
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [144690484,144724692] =>     34209 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2384] =>      2384 nucs 'mol-32-1f16-175759_2384'

Score:        2361
Aligned:      2383        nucs
Identic:      2381 (100%) nucs =>      1649 (100%)       732 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [144713918,144715566] EXCISED REGION [144715568,144716301]
 second seq =>  [        1,     1649] EXCISED REGION [     1651,     2384]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [144715567,144715567]
 second seq =>         1 nucs [1650,1650]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [144715567,144715568] to [144715568,144715569]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

144713918 GGTAAGTTCTGCATTGTCTGTTTGTTGCCATGGAAAGAGGCGGTAGCTTCCGGTGTTGCC 144713977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTAAGTTCTGCATTGTCTGTTTGTTGCCATGGAAAGAGGCGGTAGCTTCCGGTGTTGCC 60

144713978 ATGGCAATGGTAAACTGATATGGCACACTGGTGGGTGTGCCTTACAGGAGGCTCTTCTGC 144714037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGCAATGGTAAACTGATATGGCACACTGGTGGGTGTGCCTTACAGGAGGCTCTTCTGC 120

144714038 CCTGGACCTGTTTTAGCTAGTCCTCAGTTTGGTCCCATGTCCAAGCCCTGCCTCCGGAGT 144714097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTGGACCTGTTTTAGCTAGTCCTCAGTTTGGTCCCATGTCCAAGCCCTGCCTCCGGAGT 180

144714098 TGAGCTCCACCTCCTACCTCATTTTCTTTTTTTCTTTTTTAGAGACAGAGTTCCACTCTT 144714157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAGCTCCACCTCCTACCTCATTTTCTTTTTTTCTTTTTTAGAGACAGAGTTCCACTCTT 240

144714158 GTTGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTTCCAGG 144714217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTTCCAGG 300

144714218 TTCAAGCAATTATCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGTGCCACCA 144714277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCAAGCAATTATCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGTGCCACCA 360

144714278 CACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCATCATGTTGGTCCAGCTGA 144714337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCATCATGTTGGTCCAGCTGA 420

144714338 TCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGAGAGCCACCACACCCGGCA 144714397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGAGAGCCACCACACCCGGCA 480

144714398 TCATTTACTTTTGGATGTGCTTTGTGATACTCAGAAGAGACCTGCCTCCAGGCCACCCCT 144714457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATTTACTTTTGGATGTGCTTTGTGATACTCAGAAGAGACCTGCCTCCAGGCCACCCCT 540

144714458 ACCTTCTCTCTCCACCTGCAGGCACCTGAGGCCGCCTCTGTCTCATCCATCTTGAGTCTT 144714517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCTTCTCTCTCCACCTGCAGGCACCTGAGGCCGCCTCTGTCTCATCCATCTTGAGTCTT 600

144714518 GTGTGGGCTCAGCGATGCCCCTCCTTGCACGCATCACTCGTTTTCTCCCGGTGTCTGTCC 144714577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGTGGGCTCAGCGATGCCCCTCCTTGCACGCATCACTCGTTTTCTCCCGGTGTCTGTCC 660

144714578 CTCAAGATGGCCACTACTGCCACAACTCCCATCTGCACGTCTCGGGTCCTTCTCCAGCTA 144714637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCAAGATGGCCACTACTGCCACAACTCCCATCTGCACGTCTCGGGTCCTTCTCCAGCTA 720

144714638 CCAGCAGATTTTAAAAATCTTTTAATTTTTTGGCCTCACTTAGCAGCAAGGTCTCAAACT 144714697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAGCAGATTTTAAAAATCTTTTAATTTTTTGGCCTCACTTAGCAGCAAGGTCTCAAACT 780

144714698 TACATCCCAAAGTGACCTTCTGTTCTTCTTTCACCTTTCTCCCACCTGCCCCACCCTGCG 144714757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACATCCCAAAGTGACCTTCTGTTCTTCTTTCACCTTTCTCCCACCTGCCCCACCCTGCG 840

144714758 TCACCATGGATGTCAGCTTCCTGCCCACTCCCCACCCTCCTGTGAACCCTCCCTCGGCCT 144714817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCACCATGGATGTCAGCTTCCTGCCCACTCCCCACCCTCCTGTGAACCCTCCCTCGGCCT 900

144714818 TCAGAGCCAGTCCCTGCCTCTTCCTGGCTCGGTCCAGTCTCACCCCAGGTGCTCTGCTGT 144714877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGAGCCAGTCCCTGCCTCTTCCTGGCTCGGTCCAGTCTCACCCCAGGTGCTCTGCTGT 960

144714878 GTGGCTGCCATTGCCACCGTCCTCACCCTGTCCTCTGTGGTCACCACGCAGCCAACGTGT 144714937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTGGCTGCCATTGCCACCGTCCTCACCCTGTCCTCTGTGGTCACCACGCAGCCAACGTGT 1020

144714938 CTTTCCAGTGTCATCTGGCTTTTGTTACACTCCTGCTCAGAAGCCAGTGTGGGCTTCCTG 144714997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTTCCAGTGTCATCTGGCTTTTGTTACACTCCTGCTCAGAAGCCAGTGTGGGCTTCCTG 1080

144714998 TGTGGCTTGGACCGGGACCACACAATCTGCCCCACCCAGTAGTTATCTCGGAAAGACTAA 144715057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTGGCTTGGACCGGGACCACACAATCTGCCCCACCCAGTAGTTATCTCGGAAAGACTAA 1140

144715058 TTCCCAAGCTGTCTTCAGCCCTCCATTGTCATCAACTTGTCCCCAGACTCCATTCGCCCA 144715117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCCCAAGCTGTCTTCAGCCCTCCATTGTCATCAACTTGTCCCCAGACTCCATTCGCCCA 1200

144715118 AAGCAGGAAAGCTCTGCTCATGGCCCGAAGACACAGTGGCCTTCCTCAGGGACATTTCCC 144715177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGCAGGAAAGCTCTGCTCATGGCCCGAAGACACAGTGGCCTTCCTCAGGGACATTTCCC 1260

144715178 AGACAGTTTTGTGCTTGCTCCCGTACCAAGACCACCCATGGCCTGTTTTCCTAAACCCCA 144715237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGACAGTTTTGTGCTTGCTCCCGTACCAAGACCACCCATGGCCTGTTTTCCTAAACCCCA 1320

144715238 CATCCCAGATAGCTTGAAACTATGTTTTGGGATCTTTTATCAGAATTTCTGCTTTGTCTT 144715297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATCCCAGATAGCTTGAAACTATGTTTTGGGATCTTTTATCAGAATTTCTGCTTTGTCTT 1380

144715298 CAGAATGGCTCCGTCCCCTCAAATCCCTATAAATTCCCTTTCTGGCTGAATGCAGTTTCT 144715357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGAATGGCTCCGTCCCCTCAAATCCCTATAAATTCCCTTTCTGGCTGAATGCAGTTTCT 1440

