
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131690925,131712157] =>     21233 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     2772] =>      2772 nucs 'mol-32-20fa-133341_2772'

Score:        2728
Aligned:      2772        nucs
Identic:      2768 (100%) nucs =>       507 ( 99%)      2261 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131700416,131700925] EXCISED REGION [131702158,131704419]
 second seq =>  [        1,      510] EXCISED REGION [      511,     2772]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1232 nucs [131700926,131702157]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        27 nucs [131700926,131700952] to [131702158,131702184]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131700926,131700926] to [131702157,131702157]
 second seq =>         0 nucs

131700416 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTTTGGTGGGTGTAGTATCGCACACCCGTAGTCCTAGCT 131700475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTTTGGTGGGTGTAGTATCGCACACCCGTAGTCCTAGCT 60

131700476 ACTCAGGCGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCC 131700535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTCAGGCGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCC 120

131700536 AAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACCAAA 131700595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACCAAA 180

131700596 CAAACAAAAAAACCAAACCAAACCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCCTAGTC 131700655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAACAAAAAAACCAAACCAAACCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCCTAGTC 240

131700656 CCTGAGATCTTGAGCCAGTAGGGCTGCATGGGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGGTTTTTTT 131700715
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||
      241 CCTGAGATCTTGAGCCAGTAGGGCTGCATGTGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGTTTTTTTT 300

131700716 TTGAGACAGAGTTTCATTCTTGTCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCGGCTCA 131700775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGAGACAGAGTTTCATTCTTGTCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCGGCTCA 360

131700776 CTACAACTTCCGCCTCTCCGGTCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGG 131700835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      361 CTACAACTTCCGCCTCTCCGGTCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCGCAAGTAGCTGG 420

131700836 GATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGT 131700895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGT 480

131700896 TCCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 131700925
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 510

EXCISED REGION

131702158 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 131702217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      511 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 570

131702218 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 131702277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      571 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 630

131702278 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 131702337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      631 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 690

131702338 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 131702397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      691 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 750

131702398 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 131702457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      751 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 810

131702458 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 131702517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      811 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 870

131702518 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 131702577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      871 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 930

131702578 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 131702637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      931 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 990

131702638 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 131702697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      991 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 1050

131702698 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 131702757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1051 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 1110

131702758 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 131702817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1111 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 1170

131702818 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 131702877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1171 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 1230

131702878 GTGGTGTGTCAAGAAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 131702937
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1231 GTGGTGTGTCAAGGAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 1290

131702938 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 131702997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1291 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 1350

131702998 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 131703057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 1410

131703058 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 131703117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 1470

131703118 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 131703177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 1530

131703178 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 131703237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 1590

131703238 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 131703297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 1650

131703298 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 131703357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 1710

131703358 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 131703417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 1770

131703418 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 131703477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 1830

131703478 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 131703537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 1890

131703538 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 131703597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 1950

131703598 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 131703657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 2010

131703658 CCTTCCTGCTCTGGGGAGGGGGGATGTGGGGCTGGTAGGTTCCTGACCTGCTTGTGTCTC 131703717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 CCTTCCTGCTCTGGGGAGGGGGGATGTGGGGCTGGTAGGTTCCTGACCTGCTTGTGTCTC 2070

131703718 TGCCAGGGGCCCTGGTCCTCATCCATGGAGAAGTGGTACACAAGAGCAAGCAGAACCTCT 131703777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 TGCCAGGGGCCCTGGTCCTCATCCATGGAGAAGTGGTACACAAGAGCAAGCAGAACCTCT 2130

131703778 CTGACCGCTCGCGCCAGGCCTACACTTTCCACCTCATGGAGGCCTCTGGCACCACCTGGA 131703837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 CTGACCGCTCGCGCCAGGCCTACACTTTCCACCTCATGGAGGCCTCTGGCACCACCTGGA 2190

131703838 GCCCGGAGAACTGGTAGGTGACAGGGTGGGTGTGTGTGCCCGACAGTCCCCTGGAGGCTG 131703897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 GCCCGGAGAACTGGTAGGTGACAGGGTGGGTGTGTGTGCCCGACAGTCCCCTGGAGGCTG 2250

131703898 GGAACAGTGACCCTGCACCTCAAGGTTGTTTCTCCTCTATCCTCTGCAGGCTCCAGCCAA 131703957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 GGAACAGTGACCCTGCACCTCAAGGTTGTTTCTCCTCTATCCTCTGCAGGCTCCAGCCAA 2310

131703958 CAGCTGAACTGCCCTTTCCCCAACTGTACACCTAAAGGCTCTCGCAGGGCAGGAGCCCTC 131704017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 CAGCTGAACTGCCCTTTCCCCAACTGTACACCTAAAGGCTCTCGCAGGGCAGGAGCCCTC 2370

131704018 GCCCCTCCCGGGTGAAGCTGTGGGCTGTAAACACCAGTGCCTTGCTCAGCCTCCTGGTTG 131704077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 GCCCCTCCCGGGTGAAGCTGTGGGCTGTAAACACCAGTGCCTTGCTCAGCCTCCTGGTTG 2430

131704078 CAACAGGGAGGTCTTGTCTCCCCTCCTGGGCTTTCCTCCTGCCCTGTGGGCAGCAGCCTA 131704137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 CAACAGGGAGGTCTTGTCTCCCCTCCTGGGCTTTCCTCCTGCCCTGTGGGCAGCAGCCTA 2490

131704138 GGCTGGGTCAGGGGCTTCCCTAAGATCTTCACCTCTCTGCCTCCCTACTGCCCCAACATA 131704197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 GGCTGGGTCAGGGGCTTCCCTAAGATCTTCACCTCTCTGCCTCCCTACTGCCCCAACATA 2550

131704198 GCCTTGAGGAGGCTTCTCAGCCACCAAAGGGTTCTGGCCCCTTCTCACTCTCCTCTCCTC 131704257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 GCCTTGAGGAGGCTTCTCAGCCACCAAAGGGTTCTGGCCCCTTCTCACTCTCCTCTCCTC 2610

131704258 TCAGATGGAACTCTGGTTATTATGGTGTTAGTTATCGAATAAAAACGACTTCAGAATGCA 131704317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 TCAGATGGAACTCTGGTTATTATGGTGTTAGTTATCGAATAAAAACGACTTCAGAATGCA 2670

131704318 GCTTCCCTACTGAGCCTTCTTTCCCAAGCAGCATTGCTTTCCAGAGAAGAAAACTGCTTT 131704377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 GCTTCCCTACTGAGCCTTCTTTCCCAAGCAGCATTGCTTTCCAGAGAAGAAAACTGCTTT 2730

131704378 CCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTT 131704419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 CCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTT 2772

Alignment time is 2.11028 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131690925,131712157] =>     21233 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     2757] =>      2757 nucs 'mol-32-2110-094104_2757'

Score:        2701
Aligned:      2756        nucs
Identic:      2751 (100%) nucs =>       985 (100%)      1766 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131698174,131699158] EXCISED REGION [131699160,131700930]
 second seq =>  [        1,      985] EXCISED REGION [      987,     2757]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [131699159,131699159]
 second seq =>         1 nucs [986,986]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [985,985] to [986,986]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131698174 CCATCTCAAAACTAAATAAATAAATAAAAATAAAAAGTACATAGCTCAGTGGTATTAAAT 131698233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCATCTCAAAACTAAATAAATAAATAAAAATAAAAAGTACATAGCTCAGTGGTATTAAAT 60

131698234 GCATTCAATCTTATGTTTATGACAATGAGGGACTATCCCATGCCAGGCCCTGGGCTGTCC 131698293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCATTCAATCTTATGTTTATGACAATGAGGGACTATCCCATGCCAGGCCCTGGGCTGTCC 120

131698294 CTGCACATTCATTAGCCCATCGAGTCCCACACCAGTCCTGCCTCCCAGGTTCTTCTAATC 131698353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCACATTCATTAGCCCATCGAGTCCCACACCAGTCCTGCCTCCCAGGTTCTTCTAATC 180

131698354 CTCATTTGACAGAAGAGGAAACTGAGGCTTACAGGAGAGAAATGGTTACCCGAGGCCACA 131698413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCATTTGACAGAAGAGGAAACTGAGGCTTACAGGAGAGAAATGGTTACCCGAGGCCACA 240

131698414 CAGAGCAAATGGTGGTACCGAGATTGCTCCGCATGATTGGTGCCTTGGAGCCCTTAGTCG 131698473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGAGCAAATGGTGGTACCGAGATTGCTCCGCATGATTGGTGCCTTGGAGCCCTTAGTCG 300

131698474 TCTGTGAGGGGTGGGGAGTCGGGGCTGGACTGAGCTTCCCAGAAGGTCAAGAATAAGGGC 131698533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTGTGAGGGGTGGGGAGTCGGGGCTGGACTGAGCTTCCCAGAAGGTCAAGAATAAGGGC 360

131698534 ATGGGTGGCATAGGGCCTGGGGTGGGGGCAAGGCTCCTGTGGAGCCCATTACTCAGTTGT 131698593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGGGTGGCATAGGGCCTGGGGTGGGGGCAAGGCTCCTGTGGAGCCCATTACTCAGTTGT 420

131698594 AAACAAGCAGAAGGGTTAATGCCTACAAAGTAAGTGAGAATGTCAAAGTAAGCCTGAGTG 131698653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAACAAGCAGAAGGGTTAATGCCTACAAAGTAAGTGAGAATGTCAAAGTAAGCCTGAGTG 480

131698654 TGGGTGCCCAGAGCTGGGTGTGGAGGGACACGTGGGCCTGAGATGGGGCCGACAGCTTCC 131698713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGGTGCCCAGAGCTGGGTGTGGAGGGACACGTGGGCCTGAGATGGGGCCGACAGCTTCC 540

131698714 TTCTGTCCCATAGCTCTGCACGCCCACGACCCCGTCTTCAAGAGCATCACACACTCCTTC 131698773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTGTCCCATAGCTCTGCACGCCCACGACCCCGTCTTCAAGAGCATCACACACTCCTTC 600

131698774 AAGGTGCAGGTGAGCAGAGGTGGGGGTGAGGGCCAGGAGGGTGGGCCATGTGTGGCAGGC 131698833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGGTGCAGGTGAGCAGAGGTGGGGGTGAGGGCCAGGAGGGTGGGCCATGTGTGGCAGGC 660

131698834 TGGCAGCATGACCTTTGCCCCCCTCCAGACCTTGGCCAGAAGTCTGGGCCTCCAGATGCC 131698893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGCAGCATGACCTTTGCCCCCCTCCAGACCTTGGCCAGAAGTCTGGGCCTCCAGATGCC 720

131698894 CGTGGTGGTGCAGAGCATGTACATCTTTAAGGTGAGCTCCTTGTCCTTGCCTCAGTTTAC 131698953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGTGGTGGTGCAGAGCATGTACATCTTTAAGGTGAGCTCCTTGTCCTTGCCTCAGTTTAC 780

131698954 CATCTGTAAAATGGGCAGACTGCTCATACCAAGCCCTTCCTTACAATGGGCCAAAAGTTG 131699013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATCTGTAAAATGGGCAGACTGCTCATACCAAGCCCTTCCTTACAATGGGCCAAAAGTTG 840

131699014 CTGGAATTATTATGTTGGTGGGAGAACATGGAAAATCGGTCTCCTCTGGCTAAAGCACCT 131699073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGGAATTATTATGTTGGTGGGAGAACATGGAAAATCGGTCTCCTCTGGCTAAAGCACCT 900

131699074 GGAACTTAGTTGATCCTCAGTTAAAATTTGGTGGTAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGC 131699133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAACTTAGTTGATCCTCAGTTAAAATTTGGTGGTAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGC 960

131699134 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGC 131699158
          |||||||||||||||||||||||||
      961 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGC 985

EXCISED REGION

131699160 GAAGCGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGGCCAACATGGAGAAAC 131699219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 GAAGCGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGGCCAACATGGAGAAAC 1046

131699220 CCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGATGGCACACACCTGTAGTCCCA 131699279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 CCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGATGGCACACACCTGTAGTCCCA 1106

131699280 GCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGATAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTACAGTGA 131699339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 GCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGATAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTACAGTGA 1166

131699340 GTGGAGATCACGCCAATGTACTCTAGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCTCCGTCTCAAAAAA 131699399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 GTGGAGATCACGCCAATGTACTCTAGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCTCCGTCTCAAAAAA 1226

131699400 AAGAAAAATTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCTCTCAGGGAGGCAG 131699459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 AAGAAAAATTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCTCTCAGGGAGGCAG 1286

131699460 AGGTGGGAGGGTAGCTTGAACCCAGGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCAATATAGCGAGACC 131699519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 AGGTGGGAGGGTAGCTTGAACCCAGGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCAATATAGCGAGACC 1346

131699520 CCATTCTCCACAAAAAGGAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATTTGGTGGTAGGAGGGAG 131699579
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 CCATTCTCCACAAAAAGGAATAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATTTGGTGGTAGGAGGGAG 1406

131699580 GGTCATCCCCAGGCCTCCCTCGGCCTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCAATTGAAATGCTGTG 131699639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 GGTCATCCCCAGGCCTCCCTCGGCCTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCAATTGAAATGCTGTG 1466

131699640 CTCCCAGCTTTCAAGGGCCAGCTCAGTGCCACCTCTTCTAAGAAGCCTTCCAGAACCCCT 131699699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 CTCCCAGCTTTCAAGGGCCAGCTCAGTGCCACCTCTTCTAAGAAGCCTTCCAGAACCCCT 1526

131699700 GAGGAAAGAAGGACCCATCTGACTCTGGGGCTGGAAGGCTCAACTGCTGGCCTGTGTCCT 131699759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 GAGGAAAGAAGGACCCATCTGACTCTGGGGCTGGAAGGCTCAACTGCTGGCCTGTGTCCT 1586

131699760 AGCCTCTCCCTCCAGTCCTTGCCCTGCTCTGCTCTGTGATCTTGTTAGGCATGTGTGTGC 131699819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 AGCCTCTCCCTCCAGTCCTTGCCCTGCTCTGCTCTGTGATCTTGTTAGGCATGTGTGTGC 1646

131699820 TTGCACATGCTAGGAGCTTGTTGGGCAGGGGTGGGGGTTTTCTCTTTGCATCCCTCCTGG 131699879
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 TTGCACATGCTAGGAGCTTGTTGGGCAAGGGTGGGGGTTTTCTCTTTGCATCCCTCCTGG 1706

131699880 GGCTGGCATATGGTAGGTGCTCAGTAGCTGGGTGTTGATGTGGAATCCTGAGAGGAAAAT 131699939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 GGCTGGCATATGGTAGGTGCTCAGTAGCTGGGTGTTGATGTGGAATCCTGAGAGGAAAAT 1766

131699940 GCCTGTGGCCAGAGCAATAGCATCCTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAGCTCCTCTCTGCTCT 131699999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 GCCTGTGGCCAGAGCAATAGCATCCTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAGCTCCTCTCTGCTCT 1826

131700000 CTTCTGTCCTCACCAGGCTTTTCCTCTCTCTTGCAGCAACCTCACTTTGGCGGTGAAGGT 131700059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 CTTCTGTCCTCACCAGGCTTTTCCTCTCTCTTGCAGCAACCTCACTTTGGCGGTGAAGGT 1886

131700060 GAGCTGAGAGCTGTGGGCCCCTGAAAAGGCCATGGGTGGGACATCTAAGACAGCAATGGT 131700119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 GAGCTGAGAGCTGTGGGCCCCTGAAAAGGCCATGGGTGGGACATCTAAGACAGCAATGGT 1946

131700120 TCTCAGATCTTCAGAAGGAGGGAAAGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGTAGGAGCCTGGCCCG 131700179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 TCTCAGATCTTCAGAAGGAGGGAAAGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGTAGGAGCCTGGCCCG 2006

131700180 GAGAGGAGGAGCCACCTTCCATTCCTTCCCCTGATAGTGGATTGGTAGGGAAACCTTGCG 131700239
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 GAGAGGAGGAGCCACCTTCCATTCCTTCCTCTGATAGTGGATTGGTAGGGAAACCTTGCG 2066

131700240 TCCTTGGCATAGTGGGTCCTGAGCCTGCCAGCAACCCCAGCTGGTTAAAAATATAGATTT 131700299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 TCCTTGGCATAGTGGGTCCTGAGCCTGCCAGCAACCCCAGCTGGTTAAAAATATAGATTT 2126

131700300 CCTAGGACAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGAAGGCAGAGGCGAG 131700359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 CCTAGGACAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGAAGGCAGAGGCGAG 2186

131700360 CGGATCACCTGAGGTCAGGAATTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGCTGAAGCCCCATCTC 131700419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 CGGATCACCTGAGGTCAGGAATTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGCTGAAGCCCCATCTC 2246

131700420 TACTAAAAATACAAAAATTTTGGTGGGTGTAGTATCGCACACCCGTAGTCCTAGCTACTC 131700479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 TACTAAAAATACAAAAATTTTGGTGGGTGTAGTATCGCACACCCGTAGTCCTAGCTACTC 2306

131700480 AGGCGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGA 131700539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 AGGCGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGA 2366

131700540 TCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACCAAACAAA 131700599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 TCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACCAAACAAA 2426

131700600 CAAAAAAACCAAACCAAACCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCCTAGTCCCTG 131700659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 CAAAAAAACCAAACCAAACCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCCTAGTCCCTG 2486

131700660 AGATCTTGAGCCAGTAGGGCTGCATGGGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGGTTTTTTTTTGA 131700719
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2487 AGATCTTGAGCCAGTAGGGCTGCATGTGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTGA 2546

131700720 GACAGAGTTTCATTCTTGTCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCGGCTCACTAC 131700779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 GACAGAGTTTCATTCTTGTCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCGGCTCACTAC 2606

131700780 AACTTCCGCCTCTCCGGTCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATT 131700839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 AACTTCCGCCTCTCCGGTCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATT 2666

131700840 ACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTCCA 131700899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 ACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTCCA 2726

131700900 CCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTG 131700930
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 CCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTG 2757

Alignment time is 2.05625 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131690925,131712157] =>     21233 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     2337] =>      2337 nucs 'mol-32-21f7-020543_2337'

Score:        2315
Aligned:      2337        nucs
Identic:      2335 (100%) nucs =>        14 (100%)      2321 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131695640,131695653] EXCISED REGION [131702158,131704480]
 second seq =>  [        1,       14] EXCISED REGION [       15,     2337]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6504 nucs [131695654,131702157]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>      1232 nucs [131700926,131702157]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [131695654,131695658] to [131702158,131702162]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131695654,131695654] to [131702157,131702157]
 second seq =>         0 nucs

131695640 GGCTGGTCTCGAAC 131695653
          ||||||||||||||
        1 GGCTGGTCTCGAAC 14

EXCISED REGION

131702158 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 131702217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       15 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 74

131702218 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 131702277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       75 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 134

131702278 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 131702337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      135 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 194

131702338 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 131702397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      195 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 254

131702398 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 131702457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      255 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 314

131702458 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 131702517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      315 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 374

131702518 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 131702577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      375 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 434

131702578 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 131702637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 494

131702638 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 131702697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 554

131702698 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 131702757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 614

131702758 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 131702817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 674

131702818 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 131702877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 734

131702878 GTGGTGTGTCAAGAAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 131702937
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 GTGGTGTGTCAAGGAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 794

131702938 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 131702997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 854

131702998 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 131703057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 914

131703058 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 131703117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 974

131703118 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 131703177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 1034

131703178 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 131703237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 1094

131703238 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 131703297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 1154

131703298 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 131703357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 1214

131703358 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 131703417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 1274

131703418 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 131703477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 1334

131703478 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 131703537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 1394

131703538 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 131703597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 1454

131703598 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 131703657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 1514

131703658 CCTTCCTGCTCTGGGGAGGGGGGATGTGGGGCTGGTAGGTTCCTGACCTGCTTGTGTCTC 131703717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 CCTTCCTGCTCTGGGGAGGGGGGATGTGGGGCTGGTAGGTTCCTGACCTGCTTGTGTCTC 1574

