
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [133020642,133044801] =>     24160 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     4059] =>      4059 nucs 'mol-32-1e87-091731_4059'

Score:        3907
Aligned:      4065        nucs
Identic:      4049 (100%) nucs =>      1135 (100%)      2914 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [133028612,133029750] EXCISED REGION [133029756,133032680]
 second seq =>  [        1,     1137] EXCISED REGION [     1139,     4059]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [133029751,133029755]
 second seq =>         1 nucs [1138,1138]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [133029750,133029750] to [133029756,133029756]
 second seq =>         1 nucs [1137,1137] to [1139,1139]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [133029751,133029751] to [133029755,133029755]
 second seq =>         0 nucs

133028612 CCCCCCTGGAACATTCCCTCGCTCAAGGAACCTGCTCTCCCTGCTCTCCCGCGCCGTTGT 133028671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCCCCTGGAACATTCCCTCGCTCAAGGAACCTGCTCTCCCTGCTCTCCCGCGCCGTTGT 60

133028672 GAGACTTCAGCAAGTGACCTCACCTTCCCGCGCCTTACCGGCCCCACCTATGAAATGGTG 133028731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGACTTCAGCAAGTGACCTCACCTTCCCGCGCCTTACCGGCCCCACCTATGAAATGGTG 120

133028732 AGGATGGCCTCCCAGACTTGCTGAGATGTTGAAATGAGGCATTCCTCTCGAGGACTTGGG 133028791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGATGGCCTCCCAGACTTGCTGAGATGTTGAAATGAGGCATTCCTCTCGAGGACTTGGG 180

133028792 ACGCTACGAGCCTTTGCAGGGCTTTTCCTTTGGCCAATTCTTAGAATTCGCTCCCAGCGG 133028851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACGCTACGAGCCTTTGCAGGGCTTTTCCTTTGGCCAATTCTTAGAATTCGCTCCCAGCGG 240

133028852 AGGCTTGGAGACCGGAATGGCTCCCAGAGGCAGGCCTTGAGACGAAATGGGGTCCACCAC 133028911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGCTTGGAGACCGGAATGGCTCCCAGAGGCAGGCCTTGAGACGAAATGGGGTCCACCAC 300

133028912 GGACCCTGCAGTGGGGAGCGGACTCACCCTTGCTGGTCTTGTCCCCTCGCCTGTCTTCCC 133028971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGACCCTGCAGTGGGGAGCGGACTCACCCTTGCTGGTCTTGTCCCCTCGCCTGTCTTCCC 360

133028972 TGGGGAAAGGGCAGCGCCTCTCGTGTGCTGGCCCCGTGGCCTCCACCTGCTGTGTTCTCA 133029031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGGGAAAGGGCAGCGCCTCTCGTGTGCTGGCCCCGTGGCCTCCACCTGCTGTGTTCTCA 420

133029032 CAGCTGAGTTCCGCCCTAACTCCTTCTTCCCTGCACGCTGCACCTCTGCTTCCCCTTTAA 133029091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGCTGAGTTCCGCCCTAACTCCTTCTTCCCTGCACGCTGCACCTCTGCTTCCCCTTTAA 480

133029092 CCCCCTGCCTTGCAGCTCAGTGTTAGGGGCGCCCTTGAAAGGGTCCCTGGGCGCTCCACT 133029151
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCCCTTCCTTGCAGCTCAGTGTTAGGGGCGCCCTTGAAAGGGTCCCTGGGCGCTCCACT 540

133029152 GTAGAGAGTCCCAGGGACAGCGGTTGCTGAGTGAGCTGCAGGTTCCCAGCGGCGAGGAGC 133029211
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      541 GTAGAGAGTCCCAGGGACAGCGGTTGCTGAGTGAGTTGCAGGTTCCCAGCGGCGAGGAGC 600

133029212 AGGACTGCTTTCCACACTTCTTTTTTTTTTTGAGACAAGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGC 133029271
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGACTGCTTTCCACACTTCTTTTTTTTT--GAGACAAGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGC 658

133029272 TGGAGTGCAGTGGCGTGATCACAGCTCGCTGCAGCCTCGAACTCCTGGGCTCAGGTGACC 133029331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 TGGAGTGCAGTGGCGTGATCACAGCTCGCTGCAGCCTCGAACTCCTGGGCTCAGGTGACC 718

133029332 CTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAAGCATACGCCACCATGCCTGGCTGA 133029391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAAGCATACGCCACCATGCCTGGCTGA 778

133029392 TTTTTAAATTTTTTATAGACATGGAGTCTCTCTGTATTGCCCAGGCTAGTCTCAAACTCC 133029451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 TTTTTAAATTTTTTATAGACATGGAGTCTCTCTGTATTGCCCAGGCTAGTCTCAAACTCC 838

133029452 TGGCCTCAGTGATCCTCCCACTTAGGCCTCCCAAAGTGCTGAAATTACAAGCATGAGCCA 133029511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 TGGCCTCAGTGATCCTCCCACTTAGGCCTCCCAAAGTGCTGAAATTACAAGCATGAGCCA 898

133029512 CTGCACCCAGCCTCCCCAGCGTTTTTTAATGGAAAATTTCAAACTTACAGTAAAATGGGG 133029571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 CTGCACCCAGCCTCCCCAGCGTTTTTTAATGGAAAATTTCAAACTTACAGTAAAATGGGG 958

133029572 AGAAACATACATGGAACCGCCTATGCCCACCGAGAGCCTCTGAGTCATATTTTGCTTTAT 133029631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 AGAAACATACATGGAACCGCCTATGCCCACCGAGAGCCTCTGAGTCATATTTTGCTTTAT 1018

133029632 CACATCTCTCTATCATTCACCCCTCTGTCAAGGATAGCTTTATAAAGCAACAAACAAACA 133029691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 CACATCTCTCTATCATTCACCCCTCTGTCAAGGATAGCTTTATAAAGCAACAAACAAACA 1078

133029692 AACAAACAACCCCCCCAAATAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 133029750
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 AACAAACAACCCCCCCAAATAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 1137

EXCISED REGION

133029756 CGCACAGATTCCTTGCTAAATTGTACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGT 133029815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CGCACAGATTCCTTGCTAAATTGTACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGT 1198

133029816 GGCCATTGGCTGTATGAGCCAGCAAGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAA 133029875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 GGCCATTGGCTGTATGAGCCAGCAAGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAA 1258

133029876 TACCATTACAGGTTCTTAGAAAATGGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGC 133029935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 TACCATTACAGGTTCTTAGAAAATGGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGC 1318

133029936 TTCAGGCTGAGTTTGTGGTCTAGGGGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGC 133029995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TTCAGGCTGAGTTTGTGGTCTAGGGGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGC 1378

133029996 ACCACAGGGTTTTGCAGCTCAAAGCTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGA 133030055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 ACCACAGGGTTTTGCAGCTCAAAGCTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGA 1438

133030056 ACATCAGATGGACAGCTTCTATCTTGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGG 133030115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 ACATCAGATGGACAGCTTCTATCTTGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGG 1498

133030116 AGGTGGGCTGTGAAGTGTGTTCTGGCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCC 133030175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 AGGTGGGCTGTGAAGTGTGTTCTGGCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCC 1558

133030176 CCAGCTCTCTCACCCACTTTCTGAATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGG 133030235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CCAGCTCTCTCACCCACTTTCTGAATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGG 1618

133030236 AGCTTAGAGATCGTTGAATCTACCCCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGA 133030295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AGCTTAGAGATCGTTGAATCTACCCCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGA 1678

133030296 CACTGATGAGACTTTCCCAAGGCCACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCC 133030355
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CACTGATGAGATTTTCCCAAGGCCACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCC 1738

133030356 ACATTTGTCTCTGAAATATGTGGCTCCAGTGGCCCAGCAGGATAGCAGCCTTTCAGAGCC 133030415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1739 ACATTTGTCTCTGAAATATGTGGCTCCAGTGGCCCAGCAGGATACCAGCCTTTCAGAGCC 1798

133030416 AGATGTCGTGTCCTGAAGCCCAGACCAGGGTTCCTGAGACTGTCCTCGCTGCCCCATTTG 133030475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1799 AGATGTCGTGTCCTGAAGCCCAGACCAGGGTTCCTGAGGCTGTCCTCGCTGCCCCATTTG 1858

133030476 TGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCCACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCA 133030535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCCACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCA 1918

133030536 CTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCAGCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTA 133030595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCAGCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTA 1978

133030596 TGAAACAAAAATCCAGTTCTCCATCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCCGAGTGACACCCCC 133030655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TGAAACAAAAATCCAGTTCTCCATCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCCGAGTGACACCCCC 2038

133030656 AGGTTCAGACGTCGGGGAGACTTCAGCACCATGGAGCCCTTGATCTGTGTAGAGCCCAGG 133030715
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AGGTTCAGACGTCGGGGAGACTTCAGCATCATGGAGCCCTTGATCTGTGTAGAGCCCAGG 2098

133030716 GAGGCTCACAGTGTAAAGGGGCATGGTTCATTCCACGGGGCTGGTAGCCCTCTGGGACAG 133030775
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2099 GAGGCTCACAGTGTAAAGGGGCATGGTTCATTCCATGGGGCTGGTAGCCCTCTGGGACAG 2158

133030776 GCCAGGTGGGGAGTAGAAAGTGACATGTGGTGGCTCAGGTGCCAACTCCTGGCCATGGGC 133030835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GCCAGGTGGGGAGTAGAAAGTGACATGTGGTGGCTCAGGTGCCAACTCCTGGCCATGGGC 2218

133030836 CAGTAAGCAAGGAAGGGGGCTAAGGAAAGACCCCCCCCTGAGGAAGCAGCCTGTGAGTAG 133030895
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CAGTAAGCAAGGAAGGGGGCTAAGGAAAGACGCCCCCCTGAGGAAGCAGCCTGTGAGTAG 2278

133030896 GGCCTGAAGAACATCAGTGAATGTTTACTGGGTTTTGGCCGTTTGCCTGGCAGATGCCAG 133030955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GGCCTGAAGAACATCAGTGAATGTTTACTGGGTTTTGGCCGTTTGCCTGGCAGATGCCAG 2338

133030956 GTGCTGGGAACACAGCAGGGAGAGAGGACTCCCTGGGGCATGTGGAGCTGGCTGGGTAAG 133031015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GTGCTGGGAACACAGCAGGGAGAGAGGACTCCCTGGGGCATGTGGAGCTGGCTGGGTAAG 2398

133031016 GACCGGGGGATGGACAGGAGGGCTGATGTGGAGGGACAGGTGTGTGTGGGAGCTGGGTGT 133031075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GACCGGGGGATGGACAGGAGGGCTGATGTGGAGGGACAGGTGTGTGTGGGAGCTGGGTGT 2458

133031076 GCACGGGAGGAGTGGAGCGGGAAAGTGGGGAAGGGCAAGATTGGACACAGCCGTGAGTGC 133031135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GCACGGGAGGAGTGGAGCGGGAAAGTGGGGAAGGGCAAGATTGGACACAGCCGTGAGTGC 2518

133031136 AGGGCCGATTGATGCCTTGGCGGACTTGGATTTCCTTTTCCTTCTATGGGCTGTGAACAG 133031195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AGGGCCGATTGATGCCTTGGCGGACTTGGATTTCCTTTTCCTTCTATGGGCTGTGAACAG 2578

133031196 CCACCGAGGGCTTCTGAGCAGCAGTTTGGAACTGTGATTTAGGCCTGGCTGTGCCTTTTG 133031255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CCACCGAGGGCTTCTGAGCAGCAGTTTGGAACTGTGATTTAGGCCTGGCTGTGCCTTTTG 2638

133031256 AATCAGCAAATAGAATCCCCTTTGGTGGAAGAGGAACTTGAGAAACGGGTTGTAGCTGTT 133031315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 AATCAGCAAATAGAATCCCCTTTGGTGGAAGAGGAACTTGAGAAACGGGTTGTAGCTGTT 2698

133031316 TGTTCCAGCTCCCAGAGCTGCACAGCGGGAGGGTTTTCTTAAAGTAAGCCCCTCTCCTAA 133031375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TGTTCCAGCTCCCAGAGCTGCACAGCGGGAGGGTTTTCTTAAAGTAAGCCCCTCTCCTAA 2758

133031376 ACCCCAAGAGGCGGGTGCGGGGCAAATCGTGGCGGTTCTAGACTGTTCCTGCTTGGAGAC 133031435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 ACCCCAAGAGGCGGGTGCGGGGCAAATCGTGGCGGTTCTAGACTGTTCCTGCTTGGAGAC 2818

133031436 AAACTAAGATCCGTGCTTCGGAAATTTTACAGTTTCTAAATTAAAAATTGTATGTTCCCA 133031495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AAACTAAGATCCGTGCTTCGGAAATTTTACAGTTTCTAAATTAAAAATTGTATGTTCCCA 2878

133031496 GAGTAGAAAAGTTAGAAATTTGCTAATCATTGCAAAAGAGCCCTGGTTCCTTTTTTTTTT 133031555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||
     2879 GAGTAGAAAAGTTAGAAATTTGCTAATCATTGCAAAAGAGCCCTGGTTCC--TTTTTTTT 2936

133031556 TTTTTTTTTTGAAATTAGTAGTAGAAACCAAGATCTAGTGCTAAAATTTAGGTTGTTTTC 133031615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TTTTTTTTTTGAAATTAGTAGTAGAAACCAAGATCTAGTGCTAAAATTTAGGTTGTTTTC 2996

133031616 AGTGTTTCTATATTAAAATGTTACTAAGAAACTCTCTTGTAAAAATCTTTGTCTGCATCT 133031675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 AGTGTTTCTATATTAAAATGTTACTAAGAAACTCTCTTGTAAAAATCTTTGTCTGCATCT 3056

133031676 TTGATTGGTTTTTACGTAGGCTTAAGTTCCTTGAAGTGGAATTCTAGGCCATTTTTAACA 133031735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TTGATTGGTTTTTACGTAGGCTTAAGTTCCTTGAAGTGGAATTCTAGGCCATTTTTAACA 3116

133031736 CACCGAGTGGGGGGACGACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGAATGTTTCAGGAGATTGAACTT 133031795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 CACCGAGTGGGGGGACGACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGAATGTTTCAGGAGATTGAACTT 3176

133031796 CCACCAGAACTGTTTCAGGGGCCCGTTTCAGCACAGCCACCCCCAACACTGGAAATTAAT 133031855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 CCACCAGAACTGTTTCAGGGGCCCGTTTCAGCACAGCCACCCCCAACACTGGAAATTAAT 3236

133031856 ATAAAAACCTTTCTTTTCTAATTCAAAAATGGAAAATGATATCTTCTTGTTTCAATTGCT 133031915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 ATAAAAACCTTTCTTTTCTAATTCAAAAATGGAAAATGATATCTTCTTGTTTCAATTGCT 3296

133031916 AGTGAGGTTCAATATGTCTTTCAAGCGTTCACTAGATATTTTTGGTATGAATTTCTTATT 133031975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 AGTGAGGTTCAATATGTCTTTCAAGCGTTCACTAGATATTTTTGGTATGAATTTCTTATT 3356

133031976 TTGTAAACTGTCAGTTTCTTTGCAAATTTTTTCATGGGAGTTTTAGTGCTTTTATTTTTA 133032035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TTGTAAACTGTCAGTTTCTTTGCAAATTTTTTCATGGGAGTTTTAGTGCTTTTATTTTTA 3416

133032036 GTTGGAATGAGGACCTTATGTTGATGATGTTATCTGTTTTTTTTTTTGTTGTTGTTTGTT 133032095
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     3417 GTTGGAATGAGGACCTTATGTTGATGATGTTATCTG-TTTTTTTTTTGTTGTTGTTTGTT 3475

133032096 TGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGAT 133032155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 TGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGAT 3535

133032156 CTCTGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTG 133032215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 CTCTGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTG 3595

133032216 AGTAGCTGGGACTACAGATGCGTGCCACCACGTCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 133032275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 AGTAGCTGGGACTACAGATGCGTGCCACCACGTCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 3655

133032276 GACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACT 133032335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 GACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACT 3715

133032336 CACCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGCCTTAACT 133032395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 CACCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGCCTTAACT 3775

133032396 GTTTCTTTTTTTTTTTAAGTGTACTTAGTATTTTTCCTGGTTGCTTGTCTTTTAGTATTT 133032455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 GTTTCTTTTTTTTTTTAAGTGTACTTAGTATTTTTCCTGGTTGCTTGTCTTTTAGTATTT 3835

133032456 GTAATTCTTAGAAGTTTTGAAGTTTTAAATGTTTATGTAGAGAAATCTATTG-TTTTTTT 133032514
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     3836 GTAATTCTTAGAAGTTTTGAAGTTTTAAATGTTTATGTAGAGAAATCTATTGTTTTTTTT 3895

133032515 TCTTTGTGATTTCTTCACTTAGGTGCTTATAAAGGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTG 133032574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     3896 TCTTTGTGATTTCTTCACTTAGGTGCTTATAAAGGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTT- 3954

133032575 TTTTTTTTTTTCCCTATCACAAAACCAGTTAGGCAGATTTTCTAGGGTTTGTGTATGTGT 133032634
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 TTTTTTTTTTT-CCTATCACAAAACCAGTTAGGCAGATTTTCTAGGGTTTGTGTATGTGT 4013

133032635 GTGTTTTGTTTTATTTTCCTCTCTTCACATTTAATTCTTCAACTTG 133032680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 GTGTTTTGTTTTATTTTCCTCTCTTCACATTTAATTCTTCAACTTG 4059

Alignment time is 6.01546 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [133020642,133044801] =>     24160 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     2545] =>      2545 nucs 'mol-32-1f0b-105310_2545'

Score:        2522
Aligned:      2544        nucs
Identic:      2542 (100%) nucs =>       429 (100%)      2113 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [133034369,133034797] EXCISED REGION [133034799,133036913]
 second seq =>  [        1,      429] EXCISED REGION [      431,     2545]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [133034798,133034798]
 second seq =>         1 nucs [430,430]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [133034797,133034797] to [133034798,133034798]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

133034369 GAATTGTTGAGTGGGACCCCCACGGGAAACAGCTTTATTAACTAGAATACAGTTCTTTTG 133034428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAATTGTTGAGTGGGACCCCCACGGGAAACAGCTTTATTAACTAGAATACAGTTCTTTTG 60

133034429 CTTTTAGTCTTAACAGACTCCATTCATTTCCAAAATTACTTAGGCCAACACCTTCTTCAG 133034488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTTAGTCTTAACAGACTCCATTCATTTCCAAAATTACTTAGGCCAACACCTTCTTCAG 120

133034489 CTTCTTCTTCTTTTTTAAAAAAAATAAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGAATC 133034548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTCTTCTTCTTTTTTAAAAAAAATAAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGAATC 180

133034549 TCACCTTGTCTCCCAGGCTGGAATACAGTGGCGCAATCTTGGCCCACTGCAACCTCCACC 133034608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCACCTTGTCTCCCAGGCTGGAATACAGTGGCGCAATCTTGGCCCACTGCAACCTCCACC 240

133034609 TCCTGGGTTTAAGGAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTTAGTAGCTGGGATTACAGATGTGT 133034668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCTGGGTTTAAGGAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTTAGTAGCTGGGATTACAGATGTGT 300

133034669 GCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGCC 133034728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGCC 360

133034729 AGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAAGGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTCCTG 133034788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAAGGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTCCTG 420

133034789 GGATTACAG 133034797
          |||||||||
      421 GGATTACAG 429

EXCISED REGION

133034799 TGTGAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGTCTCA 133034858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 TGTGAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGTCTCA 490

133034859 TTCTGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCATCTCC 133034918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 TTCTGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCATCTCC 550

133034919 CCAAGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGCC 133034978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 CCAAGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGCC 610

133034979 ACCACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTGCCAT 133035038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 ACCACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTGCCAT 670

133035039 ATTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTCCCAA 133035098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 ATTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTCCCAA 730

133035099 AGTGCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATTCATA 133035158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 AGTGCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATTCATA 790

133035159 TTCTTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAAACTT 133035218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 TTCTTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAAACTT 850

133035219 GTCAACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCTTGAT 133035278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 GTCAACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCTTGAT 910

133035279 TTTGGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATGCCTC 133035338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 TTTGGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATGCCTC 970

133035339 TTGTTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAGATTC 133035398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 TTGTTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAGATTC 1030

133035399 AGGTTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATTTTAAGATAGTTTT 133035458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1031 AGGTTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATCTTAAGATAGTTTT 1090

133035459 GGTTTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGTATTG 133035518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 GGTTTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGTATTG 1150

133035519 CTAGTATGTTGGAAAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGCTTCTTTTACTA 133035578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 CTAGTATGTTGGAAAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGCTTCTTTTACTA 1210

133035579 AAGTTTTTTTTAACTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCTAGGTTGAGAGT 133035638
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1211 AAGTTTTTTTTAACTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCTAGGTTGAGAGC 1270

133035639 CACAGCTTGTCCAAATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATATTTCACGTTTTA 133035698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 CACAGCTTGTCCAAATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATATTTCACGTTTTA 1330

133035699 AGTGTTTTGTATTATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATAATGGTGATGGC 133035758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 AGTGTTTTGTATTATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATAATGGTGATGGC 1390

133035759 TGCAGTTATCTTGTCTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTCTTGCC 133035818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 TGCAGTTATCTTGTCTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTCTTGCC 1450

133035819 CAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCAGGCTCAAG 133035878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 CAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCAGGCTCAAG 1510

133035879 CGATTCTCTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTATTATAGGCATGCGCCACCATGCCCA 133035938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 CGATTCTCTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTATTATAGGCATGCGCCACCATGCCCA 1570

133035939 GCTAATTTTCGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCCCAA 133035998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 GCTAATTTTCGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCCCAA 1630

133035999 ACTCCTGACCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 133036058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 ACTCCTGACCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 1690

133036059 GCGCCTCCGCGCCCGGCCATCTTGTCTTGCTTTTGATTTTGCACCACTCATTGTATGATA 133036118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 GCGCCTCCGCGCCCGGCCATCTTGTCTTGCTTTTGATTTTGCACCACTCATTGTATGATA 1750

133036119 TTGATTCTTGGTTTGAGTTTTTGTCATCAAGTGAAAGAAGATGCATTCATTCCTAATTTT 133036178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 TTGATTCTTGGTTTGAGTTTTTGTCATCAAGTGAAAGAAGATGCATTCATTCCTAATTTT 1810

133036179 ACTAAAAAAAAATAAACTCAAAAAACAAGAAAAAGCAAAAACAAAACAAAAAATCCAAAC 133036238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 ACTAAAAAAAAATAAACTCAAAAAACAAGAAAAAGCAAAAACAAAACAAAAAATCCAAAC 1870

133036239 AGGGATGGGTGTTGAATTTTAGCAAGTGATTTTCTGCTTTGTTGCAATGTTTATAAGATC 133036298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 AGGGATGGGTGTTGAATTTTAGCAAGTGATTTTCTGCTTTGTTGCAATGTTTATAAGATC 1930

133036299 CTTCTCCTGTTGACCTATTAATGTGATACATTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGAGACGGAG 133036358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 CTTCTCCTGTTGACCTATTAATGTGATACATTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGAGACGGAG 1990

133036359 TCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGACTCACTGCAGCTTCCA 133036418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 TCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGACTCACTGCAGCTTCCA 2050

133036419 CCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGT 133036478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 CCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGT 2110

133036479 GCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATATGT 133036538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 GCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATATGT 2170

133036539 TGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAG 133036598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 TGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAG 2230

133036599 TACTGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAATGCGTTAATTTTCAACTATTTT 133036658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 TACTGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAATGCGTTAATTTTCAACTATTTT 2290

133036659 TGCATTTCTTGCATAAGTCCTGCTTGGTCACGGTGGATTATTCTTTAATATACAGCTGGA 133036718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 TGCATTTCTTGCATAAGTCCTGCTTGGTCACGGTGGATTATTCTTTAATATACAGCTGGA 2350

133036719 TGATAGTTTCCAGCATTTTGCTTAGAGGTTTTGCCTTTTTCCATTTCATGTGTGCAATCA 133036778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 TGATAGTTTCCAGCATTTTGCTTAGAGGTTTTGCCTTTTTCCATTTCATGTGTGCAATCA 2410

133036779 GTAAGTGGTGTTTTTCCTTTGTGTTTTTTGTCAAGTTTTACCATCAGGGTTTAGCTTTTT 133036838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 GTAAGTGGTGTTTTTCCTTTGTGTTTTTTGTCAAGTTTTACCATCAGGGTTTAGCTTTTT 2470

133036839 CAGTTAATAATCCATTCCCTTCAAGAATCTCAAAATTAATACATGCTTGTAAAATATTCT 133036898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 CAGTTAATAATCCATTCCCTTCAAGAATCTCAAAATTAATACATGCTTGTAAAATATTCT 2530

133036899 ACTACTACTCTCAAG 133036913
          |||||||||||||||
     2531 ACTACTACTCTCAAG 2545

Alignment time is 3.78375 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [133020642,133044801] =>     24160 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     7744] =>      7744 nucs 'mol-32-1f0b-108536_7744'

Score:        7545
Aligned:      7752        nucs
Identic:      7725 (100%) nucs =>        82 (100%)      7643 (100%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [133029667,133029748] EXCISED REGION [133029756,133037420]
 second seq =>  [        1,       82] EXCISED REGION [       86,     7744]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [133029749,133029755]
 second seq =>         3 nucs [83,85]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [133029748,133029748] to [133029756,133029756]
 second seq =>         1 nucs [82,82] to [86,86]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [133029749,133029751] to [133029753,133029755]
 second seq =>         1 nucs [83,83] to [85,85]

133029667 AGCTTTATAAAGCAACAAACAAACAAACAAACAACCCCCCCAAATAAAACACACACACAC 133029726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTTTATAAAGCAACAAACAAACAAACAAACAACCCCCCCAAATAAAACACACACACAC 60

133029727 ACACACACACACACACACACAC 133029748
          ||||||||||||||||||||||
       61 ACACACACACACACACACACAC 82

EXCISED REGION

133029756 CGCACAGATTCCTTGCTAAATTGTACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGT 133029815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       86 CGCACAGATTCCTTGCTAAATTGTACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGT 145

133029816 GGCCATTGGCTGTATGAGCCAGCAAGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAA 133029875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      146 GGCCATTGGCTGTATGAGCCAGCAAGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAA 205

133029876 TACCATTACAGGTTCTTAGAAAATGGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGC 133029935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      206 TACCATTACAGGTTCTTAGAAAATGGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGC 265

133029936 TTCAGGCTGAGTTTGTGGTCTAGGGGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGC 133029995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      266 TTCAGGCTGAGTTTGTGGTCTAGGGGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGC 325

133029996 ACCACAGGGTTTTGCAGCTCAAAGCTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGA 133030055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      326 ACCACAGGGTTTTGCAGCTCAAAGCTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGA 385

