
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   8252] =>      8252 nucs 'mol-32-1f0b-093147_8252'

Score:        8019
Aligned:      8260        nucs
Identic:      8234 (100%) nucs =>      7829 (100%)       405 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4368565,4376417] EXCISED REGION [4377645,4378051]
 second seq =>  [      1,   7845] EXCISED REGION [   7846,   8252]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [7844,7845] to [7846,7847]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4368565 ATGGTCTCCATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 4368624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGGTCTCCATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 60

  4368625 ACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTGCACAAGACCCCTCTTCTTAAGCCAAGCACTGG 4368684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTGCACAAGACCCCTCTTCTTAAGCCAAGCACTGG 120

  4368685 CCAAAACCTAATGGATGACTTTGACGAAGCCACTTCGTGCCTCTGAACCTTGGCTCCTCA 4368744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAAAACCTAATGGATGACTTTGACGAAGCCACTTCGTGCCTCTGAACCTTGGCTCCTCA 180

  4368745 GCTTTAAGAAGAGGAGGATAGTAGCATGCACTGGAGTCGGTTTTGAAGGACCCCTCTTGC 4368804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTTTAAGAAGAGGAGGATAGTAGCATGCACTGGAGTCGGTTTTGAAGGACCCCTCTTGC 240

  4368805 TCTTAAATTCTCTCGTTCTAATTCAAAGTGGAACTGGTGTCTAAGAACTTGCTGGTTTAT 4368864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTTAAATTCTCTCGTTCTAATTCAAAGTGGAATTGGTGTCTAAGAACTTGCTGGTTTAT 300

  4368865 ACTTGAAGCAAGGTGGCAATTTTGGTATTAAAAGACCTCTTCAAAGCTCTTCAATGAGAA 4368924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTTGAAGCAAGGTGGCAATTTTGGTATTAAAAGACCTCTTCAAAGCTCTTCAATGAGAA 360

  4368925 TAATCTAAACCTGGTTTATGTTAACCAAGGGCTTAATTAAACAGAACAAACAATGGGAAA 4368984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAATCTAAACCTGGTTTATGTTAACCAAGGGCTTAATTAAACAGAACAAACAATGGGAAA 420

  4368985 AAGAATGATGTTTTCTTTTTTCCTGAAAATTTTCTCCATTTCTCTATTTCTAAATGTAGA 4369044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGAATGATGTTTTCTTTTTTCCTGAAAATTTTCTCCATTTCTCTATTTCTAAATGTAGA 480

  4369045 GAAATAGACTCAGAATTTTAATCAGACCACAAGTACTTAGATGCTTTCTTATTATGTATC 4369104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAATAGACTCAGAATTTTAATCAGACCACAAGTACTTAGATGCTTTCTTATTATGTATC 540

  4369105 TCTTTGAAAATCAGCTTCACCTTGGAATTTTTGCACATTATTAAGACTAGTATCTCCGCC 4369164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTTGAAAATCAGCTTCACCTTGGAATTTTTGCACATTATTAAGACTAGTATCTCCGCC 600

  4369165 AGACCTTGAGGTCCTCCCATTTTAATAATGTCTGATGGATTACTCAGCCACCATTCTAGA 4369224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGACCTTGAGGTCCTCCCATTTTAATAATGTCTGATGGATTACTCAGCCACCATTCTAGA 660

  4369225 TCTTCCGAAGAAGTGTTCCCAAAGATGTTTTAAGAATCCCAGGAAGGGAAGCTTTCTAAC 4369284
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      661 TCTTCCGAAGAAGTGTTCCCAAAGATGTTTTAAGAATCCTAGGAAGGGAAGCTTTCTAAC 720

  4369285 CTAATTCTTTTCTGGATATGAGCATCCACTTTGCTCTCTGACATGGAATAAAAATATTTA 4369344
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      721 CTAATTCTTTTCTGGATATGAGCATCCACTTTGCTCTCTGACATGGAATAAGAATATTTA 780

  4369345 ACCTGCCTGATTCTCTCATCTGTAAAATAAGAACAATAATACCAATTCTAGTGCTGTCAG 4369404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCTGCCTGATTCTCTCATCTGTAAAATAAGAACAATAATACCAATTCTAGTGCTGTCAG 840

  4369405 AAGAATTGATTGCAAAATGTTGATGCATGCACTGCTCCAAGGGTAGGTTTCTGTTATATA 4369464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGAATTGATTGCAAAATGTTGATGCATGCACTGCTCCAAGGGTAGGTTTCTGTTATATA 900

  4369465 GTTTCTAGGACTTCTACCTGTAAGTTCCACCATATGATCAAAATTGTCTTGAGAGAACAT 4369524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTTCTAGGACTTCTACCTGTAAGTTCCACCATATGATCAAAATTGTCTTGAGAGAACAT 960

  4369525 GGTGCCACAGGAAGAACATTAGCCTGAGAGTCAGAAGACTCAGGTGTAGTCCTGGCTCTG 4369584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTGCCACAGGAAGAACATTAGCCTGAGAGTCAGAAGACTCAGGTGTAGTCCTGGCTCTG 1020

  4369585 ATACACCCTCCCCTGGCTGTAGGCCCTTGTGCAAGCAGTTATCCCTCTTAGCCCTCCATT 4369644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATACACCCTCCCCTGGCTGTAGGCCCTTGTGCAAGCAGTTATCCCTCTTAGCCCTCCATT 1080

  4369645 CCTCACATGCACATGGAGGATTATGATATAACAATGGCGTGATGGTCAAATGTGATTATT 4369704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTCACATGCACATGGAGGATTATGATATAACAATGGCGTGATGGTCAAATGTGATTATT 1140

  4369705 GGAAGACTTGGCTTTGAAGATCACTGACTATCAGAATCCCAAAGGACCTTGACAAGTTGG 4369764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAAGACTTGGCTTTGAAGATCACTGACTATCAGAATCCCAAAGGACCTTGACAAGTTGG 1200

  4369765 AACCATGAACTAGATCTAAAAAGAGTCTATCTAATAGAGATAAAATCCTATGTTCATGGC 4369824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACCATGAACTAGATCTAAAAAGAGTCTATCTAATAGAGATAAAATCCTATGTTCATGGC 1260

  4369825 CAAAAAAAATAAACAGTTAAAAAGGAAGCATGCAATTGCAGGACGTGGTGAATGGAGAGA 4369884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAAAAAAAATAAACAGTTAAAAAGGAAGCATGCAATTGCAGGACGTGGTGAATGGAGAGA 1320

  4369885 TAGCAAAAGGAATTCAAGAGAATCAGGCTTGGCAAGGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGC 4369944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGCAAAAGGAATTCAAGAGAATCAGGCTTGGCAAGGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGC 1380

  4369945 ATTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTGAATTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCC 4370004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTGAATTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCC 1440

  4370005 AAAATGGTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCCTGGTGGCGCAT 4370064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAATGGTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCCTGGTGGCGCAT 1500

  4370065 GCCTGTTATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGTG 4370124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCCTGTTATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGTG 1560

  4370125 GAGGTTGCAGTCATCCAAGATTGCACTCCAGCCTAGGCGACAGAGCAAGACTCCATCTCA 4370184
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGGTTGCAGTCATCCAAGACTGCACTCCAGCCTAGGCGACAGAGCAAGACTCCATCTCA 1620

  4370185 AAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCAAAAAACAAAAAACAATATAACCAAAAGTTCAAATT 4370244
          |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAAAAAAAAAAAAAAAAA-----AAAAAACAAAAAACAATATAACCAAAAGTTCAAATT 1675

  4370245 GTCCTGGGTTTCTGGATCAGTGGGGCCCTCCCCTTCCATGTGACAGTCTTCAGATGAGTG 4370304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 GTCCTGGGTTTCTGGATCAGTGGGGCCCTCCCCTTCCATGTGACAGTCTTCAGATGAGTG 1735

  4370305 AGCAGCATCACTTCCTCAGACTCCTCCAGGACAGCAGCCCTGCTCCTCCTACCCTTCCCT 4370364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 AGCAGCATCACTTCCTCAGACTCCTCCAGGACAGCAGCCCTGCTCCTCCTACCCTTCCCT 1795

  4370365 GAGAGCCATGGGGTGTTGCCTTGTCTCTAGCCCAGTGTTGCGTGTTTCTTGGGTTCTCGT 4370424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 GAGAGCCATGGGGTGTTGCCTTGTCTCTAGCCCAGTGTTGCGTGTTTCTTGGGTTCTCGT 1855

  4370425 TAGATTTTCAGCTGTAAATATAGGACTTCATCTCACTTAGTTAAATCTCCTTAAGTTTGG 4370484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 TAGATTTTCAGCTGTAAATATAGGACTTCATCTCACTTAGTTAAATCTCCTTAAGTTTGG 1915

  4370485 TTCCTTTCCTTCATTATTCCAAATTGTCAAGACCTTTGAGGATTTGGATTTGATCACACC 4370544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TTCCTTTCCTTCATTATTCCAAATTGTCAAGACCTTTGAGGATTTGGATTTGATCACACC 1975

  4370545 CTCTTTTTCTCTGGATCATGATAGATCTGAAACTGTGCCTCGTGTGGAAGGACAGAAGAA 4370604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CTCTTTTTCTCTGGATCATGATAGATCTGAAACTGTGCCTCGTGTGGAAGGACAGAAGAA 2035

  4370605 CGGAAGCTGCATAATATCAGGATTTCTAAATATTAAACATGCTATATTTAATATGTATTT 4370664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CGGAAGCTGCATAATATCAGGATTTCTAAATATTAAACATGCTATATTTAATATGTATTT 2095

  4370665 AATATACATAATAGAGTGTATTTTATATTCTGTAATAAATAAAATATATTATTTTTAATT 4370724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 AATATACATAATAGAGTGTATTTTATATTCTGTAATAAATAAAATATATTATTTTTAATT 2155

  4370725 AATTAAATTTAGCATAGTATTATATCCTTTCATTCAATTAAAGTATGAAGTTCACCCATT 4370784
          |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2156 AATTAAATTTAGCGTAGTATTATATCCTTTCATTCAATTGAAGTATGAAGTTCACCCATT 2215

  4370785 CTCAACGTACATTGGAAATTCAAAAGAAAACAGCAGACCTGCTCCTGCTTCCAGAAACAC 4370844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 CTCAACGTACATTGGAAATTCAAAAGAAAACAGCAGACCTGCTCCTGCTTCCAGAAACAC 2275

  4370845 TCAAAATAAAGACATATGAATATATAGGAACCACAAATTAGTGAAACCTCAGAAGGCAAA 4370904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2276 TCAAAATAAAGACATATGAATATATAGGAACCACAAATTAGTGAAACCTCAGAAGGTAAA 2335

  4370905 AGATATCATAACGCCTTCAAAATAGCATAAAAGACTCCTATTTTTGTAAATTAAGAAGGA 4370964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 AGATATCATAACGCCTTCAAAATAGCATAAAAGACTCCTATTTTTGTAAATTAAGAAGGA 2395

  4370965 AAATTGCAAAGATTAAGCTACTGAAGATGTGAGCCCTCAAATGTTAACAGTGACCTGGGT 4371024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 AAATTGCAAAGATTAAGCTACTGAAGATGTGAGCCCTCAAATGTTAACAGTGACCTGGGT 2455

  4371025 TGGGTAGAATTATACTTTCCTTGGCTTTTTCATTTTATTCACTTGTATTGTCTAAAATTC 4371084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TGGGTAGAATTATACTTTCCTTGGCTTTTTCATTTTATTCACTTGTATTGTCTAAAATTC 2515

  4371085 TAATTTTTGTAATAAGAAAAAAATATAATTTTTTGGTTCTTTTTAAAAATGCATGCATAA 4371144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 TAATTTTTGTAATAAGAAAAAAATATAATTTTTTGGTTCTTTTTAAAAATGCATGCATAA 2575

  4371145 ACCATTTGGTCAGGCCTGGTTACTAGGCTTGGCAGCTCCTCTGTTCCTCACAAAGGGAAA 4371204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 ACCATTTGGTCAGGCCTGGTTACTAGGCTTGGCAGCTCCTCTGTTCCTCACAAAGGGAAA 2635

  4371205 CACAATTTCCATCGGCTGATTCAGCGCTTGCTCAGGACAAATCCTGGCTGACTGGGACAG 4371264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 CACAATTTCCATCGGCTGATTCAGCGCTTGCTCAGGACAAATCCTGGCTGACTGGGACAG 2695

  4371265 GAGGCATTTAAGTAACCATAGTGCACTGTAGGGAAATAGGCATGGCTGAGTCAGTCCCTC 4371324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 GAGGCATTTAAGTAACCATAGTGCACTGTAGGGAAATAGGCATGGCTGAGTCAGTCCCTC 2755

  4371325 TTATGGGCTGTCCCCGAAGGCCCACTCCACTTCTTCCACTGGATATGACCTCAGTCGTCC 4371384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 TTATGGGCTGTCCCCGAAGGCCCACTCCACTTCTTCCACTGGATATGACCTCAGTCGTCC 2815

  4371385 TAAGCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAACTTCTGTATGTG 4371444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 TAAGCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAACTTCTGTATGTG 2875

  4371445 GCCTGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTCACAAATCCTGG 4371504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 GCCTGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTCACAAATCCTGG 2935

  4371505 CCCAGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGGGGACACCCTAC 4371564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 CCCAGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGGGGACACCCTAC 2995

  4371565 CACCCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGATCCACTAGGTA 4371624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 CACCCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGATCCACTAGGTA 3055

  4371625 TAGGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCTCTCTCACTAC 4371684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 TAGGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCTCTCTCACTAC 3115

  4371685 TCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACCACGTTACTTC 4371744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 TCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACCACGTTACTTC 3175

  4371745 TCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATCCTTAGCCTGG 4371804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 TCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATCCTTAGCCTGG 3235

  4371805 CTCCAGTTGCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCT 4371864
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 CTCCAGTCGCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCT 3295

  4371865 TTTGAATATCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGAT 4371924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 TTTGAATATCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGAT 3355

  4371925 GCTCAGCTCTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGTC 4371984
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3356 GCTCAGCTCTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAAATGCACCTGGGTTTTTGTC 3415

  4371985 AGCCCCCTTCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCT 4372044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 AGCCCCCTTCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCT 3475

  4372045 CCTGTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTG 4372104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 CCTGTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTG 3535

  4372105 CTTATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAAT 4372164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 CTTATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAAT 3595

  4372165 TCCAGATGAAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCC 4372224
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 TCCAGATGAAGAAAGAGAGAGTGCTAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCC 3655

  4372225 AGGACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTT 4372284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 AGGACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTT 3715

  4372285 AATAACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATG 4372344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 AATAACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATG 3775

  4372345 GTGCTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGC 4372404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 GTGCTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGC 3835

  4372405 TAATTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCA 4372464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 TAATTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCA 3895

  4372465 ACCAGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGG 4372524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 ACCAGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGG 3955

  4372525 CAATACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGC 4372584
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||
     3956 CAATACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAA--TCACACAGCGC 4013

  4372585 GTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACT 4372644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 GTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACT 4073

  4372645 AATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTG 4372704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 AATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTG 4133

  4372705 CTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAA 4372764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4134 CTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATGAA 4193

  4372765 GTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTAC 4372824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 GTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTAC 4253

  4372825 GTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCAT 4372884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 GTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCAT 4313

  4372885 TCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTC 4372944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 TCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTC 4373

  4372945 TATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCA 4373004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 TATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCA 4433

  4373005 GAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAG 4373064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 GAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAG 4493

  4373065 AACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAA 4373124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 AACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAA 4553

  4373125 ATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTT 4373184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 ATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTT 4613

  4373185 TCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCA 4373244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 TCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCA 4673

  4373245 TTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTT 4373304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 TTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTT 4733

  4373305 CCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTG 4373364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 CCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTG 4793

  4373365 AAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTT 4373424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 AAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTT 4853

  4373425 TCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGG 4373484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 TCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGG 4913

  4373485 GGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAAT 4373544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 GGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAAT 4973

  4373545 TTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAA 4373604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 TTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAA 5033

  4373605 AATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTT 4373664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 AATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTT 5093

  4373665 CTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCA 4373724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 CTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCA 5153

  4373725 ATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTC 4373784
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 ATGGCACGATCTCAGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTC 5213

  4373785 AGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATT 4373844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 AGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATT 5273

  4373845 TTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTG 4373904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 TTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTG 5333

  4373905 ATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 4373964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 ATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 5393

  4373965 CGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTT 4374024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 CGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTT 5453

  4374025 TTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGCG 4374084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5454 TTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGGG 5513

  4374085 GATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGA 4374144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 GATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGA 5573

  4374145 AGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCAT 4374204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 AGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCAT 5633

  4374205 CAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAA 4374264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 CAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAA 5693

  4374265 GCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCA 4374324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 GCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCA 5753

  4374325 AAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCT 4374384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 AAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCT 5813

  4374385 ATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGA 4374444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 ATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGA 5873

  4374445 TAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCT 4374504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 TAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCT 5933

  4374505 GAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCT 4374564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 GAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCT 5993

  4374565 CTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGC 4374624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 CTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGC 6053

  4374625 TGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCA 4374684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 TGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCA 6113

  4374685 GCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAA 4374744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 GCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAA 6173

  4374745 AATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACC 4374804
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     6174 AATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACA 6233

  4374805 GTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTG 4374864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 GTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTG 6293

  4374865 AATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTA 4374924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6294 AATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTA 6353

  4374925 TGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGAT 4374984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 TGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGAT 6413

  4374985 GATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATT 4375044
          ||||||||||.|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 GATTATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATT 6472

  4375045 ATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTG 4375104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6473 ATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTG 6532

  4375105 ACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCA 4375164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6533 ACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCA 6592

  4375165 GGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTA 4375224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6593 GGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTA 6652

  4375225 CAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAA 4375284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6653 CAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAA 6712

  4375285 AGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTG 4375344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6713 AGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTG 6772

  4375345 TGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCT 4375404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6773 TGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCT 6832

  4375405 TTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTG 4375464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6833 TTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTG 6892

  4375465 TGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTC 4375524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6893 TGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTC 6952

  4375525 TCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGC 4375584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6953 TCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGC 7012

  4375585 TTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTAT 4375644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7013 TTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTAT 7072

  4375645 GGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAAT 4375704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7073 GGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAAT 7132

  4375705 ATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGC 4375764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7133 ATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGC 7192

  4375765 GAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGT 4375824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7193 GAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGT 7252

  4375825 GAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACA 4375884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7253 GAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACA 7312

  4375885 AAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTG 4375944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7313 AAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTG 7372

  4375945 GCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGA 4376004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     7373 GCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGAGAGTCCCTGAGCTGTGA 7432

  4376005 GCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAG 4376064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7433 GCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAG 7492

  4376065 ACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAA 4376124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7493 ACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAA 7552

  4376125 AAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAG 4376184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7553 AAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAG 7612

  4376185 AGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAAC 4376244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7613 AGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAAC 7672

  4376245 AGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATT 4376304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7673 AGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATT 7732

  4376305 TAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGA 4376364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7733 TAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGA 7792

  4376365 GAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 4376417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7793 GAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 7845

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7846 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 7905

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     7906 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 7965

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4377824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7966 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 8025

  4377825 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4377884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8026 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 8085

  4377885 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 4377944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8086 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 8145

  4377945 AAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 4378004
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8146 AAAAGTACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 8205

  4378005 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCA 4378051
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8206 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCA 8252

Alignment time is 6.37359 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   2597] =>      2597 nucs 'mol-32-206b-048029_2597'

Score:        2563
Aligned:      2596        nucs
Identic:      2593 (100%) nucs =>       543 (100%)      2050 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4375444,4375986] EXCISED REGION [4375988,4378040]
 second seq =>  [      1,    543] EXCISED REGION [    545,   2597]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4375987,4375987]
 second seq =>         1 nucs [544,544]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [543,544] to [544,545]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4375986,4375986] to [4375988,4375988]
 second seq =>         1 nucs [543,543] to [545,545]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4375444 ATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGT 4375503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGT 60

  4375504 TTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAA 4375563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAA 120

  4375564 GATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTA 4375623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTA 180

  4375624 GAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCAT 4375683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCAT 240

  4375684 TGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTG 4375743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTG 300

  4375744 CCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACT 4375803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACT 360

  4375804 TGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCT 4375863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCT 420

  4375864 AAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAG 4375923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAG 480

  4375924 TGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGA 4375983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGA 540

  4375984 AAG 4375986
          |||
      541 AAG 543

EXCISED REGION

  4375988 GAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAA 4376047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 GAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAA 604

  4376048 TTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAG 4376107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 TTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAG 664

  4376108 CAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAG 4376167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 CAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAG 724

  4376168 GCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAA 4376227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 GCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAA 784

  4376228 GATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTT 4376287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 GATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTT 844

  4376288 TTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAG 4376347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 TTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAG 904

  4376348 ATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAA 4376407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 ATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAA 964

  4376408 GTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAG 4376467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 GTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAG 1024

  4376468 ACTGACATATTTCTATTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAA 4376527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 ACTGACATATTTCTATTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAA 1084

  4376528 AAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTA 4376587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 AAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTA 1144

  4376588 GGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAA 4376647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 GGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAA 1204

  4376648 GAAGAAATATAACTTTTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATA 4376707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 GAAGAAATATAACTTTTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATA 1264

  4376708 AATATAACAAAAACTATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTA 4376767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 AATATAACAAAAACTATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTA 1324

  4376768 ATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAG 4376827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 ATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAG 1384

  4376828 TATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAAT 4376887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 TATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAAT 1444

  4376888 GCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGG 4376947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 GCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGG 1504

  4376948 ATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCA 4377007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 ATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCA 1564

  4377008 ATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAG 4377067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 ATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAG 1624

  4377068 GGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAA 4377127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 GGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAA 1684

  4377128 AGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAG 4377187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 AGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAG 1744

  4377188 AGGACTGGTAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAG 4377247
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 AGGACTGGGAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAG 1804

  4377248 CGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGG 4377307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 CGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGG 1864

  4377308 CTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGA 4377367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 CTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGA 1924

  4377368 CTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTC 4377427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 CTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTC 1984

  4377428 AGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCT 4377487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 AGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCT 2044

  4377488 CAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTT 4377547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 CAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTT 2104

  4377548 CATATATACATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAA 4377607
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 CATATATGCATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAA 2164

  4377608 TGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAA 4377667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 TGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAA 2224

  4377668 TATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGAT 4377727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 TATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGAT 2284

  4377728 GCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTT 4377787
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 GCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTT 2344

  4377788 GTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGT 4377847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 GTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGT 2404

  4377848 GATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATT 4377907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 GATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATT 2464

  4377908 TAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTG 4377967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 TAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTG 2524

  4377968 TAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCC 4378027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 TAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCC 2584

  4378028 TTCATCTGGTAAA 4378040
          |||||||||||||
     2585 TTCATCTGGTAAA 2597

Alignment time is 1.95865 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   4935] =>      4935 nucs 'mol-32-2076-091456_4935'

Score:        4793
Aligned:      4936        nucs
Identic:      4923 (100%) nucs =>       249 (100%)      4674 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4373043,4373291] EXCISED REGION [4373293,4377979]
 second seq =>  [      1,    249] EXCISED REGION [    250,   4935]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4373292,4373292]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [4373314,4373314]
 second seq =>         1 nucs [271,271]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4373292,4373293] to [4373293,4373294]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4373043 AATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTT 4373102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTT 60

  4373103 CCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGC 4373162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGC 120

  4373163 TTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCA 4373222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCA 180

  4373223 GACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCC 4373282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCC 240

  4373283 CCTTCACCT 4373291
          |||||||||
      241 CCTTCACCT 249

EXCISED REGION

  4373293 AATCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCT 4373352
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      250 AATCAGTAGTTTCCCATCCTGCCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCT 309

  4373353 CAAGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGA 4373412
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 CAAGATTCACTCAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGA 369

  4373413 GGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAA 4373472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 GGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAA 429

  4373473 ACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACA 4373532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 ACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACA 489

  4373533 CCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTT 4373592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 CCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTT 549

  4373593 GGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGA 4373652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 GGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGA 609

  4373653 AAACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCA 4373712
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 AAACATAATTTTCTTTTC-TTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCA 668

  4373713 GGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAA 4373772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      669 GGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAA 728

  4373773 TTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTT 4373832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      729 TTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTT 788

  4373833 AATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATT 4373892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 AATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATT 848

  4373893 CCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCC 4373952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 CCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCC 908

  4373953 ACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATAC 4374012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 ACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATAC 968

  4374013 ATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTG 4374072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 ATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTG 1028

  4374073 ATGCTTTTGGCGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACT 4374132
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 ATGCTTTTGGGGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACT 1088

  4374133 GAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGA 4374192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 GAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGA 1148

  4374193 TGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTC 4374252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 TGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTC 1208

  4374253 CCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTA 4374312
          ||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 CCCTTCTCTGAAACAATGGCTGTTACGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTA 1268

  4374313 TCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCC 4374372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 TCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCC 1328

  4374373 GGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGG 4374432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 GGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGG 1388

  4374433 GTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACA 4374492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 GTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACA 1448

  4374493 CAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATG 4374552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 CAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATG 1508

  4374553 GCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGG 4374612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 GCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGG 1568

  4374613 TTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGA 4374672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 TTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGA 1628

  4374673 CCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGG 4374732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 CCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGG 1688

  4374733 CTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCG 4374792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 CTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCG 1748

  4374793 GAGAGAACCACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATG 4374852
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 GAGAGAACCACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATG 1808

  4374853 TGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCG 4374912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 TGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCG 1868

  4374913 AGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGT 4374972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 AGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGT 1928

  4374973 TTGCCGCTAGATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTT 4375032
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 TTGCCGCTAGATGATTATTTCACCCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTT 1988

  4375033 TTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCC 4375092
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 TTCACTATTATTCTAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCC 2048

  4375093 TATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTT 4375152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 TATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTT 2108

  4375153 GGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGG 4375212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 GGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGG 2168

  4375213 GAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTT 4375272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 GAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTT 2228

  4375273 CAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTC 4375332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 CAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTC 2288

  4375333 AGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTT 4375392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 AGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTT 2348

  4375393 TCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTA 4375452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 TCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTA 2408

  4375453 AGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTG 4375512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 AGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTG 2468

  4375513 ACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCA 4375572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 ACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCA 2528

  4375573 CAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACAC 4375632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 CAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACAC 2588

  4375633 GTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTG 4375692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 GTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTG 2648

  4375693 GCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAAT 4375752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 GCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAAT 2708

  4375753 AACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAA 4375812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 AACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAA 2768

  4375813 ACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTT 4375872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 ACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTT 2828

  4375873 TGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTA 4375932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 TGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTA 2888

  4375933 CACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTC 4375992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2889 CACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGGGAGTC 2948

  4375993 CCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTG 4376052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 CCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTG 3008

  4376053 CTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATC 4376112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 CTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATC 3068

  4376113 TGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATG 4376172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 TGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATG 3128

  4376173 ACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGT 4376232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 ACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGT 3188

  4376233 TAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAG 4376292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 TAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAG 3248

  4376293 GTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGT 4376352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 GTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGT 3308

  4376353 TTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGA 4376412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 TTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGA 3368

  4376413 ATCTATATGCTCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGA 4376472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 ATCTATATGCTCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGA 3428

  4376473 CATATTTCTATTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGAC 4376532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 CATATTTCTATTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGAC 3488

  4376533 AAGCAAACCTGACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAG 4376592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 AAGCAAACCTGACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAG 3548

  4376593 TTGGTTCCGTCCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGA 4376652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 TTGGTTCCGTCCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGA 3608

  4376653 AATATAACTTTTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATAT 4376712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 AATATAACTTTTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATAT 3668

  4376713 AACAAAAACTATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAG 4376772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 AACAAAAACTATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAG 3728

  4376773 AATACTCAATGCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATAC 4376832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 AATACTCAATGCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATAC 3788

  4376833 AGGCACAGTCTTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCG 4376892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 AGGCACAGTCTTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCG 3848

  4376893 TGTTCTTTGAGCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCA 4376952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 TGTTCTTTGAGCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCA 3908

  4376953 GGCTCTGAGCCAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAAC 4377012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 GGCTCTGAGCCAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAAC 3968

  4377013 TTGGCAGAAAATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTT 4377072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 TTGGCAGAAAATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTT 4028

  4377073 GTGACGGTTAATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCAT 4377132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 GTGACGGTTAATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCAT 4088

  4377133 TGTTTCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGAC 4377192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4089 TGTTTCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGAC 4148

  4377193 TGGTAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCAT 4377252
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4149 TGGGAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCAT 4208

  4377253 CTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTC 4377312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4209 CTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTC 4268

  4377313 ATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCA 4377372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4269 ATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCA 4328

  4377373 GGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCC 4377432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4329 GGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCC 4388

  4377433 TTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCT 4377492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4389 TTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCT 4448

  4377493 TACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATAT 4377552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4449 TACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATAT 4508

  4377553 ATACATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTA 4377612
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4509 ATGCATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTA 4568

  4377613 TCTTATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGG 4377672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4569 TCTTATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGG 4628

  4377673 CTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTAT 4377732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4629 CTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTAT 4688

  4377733 TAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTA 4377792
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4689 TAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTA 4748

  4377793 GGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCT 4377852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4749 GGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCT 4808

  4377853 CTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATA 4377912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4809 CTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATA 4868

  4377913 ATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAG 4377972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4869 ATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAG 4928

  4377973 CATACCA 4377979
          |||||||
     4929 CATACCA 4935

Alignment time is 3.6924 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   5564] =>      5564 nucs 'mol-32-20fa-031665_5564'

Score:        5443
Aligned:      5564        nucs
Identic:      5553 (100%) nucs =>       905 (100%)      4648 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4370907,4371811] EXCISED REGION [4371813,4376471]
 second seq =>  [      1,    905] EXCISED REGION [    907,   5564]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4371812,4371812]
 second seq =>         1 nucs [906,906]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [4373292,4373292]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4371811,4371811] to [4371812,4371812]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4370907 ATATCATAACGCCTTCAAAATAGCATAAAAGACTCCTATTTTTGTAAATTAAGAAGGAAA 4370966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATCATAACGCCTTCAAAATAGCATAAAAGACTCCTATTTTTGTAAATTAAGAAGGAAA 60

  4370967 ATTGCAAAGATTAAGCTACTGAAGATGTGAGCCCTCAAATGTTAACAGTGACCTGGGTTG 4371026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTGCAAAGATTAAGCTACTGAAGATGTGAGCCCTCAAATGTTAACAGTGACCTGGGTTG 120

  4371027 GGTAGAATTATACTTTCCTTGGCTTTTTCATTTTATTCACTTGTATTGTCTAAAATTCTA 4371086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTAGAATTATACTTTCCTTGGCTTTTTCATTTTATTCACTTGTATTGTCTAAAATTCTA 180

  4371087 ATTTTTGTAATAAGAAAAAAATATAATTTTTTGGTTCTTTTTAAAAATGCATGCATAAAC 4371146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTTTGTAATAAGAAAAAAATATAATTTTTTGGTTCTTTTTAAAAATGCATGCATAAAC 240

  4371147 CATTTGGTCAGGCCTGGTTACTAGGCTTGGCAGCTCCTCTGTTCCTCACAAAGGGAAACA 4371206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATTTGGTCAGGCCTGGTTACTAGGCTTGGCAGCTCCTCTGTTCCTCACAAAGGGAAACA 300

  4371207 CAATTTCCATCGGCTGATTCAGCGCTTGCTCAGGACAAATCCTGGCTGACTGGGACAGGA 4371266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAATTTCCATCGGCTGATTCAGCGCTTGCTCAGGACAAATCCTGGCTGACTGGGACAGGA 360

  4371267 GGCATTTAAGTAACCATAGTGCACTGTAGGGAAATAGGCATGGCTGAGTCAGTCCCTCTT 4371326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCATTTAAGTAACCATAGTGCACTGTAGGGAAATAGGCATGGCTGAGTCAGTCCCTCTT 420

  4371327 ATGGGCTGTCCCCGAAGGCCCACTCCACTTCTTCCACTGGATATGACCTCAGTCGTCCTA 4371386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGGGCTGTCCCCGAAGGCCCACTCCACTTCTTCCACTGGATATGACCTCAGTCGTCCTA 480

  4371387 AGCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAACTTCTGTATGTGGC 4371446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAACTTCTGTATGTGGC 540

  4371447 CTGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTCACAAATCCTGGCC 4371506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTCACAAATCCTGGCC 600

  4371507 CAGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGGGGACACCCTACCA 4371566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGGGGACACCCTACCA 660

  4371567 CCCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGATCCACTAGGTATA 4371626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGATCCACTAGGTATA 720

  4371627 GGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCTCTCTCACTACTC 4371686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCTCTCTCACTACTC 780

  4371687 ACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACCACGTTACTTCTC 4371746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACCACGTTACTTCTC 840

  4371747 TTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATCCTTAGCCTGGCT 4371806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATCCTTAGCCTGGCT 900

  4371807 CCAGT 4371811
          |||||
      901 CCAGT 905

EXCISED REGION

  4371813 GCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTTGAATA 4371872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 GCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTTGAATA 966

  4371873 TCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCTCAGCT 4371932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 TCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCTCAGCT 1026

  4371933 CTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGTCAGCCCCCT 4371992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 CTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGTCAGCCCCCT 1086

  4371993 TCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGG 4372052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 TCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGG 1146

  4372053 ATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCT 4372112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 ATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCT 1206

  4372113 GTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATG 4372172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 GTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATG 1266

  4372173 AAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCC 4372232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 AAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCC 1326

  4372233 GTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTT 4372292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 GTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTT 1386

  4372293 TATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTG 4372352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 TATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTG 1446

  4372353 ACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCT 4372412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 ACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCT 1506

  4372413 AGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCC 4372472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 AGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCC 1566

  4372473 AGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTC 4372532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 AGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTC 1626

  4372533 CTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACCT 4372592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 CTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACCT 1686

  4372593 AAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAG 4372652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 AAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAG 1746

  4372653 GGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATA 4372712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 GGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATA 1806

  4372713 CATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGAT 4372772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 CATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGAT 1866

  4372773 AGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCAC 4372832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 AGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCAC 1926

  4372833 CTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCC 4372892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 CTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCC 1986

  4372893 AGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACC 4372952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 AGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACC 2046

  4372953 TCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAA 4373012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 TCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAA 2106

  4373013 AAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGG 4373072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 AAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGG 2166

  4373073 ATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGC 4373132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 ATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGC 2226

  4373133 TTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATA 4373192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 TTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATA 2286

  4373193 GTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCA 4373252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 GTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCA 2346

  4373253 GAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCT 4373312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     2347 GAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCT-AATCAGTAGTTTCCCATCCT 2405

  4373313 GGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTA 4373372
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2406 GCCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTCAAGAACTA 2465

  4373373 CTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATG 4373432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 CTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATG 2525

  4373433 GTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAAC 4373492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 GTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAAC 2585

  4373493 TGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATA 4373552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 TGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATA 2645

  4373553 TTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTC 4373612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 TTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTC 2705

  4373613 CTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTT 4373672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 CTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTT 2765

  4373673 TTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACG 4373732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 TTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACG 2825

  4373733 ATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCC 4373792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 ATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCC 2885

  4373793 GAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAG 4373852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 GAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAG 2945

  4373853 AGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCT 4373912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 AGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCT 3005

  4373913 GCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATG 4373972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 GCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATG 3065

  4373973 TAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGT 4374032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 TAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGT 3125

  4374033 TACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGCGGATACACG 4374092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3126 TACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGGGGATACACG 3185

  4374093 AAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTG 4374152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 AAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTG 3245

  4374153 CTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATT 4374212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 CTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATT 3305

  4374213 TCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGC 4374272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3306 TCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAACAATGGC 3365

  4374273 TGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAA 4374332
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 TGTTACGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAA 3425

  4374333 AGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAA 4374392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 AGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAA 3485

  4374393 ACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTT 4374452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 ACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTT 3545

  4374453 CCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCT 4374512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 CCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCT 3605

  4374513 TAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATC 4374572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 TAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATC 3665

  4374573 CCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATC 4374632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 CCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATC 3725

  4374633 AGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCC 4374692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 AGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCC 3785

  4374693 CTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATA 4374752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 CTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATA 3845

  4374753 CAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTA 4374812
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3846 CAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTA 3905

  4374813 TTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACT 4374872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 TTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACT 3965

  4374873 ATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGA 4374932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 ATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGA 4025

  4374933 AATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTT 4374992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 AATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTT 4085

  4374993 CAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATG 4375052
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4086 CACCCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTCTAAAATG 4145

  4375053 ATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACC 4375112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 ATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACC 4205

  4375113 CACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCT 4375172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 CACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCT 4265

  4375173 GACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAG 4375232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 GACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAG 4325

  4375233 TCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATC 4375292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 TCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATC 4385

  4375293 ACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACA 4375352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4386 ACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACA 4445

  4375353 GAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAA 4375412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4446 GAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAA 4505

  4375413 GGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTG 4375472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4506 GGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTG 4565

  4375473 CTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTT 4375532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4566 CTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTT 4625

  4375533 GTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAAT 4375592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4626 GTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAAT 4685

  4375593 GTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTT 4375652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4686 GTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTT 4745

  4375653 TGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCAC 4375712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4746 TGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCAC 4805

  4375713 ATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGA 4375772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4806 ATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGA 4865

  4375773 AAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTT 4375832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4866 AAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTT 4925

  4375833 AGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCAC 4375892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4926 AGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCAC 4985

  4375893 AAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTT 4375952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4986 AAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTT 5045

  4375953 AACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACA 4376012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5046 AACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGGGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACA 5105

  4376013 GGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATA 4376072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5106 GGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATA 5165

  4376073 TAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGG 4376132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5166 TAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGG 5225

  4376133 GTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTC 4376192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5226 GTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTC 5285

  4376193 CCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGT 4376252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5286 CCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGT 5345

  4376253 GGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCAT 4376312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5346 GGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCAT 5405

  4376313 TAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTT 4376372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5406 TAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTT 5465

  4376373 GAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTA 4376432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5466 GAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTA 5525

  4376433 AACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTG 4376471
          ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5526 AACACAAGAGCAACGGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTG 5564

Alignment time is 4.19045 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   9823] =>      9823 nucs 'mol-32-2110-103083_9823'

Score:        9604
Aligned:      9824        nucs
Identic:      9804 (100%) nucs =>      1037 (100%)      8767 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4370775,4371811] EXCISED REGION [4371813,4380599]
 second seq =>  [      1,   1037] EXCISED REGION [   1039,   9823]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4371812,4371812]
 second seq =>         1 nucs [1038,1038]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [4373292,4373292]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4371811,4371811] to [4371812,4371812]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4370775 TTCACCCATTCTCAACGTACATTGGAAATTCAAAAGAAAACAGCAGACCTGCTCCTGCTT 4370834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCACCCATTCTCAACGTACATTGGAAATTCAAAAGAAAACAGCAGACCTGCTCCTGCTT 60

  4370835 CCAGAAACACTCAAAATAAAGACATATGAATATATAGGAACCACAAATTAGTGAAACCTC 4370894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGAAACACTCAAAATAAAGACATATGAATATATAGGAACCACAAATTAGTGAAACCTC 120

  4370895 AGAAGGCAAAAGATATCATAACGCCTTCAAAATAGCATAAAAGACTCCTATTTTTGTAAA 4370954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAGGCAAAAGATATCATAACGCCTTCAAAATAGCATAAAAGACTCCTATTTTTGTAAA 180

  4370955 TTAAGAAGGAAAATTGCAAAGATTAAGCTACTGAAGATGTGAGCCCTCAAATGTTAACAG 4371014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAAGAAGGAAAATTGCAAAGATTAAGCTACTGAAGATGTGAGCCCTCAAATGTTAACAG 240

  4371015 TGACCTGGGTTGGGTAGAATTATACTTTCCTTGGCTTTTTCATTTTATTCACTTGTATTG 4371074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGACCTGGGTTGGGTAGAATTATACTTTCCTTGGCTTTTTCATTTTATTCACTTGTATTG 300

  4371075 TCTAAAATTCTAATTTTTGTAATAAGAAAAAAATATAATTTTTTGGTTCTTTTTAAAAAT 4371134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTAAAATTCTAATTTTTGTAATAAGAAAAAAATATAATTTTTTGGTTCTTTTTAAAAAT 360

  4371135 GCATGCATAAACCATTTGGTCAGGCCTGGTTACTAGGCTTGGCAGCTCCTCTGTTCCTCA 4371194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATGCATAAACCATTTGGTCAGGCCTGGTTACTAGGCTTGGCAGCTCCTCTGTTCCTCA 420

  4371195 CAAAGGGAAACACAATTTCCATCGGCTGATTCAGCGCTTGCTCAGGACAAATCCTGGCTG 4371254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAAGGGAAACACAATTTCCATCGGCTGATTCAGCGCTTGCTCAGGACAAATCCTGGCTG 480

  4371255 ACTGGGACAGGAGGCATTTAAGTAACCATAGTGCACTGTAGGGAAATAGGCATGGCTGAG 4371314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTGGGACAGGAGGCATTTAAGTAACCATAGTGCACTGTAGGGAAATAGGCATGGCTGAG 540

  4371315 TCAGTCCCTCTTATGGGCTGTCCCCGAAGGCCCACTCCACTTCTTCCACTGGATATGACC 4371374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAGTCCCTCTTATGGGCTGTCCCCGAAGGCCCACTCCACTTCTTCCACTGGATATGACC 600

  4371375 TCAGTCGTCCTAAGCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAACT 4371434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAGTCGTCCTAAGCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAACT 660

  4371435 TCTGTATGTGGCCTGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTCA 4371494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTGTATGTGGCCTGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTCA 720

  4371495 CAAATCCTGGCCCAGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGGG 4371554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAAATCCTGGCCCAGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGGG 780

  4371555 GACACCCTACCACCCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGAT 4371614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACACCCTACCACCCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGAT 840

  4371615 CCACTAGGTATAGGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCT 4371674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCACTAGGTATAGGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCT 900

  4371675 CTCTCACTACTCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACC 4371734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCTCACTACTCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACC 960

  4371735 ACGTTACTTCTCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATC 4371794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACGTTACTTCTCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATC 1020

  4371795 CTTAGCCTGGCTCCAGT 4371811
          |||||||||||||||||
     1021 CTTAGCCTGGCTCCAGT 1037

EXCISED REGION

  4371813 GCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTTGAATA 4371872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 GCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTTGAATA 1098

  4371873 TCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCTCAGCT 4371932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 TCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCTCAGCT 1158

  4371933 CTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGTCAGCCCCCT 4371992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 CTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGTCAGCCCCCT 1218

  4371993 TCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGG 4372052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 TCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGG 1278

  4372053 ATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCT 4372112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 ATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCT 1338

  4372113 GTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATG 4372172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 GTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATG 1398

  4372173 AAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCC 4372232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 AAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCC 1458

  4372233 GTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTT 4372292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 GTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTT 1518

  4372293 TATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTG 4372352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 TATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTG 1578

  4372353 ACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCT 4372412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 ACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCT 1638

  4372413 AGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCC 4372472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 AGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCC 1698

  4372473 AGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTC 4372532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 AGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTC 1758

  4372533 CTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACCT 4372592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 CTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACCT 1818

  4372593 AAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAG 4372652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 AAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAG 1878

  4372653 GGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATA 4372712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 GGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATA 1938

  4372713 CATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGAT 4372772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 CATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGAT 1998

  4372773 AGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCAC 4372832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 AGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCAC 2058

  4372833 CTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCC 4372892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 CTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCC 2118

  4372893 AGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACC 4372952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 AGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACC 2178

  4372953 TCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAA 4373012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 TCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAA 2238

  4373013 AAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGG 4373072
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2239 AAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAACGGCCTATCTCAGAACTAGGG 2298

  4373073 ATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGC 4373132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 ATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGC 2358

  4373133 TTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATA 4373192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 TTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATA 2418

  4373193 GTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCA 4373252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 GTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCA 2478

  4373253 GAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCT 4373312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     2479 GAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCT-AATCAGTAGTTTCCCATCCT 2537

  4373313 GGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTA 4373372
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2538 GCCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTCAAGAACTA 2597

  4373373 CTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATG 4373432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 CTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATG 2657

  4373433 GTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAAC 4373492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 GTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAAC 2717

  4373493 TGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATA 4373552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 TGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATA 2777

  4373553 TTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTC 4373612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 TTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTC 2837

  4373613 CTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTT 4373672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 CTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTT 2897

  4373673 TTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACG 4373732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 TTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACG 2957

  4373733 ATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCC 4373792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 ATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCC 3017

  4373793 GAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAG 4373852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 GAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAG 3077

  4373853 AGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCT 4373912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 AGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCT 3137

  4373913 GCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATG 4373972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 GCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATG 3197

  4373973 TAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGT 4374032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 TAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGT 3257

  4374033 TACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGCGGATACACG 4374092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3258 TACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGGGGATACACG 3317

  4374093 AAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTG 4374152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3318 AAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTG 3377

  4374153 CTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATT 4374212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 CTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATT 3437

  4374213 TCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGC 4374272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3438 TCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAACAATGGC 3497

  4374273 TGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAA 4374332
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3498 TGTTACGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAA 3557

  4374333 AGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAA 4374392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3558 AGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAA 3617

  4374393 ACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTT 4374452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3618 ACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTT 3677

  4374453 CCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCT 4374512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3678 CCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCT 3737

  4374513 TAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATC 4374572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3738 TAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATC 3797

  4374573 CCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATC 4374632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3798 CCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATC 3857

  4374633 AGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCC 4374692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3858 AGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCC 3917

  4374693 CTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATA 4374752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3918 CTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATA 3977

  4374753 CAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTA 4374812
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3978 CAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTA 4037

  4374813 TTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACT 4374872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4038 TTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACT 4097

  4374873 ATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGA 4374932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4098 ATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGA 4157

  4374933 AATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTT 4374992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4158 AATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTT 4217

  4374993 CAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATG 4375052
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4218 CACCCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTCTAAAATG 4277

  4375053 ATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACC 4375112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4278 ATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACC 4337

  4375113 CACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCT 4375172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4338 CACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCT 4397

  4375173 GACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAG 4375232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4398 GACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAG 4457

  4375233 TCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATC 4375292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4458 TCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATC 4517

  4375293 ACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACA 4375352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4518 ACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACA 4577

  4375353 GAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAA 4375412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4578 GAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAA 4637

  4375413 GGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTG 4375472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4638 GGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTG 4697

  4375473 CTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTT 4375532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4698 CTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTT 4757

  4375533 GTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAAT 4375592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4758 GTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAAT 4817

  4375593 GTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTT 4375652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4818 GTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTT 4877

  4375653 TGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCAC 4375712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4878 TGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCAC 4937

  4375713 ATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGA 4375772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4938 ATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGA 4997

  4375773 AAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTT 4375832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 AAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTT 5057

  4375833 AGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCAC 4375892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 AGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCAC 5117

  4375893 AAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTT 4375952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5118 AAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTT 5177

  4375953 AACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACA 4376012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5178 AACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGGGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACA 5237

  4376013 GGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATA 4376072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 GGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATA 5297

  4376073 TAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGG 4376132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 TAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGG 5357

  4376133 GTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTC 4376192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 GTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTC 5417

  4376193 CCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGT 4376252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5418 CCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGT 5477

  4376253 GGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCAT 4376312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5478 GGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCAT 5537

  4376313 TAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTT 4376372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5538 TAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTT 5597

  4376373 GAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTA 4376432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5598 GAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTA 5657

  4376433 AACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATTTATGTTTA 4376492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5658 AACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATTTATGTTTA 5717

  4376493 AACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTA 4376552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5718 AACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTA 5777

  4376553 AGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGC 4376612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5778 AGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGC 5837

  4376613 CAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTTTCACCCTG 4376672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5838 CAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTTTCACCCTG 5897

  4376673 ACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTATTAGATACT 4376732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5898 ACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTATTAGATACT 5957

  4376733 ATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGG 4376792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5958 ATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGG 6017

  4376793 CTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAG 4376852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6018 CTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAG 6077

  4376853 GTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATT 4376912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6078 GTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATT 6137

  4376913 CCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCT 4376972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6138 CCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCT 6197

  4376973 GAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGAC 4377032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6198 GAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGAC 6257

  4377033 CCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTG 4377092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6258 CCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTG 6317

  4377093 TCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTG 4377152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6318 TCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTG 6377

  4377153 AGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGTAGAGGAAGACCCATCC 4377212
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6378 AGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGGAGAGGAAGACCCATCC 6437

  4377213 TCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAA 4377272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6438 TCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAA 6497

  4377273 GAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGAT 4377332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6498 GAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGAT 6557

  4377333 GCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAAT 4377392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6558 GCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAAT 6617

  4377393 CTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTG 4377452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6618 CTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTG 6677

  4377453 CTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGG 4377512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6678 CTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGG 6737

  4377513 ATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATACATATATCCTGCTAGTT 4377572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6738 ATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATGCATATATCCTGCTAGTT 6797

  4377573 CTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTG 4377632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6798 CTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTG 6857

  4377633 TGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAA 4377692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6858 TGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAA 6917

  4377693 GACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTAT 4377752
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     6918 GACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTAT 6977

  4377753 TAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATT 4377812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6978 TAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATT 7037

  4377813 ACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAA 4377872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7038 ACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAA 7097

  4377873 CGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAA 4377932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7098 CGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAA 7157

  4377933 TATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGC 4377992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7158 TATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGC 7217

  4377993 AGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCAC 4378052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7218 AGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCAC 7277

  4378053 AGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTA 4378112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     7278 AGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATACTAAAGTA 7337

  4378113 ATATACAAATGCTAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATTATGAAAGTA 4378172
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     7338 ATATACAAATGCTAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATTATAAAAGTA 7397

  4378173 ATTTTAATGAGCATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAATCCTCAGTC 4378232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7398 ATTTTAATGAGCATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAATCCTCAGTC 7457

  4378233 TGGGTTGCCAGGTTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAGTTTCAGATA 4378292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7458 TGGGTTGCCAGGTTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAGTTTCAGATA 7517

  4378293 AACAATGAACACTTTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAATGTTTATCAG 4378352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7518 AACAATGAACACTTTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAATGTTTATCAG 7577

  4378353 AAATATTTCAGATACACTGAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTAAAACATGTT 4378412
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7578 AAATATTTCAGATACGCTGAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTAAAACATGTT 7637

  4378413 TTTGTTTGTTTATATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGACTCTGGGAA 4378472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7638 TTTGTTTGTTTATATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGACTCTGGGAA 7697

  4378473 GAACCAGGAAGAGAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTATCTGAAATTG 4378532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7698 GAACCAGGAAGAGAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTATCTGAAATTG 7757

  4378533 AAATTTGACTAGGCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTACAAAATAGGT 4378592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     7758 AAATTTGACTAGGCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTACAAAATAGCT 7817

  4378593 ACAATAACTATATATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTGGTGCAATGG 4378652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7818 ACAATAACTATATATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTGGTGCAATGG 7877

  4378653 GAAATCACCCACTATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAATCCAGAGGC 4378712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7878 GAAATCACCCACTATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAATCCAGAGGC 7937

  4378713 AGAATGAGAAAGGCACATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGGTAAACTTCC 4378772
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7938 AGAATGAGAAAGGCGCATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGGTAAACTTCC 7997

  4378773 CTGAGAGCAATAACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAGCACCTGAAT 4378832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7998 CTGAGAGCAATAACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAGCACCTGAAT 8057

  4378833 GTGTGCTCCAAGTTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCTTCCTCTATG 4378892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8058 GTGTGCTCCAAGTTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCTTCCTCTATG 8117

  4378893 AGGTACATCTGAGCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGATTGAGGCCA 4378952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8118 AGGTACATCTGAGCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGATTGAGGCCA 8177

  4378953 AGTGTTTTGGGTTAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAGTGTTAAGTG 4379012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8178 AGTGTTTTGGGTTAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAGTGTTAAGTG 8237

  4379013 AAAATGCTATATAAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGCCTAACCTGC 4379072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8238 AAAATGCTATATAAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGCCTAACCTGC 8297

  4379073 AGCCTCTCGGCCGTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGACTGTAGGAAGGCGG 4379132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8298 AGCCTCTCGGCCGTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGACTGTAGGAAGGCGG 8357

  4379133 ATATGTTGTCCAGCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATAAGGCAGTTCTCCTATCC 4379192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8358 ATATGTTGTCCAGCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATAAGGCAGTTCTCCTATCC 8417

  4379193 AGCCTGTCACCACTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTAATAAAACCCCATGTCTC 4379252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8418 AGCCTGTCACCACTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTAATAAAACCCCATGTCTC 8477

  4379253 ATTTGCTGGCTATGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGTGCCTTCCCTACTGAGGT 4379312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8478 ATTTGCTGGCTATGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGTGCCTTCCCTACTGAGGT 8537

  4379313 TAATAGGGGTTTGGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAATGTTATAATTTCTCAAAC 4379372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8538 TAATAGGGGTTTGGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAATGTTATAATTTCTCAAAC 8597

  4379373 TATATTAATCCCAAATTCAAATGCTAAAGATAACAACATATTGCAAAGCTGACTCTAAAT 4379432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8598 TATATTAATCCCAAATTCAAATGCTAAAGATAACAACATATTGCAAAGCTGACTCTAAAT 8657

  4379433 GCCTCTGGATTTTTCAGCCCTTTTGGAAGATTGACAACATTAGTCCCTTCTTTTAGTGCA 4379492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8658 GCCTCTGGATTTTTCAGCCCTTTTGGAAGATTGACAACATTAGTCCCTTCTTTTAGTGCA 8717

  4379493 AACTATCTAGAGATGGGAGATCAAATGTGGAAATGCTTATAAGATGTTTTTAGTTGATGA 4379552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8718 AACTATCTAGAGATGGGAGATCAAATGTGGAAATGCTTATAAGATGTTTTTAGTTGATGA 8777

  4379553 GATTTCAGGATCTGGGAGCTAAACCTTGAGTTATTTCATTGCCATTGGGTGGTGGCAGTT 4379612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8778 GATTTCAGGATCTGGGAGCTAAACCTTGAGTTATTTCATTGCCATTGGGTGGTGGCAGTT 8837

  4379613 GACTTGTTTTCTGCTGTTTCAGTGGACCTTGAAATTATCATGACTATTTGCTTCACTTCA 4379672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8838 GACTTGTTTTCTGCTGTTTCAGTGGACCTTGAAATTATCATGACTATTTGCTTCACTTCA 8897

  4379673 GTGTACACCATCCCGCTCCATTTGCAGTCAGCACCACTCAGGGAATAAAACATATTCATT 4379732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8898 GTGTACACCATCCCGCTCCATTTGCAGTCAGCACCACTCAGGGAATAAAACATATTCATT 8957

  4379733 CGCAGTGTCCCTAGCAATGACAGAGGTATTTTCAAATATCTTTTTGCTCTTGAAGAAAGG 4379792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8958 CGCAGTGTCCCTAGCAATGACAGAGGTATTTTCAAATATCTTTTTGCTCTTGAAGAAAGG 9017

  4379793 AGCTCACTTTGCTTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAAAGGACCAATATTTGACACACATCAT 4379852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9018 AGCTCACTTTGCTTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAAAGGACCAATATTTGACACACATCAT 9077