131703718 TGCCAGGGGCCCTGGTCCTCATCCATGGAGAAGTGGTACACAAGAGCAAGCAGAACCTCT 131703777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 TGCCAGGGGCCCTGGTCCTCATCCATGGAGAAGTGGTACACAAGAGCAAGCAGAACCTCT 1634

131703778 CTGACCGCTCGCGCCAGGCCTACACTTTCCACCTCATGGAGGCCTCTGGCACCACCTGGA 131703837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 CTGACCGCTCGCGCCAGGCCTACACTTTCCACCTCATGGAGGCCTCTGGCACCACCTGGA 1694

131703838 GCCCGGAGAACTGGTAGGTGACAGGGTGGGTGTGTGTGCCCGACAGTCCCCTGGAGGCTG 131703897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 GCCCGGAGAACTGGTAGGTGACAGGGTGGGTGTGTGTGCCCGACAGTCCCCTGGAGGCTG 1754

131703898 GGAACAGTGACCCTGCACCTCAAGGTTGTTTCTCCTCTATCCTCTGCAGGCTCCAGCCAA 131703957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 GGAACAGTGACCCTGCACCTCAAGGTTGTTTCTCCTCTATCCTCTGCAGGCTCCAGCCAA 1814

131703958 CAGCTGAACTGCCCTTTCCCCAACTGTACACCTAAAGGCTCTCGCAGGGCAGGAGCCCTC 131704017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 CAGCTGAACTGCCCTTTCCCCAACTGTACACCTAAAGGCTCTCGCAGGGCAGGAGCCCTC 1874

131704018 GCCCCTCCCGGGTGAAGCTGTGGGCTGTAAACACCAGTGCCTTGCTCAGCCTCCTGGTTG 131704077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 GCCCCTCCCGGGTGAAGCTGTGGGCTGTAAACACCAGTGCCTTGCTCAGCCTCCTGGTTG 1934

131704078 CAACAGGGAGGTCTTGTCTCCCCTCCTGGGCTTTCCTCCTGCCCTGTGGGCAGCAGCCTA 131704137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 CAACAGGGAGGTCTTGTCTCCCCTCCTGGGCTTTCCTCCTGCCCTGTGGGCAGCAGCCTA 1994

131704138 GGCTGGGTCAGGGGCTTCCCTAAGATCTTCACCTCTCTGCCTCCCTACTGCCCCAACATA 131704197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 GGCTGGGTCAGGGGCTTCCCTAAGATCTTCACCTCTCTGCCTCCCTACTGCCCCAACATA 2054

131704198 GCCTTGAGGAGGCTTCTCAGCCACCAAAGGGTTCTGGCCCCTTCTCACTCTCCTCTCCTC 131704257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 GCCTTGAGGAGGCTTCTCAGCCACCAAAGGGTTCTGGCCCCTTCTCACTCTCCTCTCCTC 2114

131704258 TCAGATGGAACTCTGGTTATTATGGTGTTAGTTATCGAATAAAAACGACTTCAGAATGCA 131704317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 TCAGATGGAACTCTGGTTATTATGGTGTTAGTTATCGAATAAAAACGACTTCAGAATGCA 2174

131704318 GCTTCCCTACTGAGCCTTCTTTCCCAAGCAGCATTGCTTTCCAGAGAAGAAAACTGCTTT 131704377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 GCTTCCCTACTGAGCCTTCTTTCCCAAGCAGCATTGCTTTCCAGAGAAGAAAACTGCTTT 2234

131704378 CCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGC 131704437
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2235 CCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGC 2294

131704438 GGATGACCTGAGGTTGGCAGTTCTAGACCAGTTTGACCAACAT 131704480
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 GGATGACCTGAGGTTGGCAGTTCTAGACCAGTTTGACCAACAT 2337

Alignment time is 1.73608 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131690925,131712157] =>     21233 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     4942] =>      4942 nucs 'mol-32-2ff9-295872_4942'

Score:        4823
Aligned:      4944        nucs
Identic:      4933 (100%) nucs =>      1563 (100%)      3370 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131699358,131700925] EXCISED REGION [131702158,131705533]
 second seq =>  [        1,     1568] EXCISED REGION [     1569,     4942]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1232 nucs [131700926,131702157]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        27 nucs [131700926,131700952] to [131702158,131702184]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131700926,131700926] to [131702157,131702157]
 second seq =>         0 nucs

131699358 TACTCTAGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCTCCGTCTCAAAAAAAAGAAAAATTTGGCCAGG 131699417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACTCTAGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCTCCGTCTCAAAAAAAAGAAAAATTTGGCCAGG 60

131699418 CGCAGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCTCTCAGGGAGGCAGAGGTGGGAGGGTAGCTTG 131699477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGCAGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCTCTCAGGGAGGCAGAGGTGGGAGGGTAGCTTG 120

131699478 AACCCAGGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCAATATAGCGAGACCCCATTCTCCACAAAAAGG 131699537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACCCAGGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCAATATAGCGAGACCCCATTCTCCACAAAAAGG 180

131699538 AAGAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATTTGGTGGTAGGAGGGAGGGTCATCCCCAGGCCTCC 131699597
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATTTGGTGGTAGGAGGGAGGGTCATCCCCAGGCCTCC 240

131699598 CTCGGCCTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCAATTGAAATGCTGTGCTCCCAGCTTTCAAGGGC 131699657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCGGCCTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCAATTGAAATGCTGTGCTCCCAGCTTTCAAGGGC 300

131699658 CAGCTCAGTGCCACCTCTTCTAAGAAGCCTTCCAGAACCCCTGAGGAAAGAAGGACCCAT 131699717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGCTCAGTGCCACCTCTTCTAAGAAGCCTTCCAGAACCCCTGAGGAAAGAAGGACCCAT 360

131699718 CTGACTCTGGGGCTGGAAGGCTCAACTGCTGGCCTGTGTCCTAGCCTCTCCCTCCAGTCC 131699777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGACTCTGGGGCTGGAAGGCTCAACTGCTGGCCTGTGTCCTAGCCTCTCCCTCCAGTCC 420

131699778 TTGCCCTGCTCTGCTCTGTGATCTTGTTAGGCATGTGTGTGCTTGCACATGCTAGGAGCT 131699837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGCCCTGCTCTGCTCTGTGATCTTGTTAGGCATGTGTGTGCTTGCACATGCTAGGAGCT 480

131699838 TGTTGGGCAGGGGTGGGGGTTTTCTCTTTGCATCCCTCCTGGGGCTGGCATATGGTAGGT 131699897
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTGGGCAAGGGTGGGGGTTTTCTCTTTGCATCCCTCCTGGGGCTGGCATATGGTAGGT 540

131699898 GCTCAGTAGCTGGGTGTTGATGTGGAATCCTGAGAGGAAAATGCCTGTGGCCAGAGCAAT 131699957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTCAGTAGCTGGGTGTTGATGTGGAATCCTGAGAGGAAAATGCCTGTGGCCAGAGCAAT 600

131699958 AGCATCCTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAGCTCCTCTCTGCTCTCTTCTGTCCTCACCAGGC 131700017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCATCCTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAGCTCCTCTCTGCTCTCTTCTGTCCTCACCAGGC 660

131700018 TTTTCCTCTCTCTTGCAGCAACCTCACTTTGGCGGTGAAGGTGAGCTGAGAGCTGTGGGC 131700077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTCCTCTCTCTTGCAGCAACCTCACTTTGGCGGTGAAGGTGAGCTGAGAGCTGTGGGC 720

131700078 CCCTGAAAAGGCCATGGGTGGGACATCTAAGACAGCAATGGTTCTCAGATCTTCAGAAGG 131700137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCTGAAAAGGCCATGGGTGGGACATCTAAGACAGCAATGGTTCTCAGATCTTCAGAAGG 780

131700138 AGGGAAAGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGTAGGAGCCTGGCCCGGAGAGGAGGAGCCACCTT 131700197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGGAAAGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGTAGGAGCCTGGCCCGGAGAGGAGGAGCCACCTT 840

131700198 CCATTCCTTCCCCTGATAGTGGATTGGTAGGGAAACCTTGCGTCCTTGGCATAGTGGGTC 131700257
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCATTCCTTCCTCTGATAGTGGATTGGTAGGGAAACCTTGCGTCCTTGGCATAGTGGGTC 900

131700258 CTGAGCCTGCCAGCAACCCCAGCTGGTTAAAAATATAGATTTCCTAGGACAGGCGTGGTG 131700317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGAGCCTGCCAGCAACCCCAGCTGGTTAAAAATATAGATTTCCTAGGACAGGCGTGGTG 960

131700318 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGAAGGCAGAGGCGAGCGGATCACCTGAGGTCAG 131700377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGAAGGCAGAGGCGAGCGGATCACCTGAGGTCAG 1020

131700378 GAATTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGCTGAAGCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAT 131700437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAATTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGCTGAAGCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAT 1080

131700438 TTTGGTGGGTGTAGTATCGCACACCCGTAGTCCTAGCTACTCAGGCGGCTGAGGCAGGAG 131700497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGGTGGGTGTAGTATCGCACACCCGTAGTCCTAGCTACTCAGGCGGCTGAGGCAGGAG 1140

131700498 AATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCA 131700557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCA 1200

131700558 GCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACCAAACAAACAAAAAAACCAAACCAAA 131700617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACCAAACAAACAAAAAAACCAAACCAAA 1260

131700618 CCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCCTAGTCCCTGAGATCTTGAGCCAGTAGG 131700677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCCTAGTCCCTGAGATCTTGAGCCAGTAGG 1320

131700678 GCTGCATGGGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGGTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCATTCTTG 131700737
          ||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTGCATGTGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCATTCTTG 1380

131700738 TCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCGGCTCACTACAACTTCCGCCTCTCCGGT 131700797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCGGCTCACTACAACTTCCGCCTCTCCGGT 1440

131700798 CCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCAC 131700857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCAC 1500

131700858 GCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGCTGG 131700917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGCTGG 1560

131700918 TCTCGAAC 131700925
          ||||||||
     1561 TCTCGAAC 1568

EXCISED REGION

131702158 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 131702217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 1628

131702218 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 131702277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 1688

131702278 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 131702337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 1748

131702338 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 131702397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 1808

131702398 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 131702457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 1868

131702458 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 131702517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 1928

131702518 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 131702577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 1988

131702578 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 131702637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 2048

131702638 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 131702697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 2108

131702698 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 131702757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 2168

131702758 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 131702817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 2228

131702818 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 131702877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 2288

131702878 GTGGTGTGTCAAGAAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 131702937
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 GTGGTGTGTCAAGGAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 2348

131702938 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 131702997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 2408

131702998 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 131703057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 2468

131703058 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 131703117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 2528

131703118 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 131703177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 2588

131703178 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 131703237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 2648

131703238 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 131703297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 2708

131703298 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 131703357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 2768

131703358 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 131703417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 2828

131703418 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 131703477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 2888

131703478 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 131703537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 2948

131703538 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 131703597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 3008

131703598 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 131703657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 3068

131703658 CCTTCCTGCTCTGGGGAGGGGGGATGTGGGGCTGGTAGGTTCCTGACCTGCTTGTGTCTC 131703717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 CCTTCCTGCTCTGGGGAGGGGGGATGTGGGGCTGGTAGGTTCCTGACCTGCTTGTGTCTC 3128

131703718 TGCCAGGGGCCCTGGTCCTCATCCATGGAGAAGTGGTACACAAGAGCAAGCAGAACCTCT 131703777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 TGCCAGGGGCCCTGGTCCTCATCCATGGAGAAGTGGTACACAAGAGCAAGCAGAACCTCT 3188

131703778 CTGACCGCTCGCGCCAGGCCTACACTTTCCACCTCATGGAGGCCTCTGGCACCACCTGGA 131703837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 CTGACCGCTCGCGCCAGGCCTACACTTTCCACCTCATGGAGGCCTCTGGCACCACCTGGA 3248

131703838 GCCCGGAGAACTGGTAGGTGACAGGGTGGGTGTGTGTGCCCGACAGTCCCCTGGAGGCTG 131703897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 GCCCGGAGAACTGGTAGGTGACAGGGTGGGTGTGTGTGCCCGACAGTCCCCTGGAGGCTG 3308

131703898 GGAACAGTGACCCTGCACCTCAAGGTTGTTTCTCCTCTATCCTCTGCAGGCTCCAGCCAA 131703957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 GGAACAGTGACCCTGCACCTCAAGGTTGTTTCTCCTCTATCCTCTGCAGGCTCCAGCCAA 3368

131703958 CAGCTGAACTGCCCTTTCCCCAACTGTACACCTAAAGGCTCTCGCAGGGCAGGAGCCCTC 131704017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 CAGCTGAACTGCCCTTTCCCCAACTGTACACCTAAAGGCTCTCGCAGGGCAGGAGCCCTC 3428

131704018 GCCCCTCCCGGGTGAAGCTGTGGGCTGTAAACACCAGTGCCTTGCTCAGCCTCCTGGTTG 131704077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 GCCCCTCCCGGGTGAAGCTGTGGGCTGTAAACACCAGTGCCTTGCTCAGCCTCCTGGTTG 3488

131704078 CAACAGGGAGGTCTTGTCTCCCCTCCTGGGCTTTCCTCCTGCCCTGTGGGCAGCAGCCTA 131704137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 CAACAGGGAGGTCTTGTCTCCCCTCCTGGGCTTTCCTCCTGCCCTGTGGGCAGCAGCCTA 3548

131704138 GGCTGGGTCAGGGGCTTCCCTAAGATCTTCACCTCTCTGCCTCCCTACTGCCCCAACATA 131704197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 GGCTGGGTCAGGGGCTTCCCTAAGATCTTCACCTCTCTGCCTCCCTACTGCCCCAACATA 3608

131704198 GCCTTGAGGAGGCTTCTCAGCCACCAAAGGGTTCTGGCCCCTTCTCACTCTCCTCTCCTC 131704257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 GCCTTGAGGAGGCTTCTCAGCCACCAAAGGGTTCTGGCCCCTTCTCACTCTCCTCTCCTC 3668

131704258 TCAGATGGAACTCTGGTTATTATGGTGTTAGTTATCGAATAAAAACGACTTCAGAATGCA 131704317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 TCAGATGGAACTCTGGTTATTATGGTGTTAGTTATCGAATAAAAACGACTTCAGAATGCA 3728

131704318 GCTTCCCTACTGAGCCTTCTTTCCCAAGCAGCATTGCTTTCCAGAGAAGAAAACTGCTTT 131704377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 GCTTCCCTACTGAGCCTTCTTTCCCAAGCAGCATTGCTTTCCAGAGAAGAAAACTGCTTT 3788

131704378 CCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGC 131704437
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3789 CCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGC 3848

131704438 GGATGACCTGAGGTTGGCAGTTCTAGACCAGTTTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCT 131704497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 GGATGACCTGAGGTTGGCAGTTCTAGACCAGTTTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCT 3908

131704498 ACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCG 131704557
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 ACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCG 3968

131704558 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCCGGGAGGTAGAGATTGCGGTGAGTCGAGAT 131704617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCCGGGAGGTAGAGATTGCGGTGAGTCGAGAT 4028

131704618 CACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAA 131704677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     4029 CACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAAGCAAAACTCCATCTC-AAAAAAAAAAAA 4087

131704678 AAAATTGCTTTCCAGACAAGATGCTAAAATGCATCCCAGGTACCCCAGCCCTGCTTGGCG 131704737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 AAAATTGCTTTCCAGACAAGATGCTAAAATGCATCCCAGGTACCCCAGCCCTGCTTGGCG 4147

131704738 TGGCTTGCATGATTTTAATAAGTAACATTTAGTGGGCAGTGACCGTGTGCCCTGCTCTGT 131704797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 TGGCTTGCATGATTTTAATAAGTAACATTTAGTGGGCAGTGACCGTGTGCCCTGCTCTGT 4207

131704798 GCTGAGACCTTCACAGGCTTTATCTCATGGAATCCTCACTCGGAGAGGTAAGTGCCATTA 131704857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 GCTGAGACCTTCACAGGCTTTATCTCATGGAATCCTCACTCGGAGAGGTAAGTGCCATTA 4267

131704858 TCTGTACTTACAGAAGACGACGCTGAGCCAAGGAGGGGGTAAATGACCTGCCCAAGTCAC 131704917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 TCTGTACTTACAGAAGACGACGCTGAGCCAAGGAGGGGGTAAATGACCTGCCCAAGTCAC 4327

131704918 GTGGCTGCTCGGTTGTTCAGCAGGGTCAGCCTCATGCAGAGCCCGTGCTCCTAACCTTGA 131704977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 GTGGCTGCTCGGTTGTTCAGCAGGGTCAGCCTCATGCAGAGCCCGTGCTCCTAACCTTGA 4387

131704978 CACTGCCTCGTCTTCTCTTCTTGGGGAGCAGAGATGCCCAGAGCTAGGAATCCAGAGTTC 131705037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 CACTGCCTCGTCTTCTCTTCTTGGGGAGCAGAGATGCCCAGAGCTAGGAATCCAGAGTTC 4447

131705038 CAGGTTCTGGTCCTGGCTCTGTGAGCAACTTGCTCTCTGGTCTCAGGCCAGGGCCTTTCC 131705097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 CAGGTTCTGGTCCTGGCTCTGTGAGCAACTTGCTCTCTGGTCTCAGGCCAGGGCCTTTCC 4507

131705098 TTCCTCTGGGCCTGTTTCCTCCCATGTCCAGTAAGGGGGCCAGACTAGGGCCTTCAGGGG 131705157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 TTCCTCTGGGCCTGTTTCCTCCCATGTCCAGTAAGGGGGCCAGACTAGGGCCTTCAGGGG 4567

131705158 CCCTTCCTGTTTGGGCATGCTTGGCAGGCACTCAGACCTTCAGAACAACTGCCAAATCTA 131705217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 CCCTTCCTGTTTGGGCATGCTTGGCAGGCACTCAGACCTTCAGAACAACTGCCAAATCTA 4627

131705218 AAACCTTAGCTGAGGTTTGGCCCAGAGGCTACAAACTGGGGAACACAGGCTGATTCTAGC 131705277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 AAACCTTAGCTGAGGTTTGGCCCAGAGGCTACAAACTGGGGAACACAGGCTGATTCTAGC 4687

131705278 CCACAGACGCATTTTGTCTGGGCCTCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCA 131705337
          |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||.
     4688 CCACAGACGCATTTTGTCTGGGCCTCAGCA-TTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCG 4746

131705338 CTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTCATTGCGACCTCCGCCTCC 131705397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 CTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTCATTGCGACCTCCGCCTCC 4806

131705398 CGGGTTCAAGCAATTCTCTCCCTCAGTATCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCA 131705457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 CGGGTTCAAGCAATTCTCTCCCTCAGTATCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCA 4866

131705458 CCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATCTTTGCCAGGC 131705517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 CCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATCTTTGCCAGGC 4926

131705518 TGGTCTTGAACTCCTG 131705533
          ||||||||||||||||
     4927 TGGTCTTGAACTCCTG 4942

Alignment time is 3.65223 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131690925,131712157] =>     21233 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     7565] =>      7565 nucs 'mol-32-300f-224527_7565'

Score:        7418
Aligned:      7565        nucs
Identic:      7550 (100%) nucs =>      2696 (100%)      4854 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131698224,131700925] EXCISED REGION [131702158,131707017]
 second seq =>  [        1,     2702] EXCISED REGION [     2703,     7565]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1232 nucs [131700926,131702157]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        27 nucs [131700926,131700952] to [131702158,131702184]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131700926,131700926] to [131702157,131702157]
 second seq =>         0 nucs

131698224 GGTATTAAATGCATTCAATCTTATGTTTATGACAATGAGGGACTATCCCATGCCAGGCCC 131698283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTATTAAATGCATTCAATCTTATGTTTATGACAATGAGGGACTATCCCATGCCAGGCCC 60

131698284 TGGGCTGTCCCTGCACATTCATTAGCCCATCGAGTCCCACACCAGTCCTGCCTCCCAGGT 131698343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGCTGTCCCTGCACATTCATTAGCCCATCGAGTCCCACACCAGTCCTGCCTCCCAGGT 120

131698344 TCTTCTAATCCTCATTTGACAGAAGAGGAAACTGAGGCTTACAGGAGAGAAATGGTTACC 131698403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTCTAATCCTCATTTGACAGAAGAGGAAACTGAGGCTTACAGGAGAGAAATGGTTACC 180