133030056 ACATCAGATGGACAGCTTCTATCTTGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGG 133030115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      386 ACATCAGATGGACAGCTTCTATCTTGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGG 445

133030116 AGGTGGGCTGTGAAGTGTGTTCTGGCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCC 133030175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      446 AGGTGGGCTGTGAAGTGTGTTCTGGCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCC 505

133030176 CCAGCTCTCTCACCCACTTTCTGAATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGG 133030235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      506 CCAGCTCTCTCACCCACTTTCTGAATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGG 565

133030236 AGCTTAGAGATCGTTGAATCTACCCCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGA 133030295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      566 AGCTTAGAGATCGTTGAATCTACCCCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGA 625

133030296 CACTGATGAGACTTTCCCAAGGCCACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCC 133030355
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      626 CACTGATGAGATTTTCCCAAGGCCACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCC 685

133030356 ACATTTGTCTCTGAAATATGTGGCTCCAGTGGCCCAGCAGGATAGCAGCCTTTCAGAGCC 133030415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      686 ACATTTGTCTCTGAAATATGTGGCTCCAGTGGCCCAGCAGGATACCAGCCTTTCAGAGCC 745

133030416 AGATGTCGTGTCCTGAAGCCCAGACCAGGGTTCCTGAGACTGTCCTCGCTGCCCCATTTG 133030475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      746 AGATGTCGTGTCCTGAAGCCCAGACCAGGGTTCCTGAGGCTGTCCTCGCTGCCCCATTTG 805

133030476 TGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCCACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCA 133030535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      806 TGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCCACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCA 865

133030536 CTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCAGCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTA 133030595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      866 CTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCAGCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTA 925

133030596 TGAAACAAAAATCCAGTTCTCCATCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCCGAGTGACACCCCC 133030655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      926 TGAAACAAAAATCCAGTTCTCCATCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCCGAGTGACACCCCC 985

133030656 AGGTTCAGACGTCGGGGAGACTTCAGCACCATGGAGCCCTTGATCTGTGTAGAGCCCAGG 133030715
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      986 AGGTTCAGACGTCGGGGAGACTTCAGCATCATGGAGCCCTTGATCTGTGTAGAGCCCAGG 1045

133030716 GAGGCTCACAGTGTAAAGGGGCATGGTTCATTCCACGGGGCTGGTAGCCCTCTGGGACAG 133030775
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1046 GAGGCTCACAGTGTAAAGGGGCATGGTTCATTCCATGGGGCTGGTAGCCCTCTGGGACAG 1105

133030776 GCCAGGTGGGGAGTAGAAAGTGACATGTGGTGGCTCAGGTGCCAACTCCTGGCCATGGGC 133030835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1106 GCCAGGTGGGGAGTAGAAAGTGACATGTGGTGGCTCAGGTGCCAACTCCTGGCCATGGGC 1165

133030836 CAGTAAGCAAGGAAGGGGGCTAAGGAAAGACCCCCCCCTGAGGAAGCAGCCTGTGAGTAG 133030895
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1166 CAGTAAGCAAGGAAGGGGGCTAAGGAAAGACGCCCCCCTGAGGAAGCAGCCTGTGAGTAG 1225

133030896 GGCCTGAAGAACATCAGTGAATGTTTACTGGGTTTTGGCCGTTTGCCTGGCAGATGCCAG 133030955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1226 GGCCTGAAGAACATCAGTGAATGTTTACTGGGTTTTGGCCGTTTGCCTGGCAGATGCCAG 1285

133030956 GTGCTGGGAACACAGCAGGGAGAGAGGACTCCCTGGGGCATGTGGAGCTGGCTGGGTAAG 133031015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1286 GTGCTGGGAACACAGCAGGGAGAGAGGACTCCCTGGGGCATGTGGAGCTGGCTGGGTAAG 1345

133031016 GACCGGGGGATGGACAGGAGGGCTGATGTGGAGGGACAGGTGTGTGTGGGAGCTGGGTGT 133031075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1346 GACCGGGGGATGGACAGGAGGGCTGATGTGGAGGGACAGGTGTGTGTGGGAGCTGGGTGT 1405

133031076 GCACGGGAGGAGTGGAGCGGGAAAGTGGGGAAGGGCAAGATTGGACACAGCCGTGAGTGC 133031135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1406 GCACGGGAGGAGTGGAGCGGGAAAGTGGGGAAGGGCAAGATTGGACACAGCCGTGAGTGC 1465

133031136 AGGGCCGATTGATGCCTTGGCGGACTTGGATTTCCTTTTCCTTCTATGGGCTGTGAACAG 133031195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1466 AGGGCCGATTGATGCCTTGGCGGACTTGGATTTCCTTTTCCTTCTATGGGCTGTGAACAG 1525

133031196 CCACCGAGGGCTTCTGAGCAGCAGTTTGGAACTGTGATTTAGGCCTGGCTGTGCCTTTTG 133031255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1526 CCACCGAGGGCTTCTGAGCAGCAGTTTGGAACTGTGATTTAGGCCTGGCTGTGCCTTTTG 1585

133031256 AATCAGCAAATAGAATCCCCTTTGGTGGAAGAGGAACTTGAGAAACGGGTTGTAGCTGTT 133031315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1586 AATCAGCAAATAGAATCCCCTTTGGTGGAAGAGGAACTTGAGAAACGGGTTGTAGCTGTT 1645

133031316 TGTTCCAGCTCCCAGAGCTGCACAGCGGGAGGGTTTTCTTAAAGTAAGCCCCTCTCCTAA 133031375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1646 TGTTCCAGCTCCCAGAGCTGCACAGCGGGAGGGTTTTCTTAAAGTAAGCCCCTCTCCTAA 1705

133031376 ACCCCAAGAGGCGGGTGCGGGGCAAATCGTGGCGGTTCTAGACTGTTCCTGCTTGGAGAC 133031435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 ACCCCAAGAGGCGGGTGCGGGGCAAATCGTGGCGGTTCTAGACTGTTCCTGCTTGGAGAC 1765

133031436 AAACTAAGATCCGTGCTTCGGAAATTTTACAGTTTCTAAATTAAAAATTGTATGTTCCCA 133031495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 AAACTAAGATCCGTGCTTCGGAAATTTTACAGTTTCTAAATTAAAAATTGTATGTTCCCA 1825

133031496 GAGTAGAAAAGTTAGAAATTTGCTAATCATTGCAAAAGAGCCCTGGTTCCTTTTTTTTTT 133031555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||
     1826 GAGTAGAAAAGTTAGAAATTTGCTAATCATTGCAAAAGAGCCCTGGTTCC---TTTTTTT 1882

133031556 TTTTTTTTTTGAAATTAGTAGTAGAAACCAAGATCTAGTGCTAAAATTTAGGTTGTTTTC 133031615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 TTTTTTTTTTGAAATTAGTAGTAGAAACCAAGATCTAGTGCTAAAATTTAGGTTGTTTTC 1942

133031616 AGTGTTTCTATATTAAAATGTTACTAAGAAACTCTCTTGTAAAAATCTTTGTCTGCATCT 133031675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 AGTGTTTCTATATTAAAATGTTACTAAGAAACTCTCTTGTAAAAATCTTTGTCTGCATCT 2002

133031676 TTGATTGGTTTTTACGTAGGCTTAAGTTCCTTGAAGTGGAATTCTAGGCCATTTTTAACA 133031735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 TTGATTGGTTTTTACGTAGGCTTAAGTTCCTTGAAGTGGAATTCTAGGCCATTTTTAACA 2062

133031736 CACCGAGTGGGGGGACGACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGAATGTTTCAGGAGATTGAACTT 133031795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 CACCGAGTGGGGGGACGACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGAATGTTTCAGGAGATTGAACTT 2122

133031796 CCACCAGAACTGTTTCAGGGGCCCGTTTCAGCACAGCCACCCCCAACACTGGAAATTAAT 133031855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 CCACCAGAACTGTTTCAGGGGCCCGTTTCAGCACAGCCACCCCCAACACTGGAAATTAAT 2182

133031856 ATAAAAACCTTTCTTTTCTAATTCAAAAATGGAAAATGATATCTTCTTGTTTCAATTGCT 133031915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 ATAAAAACCTTTCTTTTCTAATTCAAAAATGGAAAATGATATCTTCTTGTTTCAATTGCT 2242

133031916 AGTGAGGTTCAATATGTCTTTCAAGCGTTCACTAGATATTTTTGGTATGAATTTCTTATT 133031975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 AGTGAGGTTCAATATGTCTTTCAAGCGTTCACTAGATATTTTTGGTATGAATTTCTTATT 2302

133031976 TTGTAAACTGTCAGTTTCTTTGCAAATTTTTTCATGGGAGTTTTAGTGCTTTTATTTTTA 133032035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 TTGTAAACTGTCAGTTTCTTTGCAAATTTTTTCATGGGAGTTTTAGTGCTTTTATTTTTA 2362

133032036 GTTGGAATGAGGACCTTATGTTGATGATGTTATCTGTTTTTTTTTTTGTTGTTGTTTGTT 133032095
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2363 GTTGGAATGAGGACCTTATGTTGATGATGTTATCTG-TTTTTTTTTTGTTGTTGTTTGTT 2421

133032096 TGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGAT 133032155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 TGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGAT 2481

133032156 CTCTGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTG 133032215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 CTCTGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTG 2541

133032216 AGTAGCTGGGACTACAGATGCGTGCCACCACGTCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 133032275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 AGTAGCTGGGACTACAGATGCGTGCCACCACGTCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 2601

133032276 GACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACT 133032335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 GACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACT 2661

133032336 CACCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGCCTTAACT 133032395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 CACCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGCCTTAACT 2721

133032396 GTTTCTTTTTTTTTTTAAGTGTACTTAGTATTTTTCCTGGTTGCTTGTCTTTTAGTATTT 133032455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 GTTTCTTTTTTTTTTTAAGTGTACTTAGTATTTTTCCTGGTTGCTTGTCTTTTAGTATTT 2781

133032456 GTAATTCTTAGAAGTTTTGAAGTTTTAAATGTTTATGTAGAGAAATCTATTG-TTTTTTT 133032514
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     2782 GTAATTCTTAGAAGTTTTGAAGTTTTAAATGTTTATGTAGAGAAATCTATTGTTTTTTTT 2841

133032515 TCTTTGTGATTTCTTCACTTAGGTGCTTATAAAGGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTG 133032574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     2842 TCTTTGTGATTTCTTCACTTAGGTGCTTATAAAGGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT-- 2899

133032575 TTTTTTTTTTTCCCTATCACAAAACCAGTTAGGCAGATTTTCTAGGGTTTGTGTATGTGT 133032634
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 TTTTTTTTTTT-CCTATCACAAAACCAGTTAGGCAGATTTTCTAGGGTTTGTGTATGTGT 2958

133032635 GTGTTTTGTTTTATTTTCCTCTCTTCACATTTAATTCTTCAACTTGAAATTTTAAAAATT 133032694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 GTGTTTTGTTTTATTTTCCTCTCTTCACATTTAATTCTTCAACTTGAAATTTTAAAAATT 3018

133032695 GGTAGGCTGGGCTCAGTGGCTCACACTTGTAATGCCAGTACTTTGGGAGGCTGGGGTGTG 133032754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 GGTAGGCTGGGCTCAGTGGCTCACACTTGTAATGCCAGTACTTTGGGAGGCTGGGGTGTG 3078

133032755 AGGATTGCTTGAGCCCAGGAGGTCAAGGTTGCAGGGAGCTATGATTGTGCCACTGCCCTC 133032814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 AGGATTGCTTGAGCCCAGGAGGTCAAGGTTGCAGGGAGCTATGATTGTGCCACTGCCCTC 3138

133032815 CAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAACAACAACAACAAAAAGAAA 133032874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 CAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAACAACAACAACAAAAAGAAA 3198

133032875 AACAGAAAATCTCAATAAAGTGTGGACTTGGGTTAATAATTATGTATCAATATTTATTTA 133032934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 AACAGAAAATCTCAATAAAGTGTGGACTTGGGTTAATAATTATGTATCAATATTTATTTA 3258

133032935 TTAGTTGTGATAAATGTAGCATAGTAATGTAAGATGTTAATAACATCAGCCTTCTGAGTA 133032994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 TTAGTTGTGATAAATGTAGCATAGTAATGTAAGATGTTAATAACATCAGCCTTCTGAGTA 3318

133032995 GCTGGGACTACAGGTGCACACCACCACACCTGGCTAACTTTTTGTAGAGATGGGGTCTTG 133033054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 GCTGGGACTACAGGTGCACACCACCACACCTGGCTAACTTTTTGTAGAGATGGGGTCTTG 3378

133033055 CTATGTTGCCTAGGCCGATGTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGGTCTTCCTGCCTCTGCCTC 133033114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 CTATGTTGCCTAGGCCGATGTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGGTCTTCCTGCCTCTGCCTC 3438

133033115 CCAAAGCAGGGGAATTACATACATGAGCCACGGTGCCCAGCCTTCCTCAGTTTTTCTTTA 133033174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 CCAAAGCAGGGGAATTACATACATGAGCCACGGTGCCCAGCCTTCCTCAGTTTTTCTTTA 3498

133033175 ATGCCCTTTTTCTGCTCCAGGATCCCATCCAGGATACATTAATTGTGTCTTCTTCAGCTC 133033234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 ATGCCCTTTTTCTGCTCCAGGATCCCATCCAGGATACATTAATTGTGTCTTCTTCAGCTC 3558

133033235 CTCAGGTTGTGAGTTTCTCAGGCTTACTTTCGTTTTGGTGAAATTGACAGTTTTGAGGAA 133033294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 CTCAGGTTGTGAGTTTCTCAGGCTTACTTTCGTTTTGGTGAAATTGACAGTTTTGAGGAA 3618

133033295 TACTGGTCAGCTCTTTTCCCTCAGTCATTATTTGTCTAATGTTTTTTTTCCAGTTAGACT 133033354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 TACTGGTCAGCTCTTTTCCCTCAGTCATTATTTGTCTAATGTTTTTTTTCCAGTTAGACT 3678

133033355 GGGTAATGTTTTGGGAGGAAGACCCAGCATTAAAATACCATTCTCATCGTCTCATATCAA 133033414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 GGGTAATGTTTTGGGAGGAAGACCCAGCATTAAAATACCATTCTCATCGTCTCATATCAA 3738

133033415 GAGCACACGCTATCACGGTGATGGAACGCTGTTGATGTTAAGCTTGATTGCCTGACTCGG 133033474
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 GAGCACACGCTATCACAGTGATGGAACGCTGTTGATGTTAAGCTTGATTGCCTGACTCGG 3798

133033475 ATAGTATTTTTCAGATTTCTCCACTATAGAGTTACTCTTTTTCCCCTCTCTCTTTCCATA 133033534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 ATAGTATTTTTCAGATTTCTCCACTATAGAGTTACTCTTTTTCCCCTCTCTCTTTCCATA 3858

133033535 CTGGGCTCTCTGGAAGAGAGTCACTTACTGTGTGCAGCCCACGTTTAAAAAGCGGGGAGC 133033594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 CTGGGCTCTCTGGAAGAGAGTCACTTACTGTGTGCAGCCCACGTTTAAAAAGCGGGGAGC 3918

133033595 CATGATCCACGTCCTTGGTGGGGGAGTATCTATCTACATGGATTATTTGGAATTATTCTG 133033654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 CATGATCCACGTCCTTGGTGGGGGAGTATCTATCTACATGGATTATTTGGAATTATTCTG 3978

133033655 CATGAGAGTTGTCTCTTCTGCTCCATTTATTAATTAATTCAATCACTTGTCTACATCAGC 133033714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 CATGAGAGTTGTCTCTTCTGCTCCATTTATTAATTAATTCAATCACTTGTCTACATCAGC 4038

133033715 ATAGAATCATGGCTAGCTATTTTATACTTTGTGTTATGATCCTAAACCACTTTATTTTGC 133033774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 ATAGAATCATGGCTAGCTATTTTATACTTTGTGTTATGATCCTAAACCACTTTATTTTGC 4098

133033775 TCCTCAAATGTTTCTGACTGTGGTCATCGGGAGCTCGTTCAGTTGGTTTCTGTGTCCCTT 133033834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 TCCTCAAATGTTTCTGACTGTGGTCATCGGGAGCTCGTTCAGTTGGTTTCTGTGTCCCTT 4158

133033835 GGACACCCCTCTTGTTGTGCACGTGTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCGTTTTTCCC 133033894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 GGACACCCCTCTTGTTGTGCACGTGTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCGTTTTTCCC 4218

133033895 ACATTCCTACTTTTTGGCACTGGTAGTGGCTCCAGGCTCATCTTAGGTATTTCCTGCCTC 133033954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 ACATTCCTACTTTTTGGCACTGGTAGTGGCTCCAGGCTCATCTTAGGTATTTCCTGCCTC 4278

133033955 AGTCCTTGAATTCGCTATTTCTCCAAGGAGCCCTGCTTCCTGTGATTGGAAACCAGGATA 133034014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 AGTCCTTGAATTCGCTATTTCTCCAAGGAGCCCTGCTTCCTGTGATTGGAAACCAGGATA 4338

133034015 TCCGTGCTAAGTGTGTTTGTTGGTACTGAGGTGCTGTTACTTCTAAAACCTCCCTTAGCT 133034074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 TCCGTGCTAAGTGTGTTTGTTGGTACTGAGGTGCTGTTACTTCTAAAACCTCCCTTAGCT 4398

133034075 GACAGGGCAAGGAGTTGTATGTTGTATATATAACCTGTGTTTGTACTTGTATCTATACAT 133034134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 GACAGGGCAAGGAGTTGTATGTTGTATATATAACCTGTGTTTGTACTTGTATCTATACAT 4458

133034135 AGTTTTATATGTAATCATCCGTGTCTATATTAAGCTAAACATGAGTTCATGCTGATATCT 133034194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 AGTTTTATATGTAATCATCCGTGTCTATATTAAGCTAAACATGAGTTCATGCTGATATCT 4518

133034195 TCAACTCTAATTTATATTCGATATTGGATTAGATGTATTAGGTATATGGAGAGTCAAACC 133034254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 TCAACTCTAATTTATATTCGATATTGGATTAGATGTATTAGGTATATGGAGAGTCAAACC 4578

133034255 TCTTCCTGTTCCTTATCTAGAACCTCCACGTCTAACAGTCAGAAATCTGTCTCCTGCCAC 133034314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 TCTTCCTGTTCCTTATCTAGAACCTCCACGTCTAACAGTCAGAAATCTGTCTCCTGCCAC 4638

133034315 CCACCATCCCTTTACTTTACTGTTTAGTTCCAGTATACATTTAAAGTGGTTTCAGAATTG 133034374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 CCACCATCCCTTTACTTTACTGTTTAGTTCCAGTATACATTTAAAGTGGTTTCAGAATTG 4698

133034375 TTGAGTGGGACCCCCACGGGAAACAGCTTTATTAACTAGAATACAGTTCTTTTGCTTTTA 133034434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 TTGAGTGGGACCCCCACGGGAAACAGCTTTATTAACTAGAATACAGTTCTTTTGCTTTTA 4758

133034435 GTCTTAACAGACTCCATTCATTTCCAAAATTACTTAGGCCAACACCTTCTTCAGCTTCTT 133034494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 GTCTTAACAGACTCCATTCATTTCCAAAATTACTTAGGCCAACACCTTCTTCAGCTTCTT 4818

133034495 CTTCTTTTTTAAAAAAAATAAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGAATCTCACCT 133034554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 CTTCTTTTTTAAAAAAAATAAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGAATCTCACCT 4878

133034555 TGTCTCCCAGGCTGGAATACAGTGGCGCAATCTTGGCCCACTGCAACCTCCACCTCCTGG 133034614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 TGTCTCCCAGGCTGGAATACAGTGGCGCAATCTTGGCCCACTGCAACCTCCACCTCCTGG 4938

133034615 GTTTAAGGAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTTAGTAGCTGGGATTACAGATGTGTGCCACC 133034674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 GTTTAAGGAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTTAGTAGCTGGGATTACAGATGTGTGCCACC 4998

133034675 ATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTG 133034734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 ATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTG 5058

133034735 GTCTTGAACTCCTGACCTCAAAGGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTCCTGGGATTA 133034794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 GTCTTGAACTCCTGACCTCAAAGGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTCCTGGGATTA 5118

133034795 CAGGTGTGAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGT 133034854
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 CAGATGTGAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGT 5178

133034855 CTCATTCTGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCAT 133034914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 CTCATTCTGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCAT 5238

133034915 CTCCCCAAGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACA 133034974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 CTCCCCAAGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACA 5298

133034975 TGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTG 133035034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 TGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTG 5358

133035035 CCATATTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTC 133035094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 CCATATTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTC 5418

133035095 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATT 133035154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATT 5478

133035155 CATATTCTTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAA 133035214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 CATATTCTTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAA 5538

133035215 ACTTGTCAACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCT 133035274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 ACTTGTCAACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCT 5598

133035275 TGATTTTGGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATG 133035334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 TGATTTTGGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATG 5658

133035335 CCTCTTGTTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAG 133035394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 CCTCTTGTTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAG 5718

133035395 ATTCAGGTTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATTTTAAGATAG 133035454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     5719 ATTCAGGTTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATCTTAAGATAG 5778

133035455 TTTTGGTTTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGT 133035514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 TTTTGGTTTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGT 5838

133035515 ATTGCTAGTATGTTGGAAAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGCTTCTTTT 133035574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 ATTGCTAGTATGTTGGAAAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGCTTCTTTT 5898

133035575 ACTAAAGTTTTTTTTAACTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCTAGGTTGA 133035634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 ACTAAAGTTTTTTTTAACTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCTAGGTTGA 5958

133035635 GAGTCACAGCTTGTCCAAATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATATTTCACGT 133035694
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 GAGCCACAGCTTGTCCAAATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATATTTCACGT 6018

133035695 TTTAAGTGTTTTGTATTATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATAATGGTGA 133035754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 TTTAAGTGTTTTGTATTATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATAATGGTGA 6078

133035755 TGGCTGCAGTTATCTTGTCTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTCT 133035814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 TGGCTGCAGTTATCTTGTCTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTCT 6138

133035815 TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCAGGCT 133035874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCAGGCT 6198

133035875 CAAGCGATTCTCTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTATTATAGGCATGCGCCACCATG 133035934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6199 CAAGCGATTCTCTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTATTATAGGCATGCGCCACCATG 6258

133035935 CCCAGCTAATTTTCGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTC 133035994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 CCCAGCTAATTTTCGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTC 6318

133035995 CCAAACTCCTGACCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 133036054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 CCAAACTCCTGACCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 6378

133036055 GCGTGCGCCTCCGCGCCCGGCCATCTTGTCTTGCTTTTGATTTTGCACCACTCATTGTAT 133036114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 GCGTGCGCCTCCGCGCCCGGCCATCTTGTCTTGCTTTTGATTTTGCACCACTCATTGTAT 6438

133036115 GATATTGATTCTTGGTTTGAGTTTTTGTCATCAAGTGAAAGAAGATGCATTCATTCCTAA 133036174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 GATATTGATTCTTGGTTTGAGTTTTTGTCATCAAGTGAAAGAAGATGCATTCATTCCTAA 6498

133036175 TTTTACTAAAAAAAAATAAACTCAAAAAACAAGAAAAAGCAAAAACAAAACAAAAAATCC 133036234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 TTTTACTAAAAAAAAATAAACTCAAAAAACAAGAAAAAGCAAAAACAAAACAAAAAATCC 6558

133036235 AAACAGGGATGGGTGTTGAATTTTAGCAAGTGATTTTCTGCTTTGTTGCAATGTTTATAA 133036294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 AAACAGGGATGGGTGTTGAATTTTAGCAAGTGATTTTCTGCTTTGTTGCAATGTTTATAA 6618

133036295 GATCCTTCTCCTGTTGACCTATTAATGTGATACATTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAC 133036354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 GATCCTTCTCCTGTTGACCTATTAATGTGATACATTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGAGAC 6678

133036355 GGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGACTCACTGCAGCT 133036414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6679 GGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGACTCACTGCAGCT 6738

133036415 TCCACCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGACTACAG 133036474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6739 TCCACCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGACTACAG 6798

133036475 GTGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTAT 133036534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6799 GTGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTAT 6858

133036535 ATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCC 133036594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6859 ATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCC 6918

133036595 AAAGTACTGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAATGCGTTAATTTTCAACTA 133036654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6919 AAAGTACTGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAATGCGTTAATTTTCAACTA 6978

133036655 TTTTTGCATTTCTTGCATAAGTCCTGCTTGGTCACGGTGGATTATTCTTTAATATACAGC 133036714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6979 TTTTTGCATTTCTTGCATAAGTCCTGCTTGGTCACGGTGGATTATTCTTTAATATACAGC 7038

133036715 TGGATGATAGTTTCCAGCATTTTGCTTAGAGGTTTTGCCTTTTTCCATTTCATGTGTGCA 133036774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7039 TGGATGATAGTTTCCAGCATTTTGCTTAGAGGTTTTGCCTTTTTCCATTTCATGTGTGCA 7098

133036775 ATCAGTAAGTGGTGTTTTTCCTTTGTGTTTTTTGTCAAGTTTTACCATCAGGGTTTAGCT 133036834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7099 ATCAGTAAGTGGTGTTTTTCCTTTGTGTTTTTTGTCAAGTTTTACCATCAGGGTTTAGCT 7158

133036835 TTTTCAGTTAATAATCCATTCCCTTCAAGAATCTCAAAATTAATACATGCTTGTAAAATA 133036894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7159 TTTTCAGTTAATAATCCATTCCCTTCAAGAATCTCAAAATTAATACATGCTTGTAAAATA 7218

133036895 TTCTACTACTACTCTCAAGAGGTGAAAACACTTTTAACACTCTGGTGTCCTTCCAGATCT 133036954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7219 TTCTACTACTACTCTCAAGAGGTGAAAACACTTTTAACACTCTGGTGTCCTTCCAGATCT 7278

133036955 TGTGTGCATGTATGTGTATACATTCACTCGTGTTAAACATACCTACGTTAAAAAATTATA 133037014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7279 TGTGTGCATGTATGTGTATACATTCACTCGTGTTAAACATACCTACGTTAAAAAATTATA 7338

133037015 GTACGTAAAGCATTTTACAACTTGCTTTCTTCCCCCCACATAATATGGCATGAATATCTC 133037074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7339 GTACGTAAAGCATTTTACAACTTGCTTTCTTCCCCCCACATAATATGGCATGAATATCTC 7398

133037075 TTCCTGTCAGGAAACAGAGATCCTCCCCATTGTTTTTAATGACTCTATAAGATGCCATTG 133037134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7399 TTCCTGTCAGGAAACAGAGATCCTCCCCATTGTTTTTAATGACTCTATAAGATGCCATTG 7458

133037135 GAGGAATTAGCCTAATTTACCCACCCATCCCCCTACTGTGGAAAATAGGCTGCTTTCAGT 133037194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7459 GAGGAATTAGCCTAATTTACCCACCCATCCCCCTACTGTGGAAAATAGGCTGCTTTCAGT 7518