  4379853 ATTATATTGCAAAGAATAGGAGTGTATGTGTGTGTATGCATCTGTATGTGTTTTAGCATA 4379912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9078 ATTATATTGCAAAGAATAGGAGTGTATGTGTGTGTATGCATCTGTATGTGTTTTAGCATA 9137

  4379913 GACATCAAACCAAAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAGAGGCAGACAGAGTGAAAGACCCCCA 4379972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9138 GACATCAAACCAAAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAGAGGCAGACAGAGTGAAAGACCCCCA 9197

  4379973 GGAGGACTTGGGTTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTAACTAGTTATGTTACCATCCACAAGT 4380032
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9198 GGAGGAC-TGGGTTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTAACTAGTTATGTTACCATCCACAAGT 9256

  4380033 CACCTACTCTTTCTGAGTCTCATTTTCACTATCTGTAGTGCATCAATATCTGCTCTATTC 4380092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9257 CACCTACTCTTTCTGAGTCTCATTTTCACTATCTGTAGTGCATCAATATCTGCTCTATTC 9316

  4380093 CACCGGAGCATTGTGGGACAAGGTTTCAAACCTAGAAGGCATCTTGGCTGTATACAGCTA 4380152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9317 CACCGGAGCATTGTGGGACAAGGTTTCAAACCTAGAAGGCATCTTGGCTGTATACAGCTA 9376

  4380153 GGAGAAGGAATTATAATTGGTTCATTATTGACTCTTCCTTAAGAAGTTCTAACAGAATAA 4380212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9377 GGAGAAGGAATTATAATTGGTTCATTATTGACTCTTCCTTAAGAAGTTCTAACAGAATAA 9436

  4380213 ATTTGCCTTCTTGCCTGCTAATTAGACATGTATTTAACTGTTTCTTTTTTAAATAACTCT 4380272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9437 ATTTGCCTTCTTGCCTGCTAATTAGACATGTATTTAACTGTTTCTTTTTTAAATAACTCT 9496

  4380273 CTGCTGTTATTTGAAATCTTCTATTATATGTAATAAAAATCTCTGTCACACACACATACA 4380332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9497 CTGCTGTTATTTGAAATCTTCTATTATATGTAATAAAAATCTCTGTCACACACACATACA 9556

  4380333 CAAAGATAACAATTGGCTCTAAGCAAAATGATTTCAGAAATAAGGGGGCAAACTTCAAAT 4380392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9557 CAAAGATAACAATTGGCTCTAAGCAAAATGATTTCAGAAATAAGGGGGCAAACTTCAAAT 9616

  4380393 TATTACTGCCCATCAAGGAAGTCAGGTGACAACAGAGTATTGTTAACAACAAAAATATTT 4380452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9617 TATTACTGCCCATCAAGGAAGTCAGGTGACAACAGAGTATTGTTAACAACAAAAATATTT 9676

  4380453 TCAAAAGCACCAAAGAAGATAAAAATTTAAATGTCAGAGCTGAAGACAAAGATTTCTATC 4380512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9677 TCAAAAGCACCAAAGAAGATAAAAATTTAAATGTCAGAGCTGAAGACAAAGATTTCTATC 9736

  4380513 AGTACATCTCACACTTTTGCATAATCAGAATCACATAGGAGAACTTGTTAACTATGCAGA 4380572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9737 AGTACATCTCACACTTTTGCATAATCAGAATCACATAGGAGAACTTGTTAACTATGCAGA 9796

  4380573 TTTCCGGGCCTCACACCAGAGATTCTG 4380599
          |||||||||||||||||||||||||||
     9797 TTTCCGGGCCTCACACCAGAGATTCTG 9823

Alignment time is 7.30099 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   2494] =>      2494 nucs 'mol-32-2218-004729_2494'

Score:        2428
Aligned:      2494        nucs
Identic:      2488 (100%) nucs =>       782 (100%)      1706 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4375634,4376417] EXCISED REGION [4377645,4379354]
 second seq =>  [      1,    784] EXCISED REGION [    785,   2494]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [783,784] to [785,786]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4375634 TCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGG 4375693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGG 60

  4375694 CTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATA 4375753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATA 120

  4375754 ACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAA 4375813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAA 180

  4375814 CATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTT 4375873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTT 240

  4375874 GGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTAC 4375933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTAC 300

  4375934 ACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCC 4375993
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      301 ACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGAGAGTCC 360

  4375994 CTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGC 4376053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGC 420

  4376054 TGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCT 4376113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCT 480

  4376114 GGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGA 4376173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGA 540

  4376174 CTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTT 4376233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTT 600

  4376234 AGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGG 4376293
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      601 AGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAGTTCATCTTTTCAGG 660

  4376294 TGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTT 4376353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTT 720

  4376354 TTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAA 4376413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAA 780

  4376414 TCTA 4376417
          ||||
      781 TCTA 784

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 844

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      845 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 904

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4377824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 964

  4377825 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4377884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 1024

  4377885 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 4377944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 1084

  4377945 AAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 4378004
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 AAAAGTACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 1144

  4378005 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAA 4378064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAA 1204

  4378065 AGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTAATATACAAATGC 4378124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 AGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTAATATACAAATGC 1264

  4378125 TAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATTATGAAAGTAATTTTAATGAGC 4378184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 TAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATTATGAAAGTAATTTTAATGAGC 1324

  4378185 ATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAATCCTCAGTCTGGGTTGCCAGG 4378244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 ATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAATCCTCAGTCTGGGTTGCCAGG 1384

  4378245 TTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAGTTTCAGATAAACAATGAACAC 4378304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 TTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAGTTTCAGATAAACAATGAACAC 1444

  4378305 TTTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAATGTTTATCAGAAATATTTCAGA 4378364
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 ATTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAATGTTTATCAGAAATATTTCAGA 1504

  4378365 TACACTGAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTAAAACATGTTTTTGTTTGTTTA 4378424
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 TACACTAAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTAAAACATGTTTTTGTTTGTTTA 1564

  4378425 TATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGACTCTGGGAAGAACCAGGAAGA 4378484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 TATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGACTCTGGGAAGAACCAGGAAGA 1624

  4378485 GAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTATCTGAAATTGAAATTTGACTAG 4378544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 GAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTATCTGAAATTGAAATTTGACTAG 1684

  4378545 GCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTACAAAATAGGTACAATAACTATA 4378604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 GCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTACAAAATAGGTACAATAACTATA 1744

  4378605 TATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTGGTGCAATGGGAAATCACCCAC 4378664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 TATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTGGTGCAATGGGAAATCACCCAC 1804

  4378665 TATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAATCCAGAGGCAGAATGAGAAAG 4378724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 TATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAATCCAGAGGCAGAATGAGAAAG 1864

  4378725 GCACATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGGTAAACTTCCCTGAGAGCAATA 4378784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 GCACATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGGTAAACTTCCCTGAGAGCAATA 1924

  4378785 ACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAGCACCTGAATGTGTGCTCCAAG 4378844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 ACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAGCACCTGAATGTGTGCTCCAAG 1984

  4378845 TTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCTTCCTCTATGAGGTACATCTGA 4378904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 TTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCTTCCTCTATGAGGTACATCTGA 2044

  4378905 GCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGATTGAGGCCAAGTGTTTTGGGT 4378964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 GCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGATTGAGGCCAAGTGTTTTGGGT 2104

  4378965 TAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAGTGTTAAGTGAAAATGCTATAT 4379024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 TAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAGTGTTAAGTGAAAATGCTATAT 2164

  4379025 AAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGCCTAACCTGCAGCCTCTCGGCC 4379084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 AAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGCCTAACCTGCAGCCTCTCGGCC 2224

  4379085 GTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGACTGTAGGAAGGCGGATATGTTGTCCA 4379144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 GTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGACTGTAGGAAGGCGGATATGTTGTCCA 2284

  4379145 GCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATAAGGCAGTTCTCCTATCCAGCCTGTCACCA 4379204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 GCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATAAGGCAGTTCTCCTATCCAGCCTGTCACCA 2344

  4379205 CTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTAATAAAACCCCATGTCTCATTTGCTGGCTA 4379264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 CTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTAATAAAACCCCATGTCTCATTTGCTGGCTA 2404

  4379265 TGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGTGCCTTCCCTACTGAGGTTAATAGGGGTTT 4379324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 TGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGTGCCTTCCCTACTGAGGTTAATAGGGGTTT 2464

  4379325 GGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAA 4379354
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 GGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAA 2494

Alignment time is 1.89105 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   5373] =>      5373 nucs 'mol-32-288a-084234_5373'

Score:        5210
Aligned:      5377        nucs
Identic:      5361 (100%) nucs =>      5195 (100%)       166 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4371208,4376417] EXCISED REGION [4377645,4377811]
 second seq =>  [      1,   5206] EXCISED REGION [   5207,   5373]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [5205,5206] to [5207,5208]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4371208 AATTTCCATCGGCTGATTCAGCGCTTGCTCAGGACAAATCCTGGCTGACTGGGACAGGAG 4371267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTTCCATCGGCTGATTCAGCGCTTGCTCAGGACAAATCCTGGCTGACTGGGACAGGAG 60

  4371268 GCATTTAAGTAACCATAGTGCACTGTAGGGAAATAGGCATGGCTGAGTCAGTCCCTCTTA 4371327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCATTTAAGTAACCATAGTGCACTGTAGGGAAATAGGCATGGCTGAGTCAGTCCCTCTTA 120

  4371328 TGGGCTGTCCCCGAAGGCCCACTCCACTTCTTCCACTGGATATGACCTCAGTCGTCCTAA 4371387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGGCTGTCCCCGAAGGCCCACTCCACTTCTTCCACTGGATATGACCTCAGTCGTCCTAA 180

  4371388 GCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAACTTCTGTATGTGGCC 4371447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAACTTCTGTATGTGGCC 240

  4371448 TGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTCACAAATCCTGGCCC 4371507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTCACAAATCCTGGCCC 300

  4371508 AGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGGGGACACCCTACCAC 4371567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGGGGACACCCTACCAC 360

  4371568 CCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGATCCACTAGGTATAG 4371627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGATCCACTAGGTATAG 420

  4371628 GACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCTCTCTCACTACTCA 4371687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCTCTCTCACTACTCA 480

  4371688 CTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACCACGTTACTTCTCT 4371747
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTACTCCATTGAGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACCACGTTACTTCTCT 540

  4371748 TAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATCCTTAGCCTGGCTC 4371807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATCCTTAGCCTGGCTC 600

  4371808 CAGTTGCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTT 4371867
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGTCGCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTT 660

  4371868 GAATATCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCT 4371927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAATATCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCT 720

  4371928 CAGCTCTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGTCAGC 4371987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      721 CAGCTCTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAAATGCACCTGGGTTTTTGTCAGC 780

  4371988 CCCCTTCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCT 4372047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCCTTCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCT 840

  4372048 GTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTT 4372107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTT 900

  4372108 ATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCC 4372167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCC 960

  4372168 AGATGAAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGG 4372227
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGATGAAGAAAGAGAGAGTGCTAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGG 1020

  4372228 ACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAAT 4372287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAAT 1080

  4372288 AACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTG 4372347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTG 1140

  4372348 CTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAA 4372407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAA 1200

  4372408 TTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACC 4372467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACC 1260

  4372468 AGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAA 4372527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAA 1320

  4372528 TACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTG 4372587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||
     1321 TACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAA--TCACACAGCGCGTG 1378

  4372588 CACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAAT 4372647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 CACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAAT 1438

  4372648 CTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTT 4372707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 CTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTT 1498

  4372708 AAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTT 4372767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1499 AAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATGAAGTT 1558

  4372768 ATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTT 4372827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 ATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTT 1618

  4372828 CTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCT 4372887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCT 1678

  4372888 TCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTAT 4372947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTAT 1738

  4372948 CTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAA 4373007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAA 1798

  4373008 AGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAAC 4373067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAAC 1858

  4373068 TAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATA 4373127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATA 1918

  4373128 CGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCC 4373187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCC 1978

  4373188 TGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTA 4373247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTA 2038

  4373248 AGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCC 4373307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCC 2098

  4373308 ATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAG 4373367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 ATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAG 2158

  4373368 AACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCC 4373427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCC 2218

  4373428 ACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGA 4373487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 ACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGA 2278

  4373488 AAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTG 4373547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 AAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTG 2338

  4373548 AAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAAT 4373607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAAT 2398

  4373608 ACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTT 4373667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTT 2458

  4373668 TTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATG 4373727
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TTCTTTTTTTTTTTTTT-GAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATG 2517

  4373728 GCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGT 4373787
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GCACGATCTCAGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGT 2577

  4373788 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTT 4373847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTT 2637

  4373848 AGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATC 4373907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 AGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATC 2697

  4373908 TGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGA 4373967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGA 2757

  4373968 AAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTA 4374027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 AAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTA 2817

  4374028 ACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGCGGAT 4374087
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2818 ACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGGGGAT 2877

  4374088 ACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGG 4374147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 ACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGG 2937

  4374148 ACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAG 4374207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 ACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAG 2997

  4374208 GTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCA 4374267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 GTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCA 3057

  4374268 ATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAG 4374327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 ATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAG 3117

  4374328 GAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATC 4374387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 GAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATC 3177

  4374388 TTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAG 4374447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 TTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAG 3237

  4374448 GATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAA 4374507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAA 3297

  4374508 GCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTC 4374567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 GCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTC 3357

  4374568 ACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGT 4374627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 ACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGT 3417

  4374628 CAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCA 4374687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCA 3477

  4374688 AAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAAT 4374747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 AAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAAT 3537

  4374748 GTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTC 4374807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3538 GTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTC 3597

  4374808 ACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAAT 4374867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 ACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAAT 3657

  4374868 ATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGT 4374927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 ATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGT 3717

  4374928 GGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGAT 4374987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 GGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGAT 3777

  4374988 TATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATA 4375047
          |||||||.|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATA 3836

  4375048 AAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACA 4375107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 AAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACA 3896

  4375108 GAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGA 4375167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 GAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGA 3956

  4375168 GTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAA 4375227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 GTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAA 4016

  4375228 TCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGG 4375287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 TCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGG 4076

  4375288 AGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGG 4375347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 AGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGG 4136

  4375348 GTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTA 4375407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 GTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTA 4196

  4375408 ATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGT 4375467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 ATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGT 4256

  4375468 TTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCT 4375527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4257 TTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCAGACTGATGCTCTCTCT 4316

  4375528 AGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTT 4375587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 AGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTT 4376

  4375588 ATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGA 4375647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 ATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGA 4436

  4375648 ATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATG 4375707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 ATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATG 4496

  4375708 TGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAG 4375767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 TGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAG 4556

  4375768 TGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAG 4375827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 TGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAG 4616

  4375828 TCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAG 4375887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 TCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAG 4676

  4375888 ATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCT 4375947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 ATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCT 4736

  4375948 CACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCT 4376007
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4737 CACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGAGAGTCCCTGAGCTGTGAGCT 4796

  4376008 TCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACA 4376067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 TCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACA 4856

  4376068 AAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAG 4376127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 AAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAG 4916

  4376128 TTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGA 4376187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 TTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGA 4976

  4376188 TTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGG 4376247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 TTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGG 5036

  4376248 TTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAA 4376307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 TTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAA 5096

  4376308 AGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAG 4376367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 AGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAG 5156

  4376368 CCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 4376417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 CCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 5206

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5207 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 5266

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5267 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 5326

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTAT 4377811
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5327 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTAT 5373

Alignment time is 4.11205 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   6517] =>      6517 nucs 'mol-32-29df-031765_6517'

Score:        6387
Aligned:      6519        nucs
Identic:      6507 (100%) nucs =>      2391 (100%)      4116 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4374022,4376417] EXCISED REGION [4377645,4381767]
 second seq =>  [      1,   2395] EXCISED REGION [   2396,   6517]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [2394,2395] to [2396,2397]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4374022 TTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTG 4374081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTG 60

  4374082 GCGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAG 4374141
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAG 120

  4374142 AGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCAC 4374201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCAC 180

  4374202 CATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCT 4374261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCT 240

  4374262 GAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCT 4374321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCT 300

  4374322 GCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTT 4374381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTT 360

  4374382 GCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATAT 4374441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATAT 420

  4374442 GGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAG 4374501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAG 480

  4374502 CCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTC 4374561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTC 540

  4374562 TCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAA 4374621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAA 600

  4374622 GGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTG 4374681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTG 660

  4374682 GCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATA 4374741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATA 720

  4374742 AAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACC 4374801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACC 780

  4374802 ACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAA 4374861
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAA 840

  4374862 TTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTT 4374921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTT 900

  4374922 CTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTA 4374981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTA 960

  4374982 GATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATT 4375041
          |||||||||||||.|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATGATTATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATT 1019

  4375042 ATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATC 4375101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATC 1079

  4375102 CTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTT 4375161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTT 1139

  4375162 TCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAG 4375221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAG 1199

  4375222 TTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAG 4375281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAG 1259

  4375282 TAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGA 4375341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGA 1319

  4375342 GTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATA 4375401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATA 1379

  4375402 CCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTT 4375461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTT 1439

  4375462 CTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCT 4375521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCT 1499

  4375522 CTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACAT 4375581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACAT 1559

  4375582 GGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCT 4375641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCT 1619

  4375642 TATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAA 4375701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAA 1679

  4375702 AATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAG 4375761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAG 1739

  4375762 TGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTG 4375821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTG 1799

  4375822 TGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGT 4375881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGT 1859

  4375882 ACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCA 4375941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 ACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCA 1919

  4375942 TTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTG 4376001
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1920 TTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGAGAGTCCCTGAGCTG 1979

  4376002 TGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACAC 4376061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACAC 2039

  4376062 CAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAA 4376121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAA 2099

  4376122 AAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTG 4376181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTG 2159

  4376182 GAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGA 4376241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGA 2219

  4376242 AACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGA 4376301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGA 2279

  4376302 ATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGG 4376361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 ATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGG 2339

  4376362 GGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 4376417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 2395

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 2455

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2456 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 2515

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4377824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 2575

  4377825 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4377884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 2635

  4377885 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 4377944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 2695

  4377945 AAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 4378004
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 AAAAGTACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 2755

  4378005 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAA 4378064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAA 2815

  4378065 AGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTAATATACAAATGC 4378124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 AGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTAATATACAAATGC 2875

  4378125 TAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATTATGAAAGTAATTTTAATGAGC 4378184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 TAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATTATGAAAGTAATTTTAATGAGC 2935

  4378185 ATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAATCCTCAGTCTGGGTTGCCAGG 4378244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 ATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAATCCTCAGTCTGGGTTGCCAGG 2995

  4378245 TTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAGTTTCAGATAAACAATGAACAC 4378304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 TTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAGTTTCAGATAAACAATGAACAC 3055

  4378305 TTTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAATGTTTATCAGAAATATTTCAGA 4378364
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 ATTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAATGTTTATCAGAAATATTTCAGA 3115

  4378365 TACACTGAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTAAAACATGTTTTTGTTTGTTTA 4378424
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 TACACTAAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTAAAACATGTTTTTGTTTGTTTA 3175

  4378425 TATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGACTCTGGGAAGAACCAGGAAGA 4378484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 TATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGACTCTGGGAAGAACCAGGAAGA 3235

  4378485 GAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTATCTGAAATTGAAATTTGACTAG 4378544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 GAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTATCTGAAATTGAAATTTGACTAG 3295

  4378545 GCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTACAAAATAGGTACAATAACTATA 4378604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 GCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTACAAAATAGGTACAATAACTATA 3355

  4378605 TATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTGGTGCAATGGGAAATCACCCAC 4378664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 TATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTGGTGCAATGGGAAATCACCCAC 3415

  4378665 TATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAATCCAGAGGCAGAATGAGAAAG 4378724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 TATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAATCCAGAGGCAGAATGAGAAAG 3475

  4378725 GCACATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGGTAAACTTCCCTGAGAGCAATA 4378784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 GCACATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGGTAAACTTCCCTGAGAGCAATA 3535

  4378785 ACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAGCACCTGAATGTGTGCTCCAAG 4378844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 ACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAGCACCTGAATGTGTGCTCCAAG 3595

  4378845 TTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCTTCCTCTATGAGGTACATCTGA 4378904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 TTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCTTCCTCTATGAGGTACATCTGA 3655

  4378905 GCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGATTGAGGCCAAGTGTTTTGGGT 4378964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 GCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGATTGAGGCCAAGTGTTTTGGGT 3715

  4378965 TAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAGTGTTAAGTGAAAATGCTATAT 4379024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 TAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAGTGTTAAGTGAAAATGCTATAT 3775

  4379025 AAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGCCTAACCTGCAGCCTCTCGGCC 4379084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 AAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGCCTAACCTGCAGCCTCTCGGCC 3835

  4379085 GTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGACTGTAGGAAGGCGGATATGTTGTCCA 4379144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 GTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGACTGTAGGAAGGCGGATATGTTGTCCA 3895

  4379145 GCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATAAGGCAGTTCTCCTATCCAGCCTGTCACCA 4379204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 GCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATAAGGCAGTTCTCCTATCCAGCCTGTCACCA 3955

  4379205 CTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTAATAAAACCCCATGTCTCATTTGCTGGCTA 4379264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 CTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTAATAAAACCCCATGTCTCATTTGCTGGCTA 4015

  4379265 TGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGTGCCTTCCCTACTGAGGTTAATAGGGGTTT 4379324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 TGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGTGCCTTCCCTACTGAGGTTAATAGGGGTTT 4075

  4379325 GGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAATGTTATAATTTCTCAAACTATATTAATCCC 4379384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 GGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAATGTTATAATTTCTCAAACTATATTAATCCC 4135

  4379385 AAATTCAAATGCTAAAGATAACAACATATTGCAAAGCTGACTCTAAATGCCTCTGGATTT 4379444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 AAATTCAAATGCTAAAGATAACAACATATTGCAAAGCTGACTCTAAATGCCTCTGGATTT 4195

  4379445 TTCAGCCCTTTTGGAAGATTGACAACATTAGTCCCTTCTTTTAGTGCAAACTATCTAGAG 4379504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 TTCAGCCCTTTTGGAAGATTGACAACATTAGTCCCTTCTTTTAGTGCAAACTATCTAGAG 4255

  4379505 ATGGGAGATCAAATGTGGAAATGCTTATAAGATGTTTTTAGTTGATGAGATTTCAGGATC 4379564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 ATGGGAGATCAAATGTGGAAATGCTTATAAGATGTTTTTAGTTGATGAGATTTCAGGATC 4315

  4379565 TGGGAGCTAAACCTTGAGTTATTTCATTGCCATTGGGTGGTGGCAGTTGACTTGTTTTCT 4379624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 TGGGAGCTAAACCTTGAGTTATTTCATTGCCATTGGGTGGTGGCAGTTGACTTGTTTTCT 4375

  4379625 GCTGTTTCAGTGGACCTTGAAATTATCATGACTATTTGCTTCACTTCAGTGTACACCATC 4379684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 GCTGTTTCAGTGGACCTTGAAATTATCATGACTATTTGCTTCACTTCAGTGTACACCATC 4435

  4379685 CCGCTCCATTTGCAGTCAGCACCACTCAGGGAATAAAACATATTCATTCGCAGTGTCCCT 4379744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 CCGCTCCATTTGCAGTCAGCACCACTCAGGGAATAAAACATATTCATTCGCAGTGTCCCT 4495

  4379745 AGCAATGACAGAGGTATTTTCAAATATCTTTTTGCTCTTGAAGAAAGGAGCTCACTTTGC 4379804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 AGCAATGACAGAGGTATTTTCAAATATCTTTTTGCTCTTGAAGAAAGGAGCTCACTTTGC 4555

  4379805 TTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAAAGGACCAATATTTGACACACATCATATTATATTGCAA 4379864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 TTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAAAGGACCAATATTTGACACACATCATATTATATTGCAA 4615

  4379865 AGAATAGGAGTGTATGTGTGTGTATGCATCTGTATGTGTTTTAGCATAGACATCAAACCA 4379924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 AGAATAGGAGTGTATGTGTGTGTATGCATCTGTATGTGTTTTAGCATAGACATCAAACCA 4675

  4379925 AAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAGAGGCAGACAGAGTGAAAGACCCCCAGGAGGACTTGGG 4379984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     4676 AAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAGAGGCAGACAGAGTGAAAGACCCCCAGGAGGAC-TGGG 4734

  4379985 TTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTAACTAGTTATGTTACCATCCACAAGTCACCTACTCTTT 4380044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 TTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTAACTAGTTATGTTACCATCCACAAGTCACCTACTCTTT 4794

  4380045 CTGAGTCTCATTTTCACTATCTGTAGTGCATCAATATCTGCTCTATTCCACCGGAGCATT 4380104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 CTGAGTCTCATTTTCACTATCTGTAGTGCATCAATATCTGCTCTATTCCACCGGAGCATT 4854

  4380105 GTGGGACAAGGTTTCAAACCTAGAAGGCATCTTGGCTGTATACAGCTAGGAGAAGGAATT 4380164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4855 GTGGGACAAGGTTTCAAACCTAGAAGGCATCTTGGCTGTATACAGCTAGGAGAAGGAATT 4914

  4380165 ATAATTGGTTCATTATTGACTCTTCCTTAAGAAGTTCTAACAGAATAAATTTGCCTTCTT 4380224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 ATAATTGGTTCATTATTGACTCTTCCTTAAGAAGTTCTAACAGAATAAATTTGCCTTCTT 4974

  4380225 GCCTGCTAATTAGACATGTATTTAACTGTTTCTTTTTTAAATAACTCTCTGCTGTTATTT 4380284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4975 GCCTGCTAATTAGACATGTATTTAACTGTTTCTTTTTTAAATAACTCTCTGCTGTTATTT 5034

  4380285 GAAATCTTCTATTATATGTAATAAAAATCTCTGTCACACACACATACACAAAGATAACAA 4380344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5035 GAAATCTTCTATTATATGTAATAAAAATCTCTGTCACACACACATACACAAAGATAACAA 5094

  4380345 TTGGCTCTAAGCAAAATGATTTCAGAAATAAGGGGGCAAACTTCAAATTATTACTGCCCA 4380404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5095 TTGGCTCTAAGCAAAATGATTTCAGAAATAAGGGGGCAAACTTCAAATTATTACTGCCCA 5154

  4380405 TCAAGGAAGTCAGGTGACAACAGAGTATTGTTAACAACAAAAATATTTTCAAAAGCACCA 4380464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5155 TCAAGGAAGTCAGGTGACAACAGAGTATTGTTAACAACAAAAATATTTTCAAAAGCACCA 5214

  4380465 AAGAAGATAAAAATTTAAATGTCAGAGCTGAAGACAAAGATTTCTATCAGTACATCTCAC 4380524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5215 AAGAAGATAAAAATTTAAATGTCAGAGCTGAAGACAAAGATTTCTATCAGTACATCTCAC 5274

  4380525 ACTTTTGCATAATCAGAATCACATAGGAGAACTTGTTAACTATGCAGATTTCCGGGCCTC 4380584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5275 ACTTTTGCATAATCAGAATCACATAGGAGAACTTGTTAACTATGCAGATTTCCGGGCCTC 5334

  4380585 ACACCAGAGATTCTGAGTCAATAGGACTGAAGTTGGCCAAGAAATCTGGATATTTAGCAA 4380644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5335 ACACCAGAGATTCTGAGTCAATAGGACTGAAGTTGGCCAAGAAATCTGGATATTTAGCAA 5394

  4380645 GCTACCTGGCTGATTCAGAGGCAAGTAGTTCTTTGAGAATACTTTGAGAAACACTGGTCA 4380704
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5395 GCTACGTGGCTGATTCAGAGGCAAGTAGTTCTTTGAGAATACTTTGAGAAACACTGGTCA 5454

  4380705 TTACCAATCAAATATGAACATATTGTTAAAATTTTTAAATAAAGTACGAAAGAAACTGGT 4380764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5455 TTACCAATCAAATATGAACATATTGTTAAAATTTTTAAATAAAGTACGAAAGAAACTGGT 5514

  4380765 AGAAAGGAGAATGTGGATTTAATTCAACATAAAGTTTTGGGATGGGAGATGCAAGACCCT 4380824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5515 AGAAAGGAGAATGTGGATTTAATTCAACATAAAGTTTTGGGATGGGAGATGCAAGACCCT 5574

  4380825 CCCAAGAATAGAACGAGAAGAGAAGGACTCCCTGCAATGTCTTATCTCTCAAAATGTCTC 4380884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5575 CCCAAGAATAGAACGAGAAGAGAAGGACTCCCTGCAATGTCTTATCTCTCAAAATGTCTC 5634

  4380885 TAAGGTGGATCCACAGGAGCTAGTTAGTGAAAACAATGGAGGAAAATGTACAAACCCAAG 4380944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5635 TAAGGTGGATCCACAGGAGCTAGTTAGTGAAAACAATGGAGGAAAATGTACAAACCCAAG 5694

  4380945 AGGAAAATAAGCCATATAAAATTAGAAGAAAAATGTGGGAGGACAGGCAGAAATGGCCAG 4381004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5695 AGGAAAATAAGCCATATAAAATTAGAAGAAAAATGTGGGAGGACAGGCAGAAATGGCCAG 5754

  4381005 AGGGTAAGTAGTCTCAGGGATGGTCAAATTGTTGATGGGTAAAAAGATAGGAGAAATTCA 4381064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5755 AGGGTAAGTAGTCTCAGGGATGGTCAAATTGTTGATGGGTAAAAAGATAGGAGAAATTCA 5814

  4381065 GTAGTCACTGGTCAGAGGGGAAATCTTACTCATCAAAAAGGAGAGGAAGAACCAAGTAAG 4381124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5815 GTAGTCACTGGTCAGAGGGGAAATCTTACTCATCAAAAAGGAGAGGAAGAACCAAGTAAG 5874

  4381125 TGAGAAAACAGTAAAAATGTGAATGACTTTACATTTTTAAGAAAATGACATACAATCTTC 4381184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5875 TGAGAAAACAGTAAAAATGTGAATGACTTTACATTTTTAAGAAAATGACATACAATCTTC 5934

  4381185 ATGGAAAATTTGGTGGTGGGGAAATAAAATGAGTTCAACATGAAAATATCTTTAAAAAGT 4381244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5935 ATGGAAAATTTGGTGGTGGGGAAATAAAATGAGTTCAACATGAAAATATCTTTAAAAAGT 5994

  4381245 ATCTTAGAGGAATTTTAGGATAGAAGATGAGAAAGTACTTTGAAAAGTATAAAGAATGAA 4381304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5995 ATCTTAGAGGAATTTTAGGATAGAAGATGAGAAAGTACTTTGAAAAGTATAAAGAATGAA 6054

  4381305 TTACATGATTATTGCTTGCAGTATTTTCATGATTATCAAATTTTTTCACTGTCTGCCTGG 4381364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6055 TTACATGATTATTGCTTGCAGTATTTTCATGATTATCAAATTTTTTCACTGTCTGCCTGG 6114

  4381365 CTCATAAGGTAGTTAAAGAGGGCTCTATGACATTATCTTTGGATCCCCAGAGCCTAACAG 4381424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6115 CTCATAAGGTAGTTAAAGAGGGCTCTATGACATTATCTTTGGATCCCCAGAGCCTAACAG 6174

  4381425 TATCTGATATATAATAAGCACCAACCGGACGGACAAATGGATGGGTAAATCAAGTTAACA 4381484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6175 TATCTGATATATAATAAGCACCAACCGGACGGACAAATGGATGGGTAAATCAAGTTAACA 6234

  4381485 CAGGAAAAGATAAGAGTTGCATGGTCACATAGTACTCACAAAGCCTTACAGGTTTCATTC 4381544
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6235 CAGGAAAAGATAAGAGTTGCATGGCCACATAGTACTCACAAAGCCTTACAGGTTTCATTC 6294

  4381545 TCTGATTTTATGAACACAGCACTCACGCACATTTTGGTACTAATATCTGCATGCATGAAC 4381604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6295 TCTGATTTTATGAACACAGCACTCACGCACATTTTGGTACTAATATCTGCATGCATGAAC 6354

  4381605 CTCCAACTGGGGCATGCCTGTTTGTCTTCCTGAAGGAAGTACTTCTTGATTCATTTTACT 4381664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6355 CTCCAACTGGGGCATGCCTGTTTGTCTTCCTGAAGGAAGTACTTCTTGATTCATTTTACT 6414

  4381665 TGGTGCATCAGTTGTCTACCTGCTGCCCCTGAGCTGCACTTTCACCTTATTCCATCCTGT 4381724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6415 TGGTGCATCAGTTGTCTACCTGCTGCCCCTGAGCTGCACTTTCACCTTATTCCATCCTGT 6474

  4381725 CTGTATTGCTGGGGCTGTGGGAATCCACAAACTCCATTTTCCA 4381767
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6475 CTGTATTGCTGGGGCTGTGGGAATCCACAAACTCCATTTTCCA 6517

Alignment time is 4.87191 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   2399] =>      2399 nucs 'mol-32-29df-031765_2399'

Score:        2359
Aligned:      2392        nucs
Identic:      2389 (100%) nucs =>       971 (100%)      1418 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4374022,4374994] EXCISED REGION [4375003,4376421]
 second seq =>  [      1,    973] EXCISED REGION [    981,   2399]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [4374995,4375002]
 second seq =>         7 nucs [974,980]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4374995,4374996] to [4375003,4375004]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4374994,4374994] to [4375003,4375003]
 second seq =>         1 nucs [973,973] to [981,981]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [974,976] to [978,980]

  4374022 TTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTG 4374081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTG 60

  4374082 GCGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAG 4374141
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAG 120

  4374142 AGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCAC 4374201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCAC 180

  4374202 CATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCT 4374261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCT 240

  4374262 GAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCT 4374321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCT 300

  4374322 GCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTT 4374381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTT 360

  4374382 GCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATAT 4374441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATAT 420

  4374442 GGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAG 4374501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAG 480

  4374502 CCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTC 4374561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTC 540

  4374562 TCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAA 4374621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAA 600

  4374622 GGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTG 4374681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTG 660

  4374682 GCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATA 4374741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATA 720

  4374742 AAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACC 4374801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACC 780

  4374802 ACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAA 4374861
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAA 840

  4374862 TTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTT 4374921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTT 900

  4374922 CTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTA 4374981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTA 960

  4374982 GATGATTATTTCA 4374994
          |||||||||||||
      961 GATGATTATTTCA 973

EXCISED REGION

  4375003 ACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGAT 4375062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      981 ACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGAT 1040

  4375063 TGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTT 4375122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1041 TGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTT 1100

  4375123 AGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTAT 4375182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1101 AGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTAT 1160

  4375183 AATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAAC 4375242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1161 AATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAAC 1220

  4375243 TCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCT 4375302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1221 TCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCT 1280

  4375303 CGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAG 4375362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1281 CGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAG 1340

  4375363 GGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAAC 4375422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1341 GGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAAC 1400

  4375423 AATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAA 4375482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1401 AATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAA 1460

  4375483 GATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGT 4375542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1461 GATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGT 1520

  4375543 ACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGAT 4375602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1521 ACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGAT 1580

  4375603 GTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACA 4375662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1581 GTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACA 1640

  4375663 GTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAA 4375722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1641 GTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAA 1700

  4375723 TGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGA 4375782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1701 TGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGA 1760

  4375783 ACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTG 4375842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1761 ACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTG 1820

  4375843 TCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGC 4375902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1821 TCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGC 1880

  4375903 ATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAG 4375962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1881 ATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAG 1940

  4375963 TCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGA 4376022
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 TCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGAGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGA 2000

  4376023 GGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTA 4376082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 GGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTA 2060

  4376083 TGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTG 4376142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 TGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTG 2120

  4376143 GTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAG 4376202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 GTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAG 2180

  4376203 AGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACT 4376262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 AGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACT 2240

  4376263 TACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATC 4376322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 TACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATC 2300

  4376323 CAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAA 4376382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 CAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAA 2360

  4376383 TGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATG 4376421
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 TGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATG 2399

Alignment time is 1.82747 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   5368] =>      5368 nucs 'mol-32-2b13-032055_5368'

Score:        5191
Aligned:      5367        nucs
Identic:      5351 (100%) nucs =>       332 (100%)      5019 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4373751,4374082] EXCISED REGION [4374084,4379118]
 second seq =>  [      1,    332] EXCISED REGION [    334,   5368]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4374083,4374083]
 second seq =>         1 nucs [333,333]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [331,334] to [332,335]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4374081,4374082] to [4374084,4374085]
 second seq =>         2 nucs [331,332] to [334,335]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4373751 TCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAG 4373810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAG 60

  4373811 ATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATG 4373870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATG 120

  4373871 TTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGT 4373930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGT 180

  4373931 GCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGAC 4373990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGAC 240

  4373991 TATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCA 4374050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCA 300

  4374051 ACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGG 4374082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGG 332

EXCISED REGION

  4374084 GGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAG 4374143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      334 GGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAG 393

  4374144 AAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCA 4374203
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      394 AAGGACCTGCTTGTTGAGACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCA 453

  4374204 TCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGA 4374263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      454 TCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGA 513

  4374264 AGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGC 4374323
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      514 AACAATGGCTGTTACGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGC 573

  4374324 AAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGC 4374383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      574 AAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGC 633

  4374384 TATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGG 4374443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      634 TATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGG 693

  4374444 ATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCC 4374503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      694 ATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCC 753

  4374504 TGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTC 4374563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      754 TGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTC 813

  4374564 TCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGG 4374623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      814 TCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGG 873

  4374624 CTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGC 4374683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      874 CTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGC 933

  4374684 AGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAA 4374743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      934 AGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAA 993

  4374744 AAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCAC 4374803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      994 AAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCAC 1053

  4374804 CGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATT 4374863
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1054 AGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATT 1113

  4374864 GAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCT 4374923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1114 GAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCT 1173

  4374924 ATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGA 4374983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1174 ATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGA 1233

  4374984 TGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTAT 4375043
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1234 TGATTATTTCACCCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTAT 1293

  4375044 TATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCT 4375103
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1294 TCTAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCT 1353

  4375104 GACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTC 4375163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1354 GACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTC 1413

  4375164 AGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTT 4375223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1414 AGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTT 1473

  4375224 ACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTA 4375283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 ACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTA 1533

  4375284 AAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGT 4375343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 AAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGT 1593

  4375344 GTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACC 4375403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 GTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACC 1653

  4375404 TTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCT 4375463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 TTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCT 1713

  4375464 GTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCT 4375523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 GTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCT 1773

  4375524 CTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGG 4375583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 CTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGG 1833

  4375584 CTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTA 4375643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 CTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTA 1893

  4375644 TGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAA 4375703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 TGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAA 1953

  4375704 TATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTG 4375763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 TATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTG 2013

  4375764 CGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTG 4375823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 CGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTG 2073

  4375824 TGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTAC 4375883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 TGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTAC 2133

  4375884 AAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATT 4375943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 AAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATT 2193

  4375944 GGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTG 4376003
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2194 GGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGGGAGTCCCTGAGCTGTG 2253

  4376004 AGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCA 4376063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 AGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCA 2313

  4376064 GACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAA 4376123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 GACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAA 2373

  4376124 AAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGA 4376183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 AAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGA 2433

  4376184 GAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAA 4376243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 GAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAA 2493

  4376244 CAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAAT 4376303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 CAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAAT 2553

  4376304 TTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGG 4376363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 TTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGG 2613

  4376364 AGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCT 4376423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 AGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCT 2673

  4376424 CTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTAT 4376483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 CTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTAT 2733

  4376484 TTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTG 4376543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 TTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTG 2793

  4376544 ACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTC 4376603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 ACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTC 2853

  4376604 CTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTT 4376663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 CTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTT 2913

  4376664 TTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTA 4376723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 TTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTA 2973

  4376724 TTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATG 4376783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 TTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATG 3033

  4376784 CTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCT 4376843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 CTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCT 3093

  4376844 TTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAG 4376903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 TTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAG 3153

  4376904 CCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCC 4376963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 CCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCC 3213

  4376964 AGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAA 4377023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 AGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAA 3273

  4377024 TTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAA 4377083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 TTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAA 3333

  4377084 TATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGT 4377143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 TATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGT 3393

  4377144 GTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGTAGAGGAA 4377203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3394 GTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGGAGAGGAA 3453

  4377204 GACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAG 4377263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 GACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAG 3513

  4377264 CAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCC 4377323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 CAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCC 3573

  4377324 ATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGC 4377383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 ATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGC 3633

  4377384 TTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAG 4377443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 TTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAG 3693

  4377444 CCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCC 4377503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 CCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCC 3753

  4377504 TATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATACATATATC 4377563
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3754 TATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATGCATATATC 3813

  4377564 CTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGC 4377623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 CTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGC 3873

  4377624 AAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACA 4377683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 AAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACA 3933

  4377684 TTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTT 4377743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 TTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTT 3993

  4377744 TTTCATTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTA 4377803
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 TTTCGTTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTA 4053

  4377804 CTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGA 4377863
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4054 CTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGG 4113

  4377864 AGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAAT 4377923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 AGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAAT 4173

  4377924 AGCAACCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGA 4377983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 AGCAACCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGA 4233

  4377984 TTACTCTGCAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGG 4378043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 TTACTCTGCAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGG 4293

  4378044 GTATACCACAGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGAT 4378103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4294 GTATACCACAGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGAT 4353

  4378104 AGTAAAGTAATATACAAATGCTAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATT 4378163
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 ACTAAAGTAATATACAAATGCTAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATT 4413

  4378164 ATGAAAGTAATTTTAATGAGCATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAA 4378223
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 ATAAAAGTAATTTTAATGAGCATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAA 4473

  4378224 TCCTCAGTCTGGGTTGCCAGGTTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAG 4378283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4474 TCCTCAGTCTGGGTTGCCAGGTTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAG 4533

  4378284 TTTCAGATAAACAATGAACACTTTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAAT 4378343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4534 TTTCAGATAAACAATGAACACTTTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAAT 4593

  4378344 GTTTATCAGAAATATTTCAGATACACTGAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTA 4378403
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4594 GTTTATCAGAAATATTTCAGATACGCTGAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTA 4653

  4378404 AAACATGTTTTTGTTTGTTTATATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGA 4378463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4654 AAACATGTTTTTGTTTGTTTATATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGA 4713

  4378464 CTCTGGGAAGAACCAGGAAGAGAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTAT 4378523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4714 CTCTGGGAAGAACCAGGAAGAGAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTAT 4773

  4378524 CTGAAATTGAAATTTGACTAGGCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTAC 4378583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4774 CTGAAATTGAAATTTGACTAGGCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTAC 4833

  4378584 AAAATAGGTACAATAACTATATATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTG 4378643
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4834 AAAATAGCTACAATAACTATATATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTG 4893

  4378644 GTGCAATGGGAAATCACCCACTATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAA 4378703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4894 GTGCAATGGGAAATCACCCACTATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAA 4953

  4378704 TCCAGAGGCAGAATGAGAAAGGCACATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGG 4378763
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4954 TCCAGAGGCAGAATGAGAAAGGCGCATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGG 5013

  4378764 TAAACTTCCCTGAGAGCAATAACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAG 4378823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5014 TAAACTTCCCTGAGAGCAATAACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAG 5073

  4378824 CACCTGAATGTGTGCTCCAAGTTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCT 4378883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5074 CACCTGAATGTGTGCTCCAAGTTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCT 5133

  4378884 TCCTCTATGAGGTACATCTGAGCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGA 4378943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5134 TCCTCTATGAGGTACATCTGAGCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGA 5193

  4378944 TTGAGGCCAAGTGTTTTGGGTTAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAG 4379003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5194 TTGAGGCCAAGTGTTTTGGGTTAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAG 5253

  4379004 TGTTAAGTGAAAATGCTATATAAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGC 4379063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5254 TGTTAAGTGAAAATGCTATATAAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGC 5313

  4379064 CTAACCTGCAGCCTCTCGGCCGTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGA 4379118
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5314 CTAACCTGCAGCCTCTCGGCCGTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGA 5368

Alignment time is 4.1426 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   4845] =>      4845 nucs 'mol-32-2e15-063270_4845'

Score:        4724
Aligned:      4849        nucs
Identic:      4836 (100%) nucs =>      4391 (100%)       445 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4372016,4376417] EXCISED REGION [4377645,4378091]
 second seq =>  [      1,   4398] EXCISED REGION [   4399,   4845]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [4397,4398] to [4399,4400]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4372016 GTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATATG 4372075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATATG 60

  4372076 ACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCT 4372135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCT 120

  4372136 GAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATGAAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTC 4372195
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      121 GAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATGAAGAAAGAGAGAGTGCTAGTTTC 180

  4372196 ATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAA 4372255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAA 240

  4372256 TGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTA 4372315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTA 300

  4372316 ATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCT 4372375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCT 360

  4372376 GGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGC 4372435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGC 420

  4372436 CTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCT 4372495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCT 480

  4372496 CCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATA 4372555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATA 540

  4372556 AAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGC 4372615
          |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAAAAAAAAAAAA---TCACACAGCGCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGC 597

  4372616 GTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAA 4372675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 GTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAA 657

  4372676 GTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTA 4372735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 GTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTA 717

  4372736 AAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAA 4372795
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 AAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATGAAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAA 777

  4372796 TCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATT 4372855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 TCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATT 837

  4372856 ACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTC 4372915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 ACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTC 897

  4372916 TCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGG 4372975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 TCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGG 957

  4372976 TACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACAC 4373035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 TACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACAC 1017

  4373036 AAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTC 4373095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTC 1077

  4373096 CCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAA 4373155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 CCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAA 1137

  4373156 ATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCC 4373215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 ATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCC 1197

  4373216 ATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTC 4373275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 ATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTC 1257

  4373276 CAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGG 4373335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 CAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGG 1317

  4373336 GGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGT 4373395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 GGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGT 1377

  4373396 AGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACAT 4373455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 AGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACAT 1437

  4373456 CCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTG 4373515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 CCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTG 1497

  4373516 GGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCT 4373575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCT 1557

  4373576 GGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGT 4373635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 GGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGT 1617

  4373636 TTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGT 4373695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGT 1677

  4373696 CTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCAC 4373755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1678 CTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCATGCAACCTCCAC 1737

  4373756 CTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCG 4373815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 CTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCG 1797

  4373816 CACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGC 4373875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 CACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGC 1857

  4373876 TAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGG 4373935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGG 1917

  4373936 GATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTG 4373995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 GATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTG 1977

  4373996 AACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAA 4374055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 AACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAA 2037

  4374056 TGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGCGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTC 4374115
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGGGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTC 2097

  4374116 TATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGAT 4374175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGAT 2157

  4374176 ACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAA 4374235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 ACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAA 2217

  4374236 ATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATA 4374295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 ATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATA 2277

  4374296 TCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGAT 4374355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGAT 2337

  4374356 ACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTC 4374415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 ACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTC 2397

  4374416 AAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTC 4374475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 AAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTC 2457

  4374476 TAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCA 4374535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCA 2517

  4374536 GGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCC 4374595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCC 2577

  4374596 CTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCA 4374655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCA 2637

  4374656 GGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGAT 4374715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 GGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGAT 2697

  4374716 CACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAG 4374775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAG 2757

  4374776 TCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCA 4374835
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCA 2817

  4374836 ACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCA 4374895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 ACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCA 2877

  4374896 CCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTAT 4374955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 CCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTAT 2937

  4374956 TTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATT 4375015
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||| |||||||||||||
     2938 TTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACATT 2996

  4375016 TGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTG 4375075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTG 3056

  4375076 ATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCAC 4375135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 ATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCAC 3116

  4375136 TTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTT 4375195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTT 3176

  4375196 CAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGA 4375255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 CAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGA 3236

  4375256 ATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACA 4375315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 ATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACA 3296

  4375316 GAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAAT 4375375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAAT 3356

  4375376 TATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGT 4375435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGT 3416

  4375436 TTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCT 4375495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCT 3476

  4375496 GAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGC 4375555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 GAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGC 3536

  4375556 TAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACA 4375615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACA 3596

  4375616 ACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATG 4375675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 ACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATG 3656

  4375676 CTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATT 4375735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 CTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATT 3716

  4375736 TCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACA 4375795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 TCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACA 3776

  4375796 CTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAG 4375855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 CTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAG 3836

  4375856 TCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCA 4375915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 TCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCA 3896

  4375916 GTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCT 4375975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 GTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCT 3956

  4375976 GTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAG 4376035
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 GTAAAAGAAAGAGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAG 4016

  4376036 ACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAA 4376095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 ACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAA 4076

  4376096 CAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTT 4376155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 CAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTT 4136

  4376156 CAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTC 4376215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 CAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTC 4196

  4376216 CTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAA 4376275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 CTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAA 4256

  4376276 CTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTT 4376335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 CTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTT 4316

  4376336 CAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTAT 4376395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 CAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTAT 4376

  4376396 TCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 4376417
          ||||||||||||||||||||||
     4377 TCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 4398

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4458

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4459 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 4518

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4377824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4578

  4377825 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4377884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4638

  4377885 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 4377944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 4698

  4377945 AAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 4378004
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 AAAAGTACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 4758

  4378005 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAA 4378064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAA 4818

  4378065 AGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAA 4378091
          |||||||||||||||||||||||||||
     4819 AGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAA 4845

Alignment time is 3.73652 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   2999] =>      2999 nucs 'mol-32-2e20-113203_2999'

Score:        2923
Aligned:      3000        nucs
Identic:      2993 (100%) nucs =>      2708 (100%)       285 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4373704,4376417] EXCISED REGION [4377645,4377930]
 second seq =>  [      1,   2713] EXCISED REGION [   2714,   2999]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [2712,2713] to [2714,2715]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4373704 TGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGG 4373763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
        1 TGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGG 60

  4373764 TTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCA 4373823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCA 120

  4373824 CGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGG 4373883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGG 180

  4373884 TCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAG 4373943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAG 240

  4373944 GTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTT 4374003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTT 300

  4374004 ACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAG 4374063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAG 360

  4374064 GTAATGGTGATGCTTTTGGCGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAAT 4374123
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTAATGGTGATGCTTTTGGGGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAAT 420

  4374124 TTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTT 4374183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTT 480

  4374184 CTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTA 4374243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTA 540

  4374244 GAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTC 4374303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTC 600

  4374304 CCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGA 4374363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGA 660

  4374364 CTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAAC 4374423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAAC 720

  4374424 CAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAG 4374483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAG 780

  4374484 CCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGC 4374543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGC 840

  4374544 TCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCC 4374603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCC 900

  4374604 TCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAG 4374663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAG 960

  4374664 AGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACA 4374723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACA 1020

  4374724 TAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAG 4374783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAG 1080

  4374784 CTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACAT 4374843
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACAT 1140

  4374844 GCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAA 4374903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAA 1200

  4374904 CTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATT 4374963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATT 1260

  4374964 TGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGT 4375023
          |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||| |||||||||||||||||||||
     1261 TGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACATTTGTGTTGT 1319

  4375024 TTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAA 4375083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAA 1379

  4375084 TGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAA 4375143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAA 1439

  4375144 AATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAG 4375203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAG 1499

  4375204 GTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAA 4375263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAA 1559

  4375264 TATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTG 4375323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTG 1619

  4375324 GCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTAT 4375383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTAT 1679

  4375384 ATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAAT 4375443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 ATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAAT 1739

  4375444 ATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGT 4375503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGT 1799

  4375504 TTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAA 4375563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAA 1859

  4375564 GATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTA 4375623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTA 1919

  4375624 GAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCAT 4375683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCAT 1979

  4375684 TGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTG 4375743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTG 2039

  4375744 CCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACT 4375803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACT 2099

  4375804 TGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCT 4375863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCT 2159

  4375864 AAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAG 4375923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAG 2219

  4375924 TGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGA 4375983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGA 2279

  4375984 AAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGC 4376043
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AAGAGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGC 2339

  4376044 TGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGG 4376103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGG 2399

  4376104 TTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTC 4376163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTC 2459

  4376164 TCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGG 4376223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGG 2519

  4376224 GGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCA 4376283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCA 2579

  4376284 TCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCT 4376343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCT 2639

  4376344 GAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTA 4376403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTA 2699

  4376404 AAAAGTAGAATCTA 4376417
          ||||||||||||||
     2700 AAAAGTAGAATCTA 2713

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 2773

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2774 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 2833

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4377824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 2893

  4377825 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4377884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 2953

  4377885 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACC 4377930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACC 2999

Alignment time is 2.61414 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3546] =>      3546 nucs 'mol-32-2e20-172375_3546'

Score:        3470
Aligned:      3547        nucs
Identic:      3540 (100%) nucs =>      3307 (100%)       233 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4373105,4376417] EXCISED REGION [4377645,4377878]
 second seq =>  [      1,   3312] EXCISED REGION [   3313,   3546]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [3311,3312] to [3313,3314]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4373105 TAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTT 4373164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTT 60

  4373165 ACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGA 4373224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGA 120

  4373225 CATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCC 4373284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCC 180

  4373285 TTCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTG 4373344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTG 240

  4373345 GGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGC 4373404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGC 300

  4373405 GGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTG 4373464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTG 360

  4373465 GGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTC 4373524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTC 420

  4373525 AATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTT 4373584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTT 480

  4373585 ATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTAT 4373644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTAT 540

  4373645 CTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTT 4373704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTT 600

  4373705 GTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGT 4373764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      601 GTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGT 660

  4373765 TCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCAC 4373824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCAC 720

  4373825 GCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGT 4373884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGT 780

  4373885 CTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGG 4373944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGG 840

  4373945 TGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTA 4374004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTA 900

  4374005 CTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGG 4374064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGG 960

  4374065 TAATGGTGATGCTTTTGGCGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATT 4374124
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAATGGTGATGCTTTTGGGGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATT 1020

  4374125 TTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTC 4374184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTC 1080

  4374185 TAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAG 4374244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAG 1140

  4374245 AACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCC 4374304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCC 1200

  4374305 CTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGAC 4374364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGAC 1260

  4374365 TGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACC 4374424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACC 1320

  4374425 AATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGC 4374484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGC 1380

  4374485 CCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCT 4374544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCT 1440

  4374545 CACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCT 4374604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCT 1500

  4374605 CTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGA 4374664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGA 1560

  4374665 GAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACAT 4374724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACAT 1620

  4374725 AAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGC 4374784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGC 1680

  4374785 TACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATG 4374844
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATG 1740

  4374845 CACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAAC 4374904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAAC 1800

  4374905 TCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTT 4374964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTT 1860

  4374965 GCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTT 4375024
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||| ||||||||||||||||||||||
     1861 GCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACATTTGTGTTGTT 1919

  4375025 TCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAAT 4375084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAAT 1979

  4375085 GCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAA 4375144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAA 2039

  4375145 ATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGG 4375204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGG 2099

  4375205 TTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAAT 4375264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAAT 2159

  4375265 ATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGG 4375324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGG 2219

  4375325 CTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATA 4375384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATA 2279

  4375385 TACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATA 4375444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATA 2339

  4375445 TAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTT 4375504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTT 2399

  4375505 TTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAG 4375564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAG 2459

  4375565 ATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAG 4375624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAG 2519

  4375625 AACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATT 4375684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATT 2579

  4375685 GTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGC 4375744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGC 2639

  4375745 CAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTT 4375804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTT 2699

  4375805 GACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTA 4375864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTA 2759

  4375865 AGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGT 4375924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 AGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGT 2819

  4375925 GCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAA 4375984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAA 2879