131698404 CGAGGCCACACAGAGCAAATGGTGGTACCGAGATTGCTCCGCATGATTGGTGCCTTGGAG 131698463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CGAGGCCACACAGAGCAAATGGTGGTACCGAGATTGCTCCGCATGATTGGTGCCTTGGAG 240

131698464 CCCTTAGTCGTCTGTGAGGGGTGGGGAGTCGGGGCTGGACTGAGCTTCCCAGAAGGTCAA 131698523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCTTAGTCGTCTGTGAGGGGTGGGGAGTCGGGGCTGGACTGAGCTTCCCAGAAGGTCAA 300

131698524 GAATAAGGGCATGGGTGGCATAGGGCCTGGGGTGGGGGCAAGGCTCCTGTGGAGCCCATT 131698583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAATAAGGGCATGGGTGGCATAGGGCCTGGGGTGGGGGCAAGGCTCCTGTGGAGCCCATT 360

131698584 ACTCAGTTGTAAACAAGCAGAAGGGTTAATGCCTACAAAGTAAGTGAGAATGTCAAAGTA 131698643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTCAGTTGTAAACAAGCAGAAGGGTTAATGCCTACAAAGTAAGTGAGAATGTCAAAGTA 420

131698644 AGCCTGAGTGTGGGTGCCCAGAGCTGGGTGTGGAGGGACACGTGGGCCTGAGATGGGGCC 131698703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCCTGAGTGTGGGTGCCCAGAGCTGGGTGTGGAGGGACACGTGGGCCTGAGATGGGGCC 480

131698704 GACAGCTTCCTTCTGTCCCATAGCTCTGCACGCCCACGACCCCGTCTTCAAGAGCATCAC 131698763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACAGCTTCCTTCTGTCCCATAGCTCTGCACGCCCACGACCCCGTCTTCAAGAGCATCAC 540

131698764 ACACTCCTTCAAGGTGCAGGTGAGCAGAGGTGGGGGTGAGGGCCAGGAGGGTGGGCCATG 131698823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACACTCCTTCAAGGTGCAGGTGAGCAGAGGTGGGGGTGAGGGCCAGGAGGGTGGGCCATG 600

131698824 TGTGGCAGGCTGGCAGCATGACCTTTGCCCCCCTCCAGACCTTGGCCAGAAGTCTGGGCC 131698883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGGCAGGCTGGCAGCATGACCTTTGCCCCCCTCCAGACCTTGGCCAGAAGTCTGGGCC 660

131698884 TCCAGATGCCCGTGGTGGTGCAGAGCATGTACATCTTTAAGGTGAGCTCCTTGTCCTTGC 131698943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCAGATGCCCGTGGTGGTGCAGAGCATGTACATCTTTAAGGTGAGCTCCTTGTCCTTGC 720

131698944 CTCAGTTTACCATCTGTAAAATGGGCAGACTGCTCATACCAAGCCCTTCCTTACAATGGG 131699003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCAGTTTACCATCTGTAAAATGGGCAGACTGCTCATACCAAGCCCTTCCTTACAATGGG 780

131699004 CCAAAAGTTGCTGGAATTATTATGTTGGTGGGAGAACATGGAAAATCGGTCTCCTCTGGC 131699063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAAAAGTTGCTGGAATTATTATGTTGGTGGGAGAACATGGAAAATCGGTCTCCTCTGGC 840

131699064 TAAAGCACCTGGAACTTAGTTGATCCTCAGTTAAAATTTGGTGGTAGGGGCCGGGCGTGG 131699123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAAGCACCTGGAACTTAGTTGATCCTCAGTTAAAATTTGGTGGTAGGGGCCGGGCGTGG 900

131699124 TGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCGGGCAGATCACCTGAAGTC 131699183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      901 TGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATCACCTGAAGTC 960

131699184 AGGAGTTCGAGATCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAA 131699243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGAGTTCGAGATCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAA 1020

131699244 ATTAGCCGGGCGTGATGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA 131699303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTAGCCGGGCGTGATGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA 1080

131699304 TAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTACAGTGAGTGGAGATCACGCCAATGTACTCT 131699363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTACAGTGAGTGGAGATCACGCCAATGTACTCT 1140

131699364 AGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCTCCGTCTCAAAAAAAAGAAAAATTTGGCCAGGCGCAGT 131699423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCTCCGTCTCAAAAAAAAGAAAAATTTGGCCAGGCGCAGT 1200

131699424 GGCTCACGCTTGTAATCCCAGCTCTCAGGGAGGCAGAGGTGGGAGGGTAGCTTGAACCCA 131699483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGCTCACGCTTGTAATCCCAGCTCTCAGGGAGGCAGAGGTGGGAGGGTAGCTTGAACCCA 1260

131699484 GGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCAATATAGCGAGACCCCATTCTCCACAAAAAGGAAGAAA 131699543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1261 GGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCAATATAGCGAGACCCCATTCTCCACAAAAAGGAATAAA 1320

131699544 AAAAAAAAGAAAAAAAAATTTGGTGGTAGGAGGGAGGGTCATCCCCAGGCCTCCCTCGGC 131699603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAAAAAAGAAAAAAAAATTTGGTGGTAGGAGGGAGGGTCATCCCCAGGCCTCCCTCGGC 1380

131699604 CTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCAATTGAAATGCTGTGCTCCCAGCTTTCAAGGGCCAGCTC 131699663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCAATTGAAATGCTGTGCTCCCAGCTTTCAAGGGCCAGCTC 1440

131699664 AGTGCCACCTCTTCTAAGAAGCCTTCCAGAACCCCTGAGGAAAGAAGGACCCATCTGACT 131699723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTGCCACCTCTTCTAAGAAGCCTTCCAGAACCCCTGAGGAAAGAAGGACCCATCTGACT 1500

131699724 CTGGGGCTGGAAGGCTCAACTGCTGGCCTGTGTCCTAGCCTCTCCCTCCAGTCCTTGCCC 131699783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGGGGCTGGAAGGCTCAACTGCTGGCCTGTGTCCTAGCCTCTCCCTCCAGTCCTTGCCC 1560

131699784 TGCTCTGCTCTGTGATCTTGTTAGGCATGTGTGTGCTTGCACATGCTAGGAGCTTGTTGG 131699843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGCTCTGCTCTGTGATCTTGTTAGGCATGTGTGTGCTTGCACATGCTAGGAGCTTGTTGG 1620

131699844 GCAGGGGTGGGGGTTTTCTCTTTGCATCCCTCCTGGGGCTGGCATATGGTAGGTGCTCAG 131699903
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCAAGGGTGGGGGTTTTCTCTTTGCATCCCTCCTGGGGCTGGCATATGGTAGGTGCTCAG 1680

131699904 TAGCTGGGTGTTGATGTGGAATCCTGAGAGGAAAATGCCTGTGGCCAGAGCAATAGCATC 131699963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGCTGGGTGTTGATGTGGAATCCTGAGAGGAAAATGCCTGTGGCCAGAGCAATAGCATC 1740

131699964 CTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAGCTCCTCTCTGCTCTCTTCTGTCCTCACCAGGCTTTTCC 131700023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAGCTCCTCTCTGCTCTCTTCTGTCCTCACCAGGCTTTTCC 1800

131700024 TCTCTCTTGCAGCAACCTCACTTTGGCGGTGAAGGTGAGCTGAGAGCTGTGGGCCCCTGA 131700083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTCTCTTGCAGCAACCTCACTTTGGCGGTGAAGGTGAGCTGAGAGCTGTGGGCCCCTGA 1860

131700084 AAAGGCCATGGGTGGGACATCTAAGACAGCAATGGTTCTCAGATCTTCAGAAGGAGGGAA 131700143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAGGCCATGGGTGGGACATCTAAGACAGCAATGGTTCTCAGATCTTCAGAAGGAGGGAA 1920

131700144 AGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGTAGGAGCCTGGCCCGGAGAGGAGGAGCCACCTTCCATTC 131700203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGTAGGAGCCTGGCCCGGAGAGGAGGAGCCACCTTCCATTC 1980

131700204 CTTCCCCTGATAGTGGATTGGTAGGGAAACCTTGCGTCCTTGGCATAGTGGGTCCTGAGC 131700263
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTCCTCTGATAGTGGATTGGTAGGGAAACCTTGCGTCCTTGGCATAGTGGGTCCTGAGC 2040

131700264 CTGCCAGCAACCCCAGCTGGTTAAAAATATAGATTTCCTAGGACAGGCGTGGTGGCTCAT 131700323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGCCAGCAACCCCAGCTGGTTAAAAATATAGATTTCCTAGGACAGGCGTGGTGGCTCAT 2100

131700324 GCCTGTAATCCCAGCAATTTGGAAGGCAGAGGCGAGCGGATCACCTGAGGTCAGGAATTC 131700383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCCTGTAATCCCAGCAATTTGGAAGGCAGAGGCGAGCGGATCACCTGAGGTCAGGAATTC 2160

131700384 GAGACCAGCCTGGCCAACATGCTGAAGCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTTTGGT 131700443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAGACCAGCCTGGCCAACATGCTGAAGCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTTTGGT 2220

131700444 GGGTGTAGTATCGCACACCCGTAGTCCTAGCTACTCAGGCGGCTGAGGCAGGAGAATCGC 131700503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGGTGTAGTATCGCACACCCGTAGTCCTAGCTACTCAGGCGGCTGAGGCAGGAGAATCGC 2280

131700504 TTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGG 131700563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGG 2340

131700564 GTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACCAAACAAACAAAAAAACCAAACCAAACCAAGC 131700623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACCAAACAAACAAAAAAACCAAACCAAACCAAGC 2400

131700624 AAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCCTAGTCCCTGAGATCTTGAGCCAGTAGGGCTGCA 131700683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCCTAGTCCCTGAGATCTTGAGCCAGTAGGGCTGCA 2460

131700684 TGGGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGGTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCATTCTTGTCACCC 131700743
          ||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGTGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCATTCTTGTCACCC 2520

131700744 AAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCGGCTCACTACAACTTCCGCCTCTCCGGTCCAAGT 131700803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCGGCTCACTACAACTTCCGCCTCTCCGGTCCAAGT 2580

131700804 GATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAG 131700863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAG 2640

131700864 CTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGA 131700923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGA 2700

131700924 AC 131700925
          ||
     2701 AC 2702

EXCISED REGION

131702158 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 131702217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 2762

131702218 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 131702277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 2822

131702278 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 131702337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 2882

131702338 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 131702397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 2942

131702398 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 131702457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 3002

131702458 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 131702517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 3062

131702518 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 131702577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 3122

131702578 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 131702637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 3182

131702638 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 131702697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 3242

131702698 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 131702757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 3302

131702758 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 131702817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 3362

131702818 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 131702877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 3422

131702878 GTGGTGTGTCAAGAAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 131702937
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 GTGGTGTGTCAAGGAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 3482

131702938 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 131702997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 3542

131702998 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 131703057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 3602

131703058 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 131703117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 3662

131703118 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 131703177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 3722

131703178 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 131703237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 3782

131703238 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 131703297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 3842

131703298 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 131703357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 3902

131703358 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 131703417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 3962

131703418 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 131703477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 4022

131703478 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 131703537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 4082

131703538 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 131703597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 4142

131703598 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 131703657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 4202

131703658 CCTTCCTGCTCTGGGGAGGGGGGATGTGGGGCTGGTAGGTTCCTGACCTGCTTGTGTCTC 131703717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4203 CCTTCCTGCTCTGGGGAGGGGGGATGTGGGGCTGGTAGGTTCCTGACCTGCTTGTGTCTC 4262

131703718 TGCCAGGGGCCCTGGTCCTCATCCATGGAGAAGTGGTACACAAGAGCAAGCAGAACCTCT 131703777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4263 TGCCAGGGGCCCTGGTCCTCATCCATGGAGAAGTGGTACACAAGAGCAAGCAGAACCTCT 4322

131703778 CTGACCGCTCGCGCCAGGCCTACACTTTCCACCTCATGGAGGCCTCTGGCACCACCTGGA 131703837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 CTGACCGCTCGCGCCAGGCCTACACTTTCCACCTCATGGAGGCCTCTGGCACCACCTGGA 4382

131703838 GCCCGGAGAACTGGTAGGTGACAGGGTGGGTGTGTGTGCCCGACAGTCCCCTGGAGGCTG 131703897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 GCCCGGAGAACTGGTAGGTGACAGGGTGGGTGTGTGTGCCCGACAGTCCCCTGGAGGCTG 4442

131703898 GGAACAGTGACCCTGCACCTCAAGGTTGTTTCTCCTCTATCCTCTGCAGGCTCCAGCCAA 131703957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 GGAACAGTGACCCTGCACCTCAAGGTTGTTTCTCCTCTATCCTCTGCAGGCTCCAGCCAA 4502

131703958 CAGCTGAACTGCCCTTTCCCCAACTGTACACCTAAAGGCTCTCGCAGGGCAGGAGCCCTC 131704017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 CAGCTGAACTGCCCTTTCCCCAACTGTACACCTAAAGGCTCTCGCAGGGCAGGAGCCCTC 4562

131704018 GCCCCTCCCGGGTGAAGCTGTGGGCTGTAAACACCAGTGCCTTGCTCAGCCTCCTGGTTG 131704077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 GCCCCTCCCGGGTGAAGCTGTGGGCTGTAAACACCAGTGCCTTGCTCAGCCTCCTGGTTG 4622

131704078 CAACAGGGAGGTCTTGTCTCCCCTCCTGGGCTTTCCTCCTGCCCTGTGGGCAGCAGCCTA 131704137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 CAACAGGGAGGTCTTGTCTCCCCTCCTGGGCTTTCCTCCTGCCCTGTGGGCAGCAGCCTA 4682

131704138 GGCTGGGTCAGGGGCTTCCCTAAGATCTTCACCTCTCTGCCTCCCTACTGCCCCAACATA 131704197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 GGCTGGGTCAGGGGCTTCCCTAAGATCTTCACCTCTCTGCCTCCCTACTGCCCCAACATA 4742

131704198 GCCTTGAGGAGGCTTCTCAGCCACCAAAGGGTTCTGGCCCCTTCTCACTCTCCTCTCCTC 131704257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 GCCTTGAGGAGGCTTCTCAGCCACCAAAGGGTTCTGGCCCCTTCTCACTCTCCTCTCCTC 4802

131704258 TCAGATGGAACTCTGGTTATTATGGTGTTAGTTATCGAATAAAAACGACTTCAGAATGCA 131704317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 TCAGATGGAACTCTGGTTATTATGGTGTTAGTTATCGAATAAAAACGACTTCAGAATGCA 4862

131704318 GCTTCCCTACTGAGCCTTCTTTCCCAAGCAGCATTGCTTTCCAGAGAAGAAAACTGCTTT 131704377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 GCTTCCCTACTGAGCCTTCTTTCCCAAGCAGCATTGCTTTCCAGAGAAGAAAACTGCTTT 4922

131704378 CCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGC 131704437
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4923 CCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGC 4982

131704438 GGATGACCTGAGGTTGGCAGTTCTAGACCAGTTTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCT 131704497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 GGATGACCTGAGGTTGGCAGTTCTAGACCAGTTTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCT 5042

131704498 ACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCG 131704557
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5043 ACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCG 5102

131704558 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCCGGGAGGTAGAGATTGCGGTGAGTCGAGAT 131704617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCCGGGAGGTAGAGATTGCGGTGAGTCGAGAT 5162

131704618 CACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAAGCAAAACTCCATCTC---AAAAAAAAAA 131704674
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||
     5163 CACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAA 5222

131704675 AAAAAAATTGCTTTCCAGACAAGATGCTAAAATGCATCCCAGGTACCCCAGCCCTGCTTG 131704734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5223 AAAAAAATTGCTTTCCAGACAAGATGCTAAAATGCATCCCAGGTACCCCAGCCCTGCTTG 5282

131704735 GCGTGGCTTGCATGATTTTAATAAGTAACATTTAGTGGGCAGTGACCGTGTGCCCTGCTC 131704794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5283 GCGTGGCTTGCATGATTTTAATAAGTAACATTTAGTGGGCAGTGACCGTGTGCCCTGCTC 5342

131704795 TGTGCTGAGACCTTCACAGGCTTTATCTCATGGAATCCTCACTCGGAGAGGTAAGTGCCA 131704854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5343 TGTGCTGAGACCTTCACAGGCTTTATCTCATGGAATCCTCACTCGGAGAGGTAAGTGCCA 5402

131704855 TTATCTGTACTTACAGAAGACGACGCTGAGCCAAGGAGGGGGTAAATGACCTGCCCAAGT 131704914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5403 TTATCTGTACTTACAGAAGACGACGCTGAGCCAAGGAGGGGGTAAATGACCTGCCCAAGT 5462

131704915 CACGTGGCTGCTCGGTTGTTCAGCAGGGTCAGCCTCATGCAGAGCCCGTGCTCCTAACCT 131704974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5463 CACGTGGCTGCTCGGTTGTTCAGCAGGGTCAGCCTCATGCAGAGCCCGTGCTCCTAACCT 5522

131704975 TGACACTGCCTCGTCTTCTCTTCTTGGGGAGCAGAGATGCCCAGAGCTAGGAATCCAGAG 131705034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5523 TGACACTGCCTCGTCTTCTCTTCTTGGGGAGCAGAGATGCCCAGAGCTAGGAATCCAGAG 5582

131705035 TTCCAGGTTCTGGTCCTGGCTCTGTGAGCAACTTGCTCTCTGGTCTCAGGCCAGGGCCTT 131705094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5583 TTCCAGGTTCTGGTCCTGGCTCTGTGAGCAACTTGCTCTCTGGTCTCAGGCCAGGGCCTT 5642

131705095 TCCTTCCTCTGGGCCTGTTTCCTCCCATGTCCAGTAAGGGGGCCAGACTAGGGCCTTCAG 131705154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5643 TCCTTCCTCTGGGCCTGTTTCCTCCCATGTCCAGTAAGGGGGCCAGACTAGGGCCTTCAG 5702

131705155 GGGCCCTTCCTGTTTGGGCATGCTTGGCAGGCACTCAGACCTTCAGAACAACTGCCAAAT 131705214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5703 GGGCCCTTCCTGTTTGGGCATGCTTGGCAGGCACTCAGACCTTCAGAACAACTGCCAAAT 5762

131705215 CTAAAACCTTAGCTGAGGTTTGGCCCAGAGGCTACAAACTGGGGAACACAGGCTGATTCT 131705274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5763 CTAAAACCTTAGCTGAGGTTTGGCCCAGAGGCTACAAACTGGGGAACACAGGCTGATTCT 5822

131705275 AGCCCACAGACGCATTTTGTCTGGGCCTCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTC 131705334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5823 AGCCCACAGACGCATTTTGTCTGGGCCTCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTC 5882

131705335 TCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTCATTGCGACCTCCGCC 131705394
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5883 TCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTCATTGCGACCTCCGCC 5942

131705395 TCCCGGGTTCAAGCAATTCTCTCCCTCAGTATCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTG 131705454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5943 TCCCGGGTTCAAGCAATTCTCTCCCTCAGTATCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTG 6002

131705455 CCACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATCTTTGCCA 131705514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6003 CCACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATCTTTGCCA 6062

131705515 GGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCATAGTGCTGGGA 131705574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6063 GGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCATAGTGCTGGGA 6122

131705575 TTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAGGCCTCAGCATTTAAGAAAAAACTTGAAGAT 131705634
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     6123 TTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAGGCCTCAGCATTTAAGAAAAGACTTGAAGAT 6182

131705635 TCCACATAATAATCCAGGTTCCTAAGCTTCCTCGAATGAGCATGCAATTGACAACACGGG 131705694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6183 TCCACATAATAATCCAGGTTCCTAAGCTTCCTCGAATGAGCATGCAATTGACAACACGGG 6242

131705695 GCCTACACTCTAGCATGGTGGCTACTGGCTGGAGCTCCCTTAGAGGCTCAGTGTGGTCCC 131705754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6243 GCCTACACTCTAGCATGGTGGCTACTGGCTGGAGCTCCCTTAGAGGCTCAGTGTGGTCCC 6302

