTTAGTTCCCATTGGTATGTGCTAATCATGGAAAAAAACAATGATA 5633201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 ATCCTGAGCAAAAACTTAGTTCCCATTGGTATGTGCTAATCATGGAAAAAAACAATGATA 970

  5633202 TGTCAAAAGAACCAAGCTTTGGATCAGGTATGTGATTAACTGTGTTGACCTCAGGAAGAC 5633261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 TGTCAAAAGAACCAAGCTTTGGATCAGGTATGTGATTAACTGTGTTGACCTCAGGAAGAC 1030

  5633262 CATTTTATTTGTATTTTCCCAGCATTCCCATTTCTCACCCTTTTAACTCTATTACTTTCT 5633321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 CATTTTATTTGTATTTTCCCAGCATTCCCATTTCTCACCCTTTTAACTCTATTACTTTCT 1090

  5633322 CCAGAGAGCCTTCTTTATAAATTCACTGCTCTGAAGTCTTCTAGGGTTCACTGTTGATGA 5633381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 CCAGAGAGCCTTCTTTATAAATTCACTGCTCTGAAGTCTTCTAGGGTTCACTGTTGATGA 1150

  5633382 AAGAATGGAGTTCAAACTCCTTAGTTTGATATCACAGACACTCCCTTCTTGGAATGCTCT 5633441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 AAGAATGGAGTTCAAACTCCTTAGTTTGATATCACAGACACTCCCTTCTTGGAATGCTCT 1210

  5633442 CTTGCCTCATTTCTGCCTGTCAGAGTATTATCTATCCTTTAACTGCTGTTGAAATCCTTT 5633501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 CTTGCCTCATTTCTGCCTGTCAGAGTATTATCTATCCTTTAACTGCTGTTGAAATCCTTT 1270

  5633502 CTTTATGAGTCATTCTTTACCTACCGTAACCATAAGTGTTCATTTTTCTGATGAACTACT 5633561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 CTTTATGAGTCATTCTTTACCTACCGTAACCATAAGTGTTCATTTTTCTGATGAACTACT 1330

  5633562 GCTTCCCCACTACTGCCAGCTTTGTTGAGGTATAATTGACAAATAAAAATTGTATATATT 5633621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 GCTTCCCCACTACTGCCAGCTTTGTTGAGGTATAATTGACAAATAAAAATTGTATATATT 1390

  5633622 TAAGGTGTGCTGTGCGATACTTAGATCTACCCTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTCTAA 5633681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 TAAGGTGTGCTGTGCGATACTTAGATCTACCCTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTCTAA 1450

  5633682 TTAACAGATCCACCATCTCACACAGCTCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACACTT 5633741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 TTAACAGATCCACCATCTCACACAGCTCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACACTT 1510

  5633742 AAGACCTACTCTCTTAGCAAATTTCAAGTATACAATATATGTTAATTATGGAAATAAATG 5633801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 AAGACCTACTCTCTTAGCAAATTTCAAGTATACAATATATGTTAATTATGGAAATAAATG 1570

  5633802 TCATTATTAACGATAGTTACTGGGCCATGCATTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTTATA 5633861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 TCATTATTAACGATAGTTACTGGGCCATGCATTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTTATA 1630

  5633862 CCTGAAAATTTGTACCTTTGACTGAAATACTCCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCTGGT 5633921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 CCTGAAAATTTGTACCTTTGACTGAAATACTCCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCTGGT 1690

  5633922 AATCATCGTTCTATTCTCTGTTCCTATGAATTTGACGTCTTTATATTCCATATATGAGAT 5633981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 AATCATCGTTCTATTCTCTGTTCCTATGAATTTGACGTCTTTATATTCCATATATGAGAT 1750

  5633982 CATGAAGTTGTTTTTTGTCTTGCTTACTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATGTTG 5634041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 CATGAAGTTGTTTTTTGTCTTGCTTACTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATGTTG 1810

  5634042 TTGCAGATGGCAGGATTTCCTTGTTTTTTAAAGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTATGT 5634101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 TTGCAGATGGCAGGATTTCCTTGTTTTTTAAAGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTATGT 1870

  5634102 GTGTGTGTTACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCTGTA 5634161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 GTGTGTGTTACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCTGTA 1930

  5634162 TCTTGGCTACTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATA 5634221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 TCTTGGCTACTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATA 1990

  5634222 CTGATTTCAATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTC 5634281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 CTGATTTCAATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTC 2050

  5634282 CTGTTTTTAGTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGT 5634341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 CTGTTTTTAGTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGT 2110

  5634342 CAATAGTGTACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTT 5634401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 CAATAGTGTACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTT 2170

  5634402 AACTTCTTGATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATC 5634461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 AACTTCTTGATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATC 2230

  5634462 TCCCTGATGATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATC 5634521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 TCCCTGATGATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATC 2290

  5634522 TGTTCAGATCTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTCGGTACT 5634581
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2291 TGTTCAGATCTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTTGGTACT 2350

  5634582 GAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTTTGC 5634641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 GAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTTTGC 2410

  5634642 AGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTACTGT 5634701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 AGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTACTGT 2470

  5634702 ACAATAACTTAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGCTTT 5634761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 ACAATAACTTAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGCTTT 2530

  5634762 CCATGTCATCCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTTTCT 5634821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 CCATGTCATCCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTTTCT 2590

  5634822 TCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATTTTA 5634881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 TCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATTTTA 2650

  5634882 ATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTTGATACA 5634941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 ATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTTGATACA 2710

  5634942 GGACTATAGTCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATCACCATT 5635001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 GGACTATAGTCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATCACCATT 2770

  5635002 ATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGGCTT 5635061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 ATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGGCTT 2830

  5635062 ACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAGCTG 5635121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 ACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAGCTG 2890

  5635122 GGAGTACAGATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGCTGT 5635181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 GGAGTACAGATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGCTGT 2950

  5635182 GTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTAA 5635241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 GTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTAA 3010

  5635242 AGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTTT 5635301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 AGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTTT 3070

  5635302 TGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGTG 5635361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 TGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGTG 3130

  5635362 TAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATG 5635421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 TAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATG 3190

  5635422 GTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGAT 5635481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 GTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGAT 3250

  5635482 TGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGT 5635541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 TGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGT 3310

  5635542 ATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGA 5635601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 ATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGA 3370

  5635602 AATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATC 5635661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 AATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATC 3430

  5635662 CTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGA 5635721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 CTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGA 3490

  5635722 GTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGT 5635781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 GTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGT 3550

  5635782 GTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGC 5635841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 GTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGC 3610

  5635842 CTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACT 5635901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 CTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACT 3670

  5635902 GAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTG 5635961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 GAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTG 3730

  5635962 TGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGA 5636021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 TGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGA 3790

  5636022 TGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTGT 5636081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 TGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTGT 3850

  5636082 TTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTG 5636141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3851 TTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTG 3910

  5636142 GATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGC 5636201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3911 GATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGC 3970

  5636202 CATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTT 5636261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3971 CATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTT 4030

  5636262 AAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTC 5636321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4031 AAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTC 4090

  5636322 TTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAG 5636381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4091 TTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAG 4150

  5636382 CGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCT 5636441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4151 CGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCT 4210

  5636442 CCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAG 5636501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4211 CCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAG 4270

  5636502 TAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCT 5636561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4271 TAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCT 4330

  5636562 GCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCATG 5636621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4331 GCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCATG 4390

  5636622 TTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTG 5636681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4391 TTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTG 4450

  5636682 TATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGG 5636741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4451 TATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGG 4510

  5636742 TGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTT 5636801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4511 TGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTT 4570

  5636802 CCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAGA 5636861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4571 CCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAGA 4630

  5636862 TTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACA 5636921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4631 TTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACA 4690

  5636922 AGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTGT 5636981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4691 AGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTGT 4750

  5636982 GGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTAT 5637041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4751 GGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTAT 4810

  5637042 ATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCC 5637101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4811 ATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCC 4870

  5637102 CAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAG 5637161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4871 CAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAG 4930

  5637162 CAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTG 5637221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4931 CAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTG 4990

  5637222 GCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGC 5637281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4991 GCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGC 5050

  5637282 TGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGAT 5637341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5051 TGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGAT 5110

  5637342 TACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTA 5637401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5111 TACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTA 5170

  5637402 ACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCA 5637461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5171 ACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCA 5230

  5637462 AACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAG 5637521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5231 AACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAG 5290

  5637522 TCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAG 5637581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5291 TCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAG 5350

  5637582 CCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTT 5637641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5351 CCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTT 5410

  5637642 TCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAG 5637701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5411 TCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAG 5470

  5637702 AACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGT 5637761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5471 AACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGT 5530

  5637762 TCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCA 5637821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5531 TCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCA 5590

  5637822 TTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACT 5637881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5591 TTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACT 5650

  5637882 GTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGAGGAAAG 5637941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5651 GTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGAGGAAAG 5710

  5637942 GCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTT 5638001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5711 GCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTT 5770

  5638002 ATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGT 5638061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5771 ATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGT 5830

  5638062 TGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTT 5638121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5831 TGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTT 5890

  5638122 CATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCAT 5638181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5891 CATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCAT 5950

  5638182 CCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTC 5638241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5951 CCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTC 6010

  5638242 ATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTA 5638301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6011 ATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTA 6070

  5638302 GTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAG 5638361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6071 GTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAG 6130

  5638362 AATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGT 5638421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6131 AATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGT 6190

  5638422 GTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCT 5638481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6191 GTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCT 6250

  5638482 TTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTG 5638541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6251 TTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTG 6310

  5638542 AATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCT 5638601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6311 AATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCT 6370

  5638602 AGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATT 5638661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6371 AGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATT 6430

  5638662 TTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTC 5638721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6431 TTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTC 6490

  5638722 TCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGG 5638781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6491 TCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGG 6550

  5638782 TCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTC 5638841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6551 TCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTC 6610

  5638842 TGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGG 5638901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6611 TGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGG 6670

  5638902 TTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGG 5638961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6671 TTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGG 6730

  5638962 CTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGAT 5639021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6731 CTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGAT 6790

  5639022 CCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTA 5639081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6791 CCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTA 6850

  5639082 ATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCA 5639141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6851 ATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCA 6910

  5639142 AGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCG 5639201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6911 AGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCG 6970

  5639202 GCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGC 5639261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6971 GCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGC 7030

  5639262 TTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAA 5639321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7031 TTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAA 7090

  5639322 GTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTT 5639381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     7091 GTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATCCAGGAACATATTGTT 7150

  5639382 TAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCT 5639441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7151 TAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCT 7210

  5639442 ATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGAC 5639501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7211 ATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGAC 7270

  5639502 CTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCA 5639561
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     7271 CTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCTATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCA 7330

  5639562 CCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATT 5639621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7331 CCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATT 7390

  5639622 AAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAG 5639681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7391 AAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAG 7450

  5639682 GTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTT 5639741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7451 GTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTT 7510

  5639742 TGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGC 5639801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7511 TGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGC 7570

  5639802 TGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAA 5639861
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7571 TGGATTGACTCTTTTCTCAGTTTATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAA 7630

  5639862 ATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAA 5639921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7631 ATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAA 7690

  5639922 TATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCT 5639981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7691 TATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCT 7750

  5639982 TGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTG 5640041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7751 TGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTG 7810

  5640042 ATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCA 5640101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7811 ATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCA 7870

  5640102 TTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTC 5640161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7871 TTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTC 7930

  5640162 CTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTG 5640221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7931 CTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTG 7990

  5640222 TGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAA 5640281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7991 TGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAA 8050

  5640282 CCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACA 5640341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8051 CCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACA 8110

  5640342 AAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCT 5640401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8111 AAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCT 8170

  5640402 ACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCT 5640461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8171 ACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCT 8230

  5640462 TACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTT 5640521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8231 TACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTT 8290

  5640522 CTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGT 5640581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8291 CTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGT 8350

  5640582 TATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAA 5640641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8351 TATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAA 8410

  5640642 GGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCT 5640701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8411 GGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCT 8470

  5640702 GATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGC 5640761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8471 GATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGC 8530

  5640762 ATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGT 5640821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8531 ATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGT 8590

  5640822 CTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAAT 5640881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8591 CTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAAT 8650

  5640882 GCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTG 5640941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8651 GCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTG 8710

  5640942 TAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTG 5641001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8711 TAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTG 8770

  5641002 TTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTT 5641061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8771 TTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTT 8830

  5641062 GAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCT 5641121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     8831 GAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTC-TTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCT 8889

  5641122 TGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCT 5641181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8890 TGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCT 8949

  5641182 CCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCA 5641241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8950 CCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCA 9009

  5641242 CCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCC 5641301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9010 CCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCC 9069

  5641302 AGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGG 5641361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9070 AGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGG 9129

  5641362 ATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCT 5641421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9130 ATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCT 9189

  5641422 GCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAA 5641481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9190 GCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAA 9249

  5641482 GTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTT 5641541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9250 GTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTT 9309