  4375985 AGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCT 4376044
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AGAGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCT 2939

  4376045 GAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGT 4376104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGT 2999

  4376105 TAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCT 4376164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCT 3059

  4376165 CAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGG 4376224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGG 3119

  4376225 GAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCAT 4376284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCAT 3179

  4376285 CTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTG 4376344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTG 3239

  4376345 AAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAA 4376404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 AAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAA 3299

  4376405 AAAGTAGAATCTA 4376417
          |||||||||||||
     3300 AAAGTAGAATCTA 3312

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 3372

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3373 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 3432

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4377824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 3492

  4377825 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGT 4377878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGT 3546

Alignment time is 2.68175 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3518] =>      3518 nucs 'mol-32-2f28-072710_3518'

Score:        3394
Aligned:      3493        nucs
Identic:      3484 (100%) nucs =>       559 (100%)      2925 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4377185,4377745] EXCISED REGION [4377749,4380680]
 second seq =>  [      1,    561] EXCISED REGION [    564,   3493]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [4377746,4377748]
 second seq =>         2 nucs [562,563]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4377746,4377746] to [4377749,4377749]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4377744,4377745] to [4377749,4377750]
 second seq =>         2 nucs [560,561] to [564,565]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4377185 CAGAGGACTGGTAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGC 4377244
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGAGGACTGGGAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGC 60

  4377245 CAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCC 4377304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCC 120

  4377305 TGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATC 4377364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATC 180

  4377365 AGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCT 4377424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCT 240

  4377425 CTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTT 4377484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTT 300

  4377485 CCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCC 4377544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCC 360

  4377545 TTTCATATATACATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAA 4377604
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTCATATATGCATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAA 420

  4377605 TAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTA 4377664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTA 480

  4377665 GAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAA 4377724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAA 540

  4377725 GATGCTATTAATATTATTTTT 4377745
          |||||||||||||||||||||
      541 GATGCTATTAATATTATTTTT 561

EXCISED REGION

  4377749 TTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAG 4377808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      564 TTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAG 623

  4377809 TATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTT 4377868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      624 TATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTT 683

  4377869 TTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAA 4377928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      684 TTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAA 743

  4377929 CCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACT 4377988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      744 CCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACT 803

  4377989 CTGCAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATA 4378048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 CTGCAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATA 863

  4378049 CCACAGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAA 4378108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      864 CCACAGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATACTAA 923

  4378109 AGTAATATACAAATGCTAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATTATGAA 4378168
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      924 AGTAATATACAAATGCTAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATTATAAA 983

  4378169 AGTAATTTTAATGAGCATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAATCCTC 4378228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 AGTAATTTTAATGAGCATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAATCCTC 1043

  4378229 AGTCTGGGTTGCCAGGTTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAGTTTCA 4378288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 AGTCTGGGTTGCCAGGTTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAGTTTCA 1103

  4378289 GATAAACAATGAACACTTTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAATGTTTA 4378348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 GATAAACAATGAACACTTTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAATGTTTA 1163

  4378349 TCAGAAATATTTCAGATACACTGAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTAAAACA 4378408
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 TCAGAAATATTTCAGATACGCTGAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTAAAACA 1223

  4378409 TGTTTTTGTTTGTTTATATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGACTCTG 4378468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 TGTTTTTGTTTGTTTATATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGACTCTG 1283

  4378469 GGAAGAACCAGGAAGAGAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTATCTGAA 4378528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 GGAAGAACCAGGAAGAGAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTATCTGAA 1343

  4378529 ATTGAAATTTGACTAGGCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTACAAAAT 4378588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 ATTGAAATTTGACTAGGCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTACAAAAT 1403

  4378589 AGGTACAATAACTATATATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTGGTGCA 4378648
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 AGCTACAATAACTATATATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTGGTGCA 1463

  4378649 ATGGGAAATCACCCACTATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAATCCAG 4378708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 ATGGGAAATCACCCACTATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAATCCAG 1523

  4378709 AGGCAGAATGAGAAAGGCACATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGGTAAAC 4378768
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 AGGCAGAATGAGAAAGGCGCATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGGTAAAC 1583

  4378769 TTCCCTGAGAGCAATAACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAGCACCT 4378828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 TTCCCTGAGAGCAATAACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAGCACCT 1643

  4378829 GAATGTGTGCTCCAAGTTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCTTCCTC 4378888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 GAATGTGTGCTCCAAGTTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCTTCCTC 1703

  4378889 TATGAGGTACATCTGAGCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGATTGAG 4378948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 TATGAGGTACATCTGAGCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGATTGAG 1763

  4378949 GCCAAGTGTTTTGGGTTAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAGTGTTA 4379008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 GCCAAGTGTTTTGGGTTAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAGTGTTA 1823

  4379009 AGTGAAAATGCTATATAAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGCCTAAC 4379068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 AGTGAAAATGCTATATAAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGCCTAAC 1883

  4379069 CTGCAGCCTCTCGGCCGTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGACTGTAGGAAG 4379128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 CTGCAGCCTCTCGGCCGTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGACTGTAGGAAG 1943

  4379129 GCGGATATGTTGTCCAGCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATAAGGCAGTTCTCCT 4379188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 GCGGATATGTTGTCCAGCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATAAGGCAGTTCTCCT 2003

  4379189 ATCCAGCCTGTCACCACTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTAATAAAACCCCATG 4379248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 ATCCAGCCTGTCACCACTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTAATAAAACCCCATG 2063

  4379249 TCTCATTTGCTGGCTATGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGTGCCTTCCCTACTG 4379308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 TCTCATTTGCTGGCTATGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGTGCCTTCCCTACTG 2123

  4379309 AGGTTAATAGGGGTTTGGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAATGTTATAATTTCTC 4379368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 AGGTTAATAGGGGTTTGGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAATGTTATAATTTCTC 2183

  4379369 AAACTATATTAATCCCAAATTCAAATGCTAAAGATAACAACATATTGCAAAGCTGACTCT 4379428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 AAACTATATTAATCCCAAATTCAAATGCTAAAGATAACAACATATTGCAAAGCTGACTCT 2243

  4379429 AAATGCCTCTGGATTTTTCAGCCCTTTTGGAAGATTGACAACATTAGTCCCTTCTTTTAG 4379488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 AAATGCCTCTGGATTTTTCAGCCCTTTTGGAAGATTGACAACATTAGTCCCTTCTTTTAG 2303

  4379489 TGCAAACTATCTAGAGATGGGAGATCAAATGTGGAAATGCTTATAAGATGTTTTTAGTTG 4379548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 TGCAAACTATCTAGAGATGGGAGATCAAATGTGGAAATGCTTATAAGATGTTTTTAGTTG 2363

  4379549 ATGAGATTTCAGGATCTGGGAGCTAAACCTTGAGTTATTTCATTGCCATTGGGTGGTGGC 4379608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 ATGAGATTTCAGGATCTGGGAGCTAAACCTTGAGTTATTTCATTGCCATTGGGTGGTGGC 2423

  4379609 AGTTGACTTGTTTTCTGCTGTTTCAGTGGACCTTGAAATTATCATGACTATTTGCTTCAC 4379668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 AGTTGACTTGTTTTCTGCTGTTTCAGTGGACCTTGAAATTATCATGACTATTTGCTTCAC 2483

  4379669 TTCAGTGTACACCATCCCGCTCCATTTGCAGTCAGCACCACTCAGGGAATAAAACATATT 4379728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 TTCAGTGTACACCATCCCGCTCCATTTGCAGTCAGCACCACTCAGGGAATAAAACATATT 2543

  4379729 CATTCGCAGTGTCCCTAGCAATGACAGAGGTATTTTCAAATATCTTTTTGCTCTTGAAGA 4379788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 CATTCGCAGTGTCCCTAGCAATGACAGAGGTATTTTCAAATATCTTTTTGCTCTTGAAGA 2603

  4379789 AAGGAGCTCACTTTGCTTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAAAGGACCAATATTTGACACACA 4379848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 AAGGAGCTCACTTTGCTTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAAAGGACCAATATTTGACACACA 2663

  4379849 TCATATTATATTGCAAAGAATAGGAGTGTATGTGTGTGTATGCATCTGTATGTGTTTTAG 4379908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 TCATATTATATTGCAAAGAATAGGAGTGTATGTGTGTGTATGCATCTGTATGTGTTTTAG 2723

  4379909 CATAGACATCAAACCAAAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAGAGGCAGACAGAGTGAAAGACC 4379968
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 CATAGACATCAAACC-AAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAGAGGCAGACAGAGTGAAAGACC 2782

  4379969 CCCAGGAGGACTTGGGTTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTAACTAGTTATGTTACCATCCAC 4380028
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 CCCAGGAGGAC-TGGGTTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTAACTAGTTATGTTACCATCCAC 2841

  4380029 AAGTCACCTACTCTTTCTGAGTCTCATTTTCACTATCTGTAGTGCATCAATATCTGCTCT 4380088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 AAGTCACCTACTCTTTCTGAGTCTCATTTTCACTATCTGTAGTGCATCAATATCTGCTCT 2901

  4380089 ATTCCACCGGAGCATTGTGGGACAAGGTTTCAAACCTAGAAGGCATCTTGGCTGTATACA 4380148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 ATTCCACCGGAGCATTGTGGGACAAGGTTTCAAACCTAGAAGGCATCTTGGCTGTATACA 2961

  4380149 GCTAGGAGAAGGAATTATAATTGGTTCATTATTGACTCTTCCTTAAGAAGTTCTAACAGA 4380208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 GCTAGGAGAAGGAATTATAATTGGTTCATTATTGACTCTTCCTTAAGAAGTTCTAACAGA 3021

  4380209 ATAAATTTGCCTTCTTGCCTGCTAATTAGACATGTATTTAACTGTTTCTTTTTTAAATAA 4380268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 ATAAATTTGCCTTCTTGCCTGCTAATTAGACATGTATTTAACTGTTTCTTTTTTAAATAA 3081

  4380269 CTCTCTGCTGTTATTTGAAATCTTCTATTATATGTAATAAAAATCTCTGTCACACACACA 4380328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 CTCTCTGCTGTTATTTGAAATCTTCTATTATATGTAATAAAAATCTCTGTCACACACACA 3141

  4380329 TACACAAAGATAACAATTGGCTCTAAGCAAAATGATTTCAGAAATAAGGGGGCAAACTTC 4380388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 TACACAAAGATAACAATTGGCTCTAAGCAAAATGATTTCAGAAATAAGGGGGCAAACTTC 3201

  4380389 AAATTATTACTGCCCATCAAGGAAGTCAGGTGACAACAGAGTATTGTTAACAACAAAAAT 4380448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 AAATTATTACTGCCCATCAAGGAAGTCAGGTGACAACAGAGTATTGTTAACAACAAAAAT 3261

  4380449 ATTTTCAAAAGCACCAAAGAAGATAAAAATTTAAATGTCAGAGCTGAAGACAAAGATTTC 4380508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 ATTTTCAAAAGCACCAAAGAAGATAAAAATTTAAATGTCAGAGCTGAAGACAAAGATTTC 3321

  4380509 TATCAGTACATCTCACACTTTTGCATAATCAGAATCACATAGGAGAACTTGTTAACTATG 4380568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 TATCAGTACATCTCACACTTTTGCATAATCAGAATCACATAGGAGAACTTGTTAACTATG 3381

  4380569 CAGATTTCCGGGCCTCACACCAGAGATTCTGAGTCAATAGGACTGAAGTTGGCCAAGAAA 4380628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 CAGATTTCCGGGCCTCACACCAGAGATTCTGAGTCAATAGGACTGAAGTTGGCCAAGAAA 3441

  4380629 TCTGGATATTTAGCAAGCTACCTGGCTGATTCAGAGGCAAGTAGTTCTTTGA 4380680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 TCTGGATATTTAGCAAGCTACCTGGCTGATTCAGAGGCAAGTAGTTCTTTGA 3493

Alignment time is 2.65256 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3062] =>      3062 nucs 'mol-32-2f33-018007_3062'

Score:        3023
Aligned:      3056        nucs
Identic:      3053 (100%) nucs =>       939 (100%)      2114 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4375048,4375986] EXCISED REGION [4375988,4378104]
 second seq =>  [      1,    939] EXCISED REGION [    941,   3057]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4375987,4375987]
 second seq =>         1 nucs [940,940]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [939,940] to [940,941]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4375986,4375986] to [4375988,4375988]
 second seq =>         1 nucs [939,939] to [941,941]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4375048 AAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACA 4375107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACA 60

  4375108 GAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGA 4375167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGA 120

  4375168 GTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAA 4375227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAA 180

  4375228 TCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGG 4375287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGG 240

  4375288 AGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGG 4375347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGG 300

  4375348 GTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTA 4375407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTA 360

  4375408 ATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGT 4375467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGT 420

  4375468 TTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCT 4375527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCT 480

  4375528 AGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTT 4375587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTT 540

  4375588 ATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGA 4375647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGA 600

  4375648 ATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATG 4375707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATG 660

  4375708 TGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAG 4375767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAG 720

  4375768 TGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAG 4375827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAG 780

  4375828 TCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAG 4375887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAG 840

  4375888 ATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCT 4375947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCT 900

  4375948 CACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAG 4375986
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAG 939

EXCISED REGION

  4375988 GAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAA 4376047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 GAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAA 1000

  4376048 TTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAG 4376107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 TTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAG 1060

  4376108 CAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAG 4376167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 CAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAG 1120

  4376168 GCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAA 4376227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 GCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAA 1180

  4376228 GATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTT 4376287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 GATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTT 1240

  4376288 TTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAG 4376347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 TTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAG 1300

  4376348 ATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAA 4376407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 ATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAA 1360

  4376408 GTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAG 4376467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 GTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAG 1420

  4376468 ACTGACATATTTCTATTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAA 4376527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 ACTGACATATTTCTATTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAA 1480

  4376528 AAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTA 4376587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 AAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTA 1540

  4376588 GGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAA 4376647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 GGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAA 1600

  4376648 GAAGAAATATAACTTTTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATA 4376707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 GAAGAAATATAACTTTTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATA 1660

  4376708 AATATAACAAAAACTATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTA 4376767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 AATATAACAAAAACTATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTA 1720

  4376768 ATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAG 4376827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 ATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAG 1780

  4376828 TATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAAT 4376887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 TATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAAT 1840

  4376888 GCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGG 4376947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 GCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGG 1900

  4376948 ATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCA 4377007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 ATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCA 1960

  4377008 ATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAG 4377067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 ATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAG 2020

  4377068 GGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAA 4377127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 GGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAA 2080

  4377128 AGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAG 4377187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 AGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAG 2140

  4377188 AGGACTGGTAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAG 4377247
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 AGGACTGGGAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAG 2200

  4377248 CGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGG 4377307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 CGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGG 2260

  4377308 CTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGA 4377367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 CTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGA 2320

  4377368 CTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTC 4377427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 CTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTC 2380

  4377428 AGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCT 4377487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 AGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCT 2440

  4377488 CAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTT 4377547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 CAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTT 2500

  4377548 CATATATACATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAA 4377607
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 CATATATGCATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAA 2560

  4377608 TGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAA 4377667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAA 2620

  4377668 TATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGAT 4377727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 TATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGAT 2680

  4377728 GCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTT 4377787
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 GCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTT 2740

  4377788 GTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGT 4377847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 GTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGT 2800

  4377848 GATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATT 4377907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 GATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATT 2860

  4377908 TAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTG 4377967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 TAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTG 2920

  4377968 TAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCC 4378027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 TAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCC 2980

  4378028 TTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATG 4378087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 TTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATG 3040

  4378088 AGAAGACTTTGGAGATA 4378104
          |||||||||||||||||
     3041 AGAAGACTTTGGAGATA 3057

Alignment time is 2.34605 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3036] =>      3036 nucs 'mol-32-2fb7-126574_3036'

Score:        2969
Aligned:      3035        nucs
Identic:      3029 (100%) nucs =>        33 (100%)      2996 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4374771,4374803] EXCISED REGION [4374805,4377806]
 second seq =>  [      1,     33] EXCISED REGION [     35,   3036]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4374804,4374804]
 second seq =>         1 nucs [34,34]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4374803,4374803] to [4374804,4374804]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4374771 GAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCAC 4374803
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCAC 33

EXCISED REGION

  4374805 GTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTG 4374864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       35 GTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTG 94

  4374865 AATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTA 4374924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       95 AATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTA 154

  4374925 TGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGAT 4374984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      155 TGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGAT 214

  4374985 GATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATT 4375044
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      215 GATTATTTCACCCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATT 274

  4375045 ATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTG 4375104
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      275 CTAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTG 334

  4375105 ACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCA 4375164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      335 ACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCA 394

  4375165 GGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTA 4375224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      395 GGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTA 454

  4375225 CAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAA 4375284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      455 CAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAA 514

  4375285 AGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTG 4375344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      515 AGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTG 574

  4375345 TGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCT 4375404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      575 TGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCT 634

  4375405 TTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTG 4375464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      635 TTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTG 694

  4375465 TGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTC 4375524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      695 TGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTC 754

  4375525 TCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGC 4375584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      755 TCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGC 814

  4375585 TTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTAT 4375644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      815 TTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTAT 874

  4375645 GGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAAT 4375704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      875 GGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAAT 934

  4375705 ATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGC 4375764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      935 ATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGC 994

  4375765 GAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGT 4375824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 GAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGT 1054

  4375825 GAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACA 4375884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 GAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACA 1114

  4375885 AAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTG 4375944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 AAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTG 1174

  4375945 GCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGA 4376004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1175 GCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGGGAGTCCCTGAGCTGTGA 1234

  4376005 GCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAG 4376064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 GCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAG 1294

  4376065 ACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAA 4376124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 ACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAA 1354

  4376125 AAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAG 4376184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 AAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAG 1414

  4376185 AGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAAC 4376244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 AGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAAC 1474

  4376245 AGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATT 4376304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 AGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATT 1534

  4376305 TAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGA 4376364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 TAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGA 1594

  4376365 GAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTC 4376424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 GAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTC 1654

  4376425 TCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATT 4376484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 TCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATT 1714

  4376485 TATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGA 4376544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 TATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGA 1774

  4376545 CTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCC 4376604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 CTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCC 1834

  4376605 TAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTT 4376664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 TAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTT 1894

  4376665 TCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTAT 4376724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 TCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTAT 1954

  4376725 TAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGC 4376784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 TAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGC 2014

  4376785 TGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTT 4376844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 TGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTT 2074

  4376845 TGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGC 4376904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 TGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGC 2134

  4376905 CACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCA 4376964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 CACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCA 2194

  4376965 GACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAAT 4377024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 GACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAAT 2254

  4377025 TCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAAT 4377084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 TCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAAT 2314

  4377085 ATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTG 4377144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 ATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTG 2374

  4377145 TGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGTAGAGGAAG 4377204
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2375 TGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGGAGAGGAAG 2434

  4377205 ACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGC 4377264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 ACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGC 2494

  4377265 AGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCA 4377324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 AGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCA 2554

  4377325 TGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCT 4377384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 TGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCT 2614

  4377385 TTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGC 4377444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 TTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGC 2674

  4377445 CTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCT 4377504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 CTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCT 2734

  4377505 ATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATACATATATCC 4377564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2735 ATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATGCATATATCC 2794

  4377565 TGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCA 4377624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 TGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCA 2854

  4377625 AAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACAT 4377684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 AAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACAT 2914

  4377685 TATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTT 4377744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 TATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTT 2974

  4377745 TTCATTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTAC 4377804
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 TTCGTTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTAC 3034

  4377805 TG 4377806
          ||
     3035 TG 3036

Alignment time is 2.35898 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   4506] =>      4506 nucs 'mol-32-2fcd-040392_4506'

Score:        4373
Aligned:      4505        nucs
Identic:      4493 (100%) nucs =>        14 (100%)      4479 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4373300,4373313] EXCISED REGION [4373315,4377804]
 second seq =>  [      1,     14] EXCISED REGION [     16,   4506]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4373314,4373314]
 second seq =>         1 nucs [15,15]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [372,372]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4373313,4373313] to [4373314,4373314]
 second seq =>         1 nucs [15,15] to [16,16]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4373311,4373313] to [4373315,4373317]
 second seq =>         3 nucs [12,14] to [16,18]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4373300 AGTTTCCCATCCTG 4373313
          ||||||||||||||
        1 AGTTTCCCATCCTG 14

EXCISED REGION

  4373315 CTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTACT 4373374
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
       16 CTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTCAAGAACTACT 75

  4373375 AATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGT 4373434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       76 AATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGT 135

  4373435 TCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTG 4373494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      136 TCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTG 195

  4373495 TTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATT 4373554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      196 TTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATT 255

  4373555 TAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCT 4373614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      256 TAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCT 315

  4373615 AACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTC-TTT 4373673
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
      316 AACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTTTT 375

  4373674 TTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGA 4373733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      376 TTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGA 435

  4373734 TCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCG 4373793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 TCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCG 495

  4373794 AGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 4373853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 AGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 555

  4373854 GACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTG 4373913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 GACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTG 615

  4373914 CCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGT 4373973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 CCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGT 675

  4373974 AATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTT 4374033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 AATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTT 735

  4374034 ACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGCGGATACACGA 4374093
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      736 ACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGGGGATACACGA 795

  4374094 AATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGC 4374153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 AATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGC 855

  4374154 TTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTT 4374213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 TTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTT 915

  4374214 CTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCT 4374273
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      916 CTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAACAATGGCT 975

  4374274 GTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAA 4374333
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 GTTACGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAA 1035

  4374334 GATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAA 4374393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 GATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAA 1095

  4374394 CTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTC 4374453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 CTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTC 1155

  4374454 CAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTT 4374513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 CAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTT 1215

  4374514 AAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCC 4374573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 AAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCC 1275

  4374574 CTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCA 4374633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 CTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCA 1335

  4374634 GGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCC 4374693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 GGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCC 1395

  4374694 TCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATAC 4374753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 TCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATAC 1455

  4374754 AAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTAT 4374813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1456 AAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTAT 1515

  4374814 TTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTA 4374873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 TTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTA 1575

  4374874 TTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAA 4374933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 TTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAA 1635

  4374934 ATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTC 4374993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 ATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTC 1695

  4374994 AACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGA 4375053
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1696 ACCCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTCTAAAATGA 1755

  4375054 TGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCC 4375113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 TGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCC 1815

  4375114 ACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTG 4375173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 ACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTG 1875

  4375174 ACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGT 4375233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 ACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGT 1935

  4375234 CTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCA 4375293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 CTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCA 1995

  4375294 CAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAG 4375353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 CAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAG 2055

  4375354 AGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAG 4375413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 AGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAG 2115

  4375414 GATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGC 4375473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 GATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGC 2175

  4375474 TACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTG 4375533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 TACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTG 2235

  4375534 TGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATG 4375593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 TGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATG 2295

  4375594 TGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTT 4375653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 TGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTT 2355

  4375654 GCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACA 4375713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 GCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACA 2415

  4375714 TAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAA 4375773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 TAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAA 2475

  4375774 AGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTA 4375833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 AGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTA 2535

  4375834 GCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACA 4375893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 GCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACA 2595

  4375894 AGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTA 4375953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 AGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTA 2655

  4375954 ACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAG 4376013
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2656 ACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGGGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAG 2715

  4376014 GAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATAT 4376073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 GAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATAT 2775

  4376074 AAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGG 4376133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 AAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGG 2835

  4376134 TGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCC 4376193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 TGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCC 2895

  4376194 CTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTG 4376253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 CTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTG 2955

  4376254 GGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATT 4376313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 GGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATT 3015

  4376314 AGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTG 4376373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 AGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTG 3075

  4376374 AAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTAA 4376433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 AAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTAA 3135

  4376434 ACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATTTATGTTTAA 4376493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 ACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATTTATGTTTAA 3195

  4376494 ACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTAA 4376553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 ACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTAA 3255

  4376554 GTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGCC 4376613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 GTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGCC 3315

  4376614 AGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTTTCACCCTGA 4376673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 AGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTTTCACCCTGA 3375

  4376674 CAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTATTAGATACTA 4376733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 CAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTATTAGATACTA 3435

  4376734 TTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGGC 4376793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 TTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGGC 3495

  4376794 TACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAGG 4376853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 TACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAGG 3555

  4376854 TGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATTC 4376913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 TGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATTC 3615

  4376914 CACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCTG 4376973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 CACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCTG 3675

  4376974 AGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGACC 4377033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3676 AGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGACC 3735

  4377034 CCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTGT 4377093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3736 CCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTGT 3795

  4377094 CAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTGA 4377153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3796 CAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTGA 3855

  4377154 GGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGTAGAGGAAGACCCATCCT 4377213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3856 GGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGGAGAGGAAGACCCATCCT 3915

  4377214 CGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAG 4377273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3916 CGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAG 3975

  4377274 AAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATG 4377333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3976 AAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATG 4035

  4377334 CTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATC 4377393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4036 CTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATC 4095

  4377394 TTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGC 4377453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 TTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGC 4155

  4377454 TTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGA 4377513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 TTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGA 4215

  4377514 TTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATACATATATCCTGCTAGTTC 4377573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4216 TTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATGCATATATCCTGCTAGTTC 4275

  4377574 TGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTGT 4377633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4276 TGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTGT 4335

  4377634 GAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAG 4377693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4336 GAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAG 4395

  4377694 ACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATT 4377753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4396 ACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATT 4455

  4377754 AGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTAC 4377804
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4456 AGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTAC 4506

Alignment time is 3.52161 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   8810] =>      8810 nucs 'mol-32-2fd8-025014_8810'

Score:        8583
Aligned:      8814        nucs
Identic:      8793 (100%) nucs =>      2035 (100%)      6758 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4374379,4376417] EXCISED REGION [4377645,4384419]
 second seq =>  [      1,   2038] EXCISED REGION [   2039,   8810]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [2037,2038] to [2039,2040]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4374379 CTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAA 4374438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAA 60

  4374439 TATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCT 4374498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCT 120

  4374499 CAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCT 4374558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCT 180

  4374559 GTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGA 4374618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGA 240

  4374619 CAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAG 4374678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAG 300

  4374679 TTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATA 4374738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATA 360

  4374739 ATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGA 4374798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGA 420

  4374799 ACCACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACA 4374858
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACA 480

  4374859 CAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATT 4374918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATT 540

  4374919 TTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCG 4374978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCG 600

  4374979 CTAGATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACT 4375038
          ||||||||||||||||.|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTAGATGATTATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACT 659

  4375039 ATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTT 4375098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 ATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTT 719

  4375099 ATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATT 4375158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 ATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATT 779

  4375159 CTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGG 4375218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGG 839

  4375219 GAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAG 4375278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAG 899

  4375279 AAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTG 4375338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTG 959

  4375339 AGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTT 4375398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTT 1019

  4375399 ATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTT 4375458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTT 1079

  4375459 CTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGAT 4375518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGAT 1139

  4375519 GCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACA 4375578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACA 1199

  4375579 CATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCT 4375638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCT 1259

  4375639 CCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTT 4375698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTT 1319

  4375699 TAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGT 4375758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGT 1379

  4375759 CAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGG 4375818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGG 1439

  4375819 TTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAAT 4375878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAAT 1499

  4375879 AGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTT 4375938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTT 1559

  4375939 TCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAG 4375998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1560 TCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGAGAGTCCCTGAG 1619

  4375999 CTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAA 4376058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAA 1679

  4376059 CACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATT 4376118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATT 1739

  4376119 GAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTG 4376178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTG 1799

  4376179 GTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAA 4376238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAA 1859

  4376239 GGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCA 4376298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCA 1919

  4376299 AGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCC 4376358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCC 1979

  4376359 TGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 4376417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 2038

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 2098

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2099 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 2158

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4377824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 2218

  4377825 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4377884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 2278

  4377885 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 4377944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 2338

  4377945 AAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 4378004
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AAAAGTACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 2398

  4378005 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAA 4378064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAA 2458

  4378065 AGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTAATATACAAATGC 4378124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTAATATACAAATGC 2518

  4378125 TAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATTATGAAAGTAATTTTAATGAGC 4378184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATTATGAAAGTAATTTTAATGAGC 2578

  4378185 ATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAATCCTCAGTCTGGGTTGCCAGG 4378244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAATCCTCAGTCTGGGTTGCCAGG 2638

  4378245 TTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAGTTTCAGATAAACAATGAACAC 4378304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAGTTTCAGATAAACAATGAACAC 2698

  4378305 TTTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAATGTTTATCAGAAATATTTCAGA 4378364
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 ATTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAATGTTTATCAGAAATATTTCAGA 2758

  4378365 TACACTGAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTAAAACATGTTTTTGTTTGTTTA 4378424
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TACACTAAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTAAAACATGTTTTTGTTTGTTTA 2818

  4378425 TATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGACTCTGGGAAGAACCAGGAAGA 4378484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 TATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGACTCTGGGAAGAACCAGGAAGA 2878

  4378485 GAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTATCTGAAATTGAAATTTGACTAG 4378544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTATCTGAAATTGAAATTTGACTAG 2938

  4378545 GCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTACAAAATAGGTACAATAACTATA 4378604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTACAAAATAGGTACAATAACTATA 2998

  4378605 TATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTGGTGCAATGGGAAATCACCCAC 4378664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTGGTGCAATGGGAAATCACCCAC 3058

  4378665 TATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAATCCAGAGGCAGAATGAGAAAG 4378724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAATCCAGAGGCAGAATGAGAAAG 3118

  4378725 GCACATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGGTAAACTTCCCTGAGAGCAATA 4378784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GCACATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGGTAAACTTCCCTGAGAGCAATA 3178

  4378785 ACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAGCACCTGAATGTGTGCTCCAAG 4378844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 ACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAGCACCTGAATGTGTGCTCCAAG 3238

  4378845 TTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCTTCCTCTATGAGGTACATCTGA 4378904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCTTCCTCTATGAGGTACATCTGA 3298

  4378905 GCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGATTGAGGCCAAGTGTTTTGGGT 4378964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGATTGAGGCCAAGTGTTTTGGGT 3358

  4378965 TAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAGTGTTAAGTGAAAATGCTATAT 4379024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAGTGTTAAGTGAAAATGCTATAT 3418

  4379025 AAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGCCTAACCTGCAGCCTCTCGGCC 4379084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGCCTAACCTGCAGCCTCTCGGCC 3478

  4379085 GTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGACTGTAGGAAGGCGGATATGTTGTCCA 4379144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGACTGTAGGAAGGCGGATATGTTGTCCA 3538

  4379145 GCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATAAGGCAGTTCTCCTATCCAGCCTGTCACCA 4379204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 GCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATAAGGCAGTTCTCCTATCCAGCCTGTCACCA 3598

  4379205 CTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTAATAAAACCCCATGTCTCATTTGCTGGCTA 4379264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 CTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTAATAAAACCCCATGTCTCATTTGCTGGCTA 3658

  4379265 TGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGTGCCTTCCCTACTGAGGTTAATAGGGGTTT 4379324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGTGCCTTCCCTACTGAGGTTAATAGGGGTTT 3718

  4379325 GGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAATGTTATAATTTCTCAAACTATATTAATCCC 4379384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 GGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAATGTTATAATTTCTCAAACTATATTAATCCC 3778

  4379385 AAATTCAAATGCTAAAGATAACAACATATTGCAAAGCTGACTCTAAATGCCTCTGGATTT 4379444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 AAATTCAAATGCTAAAGATAACAACATATTGCAAAGCTGACTCTAAATGCCTCTGGATTT 3838

  4379445 TTCAGCCCTTTTGGAAGATTGACAACATTAGTCCCTTCTTTTAGTGCAAACTATCTAGAG 4379504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TTCAGCCCTTTTGGAAGATTGACAACATTAGTCCCTTCTTTTAGTGCAAACTATCTAGAG 3898

  4379505 ATGGGAGATCAAATGTGGAAATGCTTATAAGATGTTTTTAGTTGATGAGATTTCAGGATC 4379564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 ATGGGAGATCAAATGTGGAAATGCTTATAAGATGTTTTTAGTTGATGAGATTTCAGGATC 3958

  4379565 TGGGAGCTAAACCTTGAGTTATTTCATTGCCATTGGGTGGTGGCAGTTGACTTGTTTTCT 4379624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TGGGAGCTAAACCTTGAGTTATTTCATTGCCATTGGGTGGTGGCAGTTGACTTGTTTTCT 4018

  4379625 GCTGTTTCAGTGGACCTTGAAATTATCATGACTATTTGCTTCACTTCAGTGTACACCATC 4379684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GCTGTTTCAGTGGACCTTGAAATTATCATGACTATTTGCTTCACTTCAGTGTACACCATC 4078

  4379685 CCGCTCCATTTGCAGTCAGCACCACTCAGGGAATAAAACATATTCATTCGCAGTGTCCCT 4379744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 CCGCTCCATTTGCAGTCAGCACCACTCAGGGAATAAAACATATTCATTCGCAGTGTCCCT 4138

  4379745 AGCAATGACAGAGGTATTTTCAAATATCTTTTTGCTCTTGAAGAAAGGAGCTCACTTTGC 4379804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AGCAATGACAGAGGTATTTTCAAATATCTTTTTGCTCTTGAAGAAAGGAGCTCACTTTGC 4198

  4379805 TTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAAAGGACCAATATTTGACACACATCATATTATATTGCAA 4379864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAAAGGACCAATATTTGACACACATCATATTATATTGCAA 4258

  4379865 AGAATAGGAGTGTATGTGTGTGTATGCATCTGTATGTGTTTTAGCATAGACATCAAACCA 4379924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 AGAATAGGAGTGTATGTGTGTGTATGCATCTGTATGTGTTTTAGCATAGACATCAAACCA 4318

  4379925 AAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAGAGGCAGACAGAGTGAAAGACCCCCAGGAGGACTTGGG 4379984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     4319 AAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAGAGGCAGACAGAGTGAAAGACCCCCAGGAGGAC-TGGG 4377

  4379985 TTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTAACTAGTTATGTTACCATCCACAAGTCACCTACTCTTT 4380044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTAACTAGTTATGTTACCATCCACAAGTCACCTACTCTTT 4437

  4380045 CTGAGTCTCATTTTCACTATCTGTAGTGCATCAATATCTGCTCTATTCCACCGGAGCATT 4380104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CTGAGTCTCATTTTCACTATCTGTAGTGCATCAATATCTGCTCTATTCCACCGGAGCATT 4497

  4380105 GTGGGACAAGGTTTCAAACCTAGAAGGCATCTTGGCTGTATACAGCTAGGAGAAGGAATT 4380164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 GTGGGACAAGGTTTCAAACCTAGAAGGCATCTTGGCTGTATACAGCTAGGAGAAGGAATT 4557

  4380165 ATAATTGGTTCATTATTGACTCTTCCTTAAGAAGTTCTAACAGAATAAATTTGCCTTCTT 4380224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 ATAATTGGTTCATTATTGACTCTTCCTTAAGAAGTTCTAACAGAATAAATTTGCCTTCTT 4617

  4380225 GCCTGCTAATTAGACATGTATTTAACTGTTTCTTTTTTAAATAACTCTCTGCTGTTATTT 4380284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 GCCTGCTAATTAGACATGTATTTAACTGTTTCTTTTTTAAATAACTCTCTGCTGTTATTT 4677

  4380285 GAAATCTTCTATTATATGTAATAAAAATCTCTGTCACACACACATACACAAAGATAACAA 4380344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 GAAATCTTCTATTATATGTAATAAAAATCTCTGTCACACACACATACACAAAGATAACAA 4737

  4380345 TTGGCTCTAAGCAAAATGATTTCAGAAATAAGGGGGCAAACTTCAAATTATTACTGCCCA 4380404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 TTGGCTCTAAGCAAAATGATTTCAGAAATAAGGGGGCAAACTTCAAATTATTACTGCCCA 4797

  4380405 TCAAGGAAGTCAGGTGACAACAGAGTATTGTTAACAACAAAAATATTTTCAAAAGCACCA 4380464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TCAAGGAAGTCAGGTGACAACAGAGTATTGTTAACAACAAAAATATTTTCAAAAGCACCA 4857

  4380465 AAGAAGATAAAAATTTAAATGTCAGAGCTGAAGACAAAGATTTCTATCAGTACATCTCAC 4380524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 AAGAAGATAAAAATTTAAATGTCAGAGCTGAAGACAAAGATTTCTATCAGTACATCTCAC 4917

  4380525 ACTTTTGCATAATCAGAATCACATAGGAGAACTTGTTAACTATGCAGATTTCCGGGCCTC 4380584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 ACTTTTGCATAATCAGAATCACATAGGAGAACTTGTTAACTATGCAGATTTCCGGGCCTC 4977

  4380585 ACACCAGAGATTCTGAGTCAATAGGACTGAAGTTGGCCAAGAAATCTGGATATTTAGCAA 4380644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 ACACCAGAGATTCTGAGTCAATAGGACTGAAGTTGGCCAAGAAATCTGGATATTTAGCAA 5037

  4380645 GCTACCTGGCTGATTCAGAGGCAAGTAGTTCTTTGAGAATACTTTGAGAAACACTGGTCA 4380704
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 GCTACGTGGCTGATTCAGAGGCAAGTAGTTCTTTGAGAATACTTTGAGAAACACTGGTCA 5097

  4380705 TTACCAATCAAATATGAACATATTGTTAAAATTTTTAAATAAAGTACGAAAGAAACTGGT 4380764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 TTACCAATCAAATATGAACATATTGTTAAAATTTTTAAATAAAGTACGAAAGAAACTGGT 5157

  4380765 AGAAAGGAGAATGTGGATTTAATTCAACATAAAGTTTTGGGATGGGAGATGCAAGACCCT 4380824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 AGAAAGGAGAATGTGGATTTAATTCAACATAAAGTTTTGGGATGGGAGATGCAAGACCCT 5217

  4380825 CCCAAGAATAGAACGAGAAGAGAAGGACTCCCTGCAATGTCTTATCTCTCAAAATGTCTC 4380884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 CCCAAGAATAGAACGAGAAGAGAAGGACTCCCTGCAATGTCTTATCTCTCAAAATGTCTC 5277

  4380885 TAAGGTGGATCCACAGGAGCTAGTTAGTGAAAACAATGGAGGAAAATGTACAAACCCAAG 4380944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 TAAGGTGGATCCACAGGAGCTAGTTAGTGAAAACAATGGAGGAAAATGTACAAACCCAAG 5337

  4380945 AGGAAAATAAGCCATATAAAATTAGAAGAAAAATGTGGGAGGACAGGCAGAAATGGCCAG 4381004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 AGGAAAATAAGCCATATAAAATTAGAAGAAAAATGTGGGAGGACAGGCAGAAATGGCCAG 5397

  4381005 AGGGTAAGTAGTCTCAGGGATGGTCAAATTGTTGATGGGTAAAAAGATAGGAGAAATTCA 4381064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 AGGGTAAGTAGTCTCAGGGATGGTCAAATTGTTGATGGGTAAAAAGATAGGAGAAATTCA 5457

  4381065 GTAGTCACTGGTCAGAGGGGAAATCTTACTCATCAAAAAGGAGAGGAAGAACCAAGTAAG 4381124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 GTAGTCACTGGTCAGAGGGGAAATCTTACTCATCAAAAAGGAGAGGAAGAACCAAGTAAG 5517

  4381125 TGAGAAAACAGTAAAAATGTGAATGACTTTACATTTTTAAGAAAATGACATACAATCTTC 4381184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 TGAGAAAACAGTAAAAATGTGAATGACTTTACATTTTTAAGAAAATGACATACAATCTTC 5577

  4381185 ATGGAAAATTTGGTGGTGGGGAAATAAAATGAGTTCAACATGAAAATATCTTTAAAAAGT 4381244
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5578 ATGGAAAATTTGGTGGTGGGGAAATAAAATGAGTTCAACATGAAAATATCTTTAAAAGGT 5637

  4381245 ATCTTAGAGGAATTTTAGGATAGAAGATGAGAAAGTACTTTGAAAAGTATAAAGAATGAA 4381304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 ATCTTAGAGGAATTTTAGGATAGAAGATGAGAAAGTACTTTGAAAAGTATAAAGAATGAA 5697

  4381305 TTACATGATTATTGCTTGCAGTATTTTCATGATTATCAAATTTTTTCACTGTCTGCCTGG 4381364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 TTACATGATTATTGCTTGCAGTATTTTCATGATTATCAAATTTTTTCACTGTCTGCCTGG 5757

  4381365 CTCATAAGGTAGTTAAAGAGGGCTCTATGACATTATCTTTGGATCCCCAGAGCCTAACAG 4381424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 CTCATAAGGTAGTTAAAGAGGGCTCTATGACATTATCTTTGGATCCCCAGAGCCTAACAG 5817

  4381425 TATCTGATATATAATAAGCACCAACCGGACGGACAAATGGATGGGTAAATCAAGTTAACA 4381484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 TATCTGATATATAATAAGCACCAACCGGACGGACAAATGGATGGGTAAATCAAGTTAACA 5877

  4381485 CAGGAAAAGATAAGAGTTGCATGGTCACATAGTACTCACAAAGCCTTACAGGTTTCATTC 4381544
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 CAGGAAAAGATAAGAGTTGCATGGCCACATAGTACTCACAAAGCCTTACAGGTTTCATTC 5937

  4381545 TCTGATTTTATGAACACAGCACTCACGCACATTTTGGTACTAATATCTGCATGCATGAAC 4381604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 TCTGATTTTATGAACACAGCACTCACGCACATTTTGGTACTAATATCTGCATGCATGAAC 5997

  4381605 CTCCAACTGGGGCATGCCTGTTTGTCTTCCTGAAGGAAGTACTTCTTGATTCATTTTACT 4381664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 CTCCAACTGGGGCATGCCTGTTTGTCTTCCTGAAGGAAGTACTTCTTGATTCATTTTACT 6057

  4381665 TGGTGCATCAGTTGTCTACCTGCTGCCCCTGAGCTGCACTTTCACCTTATTCCATCCTGT 4381724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 TGGTGCATCAGTTGTCTACCTGCTGCCCCTGAGCTGCACTTTCACCTTATTCCATCCTGT 6117

  4381725 CTGTATTGCTGGGGCTGTGGGAATCCACAAACTCCATTTTCCAGACTCCTTTACTACCTG 4381784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 CTGTATTGCTGGGGCTGTGGGAATCCACAAACTCCATTTTCCAGACTCCTTTACTACCTG 6177

  4381785 GCTTTCTGTTATGTCTGGCAAGAGGAAGAGCCATTATTTCTTTCTTATACTCTCTTTGTT 4381844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 GCTTTCTGTTATGTCTGGCAAGAGGAAGAGCCATTATTTCTTTCTTATACTCTCTTTGTT 6237

  4381845 TCTGCTGTTGGTTCTGGAAGTAGCTGTGCCCCTTCAGTGACCCAAGGTTCTGCTGGAACT 4381904
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 TCTGCTGTTGTTTCTGGAAGTAGCTGTGCCCCTTCAGTGACCCAAGGTTCTGCTGGAACT 6297

  4381905 GCCCTTAATTGGTCCCGGCTGTGGCTAGGGAGACCATCCTTGGCAGTCCCAGCACAGGCT 4381964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 GCCCTTAATTGGTCCCGGCTGTGGCTAGGGAGACCATCCTTGGCAGTCCCAGCACAGGCT 6357

  4381965 GGGTGGAATCCCTTAAGGCCTGCTCCTGGACTTTGACAGCTCCTCTTCAGTTTCATTCCC 4382024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 GGGTGGAATCCCTTAAGGCCTGCTCCTGGACTTTGACAGCTCCTCTTCAGTTTCATTCCC 6417

  4382025 CCAGTTCCTAAGGCTGGTAGCCGCTCTCTACAGATACTAATCTCGGAATGTCACCCTTTT 4382084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 CCAGTTCCTAAGGCTGGTAGCCGCTCTCTACAGATACTAATCTCGGAATGTCACCCTTTT 6477

  4382085 CCCTTTTTGCTTCTTTAGCTCCCTTGCTTATCTGTTCCAATGCCCGTAATACCAAAATCT 4382144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6478 CCCTTTTTGCTTCTTTAGCTCCCTTGCTTATCTGTTCCAATGCCCGTAATACCAAAATCT 6537

  4382145 GTAGTAAATCCCTTTTATTTGAAACATCTAGAGTGGTTTCTGTTTTTCTGGCCAGATGCT 4382204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6538 GTAGTAAATCCCTTTTATTTGAAACATCTAGAGTGGTTTCTGTTTTTCTGGCCAGATGCT 6597

  4382205 GAATGACACATCTGGAAAAATCAGGGTAAATATTATTACTCTAGGTATTGAAAGTACAGA 4382264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 GAATGACACATCTGGAAAAATCAGGGTAAATATTATTACTCTAGGTATTGAAAGTACAGA 6657

  4382265 TTGGAGAACATTTCGTTTGTTCCAGAAGAATCCTGAATGAAAACCGAAATTCAACTGGAG 4382324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 TTGGAGAACATTTCGTTTGTTCCAGAAGAATCCTGAATGAAAACCGAAATTCAACTGGAG 6717

  4382325 AGTTAGAGCATTATTGAACAGTATGTGTAGGGAATAAAATGCCTTTCCCCCATCCTGGAA 4382384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6718 AGTTAGAGCATTATTGAACAGTATGTGTAGGGAATAAAATGCCTTTCCCCCATCCTGGAA 6777

  4382385 TACCTCCCTGATTATACTACCTTATTACTGTGATTGTTTTTTAACTTCTCTGCTTTTTCA 4382444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6778 TACCTCCCTGATTATACTACCTTATTACTGTGATTGTTTTTTAACTTCTCTGCTTTTTCA 6837

  4382445 CACAAATCTACAAGAATCTCCTCTTCCTGGAAGCCTCTCTGATTACCTCACACAAACATC 4382504
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6838 CACAAATCTACAAGAATCTCCTCTTCCTGGAAGCCTCTCTGATTACCGCACACAAACATC 6897

  4382505 ATCTTGCTTAGTCTGAATTCCTATGGTTCTTTTGTTCTCTGACTTCTAGAGTATTTCTCC 4382564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6898 ATCTTGCTTAGTCTGAATTCCTATGGTTCTTTTGTTCTCTGACTTCTAGAGTATTTCTCC 6957

  4382565 AGGTATGTTAGCAATCAGTTTTTCTCTTGATCACTCCCCAAACCTGAGTGATCATCAGAA 4382624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6958 AGGTATGTTAGCAATCAGTTTTTCTCTTGATCACTCCCCAAACCTGAGTGATCATCAGAA 7017

  4382625 TCCTCAGAAAAATATAGATACCAGGCCCTTCTCCTTGTCCTAACCTCCTGAGACAAAATT 4382684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7018 TCCTCAGAAAAATATAGATACCAGGCCCTTCTCCTTGTCCTAACCTCCTGAGACAAAATT 7077

  4382685 CTAGAGTGATGAGTGGGTACTATAGGGTCGAGACAGCATCTATATATATTTTAATACCTC 4382744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7078 CTAGAGTGATGAGTGGGTACTATAGGGTCGAGACAGCATCTATATATATTTTAATACCTC 7137

  4382745 TCAGATGATAAACCCTTCAAGATCAGGGCCTTTCCATTTCTCATGTAGCTTTTACTGTAC 4382804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7138 TCAGATGATAAACCCTTCAAGATCAGGGCCTTTCCATTTCTCATGTAGCTTTTACTGTAC 7197

  4382805 CTAATACAGTTTAAGCAGACCATAAAAATCTGTTCATTTTCTAATGAATTACATGAGGGA 4382864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7198 CTAATACAGTTTAAGCAGACCATAAAAATCTGTTCATTTTCTAATGAATTACATGAGGGA 7257

  4382865 AGATTCCCAGGAAGACCAGCTGGTGTCACTACTGCCTAATTAATATTTCTGGCCCAGGGA 4382924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7258 AGATTCCCAGGAAGACCAGCTGGTGTCACTACTGCCTAATTAATATTTCTGGCCCAGGGA 7317

  4382925 AGGGCATCTCACAAAGCAAAATTTGACCTTACCTGGATTCACCGATTCTGTGCTTGAATC 4382984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7318 AGGGCATCTCACAAAGCAAAATTTGACCTTACCTGGATTCACCGATTCTGTGCTTGAATC 7377

  4382985 CATCTTCCCATCTGTCTATTTTCCTAAAAGGAAGTTGCAGAAACCTTGCCAAGAAAATAG 4383044
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     7378 CATCTTCCCATCTGTCTATTTTCCTAAAAGGGAGTTGCAGAAACCTTGCCAAGAAAATAG 7437

  4383045 ACAGCAAAACTTCAGCAGTACCAATAACTTGGGTTTTCTGAAAGGAAATGATGCCATGAC 4383104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7438 ACAGCAAAACTTCAGCAGTACCAATAACTTGGGTTTTCTGAAAGGAAATGATGCCATGAC 7497

  4383105 CTGAGGCTGCCAGACTTAATGTGAGAAAGCAAGAACTGAAACGAGTAGAAGTAGGCCTCC 4383164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7498 CTGAGGCTGCCAGACTTAATGTGAGAAAGCAAGAACTGAAACGAGTAGAAGTAGGCCTCC 7557

  4383165 CACTGGCCCAAGGCCTAAGATTTCATTGCACTTGCTTCTTGGCATTAACATTCTGTAGAA 4383224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     7558 CACTGGCCCAAGGCCTAAGATTTCATTGCACTTGCTTCTTGGCATTAACATTCTATAGAA 7617

  4383225 CAAGTTTCAGAAAAAAACGCTTAACGAATTTGCAAGCACAACCAAACTCCAACCAGATTG 4383284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7618 CAAGTTTCAGAAAAAAACGCTTAACGAATTTGCAAGCACAACCAAACTCCAACCAGATTG 7677

  4383285 CATTTTTTATTCACCTTTTACAATCTCATTCATTTTCCATAACATTTGGAACTGCTGTTT 4383344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7678 CATTTTTTATTCACCTTTTACAATCTCATTCATTTTCCATAACATTTGGAACTGCTGTTT 7737

  4383345 GAAAGTTTAATTTTCCTTTTTATCTACTATTTTCTTATTATTGACTTAAATTATTCTTGA 4383404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7738 GAAAGTTTAATTTTCCTTTTTATCTACTATTTTCTTATTATTGACTTAAATTATTCTTGA 7797

  4383405 TTCATGGATAAGCAAACTAATGTGGGTCTACCCTGAGTCATTTATTATGTATCAAAGATA 4383464
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     7798 TTCATGGATAAGCAAACTAATGTGGGTCTACCCTGAGTCATTTATTATGTATCGAAGATA 7857

  4383465 ACATAGAACTCTTCACTTCTGGCAGAAGCTGTTTAGTAATTACTTCTAATTACTAACAAA 4383524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7858 ACATAGAACTCTTCACTTCTGGCAGAAGCTGTTTAGTAATTACTTCTAATTACTAACAAA 7917

  4383525 TTAAGAACAGCATGTGCTCCAAAAGCAGTTTCTATACAAGCTCAAACCTGGCTATATTTC 4383584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7918 TTAAGAACAGCATGTGCTCCAAAAGCAGTTTCTATACAAGCTCAAACCTGGCTATATTTC 7977

  4383585 AACACTTCTAAATTCTAATTCTCTGGATGCAGAAAAAAATCTATTAAGATGGTTAAAAGG 4383644
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     7978 AACACTTCTAAATTCTAATTCTCTGGATGCAG-AAAAAATCTATTAAGATGGTTAAAAGG 8036

  4383645 AAATAAAATCTAGATGTATAAGTCCAAAAGAAGTCTCCAAAAGTCCCCTATAACCTTTCT 4383704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8037 AAATAAAATCTAGATGTATAAGTCCAAAAGAAGTCTCCAAAAGTCCCCTATAACCTTTCT 8096

  4383705 TAGGTAATATGACTTGATCATCTCCATTTGAACATTTACTTCCAGAAAAGTAGATTTTTG 4383764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8097 TAGGTAATATGACTTGATCATCTCCATTTGAACATTTACTTCCAGAAAAGTAGATTTTTG 8156

  4383765 GGATAATCAGCCTCTTTGTGTTGATTGACCACAAACTTCTATGTTCAGAAGTTTACATTT 4383824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8157 GGATAATCAGCCTCTTTGTGTTGATTGACCACAAACTTCTATGTTCAGAAGTTTACATTT 8216

  4383825 TAATTAAGAGGGAGGTATTGAATGGTAACTGGATCTCCAGTAGTTGAAATGGGCTTCTCC 4383884
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8217 TAATTAAGAGGGAGGTACTGAATGGTAACTGGATCTCCAGTAGTTGAAATGGGCTTCTCC 8276

  4383885 TTGTCTAGAATAAAGGCCTTTGTTAGCTAGGTGGTCCTAGAGAGAGCACGAACCCCTCAA 4383944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8277 TTGTCTAGAATAAAGGCCTTTGTTAGCTAGGTGGTCCTAGAGAGAGCACGAACCCCTCAA 8336

  4383945 TTCCTCTCCTTCAAGACTTACAGCCTTAAATATCCATGGAACTACCCCCACTTCTCAGGG 4384004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8337 TTCCTCTCCTTCAAGACTTACAGCCTTAAATATCCATGGAACTACCCCCACTTCTCAGGG 8396

  4384005 AGTTTGTGTGCCATTGGCTGCCAATCAGTCATGTCATTTATAGGGCAGATGAGAGTAGTC 4384064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8397 AGTTTGTGTGCCATTGGCTGCCAATCAGTCATGTCATTTATAGGGCAGATGAGAGTAGTC 8456

  4384065 TCTTTTATTTCCCACTTGGTACTGAAGAAGTTGTGGCCTTTGGGGGTTAACCAGTTACTG 4384124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8457 TCTTTTATTTCCCACTTGGTACTGAAGAAGTTGTGGCCTTTGGGGGTTAACCAGTTACTG 8516

  4384125 CCCAGCACACTGTACACAGATCGTGCCAATGAGGTGTACACGTTTTCCTCCTGCTCACTT 4384184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8517 CCCAGCACACTGTACACAGATCGTGCCAATGAGGTGTACACGTTTTCCTCCTGCTCACTT 8576

  4384185 TGTGGAGCACACTGGTGGTGAACACAGGGTGCTGGACCTTATAAGGGGTTTCCATCATGG 4384244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8577 TGTGGAGCACACTGGTGGTGAACACAGGGTGCTGGACCTTATAAGGGGTTTCCATCATGG 8636

  4384245 AGGAATCTTTTGAAACAACAGCAGTGCTGCCAGAGGTGGGAAAACGGAACTACTTTTTAG 4384304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     8637 AGGAATCTTTTGAAACAACAGCAGTGCTGCCAGAGGTGGGAAAATGGAACTACTTTTTAG 8696

  4384305 ATAATACTGTTCAGTTAGCCAGGACTCACCTTCACTGGAAAAAAAAAAACTTTTTAGAAA 4384364
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     8697 ATAATACTGTTCAGTTAGCCAGGACTCACCTTCACTGG-AAAAAAAAAACTTTTTAGAAA 8755

  4384365 TTCCAAATGAAGATAAAAATTTATTTTCTAAGTTGTCAATATCAGCTTTGTGTTC 4384419
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8756 TTCCAAATGAAGATAAAAATTTATTTTCTAAGTTGTCAATATCAGCTTTGTGTTC 8810

Alignment time is 6.75174 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   2042] =>      2042 nucs 'mol-32-2fd8-025014_2042'