131705755 CTGTTGTCGTTCACTGCGTTACCTGATTGGCCTTGGCAGTCATTTGAGTTTGTGACCCTG 131705814
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6303 CTGTTGTCATTCACTGCGTTACCTGATTGGCCTTGGCAGTCATTTGAGTTTGTGACCCTG 6362

131705815 ATGTAGCCTATCCCCCAACTATATACATGGACAACCCAAGGCCCAGAGGATAGAGCCCTT 131705874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6363 ATGTAGCCTATCCCCCAACTATATACATGGACAACCCAAGGCCCAGAGGATAGAGCCCTT 6422

131705875 TCCCAAGGCCACCCTGGGAGTCCGTGGGGCAAAGCTGGTGCTCTTTCACCAACATTTTGC 131705934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6423 TCCCAAGGCCACCCTGGGAGTCCGTGGGGCAAAGCTGGTGCTCTTTCACCAACATTTTGC 6482

131705935 TGCTTCCTTTTGCAAGCAATAGGAGGGAGCCTAAGAGAAGGGAAGCGTCTCCATTGAGTC 131705994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6483 TGCTTCCTTTTGCAAGCAATAGGAGGGAGCCTAAGAGAAGGGAAGCGTCTCCATTGAGTC 6542

131705995 CCAAAGAAATGTCTCAATACTCTCCTCTGAGGGAAAGGACATGGCAGTGATTCTCAAGCA 131706054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6543 CCAAAGAAATGTCTCAATACTCTCCTCTGAGGGAAAGGACATGGCAGTGATTCTCAAGCA 6602

131706055 GAAGCTTCGCTCCCTGGAGCTCTGCTCCCGGCTTCTGGCCTTGGTGGACCAAAGCTCTCA 131706114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6603 GAAGCTTCGCTCCCTGGAGCTCTGCTCCCGGCTTCTGGCCTTGGTGGACCAAAGCTCTCA 6662

131706115 CCTCCTCTGATGTCCTCCCAAGCTTGGGGAGAAAGGGAGAACCTTGTCCAGCCTCAGGAA 131706174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6663 CCTCCTCTGATGTCCTCCCAAGCTTGGGGAGAAAGGGAGAACCTTGTCCAGCCTCAGGAA 6722

131706175 TCTTGCTGTGCTATCTTCCTAGTGACGGAAAATGTTTATCCATTCACTATCTGTGTAGTG 131706234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6723 TCTTGCTGTGCTATCTTCCTAGTGACGGAAAATGTTTATCCATTCACTATCTGTGTAGTG 6782

131706235 TACAATTCTGGGAGGGACACAGTGCAGATGGACTCCCAAATCTACTGATTTCCTGCTCCT 131706294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6783 TACAATTCTGGGAGGGACACAGTGCAGATGGACTCCCAAATCTACTGATTTCCTGCTCCT 6842

131706295 TGTCAGTGCCCTGTGCTAGCCTTGGGGGATGGGGTGGGGAGTGAGGCAGTGCCGGAGCCT 131706354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6843 TGTCAGTGCCCTGTGCTAGCCTTGGGGGATGGGGTGGGGAGTGAGGCAGTGCCGGAGCCT 6902

131706355 GTCTTCCCAGCCAGAGAGCAAGGCTGCAGCGTGGGCCCCTCATACAGTCATTTTACCTCT 131706414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6903 GTCTTCCCAGCCAGAGAGCAAGGCTGCAGCGTGGGCCCCTCATACAGTCATTTTACCTCT 6962

131706415 CAGGAAACTCCCCCAGCCCCTGTGGATCTTTCCTACCTTAGGAAAAGACAAACACAGGTT 131706474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6963 CAGGAAACTCCCCCAGCCCCTGTGGATCTTTCCTACCTTAGGAAAAGACAAACACAGGTT 7022

131706475 TGGATAGGATTAGAACATGGAAAGGTCTTAAGAAGGGCCCCTTGATGAGGTCCTGGTGCT 131706534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7023 TGGATAGGATTAGAACATGGAAAGGTCTTAAGAAGGGCCCCTTGATGAGGTCCTGGTGCT 7082

131706535 GTTCAGCCCATCTTTCTCTATGGACACCACTCAGTGGGACACCAGAGGCGGGGTGGGGTT 131706594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7083 GTTCAGCCCATCTTTCTCTATGGACACCACTCAGTGGGACACCAGAGGCGGGGTGGGGTT 7142

131706595 GGCTAAAACAAGATCCAGCCCAAGCAGGATCTGATCCTCCCTCAACCCTGCCAAAGTTGA 131706654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7143 GGCTAAAACAAGATCCAGCCCAAGCAGGATCTGATCCTCCCTCAACCCTGCCAAAGTTGA 7202

131706655 CCCACCTCTCCCTTCAGTAATTCCTAGCCCTCTGCTCTTTCCCTCAGGAGTTCTCCACCT 131706714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7203 CCCACCTCTCCCTTCAGTAATTCCTAGCCCTCTGCTCTTTCCCTCAGGAGTTCTCCACCT 7262

131706715 CCAAGTGAAGCCAGGAGAGCAAAGGTCACTCTGGTTTCCAAGTGGTTTGCCCAGCTTTTC 131706774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7263 CCAAGTGAAGCCAGGAGAGCAAAGGTCACTCTGGTTTCCAAGTGGTTTGCCCAGCTTTTC 7322

131706775 GGCTTTTCACTAAGATGAGGACTGGTCTTTGGTAAAAATGACTCCCTTTCTGACTGCTTA 131706834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7323 GGCTTTTCACTAAGATGAGGACTGGTCTTTGGTAAAAATGACTCCCTTTCTGACTGCTTA 7382

131706835 TCAAGGGTGGGCTCTAGGCTGGACCCTCACAACACCCCGCGAGGTGTGGGCTGTCATTAC 131706894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7383 TCAAGGGTGGGCTCTAGGCTGGACCCTCACAACACCCCGCGAGGTGTGGGCTGTCATTAC 7442

131706895 TCCCATCTGCAAGAGAATTGAGGTTCAGCCTGGCTAAGTGACTCACCCAAGGTCACAAAG 131706954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7443 TCCCATCTGCAAGAGAATTGAGGTTCAGCCTGGCTAAGTGACTCACCCAAGGTCACAAAG 7502

131706955 TTGTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGAC 131707014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7503 TTGTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGAC 7562

131707015 TGG 131707017
          |||
     7563 TGG 7565

Alignment time is 5.64759 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131690925,131712157] =>     21233 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     2773] =>      2773 nucs 'mol-32-300f-224527_2773'

Score:        2707
Aligned:      2773        nucs
Identic:      2767 (100%) nucs =>      2696 (100%)        71 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131698224,131700925] EXCISED REGION [131702158,131702228]
 second seq =>  [        1,     2702] EXCISED REGION [     2703,     2773]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1232 nucs [131700926,131702157]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        27 nucs [131700926,131700952] to [131702158,131702184]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131700926,131700926] to [131702157,131702157]
 second seq =>         0 nucs

131698224 GGTATTAAATGCATTCAATCTTATGTTTATGACAATGAGGGACTATCCCATGCCAGGCCC 131698283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTATTAAATGCATTCAATCTTATGTTTATGACAATGAGGGACTATCCCATGCCAGGCCC 60

131698284 TGGGCTGTCCCTGCACATTCATTAGCCCATCGAGTCCCACACCAGTCCTGCCTCCCAGGT 131698343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGCTGTCCCTGCACATTCATTAGCCCATCGAGTCCCACACCAGTCCTGCCTCCCAGGT 120

131698344 TCTTCTAATCCTCATTTGACAGAAGAGGAAACTGAGGCTTACAGGAGAGAAATGGTTACC 131698403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTCTAATCCTCATTTGACAGAAGAGGAAACTGAGGCTTACAGGAGAGAAATGGTTACC 180

131698404 CGAGGCCACACAGAGCAAATGGTGGTACCGAGATTGCTCCGCATGATTGGTGCCTTGGAG 131698463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CGAGGCCACACAGAGCAAATGGTGGTACCGAGATTGCTCCGCATGATTGGTGCCTTGGAG 240

131698464 CCCTTAGTCGTCTGTGAGGGGTGGGGAGTCGGGGCTGGACTGAGCTTCCCAGAAGGTCAA 131698523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCTTAGTCGTCTGTGAGGGGTGGGGAGTCGGGGCTGGACTGAGCTTCCCAGAAGGTCAA 300

131698524 GAATAAGGGCATGGGTGGCATAGGGCCTGGGGTGGGGGCAAGGCTCCTGTGGAGCCCATT 131698583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAATAAGGGCATGGGTGGCATAGGGCCTGGGGTGGGGGCAAGGCTCCTGTGGAGCCCATT 360

131698584 ACTCAGTTGTAAACAAGCAGAAGGGTTAATGCCTACAAAGTAAGTGAGAATGTCAAAGTA 131698643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTCAGTTGTAAACAAGCAGAAGGGTTAATGCCTACAAAGTAAGTGAGAATGTCAAAGTA 420

131698644 AGCCTGAGTGTGGGTGCCCAGAGCTGGGTGTGGAGGGACACGTGGGCCTGAGATGGGGCC 131698703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCCTGAGTGTGGGTGCCCAGAGCTGGGTGTGGAGGGACACGTGGGCCTGAGATGGGGCC 480

131698704 GACAGCTTCCTTCTGTCCCATAGCTCTGCACGCCCACGACCCCGTCTTCAAGAGCATCAC 131698763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACAGCTTCCTTCTGTCCCATAGCTCTGCACGCCCACGACCCCGTCTTCAAGAGCATCAC 540

131698764 ACACTCCTTCAAGGTGCAGGTGAGCAGAGGTGGGGGTGAGGGCCAGGAGGGTGGGCCATG 131698823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACACTCCTTCAAGGTGCAGGTGAGCAGAGGTGGGGGTGAGGGCCAGGAGGGTGGGCCATG 600

131698824 TGTGGCAGGCTGGCAGCATGACCTTTGCCCCCCTCCAGACCTTGGCCAGAAGTCTGGGCC 131698883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGGCAGGCTGGCAGCATGACCTTTGCCCCCCTCCAGACCTTGGCCAGAAGTCTGGGCC 660

131698884 TCCAGATGCCCGTGGTGGTGCAGAGCATGTACATCTTTAAGGTGAGCTCCTTGTCCTTGC 131698943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCAGATGCCCGTGGTGGTGCAGAGCATGTACATCTTTAAGGTGAGCTCCTTGTCCTTGC 720

131698944 CTCAGTTTACCATCTGTAAAATGGGCAGACTGCTCATACCAAGCCCTTCCTTACAATGGG 131699003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCAGTTTACCATCTGTAAAATGGGCAGACTGCTCATACCAAGCCCTTCCTTACAATGGG 780

131699004 CCAAAAGTTGCTGGAATTATTATGTTGGTGGGAGAACATGGAAAATCGGTCTCCTCTGGC 131699063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAAAAGTTGCTGGAATTATTATGTTGGTGGGAGAACATGGAAAATCGGTCTCCTCTGGC 840

131699064 TAAAGCACCTGGAACTTAGTTGATCCTCAGTTAAAATTTGGTGGTAGGGGCCGGGCGTGG 131699123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAAGCACCTGGAACTTAGTTGATCCTCAGTTAAAATTTGGTGGTAGGGGCCGGGCGTGG 900

131699124 TGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCGGGCAGATCACCTGAAGTC 131699183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      901 TGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATCACCTGAAGTC 960

131699184 AGGAGTTCGAGATCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAA 131699243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGAGTTCGAGATCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAA 1020

131699244 ATTAGCCGGGCGTGATGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA 131699303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTAGCCGGGCGTGATGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA 1080

131699304 TAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTACAGTGAGTGGAGATCACGCCAATGTACTCT 131699363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTACAGTGAGTGGAGATCACGCCAATGTACTCT 1140

131699364 AGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCTCCGTCTCAAAAAAAAGAAAAATTTGGCCAGGCGCAGT 131699423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCTCCGTCTCAAAAAAAAGAAAAATTTGGCCAGGCGCAGT 1200

131699424 GGCTCACGCTTGTAATCCCAGCTCTCAGGGAGGCAGAGGTGGGAGGGTAGCTTGAACCCA 131699483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGCTCACGCTTGTAATCCCAGCTCTCAGGGAGGCAGAGGTGGGAGGGTAGCTTGAACCCA 1260

131699484 GGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCAATATAGCGAGACCCCATTCTCCACAAAAAGGAAGAAA 131699543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1261 GGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCAATATAGCGAGACCCCATTCTCCACAAAAAGGAATAAA 1320

131699544 AAAAAAAAGAAAAAAAAATTTGGTGGTAGGAGGGAGGGTCATCCCCAGGCCTCCCTCGGC 131699603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAAAAAAGAAAAAAAAATTTGGTGGTAGGAGGGAGGGTCATCCCCAGGCCTCCCTCGGC 1380

131699604 CTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCAATTGAAATGCTGTGCTCCCAGCTTTCAAGGGCCAGCTC 131699663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCAATTGAAATGCTGTGCTCCCAGCTTTCAAGGGCCAGCTC 1440

131699664 AGTGCCACCTCTTCTAAGAAGCCTTCCAGAACCCCTGAGGAAAGAAGGACCCATCTGACT 131699723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTGCCACCTCTTCTAAGAAGCCTTCCAGAACCCCTGAGGAAAGAAGGACCCATCTGACT 1500

131699724 CTGGGGCTGGAAGGCTCAACTGCTGGCCTGTGTCCTAGCCTCTCCCTCCAGTCCTTGCCC 131699783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGGGGCTGGAAGGCTCAACTGCTGGCCTGTGTCCTAGCCTCTCCCTCCAGTCCTTGCCC 1560

131699784 TGCTCTGCTCTGTGATCTTGTTAGGCATGTGTGTGCTTGCACATGCTAGGAGCTTGTTGG 131699843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGCTCTGCTCTGTGATCTTGTTAGGCATGTGTGTGCTTGCACATGCTAGGAGCTTGTTGG 1620

131699844 GCAGGGGTGGGGGTTTTCTCTTTGCATCCCTCCTGGGGCTGGCATATGGTAGGTGCTCAG 131699903
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCAAGGGTGGGGGTTTTCTCTTTGCATCCCTCCTGGGGCTGGCATATGGTAGGTGCTCAG 1680

131699904 TAGCTGGGTGTTGATGTGGAATCCTGAGAGGAAAATGCCTGTGGCCAGAGCAATAGCATC 131699963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGCTGGGTGTTGATGTGGAATCCTGAGAGGAAAATGCCTGTGGCCAGAGCAATAGCATC 1740

131699964 CTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAGCTCCTCTCTGCTCTCTTCTGTCCTCACCAGGCTTTTCC 131700023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAGCTCCTCTCTGCTCTCTTCTGTCCTCACCAGGCTTTTCC 1800

131700024 TCTCTCTTGCAGCAACCTCACTTTGGCGGTGAAGGTGAGCTGAGAGCTGTGGGCCCCTGA 131700083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTCTCTTGCAGCAACCTCACTTTGGCGGTGAAGGTGAGCTGAGAGCTGTGGGCCCCTGA 1860

131700084 AAAGGCCATGGGTGGGACATCTAAGACAGCAATGGTTCTCAGATCTTCAGAAGGAGGGAA 131700143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAGGCCATGGGTGGGACATCTAAGACAGCAATGGTTCTCAGATCTTCAGAAGGAGGGAA 1920

131700144 AGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGTAGGAGCCTGGCCCGGAGAGGAGGAGCCACCTTCCATTC 131700203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGTAGGAGCCTGGCCCGGAGAGGAGGAGCCACCTTCCATTC 1980

131700204 CTTCCCCTGATAGTGGATTGGTAGGGAAACCTTGCGTCCTTGGCATAGTGGGTCCTGAGC 131700263
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTCCTCTGATAGTGGATTGGTAGGGAAACCTTGCGTCCTTGGCATAGTGGGTCCTGAGC 2040

131700264 CTGCCAGCAACCCCAGCTGGTTAAAAATATAGATTTCCTAGGACAGGCGTGGTGGCTCAT 131700323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGCCAGCAACCCCAGCTGGTTAAAAATATAGATTTCCTAGGACAGGCGTGGTGGCTCAT 2100

131700324 GCCTGTAATCCCAGCAATTTGGAAGGCAGAGGCGAGCGGATCACCTGAGGTCAGGAATTC 131700383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCCTGTAATCCCAGCAATTTGGAAGGCAGAGGCGAGCGGATCACCTGAGGTCAGGAATTC 2160

131700384 GAGACCAGCCTGGCCAACATGCTGAAGCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTTTGGT 131700443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAGACCAGCCTGGCCAACATGCTGAAGCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTTTGGT 2220

131700444 GGGTGTAGTATCGCACACCCGTAGTCCTAGCTACTCAGGCGGCTGAGGCAGGAGAATCGC 131700503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGGTGTAGTATCGCACACCCGTAGTCCTAGCTACTCAGGCGGCTGAGGCAGGAGAATCGC 2280

131700504 TTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGG 131700563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGG 2340

131700564 GTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACCAAACAAACAAAAAAACCAAACCAAACCAAGC 131700623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACCAAACAAACAAAAAAACCAAACCAAACCAAGC 2400

131700624 AAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCCTAGTCCCTGAGATCTTGAGCCAGTAGGGCTGCA 131700683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCCTAGTCCCTGAGATCTTGAGCCAGTAGGGCTGCA 2460

131700684 TGGGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGGTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCATTCTTGTCACCC 131700743
          ||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGTGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCATTCTTGTCACCC 2520

131700744 AAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCGGCTCACTACAACTTCCGCCTCTCCGGTCCAAGT 131700803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCGGCTCACTACAACTTCCGCCTCTCCGGTCCAAGT 2580

131700804 GATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAG 131700863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAG 2640

131700864 CTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGA 131700923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGA 2700

131700924 AC 131700925
          ||
     2701 AC 2702

EXCISED REGION

131702158 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 131702217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 2762

131702218 GCCACCGCGCC 131702228
          |||||||||||
     2763 GCCACCGCGCC 2773

Alignment time is 2.0597 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131690925,131712157] =>     21233 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     3511] =>      3511 nucs 'mol-32-301a-195902_3511'

Score:        3445
Aligned:      3511        nucs
Identic:      3505 (100%) nucs =>       441 (100%)      3064 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131700483,131700925] EXCISED REGION [131702158,131705224]
 second seq =>  [        1,      443] EXCISED REGION [      444,     3511]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1232 nucs [131700926,131702157]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        27 nucs [131700926,131700952] to [131702158,131702184]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131700926,131700926] to [131702157,131702157]
 second seq =>         0 nucs

131700483 CGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCA 131700542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCA 60

131700543 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACCAAACAAACAA 131700602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACCAAACAAACAA 120

131700603 AAAAACCAAACCAAACCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCCTAGTCCCTGAGA 131700662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAACCAAACCAAACCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCCTAGTCCCTGAGA 180

131700663 TCTTGAGCCAGTAGGGCTGCATGGGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGGTTTTTTTTTGAGAC 131700722
          |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      181 TCTTGAGCCAGTAGGGCTGCATGTGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTGAGAC 240

131700723 AGAGTTTCATTCTTGTCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCGGCTCACTACAAC 131700782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAGTTTCATTCTTGTCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCGGCTCACTACAAC 300

131700783 TTCCGCCTCTCCGGTCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACA 131700842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCCGCCTCTCCGGTCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACA 360

131700843 GGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTCCACCA 131700902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTCCACCA 420

131700903 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 131700925
          |||||||||||||||||||||||
      421 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 443

EXCISED REGION

131702158 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 131702217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      444 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 503

131702218 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 131702277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      504 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 563

131702278 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 131702337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      564 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 623

131702338 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 131702397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      624 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 683

131702398 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 131702457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      684 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 743

131702458 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 131702517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      744 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 803

131702518 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 131702577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 863

131702578 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 131702637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 923

131702638 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 131702697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 983

131702698 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 131702757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 1043

131702758 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 131702817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 1103

131702818 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 131702877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 1163

131702878 GTGGTGTGTCAAGAAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 131702937
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 GTGGTGTGTCAAGGAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 1223

131702938 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 131702997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 1283