133037195 TTCTTCACAATAAACACACACATATTTGCAAACATATCTACAGAATAGATTCCCAGAGAT 133037254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7519 TTCTTCACAATAAACACACACATATTTGCAAACATATCTACAGAATAGATTCCCAGAGAT 7578

133037255 AAAATTGCTTTGTTAAAGTATAGGAGCATTTTCCATTTGGAAAGACACCATCCAACTGCC 133037314
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7579 AAAATTGCTTTGTTAAAGCATAGGAGCATTTTCCATTTGGAAAGACACCATCCAACTGCC 7638

133037315 CTCAAACACACTGCGCCATCTTGCGCCTGGACCCACGGAAGATGAGACTGTGTTTCCCCA 133037374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7639 CTCAAACACACTGCGCCATCTTGCGCCTGGACCCACGGAAGATGAGACTGTGTTTCCCCA 7698

133037375 CACCGCC----GCCAGCATCCGGGACATCACTCTGCCATTTTTTCCTTGT 133037420
          |||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7699 CAC----ACCTGCCAGCATCCGGGACATCACTCTGCCATTTTTTCCTTGT 7744

Alignment time is 10.8548 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [133020642,133044801] =>     24160 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     4265] =>      4265 nucs 'mol-32-1f21-125876_4265'

Score:        4249
Aligned:      4270        nucs
Identic:      4264 (100%) nucs =>      1218 (100%)      3046 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [133029419,133030642] EXCISED REGION [133034802,133037847]
 second seq =>  [        1,     1218] EXCISED REGION [     1220,     4265]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4159 nucs [133030643,133034801]
 second seq =>         1 nucs [1219,1219]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [133030643,133030646] to [133034802,133034805]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

133029419 CTCTCTGTATTGCCCAGGCTAGTCTCAAACTCCTGGCCTCAGTGATCCTCCCACTTAGGC 133029478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCTCTGTATTGCCCAGGCTAGTCTCAAACTCCTGGCCTCAGTGATCCTCCCACTTAGGC 60

133029479 CTCCCAAAGTGCTGAAATTACAAGCATGAGCCACTGCACCCAGCCTCCCCAGCGTTTTTT 133029538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCCCAAAGTGCTGAAATTACAAGCATGAGCCACTGCACCCAGCCTCCCCAGCGTTTTTT 120

133029539 AATGGAAAATTTCAAACTTACAGTAAAATGGGGAGAAACATACATGGAACCGCCTATGCC 133029598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATGGAAAATTTCAAACTTACAGTAAAATGGGGAGAAACATACATGGAACCGCCTATGCC 180

133029599 CACCGAGAGCCTCTGAGTCATATTTTGCTTTATCACATCTCTCTATCATTCACCCCTCTG 133029658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACCGAGAGCCTCTGAGTCATATTTTGCTTTATCACATCTCTCTATCATTCACCCCTCTG 240

133029659 TCAAGGATAGCTTTATAAAGCAACAAACAAACAAACAAACAACCCCCCCAAATAAAACAC 133029718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCAAGGATAGCTTTATAAAGCAACAAACAAACAAACAAACAACCCCCCCAAATAAAACAC 300

133029719 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCACAGATTCCTTGCTAAATTG 133029778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||
      301 ACACACACACACACACACACACACACACACAC------GCACAGATTCCTTGCTAAATTG 354

133029779 TACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGTGGCCATTGGCTGTATGAGCCAGC 133029838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      355 TACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGTGGCCATTGGCTGTATGAGCCAGC 414

133029839 AAGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAATACCATTACAGGTTCTTAGAAAA 133029898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      415 AAGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAATACCATTACAGGTTCTTAGAAAA 474

133029899 TGGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGCTTCAGGCTGAGTTTGTGGTCTAG 133029958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      475 TGGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGCTTCAGGCTGAGTTTGTGGTCTAG 534

133029959 GGGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGCACCACAGGGTTTTGCAGCTCAAA 133030018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      535 GGGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGCACCACAGGGTTTTGCAGCTCAAA 594

133030019 GCTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGAACATCAGATGGACAGCTTCTATC 133030078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      595 GCTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGAACATCAGATGGACAGCTTCTATC 654

133030079 TTGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGGAGGTGGGCTGTGAAGTGTGTTCT 133030138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      655 TTGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGGAGGTGGGCTGTGAAGTGTGTTCT 714

133030139 GGCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCCCCAGCTCTCTCACCCACTTTCTG 133030198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 GGCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCCCCAGCTCTCTCACCCACTTTCTG 774

133030199 AATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGGAGCTTAGAGATCGTTGAATCTAC 133030258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 AATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGGAGCTTAGAGATCGTTGAATCTAC 834

133030259 CCCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGACACTGATGAGACTTTCCCAAGGC 133030318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 CCCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGACACTGATGAGACTTTCCCAAGGC 894

133030319 CACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCCACATTTGTCTCTGAAATATGTGG 133030378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 CACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCCACATTTGTCTCTGAAATATGTGG 954

133030379 CTCCAGTGGCCCAGCAGGATAGCAGCCTTTCAGAGCCAGATGTCGTGTCCTGAAGCCCAG 133030438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 CTCCAGTGGCCCAGCAGGATAGCAGCCTTTCAGAGCCAGATGTCGTGTCCTGAAGCCCAG 1014

133030439 ACCAGGGTTCCTGAGACTGTCCTCGCTGCCCCATTTGTGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCC 133030498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 ACCAGGGTTCCTGAGACTGTCCTCGCTGCCCCATTTGTGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCC 1074

133030499 ACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCACTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCA 133030558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 ACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCACTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCA 1134

133030559 GCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTATGAAACAAAAATCCAGTTCTCCA 133030618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 GCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTATGAAACAAAAATCCAGTTCTCCA 1194

133030619 TCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCC 133030642
          ||||||||||||||||||||||||
     1195 TCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCC 1218

EXCISED REGION

133034802 GAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGTCTCATTC 133034861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 GAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGTCTCATTC 1279

133034862 TGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCATCTCCCCA 133034921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 TGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCATCTCCCCA 1339

133034922 AGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGCCACC 133034981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 AGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGCCACC 1399

133034982 ACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTGCCATATT 133035041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 ACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTGCCATATT 1459

133035042 GCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGT 133035101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 GCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGT 1519

133035102 GCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATTCATATTC 133035161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 GCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATTCATATTC 1579

133035162 TTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAAACTTGTC 133035221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 TTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAAACTTGTC 1639

133035222 AACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCTTGATTTT 133035281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 AACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCTTGATTTT 1699

133035282 GGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATGCCTCTTG 133035341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 GGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATGCCTCTTG 1759

133035342 TTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAGATTCAGG 133035401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 TTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAGATTCAGG 1819

133035402 TTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATTTTAAGATAGTTTTGGT 133035461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 TTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATTTTAAGATAGTTTTGGT 1879

133035462 TTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGTATTGCTA 133035521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 TTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGTATTGCTA 1939

133035522 GTATGTTGGAAAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGCTTCTTTTACTAAAG 133035581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 GTATGTTGGAAAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGCTTCTTTTACTAAAG 1999

133035582 TTTTTTTTAACTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCTAGGTTGAGAGTCAC 133035641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 TTTTTTTTAACTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCTAGGTTGAGAGTCAC 2059

133035642 AGCTTGTCCAAATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATATTTCACGTTTTAAGT 133035701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 AGCTTGTCCAAATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATATTTCACGTTTTAAGT 2119

133035702 GTTTTGTATTATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATAATGGTGATGGCTGC 133035761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 GTTTTGTATTATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATAATGGTGATGGCTGC 2179

133035762 AGTTATCTTGTCTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTCTTGCCCAG 133035821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 AGTTATCTTGTCTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTCTTGCCCAG 2239

133035822 GCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCAGGCTCAAGCGA 133035881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 GCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCAGGCTCAAGCGA 2299

133035882 TTCTCTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTATTATAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCT 133035941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 TTCTCTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTATTATAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCT 2359

133035942 AATTTTCGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCCCAAACT 133036001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 AATTTTCGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCCCAAACT 2419

133036002 CCTGACCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGCG 133036061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 CCTGACCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGCG 2479

133036062 CCTCCGCGCCCGGCCATCTTGTCTTGCTTTTGATTTTGCACCACTCATTGTATGATATTG 133036121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 CCTCCGCGCCCGGCCATCTTGTCTTGCTTTTGATTTTGCACCACTCATTGTATGATATTG 2539

133036122 ATTCTTGGTTTGAGTTTTTGTCATCAAGTGAAAGAAGATGCATTCATTCCTAATTTTACT 133036181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 ATTCTTGGTTTGAGTTTTTGTCATCAAGTGAAAGAAGATGCATTCATTCCTAATTTTACT 2599

133036182 AAAAAAAAATAAACTCAAAAAACAAGAAAAAGCAAAAACAAAACAAAAAATCCAAACAGG 133036241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 AAAAAAAAATAAACTCAAAAAACAAGAAAAAGCAAAAACAAAACAAAAAATCCAAACAGG 2659

133036242 GATGGGTGTTGAATTTTAGCAAGTGATTTTCTGCTTTGTTGCAATGTTTATAAGATCCTT 133036301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 GATGGGTGTTGAATTTTAGCAAGTGATTTTCTGCTTTGTTGCAATGTTTATAAGATCCTT 2719

133036302 CTCCTGTTGACCTATTAATGTGATACATTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGAGACGGAGTCT 133036361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 CTCCTGTTGACCTATTAATGTGATACATTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGAGACGGAGTCT 2779

133036362 CACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGACTCACTGCAGCTTCCACCT 133036421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 CACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGACTCACTGCAGCTTCCACCT 2839

133036422 CCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCA 133036481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 CCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCA 2899

133036482 CCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATATGTTGG 133036541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 CCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATATGTTGG 2959

133036542 CTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTAC 133036601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 CTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTAC 3019

133036602 TGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAATGCGTTAATTTTCAACTATTTTTGC 133036661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 TGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAATGCGTTAATTTTCAACTATTTTTGC 3079

133036662 ATTTCTTGCATAAGTCCTGCTTGGTCACGGTGGATTATTCTTTAATATACAGCTGGATGA 133036721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 ATTTCTTGCATAAGTCCTGCTTGGTCACGGTGGATTATTCTTTAATATACAGCTGGATGA 3139

133036722 TAGTTTCCAGCATTTTGCTTAGAGGTTTTGCCTTTTTCCATTTCATGTGTGCAATCAGTA 133036781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 TAGTTTCCAGCATTTTGCTTAGAGGTTTTGCCTTTTTCCATTTCATGTGTGCAATCAGTA 3199

133036782 AGTGGTGTTTTTCCTTTGTGTTTTTTGTCAAGTTTTACCATCAGGGTTTAGCTTTTTCAG 133036841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 AGTGGTGTTTTTCCTTTGTGTTTTTTGTCAAGTTTTACCATCAGGGTTTAGCTTTTTCAG 3259

133036842 TTAATAATCCATTCCCTTCAAGAATCTCAAAATTAATACATGCTTGTAAAATATTCTACT 133036901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 TTAATAATCCATTCCCTTCAAGAATCTCAAAATTAATACATGCTTGTAAAATATTCTACT 3319

133036902 ACTACTCTCAAGAGGTGAAAACACTTTTAACACTCTGGTGTCCTTCCAGATCTTGTGTGC 133036961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 ACTACTCTCAAGAGGTGAAAACACTTTTAACACTCTGGTGTCCTTCCAGATCTTGTGTGC 3379

133036962 ATGTATGTGTATACATTCACTCGTGTTAAACATACCTACGTTAAAAAATTATAGTACGTA 133037021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 ATGTATGTGTATACATTCACTCGTGTTAAACATACCTACGTTAAAAAATTATAGTACGTA 3439

133037022 AAGCATTTTACAACTTGCTTTCTTCCCCCCACATAATATGGCATGAATATCTCTTCCTGT 133037081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 AAGCATTTTACAACTTGCTTTCTTCCCCCCACATAATATGGCATGAATATCTCTTCCTGT 3499

133037082 CAGGAAACAGAGATCCTCCCCATTGTTTTTAATGACTCTATAAGATGCCATTGGAGGAAT 133037141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 CAGGAAACAGAGATCCTCCCCATTGTTTTTAATGACTCTATAAGATGCCATTGGAGGAAT 3559

133037142 TAGCCTAATTTACCCACCCATCCCCCTACTGTGGAAAATAGGCTGCTTTCAGTTTCTTCA 133037201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 TAGCCTAATTTACCCACCCATCCCCCTACTGTGGAAAATAGGCTGCTTTCAGTTTCTTCA 3619

133037202 CAATAAACACACACATATTTGCAAACATATCTACAGAATAGATTCCCAGAGATAAAATTG 133037261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 CAATAAACACACACATATTTGCAAACATATCTACAGAATAGATTCCCAGAGATAAAATTG 3679

133037262 CTTTGTTAAAGTATAGGAGCATTTTCCATTTGGAAAGACACCATCCAACTGCCCTCAAAC 133037321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 CTTTGTTAAAGTATAGGAGCATTTTCCATTTGGAAAGACACCATCCAACTGCCCTCAAAC 3739

133037322 ACACTGCGCCATCTTGCGCCTGGACCCACGGAAGATGAGACTGTGTTTCCCCACACCGCC 133037381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 ACACTGCGCCATCTTGCGCCTGGACCCACGGAAGATGAGACTGTGTTTCCCCACACCGCC 3799

133037382 GCCAGCATCCGGGACATCACTCTGCCATTTTTTCCTTGTTTTTTTGCTAGTTTCCTAGGT 133037441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 GCCAGCATCCGGGACATCACTCTGCCATTTTTTCCTTGTTTTTTTGCTAGTTTCCTAGGT 3859

133037442 GGGAGATGGTGTCCTGCCTTAATCAGCATTCATTGATCGTTGGTGACCTTCCAGTCTTCT 133037501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 GGGAGATGGTGTCCTGCCTTAATCAGCATTCATTGATCGTTGGTGACCTTCCAGTCTTCT 3919

133037502 GGAGTTTCTCCCTGGGTGTCTCTGGGGCTCCTGCGGCTCCATCATCTTTCCCAAGGGAGG 133037561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 GGAGTTTCTCCCTGGGTGTCTCTGGGGCTCCTGCGGCTCCATCATCTTTCCCAAGGGAGG 3979

133037562 AAGTGGCTTTCGCCGGTCAGAGGTGAGGATGCAGGCGTGCAGAGCAGATGTGTTTGGGCC 133037621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 AAGTGGCTTTCGCCGGTCAGAGGTGAGGATGCAGGCGTGCAGAGCAGATGTGTTTGGGCC 4039

133037622 ACACACTTGCCTGGGAGCTGGAACGGCTGGGACTCTGGTTGCATGTTCCGGGTTGTGTGT 133037681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 ACACACTTGCCTGGGAGCTGGAACGGCTGGGACTCTGGTTGCATGTTCCGGGTTGTGTGT 4099

133037682 GTGTACCTGTGATTTTTATTGTCACCCTGAGTGACATTGCTATTTTTATTTTTTAATTTA 133037741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 GTGTACCTGTGATTTTTATTGTCACCCTGAGTGACATTGCTATTTTTATTTTTTAATTTA 4159

133037742 TTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATTGTCT 133037801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4160 TTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATTGTCT 4219

133037802 CATTGCAACCCCTGCTTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAG 133037847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 CATTGCAACCCCTGCTTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAG 4265

Alignment time is 6.21936 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [133020642,133044801] =>     24160 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     2731] =>      2731 nucs 'mol-32-208c-106249_2731'

Score:        2697
Aligned:      2730        nucs
Identic:      2727 (100%) nucs =>       410 (100%)      2317 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [133033021,133033430] EXCISED REGION [133033432,133035751]
 second seq =>  [        1,      410] EXCISED REGION [      412,     2731]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [133033431,133033431]
 second seq =>         1 nucs [411,411]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [133033431,133033431] to [133033432,133033432]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

133033021 CACCTGGCTAACTTTTTGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCTAGGCCGATGTCAAAC 133033080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACCTGGCTAACTTTTTGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGCCTAGGCCGATGTCAAAC 60

133033081 TCCTGGCCTCAAGTGGTCTTCCTGCCTCTGCCTCCCAAAGCAGGGGAATTACATACATGA 133033140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCTGGCCTCAAGTGGTCTTCCTGCCTCTGCCTCCCAAAGCAGGGGAATTACATACATGA 120

133033141 GCCACGGTGCCCAGCCTTCCTCAGTTTTTCTTTAATGCCCTTTTTCTGCTCCAGGATCCC 133033200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCACGGTGCCCAGCCTTCCTCAGTTTTTCTTTAATGCCCTTTTTCTGCTCCAGGATCCC 180

133033201 ATCCAGGATACATTAATTGTGTCTTCTTCAGCTCCTCAGGTTGTGAGTTTCTCAGGCTTA 133033260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCCAGGATACATTAATTGTGTCTTCTTCAGCTCCTCAGGTTGTGAGTTTCTCAGGCTTA 240

133033261 CTTTCGTTTTGGTGAAATTGACAGTTTTGAGGAATACTGGTCAGCTCTTTTCCCTCAGTC 133033320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTCGTTTTGGTGAAATTGACAGTTTTGAGGAATACTGGTCAGCTCTTTTCCCTCAGTC 300

133033321 ATTATTTGTCTAATGTTTTTTTTCCAGTTAGACTGGGTAATGTTTTGGGAGGAAGACCCA 133033380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTATTTGTCTAATGTTTTTTTTCCAGTTAGACTGGGTAATGTTTTGGGAGGAAGACCCA 360

133033381 GCATTAAAATACCATTCTCATCGTCTCATATCAAGAGCACACGCTATCAC 133033430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATTAAAATACCATTCTCATCGTCTCATATCAAGAGCACACGCTATCAC 410

EXCISED REGION

133033432 GTGATGGAACGCTGTTGATGTTAAGCTTGATTGCCTGACTCGGATAGTATTTTTCAGATT 133033491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      412 GTGATGGAACGCTGTTGATGTTAAGCTTGATTGCCTGACTCGGATAGTATTTTTCAGATT 471

133033492 TCTCCACTATAGAGTTACTCTTTTTCCCCTCTCTCTTTCCATACTGGGCTCTCTGGAAGA 133033551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      472 TCTCCACTATAGAGTTACTCTTTTTCCCCTCTCTCTTTCCATACTGGGCTCTCTGGAAGA 531

133033552 GAGTCACTTACTGTGTGCAGCCCACGTTTAAAAAGCGGGGAGCCATGATCCACGTCCTTG 133033611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      532 GAGTCACTTACTGTGTGCAGCCCACGTTTAAAAAGCGGGGAGCCATGATCCACGTCCTTG 591

133033612 GTGGGGGAGTATCTATCTACATGGATTATTTGGAATTATTCTGCATGAGAGTTGTCTCTT 133033671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 GTGGGGGAGTATCTATCTACATGGATTATTTGGAATTATTCTGCATGAGAGTTGTCTCTT 651

133033672 CTGCTCCATTTATTAATTAATTCAATCACTTGTCTACATCAGCATAGAATCATGGCTAGC 133033731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      652 CTGCTCCATTTATTAATTAATTCAATCACTTGTCTACATCAGCATAGAATCATGGCTAGC 711

133033732 TATTTTATACTTTGTGTTATGATCCTAAACCACTTTATTTTGCTCCTCAAATGTTTCTGA 133033791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 TATTTTATACTTTGTGTTATGATCCTAAACCACTTTATTTTGCTCCTCAAATGTTTCTGA 771

133033792 CTGTGGTCATCGGGAGCTCGTTCAGTTGGTTTCTGTGTCCCTTGGACACCCCTCTTGTTG 133033851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 CTGTGGTCATCGGGAGCTCGTTCAGTTGGTTTCTGTGTCCCTTGGACACCCCTCTTGTTG 831

133033852 TGCACGTGTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCGTTTTTCCCACATTCCTACTTTTTGG 133033911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 TGCACGTGTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCGTTTTTCCCACATTCCTACTTTTTGG 891

133033912 CACTGGTAGTGGCTCCAGGCTCATCTTAGGTATTTCCTGCCTCAGTCCTTGAATTCGCTA 133033971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 CACTGGTAGTGGCTCCAGGCTCATCTTAGGTATTTCCTGCCTCAGTCCTTGAATTCGCTA 951

133033972 TTTCTCCAAGGAGCCCTGCTTCCTGTGATTGGAAACCAGGATATCCGTGCTAAGTGTGTT 133034031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 TTTCTCCAAGGAGCCCTGCTTCCTGTGATTGGAAACCAGGATATCCGTGCTAAGTGTGTT 1011

133034032 TGTTGGTACTGAGGTGCTGTTACTTCTAAAACCTCCCTTAGCTGACAGGGCAAGGAGTTG 133034091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 TGTTGGTACTGAGGTGCTGTTACTTCTAAAACCTCCCTTAGCTGACAGGGCAAGGAGTTG 1071

133034092 TATGTTGTATATATAACCTGTGTTTGTACTTGTATCTATACATAGTTTTATATGTAATCA 133034151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 TATGTTGTATATATAACCTGTGTTTGTACTTGTATCTATACATAGTTTTATATGTAATCA 1131

133034152 TCCGTGTCTATATTAAGCTAAACATGAGTTCATGCTGATATCTTCAACTCTAATTTATAT 133034211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 TCCGTGTCTATATTAAGCTAAACATGAGTTCATGCTGATATCTTCAACTCTAATTTATAT 1191

133034212 TCGATATTGGATTAGATGTATTAGGTATATGGAGAGTCAAACCTCTTCCTGTTCCTTATC 133034271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 TCGATATTGGATTAGATGTATTAGGTATATGGAGAGTCAAACCTCTTCCTGTTCCTTATC 1251

133034272 TAGAACCTCCACGTCTAACAGTCAGAAATCTGTCTCCTGCCACCCACCATCCCTTTACTT 133034331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 TAGAACCTCCACGTCTAACAGTCAGAAATCTGTCTCCTGCCACCCACCATCCCTTTACTT 1311

133034332 TACTGTTTAGTTCCAGTATACATTTAAAGTGGTTTCAGAATTGTTGAGTGGGACCCCCAC 133034391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 TACTGTTTAGTTCCAGTATACATTTAAAGTGGTTTCAGAATTGTTGAGTGGGACCCCCAC 1371

133034392 GGGAAACAGCTTTATTAACTAGAATACAGTTCTTTTGCTTTTAGTCTTAACAGACTCCAT 133034451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 GGGAAACAGCTTTATTAACTAGAATACAGTTCTTTTGCTTTTAGTCTTAACAGACTCCAT 1431

133034452 TCATTTCCAAAATTACTTAGGCCAACACCTTCTTCAGCTTCTTCTTCTTTTTTAAAAAAA 133034511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 TCATTTCCAAAATTACTTAGGCCAACACCTTCTTCAGCTTCTTCTTCTTTTTTAAAAAAA 1491

133034512 ATAAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGAATCTCACCTTGTCTCCCAGGCTGGAA 133034571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 ATAAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGAATCTCACCTTGTCTCCCAGGCTGGAA 1551

133034572 TACAGTGGCGCAATCTTGGCCCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTTAAGGAATTCTCCT 133034631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 TACAGTGGCGCAATCTTGGCCCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTTAAGGAATTCTCCT 1611

133034632 GCCTCAGCCTTCTTAGTAGCTGGGATTACAGATGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTT 133034691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 GCCTCAGCCTTCTTAGTAGCTGGGATTACAGATGTGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTT 1671

133034692 GTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACC 133034751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 GTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACC 1731

133034752 TCAAAGGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTCCTGGGATTACAGGTGTGAGTCACCAT 133034811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1732 TCAAAGGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTCCTGGGATTACAGATGTGAGTCACCAT 1791

133034812 GCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGTCTCATTCTGTTGCCCAG 133034871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 GCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGTCTCATTCTGTTGCCCAG 1851

133034872 GCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCATCTCCCCAAGCTCAGGTG 133034931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 GCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCATCTCCCCAAGCTCAGGTG 1911

133034932 ATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGCCACCACACCTGGCT 133034991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 ATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGCCACCACACCTGGCT 1971

133034992 AATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGTTG 133035051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 AATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGTTG 2031

133035052 GTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 133035111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 GTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 2091

133035112 CAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATTCATATTCTTCATTTGCA 133035171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 CAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATTCATATTCTTCATTTGCA 2151

133035172 AAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAAACTTGTCAACTTCCAAA 133035231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 AAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAAACTTGTCAACTTCCAAA 2211

133035232 AATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCTTGATTTTGGGGAAGAGT 133035291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 AATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCTTGATTTTGGGGAAGAGT 2271

133035292 TATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATGCCTCTTGTTCTGTTCAC 133035351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 TATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATGCCTCTTGTTCTGTTCAC 2331

133035352 ATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAGATTCAGGTTTTTTTTCT 133035411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 ATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAGATTCAGGTTTTTTTTCT 2391

133035412 CATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATTTTAAGATAGTTTTGGTTTTGTTACTA 133035471
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2392 CATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATCTTAAGATAGTTTTGGTTTTGTTACTA 2451

133035472 TTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGTATTGCTAGTATGTTGGA 133035531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 TTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGTATTGCTAGTATGTTGGA 2511

133035532 AAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGCTTCTTTTACTAAAGTTTTTTTTAA 133035591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 AAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGCTTCTTTTACTAAAGTTTTTTTTAA 2571

133035592 CTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCTAGGTTGAGAGTCACAGCTTGTCCA 133035651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2572 CTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCTAGGTTGAGAGCCACAGCTTGTCCA 2631

133035652 AATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATATTTCACGTTTTAAGTGTTTTGTATT 133035711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 AATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATATTTCACGTTTTAAGTGTTTTGTATT 2691

133035712 ATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATAATGG 133035751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 ATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATAATGG 2731

Alignment time is 4.37892 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [133020642,133044801] =>     24160 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     3053] =>      3053 nucs 'mol-32-2105-107266_3053'

Score:        3010
Aligned:      3054        nucs
Identic:      3050 (100%) nucs =>       252 (100%)      2798 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [133032256,133032507] EXCISED REGION [133032508,133035309]
 second seq =>  [        1,      252] EXCISED REGION [      254,     3053]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [253,253]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [133033431,133033431]
 second seq =>         1 nucs [1175,1175]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [253,260] to [254,261]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

133032256 ATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTAAACTC 133032315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTAAACTC 60

133032316 CTGACCTCAAGTGATCCACTCACCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGC 133032375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGACCTCAAGTGATCCACTCACCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGC 120

133032376 TACCATGCCTGGCCTTAACTGTTTCTTTTTTTTTTTAAGTGTACTTAGTATTTTTCCTGG 133032435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACCATGCCTGGCCTTAACTGTTTCTTTTTTTTTTTAAGTGTACTTAGTATTTTTCCTGG 180