  5641542 AAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTT 5641601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9310 AAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTT 9369

  5641602 TTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAA 5641661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9370 TTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAA 9429

  5641662 GCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCT 5641721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9430 GCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCT 9489

  5641722 TCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAA 5641781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9490 TCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAA 9549

  5641782 TTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCT 5641841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9550 TTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCT 9609

  5641842 TTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCT 5641901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9610 TTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCT 9669

  5641902 GTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGG 5641961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9670 GTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGG 9729

  5641962 ATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTA 5642021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9730 ATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTA 9789

  5642022 TTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCC 5642081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9790 TTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCC 9849

  5642082 AGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGA 5642141
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9850 AGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGA 9909

  5642142 GGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAG 5642201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9910 GGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAG 9969

  5642202 ACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTC 5642261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9970 ACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTC 10029

  5642262 TCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTG 5642321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10030 TCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTG 10089

  5642322 AAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTG 5642381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10090 AAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTG 10149

  5642382 TCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAG 5642441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10150 TCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAG 10209

  5642442 GTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCA 5642501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10210 GTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCA 10269

  5642502 GGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTG 5642561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10270 GGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTG 10329

  5642562 TTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCC 5642621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10330 TTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCC 10389

  5642622 CACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAG 5642681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10390 CACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAG 10449

  5642682 GGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCA 5642741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10450 GGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCA 10509

  5642742 TTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTT 5642801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10510 TTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTT 10569

  5642802 TACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTT 5642861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10570 TACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTT 10629

  5642862 TTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAA 5642921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10630 TTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAA 10689

  5642922 ATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAG 5642981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10690 ATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAG 10749

  5642982 ATATTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCT 5643041
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10750 ATCTTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCT 10809

  5643042 GTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGA 5643101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10810 GTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGA 10869

  5643102 CCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAG 5643161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10870 CCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAG 10929

  5643162 CTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATT 5643221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10930 CTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATT 10989

  5643222 GTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTT 5643277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10990 GTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTT 11045

Alignment time is 13.3007 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   9822] =>      9822 nucs 'mol-32-3332-032134_9822'

Score:        9744
Aligned:      9821        nucs
Identic:      9814 (100%) nucs =>       204 (100%)      9610 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5631926,5632129] EXCISED REGION [5632131,5641747]
 second seq =>  [      1,    204] EXCISED REGION [    206,   9822]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5632130,5632130]
 second seq =>         1 nucs [205,205]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5632129,5632129] to [5632131,5632131]
 second seq =>         1 nucs [204,204] to [206,206]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5631926 TAAATTAAAGGGCTATCAGTTATACTTCCATAATTTAGAGTGAATTGGTTTAAAAAGTTC 5631985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAATTAAAGGGCTATCAGTTATACTTCCATAATTTAGAGTGAATTGGTTTAAAAAGTTC 60

  5631986 TCATGGAGCTGCTAAAAGCTTTGATTTTTGAGAGGCTGTAGATACAAGTAGTTTTATAAT 5632045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCATGGAGCTGCTAAAAGCTTTGATTTTTGAGAGGCTGTAGATACAAGTAGTTTTATAAT 120

  5632046 AATATGTGAAGATCTACAGGATTTTACAGAGTTGAAGTCTTACAGCTGCTTGAGGGCATT 5632105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATATGTGAAGATCTACAGGATTTTACAGAGTTGAAGTCTTACAGCTGCTTGAGGGCATT 180

  5632106 TGAAGGCAGGGAGACATGCTCGTA 5632129
          ||||||||||||||||||||||||
      181 TGAAGGCAGGGAGACATGCTCGTA 204

EXCISED REGION

  5632131 AGATGATAAAACAAGATTTGCTTACCTGAAATTTTGTTAGGGCTCACTTAGTAAATCAGG 5632190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      206 AGATGATAAAACAAGATTTGCTTACCTGAAATTTTGTTAGGGCTCACTTAGTAAATCAGG 265

  5632191 CTCTCTTAGGAGTGATATATTTTAAAAAGAGACAACTAGCCTTGTGGAAGGGACAGTCGT 5632250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      266 CTCTCTTAGGAGTGATATATTTTAAAAAGAGACAACTAGCCTTGTGGAAGGGACAGTCGT 325

  5632251 TTAGTAGTCTAAGCTGGTTGTTTCAATGTTCAAAAGAATTGTGGAAATTGTATGTGTACA 5632310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      326 TTAGTAGTCTAAGCTGGTTGTTTCAATGTTCAAAAGAATTGTGGAAATTGTATGTGTACA 385

  5632311 GTGATAATTCATAAGACTGAATCTCTATTAAAATCTCTAACTGTACATTATATGGGTCTT 5632370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      386 GTGATAATTCATAAGACTGAATCTCTATTAAAATCTCTAACTGTACATTATATGGGTCTT 445

  5632371 CTAATGAACTTTTATGTACTACTTATACCTACTGTCCTCTATTCTAAGTAGGTATTCGGA 5632430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      446 CTAATGAACTTTTATGTACTACTTATACCTACTGTCCTCTATTCTAAGTAGGTATTCGGA 505

  5632431 ATTCCACTGTTTAGACTCATATCTCTTCAGAATTATTTCCTACCCCAAATTTGAGAAATA 5632490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      506 ATTCCACTGTTTAGACTCATATCTCTTCAGAATTATTTCCTACCCCAAATTTGAGAAATA 565

  5632491 CAGTATAGTGTTGTTTATGAACAAAAGAGCCTCTAGATAGTTACTTAGCTTTTTTATATT 5632550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      566 CAGTATAGTGTTGTTTATGAACAAAAGAGCCTCTAGATAGTTACTTAGCTTTTTTATATT 625

  5632551 GGAGCCCCAATATTATATTTTGGAGCCCCCCAAATGGTGTTAAAAAAAGGCTCAGTATGT 5632610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      626 GGAGCCCCAATATTATATTTTGGAGCCCCCCAAATGGTGTTAAAAAAAGGCTCAGTATGT 685

  5632611 GTAGGCTAGATTGGGGTGGTAGAGGTAGAACTTGACTGGGGGCAGTTGGTACATTTCTGC 5632670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      686 GTAGGCTAGATTGGGGTGGTAGAGGTAGAACTTGACTGGGGGCAGTTGGTACATTTCTGC 745

  5632671 TAAGGTTATTGTAAAAGGACTAGTTTCAGCTTTGAGGATGAAACTGTTGCATAAGGTAGG 5632730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      746 TAAGGTTATTGTAAAAGGACTAGTTTCAGCTTTGAGGATGAAACTGTTGCGTAAGGTAGG 805

  5632731 TTATGATTTATGATTGACGTAGGTGTAGTGTGAGATGAATTACATTTTGTACTGTACTGA 5632790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      806 TTATGATTTATGATTGACGTAGGTGTAGTGTGAGATGAATTACATTTTGTACTGTACTGA 865

  5632791 GGGCCCAGAATTATTCCTTTAATATACTAACTGTGACTATGAAAGTCTATATATGTGAAC 5632850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      866 GGGCCCAGAATTATTCCTTTAATATACTAACTGTGACTATGAAAGTCTATATATGTGAAC 925

  5632851 ATCAGAATGGTATCTTTGAATTTAGCCATTCTAAATTAGATGTATAGACATTCTCGTTTT 5632910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      926 ATCAGAATGGTATCTTTGAATTTAGCCATTCTAAATTAGATGTATAGACATTCTCGTTTT 985

  5632911 TCAGGTCACCGACTTTAAACATTTAAATTAGCTTCAGAAGTATTTTTGAACATCAACTGT 5632970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      986 TCAGGTCACCGACTTTAAACATTTAAATTAGCTTCAGAAGTATTTTTGAACATCAACTGT 1045

  5632971 AAAAGACAGATGTGTATAAAAGGGATGAAGAGACATGTTATATGTTAGTGTGTTAGATGT 5633030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1046 AAAAGACAGATGTGTATAAAAGGGATGAAGAGACATGTTATATGTTAGTGTGTTAGATGT 1105

  5633031 TAGTGTGTTAATATAAATCTTGTGAGATATCACTGTTGTAGGTAGCTAATAAAAAGCTGA 5633090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1106 TAGTGTGTTAATATAAATCTTGTGAGATATCACTGTTGTAGGTAGCTAATAAAAAGCTGA 1165

  5633091 AATGGGCAAATAATTACTAGGCTTATAAAATAAATTATATGTCGTTTAGTAATCCTGAGC 5633150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1166 AATGGGCAAATAATTACTAGGCTTATAAAATAAATTATATGTCGTTTAGTAATCCTGAGC 1225

  5633151 AAAAACTTAGTTCCCATTGGTATGTGCTAATCATGGAAAAAAACAATGATATGTCAAAAG 5633210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1226 AAAAACTTAGTTCCCATTGGTATGTGCTAATCATGGAAAAAAACAATGATATGTCAAAAG 1285

  5633211 AACCAAGCTTTGGATCAGGTATGTGATTAACTGTGTTGACCTCAGGAAGACCATTTTATT 5633270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1286 AACCAAGCTTTGGATCAGGTATGTGATTAACTGTGTTGACCTCAGGAAGACCATTTTATT 1345

  5633271 TGTATTTTCCCAGCATTCCCATTTCTCACCCTTTTAACTCTATTACTTTCTCCAGAGAGC 5633330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1346 TGTATTTTCCCAGCATTCCCATTTCTCACCCTTTTAACTCTATTACTTTCTCCAGAGAGC 1405

  5633331 CTTCTTTATAAATTCACTGCTCTGAAGTCTTCTAGGGTTCACTGTTGATGAAAGAATGGA 5633390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1406 CTTCTTTATAAATTCACTGCTCTGAAGTCTTCTAGGGTTCACTGTTGATGAAAGAATGGA 1465

  5633391 GTTCAAACTCCTTAGTTTGATATCACAGACACTCCCTTCTTGGAATGCTCTCTTGCCTCA 5633450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1466 GTTCAAACTCCTTAGTTTGATATCACAGACACTCCCTTCTTGGAATGCTCTCTTGCCTCA 1525

  5633451 TTTCTGCCTGTCAGAGTATTATCTATCCTTTAACTGCTGTTGAAATCCTTTCTTTATGAG 5633510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1526 TTTCTGCCTGTCAGAGTATTATCTATCCTTTAACTGCTGTTGAAATCCTTTCTTTATGAG 1585

  5633511 TCATTCTTTACCTACCGTAACCATAAGTGTTCATTTTTCTGATGAACTACTGCTTCCCCA 5633570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1586 TCATTCTTTACCTACCGTAACCATAAGTGTTCATTTTTCTGATGAACTACTGCTTCCCCA 1645

  5633571 CTACTGCCAGCTTTGTTGAGGTATAATTGACAAATAAAAATTGTATATATTTAAGGTGTG 5633630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1646 CTACTGCCAGCTTTGTTGAGGTATAATTGACAAATAAAAATTGTATATATTTAAGGTGTG 1705

  5633631 CTGTGCGATACTTAGATCTACCCTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTCTAATTAACAGAT 5633690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 CTGTGCGATACTTAGATCTACCCTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTCTAATTAACAGAT 1765

  5633691 CCACCATCTCACACAGCTCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACACTTAAGACCTAC 5633750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 CCACCATCTCACACAGCTCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACACTTAAGACCTAC 1825

  5633751 TCTCTTAGCAAATTTCAAGTATACAATATATGTTAATTATGGAAATAAATGTCATTATTA 5633810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 TCTCTTAGCAAATTTCAAGTATACAATATATGTTAATTATGGAAATAAATGTCATTATTA 1885

  5633811 ACGATAGTTACTGGGCCATGCATTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTTATACCTGAAAAT 5633870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 ACGATAGTTACTGGGCCATGCATTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTTATACCTGAAAAT 1945

  5633871 TTGTACCTTTGACTGAAATACTCCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCTGGTAATCATCGT 5633930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 TTGTACCTTTGACTGAAATACTCCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCTGGTAATCATCGT 2005

  5633931 TCTATTCTCTGTTCCTATGAATTTGACGTCTTTATATTCCATATATGAGATCATGAAGTT 5633990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 TCTATTCTCTGTTCCTATGAATTTGACGTCTTTATATTCCATATATGAGATCATGAAGTT 2065

  5633991 GTTTTTTGTCTTGCTTACTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATGTTGTTGCAGATG 5634050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 GTTTTTTGTCTTGCTTACTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATGTTGTTGCAGATG 2125

  5634051 GCAGGATTTCCTTGTTTTTTAAAGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTATGTGTGTGTGTT 5634110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 GCAGGATTTCCTTGTTTTTTAAAGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTATGTGTGTGTGTT 2185

  5634111 ACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCTGTATCTTGGCTA 5634170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 ACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCTGTATCTTGGCTA 2245

  5634171 CTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATACTGATTTCA 5634230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 CTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATACTGATTTCA 2305

  5634231 ATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTTTTA 5634290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 ATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTTTTA 2365

  5634291 GTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAGTGT 5634350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 GTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAGTGT 2425