131702998 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 131703057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 1343

131703058 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 131703117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 1403

131703118 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 131703177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 1463

131703178 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 131703237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 1523

131703238 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 131703297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 1583

131703298 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 131703357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 1643

131703358 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 131703417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 1703

131703418 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 131703477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 1763

131703478 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 131703537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 1823

131703538 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 131703597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 1883

131703598 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 131703657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 1943

131703658 CCTTCCTGCTCTGGGGAGGGGGGATGTGGGGCTGGTAGGTTCCTGACCTGCTTGTGTCTC 131703717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 CCTTCCTGCTCTGGGGAGGGGGGATGTGGGGCTGGTAGGTTCCTGACCTGCTTGTGTCTC 2003

131703718 TGCCAGGGGCCCTGGTCCTCATCCATGGAGAAGTGGTACACAAGAGCAAGCAGAACCTCT 131703777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 TGCCAGGGGCCCTGGTCCTCATCCATGGAGAAGTGGTACACAAGAGCAAGCAGAACCTCT 2063

131703778 CTGACCGCTCGCGCCAGGCCTACACTTTCCACCTCATGGAGGCCTCTGGCACCACCTGGA 131703837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 CTGACCGCTCGCGCCAGGCCTACACTTTCCACCTCATGGAGGCCTCTGGCACCACCTGGA 2123

131703838 GCCCGGAGAACTGGTAGGTGACAGGGTGGGTGTGTGTGCCCGACAGTCCCCTGGAGGCTG 131703897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 GCCCGGAGAACTGGTAGGTGACAGGGTGGGTGTGTGTGCCCGACAGTCCCCTGGAGGCTG 2183

131703898 GGAACAGTGACCCTGCACCTCAAGGTTGTTTCTCCTCTATCCTCTGCAGGCTCCAGCCAA 131703957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 GGAACAGTGACCCTGCACCTCAAGGTTGTTTCTCCTCTATCCTCTGCAGGCTCCAGCCAA 2243

131703958 CAGCTGAACTGCCCTTTCCCCAACTGTACACCTAAAGGCTCTCGCAGGGCAGGAGCCCTC 131704017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 CAGCTGAACTGCCCTTTCCCCAACTGTACACCTAAAGGCTCTCGCAGGGCAGGAGCCCTC 2303

131704018 GCCCCTCCCGGGTGAAGCTGTGGGCTGTAAACACCAGTGCCTTGCTCAGCCTCCTGGTTG 131704077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 GCCCCTCCCGGGTGAAGCTGTGGGCTGTAAACACCAGTGCCTTGCTCAGCCTCCTGGTTG 2363

131704078 CAACAGGGAGGTCTTGTCTCCCCTCCTGGGCTTTCCTCCTGCCCTGTGGGCAGCAGCCTA 131704137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 CAACAGGGAGGTCTTGTCTCCCCTCCTGGGCTTTCCTCCTGCCCTGTGGGCAGCAGCCTA 2423

131704138 GGCTGGGTCAGGGGCTTCCCTAAGATCTTCACCTCTCTGCCTCCCTACTGCCCCAACATA 131704197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 GGCTGGGTCAGGGGCTTCCCTAAGATCTTCACCTCTCTGCCTCCCTACTGCCCCAACATA 2483

131704198 GCCTTGAGGAGGCTTCTCAGCCACCAAAGGGTTCTGGCCCCTTCTCACTCTCCTCTCCTC 131704257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 GCCTTGAGGAGGCTTCTCAGCCACCAAAGGGTTCTGGCCCCTTCTCACTCTCCTCTCCTC 2543

131704258 TCAGATGGAACTCTGGTTATTATGGTGTTAGTTATCGAATAAAAACGACTTCAGAATGCA 131704317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 TCAGATGGAACTCTGGTTATTATGGTGTTAGTTATCGAATAAAAACGACTTCAGAATGCA 2603

131704318 GCTTCCCTACTGAGCCTTCTTTCCCAAGCAGCATTGCTTTCCAGAGAAGAAAACTGCTTT 131704377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 GCTTCCCTACTGAGCCTTCTTTCCCAAGCAGCATTGCTTTCCAGAGAAGAAAACTGCTTT 2663

131704378 CCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGC 131704437
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2664 CCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGC 2723

131704438 GGATGACCTGAGGTTGGCAGTTCTAGACCAGTTTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCT 131704497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 GGATGACCTGAGGTTGGCAGTTCTAGACCAGTTTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCT 2783

131704498 ACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCG 131704557
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 ACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCG 2843

131704558 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCCGGGAGGTAGAGATTGCGGTGAGTCGAGAT 131704617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCCGGGAGGTAGAGATTGCGGTGAGTCGAGAT 2903

131704618 CACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAAGCAAAACTCCATCTC-AAAAAAAAAAAA 131704676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     2904 CACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAA 2963

131704677 AAAAATTGCTTTCCAGACAAGATGCTAAAATGCATCCCAGGTACCCCAGCCCTGCTTGGC 131704736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 AAAAATTGCTTTCCAGACAAGATGCTAAAATGCATCCCAGGTACCCCAGCCCTGCTTGGC 3023

131704737 GTGGCTTGCATGATTTTAATAAGTAACATTTAGTGGGCAGTGACCGTGTGCCCTGCTCTG 131704796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 GTGGCTTGCATGATTTTAATAAGTAACATTTAGTGGGCAGTGACCGTGTGCCCTGCTCTG 3083

131704797 TGCTGAGACCTTCACAGGCTTTATCTCATGGAATCCTCACTCGGAGAGGTAAGTGCCATT 131704856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 TGCTGAGACCTTCACAGGCTTTATCTCATGGAATCCTCACTCGGAGAGGTAAGTGCCATT 3143

131704857 ATCTGTACTTACAGAAGACGACGCTGAGCCAAGGAGGGGGTAAATGACCTGCCCAAGTCA 131704916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 ATCTGTACTTACAGAAGACGACGCTGAGCCAAGGAGGGGGTAAATGACCTGCCCAAGTCA 3203

131704917 CGTGGCTGCTCGGTTGTTCAGCAGGGTCAGCCTCATGCAGAGCCCGTGCTCCTAACCTTG 131704976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 CGTGGCTGCTCGGTTGTTCAGCAGGGTCAGCCTCATGCAGAGCCCGTGCTCCTAACCTTG 3263

131704977 ACACTGCCTCGTCTTCTCTTCTTGGGGAGCAGAGATGCCCAGAGCTAGGAATCCAGAGTT 131705036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 ACACTGCCTCGTCTTCTCTTCTTGGGGAGCAGAGATGCCCAGAGCTAGGAATCCAGAGTT 3323

131705037 CCAGGTTCTGGTCCTGGCTCTGTGAGCAACTTGCTCTCTGGTCTCAGGCCAGGGCCTTTC 131705096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 CCAGGTTCTGGTCCTGGCTCTGTGAGCAACTTGCTCTCTGGTCTCAGGCCAGGGCCTTTC 3383

131705097 CTTCCTCTGGGCCTGTTTCCTCCCATGTCCAGTAAGGGGGCCAGACTAGGGCCTTCAGGG 131705156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 CTTCCTCTGGGCCTGTTTCCTCCCATGTCCAGTAAGGGGGCCAGACTAGGGCCTTCAGGG 3443

131705157 GCCCTTCCTGTTTGGGCATGCTTGGCAGGCACTCAGACCTTCAGAACAACTGCCAAATCT 131705216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 GCCCTTCCTGTTTGGGCATGCTTGGCAGGCACTCAGACCTTCAGAACAACTGCCAAATCT 3503

131705217 AAAACCTT 131705224
          ||||||||
     3504 AAAACCTT 3511

Alignment time is 2.57409 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131690925,131712157] =>     21233 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     8222] =>      8222 nucs 'mol-32-321f-178183_8222'

Score:        8031
Aligned:      8211        nucs
Identic:      8193 (100%) nucs =>      3150 (100%)      5043 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131697768,131700925] EXCISED REGION [131702158,131707208]
 second seq =>  [        1,     3158] EXCISED REGION [     3159,     8208]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1232 nucs [131700926,131702157]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        27 nucs [131700926,131700952] to [131702158,131702184]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131700926,131700926] to [131702157,131702157]
 second seq =>         0 nucs

131697768 TTGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAA 131697827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAA 60

131697828 ACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA-GAAAAGATTTACCATATCATCATAACCCTTTT 131697886
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGATTTACCATATCATCATAACCCTTTT 120

131697887 AAAGTACGTAGCTTGGCCGGGCGCGGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 131697946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGTACGTAGCTTGGCCGGGCGCGGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 180

131697947 CCGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAAA 131698006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAAA 240

131698007 ACCATTTCTACTAAAAATACAATAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCA 131698066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCATTTCTACTAAAAATACAATAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCA 300

131698067 GCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACTAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 131698126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACTAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 360

131698127 GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAACT 131698186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAACT 420

131698187 AAATAAATAAATAAAAATAAAAAGTACATAGCTCAGTGGTATTAAATGCATTCAATCTTA 131698246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAATAAATAAATAAAAATAAAAAGTACATAGCTCAGTGGTATTAAATGCATTCAATCTTA 480

131698247 TGTTTATGACAATGAGGGACTATCCCATGCCAGGCCCTGGGCTGTCCCTGCACATTCATT 131698306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTTATGACAATGAGGGACTATCCCATGCCAGGCCCTGGGCTGTCCCTGCACATTCATT 540

131698307 AGCCCATCGAGTCCCACACCAGTCCTGCCTCCCAGGTTCTTCTAATCCTCATTTGACAGA 131698366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCCCATCGAGTCCCACACCAGTCCTGCCTCCCAGGTTCTTCTAATCCTCATTTGACAGA 600

131698367 AGAGGAAACTGAGGCTTACAGGAGAGAAATGGTTACCCGAGGCCACACAGAGCAAATGGT 131698426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAGGAAACTGAGGCTTACAGGAGAGAAATGGTTACCCGAGGCCACACAGAGCAAATGGT 660

131698427 GGTACCGAGATTGCTCCGCATGATTGGTGCCTTGGAGCCCTTAGTCGTCTGTGAGGGGTG 131698486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTACCGAGATTGCTCCGCATGATTGGTGCCTTGGAGCCCTTAGTCGTCTGTGAGGGGTG 720

131698487 GGGAGTCGGGGCTGGACTGAGCTTCCCAGAAGGTCAAGAATAAGGGCATGGGTGGCATAG 131698546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGAGTCGGGGCTGGACTGAGCTTCCCAGAAGGTCAAGAATAAGGGCATGGGTGGCATAG 780

131698547 GGCCTGGGGTGGGGGCAAGGCTCCTGTGGAGCCCATTACTCAGTTGTAAACAAGCAGAAG 131698606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCCTGGGGTGGGGGCAAGGCTCCTGTGGAGCCCATTACTCAGTTGTAAACAAGCAGAAG 840

131698607 GGTTAATGCCTACAAAGTAAGTGAGAATGTCAAAGTAAGCCTGAGTGTGGGTGCCCAGAG 131698666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTTAATGCCTACAAAGTAAGTGAGAATGTCAAAGTAAGCCTGAGTGTGGGTGCCCAGAG 900

131698667 CTGGGTGTGGAGGGACACGTGGGCCTGAGATGGGGCCGACAGCTTCCTTCTGTCCCATAG 131698726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGGTGTGGAGGGACACGTGGGCCTGAGATGGGGCCGACAGCTTCCTTCTGTCCCATAG 960

131698727 CTCTGCACGCCCACGACCCCGTCTTCAAGAGCATCACACACTCCTTCAAGGTGCAGGTGA 131698786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCTGCACGCCCACGACCCCGTCTTCAAGAGCATCACACACTCCTTCAAGGTGCAGGTGA 1020

131698787 GCAGAGGTGGGGGTGAGGGCCAGGAGGGTGGGCCATGTGTGGCAGGCTGGCAGCATGACC 131698846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCAGAGGTGGGGGTGAGGGCCAGGAGGGTGGGCCATGTGTGGCAGGCTGGCAGCATGACC 1080

131698847 TTTGCCCCCCTCCAGACCTTGGCCAGAAGTCTGGGCCTCCAGATGCCCGTGGTGGTGCAG 131698906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGCCCCCCTCCAGACCTTGGCCAGAAGTCTGGGCCTCCAGATGCCCGTGGTGGTGCAG 1140

131698907 AGCATGTACATCTTTAAGGTGAGCTCCTTGTCCTTGCCTCAGTTTACCATCTGTAAAATG 131698966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCATGTACATCTTTAAGGTGAGCTCCTTGTCCTTGCCTCAGTTTACCATCTGTAAAATG 1200

131698967 GGCAGACTGCTCATACCAAGCCCTTCCTTACAATGGGCCAAAAGTTGCTGGAATTATTAT 131699026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGCAGACTGCTCATACCAAGCCCTTCCTTACAATGGGCCAAAAGTTGCTGGAATTATTAT 1260

131699027 GTTGGTGGGAGAACATGGAAAATCGGTCTCCTCTGGCTAAAGCACCTGGAACTTAGTTGA 131699086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTTGGTGGGAGAACATGGAAAATCGGTCTCCTCTGGCTAAAGCACCTGGAACTTAGTTGA 1320

131699087 TCCTCAGTTAAAATTTGGTGGTAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGC 131699146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCTCAGTTAAAATTTGGTGGTAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGC 1380

131699147 ACTTTGGGAGGCTGAAGCGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGGCC 131699206
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGGCC 1440

131699207 AACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGATGGCACAC 131699266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGATGGCACAC 1500

131699267 ACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGATAATTGCTTGAACCCAGGAGGTG 131699326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGATAATTGCTTGAACCCAGGAGGTG 1560

131699327 GAGGTTACAGTGAGTGGAGATCACGCCAATGTACTCTAGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCT 131699386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGGTTACAGTGAGTGGAGATCACGCCAATGTACTCTAGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCT 1620

131699387 CCGTCTCAAAAAAAAGAAAAATTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCT 131699446
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1621 CCGTCTCAAAAAAAAGAAAAATTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCTTGTAATTCCAGCT 1680

131699447 CTCAGGGAGGCAGAGGTGGGAGGGTAGCTTGAACCCAGGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCA 131699506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTCAGGGAGGCAGAGGTGGGAGGGTAGCTTGAACCCAGGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCA 1740

131699507 ATATAGCGAGACCCCATTCTCCACAAAAAGGAAGA-AAAAAAAAAAGAAAAAAAAATTTG 131699565
          |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||
     1741 ATATAGCGAGACCCCATTCTCCACAAAAAGGAA--TAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATTTG 1798

131699566 GTGGTAGGAGGGAGGGTCATCCCCAGGCCTCCCTCGGCCTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCA 131699625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GTGGTAGGAGGGAGGGTCATCCCCAGGCCTCCCTCGGCCTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCA 1858

131699626 ATTGAAATGCTGTGCTCCCAGCTTTCAAGGGCCAGCTCAGTGCCACCTCTTCTAAGAAGC 131699685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 ATTGAAATGCTGTGCTCCCAGCTTTCAAGGGCCAGCTCAGTGCCACCTCTTCTAAGAAGC 1918

131699686 CTTCCAGAACCCCTGAGGAAAGAAGGACCCATCTGACTCTGGGGCTGGAAGGCTCAACTG 131699745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CTTCCAGAACCCCTGAGGAAAGAAGGACCCATCTGACTCTGGGGCTGGAAGGCTCAACTG 1978

131699746 CTGGCCTGTGTCCTAGCCTCTCCCTCCAGTCCTTGCCCTGCTCTGCTCTGTGATCTTGTT 131699805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CTGGCCTGTGTCCTAGCCTCTCCCTCCAGTCCTTGCCCTGCTCTGCTCTGTGATCTTGTT 2038

131699806 AGGCATGTGTGTGCTTGCACATGCTAGGAGCTTGTTGGGCAGGGGTGGGGGTTTTCTCTT 131699865
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2039 AGGCATGTGTGTGCTTGCACATGCTAGGAGCTTGTTGGGCAAGGGTGGGGGTTTTCTCTT 2098

131699866 TGCATCCCTCCTGGGGCTGGCATATGGTAGGTGCTCAGTAGCTGGGTGTTGATGTGGAAT 131699925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TGCATCCCTCCTGGGGCTGGCATATGGTAGGTGCTCAGTAGCTGGGTGTTGATGTGGAAT 2158

131699926 CCTGAGAGGAAAATGCCTGTGGCCAGAGCAATAGCATCCTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAG 131699985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CCTGAGAGGAAAATGCCTGTGGCCAGAGCAATAGCATCCTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAG 2218

131699986 CTCCTCTCTGCTCTCTTCTGTCCTCACCAGGCTTTTCCTCTCTCTTGCAGCAACCTCACT 131700045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CTCCTCTCTGCTCTCTTCTGTCCTCACCAGGCTTTTCCTCTCTCTTGCAGCAACCTCACT 2278

131700046 TTGGCGGTGAAGGTGAGCTGAGAGCTGTGGGCCCCTGAAAAGGCCATGGGTGGGACATCT 131700105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTGGCGGTGAAGGTGAGCTGAGAGCTGTGGGCCCCTGAAAAGGCCATGGGTGGGACATCT 2338

131700106 AAGACAGCAATGGTTCTCAGATCTTCAGAAGGAGGGAAAGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGT 131700165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AAGACAGCAATGGTTCTCAGATCTTCAGAAGGAGGGAAAGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGT 2398

131700166 AGGAGCCTGGCCCGGAGAGGAGGAGCCACCTTCCATTCCTTCCCCTGATAGTGGATTGGT 131700225
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2399 AGGAGCCTGGCCCGGAGAGGAGGAGCCACCTTCCATTCCTTCCTCTGATAGTGGATTGGT 2458

131700226 AGGGAAACCTTGCGTCCTTGGCATAGTGGGTCCTGAGCCTGCCAGCAACCCCAGCTGGTT 131700285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AGGGAAACCTTGCGTCCTTGGCATAGTGGGTCCTGAGCCTGCCAGCAACCCCAGCTGGTT 2518

131700286 AAAAATATAGATTTCCTAGGACAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGG 131700345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AAAAATATAGATTTCCTAGGACAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGG 2578

131700346 AAGGCAGAGGCGAGCGGATCACCTGAGGTCAGGAATTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGC 131700405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AAGGCAGAGGCGAGCGGATCACCTGAGGTCAGGAATTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGC 2638

131700406 TGAAGCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTTTGGTGGGTGTAGTATCGCACACCCGT 131700465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGAAGCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTTTGGTGGGTGTAGTATCGCACACCCGT 2698

131700466 AGTCCTAGCTACTCAGGCGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTT 131700525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 AGTCCTAGCTACTCAGGCGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTT 2758

131700526 GCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCT 131700585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCT 2818

131700586 CAAAACCAAACAAACAAAAAAACCAAACCAAACCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTG 131700645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CAAAACCAAACAAACAAAAAAACCAAACCAAACCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTG 2878

131700646 GGCCCTAGTCCCTGAGATCTTGAGCCAGTAGGGCTGCATGGGCCTGGGAATCTGTTTTTT 131700705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2879 GGCCCTAGTCCCTGAGATCTTGAGCCAGTAGGGCTGCATGTGCCTGGGAATCTGTTTTTT 2938

131700706 GGGTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCATTCTTGTCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAA 131700765
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GGTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCATTCTTGTCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAA 2998

131700766 TTTCGGCTCACTACAACTTCCGCCTCTCCGGTCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCC 131700825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TTTCGGCTCACTACAACTTCCGCCTCTCCGGTCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCC 3058

131700826 AAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTA 131700885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTA 3118

131700886 GAGACGGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 131700925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GAGACGGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 3158

EXCISED REGION

131702158 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 131702217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3159 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 3218

131702218 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 131702277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3219 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 3278

131702278 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 131702337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3279 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 3338

131702338 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 131702397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3339 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 3398

131702398 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 131702457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3399 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 3458

131702458 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 131702517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3459 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 3518

131702518 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 131702577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3519 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 3578

131702578 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 131702637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3579 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 3638

131702638 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 131702697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3639 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 3698

131702698 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 131702757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3699 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 3758

131702758 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 131702817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3759 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 3818

131702818 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 131702877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3819 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 3878

131702878 GTGGTGTGTCAAGAAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 131702937
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3879 GTGGTGTGTCAAGGAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 3938

131702938 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 131702997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3939 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 3998

131702998 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 131703057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3999 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 4058

131703058 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 131703117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4059 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 4118

131703118 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 131703177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4119 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 4178

131703178 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 131703237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4179 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 4238

131703238 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 131703297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4239 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 4298

131703298 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 131703357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4299 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 4358

131703358 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 131703417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4359 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 4418

131703418 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 131703477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4419 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 4478

131703478 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 131703537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4479 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 4538

131703538 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 131703597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4539 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 4598

131703598 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 131703657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4599 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 4658

131703658 CCTTCCTGCTCTGGGGAGGGGGGATGTGGGGCTGGTAGGTTCCTGACCTGCTTGTGTCTC 131703717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4659 CCTTCCTGCTCTGGGGAGGGGGGATGTGGGGCTGGTAGGTTCCTGACCTGCTTGTGTCTC 4718

131703718 TGCCAGGGGCCCTGGTCCTCATCCATGGAGAAGTGGTACACAAGAGCAAGCAGAACCTCT 131703777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4719 TGCCAGGGGCCCTGGTCCTCATCCATGGAGAAGTGGTACACAAGAGCAAGCAGAACCTCT 4778

131703778 CTGACCGCTCGCGCCAGGCCTACACTTTCCACCTCATGGAGGCCTCTGGCACCACCTGGA 131703837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4779 CTGACCGCTCGCGCCAGGCCTACACTTTCCACCTCATGGAGGCCTCTGGCACCACCTGGA 4838

131703838 GCCCGGAGAACTGGTAGGTGACAGGGTGGGTGTGTGTGCCCGACAGTCCCCTGGAGGCTG 131703897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4839 GCCCGGAGAACTGGTAGGTGACAGGGTGGGTGTGTGTGCCCGACAGTCCCCTGGAGGCTG 4898

131703898 GGAACAGTGACCCTGCACCTCAAGGTTGTTTCTCCTCTATCCTCTGCAGGCTCCAGCCAA 131703957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4899 GGAACAGTGACCCTGCACCTCAAGGTTGTTTCTCCTCTATCCTCTGCAGGCTCCAGCCAA 4958

131703958 CAGCTGAACTGCCCTTTCCCCAACTGTACACCTAAAGGCTCTCGCAGGGCAGGAGCCCTC 131704017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4959 CAGCTGAACTGCCCTTTCCCCAACTGTACACCTAAAGGCTCTCGCAGGGCAGGAGCCCTC 5018

131704018 GCCCCTCCCGGGTGAAGCTGTGGGCTGTAAACACCAGTGCCTTGCTCAGCCTCCTGGTTG 131704077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5019 GCCCCTCCCGGGTGAAGCTGTGGGCTGTAAACACCAGTGCCTTGCTCAGCCTCCTGGTTG 5078

131704078 CAACAGGGAGGTCTTGTCTCCCCTCCTGGGCTTTCCTCCTGCCCTGTGGGCAGCAGCCTA 131704137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5079 CAACAGGGAGGTCTTGTCTCCCCTCCTGGGCTTTCCTCCTGCCCTGTGGGCAGCAGCCTA 5138

131704138 GGCTGGGTCAGGGGCTTCCCTAAGATCTTCACCTCTCTGCCTCCCTACTGCCCCAACATA 131704197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5139 GGCTGGGTCAGGGGCTTCCCTAAGATCTTCACCTCTCTGCCTCCCTACTGCCCCAACATA 5198

131704198 GCCTTGAGGAGGCTTCTCAGCCACCAAAGGGTTCTGGCCCCTTCTCACTCTCCTCTCCTC 131704257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5199 GCCTTGAGGAGGCTTCTCAGCCACCAAAGGGTTCTGGCCCCTTCTCACTCTCCTCTCCTC 5258

131704258 TCAGATGGAACTCTGGTTATTATGGTGTTAGTTATCGAATAAAAACGACTTCAGAATGCA 131704317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5259 TCAGATGGAACTCTGGTTATTATGGTGTTAGTTATCGAATAAAAACGACTTCAGAATGCA 5318

131704318 GCTTCCCTACTGAGCCTTCTTTCCCAAGCAGCATTGCTTTCCAGAGAAGAAAACTGCTTT 131704377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5319 GCTTCCCTACTGAGCCTTCTTTCCCAAGCAGCATTGCTTTCCAGAGAAGAAAACTGCTTT 5378

131704378 CCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGC 131704437
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5379 CCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGC 5438

131704438 GGATGACCTGAGGTTGGCAGTTCTAGACCAGTTTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCT 131704497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5439 GGATGACCTGAGGTTGGCAGTTCTAGACCAGTTTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCT 5498

131704498 ACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCG 131704557
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5499 ACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCG 5558

131704558 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCCGGGAGGTAGAGATTGCGGTGAGTCGAGAT 131704617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5559 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCCGGGAGGTAGAGATTGCGGTGAGTCGAGAT 5618

131704618 CACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAA 131704677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5619 CACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAA 5678

131704678 AAAATTGCTTTCCAGACAAGATGCTAAAATGCATCCCAGGTACCCCAGCCCTGCTTGGCG 131704737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5679 AAAATTGCTTTCCAGACAAGATGCTAAAATGCATCCCAGGTACCCCAGCCCTGCTTGGCG 5738

131704738 TGGCTTGCATGATTTTAATAAGTAACATTTAGTGGGCAGTGACCGTGTGCCCTGCTCTGT 131704797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5739 TGGCTTGCATGATTTTAATAAGTAACATTTAGTGGGCAGTGACCGTGTGCCCTGCTCTGT 5798

131704798 GCTGAGACCTTCACAGGCTTTATCTCATGGAATCCTCACTCGGAGAGGTAAGTGCCATTA 131704857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5799 GCTGAGACCTTCACAGGCTTTATCTCATGGAATCCTCACTCGGAGAGGTAAGTGCCATTA 5858

131704858 TCTGTACTTACAGAAGACGACGCTGAGCCAAGGAGGGGGTAAATGACCTGCCCAAGTCAC 131704917
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5859 TCCGTACTTACAGAAGACGACGCTGAGCCAAGGAGGGGGTAAATGACCTGCCCAAGTCAC 5918

131704918 GTGGCTGCTCGGTTGTTCAGCAGGGTCAGCCTCATGCAGAGCCCGTGCTCCTAACCTTGA 131704977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5919 GTGGCTGCTCGGTTGTTCAGCAGGGTCAGCCTCATGCAGAGCCCGTGCTCCTAACCTTGA 5978

131704978 CACTGCCTCGTCTTCTCTTCTTGGGGAGCAGAGATGCCCAGAGCTAGGAATCCAGAGTTC 131705037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5979 CACTGCCTCGTCTTCTCTTCTTGGGGAGCAGAGATGCCCAGAGCTAGGAATCCAGAGTTC 6038

131705038 CAGGTTCTGGTCCTGGCTCTGTGAGCAACTTGCTCTCTGGTCTCAGGCCAGGGCCTTTCC 131705097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6039 CAGGTTCTGGTCCTGGCTCTGTGAGCAACTTGCTCTCTGGTCTCAGGCCAGGGCCTTTCC 6098

131705098 TTCCTCTGGGCCTGTTTCCTCCCATGTCCAGTAAGGGGGCCAGACTAGGGCCTTCAGGGG 131705157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6099 TTCCTCTGGGCCTGTTTCCTCCCATGTCCAGTAAGGGGGCCAGACTAGGGCCTTCAGGGG 6158

131705158 CCCTTCCTGTTTGGGCATGCTTGGCAGGCACTCAGACCTTCAGAACAACTGCCAAATCTA 131705217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6159 CCCTTCCTGTTTGGGCATGCTTGGCAGGCACTCAGACCTTCAGAACAACTGCCAAATCTA 6218

131705218 AAACCTTAGCTGAGGTTTGGCCCAGAGGCTACAAACTGGGGAACACAGGCTGATTCTAGC 131705277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6219 AAACCTTAGCTGAGGTTTGGCCCAGAGGCTACAAACTGGGGAACACAGGCTGATTCTAGC 6278

131705278 CCACAGACGCATTTTGTCTGGGCCTCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCA 131705337
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||.
     6279 CCACAGACGCATTTTGTCTGGGCCTCAGCATTTTTTTTTTTTTTTT-AGACAGAGTCTCG 6337

131705338 CTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTCATTGCGACCTCCGCCTCC 131705397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6338 CTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTCATTGCGACCTCCGCCTCC 6397

131705398 CGGGTTCAAGCAATTCTCTCCCTCAGTATCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCA 131705457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6398 CGGGTTCAAGCAATTCTCTCCCTCAGTATCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCA 6457

131705458 CCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATCTTTGCCAGGC 131705517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6458 CCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATCTTTGCCAGGC 6517

131705518 TGGTCTTGAACTCCTGACCTAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTA 131705577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6518 TGGTCTTGAACTCCTGACCTAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTA 6577

131705578 CAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAGGCCTCAGCATTTAAGAAAAAACTTGAAGATTCC 131705637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6578 CAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAGGCCTCAGCATTTAAGAAAAAACTTGAAGATTCC 6637

131705638 ACATAATAATCCAGGTTCCTAAGCTTCCTCGAATGAGCATGCAATTGACAACACGGGGCC 131705697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6638 ACATAATAATCCAGGTTCCTAAGCTTCCTCGAATGAGCATGCAATTGACAACACGGGGCC 6697

131705698 TACACTCTAGCATGGTGGCTACTGGCTGGAGCTCCCTTAGAGGCTCAGTGTGGTCCCCTG 131705757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6698 TACACTCTAGCATGGTGGCTACTGGCTGGAGCTCCCTTAGAGGCTCAGTGTGGTCCCCTG 6757

131705758 TTGTCGTTCACTGCGTTACCTGATTGGCCTTGGCAGTCATTTGAGTTTGTGACCCTGATG 131705817
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6758 TTGTCATTCACTGCGTTACCTGATTGGCCTTGGCAGTCATTTGAGTTTGTGACCCTGATG 6817

131705818 TAGCCTATCCCCCAACTATATACATGGACAACCCAAGGCCCAGAGGATAGAGCCCTTTCC 131705877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6818 TAGCCTATCCCCCAACTATATACATGGACAACCCAAGGCCCAGAGGATAGAGCCCTTTCC 6877

131705878 CAAGGCCACCCTGGGAGTCCGTGGGGCAAAGCTGGTGCTCTTTCACCAACATTTTGCTGC 131705937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6878 CAAGGCCACCCTGGGAGTCCGTGGGGCAAAGCTGGTGCTCTTTCACCAACATTTTGCTGC 6937

131705938 TTCCTTTTGCAAGCAATAGGAGGGAGCCTAAGAGAAGGGAAGCGTCTCCATTGAGTCCCA 131705997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6938 TTCCTTTTGCAAGCAATAGGAGGGAGCCTAAGAGAAGGGAAGCGTCTCCATTGAGTCCCA 6997

131705998 AAGAAATGTCTCAATACTCTCCTCTGAGGGAAAGGACATGGCAGTGATTCTCAAGCAGAA 131706057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6998 AAGAAATGTCTCAATACTCTCCTCTGAGGGAAAGGACATGGCAGTGATTCTCAAGCAGAA 7057

131706058 GCTTCGCTCCCTGGAGCTCTGCTCCCGGCTTCTGGCCTTGGTGGACCAAAGCTCTCACCT 131706117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7058 GCTTCGCTCCCTGGAGCTCTGCTCCCGGCTTCTGGCCTTGGTGGACCAAAGCTCTCACCT 7117

131706118 CCTCTGATGTCCTCCCAAGCTTGGGGAGAAAGGGAGAACCTTGTCCAGCCTCAGGAATCT 131706177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7118 CCTCTGATGTCCTCCCAAGCTTGGGGAGAAAGGGAGAACCTTGTCCAGCCTCAGGAATCT 7177

131706178 TGCTGTGCTATCTTCCTAGTGACGGAAAATGTTTATCCATTCACTATCTGTGTAGTGTAC 131706237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7178 TGCTGTGCTATCTTCCTAGTGACGGAAAATGTTTATCCATTCACTATCTGTGTAGTGTAC 7237

131706238 AATTCTGGGAGGGACACAGTGCAGATGGACTCCCAAATCTACTGATTTCCTGCTCCTTGT 131706297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7238 AATTCTGGGAGGGACACAGTGCAGATGGACTCCCAAATCTACTGATTTCCTGCTCCTTGT 7297

131706298 CAGTGCCCTGTGCTAGCCTTGGGGGATGGGGTGGGGAGTGAGGCAGTGCCGGAGCCTGTC 131706357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7298 CAGTGCCCTGTGCTAGCCTTGGGGGATGGGGTGGGGAGTGAGGCAGTGCCGGAGCCTGTC 7357

131706358 TTCCCAGCCAGAGAGCAAGGCTGCAGCGTGGGCCCCTCATACAGTCATTTTACCTCTCAG 131706417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7358 TTCCCAGCCAGAGAGCAAGGCTGCAGCGTGGGCCCCTCATACAGTCATTTTACCTCTCAG 7417

131706418 GAAACTCCCCCAGCCCCTGTGGATCTTTCCTACCTTAGGAAAAGACAAACACAGGTTTGG 131706477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7418 GAAACTCCCCCAGCCCCTGTGGATCTTTCCTACCTTAGGAAAAGACAAACACAGGTTTGG 7477

131706478 ATAGGATTAGAACATGGAAAGGTCTTAAGAAGGGCCCCTTGATGAGGTCCTGGTGCTGTT 131706537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7478 ATAGGATTAGAACATGGAAAGGTCTTAAGAAGGGCCCCTTGATGAGGTCCTGGTGCTGTT 7537

131706538 CAGCCCATCTTTCTCTATGGACACCACTCAGTGGGACACCAGAGGCGGGGTGGGGTTGGC 131706597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7538 CAGCCCATCTTTCTCTATGGACACCACTCAGTGGGACACCAGAGGCGGGGTGGGGTTGGC 7597

131706598 TAAAACAAGATCCAGCCCAAGCAGGATCTGATCCTCCCTCAACCCTGCCAAAGTTGACCC 131706657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7598 TAAAACAAGATCCAGCCCAAGCAGGATCTGATCCTCCCTCAACCCTGCCAAAGTTGACCC 7657

131706658 ACCTCTCCCTTCAGTAATTCCTAGCCCTCTGCTCTTTCCCTCAGGAGTTCTCCACCTCCA 131706717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7658 ACCTCTCCCTTCAGTAATTCCTAGCCCTCTGCTCTTTCCCTCAGGAGTTCTCCACCTCCA 7717

131706718 AGTGAAGCCAGGAGAGCAAAGGTCACTCTGGTTTCCAAGTGGTTTGCCCAGCTTTTCGGC 131706777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7718 AGTGAAGCCAGGAGAGCAAAGGTCACTCTGGTTTCCAAGTGGTTTGCCCAGCTTTTCGGC 7777

131706778 TTTTCACTAAGATGAGGACTGGTCTTTGGTAAAAATGACTCCCTTTCTGACTGCTTATCA 131706837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7778 TTTTCACTAAGATGAGGACTGGTCTTTGGTAAAAATGACTCCCTTTCTGACTGCTTATCA 7837

131706838 AGGGTGGGCTCTAGGCTGGACCCTCACAACACCCCGCGAGGTGTGGGCTGTCATTACTCC 131706897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7838 AGGGTGGGCTCTAGGCTGGACCCTCACAACACCCCGCGAGGTGTGGGCTGTCATTACTCC 7897

131706898 CATCTGCAAGAGAATTGAGGTTCAGCCTGGCTAAGTGACTCACCCAAGGTCACAAAGTTG 131706957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7898 CATCTGCAAGAGAATTGAGGTTCAGCCTGGCTAAGTGACTCACCCAAGGTCACAAAGTTG 7957

131706958 TTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGACTGG 131707017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7958 TTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGACTGG 8017

131707018 AGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACTTCAACCTCCGTCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTC 131707077
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     8018 AGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACTTCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTC 8077

131707078 CTGCCTCAGCCTCTCTAGTAGGTGGGATTACAGGCATATGCCACCACGCCTGGCTAATTT 131707137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8078 CTGCCTCAGCCTCTCTAGTAGGTGGGATTACAGGCATATGCCACCACGCCTGGCTAATTT 8137

131707138 TGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGATCTCCCGAC 131707197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8138 TGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGATCTCCCGAC 8197

131707198 CTCAGGTGATC 131707208
          |||||||||||
     8198 CTCAGGTGATC 8208

Alignment time is 6.06767 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131690925,131712157] =>     21233 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     3229] =>      3229 nucs 'mol-32-321f-178183_3229'

Score:        3139
Aligned:      3231        nucs
Identic:      3221 (100%) nucs =>      3150 (100%)        71 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131697768,131700925] EXCISED REGION [131702158,131702228]
 second seq =>  [        1,     3158] EXCISED REGION [     3159,     3229]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1232 nucs [131700926,131702157]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        27 nucs [131700926,131700952] to [131702158,131702184]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131700926,131700926] to [131702157,131702157]
 second seq =>         0 nucs

131697768 TTGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAA 131697827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAA 60

131697828 ACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA-GAAAAGATTTACCATATCATCATAACCCTTTT 131697886
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGATTTACCATATCATCATAACCCTTTT 120

131697887 AAAGTACGTAGCTTGGCCGGGCGCGGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 131697946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGTACGTAGCTTGGCCGGGCGCGGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 180

131697947 CCGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAAA 131698006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAAA 240

131698007 ACCATTTCTACTAAAAATACAATAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCA 131698066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCATTTCTACTAAAAATACAATAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCA 300

131698067 GCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACTAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 131698126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACTAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 360

131698127 GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAACT 131698186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAACT 420

131698187 AAATAAATAAATAAAAATAAAAAGTACATAGCTCAGTGGTATTAAATGCATTCAATCTTA 131698246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAATAAATAAATAAAAATAAAAAGTACATAGCTCAGTGGTATTAAATGCATTCAATCTTA 480

131698247 TGTTTATGACAATGAGGGACTATCCCATGCCAGGCCCTGGGCTGTCCCTGCACATTCATT 131698306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTTATGACAATGAGGGACTATCCCATGCCAGGCCCTGGGCTGTCCCTGCACATTCATT 540

131698307 AGCCCATCGAGTCCCACACCAGTCCTGCCTCCCAGGTTCTTCTAATCCTCATTTGACAGA 131698366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCCCATCGAGTCCCACACCAGTCCTGCCTCCCAGGTTCTTCTAATCCTCATTTGACAGA 600

131698367 AGAGGAAACTGAGGCTTACAGGAGAGAAATGGTTACCCGAGGCCACACAGAGCAAATGGT 131698426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAGGAAACTGAGGCTTACAGGAGAGAAATGGTTACCCGAGGCCACACAGAGCAAATGGT 660

131698427 GGTACCGAGATTGCTCCGCATGATTGGTGCCTTGGAGCCCTTAGTCGTCTGTGAGGGGTG 131698486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTACCGAGATTGCTCCGCATGATTGGTGCCTTGGAGCCCTTAGTCGTCTGTGAGGGGTG 720

131698487 GGGAGTCGGGGCTGGACTGAGCTTCCCAGAAGGTCAAGAATAAGGGCATGGGTGGCATAG 131698546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGAGTCGGGGCTGGACTGAGCTTCCCAGAAGGTCAAGAATAAGGGCATGGGTGGCATAG 780

131698547 GGCCTGGGGTGGGGGCAAGGCTCCTGTGGAGCCCATTACTCAGTTGTAAACAAGCAGAAG 131698606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCCTGGGGTGGGGGCAAGGCTCCTGTGGAGCCCATTACTCAGTTGTAAACAAGCAGAAG 840

131698607 GGTTAATGCCTACAAAGTAAGTGAGAATGTCAAAGTAAGCCTGAGTGTGGGTGCCCAGAG 131698666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTTAATGCCTACAAAGTAAGTGAGAATGTCAAAGTAAGCCTGAGTGTGGGTGCCCAGAG 900

131698667 CTGGGTGTGGAGGGACACGTGGGCCTGAGATGGGGCCGACAGCTTCCTTCTGTCCCATAG 131698726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGGTGTGGAGGGACACGTGGGCCTGAGATGGGGCCGACAGCTTCCTTCTGTCCCATAG 960