144715358 TTGGACAGCTTTCCTTTCTTGAGCTCTGGTTATGGCAACAGCGCCAGCCTCATCTTGCAT 144715417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGGACAGCTTTCCTTTCTTGAGCTCTGGTTATGGCAACAGCGCCAGCCTCATCTTGCAT 1500

144715418 GGCAGCCTCCCCTCGGGCCTTTTGCCTTCCAGCCACACTCCTTGGTTTTGGCATTGTACT 144715477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGCAGCCTCCCCTCGGGCCTTTTGCCTTCCAGCCACACTCCTTGGTTTTGGCATTGTACT 1560

144715478 TGCTCTAGGTCAAGGGCTTTGGAGGCAGATGGCTACATCTGAGGCCTCCTCCAGCATGTC 144715537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGCTCTAGGTCAAGGGCTTTGGAGGCAGATGGCTACATCTGAGGCCTCCTCCAGCATGTC 1620

144715538 CTGGCTGATACCTTAGGTGAGCCATTTGG 144715566
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGGCTGATACCTTAGGTGAGCCATTTGG 1649

EXCISED REGION

144715568 TTCCCTATTTCTGTTTCCTCATCTATAAAATGGAGATAATATTAGAAGTCACCTGGCAAG 144715627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 TTCCCTATTTCTGTTTCCTCATCTATAAAATGGAGATAATATTAGAAGTCACCTGGCAAG 1710

144715628 GCTGCTGTGGCTCGAGGGGGCTCCTAGGTGGGGAGCAGACTTTCACGGAGTGATGTTGGA 144715687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1711 GCTGCTGTGGCTCGAGGGGGCTCCTAGGTGGGGAGCAGACTTTCACGGAGTGGTGTTGGA 1770

144715688 CCTGTGGAGGGGAAGACACAAGAGGCAGGAGTGGGGCTGTGATGCCATCAAGCACAGCGG 144715747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 CCTGTGGAGGGGAAGACACAAGAGGCAGGAGTGGGGCTGTGATGCCATCAAGCACAGCGG 1830

144715748 CTACTGGTCCCCCACAGGGAGCTCTGCCACAGAAGTGGTCCTCAGGGCTGTCCTCGGTTG 144715807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 CTACTGGTCCCCCACAGGGAGCTCTGCCACAGAAGTGGTCCTCAGGGCTGTCCTCGGTTG 1890

144715808 GACCAGGATGTCCAGGACTTTGCAATGTGGGCTGTCCCAGGGAAGGGTGTGACCCTGGCG 144715867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 GACCAGGATGTCCAGGACTTTGCAATGTGGGCTGTCCCAGGGAAGGGTGTGACCCTGGCG 1950

144715868 AGTTGCAGCTGATGGCTGAAGGCCGCTTACCACACCCTGAACAACTGGGACACCCAGCCT 144715927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 AGTTGCAGCTGATGGCTGAAGGCCGCTTACCACACCCTGAACAACTGGGACACCCAGCCT 2010

144715928 GTCACTGGAGGGGTCTCCCGGGGCCTCTCATCGCAGCATCCACCACAGTTGCTGAGGTCC 144715987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 GTCACTGGAGGGGTCTCCCGGGGCCTCTCATCGCAGCATCCACCACAGTTGCTGAGGTCC 2070

144715988 ACATGGGCCAGGCACTGGGCTAGACATGGAACGAGACGGGGGTCCCTGACCTTACGGAGC 144716047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 ACATGGGCCAGGCACTGGGCTAGACATGGAACGAGACGGGGGTCCCTGACCTTACGGAGC 2130

144716048 TTCCTTTCTACTGGCAGGGACAATCAGTACCAAACAAGTAAACTCAAAGTATTAAGTGCC 144716107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 TTCCTTTCTACTGGCAGGGACAATCAGTACCAAACAAGTAAACTCAAAGTATTAAGTGCC 2190

144716108 AGCCGGGCATGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGTGGA 144716167
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2191 AGCCGGGCATGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCTGAGGCGGGTGGA 2250

144716168 TCACGAGGTCAGGAGATCGAGAACATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCTGTCTCCACTAA 144716227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 TCACGAGGTCAGGAGATCGAGAACATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCTGTCTCCACTAA 2310

144716228 AAAACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGC 144716287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 AAAACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGC 2370

144716288 TGAGGCAGGAGAAT 144716301
          ||||||||||||||
     2371 TGAGGCAGGAGAAT 2384

Alignment time is 3.06008 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [144690484,144724692] =>     34209 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     3073] =>      3073 nucs 'mol-32-2e20-010383_3073'

Score:        3018
Aligned:      3073        nucs
Identic:      3068 (100%) nucs =>      1769 (100%)      1299 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [144713798,144715566] EXCISED REGION [144715568,144716871]
 second seq =>  [        1,     1769] EXCISED REGION [     1771,     3073]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [144715567,144715567]
 second seq =>         1 nucs [1770,1770]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [144716388,144716388]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [144715567,144715568] to [144715568,144715569]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

144713798 ACCCTGGGGGCAGAGGCTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAA 144713857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCCTGGGGGCAGAGGCTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAA 60

144713858 CAGAGTGAGAACCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATTTCTAGAATTAGCTT 144713917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGAGTGAGAACCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATTTCTAGAATTAGCTT 120

144713918 GGTAAGTTCTGCATTGTCTGTTTGTTGCCATGGAAAGAGGCGGTAGCTTCCGGTGTTGCC 144713977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTAAGTTCTGCATTGTCTGTTTGTTGCCATGGAAAGAGGCGGTAGCTTCCGGTGTTGCC 180

144713978 ATGGCAATGGTAAACTGATATGGCACACTGGTGGGTGTGCCTTACAGGAGGCTCTTCTGC 144714037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGGCAATGGTAAACTGATATGGCACACTGGTGGGTGTGCCTTACAGGAGGCTCTTCTGC 240

144714038 CCTGGACCTGTTTTAGCTAGTCCTCAGTTTGGTCCCATGTCCAAGCCCTGCCTCCGGAGT 144714097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTGGACCTGTTTTAGCTAGTCCTCAGTTTGGTCCCATGTCCAAGCCCTGCCTCCGGAGT 300

144714098 TGAGCTCCACCTCCTACCTCATTTTCTTTTTTTCTTTTTTAGAGACAGAGTTCCACTCTT 144714157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAGCTCCACCTCCTACCTCATTTTCTTTTTTTCTTTTTTAGAGACAGAGTTCCACTCTT 360

144714158 GTTGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTTCCAGG 144714217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTTCCAGG 420

144714218 TTCAAGCAATTATCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGTGCCACCA 144714277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCAAGCAATTATCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGTGCCACCA 480

144714278 CACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCATCATGTTGGTCCAGCTGA 144714337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCATCATGTTGGTCCAGCTGA 540

144714338 TCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGAGAGCCACCACACCCGGCA 144714397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGAGAGCCACCACACCCGGCA 600

144714398 TCATTTACTTTTGGATGTGCTTTGTGATACTCAGAAGAGACCTGCCTCCAGGCCACCCCT 144714457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCATTTACTTTTGGATGTGCTTTGTGATACTCAGAAGAGACCTGCCTCCAGGCCACCCCT 660

144714458 ACCTTCTCTCTCCACCTGCAGGCACCTGAGGCCGCCTCTGTCTCATCCATCTTGAGTCTT 144714517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCTTCTCTCTCCACCTGCAGGCACCTGAGGCCGCCTCTGTCTCATCCATCTTGAGTCTT 720

144714518 GTGTGGGCTCAGCGATGCCCCTCCTTGCACGCATCACTCGTTTTCTCCCGGTGTCTGTCC 144714577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGTGGGCTCAGCGATGCCCCTCCTTGCACGCATCACTCGTTTTCTCCCGGTGTCTGTCC 780

144714578 CTCAAGATGGCCACTACTGCCACAACTCCCATCTGCACGTCTCGGGTCCTTCTCCAGCTA 144714637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCAAGATGGCCACTACTGCCACAACTCCCATCTGCACGTCTCGGGTCCTTCTCCAGCTA 840

144714638 CCAGCAGATTTTAAAAATCTTTTAATTTTTTGGCCTCACTTAGCAGCAAGGTCTCAAACT 144714697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAGCAGATTTTAAAAATCTTTTAATTTTTTGGCCTCACTTAGCAGCAAGGTCTCAAACT 900

144714698 TACATCCCAAAGTGACCTTCTGTTCTTCTTTCACCTTTCTCCCACCTGCCCCACCCTGCG 144714757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACATCCCAAAGTGACCTTCTGTTCTTCTTTCACCTTTCTCCCACCTGCCCCACCCTGCG 960

144714758 TCACCATGGATGTCAGCTTCCTGCCCACTCCCCACCCTCCTGTGAACCCTCCCTCGGCCT 144714817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCACCATGGATGTCAGCTTCCTGCCCACTCCCCACCCTCCTGTGAACCCTCCCTCGGCCT 1020

144714818 TCAGAGCCAGTCCCTGCCTCTTCCTGGCTCGGTCCAGTCTCACCCCAGGTGCTCTGCTGT 144714877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCAGAGCCAGTCCCTGCCTCTTCCTGGCTCGGTCCAGTCTCACCCCAGGTGCTCTGCTGT 1080

144714878 GTGGCTGCCATTGCCACCGTCCTCACCCTGTCCTCTGTGGTCACCACGCAGCCAACGTGT 144714937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTGGCTGCCATTGCCACCGTCCTCACCCTGTCCTCTGTGGTCACCACGCAGCCAACGTGT 1140

144714938 CTTTCCAGTGTCATCTGGCTTTTGTTACACTCCTGCTCAGAAGCCAGTGTGGGCTTCCTG 144714997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTCCAGTGTCATCTGGCTTTTGTTACACTCCTGCTCAGAAGCCAGTGTGGGCTTCCTG 1200

144714998 TGTGGCTTGGACCGGGACCACACAATCTGCCCCACCCAGTAGTTATCTCGGAAAGACTAA 144715057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTGGCTTGGACCGGGACCACACAATCTGCCCCACCCAGTAGTTATCTCGGAAAGACTAA 1260

144715058 TTCCCAAGCTGTCTTCAGCCCTCCATTGTCATCAACTTGTCCCCAGACTCCATTCGCCCA 144715117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCCCAAGCTGTCTTCAGCCCTCCATTGTCATCAACTTGTCCCCAGACTCCATTCGCCCA 1320

144715118 AAGCAGGAAAGCTCTGCTCATGGCCCGAAGACACAGTGGCCTTCCTCAGGGACATTTCCC 144715177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGCAGGAAAGCTCTGCTCATGGCCCGAAGACACAGTGGCCTTCCTCAGGGACATTTCCC 1380

144715178 AGACAGTTTTGTGCTTGCTCCCGTACCAAGACCACCCATGGCCTGTTTTCCTAAACCCCA 144715237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGACAGTTTTGTGCTTGCTCCCGTACCAAGACCACCCATGGCCTGTTTTCCTAAACCCCA 1440

144715238 CATCCCAGATAGCTTGAAACTATGTTTTGGGATCTTTTATCAGAATTTCTGCTTTGTCTT 144715297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATCCCAGATAGCTTGAAACTATGTTTTGGGATCTTTTATCAGAATTTCTGCTTTGTCTT 1500

144715298 CAGAATGGCTCCGTCCCCTCAAATCCCTATAAATTCCCTTTCTGGCTGAATGCAGTTTCT 144715357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGAATGGCTCCGTCCCCTCAAATCCCTATAAATTCCCTTTCTGGCTGAATGCAGTTTCT 1560

144715358 TTGGACAGCTTTCCTTTCTTGAGCTCTGGTTATGGCAACAGCGCCAGCCTCATCTTGCAT 144715417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGGACAGCTTTCCTTTCTTGAGCTCTGGTTATGGCAACAGCGCCAGCCTCATCTTGCAT 1620

144715418 GGCAGCCTCCCCTCGGGCCTTTTGCCTTCCAGCCACACTCCTTGGTTTTGGCATTGTACT 144715477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGCAGCCTCCCCTCGGGCCTTTTGCCTTCCAGCCACACTCCTTGGTTTTGGCATTGTACT 1680

144715478 TGCTCTAGGTCAAGGGCTTTGGAGGCAGATGGCTACATCTGAGGCCTCCTCCAGCATGTC 144715537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCTCTAGGTCAAGGGCTTTGGAGGCAGATGGCTACATCTGAGGCCTCCTCCAGCATGTC 1740

144715538 CTGGCTGATACCTTAGGTGAGCCATTTGG 144715566
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGGCTGATACCTTAGGTGAGCCATTTGG 1769

EXCISED REGION

144715568 TTCCCTATTTCTGTTTCCTCATCTATAAAATGGAGATAATATTAGAAGTCACCTGGCAAG 144715627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 TTCCCTATTTCTGTTTCCTCATCTATAAAATGGAGATAATATTAGAAGTCACCTGGCAAG 1830

144715628 GCTGCTGTGGCTCGAGGGGGCTCCTAGGTGGGGAGCAGACTTTCACGGAGTGATGTTGGA 144715687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1831 GCTGCTGTGGCTCGAGGGGGCTCCTAGGTGGGGAGCAGACTTTCACGGAGTGGTGTTGGA 1890

144715688 CCTGTGGAGGGGAAGACACAAGAGGCAGGAGTGGGGCTGTGATGCCATCAAGCACAGCGG 144715747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 CCTGTGGAGGGGAAGACACAAGAGGCAGGAGTGGGGCTGTGATGCCATCAAGCACAGCGG 1950

144715748 CTACTGGTCCCCCACAGGGAGCTCTGCCACAGAAGTGGTCCTCAGGGCTGTCCTCGGTTG 144715807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 CTACTGGTCCCCCACAGGGAGCTCTGCCACAGAAGTGGTCCTCAGGGCTGTCCTCGGTTG 2010