  5634351 ACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTCTTG 5634410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 ACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTCTTG 2485

  5634411 ATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTGATG 5634470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 ATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTGATG 2545

  5634471 ATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCAGAT 5634530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 ATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCAGAT 2605

  5634531 CTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTCGGTACTGAGTTGTAT 5634590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2606 CTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCTTGGTACTGAGTTGTAT 2665

  5634591 GAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTTTGCAGATATTTT 5634650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 GAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATGGTTTGCAGATATTTT 2725

  5634651 CTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTACTGTACAATAACT 5634710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 CTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTTTACTGTACAATAACT 2785

  5634711 TAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGCTTTCCATGTCAT 5634770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 TAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTGTGCTTTCCATGTCAT 2845

  5634771 CCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTTTCTTCTAGGATT 5634830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 CCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTGTTTTCTTCTAGGATT 2905

  5634831 TGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATTTTAATTTTTGTG 5634890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 TGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTTATTTTAATTTTTGTG 2965

  5634891 GGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTTGATACAGGACTATAG 5634950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 GGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTTGATACAGGACTATAG 3025

  5634951 TCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATCACCATTATTATTTTG 5635010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 TCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATCACCATTATTATTTTG 3085

  5635011 AGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGGCTTACTGCAGCC 5635070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 AGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCATGGCTTACTGCAGCC 3145

  5635071 TCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAGCTGGGAGTACAG 5635130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 TCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAGTAGCTGGGAGTACAG 3205

  5635131 ATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGCTGTGTTGCCCAG 5635190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 ATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCTTGCTGTGTTGCCCAG 3265

  5635191 GCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTAAAGTGCTAGG 5635250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 GCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTAAAGTGCTAGG 3325

  5635251 ATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTTTTGTACCCAT 5635310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 ATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTTTTGTACCCAT 3385

  5635311 TAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGTGTAAGATAAG 5635370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 TAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGTGTAAGATAAG 3445

  5635371 GGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATGGTGTTGAAA 5635430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 GGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTATGGTGTTGAAA 3505

  5635431 AGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGATTGACTATAT 5635490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 AGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGATTGACTATAT 3565

  5635491 ATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGTATCTCTTTT 5635550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 ATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATGTATCTCTTTT 3625

  5635551 TATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGAAATCAGGTT 5635610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 TATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTGAAATCAGGTT 3685

  5635611 GATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATCCTCATAATC 5635670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 GATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAATCCTCATAATC 3745

  5635671 CCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGAGTTTTCCTC 5635730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 CCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGGAGTTTTCCTC 3805

  5635731 ATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTGACTG 5635790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 ATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGTGTTTGACTG 3865

  5635791 TTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCC 5635850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 TTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTGCCTGCTTCCC 3925

  5635851 CTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATCTATT 5635910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 CTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAACTGAATCTATT 3985

  5635911 CAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGG 5635970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 CAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGTGTGAAAATGG 4045

  5635971 ACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGG 5636030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 ACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAGATGGCCTTGG 4105

  5636031 CTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTGTTTATGTGAA 5636090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 CTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTGTTTATGTGAA 4165

  5636091 AATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAGTAGG 5636150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 AATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTTGGATAGTAGG 4225

  5636151 GACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTTATTT 5636210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 GACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAGCCATTTATTT 4285

  5636211 GTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATT 5636270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 GTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGTTAAATGTATT 4345

  5636271 CTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGT 5636330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 CTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGT 4405

  5636331 TTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAA 5636390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 TTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCAA 4465

  5636391 CTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAG 5636450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 CTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAG 4525

  5636451 CTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAG 5636510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 CTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAG 4585

  5636511 GGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTC 5636570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 GGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATCTGCCTGCCTC 4645

  5636571 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCATGTTTTCTTAA 5636630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCATGTTTTCTTAA 4705

  5636631 TTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATATTGAT 5636690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 TTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTTGTATATTGAT 4765

  5636691 TTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTA 5636750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 TTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTGGTGGTTTTTA 4825

  5636751 GGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAAC 5636810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 GGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTTTCCTTTGAAC 4885

  5636811 TACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAGATTATAAGTT 5636870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 TACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAGATTATAAGTT 4945

  5636871 TCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATG 5636930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 TCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTACAAGGAAGATG 5005

  5636931 TTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTGTGGCACAGCA 5636990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 TTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTGTGGCACAGCA 5065

  5636991 ATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATTTATG 5637050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 ATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTATATATTTATG 5125

  5637051 ATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGA 5637110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 ATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGCCCAGGTTGGA 5185

  5637111 GTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCC 5637170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 GTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCAGCTGTCC 5245

  5637171 TGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTT 5637230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 TGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTTGGCTAATTTT 5305

  5637231 TTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGA 5637290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 TTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACGCTGGTCTTGA 5365

  5637291 ACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 5637350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 ACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 5425

  5637351 GAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGT 5637410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 GAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGTAACAATCAGT 5485

  5637411 TCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCA 5637470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 TCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCCAAACAATCCA 5545

  5637471 TATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGT 5637530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 TATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTAGTCACCCTGT 5605

  5637531 TGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCA 5637590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 TGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTAGCCGTTCCCA 5665

  5637591 CCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTT 5637650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 CCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCTTTCCACTCTT 5725

  5637651 TATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGA 5637710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 TATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGAGAACATGCGA 5785

  5637711 TGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCAT 5637770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 TGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAGTTCCATCCAT 5845

  5637771 GTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCA 5637830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 GTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCCATTATGTGCA 5905

  5637831 AGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAAT 5637890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 AGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTACTGTGTTGAAT 5965

  5637891 AACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGT 5637950
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5966 AACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGT 6025

  5637951 TTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTG 5638010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 TTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATGGCTTTTATTATGTTG 6085

  5638011 AGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTT 5638070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 AGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAGGGATGTTGAATTTTT 6145

  5638071 ATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTT 5638130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 ATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTT 6205

  5638131 GATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAAT 5638190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 GATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAAT 6265

  5638191 AAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTG 5638250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 AAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTG 6325

  5638251 TATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTT 5638310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 TATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTT 6385

  5638311 ATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTT 5638370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 ATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTT 6445

  5638371 AGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTT 5638430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 AGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTT 6505

  5638431 TAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGA 5638490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 TAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGA 6565

  5638491 GACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTC 5638550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6566 GACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTC 6625

  5638551 ATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCC 5638610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6626 ATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCC 6685

  5638611 AGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTA 5638670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6686 AGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTA 6745

  5638671 TCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAG 5638730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6746 TCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAG 6805

  5638731 GTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCA 5638790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6806 GTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCA 6865

  5638791 TTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAA 5638850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6866 TTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAA 6925

  5638851 TTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATT 5638910
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6926 TTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATT 6985

  5638911 TGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGC 5638970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6986 TGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGC 7045

  5638971 AGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACC 5639030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7046 AGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACC 7105

  5639031 TCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTA 5639090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7106 TCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTA 7165

  5639091 GAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTG 5639150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7166 GAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTG 7225

  5639151 CCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTT 5639210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7226 CCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTT 7285

  5639211 CTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGT 5639270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7286 CTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGT 7345

  5639271 CTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGT 5639330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7346 CTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGT 7405

  5639331 TTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCA 5639390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7406 TTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCA 7465

  5639391 AGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGA 5639450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7466 AGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGA 7525

  5639451 GAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATAT 5639510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7526 GAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATAT 7585

  5639511 GAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGA 5639570
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7586 GAGCAATCCTTAAGTGATCTATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGA 7645

  5639571 TGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGAT 5639630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7646 TGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGAT 7705

  5639631 GTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAG 5639690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7706 GTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAG 7765

  5639691 TCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTA 5639750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7766 TCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTA 7825

  5639751 TATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGAC 5639810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7826 TATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGAC 7885

  5639811 TCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTT 5639870
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7886 TCTTTTCTCAGTTTATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTT 7945

  5639871 GTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTT 5639930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7946 GTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTT 8005

  5639931 CATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAA 5639990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8006 CATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAA 8065

  5639991 CAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAG 5640050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8066 CAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAG 8125

  5640051 TTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATAT 5640110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8126 TTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATAT 8185

  5640111 ATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTG 5640170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8186 ATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTG 8245

  5640171 AAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGT 5640230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8246 AAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGT 8305

  5640231 TGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATT 5640290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8306 TGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATT 8365

  5640291 TTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTA 5640350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8366 TTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTA 8425

  5640351 AAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAA 5640410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8426 AAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAA 8485

  5640411 CTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACT 5640470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8486 CTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACT 8545

  5640471 ATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAG 5640530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8546 ATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAG 8605

  5640531 AGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTT 5640590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8606 AGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTT 8665

  5640591 GAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATA 5640650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8666 GAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATA 8725

  5640651 CTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTC 5640710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8726 CTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTC 8785

  5640711 TTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGA 5640770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8786 TTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGA 8845

  5640771 GGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTC 5640830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8846 GGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTC 8905

  5640831 TCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTT 5640890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8906 TCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTT 8965

  5640891 TGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTT 5640950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8966 TGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTT 9025

  5640951 TACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTC 5641010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9026 TACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTC 9085

  5641011 TCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTG 5641070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9086 TCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTG 9145

  5641071 TTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTC 5641130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9146 TTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTC 9205

  5641131 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTC 5641190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9206 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTC 9265

  5641191 ACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACAC 5641250
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9266 ATGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACAC 9325

  5641251 CCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTC 5641310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9326 CCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTC 9385

  5641311 TCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 5641370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9386 TCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 9445

  5641371 ATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGT 5641430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9446 ATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGT 9505

  5641431 TCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCT 5641490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9506 TCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCT 9565

  5641491 TATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAAT 5641550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9566 TATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAAT 9625

  5641551 ACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCT 5641610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9626 ACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCT 9685

  5641611 TTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAA 5641670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9686 TTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAA 9745

  5641671 TTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGT 5641730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9746 TTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGT 9805

  5641731 TGGTTGCATTTTTCAAC 5641747
          |||||||||||||||||
     9806 TGGTTGCATTTTTCAAC 9822

Alignment time is 12.1379 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   9018] =>      9018 nucs 'mol-32-3395-179061_9018'

Score:        8941
Aligned:      9018        nucs
Identic:      9011 (100%) nucs =>       947 (100%)      8064 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5633628,5634574] EXCISED REGION [5634576,5642646]
 second seq =>  [      1,    947] EXCISED REGION [    949,   9018]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5634575,5634575]
 second seq =>         1 nucs [948,948]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [5637108,5637108]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [947,947] to [948,948]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5633628 GTGCTGTGCGATACTTAGATCTACCCTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTCTAATTAACA 5633687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCTGTGCGATACTTAGATCTACCCTGTGAGTTGATAATCACAATCAGTCTAATTAACA 60

  5633688 GATCCACCATCTCACACAGCTCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACACTTAAGACC 5633747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATCCACCATCTCACACAGCTCCCTCTTTTTTTGTATGTGGGATGAGAACACTTAAGACC 120

  5633748 TACTCTCTTAGCAAATTTCAAGTATACAATATATGTTAATTATGGAAATAAATGTCATTA 5633807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACTCTCTTAGCAAATTTCAAGTATACAATATATGTTAATTATGGAAATAAATGTCATTA 180

  5633808 TTAACGATAGTTACTGGGCCATGCATTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTTATACCTGAA 5633867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAACGATAGTTACTGGGCCATGCATTAGGTCCCCAGAACGTATTCATCTTATACCTGAA 240

  5633868 AATTTGTACCTTTGACTGAAATACTCCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCTGGTAATCAT 5633927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTTGTACCTTTGACTGAAATACTCCCATTTCACCCACCTCCCAGCCCCTGGTAATCAT 300

  5633928 CGTTCTATTCTCTGTTCCTATGAATTTGACGTCTTTATATTCCATATATGAGATCATGAA 5633987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGTTCTATTCTCTGTTCCTATGAATTTGACGTCTTTATATTCCATATATGAGATCATGAA 360

  5633988 GTTGTTTTTTGTCTTGCTTACTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATGTTGTTGCAG 5634047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTGTTTTTTGTCTTGCTTACTTAGTATACTGTCCTTAAGTTTTGTCCATGTTGTTGCAG 420

  5634048 ATGGCAGGATTTCCTTGTTTTTTAAAGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTATGTGTGTGT 5634107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGGCAGGATTTCCTTGTTTTTTAAAGGCTGAATAATATTTTATGTGTGTATGTGTGTGT 480

  5634108 GTTACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCTGTATCTTGG 5634167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTACATTTTCTTTATCCATTCATCTATTGACAGACACTTAGGTTGTTTCTGTATCTTGG 540

  5634168 CTACTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATACTGATT 5634227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACTTTGAATAATGCTGCAATGAATATGAAAGTGCAGATATCTCTTTGAGATACTGATT 600

  5634228 TCAATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTT 5634287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAATTCCTTTGGATATATACCTAGAAGTAGGATTGTTGGATCATGTGGTAGTCCTGTTT 660

