
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3381] =>      3381 nucs 'mol-32-211b-055414_3381'

Score:        3380
Aligned:      3380        nucs
Identic:      3380 (100%) nucs =>       154 (100%)      3226 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22651887,22652040] EXCISED REGION [22652042,22655267]
 second seq =>  [       1,     154] EXCISED REGION [     156,    3381]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [22652041,22652041]
 second seq =>         1 nucs [155,155]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22652040,22652040] to [22652042,22652042]
 second seq =>         1 nucs [154,154] to [156,156]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22651887 AGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGCACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAA 22651946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGCACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAA 60

 22651947 AACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCC 22652006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCC 120

 22652007 ATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAGCTGTTTTT 22652040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAGCTGTTTTT 154

EXCISED REGION

 22652042 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 22652101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      156 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 215

 22652102 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 22652161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      216 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 275

 22652162 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 22652221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      276 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 335

 22652222 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 22652281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      336 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 395

 22652282 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 22652341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      396 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 455

 22652342 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 22652401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      456 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 515

 22652402 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 22652461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      516 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 575

 22652462 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 22652521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 635

 22652522 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 22652581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      636 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 695

 22652582 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 22652641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 755

 22652642 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 22652701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 815

 22652702 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 22652761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 875

 22652762 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 22652821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 935

 22652822 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 22652881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 995

 22652882 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 22652941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 1055

 22652942 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 22653001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 1115

 22653002 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 22653061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 1175

 22653062 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 22653121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 1235

 22653122 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 22653181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 1295

 22653182 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 22653241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 1355

 22653242 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 22653301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 1415

 22653302 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 22653361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 1475

 22653362 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 22653421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 1535

 22653422 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 22653481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 1595

 22653482 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 22653541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 1655

 22653542 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 22653601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 1715

 22653602 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 22653661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 1775

 22653662 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 22653721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 1835

 22653722 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 22653781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 1895

 22653782 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 22653841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 1955

 22653842 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 22653901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 2015

 22653902 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 22653961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 2075

 22653962 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 22654021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 2135

 22654022 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 22654081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 2195

 22654082 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 22654141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 2255

 22654142 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 22654201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 2315

 22654202 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 22654261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 2375

 22654262 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 22654321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 2435

 22654322 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 22654381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 2495

 22654382 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 22654441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 2555

 22654442 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 22654501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 2615

 22654502 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 22654561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 2675

 22654562 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 22654621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 2735

 22654622 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 22654681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 2795

 22654682 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 22654741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 2855

 22654742 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 22654801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 2915

 22654802 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 22654861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 2975

 22654862 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 22654921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 3035

 22654922 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 22654981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 3095

 22654982 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGAC 22655041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGAC 3155

 22655042 ATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTT 22655101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 ATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTT 3215

 22655102 ATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTCATATATTTTAGCT 22655161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 ATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTCATATATTTTAGCT 3275

 22655162 TTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGGAATTTTTAATGTC 22655221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 TTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGGAATTTTTAATGTC 3335

 22655222 ATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGA 22655267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 ATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGA 3381

Alignment time is 2.48715 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2606] =>      2606 nucs 'mol-32-220d-043978_2606'

Score:        2595
Aligned:      2606        nucs
Identic:      2605 (100%) nucs =>      1538 (100%)      1067 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22651856,22653394] EXCISED REGION [22653769,22654835]
 second seq =>  [       1,    1539] EXCISED REGION [    1540,    2606]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [22653395,22653768]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22653395,22653395] to [22653769,22653769]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22651856 CTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGCACA 22651915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGCACA 60

 22651916 TGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGTTTG 22651975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGTTTG 120

 22651976 GTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAGCTG 22652035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAGCTG 180

 22652036 TTTTTGTCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGG 22652095
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTATCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGG 240

 22652096 TTGAATCCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGT 22652155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGAATCCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGT 300

 22652156 GAACTTGTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCT 22652215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAACTTGTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCT 360

 22652216 GGCTTTTGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTAT 22652275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCTTTTGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTAT 420

 22652276 ATAAGCAAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTC 22652335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAAGCAAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTC 480

 22652336 TCTGTTTTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAAT 22652395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTGTTTTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAAT 540

 22652396 GTGCTCTGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTA 22652455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGCTCTGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTA 600

 22652456 GAAGTCCAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATT 22652515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAGTCCAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATT 660

 22652516 TTAGGCTACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAG 22652575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAGGCTACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAG 720

 22652576 ATTCCCAGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTC 22652635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCCCAGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTC 780

 22652636 AATCACTGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCA 22652695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATCACTGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCA 840

 22652696 TTTAAAGATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATT 22652755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTAAAGATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATT 900

 22652756 GTTGGCAGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAA 22652815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTGGCAGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAA 960

 22652816 TGGATCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACA 22652875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGATCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACA 1020

 22652876 TTAGGCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGT 22652935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAGGCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGT 1080

 22652936 GAAACCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCA 22652995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAACCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCA 1140

 22652996 CAACAATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTT 22653055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAACAATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTT 1200

 22653056 TATCCCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAG 22653115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATCCCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAG 1260

 22653116 GCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGC 22653175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGC 1320

 22653176 TGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCT 22653235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCT 1380

 22653236 GAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAG 22653295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAG 1440

 22653296 AGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAAT 22653355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAAT 1500

 22653356 ATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 22653394
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 1539

EXCISED REGION

 22653769 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 22653828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 1599

 22653829 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 22653888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 1659

 22653889 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 22653948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 1719

 22653949 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 22654008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 1779

 22654009 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 22654068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 1839

 22654069 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 22654128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 1899

 22654129 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 22654188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 1959

 22654189 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 22654248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 2019

 22654249 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 22654308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 2079

 22654309 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 22654368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 2139

 22654369 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 22654428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 2199

 22654429 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 22654488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 2259

 22654489 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 22654548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 2319

 22654549 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 22654608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 2379

 22654609 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 22654668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 2439

 22654669 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 22654728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 2499

 22654729 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 22654788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 2559

 22654789 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAA 22654835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAA 2606

Alignment time is 1.92391 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2511] =>      2511 nucs 'mol-32-22e9-056916_2511'

Score:        2511
Aligned:      2511        nucs
Identic:      2511 (100%) nucs =>       286 (100%)      2225 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22653109,22653394] EXCISED REGION [22653769,22655993]
 second seq =>  [       1,     286] EXCISED REGION [     287,    2511]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [22653395,22653768]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22653395,22653395] to [22653769,22653769]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22653109 TATATAGGCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTC 22653168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATATAGGCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTC 60

 22653169 TGACTGCTGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCAC 22653228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGACTGCTGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCAC 120

 22653229 CATACCTGAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGA 22653288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATACCTGAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGA 180

 22653289 AGAGCAGAGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATA 22653348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAGCAGAGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATA 240

 22653349 TTGGAATATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 22653394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGGAATATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 286

EXCISED REGION

 22653769 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 22653828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      287 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 346

 22653829 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 22653888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      347 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 406

 22653889 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 22653948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      407 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 466

 22653949 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 22654008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      467 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 526

 22654009 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 22654068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      527 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 586

 22654069 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 22654128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      587 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 646

 22654129 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 22654188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      647 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 706

 22654189 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 22654248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      707 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 766

 22654249 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 22654308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      767 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 826

 22654309 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 22654368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      827 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 886

 22654369 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 22654428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      887 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 946

 22654429 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 22654488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      947 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 1006

 22654489 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 22654548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1007 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 1066

 22654549 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 22654608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 1126

 22654609 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 22654668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 1186

 22654669 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 22654728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 1246

 22654729 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 22654788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 1306

 22654789 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 22654848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 1366

 22654849 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 22654908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 1426

 22654909 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGC 22654968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGC 1486

 22654969 CACCTATTCCACATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAA 22655028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 CACCTATTCCACATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAA 1546

 22655029 GAATCCTGATGACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAA 22655088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 GAATCCTGATGACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAA 1606

 22655089 TGTGAGTCTTTTTATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTC 22655148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 TGTGAGTCTTTTTATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTC 1666

 22655149 ATATATTTTAGCTTTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGG 22655208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 ATATATTTTAGCTTTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGG 1726

 22655209 AATTTTTAATGTCATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGAT 22655268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 AATTTTTAATGTCATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGAT 1786

 22655269 CAGTTATTATGTTTATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTAC 22655328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 CAGTTATTATGTTTATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTAC 1846

 22655329 TAATATATTTCCTTATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATT 22655388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 TAATATATTTCCTTATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATT 1906

 22655389 CCAGTGTTCAGACAGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATAC 22655448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 CCAGTGTTCAGACAGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATAC 1966

 22655449 ATCTAGTTATCTTCCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTA 22655508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 ATCTAGTTATCTTCCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTA 2026

 22655509 ATATGTACTATGGAATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAG 22655568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 ATATGTACTATGGAATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAG 2086

 22655569 AAAAAGAAAACGGGCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAG 22655628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 AAAAAGAAAACGGGCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAG 2146

 22655629 TCCTCCACCAGGCAACTGCTGTGATTGGGATTTATCATCAATACCTTAGGAAGAAGCAGC 22655688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 TCCTCCACCAGGCAACTGCTGTGATTGGGATTTATCATCAATACCTTAGGAAGAAGCAGC 2206

 22655689 ATTGAGAAAAGGTTATTCGTCTAGTTTGTCATCTACAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGG 22655748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 ATTGAGAAAAGGTTATTCGTCTAGTTTGTCATCTACAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGG 2266

 22655749 ATGGAGAAGAGAGTGATTAAGTGGGGAGATATAAGGCACTATGGATAATATAACAATCCA 22655808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 ATGGAGAAGAGAGTGATTAAGTGGGGAGATATAAGGCACTATGGATAATATAACAATCCA 2326

 22655809 AGTTAAAAGGGAAATTTAGACTGACAAAATATCTTTGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGA 22655868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 AGTTAAAAGGGAAATTTAGACTGACAAAATATCTTTGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGA 2386

 22655869 TAAACAATGTGATAACAATTCAGGCTCAATGACGCTACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAG 22655928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 TAAACAATGTGATAACAATTCAGGCTCAATGACGCTACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAG 2446

 22655929 GGCTAATTTTTCGTTCTTTGGACTTTAGTGTACCCATAAATAAAACGGGAATATGATAGT 22655988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 GGCTAATTTTTCGTTCTTTGGACTTTAGTGTACCCATAAATAAAACGGGAATATGATAGT 2506

 22655989 ACCCA 22655993
          |||||
     2507 ACCCA 2511

Alignment time is 1.86477 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3276] =>      3276 nucs 'mol-32-2378-090248_3276'

Score:        3264
Aligned:      3275        nucs
Identic:      3274 (100%) nucs =>       188 (100%)      3086 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22651853,22652040] EXCISED REGION [22652042,22655128]
 second seq =>  [       1,     188] EXCISED REGION [     190,    3276]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [22652041,22652041]
 second seq =>         1 nucs [189,189]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22652040,22652040] to [22652042,22652042]
 second seq =>         1 nucs [188,188] to [190,190]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22651853 CTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGC 22651912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGC 60

 22651913 ACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGT 22651972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGT 120

 22651973 TTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAG 22652032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAG 180

 22652033 CTGTTTTT 22652040
          ||||||||
      181 CTGTTTTT 188

EXCISED REGION

 22652042 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 22652101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      190 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 249

 22652102 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 22652161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      250 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 309

 22652162 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 22652221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 369

 22652222 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 22652281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 429

 22652282 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 22652341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 489

 22652342 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 22652401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 549

 22652402 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 22652461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 609

 22652462 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 22652521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 669

 22652522 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 22652581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 729

 22652582 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 22652641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 789

 22652642 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 22652701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 849

 22652702 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 22652761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 909

 22652762 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 22652821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 969

 22652822 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 22652881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 1029

 22652882 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 22652941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 1089

 22652942 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 22653001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 1149

 22653002 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 22653061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 1209

 22653062 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 22653121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 1269

 22653122 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 22653181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 1329

 22653182 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 22653241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 1389

 22653242 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 22653301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 1449

 22653302 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 22653361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 1509

 22653362 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 22653421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 1569

 22653422 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 22653481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 1629

 22653482 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 22653541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 1689

 22653542 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 22653601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 1749

 22653602 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 22653661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 1809

 22653662 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 22653721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 1869

 22653722 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 22653781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 1929

 22653782 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 22653841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 1989

 22653842 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 22653901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 2049

 22653902 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 22653961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 2109

 22653962 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 22654021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 2169

 22654022 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 22654081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 2229

 22654082 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 22654141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 2289

 22654142 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 22654201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 2349

 22654202 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 22654261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 2409

 22654262 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 22654321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 2469

 22654322 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 22654381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 2529

 22654382 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 22654441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 2589

 22654442 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 22654501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 2649

 22654502 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 22654561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 2709

 22654562 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 22654621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 2769

 22654622 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 22654681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 2829

 22654682 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 22654741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 2889

 22654742 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 22654801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 2949

 22654802 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 22654861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 3009

 22654862 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 22654921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 3069

 22654922 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 22654981
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 GCTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 3129

 22654982 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGAC 22655041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGAC 3189

 22655042 ATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTT 22655101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 ATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTT 3249

 22655102 ATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATAT 22655128
          |||||||||||||||||||||||||||
     3250 ATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATAT 3276

Alignment time is 2.51384 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2308] =>      2308 nucs 'mol-32-23ba-029922_2308'

Score:        2308
Aligned:      2308        nucs
Identic:      2308 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22652820,22655127]
 second seq =>  [       1,    2308]

 22652820 TCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAG 22652879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAG 60

 22652880 GCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAA 22652939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAA 120

 22652940 CCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAAC 22652999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAAC 180

 22653000 AATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATC 22653059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATC 240

 22653060 CCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTC 22653119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTC 300

 22653120 TAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTA 22653179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTA 360

 22653180 TTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGG 22653239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGG 420

 22653240 TCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGAT 22653299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGAT 480

 22653300 TTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGT 22653359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGT 540

 22653360 GACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGT 22653419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGT 600

 22653420 TTCTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAG 22653479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAG 660

 22653480 CCTGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAA 22653539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAA 720

 22653540 CCTCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAA 22653599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAA 780

 22653600 TTTGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAG 22653659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAG 840

 22653660 GACTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACA 22653719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GACTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACA 900

 22653720 TCACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTC 22653779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTC 960

 22653780 CATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAA 22653839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAA 1020

 22653840 TAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAAT 22653899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAAT 1080

 22653900 CCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATT 22653959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATT 1140

 22653960 ATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATT 22654019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATT 1200

 22654020 AGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGA 22654079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGA 1260

 22654080 GGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAA 22654139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAA 1320

 22654140 CACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACT 22654199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACT 1380

 22654200 ACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAAT 22654259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAAT 1440

 22654260 TTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTA 22654319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTA 1500

 22654320 CATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTT 22654379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTT 1560

 22654380 TGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCC 22654439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCC 1620

 22654440 CACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGAC 22654499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGAC 1680

 22654500 GGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTC 22654559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTC 1740

 22654560 AGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTA 22654619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTA 1800

 22654620 AACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTG 22654679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTG 1860

 22654680 AAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTAT 22654739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTAT 1920

 22654740 AAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTG 22654799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTG 1980

 22654800 TGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAG 22654859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAG 2040

 22654860 CAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAG 22654919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAG 2100

 22654920 TCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCA 22654979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCA 2160

 22654980 CATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATG 22655039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATG 2220

 22655040 ACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTT 22655099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTT 2280

 22655100 TTATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATA 22655127
          ||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATA 2308

Alignment time is 1.5657 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2039] =>      2039 nucs 'mol-32-29b3-057737_2039'

Score:        2038
Aligned:      2038        nucs
Identic:      2038 (100%) nucs =>       203 (100%)      1835 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22651838,22652040] EXCISED REGION [22652042,22653876]
 second seq =>  [       1,     203] EXCISED REGION [     205,    2039]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [22652041,22652041]
 second seq =>         1 nucs [204,204]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22652040,22652040] to [22652042,22652042]
 second seq =>         1 nucs [203,203] to [205,205]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22651838 GAACAATTCTAATTACTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATA 22651897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAACAATTCTAATTACTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATA 60

 22651898 GTACAGGGCTGGAGCACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGA 22651957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTACAGGGCTGGAGCACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGA 120

 22651958 AAAGCAAGTGGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGA 22652017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGCAAGTGGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGA 180

 22652018 GTTGAGTGAAGGGAGCTGTTTTT 22652040
          |||||||||||||||||||||||
      181 GTTGAGTGAAGGGAGCTGTTTTT 203

EXCISED REGION

 22652042 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 22652101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      205 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 264

 22652102 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 22652161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      265 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 324

 22652162 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 22652221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 384

 22652222 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 22652281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 444

 22652282 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 22652341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 504

 22652342 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 22652401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 564

 22652402 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 22652461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 624

 22652462 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 22652521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 684

 22652522 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 22652581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 744

 22652582 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 22652641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 804

 22652642 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 22652701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 864

 22652702 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 22652761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 924

 22652762 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 22652821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 984

 22652822 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 22652881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 1044

 22652882 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 22652941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 1104

 22652942 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 22653001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 1164

 22653002 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 22653061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 1224

 22653062 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 22653121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 1284

 22653122 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 22653181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 1344

 22653182 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 22653241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 1404

 22653242 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 22653301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 1464

 22653302 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 22653361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 1524

 22653362 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 22653421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 1584

 22653422 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 22653481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 1644

 22653482 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 22653541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 1704

 22653542 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 22653601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 1764

 22653602 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 22653661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 1824

 22653662 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 22653721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 1884

 22653722 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 22653781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 1944

 22653782 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 22653841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 2004

 22653842 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAG 22653876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAG 2039

Alignment time is 1.51587 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    5707] =>      5707 nucs 'mol-32-2b55-065814_5707'

Score:        5685
Aligned:      5707        nucs
Identic:      5705 (100%) nucs =>      1550 (100%)      4155 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22651843,22653394] EXCISED REGION [22653769,22657923]
 second seq =>  [       1,    1552] EXCISED REGION [    1553,    5707]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [22653395,22653768]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22653395,22653395] to [22653769,22653769]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22651843 ATTCTAATTACTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACA 22651902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCTAATTACTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACA 60

 22651903 GGGCTGGAGCACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGC 22651962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGCTGGAGCACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGC 120

 22651963 AAGTGGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGA 22652022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGTGGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGA 180

 22652023 GTGAAGGGAGCTGTTTTTGTCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTC 22652082
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGAAGGGAGCTGTTTTTATCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTC 240

 22652083 TATGTGAGCCTGGTTGAATCCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTC 22652142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATGTGAGCCTGGTTGAATCCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTC 300

 22652143 TGTTACATATAGTGAACTTGTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCC 22652202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTACATATAGTGAACTTGTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCC 360

 22652203 TTCCTTATGCCCTGGCTTTTGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATC 22652262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCCTTATGCCCTGGCTTTTGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATC 420

 22652263 AGACATATCCTATATAAGCAAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTC 22652322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGACATATCCTATATAAGCAAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTC 480

 22652323 TATCCCACTTCTCTCTGTTTTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTT 22652382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATCCCACTTCTCTCTGTTTTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTT 540

 22652383 TGGGAAAACAAATGTGCTCTGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAA 22652442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGGAAAACAAATGTGCTCTGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAA 600

 22652443 AAATGCATTTCTAGAAGTCCAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTA 22652502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATGCATTTCTAGAAGTCCAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTA 660

 22652503 TGTGGAGAGAATTTTAGGCTACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATA 22652562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTGGAGAGAATTTTAGGCTACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATA 720

 22652563 GCCAAAAGTAGAGATTCCCAGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTT 22652622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCAAAAGTAGAGATTCCCAGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTT 780

 22652623 TGAAATGATTTTCAATCACTGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTG 22652682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAAATGATTTTCAATCACTGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTG 840

 22652683 TGTATCTTCACCATTTAAAGATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTA 22652742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTATCTTCACCATTTAAAGATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTA 900

 22652743 GAGTGAATTTATTGTTGGCAGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCT 22652802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGTGAATTTATTGTTGGCAGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCT 960

 22652803 GTTCCCTACATAATGGATCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTT 22652862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTCCCTACATAATGGATCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTT 1020

 22652863 CTGCCAGTCTACATTAGGCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACT 22652922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGCCAGTCTACATTAGGCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACT 1080

 22652923 CTGTAAAGTATGTGAAACCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAAT 22652982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGTAAAGTATGTGAAACCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAAT 1140

 22652983 TTGGCTAAGTGCACAACAATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAAT 22653042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1141 TTGGCTAAGTGCACAACAATGTAAGGATTGAATATCCCAGCAATTTACCTCAATCATAAT 1200

 22653043 AGCTCATGTCTTTTATCCCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTC 22653102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCTCATGTCTTTTATCCCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTC 1260

 22653103 CTCTTCTATATAGGCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGC 22653162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCTTCTATATAGGCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGC 1320

 22653163 ATGTTCTGACTGCTGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAA 22653222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGTTCTGACTGCTGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAA 1380

 22653223 TCCCACCATACCTGAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTT 22653282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCCACCATACCTGAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTT 1440

 22653283 AGTGGAAGAGCAGAGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGA 22653342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTGGAAGAGCAGAGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGA 1500

 22653343 CAAATATTGGAATATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 22653394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAATATTGGAATATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 1552

EXCISED REGION

 22653769 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 22653828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 1612

 22653829 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 22653888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 1672

 22653889 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 22653948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 1732

 22653949 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 22654008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 1792

 22654009 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 22654068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 1852

 22654069 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 22654128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 1912

 22654129 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 22654188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 1972

 22654189 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 22654248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 2032

 22654249 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 22654308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 2092

 22654309 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 22654368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 2152

 22654369 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 22654428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 2212

 22654429 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 22654488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 2272

 22654489 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 22654548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 2332

 22654549 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 22654608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 2392

 22654609 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 22654668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 2452

 22654669 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 22654728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 2512

 22654729 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 22654788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 2572

 22654789 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 22654848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 2632

 22654849 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 22654908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 2692

 22654909 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGC 22654968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGC 2752

 22654969 CACCTATTCCACATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAA 22655028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 CACCTATTCCACATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAA 2812

 22655029 GAATCCTGATGACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAA 22655088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 GAATCCTGATGACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAA 2872

 22655089 TGTGAGTCTTTTTATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTC 22655148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 TGTGAGTCTTTTTATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTC 2932

 22655149 ATATATTTTAGCTTTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGG 22655208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 ATATATTTTAGCTTTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGG 2992

 22655209 AATTTTTAATGTCATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGAT 22655268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 AATTTTTAATGTCATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGAT 3052

 22655269 CAGTTATTATGTTTATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTAC 22655328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 CAGTTATTATGTTTATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTAC 3112

 22655329 TAATATATTTCCTTATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATT 22655388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 TAATATATTTCCTTATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATT 3172

 22655389 CCAGTGTTCAGACAGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATAC 22655448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 CCAGTGTTCAGACAGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATAC 3232

 22655449 ATCTAGTTATCTTCCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTA 22655508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 ATCTAGTTATCTTCCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTA 3292

 22655509 ATATGTACTATGGAATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAG 22655568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 ATATGTACTATGGAATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAG 3352

 22655569 AAAAAGAAAACGGGCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAG 22655628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 AAAAAGAAAACGGGCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAG 3412

 22655629 TCCTCCACCAGGCAACTGCTGTGATTGGGATTTATCATCAATACCTTAGGAAGAAGCAGC 22655688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 TCCTCCACCAGGCAACTGCTGTGATTGGGATTTATCATCAATACCTTAGGAAGAAGCAGC 3472

 22655689 ATTGAGAAAAGGTTATTCGTCTAGTTTGTCATCTACAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGG 22655748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 ATTGAGAAAAGGTTATTCGTCTAGTTTGTCATCTACAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGG 3532

 22655749 ATGGAGAAGAGAGTGATTAAGTGGGGAGATATAAGGCACTATGGATAATATAACAATCCA 22655808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 ATGGAGAAGAGAGTGATTAAGTGGGGAGATATAAGGCACTATGGATAATATAACAATCCA 3592

 22655809 AGTTAAAAGGGAAATTTAGACTGACAAAATATCTTTGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGA 22655868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 AGTTAAAAGGGAAATTTAGACTGACAAAATATCTTTGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGA 3652

 22655869 TAAACAATGTGATAACAATTCAGGCTCAATGACGCTACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAG 22655928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 TAAACAATGTGATAACAATTCAGGCTCAATGACGCTACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAG 3712

 22655929 GGCTAATTTTTCGTTCTTTGGACTTTAGTGTACCCATAAATAAAACGGGAATATGATAGT 22655988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 GGCTAATTTTTCGTTCTTTGGACTTTAGTGTACCCATAAATAAAACGGGAATATGATAGT 3772

 22655989 ACCCAACTCTTAGGGTTTTGTGATGATTAAATGATACACTATTATATATAAATTTTAGAG 22656048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 ACCCAACTCTTAGGGTTTTGTGATGATTAAATGATACACTATTATATATAAATTTTAGAG 3832

 22656049 TTCCAAAAATGAGTGTGTTTTACTCTGGAAACTTAAAAGGTGCTTTATTTAATTTTAAGA 22656108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 TTCCAAAAATGAGTGTGTTTTACTCTGGAAACTTAAAAGGTGCTTTATTTAATTTTAAGA 3892

 22656109 AATACATGGCTGTTGTGTAGGCTTACTAAATGGTTTAGGTATTTATTTATCCCATGAGTT 22656168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 AATACATGGCTGTTGTGTAGGCTTACTAAATGGTTTAGGTATTTATTTATCCCATGAGTT 3952

 22656169 TGTGGGATTGTGCATCTGGGGTACAATAATTTTTAAGTGTTTAGTTCTTTGAACAATTGT 22656228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 TGTGGGATTGTGCATCTGGGGTACAATAATTTTTAAGTGTTTAGTTCTTTGAACAATTGT 4012

 22656229 GCAGCATACATACAGACCTCTCTGCCTCCCTCTCTCCCGAATGCAATCCACTGTGGGAAG 22656288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 GCAGCATACATACAGACCTCTCTGCCTCCCTCTCTCCCGAATGCAATCCACTGTGGGAAG 4072

 22656289 CATGATTTGTAGCTAATAGTGAACATCAACTTGGTGAAAAAATAAATTTTTCTTACAATG 22656348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 CATGATTTGTAGCTAATAGTGAACATCAACTTGGTGAAAAAATAAATTTTTCTTACAATG 4132

 22656349 AATTTCTCTCTTTAATAGGGATTTAATTTTGTTAAAAGTAATAACAACTAAATAAAGAAT 22656408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 AATTTCTCTCTTTAATAGGGATTTAATTTTGTTAAAAGTAATAACAACTAAATAAAGAAT 4192

 22656409 GTTTTCTTCATCCAGTAAGATCACTGACTTTCTCAAATAACTGGTGATGCTCTAGTATGT 22656468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 GTTTTCTTCATCCAGTAAGATCACTGACTTTCTCAAATAACTGGTGATGCTCTAGTATGT 4252

 22656469 CCATAATGGCAGATATCCAGATCCCAGTGTGACCTGCTTTAAACTTTGAGAAAACAGATA 22656528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 CCATAATGGCAGATATCCAGATCCCAGTGTGACCTGCTTTAAACTTTGAGAAAACAGATA 4312

 22656529 TGCGCATTAAAGGATAATGGTTTTATGAGGAAATATAAATAATCTCAACTAACCAGACTC 22656588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 TGCGCATTAAAGGATAATGGTTTTATGAGGAAATATAAATAATCTCAACTAACCAGACTC 4372

 22656589 CATTGATTTTCATAGTTCCATTGTAATAAATGAAAACAAATCTTGTGCTAATTTTAAAGA 22656648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 CATTGATTTTCATAGTTCCATTGTAATAAATGAAAACAAATCTTGTGCTAATTTTAAAGA 4432

 22656649 TCATAGATGCTAAGAGGGGCCAGTTTAGAGAATAAAGTGATACAGTAAAATGAAAAAAAA 22656708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 TCATAGATGCTAAGAGGGGCCAGTTTAGAGAATAAAGTGATACAGTAAAATGAAAAAAAA 4492

 22656709 AGGAGAAATTTCTTTTTCATTTTGTGTGAAAGACCAGTATTTAAAGATTGCAGGATCAAT 22656768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 AGGAGAAATTTCTTTTTCATTTTGTGTGAAAGACCAGTATTTAAAGATTGCAGGATCAAT 4552

 22656769 AGCACATTTCTGCTTGAATGAGAGACAGTGAGATCAGGAAAACATGACGTATAAACAAAA 22656828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 AGCACATTTCTGCTTGAATGAGAGACAGTGAGATCAGGAAAACATGACGTATAAACAAAA 4612

 22656829 GAAAATGGACATAATTGTTCTTGTATTATATTAATAAATATAGTGGTAAAATGGAAACTA 22656888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 GAAAATGGACATAATTGTTCTTGTATTATATTAATAAATATAGTGGTAAAATGGAAACTA 4672

 22656889 GAACGGATATGTAAAATGACTAAAGGAACTGCAGTGATAAAGTAAATTATTAATAGAAAA 22656948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 GAACGGATATGTAAAATGACTAAAGGAACTGCAGTGATAAAGTAAATTATTAATAGAAAA 4732

 22656949 TACCGTATGTTCAACTCATTAGTAGTATTTAGATCTCTGACCCACTTAGAAAGAAATAGT 22657008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 TACCGTATGTTCAACTCATTAGTAGTATTTAGATCTCTGACCCACTTAGAAAGAAATAGT 4792

 22657009 TTTTCTGTCTTAGTGTTCATAACTGCTGAACAGGCCAGGATTGGCAACTATAACTAGGAC 22657068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 TTTTCTGTCTTAGTGTTCATAACTGCTGAACAGGCCAGGATTGGCAACTATAACTAGGAC 4852

 22657069 TAGATTTCCTACAGTAAATCATTTAAGTTGCATGTAGTACCTATTATCAAAAAGCAAATG 22657128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 TAGATTTCCTACAGTAAATCATTTAAGTTGCATGTAGTACCTATTATCAAAAAGCAAATG 4912

 22657129 AAGAATTCATTTAATAGTGTATGCTGGTTAGGAACCTTCATTGAAACCTGATTTTCCTCC 22657188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 AAGAATTCATTTAATAGTGTATGCTGGTTAGGAACCTTCATTGAAACCTGATTTTCCTCC 4972

 22657189 ACGAAGTGTATATGCCTTCACCATCTGTAGTTCTCAAATTCAAGCCATGCTAATGCTAAC 22657248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 ACGAAGTGTATATGCCTTCACCATCTGTAGTTCTCAAATTCAAGCCATGCTAATGCTAAC 5032

 22657249 AAAGTGGCTGGCTTGGCAGATCAATCAGAGAGGGAGCCTGGAGATTTACCTACTTTGGAA 22657308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 AAAGTGGCTGGCTTGGCAGATCAATCAGAGAGGGAGCCTGGAGATTTACCTACTTTGGAA 5092

 22657309 AGGTAATTTAAAACTAAATCCACCTTTAGAAGTGAGTGTCCCATTTGTGTTTATAGGTTT 22657368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 AGGTAATTTAAAACTAAATCCACCTTTAGAAGTGAGTGTCCCATTTGTGTTTATAGGTTT 5152

 22657369 CACTAGAGGGGAGCCCTACATATTAGAAGCATTTCCTTTTGTTTGCCAATAGCAGTGAAG 22657428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 CACTAGAGGGGAGCCCTACATATTAGAAGCATTTCCTTTTGTTTGCCAATAGCAGTGAAG 5212

 22657429 ACTAAGGCTAAAACCCAAAAGGATATGACTTACACAAGAATGAGCATATGGCTGTCAAAG 22657488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 ACTAAGGCTAAAACCCAAAAGGATATGACTTACACAAGAATGAGCATATGGCTGTCAAAG 5272

 22657489 TTTTAATCACTAGGAAAGGAAAATATAGTTGCAGCTTGTAGATAAACAGCTCTGTTTTAG 22657548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 TTTTAATCACTAGGAAAGGAAAATATAGTTGCAGCTTGTAGATAAACAGCTCTGTTTTAG 5332

 22657549 CAAAAGCCAGATGAGGACAGACTTGGTTGTAAGATAATTGGTAAAAAATGTCAGCCCTTT 22657608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 CAAAAGCCAGATGAGGACAGACTTGGTTGTAAGATAATTGGTAAAAAATGTCAGCCCTTT 5392

 22657609 AAAGGAGCATATCAGTTTTGCATGCTCAATAAAACAACAACAACAACTCACCTAAGGAGA 22657668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 AAAGGAGCATATCAGTTTTGCATGCTCAATAAAACAACAACAACAACTCACCTAAGGAGA 5452

 22657669 GGTGAGTCTAACAGGAAAAATTCAAGCAGCAGAAAAATTTGGTACAATAATCTCCTATGA 22657728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 GGTGAGTCTAACAGGAAAAATTCAAGCAGCAGAAAAATTTGGTACAATAATCTCCTATGA 5512

 22657729 ACTAAATTACCTGAAGTATTTTATCAGTATCTTTCATAGAGTTAAGAGGCAGGAGTTCAG 22657788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 ACTAAATTACCTGAAGTATTTTATCAGTATCTTTCATAGAGTTAAGAGGCAGGAGTTCAG 5572

 22657789 GCACTGCATTTAAAAATGGTTTGGCACAGTCATTGCCAATGTTACTAAAACTTCTAAAGG 22657848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 GCACTGCATTTAAAAATGGTTTGGCACAGTCATTGCCAATGTTACTAAAACTTCTAAAGG 5632

 22657849 GATAAGGAAACAATTTCTTGTGCAATTTTGGAGGATCATATGATTCATACTATATTGGAA 22657908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 GATAAGGAAACAATTTCTTGTGCAATTTTGGAGGATCATATGATTCATACTATATTGGAA 5692

 22657909 TTTTCATGGTAAAAT 22657923
          |||||||||||||||
     5693 TTTTCATGGTAAAAT 5707

Alignment time is 4.15429 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    4139] =>      4139 nucs 'mol-32-2e0a-102287_4139'

Score:        4127
Aligned:      4138        nucs
Identic:      4137 (100%) nucs =>       205 (100%)      3932 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22651836,22652040] EXCISED REGION [22652042,22655974]
 second seq =>  [       1,     205] EXCISED REGION [     207,    4139]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [22652041,22652041]
 second seq =>         1 nucs [206,206]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22652040,22652040] to [22652042,22652042]
 second seq =>         1 nucs [205,205] to [207,207]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22651836 TTGAACAATTCTAATTACTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCA 22651895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGAACAATTCTAATTACTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCA 60

 22651896 TAGTACAGGGCTGGAGCACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGAT 22651955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGTACAGGGCTGGAGCACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGAT 120

 22651956 GAAAAGCAAGTGGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCA 22652015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAAAGCAAGTGGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCA 180

 22652016 GAGTTGAGTGAAGGGAGCTGTTTTT 22652040
          |||||||||||||||||||||||||
      181 GAGTTGAGTGAAGGGAGCTGTTTTT 205

EXCISED REGION

 22652042 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 22652101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      207 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 266

 22652102 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 22652161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      267 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 326

 22652162 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 22652221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      327 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 386

 22652222 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 22652281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      387 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 446

 22652282 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 22652341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      447 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 506

 22652342 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 22652401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      507 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 566

 22652402 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 22652461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      567 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 626

 22652462 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 22652521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      627 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 686

 22652522 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 22652581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      687 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 746

 22652582 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 22652641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 806

 22652642 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 22652701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 866

 22652702 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 22652761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 926

 22652762 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 22652821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 986

 22652822 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 22652881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 1046

 22652882 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 22652941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 1106

 22652942 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 22653001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 1166

 22653002 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 22653061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 1226

 22653062 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 22653121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 1286

 22653122 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 22653181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 1346

 22653182 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 22653241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 1406

 22653242 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 22653301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 1466

 22653302 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 22653361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 1526

 22653362 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 22653421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 1586

 22653422 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 22653481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 1646

 22653482 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 22653541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 1706

 22653542 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 22653601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 1766

 22653602 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 22653661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 1826

 22653662 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 22653721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 1886

 22653722 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 22653781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 1946

 22653782 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 22653841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 2006

 22653842 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 22653901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 2066

 22653902 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 22653961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 2126

 22653962 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 22654021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 2186

 22654022 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 22654081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 2246

 22654082 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 22654141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 2306

 22654142 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 22654201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 2366

 22654202 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 22654261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 2426

 22654262 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 22654321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 2486

 22654322 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 22654381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 2546

 22654382 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 22654441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 2606

 22654442 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 22654501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 2666

 22654502 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 22654561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 2726

 22654562 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 22654621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 2786

 22654622 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 22654681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 2846

 22654682 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 22654741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 2906

 22654742 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 22654801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 2966

 22654802 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 22654861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 3026

 22654862 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 22654921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 3086

 22654922 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 22654981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 3146

 22654982 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGAC 22655041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGAC 3206

 22655042 ATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTT 22655101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 ATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTT 3266

 22655102 ATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTCATATATTTTAGCT 22655161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 ATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTCATATATTTTAGCT 3326

 22655162 TTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGGAATTTTTAATGTC 22655221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 TTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGGAATTTTTAATGTC 3386

 22655222 ATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGATCAGTTATTATGTT 22655281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 ATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGATCAGTTATTATGTT 3446

 22655282 TATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTACTAATATATTTCCT 22655341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 TATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTACTAATATATTTCCT 3506

 22655342 TATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATTCCAGTGTTCAGAC 22655401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 TATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATTCCAGTGTTCAGAC 3566

 22655402 AGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATACATCTAGTTATCTT 22655461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 AGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATACATCTAGTTATCTT 3626

 22655462 CCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTAATATGTACTATGG 22655521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 CCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTAATATGTACTATGG 3686

 22655522 AATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAGAAAAAGAAAACGG 22655581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 AATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAGAAAAAGAAAACGG 3746

 22655582 GCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAGTCCTCCACCAGGC 22655641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 GCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAGTCCTCCACCAGGC 3806

 22655642 AACTGCTGTGATTGGGATTTATCATCAATACCTTAGGAAGAAGCAGCATTGAGAAAAGGT 22655701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 AACTGCTGTGATTGGGATTTATCATCAATACCTTAGGAAGAAGCAGCATTGAGAAAAGGT 3866

 22655702 TATTCGTCTAGTTTGTCATCTACAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGGATGGAGAAGAGAG 22655761
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 TATTCGTCTAGTTTGTCATCTGCAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGGATGGAGAAGAGAG 3926

 22655762 TGATTAAGTGGGGAGATATAAGGCACTATGGATAATATAACAATCCAAGTTAAAAGGGAA 22655821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 TGATTAAGTGGGGAGATATAAGGCACTATGGATAATATAACAATCCAAGTTAAAAGGGAA 3986

 22655822 ATTTAGACTGACAAAATATCTTTGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGATAAACAATGTGAT 22655881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 ATTTAGACTGACAAAATATCTTTGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGATAAACAATGTGAT 4046

 22655882 AACAATTCAGGCTCAATGACGCTACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAGGGCTAATTTTTCG 22655941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 AACAATTCAGGCTCAATGACGCTACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAGGGCTAATTTTTCG 4106

 22655942 TTCTTTGGACTTTAGTGTACCCATAAATAAAAC 22655974
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 TTCTTTGGACTTTAGTGTACCCATAAATAAAAC 4139

Alignment time is 2.98529 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2295] =>      2295 nucs 'mol-32-2f28-056182_2295'

Score:        2295
Aligned:      2295        nucs
Identic:      2295 (100%) nucs =>      1121 (100%)      1174 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22652274,22653394] EXCISED REGION [22653769,22654942]
 second seq =>  [       1,    1121] EXCISED REGION [    1122,    2295]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [22653395,22653768]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22653395,22653395] to [22653769,22653769]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22652274 ATATAAGCAAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTC 22652333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATAAGCAAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTC 60

 22652334 TCTCTGTTTTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAA 22652393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCTGTTTTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAA 120

 22652394 ATGTGCTCTGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTC 22652453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTGCTCTGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTC 180

 22652454 TAGAAGTCCAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAA 22652513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGAAGTCCAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAA 240

 22652514 TTTTAGGCTACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAG 22652573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTAGGCTACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAG 300

 22652574 AGATTCCCAGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTT 22652633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATTCCCAGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTT 360

 22652634 TCAATCACTGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCAC 22652693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAATCACTGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCAC 420

 22652694 CATTTAAAGATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTA 22652753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATTTAAAGATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTA 480

 22652754 TTGTTGGCAGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACAT 22652813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTTGGCAGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACAT 540

 22652814 AATGGATCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTA 22652873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATGGATCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTA 600

 22652874 CATTAGGCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTAT 22652933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATTAGGCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTAT 660

 22652934 GTGAAACCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTG 22652993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGAAACCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTG 720

 22652994 CACAACAATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCT 22653053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACAACAATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCT 780

 22653054 TTTATCCCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATAT 22653113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTATCCCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATAT 840

 22653114 AGGCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACT 22653173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACT 900

 22653174 GCTGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATAC 22653233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATAC 960

 22653234 CTGAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGC 22653293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGC 1020

 22653294 AGAGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGA 22653353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGA 1080

 22653354 ATATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 22653394
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 1121

EXCISED REGION

 22653769 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 22653828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 1181

 22653829 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 22653888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 1241

 22653889 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 22653948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 1301

 22653949 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 22654008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 1361

 22654009 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 22654068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 1421

 22654069 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 22654128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 1481

 22654129 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 22654188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 1541

 22654189 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 22654248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 1601

 22654249 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 22654308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 1661

 22654309 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 22654368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 1721

 22654369 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 22654428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 1781

 22654429 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 22654488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 1841

 22654489 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 22654548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 1901

 22654549 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 22654608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 1961

 22654609 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 22654668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 2021

 22654669 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 22654728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 2081

 22654729 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 22654788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 2141

 22654789 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 22654848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 2201

 22654849 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 22654908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 2261

 22654909 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGA 22654942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGA 2295

Alignment time is 1.6946 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3382] =>      3382 nucs 'mol-32-3004-045280_3382'

Score:        3371
Aligned:      3382        nucs
Identic:      3381 (100%) nucs =>       165 (100%)      3216 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22651636,22651800] EXCISED REGION [22651802,22655018]
 second seq =>  [       1,     165] EXCISED REGION [     166,    3382]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [22651801,22651801]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [22652041,22652041]
 second seq =>         1 nucs [405,405]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        24 nucs [22651801,22651824] to [22651802,22651825]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22651636 AAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCATGCGTGGTGGTGGGTGCCTATAGTCCCAGCTACTCT 22651695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCATGCGTGGTGGTGGGTGCCTATAGTCCCAGCTACTCT 60

 22651696 GGAGGCTAAGGCAAGATAATCGTTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGAT 22651755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAGGCTAAGGCAAGATAATCGTTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGAT 120

 22651756 CACACCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCGAGACACCATCTC 22651800
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACACCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCGAGACACCATCTC 165

EXCISED REGION

 22651802 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTGAACAATTGAACAATTCTAATTACTACTCATG 22651861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      166 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTGAACAATTGAACAATTCTAATTACTACTCATG 225

 22651862 CTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGCACATGGGCT 22651921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      226 CTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGCACATGGGCT 285

 22651922 ACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGTTTGGTGTGA 22651981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      286 ACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGTTTGGTGTGA 345

 22651982 GAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAGCTGTTTTTG 22652041
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      346 GAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAGCTGTTTTTA 405

 22652042 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 22652101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      406 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 465

 22652102 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 22652161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      466 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 525

 22652162 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 22652221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      526 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 585

 22652222 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 22652281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      586 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 645

 22652282 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 22652341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      646 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 705

 22652342 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 22652401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      706 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 765

 22652402 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 22652461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      766 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 825

 22652462 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 22652521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      826 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 885

 22652522 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 22652581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      886 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 945

 22652582 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 22652641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      946 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 1005

 22652642 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 22652701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1006 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 1065

 22652702 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 22652761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 1125

 22652762 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 22652821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1126 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 1185

 22652822 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 22652881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1186 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 1245

 22652882 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 22652941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1246 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 1305

 22652942 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 22653001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1306 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 1365

 22653002 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 22653061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 1425

 22653062 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 22653121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 1485

 22653122 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 22653181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 1545

 22653182 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 22653241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 1605

 22653242 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 22653301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 1665

 22653302 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 22653361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 1725

 22653362 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 22653421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 1785

 22653422 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 22653481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 1845

 22653482 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 22653541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 1905

 22653542 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 22653601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 1965

 22653602 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 22653661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 2025

 22653662 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 22653721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 2085

 22653722 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 22653781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 2145

 22653782 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 22653841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 2205

 22653842 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 22653901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 2265

 22653902 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 22653961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 2325

 22653962 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 22654021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 2385

 22654022 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 22654081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 2445

 22654082 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 22654141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 2505

 22654142 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 22654201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 2565

 22654202 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 22654261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 2625

 22654262 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 22654321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 2685

 22654322 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 22654381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 2745

 22654382 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 22654441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 2805

 22654442 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 22654501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 2865

 22654502 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 22654561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 2925

 22654562 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 22654621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 2985

 22654622 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 22654681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 3045

 22654682 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 22654741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 3105

 22654742 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 22654801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 3165

 22654802 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 22654861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 3225

 22654862 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 22654921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 3285

 22654922 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 22654981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 3345

 22654982 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTT 22655018
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTT 3382

Alignment time is 2.47483 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    7978] =>      7978 nucs 'mol-32-3004-278652_7978'

Score:        7909
Aligned:      7987        nucs
Identic:      7975 (100%) nucs =>      6876 (100%)      1099 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22646508,22653394] EXCISED REGION [22653769,22654867]
 second seq =>  [       1,    6879] EXCISED REGION [    6880,    7978]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [22653395,22653768]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22653395,22653395] to [22653769,22653769]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22646508 ATTGTGTGCATCTGATCGTGCTGCACATTCCCTTTAGGTTGCAATCTCTGCTGTTATTAC 22646567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTGTGTGCATCTGATCGTGCTGCACATTCCCTTTAGGTTGCAATCTCTGCTGTTATTAC 60

 22646568 CGACAACAACTGAGACTACAGTTTTAACTCTGTATTTACTTCTAGTTATCCCACAATTGG 22646627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGACAACAACTGAGACTACAGTTTTAACTCTGTATTTACTTCTAGTTATCCCACAATTGG 120