144715808 GACCAGGATGTCCAGGACTTTGCAATGTGGGCTGTCCCAGGGAAGGGTGTGACCCTGGCG 144715867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 GACCAGGATGTCCAGGACTTTGCAATGTGGGCTGTCCCAGGGAAGGGTGTGACCCTGGCG 2070

144715868 AGTTGCAGCTGATGGCTGAAGGCCGCTTACCACACCCTGAACAACTGGGACACCCAGCCT 144715927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 AGTTGCAGCTGATGGCTGAAGGCCGCTTACCACACCCTGAACAACTGGGACACCCAGCCT 2130

144715928 GTCACTGGAGGGGTCTCCCGGGGCCTCTCATCGCAGCATCCACCACAGTTGCTGAGGTCC 144715987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 GTCACTGGAGGGGTCTCCCGGGGCCTCTCATCGCAGCATCCACCACAGTTGCTGAGGTCC 2190

144715988 ACATGGGCCAGGCACTGGGCTAGACATGGAACGAGACGGGGGTCCCTGACCTTACGGAGC 144716047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 ACATGGGCCAGGCACTGGGCTAGACATGGAACGAGACGGGGGTCCCTGACCTTACGGAGC 2250

144716048 TTCCTTTCTACTGGCAGGGACAATCAGTACCAAACAAGTAAACTCAAAGTATTAAGTGCC 144716107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 TTCCTTTCTACTGGCAGGGACAATCAGTACCAAACAAGTAAACTCAAAGTATTAAGTGCC 2310

144716108 AGCCGGGCATGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGTGGA 144716167
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2311 AGCCGGGCATGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCTGAGGCGGGTGGA 2370

144716168 TCACGAGGTCAGGAGATCGAGAACATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCTGTCTCCACTAA 144716227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 TCACGAGGTCAGGAGATCGAGAACATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCTGTCTCCACTAA 2430

144716228 AAAACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGC 144716287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 AAAACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGC 2490

144716288 TGAGGCAGGAGAATGGCATAAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCC 144716347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 TGAGGCAGGAGAATGGCATAAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCC 2550

144716348 ACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGAGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 144716407
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     2551 ACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGAGAGACTCTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2609

144716408 AGTATTAAGTGCCAAGCTGCAGCCATGTGTTAGCTGTTGGTGGGGTTGAAGTGGCAGGCG 144716467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 AGTATTAAGTGCCAAGCTGCAGCCATGTGTTAGCTGTTGGTGGGGTTGAAGTGGCAGGCG 2669

144716468 TCAGGTGTACAAGGCAGATTTTGATCTGTGACAACCTGCTCAGGCGGTGTTCTCAAGCTC 144716527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 TCAGGTGTACAAGGCAGATTTTGATCTGTGACAACCTGCTCAGGCGGTGTTCTCAAGCTC 2729

144716528 TTTGGGCCTGCGGACAGGGAGGCTGAAAGGTCTGTAAGCCCTGTGGGGAAGAGGCCTCAA 144716587
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2730 TTTGGGCCTGCGGACAGGGAGGCTGAAAGGTCTGTAAGCCCCGTGGGGAAGAGGCCTCAA 2789

144716588 GCCCTTCTCGCCTTAAGAGCTGGGTCCCATGGTAAGCTGGCAATAGGGTTGCAGCAGCCA 144716647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 GCCCTTCTCGCCTTAAGAGCTGGGTCCCATGGTAAGCTGGCAATAGGGTTGCAGCAGCCA 2849

144716648 AGGTCTCCGGGCCTGGATGAGAGGTGGGGTCGCTCAATGTAGGGCTTTCACACACACCCC 144716707
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 AGGTCTCCGGGCCTGGATGAAAGGTGGGGTCGCTCAATGTAGGGCTTTCACACACACCCC 2909

144716708 TGGAACACAGAAGCCTTTCCAAGAGCCGGGGAGCCCCTGGAGAATCACAGCAGGAGTTCC 144716767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 TGGAACACAGAAGCCTTTCCAAGAGCCGGGGAGCCCCTGGAGAATCACAGCAGGAGTTCC 2969

144716768 ACATGGATTCTGCCCTGGAATTCCTGTAGAAGGTCCTTGGATGAGGGCACGCGCCTAGCG 144716827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 ACATGGATTCTGCCCTGGAATTCCTGTAGAAGGTCCTTGGATGAGGGCACGCGCCTAGCG 3029

144716828 TGTCCCCCTTGGCCACAGCTCCTTCTCCCACGTTGCTTCTCTTC 144716871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 TGTCCCCCTTGGCCACAGCTCCTTCTCCCACGTTGCTTCTCTTC 3073

Alignment time is 3.77288 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [144690484,144724692] =>     34209 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     4203] =>      4203 nucs 'mol-32-2f28-076509_4203'

Score:        4060
Aligned:      4181        nucs
Identic:      4170 (100%) nucs =>      3294 (100%)       876 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [144713087,144716387] EXCISED REGION [144716390,144717269]
 second seq =>  [        1,     3300] EXCISED REGION [     3301,     4180]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [144716388,144716389]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [144716388,144716406] to [144716390,144716408]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [144716388,144716388] to [144716389,144716389]
 second seq =>         0 nucs

144713087 CTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCGCGCGC 144713146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCGCGCGC 60

144713147 CACCACACCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGG 144713206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACCACACCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGG 120

144713207 CTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGA 144713266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGA 180

144713267 TTACAGGTGTGAGCCACCGCACCCGGCCAGAGATCTTTTAAAAAAATATTTTTGATGAAG 144713326
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      181 TTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGAGATCTTTTAAAAAAATATTTTTGAGGAAG 240

144713327 GGCAGGCGAGCCCCAAAATTGTGGCTTAGCCCACGAGGGTTCTTGGCTTTGCCCAGGAAA 144713386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCAGGCGAGCCCCAAAATTGTGGCTTAGCCCACGAGGGTTCTTGGCTTTGCCCAGGAAA 300

144713387 GAATTCAAGAGCGAGCCTATGGTGTTCAAAGCACCTTTGATTGAAGTGGCGTGTACAGCA 144713446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAATTCAAGAGCGAGCCTATGGTGTTCAAAGCACCTTTGATTGAAGTGGCGTGTACAGCA 360

144713447 GCAGCAGAGGGACTGCTCCTTGCAGACAGGGCTACCCCATAGGCAGTGAGCCCAGGGAAG 144713506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCAGCAGAGGGACTGCTCCTTGCAGACAGGGCTACCCCATAGGCAGTGAGCCCAGGGAAG 420

144713507 CAGCTCAGAGGCACTTCTGCAGTCACATGTATATCCACTTTTAATCATATGCAAATTAAG 144713566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGCTCAGAGGCACTTCTGCAGTCACATGTATATCCACTTTTAATCATATGCAAATTAAG 480