  5634288 TTAGTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAG 5634347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAGTTTGAGGAACTTCTGTTTTCCATCATGACTGTACCATTTTGCAGTCCCGTCAATAG 720

  5634348 TGTACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTC 5634407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTACAGGGAGGGGATCCCTTTTCTCCACGTCTTTGCCGACCTTGTTATGATTTAACTTC 780

  5634408 TTGATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTG 5634467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGATAATAGATATCCTAACAGGTGTGAGGTATCTTATGGTTTTGATTTGCATCTCCCTG 840

  5634468 ATGATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCA 5634527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGATTAGTGTATTGAGCACCTATTGGCCATTGGCTGTTTTTTGGTAAAACATCTGTTCA 900

  5634528 GATCTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCT 5634574
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATCTCTTGTCCATTTTTAAATTAGGTTATCTGTTTTGTTTTTTTCT 947

EXCISED REGION

  5634576 GGTACTGAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATG 5634635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 GGTACTGAGTTGTATGAGTTCCTTACATATCTTGAATATTAGCCCCCTTTTAGATGTATG 1008

  5634636 GTTTGCAGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTT 5634695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 GTTTGCAGATATTTTCTCCTATTCCATAGGTTGCTTTTTTATCTTGTTGATTGTTTTCTT 1068

  5634696 TACTGTACAATAACTTAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTG 5634755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 TACTGTACAATAACTTAATTTCATGTAATCCTACTTGTTTATTTTTGCTTTTGTCACCTG 1128

  5634756 TGCTTTCCATGTCATCCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTG 5634815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 TGCTTTCCATGTCATCCAAAATACCATCGTGAAAACAGATGTCAGGGTGTTTTTCCCCTG 1188

  5634816 TTTTCTTCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTT 5634875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 TTTTCTTCTAGGATTTGCATGGTTTCAGGTTTTACATTTAAGTCTTTGATCCTTCTTCTT 1248

  5634876 ATTTTAATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTT 5634935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 ATTTTAATTTTTGTGGGTACATAGTAGATCTGTGTATTTGTGGGGTATATGGGATATTTT 1308

  5634936 GATACAGGACTATAGTCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATC 5634995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 GATACAGGACTATAGTCACCCTGTTGTACTATCAAATACTAGATTTTATTCATCATCATC 1368

  5634996 ACCATTATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCA 5635055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 ACCATTATTATTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACTCTGGAGTACAGAGTCATGATCA 1428

  5635056 TGGCTTACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAG 5635115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 TGGCTTACTGCAGCCTCGACCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTTAGCATCCTGAG 1488

  5635116 TAGCTGGGAGTACAGATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCT 5635175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 TAGCTGGGAGTACAGATGCATGCCACCATGCCTAGTTAATTTTTTGAAGAGATGTGGTCT 1548

  5635176 TGCTGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCC 5635235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 TGCTGTGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCC 1608

  5635236 TCCTAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCT 5635295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 TCCTAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCT 1668

  5635296 ATTTTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTG 5635355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 ATTTTTTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTG 1728

  5635356 ATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAAC 5635415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 ATAGTGTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAAC 1788

  5635416 ACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTG 5635475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 ACTATGGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTG 1848

  5635476 AAAGATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGT 5635535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 AAAGATTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGT 1908

  5635536 CTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATA 5635595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 CTATGTATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATA 1968

  5635596 CTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATC 5635655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 CTTTGAAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATC 2028

  5635656 GTAATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATA 5635715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 GTAATCCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATA 2088

  5635716 GCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTT 5635775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 GCGGGAGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTT 2148

  5635776 ATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAAC 5635835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 ATAAGTGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAAC 2208

  5635836 AAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTAT 5635895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 AAGTGCCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTAT 2268

  5635896 GGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATA 5635955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 GGAACTGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATA 2328

  5635956 GCAGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTC 5636015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 GCAGTGTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTC 2388

  5636016 TCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTT 5636075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 TCAAGATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTT 2448

  5636076 TTCTGTTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATT 5636135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 TTCTGTTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATT 2508

  5636136 GGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATA 5636195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 GGTTTGGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATA 2568

  5636196 TCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTG 5636255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 TCCAGCCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTG 2628

  5636256 GCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTC 5636315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 GCGGTTAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTC 2688

  5636316 TTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCA 5636375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 TTTTTCTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCA 2748

  5636376 ATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCC 5636435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 ATGGAGCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCC 2808

  5636436 CAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTAT 5636495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 CAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTAT 2868

  5636496 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGT 5636555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGT 2928

  5636556 TGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCA 5636615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 TGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCA 2988

  5636616 GCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTA 5636675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 GCCATGTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTA 3048

  5636676 TTCTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATT 5636735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 TTCTTGTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATT 3108

  5636736 TTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTG 5636795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 TTTTGGTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTG 3168

  5636796 CTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCA 5636855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 CTTTTTCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCA 3228

  5636856 GCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCT 5636915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 GCTAGATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCT 3288

  5636916 TGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCAT 5636975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 TGTACAAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCAT 3348

  5636976 ACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGT 5637035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 ACGTGTGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGT 3408

  5637036 AGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCA 5637095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 AGGTATATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCA 3468

  5637096 GTTGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGG 5637155
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 GTTGCCCAGGTT-GAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGG 3527

  5637156 CTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTG 5637215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 CTCAAGCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTG 3587

  5637216 CACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGC 5637275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 CACTTGGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGC 3647

  5637276 CCACGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGC 5637335
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 CCACGCTGGTCCTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGC 3707

  5637336 TGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAA 5637395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 TGGGATTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAA 3767

  5637396 TTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCAT 5637455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 TTTGTAACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCAT 3827

  5637456 GTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGA 5637515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 GTTCCAAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGA 3887

  5637516 CTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACC 5637575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 CTGTAGTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACC 3947

  5637576 CATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAAT 5637635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 CATTAGCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAAT 4007

  5637636 CATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATA 5637695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 CATCTTTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATA 4067

  5637696 AGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACC 5637755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 AGTGAGAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACC 4127

  5637756 TCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGT 5637815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 TCTAGTTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGT 4187

  5637816 ACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCC 5637875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 ACTCCATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCC 4247

  5637876 AGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCAGATCTTAGA 5637935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4248 AGTACTGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCCGGATCTTAGA 4307

  5637936 GGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATG 5637995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4308 GGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTGTTATATATG 4367

  5637996 GCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAG 5638055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 GCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTTTTTATGAAG 4427

  5638056 GGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTG 5638115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 GGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCATATAGTTTTG 4487

  5638116 GTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCC 5638175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 GTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCC 4547

  5638176 TTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTG 5638235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4548 TTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTG 4607

  5638236 AATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGA 5638295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4608 AATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGA 4667

  5638296 CCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCC 5638355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4668 CCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCC 4727

  5638356 TCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGT 5638415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4728 TCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGT 4787

  5638416 ATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGC 5638475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4788 ATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGC 4847

  5638476 TTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAG 5638535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4848 TTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAG 4907

  5638536 GTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATT 5638595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4908 GTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATT 4967

  5638596 TCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTT 5638655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4968 TCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTT 5027

  5638656 TGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTG 5638715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5028 TGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTG 5087

  5638716 GTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTT 5638775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5088 GTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTT 5147

  5638776 CTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTAT 5638835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5148 CTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTAT 5207

  5638836 TATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATC 5638895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5208 TATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATC 5267

  5638896 ATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTC 5638955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5268 ATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTC 5327

  5638956 TCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCA 5639015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5328 TCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCA 5387

  5639016 TGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCC 5639075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5388 TGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCC 5447

  5639076 CAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTG 5639135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5448 CAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTG 5507

  5639136 AGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTA 5639195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5508 AGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTA 5567

  5639196 TACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAA 5639255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5568 TACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAA 5627

  5639256 TACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTC 5639315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5628 TACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTC 5687

  5639316 AATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACAT 5639375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5688 AATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACAT 5747

  5639376 ATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTT 5639435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5748 ATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTT 5807

  5639436 AACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATT 5639495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5808 AACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATT 5867

  5639496 TGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGT 5639555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5868 TGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCTATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGT 5927

  5639556 TCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTG 5639615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5928 TCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTG 5987

  5639616 CAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAA 5639675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5988 CAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAA 6047

  5639676 AGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAAT 5639735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6048 AGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAAT 6107

  5639736 AATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTC 5639795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6108 AATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTC 6167

  5639796 TATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGT 5639855
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6168 TATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTTTATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGT 6227

  5639856 CTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGC 5639915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6228 CTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGC 6287

  5639916 ATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGT 5639975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6288 ATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGT 6347

  5639976 GTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGT 5640035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6348 GTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGT 6407

  5640036 CTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTT 5640095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6408 CTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTT 6467

  5640096 CTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCT 5640155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6468 CTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCT 6527

  5640156 GTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTAT 5640215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6528 GTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTAT 6587

  5640216 GTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTC 5640275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6588 GTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTC 6647

  5640276 TTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACA 5640335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6648 TTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACA 6707

  5640336 CACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCAT 5640395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6708 CACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCAT 6767

  5640396 CCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTT 5640455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6768 CCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTT 6827

  5640456 ATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCA 5640515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6828 ATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCA 6887

  5640516 GTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTG 5640575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6888 GTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTG 6947

  5640576 TTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAA 5640635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6948 TTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAA 7007

  5640636 GTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTA 5640695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7008 GTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTA 7067

  5640696 CCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCC 5640755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7068 CCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCC 7127

  5640756 TTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGT 5640815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7128 TTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGT 7187

  5640816 GAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAG 5640875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7188 GAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAG 7247

  5640876 GTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCT 5640935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7248 GTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCT 7307

  5640936 GGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGT 5640995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7308 GGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGT 7367

  5640996 TATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTA 5641055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7368 TATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTA 7427

  5641056 TCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACG 5641115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7428 TCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACG 7487

  5641116 GGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCT 5641175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7488 GGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCT 7547

  5641176 CTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGG 5641235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7548 CTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGG 7607

  5641236 CGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTG 5641295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7608 CGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTG 7667

  5641296 TTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGT 5641355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7668 TTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGT 7727

  5641356 GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTT 5641415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7728 GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTT 7787

  5641416 AAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTT 5641475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7788 AAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTT 7847

  5641476 TGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTC 5641535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7848 TGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTC 7907

  5641536 CTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTC 5641595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7908 CTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTC 7967

  5641596 ACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGT 5641655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7968 ACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAAGTAGCCTGT 8027

  5641656 CTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATG 5641715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8028 CTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAGACTCTGATG 8087

  5641716 CATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAA 5641775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8088 CATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGATTTTTAAAAA 8147

  5641776 TTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCA 5641835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8148 TTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTGTTATCTTCA 8207

  5641836 ATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCT 5641895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8208 ATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGTCACATATCT 8267

  5641896 ATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTT 5641955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8268 ATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGGGTCATGTTT 8327

  5641956 TCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGG 5642015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8328 TCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCATCAAAGAGG 8387

  5642016 TAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGT 5642075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8388 TAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTTTTGAGAAGT 8447

  5642076 CTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGA 5642135
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8448 CTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGA 8507

  5642136 CTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCAC 5642195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8508 CTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCAC 8567

  5642196 GTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGC 5642255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8568 GTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGC 8627

  5642256 TGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCA 5642315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8628 TGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCA 8687

  5642316 CCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGC 5642375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8688 CCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGC 8747

  5642376 CTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCAT 5642435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8748 CTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCAT 8807

  5642436 CAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAA 5642495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8808 CAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAA 8867

  5642496 ACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGC 5642555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8868 ACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGC 8927

  5642556 AATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAAT 5642615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8928 AATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAAT 8987

  5642616 TCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAG 5642646
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     8988 TCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAG 9018

Alignment time is 11.0968 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3267] =>      3267 nucs 'mol-32-3419-103236_3267'

Score:        3255
Aligned:      3266        nucs
Identic:      3265 (100%) nucs =>      1543 (100%)      1722 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5640554,5642096] EXCISED REGION [5642098,5643820]
 second seq =>  [      1,   1543] EXCISED REGION [   1545,   3267]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5642097,5642097]
 second seq =>         1 nucs [1544,1544]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1544,1545] to [1545,1546]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5640554 ACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAA 5640613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAA 60

  5640614 TTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGC 5640673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGC 120

  5640674 TTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTT 5640733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTT 180

  5640734 TCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAAC 5640793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAAC 240

  5640794 TCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTT 5640853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTT 300

  5640854 TCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCA 5640913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCA 360

  5640914 ACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAG 5640973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAG 420

  5640974 ATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTC 5641033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTC 480

  5641034 TTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTC 5641093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTC 540

  5641094 TTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTG 5641153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTG 600

  5641154 CCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCT 5641213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCT 660

  5641214 CCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTA 5641273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTA 720

  5641274 GTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCT 5641333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCT 780

  5641334 GCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCC 5641393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCC 840

  5641394 ATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAA 5641453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAA 900