Score:        2013
Aligned:      2035        nucs
Identic:      2033 (100%) nucs =>       615 (100%)      1418 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4374379,4374994] EXCISED REGION [4375003,4376421]
 second seq =>  [      1,    616] EXCISED REGION [    624,   2042]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [4374995,4375002]
 second seq =>         7 nucs [617,623]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4374995,4374996] to [4375003,4375004]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4374994,4374994] to [4375003,4375003]
 second seq =>         1 nucs [616,616] to [624,624]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [617,619] to [621,623]

  4374379 CTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAA 4374438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAA 60

  4374439 TATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCT 4374498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCT 120

  4374499 CAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCT 4374558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCT 180

  4374559 GTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGA 4374618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGA 240

  4374619 CAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAG 4374678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAG 300

  4374679 TTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATA 4374738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATA 360

  4374739 ATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGA 4374798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGA 420

  4374799 ACCACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACA 4374858
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACA 480

  4374859 CAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATT 4374918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATT 540

  4374919 TTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCG 4374978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCG 600

  4374979 CTAGATGATTATTTCA 4374994
          ||||||||||||||||
      601 CTAGATGATTATTTCA 616

EXCISED REGION

  4375003 ACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGAT 4375062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      624 ACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGAT 683

  4375063 TGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTT 4375122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      684 TGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTT 743

  4375123 AGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTAT 4375182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      744 AGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTAT 803

  4375183 AATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAAC 4375242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 AATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAAC 863

  4375243 TCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCT 4375302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 TCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCT 923

  4375303 CGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAG 4375362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 CGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAG 983

  4375363 GGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAAC 4375422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 GGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAAC 1043

  4375423 AATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAA 4375482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 AATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAA 1103

  4375483 GATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGT 4375542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 GATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGT 1163

  4375543 ACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGAT 4375602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 ACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGAT 1223

  4375603 GTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACA 4375662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 GTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACA 1283

  4375663 GTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAA 4375722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 GTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAA 1343

  4375723 TGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGA 4375782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 TGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGA 1403

  4375783 ACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTG 4375842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 ACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTG 1463

  4375843 TCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGC 4375902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 TCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGC 1523

  4375903 ATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAG 4375962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 ATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAG 1583

  4375963 TCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGA 4376022
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 TCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGAGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGA 1643

  4376023 GGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTA 4376082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 GGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTA 1703

  4376083 TGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTG 4376142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 TGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTG 1763

  4376143 GTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAG 4376202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 GTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAG 1823

  4376203 AGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACT 4376262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 AGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACT 1883

  4376263 TACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATC 4376322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 TACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATC 1943

  4376323 CAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAA 4376382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 CAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAA 2003

  4376383 TGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATG 4376421
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 TGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATG 2042

Alignment time is 1.5932 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   7874] =>      7874 nucs 'mol-32-300f-221645_7874'

Score:        7690
Aligned:      7877        nucs
Identic:      7860 (100%) nucs =>      1837 (100%)      6023 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4374577,4376417] EXCISED REGION [4377645,4383680]
 second seq =>  [      1,   1840] EXCISED REGION [   1841,   7874]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [1839,1840] to [1841,1842]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4374577 TCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGG 4374636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGG 60

  4374637 CATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCT 4374696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCT 120

  4374697 CATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAG 4374756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAG 180

  4374757 ACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTATTTA 4374816
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      181 ACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTATTTA 240

  4374817 TTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTT 4374876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTT 300

  4374877 TGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATA 4374936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATA 360

  4374937 TTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCAAC 4374996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      361 TTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCACC 420

  4374997 CCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGC 4375056
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCCC-ACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGC 479

  4375057 TTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACT 4375116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACT 539

  4375117 GTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACC 4375176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACC 599

  4375177 TCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTA 4375236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTA 659

  4375237 ATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAA 4375296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 ATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAA 719

  4375297 AGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGA 4375356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGA 779

  4375357 GAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGAT 4375416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGAT 839

  4375417 GAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTAC 4375476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTAC 899

  4375477 ATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGC 4375536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 ATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGC 959

  4375537 AATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGT 4375596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGT 1019

  4375597 AAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCT 4375656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 AAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCT 1079

  4375657 TCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAA 4375716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAA 1139

  4375717 AACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGT 4375776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGT 1199

  4375777 TTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCT 4375836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCT 1259

  4375837 CTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGA 4375896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGA 1319

  4375897 GCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACT 4375956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACT 1379

  4375957 TCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAA 4376016
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGAGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAA 1439

  4376017 TGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAA 4376076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAA 1499

  4376077 GCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGG 4376136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGG 1559

  4376137 GGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTG 4376196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTG 1619

  4376197 AAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGG 4376256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGG 1679

  4376257 AAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGG 4376316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGG 1739

  4376317 AGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAA 4376376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 AGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAA 1799

  4376377 AAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 4376417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 1840

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 1900

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1901 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 1960

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4377824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 2020

  4377825 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4377884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 2080

  4377885 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 4377944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 2140

  4377945 AAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 4378004
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 AAAAGTACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 2200

  4378005 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAA 4378064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAA 2260

  4378065 AGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTAATATACAAATGC 4378124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 AGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTAATATACAAATGC 2320

  4378125 TAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATTATGAAAGTAATTTTAATGAGC 4378184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 TAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATTATGAAAGTAATTTTAATGAGC 2380

  4378185 ATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAATCCTCAGTCTGGGTTGCCAGG 4378244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 ATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAATCCTCAGTCTGGGTTGCCAGG 2440

  4378245 TTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAGTTTCAGATAAACAATGAACAC 4378304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 TTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAGTTTCAGATAAACAATGAACAC 2500

  4378305 TTTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAATGTTTATCAGAAATATTTCAGA 4378364
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 ATTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAATGTTTATCAGAAATATTTCAGA 2560

  4378365 TACACTGAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTAAAACATGTTTTTGTTTGTTTA 4378424
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TACACTAAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTAAAACATGTTTTTGTTTGTTTA 2620

  4378425 TATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGACTCTGGGAAGAACCAGGAAGA 4378484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 TATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGACTCTGGGAAGAACCAGGAAGA 2680

  4378485 GAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTATCTGAAATTGAAATTTGACTAG 4378544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 GAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTATCTGAAATTGAAATTTGACTAG 2740

  4378545 GCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTACAAAATAGGTACAATAACTATA 4378604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 GCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTACAAAATAGGTACAATAACTATA 2800

  4378605 TATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTGGTGCAATGGGAAATCACCCAC 4378664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 TATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTGGTGCAATGGGAAATCACCCAC 2860

  4378665 TATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAATCCAGAGGCAGAATGAGAAAG 4378724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 TATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAATCCAGAGGCAGAATGAGAAAG 2920

  4378725 GCACATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGGTAAACTTCCCTGAGAGCAATA 4378784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 GCACATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGGTAAACTTCCCTGAGAGCAATA 2980

  4378785 ACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAGCACCTGAATGTGTGCTCCAAG 4378844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 ACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAGCACCTGAATGTGTGCTCCAAG 3040

  4378845 TTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCTTCCTCTATGAGGTACATCTGA 4378904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 TTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCTTCCTCTATGAGGTACATCTGA 3100

  4378905 GCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGATTGAGGCCAAGTGTTTTGGGT 4378964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 GCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGATTGAGGCCAAGTGTTTTGGGT 3160

  4378965 TAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAGTGTTAAGTGAAAATGCTATAT 4379024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 TAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAGTGTTAAGTGAAAATGCTATAT 3220

  4379025 AAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGCCTAACCTGCAGCCTCTCGGCC 4379084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 AAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGCCTAACCTGCAGCCTCTCGGCC 3280

  4379085 GTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGACTGTAGGAAGGCGGATATGTTGTCCA 4379144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 GTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGACTGTAGGAAGGCGGATATGTTGTCCA 3340

  4379145 GCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATAAGGCAGTTCTCCTATCCAGCCTGTCACCA 4379204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 GCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATAAGGCAGTTCTCCTATCCAGCCTGTCACCA 3400

  4379205 CTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTAATAAAACCCCATGTCTCATTTGCTGGCTA 4379264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 CTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTAATAAAACCCCATGTCTCATTTGCTGGCTA 3460

  4379265 TGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGTGCCTTCCCTACTGAGGTTAATAGGGGTTT 4379324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 TGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGTGCCTTCCCTACTGAGGTTAATAGGGGTTT 3520

  4379325 GGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAATGTTATAATTTCTCAAACTATATTAATCCC 4379384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 GGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAATGTTATAATTTCTCAAACTATATTAATCCC 3580

  4379385 AAATTCAAATGCTAAAGATAACAACATATTGCAAAGCTGACTCTAAATGCCTCTGGATTT 4379444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 AAATTCAAATGCTAAAGATAACAACATATTGCAAAGCTGACTCTAAATGCCTCTGGATTT 3640

  4379445 TTCAGCCCTTTTGGAAGATTGACAACATTAGTCCCTTCTTTTAGTGCAAACTATCTAGAG 4379504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 TTCAGCCCTTTTGGAAGATTGACAACATTAGTCCCTTCTTTTAGTGCAAACTATCTAGAG 3700

  4379505 ATGGGAGATCAAATGTGGAAATGCTTATAAGATGTTTTTAGTTGATGAGATTTCAGGATC 4379564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 ATGGGAGATCAAATGTGGAAATGCTTATAAGATGTTTTTAGTTGATGAGATTTCAGGATC 3760

  4379565 TGGGAGCTAAACCTTGAGTTATTTCATTGCCATTGGGTGGTGGCAGTTGACTTGTTTTCT 4379624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 TGGGAGCTAAACCTTGAGTTATTTCATTGCCATTGGGTGGTGGCAGTTGACTTGTTTTCT 3820

  4379625 GCTGTTTCAGTGGACCTTGAAATTATCATGACTATTTGCTTCACTTCAGTGTACACCATC 4379684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 GCTGTTTCAGTGGACCTTGAAATTATCATGACTATTTGCTTCACTTCAGTGTACACCATC 3880

  4379685 CCGCTCCATTTGCAGTCAGCACCACTCAGGGAATAAAACATATTCATTCGCAGTGTCCCT 4379744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 CCGCTCCATTTGCAGTCAGCACCACTCAGGGAATAAAACATATTCATTCGCAGTGTCCCT 3940

  4379745 AGCAATGACAGAGGTATTTTCAAATATCTTTTTGCTCTTGAAGAAAGGAGCTCACTTTGC 4379804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 AGCAATGACAGAGGTATTTTCAAATATCTTTTTGCTCTTGAAGAAAGGAGCTCACTTTGC 4000

  4379805 TTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAAAGGACCAATATTTGACACACATCATATTATATTGCAA 4379864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 TTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAAAGGACCAATATTTGACACACATCATATTATATTGCAA 4060

  4379865 AGAATAGGAGTGTATGTGTGTGTATGCATCTGTATGTGTTTTAGCATAGACATCAAACCA 4379924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 AGAATAGGAGTGTATGTGTGTGTATGCATCTGTATGTGTTTTAGCATAGACATCAAACCA 4120

  4379925 AAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAGAGGCAGACAGAGTGAAAGACCCCCAGGAGGACTTGGG 4379984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     4121 AAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAGAGGCAGACAGAGTGAAAGACCCCCAGGAGGAC-TGGG 4179

  4379985 TTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTAACTAGTTATGTTACCATCCACAAGTCACCTACTCTTT 4380044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4180 TTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTAACTAGTTATGTTACCATCCACAAGTCACCTACTCTTT 4239

  4380045 CTGAGTCTCATTTTCACTATCTGTAGTGCATCAATATCTGCTCTATTCCACCGGAGCATT 4380104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4240 CTGAGTCTCATTTTCACTATCTGTAGTGCATCAATATCTGCTCTATTCCACCGGAGCATT 4299

  4380105 GTGGGACAAGGTTTCAAACCTAGAAGGCATCTTGGCTGTATACAGCTAGGAGAAGGAATT 4380164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4300 GTGGGACAAGGTTTCAAACCTAGAAGGCATCTTGGCTGTATACAGCTAGGAGAAGGAATT 4359

  4380165 ATAATTGGTTCATTATTGACTCTTCCTTAAGAAGTTCTAACAGAATAAATTTGCCTTCTT 4380224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4360 ATAATTGGTTCATTATTGACTCTTCCTTAAGAAGTTCTAACAGAATAAATTTGCCTTCTT 4419

  4380225 GCCTGCTAATTAGACATGTATTTAACTGTTTCTTTTTTAAATAACTCTCTGCTGTTATTT 4380284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4420 GCCTGCTAATTAGACATGTATTTAACTGTTTCTTTTTTAAATAACTCTCTGCTGTTATTT 4479

  4380285 GAAATCTTCTATTATATGTAATAAAAATCTCTGTCACACACACATACACAAAGATAACAA 4380344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4480 GAAATCTTCTATTATATGTAATAAAAATCTCTGTCACACACACATACACAAAGATAACAA 4539

  4380345 TTGGCTCTAAGCAAAATGATTTCAGAAATAAGGGGGCAAACTTCAAATTATTACTGCCCA 4380404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4540 TTGGCTCTAAGCAAAATGATTTCAGAAATAAGGGGGCAAACTTCAAATTATTACTGCCCA 4599

  4380405 TCAAGGAAGTCAGGTGACAACAGAGTATTGTTAACAACAAAAATATTTTCAAAAGCACCA 4380464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4600 TCAAGGAAGTCAGGTGACAACAGAGTATTGTTAACAACAAAAATATTTTCAAAAGCACCA 4659

  4380465 AAGAAGATAAAAATTTAAATGTCAGAGCTGAAGACAAAGATTTCTATCAGTACATCTCAC 4380524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4660 AAGAAGATAAAAATTTAAATGTCAGAGCTGAAGACAAAGATTTCTATCAGTACATCTCAC 4719

  4380525 ACTTTTGCATAATCAGAATCACATAGGAGAACTTGTTAACTATGCAGATTTCCGGGCCTC 4380584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4720 ACTTTTGCATAATCAGAATCACATAGGAGAACTTGTTAACTATGCAGATTTCCGGGCCTC 4779

  4380585 ACACCAGAGATTCTGAGTCAATAGGACTGAAGTTGGCCAAGAAATCTGGATATTTAGCAA 4380644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4780 ACACCAGAGATTCTGAGTCAATAGGACTGAAGTTGGCCAAGAAATCTGGATATTTAGCAA 4839

  4380645 GCTACCTGGCTGATTCAGAGGCAAGTAGTTCTTTGAGAATACTTTGAGAAACACTGGTCA 4380704
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4840 GCTACGTGGCTGATTCAGAGGCAAGTAGTTCTTTGAGAATACTTTGAGAAACACTGGTCA 4899

  4380705 TTACCAATCAAATATGAACATATTGTTAAAATTTTTAAATAAAGTACGAAAGAAACTGGT 4380764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4900 TTACCAATCAAATATGAACATATTGTTAAAATTTTTAAATAAAGTACGAAAGAAACTGGT 4959

  4380765 AGAAAGGAGAATGTGGATTTAATTCAACATAAAGTTTTGGGATGGGAGATGCAAGACCCT 4380824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4960 AGAAAGGAGAATGTGGATTTAATTCAACATAAAGTTTTGGGATGGGAGATGCAAGACCCT 5019

  4380825 CCCAAGAATAGAACGAGAAGAGAAGGACTCCCTGCAATGTCTTATCTCTCAAAATGTCTC 4380884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5020 CCCAAGAATAGAACGAGAAGAGAAGGACTCCCTGCAATGTCTTATCTCTCAAAATGTCTC 5079

  4380885 TAAGGTGGATCCACAGGAGCTAGTTAGTGAAAACAATGGAGGAAAATGTACAAACCCAAG 4380944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5080 TAAGGTGGATCCACAGGAGCTAGTTAGTGAAAACAATGGAGGAAAATGTACAAACCCAAG 5139

  4380945 AGGAAAATAAGCCATATAAAATTAGAAGAAAAATGTGGGAGGACAGGCAGAAATGGCCAG 4381004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5140 AGGAAAATAAGCCATATAAAATTAGAAGAAAAATGTGGGAGGACAGGCAGAAATGGCCAG 5199

  4381005 AGGGTAAGTAGTCTCAGGGATGGTCAAATTGTTGATGGGTAAAAAGATAGGAGAAATTCA 4381064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5200 AGGGTAAGTAGTCTCAGGGATGGTCAAATTGTTGATGGGTAAAAAGATAGGAGAAATTCA 5259

  4381065 GTAGTCACTGGTCAGAGGGGAAATCTTACTCATCAAAAAGGAGAGGAAGAACCAAGTAAG 4381124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5260 GTAGTCACTGGTCAGAGGGGAAATCTTACTCATCAAAAAGGAGAGGAAGAACCAAGTAAG 5319

  4381125 TGAGAAAACAGTAAAAATGTGAATGACTTTACATTTTTAAGAAAATGACATACAATCTTC 4381184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5320 TGAGAAAACAGTAAAAATGTGAATGACTTTACATTTTTAAGAAAATGACATACAATCTTC 5379

  4381185 ATGGAAAATTTGGTGGTGGGGAAATAAAATGAGTTCAACATGAAAATATCTTTAAAAAGT 4381244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5380 ATGGAAAATTTGGTGGTGGGGAAATAAAATGAGTTCAACATGAAAATATCTTTAAAAAGT 5439

  4381245 ATCTTAGAGGAATTTTAGGATAGAAGATGAGAAAGTACTTTGAAAAGTATAAAGAATGAA 4381304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5440 ATCTTAGAGGAATTTTAGGATAGAAGATGAGAAAGTACTTTGAAAAGTATAAAGAATGAA 5499

  4381305 TTACATGATTATTGCTTGCAGTATTTTCATGATTATCAAATTTTTTCACTGTCTGCCTGG 4381364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5500 TTACATGATTATTGCTTGCAGTATTTTCATGATTATCAAATTTTTTCACTGTCTGCCTGG 5559

  4381365 CTCATAAGGTAGTTAAAGAGGGCTCTATGACATTATCTTTGGATCCCCAGAGCCTAACAG 4381424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5560 CTCATAAGGTAGTTAAAGAGGGCTCTATGACATTATCTTTGGATCCCCAGAGCCTAACAG 5619

  4381425 TATCTGATATATAATAAGCACCAACCGGACGGACAAATGGATGGGTAAATCAAGTTAACA 4381484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5620 TATCTGATATATAATAAGCACCAACCGGACGGACAAATGGATGGGTAAATCAAGTTAACA 5679

  4381485 CAGGAAAAGATAAGAGTTGCATGGTCACATAGTACTCACAAAGCCTTACAGGTTTCATTC 4381544
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5680 CAGGAAAAGATAAGAGTTGCATGGCCACATAGTACTCACAAAGCCTTACAGGTTTCATTC 5739

  4381545 TCTGATTTTATGAACACAGCACTCACGCACATTTTGGTACTAATATCTGCATGCATGAAC 4381604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5740 TCTGATTTTATGAACACAGCACTCACGCACATTTTGGTACTAATATCTGCATGCATGAAC 5799

  4381605 CTCCAACTGGGGCATGCCTGTTTGTCTTCCTGAAGGAAGTACTTCTTGATTCATTTTACT 4381664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5800 CTCCAACTGGGGCATGCCTGTTTGTCTTCCTGAAGGAAGTACTTCTTGATTCATTTTACT 5859

  4381665 TGGTGCATCAGTTGTCTACCTGCTGCCCCTGAGCTGCACTTTCACCTTATTCCATCCTGT 4381724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5860 TGGTGCATCAGTTGTCTACCTGCTGCCCCTGAGCTGCACTTTCACCTTATTCCATCCTGT 5919

  4381725 CTGTATTGCTGGGGCTGTGGGAATCCACAAACTCCATTTTCCAGACTCCTTTACTACCTG 4381784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5920 CTGTATTGCTGGGGCTGTGGGAATCCACAAACTCCATTTTCCAGACTCCTTTACTACCTG 5979

  4381785 GCTTTCTGTTATGTCTGGCAAGAGGAAGAGCCATTATTTCTTTCTTATACTCTCTTTGTT 4381844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5980 GCTTTCTGTTATGTCTGGCAAGAGGAAGAGCCATTATTTCTTTCTTATACTCTCTTTGTT 6039

  4381845 TCTGCTGTTGGTTCTGGAAGTAGCTGTGCCCCTTCAGTGACCCAAGGTTCTGCTGGAACT 4381904
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6040 TCTGCTGTTGTTTCTGGAAGTAGCTGTGCCCCTTCAGTGACCCAAGGTTCTGCTGGAACT 6099

  4381905 GCCCTTAATTGGTCCCGGCTGTGGCTAGGGAGACCATCCTTGGCAGTCCCAGCACAGGCT 4381964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6100 GCCCTTAATTGGTCCCGGCTGTGGCTAGGGAGACCATCCTTGGCAGTCCCAGCACAGGCT 6159

  4381965 GGGTGGAATCCCTTAAGGCCTGCTCCTGGACTTTGACAGCTCCTCTTCAGTTTCATTCCC 4382024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6160 GGGTGGAATCCCTTAAGGCCTGCTCCTGGACTTTGACAGCTCCTCTTCAGTTTCATTCCC 6219

  4382025 CCAGTTCCTAAGGCTGGTAGCCGCTCTCTACAGATACTAATCTCGGAATGTCACCCTTTT 4382084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6220 CCAGTTCCTAAGGCTGGTAGCCGCTCTCTACAGATACTAATCTCGGAATGTCACCCTTTT 6279

  4382085 CCCTTTTTGCTTCTTTAGCTCCCTTGCTTATCTGTTCCAATGCCCGTAATACCAAAATCT 4382144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6280 CCCTTTTTGCTTCTTTAGCTCCCTTGCTTATCTGTTCCAATGCCCGTAATACCAAAATCT 6339

  4382145 GTAGTAAATCCCTTTTATTTGAAACATCTAGAGTGGTTTCTGTTTTTCTGGCCAGATGCT 4382204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6340 GTAGTAAATCCCTTTTATTTGAAACATCTAGAGTGGTTTCTGTTTTTCTGGCCAGATGCT 6399

  4382205 GAATGACACATCTGGAAAAATCAGGGTAAATATTATTACTCTAGGTATTGAAAGTACAGA 4382264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6400 GAATGACACATCTGGAAAAATCAGGGTAAATATTATTACTCTAGGTATTGAAAGTACAGA 6459

  4382265 TTGGAGAACATTTCGTTTGTTCCAGAAGAATCCTGAATGAAAACCGAAATTCAACTGGAG 4382324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6460 TTGGAGAACATTTCGTTTGTTCCAGAAGAATCCTGAATGAAAACCGAAATTCAACTGGAG 6519

  4382325 AGTTAGAGCATTATTGAACAGTATGTGTAGGGAATAAAATGCCTTTCCCCCATCCTGGAA 4382384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6520 AGTTAGAGCATTATTGAACAGTATGTGTAGGGAATAAAATGCCTTTCCCCCATCCTGGAA 6579

  4382385 TACCTCCCTGATTATACTACCTTATTACTGTGATTGTTTTTTAACTTCTCTGCTTTTTCA 4382444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6580 TACCTCCCTGATTATACTACCTTATTACTGTGATTGTTTTTTAACTTCTCTGCTTTTTCA 6639

  4382445 CACAAATCTACAAGAATCTCCTCTTCCTGGAAGCCTCTCTGATTACCTCACACAAACATC 4382504
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6640 CACAAATCTACAAGAATCTCCTCTTCCTGGAAGCCTCTCTGATTACCGCACACAAACATC 6699

  4382505 ATCTTGCTTAGTCTGAATTCCTATGGTTCTTTTGTTCTCTGACTTCTAGAGTATTTCTCC 4382564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6700 ATCTTGCTTAGTCTGAATTCCTATGGTTCTTTTGTTCTCTGACTTCTAGAGTATTTCTCC 6759

  4382565 AGGTATGTTAGCAATCAGTTTTTCTCTTGATCACTCCCCAAACCTGAGTGATCATCAGAA 4382624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6760 AGGTATGTTAGCAATCAGTTTTTCTCTTGATCACTCCCCAAACCTGAGTGATCATCAGAA 6819

  4382625 TCCTCAGAAAAATATAGATACCAGGCCCTTCTCCTTGTCCTAACCTCCTGAGACAAAATT 4382684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6820 TCCTCAGAAAAATATAGATACCAGGCCCTTCTCCTTGTCCTAACCTCCTGAGACAAAATT 6879

  4382685 CTAGAGTGATGAGTGGGTACTATAGGGTCGAGACAGCATCTATATATATTTTAATACCTC 4382744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6880 CTAGAGTGATGAGTGGGTACTATAGGGTCGAGACAGCATCTATATATATTTTAATACCTC 6939

  4382745 TCAGATGATAAACCCTTCAAGATCAGGGCCTTTCCATTTCTCATGTAGCTTTTACTGTAC 4382804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6940 TCAGATGATAAACCCTTCAAGATCAGGGCCTTTCCATTTCTCATGTAGCTTTTACTGTAC 6999

  4382805 CTAATACAGTTTAAGCAGACCATAAAAATCTGTTCATTTTCTAATGAATTACATGAGGGA 4382864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7000 CTAATACAGTTTAAGCAGACCATAAAAATCTGTTCATTTTCTAATGAATTACATGAGGGA 7059

  4382865 AGATTCCCAGGAAGACCAGCTGGTGTCACTACTGCCTAATTAATATTTCTGGCCCAGGGA 4382924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7060 AGATTCCCAGGAAGACCAGCTGGTGTCACTACTGCCTAATTAATATTTCTGGCCCAGGGA 7119

  4382925 AGGGCATCTCACAAAGCAAAATTTGACCTTACCTGGATTCACCGATTCTGTGCTTGAATC 4382984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7120 AGGGCATCTCACAAAGCAAAATTTGACCTTACCTGGATTCACCGATTCTGTGCTTGAATC 7179

  4382985 CATCTTCCCATCTGTCTATTTTCCTAAAAGGAAGTTGCAGAAACCTTGCCAAGAAAATAG 4383044
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     7180 CATCTTCCCATCTGTCTATTTTCCTAAAAGGGAGTTGCAGAAACCTTGCCAAGAAAATAG 7239

  4383045 ACAGCAAAACTTCAGCAGTACCAATAACTTGGGTTTTCTGAAAGGAAATGATGCCATGAC 4383104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7240 ACAGCAAAACTTCAGCAGTACCAATAACTTGGGTTTTCTGAAAGGAAATGATGCCATGAC 7299

  4383105 CTGAGGCTGCCAGACTTAATGTGAGAAAGCAAGAACTGAAACGAGTAGAAGTAGGCCTCC 4383164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7300 CTGAGGCTGCCAGACTTAATGTGAGAAAGCAAGAACTGAAACGAGTAGAAGTAGGCCTCC 7359

  4383165 CACTGGCCCAAGGCCTAAGATTTCATTGCACTTGCTTCTTGGCATTAACATTCTGTAGAA 4383224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     7360 CACTGGCCCAAGGCCTAAGATTTCATTGCACTTGCTTCTTGGCATTAACATTCTATAGAA 7419

  4383225 CAAGTTTCAGAAAAAAACGCTTAACGAATTTGCAAGCACAACCAAACTCCAACCAGATTG 4383284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7420 CAAGTTTCAGAAAAAAACGCTTAACGAATTTGCAAGCACAACCAAACTCCAACCAGATTG 7479

  4383285 CATTTTTTATTCACCTTTTACAATCTCATTCATTTTCCATAACATTTGGAACTGCTGTTT 4383344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7480 CATTTTTTATTCACCTTTTACAATCTCATTCATTTTCCATAACATTTGGAACTGCTGTTT 7539

  4383345 GAAAGTTTAATTTTCCTTTTTATCTACTATTTTCTTATTATTGACTTAAATTATTCTTGA 4383404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7540 GAAAGTTTAATTTTCCTTTTTATCTACTATTTTCTTATTATTGACTTAAATTATTCTTGA 7599

  4383405 TTCATGGATAAGCAAACTAATGTGGGTCTACCCTGAGTCATTTATTATGTATCAAAGATA 4383464
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     7600 TTCATGGATAAGCAAACTAATGTGGGTCTACCCTGAGTCATTTATTATGTATCGAAGATA 7659

  4383465 ACATAGAACTCTTCACTTCTGGCAGAAGCTGTTTAGTAATTACTTCTAATTACTAACAAA 4383524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7660 ACATAGAACTCTTCACTTCTGGCAGAAGCTGTTTAGTAATTACTTCTAATTACTAACAAA 7719

  4383525 TTAAGAACAGCATGTGCTCCAAAAGCAGTTTCTATACAAGCTCAAACCTGGCTATATTTC 4383584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7720 TTAAGAACAGCATGTGCTCCAAAAGCAGTTTCTATACAAGCTCAAACCTGGCTATATTTC 7779

  4383585 AACACTTCTAAATTCTAATTCTCTGGATGCAGAAAAAAATCTATTAAGATGGTTAAAAGG 4383644
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     7780 AACACTTCTAAATTCTAATTCTCTGGATGCAG-AAAAAATCTATTAAGATGGTTAAAAGG 7838

  4383645 AAATAAAATCTAGATGTATAAGTCCAAAAGAAGTCT 4383680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7839 AAATAAAATCTAGATGTATAAGTCCAAAAGAAGTCT 7874

Alignment time is 5.90075 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   2098] =>      2098 nucs 'mol-32-301a-008294_2098'

Score:        2075
Aligned:      2097        nucs
Identic:      2095 (100%) nucs =>       479 (100%)      1616 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4375508,4375986] EXCISED REGION [4375988,4377605]
 second seq =>  [      1,    479] EXCISED REGION [    481,   2098]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4375987,4375987]
 second seq =>         1 nucs [480,480]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [479,480] to [480,481]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4375986,4375986] to [4375988,4375988]
 second seq =>         1 nucs [479,479] to [481,481]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4375508 AGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATA 4375567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATA 60

  4375568 ATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAAC 4375627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAAC 120

  4375628 TACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTC 4375687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTC 180

  4375688 TAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAA 4375747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAA 240

  4375748 CCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGAC 4375807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGAC 300

  4375808 AGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGA 4375867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGA 360

  4375868 AACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCC 4375927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCC 420

  4375928 AGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAG 4375986
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAG 479

EXCISED REGION

  4375988 GAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAA 4376047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAA 540

  4376048 TTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAG 4376107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAG 600

  4376108 CAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAG 4376167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAG 660

  4376168 GCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAA 4376227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAA 720

  4376228 GATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTT 4376287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTT 780

  4376288 TTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAG 4376347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAG 840

  4376348 ATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAA 4376407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAA 900

  4376408 GTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAG 4376467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAG 960

  4376468 ACTGACATATTTCTATTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAA 4376527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTGACATATTTCTATTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAA 1020

  4376528 AAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTA 4376587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTA 1080

  4376588 GGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAA 4376647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAA 1140

  4376648 GAAGAAATATAACTTTTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATA 4376707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAGAAATATAACTTTTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATA 1200

  4376708 AATATAACAAAAACTATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTA 4376767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATATAACAAAAACTATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTA 1260

  4376768 ATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAG 4376827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAG 1320

  4376828 TATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAAT 4376887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAAT 1380

  4376888 GCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGG 4376947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGG 1440

  4376948 ATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCA 4377007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCA 1500

  4377008 ATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAG 4377067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAG 1560

  4377068 GGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAA 4377127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAA 1620

  4377128 AGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAG 4377187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAG 1680

  4377188 AGGACTGGTAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAG 4377247
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGACTGGGAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAG 1740

  4377248 CGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGG 4377307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGG 1800

  4377308 CTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGA 4377367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGA 1860

  4377368 CTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTC 4377427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTC 1920

  4377428 AGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCT 4377487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCT 1980

  4377488 CAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTT 4377547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTT 2040

  4377548 CATATATACATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAAT 4377605
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATATATGCATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAAT 2098

Alignment time is 1.60291 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   4721] =>      4721 nucs 'mol-32-3030-110389_4721'

Score:        4600
Aligned:      4721        nucs
Identic:      4710 (100%) nucs =>       272 (100%)      4438 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4373399,4373670] EXCISED REGION [4373672,4378120]
 second seq =>  [      1,    272] EXCISED REGION [    273,   4721]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4373671,4373671]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [4374083,4374083]
 second seq =>         1 nucs [684,684]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [4373671,4373684] to [4373672,4373685]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4373399 GGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCA 4373458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCA 60

  4373459 GCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGA 4373518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGA 120

  4373519 CCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGC 4373578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGC 180

  4373579 CAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTT 4373638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTT 240

  4373639 TGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTC 4373670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTC 272

EXCISED REGION

  4373672 TTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCAC 4373731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      273 TTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCAC 332

  4373732 GATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCC 4373791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      333 GATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCC 392

  4373792 CGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTA 4373851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      393 CGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTA 452

  4373852 GAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCC 4373911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      453 GAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCC 512

  4373912 TGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAAT 4373971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      513 TGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAAT 572

  4373972 GTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAG 4374031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      573 GTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAG 632

  4374032 TTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGCGGATACAC 4374091
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      633 TTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGGGGATACAC 692

  4374092 GAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCT 4374151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      693 GAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCT 752

  4374152 GCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTAT 4374211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      753 GCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTAT 812

  4374212 TTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGG 4374271
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      813 TTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAACAATGG 872

  4374272 CTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAA 4374331
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      873 CTGTTACGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAA 932

  4374332 AAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGA 4374391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      933 AAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGA 992

  4374392 AACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATT 4374451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      993 AACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATT 1052

  4374452 TCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCC 4374511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 TCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCC 1112

  4374512 TTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACAT 4374571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 TTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACAT 1172

  4374572 CCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAAT 4374631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 CCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAAT 1232

  4374632 CAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGC 4374691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 CAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGC 1292

  4374692 CCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTAT 4374751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 CCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTAT 1352

  4374752 ACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTT 4374811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1353 ACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTT 1412

  4374812 ATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATAC 4374871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 ATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATAC 1472

  4374872 TATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTG 4374931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 TATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTG 1532

  4374932 AAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATT 4374991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 AAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATT 1592

  4374992 TCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAAT 4375051
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1593 TCACCCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTCTAAAAT 1652

  4375052 GATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAAC 4375111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 GATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAAC 1712

  4375112 CCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGC 4375171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 CCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGC 1772

  4375172 TGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAA 4375231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 TGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAA 1832

  4375232 GTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGAT 4375291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 GTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGAT 1892

  4375292 CACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTAC 4375351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 CACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTAC 1952

  4375352 AGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGA 4375411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 AGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGA 2012

  4375412 AGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGT 4375471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 AGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGT 2072

  4375472 GCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGT 4375531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 GCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGT 2132

  4375532 TGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAA 4375591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 TGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAA 2192

  4375592 TGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGT 4375651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 TGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGT 2252

  4375652 TTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCA 4375711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 TTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCA 2312

  4375712 CATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGG 4375771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 CATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGG 2372

  4375772 AAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTT 4375831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 AAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTT 2432

  4375832 TAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCA 4375891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 TAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCA 2492

  4375892 CAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACT 4375951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 CAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACT 2552

  4375952 TAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCAC 4376011
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2553 TAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGGGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCAC 2612

  4376012 AGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAAT 4376071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 AGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAAT 2672

  4376072 ATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGG 4376131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 ATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGG 2732

  4376132 GGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGT 4376191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 GGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGT 2792

  4376192 CCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGG 4376251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 CCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGG 2852

  4376252 TGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCA 4376311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 TGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCA 2912

  4376312 TTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTT 4376371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 TTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTT 2972

  4376372 TGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCT 4376431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 TGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCT 3032

  4376432 AAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATTTATGTTT 4376491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 AAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATTTATGTTT 3092

  4376492 AAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGACTTTTGT 4376551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 AAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGACTTTTGT 3152

  4376552 AAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATG 4376611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 AAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATG 3212

  4376612 CCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTTTCACCCT 4376671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 CCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTTTCACCCT 3272

  4376672 GACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTATTAGATAC 4376731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 GACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTATTAGATAC 3332

  4376732 TATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGCTGAAAAG 4376791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 TATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGCTGAAAAG 3392

  4376792 GCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTTTGCAGAA 4376851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 GCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTTTGCAGAA 3452

  4376852 GGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGAT 4376911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 GGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGAT 3512

  4376912 TCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACC 4376971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 TCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACC 3572

  4376972 TGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGA 4377031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 TGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGA 3632

  4377032 CCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAATATTAGGT 4377091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 CCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAATATTAGGT 3692

  4377092 GTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGT 4377151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 GTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGT 3752

  4377152 GAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGTAGAGGAAGACCCATC 4377211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3753 GAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGGAGAGGAAGACCCATC 3812

  4377212 CTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGA 4377271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 CTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGA 3872

  4377272 AGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGA 4377331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 AGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGA 3932

  4377332 TGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAA 4377391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 TGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAA 3992

  4377392 TCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCT 4377451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 TCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCT 4052

  4377452 GCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGG 4377511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 GCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGG 4112

  4377512 GATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATACATATATCCTGCTAGT 4377571
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4113 GATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATGCATATATCCTGCTAGT 4172

  4377572 TCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGT 4377631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4173 TCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGT 4232

  4377632 GTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACA 4377691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 GTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACA 4292

  4377692 AGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTA 4377751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4293 AGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTA 4352

  4377752 TTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTAT 4377811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 TTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTAT 4412

  4377812 TACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTA 4377871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 TACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTA 4472

  4377872 ACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCA 4377931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 ACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCA 4532

  4377932 ATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTG 4377991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4533 ATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTG 4592

  4377992 CAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCA 4378051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4593 CAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCA 4652

  4378052 CAGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGT 4378111
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4653 CAGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATACTAAAGT 4712

  4378112 AATATACAA 4378120
          |||||||||
     4713 AATATACAA 4721

Alignment time is 3.66472 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   4000] =>      4000 nucs 'mol-32-303b-221356_4000'

Score:        3900
Aligned:      3999        nucs
Identic:      3990 (100%) nucs =>       238 (100%)      3752 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4373845,4374082] EXCISED REGION [4374084,4377844]
 second seq =>  [      1,    238] EXCISED REGION [    240,   4000]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4374083,4374083]
 second seq =>         1 nucs [239,239]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [237,240] to [238,241]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4374081,4374082] to [4374084,4374085]
 second seq =>         2 nucs [237,238] to [240,241]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4373845 TTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTG 4373904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTG 60

  4373905 ATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 4373964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGC 120

  4373965 CGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTT 4374024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTT 180

  4374025 TTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGG 4374082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGG 238

EXCISED REGION

  4374084 GGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAG 4374143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 GGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAG 299

  4374144 AAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCA 4374203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 AAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCA 359

  4374204 TCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGA 4374263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 TCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGA 419

  4374264 AGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGC 4374323
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 AACAATGGCTGTTACGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGC 479

  4374324 AAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGC 4374383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 AAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGC 539

  4374384 TATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGG 4374443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGG 599

  4374444 ATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCC 4374503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 ATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCC 659

  4374504 TGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTC 4374563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTC 719

  4374564 TCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGG 4374623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGG 779

  4374624 CTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGC 4374683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGC 839

  4374684 AGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAA 4374743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAA 899

  4374744 AAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCAC 4374803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCAC 959

  4374804 CGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATT 4374863
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATT 1019

  4374864 GAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCT 4374923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCT 1079

  4374924 ATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGA 4374983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGA 1139

  4374984 TGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTAT 4375043
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TGATTATTTCACCCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTAT 1199

  4375044 TATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCT 4375103
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TCTAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCT 1259

  4375104 GACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTC 4375163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTC 1319

  4375164 AGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTT 4375223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTT 1379

  4375224 ACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTA 4375283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTA 1439

  4375284 AAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGT 4375343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGT 1499

  4375344 GTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACC 4375403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACC 1559

  4375404 TTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCT 4375463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCT 1619

  4375464 GTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCT 4375523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCT 1679

  4375524 CTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGG 4375583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGG 1739

  4375584 CTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTA 4375643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTA 1799

  4375644 TGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAA 4375703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAA 1859

  4375704 TATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTG 4375763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTG 1919

  4375764 CGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTG 4375823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTG 1979

  4375824 TGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTAC 4375883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTAC 2039

  4375884 AAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATT 4375943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATT 2099

  4375944 GGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTG 4376003
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2100 GGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGGGAGTCCCTGAGCTGTG 2159

  4376004 AGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCA 4376063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCA 2219

  4376064 GACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAA 4376123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAA 2279

  4376124 AAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGA 4376183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGA 2339

  4376184 GAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAA 4376243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAA 2399

  4376244 CAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAAT 4376303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAAT 2459

  4376304 TTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGG 4376363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGG 2519

  4376364 AGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCT 4376423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCT 2579

  4376424 CTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTAT 4376483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTAT 2639

  4376484 TTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTG 4376543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTG 2699

  4376544 ACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTC 4376603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTC 2759

  4376604 CTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTT 4376663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTT 2819

  4376664 TTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTA 4376723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTA 2879

  4376724 TTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATG 4376783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATG 2939

  4376784 CTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCT 4376843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCT 2999

  4376844 TTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAG 4376903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAG 3059

  4376904 CCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCC 4376963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCC 3119

  4376964 AGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAA 4377023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAA 3179

  4377024 TTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAA 4377083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAA 3239

  4377084 TATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGT 4377143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGT 3299

  4377144 GTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGTAGAGGAA 4377203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3300 GTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGGAGAGGAA 3359

  4377204 GACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAG 4377263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAG 3419

  4377264 CAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCC 4377323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 CAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCC 3479

  4377324 ATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGC 4377383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 ATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGC 3539

  4377384 TTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAG 4377443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAG 3599

  4377444 CCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCC 4377503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCC 3659

  4377504 TATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATACATATATC 4377563
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3660 TATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATGCATATATC 3719

  4377564 CTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGC 4377623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 CTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGC 3779

  4377624 AAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACA 4377683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 AAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACA 3839

  4377684 TTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTT 4377743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTT 3899

  4377744 TTTCATTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTA 4377803
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TTTCGTTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTA 3959

  4377804 CTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGT 4377844
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGT 4000

Alignment time is 3.01311 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3060] =>      3060 nucs 'mol-32-3046-017931_3060'

Score:        2993
Aligned:      3059        nucs
Identic:      3053 (100%) nucs =>       104 (100%)      2949 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4374700,4374803] EXCISED REGION [4374805,4377759]
 second seq =>  [      1,    104] EXCISED REGION [    106,   3060]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4374804,4374804]
 second seq =>         1 nucs [105,105]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4374803,4374803] to [4374804,4374804]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4374700 CTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACT 4374759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACT 60

  4374760 CAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCAC 4374803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCAC 104

EXCISED REGION

  4374805 GTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTG 4374864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      106 GTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTG 165

  4374865 AATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTA 4374924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      166 AATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTA 225

  4374925 TGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGAT 4374984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      226 TGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGAT 285

  4374985 GATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATT 4375044
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      286 GATTATTTCACCCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATT 345

  4375045 ATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTG 4375104
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      346 CTAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTG 405

  4375105 ACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCA 4375164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      406 ACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCA 465

  4375165 GGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTA 4375224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      466 GGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTA 525

  4375225 CAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAA 4375284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      526 CAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAA 585

  4375285 AGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTG 4375344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      586 AGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTG 645

  4375345 TGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCT 4375404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      646 TGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCT 705

  4375405 TTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTG 4375464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      706 TTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTG 765

  4375465 TGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTC 4375524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      766 TGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTC 825

  4375525 TCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGC 4375584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      826 TCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGC 885

  4375585 TTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTAT 4375644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      886 TTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTAT 945

  4375645 GGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAAT 4375704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      946 GGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAAT 1005

  4375705 ATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGC 4375764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1006 ATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGC 1065

  4375765 GAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGT 4375824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 GAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGT 1125

  4375825 GAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACA 4375884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1126 GAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACA 1185

  4375885 AAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTG 4375944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1186 AAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTG 1245

  4375945 GCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGA 4376004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1246 GCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGGGAGTCCCTGAGCTGTGA 1305

  4376005 GCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAG 4376064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1306 GCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAG 1365

  4376065 ACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAA 4376124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 ACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAA 1425

  4376125 AAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAG 4376184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 AAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAG 1485

  4376185 AGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAAC 4376244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 AGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAAC 1545

  4376245 AGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATT 4376304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 AGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATT 1605

  4376305 TAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGA 4376364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 TAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGA 1665

  4376365 GAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTC 4376424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 GAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTC 1725

  4376425 TCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATT 4376484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 TCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATT 1785

  4376485 TATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGA 4376544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 TATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGA 1845

  4376545 CTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCC 4376604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 CTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCC 1905

  4376605 TAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTT 4376664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 TAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTT 1965

  4376665 TCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTAT 4376724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 TCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTAT 2025

  4376725 TAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGC 4376784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 TAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGC 2085

  4376785 TGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTT 4376844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 TGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTT 2145

  4376845 TGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGC 4376904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 TGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGC 2205

  4376905 CACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCA 4376964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 CACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCA 2265

  4376965 GACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAAT 4377024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 GACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAAT 2325

  4377025 TCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAAT 4377084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 TCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAAT 2385

  4377085 ATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTG 4377144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 ATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTG 2445

  4377145 TGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGTAGAGGAAG 4377204
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2446 TGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGGAGAGGAAG 2505

  4377205 ACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGC 4377264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 ACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGC 2565

  4377265 AGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCA 4377324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 AGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCA 2625

  4377325 TGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCT 4377384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCT 2685

  4377385 TTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGC 4377444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 TTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGC 2745

  4377445 CTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCT 4377504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 CTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCT 2805

  4377505 ATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATACATATATCC 4377564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2806 ATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATGCATATATCC 2865

  4377565 TGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCA 4377624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 TGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCA 2925

  4377625 AAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACAT 4377684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 AAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACAT 2985

  4377685 TATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTT 4377744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 TATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTT 3045

  4377745 TTCATTATTAGACAA 4377759
          |||.|||||||||||
     3046 TTCGTTATTAGACAA 3060

Alignment time is 2.66936 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   6412] =>      6412 nucs 'mol-32-3046-056921_6412'

Score:        6247
Aligned:      6412        nucs
Identic:      6397 (100%) nucs =>       420 (100%)      5977 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4371392,4371811] EXCISED REGION [4371813,4377804]
 second seq =>  [      1,    420] EXCISED REGION [    422,   6412]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4371812,4371812]
 second seq =>         1 nucs [421,421]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [4373292,4373292]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4371811,4371811] to [4371812,4371812]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4371392 CAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAACTTCTGTATGTGGCCTGTG 4371451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAACTTCTGTATGTGGCCTGTG 60

  4371452 TTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTCACAAATCCTGGCCCAGTA 4371511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTCACAAATCCTGGCCCAGTA 120

  4371512 ACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGGGGACACCCTACCACCCCT 4371571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGGGGACACCCTACCACCCCT 180

  4371572 AACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGATCCACTAGGTATAGGACT 4371631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGATCCACTAGGTATAGGACT 240

  4371632 ACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCTCTCTCACTACTCACTAC 4371691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCTCTCTCACTACTCACTAC 300

  4371692 TCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACCACGTTACTTCTCTTAGG 4371751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACCACGTTACTTCTCTTAGG 360

  4371752 CTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATCCTTAGCCTGGCTCCAGT 4371811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATCCTTAGCCTGGCTCCAGT 420

EXCISED REGION

  4371813 GCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTTGAATA 4371872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      422 GCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTTGAATA 481

  4371873 TCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCTCAGCT 4371932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      482 TCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCTCAGCT 541

  4371933 CTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGTCAGCCCCCT 4371992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      542 CTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGTCAGCCCCCT 601

  4371993 TCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGG 4372052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      602 TCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGG 661

  4372053 ATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCT 4372112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      662 ATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCT 721

  4372113 GTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATG 4372172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      722 GTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATG 781

  4372173 AAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCC 4372232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      782 AAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCC 841

  4372233 GTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTT 4372292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 GTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTT 901

  4372293 TATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTG 4372352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 TATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTG 961

  4372353 ACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCT 4372412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 ACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCT 1021

  4372413 AGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCC 4372472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 AGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCC 1081

  4372473 AGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTC 4372532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 AGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTC 1141

  4372533 CTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACCT 4372592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 CTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACCT 1201

  4372593 AAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAG 4372652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 AAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAG 1261

  4372653 GGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATA 4372712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 GGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATA 1321

  4372713 CATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGAT 4372772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 CATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGAT 1381

  4372773 AGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCAC 4372832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 AGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCAC 1441

  4372833 CTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCC 4372892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 CTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCC 1501

  4372893 AGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACC 4372952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 AGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACC 1561

  4372953 TCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAA 4373012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 TCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAA 1621

  4373013 AAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGG 4373072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 AAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGG 1681

  4373073 ATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGC 4373132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 ATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGC 1741

  4373133 TTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATA 4373192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 TTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATA 1801

  4373193 GTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCA 4373252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 GTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCA 1861

  4373253 GAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCT 4373312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     1862 GAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCT-AATCAGTAGTTTCCCATCCT 1920

  4373313 GGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTA 4373372
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1921 GCCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTCAAGAACTA 1980

  4373373 CTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATG 4373432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATG 2040

  4373433 GTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAAC 4373492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAAC 2100

  4373493 TGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATA 4373552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATA 2160

  4373553 TTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTC 4373612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTC 2220

  4373613 CTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTT 4373672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTT 2280

  4373673 TTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACG 4373732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACG 2340

  4373733 ATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCC 4373792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCC 2400

  4373793 GAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAG 4373852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAG 2460

  4373853 AGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCT 4373912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCT 2520

  4373913 GCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATG 4373972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATG 2580

  4373973 TAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGT 4374032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGT 2640

  4374033 TACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGCGGATACACG 4374092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2641 TACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGGGGATACACG 2700

  4374093 AAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTG 4374152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTG 2760

  4374153 CTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATT 4374212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATT 2820

  4374213 TCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGC 4374272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2821 TCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAACAATGGC 2880

  4374273 TGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAA 4374332
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGTTACGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAA 2940

  4374333 AGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAA 4374392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAA 3000

  4374393 ACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTT 4374452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCGATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTT 3060

  4374453 CCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCT 4374512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCT 3120

  4374513 TAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATC 4374572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATC 3180

  4374573 CCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATC 4374632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATC 3240

  4374633 AGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCC 4374692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCC 3300

  4374693 CTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATA 4374752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATA 3360

  4374753 CAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTA 4374812
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3361 CAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTA 3420

  4374813 TTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACT 4374872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACT 3480

  4374873 ATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGA 4374932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGA 3540

  4374933 AATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTT 4374992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTT 3600

  4374993 CAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATG 4375052
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3601 CACCCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTCTAAAATG 3660

  4375053 ATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACC 4375112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACC 3720

  4375113 CACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCT 4375172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCT 3780

  4375173 GACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAG 4375232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAG 3840

  4375233 TCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATC 4375292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATC 3900

  4375293 ACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACA 4375352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACA 3960

  4375353 GAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAA 4375412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAA 4020

  4375413 GGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTG 4375472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTG 4080

  4375473 CTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTT 4375532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTT 4140

  4375533 GTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAAT 4375592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAAT 4200

  4375593 GTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTT 4375652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTT 4260

  4375653 TGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCAC 4375712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCAC 4320

  4375713 ATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGA 4375772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGA 4380

  4375773 AAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTT 4375832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTT 4440

  4375833 AGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCAC 4375892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCAC 4500

  4375893 AAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTT 4375952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTT 4560

  4375953 AACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACA 4376012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4561 AACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGGGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACA 4620

  4376013 GGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATA 4376072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATA 4680

  4376073 TAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGG 4376132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGG 4740

  4376133 GTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTC 4376192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTC 4800

  4376193 CCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGT 4376252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGT 4860

  4376253 GGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCAT 4376312
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GGGGAAAACTTACGAGAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCAT 4920

  4376313 TAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTT 4376372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTT 4980

  4376373 GAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTA 4376432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTA 5040

  4376433 AACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATTTATGTTTA 4376492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATTTATGTTTA 5100

  4376493 AACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTA 4376552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTA 5160

  4376553 AGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGC 4376612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGC 5220

  4376613 CAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTTTCACCCTG 4376672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTTTCACCCTG 5280

  4376673 ACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTATTAGATACT 4376732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 ACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTATTAGATACT 5340

  4376733 ATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGG 4376792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 ATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGG 5400

  4376793 CTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAG 4376852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAG 5460

  4376853 GTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATT 4376912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATT 5520

  4376913 CCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCT 4376972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCT 5580

  4376973 GAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGAC 4377032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGAC 5640

  4377033 CCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTG 4377092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTG 5700

  4377093 TCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTG 4377152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTG 5760

  4377153 AGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGTAGAGGAAGACCCATCC 4377212
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5761 AGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGGAGAGGAAGACCCATCC 5820

  4377213 TCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAA 4377272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAA 5880

  4377273 GAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGAT 4377332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGAT 5940

  4377333 GCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAAT 4377392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 GCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAAT 6000

  4377393 CTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTG 4377452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTG 6060

  4377453 CTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGG 4377512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGG 6120

  4377513 ATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATACATATATCCTGCTAGTT 4377572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6121 ATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATGCATATATCCTGCTAGTT 6180

  4377573 CTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTG 4377632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 CTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTG 6240

  4377633 TGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAA 4377692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAA 6300

  4377693 GACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTAT 4377752
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     6301 GACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTAT 6360

  4377753 TAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTAC 4377804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 TAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTAC 6412

Alignment time is 5.15691 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   2182] =>      2182 nucs 'mol-32-3046-110418_2182'

Score:        2106
Aligned:      2183        nucs
Identic:      2176 (100%) nucs =>      1993 (100%)       183 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4374420,4376417] EXCISED REGION [4377645,4377829]
 second seq =>  [      1,   1997] EXCISED REGION [   1998,   2182]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [1996,1997] to [1998,1999]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4374420 GAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAA 4374479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAA 60

  4374480 AGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCA 4374539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCA 120

  4374540 AAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTC 4374599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTC 180

  4374600 CTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAG 4374659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAG 240

  4374660 GAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACA 4374719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACA 300

  4374720 TACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAA 4374779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAA 360

  4374780 TTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACAC 4374839
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACAC 420

  4374840 ACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTG 4374899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTG 480

  4374900 ACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTAC 4374959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTAC 540

  4374960 AATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTG 4375019
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||| |||||||||||||||||
      541 AATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACATTTGTG 599

  4375020 TTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCT 4375079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCT 659

  4375080 TAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTG 4375139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTG 719

  4375140 CAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAA 4375199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAA 779

  4375200 AGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGA 4375259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 AGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGA 839

  4375260 CAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAAC 4375319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAAC 899

  4375320 TTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATA 4375379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATA 959

  4375380 GTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTA 4375439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTA 1019

  4375440 TAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAG 4375499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAG 1079

  4375500 ATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAAC 4375559
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ATGTTTTCAGCTGACTGATGTTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAAC 1139

  4375560 AAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTA 4375619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTA 1199

  4375620 AGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCA 4375679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCA 1259

  4375680 TCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCT 4375739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCT 1319

  4375740 GTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAG 4375799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAG 1379

  4375800 TACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCAT 4375859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCAT 1439

  4375860 TCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTT 4375919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTT 1499

  4375920 CTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAA 4375979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAA 1559

  4375980 AAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACAT 4376039
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AAGAAAGAGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACAT 1619

  4376040 ATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGT 4376099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 ATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGT 1679

  4376100 TGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAA 4376159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAA 1739

  4376160 GTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTT 4376219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTT 1799

  4376220 CAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAA 4376279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAA 1859

  4376280 TTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGA 4376339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGA 1919