144713567 GGGTAGCTTATGCAGAAATTTCTAGAATTAGGCCAGGTGAGGTGGCTCATGCCTGTAATC 144713626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGTAGCTTATGCAGAAATTTCTAGAATTAGGCCAGGTGAGGTGGCTCATGCCTGTAATC 540

144713627 CCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTCAGGGGTTCGAGACCAGCC 144713686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTCAGGGGTTCGAGACCAGCC 600

144713687 TGACCAACATGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATACAAATATTAACCAGGTGTGGTAGC 144713746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGACCAACATGGTGAAACCCATCTCTACTAAAAATACAAATATTAACCAGGTGTGGTAGC 660

144713747 GCACGCCTGTGGTCCCACTACTTAGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCTGGGG 144713806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCACGCCTGTGGTCCCACTACTTAGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCTGGGG 720

144713807 GCAGAGGCTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAG 144713866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCAGAGGCTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAG 780

144713867 AACCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATTTCTAGAATTAGCTTGGTAAGTTC 144713926
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-AAATTTCTAGAATTAGCTTGGTAAGTTC 839

144713927 TGCATTGTCTGTTTGTTGCCATGGAAAGAGGCGGTAGCTTCCGGTGTTGCCATGGCAATG 144713986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TGCATTGTCTGTTTGTTGCCATGGAAAGAGGCGGTAGCTTCCGGTGTTGCCATGGCAATG 899

144713987 GTAAACTGATATGGCACACTGGTGGGTGTGCCTTACAGGAGGCTCTTCTGCCCTGGACCT 144714046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GTAAACTGATATGGCACACTGGTGGGTGTGCCTTACAGGAGGCTCTTCTGCCCTGGACCT 959

144714047 GTTTTAGCTAGTCCTCAGTTTGGTCCCATGTCCAAGCCCTGCCTCCGGAGTTGAGCTCCA 144714106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GTTTTAGCTAGTCCTCAGTTTGGTCCCATGTCCAAGCCCTGCCTCCGGAGTTGAGCTCCA 1019

144714107 CCTCCTACCTCATTTTCTTTTTTTCTTTTTTAGAGACAGAGTTCCACTCTTGTTGCCCAG 144714166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CCTCCTACCTCATTTTCTTTTTTTCTTTTTTAGAGACAGAGTTCCACTCTTGTTGCCCAG 1079

144714167 GCTGTAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTTCCAGGTTCAAGCAA 144714226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GCTGTAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTTCCAGGTTCAAGCAA 1139

144714227 TTATCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGTGCCACCACACCCAGCT 144714286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTATCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGTGCCACCACACCCAGCT 1199

144714287 AATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCATCATGTTGGTCCAGCTGATCCACCCAC 144714346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1200 AATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCATCATGTTGGTCCATCTGATCCACCCAC 1259

144714347 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGAGAGCCACCACACCCGGCATCATTTACT 144714406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGAGAGCCACCACACCCGGCATCATTTACT 1319

144714407 TTTGGATGTGCTTTGTGATACTCAGAAGAGACCTGCCTCCAGGCCACCCCTACCTTCTCT 144714466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTTGGATGTGCTTTGTGATACTCAGAAGAGACCTGCCTCCAGGCCACCCCTACCTTCTCT 1379

144714467 CTCCACCTGCAGGCACCTGAGGCCGCCTCTGTCTCATCCATCTTGAGTCTTGTGTGGGCT 144714526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CTCCACCTGCAGGCACCTGAGGCCGCCTCTGTCTCATCCATCTTGAGTCTTGTGTGGGCT 1439

144714527 CAGCGATGCCCCTCCTTGCACGCATCACTCGTTTTCTCCCGGTGTCTGTCCCTCAAGATG 144714586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CAGCGATGCCCCTCCTTGCACGCATCACTCGTTTTCTCCCGGTGTCTGTCCCTCAAGATG 1499

144714587 GCCACTACTGCCACAACTCCCATCTGCACGTCTCGGGTCCTTCTCCAGCTACCAGCAGAT 144714646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GCCACTACTGCCACAACTCCCATCTGCACGTCTCGGGTCCTTCTCCAGCTACCAGCAGAT 1559

144714647 TTTAAAAATCTTTTAATTTTTTGGCCTCACTTAGCAGCAAGGTCTCAAACTTACATCCCA 144714706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTTAAAAATCTTTTAATTTTTTGGCCTCACTTAGCAGCAAGGTCTCAAACTTACATCCCA 1619

144714707 AAGTGACCTTCTGTTCTTCTTTCACCTTTCTCCCACCTGCCCCACCCTGCGTCACCATGG 144714766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AAGTGACCTTCTGTTCTTCTTTCACCTTTCTCCCACCTGCCCCACCCTGCGTCACCATGG 1679

144714767 ATGTCAGCTTCCTGCCCACTCCCCACCCTCCTGTGAACCCTCCCTCGGCCTTCAGAGCCA 144714826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 ATGTCAGCTTCCTGCCCACTCCCCACCCTCCTGTGAACCCTCCCTCGGCCTTCAGAGCCA 1739

144714827 GTCCCTGCCTCTTCCTGGCTCGGTCCAGTCTCACCCCAGGTGCTCTGCTGTGTGGCTGCC 144714886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GTCCCTGCCTCTTCCTGGCTCGGTCCAGTCTCACCCCAGGTGCTCTGCTGTGTGGCTGCC 1799

144714887 ATTGCCACCGTCCTCACCCTGTCCTCTGTGGTCACCACGCAGCCAACGTGTCTTTCCAGT 144714946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ATTGCCACCGTCCTCACCCTGTCCTCTGTGGTCACCACGCAGCCAACGTGTCTTTCCAGT 1859

144714947 GTCATCTGGCTTTTGTTACACTCCTGCTCAGAAGCCAGTGTGGGCTTCCTGTGTGGCTTG 144715006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GTCATCTGGCTTTTGTTACACTCCTGCTCAGAAGCCAGTGTGGGCTTCCTGTGTGGCTTG 1919

144715007 GACCGGGACCACACAATCTGCCCCACCCAGTAGTTATCTCGGAAAGACTAATTCCCAAGC 144715066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GACCGGGACCACACAATCTGCCCCACCCAGTAGTTATCTCGGAAAGACTAATTCCCAAGC 1979

144715067 TGTCTTCAGCCCTCCATTGTCATCAACTTGTCCCCAGACTCCATTCGCCCAAAGCAGGAA 144715126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGTCTTCAGCCCTCCATTGTCATCAACTTGTCCCCAGACTCCATTCGCCCAAAGCAGGAA 2039

144715127 AGCTCTGCTCATGGCCCGAAGACACAGTGGCCTTCCTCAGGGACATTTCCCAGACAGTTT 144715186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AGCTCTGCTCATGGCCCGAAGACACAGTGGCCTTCCTCAGGGACATTTCCCAGACAGTTT 2099