133032436 TTGCTTGTCTTTTAGTATTTGTAATTCTTAGAAGTTTTGAAGTTTTAAATGTTTATGTAG 133032495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGCTTGTCTTTTAGTATTTGTAATTCTTAGAAGTTTTGAAGTTTTAAATGTTTATGTAG 240

133032496 AGAAATCTATTG 133032507
          ||||||||||||
      241 AGAAATCTATTG 252

EXCISED REGION

133032508 TTTTTTTTCTTTGTGATTTCTTCACTTAGGTGCTTATAAAGGTTTTTTTTGTTTGTTTGT 133032567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      254 TTTTTTTTCTTTGTGATTTCTTCACTTAGGTGCTTATAAAGGTTTTTTTTGTTTGTTTGT 313

133032568 TTGTTTGTTTTTTTTTTTCCCTATCACAAAACCAGTTAGGCAGATTTTCTAGGGTTTGTG 133032627
          |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      314 TTGTTT-TTTTTTTTTTT-CCTATCACAAAACCAGTTAGGCAGATTTTCTAGGGTTTGTG 371

133032628 TATGTGTGTGTTTTGTTTTATTTTCCTCTCTTCACATTTAATTCTTCAACTTGAAATTTT 133032687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      372 TATGTGTGTGTTTTGTTTTATTTTCCTCTCTTCACATTTAATTCTTCAACTTGAAATTTT 431

133032688 AAAAATTGGTAGGCTGGGCTCAGTGGCTCACACTTGTAATGCCAGTACTTTGGGAGGCTG 133032747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      432 AAAAATTGGTAGGCTGGGCTCAGTGGCTCACACTTGTAATGCCAGTACTTTGGGAGGCTG 491

133032748 GGGTGTGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGGTCAAGGTTGCAGGGAGCTATGATTGTGCCAC 133032807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      492 GGGTGTGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGGTCAAGGTTGCAGGGAGCTATGATTGTGCCAC 551

133032808 TGCCCTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAACAACAACAACAA 133032867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      552 TGCCCTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAACAACAACAACAA 611

133032868 AAAGAAAAACAGAAAATCTCAATAAAGTGTGGACTTGGGTTAATAATTATGTATCAATAT 133032927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      612 AAAGAAAAACAGAAAATCTCAATAAAGTGTGGACTTGGGTTAATAATTATGTATCAATAT 671

133032928 TTATTTATTAGTTGTGATAAATGTAGCATAGTAATGTAAGATGTTAATAACATCAGCCTT 133032987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      672 TTATTTATTAGTTGTGATAAATGTAGCATAGTAATGTAAGATGTTAATAACATCAGCCTT 731

133032988 CTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCACACCACCACACCTGGCTAACTTTTTGTAGAGATGG 133033047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 CTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCACACCACCACACCTGGCTAACTTTTTGTAGAGATGG 791

133033048 GGTCTTGCTATGTTGCCTAGGCCGATGTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGGTCTTCCTGCCT 133033107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 GGTCTTGCTATGTTGCCTAGGCCGATGTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGGTCTTCCTGCCT 851

133033108 CTGCCTCCCAAAGCAGGGGAATTACATACATGAGCCACGGTGCCCAGCCTTCCTCAGTTT 133033167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 CTGCCTCCCAAAGCAGGGGAATTACATACATGAGCCACGGTGCCCAGCCTTCCTCAGTTT 911

133033168 TTCTTTAATGCCCTTTTTCTGCTCCAGGATCCCATCCAGGATACATTAATTGTGTCTTCT 133033227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 TTCTTTAATGCCCTTTTTCTGCTCCAGGATCCCATCCAGGATACATTAATTGTGTCTTCT 971

133033228 TCAGCTCCTCAGGTTGTGAGTTTCTCAGGCTTACTTTCGTTTTGGTGAAATTGACAGTTT 133033287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 TCAGCTCCTCAGGTTGTGAGTTTCTCAGGCTTACTTTCGTTTTGGTGAAATTGACAGTTT 1031

133033288 TGAGGAATACTGGTCAGCTCTTTTCCCTCAGTCATTATTTGTCTAATGTTTTTTTTCCAG 133033347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 TGAGGAATACTGGTCAGCTCTTTTCCCTCAGTCATTATTTGTCTAATGTTTTTTTTCCAG 1091

133033348 TTAGACTGGGTAATGTTTTGGGAGGAAGACCCAGCATTAAAATACCATTCTCATCGTCTC 133033407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 TTAGACTGGGTAATGTTTTGGGAGGAAGACCCAGCATTAAAATACCATTCTCATCGTCTC 1151

133033408 ATATCAAGAGCACACGCTATCACGGTGATGGAACGCTGTTGATGTTAAGCTTGATTGCCT 133033467
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 ATATCAAGAGCACACGCTATCACAGTGATGGAACGCTGTTGATGTTAAGCTTGATTGCCT 1211

133033468 GACTCGGATAGTATTTTTCAGATTTCTCCACTATAGAGTTACTCTTTTTCCCCTCTCTCT 133033527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 GACTCGGATAGTATTTTTCAGATTTCTCCACTATAGAGTTACTCTTTTTCCCCTCTCTCT 1271

133033528 TTCCATACTGGGCTCTCTGGAAGAGAGTCACTTACTGTGTGCAGCCCACGTTTAAAAAGC 133033587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 TTCCATACTGGGCTCTCTGGAAGAGAGTCACTTACTGTGTGCAGCCCACGTTTAAAAAGC 1331

133033588 GGGGAGCCATGATCCACGTCCTTGGTGGGGGAGTATCTATCTACATGGATTATTTGGAAT 133033647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 GGGGAGCCATGATCCACGTCCTTGGTGGGGGAGTATCTATCTACATGGATTATTTGGAAT 1391

133033648 TATTCTGCATGAGAGTTGTCTCTTCTGCTCCATTTATTAATTAATTCAATCACTTGTCTA 133033707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 TATTCTGCATGAGAGTTGTCTCTTCTGCTCCATTTATTAATTAATTCAATCACTTGTCTA 1451

133033708 CATCAGCATAGAATCATGGCTAGCTATTTTATACTTTGTGTTATGATCCTAAACCACTTT 133033767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 CATCAGCATAGAATCATGGCTAGCTATTTTATACTTTGTGTTATGATCCTAAACCACTTT 1511

133033768 ATTTTGCTCCTCAAATGTTTCTGACTGTGGTCATCGGGAGCTCGTTCAGTTGGTTTCTGT 133033827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 ATTTTGCTCCTCAAATGTTTCTGACTGTGGTCATCGGGAGCTCGTTCAGTTGGTTTCTGT 1571

133033828 GTCCCTTGGACACCCCTCTTGTTGTGCACGTGTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCGT 133033887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 GTCCCTTGGACACCCCTCTTGTTGTGCACGTGTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCGT 1631

133033888 TTTTCCCACATTCCTACTTTTTGGCACTGGTAGTGGCTCCAGGCTCATCTTAGGTATTTC 133033947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 TTTTCCCACATTCCTACTTTTTGGCACTGGTAGTGGCTCCAGGCTCATCTTAGGTATTTC 1691

133033948 CTGCCTCAGTCCTTGAATTCGCTATTTCTCCAAGGAGCCCTGCTTCCTGTGATTGGAAAC 133034007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 CTGCCTCAGTCCTTGAATTCGCTATTTCTCCAAGGAGCCCTGCTTCCTGTGATTGGAAAC 1751

133034008 CAGGATATCCGTGCTAAGTGTGTTTGTTGGTACTGAGGTGCTGTTACTTCTAAAACCTCC 133034067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 CAGGATATCCGTGCTAAGTGTGTTTGTTGGTACTGAGGTGCTGTTACTTCTAAAACCTCC 1811

133034068 CTTAGCTGACAGGGCAAGGAGTTGTATGTTGTATATATAACCTGTGTTTGTACTTGTATC 133034127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 CTTAGCTGACAGGGCAAGGAGTTGTATGTTGTATATATAACCTGTGTTTGTACTTGTATC 1871

133034128 TATACATAGTTTTATATGTAATCATCCGTGTCTATATTAAGCTAAACATGAGTTCATGCT 133034187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 TATACATAGTTTTATATGTAATCATCCGTGTCTATATTAAGCTAAACATGAGTTCATGCT 1931

133034188 GATATCTTCAACTCTAATTTATATTCGATATTGGATTAGATGTATTAGGTATATGGAGAG 133034247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 GATATCTTCAACTCTAATTTATATTCGATATTGGATTAGATGTATTAGGTATATGGAGAG 1991

133034248 TCAAACCTCTTCCTGTTCCTTATCTAGAACCTCCACGTCTAACAGTCAGAAATCTGTCTC 133034307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 TCAAACCTCTTCCTGTTCCTTATCTAGAACCTCCACGTCTAACAGTCAGAAATCTGTCTC 2051

133034308 CTGCCACCCACCATCCCTTTACTTTACTGTTTAGTTCCAGTATACATTTAAAGTGGTTTC 133034367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 CTGCCACCCACCATCCCTTTACTTTACTGTTTAGTTCCAGTATACATTTAAAGTGGTTTC 2111

133034368 AGAATTGTTGAGTGGGACCCCCACGGGAAACAGCTTTATTAACTAGAATACAGTTCTTTT 133034427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 AGAATTGTTGAGTGGGACCCCCACGGGAAACAGCTTTATTAACTAGAATACAGTTCTTTT 2171

133034428 GCTTTTAGTCTTAACAGACTCCATTCATTTCCAAAATTACTTAGGCCAACACCTTCTTCA 133034487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 GCTTTTAGTCTTAACAGACTCCATTCATTTCCAAAATTACTTAGGCCAACACCTTCTTCA 2231

133034488 GCTTCTTCTTCTTTTTTAAAAAAAATAAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGAAT 133034547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 GCTTCTTCTTCTTTTTTAAAAAAAATAAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGAAT 2291

133034548 CTCACCTTGTCTCCCAGGCTGGAATACAGTGGCGCAATCTTGGCCCACTGCAACCTCCAC 133034607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 CTCACCTTGTCTCCCAGGCTGGAATACAGTGGCGCAATCTTGGCCCACTGCAACCTCCAC 2351

133034608 CTCCTGGGTTTAAGGAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTTAGTAGCTGGGATTACAGATGTG 133034667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 CTCCTGGGTTTAAGGAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTTAGTAGCTGGGATTACAGATGTG 2411

133034668 TGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGC 133034727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 TGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGC 2471

133034728 CAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAAGGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTCCT 133034787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 CAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAAGGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTCCT 2531

133034788 GGGATTACAGGTGTGAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAG 133034847
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 GGGATTACAGATGTGAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAG 2591

133034848 ACAGGGTCTCATTCTGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTT 133034907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 ACAGGGTCTCATTCTGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTT 2651

133034908 CCTCCATCTCCCCAAGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCAC 133034967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 CCTCCATCTCCCCAAGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCAC 2711

133034968 AGGCACATGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAG 133035027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 AGGCACATGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAG 2771

133035028 GGTCTTGCCATATTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCT 133035087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 GGTCTTGCCATATTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCT 2831

133035088 TGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCT 133035147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 TGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCT 2891

133035148 TTTTATTCATATTCTTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATG 133035207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 TTTTATTCATATTCTTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATG 2951

133035208 TAGAAAAACTTGTCAACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGT 133035267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 TAGAAAAACTTGTCAACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGT 3011

133035268 TAAATCTTGATTTTGGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACT 133035309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 TAAATCTTGATTTTGGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACT 3053

Alignment time is 4.65484 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [133020642,133044801] =>     24160 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     2564] =>      2564 nucs 'mol-32-21ec-039944_2564'

Score:        2464
Aligned:      2565        nucs
Identic:      2555 (100%) nucs =>       849 (100%)      1706 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [133028898,133029750] EXCISED REGION [133029756,133031467]
 second seq =>  [        1,      851] EXCISED REGION [      853,     2564]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [133029751,133029755]
 second seq =>         1 nucs [852,852]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [133029750,133029750] to [133029756,133029756]
 second seq =>         1 nucs [851,851] to [853,853]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [133029751,133029751] to [133029755,133029755]
 second seq =>         0 nucs

133028898 ATGGGGTCCACCACGGACCCTGCAGTGGGGAGCGGACTCACCCTTGCTGGTCTTGTCCCC 133028957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGGGGTCCACCACGGACCCTGCAGTGGGGAGCGGACTCACCCTTGCTGGTCTTGTCCCC 60

133028958 TCGCCTGTCTTCCCTGGGGAAAGGGCAGCGCCTCTCGTGTGCTGGCCCCGTGGCCTCCAC 133029017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCGCCTGTCTTCCCTGGGGAAAGGGCAGCGCCTCTCGTGTGCTGGCCCCGTGGCCTCCAC 120

133029018 CTGCTGTGTTCTCACAGCTGAGTTCCGCCCTAACTCCTTCTTCCCTGCACGCTGCACCTC 133029077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCTGTGTTCTCACAGCTGAGTTCCGCCCTAACTCCTTCTTCCCTGCACGCTGCACCTC 180

133029078 TGCTTCCCCTTTAACCCCCTGCCTTGCAGCTCAGTGTTAGGGGCGCCCTTGAAAGGGTCC 133029137
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCTTCCCCTTTAACCCCCTTCCTTGCAGCTCAGTGTTAGGGGCGCCCTTGAAAGGGTCC 240

133029138 CTGGGCGCTCCACTGTAGAGAGTCCCAGGGACAGCGGTTGCTGAGTGAGCTGCAGGTTCC 133029197
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      241 CTGGGCGCTCCACTGTAGAGAGTCCCAGGGACAGCGGTTGCTGAGTGAGTTGCAGGTTCC 300

133029198 CAGCGGCGAGGAGCAGGACTGCTTTCCACACTTCTTTTTTTTTTTGAGACAAGGTCTGGC 133029257
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||
      301 CAGCGGCGAGGAGCAGGACTGCTTTCCACACTTCTTTTTTTTT--GAGACAAGGTCTGGC 358

133029258 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCACAGCTCGCTGCAGCCTCGAACTCCT 133029317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCACAGCTCGCTGCAGCCTCGAACTCCT 418

133029318 GGGCTCAGGTGACCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAAGCATACGCCA 133029377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 GGGCTCAGGTGACCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAAGCATACGCCA 478

133029378 CCATGCCTGGCTGATTTTTAAATTTTTTATAGACATGGAGTCTCTCTGTATTGCCCAGGC 133029437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 CCATGCCTGGCTGATTTTTAAATTTTTTATAGACATGGAGTCTCTCTGTATTGCCCAGGC 538

133029438 TAGTCTCAAACTCCTGGCCTCAGTGATCCTCCCACTTAGGCCTCCCAAAGTGCTGAAATT 133029497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 TAGTCTCAAACTCCTGGCCTCAGTGATCCTCCCACTTAGGCCTCCCAAAGTGCTGAAATT 598

133029498 ACAAGCATGAGCCACTGCACCCAGCCTCCCCAGCGTTTTTTAATGGAAAATTTCAAACTT 133029557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 ACAAGCATGAGCCACTGCACCCAGCCTCCCCAGCGTTTTTTAATGGAAAATTTCAAACTT 658

133029558 ACAGTAAAATGGGGAGAAACATACATGGAACCGCCTATGCCCACCGAGAGCCTCTGAGTC 133029617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 ACAGTAAAATGGGGAGAAACATACATGGAACCGCCTATGCCCACCGAGAGCCTCTGAGTC 718

133029618 ATATTTTGCTTTATCACATCTCTCTATCATTCACCCCTCTGTCAAGGATAGCTTTATAAA 133029677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 ATATTTTGCTTTATCACATCTCTCTATCATTCACCCCTCTGTCAAGGATAGCTTTATAAA 778

133029678 GCAACAAACAAACAAACAAACAACCCCCCCAAATAAAACACACACACACACACACACACA 133029737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GCAACAAACAAACAAACAAACAACCCCCCCAAATAAAACACACACACACACACACACACA 838

133029738 CACACACACACAC 133029750
          |||||||||||||
      839 CACACACACACAC 851

EXCISED REGION

133029756 CGCACAGATTCCTTGCTAAATTGTACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGT 133029815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      853 CGCACAGATTCCTTGCTAAATTGTACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGT 912

133029816 GGCCATTGGCTGTATGAGCCAGCAAGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAA 133029875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 GGCCATTGGCTGTATGAGCCAGCAAGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAA 972

133029876 TACCATTACAGGTTCTTAGAAAATGGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGC 133029935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 TACCATTACAGGTTCTTAGAAAATGGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGC 1032

133029936 TTCAGGCTGAGTTTGTGGTCTAGGGGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGC 133029995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 TTCAGGCTGAGTTTGTGGTCTAGGGGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGC 1092

133029996 ACCACAGGGTTTTGCAGCTCAAAGCTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGA 133030055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 ACCACAGGGTTTTGCAGCTCAAAGCTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGA 1152

133030056 ACATCAGATGGACAGCTTCTATCTTGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGG 133030115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 ACATCAGATGGACAGCTTCTATCTTGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGG 1212

133030116 AGGTGGGCTGTGAAGTGTGTTCTGGCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCC 133030175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 AGGTGGGCTGTGAAGTGTGTTCTGGCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCC 1272

133030176 CCAGCTCTCTCACCCACTTTCTGAATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGG 133030235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 CCAGCTCTCTCACCCACTTTCTGAATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGG 1332

133030236 AGCTTAGAGATCGTTGAATCTACCCCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGA 133030295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 AGCTTAGAGATCGTTGAATCTACCCCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGA 1392

133030296 CACTGATGAGACTTTCCCAAGGCCACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCC 133030355
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 CACTGATGAGATTTTCCCAAGGCCACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCC 1452

133030356 ACATTTGTCTCTGAAATATGTGGCTCCAGTGGCCCAGCAGGATAGCAGCCTTTCAGAGCC 133030415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1453 ACATTTGTCTCTGAAATATGTGGCTCCAGTGGCCCAGCAGGATACCAGCCTTTCAGAGCC 1512

133030416 AGATGTCGTGTCCTGAAGCCCAGACCAGGGTTCCTGAGACTGTCCTCGCTGCCCCATTTG 133030475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1513 AGATGTCGTGTCCTGAAGCCCAGACCAGGGTTCCTGAGGCTGTCCTCGCTGCCCCATTTG 1572

133030476 TGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCCACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCA 133030535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 TGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCCACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCA 1632

133030536 CTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCAGCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTA 133030595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 CTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCAGCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTA 1692

133030596 TGAAACAAAAATCCAGTTCTCCATCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCCGAGTGACACCCCC 133030655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 TGAAACAAAAATCCAGTTCTCCATCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCCGAGTGACACCCCC 1752

133030656 AGGTTCAGACGTCGGGGAGACTTCAGCACCATGGAGCCCTTGATCTGTGTAGAGCCCAGG 133030715
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 AGGTTCAGACGTCGGGGAGACTTCAGCATCATGGAGCCCTTGATCTGTGTAGAGCCCAGG 1812

133030716 GAGGCTCACAGTGTAAAGGGGCATGGTTCATTCCACGGGGCTGGTAGCCCTCTGGGACAG 133030775
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1813 GAGGCTCACAGTGTAAAGGGGCATGGTTCATTCCATGGGGCTGGTAGCCCTCTGGGACAG 1872

133030776 GCCAGGTGGGGAGTAGAAAGTGACATGTGGTGGCTCAGGTGCCAACTCCTGGCCATGGGC 133030835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 GCCAGGTGGGGAGTAGAAAGTGACATGTGGTGGCTCAGGTGCCAACTCCTGGCCATGGGC 1932

133030836 CAGTAAGCAAGGAAGGGGGCTAAGGAAAGACCCCCCCCTGAGGAAGCAGCCTGTGAGTAG 133030895
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1933 CAGTAAGCAAGGAAGGGGGCTAAGGAAAGACGCCCCCCTGAGGAAGCAGCCTGTGAGTAG 1992

133030896 GGCCTGAAGAACATCAGTGAATGTTTACTGGGTTTTGGCCGTTTGCCTGGCAGATGCCAG 133030955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 GGCCTGAAGAACATCAGTGAATGTTTACTGGGTTTTGGCCGTTTGCCTGGCAGATGCCAG 2052

133030956 GTGCTGGGAACACAGCAGGGAGAGAGGACTCCCTGGGGCATGTGGAGCTGGCTGGGTAAG 133031015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 GTGCTGGGAACACAGCAGGGAGAGAGGACTCCCTGGGGCATGTGGAGCTGGCTGGGTAAG 2112

133031016 GACCGGGGGATGGACAGGAGGGCTGATGTGGAGGGACAGGTGTGTGTGGGAGCTGGGTGT 133031075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 GACCGGGGGATGGACAGGAGGGCTGATGTGGAGGGACAGGTGTGTGTGGGAGCTGGGTGT 2172

133031076 GCACGGGAGGAGTGGAGCGGGAAAGTGGGGAAGGGCAAGATTGGACACAGCCGTGAGTGC 133031135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 GCACGGGAGGAGTGGAGCGGGAAAGTGGGGAAGGGCAAGATTGGACACAGCCGTGAGTGC 2232

133031136 AGGGCCGATTGATGCCTTGGCGGACTTGGATTTCCTTTTCCTTCTATGGGCTGTGAACAG 133031195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 AGGGCCGATTGATGCCTTGGCGGACTTGGATTTCCTTTTCCTTCTATGGGCTGTGAACAG 2292

133031196 CCACCGAGGGCTTCTGAGCAGCAGTTTGGAACTGTGATTTAGGCCTGGCTGTGCCTTTTG 133031255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 CCACCGAGGGCTTCTGAGCAGCAGTTTGGAACTGTGATTTAGGCCTGGCTGTGCCTTTTG 2352

133031256 AATCAGCAAATAGAATCCCCTTTGGTGGAAGAGGAACTTGAGAAACGGGTTGTAGCTGTT 133031315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 AATCAGCAAATAGAATCCCCTTTGGTGGAAGAGGAACTTGAGAAACGGGTTGTAGCTGTT 2412

133031316 TGTTCCAGCTCCCAGAGCTGCACAGCGGGAGGGTTTTCTTAAAGTAAGCCCCTCTCCTAA 133031375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 TGTTCCAGCTCCCAGAGCTGCACAGCGGGAGGGTTTTCTTAAAGTAAGCCCCTCTCCTAA 2472

133031376 ACCCCAAGAGGCGGGTGCGGGGCAAATCGTGGCGGTTCTAGACTGTTCCTGCTTGGAGAC 133031435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 ACCCCAAGAGGCGGGTGCGGGGCAAATCGTGGCGGTTCTAGACTGTTCCTGCTTGGAGAC 2532

133031436 AAACTAAGATCCGTGCTTCGGAAATTTTACAG 133031467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 AAACTAAGATCCGTGCTTCGGAAATTTTACAG 2564

Alignment time is 4.16086 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [133020642,133044801] =>     24160 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     2760] =>      2760 nucs 'mol-32-23af-050542_2760'

Score:        2649
Aligned:      2739        nucs
Identic:      2730 (100%) nucs =>       274 (100%)      2456 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [133029477,133029750] EXCISED REGION [133029756,133032220]
 second seq =>  [       24,      297] EXCISED REGION [      299,     2760]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [133029751,133029755]
 second seq =>         1 nucs [298,298]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [133029750,133029750] to [133029756,133029756]
 second seq =>         1 nucs [297,297] to [299,299]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [133029751,133029751] to [133029755,133029755]
 second seq =>         0 nucs

133029477 GCCTCCCAAAGTGCTGAAATTACAAGCATGAGCCACTGCACCCAGCCTCCCCAGCGTTTT 133029536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       24 GCCTCCCAAAGTGCTGAAATTACAAGCATGAGCCACTGCACCCAGCCTCCCCAGCGTTTT 83

133029537 TTAATGGAAAATTTCAAACTTACAGTAAAATGGGGAGAAACATACATGGAACCGCCTATG 133029596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       84 TTAATGGAAAATTTCAAACTTACAGTAAAATGGGGAGAAACATACATGGAACCGCCTATG 143

133029597 CCCACCGAGAGCCTCTGAGTCATATTTTGCTTTATCACATCTCTCTATCATTCACCCCTC 133029656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      144 CCCACCGAGAGCCTCTGAGTCATATTTTGCTTTATCACATCTCTCTATCATTCACCCCTC 203

133029657 TGTCAAGGATAGCTTTATAAAGCAACAAACAAACAAACAAACAACCCCCCCAAATAAAAC 133029716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      204 TGTCAAGGATAGCTTTATAAAGCAACAAACAAACAAACAAACAACCCCCCCAAATAAAAC 263

133029717 ACACACACACACACACACACACACACACACACAC 133029750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      264 ACACACACACACACACACACACACACACACACAC 297

EXCISED REGION

133029756 CGCACAGATTCCTTGCTAAATTGTACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGT 133029815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 CGCACAGATTCCTTGCTAAATTGTACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGT 358

133029816 GGCCATTGGCTGTATGAGCCAGCAAGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAA 133029875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 GGCCATTGGCTGTATGAGCCAGCAAGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAA 418

133029876 TACCATTACAGGTTCTTAGAAAATGGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGC 133029935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 TACCATTACAGGTTCTTAGAAAATGGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGC 478

133029936 TTCAGGCTGAGTTTGTGGTCTAGGGGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGC 133029995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 TTCAGGCTGAGTTTGTGGTCTAGGGGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGC 538

133029996 ACCACAGGGTTTTGCAGCTCAAAGCTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGA 133030055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 ACCACAGGGTTTTGCAGCTCAAAGCTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGA 598

133030056 ACATCAGATGGACAGCTTCTATCTTGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGG 133030115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 ACATCAGATGGACAGCTTCTATCTTGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGG 658

133030116 AGGTGGGCTGTGAAGTGTGTTCTGGCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCC 133030175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 AGGTGGGCTGTGAAGTGTGTTCTGGCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCC 718

133030176 CCAGCTCTCTCACCCACTTTCTGAATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGG 133030235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CCAGCTCTCTCACCCACTTTCTGAATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGG 778

133030236 AGCTTAGAGATCGTTGAATCTACCCCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGA 133030295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 AGCTTAGAGATCGTTGAATCTACCCCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGA 838

133030296 CACTGATGAGACTTTCCCAAGGCCACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCC 133030355
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CACTGATGAGATTTTCCCAAGGCCACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCC 898

133030356 ACATTTGTCTCTGAAATATGTGGCTCCAGTGGCCCAGCAGGATAGCAGCCTTTCAGAGCC 133030415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      899 ACATTTGTCTCTGAAATATGTGGCTCCAGTGGCCCAGCAGGATACCAGCCTTTCAGAGCC 958

133030416 AGATGTCGTGTCCTGAAGCCCAGACCAGGGTTCCTGAGACTGTCCTCGCTGCCCCATTTG 133030475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      959 AGATGTCGTGTCCTGAAGCCCAGACCAGGGTTCCTGAGGCTGTCCTCGCTGCCCCATTTG 1018

133030476 TGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCCACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCA 133030535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCCACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCA 1078

133030536 CTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCAGCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTA 133030595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCAGCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTA 1138

133030596 TGAAACAAAAATCCAGTTCTCCATCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCCGAGTGACACCCCC 133030655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TGAAACAAAAATCCAGTTCTCCATCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCCGAGTGACACCCCC 1198

133030656 AGGTTCAGACGTCGGGGAGACTTCAGCACCATGGAGCCCTTGATCTGTGTAGAGCCCAGG 133030715
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 AGGTTCAGACGTCGGGGAGACTTCAGCATCATGGAGCCCTTGATCTGTGTAGAGCCCAGG 1258

133030716 GAGGCTCACAGTGTAAAGGGGCATGGTTCATTCCACGGGGCTGGTAGCCCTCTGGGACAG 133030775
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1259 GAGGCTCACAGTGTAAAGGGGCATGGTTCATTCCATGGGGCTGGTAGCCCTCTGGGACAG 1318

133030776 GCCAGGTGGGGAGTAGAAAGTGACATGTGGTGGCTCAGGTGCCAACTCCTGGCCATGGGC 133030835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 GCCAGGTGGGGAGTAGAAAGTGACATGTGGTGGCTCAGGTGCCAACTCCTGGCCATGGGC 1378

133030836 CAGTAAGCAAGGAAGGGGGCTAAGGAAAGACCCCCCCCTGAGGAAGCAGCCTGTGAGTAG 133030895
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1379 CAGTAAGCAAGGAAGGGGGCTAAGGAAAGACGCCCCCCTGAGGAAGCAGCCTGTGAGTAG 1438

133030896 GGCCTGAAGAACATCAGTGAATGTTTACTGGGTTTTGGCCGTTTGCCTGGCAGATGCCAG 133030955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GGCCTGAAGAACATCAGTGAATGTTTACTGGGTTTTGGCCGTTTGCCTGGCAGATGCCAG 1498

133030956 GTGCTGGGAACACAGCAGGGAGAGAGGACTCCCTGGGGCATGTGGAGCTGGCTGGGTAAG 133031015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GTGCTGGGAACACAGCAGGGAGAGAGGACTCCCTGGGGCATGTGGAGCTGGCTGGGTAAG 1558

133031016 GACCGGGGGATGGACAGGAGGGCTGATGTGGAGGGACAGGTGTGTGTGGGAGCTGGGTGT 133031075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GACCGGGGGATGGACAGGAGGGCTGATGTGGAGGGACAGGTGTGTGTGGGAGCTGGGTGT 1618

133031076 GCACGGGAGGAGTGGAGCGGGAAAGTGGGGAAGGGCAAGATTGGACACAGCCGTGAGTGC 133031135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 GCACGGGAGGAGTGGAGCGGGAAAGTGGGGAAGGGCAAGATTGGACACAGCCGTGAGTGC 1678

133031136 AGGGCCGATTGATGCCTTGGCGGACTTGGATTTCCTTTTCCTTCTATGGGCTGTGAACAG 133031195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AGGGCCGATTGATGCCTTGGCGGACTTGGATTTCCTTTTCCTTCTATGGGCTGTGAACAG 1738

133031196 CCACCGAGGGCTTCTGAGCAGCAGTTTGGAACTGTGATTTAGGCCTGGCTGTGCCTTTTG 133031255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CCACCGAGGGCTTCTGAGCAGCAGTTTGGAACTGTGATTTAGGCCTGGCTGTGCCTTTTG 1798

133031256 AATCAGCAAATAGAATCCCCTTTGGTGGAAGAGGAACTTGAGAAACGGGTTGTAGCTGTT 133031315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AATCAGCAAATAGAATCCCCTTTGGTGGAAGAGGAACTTGAGAAACGGGTTGTAGCTGTT 1858

133031316 TGTTCCAGCTCCCAGAGCTGCACAGCGGGAGGGTTTTCTTAAAGTAAGCCCCTCTCCTAA 133031375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TGTTCCAGCTCCCAGAGCTGCACAGCGGGAGGGTTTTCTTAAAGTAAGCCCCTCTCCTAA 1918

133031376 ACCCCAAGAGGCGGGTGCGGGGCAAATCGTGGCGGTTCTAGACTGTTCCTGCTTGGAGAC 133031435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ACCCCAAGAGGCGGGTGCGGGGCAAATCGTGGCGGTTCTAGACTGTTCCTGCTTGGAGAC 1978

133031436 AAACTAAGATCCGTGCTTCGGAAATTTTACAGTTTCTAAATTAAAAATTGTATGTTCCCA 133031495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAACTAAGATCCGTGCTTCGGAAATTTTACAGTTTCTAAATTAAAAATTGTATGTTCCCA 2038

133031496 GAGTAGAAAAGTTAGAAATTTGCTAATCATTGCAAAAGAGCCCTGGTTCCTTTTTTTTTT 133031555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||
     2039 GAGTAGAAAAGTTAGAAATTTGCTAATCATTGCAAAAGAGCCCTGGTTCC--TTTTTTTT 2096

133031556 TTTTTTTTTTGAAATTAGTAGTAGAAACCAAGATCTAGTGCTAAAATTTAGGTTGTTTTC 133031615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TTTTTTTTTTGAAATTAGTAGTAGAAACCAAGATCTAGTGCTAAAATTTAGGTTGTTTTC 2156

133031616 AGTGTTTCTATATTAAAATGTTACTAAGAAACTCTCTTGTAAAAATCTTTGTCTGCATCT 133031675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 AGTGTTTCTATATTAAAATGTTACTAAGAAACTCTCTTGTAAAAATCTTTGTCTGCATCT 2216

133031676 TTGATTGGTTTTTACGTAGGCTTAAGTTCCTTGAAGTGGAATTCTAGGCCATTTTTAACA 133031735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TTGATTGGTTTTTACGTAGGCTTAAGTTCCTTGAAGTGGAATTCTAGGCCATTTTTAACA 2276

133031736 CACCGAGTGGGGGGACGACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGAATGTTTCAGGAGATTGAACTT 133031795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 CACCGAGTGGGGGGACGACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGAATGTTTCAGGAGATTGAACTT 2336

133031796 CCACCAGAACTGTTTCAGGGGCCCGTTTCAGCACAGCCACCCCCAACACTGGAAATTAAT 133031855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 CCACCAGAACTGTTTCAGGGGCCCGTTTCAGCACAGCCACCCCCAACACTGGAAATTAAT 2396

133031856 ATAAAAACCTTTCTTTTCTAATTCAAAAATGGAAAATGATATCTTCTTGTTTCAATTGCT 133031915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 ATAAAAACCTTTCTTTTCTAATTCAAAAATGGAAAATGATATCTTCTTGTTTCAATTGCT 2456

133031916 AGTGAGGTTCAATATGTCTTTCAAGCGTTCACTAGATATTTTTGGTATGAATTTCTTATT 133031975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 AGTGAGGTTCAATATGTCTTTCAAGCGTTCACTAGATATTTTTGGTATGAATTTCTTATT 2516

133031976 TTGTAAACTGTCAGTTTCTTTGCAAATTTTTTCATGGGAGTTTTAGTGCTTTTATTTTTA 133032035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TTGTAAACTGTCAGTTTCTTTGCAAATTTTTTCATGGGAGTTTTAGTGCTTTTATTTTTA 2576

133032036 GTTGGAATGAGGACCTTATGTTGATGATGTTATCTGTTTTTTTTTTTGTTGTTGTTTGTT 133032095
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2577 GTTGGAATGAGGACCTTATGTTGATGATGTTATCTG-TTTTTTTTTTGTTGTTGTTTGTT 2635

133032096 TGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGAT 133032155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 TGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGAT 2695

133032156 CTCTGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTG 133032215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 CTCTGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTG 2755

133032216 AGTAG 133032220
          |||||
     2756 AGTAG 2760

Alignment time is 4.22177 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [133020642,133044801] =>     24160 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     4226] =>      4226 nucs 'mol-32-285e-014545_4226'

Score:        4208
Aligned:      4233        nucs
Identic:      4225 (100%) nucs =>      1760 (100%)      2465 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [133028875,133030642] EXCISED REGION [133034802,133037266]
 second seq =>  [        1,     1760] EXCISED REGION [     1762,     4226]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4159 nucs [133030643,133034801]
 second seq =>         1 nucs [1761,1761]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [133030643,133030646] to [133034802,133034805]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

133028875 CCAGAGGCAGGCCTTGAGACGAAATGGGGTCCACCACGGACCCTGCAGTGGGGAGCGGAC 133028934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGAGGCAGGCCTTGAGACGAAATGGGGTCCACCACGGACCCTGCAGTGGGGAGCGGAC 60

133028935 TCACCCTTGCTGGTCTTGTCCCCTCGCCTGTCTTCCCTGGGGAAAGGGCAGCGCCTCTCG 133028994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCACCCTTGCTGGTCTTGTCCCCTCGCCTGTCTTCCCTGGGGAAAGGGCAGCGCCTCTCG 120

133028995 TGTGCTGGCCCCGTGGCCTCCACCTGCTGTGTTCTCACAGCTGAGTTCCGCCCTAACTCC 133029054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGCTGGCCCCGTGGCCTCCACCTGCTGTGTTCTCACAGCTGAGTTCCGCCCTAACTCC 180

133029055 TTCTTCCCTGCACGCTGCACCTCTGCTTCCCCTTTAACCCCCTGCCTTGCAGCTCAGTGT 133029114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTTCCCTGCACGCTGCACCTCTGCTTCCCCTTTAACCCCCTGCCTTGCAGCTCAGTGT 240

133029115 TAGGGGCGCCCTTGAAAGGGTCCCTGGGCGCTCCACTGTAGAGAGTCCCAGGGACAGCGG 133029174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGGGGCGCCCTTGAAAGGGTCCCTGGGCGCTCCACTGTAGAGAGTCCCAGGGACAGCGG 300

133029175 TTGCTGAGTGAGCTGCAGGTTCCCAGCGGCGAGGAGCAGGACTGCTTTCCACACTTCTTT 133029234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGCTGAGTGAGCTGCAGGTTCCCAGCGGCGAGGAGCAGGACTGCTTTCCACACTTCTTT 360

133029235 TTTTTTTTGAGACAAGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCACA 133029294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTTTTGAGACAAGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCACA 420

133029295 GCTCGCTGCAGCCTCGAACTCCTGGGCTCAGGTGACCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTA 133029354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTCGCTGCAGCCTCGAACTCCTGGGCTCAGGTGACCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTA 480

133029355 GCTGGGACTACAAGCATACGCCACCATGCCTGGCTGATTTTTAAATTTTTTATAGACATG 133029414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTGGGACTACAAGCATACGCCACCATGCCTGGCTGATTTTTAAATTTTTTATAGACATG 540

133029415 GAGTCTCTCTGTATTGCCCAGGCTAGTCTCAAACTCCTGGCCTCAGTGATCCTCCCACTT 133029474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGTCTCTCTGTATTGCCCAGGCTAGTCTCAAACTCCTGGCCTCAGTGATCCTCCCACTT 600

133029475 AGGCCTCCCAAAGTGCTGAAATTACAAGCATGAGCCACTGCACCCAGCCTCCCCAGCGTT 133029534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGCCTCCCAAAGTGCTGAAATTACAAGCATGAGCCACTGCACCCAGCCTCCCCAGCGTT 660

133029535 TTTTAATGGAAAATTTCAAACTTACAGTAAAATGGGGAGAAACATACATGGAACCGCCTA 133029594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTAATGGAAAATTTCAAACTTACAGTAAAATGGGGAGAAACATACATGGAACCGCCTA 720

133029595 TGCCCACCGAGAGCCTCTGAGTCATATTTTGCTTTATCACATCTCTCTATCATTCACCCC 133029654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCCCACCGAGAGCCTCTGAGTCATATTTTGCTTTATCACATCTCTCTATCATTCACCCC 780

133029655 TCTGTCAAGGATAGCTTTATAAAGCAACAAACAAACAAACAAACAACCCCCCCAAATAAA 133029714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGTCAAGGATAGCTTTATAAAGCAACAAACAAACAAACAAACAACCCCCCCAAATAAA 840

133029715 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCACAGATTCCTTGCTAA 133029774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||
      841 ACACACACACACACACACACACACACACACACAC--------GCACAGATTCCTTGCTAA 892

133029775 ATTGTACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGTGGCCATTGGCTGTATGAGC 133029834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 ATTGTACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGTGGCCATTGGCTGTATGAGC 952

133029835 CAGCAAGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAATACCATTACAGGTTCTTAG 133029894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 CAGCAAGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAATACCATTACAGGTTCTTAG 1012

133029895 AAAATGGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGCTTCAGGCTGAGTTTGTGGT 133029954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 AAAATGGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGCTTCAGGCTGAGTTTGTGGT 1072

133029955 CTAGGGGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGCACCACAGGGTTTTGCAGCT 133030014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 CTAGGGGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGCACCACAGGGTTTTGCAGCT 1132

133030015 CAAAGCTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGAACATCAGATGGACAGCTTC 133030074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 CAAAGCTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGAACATCAGATGGACAGCTTC 1192

133030075 TATCTTGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGGAGGTGGGCTGTGAAGTGTG 133030134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 TATCTTGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGGAGGTGGGCTGTGAAGTGTG 1252

133030135 TTCTGGCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCCCCAGCTCTCTCACCCACTT 133030194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TTCTGGCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCCCCAGCTCTCTCACCCACTT 1312

133030195 TCTGAATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGGAGCTTAGAGATCGTTGAAT 133030254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 TCTGAATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGGAGCTTAGAGATCGTTGAAT 1372

133030255 CTACCCCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGACACTGATGAGACTTTCCCA 133030314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 CTACCCCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGACACTGATGAGACTTTCCCA 1432

133030315 AGGCCACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCCACATTTGTCTCTGAAATAT 133030374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 AGGCCACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCCACATTTGTCTCTGAAATAT 1492

133030375 GTGGCTCCAGTGGCCCAGCAGGATAGCAGCCTTTCAGAGCCAGATGTCGTGTCCTGAAGC 133030434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 GTGGCTCCAGTGGCCCAGCAGGATAGCAGCCTTTCAGAGCCAGATGTCGTGTCCTGAAGC 1552

133030435 CCAGACCAGGGTTCCTGAGACTGTCCTCGCTGCCCCATTTGTGGCCATGAGCCTCAGGAA 133030494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 CCAGACCAGGGTTCCTGAGACTGTCCTCGCTGCCCCATTTGTGGCCATGAGCCTCAGGAA 1612

133030495 GCCCACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCACTGAGCTGGTGGGCAGTTC 133030554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 GCCCACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCACTGAGCTGGTGGGCAGTTC 1672

133030555 TCCAGCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTATGAAACAAAAATCCAGTTC 133030614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TCCAGCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTATGAAACAAAAATCCAGTTC 1732

133030615 TCCATCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCC 133030642
          ||||||||||||||||||||||||||||
     1733 TCCATCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCC 1760

EXCISED REGION

133034802 GAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGTCTCATTC 133034861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 GAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGTCTCATTC 1821

133034862 TGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCATCTCCCCA 133034921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 TGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCATCTCCCCA 1881

133034922 AGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGCCACC 133034981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 AGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGCCACC 1941

133034982 ACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTGCCATATT 133035041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 ACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTGCCATATT 2001

133035042 GCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGT 133035101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 GCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGT 2061

133035102 GCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATTCATATTC 133035161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 GCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATTCATATTC 2121

133035162 TTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAAACTTGTC 133035221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 TTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAAACTTGTC 2181

133035222 AACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCTTGATTTT 133035281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 AACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCTTGATTTT 2241

133035282 GGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATGCCTCTTG 133035341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 GGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATGCCTCTTG 2301

133035342 TTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAGATTCAGG 133035401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 TTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAGATTCAGG 2361

133035402 TTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATTTTAAGATAGTTTTGGT 133035461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 TTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATTTTAAGATAGTTTTGGT 2421

133035462 TTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGTATTGCTA 133035521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 TTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGTATTGCTA 2481

133035522 GTATGTTGGAAAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGCTTCTTTTACTAAAG 133035581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 GTATGTTGGAAAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGCTTCTTTTACTAAAG 2541

133035582 TTTTTTTTAACTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCTAGGTTGAGAGTCAC 133035641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 TTTTTTTTAACTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCTAGGTTGAGAGTCAC 2601

133035642 AGCTTGTCCAAATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATATTTCACGTTTTAAGT 133035701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 AGCTTGTCCAAATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATATTTCACGTTTTAAGT 2661

133035702 GTTTTGTATTATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATAATGGTGATGGCTGC 133035761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 GTTTTGTATTATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATAATGGTGATGGCTGC 2721

133035762 AGTTATCTTGTCTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTCTTGCCCAG 133035821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 AGTTATCTTGTCTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTCTTGCCCAG 2781

133035822 GCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCAGGCTCAAGCGA 133035881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 GCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCAGGCTCAAGCGA 2841

133035882 TTCTCTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTATTATAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCT 133035941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 TTCTCTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTATTATAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCT 2901

133035942 AATTTTCGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCCCAAACT 133036001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 AATTTTCGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCCCAAACT 2961

133036002 CCTGACCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGCG 133036061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 CCTGACCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGCG 3021

133036062 CCTCCGCGCCCGGCCATCTTGTCTTGCTTTTGATTTTGCACCACTCATTGTATGATATTG 133036121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 CCTCCGCGCCCGGCCATCTTGTCTTGCTTTTGATTTTGCACCACTCATTGTATGATATTG 3081

133036122 ATTCTTGGTTTGAGTTTTTGTCATCAAGTGAAAGAAGATGCATTCATTCCTAATTTTACT 133036181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 ATTCTTGGTTTGAGTTTTTGTCATCAAGTGAAAGAAGATGCATTCATTCCTAATTTTACT 3141

133036182 AAAAAAAAATAAACTCAAAAAACAAGAAAAAGCAAAAACAAAACAAAAAATCCAAACAGG 133036241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 AAAAAAAAATAAACTCAAAAAACAAGAAAAAGCAAAAACAAAACAAAAAATCCAAACAGG 3201

133036242 GATGGGTGTTGAATTTTAGCAAGTGATTTTCTGCTTTGTTGCAATGTTTATAAGATCCTT 133036301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 GATGGGTGTTGAATTTTAGCAAGTGATTTTCTGCTTTGTTGCAATGTTTATAAGATCCTT 3261

133036302 CTCCTGTTGACCTATTAATGTGATACATTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGAGACGGAGTCT 133036361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 CTCCTGTTGACCTATTAATGTGATACATTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGAGACGGAGTCT 3321

133036362 CACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGACTCACTGCAGCTTCCACCT 133036421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 CACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGACTCACTGCAGCTTCCACCT 3381

133036422 CCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCA 133036481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 CCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCA 3441

133036482 CCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATATGTTGG 133036541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 CCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATATGTTGG 3501

133036542 CTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTAC 133036601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 CTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTAC 3561

133036602 TGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAATGCGTTAATTTTCAACTATTTTTGC 133036661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 TGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAATGCGTTAATTTTCAACTATTTTTGC 3621

133036662 ATTTCTTGCATAAGTCCTGCTTGGTCACGGTGGATTATTCTTTAATATACAGCTGGATGA 133036721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 ATTTCTTGCATAAGTCCTGCTTGGTCACGGTGGATTATTCTTTAATATACAGCTGGATGA 3681

133036722 TAGTTTCCAGCATTTTGCTTAGAGGTTTTGCCTTTTTCCATTTCATGTGTGCAATCAGTA 133036781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 TAGTTTCCAGCATTTTGCTTAGAGGTTTTGCCTTTTTCCATTTCATGTGTGCAATCAGTA 3741

133036782 AGTGGTGTTTTTCCTTTGTGTTTTTTGTCAAGTTTTACCATCAGGGTTTAGCTTTTTCAG 133036841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 AGTGGTGTTTTTCCTTTGTGTTTTTTGTCAAGTTTTACCATCAGGGTTTAGCTTTTTCAG 3801

133036842 TTAATAATCCATTCCCTTCAAGAATCTCAAAATTAATACATGCTTGTAAAATATTCTACT 133036901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 TTAATAATCCATTCCCTTCAAGAATCTCAAAATTAATACATGCTTGTAAAATATTCTACT 3861

133036902 ACTACTCTCAAGAGGTGAAAACACTTTTAACACTCTGGTGTCCTTCCAGATCTTGTGTGC 133036961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 ACTACTCTCAAGAGGTGAAAACACTTTTAACACTCTGGTGTCCTTCCAGATCTTGTGTGC 3921

133036962 ATGTATGTGTATACATTCACTCGTGTTAAACATACCTACGTTAAAAAATTATAGTACGTA 133037021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 ATGTATGTGTATACATTCACTCGTGTTAAACATACCTACGTTAAAAAATTATAGTACGTA 3981

133037022 AAGCATTTTACAACTTGCTTTCTTCCCCCCACATAATATGGCATGAATATCTCTTCCTGT 133037081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 AAGCATTTTACAACTTGCTTTCTTCCCCCCACATAATATGGCATGAATATCTCTTCCTGT 4041

133037082 CAGGAAACAGAGATCCTCCCCATTGTTTTTAATGACTCTATAAGATGCCATTGGAGGAAT 133037141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 CAGGAAACAGAGATCCTCCCCATTGTTTTTAATGACTCTATAAGATGCCATTGGAGGAAT 4101

133037142 TAGCCTAATTTACCCACCCATCCCCCTACTGTGGAAAATAGGCTGCTTTCAGTTTCTTCA 133037201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 TAGCCTAATTTACCCACCCATCCCCCTACTGTGGAAAATAGGCTGCTTTCAGTTTCTTCA 4161

133037202 CAATAAACACACACATATTTGCAAACATATCTACAGAATAGATTCCCAGAGATAAAATTG 133037261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 CAATAAACACACACATATTTGCAAACATATCTACAGAATAGATTCCCAGAGATAAAATTG 4221

133037262 CTTTG 133037266
          |||||
     4222 CTTTG 4226

Alignment time is 6.40083 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [133020642,133044801] =>     24160 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     6709] =>      6709 nucs 'mol-32-29df-017093_6709'

Score:        6557
Aligned:      6713        nucs
Identic:      6698 (100%) nucs =>      1078 (100%)      5620 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [133030465,133031545] EXCISED REGION [133031549,133037179]
 second seq =>  [        1,     1081] EXCISED REGION [     1082,     6709]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [133031546,133031548]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [133031546,133031562] to [133031549,133031565]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [133031546,133031546] to [133031548,133031548]
 second seq =>         0 nucs

133030465 TGCCCCATTTGTGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCCACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTC 133030524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCCCCATTTGTGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCCACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTC 60

133030525 CTCTCTGGGCACTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCAGCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCAC 133030584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCTCTGGGCACTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCAGCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCAC 120

133030585 TCCATCCTCTATGAAACAAAAATCCAGTTCTCCATCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCCGA 133030644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCATCCTCTATGAAACAAAAATCCAGTTCTCCATCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCCGA 180

133030645 GTGACACCCCCAGGTTCAGACGTCGGGGAGACTTCAGCACCATGGAGCCCTTGATCTGTG 133030704
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      181 GTGACACCCCCAGGTTCAGACGTCGGGGAGACTTCAGCATCATGGAGCCCTTGATCTGTG 240

133030705 TAGAGCCCAGGGAGGCTCACAGTGTAAAGGGGCATGGTTCATTCCACGGGGCTGGTAGCC 133030764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      241 TAGAGCCCAGGGAGGCTCACAGTGTAAAGGGGCATGGTTCATTCCATGGGGCTGGTAGCC 300

133030765 CTCTGGGACAGGCCAGGTGGGGAGTAGAAAGTGACATGTGGTGGCTCAGGTGCCAACTCC 133030824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTGGGACAGGCCAGGTGGGGAGTAGAAAGTGACATGTGGTGGCTCAGGTGCCAACTCC 360

133030825 TGGCCATGGGCCAGTAAGCAAGGAAGGGGGCTAAGGAAAGACCCCCCCCTGAGGAAGCAG 133030884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      361 TGGCCATGGGCCAGTAAGCAAGGAAGGGGGCTAAGGAAAGACGCCCCCCTGAGGAAGCAG 420

133030885 CCTGTGAGTAGGGCCTGAAGAACATCAGTGAATGTTTACTGGGTTTTGGCCGTTTGCCTG 133030944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTGTGAGTAGGGCCTGAAGAACATCAGTGAATGTTTACTGGGTTTTGGCCGTTTGCCTG 480

133030945 GCAGATGCCAGGTGCTGGGAACACAGCAGGGAGAGAGGACTCCCTGGGGCATGTGGAGCT 133031004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAGATGCCAGGTGCTGGGAACACAGCAGGGAGAGAGGACTCCCTGGGGCATGTGGAGCT 540

133031005 GGCTGGGTAAGGACCGGGGGATGGACAGGAGGGCTGATGTGGAGGGACAGGTGTGTGTGG 133031064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCTGGGTAAGGACCGGGGGATGGACAGGAGGGCTGATGTGGAGGGACAGGTGTGTGTGG 600

133031065 GAGCTGGGTGTGCACGGGAGGAGTGGAGCGGGAAAGTGGGGAAGGGCAAGATTGGACACA 133031124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGCTGGGTGTGCACGGGAGGAGTGGAGCGGGAAAGTGGGGAAGGGCAAGATTGGACACA 660

133031125 GCCGTGAGTGCAGGGCCGATTGATGCCTTGGCGGACTTGGATTTCCTTTTCCTTCTATGG 133031184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCCGTGAGTGCAGGGCCGATTGATGCCTTGGCGGACTTGGATTTCCTTTTCCTTCTATGG 720

133031185 GCTGTGAACAGCCACCGAGGGCTTCTGAGCAGCAGTTTGGAACTGTGATTTAGGCCTGGC 133031244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTGTGAACAGCCACCGAGGGCTTCTGAGCAGCAGTTTGGAACTGTGATTTAGGCCTGGC 780

133031245 TGTGCCTTTTGAATCAGCAAATAGAATCCCCTTTGGTGGAAGAGGAACTTGAGAAACGGG 133031304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTGCCTTTTGAATCAGCAAATAGAATCCCCTTTGGTGGAAGAGGAACTTGAGAAACGGG 840

133031305 TTGTAGCTGTTTGTTCCAGCTCCCAGAGCTGCACAGCGGGAGGGTTTTCTTAAAGTAAGC 133031364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGTAGCTGTTTGTTCCAGCTCCCAGAGCTGCACAGCGGGAGGGTTTTCTTAAAGTAAGC 900

133031365 CCCTCTCCTAAACCCCAAGAGGCGGGTGCGGGGCAAATCGTGGCGGTTCTAGACTGTTCC 133031424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCCTCTCCTAAACCCCAAGAGGCGGGTGCGGGGCAAATCGTGGCGGTTCTAGACTGTTCC 960

133031425 TGCTTGGAGACAAACTAAGATCCGTGCTTCGGAAATTTTACAGTTTCTAAATTAAAAATT 133031484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCTTGGAGACAAACTAAGATCCGTGCTTCGGAAATTTTACAGTTTCTAAATTAAAAATT 1020

133031485 GTATGTTCCCAGAGTAGAAAAGTTAGAAATTTGCTAATCATTGCAAAAGAGCCCTGGTTC 133031544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTATGTTCCCAGAGTAGAAAAGTTAGAAATTTGCTAATCATTGCAAAAGAGCCCTGGTTC 1080