 22646628 TACATAGTATTGGATGGAGCCCTGTATTTCAAGGAGTTCAACTACCTAATTTTCATAGCT 22646687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACATAGTATTGGATGGAGCCCTGTATTTCAAGGAGTTCAACTACCTAATTTTCATAGCT 180

 22646688 GAGATAACTAAGTTTCTGAGTCCGTTTTCCTTTTTCCAGTCTGATCTCTCCTTTTCTCAA 22646747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGATAACTAAGTTTCTGAGTCCGTTTTCCTTTTTCCAGTCTGATCTCTCCTTTTCTCAA 240

 22646748 GGCTACTTTCGTTTCTGATAACATACTAAAGGTTATAGGATTTATCGGTATTTTGCCTCC 22646807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCTACTTTCGTTTCTGATAACATACTAAAGGTTATAGGATTTATCGGTATTTTGCCTCC 300

 22646808 TGGGGTCATTTGTTATTAAAAAAGAAACTCTATTCAAATAACTGAATCTCTACTATTGGA 22646867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGGGTCATTTGTTATTAAAAAAGAAACTCTATTCAAATAACTGAATCTCTACTATTGGA 360

 22646868 TTTTCCAAAGCTATGATAGACCAGCTAGTGAAACTATTTTGTACTGGAATTTGGCAGGGT 22646927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTCCAAAGCTATGATAGACCAGCTAGTGAAACTATTTTGTACTGGAATTTGGCAGGGT 420

 22646928 GATGGGGTGGGGAGAAGGTGTGGAGAGGAATTCTTGTCCTCAGTCCTGATATTTCTTTCC 22646987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATGGGGTGGGGAGAAGGTGTGGAGAGGAATTCTTGTCCTCAGTCCTGATATTTCTTTCC 480

 22646988 AGGTGAATGTGGTCTTCCGTGTGCTACACTCCTTGCCTCTCTCTGCTCTTCTATTCACTA 22647047
          |||| |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGT-AATGTGGTCTTCCGTGTGCTATACTCCTTGCCTCTCTCTGCTCTTCTATTCACTA 539

 22647048 TCTACCAGAGAAGATGGAGTGATTCACTCTGATTAATAAATTTGGAAAAAATCAATTAGA 22647107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TCTACCAGAGAAGATGGAGTGATTCACTCTGATTAATAAATTTGGAAAAAATCAATTAGA 599

 22647108 CATGCTCCGAATAGTTCCACCCTTTTTGTCTTAGAAGACAGCTGCCCTCAGAGAGCAAGA 22647167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CATGCTCCGAATAGTTCCACCCTTTTTGTCTTAGAAGACAGCTGCCCTCAGAGAGCAAGA 659

 22647168 TTTTACCTTTGTAAATTGGTACACATGATCTAGCTTAGCATTGCTTTTAACAGGGGGAAG 22647227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TTTTACCTTTGTAAATTGGTACACATGATCTAGCTTAGCATTGCTTTTAACAGGGGGAAG 719

 22647228 TCTGTATAATTCCTGGATTATTATCATGCCAGTGGGTTCTCATATTATACTTTATCCTCC 22647287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TCTGTATAATTCCTGGATTATTATCATGCCAGTGGGTTCTCATATTATACTTTATCCTCC 779

 22647288 AAATTAATTTTTTGTGGTGAAATTGATGCTTTTACTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTT 22647347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 AAATTAATTTTTTGTGGTGAAATTGATGCTTTTACTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTT 839

 22647348 TTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCAT 22647407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCAT 899

 22647408 CTTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTAGCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCG 22647467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CTTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTAGCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCG 959

 22647468 AGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 22647527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 1019

 22647528 GACGGGGCTTCACTGTGTTAGCCAGGATGATCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCACCCG 22647587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GACGGGGCTTCACTGTGTTAGCCAGGATGATCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCACCCG 1079

 22647588 CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCGATGCTTT 22647647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCGATGCTTT 1139

 22647648 TATTTCTATCTTCTCATTTGTGTAAAGTGAATAATGATATCTCACTGTGATTTCTAGTTC 22647707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TATTTCTATCTTCTCATTTGTGTAAAGTGAATAATGATATCTCACTGTGATTTCTAGTTC 1199

 22647708 ATTTTTGTGACTCACAAATATAGATACTACTTCCGTTATATTACCTGTTTATTTTCTTAT 22647767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ATTTTTGTGACTCACAAATATAGATACTACTTCCGTTATATTACCTGTTTATTTTCTTAT 1259

 22647768 GTGAATTGCTTTCTCATACCCTTTTCTAAATTTTCTCTTCAGTACTTTACAAAGGGATTT 22647827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GTGAATTGCTTTCTCATACCCTTTTCTAAATTTTCTCTTCAGTACTTTACAAAGGGATTT 1319

 22647828 GAAAGTGAGTTTGGTGATAATACGAAAGTATTTCAAGTGGACAAAGTGCAAATAATAGTA 22647887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GAAAGTGAGTTTGGTGATAATACGAAAGTATTTCAAGTGGACAAAGTGCAAATAATAGTA 1379

 22647888 TCAGTTGATGTTAGCATACACACACAGGAATGTCTTCTTTTATAGTAAAATTTATTTATT 22647947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TCAGTTGATGTTAGCATACACACACAGGAATGTCTTCTTTTATAGTAAAATTTATTTATT 1439

 22647948 TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAT 22648007
          |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||
     1440 TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAT----GACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAT 1495

 22648008 GCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTACAAGCTCAGCCTCCCAGGTTCACGCCA 22648067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 GCTGGAGTGCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTACAAGCTCAGCCTCCCAGGTTCACGCCA 1555

 22648068 TTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCT 22648127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCT 1615

 22648128 AATTTTTTGTATTGTTGTTAGTAGAGACGGGGTCTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTGG 22648187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 AATTTTTTGTATTGTTGTTAGTAGAGACGGGGTCTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTGG 1675

 22648188 ATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGTATAGTAAAATA 22648247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 ATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGTATAGTAAAATA 1735

 22648248 TTGAGTGTGTGTGTATATGATAGAGAGAAAATAATACTAATTTTAAGAGAGTTATATGAA 22648307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 TTGAGTGTGTGTGTATATGATAGAGAGAAAATAATACTAATTTTAAGAGAGTTATATGAA 1795

 22648308 AATTCTTTTAGATTTCTAAGGAAAAGACTGACTCGAACAAATGGACATTTTAAGAAAGCT 22648367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 AATTCTTTTAGATTTCTAAGGAAAAGACTGACTCGAACAAATGGACATTTTAAGAAAGCT 1855

 22648368 ATTGCTACTTAGTAATGTATGAGTCAAATGGATAGAAACTCCACTATTTGATGTGAGGTG 22648427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 ATTGCTACTTAGTAATGTATGAGTCAAATGGATAGAAACTCCACTATTTGATGTGAGGTG 1915

 22648428 TCTAGAATGTTGGGAAAGTGTTAATTCAATAGTGCTGTAGACAAAAAGTTTTCCACATTG 22648487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TCTAGAATGTTGGGAAAGTGTTAATTCAATAGTGCTGTAGACAAAAAGTTTTCCACATTG 1975

 22648488 ATCCTATTTGTTCACCCATCTCCCTCCACCTAGGGGAACTACTTTTTAAAAGATGTTATG 22648547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 ATCCTATTTGTTCACCCATCTCCCTCCACCTAGGGGAACTACTTTTTAAAAGATGTTATG 2035

 22648548 TTGTTCAAATTTCATATATAACCAATGTAAGTGAGCCATTAGTGTTTTTGGAGTATGAGG 22648607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 TTGTTCAAATTTCATATATAACCAATGTAAGTGAGCCATTAGTGTTTTTGGAGTATGAGG 2095

 22648608 TAATAGATTCCTGTCCCCCACCAACTCCCTTATTTATCCCCTTTATGATTTCCTCACATA 22648667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 TAATAGATTCCTGTCCCCCACCAACTCCCTTATTTATCCCCTTTATGATTTCCTCACATA 2155

 22648668 GCTAATAATGCAACAAGAAGAGCTTTAGGGGTGCAGAGAACTCAGAAATATCCCATTGCA 22648727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 GCTAATAATGCAACAAGAAGAGCTTTAGGGGTGCAGAGAACTCAGAAATATCCCATTGCA 2215

 22648728 ATAGAAGGATATGTTTCCTTTTAAGGTAGCTCCGAAACAGCCCATTATATAATCATTTTG 22648787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 ATAGAAGGATATGTTTCCTTTTAAGGTAGCTCCGAAACAGCCCATTATATAATCATTTTG 2275

 22648788 TCCCAAAGCAGTGGCTTTCATACTCACCCTGCCCATGGGCCTGACCATAACTGTTATTTC 22648847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TCCCAAAGCAGTGGCTTTCATACTCACCCTGCCCATGGGCCTGACCATAACTGTTATTTC 2335

 22648848 ACTAAATCAGGTTATTTTTGGAGTGCCCAATTCTAAGTTGGCTGCTACTGGTGACATACA 22648907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 ACTAAATCAGGTTATTTTTGGAGTGCCCAATTCTAAGTTGGCTGCTACTGGTGACATACA 2395

 22648908 TTTCATTATAGTTTGAGAGTTGTCAATATAAATACTCCACTCATAGACACCAAGAAGGTT 22648967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TTTCATTATAGTTTGAGAGTTGTCAATATAAATACTCCACTCATAGACACCAAGAAGGTT 2455

 22648968 CTTAGGAGGCAAGATCTAATCTTTAGAAAAATTTTATTGACATTTCATAAAATATTTATT 22649027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 CTTAGGAGGCAAGATCTAATCTTTAGAAAAATTTTATTGACATTTCATAAAATATTTATT 2515

 22649028 TAAAGCTTGAGAAGGAAACTTTCTGGCTGTTAATGTTTTTCAGCTACCAATGAGTCTAAC 22649087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 TAAAGCTTGAGAAGGAAACTTTCTGGCTGTTAATGTTTTTCAGCTACCAATGAGTCTAAC 2575

 22649088 TCACGCATCTTTTTTCTTTTGGTTGCAATTATTATACAACCTCCTGCACGCCCGCTCCAT 22649147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 TCACGCATCTTTTTTCTTTTGGTTGCAATTATTATACAACCTCCTGCACGCCCGCTCCAT 2635

 22649148 TGCACCTGCCTCTCAAAACCTAAAGAAAAAAGATTTAAGCAGCTAAAATTTTAATAAAAT 22649207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 TGCACCTGCCTCTCAAAACCTAAAGAAAAAAGATTTAAGCAGCTAAAATTTTAATAAAAT 2695

 22649208 ATGGAACAGTCACATGAATTTCTGAACTTTAAAATGGGGAAAACAATCATAGGCTCTGAT 22649267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 ATGGAACAGTCACATGAATTTCTGAACTTTAAAATGGGGAAAACAATCATAGGCTCTGAT 2755

 22649268 GGCTAATTTCAGAATCCTTTACATTTCATAATGAAAATTTCTATGTATAAAGATTCAAAC 22649327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 GGCTAATTTCAGAATCCTTTACATTTCATAATGAAAATTTCTATGTATAAAGATTCAAAC 2815

 22649328 TATTTGGAGACTTACATTTCAAAGGATAATTCTACTTTTTAGGCACTGTAACTTATTTTT 22649387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 TATTTGGAGACTTACATTTCAAAGGATAATTCTACTTTTTAGGCACTGTAACTTATTTTT 2875

 22649388 ATCCAAGAGAAAGAAGAAATGGTTAACTGAAAAGATTTAGTGACAGTGTTGTGATAGGAG 22649447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 ATCCAAGAGAAAGAAGAAATGGTTAACTGAAAAGATTTAGTGACAGTGTTGTGATAGGAG 2935

 22649448 TCAAAACGTCTCTAGTTGGCATAAGCATAGGAAAATAACTTTGTTGCAAAACACTTGAGC 22649507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 TCAAAACGTCTCTAGTTGGCATAAGCATAGGAAAATAACTTTGTTGCAAAACACTTGAGC 2995

 22649508 TCTGTTTGCAGAAATGAATGGCTAGCGGATATTTTTGTTCTCTCTGTTATACTAATGGAT 22649567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 TCTGTTTGCAGAAATGAATGGCTAGCGGATATTTTTGTTCTCTCTGTTATACTAATGGAT 3055

 22649568 AAAGGCATGCTGATAAGTCACTGTAGCTCTGTGGGGTTAATGCCAGAATGAAATACCAGA 22649627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 AAAGGCATGCTGATAAGTCACTGTAGCTCTGTGGGGTTAATGCCAGAATGAAATACCAGA 3115

 22649628 GCTGTACTCTTTCTTAGGAAATAGCAGATTCTTACAGACATGATCACAACACATTTTACA 22649687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 GCTGTACTCTTTCTTAGGAAATAGCAGATTCTTACAGACATGATCACAACACATTTTACA 3175

 22649688 GACAAACTACATTGCCTCATGTACTGTAGCCCCTATTCTGTGCTTTGGGGGTCACCACAA 22649747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 GACAAACTACATTGCCTCATGTACTGTAGCCCCTATTCTGTGCTTTGGGGGTCACCACAA 3235

 22649748 TAATTTCTCTTAGAAATTTCCTAATTTCAATAAAGCCTACCATGGAAACTTATTTGGTTG 22649807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 TAATTTCTCTTAGAAATTTCCTAATTTCAATAAAGCCTACCATGGAAACTTATTTGGTTG 3295

 22649808 TTTGTTCCCTCTCTTATATCTGCTCCTCTGCGTCTTTCCCTTCTTTTCTGGCATTTGTTT 22649867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 TTTGTTCCCTCTCTTATATCTGCTCCTCTGCGTCTTTCCCTTCTTTTCTGGCATTTGTTT 3355

 22649868 TTCTTCTGTTCCTTTGGAGAAAGCACAGCCTTTAGAGCTAGTCAGTTTAGAATTTAGCTC 22649927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 TTCTTCTGTTCCTTTGGAGAAAGCACAGCCTTTAGAGCTAGTCAGTTTAGAATTTAGCTC 3415

 22649928 AAATTTTATCTTGGTCACATATAACTATGGAAAAAGTATTTCCTTTCTAAAACCTCTCTG 22649987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 AAATTTTATCTTGGTCACATATAACTATGGAAAAAGTATTTCCTTTCTAAAACCTCTCTG 3475

 22649988 TTTTTTCATACGGCAAATGGAGACTATATACTCTACACTTAGGATTAGAATTAACTGAGA 22650047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 TTTTTTCATACGGCAAATGGAGACTATATACTCTACACTTAGGATTAGAATTAACTGAGA 3535

 22650048 GACACACACATTTTCTCATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTG 22650107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 GACACACACATTTTCTCATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTG 3595

 22650108 CTTCTCAATCAGCTCAGTTCTCTGTAGTAGATGAGGTAGTTATCAACGGGGAGGAGCTAG 22650167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 CTTCTCAATCAGCTCAGTTCTCTGTAGTAGATGAGGTAGTTATCAACGGGGAGGAGCTAG 3655

 22650168 GAGTTTCCAGCTTAGCAATTTAATACTTTTAATAACTATACAATTATTTCGTACAAATAC 22650227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 GAGTTTCCAGCTTAGCAATTTAATACTTTTAATAACTATACAATTATTTCGTACAAATAC 3715

 22650228 AAGAACCTAAACAGCTTATAGAGCAAGAATTACAGTAAGATTGGCCCACCATGCTTTTCG 22650287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 AAGAACCTAAACAGCTTATAGAGCAAGAATTACAGTAAGATTGGCCCACCATGCTTTTCG 3775

 22650288 CAATCTCCCATAGTTGTGCTTTCATAAACAAAAGTGCTAACCTGAACTTCCAAATCAACA 22650347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 CAATCTCCCATAGTTGTGCTTTCATAAACAAAAGTGCTAACCTGAACTTCCAAATCAACA 3835

 22650348 ACTAAGCTCTGGCTCTATTACTACATCCCAGAACCATGACACAGATACATGATTATAGAC 22650407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 ACTAAGCTCTGGCTCTATTACTACATCCCAGAACCATGACACAGATACATGATTATAGAC 3895

 22650408 CCTGAACAACAATGCCCATCTTCACAGGCACTTTGAAATGGGGCAGGTTTCATTTTAGAG 22650467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 CCTGAACAACAATGCCCATCTTCACAGGCACTTTGAAATGGGGCAGGTTTCATTTTAGAG 3955

 22650468 TATATTTTAAGGCATAAGAGTTTGCCTCCAGAATTTTAAGTTGTAGTGAAAATACTCTGT 22650527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 TATATTTTAAGGCATAAGAGTTTGCCTCCAGAATTTTAAGTTGTAGTGAAAATACTCTGT 4015

 22650528 CTGTAACATAGAAAAATAAGCTTAGAAGACTCTCCGAGTTTCCTTCATGGATTAAAAAGT 22650587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 CTGTAACATAGAAAAATAAGCTTAGAAGACTCTCCGAGTTTCCTTCATGGATTAAAAAGT 4075

 22650588 TGAGGATTCTTTTAACTACATAAATTCTGTGTCCTTTCAAATAGTAGTACCCTTACAACT 22650647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 TGAGGATTCTTTTAACTACATAAATTCTGTGTCCTTTCAAATAGTAGTACCCTTACAACT 4135

 22650648 TAAATAGCACAGGTGTACGTTACCATTTCATACCGATCAGCCCCAGTGGGGCGTGGAGGT 22650707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 TAAATAGCACAGGTGTACGTTACCATTTCATACCGATCAGCCCCAGTGGGGCGTGGAGGT 4195

 22650708 AGGGGAAACAGTTAAATAGAGACTTTCCCAGATGTGTTCCAAAATCTGTCATTTCTGTTA 22650767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 AGGGGAAACAGTTAAATAGAGACTTTCCCAGATGTGTTCCAAAATCTGTCATTTCTGTTA 4255

 22650768 AATTGGTAATTATCAAATTTATGACTAAATAAAGATCATATAGAGCTTTTCTAAACACAG 22650827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 AATTGGTAATTATCAAATTTATGACTAAATAAAGATCATATAGAGCTTTTCTAAACACAG 4315

 22650828 ATTTCAGAGTCTCAAATTTAGAGAGTCTACTTCAGTAGCTCTGGAGCATAGGCTAAGACT 22650887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 ATTTCAGAGTCTCAAATTTAGAGAGTCTACTTCAGTAGCTCTGGAGCATAGGCTAAGACT 4375

 22650888 CTGGATTTTTACAATGCATTTTAAGGAATCTTGATGTAAGTAGTCCTTGAACTTTACTGA 22650947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 CTGGATTTTTACAATGCATTTTAAGGAATCTTGATGTAAGTAGTCCTTGAACTTTACTGA 4435

 22650948 AAAACTTTGCCCTACACCCTGCCTTATAAATAAGTTATACAACTGCTTCTTGGGGCTGTT 22651007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 AAAACTTTGCCCTACACCCTGCCTTATAAATAAGTTATACAACTGCTTCTTGGGGCTGTT 4495

 22651008 AAGCAATGGAGTCTAGTGAGATTGTTGCAATTTCTTGTGCTGAGAGAAAGAAATCCAATT 22651067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 AAGCAATGGAGTCTAGTGAGATTGTTGCAATTTCTTGTGCTGAGAGAAAGAAATCCAATT 4555

 22651068 AAGAAATGTAAATTCTTCTTCATGCTGAGAGAATATGAGGCAATAAAAATATGAATTTCT 22651127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 AAGAAATGTAAATTCTTCTTCATGCTGAGAGAATATGAGGCAATAAAAATATGAATTTCT 4615

 22651128 TTATGTTGCATAGAAGCTTCTGGGAGCCCATAAAGGGTGAGCAATCCTTACCAAGCAGCT 22651187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 TTATGTTGCATAGAAGCTTCTGGGAGCCCATAAAGGGTGAGCAATCCTTACCAAGCAGCT 4675

 22651188 GGACTGTCATCATCTTCTCTGGCTTTTATGGGAGAAGATGAGGTACTTTTGGCACTTTTC 22651247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 GGACTGTCATCATCTTCTCTGGCTTTTATGGGAGAAGATGAGGTACTTTTGGCACTTTTC 4735

 22651248 TGAAAACAATCTCTTTAAGAGTTTCTGTACAGGCTGCAAGGCTTTTTCTTTTAATGCTTG 22651307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 TGAAAACAATCTCTTTAAGAGTTTCTGTACAGGCTGCAAGGCTTTTTCTTTTAATGCTTG 4795

 22651308 AAATTCATAATTAACAATTTAGAATGGGGGAGAAATGTTAAAATATGGAATAAGTGCAAT 22651367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 AAATTCATAATTAACAATTTAGAATGGGGGAGAAATGTTAAAATATGGAATAAGTGCAAT 4855

 22651368 CCTTTTTCAGGATGATTATCTGATTTCTAATTGCACCCAGCAATACAGTTGTTCAGAAAG 22651427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 CCTTTTTCAGGATGATTATCTGATTTCTAATTGCACCCAGCAATACAGTTGTTCAGAAAG 4915

 22651428 ACTGGTGGTTGGGAATAAAGAAAGCGTTTTCAGTAACTTTTAAGGAGACTTGTTAGTGCT 22651487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 ACTGGTGGTTGGGAATAAAGAAAGCGTTTTCAGTAACTTTTAAGGAGACTTGTTAGTGCT 4975

 22651488 TTAAAAAAGAGTGAACAGGCTGGGCGTGGTGGCTCACCTCTGTAACCCCAGCACTTTGGG 22651547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 TTAAAAAAGAGTGAACAGGCTGGGCGTGGTGGCTCACCTCTGTAACCCCAGCACTTTGGG 5035

 22651548 AGGCTGAGGTGGACGGATCACAAGGTCAAGTGATCAAGACCATCCTGGCCAACATGGTGA 22651607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 AGGCTGAGGTGGACGGATCACAAGGTCAAGTGATCAAGACCATCCTGGCCAACATGGTGA 5095

 22651608 AACTCCATCTCTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TTAGCCATGCGTGG 22651666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     5096 AACTCCATCTCTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCATGCGTGG 5155

 22651667 TGGTGGGTGCCTATAGTCCCAGCTACTCTGGAGGCTAAGGCAAGATAATCGTTTGAACCC 22651726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 TGGTGGGTGCCTATAGTCCCAGCTACTCTGGAGGCTAAGGCAAGATAATCGTTTGAACCC 5215

 22651727 AGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAG 22651786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5216 AGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAG 5275

 22651787 CGAGACACCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTGAACAATTGAACAATTC 22651846
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||
     5276 CGAGACACCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA----GAGTGAACAATTGAACAATTC 5331

 22651847 TAATTACTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGC 22651906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 TAATTACTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGC 5391

 22651907 TGGAGCACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGT 22651966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 TGGAGCACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGT 5451

 22651967 GGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGA 22652026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5452 GGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGA 5511

 22652027 AGGGAGCTGTTTTTGTCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATG 22652086
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5512 AGGGAGCTGTTTTTATCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATG 5571

 22652087 TGAGCCTGGTTGAATCCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTT 22652146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5572 TGAGCCTGGTTGAATCCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTT 5631

 22652147 ACATATAGTGAACTTGTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCC 22652206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5632 ACATATAGTGAACTTGTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCC 5691

 22652207 TTATGCCCTGGCTTTTGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGAC 22652266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5692 TTATGCCCTGGCTTTTGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGAC 5751

 22652267 ATATCCTATATAAGCAAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATC 22652326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5752 ATATCCTATATAAGCAAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATC 5811

 22652327 CCACTTCTCTCTGTTTTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGG 22652386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5812 CCACTTCTCTCTGTTTTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGG 5871

 22652387 AAAACAAATGTGCTCTGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAAT 22652446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5872 AAAACAAATGTGCTCTGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAAT 5931

 22652447 GCATTTCTAGAAGTCCAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTG 22652506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5932 GCATTTCTAGAAGTCCAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTG 5991

 22652507 GAGAGAATTTTAGGCTACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCA 22652566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5992 GAGAGAATTTTAGGCTACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCA 6051

 22652567 AAAGTAGAGATTCCCAGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAA 22652626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6052 AAAGTAGAGATTCCCAGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAA 6111

 22652627 ATGATTTTCAATCACTGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTA 22652686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6112 ATGATTTTCAATCACTGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTA 6171

 22652687 TCTTCACCATTTAAAGATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGT 22652746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6172 TCTTCACCATTTAAAGATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGT 6231

 22652747 GAATTTATTGTTGGCAGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTC 22652806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6232 GAATTTATTGTTGGCAGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTC 6291

 22652807 CCTACATAATGGATCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGC 22652866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6292 CCTACATAATGGATCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGC 6351

 22652867 CAGTCTACATTAGGCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGT 22652926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6352 CAGTCTACATTAGGCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGT 6411

 22652927 AAAGTATGTGAAACCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGG 22652986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6412 AAAGTATGTGAAACCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGG 6471

 22652987 CTAAGTGCACAACAATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCT 22653046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6472 CTAAGTGCACAACAATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCT 6531

 22653047 CATGTCTTTTATCCCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCT 22653106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6532 CATGTCTTTTATCCCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCT 6591

 22653107 TCTATATAGGCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGT 22653166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6592 TCTATATAGGCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGT 6651

 22653167 TCTGACTGCTGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCC 22653226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6652 TCTGACTGCTGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCC 6711

 22653227 ACCATACCTGAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTG 22653286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6712 ACCATACCTGAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTG 6771

 22653287 GAAGAGCAGAGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAA 22653346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6772 GAAGAGCAGAGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAA 6831

 22653347 TATTGGAATATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 22653394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6832 TATTGGAATATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 6879

EXCISED REGION

 22653769 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 22653828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6880 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 6939

 22653829 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 22653888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6940 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 6999

 22653889 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 22653948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7000 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 7059

 22653949 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 22654008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7060 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 7119

 22654009 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 22654068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7120 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 7179

 22654069 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 22654128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7180 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 7239

 22654129 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 22654188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7240 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 7299

 22654189 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 22654248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7300 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 7359

 22654249 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 22654308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7360 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 7419

 22654309 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 22654368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7420 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 7479

 22654369 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 22654428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7480 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 7539

 22654429 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 22654488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7540 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 7599

 22654489 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 22654548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7600 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 7659

 22654549 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 22654608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7660 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 7719

 22654609 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 22654668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7720 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 7779

 22654669 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 22654728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7780 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 7839

 22654729 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 22654788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7840 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 7899

 22654789 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 22654848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7900 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 7959

 22654849 GTTTTTCTAAGCAGTATTA 22654867
          |||||||||||||||||||
     7960 GTTTTTCTAAGCAGTATTA 7978

Alignment time is 5.75715 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2223] =>      2223 nucs 'mol-32-300f-039756_2223'

Score:        2223
Aligned:      2223        nucs
Identic:      2223 (100%) nucs =>       909 (100%)      1314 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22652486,22653394] EXCISED REGION [22653769,22655082]
 second seq =>  [       1,     909] EXCISED REGION [     910,    2223]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [22653395,22653768]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22653395,22653395] to [22653769,22653769]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22652486 TAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGCTACTATATTCAAAAATTGCTTTAT 22652545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGCTACTATATTCAAAAATTGCTTTAT 60

 22652546 TAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCCAGAACAATTGTAAATGAGTCATTG 22652605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCCAGAACAATTGTAAATGAGTCATTG 120

 22652606 AATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCACTGAATAGACTTAGTAAGTACAAAG 22652665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCACTGAATAGACTTAGTAAGTACAAAG 180

 22652666 ACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAAGATATTCACAGGTTTAAAATTTAA 22652725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAAGATATTCACAGGTTTAAAATTTAA 240

 22652726 TGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGCAGAAAATGCATGAGAGTCCGGACT 22652785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGCAGAAAATGCATGAGAGTCCGGACT 300

 22652786 GGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAG 22652845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAG 360

 22652846 GATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAG 22652905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAG 420

 22652906 CTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAG 22652965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAG 480

 22652966 GAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAA 22653025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAA 540

 22653026 TTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGC 22653085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGC 600

 22653086 TTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTC 22653145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTC 660

 22653146 TATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACA 22653205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACA 720

 22653206 CTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATA 22653265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATA 780

 22653266 AGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAA 22653325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAA 840

 22653326 GTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTG 22653385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTG 900

 22653386 TGAATTCAT 22653394
          |||||||||
      901 TGAATTCAT 909

EXCISED REGION

 22653769 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 22653828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 969

 22653829 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 22653888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 1029

 22653889 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 22653948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 1089

 22653949 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 22654008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 1149

 22654009 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 22654068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 1209

 22654069 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 22654128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 1269

 22654129 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 22654188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 1329

 22654189 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 22654248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 1389

 22654249 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 22654308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 1449

 22654309 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 22654368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 1509

 22654369 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 22654428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 1569

 22654429 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 22654488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 1629

 22654489 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 22654548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 1689

 22654549 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 22654608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 1749

 22654609 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 22654668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 1809

 22654669 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 22654728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 1869

 22654729 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 22654788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 1929

 22654789 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 22654848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 1989

 22654849 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 22654908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 2049

 22654909 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGC 22654968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGC 2109

 22654969 CACCTATTCCACATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAA 22655028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 CACCTATTCCACATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAA 2169

 22655029 GAATCCTGATGACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGT 22655082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 GAATCCTGATGACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGT 2223

Alignment time is 1.65449 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3358] =>      3358 nucs 'mol-32-301a-073344_3358'

Score:        3357
Aligned:      3357        nucs
Identic:      3357 (100%) nucs =>       198 (100%)      3159 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22651843,22652040] EXCISED REGION [22652042,22655200]
 second seq =>  [       1,     198] EXCISED REGION [     200,    3358]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [22652041,22652041]
 second seq =>         1 nucs [199,199]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22652040,22652040] to [22652042,22652042]
 second seq =>         1 nucs [198,198] to [200,200]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22651843 ATTCTAATTACTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACA 22651902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCTAATTACTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACA 60

 22651903 GGGCTGGAGCACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGC 22651962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGCTGGAGCACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGC 120

 22651963 AAGTGGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGA 22652022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGTGGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGA 180

 22652023 GTGAAGGGAGCTGTTTTT 22652040
          ||||||||||||||||||
      181 GTGAAGGGAGCTGTTTTT 198

EXCISED REGION

 22652042 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 22652101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      200 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 259

 22652102 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 22652161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      260 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 319

 22652162 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 22652221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      320 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 379

 22652222 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 22652281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      380 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 439

 22652282 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 22652341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 499

 22652342 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 22652401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      500 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 559

 22652402 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 22652461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      560 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 619

 22652462 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 22652521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 679

 22652522 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 22652581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      680 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 739

 22652582 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 22652641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 799

 22652642 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 22652701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 859

 22652702 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 22652761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 919

 22652762 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 22652821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 979

 22652822 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 22652881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 1039

 22652882 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 22652941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 1099

 22652942 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 22653001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 1159

 22653002 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 22653061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 1219

 22653062 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 22653121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 1279

 22653122 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 22653181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 1339

 22653182 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 22653241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 1399

 22653242 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 22653301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 1459

 22653302 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 22653361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 1519

 22653362 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 22653421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 1579

 22653422 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 22653481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 1639

 22653482 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 22653541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 1699

 22653542 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 22653601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 1759

 22653602 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 22653661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 1819

 22653662 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 22653721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 1879

 22653722 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 22653781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 1939

 22653782 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 22653841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 1999

 22653842 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 22653901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 2059

 22653902 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 22653961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 2119

 22653962 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 22654021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 2179

 22654022 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 22654081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 2239

 22654082 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 22654141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 2299

 22654142 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 22654201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 2359

 22654202 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 22654261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 2419

 22654262 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 22654321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 2479

 22654322 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 22654381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 2539

 22654382 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 22654441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 2599

 22654442 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 22654501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 2659

 22654502 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 22654561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 2719

 22654562 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 22654621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 2779

 22654622 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 22654681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 2839

 22654682 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 22654741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 2899

 22654742 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 22654801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 2959

 22654802 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 22654861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 3019

 22654862 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 22654921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 3079

 22654922 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 22654981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 3139

 22654982 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGAC 22655041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGAC 3199

 22655042 ATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTT 22655101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 ATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTT 3259

 22655102 ATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTCATATATTTTAGCT 22655161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 ATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTCATATATTTTAGCT 3319

 22655162 TTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTG 22655200
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 TTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTG 3358

Alignment time is 2.46027 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2101] =>      2101 nucs 'mol-32-3025-083161_2101'

Score:        2100
Aligned:      2100        nucs
Identic:      2100 (100%) nucs =>       198 (100%)      1902 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22651843,22652040] EXCISED REGION [22652042,22653943]
 second seq =>  [       1,     198] EXCISED REGION [     200,    2101]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [22652041,22652041]
 second seq =>         1 nucs [199,199]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22652040,22652040] to [22652042,22652042]
 second seq =>         1 nucs [198,198] to [200,200]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22651843 ATTCTAATTACTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACA 22651902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCTAATTACTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACA 60

 22651903 GGGCTGGAGCACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGC 22651962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGCTGGAGCACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGC 120

 22651963 AAGTGGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGA 22652022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGTGGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGA 180

 22652023 GTGAAGGGAGCTGTTTTT 22652040
          ||||||||||||||||||
      181 GTGAAGGGAGCTGTTTTT 198

EXCISED REGION

 22652042 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 22652101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      200 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 259

 22652102 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 22652161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      260 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 319

 22652162 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 22652221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      320 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 379

 22652222 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 22652281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      380 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 439

 22652282 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 22652341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 499

 22652342 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 22652401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      500 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 559

 22652402 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 22652461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      560 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 619

 22652462 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 22652521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 679

 22652522 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 22652581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      680 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 739

 22652582 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 22652641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 799

 22652642 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 22652701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 859

 22652702 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 22652761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 919

 22652762 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 22652821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 979

 22652822 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 22652881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 1039

 22652882 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 22652941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 1099

 22652942 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 22653001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 1159

 22653002 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 22653061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 1219

 22653062 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 22653121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 1279

 22653122 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 22653181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 1339

 22653182 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 22653241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 1399

 22653242 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 22653301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 1459

 22653302 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 22653361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 1519

 22653362 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 22653421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 1579

 22653422 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 22653481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 1639

 22653482 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 22653541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 1699

 22653542 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 22653601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 1759

 22653602 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 22653661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 1819

 22653662 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 22653721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 1879

 22653722 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 22653781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 1939

 22653782 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 22653841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 1999

 22653842 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 22653901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 2059

 22653902 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCT 22653943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCT 2101

Alignment time is 1.51966 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2760] =>      2760 nucs 'mol-32-30eb-188568_2760'

Score:        2749
Aligned:      2760        nucs
Identic:      2759 (100%) nucs =>      1541 (100%)      1218 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22651853,22653394] EXCISED REGION [22653769,22654986]
 second seq =>  [       1,    1542] EXCISED REGION [    1543,    2760]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [22653395,22653768]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22653395,22653395] to [22653769,22653769]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22651853 CTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGC 22651912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGC 60

 22651913 ACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGT 22651972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGT 120

 22651973 TTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAG 22652032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAG 180

 22652033 CTGTTTTTGTCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCC 22652092
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGTTTTTATCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCC 240

 22652093 TGGTTGAATCCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATAT 22652152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGTTGAATCCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATAT 300

 22652153 AGTGAACTTGTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGC 22652212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTGAACTTGTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGC 360

 22652213 CCTGGCTTTTGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCC 22652272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTGGCTTTTGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCC 420

 22652273 TATATAAGCAAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTT 22652332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATATAAGCAAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTT 480

 22652333 CTCTCTGTTTTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACA 22652392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTCTGTTTTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACA 540

 22652393 AATGTGCTCTGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTT 22652452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATGTGCTCTGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTT 600

 22652453 CTAGAAGTCCAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGA 22652512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTAGAAGTCCAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGA 660

 22652513 ATTTTAGGCTACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTA 22652572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTTAGGCTACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTA 720

 22652573 GAGATTCCCAGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATT 22652632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGATTCCCAGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATT 780

 22652633 TTCAATCACTGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCA 22652692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCAATCACTGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCA 840

 22652693 CCATTTAAAGATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTT 22652752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCATTTAAAGATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTT 900

 22652753 ATTGTTGGCAGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACA 22652812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTGTTGGCAGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACA 960

 22652813 TAATGGATCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCT 22652872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAATGGATCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCT 1020

 22652873 ACATTAGGCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTA 22652932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACATTAGGCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTA 1080

 22652933 TGTGAAACCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGT 22652992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTGAAACCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGT 1140

 22652993 GCACAACAATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTC 22653052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCACAACAATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTC 1200

 22653053 TTTTATCCCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATA 22653112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTATCCCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATA 1260

 22653113 TAGGCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGAC 22653172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGGCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGAC 1320

 22653173 TGCTGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATA 22653232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCTGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATA 1380

 22653233 CCTGAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAG 22653292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCTGAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAG 1440

 22653293 CAGAGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGG 22653352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGAGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGG 1500

 22653353 AATATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 22653394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 1542

EXCISED REGION

 22653769 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 22653828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 1602

 22653829 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 22653888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 1662

 22653889 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 22653948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 1722

 22653949 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 22654008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 1782

 22654009 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 22654068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 1842

 22654069 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 22654128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 1902

 22654129 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 22654188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 1962

 22654189 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 22654248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 2022

 22654249 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 22654308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 2082

 22654309 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 22654368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 2142

 22654369 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 22654428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 2202

 22654429 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 22654488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 2262

 22654489 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 22654548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 2322

 22654549 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 22654608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 2382

 22654609 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 22654668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 2442

 22654669 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 22654728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 2502

 22654729 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 22654788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 2562

 22654789 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 22654848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 2622

 22654849 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 22654908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 2682

 22654909 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGC 22654968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGC 2742

 22654969 CACCTATTCCACATTCCT 22654986
          ||||||||||||||||||
     2743 CACCTATTCCACATTCCT 2760

Alignment time is 2.02136 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3509] =>      3509 nucs 'mol-32-316f-183745_3509'

Score:        3486
Aligned:      3508        nucs
Identic:      3506 (100%) nucs =>      2275 (100%)      1231 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22653448,22655722] EXCISED REGION [22655724,22656956]
 second seq =>  [       1,    2275] EXCISED REGION [    2277,    3509]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [22655723,22655723]
 second seq =>         1 nucs [2276,2276]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22653448 TTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCCTGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTT 22653507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCCTGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTT 60

 22653508 AATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACCTCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGA 22653567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACCTCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGA 120

 22653568 TAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATTTGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGG 22653627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATTTGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGG 180

 22653628 CAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGACTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCC 22653687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGACTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCC 240

 22653688 TACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATCACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCC 22653747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATCACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCC 300

 22653748 TGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGAC 22653807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGAC 360

 22653808 CGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTG 22653867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTG 420

 22653868 TAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTC 22653927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTC 480

 22653928 AGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTA 22653987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTA 540

 22653988 TTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAAC 22654047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAAC 600

 22654048 CATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCT 22654107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCT 660

 22654108 CAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTA 22654167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTA 720

 22654168 CATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGA 22654227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGA 780

 22654228 AAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTG 22654287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTG 840

 22654288 TGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAA 22654347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAA 900

 22654348 GGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCA 22654407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCA 960

 22654408 TTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATA 22654467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATA 1020

 22654468 TCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTT 22654527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTT 1080

 22654528 CTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAAT 22654587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAAT 1140

 22654588 GGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACA 22654647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACA 1200

 22654648 GCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGT 22654707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGT 1260

 22654708 AAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAA 22654767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAA 1320

 22654768 TATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAA 22654827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAA 1380

 22654828 AAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTAC 22654887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTAC 1440

 22654888 ATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGT 22654947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGT 1500

 22654948 TAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTA 22655007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTA 1560

 22655008 TTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTT 22655067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTT 1620

 22655068 TTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTTATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATA 22655127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTTATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATA 1680

 22655128 TCATTTCTACTTCTGTTTTTCATATATTTTAGCTTTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTA 22655187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCATTTCTACTTCTGTTTTTCATATATTTTAGCTTTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTA 1740

 22655188 TATTTTTCTTCTGCCTTCTGGAATTTTTAATGTCATCTTCTAATTCACATATTTATTCTT 22655247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATTTTTCTTCTGCCTTCTGGAATTTTTAATGTCATCTTCTAATTCACATATTTATTCTT 1800

 22655248 AAGTGTATCATCTTCTTTGATCAGTTATTATGTTTATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCA 22655307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGTGTATCATCTTCTTTGATCAGTTATTATGTTTATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCA 1860

 22655308 GATTTCTTGTTCTTATGTTACTAATATATTTCCTTATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTT 22655367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATTTCTTGTTCTTATGTTACTAATATATTTCCTTATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTT 1920

 22655368 TACATTATTGATCCATCCATTCCAGTGTTCAGACAGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAA 22655427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TACATTATTGATCCATCCATTCCAGTGTTCAGACAGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAA 1980

 22655428 CAGTCCTTGCAATCTTTATACATCTAGTTATCTTCCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATG 22655487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGTCCTTGCAATCTTTATACATCTAGTTATCTTCCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATG 2040

 22655488 GTATACTTACTGTGTCTGGTAATATGTACTATGGAATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTC 22655547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTATACTTACTGTGTCTGGTAATATGTACTATGGAATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTC 2100

 22655548 TGTATGTCCAAGTTAATTTAGAAAAAGAAAACGGGCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAG 22655607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTATGTCCAAGTTAATTTAGAAAAAGAAAACGGGCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAG 2160

 22655608 GACTATTATTTCTCTTTGCAGTCCTCCACCAGGCAACTGCTGTGATTGGGATTTATCATC 22655667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GACTATTATTTCTCTTTGCAGTCCTCCACCAGGCAACTGCTGTGATTGGGATTTATCATC 2220

 22655668 AATACCTTAGGAAGAAGCAGCATTGAGAAAAGGTTATTCGTCTAGTTTGTCATCT 22655722
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATACCTTAGGAAGAAGCAGCATTGAGAAAAGGTTATTCGTCTAGTTTGTCATCT 2275

EXCISED REGION

 22655724 CAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGGATGGAGAAGAGAGTGATTAAGTGGGGAGATATAAG 22655783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 CAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGGATGGAGAAGAGAGTGATTAAGTGGGGAGATATAAG 2336

 22655784 GCACTATGGATAATATAACAATCCAAGTTAAAAGGGAAATTTAGACTGACAAAATATCTT 22655843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GCACTATGGATAATATAACAATCCAAGTTAAAAGGGAAATTTAGACTGACAAAATATCTT 2396

 22655844 TGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGATAAACAATGTGATAACAATTCAGGCTCAATGACGC 22655903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 TGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGATAAACAATGTGATAACAATTCAGGCTCAATGACGC 2456

 22655904 TACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAGGGCTAATTTTTCGTTCTTTGGACTTTAGTGTACCC 22655963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAGGGCTAATTTTTCGTTCTTTGGACTTTAGTGTACCC 2516

 22655964 ATAAATAAAACGGGAATATGATAGTACCCAACTCTTAGGGTTTTGTGATGATTAAATGAT 22656023
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2517 ATAAATAAAACGGGAATATGATAGTACCCAACTCTTAGGGTCTTGTGATGATTAAATGAT 2576

 22656024 ACACTATTATATATAAATTTTAGAGTTCCAAAAATGAGTGTGTTTTACTCTGGAAACTTA 22656083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 ACACTATTATATATAAATTTTAGAGTTCCAAAAATGAGTGTGTTTTACTCTGGAAACTTA 2636

 22656084 AAAGGTGCTTTATTTAATTTTAAGAAATACATGGCTGTTGTGTAGGCTTACTAAATGGTT 22656143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 AAAGGTGCTTTATTTAATTTTAAGAAATACATGGCTGTTGTGTAGGCTTACTAAATGGTT 2696

 22656144 TAGGTATTTATTTATCCCATGAGTTTGTGGGATTGTGCATCTGGGGTACAATAATTTTTA 22656203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 TAGGTATTTATTTATCCCATGAGTTTGTGGGATTGTGCATCTGGGGTACAATAATTTTTA 2756

 22656204 AGTGTTTAGTTCTTTGAACAATTGTGCAGCATACATACAGACCTCTCTGCCTCCCTCTCT 22656263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 AGTGTTTAGTTCTTTGAACAATTGTGCAGCATACATACAGACCTCTCTGCCTCCCTCTCT 2816

 22656264 CCCGAATGCAATCCACTGTGGGAAGCATGATTTGTAGCTAATAGTGAACATCAACTTGGT 22656323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 CCCGAATGCAATCCACTGTGGGAAGCATGATTTGTAGCTAATAGTGAACATCAACTTGGT 2876

 22656324 GAAAAAATAAATTTTTCTTACAATGAATTTCTCTCTTTAATAGGGATTTAATTTTGTTAA 22656383
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 GAAAAAATAAATTTTTCTTACAGTGAATTTCTCTCTTTAATAGGGATTTAATTTTGTTAA 2936

 22656384 AAGTAATAACAACTAAATAAAGAATGTTTTCTTCATCCAGTAAGATCACTGACTTTCTCA 22656443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 AAGTAATAACAACTAAATAAAGAATGTTTTCTTCATCCAGTAAGATCACTGACTTTCTCA 2996

 22656444 AATAACTGGTGATGCTCTAGTATGTCCATAATGGCAGATATCCAGATCCCAGTGTGACCT 22656503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 AATAACTGGTGATGCTCTAGTATGTCCATAATGGCAGATATCCAGATCCCAGTGTGACCT 3056

 22656504 GCTTTAAACTTTGAGAAAACAGATATGCGCATTAAAGGATAATGGTTTTATGAGGAAATA 22656563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 GCTTTAAACTTTGAGAAAACAGATATGCGCATTAAAGGATAATGGTTTTATGAGGAAATA 3116

 22656564 TAAATAATCTCAACTAACCAGACTCCATTGATTTTCATAGTTCCATTGTAATAAATGAAA 22656623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TAAATAATCTCAACTAACCAGACTCCATTGATTTTCATAGTTCCATTGTAATAAATGAAA 3176

 22656624 ACAAATCTTGTGCTAATTTTAAAGATCATAGATGCTAAGAGGGGCCAGTTTAGAGAATAA 22656683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 ACAAATCTTGTGCTAATTTTAAAGATCATAGATGCTAAGAGGGGCCAGTTTAGAGAATAA 3236