144715187 TGTGCTTGCTCCCGTACCAAGACCACCCATGGCCTGTTTTCCTAAACCCCACATCCCAGA 144715246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TGTGCTTGCTCCCGTACCAAGACCACCCATGGCCTGTTTTCCTAAACCCCACATCCCAGA 2159

144715247 TAGCTTGAAACTATGTTTTGGGATCTTTTATCAGAATTTCTGCTTTGTCTTCAGAATGGC 144715306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TAGCTTGAAACTATGTTTTGGGATCTTTTATCAGAATTTCTGCTTTGTCTTCAGAATGGC 2219

144715307 TCCGTCCCCTCAAATCCCTATAAATTCCCTTTCTGGCTGAATGCAGTTTCTTTGGACAGC 144715366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TCCGTCCCCTCAAATCCCTATAAATTCCCTTTCTGGCTGAATGCAGTTTCTTTGGACAGC 2279

144715367 TTTCCTTTCTTGAGCTCTGGTTATGGCAACAGCGCCAGCCTCATCTTGCATGGCAGCCTC 144715426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TTTCCTTTCTTGAGCTCTGGTTATGGCAACAGCGCCAGCCTCATCTTGCATGGCAGCCTC 2339

144715427 CCCTCGGGCCTTTTGCCTTCCAGCCACACTCCTTGGTTTTGGCATTGTACTTGCTCTAGG 144715486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CCCTCGGGCCTTTTGCCTTCCAGCCACACTCCTTGGTTTTGGCATTGTACTTGCTCTAGG 2399

144715487 TCAAGGGCTTTGGAGGCAGATGGCTACATCTGAGGCCTCCTCCAGCATGTCCTGGCTGAT 144715546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TCAAGGGCTTTGGAGGCAGATGGCTACATCTGAGGCCTCCTCCAGCATGTCCTGGCTGAT 2459

144715547 ACCTTAGGTGAGCCATTTGGTTTCCCTATTTCTGTTTCCTCATCTATAAAATGGAGATAA 144715606
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ACCTTAGGTGAGCCATTTGGCTTCCCTATTTCTGTTTCCTCATCTATAAAATGGAGATAA 2519

144715607 TATTAGAAGTCACCTGGCAAGGCTGCTGTGGCTCGAGGGGGCTCCTAGGTGGGGAGCAGA 144715666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TATTAGAAGTCACCTGGCAAGGCTGCTGTGGCTCGAGGGGGCTCCTAGGTGGGGAGCAGA 2579

144715667 CTTTCACGGAGTGATGTTGGACCTGTGGAGGGGAAGACACAAGAGGCAGGAGTGGGGCTG 144715726
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CTTTCACGGAGTGGTGTTGGACCTGTGGAGGGGAAGACACAAGAGGCAGGAGTGGGGCTG 2639

144715727 TGATGCCATCAAGCACAGCGGCTACTGGTCCCCCACAGGGAGCTCTGCCACAGAAGTGGT 144715786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TGATGCCATCAAGCACAGCGGCTACTGGTCCCCCACAGGGAGCTCTGCCACAGAAGTGGT 2699

144715787 CCTCAGGGCTGTCCTCGGTTGGACCAGGATGTCCAGGACTTTGCAATGTGGGCTGTCCCA 144715846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CCTCAGGGCTGTCCTCGGTTGGACCAGGATGTCCAGGACTTTGCAATGTGGGCTGTCCCA 2759

144715847 GGGAAGGGTGTGACCCTGGCGAGTTGCAGCTGATGGCTGAAGGCCGCTTACCACACCCTG 144715906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GGGAAGGGTGTGACCCTGGCGAGTTGCAGCTGATGGCTGAAGGCCGCTTACCACACCCTG 2819

144715907 AACAACTGGGACACCCAGCCTGTCACTGGAGGGGTCTCCCGGGGCCTCTCATCGCAGCAT 144715966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AACAACTGGGACACCCAGCCTGTCACTGGAGGGGTCTCCCGGGGCCTCTCATCGCAGCAT 2879

144715967 CCACCACAGTTGCTGAGGTCCACATGGGCCAGGCACTGGGCTAGACATGGAACGAGACGG 144716026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CCACCACAGTTGCTGAGGTCCACATGGGCCAGGCACTGGGCTAGACATGGAACGAGACGG 2939

144716027 GGGTCCCTGACCTTACGGAGCTTCCTTTCTACTGGCAGGGACAATCAGTACCAAACAAGT 144716086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GGGTCCCTGACCTTACGGAGCTTCCTTTCTACTGGCAGGGACAATCAGTACCAAACAAGT 2999

144716087 AAACTCAAAGTATTAAGTGCCAGCCGGGCATGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTT 144716146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 AAACTCAAAGTATTAAGTGCCAGCCGGGCATGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTT 3059

144716147 TGGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGAACATCCTGGCTAACATG 144716206
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TGGAAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGAACATCCTGGCTAACATG 3119

144716207 GTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAAACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGT 144716266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAAACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGT 3179

144716267 AGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATAAACCCGGGAGGCAGAGCTT 144716326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 AGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATAAACCCGGGAGGCAGAGCTT 3239

144716327 GCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGAGAGACTCTGTCT 144716386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGAGAGACTCTGTCT 3299

144716387 C 144716387
          |
     3300 C 3300

EXCISED REGION

144716390 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTAAGTGCCAAGCTGCAGCCATGTGTTAGCTGTTGGTG 144716449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTAAGTGCCAAGCTGCAGCCATGTGTTAGCTGTTGGTG 3360

144716450 GGGTTGAAGTGGCAGGCGTCAGGTGTACAAGGCAGATTTTGATCTGTGACAACCTGCTCA 144716509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGGTTGAAGTGGCAGGCGTCAGGTGTACAAGGCAGATTTTGATCTGTGACAACCTGCTCA 3420

144716510 GGCGGTGTTCTCAAGCTCTTTGGGCCTGCGGACAGGGAGGCTGAAAGGTCTGTAAGCCCT 144716569
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3421 GGCGGTGTTCTCAAGCTCTTTGGGCCTGCGGACAGGGAGGCTGAAAGGTCTGTAAGCCCC 3480

144716570 GTGGGGAAGAGGCCTCAAGCCCTTCTCGCCTTAAGAGCTGGGTCCCATGGTAAGCTGGCA 144716629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTGGGGAAGAGGCCTCAAGCCCTTCTCGCCTTAAGAGCTGGGTCCCATGGTAAGCTGGCA 3540

144716630 ATAGGGTTGCAGCAGCCAAGGTCTCCGGGCCTGGATGAGAGGTGGGGTCGCTCAATGTAG 144716689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3541 ATAGGGTTGCAGCAGCCAAGGTCTCCGGGCCTGGATGAAAGGTGGGGTCGCTCAATGTAG 3600

144716690 GGCTTTCACACACACCCCTGGAACACAGAAGCCTTTCCAAGAGCCGGGGAGCCCCTGGAG 144716749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GGCTTTCACACACACCCCTGGAACACAGAAGCCTTTCCAAGAGCCGGGGAGCCCCTGGAG 3660