133031545 C 133031545
          |
     1081 C 1081

EXCISED REGION

133031549 TTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATTAGTAGTAGAAACCAAGATCTAGTGCTAAAATTTAGGT 133031608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 TTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATTAGTAGTAGAAACCAAGATCTAGTGCTAAAATTTAGGT 1141

133031609 TGTTTTCAGTGTTTCTATATTAAAATGTTACTAAGAAACTCTCTTGTAAAAATCTTTGTC 133031668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 TGTTTTCAGTGTTTCTATATTAAAATGTTACTAAGAAACTCTCTTGTAAAAATCTTTGTC 1201

133031669 TGCATCTTTGATTGGTTTTTACGTAGGCTTAAGTTCCTTGAAGTGGAATTCTAGGCCATT 133031728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 TGCATCTTTGATTGGTTTTTACGTAGGCTTAAGTTCCTTGAAGTGGAATTCTAGGCCATT 1261

133031729 TTTAACACACCGAGTGGGGGGACGACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGAATGTTTCAGGAGAT 133031788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 TTTAACACACCGAGTGGGGGGACGACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGAATGTTTCAGGAGAT 1321

133031789 TGAACTTCCACCAGAACTGTTTCAGGGGCCCGTTTCAGCACAGCCACCCCCAACACTGGA 133031848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 TGAACTTCCACCAGAACTGTTTCAGGGGCCCGTTTCAGCACAGCCACCCCCAACACTGGA 1381

133031849 AATTAATATAAAAACCTTTCTTTTCTAATTCAAAAATGGAAAATGATATCTTCTTGTTTC 133031908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 AATTAATATAAAAACCTTTCTTTTCTAATTCAAAAATGGAAAATGATATCTTCTTGTTTC 1441

133031909 AATTGCTAGTGAGGTTCAATATGTCTTTCAAGCGTTCACTAGATATTTTTGGTATGAATT 133031968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 AATTGCTAGTGAGGTTCAATATGTCTTTCAAGCGTTCACTAGATATTTTTGGTATGAATT 1501

133031969 TCTTATTTTGTAAACTGTCAGTTTCTTTGCAAATTTTTTCATGGGAGTTTTAGTGCTTTT 133032028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 TCTTATTTTGTAAACTGTCAGTTTCTTTGCAAATTTTTTCATGGGAGTTTTAGTGCTTTT 1561

133032029 ATTTTTAGTTGGAATGAGGACCTTATGTTGATGATGTTATCTGTTTTTTTTTTTGTTGTT 133032088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     1562 ATTTTTAGTTGGAATGAGGACCTTATGTTGATGATGTTATCTG-TTTTTTTTTTGTTGTT 1620

133032089 GTTTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 133032148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTTTGTTTGTTTGTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 1680

133032149 GCGTGATCTCTGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAG 133032208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCGTGATCTCTGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAG 1740

133032209 CCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGATGCGTGCCACCACGTCCGGCTAATTTTTGTATTTT 133032268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGATGCGTGCCACCACGTCCGGCTAATTTTTGTATTTT 1800

133032269 TAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGACCTCAAGTG 133032328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGACCTCAAGTG 1860

133032329 ATCCACTCACCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGC 133032388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1861 ATCCACTCACCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCCGGC 1920

133032389 CTTAACTGTTTCTTTTTTTTTTTAAGTGTACTTAGTATTTTTCCTGGTTGCTTGTCTTTT 133032448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTAACTGTTTCTTTTTTTTTTTAAGTGTACTTAGTATTTTTCCTGGTTGCTTGTCTTTT 1980

133032449 AGTATTTGTAATTCTTAGAAGTTTTGAAGTTTTAAATGTTTATGTAGAGAAATCTATTG- 133032507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     1981 AGTATTTGTAATTCTTAGAAGTTTTGAAGTTTTAAATGTTTATGTAGAGAAATCTATTGT 2040

133032508 TTTTTTTTCTTTGTGATTTCTTCACTTAGGTGCTTATAAAGGTTTTTTTTGTTTGTTTGT 133032567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTTTTTCTTTGTGATTTCTTCACTTAGGTGCTTATAAAGGTTTTTTTTGTTTGTTTGT 2100

133032568 TTGTTTGTTTTTTTTTTTCCCTATCACAAAACCAGTTAGGCAGATTTTCTAGGGTTTGTG 133032627
          |||||  ||||||||||| ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGTT--TTTTTTTTTTT-CCTATCACAAAATCAGTTAGGCAGATTTTCTAGGGTTTGTG 2157

133032628 TATGTGTGTGTTTTGTTTTATTTTCCTCTCTTCACATTTAATTCTTCAACTTGAAATTTT 133032687
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TATGTGTGTGTTTTGTCTTATTTTCCTCTCTTCACATTTAATTCTTCAACTTGAAATTTT 2217

133032688 AAAAATTGGTAGGCTGGGCTCAGTGGCTCACACTTGTAATGCCAGTACTTTGGGAGGCTG 133032747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 AAAAATTGGTAGGCTGGGCTCAGTGGCTCACACTTGTAATGCCAGTACTTTGGGAGGCTG 2277

133032748 GGGTGTGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGGTCAAGGTTGCAGGGAGCTATGATTGTGCCAC 133032807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 GGGTGTGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGGTCAAGGTTGCAGGGAGCTATGATTGTGCCAC 2337

133032808 TGCCCTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAACAACAACAACAA 133032867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TGCCCTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAACAACAACAACAA 2397

133032868 AAAGAAAAACAGAAAATCTCAATAAAGTGTGGACTTGGGTTAATAATTATGTATCAATAT 133032927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 AAAGAAAAACAGAAAATCTCAATAAAGTGTGGACTTGGGTTAATAATTATGTATCAATAT 2457

133032928 TTATTTATTAGTTGTGATAAATGTAGCATAGTAATGTAAGATGTTAATAACATCAGCCTT 133032987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TTATTTATTAGTTGTGATAAATGTAGCATAGTAATGTAAGATGTTAATAACATCAGCCTT 2517

133032988 CTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCACACCACCACACCTGGCTAACTTTTTGTAGAGATGG 133033047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 CTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCACACCACCACACCTGGCTAACTTTTTGTAGAGATGG 2577

133033048 GGTCTTGCTATGTTGCCTAGGCCGATGTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGGTCTTCCTGCCT 133033107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 GGTCTTGCTATGTTGCCTAGGCCGATGTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGGTCTTCCTGCCT 2637

133033108 CTGCCTCCCAAAGCAGGGGAATTACATACATGAGCCACGGTGCCCAGCCTTCCTCAGTTT 133033167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 CTGCCTCCCAAAGCAGGGGAATTACATACATGAGCCACGGTGCCCAGCCTTCCTCAGTTT 2697

133033168 TTCTTTAATGCCCTTTTTCTGCTCCAGGATCCCATCCAGGATACATTAATTGTGTCTTCT 133033227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TTCTTTAATGCCCTTTTTCTGCTCCAGGATCCCATCCAGGATACATTAATTGTGTCTTCT 2757

133033228 TCAGCTCCTCAGGTTGTGAGTTTCTCAGGCTTACTTTCGTTTTGGTGAAATTGACAGTTT 133033287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TCAGCTCCTCAGGTTGTGAGTTTCTCAGGCTTACTTTCGTTTTGGTGAAATTGACAGTTT 2817

133033288 TGAGGAATACTGGTCAGCTCTTTTCCCTCAGTCATTATTTGTCTAATGTTTTTTTTCCAG 133033347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 TGAGGAATACTGGTCAGCTCTTTTCCCTCAGTCATTATTTGTCTAATGTTTTTTTTCCAG 2877

133033348 TTAGACTGGGTAATGTTTTGGGAGGAAGACCCAGCATTAAAATACCATTCTCATCGTCTC 133033407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TTAGACTGGGTAATGTTTTGGGAGGAAGACCCAGCATTAAAATACCATTCTCATCGTCTC 2937

133033408 ATATCAAGAGCACACGCTATCACGGTGATGGAACGCTGTTGATGTTAAGCTTGATTGCCT 133033467
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 ATATCAAGAGCACACGCTATCACAGTGATGGAACGCTGTTGATGTTAAGCTTGATTGCCT 2997

133033468 GACTCGGATAGTATTTTTCAGATTTCTCCACTATAGAGTTACTCTTTTTCCCCTCTCTCT 133033527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 GACTCGGATAGTATTTTTCAGATTTCTCCACTATAGAGTTACTCTTTTTCCCCTCTCTCT 3057

133033528 TTCCATACTGGGCTCTCTGGAAGAGAGTCACTTACTGTGTGCAGCCCACGTTTAAAAAGC 133033587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 TTCCATACTGGGCTCTCTGGAAGAGAGTCACTTACTGTGTGCAGCCCACGTTTAAAAAGC 3117

133033588 GGGGAGCCATGATCCACGTCCTTGGTGGGGGAGTATCTATCTACATGGATTATTTGGAAT 133033647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 GGGGAGCCATGATCCACGTCCTTGGTGGGGGAGTATCTATCTACATGGATTATTTGGAAT 3177

133033648 TATTCTGCATGAGAGTTGTCTCTTCTGCTCCATTTATTAATTAATTCAATCACTTGTCTA 133033707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 TATTCTGCATGAGAGTTGTCTCTTCTGCTCCATTTATTAATTAATTCAATCACTTGTCTA 3237

133033708 CATCAGCATAGAATCATGGCTAGCTATTTTATACTTTGTGTTATGATCCTAAACCACTTT 133033767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 CATCAGCATAGAATCATGGCTAGCTATTTTATACTTTGTGTTATGATCCTAAACCACTTT 3297

133033768 ATTTTGCTCCTCAAATGTTTCTGACTGTGGTCATCGGGAGCTCGTTCAGTTGGTTTCTGT 133033827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 ATTTTGCTCCTCAAATGTTTCTGACTGTGGTCATCGGGAGCTCGTTCAGTTGGTTTCTGT 3357

133033828 GTCCCTTGGACACCCCTCTTGTTGTGCACGTGTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCGT 133033887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GTCCCTTGGACACCCCTCTTGTTGTGCACGTGTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCGT 3417

133033888 TTTTCCCACATTCCTACTTTTTGGCACTGGTAGTGGCTCCAGGCTCATCTTAGGTATTTC 133033947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 TTTTCCCACATTCCTACTTTTTGGCACTGGTAGTGGCTCCAGGCTCATCTTAGGTATTTC 3477

133033948 CTGCCTCAGTCCTTGAATTCGCTATTTCTCCAAGGAGCCCTGCTTCCTGTGATTGGAAAC 133034007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 CTGCCTCAGTCCTTGAATTCGCTATTTCTCCAAGGAGCCCTGCTTCCTGTGATTGGAAAC 3537

133034008 CAGGATATCCGTGCTAAGTGTGTTTGTTGGTACTGAGGTGCTGTTACTTCTAAAACCTCC 133034067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 CAGGATATCCGTGCTAAGTGTGTTTGTTGGTACTGAGGTGCTGTTACTTCTAAAACCTCC 3597

133034068 CTTAGCTGACAGGGCAAGGAGTTGTATGTTGTATATATAACCTGTGTTTGTACTTGTATC 133034127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 CTTAGCTGACAGGGCAAGGAGTTGTATGTTGTATATATAACCTGTGTTTGTACTTGTATC 3657

133034128 TATACATAGTTTTATATGTAATCATCCGTGTCTATATTAAGCTAAACATGAGTTCATGCT 133034187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 TATACATAGTTTTATATGTAATCATCCGTGTCTATATTAAGCTAAACATGAGTTCATGCT 3717

133034188 GATATCTTCAACTCTAATTTATATTCGATATTGGATTAGATGTATTAGGTATATGGAGAG 133034247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 GATATCTTCAACTCTAATTTATATTCGATATTGGATTAGATGTATTAGGTATATGGAGAG 3777

133034248 TCAAACCTCTTCCTGTTCCTTATCTAGAACCTCCACGTCTAACAGTCAGAAATCTGTCTC 133034307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TCAAACCTCTTCCTGTTCCTTATCTAGAACCTCCACGTCTAACAGTCAGAAATCTGTCTC 3837

133034308 CTGCCACCCACCATCCCTTTACTTTACTGTTTAGTTCCAGTATACATTTAAAGTGGTTTC 133034367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 CTGCCACCCACCATCCCTTTACTTTACTGTTTAGTTCCAGTATACATTTAAAGTGGTTTC 3897

133034368 AGAATTGTTGAGTGGGACCCCCACGGGAAACAGCTTTATTAACTAGAATACAGTTCTTTT 133034427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 AGAATTGTTGAGTGGGACCCCCACGGGAAACAGCTTTATTAACTAGAATACAGTTCTTTT 3957

133034428 GCTTTTAGTCTTAACAGACTCCATTCATTTCCAAAATTACTTAGGCCAACACCTTCTTCA 133034487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 GCTTTTAGTCTTAACAGACTCCATTCATTTCCAAAATTACTTAGGCCAACACCTTCTTCA 4017

133034488 GCTTCTTCTTCTTTTTTAAAAAAAATAAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGAAT 133034547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 GCTTCTTCTTCTTTTTTAAAAAAAATAAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGAAT 4077

133034548 CTCACCTTGTCTCCCAGGCTGGAATACAGTGGCGCAATCTTGGCCCACTGCAACCTCCAC 133034607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 CTCACCTTGTCTCCCAGGCTGGAATACAGTGGCGCAATCTTGGCCCACTGCAACCTCCAC 4137

133034608 CTCCTGGGTTTAAGGAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTTAGTAGCTGGGATTACAGATGTG 133034667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 CTCCTGGGTTTAAGGAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTTAGTAGCTGGGATTACAGATGTG 4197

133034668 TGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGC 133034727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGC 4257

133034728 CAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAAGGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTCCT 133034787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 CAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAAGGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTCCT 4317

133034788 GGGATTACAGGTGTGAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAG 133034847
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 GGGATTACAGATGTGAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAG 4377

133034848 ACAGGGTCTCATTCTGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTT 133034907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 ACAGGGTCTCATTCTGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTT 4437

133034908 CCTCCATCTCCCCAAGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCAC 133034967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CCTCCATCTCCCCAAGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCAC 4497

133034968 AGGCACATGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAG 133035027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 AGGCACATGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAG 4557

133035028 GGTCTTGCCATATTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCT 133035087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 GGTCTTGCCATATTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCT 4617

133035088 TGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCT 133035147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCT 4677

133035148 TTTTATTCATATTCTTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATG 133035207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 TTTTATTCATATTCTTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATG 4737

133035208 TAGAAAAACTTGTCAACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGT 133035267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 TAGAAAAACTTGTCAACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGT 4797

133035268 TAAATCTTGATTTTGGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATC 133035327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TAAATCTTGATTTTGGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATC 4857

133035328 AGACATGCCTCTTGTTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTT 133035387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 AGACATGCCTCTTGTTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTT 4917

133035388 TGTAAAGATTCAGGTTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATTTT 133035447
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4918 TGTAAAGATTCAGGTTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATCTT 4977

133035448 AAGATAGTTTTGGTTTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACA 133035507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 AAGATAGTTTTGGTTTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACA 5037

133035508 AATGAGTATTGCTAGTATGTTGGAAAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGC 133035567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 AATGAGTATTGCTAGTATGTTGGAAAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGC 5097

133035568 TTCTTTTACTAAAGTTTTTTTTAACTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCT 133035627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 TTCTTTTACTAAAGTTTTTTTTAACTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCT 5157

133035628 AGGTTGAGAGTCACAGCTTGTCCAAATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATAT 133035687
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 AGGTTGAGAGCCACAGCTTGTCCAAATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATAT 5217

133035688 TTCACGTTTTAAGTGTTTTGTATTATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATA 133035747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 TTCACGTTTTAAGTGTTTTGTATTATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATA 5277

133035748 ATGGTGATGGCTGCAGTTATCTTGTCTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTGAGACTGAGTCTC 133035807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 ATGGTGATGGCTGCAGTTATCTTGTCTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTGAGACTGAGTCTC 5337

133035808 ACTCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCCC 133035867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 ACTCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCCC 5397

133035868 CCAGGCTCAAGCGATTCTCTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTATTATAGGCATGCGC 133035927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 CCAGGCTCAAGCGATTCTCTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTATTATAGGCATGCGC 5457

133035928 CACCATGCCCAGCTAATTTTCGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAG 133035987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 CACCATGCCCAGCTAATTTTCGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAG 5517

133035988 GCTGGTCCCAAACTCCTGACCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 133036047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 GCTGGTCCCAAACTCCTGACCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 5577

133036048 ATTACAGGCGTGCGCCTCCGCGCCCGGCCATCTTGTCTTGCTTTTGATTTTGCACCACTC 133036107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 ATTACAGGCGTGCGCCTCCGCGCCCGGCCATCTTGTCTTGCTTTTGATTTTGCACCACTC 5637

133036108 ATTGTATGATATTGATTCTTGGTTTGAGTTTTTGTCATCAAGTGAAAGAAGATGCATTCA 133036167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 ATTGTATGATATTGATTCTTGGTTTGAGTTTTTGTCATCAAGTGAAAGAAGATGCATTCA 5697

133036168 TTCCTAATTTTACTAAAAAAAAATAAACTCAAAAAACAAGAAAAAGCAAAAACAAAACAA 133036227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 TTCCTAATTTTACTAAAAAAAAATAAACTCAAAAAACAAGAAAAAGCAAAAACAAAACAA 5757

133036228 AAAATCCAAACAGGGATGGGTGTTGAATTTTAGCAAGTGATTTTCTGCTTTGTTGCAATG 133036287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 AAAATCCAAACAGGGATGGGTGTTGAATTTTAGCAAGTGATTTTCTGCTTTGTTGCAATG 5817

133036288 TTTATAAGATCCTTCTCCTGTTGACCTATTAATGTGATACATTAATTTTTTTTTTTTTTT 133036347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 TTTATAAGATCCTTCTCCTGTTGACCTATTAATGTGATACATTAATTTTTTTTTTTTTTT 5877

133036348 GAGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGACTCAC 133036407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 GAGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGACTCAC 5937

133036408 TGCAGCTTCCACCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGG 133036467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 TGCAGCTTCCACCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGG 5997

133036468 ACTACAGGTGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTT 133036527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 ACTACAGGTGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTT 6057

133036528 TCACTATATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCA 133036587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 TCACTATATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCA 6117

133036588 GCCTCCCAAAGTACTGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAATGCGTTAATTT 133036647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 GCCTCCCAAAGTACTGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAATGCGTTAATTT 6177

133036648 TCAACTATTTTTGCATTTCTTGCATAAGTCCTGCTTGGTCACGGTGGATTATTCTTTAAT 133036707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 TCAACTATTTTTGCATTTCTTGCATAAGTCCTGCTTGGTCACGGTGGATTATTCTTTAAT 6237

133036708 ATACAGCTGGATGATAGTTTCCAGCATTTTGCTTAGAGGTTTTGCCTTTTTCCATTTCAT 133036767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 ATACAGCTGGATGATAGTTTCCAGCATTTTGCTTAGAGGTTTTGCCTTTTTCCATTTCAT 6297

133036768 GTGTGCAATCAGTAAGTGGTGTTTTTCCTTTGTGTTTTTTGTCAAGTTTTACCATCAGGG 133036827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 GTGTGCAATCAGTAAGTGGTGTTTTTCCTTTGTGTTTTTTGTCAAGTTTTACCATCAGGG 6357

133036828 TTTAGCTTTTTCAGTTAATAATCCATTCCCTTCAAGAATCTCAAAATTAATACATGCTTG 133036887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 TTTAGCTTTTTCAGTTAATAATCCATTCCCTTCAAGAATCTCAAAATTAATACATGCTTG 6417

133036888 TAAAATATTCTACTACTACTCTCAAGAGGTGAAAACACTTTTAACACTCTGGTGTCCTTC 133036947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 TAAAATATTCTACTACTACTCTCAAGAGGTGAAAACACTTTTAACACTCTGGTGTCCTTC 6477

133036948 CAGATCTTGTGTGCATGTATGTGTATACATTCACTCGTGTTAAACATACCTACGTTAAAA 133037007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6478 CAGATCTTGTGTGCATGTATGTGTATACATTCACTCGTGTTAAACATACCTACGTTAAAA 6537

133037008 AATTATAGTACGTAAAGCATTTTACAACTTGCTTTCTTCCCCCCACATAATATGGCATGA 133037067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6538 AATTATAGTACGTAAAGCATTTTACAACTTGCTTTCTTCCCCCCACATAATATGGCATGA 6597

133037068 ATATCTCTTCCTGTCAGGAAACAGAGATCCTCCCCATTGTTTTTAATGACTCTATAAGAT 133037127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 ATATCTCTTCCTGTCAGGAAACAGAGATCCTCCCCATTGTTTTTAATGACTCTATAAGAT 6657

133037128 GCCATTGGAGGAATTAGCCTAATTTACCCACCCATCCCCCTACTGTGGAAAA 133037179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 GCCATTGGAGGAATTAGCCTAATTTACCCACCCATCCCCCTACTGTGGAAAA 6709

Alignment time is 9.67054 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [133020642,133044801] =>     24160 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     2062] =>      2062 nucs 'mol-32-3030-221693_2062'

Score:        2046
Aligned:      2067        nucs
Identic:      2061 (100%) nucs =>      1337 (100%)       724 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [133029300,133030642] EXCISED REGION [133034802,133035525]
 second seq =>  [        1,     1337] EXCISED REGION [     1339,     2062]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4159 nucs [133030643,133034801]
 second seq =>         1 nucs [1338,1338]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [133030643,133030646] to [133034802,133034805]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

133029300 CTGCAGCCTCGAACTCCTGGGCTCAGGTGACCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 133029359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGCAGCCTCGAACTCCTGGGCTCAGGTGACCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 60

133029360 GACTACAAGCATACGCCACCATGCCTGGCTGATTTTTAAATTTTTTATAGACATGGAGTC 133029419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACTACAAGCATACGCCACCATGCCTGGCTGATTTTTAAATTTTTTATAGACATGGAGTC 120

133029420 TCTCTGTATTGCCCAGGCTAGTCTCAAACTCCTGGCCTCAGTGATCCTCCCACTTAGGCC 133029479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTCTGTATTGCCCAGGCTAGTCTCAAACTCCTGGCCTCAGTGATCCTCCCACTTAGGCC 180

133029480 TCCCAAAGTGCTGAAATTACAAGCATGAGCCACTGCACCCAGCCTCCCCAGCGTTTTTTA 133029539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCCAAAGTGCTGAAATTACAAGCATGAGCCACTGCACCCAGCCTCCCCAGCGTTTTTTA 240

133029540 ATGGAAAATTTCAAACTTACAGTAAAATGGGGAGAAACATACATGGAACCGCCTATGCCC 133029599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGGAAAATTTCAAACTTACAGTAAAATGGGGAGAAACATACATGGAACCGCCTATGCCC 300

133029600 ACCGAGAGCCTCTGAGTCATATTTTGCTTTATCACATCTCTCTATCATTCACCCCTCTGT 133029659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCGAGAGCCTCTGAGTCATATTTTGCTTTATCACATCTCTCTATCATTCACCCCTCTGT 360

133029660 CAAGGATAGCTTTATAAAGCAACAAACAAACAAACAAACAACCCCCCCAAATAAAACACA 133029719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAGGATAGCTTTATAAAGCAACAAACAAACAAACAAACAACCCCCCCAAATAAAACACA 420

133029720 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCACAGATTCCTTGCTAAATTGT 133029779
          |||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||
      421 CACACACACACACACACACACACACACACAC------GCACAGATTCCTTGCTAAATTGT 474

133029780 ACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGTGGCCATTGGCTGTATGAGCCAGCA 133029839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      475 ACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGTGGCCATTGGCTGTATGAGCCAGCA 534

133029840 AGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAATACCATTACAGGTTCTTAGAAAAT 133029899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      535 AGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAATACCATTACAGGTTCTTAGAAAAT 594

133029900 GGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGCTTCAGGCTGAGTTTGTGGTCTAGG 133029959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      595 GGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGCTTCAGGCTGAGTTTGTGGTCTAGG 654

133029960 GGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGCACCACAGGGTTTTGCAGCTCAAAG 133030019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      655 GGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGCACCACAGGGTTTTGCAGCTCAAAG 714

133030020 CTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGAACATCAGATGGACAGCTTCTATCT 133030079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 CTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGAACATCAGATGGACAGCTTCTATCT 774

133030080 TGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGGAGGTGGGCTGTGAAGTGTGTTCTG 133030139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 TGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGGAGGTGGGCTGTGAAGTGTGTTCTG 834

133030140 GCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCCCCAGCTCTCTCACCCACTTTCTGA 133030199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 GCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCCCCAGCTCTCTCACCCACTTTCTGA 894

133030200 ATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGGAGCTTAGAGATCGTTGAATCTACC 133030259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 ATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGGAGCTTAGAGATCGTTGAATCTACC 954

133030260 CCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGACACTGATGAGACTTTCCCAAGGCC 133030319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 CCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGACACTGATGAGACTTTCCCAAGGCC 1014

133030320 ACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCCACATTTGTCTCTGAAATATGTGGC 133030379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 ACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCCACATTTGTCTCTGAAATATGTGGC 1074

133030380 TCCAGTGGCCCAGCAGGATAGCAGCCTTTCAGAGCCAGATGTCGTGTCCTGAAGCCCAGA 133030439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 TCCAGTGGCCCAGCAGGATAGCAGCCTTTCAGAGCCAGATGTCGTGTCCTGAAGCCCAGA 1134

133030440 CCAGGGTTCCTGAGACTGTCCTCGCTGCCCCATTTGTGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCCA 133030499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 CCAGGGTTCCTGAGACTGTCCTCGCTGCCCCATTTGTGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCCA 1194

133030500 CCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCACTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCAG 133030559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 CCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCACTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCAG 1254

133030560 CCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTATGAAACAAAAATCCAGTTCTCCAT 133030619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 CCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTATGAAACAAAAATCCAGTTCTCCAT 1314

133030620 CCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCC 133030642
          |||||||||||||||||||||||
     1315 CCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCC 1337

EXCISED REGION

133034802 GAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGTCTCATTC 133034861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 GAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGTCTCATTC 1398

133034862 TGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCATCTCCCCA 133034921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 TGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCATCTCCCCA 1458

133034922 AGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGCCACC 133034981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 AGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGCCACC 1518

133034982 ACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTGCCATATT 133035041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 ACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTGCCATATT 1578

133035042 GCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGT 133035101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 GCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGT 1638

133035102 GCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATTCATATTC 133035161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 GCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATTCATATTC 1698

133035162 TTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAAACTTGTC 133035221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 TTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAAACTTGTC 1758

133035222 AACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCTTGATTTT 133035281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 AACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCTTGATTTT 1818

133035282 GGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATGCCTCTTG 133035341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 GGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATGCCTCTTG 1878

133035342 TTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAGATTCAGG 133035401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 TTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAGATTCAGG 1938