  5641454 TGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTA 5641513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTA 960

  5641514 CTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCA 5641573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCA 1020

  5641574 TGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTG 5641633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTG 1080

  5641634 ACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATT 5641693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTATATTGTCAAGTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATT 1140

  5641694 CTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGA 5641753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGCTTTTCAGAGACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGA 1200

  5641754 ATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAG 5641813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTGCTGCTTGATTTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAG 1260

  5641814 GTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTC 5641873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTCCTTCTCTGTGTTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTC 1320

  5641874 CTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAG 5641933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGCCTGAAAGGTCACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAG 1380

  5641934 TTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCAT 5641993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCATTTGGTGGGGTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCAT 1440

  5641994 TGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTT 5642053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGTGTGTAGGCATCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTT 1500

  5642054 GTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGA 5642096
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTATCTGTCCTTTTTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGA 1543

EXCISED REGION

  5642098 TTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGG 5642157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 TTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGTTTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGG 1604

  5642158 TCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCT 5642217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 TCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTGGATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCT 1664

  5642218 GTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGAT 5642277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 GTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTCTCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGAT 1724

  5642278 GTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTA 5642337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 GTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTGTTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTA 1784

  5642338 GACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCT 5642397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 GACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTCATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCT 1844

  5642398 ACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCA 5642457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 ACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGGCTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCA 1904

  5642458 GGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATG 5642517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 GGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTCATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATG 1964

  5642518 CTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCT 5642577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 CTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAAATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCT 2024

  5642578 GTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTC 5642637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 GTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTAACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTC 2084

  5642638 CACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCT 5642697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 CACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGGCCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCT 2144

  5642698 GCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATAT 5642757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 GCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCAGGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATAT 2204

  5642758 TATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCA 5642817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 TATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACTGTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCA 2264

  5642818 AAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATA 5642877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 AAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATA 2324

  5642878 CTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATAC 5642937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 CTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATAC 2384

  5642938 TTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGAAGGAATA 5642997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2385 TTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATCTTATGAAGGAATA 2444

  5642998 CAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTT 5643057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 CAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTT 2504

  5643058 TGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTAT 5643117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 TGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTAT 2564

  5643118 AGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGC 5643177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 AGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGC 2624

  5643178 ATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATG 5643237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 ATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATG 2684

  5643238 TCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCT 5643297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 TCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCT 2744

  5643298 TTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAAC 5643357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 TTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAAC 2804

  5643358 CAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACA 5643417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 CAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACA 2864

  5643418 GAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCC 5643477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 GAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCC 2924

  5643478 AGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCC 5643537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 AGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCC 2984

  5643538 TGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTG 5643597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 TGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTG 3044

  5643598 CTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAA 5643657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 CTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAA 3104

  5643658 GAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCAT 5643717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 GAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCAT 3164

  5643718 CTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAA 5643777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 CTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAA 3224

  5643778 TTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAA 5643820
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 TTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAA 3267

Alignment time is 4.37486 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   9308] =>      9308 nucs 'mol-32-34b3-057965_9308'

Score:        9232
Aligned:      9309        nucs
Identic:      9302 (100%) nucs =>      2745 (100%)      6557 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5635181,5637925] EXCISED REGION [5637927,5644490]
 second seq =>  [      1,   2745] EXCISED REGION [   2747,   9308]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5637926,5637926]
 second seq =>         1 nucs [2746,2746]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [5641097,5641097]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2746,2746] to [2747,2747]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5635181 TGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTA 5635240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTTGCCCAGGCCGGTCTCAGACTCCTGGACACAAGTGATCTGCCCATCTCAGCCTCCTA 60

  5635241 AAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTT 5635300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTGCTAGGATTACAAGCATGGGCCACCACACCCAGTCCTTATTCATTTTTTCTATTTT 120

  5635301 TTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGT 5635360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTACCCATTAACCATCCTTCCTTCCCCCTCCGTCTTTAATCCTTCTTGAGTTGATAGT 180

  5635361 GTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTAT 5635420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTAAGATAAGGGTCCAGTTTCCTTCCTTAGCATGTGGATATCCAGTTTTTCTAACACTAT 240

  5635421 GGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGA 5635480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTGTTGAAAAGTCAGTGTTGCAAGATGTGTTTTCTCCATTCTTAGCACTTTGTGAAAGA 300

  5635481 TTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATG 5635540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGACTATATATGCATGCGTGGTTTTATTTCTGGACTCCATTCTGTTGCATTGGTCTATG 360

  5635541 TATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTG 5635600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATCTCTTTTTATGTCAGTACCATACTATTTTGATTACTATAGCTTTGTAATATACTTTG 420

  5635601 AAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAAT 5635660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAATCAGGTTGATATGGTTTGGCTCTATTTCCCCACCCAAATTTCATCTCTAATCGTAAT 480

  5635661 CCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGG 5635720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTCATAATCCCCATGTATGGAGGGCAGGACCTGGTAGGGGGTCATTAGATCATAGCGGG 540

  5635721 AGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAG 5635780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTTTTCCTCATGCTGTTCTTGTGATAGTAAGTTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAG 600

  5635781 TGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTG 5635840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTTTGACTGTTCCTTCTACACGCTCTGTCTCTCTCTTGCCTGCCAGCATGTAACAAGTG 660

  5635841 CCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAAC 5635900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGCTTCCCCTTCTGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCACCAGCCATTATGGAAC 720

  5635901 TGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGT 5635960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAATCTATTCAACCTTTCTTTATAAATTACCAAATCTCAGGGAAGTTTGTTATAGCAGT 780

  5635961 GTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAG 5636020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGAAAATGGACTAACACACAGGTAATGTGACACTTCCAGCTTTGTTGTTCTTTCTCAAG 840

  5636021 ATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTG 5636080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGGCCTTGGCTATTCATGGGCTATTGTGGTTTTGTATAAATTTTAGGATTGTTTTTCTG 900

  5636081 TTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTT 5636140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTATGTGAAAATATCATTGAAATTCTGATAGAGATTGCATTGAATCCATAGATTGGTTT 960

  5636141 GGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAG 5636200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGATAGTAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAATCCATGAACATAAGATATCCAG 1020

  5636201 CCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGT 5636260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCATTTATTTGTACCTTCTTCAGTTTATTTCATCAGCATTTTATGGTGTTTAGTGGCGGT 1080

  5636261 TAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTT 5636320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAATGTATTCTAAGTATTTAGTTTTTTGGAGCTACCATAAATGGTATTGTTTTCTTTTT 1140

  5636321 CTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGA 5636380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTTTCTGTTTTTTTTAGACAAAGTCTCGCTCTTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAATGGA 1200

  5636381 GCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCC 5636440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCGATCTCAACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCCCAGCC 1260

  5636441 TCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTA 5636500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTA 1320

  5636501 GTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATC 5636560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGATTCCTGACCTCAGTTGATC 1380

  5636561 TGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCAT 5636620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCACTCCCAGCCAT 1440

  5636621 GTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTT 5636680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTTTCTTAATTTATTTTTTAGATACTCATTGTTCTTGTGTAGAAACACAACTTATTCTT 1500

  5636681 GTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTG 5636740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTATATTGATTTTATATCTTGCAACTTTACTAAATTCATTTCTTAGTTCTAAATTTTTTG 1560

  5636741 GTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTT 5636800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTGGTTTTTAGGTTTTTCTAAATATAAGATTATGTCATCTTCAGAGACAATTTTGCTTTT 1620

  5636801 TCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAG 5636860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCCTTTGAACTACTGCTTTATATCGTAAGTTTTGCACTTATGCTTTATTTCTCCAGCTAG 1680

  5636861 ATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTAC 5636920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTATAAGTTTCTGGAGCACAGAAACTATCTTAATTTGTATTATCTATAGTGCCTTGTAC 1740

  5636921 AAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTG 5636980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGGAAGATGTTTAATAAACATTTTTAATATTAATGAATTTAAGGTATTTGTCATACGTG 1800

  5636981 TGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTA 5637040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGCACAGCAATTTTTTTTTAAGTTTTAGTGTTTTGATTTTTGTGAGAACACAGTAGGTA 1860

  5637041 TATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGC 5637100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATATTTATGATTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTCACTTCAGTTGC 1920

  5637101 CCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAA 5637160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAATCTCTGCCTACTGGGCTCAA 1980

  5637161 GCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTT 5637220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCAGCTGTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCCCACTGCACTT 2040

  5637221 GGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACG 5637280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGCTAATTTTTTTTTTTCTGTAATTTTTTATAGAGATGGGATTTCACCATGTTGCCCACG 2100

  5637281 CTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGA 5637340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTGGTCTTGAACTCCTGAGCTCAAGTGATCCATCCACCTCGGGCTCCCAAAGTGCTGGGA 2160

  5637341 TTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGT 5637400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTACAGGCATGAGCCACTATACCCAGCCATGAGATATTTTGATACTAGCGTGCAATTTGT 2220

  5637401 AACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCC 5637460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AACAATCAGTTCATGAAAAATAGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTAACCTTCATGTTCC 2280

  5637461 AAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTA 5637520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAACAATCCATATGTACTCATAGTTATTTTAAAATATACAATTAAATTATTTTGACTGTA 2340

  5637521 GTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTA 5637580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTCACCCTGTTGTGCTATCAAATACTAGGTCATACTCATTCTCTTTTTTTGTACCCATTA 2400

  5637581 GCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCT 5637640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCCGTTCCCACCTCCCTTCCTATCCCCCCAGTTACCTTTCTCAGCCTCTGGTAATCATCT 2460

  5637641 TTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGA 5637700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTCCACTCTTTATCACCATTAGTTCAATTGTTTTGATTTGTAGATCCCACAAATAAGTGA 2520

  5637701 GAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAG 5637760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAACATGCGATGTTTGTCTCTCTATGCCTTGCTTATTGCACTTAACATAATGACCTCTAG 2580

  5637761 TTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCC 5637820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCCATCCATGTTGTTGTAAATGACCGGATCTCATTTTTTTTGTAACTGAATAGTACTCC 2640

  5637821 ATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTAC 5637880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTATGTGCAAGTACCATGTTTTCTTTATCCATCCATCTGTTGATGGACACTTCCAGTAC 2700

  5637881 TGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCC 5637925
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGTGTTGAATAACAATAGTGAAGGTGGGCATCTTTGTCGTGTTCC 2745

EXCISED REGION

  5637927 GATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTG 5637986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 GATCTTAGAGGAAAGGCTTTCGGTTTTTACATACTCAGTATGATACTAGCTATGGGTCTG 2806

  5637987 TTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTT 5638046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 TTATATATGGCTTTTATTATGTTGAGGTATGTTCCTTCTATACCCAGTTTTTTTAGGGTT 2866

  5638047 TTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCAT 5638106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 TTTATGAAGGGATGTTGAATTTTTATGAAATGCTTTTTCAGCATCAGTTGAAATGATCAT 2926

  5638107 ATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTT 5638166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 ATAGTTTTGGTCCTTCATTCTGTTGATATGATGTATCACATTGATTGATTTGCATATGTT 2986

  5638167 GAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAAT 5638226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 GAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACTTGTTCATGATGAATGATCTTTTTAAT 3046

  5638227 ATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAG 5638286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 ATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTGAGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAG 3106

  5638287 AAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTA 5638346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 AAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGTCTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTA 3166

  5638347 ATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGT 5638406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 ATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTCCCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGT 3226

  5638407 TTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAG 5638466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 TTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTGTTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAG 3286

  5638467 GTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAG 5638526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 GTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTATTACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAG 3346

  5638527 TCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGAT 5638586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 TCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAATCTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGAT 3406

  5638587 TTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTG 5638646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 TTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTG 3466

  5638647 ATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTA 5638706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 ATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAATATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTA 3526

  5638707 TTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAAC 5638766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 TTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAATTTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAAC 3586

  5638767 TTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTC 5638826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 TTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTTCATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTC 3646

  5638827 CATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTA 5638886
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3647 CATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTGTTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTA 3706

  5638887 AGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTC 5638946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 AGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTTCTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTC 3766

  5638947 TCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTC 5639006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 TCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTC 3826

  5639007 CCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGC 5639066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 CCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCTAAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGC 3886

  5639067 CACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTC 5639126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 CACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTC 3946

  5639127 AAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCAT 5639186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 AAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGGCTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCAT 4006

  5639187 GAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTT 5639246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 GAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTATGGTGTAATACTTATAGCTATAAATTT 4066

  5639247 CTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATC 5639306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 CTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAACTTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATC 4126

  5639307 ATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATT 5639366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4127 ATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTAATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATT 4186

  5639367 CAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGAT 5639426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 CAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATATGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGAT 4246

  5639427 TTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATAT 5639486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4247 TTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTTGATATTATTTCAGTTTTTTTGAATAT 4306

  5639487 TTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAG 5639546
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4307 TTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCTTAAGTGATCTATGTACTGAGGGAAAG 4366

  5639547 AATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGT 5639606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 AATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTCTATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGT 4426