144716750 AATCACAGCAGGAGTTCCACATGGATTCTGCCCTGGAATTCCTGTAGAAGGTCCTTGGAT 144716809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AATCACAGCAGGAGTTCCACATGGATTCTGCCCTGGAATTCCTGTAGAAGGTCCTTGGAT 3720

144716810 GAGGGCACGCGCCTAGCGTGTCCCCCTTGGCCACAGCTCCTTCTCCCACGTTGCTTCTCT 144716869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GAGGGCACGCGCCTAGCGTGTCCCCCTTGGCCACAGCTCCTTCTCCCACGTTGCTTCTCT 3780

144716870 TCCTTTATTCACCCTGGTACCTGGCCTTGGTACCTGGGCTGTCCTCCTCATCAAAGGGAC 144716929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCCTTTATTCACCCTGGTACCTGGCCTTGGTACCTGGGCTGTCCTCCTCATCAAAGGGAC 3840

144716930 AATTCAAAACTCTGCAGTTGATTTTAAGAAAGTAGGTGAATTTATTGGCTGGGAAAGACT 144716989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AATTCAAAACTCTGCAGTTGATTTTAAGAAAGTAGGTGAATTTATTGGCTGGGAAAGACT 3900

144716990 TCATGTAGTTTTGCACTTTAGGTTACTTCTAATTCTTTGTTTGCTTCTGTCAAAATTTAA 144717049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TCATGTAGTTTTGCACTTTAGGTTACTTCTAATTCTTTGTTTGCTTCTGTCAAAATTTAA 3960

144717050 AAAGGACCTATTCAAGTGGTCAACTGACAGGTCATTAAGTACACTTGGTGATAAACTGCT 144717109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAAGGACCTATTCAAGTGGTCAACTGACAGGTCATTAAGTACACTTGGTGATAAACTGCT 4020

144717110 GTTATGTTTTTTGCATATAAGTCAGAAAGAGCTAAAGAAATTGAGCGTCGGCTGGGAACA 144717169
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||
     4021 GTTATGTTTTTTGCATATAAGTCAGAAAGAGCTAAAGAAATTGAGTGTCGGCTGGGCACA 4080

144717170 GCGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACGAGGTCA 144717229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GCGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACGAGGTCA 4140

144717230 GGAGATCAAGACCATCCTGGCCAACAAGGTGAAACTCTGT 144717269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GGAGATCAAGACCATCCTGGCCAACAAGGTGAAACTCTGT 4180

Alignment time is 5.24484 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [144690484,144724692] =>     34209 nucs '8 dna:chromosome chromosome:GRCh37:8:1:146364022:1'
Second seq [        1,     2277] =>      2277 nucs 'mol-32-3487-001260_2277'

Score:        2259
Aligned:      2270        nucs
Identic:      2269 (100%) nucs =>      1683 (100%)       586 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [144713884,144715566] EXCISED REGION [144715568,144716154]
 second seq =>  [        1,     1683] EXCISED REGION [     1685,     2271]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [144715567,144715567]
 second seq =>         1 nucs [1684,1684]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [144715567,144715568] to [144715568,144715569]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

144713884 AAAAAAAAAAAAAAGAAATTTCTAGAATTAGCTTGGTAAGTTCTGCATTGTCTGTTTGTT 144713943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAAAAAAAAAGAAATTTCTAGAATTAGCTTGGTAAGTTCTGCATTGTCTGTTTGTT 60

144713944 GCCATGGAAAGAGGCGGTAGCTTCCGGTGTTGCCATGGCAATGGTAAACTGATATGGCAC 144714003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCATGGAAAGAGGCGGTAGCTTCCGGTGTTGCCATGGCAATGGTAAACTGATATGGCAC 120

144714004 ACTGGTGGGTGTGCCTTACAGGAGGCTCTTCTGCCCTGGACCTGTTTTAGCTAGTCCTCA 144714063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTGGTGGGTGTGCCTTACAGGAGGCTCTTCTGCCCTGGACCTGTTTTAGCTAGTCCTCA 180

144714064 GTTTGGTCCCATGTCCAAGCCCTGCCTCCGGAGTTGAGCTCCACCTCCTACCTCATTTTC 144714123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTTGGTCCCATGTCCAAGCCCTGCCTCCGGAGTTGAGCTCCACCTCCTACCTCATTTTC 240

144714124 TTTTTTTCTTTTTTAGAGACAGAGTTCCACTCTTGTTGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCA 144714183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTTTTCTTTTTTAGAGACAGAGTTCCACTCTTGTTGCCCAGGCTGTAGTGCAATGGCA 300

144714184 TGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTTCCAGGTTCAAGCAATTATCCTACCTCAGCCT 144714243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTTCCAGGTTCAAGCAATTATCCTACCTCAGCCT 360

144714244 CCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 144714303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 420

144714304 TAGAGACGAGGTTTCATCATGTTGGTCCAGCTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTG 144714363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGAGACGAGGTTTCATCATGTTGGTCCAGCTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTG 480

144714364 CTGGGATTACAGGCGAGAGCCACCACACCCGGCATCATTTACTTTTGGATGTGCTTTGTG 144714423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGGGATTACAGGCGAGAGCCACCACACCCGGCATCATTTACTTTTGGATGTGCTTTGTG 540

144714424 ATACTCAGAAGAGACCTGCCTCCAGGCCACCCCTACCTTCTCTCTCCACCTGCAGGCACC 144714483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATACTCAGAAGAGACCTGCCTCCAGGCCACCCCTACCTTCTCTCTCCACCTGCAGGCACC 600

144714484 TGAGGCCGCCTCTGTCTCATCCATCTTGAGTCTTGTGTGGGCTCAGCGATGCCCCTCCTT 144714543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAGGCCGCCTCTGTCTCATCCATCTTGAGTCTTGTGTGGGCTCAGCGATGCCCCTCCTT 660

144714544 GCACGCATCACTCGTTTTCTCCCGGTGTCTGTCCCTCAAGATGGCCACTACTGCCACAAC 144714603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCACGCATCACTCGTTTTCTCCCGGTGTCTGTCCCTCAAGATGGCCACTACTGCCACAAC 720

144714604 TCCCATCTGCACGTCTCGGGTCCTTCTCCAGCTACCAGCAGATTTTAAAAATCTTTTAAT 144714663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCCATCTGCACGTCTCGGGTCCTTCTCCAGCTACCAGCAGATTTTAAAAATCTTTTAAT 780

144714664 TTTTTGGCCTCACTTAGCAGCAAGGTCTCAAACTTACATCCCAAAGTGACCTTCTGTTCT 144714723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTGGCCTCACTTAGCAGCAAGGTCTCAAACTTACATCCCAAAGTGACCTTCTGTTCT 840

144714724 TCTTTCACCTTTCTCCCACCTGCCCCACCCTGCGTCACCATGGATGTCAGCTTCCTGCCC 144714783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTTTCACCTTTCTCCCACCTGCCCCACCCTGCGTCACCATGGATGTCAGCTTCCTGCCC 900