131698727 CTCTGCACGCCCACGACCCCGTCTTCAAGAGCATCACACACTCCTTCAAGGTGCAGGTGA 131698786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCTGCACGCCCACGACCCCGTCTTCAAGAGCATCACACACTCCTTCAAGGTGCAGGTGA 1020

131698787 GCAGAGGTGGGGGTGAGGGCCAGGAGGGTGGGCCATGTGTGGCAGGCTGGCAGCATGACC 131698846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCAGAGGTGGGGGTGAGGGCCAGGAGGGTGGGCCATGTGTGGCAGGCTGGCAGCATGACC 1080

131698847 TTTGCCCCCCTCCAGACCTTGGCCAGAAGTCTGGGCCTCCAGATGCCCGTGGTGGTGCAG 131698906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGCCCCCCTCCAGACCTTGGCCAGAAGTCTGGGCCTCCAGATGCCCGTGGTGGTGCAG 1140

131698907 AGCATGTACATCTTTAAGGTGAGCTCCTTGTCCTTGCCTCAGTTTACCATCTGTAAAATG 131698966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCATGTACATCTTTAAGGTGAGCTCCTTGTCCTTGCCTCAGTTTACCATCTGTAAAATG 1200

131698967 GGCAGACTGCTCATACCAAGCCCTTCCTTACAATGGGCCAAAAGTTGCTGGAATTATTAT 131699026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGCAGACTGCTCATACCAAGCCCTTCCTTACAATGGGCCAAAAGTTGCTGGAATTATTAT 1260

131699027 GTTGGTGGGAGAACATGGAAAATCGGTCTCCTCTGGCTAAAGCACCTGGAACTTAGTTGA 131699086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTTGGTGGGAGAACATGGAAAATCGGTCTCCTCTGGCTAAAGCACCTGGAACTTAGTTGA 1320

131699087 TCCTCAGTTAAAATTTGGTGGTAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGC 131699146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCTCAGTTAAAATTTGGTGGTAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGC 1380

131699147 ACTTTGGGAGGCTGAAGCGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGGCC 131699206
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGGCC 1440

131699207 AACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGATGGCACAC 131699266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGATGGCACAC 1500

131699267 ACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGATAATTGCTTGAACCCAGGAGGTG 131699326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGATAATTGCTTGAACCCAGGAGGTG 1560

131699327 GAGGTTACAGTGAGTGGAGATCACGCCAATGTACTCTAGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCT 131699386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGGTTACAGTGAGTGGAGATCACGCCAATGTACTCTAGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCT 1620

131699387 CCGTCTCAAAAAAAAGAAAAATTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCT 131699446
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1621 CCGTCTCAAAAAAAAGAAAAATTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCTTGTAATTCCAGCT 1680

131699447 CTCAGGGAGGCAGAGGTGGGAGGGTAGCTTGAACCCAGGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCA 131699506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTCAGGGAGGCAGAGGTGGGAGGGTAGCTTGAACCCAGGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCA 1740

131699507 ATATAGCGAGACCCCATTCTCCACAAAAAGGAAGA-AAAAAAAAAAGAAAAAAAAATTTG 131699565
          |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||
     1741 ATATAGCGAGACCCCATTCTCCACAAAAAGGAA--TAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATTTG 1798

131699566 GTGGTAGGAGGGAGGGTCATCCCCAGGCCTCCCTCGGCCTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCA 131699625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GTGGTAGGAGGGAGGGTCATCCCCAGGCCTCCCTCGGCCTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCA 1858

131699626 ATTGAAATGCTGTGCTCCCAGCTTTCAAGGGCCAGCTCAGTGCCACCTCTTCTAAGAAGC 131699685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 ATTGAAATGCTGTGCTCCCAGCTTTCAAGGGCCAGCTCAGTGCCACCTCTTCTAAGAAGC 1918

131699686 CTTCCAGAACCCCTGAGGAAAGAAGGACCCATCTGACTCTGGGGCTGGAAGGCTCAACTG 131699745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CTTCCAGAACCCCTGAGGAAAGAAGGACCCATCTGACTCTGGGGCTGGAAGGCTCAACTG 1978

131699746 CTGGCCTGTGTCCTAGCCTCTCCCTCCAGTCCTTGCCCTGCTCTGCTCTGTGATCTTGTT 131699805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CTGGCCTGTGTCCTAGCCTCTCCCTCCAGTCCTTGCCCTGCTCTGCTCTGTGATCTTGTT 2038

131699806 AGGCATGTGTGTGCTTGCACATGCTAGGAGCTTGTTGGGCAGGGGTGGGGGTTTTCTCTT 131699865
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2039 AGGCATGTGTGTGCTTGCACATGCTAGGAGCTTGTTGGGCAAGGGTGGGGGTTTTCTCTT 2098

131699866 TGCATCCCTCCTGGGGCTGGCATATGGTAGGTGCTCAGTAGCTGGGTGTTGATGTGGAAT 131699925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TGCATCCCTCCTGGGGCTGGCATATGGTAGGTGCTCAGTAGCTGGGTGTTGATGTGGAAT 2158

131699926 CCTGAGAGGAAAATGCCTGTGGCCAGAGCAATAGCATCCTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAG 131699985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CCTGAGAGGAAAATGCCTGTGGCCAGAGCAATAGCATCCTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAG 2218

131699986 CTCCTCTCTGCTCTCTTCTGTCCTCACCAGGCTTTTCCTCTCTCTTGCAGCAACCTCACT 131700045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CTCCTCTCTGCTCTCTTCTGTCCTCACCAGGCTTTTCCTCTCTCTTGCAGCAACCTCACT 2278

131700046 TTGGCGGTGAAGGTGAGCTGAGAGCTGTGGGCCCCTGAAAAGGCCATGGGTGGGACATCT 131700105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTGGCGGTGAAGGTGAGCTGAGAGCTGTGGGCCCCTGAAAAGGCCATGGGTGGGACATCT 2338

131700106 AAGACAGCAATGGTTCTCAGATCTTCAGAAGGAGGGAAAGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGT 131700165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AAGACAGCAATGGTTCTCAGATCTTCAGAAGGAGGGAAAGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGT 2398

131700166 AGGAGCCTGGCCCGGAGAGGAGGAGCCACCTTCCATTCCTTCCCCTGATAGTGGATTGGT 131700225
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2399 AGGAGCCTGGCCCGGAGAGGAGGAGCCACCTTCCATTCCTTCCTCTGATAGTGGATTGGT 2458

131700226 AGGGAAACCTTGCGTCCTTGGCATAGTGGGTCCTGAGCCTGCCAGCAACCCCAGCTGGTT 131700285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AGGGAAACCTTGCGTCCTTGGCATAGTGGGTCCTGAGCCTGCCAGCAACCCCAGCTGGTT 2518

131700286 AAAAATATAGATTTCCTAGGACAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGG 131700345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AAAAATATAGATTTCCTAGGACAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGG 2578

131700346 AAGGCAGAGGCGAGCGGATCACCTGAGGTCAGGAATTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGC 131700405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AAGGCAGAGGCGAGCGGATCACCTGAGGTCAGGAATTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGC 2638

131700406 TGAAGCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTTTGGTGGGTGTAGTATCGCACACCCGT 131700465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGAAGCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTTTGGTGGGTGTAGTATCGCACACCCGT 2698

131700466 AGTCCTAGCTACTCAGGCGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTT 131700525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 AGTCCTAGCTACTCAGGCGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTT 2758

131700526 GCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCT 131700585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCT 2818

131700586 CAAAACCAAACAAACAAAAAAACCAAACCAAACCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTG 131700645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CAAAACCAAACAAACAAAAAAACCAAACCAAACCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTG 2878

131700646 GGCCCTAGTCCCTGAGATCTTGAGCCAGTAGGGCTGCATGGGCCTGGGAATCTGTTTTTT 131700705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2879 GGCCCTAGTCCCTGAGATCTTGAGCCAGTAGGGCTGCATGTGCCTGGGAATCTGTTTTTT 2938

131700706 GGGTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCATTCTTGTCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAA 131700765
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GGTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCATTCTTGTCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAA 2998

131700766 TTTCGGCTCACTACAACTTCCGCCTCTCCGGTCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCC 131700825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TTTCGGCTCACTACAACTTCCGCCTCTCCGGTCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCC 3058

131700826 AAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTA 131700885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTA 3118

131700886 GAGACGGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 131700925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GAGACGGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 3158

EXCISED REGION

131702158 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 131702217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3159 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 3218

131702218 GCCACCGCGCC 131702228
          |||||||||||
     3219 GCCACCGCGCC 3229

Alignment time is 2.43821 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131690925,131712157] =>     21233 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     5644] =>      5644 nucs 'mol-32-3403-044173_5644'

Score:        5480
Aligned:      5645        nucs
Identic:      5630 (100%) nucs =>      1649 (100%)      3981 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131699271,131700925] EXCISED REGION [131702158,131706146]
 second seq =>  [        1,     1655] EXCISED REGION [     1656,     5644]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1232 nucs [131700926,131702157]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        27 nucs [131700926,131700952] to [131702158,131702184]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131700926,131700926] to [131702157,131702157]
 second seq =>         0 nucs

131699271 GTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGATAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGG 131699330
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCGGGATAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGG 60

131699331 TTACAGTGAGTGGAGATCACGCCAATGTACTCTAGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCTCCGT 131699390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTACAGTGAGTGGAGATCACGCCAATGTACTCTAGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCTCCGT 120

131699391 CTCAAAAAAAAGAAAAATTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCTCTCA 131699450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCAAAAAAAAGAAAAATTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCTCTCA 180

131699451 GGGAGGCAGAGGTGGGAGGGTAGCTTGAACCCAGGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCAATAT 131699510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGAGGCAGAGGTGGGAGGGTAGCTTGAACCCAGGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCAATAT 240

131699511 AGCGAGACCCCATTCTCCACAAAAAGGAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATTTGGTGGT 131699570
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCGAGACCCCATTCTCCACAAAAAGGAATAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATTTGGTGGT 300

131699571 AGGAGGGAGGGTCATCCCCAGGCCTCCCTCGGCCTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCAATTGA 131699630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGAGGGAGGGTCATCCCCAGGCCTCCCTCGGCCTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCAATTGA 360

131699631 AATGCTGTGCTCCCAGCTTTCAAGGGCCAGCTCAGTGCCACCTCTTCTAAGAAGCCTTCC 131699690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGCTGTGCTCCCAGCTTTCAAGGGCCAGCTCAGTGCCACCTCTTCTAAGAAGCCTTCC 420

131699691 AGAACCCCTGAGGAAAGAAGGACCCATCTGACTCTGGGGCTGGAAGGCTCAACTGCTGGC 131699750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAACCCCTGAGGAAAGAAGGACCCATCTGACTCTGGGGCTGGAAGGCTCAACTGCTGGC 480

131699751 CTGTGTCCTAGCCTCTCCCTCCAGTCCTTGCCCTGCTCTGCTCTGTGATCTTGTTAGGCA 131699810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGTGTCCTAGCCTCTCCCTCCAGTCCTTGCCCTGCTCTGCTCTGTGATCTTGTTAGGCA 540

131699811 TGTGTGTGCTTGCACATGCTAGGAGCTTGTTGGGCAGGGGTGGGGGTTTTCTCTTTGCAT 131699870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      541 TGTGTGTGCTTGCACATGCTAGGAGCTTGTTGGGCAAGGGTGGGGGTTTTCTCTTTGCAT 600

131699871 CCCTCCTGGGGCTGGCATATGGTAGGTGCTCAGTAGCTGGGTGTTGATGTGGAATCCTGA 131699930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCTCCTGGGGCTGGCATATGGTAGGTGCTCAGTAGCTGGGTGTTGATGTGGAATCCTGA 660

131699931 GAGGAAAATGCCTGTGGCCAGAGCAATAGCATCCTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAGCTCCT 131699990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGGAAAATGCCTGTGGCCAGAGCAATAGCATCCTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAGCTCCT 720

131699991 CTCTGCTCTCTTCTGTCCTCACCAGGCTTTTCCTCTCTCTTGCAGCAACCTCACTTTGGC 131700050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCTGCTCTCTTCTGTCCTCACCAGGCTTTTCCTCTCTCTTGCAGCAACCTCACTTTGGC 780

131700051 GGTGAAGGTGAGCTGAGAGCTGTGGGCCCCTGAAAAGGCCATGGGTGGGACATCTAAGAC 131700110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTGAAGGTGAGCTGAGAGCTGTGGGCCCCTGAAAAGGCCATGGGTGGGACATCTAAGAC 840

131700111 AGCAATGGTTCTCAGATCTTCAGAAGGAGGGAAAGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGTAGGAG 131700170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCAATGGTTCTCAGATCTTCAGAAGGAGGGAAAGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGTAGGAG 900

131700171 CCTGGCCCGGAGAGGAGGAGCCACCTTCCATTCCTTCCCCTGATAGTGGATTGGTAGGGA 131700230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      901 CCTGGCCCGGAGAGGAGGAGCCACCTTCCATTCCTTCCTCTGATAGTGGATTGGTAGGGA 960

131700231 AACCTTGCGTCCTTGGCATAGTGGGTCCTGAGCCTGCCAGCAACCCCAGCTGGTTAAAAA 131700290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACCTTGCGTCCTTGGCATAGTGGGTCCTGAGCCTGCCAGCAACCCCAGCTGGTTAAAAA 1020

131700291 TATAGATTTCCTAGGACAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGAAGGC 131700350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATAGATTTCCTAGGACAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGAAGGC 1080

131700351 AGAGGCGAGCGGATCACCTGAGGTCAGGAATTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGCTGAAG 131700410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAGGCGAGCGGATCACCTGAGGTCAGGAATTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGCTGAAG 1140

131700411 CCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTTTGGTGGGTGTAGTATCGCACACCCGTAGTCC 131700470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTTTGGTGGGTGTAGTATCGCACACCCGTAGTCC 1200

131700471 TAGCTACTCAGGCGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGT 131700530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGCTACTCAGGCGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGT 1260

131700531 GAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAA 131700590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAA 1320

131700591 CCAAACAAACAAAAAAACCAAACCAAACCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCC 131700650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAAACAAACAAAAAAACCAAACCAAACCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCC 1380

131700651 TAGTCCCTGAGATCTTGAGCCAGTAGGGCTGCATGGGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGGTT 131700710
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||
     1381 TAGTCCCTGAGATCTTGAGCCAGTAGGGCTGCATGTGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGTTT 1440

131700711 TTTTTTTGAGACAGAGTTTCATTCTTGTCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCG 131700770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTTTTTGAGACAGAGTTTCATTCTTGTCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCG 1500

131700771 GCTCACTACAACTTCCGCCTCTCCGGTCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTA 131700830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTCACTACAACTTCCGCCTCTCCGGTCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTA 1560

131700831 GCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC 131700890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC 1620

131700891 GGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 131700925
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 1655

EXCISED REGION

131702158 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 131702217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 1715

131702218 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 131702277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 1775

131702278 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 131702337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 1835

131702338 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 131702397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 1895

131702398 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 131702457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 1955

131702458 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 131702517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 2015

131702518 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 131702577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 2075

131702578 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 131702637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 2135

131702638 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 131702697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 2195

131702698 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 131702757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 2255

131702758 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 131702817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 2315

131702818 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 131702877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 2375

131702878 GTGGTGTGTCAAGAAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 131702937
          |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2376 GTGGTGTGTCAAGGAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCATGGTACCAGCTTCC 2435

131702938 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 131702997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 2495

131702998 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 131703057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 2555

131703058 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 131703117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 2615

131703118 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 131703177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 2675

131703178 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 131703237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 2735

131703238 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 131703297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 2795

131703298 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 131703357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 2855

131703358 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 131703417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 2915

131703418 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 131703477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 2975

131703478 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 131703537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 3035

131703538 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 131703597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 3095

131703598 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 131703657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 3155

131703658 CCTTCCTGCTCTGGGGAGGGGGGATGTGGGGCTGGTAGGTTCCTGACCTGCTTGTGTCTC 131703717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 CCTTCCTGCTCTGGGGAGGGGGGATGTGGGGCTGGTAGGTTCCTGACCTGCTTGTGTCTC 3215

131703718 TGCCAGGGGCCCTGGTCCTCATCCATGGAGAAGTGGTACACAAGAGCAAGCAGAACCTCT 131703777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 TGCCAGGGGCCCTGGTCCTCATCCATGGAGAAGTGGTACACAAGAGCAAGCAGAACCTCT 3275

131703778 CTGACCGCTCGCGCCAGGCCTACACTTTCCACCTCATGGAGGCCTCTGGCACCACCTGGA 131703837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 CTGACCGCTCGCGCCAGGCCTACACTTTCCACCTCATGGAGGCCTCTGGCACCACCTGGA 3335

131703838 GCCCGGAGAACTGGTAGGTGACAGGGTGGGTGTGTGTGCCCGACAGTCCCCTGGAGGCTG 131703897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 GCCCGGAGAACTGGTAGGTGACAGGGTGGGTGTGTGTGCCCGACAGTCCCCTGGAGGCTG 3395

131703898 GGAACAGTGACCCTGCACCTCAAGGTTGTTTCTCCTCTATCCTCTGCAGGCTCCAGCCAA 131703957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 GGAACAGTGACCCTGCACCTCAAGGTTGTTTCTCCTCTATCCTCTGCAGGCTCCAGCCAA 3455

131703958 CAGCTGAACTGCCCTTTCCCCAACTGTACACCTAAAGGCTCTCGCAGGGCAGGAGCCCTC 131704017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 CAGCTGAACTGCCCTTTCCCCAACTGTACACCTAAAGGCTCTCGCAGGGCAGGAGCCCTC 3515

131704018 GCCCCTCCCGGGTGAAGCTGTGGGCTGTAAACACCAGTGCCTTGCTCAGCCTCCTGGTTG 131704077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 GCCCCTCCCGGGTGAAGCTGTGGGCTGTAAACACCAGTGCCTTGCTCAGCCTCCTGGTTG 3575

131704078 CAACAGGGAGGTCTTGTCTCCCCTCCTGGGCTTTCCTCCTGCCCTGTGGGCAGCAGCCTA 131704137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 CAACAGGGAGGTCTTGTCTCCCCTCCTGGGCTTTCCTCCTGCCCTGTGGGCAGCAGCCTA 3635

131704138 GGCTGGGTCAGGGGCTTCCCTAAGATCTTCACCTCTCTGCCTCCCTACTGCCCCAACATA 131704197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 GGCTGGGTCAGGGGCTTCCCTAAGATCTTCACCTCTCTGCCTCCCTACTGCCCCAACATA 3695

131704198 GCCTTGAGGAGGCTTCTCAGCCACCAAAGGGTTCTGGCCCCTTCTCACTCTCCTCTCCTC 131704257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 GCCTTGAGGAGGCTTCTCAGCCACCAAAGGGTTCTGGCCCCTTCTCACTCTCCTCTCCTC 3755

131704258 TCAGATGGAACTCTGGTTATTATGGTGTTAGTTATCGAATAAAAACGACTTCAGAATGCA 131704317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 TCAGATGGAACTCTGGTTATTATGGTGTTAGTTATCGAATAAAAACGACTTCAGAATGCA 3815

131704318 GCTTCCCTACTGAGCCTTCTTTCCCAAGCAGCATTGCTTTCCAGAGAAGAAAACTGCTTT 131704377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 GCTTCCCTACTGAGCCTTCTTTCCCAAGCAGCATTGCTTTCCAGAGAAGAAAACTGCTTT 3875

131704378 CCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGC 131704437
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3876 CCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGC 3935

131704438 GGATGACCTGAGGTTGGCAGTTCTAGACCAGTTTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCT 131704497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 GGATGACCTGAGGTTGGCAGTTCTAGACCAGTTTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCT 3995

131704498 ACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCG 131704557
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 ACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCG 4055

131704558 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCCGGGAGGTAGAGATTGCGGTGAGTCGAGAT 131704617
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 GGAGGCTGAGGCAGGAGAGTAGCTTGAACCCGGGAGGTAGAGATTGCGGTGAGTCGAGAT 4115