  5639607 TGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTC 5639666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 TGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGTTGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTC 4486

  5639667 AGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTT 5639726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4487 AGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTATCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTT 4546

  5639727 AGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATT 5639786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4547 AGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTGTGTTGGGTGCATATGTACATATGATT 4606

  5639787 GTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTATATAATGACATTCTTTGTCTCAC 5639846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4607 GTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCAGTTTATAATGACATTCTTTGTCTCAC 4666

  5639847 AATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTT 5639906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4667 AATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTTATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTT 4726

  5639907 TCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTAT 5639966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4727 TCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTATTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTAT 4786

  5639967 GTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCC 5640026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4787 GTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTGGATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCC 4846

  5640027 ACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAG 5640086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4847 ACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCATTTGTATTCAATGCTATTATTGATAAG 4906

  5640087 TAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCT 5640146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4907 TAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTGGTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCT 4966

  5640147 TTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTT 5640206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4967 TTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTTTCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTT 5026

  5640207 GCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCA 5640266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5027 GCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTTGATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCA 5086

  5640267 AGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGC 5640326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5087 AGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCACGACAACTTAACACTGATTGTATAAGC 5146

  5640327 AGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTT 5640386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5147 AGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATTAAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTT 5206

  5640387 TAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTG 5640446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5207 TAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTG 5266

  5640447 TTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTC 5640506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5267 TTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAAAAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTC 5326

  5640507 GTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAA 5640566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5327 GTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTACACACTACAATAACACTTATAAAATAA 5386

  5640567 GAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAA 5640626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5387 GAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAGAATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAA 5446

  5640627 ACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAG 5640686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5447 ACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTGTTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAG 5506

  5640687 CGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGA 5640746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5507 CGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCATTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGA 5566

  5640747 ACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTT 5640806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5567 ACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCCAGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTT 5626

  5640807 TTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATAC 5640866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5627 TTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGCTTGAAGGATATTTTCACTGGATATAC 5686

  5640867 TGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCA 5640926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5687 TGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCA 5746

  5640927 CTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCT 5640986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5747 CTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCT 5806

  5640987 ATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATA 5641046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5807 ATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATA 5866

  5641047 AAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTT 5641106
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     5867 AAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTC-TTTTTTTTT 5925

  5641107 TTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCA 5641166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5926 TTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCA 5985

  5641167 CTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGG 5641226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5986 CTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGG 6045

  5641227 GACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT 5641286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6046 GACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT 6105

  5641287 TTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCC 5641346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6106 TTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCC 6165

  5641347 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTT 5641406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6166 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTT 6225

  5641407 CTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTT 5641466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6226 CTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTT 6285

  5641467 CTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTT 5641526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6286 CTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTT 6345

  5641527 CTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAG 5641586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6346 CTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAG 6405

  5641587 GCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAA 5641646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6406 GCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTGACTATATTGTCAA 6465

  5641647 GTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAG 5641706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6466 GTAGCCTGTCTCCAAGCCCACTAATTCTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTTTTCAGAG 6525

  5641707 ACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGAT 5641766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6526 ACTCTGATGCATTCTTCAGTTTGTTGGTTGCATTTTTCAACTTTAGAATTGCTGCTTGAT 6585

  5641767 TTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTG 5641826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6586 TTTTAAAAATTTAAATTTCTTTGTTTAAAATGTGATAGAATTCTGAGGTCCTTCTCTGTG 6645

  5641827 TTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGT 5641886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6646 TTATCTTCAATTTCTTTGACTTTCCTCAACATAGCTATTTTGAATTCCTGCCTGAAAGGT 6705

  5641887 CACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGG 5641946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6706 CACATATCTATCTCTGTTTTTCCAGGATTGGTCCCTGCCTTACTTAGTTCATTTGGTGGG 6765

  5641947 GTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCA 5642006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6766 GTCATGTTTTCCTGGATGATCTTGATTTGATGCTTGTAGATGTTCATTGGTGTGTAGGCA 6825

  5642007 TCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTT 5642066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6826 TCAAAGAGGTAGGTATTTATTGTAGTCTTTGCAGTCTGGGCTTGTTTGTATCTGTCCTTT 6885

  5642067 TTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGACTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGT 5642126
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     6886 TTGAGAAGTCTTTCCAGTTATTCGAAGGGATTTGGGCCCCAAGCCCAATAATGCTGAGGT 6945

  5642127 TTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTG 5642186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6946 TTTTGCAGACTCAGAGGTACTGCCTTGGTGGTCTTGGATAAAATCTGGAAGAATTATTTG 7005

  5642187 GATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTC 5642246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7006 GATTACCACGTAGAGACTCTTGTTCTTTTCTGTTACTTTCTTCCAAACAAATGGAGTCTC 7065

  5642247 TCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTG 5642306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7066 TCTCTGTGCTGAGTCTCCTGGAACTAGGGATGTGTTCATGCGTTGATGCAAGCACCCCTG 7125

  5642307 TTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTC 5642366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7126 TTGCCACCACCACTGAAACTAAGCTGGGTTAGACCTGAAGCCAGCAGAGCACTGGGTCTC 7185

  5642367 ATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGG 5642426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7186 ATCCAAGGCCTGCTGTCACCACCACCTGGCTACCACCTATGTTCACTCAAGGCCCTAAGG 7245

  5642427 CTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTC 5642486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7246 CTCTACCATCAGCAGGTGGTGAAGCCAGCCAGGTTTATGTCCTTCCCTTCAGAGTGTCTC 7305

  5642487 ATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAA 5642546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7306 ATTCCCCAAACCCCAGGCCAGTCCAGAAATGCTGTCTGGAAGCCAGGGATTAGAGTCAAA 7365

  5642547 ATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTA 5642606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7366 ATTCTTAGCAATTTGTTTGATATTCTGTTCTGTTGTGGCTAAGCAGGCACTCAAACCGTA 7425

  5642607 ACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGG 5642666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7426 ACACAAAATTCTTCCCACTTTTTCCCCTGTCCACAGGCAGAGGAGAATCTGCCTCTGTGG 7485

  5642667 CCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCA 5642726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7486 CCACCACTACCACAGGGCCATAGTGGGTTCTGCCTGGCCACTGCCGGGCAGTCATCTTCA 7545

  5642727 GGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACT 5642786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7546 GGTGTTTATGAATCATTAACATAATCCATATTATAGTTAAATATTTATTTGGAGTTTACT 7605

  5642787 GTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATT 5642846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7606 GTGGACTAGGTATTTTACATCATAGTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATT 7665

  5642847 TCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTG 5642906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7666 TCTCATTCATGACTTTTGGCCTGTTCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTG 7725

  5642907 AAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCAT 5642966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7726 AAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAATTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCAT 7785

  5642967 TTTTATGAATAGAAGATATTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCA 5643026
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7786 TTTTATGAATAGAAGATCTTATGAAGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCA 7845

  5643027 TGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAG 5643086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7846 TGGTGGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAG 7905

  5643087 CCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAA 5643146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7906 CCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAA 7965

  5643147 AAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGC 5643206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7966 AAATAAAAAAATCAGCTGGCCATGGTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGC 8025

  5643207 TGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACT 5643266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8026 TGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCCTGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACT 8085

  5643267 AAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATA 5643326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8086 AAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTATACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATA 8145

  5643327 GATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGA 5643386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8146 GATCATGTCAATATAAACACATACTGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGA 8205

  5643387 CTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCT 5643446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8206 CTGTATACTATTTAAATTTTGATGAACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCT 8265

  5643447 GCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCT 5643506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8266 GCAGTGAGCCATGATTGCACTATGGCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCT 8325

  5643507 CAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAA 5643566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8326 CAAAAAAAAAGTTATGAAAAATATGGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAA 8385

  5643567 AAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGA 5643626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8386 AAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATGCAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGA 8445

  5643627 TACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTAT 5643686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8446 TACTCTCCTTACGTAAATAAAAAAGATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTAT 8505

  5643687 GTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAA 5643746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8506 GTGATTGTTTACTTCAGTATTTGTATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAA 8565

  5643747 AGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAAT 5643806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8566 AGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGTTAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAAT 8625

  5643807 TTACAATTTAAAAATATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTT 5643866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8626 TTACAATTTAAAAATATTTTGGAATTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTT 8685

  5643867 CAGATTTCTTACTCATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTT 5643926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8686 CAGATTTCTTACTCATGAGCAGGCATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTT 8745

  5643927 AAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTA 5643986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8746 AAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAGTTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTA 8805

  5643987 CCTTATTTCAACCATAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAG 5644046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8806 CCTTATTTCAACCATAAATCATACAAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAG 8865

  5644047 ATAATACTGTAGAATTTGCTATGGTTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATA 5644106
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     8866 ATAATACTGTAGAATTTGCTATGGTTTAAA-TTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATA 8924

  5644107 CATCTAAGTGTACATTGATTTTTAGTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTC 5644166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8925 CATCTAAGTGTACATTGATTTTTAGTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTC 8984

  5644167 TAGTTTTAGAACATTTATATCAGCCTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCT 5644226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8985 TAGTTTTAGAACATTTATATCAGCCTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCT 9044

  5644227 TCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAACCTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCC 5644286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9045 TCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAACCTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCC 9104

  5644287 TAGAATTTTCATATCATTGGAATCATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTT 5644346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9105 TAGAATTTTCATATCATTGGAATCATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTT 9164

  5644347 AGCATAATGTTTTTGAGGTGCATCCAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAA 5644406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9165 AGCATAATGTTTTTGAGGTGCATCCAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAA 9224

  5644407 ACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTTTTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGG 5644466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9225 ACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTTTTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGG 9284

  5644467 CTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||
     9285 CTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 9308

Alignment time is 11.3226 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   8273] =>      8273 nucs 'mol-32-34c9-042913_8273'

Score:        8183
Aligned:      8277        nucs
Identic:      8266 (100%) nucs =>      3485 (100%)      4781 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5638141,5641632] EXCISED REGION [5642811,5647594]
 second seq =>  [      1,   3488] EXCISED REGION [   3489,   8273]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1178 nucs [5641633,5642810]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5641633,5641633] to [5642811,5642811]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5638141 ATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACT 5638200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACT 60

  5638201 TGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTG 5638260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTG 120

  5638261 AGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGT 5638320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGT 180

  5638321 CTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTC 5638380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTC 240

  5638381 CCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTG 5638440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTG 300

  5638441 TTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTAT 5638500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTAT 360

  5638501 TACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAAT 5638560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAAT 420

  5638561 CTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGG 5638620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGG 480

  5638621 CATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAA 5638680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAA 540

  5638681 TATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAAT 5638740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAAT 600

  5638741 TTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTT 5638800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTT 660

  5638801 CATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTG 5638860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTG 720

  5638861 TTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTT 5638920
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTT 780

  5638921 CTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAA 5638980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAA 840

  5638981 TCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCT 5639040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCT 900

  5639041 AAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGAT 5639100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGAT 960

  5639101 TTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGG 5639160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGG 1020

  5639161 CTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTAT 5639220
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATAAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTAT 1080

  5639221 GGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAAC 5639280
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTGTAGTACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAAC 1140

  5639281 TTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTA 5639340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTA 1200

  5639341 ATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATA 5639400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATA 1260

  5639401 TGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTT 5639460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTT 1320

  5639461 GATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCT 5639520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCT 1380

  5639521 TAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTC 5639580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTC 1440

  5639581 TATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGT 5639640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGT 1500

  5639641 TGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTA 5639700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTA 1560

  5639701 TCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTG 5639760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTG 1620

  5639761 TGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCA 5639820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCA 1680

  5639821 GTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTT 5639880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTT 1740

  5639881 ATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTA 5639940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTA 1800

  5639941 TTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTG 5640000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTG 1860

  5640001 GATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCAT 5640060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCAT 1920

  5640061 TTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTG 5640120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTG 1980

  5640121 GTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTT 5640180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTT 2040

  5640181 TCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTT 5640240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTT 2100

  5640241 GATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCAC 5640300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCAC 2160

  5640301 GACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATT 5640360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATT 2220

  5640361 AAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCT 5640420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCT 2280

  5640421 CTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAA 5640480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAA 2340

  5640481 AAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTAC 5640540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTAC 2400

  5640541 ACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAG 5640600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAG 2460

  5640601 AATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTG 5640660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTG 2520

  5640661 TTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCA 5640720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCA 2580

  5640721 TTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCC 5640780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCC 2640

  5640781 AGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGC 5640840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGC 2700

  5640841 TTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTTGTTTTTTTT 5640900
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
     2701 TTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCTTTTGTTT----TTTTT 2756

  5640901 GTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAG 5640960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 GTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTTTACTGAAGAG 2816

  5640961 TCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTT 5641020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTTTCTCTTGCCGTT 2876

  5641021 TTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATG 5641080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTTTGTTTATAGATG 2936

  5641081 CCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTG 5641140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 CCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTG 2996

  5641141 GAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCT 5641200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 GAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCT 3056