 22656684 AGTGATACAGTAAAATGAAAAAAAAAGGAGAAATTTCTTTTTCATTTTGTGTGAAAGACC 22656743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 AGTGATACAGTAAAATGAAAAAAAAAGGAGAAATTTCTTTTTCATTTTGTGTGAAAGACC 3296

 22656744 AGTATTTAAAGATTGCAGGATCAATAGCACATTTCTGCTTGAATGAGAGACAGTGAGATC 22656803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 AGTATTTAAAGATTGCAGGATCAATAGCACATTTCTGCTTGAATGAGAGACAGTGAGATC 3356

 22656804 AGGAAAACATGACGTATAAACAAAAGAAAATGGACATAATTGTTCTTGTATTATATTAAT 22656863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 AGGAAAACATGACGTATAAACAAAAGAAAATGGACATAATTGTTCTTGTATTATATTAAT 3416

 22656864 AAATATAGTGGTAAAATGGAAACTAGAACGGATATGTAAAATGACTAAAGGAACTGCAGT 22656923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 AAATATAGTGGTAAAATGGAAACTAGAACGGATATGTAAAATGACTAAAGGAACTGCAGT 3476

 22656924 GATAAAGTAAATTATTAATAGAAAATACCGTAT 22656956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 GATAAAGTAAATTATTAATAGAAAATACCGTAT 3509

Alignment time is 2.54508 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    4857] =>      4857 nucs 'mol-32-3190-007763_4857'

Score:        4834
Aligned:      4856        nucs
Identic:      4854 (100%) nucs =>       188 (100%)      4666 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22651853,22652040] EXCISED REGION [22652042,22656709]
 second seq =>  [       1,     188] EXCISED REGION [     190,    4857]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [22652041,22652041]
 second seq =>         1 nucs [189,189]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22652040,22652040] to [22652042,22652042]
 second seq =>         1 nucs [188,188] to [190,190]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22651853 CTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGC 22651912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTACTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGC 60

 22651913 ACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGT 22651972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGT 120

 22651973 TTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAG 22652032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAG 180

 22652033 CTGTTTTT 22652040
          ||||||||
      181 CTGTTTTT 188

EXCISED REGION

 22652042 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 22652101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      190 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 249

 22652102 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 22652161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      250 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 309

 22652162 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 22652221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 369

 22652222 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 22652281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 429

 22652282 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 22652341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 489

 22652342 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 22652401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 549

 22652402 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 22652461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 609

 22652462 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 22652521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 669

 22652522 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 22652581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 729

 22652582 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 22652641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 789

 22652642 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 22652701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 849

 22652702 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 22652761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 909

 22652762 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 22652821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 969

 22652822 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 22652881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 1029

 22652882 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 22652941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 1089

 22652942 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 22653001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 1149

 22653002 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 22653061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 1209

 22653062 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 22653121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 1269

 22653122 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 22653181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 1329

 22653182 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 22653241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 1389

 22653242 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 22653301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 1449

 22653302 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 22653361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 1509

 22653362 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 22653421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 1569

 22653422 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 22653481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 1629

 22653482 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 22653541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 1689

 22653542 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 22653601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 1749

 22653602 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 22653661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 1809

 22653662 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 22653721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 1869

 22653722 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 22653781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 1929

 22653782 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 22653841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 1989

 22653842 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 22653901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 2049

 22653902 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 22653961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 2109

 22653962 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 22654021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 2169

 22654022 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 22654081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 2229

 22654082 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 22654141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 2289

 22654142 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 22654201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 2349

 22654202 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 22654261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 2409

 22654262 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 22654321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 2469

 22654322 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 22654381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 2529

 22654382 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 22654441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 2589

 22654442 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 22654501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 2649

 22654502 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 22654561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 2709

 22654562 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 22654621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 2769

 22654622 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 22654681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 2829

 22654682 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 22654741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 2889

 22654742 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 22654801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 2949

 22654802 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 22654861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 3009

 22654862 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 22654921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 3069

 22654922 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 22654981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 3129

 22654982 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGAC 22655041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGAC 3189

 22655042 ATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTT 22655101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 ATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTT 3249

 22655102 ATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTCATATATTTTAGCT 22655161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 ATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTCATATATTTTAGCT 3309

 22655162 TTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGGAATTTTTAATGTC 22655221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 TTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGGAATTTTTAATGTC 3369

 22655222 ATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGATCAGTTATTATGTT 22655281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 ATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGATCAGTTATTATGTT 3429

 22655282 TATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTACTAATATATTTCCT 22655341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 TATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTACTAATATATTTCCT 3489

 22655342 TATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATTCCAGTGTTCAGAC 22655401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 TATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATTCCAGTGTTCAGAC 3549

 22655402 AGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATACATCTAGTTATCTT 22655461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 AGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATACATCTAGTTATCTT 3609

 22655462 CCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTAATATGTACTATGG 22655521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 CCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTAATATGTACTATGG 3669

 22655522 AATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAGAAAAAGAAAACGG 22655581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 AATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAGAAAAAGAAAACGG 3729

 22655582 GCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAGTCCTCCACCAGGC 22655641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 GCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAGTCCTCCACCAGGC 3789

 22655642 AACTGCTGTGATTGGGATTTATCATCAATACCTTAGGAAGAAGCAGCATTGAGAAAAGGT 22655701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 AACTGCTGTGATTGGGATTTATCATCAATACCTTAGGAAGAAGCAGCATTGAGAAAAGGT 3849

 22655702 TATTCGTCTAGTTTGTCATCTACAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGGATGGAGAAGAGAG 22655761
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3850 TATTCGTCTAGTTTGTCATCTGCAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGGATGGAGAAGAGAG 3909

 22655762 TGATTAAGTGGGGAGATATAAGGCACTATGGATAATATAACAATCCAAGTTAAAAGGGAA 22655821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 TGATTAAGTGGGGAGATATAAGGCACTATGGATAATATAACAATCCAAGTTAAAAGGGAA 3969

 22655822 ATTTAGACTGACAAAATATCTTTGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGATAAACAATGTGAT 22655881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 ATTTAGACTGACAAAATATCTTTGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGATAAACAATGTGAT 4029

 22655882 AACAATTCAGGCTCAATGACGCTACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAGGGCTAATTTTTCG 22655941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 AACAATTCAGGCTCAATGACGCTACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAGGGCTAATTTTTCG 4089

 22655942 TTCTTTGGACTTTAGTGTACCCATAAATAAAACGGGAATATGATAGTACCCAACTCTTAG 22656001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 TTCTTTGGACTTTAGTGTACCCATAAATAAAACGGGAATATGATAGTACCCAACTCTTAG 4149

 22656002 GGTTTTGTGATGATTAAATGATACACTATTATATATAAATTTTAGAGTTCCAAAAATGAG 22656061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 GGTTTTGTGATGATTAAATGATACACTATTATATATAAATTTTAGAGTTCCAAAAATGAG 4209

 22656062 TGTGTTTTACTCTGGAAACTTAAAAGGTGCTTTATTTAATTTTAAGAAATACATGGCTGT 22656121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 TGTGTTTTACTCTGGAAACTTAAAAGGTGCTTTATTTAATTTTAAGAAATACATGGCTGT 4269

 22656122 TGTGTAGGCTTACTAAATGGTTTAGGTATTTATTTATCCCATGAGTTTGTGGGATTGTGC 22656181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 TGTGTAGGCTTACTAAATGGTTTAGGTATTTATTTATCCCATGAGTTTGTGGGATTGTGC 4329

 22656182 ATCTGGGGTACAATAATTTTTAAGTGTTTAGTTCTTTGAACAATTGTGCAGCATACATAC 22656241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 ATCTGGGGTACAATAATTTTTAAGTGTTTAGTTCTTTGAACAATTGTGCAGCATACATAC 4389

 22656242 AGACCTCTCTGCCTCCCTCTCTCCCGAATGCAATCCACTGTGGGAAGCATGATTTGTAGC 22656301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 AGACCTCTCTGCCTCCCTCTCTCCCGAATGCAATCCACTGTGGGAAGCATGATTTGTAGC 4449

 22656302 TAATAGTGAACATCAACTTGGTGAAAAAATAAATTTTTCTTACAATGAATTTCTCTCTTT 22656361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4450 TAATAGTGAACATCAACTTGGTGAAAAAATAAATTTTTCTTACAGTGAATTTCTCTCTTT 4509

 22656362 AATAGGGATTTAATTTTGTTAAAAGTAATAACAACTAAATAAAGAATGTTTTCTTCATCC 22656421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 AATAGGGATTTAATTTTGTTAAAAGTAATAACAACTAAATAAAGAATGTTTTCTTCATCC 4569

 22656422 AGTAAGATCACTGACTTTCTCAAATAACTGGTGATGCTCTAGTATGTCCATAATGGCAGA 22656481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 AGTAAGATCACTGACTTTCTCAAATAACTGGTGATGCTCTAGTATGTCCATAATGGCAGA 4629

 22656482 TATCCAGATCCCAGTGTGACCTGCTTTAAACTTTGAGAAAACAGATATGCGCATTAAAGG 22656541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4630 TATCCAGATCCCAGTGTGACCTGCTTTAAACTTTGAGAAAACAGATATGCGCATTAAAGG 4689

 22656542 ATAATGGTTTTATGAGGAAATATAAATAATCTCAACTAACCAGACTCCATTGATTTTCAT 22656601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4690 ATAATGGTTTTATGAGGAAATATAAATAATCTCAACTAACCAGACTCCATTGATTTTCAT 4749

 22656602 AGTTCCATTGTAATAAATGAAAACAAATCTTGTGCTAATTTTAAAGATCATAGATGCTAA 22656661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4750 AGTTCCATTGTAATAAATGAAAACAAATCTTGTGCTAATTTTAAAGATCATAGATGCTAA 4809

 22656662 GAGGGGCCAGTTTAGAGAATAAAGTGATACAGTAAAATGAAAAAAAAA 22656709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4810 GAGGGGCCAGTTTAGAGAATAAAGTGATACAGTAAAATGAAAAAAAAA 4857

Alignment time is 3.5052 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    2397] =>      2397 nucs 'mol-32-32fb-106642_2397'

Score:        2397
Aligned:      2397        nucs
Identic:      2397 (100%) nucs =>      1046 (100%)      1351 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22652349,22653394] EXCISED REGION [22653769,22655119]
 second seq =>  [       1,    1046] EXCISED REGION [    1047,    2397]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [22653395,22653768]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22653395,22653395] to [22653769,22653769]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22652349 ATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTCTGGGATT 22652408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTCTGGGATT 60

 22652409 AACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTCCAGCATA 22652468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTCCAGCATA 120

 22652469 ATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGCTACTATA 22652528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGCTACTATA 180

 22652529 TTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCCAGAACAA 22652588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCCAGAACAA 240

 22652589 TTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCACTGAATAG 22652648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCACTGAATAG 300

 22652649 ACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAAGATATTC 22652708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAAGATATTC 360

 22652709 ACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGCAGAAAAT 22652768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGCAGAAAAT 420

 22652769 GCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATCTAGCAGA 22652828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATCTAGCAGA 480

 22652829 AATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGCATGATTA 22652888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGCATGATTA 540

 22652889 GAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACCACCTTGT 22652948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACCACCTTGT 600

 22652949 GTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAATGTAAGG 22653008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAATGTAAGG 660

 22653009 ATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCCTTAGGTT 22653068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCCTTAGGTT 720

 22653069 GGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTAGGCCTCA 22653128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTAGGCCTCA 780

 22653129 GACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATTGTCTCCT 22653188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATTGTCTCCT 840

 22653189 AAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTCCAAAGTA 22653248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTCCAAAGTA 900

 22653249 GGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTTAAATTCA 22653308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTTAAATTCA 960

 22653309 GATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGACATGTAA 22653368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGACATGTAA 1020

 22653369 TAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 22653394
          ||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 1046

EXCISED REGION

 22653769 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 22653828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 1106

 22653829 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 22653888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 1166

 22653889 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 22653948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 1226

 22653949 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 22654008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 1286

 22654009 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 22654068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 1346

 22654069 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 22654128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 1406

 22654129 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 22654188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 1466

 22654189 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 22654248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 1526

 22654249 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 22654308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 1586

 22654309 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 22654368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 1646

 22654369 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 22654428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 1706

 22654429 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 22654488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 1766

 22654489 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 22654548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 1826

 22654549 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 22654608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 1886

 22654609 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 22654668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 1946

 22654669 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 22654728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 2006

 22654729 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 22654788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 2066

 22654789 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 22654848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 2126

 22654849 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 22654908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 2186

 22654909 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGC 22654968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGC 2246

 22654969 CACCTATTCCACATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAA 22655028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 CACCTATTCCACATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAA 2306

 22655029 GAATCCTGATGACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAA 22655088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 GAATCCTGATGACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAA 2366

 22655089 TGTGAGTCTTTTTATAGCAAAACTTCTGACA 22655119
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 TGTGAGTCTTTTTATAGCAAAACTTCTGACA 2397

Alignment time is 1.78123 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,   12002] =>     12002 nucs 'mol-32-3306-157387_12002'

Score:       11845
Aligned:     12015        nucs
Identic:     11993 (100%) nucs =>      8777 (100%)      3216 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22644597,22653394] EXCISED REGION [22653769,22656984]
 second seq =>  [       1,    8786] EXCISED REGION [    8787,   12002]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [22653395,22653768]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22653395,22653395] to [22653769,22653769]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22644597 AAGAAGCAAGCCCTCTCATATCTCTTTTTATAAGGGCACTAATCTCAGATGAGACAGAGC 22644656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
        1 AAGAAGCAAGCCCTCTCATATCTCTTTTTATAAGGGCACTAATCTCAGATGAGAGAGAGC 60

 22644657 AACATAGAATGAAAAAATAAAAAGAACAAAATAGGGAGCATGAAATTTTAGTGACTTGAC 22644716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACATAGAATGAAAAAATAAAAAGAACAAAATAGGGAGCATGAAATTTTAGTGACTTGAC 120

 22644717 AAACAATAGACATTTTTCTTTCTCTGCTCATACATCGACAGAAACTGGGAATATTTTTGT 22644776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAACAATAGACATTTTTCTTTCTCTGCTCATACATCGACAGAAACTGGGAATATTTTTGT 180

 22644777 CATATTCTGCCACACTTGAACAAATTTCAGTGGAGGCATCATAACTGAGCCTGTGTTAAG 22644836
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATATTCTGCCACACTTGAACAAATTTCAATGGAGGCATCATAACTGAGCCTGTGTTAAG 240

 22644837 ACCAAACCTTTACTTGACTTACAAAACTTTCTGTGAGTTTTTTTCTTAGTATGGTTGATT 22644896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCAAACCTTTACTTGACTTACAAAACTTTCTGTGAGTTTTTTTCTTAGTATGGTTGATT 300

 22644897 TCTTCAAGAAAAAGGATGTAAGTTTACCAATAAGGTATTTAAAGTACAAGTTACTTAATT 22644956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTTCAAGAAAAAGGATGTAAGTTTACCAATAAGGTATTTAAAGTACAAGTTACTTAATT 360

 22644957 CTTTATTAGCAAATAGTTGGCTGCTAATTTTTGCTTCTGAAAACACTTAATAATTAAAGG 22645016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTTATTAGCAAATAGTTGGCTGCTAATTTTTGCTTCTGAAAACACTTAATAATTAAAGG 420

 22645017 CTACAATATTTATATCTCAAGAAACGTCTCAGGTTTTTTCTCGTCACTAAGCTTAAATCT 22645076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTACAATATTTATATCTCAAGAAACGTCTCAGGTTTTTTCTCGTCACTAAGCTTAAATCT 480

 22645077 TACTCTTAAGCAAAAATATTTTAAATTTGAAAACATACATTGTATTTGACTATTAGCTTT 22645136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACTCTTAAGCAAAAATATTTTAAATTTGAAAACATACATTGTATTTGACTATTAGCTTT 540

 22645137 TTTTTTAAAGAGAAGTCATTAAACTTAAAGCTAAAAATAAATTTTATATTTATGTGTAGC 22645196
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTT-AAAGAGAAGTCATTAAACTTAAAGCTAAAAATAAATTTTATATTTATGTGTAGC 599

 22645197 AGTTACCATATTGATGTGCTAAAAAGTTTATAGATTTAGCTACCGCAATAACAACTTTCT 22645256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 AGTTACCATATTGATGTGCTAAAAAGTTTATAGATTTAGCTACCGCAATAACAACTTTCT 659

 22645257 AATCAAAAGTTGAGACTGTTGTGAACAACTCTTTTGTGAATATAACCTAGCATTGTACAG 22645316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 AATCAAAAGTTGAGACTGTTGTGAACAACTCTTTTGTGAATATAACCTAGCATTGTACAG 719

 22645317 TATAGATTGACTATCGCATATGCAAAATGCTTGGAACCAAAAGTGTTTCAGATTTCAGAT 22645376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TATAGATTGACTATCGCATATGCAAAATGCTTGGAACCAAAAGTGTTTCAGATTTCAGAT 779

 22645377 TTTTTTTTTTT-CAGATTTGGGAATATTTATTTGCATATGCATAATGAGACATCTTAAGG 22645435
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTTTTTTTTTTTCAGATTTGGGAATATTTATTTGCATATGCATAATGAGACATCTTAAGG 839

 22645436 ATGGGACACAAGTCTAAACACAAAATTCATTTATGTTTAATATACACTGTATACACAAAA 22645495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 ATGGGACACAAGTCTAAACACAAAATTCATTTATGTTTAATATACACTGTATACACAAAA 899

 22645496 CTGAAGATAATTTTATATAATATTTTACGTAACTTTGTACCTGAAACAAAGTTCTGTCTG 22645555
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CTGAAGATAATCTTATATAATATTTTACGTAACTTTGTACCTGAAACAAAGTTCTGTCTG 959

 22645556 TGTTTTGACTGAGATTTGTCATATGAAATCAAGTGTGGAATTTTCCACTTGTGGCATCAT 22645615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TGTTTTGACTGAGATTTGTCATATGAAATCAAGTGTGGAATTTTCCACTTGTGGCATCAT 1019

 22645616 GTCAGCAATCAAAAAGTTTAGATTTTGGAGCATTTCCAGTTTTGAACTTTTGGATTAGAG 22645675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1020 GTCAGCAATCAAAAAGTTTAGATTTTGGAGCATTTCCAATTTTGAACTTTTGGATTAGAG 1079

 22645676 ATGCTCAACCTGTATTTCCTACAAACTGTCATTAGGAAAAATCAGAAGACTAATTATTGT 22645735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ATGCTCAACCTGTATTTCCTACAAACTGTCATTAGGAAAAATCAGAAGACTAATTATTGT 1139

 22645736 CTAAATTTTACCGTCTAGAATTTCTAATATCATTCAGCATTTTCAACTTTTTTCTTAATA 22645795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CTAAATTTTACCGTCTAGAATTTCTAATATCATTCAGCATTTTCAACTTTTTTCTTAATA 1199

 22645796 GTTTCATATTGGACTGCTTGCTTCAAATTCACACATTAACCTAATAATTAAAAGCTAGTG 22645855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GTTTCATATTGGACTGCTTGCTTCAAATTCACACATTAACCTAATAATTAAAAGCTAGTG 1259

 22645856 GAAAGAATTATCAGATTAAAGCCTTAATTTCTACAAAGCATAAGTTAATAGAGAAAAACA 22645915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1260 GAAAGAATTATCAGATTAAAGCCTTAATTTCTACAAAGCATAAGTTAATAGAGAAAAAGA 1319

 22645916 AGTGCAAAGAGAGGCACCAGGTGGTTCATAGGACCTTCAGGTAAAACAAATGAGATTTTA 22645975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AGTGCAAAGAGAGGCACCAGGTGGTTCATAGGACCTTCAGGTAAAACAAATGAGATTTTA 1379

 22645976 TTAGGCTTACAGATAGAATTTTTGCCTGTGTGTCAAGGGATAACAGGAGTGTTGATTTGA 22646035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TTAGGCTTACAGATAGAATTTTTGCCTGTGTGTCAAGGGATAACAGGAGTGTTGATTTGA 1439

 22646036 GTGGCTTATGAAACAGGCATGTTTAGCTCAGCAATATTACTCATCACTTGGCTTTTTAAT 22646095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GTGGCTTATGAAACAGGCATGTTTAGCTCAGCAATATTACTCATCACTTGGCTTTTTAAT 1499

 22646096 CTGCCAAGAGATGGGTACGATTTGCACTTATGAACTGTGTGTAATTATGGTGATTCAGGT 22646155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CTGCCAAGAGATGGGTACGATTTGCACTTATGAACTGTGTGTAATTATGGTGATTCAGGT 1559

 22646156 TTTGGCTTATAATGAATCCTCCATCACAGTCTGTTTTCTCGGTCTTTTATTTTCTGTTCC 22646215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTTGGCTTATAATGAATCCTCCATCACAGTCTGTTTTCTCGGTCTTTTATTTTCTGTTCC 1619

 22646216 TCTAAGGGAAGAGAGACCAAAGAGAATTCTACTTTGACCCTGGCTTAAGAGTGGAACATA 22646275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TCTAAGGGAAGAGAGACCAAAGAGAATTCTACTTTGACCCTGGCTTAAGAGTGGAACATA 1679

 22646276 GATGTCTATAAAACTATGTGGTATGTACATTTATAAAAATTTTAATTTGCATTTTCTCTA 22646335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GATGTCTATAAAACTATGTGGTATGTACATTTATAAAAATTTTAATTTGCATTTTCTCTA 1739

 22646336 GGTTTTATGTTTTTGGTGATAACAGAATAAAGTGTGCATGCCATCCAAGATAAATGGATG 22646395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GGTTTTATGTTTTTGGTGATAACAGAATAAAGTGTGCATGCCATCCAAGATAAATGGATG 1799

 22646396 AAGGAAGTTCACTTCTTTTTAATTATCTTATACTGACAGATAAAGCAAAATAGAAAAAAA 22646455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AAGGAAGTTCACTTCTTTTTAATTATCTTATACTGACAGATAAAGCAAAATAGAAAAAAA 1859

 22646456 ATTCTGTATTTAACCTTAACAAGCTGAGACACACTAGAGAAGTGGAAAATAGATTGTGTG 22646515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 ATTCTGTATTTAACCTTAACAAGCTGAGACACACTAGAGAAGTGGAAAATAGATTGTGTG 1919

 22646516 CATCTGATCGTGCTGCACATTCCCTTTAGGTTGCAATCTCTGCTGTTATTACCGACAACA 22646575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CATCTGATCGTGCTGCACATTCCCTTTAGGTTGCAATCTCTGCTGTTATTACCGACAACA 1979

 22646576 ACTGAGACTACAGTTTTAACTCTGTATTTACTTCTAGTTATCCCACAATTGGTACATAGT 22646635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ACTGAGACTACAGTTTTAACTCTGTATTTACTTCTAGTTATCCCACAATTGGTACATAGT 2039

 22646636 ATTGGATGGAGCCCTGTATTTCAAGGAGTTCAACTACCTAATTTTCATAGCTGAGATAAC 22646695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ATTGGATGGAGCCCTGTATTTCAAGGAGTTCAACTACCTAATTTTCATAGCTGAGATAAC 2099