133035402 TTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATTTTAAGATAGTTTTGGT 133035461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 TTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATTTTAAGATAGTTTTGGT 1998

133035462 TTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGTATTGCTA 133035521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 TTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGTATTGCTA 2058

133035522 GTAT 133035525
          ||||
     2059 GTAT 2062

Alignment time is 3.45443 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [133020642,133044801] =>     24160 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     4275] =>      4275 nucs 'mol-32-3327-026627_4275'

Score:        4264
Aligned:      4275        nucs
Identic:      4274 (100%) nucs =>       736 (100%)      3538 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [133029907,133030642] EXCISED REGION [133034802,133038340]
 second seq =>  [        1,      736] EXCISED REGION [      738,     4275]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4159 nucs [133030643,133034801]
 second seq =>         1 nucs [737,737]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [133030643,133030646] to [133034802,133034805]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

133029907 ACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGCTTCAGGCTGAGTTTGTGGTCTAGGGGCTTGG 133029966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGCTTCAGGCTGAGTTTGTGGTCTAGGGGCTTGG 60

133029967 AGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGCACCACAGGGTTTTGCAGCTCAAAGCTCAGAA 133030026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGCACCACAGGGTTTTGCAGCTCAAAGCTCAGAA 120

133030027 GCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGAACATCAGATGGACAGCTTCTATCTTGGAGTC 133030086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGAACATCAGATGGACAGCTTCTATCTTGGAGTC 180

133030087 AGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGGAGGTGGGCTGTGAAGTGTGTTCTGGCACTTA 133030146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGGAGGTGGGCTGTGAAGTGTGTTCTGGCACTTA 240

133030147 AGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCCCCAGCTCTCTCACCCACTTTCTGAATTGTTC 133030206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCCCCAGCTCTCTCACCCACTTTCTGAATTGTTC 300

133030207 TGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGGAGCTTAGAGATCGTTGAATCTACCCCTTTAT 133030266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGGAGCTTAGAGATCGTTGAATCTACCCCTTTAT 360

133030267 CTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGACACTGATGAGACTTTCCCAAGGCCACCTGCC 133030326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGACACTGATGAGACTTTCCCAAGGCCACCTGCC 420

133030327 AGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCCACATTTGTCTCTGAAATATGTGGCTCCAGTG 133030386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCCACATTTGTCTCTGAAATATGTGGCTCCAGTG 480

133030387 GCCCAGCAGGATAGCAGCCTTTCAGAGCCAGATGTCGTGTCCTGAAGCCCAGACCAGGGT 133030446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCCAGCAGGATAGCAGCCTTTCAGAGCCAGATGTCGTGTCCTGAAGCCCAGACCAGGGT 540

133030447 TCCTGAGACTGTCCTCGCTGCCCCATTTGTGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCCACCTCCCA 133030506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCTGAGACTGTCCTCGCTGCCCCATTTGTGGCCATGAGCCTCAGGAAGCCCACCTCCCA 600

133030507 CCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCACTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCAGCCTTCAC 133030566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCACTGAGCTGGTGGGCAGTTCTCCAGCCTTCAC 660

133030567 CAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTATGAAACAAAAATCCAGTTCTCCATCCTGGTT 133030626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTATGAAACAAAAATCCAGTTCTCCATCCTGGTT 720

133030627 CCCCAAATTAGCTTCC 133030642
          ||||||||||||||||
      721 CCCCAAATTAGCTTCC 736

EXCISED REGION

133034802 GAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGTCTCATTC 133034861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      738 GAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGTCTCATTC 797

133034862 TGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCATCTCCCCA 133034921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 TGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCATCTCCCCA 857

133034922 AGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGCCACC 133034981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 AGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGCCACC 917

133034982 ACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTGCCATATT 133035041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 ACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTGCCATATT 977

133035042 GCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGT 133035101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 GCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGT 1037

133035102 GCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATTCATATTC 133035161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 GCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATTCATATTC 1097

133035162 TTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAAACTTGTC 133035221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 TTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAAACTTGTC 1157

133035222 AACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCTTGATTTT 133035281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 AACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCTTGATTTT 1217

133035282 GGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATGCCTCTTG 133035341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 GGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATGCCTCTTG 1277

133035342 TTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAGATTCAGG 133035401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 TTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAGATTCAGG 1337

133035402 TTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATTTTAAGATAGTTTTGGT 133035461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 TTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATTTTAAGATAGTTTTGGT 1397

133035462 TTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGTATTGCTA 133035521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 TTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGTATTGCTA 1457

133035522 GTATGTTGGAAAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGCTTCTTTTACTAAAG 133035581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 GTATGTTGGAAAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGCTTCTTTTACTAAAG 1517

133035582 TTTTTTTTAACTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCTAGGTTGAGAGTCAC 133035641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 TTTTTTTTAACTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCTAGGTTGAGAGTCAC 1577

133035642 AGCTTGTCCAAATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATATTTCACGTTTTAAGT 133035701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 AGCTTGTCCAAATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATATTTCACGTTTTAAGT 1637

133035702 GTTTTGTATTATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATAATGGTGATGGCTGC 133035761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 GTTTTGTATTATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATAATGGTGATGGCTGC 1697

133035762 AGTTATCTTGTCTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTCTTGCCCAG 133035821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 AGTTATCTTGTCTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTCTTGCCCAG 1757

133035822 GCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCAGGCTCAAGCGA 133035881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 GCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCAGGCTCAAGCGA 1817

133035882 TTCTCTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTATTATAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCT 133035941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 TTCTCTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTATTATAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCT 1877

133035942 AATTTTCGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCCCAAACT 133036001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 AATTTTCGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCCCAAACT 1937

133036002 CCTGACCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGCG 133036061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 CCTGACCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGCG 1997

133036062 CCTCCGCGCCCGGCCATCTTGTCTTGCTTTTGATTTTGCACCACTCATTGTATGATATTG 133036121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 CCTCCGCGCCCGGCCATCTTGTCTTGCTTTTGATTTTGCACCACTCATTGTATGATATTG 2057

133036122 ATTCTTGGTTTGAGTTTTTGTCATCAAGTGAAAGAAGATGCATTCATTCCTAATTTTACT 133036181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 ATTCTTGGTTTGAGTTTTTGTCATCAAGTGAAAGAAGATGCATTCATTCCTAATTTTACT 2117

133036182 AAAAAAAAATAAACTCAAAAAACAAGAAAAAGCAAAAACAAAACAAAAAATCCAAACAGG 133036241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 AAAAAAAAATAAACTCAAAAAACAAGAAAAAGCAAAAACAAAACAAAAAATCCAAACAGG 2177

133036242 GATGGGTGTTGAATTTTAGCAAGTGATTTTCTGCTTTGTTGCAATGTTTATAAGATCCTT 133036301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 GATGGGTGTTGAATTTTAGCAAGTGATTTTCTGCTTTGTTGCAATGTTTATAAGATCCTT 2237

133036302 CTCCTGTTGACCTATTAATGTGATACATTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGAGACGGAGTCT 133036361
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     2238 CTCCTGTTGACCTATTAATGTGATACATTAA-TTTTTTTTTTTTTTGAGAGACGGAGTCT 2296

133036362 CACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGACTCACTGCAGCTTCCACCT 133036421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 CACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGACTCACTGCAGCTTCCACCT 2356

133036422 CCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCA 133036481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 CCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCA 2416

133036482 CCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATATGTTGG 133036541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 CCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATATGTTGG 2476

133036542 CTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTAC 133036601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 CTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTAC 2536

133036602 TGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAATGCGTTAATTTTCAACTATTTTTGC 133036661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 TGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAATGCGTTAATTTTCAACTATTTTTGC 2596

133036662 ATTTCTTGCATAAGTCCTGCTTGGTCACGGTGGATTATTCTTTAATATACAGCTGGATGA 133036721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 ATTTCTTGCATAAGTCCTGCTTGGTCACGGTGGATTATTCTTTAATATACAGCTGGATGA 2656

133036722 TAGTTTCCAGCATTTTGCTTAGAGGTTTTGCCTTTTTCCATTTCATGTGTGCAATCAGTA 133036781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 TAGTTTCCAGCATTTTGCTTAGAGGTTTTGCCTTTTTCCATTTCATGTGTGCAATCAGTA 2716

133036782 AGTGGTGTTTTTCCTTTGTGTTTTTTGTCAAGTTTTACCATCAGGGTTTAGCTTTTTCAG 133036841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 AGTGGTGTTTTTCCTTTGTGTTTTTTGTCAAGTTTTACCATCAGGGTTTAGCTTTTTCAG 2776

133036842 TTAATAATCCATTCCCTTCAAGAATCTCAAAATTAATACATGCTTGTAAAATATTCTACT 133036901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 TTAATAATCCATTCCCTTCAAGAATCTCAAAATTAATACATGCTTGTAAAATATTCTACT 2836

133036902 ACTACTCTCAAGAGGTGAAAACACTTTTAACACTCTGGTGTCCTTCCAGATCTTGTGTGC 133036961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 ACTACTCTCAAGAGGTGAAAACACTTTTAACACTCTGGTGTCCTTCCAGATCTTGTGTGC 2896

133036962 ATGTATGTGTATACATTCACTCGTGTTAAACATACCTACGTTAAAAAATTATAGTACGTA 133037021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 ATGTATGTGTATACATTCACTCGTGTTAAACATACCTACGTTAAAAAATTATAGTACGTA 2956

133037022 AAGCATTTTACAACTTGCTTTCTTCCCCCCACATAATATGGCATGAATATCTCTTCCTGT 133037081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 AAGCATTTTACAACTTGCTTTCTTCCCCCCACATAATATGGCATGAATATCTCTTCCTGT 3016

133037082 CAGGAAACAGAGATCCTCCCCATTGTTTTTAATGACTCTATAAGATGCCATTGGAGGAAT 133037141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 CAGGAAACAGAGATCCTCCCCATTGTTTTTAATGACTCTATAAGATGCCATTGGAGGAAT 3076

133037142 TAGCCTAATTTACCCACCCATCCCCCTACTGTGGAAAATAGGCTGCTTTCAGTTTCTTCA 133037201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 TAGCCTAATTTACCCACCCATCCCCCTACTGTGGAAAATAGGCTGCTTTCAGTTTCTTCA 3136

133037202 CAATAAACACACACATATTTGCAAACATATCTACAGAATAGATTCCCAGAGATAAAATTG 133037261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 CAATAAACACACACATATTTGCAAACATATCTACAGAATAGATTCCCAGAGATAAAATTG 3196

133037262 CTTTGTTAAAGTATAGGAGCATTTTCCATTTGGAAAGACACCATCCAACTGCCCTCAAAC 133037321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 CTTTGTTAAAGTATAGGAGCATTTTCCATTTGGAAAGACACCATCCAACTGCCCTCAAAC 3256

133037322 ACACTGCGCCATCTTGCGCCTGGACCCACGGAAGATGAGACTGTGTTTCCCCACACCGCC 133037381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 ACACTGCGCCATCTTGCGCCTGGACCCACGGAAGATGAGACTGTGTTTCCCCACACCGCC 3316

133037382 GCCAGCATCCGGGACATCACTCTGCCATTTTTTCCTTGTTTTTTTGCTAGTTTCCTAGGT 133037441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 GCCAGCATCCGGGACATCACTCTGCCATTTTTTCCTTGTTTTTTTGCTAGTTTCCTAGGT 3376

133037442 GGGAGATGGTGTCCTGCCTTAATCAGCATTCATTGATCGTTGGTGACCTTCCAGTCTTCT 133037501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 GGGAGATGGTGTCCTGCCTTAATCAGCATTCATTGATCGTTGGTGACCTTCCAGTCTTCT 3436

133037502 GGAGTTTCTCCCTGGGTGTCTCTGGGGCTCCTGCGGCTCCATCATCTTTCCCAAGGGAGG 133037561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 GGAGTTTCTCCCTGGGTGTCTCTGGGGCTCCTGCGGCTCCATCATCTTTCCCAAGGGAGG 3496

133037562 AAGTGGCTTTCGCCGGTCAGAGGTGAGGATGCAGGCGTGCAGAGCAGATGTGTTTGGGCC 133037621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 AAGTGGCTTTCGCCGGTCAGAGGTGAGGATGCAGGCGTGCAGAGCAGATGTGTTTGGGCC 3556

133037622 ACACACTTGCCTGGGAGCTGGAACGGCTGGGACTCTGGTTGCATGTTCCGGGTTGTGTGT 133037681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3557 ACACACTTGCCTGGGAGCTGGAACGGCTGGGACTCTGGTTGCATGTTCCGGGTTGTGTGT 3616

133037682 GTGTACCTGTGATTTTTATTGTCACCCTGAGTGACATTGCTATTTTTATTTTTTAATTTA 133037741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3617 GTGTACCTGTGATTTTTATTGTCACCCTGAGTGACATTGCTATTTTTATTTTTTAATTTA 3676

133037742 TTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATTGTCT 133037801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3677 TTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATATTGTCT 3736

133037802 CATTGCAACCCCTGCTTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCT 133037861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 CATTGCAACCCCTGCTTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCT 3796

133037862 GGGATTACAGGTGCCTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGATGGAG 133037921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 GGGATTACAGGTGCCTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGATGGAG 3856

133037922 TTTCACTATGTTGGCCAGACTGGTCACGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCCCCTGCCTCG 133037981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 TTTCACTATGTTGGCCAGACTGGTCACGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCCCCTGCCTCG 3916

133037982 GCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGACATTGCTAT 133038041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 GCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCGTGACATTGCTAT 3976

133038042 TAACCAGCCTTGCCTCATGAAATAGAAACCATCAGTCCTTCTTCTGAGGGGAAAATTCAC 133038101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 TAACCAGCCTTGCCTCATGAAATAGAAACCATCAGTCCTTCTTCTGAGGGGAAAATTCAC 4036

133038102 TCTCTTAACCTGGCCCTGGGCACGTCCCTCCTTGGAGGCCTGGAGGCCTGGAGGTCTGAG 133038161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 TCTCTTAACCTGGCCCTGGGCACGTCCCTCCTTGGAGGCCTGGAGGCCTGGAGGTCTGAG 4096

133038162 CGGCCCGTGAGGTGTGAGCTGGACTAGGCACGTCCCTGTCATTCCCAGGGTGCCTGATGG 133038221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 CGGCCCGTGAGGTGTGAGCTGGACTAGGCACGTCCCTGTCATTCCCAGGGTGCCTGATGG 4156

133038222 GTTGGCGGGGAGTGGCCTGGCTGGGCCAAATAACACCTCATCAAAGGGCTTTCCAGGCGA 133038281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 GTTGGCGGGGAGTGGCCTGGCTGGGCCAAATAACACCTCATCAAAGGGCTTTCCAGGCGA 4216

133038282 GGAACTGTGCAGGGGAGGGGTGCTAGAAAGAGATGGCCCAGGGTGCCTGCAGGGGGAGG 133038340
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 GGAACTGTGCAGGGGAGGGGTGCTAGAAAGAGATGGCCCAGGGTGCCTGCAGGGGGAGG 4275

Alignment time is 6.47863 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [133020642,133044801] =>     24160 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     9087] =>      9087 nucs 'mol-32-34b3-113353_9087'

Score:        8850
Aligned:      9095        nucs
Identic:      9067 (100%) nucs =>      8733 (100%)       334 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [133028620,133037377] EXCISED REGION [133037382,133037716]
 second seq =>  [        1,     8748] EXCISED REGION [     8753,     9087]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [133037378,133037381]
 second seq =>         4 nucs [8749,8752]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [133037377,133037377] to [133037381,133037381]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [133037378,133037378] to [133037381,133037381]
 second seq =>         0 nucs

133028620 GAACATTCCCTCGCTCAAGGAACCTGCTCTCCCTGCTCTCCCGCGCCGTTGTGAGACTTC 133028679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAACATTCCCTCGCTCAAGGAACCTGCTCTCCCTGCTCTCCCGCGCCGTTGTGAGACTTC 60

133028680 AGCAAGTGACCTCACCTTCCCGCGCCTTACCGGCCCCACCTATGAAATGGTGAGGATGGC 133028739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCAAGTGACCTCACCTTCCCGCGCCTTACCGGCCCCACCTATGAAATGGTGAGGATGGC 120

133028740 CTCCCAGACTTGCTGAGATGTTGAAATGAGGCATTCCTCTCGAGGACTTGGGACGCTACG 133028799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCCCAGACTTGCTGAGATGTTGAAATGAGGCATTCCTCTCGAGGACTTGGGACGCTACG 180

133028800 AGCCTTTGCAGGGCTTTTCCTTTGGCCAATTCTTAGAATTCGCTCCCAGCGGAGGCTTGG 133028859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCCTTTGCAGGGCTTTTCCTTTGGCCAATTCTTAGAATTCGCTCCCAGCGGAGGCTTGG 240

133028860 AGACCGGAATGGCTCCCAGAGGCAGGCCTTGAGACGAAATGGGGTCCACCACGGACCCTG 133028919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGACCGGAATGGCTCCCAGAGGCAGGCCTTGAGACGAAATGGGGTCCACCACGGACCCTG 300

133028920 CAGTGGGGAGCGGACTCACCCTTGCTGGTCTTGTCCCCTCGCCTGTCTTCCCTGGGGAAA 133028979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGTGGGGAGCGGACTCACCCTTGCTGGTCTTGTCCCCTCGCCTGTCTTCCCTGGGGAAA 360

133028980 GGGCAGCGCCTCTCGTGTGCTGGCCCCGTGGCCTCCACCTGCTGTGTTCTCACAGCTGAG 133029039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGCAGCGCCTCTCGTGTGCTGGCCCCGTGGCCTCCACCTGCTGTGTTCTCACAGCTGAG 420

133029040 TTCCGCCCTAACTCCTTCTTCCCTGCACGCTGCACCTCTGCTTCCCCTTTAACCCCCTGC 133029099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      421 TTCCGCCCTAACTCCTTCTTCCCTGCACGCTGCACCTCTGCTTCCCCTTTAACCCCCTTC 480

133029100 CTTGCAGCTCAGTGTTAGGGGCGCCCTTGAAAGGGTCCCTGGGCGCTCCACTGTAGAGAG 133029159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTGCAGCTCAGTGTTAGGGGCGCCCTTGAAAGGGTCCCTGGGCGCTCCACTGTAGAGAG 540

133029160 TCCCAGGGACAGCGGTTGCTGAGTGAGCTGCAGGTTCCCAGCGGCGAGGAGCAGGACTGC 133029219
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCCAGGGACAGCGGTTGCTGAGTGAGTTGCAGGTTCCCAGCGGCGAGGAGCAGGACTGC 600

133029220 TTTCCACACTTCTTTTTTTTTTTGAGACAAGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGC 133029279
          |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTCCACACTTCTTTTTTTTT--GAGACAAGGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGC 658

133029280 AGTGGCGTGATCACAGCTCGCTGCAGCCTCGAACTCCTGGGCTCAGGTGACCCTCCTGCT 133029339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 AGTGGCGTGATCACAGCTCGCTGCAGCCTCGAACTCCTGGGCTCAGGTGACCCTCCTGCT 718

133029340 TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAAGCATACGCCACCATGCCTGGCTGATTTTTAAA 133029399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAAGCATACGCCACCATGCCTGGCTGATTTTTAAA 778

133029400 TTTTTTATAGACATGGAGTCTCTCTGTATTGCCCAGGCTAGTCTCAAACTCCTGGCCTCA 133029459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 TTTTTTATAGACATGGAGTCTCTCTGTATTGCCCAGGCTAGTCTCAAACTCCTGGCCTCA 838

133029460 GTGATCCTCCCACTTAGGCCTCCCAAAGTGCTGAAATTACAAGCATGAGCCACTGCACCC 133029519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 GTGATCCTCCCACTTAGGCCTCCCAAAGTGCTGAAATTACAAGCATGAGCCACTGCACCC 898

133029520 AGCCTCCCCAGCGTTTTTTAATGGAAAATTTCAAACTTACAGTAAAATGGGGAGAAACAT 133029579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 AGCCTCCCCAGCGTTTTTTAATGGAAAATTTCAAACTTACAGTAAAATGGGGAGAAACAT 958

133029580 ACATGGAACCGCCTATGCCCACCGAGAGCCTCTGAGTCATATTTTGCTTTATCACATCTC 133029639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 ACATGGAACCGCCTATGCCCACCGAGAGCCTCTGAGTCATATTTTGCTTTATCACATCTC 1018

133029640 TCTATCATTCACCCCTCTGTCAAGGATAGCTTTATAAAGCAACAAACAAACAAACAAACA 133029699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TCTATCATTCACCCCTCTGTCAAGGATAGCTTTATAAAGCAACAAACAAACAAACAAACA 1078

133029700 ACCCCCCCAAATAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA-CGC 133029758
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||
     1079 ACCCCCCCAAATAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACAC-----GCGC 1133

133029759 ACAGATTCCTTGCTAAATTGTACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGTGGC 133029818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 ACAGATTCCTTGCTAAATTGTACTGCAGAGTGTTCTTGTGCTGAAGAAATAGACGGTGGC 1193

133029819 CATTGGCTGTATGAGCCAGCAAGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAATAC 133029878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 CATTGGCTGTATGAGCCAGCAAGTCCTTGCAGAGGGATTTGCATTTATTAATCACAATAC 1253

133029879 CATTACAGGTTCTTAGAAAATGGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGCTTC 133029938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 CATTACAGGTTCTTAGAAAATGGACAAAACAGTGGGAAGACATAGTTCTACGTAGGCTTC 1313

133029939 AGGCTGAGTTTGTGGTCTAGGGGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGCACC 133029998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 AGGCTGAGTTTGTGGTCTAGGGGCTTGGAGGCCCCTCTGCTTCCAGGAGTTCTGGGCACC 1373

133029999 ACAGGGTTTTGCAGCTCAAAGCTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGAACA 133030058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 ACAGGGTTTTGCAGCTCAAAGCTCAGAAGCCAAGGCTCTAGACAAAGATTTCTAGGAACA 1433

133030059 TCAGATGGACAGCTTCTATCTTGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGGAGG 133030118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TCAGATGGACAGCTTCTATCTTGGAGTCAGGGGGCAACCAAGCTGGGGGTTGTGAGGAGG 1493

133030119 TGGGCTGTGAAGTGTGTTCTGGCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCCCCA 133030178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 TGGGCTGTGAAGTGTGTTCTGGCACTTAAGCTGGAACACAGGTCACCCTCCGTCTCCCCA 1553

133030179 GCTCTCTCACCCACTTTCTGAATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGGAGC 133030238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 GCTCTCTCACCCACTTTCTGAATTGTTCTGGGGCTTCCGAAGACATCACACTGAAGGAGC 1613

133030239 TTAGAGATCGTTGAATCTACCCCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGACAC 133030298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 TTAGAGATCGTTGAATCTACCCCTTTATCTTACAGTTGGAAAAACTGAGGCTCAGGACAC 1673

133030299 TGATGAGACTTTCCCAAGGCCACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCCACA 133030358
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 TGATGAGATTTTCCCAAGGCCACCTGCCAGGGTGGCGTCATTCCTGAATCATAACCCACA 1733

133030359 TTTGTCTCTGAAATATGTGGCTCCAGTGGCCCAGCAGGATAGCAGCCTTTCAGAGCCAGA 133030418
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1734 TTTGTCTCTGAAATATGTGGCTCCAGTGGCCCAGCAGGATACCAGCCTTTCAGAGCCAGA 1793

133030419 TGTCGTGTCCTGAAGCCCAGACCAGGGTTCCTGAGACTGTCCTCGCTGCCCCATTTGTGG 133030478
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1794 TGTCGTGTCCTGAAGCCCAGACCAGGGTTCCTGAGGCTGTCCTCGCTGCCCCATTTGTGG 1853

133030479 CCATGAGCCTCAGGAAGCCCACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCACTG 133030538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 CCATGAGCCTCAGGAAGCCCACCTCCCACCCCTGCTCTTCCCTCTCCTCTCTGGGCACTG 1913

133030539 AGCTGGTGGGCAGTTCTCCAGCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTATGA 133030598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 AGCTGGTGGGCAGTTCTCCAGCCTTCACCAGGCTCAGCCCCCTCACTCCATCCTCTATGA 1973

133030599 AACAAAAATCCAGTTCTCCATCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCCGAGTGACACCCCCAGG 133030658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 AACAAAAATCCAGTTCTCCATCCTGGTTCCCCAAATTAGCTTCCGAGTGACACCCCCAGG 2033

133030659 TTCAGACGTCGGGGAGACTTCAGCACCATGGAGCCCTTGATCTGTGTAGAGCCCAGGGAG 133030718
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 TTCAGACGTCGGGGAGACTTCAGCATCATGGAGCCCTTGATCTGTGTAGAGCCCAGGGAG 2093

133030719 GCTCACAGTGTAAAGGGGCATGGTTCATTCCACGGGGCTGGTAGCCCTCTGGGACAGGCC 133030778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2094 GCTCACAGTGTAAAGGGGCATGGTTCATTCCATGGGGCTGGTAGCCCTCTGGGACAGGCC 2153

133030779 AGGTGGGGAGTAGAAAGTGACATGTGGTGGCTCAGGTGCCAACTCCTGGCCATGGGCCAG 133030838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 AGGTGGGGAGTAGAAAGTGACATGTGGTGGCTCAGGTGCCAACTCCTGGCCATGGGCCAG 2213

133030839 TAAGCAAGGAAGGGGGCTAAGGAAAGACCCCCCCCTGAGGAAGCAGCCTGTGAGTAGGGC 133030898
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 TAAGCAAGGAAGGGGGCTAAGGAAAGACGCCCCCCTGAGGAAGCAGCCTGTGAGTAGGGC 2273

133030899 CTGAAGAACATCAGTGAATGTTTACTGGGTTTTGGCCGTTTGCCTGGCAGATGCCAGGTG 133030958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 CTGAAGAACATCAGTGAATGTTTACTGGGTTTTGGCCGTTTGCCTGGCAGATGCCAGGTG 2333

133030959 CTGGGAACACAGCAGGGAGAGAGGACTCCCTGGGGCATGTGGAGCTGGCTGGGTAAGGAC 133031018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 CTGGGAACACAGCAGGGAGAGAGGACTCCCTGGGGCATGTGGAGCTGGCTGGGTAAGGAC 2393

133031019 CGGGGGATGGACAGGAGGGCTGATGTGGAGGGACAGGTGTGTGTGGGAGCTGGGTGTGCA 133031078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 CGGGGGATGGACAGGAGGGCTGATGTGGAGGGACAGGTGTGTGTGGGAGCTGGGTGTGCA 2453

133031079 CGGGAGGAGTGGAGCGGGAAAGTGGGGAAGGGCAAGATTGGACACAGCCGTGAGTGCAGG 133031138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 CGGGAGGAGTGGAGCGGGAAAGTGGGGAAGGGCAAGATTGGACACAGCCGTGAGTGCAGG 2513