  5641201 CCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATT 5641260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 CCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCTAATT 3116

  5641261 TTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCT 5641320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCT 3176

  5641321 GACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACC 5641380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 GACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACC 3236

  5641381 GCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCT 5641440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 GCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGCGTTCTGTAACCT 3296

  5641441 TCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTG 5641500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 TCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCTCTTATCCCTTTG 3356

  5641501 AATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATA 5641560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 AATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCAATACCTCTTATA 3416

  5641561 TTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTT 5641620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATTCTTTTTTCTTTT 3476

  5641621 GTGGTCTCCTCT 5641632
          ||||||||||||
     3477 GTGGTCTCCTCT 3488

EXCISED REGION

  5642811 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 5642870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 GTAAGCAAAGTTTCCCAAATTTAAGTTCTTTTTATTTCTCATTCATGACTTTTGGCCTGT 3548

  5642871 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 5642930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 TCTCATACTACCTATTCATTGTAACTTTTAAACTTGAAAGTCTCTTTCAAAATAAATGAA 3608

  5642931 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 5642990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 TTTATACTTTTACCATAAATGGAAATCTAGTACCATTTTTATGAATAGAAGATATTATGA 3668

  5642991 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 5643050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 AGGAATACAATAAAAACAATTTTATAAGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAACCTCA 3728

  5643051 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 5643110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 GCACTTTTGGGGGCCTAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGG 3788

  5643111 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 5643170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 ACAGTATAGGGAGACCCCCATCTCTATAAAAAATAAAAATAAAAAAATCAGCTGGCCATG 3848

  5643171 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 5643230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 GTGGTGCATGCCTGTGGTCTCAGCTAATCTGGTGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGCC 3908

  5643231 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 5643290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 TGGGATGTCTTGATTCATAAACACATGAAGATGACTAAAATCTCCTTTTAAATTTGTTTA 3968

  5643291 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 5643350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 TACTGCTTTTTCTTCTATGGCTTTCTTTTTTTCATAGATCATGTCAATATAAACACATAC 4028

  5643351 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 5643410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 TGAGAACCAGGAGTTTGAGTGATTCTATATGAATGACTGTATACTATTTAAATTTTGATG 4088

  5643411 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 5643470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4089 AACTACAGAGTAGTTTGAGCCTAGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACTATG 4148

  5643471 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 5643530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4149 GCAACCCAGCCAGGATGACAGGGTGAAACCCTTTCTCAAAAAAAAAGTTATGAAAAATAT 4208

  5643531 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 5643590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4209 GGTTTCCTGCCAAACTCATAATTACTCCTTTATTAAAAAGGGCAATTAGCCCTTTTTATG 4268

  5643591 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 5643650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4269 CAAGGTGCTTAAAAATAAACTAGCACCTCATTTAGATACTCTCCTTACGTAAATAAAAAA 4328

  5643651 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 5643710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4329 GATTGAAGAGGAGTTGAAAAAAGATTTTTTTCCTATGTGATTGTTTACTTCAGTATTTGT 4388

  5643711 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 5643770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4389 ATGTCATCTAAAATGGTGATATAGGACCTGCATTAAAGTGTTCCACCTGTATTAGTTTGT 4448

  5643771 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 5643830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4449 TAGGCAATTTATTTAATCAGAAAAAATAAAATAAATTTACAATTTAAAAATATTTTGGAA 4508

  5643831 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 5643890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4509 TTTACACCTGCCACAAAATGAGACAGTTTCTTCGTTCAGATTTCTTACTCATGAGCAGGC 4568

  5643891 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 5643950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4569 ATCAATTGGTTGGAATCAGAGAGGTTTCTTACCTTTAAGTTACAATTGCTTTCCTTTGAG 4628

  5643951 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 5644010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4629 TTGCTGTCACAAATCTACTGTCCCCCAAGTAGTTTACCTTATTTCAACCATAAATCATAC 4688

  5644011 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 5644070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4689 AAAAATTTACCTATGAAAATTTGGATATTATTGTAGATAATACTGTAGAATTTGCTATGG 4748

  5644071 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 5644130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4749 TTTAAATTTTTAAGAGCTTTGAGGTGCATAAAAATACATCTAAGTGTACATTGATTTTTA 4808

  5644131 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 5644190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4809 GTAAATTTATAGTGTTGTGCATCCATAATCACAGTCTAGTTTTAGAACATTTATATCAGC 4868

  5644191 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 5644250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4869 CTTAAAAAGTACTATGCCCATTTGTCATCAACCTCTTCTCCCATTCCAGCCTTAGAAAAC 4928

  5644251 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 5644310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4929 CTTGGCCTACTTTTTGTCCATTTGATTTAGCTTTCCTAGAATTTTCATATCATTGGAATC 4988

  5644311 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5644370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4989 ATATGGTATATGGTCATTTGTGTTTGGTTTTTATTTAGCATAATGTTTTTGAGGTGCATC 5048

  5644371 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5644430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5049 CAGGTCATAATATTTCTTTTTTCAAAATGTGTGTAAACTAAGGGATACAAGTGCAGTTTT 5108

  5644431 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5644490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5109 TTTACAGGGACATATTGCACAGTGGTAAAGTCTGGGCTTTTAGTGTAATCATCAGCTAAA 5168

  5644491 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5644550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5169 GAATGTGCATTGTACACATAAGTAACTTCTTATCCTTTATCCCCTTCTCATCCTTCTGAG 5228

  5644551 TCTGGTATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 5644610
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5229 TCTGATATCTGTTATTCCACACTCTATGTCCATGTGGTAGTATTCCTTTTTGTTGCTGAA 5288

  5644611 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 5644670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5289 TATTTTTCCATTATTTGCATATGCCGCATTTCTATCTCCATTCACCAGTTGACAGGTATT 5348

  5644671 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 5644730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5349 TGAGTCATTGTGAATAATACTCTCATTTTGAATGATTGTGAGTAATACTGCTGTAAACAT 5408

  5644731 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 5644790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5409 TTGTATACATGTCTGTGTGTGGATAAATGTTACTCTTCTAGAGAGATACCTAGGAGTGCA 5468

  5644791 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 5644850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5469 ACTACTAAGTCATATGGCAAGTTTAACTTATTGGTAAAGTGCAAAACTTTGTTCCAAAGT 5528

  5644851 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 5644910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5529 GACTGTAGCATTTTACAACCCCACCAATAATGTATGGAAGTTTCTGTTTCTCCACACCCG 5588

  5644911 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 5644970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5589 TTCTAGAGGGTTTGTAGTGGTGTCTTATTTGTGGCTTTAATTTGGTGTTTTTCTAATGAC 5648

  5644971 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 5645030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5649 TAAAAAATGTTTGGCATGATTTCATTTGCTTATTAGCTATTTATATATCTTATTCCATTT 5708

  5645031 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 5645090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5709 ATATATCTTATTAGCCATTTCGCTATACCTATGTAGTTAATTATCTATTCAAATCCTTTG 5768

  5645091 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 5645150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5769 TCCATTTAAAAAAAAAACAGTGATCTGATCTTGGGTCACTGCAGCCTTGAACTCTTGGGC 5828

  5645151 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 5645210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5829 TCAAGTGATCCTTCCACCCCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCAACAGCAT 5888

  5645211 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 5645270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5889 GCCTCACTTATTTAAAAATTTTGTAGAGACAGGGTCTCCATAAGTTGCCCAGGCTGGTCT 5948

  5645271 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCGAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 5645330
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5949 TAAACTCCCATCGTCAGGCTATCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAAGTATTAGCCATGAT 6008

  5645331 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 5645390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6009 GCCCAGACCATTTTTGTTTAAGTGGAATATTTCTCTTATTATTCAGTTGTAAGAGTTCTT 6068

  5645391 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 5645450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6069 TATATGTCTTGATACAAATTATTTAGCAGATATATACTTCGCAAAGTTCTGCAGCATTAA 6128

  5645451 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 5645510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6129 GTACATTCACATTATCATGTAACCATTACCACCATCAGTATCCAGAACTTTCATTTTCAT 6188

  5645511 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 5645570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6189 TTTCCCAAACTGAAGCTTCGTACCCTGTAAATGGTAATTCCTGGTTTTCTCATCCCATCA 6248

  5645571 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 5645630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6249 GTCCCTGGAAACTACTATTGTATTTTCTGTCTTTATGAATTTGATTTGTGTGGGTACCTC 6308

  5645631 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 5645690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6309 AGACAAGTGGAACCACACACTATTTGTCTTTTTGTGATTGACTTATTGCACTCAGCATGT 6368

  5645691 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 5645750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6369 CTTAAGTTTTATCCATGCTGTAGCATGTACCAAAATTTCCTTCCTTCTTAAGGCTGAATG 6428

  5645751 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 5645810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6429 ATACTCCATTGTATATGTACATACTGCATTTTGTTTTATTCATTCATCTGTTGATGGACA 6488

  5645811 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 5645870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6489 CATGGGCTGCTTTTACCTCTTGGATATTGTGAATAATGCTGCTGTGAACATGGGTAGACA 6548

  5645871 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 5645930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6549 AATATCCAGATCCCTGCTTTACTTCTTTTGGGTACATACCCAGAAGTGGACCTGCTGTTT 6608

  5645931 CATTTGGTTATTCTATAGG-TTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATG 5645989
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6609 CATTTGGTTATTCTATAGGTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTGCTTTTTTTTTTAATG 6668

  5645990 TTAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCA 5646049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6669 TTAAGAAATTGCCACATACTGTGTTTCCACAGTGTACATCATTTTACATTCTTACCAGCA 6728

  5646050 ATACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGA 5646109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6729 ATACAGTGGTTCCAGTTTCTTCACATCCTTGCTAGTACTTGTTTTCTGTTGTTTTGATGA 6788

  5646110 TTGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGG 5646169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6789 TTGCCATTCCATTGGGTCCAATGTGGTATGTCATGGTTTTGGTTTGCATTTTCCTAATGG 6848

  5646170 TTATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGT 5646229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6849 TTATTAATGTCGAGCATCTTTTATGTACTTGTAAGTCATGTGTATGCCTTCTTTGAAAGT 6908

  5646230 GTCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGC 5646289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6909 GTCCGTTGAAGTTCTTTGCCCATTGTTTTTCTTGGGTTATTTTTTGTTGAGTTGTAACGC 6968

  5646290 TTCATGTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCC 5646349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6969 TTCATGTATTCTGGGTATAATCCTTTATCAGATATGTGGTTTCTAATACAGTTATGCTCC 7028

  5646350 ATGTAATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTAT 5646409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7029 ATGTAATGGCAGTTTGAGATGTTCCTGTCAACAGACTGCATTATATGATGGTGGCCCTAT 7088

  5646410 AAAATTCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGT 5646469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7089 AAAATTCTAATGGAGCTGAAAAATTCTTCTTGCCTAGTGACAATAGAAATTTTATATAGT 7148

  5646470 GTAATGCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATG 5646529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7149 GTAATGCATTACTTTTTCTATGTTTAGAAGTATTTAGATATAGAAATATTTACCATTATG 7208

  5646530 GCACAATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCA 5646589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7209 GCACAATTGCTTATGTATTCAGTATAGTAATATGCTATATAGGCTTGTATCCTAGGAGCA 7268

  5646590 ATAGGGTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAG 5646649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7269 ATAGGGTATACCTTATAGCCAAGGTGTGTAGTAGGCCATAACGTCTAGGTTTGTGTTAAG 7328

  5646650 TACCCACTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTA 5646709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7329 TACCCACTGTGATGTTCACATGATGACAAAATTGCCTAGTGATGCATTTCTTGGAACTTA 7388

  5646710 TCCCCTCTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGGGTTACATTTTT 5646769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7389 TCCCCTCTTGTTAAAGTGACACGTGACTGTATTTTCTTCTGTTTCAAGGGTTACATTTTT 7448

  5646770 ACTCTCTTTGTAGTAGCCATTGATGCACAGCATTTTCAATTTTGATGAAGTCTGTCTTAC 5646829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7449 ACTCTCTTTGTAGTAGCCATTGATGCACAGCATTTTCAATTTTGATGAAGTCTGTCTTAC 7508

  5646830 CTATTTTTTTTTGTTGCCTGTGCTTTCAGTATCATATCCAAGAAATTGTTTTCAAATCCA 5646889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7509 CTATTTTTTTTTGTTGCCTGTGCTTTCAGTATCATATCCAAGAAATTGTTTTCAAATCCA 7568

  5646890 AAGTCATGAAGTTTTTGGCTTGTGTTTTCTTCTAAGAGTTTTATAGGGTGAGGTCTTCTG 5646949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7569 AAGTCATGAAGTTTTTGGCTTGTGTTTTCTTCTAAGAGTTTTATAGGGTGAGGTCTTCTG 7628

  5646950 TTTAGAGTTTTGATCACTTTGAGACAATTTTTGTATATAGTATAAGATAAGGGTCCAGCT 5647009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7629 TTTAGAGTTTTGATCACTTTGAGACAATTTTTGTATATAGTATAAGATAAGGGTCCAGCT 7688