144714784 ACTCCCCACCCTCCTGTGAACCCTCCCTCGGCCTTCAGAGCCAGTCCCTGCCTCTTCCTG 144714843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTCCCCACCCTCCTGTGAACCCTCCCTCGGCCTTCAGAGCCAGTCCCTGCCTCTTCCTG 960

144714844 GCTCGGTCCAGTCTCACCCCAGGTGCTCTGCTGTGTGGCTGCCATTGCCACCGTCCTCAC 144714903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTCGGTCCAGTCTCACCCCAGGTGCTCTGCTGTGTGGCTGCCATTGCCACCGTCCTCAC 1020

144714904 CCTGTCCTCTGTGGTCACCACGCAGCCAACGTGTCTTTCCAGTGTCATCTGGCTTTTGTT 144714963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTGTCCTCTGTGGTCACCACGCAGCCAACGTGTCTTTCCAGTGTCATCTGGCTTTTGTT 1080

144714964 ACACTCCTGCTCAGAAGCCAGTGTGGGCTTCCTGTGTGGCTTGGACCGGGACCACACAAT 144715023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACACTCCTGCTCAGAAGCCAGTGTGGGCTTCCTGTGTGGCTTGGACCGGGACCACACAAT 1140

144715024 CTGCCCCACCCAGTAGTTATCTCGGAAAGACTAATTCCCAAGCTGTCTTCAGCCCTCCAT 144715083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGCCCCACCCAGTAGTTATCTCGGAAAGACTAATTCCCAAGCTGTCTTCAGCCCTCCAT 1200

144715084 TGTCATCAACTTGTCCCCAGACTCCATTCGCCCAAAGCAGGAAAGCTCTGCTCATGGCCC 144715143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTCATCAACTTGTCCCCAGACTCCATTCGCCCAAAGCAGGAAAGCTCTGCTCATGGCCC 1260

144715144 GAAGACACAGTGGCCTTCCTCAGGGACATTTCCCAGACAGTTTTGTGCTTGCTCCCGTAC 144715203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAGACACAGTGGCCTTCCTCAGGGACATTTCCCAGACAGTTTTGTGCTTGCTCCCGTAC 1320

144715204 CAAGACCACCCATGGCCTGTTTTCCTAAACCCCACATCCCAGATAGCTTGAAACTATGTT 144715263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAGACCACCCATGGCCTGTTTTCCTAAACCCCACATCCCAGATAGCTTGAAACTATGTT 1380

144715264 TTGGGATCTTTTATCAGAATTTCTGCTTTGTCTTCAGAATGGCTCCGTCCCCTCAAATCC 144715323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGGGATCTTTTATCAGAATTTCTGCTTTGTCTTCAGAATGGCTCCGTCCCCTCAAATCC 1440

144715324 CTATAAATTCCCTTTCTGGCTGAATGCAGTTTCTTTGGACAGCTTTCCTTTCTTGAGCTC 144715383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTATAAATTCCCTTTCTGGCTGAATGCAGTTTCTTTGGACAGCTTTCCTTTCTTGAGCTC 1500

144715384 TGGTTATGGCAACAGCGCCAGCCTCATCTTGCATGGCAGCCTCCCCTCGGGCCTTTTGCC 144715443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGTTATGGCAACAGCGCCAGCCTCATCTTGCATGGCAGCCTCCCCTCGGGCCTTTTGCC 1560

144715444 TTCCAGCCACACTCCTTGGTTTTGGCATTGTACTTGCTCTAGGTCAAGGGCTTTGGAGGC 144715503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCAGCCACACTCCTTGGTTTTGGCATTGTACTTGCTCTAGGTCAAGGGCTTTGGAGGC 1620

144715504 AGATGGCTACATCTGAGGCCTCCTCCAGCATGTCCTGGCTGATACCTTAGGTGAGCCATT 144715563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGATGGCTACATCTGAGGCCTCCTCCAGCATGTCCTGGCTGATACCTTAGGTGAGCCATT 1680

144715564 TGG 144715566
          |||
     1681 TGG 1683

EXCISED REGION

144715568 TTCCCTATTTCTGTTTCCTCATCTATAAAATGGAGATAATATTAGAAGTCACCTGGCAAG 144715627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 TTCCCTATTTCTGTTTCCTCATCTATAAAATGGAGATAATATTAGAAGTCACCTGGCAAG 1744

144715628 GCTGCTGTGGCTCGAGGGGGCTCCTAGGTGGGGAGCAGACTTTCACGGAGTGATGTTGGA 144715687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1745 GCTGCTGTGGCTCGAGGGGGCTCCTAGGTGGGGAGCAGACTTTCACGGAGTGGTGTTGGA 1804

144715688 CCTGTGGAGGGGAAGACACAAGAGGCAGGAGTGGGGCTGTGATGCCATCAAGCACAGCGG 144715747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 CCTGTGGAGGGGAAGACACAAGAGGCAGGAGTGGGGCTGTGATGCCATCAAGCACAGCGG 1864

144715748 CTACTGGTCCCCCACAGGGAGCTCTGCCACAGAAGTGGTCCTCAGGGCTGTCCTCGGTTG 144715807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 CTACTGGTCCCCCACAGGGAGCTCTGCCACAGAAGTGGTCCTCAGGGCTGTCCTCGGTTG 1924

144715808 GACCAGGATGTCCAGGACTTTGCAATGTGGGCTGTCCCAGGGAAGGGTGTGACCCTGGCG 144715867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 GACCAGGATGTCCAGGACTTTGCAATGTGGGCTGTCCCAGGGAAGGGTGTGACCCTGGCG 1984

144715868 AGTTGCAGCTGATGGCTGAAGGCCGCTTACCACACCCTGAACAACTGGGACACCCAGCCT 144715927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 AGTTGCAGCTGATGGCTGAAGGCCGCTTACCACACCCTGAACAACTGGGACACCCAGCCT 2044

144715928 GTCACTGGAGGGGTCTCCCGGGGCCTCTCATCGCAGCATCCACCACAGTTGCTGAGGTCC 144715987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 GTCACTGGAGGGGTCTCCCGGGGCCTCTCATCGCAGCATCCACCACAGTTGCTGAGGTCC 2104

144715988 ACATGGGCCAGGCACTGGGCTAGACATGGAACGAGACGGGGGTCCCTGACCTTACGGAGC 144716047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 ACATGGGCCAGGCACTGGGCTAGACATGGAACGAGACGGGGGTCCCTGACCTTACGGAGC 2164

144716048 TTCCTTTCTACTGGCAGGGACAATCAGTACCAAACAAGTAAACTCAAAGTATTAAGTGCC 144716107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 TTCCTTTCTACTGGCAGGGACAATCAGTACCAAACAAGTAAACTCAAAGTATTAAGTGCC 2224

144716108 AGCCGGGCATGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGC 144716154
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 AGCCGGGCATGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGC 2271

Alignment time is 2.8954 s