  4376340 GGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAG 4376399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAG 1979

  4376400 TTTAAAAAGTAGAATCTA 4376417
          ||||||||||||||||||
     1980 TTTAAAAAGTAGAATCTA 1997

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 2057

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2058 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 2117

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4377824
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2118 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTGTTACTTTTAGTTGG 2177

  4377825 GCAAT 4377829
          |||||
     2178 GCAAT 2182

Alignment time is 1.69083 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   6131] =>      6131 nucs 'mol-32-316f-010788_6131'

Score:        5968
Aligned:      6122        nucs
Identic:      6108 (100%) nucs =>       187 (100%)      5921 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4371625,4371811] EXCISED REGION [4371813,4377747]
 second seq =>  [      1,    187] EXCISED REGION [    189,   6121]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4371812,4371812]
 second seq =>         1 nucs [188,188]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [4373292,4373292]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4371811,4371811] to [4371812,4371812]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4371625 TAGGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCTCTCTCACTAC 4371684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCTCTCTCACTAC 60

  4371685 TCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACCACGTTACTTC 4371744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACCACGTTACTTC 120

  4371745 TCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATCCTTAGCCTGG 4371804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATCCTTAGCCTGG 180

  4371805 CTCCAGT 4371811
          |||||||
      181 CTCCAGT 187

EXCISED REGION

  4371813 GCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTTGAATA 4371872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      189 GCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTTGAATA 248

  4371873 TCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCTCAGCT 4371932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      249 TCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCTCAGCT 308

  4371933 CTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGTCAGCCCCCT 4371992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      309 CTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGTCAGCCCCCT 368

  4371993 TCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGG 4372052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      369 TCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGG 428

  4372053 ATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCT 4372112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      429 ATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCT 488

  4372113 GTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATG 4372172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      489 GTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATG 548

  4372173 AAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCC 4372232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      549 AAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCC 608

  4372233 GTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTT 4372292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      609 GTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTT 668

  4372293 TATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTG 4372352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      669 TATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTG 728

  4372353 ACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCT 4372412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      729 ACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCT 788

  4372413 AGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCC 4372472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 AGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCC 848

  4372473 AGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTC 4372532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 AGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTC 908

  4372533 CTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACCT 4372592
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 CTCTGCACAGTGACCCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACCT 968

  4372593 AAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAG 4372652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 AAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAG 1028

  4372653 GGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATA 4372712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 GGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATA 1088

  4372713 CATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGAT 4372772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 CATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGAT 1148

  4372773 AGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCAC 4372832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 AGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCAC 1208

  4372833 CTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCC 4372892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 CTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCC 1268

  4372893 AGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACC 4372952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 AGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACC 1328

  4372953 TCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAA 4373012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 TCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAA 1388

  4373013 AAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGG 4373072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 AAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGG 1448

  4373073 ATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGC 4373132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 ATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGC 1508

  4373133 TTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATA 4373192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 TTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATA 1568

  4373193 GTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCA 4373252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 GTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCA 1628

  4373253 GAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCT 4373312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     1629 GAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCT-AATCAGTAGTTTCCCATCCT 1687

  4373313 GGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTA 4373372
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1688 GCCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTCAAGAACTA 1747

  4373373 CTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATG 4373432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 CTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATG 1807

  4373433 GTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAAC 4373492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 GTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAAC 1867

  4373493 TGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATA 4373552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 TGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATA 1927

  4373553 TTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTC 4373612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 TTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTC 1987

  4373613 CTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTT 4373672
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     1988 CTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTC-T 2046

  4373673 TTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACG 4373732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 TTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACG 2106

  4373733 ATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCC 4373792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 ATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCC 2166

  4373793 GAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAG 4373852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 GAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAG 2226

  4373853 AGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCT 4373912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 AGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCT 2286

  4373913 GCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATG 4373972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 GCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATG 2346

  4373973 TAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGT 4374032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 TAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGT 2406

  4374033 TACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGCGGATACACG 4374092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2407 TACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGGGGATACACG 2466

  4374093 AAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTG 4374152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 AAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTG 2526

  4374153 CTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATT 4374212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 CTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATT 2586

  4374213 TCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGC 4374272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2587 TCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAACAATGGC 2646

  4374273 TGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAA 4374332
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 TGTTACGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAA 2706

  4374333 AGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAA 4374392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 AGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAA 2766

  4374393 ACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTT 4374452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 ACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTT 2826

  4374453 CCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCT 4374512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 CCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCT 2886

  4374513 TAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATC 4374572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 TAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATC 2946

  4374573 CCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATC 4374632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 CCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATC 3006

  4374633 AGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCC 4374692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 AGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCC 3066

  4374693 CTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATA 4374752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 CTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATA 3126

  4374753 CAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTA 4374812
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3127 CAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTA 3186

  4374813 TTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACT 4374872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 TTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACT 3246

  4374873 ATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGA 4374932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 ATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGA 3306

  4374933 AATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTT 4374992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 AATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTT 3366

  4374993 CAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATG 4375052
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3367 CACCCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTCTAAAATG 3426

  4375053 ATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACC 4375112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 ATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACC 3486

  4375113 CACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCT 4375172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 CACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCT 3546

  4375173 GACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAG 4375232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 GACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAG 3606

  4375233 TCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATC 4375292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 TCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATC 3666

  4375293 ACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACA 4375352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 ACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACA 3726

  4375353 GAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAA 4375412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 GAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAA 3786

  4375413 GGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTG 4375472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 GGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTG 3846

  4375473 CTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTT 4375532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 CTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTT 3906

  4375533 GTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAAT 4375592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 GTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAAT 3966

  4375593 GTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTT 4375652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 GTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTT 4026

  4375653 TGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCAC 4375712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 TGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCAC 4086

  4375713 ATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGA 4375772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 ATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGA 4146

  4375773 AAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTT 4375832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 AAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTT 4206

  4375833 AGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCAC 4375892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 AGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCAC 4266

  4375893 AAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTT 4375952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 AAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTT 4326

  4375953 AACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACA 4376012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4327 AACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGGGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACA 4386

  4376013 GGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATA 4376072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 GGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATA 4446

  4376073 TAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGG 4376132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 TAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGG 4506

  4376133 GTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTC 4376192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 GTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTC 4566

  4376193 CCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGT 4376252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 CCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGT 4626

  4376253 GGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCAT 4376312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 GGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCAT 4686

  4376313 TAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTT 4376372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 TAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTT 4746

  4376373 GAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTA 4376432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 GAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTA 4806

  4376433 AACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATTTATGTTTA 4376492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 AACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATTTATGTTTA 4866

  4376493 AACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTA 4376552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 AACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTA 4926

  4376553 AGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGC 4376612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 AGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGC 4986

  4376613 CAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTTTCACCCTG 4376672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 CAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTTTCACCCTG 5046

  4376673 ACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTATTAGATACT 4376732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 ACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTATTAGATACT 5106

  4376733 ATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGG 4376792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 ATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGG 5166

  4376793 CTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAG 4376852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 CTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAG 5226

  4376853 GTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATT 4376912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 GTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATT 5286

  4376913 CCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCT 4376972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 CCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCT 5346

  4376973 GAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGAC 4377032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 GAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGAC 5406

  4377033 CCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTG 4377092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 CCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTG 5466

  4377093 TCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTG 4377152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTG 5526

  4377153 AGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGTAGAGGAAGACCCATCC 4377212
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5527 AGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGGAGAGGAAGACCCATCC 5586

  4377213 TCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAA 4377272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 TCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAA 5646

  4377273 GAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGAT 4377332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 GAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGAT 5706

  4377333 GCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAAT 4377392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 GCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAAT 5766

  4377393 CTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTG 4377452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 CTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTG 5826

  4377453 CTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGG 4377512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 CTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGG 5886

  4377513 ATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATACATATATCCTGCTAGTT 4377572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5887 ATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATGCATATATCCTGCTAGTT 5946

  4377573 CTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTG 4377632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 CTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTG 6006

  4377633 TGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAA 4377692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 TGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAA 6066

  4377693 GACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTC 4377747
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 GACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTC 6121

Alignment time is 4.67777 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3795] =>      3795 nucs 'mol-32-316f-039417_3795'

Score:        3709
Aligned:      3797        nucs
Identic:      3789 (100%) nucs =>      3724 (100%)        65 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4372686,4376417] EXCISED REGION [4377645,4377709]
 second seq =>  [      1,   3730] EXCISED REGION [   3731,   3795]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [3729,3730] to [3731,3732]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4372686 TTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAAT 4372745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAAT 60

  4372746 CAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTA 4372805
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAGGGAAGATGCTATGAAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTA 120

  4372806 TTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCA 4372865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCA 180

  4372866 ATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAA 4372925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAA 240

  4372926 GGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGG 4372985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGG 300

  4372986 TACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAAT 4373045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAAT 360

  4373046 ATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCT 4373105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCT 420

  4373106 AAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTA 4373165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTA 480

  4373166 CTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGAC 4373225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGAC 540

  4373226 ATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCT 4373285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCT 600

  4373286 TCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGG 4373345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGG 660

  4373346 GAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCG 4373405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCG 720

  4373406 GATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGG 4373465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGG 780

  4373466 GGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCA 4373525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCA 840

  4373526 ATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTA 4373585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTA 900

  4373586 TCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATC 4373645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATC 960

  4373646 TAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTG 4373705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
      961 TAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTT-GAGACGGAGTCTTGCTCTTG 1019

  4373706 TCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTT 4373765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1020 TCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTT 1079

  4373766 CAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACG 4373825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACG 1139

  4373826 CCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTC 4373885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTC 1199

  4373886 TCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGT 4373945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGT 1259

  4373946 GTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTAC 4374005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTAC 1319

  4374006 TTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGT 4374065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGT 1379

  4374066 AATGGTGATGCTTTTGGCGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTT 4374125
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AATGGTGATGCTTTTGGGGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTT 1439

  4374126 TGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCT 4374185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCT 1499

  4374186 AATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGA 4374245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGA 1559

  4374246 ACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCC 4374305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCC 1619

  4374306 TGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACT 4374365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACT 1679

  4374366 GTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCA 4374425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCA 1739

  4374426 ATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCC 4374485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCC 1799

  4374486 CCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTC 4374545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTC 1859

  4374546 ACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTC 4374605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 ACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTC 1919

  4374606 TGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAG 4374665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAG 1979

  4374666 AATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATA 4374725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATA 2039

  4374726 AAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCT 4374785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCT 2099

  4374786 ACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGC 4374845
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGC 2159

  4374846 ACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACT 4374905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACT 2219

  4374906 CATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTG 4374965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTG 2279

  4374966 CAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTT 4375025
          |||||||||||||||||||||||||||||.|||||| |||||||||||||||||||||||
     2280 CAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACATTTGTGTTGTTT 2338

  4375026 CTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATG 4375085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATG 2398

  4375086 CAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAA 4375145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAA 2458

  4375146 TGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGT 4375205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGT 2518

  4375206 TTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATA 4375265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATA 2578

  4375266 TCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGC 4375325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGC 2638

  4375326 TTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATAT 4375385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATAT 2698

  4375386 ACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATAT 4375445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 ACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATAT 2758

  4375446 AAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTT 4375505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTT 2818

  4375506 TCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGA 4375565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 TCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGA 2878

  4375566 TAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGA 4375625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGA 2938

  4375626 ACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTG 4375685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTG 2998

  4375686 TCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCC 4375745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCC 3058

  4375746 AACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTG 4375805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTG 3118

  4375806 ACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAA 4375865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 ACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAA 3178

  4375866 GAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTG 4375925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTG 3238

  4375926 CCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAA 4375985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAA 3298

  4375986 GTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTG 4376045
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GAGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTG 3358

  4376046 AATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTT 4376105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 AATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTT 3418

  4376106 AGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTC 4376165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTC 3478

  4376166 AGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGG 4376225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 AGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGG 3538

  4376226 AAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATC 4376285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 AAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATC 3598

  4376286 TTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGA 4376345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGA 3658

  4376346 AGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAA 4376405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 AGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAA 3718

  4376406 AAGTAGAATCTA 4376417
          ||||||||||||
     3719 AAGTAGAATCTA 3730

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 3790

  4377705 ATTAT 4377709
          |||||
     3791 ATTAT 3795

Alignment time is 2.91073 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   6568] =>      6568 nucs 'mol-32-317a-171793_6568'

Score:        6393
Aligned:      6569        nucs
Identic:      6553 (100%) nucs =>       249 (100%)      6304 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4377306,4377554] EXCISED REGION [4377556,4383875]
 second seq =>  [      1,    249] EXCISED REGION [    251,   6568]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4377555,4377555]
 second seq =>         1 nucs [250,250]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [4379980,4379980]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [4377548,4377554] to [4377556,4377562]
 second seq =>         7 nucs [243,249] to [251,257]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4377306 GGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCA 4377365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCA 60

  4377366 GACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTC 4377425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTC 120

  4377426 TCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTC 4377485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTC 180

  4377486 CTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCT 4377545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCT 240

  4377546 TTCATATAT 4377554
          |||||||||
      241 TTCATATAT 249

EXCISED REGION

  4377556 CATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCT 4377615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      251 CATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCT 310

  4377616 TATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTG 4377675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      311 TATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTG 370

  4377676 GTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAA 4377735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      371 GTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAA 430

  4377736 TATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGC 4377795
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 TATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGC 490

  4377796 AATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTA 4377855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 AATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTA 550

  4377856 ACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATA 4377915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 ACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATA 610

  4377916 TTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCAT 4377975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 TTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCAT 670

  4377976 ACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTG 4378035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 ACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTG 730

  4378036 GTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACT 4378095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 GTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACT 790

  4378096 TTGGAGATAGTAAAGTAATATACAAATGCTAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAA 4378155
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 TTGGAGATACTAAAGTAATATACAAATGCTAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAA 850

  4378156 GCTCAATTATGAAAGTAATTTTAATGAGCATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATAT 4378215
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 GCTCAATTATAAAAGTAATTTTAATGAGCATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATAT 910

  4378216 ATAATTAATCCTCAGTCTGGGTTGCCAGGTTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTA 4378275
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 ATAATTAATCCTCAGTCTGGGTTGCCGGGTTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTA 970

  4378276 CATTTCAGTTTCAGATAAACAATGAACACTTTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAAT 4378335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 CATTTCAGTTTCAGATAAACAATGAACACTTTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAAT 1030

  4378336 TATTCAATGTTTATCAGAAATATTTCAGATACACTGAAAACATATTCACTGTTTCTCCAA 4378395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1031 TATTCAATGTTTATCAGAAATATTTCAGATACGCTGAAAACATATTCACTGTTTCTCCAA 1090

  4378396 AATATTTAAAACATGTTTTTGTTTGTTTATATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCT 4378455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 AATATTTAAAACATGTTTTTGTTTGTTTATATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCT 1150

  4378456 TTTCCTGACTCTGGGAAGAACCAGGAAGAGAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAAT 4378515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 TTTCCTGACTCTGGGAAGAACCAGGAAGAGAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAAT 1210

  4378516 GTATTTATCTGAAATTGAAATTTGACTAGGCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATC 4378575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 GTATTTATCTGAAATTGAAATTTGACTAGGCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATC 1270

  4378576 AATCCTACAAAATAGGTACAATAACTATATATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCAT 4378635
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 AATCCTACAAAATAGCTACAATAACTATATATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCAT 1330

  4378636 TTTGGTTGGTGCAATGGGAAATCACCCACTATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAA 4378695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 TTTGGTTGGTGCAATGGGAAATCACCCACTATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAA 1390

  4378696 ATCCTAAATCCAGAGGCAGAATGAGAAAGGCACATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCAT 4378755
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1391 ATCCTAAATCCAGAGGCAGAATGAGAAAGGCGCATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCAT 1450

  4378756 GTGTAGGGTAAACTTCCCTGAGAGCAATAACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTAT 4378815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 GTGTAGGGTAAACTTCCCTGAGAGCAATAACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTAT 1510

  4378816 GGCAGAAGCACCTGAATGTGTGCTCCAAGTTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGA 4378875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 GGCAGAAGCACCTGAATGTGTGCTCCAAGTTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGA 1570

  4378876 CTGATTCTTCCTCTATGAGGTACATCTGAGCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAAT 4378935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 CTGATTCTTCCTCTATGAGGTACATCTGAGCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAAT 1630

  4378936 GAAGGGGATTGAGGCCAAGTGTTTTGGGTTAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAA 4378995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 GAAGGGGATTGAGGCCAAGTGTTTTGGGTTAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAA 1690

  4378996 GGGAAGAGTGTTAAGTGAAAATGCTATATAAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGT 4379055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 GGGAAGAGTGTTAAGTGAAAATGCTATATAAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGT 1750

  4379056 TTTCTTGCCTAACCTGCAGCCTCTCGGCCGTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACT 4379115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 TTTCTTGCCTAACCTGCAGCCTCTCGGCCGTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACT 1810

  4379116 GGACTGTAGGAAGGCGGATATGTTGTCCAGCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATA 4379175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 GGACTGTAGGAAGGCGGATATGTTGTCCAGCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATA 1870

  4379176 AGGCAGTTCTCCTATCCAGCCTGTCACCACTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTA 4379235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 AGGCAGTTCTCCTATCCAGCCTGTCACCACTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTA 1930

  4379236 ATAAAACCCCATGTCTCATTTGCTGGCTATGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGT 4379295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 ATAAAACCCCATGTCTCATTTGCTGGCTATGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGT 1990

  4379296 GCCTTCCCTACTGAGGTTAATAGGGGTTTGGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAAT 4379355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 GCCTTCCCTACTGAGGTTAATAGGGGTTTGGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAAT 2050

  4379356 GTTATAATTTCTCAAACTATATTAATCCCAAATTCAAATGCTAAAGATAACAACATATTG 4379415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 GTTATAATTTCTCAAACTATATTAATCCCAAATTCAAATGCTAAAGATAACAACATATTG 2110

  4379416 CAAAGCTGACTCTAAATGCCTCTGGATTTTTCAGCCCTTTTGGAAGATTGACAACATTAG 4379475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 CAAAGCTGACTCTAAATGCCTCTGGATTTTTCAGCCCTTTTGGAAGATTGACAACATTAG 2170

  4379476 TCCCTTCTTTTAGTGCAAACTATCTAGAGATGGGAGATCAAATGTGGAAATGCTTATAAG 4379535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 TCCCTTCTTTTAGTGCAAACTATCTAGAGATGGGAGATCAAATGTGGAAATGCTTATAAG 2230

  4379536 ATGTTTTTAGTTGATGAGATTTCAGGATCTGGGAGCTAAACCTTGAGTTATTTCATTGCC 4379595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 ATGTTTTTAGTTGATGAGATTTCAGGATCTGGGAGCTAAACCTTGAGTTATTTCATTGCC 2290

  4379596 ATTGGGTGGTGGCAGTTGACTTGTTTTCTGCTGTTTCAGTGGACCTTGAAATTATCATGA 4379655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 ATTGGGTGGTGGCAGTTGACTTGTTTTCTGCTGTTTCAGTGGACCTTGAAATTATCATGA 2350

  4379656 CTATTTGCTTCACTTCAGTGTACACCATCCCGCTCCATTTGCAGTCAGCACCACTCAGGG 4379715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 CTATTTGCTTCACTTCAGTGTACACCATCCCGCTCCATTTGCAGTCAGCACCACTCAGGG 2410

  4379716 AATAAAACATATTCATTCGCAGTGTCCCTAGCAATGACAGAGGTATTTTCAAATATCTTT 4379775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 AATAAAACATATTCATTCGCAGTGTCCCTAGCAATGACAGAGGTATTTTCAAATATCTTT 2470

  4379776 TTGCTCTTGAAGAAAGGAGCTCACTTTGCTTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAAAGGACCAA 4379835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 TTGCTCTTGAAGAAAGGAGCTCACTTTGCTTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAAAGGACCAA 2530

  4379836 TATTTGACACACATCATATTATATTGCAAAGAATAGGAGTGTATGTGTGTGTATGCATCT 4379895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 TATTTGACACACATCATATTATATTGCAAAGAATAGGAGTGTATGTGTGTGTATGCATCT 2590

  4379896 GTATGTGTTTTAGCATAGACATCAAACCAAAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAGAGGCAGAC 4379955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 GTATGTGTTTTAGCATAGACATCAAACCAAAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAGAGGCAGAC 2650

  4379956 AGAGTGAAAGACCCCCAGGAGGACTTGGGTTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTAACTAGTTA 4380015
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 AGAGTGAAAGACCCCCAGGAGGAC-TGGGTTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTAACTAGTTA 2709

  4380016 TGTTACCATCCACAAGTCACCTACTCTTTCTGAGTCTCATTTTCACTATCTGTAGTGCAT 4380075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 TGTTACCATCCACAAGTCACCTACTCTTTCTGAGTCTCATTTTCACTATCTGTAGTGCAT 2769

  4380076 CAATATCTGCTCTATTCCACCGGAGCATTGTGGGACAAGGTTTCAAACCTAGAAGGCATC 4380135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 CAATATCTGCTCTATTCCACCGGAGCATTGTGGGACAAGGTTTCAAACCTAGAAGGCATC 2829

  4380136 TTGGCTGTATACAGCTAGGAGAAGGAATTATAATTGGTTCATTATTGACTCTTCCTTAAG 4380195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 TTGGCTGTATACAGCTAGGAGAAGGAATTATAATTGGTTCATTATTGACTCTTCCTTAAG 2889

  4380196 AAGTTCTAACAGAATAAATTTGCCTTCTTGCCTGCTAATTAGACATGTATTTAACTGTTT 4380255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 AAGTTCTAACAGAATAAATTTGCCTTCTTGCCTGCTAATTAGACATGTATTTAACTGTTT 2949

  4380256 CTTTTTTAAATAACTCTCTGCTGTTATTTGAAATCTTCTATTATATGTAATAAAAATCTC 4380315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 CTTTTTTAAATAACTCTCTGCTGTTATTTGAAATCTTCTATTATATGTAATAAAAATCTC 3009

  4380316 TGTCACACACACATACACAAAGATAACAATTGGCTCTAAGCAAAATGATTTCAGAAATAA 4380375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 TGTCACACACACATACACAAAGATAACAATTGGCTCTAAGCAAAATGATTTCAGAAATAA 3069

  4380376 GGGGGCAAACTTCAAATTATTACTGCCCATCAAGGAAGTCAGGTGACAACAGAGTATTGT 4380435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 GGGGGCAAACTTCAAATTATTACTGCCCATCAAGGAAGTCAGGTGACAACAGAGTATTGT 3129

  4380436 TAACAACAAAAATATTTTCAAAAGCACCAAAGAAGATAAAAATTTAAATGTCAGAGCTGA 4380495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 TAACAACAAAAATATTTTCAAAAGCACCAAAGAAGATAAAAATTTAAATGTCAGAGCTGA 3189

  4380496 AGACAAAGATTTCTATCAGTACATCTCACACTTTTGCATAATCAGAATCACATAGGAGAA 4380555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 AGACAAAGATTTCTATCAGTACATCTCACACTTTTGCATAATCAGAATCACATAGGAGAA 3249

  4380556 CTTGTTAACTATGCAGATTTCCGGGCCTCACACCAGAGATTCTGAGTCAATAGGACTGAA 4380615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 CTTGTTAACTATGCAGATTTCCGGGCCTCACACCAGAGATTCTGAGTCAATAGGACTGAA 3309

  4380616 GTTGGCCAAGAAATCTGGATATTTAGCAAGCTACCTGGCTGATTCAGAGGCAAGTAGTTC 4380675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 GTTGGCCAAGAAATCTGGATATTTAGCAAGCTACCTGGCTGATTCAGAGGCAAGTAGTTC 3369

  4380676 TTTGAGAATACTTTGAGAAACACTGGTCATTACCAATCAAATATGAACATATTGTTAAAA 4380735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 TTTGAGAATACTTTGAGAAACACTGGTCATTACCAATCAAATATGAACATATTGTTAAAA 3429

  4380736 TTTTTAAATAAAGTACGAAAGAAACTGGTAGAAAGGAGAATGTGGATTTAATTCAACATA 4380795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 TTTTTAAATAAAGTACGAAAGAAACTGGTAGAAAGGAGAATGTGGATTTAATTCAACATA 3489

  4380796 AAGTTTTGGGATGGGAGATGCAAGACCCTCCCAAGAATAGAACGAGAAGAGAAGGACTCC 4380855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 AAGTTTTGGGATGGGAGATGCAAGACCCTCCCAAGAATAGAACGAGAAGAGAAGGACTCC 3549

  4380856 CTGCAATGTCTTATCTCTCAAAATGTCTCTAAGGTGGATCCACAGGAGCTAGTTAGTGAA 4380915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 CTGCAATGTCTTATCTCTCAAAATGTCTCTAAGGTGGATCCACAGGAGCTAGTTAGTGAA 3609

  4380916 AACAATGGAGGAAAATGTACAAACCCAAGAGGAAAATAAGCCATATAAAATTAGAAGAAA 4380975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 AACAATGGAGGAAAATGTACAAACCCAAGAGGAAAATAAGCCATATAAAATTAGAAGAAA 3669

  4380976 AATGTGGGAGGACAGGCAGAAATGGCCAGAGGGTAAGTAGTCTCAGGGATGGTCAAATTG 4381035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 AATGTGGGAGGACAGGCAGAAATGGCCAGAGGGTAAGTAGTCTCAGGGATGGTCAAATTG 3729

  4381036 TTGATGGGTAAAAAGATAGGAGAAATTCAGTAGTCACTGGTCAGAGGGGAAATCTTACTC 4381095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 TTGATGGGTAAAAAGATAGGAGAAATTCAGTAGTCACTGGTCAGAGGGGAAATCTTACTC 3789

  4381096 ATCAAAAAGGAGAGGAAGAACCAAGTAAGTGAGAAAACAGTAAAAATGTGAATGACTTTA 4381155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 ATCAAAAAGGAGAGGAAGAACCAAGTAAGTGAGAAAACAGTAAAAATGTGAATGACTTTA 3849

  4381156 CATTTTTAAGAAAATGACATACAATCTTCATGGAAAATTTGGTGGTGGGGAAATAAAATG 4381215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3850 CATTTTTAAGAAAATGACATACAATCTTCATGGAAAATTTGGTGGTGGGGAAATAAAATG 3909

  4381216 AGTTCAACATGAAAATATCTTTAAAAAGTATCTTAGAGGAATTTTAGGATAGAAGATGAG 4381275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 AGTTCAACATGAAAATATCTTTAAAAAGTATCTTAGAGGAATTTTAGGATAGAAGATGAG 3969

  4381276 AAAGTACTTTGAAAAGTATAAAGAATGAATTACATGATTATTGCTTGCAGTATTTTCATG 4381335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 AAAGTACTTTGAAAAGTATAAAGAATGAATTACATGATTATTGCTTGCAGTATTTTCATG 4029

  4381336 ATTATCAAATTTTTTCACTGTCTGCCTGGCTCATAAGGTAGTTAAAGAGGGCTCTATGAC 4381395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 ATTATCAAATTTTTTCACTGTCTGCCTGGCTCATAAGGTAGTTAAAGAGGGCTCTATGAC 4089

  4381396 ATTATCTTTGGATCCCCAGAGCCTAACAGTATCTGATATATAATAAGCACCAACCGGACG 4381455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 ATTATCTTTGGATCCCCAGAGCCTAACAGTATCTGATATATAATAAGCACCAACCGGACG 4149

  4381456 GACAAATGGATGGGTAAATCAAGTTAACACAGGAAAAGATAAGAGTTGCATGGTCACATA 4381515
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4150 GACAAATGGATGGGTAAATCAAGTTAACACAGGAAAAGATAAGAGTTGCATGGCCACATA 4209

  4381516 GTACTCACAAAGCCTTACAGGTTTCATTCTCTGATTTTATGAACACAGCACTCACGCACA 4381575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 GTACTCACAAAGCCTTACAGGTTTCATTCTCTGATTTTATGAACACAGCACTCACGCACA 4269

  4381576 TTTTGGTACTAATATCTGCATGCATGAACCTCCAACTGGGGCATGCCTGTTTGTCTTCCT 4381635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 TTTTGGTACTAATATCTGCATGCATGAACCTCCAACTGGGGCATGCCTGTTTGTCTTCCT 4329

  4381636 GAAGGAAGTACTTCTTGATTCATTTTACTTGGTGCATCAGTTGTCTACCTGCTGCCCCTG 4381695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 GAAGGAAGTACTTCTTGATTCATTTTACTTGGTGCATCAGTTGTCTACCTGCTGCCCCTG 4389

  4381696 AGCTGCACTTTCACCTTATTCCATCCTGTCTGTATTGCTGGGGCTGTGGGAATCCACAAA 4381755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 AGCTGCACTTTCACCTTATTCCATCCTGTCTGTATTGCTGGGGCTGTGGGAATCCACAAA 4449

  4381756 CTCCATTTTCCAGACTCCTTTACTACCTGGCTTTCTGTTATGTCTGGCAAGAGGAAGAGC 4381815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4450 CTCCATTTTCCAGACTCCTTTACTACCTGGCTTTCTGTTATGTCTGGCAAGAGGAAGAGC 4509

  4381816 CATTATTTCTTTCTTATACTCTCTTTGTTTCTGCTGTTGGTTCTGGAAGTAGCTGTGCCC 4381875
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4510 CATTATTTCTTTCTTATACTCTCTTTGTTTCTGCTGTTGTTTCTGGAAGTAGCTGTGCCC 4569

  4381876 CTTCAGTGACCCAAGGTTCTGCTGGAACTGCCCTTAATTGGTCCCGGCTGTGGCTAGGGA 4381935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 CTTCAGTGACCCAAGGTTCTGCTGGAACTGCCCTTAATTGGTCCCGGCTGTGGCTAGGGA 4629

  4381936 GACCATCCTTGGCAGTCCCAGCACAGGCTGGGTGGAATCCCTTAAGGCCTGCTCCTGGAC 4381995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4630 GACCATCCTTGGCAGTCCCAGCACAGGCTGGGTGGAATCCCTTAAGGCCTGCTCCTGGAC 4689

  4381996 TTTGACAGCTCCTCTTCAGTTTCATTCCCCCAGTTCCTAAGGCTGGTAGCCGCTCTCTAC 4382055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4690 TTTGACAGCTCCTCTTCAGTTTCATTCCCCCAGTTCCTAAGGCTGGTAGCCGCTCTCTAC 4749

  4382056 AGATACTAATCTCGGAATGTCACCCTTTTCCCTTTTTGCTTCTTTAGCTCCCTTGCTTAT 4382115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4750 AGATACTAATCTCGGAATGTCACCCTTTTCCCTTTTTGCTTCTTTAGCTCCCTTGCTTAT 4809

  4382116 CTGTTCCAATGCCCGTAATACCAAAATCTGTAGTAAATCCCTTTTATTTGAAACATCTAG 4382175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4810 CTGTTCCAATGCCCGTAATACCAAAATCTGTAGTAAATCCCTTTTATTTGAAACATCTAG 4869

  4382176 AGTGGTTTCTGTTTTTCTGGCCAGATGCTGAATGACACATCTGGAAAAATCAGGGTAAAT 4382235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4870 AGTGGTTTCTGTTTTTCTGGCCAGATGCTGAATGACACATCTGGAAAAATCAGGGTAAAT 4929

  4382236 ATTATTACTCTAGGTATTGAAAGTACAGATTGGAGAACATTTCGTTTGTTCCAGAAGAAT 4382295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4930 ATTATTACTCTAGGTATTGAAAGTACAGATTGGAGAACATTTCGTTTGTTCCAGAAGAAT 4989

  4382296 CCTGAATGAAAACCGAAATTCAACTGGAGAGTTAGAGCATTATTGAACAGTATGTGTAGG 4382355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4990 CCTGAATGAAAACCGAAATTCAACTGGAGAGTTAGAGCATTATTGAACAGTATGTGTAGG 5049

  4382356 GAATAAAATGCCTTTCCCCCATCCTGGAATACCTCCCTGATTATACTACCTTATTACTGT 4382415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5050 GAATAAAATGCCTTTCCCCCATCCTGGAATACCTCCCTGATTATACTACCTTATTACTGT 5109

  4382416 GATTGTTTTTTAACTTCTCTGCTTTTTCACACAAATCTACAAGAATCTCCTCTTCCTGGA 4382475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5110 GATTGTTTTTTAACTTCTCTGCTTTTTCACACAAATCTACAAGAATCTCCTCTTCCTGGA 5169

  4382476 AGCCTCTCTGATTACCTCACACAAACATCATCTTGCTTAGTCTGAATTCCTATGGTTCTT 4382535
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5170 AGCCTCTCTGATTACCGCACACAAACATCATCTTGCTTAGTCTGAATTCCTATGGTTCTT 5229

  4382536 TTGTTCTCTGACTTCTAGAGTATTTCTCCAGGTATGTTAGCAATCAGTTTTTCTCTTGAT 4382595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5230 TTGTTCTCTGACTTCTAGAGTATTTCTCCAGGTATGTTAGCAATCAGTTTTTCTCTTGAT 5289

  4382596 CACTCCCCAAACCTGAGTGATCATCAGAATCCTCAGAAAAATATAGATACCAGGCCCTTC 4382655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5290 CACTCCCCAAACCTGAGTGATCATCAGAATCCTCAGAAAAATATAGATACCAGGCCCTTC 5349

  4382656 TCCTTGTCCTAACCTCCTGAGACAAAATTCTAGAGTGATGAGTGGGTACTATAGGGTCGA 4382715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5350 TCCTTGTCCTAACCTCCTGAGACAAAATTCTAGAGTGATGAGTGGGTACTATAGGGTCGA 5409

  4382716 GACAGCATCTATATATATTTTAATACCTCTCAGATGATAAACCCTTCAAGATCAGGGCCT 4382775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5410 GACAGCATCTATATATATTTTAATACCTCTCAGATGATAAACCCTTCAAGATCAGGGCCT 5469

  4382776 TTCCATTTCTCATGTAGCTTTTACTGTACCTAATACAGTTTAAGCAGACCATAAAAATCT 4382835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5470 TTCCATTTCTCATGTAGCTTTTACTGTACCTAATACAGTTTAAGCAGACCATAAAAATCT 5529

  4382836 GTTCATTTTCTAATGAATTACATGAGGGAAGATTCCCAGGAAGACCAGCTGGTGTCACTA 4382895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5530 GTTCATTTTCTAATGAATTACATGAGGGAAGATTCCCAGGAAGACCAGCTGGTGTCACTA 5589

  4382896 CTGCCTAATTAATATTTCTGGCCCAGGGAAGGGCATCTCACAAAGCAAAATTTGACCTTA 4382955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5590 CTGCCTAATTAATATTTCTGGCCCAGGGAAGGGCATCTCACAAAGCAAAATTTGACCTTA 5649

  4382956 CCTGGATTCACCGATTCTGTGCTTGAATCCATCTTCCCATCTGTCTATTTTCCTAAAAGG 4383015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5650 CCTGGATTCACCGATTCTGTGCTTGAATCCATCTTCCCATCTGTCTATTTTCCTAAAAGG 5709

  4383016 AAGTTGCAGAAACCTTGCCAAGAAAATAGACAGCAAAACTTCAGCAGTACCAATAACTTG 4383075
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5710 GAGTTGCAGAAACCTTGCCAAGAAAATAGACAGCAAAACTTCAGCAGTACCAATAACTTG 5769

  4383076 GGTTTTCTGAAAGGAAATGATGCCATGACCTGAGGCTGCCAGACTTAATGTGAGAAAGCA 4383135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5770 GGTTTTCTGAAAGGAAATGATGCCATGACCTGAGGCTGCCAGACTTAATGTGAGAAAGCA 5829

  4383136 AGAACTGAAACGAGTAGAAGTAGGCCTCCCACTGGCCCAAGGCCTAAGATTTCATTGCAC 4383195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5830 AGAACTGAAACGAGTAGAAGTAGGCCTCCCACTGGCCCAAGGCCTAAGATTTCATTGCAC 5889

  4383196 TTGCTTCTTGGCATTAACATTCTGTAGAACAAGTTTCAGAAAAAAACGCTTAACGAATTT 4383255
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5890 TTGCTTCTTGGCATTAACATTCTATAGAACAAGTTTCAGAAAAAAACGCTTAACGAATTT 5949

  4383256 GCAAGCACAACCAAACTCCAACCAGATTGCATTTTTTATTCACCTTTTACAATCTCATTC 4383315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5950 GCAAGCACAACCAAACTCCAACCAGATTGCATTTTTTATTCACCTTTTACAATCTCATTC 6009

  4383316 ATTTTCCATAACATTTGGAACTGCTGTTTGAAAGTTTAATTTTCCTTTTTATCTACTATT 4383375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6010 ATTTTCCATAACATTTGGAACTGCTGTTTGAAAGTTTAATTTTCCTTTTTATCTACTATT 6069

  4383376 TTCTTATTATTGACTTAAATTATTCTTGATTCATGGATAAGCAAACTAATGTGGGTCTAC 4383435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6070 TTCTTATTATTGACTTAAATTATTCTTGATTCATGGATAAGCAAACTAATGTGGGTCTAC 6129

  4383436 CCTGAGTCATTTATTATGTATCAAAGATAACATAGAACTCTTCACTTCTGGCAGAAGCTG 4383495
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6130 CCTGAGTCATTTATTATGTATCGAAGATAACATAGAACTCTTCACTTCTGGCAGAAGCTG 6189

  4383496 TTTAGTAATTACTTCTAATTACTAACAAATTAAGAACAGCATGTGCTCCAAAAGCAGTTT 4383555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6190 TTTAGTAATTACTTCTAATTACTAACAAATTAAGAACAGCATGTGCTCCAAAAGCAGTTT 6249

  4383556 CTATACAAGCTCAAACCTGGCTATATTTCAACACTTCTAAATTCTAATTCTCTGGATGCA 4383615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6250 CTATACAAGCTCAAACCTGGCTATATTTCAACACTTCTAAATTCTAATTCTCTGGATGCA 6309

  4383616 GAAAAAAATCTATTAAGATGGTTAAAAGGAAATAAAATCTAGATGTATAAGTCCAAAAGA 4383675
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6310 G-AAAAAATCTATTAAGATGGTTAAAAGGAAATAAAATCTAGATGTATAAGTCCAAAAGA 6368

  4383676 AGTCTCCAAAAGTCCCCTATAACCTTTCTTAGGTAATATGACTTGATCATCTCCATTTGA 4383735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6369 AGTCTCCAAAAGTCCCCTATAACCTTTCTTAGGTAATATGACTTGATCATCTCCATTTGA 6428

  4383736 ACATTTACTTCCAGAAAAGTAGATTTTTGGGATAATCAGCCTCTTTGTGTTGATTGACCA 4383795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6429 ACATTTACTTCCAGAAAAGTAGATTTTTGGGATAATCAGCCTCTTTGTGTTGATTGACCA 6488

  4383796 CAAACTTCTATGTTCAGAAGTTTACATTTTAATTAAGAGGGAGGTATTGAATGGTAACTG 4383855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     6489 CAAACTTCTATGTTCAGAAGTTTACATTTTAATTAAGAGGGAGGTACTGAATGGTAACTG 6548

  4383856 GATCTCCAGTAGTTGAAATG 4383875
          ||||||||||||||||||||
     6549 GATCTCCAGTAGTTGAAATG 6568

Alignment time is 4.98672 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   4807] =>      4807 nucs 'mol-32-3190-168174_4807'

Score:        4665
Aligned:      4810        nucs
Identic:      4796 (100%) nucs =>      4682 (100%)       114 ( 99%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4371723,4376417] EXCISED REGION [4377645,4377759]
 second seq =>  [      1,   4692] EXCISED REGION [   4693,   4807]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [4691,4692] to [4693,4694]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4371723 AGAAATTACACCACGTTACTTCTCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAAT 4371782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAAATTACACCACGTTACTTCTCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAAT 60

  4371783 GAATTTAAAATCCTTAGCCTGGCTCCAGTTGCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAG 4371842
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAATTTAAAATCCTTAGCCTGGCTCCAGTCGCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAG 120

  4371843 ATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTTGAATATCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACT 4371902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTTGAATATCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACT 180

  4371903 GTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCTCAGCTCTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCA 4371962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCTCAGCTCTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCA 240

  4371963 TAATTGCACCTGGGTTTTTGTCAGCCCCCTTCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGT 4372022
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAATGCACCTGGGTTTTTGTCAGCCCCCTTCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGT 300

  4372023 CTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGT 4372082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGT 360

  4372083 AACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAG 4372142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAG 420

  4372143 GAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATGAAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGT 4372202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      421 GAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATGAAGAAAGAGAGAGTGCTAGTTTCATCATGT 480

  4372203 ATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTG 4372262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTG 540

  4372263 CTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTG 4372322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTG 600

  4372323 ATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGG 4372382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGG 660

  4372383 TACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAG 4372442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAG 720

  4372443 CATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTAT 4372502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTAT 780

  4372503 CTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAA 4372562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAA 840

  4372563 AAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAAT 4372622
          |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAAAAAA--TCACACAGCGCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAAT 898

  4372623 TTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGT 4372682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 TTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGT 958

  4372683 GGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAG 4372742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 GGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAG 1018

  4372743 AATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTG 4372802
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 AATCAAGGGAAGATGCTATGAAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTG 1078

  4372803 CTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAA 4372862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAA 1138

  4372863 GCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAA 4372922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 GCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAA 1198

  4372923 CAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGT 4372982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGT 1258

  4372983 AGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGG 4373042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 AGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGG 1318

  4373043 AATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTT 4373102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 AATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTT 1378

  4373103 CCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGC 4373162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 CCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGC 1438

  4373163 TTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCA 4373222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCA 1498

  4373223 GACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCC 4373282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCC 1558

  4373283 CCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAAT 4373342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAAT 1618

  4373343 TGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGAT 4373402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGAT 1678

  4373403 GCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCAT 4373462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 GCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCAT 1738

  4373463 TGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCAC 4373522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCAC 1798

  4373523 TCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAG 4373582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAG 1858

  4373583 TTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTT 4373642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTT 1918

  4373643 ATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTC 4373702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTC 1978

  4373703 TTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGG 4373762
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1979 TTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGG 2038

  4373763 GTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACC 4373822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACC 2098

  4373823 ACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTG 4373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 ACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTG 2158

  4373883 GTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACA 4373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACA 2218

  4373943 GGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATT 4374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATT 2278

  4374003 TACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATA 4374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATA 2338

  4374063 GGTAATGGTGATGCTTTTGGCGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAA 4374122
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GGTAATGGTGATGCTTTTGGGGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAA 2398

  4374123 TTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCT 4374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCT 2458

  4374183 TCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATT 4374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATT 2518

  4374243 AGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACT 4374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACT 2578

  4374303 CCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTG 4374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTG 2638

  4374363 ACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAA 4374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 ACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAA 2698

  4374423 CCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGA 4374482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 CCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGA 2758

  4374483 GCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAG 4374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAG 2818

  4374543 CTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTC 4374602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTC 2878

  4374603 CTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAA 4374662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAA 2938

  4374663 GAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATAC 4374722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATAC 2998

  4374723 ATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTA 4374782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 ATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTA 3058

  4374783 GCTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACA 4374842
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 GCTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACA 3118

  4374843 TGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACA 4374902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACA 3178

  4374903 ACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAAT 4374962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 ACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAAT 3238

  4374963 TTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTG 4375022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||| ||||||||||||||||||||
     3239 TTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACATTTGTGTTG 3297

  4375023 TTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAA 4375082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAA 3357

  4375083 ATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAA 4375142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 ATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAA 3417

  4375143 AAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGA 4375202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 AAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGA 3477

  4375203 GGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAA 4375262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 GGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAA 3537

  4375263 ATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTT 4375322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 ATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTT 3597

  4375323 GGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTA 4375382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 GGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTA 3657

  4375383 TATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAA 4375442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 TATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAA 3717

  4375443 TATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATG 4375502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATG 3777

  4375503 TTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAA 4375562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAA 3837

  4375563 AGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGT 4375622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 AGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGT 3897

  4375623 AGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCA 4375682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 AGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCA 3957

  4375683 TTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTT 4375742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 TTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTT 4017

  4375743 GCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTAC 4375802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 GCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTAC 4077

  4375803 TTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCC 4375862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCC 4137

  4375863 TAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTA 4375922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTA 4197

  4375923 GTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAG 4375982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 GTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAG 4257

  4375983 AAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATG 4376042
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 AAAGAGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATG 4317

  4376043 CTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGG 4376102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 CTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGG 4377

  4376103 GTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTT 4376162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 GTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTT 4437

  4376163 CTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAG 4376222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAG 4497

  4376223 GGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTC 4376282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 GGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTC 4557

  4376283 ATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGC 4376342
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 ATCTTTTCAGGTGTCAAGAGTTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGC 4617

  4376343 TGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTT 4376402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTT 4677

  4376403 AAAAAGTAGAATCTA 4376417
          |||||||||||||||
     4678 AAAAAGTAGAATCTA 4692

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4693 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4752

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAA 4377759
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4753 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAA 4807

Alignment time is 3.69213 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   5229] =>      5229 nucs 'mol-32-322a-023641_5229'

Score:        5065
Aligned:      5234        nucs
Identic:      5217 (100%) nucs =>      4749 (100%)       468 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4371654,4376417] EXCISED REGION [4377645,4378114]
 second seq =>  [      1,   4759] EXCISED REGION [   4760,   5229]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [4758,4759] to [4760,4761]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4371654 CCTCTGCCCCCTGCCTCATCTCTCTCACTACTCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCT 4371713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCTGCCCCCTGCCTCATCTCTCTCACTACTCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCT 60

  4371714 TTGCAAAACAGAAATTACACCACGTTACTTCTCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTC 4371773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGCAAAACAGAAATTACACCACGTTACTTCTCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTC 120

  4371774 CTACAAAATGAATTTAAAATCCTTAGCCTGGCTCCAGTTGCCCTGAAGATCTGAACTTTT 4371833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      121 CTACAAAATGAATTTAAAATCCTTAGCCTGGCTCCAGTCGCCCTGAAGATCTGAACTTTT 180

  4371834 GCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTTGAATATCACACAATAAACGCATCCAG 4371893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTTGAATATCACACAATAAACGCATCCAG 240

  4371894 AATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCTCAGCTCTGCCTGTCTGCTCACCCCTT 4371953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCTCAGCTCTGCCTGTCTGCTCACCCCTT 300

  4371954 CTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGTCAGCCCCCTTCTGGTCCAGCCTCCATGAAT 4372013
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTGGCCATAAATGCACCTGGGTTTTTGTCAGCCCCCTTCTGGTCCAGCCTCCATGAAT 360

  4372014 AGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATA 4372073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATA 420

  4372074 TGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTC 4372133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTC 480

  4372134 CTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATGAAGAAAGAGAGAGTGCCAGTT 4372193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      481 CTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATGAAGAAAGAGAGAGTGCTAGTT 540

  4372194 TCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTT 4372253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTT 600

  4372254 AATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTAT 4372313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTAT 660

  4372314 TAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGAT 4372373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGAT 720

  4372374 CTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTT 4372433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTT 780

  4372434 GCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCAC 4372493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCAC 840

  4372494 CTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAA 4372553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAA 900

  4372554 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTT 4372613
          |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAAAAAAAAAAAAAAA---TCACACAGCGCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTT 957

  4372614 GCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGA 4372673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 GCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGA 1017

  4372674 AAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCC 4372733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCC 1077

  4372734 TAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGG 4372793
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 TAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATGAAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGG 1137

  4372794 AATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTA 4372853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 AATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTA 1197

  4372854 TTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACT 4372913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACT 1257

  4372914 TCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATT 4372973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATT 1317

  4372974 GGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAAC 4373033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 GGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAAC 1377

  4373034 ACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCT 4373093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 ACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCT 1437

  4373094 TCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCA 4373153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCA 1497

  4373154 AAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATG 4373213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 AAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATG 1557

  4373214 CCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCT 4373273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCT 1617

  4373274 TCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCT 4373333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCT 1677

  4373334 GGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTA 4373393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 GGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTA 1737

  4373394 GTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCAC 4373453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCAC 1797

  4373454 ATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTC 4373513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 ATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTC 1857

  4373514 TGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCC 4373573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCC 1917

  4373574 CTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGA 4373633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 CTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGA 1977

  4373634 GTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGA 4373693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     1978 GTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTT-GAGACGGA 2036

  4373694 GTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCC 4373753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2037 GTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCATGCAACCTCC 2096

  4373754 ACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATG 4373813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 ACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATG 2156

  4373814 CGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTG 4373873
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 CGCACAACCACGCCCAGTGAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTG 2216

  4373874 GCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCT 4373933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 GCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCT 2276

  4373934 GGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTAT 4373993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 GGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTAT 2336

  4373994 TGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACG 4374053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACG 2396

  4374054 AATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGCGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCC 4374113
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 AATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGGGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCC 2456

  4374114 TCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTG 4374173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTG 2516

  4374174 ATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACA 4374233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 ATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACA 2576

  4374234 AAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTA 4374293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 AAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTA 2636

  4374294 TATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGG 4374353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 TATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGG 2696

  4374354 ATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATT 4374413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 ATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATT 2756

  4374414 TCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTC 4374473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTC 2816

  4374474 TCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTC 4374533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTC 2876

  4374534 CAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCC 4374593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 CAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCC 2936

  4374594 CCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCAC 4374653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 CCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCAC 2996

  4374654 CAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATG 4374713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 CAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATG 3056

  4374714 ATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAA 4374773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 ATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAA 3116

  4374774 AGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCAT 4374833
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3117 AGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCAT 3176

  4374834 CAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTC 4374893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 CAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTC 3236

  4374894 CACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCT 4374953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 CACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCT 3296

  4374954 ATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACA 4375013
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||| |||||||||||
     3297 ATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACA 3355

  4375014 TTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCT 4375073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 TTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCT 3415

  4375074 TGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCC 4375133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 TGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCC 3475

  4375134 ACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCG 4375193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 ACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCG 3535

  4375194 TTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCA 4375253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 TTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCA 3595

  4375254 GAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAA 4375313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 GAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAA 3655

  4375314 CAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAA 4375373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 CAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAA 3715

  4375374 ATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACT 4375433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 ATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACT 3775

  4375434 GTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTT 4375493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 GTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTT 3835

  4375494 CTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTG 4375553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 CTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTG 3895

  4375554 GCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAA 4375613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 GCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAA 3955

  4375614 CAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACA 4375673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 CAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACA 4015

  4375674 TGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTA 4375733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 TGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTA 4075

  4375734 TTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAA 4375793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 TTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAA 4135

  4375794 CACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTA 4375853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 CACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTA 4195

  4375854 AGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAAC 4375913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 AGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAAC 4255

  4375914 CAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCAT 4375973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 CAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCAT 4315

  4375974 CTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATG 4376033
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 CTGTAAAAGAAAGAGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATG 4375

  4376034 AGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAG 4376093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 AGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAG 4435

  4376094 AACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCC 4376153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 AACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCC 4495

  4376154 TTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGT 4376213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 TTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGT 4555

  4376214 TCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAA 4376273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 TCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAA 4615

  4376274 AACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGAT 4376333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 AACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGAT 4675

  4376334 TTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATT 4376393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 TTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATT 4735

  4376394 ATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 4376417
          ||||||||||||||||||||||||
     4736 ATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 4759

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4819

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4820 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 4879

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4377824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4939

  4377825 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4377884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4999

  4377885 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 4377944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5000 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 5059

  4377945 AAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 4378004
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5060 AAAAGTACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 5119

  4378005 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAA 4378064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5120 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAA 5179

  4378065 AGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTAAT 4378114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5180 AGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTAAT 5229

Alignment time is 4.57477 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   3093] =>      3093 nucs 'mol-32-3240-171506_3093'

Score:        3026
Aligned:      3092        nucs
Identic:      3086 (100%) nucs =>       880 (100%)      2206 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4375107,4375986] EXCISED REGION [4375988,4378199]
 second seq =>  [      1,    880] EXCISED REGION [    882,   3093]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4375987,4375987]
 second seq =>         1 nucs [881,881]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [880,881] to [881,882]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4375986,4375986] to [4375988,4375988]
 second seq =>         1 nucs [880,880] to [882,882]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4375107 AGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGG 4375166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGG 60

  4375167 AGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACA 4375226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACA 120

  4375227 ATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAG 4375286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAG 180

  4375287 GAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTG 4375346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTG 240

  4375347 GGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTT 4375406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTT 300

  4375407 AATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTG 4375466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTG 360

  4375467 TTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTC 4375526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTC 420

  4375527 TAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTT 4375586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTT 480

  4375587 TATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGG 4375646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGG 540

  4375647 AATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATAT 4375706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATAT 600

  4375707 GTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGA 4375766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGA 660

  4375767 GTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGA 4375826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGA 720

  4375827 GTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAA 4375886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAA 780

  4375887 GATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGC 4375946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGC 840

  4375947 TCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAG 4375986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAG 880

EXCISED REGION

  4375988 GAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAA 4376047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 GAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAA 941

  4376048 TTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAG 4376107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 TTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAG 1001

  4376108 CAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAG 4376167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 CAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAG 1061

  4376168 GCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAA 4376227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 GCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAA 1121

  4376228 GATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTT 4376287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 GATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTT 1181

  4376288 TTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAG 4376347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 TTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAG 1241

  4376348 ATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAA 4376407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 ATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAA 1301

  4376408 GTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAG 4376467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 GTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAG 1361

  4376468 ACTGACATATTTCTATTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAA 4376527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 ACTGACATATTTCTATTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAA 1421

  4376528 AAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTA 4376587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 AAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTA 1481

  4376588 GGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAA 4376647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 GGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAA 1541

  4376648 GAAGAAATATAACTTTTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATA 4376707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 GAAGAAATATAACTTTTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATA 1601

  4376708 AATATAACAAAAACTATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTA 4376767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 AATATAACAAAAACTATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTA 1661

  4376768 ATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAG 4376827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 ATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAG 1721

  4376828 TATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAAT 4376887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 TATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAAT 1781

  4376888 GCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGG 4376947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 GCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGG 1841

  4376948 ATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCA 4377007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 ATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCA 1901

  4377008 ATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAG 4377067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 ATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAG 1961

  4377068 GGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAA 4377127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 GGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAA 2021

  4377128 AGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAG 4377187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 AGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAG 2081

  4377188 AGGACTGGTAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAG 4377247
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 AGGACTGGGAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAG 2141

  4377248 CGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGG 4377307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 CGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGG 2201

  4377308 CTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGA 4377367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 CTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGA 2261

  4377368 CTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTC 4377427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 CTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTC 2321

  4377428 AGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCT 4377487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 AGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCT 2381

  4377488 CAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTT 4377547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 CAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTT 2441

  4377548 CATATATACATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAA 4377607
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 CATATATGCATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAA 2501

  4377608 TGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAA 4377667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 TGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAA 2561

  4377668 TATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGAT 4377727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 TATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGAT 2621

  4377728 GCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTT 4377787
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 GCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTT 2681

  4377788 GTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGT 4377847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 GTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGT 2741

  4377848 GATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATT 4377907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 GATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATT 2801

  4377908 TAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTG 4377967
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 TAATAATGTTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTG 2861

  4377968 TAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCC 4378027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 TAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCC 2921

  4378028 TTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATG 4378087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 TTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATG 2981