 22646696 TAAGTTTCTGAGTCCGTTTTCCTTTTTCCAGTCTGATCTCTCCTTTTCTCAAGGCTACTT 22646755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TAAGTTTCTGAGTCCGTTTTCCTTTTTCCAGTCTGATCTCTCCTTTTCTCAAGGCTACTT 2159

 22646756 TCGTTTCTGATAACATACTAAAGGTTATAGGATTTATCGGTATTTTGCCTCCTGGGGTCA 22646815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TCGTTTCTGATAACATACTAAAGGTTATAGGATTTATCGGTATTTTGCCTCCTGGGGTCA 2219

 22646816 TTTGTTATTAAAAAAGAAACTCTATTCAAATAACTGAATCTCTACTATTGGATTTTCCAA 22646875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TTTGTTATTAAAAAAGAAACTCTATTCAAATAACTGAATCTCTACTATTGGATTTTCCAA 2279

 22646876 AGCTATGATAGACCAGCTAGTGAAACTATTTTGTACTGGAATTTGGCAGGGTGATGGGGT 22646935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AGCTATGATAGACCAGCTAGTGAAACTATTTTGTACTGGAATTTGGCAGGGTGATGGGGT 2339

 22646936 GGGGAGAAGGTGTGGAGAGGAATTCTTGTCCTCAGTCCTGATATTTCTTTCCAGGTGAAT 22646995
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     2340 GGGGAGAAGGTGTGGAGAGGAATTCTTGTCCTCAGTCCTGATATTTCTTTCCAGGT-AAT 2398

 22646996 GTGGTCTTCCGTGTGCTACACTCCTTGCCTCTCTCTGCTCTTCTATTCACTATCTACCAG 22647055
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GTGGTCTTCCGTGTGCTATACTCCTTGCCTCTCTCTGCTCTTCTATTCACTATCTACCAG 2458

 22647056 AGAAGATGGAGTGATTCACTCTGATTAATAAATTTGGAAAAAATCAATTAGACATGCTCC 22647115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AGAAGATGGAGTGATTCACTCTGATTAATAAATTTGGAAAAAATCAATTAGACATGCTCC 2518

 22647116 GAATAGTTCCACCCTTTTTGTCTTAGAAGACAGCTGCCCTCAGAGAGCAAGATTTTACCT 22647175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 GAATAGTTCCACCCTTTTTGTCTTAGAAGACAGCTGCCCTCAGAGAGCAAGATTTTACCT 2578

 22647176 TTGTAAATTGGTACACATGATCTAGCTTAGCATTGCTTTTAACAGGGGGAAGTCTGTATA 22647235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TTGTAAATTGGTACACATGATCTAGCTTAGCATTGCTTTTAACAGGGGGAAGTCTGTATA 2638

 22647236 ATTCCTGGATTATTATCATGCCAGTGGGTTCTCATATTATACTTTATCCTCCAAATTAAT 22647295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 ATTCCTGGATTATTATCATGCCAGTGGGTTCTCATATTATACTTTATCCTCCAAATTAAT 2698

 22647296 TTTTTGTGGTGAAATTGATGCTTTTACTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTT 22647355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTTTTGTGGTGAAATTGATGCTTTTACTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTT 2758

 22647356 TTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTC 22647415
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TTTTTAGACGGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTC 2818

 22647416 ACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTAGCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTG 22647475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 ACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTAGCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTG 2878

 22647476 GGACTACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGC 22647535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GGACTACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGC 2938

 22647536 TTCACTGTGTTAGCCAGGATGATCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCACCCGCCTCGGCC 22647595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TTCACTGTGTTAGCCAGGATGATCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCACCCGCCTCGGCC 2998

 22647596 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCGATGCTTTTATTTCTA 22647655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCGATGCTTTTATTTCTA 3058

 22647656 TCTTCTCATTTGTGTAAAGTGAATAATGATATCTCACTGTGATTTCTAGTTCATTTTTGT 22647715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TCTTCTCATTTGTGTAAAGTGAATAATGATATCTCACTGTGATTTCTAGTTCATTTTTGT 3118

 22647716 GACTCACAAATATAGATACTACTTCCGTTATATTACCTGTTTATTTTCTTATGTGAATTG 22647775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GACTCACAAATATAGATACTACTTCCGTTATATTACCTGTTTATTTTCTTATGTGAATTG 3178

 22647776 CTTTCTCATACCCTTTTCTAAATTTTCTCTTCAGTACTTTACAAAGGGATTTGAAAGTGA 22647835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CTTTCTCATACCCTTTTCTAAATTTTCTCTTCAGTACTTTACAAAGGGATTTGAAAGTGA 3238

 22647836 GTTTGGTGATAATACGAAAGTATTTCAAGTGGACAAAGTGCAAATAATAGTATCAGTTGA 22647895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GTTTGGTGATAATACGAAAGTATTTCAAGTGGACAAAGTGCAAATAATAGTATCAGTTGA 3298

 22647896 TGTTAGCATACACACACAGGAATGTCTTCTTTTATAGTAAAATTTATTTATTTATTTATT 22647955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TGTTAGCATACACACACAGGAATGTCTTCTTTTATAGTAAAATTTATTTATTTATTTATT 3358

 22647956 TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCATGCTGGAGT 22648015
          |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TATTTATTTATTTATTTATTTAT----GACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCATGCTGGAGT 3414

 22648016 GCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTACAAGCTCAGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTG 22648075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 GCAGTGGCCCTATCTCGGCTCACTACAAGCTCAGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTG 3474

 22648076 CCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTT 22648135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 CCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTT 3534

 22648136 GTATTGTTGTTAGTAGAGACGGGGTCTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTGGATCTCCTG 22648195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 GTATTGTTGTTAGTAGAGACGGGGTCTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTGGATCTCCTG 3594

 22648196 ACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGTATAGTAAAATATTGAGTGT 22648255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 ACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGTATAGTAAAATATTGAGTGT 3654

 22648256 GTGTGTATATGATAGAGAGAAAATAATACTAATTTTAAGAGAGTTATATGAAAATTCTTT 22648315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 GTGTGTATATGATAGAGAGAAAATAATACTAATTTTAAGAGAGTTATATGAAAATTCTTT 3714

 22648316 TAGATTTCTAAGGAAAAGACTGACTCGAACAAATGGACATTTTAAGAAAGCTATTGCTAC 22648375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 TAGATTTCTAAGGAAAAGACTGACTCGAACAAATGGACATTTTAAGAAAGCTATTGCTAC 3774

 22648376 TTAGTAATGTATGAGTCAAATGGATAGAAACTCCACTATTTGATGTGAGGTGTCTAGAAT 22648435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 TTAGTAATGTATGAGTCAAATGGATAGAAACTCCACTATTTGATGTGAGGTGTCTAGAAT 3834

 22648436 GTTGGGAAAGTGTTAATTCAATAGTGCTGTAGACAAAAAGTTTTCCACATTGATCCTATT 22648495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 GTTGGGAAAGTGTTAATTCAATAGTGCTGTAGACAAAAAGTTTTCCACATTGATCCTATT 3894

 22648496 TGTTCACCCATCTCCCTCCACCTAGGGGAACTACTTTTTAAAAGATGTTATGTTGTTCAA 22648555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 TGTTCACCCATCTCCCTCCACCTAGGGGAACTACTTTTTAAAAGATGTTATGTTGTTCAA 3954

 22648556 ATTTCATATATAACCAATGTAAGTGAGCCATTAGTGTTTTTGGAGTATGAGGTAATAGAT 22648615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 ATTTCATATATAACCAATGTAAGTGAGCCATTAGTGTTTTTGGAGTATGAGGTAATAGAT 4014

 22648616 TCCTGTCCCCCACCAACTCCCTTATTTATCCCCTTTATGATTTCCTCACATAGCTAATAA 22648675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 TCCTGTCCCCCACCAACTCCCTTATTTATCCCCTTTATGATTTCCTCACATAGCTAATAA 4074

 22648676 TGCAACAAGAAGAGCTTTAGGGGTGCAGAGAACTCAGAAATATCCCATTGCAATAGAAGG 22648735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 TGCAACAAGAAGAGCTTTAGGGGTGCAGAGAACTCAGAAATATCCCATTGCAATAGAAGG 4134

 22648736 ATATGTTTCCTTTTAAGGTAGCTCCGAAACAGCCCATTATATAATCATTTTGTCCCAAAG 22648795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 ATATGTTTCCTTTTAAGGTAGCTCCGAAACAGCCCATTATATAATCATTTTGTCCCAAAG 4194

 22648796 CAGTGGCTTTCATACTCACCCTGCCCATGGGCCTGACCATAACTGTTATTTCACTAAATC 22648855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 CAGTGGCTTTCATACTCACCCTGCCCATGGGCCTGACCATAACTGTTATTTCACTAAATC 4254

 22648856 AGGTTATTTTTGGAGTGCCCAATTCTAAGTTGGCTGCTACTGGTGACATACATTTCATTA 22648915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 AGGTTATTTTTGGAGTGCCCAATTCTAAGTTGGCTGCTACTGGTGACATACATTTCATTA 4314

 22648916 TAGTTTGAGAGTTGTCAATATAAATACTCCACTCATAGACACCAAGAAGGTTCTTAGGAG 22648975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 TAGTTTGAGAGTTGTCAATATAAATACTCCACTCATAGACACCAAGAAGGTTCTTAGGAG 4374

 22648976 GCAAGATCTAATCTTTAGAAAAATTTTATTGACATTTCATAAAATATTTATTTAAAGCTT 22649035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 GCAAGATCTAATCTTTAGAAAAATTTTATTGACATTTCATAAAATATTTATTTAAAGCTT 4434

 22649036 GAGAAGGAAACTTTCTGGCTGTTAATGTTTTTCAGCTACCAATGAGTCTAACTCACGCAT 22649095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 GAGAAGGAAACTTTCTGGCTGTTAATGTTTTTCAGCTACCAATGAGTCTAACTCACGCAT 4494

 22649096 CTTTTTTCTTTTGGTTGCAATTATTATACAACCTCCTGCACGCCCGCTCCATTGCACCTG 22649155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 CTTTTTTCTTTTGGTTGCAATTATTATACAACCTCCTGCACGCCCGCTCCATTGCACCTG 4554

 22649156 CCTCTCAAAACCTAAAGAAAAAAGATTTAAGCAGCTAAAATTTTAATAAAATATGGAACA 22649215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 CCTCTCAAAACCTAAAGAAAAAAGATTTAAGCAGCTAAAATTTTAATAAAATATGGAACA 4614

 22649216 GTCACATGAATTTCTGAACTTTAAAATGGGGAAAACAATCATAGGCTCTGATGGCTAATT 22649275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4615 GTCACATGAATTTCTGAACTTTAAAATGGGGAAAACAATCATAGGCTCTGATGGCTAATT 4674

 22649276 TCAGAATCCTTTACATTTCATAATGAAAATTTCTATGTATAAAGATTCAAACTATTTGGA 22649335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4675 TCAGAATCCTTTACATTTCATAATGAAAATTTCTATGTATAAAGATTCAAACTATTTGGA 4734

 22649336 GACTTACATTTCAAAGGATAATTCTACTTTTTAGGCACTGTAACTTATTTTTATCCAAGA 22649395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 GACTTACATTTCAAAGGATAATTCTACTTTTTAGGCACTGTAACTTATTTTTATCCAAGA 4794

 22649396 GAAAGAAGAAATGGTTAACTGAAAAGATTTAGTGACAGTGTTGTGATAGGAGTCAAAACG 22649455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 GAAAGAAGAAATGGTTAACTGAAAAGATTTAGTGACAGTGTTGTGATAGGAGTCAAAACG 4854

 22649456 TCTCTAGTTGGCATAAGCATAGGAAAATAACTTTGTTGCAAAACACTTGAGCTCTGTTTG 22649515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4855 TCTCTAGTTGGCATAAGCATAGGAAAATAACTTTGTTGCAAAACACTTGAGCTCTGTTTG 4914

 22649516 CAGAAATGAATGGCTAGCGGATATTTTTGTTCTCTCTGTTATACTAATGGATAAAGGCAT 22649575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 CAGAAATGAATGGCTAGCGGATATTTTTGTTCTCTCTGTTATACTAATGGATAAAGGCAT 4974

 22649576 GCTGATAAGTCACTGTAGCTCTGTGGGGTTAATGCCAGAATGAAATACCAGAGCTGTACT 22649635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4975 GCTGATAAGTCACTGTAGCTCTGTGGGGTTAATGCCAGAATGAAATACCAGAGCTGTACT 5034

 22649636 CTTTCTTAGGAAATAGCAGATTCTTACAGACATGATCACAACACATTTTACAGACAAACT 22649695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5035 CTTTCTTAGGAAATAGCAGATTCTTACAGACATGATCACAACACATTTTACAGACAAACT 5094

 22649696 ACATTGCCTCATGTACTGTAGCCCCTATTCTGTGCTTTGGGGGTCACCACAATAATTTCT 22649755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5095 ACATTGCCTCATGTACTGTAGCCCCTATTCTGTGCTTTGGGGGTCACCACAATAATTTCT 5154

 22649756 CTTAGAAATTTCCTAATTTCAATAAAGCCTACCATGGAAACTTATTTGGTTGTTTGTTCC 22649815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5155 CTTAGAAATTTCCTAATTTCAATAAAGCCTACCATGGAAACTTATTTGGTTGTTTGTTCC 5214

 22649816 CTCTCTTATATCTGCTCCTCTGCGTCTTTCCCTTCTTTTCTGGCATTTGTTTTTCTTCTG 22649875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5215 CTCTCTTATATCTGCTCCTCTGCGTCTTTCCCTTCTTTTCTGGCATTTGTTTTTCTTCTG 5274

 22649876 TTCCTTTGGAGAAAGCACAGCCTTTAGAGCTAGTCAGTTTAGAATTTAGCTCAAATTTTA 22649935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5275 TTCCTTTGGAGAAAGCACAGCCTTTAGAGCTAGTCAGTTTAGAATTTAGCTCAAATTTTA 5334

 22649936 TCTTGGTCACATATAACTATGGAAAAAGTATTTCCTTTCTAAAACCTCTCTGTTTTTTCA 22649995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5335 TCTTGGTCACATATAACTATGGAAAAAGTATTTCCTTTCTAAAACCTCTCTGTTTTTTCA 5394

 22649996 TACGGCAAATGGAGACTATATACTCTACACTTAGGATTAGAATTAACTGAGAGACACACA 22650055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5395 TACGGCAAATGGAGACTATATACTCTACACTTAGGATTAGAATTAACTGAGAGACACACA 5454

 22650056 CATTTTCTCATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTGCTTCTCAA 22650115
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     5455 CATTTTCTCATTTTCTTTTCTTTTTTTTTTT-CTTTTCTTTTTTTTTTTTTGCTTCTCAA 5513

 22650116 TCAGCTCAGTTCTCTGTAGTAGATGAGGTAGTTATCAACGGGGAGGAGCTAGGAGTTTCC 22650175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 TCAGCTCAGTTCTCTGTAGTAGATGAGGTAGTTATCAACGGGGAGGAGCTAGGAGTTTCC 5573

 22650176 AGCTTAGCAATTTAATACTTTTAATAACTATACAATTATTTCGTACAAATACAAGAACCT 22650235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 AGCTTAGCAATTTAATACTTTTAATAACTATACAATTATTTCGTACAAATACAAGAACCT 5633

 22650236 AAACAGCTTATAGAGCAAGAATTACAGTAAGATTGGCCCACCATGCTTTTCGCAATCTCC 22650295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 AAACAGCTTATAGAGCAAGAATTACAGTAAGATTGGCCCACCATGCTTTTCGCAATCTCC 5693

 22650296 CATAGTTGTGCTTTCATAAACAAAAGTGCTAACCTGAACTTCCAAATCAACAACTAAGCT 22650355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 CATAGTTGTGCTTTCATAAACAAAAGTGCTAACCTGAACTTCCAAATCAACAACTAAGCT 5753

 22650356 CTGGCTCTATTACTACATCCCAGAACCATGACACAGATACATGATTATAGACCCTGAACA 22650415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 CTGGCTCTATTACTACATCCCAGAACCATGACACAGATACATGATTATAGACCCTGAACA 5813

 22650416 ACAATGCCCATCTTCACAGGCACTTTGAAATGGGGCAGGTTTCATTTTAGAGTATATTTT 22650475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 ACAATGCCCATCTTCACAGGCACTTTGAAATGGGGCAGGTTTCATTTTAGAGTATATTTT 5873

 22650476 AAGGCATAAGAGTTTGCCTCCAGAATTTTAAGTTGTAGTGAAAATACTCTGTCTGTAACA 22650535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 AAGGCATAAGAGTTTGCCTCCAGAATTTTAAGTTGTAGTGAAAATACTCTGTCTGTAACA 5933

 22650536 TAGAAAAATAAGCTTAGAAGACTCTCCGAGTTTCCTTCATGGATTAAAAAGTTGAGGATT 22650595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 TAGAAAAATAAGCTTAGAAGACTCTCCGAGTTTCCTTCATGGATTAAAAAGTTGAGGATT 5993

 22650596 CTTTTAACTACATAAATTCTGTGTCCTTTCAAATAGTAGTACCCTTACAACTTAAATAGC 22650655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 CTTTTAACTACATAAATTCTGTGTCCTTTCAAATAGTAGTACCCTTACAACTTAAATAGC 6053

 22650656 ACAGGTGTACGTTACCATTTCATACCGATCAGCCCCAGTGGGGCGTGGAGGTAGGGGAAA 22650715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 ACAGGTGTACGTTACCATTTCATACCGATCAGCCCCAGTGGGGCGTGGAGGTAGGGGAAA 6113

 22650716 CAGTTAAATAGAGACTTTCCCAGATGTGTTCCAAAATCTGTCATTTCTGTTAAATTGGTA 22650775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 CAGTTAAATAGAGACTTTCCCAGATGTGTTCCAAAATCTGTCATTTCTGTTAAATTGGTA 6173

 22650776 ATTATCAAATTTATGACTAAATAAAGATCATATAGAGCTTTTCTAAACACAGATTTCAGA 22650835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6174 ATTATCAAATTTATGACTAAATAAAGATCATATAGAGCTTTTCTAAACACAGATTTCAGA 6233

 22650836 GTCTCAAATTTAGAGAGTCTACTTCAGTAGCTCTGGAGCATAGGCTAAGACTCTGGATTT 22650895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 GTCTCAAATTTAGAGAGTCTACTTCAGTAGCTCTGGAGCATAGGCTAAGACTCTGGATTT 6293

 22650896 TTACAATGCATTTTAAGGAATCTTGATGTAAGTAGTCCTTGAACTTTACTGAAAAACTTT 22650955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6294 TTACAATGCATTTTAAGGAATCTTGATGTAAGTAGTCCTTGAACTTTACTGAAAAACTTT 6353

 22650956 GCCCTACACCCTGCCTTATAAATAAGTTATACAACTGCTTCTTGGGGCTGTTAAGCAATG 22651015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 GCCCTACACCCTGCCTTATAAATAAGTTATACAACTGCTTCTTGGGGCTGTTAAGCAATG 6413

 22651016 GAGTCTAGTGAGATTGTTGCAATTTCTTGTGCTGAGAGAAAGAAATCCAATTAAGAAATG 22651075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 GAGTCTAGTGAGATTGTTGCAATTTCTTGTGCTGAGAGAAAGAAATCCAATTAAGAAATG 6473

 22651076 TAAATTCTTCTTCATGCTGAGAGAATATGAGGCAATAAAAATATGAATTTCTTTATGTTG 22651135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 TAAATTCTTCTTCATGCTGAGAGAATATGAGGCAATAAAAATATGAATTTCTTTATGTTG 6533

 22651136 CATAGAAGCTTCTGGGAGCCCATAAAGGGTGAGCAATCCTTACCAAGCAGCTGGACTGTC 22651195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 CATAGAAGCTTCTGGGAGCCCATAAAGGGTGAGCAATCCTTACCAAGCAGCTGGACTGTC 6593

 22651196 ATCATCTTCTCTGGCTTTTATGGGAGAAGATGAGGTACTTTTGGCACTTTTCTGAAAACA 22651255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6594 ATCATCTTCTCTGGCTTTTATGGGAGAAGATGAGGTACTTTTGGCACTTTTCTGAAAACA 6653

 22651256 ATCTCTTTAAGAGTTTCTGTACAGGCTGCAAGGCTTTTTCTTTTAATGCTTGAAATTCAT 22651315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6654 ATCTCTTTAAGAGTTTCTGTACAGGCTGCAAGGCTTTTTCTTTTAATGCTTGAAATTCAT 6713

 22651316 AATTAACAATTTAGAATGGGGGAGAAATGTTAAAATATGGAATAAGTGCAATCCTTTTTC 22651375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6714 AATTAACAATTTAGAATGGGGGAGAAATGTTAAAATATGGAATAAGTGCAATCCTTTTTC 6773

 22651376 AGGATGATTATCTGATTTCTAATTGCACCCAGCAATACAGTTGTTCAGAAAGACTGGTGG 22651435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6774 AGGATGATTATCTGATTTCTAATTGCACCCAGCAATACAGTTGTTCAGAAAGACTGGTGG 6833

 22651436 TTGGGAATAAAGAAAGCGTTTTCAGTAACTTTTAAGGAGACTTGTTAGTGCTTTAAAAAA 22651495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6834 TTGGGAATAAAGAAAGCGTTTTCAGTAACTTTTAAGGAGACTTGTTAGTGCTTTAAAAAA 6893

 22651496 GAGTGAACAGGCTGGGCGTGGTGGCTCACCTCTGTAACCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAG 22651555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6894 GAGTGAACAGGCTGGGCGTGGTGGCTCACCTCTGTAACCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAG 6953

 22651556 GTGGACGGATCACAAGGTCAAGTGATCAAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACTCCAT 22651615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6954 GTGGACGGATCACAAGGTCAAGTGATCAAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACTCCAT 7013

 22651616 CTCTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCATGCGTGGTGGTGGGTG 22651675
          |||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||
     7014 CTCTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA------TTAGCCATGCGTGGTGGTGGGTG 7067

 22651676 CCTATAGTCCCAGCTACTCTGGAGGCTAAGGCAAGATAATCGTTTGAACCCAGGAGGCGG 22651735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7068 CCTATAGTCCCAGCTACTCTGGAGGCTAAGGCAAGATAATCGTTTGAACCCAGGAGGCGG 7127

 22651736 AGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCGAGACACC 22651795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7128 AGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCGAGACACC 7187

 22651796 ATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTGAACAATTGAACAATTCTAATTACTA 22651855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7188 ATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTGAACAATTGAACAATTCTAATTACTA 7247

 22651856 CTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGCACA 22651915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7248 CTCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGCACA 7307

 22651916 TGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGTTTG 22651975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7308 TGGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGTTTG 7367

 22651976 GTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAGCTG 22652035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7368 GTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAGCTG 7427

 22652036 TTTTTGTCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGG 22652095
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7428 TTTTTATCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGG 7487

 22652096 TTGAATCCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGT 22652155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7488 TTGAATCCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGT 7547

 22652156 GAACTTGTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCT 22652215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7548 GAACTTGTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCT 7607

 22652216 GGCTTTTGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTAT 22652275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7608 GGCTTTTGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTAT 7667

 22652276 ATAAGCAAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTC 22652335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7668 ATAAGCAAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTC 7727

 22652336 TCTGTTTTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAAT 22652395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7728 TCTGTTTTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAAT 7787