133031139 GCCGATTGATGCCTTGGCGGACTTGGATTTCCTTTTCCTTCTATGGGCTGTGAACAGCCA 133031198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 GCCGATTGATGCCTTGGCGGACTTGGATTTCCTTTTCCTTCTATGGGCTGTGAACAGCCA 2573

133031199 CCGAGGGCTTCTGAGCAGCAGTTTGGAACTGTGATTTAGGCCTGGCTGTGCCTTTTGAAT 133031258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 CCGAGGGCTTCTGAGCAGCAGTTTGGAACTGTGATTTAGGCCTGGCTGTGCCTTTTGAAT 2633

133031259 CAGCAAATAGAATCCCCTTTGGTGGAAGAGGAACTTGAGAAACGGGTTGTAGCTGTTTGT 133031318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 CAGCAAATAGAATCCCCTTTGGTGGAAGAGGAACTTGAGAAACGGGTTGTAGCTGTTTGT 2693

133031319 TCCAGCTCCCAGAGCTGCACAGCGGGAGGGTTTTCTTAAAGTAAGCCCCTCTCCTAAACC 133031378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 TCCAGCTCCCAGAGCTGCACAGCGGGAGGGTTTTCTTAAAGTAAGCCCCTCTCCTAAACC 2753

133031379 CCAAGAGGCGGGTGCGGGGCAAATCGTGGCGGTTCTAGACTGTTCCTGCTTGGAGACAAA 133031438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 CCAAGAGGCGGGTGCGGGGCAAATCGTGGCGGTTCTAGACTGTTCCTGCTTGGAGACAAA 2813

133031439 CTAAGATCCGTGCTTCGGAAATTTTACAGTTTCTAAATTAAAAATTGTATGTTCCCAGAG 133031498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 CTAAGATCCGTGCTTCGGAAATTTTACAGTTTCTAAATTAAAAATTGTATGTTCCCAGAG 2873

133031499 TAGAAAAGTTAGAAATTTGCTAATCATTGCAAAAGAGCCCTGGTTCCTTTTTTTTTTTTT 133031558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 TAGAAAAGTTAGAAATTTGCTAATCATTGCAAAAGAGCCCTGGTTCCTTTTTTTTTTTTT 2933

133031559 TTTTTTTGAAATTAGTAGTAGAAACCAAGATCTAGTGCTAAAATTTAGGTTGTTTTCAGT 133031618
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 TTTTT--GAAATTAGTAGTAGAAACCAAGATCTAGTGCTAAAATTTAGGTTGTTTTCAGT 2991

133031619 GTTTCTATATTAAAATGTTACTAAGAAACTCTCTTGTAAAAATCTTTGTCTGCATCTTTG 133031678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 GTTTCTATATTAAAATGTTACTAAGAAACTCTCTTGTAAAAATCTTTGTCTGCATCTTTG 3051

133031679 ATTGGTTTTTACGTAGGCTTAAGTTCCTTGAAGTGGAATTCTAGGCCATTTTTAACACAC 133031738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 ATTGGTTTTTACGTAGGCTTAAGTTCCTTGAAGTGGAATTCTAGGCCATTTTTAACACAC 3111

133031739 CGAGTGGGGGGACGACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGAATGTTTCAGGAGATTGAACTTCCA 133031798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 CGAGTGGGGGGACGACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGAATGTTTCAGGAGATTGAACTTCCA 3171

133031799 CCAGAACTGTTTCAGGGGCCCGTTTCAGCACAGCCACCCCCAACACTGGAAATTAATATA 133031858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 CCAGAACTGTTTCAGGGGCCCGTTTCAGCACAGCCACCCCCAACACTGGAAATTAATATA 3231

133031859 AAAACCTTTCTTTTCTAATTCAAAAATGGAAAATGATATCTTCTTGTTTCAATTGCTAGT 133031918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 AAAACCTTTCTTTTCTAATTCAAAAATGGAAAATGATATCTTCTTGTTTCAATTGCTAGT 3291

133031919 GAGGTTCAATATGTCTTTCAAGCGTTCACTAGATATTTTTGGTATGAATTTCTTATTTTG 133031978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 GAGGTTCAATATGTCTTTCAAGCGTTCACTAGATATTTTTGGTATGAATTTCTTATTTTG 3351

133031979 TAAACTGTCAGTTTCTTTGCAAATTTTTTCATGGGAGTTTTAGTGCTTTTATTTTTAGTT 133032038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 TAAACTGTCAGTTTCTTTGCAAATTTTTTCATGGGAGTTTTAGTGCTTTTATTTTTAGTT 3411

133032039 GGAATGAGGACCTTATGTTGATGATGTTATCTGTTTTTTTTTTTGTTGTTGTTTGTTTGT 133032098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     3412 GGAATGAGGACCTTATGTTGATGATGTTATCTGTTTTTTTTTT-GTTGTTGTTTGTTTGT 3470

133032099 TTGTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTC 133032158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 TTGTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTC 3530

133032159 TGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT 133032218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 TGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT 3590

133032219 AGCTGGGACTACAGATGCGTGCCACCACGTCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC 133032278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 AGCTGGGACTACAGATGCGTGCCACCACGTCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC 3650

133032279 AGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACTCAC 133032338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 AGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACTCAC 3710

133032339 CTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGCCTTAACTGTT 133032398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 CTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGCCTTAACTGTT 3770

133032399 TCTTTTTTTTTTTAAGTGTACTTAGTATTTTTCCTGGTTGCTTGTCTTTTAGTATTTGTA 133032458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 TCTTTTTTTTTTTAAGTGTACTTAGTATTTTTCCTGGTTGCTTGTCTTTTAGTATTTGTA 3830

133032459 ATTCTTAGAAGTTTTGAAGTTTTAAATGTTTATGTAGAGAAATCTATTGTTTTTTTT-CT 133032517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     3831 ATTCTTAGAAGTTTTGAAGTTTTAAATGTTTATGTAGAGAAATCTATTGTTTTTTTTTCT 3890

133032518 TTGTGATTTCTTCACTTAGGTGCTTATAAAGGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTT 133032577
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     3891 TTGTGATTTCTTCACTTAGGTGCTTATAAAGGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTT-TTT 3949

133032578 TTTTTTTTCCCTATCACAAAACCAGTTAGGCAGATTTTCTAGGGTTTGTGTATGTGTGTG 133032637
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3950 TTTTTTTTCC-TATCACAAAACCAGTTAGGCAGATTTTCTAGGGTTTGTGTATGTGTGTG 4008

133032638 TTTTGTTTTATTTTCCTCTCTTCACATTTAATTCTTCAACTTGAAATTTTAAAAATTGGT 133032697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 TTTTGTTTTATTTTCCTCTCTTCACATTTAATTCTTCAACTTGAAATTTTAAAAATTGGT 4068

133032698 AGGCTGGGCTCAGTGGCTCACACTTGTAATGCCAGTACTTTGGGAGGCTGGGGTGTGAGG 133032757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 AGGCTGGGCTCAGTGGCTCACACTTGTAATGCCAGTACTTTGGGAGGCTGGGGTGTGAGG 4128

133032758 ATTGCTTGAGCCCAGGAGGTCAAGGTTGCAGGGAGCTATGATTGTGCCACTGCCCTCCAG 133032817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 ATTGCTTGAGCCCAGGAGGTCAAGGTTGCAGGGAGCTATGATTGTGCCACTGCCCTCCAG 4188

133032818 CCTGGGCGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAACAACAACAACAAAAAGAAAAAC 133032877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 CCTGGGCGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAGAAAACAACAACAACAAAAAGAAAAAC 4248

133032878 AGAAAATCTCAATAAAGTGTGGACTTGGGTTAATAATTATGTATCAATATTTATTTATTA 133032937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 AGAAAATCTCAATAAAGTGTGGACTTGGGTTAATAATTATGTATCAATATTTATTTATTA 4308

133032938 GTTGTGATAAATGTAGCATAGTAATGTAAGATGTTAATAACATCAGCCTTCTGAGTAGCT 133032997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 GTTGTGATAAATGTAGCATAGTAATGTAAGATGTTAATAACATCAGCCTTCTGAGTAGCT 4368

133032998 GGGACTACAGGTGCACACCACCACACCTGGCTAACTTTTTGTAGAGATGGGGTCTTGCTA 133033057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 GGGACTACAGGTGCACACCACCACACCTGGCTAACTTTTTGTAGAGATGGGGTCTTGCTA 4428

133033058 TGTTGCCTAGGCCGATGTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGGTCTTCCTGCCTCTGCCTCCCA 133033117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 TGTTGCCTAGGCCGATGTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGGTCTTCCTGCCTCTGCCTCCCA 4488

133033118 AAGCAGGGGAATTACATACATGAGCCACGGTGCCCAGCCTTCCTCAGTTTTTCTTTAATG 133033177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 AAGCAGGGGAATTACATACATGAGCCACGGTGCCCAGCCTTCCTCAGTTTTTCTTTAATG 4548

133033178 CCCTTTTTCTGCTCCAGGATCCCATCCAGGATACATTAATTGTGTCTTCTTCAGCTCCTC 133033237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 CCCTTTTTCTGCTCCAGGATCCCATCCAGGATACATTAATTGTGTCTTCTTCAGCTCCTC 4608

133033238 AGGTTGTGAGTTTCTCAGGCTTACTTTCGTTTTGGTGAAATTGACAGTTTTGAGGAATAC 133033297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 AGGTTGTGAGTTTCTCAGGCTTACTTTCGTTTTGGTGAAATTGACAGTTTTGAGGAATAC 4668

133033298 TGGTCAGCTCTTTTCCCTCAGTCATTATTTGTCTAATGTTTTTTTTCCAGTTAGACTGGG 133033357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 TGGTCAGCTCTTTTCCCTCAGTCATTATTTGTCTAATGTTTTTTTTCCAGTTAGACTGGG 4728

133033358 TAATGTTTTGGGAGGAAGACCCAGCATTAAAATACCATTCTCATCGTCTCATATCAAGAG 133033417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 TAATGTTTTGGGAGGAAGACCCAGCATTAAAATACCATTCTCATCGTCTCATATCAAGAG 4788

133033418 CACACGCTATCACGGTGATGGAACGCTGTTGATGTTAAGCTTGATTGCCTGACTCGGATA 133033477
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 CACACGCTATCACAGTGATGGAACGCTGTTGATGTTAAGCTTGATTGCCTGACTCGGATA 4848

133033478 GTATTTTTCAGATTTCTCCACTATAGAGTTACTCTTTTTCCCCTCTCTCTTTCCATACTG 133033537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 GTATTTTTCAGATTTCTCCACTATAGAGTTACTCTTTTTCCCCTCTCTCTTTCCATACTG 4908

133033538 GGCTCTCTGGAAGAGAGTCACTTACTGTGTGCAGCCCACGTTTAAAAAGCGGGGAGCCAT 133033597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4909 GGCTCTCTGGAAGAGAGTCACTTACTGTGTGCAGCCCACGTTTAAAAAGCGGGGAGCCAT 4968

133033598 GATCCACGTCCTTGGTGGGGGAGTATCTATCTACATGGATTATTTGGAATTATTCTGCAT 133033657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4969 GATCCACGTCCTTGGTGGGGGAGTATCTATCTACATGGATTATTTGGAATTATTCTGCAT 5028

133033658 GAGAGTTGTCTCTTCTGCTCCATTTATTAATTAATTCAATCACTTGTCTACATCAGCATA 133033717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5029 GAGAGTTGTCTCTTCTGCTCCATTTATTAATTAATTCAATCACTTGTCTACATCAGCATA 5088

133033718 GAATCATGGCTAGCTATTTTATACTTTGTGTTATGATCCTAAACCACTTTATTTTGCTCC 133033777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5089 GAATCATGGCTAGCTATTTTATACTTTGTGTTATGATCCTAAACCACTTTATTTTGCTCC 5148

133033778 TCAAATGTTTCTGACTGTGGTCATCGGGAGCTCGTTCAGTTGGTTTCTGTGTCCCTTGGA 133033837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5149 TCAAATGTTTCTGACTGTGGTCATCGGGAGCTCGTTCAGTTGGTTTCTGTGTCCCTTGGA 5208

133033838 CACCCCTCTTGTTGTGCACGTGTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCGTTTTTCCCACA 133033897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5209 CACCCCTCTTGTTGTGCACGTGTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCGTTTTTCCCACA 5268

133033898 TTCCTACTTTTTGGCACTGGTAGTGGCTCCAGGCTCATCTTAGGTATTTCCTGCCTCAGT 133033957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5269 TTCCTACTTTTTGGCACTGGTAGTGGCTCCAGGCTCATCTTAGGTATTTCCTGCCTCAGT 5328

133033958 CCTTGAATTCGCTATTTCTCCAAGGAGCCCTGCTTCCTGTGATTGGAAACCAGGATATCC 133034017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5329 CCTTGAATTCGCTATTTCTCCAAGGAGCCCTGCTTCCTGTGATTGGAAACCAGGATATCC 5388

133034018 GTGCTAAGTGTGTTTGTTGGTACTGAGGTGCTGTTACTTCTAAAACCTCCCTTAGCTGAC 133034077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5389 GTGCTAAGTGTGTTTGTTGGTACTGAGGTGCTGTTACTTCTAAAACCTCCCTTAGCTGAC 5448

133034078 AGGGCAAGGAGTTGTATGTTGTATATATAACCTGTGTTTGTACTTGTATCTATACATAGT 133034137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5449 AGGGCAAGGAGTTGTATGTTGTATATATAACCTGTGTTTGTACTTGTATCTATACATAGT 5508

133034138 TTTATATGTAATCATCCGTGTCTATATTAAGCTAAACATGAGTTCATGCTGATATCTTCA 133034197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5509 TTTATATGTAATCATCCGTGTCTATATTAAGCTAAACATGAGTTCATGCTGATATCTTCA 5568

133034198 ACTCTAATTTATATTCGATATTGGATTAGATGTATTAGGTATATGGAGAGTCAAACCTCT 133034257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5569 ACTCTAATTTATATTCGATATTGGATTAGATGTATTAGGTATATGGAGAGTCAAACCTCT 5628

133034258 TCCTGTTCCTTATCTAGAACCTCCACGTCTAACAGTCAGAAATCTGTCTCCTGCCACCCA 133034317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5629 TCCTGTTCCTTATCTAGAACCTCCACGTCTAACAGTCAGAAATCTGTCTCCTGCCACCCA 5688

133034318 CCATCCCTTTACTTTACTGTTTAGTTCCAGTATACATTTAAAGTGGTTTCAGAATTGTTG 133034377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5689 CCATCCCTTTACTTTACTGTTTAGTTCCAGTATACATTTAAAGTGGTTTCAGAATTGTTG 5748

133034378 AGTGGGACCCCCACGGGAAACAGCTTTATTAACTAGAATACAGTTCTTTTGCTTTTAGTC 133034437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5749 AGTGGGACCCCCACGGGAAACAGCTTTATTAACTAGAATACAGTTCTTTTGCTTTTAGTC 5808

133034438 TTAACAGACTCCATTCATTTCCAAAATTACTTAGGCCAACACCTTCTTCAGCTTCTTCTT 133034497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5809 TTAACAGACTCCATTCATTTCCAAAATTACTTAGGCCAACACCTTCTTCAGCTTCTTCTT 5868

133034498 CTTTTTTAAAAAAAATAAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGAATCTCACCTTGT 133034557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5869 CTTTTTTAAAAAAAATAAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGATGGAATCTCACCTTGT 5928

133034558 CTCCCAGGCTGGAATACAGTGGCGCAATCTTGGCCCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTT 133034617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5929 CTCCCAGGCTGGAATACAGTGGCGCAATCTTGGCCCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTT 5988

133034618 TAAGGAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTTAGTAGCTGGGATTACAGATGTGTGCCACCATG 133034677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5989 TAAGGAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTTAGTAGCTGGGATTACAGATGTGTGCCACCATG 6048

133034678 CCTAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTC 133034737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6049 CCTAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTC 6108

133034738 TTGAACTCCTGACCTCAAAGGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTCCTGGGATTACAG 133034797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6109 TTGAACTCCTGACCTCAAAGGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTCCTGGGATTACAG 6168

133034798 GTGTGAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGTCTC 133034857
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6169 ATGTGAGTCACCATGCCTGGCCTCTTCTTCTTCTTCTTTTAAACTTTGAGACAGGGTCTC 6228

133034858 ATTCTGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCATCTC 133034917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6229 ATTCTGTTGCCCAGGCTGGGTGGCAGTGGCTCGATCATGGCTCACTGCTTCCTCCATCTC 6288

133034918 CCCAAGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGC 133034977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6289 CCCAAGCTCAGGTGATCCTCCCACTTCACCCCCAGAGTAGCTGGGACCACAGGCACATGC 6348

133034978 CACCACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTGCCA 133035037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6349 CACCACACCTGGCTAATTTTTGTGTGTGTATATATATTTGGTAGAGACAGGGTCTTGCCA 6408

133035038 TATTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTCCCA 133035097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6409 TATTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGGTCCACCCACCTTGGCCTCCCA 6468

133035098 AAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATTCAT 133035157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6469 AAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAACCACTGCGCCTGGCCGAGCATCTTCTTTTTATTCAT 6528

133035158 ATTCTTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAAACT 133035217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6529 ATTCTTCATTTGCAAAAGCTTCTTGAGAATTTTATCTTTTAGATGACATGTAGAAAAACT 6588

133035218 TGTCAACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCTTGA 133035277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6589 TGTCAACTTCCAAAAATTTTTTTCTACTGTGATTTTTCTTGGAATTGTGTTAAATCTTGA 6648

133035278 TTTTGGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATGCCT 133035337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6649 TTTTGGGGAAGAGTTATCATTTTCAAAAAACTCTATTGTTCTCATCCATCAGACATGCCT 6708

133035338 CTTGTTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAGATT 133035397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6709 CTTGTTCTGTTCACATTTATTTCTTTTAGTAAAGATTCATAGTTTTTCTTTGTAAAGATT 6768

133035398 CAGGTTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATTTTAAGATAGTTT 133035457
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6769 CAGGTTTTTTTTCTCATAGGTTCCACCCTTTTTTTTTTAAAGATTATCTTAAGATAGTTT 6828

133035458 TGGTTTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGTATT 133035517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6829 TGGTTTTGTTACTATTTTGCCCAGAATTTTTTTCCATTACATTTTTTACAAATGAGTATT 6888

133035518 GCTAGTATGTTGGAAAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGCTTCTTTTACT 133035577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6889 GCTAGTATGTTGGAAAGGAATTCATTTCATATATTAATTTTCTTTCCAGCTTCTTTTACT 6948

133035578 AAAGTTTTTTTTAACTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCTAGGTTGAGAG 133035637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6949 AAAGTTTTTTTTAACTACTTCTAATTTTTTGTTAATGTCTTCAGTTTTCTAGGTTGAGAG 7008

133035638 TCACAGCTTGTCCAAATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATATTTCACGTTTT 133035697
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7009 CCACAGCTTGTCCAAATTATAATACTGTCGCTTCTTTTCCAATCAAATATTTCACGTTTT 7068

133035698 AAGTGTTTTGTATTATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATAATGGTGATGG 133035757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7069 AAGTGTTTTGTATTATTTATCAGCAAAAACTGTCAGAACAATACCACATAATGGTGATGG 7128

133035758 CTGCAGTTATCTTGTCTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTCTTGC 133035817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7129 CTGCAGTTATCTTGTCTTGCTTTTTTTTTTTATTTTTGAGACTGAGTCTCACTCTCTTGC 7188

133035818 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCAGGCTCAA 133035877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7189 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAGTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCAGGCTCAA 7248

133035878 GCGATTCTCTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTATTATAGGCATGCGCCACCATGCCC 133035937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7249 GCGATTCTCTCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGTATTATAGGCATGCGCCACCATGCCC 7308

133035938 AGCTAATTTTCGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCCCA 133035997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7309 AGCTAATTTTCGTATCTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCCCA 7368

133035998 AACTCCTGACCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCG 133036057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7369 AACTCCTGACCTCAGGTGATTCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCG 7428

133036058 TGCGCCTCCGCGCCCGGCCATCTTGTCTTGCTTTTGATTTTGCACCACTCATTGTATGAT 133036117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7429 TGCGCCTCCGCGCCCGGCCATCTTGTCTTGCTTTTGATTTTGCACCACTCATTGTATGAT 7488

133036118 ATTGATTCTTGGTTTGAGTTTTTGTCATCAAGTGAAAGAAGATGCATTCATTCCTAATTT 133036177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7489 ATTGATTCTTGGTTTGAGTTTTTGTCATCAAGTGAAAGAAGATGCATTCATTCCTAATTT 7548

133036178 TACTAAAAAAAAATAAACTCAAAAAACAAGAAAAAGCAAAAACAAAACAAAAAATCCAAA 133036237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7549 TACTAAAAAAAAATAAACTCAAAAAACAAGAAAAAGCAAAAACAAAACAAAAAATCCAAA 7608

133036238 CAGGGATGGGTGTTGAATTTTAGCAAGTGATTTTCTGCTTTGTTGCAATGTTTATAAGAT 133036297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7609 CAGGGATGGGTGTTGAATTTTAGCAAGTGATTTTCTGCTTTGTTGCAATGTTTATAAGAT 7668

133036298 CCTTCTCCTGTTGACCTATTAATGTGATACATTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGAGACGGA 133036357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7669 CCTTCTCCTGTTGACCTATTAATGTGATACATTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGAGACGGA 7728

133036358 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGACTCACTGCAGCTTCC 133036417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7729 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGACTCACTGCAGCTTCC 7788

133036418 ACCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTG 133036477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7789 ACCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTG 7848

133036478 TGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATATG 133036537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7849 TGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATATG 7908

133036538 TTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAA 133036597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7909 TTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAA 7968

133036598 GTACTGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAATGCGTTAATTTTCAACTATTT 133036657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7969 GTACTGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAATGCGTTAATTTTCAACTATTT 8028

133036658 TTGCATTTCTTGCATAAGTCCTGCTTGGTCACGGTGGATTATTCTTTAATATACAGCTGG 133036717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8029 TTGCATTTCTTGCATAAGTCCTGCTTGGTCACGGTGGATTATTCTTTAATATACAGCTGG 8088

133036718 ATGATAGTTTCCAGCATTTTGCTTAGAGGTTTTGCCTTTTTCCATTTCATGTGTGCAATC 133036777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8089 ATGATAGTTTCCAGCATTTTGCTTAGAGGTTTTGCCTTTTTCCATTTCATGTGTGCAATC 8148

133036778 AGTAAGTGGTGTTTTTCCTTTGTGTTTTTTGTCAAGTTTTACCATCAGGGTTTAGCTTTT 133036837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8149 AGTAAGTGGTGTTTTTCCTTTGTGTTTTTTGTCAAGTTTTACCATCAGGGTTTAGCTTTT 8208

133036838 TCAGTTAATAATCCATTCCCTTCAAGAATCTCAAAATTAATACATGCTTGTAAAATATTC 133036897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8209 TCAGTTAATAATCCATTCCCTTCAAGAATCTCAAAATTAATACATGCTTGTAAAATATTC 8268

133036898 TACTACTACTCTCAAGAGGTGAAAACACTTTTAACACTCTGGTGTCCTTCCAGATCTTGT 133036957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8269 TACTACTACTCTCAAGAGGTGAAAACACTTTTAACACTCTGGTGTCCTTCCAGATCTTGT 8328

133036958 GTGCATGTATGTGTATACATTCACTCGTGTTAAACATACCTACGTTAAAAAATTATAGTA 133037017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8329 GTGCATGTATGTGTATACATTCACTCGTGTTAAACATACCTACGTTAAAAAATTATAGTA 8388

133037018 CGTAAAGCATTTTACAACTTGCTTTCTTCCCCCCACATAATATGGCATGAATATCTCTTC 133037077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8389 CGTAAAGCATTTTACAACTTGCTTTCTTCCCCCCACATAATATGGCATGAATATCTCTTC 8448

133037078 CTGTCAGGAAACAGAGATCCTCCCCATTGTTTTTAATGACTCTATAAGATGCCATTGGAG 133037137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8449 CTGTCAGGAAACAGAGATCCTCCCCATTGTTTTTAATGACTCTATAAGATGCCATTGGAG 8508

133037138 GAATTAGCCTAATTTACCCACCCATCCCCCTACTGTGGAAAATAGGCTGCTTTCAGTTTC 133037197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8509 GAATTAGCCTAATTTACCCACCCATCCCCCTACTGTGGAAAATAGGCTGCTTTCAGTTTC 8568

133037198 TTCACAATAAACACACACATATTTGCAAACATATCTACAGAATAGATTCCCAGAGATAAA 133037257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8569 TTCACAATAAACACACACATATTTGCAAACATATCTACAGAATAGATTCCCAGAGATAAA 8628

133037258 ATTGCTTTGTTAAAGTATAGGAGCATTTTCCATTTGGAAAGACACCATCCAACTGCCCTC 133037317
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8629 ATTGCTTTGTTAAAGCATAGGAGCATTTTCCATTTGGAAAGACACCATCCAACTGCCCTC 8688

133037318 AAACACACTGCGCCATCTTGCGCCTGGACCCACGGAAGATGAGACTGTGTTTCCCCACAC 133037377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8689 AAACACACTGCGCCATCTTGCGCCTGGACCCACGGAAGATGAGACTGTGTTTCCCCACAC 8748

EXCISED REGION

133037382 GCCAGCATCCGGGACATCACTCTGCCATTTTTTCCTTGTTTTTTTGCTAGTTTCCTAGGT 133037441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8753 GCCAGCATCCGGGACATCACTCTGCCATTTTTTCCTTGTTTTTTTGCTAGTTTCCTAGGT 8812

133037442 GGGAGATGGTGTCCTGCCTTAATCAGCATTCATTGATCGTTGGTGACCTTCCAGTCTTCT 133037501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8813 GGGAGATGGTGTCCTGCCTTAATCAGCATTCATTGATCGTTGGTGACCTTCCAGTCTTCT 8872

133037502 GGAGTTTCTCCCTGGGTGTCTCTGGGGCTCCTGCGGCTCCATCATCTTTCCCAAGGGAGG 133037561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8873 GGAGTTTCTCCCTGGGTGTCTCTGGGGCTCCTGCGGCTCCATCATCTTTCCCAAGGGAGG 8932

133037562 AAGTGGCTTTCGCCGGTCAGAGGTGAGGATGCAGGCGTGCAGAGCAGATGTGTTTGGGCC 133037621
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     8933 AAGTGGCTTTCGCCGGTCAGAGGTGAGGATGCAGGCGGGCAGAGCAGATGTGTTTGGGCC 8992

133037622 ACACACTTGCCTGGGAGCTGGAACGGCTGGGACTCTGGTTGCATGTTCCGGGTTGTGTGT 133037681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8993 ACACACTTGCCTGGGAGCTGGAACGGCTGGGACTCTGGTTGCATGTTCCGGGTTGTGTGT 9052

133037682 GTGTACCTGTGATTTTTATTGTCACCCTGAGTGAC 133037716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9053 GTGTACCTGTGATTTTTATTGTCACCCTGAGTGAC 9087

Alignment time is 12.591 s