  4378088 AGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTAATATACAAATGCTAATTATTACCACTTATGAGGGT 4378147
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 AGAAGACTTTGGAGATACTAAAGTAATATACAAATGCTAATTATTACCACTTATGAGGGT 3041

  4378148 GTGTAGAAGCTCAATTATGAAAGTAATTTTAATGAGCATTTACTATGTGCCA 4378199
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 GTGTAGAAGCTCAATTATAAAAGTAATTTTAATGAGCATTTACTATGTGCCA 3093

Alignment time is 2.37823 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   5343] =>      5343 nucs 'mol-32-3311-279465_5343'

Score:        5212
Aligned:      5346        nucs
Identic:      5333 (100%) nucs =>      5031 (100%)       302 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4371375,4376417] EXCISED REGION [4377645,4377947]
 second seq =>  [      1,   5040] EXCISED REGION [   5041,   5343]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [5039,5040] to [5041,5042]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4371375 TCAGTCGTCCTAAGCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAACT 4371434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCAGTCGTCCTAAGCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAACT 60

  4371435 TCTGTATGTGGCCTGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTCA 4371494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTGTATGTGGCCTGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTCA 120

  4371495 CAAATCCTGGCCCAGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGGG 4371554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAATCCTGGCCCAGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGGG 180

  4371555 GACACCCTACCACCCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGAT 4371614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACACCCTACCACCCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGAT 240

  4371615 CCACTAGGTATAGGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCT 4371674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCACTAGGTATAGGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCT 300

  4371675 CTCTCACTACTCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACC 4371734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTCACTACTCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACC 360

  4371735 ACGTTACTTCTCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATC 4371794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACGTTACTTCTCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATC 420

  4371795 CTTAGCCTGGCTCCAGTTGCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACT 4371854
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTAGCCTGGCTCCAGTCGCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACT 480

  4371855 TCTTAGTTCTTTTGAATATCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCAC 4371914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTTAGTTCTTTTGAATATCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCAC 540

  4371915 CTACTTCGATGCTCAGCTCTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTG 4371974
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      541 CTACTTCGATGCTCAGCTCTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAAATGCACCTG 600

  4371975 GGTTTTTGTCAGCCCCCTTCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGC 4372034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTTTTTGTCAGCCCCCTTCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGC 660

  4372035 CCCCTCCTCTCCTGTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGA 4372094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCCTCCTCTCCTGTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGA 720

  4372095 ACCAGTTCTGCTTATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTC 4372154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCAGTTCTGCTTATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTC 780

  4372155 TAGAAAGAATTCCAGATGAAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCG 4372214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      781 TAGAAAGAATTCCAGATGAAGAAAGAGAGAGTGCTAGTTTCATCATGTATGTACCACCCG 840

  4372215 TGCAGTTGCCAGGACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCT 4372274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCAGTTGCCAGGACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCT 900

  4372275 TGAAACTTTTAATAACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCT 4372334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAAACTTTTAATAACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCT 960

  4372335 GTATTTGATGGTGCTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCC 4372394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTATTTGATGGTGCTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCC 1020

  4372395 CATGGTTAGCTAATTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAAC 4372454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATGGTTAGCTAATTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAAC 1080

  4372455 ATGCAAACCAACCAGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACA 4372514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGCAAACCAACCAGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACA 1140

  4372515 CTTCAGGAGGCAATACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 4372574
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
     1141 CTTCAGGAGGCAATACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAA--T 1198

  4372575 CACACAGCGCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCT 4372634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CACACAGCGCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCT 1258

  4372635 AAATTTAACTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGA 4372694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 AAATTTAACTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGA 1318

  4372695 CCCAGATCTGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAG 4372754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 CCCAGATCTGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAG 1378

  4372755 ATGCTATAAAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTA 4372814
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 ATGCTATGAAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTA 1438

  4372815 TTTCACCTACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGG 4372874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TTTCACCTACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGG 1498

  4372875 ACTCCACCATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGG 4372934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 ACTCCACCATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGG 1558

  4372935 CTGATATTTCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACA 4372994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CTGATATTTCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACA 1618

  4372995 GAAGTTTGCAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGG 4373054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 GAAGTTTGCAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGG 1678

  4373055 CCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAA 4373114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAA 1738

  4373115 GCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAA 4373174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAA 1798

  4373175 AACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGAT 4373234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGAT 1858

  4373235 CACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAA 4373294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAA 1918

  4373295 TCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCA 4373354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCA 1978

  4373355 AGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGG 4373414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGG 2038

  4373415 TTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAAC 4373474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAAC 2098

  4373475 TGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACC 4373534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACC 2158

  4373535 AATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGG 4373594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGG 2218

  4373595 GAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAA 4373654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAA 2278

  4373655 ACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGG 4373714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 ACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGG 2338

  4373715 CTGTAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATT 4373774
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CTGTAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATT 2398

  4373775 CTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAA 4373834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAA 2458

  4373835 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCC 4373894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCC 2518

  4373895 TGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCAC 4373954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCAC 2578

  4373955 CGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACAT 4374014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACAT 2638

  4374015 GGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGAT 4374074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGAT 2698

  4374075 GCTTTTGGCGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGA 4374134
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GCTTTTGGGGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGA 2758

  4374135 AGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATG 4374194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATG 2818

  4374195 CCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCC 4374254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCC 2878

  4374255 CTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATC 4374314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATC 2938

  4374315 TATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGG 4374374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGG 2998

  4374375 GCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGT 4374434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 GCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGT 3058

  4374435 CTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACA 4374494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACA 3118

  4374495 GGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGC 4374554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGC 3178

  4374555 GGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTT 4374614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTT 3238

  4374615 CCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACC 4374674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACC 3298

  4374675 TAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCT 4374734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCT 3358

  4374735 TATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGA 4374794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGA 3418

  4374795 GAGAACCACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTG 4374854
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 GAGAACCACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTG 3478

  4374855 CACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAG 4374914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAG 3538

  4374915 CATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTT 4374974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTT 3598

  4374975 GCCGCTAGATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTT 4375034
          ||||||||||||||||||||.|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 GCCGCTAGATGATTATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTT 3657

  4375035 CACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTA 4375094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 CACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTA 3717

  4375095 TCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGG 4375154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGG 3777

  4375155 AATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGA 4375214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 AATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGA 3837

  4375215 AGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCA 4375274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 AGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCA 3897

  4375275 GTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAG 4375334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 GTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAG 3957

  4375335 GTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTC 4375394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 GTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTC 4017

  4375395 CTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAG 4375454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 CTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAG 4077

  4375455 GTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGAC 4375514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 GTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGAC 4137

  4375515 TGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACA 4375574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACA 4197

  4375575 GACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGT 4375634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 GACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGT 4257

  4375635 CCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGC 4375694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 CCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGC 4317

  4375695 TTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAA 4375754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 TTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAA 4377

  4375755 CAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAAC 4375814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 CAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAAC 4437

  4375815 ATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTG 4375874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 ATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTG 4497

  4375875 GAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACA 4375934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 GAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACA 4557

  4375935 CGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCC 4375994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4558 CGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGAGAGTCCC 4617

  4375995 TGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCT 4376054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCT 4677

  4376055 GAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTG 4376114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 GAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTG 4737

  4376115 GATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGAC 4376174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 GATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGAC 4797

  4376175 TCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTA 4376234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTA 4857

  4376235 GGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGT 4376294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 GGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGT 4917

  4376295 GTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTT 4376354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 GTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTT 4977

  4376355 TTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAAT 4376414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 TTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAAT 5037

  4376415 CTA 4376417
          |||
     5038 CTA 5040

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 5100

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5101 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 5160

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4377824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 5220

  4377825 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4377884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 5280

  4377885 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 4377944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 5340

  4377945 AAA 4377947
          |||
     5341 AAA 5343

Alignment time is 4.39521 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   4690] =>      4690 nucs 'mol-32-3327-054194_4690'

Score:        4559
Aligned:      4693        nucs
Identic:      4680 (100%) nucs =>      4300 (100%)       380 ( 99%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4372108,4376417] EXCISED REGION [4377645,4378027]
 second seq =>  [      1,   4307] EXCISED REGION [   4308,   4690]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [4306,4307] to [4308,4309]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4372108 ATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCC 4372167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCC 60

  4372168 AGATGAAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGG 4372227
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGATGAAGAAAGAGAGAGTGCTAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGG 120

  4372228 ACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAAT 4372287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAAT 180

  4372288 AACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTG 4372347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTG 240

  4372348 CTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAA 4372407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAA 300

  4372408 TTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACC 4372467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACC 360

  4372468 AGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAA 4372527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAA 420

  4372528 TACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTG 4372587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||
      421 TACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAA--TCACACAGCGCGTG 478

  4372588 CACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAAT 4372647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 CACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAAT 538

  4372648 CTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTT 4372707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTT 598

  4372708 AAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTT 4372767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      599 AAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATGAAGTT 658

  4372768 ATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTT 4372827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 ATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTT 718

  4372828 CTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCT 4372887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCT 778

  4372888 TCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTAT 4372947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 TCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTAT 838

  4372948 CTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAA 4373007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAA 898

  4373008 AGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAAC 4373067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 AGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAAC 958

  4373068 TAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATA 4373127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 TAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATA 1018

  4373128 CGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCC 4373187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 CGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCC 1078

  4373188 TGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTA 4373247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 TGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTA 1138

  4373248 AGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCC 4373307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 AGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCC 1198

  4373308 ATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAG 4373367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 ATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAG 1258

  4373368 AACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCC 4373427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 AACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCC 1318

  4373428 ACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGA 4373487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 ACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGA 1378

  4373488 AAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTG 4373547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 AAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTG 1438

  4373548 AAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAAT 4373607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 AAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAAT 1498

  4373608 ACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTT 4373667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 ACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTT 1558

  4373668 TTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATG 4373727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATG 1618

  4373728 GCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGT 4373787
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 GCACGATCTCAGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGT 1678

  4373788 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTT 4373847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTT 1738

  4373848 AGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATC 4373907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATC 1798

  4373908 TGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGA 4373967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGA 1858

  4373968 AAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTA 4374027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 AAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTA 1918

  4374028 ACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGCGGAT 4374087
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1919 ACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGGGGAT 1978

  4374088 ACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGG 4374147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 ACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGG 2038

  4374148 ACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAG 4374207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 ACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAG 2098

  4374208 GTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCA 4374267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCA 2158

  4374268 ATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAG 4374327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 ATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAG 2218

  4374328 GAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATC 4374387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATC 2278

  4374388 TTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAG 4374447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAG 2338

  4374448 GATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAA 4374507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAA 2398

  4374508 GCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTC 4374567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTC 2458

  4374568 ACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGT 4374627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 ACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGT 2518

  4374628 CAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCA 4374687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 CAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCA 2578

  4374688 AAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAAT 4374747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAAT 2638

  4374748 GTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTC 4374807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2639 GTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTC 2698

  4374808 ACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAAT 4374867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 ACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAAT 2758

  4374868 ATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGT 4374927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 ATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGT 2818

  4374928 GGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGAT 4374987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGAT 2878

  4374988 TATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATA 4375047
          |||||||.|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATA 2937

  4375048 AAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACA 4375107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 AAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACA 2997

  4375108 GAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGA 4375167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 GAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGA 3057

  4375168 GTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAA 4375227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 GTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAA 3117

  4375228 TCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGG 4375287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 TCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGG 3177

  4375288 AGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGG 4375347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGG 3237

  4375348 GTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTA 4375407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTA 3297

  4375408 ATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGT 4375467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 ATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGT 3357

  4375468 TTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCT 4375527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCT 3417

  4375528 AGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTT 4375587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 AGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTT 3477

  4375588 ATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGA 4375647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 ATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGA 3537

  4375648 ATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATG 4375707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 ATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATG 3597

  4375708 TGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAG 4375767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAG 3657

  4375768 TGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAG 4375827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 TGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAG 3717

  4375828 TCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAG 4375887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAG 3777

  4375888 ATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCT 4375947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 ATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCT 3837

  4375948 CACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCT 4376007
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3838 CACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGAGAGTCCCTGAGCTGTGAGCT 3897

  4376008 TCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACA 4376067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 TCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACA 3957

  4376068 AAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAG 4376127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 AAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAG 4017

  4376128 TTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGA 4376187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 TTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGA 4077

  4376188 TTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGG 4376247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGG 4137

  4376248 TTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAA 4376307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAA 4197

  4376308 AGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAG 4376367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 AGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAG 4257

  4376368 CCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 4376417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 CCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 4307

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4308 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACACGACACTAATAAT 4367

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4368 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 4427

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4377824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4487

  4377825 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4377884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4547

  4377885 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 4377944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4548 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 4607

  4377945 AAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 4378004
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4608 AAAAGTACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 4667

  4378005 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCC 4378027
          |||||||||||||||||||||||
     4668 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCC 4690

Alignment time is 3.65847 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   2511] =>      2511 nucs 'mol-32-3332-007492_2511'

Score:        2422
Aligned:      2510        nucs
Identic:      2502 (100%) nucs =>       134 (100%)      2368 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4373901,4374034] EXCISED REGION [4374036,4376411]
 second seq =>  [      1,    134] EXCISED REGION [    136,   2511]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4374035,4374035]
 second seq =>         1 nucs [135,135]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4374034,4374034] to [4374036,4374036]
 second seq =>         1 nucs [134,134] to [136,136]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4373901 CGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCC 4373960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCC 60

  4373961 TGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCAC 4374020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCAC 120

  4374021 CTTTTTAACAGTTA 4374034
          ||||||||||||||
      121 CTTTTTAACAGTTA 134

EXCISED REGION

  4374036 ATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGCGGATACACGAAA 4374095
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      136 ATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGGGGATACACGAAA 195

  4374096 TCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTT 4374155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      196 TCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTT 255

  4374156 GTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCT 4374215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      256 GTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCT 315

  4374216 CCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGT 4374275
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      316 CCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAACAATGGCTGT 375

  4374276 TATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGA 4374335
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      376 TACGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGA 435

  4374336 TGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACT 4374395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 TGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACT 495

  4374396 TCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCA 4374455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 TCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCA 555

  4374456 ACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAA 4374515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 ACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAA 615

  4374516 GATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCT 4374575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 GATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCT 675

  4374576 TTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGG 4374635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 TTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGG 735

  4374636 GCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTC 4374695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 GCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTC 795

  4374696 TCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAA 4374755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 TCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAA 855

  4374756 GACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTATTT 4374815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      856 GACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTATTT 915

  4374816 ATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATT 4374875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 ATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATT 975

  4374876 TTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAAT 4374935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 TTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAAT 1035

  4374936 ATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCAA 4374995
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1036 ATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCAC 1095

  4374996 CCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATG 4375055
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1096 CCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTCTAAAATGATG 1155

  4375056 CTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCAC 4375115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 CTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCAC 1215

  4375116 TGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGAC 4375175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 TGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGAC 1275

  4375176 CTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCT 4375235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 CTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCT 1335

  4375236 AATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACA 4375295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 AATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACA 1395

  4375296 AAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAG 4375355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 AAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAG 1455

  4375356 AGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGA 4375415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 AGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGA 1515

  4375416 TGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTA 4375475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 TGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTA 1575

  4375476 CATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTG 4375535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 CATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTG 1635

  4375536 CAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTG 4375595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 CAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTG 1695

  4375596 TAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGC 4375655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 TAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGC 1755

  4375656 TTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATA 4375715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 TTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATA 1815

  4375716 AAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAG 4375775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 AAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAG 1875

  4375776 TTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGC 4375835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 TTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGC 1935

  4375836 TCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAG 4375895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 TCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAG 1995

  4375896 AGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAAC 4375955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 AGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAAC 2055

  4375956 TTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGA 4376015
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2056 TTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGGGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGA 2115

  4376016 ATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAA 4376075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 ATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAA 2175

  4376076 AGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTG 4376135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 AGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTG 2235

  4376136 GGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCT 4376195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 GGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCT 2295

  4376196 GAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGG 4376255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 GAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGG 2355

  4376256 GAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAG 4376315
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 GAAAACTTACGAAGGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAG 2415

  4376316 GAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAA 4376375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 GAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAA 2475

  4376376 AAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAG 4376411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 AAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAG 2511

Alignment time is 1.9486 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   5547] =>      5547 nucs 'mol-32-3332-022806_5547'

Score:        5383
Aligned:      5548        nucs
Identic:      5533 (100%) nucs =>       247 (100%)      5286 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4372308,4372554] EXCISED REGION [4372555,4377855]
 second seq =>  [      1,    247] EXCISED REGION [    249,   5547]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [248,248]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [4373314,4373314]
 second seq =>         1 nucs [1007,1007]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        19 nucs [248,266] to [249,267]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4372308 TTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTGACATCTTGGGGCTTT 4372367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTGACATCTTGGGGCTTT 60

  4372368 GTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCTAGAGATAGCAAACAT 4372427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCTAGAGATAGCAAACAT 120

  4372428 CAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCCAGAGTCGATACTTCA 4372487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCCAGAGTCGATACTTCA 180

  4372488 AATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTCCTCTGCACAGTGACC 4372547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTCCTCTGCACAGTGACC 240

  4372548 CTCCAAT 4372554
          |||||||
      241 CTCCAAT 247

EXCISED REGION

  4372555 AAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTG 4372614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      249 AAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTG 308

  4372615 CGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAA 4372674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      309 CGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAA 368

  4372675 AGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCT 4372734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      369 AGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCT 428

  4372735 AAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGA 4372794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      429 AAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGA 488

  4372795 ATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTAT 4372854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      489 ATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTAT 548

  4372855 TACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTT 4372914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      549 TACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTT 608

  4372915 CTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTG 4372974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      609 CTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTG 668

  4372975 GTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACA 4373034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      669 GTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACA 728

  4373035 CAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTT 4373094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      729 CAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTT 788

  4373095 CCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAA 4373154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 CCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAA 848

  4373155 AATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGC 4373214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 AATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGC 908

  4373215 CATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTT 4373274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 CATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTT 968

  4373275 CCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTG 4373334
          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      969 CCAGGTCCCCTTCACCT-AATCAGTAGTTTCCCATCCTGCCTGTATTTCAGAATCACCTG 1027

  4373335 GGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAG 4373394
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 GGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTCAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAG 1087

  4373395 TAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACA 4373454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 TAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACA 1147

  4373455 TCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCT 4373514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 TCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCT 1207

  4373515 GGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCC 4373574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 GGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCC 1267

  4373575 TGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAG 4373634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 TGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAG 1327

  4373635 TTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAG 4373694
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     1328 TTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTC-TTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAG 1386

  4373695 TCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCA 4373754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 TCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCA 1446

  4373755 CCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGC 4373814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 CCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGC 1506

  4373815 GCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGG 4373874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 GCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGG 1566

  4373875 CTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTG 4373934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 CTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTG 1626

  4373935 GGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATT 4373994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 GGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATT 1686

  4373995 GAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGA 4374054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 GAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGA 1746

  4374055 ATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGCGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCT 4374114
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 ATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGGGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCT 1806

  4374115 CTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGA 4374174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 CTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGA 1866

  4374175 TACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAA 4374234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 TACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAA 1926

  4374235 AATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTAT 4374294
          ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||
     1927 AATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAACAATGGCTGTTACGGGCTAAATCCTCTAT 1986

  4374295 ATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGA 4374354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 ATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGA 2046

  4374355 TACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTT 4374414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 TACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTT 2106

  4374415 CAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCT 4374474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 CAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCT 2166

  4374475 CTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCC 4374534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 CTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCC 2226

  4374535 AGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCC 4374594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 AGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCC 2286

  4374595 CCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACC 4374654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 CCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACC 2346

  4374655 AGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGA 4374714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 AGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGA 2406

  4374715 TCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAA 4374774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 TCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAA 2466

  4374775 GTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATC 4374834
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 GTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATC 2526

  4374835 AACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCC 4374894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 AACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCC 2586

  4374895 ACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTA 4374954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 ACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTA 2646

  4374955 TTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACAT 4375014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2647 TTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATTTCACCCCCCCTACTGTTGGACAT 2706

  4375015 TTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTT 4375074
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2707 TTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTCTAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTT 2766

  4375075 GATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCA 4375134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 GATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCA 2826

  4375135 CTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGT 4375194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 CTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGT 2886

  4375195 TCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAG 4375254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 TCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAG 2946

  4375255 AATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAAC 4375314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 AATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAAC 3006

  4375315 AGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAA 4375374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 AGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAA 3066

  4375375 TTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTG 4375434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 TTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTG 3126

  4375435 TTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTC 4375494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 TTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTC 3186

  4375495 TGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGG 4375554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 TGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGG 3246

  4375555 CTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAAC 4375614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 CTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAAC 3306

  4375615 AACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACAT 4375674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 AACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACAT 3366

  4375675 GCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTAT 4375734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 GCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTAT 3426

  4375735 TTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAAC 4375794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 TTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAAC 3486

  4375795 ACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAA 4375854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 ACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAA 3546

  4375855 GTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACC 4375914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 GTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACC 3606

  4375915 AGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATC 4375974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 AGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATC 3666

  4375975 TGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGA 4376034
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 TGTAAAAGAAAGGGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGA 3726

  4376035 GACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGA 4376094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 GACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGA 3786

  4376095 ACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCT 4376154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 ACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCT 3846

  4376155 TCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTT 4376214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 TCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTT 3906

  4376215 CCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAA 4376274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 CCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAA 3966

  4376275 ACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATT 4376334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 ACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATT 4026

  4376335 TCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTA 4376394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 TCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTA 4086

  4376395 TTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAA 4376454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 TTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAA 4146

  4376455 CCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCA 4376514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 CCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCA 4206

  4376515 AACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAA 4376574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 AACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAA 4266

  4376575 TAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATAT 4376634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 TAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATAT 4326

  4376635 ACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTA 4376694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 ACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTA 4386

  4376695 TTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGA 4376754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 TTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGA 4446

  4376755 GAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGT 4376814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 GAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGT 4506

  4376815 TCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAG 4376874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 TCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAG 4566

  4376875 GATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGT 4376934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 GATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGT 4626

  4376935 GCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACC 4376994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 GCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACC 4686

  4376995 ACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTG 4377054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 ACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTG 4746

  4377055 ATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCT 4377114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 ATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCT 4806

  4377115 AGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTG 4377174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 AGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTG 4866

  4377175 ACATTTGAGTCAGAGGACTGGTAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCC 4377234
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 ACATTTGAGTCAGAGGACTGGGAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCC 4926

  4377235 AACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTG 4377294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 AACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTG 4986

  4377295 CTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACC 4377354
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 CTGAGTCTCCTGGCTTTCACCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACC 5046

  4377355 CTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTT 4377414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 CTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTT 5106

  4377415 GCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGG 4377474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 GCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGG 5166

  4377475 CTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGA 4377534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 CTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGA 5226

  4377535 GCCAGTTCCCTTTCATATATACATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAA 4377594
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 GCCAGTTCCCTTTCATATATGCATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAA 5286

  4377595 TACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGT 4377654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 TACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGT 5346

  4377655 AGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTA 4377714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 AGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTA 5406

  4377715 TATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCT 4377774
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5407 TATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCT 5466

  4377775 GAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGG 4377834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 GAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGG 5526

  4377835 AAAAAACAGTCGTGATCTCTA 4377855
          |||||||||||||||||||||
     5527 AAAAAACAGTCGTGATCTCTA 5547

Alignment time is 4.77148 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   6892] =>      6892 nucs 'mol-32-3332-161643_6892'

Score:        6720
Aligned:      6885        nucs
Identic:      6870 (100%) nucs =>       687 (100%)      6183 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4371125,4371811] EXCISED REGION [4371813,4378009]
 second seq =>  [      9,    695] EXCISED REGION [    697,   6892]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4371812,4371812]
 second seq =>         1 nucs [696,696]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [4373292,4373292]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4371811,4371811] to [4371812,4371812]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4371125 TTTTAAAAATGCATGCATAAACCATTTGGTCAGGCCTGGTTACTAGGCTTGGCAGCTCCT 4371184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        9 TTTTAAAAATGCATGCATAAACCATTTGGTCAGGCCTGGTTACTAGGCTTGGCAGCTCCT 68

  4371185 CTGTTCCTCACAAAGGGAAACACAATTTCCATCGGCTGATTCAGCGCTTGCTCAGGACAA 4371244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       69 CTGTTCCTCACAAAGGGAAACACAATTTCCATCGGCTGATTCAGCGCTTGCTCAGGACAA 128

  4371245 ATCCTGGCTGACTGGGACAGGAGGCATTTAAGTAACCATAGTGCACTGTAGGGAAATAGG 4371304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      129 ATCCTGGCTGACTGGGACAGGAGGCATTTAAGTAACCATAGTGCACTGTAGGGAAATAGG 188

  4371305 CATGGCTGAGTCAGTCCCTCTTATGGGCTGTCCCCGAAGGCCCACTCCACTTCTTCCACT 4371364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      189 CATGGCTGAGTCAGTCCCTCTTATGGGCTGTCCCCGAAGGCCCACTCCACTTCTTCCACT 248

  4371365 GGATATGACCTCAGTCGTCCTAAGCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTT 4371424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      249 GGATATGACCTCAGTCGTCCTAAGCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTT 308

  4371425 CCTTTGAACTTCTGTATGTGGCCTGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGA 4371484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      309 CCTTTGAACTTCTGTATGTGGCCTGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGA 368

  4371485 GTCTTGTTCACAAATCCTGGCCCAGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACT 4371544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      369 GTCTTGTTCACAAATCCTGGCCCAGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACT 428

  4371545 TGCCAATGGGGACACCCTACCACCCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTC 4371604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      429 TGCCAATGGGGACACCCTACCACCCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTC 488

  4371605 TCACTGGGATCCACTAGGTATAGGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCC 4371664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      489 TCACTGGGATCCACTAGGTATAGGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCC 548

  4371665 TGCCTCATCTCTCTCACTACTCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAG 4371724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      549 TGCCTCATCTCTCTCACTACTCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAG 608

  4371725 AAATTACACCACGTTACTTCTCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGA 4371784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      609 AAATTACACCACGTTACTTCTCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGA 668

  4371785 ATTTAAAATCCTTAGCCTGGCTCCAGT 4371811
          |||||||||||||||||||||||||||
      669 ATTTAAAATCCTTAGCCTGGCTCCAGT 695

EXCISED REGION

  4371813 GCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTTGAATA 4371872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      697 GCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTCTTTTGAATA 756

  4371873 TCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCTCAGCT 4371932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 TCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGATGCTCAGCT 816

  4371933 CTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGTCAGCCCCCT 4371992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 CTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGTCAGCCCCCT 876

  4371993 TCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGG 4372052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 TCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTCTCCTGTGGG 936

  4372053 ATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCT 4372112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 ATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCTGCTTATGCT 996

  4372113 GTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATG 4372172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 GTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAATTCCAGATG 1056

  4372173 AAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCC 4372232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 AAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGCCAGGACCCC 1116

  4372233 GTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTT 4372292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 GTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTTTAATAACTT 1176

  4372293 TATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTG 4372352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 TATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGATGGTGCTTTG 1236

  4372353 ACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCT 4372412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 ACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAGCTAATTCCT 1296

  4372413 AGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCC 4372472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 AGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACCAACCAGTCC 1356

  4372473 AGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTC 4372532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 AGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAGGCAATACTC 1416

  4372533 CTCTGCACAGTGACCCTCCAAT-AAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACC 4372591
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 CTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGCGCGTGCACC 1476

  4372592 TAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTA 4372651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 TAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAACTAATCTTA 1536

  4372652 GGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAAT 4372711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATCTGCTTAAAT 1596

  4372712 ACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGA 4372771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 ACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATAAAGTTATGA 1656

  4372772 TAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCA 4372831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 TAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCTACGTTCTCA 1716

  4372832 CCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCC 4372891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 CCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACCATTCTTCCC 1776

  4372892 CAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTAC 4372951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 CAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATTTCTATCTAC 1836

  4372952 CTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCA 4373011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 CTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTGCAGAAAGCA 1896

  4373012 AAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGG 4373071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 AAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTCAGAACTAGG 1956

  4373072 GATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGG 4373131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 GATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAAAAATACGGG 2016

  4373132 CTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGAT 4373191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 CTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAACTTTCCTGAT 2076

  4373192 AGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGC 4373251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 AGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATGCATTAAGGC 2136

  4373252 AGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGTTTCCCATCC 4373311
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     2137 AGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCT-AATCAGTAGTTTCCCATCC 2195

  4373312 TGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTGAAGAACT 4373371
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2196 TGCCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCACTCAAGAACT 2255

  4373372 ACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACAT 4373431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 ACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCCTTTCCACAT 2315

  4373432 GGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAA 4373491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 GGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGGGGGGAAAAA 2375

  4373492 CTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAAT 4373551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 CTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCAATTTGAAAT 2435

  4373552 ATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTT 4373611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 ATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAAAAAATACTT 2495

  4373612 CCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTCT 4373671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2496 CCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATTTTCTTTTC- 2554

  4373672 TTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCAC 4373731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 TTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCAC 2614

  4373732 GATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCC 4373791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 GATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGTCTCC 2674

  4373792 CGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTA 4373851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 CGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTA 2734

  4373852 GAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCC 4373911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 GAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCGTGATCTGCC 2794

  4373912 TGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAAT 4373971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 TGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCGAAAAT 2854

  4373972 GTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAG 4374031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 GTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCTTTTTAACAG 2914

  4374032 TTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGCGGATACAC 4374091
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2915 TTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGGGGGATACAC 2974

  4374092 GAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCT 4374151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 GAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGAGAAGGACCT 3034

  4374152 GCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTAT 4374211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 GCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACCATCAGGTAT 3094

  4374212 TTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAGCAATGG 4374271
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3095 TTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTGAAACAATGG 3154

  4374272 CTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAA 4374331
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 CTGTTACGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTGCAAAGGAAA 3214

  4374332 AAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGA 4374391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 AAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTGCTATCTTGA 3274

  4374392 AACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATT 4374451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 AACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATGGATAGGATT 3334

  4374452 TCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCC 4374511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 TCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGCCTGAAGCCC 3394

  4374512 TTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACAT 4374571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 TTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCTCTCTCACAT 3454

  4374572 CCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAAT 4374631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 CCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAGGCTGTCAAT 3514

  4374632 CAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGC 4374691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 CAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGGCAGCAAAGC 3574

  4374692 CCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTAT 4374751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 CCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAAAAAATGTAT 3634

  4374752 ACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACCGTCACTT 4374811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3635 ACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCACAGTCACTT 3694

  4374812 ATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATAC 4374871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 ATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAATTGAATATAC 3754

  4374872 TATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTG 4374931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 TATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTCTATGTGGTG 3814

  4374932 AAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATT 4374991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 AAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAGATGATTATT 3874

  4374992 TCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTATAAAAT 4375051
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3875 TCACCCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTATTCTAAAAT 3934

  4375052 GATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAAC 4375111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 GATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCCTGACAGAAC 3994

  4375112 CCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGC 4375171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 CCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTTCAGGAGTGC 4054

  4375172 TGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAA 4375231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 TGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGTTACAATCAA 4114

  4375232 GTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGAT 4375291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 GTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGTAAAGGAGAT 4174

  4375292 CACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTAC 4375351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 CACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTAC 4234

  4375352 AGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGA 4375411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 AGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGA 4294

  4375412 AGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGT 4375471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 AGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGT 4354

  4375472 GCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGT 4375531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 GCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGT 4414

  4375532 TGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAA 4375591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 TGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAA 4474

  4375592 TGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGT 4375651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 TGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGT 4534

  4375652 TTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCA 4375711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 TTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCA 4594

  4375712 CATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGG 4375771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 CATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGG 4654

  4375772 AAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTT 4375831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 AAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTT 4714

  4375832 TAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCA 4375891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 TAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCA 4774

  4375892 CAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACT 4375951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 CAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACT 4834

  4375952 TAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCAC 4376011
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4835 TAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGGGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCAC 4894

  4376012 AGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAAT 4376071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4895 AGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAAT 4954

  4376072 ATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGG 4376131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4955 ATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGG 5014

  4376132 GGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGT 4376191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5015 GGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGT 5074

  4376192 CCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGG 4376251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5075 CCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGG 5134

  4376252 TGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCA 4376311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5135 TGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCA 5194

  4376312 TTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTT 4376371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5195 TTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTT 5254

  4376372 TGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCT 4376431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5255 TGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGCTCTCTTTCT 5314

  4376432 AAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATTTATGTTT 4376491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5315 AAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTATTTATGTTT 5374

  4376492 AAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGACTTTTGT 4376551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5375 AAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCTGACTTTTGT 5434

  4376552 AAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATG 4376611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5435 AAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATG 5494

  4376612 CCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTTTCACCCT 4376671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5495 CCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTTTTTCACCCT 5554

  4376672 GACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTATTAGATAC 4376731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5555 GACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACTATTAGATAC 5614

  4376732 TATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGCTGAAAAG 4376791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5615 TATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAATGCTGAAAAG 5674

  4376792 GCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTTTGCAGAA 4376851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5675 GCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTCTTTGCAGAA 5734

  4376852 GGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGAT 4376911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5735 GGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGAT 5794

  4376912 TCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACC 4376971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5795 TCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACC 5854

  4376972 TGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGA 4377031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5855 TGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGA 5914

  4377032 CCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAATATTAGGT 4377091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5915 CCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTAATATTAGGT 5974

  4377092 GTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGT 4377151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5975 GTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGT 6034

  4377152 GAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGTAGAGGAAGACCCATC 4377211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6035 GAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGGAGAGGAAGACCCATC 6094

  4377212 CTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGA 4377271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6095 CTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGA 6154

  4377272 AGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGA 4377331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6155 AGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGA 6214

  4377332 TGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAA 4377391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6215 TGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAA 6274

  4377392 TCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCT 4377451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6275 TCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCT 6334

  4377452 GCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGG 4377511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6335 GCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGCCTATCGTGG 6394

  4377512 GATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATACATATATCCTGCTAGT 4377571
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6395 GATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATGCATATATCCTGCTAGT 6454

  4377572 TCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGT 4377631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6455 TCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGT 6514

  4377632 GTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACA 4377691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6515 GTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACA 6574

  4377692 AGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTA 4377751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6575 AGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTA 6634

  4377752 TTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTAT 4377811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6635 TTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTAT 6694

  4377812 TACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTA 4377871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6695 TACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTA 6754

  4377872 ACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCA 4377931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6755 ACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCA 6814

  4377932 ATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTG 4377991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6815 ATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTG 6874

  4377992 CAGCCAGTAAAACTTATG 4378009
          ||||||||||||||||||
     6875 CAGCCAGTAAAACTTATG 6892

Alignment time is 5.25673 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   4101] =>      4101 nucs 'mol-32-33a0-047133_4101'

Score:        4003
Aligned:      4104        nucs
Identic:      4094 (100%) nucs =>      3826 (100%)       268 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4372583,4376417] EXCISED REGION [4377645,4377913]
 second seq =>  [      1,   3832] EXCISED REGION [   3833,   4101]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [3831,3832] to [3833,3834]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4372583 GCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAA 4372642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAA 60

  4372643 CTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATC 4372702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATC 120

  4372703 TGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATA 4372762
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      121 TGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATG 180

  4372763 AAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCT 4372822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCT 240

  4372823 ACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACC 4372882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACC 300

  4372883 ATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATT 4372942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATT 360

  4372943 TCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTG 4373002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTG 420

  4373003 CAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTC 4373062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTC 480

  4373063 AGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAA 4373122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAA 540

  4373123 AAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAAC 4373182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAAC 600

  4373183 TTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATG 4373242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATG 660

  4373243 CATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGT 4373302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGT 720

  4373303 TTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCAC 4373362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCAC 780

  4373363 TGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCC 4373422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCC 840

  4373423 TTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGG 4373482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGG 900

  4373483 GGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCA 4373542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCA 960

  4373543 ATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAA 4373602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAA 1020

  4373603 AAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATT 4373662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATT 1080

  4373663 TTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTG 4373722
          |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTTTTCTTTTTTTTTTTTT--GAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTG 1138

  4373723 CAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCC 4373782
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CAATGGCACGATCTCAGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCC 1198

  4373783 TCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTA 4373842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTA 1258

  4373843 TTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCG 4373902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 TTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCG 1318

  4373903 TGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTG 4373962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTG 1378

  4373963 GCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCT 4374022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCT 1438

  4374023 TTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGG 4374082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGG 1498

  4374083 CGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGA 4374142
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGA 1558

  4374143 GAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACC 4374202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACC 1618

  4374203 ATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTG 4374262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 ATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTG 1678

  4374263 AAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTG 4374322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTG 1738

  4374323 CAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTG 4374382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTG 1798

  4374383 CTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATG 4374442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATG 1858

  4374443 GATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGC 4374502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGC 1918

  4374503 CTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCT 4374562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCT 1978

  4374563 CTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAG 4374622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAG 2038

  4374623 GCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGG 4374682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGG 2098

  4374683 CAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAA 4374742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAA 2158

  4374743 AAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCA 4374802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCA 2218

  4374803 CCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAAT 4374862
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAAT 2278

  4374863 TGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTC 4374922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTC 2338

  4374923 TATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAG 4374982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAG 2398

  4374983 ATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTA 4375042
          ||||||||||||.|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ATGATTATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTA 2457

  4375043 TTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCC 4375102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCC 2517

  4375103 TGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTT 4375162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTT 2577

  4375163 CAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGT 4375222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGT 2637

  4375223 TACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGT 4375282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGT 2697

  4375283 AAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAG 4375342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 AAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAG 2757

  4375343 TGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATAC 4375402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATAC 2817

  4375403 CTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTC 4375462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 CTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTC 2877

  4375463 TGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTC 4375522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTC 2937

  4375523 TCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATG 4375582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATG 2997

  4375583 GCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTT 4375642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 GCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTT 3057

  4375643 ATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAA 4375702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 ATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAA 3117

  4375703 ATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGT 4375762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 ATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGT 3177

  4375763 GCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGT 4375822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGT 3237

  4375823 GTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTA 4375882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTA 3297

  4375883 CAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCAT 4375942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCAT 3357

  4375943 TGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGT 4376002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3358 TGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGAGAGTCCCTGAGCTGT 3417

  4376003 GAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACC 4376062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 GAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACC 3477

  4376063 AGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAA 4376122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 AGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAA 3537

  4376123 AAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGG 4376182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 AAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGG 3597

  4376183 AGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAA 4376242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 AGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAA 3657

  4376243 ACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAA 4376302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 ACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAA 3717

  4376303 TTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGG 4376362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGG 3777

  4376363 GAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 4376417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 GAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTA 3832

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 3892

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3893 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 3952

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4377824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4012

  4377825 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4377884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4072

  4377885 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAA 4377913
          |||||||||||||||||||||||||||||
     4073 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAA 4101

Alignment time is 3.18401 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   9004] =>      9004 nucs 'mol-32-3492-147402_9004'

Score:        8806
Aligned:      9004        nucs
Identic:      8986 (100%) nucs =>      1259 (100%)      7727 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4368923,4370183] EXCISED REGION [4370184,4377925]
 second seq =>  [      1,   1261] EXCISED REGION [   1264,   9004]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1262,1263]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        20 nucs [1262,1281] to [1264,1283]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1262,1262] to [1263,1263]

  4368923 AATAATCTAAACCTGGTTTATGTTAACCAAGGGCTTAATTAAACAGAACAAACAATGGGA 4368982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAATCTAAACCTGGTTTATGTTAACCAAGGGCTTAATTAAACAGAACAAACAATGGGA 60

  4368983 AAAAGAATGATGTTTTCTTTTTTCCTGAAAATTTTCTCCATTTCTCTATTTCTAAATGTA 4369042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAAGAATGATGTTTTCTTTTTTCCTGAAAATTTTCTCCATTTCTCTATTTCTAAATGTA 120

  4369043 GAGAAATAGACTCAGAATTTTAATCAGACCACAAGTACTTAGATGCTTTCTTATTATGTA 4369102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAAATAGACTCAGAATTTTAATCAGACCACAAGTACTTAGATGCTTTCTTATTATGTA 180

  4369103 TCTCTTTGAAAATCAGCTTCACCTTGGAATTTTTGCACATTATTAAGACTAGTATCTCCG 4369162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCTTTGAAAATCAGCTTCACCTTGGAATTTTTGCACATTATTAAGACTAGTATCTCCG 240

  4369163 CCAGACCTTGAGGTCCTCCCATTTTAATAATGTCTGATGGATTACTCAGCCACCATTCTA 4369222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAGACCTTGAGGTCCTCCCATTTTAATAATGTCTGATGGATTACTCAGCCACCATTCTA 300

  4369223 GATCTTCCGAAGAAGTGTTCCCAAAGATGTTTTAAGAATCCCAGGAAGGGAAGCTTTCTA 4369282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATCTTCCGAAGAAGTGTTCCCAAAGATGTTTTAAGAATCCCAGGAAGGGAAGCTTTCTA 360

  4369283 ACCTAATTCTTTTCTGGATATGAGCATCCACTTTGCTCTCTGACATGGAATAAAAATATT 4369342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      361 ACCTAATTCTTTTCTGGATATGAGCATCCACTTTGCTCTCTGACATTGAATAAAAATATT 420

  4369343 TAACCTGCCTGATTCTCTCATCTGTAAAATAAGAACAATAATACCAATTCTAGTGCTGTC 4369402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAACCTGCCTGATTCTCTCATCTGTAAAATAAGAACAATAATACCAATTCTAGTGCTGTC 480

  4369403 AGAAGAATTGATTGCAAAATGTTGATGCATGCACTGCTCCAAGGGTAGGTTTCTGTTATA 4369462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAAGAATTGATTGCAAAATGTTGATGCATGCACTGCTCCAAGGGTAGGTTTCTGTTATA 540

  4369463 TAGTTTCTAGGACTTCTACCTGTAAGTTCCACCATATGATCAAAATTGTCTTGAGAGAAC 4369522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGTTTCTAGGACTTCTACCTGTAAGTTCCACCATATGATCAAAATTGTCTTGAGAGAAC 600

  4369523 ATGGTGCCACAGGAAGAACATTAGCCTGAGAGTCAGAAGACTCAGGTGTAGTCCTGGCTC 4369582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGTGCCACAGGAAGAACATTAGCCTGAGAGTCAGAAGACTCAGGTGTAGTCCTGGCTC 660

  4369583 TGATACACCCTCCCCTGGCTGTAGGCCCTTGTGCAAGCAGTTATCCCTCTTAGCCCTCCA 4369642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGATACACCCTCCCCTGGCTGTAGGCCCTTGTGCAAGCAGTTATCCCTCTTAGCCCTCCA 720

  4369643 TTCCTCACATGCACATGGAGGATTATGATATAACAATGGCGTGATGGTCAAATGTGATTA 4369702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCCTCACATGCACATGGAGGATTATGATATAACAATGGCGTGATGGTCAAATGTGATTA 780

  4369703 TTGGAAGACTTGGCTTTGAAGATCACTGACTATCAGAATCCCAAAGGACCTTGACAAGTT 4369762
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGGAAGACTTGGCTTTGAAGATCACCGACTATCAGAATCCCAAAGGACCTTGACAAGTT 840

  4369763 GGAACCATGAACTAGATCTAAAAAGAGTCTATCTAATAGAGATAAAATCCTATGTTCATG 4369822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAACCATGAACTAGATCTAAAAAGAGTCTATCTAATAGAGATAAAATCCTATGTTCATG 900

  4369823 GCCAAAAAAAATAAACAGTTAAAAAGGAAGCATGCAATTGCAGGACGTGGTGAATGGAGA 4369882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCCAAAAAAAATAAACAGTTAAAAAGGAAGCATGCAATTGCAGGACGTGGTGAATGGAGA 960

  4369883 GATAGCAAAAGGAATTCAAGAGAATCAGGCTTGGCAAGGTGGCTCATGCCCATAATCCCA 4369942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATAGCAAAAGGAATTCAAGAGAATCAGGCTTGGCAAGGTGGCTCATGCCCATAATCCCA 1020

  4369943 GCATTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTGAATTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGG 4370002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCATTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTGAATTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGG 1080

  4370003 CCAAAATGGTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCCTGGTGGCGC 4370062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCAAAATGGTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCCTGGTGGCGC 1140

  4370063 ATGCCTGTTATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGG 4370122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGCCTGTTATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGG 1200

  4370123 TGGAGGTTGCAGTCATCCAAGATTGCACTCCAGCCTAGGCGACAGAGCAAGACTCCATCT 4370182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGAGGTTGCAGTCATCCAAGATTGCACTCCAGCCTAGGCGACAGAGCAAGACTCCATCT 1260

  4370183 C 4370183
          |
     1261 C 1261

EXCISED REGION

  4370184 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCAAAAAACAAAAAACAATATAACCAAAAGTTCAAAT 4370243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCAAAAAACAAAAAACAATATAACCAAAAGTTCAAAT 1323

  4370244 TGTCCTGGGTTTCTGGATCAGTGGGGCCCTCCCCTTCCATGTGACAGTCTTCAGATGAGT 4370303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 TGTCCTGGGTTTCTGGATCAGTGGGGCCCTCCCCTTCCATGTGACAGTCTTCAGATGAGT 1383

  4370304 GAGCAGCATCACTTCCTCAGACTCCTCCAGGACAGCAGCCCTGCTCCTCCTACCCTTCCC 4370363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 GAGCAGCATCACTTCCTCAGACTCCTCCAGGACAGCAGCCCTGCTCCTCCTACCCTTCCC 1443

  4370364 TGAGAGCCATGGGGTGTTGCCTTGTCTCTAGCCCAGTGTTGCGTGTTTCTTGGGTTCTCG 4370423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 TGAGAGCCATGGGGTGTTGCCTTGTCTCTAGCCCAGTGTTGCGTGTTTCTTGGGTTCTCG 1503

  4370424 TTAGATTTTCAGCTGTAAATATAGGACTTCATCTCACTTAGTTAAATCTCCTTAAGTTTG 4370483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 TTAGATTTTCAGCTGTAAATATAGGACTTCATCTCACTTAGTTAAATCTCCTTAAGTTTG 1563

  4370484 GTTCCTTTCCTTCATTATTCCAAATTGTCAAGACCTTTGAGGATTTGGATTTGATCACAC 4370543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 GTTCCTTTCCTTCATTATTCCAAATTGTCAAGACCTTTGAGGATTTGGATTTGATCACAC 1623

  4370544 CCTCTTTTTCTCTGGATCATGATAGATCTGAAACTGTGCCTCGTGTGGAAGGACAGAAGA 4370603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 CCTCTTTTTCTCTGGATCATGATAGATCTGAAACTGTGCCTCGTGTGGAAGGACAGAAGA 1683

  4370604 ACGGAAGCTGCATAATATCAGGATTTCTAAATATTAAACATGCTATATTTAATATGTATT 4370663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 ACGGAAGCTGCATAATATCAGGATTTCTAAATATTAAACATGCTATATTTAATATGTATT 1743

  4370664 TAATATACATAATAGAGTGTATTTTATATTCTGTAATAAATAAAATATATTATTTTTAAT 4370723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 TAATATACATAATAGAGTGTATTTTATATTCTGTAATAAATAAAATATATTATTTTTAAT 1803

  4370724 TAATTAAATTTAGCATAGTATTATATCCTTTCATTCAATTAAAGTATGAAGTTCACCCAT 4370783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 TAATTAAATTTAGCATAGTATTATATCCTTTCATTCAATTAAAGTATGAAGTTCACCCAT 1863

  4370784 TCTCAACGTACATTGGAAATTCAAAAGAAAACAGCAGACCTGCTCCTGCTTCCAGAAACA 4370843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 TCTCAACGTACATTGGAAATTCAAAAGAAAACAGCAGACCTGCTCCTGCTTCCAGAAACA 1923

  4370844 CTCAAAATAAAGACATATGAATATATAGGAACCACAAATTAGTGAAACCTCAGAAGGCAA 4370903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 CTCAAAATAAAGACATATGAATATATAGGAACCACAAATTAGTGAAACCTCAGAAGGCAA 1983

  4370904 AAGATATCATAACGCCTTCAAAATAGCATAAAAGACTCCTATTTTTGTAAATTAAGAAGG 4370963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 AAGATATCATAACGCCTTCAAAATAGCATAAAAGACTCCTATTTTTGTAAATTAAGAAGG 2043

  4370964 AAAATTGCAAAGATTAAGCTACTGAAGATGTGAGCCCTCAAATGTTAACAGTGACCTGGG 4371023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 AAAATTGCAAAGATTAAGCTACTGAAGATGTGAGCCCTCAAATGTTAACAGTGACCTGGG 2103

  4371024 TTGGGTAGAATTATACTTTCCTTGGCTTTTTCATTTTATTCACTTGTATTGTCTAAAATT 4371083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 TTGGGTAGAATTATACTTTCCTTGGCTTTTTCATTTTATTCACTTGTATTGTCTAAAATT 2163

  4371084 CTAATTTTTGTAATAAGAAAAAAATATAATTTTTTGGTTCTTTTTAAAAATGCATGCATA 4371143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 CTAATTTTTGTAATAAGAAAAAAATATAATTTTTTGGTTCTTTTTAAAAATGCATGCATA 2223

  4371144 AACCATTTGGTCAGGCCTGGTTACTAGGCTTGGCAGCTCCTCTGTTCCTCACAAAGGGAA 4371203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 AACCATTTGGTCAGGCCTGGTTACTAGGCTTGGCAGCTCCTCTGTTCCTCACAAAGGGAA 2283

  4371204 ACACAATTTCCATCGGCTGATTCAGCGCTTGCTCAGGACAAATCCTGGCTGACTGGGACA 4371263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 ACACAATTTCCATCGGCTGATTCAGCGCTTGCTCAGGACAAATCCTGGCTGACTGGGACA 2343

  4371264 GGAGGCATTTAAGTAACCATAGTGCACTGTAGGGAAATAGGCATGGCTGAGTCAGTCCCT 4371323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 GGAGGCATTTAAGTAACCATAGTGCACTGTAGGGAAATAGGCATGGCTGAGTCAGTCCCT 2403

  4371324 CTTATGGGCTGTCCCCGAAGGCCCACTCCACTTCTTCCACTGGATATGACCTCAGTCGTC 4371383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CTTATGGGCTGTCCCCGAAGGCCCACTCCACTTCTTCCACTGGATATGACCTCAGTCGTC 2463

  4371384 CTAAGCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAACTTCTGTATGT 4371443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 CTAAGCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAACTTCTGTATGT 2523

  4371444 GGCCTGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTCACAAATCCTG 4371503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 GGCCTGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTCACAAATCCTG 2583

  4371504 GCCCAGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGGGGACACCCTA 4371563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 GCCCAGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGGGGACACCCTA 2643

  4371564 CCACCCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGATCCACTAGGT 4371623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CCACCCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGATCCACTAGGT 2703

  4371624 ATAGGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCTCTCTCACTA 4371683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 ATAGGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATCTCTCTCACTA 2763

  4371684 CTCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACCACGTTACTT 4371743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 CTCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACACCACGTTACTT 2823

  4371744 CTCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATCCTTAGCCTG 4371803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 CTCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAATCCTTAGCCTG 2883

  4371804 GCTCCAGTTGCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTC 4371863
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 GCTCCAGTCGCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCACTTCTTAGTTC 2943

  4371864 TTTTGAATATCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGA 4371923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 TTTTGAATATCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCACCTACTTCGA 3003

  4371924 TGCTCAGCTCTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGT 4371983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 TGCTCAGCTCTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCTGGGTTTTTGT 3063

  4371984 CAGCCCCCTTCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTC 4372043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 CAGCCCCCTTCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTGCCCCCTCCTC 3123

  4372044 TCCTGTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCT 4372103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 TCCTGTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTGAACCAGTTCT 3183

  4372104 GCTTATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAA 4372163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 GCTTATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGTCTAGAAAGAA 3243

  4372164 TTCCAGATGAAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGC 4372223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 TTCCAGATGAAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCCGTGCAGTTGC 3303

  4372224 CAGGACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTT 4372283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 CAGGACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATCTTGAAACTTT 3363

  4372284 TAATAACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGAT 4372343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 TAATAACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTCTGTATTTGAT 3423

  4372344 GGTGCTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAG 4372403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 GGTGCTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTCCCATGGTTAG 3483

  4372404 CTAATTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACC 4372463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 CTAATTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAACATGCAAACC 3543

  4372464 AACCAGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAG 4372523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 AACCAGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTACACTTCAGGAG 3603

  4372524 GCAATACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAAT-AAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGC 4372582
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     3604 GCAATACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACACAGC 3663

  4372583 GCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAA 4372642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 GCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTCTAAATTTAA 3723

  4372643 CTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATC 4372702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 CTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAGACCCAGATC 3783

  4372703 TGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATA 4372762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 TGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAAGATGCTATA 3843

  4372763 AAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCT 4372822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 AAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTTATTTCACCT 3903

  4372823 ACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACC 4372882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3904 ACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGGGACTCCACC 3963

  4372883 ATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATT 4372942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3964 ATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACGGCTGATATT 4023

  4372943 TCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTG 4373002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4024 TCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCACAGAAGTTTG 4083

  4373003 CAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTC 4373062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4084 CAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATGGCCTATCTC 4143

  4373063 AGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAA 4373122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4144 AGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCAAGCACAGAA 4203

  4373123 AAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAAC 4373182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4204 AAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATAAAACTGAAC 4263

  4373183 TTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATG 4373242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4264 TTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGATCACGCATG 4323

  4373243 CATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAAATCAGTAGT 4373302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     4324 CATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCT-AATCAGTAGT 4382

  4373303 TTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCAC 4373362
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 TTCCCATCCTGCCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTCAAGATTCAC 4442

  4373363 TGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCC 4373422
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 TCAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAGGTTAAATCC 4502

  4373423 TTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGG 4373482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 TTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAACTGCTCTGG 4562

  4373483 GGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCA 4373542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 GGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACACCAATAATCA 4622

  4373543 ATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAA 4373602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 ATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTGGGAGCTAAA 4682

  4373603 AAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATT 4373662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 AAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAAAACATAATT 4742

  4373663 TTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTG 4373722
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 TTCTTTTC-TTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTGTAGTG 4801

  4373723 CAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCC 4373782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4802 CAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCC 4861

  4373783 TCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTA 4373842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4862 TCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTAATTTTTGTA 4921

  4373843 TTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCG 4373902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4922 TTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCG 4981

  4373903 TGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTG 4373962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4982 TGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTG 5041

  4373963 GCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCT 4374022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5042 GCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACATGGGCACCT 5101

  4374023 TTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGG 4374082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5102 TTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGATGCTTTTGG 5161

  4374083 CGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGA 4374142
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5162 GGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTGAAGGGCAGA 5221

  4374143 GAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACC 4374202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5222 GAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGATGCCAGCACC 5281

  4374203 ATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTG 4374262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5282 ATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCCCCTTCTCTG 5341

  4374263 AAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTG 4374322
          ||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5342 AAACAATGGCTGTTACGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTATCTATCCCTG 5401

  4374323 CAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTG 4374382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5402 CAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCGGGCTCCTTG 5461

  4374383 CTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATG 4374442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5462 CTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGGTCTAATATG 5521

  4374443 GATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGC 4374502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5522 GATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACACAGGCTCAGC 5581

  4374503 CTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCT 4374562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5582 CTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGGCGGCTGTCT 5641