  5647010 TTATTTTTTTACATGTGGATATCCAGTTTTCCCAGCACTGTTTGTTGAAAAGACTTTCTT 5647069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7689 TTATTTTTTTACATGTGGATATCCAGTTTTCCCAGCACTGTTTGTTGAAAAGACTTTCTT 7748

  5647070 TCCTTTTCCCCTTTGAATGGTCTAGGTAGCCTTGTGGAAAATAATTTGACTATTTATGCA 5647129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7749 TCCTTTTCCCCTTTGAATGGTCTAGGTAGCCTTGTGGAAAATAATTTGACTATTTATGCA 7808

  5647130 AGAGTGTATTTCTGGACTCTGTGTTTTATTCTGTTGGTCTATATGTGTATCCTTGTGCCA 5647189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7809 AGAGTGTATTTCTGGACTCTGTGTTTTATTCTGTTGGTCTATATGTGTATCCTTGTGCCA 7868

  5647190 GTACGACAGTATTTTGATTGCTGTAGTCTTCTAGTAAGTTTTGATGTCAGGAAATGTGAG 5647249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7869 GTACGACAGTATTTTGATTGCTGTAGTCTTCTAGTAAGTTTTGATGTCAGGAAATGTGAG 7928

  5647250 ACGTCCAACTTTGTTATTTTCAAGTTTGTTTTGTCTATTCGAGGTCTCTTGGGAATCCAT 5647309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7929 ACGTCCAACTTTGTTATTTTCAAGTTTGTTTTGTCTATTCGAGGTCTCTTGGGAATCCAT 7988

  5647310 ATGAATTTTAGGATGGATTTTTCTGTTTCTGCTAAAAATGCTGTTAGGATTTTGAAAGGA 5647369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7989 ATGAATTTTAGGATGGATTTTTCTGTTTCTGCTAAAAATGCTGTTAGGATTTTGAAAGGA 8048

  5647370 CTTACATTGACTATGTAGATTGCTTTGGGTAGTATTGACATCTTAACAATATTAAATTTT 5647429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     8049 CTTACATTGACTATGTAGATTGCTTTGGGTAGTATTGACATCTTAACAGTATTAAATTTT 8108

  5647430 CTAATCCATGAACAGAGGATATCTTTTCATTTATTTGTGTCTAATTTCTTTCAGTGATAT 5647489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8109 CTAATCCATGAACAGAGGATATCTTTTCATTTATTTGTGTCTAATTTCTTTCAGTGATAT 8168

  5647490 TTTGCAGTTTTCACTGTAGAAGTCTTTTGCCTGCTTGGTTAGGTTTAGTCCTAAGTACTT 5647549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8169 TTTGCAGTTTTCACTGTAGAAGTCTTTTGCCTGCTTGGTTAGGTTTAGTCCTAAGTACTT 8228

  5647550 TATTCTTTTTGATGTTACGGTTTGCTGATTTTTCTGTGTTGATTT 5647594
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8229 TATTCTTTTTGATGTTACGGTTTGCTGATTTTTCTGTGTTGATTT 8273

Alignment time is 10.4073 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5631632,5652810] =>     21179 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3489] =>      3489 nucs 'mol-32-34c9-042913_3489'

Score:        3456
Aligned:      3489        nucs
Identic:      3486 (100%) nucs =>      2741 (100%)       745 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5638141,5640884] EXCISED REGION [5640889,5641633]
 second seq =>  [      1,   2744] EXCISED REGION [   2745,   3489]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [5640885,5640888]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [5640885,5640891] to [5640889,5640895]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5640884,5640884] to [5640889,5640889]
 second seq =>         1 nucs [2744,2744] to [2745,2745]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5638141 ATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACT 5638200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCACATTGATTGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGAATAAATACCACT 60

  5638201 TGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTG 5638260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTCATGATGAATGATCTTTTTAATATATTGTTGAATCTCATTAGCTTGTATTTTGTTG 120

  5638261 AGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGT 5638320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGGTTTTCACATCAGTGTTCATCAGAAATATTGACCTGTAGTTTTCTTTATTGATGTGT 180

  5638321 CTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTC 5638380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTTGTCTGGGTTTGGTATGAGGGTAATCCTGGCCTCATAGAATGAGTTTAGAAGTACTC 240

  5638381 CCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTG 5638440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTCCTCCTGTATTTTTCAGAACAGTTTCAGTAGTATTGGTGTTCTTCTTTAAATGTTTG 300

  5638441 TTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTAT 5638500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGGAATTGAGCAGTGAAACCACTAGGTCTTGGGCTTTTCTTTACTGGGAGACTTTTTAT 360

  5638501 TACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAAT 5638560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACAGGTTCAATCTCACTGTTGTTAGTCTGTTCAGGTTTTGAATTTCTTCATGATTCAAT 420

  5638561 CTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGG 5638620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTGGTAGGTTGTATGTGCTAGGGATTTATCCATTTCCTCTAGATTTTCCAGTTTATTGG 480

  5638621 CATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAA 5638680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATATAGTTGCTCATAGTAGTTTGTGATGATCGTTTGAATTTTTGCGGTATCAATTGTAA 540

  5638681 TATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAAT 5638740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATCTCCTTTCTTATCTCTGATTTTATTTATTTTGGTTTTCTCTTTTAAGGTTTGTCAAT 600

  5638741 TTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTT 5638800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTGTTTATCTTTTCTAAAAAGCAACTTTATGTTTCTTTGGTCTTTTGCATTATTTTCTT 660

  5638801 CATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTG 5638860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATTTCAAGTTAATTTATTTCTGCTCCATCTTTATTATTTCTGTTACTAATTTTGGGTTG 720

  5638861 TTTGCTCTTGCTTTTCTTGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTT 5638920
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTGCTCTTGCTTTTCTAGTTGTTTAAGAGGCATCATTAGGTTATTTATTTGAAGTTTTT 780

  5638921 CTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAA 5638980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTCTTGTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTTTATTCTCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCAA 840

  5638981 TCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCT 5639040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTCGTCTCACTGTAGCCTCAACCTCCCAAGTTCATGTGATCCTCCCACCTCAGCCCCCT 900

  5639041 AAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGAT 5639100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATAGTTGGGACTACAGTTGCATGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTAGAGACAGGAT 960

  5639101 TTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGG 5639160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCACCATGTTTCCCAGGCTGTTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCCACCTCGG 1020

  5639161 CTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATGAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTAT 5639220
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCCCAAAGTGCTAGGATTCAGGCATAAGCCACTATACCCGGCCATTTTTCTTCTTTTAT 1080

  5639221 GGTGTAATACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAAC 5639280
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTGTAGTACTTATAGCTATAAATTTCTCTGTTAATACTGCTTTTGCTGTCTCCCATAAC 1140

  5639281 TTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTA 5639340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTGATATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTCAATAAAGTTTTCAGTTTGCTTCTTA 1200

  5639341 ATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATA 5639400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTTCTGCACTGACCCATTGGTCATTCAGGAACATATTGTTTAATTTCCAAGTGTTTATA 1260

  5639401 TGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTT 5639460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGATTTCCAGAATTGTTCTTATTGATTTCTAGTTTAACTCTATTATGAGAGAAGATGCTT 1320

  5639461 GATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCT 5639520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATATTATTTCAGTTTTTTTGAATATTTTAAGATTTGTGACCTATCATATGAGCAATCCT 1380

  5639521 TAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTC 5639580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAGTGATCCATGTACTGAGGGAAAGAATGTGTGTTCTGCACCCTTTGGATGAAATGTTC 1440

  5639581 TATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGT 5639640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TATAAATATCTGTTAGGTCCATTTGTTGTATAGTGCAGATTAAGTCCGATGTTTCTTTGT 1500

  5639641 TGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTA 5639700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGAGTTTCTGTCTGGGAGTTGGGTTCAGTGCTGAAAGTGAGGTGTTGAAGTCTCCAGCTA 1560

  5639701 TCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTG 5639760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCATATTGAGGTCTAGCTCTCTCTTTAGCCCTAATAATGTTTGCTTTGTATATCTGGGTG 1620

  5639761 TGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCA 5639820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTTGGGTGCATATGTACATATGATTGTTATATTCTATTGCTGGATTGACTCTTTTCTCA 1680

  5639821 GTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTT 5639880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTATATAATGACATTCTTTGTCTCACAATTTTTGTCTTGAAATCTATTTTGTCAGTATTT 1740

  5639881 ATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTA 5639940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATATAATTACTCCTGCTCTTTTGGTTTCCATTGGCATGTAATATCTTTTTCATCCCCTTA 1800

  5639941 TTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTG 5640000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTCAGTCTATGCATACCTTTGTATGTGAAGTGTGTTTCTTGTGGGCAACAGATCAGTG 1860

  5640001 GATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCAT 5640060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATCTTGTTTTTTCATCCATTCACCCACTCTCTGTCTTTTGATTGGAGAGTTTGGTCCAT 1920

  5640061 TTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTG 5640120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGTATTCAATGCTATTATTGATAAGTAGGGACTTCTGCCATTTTGATATATATTTTCTG 1980

  5640121 GTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTT 5640180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTTGTTTTGTGGTCTTCGTTCTTTCTTTACTTGCTGTGTTCCTTTTAGTGAAGGTGGTTT 2040

  5640181 TCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTT 5640240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTCTGGTGCTATGATTTAATTTCTTGCTTTTTATGTTTTGTGTATCTGTTGTGTTTTTT 2100

  5640241 GATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCAC 5640300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATTTGAGTTTACTGTGAGACTTGCAAGTACTGTCTTATAACCCATTATTTTAAACTCAC 2160

  5640301 GACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATT 5640360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GACAACTTAACACTGATTGTATAAGCAGTCAAACACACACAAAGTGTTTAAAGTGTAATT 2220

  5640361 AAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCT 5640420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAAGTGTAATTAAAACTCTACACTTTAACTTCATCCCTCTACACTTTAACTTCATCCCT 2280

  5640421 CTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAA 5640480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGCTTTTTAACTTTTTTGTTTGTTGTTTCTCCTTATGTCTTACTGTACTATGTCTTGAA 2340

  5640481 AAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTAC 5640540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAGTTGTCGTTATTCTTTATTGGTTCGTTTCATCAGTCTTTCTACTTAAGAGTAGTTTAC 2400

  5640541 ACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAG 5640600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACACTACAATAACACTTATAAAATAAGAATCATTGTTAGGTTATTTATTTGAAGTTACAG 2460

  5640601 AATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTG 5640660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATAAGAGTGTAATTGTGCTGTGTAAACTACTCAAGTAGAAGGAGTTATACTCTTCTGTG 2520

  5640661 TTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCA 5640720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTTTCTGTGTGCTTACTATTACCAGCGAGTTGTACCTTCTGATGGTTTCTTCTTGGTCA 2580

  5640721 TTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCC 5640780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTAAATACTCTTTTCTTTCAGATTGAACAACTCCCTTTAGCATTTCTTGAGGGCAGATCC 2640

  5640781 AGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGC 5640840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGTGTTGATGAACTCTCTCAGCATTTTTTGTCTGTGAAGGTCTTTGTTTCTCCTTCATGC 2700

  5640841 TTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCT 5640884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTGAAGGATATTTTCACTGGATATACTGTTCTAAGGTAAATGCT 2744

EXCISED REGION

  5640889 TTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATT 5640948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 TTTGTTTTTTTTGTCAGCACTTTCAACATATTGTGCCACTCTCTCCTGGCCTGTAAGATT 2804

  5640949 TTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTT 5641008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 TTTACTGAAGAGTCTGCTGTCAGAGATATTGGAGCTCTATTGTATGTTATTTGTTTCTTT 2864

  5641009 TCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTT 5641068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 TCTCTTGCCGTTTTTAGGATCTTTCTTTATCCTTGATAAAGAAACTATCCTTTGAGAGTT 2924

  5641069 TGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTG 5641128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 TGTTTATAGATGCCATAAGGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGTCTTGCTCTG 2984

  5641129 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGT 5641188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGT 3044

  5641189 TCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCAC 5641248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 TCACGCCATTCTCCAGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCAC 3104

  5641249 ACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGG 5641308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 ACCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGG 3164

  5641309 TCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 5641368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 TCTCGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 3224

  5641369 GCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGC 5641428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 GCATGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCATGAGGTACTCTTCTTTAGGTTAAATCTGCTTGGC 3284

  5641429 GTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCT 5641488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 GTTCTGTAACCTTCTCATACTTGAATGCAGATATCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTCTCT 3344

  5641489 CTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCA 5641548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 CTTATCCCTTTGAATGAACTTTCTACTCCGGTCTCTTTCTCTACTTCCTCTTTAAGGCCA 3404

  5641549 ATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATT 5641608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 ATACCTCTTATATTTGCCCTTTTCATGCTATTTTTTAGGCATGCTTCACTGTTTTCTATT 3464

  5641609 CTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTG 5641633
          |||||||||||||||||||||||||
     3465 CTTTTTTCTTTTGTGGTCTCCTCTG 3489

Alignment time is 4.71006 s