 22652396 GTGCTCTGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTA 22652455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7788 GTGCTCTGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTA 7847

 22652456 GAAGTCCAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATT 22652515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7848 GAAGTCCAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATT 7907

 22652516 TTAGGCTACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAG 22652575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7908 TTAGGCTACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAG 7967

 22652576 ATTCCCAGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTC 22652635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7968 ATTCCCAGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTC 8027

 22652636 AATCACTGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCA 22652695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8028 AATCACTGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCA 8087

 22652696 TTTAAAGATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATT 22652755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8088 TTTAAAGATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATT 8147

 22652756 GTTGGCAGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAA 22652815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8148 GTTGGCAGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAA 8207

 22652816 TGGATCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACA 22652875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8208 TGGATCTAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACA 8267

 22652876 TTAGGCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGT 22652935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8268 TTAGGCATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGT 8327

 22652936 GAAACCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCA 22652995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8328 GAAACCACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCA 8387

 22652996 CAACAATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTT 22653055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8388 CAACAATGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTT 8447

 22653056 TATCCCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAG 22653115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8448 TATCCCTTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAG 8507

 22653116 GCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGC 22653175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8508 GCTCTAGGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGC 8567

 22653176 TGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCT 22653235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8568 TGTATTGTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCT 8627

 22653236 GAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAG 22653295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8628 GAGGTCCAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAG 8687

 22653296 AGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAAT 22653355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8688 AGATTTAAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAAT 8747

 22653356 ATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 22653394
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8748 ATGTGACATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCAT 8786

EXCISED REGION

 22653769 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 22653828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8787 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 8846

 22653829 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 22653888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8847 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 8906

 22653889 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 22653948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8907 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 8966

 22653949 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 22654008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8967 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 9026

 22654009 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 22654068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9027 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 9086

 22654069 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 22654128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9087 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 9146

 22654129 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 22654188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9147 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 9206

 22654189 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 22654248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9207 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 9266

 22654249 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 22654308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9267 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 9326

 22654309 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 22654368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9327 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 9386

 22654369 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 22654428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9387 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 9446

 22654429 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 22654488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9447 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 9506

 22654489 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 22654548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9507 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 9566

 22654549 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 22654608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9567 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 9626

 22654609 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 22654668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9627 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 9686

 22654669 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 22654728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9687 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 9746

 22654729 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 22654788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9747 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 9806

 22654789 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 22654848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9807 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 9866

 22654849 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 22654908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9867 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 9926

 22654909 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGC 22654968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9927 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGC 9986

 22654969 CACCTATTCCACATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAA 22655028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9987 CACCTATTCCACATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAA 10046

 22655029 GAATCCTGATGACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAA 22655088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10047 GAATCCTGATGACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAA 10106

 22655089 TGTGAGTCTTTTTATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTC 22655148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10107 TGTGAGTCTTTTTATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTC 10166

 22655149 ATATATTTTAGCTTTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGG 22655208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10167 ATATATTTTAGCTTTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGG 10226

 22655209 AATTTTTAATGTCATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGAT 22655268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10227 AATTTTTAATGTCATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGAT 10286

 22655269 CAGTTATTATGTTTATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTAC 22655328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10287 CAGTTATTATGTTTATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTAC 10346

 22655329 TAATATATTTCCTTATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATT 22655388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10347 TAATATATTTCCTTATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATT 10406

 22655389 CCAGTGTTCAGACAGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATAC 22655448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10407 CCAGTGTTCAGACAGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATAC 10466

 22655449 ATCTAGTTATCTTCCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTA 22655508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10467 ATCTAGTTATCTTCCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTA 10526

 22655509 ATATGTACTATGGAATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAG 22655568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10527 ATATGTACTATGGAATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAG 10586

 22655569 AAAAAGAAAACGGGCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAG 22655628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10587 AAAAAGAAAACGGGCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAG 10646

 22655629 TCCTCCACCAGGCAACTGCTGTGATTGGGATTTATCATCAATACCTTAGGAAGAAGCAGC 22655688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10647 TCCTCCACCAGGCAACTGCTGTGATTGGGATTTATCATCAATACCTTAGGAAGAAGCAGC 10706

 22655689 ATTGAGAAAAGGTTATTCGTCTAGTTTGTCATCTACAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGG 22655748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10707 ATTGAGAAAAGGTTATTCGTCTAGTTTGTCATCTACAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGG 10766

 22655749 ATGGAGAAGAGAGTGATTAAGTGGGGAGATATAAGGCACTATGGATAATATAACAATCCA 22655808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10767 ATGGAGAAGAGAGTGATTAAGTGGGGAGATATAAGGCACTATGGATAATATAACAATCCA 10826

 22655809 AGTTAAAAGGGAAATTTAGACTGACAAAATATCTTTGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGA 22655868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10827 AGTTAAAAGGGAAATTTAGACTGACAAAATATCTTTGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGA 10886

 22655869 TAAACAATGTGATAACAATTCAGGCTCAATGACGCTACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAG 22655928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10887 TAAACAATGTGATAACAATTCAGGCTCAATGACGCTACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAG 10946

 22655929 GGCTAATTTTTCGTTCTTTGGACTTTAGTGTACCCATAAATAAAACGGGAATATGATAGT 22655988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10947 GGCTAATTTTTCGTTCTTTGGACTTTAGTGTACCCATAAATAAAACGGGAATATGATAGT 11006

 22655989 ACCCAACTCTTAGGGTTTTGTGATGATTAAATGATACACTATTATATATAAATTTTAGAG 22656048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11007 ACCCAACTCTTAGGGTTTTGTGATGATTAAATGATACACTATTATATATAAATTTTAGAG 11066

 22656049 TTCCAAAAATGAGTGTGTTTTACTCTGGAAACTTAAAAGGTGCTTTATTTAATTTTAAGA 22656108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11067 TTCCAAAAATGAGTGTGTTTTACTCTGGAAACTTAAAAGGTGCTTTATTTAATTTTAAGA 11126

 22656109 AATACATGGCTGTTGTGTAGGCTTACTAAATGGTTTAGGTATTTATTTATCCCATGAGTT 22656168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11127 AATACATGGCTGTTGTGTAGGCTTACTAAATGGTTTAGGTATTTATTTATCCCATGAGTT 11186

 22656169 TGTGGGATTGTGCATCTGGGGTACAATAATTTTTAAGTGTTTAGTTCTTTGAACAATTGT 22656228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11187 TGTGGGATTGTGCATCTGGGGTACAATAATTTTTAAGTGTTTAGTTCTTTGAACAATTGT 11246

 22656229 GCAGCATACATACAGACCTCTCTGCCTCCCTCTCTCCCGAATGCAATCCACTGTGGGAAG 22656288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11247 GCAGCATACATACAGACCTCTCTGCCTCCCTCTCTCCCGAATGCAATCCACTGTGGGAAG 11306

 22656289 CATGATTTGTAGCTAATAGTGAACATCAACTTGGTGAAAAAATAAATTTTTCTTACAATG 22656348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11307 CATGATTTGTAGCTAATAGTGAACATCAACTTGGTGAAAAAATAAATTTTTCTTACAATG 11366

 22656349 AATTTCTCTCTTTAATAGGGATTTAATTTTGTTAAAAGTAATAACAACTAAATAAAGAAT 22656408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11367 AATTTCTCTCTTTAATAGGGATTTAATTTTGTTAAAAGTAATAACAACTAAATAAAGAAT 11426

 22656409 GTTTTCTTCATCCAGTAAGATCACTGACTTTCTCAAATAACTGGTGATGCTCTAGTATGT 22656468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11427 GTTTTCTTCATCCAGTAAGATCACTGACTTTCTCAAATAACTGGTGATGCTCTAGTATGT 11486

 22656469 CCATAATGGCAGATATCCAGATCCCAGTGTGACCTGCTTTAAACTTTGAGAAAACAGATA 22656528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11487 CCATAATGGCAGATATCCAGATCCCAGTGTGACCTGCTTTAAACTTTGAGAAAACAGATA 11546

 22656529 TGCGCATTAAAGGATAATGGTTTTATGAGGAAATATAAATAATCTCAACTAACCAGACTC 22656588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11547 TGCGCATTAAAGGATAATGGTTTTATGAGGAAATATAAATAATCTCAACTAACCAGACTC 11606

 22656589 CATTGATTTTCATAGTTCCATTGTAATAAATGAAAACAAATCTTGTGCTAATTTTAAAGA 22656648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11607 CATTGATTTTCATAGTTCCATTGTAATAAATGAAAACAAATCTTGTGCTAATTTTAAAGA 11666

 22656649 TCATAGATGCTAAGAGGGGCCAGTTTAGAGAATAAAGTGATACAGTAAAATGAAAAAAAA 22656708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11667 TCATAGATGCTAAGAGGGGCCAGTTTAGAGAATAAAGTGATACAGTAAAATGAAAAAAAA 11726

 22656709 AGGAGAAATTTCTTTTTCATTTTGTGTGAAAGACCAGTATTTAAAGATTGCAGGATCAAT 22656768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11727 AGGAGAAATTTCTTTTTCATTTTGTGTGAAAGACCAGTATTTAAAGATTGCAGGATCAAT 11786

 22656769 AGCACATTTCTGCTTGAATGAGAGACAGTGAGATCAGGAAAACATGACGTATAAACAAAA 22656828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11787 AGCACATTTCTGCTTGAATGAGAGACAGTGAGATCAGGAAAACATGACGTATAAACAAAA 11846

 22656829 GAAAATGGACATAATTGTTCTTGTATTATATTAATAAATATAGTGGTAAAATGGAAACTA 22656888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11847 GAAAATGGACATAATTGTTCTTGTATTATATTAATAAATATAGTGGTAAAATGGAAACTA 11906

 22656889 GAACGGATATGTAAAATGACTAAAGGAACTGCAGTGATAAAGTAAATTATTAATAGAAAA 22656948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11907 GAACGGATATGTAAAATGACTAAAGGAACTGCAGTGATAAAGTAAATTATTAATAGAAAA 11966

 22656949 TACCGTATGTTCAACTCATTAGTAGTATTTAGATCT 22656984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11967 TACCGTATGTTCAACTCATTAGTAGTATTTAGATCT 12002

Alignment time is 8.41996 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3216] =>      3216 nucs 'mol-32-3306-157387_3216'

Score:        3216
Aligned:      3216        nucs
Identic:      3216 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22653769,22656984]
 second seq =>  [       1,    3216]

 22653769 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 22653828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGATAATTTCCATTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAAT 60

 22653829 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 22653888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAATTAGAAATAAAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAG 120

 22653889 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 22653948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCATTGAAATCCTACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCA 180

 22653949 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 22654008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTAATGGATTATATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCC 240

 22654009 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 22654068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATGGGCATTAGGGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAA 300

 22654069 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 22654128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTCATCAGGAGGCATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTG 360

 22654129 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 22654188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAACTTCAAACACAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAG 420

 22654189 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 22654248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAGGGAAACTACTAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATAC 480

 22654249 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 22654308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCATCTAATTTGTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGG 540

 22654309 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 22654368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGACAAGACTACATAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTC 600

 22654369 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 22654428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTCAATACTTTGTACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCT 660

 22654429 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 22654488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCTCTATCCCACCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTT 720

 22654489 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 22654548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGAACAGGACGGAGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAA 780

 22654549 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 22654608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATAACGGGTCAGAAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTG 840

 22654609 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 22654668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGGACAGTTAAACAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGT 900

 22654669 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 22654728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTGAGGTCTGAAAACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAA 960

 22654729 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 22654788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGGTAGGTATAAATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTAT 1020

 22654789 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 22654848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCCAGGACTTGTGATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTT 1080

 22654849 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 22654908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTTTTCTAAGCAGTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAAC 1140

 22654909 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGC 22654968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAATGGTAAGTCACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGC 1200

 22654969 CACCTATTCCACATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAA 22655028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACCTATTCCACATTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAA 1260

 22655029 GAATCCTGATGACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAA 22655088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAATCCTGATGACATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAA 1320

 22655089 TGTGAGTCTTTTTATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTC 22655148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTGAGTCTTTTTATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTC 1380

 22655149 ATATATTTTAGCTTTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGG 22655208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATATATTTTAGCTTTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGG 1440

 22655209 AATTTTTAATGTCATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGAT 22655268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATTTTTAATGTCATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGAT 1500

 22655269 CAGTTATTATGTTTATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTAC 22655328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGTTATTATGTTTATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTAC 1560

 22655329 TAATATATTTCCTTATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATT 22655388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAATATATTTCCTTATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATT 1620

 22655389 CCAGTGTTCAGACAGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATAC 22655448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCAGTGTTCAGACAGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATAC 1680

 22655449 ATCTAGTTATCTTCCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTA 22655508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCTAGTTATCTTCCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTA 1740

 22655509 ATATGTACTATGGAATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAG 22655568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATATGTACTATGGAATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAG 1800

 22655569 AAAAAGAAAACGGGCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAG 22655628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAAAGAAAACGGGCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAG 1860

 22655629 TCCTCCACCAGGCAACTGCTGTGATTGGGATTTATCATCAATACCTTAGGAAGAAGCAGC 22655688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCCTCCACCAGGCAACTGCTGTGATTGGGATTTATCATCAATACCTTAGGAAGAAGCAGC 1920

 22655689 ATTGAGAAAAGGTTATTCGTCTAGTTTGTCATCTACAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGG 22655748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTGAGAAAAGGTTATTCGTCTAGTTTGTCATCTACAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGG 1980

 22655749 ATGGAGAAGAGAGTGATTAAGTGGGGAGATATAAGGCACTATGGATAATATAACAATCCA 22655808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATGGAGAAGAGAGTGATTAAGTGGGGAGATATAAGGCACTATGGATAATATAACAATCCA 2040

 22655809 AGTTAAAAGGGAAATTTAGACTGACAAAATATCTTTGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGA 22655868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGTTAAAAGGGAAATTTAGACTGACAAAATATCTTTGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGA 2100

 22655869 TAAACAATGTGATAACAATTCAGGCTCAATGACGCTACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAG 22655928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAAACAATGTGATAACAATTCAGGCTCAATGACGCTACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAG 2160

 22655929 GGCTAATTTTTCGTTCTTTGGACTTTAGTGTACCCATAAATAAAACGGGAATATGATAGT 22655988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGCTAATTTTTCGTTCTTTGGACTTTAGTGTACCCATAAATAAAACGGGAATATGATAGT 2220

 22655989 ACCCAACTCTTAGGGTTTTGTGATGATTAAATGATACACTATTATATATAAATTTTAGAG 22656048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCCAACTCTTAGGGTTTTGTGATGATTAAATGATACACTATTATATATAAATTTTAGAG 2280

 22656049 TTCCAAAAATGAGTGTGTTTTACTCTGGAAACTTAAAAGGTGCTTTATTTAATTTTAAGA 22656108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCCAAAAATGAGTGTGTTTTACTCTGGAAACTTAAAAGGTGCTTTATTTAATTTTAAGA 2340

 22656109 AATACATGGCTGTTGTGTAGGCTTACTAAATGGTTTAGGTATTTATTTATCCCATGAGTT 22656168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATACATGGCTGTTGTGTAGGCTTACTAAATGGTTTAGGTATTTATTTATCCCATGAGTT 2400

 22656169 TGTGGGATTGTGCATCTGGGGTACAATAATTTTTAAGTGTTTAGTTCTTTGAACAATTGT 22656228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGTGGGATTGTGCATCTGGGGTACAATAATTTTTAAGTGTTTAGTTCTTTGAACAATTGT 2460

 22656229 GCAGCATACATACAGACCTCTCTGCCTCCCTCTCTCCCGAATGCAATCCACTGTGGGAAG 22656288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCAGCATACATACAGACCTCTCTGCCTCCCTCTCTCCCGAATGCAATCCACTGTGGGAAG 2520

 22656289 CATGATTTGTAGCTAATAGTGAACATCAACTTGGTGAAAAAATAAATTTTTCTTACAATG 22656348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CATGATTTGTAGCTAATAGTGAACATCAACTTGGTGAAAAAATAAATTTTTCTTACAATG 2580

 22656349 AATTTCTCTCTTTAATAGGGATTTAATTTTGTTAAAAGTAATAACAACTAAATAAAGAAT 22656408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATTTCTCTCTTTAATAGGGATTTAATTTTGTTAAAAGTAATAACAACTAAATAAAGAAT 2640

 22656409 GTTTTCTTCATCCAGTAAGATCACTGACTTTCTCAAATAACTGGTGATGCTCTAGTATGT 22656468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTTTTCTTCATCCAGTAAGATCACTGACTTTCTCAAATAACTGGTGATGCTCTAGTATGT 2700

 22656469 CCATAATGGCAGATATCCAGATCCCAGTGTGACCTGCTTTAAACTTTGAGAAAACAGATA 22656528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCATAATGGCAGATATCCAGATCCCAGTGTGACCTGCTTTAAACTTTGAGAAAACAGATA 2760

 22656529 TGCGCATTAAAGGATAATGGTTTTATGAGGAAATATAAATAATCTCAACTAACCAGACTC 22656588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGCGCATTAAAGGATAATGGTTTTATGAGGAAATATAAATAATCTCAACTAACCAGACTC 2820

 22656589 CATTGATTTTCATAGTTCCATTGTAATAAATGAAAACAAATCTTGTGCTAATTTTAAAGA 22656648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CATTGATTTTCATAGTTCCATTGTAATAAATGAAAACAAATCTTGTGCTAATTTTAAAGA 2880

 22656649 TCATAGATGCTAAGAGGGGCCAGTTTAGAGAATAAAGTGATACAGTAAAATGAAAAAAAA 22656708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCATAGATGCTAAGAGGGGCCAGTTTAGAGAATAAAGTGATACAGTAAAATGAAAAAAAA 2940

 22656709 AGGAGAAATTTCTTTTTCATTTTGTGTGAAAGACCAGTATTTAAAGATTGCAGGATCAAT 22656768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGGAGAAATTTCTTTTTCATTTTGTGTGAAAGACCAGTATTTAAAGATTGCAGGATCAAT 3000

 22656769 AGCACATTTCTGCTTGAATGAGAGACAGTGAGATCAGGAAAACATGACGTATAAACAAAA 22656828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGCACATTTCTGCTTGAATGAGAGACAGTGAGATCAGGAAAACATGACGTATAAACAAAA 3060

 22656829 GAAAATGGACATAATTGTTCTTGTATTATATTAATAAATATAGTGGTAAAATGGAAACTA 22656888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAAAATGGACATAATTGTTCTTGTATTATATTAATAAATATAGTGGTAAAATGGAAACTA 3120

 22656889 GAACGGATATGTAAAATGACTAAAGGAACTGCAGTGATAAAGTAAATTATTAATAGAAAA 22656948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAACGGATATGTAAAATGACTAAAGGAACTGCAGTGATAAAGTAAATTATTAATAGAAAA 3180

 22656949 TACCGTATGTTCAACTCATTAGTAGTATTTAGATCT 22656984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TACCGTATGTTCAACTCATTAGTAGTATTTAGATCT 3216

Alignment time is 2.02474 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    3687] =>      3687 nucs 'mol-32-3492-134760_3687'

Score:        3675
Aligned:      3686        nucs
Identic:      3685 (100%) nucs =>        78 (100%)      3607 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22651963,22652040] EXCISED REGION [22652042,22655649]
 second seq =>  [       1,      78] EXCISED REGION [      80,    3687]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [22652041,22652041]
 second seq =>         1 nucs [79,79]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22652040,22652040] to [22652042,22652042]
 second seq =>         1 nucs [78,78] to [80,80]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22651963 AAGTGGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGA 22652022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGTGGGAGTTTGGTGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGA 60

 22652023 GTGAAGGGAGCTGTTTTT 22652040
          ||||||||||||||||||
       61 GTGAAGGGAGCTGTTTTT 78

EXCISED REGION

 22652042 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 22652101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       80 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 139

 22652102 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 22652161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      140 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 199

 22652162 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 22652221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      200 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 259

 22652222 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 22652281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      260 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 319

 22652282 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 22652341
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      320 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTATCTCTGTT 379

 22652342 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 22652401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      380 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 439

 22652402 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 22652461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 499

 22652462 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 22652521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      500 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 559

 22652522 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 22652581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      560 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 619

 22652582 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 22652641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 679

 22652642 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 22652701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      680 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 739

 22652702 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 22652761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 799

 22652762 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 22652821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 859

 22652822 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 22652881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 919

 22652882 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 22652941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 979

 22652942 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 22653001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 1039

 22653002 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 22653061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 1099

 22653062 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 22653121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 1159

 22653122 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 22653181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 1219

 22653182 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 22653241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 1279

 22653242 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 22653301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 1339

 22653302 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 22653361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 1399

 22653362 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 22653421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 1459

 22653422 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 22653481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 1519

 22653482 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 22653541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 1579

 22653542 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 22653601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 1639

 22653602 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 22653661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 1699

 22653662 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 22653721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 1759

 22653722 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 22653781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 1819

 22653782 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 22653841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 1879

 22653842 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 22653901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 1939

 22653902 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 22653961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 1999

 22653962 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 22654021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 2059

 22654022 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 22654081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 2119

 22654082 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 22654141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 2179

 22654142 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 22654201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 2239

 22654202 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 22654261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 2299

 22654262 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 22654321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 2359

 22654322 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 22654381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 2419

 22654382 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 22654441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 2479

 22654442 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 22654501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 2539

 22654502 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 22654561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 2599

 22654562 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 22654621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 2659

 22654622 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 22654681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 2719

 22654682 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 22654741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 2779

 22654742 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 22654801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 2839

 22654802 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 22654861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 2899

 22654862 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 22654921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 2959

 22654922 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 22654981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 3019

 22654982 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGAC 22655041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGAC 3079

 22655042 ATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTT 22655101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 ATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTT 3139

 22655102 ATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTCATATATTTTAGCT 22655161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 ATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTCATATATTTTAGCT 3199

 22655162 TTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGGAATTTTTAATGTC 22655221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 TTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGGAATTTTTAATGTC 3259

 22655222 ATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGATCAGTTATTATGTT 22655281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 ATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGATCAGTTATTATGTT 3319

 22655282 TATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTACTAATATATTTCCT 22655341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 TATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTACTAATATATTTCCT 3379

 22655342 TATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATTCCAGTGTTCAGAC 22655401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 TATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATTCCAGTGTTCAGAC 3439

 22655402 AGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATACATCTAGTTATCTT 22655461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 AGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATACATCTAGTTATCTT 3499

 22655462 CCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTAATATGTACTATGG 22655521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 CCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTAATATGTACTATGG 3559

 22655522 AATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAGAAAAAGAAAACGG 22655581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 AATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAGAAAAAGAAAACGG 3619

 22655582 GCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAGTCCTCCACCAGGC 22655641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 GCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAGTCCTCCACCAGGC 3679

 22655642 AACTGCTG 22655649
          ||||||||
     3680 AACTGCTG 3687

Alignment time is 2.64475 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [22643394,22663768] =>     20375 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [       1,    6360] =>      6360 nucs 'mol-32-34c9-001637_6360'