  4374563 CTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAG 4374622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5642 CTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGTTCCGACAAG 5701

  4374623 GCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGG 4374682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5702 GCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGACCTAAGTTGG 5761

  4374683 CAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAA 4374742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5762 CAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGCTTATAATAA 5821

  4374743 AAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCA 4374802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5822 AAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGGAGAGAACCA 5881

  4374803 CCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAAT 4374862
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5882 CAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGTGCACACAAT 5941

  4374863 TGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTC 4374922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5942 TGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGAGCATTTTTC 6001

  4374923 TATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAG 4374982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6002 TATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTTTGCCGCTAG 6061

  4374983 ATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTA 4375042
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6062 ATGATTATTTCACCCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTTTCACTATTA 6121

  4375043 TTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCC 4375102
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6122 TTCTAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCTATCTTATCC 6181

  4375103 TGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTT 4375162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6182 TGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTGGAATTCTTT 6241

  4375163 CAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGT 4375222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6242 CAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGGAAGGGGAGT 6301

  4375223 TACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGT 4375282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6302 TACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTCAGTAGAAGT 6361

  4375283 AAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAG 4375342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6362 AAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAG 6421

  4375343 TGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATAC 4375402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6422 TGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTTCCTTTATAC 6481

  4375403 CTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTC 4375462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6482 CTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAAGGTTTCTTC 6541

  4375463 TGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTC 4375522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6542 TGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGACTGATGCTC 6601

  4375523 TCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATG 4375582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6602 TCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATG 6661

  4375583 GCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTT 4375642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6662 GCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTT 6721

  4375643 ATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAA 4375702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6722 ATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAA 6781

  4375703 ATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGT 4375762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6782 ATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGT 6841

  4375763 GCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGT 4375822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6842 GCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGT 6901

  4375823 GTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTA 4375882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6902 GTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTA 6961

  4375883 CAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCAT 4375942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6962 CAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCAT 7021

  4375943 TGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGT 4376002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     7022 TGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGGGAGTCCCTGAGCTGT 7081

  4376003 GAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACC 4376062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7082 GAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGCTGAAACACC 7141

  4376063 AGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAA 4376122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7142 AGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAA 7201

  4376123 AAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGG 4376182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7202 AAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGG 7261

  4376183 AGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAA 4376242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7262 AGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAA 7321

  4376243 ACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAA 4376302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7322 ACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAA 7381

  4376303 TTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGG 4376362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7382 TTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGG 7441

  4376363 GAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGC 4376422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7442 GAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAATCTATATGC 7501

  4376423 TCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTA 4376482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7502 TCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAGACTGACATATTTCTA 7561

  4376483 TTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCT 4376542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7562 TTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAAAAGACAAGCAAACCT 7621

  4376543 GACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGT 4376602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7622 GACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTAGGTAGTTGGTTCCGT 7681

  4376603 CCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTT 4376662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7682 CCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAAGAAGAAATATAACTT 7741

  4376663 TTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACT 4376722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7742 TTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATAAATATAACAAAAACT 7801

  4376723 ATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAAT 4376782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7802 ATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTAATGAGAATACTCAAT 7861

  4376783 GCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTC 4376842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7862 GCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAGTATACAGGCACAGTC 7921

  4376843 TTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGA 4376902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7922 TTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAATGCGCGTGTTCTTTGA 7981

  4376903 GCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGC 4376962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7982 GCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGGATGCAGGCTCTGAGC 8041

  4376963 CAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAA 4377022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8042 CAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCAATAACTTGGCAGAAA 8101

  4377023 ATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTA 4377082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8102 ATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAGGGTTTGTGACGGTTA 8161

  4377083 ATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGG 4377142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8162 ATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAAGCATTGTTTCTGGG 8221

  4377143 TGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGTAGAGGA 4377202
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     8222 TGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAGAGGACTGGGAGAGGA 8281

  4377203 AGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAA 4377262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8282 AGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAGCGCATCTGGAACAAA 8341

  4377263 GCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCC 4377322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8342 GCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGGCTTTCATCTTTCTCC 8401

  4377323 CATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGG 4377382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8402 CATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGACTCCAGGTTCTTTGG 8461

  4377383 CTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACA 4377442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8462 CTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTCAGGCCTTTGGCCACA 8521

  4377443 GCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGC 4377502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8522 GCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCTCAGCTTACAGACGGC 8581

  4377503 CTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATACATATAT 4377562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     8582 CTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTTCATATATGCATATAT 8641

  4377563 CCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCG 4377622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8642 CCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAATGCTATCTTATTTCG 8701

  4377623 CAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTAC 4377682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8702 CAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTAC 8761

  4377683 ATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATT 4377742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8762 ATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATT 8821

  4377743 TTTTCATTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTT 4377802
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8822 TTTTCGTTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTT 8881

  4377803 ACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAG 4377862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8882 ACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAG 8941

  4377863 AAGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAA 4377922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8942 AAGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAA 9001

  4377923 TAG 4377925
          |||
     9002 TAG 9004

Alignment time is 7.19968 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   9070] =>      9070 nucs 'mol-32-34b3-015701_9070'

Score:        8841
Aligned:      9072        nucs
Identic:      9051 (100%) nucs =>       439 (100%)      8612 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4375548,4375986] EXCISED REGION [4375988,4384620]
 second seq =>  [      1,    439] EXCISED REGION [    441,   9070]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [4375987,4375987]
 second seq =>         1 nucs [440,440]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [4379980,4379980]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [439,440] to [440,441]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [4375986,4375986] to [4375988,4375988]
 second seq =>         1 nucs [439,439] to [441,441]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  4375548 CTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAA 4375607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAA 60

  4375608 AAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCAT 4375667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTAACAACTAAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCAT 120

  4375668 AAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTA 4375727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTA 180

  4375728 AGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTT 4375787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTT 240

  4375788 CTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTG 4375847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTG 300

  4375848 ATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAG 4375907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAG 360

  4375908 AATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTT 4375967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTT 420

  4375968 GTTCATCTGTAAAAGAAAG 4375986
          |||||||||||||||||||
      421 GTTCATCTGTAAAAGAAAG 439

EXCISED REGION

  4375988 GAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAA 4376047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      441 GAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAA 500

  4376048 TTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAG 4376107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      501 TTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAG 560

  4376108 CAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAG 4376167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      561 CAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAG 620

  4376168 GCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAA 4376227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      621 GCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAA 680

  4376228 GATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTT 4376287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      681 GATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTT 740

  4376288 TTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAG 4376347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      741 TTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAG 800

  4376348 ATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAA 4376407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      801 ATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAA 860

  4376408 GTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAG 4376467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 GTAGAATCTATATGCTCTCTTTCTAAACACAAGAGCAACAGAAGAAACCACAAAGGAAAG 920

  4376468 ACTGACATATTTCTATTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAA 4376527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      921 ACTGACATATTTCTATTTATGTTTAAACTTTATAAGCCAAGTGTCCAAACACAAAGCTAA 980

  4376528 AAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTA 4376587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      981 AAGACAAGCAAACCTGACTTTTGTAAGTCATTAGCAAGTCACGAAAATAGAAGTCATGTA 1040

  4376588 GGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAA 4376647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1041 GGTAGTTGGTTCCGTCCTAATATGCCAGTGGGTACTAATGTAAATATACATCTTATAAAA 1100

  4376648 GAAGAAATATAACTTTTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATA 4376707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1101 GAAGAAATATAACTTTTTCACCCTGACAAAAAAGAAAGCTCAACCTATTGTAATCAAATA 1160

  4376708 AATATAACAAAAACTATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTA 4376767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1161 AATATAACAAAAACTATTAGATACTATTTTTAACCTATCAAATATGAGAAAAAAGTTTTA 1220

  4376768 ATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAG 4376827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1221 ATGAGAATACTCAATGCTGAAAAGGCTACACTGAGATACTCCTGTGTTCTGGTGGGAGAG 1280

  4376828 TATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAAT 4376887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1281 TATACAGGCACAGTCTTTGCAGAAGGTGACTTTGCAATATGCATCAGGATGCTTGCAAAT 1340

  4376888 GCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGG 4376947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1341 GCGCGTGTTCTTTGAGCCACTGATTCCACTGCTGGAGGCTGATTAGTGCAATGGCAAAGG 1400

  4376948 ATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCA 4377007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1401 ATGCAGGCTCTGAGCCAGACCACCTGAGATTGCCTCCCAGCCCCACCACTTACTAGCCCA 1460

  4377008 ATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAG 4377067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1461 ATAACTTGGCAGAAAATTCCCTGACCCCTTTGTGCCTCAAAGTCCTGATCTGTAACACAG 1520

  4377068 GGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAA 4377127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1521 GGTTTGTGACGGTTAATATTAGGTGTCAAATTGATTGAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAA 1580

  4377128 AGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAG 4377187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1581 AGCATTGTTTCTGGGTGTGTCTGTGAGGGTGTTGCCAGAGGAGACTGACATTTGAGTCAG 1640

  4377188 AGGACTGGTAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAG 4377247
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1641 AGGACTGGGAGAGGAAGACCCATCCTCGATGTGGGTGGCCACCATCCAACTGGCTGCCAG 1700

  4377248 CGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGG 4377307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1701 CGCATCTGGAACAAAGCAGGAGGAAGAAGGTGGGATAAGCTGGCTTGCTGAGTCTCCTGG 1760

  4377308 CTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGA 4377367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1761 CTTTCATCTTTCTCCCATGCTGGATGCTTCCTTCCATTCCTCCCACCCTAGGACATCAGA 1820

  4377368 CTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTC 4377427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1821 CTCCAGGTTCTTTGGCTTTTGGAATCTTGGAGTTACACCAGTTGTTTGCTGGGGGCTCTC 1880

  4377428 AGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCT 4377487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1881 AGGCCTTTGGCCACAGCCTTCCCTGCTTTGGACTGAGCCACTACTGGCTTCTTTCTTCCT 1940

  4377488 CAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTT 4377547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 CAGCTTACAGACGGCCTATCGTGGGATTTCACCTTGTGATCCTGTGAGCCAGTTCCCTTT 2000

  4377548 CATATATACATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAA 4377607
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 CATATATGCATATATCCTGCTAGTTCTGTCCCTCCGGAGAACCCTAATACAGGGTAATAA 2060

  4377608 TGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAA 4377667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 TGCTATCTTATTTCGCAAAGTAGTGTGAAGATTCTATTATGAAATGTAGGCCATCTAGAA 2120

  4377668 TATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGAT 4377727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 TATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAATATTATTGTTATATAGTATAAGAT 2180

  4377728 GCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTT 4377787
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 GCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTAGCAATAATCTGAAAGTTGCACTT 2240

  4377788 GTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGT 4377847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 GTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGGGCAATGGAGGAAAAAACAGTCGT 2300

  4377848 GATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATT 4377907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 GATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAAAAACATGCTCTTAGAAGTTCATT 2360

  4377908 TAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTG 4377967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 TAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTCAAAAATACATGTCTATAAGATTG 2420

  4377968 TAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCC 4378027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 TAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAACTTATGTGTATGAGGCTTAACTCC 2480

  4378028 TTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATG 4378087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 TTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAAAGATTAGAATGATCGTGAACATG 2540

  4378088 AGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTAATATACAAATGCTAATTATTACCACTTATGAGGGT 4378147
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 AGAAGACTTTGGAGATACTAAAGTAATATACAAATGCTAATTATTACCACTTATGAGGGT 2600

  4378148 GTGTAGAAGCTCAATTATGAAAGTAATTTTAATGAGCATTTACTATGTGCCAGATACTAT 4378207
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 GTGTAGAAGCTCAATTATAAAAGTAATTTTAATGAGCATTTACTATGTGCCAGATACTAT 2660

  4378208 ATATATATATAATTAATCCTCAGTCTGGGTTGCCAGGTTTAGAAAATAAAATTACATAAT 4378267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 ATATATATATAATTAATCCTCAGTCTGGGTTGCCAGGTTTAGAAAATAAAATTACATAAT 2720

  4378268 GCCAGTTACATTTCAGTTTCAGATAAACAATGAACACTTTTTTAGTATAAGTATATCCCA 4378327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 GCCAGTTACATTTCAGTTTCAGATAAACAATGAACACTTTTTTAGTATAAGTATATCCCA 2780

  4378328 GGTGCAATTATTCAATGTTTATCAGAAATATTTCAGATACACTGAAAACATATTCACTGT 4378387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2781 GGTGCAATTATTCAATGTTTATCAGAAATATTTCAGATACGCTGAAAACATATTCACTGT 2840

  4378388 TTCTCCAAAATATTTAAAACATGTTTTTGTTTGTTTATATTTTTTTCTTTCACCCTCTCA 4378447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 TTCTCCAAAATATTTAAAACATGTTTTTGTTTGTTTATATTTTTTTCTTTCACCCTCTCA 2900

  4378448 GTCCAGCTTTTCCTGACTCTGGGAAGAACCAGGAAGAGAAGGCCTTAAAATATGTTTATA 4378507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 GTCCAGCTTTTCCTGACTCTGGGAAGAACCAGGAAGAGAAGGCCTTAAAATATGTTTATA 2960

  4378508 CCAAAAATGTATTTATCTGAAATTGAAATTTGACTAGGCACCTGTATTTTCTCTGGCAAC 4378567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 CCAAAAATGTATTTATCTGAAATTGAAATTTGACTAGGCACCTGTATTTTCTCTGGCAAC 3020

  4378568 CCTACATCAATCCTACAAAATAGGTACAATAACTATATATATAATGAAAACAGAAAGAGA 4378627
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 CCTACATCAATCCTACAAAATAGCTACAATAACTATATATATAATGAAAACAGAAAGAGA 3080

  4378628 GATTCCATTTTGGTTGGTGCAATGGGAAATCACCCACTATTCCTAATATGGACTATGTAG 4378687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 GATTCCATTTTGGTTGGTGCAATGGGAAATCACCCACTATTCCTAATATGGACTATGTAG 3140

  4378688 AGAAGGAAATCCTAAATCCAGAGGCAGAATGAGAAAGGCACATATTATTTCTTGGTTCTT 4378747
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3141 AGAAGGAAATCCTAAATCCAGAGGCAGAATGAGAAAGGCGCATATTATTTCTTGGTTCTT 3200

  4378748 GATAGCATGTGTAGGGTAAACTTCCCTGAGAGCAATAACTTAAACACACCTTTAGAATGA 4378807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 GATAGCATGTGTAGGGTAAACTTCCCTGAGAGCAATAACTTAAACACACCTTTAGAATGA 3260

  4378808 GCTTGTATGGCAGAAGCACCTGAATGTGTGCTCCAAGTTAGGGAATCTGGGCATGGCCGA 4378867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 GCTTGTATGGCAGAAGCACCTGAATGTGTGCTCCAAGTTAGGGAATCTGGGCATGGCCGA 3320

  4378868 CCTGGAGACTGATTCTTCCTCTATGAGGTACATCTGAGCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTG 4378927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 CCTGGAGACTGATTCTTCCTCTATGAGGTACATCTGAGCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTG 3380

  4378928 GGTTAAATGAAGGGGATTGAGGCCAAGTGTTTTGGGTTAAATGAAGGCTGACAGGTGGAG 4378987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 GGTTAAATGAAGGGGATTGAGGCCAAGTGTTTTGGGTTAAATGAAGGCTGACAGGTGGAG 3440

  4378988 ATTGTTAAGGGAAGAGTGTTAAGTGAAAATGCTATATAAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTG 4379047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 ATTGTTAAGGGAAGAGTGTTAAGTGAAAATGCTATATAAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTG 3500

  4379048 CTTGTGGTTTTCTTGCCTAACCTGCAGCCTCTCGGCCGTGTCGTTATGTTATCCATCCCA 4379107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 CTTGTGGTTTTCTTGCCTAACCTGCAGCCTCTCGGCCGTGTCGTTATGTTATCCATCCCA 3560

  4379108 CCACCACTGGACTGTAGGAAGGCGGATATGTTGTCCAGCGCCCCATCACTGTACCATTTC 4379167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 CCACCACTGGACTGTAGGAAGGCGGATATGTTGTCCAGCGCCCCATCACTGTACCATTTC 3620

  4379168 TGTACATAAGGCAGTTCTCCTATCCAGCCTGTCACCACTGCACTCTCTCCCCTCTATGTA 4379227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 TGTACATAAGGCAGTTCTCCTATCCAGCCTGTCACCACTGCACTCTCTCCCCTCTATGTA 3680

  4379228 AGCTCCTAATAAAACCCCATGTCTCATTTGCTGGCTATGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTG 4379287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3681 AGCTCCTAATAAAACCCCATGTCTCATTTGCTGGCTATGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTG 3740

  4379288 AACCTGGTGCCTTCCCTACTGAGGTTAATAGGGGTTTGGCAAAACACCATGCTACTGTTA 4379347
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 AACCTGGTGCCTTTCCTACTGAGGTTAATAGGGGTTTGGCAAAACACCATGCTACTGTTA 3800

  4379348 TTTAAAATGTTATAATTTCTCAAACTATATTAATCCCAAATTCAAATGCTAAAGATAACA 4379407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 TTTAAAATGTTATAATTTCTCAAACTATATTAATCCCAAATTCAAATGCTAAAGATAACA 3860

  4379408 ACATATTGCAAAGCTGACTCTAAATGCCTCTGGATTTTTCAGCCCTTTTGGAAGATTGAC 4379467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 ACATATTGCAAAGCTGACTCTAAATGCCTCTGGATTTTTCAGCCCTTTTGGAAGATTGAC 3920

  4379468 AACATTAGTCCCTTCTTTTAGTGCAAACTATCTAGAGATGGGAGATCAAATGTGGAAATG 4379527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3921 AACATTAGTCCCTTCTTTTAGTGCAAACTATCTAGAGATGGGAGATCAAATGTGGAAATG 3980

  4379528 CTTATAAGATGTTTTTAGTTGATGAGATTTCAGGATCTGGGAGCTAAACCTTGAGTTATT 4379587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3981 CTTATAAGATGTTTTTAGTTGATGAGATTTCAGGATCTGGGAGCTAAACCTTGAGTTATT 4040

  4379588 TCATTGCCATTGGGTGGTGGCAGTTGACTTGTTTTCTGCTGTTTCAGTGGACCTTGAAAT 4379647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4041 TCATTGCCATTGGGTGGTGGCAGTTGACTTGTTTTCTGCTGTTTCAGTGGACCTTGAAAT 4100

  4379648 TATCATGACTATTTGCTTCACTTCAGTGTACACCATCCCGCTCCATTTGCAGTCAGCACC 4379707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4101 TATCATGACTATTTGCTTCACTTCAGTGTACACCATCCCGCTCCATTTGCAGTCAGCACC 4160

  4379708 ACTCAGGGAATAAAACATATTCATTCGCAGTGTCCCTAGCAATGACAGAGGTATTTTCAA 4379767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4161 ACTCAGGGAATAAAACATATTCATTCGCAGTGTCCCTAGCAATGACAGAGGTATTTTCAA 4220

  4379768 ATATCTTTTTGCTCTTGAAGAAAGGAGCTCACTTTGCTTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAA 4379827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4221 ATATCTTTTTGCTCTTGAAGAAAGGAGCTCACTTTGCTTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAA 4280

  4379828 AGGACCAATATTTGACACACATCATATTATATTGCAAAGAATAGGAGTGTATGTGTGTGT 4379887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4281 AGGACCAATATTTGACACACATCATATTATATTGCAAAGAATAGGAGTGTATGTGTGTGT 4340

  4379888 ATGCATCTGTATGTGTTTTAGCATAGACATCAAACCAAAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAG 4379947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4341 ATGCATCTGTATGTGTTTTAGCATAGACATCAAACCAAAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAG 4400

  4379948 AGGCAGACAGAGTGAAAGACCCCCAGGAGGACTTGGGTTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTA 4380007
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     4401 AGGCAGACAGAGTGAAAGACCCCCAGGAGGAC-TGGGTTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTA 4459

  4380008 ACTAGTTATGTTACCATCCACAAGTCACCTACTCTTTCTGAGTCTCATTTTCACTATCTG 4380067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 ACTAGTTATGTTACCATCCACAAGTCACCTACTCTTTCTGAGTCTCATTTTCACTATCTG 4519

  4380068 TAGTGCATCAATATCTGCTCTATTCCACCGGAGCATTGTGGGACAAGGTTTCAAACCTAG 4380127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 TAGTGCATCAATATCTGCTCTATTCCACCGGAGCATTGTGGGACAAGGTTTCAAACCTAG 4579

  4380128 AAGGCATCTTGGCTGTATACAGCTAGGAGAAGGAATTATAATTGGTTCATTATTGACTCT 4380187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 AAGGCATCTTGGCTGTATACAGCTAGGAGAAGGAATTATAATTGGTTCATTATTGACTCT 4639

  4380188 TCCTTAAGAAGTTCTAACAGAATAAATTTGCCTTCTTGCCTGCTAATTAGACATGTATTT 4380247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 TCCTTAAGAAGTTCTAACAGAATAAATTTGCCTTCTTGCCTGCTAATTAGACATGTATTT 4699

  4380248 AACTGTTTCTTTTTTAAATAACTCTCTGCTGTTATTTGAAATCTTCTATTATATGTAATA 4380307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 AACTGTTTCTTTTTTAAATAACTCTCTGCTGTTATTTGAAATCTTCTATTATATGTAATA 4759

  4380308 AAAATCTCTGTCACACACACATACACAAAGATAACAATTGGCTCTAAGCAAAATGATTTC 4380367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 AAAATCTCTGTCACACACACATACACAAAGATAACAATTGGCTCTAAGCAAAATGATTTC 4819

  4380368 AGAAATAAGGGGGCAAACTTCAAATTATTACTGCCCATCAAGGAAGTCAGGTGACAACAG 4380427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 AGAAATAAGGGGGCAAACTTCAAATTATTACTGCCCATCAAGGAAGTCAGGTGACAACAG 4879

  4380428 AGTATTGTTAACAACAAAAATATTTTCAAAAGCACCAAAGAAGATAAAAATTTAAATGTC 4380487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 AGTATTGTTAACAACAAAAATATTTTCAAAAGCACCAAAGAAGATAAAAATTTAAATGTC 4939

  4380488 AGAGCTGAAGACAAAGATTTCTATCAGTACATCTCACACTTTTGCATAATCAGAATCACA 4380547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 AGAGCTGAAGACAAAGATTTCTATCAGTACATCTCACACTTTTGCATAATCAGAATCACA 4999

  4380548 TAGGAGAACTTGTTAACTATGCAGATTTCCGGGCCTCACACCAGAGATTCTGAGTCAATA 4380607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5000 TAGGAGAACTTGTTAACTATGCAGATTTCCGGGCCTCACACCAGAGATTCTGAGTCAATA 5059

  4380608 GGACTGAAGTTGGCCAAGAAATCTGGATATTTAGCAAGCTACCTGGCTGATTCAGAGGCA 4380667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5060 GGACTGAAGTTGGCCAAGAAATCTGGATATTTAGCAAGCTACCTGGCTGATTCAGAGGCA 5119

  4380668 AGTAGTTCTTTGAGAATACTTTGAGAAACACTGGTCATTACCAATCAAATATGAACATAT 4380727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5120 AGTAGTTCTTTGAGAATACTTTGAGAAACACTGGTCATTACCAATCAAATATGAACATAT 5179

  4380728 TGTTAAAATTTTTAAATAAAGTACGAAAGAAACTGGTAGAAAGGAGAATGTGGATTTAAT 4380787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5180 TGTTAAAATTTTTAAATAAAGTACGAAAGAAACTGGTAGAAAGGAGAATGTGGATTTAAT 5239

  4380788 TCAACATAAAGTTTTGGGATGGGAGATGCAAGACCCTCCCAAGAATAGAACGAGAAGAGA 4380847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5240 TCAACATAAAGTTTTGGGATGGGAGATGCAAGACCCTCCCAAGAATAGAACGAGAAGAGA 5299

  4380848 AGGACTCCCTGCAATGTCTTATCTCTCAAAATGTCTCTAAGGTGGATCCACAGGAGCTAG 4380907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5300 AGGACTCCCTGCAATGTCTTATCTCTCAAAATGTCTCTAAGGTGGATCCACAGGAGCTAG 5359

  4380908 TTAGTGAAAACAATGGAGGAAAATGTACAAACCCAAGAGGAAAATAAGCCATATAAAATT 4380967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5360 TTAGTGAAAACAATGGAGGAAAATGTACAAACCCAAGAGGAAAATAAGCCATATAAAATT 5419

  4380968 AGAAGAAAAATGTGGGAGGACAGGCAGAAATGGCCAGAGGGTAAGTAGTCTCAGGGATGG 4381027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5420 AGAAGAAAAATGTGGGAGGACAGGCAGAAATGGCCAGAGGGTAAGTAGTCTCAGGGATGG 5479

  4381028 TCAAATTGTTGATGGGTAAAAAGATAGGAGAAATTCAGTAGTCACTGGTCAGAGGGGAAA 4381087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5480 TCAAATTGTTGATGGGTAAAAAGATAGGAGAAATTCAGTAGTCACTGGTCAGAGGGGAAA 5539

  4381088 TCTTACTCATCAAAAAGGAGAGGAAGAACCAAGTAAGTGAGAAAACAGTAAAAATGTGAA 4381147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5540 TCTTACTCATCAAAAAGGAGAGGAAGAACCAAGTAAGTGAGAAAACAGTAAAAATGTGAA 5599

  4381148 TGACTTTACATTTTTAAGAAAATGACATACAATCTTCATGGAAAATTTGGTGGTGGGGAA 4381207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5600 TGACTTTACATTTTTAAGAAAATGACATACAATCTTCATGGAAAATTTGGTGGTGGGGAA 5659

  4381208 ATAAAATGAGTTCAACATGAAAATATCTTTAAAAAGTATCTTAGAGGAATTTTAGGATAG 4381267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5660 ATAAAATGAGTTCAACATGAAAATATCTTTAAAAAGTATCTTAGAGGAATTTTAGGATAG 5719

  4381268 AAGATGAGAAAGTACTTTGAAAAGTATAAAGAATGAATTACATGATTATTGCTTGCAGTA 4381327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5720 AAGATGAGAAAGTACTTTGAAAAGTATAAAGAATGAATTACATGATTATTGCTTGCGGTA 5779

  4381328 TTTTCATGATTATCAAATTTTTTCACTGTCTGCCTGGCTCATAAGGTAGTTAAAGAGGGC 4381387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5780 TTTTCATGATTATCAAATTTTTTCACTGTCTGCCTGGCTCATAAGGTAGTTAAAGAGGGC 5839

  4381388 TCTATGACATTATCTTTGGATCCCCAGAGCCTAACAGTATCTGATATATAATAAGCACCA 4381447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5840 TCTATGACATTATCTTTGGATCCCCAGAGCCTAACAGTATCTGATATATAATAAGCACCA 5899

  4381448 ACCGGACGGACAAATGGATGGGTAAATCAAGTTAACACAGGAAAAGATAAGAGTTGCATG 4381507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5900 ACCGGACGGACAAATGGATGGGTAAATCAAGTTAACACAGGAAAAGATAAGAGTTGCATG 5959

  4381508 GTCACATAGTACTCACAAAGCCTTACAGGTTTCATTCTCTGATTTTATGAACACAGCACT 4381567
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5960 GCCACATAGTACTCACAAAGCCTTACAGGTTTCATTCTCTGATTTTATGAACACAGCACT 6019

  4381568 CACGCACATTTTGGTACTAATATCTGCATGCATGAACCTCCAACTGGGGCATGCCTGTTT 4381627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6020 CACGCACATTTTGGTACTAATATCTGCATGCATGAACCTCCAACTGGGGCATGCCTGTTT 6079

  4381628 GTCTTCCTGAAGGAAGTACTTCTTGATTCATTTTACTTGGTGCATCAGTTGTCTACCTGC 4381687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6080 GTCTTCCTGAAGGAAGTACTTCTTGATTCATTTTACTTGGTGCATCAGTTGTCTACCTGC 6139

  4381688 TGCCCCTGAGCTGCACTTTCACCTTATTCCATCCTGTCTGTATTGCTGGGGCTGTGGGAA 4381747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6140 TGCCCCTGAGCTGCACTTTCACCTTATTCCATCCTGTCTGTATTGCTGGGGCTGTGGGAA 6199

  4381748 TCCACAAACTCCATTTTCCAGACTCCTTTACTACCTGGCTTTCTGTTATGTCTGGCAAGA 4381807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6200 TCCACAAACTCCATTTTCCAGACTCCTTTACTACCTGGCTTTCTGTTATGTCTGGCAAGA 6259

  4381808 GGAAGAGCCATTATTTCTTTCTTATACTCTCTTTGTTTCTGCTGTTGGTTCTGGAAGTAG 4381867
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6260 GGAAGAGCCATTATTTCTTTCTTATACTCTCTTTGTTTCTGCTGTTGTTTCTGGAAGTAG 6319

  4381868 CTGTGCCCCTTCAGTGACCCAAGGTTCTGCTGGAACTGCCCTTAATTGGTCCCGGCTGTG 4381927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 CTGTGCCCCTTCAGTGACCCAAGGTTCTGCTGGAACTGCCCTTAATTGGTCCCGGCTGTG 6379

  4381928 GCTAGGGAGACCATCCTTGGCAGTCCCAGCACAGGCTGGGTGGAATCCCTTAAGGCCTGC 4381987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6380 GCTAGGGAGACCATCCTTGGCAGTCCCAGCACAGGCTGGGTGGAATCCCTTAAGGCCTGC 6439

  4381988 TCCTGGACTTTGACAGCTCCTCTTCAGTTTCATTCCCCCAGTTCCTAAGGCTGGTAGCCG 4382047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6440 TCCTGGACTTTGACAGCTCCTCTTCAGTTTCATTCCCCCAGTTCCTAAGGCTGGTAGCCG 6499

  4382048 CTCTCTACAGATACTAATCTCGGAATGTCACCCTTTTCCCTTTTTGCTTCTTTAGCTCCC 4382107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6500 CTCTCTACAGATACTAATCTCGGAATGTCACCCTTTTCCCTTTTTGCTTCTTTAGCTCCC 6559

  4382108 TTGCTTATCTGTTCCAATGCCCGTAATACCAAAATCTGTAGTAAATCCCTTTTATTTGAA 4382167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6560 TTGCTTATCTGTTCCAATGCCCGTAATACCAAAATCTGTAGTAAATCCCTTTTATTTGAA 6619

  4382168 ACATCTAGAGTGGTTTCTGTTTTTCTGGCCAGATGCTGAATGACACATCTGGAAAAATCA 4382227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6620 ACATCTAGAGTGGTTTCTGTTTTTCTGGCCAGATGCTGAATGACACATCTGGAAAAATCA 6679

  4382228 GGGTAAATATTATTACTCTAGGTATTGAAAGTACAGATTGGAGAACATTTCGTTTGTTCC 4382287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6680 GGGTAAATATTATTACTCTAGGTATTGAAAGTACAGATTGGAGAACATTTCGTTTGTTCC 6739

  4382288 AGAAGAATCCTGAATGAAAACCGAAATTCAACTGGAGAGTTAGAGCATTATTGAACAGTA 4382347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6740 AGAAGAATCCTGAATGAAAACCGAAATTCAACTGGAGAGTTAGAGCATTATTGAACAGTA 6799

  4382348 TGTGTAGGGAATAAAATGCCTTTCCCCCATCCTGGAATACCTCCCTGATTATACTACCTT 4382407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6800 TGTGTAGGGAATAAAATGCCTTTCCCCCATCCTGGAATACCTCCCTGATTATACTACCTT 6859

  4382408 ATTACTGTGATTGTTTTTTAACTTCTCTGCTTTTTCACACAAATCTACAAGAATCTCCTC 4382467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6860 ATTACTGTGATTGTTTTTTAACTTCTCTGCTTTTTCACACAAATCTACAAGAATCTCCTC 6919

  4382468 TTCCTGGAAGCCTCTCTGATTACCTCACACAAACATCATCTTGCTTAGTCTGAATTCCTA 4382527
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6920 TTCCTGGAAGCCTCTCTGATTACCGCACACAAACATCATCTTGCTTAGTCTGAATTCCTA 6979

  4382528 TGGTTCTTTTGTTCTCTGACTTCTAGAGTATTTCTCCAGGTATGTTAGCAATCAGTTTTT 4382587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6980 TGGTTCTTTTGTTCTCTGACTTCTAGAGTATTTCTCCAGGTATGTTAGCAATCAGTTTTT 7039

  4382588 CTCTTGATCACTCCCCAAACCTGAGTGATCATCAGAATCCTCAGAAAAATATAGATACCA 4382647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7040 CTCTTGATCACTCCCCAAACCTGAGTGATCATCAGAATCCTCAGAAAAATATAGATACCA 7099

  4382648 GGCCCTTCTCCTTGTCCTAACCTCCTGAGACAAAATTCTAGAGTGATGAGTGGGTACTAT 4382707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7100 GGCCCTTCTCCTTGTCCTAACCTCCTGAGACAAAATTCTAGAGTGATGAGTGGGTACTAT 7159

  4382708 AGGGTCGAGACAGCATCTATATATATTTTAATACCTCTCAGATGATAAACCCTTCAAGAT 4382767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7160 AGGGTCGAGACAGCATCTATATATATTTTAATACCTCTCAGATGATAAACCCTTCAAGAT 7219

  4382768 CAGGGCCTTTCCATTTCTCATGTAGCTTTTACTGTACCTAATACAGTTTAAGCAGACCAT 4382827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7220 CAGGGCCTTTCCATTTCTCATGTAGCTTTTACTGTACCTAATACAGTTTAAGCAGACCAT 7279

  4382828 AAAAATCTGTTCATTTTCTAATGAATTACATGAGGGAAGATTCCCAGGAAGACCAGCTGG 4382887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7280 AAAAATCTGTTCATTTTCTAATGAATTACATGAGGGAAGATTCCCAGGAAGACCAGCTGG 7339

  4382888 TGTCACTACTGCCTAATTAATATTTCTGGCCCAGGGAAGGGCATCTCACAAAGCAAAATT 4382947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7340 TGTCACTACTGCCTAATTAATATTTCTGGCCCAGGGAAGGGCATCTCACAAAGCAAAATT 7399

  4382948 TGACCTTACCTGGATTCACCGATTCTGTGCTTGAATCCATCTTCCCATCTGTCTATTTTC 4383007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7400 TGACCTTACCTGGATTCACCGATTCTGTGCTTGAATCCATCTTCCCATCTGTCTATTTTC 7459

  4383008 CTAAAAGGAAGTTGCAGAAACCTTGCCAAGAAAATAGACAGCAAAACTTCAGCAGTACCA 4383067
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7460 CTAAAAGGGAGTTGCAGAAACCTTGCCAAGAAAATAGACAGCAAAACTTCAGCAGTACCA 7519

  4383068 ATAACTTGGGTTTTCTGAAAGGAAATGATGCCATGACCTGAGGCTGCCAGACTTAATGTG 4383127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7520 ATAACTTGGGTTTTCTGAAAGGAAATGATGCCATGACCTGAGGCTGCCAGACTTAATGTG 7579

  4383128 AGAAAGCAAGAACTGAAACGAGTAGAAGTAGGCCTCCCACTGGCCCAAGGCCTAAGATTT 4383187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7580 AGAAAGCAAGAACTGAAACGAGTAGAAGTAGGCCTCCCACTGGCCCAAGGCCTAAGATTT 7639

  4383188 CATTGCACTTGCTTCTTGGCATTAACATTCTGTAGAACAAGTTTCAGAAAAAAACGCTTA 4383247
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     7640 CATTGCACTTGCTTCTTGGCATTAACATTCTATAGAACAAGTTTCAGAAAAAAACGCTTA 7699

  4383248 ACGAATTTGCAAGCACAACCAAACTCCAACCAGATTGCATTTTTTATTCACCTTTTACAA 4383307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7700 ACGAATTTGCAAGCACAACCAAACTCCAACCAGATTGCATTTTTTATTCACCTTTTACAA 7759

  4383308 TCTCATTCATTTTCCATAACATTTGGAACTGCTGTTTGAAAGTTTAATTTTCCTTTTTAT 4383367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7760 TCTCATTCATTTTCCATAACATTTGGAACTGCTGTTTGAAAGTTTAATTTTCCTTTTTAT 7819

  4383368 CTACTATTTTCTTATTATTGACTTAAATTATTCTTGATTCATGGATAAGCAAACTAATGT 4383427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7820 CTACTATTTTCTTATTATTGACTTAAATTATTCTTGATTCATGGATAAGCAAACTAATGT 7879

  4383428 GGGTCTACCCTGAGTCATTTATTATGTATCAAAGATAACATAGAACTCTTCACTTCTGGC 4383487
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     7880 GGGTCTACCCTGAGTCATTTATTATGTATCGAAGATAACATAGAACTCTTCACTTCTGGC 7939

  4383488 AGAAGCTGTTTAGTAATTACTTCTAATTACTAACAAATTAAGAACAGCATGTGCTCCAAA 4383547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7940 AGAAGCTGTTTAGTAATTACTTCTAATTACTAACAAATTAAGAACAGCATGTGCTCCAAA 7999

  4383548 AGCAGTTTCTATACAAGCTCAAACCTGGCTATATTTCAACACTTCTAAATTCTAATTCTC 4383607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8000 AGCAGTTTCTATACAAGCTCAAACCTGGCTATATTTCAACACTTCTAAATTCTAATTCTC 8059

  4383608 TGGATGCAGAAAAAAATCTATTAAGATGGTTAAAAGGAAATAAAATCTAGATGTATAAGT 4383667
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8060 TGGATGCAG-AAAAAATCTATTAAGATGGTTAAAAGGAAATAAAATCTAGATGTATAAGT 8118

  4383668 CCAAAAGAAGTCTCCAAAAGTCCCCTATAACCTTTCTTAGGTAATATGACTTGATCATCT 4383727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8119 CCAAAAGAAGTCTCCAAAAGTCCCCTATAACCTTTCTTAGGTAATATGACTTGATCATCT 8178

  4383728 CCATTTGAACATTTACTTCCAGAAAAGTAGATTTTTGGGATAATCAGCCTCTTTGTGTTG 4383787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8179 CCATTTGAACATTTACTTCCAGAAAAGTAGATTTTTGGGATAATCAGCCTCTTTGTGTTG 8238

  4383788 ATTGACCACAAACTTCTATGTTCAGAAGTTTACATTTTAATTAAGAGGGAGGTATTGAAT 4383847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     8239 ATTGACCACAAACTTCTATGTTCAGAAGTTTACATTTTAATTAAGAGGGAGGTACTGAAT 8298

  4383848 GGTAACTGGATCTCCAGTAGTTGAAATGGGCTTCTCCTTGTCTAGAATAAAGGCCTTTGT 4383907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8299 GGTAACTGGATCTCCAGTAGTTGAAATGGGCTTCTCCTTGTCTAGAATAAAGGCCTTTGT 8358

  4383908 TAGCTAGGTGGTCCTAGAGAGAGCACGAACCCCTCAATTCCTCTCCTTCAAGACTTACAG 4383967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8359 TAGCTAGGTGGTCCTAGAGAGAGCACGAACCCCTCAATTCCTCTCCTTCAAGACTTACAG 8418

  4383968 CCTTAAATATCCATGGAACTACCCCCACTTCTCAGGGAGTTTGTGTGCCATTGGCTGCCA 4384027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8419 CCTTAAATATCCATGGAACTACCCCCACTTCTCAGGGAGTTTGTGTGCCATTGGCTGCCA 8478

  4384028 ATCAGTCATGTCATTTATAGGGCAGATGAGAGTAGTCTCTTTTATTTCCCACTTGGTACT 4384087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8479 ATCAGTCATGTCATTTATAGGGCAGATGAGAGTAGTCTCTTTTATTTCCCACTTGGTACT 8538

  4384088 GAAGAAGTTGTGGCCTTTGGGGGTTAACCAGTTACTGCCCAGCACACTGTACACAGATCG 4384147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8539 GAAGAAGTTGTGGCCTTTGGGGGTTAACCAGTTACTGCCCAGCACACTGTACACAGATCG 8598

  4384148 TGCCAATGAGGTGTACACGTTTTCCTCCTGCTCACTTTGTGGAGCACACTGGTGGTGAAC 4384207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8599 TGCCAATGAGGTGTACACGTTTTCCTCCTGCTCACTTTGTGGAGCACACTGGTGGTGAAC 8658

  4384208 ACAGGGTGCTGGACCTTATAAGGGGTTTCCATCATGGAGGAATCTTTTGAAACAACAGCA 4384267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8659 ACAGGGTGCTGGACCTTATAAGGGGTTTCCATCATGGAGGAATCTTTTGAAACAACAGCA 8718

  4384268 GTGCTGCCAGAGGTGGGAAAACGGAACTACTTTTTAGATAATACTGTTCAGTTAGCCAGG 4384327
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8719 GTGCTGCCAGAGGTGGGAAAATGGAACTACTTTTTAGATAATACTGTTCAGTTAGCCAGG 8778

  4384328 ACTCACCTTCACTGGAAAAAAAAAAACTTTTTAGAAATTCCAAATGAAGATAAAAATTTA 4384387
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8779 ACTCACCTTCACTGG-AAAAAAAAAACTTTTTAGAAATTCCAAATGAAGATAAAAATTTA 8837

  4384388 TTTTCTAAGTTGTCAATATCAGCTTTGTGTTCTTTAACAAGGACTATTACTCATGGTTGA 4384447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8838 TTTTCTAAGTTGTCAATATCAGCTTTGTGTTCTTTAACAAGGACTATTACTCATGGTTGA 8897

  4384448 TTGTTTGCCAATGGCATTGAAATTGTTTCTTTTTCTCTTTCTTTCTCTCTCTTTCCCTCC 4384507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8898 TTGTTTGCCAATGGCATTGAAATTGTTTCTTTTTCTCTTTCTTTCTCTCTCTTTCCCTCC 8957

  4384508 CTTCCTTCCTTCTTTTCTTCCTTACTTCTTTCCTTTATATAATATATATAAAACCTCTTT 4384567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8958 CTTCCTTCCTTCTTTTCTTCCTTACTTCTTTCCTTTATATAATATATATAAAACCTCTTT 9017

  4384568 CCTTTATATATAATATATATGTATATATATTTATGACTCTCTAATTTCTTCCC 4384620
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9018 CCTTTATATATAATATATATGTATATATATTTATGACTCTCTAATTTCTTCCC 9070

Alignment time is 7.47891 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,   6342] =>      6342 nucs 'mol-32-34b3-125712_6342'

Score:        6177
Aligned:      6346        nucs
Identic:      6329 (100%) nucs =>      6168 (100%)       161 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4370234,4376417] EXCISED REGION [4377645,4377806]
 second seq =>  [      1,   6180] EXCISED REGION [   6181,   6342]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [6179,6180] to [6181,6182]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4370234 AAGTTCAAATTGTCCTGGGTTTCTGGATCAGTGGGGCCCTCCCCTTCCATGTGACAGTCT 4370293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGTTCAAATTGTCCTGGGTTTCTGGATCAGTGGGGCCCTCCCCTTCCATGTGACAGTCT 60

  4370294 TCAGATGAGTGAGCAGCATCACTTCCTCAGACTCCTCCAGGACAGCAGCCCTGCTCCTCC 4370353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAGATGAGTGAGCAGCATCACTTCCTCAGACTCCTCCAGGACAGCAGCCCTGCTCCTCC 120

  4370354 TACCCTTCCCTGAGAGCCATGGGGTGTTGCCTTGTCTCTAGCCCAGTGTTGCGTGTTTCT 4370413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACCCTTCCCTGAGAGCCATGGGGTGTTGCCTTGTCTCTAGCCCAGTGTTGCGTGTTTCT 180

  4370414 TGGGTTCTCGTTAGATTTTCAGCTGTAAATATAGGACTTCATCTCACTTAGTTAAATCTC 4370473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGGTTCTCGTTAGATTTTCAGCTGTAAATATAGGACTTCATCTCACTTAGTTAAATCTC 240

  4370474 CTTAAGTTTGGTTCCTTTCCTTCATTATTCCAAATTGTCAAGACCTTTGAGGATTTGGAT 4370533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTAAGTTTGGTTCCTTTCCTTCATTATTCCAAATTGTCAAGACCTTTGAGGATTTGGAT 300

  4370534 TTGATCACACCCTCTTTTTCTCTGGATCATGATAGATCTGAAACTGTGCCTCGTGTGGAA 4370593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGATCACACCCTCTTTTTCTCTGGATCATGATAGATCTGAAACTGTGCCTCGTGTGGAA 360

  4370594 GGACAGAAGAACGGAAGCTGCATAATATCAGGATTTCTAAATATTAAACATGCTATATTT 4370653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGACAGAAGAACGGAAGCTGCATAATATCAGGATTTCTAAATATTAAACATGCTATATTT 420

  4370654 AATATGTATTTAATATACATAATAGAGTGTATTTTATATTCTGTAATAAATAAAATATAT 4370713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATATGTATTTAATATACATAATAGAGTGTATTTTATATTCTGTAATAAATAAAATATAT 480

  4370714 TATTTTTAATTAATTAAATTTAGCATAGTATTATATCCTTTCATTCAATTAAAGTATGAA 4370773
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      481 TATTTTTAATTAATTAAATTTAGCGTAGTATTATATCCTTTCATTCAATTGAAGTATGAA 540

  4370774 GTTCACCCATTCTCAACGTACATTGGAAATTCAAAAGAAAACAGCAGACCTGCTCCTGCT 4370833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTCACCCATTCTCAACGTACATTGGAAATTCAAAAGAAAACAGCAGACCTGCTCCTGCT 600

  4370834 TCCAGAAACACTCAAAATAAAGACATATGAATATATAGGAACCACAAATTAGTGAAACCT 4370893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCAGAAACACTCAAAATAAAGACATATGAATATATAGGAACCACAAATTAGTGAAACCT 660

  4370894 CAGAAGGCAAAAGATATCATAACGCCTTCAAAATAGCATAAAAGACTCCTATTTTTGTAA 4370953
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGAAGGTAAAAGATATCATAACGCCTTCAAAATAGCATAAAAGACTCCTATTTTTGTAA 720

  4370954 ATTAAGAAGGAAAATTGCAAAGATTAAGCTACTGAAGATGTGAGCCCTCAAATGTTAACA 4371013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTAAGAAGGAAAATTGCAAAGATTAAGCTACTGAAGATGTGAGCCCTCAAATGTTAACA 780

  4371014 GTGACCTGGGTTGGGTAGAATTATACTTTCCTTGGCTTTTTCATTTTATTCACTTGTATT 4371073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGACCTGGGTTGGGTAGAATTATACTTTCCTTGGCTTTTTCATTTTATTCACTTGTATT 840

  4371074 GTCTAAAATTCTAATTTTTGTAATAAGAAAAAAATATAATTTTTTGGTTCTTTTTAAAAA 4371133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCTAAAATTCTAATTTTTGTAATAAGAAAAAAATATAATTTTTTGGTTCTTTTTAAAAA 900

  4371134 TGCATGCATAAACCATTTGGTCAGGCCTGGTTACTAGGCTTGGCAGCTCCTCTGTTCCTC 4371193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCATGCATAAACCATTTGGTCAGGCCTGGTTACTAGGCTTGGCAGCTCCTCTGTTCCTC 960

  4371194 ACAAAGGGAAACACAATTTCCATCGGCTGATTCAGCGCTTGCTCAGGACAAATCCTGGCT 4371253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACAAAGGGAAACACAATTTCCATCGGCTGATTCAGCGCTTGCTCAGGACAAATCCTGGCT 1020

  4371254 GACTGGGACAGGAGGCATTTAAGTAACCATAGTGCACTGTAGGGAAATAGGCATGGCTGA 4371313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GACTGGGACAGGAGGCATTTAAGTAACCATAGTGCACTGTAGGGAAATAGGCATGGCTGA 1080

  4371314 GTCAGTCCCTCTTATGGGCTGTCCCCGAAGGCCCACTCCACTTCTTCCACTGGATATGAC 4371373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCAGTCCCTCTTATGGGCTGTCCCCGAAGGCCCACTCCACTTCTTCCACTGGATATGAC 1140

  4371374 CTCAGTCGTCCTAAGCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAAC 4371433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCAGTCGTCCTAAGCCCCAGGCTCCTCCTCCCCATAAGTGCTAAGCCTTTCCTTTGAAC 1200

  4371434 TTCTGTATGTGGCCTGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTC 4371493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCTGTATGTGGCCTGTGTTGCTCTGCAAACTCCTTTACTCGAAGGTTGGAGTCTTGTTC 1260

  4371494 ACAAATCCTGGCCCAGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGG 4371553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAAATCCTGGCCCAGTAACAGCAGTTCAGATGGTTTTCGCTGCCTAGACTTGCCAATGG 1320

  4371554 GGACACCCTACCACCCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGA 4371613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGACACCCTACCACCCCTAACCCCCAGCCTGTGCCCCTCCTTGCTGATCTCTCACTGGGA 1380

  4371614 TCCACTAGGTATAGGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATC 4371673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCACTAGGTATAGGACTACCACTACAACCTTTCAACTGGCCTCTGCCCCCTGCCTCATC 1440

  4371674 TCTCTCACTACTCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACAC 4371733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTCTCACTACTCACTACTCCATTGTGGCAAAAGTCATCTTTGCAAAACAGAAATTACAC 1500

  4371734 CACGTTACTTCTCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAAT 4371793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACGTTACTTCTCTTAGGCTTTAAAGTGGGTCCCCATCTCCTACAAAATGAATTTAAAAT 1560

  4371794 CCTTAGCCTGGCTCCAGTTGCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCAC 4371853
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTTAGCCTGGCTCCAGTCGCCCTGAAGATCTGAACTTTTGCTTCAAAGATAGAGGCCAC 1620

  4371854 TTCTTAGTTCTTTTGAATATCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCA 4371913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCTTAGTTCTTTTGAATATCACACAATAAACGCATCCAGAATTGAACTGTGTCCTCCCA 1680

  4371914 CCTACTTCGATGCTCAGCTCTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAATTGCACCT 4371973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1681 CCTACTTCGATGCTCAGCTCTGCCTGTCTGCTCACCCCTTCTCTGGCCATAAATGCACCT 1740

  4371974 GGGTTTTTGTCAGCCCCCTTCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTG 4372033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGTTTTTGTCAGCCCCCTTCTGGTCCAGCCTCCATGAATAGGTCTGGTCTTGGGTCTTG 1800

  4372034 CCCCCTCCTCTCCTGTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTG 4372093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCCCCTCCTCTCCTGTGGGATCCCTGTTATTTTGAAGATATGACTGAGTAACTGCTATTG 1860

  4372094 AACCAGTTCTGCTTATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGT 4372153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AACCAGTTCTGCTTATGCTGTGAAGGGTGGCCGAAGTGTCCTGAGGCAGGAGGAATTAGT 1920

  4372154 CTAGAAAGAATTCCAGATGAAGAAAGAGAGAGTGCCAGTTTCATCATGTATGTACCACCC 4372213
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1921 CTAGAAAGAATTCCAGATGAAGAAAGAGAGAGTGCTAGTTTCATCATGTATGTACCACCC 1980

  4372214 GTGCAGTTGCCAGGACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATC 4372273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTGCAGTTGCCAGGACCCCGTGCTCAGATGGGCTTGGTTTAATGCTTTGCTGTTGCCATC 2040

  4372274 TTGAAACTTTTAATAACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTC 4372333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTGAAACTTTTAATAACTTTATTTTTTAACCAGGTTGTATTAATCATTGATTTTATTTTC 2100

  4372334 TGTATTTGATGGTGCTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTC 4372393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTATTTGATGGTGCTTTGACATCTTGGGGCTTTGTGGATCTGGGGTGGTACTGCCCCTC 2160

  4372394 CCATGGTTAGCTAATTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAA 4372453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCATGGTTAGCTAATTCCTAGAGATAGCAAACATCAACTTGCCTGTAAGCATGTCTTCAA 2220

  4372454 CATGCAAACCAACCAGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTAC 4372513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CATGCAAACCAACCAGTCCAGAGTCGATACTTCAAATCACCTCCTCTATCTGGCTTTTAC 2280

  4372514 ACTTCAGGAGGCAATACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 4372573
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
     2281 ACTTCAGGAGGCAATACTCCTCTGCACAGTGACCCTCCAATAAAAAAAAAAAAAAAA--- 2337

  4372574 TCACACAGCGCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTC 4372633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TCACACAGCGCGTGCACCTAAATTCTAACTTAAGGAATTTGCGTCAAATTTAAGACTTTC 2397

  4372634 TAAATTTAACTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAG 4372693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TAAATTTAACTAATCTTAGGGACCGATGACCAAACGGAGAAAGTCTTGTGGCTTGGGGAG 2457

  4372694 ACCCAGATCTGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAA 4372753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 ACCCAGATCTGCTTAAATACATGATTTTCCTAAAGACTCCTAAAAATAGAATCAAGGGAA 2517

  4372754 GATGCTATAAAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTT 4372813
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GATGCTATGAAGTTATGATAGCTCATCTAACTTTTGAAGGAATCTTGTGCTATTATCCTT 2577

  4372814 ATTTCACCTACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGG 4372873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 ATTTCACCTACGTTCTCACCTCCTGCCACTTTGGCAGGTATTACCCTAAGCAATGATAGG 2637

  4372874 GACTCCACCATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACG 4372933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 GACTCCACCATTCTTCCCCAGCCTCTAATGGGCAGTGACTTCTCAGGAACAAGGAGAACG 2697

  4372934 GCTGATATTTCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCAC 4372993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 GCTGATATTTCTATCTACCTCAGGGCCTTGTGCAGTGATTGGTACTAGTAGGTACTGCAC 2757

  4372994 AGAAGTTTGCAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATG 4373053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 AGAAGTTTGCAGAAAGCAAAAATGTACCATAAAGAAAAACACAAGTTGGAATATTAAATG 2817

  4373054 GCCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCA 4373113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GCCTATCTCAGAACTAGGGATAACCCCCAGAAAAGTGGCTTCCCTGTTTCCTAAGTTCCA 2877

  4373114 AGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATA 4373173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 AGCACAGAAAAATACGGGCTTTTGTGATTTCCCCATCTCAAAATGATGCTTACTTATATA 2937

  4373174 AAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGA 4373233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 AAACTGAACTTTCCTGATAGTACCTGGTGTACCTAGAATGCCATTCTCAGACATCACTGA 2997

  4373234 TCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAA 4373293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TCACGCATGCATTAAGGCAGAGTATGAGCAGTTAACAGCTTCCAGGTCCCCTTCACCTAA 3057

  4373294 ATCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTC 4373353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 ATCAGTAGTTTCCCATCCTGGCTGTATTTCAGAATCACCTGGGGGAAATTGGGAAATCTC 3117

  4373354 AAGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAG 4373413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 AAGATTCACTGAAGAACTACTAATTCAGAATCTGGGAGTAGTAGGGGATGCGGATGGGAG 3177

  4373414 GTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAA 4373473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GTTAAATCCTTTCCACATGGTTCTGATAGAGTTGATCCACATCCAGCATTGGGGAACAAA 3237

  4373474 CTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACAC 4373533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 CTGCTCTGGGGGGAAAAACTGTTGAAGCTGCACGTATTTCTGGGACCACTCAATTTACAC 3297

  4373534 CAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTG 4373593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CAATAATCAATTTGAAATATTTAAATACGATGCAAACTCCCTGGCCAAGTTATCCTTTTG 3357

  4373594 GGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAA 4373653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GGAGCTAAAAAAATACTTCCTAACACTTAGAAATTAATGAGTTTTTGTTATCTAGGGGAA 3417

  4373654 AACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAG 4373713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 AACATAATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAG 3477

  4373714 GCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAAT 4373773
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 GCTGTAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCATGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAAT 3537