131704618 CACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAAGCAAAACTCCATCTC-AAAAAAAAAAAA 131704676
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
     4116 CACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAAGCAAAACTCCAT-TCAAAAAAAAAAAAA 4174

131704677 AAAAATTGCTTTCCAGACAAGATGCTAAAATGCATCCCAGGTACCCCAGCCCTGCTTGGC 131704736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 AAAAATTGCTTTCCAGACAAGATGCTAAAATGCATCCCAGGTACCCCAGCCCTGCTTGGC 4234

131704737 GTGGCTTGCATGATTTTAATAAGTAACATTTAGTGGGCAGTGACCGTGTGCCCTGCTCTG 131704796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 GTGGCTTGCATGATTTTAATAAGTAACATTTAGTGGGCAGTGACCGTGTGCCCTGCTCTG 4294

131704797 TGCTGAGACCTTCACAGGCTTTATCTCATGGAATCCTCACTCGGAGAGGTAAGTGCCATT 131704856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 TGCTGAGACCTTCACAGGCTTTATCTCATGGAATCCTCACTCGGAGAGGTAAGTGCCATT 4354

131704857 ATCTGTACTTACAGAAGACGACGCTGAGCCAAGGAGGGGGTAAATGACCTGCCCAAGTCA 131704916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 ATCTGTACTTACAGAAGACGACGCTGAGCCAAGGAGGGGGTAAATGACCTGCCCAAGTCA 4414

131704917 CGTGGCTGCTCGGTTGTTCAGCAGGGTCAGCCTCATGCAGAGCCCGTGCTCCTAACCTTG 131704976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 CGTGGCTGCTCGGTTGTTCAGCAGGGTCAGCCTCATGCAGAGCCCGTGCTCCTAACCTTG 4474

131704977 ACACTGCCTCGTCTTCTCTTCTTGGGGAGCAGAGATGCCCAGAGCTAGGAATCCAGAGTT 131705036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 ACACTGCCTCGTCTTCTCTTCTTGGGGAGCAGAGATGCCCAGAGCTAGGAATCCAGAGTT 4534

131705037 CCAGGTTCTGGTCCTGGCTCTGTGAGCAACTTGCTCTCTGGTCTCAGGCCAGGGCCTTTC 131705096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 CCAGGTTCTGGTCCTGGCTCTGTGAGCAACTTGCTCTCTGGTCTCAGGCCAGGGCCTTTC 4594

131705097 CTTCCTCTGGGCCTGTTTCCTCCCATGTCCAGTAAGGGGGCCAGACTAGGGCCTTCAGGG 131705156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 CTTCCTCTGGGCCTGTTTCCTCCCATGTCCAGTAAGGGGGCCAGACTAGGGCCTTCAGGG 4654

131705157 GCCCTTCCTGTTTGGGCATGCTTGGCAGGCACTCAGACCTTCAGAACAACTGCCAAATCT 131705216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 GCCCTTCCTGTTTGGGCATGCTTGGCAGGCACTCAGACCTTCAGAACAACTGCCAAATCT 4714

131705217 AAAACCTTAGCTGAGGTTTGGCCCAGAGGCTACAAACTGGGGAACACAGGCTGATTCTAG 131705276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 AAAACCTTAGCTGAGGTTTGGCCCAGAGGCTACAAACTGGGGAACACAGGCTGATTCTAG 4774

131705277 CCCACAGACGCATTTTGTCTGGGCCTCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTC 131705336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 CCCACAGACGCATTTTGTCTGGGCCTCAGCATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTC 4834

131705337 ACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTCATTGCGACCTCCGCCTC 131705396
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4835 GCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTCATTGCGACCTCCGCCTC 4894

131705397 CCGGGTTCAAGCAATTCTCTCCCTCAGTATCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCC 131705456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4895 CCGGGTTCAAGCAATTCTCTCCCTCAGTATCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCC 4954

131705457 ACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATCTTTGCCAGG 131705516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4955 ACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATCTTTGCCAGG 5014

131705517 CTGGTCTTGAACTCCTGACCTAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCATAGTGCTGGGATT 131705576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5015 CTGGTCTTGAACTCCTGACCTAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCATAGTGCTGGGATT 5074

131705577 ACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAGGCCTCAGCATTTAAGAAAAAACTTGAAGATTC 131705636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5075 ACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCAGGCCTCAGCATTTAAGAAAAAACTTGAAGATTC 5134

131705637 CACATAATAATCCAGGTTCCTAAGCTTCCTCGAATGAGCATGCAATTGACAACACGGGGC 131705696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5135 CACATAATAATCCAGGTTCCTAAGCTTCCTCGAATGAGCATGCAATTGACAACACGGGGC 5194

131705697 CTACACTCTAGCATGGTGGCTACTGGCTGGAGCTCCCTTAGAGGCTCAGTGTGGTCCCCT 131705756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5195 CTACACTCTAGCATGGTGGCTACTGGCTGGAGCTCCCTTAGAGGCTCAGTGTGGTCCCCT 5254

131705757 GTTGTCGTTCACTGCGTTACCTGATTGGCCTTGGCAGTCATTTGAGTTTGTGACCCTGAT 131705816
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5255 GTTGTCATTCACTGCGTTACCTGATTGGCCTTGGCAGTCATTTGAGTTTGTGACCCTGAT 5314

131705817 GTAGCCTATCCCCCAACTATATACATGGACAACCCAAGGCCCAGAGGATAGAGCCCTTTC 131705876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5315 GTAGCCTATCCCCCAACTATATACATGGACAACCCAAGGCCCAGAGGATAGAGCCCTTTC 5374

131705877 CCAAGGCCACCCTGGGAGTCCGTGGGGCAAAGCTGGTGCTCTTTCACCAACATTTTGCTG 131705936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5375 CCAAGGCCACCCTGGGAGTCCGTGGGGCAAAGCTGGTGCTCTTTCACCAACATTTTGCTG 5434

131705937 CTTCCTTTTGCAAGCAATAGGAGGGAGCCTAAGAGAAGGGAAGCGTCTCCATTGAGTCCC 131705996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5435 CTTCCTTTTGCAAGCAATAGGAGGGAGCCTAAGAGAAGGGAAGCGTCTCCATTGAGTCCC 5494

131705997 AAAGAAATGTCTCAATACTCTCCTCTGAGGGAAAGGACATGGCAGTGATTCTCAAGCAGA 131706056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5495 AAAGAAATGTCTCAATACTCTCCTCTGAGGGAAAGGACATGGCAGTGATTCTCAAGCAGA 5554

131706057 AGCTTCGCTCCCTGGAGCTCTGCTCCCGGCTTCTGGCCTTGGTGGACCAAAGCTCTCACC 131706116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5555 AGCTTCGCTCCCTGGAGCTCTGCTCCCGGCTTCTGGCCTTGGTGGACCAAAGCTCTCACC 5614

131706117 TCCTCTGATGTCCTCCCAAGCTTGGGGAGA 131706146
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     5615 TCCTCTGATGTCCTCCCAAGCTTGGGGAGA 5644

Alignment time is 4.2442 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131690925,131712157] =>     21233 nucs '9 dna:chromosome chromosome:GRCh37:9:1:141213431:1'
Second seq [        1,     3688] =>      3688 nucs 'mol-32-34b3-039982_3688'

Score:        3611
Aligned:      3688        nucs
Identic:      3681 (100%) nucs =>      2176 (100%)      1505 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131698744,131700925] EXCISED REGION [131702158,131703663]
 second seq =>  [        1,     2182] EXCISED REGION [     2183,     3688]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1232 nucs [131700926,131702157]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        27 nucs [131700926,131700952] to [131702158,131702184]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131700926,131700926] to [131702157,131702157]
 second seq =>         0 nucs

131698744 CCCGTCTTCAAGAGCATCACACACTCCTTCAAGGTGCAGGTGAGCAGAGGTGGGGGTGAG 131698803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCGTCTTCAAGAGCATCACACACTCCTTCAAGGTGCAGGTGAGCAGAGGTGGGGGTGAG 60

131698804 GGCCAGGAGGGTGGGCCATGTGTGGCAGGCTGGCAGCATGACCTTTGCCCCCCTCCAGAC 131698863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCCAGGAGGGTGGGCCATGTGTGGCAGGCTGGCAGCATGACCTTTGCCCCCCTCCAGAC 120

131698864 CTTGGCCAGAAGTCTGGGCCTCCAGATGCCCGTGGTGGTGCAGAGCATGTACATCTTTAA 131698923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTGGCCAGAAGTCTGGGCCTCCAGATGCCCGTGGTGGTGCAGAGCATGTACATCTTTAA 180

131698924 GGTGAGCTCCTTGTCCTTGCCTCAGTTTACCATCTGTAAAATGGGCAGACTGCTCATACC 131698983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTGAGCTCCTTGTCCTTGCCTCAGTTTACCATCTGTAAAATGGGCAGACTGCTCATACC 240

131698984 AAGCCCTTCCTTACAATGGGCCAAAAGTTGCTGGAATTATTATGTTGGTGGGAGAACATG 131699043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCCCTTCCTTACAATGGGCCAAAAGTTGCTGGAATTATTATGTTGGTGGGAGAACATG 300

131699044 GAAAATCGGTCTCCTCTGGCTAAAGCACCTGGAACTTAGTTGATCCTCAGTTAAAATTTG 131699103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAAATCGGTCTCCTCTGGCTAAAGCACCTGGAACTTAGTTGATCCTCAGTTAAAATTTG 360

131699104 GTGGTAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAG 131699163
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      361 GTGGTAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAG 420

131699164 CGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCA 131699223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCA 480

131699224 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGATGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTA 131699283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGATGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTA 540

131699284 CTCGGGAGGCTGAGGCAGGATAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTACAGTGAGTGG 131699343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCGGGAGGCTGAGGCAGGATAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTACAGTGAGTGG 600

131699344 AGATCACGCCAATGTACTCTAGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCTCCGTCTCAAAAAAAAGA 131699403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGATCACGCCAATGTACTCTAGCCTGGGGGATAGAGCAAGGCTCCGTCTCAAAAAAAAGA 660

131699404 AAAATTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCTCTCAGGGAGGCAGAGGT 131699463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAATTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCTCTCAGGGAGGCAGAGGT 720

131699464 GGGAGGGTAGCTTGAACCCAGGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCAATATAGCGAGACCCCAT 131699523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGAGGGTAGCTTGAACCCAGGAGTTTGAGACCTGCCTGGGCAATATAGCGAGACCCCAT 780

131699524 TCTCCACAAAAAGGAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATTTGGTGGTAGGAGGGAGGGTC 131699583
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTCCACAAAAAGGAATAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATTTGGTGGTAGGAGGGAGGGTC 840

131699584 ATCCCCAGGCCTCCCTCGGCCTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCAATTGAAATGCTGTGCTCC 131699643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCCCCAGGCCTCCCTCGGCCTTCCTCCTCCCTTCTTTGGCAATTGAAATGCTGTGCTCC 900

131699644 CAGCTTTCAAGGGCCAGCTCAGTGCCACCTCTTCTAAGAAGCCTTCCAGAACCCCTGAGG 131699703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGCTTTCAAGGGCCAGCTCAGTGCCACCTCTTCTAAGAAGCCTTCCAGAACCCCTGAGG 960

131699704 AAAGAAGGACCCATCTGACTCTGGGGCTGGAAGGCTCAACTGCTGGCCTGTGTCCTAGCC 131699763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAGAAGGACCCATCTGACTCTGGGGCTGGAAGGCTCAACTGCTGGCCTGTGTCCTAGCC 1020

131699764 TCTCCCTCCAGTCCTTGCCCTGCTCTGCTCTGTGATCTTGTTAGGCATGTGTGTGCTTGC 131699823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTCCCTCCAGTCCTTGCCCTGCTCTGCTCTGTGATCTTGTTAGGCATGTGTGTGCTTGC 1080

131699824 ACATGCTAGGAGCTTGTTGGGCAGGGGTGGGGGTTTTCTCTTTGCATCCCTCCTGGGGCT 131699883
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACATGCTAGGAGCTTGTTGGGCAAGGGTGGGGGTTTTCTCTTTGCATCCCTCCTGGGGCT 1140

131699884 GGCATATGGTAGGTGCTCAGTAGCTGGGTGTTGATGTGGAATCCTGAGAGGAAAATGCCT 131699943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCATATGGTAGGTGCTCAGTAGCTGGGTGTTGATGTGGAATCCTGAGAGGAAAATGCCT 1200

131699944 GTGGCCAGAGCAATAGCATCCTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAGCTCCTCTCTGCTCTCTTC 131700003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGGCCAGAGCAATAGCATCCTGGGAGTCTCAGCAAGCCCAGCTCCTCTCTGCTCTCTTC 1260

131700004 TGTCCTCACCAGGCTTTTCCTCTCTCTTGCAGCAACCTCACTTTGGCGGTGAAGGTGAGC 131700063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTCCTCACCAGGCTTTTCCTCTCTCTTGCAGCAACCTCACTTTGGCGGTGAAGGTGAGC 1320

131700064 TGAGAGCTGTGGGCCCCTGAAAAGGCCATGGGTGGGACATCTAAGACAGCAATGGTTCTC 131700123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAGAGCTGTGGGCCCCTGAAAAGGCCATGGGTGGGACATCTAAGACAGCAATGGTTCTC 1380

131700124 AGATCTTCAGAAGGAGGGAAAGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGTAGGAGCCTGGCCCGGAGA 131700183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGATCTTCAGAAGGAGGGAAAGCGCTTGCTCCTGTCTGTTGTAGGAGCCTGGCCCGGAGA 1440

131700184 GGAGGAGCCACCTTCCATTCCTTCCCCTGATAGTGGATTGGTAGGGAAACCTTGCGTCCT 131700243
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGAGGAGCCACCTTCCATTCCTTCCTCTGATAGTGGATTGGTAGGGAAACCTTGCGTCCT 1500

131700244 TGGCATAGTGGGTCCTGAGCCTGCCAGCAACCCCAGCTGGTTAAAAATATAGATTTCCTA 131700303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGCATAGTGGGTCCTGAGCCTGCCAGCAACCCCAGCTGGTTAAAAATATAGATTTCCTA 1560

131700304 GGACAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGAAGGCAGAGGCGAGCGGA 131700363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGACAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGAAGGCAGAGGCGAGCGGA 1620

131700364 TCACCTGAGGTCAGGAATTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGCTGAAGCCCCATCTCTACT 131700423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCACCTGAGGTCAGGAATTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGCTGAAGCCCCATCTCTACT 1680

131700424 AAAAATACAAAAATTTTGGTGGGTGTAGTATCGCACACCCGTAGTCCTAGCTACTCAGGC 131700483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAATACAAAAATTTTGGTGGGTGTAGTATCGCACACCCGTAGTCCTAGCTACTCAGGC 1740

131700484 GGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCAC 131700543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCAC 1800

131700544 ACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACCAAACAAACAAA 131700603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACCAAACAAACAAA 1860

131700604 AAAACCAAACCAAACCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCCTAGTCCCTGAGAT 131700663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAACCAAACCAAACCAAGCAAACAAAAAAAACAGATTCCTGGGCCCTAGTCCCTGAGAT 1920

131700664 CTTGAGCCAGTAGGGCTGCATGGGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGGTTTTTTTTTGAGACA 131700723
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1921 CTTGAGCCAGTAGGGCTGCATGTGCCTGGGAATCTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTGAGACA 1980

131700724 GAGTTTCATTCTTGTCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCGGCTCACTACAACT 131700783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAGTTTCATTCTTGTCACCCAAGGTGGAGTACAATGGCACAATTTCGGCTCACTACAACT 2040

131700784 TCCGCCTCTCCGGTCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAG 131700843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCCGCCTCTCCGGTCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAG 2100

131700844 GTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTCCACCAT 131700903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTCCACCAT 2160

131700904 GTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 131700925
          ||||||||||||||||||||||
     2161 GTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 2182

EXCISED REGION

131702158 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 131702217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 TCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTATAGGTGTGA 2242

131702218 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 131702277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 GCCACCGCGCCAAGCCCCAACCTCCCAAACTTAGGCCACTGGGTGAACCATCTGGTGGCT 2302

131702278 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 131702337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 GGGGGCCGCTTGTCCCTGGTTAAGAAGGGTGGCTTGAGTTATCTCACTGGAATTAAACAG 2362

131702338 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 131702397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 TAGTGCTACTTTATATCAAGCAGTTACATTGTTGGGCCCTAAGCACTTTTCATACATCAT 2422

131702398 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 131702457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 CTCATAGAATCCTCCAGCACCCTGTGAGGTAGGTTGTTGTTGGAGCCACTTCACGGTTTA 2482

131702458 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 131702517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 GGAAATTGAGGCTTTGAGAGGTGAAATCGCTTGCCTTAGAGTCCTGGGCCAGGAAGTGAT 2542

131702518 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 131702577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 GAGATTCTAACTGATCATGGGAAGGCTGGCCCTGGAGAGCACCCAGAGGACTGAGGAATA 2602

131702578 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 131702637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 GGTAATGAGGCCAAGGTGAGGTGGAAACAGGCAAAAGGATGAGCTCCTCACCCCCCGTGG 2662

131702638 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 131702697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 GCCTGCTTAGTCTCCCCTCATCAGGACGCCTCCTTCCTGTACACGGAGCCCCTGGGCCGG 2722

131702698 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 131702757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 GTGCTGGGCGTGTGGATCGCAGTGGAGGATGCCACGCTGGAGAACGGCTGTCTCTGGTTC 2782

131702758 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 131702817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 ATCCCTGGCTCCCACACCAGTGAGGAACCCTGTCTCTTCTGCCCACTTGGGACTCCCCAC 2842

131702818 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 131702877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 CCCCTAGGGAGAGGGACCTTGAGAAAGGAGGAGTTTAAGGCTCTCCATCTTGGCCTGCAG 2902

131702878 GTGGTGTGTCAAGAAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 131702937
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 GTGGTGTGTCAAGGAGGATGGTCCGGGCCCCTGTTGGCTCAGCGCCTGGTACCAGCTTCC 2962

131702938 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 131702997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 TTGGGTCAGAGCCAGCCCGGGATAACAGCCTCTTTGTGCCCACCCCAGTGCAGAGAGGTA 3022

131702998 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 131703057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 GGCAGATGCAGAGGGCAGAGAGGCAGGGGGCTGAGTCCATCAGTCTGTGCTTGCTCGACT 3082

131703058 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 131703117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 ACCCAGCGTCCAAGAGGTTGCCCTCGGGGTCATCTGAGGGCAGTGAAGTCACAGAAAGAG 3142

131703118 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 131703177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 AAGGAGGGGCTGGATGGGCGCTGGGAAGTCAGGAAGCAGCATGTTTTCCTGCAGGCTGAT 3202

131703178 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 131703237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3203 CCAGATCACCCTGGAATCCACACTCTGCTACTTATGGGCTGTTTCTCTGGGCAAATGACT 3262

131703238 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 131703297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3263 GACTCCCTGAGCCTTAATTTCCCCAAACGTAAAGTGGAAAGTCAGTGAGATGATAAATAT 3322

131703298 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 131703357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 GTTGATATAGAGTCTGCCTAGTGCATAGCCACTGCTCAACAAATGTTGGCTGTTGGGCGG 3382

131703358 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 131703417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 CCCTTTTTCTTATGAAAAGGGAAAACCAATGTCTAACTCAGCATCACCGGAGAGGTCCCA 3442

131703418 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 131703477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 GTGGACTGGCACAGGACAGAGGGCTTCTGCCTGATCCTGCAAAGACCTCGGGAGGGGAGG 3502

131703478 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 131703537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 CCCTTCCTAAGGCTTGCCAAGGCCACAGTCCACAGCAGAGGGGACTTGATCCCAGAGGAA 3562

131703538 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 131703597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3563 CATGCATCTCAATAGCTTAGCTTTTGTCCCTGAGGGAGGCTGCAGATGCCTGAGCTTTCA 3622

131703598 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 131703657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3623 GGGAAGGGAATGGGGATGGATGGGGGCCACAAAACCACTGGAAGGAGGAGGGCCCATGTC 3682

131703658 CCTTCC 131703663
          ||||||
     3683 CCTTCC 3688

Alignment time is 2.76023 s