Score:        6315
Aligned:      6348        nucs
Identic:      6345 (100%) nucs =>       244 (100%)      6101 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [22651797,22652040] EXCISED REGION [22652042,22658145]
 second seq =>  [      12,     255] EXCISED REGION [     257,    6360]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [22652041,22652041]
 second seq =>         1 nucs [256,256]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [22652040,22652040] to [22652042,22652042]
 second seq =>         1 nucs [255,255] to [257,257]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 22651797 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTGAACAATTGAACAATTCTAATTACTAC 22651856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       12 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTGAACAATTGAACAATTCTAATTACTAC 71

 22651857 TCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGCACAT 22651916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       72 TCATGCTCCAACATGGCTGTGTTACCCTGAAGCAGACCATAGTACAGGGCTGGAGCACAT 131

 22651917 GGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGTTTGG 22651976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      132 GGGCTACTGTTGAAAATGTCAGAAAACTAAAACAAAGATGAAAAGCAAGTGGGAGTTTGG 191

 22651977 TGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAGCTGT 22652036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      192 TGTGAGAGATTCTATTGCCTTGATATGCCCATAGAAGCAGAGTTGAGTGAAGGGAGCTGT 251

 22652037 TTTT 22652040
          ||||
      252 TTTT 255

EXCISED REGION

 22652042 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 22652101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      257 TCATTGAGAGGTTCCTTTCATTTAGTTTTCTGAGAGAATTCTATGTGAGCCTGGTTGAAT 316

 22652102 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 22652161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      317 CCTATCTGCCACTTCAAATACTGTCTTCCTTTCCATTTTTCTGTTACATATAGTGAACTT 376

 22652162 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 22652221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      377 GTTCCAATAACCTTTTCAAGTAGATTCCTGGTTATGTTTCCTTCCTTATGCCCTGGCTTT 436

 22652222 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 22652281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      437 TGTAAATTCAATCTCTGCCTTAGTGATTCTAAATCCACATCAGACATATCCTATATAAGC 496

 22652282 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 22652341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      497 AAACATATGTTGTTCAAGACATATTCCTAAGCAGCATCTTCTATCCCACTTCTCTCTGTT 556

 22652342 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 22652401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      557 TTTCATTATGCTCCTGATTCTTGATTTAAATGATGCTATTTTGGGAAAACAAATGTGCTC 616

 22652402 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 22652461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      617 TGGGATTAACAGCAATTCCCTTTGTAAACCAAGCCTGTTAAAAATGCATTTCTAGAAGTC 676

 22652462 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 22652521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      677 CAGCATAATTTGAACCAGCAAATCTAAGCATCTTCTTTCTATGTGGAGAGAATTTTAGGC 736

 22652522 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 22652581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      737 TACTATATTCAAAAATTGCTTTATTAGCCACAGAAGAAATAGCCAAAAGTAGAGATTCCC 796

 22652582 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 22652641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      797 AGAACAATTGTAAATGAGTCATTGAATTTAGAACACCATTTTGAAATGATTTTCAATCAC 856

 22652642 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 22652701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      857 TGAATAGACTTAGTAAGTACAAAGACAACTCAATTCTGGTGTGTATCTTCACCATTTAAA 916

 22652702 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 22652761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      917 GATATTCACAGGTTTAAAATTTAATGTTTTCTTTGCATTTAGAGTGAATTTATTGTTGGC 976

 22652762 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 22652821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      977 AGAAAATGCATGAGAGTCCGGACTGGAGAATTAAGTCTTCTGTTCCCTACATAATGGATC 1036

 22652822 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 22652881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 TAGCAGAAATGTTTAGCTATTTAGGATTCATGAGTGCTGTTCTGCCAGTCTACATTAGGC 1096

 22652882 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 22652941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1097 ATGATTAGAGAGGGCCAACTGAAGCTGGGATGTATTGAACTCTGTAAAGTATGTGAAACC 1156

 22652942 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 22653001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 ACCTTGTGTCAGGGCCTGTTTAAGGAATGAAAGCTAAGAATTTGGCTAAGTGCACAACAA 1216

 22653002 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 22653061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1217 TGTAAGGATTGAATATCTCAGCAATTTACCTCAATCATAATAGCTCATGTCTTTTATCCC 1276

 22653062 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 22653121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 TTAGGTTGGGGCCCATTGTCTAGCTTACTGACTTCAACTTCCTCTTCTATATAGGCTCTA 1336

 22653122 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 22653181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 GGCCTCAGACATAGTGTTGATTTCTATAAGCAACCATAGGCATGTTCTGACTGCTGTATT 1396

 22653182 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 22653241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 GTCTCCTAAAGAAGGCATCTTACACTGTAAAGTTAGGAAAATCCCACCATACCTGAGGTC 1456

 22653242 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 22653301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 CAAAGTAGGGGTATTACTAGCATAAGGTCATATCACTAGTTAGTGGAAGAGCAGAGATTT 1516

 22653302 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 22653361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 AAATTCAGATTTTAGAAAAAAGAAGTAAGGTAAAGTTTTGACAAATATTGGAATATGTGA 1576

 22653362 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 22653421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 CATGTAATAGATCAACTTGGTTTGTGAATTCATATTAGGTATTGCATTCTGTATTAGTTT 1636

 22653422 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 22653481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 CTGCCACAAAGGAAGGAAGGGAACATTTATGGAACATACAGATTTTGAGTCAGGCAAGCC 1696

 22653482 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 22653541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 TGGGTTCAAATTCTGTCCCACTACTTAATAGCACAGTGATTTGGGGGAAATTACGAAACC 1756

 22653542 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 22653601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 TCTCAAGGACTCACTGCCATCATTGATAAAATGGGAATAATACTAAACTTCATAACAATT 1816

 22653602 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 22653661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 TGCAAGACCATTTATAAAGAGGTTGGCAGAGTGCCTAAGTAATAGTAGACTTAGTGAGGA 1876

 22653662 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 22653721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 CTCAGCTGTAAAGCCTACACTCTCCCTACCATACCATAGATCCTTCCTATTGGCAACATC 1936

 22653722 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 22653781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 ACTGTATTTGTAACTATGTATTTCCCTGTCACTCTAATAATAGTCACAAGATAATTTCCA 1996

 22653782 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 22653841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 TTATGAGATATCAAAATTTCCAAGACCGTGTGATAAGTTTGACTAATACAATTAGAAATA 2056

 22653842 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 22653901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 AAGAAGGAAATGCCATTATATATTTGTAAAGTAAGATTTTAAATGAGATCATTGAAATCC 2116

 22653902 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 22653961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 TACTTGTTTATCTTTCAGAGACACTCAGTGATTCTTTTTTCTTCCCAAGTAATGGATTAT 2176

 22653962 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 22654021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 ATGGATTATTATATATTTAATTGCTATTTTGAGAAAGGTATTCCTCCAAATGGGCATTAG 2236

 22654022 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 22654081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 GGAAACAGGACAGATTTTAATTAAACCATTTAGCACATACTGAATAACCTCATCAGGAGG 2296

 22654082 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 22654141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 CATGATAAAAGTATGCTTAATTGGCTCAGAAAGATGGTAGTAATGTGAGAACTTCAAACA 2356

 22654142 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 22654201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 CAAAGTTAACTGCAGAGATAATTCTACATCTATCTCCTAATCAACAGCAAGGGAAACTAC 2416

 22654202 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 22654261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 TAAACATTTAAATAGGCAAGGCAAGAAAATCAGAGAATAGGCTATACTTTCATCTAATTT 2476

 22654262 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 22654321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 GTCTCTCAAAAAAGTTTCTTCAGGTGTGCACGTGTATTCTATTTTGGTGACAAGACTACA 2536

 22654322 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 22654381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 TAAGGAAGGGACTGCTTTATTTCTAAGGCTGTCTGACAGCACGTTTCCCTCAATACTTTG 2596

 22654382 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 22654441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 TACAGTGTGTATGGTAGTGTTTCTCATTCTATTATTCCTTTCATTCTTCTCTCTATCCCA 2656

 22654442 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 22654501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 CCTAAAACTTAACACTTTTCTAAATATCAGTGCCAGCATAGGCACTTAAGAACAGGACGG 2716

 22654502 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 22654561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 AGAATAGAATTGTCTATCCCATGTTTCTATTTGTCTCCACCAGGCAATATAACGGGTCAG 2776

 22654562 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 22654621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 AAGACCAGGCAGACTGGTCAGAGAATGGGGCAGCACTGGACCAATTGCAGGACAGTTAAA 2836

 22654622 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 22654681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 CAGCTAGCTAGCTAGATTGTAAAACAGCTATCTGAAGTCAACTAAGTTCTGAGGTCTGAA 2896

 22654682 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 22654741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 AACCAGAAGACCACAAAAGATCAAGTAAATGAATGATAGAATTGAAAGAGGTAGGTATAA 2956

 22654742 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 22654801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 ATCAGCTCAGTTCCATTTCGCCTGAATATAGAGAATGGCCATTGTATGCCAGGACTTGTG 3016

 22654802 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 22654861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 ATAGATTATGAAAATTTAGAATACAAAAGTAAAATAATTTCACACTTGTTTTTCTAAGCA 3076

 22654862 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 22654921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 GTATTACTATCAGAGGAAACATGTACATGAGCAGATTATAACAAAACAGAATGGTAAGTC 3136

 22654922 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 22654981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 ACTTGACAGAGCTTTGTATGAGGTGTTAGGGAGGCACATAGCATGGCCACCTATTCCACA 3196

 22654982 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGAC 22655041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 TTCCTTGATTTCACTGTTCATGATTATTGTTATGTTTGGGATACTAAGAATCCTGATGAC 3256

 22655042 ATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTT 22655101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 ATCATTCTTTTATCTTACTTGAGCTTTTCTAGCAAGAATGTTTTCAATGTGAGTCTTTTT 3316

 22655102 ATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTCATATATTTTAGCT 22655161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 ATAGCAAAACTTCTGACATCAGAATATCATTTCTACTTCTGTTTTTCATATATTTTAGCT 3376

 22655162 TTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGGAATTTTTAATGTC 22655221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 TTGATTTTATAGCTTCCCTCTTTTTATATTTTTCTTCTGCCTTCTGGAATTTTTAATGTC 3436

 22655222 ATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGATCAGTTATTATGTT 22655281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 ATCTTCTAATTCACATATTTATTCTTAAGTGTATCATCTTCTTTGATCAGTTATTATGTT 3496

 22655282 TATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTACTAATATATTTCCT 22655341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 TATCATTTCCACCAGTTTACTTTTCAGATTTCTTGTTCTTATGTTACTAATATATTTCCT 3556

 22655342 TATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATTCCAGTGTTCAGAC 22655401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3557 TATCTTCTAAAGTATTACAGTTATTTTACATTATTGATCCATCCATTCCAGTGTTCAGAC 3616

 22655402 AGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATACATCTAGTTATCTT 22655461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3617 AGTTTATTGAGTTTGTCTTTCTTTAACAGTCCTTGCAATCTTTATACATCTAGTTATCTT 3676

 22655462 CCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTAATATGTACTATGG 22655521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3677 CCCTAGGTGCTCATTTCACCATGATGGTATACTTACTGTGTCTGGTAATATGTACTATGG 3736

 22655522 AATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAGAAAAAGAAAACGG 22655581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 AATGCCCAAGGCCATGCCTTCCTCTCTGTATGTCCAAGTTAATTTAGAAAAAGAAAACGG 3796

 22655582 GCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAGTCCTCCACCAGGC 22655641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 GCTTAATTTCAGGAAAGAGAGCTCAGGACTATTATTTCTCTTTGCAGTCCTCCACCAGGC 3856

 22655642 AACTGCTGTGATTGGGATTTATCATCAATACCTTAGGAAGAAGCAGCATTGAGAAAAGGT 22655701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 AACTGCTGTGATTGGGATTTATCATCAATACCTTAGGAAGAAGCAGCATTGAGAAAAGGT 3916

 22655702 TATTCGTCTAGTTTGTCATCTACAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGGATGGAGAAGAGAG 22655761
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 TATTCGTCTAGTTTGTCATCTGCAAACTTGGAGTTTAAAGAAAGGGGATGGAGAAGAGAG 3976

 22655762 TGATTAAGTGGGGAGATATAAGGCACTATGGATAATATAACAATCCAAGTTAAAAGGGAA 22655821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 TGATTAAGTGGGGAGATATAAGGCACTATGGATAATATAACAATCCAAGTTAAAAGGGAA 4036

 22655822 ATTTAGACTGACAAAATATCTTTGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGATAAACAATGTGAT 22655881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 ATTTAGACTGACAAAATATCTTTGGTTTGCTCTCTTAACCAACATGATAAACAATGTGAT 4096

 22655882 AACAATTCAGGCTCAATGACGCTACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAGGGCTAATTTTTCG 22655941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 AACAATTCAGGCTCAATGACGCTACCAGTTATGGCTTTTGTACTTAGGGCTAATTTTTCG 4156

 22655942 TTCTTTGGACTTTAGTGTACCCATAAATAAAACGGGAATATGATAGTACCCAACTCTTAG 22656001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 TTCTTTGGACTTTAGTGTACCCATAAATAAAACGGGAATATGATAGTACCCAACTCTTAG 4216

 22656002 GGTTTTGTGATGATTAAATGATACACTATTATATATAAATTTTAGAGTTCCAAAAATGAG 22656061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 GGTTTTGTGATGATTAAATGATACACTATTATATATAAATTTTAGAGTTCCAAAAATGAG 4276

 22656062 TGTGTTTTACTCTGGAAACTTAAAAGGTGCTTTATTTAATTTTAAGAAATACATGGCTGT 22656121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 TGTGTTTTACTCTGGAAACTTAAAAGGTGCTTTATTTAATTTTAAGAAATACATGGCTGT 4336

 22656122 TGTGTAGGCTTACTAAATGGTTTAGGTATTTATTTATCCCATGAGTTTGTGGGATTGTGC 22656181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 TGTGTAGGCTTACTAAATGGTTTAGGTATTTATTTATCCCATGAGTTTGTGGGATTGTGC 4396

 22656182 ATCTGGGGTACAATAATTTTTAAGTGTTTAGTTCTTTGAACAATTGTGCAGCATACATAC 22656241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 ATCTGGGGTACAATAATTTTTAAGTGTTTAGTTCTTTGAACAATTGTGCAGCATACATAC 4456

 22656242 AGACCTCTCTGCCTCCCTCTCTCCCGAATGCAATCCACTGTGGGAAGCATGATTTGTAGC 22656301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 AGACCTCTCTGCCTCCCTCTCTCCCGAATGCAATCCACTGTGGGAAGCATGATTTGTAGC 4516

 22656302 TAATAGTGAACATCAACTTGGTGAAAAAATAAATTTTTCTTACAATGAATTTCTCTCTTT 22656361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4517 TAATAGTGAACATCAACTTGGTGAAAAAATAAATTTTTCTTACAGTGAATTTCTCTCTTT 4576

 22656362 AATAGGGATTTAATTTTGTTAAAAGTAATAACAACTAAATAAAGAATGTTTTCTTCATCC 22656421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 AATAGGGATTTAATTTTGTTAAAAGTAATAACAACTAAATAAAGAATGTTTTCTTCATCC 4636

 22656422 AGTAAGATCACTGACTTTCTCAAATAACTGGTGATGCTCTAGTATGTCCATAATGGCAGA 22656481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4637 AGTAAGATCACTGACTTTCTCAAATAACTGGTGATGCTCTAGTATGTCCATAATGGCAGA 4696

 22656482 TATCCAGATCCCAGTGTGACCTGCTTTAAACTTTGAGAAAACAGATATGCGCATTAAAGG 22656541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4697 TATCCAGATCCCAGTGTGACCTGCTTTAAACTTTGAGAAAACAGATATGCGCATTAAAGG 4756

 22656542 ATAATGGTTTTATGAGGAAATATAAATAATCTCAACTAACCAGACTCCATTGATTTTCAT 22656601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4757 ATAATGGTTTTATGAGGAAATATAAATAATCTCAACTAACCAGACTCCATTGATTTTCAT 4816

 22656602 AGTTCCATTGTAATAAATGAAAACAAATCTTGTGCTAATTTTAAAGATCATAGATGCTAA 22656661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4817 AGTTCCATTGTAATAAATGAAAACAAATCTTGTGCTAATTTTAAAGATCATAGATGCTAA 4876

 22656662 GAGGGGCCAGTTTAGAGAATAAAGTGATACAGTAAAATGAAAAAAAAAGGAGAAATTTCT 22656721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4877 GAGGGGCCAGTTTAGAGAATAAAGTGATACAGTAAAATGAAAAAAAAAGGAGAAATTTCT 4936

 22656722 TTTTCATTTTGTGTGAAAGACCAGTATTTAAAGATTGCAGGATCAATAGCACATTTCTGC 22656781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4937 TTTTCATTTTGTGTGAAAGACCAGTATTTAAAGATTGCAGGATCAATAGCACATTTCTGC 4996

 22656782 TTGAATGAGAGACAGTGAGATCAGGAAAACATGACGTATAAACAAAAGAAAATGGACATA 22656841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4997 TTGAATGAGAGACAGTGAGATCAGGAAAACATGACGTATAAACAAAAGAAAATGGACATA 5056

 22656842 ATTGTTCTTGTATTATATTAATAAATATAGTGGTAAAATGGAAACTAGAACGGATATGTA 22656901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5057 ATTGTTCTTGTATTATATTAATAAATATAGTGGTAAAATGGAAACTAGAACGGATATGTA 5116

 22656902 AAATGACTAAAGGAACTGCAGTGATAAAGTAAATTATTAATAGAAAATACCGTATGTTCA 22656961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5117 AAATGACTAAAGGAACTGCAGTGATAAAGTAAATTATTAATAGAAAATACCGTATGTTCA 5176

 22656962 ACTCATTAGTAGTATTTAGATCTCTGACCCACTTAGAAAGAAATAGTTTTTCTGTCTTAG 22657021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5177 ACTCATTAGTAGTATTTAGATCTCTGACCCACTTAGAAAGAAATAGTTTTTCTGTCTTAG 5236

 22657022 TGTTCATAACTGCTGAACAGGCCAGGATTGGCAACTATAACTAGGACTAGATTTCCTACA 22657081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5237 TGTTCATAACTGCTGAACAGGCCAGGATTGGCAACTATAACTAGGACTAGATTTCCTACA 5296

 22657082 GTAAATCATTTAAGTTGCATGTAGTACCTATTATCAAAAAGCAAATGAAGAATTCATTTA 22657141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5297 GTAAATCATTTAAGTTGCATGTAGTACCTATTATCAAAAAGCAAATGAAGAATTCATTTA 5356

 22657142 ATAGTGTATGCTGGTTAGGAACCTTCATTGAAACCTGATTTTCCTCCACGAAGTGTATAT 22657201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5357 ATAGTGTATGCTGGTTAGGAACCTTCATTGAAACCTGATTTTCCTCCACGAAGTGTATAT 5416

 22657202 GCCTTCACCATCTGTAGTTCTCAAATTCAAGCCATGCTAATGCTAACAAAGTGGCTGGCT 22657261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5417 GCCTTCACCATCTGTAGTTCTCAAATTCAAGCCATGCTAATGCTAACAAAGTGGCTGGCT 5476

 22657262 TGGCAGATCAATCAGAGAGGGAGCCTGGAGATTTACCTACTTTGGAAAGGTAATTTAAAA 22657321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5477 TGGCAGATCAATCAGAGAGGGAGCCTGGAGATTTACCTACTTTGGAAAGGTAATTTAAAA 5536

 22657322 CTAAATCCACCTTTAGAAGTGAGTGTCCCATTTGTGTTTATAGGTTTCACTAGAGGGGAG 22657381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5537 CTAAATCCACCTTTAGAAGTGAGTGTCCCATTTGTGTTTATAGGTTTCACTAGAGGGGAG 5596

 22657382 CCCTACATATTAGAAGCATTTCCTTTTGTTTGCCAATAGCAGTGAAGACTAAGGCTAAAA 22657441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5597 CCCTACATATTAGAAGCATTTCCTTTTGTTTGCCAATAGCAGTGAAGACTAAGGCTAAAA 5656

 22657442 CCCAAAAGGATATGACTTACACAAGAATGAGCATATGGCTGTCAAAGTTTTAATCACTAG 22657501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5657 CCCAAAAGGATATGACTTACACAAGAATGAGCATATGGCTGTCAAAGTTTTAATCACTAG 5716

 22657502 GAAAGGAAAATATAGTTGCAGCTTGTAGATAAACAGCTCTGTTTTAGCAAAAGCCAGATG 22657561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5717 GAAAGGAAAATATAGTTGCAGCTTGTAGATAAACAGCTCTGTTTTAGCAAAAGCCAGATG 5776

 22657562 AGGACAGACTTGGTTGTAAGATAATTGGTAAAAAATGTCAGCCCTTTAAAGGAGCATATC 22657621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5777 AGGACAGACTTGGTTGTAAGATAATTGGTAAAAAATGTCAGCCCTTTAAAGGAGCATATC 5836

 22657622 AGTTTTGCATGCTCAATAAAACAACAACAACAACTCACCTAAGGAGAGGTGAGTCTAACA 22657681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5837 AGTTTTGCATGCTCAATAAAACAACAACAACAACTCACCTAAGGAGAGGTGAGTCTAACA 5896

 22657682 GGAAAAATTCAAGCAGCAGAAAAATTTGGTACAATAATCTCCTATGAACTAAATTACCTG 22657741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5897 GGAAAAATTCAAGCAGCAGAAAAATTTGGTACAATAATCTCCTATGAACTAAATTACCTG 5956

 22657742 AAGTATTTTATCAGTATCTTTCATAGAGTTAAGAGGCAGGAGTTCAGGCACTGCATTTAA 22657801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5957 AAGTATTTTATCAGTATCTTTCATAGAGTTAAGAGGCAGGAGTTCAGGCACTGCATTTAA 6016

 22657802 AAATGGTTTGGCACAGTCATTGCCAATGTTACTAAAACTTCTAAAGGGATAAGGAAACAA 22657861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6017 AAATGGTTTGGCACAGTCATTGCCAATGTTACTAAAACTTCTAAAGGGATAAGGAAACAA 6076

 22657862 TTTCTTGTGCAATTTTGGAGGATCATATGATTCATACTATATTGGAATTTTCATGGTAAA 22657921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6077 TTTCTTGTGCAATTTTGGAGGATCATATGATTCATACTATATTGGAATTTTCATGGTAAA 6136

 22657922 ATTGTCAATCCCTTGGTGATTTTTCCAACTTTCAACATAAAATTGCAAGTCTGTTTTGAA 22657981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6137 ATTGTCAATCCCTTGGTGATTTTTCCAACTTTCAACATAAAATTGCAAGTCTGTTTTGAA 6196

 22657982 ATAGGAGCAAAGTGCAATCTGTCTTTACAAGAGCTAAAATGTTTGCAAATTTCATAATGT 22658041
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6197 ATAGGAGCAAAGTGCAATCCGTCTTTACAAGAGCTAAAATGTTTGCAAATTTCATAATGT 6256

 22658042 TATCTTATTTCCTGACTGTACGTGTTCCTTTAGAATCTTTGACCAAAATCCATTATTTAC 22658101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6257 TATCTTATTTCCTGACTGTACGTGTTCCTTTAGAATCTTTGACCAAAATCCATTATTTAC 6316

 22658102 TTGTAAAAAGTTAAAGGCTCAATGATAAAATATACAGTACTCCT 22658145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6317 TTGTAAAAAGTTAAAGGCTCAATGATAAAATATACAGTACTCCT 6360

Alignment time is 4.49087 s