  4373774 TCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTA 4373833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 TCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCGCACAACCACGCCCAGTTA 3597

  4373834 ATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTC 4373893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 ATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCAAATTC 3657

  4373894 CTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCA 4373953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 CTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCA 3717

  4373954 CCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACA 4374013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 CCGCGCCTGGCCGAAAATGTAATTTTCAAACTGTGACTATTGAACAATTTACTTCATACA 3777

  4374014 TGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGA 4374073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TGGGCACCTTTTTAACAGTTACATTTCACATCTTGCAACGAATGGAATAGGTAATGGTGA 3837

  4374074 TGCTTTTGGCGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTG 4374133
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 TGCTTTTGGGGGATACACGAAATCTGTCCACCTGTATTCCTCTATTTAATTTTGCTACTG 3897

  4374134 AAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGAT 4374193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 AAGGGCAGAGAAGGACCTGCTTGTTGAAACTGCTTCAGTGATACTGCCTTCTAATTGGAT 3957

  4374194 GCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCC 4374253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 GCCAGCACCATCAGGTATTTCTCCTCCAAGAGAAGTTACAAAATGAATTAGAACAACTCC 4017

  4374254 CCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTAT 4374313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 CCTTCTCTGAAGCAATGGCTGTTATGGGCTAAATCCTCTATATCTTACTCCCTGCTTTAT 4077

  4374314 CTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCG 4374373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 CTATCCCTGCAAAGGAAAAAGATGGAAAGGGCTGCTGTGGATACTTTTGACTGTTCTCCG 4137

  4374374 GGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGG 4374433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 GGCTCCTTGCTATCTTGAAACTTCCACCTTATAGCATATTTCAAAAGAACCAATATTGGG 4197

  4374434 TCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACAC 4374493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TCTAATATGGATAGGATTTCCAACTAATTATTGGCCAGTCTCTAAAAGAGCCCCTCACAC 4257

  4374494 AGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGG 4374553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 AGGCTCAGCCTGAAGCCCTTAAGATGCCCTTAAGCCTGTCCAGGCAAAGCTCACACATGG 4317

  4374554 CGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGT 4374613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 CGGCTGTCTCTCTCACATCCCTTTCTTGGGGAACTATTCCCCCTTCCTCCTCTGTGTGGT 4377

  4374614 TCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGAC 4374673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TCCGACAAGGCTGTCAATCAGGGCATCTTGTCTTCTCCACCAGGAGGAAGAGAATGAGAC 4437

  4374674 CTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGC 4374733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CTAAGTTGGCAGCAAAGCCCTCTCATCTTCTAGATGAATGATCACATACATAAAGCAGGC 4497

  4374734 TTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGG 4374793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 TTATAATAAAAAATGTATACAAGACTCAAACGTCCAAGAAAGTCAATTAGCTACACTCGG 4557

  4374794 AGAGAACCACCGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGT 4374853
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 AGAGAACCACAGTCACTTATTTATTGCACGCATCTGCCATCAACACACATGCACATATGT 4617

  4374854 GCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGA 4374913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 GCACACAATTGAATATACTATTTTGCCATCCATTTTTTTCCACCTGACAACTCATCTCGA 4677

  4374914 GCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTT 4374973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 GCATTTTTCTATGTGGTGAAATATTATTCTGCAGCTTGCTATTTACAATTTGCAACAGTT 4737

  4374974 TGCCGCTAGATGATTATTTCAACCCCCCTACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTT 4375033
          |||||||||||||||||||||.|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 TGCCGCTAGATGATTATTTCACCCCCCC-ACTGTTGGACATTTGTGTTGTTTCTAACTTT 4796

  4375034 TCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCT 4375093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 TCACTATTATTATAAAATGATGCTTTGATTGCTCTCTGCTTGATCTTAAATGCAAATCCT 4856

  4375094 ATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTG 4375153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 ATCTTATCCTGACAGAACCCACTGTTCTTAGTCATTTCCCACTTTGCAAAAATGAATTTG 4916

  4375154 GAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGG 4375213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 GAATTCTTTCAGGAGTGCTGACCTCCTATAATCAGCCTCGTTCAAAAGAGGTTTGAAGGG 4976

  4375214 AAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTC 4375273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 AAGGGGAGTTACAATCAAGTCTAATGAACTCCCAACATCAGAATGACAAATATCTCCTTC 5036

  4375274 AGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCA 4375333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 AGTAGAAGTAAAGGAGATCACAAAGTTCTCGTGGAACAAACAGAACTTTGGCTTTTTTCA 5096

  4375334 GGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTT 4375393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 GGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTATAGTATATACAAGTTT 5156

  4375394 CCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAA 4375453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 CCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTTATAATATAAATGTAA 5216

  4375454 GGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGA 4375513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 GGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAAGATGTTTTCAGCTGA 5276

  4375514 CTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCAC 4375573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 CTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAACAAAAGATAATCCAC 5336

  4375574 AGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACG 4375633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 AGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACTAAGTAGAACTACACG 5396

  4375634 TCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGG 4375693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 TCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTCATCATTGTCTAGTGG 5456

  4375694 CTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATA 4375753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 CTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCCTGTTGCCAACCAATA 5516

  4375754 ACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAA 4375813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 ACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTAGTACTTGACAGAAAA 5576

  4375814 CATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTT 4375873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 CATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCATTCCTAAGAAACTTT 5636

  4375874 GGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTAC 4375933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 GGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTTTCTAGTGCCAGCTAC 5696

  4375934 ACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGTGAGTCC 4375993
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5697 ACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTAAAAGAAAGAGAGTCC 5756

  4375994 CTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGC 4376053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 CTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACATATGCTGAATTCTGC 5816

  4376054 TGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCT 4376113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 TGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAGTTGGGTTAGCAATCT 5876

  4376114 GGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGA 4376173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 GGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAAAGTTCTCAGGCATGA 5936

  4376174 CTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTT 4376233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 CTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTTTCAGGGGAAGATGTT 5996

  4376234 AGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGG 4376293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 AGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTAATTCATCTTTTCAGG 6056

  4376294 TGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTT 4376353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 TGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAGAGGCTGAAGATTGTT 6116

  4376354 TTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAA 4376413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 TTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCAGTTTAAAAAGTAGAA 6176

  4376414 TCTA 4376417
          ||||
     6177 TCTA 6180

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 6240

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6241 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 6300

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTG 4377806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTG 6342

Alignment time is 4.6784 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [4366417,4387644] =>     21228 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [      1,  11049] =>     11049 nucs 'mol-32-34d4-128441_11049'

Score:       10681
Aligned:     11075        nucs
Identic:     11022 (100%) nucs =>      1098 (100%)      9924 ( 99%)
Gaps:           29 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [4375319,4376417] EXCISED REGION [4377645,4387617]
 second seq =>  [      1,   1099] EXCISED REGION [   1100,  11049]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1227 nucs [4376418,4377644]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [4376418,4376421] to [4377645,4377648]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [4376416,4376417] to [4377645,4377646]
 second seq =>         2 nucs [1098,1099] to [1100,1101]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [4376418,4376420] to [4377642,4377644]
 second seq =>         0 nucs

  4375319 CTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTAT 4375378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTGGCTTTTTTCAGGTTGAGAGTGTGGGTACAGAGAGAAAAGGGATATATCAAATTAT 60

  4375379 AGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTT 4375438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTATATACAAGTTTCCTTTATACCTTTAATGAAGGATGAAAACAATTTGCGACTGTTTT 120

  4375439 ATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAA 4375498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAATATAAATGTAAGGTTTCTTCTGTGTTTGTGCTACATTGAAGATTAATCTTTCTGAA 180

  4375499 GATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAA 4375558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATGTTTTCAGCTGACTGATGCTCTCTCTAGGTTGTGCAATGGTACCATCTTGTGGCTAA 240

  4375559 CAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACT 4375618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAAAGATAATCCACAGACACATGGCTTTATAATGTGTAAGGATGTAAAAAGTAACAACT 300

  4375619 AAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTC 4375678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGTAGAACTACACGTCCCTCCTTATGGAATGTTTGCTTCTACAGTCATAAAACATGCTC 360

  4375679 ATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCC 4375738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCATTGTCTAGTGGCTTTTTAAAATATGTGCACATAAAACAAATGTTAAGAGTATTTCC 420

  4375739 TGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTA 4375798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTTGCCAACCAATAACAGTCAGTGCGAGTGGGAAAGTTTTAGAACCTTCTAAAACACTA 480

  4375799 GTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCA 4375858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTACTTGACAGAAAACATGGTTGTGTGAGTCTTTAGCTCTCCTGTCGTGATAGTAAGTCA 540

  4375859 TTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTT 4375918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCCTAAGAAACTTTGGAATAGTACAAAGATCACAAGAGCAGGCATTAGAATAACCAGTT 600

  4375919 TCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTA 4375978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTAGTGCCAGCTACACGTTTCATTGGCTCACTTAACTTCTCAGTCTTTGTTCATCTGTA 660

  4375979 AAAGAAAGTGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACA 4376038
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGAAAGAGAGTCCCTGAGCTGTGAGCTTCACAGGAATGCTGAGGTCACATATGAGACA 720

  4376039 TATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAG 4376098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATGCTGAATTCTGCTGAAACACCAGACAAAATATAAAGCCTTATGATCGTTCAGAACAG 780

  4376099 TTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAA 4376158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGGGTTAGCAATCTGGATTGAAAAAAAGTTGGGGTGGGGTTTGGTGTGCGCTCCTTCAA 840

  4376159 AGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTT 4376218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTTCTCAGGCATGACTCTGGTGGAGAGATTGTCCCTGAAGCAGAGACAAATGGTTCCTT 900

  4376219 TCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTA 4376278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGGGGAAGATGTTAGGAAGGAAACAGGTTGGTGGGGAAAACTTACGAAAGAAAAACTA 960

  4376279 ATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAG 4376338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTCATCTTTTCAGGTGTCAAGAATTTAAAGCATTAGGAGTATCCAAGGAGAGATTTCAG 1020

  4376339 AGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCA 4376398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGCTGAAGATTGTTTTTCCTGGGGAGAGCCTTTGAAAAAACAATGGAAGACATTATTCA 1080

  4376399 GTTTAAAAAGTAGAATCTA 4376417
          |||||||||||||||||||
     1081 GTTTAAAAAGTAGAATCTA 1099

EXCISED REGION

  4377645 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 4377704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 TATGAAATGTAGGCCATCTAGAATATGGCTGGTTTTACATTATTACAAGACACTAATAAT 1159

  4377705 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCATTATTAGACAAAGCTA 4377764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1160 ATTATTGTTATATAGTATAAGATGCTATTAATATTATTTTTTCGTTATTAGACAAAGCTA 1219

  4377765 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 4377824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 GCAATAATCTGAAAGTTGCACTTGTTTAGGCAATATTTACTGAGTATTACTTTTAGTTGG 1279

  4377825 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 4377884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 GCAATGGAGGAAAAAACAGTCGTGATCTCTAACCTAAGAAGTTTTTAACGTAGTTGTAAA 1339

  4377885 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 4377944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 AAACATGCTCTTAGAAGTTCATTTAATAATATTTATAATAGCAACCAATATTAAATATTC 1399

  4377945 AAAAATACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 4378004
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 AAAAGTACATGTCTATAAGATTGTAAAGCATACCATGGATTACTCTGCAGCCAGTAAAAC 1459

  4378005 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAA 4378064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 TTATGTGTATGAGGCTTAACTCCTTCATCTGGTAAATGGGTATACCACAGAACCATTAAA 1519

  4378065 AGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTAATATACAAATGC 4378124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 AGATTAGAATGATCGTGAACATGAGAAGACTTTGGAGATAGTAAAGTAATATACAAATGC 1579

  4378125 TAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATTATGAAAGTAATTTTAATGAGC 4378184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 TAATTATTACCACTTATGAGGGTGTGTAGAAGCTCAATTATGAAAGTAATTTTAATGAGC 1639

  4378185 ATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAATCCTCAGTCTGGGTTGCCAGG 4378244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 ATTTACTATGTGCCAGATACTATATATATATATAATTAATCCTCAGTCTGGGTTGCCAGG 1699

  4378245 TTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAGTTTCAGATAAACAATGAACAC 4378304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 TTTAGAAAATAAAATTACATAATGCCAGTTACATTTCAGTTTCAGATAAACAATGAACAC 1759

  4378305 TTTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAATGTTTATCAGAAATATTTCAGA 4378364
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 ATTTTTAGTATAAGTATATCCCAGGTGCAATTATTCAATGTTTATCAGAAATATTTCAGA 1819

  4378365 TACACTGAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTAAAACATGTTTTTGTTTGTTTA 4378424
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 TACACTAAAAACATATTCACTGTTTCTCCAAAATATTTAAAACATGTTTTTGTTTGTTTA 1879

  4378425 TATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGACTCTGGGAAGAACCAGGAAGA 4378484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 TATTTTTTTCTTTCACCCTCTCAGTCCAGCTTTTCCTGACTCTGGGAAGAACCAGGAAGA 1939

  4378485 GAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTATCTGAAATTGAAATTTGACTAG 4378544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 GAAGGCCTTAAAATATGTTTATACCAAAAATGTATTTATCTGAAATTGAAATTTGACTAG 1999

  4378545 GCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTACAAAATAGGTACAATAACTATA 4378604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 GCACCTGTATTTTCTCTGGCAACCCTACATCAATCCTACAAAATAGGTACAATAACTATA 2059

  4378605 TATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTGGTGCAATGGGAAATCACCCAC 4378664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 TATATAATGAAAACAGAAAGAGAGATTCCATTTTGGTTGGTGCAATGGGAAATCACCCAC 2119

  4378665 TATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAATCCAGAGGCAGAATGAGAAAG 4378724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 TATTCCTAATATGGACTATGTAGAGAAGGAAATCCTAAATCCAGAGGCAGAATGAGAAAG 2179

  4378725 GCACATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGGTAAACTTCCCTGAGAGCAATA 4378784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 GCACATATTATTTCTTGGTTCTTGATAGCATGTGTAGGGTAAACTTCCCTGAGAGCAATA 2239

  4378785 ACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAGCACCTGAATGTGTGCTCCAAG 4378844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 ACTTAAACACACCTTTAGAATGAGCTTGTATGGCAGAAGCACCTGAATGTGTGCTCCAAG 2299

  4378845 TTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCTTCCTCTATGAGGTACATCTGA 4378904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 TTAGGGAATCTGGGCATGGCCGACCTGGAGACTGATTCTTCCTCTATGAGGTACATCTGA 2359

  4378905 GCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGATTGAGGCCAAGTGTTTTGGGT 4378964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 GCCCCCATCAAGCCAAGTGTTTGGGTTAAATGAAGGGGATTGAGGCCAAGTGTTTTGGGT 2419

  4378965 TAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAGTGTTAAGTGAAAATGCTATAT 4379024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 TAAATGAAGGCTGACAGGTGGAGATTGTTAAGGGAAGAGTGTTAAGTGAAAATGCTATAT 2479

  4379025 AAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGCCTAACCTGCAGCCTCTCGGCC 4379084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 AAGCTCCGTGCTGTTTTCAAGTGCTTGTGGTTTTCTTGCCTAACCTGCAGCCTCTCGGCC 2539

  4379085 GTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGACTGTAGGAAGGCGGATATGTTGTCCA 4379144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 GTGTCGTTATGTTATCCATCCCACCACCACTGGACTGTAGGAAGGCGGATATGTTGTCCA 2599

  4379145 GCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATAAGGCAGTTCTCCTATCCAGCCTGTCACCA 4379204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 GCGCCCCATCACTGTACCATTTCTGTACATAAGGCAGTTCTCCTATCCAGCCTGTCACCA 2659

  4379205 CTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTAATAAAACCCCATGTCTCATTTGCTGGCTA 4379264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 CTGCACTCTCTCCCCTCTATGTAAGCTCCTAATAAAACCCCATGTCTCATTTGCTGGCTA 2719

  4379265 TGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGTGCCTTCCCTACTGAGGTTAATAGGGGTTT 4379324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 TGGGTCTCTTCTTCAGCCTCTTGAACCTGGTGCCTTCCCTACTGAGGTTAATAGGGGTTT 2779

  4379325 GGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAATGTTATAATTTCTCAAACTATATTAATCCC 4379384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 GGCAAAACACCATGCTACTGTTATTTAAAATGTTATAATTTCTCAAACTATATTAATCCC 2839

  4379385 AAATTCAAATGCTAAAGATAACAACATATTGCAAAGCTGACTCTAAATGCCTCTGGATTT 4379444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 AAATTCAAATGCTAAAGATAACAACATATTGCAAAGCTGACTCTAAATGCCTCTGGATTT 2899

  4379445 TTCAGCCCTTTTGGAAGATTGACAACATTAGTCCCTTCTTTTAGTGCAAACTATCTAGAG 4379504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 TTCAGCCCTTTTGGAAGATTGACAACATTAGTCCCTTCTTTTAGTGCAAACTATCTAGAG 2959

  4379505 ATGGGAGATCAAATGTGGAAATGCTTATAAGATGTTTTTAGTTGATGAGATTTCAGGATC 4379564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 ATGGGAGATCAAATGTGGAAATGCTTATAAGATGTTTTTAGTTGATGAGATTTCAGGATC 3019

  4379565 TGGGAGCTAAACCTTGAGTTATTTCATTGCCATTGGGTGGTGGCAGTTGACTTGTTTTCT 4379624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 TGGGAGCTAAACCTTGAGTTATTTCATTGCCATTGGGTGGTGGCAGTTGACTTGTTTTCT 3079

  4379625 GCTGTTTCAGTGGACCTTGAAATTATCATGACTATTTGCTTCACTTCAGTGTACACCATC 4379684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 GCTGTTTCAGTGGACCTTGAAATTATCATGACTATTTGCTTCACTTCAGTGTACACCATC 3139

  4379685 CCGCTCCATTTGCAGTCAGCACCACTCAGGGAATAAAACATATTCATTCGCAGTGTCCCT 4379744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 CCGCTCCATTTGCAGTCAGCACCACTCAGGGAATAAAACATATTCATTCGCAGTGTCCCT 3199

  4379745 AGCAATGACAGAGGTATTTTCAAATATCTTTTTGCTCTTGAAGAAAGGAGCTCACTTTGC 4379804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 AGCAATGACAGAGGTATTTTCAAATATCTTTTTGCTCTTGAAGAAAGGAGCTCACTTTGC 3259

  4379805 TTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAAAGGACCAATATTTGACACACATCATATTATATTGCAA 4379864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 TTTTGCAAAAGACAGGTGCAAAAAGGACCAATATTTGACACACATCATATTATATTGCAA 3319

  4379865 AGAATAGGAGTGTATGTGTGTGTATGCATCTGTATGTGTTTTAGCATAGACATCAAACCA 4379924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 AGAATAGGAGTGTATGTGTGTGTATGCATCTGTATGTGTTTTAGCATAGACATCAAACCA 3379

  4379925 AAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAGAGGCAGACAGAGTGAAAGACCCCCAGGAGGACTTGGG 4379984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     3380 AAAAAAAAGGAGGTCTGTCTTAGAGGCAGACAGAGTGAAAGACCCCCAGGAGGAC-TGGG 3438

  4379985 TTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTAACTAGTTATGTTACCATCCACAAGTCACCTACTCTTT 4380044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 TTCCAATCTTGGCTTTGCAAGTAACTAGTTATGTTACCATCCACAAGTCACCTACTCTTT 3498

  4380045 CTGAGTCTCATTTTCACTATCTGTAGTGCATCAATATCTGCTCTATTCCACCGGAGCATT 4380104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 CTGAGTCTCATTTTCACTATCTGTAGTGCATCAATATCTGCTCTATTCCACCGGAGCATT 3558

  4380105 GTGGGACAAGGTTTCAAACCTAGAAGGCATCTTGGCTGTATACAGCTAGGAGAAGGAATT 4380164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 GTGGGACAAGGTTTCAAACCTAGAAGGCATCTTGGCTGTATACAGCTAGGAGAAGGAATT 3618

  4380165 ATAATTGGTTCATTATTGACTCTTCCTTAAGAAGTTCTAACAGAATAAATTTGCCTTCTT 4380224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 ATAATTGGTTCATTATTGACTCTTCCTTAAGAAGTTCTAACAGAATAAATTTGCCTTCTT 3678

  4380225 GCCTGCTAATTAGACATGTATTTAACTGTTTCTTTTTTAAATAACTCTCTGCTGTTATTT 4380284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 GCCTGCTAATTAGACATGTATTTAACTGTTTCTTTTTTAAATAACTCTCTGCTGTTATTT 3738

  4380285 GAAATCTTCTATTATATGTAATAAAAATCTCTGTCACACACACATACACAAAGATAACAA 4380344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 GAAATCTTCTATTATATGTAATAAAAATCTCTGTCACACACACATACACAAAGATAACAA 3798

  4380345 TTGGCTCTAAGCAAAATGATTTCAGAAATAAGGGGGCAAACTTCAAATTATTACTGCCCA 4380404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 TTGGCTCTAAGCAAAATGATTTCAGAAATAAGGGGGCAAACTTCAAATTATTACTGCCCA 3858

  4380405 TCAAGGAAGTCAGGTGACAACAGAGTATTGTTAACAACAAAAATATTTTCAAAAGCACCA 4380464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 TCAAGGAAGTCAGGTGACAACAGAGTATTGTTAACAACAAAAATATTTTCAAAAGCACCA 3918

  4380465 AAGAAGATAAAAATTTAAATGTCAGAGCTGAAGACAAAGATTTCTATCAGTACATCTCAC 4380524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 AAGAAGATAAAAATTTAAATGTCAGAGCTGAAGACAAAGATTTCTATCAGTACATCTCAC 3978

  4380525 ACTTTTGCATAATCAGAATCACATAGGAGAACTTGTTAACTATGCAGATTTCCGGGCCTC 4380584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 ACTTTTGCATAATCAGAATCACATAGGAGAACTTGTTAACTATGCAGATTTCCGGGCCTC 4038

  4380585 ACACCAGAGATTCTGAGTCAATAGGACTGAAGTTGGCCAAGAAATCTGGATATTTAGCAA 4380644
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4039 ACACCAGAGATTCTGAGTCAATAGGACTGAAGTTGGCCAAGAAATCTGGATATTTGGCAA 4098

  4380645 GCTACCTGGCTGATTCAGAGGCAAGTAGTTCTTTGAGAATACTTTGAGAAACACTGGTCA 4380704
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 GCTACGTGGCTGATTCAGAGGCAAGTAGTTCTTTGAGAATACTTTGAGAAACACTGGTCA 4158

  4380705 TTACCAATCAAATATGAACATATTGTTAAAATTTTTAAATAAAGTACGAAAGAAACTGGT 4380764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 TTACCAATCAAATATGAACATATTGTTAAAATTTTTAAATAAAGTACGAAAGAAACTGGT 4218

  4380765 AGAAAGGAGAATGTGGATTTAATTCAACATAAAGTTTTGGGATGGGAGATGCAAGACCCT 4380824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 AGAAAGGAGAATGTGGATTTAATTCAACATAAAGTTTTGGGATGGGAGATGCAAGACCCT 4278

  4380825 CCCAAGAATAGAACGAGAAGAGAAGGACTCCCTGCAATGTCTTATCTCTCAAAATGTCTC 4380884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 CCCAAGAATAGAACGAGAAGAGAAGGACTCCCTGCAATGTCTTATCTCTCAAAATGTCTC 4338

  4380885 TAAGGTGGATCCACAGGAGCTAGTTAGTGAAAACAATGGAGGAAAATGTACAAACCCAAG 4380944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 TAAGGTGGATCCACAGGAGCTAGTTAGTGAAAACAATGGAGGAAAATGTACAAACCCAAG 4398

  4380945 AGGAAAATAAGCCATATAAAATTAGAAGAAAAATGTGGGAGGACAGGCAGAAATGGCCAG 4381004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 AGGAAAATAAGCCATATAAAATTAGAAGAAAAATGTGGGAGGACAGGCAGAAATGGCCAG 4458

  4381005 AGGGTAAGTAGTCTCAGGGATGGTCAAATTGTTGATGGGTAAAAAGATAGGAGAAATTCA 4381064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 AGGGTAAGTAGTCTCAGGGATGGTCAAATTGTTGATGGGTAAAAAGATAGGAGAAATTCA 4518

  4381065 GTAGTCACTGGTCAGAGGGGAAATCTTACTCATCAAAAAGGAGAGGAAGAACCAAGTAAG 4381124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 GTAGTCACTGGTCAGAGGGGAAATCTTACTCATCAAAAAGGAGAGGAAGAACCAAGTAAG 4578

  4381125 TGAGAAAACAGTAAAAATGTGAATGACTTTACATTTTTAAGAAAATGACATACAATCTTC 4381184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 TGAGAAAACAGTAAAAATGTGAATGACTTTACATTTTTAAGAAAATGACATACAATCTTC 4638

  4381185 ATGGAAAATTTGGTGGTGGGGAAATAAAATGAGTTCAACATGAAAATATCTTTAAAAAGT 4381244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 ATGGAAAATTTGGTGGTGGGGAAATAAAATGAGTTCAACATGAAAATATCTTTAAAAAGT 4698

  4381245 ATCTTAGAGGAATTTTAGGATAGAAGATGAGAAAGTACTTTGAAAAGTATAAAGAATGAA 4381304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 ATCTTAGAGGAATTTTAGGATAGAAGATGAGAAAGTACTTTGAAAAGTATAAAGAATGAA 4758

  4381305 TTACATGATTATTGCTTGCAGTATTTTCATGATTATCAAATTTTTTCACTGTCTGCCTGG 4381364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 TTACATGATTATTGCTTGCAGTATTTTCATGATTATCAAATTTTTTCACTGTCTGCCTGG 4818

  4381365 CTCATAAGGTAGTTAAAGAGGGCTCTATGACATTATCTTTGGATCCCCAGAGCCTAACAG 4381424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 CTCATAAGGTAGTTAAAGAGGGCTCTATGACATTATCTTTGGATCCCCAGAGCCTAACAG 4878

  4381425 TATCTGATATATAATAAGCACCAACCGGACGGACAAATGGATGGGTAAATCAAGTTAACA 4381484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 TATCTGATATATAATAAGCACCAACCGGACGGACAAATGGATGGGTAAATCAAGTTAACA 4938

  4381485 CAGGAAAAGATAAGAGTTGCATGGTCACATAGTACTCACAAAGCCTTACAGGTTTCATTC 4381544
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 CAGGAAAAGATAAGAGTTGCATGGCCACATAGTACTCACAAAGCCTTACAGGTTTCATTC 4998

  4381545 TCTGATTTTATGAACACAGCACTCACGCACATTTTGGTACTAATATCTGCATGCATGAAC 4381604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 TCTGATTTTATGAACACAGCACTCACGCACATTTTGGTACTAATATCTGCATGCATGAAC 5058

  4381605 CTCCAACTGGGGCATGCCTGTTTGTCTTCCTGAAGGAAGTACTTCTTGATTCATTTTACT 4381664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 CTCCAACTGGGGCATGCCTGTTTGTCTTCCTGAAGGAAGTACTTCTTGATTCATTTTACT 5118

  4381665 TGGTGCATCAGTTGTCTACCTGCTGCCCCTGAGCTGCACTTTCACCTTATTCCATCCTGT 4381724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 TGGTGCATCAGTTGTCTACCTGCTGCCCCTGAGCTGCACTTTCACCTTATTCCATCCTGT 5178

  4381725 CTGTATTGCTGGGGCTGTGGGAATCCACAAACTCCATTTTCCAGACTCCTTTACTACCTG 4381784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 CTGTATTGCTGGGGCTGTGGGAATCCACAAACTCCATTTTCCAGACTCCTTTACTACCTG 5238

  4381785 GCTTTCTGTTATGTCTGGCAAGAGGAAGAGCCATTATTTCTTTCTTATACTCTCTTTGTT 4381844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 GCTTTCTGTTATGTCTGGCAAGAGGAAGAGCCATTATTTCTTTCTTATACTCTCTTTGTT 5298

  4381845 TCTGCTGTTGGTTCTGGAAGTAGCTGTGCCCCTTCAGTGACCCAAGGTTCTGCTGGAACT 4381904
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 TCTGCTGTTGTTTCTGGAAGTAGCTGTGCCCCTTCAGTGACCCAAGGTTCTGCTGGAACT 5358

  4381905 GCCCTTAATTGGTCCCGGCTGTGGCTAGGGAGACCATCCTTGGCAGTCCCAGCACAGGCT 4381964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 GCCCTTAATTGGTCCCGGCTGTGGCTAGGGAGACCATCCTTGGCAGTCCCAGCACAGGCT 5418

  4381965 GGGTGGAATCCCTTAAGGCCTGCTCCTGGACTTTGACAGCTCCTCTTCAGTTTCATTCCC 4382024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 GGGTGGAATCCCTTAAGGCCTGCTCCTGGACTTTGACAGCTCCTCTTCAGTTTCATTCCC 5478

  4382025 CCAGTTCCTAAGGCTGGTAGCCGCTCTCTACAGATACTAATCTCGGAATGTCACCCTTTT 4382084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 CCAGTTCCTAAGGCTGGTAGCCGCTCTCTACAGATACTAATCTCGGAATGTCACCCTTTT 5538

  4382085 CCCTTTTTGCTTCTTTAGCTCCCTTGCTTATCTGTTCCAATGCCCGTAATACCAAAATCT 4382144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 CCCTTTTTGCTTCTTTAGCTCCCTTGCTTATCTGTTCCAATGCCCGTAATACCAAAATCT 5598

  4382145 GTAGTAAATCCCTTTTATTTGAAACATCTAGAGTGGTTTCTGTTTTTCTGGCCAGATGCT 4382204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 GTAGTAAATCCCTTTTATTTGAAACATCTAGAGTGGTTTCTGTTTTTCTGGCCAGATGCT 5658

  4382205 GAATGACACATCTGGAAAAATCAGGGTAAATATTATTACTCTAGGTATTGAAAGTACAGA 4382264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 GAATGACACATCTGGAAAAATCAGGGTAAATATTATTACTCTAGGTATTGAAAGTACAGA 5718

  4382265 TTGGAGAACATTTCGTTTGTTCCAGAAGAATCCTGAATGAAAACCGAAATTCAACTGGAG 4382324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5719 TTGGAGAACATTTCGTTTGTTCCAGAAGAATCCTGAATGAAAACCGAAATTCAACTGGAG 5778

  4382325 AGTTAGAGCATTATTGAACAGTATGTGTAGGGAATAAAATGCCTTTCCCCCATCCTGGAA 4382384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 AGTTAGAGCATTATTGAACAGTATGTGTAGGGAATAAAATGCCTTTCCCCCATCCTGGAA 5838

  4382385 TACCTCCCTGATTATACTACCTTATTACTGTGATTGTTTTTTAACTTCTCTGCTTTTTCA 4382444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 TACCTCCCTGATTATACTACCTTATTACTGTGATTGTTTTTTAACTTCTCTGCTTTTTCA 5898

  4382445 CACAAATCTACAAGAATCTCCTCTTCCTGGAAGCCTCTCTGATTACCTCACACAAACATC 4382504
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5899 CACAAATCTACAAGAATCTCCTCTTCCTGGAAGCCTCTCTGATTACCGCACACAAACATC 5958

  4382505 ATCTTGCTTAGTCTGAATTCCTATGGTTCTTTTGTTCTCTGACTTCTAGAGTATTTCTCC 4382564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 ATCTTGCTTAGTCTGAATTCCTATGGTTCTTTTGTTCTCTGACTTCTAGAGTATTTCTCC 6018

  4382565 AGGTATGTTAGCAATCAGTTTTTCTCTTGATCACTCCCCAAACCTGAGTGATCATCAGAA 4382624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 AGGTATGTTAGCAATCAGTTTTTCTCTTGATCACTCCCCAAACCTGAGTGATCATCAGAA 6078

  4382625 TCCTCAGAAAAATATAGATACCAGGCCCTTCTCCTTGTCCTAACCTCCTGAGACAAAATT 4382684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 TCCTCAGAAAAATATAGATACCAGGCCCTTCTCCTTGTCCTAACCTCCTGAGACAAAATT 6138

  4382685 CTAGAGTGATGAGTGGGTACTATAGGGTCGAGACAGCATCTATATATATTTTAATACCTC 4382744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 CTAGAGTGATGAGTGGGTACTATAGGGTCGAGACAGCATCTATATATATTTTAATACCTC 6198

  4382745 TCAGATGATAAACCCTTCAAGATCAGGGCCTTTCCATTTCTCATGTAGCTTTTACTGTAC 4382804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6199 TCAGATGATAAACCCTTCAAGATCAGGGCCTTTCCATTTCTCATGTAGCTTTTACTGTAC 6258

  4382805 CTAATACAGTTTAAGCAGACCATAAAAATCTGTTCATTTTCTAATGAATTACATGAGGGA 4382864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 CTAATACAGTTTAAGCAGACCATAAAAATCTGTTCATTTTCTAATGAATTACATGAGGGA 6318

  4382865 AGATTCCCAGGAAGACCAGCTGGTGTCACTACTGCCTAATTAATATTTCTGGCCCAGGGA 4382924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 AGATTCCCAGGAAGACCAGCTGGTGTCACTACTGCCTAATTAATATTTCTGGCCCAGGGA 6378

  4382925 AGGGCATCTCACAAAGCAAAATTTGACCTTACCTGGATTCACCGATTCTGTGCTTGAATC 4382984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 AGGGCATCTCACAAAGCAAAATTTGACCTTACCTGGATTCACCGATTCTGTGCTTGAATC 6438

  4382985 CATCTTCCCATCTGTCTATTTTCCTAAAAGGAAGTTGCAGAAACCTTGCCAAGAAAATAG 4383044
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     6439 CATCTTCCCATCTGTCTATTTTCCTAAAAGGGAGTTGCAGAAACCTTGCCAAGAAAATAG 6498

  4383045 ACAGCAAAACTTCAGCAGTACCAATAACTTGGGTTTTCTGAAAGGAAATGATGCCATGAC 4383104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 ACAGCAAAACTTCAGCAGTACCAATAACTTGGGTTTTCTGAAAGGAAATGATGCCATGAC 6558

  4383105 CTGAGGCTGCCAGACTTAATGTGAGAAAGCAAGAACTGAAACGAGTAGAAGTAGGCCTCC 4383164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 CTGAGGCTGCCAGACTTAATGTGAGAAAGCAAGAACTGAAACGAGTAGAAGTAGGCCTCC 6618

  4383165 CACTGGCCCAAGGCCTAAGATTTCATTGCACTTGCTTCTTGGCATTAACATTCTGTAGAA 4383224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6619 CACTGGCCCAAGGCCTAAGATTTCATTGCACTTGCTTCTTGGCATTAACATTCTATAGAA 6678

  4383225 CAAGTTTCAGAAAAAAACGCTTAACGAATTTGCAAGCACAACCAAACTCCAACCAGATTG 4383284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6679 CAAGTTTCAGAAAAAAACGCTTAACGAATTTGCAAGCACAACCAAACTCCAACCAGATTG 6738

  4383285 CATTTTTTATTCACCTTTTACAATCTCATTCATTTTCCATAACATTTGGAACTGCTGTTT 4383344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6739 CATTTTTTATTCACCTTTTACAATCTCATTCATTTTCCATAACATTTGGAACTGCTGTTT 6798

  4383345 GAAAGTTTAATTTTCCTTTTTATCTACTATTTTCTTATTATTGACTTAAATTATTCTTGA 4383404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6799 GAAAGTTTAATTTTCCTTTTTATCTACTATTTTCTTATTATTGACTTAAATTATTCTTGA 6858

  4383405 TTCATGGATAAGCAAACTAATGTGGGTCTACCCTGAGTCATTTATTATGTATCAAAGATA 4383464
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6859 TTCATGGATAAGCAAACTAATGTGGGTCTACCCTGAGTCATTTATTATGTATCGAAGATA 6918

  4383465 ACATAGAACTCTTCACTTCTGGCAGAAGCTGTTTAGTAATTACTTCTAATTACTAACAAA 4383524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6919 ACATAGAACTCTTCACTTCTGGCAGAAGCTGTTTAGTAATTACTTCTAATTACTAACAAA 6978

  4383525 TTAAGAACAGCATGTGCTCCAAAAGCAGTTTCTATACAAGCTCAAACCTGGCTATATTTC 4383584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6979 TTAAGAACAGCATGTGCTCCAAAAGCAGTTTCTATACAAGCTCAAACCTGGCTATATTTC 7038

  4383585 AACACTTCTAAATTCTAATTCTCTGGATGCAGAAAAAAATCTATTAAGATGGTTAAAAGG 4383644
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     7039 AACACTTCTAAATTCTAATTCTCTGGATGCAG-AAAAAATCTATTAAGATGGTTAAAAGG 7097

  4383645 AAATAAAATCTAGATGTATAAGTCCAAAAGAAGTCTCCAAAAGTCCCCTATAACCTTTCT 4383704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7098 AAATAAAATCTAGATGTATAAGTCCAAAAGAAGTCTCCAAAAGTCCCCTATAACCTTTCT 7157

  4383705 TAGGTAATATGACTTGATCATCTCCATTTGAACATTTACTTCCAGAAAAGTAGATTTTTG 4383764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7158 TAGGTAATATGACTTGATCATCTCCATTTGAACATTTACTTCCAGAAAAGTAGATTTTTG 7217

  4383765 GGATAATCAGCCTCTTTGTGTTGATTGACCACAAACTTCTATGTTCAGAAGTTTACATTT 4383824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7218 GGATAATCAGCCTCTTTGTGTTGATTGACCACAAACTTCTATGTTCAGAAGTTTACATTT 7277

  4383825 TAATTAAGAGGGAGGTATTGAATGGTAACTGGATCTCCAGTAGTTGAAATGGGCTTCTCC 4383884
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7278 TAATTAAGAGGGAGGTACTGAATGGTAACTGGATCTCCAGTAGTTGAAATGGGCTTCTCC 7337

  4383885 TTGTCTAGAATAAAGGCCTTTGTTAGCTAGGTGGTCCTAGAGAGAGCACGAACCCCTCAA 4383944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7338 TTGTCTAGAATAAAGGCCTTTGTTAGCTAGGTGGTCCTAGAGAGAGCACGAACCCCTCAA 7397

  4383945 TTCCTCTCCTTCAAGACTTACAGCCTTAAATATCCATGGAACTACCCCCACTTCTCAGGG 4384004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7398 TTCCTCTCCTTCAAGACTTACAGCCTTAAATATCCATGGAACTACCCCCACTTCTCAGGG 7457

  4384005 AGTTTGTGTGCCATTGGCTGCCAATCAGTCATGTCATTTATAGGGCAGATGAGAGTAGTC 4384064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7458 AGTTTGTGTGCCATTGGCTGCCAATCAGTCATGTCATTTATAGGGCAGATGAGAGTAGTC 7517

  4384065 TCTTTTATTTCCCACTTGGTACTGAAGAAGTTGTGGCCTTTGGGGGTTAACCAGTTACTG 4384124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7518 TCTTTTATTTCCCACTTGGTACTGAAGAAGTTGTGGCCTTTGGGGGTTAACCAGTTACTG 7577

  4384125 CCCAGCACACTGTACACAGATCGTGCCAATGAGGTGTACACGTTTTCCTCCTGCTCACTT 4384184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7578 CCCAGCACACTGTACACAGATCGTGCCAATGAGGTGTACACGTTTTCCTCCTGCTCACTT 7637

  4384185 TGTGGAGCACACTGGTGGTGAACACAGGGTGCTGGACCTTATAAGGGGTTTCCATCATGG 4384244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7638 TGTGGAGCACACTGGTGGTGAACACAGGGTGCTGGACCTTATAAGGGGTTTCCATCATGG 7697

  4384245 AGGAATCTTTTGAAACAACAGCAGTGCTGCCAGAGGTGGGAAAACGGAACTACTTTTTAG 4384304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     7698 AGGAATCTTTTGAAACAACAGCAGTGCTGCCAGAGGTGGGAAAATGGAACTACTTTTTAG 7757

  4384305 ATAATACTGTTCAGTTAGCCAGGACTCACCTTCACTGGAAAAAAAAAAACTTTTTAGAAA 4384364
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     7758 ATAATACTGTTCAGTTAGCCAGGACTCACCTTCACTGG-AAAAAAAAAACTTTTTAGAAA 7816

  4384365 TTCCAAATGAAGATAAAAATTTATTTTCTAAGTTGTCAATATCAGCTTTGTGTTCTTTAA 4384424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7817 TTCCAAATGAAGATAAAAATTTATTTTCTAAGTTGTCAATATCAGCTTTGTGTTCTTTAA 7876

  4384425 CAAGGACTATTACTCATGGTTGATTGTTTGCCAATGGCATTGAAATTGTTTCTTTTTCTC 4384484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7877 CAAGGACTATTACTCATGGTTGATTGTTTGCCAATGGCATTGAAATTGTTTCTTTTTCTC 7936

  4384485 TTTCTTTCTCTCTCTTTCCCTCCCTTCCTTCCTTCTTTTCTTCCTTACTTCTTTCCTTTA 4384544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7937 TTTCTTTCTCTCTCTTTCCCTCCCTTCCTTCCTTCTTTTCTTCCTTACTTCTTTCCTTTA 7996

  4384545 TATAATATATATAAAACCTCTTTCCTTTATATATAATATATATGTATATATATTTATGAC 4384604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7997 TATAATATATATAAAACCTCTTTCCTTTATATATAATATATATGTATATATATTTATGAC 8056

  4384605 TCTCTAATTTCTTCCCTGGACAGCAAGATGCCACCCACTGCCTTATCCCTAACCTAAATC 4384664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8057 TCTCTAATTTCTTCCCTGGACAGCAAGATGCCACCCACTGCCTTATCCCTAACCTAAATC 8116

  4384665 ATGGTCTCCCAGCTTACTGCTTATTCAAGGGCTAGGTAATAAATTCCATTTCCTTTTTAA 4384724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8117 ATGGTCTCCCAGCTTACTGCTTATTCAAGGGCTAGGTAATAAATTCCATTTCCTTTTTAA 8176

  4384725 AAATTTCCTTCACCAGCTGGTTAATATCCAGAGTCACGTGTCTTCCTCTTCCTACGCTCC 4384784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     8177 AAATTTCCTTCACCAGCTGGTTAATATCCAGAGTCACGTGTCTTCCTCTTCCTACGTTCC 8236

  4384785 CATGTCTCCCACTCCCACCCACTCAACCTCCAGCCCCGTGTACACATCCAAAACATATCA 4384844
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     8237 CATGTCTCCCACTCCCACCCACTCAACCTCCAGTCCCGTGTACACATCCAAAACATATCA 8296

  4384845 GATAGAAGACTTTCCTTTCCTTGAGATCCAAACTGGGAACCTGGAGCCAGACACTGTTGC 4384904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8297 GATAGAAGACTTTCCTTTCCTTGAGATCCAAACTGGGAACCTGGAGCCAGACACTGTTGC 8356

  4384905 ACAACATTGGGTCCTAACTGTCATTGTAACGATTTTCAACTCACCTGTCAGCATTCAGCT 4384964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8357 ACAACATTGGGTCCTAACTGTCATTGTAACGATTTTCAACTCACCTGTCAGCATTCAGCT 8416

  4384965 ATACAAGCTTCATAATGTTGCCCAACAGAGGCGCAGAAACCAAGGGCAGATGCCTCAGCC 4385024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8417 ATACAAGCTTCATAATGTTGCCCAACAGAGGCGCAGAAACCAAGGGCAGATGCCTCAGCC 8476

  4385025 TTTTAGAAGTTGCTTGTAAAACAATAGTGGAGCAATATATTTTGAAGTGTGTTTTGAATT 4385084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8477 TTTTAGAAGTTGCTTGTAAAACAATAGTGGAGCAATATATTTTGAAGTGTGTTTTGAATT 8536

  4385085 TCTTAAAAAAGGAAAAATCTAACACTCCTCAGAACAGTTTACTGTACACAGTGAACTCTT 4385144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8537 TCTTAAAAAAGGAAAAATCTAACACTCCTCAGAACAGTTTACTGTACACAGTGAACTCTT 8596

  4385145 AGCACCTAGGATCTCATGGGTTGCAGTGTGCCTGCAGGACTGTTTCTGCATTCCCTTCGA 4385204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8597 AGCACCTAGGATCTCATGGGTTGCAGTGTGCCTGCAGGACTGTTTCTGCATTCCCTTCGA 8656

  4385205 TTTCCCACATTCCGTTTCTTCGTGGATTCCCTCTGCAGCTAAAAATTTCAAGGATTTTCC 4385264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8657 TTTCCCACATTCCGTTTCTTCGTGGATTCCCTCTGCAGCTAAAAATTTCAAGGATTTTCC 8716

  4385265 CAACCCCAAAGATAGAAGTTGATACCTAAAATCCAAAAGCTGCATTTTCCAAGCAATATA 4385324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8717 CAACCCCAAAGATAGAAGTTGATACCTAAAATCCAAAAGCTGCATTTTCCAAGCAATATA 8776

  4385325 GATGTTAGACTCCATGAACCTCAGACTTAGCCTGGGCTTCTAGAAAATACAGTTCTTGGC 4385384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8777 GATGTTAGACTCCATGAACCTCAGACTTAGCCTGGGCTTCTAGAAAATACAGTTCTTGGC 8836

  4385385 CAGGCACAGTGGCTCACGCCTATAATCCCAACACTGTGGGAGCCTGAGGCCGGTGGATCA 4385444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8837 CAGGCACAGTGGCTCACGCCTATAATCCCAACACTGTGGGAGCCTGAGGCCGGTGGATCA 8896

  4385445 CCTGAGGTCAGGAGTCCGAGACCAGCTTGGCCAACATGGCATAACCCTGTCTCTACTAAA 4385504
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8897 CCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAACATGGCATAACCCTGTCTCTACTAAA 8956

  4385505 AAATACAAAACTTAGCCAGGTGTAGTGATGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGC 4385564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     8957 AAATACAAAACTTAGCCAGGTGTAGTGATGGGCACCTGTATTCCCAGCTACTCGGGAGGC 9016

  4385565 CGAGGCCGGAGAAATGCTTGAACCTAGGAGGCAGAGGTTTCAGTGAGCTGAGATCACGCT 4385624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9017 CGAGGCCGGAGAAATGCTTGAACCTAGGAGGCAGAGGTTTCAGTGAGCTGAGATCACGCT 9076

  4385625 ATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAACAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGA 4385684
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
     9077 ATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAACAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAA--A 9134

  4385685 AAAAAGAAAGAAAGAAACAA---AGAAAGGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAAAAAG 4385741
          ||||||||||||.||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9135 AAAAAGAAAGAACGAAA---GACAGAAAGGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAAAAAG 9191

  4385742 AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 4385801
          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9192 AAAGAA--AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG 9249

  4385802 AAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAGAAAAGAAAGAAAAAATGCCGTTCTTTTTCCTGGTGCA 4385861
          ||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9250 AAAGAA---------------AGAAAAGAAAGAAAAAATGCCGTTCTTTTTCCTGGTGCA 9294

  4385862 CAAGGCTCACCCCAACCCTGAGCCAATCCCGAAAGAGATTCTAATCTCCTGTACCACTTA 4385921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9295 CAAGGCTCACCCCAACCCTGAGCCAATCCCGAAAGAGATTCTAATCTCCTGTACCACTTA 9354

  4385922 CCATCTGTACCAATCATGCAACACTTAGCAGAGAATGCTTCAGGACACAAAGAAATATAT 4385981
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     9355 CCATCTGTACCAATCATGCAACACTTAGCAGAGAATGCTTCAGGACACAAAGAAATATAC 9414

  4385982 TGAGATCCCTATTCCCATCTATTTATGGCATCTTTGCTGCCTCATCACTCATGGCCAACC 4386041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9415 TGAGATCCCTATTCCCATCTATTTATGGCATCTTTGCTGCCTCATCACTCATGGCCAACC 9474

  4386042 AGTGACAAACTACCTCTGGGGTGAGAATTTATCCCTTCTGCAAATGCTTTATTTGGATTA 4386101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9475 AGTGACAAACTACCTCTGGGGTGAGAATTTATCCCTTCTGCAAATGCTTTATTTGGATTA 9534

  4386102 TTCCCTTTATTGTAACAGCACATGTCCACAGTAGAAATCAAGGGAGAAAAACAAGAGAGA 4386161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9535 TTCCCTTTATTGTAACAGCACATGTCCACAGTAGAAATCAAGGGAGAAAAACAAGAGAGA 9594

  4386162 GAGAATAAAAACAGAATCTCCTCTAATCACCCTAATCACCCTACTCAGAAGGAGCTTTGG 4386221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9595 GAGAATAAAAACAGAATCTCCTCTAATCACCCTAATCACCCTACTCAGAAGGAGCTTTGG 9654

  4386222 TTACTAAGCTATATTACAGTTATCTCATTATAATAATAAAAATTGTGTCTATACATGTGT 4386281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9655 TTACTAAGCTATATTACAGTTATCTCATTATAATAATAAAAATTGTGTCTATACATGTGT 9714

  4386282 ATTATAGGGCTGCAATGAACATTTTCATAGCCAAATCTTTTGTGTGTAGCCAGGAATATT 4386341
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9715 ATTATACGGCTGCAATGAACATTTTCATAGCCAAATCTTTTGTGTGTAGCCAGGAATATT 9774

  4386342 TTTATTTTTGTTTTTATTTTTATTAGTTTTTCTTCATTTTCTTTTCTTTTTAAAAAAAAT 4386401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     9775 TTTATTTTTGTTTTTATTTTTATTAGTTTTTCTTCATTTTCTTTTCTTTTT-AAAAAAAT 9833

  4386402 TATGATTTTTTTAAATGAAACACTTCACAAATTTGCATGTTATCCTTGTGCAAGGAGCAT 4386461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9834 TATGATTTTTTTAAATGAAACACTTCACAAATTTGCATGTTATCCTTGTGCAAGGAGCAT 9893

  4386462 GTTAATCTTCTCTGTATCATTCCAATTTTAGTATATGTGTTAACGGTGGAAGGTGTACAG 4386521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9894 GTTAATCTTCTCTGTATCATTCCAATTTTAGTATATGTGTTAACGGTGGAAGGTGTACAG 9953

  4386522 ATTCTTGGCGTGTTGAACAAAGAATTGGACAACACACACAAAGAAGGGTTTTAATGAAAA 4386581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9954 ATTCTTGGCGTGTTGAACAAAGAATTGGACAACACACACAAAGAAGGGTTTTAATGAAAA 10013

  4386582 TGAAAGTACTCCATGGTGTGGGAGCAGGCCTGAGCTTGGGAGCTAAAAGGTCCCGTTACA 4386641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10014 TGAAAGTACTCCATGGTGTGGGAGCAGGCCTGAGCTTGGGAGCTAAAAGGTCCCGTTACA 10073

  4386642 GAATTTTTGGGAGTTGAAATACCCCCTAGAGGATTCCACTGATTACTTGGGGTATGCCCT 4386701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10074 GAATTTTTGGGAGTTGAAATACCCCCTAGAGGATTCCACTGATTACTTGGGGTATGCCCT 10133

  4386702 ATGTAAATGGAAAGGATGACATAAAGTTACAAAGTCATTTACTTGGCTCTATTCCCAATG 4386761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10134 ATGTAAATGGAAAGGATGACATAAAGTTACAAAGTCATTTACTTGGCTCTATTCCCAATG 10193

  4386762 GAGAGGATATTCCTGTCATAGCTAAAGTGTGAATTGGCCTTATGTTCCCTGCCTCCAGAC 4386821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10194 GAGAGGATATTCCTGTCATAGCTAAAGTGTGAATTGGCCTTATGTTCCCTGCCTCCAGAC 10253

  4386822 CCTATTTTCCTGCTTCATCTCCCCACTGAGAGATGTGATCCCCATACATTTTATGAGAGT 4386881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10254 CCTATTTTCCTGCTTCATCTCCCCACTGAGAGATGTGATCCCCATACATTTTATGAGAGT 10313

  4386882 CAGAGGGACCGATGGTCTTTTTTCTGTAACTGCTTCATGCTGGCTTGGGGCATAGTCCCT 4386941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10314 CAGAGGGACCGATGGTCTTTTTTCTGTAACTGCTTCATGCTGGCTTGGGGCATAGTCCCT 10373

  4386942 GTTGAGGATCACAGAACTCTCACCCTACTCTGTCTATTGGTGGCAGGGTAGCTCCTTAAA 4387001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10374 GTTGAGGATCACAGAACTCTCACCCTACTCTGTCTATTGGTGGCAGGGTAGCTCCTTAAA 10433

  4387002 TGGCCAGGGGTGGTGTCTTCACCTGGAACTTTTGTTGCATGATCATCTGAAGCTTGATGG 4387061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
    10434 TGGCCAGGGGTGGTGTCTTCACCTGGAACTTTTGTTGCATGATCATCTGAAGCTTGATAG 10493

  4387062 TCTCTAGGCAACAGGAAATGAATTTGGTTAAAAGATTTAATGGCAACTTCAGGGAGCGGA 4387121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10494 TCTCTAGGCAACAGGAAATGAATTTGGTTAAAAGATTTAATGGCAACTTCAGGGAGCGGA 10553

  4387122 TACCTACGCTGTCAGAAATGTTTGTTATAGAGATGTGCAGCAGGAAAAAAACAAAACCTG 4387181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10554 TACCTACGCTGTCAGAAATGTTTGTTATAGAGATGTGCAGCAGGAAAAAAACAAAACCTG 10613

  4387182 GACTGTTCTAGAATCTCTGTGCTTCCTTAAAGTCTTAGCATGAGCAATTCTATTTTGGTT 4387241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10614 GACTGTTCTAGAATCTCTGTGCTTCCTTAAAGTCTTAGCATGAGCAATTCTATTTTGGTT 10673

  4387242 TGGTTTGTTGGGGCCTAGTGTATGAGCTCAATCCAAAACAATGGCCTCCCAGAATTTTTT 4387301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10674 TGGTTTGTTGGGGCCTAGTGTATGAGCTCAATCCAAAACAATGGCCTCCCAGAATTTTTT 10733

  4387302 TTTTAATTCCCCCTTTTTTTGGTCAGGTTCTTACTTACATGAGAGTGTGACCAAAACTTA 4387361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10734 TTTTAATTCCCCCTTTTTTTGGTCAGGTTCTTACTTACATGAGAGTGTGACCAAAACTTA 10793

  4387362 CGGCCTTAGTGCCACTCTCAGTTACCATCATTTTGGGTTTCCGATTTCAGCATGTCATTC 4387421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10794 CGGCCTTAGTGCCACTCTCAGTTACCATCATTTTGGGTTTCCGATTTCAGCATGTCATTC 10853

  4387422 ATAGGTTACGGTGTCCTCACGGTTGCACATTTCTTTCAGCTCTTGTCGTTCAAATTGGAG 4387481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10854 ATAGGTTACGGTGTCCTCACGGTTGCACATTTCTTTCAGCTCTTGTCGTTCAAATTGGAG 10913

  4387482 ACAGACTATATGACATTCTAGAGATGGCTGCATGCAAGCATTTAAAATTTTTGAGAGAAT 4387541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
    10914 ACAGACTATATGACATTCTAGAGATGGCTGCATGCAAGCATTTAAAATCTTTGAGAGAAT 10973

  4387542 ACAGTGCAGCAGGGAGACTATTACTATGACTATTGGGAGGATAATACCAAGAGTTTGGAA 4387601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10974 ACAGTGCAGCAGGGAGACTATTACTATGACTATTGGGAGGATAATACCAAGAGTTTGGAA 11033

  4387602 TATGCTCCTTATCCAG 4387617
          ||||||||||||||||
    11034 TATGCTCCTTATCCAG 11049

Alignment time is 8.611 s

